Особенности генетической изменчивости вируса Эбола в процессе адаптации к морским свинкам тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.00.03, кандидат биологических наук Субботина, Екатерина Леонидовна

• Субботина, Екатерина Леонидовна
• кандидат биологических наук
• 2009

Оглавление диссертации кандидат биологических наук Субботина, Екатерина Леонидовна

СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННЫХ СОКРАЩЕНИЙ.

ВВЕДЕНИЕ.

1 ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.

1.1 Семейство Filoviridae: общие сведения и классификация.

1.2 Клиническая и патогенетическая характеристика геморрагической лихорадки

Эбола.

1.3 Строение генома вируса Эбола.

1.4 Генетическое разнообразие, происхождение и эволюция вируса Эбола.

1.5 Структура вириона и свойства белков вируса Эбола.

1.6 Эпидемиологическая характеристика геморрагической лихорадки Эбола. Природные резервуары и переносчики.

1.7 Инфекция Эбола у лабораторных животных и получение адаптированных штаммов.

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Особенности генетической изменчивости вируса Эбола в процессе адаптации к морским свинкам»

Вирус Эбола (ВЭ) - это общее название группы вирусов, принадлежащих к роду Ebolavirus семейства Filoviridae. ВЭ был впервые выделен в 1976 году, когда одновременно на юге Судана и на севере Заира (Демократической Республики Конго) были зафиксированы первые эпидемические вспышки геморрагической лихорадки Эбола (Jonhson К.М., et al., 1977). На сегодняшний день род Ebolavirus, объединяет пять выделенных в различное время вида ВЭ: Zaire ebolavirus (ВЭ-Заир), Sudan ebolavirus (ВЭ-Судан), Ivory Coast ebolavirus (ВЭ-Берег Слоновой Кости), Reslon ebolavirus (ВЭ-Рестон), Bundibugyo ebolavirus (ВЭ-Бундибугио).

В Центральноафриканском регионе периодически регистрируются вспышки лихорадки Эбола, уровни летальности при которых значительно варьируют (http://www.who.int/rnediacentre/factsheets/fsl03/eri/indexl.htmn. Средства специфической терапии и профилактики лихорадки Эбола в настоящее время отсутствуют. Наиболее тяжелые случаи заболевания с высокой вероятностью летального исхода (до 88%), как правило, ассоциированы с ВЭ-Заир, в то время как заболевание, ассоциированное с ВЭ-Судан, характеризуется более низким процентом летальности (до 65%). ВЭ-Рестон, единственный азиатский вид ВЭ, будучи высоковирулентным для приматов, не проявляет патогенности для человека (Peters, С. et al., 1994; Feldmann, Н. et al., 1996).

Еще на начальных этапах изучения филовирусных геморрагических лихорадок возник вопрос о выявлении характерных особенностей (факторов), присущих вирусным штаммам, детерминирующих форму (от бессимптомной до острой) и клинический исход вызываемого ими заболевания. Знания о факторах патогенности позволило бы выявить ключевые стадии патогенеза, определяющие исход лихорадки Эбола, прогнозировать вероятный исход заболевания и с учетом данного прогноза выработать эффективные методы лечения. Кроме того, знания о факторах патогенности применимы в работах по созданию вакцинных и терапевтических препаратов.

В результате первых работ, не включающих генетический анализ ВЭ, пониженную вирулентность для человека ВЭ-Судан по сравнению с ВЭ-Заир связывали с обнаружением большого количества дефектных вирусных частиц при его размножении в культуре клеток и в организме хозяина (Ellis D.S. et al., 1978; Ellis D.S. et al., 1979; Bowen E.T. et al., 1980; McCormick J.B. et al., 1983). Позже были определены нуклеотидные последовательности геномов ВЭ-Заир, ВЭ-Судан и ВЭ-Рестон. Высокие уровни различий между геномами ВЭ (межвидовые различия при попарном сравнении составляли около 40%) не позволили связать конкретные особенности генетической структуры с патогенными свойствами ВЭ. Дальнейшее изучение генетического разнообразия ВЭ, частичное определение нуклеотидных последовательностей геномов штаммов и изолятов, выделенных в течение одной вспышки (в Габоне в 1996 г.) от больных с различными формами лихорадки Эбола (от бессимптомной до тяжелой, в том числе, закончившейся летально), также не привели к выявлению специфических генетических характеристик вируса, ассоциированных с той или иной формой лихорадки Эбола (Leroy Е. et al., 2002).

Было отмечено, что природные высоковирулентные для человека изоляты ВЭ проявляют низкую вирулентность для мышей и морских свинок (van der Groen G. et al., 1979; Bowen E.T. et al., 1980). Наблюдения, сделанные при попытках создания лабораторной модели для изучения геморрагической лихорадки Эбола, показали, что в процессе последовательных пассажей ВЭ на животных его вирулентность может возрастать. Данное явление было названо адаптацией ВЭ к новому хозяину. Экспериментальный подход на основе адаптации создает удобную модель для изучения изменяющихся патогенных свойств ВЭ.

С использованием данного подхода в различных лабораториях на основе ВЭ штамма Mayinga были получены несколько адаптированных к мышам и морским свинкам б вариантов и штаммов ВЭ (Чепурнов А.А., и др., 1995; Bray М. et al., 1996; Ryabchikova Е., et al. 1996; Conolly B.M et al., 1999). В результате определения нуклеотидных последовательностей геномов двух адаптированных штаммов ВЭ: для мышей (штамм MA) (Hart М.К., 2003) и морских свинок (штамм 8МС) (Volchkov V. et al., 2000), был выявлен ряд нуклеотидных замен (как значимых, так и синонимичных) по сравнению с геномом штамма Mayinga, которые затрагивали большую часть вирусных генов. Следовательно, для выявления генов и мутаций, потенциально ассоциированных с патогенностью, вновь потребовались более детальные эксперименты. С использованием методов обратной генетики было показано, что рост патогенности ВЭ для мышей обусловлен появлением пары точечных мутаций в генах NP и VP24 (Ebihara et al., 2006). Также было показано, что в сочетании с ними точечные мутации в генах VP35 и L могут усиливать патогенные свойства ВЭ (Ebihara et al., 2006).

Изучение изменчивости вирусного генома, сопровождающей его адаптацию к морским свинкам, и возможное выявление генов и мутаций, ассоциированных с ростом вирулентности ВЭ для данного вида лабораторных животных, позволило бы подтвердить значимость генов NP и VP24 для изменения патогенности ВЭ, либо выявить иные возможные механизмы изменения его вирулентности. С этой целью нами был выбран подход поэтапной генетической характеристики вариантов ВЭ, полученных при проведении последовательных селективных пассажей на морских свинках полученного на культуре клеток клона ВЭ.

Целью настоящего исследования являлось изучение генетической изменчивости вируса Эбола в процессе адаптации к морским свинкам. Задачами настоящего исследования являлись:

1. Адаптация вируса Эбола к морским свинкам: получение клона ВЭ в культуре клеток; проведение селективных пассажей полученного клона на морских свинках для достижения им высоковирулентных для этих животных свойств; анализ изменения 7 основных гематологических показателей, возникающих у животных в результате инфекции Эбола при проведении пассажей.

