Паспортизация сортов люпина методами ISSR-PCR и RAPD-PCR для биотехнологических исследований тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.01.06, кандидат биологических наук Артюхова, Анастасия Валентиновна

• Артюхова, Анастасия Валентиновна
• кандидат биологических наук
• 2011

Оглавление диссертации кандидат биологических наук Артюхова, Анастасия Валентиновна

Список использованных сокращений

Введение

Глава 1. Обзор литературы

1.1. Характеристика объекта исследования

1.2. Современные методы исследования генетического полиморфизма растений

1.2.1. Молекулярно-генетический анализ ДНК с помощью RAPD-маркеров

1.2.2. Молекулярно-генетический анализ ДНК с помощью

ISSR- и SSR маркеров

1.2.3. Другие молекулярно-генетические мультилокусные методы анализа полиморфизма растений

1.3. Методы паспортизации сортов растений

1.4. Маркирование видов и сортов люпина

Глава 2. Материалы и методы

2.1. Исходный материал

2.2. Выделение геномной ДНК люпина

2.3. Определение качества и количества ДНК '

2.4. Полимеразная цепная реакция

2.5. Электрофоретический анализ ДНК

2.6. Обработка результатов генетического анализа

Глава 3. Результаты и обсуждение

3.1. Выбор метода выделения ДНК люпина

3.2. Оптимизация условий PCR

3.3. Характеристика праймеров для RAPD-и ISSR-PCR

3.4. Характеристика полиморфных фрагментов, амплифицируемых при

ISSR-PCR

3.4.1. Межвидовой полиморфизм

3.4.2. Внутривидовой полиморфизм

3.5. Генетическое сходство сортов люпина по 188Ы-маркерам

3.6. Разработка системы паспортизации сортов люпина

3.7. Дихотомический ключ определения сортов люпина 84 Выводы 88 Рекомендации производству 89 Список использованной литературы 90 Приложения

СОКРАЩЕНИЯ

БГБ - белорусский генетический банк ДНК — дезоксирибонуклеиновая кислота НК - нуклеиновая кислота

ПДРФ - полиморфизм длин рестрикционных фрагментов п.н. — пара нуклеотидов

ПЦР - полимеразная цепная реакция

РНК - рибонуклеиновая кислота

AFLP - Amplified Fragment Length Polymorphism

СТАВ - Cetyl Trimethyl Ammonium Bromide

DArT - Diversity Array Technology

HRM - High-Resolution Melt analysis

IRAP - Inter-Retrotransposon Amplified Polymorphysm

ITAP - Intron-Target Amplified Polimorphism,

ISSR - Inter-Simple Sequence Repeat

LP-RAPD - Long Primer Random Amplified Polymorphic DNA MAS - Marker Assisted Selection

MFLP - Microsatellite-anchored Fragment Length Polymorphisms

PCR - Polymerase Chain Reaction

QTL - Quantitative Trait Loci

RAPD - Random Amplified Polymorphic DNA

RAMP - Randomly Amplified Microsatellite Polymorphism

REMAP - Retrotransposone Microsatellite Amplified Polymorphism

RFLP - Restriction Fragment Length Polymorphism

SAMPL - Selective Amplification of Microsatellite Polymorphic Loci

SCAR - Sequence Characterized Amplified Region

SNP - Single Nucleotide Polymorphism

SSLP - Simple Sequence Length Polymorphism

SSR - Simple Sequence Repeats

STR - Short Tandem Repeats

UPGMA - Unweighted Pair Group Method with Arithmetic mean

VNTR - Variable Number Tandem Repeat

WPGMA - Weighted Pair Group Method with Arithmetic mean

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Паспортизация сортов люпина методами ISSR-PCR и RAPD-PCR для биотехнологических исследований»

В современной мировой науке биотехнология является одной из наиболее динамично развивающихся дисциплин биологического профиля. На развитие исследований по биотехнологии в мире выделяются сотни миллиардов долларов, а валовой доход мирового биотехнологического производства составляет триллионы долларов США. В России разработана программа развития биотехнологии, она входит в число приоритетных направлений развития науки.

Биотехнология возникла на стыке таких фундаментальных дисциплин, как генетика, физиология, молекулярная биология, микробиология. В 80-х годах прошлого столетия она была выделена в отдельную дисциплину и продолжает активно развиваться. Например, недавно появилось новое направление - бионанотехнология.

В настоящее время биотехнологические методы широко используются для проведения исследований в смежных областях науки, в частности в селекции растений, растениеводстве и семеноводстве (Харченко, 2006; Сельскохозяйственная биотехнология, 2008). Сегодня невозможно представить успешное развитие селекционных работ без применения методов генетической и клеточной инженерии, культивирования органов и тканей растений in vitro, молекулярных белковых или ДНК-маркеров, ПЦР-диагностики фитопатогенов.

