Оптимизация методов диагностики Helicobacter pylori-инфекции у больных хроническими воспалительными заболеваниями гепатобилиарной системы тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.02.03, кандидат наук Исаева, Гузель Шавхатовна

• Исаева, Гузель Шавхатовна
• кандидат наук
• 2013

Оглавление диссертации кандидат наук Исаева, Гузель Шавхатовна

ОГЛАВЛЕНИЕ

Стр.

ВВЕДЕНИЕ_ 6

Глава 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Общая характеристика бактерий рода Helicobacter_ 18

1.2. Биологические свойства Н.pylori_ 22

1.3. Эпидемиология H.pylori - инфекции_ 35

1.4. Устойчивость H.pylori к антибактериальным препаратам_ 38

1.5. Методы микробиологической диагностики H.pylori - инфекции_ 51

СОБСТВЕННЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ

Глава 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЙ

2.1. Общая характеристика клинических наблюдений_82

2.2. Методы исследований_86

2.2.1. Гистологический и иммуногистохимический

метод_86

2.2.2. Цитологический метод_90

2.2.3. Бактериологический метод_91

2.2.4. Молекулярный метод_96

2.2.5. Биохимический метод_109

2.2.6. Статистический метод_111

РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЙ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ

Глава 3. МОРФОЛОГИЧЕСКИЕ МЕТОДЫ ОБНАРУЖЕНИЯ Я. PYLORI У

БОЛЬНЫХ С ХРОНИЧЕСКИМИ ВОСПАЛИТЕЛЬНЫМИ

ЗАБОЛЕВАНИЯМИ ГЕПАТОБИЛИАРНОЙ СИСТЕМЫ

3.1. Изучение микробиоценоза билиарного тракта_113

3.2. Изучение степени обсемененности желчи различными микроорганизмами_ 124

3.3. Морфологические изменения желчного эпителия при хронических воспалительных заболеваниях гепатобилиарной системы_134

3.4. Микрофлора и морфологические изменения слизистой оболочки желудка у больных хроническим холециститом_143

Глава 4. ОБНАРУЖЕНИЕ Н.PYLORI У БОЛЬНЫХ ХРОНИЧЕСКИМИ ВОСПАЛИТЕЛЬНЫМИ ЗАБОЛЕВАНИЯМИ ГЕПАТОБИЛИАРНОЙ СИСТЕМЫ МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИМ МЕТОДОМ С ГЕНОТИПИРОВАНИЕМ ИЗОЛЯТОВ

4.1. Обнаружение Н.pylori в гепатобилиарной системе методом ПЦР _149

4.2. Определение генов патогенности изолятов H.pylori, выделенных от больных хроническими воспалительными заболеваниями гепатобилиарной системы_153

4.3. Частота встречаемости комбинаций генов патогенности Н. pylori_ 157

4.4. Распределение генотипов H.pylori в различных биотопах гепатобилиарной системы_162

4.5. Детекция энтерогепатических хеликобактеров в гепатобилиарной системе 165

Глава 5. ОБНАРУЖЕНИЕ Н.РУЮШ У БОЛЬНЫХ ХРОНИЧЕСКИМИ ВОСПАЛИТЕЛЬНЫМИ ЗАБОЛЕВАНИЯМИ ГЕПАТОБИЛИАРНОЙ СИСТЕМЫ БАКТЕРИОЛОГИЧЕСКИМ МЕТОДОМ.

МИКРОБИОЛОГИЧЕСКИЙ МОНИТОРИНГ ЗА Н.РУЬОШ - ИНФЕКЦИЕЙ В РЕСПУБЛИКЕ ТАТАРСТАН.

5.1. Выделение Н.ру1оп бактериологическим методом из желчи_167

5.2. Микробиологический мониторинг за распространенностью Н.ру1оп -инфекции в г.Казани_170

Глава 6. СОВЕРШЕНСТВОВАНИЕ ДИАГНОСТИКИ Н.PYLORI -ИНФЕКЦИИ

6.1.Разработка технологии тонкослойного культивирования Н.pylori на двухфазной питательной среде_ 175

6.2. Совершенствование цитологического метода диагностики Н.pylori -инфекции_ 177

6.3. Сравнение эффективности методов диагностики заболеваний гепатобилиарной системы, ассоциированных с H.pylori_ 184

6.3.1. Оценка цитологического метода_185

6.3.2. Оценка гистологического метода_186

б.З.З.Оценка бактериологического метода_188

6.3.4. Оценка молекулярно-генетического метода_190

6.3.5. Оценка биохимического метода_ 192

6.4. Алгоритм диагностики H.pylori- инфекции у больных с ХВЗ ГБС_196

ЗАКЛЮЧЕНИЕ_204

ВЫВОДЫ_238

ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ. СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

240 242

ВВЕДЕНИЕ Актуальность темы Болезни желчного пузыря и желчевыводящих путей составляют одну из важнейших медицинских и социальных проблем: во всем мире отмечается постоянный рост заболеваний гепатобилиарной системы. По данным эпидемиологических исследований, число больных с заболеваниями желчевыводящих путей вдвое превышает число лиц, страдающих язвенной болезнью желудка и 12-перстной кишки [33]. Хронический некалькулезный холецистит является одним из самых распространенных заболеваний не только среди болезней билиарного тракта, но и среди заболеваний органов пищеварения [14]. Хроническим калькулезным холециститом страдает до 10% взрослого населения развитых стран. Это заболевание можно отнести к болезням цивилизации. Из года в год растет количество операций на желчных путях, а также число послеоперационных осложнений, которые заставляют прибегать к повторным хирургическим вмешательствам и нередко приводят к стойкой потере трудоспособности больного.

Этиология заболеваний желчевыводящих путей до настоящего времени окончательно не установлена. Существует две теории патогенеза заболеваний билиарного тракта: инфекционная и метаболическая. В конце XIX и начале XX века были высказаны мнения, что этиологическим фактором, вызывающим воспаление желчных путей, могут быть различные микроорганизмы [19]. В 60-е годы XX века после работ Admirand W.H. и Small D.M. (1968) развитие получила метаболическая теория [40]. В 90-е годы на Западе стала доминировать концепция об асептическом механизме камнеобразования [85]. Для отечественных ученых была характерна точка зрения, объединяющая основные положения инфекционной и метаболической теорий [32]. В желчи больных с патологией билиарной системы обнаруживают патогенные (сальмонеллы, лептоспиры и др.) и условно-патогенные бактерии (кишечная палочка, клебсиеллы, протей,

энтеробактер, стафилококки, энтерококки и др.), вирус гепатита А, грибы рода Кандида, возбудители протозойных и глистных инвазий. В печати последних лет появились сообщения об обнаружении ДНК бактерий рода Helicobacter в органах гепатобилиарной системы[57; 87; 131; 140; 144; 154; 161; 231; 266; 327; 347; 391; 422; 489]. Роль Helicobacter pylori в развитии воспалительных заболеваний билиарной системы окончательно не изучена. Возможное участие H.pylori в патогенезе заболеваний гепатобилиарной системы подтверждают положительные результаты молекулярно-генетических, серологических исследований, выявление цитотоксического действия H.pylori на клеточные культуры гепатоцитов in vitro и в опытах in vivo на животных моделях [503]. Детекция ДНК H.pylori в образцах слизистой оболочки желчного пузыря при холециститах, холелитиазе и карциноме сочеталась с выявлением в тканях иммуногистохимическими методами, что доказывает возможность обитания этой бактерии в билиарном тракте [490]. Серологическое исследование, проведенное AnanievaD. с соавт. (2002), выявило достоверную разницу между уровнем антител к наружным протеинам H.pullorum, H.bilis, H.hepaticus, H.pylori у пациентов с хроническими заболеваниями печени и здоровых [45]. Исследования на тканевых печеночных культурах, зараженных хеликобактерами, показали присутствие цитотоксинов [441]. Двухлетнее изучение патогенного действия H.pylori на мышах линии C57BL/6, зараженных перорально, показало наличие сочетанного поражения слизистой оболочки желудка и печени в виде воспаления, фиброза, гиперплазии гепатоцитов [447] и развитие первичного билиарного цирроза [180]. Выявление корреляции между присутствием ДНК хеликобактеров и повышением клеточной пролиферации желчного эпителия демонстрирует высокую вероятность участия этих бактерий в генезе заболеваний билиарной системы [161].

Штаммы Н. pylori отличает большое разнообразие. Для клинических изолятов H.pylori, выявляемых у больных с гастродуоденальной патологией,

характерна выраженная генетическая гетерогенность в отношении факторов вирулентности - продуктов генов cagA, vacA, ЪаЪА2 [492]. При этом распределение генотипов Н. pylori в отношении генов патогенности в разных регионах мира различаются и имеют этно-географические особенности [492; 493]. Определение связи между генотипами Н. pylori и клиническими проявлениями у лиц, инфицированных определенными штаммами, представляет большой научный и практический интерес. Важность представлений о распределении генотипов H.pylori при различных заболеваниях может быть обусловлена следующими фактами: штаммы CagA оказывают более значимое воздействие на прогноз заболевания, чем штаммы без CagA [67; 109]; штаммы с типом VacA si чаще ассоциированы с заболеваниями желудка, чем штаммы VacAs2 [52]; BabA2 штаммы H.pylori строго связаны с язвенной болезнью двенадцатиперстной кишки и аденокарциномой в отличии от Vac As 1 и CagA штаммов, которые ассоциированы только с язвенной болезнью двенадцатиперстной кишки [167]; эффективность лечения также во многом зависит от генотипа H.pylori [465; 466]. Но если распределение генотипов H.pylori при различных заболеваниях желудка и 12-перстной кишки изучено достаточно полно, то вопрос о генотипах H.pylori, колонизирующих ткани печени и желчных путей, остается не изученным.

Следует заметить, что в большинстве опубликованных работ указывается на трудности получения чистой культуры хеликобактеров: сообщения об успешном выделении бактерий рода Helicobacter из печени и желчи единичны [117; 489]. Трудности бактериологического метода исследования могут быть обусловлены различными факторами. Возможно, что исследуемый материал (биоптаты печени, желчного пузыря, желчь) содержит ингибиторы роста хеликобактеров (желчные кислоты, ферменты и т.д.), либо это связано с недостатками технического исполнения (длительная транспортировка, замораживание образцов и т.д.), а также с особенностями

микроорганизмов (большинство энтерогепатических относятся к некультивируемым, и получение культуры возбудителя возможно только биологическим методом). Н.ру1оп - это очень прихотливый микроорганизм, чувствительный к любым изменениям окружающей среды, нуждающийся в создании комплекса условий, включающих определенную атмосферу, температуру культивирования и состав питательной среды. Недостатком способов выращивания на плотных питательных средах является невысокая эффективность высеваемости хеликобактеров при первичной изоляции, также при дальнейших пересевах для получения чистых культур штаммы теряются, всхожесть ослабевает и утрачивается, а скудность роста чистых культур приводит к невозможности определения чувствительности выделенного штамма к антибиотикам и химиопрепаратам. Проблему накопления культуры можно решить с помощью использования жидких сред, но к недостаткам культивирования на жидких питательных средах можно отнести сложность создания и поддержания микроаэрофильных условий в жидких питательных средах и необходимость использования дополнительного оборудования для принудительного введения углекислого газа. Поэтому возникает необходимость разработки новых технологий культивирования микроаэрофильных и капнофильных бактерий, доступных к применению в рутинной лабораторной практике.

Анатомо-функциональная взаимосвязь гепато-дуоденальной зоны является одной из причин общности патологических механизмов развития сочетанной патологии. Объединяющим фактором здесь может служить инфицирование Н.ру1оп, хотя патогенетические механизмы участия этого микроорганизма в развитии заболеваний гепатобилиарной системы пока не изучены. Потенциальная роль желчетолерантных хеликобактеров в генезе поражений печени и билиарного тракта может быть объяснена наличием определенных факторов патогенности этих возбудителей, запускающих каскад патологических процессов в гепатобилиарной системе, но их роль в

поражении эпителия желчного пузыря и гепатоцитов остается не выясненной. Отсутствие «золотого» стандарта микробиологического подтверждения об обнаружении хеликобактеров в тканях печени и желчного пузыря, желчи может оказывать сдерживающий эффект в исследованиях по изучению этиологической значимости этих бактерий в патогенезе заболеваний ГБС. Эта проблема требует совершенствования микробиологических методов диагностики H.pylori. Все вышесказанное объективно обосновывает необходимость оптимизации диагностики заболеваний, ассоциированных с H.pylori - инфекцией. Цель исследования: оптимизация методов диагностики Helicobacter pylori инфекции у больных хроническими воспалительными заболеваниями гепатобилиарной системы с разработкой новых биотехнологий культивирования и детекции микроаэрофильных и капнофильных бактерий рода Helicobacter.

В соответствии с этой целью были поставлены следующие задачи:

1. Изучить микробиоценозы различных биотопов желудочно-кишечного тракта (желудка, 12-перстной кишки и желчного пузыря) у больных хроническими воспалительными заболеваниями гепатобилиарной системы.

2. Определить частоту обнаружения H.pylori в органах гепатобилиарной системы и морфологические изменения слизистой оболочки желчного пузыря при H.pylori - инфекции.

3. Выявить частоту обнаружения H.pylori молекулярно-генетическими методами и изучить гены патогенности изолятов H.pylori, выделенных от больных с гепатобилиарной патологией.

4. Провести микробиологический мониторинг циркуляции H.pylori -инфекции с изучением динамики распространенности хеликобактериоза среди жителей г.Казани.

5. Усовершенствовать диагностику Н.pylori -инфекции путем разработки новых биотехнологий культивирования и детекции.

6. Разработать алгоритм комплексного исследования, направленного на выявление инфицирования H.pylori больных с гепатобилиарной патологией.

Научная новизна

Впервые выполнено одновременное изучение пристеночной микрофлоры слизистой оболочки желудка, 12- перстной кишки, желчного пузыря и желчных протоков с морфологической оценкой патологических изменений слизистых оболочек больных с воспалительными заболеваниями билиарного тракта и пациентов контрольной группы без гепатобилиарной патологии, что позволило оценить значение расстройств микробиоценозов биотопов гастродуоденальной зоны и билиарного тракта в развитии хронических воспалительных заболеваний гепатобилиарной системы. Выявлена высокая частота инфицирования органов гепатобилиарной системы H.pylori у больных хроническим некалькулезным холециститом и циррозом печени, ассоциированная с развитием патологических морфологических изменений, что дало возможность установить этиологическое значение этого микроорганизма в патогенезе хронических воспалительных заболеваний гепатобилиарной системы. Обнаружены закономерности колонизации различных биотопов микроорганизмами (бактериями, грибами простейшими) с определением частоты и степени обсемененности, что позволило продемонстрировать прямую связь гастродуоденального дисмикробиоценоза и микробохолии, а также верифицировать восходящий (дуоденогенный) путь инфицирования желчных путей.

Впервые в результате изучения генов патогенности изолятов H.pylori, выделенных из органов гепатобилиарной системы, определены

доминирующие генотипы, выявлены закономерности распределения Тох+ и Тох- генотипов при патологии гепатобилиарной системы. Обнаружены существенные различия генотипов H.pylori, выделенных из

гастродуоденальной зоны, желчного пузыря и печени, что позволило выявить феномен специфичной колонизации гепатобилиарного тракта штаммами хеликобактеров, отличных от изолятов, колонизирующих желудок или двенадцатиперстную кишку. Впервые получены новые данные о преимущественной роли cagA - негативных штаммов H.pylori, связанные с выявлением ранее неизученных сторон патогенеза хеликобактериоза, при этом показана роль данного микроорганизма в развитии хронических воспалительных заболеваний гепатобилиарной системы.

Установлена высокая частота распространенности H.pylori инфекции

в

среди жителей города Казани как среди детского, так и взрослого населения с тенденцией повышения инфицированности с возрастом и достижения в подростковом возрасте уровней инфицирования взрослых, что указывает на сохранение высоких степеней риска для этой популяции развития онкологических заболеваний желудочно-кишечного тракта и требует широкого внедрения скрининговых методов диагностики хеликобактериоза | и проведения своевременной эрадикационной терапии с целью первичной профилактики злокачественных новообразований.

Разработан оптимальный диагностический комплекс исследований для применения в условиях микробиологических лабораторий, который включает современные высокоэффективные микробиологические и молекулярно-генетические методы и отвечает актуальным требованиям технологии обследования пациентов с целью выявления возбудителя и назначения эрадикационной терапии. Создана комбинированная питательная среда для накопления бактерий рода Helicobacter, позволяющая облегчить идентификацию и постановку антибиотикограмм, а также разработан метод

окраски катионовым синим (О) основным для детекции H.pylori и выявления патоморфологических изменений.

Теоретическая значимость работы.

Исследования микробиоценозов различных биотопов желудочно-кишечного тракта (желудка, 12-перстной кишки и желчного пузыря) у больных хроническими воспалительными заболеваниями гепатобилиарной системы позволили установить связь дисбиотических нарушений с развитием патологических морфологических изменений в органах гепатобилиарной системы. Научно обоснована и разработана новая концепция этиологической и патогенетической роли Н. pylori в развитии хронических воспалительных заболеваний гепатобилиарной системы. Выявление закономерностей колонизации органов гепатобилиарной системы различными генетическими вариантами H.pylori позволило раскрыть ранее неизученные вопросы патогенеза хеликобактериоза и послужило основой для развития инфекционной теории роли микроорганизмов в патогенезе воспалительных заболеваний гепатобилиарной системы.

Практическая значимость исследования.

Выявлена корреляция патоморфологических изменений слизистой оболочки желчного эпителия с микробохолией, которая позволяет предположить значение микробной колонизации желчных путей в развитии хронического воспаления. При этом тяжесть морфологических изменений находится в прямой зависимости от колонизации H.pylori и степени обсемененности. Результаты, полученные в ходе исследования, подтверждают предположение о существовании желчетолерантных вариантов H.pylori, что указывает на необходимость коррекции

микробиоценозов желчевыводящих путей с помощью противомикробных и пробиотических препаратов.

Высокая частота распространенности Я./ту/оп-инфекции среди жителей города Казани как среди детского, так и взрослого населения указывает на необходимость проведения комплексных противоэпидемических и санитарно-гигиенических мероприятий по разрыву путей передачи инфекции, внедрения скрининговых малоинвазивных методов для наиболее полного выявления инфицированных и проведения эрадикационной терапии.

