Патогенетические механизмы диссеминации рака яичников с участием генов некодирующих РНК тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 00.00.00, кандидат наук Лукина Светлана Сергеевна
Лукина Светлана Сергеевна
кандидат наук
2024
- Специальность ВАК РФ00.00.00
- Количество страниц 140
Оглавление диссертации кандидат наук Лукина Светлана Сергеевна
СОДЕРЖАНИЕ
ВВЕДЕНИЕ
ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1.1. Общие закономерности канцерогенеза
1.2. Рак яичников и эпигенетические механизмы
1.2.1. Патофизиологические особенности опухоли
1.2.2. Базовые механизмы, действующие при развитии и 15 метастазировании рака яичников
1.2.2.1. Метилирование
1.2.2.2. Эпителиально-мезенхимальный переход (ЭМП)
1.3. Длинные некодирующие РНК (днРНК)
1.3.1. Роль в патофизиологических процессах
1.3.2. Роль некоторых днРНК в ЭМП
1.4. Клиническая значимость некодирующих РНК (нкРНК) 49 Заключение 51 ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ
2.1. Общая характеристика образцов больных раком яичников
2.2. Методы исследования
2.2.1. Биоинформатические методы анализа; критерии отбора 58 днРНК
2.2.2. Выделение тотальной ДНК и РНК из биологического 59 материала
2.2.2.1. Выделение ДНК из ткани
2.2.2.2. Выделение РНК
2.2.3. Бисульфитная конверсия ДНК. Метил-специфичная 62 количественная полимеразная цепная реакция (МС-ПЦР)
2.2.3.1. Бисульфитная конверсия ДНК в растворе
2.2.3.2. Метил-специфичная полимеразная цепная реакция в 63 реальном времени (МС-ПЦР-РВ)
2.2.4. Экспрессионный анализ днРНК
2.2.4.1. Реакция обратной транскрипции
2.2.4.2. SYBR Green ПЦР в реальном времени
2.3. Статистическая обработка результатов исследования
2.4. Метод дискриминантного анализа
2.5. Метод RОС-анализа 72 ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ
3.1. Результаты биоинформатического анализа баз данных
3.2. Изменения уровня метилирования генов днРНК в парных 76 образцах опухолей яичников и в перитонеальных метастазах
3.2.1. Идентификация генов днРНК, гиперметилированных в 76 опухолях больных раком яичников
3.2.2. Связь уровня метилирования с характеристиками прогрессии 78 рака яичников
3.2.3. Связь уровня метилирования с метастазированием при 81 сравнении опухоли от пациентов с метастазами и без них
3.2.4. Изменение уровней метилирования генов днРНК в 85 перитонеальных метастазах
3.3. Изменение уровней экспрессии днРНК в опухолях яичников: 87 связь с прогрессией и метастазированием
3.3.1. Изменения уровней экспрессии днРНК в парных образцах 87 опухолей яичников и перитонеальных метастазах
3.3.2. Связь изменений уровня экспрессии днРНК с 89 характеристиками прогрессии РЯ
3.3.3. Связь изменений уровня экспрессии днРНК в опухолях 90 больных рака яичников с лимфогенным метастазированием и диссеминацией по брюшине
3.4. Вклад аберрантного метилирования в нарушение экспрессии 92 днРНК в злокачественных опухолях яичников
3.4.1. Оценка влияния метилирования ряда генов днРНК на 92 изменение уровня их экспрессии в опухолях яичников
3.4.2. Синергизм в эпигенетических изменениях ряда генов днРНК
3.4.2.1. Ко-метилирование генов днРНК в опухолях яичников
3.4.2.2. Ко-экспрессия генов днРНК в опухолях яичников
3.5. Новые маркеры прогноза метастазирования рака яичников 97 ГЛАВА 4. ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ 100 ЗАКЛЮЧЕНИЕ 109 ВЫВОДЫ 114 СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
ВВЕДЕНИЕ
Актуальность темы исследования и степень ее разработанности
Рак яичников (РЯ) - второе по распространённости после рака молочной железы злокачественное образование у женщин. Ежегодно выявляется более 225 тысяч новых случаев манифестации РЯ и порядка 140 тысяч неблагоприятных исходов (Sung H. et al., 2021). Например, в 2021 году в России количество выявленных случаев РЯ оказалось на 171 пациентку выше, чем в 2020. Данный вид онкологии характеризуется агрессивным, почти бессимптомным течением и гетерогенностью гистологических типов с устойчивостью к лекарственной терапии, за что получил ненаучное название «тихий убийца» (Vogell A. et al., 2019; Gaona-Luviano P. et al., 2020; Каприн А.Д. и др., 2022). Известно, что РЯ активно метастазирующая опухоль. Для этого вида онкологии характерно развитие не только лимфогенных и отдаленных метастазов, но и особый тип метастазирования: диссеминация по брюшине (Barbolina M.V., 2018).
Не всякое нарушение механизмов внутри клетки приводит к озлокачествлению. Однако нарушения в нескольких ключевых процессах в клетке, в частности, нарушение эпигенетических механизмов, могут стать причиной образования злокачественных опухолей яичников (Klymenko Y., Nephew K.P., 2018). Характерной особенностью всех эпигенетических механизмов является их участие в регуляции экспрессии генов на всех уровнях - от геномно-транскрипционного до пост-трансляционного, без изменения генома.
Одним из наиболее фундаментальных механизмов эпигенетической регуляции клеточной стабильности генома является механизм метилирования ДНК (Biswas S., Rao C.M., 2017). Так, в опухолевой клетке наблюдается глобальное деметилирование генома, что вызывает резкое снижение стабильности генома. Разнонаправленные процессы изменения статуса и уровня метилирования опухоль-ассоциированных генов, а именно деметилирование онкогенов и гиперметилирование генов-супрессоров, характеризующие опухолевую клетку, в частности при РЯ, приводят к инициации, прогрессии и метастазированию данного типа рака (Jung M., Pfeifer G.P., 2015; Padrao N.A. et al., 2017; Bakshi A. et al., 2018; Pfeifer G.P., 2018; Gaona-Luviano P. et al., 2020; Xie W. et al., 2021; Loginov V.I. et
al., 2022).
Важным аспектом процесса метилирования является его обратимость, что может усиливать пластичность таких процессов как, эпителиально-мезенхимальный переход (ЭМП), важный в метастазировании рака. В нормальной клетке все процессы контролируются сложной и многоступенчатой системой генных взаимодействий, где каждый элемент отвечает за свой процесс. При разнообразных патологических изменениях эта система нарушается (Jung M., Pfeifer G.P., 2015; Гапонова А.В. и др., 2020; Colella M. et al., 2021). Так, при РЯ наблюдается аберрантное гиперметилирование и снижение экспрессии супрессорных генов, которые в норме сдерживают ЭМП (Gong G. et al., 2020).
Постгеномные исследования показали, что в транскриптоме человека преобладают некодирующие РНК, которые не транслируются, то есть не образуют белковый продукт (Beermann J. et al., 2016; Филатова А.Ю. и др., 2017; Zhang X. et al., 2019). Некодирующим РНК (нкРНК) отводится важная роль в системе регуляторных взаимодействий. Так, открытие микроРНК в самом начале 21 века стало революционным событием в биологии, обозначив новые механизмы регуляции экспрессии генов, кодирующих белки, а также сигнальных путей и процессов, в которых они участвуют. Особый интерес среди регуляторных нкРНК представляет новый класс РНК, а именно длинные некодирующие РНК (днРНК), которые также участвуют в регуляции экспрессии белок-кодирующих генов. Причем, выявлены взаимодействия днРНК как с матричной РНК, так и с участками ДНК промоторов генов, а также показано воздействие днРНК на мРНК при посредничестве микроРНК или РНК-связывающих белков (RBP) (Vrba L et al., 2015; Blagden S. et al., 2018; Deb B. et al., 2018; Qu R. et al., 2018; Zhao X. et al., 2019; Salamini-Montemurri M. et al., 2020; Yang C. et al., 2020; Коваленко Т.Ф. и др., 2021; Feng L.Y. et al., 2021).
В настоящее время получены убедительные данные о том, что в опухолях разных локализаций происходит нарушение регуляции экспрессии генов днРНК и эти регуляторные РНК могут выступать как в роли онкогенов, так и супрессоров опухоли (Tomlins S.A. et al., 2016; Anastasiadou E. et al., 2018; Коваленко Т. Ф. и др., 2021).
Следует отметить, что комплексные исследования роли днРНК в развитии
метастазов при РЯ встречаются крайне редко. В большинстве работ проводится анализ взаимодействий одной из днРНК с микроРНК и мРНК белка, как например, в работе Лян Х. и соавторов (Liang H. et al., 2018).
Нами изучена роль группы генов днРНК в патофизиологических процессах, связанных с развитием и диссеминацией РЯ. Нам удалось проследить цепь эпигенетических изменений 10 генов днРНК (MEG3, GAS5, HAND2-AS1, SNHG6, SSTR5-AS1, SEMA3B-AS1, ZEB1-AS1, ZNF667-AS1, KCNK15-AS1, MAGI2-AS3) как в инициации метастазирования, так и в формировании метастатического очага, которые, по-видимому, связаны с ЭМП-переходом и его реверсией. Определен набор факторов, которые предложены как маркеры прогноза метастазирования РЯ.
Однако, необходимы дальнейшие исследования эпигенетических механизмов в диссеминации РЯ, а также поиск и валидация новых маркеров для диагностики и прогноза эффективности лечения РЯ.
Цель исследования.
Определить влияние длинных некодирующих РНК (днРНК) и эпигенетических модификаций их генов на развитие, прогрессирование и образование метастазов рака яичников.
Задачи исследования
1. Провести анализ баз данных NCBI GEO и GEPIA 2.0 и отбор генов днРНК, изменяющих уровень метилирования и экспрессии в опухолях яичников.
2. На представительной выборке парных образцов опухолей яичников провести анализ уровня метилирования группы генов днРНК и идентифицировать гены днРНК, вовлеченные в процессы развития РЯ.
3. С учетом патоморфологических характеристик опухолей оценить вклад эпигенетических модификаций в прогрессирование РЯ.
4. Оценить роль метилирования в подавлении экспрессии генов днРНК на клинических образцах РЯ.
5. Определить значимость эпигенетических изменений ряда генов днРНК в процессах диссеминации рака яичников: от опухолей больных без метастазов к перитонеальным метастазам.
6. Оценить патофизиологическую и клиническую значимость новых гиперметилированных генов днРНК как факторов и маркеров прогноза
метастазирования.
Научная новизна
Настоящее исследование представляет собой комплексный анализ участия группы днРНК и эпигенетической модификации их генов в патофизиологических процессах развития и прогрессирования рака яичников. На базе проведенного биоинформатического анализа отобраны 12 генов днРНК (MEG3, GAS5, HAND2-AS1, SNHG6, SSTR5-AS1, SEMA3B-AS1, ZEB1-AS1, ZNF667-AS1, KCNK15-AS1, MAGI2-AS3, HOTAIR, MALAT1), которые на следующих этапах работы на резекционном материале больных РЯ были исследованы экспериментально.
С использованием выборки из 119 парных образцов опухолевой и гистологически нормальной ткани больных РЯ впервые изучен профиль метилирования группы 12 генов днРНК. Результаты сравнительного анализа уровней метилирования впервые выявили гиперметилирование 9 генов днРНК (GAS5, HAND2-AS1, SNHG6, SSTR5-AS1, SEMA3B-AS1, ZEB1-AS1, KCNK15-AS1, MAGI2-AS3, ZNF667-AS1 (p<0.001, FDR=0.1)) в опухолевых тканях рака яичников.
В настоящем исследовании удалось проследить изменения уровня метилирования и экспрессии генов днРНК в группах больных РЯ на разных этапах прогрессии рака. В исследование включены опухоли с ранними и поздними стадиями, с различным размером и разной степенью дифференцировки и другими клиникоморфологическими особенностями. По результатам впервые показано, что уровень метилирования промоторных районов генов GAS5, KCNK15-AS1, MEG3, SEMA3B-AS1, SNHG6, ZEB1-AS1, ZNF667-AS1 значимо повышался при переходе от ранних стадий развития опухоли к более поздним тяжелым стадиям.
При сравнении опухолей больных с наличием и отсутствием метастазов мы впервые определили, что увеличение уровня метилирования 7 генов днРНК (GAS5, KCNK15-AS1, MEG3, SEMA3B-AS1, SNHG6, ZEB1-AS1, ZNF667-AS1) связано с развитием метастазов.
Определены группы гиперметилированных генов днРНК, специфичные для разных типов метастазирования, включая лимфогенное, в большой сальник, диссеминацию по брюшине и возникновение асцита.
Также, впервые обнаружено статистически значимое снижение уровня метилирования 7 генов HAND2-AS1, MAGI2-AS3, MEG3, SEMA3B-AS1, SSTR5-AS1,
ZEB1-AS1, ZNF667-AS1 (р<0.01) в перитонеальных метастазах относительно парной опухолевой ткани, что предположительно, может быть связано с пластической реверсией эпителиально-мезенхимального клеточного процесса, вовлеченного в инициацию метастазирования, в мезенхимально-эпителиальный переход (ЭМП-МЭП).
Таким образом, получены новые данные об эпигенетической инактивации группы генов днРНК, не описанные в мировой литературе. Определены новые гиперметилируемые в РЯ гены днРНК и связь метилирования и экспрессии этих генов с прогрессированием опухолевого процесса и диссеминацией РЯ. Определены новые потенциальные маркеры прогноза метастазирования РЯ (MEG3, ZNF667-AS1, ZEB1-AS1, GAS5, SEMA3B-AS1 и KCNK15-AS1).
Теоретическая и практическая значимость
Теоретическая значимость работы заключается в определении группы генов днРНК, эпигенетическая инактивация которых связана с процессами развития и диссеминации РЯ. Для набора генов днРНК установлено ко-метилирование и синергизм в изменениях экспрессии, что позволяет предположить их участие в общих процессах.
Полученные данные о профилях метилирования и экспрессии генов днРНК (MEG3, GAS5, HAND2-AS1, SNHG6, SSTR5-AS1, SEMA3B-AS1, ZEB1-AS1, ZNF667-AS1, KCNK15-AS1, MAGI2-AS3, HOTAIR, MALAT1) предлагается использовать при прогнозе развития метастазов у пациенток с РЯ - составлен прогностический набор маркеров.
Методы и методология исследования
Настоящая работа основана на анализе ретроспективных данных комплексного обследования больных раком яичников, получавших лечение в НМИЦ онкологии имени Н.Н. Блохина с 2020 по 2022 гг.
Парные образцы опухолевой и здоровой ткани, а также образцы перитонеальных метастазов брюшины (резекционный материал) были получены в Отделе патологической анатомии опухолей человека ФГБУ «НМИЦ онкологии имени Н.Н. Блохина». Исследование проводилось с соблюдением принципов добровольности и конфиденциальности в соответствии с «Основами законодательства РФ об охране здоровья граждан» (Указ Президента РФ от
24.12.93 № 2288). Использовались ткани только тех больных, которые до операции не получали лучевую или химиотерапию. Все случаи РЯ классифицированы клинически по системе TNM в соответствии с требованиями Международного противоракового общества (UICC, версия 2002 г.) и описаны гистологически на основании классификации Всемирной Организации Здравоохранения (ВОЗ) в отделе патоморфологии опухолей ФГБУ «НМИЦ онкологии имени Н.Н. Блохина».