Особое значение в современной биотехнологии имеет разработка современных методов анализа сортов и видов растений на основе полимеразноцепной реакции, поскольку метод ПЦР имеет высокую чувствительность, точность, воспроизводимость результатов и производительность анализа, достаточно прост в исполнении и не требует сложного дорогостоящего оборудования (Сулимова, 2004; Карлов, 2009). ПЦР широко используется в медицине для экспресс-диагностики инфекционных и генетических заболеваний, в исследованиях по эволюционному и филогенетическому анализу разных таксонов животных и растений (Kochieva, 2004; Лукашов, б

2009), в генетике и селекции для определения генетического родства сортов разных видов' растений- (Зайцев, 2001; Нам, 2004), является неотъемлемой частью работ по генетической инженерии.

Большое значение для- селекции хозяйственно-ценных культур и семеноводства имеет разработка методов паспортизации сортов растений на основе молекулярных маркеров. Ранее для анализа генотиповш' сортов разных культур использовался метод белковых маркеров,- который позволял по спектрам альбуминов, глобулинов, пролактинов и различных, изоферментных систем разных культур определять сортовую принадлежность таких важных злаковых культур, как рожь, пшеница и др. (Созинов, 1985; Конарев, 1993). Полученные результаты использовали в селекции, для составления схем гибридизации, анализа, гибридных образцов, контроля сортовой чистоты различных партий элитных семян.

Однако метод белковых маркеров был часто сопряжен с недостаточным полиморфизмом белков, в частности альбуминов или глобулинов. Для некоторых видов* растений применение метода белковых маркеров в сортовой идентификации был непригоден из-за низкого уровня межсортового разнообразия. Метод белковых маркеров отражает лишь ту часть генома, экспрессия которой проявляется в синтезе белковых молекул: Однако- более половины генома, растений представлена сателлитной и микросателлитной ДНК, функции которой не* связаны с биосинтезом белков, и эта часть генома никак не может быть выявлена методами белковых маркеров. В то же время доказана высокая вариабельность этих последовательностей ДНК, что в последние 20 лет активно используется в биотехнологических исследованиях для изучения происхождения и генетического родства представителей разных таксонов.

Развитие методов ДНК-маркеров на основе полимеразно-цепной реакции с использованием случайных праймеров (ИАРО-РСК., АРЬР), а также микросателлитных последовательностей (ЗБЯ-РСЯ, ^БЯ-РСЫ, МРЪР) позволило расширить возможности для разработки методов молекулярного 7 маркирования с целью изучения филогенетических связей, генетического родства внутри разных семейств и родов растений:

ДНК-маркеры используются для паспортизации сортов и в семеноводстве различных сельскохозяйственных культур, в частности, были разработаны молекулярные, маркеры, хозяйственно-ценных^ признаков ; люпина : узколистного (Yang, 2004» 2008) и. способ идентификации« ряда, австралийских; сортов узколистного: люпина (Yuan, 2005). В России подобные исследования; на люпине разных видов не проводились.

Люпин является важной для России зернобобовой культурой кормового й сидерального направления, семена- которой характеризуются: высоким качеством'запасных белков. Люпин называют «северной соей», но в отличие от сои люпин неприхотлив, к: плодородию почв, он относится к пионерским культурам и может произрастать, на бедных почвах - например, на песчаниках или, лавовых потоках после извержений вулканов. Для созревания семян люпина не требуется высокой суммы активных температур, он приспособлен к произрастанию В; условиях средней полосы России, в Белоруссии, Украине и Польше. .

В нашей стране проводятся селекционные работы; по созданию высокопродуктивных и устойчивых сортов;трех видов люпина: белого, желтого и узколистного. Поскольку зачастую: исходным- материалом- для селекции являются.'формы белорусской, польской», украинской" селекции, а также в связи с постоянным обменом селекционными образцами между селекционерами и генетиками этих, стран, логично ожидать,, что сорта российской: селекции должны быть близки по генетической природе сортам, завезенным из этих стран.

В: связи с вышесказанным, разработка биотехнологических высокопроизводительных методов на основе ПЦР, позволяющих провести экспресс-анализ для паспортизации сортов люпина разных видов, подбора родительских пар при скрещивании с целью ускорения селекции- люпина, определения, сорта или анализа сортовой чистоты элитной партии семян, 8 является актуальным направлением биотехнологии применительно к, данной культуре.

Настоящее исследование посвящено разработке метода паспортизации сортов трех видов люпина на основе 18811- и КАРО-РСЫ, что необходимо для ускорения селекционной работы, идентификации сортов разных видов люпина, а также контроля чистоты разных партий семян в семеноводстве этой культуры.

Цель и задачи исследования. Целью настоящего исследования являлась разработка метода паспортизации сортов люпина разных видов на основе методов 18811-РСК и КАРБ-РСЯ.

