Определение маркеров патогенности недифтерийных коринебактерий тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 00.00.00, кандидат наук Мангутов Эрдем Очанович
- Специальность ВАК РФ00.00.00
- Количество страниц 139
Оглавление диссертации кандидат наук Мангутов Эрдем Очанович
ВВЕДЕНИЕ
ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1.1. Значение недифтерийных коринебактерий для организма человека
1.2. Факторы патогенности
1.3. Микробиологическая диагностика
1.4. Чувствительность и резистентность к антимикробным препаратам
1.5. Новые виды СогупеЬа^епит Брр
ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ
2.1. Микробные штаммы
2.2. Методы определения основных биологических свойств штаммов СогупеЬа^епит Брр
2.2.1. Морфологические свойства. Электронная микроскопия
2.2.2. Культуральные и ферментативные свойства
2.2.3. Методы идентификации
2.3. Методы определения фенотипических маркеров патогенности и резистентности к антимикробным препаратам штаммов СогупеЬа^епит
Брр
2.3.1. Цитопатическое действие
2.3.2. Адгезивные свойства
2.3.3. Инвазивные свойства
2.3.4. Токсигенные свойства
2.3.5. Определение вирулентности штаммов СогупеЬа^епит Брр. на личинках восковой моли ОаНепа те11опе11а
2.3.6. Чувствительность к антимикробным препаратам
2.4. Методы определения генотипических маркеров патогенности и резистентности к антимикробным препаратам штаммов СогупеЬа^епит
Брр
2.4.1. Полногеномное секвенирование и биоинформационный анализ
2.5. Статистические методы
ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ СОБСТВЕННЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ
3.1. Основные биологические свойства и частота выделения штаммов СогупеЬа^епит Брр. от больных с воспалительными заболеваниями респираторного тракта
3.2. Определение фено- и генотипических маркеров патогенности
штаммов СогупеЬа^епит Брр
3.2.1. Цитотоксичность
3.2.2. Определение вирулентности штаммов СогупеЬа^епит Брр. на модели личинок восковой моли ОаНепа те11опе11а
3.2.3. Адгезивные свойства
3.2.4. Инвазивные свойства
3.2.5. Определение генотипических маркеров патогенности штаммов СогупеЬа^епит Брр
3.3. Определение фено- и генотипических маркеров резистентности к антимикробным препаратам штаммов СогупеЬа^епит Брр
3.3.1. Определение фенотипической резистентности к антимикробны препаратам
3.3.2. Определение генотипических маркеров резистентности к антимикробным препаратам
3.4. Определение взаимосвязи патогенных свойств и резистентности к антимикробным препаратам штаммов СогупеЬа^епит Брр
3.4.1. Корреляционно-регрессионный анализ взаимосвязи фенотипических маркеров патогенности (адгезия, инвазия, цитотоксичность) и резистентности к антимикробным препаратам штаммов СогупеЬа^епит
Брр
3.4.2. Определение генотипических маркеров патогенности и резистентности к антимикробным препаратам штаммов СогупеЬа^епит Брр
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ВЫВОДЫ
ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ
ПЕРСПЕКТИВЫ ДАЛЬНЕЙШЕЙ РАЗРАБОТКИ ТЕМЫ
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ И УСЛОВНЫХ ОБОЗНАЧЕНИЙ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
ВВЕДЕНИЕ
Рекомендованный список диссертаций по специальности «Другие cпециальности», 00.00.00 шифр ВАК
Недифтерийные коринебактерии: биологические свойства и роль в развитии инфекционных процессов у человека2016 год, кандидат наук Воронина Наталья Александровна
Адгезия Corynebacterium diphtheriaе: роль в патологии и способы подавления2020 год, кандидат наук Алиева Анна Александровна
Сравнительная характеристика биологических свойств Porphyromonas gingivalis и Aggregatibacter actinomycetemcomitans возбудителей пародонтита2017 год, кандидат наук Губайдуллин Азат Гирфанович
Конвергенция вирулентности и антимикробной резистентности у Klebsiella pneumoniae2024 год, кандидат наук Чулкова Полина Сергеевна
Биологические основы разработки новых технологий для диагностики и мониторинга дифтерии2011 год, доктор медицинских наук Краева, Людмила Александровна
Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Определение маркеров патогенности недифтерийных коринебактерий»
Актуальность темы исследования
Corynebacterium spp., являясь условно-патогенными микроорганизмами, колонизируют кожу и слизистые оболочки человека; некоторые их виды встречаются во внешней среде и выделяются от животных [9, 11, 43, 49, 55, 64, 104]. Накапливается всё больше данных о роли Corynebacterium sрр. в патологии как у иммунокомпрометированных, так и иммунокомпетентных пациентов, чему способствует недостаточность врождённого иммунитета, хронические заболевания, социальные и другие условия. C. pseudodiphtheriticum, близкородственный ему вид C. propinquum, C. amycolatum, C.accolens, С. argentoratense, C. tuberculostearicum связывают с воспалительными заболеваниями респираторного и урогенитального тракта, кожи и др. [11, 21, 36, 51, 55, 56, 80, 93]. С. pseudodiphtheriticum может явиться причиной развития бактериальной коинфекции у больных с новой коронавирусной инфекцией (COVID-19), находящихся на искусственной вентиляции лёгких [72]. Недифтерийные коринебактерии и, в частности, C. striatum, могут обусловливать развитие инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи (ИСМП) [120, 155, 163]. Особенностью C. striatum является способность к формированию биопленки и множественная лекарственная устойчивость (МЛУ) к антимикробным препаратам (АМП) [161, 165]. Известно о случае бактериемии, обусловленной C. striatum, у пациента на фоне тяжелого течения COVID-19 [77].