Для накопления культуры H.pylori рекомендован метод тонкослойного двухфазного культивирования, обладающий рядом преимуществ, а именно отсутствие необходимости использования дополнительного оборудования для поддержания микроаэрофильных условий в жидкой фазе среды, использование стандартных питательных сред (Колумбия агара и бульон Шедлера), накопление чистой культуры H.pylori в количестве, достаточном для морфологической, биохимической идентификации и постановки антибиотикограммы. Разработана биотехнология культивирования микроаэрофильных и капнофильных бактерий на двухфазной питательной среде, основанная на биологических особенностях хеликобактеров, которая создает условия роста и размножения, приближенные к естественным, когда часть жизненного цикла микроба требует плотной питательной среды, а другие стадии проходят в жидкой фазе, что свойственно эпителиальным патогенам, к которым относятся бактерии рода Helicobacter, размножающиеся пристеночно и в просвете органа.

Окраска катионовым синим О (основным) для цитологического метода диагностики H.pylori обеспечивает высокую контрастность микроорганизмов, а также позволяет оценить морфологические изменения окружающих тканей. Предложенный метод отличается быстротой, простотой, доступностью исполнения, воспроизводимостью полученных

результатов и может быть использован как для первичной диагностики if.^y/ои'-инфекции, так и для контроля эрадикационной терапии.

Разработан алгоритм комплексного обнаружения H.pylori у больных хроническими воспалительными заболеваниями гепатобилиарной системы. В качестве «золотого» стандарта детекции бактерий рода Helicobacter в органах гепатобилиарной системы предложена многоступенчатая полимеразно-цепная реакция, которая предусматривает проведение поэтапной генетической идентификации хеликобактеров. Основные положения, выносимые на защиту:

1. Нарушения микробиоценозов гастродуоденального и гепатобилиарного биотопов указывают на возможность развития сочетанной патологии.

2. H.pylori способен колонизировать органы гепатобилиарной системы, что подтверждено цитологическим, иммуногистохимическим, молекулярно-генетическим и бактериологическим методами, и может являться одним из этиологических факторов развития хронических воспалительных заболеваний гепатобилиарной системы и одним из факторов риска развития неоплазий желудочно-кишечного тракта.

3. Доминирующий генотип изолятов H.pylori, выделенных от больных хроническими воспалительными заболеваниями гепатобилиарной системы, представлен ureA+vacA+cagA-babA- подтипом.

4. Алгоритм обнаружения H.pylori, включающий морфологические, молекулярно-генетические, микробиологические исследования с использованием биотехнологических методов, позволяет оптимизировать диагностику H.pylori - инфекции у больных с гепатобилиарной патологией.

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Оптимизация методов диагностики Helicobacter pylori-инфекции у больных хроническими воспалительными заболеваниями гепатобилиарной системы»

Апробация работы.

Основные положения диссертации доложены на IX съезде Научного общества гастроэнтерологов России (Москва, 2009); XXII International

Workshop on Helicobacter and related bacteria in chronic digestive inflammation and gastric cancer (Porto, Portugal, 2009); GASTRO - 2009, UEGW/WCOG (The United European Gastroenterology Federation (UEGF) and the World Gastroenterology Organization (WGO) (London, 2009); международном форуме «Гастро-2010» (Санкт-Петербург, 2010); XXIII International Workshop on Helicobacter and related bacteria in chronic digestive inflammation and gastric cancer (Rotterdam, 2010); 8 Северо-Западной научной гастроэнтерологической сессии (С.-Петербург, 2011); XXV International Workshop on Helicobacter and related bacteria in chronic digestive inflammation and gastric cancer (Slovenia, 2012); 14 Международном Славяно-Балтийском научном форуме «Санкт-Петербург-Гастро-2012»; IV Всероссийском конгрессе по инфекционным болезням (Москва, 2012); X съезде Всероссийского общества эпидемиологов, микробиологов и паразитологов «Итоги и перспективы обеспечения эпидемиологического благополучия населения Российской Федерации» (Москва, 2012); III Международной научной онлайн-конференции "Актуальные проблемы биохимии и бионанотехнологии" (Казань, 2012). Результаты исследования были представлены на Всероссийском конкурсе научных работ «Инфекция H.pylori в России» (С.-Петербург, 2010), где была отмечена дипломом почетного участника; на II международном конкурсе научно-исследовательских работ «Инфекция Helicobacter pylori и дыхательная диагностика заболеваний и патологических состояний организма человека по выдыхаемому воздуху» (С.-Петербург, 2011); на III международном конкурсе научно-исследовательских работ «Диагностика заболеваний желудочно-кишечного тракта по выдыхаемому воздуху» (С.Петербург, 2012).

Внедрение результатов исследования.

Подана заявка на патент «Способ тонкослойного культивирования Helicobacter pylori и двухфазная питательная среда для его осуществления» (приоритетная справка №2012125394/10 от 20.06.2012) и получено

положительное заключение экспертизы.

Результаты исследования внедрены в лечебно-диагностическую работу эндоскопического центра и бактериологической лаборатории ГАУЗ «Республиканский клинический онкологический диспансер» МЗ Республики Татарстан (акт о внедрении от 5.06.2012); цитологической лаборатории ООО «Лечебно-диагностический центр «Фарм-Т» (г.Казань) (акт о внедрении от 3.04.2012г.). Полученные результаты внедрены в научно-исследовательскую работу научно-исследовательских лабораторий кафедр микробиологии и генетики Института фундаментальной медицины и биологии ФГАОУ ВПО «Казанский (Приволжский) Федеральный Университет» Министерства образования и науки РФ (акт о внедрении от 10.04.2012 г.); ООО «ГенДжин» (г.Казань) (акт о внедрении от 15.09. 2012 г.); лаборатории диагностики и профилактики инфекционных заболеваний ФБУН МИИЭМ им. Г.Н. Габричевского Роспотребнадзора РФ (акт о внедрении от 20.09 2012г.).

ГЛАВА 1 ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Общая характеристика бактерий рода Helicobacter

История открытия H.pylori связана с изучением этиологии и патогенеза гастрита и язвенной болезни. Впервые гипотеза об инфекционной природе этих заболеваний возникла в конце XIX - начале XX веков — с появления в печати первых сообщений об обнаружении спиралевидных бактерий у собак в 1874 году и у человека в 1906 году. Однако этиологическую роль этих бактерий в патогенезе заболеваний желудочно-кишечного тракта человека доказали только через сто лет австралийские исследователи B.J.Marchall и R.Warren в 1984 году, опубликовав сообщение об открытии и успешном культивировании новой бактерии, выделенной из биоптатов слизистой оболочки желудка у больных язвенной болезнью желудка и гастритом [296]. В 1985 году эти микроорганизмы были включены в международную таксономию под названием Campylobacter pyloridis. По ультраструктуре, набору жирных кислот, последовательности РНК эти бактерии отличались от кампилобактеров, и поэтому в 1989 году они были выделены в отдельный род Helicobacter [182]. Этот термин отражает два морфологических признака H.pylori'. in vivo они спиралевидные (helical), in vitro- палочковидные (bacter). В 2005 году за открытие роли H.pylori в патогенезе хронического гастрита и язвенной болезни ученым R.Warren и В.Marshal была вручена Нобелевская премия по физиологии и медицине [301].

Согласно Определителю бактерий Берджи Н. pylori относят к I роду Helicobacter семейства Helicobacteriaceae. Это семейство, включающее два рода Helicobacter и Wolinella, относится к I порядку Campylobacterales V класса Epsilonproteobacteria [164]. К роду Helicobacter в настоящее время отнесены двадцать три вида и два кандидата. Описано еще восемь видов хеликобактеров, которые в ближайшее время должны быть включены в этот

род. Список кандидатов на включение в состав рода Helicobacter постоянно пополняется новыми предложениями. Недавно опубликованы доклады о выделении новых видов: Я cynogastricus [463], H.callitrichis [483], H.equorum [333], Hansen и H.brantae [156].

В зависимости от занимаемой экологической ниши все хеликобактеры условно разделяют на «желудочные» и «внежелудочные». Дифференциальные признаки представлены в таблицах 1 и 2. «Желудочные» хеликобактеры колонизируют желудок человека и животных, уреазоположительные. Из них наиболее известными являются Я.pylori, H.heilmannii, H.felis, H.mustelae. «Внежелудочные» хеликобактеры составляют большую часть известных на сегодняшний день представителей этого рода. Эволюционно эти виды приобрели способность колонизировать слизистую оболочку кишечника, желчного пузыря, желчевыводящих путей, а также печень, поэтому иначе их называют энтерогепатическими. Некоторые из энтерогепатических хеликобактеров уреазоотрицательны и толеранты к действию желчи, что отличает их от «желудочных» хеликобактеров. Все известные виды этих бактерий колонизируют организм животных, но некоторые из них обнаружены у человека [157]. От человека изолированы H.hepaticus, H.cinaedi, H.fennelliae, H.canis, H.bilis, H.pullorum, H. canadensis, H.rappini и другие.

Таблица 1.

Дифференциальные свойства внежелудочных бактерий рода Helicobacter (по Fox J.G., 2002) [153].

Вид каталаза уреаза Восстановление нитритов Рост при 42° С Рост при 1% глицина Периплазматические фимбрии Количество жгутиков Расположение жгутиков Чувствительность к

Налидиксов ой кислоте (ЗОмг/диск) Цефалотину (ЗОмг/диск)

H.aurati + + — + — + От 7 до 10 биполярное S R

H.bilis + + + + + + От 3 до 14 биполярное R R

H.canadensis + — + + + — 2 биполярное R R

H.canis — — — + ND — 2 биполярное S I

H.cholecystus + — + + + — 2 биполярное I R

H.cinaedi + — + — + — От 1 до 2 биполярное S I

H.fennelliae + — — — + — 2 биполярное S S

H.hepaticus + + + — + — 2 биполярное R R

H.mesocricetorum + — + ND — — 2 биполярное S R

H.muridarum + + — — — + От 10 до 14 биполярное R R

H.pametensis + — + + + — 2 биполярное S S

H.pullorum + — + + ND — 1 монополяр. R S

H.rappini + + — + — + От 10 до 20 биполярное R R

H.rodentium + — + + + — 2 биполярное R R

H.trogontum + + + + ND + От 5до 7 биполярное R R

H.typhlonicus + — +/- + + — 1 биполярное S R

H.westmeadii + — + ND — 1 биполярное S R

H. winghamensis — — — — ND — От 1 до 2 биполярное S S

Условные обозначения: «+»- положительная реакция «—»- отрицательная реакция Б- чувствительные II - устойчивые I - умеренно устойчивые N0 - не детерминирован

Таблица 2.

Характеристика желудочных хеликобактеров (по Solnick J.V., Schauer D.B., 2001) [429].

Вид каталаза уреаза Восстановление нитритов Рост при 42° С Рост при 1% глицина Периплазматические фимбрии Количество жгутиков Расположение жгутиков Чувствительность к

Налидиксов ой кислоте (ЗОмг/диск) Цефалотину (ЗОмг/диск)

H.mustelae + + + + — - От 4 до 8 перитрих Э R

H.pylori + + - - - - От 4 до 8 биполярное К S

H.bizzozeronii + + + + - — 10-20 биполярное Л S

H.felis + + + + + + 14-20 биполярное я S

H.acinonychis + + - - - — 2-5 биполярное и S

H.nemestrinae + + - + - — От 4 до 8 биполярное я S

H.salomonis + + + — ND — 10-23 биполярное II S

H.suncus + + + ND ND — 2 биполярное я R

Условные обозначения: «+»- положительная реакция «—»- отрицательная реакция Б- чувствительные II - устойчивые I - умеренно устойчивые N0 - не детерминирован

1.2. Биологические свойства Helicobacter pylori

Морфология, физиология.

Н. pylori - это грамотрицательные неспорообразующие спиралевидной формы палочки длиной 2,2-5,0 мкм и диаметром 0,5-1 мкм с закругленными концами. Эти бактерии совершают стремительные движения за счет наличия на одном из полюсов от 2 до 6 жгутиков. В тканях Н. pylori имеет всегда типичную спиралевидную форму, но при культивировании может иметь бациллярную, с-образную форму [199], отличаясь полиморфизмом. Стареющие клетки культуры Н. pylori утрачивают типичную спиралевидную форму (тип 1) и переходят в кокковую (тип 2), что также может происходить при неблагоприятных условиях среды (изменение температуры или рН) или при антибиотикотерапии [480]. Кокковые формы 2 типа теряют ферментативные и репродуктивные свойства, что способствует их сохранению в кишечнике и в окружающей среде [63].

H.pylori - микроаэрофилы (оптимальная концентрация 02 3-15%) и капнофилы (оптимальная концентрация СО2 10-15%) [230]. Требовательны к

питательным средам, растут на средах, содержащих кровь или сыворотку. На кровяном или шоколадном агаре дают рост через 2-5 суток в виде мелких (диаметром 1-2 мм), влажных, прозрачных колоний. Некоторые штаммы проявляют гемолитическую активность (а-гемолиз). Оптимальная температура роста 37 °С. В качестве факторов роста и размножения Н. pylori нуждаются и в ряде готовых аминокислот, в частности в аргинине, гистидине, изолейцине, лейцине, метионине, фенилаланине, валине и серине. Они используют эти аминокислоты не только для синтеза белков, но и как основной источник энергии [293].

Каталазо- и оксидазоположительные, однако описаны каталаза-негативные мутанты [477]. В большом количестве выделяют уреазу, не разлагают углеводы. Тесты на образование H2S, восстановление нитратов в нитриты вариабельные. Выделяют щелочную фосфатазу, у-

глутамилтранспептидазу, лейцинаминопептидазу [276]. Для дифференцировки от бактерий семейства Campylobacteriaceae используют тесты на определение способности H.pylori расти в присутствии 2,3,5 -трифенилтетразолин хлорида (0,4 и 1 мг/л), селенита натрия (0,1%), глицина (1%); отсутствия роста в 8% растворе глюкозы и 3,5% хлорида натрия; чувствительности к цефалотину и устойчивости к налидиксовой кислоте [304].

Факторы патогенности.

H.pylori располагает широким набором факторов патогенности: адгезины, цитотоксины, ферменты агрессии, факторы, обеспечивающие защиту от бактерицидных систем макроорганизма и т.д.

Важнейшим фактором патогенности Н. pylori является его способность колонизировать эпителий желудка и метапластически измененный эпителий двенадцатиперстной кишки. Спиралевидная форма и наличие на одном полюсе жгутиков позволяет микроорганизму быстро передвигаться в толще слизи и проникать через межклеточные контакты. Жгутики Н. pylori представлены белками - флагеллинами FlaA и FlaB, кодируемыми генами flaA и flab[ 11]. Жгутики окружены мембрано-подобным чехлом, защищающим их от деполяризации при низких значениях pH желудка. Неподвижные штаммы Н. pylori, мутантные по генам flaA и flaB, не способны к колонизации эпителия [191].

Важным свойством бактерий является способность секретировать компоненты гликокаликса, что позволяет Н. pylori образовывать биопленку, что способствует колонизации эпителия и выживанию в неблагоприятных условиях [104]. Сплошное покрытие биопленкой слизистой оболочки желудка наблюдается у уреазо-положительных пациентов, тогда как у уреазоотрицательных такое покрытие составляет менее 2% поверхности [105].

Адгезия H.pylori к эпителиальным клеткам желудка, облегчающая доступ бактерии к питательным веществам и доставку эффекторных молекул, является важнейшим фактором патогенности. Некоторые поверхностные белки Hop (H.pylori outer membrane proteins) отнесены к факторам адгезии, например, HopQ, НорР, HopZ, они обеспечивает колонизацию и обсемененность слизистой оболочки желудка, однако их роль окончательно не установлена.

Рецепторами для Н. pylori являются молекулярные структуры, входящие в состав слизи: остатки сиаловых кислот, сульфогруппы гликопротеинов, гликолипидов, фосфолипидов и остатки фукозы льюисподобных антигенов, свойственных не только клеткам эпителия желудка, но и эритроцитам группы крови I (0) [49]. Показана также способность микроорганизма связываться с белками соединительной ткани, в частности с коллагеном, ламинином, витронектином и другими [11].

Белки Bab (blood group antigen-binding adhesion - адгезин, ассоциированный с группой крови), гены которых фаЬА и ЬаЬВ) присутствуют в виде нескольких аллелей [215], обуславливают адгезию H.pylori с системой антигенов Lewis на эпителиальных клетках желудка. In vitro было показано, что H.pylori специфически связывается со слизистой оболочкой желудка, и этот процесс регулируется фукозилированными антигенами этой группы. Предварительные доклады о том, что штаммы с высоким уровнем экспрессии ВаЬА определяют более серьезные повреждения слизистой и чаще ассоциированы с язвой желудка, чем с низким уровнем экспрессии или ¿^-отрицательные, в настоящее время не находят подтверждения [160], но в то же время генотипическое разнообразие генов ЬаЬА и ЬаЬВ может влиять на избирательность адгезии различных штаммов H.pylori [103].

У Н. pylori выявлены адгезины SabA (sialic acid binding adhesin, адгезин связывающий сиаловые кислоты), поддерживающие воспаление,

способствующие персистенции инфекции Н. pylori [215]. Yamaoko Y. et al. (2006) обнаружили ассоциацию OipA-положительных штаммов с дуоденальной язвой и нейтрофильной инфильтрацией, тогда как SabA генотип был ассоциирован с раком желудка, кишечной метаплазией, атрофией тела желудка [494]. К адгезинам Н. pylori также относят и гемагглютинин NLBH (neuraminyl lactose binding haemagglutinin, адгезин связывающий нейрамиллактозу), представляющий из себя белок (М.м. 3 кДа), влияющий на секрецию соляной кислоты париетальными клетками [358]; НраА - H.pylori adhesin А), представленный поверхностными липопротеинами AlpA и AlpB, обеспечивающих прикрепление бактерии к эпителию желудка [284]. В адгезии могут принимать участие и поверхностные белки H.pylori НР1188 и НР1430, не гомологичные прочим адгезинам, но имеющие функциональное сходство с ВаЬА [396].