Молекулярно-генетические исследования проведены на базе лаборатории патогеномики и транскриптомики ФГБНУ «Научно-исследовательского института общей патологии и патофизиологии» (и.о. заведующий лабораторией - д.б.н., проф. Брага Э.А.).
Для выполнения экспериментального исследования из образцов ткани проводили выделение высокомолекулярной ДНК и РНК. Оценка уровня метилирования CpG-районов промоторных областей генов MEG3, GAS5, HAND2-AS1, SNHG6, SSTR5-AS1, SEMA3B-AS1, MAGI2-AS3, KCNK15-AS1, ZEB1-AS1, ZNF667-AS1, HOTAIR, MALAT1 проводилась с применением бисульфитной конверсии ДНК с последующей метил-специфичной ПЦР в реальном времени. Для определения уровня экспрессии днРНК MEG3, GAS5, HAND2-AS1, SNHG6, SSTR5-AS1, SEMA3B-AS1, MAGI2-AS3, KCNK15-AS1, ZEB1-AS1, ZNF667-AS1, HOTAIR, MALAT1 проводили ПЦР в режиме реального времени (ПЦР-РВ) на кДНК матрице. Для статистической обработки результатов исследования была использована програмная среда R.
Положения, выносимые на защиту
1. Эпигенетические механизмы дерегуляции 10 генов длинных некодирующих РНК (GAS5, HAND2-AS1, KCNK15-AS1, MAGI2-AS3, MEG3, SEMA3B-AS1, SNHG6, SSTR5-AS1, ZEB1-AS1, ZNF667-AS1) влияют на развитие и прогрессию рака яичников.
2. Группа из 9 гиперметилированных генов длинных некодирующих РНК связана с разными типами метастазирования: лимфогенным и отдаленным, в большой сальник, диссеминацией по брюшине и образованием асцита (GAS5, HAND2-AS1, KCNK15-AS1, MEG3, SEMA3B-AS1, SNHG6, SSTR5-AS1, ZEB1-AS1, ZNF667-AS1).
3. Снижение экспрессии 8 генов днРНК (HAND2-AS1, KCNK15-AS1, MAGI2-AS3, MEG3, SEMA3B-AS1, SNHG6, SSTR5-AS1, ZEB1-AS1) в опухолях яичников связано с ДНК-метилированием.
4. Тест-система из 6 маркеров GAS5, MEG3, KCNK15-AS1, SEMA3B-AS1, ZEB1-AS1, ZNF667-AS1 составлена для прогноза метастазирования в опухолях яичников.
Рекомендованный список диссертаций по специальности «Другие cпециальности», 00.00.00 шифр ВАК
Роль эпигенетических механизмов регуляции группы опухоль-ассоциированных генов в патогенезе немелкоклеточного рака легкого2023 год, кандидат наук Губенко Марина Сергеевна
Аномальная экспрессия и аберрантное метилирование генов и микроРНК, связанных с апоптозом, в патогенезе рака молочной железы и яичников2020 год, кандидат наук Филиппова Елена Александровна
Гены длинных некодирующих РНК: их метилирование, экспрессия и функции в развитии глиобластомы и карциномы эндометрия2022 год, кандидат наук Коваленко Татьяна Феликсовна
Рак яичников. Новые подходы к прогнозу течения заболевания и экспериментальной терапии (клинико-экспериментальное исследование)2021 год, доктор наук Вереникина Екатерина Владимировна
Онкосупрессорные свойства SCP фосфатаз при немелкоклеточном раке лёгкого2020 год, кандидат наук Пузанов Григорий Андреевич
Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Патогенетические механизмы диссеминации рака яичников с участием генов некодирующих РНК»
Апробация работы
Результаты работы были доложены автором и обсуждены на следующих конференциях: 45th FEBS Congress, Molecules of Life: Towards New Horizons, Ljubljana, Slovenia, July 3-8, 2021, Poster; «Клиническая лабораторная диагностика» 19-21 октября 2021 (г. Москва), устный доклад; XXVII Всероссийская научно-практическая конференция с международным участием. Лабораторная медицина: вклад в борьбу с пандемией. 4-6 апреля 2022 г. (г. Москва), устный доклад; Scholars International Webinar on Cancer Research and Therapeutics. Virtual Theme: "Frontiers in Cancer Research and Therapy". 16-18 May 2022, E-poster; 9TH INTERNATIONAL CONGRESS OF PATHOPHYSIOLOGY 4-6 июля 2023 г. (г. Белград, Сербия), устный доклад; The 47th FEBS Congress. 8-12 July 2023, Tours, France, постерный доклад; VIII Всероссийская Конференция по молекулярной онкологии 20-22 декабря 2023 г. (г. Москва, Россия), устный доклад; ESMO TAT. February 26-28, 2024, Paris, France, постерный доклад.
Публикации по теме диссертации:
По теме диссертации опубликовано 23 работы, из которых 6 статей в реферируемых российских изданиях, рекомендованных ВАК РФ и 17 тезисов в реферируемых российских и зарубежных журналах.
Личный вклад автора
При выполнении работы автор лично: проводила постановку и выполнение всех экспериментальных исследований; участвовала в сопоставлении полученных результатов с патоморфологическими, гистологическими и клиническими характеристиками образцов опухолей пациенток; совместно с сотрудниками лаборатории проводила биоинформатический анализ на основе доступных баз данных, проводила статистический анализ полученных результатов, и интерпретировала научные результаты. Также автор участвовала в написании и
10
оформлении научных статей по теме диссертационной работы и делала устные и стендовые сообщения на конференциях.
ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ 1.1. Общие закономерности канцерогенеза
Весь процесс накопления генетических и эпигенетических ошибок определяет механизм образования неопластических клеток, которые впоследствии приобретают способность к инвазии и становятся злокачественными. (Chen J.F. et al., 2021; Hanahan D. 2022). Все эпигенетические механизмы осуществляются без нарушения нуклеотидной последовательности в геноме и в нормальной клетке обратимы. Данные механизмы вовлечены в большое число системных клеточных процессов и включают несколько групп, одной из которых является метилирование ДНК. Этот процесс характеризуется присоединением метильной группы к остатку цитозина в CG-группе, локализованных чаще всего внутри или вблизи промоторных участков генома, или в так называемых CpG-островках. В опухолевой клетке, в том числе рака яичников, наблюдается подавление системных процессов путем метилирования промоторных районов генов-супрессоров опухолевого роста и других генов, обеспечивающих гомеостаз. Одновременно с этим происходит деметилирование онкогенов. Такой дисбаланс приводит к злокачественной трансформации. (Alghamian Y. et al., 2022; Kumari P. et al., 2022; Throwba H. et al., 2022).
Механизм злокачественной трансформации многоэтапный сложный и многофакторный процесс. Выделяют несколько значимых свойств опухолевой клетки. Вначале клетка снижает потребность во внешних сигналах для поддержания клеточной пролиферации. Это называется независимостью в пролиферативных сигналах (Amer M. et al., 2021). Вторым свойством считается снижение чувствительности к антипролиферативным сигналам. В опухолевой клетке снижается чувствительность к действию факторов, подавляющих рост опухоли и факторов специфического и неспецифического противоопухолевого иммунитета. Они могут продолжать пролиферацию при повреждении ДНК и при прочих неблагоприятных условиях - недостатке нуклеотидов, гипоксии и т.д. (Choi J. et al., 2018; Larionova I. et al., 2020). Ещё одним важным свойством опухолевой клетки является иммортализация, процесс неограниченного деления клеток.
Известно, что зрелые клетки человека имеют ограниченное число делений (до 70), что обусловлено особенностями работы теломеразы (Dogan F, Biray Avci C. 2018). Также, важнейшей способностью опухолевой клетки является её избегание апоптоза, что резко повышает её жизнеспособность и делает её не чувствительной к факторам противоопухолевого иммунитета и терапевтическим воздействиям (Amin A.R.M.R. et al., 2015; Carneiro B.A., El-Deiry W.S. 2020). Изучение механизма образования опухоли кроме фундаментальной составляющей позволяет находить новые инновационные способы ранней диагностики, а также прогнозирования выживаемости больных и ответа на терапию (Повещенко А.Ф. и др., 2021; Hanahan D. 2022).
1.2. Рак яичников и эпигенетические механизмы.
1.2.1. Патофизиологические особенности опухоли
Интерес к онкологическим заболеваниям обусловлен высокими показателями заболеваемости и смертности, несмотря на значительные успехи в радио- и химиотерапии рака. Проблема инвалидизации и высокой частоты неблагоприятных исходов от онкологических заболеваний представляет огромную социальную проблему. У женщин вторым по встречаемости после РМЖ злокачественным образованием с поздней выявляемостью является рак яичников (РЯ). На его долю приходится более 225 тысяч новых случаев злокачественных новообразований яичника ежегодно и порядка 140 тысяч из них заканчиваются неблагоприятным исходом (Sun Q. et al., 2019).
Следует отметить, что данный вид онкологии характеризуется не только агрессивным течением, но довольно сильной гетерогенностью своих гистологических типов. По причине бессимптомного протекания вплоть до поздних стадий, осложнённых лекарственной устойчивостью, а также вследствие высокой гетерогенности, РЯ остается угрозой для жизни женщин. Так, в 2021 году в России количество выявленных случаев РЯ на 171 пациентку оказалось выше, чем в 2020. (Каприн А.Д. и др., 2022; Vannini I. et al., 2018).
Известно, что РЯ активно метастазирующая опухоль. Для этого вида онкологии характерно развитие лимфогенных и отдаленных метастазов, а также
особый тип метастазирования: имплантационный (диссеминация по брюшине) (Barbolina M.V. 2018).
Важно отметить, что в основе любого новообразования лежит бесконтрольное деление клеток, и сбой может произойти на любом этапе. Таким образом, по степени дифференцировки различают доброкачественные, пограничные и злокачественные опухоли. Для яичников образование доброкачественных опухолей у женщин детородного возраста процесс обычный и происходит в 80% случаев. Он связан с гормональными нарушениями. Опасность данных новообразований состоит, главным образом, в возможности перерождения. К такому типу опухоли относят кисты и простые серозные цистаденомы. Первые не содержат солидный компонент и без осложнений хирургического вмешательства не требуют. Вторые подобны первым и имеют крайне низкую возможность к перерождению.
К следующей группе, выявляемой в 5-10% случаев, относят пограничные опухоли яичников (ПОЯ). Они характеризуются низкой степенью злокачественности и чаще обнаруживаются у молодых. По происхождению они подразделяются на серозные и муцинозные. Реже встречаются ПОЯ эндометриоидной и светлоклеточной гистологии. Серозные пограничные образования характеризуются формированием узловых структур с возможностью роста по брюшине с образованием асцита. При этом после радикального лечения они редко рецидивирует. Муцинозные пограничные опухоли характеризуются чаще всего односторонним образованием с быстрым ростом до больших размеров (до 50 см), имеют слизистое содержимое и многокамерное строение. Наконец, эндометроидные, светлоклеточные опухоли, а также опухоль Бреннера составляют не более 2%, являются односторонними и характеризуются менее агрессивным по сравнению с муцинозными ростом.
При этом из всех новообразований яичника у женщин злокачественными являются лишь 10-15%. Из них до 80% - эпителиальные (собственно рак). Причем, половину случаев составляют опухоли серозной гистологии, ещё четверть -
эндометроидные, а на муцинозные, светлоклеточные и недиференцированные в совокупности приходится около 30%.
Серозные опухоли характеризуются двусторонней локализацией, малым размером и в 20% случаев являются результатом перерождения пограничной опухоли. При ранней выявляемости выживаемость составляет более 80%. Для муцинозных карцином характерно наличие участков пограничной опухоли и крупных односторонних кист. Выживаемость при ранних стадиях составляет до 85%. Эндометриоидный рак представляет собой крупные образования с множественными очагами. Особенность таких опухолей состоит в их сочетании с онкологией эндометрия. Выживаемость при выявлении заболевания на ранних стадиях составляет 60-80%. Светлоклеточный рак является наиболее неблагоприятным гистологическим типом, и даже при ранней выявляемости он характеризуется неблагоприятным прогнозом, ассоциирован с эндометриозом и гиперкальциемией, имеет высокую степень злокачественности, быстро распространяется на соседние органы, и трудно поддается лечению. Недифференцируемый и неклассифицируемый рак представляет собой группу редко встречающихся новообразований. Происходит из низкодифференцируемых клеток и характеризуется неясной гистологической картиной (https://berishvili.ru/lechenie/lechenie-raka-yaichnikov).
При этом следует отметить, что как было сказано выше, из-за отсутствия четких симптомов на ранних стадиях, высокой лекарственной устойчивости на выявляемых поздних стадиях, а также отличительных особенностей каждого подтипа, РЯ остается реальной угрозой для жизни женщин.
1.2.2. Базовые механизмы, действующие при развитии и метастазировании рака яичников.
РЯ, как и многие другие виды рака, имеет многофакторную природу, обусловленную наличием критических повреждений в механизмах поддержания гомеостаза. Следует учитывать, что не всякое нарушение приводит к озлокачествлению. Однако несколько таких событий в клетке, в частности, при
нарушении эпигенетических механизмов, могут стать причиной возникновения злокачественной трансформации (Klymenko Y., Nephew K.P. 2018).
Мировые исследования по изучению анатомии рака позволили установить значительное влияние эпигенетических изменений на развитие рака и его пластичность. Важным аспектом эпигенетических преобразований является их участие в регуляции экспрессии генов на всех уровнях - от геномно-транскрипционного до пост-трансляционного без изменения структуры генома, но при этом, эти изменения являются своего рода «переключателями внешних триггеров» на внутренние механизмы регуляции генов, переводя хроматин из активной формы в неактивную и обратно. При онкогенезе этот механизм существенно преобразуется, открывая способность неопластической клетке становиться раковой, закладывая в уже перерождённые клетки метастатический потенциал. Пластичность эпигенетических механизмов в раковой клетке заключается в запуске множественных альтернативных алгоритмов регуляции экспрессии генов, которые влияют не только на саму клетку, но и на её окружение. Метилирование, как один из ключевых механизмов эпигенетической регуляции, является фактором, нарушающим геномную стабильность, закладывая в клетку способность к перерождению (Biswas S., Rao C.M. 2017). Другим, не менее значимым фактором являются модификации РНК, в том числе некодирующих. Важно отметить, что сочетание нескольких факторов становится критическим событием для онкогенеза (Бейлерли О.А. и др., 2019).
1.2.2.1. Метилирование.
Одним из фундаментальных механизмов эпигенетической регуляции контроля клеточной стабильности является механизм метилирования генома (Biswas S., Rao C.M. 2017). Важным аспектом этого процесса является его пластичность, обусловленная рядом факторов, таких как, например, эпителиально-мезенхимальный переход (ЭМП). При разнообразных патологических процессах этот механизм нарушается (Chung V.Y. et al., 2019; Jung M., Pfeifer G.P. 2015). Следует отметить, что процесс аномального изменения статуса и уровня метилирования является двусторонним. Так, с одной стороны, происходит
глобальное деметилирование всего генома, снижающее геномную стабильность, и деметилирование протоонкогенов, которые с утратой контроля за экспрессией активируются. С другой стороны, нарастает гиперметилирование промоторных областей генов-супрессоров опухолевого роста в различных тканях, причём этот процесс специфичен. Таким образом, эти разнонаправленные процессы изменения статуса и уровня метилирования являются одной из характерных черт опухолевой клетки в разных локализациях, в том числе и РЯ (Jung M., Pfeifer G.P. 2015; Wu Y. et al., 2019).