Для достижения цели решались следующие задачи:

1) выбор метода выделения ДНК из образцов люпина;

2) подбор оптимальных условий проведения 18811- и КАРО-РСЫ на ДНК люпина;

3) подбор праймеров, обеспечивающих достаточный полиморфизм и стабильную амплификацию полиморфных фрагментов люпина;

4) изучение генетического полиморфизма сортов, сортообразцов и гибридных форм люпина;

5) составление генетических паспортов сортов люпина узколистного, желтого и белого;

6) изучение генетического сходства сортов и сортообразцов люпина узколистного;

7) разработка схем дихотомического ключа для идентификации сортов люпина по генетическим паспортам.

Научная новизна и значимость работы. Впервые в России разработан метод паспортизации сортов люпина трех видов на основе 188Я-РСК. Метод паспортизации сортов люпина включает протокол выделения ДНК, набор праймеров и условия проведения 188К-РСК. Составлены паспорта сортов трех видов люпина, возделываемых в России, установлено генетическое сходство сортов люпина узколистного. Установлены уровни внутривидового разнообразия, степень генетической дифференциации сортов.

Практическая ценность исследований. Полученные в данной работе паспорта сортов люпина белого, желтого и узколистного будут использованы в селекции люпина, а также для поиска маркеров хозяйственно-ценных признаков при разработке биотехнологий получения высокопродуктивных сортов этого ценного растения. Составленные паспорта могут быть использованы при передаче сортов в Госкомиссию и для контроля чистоты посевного материала.

Основные положения, выносимые на защиту.

1. Метод паспортизации сортов трех видов люпина.

2. Паспорта сортов люпина узколистного, желтого и белого.

3. Дихотомический ключ идентификации сортов люпина.

4. Генетическое сходство сортов люпина узколистного.

Заключение диссертации по теме «Биотехнология (в том числе бионанотехнологии)», Артюхова, Анастасия Валентиновна

5. Результаты работы предлагается использовать при составлении курсов биотехнологии, генетики и основ сельского хозяйства в вузах.

Р9 ол

Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Артюхова, Анастасия Валентиновна, 2011 год

1. Артюкова, Е.В. Анализ генетической изменчивости редкого эндемичного вида Oxytropis chankaensis Jurtz. (Fabaceaé) на основе RAPD маркеров / Е.В.Артюкова, А.Б. Холина, М.М. Козыренко, Ю.Н. Журавлев // Генетика. -2004. Т. 40. - № 7. - С. 877-884.

2. Боронникова, C.B. Генетическая паспортизация популяций редких видов растений рода Adonis с использованием ISSR- и RAPD-маркеров / C.B. Боронникова II Известия ТХСА. 2009. - Вып. 1. - С. 82-88.

3. Вишнякова, М.А. RAPD анализ видового полиморфизма рода чина1.thyrus L. семейства Fabaceae Lindl. / М.А. Вишнякова, М.О. Бурляева,i

4. Н.В. Алпатьева, Ю.В. Чесноков // Информационный вестник ВОГиС. — 2008. -Т. 12.-№4.-С. 595-607.

5. Волосевич, H.H. Молекулярное маркирование признака устойчивости к коккомикозу у вишни с использованием RAPD-PCR / H.H. Волосевич, А.Л. Лагоненко, Н.В. Кухарчик // Плодоводство. 2007. - Т. 19. - С. 117-123.

6. Генная инженерия растений. Лабораторное руководство: пер с англ. / [под. ред. Дж. Дрейпера, Р. Скотта, Ф. Армитиджа, Р. Уолдена]. М.: Мир, 1991.-408 с.

7. Генофонд и селекция зернобобовых культур (люпин, вика, соя, фасоль) / под ред. Курловича Б.С., Репьева С.И.. СПб, 1995. 430 с.

8. Глазко, Т.Т. Молекулярно-генетические подходы в селекции зерновых / Т.Т. Глазко, В.И.Глазко // Известия ТСХА. 2006. - Вып. 4. - С. 100-107.

9. Глазко, В.И. Оценка полиморфизма различных генетических элементов в контроле разнообразия генофондов культурных растений / В.И. Глазко // Вестник ВОГиС. 2008. - Т. 12. - №4. - С. 590-594.

10. Гостимский, С.А. Использование молекулярный маркеров для анализа генома растений / С.А. Гостимский, З.Г. Кокаева, В.К. Боброва // Генетика. -1999. Т. 35.-№ И.-С. 1538-1549.