Важным фактором патогенности H.pylori является способность к образованию уреазы. Она представлена Ni -зависимым ферментом, состоящим из субъединиц UreA (26.5 кДа) и UreB (60.3 кДа), которые образуют полную молекулу с М.м. 540 кДа. Уреаза, состоящая из субъединиц UreA, UreB, UreC, Urel, является собственно маркером инфекции Н. pylori и фактором защиты микроорганизма от действия соляной кислоты, обеспечивает длительное персистирование Н. pylori в желудке человека, усиливает воспалительные реакции посредством активации моноцитов, нейтрофилов, секреции цитокинов, образования свободных радикалов и окиси азота. Считается, что большая субъединица уреазы — UreB — действует как аттрактант для лейкоцитов. H.pylori производит огромное количество этого фермента, позволяющего нейтрализовать кислую среду и создать вокруг бактерии микроокружение - «облако» из аммиака [190]. Объём ее образования достигает 10-15% общего белка, синтезируемого H.pylori [320], кроме того она имеет наивысшую активность среди бактериальных уреаз [362]. От других уреазоположительных бактерий

H. pylori отличается образованием внеклеточной уреазы за счет аутолиза части клеток и адсорбции фермента на поверхности выживших бактерий. Будучи сильным антигеном уреаза связывает антитела, комплекс антиген -антитело удаляется с поверхности бактериальной клетки, тем самым защищая Н. pylori от лизиса [12]. Ведущая роль уреазы в колонизации слизистой оболочки желудка была доказана на животных моделях, когда уреазоотрицательные штаммы Н. pylori были не способны колонизировать эпителий желудка гнотобионтов даже после нейтрализации соляной кислотой.

Этот фермент имеет и другие важные функции. Уреаза действует на эпителиоциты как токсин: образующиеся ионы аммония способны разрушать плотные межклеточные контакты и повреждать эпителий. В частности, установлено его цитотоксическое действие на клетки эпителия желудка in vitro [142].

Уреаза также является индуктором острых и хронических клеточных ответов хозяина. Большая субъединица уреазы (UreB) стимулирует хемотаксис лейкоцитов. Взаимодействие аммиака с полиморфноядерными лейкоцитами стимулирует синтез миелопероксидазы, запускающей ряд биохимических реакций с образованием высокотоксичных продуктов (перекись водорода, хлорноватистая кислота, монохлорамин и других), оказывающее повреждающее действие на слизистую оболочку желудка [439].

Дополнительным механизмом развития воспалительного ответа, опосредованным через его медиаторы, является способность уреазы Н. pylori индуцировать агрегацию тромбоцитов, с последующим запуском метаболизма арахидоновых кислот по липоксигеназному пути [362]. Помимо уреазы в качестве обязательных факторов колонизации H.pylori рассматривают еще и гамма-глутамилтранспептидазу — ключевой фермент в метаболизме глутатиона [408].

Цитотоксичность - важнейший фактор патогенности Н. pylori. Последние исследования показывают, что Н. pylori непосредственно способствует повреждению эпителиальных клеток посредством выработки цитотоксинов VacA (vacuolating-associatted cytotoxirí) и CagA (cytotoxin-associated gene). Вакуолизирующий токсин кодируется геном vacA, существующем в двух аллельных вариантах. Уровень секреции вакуолизирующего токсина определяется мозаичной структурой vacA гена. Регион vacA s существует в двух аллельных типах: si и s2. В si идентифицированы подтипы: si a, sib, sic. Средний регион т существует в двух аллельных вариантах: ml и т2 [52]. Штаммы H.pylori, имеющие генотипы slml и slm2, обладают максимальным или средним уровнем секреции цитотоксина, тогда как штаммы s2m2 проявляют незначительную токсическую активность [107; 188].

Вакуолизирующий (VacA) токсин (полипептид с молекулярной массой 55 кД) стимулирует формирование вакуолей в клетках in vitro. In vivo он вызывает образование эрозий и язв [419]. Этот цитотоксин увеличивает проницаемость мембран по отношению к анионам, достоверно уменьшает скорость реэпителизации экспериментальных язв и пролиферацию эпителиоцитов за счет нарушения функции клетки, связанных с целостностью ее цитоскелета, пассивный транспорт мочевины через эпителиальные клетки желудка, влияет на выживание Н. pylori в клетках хозяина, снижает содержание АТФ в эпителиоцитах, стимулирует апоптоз клеток. При низких значениях pH неактивные додекамеры VacA распадаются на мономеры, при взаимодействии с фосфолипидными слоем восстанавливаются как гексамерные анион-селективные каналы. VacA изменяет работу протонных насосов и влияет на поток ионов, вызывая при этом накопление вакуолей в клетках, что приводит к атрофии слизистой желудка [165]. Возможно, что образующиеся вакуоли защищают H.pylori от бактерицидного действия лизосом, что способствует персистенции бактерии

[443]. VacA нарушает транспорт белков, увеличивает проницаемость мембран, повреждает цитоскелет, а также ингибирует опсонизацию бактерий, тем самым нарушая нормальное функционирование защитных механизмов на слизистой оболочке желудка. Кроме того, VacA стимулирует диффузию уреазы через эпителий, делая подслизистый слой доступным для действия фермента. Очищенный цитотоксин VacA ингибирует пролиферацию эпителиоцитов и уменьшает скорость заживления язв желудка у крыс [314; 315].

Белок CagA (120-140 кД) является маркером присутствия cag-PAI {Pathogenicity Island, остров патогенности). Размеры «острова патогенности» cag PAI у Н. pylori варьируют от 37 до 40 пар оснований [5]. Ген cagA кодирует белки IV секреторной системы H.pylori, функция которой состоит в транспортировке эффекторных молекул бактерии к эукариотическим клеткам [355]. За перенос CagA непосредственно в эпителиоциты отвечают продукты генов, входящих в состав «островка патогенности» cag-PAI, прикрепляясь к мукоциту, подобно действию «молекулярного шприца», они впрыскивают в клетку CagA-протеин. Внутри эпителиоцита CagA белок подвергается фосфорилированию, что приводит к изменению цитоскелета. Этот фосфорилированный белок изменяет активность цитокиновых генов, инициирующих мононуклеарные фагоциты и, таким образом, вызывает индукцию интерлейкина-lß— медиатора гипохлоргидрии. Как известно, гипохлоргидрия ведет к атрофии и через последовательные этапы — к канцерогенезу. С активностью фосфолированного CagA связывают транскрипцию ядерных генов, что объясняет высокую частоту возникновения рака желудка у людей инфицированных cagA-

положительными штаммами Н. pylori [101]. Также показана способность CagA инициировать синтез интерлейкина-8 [354]. Цитотоксин CagA, маркер «острова патогенности» Н. pylori, участвует в ремоделировании тканей, ангиогенезе, язвообразовании, развитии атрофии, в процессе деградации и

разрушения межклеточного матрикса и базальной мембраны, опухолевой инвазии и метастазировании посредством индукции комплекса иРА (urokinase-type plasminogen activator) и uPAR {urokinase-type plasminogen activator receptor) в раковые клетки в желудке, стимуляции выработки интерлейкина-8, способствует повышению активности антрального гастрита. Цитотоксины CagC, CagE, CagH стимулируют выработку интерлейкина-8, а CagF вовлечен в процесс распознавания и доставки CagA в каналы Т4СС (IV секреторной системы).

Описан белок IceA {Induced by contact with epithelium), кодируемый геном iceA. Он существует в двух аллельных вариантах: ice Al и iceA2. Предполагают, что iceAl является маркером язвенной болезни желудка. У больных, инфицированных штаммами H.pylori с генотипом IceAl, инфильтрация собственной пластинки слизистой оболочки желудка полиморфно-ядерными нейтрофилами выше, чем у инфицированных.

Наружный воспалительный белок OipA {outer inflammatory protein) поддерживает воспаление слизистой оболочки желудка, связан с секрецией интерлейкина-8 и интерлейкина-6, со степенью обсемененности Н pylori, выраженностью нейтрофильной инфильтрацией, с развитием интерстициальной метаплазии.

Описаны новые потенциальные факторы патогенности H.pylori, обнаруженные у штаммов, выделенных от больных с различными заболеваниями: белки наружной мембраны Отр26, ОтрЗО, Отрб и ген jph0562, кодирующий синтез липополисахарида клеточной [86]; ген jph0870, ответственный за синтез белка наружной мембраны [361]; ген пар А {neutrophil-activating protein), кодирующий синтез белка NapA - активатора окислительного стресса, способного индуцировать процесс освобождения свободных радикалов в нейтрофилах, что приводит к повреждению слизистой оболочки желудка. Гены jhp0870 и jhp0562 могут быть маркерами штаммов, ассоциированных с язвой желудка у детей. Бразильские

исследователи обнаружили высокую частоту встречаемости этих генов (80%) у инфицированных H.pylori детей, больных язвенной болезнью желудка, по сравнению с контрольной группой (30%) [361]. Lin Y.F. (2007) et al. выявили высокий уровень экспрессии фактора элонгации - EF-G (FusA), каталазы - Kat, субъединицы А уреазы - UreA в образцах, полученных от больных дуоденальной язвой, чем от больных раком желудка [277]. Новый липолитический энзим EstV вызывает деградацию слизистой оболочки и освобождение воспалительных и цитотоксических компонентов [399]. Ферменты агрессии позволяют подавлять иммунный ответ организма хозяина. Так, супероксиддисмутаза, кодируемая геном sod, и каталаза, кодируемая геном kat, катализируют реакцию превращения бактерицидных соединений кислорода, высвобождаемых активированными в результате инфекции нейтрофилами, в кислород и воду, являющиеся безвредными для микроба.

H.pylori продуцирует широкий набор ферментов: уреазу, цитохромоксидазу, каталазу, щелочную фосфотазу, алкогольдегидрогеназу, липазу, у- глутамилтранспептидазу, лейцинаминопептидазу, протеазы и липазы, но не выделяет сахаролитические ферменты. Метаболизм H.pylori обеспечивается энергией при разложении трикарбоновых кислот и аминокислот, но не углеводов. В ходе эволюции эта бактерия приобрела свойства, позволяющие ей выживать в неблагоприятных условиях окружающей среды. H.pylori способен изменять условия своего микроокружения. В условиях кислой среды «включается» мощная система ощелачивания - происходит выработка уреазы в огромных количествах, но при рН=8 происходит гибель бактерии, поэтому в условиях нейтральной среды H.pylori «включает» систему оксидазных ферментов, которые при окислении субстрата приводят к выделению ионов водорода, что сдвигает рН в кислую сторону. Окислительные ферменты не только закисляют микроокружение H.pylori, но и продуцируют активные формы кислорода,

повреждающие ткани слизистых оболочек. Таким образом, при рН ниже 6 токсический эффект оказывает уреаза, а при изменении рН в щелочную сторону (что часто возникает на фоне применения антисекреторных препаратов), повреждающее действие оказывают оксидазы [22]. Другим примером приспособительной реакции H.pylori может служить образование кокковидных форм. Эти инволюционные формы теряют активность уреазных ферментов, но сохраняют высокую активность окислительного метаболизма. F.F. She и соавт. (2003), изучив токсичность и инфекционную способность кокковидных форм в эксперименте на лабораторных животных (мышах), пришли к выводу, что, несмотря на снижение уреазной активности и токсичности по сравнению со спиралевидными формами, они сохраняют способность колонизировать клетки эпителия желудка и вызывать их повреждение [415]. Установлено, что кокковидные формы чаще встречаются при раке желудка, чем при язвенной болезни [91], и вызывают более раннюю трансформацию эпителиальных клеток [411].

Хорошо известно, что у бактерий гены, кодирующие факторы патогенности, как и многие другие гены, экспрессируются лишь при необходимости в их продуктах. Для переключения одного «образа жизни» на другой у бактерий существуют системы анализа условий среды обитания и выработки соответствующего сигнала, его передачи генетическим структурам и последовательного включения транскрипции и трансляции необходимой наследственной информации.

На уровне отдельной бактериальной клетки экспрессию генов патогенности одновременно регулируют несколько систем. Наиболее высоким уровнем регуляции вирулентности, вероятно, является феномен кооперативной чувствительности, или «чувства кворума» (<quorum sensing) [316]. Его смысл заключается в модификации физиологических функций бактерий в ответ на изменение их численности. Механизм реализации феномена кооперативной чувствительности заключается в продукции

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Исаева, Гузель Шавхатовна, 2013 год

ЛИТЕРАТУРА

1. Абузарова Э.Р. Особенности генотипов Helicobacter pylori и полиморфных локусов генотипов (IL-1 и IL10) у больных язвенной болезнью желудка и 12-перстной кишки. // Авт. дисс. к.б.н,- Казань. -2008.-23с.

2. Алиев М.А., Сейсембаев М.А., Адильгиреева Л.Х., Гусманов З.К., Аминова Г.П. Дуоденит при хирургических заболеваниях органов гепатопанкреатодуоденальной зоны. // Клин. хир. - 1990.- №9. - С.31-32.

3. Баженов Л.Г., Ходжаева Н.У., Садыков Р.А., Саидханов Б.А. Выделение Helicobacter pylori из желудочного сока. // Лаб. дело. — 1993. — №5. — С. 19-22.

4. Богомаз В.М. Микробиологическое исследование желчи при хроническом холецистите. // Рос. Журнал гастроэнтерол., гепатолог., колопроктолог. -2003. -Т.5. -№13. - С. 101.

5. Бондаренко В.М. «Острова патогенности» бактерий. // Журнал микробиологии, эпидемиологии, иммунологии. — 2001. — №4. — С.67-74.

6. Бондаренко В.М., Червинец В.М., Воробьев А.А. Роль персистирующих условно-патогенных бактерий в патогенезе язвенной болезни желудка и 12-перстной кишки. // Журнал микробиол., эпидемиол., иммун. - 2003. -№4 - С. 11-17.

7. Валеева Ю.В. Обнаружение Helocobacter pylori при хронических заболеваниях желчевыводящих путей. // Авт. дисс. к.м.н.- Уфа. - 2011. - 18с.

8. Веселов А.Я., Витебский Я.Д., Терещенко В.Н., Малышкин Н.В. Микрофлора желчи при некоторых неинфекционных заболеваниях органов пищеварения и ее чувствительность к антибиотикам. // Антибиотики. -1981.- т.26. - № 1. - С.65-69.

9. Герман С.В., Зыкова И.Е., Модестова А.В., Ермаков Н.В. Эпидемиологические особенности пилорической хеликобактерной инфекции в Москве. // Гигиена и санитария. - 2011. - №2, - С.44-48.

10. Грек Е.А. Роль хеликобактерной и лямблиозной инфекций в диагностике и лечении хронической крапивницы. // Эксп. клин гастроэнтнрол. - 2007. - №2. - С. 138-142.

11. Домарадский И.В. Вопросы патогенности Helicobacter pylori. // Эпидемиология и инфекционные болезни. — 2001. — №2. — С.45-47.

12. Домарадский И.В. Молекулярно-биологические основы изменчивости Helicobacter pylori. // Журн. микробиол., эпидемиол. и иммунолог. — 2002.—№3.—С.79-84.

13. Жебрун А.Б., Александрова В.А., Гончарова Л.Б. и др. Диагностика, профилактика и лечение заболеваний, ассоциированных с Helicobacter pylori -инфекцией. (Пособие для врачей). // Спб. - 2002.

14. Ильиченко А.А. Заболевания желчного пузыря и желчных путей. // Руководство для врачей. - 2006. - М:Анахарсис. - 500с.

15. Исаева Г.Ш., Абузарова Э.Р., Валеева Ю.В. и соавт. Helicobacter pylori у больных с заболеваниями гепатобилиарной системы. // Журнал микробиол., эпидемиол., иммун. - 2009. - №2. - С.96-101.

16. Казимирова А.А., Волосников Д.К., Бахарева Л.И. Микробиоценоз желудка при хроническом гастрите у детей. // Журнал микробиол., эпидемиол., иммун. - 2007. - №2. - С.71 -75.

17. Климанская Е.В., Возжаева Ф.С., Новикова А.В., Шевцова Г.В. Клинико-эпидемиологическое наблюдение при хроническом гастродоудените у детей, проживающих в условиях мегаполиса. // Российский журнал гастроэнтерологии, гепатологии и колопроктологии. -1997. - Том VII. - № 5 ( приложение N 4). - С. 193.

18. Комаров Ф.И. Руководство по гастроэнтерологии. М:Медицина. -1995. -Т.2.

19. Кончаловский М.П., Мясников A.JI. Желчекаменная болезнь. // М. -1959.-234с.

20. Кудрявцева JI.B. Состояние антибиотикорезистентности Helicobacter pylori в России. // Эксп. и клин. Гастроэнтерол. — 2003. — №3. — С.7.

21. Кудрявцева JI.B., Исаков В.А., Щербаков П.Л., Иваников И.О., Минаев В.И. Динамика резистентности штаммов Helicobacter pylori к антибиотикам у городского населения в России в 1996-1998 г.г. // В кн.: Helicobacter pylori: революция в гастроэнтерологии. Ивашкин В.Т., Мегро Ф., Лапина Т.Л. - Триада-Х, Москва. - 1999. - С.191-196.

22. Лазебник Л.Б., Морозов И.А., Ильиченко A.A., Хомерики С.Г. Проблемы и перспективы исследований инфекции Helicobacter pylori. II Экс. Клин. Гастроэнтерол. — 2006. — №2. — С.4-14.

23. Меджидов М.М., Темирханова З.У., Алиева Х.М. и др. Оценка питательной среды для выделения и культивирования Helicobacter pylori. И Журн. микробиол., эпидемиол., иммунол. - 2000. - №2. - С.25-29.

24. Момыналиев К.Т., Смирнова О.В., Челищева В.В. и др. Идентификация H.pylori в желчных камнях у детей. // Рос. журнал гастроэнтерологии, гепатологии, колопроктологии. - 2003. - №3(прил.19).

- С.17-20.

25. Мосолова Г.П., Щекотихина Ж.В., Матушанская Е.В. О практической ценности окраски цитологических препаратов катионовым синим. //Новости клинической цитологии России. - 2000. - Том 6 . - №1-2.

- С.39-42

26.Новикова Л.Д., Метальникова Г.А., Мальков П.Г. Экологические аспекты формирования хронического гастрита у детей. //Материалы V

сессии Российской группы по изучению Helicobacter pylori. - Омск. -1997. - С. 44-45.

27. Петров С.В., Райхлин Н.Т. Руководство по иммуногистохимической диагностике опухолей человека. - Казань. - Титул. - 2004. - 450с.