2. Генетический анализ исходного клона вируса Эбола, полученного в результате клонирования " в культуре клеток: определение полной нуклеотидной последовательности генома клона, сравнение полученной последовательности с последовательностями геномов штаммов вируса Эбола, доступными в базе данных GenBank; теоретическая оценка значимости выявленных нуклеотидных замен.

3. Генетический анализ адаптированного к морским свинкам варианта вируса Эбола: определение полной последовательности генома адаптированного варианта, сравнение полученной последовательности с последовательностями геномов клона-предшественника и штаммов вируса Эбола, доступными в базе данных GenBank; теоретическая оценка значимости выявленных нуклеотидных замен.

4. Анализ генетической изменчивости вируса Эбола в процессе его адаптации к морским свинкам: частичное определение нуклеотидных последовательностей геномов вариантов вируса Эбола, полученных на каждом пассаже; выявление корреляции возникновения нуклеотидных замен с ростом вирулентности ВЭ для морских свинок.

5. Теоретический анализ потенциального влияния аминокислотных замен, на структуру, термодинамическую стабильность и участки посттрансляционных модификаций вирусных белков. Теоретическая оценка влияния отбора на отдельные вирусные гены при проведении пассажей ВЭ на морских свинках.

Научная новизна работы. Впервые проведен поэтапный генетический и фенотипический анализ вариантов вируса Эбола, полученных в процессе адаптации его индивидуального клона к морским свинкам. Выявлены аминокислотные замены в вирусных белках NP (Asn->Ser566) и VP24 (Leu-^Pro147), возникновение которых сопровождалось проявлением вирусом Эбола способности вызывать летальное заболевание у морских свинок. Выявлены аминокислотные замены в вирусных белках VP24 (Met~>Ile71 и Arg-^Leu154) и L (VaI->Ile236), сопутствующие дальнейшему росту патогенности вируса Эбола для морских свинок. Впервые проведен теоретический анализ выведенных аминокислотных последовательностей белков NP, VP24 и L, вариантов вируса Эбола, полученных при пассажах, сопровождающихся ростом вирулентности вируса для морских свинок.

Практическая значимость работы. Рассчитаны и получены олигонуклеотидные праймеры для амплификации и определения последовательности нуклеотидных остатков штаммов ВЭ-Заир. Последовательность нуклеотидных остатков полноразмерного адаптированного к морским свинкам варианта вируса Эбола GPA-P7 задепонирована в базе данных GenBank под номером EU224440. Выявлены аминокислотные замены в вирусных белках, сопутствующие росту вирулентности вируса Эбола для морских свинок (гены VP24, NP и L). Результаты настоящего исследования вносят вклад как в изучение молекулярных основ патогенных свойств вируса Эбола, так и в определение роли белков VP24, NP и L в- патогенезе лихорадки Эбола. Гены VP24 и NP, содержащие аминокислотные остатки, определяющие вирулентность вируса Эбола для морских свинок, могут служить мишенями для генной терапии, а также использоваться в разработке вакцин против лихорадки Эбола.

Положения, выносимые на защиту.

1. В результате селективных пассажей индивидуального клона вируса Эбола на морских свинках вирус приобрел способность вызывать летальное заболевание у данного вида животных.

2. Охарактеризован процесс поэтапного возникновения мутаций в геноме вируса Эбола в ходе пассажей на морских свинках.

3. Выявлены аминокислотные замены в структуре вирусных белков NP, VP24 и L, сопутствующие росту уровня вирулентности вируса Эбола для морских свинок.

4. В результате теоретического анализа были выявлены аминокислотные замены, оказывающие потенциальное влияние на структуру и участки посттрансляционных модификаций вирусных белков.

Апробация работы. Результаты работы были представлены на следующих международных конференциях: "Joint Meeting of the 3 Divisions of the International Union of Microbiological Societies" (Сан-Франциско, 2005), "Проблемы инфекционной патологии в регионах Сибири, Дальнего Востока и Крайнего Севера" (Новосибирск, 2006). Публикации. По материалам диссертации опубликовано 3 статьи в рецензируемом издании (журнал «Вопросы вирусологии») и 5 сообщениях в сборниках трудов конференций.

Вклад автора. Результаты изложенных работ, за исключением проведения пассажей ВЭ на морских свинках, получены непосредственно автором. Клонирование вируса на культуре клеток и пассажи на животных проведены при участии автора в режиме «под руководством».

1 ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

Заключение диссертации по теме «Молекулярная биология», Субботина, Екатерина Леонидовна

6 выводы

1. Определена нуклеотидная последовательность генома индивидуального вирусного клона, полученного в результате клонирования вируса Эбола, принадлежащего к виду Zaire ebolavirus, штамм Заир, в культуре клеток Vero (preGPA-clone). В геноме preGPA-clone выявлены четыре значимые нуклеотидные замены в структуре гена NP по сравнению с геномом эталонного штамма Mayinga данного вида вируса Эбола.

2. Проведены семь селективных пассажей индивидуального клона вируса Эбола preGPA-clone на белых морских свинках породы Hartley. В результате семи пассажей вирус Эбола приобрел способность вызывать летальное заболевание у морских свинок.

3. Показано, что с ростом числа пассажей инфекция Эбола у морских свинок сопровождалась развитием лейкоцитоза. При этом количество нейтрофилов (как процентное, так и абсолютное) в популяции лейкоцитов крови возрастало, а количество лимфоцитов (процентное) и моноцитов (как процентное, так и абсолютное) - снижалось. На пятом-седьмом пассажах было выявлено значительное снижение фагоцитарной активности нейтрофилов крови. Шестой и седьмой пассажи сопровождались достоверным снижением числа тромбоцитов в крови.

4. Определена нуклеотидная последовательность генома варианта вируса Эбола, прошедшего семь пассажей на морских свинках (GPA-P7), а также фрагментов генома вариантов вируса, полученных на промежуточных пассажах. В геноме GPA-P7 выявлены семнадцать нуклеотидных замен по сравнению с геномом исходного клона preGPA-clone, в том числе восемь значимых, расположенных в генах NP, VP24 и L. Двенадцать из них, в том числе три значимых в последовательности гена NP, возникли в вирусном геноме на первом пассаже. Впервые показано, что возникновение пяти значимых нуклеотидных замен в последовательности генов NP (Asn-^Ser566), VP24

Met-Mle71, Leu->Pro147, Arg^Leu154) и L (Val^De236) коррелирует с ростом уровня летальности инфекции Эбола у морских свинок.

5. Теоретический анализ выведенных аминокислотных последовательностей белков NP, VP24 и L адаптированного к морским свинкам варианта вируса Эбола GPA-P7, показал: а) аминокислотные замены в структуре белков NP (Leu-*Pro544, Asn-^Ser566, Ser-»Pro598) и VP24 (Met-»Ile71, Leu-»Pro147 Arg^Leu154) могут приводить к значимым изменениям вероятной вторичной структуры указанных белков; б) аминокислотные замены в белке NP (Leu->Pro544, Asn->Ser566, Ser->Pro598, Arg^Lys525, Ser^Phe647), а также аминокислотная замена в белке L (Val^Ue236), могут изменять расположение участков фосфорилирования и гликозилирования данных белков; в) аминокислотная замена Met-Mle71 в структуре белка VP24 может увеличивать термодинамическую стабильность глобулярной структуры VP24; г) скорость накопления мутаций при пассажах вируса Эбола на морских свинках возросла для гена NP в 20 раз и для гена VP24 в 13 раз.