11. Динамика популяционных генофондов при антропогенных воздействиях / под ред. Ю.П. Алтухова. М. : Наука, 2004. - 619 с.1. ПГ1

12. Домблидес, Е.А. Оценка генетической изменчивости позднеспелых сортов капусты белокочанной с использованием RAPD-маркеров / Е.А. Домблидес, A.C. Домблидес, Е.Г. Добруцкая, Е.В. Шевцова // Овоч1вництво i баштанництво. — 2007. Вип. 53. - С. 3-9.

13. Еленевский, А.Г. Ботаника: систематика высших, или наземных растений: Учеб. для студентов высших пед. учебных заведений / А.Г. Еленевский, М.П. Соловьева, В.Н. Тихомиров. М. : Академия, 2004. -432 с.

14. Епринцев, А.Т. Идентификация и исследование экспрессии генов: учебно-методическое пособие для вузов / А.Т. Епринцев, В.Н. Попов, Д.Н. Федорин. Воронеж : ИПЦ ВГУ, 2008. - 64 с.

15. Журавлев, Ю.Н. ПЦР-генотипирование женьшеня с использованием произвольных праймеров / Ю.Н. Журавлев и др. // Докл. Академии наук. -1996.-Т. 349.-№ 1.-С. 111-114.

16. Зайцев, B.C. Идентификация генотипов растений с помощью ПЦР-анализа* рассеянных повторов последовательностей R173 / B.C. Зайцев, Э.Е. Хавкин // Докл. РАСХН. 2001. - №3. - С. 3-5.

17. Календарь, Р.Н. Типы молекулярно-генетических маркеров w их применение / Р.Н. Календарь, В.И. Глазко // Физиология и биохимия культурных растений. 2002. - Т. 34. - № 4. - С. 279-296.

18. Карлов, Г.И. Молекулярно-генетические и молекулярно-цитогенетические подходы для ускоренного создания селекционного материала растений с заданными свойствами : автореф. дис. . д-ра.биол. наук / Г.И. Карлов. М., 2009. - 50 с.

19. Конарев, В.Г. Молекулярно-биологические аспекты прикладной ботаники, генетики и селекции (Теор. осн. селекции Т. 1) / В.Г. Конарев, И.П. Гаврилюк, Н.К. Губарева. -М.:Колосс, 1993. 447 с.

20. Кочиева, Е.З. Идентификация видового и сортового полиморфизма у томатов / Е.З. Кочиева, Т.П.Супрунова // Генетика. 1999а. - Т. 35. - № 10. -С. 1386-1389.1. П1

21. Кочиева, Е.З. Использование RAPD-анализа для идентификации сортов баклажанов {Solamum melongena L.) / Е.З. Кочиева, Т.П. Супрунова, С.К. Семенова // Генетика. 1999b. - Т. 35, - № 8. - С. 1165-1168.

22. Купцов, Н.С. Люпин. Генетика, селекция, гетерогенные посевы. / Н.С. Купцов, И.П. Такунов. Клинцы: Клинцовская городская типография., 2006. - 576 с.

23. Лукашов, В.В. Молекулярная эволюция и филогенетический анализ / В.В. Лукашов. М.: БИНОМ, 2009. - 256 с.

24. Майсурян, H.A. Люпин. / H.A. Майсурян, А.И. Атабекова. М., 1974. -199 с.

25. Малышев, C.B. Молекулярные маркеры в генетическом картировании растений / C.B. Малышев, H.A. Картель // Молекулярная биология. 1997. -Т. 3. -№ 62. - С. 197-208.

26. Мироненко, A.B. Биохимия люпина. / A.B. Мироненко. Минск: Наука и техника, 1975. - 312 с.

27. Нам, И .Я. Оптимизация применения регуляторов роста и развития растений в биотехнологиях in vitro : автореферат дис. . доктора биологических наук : 03.00.23 / И.Я. Нам. М., 2004. - 42 с.

28. Ней, М. Молекулярная эволюция и филогенетика / М. Ней, С. Кумар пер. с англ.. Киев: КВ1Ц, 2004. - 418 с.

29. Оганисян, A.C. Маркирование видов и сортов картофеля с помощью метода RAPD-PCR / A.C. Оганисян.С., Е.З. Кочиева, А.П. Рысков // Генетика. 1996. Т. 32. - № 3. - С. 448-451.

30. Патрушев, Л.И. Искусственные генетические системы / Л.И. Патрушев. -М.: Наука, 2004.-526 с.

31. Рамазанова, С.А. Идентификация сортов сои с использованием молекулярно-генетических методов: автореф. дис. . канд.биол. наук — Краснодар, 2008. 26 с.

32. Сельскохозяйственная биотехнология / под ред. B.C. Шевелухи. 2-е издание перераб. и доп. - М.: Высшая школа, 2008. - 710 с.

33. Сиволап, Ю.М. Генетический полиморфизм злаковых растений, при помощи ПЦР с произвольными праймерами / Ю.М. Сиволап, Р.Н. Календарь, C.B. Чеботарь // Цитология и генетика. 1994. - Т. 28. - № 6. - С. 54-61.