28. Пюрвеева К.В., Лапина Т.Л., Момыналиев К.Т., Кудрявцева Л.В., Говорун В.М., Ивашкин В.Т. Генотипирование в клинической практике ведения больных язвенной болезнью двенадцатиперстной кишки. // Рос. Журнал гастроэнтерол., гепатолог., колопроктол. - 2003. - №3. - Том XIII. - С.21-24.

29. Решетников О.В., Курилович С.А., Кротов С.А., Кротова В.А: Мониторинг инфекции, вызванной Helicobacter pylori, в Новосибирске. // Журнал микробиологии, эпидемиологии, иммунобиологии. - 2008. - №1. -С.99-100.

30. Сафонова Н.В., Жебрун А.Б. Гастрит, язвенная болезнь и хеликобактериоз. (Реком. для врачей). // Спб. - 1995.

31. Сигал М.З., Хайрутдинова Г.Н. Новый способ окраски цитологических препаратов для срочных исследований. // Лаб.дело. - 1991. - №1. - С.40-42.

32. Скуя Н.А. Хронические заболевания желчных путей. // Л. Медицина. -1972.-228с.

33. Скуя Н.А., Жихар Л.Ю. Эпидемиологические исследования по выявлению хронических заболеваний желчных путей. // Тер.архив. - 1984. -№1. - С.35-41.

34. Скуя Н.А., Межецка С.Э. Пролиферация кишечных бактерий в верхнем отделе кишечника при наличии синдрома правого подреберья. // Тер. арх. - 1988. - Т.60. - №2. - С.86-88.

35. Цуканов В.В., Грищенко Н.Н. Ассоциация Helicobacter pylori и хронического холецистита. // Эксп. и клин, гастроэнтерол. - 2003. - №6. -С.80-82.

36. Хайбулин Э.З., Джансугуров Л.Б., Музгаев А.В., Рафикова Ф.А., Шибанова А.И. Helicobacter pylori при заболеваниях желудочно-кишечного тракта. //Новости клинической цитологии России. - 2008. -Том 12. - №1-2. - С.26-29.

37. Abou El-Hoda М.М., Osman Н.М., Rasha M.M., Douidar N.L., Enany A.Y. Impact of Helicobacter pylori infection on the activities of urease and lipase enzymes in patients with giardiasis. // J. Egypt Public Health Assoc. -2007. - Vol.82(3-4). - P.273-82.

38. Adachi K., Kawamura A., Ono M., Masuzaki K., Takashima Т., Yuki M., Fujishiro H., Ishihara S. and Kinoshita Y. Comparative evaluation of urine-based and other minimally invasive methods for the diagnosis of Helicobacter pylori infection. // J. Gastroenterol. - 2002. - Vol.37. - P.703-708.

39. Adam R.D. The biology of Giardia spp. И Microbiol. Rev. - 1991. - Vol.55. -P.706-732.

40. Admirand W.H., Small D.M. The physicochemical basis of cholesterol gallstone formation in man. // J. Clin. Invest. - 1968. - Vol.47. - №5. - P.1043-1052.

41. Alemohammad M.M., Foley T.J., Cohen H. Detection of immunoglobulin G antibodies to Helicobacter pylori in urine by an enzyme immunoassay method. // J. Clin. Microbiol. - 1993. - Vol.31 -P.2174-2177.

42. Allen L.A. Modulating phagocyte activation the pros and cons of Helicobacter pylori virulence factors. // J. Exp. Med. - 2000. - Vol.l91(9). -P.1451-1454.

43. Allen L.A., Schlesinger L.S., Kang B. Virulent srains of Helicobacter pylori demonstrate delaed phagocytosis and stimulate homotypic phagosome fusion in macrophages. // J. Exp. Med. - 2000. - Vol.l91(9). - P.l 15-128.

44. Alm R.A., Ling L.S., Moir D.T., King B.L., Brown E.D., Doig P.C. et al. Genomic - sequence comparison of two unrelated isolates of the human gastric pathogen Helicobacter pylori. II Nature. - 1999. - Vol.397. - P.176-180.

45. Ananieva O., Nilsson I., Vorobjova T. et al. Immune responces to bile-tolerant Helicobacter species in patients with chronic liver diseases a randomized population group, and healthy blood donors. // Clin. Diag. Lab. Immun. - 2002. - Vol.9. - P.l 160-1164.

46. Annibale B., lahner E., Santucci A., Vaira D., Pasquali A., Seven C., Mini R., Figura N., Delle Fave G. CagA and VacA immunoblot markers of past Helicobacter pylori infection in atrophic body gastritis. // Helicobacter. - 2007.

- Vol.12.-P.23-30.

47. Ansorg R., Von Recklinghausen G., Pomarius R., Schmid E.N. Evaluation of techniques for isolation, subcultivation, and preservation of Helicobacter pylori. II J. Clin. Microb. — 1991. — Vol.29(l). — P.51-53.

48. Apostolov E, Al-Soud W.A., Nilsson I., Kornilovska I., Usenko V., Lyzogubov V., Gaydar Y., Wadstrom T., Ljungh A.

Helicobacter pylori and other Helicobacter species in gallbladder and liver of patients with chronic cholecystitis detected

by immunological and molecular methods. // Scand. J. Gastroenterol. - 2005. -Vol.40. -P.96-102.

49. Appelmelk B.J., Monteiro M.A., Martin S.L., Moran A.P., Vandenbroucke-Grauls C. M. Why Helicobacter pylori has Lewis antigens. // Trends Microbiol.

— 2000. — Vol.8(12). — P.565-70.

50. Arents N.L., Van Zwet A.A., Thijs J.C., Kooistra-Smid A.M., Van Slochteren K.R., Degener J.E., et al . The importance of vacA, cagA, and iceA

genotypes of Helicobacter pylori infection in peptic ulcer disease and gastroesophageal reflux disease. // Am. J. Gastroenterol. - 2001. - Vol.96. -P.2603-8.

51. Arismendi-Morillo G., Cardozo-Ramones V., Torres-Nava G., Romero-Amaro Z. Histopathological study of the presence of Helicobacter pylori-type bacteria in surgical specimens from patients with chronic cholecystitis. // Gastroenterol Hepatol. - 2011. - Vol.34(7). - P.449-453.

52. Atherton J.C., Cao P., Peek R.M.J., Tummuru M.K., Blaser M.J., Cover T.L. Mosaicium in vacuolating cytotoxin alleles of Helicobacter pylori. Association of specific vacA types with cytotoxin production and peptic ulceration. // J. Biol. Chem. — 1995. — Vol.28. — № 270(30). — P.17771-17777.

53. Atherton J.C., Peek R.M., Tham K.T., Cover T.L. and Blaser M.J. Clinical and pathological importance of heterogeneity in vacA, the vacuolating cytotoxin gene of Helicobacter pylori. II Gastroenterology. - 1997. - Vol.112. -P.92-99.

54. Atherton J.C., Peek R.M.. Quantitative culture of Helicobacter pylori in gastric antrum: association of bacterial density with duodenal ulcers status and infection with cagA positive bacterial strain, and negative association with serum IgG levels. // Am J Gastroenterol. - 1994. - Vol. 89. - P. 1322.

55. Atherton J.C., Tham K.T., Peek R.M.J., Cover T.L. and Blaser M.J. Density of Helicobacter pylori infection in vivo as assessed by quantitative culture and histology. // J. Infect. Dis. - 1996. - Vol.174. - P.552-556.

56. Auroux J., Lamarque D., Tankovic J., Benamouzig R., Mahe S., Chaumette M.T. and Delchier J.C. Comparison of quantifying Helicobacter pylori gastric infection by culture, histology and C13 urea breath test. // Gastroenterol. Clin. Biol. - 1998. - Vol.22. -P.407-412.

57. Avenaud P., Marais A., Monteiro L. et al. Detection of Helicobacter species in the liver of patients with and without primary liver carcinoma. // Cancer. -2000.-Vol.89.-P.1431-1439.

58. Azevedo N.F., Guimaraes N., Figueredo C. et al. A new model for the transmission of Helicobacter pylori: role of environmental reservoirs as gene pools to increase strain diversity. //Crit Rev Microbiol - 2007. - Vol.33. -P.157-169.

59. Bätaga S.M., Torna F., Mocan S., Bätaga T. Giardia lamblia and duodenal involvement. // Bacteriol. Virusol. Parazitol. Epidemiol. - 2004. - Vol.49(3-4). -P.145-50.

60. Bayerdorffer E., Oertel H., Lehn N., Kasper G., Mannes G.A., Sauerbruch T. and Stolte M. Topographic association between active gastritis and Campylobacter pylori colonisation. // J. Clin. Pathol. — 1989. — Vol.42. — P.834-839.

61. Beales I.L., Crabtree J.E., Scunes D., Covacci A. and Calam J. Antibodies to CagA protein are associated with gastric atrophy in Helicobacter pylori infection. // Eur. J. Gastroenterol. Hepatol. - 1996. - Vol.8. - P.645-649.

62. Beizer C., Stoof J., Beckwith C.S. et al. Differential regulation of urease activity in Helicobacter hepaticus and Helicobacter pylori. II Microbiol. - 2006. - Vol.l51(12). -P.3989-3995.

63. Benaissa M., Babin P., Quellard N., Pezennec L., Cenatiempo Y. and Fauchere J. L. Changes in Helicobacter pylori ultrastructure and antigens during conversion from the bacillary to the coccoid form. // Infect. Immun. — 1996. — Vol.64. —P.2331-2335.

64. Bengolea A.A., Negri A. La maladie du choledoque terminal. // Rev.Chir. -1947,-Vol.43.-P.64-70.

65. Berg D.E. Variabilité genomique de Helicobacter pylori: étendue, signification. // La lettre de l'infectiologue. - 1999. - Vol.3. - P.9-15.

66. Bina J.E., Alm R.A., UriaNickelsen M., Thomas S.R., Trust T.J. and Hancock R.E.W. Helicobacter pylori uptake and efflux: basis for intrinsic

susceptibility to antibiotics in vitro. // Antimicrob. Agents Chemother. — 2000. — Vol.44. — P.248-254.

67. Blaser M.J., Perez-Perez G.I., Kleanous H., Cover T.L., Peek R.M., Chyou P.H., Stemmermann G.N. and Nomura A. Infection with Helicobacter pylori strains possessing cagA is associated with an increased risk of developing adenocarcinoma of the stomach. // Cancer Res. - 1995. - Vol.55. - P.2111-2115.

68. Bockelmann U., Dorries H.H., Ayuso-Gabella M.N. et al. Quantitative PCR monitoring of antibiotic resistance genes and bacterial pathogens in three European artificial groundwater recharge systems. //Appl Environ Microbiol. -2009.-Vol.75.-P.154-163.

69. Bogdanos D.P., Vergani D. Bacteria and primary biliary cirrhosis. // Clin. Rev. allergy Immunol. - 2009. - Vol.36(l). - P.30-39.

70. Bohr U.R.M., Annibale B., Franceschi F. et al. Extragastric manifestations of Helicobacter pylori and other Helicobacters. II Helicobacter. - 2007. -Vol.l2(l). -P.45-53.

71. Bolek B.K., Salih B.A., Sander E. Genotyping of Helicobacter pylori strains from gastric biopsies by multiplex polymerase chain reaction. How advantageous is it? // Diagn. Microbiol. Infect. Dis. - 2007. - Vol.58. - P.574-580.

72. Boyanova L., Stancheva I., Todorov D., Kumanova R., Petrov S., Vladimirov B., Pehlivanov N., Mitova R., Chakarski I. and Churchev I. Comparison of three urease tests for detection of Helicobacter pylori in gastric biopsy specimens. // Eur. J. Gastroenterol. Hepatol. — 1996. — Vol.8. — P.911-914.

73. Brands-Heerma S., Van Vliet A.H.M., Kuipers E.J. et al. Genomic changes in Helicobacter pylori during chronic infection. // Gut. —2000. —Vol.47 (1). — P.18.

74. Bryner J.H., Ritchie A.E., Pollet L. et al. Experimental infection and abortion of pregnant guinea pigs with a unique spirillum-like bacterium isolated from aborted ovine fetuses. //Am J Vet Res. - 1987. - Vol.48. - P.91-97.

75. Buck G.E., Smith J.S. Medium supplementation for growth of Campylobacterpyloridis. II J. Clin. Microbiol. - 1987. - Vol.25. - P.597-599.

76. Bulajic M., Maisonneuve P., Schneider-Brachert W. et al. Helicobacter pylori and the risk of benign and malignant biliary tract disease. // Cancer. -2002. - Vol.95. - P.1946-1953.

77. Burgers R., Schneider-Brachert W., Reischl U. et al. //Helicobacterpylori in human oral cavity and stomach. //Eur J Oral Sei. -2008. - Vol.116- P.297-304.

78. Bury-Mone S., Kaakoush N.O., Asencio C., Megraud F., Thibonnier M., De Reuse H., Mendz G.L. Is Helicobacter pylori a true microaerophile? // Helicobacter. -2006. - Vol.11. -P.296-303.

79. Butcher G.P., Ryder S.D., Hughes S.J., Stewart M., Bird N., Haqqani M.T., Rhodes J.M. Use of an ammonia electrode for rapid quantification of Helicobacter pylori urease: its use in the endoscopy room and in the assessment of urease inhibition by bismuth subsalicylate. // Digestion. — 1992. — Vol.53. — P.142-148.

80. Cabrita J., Oleastro M., Matos R., Manhente A., Cabral J., Barros R., Lopes A.I., Ramalho P., Neves B.C., Guerreiro A.S. Features and trends in Helicobacter pylori antibiotic resistance in Lisbon area, Portugal (1990-1999). // J. Antimicrob. Chemother. — 2000. — Vol.46. — P. 1029-1031.

81. Caldwell M.T.P., McDermott M., Jazrawi S. et al. Helicobacter pylori infection increases following cholecystectomy. // J. Med. Sei. - 1995. - Vol.164. -P.52-55.

82. Camorlinga-Ponce M., Romo C., Gonzalez-Valencia G. et al. Topographical localisation of cagA positive and cagA negative Helicobacter pylori strains in

the gastric mucosa; an in situ hybridisation study. // J. Clin. Pathol. - 2004. -Vol.57.-P.822-828.

83. Camorlinga-Ponce M., Perez-Perez G., Gonzalez-Valencia G., Mendoza I., Peñaloza-Espinosa R., Ramos I., Kersulyte D., Reyes-Leon A., Romo C., Granados J., Muñoz L., Berg D.E., Torres J. Helicobacter pylori genotyping from American indigenous groups shows novel Amerindian vacA and cagA alleles and Asian, African and European admixture. //PLoS One. - 2011/ -Vol.6(ll).-e27212.

84. Capurso G., Carnuccio A., Lahner E., Panzuto F., Baccini F., Delle Fave G., Annibale B. Corpus predominant gastritis as a risk factor for false-negative 13C-urea breath test results. // Aliment. Pharmacol.Ther. - 2006. - Vol.24. - P. 14531460.

85. Carey M.C. Pathogenesis of gallstones. // Am.J. Surg. - 1993. - Vol.65. -№4. -P.410-419.

86. Carlsohn E., Nystrom J., Karlsson H. et al. Characterization of the outer membrane protein profile from disease-related Helicobacter pylori isolates by subcellular fractionation and Nano-LC FT-ICR MS analysis. // J. Proteome Res. - 2006. - Vol.5. - P.3197-31204.

87. Casswall T.H., Németh A., Nilsson I., Wadström T., Nilsson H.O. Helicobacter species DNA in liver and gastric tissues in children and adolescents with chronic liver disease. //Scand J Gastroenterol. - 2010. - Vol. 45(2). -P.160-167.

88. Cederbrant G., Kahlmeter G. and Ljungh A. Proposed mechanism for metronidazole resistance in Helicobacter pylori. // J. Antimicrob. Chemother. — 1992. — Vol.29. — P.l 15-120.

89. Cellini L., Allocati N., Piccolomini R., Di Campli E. et al. New plate medium for growth and detection of urease activity of Helicobacter pylori. II J. Clin. Microbiol. - 1992. - Vol.30. -P.1351-1353.

90. Cellini L., Grande R., Di Campli E. et al. Characterization of an Helicobacter pylori environmental strain. //J Appl Microbiol. - 2008. - Vol.105. -P.761-769.

91. Chan W.Y., Hui P.K., Leung K.M., Chow J., Kwok F., Neg C.S. Coccoid forms of Helicobacter pylori in the human stomach. // Am. J. Clin. Pathol. — 1994. — Vol. 102(4). — P.503-507.

92. Chang M.C., Chang Y.T., Sun C.T., Wu M.S., Wang H.P., Lin J.T. Quantitative correlation of Helicobacter pylori stool antigen (HpSA) test with C-13-urea breath test (C-13-UBT) by the updated Sydney grading system of gastritis. // Hepatogastroenterology. — 2002. — Vol.49. — P.576-579.

93. Chattopadhyay S., Patra R., Ramamurthy T., Chowdhury A., Santra A., Dhali G.K., Bhattacharya S.K., Berg D.E., Nair G.B., Mukhopadhyay A.K. Multiplex PCR assay for rapid detection and genotyping of Helicobacter pylori directly from biopsy specimens. // J. Clin. Microbiol. - 2004. - Vol.42. -P.2821-2824.

94. Chen W., Li D., Cannan R.J., Stubbs R.S. Common presence of Helicobacter DNA in the gallbladder of patients with gallstone diseases and controls. // Dig. Liver Dis. - 2003. - Vol.35. - P.237-243.

95. Chen D.F., Hu L., Yi P., Fang D.C. et al. H.pylori exist in the gallbladder mucosa of patients with chronic cholecystitis. // W. J. Gastroenterol. - 2007. -Vol.13, № 10. -P.1608-1611.

96. Chen D.F., Hu L., Yi P., Liu W.W., Fang D-Ch., Cao H. H.pylori are associated with chronic cholecystitis. // W. J. Gastroenterol. - 2007. - Vol.13, №7. - P.l 119-1122.

97. Chen D.F., Hu L., Yi P., Liu W.W., Fang D-Ch., Cao H. Helicobacter pylori damages human gallbladder epithelial cells in vitro. II W J Gastroenterol. - 2008. - Vol.14 (45). - P.6924-6928.