Важно отметить, что механизм метилирования включает несколько разных вариантов, таких, как ДНК- и РНК-метилирование и метилирование белков-гистонов. В нашей работе мы рассматриваем ДНК-метилирование, типичное для генов-супрессоров и характеризующееся присоединением метильной группы к остаткам цитозина в составе CG-группы с образованием 5-метилцитозина, что приводит к инактивации гена. В нормальной клетке этот процесс затрагивает области импринтинга (Bakshi A. et al., 2018). При этом CG богатые области, иначе называемые CpG-островками, находящиеся в 5'-областях вблизи промоторных участков генов, в нормальной клетке метилированию не подвергаются, чтобы не нарушать транскрипцию этих генов.
Однако в опухоли аберрантное метилирование этих областей в генах супрессорах может приводить к подавлению экспрессии ряда генов-супрессоров, что является спусковым механизмом развития и прогрессии рака (Peng Y. et al., 2019). В частности, для рака яичников показано, что снижение экспрессии, обнаруженное с помощью технологии полногеномного секвенирования набора генов, коррелировало с увеличенным уровнем метилирования этих генов. Идентифицированные в ходе экспериментов аберрантно метилированные гены могут быть использованы как маркеры данного типа опухоли (Gong G. et al., 2020). Таким образом, выявление метилирования может помочь в клинической практике при проведении молекулярно-генетического анализа для определения «триггеров» инициации рака, что позволит уточнить диагноз, включая определение не только типа опухоли и её гистологического подтипа, но также показатели прогрессии
опухоли согласно современной классификации, что будет определять и тактику, и стратегию лечения конкретного пациента.
1.2.2.2. Эпителиально-мезенхимальный переход (ЭМП).
В процессе эмбрионального развития, а также при заживлении ран нормальная клетка запускает обратимый эволюционно консервативный механизм перехода от эпителиального статуса к мезенхимальному. Этот процесс характеризуется высокой пластичностью и обратный переход не менее важен для клеточной стабильности. При рассмотрении эпителиальных клеток отмечают плотный контакт с окружением через соединительные комплексы. В сравнении клетки мезенхимы рыхлые и свободно расположены во внеклеточном матриксе. Механизм эпителиально-мезенхимального перехода (ЭМП) представляет собой спектр множества промежуточных этапов и является очень значимым для всех биологических процессов. Процесс ЭМП тесно связан с процессами миграции и инвазии. Эта связь крайне важна не только для нормальной, но также для опухолевой метастазирующей клетки. Отмечают влияние ЭМП и при образовании раковых стволовых клеток и при уклонении от апоптоза (Дворяшина И.А. и др., 2021; Alghamian Y. et б1., 2022; Qin I, Xu J. 2022).
Сам процесс перехода от эпителиальной клетки к мезенхимальной ранее был описан для трех основных биологических процессов: эмбриогенеза, рака и фиброза. Во время эмбрионального развития события перехода эпителия в мезенхиму можно разделить на три группы: начальный, продолжающийся и финальный этапы преобразования эпителиальной клетки в мезенхимальную. В частности, при формировании гаструлы во время формирования плода у млекопитающих наблюдается первичный этап ЭМП. Результатом данного этапа становится образование мезодермального слоя, из которого впоследствии будет образована хорда, сомиты, примордии мочеполовой системы, и ряд других ключевых закладок у эмбриона.
Другим ключевым событием эмбриогенеза необходимо считать развитие клеток нервного гребня, которые претерпевая эпителиальный переход, получают способность к миграции (рис. 1). Впоследствии эти клетки подвергнутся
дифференцировке в различные другие типы клеток и тканей в зависимости от их конечного пункта назначения. Следующий этап ЭМП характерен для тканей, сформированных из мезодермального и энтодермального слоя и заключается он в запуске обратного процесса: перехода мезенхимальной клетки в эпителиальную (МЭП). В частности, такой процесс наблюдается при формировании опорно-двигательного аппарата, когда сформировавшиеся после гаструляции мезенхимальные предшественники с помощью МЭП образуют вторичные эпителиальные предшественники дермы, мышц и позвонков. Аналогичным образом, эндокринные клетки поджелудочной железы, имеющие энтодермальное происхождение с помощью ЭМП-МЭП становятся островками Лангерганса. Наконец, финальный или третичный этап ЭМП происходит в клетках эндотелия, в атриовентрикулярном канале и выводном тракте сердца во время формирования эндокардиальных подушек (Потапов В.Е. и др., 2016).
Рисунок 1. ЭМП в эмбриональном развитии и при патологии (взято из (Потапов В.Е. и др., 2016) в модификации автора).
Данный процесс приобретает особенную важность, когда речь заходит о патологическом процессе, в особенности при прогрессии рака, при котором злокачественные эпителиальные клетки подвергаются ЭМП и приобретают способность к миграции и проникают в близлежащие кровеносные сосуды. Двигаясь по сосудам, эти клетки подвергаются обратному МЭП процессу с
19
образованием колонии клеток с эпителиальными свойствами. Так определяется метастатический потенциал опухоли.
В ряде исследований, выполненных на образцах и клеточных линиях рака разной этиологии, а также на моделях мышей с опухолями разной локализации, была определена связь между ЭМП и различными аспектами злокачественности, в том числе пролиферацией, инвазией и миграцией (Чулкова С.В. и др., 2020; Zhao R., Trainor P.A. 2023).
Следует отметить, что процесс ЭМП в раковой клетке подвергается динамической эпигенетической регуляции, но не генетическим изменениям, которые необратимы. Таким образом, на первый план выходят механизмы, имеющие алгоритмы динамического транскрипционного программирования (Li L., Li W. 2015). Через эпигенетические модификации вероятно осуществляется и связь с микроокружением опухоли.
Механизм эпителиально-мезенхимального перехода в полной мере задействован раковой клеткой при метастазировании - процессе, сопровождающимся инвазией, миграцией и последующей колонизацией. Данный механизм описывает 6 последовательных этапов, начинающихся с локальной инвазии, индуцируемой при ЭМП, далее через интравазацию, миграцию в кровотоке, прикрепление и экстравазацию происходит образование микрометастазов с последующей колонизацией в отдалённом органе. При этом задействован ряд молекулярных путей, обеспечивающих весь каскад процессов метастазирования (Мнихович М.В. и др., 2022; Saha S. et al., 2023).
На молекулярном уровне процесс ЭМП регулируется рядом транскрипционных факторов, которые подавляют экспрессию генов, связанных с эпителиальным фенотипом с одновременным усилением экспрессии генов, поддерживающих мезенхимальный фенотип. Эти транскрипционные факторы поддерживают клеточную адгезию, поляризацию и мобильность. К наиболее изученным генам, вовлеченным в регуляцию ЭМП, относят SNAIL1, SNAIL2, ZEB1, ZEB2, BHLH, TWIST1 и TWIST2 (Huang Y. et al., 2022).
В частности, установлено, что гены SNAIL1, SNAIL2 участвуют в ранних этапах ЭМП, способствуя инвазии и миграции через подавление определённых генов. В клетках опухоли эти гены проявляют свойства онкогенов (Huang Y. et al., 2022). Так, в исследовании возможных триггеров рака носоглотки ученые выявили путь генных взаимодействий, который приводит к развитию данного вида онкологии. Результаты исследования определили ген Capn4, который, при взаимодействии с геном SNAIL, запускает каскад PI3K/AKT/Snail/claudin-11, в результате чего происходит развитие рака носоглотки и его прогрессия, включая образование метастазов. Дальнейшие исследования подтвердили, что блокировка пути CAPN4/AKT/Snail/claudin-11 приводит к подавлению инвазии и к подавлению образования метастазов рака носоглотки (Yang F. et al., 2023).
В другом исследовании был выявлен путь, который связан с развитием и прогрессией рака яичников. Авторы исследования выявили ген UBE2E2, экспрессия которого была значительно выше в опухоли по сравнению с нормой. Также установили, что этот ген связан с миграцией, ЭМП и образованием метастазов. С помощью экспериментов in vitro удалось проследить путь UBE2E2-Nrf2-p62-Snail, который влиял на изменение активности клеток рака яичников (Hong X. et al., 2023).
Таким образом, установлена значительная роль генов эпителиально-мезенхимального перехода в развитии рака различной этиологии. 1.3. Длинные некодирующие РНК (днРНК)
Все метаболические процессы в нормальной клетке контролируются сложной и многоступенчатой системой генных взаимодействий, где каждый элемент отвечает за свой процесс. В этой сложной системе взаимодействий выделяют две группы генов. К одной относят гены, кодирующие белки, к другой -гены, транскрибируемые, но не транслируемые, то есть не кодирующие белковый продукт. Таким образом, можно выделить производственные и регуляторные гены. Класс регуляторных генов представлен значительным количеством подклассов генов некодирующих (белок) РНК (Sparber P. et al., 2019). Согласно двум крупномасштабным геномным проектам ENCODE и FANTOM, белок-кодирующие
гены занимают не более 2-3% генома человека, в то время как 80% генома человека транскрибируется, и 90% транскриптома человека представлено некодирующими РНК (нкРНК) (Hoeppner M.P. et al., 2018).
В настоящее время уже получены убедительные данные о том, что в опухолях разных локализаций происходит нарушение регуляции экспрессии генов некодирующих РНК и эти регуляторные нкРНК могут выступать как в роли онкогенов, так и супрессоров опухоли (Beermann J. et al., 2016; Tomlins S.A. et al., 2016; Буре И.В. и др., 2018; Anastasiadou E. et al., 2018). Более того, было показано, что многие нкРНК играют важную роль как в нормальной физиологии клетки, так и при заболеваниях, в том числе и при раке. Таким образом, обнаруженные в кровотоке определённые нкРНК достаточно стабильны, чтобы быть использованными для определения эффективности лечения различных видов рака (Chi Y. et al., 2019; Winkle M. et al., 2021). Также, нкРНК могут быть использованы в качестве лекарств (Levin A.A. 2019; Song Y. et al., 2021). Регуляторные некодирующие РНК можно разделить на две основные группы в зависимости от их размера и строения: линейные РНК, включающие малые некодирующие РНК (мнкРНК), подразделяющиеся на микроРНК (microRNA/миРНК), малые (small) интерферирующие РНК (siRNA) и piwi-взаимодействующие РНК (пиРНК), и длинные некодирующие РНК (lncRNA/днРНК); кольцевые РНК (circRNA/циркРНК), (рис. 2). ЦиркРНК, в отличие от линейных РНК, могут образовывать ковалентно замкнутую петлю без 5'- и 3'-полярных участков (Peng Y. et al., 2019).
Рисунок 2. Схематическая классификация некодирующих РНК. Взято из
https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/4/45/%D0%A2%D0%B8%D0%BF%D1%8B %Р0%Л0%Р0%9Р%Р0
%9л.рпа с модификацией автора.
В последнее время всё больший интерес для изучения преобретают длинные некодирующие РНК (днРНК) (Yang D. et al., 2016). Ранее, открытие миРНК произвело революцию в биологии и в биомедицине, поскольку была установлена их способность связываться с регулируемыми матричными РНК по одинаковой схеме в З'-нетранслируемой области мРНК, которая может содержать участки связывания для нескольких миРНК (MRE, miRNA Response Elemewnts) (Chan J.J., Tay Y. 2018). В результате каждая миРНК может участвовать в регуляции множества белковых генов, а индивидуальная мРНК может регулироваться многими разными миРНК. Причем, показано, что миРНК участвуют в регуляции более 60% белок-кодирующих генов (de Rooij L.A. et al., 2022). Поэтому миРНК вовлечены в регуляцию многих жизненно важных процессов клеточной активности: пролиферацию, дифференцировку, апоптоз, адгезию, эпителиально-мезенхимальный переход (ЭМП) и метастазирование, что подтверждается исследованиями опухолей различного происхождения, включая РЯ (Deb B. et al., 2018).
В настоящее время установлено, что миРНК вовлечены в конкурирующие взаимодействия с днРНК за связывания с мРНК, и такие конкурирующие взаимодействия приводят к пластично регулируемым генным сетям, определение которых стало новой задачей биологии и биомедицины и новым источником понимания фундаментальных механизмов в природе, а также базой для формирования новых подходов к поиску маркеров и инновационных таргетных лекарственных средств лечения онкологических, кардиологических и других заболеваний.
Сам механизм конкурирующих эндогенных РНК основывается на том, что и днРНК могут связывать миРНК в аналогичных MRE-сайтах, что приводит к конкурирующим взаимодействиям по схеме днРНК/миРНК/мРНК Причем, в этих взаимодействиях могут участвовать большое число мРНК, днРНК и миРНК, где миРНК оказываются возможными посредниками в активирующих воздействиях днРНК на мРНК. В результате, генные регуляторные сети стали многослойными и резко усложнились (Dai X. et al., 2020).
Показано также, что при злокачественных новообразованиях изменения статуса метилирования многих миРНК и днРНК могут смещаться в ту или иную сторону, в зависимости от тканевого происхождения опухоли, микроокружения и генов-мишеней, участвующих в канцерогенезе опухоли (Pa M. et al., 2017; Ghafouri-Fard S., Taheri M. 2019; Liu Y. et al., 2021).
Похожие диссертационные работы по специальности «Другие cпециальности», 00.00.00 шифр ВАК
Изменение уровней экспрессии генов из критичных районов хромосомы 3 человека в эпителиальных опухолях разных локализаций2010 год, кандидат биологических наук Пронина, Ирина Валерьевна
Делекционное картирование короткого плеча хромосомы 3 человека и спектр метилирования генов RASSF1A, SEMA3B и RAR-beta 2 в эпителиальных опухолях разных локализаций2004 год, кандидат биологических наук Логинов, Виталий Игоревич
Экспрессия генов лигандов иммунных контрольных точек в ткани аденокарциномы желудка2023 год, кандидат наук Мансорунов Данзан Жаргалович
Изучение белок-кодирующего потенциала длинных некодирующих РНК человека на примере LINC01420 и LINC004932023 год, кандидат наук Конина Дарья Олеговна
Идентификация потенциальных онкогенов и генов-супрессоров эпителиальных опухолей человека2007 год, доктор биологических наук Брага, Элеонора Александровна
Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Лукина Светлана Сергеевна, 2024 год
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
1. Бейлерли О.А., Гареев И.Ф., Бейлерли А.Т. Длинные некодирующие РНК и их роль в метастазировании // Вестник Северо-Западного государственного медицинского университета им. И.И. Мечникова. - 2019. - Т. 11. - №2. - C. 91-97. doi: 10.17816/mechnikov201911291-97
2. Бейлерли О.А., Гареев И.Ф., Измайлов А., Липатов О.Н. Особенности методов профилирования экспрессии длинных некодирующих РНК при опухолях // Вестник Северо-Западного государственного медицинского университета им. И.И. Мечникова. - 2020. - Т. 12. - №3. - C. 11-20. doi: 10.17816/mechnikov34740
3. Бурдённый А.М., Логинов В.И., Брага Э.А., Лукина С.С. и др (всего 8). Патент на изобретение № 2779550 С1 от 08.09.2022 (Заявка от 22.06.2021). Способ для диагностирования рака яичников на основе набора генов длинных некодирующих РНК
4. Бурдённый А.М., Филиппова Е.А., Иванова Н.А., Лукина С.С., Пронина И.В., Логинов В.И., Фридман М.В., Казубская Т.П., Уткин Д.О., Брага Э.А., Кушлинский Н.Е. Гиперметилирование генов новых длинных некодирующих РНК в опухолях яичников и метастазах: двойственный эффект // Бюллетень экспериментальной биологии и медицины. 2021. Т. 171. № 3. С. 353-358
5. Буре, И. В., Кузнецова Е. Б., Залетаев Д. В. Длинные некодирующие РНК и их роль в онкогенезе // Молекулярная биология. - 2018. - Т. 52, № 6. - С. 907-920. - DOI 10.1134/S0026898418060034.