34. Соболев, В.В. Использование ISSR-маркеров для молекулярно-генетической идентификации и паспортизации сортов малины / В.В. Соболевой др. // Сельскохозяйственная биология. 2006. - №5. - С. 48-52.

35. Созинов, A.A. Полиморфизм белков и его значение в генетике и селекции /A.A. Созинов. -М.: Наука, 1985.-217 с.

36. Сорта селекции всероссийского научно-исследовательского института люпина / П.А. Агеева и др.. Брянск: Читай-город, 2005. — 48 с.

37. Сулимова, Г.Е. ДНК-маркеры в генетических исследованиях: типы маркеров, их свойства и области применения / Г.Е. Сулимова // Успехи современной биологии. 2004. - Т. 124. - № 3. - С.260-271.

38. Урбанович, О.Ю. Идентификация сортов яблони с использованием SSR-анализа в Беларуси / О.Ю. Урбанович, З.А. Козловская, H.A. Картель // Плодоводство. 2007. - Т. 19. - С. 32-39.

39. Халяфян, A.A. Statistica 6. Статистический анализ данных. Учебник. / A.A. Халяфян. 3-е изд. - М.: Бином-Пресс, 2007. - 512 с.

40. Харченко, П.Н. ДНК-технологии в развитии агробиологии / П.Н. Харченко, В.И. Глазко. М.: Воскресение, 2006. - 480 с.

41. Цветков^ И.А. Генетическая дифференциация сортов риса по1 IRAP-маркерам / И.А. Цветков, А.Н. Иванов, В.И. Глазко // Известия ТСХА. 2006. -№4.-С. 155-159:

42. Чекалин, Н.М. Генетические основы селекции зернобобовых культур на устойчивость к патогенам / Н.М. Чекалин. Полтава: 1нтерграфжа., 2003.- 186 с.

43. Чекалин, Н.М. Селекция зернобобовых культур / Н.М. Чекалин. М.: Колос, 1981.-335 с.

44. Aïnouche, A.K. Phylogenetic relationships in Lupinus (Fabaceae: Papilionoideae) based on internal transcribed spacer sequences (ITS) of nuclear9b

45. Akkaya, M.S. Length polymorphisms of simple sequence repeat DNA in soybean / M.S. Akkaya, A.A. Bhagwat, P.B. Cregan // Genetics. 1992. - Vol. 132. -P. 1132-1139.

46. Ammiraju, J.S.S. Identification of inter simple sequence repeat (ISSR) marker associated with seed size in wheat / J.S.S. Ammiraju et al. // Theoretical and applied genetics. 2001 - Vol. 102. - P. 726-733.

47. Arcade, A. Application of AFLP, RAPD and ISSR markers to genetic mapping of European and Japanese larch / A. Arcade et al. // Theoretical and applied genetics. 2000. - Vol. 100. - P. 299-307.

48. Astarini, I.A. Fingerprinting of cauliflower cultivars using RAPD markers / I.A. Astarini, J.A. Plummer, R.A. Lancaster, G. Yan // Australian journal of agricultural research. 2004. - Vol. 55. - P. 117-124.

49. Badr, A. Chloroplast DNA restriction polymorphismin Genistae (Legumninosae) suggests a common origin for European and American lupines / A. Badr, W. Martin U. Jensen // plant systematic and evolution. 1994. -P.95-106

50. Badr, A. Systematic relationships in Lathyrus sect. Lethyrus (Fabaceae) based on ampliphied fragment polymorphism (AFLP) data / A. Badr, H. el Shazly, H. el Rabey, L.E. Watson // Canadian, journal of botany. 2002. - Vol. 80. -P. 962-969.9Yn/l

51. Becker, J. Combined mapping of AFLP and RFLP markers an barley / J. Becker, P. Vos, M. Kuiper, F. Salamini, M. Heun // Molecular genetics and genomics. 1995. - Vol. 249. - P. 65-73.

52. Boersma, J.G. Development of a PCR marker tightly linked to mollis, the gene-that controls seed dormancy in Lupinus angusifolius L. / J.G. Boersma, B.J. Buirchell, K. Sivasithamparam, H. Yang // Plant breeding. 2007a. - Vol. 126. -P. 612-616.

53. Boersma, J.G Contribution of the molecular genetics of the narrow-leafed lupin {Lupinus angustifolius L.) — mapping, marker development and QTL analusis / J.G. Boersma. The University of Wester Australia, 2007d. - P. 216.