98. Chey W.D., Murthy U., Toskes P., Carpenter S., Laine L. The 13C-urea blood test accurately detects active Helicobacter pylori infection: a United States, multicenter trial. // Am. J. Gastroenterol. — 1999. — Vol.94. — P. 15221524.

99. Chisholm S.A., Owen R.J., Teare E.L., Saverymuttu S. PCR-based diagnosis of Helicobacter pylori infection and real-time determination of clarithromycin resistance directly from human gastric biopsy samples. // J. Clin. Microbiol. -2001.- Vol.39.-P.1217-1220.

100. Chong S.K.F., Lou Q.Y., Fitzgerald J.F. and Lee C.H. Evaluation of 16S rRNA gene PCR with primers Hpl and Hp2 for detection of Helicobacter pylori. II J. Clin. Microbiol. - 1996. - Vol.34. - P.2728-2730.

101. Chow W.H., Blaser M.J., Blot W.J. et al. An inverse relation between cagA strains of Helicobacter pylori infection and risk of esophageal and gastric cardia adenocarcinomas. // Cancer Res. — 1998. — Vol.58. — P.588-590.

102. Clayton C., Kleanthous K., Tabaqchali S. Detection and identification of Helicobacter pylori by the polymerase chain reaction. // J. Clin. Pathol. -1991.-Vol.44.-P.515-516.

103. Colbeck J.C., Hansen I.M., Fong J.M. et al. Genotypic profile of the outer membrane proteins BabA and BabB in clinical isolates of Helicobacter pylori. II Infect, immune. - 2006. - Vol.74. - P.4375-4378.

104. Cole S.P., Harwood J., Lee R. et al. Characterization of monospecies biofilm formation by Helicobacter pylori. II J. of Bacteriology. — 2003. — Vol.186 (10). — P.3124-3132.

105. Coticchia J.M., Sugawa C,. Tran V.R. et al. Presence and density of Helicobacter pylori biofilms in human gastric mucosa in patients with peptic ulcer disease. //J. Gastrointest Surg. - 2006. - Vol.10. - P.883-889.

106. Coudron P.E., Stratton C.W. Factors affecting growth and susceptibility testing of Helicobacter pylori in liquid media. // J. Clin. Microbiol. - 1995. - Vol.33. - P.1028-1030.

107. Cover T.L., Blaser M.J. Purification and characterization of the vacuolating toxin from Helicobacter pylori. II J. Biol. Chem. — 1992. — Vol.267. —P.10570-10575.

108. Cover T.L., Dooley C.P., Blaser M.J. Characterization of human serologic response to proteins in Helicobacter pylori broth culture supernatants with vacuolizing cytotoxin activity. // Infect. Immun. - 1990. - Vol.58. - P.603-610.

109. Cover T.L., Glupczynski Y., Lage A.P., Burette A., Tummuru M.K., Perez-Perez G.I., Blaser M.J. Serologic detection of infection with cagA+ Helicobacter pylori strains. // J. Clin. Microbiol. - 1995. - Vol.33. - P.1496-1500.

110. Cuccherini B., Chua K., Gill V. et al. Bacteremia and skin/bone infections in two patients with X-linked agammaglobulinemia caused by an unusual organism related to Flexispira/Helicobacter species. II Clin Immunol. -2000.- Vol.97. -P.121-129.

111. Cutler A.F., Toskes P. Comparison of [13C]urea blood test to [13C]urea breath test for the diagnosis of Helicobacter pylori. II Am. J. Gastroenterol. — 1999. — Vol.94. — P.959-961.

112. Dailidiene D., Bertoli M.T., Miciuleviciene J., Mukhopadhyay A.K., Dailide G., Pascasio M.A., Kupcinskas L., Berg D.E. Emergence of tetracycline resistance in Helicobacter pylori: multiple mutational changes in 16S ribosomal DNA and other genetic loci. // Antimicrob. Agents Chemother. — 2002. — Vol.46. — P.3940-3946.

113. Daugule I., Rumba I., Engstrand L., Ejderhamn J. Infection with cagA-positive and cagA-negative types of Helicobacter pylori among children

and adolescents with gastrointestinal symptoms in Latvia. // Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. - 2003. - Vol.22. - P.622-624.

114. De Francesco V., Margiotta M., Zulla A. et al. Clarithromicyn resistance and Helicobacter pylori genotypes in Italy. // J. Microbiol. - 2006. -Vol.28.-P.6-13.

115. De Francesco V., Margiotta M., Zulla A. et al. Prevalence of primary clarithromycin resistance in Helicobacter pylori strains over 15 year period in Italy. // J. Antimicrob Chemother. - 2007. - Vol.59. - P.783-785.

116. De Jong D., Van der Hülst R.W.M., Pals G., Van Dijk W.C., Van der Ende A., Tytgat G.N.J., Taal B.G., Boot H. Gastric non-Hodgkin lymphomas of mucosa-associated lymphoid tissue are not associated with more aggressive Helicobacter pylori strains as identified by CagA. // Am. J. Clin. Pathol. - 1996. -Vol.106. -P.670-675.

117. De Magalhaes Queiroz D.M., Santos A. Isolation of a Helicobacter strain from the human liver. // Gastroenterology. - 2001. - Vol.121. - P.1023-1024.

118. De Reuse H., Labigne A., Mengin-Lecreulx D. The Helicobacter pylori ureC gene codes for a phosphoglucosamine mutase. // J. Bacteriol. -1997. - Vol.179. - P.3488-3493.

119. Debongnie J.C., Beyaert C., Legros G. Touch cytology, a useful diagnostic method for diagnosis of upper gastrointestinal tract infections. // Dig. Dis. Sei. - 1989. - Vol.34. - P.1025-1027.

120. Debongnie J.C., Donnay M., Mairesse J. Gastrospirillum hominis Helicobacter heilmannii: a cause of gastritis, sometimes transient, better diagnosed by touch cytology? // Am. J. Gastroenterol. - 1995. - Vol.90. -P.411-416.

121. Degnan A. J.,' Sonzogni W. C., Standridge J. H. Development of a Plating Medium for Selection of Helicobacter pylori from Water Samples. //

Applied and Environmental Microbiology. - 2003. - Vol. 69. - No. 5. - P. 29142918

122. DeLoney C.R., Schiller N.L. Characterization of an in vitro-selected amoxicillin-resistant strain of Helicobacter pylori. II Antimicrob. Agents Chemother. — 2000. — Vol.44. — P.3368-3373.

123. Dewhirst F.E., Fox J.G., Mendes E.N. et al. . Flexispira rappini strains represent at least ten Helicobacter taxa. //Int J Syst Bacteriol. - 2000. -Vol.50. -P.1781-1787.

124. Dierikx C.M., Martodihardjo J., Kuipers E.J., Hensgens C.M., Küsters J.G.,Suzuki H., de Groot N., Van Vliet A.H. Serum and animal tissue free medium for transport and growth of Helicobacter pylori. II Immunol. Med. Microbiol. -2007. - Vol.50. - P. 239-243.

125. Dixon M.F., Genta R., Yardley J.H. and Correa P. Classification and grading of gastritis: the updated Sydney System. // Am. J. Surg. Pathol. — 1996. — Vol.20. — P.l 161-1181.

126. Doglioni C., De Boni M., Cielo R., Laurino L., Pelosio P., Braidotti P., Viale G. Gastric giardiasis. // J. Cli. Pathol. - 1992. - Vol.45. - P.964-967.

127. Doglioni C., Turrin M., Macri E., Chiarelli C., Germana B., Barbareschi M. HpSS: a new silver staining method for Helicobacter pylori. II J. Clin. Pathol. — 1997. — Vol.50. — P.461-464.

128. Doom L.J., Ceu Figueiredo, Sanna R. et al. // 11-th International Workshop on Gastrodujdenal Pathology and Helicobacter pylori. - Budapest. -1998. -P.A15.

129. Dore M.P., Graham D.Y. and Sepulveda A.R. Different penicillin-binding protein profiles in amoxicillin-resistant Helicobacter pylori. II Helicobacter. — 1999. — Vol.4. — P.154-161.

130. Dore M.P., Osato M.S., Malaty H.M., Graham D.Y. Characterization of a culture method to recover Helicobacter pylori from the feces of infected patients. // Helicobacter. - 2000. - Vol.5 - P. 165-168.

131. Dore M.P., Realdi G., Mura D. et al. Helicobacter infection in patients with HCV-related chronic hepatitis, cirrhosis, and hepatocellular carcinoma. // Dig. Dis. Sei. - 2002. - Vol.47. - P.1638-1643.

132. Dore M.P., Realdi G., Sepulveda A.R., Graham D.Y. Detection of genomic Helicobacter pylori DNA in the blood of patients positive for the infection. // Dig. Liver Dis. - 2003. - Vol.35. - P.839-840.

133. Duck W.M., Sobel J., Pruckler J.M., Song O.S., Swerdlow D., Friedman C., Sulka A., Swaminathan B., Taylor T., Hoekstra M., Griffin P., Smoot D., Peek R., Metz D.C., Bloom P.B., Goldschmid S., Parsonnet J., Triadafilopoulos G., Perez Perez G.I., Vakil N., Ernst P., Czinn S., Dunne D. and Gold B.D. Antimicrobial resistance incidence and risk factors among Helicobacter pylori-infected persons, United States. // Emerg. Infect. Dis. — 2004. — Vol.10. — P.1088-1094.

134. Duque -Jamaica R., Arevalo-Galvis A., Poutou-Pinales P.A. et al. Sequential statistical improvement of the liquid cultivation of Helicobacter pylori. //Helicobacter. - 2010. - Vol.15. - P.303-312.

135. Ekesbo R., Toth E., Fork F.T., Held M., Nillson I., Wadström T., Sjölund K. Chronic Helicobacter pylori infection in a population in southern Sweden analysed by histopathology, immunoblot and ELISA serology. I I Eur. J. Gastroenterol. Hepatol. - 2006. - Vol.18. - P.589-593.

136. Ellenrieder V., Glasbrenner B., Stoffels C., Weiler S., Bode G., Moller P., Adler G. Qualitative and semi-quantitative value of a modified 13C-urea breath test for identification of Helicobacter pylori infection. // Eur. J. Gastroenterol. Hepatol. — 1997. — Vol.9. — P.1085-1089.

137. El-Zaatari F.A., Nguyen A.M., Genta R.M., Klein P.D., Graham D.Y. Determination of Helicobacter pylori status by reverse transcription-polymerase chain reaction. Comparison with urea breath test. // Dig. Dis. Sci. -1995.- Vol.40. -P.109-113.

138. Engstrand L., Nguyen A.M.H., Graham D.Y. and El-Zaatari F.A.K. Reverse transcription and polymerase chain reaction amplification of rRNA for detection of Helicobacter pylori species. // J. Clin. Microbiol. - 1992. -Vol.30.-P.2295-2301.

139. Erzin Y., Koksal V., Altun S., Dobrucali A., Asian M., Erdamar S., Dirican A., Kocazeybek B. Prevalence of Helicobacter pylori vacA, cagA, cagE, iceA, babA2 genotypes and correlation with clinical outcome in Turkish patients with dyspepsia. // Helicobacter. - 2006. - Vol.11. - P.574-580

140. Esmat G., El-Bendary M., Zakarya S., Ela M.A., Zalata K. Role of Helicobacter pylori in patients with HCV-related chronic hepatitis and cirrhosis with or without hepatocellular carcinoma: possible association with disease progression. //J Viral Hepat. - 2012. - Vol.l9(7). - P.473-479.

141. Fallone C.A., Loo V.G., Lough J., Barkun A.N. Hematoxylin and eosin staining of gastric tissue for the detection of Helicobacter pylori. II Helicobacter. — 1997. — Vol.2. — P.32-35.

142. Fan X., Gunasena H., Cheng Z., Espejo R., Crowe S.E., Ernst P.B., Reyes V.E. Helicobacter pylori urease binds to class II MHC on gastric epithelial cells and induces their apoptosis. // Immunology. — 2000. — Vol.165. — P.1918-1924.

143. Fan X.G. and Li T.G. Growth of Helicobacter pylori in candle jars. // J. Med. Microbiol. - 1997. - Vol.46. - P.354-355.

144. Fan X.G., Peng X.N., Huang Y. et al. Helicobacter species ribosomal DNA recovered from the liver tissue of Chinese patients with primary hepatocellular carcinoma. // Clin. Infect.Dis. - 2002. - Vol.35. - P. 1555-1557.

145. Fantry G.T., Zheng Q.X., Darwin P.E., Rosenstein A.H. and James S.P. Mixed infection with cagA-positive and cagA-negative strains of Helicobacter pylori. II Helicobacter. - 1996. - Vol.1. - P.98-106.

146. Farshad Sh., Alborzi A., Malek Hosseini S.A., Oboodi B., Rasouli M., Japoni A., Nasiri J. //Identification of Helicobacter pylori DNA in Iranian patients with gallstones. - Epidemiol Infect. - 2004. - Vol. 132(6). - P. 11851189.

147. Figueiredo C., Van Doom L.J. et al. Helicobacter pylori genotypes are associated with clinical outcome in Portuguese patients and show a high prevalence of infections with multiple strains. // J. Gastroenterol. - 2001. -Vol.36(2). -P.128-135.

148. Figura F., Franceschi F., Santucci A. et al. Extragastric manifestations of Helicobacter pylori infection. II Helicobacter. - 2010. - Vol.15 (suppl.l). -P.60-69.

149. Figura N., Cetta F., Angélico M. et al. Most Helicobacter pylori -infected patients have specific antibodies, and some also have H.pylori antigens and genomic material in bile: Is it a risk factor for gallstone formation? // Dig. Dis. Sei. - 1998. - Vol.48. -P.854.

150. Finger S.A., Velapatiño B., Kosek M., Santivañez L., Dailidiene D., Quino W., Balqui J., Herrera P., Berg D.E., Gilman R.H. Effectiveness of enterobacterial repetitive intergenic consensus PCR and random amplified polymorphic DNA fingerprinting for Helicobacter pylori strain differentiation. // Appl. Envirob. Microbiol. - 2006. - Vol.72. - P.4713-4716.

151. Flanagan P.A. Giardia-dmgnosis, clinical course and epidemiology. // A review Epidemio. Infect. - 1992. - Vol.109. - P. 1-22.

152. Ford A.C., Axon A.T.R. Epidemiology of Helicobacter infection and public health implications. //Helicobacter. - 2010. - Vol.15. - P.l-6.

153. Fox J.G. The non-H.pylori helicobacters: their expanding role in gastrointestinal and systemic diseases.// Gut. - 2002. - Vol.50. - p.273-283.

154. Fox J.G., Dewhirst F.E., Shen Z. et al. Hepatic Helicobacter species identified in bile and gallbladder tissue from Chileans with chronic cholecystitis. // Gastroenterology. - 1998. - Vol.114. - P.755-63.

155. Fox J.G., Lee A. The role of Helicobacter species in gastrointestinal tract diseases of animals. // Lab. Anim. Sei. — 1997. — Vol.47. — P.222-255.

156. Fox J.G., Taylor N.S., Nowe S. et al Helicobacter anseris sp. nov. and Helicobacter brantae sp.nov., isolated from feces of resident Canada geese in the greater Boston area. // Appl. Envirin Microbiol. — 2006. — Vol.72. — P.4633-4637.

157. Fox J.G., Yan L.L., Dewhirst E., Paster B.J., Shames B., Murphy J.C. et al. Helicobacter bilis sp.nov., a novel Helicobacter species isolated from bile, livers, and intestines of aged, inbred mice. // J. Clin. Microbiol. - 1995. -Vol.33.-P.445-454.

158. Franceschi F., Sepulveda A.R., Gasbarrini A., Pola P., Silveri N.G., Gasbarrini G., Graham D.Y. and Genta R.M. Cross-reactivity of anti-CagA antibodies with vascular wall antigens-possible pathogenic link between Helicobacter pylori infection and atherosclerosis. // Circulation. - 2002. -Vol.106-P.430-434.

159. Franklin C.L., Beckwith C.S., Livingston R.S. et al. Isolation of a novel Helicobacter cholecystus sp. nov., from the gallbladders of Syrian hamsters with cholangiofibrosis and centrilobular pancreatitis. // J. Clin. Microbiol. - 1996. - Vol.34. - №12. - P.2952-2958.

160. Fujimoto S., Olaniyi O., Arnqvist A. et al. Helicobacter pylori BabA expression, gastric mucosal injury, and clinical outcome. // Clin. Gastroenterol. Hepatol. - 2007. - Vol.5. - P.49-58.

161. Fukuda K., Kuroki T., Tajima Y. et al. Comparative analysis of helicobacter DNAs and biliary pathology in patients with and without hepatobiliary cancer. // Carcinogenesis. - 2002. - Vol.23. - P.1927-1931.

162. Fuqua W.C., Winans C., Greenberg E. P. Quorum sensing in bacteria: the LuxR/LuxI family of cell density-responsive transcriptional regulators. // J. Bacteriol. — 1994. — Vol.176. — P.269-275.

163. Garcia-Vallve S., Romeu A., Palau J. Horizontal gene transfer in bacterial and archaeal complete genomes. // Genome Res. - 2000. - Vol.110. -P.1719-1725.

164. Garrity G.M., Bell J.A., Liburn T., Family I.I. Helicobacteriaceae fam.nov. In: Brennen D.J., Krieg N.R., Staley J.T. Bergey' s Manual of Determinative Bacteriology. // Springer. — New York. — 2005. — Vol.2.2nd edn. — P. 1168-1194.

165. Gebert B., Fischer W., Weiss E., Hoffmann R., Haas R. Helicobacter pylori vacuolating cytotoxin inhibits T lymphocyte activation. // Science. — 2003. — Vol.301. — P.1099-1102.

166. Genta R.M., Robason G.O., Graham D.Y. Simultaneous visualization of Helicobacter pylori and gastric morphology: a new stain. // Hum. Pathol. — 1994. — Vol.25. — P.221-226.

167. Gerhard M., Lehn N., Neumayer N., Boren T. et al. Clinical relevance of the Helicobacter pylori gene for blood-group antigen binding adhesin. // Gastroenterol. - 1998. - Vol.115. -N.l. -P.58-66.

168. Gerrits M.M., Berning M., Van Vliet A.H.M., Kuipers E.J., Küsters J.G. Effects of 16S rRNA gene mutations on tetracycline resistance in Helicobacter pylori. // Antimicrob. Agents Chemother. — 2003. — Vol.47. — P.2984-2986.