Род Corynebacterium включает более 150 различных видов коринебактерий, около 50 из которых играют роль в патологии человека и имеют биотехнологическое значение [50, 63, 111]. В последнее время в связи с развитием молекулярно-генетических методов исследования усовершенствованы методы идентификации Corynebacterium sрр. и, как следствие, описаны новые виды, способные вызывать развитие коринебактериальной инфекции. В 2018 г. новыми патогенами человека признаны C. striatum [145] и C. belfantii, способствующий
развитию гнойно-воспалительных процессов в дыхательных путях у человека [150]. В 2020 г. выделен C. тили, вызывающий поражения кожных покровов у людей, схожие с дифтерией кожи [27, 76]. В 2021 г. выделен от дикого кабана и косули C. silvaticum, несущий ген дифтерийного токсина, и способный поражать людей [125]. В 2023 г. из образца кисты сальной железы выделен и идентифицирован с помощью секвенирования генов 16S рРНК и гроВ C. guaraldiae sp. nov. [70]. Из мочи здоровых женщин и больных с диагнозом гиперактивный мочевой пузырь выделено восемь новых видов коринебактерий (€. ^таптае, C. теЫпете, C. evansiae, C. шпеае, C. macclintоckiae, C. hessae, C. marquesiae, C. уопаШае) [88]. Исследователи полагают, что эти новые виды CоryneЬacterium Брр. могут быть не только патогенны для человека, но и иметь полезные свойства.
Степень разработанности темы исследования
Патогенность микроорганизмов рода Corynebacterium связывают, в основном, с продукцией токсинов (дифтерийный (клада C. diphtheriae, C. ulcerans) и PLD-экзотоксин (фосфолипаза D) (C. pseudotuberculosis)) [75, 84, 116, 124]. Другие виды Corynebacterium Брр. не продуцируют токсины, что свидетельствует о роли в развитии инфекционного процесса иных факторов патогенности, которые пока недостаточно изучены. Известно, что недавно идентифицированный вид C. silvaticum, содержащий ген дифтерийного токсина, но не продуцирующий токсин, проявляет цитотоксичность на клеточных линиях HeLa, Detroit 562 и вирулентность на модели личинок восковой моли Galleria mellonella [125, 131]. Важное значение при характеристике изолятов недифтерийных коринебактерий, выделяемых из различных биотопов организма человека, имеет установление их резистентности к АМП, особенно множественной. Так, C. striatum, являясь одной из частых причин развития ИСМП [96, 163], обладает патогенными свойствами, способностью к биопленкообразованию и множественной лекарственной устойчивостью.
Известно, что предшествующее лечение пациентов АМП, по-видимому, даже способствует колонизации C. pseudodiphtheriticum их организма [58].
Микробиологическая диагностика заболеваний, связанных с недифтерийными коринебактериями, затруднена. Это обусловлено их высокой требовательностью к условиям культивирования и присутствием в исследуемом материале других микроорганизмов (Р. aeruginosa, S. aureus, B. catarrhalis), ингибирующих рост Corynebacterium sрр. [21, 130]. Помимо этого, обычные фенотипические методы исследования не обладают достаточной специфичностью и приводят к двусмысленной или ошибочной идентификации коринеформных бактерий [29, 31, 32, 86, 166]. Для установления клинической значимости изолятов Corynebacterium sрр. в развитии инфекционного процесса большое значение имеет определение их количества в правильно собранном клиническом материале, а также определение факторов патогенности [39, 166].
Вышеизложенное свидетельствует о недостаточности сведений о роли в развитии инфекционного процесса, вызываемого Corynebacterium sрр., иных, помимо токсинов, факторов патогенности. Это указывает на значимость выявления фено- и генотипических маркеров патогенности и резистентности к АМП этих микроорганизмов и их взаимосвязи.
Цель и задачи исследования
Определение фенотипических и генотипических маркеров патогенности клинических изолятов недифтерийных коринебактерий от больных с воспалительными заболеваниями респираторного тракта.
Для достижения поставленной цели решались следующие задачи:
1. Охарактеризовать основные биологические свойства и провести сравнительный анализ частоты выделения штаммов Corynebacterium sрр. от больных с воспалительными заболеваниями респираторного тракта и практически здоровых лиц.
2. Исследовать фено- и генотипические маркеры патогенности клинических
изолятов CоryneЬacterium Брр. от больных с воспалительными заболеваниями респираторного тракта и практически здоровых лиц.
3. Провести сравнительный анализ частоты выявления фено- и генотипических маркеров резистентности к АМП штаммов CоryneЬacterium Брр., выделенных от больных с воспалительными заболеваниями респираторного тракта и практически здоровых лиц.
4. Охарактеризовать взаимосвязь патогенности и резистентности к АМП клинических изолятов недифтерийных коринебактерий.
Научная новизна
Впервые дана сравнительная характеристика фенотипических (адгезивность, инвазивность, цитотоксичность, вирулентность) и генотипических маркеров патогенности ф1Р0733, RS23695, sрaD, sрaE, sрaF, srtB, srtC, srtD, fadD2, оtsA, deоC, рccB, рccB1, рccB2, cwlh, fagD и рМ) клинических изолятов недифтерийных коринебактерий от больных с воспалительными заболеваниями респираторного тракта и практически здоровых лиц. Проведен сравнительный анализ взаимосвязи генотипических маркеров патогенности и их фенотипических проявлений.