54. Brien, S.J. A molecular marker for early maturity {Ku) and marker-assisted breeding of Lupinnus angustifolius / S.J. Brien et al. // Proc. 11th aust. plant breeding conf. (Adelaide). 1999. - P. 204-205.r»r

55. Garlier, J.D. Genetic maps of RAPD, AFLP and ISSR; markers in Ananas bractealus and A. comosus using the pseudo-testcross; strategy / J.D: Carlier et al. //

56. Plant-breeding, -2004. Vol; 123. - P: 186-192.

57. Chomczynski, P.' Single-step 'method of RNA isolation by acid guanidine thiocyanate-phenol-chloroform extraction / P. Chomczynski, N. Sacchi // Analytical biochemistry:.- 1987. Vol- 162; - P. 156-159?

58. Croft;,ÄiM'; Molecular«'analysisoi--Lethyeusf sativüs:B. (grass pea); and related species / A.M; Croft, E.C.K.Pang, P.W J;Taylor // Euphytica. - 1999; - Vol. 107. - P. 167-176.

59. Dangi,.R.S. Assessment of genetic diversity in Trigonellafoenum-graecum and Trigonella caerulea using ISSR and RAPD markers / R.S. Dangi et al. // BMC Plant biology. 2004. - P. 4-13.

60. Dulson, J. Efficacy of bulked DNA samples for RAPD DNA fingerprinting of 1 genetically complex Brassica napus.xultivars / J. Dulson, L.S. Kott, V.L. Ripley //

61. Euphitica. 1998. - Vol. 102. - P. 65-70.

62. Ferreira, A.R. Soybean genetic map of RAPD markers assigned to an existing scaffold RPLP map / A.R. Ferreira, K.R. Foutz, P. Keim // Journal of heredity. -2000; Vol. 91. - P. 392-396.

63. Gillings, M: Amplification of anonymous DNA fragments usingi pairs ? of long primers generates reproducible DNA fingerprints that are sensitive to genetic variation / M. Gillings, M; Holley // Electrophoresis. 1997. - Vol. 18. - P; 15121518.

64. Gladstones, J.S. A historical view of lupins in Australia // Proceedings of the First Australian Lupin Technical Symposium Eds. Dracup M;, Palta J.J. 1994. -P. 1-38.

65. Gupta, S. Interspecific reproductive barriers and genomic similarity among the rough-seeded Lupinus species / S. Gupta, B.J. Buirchell, W.A. Cowling // Plant breeding. 1996. - Vol. 115. - P. 123-127.

66. Gupta, S. Molecular markers and their application in wheat breading / S. Gupta, R.K. Varshney, P.C. Sharma, B. Ramesh // Plant breeding. 1999. - Vol. 118.-P. 369-390.

67. Harrison, J.E.M: General control of alkaloids in Lupinus albus / J.E.M. Harrison, W. Williams // Euphytica. 1982. - Vol. 31. - P. 357-364.

68. He, Q. Effects of thermocyclers and primers an the reproducibility of banding patterns in randomly amplified polymorphic DNA analysis / Q. He, M.K. Viljanen, J. Mertsola // Molecular and cellular probes. 1994. - Vol. 8. -P. 155-160.

69. Hu, J. Generation of DNA-based markers in specific genome regions by two primer RAPD reactions / J. Hu, J. van Eysden, C.F. Quiros // PGR methods and appl. 1995. - Vol. 4. - № 6. - P. 346-351.

70. Janssen, P. Evaluation of the DNA fingerprinting method' AFLP as a new tool in bacterial taxonomy / P. Janssen et al. // Microbiology. 1996. - Vol. 142.-P. 1881-1893.

71. Jones, C.J. Reproducibility testing of RAPD, AFLP and SSR markers in plants by a network of European laboratories / C.J. Jones et al. // Molecular breeding. -1997.-Vol. 3.-P. 381-390.

72. Joshi, S.P. Genetic diversity and phylogenetic relationship as revealed by inter simple sequence repeat (ISSR) polymorphism in the genus Oryza / S.P. Joshi et al. // Theoretical and applied genetics. 2000. - Vol. 100. - № 8. - P. 1311-1320.

73. Kalendar R. IRAP and REMAPA two new retrotransposon-based DNA fingerprinting techniques / R. Kalendar et al. // Theoretical and applied genetics. -1999.-Vol. 98.-P. 701-711.

74. Kass, E. Molecular phylogeny and phylogeography of Lupinus (Leguminosae) inferred from nucleotide sequences of the rbcL gene and ITS 1+2 regions of rDNA /nr»"7

75. E. Kass., M. Wink // Plant systematics and evolution. 1997. -Vol. 208. - P. 139-167.

76. Kenicer, G J. Systematics and biogeography of Lathyrus (Leguminosae) based on internal transcribed spacer and cpDNA sequence data / G.J. Kenicer, T. Kajita, R.T. Pennington, J. Murata // American journal of. botany. 2005. - Vol. 97.-P. 1199-1209.