169. Gerrits M.M., Schuijffel D., van Zwet A.A., Kuipers E.J., Vandenbroucke-Grauls C.M.J.E., Küsters J.G. Alterations in penicillin-binding

protein 1A confer resistance to beta-lactam antibiotics in Helicobacter pylon. II Antimicrob. Agents Chemother. — 2002. — Vol.46. — P.2229-2233.

170. Gerrits M.M., Van Villet A.H., Kuipers E.J., Kusters J.G. Helicobacter pylori and antimicrobial resistance: molecular mechanisms and clinical implications. // Lancet. Infect. Dis. - 2006. - Vol.6. - P.699-709.

171. Ghil H.M., Yoo J.H., Jung W.S. et al. Survey of Helicobacter infection in domestic and feral cats in Korea. // J Vet Sci. - 2009. - Vol.10. -P.67-72.

172. Giao M.S., Azevedo N.F., Wilks S.A. et al. Persistence of Helicobacter pylori in heterotrophic drinking-water biofilms. //Appl Environ Micobiol - 2008. - Vol.48. - P.465-471.

173. Gibson J.R., Saunders N.A., Burke B. and Owen R.J. Novel method for rapid determination of clarithromycin sensitivity in Helicobacter pylori. II J. Clin. Microbiol. - 1999. - Vol.37. - P.3746-3748.

174. Gisbert J.P., De la Morena F., Abraria V. Accuracy of monoclonal stool antigen test for the diagnosis of Helicobacter pylori infection: a systematic review and meta-analysis. // Am. J. gastroenterol. - 2006. - Vol.55. -P.269-273.

175. Glocker E., Kist M. Rapid detection of point mutations in the gyrA gene of Helicobacter pylori conferring resistance to ciprofloxacin by a fluorescence resonance energy transfer-based real-time PCR approach. // J. Clin. Microbiol. - 2004. - Vol.42. - P.2241-2246.

176. Glupczynski Y., Broutet N., Cantagrel A., Andersen L.P., Alarcon T., Lopez Brea M. and Megraud F. Comparison of the E test and agar dilution method for antimicrobial suceptibility testing of Helicobacter pylori. II Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. - 2002. - Vol.21. -P.549-552.

177. Glupczynski Y., Labbe M., Thiabaumont F. Comparative evaluation of a new selective culture medium for improved isolation of Campylobacter pylori from gastric biopsy specimens, 1989: 3-6. In: F. Megraud and H.

Lamouliatte (ed.), Gastroduodenal pathology and Campylobacter pylori. Elsevier ICS 847, Amsterdam, The Netherlands.

178. Glupczynski Y., Megraud F., Lopez Brea M. and Andersen L.P. European Multicentre survey of in vitro antimicrobial resistance in Helicobacter pylori. II Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. — 2001. — Vol.20. — P.820-823.

179. Godoy A.P., Ribeiro M.L., Benvengo Y.H., Vitiello L., Miranda Mde C., Mendonca S. et al. Analysis of antimicrobial susceptibility and virulence factors in Helicobacter pylori clinical isolates. // BMC Gastroenterol. - 2003. -Vol.3.-P.20.

180. Goo M.J., Ki M.R., Lee H.R., Hong I.H., Park J.K. et al. Primary biliary, cirrhosis similar ti that in human beings, in a male C57BL/6 mouse infected by Helicobacter pylori. II Eur. J. Gastroenterol. Hepatol. - 2008. -Vol.20(10). -P.1045-1048.

181. Goodwin C.S., Blincow E.D., Warren J.R., Waters T.E., Sanderson C.R. and L. Easton. Evaluation of cultural techniques for isolating Campylobacter pyloridis from endoscopic biopsies of gastric mucosa. // J. Clin. Pathol. - 1985. - Vol.38. -P.l 127-1131.

182. Goodwin et al. Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. // Int. J. Syst. Bact. — 1989. — Vol.39. — P.397-405.

183. Goossens H., Glupczynski Y., Burette A., Van den Borre C., DePrez C., Bodenmann J., Keller A., Butzler J.P. Evaluation of a commercially available complement fixation test for diagnosis of Helicobacter pylori infection and for follow-up after antimicrobial therapy. // J. Clin. Microbiol. - 1992. -Vol.30.-P.3230-3233.

184. Graham D.Y., Klein P.D., Evans D.J., Evans D.G., Alpert L.C., Opekun A.R., Boutton T.W. Campylobacter pylori detected noninvasively by the 13C-urea breath test. //Lancet. — 1987. — P.l 174-1177.

185. Grazioli В., Matera G., Laratta C., Schipani G., Guarnieri G., Spiniello E., Imeneo M., Amorosi A., Foca A., Luzza F. Giardia lamblia infection in patients with irritable bowel syndrome and dyspepsia: A prospective study. // World J. Gastroenterol. - 2006. - Vol. 12(12). - P.1941-1944.

186. Greff M. Ятрогенный путь передачи инфекции Н.pylori и стерилизация эндоскопического оборудования. // В кн.: Helicobacter pylori: революция в гастроэнтерологии. Под ред. Ивашкина В.Т., Мегро Ф., Лапиной Т.Л. — Москва. — 1999. — С.21-28.

187. Grignon В., Tankovic J., Megraud F., Glupczynski Y., Husson M.O., Conroy M.C., Emond J.P., Loulergue J., Raymond J., Fauchere J.L. Validation of diffusion methods for macrolide susceptibility testing of Helicobacter pylori. // Microb. Drug Resist. - 2002. - Vol.8 - P.61-66.

188. Grove D.I., McLeay R.A.B., Byron K.E. and Koutsouridis G. Isolation of Helicobacter pylori after transport from a regional laboratory of gastric biopsy specimens in saline, Portagerm pylori or cultured on chocolate agar. // Pathology— 2001. — Vol.33. — P.362-364.

189. Guruge J.L., Falk P.G., Lorens R.G., Dans M., With H.P., Blaser M.J., Berg D.E., Gordon J.I. Epithelial attachment alters the outcome of Helicobacter pylori infection. // Proc. Nalt. Acad. Sci. USA. — 1998. — Vol.31. — №95(7). — P.3925-3930.

190. Ha N.C., Oh S.T., Sung J.Y., Cha K.A., Lee M.H., Oh B.H. Supramolecular assembly and acid resistance of Helicobacter pylori urease. // Nat. Struct. Biol. — 2001. — Vol.8. — P.505-509.

191. Haas R., Leying H., van Putten J.P. Cloning of a Helicobacter pylori flagellin gene and constriction of a non- flagellated mutant by transformation -mediated allelic exchange. // In: Basic and clinical aspects of Helicobacter pylori infection, Ed. by Gasbarini G., Pretolani S. — Berlin. —1994. — P.183-188.

192. Hachem C.Y., Clarridge J.E., Reddy R., Flamm R., Evans D.G., Tanaka K., Graham D.Y. Antimicrobial susceptibility testing of Helicobacter pylori: comparison of E-test, broth microdilution, and disk diffusion for ampicillin, clarithromycin, and metronidazole. // Diagn. Microbiol. Infect. Dis. -1996. - Vol.24. -P.37-41.

193. Hamlet A.K., Erlandsson K.I.M., Olbe L., Svennerholm A.M., Backman V.E.M., Pettersson A.B. A simple, rapid, and highly reliable capsule-based C-14 urea breath test for diagnosis of Helicobacter pylori infection. // Scand. J. Gastroenterol. — 1995. — Vol.30. — P.1058-1063.

194. Hammar M., Tyszkiewicz T., Wadstrom T., O'Toole P.W. Rapid detection of Helicobacter pylori in gastric biopsy material by polymerase chain reaction. // J. Clin. Microbiol. - 1992. - Vol.30. - P.54-58.

195. Han F.C., Li X.J., Jiang H., Qin L.P., Li D., Guo Y.H., Liu Z.G., Zhang L., Yan X.J. Detection of H.pylori antibody profile in serum by protein array. // World J. Gastroenterol. - 2006. - Vol.12. - P.4044-4048.

196. Han S.W., Flamm R., Hachem C.Y., Kim H.Y., Clarridge J.E., Evans D.G., Beyer J., Drnec J. and Graham D.Y. Transport and storage of Helicobacter pylori from gastric mucosal biopsies and clinical isolates. // Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. - 1995. -Vol.14. -P.349-352.

197. Hanninen M.L. Sensivity of Helicobacter pylori to different bile salts. //Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. - 1991. - Vol.10. -P.515-518.

198. Harada K., Ozak S., Kono N. et al. Frequent molecular identification of Campylobacter but not Helicobacter genus in bile and biliary epithelium in hepatolithiasis. // J. Pathol. - 2001. - Vol.193. - P.218-223.

199. Hazell S. L., Lee A., Hennessy W. Campylobacter pyloridis and gastritis: association with intercellular spaces and adaptation to an environment of mucus as important factors in colonization of the gastric epithelium. // J. Infect. Dis. — 1986. —Vol.153. — P.658-663.

200. Hazell S.L., Markesich D.C., Evans D.J., Evans D.G., Graham D.Y. Influence of media supplements on growth and survival of Campylobacter pylori. II Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. - 1989. - Vol.8. - P.597-602.

201. He Q., Wang J.P., Osato M. and Lachman L.B. Real-time quantitative PCR for detection of Helicobacter pylori. II J. Clin. Microbiol. - 2002. - Vol.40. -P.3720-3728.

202. Heep M., Beck D., Bayerdorffer E., Lehn N. Rifampin and rifabutin resistance mechanism in Helicobacter pylori. II Antimicrob. Agents Chemother. — 1999. — Vol.43. — P.1497-1499.

203. Heep M., Kist M., Strobel S., Beck D., Lehn N. Secondary resistance among 554 isolates of Helicobacter pylori after failure of therapy. // Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. — 2000. — Vol.19. — P.538-541.

204. Heep M., Rieger U., Beck D, Lehn N. Mutations in the beginning of the rpoB gene can induce resistance to rifamycins in both Helicobacter pylori and Mycobacterium tuberculosis. I I Antimicrob. Agents Chemother. — 2000. — Vol.44. — P.1075-1077.

205. Heep M., Scheibl K., Degrell A. and Lehn N. Transport and storage of fresh and frozen gastric biopsy specimens for optimal recovery of Helicobacter pylori. II J. Clin. Microbiol. — 1999. — Vol.37. — P.3764-3766.

206. Hegedus O., Ryden J., Rehnberg A.S., Nilsson S., Hellstrom P.M. Validated accuracy of a novel urea breath test for rapid Helicobacter pylori detection and in-office analysis. // Eur. J. Gastroenterol. Hepatol. — 2002. — Vol.14. —P.513-520.

207. Heid C.A. Real-time quantitative PCR. // Genome Res. - 1996. - №6. -P.986-994.

208. Higuchi R. Kinetic PCR Analysis: Real-time monitoring of DNA amplification reactions. //Biotechnology. - 1993. -№ 11. -P.1026-1030.

209. Hirschl A.M., Hirschl M.M., Berger J., Rotter M.L. Evaluation of a commercial latex test for serological diagnosis of Helicobacter pylori infection in treated and untreated patients. // Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. - 1991. -Vol.10.-P.971-974.

210. Ho S.A., Hoyle J.A., Lewis F.A., Seeker A.D., Cross D., Mapstone N.P., Dixon M.F., Wyatt J.I., Tompkins D.S., Taylor G.R. and Quirke P. Direct polymerase chain reaction test for detection of Helicobacter pylori in humans and animals. // J. Clin. Microbiol. - 1991. - Vol.29. - P.2543-2549.

211. Hoshina S., Kahn S.M., Jiang W., Green P.H.R., Neu H.C., Chin N., Morotomi M., LoGerfo P. and Weinstein I.B. Direct detection and amplification of Helicobacter pylori ribosomal 16S gene segments from gastric endoscopic biopsies. // Diagn. Microbiol. Infect. Dis. - 1990. - Vol.13. - P.473-479.

212. Hulten K., Han S.W., Enroth H., Klein P.D., Opekun A.R. et all. Helicobacter pylori in drinking water in Peru. // Gastroenterology. — 1996. — Vol. 110(4). —P. 1031-1035.

213. Hynes S.O., Teneberg S., Roche N. et al. Glycoconjugate binding of gastric and enterohepatic Helicobacter spp. II Infect. Immun. - 2003. - Vol.71. -P.2976-2980.

214. IARC Worcing Group on the Evaluation of Carcinogenesis Risks to Humans. Monographs. - Lyon. — 1994. — Vol.61. — P. 177-240.

215. liver D., Arnqvist A., Ogren J., Frick I.M., Kersulyte D., Incecik E.T., Berg D.E., Covacci A., Engstrand L., Boren T. Helicobacter pylori adhesin binding fucosylated histo-blood group antigens revealed by retagging. // Science. — 1998. — Vol.279. — P.373-377.

216. Isomoto H., Kawazoe K., Inoue K., Kohno S. Usefulness of the immunological rapid urease test for detection of Helicobacter pylori in the patients who are reluctant undergo endoscopic biopsies. // Dig. Dis. Sei. — 2006. — Vol.51. — P.2302-2305.

217.1ten A., Graf S., Egger M. et al. Helicobacter sp. Flexispira bacteremia in a immunocompetent young adult. //J Clin Microbiol - 2001. - Vol.39(5). -P. 16-20.

218. Ito K., Yamaoka Y., Ota H., El-Zimaity H., Graham D.Y. Adherence, internalization, and persistence of Helicobacter pylori in hepatocytes. // Dig. Dis. Sei. - 2008. - Vol.53(9). - P.2541-2549.

219. Ito K., Yamaoka Y., Yoffe B., Graham D.Y. Disturbance of apoptosis and DNA synthesis by Helicobacter pylori infection of hepatocytes. // Dig Dis Sei. - 2008. - Vol.53. - P.2532-2540.

220. Janzon A., Bhuiyan T., Lundgren A. et al. Presence of high numbers of transcriptionally active Helicobacter pylori in vomitus from Bangladeshi patients suffering from acute gastroenteritis.//Helicobacter. - 2009. - Vol.14. -P.237-247.

221. Jeong J.Y., Mukhopadhyay A.K., Akada J.K., Dailidiene D., Hoffman P.S., Berg D.E. Roles of FrxA and RdxA nitroreductase of Helicobacter pylori in seceptibility and resistance to metronidazole. // J. Bacteriol. - 2001. -Vol.l83(17). - P.155-162.

222. Jiang X.P., Doyle M.P. Growth supplements for Helicobacter pylori. // J. Clin. Microbiol. - 2000. - Vol.38. - P.1984-1987.

223. Jolley C.D., Wagner D.A. Comparison of the 13C-urea blood test to histology and rapid urease testing in the diagnosis of Helicobacter pylori infection in children. // J. Pediatr. Gastroenterol. - 2006. - Vol.101. - P.1921-1930.

224. Jonaitis L.V., Kiudelis G., Kupcinskas L. Evaluation of a novel 14C-urea breath test «Heliprobe» in diagnosis of Helicobacter pylori infection. // Medicina (Kaunas). - 2007. - Vol.13. - P.32-35.

225. Jones D.M., Lessells A.M., Eldridge J. Campylobacter like organisms on the gastric mucosa: culture, histological, and serological studies. // J. Clin. Pathol. - 1984. - Vol.37. - P.1002-1006.

226. Jonkers D., Stobberingh E. and Stockbrugger R. Influence of oropharyngeal flora and specimen pretreatment on the recovery of Helicobacter pylori. II Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. — 1996. — Vol.15.—P.378-382.

227. Jonkers D., Stobberingh E., deBruine A., Arends J.W. and Stockbrugger R. Evaluation of immunohistochemistry for the detection of Helicobacter pylori in gastric mucosal biopsies. // J. Infect. — 1997. — Vol.35. — P.149-154.

228. Joo J.-S., Park K.- C., Song J.-Y. et al. A thin-layer liquid culture technique for the growth of Helicobacter pylori. II Helicobacter. - 2010. -Vol.15.-P.295-302.

229. Joyce E.A., Bassler B.L., Wright A. Evidence for a signaling system in Helicobacter pylori: detection of a luxS-encoded autoinducer. // J. Bacteriology. — 2000. — Vol.l82(13). — P.3638-3643.

230. Kangatharalingam N. and Amy P.S. Helicobacter pylori comb nov exhibits facultative acidophilism and obligate microaerophilism. // Appl. Environ. Microbiol. - 1994. - Vol.60. - P.2176-2198.

231. Karagin P.H., Stenram U., Wadstrom T., Ljungh A. Helicobacter species and common gut bacterial DNA in gallbladder with cholecystitis. // World J Gastroenterol. - 2010. - Vol.l6(38). - P.4817-4822.

232. Kato M., Asaka M., Saito M., Sekine H., Ohara S., Toyota T., Akamatsu T., Kaneko T., Kiyosawa K., Nishizawa O., Kumagai T., Katsuyama T., Abe M., Kosaka M., Hariya S., Minami K., Sanai Y., Sawamura M. and Tachikawa T. Clinical usefulness of urine-based enzyme-linked immunosorbent assay for detection of antibody to Helicobacter pylori: a collaborative study in nine medical institutions in Japan. // Helicobacter. - 2000. - Vol.5. - P. 109-119.

233. Kato M., Saito M., Fukuda S., Kato C., Ohara S., Hamada S., Nagashima R., Obara K., Suzuki M., Honda H., Asaka M. and Toyota T. C-13-urea breath test, using a new compact nondispersive isotope-selective infrared spectrophotometer: comparison with mass spectrometry. // J. Gastroenterol. — 2004. — Vol.39. — P.629-634.

234. Kato S., Tachikawa T., Ozawa K., Konno M., Okuda M., Fujisawa T., Nakazato Y., Tajiri H. and Iinuma K. Urine-based enzyme-linked immunosorbent assay for the detection of Helicobacter pylori infection in children. // Pediatrics. - 2001. - Vol.107. - P.87.

235. Katsuragi K., Noda A., Tachikawa T., Azuma A., Mukai F., Murakami K., Fujioka T., Kato M. and Asaka M. Highly sensitive urine-based enzyme-linked immunosorbent assay for detection of antibody to Helicobacter pylori. II Helicobacter. - 1998. - Vol.3. - P.289-295.

236.Kawaguchi K., Matsuo J., Osaki T. et al. Prevalence of Helicobacter and Acanthamoeba in natural environment. //Lett Appl Microbiol. - 2009. -Vol.48. -P.465-471.