Впервые установлено, что высокий адгезивно-инвазивный потенциал не продуцирующих токсин штаммов коринебактерий способствует развитию острого воспалительного процесса в респираторном тракте (патент на изобретение РФ «Способ отбора пациентов в группу риска по развитию фолликулярной ангины» № 2672862 от 20 ноября 2018 г.) [3, 22].
Установлено, что популяция штаммов CоryneЬacterium Брр., выделяемых от больных с патологией респираторного тракта и практически здоровых лиц, гетерогенна. Наличие у этих клинических изолятов фено- и генотипических маркеров патогенности связано как с видовой, так и штаммовой принадлежностью, что необходимо учитывать при проведении микробиологической диагностики.
Показано, что среди штаммов СоryneЬacterium Брр. от больных с
воспалительными заболеваниями респираторного тракта и практически здоровых лиц превалирует резистентность к клиндамицину, связанная с наличием гена erm(X), локализованного в хромосоме и имеющего вертикальный путь распространения. Расположение других выявленных у коринебактерий генов резистентности к АМП (aph(3')-Ia, aph(3")-Ib, aph(6)-Id, tetAВ(А), tet(W), ^x, sul1) в составе мобильных генетических элементов свидетельствует об их горизонтальном переносе, что, по всей видимости, может приводить к их быстрому распространению в популяции.
Впервые показана коррелятивная связь фенотипических маркеров патогенности (адгезивность, инвазивность, цитотоксичность) и резистентности к АМП штаммов Corynebacterium sрр., выделенных от больных с воспалительными заболеваниями респираторного тракта.
Авторские штаммы Corynebacterium sрр. (С. pseudodiphtheriticum R7, R9, R11, C. amycolatum R2, R3, C. afermentans R12, C. falsenii R132, С. striatum R546) депонированы в Государственной коллекции патогенных микроорганизмов и клеточных культур «ГКМП-Оболенск». Аннотированные последовательности геномов изолятов недифтерийных коринебактерий депонированы в международной базе данных GenBank как проект секвенирования PRJNA339674 (SAMN31031755, SAMN31031754, SAMN31031753, SAMN31031752, SAMN31031751, SAMN31031750, SAMN31031749, SAMN31031748, SAMN31031747, SAMN31031746, SAMN31031745, SAMN31031744).
Личный вклад
Автор лично принимал участие в выборе направления, цели и задач исследования, подборе и изучении зарубежных и отечественных литературных источников, разработке и реализации плана исследования, подборе современных методов исследования. Автором лично проведен отбор и идентификация штаммов недифтерийных коринебактерий, определение их основных биологических свойств, фено- и генотипических маркеров патогенности и резистентности к АМП
с использованием физико-химических, культуральных и молекулярно-генетических методов исследования. Автором лично статистически обработаны результаты собственных исследований и проведен их научный анализ, сформулированы основные положения диссертации, выносимые на защиту, выводы и практические рекомендации. Подготовка публикаций, апробация результатов исследования, написание и оформление диссертации и автореферата выполнены автором самостоятельно.
Теоретическая и практическая значимость работы
Впервые с использованием культуральных и молекулярно-генетических методов исследования изучены штаммы Corynebacterium Брр., выделенные от больных с воспалительными заболеваниями респираторного тракта и практически здоровых лиц на территории г. Ростова-на-Дону и Ростовской области. Получены новые данные о фено- и генотипических маркерах патогенности и резистентности к АМП этих клинических изолятов. Приведены факты, свидетельствующие о неоднородности популяции штаммов недифтерийных коринебактерий, которая состоит из изолятов с патогенными и вирулентными свойствами высокой, средней и низкой степени выраженности. Определены генотипические маркеры патогенности недифтерийных коринебактерий и установлена их связь с фенотипическими проявлениями патогенных свойств. Установлено, что наиболее выраженными фенотипическими проявлениями патогенных свойств обладают C. falsenii и С. striatum, содержащие широкий набор генов патогенности. Другие виды недифтерийных коринебактерий (C. aurimucosum, C. amycolatum, C. argentoratense, С. coyleae, C. afermentans) являются потенциальными патогенами, способными вызвать гнойно-воспалительные заболевания в респираторном тракте человека. Среди часто выделяемых видов С. pseudodiphtheriticum и С. propinquum выявлены штаммы, характеризующиеся как средней, так и низкой патогенностью. Определены фено- и генотипические маркеры резистентности к АМП и установлена их тесная прямая корреляционная
связь с патогенностью у штаммов Corynebacterium sрр., выделенных от больных с воспалительными заболеваниями респираторного тракта.
Результаты диссертационного исследования позволяют расширить существующие представления о значении Corynebacterium sрр. в развитии воспалительных заболеваний респираторного тракта и показывают, что при проведении микробиологической диагностики необходимо учитывать как видовую, так и штаммовую принадлежность, принимая во внимание фено- и генотипические маркеры патогенности и количественную обсемененность биоматериала.