6. Гапонова А.В., Родин С., Мазина А.А., Волчков П.В. Эпителиально-мезенхимальный переход: злокачественная прогрессия и перспективы противоопухолевой терапии // Acta Naturae. - 2020. - Т. 12. - №3. - C. 4-23. doi: 10.32607/actanaturae.11010
7. Дворяшина И. А., Великородная Ю.И., Терентьев А.В., Загребин В.Л. Эпителиально-мезенхимальный переход I типа как важный биологический процесс в эмбриогенезе // Вестник ВолГМУ. 2021. №2 (78)
8. Каприн А.Д., Старинский В.В., Шахзадова А.О. Злокачественные новообразования в России в 2021 году (заболеваемость и смертность). М.: МНИОИ им. П.А. Герцена - филиал ФГБУ «НМИЦ радиологии» Минздрава России, 2022, - илл. - 252 с.
9. Кит О.И., Кириченко Е.Ю., Кириченко Ю.Г., Новикова И.А., Селютина О.Н.,
Филиппова С.Ю. Длинные некодирующие РНК, ассоциированные с канцерогенезом: биологическое значение и перспективы применения в диагностике // Клиническая лабораторная диагностика. 2016. №1
10. Коваленко Т. Ф., Ларионова Т. Д., Антипова Н. В., Шахпаронов М. И., Павлюков М. С. Некодирующие РНК в патогенезе глиальных опухолей // Acta Naturae (русскоязычная версия). 2021. №3
11. Лукина С.С., Бурденный А.М., Филиппова Е.А., Пронина И.В., Иванова Н.А., Казубская Т.П., Брага Э.А., Логинов В.И. Роль длинных некодирующих РНК и ДНК-метилирования в патогенезе рака яичников // Патологическая физиология и экспериментальная терапия. 2022; 66(4): - DOI: 10.25557/0031-2991.2022.04
12. Лукина С.С., Пронина И.В., Бурдённый А.М., Филиппова Е.А., Казубская Т.П., Кушлинский Н.Е., Брага Э.А., Логинов В.И. Аберрантная экспрессия группы длинных некодирующих РНК при раке яичников // Патологическая физиология и экспериментальная терапия. 2023; 67(2): 26-32. DOI: 10.25557/0031-2991.2023.02.2632
13. Мнихович М. В., Безуглова Т. В., Буньков К. В., Зорин С. Н., Романов А. В., Мишина Е. С., Скафи К. Х. Роль эпителиально-мезенхимального перехода в формировании метастатического потенциала злокачественной опухоли на примере рака молочной железы // Вопросы онкологии. 2022. - Т. 68, №3. - С. 251-259. - DOI: 10.37469/05073758-2022-68-3-251-259
14. Повещенко А. Ф., Коненков В. И., Летягин А. Ю., Шкурат Г. А. Биологические маркеры злокачественных новообразований // Успехи физиологических наук. -2021. - Т. 52, № 3. - С. 93-104. - DOI 10.31857/S030117982103005X
15. Потапов В.Е., Синельник Е.А., Акименко М.А., Пасечник Д.Г. Современные представления о роли эпителиально-мезенхимального перехода в прогрессии хронической болезни почек // Кубанский научный медицинский вестник. 2016;(6):104-109. DOI: 10.25207/1608-6228-2016-6-104-109
16. Филатова А.Ю., Спарбер П.А., Кривошеева И.А., Скоблов М.Ю. Длинные некодирующие РНК - перспективная мишень для терапии различных заболеваний // Вестник РГМУ. 2017. №3. C. 5-17. DOI: 10.24075/brsmu.2017-03-01
17. Филиппова Е.А. Аномальная экспрессия и аберрантное метилирование генов и микроРНК, связанных с апоптозом, в патогенезе рака молочной железы и яичников.
дис. ... канд. биол. наук: 14.03.03 / Филиппова Елена Александровна; науч. рук В.И. Логинов, Э. А. Брага. - Москва, 2020. - 134 с.
18. Франк Г.А., Москвина Л.В., Андреева Ю.Ю. Новая классификация опухолей яичника. // Архив патологии. - 2015. - Том. 77, №4. - С. 40-50. doi: 10.17116/patol201577440-50.
19. Чулкова С.В., Рябчиков Д.А., Дудина И.А., Савченко И.В., Егорова А.В., Гладилина И.А., Тупицын Н.Н. Роль и механизмы эпителиально-мезенхимального перехода в прогрессировании меланомы // Российский биотерапевтический журнал. 2020. 19(4):8—17. DOI: 10.17650/1726-9784-2020-19-4-8-17
20. Шестак А.Г., Шевченко С.Ю., Румянцева В.А. Проблемы понимания результатов генетической диагностики клиницистами // Горизонты гуманитарного знания. -2021. - №. 2. - С. 37-53. DOI: 10.17805/ggz.2021.2.3
21. Alghamian Y., Soukkarieh C., Abbady A.Q., Murad H. Investigation of role of CpG methylation in some epithelial mesenchymal transition gene in a chemoresistant ovarian cancer cell line // Scientific Reports. 2022. Vol. 12, No 1. P. 7494. DOI: 10.1038/s41598-022-11634-6
22. Amer M., Shi L., Wolfenson H. The 'Yin and Yang' of Cancer Cell Growth and Mechanosensing // Cancers (Basel). 2021. Vol. 13, No 19. P. 4754. DOI: 10.3390/cancers13194754
23. Amin A.R.M.R., Karpowicz P.A., Carey T.E., Arbiser J., Nahta R., Chen Z.G., Dong J.T., Kucuk O., Khan G.N., Huang G.S., Mi S., Lee H.Y., et al. Evasion of anti-growth signaling: A key step in tumorigenesis and potential target for treatment and prophylaxis by natural compounds // Seminars in Cancer Biology. 2015. Vol. 35. P. S55-S77. DOI: 10.1016/j.semcancer.2015.02.005
24. Amin V., Harris R.A., Onuchic V., Jackson A.R., Charnecki T., Paithankar S., Lakshmi Subramanian S., Riehle K., Coarfa C., Milosavljevic A. Epigenomic footprints across 111 reference epigenomes reveal tissue-specific epigenetic regulation of lincRNAs // Nature Communications. 2015. Vol. 6. P. 6370. DOI: 10.1038/ncomms7370
25. Anastasiadou E., Jacob L.S., Slack F.J. Non-coding RNA networks in cancer // Nature Reviews Cancer. 2018. Vol. 18, No 1. P. 5-18. DOI: 10.1038/nrc.2017.99
26. Bakshi A., Bretz C.L., Cain T.L., Kim J. Intergenic and intronic DNA hypomethylated regions as putative regulators of imprinted domains // Epigenomics. 2018. Vol. 10, No 4.
P. 445-461. DOI: 10.2217/epi-2017-0125
27. Barbolina M.V. Molecular Mechanisms Regulating Organ-Specific Metastases in Epithelial Ovarian Carcinoma // Cancers (Basel). 2018. Vol. 10, No 11. P. 444. DOI: 10.3390/cancers10110444
28. Battistelli C., Cicchini C., Santangelo L., Tramontano A., Grassi L., Gonzalez F.J., de Nonno V., Grassi G., Amicone L., Tripodi M. The Snail repressor recruits EZH2 to specific genomic sites through the enrollment of the lncRNA HOTAIR in epithelial-to-mesenchymal transition // Oncogene. 2017. Vol. 36, No 7. P. 942-955. DOI: 10.1038/onc.2016.260
29. Beermann J., Piccoli M.T., Viereck J., Thum T. Non-coding RNAs in Development and Disease: Background, Mechanisms, and Therapeutic Approaches // Physiological Reviews. 2016. Vol. 96, No 4. P. 1297-1325. DOI: 10.1152/physrev.00041.2015
30. Beylerli O., Gareev I., Sufianov A., Ilyasova T., Guang Y. Long noncoding RNAs as promising biomarkers in cancer // Noncoding RNA Research. 2022. Vol. 7, No 2. P. 6670. DOI: 10.1016/j.ncrna.2022.02.004
31. Bhan A., Soleimani M., Mandal S. S. Long Non-Coding RNA and Cancer: A New Paradigm // Cancer Research. 2017. Vol. 77, No 15. P. 3965-3981. DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-16-2634
32. Biswas S., Rao C. M. Epigenetics in cancer: Fundamentals and Beyond // Pharmacology & Therapeutics. 2017. Vol. 173. P. 118-134. DOI: 10.1016/j.pharmthera.2017.02.011
33. Blagden S., Abdel Mouti M., Chettle J. Ancient and modern: hints of a core post-transcriptional network driving chemotherapy resistance in ovarian cancer // Wiley Interdisciplinary Reviews: RNA. 2018. Vol. 9, No 1. P. e1432. DOI: 10.1002/wrna.1432
34. Brown L.J., Achinger-Kawecka J., Portman N., Clark S., Stirzaker C., Lim E. Epigenetic Therapies and Biomarkers in Breast Cancer // Cancers (Basel). 2022. Vol. 14, No 3. P. 474. DOI: 10.3390/cancers14030474
35. Carneiro B.A., El-Deiry W.S. Targeting apoptosis in cancer therapy // Nature Reviews Clinical Oncology. 2020. Vol. 17, No 7. P. 395-417. DOI: 10.1038/s41571-020-0341-y
36. Cayir A. Environmental exposures and RNA N6-Methyladenosine modified long Non-Coding RNAs // Critical Reviews in Toxicology. 2020. Vol. 50, No 8. P. 641-649. DOI: 10.1080/10408444.2020.1812511
37. Chan J.J., TayY. Noncoding RNA: RNA Regulatory Networks in Cancer // International
Journal of Molecular Sciences. 2018. Vol. 19, No 5. P. 1310. DOI: 10.3390/ijms19051310
38. Chang H., Zhang X., Li B., Meng X. MAGI2-AS3 suppresses MYC signaling to inhibit cell proliferation and migration in ovarian cancer through targeting miR-525-5p/MXD1 axis // Cancer Medicine. 2020. Vol. 9, No 17. P. 6377-6386. DOI: 10.1002/cam4.3126
39. Chang L., Guo R., Yuan Z., Shi H., Zhang D. LncRNA HOTAIR Regulates CCND1 and CCND2 Expression by Sponging miR-206 in Ovarian Cancer // Cellular Physiology and Biochemistry. 2018. Vol. 49, No 4. P. 1289-1303. DOI: 10.1159/000493408
40. Chang L., Yuan Y., Li C., Guo T., Qi H., Xiao Y., Dong X., Liu Z., Liu Q. Upregulation of SNHG6 regulates ZEB1 expression by competitively binding miR-101-3p and interacting with UPF1 in hepatocellular carcinoma // Cancer Letters. 2016. Vol. 383, No 2. P. 183-194. DOI: 10.1016/j.canlet.2016.09.034
41. Chen J.F., Yan Q. The roles of epigenetics in cancer progression and metastasis // The Biochemical journal. 2021. Vol. 478, No 17. P. 3373-3393. DOI: 10.1042/BCJ20210084
42. Chen S., Xu X., Lu S., Hu B. Long non-coding RNA HAND2-AS1 targets glucose metabolism and inhibits cancer cell proliferation in osteosarcoma // Oncology Letters. 2019. Vol. 18, No 2. P. 1323-1329. DOI: 10.3892/ol.2019.10445
43. Chen X., Wu W., Cao X., Zhao X., Li W., Deng C., Huang Z. lncRNA mortal obligate RNA transcript was downregulated in ovarian carcinoma and inhibits cancer cell proliferation by downregulating miRNA-21 // Journal of Cellular Biochemistry. 2019. DOI: 10.1002/jcb.28478
44. Cheng R., Li N., Yang S., Liu L., Han S. Long non-coding RNA ZEB1-AS1 promotes cell invasion and epithelial to mesenchymal transition through inducing ZEB1 expression in cervical cancer // OncoTargets and therapy. 2018. Vol. 11. P. 7245-7253. DOI: 10.2147/OTT.S179937
45. Cheng Y., Di J., Wu J., Shi H. T., Zou B. C., Zhang Y., Xie D.H. Diagnostic and prognostic significance of long non-coding RNA SSTR5-AS1 in patients with gastric cancer // European Review for Medical and Pharmacological Sciences. 2020. Vol. 24, No 10. P. 5385-5390. DOI: 10.26355/eurrev_202005_21322
46. Cheon D. J., Orsulic S. Ten-gene biomarker panel: a new hope for ovarian cancer? // Biomarkers in Medicine. 2014. Vol. 8, No 4. P. 523-526. DOI: 10.2217/bmm.14.16
47. Chi Y., Wang D., Wang J., Yu W., Yang J. Long Non-coding RNA in the Pathogenesis of Cancers // Cells. 2019. Vol. 8, No 9. P. 1015. DOI: 10.3390/cells8091015
48. Choi J., Gyamfi J., Jang H., Koo J.S. The role of tumor-associated macrophage in breast cancer biology // Histology and histopathology. 2018. Vol. 33, No 2. P. 133-145. DOI: 10.14670/HH-11-916
49. Chou J., Wang B., Zheng T., Li X., Zheng L., Hu J., Zhang Y., Xing Y., Xi T. MALAT1 induced migration and invasion of human breast cancer cells by competitively binding miR-1 with cdc42 // Biochemical and Biophysical Research Communications. 2016. Vol. 472, No 1. P. 262-269. DOI: 10.1016/j.bbrc.2016.02.102
50. Chung V.Y., Tan T. Z., Ye J., Huang R. L., Lai H.C., Kappei D., Wollmann H., Guccione E., Huang R. Y. The role of GRHL2 and epigenetic remodeling in epithelial-mesenchymal plasticity in ovarian cancer cells // Communications Biology. 2019. Vol. 2. P. 272. DOI: 10.1038/s42003-019-0506-3
51. Colella M., Cuomo D., Peluso T., Falanga I., Mallardo M., De Felice M., Ambrosino C. Ovarian Aging: Role of Pituitary-Ovarian Axis Hormones and ncRNAs in Regulating Ovarian Mitochondrial Activity // Frontiers in Endocrinology. 2021. Vol. 12. P. 791071. DOI: 10.3389/fendo.2021.791071
52. Dai X., Zhang S., Zaleta-Rivera K. RNA: interactions drive functionalities // Molecular Biology Reports. 2020. Vol. 47, No 2. P. 1413-1434. DOI: 10.1007/s11033-019-05230-7
53. de Rooij L.A., Mastebroek D. J., Ten Voorde N., van der Wall E., van Diest P.J., Moelans C. B. The microRNA Lifecycle in Health and Cancer // Cancers (Basel). 2022. Vol. 14, No 23. P. 5748. DOI: 10.3390/cancers14235748