5 ЗАКЛЮЧЕНИЕ

С момента открытия ВЭ (в 1976 г.) и до настоящего времени вопрос о патогенетических механизмах, лежащих в основе высокой летальности при геморрагической лихорадке Эбола остается до конца не решенным. На основе данных современных исследований сформирована точка зрения о том, что данный инфекционный агент вызывает развитие неадекватных реакций защитных систем организма, включающих подавление активации дендритных клеток, индукцию апоптоза лимфоцитов, супрессию ИФН-зависимого иммунного ответа, а также чрезмерный выброс провоспалительных цитокинов и ФНО (явление, называемое «цитокиновым штормом»), что в конечном итоге приводит к развитию геморрагического синдрома, гиповолемического шока и смертельному исходу. Индукцию подобных неадекватных реакций ВЭ реализует благодаря своей способности неудержимо распространяться внутри восприимчивого организма, избегая элиминации иммунной системой и реплицируясь практически во всех типах клеток (за исключением клеток лимфоидного ряда). Известно, что вирулентность ВЭ-Заир для человека выше, чем вирулентность ВЭ-Судан, что выражается в различиях уровней летальности при вспышках геморрагической лихорадки Эбола среди людей. Из данного наблюдения следует, что уровень патогенности вируса Эбола определяется не только восприимчивостью организма-хозяина к данному инфекционному агенту, но и его собственными генетическими особенностями.

У лабораторных животных, таких, как мыши и морские свинки, ВЭ способен вызывать заболевание, не являющееся летальным. Однако при проведении нескольких последовательных селективных пассажей вируса на лабораторных животных, возможно возрастание его вирулентности и получение адаптированных к мышам и морским свинкам штаммов. Изучение данного явления дает возможность выявления генетических факторов,

134 ответственных за изменение вирулентности ВЭ, знание о которых вносит вклад в разрешение вопроса о механизмах патогенеза летальной лихорадки Эбола. На примере адаптированного к мышам BALB/c штамма ВЭ было показано, что всего две аминокислотные замены в белках NP и VP24 придают ВЭ способность вызывать летальное заболевание у мышей. Были также найдены нуклеотидные замены в генах VP30 и L (в том числе и синонимичные) вызывающие дальнейший рост вирулентных свойств ВЭ для мышей

С целью изучения генетической изменчивости ВЭ в процессе адаптации к морским свинкам, а также выявления возможных генетических факторов вирулентности ВЭ для данного вида животных, в рамках настоящей работы был применен подход поэтапного генетического анализа вирусных вариантов, получаемых в ходе пассажей индивидуального, генетически охарактеризованного клона ВЭ (preGPA-clone), и выявления возникающих в его геноме нуклеотидных замен, сопутствующих адаптации вируса к нетипичному хозяину и прогрессивному росту его вирулентности. При проведении селективных пассажей клона ВЭ preGPA-clone на морских свинках на первом пассаже в вирусном геноме фиксировались двенадцать нуклеотидных замен, вероятно, являющихся результатом адаптации вирусных систем транскрипции/репликации к молекулярному окружению, свойственному клеткам нетипичного хозяина. Первый летальный исход в результате инфекции Эбола был отмечен на третьем пассаже, что совпало с появлением в геноме части вирусных частиц двух точечных мутаций в белках NP (Asn->Ser566) и VP24 (Leu~>Pro147) Закрепление указанных мутаций в вирусной популяции привело к приобретению вирусом стабильных вирулентных для морских свинок свойств, возрастающих с последовательным появлением мутаций Leu->Pro147, Arg->Leu154 в белке VP24 и Val->Ile236 в белке L

Теоретическая оценка влияния мутаций на структуру, термодинамические свойства, а также сайты пострансляционных модификаций (О-гликозилирование и фосфорилирование) белков NP, VP24 и L, показала, что аминокислотные замены, найденные в последовательности белка VP24, могут приводить к формированию определенной вторичной данного белка, характерной и для других высоко патогенных для морских свинок штаммов (8МС и МА). Мутации в генах NP и L могут приводить к изменению расположения сайтов фосфорилирования и гликозилирования в указанных белках. Вследствие мутации Met^Ile71 в белке VP24 ожидается увеличение термодинамической стабильности белковой глобулы. Рассчитано, что в условиях проводимого эксперимента (введение вируса в организм нетипичного хозяина и проведение селективных пассажей) скорость накопления нуклеотидных замен в генах NP и VP24 возрастает в 20 и 13 раз, соответственно.

В результате анализа литературных и экспериментальных данных можно сделать вывод, что вирулентность ВЭ является мультифакторным признаком. Данное свойство объясняется использованием вирусом одновременно нескольких стратегий, позволяющих ему не только эффективно реплицироваться в клетках организма, распространяясь во все органы и системы, но и вызывать каскад цитокиновых реакций, приводящих к развитию геморрагического синдрома. Мутации в белках NP и L, входящих в состав полимеразного комплекса, осуществляющего процессы транскрипции и репликации вирусной РНК, а также синонимичные нуклеотидные замены и замены в нетранслируемых областях, вероятно, делают размножение вируса в молекулярном окружении, свойственном для цитоплазмы клеток нового хозяина, более эффективным. Кроме того, белок NP выполняет структурную функцию (защита вирусной РНК от деградации, формирования нуклеокапсида), следовательно, аминокислотные замены в N-концевой части белка NP (обнаруженные, например, у адаптированного к мышам штамма ВЭ) могут делать вирусную РНК более устойчивой, а процесс сборки вирусных частиц более эффективным. В недавних исследованиях появились сведения о том, что белок VP24 обладает функциями антагониста ИФН (Halfmann P. et al., 2005). Для адаптированного к мышам штамма ВЭ показано, что при наличие пары мутаций в генах NP и VP24, ВЭ приобретает способность преодолевать ИФН-зависимый ответ (Ebihara Н. Et al., 2006). Таким образом, мутации в белке VP24, обнаруженные у адаптированного к морским свинкам варианта GPA-P7, возможно, придают ему характерную вторичную структуру и могут быть связаны с функционированием VP24 в качестве антагониста ИФН.

Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Субботина, Екатерина Леонидовна, 2009 год

1. Ашмарин И.П., Воробьев JI.A. Статистические методы в микробиологических исследованиях. Ленинград, 1962.

2. Балуда В.П., Баркаган З.С., Гольдберг Е.Д., Кузник Б.И., Лакин К.М. Лабораторные методы исследования системы гемостаза,- Томск, 1980. С. 169-171, 216-217.

3. Белокриницкий Д.В., Дудкина Л.Н., Тарасова Л.Р. Теофиллиновый тест в оценке состояния клеточного иммунитета у детей с различным клиническим течением системной красной волчанки. // Лаб. дело. 1989. -N9. - С. 54-56.

4. Дадаева А. А., Сизикова Л. П., Чепурнов А. А. Функциональная активность перитонеальных макрофагов при экспериментальной лихорадке Эбола // Вестн. Росс. акад. мед наук. 2004. - №8. - С. 7 - 11.

5. Дадаева А.А., Сизикова Л.П., Бакулина Л.Ф., Чепурнов А.А. Исследование фагоцитарной способности полиморфноядерных лейкоцитов крови кроликов и морских свинок при введении вируса Эбола. // Вопр. вирусол. 1997. - Т.42. - N 2,- С. 56-59.