77. Kennedy, G.C. The minisatellite an the diabetes susceptibility locus IDDM2 regulates insulin transcription / G.C. Kennedy, M.S. German, W.J. Rutter // Nature genetics. 1995. - №9. - P. 293-298.

78. Kim, D.H. Genetic relationships of sesame germplasm collection as revealed by inter-simple sequence repeats / D.H. Kim et al. // Plant breeding. 2002. -Vol. 121.-P. 259-262.

79. Kochieva E.Z. Assessment of genetic relationships in the genus Capsicum using different DNA marker systems / E.Z. Kochieva, N.N. Ryzhova, W. van Dooijeweert, I.W. Boukema, P. Arens .// Eucarpia. 2004. - P. 44-50.

80. Koreth, J. Microsatellites and PCR genome analysis / J. Koreth, J.J. O'Leary, J.O. McGee // The journal of pathology. 1996. - Vol. 178. -P. 239-248.

81. Kruszka, K. Linkage maps of morphological and molecular markers in lupin / K. Kruszka, B. Wolko II Proc. 9th Int. Lupin conf. Klink/Muritz, Germany. International Lupin Association. 1999. - P. 100-105.

82. Lagercrantz U. The abundance of various polymorphic microsatellite motifs differs between plants and vertebrates / U. Lagercrantz, H. Ellegren, L. Andersson // Nucleic acids research. 1993. - Vol. 21. - № 5. - P. 1111-1115.

83. Li, Y.-Ch. Microsatellites: genomic distribution, putative functions and mutational mechanisms: a review / Y.-Ch. Li et al. // Molecular ecology. 2002. -Vol. 11.-P. 2453-2465.

84. Liebhard, R. Development and characterization of 140 new microsatellites an apple {Malus x domestica Borkh.) / R. Liebhard et al. // Molecular breeding. —2002. -Vol. 10.-P. 217-241.

85. Lin, J.-J. Identification of molecular markers in soybean comparing RFLP, RAPD and AFLP DNA mapping techniques / J.-J. Lin et al. // Plant molecular biology reporter.-1996.-Vol. 14.-P. 156-159.

86. Lin, R. Development of a sequence-specific PCR marker linked to the gene "pauper" conferring low-alkaloids in white lupin (Lupinus albus L.) for marker assisted selection / R. Lin et al. // Molecular breeding. 2009. - Vol. 23. -P. 153-161.

87. Lin, R. Characterisation of genetic diversity and DNA fingerprinting of Australian chickpea (Cicer arietmum L.) cultivars using MFLP markers / R. Lin et al. // Australian journal of agricultural research. 2008. - Vol. 59. — P.707-713.

88. Lupins as crop plants: biology, production and utilization / Gladstones J.S., Atkins C.A., Hamblin J., eds. 1998. - P. 192.

89. MacPherson, J.M. Variability of the random amplified polymorphic DNA assay among thermal cyclers, and effects of primer and DNA concentration / J.M. MacPherson, P.E. Eckstein, A.A. Gajadhar // Molecular and cellular probes. -1993.-Vol. 7.-P. 293-299.

90. Meuneir, J.R. Factors affecting reproducibility of random amplified polymorphic DNA fingerprinting / J.R. Meuneir, P.A. Grimont // Research in microbiology. 1993. - Vol. 144. - P. 373-379.

91. Nelson, M.N. The first gene-based map of Lupinus angustifalius L.location of domestication genes and conserved synteny with Medicago truncatula 7 M:N. Nelson et al. // TAG Theoretical and applied genetics. 2006. - Vol. 113. - P 225238.

92. Pearl, H.M. Construction of a genetic map for Arabica coffee / H.M. Pearl et al. // Theoretical and applied genetics. 2004. - Vol. 108: - P. 829-835.

93. Penner, G.A. Reproducibiliy of random amplified polymorphic DNA (RAPD) analysis among laboratories / G.A. Penner et al.'// PCR methods and applications. -1993a.-Vol. 2.-P. 341-345.1. WO

94. Penner, G.A. Identification of a RAPD marker linked to the oat stem rust gene Pg3 / G.A. Penner et al. // TAG Theoretical and applied genetics. 1993b. - Vol. 85.-P. 702-705.

95. Pradhan, A. Development of DNA fingerprinting keys for the identification of radish cultivars / A. Pradhan, G. Yan, J.A. Plummer // Australian journal of experimental agriculture. 2004. - Vol. 44. - P. 95-102.

96. Prevost, A. A new system of comparing PCR primers applied to ISSR fingerprinting of potato cultivars / A. Prevost, M.J. Wilkinson // TAG Theoretical and applied genetics. 1999. - Vol. 98. - P. 107-112.

97. Qiu, J. Evaluating genetic diversity of white lupin using polymerase chain reaction based RAPD technology / J. Qiu, E. van Santen, S. Tuzun // VII International Lupin Conference, April 18-23, 1993. Evora, Portugal. P. 51-53.