54. Deb B., Uddin A., Chakraborty S. miRNAs and ovarian cancer: An overview // Journal of Cellular Physiology. 2018. Vol. 233. P. 3846-3854. DOI: 10.1002/jcp.26095
55. Deng S. J., Chen H.Y., Ye Z., Deng S. C., Zhu S., Zeng Z., He C. J., Liu M. L., Huang K., Zhong J. X., Xu F.Y., Li Q., Liu Y., Wang C.Y., Zhao G. Hypoxia-induced LncRNA-BX111 promotes metastasis and progression of pancreatic cancer through regulating ZEB1 transcription // Oncogene. 2018. Vol. 37, No 44. P. 5811-5828. DOI: 10.1038/s41388-018-0382-1
56. Ding Y. X., Duan K. C., Chen S.L. Low expression of lncRNA-GAS5 promotes epithelial-mesenchymal transition of breast cancer cells in vitro // Chinese Journal of Cancer Research. 2017. Vol. 29, No 4. P. 327-335. DOI: 10.21147/j.issn.1000-9604.2017.04.02
57. Dogan F., Biray Avci C. Correlation between telomerase and mTOR pathway in cancer stem cells // Gene. 2018. Vol. 641. P. 235-239. DOI: 10.1016/j.gene.2017.09.072
58. Dong Z., Liang X., Liu L., Guo Y., Shen S., Liang J., Dong Z. MiR-6872 host gene SEMA3B and its antisense lncRNA SEMA3B-AS1 function synergistically to suppress gastric cardia adenocarcinoma progression // Gastric Cancer. 2019. Vol. 22, No 4. P. 705722. DOI: 10.1007/s10120-019-00924-0
59. Du J., Su Y., Gao J., Tai Y. The expression and function of long non-coding RNAs in hepatocellular carcinoma // Cancer Innovations. 2023. Vol. 2, No 6. P. 488-499. DOI: 10.1002/cai2.90
60. Du S., Hu W., Zhao Y., Zhou H., Wen W., Xu M., Zhao P., Liu K. Long non-coding RNA MAGI2-AS3 inhibits breast cancer cell migration and invasion via sponging microRNA-374a // Cancer Biomarkers. 2019. Vol. 24, No 3. P. 269-277. DOI: 10.3233/CBM-182216
61. Du Z., Sun T., Hacisuleyman E., Fei T., Wang X., Brown M., Rinn J.L., Lee M.G., Chen Y., Kantoff P.W., Liu X.S. Integrative analyses reveal a long noncoding RNA-mediated sponge regulatory network in prostate cancer // Nature Communications. 2016. Vol. 7. P. 10982. DOI: 10.1038/ncomms10982
62. Feng L.Y., Yan B.B., Huang Y.Z., Li L. Abnormal methylation characteristics predict chemoresistance and poor prognosis in advanced high-grade serous ovarian cancer // Clin Epigenetics. 2021. Vol. 13, No 1. P. 141. doi: 10.1186/s13148-021-01133-2
63. Gaona-Luviano P., Medina-Gaona L.A., Magaña-Pérez K. Epidemiology of ovarian cancer // Chin Clin Oncol. 2020. Vol. 9, No 4. P. 47. doi: 10.21037/cco-20-34
64. Gentile C., Kmita M. Polycomb Repressive Complexes in Hox Gene Regulation: Silencing and Beyond: The Functional Dynamics of Polycomb Repressive Complexes in Hox Gene Regulation // Bioessays. 2020. Vol. 42, No 10. P. e1900249. doi: 10.1002/bies.201900249
65. Ghafouri-Fard S., Taheri M. Maternally expressed gene 3 (MEG3): A tumor suppressor long non coding RNA // Biomed Pharmacother. 2019. Vol. 118. P. 109129. doi: 10.1016/j.biopha.2019.109129
66. Gokulnath P., de Cristofaro T., Manipur I., Di Palma T., Soriano A.A., Guarracino M.R., Zannini M. Long Non-Coding RNA HAND2-AS1 Acts as a Tumor Suppressor in HighGrade Serous Ovarian Carcinoma // Int J Mol Sci. 2020. Vol. 21, No 11. P. 4059. doi: 10.3390/ijms21114059
67. Gong G., Lin T., Yuan Y. Integrated analysis of gene expression and DNA methylation profiles in ovarian cancer // J Ovarian Res. 2020. Vol. 13, No 1. P. 30. doi: 10.1186/s13048-020-00632-9
68. Gong J., Fan H., Deng J., Zhang Q. LncRNA HAND2-AS1 represses cervical cancer progression by interaction with transcription factor E2F4 at the promoter of C16orf74 // J Cell Mol Med. 2020. Vol. 24, No 11. P. 6015-6027. doi: 10.1111/jcmm.15117
69. Goustin A.S., Thepsuwan P., Kosir M.A., Lipovich L. The Growth-Arrest-Specific (GAS)-5 Long Non-Coding RNA: A Fascinating lncRNA Widely Expressed in Cancers // Noncoding RNA. 2019. Vol. 5, No 3. P. 46. doi: 10.3390/ncrna5030046
70. Grillone K., Riillo C., Scionti F., Rocca R., Tradigo G., Guzzi P.H., Alcaro S., Di Martino M.T., Tagliaferri P., Tassone P. Non-coding RNAs in cancer: platforms and strategies for investigating the genomic "dark matter" // J Exp Clin Cancer Res. 2020. Vol. 39, No 1. P. 117. doi: 10.1186/s13046-020-01622-x
71. Guo W., Liang X., Liu L., Guo Y., Shen S., Liang J., Dong Z. MiR-6872 host gene SEMA3B and its antisense lncRNA SEMA3B-AS1 function synergistically to suppress gastric cardia adenocarcinoma progression // Gastric Cancer. 2019. Vol. 22, No 4. P. 705722. doi: 10.1007/s10120-019-00924-0
72. Han L., Ma P., Liu S.M., Zhou X. Circulating long noncoding RNA GAS5 as a potential biomarker in breast cancer for assessing the surgical effects // Tumour Biol. 2016. Vol. 37, No 5. P. 6847-6854. doi: 10.1007/s13277-015-4568-7
73. Hanahan D. Hallmarks of Cancer: New Dimensions // Cancer Discov. 2022. Vol. 12, No 1. P. 31-46. doi: 10.1158/2159-8290.CD-21-1059
74. He Y., Yue H., Cheng Y., Ding Z., Xu Z., Lv C., Wang Z., Wang J., Yin C., Hao H., Chen C. ALKBH5-mediated m6A demethylation of KCNK15-AS1 inhibits pancreatic cancer progression via regulating KCNK15 and PTEN/AKT signaling // Cell Death Dis. 2021. Vol. 12, No 12. P. 1121. doi: 10.1038/s41419-021-04401-4
75. Hoeppner M.P., Denisenko E., Gardner P.P., Schmeier S., Poole A.M. An Evaluation of Function of Multicopy Noncoding RNAs in Mammals Using ENCODE/FANTOM Data and Comparative Genomics // Mol Biol Evol. 2018. Vol. 35, No 6. P. 1451-1462. doi: 10.1093/molbev/msy046
76. Hong X., Ma N., Li D., Zhang M., Dong W., Huang J., Ci X., Zhang S. UBE2E2 enhances Snail-mediated epithelial-mesenchymal transition and Nrf2-mediated antioxidant activity in ovarian cancer // Cell Death Dis. 2023. Vol. 14, No 2. P. 100. doi: 10.1038/s41419-023-05636-z
77. Hosono Y., Niknafs Y.S., Prensner J.R., Iyer M.K., Dhanasekaran S.M., Mehra R.,
Pitchiaya S., Tien J., Escara-Wilke J., Poliakov A., et al. Oncogenic Role of THOR, a Conserved Cancer/Testis Long Non-coding RNA // Cell. 2017. Vol. 171, No 7. P. 15591572. doi: 10.1016/j.cell.2017.11.040
78. Hu Y., Mao N., Zheng W., Hong B., Deng X. lncRNA SSTR5-AS1 Predicts Poor Prognosis and Contributes to the Progression of Esophageal Cancer // Dis Markers. 2023. doi: 10.1155/2023/5025868
79. Huang G., Xiang Z., Wu H., He Q., Dou R., Yang C., Song J., Huang S., Wang S., Xiong B. The lncRNA SEMA3B-AS1/HMGB1/FBXW7 Axis Mediates the Peritoneal Metastasis of Gastric Cancer by Regulating BGN Protein Ubiquitination // Oxid Med Cell Longev. 2022. doi: 10.1155/2022/5055684
80. Huang Y., Hong W., Wei X. The molecular mechanisms and therapeutic strategies of EMT in tumor progression and metastasis // J Hematol Oncol. 2022. Vol. 15, No 1. P. 129. doi: 10.1186/s13045-022-01347-8
81. Iyer MK., Niknafs Y.S., Malik R., Singhal U., Sahu A., Hosono Y., Barrette T.R., Prensner J.R., Evans J.R., Zhao S., et al. The landscape of long noncoding RNAs in the human transcriptome // Nat Genet. 2015. Vol. 47, No 3. P. 199-208. doi: 10.1038/ng.3192
82. Jafari-Oliayi A., Asadi M.H. SNHG6 is upregulated in primary breast cancers and promotes cell cycle progression in breast cancer-derived cell lines // Cell Oncol (Dordr). 2019. Vol. 42, No 2. P. 211-221. doi: 10.1007/s13402-019-00422-6
83. Ji J., Dai X., Yeung S.J., He X. The role of long non-coding RNA GAS5 in cancers // Cancer Manag Res. 2019. Vol. 11. P. 2729-2737. doi: 10.2147/CMAR.S189052
84. Jiang L., He Y., Shen G., Ni J., Xia Z., Liu H., Cao Y., Li X. lncRNA HAND2 AS1 mediates the downregulation of ROCK2 in hepatocellular carcinoma and inhibits cancer cell proliferation, migration and invasion // Mol Med Rep. 2020. Vol. 21, No 3. P. 13041309. doi: 10.3892/mmr.2020.10928
85. Jiang Z., Li L., Hou Z., Liu W., Wang H., Zhou T., Li Y., Chen S. LncRNA HAND2-AS1 inhibits 5-fluorouracil resistance by modulating miR-20a/PDCD4 axis in colorectal cancer // Cell Signal. 2020. Vol. 66. doi: 10.1016/j.cellsig.2019.109483
86. Jin J., Wang H., Si J., Ni R., Liu Y., Wang J. ZEB1-AS1 is associated with poor prognosis in non-small-cell lung cancer and influences cell migration and apoptosis by repressing ID1 // Clin Sci (Lond). 2019. Vol. 133, No 2. P. 381-392. doi: 10.1042/CS20180983
87. Jin Y., Feng S.J., Qiu S., Shao N., Zheng J.H. LncRNA MALAT1 promotes proliferation
and metastasis in epithelial ovarian cancer via the PI3K-AKT pathway // Eur Rev Med Pharmacol Sci. 2017. Vol. 21, No 14. P. 3176-3184.
88. Jung M., Pfeifer G.P. Aging and DNA methylation // BMC Biol. 2015. Vol. 13. P. 7. doi: 10.1186/s12915-015-0118-4
89. Khan M.I., Ahmad A. LncRNA SNHG6 sponges miR-101 and induces tamoxifen resistance in breast cancer cells through induction of EMT // Front Oncol. 2022. Vol. 12. P. 1015428. doi: 10.3389/fonc.2022.1015428
90. Klymenko Y, Kim O, Stack MS. Complex Determinants of Epithelial: Mesenchymal Phenotypic Plasticity in Ovarian Cancer // Cancers (Basel). 2017 Vol. 9. No 8. Art. No 104. doi: 10.3390/cancers9080104.
91. Klymenko Y., Nephew K.P. Epigenetic Crosstalk between the Tumor Microenvironment and Ovarian Cancer Cells: A Therapeutic Road Less Traveled // Cancers (Basel). 2018. Vol. 10, No 9. P. 295. doi: 10.3390/cancers10090295
92. Kopp F., Mendell J.T. Functional Classification and Experimental Dissection of Long Noncoding RNAs // Cell. 2018. Vol. 172, No 3. P. 393-407. doi: 10.1016/j.cell.2018.01.011
93. Kumari P., Sharma I., Saha S.C., Srinivasan R., Sharma A. Promoter methylation status of key genes and its implications in the pathogenesis of endometriosis, endometrioid carcinoma of ovary and endometrioid endometrial cancer // J Cancer Res Ther. 2022. Vol. 18. P. 328-334. doi: 10.4103/jcrt.JCRT_1704_20
94. Lambrou G.I., Hatziagapiou K., Zaravinos A. The Non-Coding RNA GAS5 and Its Role in Tumor Therapy-Induced Resistance // Int J Mol Sci. 2020. Vol. 21, No 20. P. 7633. doi: 10.3390/ijms21207633
95. Larionova I. et al. Tumor-Associated Macrophages in Human Breast, Colorectal, Lung, Ovarian and Prostate Cancers // Front Oncol. 2020. Vol. 10. P. 566511. doi: 10.3389/fonc.2020.566511
96. Lei K., Liang X., Gao Y., Xu B., Xu Y., Li Y., Tao Y., Shi W., Liu J. Lnc-ATB contributes to gastric cancer growth through a MiR-141-3p/TGF02 feedback loop // Biochem Biophys Res Commun. 2017. Vol. 484, No 3. P. 514-521. doi: 10.1016/j.bbrc.2017.01.094
97. Lei R., Xue M., Zhang L., Lin Z. Long noncoding RNA MALAT1-regulated microRNA 506 modulates ovarian cancer growth by targeting iASPP // Onco Targets Ther. 2016. Vol. 10. P. 35-46. doi: 10.2147/OTT.S112686
98. Levin A.A. Treating Disease at the RNA Level with Oligonucleotides // N Engl J Med. 2019. 380(1):57-70. doi: 10.1056/NEJMra1705346.
99. Li B, Chen P, Qu J, Shi L, Zhuang W, Fu J, Li J, Zhang X, Sun Y, Zhuang W. Activation of LTBP3 gene by a long noncoding RNA (lncRNA) MALAT1 transcript in mesenchymal stem cells from multiple myeloma // J Biol Chem. 2014. Vol. 289, No 42. P. 29365-29375. doi: 10.1074/jbc.M114.572693
100. Li G.Y., Wang W., Sun J.Y., Xin B., Zhang X., Wang T., Zhang Q.F., Yao L.B., Han H., Fan D.M., Yang A.G., Jia L.T., Wang L. Long non-coding RNAs AC026904.1 and UCA1: a "one-two punch" for TGF-ß-induced SNAI2 activation and epithelial-mesenchymal transition in breast cancer // Theranostics. 2018. Vol. 8, No 10. P. 2846-2861. doi: 10.7150/thno.23463
101. Li J, Li L, Yuan H, Huang XW, Xiang T, Dai S. Up-regulated lncRNA GAS5 promotes chemosensitivity and apoptosis of triple-negative breast cancer cells // Cell Cycle. 2019. Vol. 18, No 16. P. 1965-1975. doi: 10.1080/15384101.2019.1635870
102. Li L., Li L., Hu L., Li T., Xie D., Liu X. Long non coding RNA HAND2 AS 1/miR 106a/PTEN axis re sensitizes cisplatin resistant ovarian cells to cisplatin treatment // Mol Med Rep. 2021. Vol. 24, No 5. P. 762. doi: 10.3892/mmr.2021.12402.