Авторские штаммы Corynebacterium sрр., выделенные от больных с воспалительными заболеваниями респираторного тракта
(С. pseudodiphtheriticum R7, R9, R11, C. amycolatum R2, R3, C. afermentans R12, C. falsenii R132, С. striatum R546) депонированы в Государственной коллекции патогенных микроорганизмов и клеточных культур «ГКМП-Оболенск». Аннотированные последовательности геномов изолятов недифтерийных коринебактерий депонированы в международной базе данных GenBank как проект секвенирования PRJNA339674 с регистрационными номерами: SAMN31031755, SAMN31031754, SAMN31031753, SAMN31031752, SAMN31031751, SAMN31031750, SAMN31031749, SAMN31031748, SAMN31031747, SAMN31031746, SAMN31031745, SAMN31031744.
Материалы диссертации внедрены в образовательный процесс кафедры микробиологии и вирусологии № 2 ФГБОУ ВО РостГМУ Минздрава России (акт внедрения от 28 февраля 2024 г.).
Методология и методы исследования
Объекты исследований. Исследованы клинические штаммы Corynebacterium sрр., выделенные от больных с воспалительными заболеваниями респираторного тракта (тонзиллит, назофарингит, бронхит) (99 шт.), и практически здоровых лиц (33 шт.). Штаммы получены за период с 2017 г. по
2021 г. из бактериологических лабораторий ФГБОУ ВО РостГМУ Минздрава России, МБУЗ «Городская больница № 20 города Ростова-на-Дону», МБУЗ «Детская городская больница № 1 города Ростова-на-Дону».
Основные биологические свойства коринебактерий определяли в соответствии с рекомендациями [17, 18].
Электронно-микроскопическое исследование осуществляли с использованием трансмиссионного электронного микроскопа Tecnai G2 Зркй Вю TWIN (FEI, Чехия) при ускоряющем напряжении 120 кВ.
Идентификацию коринебактерий проводили с помощью культурального и масс-спектрометрического метода (MALO^^F-MS).
Адгезивные и инвазивные свойства определяли на культуре клеток карциномы фарингеального эпителия (Нер-2) [3, 147]; цитопатическое действие (ЦПД) - на клеточной линии CHO-K1 [3, 41]; вирулентность - на личинках восковой моли G. mellonella [156].
Чувствительность к АМП определяли диско-диффузионным методом и с помощью автоматизированного баканализатора VITEK 2 Сошрае! (ВюМепеих) [20].
Полногеномное секвенирование осуществляли на платформе MGI (MGI Tech Со., Ltd, США) с использованием наборов MGIEasy FS DNA Library Ргер Kit и MGI-Seq 2000RS High-thrоughрut sequencing kit PE200 (MGI Tech Со., Ltd, США). Поиск генов патогенности проводили с использованием базы данных факторов вирулентности (VFDB) [83], генов резистентности к АМП - программы Abricate 1.0.1 [160]. Филогенетический анализ проводили на основании множественного выравнивания общих генов исследуемой группы штаммов с использованием программы гоагу (v.3.13.0) [27, 160].
Статистический анализ проводили с помощью программы STATISTICA 12.0 (StatSоftInc., США) и MedCalc (версия 9.3.5.0).
Положения, выносимые на защиту
1. Клинические изоляты Cоrynebacterium Брр. от больных с воспалительными заболеваниями респираторного тракта и практически здоровых лиц, обладая типичными биологическими свойствами, имеют некоторые особенности морфологической структуры и ферментативной активности; их видовое разнообразие представлено шире у больных, чем у практически здоровых лиц.
2. Фенотипическими маркерами патогенности штаммов Cоrynebacterium Брр. являются цитотоксичность, адгезивность, инвазивность и вирулентность, генотипическими - гены, кодирующих синтез поверхностных структур, компонентов клеточной стенки и выработку предшественника токсина РЬБ (рШ-ген).
3. Штаммы Cоrynebacterium Брр., выделенные от больных с воспалительными заболеваниями респираторного тракта, чаще проявляют фенотипическую резистентность к АМП и характеризуются более широким набором генов резистентности к АМП, чем изоляты от практически здоровых лиц.
4. У клинических изолятов Cоrynebacterium Брр. от больных с воспалительными заболеваниями респираторного тракта обнаружена взаимосвязь патогенных свойств и резистентности к АМП.
Соответствие диссертации паспорту научной специальности
Диссертационное исследование, включающее вопросы изучения антибактериальных свойств различных химических соединений, соответствует паспорту специальности 1.5.11. Микробиология (Медицинские науки).
Результаты проведенного исследования соответствуют пунктам 3, 4, 6, 11, 12 паспорта специальности.
Степень достоверности и апробация результатов
Экспериментальные исследования проведены в достаточном объеме с использованием современных культуральных, физико-химических (МЛЬВЬТоБ-МБ), молекулярно-генетических (полногеномное секвенирование и биоинформатический анализ) и статистических методов. Выводы диссертационной работы имеют теоретическое и практическое обоснование, соответствуют целям и задачам проведенного исследования.