98. Rafalski, J.A. Genetic diagnostics in plant breeding: RAPDs, microsatellites and machines / J.A. Rafalski, S.V. Tingey // Trends in genetics. 1993. - Vol. 9. - P. 275-280.

99. Rakoczy-Trojanowska, M. Characteristics and comparison of three classes of microsatellite-based markers and their application in plants / M. Rakoczy-Trojanowska, H. Bolibok // Cellular and molecular biology letters. 2004. - Vol. 9. -№2.-P. 221-238.

100. Reiter, R.S. Global and local genome mapping in Arabidopsis thaliana by using recombinant inbred lines and random amplified polymorphic DNAs / R.S. Reiter et al. // Proceedings of the national academy science. 1992. - Vol. 89. -P. 1477-1481.

101. Roy, A. Evaluation of genetic diversity in jute {Corchorus species) using STMS, ISSR and RAPD markers / A. Roy et al. // Plant breeding. 2006. - Vol. 125.-P. 292-297.

102. Saliba-Colombani, V. Efficiency of PFLP, RAPD and AFLP markers for the construction of an intraspecific map of the tomato genome / V. Saliba-Colombani, M. Causse, L. Gervais., J. Philouse // Genome. 2000. - Vol. 43. - P. 29-40.

103. Shan X. Convertion of AFLP markers to sequence-specific PCR markers in barley and weat / X. Shan, T.K. Blake, L.E. Talbert // TAG Theoretical and applied genetic. 1999. - Vol. 98. - P. 1072-1078.

104. Sica, M. ISSR markers show differentiation among Italian populations of Asparagus acutifolius L. / M. Sica et al. // BMC Genetics. 2005. - Vol. 6. - P. 6-17.

105. Southern, E.M. Detection of specific sequences among DNA fragments separated by gel electrophoresis / E.M., Southern // Journal of molecular biology. 1975. Vol. 98 -№. 3. - P. 503-517.

106. Steele, K.P. Phylogenetic analysis of tribes Trifolieae and Vicieae, based on sequences of the plastid gene matK (Papilionoideae: Leguminosae) / K.P. Steele, M.F. Wojciechowski // Advances in Legume Systematics / Eds K. KHtgaard, A.

107. Bruneau. Part 10, High Level Systematics. Royal Botanic Garden, Kew. 2003. P. 355-370.

108. Talhinhas, P. AFLP, ISSR, RAPD markers reveal high levels of genetic diversity among Lupinus spp. / P. Talhinhas, J. Neves-Martins, J. Leitao // Plant breeding. 2003. - Vol. 122. - P. 507-510.

109. Tautz, D. Hypervariability af simple sequences as a general source for polymorphic DNA / D. Tautz // Nucleic acids research. 1989. - Vol. 17. — P. 6463-6471.

110. Vos, P. AFLP: a new technique for DNA fingerprinting / P. Vos et al. // Nucleic acids research. 1995. - Vol. 23. - P. 4407-4414.

111. Waldron, J. Randomly amplified DNA fingerprinting: a culmination of DNA marker technologies based on arbitrarily-primed PCR amplification / J. Waldron et al. // Journal of biomedicine and biotechnology. 2002. - Vol. 2. - № 3. -P. 141-150.

112. Weber, J.L. Abundant class of human DNA polymorphism wich can be typed using the polymerase chain reaction / J.L. Weber, P.E. May // American journal of human-genetic. 1989. - Vol. 44. - P. 388-396.

113. Williams, J.G.K. DNA polymorphism amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers / J.G.K. Williams et al. // Nucleic acids research. 1990. - Vol. 18.-P. 6531-6535.

114. Wolko, B. Molecular markers in genetic studies of Lupinus genus / B. Wolko // Hodowla rolin aklimatizacia i nasiennictwo. 1995. - Vol. 39. - P. 3-64.

115. Wu, K. Detection of microsatellite polymorphisms without cloning / K. Wu, R. Jones, L. Dannederger, P.A. Scolnik // Nucleic acids research. 1994. - Vol. 22. -P. 3257-3258.

116. Yaish, M.W.F. Isolation of (GA)n microsatellite sequences and description of a predicted MADS-box sequence isolated from common bean / M.W.F. Yaish, M. Perez de la Vega // Genetics, molecular, biology. 2003. - Vol. 26. — P. 337-342.

117. You, M. A PCR-based molecular marker applicable for marker-assisted selection for anthracnose disease resistance in lupin breeding / M. You et al. // Cellular and molecular biology letters. 2005. - Vol. 10. - P. 123-134.

118. Yu, K. Optimization of PCR program for RAPD analysis / K. Yu., K.P. Pauls // Nucleic acids research. 1992. - Vol. 20. - P. 2606.