103. Li L., Li W. Epithelial-mesenchymal transition in human cancer: comprehensive reprogramming of metabolism, epigenetics, and differentiation // Pharmacol Ther. 2015. Vol. 150. P. 33-46. doi: 10.1016/j.pharmthera.2015.01.004
104. Li W., Li N., Shi K., Chen Q. Systematic review and meta-analysis of the utility of long non-coding RNA GAS5 as a diagnostic and prognostic cancer biomarker // Oncotarget. 2017. Vol. 8, No 39. P. 66414-66425. doi: 10.18632/oncotarget.19040
105. Li W., Zhang Z., Liu X., Cheng X., Zhang Y., Han X., Zhang Y., Liu S., Yang J., Xu B., He L., Sun L., Liang J., Shang Y. The FOXN3-NEAT1-SIN3A repressor complex promotes progression of hormonally responsive breast cancer // J Clin Invest. 2017. Vol. 127, No 9. P. 3421-3440. doi: 10.1172/JCI94233
106. Li Y., Cheng C. Long noncoding RNA NEAT1 promotes the metastasis of osteosarcoma via interaction with the G9a-DNMT1-Snail complex // Am J Cancer Res. 2018. Vol. 8, No 1. P. 81-90.
107. Li Y., Guo X.B., Wei Y.H. LncRNA GAS5 affects epithelial-mesenchymal transition and invasion of breast cancer cells by regulating miR-216b // Eur Rev Med Pharmacol Sci.
2020. Vol. 24, No 9. P. 4873-4881. doi: 10.26355/eurrev_202005_21176
108. Li Y, Zhang L, Zhao Y, Peng H, Zhang N, Bai W. MEG3 sponges miRNA-376a and YBX1 to regulate angiogenesis in ovarian cancer endothelial cells // Heliyon. 2023 Vol 9. No 2 e13204. doi: 10.1016/j.heliyon.2023.e13204.
109. Liang H., Yu T., Han Y., Jiang H., Wang C., You T., Zhao X., Shan H., Yang R., Yang L., Shan H., Gu Y. LncRNA PTAR promotes EMT and invasion-metastasis in serous ovarian cancer by competitively binding miR-101-3p to regulate ZEB1 expression // Mol Cancer. 2018. Vol. 17, No 1. P. 119. doi: 10.1186/s12943-018-0870-5
110. Liang R., Xiao G., Wang M., Li X., Li Y., Hui Z., Sun X., Qin S., Zhang B., Du N., Liu D., Ren H. SNHG6 functions as a competing endogenous RNA to regulate E2F7 expression by sponging miR-26a-5p in lung adenocarcinoma // Biomed Pharmacother. 2018. Vol. 107. P. 1434-1446. doi: 10.1016/j.biopha.2018.08.099
111. Liang W.C., Fu W.M., Wong C.W., Wang Y., Wang W.M., Hu G.X., Zhang L., Xiao L.J., Wan D.C., Zhang J.F., Waye M.M. The lncRNA H19 promotes epithelial to mesenchymal transition by functioning as miRNA sponges in colorectal cancer // Oncotarget. 2015. Vol. 6, No 26. P. 22513-22525. doi: 10.18632/oncotarget.4154
112. Lin Y., Schmidt B.F., Bruchez M.P., McManus C.J. Structural analyses of NEAT1 lncRNAs suggest long-range RNA interactions that may contribute to paraspeckle architecture // Nucleic Acids Res. 2018. Vol. 46, No 7. P. 3742-3752. doi: 10.1093/nar/gky046
113. Liu S.J., Dang H.X., Lim D.A., Feng F.Y., Maher C.A. Long noncoding RNAs in cancer metastasis // Nat Rev Cancer. 2021. Vol. 21, No 7. P. 446-460. doi: 10.1038/s41568-021-00353-1
114. Liu X.J., Li S.L., Li J.S., Lu H., Yin L.L., Zheng W.F., Wang W.C. Long non-coding RNA ZEB1-AS1 is associated with poor prognosis in gastric cancer and promotes cancer cell metastasis // Eur Rev Med Pharmacol Sci. 2018. Vol. 22, No 9. P. 2624-2630. doi: 10.26355/eurrev_201805_14956
115. Liu Y., Wang Q., Wen J., Wu Y., Man C. MiR-375: A novel multifunctional regulator // Life Sci. 2021. Vol. 275. P. 119323. doi: 10.1016/j.lfs.2021.119323
116. Loginov V.I., Pronina I.V., Filippova E.A., Burdennyy A.M., Lukina S.S., Kazubskaya T.P., Uroshlev L.A., Fridman M.V., Brovkina O.I., Apanovich N.V., Karpukhin A.V., Stilidi I.S., Kushlinskii N.E., Dmitriev A.A., Braga E.A. Aberrant Methylation of 20
miRNA Genes Specifically Involved in Various Steps of Ovarian Carcinoma Spread: From Primary Tumors to Peritoneal Macroscopic Metastases // Int J Mol Sci. 2022. Vol. 23, No 3. P. 1300. doi: 10.3390/ijms23031300
117. López-Camarillo C., Ruíz-García E., Salinas-Vera Y.M., Silva-Cázares M.B., Hernández-de la Cruz O.N., Marchat L.A., Gallardo-Rincón D. Deciphering the Long Non-Coding RNAs and MicroRNAs Coregulation Networks in Ovarian Cancer Development: An Overview // Cells. 2021. Vol. 10, No 6. P. 1407. doi: 10.3390/cells10061407
118. Luo G., Liu D., Huang C., Wang M., Xiao X., Zeng F., Wang L., Jiang G. LncRNA GAS5 Inhibits Cellular Proliferation by Targeting P27Kip1 // Mol Cancer Res. 2017. Vol. 15, No 7. P. 789-799. doi: 10.1158/1541-7786.MCR-16-0331
119. Luo N., Zhang K., Li X., Hu Y. ZEB1 induced-upregulation of long noncoding RNA ZEB1-AS1 facilitates the progression of triple negative breast cancer by binding with ELAVL1 to maintain the stability of ZEB1 mRNA // J Cell Biochem. 2020. Vol. 121, No 10. P. 4176-4187. doi: 10.1002/jcb.29572
120. Lv Q.L., Hu L., Chen S.H., Sun B., Fu M.L., Qin C.Z., Qu Q., Wang G.H., He C.J., Zhou H.H. A Long Noncoding RNA ZEB1-AS1 Promotes Tumorigenesis and Predicts Poor Prognosis in Glioma // Int J Mol Sci. 2016. Vol. 17, No 9. P. 1431. doi: 10.3390/ijms17091431
121. Lv S.Y., Shan T.D., Pan X.T., Tian Z.B., Liu X.S., Liu F.G., Sun X.G., Xue H.G., Li X.H., Han Y., Sun L.J., Chen L., Zhang L.Y. The lncRNA ZEB1-AS1 sponges miR-181a-5p to promote colorectal cancer cell proliferation by regulating Wnt/ß-catenin signaling // Cell Cycle. 2018. Vol. 17, No 10. P. 1245-1254. doi: 10.1080/15384101.2018.1471317
122. Ma M.H., An J.X., Zhang C., Liu J., Liang Y., Zhang C.D., Zhang Z., Dai D.Q. ZEB1-AS1 initiates a miRNA-mediated ceRNA network to facilitate gastric cancer progression // Cancer Cell Int. 2019. Vol. 19. P. 27. doi: 10.1186/s12935-019-0742-0
123. Matouk I.J., Halle D., Gilon M., Hochberg A. The non-coding RNAs of the H19-IGF2 imprinted loci: a focus on biological roles and therapeutic potential in Lung Cancer // J Transl Med. 2015. Vol. 13. P. 113. doi: 10.1186/s12967-015-0467-3
124. McGarty T.P. EMT AND CANCERS. // White Paper. 2019, Vol. 157 P. 1-40. DOI: 10.13140/RG.2.2.34075.92961.
125. Meng W., Cui W., Zhao L., Chi W., Cao H., Wang B. Aberrant methylation and downregulation of ZNF667-AS1 and ZNF667 promote the malignant progression of
laryngeal squamous cell carcinoma // J Biomed Sci. 2019. Vol. 26, No 1. P. 13. doi: 10.1186/s12929-019-0506-0
126. Meng X., Joosse S.A., Müller V., Trillsch F., Milde-Langosch K., Mahner S., Geffken M., Pantel K., Schwarzenbach H. Diagnostic and prognostic potential of serum miR-7, miR-16, miR-25, miR-93, miR-182, miR-376a and miR-429 in ovarian cancer patients // Br J Cancer. 2015. Vol. 113, No 9. P. 1358-1366. doi: 10.1038/bjc.2015.340
127. Miao F., Chen J., Shi M., Song Y., Chen Z., Pang L. LncRNA HAND2-AS1 inhibits non-small cell lung cancer migration, invasion and maintains cell stemness through the interactions with TGF-ß 1 // Biosci Rep. 2019. Vol. 39, No 1. doi: 10.1042/BSR20181525
128. Mitra R, Chen X, Greenawalt EJ, Maulik U, Jiang W, Zhao Z, Eischen CM. Decoding critical long non-coding RNA in ovarian cancer epithelial-to-mesenchymal transition // Nat Commun. 2017 Vol. 8. No 1. Art No 1604. doi: 10.1038/s41467-017-01781-0.
129. Mondal T., Subhash S., Vaid R., Enroth S., Uday S., Reinius B., Mitra S., Mohammed A., James A.R., Hoberg E., Moustakas A., Gyllensten U., Jones S.J., Gustafsson C.M., Sims A.H., Westerlund F., Gorab E., Kanduri C. MEG3 long noncoding RNA regulates the TGF-ß pathway genes through formation of RNA-DNA triplex structures // Nat Commun. 2015. Vol. 6. P. 7743. doi: 10.1038/ncomms8743
130. Mu B., Lv C., Liu Q., Yang H. Long non-coding RNA ZEB1-AS1 promotes proliferation and metastasis of hepatocellular carcinoma cells by targeting miR-299-3p/E2F1 axis // J Biochem. 2021. Vol. 170, No 1. P. 41-50. doi: 10.1093/jb/mvab042
131. Oncul S., Amero P., Rodriguez-Aguayo C., Calin G.A., Sood A.K., Lopez-Berestein G. Long non-coding RNAs in ovarian cancer: expression profile and functional spectrum // RNA Biol. 2020. Vol. 17, No 11. P. 1523-1534. doi: 10.1080/15476286.2019.1702283
132. Pa M., Naizaer G., Seyiti A., Kuerbang G. Long Noncoding RNA MALAT1 Functions as a Sponge of MiR-200c in Ovarian Cancer // Oncol Res. 2017. doi: 10.3727/096504017X15049198963076
133. Padrao N.A., Monteiro-Reis S., Torres-Ferreira J., Antunes L., Le?a L., Montezuma D., Ramalho-Carvalho J., Dias P.C., Monteiro P., Oliveira J., Henrique R., Jerónimo C. MicroRNA promoter methylation: a new tool for accurate detection of urothelial carcinoma // Br J Cancer. 2017. Vol. 116, No 5. P. 634-639. doi: 10.1038/bjc.2016.454
134. Pan J., Fang S., Tian H., Zhou C., Zhao X., Tian H., He J., Shen W., Meng X., Jin X., Gong Z. lncRNA JPX/miR-33a-5p/Twist1 axis regulates tumorigenesis and metastasis of lung
cancer by activating Wnt/ß-catenin signaling // Mol Cancer. 2020. Vol. 19, No 1. P. 9. doi: 10.1186/s12943-020-1133-9
135. Pan Y., Tong S., Cui R., Fan J., Liu C., Lin Y., Tang J., Xie H., Lin P., Zheng T., Yu X. Long Non-Coding MALAT1 Functions as a Competing Endogenous RNA to Regulate Vimentin Expression by Sponging miR-30a-5p in Hepatocellular Carcinoma // Cell Physiol Biochem. 2018. Vol. 50, No 1. P. 108-120. doi: 10.1159/000493962
136. Papoutsoglou P., Tsubakihara Y., Caja L., Moren A., Pallis P., Ameur A., Heldin C.H., Moustakas A. The TGFB2-AS1 lncRNA Regulates TGF-ß Signaling by Modulating Corepressor Activity // Cell Rep. 2019. Vol. 28, No 12. P. 3182-3198.e11. doi: 10.1016/j.celrep.2019.08.028
137. Park E.G., Pyo S.J., Cui Y., Yoon S.H., Nam J.W. Tumor immune microenvironment lncRNAs // Brief Bioinform. 2022. Vol. 23, No 1. doi: 10.1093/bib/bbab504
138. Peng S., Yin X., Zhang Y., Mi W., Li T., Yu Y., Jiang J., Liu Q., Fu Y. Competing endogenous RNA network analysis reveals potential long non-coding RNAs as predictive biomarkers of gastric cancer // Oncol Lett. 2020. Vol. 19, No 3. P. 2185-2196. doi: 10.3892/ol.2020.11351
139. Peng Y., Li J., Zhu L. Chapter 8 - Cancer and non-coding RNAs // Ed.: Bradley S. Ferguson. In: Translational Epigenetics, Nutritional Epigenomics. Academic Press, Volume 14, 2019: 119-132. DOI: 10.1016/B978-0-12-816843-1.00008-4
140. Pfeifer G.P. Defining Driver DNA Methylation Changes in Human Cancer // Int J Mol Sci. 2018. Vol. 19, No 4. P. 1166. doi: 10.3390/ijms19041166