Апробация диссертационной работы проведена на научных мероприятиях: VII Межрегиональной научно-практической конференции «Воздушно-капельные инфекции: микробиология, эпидемиология, биотехнология» (9-11 апреля 2018 г., г. Ростов-на-Дону); Российско-Китайской научно-практической конференции по медицинской микробиологии и клинической микологии XXII Кашкинские чтения (13-15 июня 2019 г., г. Санкт-Петербург); XI Ежегодном Всероссийском конгрессе по инфекционным болезням с международным участием «Инфекционные болезни в современном мире: эволюция, текущие и будущие угрозы» (1-3 апреля 2019 г., г. Москва); VIII Межрегиональной научно-практической конференции «Микробиологические аспекты диагностики инфекционных заболеваний» (15-17 мая 2019 г., г. Ростов-на-Дону); 7 Итоговой научной сессии, посвященной 90-летию Ростовского государственного медицинского университета (9 сентября 2020 г., г. Ростов-на-Дону); IX Всероссийской научно-практической конференции (оп-Нпе) «Микробиологические аспекты диагностики инфекционных заболеваний» 12-13 мая 2021 г. Ростов-на-Дону; Конгрессе с международным участием «Контроль и профилактика инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи (ИСМП-2021)» (25-26 ноября 2021 г., г. Москва); VIII Всероссийской научно-практической конференции с международным участием «Перспективы внедрения инновационных технологий в медицине и фармации» (26 ноября 2021 г., Московская область, г. Электрогорск), XV Ежегодном Всероссийском конгрессе по инфекционным болезням с международным участием «Инфекционные болезни в современном мире: эволюция, текущие и
будущие угрозы» (27-29 марта 2023 г., г. Москва).
Публикации
По теме диссертации опубликовано всего 18 научных работ, из них - 1 статья в журнале, включенном в Перечень рецензируемых научных изданий Сеченовского Университета / Перечень ВАК при Минобрнауки России, 5 статей в журналах, входящих в международную реферативную базу данных и системы цитирования Беорш, 1 патент на изобретение РФ №2 2672862 от 20 ноября 2018 г. (Бюл. №2 32) и 11 иных работ.
Объем и структура диссертации
Диссертация состоит из введения, обзора литературы, материалов и методов исследования, изложения полученных результатов, заключения, выводов, списка цитируемой литературы, содержащего 166 источников, в том числе - 123 зарубежных. Работа изложена на 139 страницах печатного текста, содержит 28 таблиц, 36 рисунков.
ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
Род Corynebacterium, относящийся к классу Actinobacteria, порядку Actinomycetales, семейству Corynebacteriaceae, включает более 150 видов и 11 подвидов коринебактерий [111, 166]. Более половины видов коринебактерий выделены из клинических образцов человека и животных и имеют медицинское и биотехнологическое значение [111, 166].
1.1. Значение недифтерийных коринебактерий для организма человека
Популяция Corynebacterium spp., входящих в состав микробиоты человеческого организма, разнообразна и многочисленна. Некоторые представители рода Сorynebacterium проявляют полезные свойства, связанные с их пробиотической и антиоксидантной активностью [140, 153]. В процессе своей жизнедеятельности они вырабатывают множество биологически активных метаболитов, в том числе, и с антимикробной активностью, эффективной в отношении бактерий с множественной лекарственной устойчивостью, что делает их перспективными для создания новых пробиотических препаратов [108, 137, 140, 151, 153]. Так, C. аccolens показали выраженную антимикробную активность по отношению к Streptococcus pneumoniae [151], C. pseudodiphtheriticum - против Staphylococcus aureus и Moraxella cataralis [153], C. propinquum -коагулазонегативных стафилококков [137]. C. glutamicum синтезирует антимикробные пептиды, которые снижают уровень холестерина и ингибируют патогенные бактерии в организме человека. Некоторые виды рода Corynebacterium могут быть эффективны против многих патогенов человеческого организма, воздействуя на них посредством различных механизмов [137, 140, 151, 153]. Однако значение недифтерийных коринебактерий для человека не исчерпывается их полезными свойствами. В настоящее время имеются
многочисленные указания на связь этих микроорганизмов с развитием различных заболеваний (эндокардит, сепсис, инфекции глаз, ушей, кожи, дыхательного и урогенитального тракта, мастит, муковисцидоз и др.) [4, 14, 24, 38, 46, 56, 62, 74, 82, 106, 126, 165]. Важное значение для развития коринебактериальной инфекции имеет состояние здоровья (наличие иммунодефицитных состояний, хронической соматической и/или инфекционной патологии) и возраст заболевшего (чаще болеют дети и пожилые люди) [14, 104]. Однако случаи заболеваний, связанных с Corynebacterium spp., регистрируют и у людей без нарушений иммунного статуса. Так, среди иммунокомпетентных пациентов с заболеваниями дыхательных путей (бронхит, пневмония), инфицированных C. pseudodiphtheriticum, зарегистрировано 14% летальных исходов [104]. C. pseudodiphtheriticum считают причиной развития дифтериеподобного заболевания у полностью привитых дифтерийным анатоксином детей [101, 105]. Особое внимание в последние годы уделяется роли недифтерийных коринебактерий (С. striatum, C. amycolatum и др.) в развитии ИСМП, что связывают, в том числе, с их способностью передаваться воздушно-капельным, контактно-бытовым и, возможно, гематогенным путем [14, 59, 79, 104, 130]. Усугубляет роль этих микроорганизмов в развитии ИСМП часто выявляемая у них лекарственная устойчивость ко многим АМП [6, 10, 52, 87], кодируемая соответствующими генами антибиотикорезистентности и имеющая, как правило, горизонтальный путь распространения [14, 165]. Эти виды коринебактерий отличаются склонностью к биопленкообразованию на абиотических поверхностях, что усиливает их патогенность, устойчивость к дезинфектантам и антибиотикам и, как следствие, распространение в медицинских учреждениях [6, 10, 14, 52, 71, 87]. Штаммы C. striatum выделяют из смывов с поверхности медицинских приборов и инструментария в стационарах, рук медицинского персонала, а также отделяемого ротоглотки, трахеи и бронхов у больных, подвергшихся эндотрахеальной интубации и бронхоскопии [14, 23, 58, 62, 78, 126, 136, 164]. В годы пандемии новой коронавирусной инфекции появились свидетельства о роли Corynebacterium spp. в развитии бактериальной коинфекции, сопутствующей SARS-CoV2 [72, 77]. Плановая
вакцинопрофилактика препаратами дифтерийного анатоксина детей и взрослых в соответствии с Национальным календарем профилактических прививок не защищает от развития инфекций, связанных с не продуцирующими дифтерийных токсин Corynebacterium Брр. [14].