237. Kawai M., Iwahashi M., Uchiyama K. et al. Gram positive cocci are associated with the formation of completely pure cholesterol stones. // Am. J. Gastroenterol. - 2002. - Vol.97. - P.83-88.

238. Kehler E.G., Midkiff B.R., Westblom T.U. Evaluation of three commercially available blood culture systems for cultivation of Helicobacter pylori. II J. Clin. Microbiol. - 1994. - Vol.32. - P.1597-1598.

239. Kelly S.M., Pitcher M.C.L., Farmery S.M. et al. Isolation of Helicobacter pylori from feces with dyspepsia in the United Kingdom. // Gastroenterology. -1994. - Vol.107. - P. 1671-1674.

240. Khan R., Nahar S., Mukhopadhyay A.K. et al. Isolation of tetracycline - resistant clinical Helicobacter pylori without mutations in 16S rRNA gene in Bangladesh. //Microbiol Immunol. - 2008. - Vol.52(10). - P.508-511.

241. Kim J.J., Reddy R., Lee M., Kim J.G., El Zaatari F.A.K., Osato M.S., Graham D.Y. and Kwon D.H. Analysis of metronidazole, clarithromycin and tetracycline resistance of Helicobacter pylori isolates from Korea. // J. Antimicrob. Chemother. — 2001. — Vol.47. — P.459-461.

242. Kim J.M., Kim J.S., Kim N., Kim S.G., Jung H.C., Song I.S. Comparison of primary and secondary antimicrobial minimum inhibitory concentration for Helicobacter pylori isolated from Korean patients. // Int. J. Antimicrob Agents. - 2006. - Vol.28. - P.6-13.

243. Kim M.J., Michener R. and Triadafilopoulos G. Serum 13C-bicarbonate assay for the diagnosis of gastric Helicobacter pylori infection and response to treatment. // Gastroenterology. — 1997. — Vol.113 — P.31-37.

244. Kimala W. Evaluation of the motility indole urease (MIU) test to detect Helicobacter pylori infection. // Southeast Asian J. Trop. Med. Public Health. - 2006. - Vol.37. - P.966-969.

245. Kobayashi D., Eishi Y., Ohkusa T., Ishige I., Suzuki T., Minami J., Yamada T., Takizawa T. and Koike M. Gastric mucosal density of Helicobacter pylori estimated by real-time PCR compared with results of urea breath test and histological grading. // J. Med. Microbiol. - 2002. - Vol.51. - P.305-311.

246. Koletzko S., Richy F., Bontems P., Crone J., Kalach N., Monteiro M.L., Gottrand F., Celinska-Cedro D., Roma-Giannikou E., Oderda G., Kolacek S., Urruzuno P., Martinez Gomez M.J., Casswall T., Ashorn M., Bodanszky H. and Megraud F. Prospective multicentre study on antibiotic resistance of Helicobacter pylori strains obtained from children living in Europe. // Gut. — 2006. — Vol.55. — P.1711-1716.

247. Kolts B.E., Joseph B., Achem S.R., Bianchi T. and Monteiro C. Helicobacter pylori detection: a quality and cost analysis. // Am. J. Gastroenterol. — 1993. — Vol.88. — P.650-655.

248. Konturek S.J., Gonciarz M., Gonciarz Z. et al. Progastrin and its products from patients with chronic viral hepatitis and liver cirrhosis. //Scand. J Gastroenterol.- 2003. - Vol.38. - P. 643-647.

249. Korstanje A., Van Eeden S., Offerhaus G.J., Sabbe L.J., den Hartog

__I

G., Biemond I., Lamers C.B. The Carbon urea breath test for the diagnosis of Helicobacter pylori infection in subjects with atrophic gastritis: evaluation in a primary care setting. //Aliment. Pharmacol.Ther. - 2006. - Vol.24. - P.643-650.

250. Kosunen T.U., Seppala K., Sarna S., Sipponen P. Diagnostic value of decreasing IgG, IgA, and IgM antibody titres after eradication of Helicobacter pylori. II Lancet. - 1992. - Vol.339. - P.893-895.

251. Kozak K., Larka C., Nickol A., Yi A. Detection of H. pylori antigen in stool specimens using a novel enzyme immunoassay, abstr. // C272, P. 161. Abstr. 97th Gen. Meet. Am. Soc. Microbiol., 4 to 8 May 1997.

252. Krajden S., Bohnen J., Anderson J., Kempston J., Fuksa M., Matlow A., Marcon N., Haber G., Kortan P., Karmali M. et al. Comparison of selective and nonselective media for recovery of Campylobacter pylori from antral biopsies. // J. Clin. Microbiol. - 1987. - Vol.25. - P.l 117-1118.

253. Kuipers E., Pena A., Van Kamp G., Uyterlinde A., Pals G., Pels N., Kurz-Pohlmann E. and Meuwissen S. Seroconversion for Helicobacter pylori. II Lancet. - 1993. - Vol.342. - P.328-331.

254. Kuntz E., Kuntz H.D. Hepatology. Principles and practice. // Springer Medizin Verlag. Heidelberg. - 2006.

255. Kuroki T., Fukuda K., Yamanouchi K. et al. Helicobacter pylori accelerates the biliary epithelial cell proliferation activity in hepatolithiasis. // Hepato-Gastroenterol. - 2002. - Vol.49. - P.648-651.

256. Kutschke A., de Jonge B.L. Compound efflux in Helicobacter pylori. II Antimicrob. Agents Chemother. — 2005. — Vol.49. — P.3009-3010.

257. Labigne A., Lamouliatte H., Birac C., Sedallian A., Megraud F. Distribution of the cagA gene among Helicobacter pylori strains associated with peptic ulcer. // Am. J. Gastroenterol. - 1994. - Vol.89. - P. 1326.

258. Lage A.P., Fauconnier A., Burette A., Glupczynski Y., Bollen A., Godfroid E. Rapid colorimetric hybridization assay for detecting amplified Helicobacter pylori DNA in gastric biopsy specimens. // J. Clin. Microbiol. -1996.- Vol.34. -P.530-533.

259. Laine L., Chun D., Stein C., El-Beblawi I., Sharma V., Chandrasoma P. The influence of size or number of biopsies on rapid urease test results: a prospective evaluation. // Gastrointest. Endosc. — 1996. — Vol.43. — P.49-53.

260. Laine L., Estrada R., Lewin D.N., Cohen H. The influence of warming on rapid urease test results: a prospective evaluation. // Gastrointest. Endosc. — 1996. — Vol.44. — P.429-432.

261. Land K.M., Johnson P.J. Molecular basis of metronidazole resistance in pathogenic bacteria and protozoa. // Drug Resist. Update. - 1999. - Vol.2. -P.289-294.

262. Langenberg M.I., Tytgat G.N.J., Schipper M.E.I., Rietra P.J.G.M., Zanen H.C. Campylobacter-like organisms in the stomach of patients and healthy individuals. // Lancet. — 1984. — P.1348-1349.

263. Lascols C., Lamarque D., Costa J.M., Copie Bergman C., Le Glaunec J.M., Deforges L., Soussy C.J., Petit J.C., Delchier J.C., Tankovic J.. Fast and accurate quantitative detection of Helicobacter pylori and identification of clarithromycin resistance mutations in H. pylori isolates from gastric biopsy specimens by real-time PCR. // J. Clin. Microbiol. - 2003. - Vol.41. - P.4573-4577.

264. Latham S.R., Labigne A., Jenks P.J. Production of the RdxA protein in metronidazole-susceptible and - resistant isolates of Helicobacter pylori

cultured from treated mice. // J. Antimicrob. Chemother. - 2002. - Vol.49. -P.675-678.

265. Lee D.K., Tarr P.I., Haigh W.C. et al. Bacterial DNA in mixed cholesterol gallstones. // Am. J. Gastroenterol. - 1999. - Vol.94(12). - P.3502-3506.

266. Lee J.-W., Lee D.H., Lee J.I. et al. Identification of Helicobacter pylori in Gallstone, Bile, and Other Hepatobiliary Tissues of Patients with Cholecystitis. // Gut Liver.- 2010. - Vol. 4(1). - P. 60-67.

267. Leodolter A., Dominguez Munoz J.E., Von Arnim U. and Malfertheiner P. Citric acid or orange juice for the C-13-urea breath test: the impact of pH and gastric emptying. // Aliment. Pharmacol. Ther. — 1999. — Vol.13. —P.1057-1062.

268. Leodolter A., Dominguez Munoz J.E., Von Arnim U., Manes G., Malfertheiner P. 13C urea breath test for the diagnosis of Helicobacter pylori infection-a further simplification for clinical practice. // Scand. J. Gastroenterol. — 1998. — Vol.33. — P.267-270.

269. Lepper P.M., Moricke A., Vogt K., Bode G., Trautmann M. Comparison of different criteria for interpretation of immunoglobulin G Immunoblotting results for diagnosis of Helicobacter pylori infection. // Clin. Diagn. Lab. Immunol. - 2004. - Vol.11. - P.569-576.

270. Leung J.W., Liu Y.L., Leung P.S. et al. Expression of bacterial beta-glucuronidase in human bile: an in vitro study. // Gastrointestinal Endosc. -2001. - Vol.54(3). - P.346-350.

271.Leung W.K., Siu K.L.K., Kwok C.K.L. et al. //Isolation of Helicobacter pylori from vomitus in children and implication in gastro-oral transmission.//Am J Gastroenterol. - 1999. - Vol.94. -P.2881-2884.

272. Levine A., Shevah O., Shabat Sehayek V., Aeed H., Boaz M., Moss S.F., Niv Y., Avni Y., Shirin H. Masking of C-13 urea breath test by proton

pump inhibitors is dependent on type of medication: comparison between omeprazole, pantoprazole, lansoprazole and esomeprazole. // Aliment. Pharmacol. Ther. — 2004. — Vol.20. — P.l 17-122.

273. Li Y., Dannelly H.K. Inactivation of the putative tetracycline resistance gene HP 1165 in Helicobacter pylori led to loss of inducible tetracycline resistance. // Arch. Microbiol. — 2006. — Vol.185. — P.255-262.

274. Liang S.W., Redlinger T. A protocol for isolating putative Helicobacter pylori from fecal specimens and genotyping using vacA alleles. // Helicobacter. - 2003. - Vol.8. - P.561-567.

275. Liaw S.J., Teng L.J., Ho S.W., Luh K.T. Comparison of preservation mixtures for Helicobacter pylori. II J.Microbiol. Immunol. Infect. - 1998. — Vol.31(4). — P.261-263.

276. Lim T.S., Ho B. A computer program in QuickBasic for the selection of tests for the identification of Helicobacter pylori. II Comput. Biol. Med. — 1993. —Vol.23. —P.21-27.

277. Lin Y.F., Chen C.Y., Tsai M.H. et al. Duodenal ulcer-related antigens from Helicobacter pylori: immunoproteome and protein microarray approaches. // Mol. Cell. Proteomics. - 2007.

278. Lin Y.L., Lee N., Chan E.C. Determination of optimal liquid medium for enzyme expression by Helicobacter pylori. II J. Clin. Pathol. - 1996. -Vol.49.-P.818-820.

279. Liu Z.Q., Zhenq. P.Y., Yamg P.C. Efflux pump gene hefA plays an important role in multidrug resistance. //World J Gastroenterol. - 2008. -Vol.14(33). -P.5217-5222.

280. Lockard V.G., Boler R.K. infrastructure of a spiraled microorganism in the gastric mucosa of dogs. //Am J Vet Res. - 1970. - Vol.31. - P. 14531462.

281. Logan R., Dill S., Bauer F., Walker M., Hirschl A., Gummett P., Good D., Mossi S. The European 13C-urea breath test for the detection of Helicobacter pylori. II Eur. J. Gastroenterol. Hepatol. — 1991. — Vol.3. — P.915-921.

282. Lottspeich C., Schwarzer A., Panthel K., Koletzko S., Russmann H. Evaluation of the novel H.pylori ClariRes Real-Time PCR Assay for detection and clarithromycin susceptibility testing of Helicobacter pylori in stool specimens from symptomatic children. // J. Clin. Microbiol. - 2007. - Vol.45. -P.1718-1722.

283. Luenk R.D., P.T. Johnson, B C. David. Cytotoxic activity in broth-culture filrates of Campylobacter pylori. .//J Med Microbiol. - 1988. - Vol. 26. -P.93-99

284. Lundstrom A.M., Blom K., Sundaeus V., Bolin I. HpaA shows variable surface localization but the gene expression is similar in different Helicobacter pylori strains. // Microb. Pathog. — 2001. — Vol.31. — P.243-253.

285. Luzza F., Maletta M., Imeneo M., Marcheggiano A., Iannoni C., Biancone L., Pallone F. Salivary-specific immunoglobulin G in the diagnosis of Helicobacter pylori infection in dyspeptic patients. // Am. J. Gastroenterol. -1995.-Vol.90.-P.1820-1823.

286. Machado R.S., Kawakami E., Da Silva Patriccio F.R., Reber M. Urease activity does not reflect the degree of colonization by Helicobacter pylori in children. // Pediatr.Int. - 2006. - Vol.48. - P.398-402.

287. Makristathis A., Barousch W., Pasching E., Binder C., Kuderna C., Apfalter P., Rotter M.L., Hirschl A.M. Two enzyme immunoassays and PCR for detection of Helicobacter pylori in stool specimens from pediatric patients before and after eradication therapy. // J. Clin. Microbiol. - 2000. - Vol.38. -P.3710-3714.

288.Malaty H.M., Graham D.Y., Klien P.D., Evans D.G., Adam E., Evans D.J. Transmission of Helicobacter pylori infection: studies in families of individuals. // Scand. J. Gastroenterol. — 1991. — Vol.9 — P.927-932.

289. Malaty H.M., Logan N.D., Graham D.Y., Ramchatesingh J.E., Reddy S.G. Helicobacter pylori infection in asymptomatic children: comparison of diagnostic tests. // Helicobacter. - 2000. - Vol.5. - P.155-159.

290. Malfertheiner P., Megraud F., O'Morain C., Bazzoli F., El-Omar E., Graham D., Hunt R., Rokkas T., Vakil N. and Kuipers E.J. Current concepts in the management of Helicobacter pylori infection-The Maastricht III Consensus Report. Gut doi:10.1136. // gut.2006.101634. — 14 December 2006.

291. Manjunath S.M., Desai N.D., Alexander J., Patil S., Ughade S., Sawant P. Can anti- Helicobacter pylori and anti-CagA antibodies be used to select patients with dyspepsia for gastroscopy? // Trap. Gastroenterol. - 2006. -Vol.27. -P.122-126.

292. Marais A., Bilardi C., Cantet F., Mendz G.L. and Megraud F. Characterization of the genes rdxA and frxA involved in metronidazole resistance in Helicobacter pylori. II Res. Microbiol. — 2003. — Vol.154. — P.137-144.

293. Marais A., Montiero L., Megraud F. Microbiology of Helicobacter pylori. II Curr. Top Microbiol. Immunol. — 1999. — Vol.241. — P.103-22.

294. Marshall B.J. and Surveyor I. Carbon-14 urea breath test for the diagnosis of Campylobacter pylori associated gastritis. // J. Nucl. Med. — 1988. — Vol.29.—P.ll-16.

295. Marshall B.J., McGechie D.B., Francis G.J., Utley P.J. Pyloric Campylobacter serology. // Lancet. -1984. - P.281.

296. Marshall B.J., Warren L.R. Unidentified curved bacilli in the stomach of patients with gastritis and peptic ulceration. // Lancet. — 1984. — Vol.l(8390). —P.1311-1315.

297. Maurer K.J., Ihrig M.M., Rogers A.B. et al. Identification of cholelithogenic enterohepatic Helicobacter species and their role in murine cholesterol gallstone formation. // Gastroenterol. - 2005. - Vol.93(7). - P. 10231033.

298. Mayo K., Pretolani S., Gasbarrini G., Ghironzi G., Megraud F. Heterogeneity of immunoglobulin G response to Helicobacter pylori measured by the unweighted pair group method with averages. // Clin. Diagn. Lab. Immunol. - 1998. - Vol.5. - P.70-73.

299.Mazari -Hiriart M., Ponce-deLeon S., Lopez-Vidal Y. et al. Microbiological implications of periurban agriculture and water reuse in Mixico City. //PLoS ONE . - 2008. - Vol.3. -e2305

300. McNulty C.A.M., Wise R. Rapid diagnosis of Campylobacter-associated gastritis. // Lancet. — 1985. — P. 1443-1444.

301. Megraud F. A humble bacterium sweeps this year's Nobel Prize. // Cell. — 2005. — Vol.123. — P.975-976.

302. Megraud F. H. pylori antibiotic resistance: prevalence, importance, and advances in testing. // Gut. — 2004. — Vol.53. — P.1374-1384.

303. Megraud F. Risk factors for atrophic chronic gastritis in a European population: results of the Eurohepygast study. // Gut. - 2002. - Vol.50. - P.779-785.

304. Megraud F., Bonnet F., Gamier M. and Lamouliatte H. Characterization of Campylobacter pyloridis by culture, enzymatic profile, and protein content. // J. Clin. Microbiol. — 1985. — Vol.22. — P.1007-1010.

305. Megraud F., Boyanova L. and Lamouliatte H. Activity of lansoprazole against Helicobacter pylori. II Lancet. — 1991. — Vol.337. — P.1486.

306. Megraud F., Lehours P. Helicobacter pylori detection and antimicrobial Susceptibility Testing. //Clinical Microbiology Reviews. — 2007. — Vol.20. — №2. — P.280-322.

307. Menard A., Santos A., Megraud F., Oleastro M. PCR-restriction fragment length polymorphism can also detect point mutation A2142C in the 23 S rRNA gene, associated with Helicobacter pylori resistance to clarithromycin. // Antimicrob. Agents Chemother. - 2002. - Vol.46. - P. 11561157.

308.Mendall M.A., Goggin P.M., Molineau N., Levy J., Toosy T., Strachan D., Northfield T.C. Childhood living condition and Helicobacter pylori seropositivity in adult life. // Lancet. — 1992. — Vol.339. — P.896-897.

309. Mendez-Sanchez N., Pichardo R., Gonzalez J. et al. Lack of association between Helicobacter sp. colonization and gallstone disease. // J. Clin. Gastroenterol. - 2001. - Vol.32. - P.138-141.