141. Pronina I.V., Loginov V.I., Burdennyy A.M., Fridman M.V., Kazubskaya T.P., Dmitriev A.A., Braga E.A. Expression and DNA methylation alterations of seven cancer-associated 3p genes and their predicted regulator miRNAs (miR-129-2, miR-9-1) in breast and ovarian cancers // Gene. 2016. Vol. 576, No 1 Pt 3. P. 483-491. doi: 10.1016/j.gene.2015.10.059
142. Qin J., Xu J. Arginine methylation in the epithelial-to-mesenchymal transition // FEBS J. 2022. Vol. 289, No 23. P. 7292-7303. doi: 10.1111/febs.16152
143. Qu R., Chen X., Zhang C. LncRNA ZEB1-AS1/miR-409-3p/ZEB1 feedback loop is involved in the progression of non-small cell lung cancer // Biochem Biophys Res Commun. 2018. Vol. 507, No 1-4. P. 450-456. doi: 10.1016/j.bbrc.2018.11.059
144. Quinn J.J., Chang H.Y. Unique features of long non-coding RNA biogenesis and function
// Nat Rev Genet. 2016. Vol. 17, No 1. P. 47-62. doi: 10.1038/nrg.2015.10
145. Ren H., Li Z., Tang Z., Li J., Lang X. Long noncoding MAGI2-AS3 promotes colorectal cancer progression through regulating miR-3163/TMEM106B axis // J Cell Physiol. 2020. Vol. 235, No 5. P. 4824-4833. doi: 10.1002/jcp.29360
146. Rupaimoole R., Slack F.J. MicroRNA therapeutics: towards a new era for the management of cancer and other diseases // Nat Rev Drug Discov. 2017. Vol. 16, No 3. P. 203-222. doi: 10.1038/nrd.2016.246
147. Saha S., Pradhan N., B N., Mahadevappa R., Minocha S., Kumar S. Cancer plasticity: Investigating the causes for this agility // Semin Cancer Biol. 2023. Vol. 88. P. 138-156. doi: 10.1016/j.semcancer.2022.12.005
148. Salamini-Montemurri M., Lamas-Maceiras M., Barreiro-Alonso A., Vizoso-Vazquez A., Rodriguez-Belmonte E., Quindos-Varela M., Cerdan M.E. The Challenges and Opportunities of LncRNAs in Ovarian Cancer Research and Clinical Use // Cancers (Basel). 2020. Vol. 12, No 4. P. 1020. doi: 10.3390/cancers12041020
149. Sanchez Calle A., Kawamura Y., Yamamoto Y., Takeshita F., Ochiya T. Emerging roles of long non-coding RNA in cancer // Cancer Sci. 2018. Vol. 109, No 7. P. 2093-2100. doi: 10.1111/cas.13642
150. Shen D, Xu J, Cao X, Cao X, Tan H, Deng H. Long noncoding RNA MAGI2-AS3 inhibits bladder cancer progression through MAGI2/PTEN/epithelial-mesenchymal transition (EMT) axis // Cancer Biomark. 2021. Vol. 30 No 2 P. 155-165. doi: 10.3233/CBM-201421
151. Sheng X., Li J., Yang L., Chen Z., Zhao Q., Tan L., Zhou Y., Li J. Promoter hypermethylation influences the suppressive role of maternally expressed 3, a long non-coding RNA, in the development of epithelial ovarian cancer // Oncology reports. 2014. Vol. 32, No 1. P. 277-285. doi: 10.3892/or.2014.3208
152. Shi S., Tan Q., Feng F., Huang H., Liang J., Cao D., Wang Z. Identification of core genes in the progression of endometrial cancer and cancer cell-derived exosomes by an integrative analysis // Scientific reports. 2020. Vol. 10, No 1. P. 9862. doi: 10.1038/s41598-020-66872-3
153. Shi X., Sun M., Liu H., Yao Y., Kong R., Chen F., Song Y. A critical role for the long non-coding RNA GAS5 in proliferation and apoptosis in non-small-cell lung cancer // Molecular carcinogenesis. 2015. Vol. 54, suppl. 1. P. E1-E12. doi: 10.1002/mc.22120
154. Shi X., Xiao L., Mao X., He J., Ding Y., Huang J., Peng C., Xu Z. miR-205-5p Mediated Downregulation of PTEN Contributes to Cisplatin Resistance in C13K Human Ovarian Cancer Cells // Frontiers in genetics. 2018. Vol. 9. P. 555. doi: 10.3389/fgene.2018.00555
155. Shiao M.S., Chang J.M., Lertkhachonsuk A.A., Rermluk N., Jinawath N. Circulating Exosomal miRNAs as Biomarkers in Epithelial Ovarian Cancer // Biomedicines. 2021. Vol. 9, No 10. P. 1433. doi: 10.3390/biomedicines9101433
156. Song Y., Ke X., Chen L. The Potential Use of RNA-based Therapeutics for Breast Cancer Treatment // Current medicinal chemistry. 2021. Vol. 28, No 25. P. 5110-5136. doi: 10.2174/0929867327666201117100336
157. Sparber P., Filatova A., Khantemirova M., Skoblov M. The role of long non-coding RNAs in the pathogenesis of hereditary diseases // BMC medical genomics. 2019. Vol. 12, suppl. 2. P. 42. doi: 10.1186/s12920-019-0487-6
158. Su W., Xu M., Chen X., Chen N., Gong J., Nie L., Li L., Li X., Zhang M., Zhou Q. Long noncoding RNA ZEB1-AS1 epigenetically regulates the expressions of ZEB1 and downstream molecules in prostate cancer // Molecular Cancer. 2017. Vol. 16, No 1. P. 142. doi: 10.1186/s12943-017-0711-y
159. Sui Y., Chi W., Feng L., Jiang J. LncRNA MAGI2-AS3 is downregulated in non-small cell lung cancer and may be a sponge of miR-25 // BMC pulmonary medicine. 2020. Vol. 20, No 1. P. 59. doi: 10.1186/s12890-020-1064-7
160. Sun J., Zhang Y. LncRNA XIST enhanced TGF-02 expression by targeting miR-141-3p to promote pancreatic cancer cells invasion // Bioscience reports. 2019. Vol. 39, No 7. P. BSR20190332. doi: 10.1042/BSR20190332
161. Sun Q., Li Q., Xie F. LncRNA-MALAT1 regulates proliferation and apoptosis of ovarian cancer cells by targeting miR-503-5p // OncoTargets and therapy. 2019. Vol. 12. P. 62976307. doi: 10.2147/OTT.S214689
162. Sung H., Ferlay J., Siegel R.L., Laversanne M., Soerjomataram I., Jemal A., Bray F. Global Cancer Statistics 2020: GLOBOCAN Estimates of Incidence and Mortality Worldwide for 36 Cancers in 185 Countries // CA: a cancer journal for clinicians. 2021. Vol. 71, No 3. P. 209-249. doi: 10.3322/caac.21660
163. Tao F., Tian X., Ruan S., Shen M., Zhang Z. miR-211 sponges lncRNA MALAT1 to suppress tumor growth and progression through inhibiting PHF19 in ovarian carcinoma // The FASEB Journal. 2018. FJ201800495RR. doi: 10.1096/fj.201800495RR
164. Tao P., Yang B., Zhang H., Sun L., Wang Y., Zheng W. The overexpression of lncRNA MEG3 inhibits cell viability and invasion and promotes apoptosis in ovarian cancer by sponging miR-205-5p // Int J Clin Exp Pathol. 2020. Vol. 13, No5. P. 869-879
165. Teschendorff AE, Lee SH, Jones A, Fiegl H, Kalwa M, Wagner W, Chindera K, Evans I, Dubeau L, Orjalo A, Horlings HM, Niederreiter L, Kaser A, Yang W, Goode EL, Fridley BL, Jenner RG, Berns EM, Wik E, Salvesen HB, Wisman GB, van der Zee AG, Davidson B, Trope CG, Lambrechts S, Vergote I, Calvert H, Jacobs IJ, Widschwendter M. HOTAIR and its surrogate DNA methylation signature indicate carboplatin resistance in ovarian cancer. // Genome Med. 2015 Vol 7. Art No 108. doi: 10.1186/s13073-015-0233-4.
166. Terashima M, Tange S, Ishimura A, Suzuki T. MEG3 Long Noncoding RNA Contributes to the Epigenetic Regulation of Epithelial-Mesenchymal Transition in Lung Cancer Cell Lines // J Biol Chem. 2017 Vol. 292. No 1. P.82-99. doi: 10.1074/jbc.M116.750950.
167. Throwba H.P.K., Unnikrishnan L., Pangath M., Vasudevan K., Jayaraman S., Li M., Iyaswamy A., Palaniyandi K., Gnanasampanthapandian D. The epigenetic correlation among ovarian cancer, endometriosis and PCOS: A review // Critical Reviews in Oncology/Hematology. 2022. Vol. 180. P. 103852. doi:10.1016/j.critrevonc.2022.103852
168. Tian Y., Ma R., Sun Y., Liu H., Zhang H., Sun Y., Liu L., Li Y., Song L., Gao P. SP1-activated long noncoding RNA lncRNA GCMA functions as a competing endogenous RNA to promote tumor metastasis by sponging miR-124 and miR-34a in gastric cancer // Oncogene. 2020. Vol. 39, No 25. P. 4854-4868. doi: 10.1038/s41388-020-1330-4
169. Tomlins S.A., Day J.R., Lonigro R.J., Hovelson D.H., Siddiqui J., Kunju L.P., Dunn R.L., Meyer S., Hodge P., Groskopf J., Wei J.T., Chinnaiyan A.M. Urine TMPRSS2:ERG Plus PCA3 for Individualized Prostate Cancer Risk Assessment // Eur Urol. 2016. Vol. 70, No 1. P. 45-53. doi: 10.1016/j.eururo.2015.04.039
170. Vannini I., Fanini F., Fabbri M. Emerging roles of microRNAs in cancer // Current opinion in genetics & development. 2018. Vol. 48. P. 128-133. doi: 10.1016/j.gde.2018.01.001
171. Vazana-Netzarim R., Elmalem Y., Sofer S., Bruck H., Danino N., Sarig U. Distinct HAND2/HAND2-AS1 Expression Levels May Fine-Tune Mesenchymal and Epithelial Cell Plasticity of Human Mesenchymal Stem Cells // International Journal of Molecular Sciences. 2023. Vol. 24, No 22. P. 16546. doi: 10.3390/ijms242216546
172. Vo J.N., Cieslik M., Zhang Y., Shukla S., Xiao L., Zhang Y., Wu Y.M., Dhanasekaran S.M., Engelke C.G., Cao X., Robinson D.R., Nesvizhskii A.I., Chinnaiyan A.M. The
Landscape of Circular RNA in Cancer // Cell. 2019. Vol. 176, No 4. P. 869-881.e13. doi: 10.1016/j.cell.2018.12.021
173. Vogell A., Evans M.L. Cancer Screening in Women // Obstetrics and Gynecology Clinics of North America. 2019. Vol. 46, No 3. P. 485-499. doi: 10.1016/j.ogc.2019.04.007
174. Vrba L., Futscher B.W. Epigenetic Silencing of MORT Is an Early Event in Cancer and Is Associated with Luminal, Receptor Positive Breast Tumor Subtypes // Journal of Breast Cancer. 2017. Vol. 20, No 2. P. 198-202. doi: 10.4048/jbc.2017.20.2.198
175. Vrba L., Garbe J.C., Stampfer M.R., Futscher B.W. A lincRNA connected to cell mortality and epigenetically-silenced in most common human cancers // Epigenetics. 2015. Vol. 10, No 11. P. 1074-1083. doi: 10.1080/15592294.2015.1106673
176. Wang J.Y., Lu A.Q., Chen L.J. LncRNAs in ovarian cancer // Clinica Chimica Acta. 2019. Vol. 490. P. 17-27. doi: 10.1016/j.cca.2018.12.013
177. Wang W, Fang F, Ozes A, Nephew KP. Targeting Ovarian Cancer Stem Cells by Dual Inhibition of HOTAIR and DNA Methylation. // Mol Cancer Ther. 2021 Vol. 20 No 6. P.1092-1101. doi: 10.1158/1535-7163.MCT-20-0826.
178. Wang Y., Cai X. Long non-coding RNA HAND2-AS1 restrains proliferation and metastasis of breast cancer cells through sponging miR-1275 and promoting SOX7 // Cancer biomarkers. 2020. Vol. 27, No 1. P. 85-94. doi: 10.3233/CBM-190530
179. Wang Y.L., Bai Y., Yao W.J., Guo L., Wang Z.M. Expression of long non-coding RNA ZEB1-AS1 in esophageal squamous cell carcinoma and its correlation with tumor progression and patient survival // International journal of clinical and experimental pathology. 2015. Vol. 8, No 9. P. 11871-11876.