6. Деменков П.С., Аман Е.Э., Иванисенко В.А. Предсказание изменения термодинамической стабильности белков при одиночных аминокислотных заменах // В печати.

7. Загоруйко Н.Г. Прикладные методы анализа данных и знаний. Новосибирск: Изд-во Инта математики, 1999. С. 158-165

8. Иванов А.П., Ткаченко Е.А., ван дер Гроен Г., Бутенко A.M., Константинов O.K. Непрямой иммуноферментный метод для лабораторной диагностики геморрагических лихорадок Ласса и Эбола. //Вопр. вирусол. 1986. -N 2. - С. 186-190.

9. Игнатьев Г.М., Твердохлебов А.В., Калиберов С.А., Перебоева Л.А., Патрушева И.В., Кашенцева Е.А. Показатели иммунитета при заражении мышей различных линий вирусом Мачупо. //Вопр. вирусол. 1993. - Т.38, N4. - С.167-170.

10. П.Игнатьев Г.М., Чепурнов А.А., Прозоровский Н.С., Стрельцова М.А., Агафонов А.П. Влияние индуктора интерлейкина 2 диуцифона на течение геморрагической лихорадки, вызываемой вирусом Марбург. //Интерферон-92, М., 1992. - С. 160-164.

11. Рябчикова Е.И., Баранова С.Г., Ткачев В.К., Гражданцева А.А. Морфологические изменения при Эбола-инфекции у морских свинок. // Вопр. вирусол. 1993. - Т.38. - N4. -С.176-179.

12. Титенко А. М. Филовирусные геморрагичесие лихорадки: лихорадка Эбола // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунологии. 2002. - №5. - С. 116-122.

13. Устинова Е.Н., Шестопалов А.М., Бакулина Л.Ф., Чепурнов А.А. Титрование вирусов Эбола и Марбург по бляшкообразованию под полужидким агаровым покрытием. // Вопросы вирусологии. 2003. - Т. 48. - N 1. - С. 43-44.

14. Чепурнов А.А., Мерзликин Н.В., Рябчикова Е.И., Воробьева М.С. Получение очищенного вируса Эбола. //Вопр. вирусол. 1994. - Т.39. - N6. - С.254-257.

15. Чепурнов А.А., Чернухин И.В., Терновой В.А., Кудоярова Н.М., Махова Н.М., Азаев М.Ш., Смолина М.П. Попытка получения вакцины против лихорадки Эбола. // Вопр. вирусол,- 1995. Т.40. - N6.-C.257-260.

16. Adzhubei A.A., Sternberg M.J. Left-handed polyproline П helices commonly occur in globular proteins //JMol Biol. 1993. - Vol. 229(2). - P. 472-493.

17. Aman M. J., Bosio С. M., Panchal R. G. et al. Molecular mechanisms of filovirus cellular trafficking // Microbes Infect. 2003. - Vol. 5. - P. 639-649.

18. Ardouin С., Chevalier J.M., Algayres J.P. Less fevers hemorragiques virales de Marburg, Lassa et Ebola. //Med. Trop. Mars. -1981. Vol. 41. -P.191-199.

19. Badovinac V. P. & Harty J. T. Programming, demarcating, and manipulating CD8+ T-cell memory // Immunol. 2006. - Vol. 211. - P. 67-80.

20. Baize S, Leroy EM, Georges AJ, Georges-Courbot MC, Capron M, Bedjabaga I, Lansoud-Soukate J, Mavoungou E. Inflammatory responses in Ebola virus infected patients // Clin. Exp. Immunol. 2002. - Vol. 128. - P. 163-168 .

21. Baiter M. Emerging diseases. On the Trail of Ebola and Marburg Viruses // Science. 2000. -Vol. 290.-P. 923-925.

22. Baskerville A., Bowen E. T. W., Piatt G. S„ McArdell L. В., and Simpson D. I. H. The pathology of experimental Ebola virus infection in monkeys // J. Pathol. 1978. - Vol. 125. - P. 131-138

23. Baskerville A., Fisher-Hoch S. P., Neild G. H., and Dowsett A. B. Ultrastructural pathology of experimental Ebola haemorrhagic fever virus infection // J. Pathol. 1985. - Vol. 147. - P. 199209.

24. Basler C. F., Mikulasova A., Martinez-Sobrido L. et al. The Ebola virus VP35 protein inhibits activation of interferon regulatory factor 3 // J. Virol. 2003. - Vol. 77. - P. 7945-7956.

25. Basler C. F., Wang X., Muhlberger E., Volchkov V., Paragas J., Klenk H.-D., Garcia-Sastre A , and Palese P. The Ebola virus VP35 protein functions as a type 1 IFN antagonist // Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2000. - Vol. 97. - P. 12289-12294.

26. Becker, S., Spiess, M. & Klenk, H. D. The asialoglycoprotein receptor is a potential liverspecific receptor for Marburg virus // J. Gen. Virol. 1995. - Vol. 76. - P. 393-399.

27. Bergmann J.F. These pour le Doktorat en Medicine. Cochin, Port-Royal, 1981.

28. Bermejo M., Rodriguez-Teijeiro J.D., Illera G., Barroso A., Vila C., Walsh P.D. Ebola outbreak killed 5000 gorillas// Science -2006. Vol. 8; 314(5805). - P. 1564.

29. Biek R, Walsh P. D., Leroy E. M., and Real L. A. Recent Common Ancestry of Ebola Zaire Virus Found in a Bat Reservoir // PLoS. Pathog. 2006. - Vol. 2(10). - P. 0885-0886.

30. Blom N., Gammeltoft S., and Brunak S. Sequence- and structure-based prediction of eukaryotic protein phosphorylation sites // Journal of Molecular Biology. 1999. - Vol. 294(5). - P. 13511362.

31. Blom N., Sicheritz-Ponten Т., Gupta R., Gammeltoft S., Brunak S. Prediction of post-translational glycosylation and phosphorylation of proteins from the amino acid sequence. // Proteomics. 2004. - Vol.4(6). - P. 1633-1649.

32. Bobardt M.D., Saphire A.C., Hung H.C., Yu X., Van der Schueren В., Zhang Z., David G., Gallay P.A. Syndecan captures, protects, and transmits HIV to T lymphocytes // Immunity. -2003.-Vol. 18. P. 27-39.

33. Bowen E.T., Piatt G.S., Lloyd G., Raymond R.T., Simpson D.I. A comparative study of strains of Ebola virus isolated from southern Sudan and northern Zaire in 1976 // J. Med. Virol. 1980. -Vol. 6.-P. 129-138.

34. Bray M. The role of the type I interferon response in the resistance of mice to filovirus infection // J. Gen. Virol. 2001. - Vol. 82. -P. 1365-1373.

35. Bray M., Davis K., Geisbert Т., Schmal J., Huggins J. Mouse model for evaluation of Ebola prophylaxis and therapy. // Abstracts of International Colloqium "Ebola virus research". -Antwerp, Belgium, 4-7 Sep, 1996. P.83.

36. Bryson К, McGuffin L.J., Marsden R.L., Ward J J., Sodhi J.S. & Jones D.T. Protein structure prediction servers at University College London // Nucl. Acids Res. 2005. - Vol. 33. - P. W36-38.