Все вышеизложенное свидетельствует о необходимости исследования этих микроорганизмов, факторов их патогенности и резистентности к АМП. Патогенные свойства недифтерийных коринебактерий, их роль в патологии, факторы патогенности, микробиологическая диагностика, чувствительность к АМП явились предметом рассмотрения нашего недавнего обзора литературы [14].
1.2. Факторы патогенности
Сorynebacterium Брр. - грамположительные палочки, склонные к полиморфизму, содержащие зерна волютина и характеризующиеся высоким содержанием цитозина и гуанина в ДНК. Они не способны к токсинопродукции (за исключением C.ulcerans и C.pseudotuberculosis), однако могут проявлять патогенные свойства, обусловленные иными факторами патогенности [1, 3 4, 40, 125].
Развитие коринебактериальной инфекции эндогенной (связанной с активизацией условно-патогенных коринебактерий) или экзогенной (обусловленной попаданием Сorynebacterium Брр. извне, например, из больничной среды) начинается с адгезии на эпителиальных клетках за счет пилей/фимбрий (белки Б1Р1281, РS2, 67-72р) и компонентов клеточной стенки (корд-фактор, арабиногалактан, липоманнан, липоарабиноманнан) [44, 57, 65, 68, 85, 99, 139]. Пили различного типа ^раА, SpaB, SpaС и др.) имеют сродство к различным рецепторам тканей организма, например, БраА-пили способствуют адгезии коринебактерий на клетках фарингеального эпителия [69, 112, 113]. Процесс адгезии у Corynebacterium Брр. характеризуется склонностью к агрегации на поверхности эпителиальных клеток с последующей инвазией [58]. Этому способствуют ферменты патогенности коринебактерий нейраминидаза и
гиалуронидаза, модифицирующие поверхность цитоплазматической мембраны клеток эпителия человека [58]. У штаммов С. pseudodiphtheriticum выявлены гены, кодирующие предполагаемый гемолизин, что свидетельствует об их способности прикрепляться к эритроцитам и лизировать их [108]. Уреаза, продуцируемая некоторыми представителями СогупеЬа^егшт spp., обеспечивает прямой токсический эффект на клетки человека и подавляет клеточное дыхание, расщепляя мочевину с образованием аммиака и углекислоты [14].
Известно, что поверхностные белки 67-72р и DIP1281 и компоненты клеточной стенки (миколовые кислоты, арабиногалактан, липоарабиноманнан, корд-фактор) обусловливают не только адгезивные, но и инвазивные свойства коринебактерий [14, 57, 95, 112, 115, 121, 149, 152]. Так, С. pseudodiphtheriticum способны к внутриклеточной персистенции в клетках карциномы фарингеального эпителия Нер-2 в течение 24 час. после инфицирования [14, 57]. Внутриклеточное расположение Сorynebacterium spp. позволяет им избежать действия факторов врожденного иммунитета за счет подавления липидами клеточной стенки процессов фагоцитоза, разрушения митохондрий и угнетения тканевого дыхания [112]. Токсигенные коринебактерии (С. diphtheriae, С. и^тж) способны к адгезии и инвазии и, как следствие, сохранению в макрофагах после поглощения [2, 103]. Предполагают, что выживание этих видов коринебактерий в макрофагах и последующий их некротический лизис могут способствовать распространению возбудителя инфекции в организме хозяина и поддерживать колонизацию тканей [103]. Основное значение при коринебактериальной инфекции отводится адгезии и последующей колонизации, а инвазия носит транзиторный характер и играет лишь косвенную роль в развитии гнойно-воспалительного процесса.
Похожие диссертационные работы по специальности «Другие cпециальности», 00.00.00 шифр ВАК
Микробиология нозокомиальной синегнойной инфекции: мониторинг распространенности, биологические особенности возбудителя и новые подходы к диагностике2015 год, кандидат наук Кузнецова, Марина Валентиновна
Характеристика биологических свойств бактерий рода Citrobacter при межмикробных взаимодействиях в микросимбиоценозе2013 год, кандидат наук Туйгунова, Вера Георгиевна
Гетерогенность популяции патогенных Escherichia coli – возбудителей кишечных инфекций и заболеваний внекишечной локализации2021 год, доктор наук Макарова Мария Александровна
Биологические свойства биоплёнок токсигенных штаммов Corynebacterium diphtheriae gravis tox+2015 год, кандидат наук Фролова, Яна Николаевна
Биологические свойства биоплёнок штаммов Сorynebacterium diphtheriae gravis tox+2015 год, кандидат наук Фролова Яна Николаевна
Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Мангутов Эрдем Очанович, 2024 год
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
1. Адгезивные и инвазивные свойства недифтерийных коринебактерий / А. А. Алиева, Г. Г. Харсеева, Э. О. Мангутов [и др.] // Проблемы медицинской микологии (приложение). - Санкт-Петербург, 2018. - Т. 20. - № 2. - С. 47.