180. Wang Y.Q., Huang G., Chen J., Cao H., Xu W.T. LncRNA SNHG6 promotes breast cancer progression and epithelial-mesenchymal transition via miR-543/LAMC1 axis // Breast cancer research and treatment. 2021. Vol. 188, No 1. P. 1-14. doi: 10.1007/s10549-021-06190-y
181. Wang Z., Yang B., Zhang M., Guo W., Wu Z., Wang Y., Jia L., Li S.; Cancer Genome Atlas Research Network; Xie W., Yang D. lncRNA Epigenetic Landscape Analysis Identifies EPIC1 as an Oncogenic lncRNA that Interacts with MYC and Promotes Cell-Cycle Progression in Cancer // Cancer cell. 2018. Vol. 33, No 4. P. 706-720.e9. doi: 10.1016/j.ccell.2018.03.006
182. Winkle M., El-Daly S.M., Fabbri M., Calin G.A. Noncoding RNA therapeutics -
challenges and potential solutions // Nature reviews Drug discovery. 2021. Vol. 20, No 8. P. 629-651. doi: 10.1038/s41573-021-00219-z
183. Wu H., Hu Y., Liu X., Song W., Gong P., Zhang K., Chen Z., Zhou M., Shen X., Qian Y., Fan H. LncRNA TRERNA1 Function as an Enhancer of SNAI1 Promotes Gastric Cancer Metastasis by Regulating Epithelial-Mesenchymal Transition // Molecular therapy-nucleic acids. 2017. Vol. 8. P. 291-299. doi: 10.1016/j.omtn.2017.06.021
184. Wu L., Zhu L., Li Y., Zheng Z., Lin X., Yang C. LncRNA MEG3 promotes melanoma growth, metastasis and formation through modulating miR-21/E-cadherin axis // Cancer cell international. 2020. Vol. 20, No 1. P. 12. doi: 10.1186/s12935-019-1087-4
185. Wu Y., Deng Y., Guo Q., Zhu J., Cao L., Guo X., Xu F., Weng W., Ju X., Wu X. Long non-coding RNA SNHG6 promotes cell proliferation and migration through sponging miR-4465 in ovarian clear cell carcinoma // Journal of cellular and molecular medicine. 2019. Vol. 23, No 8. P. 5025-5036. doi: 10.1111/jcmm.14359
186. Wu Y., Zhang Y., Zhu X., Liu H. The Association of Long Non-Coding RNA SNHG6 Expression with Clinicopathological Features and Prognosis in Cancer // Clinical laboratory. 2019. Vol. 65, No 11. doi: 10.7754/Clin.Lab.2019.190346
187. Xie W., Sun H., Li X., Lin F., Wang Z., Wang X. Ovarian cancer: epigenetics, drug resistance, and progression // Cancer cell international. 2021. Vol. 21, No 1. P. 434. doi: 10.1186/s12935-021-02136-y
188. Xin X., Li Q., Fang J., Zhao T. LncRNA HOTAIR: A Potential Prognostic Factor and Therapeutic Target in Human Cancers // Frontiers in oncology. 2021. Vol. 11. P. 679244. doi: 10.3389/fonc.2021.679244
189. Xu J., Wu J., Fu C., Teng F., Liu S., Dai C., Shen R., Jia X. Multidrug resistant lncRNA profile in chemotherapeutic sensitive and resistant ovarian cancer cells // Journal of cellular physiology. 2018. Vol. 233, No 6. P. 5034-5043. doi: 10.1002/jcp.26369
190. Xu L., Wei B., Hui H., Sun Y., Liu Y., Yu X., Dai J. Positive feedback loop of lncRNA LINC01296/miR-598/Twist1 promotes non-small cell lung cancer tumorigenesis // Journal of cellular physiology. 2019. Vol. 234, No 4. P. 4563-4571. doi: 10.1002/jcp.27235
191. Xu X., Yuan X., Ni J., Guo J., Gao Y., Yin W., Li F., Wei L., Zhang J. MAGI2-AS3 inhibits breast cancer by downregulating DNA methylation of MAGI2 // Journal of Cellular Physiology. 2021. Vol. 236, No 2. P. 1116-1130. doi: 10.1002/jcp.29922
192. Xue Z., Yang B., Xu Q., Zhu X., Qin G. Long non-coding RNA SSTR5-AS1 facilitates
gemcitabine resistance via stabilizing NONO in gallbladder carcinoma // Biochemical and biophysical research communications. 2020. Vol. 522, No 4. P. 952-959. doi: 10.1016/j.bbrc.2019.10.104
193. Yan Z., Ruoyu L., Xing L., Hua L., Jun Z., Yaqin P., Lu W., Aili T., Yuzi Z., Lin M., Huiping T. Long non-coding RNA GAS5 regulates the growth and metastasis of human cervical cancer cells via induction of apoptosis and cell cycle arrest // Archives of biochemistry and biophysics. 2020. Vol. 684. P. 108320. doi: 10.1016/j.abb.2020.108320
194. Yang C., Li H., Zhang T., Chu Y., Chen D., Zuo J. miR-200c overexpression inhibits the invasion and tumorigenicity of epithelial ovarian cancer cells by suppressing lncRNA HOTAIR in mice // Journal of Cellular Biochemistry. 2020. Vol. 121, No 2. P. 1514-1523. doi: 10.1002/jcb.29387
195. Yang D., Sun L., Li Z., Gao P. Noncoding RNAs in Regulation of Cancer Metabolic Reprogramming // Advances in Experimental Medicine and Biology. 2016. Vol. 927. P. 191-215. doi: 10.1007/978-981-10-1498-7_7
196. Yang F., Wang F., Gao Z.S., Quang G.Q., Hu H.B., Zheng M. Capn4 regulates Snail to promote the epithelial-mesenchymal transition of nasopharyngeal carcinoma by mediating the transcriptional activity of claudin-11 // The Kaohsiung Journal of Medical Sciences. 2023. Vol. 39, No 2. P. 134-144. doi: 10.1002/kjm2.12614
197. Yang H., Cai M.Y., Rong H., Ma L.R., Xu Y.L. ZNF667-AS1, a positively regulating MEGF10, inhibits the progression of uveal melanoma by modulating cellular aggressiveness // J Biochem Mol Toxicol. 2021. Vol. 35, No 5. P. e22732. doi: 10.1002/jbt.22732
198. Yang J., Qi M., Fei X., Wang X., Wang K. Long non-coding RNA XIST: a novel oncogene in multiple cancers // Mol Med. 2021. Vol. 27, No 1. P. 159. doi: 10.1186/s10020-021-00421-0
199. Yang J.R., Shi M.X., Zeng Y. LncRNA HAND2-AS1 inhibits proliferation and promotes apoptosis of chronic myeloid leukemia cells by sponging with micRNA-1275 // Eur Rev Med Pharmacol Sci. 2019. Vol. 23, No 5. P. 2103-2111. doi: 10.26355/eurrev_201903_17254
200. Yang W., Xu X., Hong L., Wang Q., Huang J., Jiang L. Upregulation of lncRNA GAS5 inhibits the growth and metastasis of cervical cancer cells // Journal of cellular physiology. 2019. Vol. 234, No 12. P. 23571-23580. doi: 10.1002/jcp.28926
201. Yang X., Wang C.C., Lee W.Y.W., Trovik J., Chung T.K.H., Kwong J. Long non-coding RNA HAND2-AS1 inhibits invasion and metastasis in endometrioid endometrial carcinoma through inactivating neuromedin U // Cancer Letters. 2018. Vol. 413. P. 23-34. doi: 10.1016/j.canlet.2017.10.028
202. Yang X., Xie Z., Lei X., Gan R. Long non-coding RNA GAS5 in human cancer // Oncology letters. 2020. Vol. 20, No 3. P. 2587-2594. doi: 10.3892/ol.2020.11809
203. Ye W., Ni Z., Yicheng S., Pan H., Huang Y., Xiong Y., Liu T. Anisomycin inhibits angiogenesis in ovarian cancer by attenuating the molecular sponge effect of the lncRNA-Meg3/miR-421/PDGFRA axis // International journal of oncology. 2019. Vol. 55, No 6. P. 1296-1312. doi: 10.3892/ijo.2019.4887
204. Yin Z., Ma T., Yan J., Shi N., Zhang C., Lu X., Hou B., Jian Z. LncRNA MAGI2-AS3 inhibits hepatocellular carcinoma cell proliferation and migration by targeting the miR-374b-5p/SMG1 signaling pathway // J Cell Physiol. 2019. Vol. 234, No 10. P. 1882518836. doi: 10.1002/jcp.28521
205. Yiwei T., Hua H., Hui G., Mao M., Xiang L. HOTAIR Interacting with MAPK1 Regulates Ovarian Cancer skov3 Cell Proliferation, Migration, and Invasion // Med Sci Monit. 2015. Vol. 21. P. 1856-63. doi: 10.12659/MSM.893528
206. Yu C., Sun J., Leng X., Yang J. Long non-coding RNA SNHG6 functions as a competing endogenous RNA by sponging miR-181a-5p to regulate E2F5 expression in colorectal cancer // Cancer management and research. 2019. Vol. 11. P. 611-624. doi: 10.2147/CMAR.S182719
207. Yu X., Li Z. Long non-coding RNA growth arrest-specific transcript 5 in tumor biology // Oncology letters. 2015. Vol. 10, No 4. P. 1953-1958. doi: 10.3892/ol.2015.3553
208. Yu X., Ye Z., Hou L., Zhang X., Liu Z., Wu R., Huang F., Wang G., Geng X., Zhao H. Hepatitis B virus x gene-downregulated growth-arrest specific 5 inhibits the cell viability and invasion of hepatocellular carcinoma cell lines by activating Y-box-binding protein 1/p21 signaling // J Cell Commun Signal. 2022. Vol. 16, No 2. P. 179-190. doi: 10.1007/s12079-021-00645-z
209. Yu Y., Hann S.S. Novel Tumor Suppressor lncRNA Growth Arrest-Specific 5 (GAS5) In Human Cancer // Onco Targets Ther. 2019. Vol. 11, No 12. P. 8421-8436. doi: 10.2147/OTT.S221305
210. Yuan J.H., Yang F., Wang F., Ma J.Z., Guo Y.J., Tao Q.F., Liu F., Pan W., Wang T.T.,
Zhou C.C., Wang S.B., Wang Y.Z., Yang Y., Yang N., Zhou W.P., Yang G.S., Sun S.H. A long noncoding RNA activated by TGF-P promotes the invasion-metastasis cascade in hepatocellular carcinoma // Cancer cell. 2014. Vol. 25, No 5. P. 666-681. doi: 10.1016/j.ccr.2014.03.010
211. Yuan S., Bi J., Zhang Y. LncRNA SSTR5-AS1 as a Prognostic Marker Promotes Cell Proliferation and Epithelial-to-Mesenchymal Transition in Prostate Cancer // Crit Rev Eukaryot Gene Expr. 2023. Vol. 33, No 2. P. 1-12. doi: 10.1615/CritRevEukaryotGeneExpr.2022042183
212. Zavesky L., Jandakova E., Weinberger V., Hanzikova V., Slanar O., Kohoutova M. Ascites in ovarian cancer: MicroRNA deregulations and their potential roles in ovarian carcinogenesis // Cancer biomarkers. 2022. Vol. 33, No 1. P. 1-16. doi: 10.3233/CBM-210219
213. Zhang H., Zhang Z., Wang D. Epigenetic regulation of IncRNA KCNKI5-ASI in gastric cancer // Cancer management and research. 2019. Vol. 11. P. 8589-8602. doi: 10.2147/CMAR.S186002
214. Zhang N., Wang A.Y., Wang X.K., Sun X.M., Xue H.Z. GAS5 is downregulated in gastric cancer cells by promoter hypermethylation and regulates adriamycin sensitivity // European Review for Medical and Pharmacological Sciences. 2016. Vol. 20, No 15. P. 3199-3205.
215. Zhang N., Yang G.Q., Shao X.M., Wei L. GAS5 modulated autophagy is a mechanism modulating cisplatin sensitivity in NSCLC cells // European review for medical and pharmacological sciences. 2016. Vol. 20, No 11. P. 2271-2277.
216. Zhang W., Shi S., Jiang J., Li X., Lu H., Ren F. LncRNA MEG3 inhibits cell epithelial-mesenchymal transition by sponging miR-421 targeting E-cadherin in breast cancer // Biomedicine & pharmacotherapy. 2017. Vol. 91. P. 312-319. doi: 10.1016/j.biopha.2017.04.085
217. Zhang X., Yao J., Shi H., Gao B., Zhang L. LncRNA TINCR/microRNA- 107/CD36 regulates cell proliferation and apoptosis in colorectal cancer via PPAR signaling pathway based on bioinformatics analysis // Biological Chemistry. 2019. Vol. 400, No 5. P. 663675. doi: 10.1515/hsz-2018-0236
218. Zhang X., Wang W., Zhu W., Dong J., Cheng Y., Yin Z., Shen F. Mechanisms and Functions of Long Non-Coding RNAs at Multiple Regulatory Levels // International
Journal of Molecular Sciences. 2019. Vol. 20, No 22. P. 5573. doi: 10.3390/ijms20225573
219. Zhang Y., Ai H., Fan X., Chen S., Wang Y., Liu L. Knockdown of long non-coding RNA HOTAIR reverses cisplatin resistance of ovarian cancer cells through inhibiting miR-138-5p-regulated EZH2 and SIRT1 // Biological Research. 2020. Vol. 53, No 1. P. 18. doi: 10.1186/s40659-020-00286-3
220. Zhang Y., Guo J., Cai E., Cai J., Wen Y., Lu S., Li X., Han Q., Jiang J., Li T., Wang Z. HOTAIR maintains the stemness of ovarian cancer stem cells via the miR-206/TBX3 axis // Experimental Cell Research. 2020. Vol. 395, No 2. P. 112218. doi: 10.1016/j.yexcr.2020.112218
221. Zhang Y., Pitchiaya S., Cieslik M., Niknafs Y.S., Tien J.C., Hosono Y., Iyer M.K., Yazdani S., Subramaniam S., Shukla S.K., Jiang X., Wang L., Liu T.Y., Uhl M., Gawronski A.R., Qiao Y., Xiao L., Dhanasekaran S.M., Juckette K.M., Kunju L.P., Cao X., Patel U., Batish M., Shukla G.C., Paulsen M.T., Ljungman M., Jiang H., Mehra R., Backofen R., Sahinalp C.S., Freier S.M., Watt A.T., Guo S., Wei J.T., Feng F.Y., Malik R., Chinnaiyan A.M. Analysis of the androgen receptor-regulated lncRNA landscape identifies a role for ARLNC1 in prostate cancer progression // Nature Genetics. 2018. Vol. 50, No 6. P. 814824. doi: 10.1038/s41588-018-0120-1
222. Zhao J., Wu J., Qin Y., Zhang W., Huang G., Qin L. LncRNA PVT1 induces aggressive vasculogenic mimicry formation through activating the STAT3/Slug axis and epithelial-to-mesenchymal transition in gastric cancer // Cellular Oncology. 2020. Vol. 43, No 5. P. 863-876. doi: 10.1007/s13402-020-00532-6
223. Zhao R., Trainor P.A. Epithelial to mesenchymal transition during mammalian neural crest cell delamination // Seminars in Cell and Developmental Biology. 2023. Vol. 138. P. 5467. doi: 10.1016/j.semcdb.2022.02.018
224. Zhao X., Liu Y., Zheng J., Liu X., Chen J., Liu L., Wang P., Xue Y. GAS5 suppresses malignancy of human glioma stem cells via a miR-196a-5p/FOXO1 feedback loop // Biochimica et Biophysica Acta - Molecular Cell Research. 2017. Vol. 1864, No 10. P. 1605-1617. doi: 10.1016/j.bbamcr.2017.06.020
225. Zhao X., Wang D., Ding Y., Zhou J., Liu G., Ji Z. lncRNA ZEB1-AS1 promotes migration and metastasis of bladder cancer cells by post-transcriptional activation of ZEB1 // International Journal of Molecular Medicine. 2019. Vol. 44, No 1. P. 196-206. doi: 10.3892/ijmm.2019.4187
226. Zhao Y., Wang N., Zhang X., Liu H., Yang S. LncRNA ZEB1-AS1 down-regulation suppresses the proliferation and invasion by inhibiting ZEB1 expression in oesophageal squamous cell carcinoma // Journal of Cellular and Molecular Medicine. 2019. Vol. 23, No 12. P. 8206-8218. doi: 10.1111/jcmm.14692
227. Zheng Y., Katsaros D., Shan S.J., de la Longrais I.R., Porpiglia M., Scorilas A., Kim N.W., Wolfert R.L., Simon I., Li L., Feng Z., Diamandis E.P. A multiparametric panel for ovarian cancer diagnosis, prognosis, and response to chemotherapy // Clinical Cancer Research. 2007. Vol. 13, No 23. P. 6984-6992. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-07-1409
228. Zhong Y., Li Y., Song T., Zhang D. MiR-718 mediates the indirect interaction between lncRNA SEMA3B-AS1 and PTEN to regulate the proliferation of hepatocellular carcinoma cells // Physiological Genomics. 2019. Vol. 51, No 10. P. 500-505. doi: 10.1152/physiolgenomic s.00019.2019
229. Zhou C., Cao H., Meng X., Zhang Q. Lnc-MEG3 inhibits invasion, migration, and epithelial- mesenchymal transition of nasopharyngeal carcinoma cells by regulating sequestosome 1 // Head & Neck. 2022. Vol. 44, No 1. P. 201-211. doi: 10.1002/hed.26917
230. Zhou Y., Fan R.G., Qin C.L., Jia J., Wu X.D., Zha W.Z. LncRNA-H19 activates CDC42/PAK1 pathway to promote cell proliferation, migration and invasion by targeting miR-15b in hepatocellular carcinoma // Genomics. 2019. Vol. 111, No 6. P. 1862-1872. doi: 10.1016/j.ygeno.2018.12.009
231. Zhou Y., Wu K., Jiang J., Huang J., Zhang P., Zhu Y., Hu G., Lang J., Shi Y., Hu L., Huang T., Kong X. Integrative analysis reveals enhanced regulatory effects of human long intergenic non-coding RNAs in lung adenocarcinoma // Journal of Genetics and Genomics. 2015. Vol. 42, No 8. P. 423-436. doi: 10.1016/j.jgg.2015.07.001
232. Zhuang L., Ding W., Ding W., Zhang Q., Xu X., Xi D. lncRNA ZNF667-AS1 (NR_036521.1) inhibits the progression of colorectal cancer via regulating ANK2/JAK2 expression // Journal of Cellular Physiology. 2021. Vol. 236, No 3. P. 2178-2193. doi: 10.1002/jcp.30004.
Обратите внимание, представленные выше научные тексты размещены для ознакомления и получены посредством распознавания оригинальных текстов диссертаций (OCR). В связи с чем, в них могут содержаться ошибки, связанные с несовершенством алгоритмов распознавания. В PDF файлах диссертаций и авторефератов, которые мы доставляем, подобных ошибок нет.