37. Bukreyev A , Rollin P. E., Tate M K., Yang L., Zaki S. R., Shieh W.-J , Murphy В R., Collins P. L., and Sanchez A. Successful Topical Respiratory Tract Immunization of Primates against Ebola Virus//! Virol. 2007. - Vol. 81(12). - P. 6379-6388.

38. Chan S. Y., Ma M. C., Goldsmith M. A. Differential induction of cellular detachment by envelope glycoproteins of Marburg and Ebola Zaire viruses // J. Gen. Virol. 2000. - Vol. 81. -P. 2155-2159.

39. Chepurnov A. A., Tuzova M. N., Ternovoy V. A. et al. Suppressive effect of Ebola virus on T cell proliferation in vitro is provided by a 125-kDa GP viral protein // Immunol. Lett. 1999. -Vol. 68.-P. 257-61.

40. Chepurnov A.A., Chernukhin I.Y. Lethal for guinea pigs strain of Ebola virus provides generation of antibody that reacts with host endovascular cells. // Abstracts of 10th International Congress of Virology. Jerusalem, Israel, 11-16 Aug, 1996. -P.259.

41. Colebunders R. and Borchert M. Ebola haemorrhagic fever a review // J. Infect. - 2000. - Vol. 40.-P. 16-20.

42. Connolly B.M., Steele K.E., Davis K.J., Geisbert T.W., Kell W.M., Jaax N.K., Jahrling P.B. Pathogenesis of experimental Ebola virus infection in guinea pigs // J. Infect. Dis. 1999. - Vol. 179.-P. S203-S217.

43. Creamer T.P. Left-handed polyproline II helix formation is (very) locally driven. Proteins. 1998 Nov l;33(2):218-26.

44. Dessen A., Forest E., Volchkov V. et al. Crystallization and preliminary X-ray analysis of the matrix protein from Ebola virus // Acta Ciystallogr. D Biol. Ciystallogr. 2000b. - Vol. 56. - P. 758-760.

45. Dessen A., Volchkov V., Dolnik O. et al. Crystal structure of the matrix protein VP40 from Ebola virus // EMBO J. 2000. - Vol. 19. - P. 4228^1236.

46. Dolnik O., Volchkova V., Garten W. et al. Ectodomain shedding of the glycoprotein GP of Ebola virus//EMBO J. -2004.-Vol. 23.-P. 2175-2184.

47. Drake J.W. and Holland J.J. Mutation rates among RNA viruses // Procl. Natl. Acad. Sci. USA. -1999. Vol. 96(24). - P. 13910.

48. Ebihara H., Takada A, Kobasa D., Jones S., Neumann G., Theriault S., Bray M., Feldmann H., Kawaoka Y. Molecular determinants of Ebola virus virulence in mice // PLoS. Pathog. 2006. -Vol. 2(7).-P. e73.

49. Eckert D. M., Kim P. S. Mechanisms of viral membrane fusion and its inhibition // Annu. Rev. Biochem. -2001. Vol. 70. - P. 777-810.

50. Elliott L. H., Kiley M. P., McCormick J. B. Descriptive analysis of Ebola virus proteins // Virology.- 1985.-Vol. 147.N1.-P. 169-176.

51. Elliott L. H., Sanchez A., Holloway B. P. et al. Ebola protein analyses for the determination of genetic organization // Arch. Virol. 1993. - Vol. 133. - P.423-436.

52. Ellis D.S., Bowen E.T., Simpson D.I., Stamford S. Ebola virus: a comparison, at ultrastructural level, of the behaviour of the Sudan and Zaire strains in monkeys // Br. J. Exp. Pathol. 1978. -Vol. 59.-P. 584-593.

53. Ellis D.S., Stamford S., Lloyd G., Bowen E.T., Piatt G.S., Way H., Simpson D.I. Ebola and Marburg viruses: I. Some ultrastructural differences between strains when grown in Vero cells // J. Med. Virol. 1979. - Vol. 4. - P. 201-211.

54. Feldman H., Slenczka W., Klenk H.-D. Emerging and reemerging of filoviruses // Arch. Virol. -1996c.-Vol. 11.-P. 77-100.

55. Feldmann H., Bugany H., Mahner F., Klenk H. D., Drenckhahn D., and Schnittler H. J. Filovirus-induced endothelial leakage triggered by infected monocytes/macrophages // J. Virol. -1996,- Vol. 70. P. 2208-2214.

56. Feldmann H., Jones S., Klenk H. D. & Schnittler H. J. Ebola virus: from discovery to vaccine // Nature Rev. Immunol. 2003. - Vol. 3. - P. 677-685.

57. Feldmann H., Kiley M. P. Classification, structure, and replication of filoviruses // Curr. Top. Microbiol. Immunol. 1999. - Vol. 235 - P. 1-21.

58. Feldmann H., Nichol S. Т., Klenk, H. D. et al. Characterization of filoviruses based on differences in structure and antigenicity of the virion glycoprotein // Virology. 1994. - Vol. 199.-P. 469-473.

59. Feldmann H., Volchkov V. E., Volchkova V. A. et al. Biosynthesis and role of filoviral glycoproteins // J. Gen. Virol. 2001. - Vol 82. - P. 2839-2848.

60. Ferron F., Longhi S., Henrissat B. et al. Viral RNA-polymerases a predicted 2'-0-ribose methyltransferase domain shared by all Mononegavirales // Trends Biochem. Sci. - 2002. - Vol. 27.-P. 222-224.

61. Felsenstein J. Confidence limits on phylogenies: An approach using the bootstrap // Evolution. -1985,-Vol. 39. P. 783-791.

62. Freed E.O. Viral late domains // J. Virol. 2002. - Vol. 76. - P. 4679^1687.

63. Garoff H., Hewson R., Opstelten D. J. Virus maturation by budding // Microbiol. Mol. Biol. Rev. 1998. - Vol. 62. - P. 1171-1190.

64. Geisbert T.W., Hensley L.E., Gibb T.R., Steele K.E., JaaxN.K., Jahrling P.B. Apoptosis induced in vitro and in vivo during infection by Ebola and Marburg viruses // Lab. Invest. 2000. - Vol. 80.-P. 171-186.

65. Georges A.J., Gonzales J.P., Mathiot C.C. Epidemiological and epizoological investigations of Filoviruses in the Central African Republic. // Annu. Rep. Inst. Pasteur Bangui. 1989. - Vol.89, N 1. - P. 164.

66. Gibb T.R., Bray M., Geisbert T.W., Steele K.E., Kell W.M, et al. Pathogenesis of experimental Ebola Zaire virus infection in BALB/c mice // J. Сотр. Pathol. 2001. - Vol.125. - P. 233-242.

67. Gojobori Т., Moriyama E. N. & Kimura M. Molecular clock of viral evolution, and the neutral theory // Proceedings of the National Academy of Sciences, US. 1990. - Vol. 87. - P. 1001510018.

68. Gruber A.R., Lorenz R., Bernhart S.H., Neubock R., Hofacker I.L.The Vienna RNA Websuite // Nucleic Acids Res. 2008. - Vol. 36. - P. 70-74.

69. Gupta R. and Brunak S. Prediction of glycosylation across the human proteome and the correlation to protein function. Essays on the Pacific Symposium on Biocomputing. Lihue, 2002.-Vol. 7.-P. 310-322.