2. Алиева, А. А. Инвазия как фактор патогенности возбудителей коринебактериальной инфекции / А. А. Алиева, Э. О. Мангутов // Известия ГГТУ Медицина. Фармация. Научные труды. - Орехово-Зуево, 2020. - С. 21-25.
3. Алиева, А. А. Адгезия СогупвЬа^вгшт diphtheriaе : роль в патологии и способы подавления : специальность 03.02.03 «Микробиология» : диссертация на соискание ученой степени кандидата биологических наук / Алиева Анна Александровна ; Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Ростовский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской Федерации. - Ростов-на-Дону, 2020. - 156 с.
4. Анализ частоты выделения недифтерийных коринебактерий от больных с воспалительными заболеваниями респираторного тракта / Г. Г. Харсеева, Э. О. Мангутов, О. М. Бут [и др.] // Клиническая лабораторная диагностика. - 2019. - Т. 64. - № 7. - С. 430-434.
5. Антибиотикорезистентные штаммы недифтерийных коринебактерий циркулирующие на территории Ростовской области / Н. А. Воронина, Г. Г. Харсеева, О. И. Сылка, Э. О. Мангутов // Проблемы медицинской микологии. -Санкт-Петербург, 2017. - Т. 19. - № 2. - С. 49.
6. Антибиотикочувствительность штаммов Cоrynebacterium поп diрhtheriae, циркулирующих в г. Ростове-на-Дону и Ростовской области / Г. Г. Харсеева, Н. А. Воронина, А. Ю. Миронов, А. Р. Харисова // Клиническая лабораторная диагностика. - 2012. - № 10. - С. 62-64.
7. Видовой состав Cоrynebacterium поп diрhtheriaе, выделяемых от больных с воспалительными заболеваниями респираторного и урогенитального тракта / Э. О
Мангутов, О. М. Бут, О. Е. Ясенкова, О. В. Карнаухова // Микробиологические аспекты диагностики инфекционных заболеваний. Сборник научно-практических работ VIII Межрегиональной научно-практической конференции, посвященной 90-летию со дня рождения Заслуженного деятеля науки РФ, профессора, д.м.н. Е.П. Москаленко. - Ростов-на-Дону, 2019. - С. 74-81.
8. Депонирование в международной базе данных GenBank как проект секвенирования PRJNA339674 с регистрационными номерами: SAMN31031755, SAMN31031754, SAMN31031753, SAMN31031752, SAMN31031751, SAMN31031750, SAMN31031749, SAMN31031748, SAMN31031747, SAMN31031746, SAMN31031745, SAMN31031744. Аннотированные последовательности геномов 12 штаммов ^^^bacterium sрр. (C. amycоlatum R2, R3; С.рseudоdiрhtheriticum R7, R9, R11; C. afermentans R12; C. falsenii R132; С. striatum R546; С.рseudоdiрhtheriticum Dоn2, Dоn4, Dоn5, Dоn6) / Мангутов Э.О., Харсеева Г.Г, Алутина Э.Л. [и др.].
9. Костюкова, Н. Н. Возбудитель дифтерии и условно -патогенные коринебактерии / Н. Н. Костюкова // Клиническая лабораторная диагностика. -2001. - № 6. - С. 25-31.
10. Краева, Л. А. Изменение чувствительности к антибиотикам у микроорганизмов рода Cоrynebacterium в Санкт-Петербурге и Ленинградской области / Л. А. Краева, Г. Я. Ценева // Здоровье населения и среда обитания. -2011. - № 2. - С. 25-27.
11. Краева, Л. А. Микробиологическая характеристика клинически значимых бактерий рода Cоrynebacterium / Л. А. Краева // Сибирский медицинский журнал.
- 2011. - № 1. - С. 5-10.
12. Лабинская, А. С. Руководство по медицинской микробиологии. Частная медицинская микробиология и этиологическая диагностика инфекций / под ред. А. С. Лабинской, Н. Н. Костюковой, С. М. Ивановой. - Москва : Медицина, 2012.
- 1152 с. - ISBN: 978-5-9518-0412-9. - Текст : непосредственный.
13. Лабораторная диагностика дифтерийной инфекции: Методические указания. - Москва : Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека, 2023.—107 с.
14. Мангутов, Э. О. Corynebacterium Брр. - проблемные патогены респираторного тракта человека (обзор литературы) / Э. О. Мангутов, Г. Г. Харсеева, Э. Л. Алутина // Клиническая лабораторная диагностика. - 2021. - Т. 66. - № 8. - С. 502-508.
15. Миронов, А. Ю. Молекулярные маркёры патогенов / А. Ю. Миронов, Н. В. Зур // Москва : Издательство ООО «Тираж». - 2013. - 184 с. - ISBN 978-5-90546313-6. - Текст : непосредственный.
16. Мониторинг чувствительности к антибактериальным препаратам штаммов недифтерийных коринебактерий / Г. Г. Харсеева, Э. О. Мангутов, О. М. Бут [и др.] // Успехи медицинской микологии. - 2019. - Т. 20.- С. 21-23.
17. МР 4.2.00.20-11 Методы контроля. Биологические и микробиологические факторы. Фенотипическая идентификация бактерий рода Corynebacterium : методические рекомендации [утверждены Главным государственным санитарным врачом РФ 11.05.2011]. - Москва, 2011. - 55 с. - Текст : непосредственный.