310. Mendz G.L., Megraud F. Is the molecular basis of metronidazole resistance in microaerophilic organisms understood? // Trends Microbiol. — 2002. — Vol.10. — P.370-375.

311. Meunier O., Walter P., Chamouard P., Piemont Y., Monteil H. Isolation of Helicobacter pylori: necessity of control of transport conditions. // Pathol. Biol. (Paris). — 1997. — Vol.45. — P.82-85.

312. Meyer J.M., Silliman N.P., Wang W.J., Siepman N.Y., Sugg J.E., Morris D., Zhang J., Bhattacharyya H., King E.C., Hopkins R.J. Risk factors for Helicobacter pylori resistance in the United States: the surveillance of H. pylori. Antimicrobial Resistance partnership (SHARP) Study, 1993-1999. // Ann. Int. Med. — 2002. — Vol.136. — P.13-24.

313. Midolo P.D., Korman M.G., Turnbridge J.D. et al. Helicobacter pylori resistance to tetracycline. // Lancet. - 1996. - Vol.347. - P.l 194-1195.

314. Miehlke S., Kirsch C., AghaAmiri K., Gunther T., Lehn N., Malfertheiner P., Stolte M., Ehninger G., Bayerdorffer E. The Helicobacter pylori vacA si, ml genotype and cagA is associated with gastric carcinoma in Germany. // Int. J. Cancer. - 2000. - Vol.87. - P.322-327.

315. Miehlke S., Yu J., Schuppler M. et al. Helicobacter pylori vac A, ice A, and cagA status and pattern of gastritis in patients with malignant and benign gastroduodenal disease. // Am. J. Gastroenterol. — 2001. — Vol.96(4). — P.1008-1013.

316. Miller M.B., Bassler B.L. Quorum sensing in bacteria. // Annu. Rev. Microbiol. — 2001. — Vol.55. — P.165-199.

317. Minami M., Ohta M., Ohkura T., Ando T., Torii K., Hasegawa T., Goto H. Use of a combination of brushing technique and loop-mediated isothermal amplification method as a novel, rapid, and safe system for detection of Helicobacter pylori. II J. Clin. Microbiol. - 2006. - Vol.44. - P.4032-4037.

318. Misra V., Misra S.P., Singh P.A., Dwivedi M., Verma K., Narayan U. Significance of cytomorphological and microbiological examination of bile collected by endoscopic cannulation of the papilla of vater. // Indian J Pathol Microbiol. - 2009. - Vol.52. - P.328-331

319. Misra V., Misra S.P., Dwivedi M., Singh P.A. Giardia lamblia trophozoites in gastric biopsies. // Indian J. Pathol. Microbiol. - 2006. -Vol.49(4). - P.519-23.

320. Mobley H.L.T., Cortesia M.J., Rosenthal L.E. et al. Characterization of urease from Campylobacter pylori. II J. Clin. Microbiol. - 1988. - Vol.26. -P.831-836.

321. Monstein H.J., Jonsson Y., Zdolsek J. et al. Inentification of Helicobacter pylori DNA in human cholesterol gallstones. // Scand. J. Gastroenterol. - 2002. - Vol.37(l). - P. 112-119.

322. Monteiro L., Bonnemaison D., Vekris A., Petry K.G., Bonnet J., Vidal R., Cabrita J., Megraud F. Complex polysaccharides as PCR inhibitors in feces: Helicobacter pylori model. // J. Clin. Microbiol. - 1997. - Vol.35. - P.995-998.

323. Monteiro L., Gras N., Vidal R., Cabrita J., Megraud F. Detection of Helicobacter pylori DNA in human feces by PCR: DNA stability and removal of inhibitors. // J. Microbiol. Methods. - 2001. - Vol.45. - P.89-94.

324. Montgomery E.A., Martin D.F., Peura D.A. Rapid diagnosis of Campylobacter pylori by Gram's stain. // Am. J. Clin. Pathol. -1988. - Vol.90. -P.606-609.

325. Moorchung N., Srivastava An Gupta N.K., Achyut B.R., Mittal B. The histopathology of chronic gastritis. // Indian J. Pathol. Microbiol. - 2007. -Vol.38.-P.18-24.

326. Moreira E.D., Nassri V.B., Santos R.S., Matos J.F., De Carvalho W.A., Silvani C.S., Sant'Ana C.S. Association of Helicobacter pylori infection and giardiasis: Results from a study of surrogate markers for fecal exposure among children. // World J. Gastroenterol. - 2005. - Vol.11(18). - P.2759-2763.

327. Moricz A., Melo M., Castro A.M., Campos T.,; Rodrigo Altenfelder Silva R.A., Pacheco Jr A.M. Prevalence of Helicobacter spp in chronic cholecystitis and correlation with changes on the histological pattern of the gallbladder. // Acta Cir. Bras. - 2010. - №3. - P.218-224.

328. Morris A.J., Ali M.R., Nicholson G.I., Perez-Perez G.I., Blaser M.J. Long-term follow-up of voluntary ingestion of Helicobacter pylori. H Ann. Int. Med. - 1991. - Vol.114. -P.662-663.

329. Morrison S., Ward A., Hoyle C.J., Henderson P.J.F. Cloning, expression, purification and properties of a putative multidrug resistance efflux protein from Helicobacter pylori. // Int. J. Antimicrob. Agents — 2003. — Vol.22. —P.242-249.

330. Morshed M.G., Karita M., Konishi H., Okita K., Nakazawa T. Growth medium containing cyclodextrin and low concentration of horse serum for cultivation of Helicobacter pylori. II Microbiol. Immunol. - 1994. - Vol.38(ll). -P.897-900.

331. Morton D., Bardhan K.D. Effect of transport medium and transportation time on culture of Helicobacter pylori from gastric biopsy specimens. // J. Clin. Pathol. -1995. - Vol. 48(1). - P.91-92.

332. Moulton-Barrett R., Triadafilopoulos G., Michener R. and Gologorsky D. Serum 13C-bicarbonate in the assessment of gastric Helicobacter pylori urease activity. // Am. J. Gastroenterol. — 1993. — Vol.88. —P.369-374.

333. Moyaert H., Decostere A., Vandamme P. et al. Helicobacter equorum sp.nov., a urease-negative Helicobacter species isolated from horse feces. // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. — 2007. — Vol.57. — P.213-218.

334. Moyaert H., Franceschi F., Roccarina D. et al. Extragastric manifestations of Helicobacter pylori infection: other Helicobacters. //Helicobacter. - 2008. - Vol.l3(l). -P.47-57.

335. Mubarak S.A., Adeel Islam A., Abida A.E. Analysis of Helicobacter pylori antimicrobial susceptibility and virulence genes in gastric mucosal biopsies in the United Arab Emirates. // Indian J. Gastroenterol. - 2007. -Vol.26.-P.221-224

336. Mukhopadhyay A.K., Jeong J.Y., Dailidiene D., Hoffman P.S., Berg D.E. ThJeong J.Y. fdxA ferrodoxin gene can down regulate frxA nitroreductase gene expression and is essential in many strains of Helicobacter pylori. II J. bacterial. - 2003. - Vol.l85(9). -P.2927-2935.

337. Mukhopadhyay A.K., Kersulyte D., Jeong J.Y., Datta S., Ito Y., Chowdhury A. et al . Distinctiveness of genotypes of Helicobacter pylori in Calcutta, India . // J. Bacteriol. - 2000. - Vol.182. - P.3219-27.

338. Munster D.J., Chapman B.A., Burt M.J., Dobbs B.R., Allardyce R.A., Bagshaw P.F., Troughton W.D., Cook H.B. The fate of ingested 14C-urea in the urea breath test for Helicobacter pylori infection. // Scand. J. Gastroenterol. — 1993. — Vol.28. — P.661-666.

339. Murano A., Miyake M., Kato J., Tanzawa H., Takeo K., Nöda M. Enhancement of the growth of Helicobacter pylori in Brucella broth by hydrogen peroxide. // Microbiol. Immunol. - 1999. - 43(11). - P.1009-15.

340. Myung S J., Kim M.H., Shim K.N. et al. Detection of Helicobacter pylori DNA in human biliary tree and its association with hepatolithiasis. // Dig. Dis. Sei. - 2000. - Vol.45. - №7. - P.1405-1412.

341. Nahar S., Mukhopadhyay A.K., Khan R., Ahmad M.M., Datta S., Chattopadhyay S., Dhar S.C., Sarker S.A., Engstrand L., Berg D.E., Nair G.B., Rahman M. Antimicrobial susceptibility of Helicobacter pylori strains isolated in Bangladesh. // J. Clin. Microbiol. — 2004. — Vol.42. —P.4856-4858.

342. NCCLS. 1995. Performance standards for antimicrobial susceptibilities testing. M7-A3. National Committee for Clinical Laboratory Standards, Villanova, PA.

343. Ndawula E.M., Owen R.J., Mihr G., Borman P., Hurtado A. Helicobacter pylori bacteraemia. // Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. - 1994. -Vol.13.-P.621.

344. Necchi V., Candusso M.E., Tava F., Luinetti O., Ventura U., Fiocca R., Ricci V., Solcia E. Intracellular, intercellular, and stromal invasion of gastric mucosa, preneoplastic lesions, and cancer by Helicobacter pylori. II Gastroenterology. - 2007. - Vol.132. - P.1009-1023.

345. Neri V., Magriotta M., De Francesco V. et al., DNA sequences and protein antigens of H.pylori in cholecystic bile and tissue of patients with gallstones. // Aliment. Pharmacol. Ther. - 2005. - Vol. 15(22). - P.715-720.

346. Newell D.G. and Rathbone B.J. The serodiagnosis of Campylobacter pylori infection-a review. // Serodiagn. Immunother. - 1989. - Vol.3. - P.l.

347. Nilsson H.O., Mulchandani R., Stenram U. et al. Helicobacter species identified in liver from patients with cholangiocarcinoma and hepatocellular carcinoma. // Gastroenterology. - 2001. - Vol.120. - P.323-324.

348. Nilsson I., Ljungh A., Aleljung P., Wadström T. Immunoblot assay for serodiagnosis of Helicobacter pylori infections. // J. Clin. Microbiol. - 1997. - Vol.35.-P.427-432.

349. Nimri L.F., Matalka I., Bani Hani K., Ibrahim M. Helicobacter pylori genotypes identified in gastric biopsy specimens from Jordanian patients. // BCM Gastroenterol. - 2006. - Vol.6. - P.27.

350. Nishizawa T., Suzuki H., Umezawa A., Muraoka H., Iwasaki E., Masaoka T., Kobayashi I., Hibi T. Rapid detection of point mutations conferring resistance to fluoroquinolone in gyrA of Helicobacter pylori by allele-specific PCR. // J. Clin. Microbiol. - 2007. - Vol.45. - P.303-305.

351. Nonaka L., Connell S.R., Taylor D.E. 16S rRNA mutations that confer tetracycline resistance in Helicobacter pylori decrease drug binding in Escherichia coli ribosomes. // J. Bacteriol. — 2005. — Vol.187. — P.3708-3712.

352.Nowotty Y., Heilmann K.I. Epidemiology of Helicobacter pylori infection. // Leber. Magen. Darm. — 1990. — Vol.20. — P.183-186.

353. Occhialini A., Urdaci M., Doucet-Populaire F., Bebear C.M., Lamouliatte H., Megraud F. Macrolide resistance in Helicobacter pylori: rapid detection of point mutations and assays of macrolide binding to ribosomes. // Antimicrob. Agents Chemother. — 1997. — Vol.41. — P.2724-2728.

354. Odenbreit S., Kavermann H., Puls J., Haas R. CagA tyrosine phosphorylation and interleukin-8 induction by Helicobacter pylori are independent from AlpAB, HopZ and Bab-group outer membrane proteins. // Int. J. Med. Microbiol. — 2002. — Vol.292. — P.257-266.

355. Odenbreit S., Puls J., Sedlmaier B., Gerland E., Fischer W., Haas R. Translocation of Helicobacter pylori CagA into gastric epithelial cells by type IV secretion. // Science. — 2000. — Vol.287. — P.1497-1500.

356. Odoi A., Martin S.W., Michel P., Holt J., Middleton D., Wilson J. Determinants of the geographical distribution of endemic giardiasis in Ontario, Canada: a spatial modelling approach. // Epidemiol. Infect. - 2004. - Vol.132. -P.967-976.

357. Offner G.D., Gong D., Afdhal N.H. Identification of a 130 kilodalton human biliary concavalin a binding protein as aminopeptidase. // N. Gastroenterol. - 1994. - Vol.106. - P.755-762.

358. Ogura K., Maeda S., Nakao M. et al. Virulence factors of Helicobacter pylori responsible for gastric diseases in Mongolian gerbil. // J. Exp. Med. —2000. — Vol.l92(ll). — P.1601-1610.

359. Oksanen A., Veijola L., Sipponen P., Schauman K.O., Rautelin H.I. Evaluation of Pyloriset screen, a rapid whole-blood diagnostic test for Helicobacter pylori infection. // J. Clin. Microbiol. - 1998. - Vol.36. - P.955-957.

360. Oksanen K., Kainulainen H., Ruuska T., Maki M., Ashorn M. Reverse transcription polymerase chain reaction in the diagnosis of Helicobacter pylori infection in Finnish children. // J. Pediatr. Gastroenterol. Nutr. - 1999. -Vol.28.-P.252-256.

361. Oleastro M., Monteiro L., Lehours P. et al. Identification of markers of Helicobacter pylori strains isolated from children with peptic ulcer disease by subtractive hybridization. // Infect Immun. - 2006. - Vol.74. - P.4064-4074.

362. Olivera-Severo D., Wassermann G.E., Carlini C.R. Ureases display biological effects independent of enzymatic activity. Is there a connection to diseases caused by urease-producing bacteria? // Brazilian Journal of Medical and Biological Research. — 2006. — Vol.39. — P.851-861.

363. Olivieri R., Bugnoli M., Armellini D. Growth of Helicobacter pylori in media containing cyclodextrins. // J. Clin. Microbiol. - 1993. - Vol.31. -P.160-162.

364. Osato M.S., Reddy R., Reddy S.G., Penland R.L., Malaty H.M., Graham D.Y. Pattern of primary resistance of Helicobacter pylori to metronidazole or clarithromycin in the United States. // Arch. Int. Med. —2001.

— Vol.161. —P.1217-1220.

365. Owen R.E. The genome: viewpoint of biologist. The Year in Helicobacter pylori. II Current opinion Gastroenterol. — 1998. — Vol.14 (1). — P. 164.

366. Owen R.J., On S.L., Costas M. The effect of cooling rate, freeze-drying suspending fluid and culture age on the preservation of Campylobacter pylori. II J. Appl. Bacteriol. - 1989. - Vol.66. - P.331-337.

367. Pal D., Banerjee S., Cui S. et al. Giardia, Entamoeba, Trichomonas enzymes activate metronidazole (nitroreductases) and inactivate metronidazole (NIMs). // Antimicrob Agents Chemother. - 2008. - (in print).

368. Patel P., Mendall M.A., Khulusi S., Molineaux N., Levy J., Maxwell J.D., Northfield T.C. Salivary antibodies to Helicobacter pylori: screening dyspeptic patients before endoscopy. // Lancet. - 1994. - Vol.344. - P.511-512.

369.Patel P., Mendall M.A., Khulusi S., Northfield T.C., Strachan D.P. Helicobacter pylori infection in childhood: risk factors and effect on growth. //Br. Med. J. — 1994. — Vol.309. — P. 1119-1123.

370. Pathak C.M., Bhasin D.K., Panigrahi D., Goel R.C. Evaluation of 14C-urinary excretion and its comparison with 14C02 in breath after 14C-urea administration in Helicobacter pylori infection. I I Am. J. Gastroenterol. — 1994.

— Vol.89.—P.734-738.

371. Pellicano R., Franceschi F., Saracco G. et al Helicobacters and extragastric diseases. // Helicobacter. - 2009. - Vol.l4(suppl.l). - P.58-68.

372. Pellicano R., Leone N., Berrutti M. et al. Helicobacter pylori seroprevalence in hepatitis C virus positive patients with cirrhosis. // Journal Hepatology. - 2000. - Vol.33. - P.648-650.

373. Pellicano R., Menard A., Rizzetto M., Megraud F. Helicobacter species and liver diseases: association or causation? // Lancet. Infect. Dis. -2008. - Vol.8(4). - P.254-260.

374. Perez Aldana L., Kato M., Nakagawa S., Kawarasaki M., Nagasako T., Mizushima T., Oda H., Kodaira J., Shimizu Y., Komatsu Y., Zheng R., Takeda H., Sugiyama T., Asaka M. The relationship between consumption of antimicrobial agents and the prevalence of primary Helicobacter pylori resistance. // Helicobacter. — 2002. — Vol.7. — P.306-309.

375. Piccolomini R., DeBonaventura G., Festi D. Optimal combination of media for primary isolation of Helicobacter pylori from gastric biopsy specimens. // J. Clin. Microbiol. - 1997. - Vol.35. - P.1541-1544.

376. Piccolomini R., DiBonaventura G., Catamo G., Carbone F., Neri M. Comparative evaluation of the E test, agar dilution, and broth microdilution for testing susceptibilities of Helicobacter pylori strains to 20 antimicrobial agents. // J. Clin. Microbiol. - 1997. - Vol.35. - P.1842-1846.

377. Pietroiusti A., Diomedi M., Silvestrini M., Cupini L.M., Luzzi I., Gomez Miguel M.J., Bergamaschi A., Magrini A., Carrabs T., Vellini M., Galante A. Cytotoxin-associated gene-A-positive Helicobacter pylori strains are associated with atherosclerotic stroke. // Circulation. - 2002. - Vol.106. -P.580-584.

378. Pilotto A., Rassu M., Bozzola L., Leandro G., Franceschi M., Furlan F., Meli S., Scagnelli M., Di Mario F., Valerio G. Cytotoxin-associated gene Apositive Helicobacter pylori infection in the elderly. Association with gastric atrophy and intestinal metaplasia. // J. Clin. Gastroenterol. - 1998. - Vol.26. -P. 18-22.

379. Pinkard K.J., Harrison B., Capstick J.A., Medley G., Lambert J.R. Detection of Campylobacter pyloridis in gastric mucosa by phase contrast microscopy. // J. Clin. Pathol. - 1986. - Vol.36. - P.l 12-113.