70. Gupta M., Mahanty S., Greer P., Towner J.S., Shieh W.J., Zaki S.R., Ahmed R., Rollin P.E. Persistent infection with Ebola virus under conditions of partial immunity // J. Virol. 2004. -Vol. 78.-P. 958-967.

71. Halfmann P., Kawaoka Y. Ebola VP24 inhibits type I interferon signaling // ХП1 International Congress of Virology. 2005, San Francisco, USA.

72. Han Z., Boshra H., Sunyer J. O. et al. Biochemical and functional characterization of the Ebola virus VP24 protein: implications for a role in virus assembly and budding // J. Virol. 2003. -Vol.77. - P. 1793-1800.

73. Haring J. S., Badovinac V. P. & Harty J. T. Inflaming the CD8+ T cell response // Immunity. -2006.-Vol. 25.-P. 19-29.

74. Hart M.K. Vaccine research efforts for filoviruses // Int. J. Parasitol. 2003. - Vol. 33. - P. 583595.

75. Hartlieb В., Modrof J., Muhlberger E. et al. Oligomerization of Ebola virus VP30 is essential for viral transcription and can be inhibited by a synthetic peptide // J. Biol. Chem. 2003. - Vol. 278.-P. 41830—41836.

76. Hercyk N., Horikami S. M., Moyer S. A. The vesicular stomatitis virus L protein possesses the mRNA methyltransferase activities // Virology. 1988. - Vol. 163. - P. 222-225.

77. Hevey M., Negley D., Pushko P., Smith J. & Schmaljohn A. Marburg virus vaccines based upon alphavirus replicons protect guinea pigs and nonhuman primates // Virology. 1998. - Vol. 251. -P. 28-37.

78. Hofacker I.L., Fekete M., Stadler P.F. Secondary Structure Prediction for Aligned RNA Sequences // J.Mol.Biol 2002. - Vol. 319. - P. 1059-1066.

79. Huang Y., Xu L., Sun Y. et al. The assembly of Ebola virus nucleocapsid requires virion-associated proteins 35 and 24 and posttranslational modification of nucleoprotein // Mol. Cell. -2002.-Vol. 10.-P. 307-316.

80. Hughes A.L., Nei M. Pattern of nucleotide substitution at major histocompatibility complex class I loci reveals overdominant selection // Nature. 1988. - Vol. 335(6186) - P. 167-170.

81. Ignatyev G. M. Immune response to filovirus infections // Curr. Top. Microbiol. Immunol. -1999.-Vol. 235.-P. 205-217.

82. Ito H., Watanabe S., Takada A. et al. Ebola virus glycoprotein: proteolytic processing, acylation, cell tropism, and detection of neutralizing antibodies // J. Virol. 2001. Vol. 75. - P. 1576-1580.

83. Jahrling P.B., Geisbert T.W., Jaax N.K., Hanes M.A., Ksiazek T.G., Peters C.J. Experimental infection of cynomolgus macaques with Ebola-Reston filoviruses from the 1989-1990 U.S. epizootic // Arch. Virol. Suppl. 1996. - Vol. 11,/ - P.l 15-134.

84. Jasenosky L. D., Neumann G., Lukashevich I. et al. Ebola virus VP40-induced particle formation and association with the lipid bilayer // J. Virol. 2001. - Vol. 75. - P. 5205-5214.

85. Johnson K.M., Lange J.V., Webb P.A., Murphy F.A. Isolation and partial characterisation of a new virus causing acute haemorrhagic fever in Zaire // Lancet. 1977. - Vol. 12,1(8011). - P. 569-571.

86. Jones D.T. Protein secondary structure prediction based on position-specific scoring matrices // J. Mol. Biol. 1999. - Vol. 292. - P. 195-202.

87. Julenius K., Malgaard A., Gupta R. and Brunak S. Prediction, conservation analysis and structural characterization of mammalian mucin-type O-glycosylation sites // Glycobiology. -2005,-Vol. 15.-P. 153-164.

88. Kimura M A simple method for estimating evolutionary rate of base substitutions through comparative studies of nucleotide sequences // Journal of Molecular Evolution. 1980. - Vol. 16.-P. 111-120.

89. Klenk H. D., Feldmann H., Volchkov, V. E. et al. Structure and function of the proteins of Marburg and Ebola viruses // SGM symposium 60: New challenges to health: the threat of virus infection. Cambridge University Press, 2001. - P. 233-245.

90. Kneller D. G., Cohen F. E. and Langridge R. Improvements in Protein Secondary Structure Prediction by an Enhanced Neural Network // J. Mol. Biol. 1990. - Vol. 214. - P. 171-182.

91. Knobloch J., Albiez E.J., Schmitz H. A serological survey on viral haemorrhagic fevers in Liberia.//Ann. Virol. -1982. Vol.133E. - P. 125-128.

92. Kurata, Т., Aoyama Y., Tsai T.F., Bauer S. and McCormic G. B. Disseminated infection of suckling mice with Edola vims. // Abstracts of 6th International Congress of Virology. Sendai, Japan, 1-7 Sep., 1984. -P 2-73, 269 (CDC Atlanta, Univ. Tokio).

93. Kyte J., Doolittle R.F. A simple method for displaying the hydropathic character of a protein//J. Mol. Biol. 1982. - Vol. 157. - P. 105-132.

94. Lahm S.A., Kombila M., Swanepoel R., Barnes R.F. Morbidity and mortality of wild animals in relation to outbreaks of Ebola haemorrhagic fever in Gabon, 1994-2003 // Trans. R. Soc. Trop. Med. Hyg. 2007. - Vol 101. - P. 64-78.

95. Leroy E. M. et al. Human asymptomatic Ebola infection and strong inflammatory response // Lancet. -2000. Vol. 355. - P. 2210-2215.

96. Leroy E.M., Kumulungui В., Pourrut X., Rouquet P., Hassanin A., Yaba P., ОёИса! A., Paweska J.T., Gonzalez J.P., Swanepoel R. Fmit bats as reservoirs of Ebola vims // Nature. -2005. Vol. 438. - P. 575-576.

97. Licata J. M., Johnson R. F., Han Z. et al. Contribution of ebola vims glycoprotein, nucleoprotein, and VP24 to budding of VP40 vims-like particles // J. Virol. 2004. - Vol.78. -P. 7344-7351.

98. Lofts L. L., Ibrahim M. S., Negley D. L., Hevey M. C., Schmaljohn A. L. Genomic differences between guinea pig lethal and nonlethal Marburg virus variants // J. Infect. Dis. -2007,-Vol. 15(196).-P. S305-S312.

99. Mahanty S., Hutchinson K., Agarwal S., McRae M., Rollin P.E., Pulendran B. Cutting edge: impairment of dendritic cells and adaptive immunity by Ebola and Lassa viruses // J. Immunol. -2003. Vol. 170. - P. 2797-2801.

100. McClelland J. L. and Rumelhart D. E. Explorations in Parallel Distributed Processing // MIT Press, Cambridge MA. 1988. - Vol. 3. - P. 318-362.

101. McCormick J.B., Bauer S.P., Elliott L.H., Webb P.A., Johnson K.M. Biologic differences between strains of Ebola virus from Zaire and Sudan // J. Infect. Dis. 1983. - Vol. 147. - P. 264-267.

102. McGuffin L.J., Bryson K., Jones D.T. The PSIPRED protein structure prediction server. // Bioinformatics. 2000. - Vol. 16. - P. 404-405.

103. Modrof J., Becker S., Muhlberger E. Ebola virus transcription activator VP30 is a zinc-binding protein // J. Virol. 2003. - Vol. 77. - P. 3334-3338.

104. Modrof J., Muhlberger E., Klenk H. D. et al. Phosphorylation of VP30 impairs Ebola virus transcription // J. Biol. Chem. 2002. - Vol. 277. - P. 33099-33104.

105. Mohamadzadeh M., Chen L., and Schmaljohn A.L. How Ebola and Marburg viruses battle the immune system // Nat. Rev. Immunol. 2007. - Vol.7 (7). - P. 556-567.

106. Mohamadzadeh M., Mohamadzadeh H., Brammer M., Sestak K. & Luftig R. B. Identification of proteases employed by dendritic cells in the processing of protein purified derivative (PPD) // J. Immune Based Ther. Vaccines. 2004. - Vol. 2. - P. 8.

107. Muhlberger E., Weik M., Volchkov V. E. et al. Comparison of the transcription and replication strategies of marburg virus and Ebola virus by using artificial replication systems // J. Virol. 1999. - Vol. 73. - P. 2333-2342.

108. Neumann G., Feldmann H., Watanabe S. Reverse Genetics Demonstrates that Proteolytic Processing of the Ebola Virus Glycoprotein Is Not Essential for Replication in Cell Culture // J. Virol. 2002. - Vol. 76. - P. 406-410.

109. Noda Т., Sagara H., Suzuki E. Ebola virus VP40 drives the formation of virus-like filamentous particles along with GP // J. Virol. 2002. - Vol. 76. - P. 4855^1865.

110. Pattyn S., van der Groen G., Courteille G., Jacob W., Piot P. Isolation of Marburg-like viais from a case of haemorrhagic fever in Zaire // Lancet. 1977. - Vol. 12. - P. 573-574

111. Peters C.J., Sanchez A., Feldmann A., Rollin P.E., Nichol S., Ksiazek T.G. Filoviruses as emerging pathogens// Semin. Virol. 1994. - Vol. 5. - P. 147-154.

112. Peterson A.T., Bauer J.T., Mills J.N. Ecologic and geographic distribution of filovirus disease // Emerg. Infect. Dis. 2004. - Vol. 10. - P. 40-47.

113. Pinzon J.E., Wilson J.M., Tucker С .J., Arthur R., Jahrling P.B., Formenty P. Trigger events: enviroclimatic coupling of Ebola hemorrhagic fever outbreaks // Am. J. Trop. Med. Hyg. 2004. -Vol. 71.-P. 664-674.

114. Pourrut X., Kumulungui В., Wittmann Т., Moussavou G., Delicat A., Yaba P., Nkoghe D., Gonzalez J.P., Leroy E.M. The natural history of Ebola vims in Africa // Microbes Infect. -2005. Vol. 7. - P. 1005-1014.

115. Reed D. S„ Hensley L. E., Geisbert J. В., Jahrling P. B. & Geisbert T. W. Depletion of peripheral blood T lymphocytes and NK cells during the course of Ebola hemorrhagic fever in cynomolgus macaques // Viral Immunol. 2004. - Vol. 17. - P. 390^400.

116. Reid S.P., Leung L.W., Hartman A.L., Martinez O., Shaw M L., Carbonnelle C., Volchkov V.E., Nichol S.T., Basler C.F. Ebola virus VP24 binds kaiyopherin al and blocks STAT1 nuclear accumulation // J. Virol. 2006. - Vol. 80. - P. 5156-5167.

117. Ruigrok R. W., Schoehn G., Dessen A. et al. Structural characterization and membrane binding properties of the matrix proteinVP40 of Ebola virus // J. Mol. Biol. 2000. - Vol. 300. -P. 103-112.

118. Ruthel G., Demmin G. L., Kallstrom G. et al. Association of ebola virus matrix protein VP40 with microtubules // J. Virol. 2005. - Vol. 79. - P. 4709-4719.

119. Ryabchikova, E. I., Kolesnikova, L. V. & Luchko, S. V. An analysis of features of pathogenesis in two animal models of Ebola virus infection. // J. Infect. Dis. 1999. - Vol. 179 (Suppl. 1). - P. 199-202.

120. Saez-Cirion A., Gomara M. J., Agirre A. et al. Pretransmembrane sequence of Ebola glycoprotein interfacial hydrophobicity distribution and interaction with membranes // FEBS Lett. 2002. - Vol. 533. - P. 47-53.

121. Saijo M., Niikura M., Morikawa S. et al. Enzyme-linked immunosorbent assays for detection of antibodies to Ebola and Marburg viruses using recombinant nucleoproteins // J. Clin. Microbiol. 2001. - Vol. 39. - P. 1-7.

122. Sanchez A., Khan A.S., Zaki S.R., Nabel G.J., Ksiazek T.G., and Peters С J. Filoviridae: Marburg and Ebola viruses // In D. M. Knipe and P. M. Howley (ed.). Fields virology. -Lippincott, Williams & Wilkins, Philadelphia, Pa. 2001. - P. 1279-1304.

123. Sanchez A., Kiley M. P., Holloway B. P. et al. Sequence analysis of the Ebola virus genome: organization, genetic elements, and comparison with the genome of Marburg virus // Virus Res. 1993. - Vol. 29. - P. 215-240.

124. Sanchez A., Trappier S. G., Mahy B. W. et al. The virion glycoprotein of Ebola viruses are encoded in two reading frames and are expressed through transcriptional editing // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1996. - Vol. 93. - P. 3602-3607.

125. Sanchez A., Yang Z. Y., Xu L. et al. Biochemical analysis of the secreted and virion glycoproteins of Ebola virus // J. Virol. 1998. - Vol. 72. - P. 6442-6447.

126. Sanger F., J. E. Donelson A. R. Coulson H. K. and D. Fischer. Use of DNA polymerase I primed by a synthetic oligonucleotide to determine a nucleotide sequence in phage fl DNA // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1973. - Vol. 70(4). - P. 1209.

127. Sanger F., Nicklen S., Coulson A. R. DNA sequencing with chain-terminating inhibitors // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1977. - Vol. 74(12). - P. 5463.

128. Sankararamakrishnan R., Vishveshwara S. Characterization of proline-containing alpha-helix (helix F model of bacteriorhodopsin) by molecular dynamics studies //Proteins. 1993. -Vol. 15(1).-P. 26-41.

129. Scianimanico S., Schoehn G., Timmins J. et al. Membrane association induces a conformational change in the Ebola virus matrix protein // EMBO J. 2000 - Vol. 19. - P. 6732-6741.

130. Simmons G., Wool-Lewis R. J., Baribaud F. et al. Ebola virus glycoproteins induce global surface protein down-modulation and loss of cell adherence // J. Virol. 2002. - Vol. 76. - P. 2518-2528.

131. Shackelton L.A., Parrish C.R., Truyen U., Holmes E.C. High rate of viral evolution associated with the emergence of carnivore parvovirus // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2005 -Vol. 102.-P. 379-384.

132. Sheridan I., Pybus O.G., Holmes E.C., Klenerman P. High-resolution phylogenetic analysis of hepatitis С virus adaptation and its relationship to disease progression // J. Virol. 2004,- Vol. 78.-P. 3447-3454.

133. Slenczka, W. G. The Marburg virus outbreak of 1967 and subsequent episodes. // Curr. Top. Microbiol. Immunol. 1999. - Vol. 235. - P. 49-75.

134. Sneath P.H.A., Sokal R.R. Numerical Taxonomy. Freeman, San Francisco, 1973, 673 p.

135. Soukate P. Debre, S. P. Fisher-Hoch, J. B. McCormick, and A. J. Georges.Defective humoral responses and extensive intravascular apoptosis are associated with fatal outcome in Ebola virus-infected patients // Nat. Med. 1999. - Vol. 5. - P. 423-426.

136. Sullivan N., Yang Z.-Y., and Nabel G. J. Ebola Virus Pathogenesis: Implications for Vaccines and Therapies // J. Virol. 2003. - Vol. 77(18). - P. 9733-9737.

137. Sundar K., Boesen A., Coico R. Computational prediction and identification of HLA-A2.1-specific Ebola virus CTL epitopes // Virology. 2007. - Vol 360. - P. 257-263.

138. Tajima F. Simple methods for testing the molecular evolutionary clock hypothesis // Genetics 1993.- Vol. 135(2). - P. 599-607.

139. Takada A., Feldmann H., Stroeher U. et al. Identification of protective epitopes on ebola virus glycoprotein at the single amino acid level by using recombinant vesicular stomatitis viruses // J. Virol. 2003. - Vol. 77. -P. 1069-1074.

140. Takada A., Watanabe S., Ito H.et al. Downregulation of betal integrins by Ebola virus glycoprotein: implication for virus entry // Virology. 2000. - Vol. 278. - P. 20-26.

141. Takezaki N., Rzhetsky A. & Nei M. Phylogenetic test of the molecular clock and linearized trees // Molecular Biology and Evolution. 2004. - Vol. 12. - P. 823-833.

142. Tamura К., Dudley J., Nei M. & Kumar S. MEGA4: Molecular Evolutionary Genetics Analysis (MEGA) software version 4.0 // Molecular Biology and Evolution. 2007. -10.1093/molbev/msm092.

143. Theriault S., Groseth A., Neumann G. et al. Rescue of Ebola virus from cDNA using heterologous support proteins // Virus Res. 2004. - Vol. 106. - P. 43-50.

144. Tignor G.H., Casals G., Shope RE. The yellow fever epidemic in Ethiopia, 1961-1962: retrospective serological evidence for concominant Ebola or Ebola-like virus infection. // Trans. Roy. Soc. Trop. Med. and Hyg. 1993. - Vol. 87, N 2. -P.162.

145. Villinger F., Rollin P. E., Brar S. S., Chikkala N. F., Winter J., Sundstrom J., Zaki S. R„ Swanepoel R., Ansari A., and Peters C. J. Markedly elevated levels of interferon (IFN)-gamma,

146. N-alpha, interleukin (IL)-2, IL-10, and tumor necrosis factor-alpha associated with fatal Ebola virus infection // J. Infect. Dis. 1999. - Vol. 179. - P. S188-S191.

147. Volchkov V. E., Becker S., Volchkova V. A. et al. GP mRNA of Ebola virus is edited by the Ebola virus polymerase and by T7 and vaccinia virus polymerases // Virology. 1995. - Vol. 214.-P. 421-430.

148. Volchkov V. E., Blinov V. M., Netesov S. V. The envelope glycoprotein of Ebola virus contains an immunosuppressive-like domain similar to oncogenic retroviruses // FEBS Lett. -1992. Vol. 305. -P. 181-184.

149. Volchkov V. E., Chepurnov A. A., Volchkova V. A. et al. Molecular characterization of guinea pig-adapted variants of Ebola virus // Virology. 2000. - Vol. 277. - P. 147-155.

150. Volchkov V. E., Feldmann H., Volchkova V. A. et al. Processing of the Ebola virus glycoprotein by the proprotein convertase furin // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1998. - Vol. 95. -P. 5762-5767.

151. Volchkov VE, Volchkova VA, Chepurnov AA, Blinov VM, Dolnik O, Netesov SV, Feldmann H. Characterization of the L gene and 5' trailer region of Ebola virus // J. Gen. Virol. -1999.-Vol. 80.-P. 355-362.

152. Volchkov V. E., Volchkova V. A., Muhlberger E. et al. Recovery of infectious Ebola virus from complementary DNA: RNA editing of the GP gene and viral cytotoxicity // Science. 2001. -Vol. 291.-P. 1965-1969.

153. Volchkov V. E., Volchkova V. A., Slenczka W. et al. Release of viral glycoproteins during Ebola virus infection // Virology. 1998b. - Vol. 245. - P. 110-119.

154. Volchkova V. A., Feldmann H., Klenk H. D. et al. The nonstructural small glycoprotein of Ebola virus is secreted as an antiparallel-orientated homodimer // Virology. 1998. - Vol. 250. -P. 408-414.

155. Volchkova V., Klenk H. D., Volchkov V. D-peptide is the carboxy-terminal cleavage fragment of the nonstructural small glycoprotein sGP of Ebola virus // Virology. 1999. - Vol. 265.-P. 164-171.

156. Wahl-Jensen V., Kurz S. K., Hazelton P. R. et al. Role of Ebola virus secreted glycoproteins and virus-like particles in activation of human macrophages // J. Virol. 2005. - Vol. 79. - P. 2413-2419.

157. Walsh P.D., Biek R., Real L.A. Wave-like spread of Ebola Zaire // PLoS Biol. 2005. -Vol. 3(11).-P. e371.

158. Watanabe S, Noda T, Kawaoka Y. Functional mapping of the nucleoprotein of Ebola virus //J. Virol. -2006. Vol. 80(8). - P. 3743-3751.

159. Watanabe S., Watanabe Т., Noda T. et al. Production of novel Ebola virus-like particles from cDNAs: an alternative to Ebola virus generation by reverse genetics // J. Virol. 2004. -Vol. 78.-P. 999-1005.

160. Weik M., Modrof J., Klenk H. D. et al. Ebola virus VP30-mediated transcription is regulated by RNA secondary structure formation // J. Virol. 2002. - Vol. 76. - P. 8532-8539.

161. Weissenhorn W., Carfi A., Lee К. H. et. al. Crystal structure of the Ebola virus membrane fusion subunit, GP2, from the envelope glycoprotein ectodomain //Mol. Cell. 1998. - Vol. 2. -P. 605-616.

162. Wilson J. A., Hevey M., Bakken R., Guest S., Bray M., Schmaljohn A. L., and Hart M. K. Epitopes involved in antibody-mediated protection from Ebola virus // Science. 2000. - Vol. 287.-P. 1664-1666.

163. Yang Z.Y., Delgado R., Xu L. et al. Distinct cellular interactions of secreted and transmembrane Ebola virus glycoproteins // Science. 1998. - Vol. 279. - P. 1034-1037.

164. Yang Z., Nielsen R., Goldman N., Pedersen A.M. Codon-substitution models for heterogeneous selection pressure at amino acid sites // Genetics. 2000. - Vol. 155. - P. 431449.

165. Zhang J., Rosenberg H.F. & Nei M. Positive Darwinian selection after gene duplication in primate ribonuclease genes //Proc. Nat. Acad. Sci. USA. 1998. - Vol. 95. - P. 3708-3713.