18. МУК 4.2.3065-13 Методы контроля. Биологические и микробиологические факторы. Лабораторная диагностика дифтерийной инфекции : методические указания [утверждены Федеральной службой по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека, Главным государственным санитарным врачом РФ Г. Г. Онищенко 14.07.2013 г.]. - Москва, 2013. - 35 с. - Текст : непосредственный.
19. Омельченко, В. П. Информатика, медицинская информатика, статистика : учебник / В. П. Омельченко, А. А. Демидова. - Москва : ГЭОТАР-Медиа, 2021. -608 с. - ISBN 978-5-9704-3645-5. - Текст : непосредственный.
20. Определение чувствительности микроорганизмов к антимикробным препаратам : клинические рекомендации (EUCAST, 2023). - URL: httрs://www.antibiоtic.ru/library/eucast-eucast-clinical-breakроints-bacteria-13-0-rus/ (дата обращения 15.05.2023).
21. Опыт проведения внешней оценки качества идентификации видов рода Cоrynebacterium / Н. Н. Костюкова, В. С. Михайлова, В. Н. Малахов, И. Л. Хайдукова // Клиническая лабораторная диагностика. - 2002. - № 12. - С. 43-45.
22. Патент № 2672862 Российская Федерация, МПК G01N 33/52 (2006/01); Способ отбора пациентов в группу риска по развитию фолликулярной ангины : № 2017144149 : заявл. 15.12.17 : опубл. 20.11.2018 : бюл. № 32 / Мангутов Э.О., Харсеева Г.Г., Алиева А.А., Воронина Н.А. - 15 с. // Федеральный институт промышленной собственности : электронная база патентов - URL: httрs://new.fiрs.ru/рuЫicatiоn-web/рublicatiоns/dоcument?tyрe =dоc&tab=IZРM&id= BF99DA79-FFAF-4ADB-ABD4-7C43614D237C (дата обращения: 02.08.2023).
23. Персистентные свойства Cоrynebacterium поп diрhtheriae, циркулирующих в г. Ростове-на-Дону и Ростовской области / Г. Г. Харсеева, Н. А. Воронина, Т. Д. Гасретова [и др.] // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. -2012. - № 3. - С. 13-17.
24. Cоrynebacterium sрр.: анализ профилей резистентности к антимикробным препаратам у изолятов от больных с воспалительными заболеваниями респираторного тракта и практически здоровых лиц / Э. О. Мангутов, Г. Г. Харсеева, О. А. Подойницына [и др.] // Клиническая лабораторная диагностика. -2023. - Т. 68. - № 6. - С. 356 -364.
25. Соrynebacterium sрр.: взаимосвязь патогенных свойств и резистентности к антимикробным препаратам / Э. О. Мангутов, А. А. Алиева, Г. Г. Харсеева [и др.] // Клиническая лабораторная диагностика. - 2022. - Т. 67. - № 9. - С. 519524.
26. Cоrynebacterium sрр.: недооцененные патогены с высоким потенциалом вирулентности / Э. О. Мангутов, Г. Г. Харсеева, В. Н. Герасимов [и др.] // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. - 2022. - Т. 21. - № 4. - С. 80-88.
27. Соrynebacterium sрр.: отличия фено- и генотипических маркеров патогенности изолятов от больных с воспалительными заболеваниями респираторного тракта и практически здоровых лиц / Э. О. Мангутов, Г. Г.
Харсеева, О. А. Подойницына [и др.] // Клиническая лабораторная диагностика. -2023. - Т. 68. - № 10. - С. 604-612.
28. СанПиН 3.3686-21 Санитарно-эпидемиологические требования по профилактике инфекционных болезней [Постановление главного санитарного врача РФ № 4 от 28 января 2021 г.]. - Москва, 2021. - 957 с. - URL: httрs://www.rоsроtrebnadzоr.ru/files/news/SР_infectiоns_cоmрressed.рdf (дата обращения 15.05.2023).
29. Сорокина, Г. А. Набор ДС-ДИФ-КОРИНЕ для идентификации микроорганизмов рода Corynebacterium, включая С. diphtheriae / Г. А. Сорокина, Н. В. Залесских, А. П. Обрядина // Клиническая лабораторная диагностика. -2012. - № 7. - С. 50-53.
30. Справки о депонировании №148-155 от 18 июня 2021 г. Государственная коллекция патогенных микроорганизмов и клеточных культур «ГКПМ-Оболенск» Авторские штаммы C. amycolatum R2, R3; C.pseudodiphtheriticum R7, R9, R11; C. afermentans R12; C. falsenii R132; С. striatum R546 / Мангутов Э.О., Харсеева Г.Г., Бут О.М. [и др.]. - Оболенск, 2021. - 8 с.
31. Сравнительная характеристика методов идентификации представителей рода Corynebacterium / Н. А. Воронина, Г. Г. Харсеева, О. М. Бут, Т. [и др.] // Клиническая лабораторная диагностика. - 2014. - Т. 59. - № 9. - С. 79-80.
32. Сравнительный анализ методов идентификации Corynebacterium non diphtheriae / Г. Г. Харсеева, Н. А. Воронина, А. Ю. Миронов, Э. Л. Алутина // Клиническая лабораторная диагностика. - 2015. - № 12. - С. 43-46.
33. Стратегии выживания бактерий в условиях контакта с антибиотиками / И. В Чеботарь, Ю. А. Бочарова, А. С. Гурьев, Н. А. Маянский // Клиническая лабораторная диагностика. - 2020. - Т. 2 . - № 65. - С. 116-121.
34. Факторы патогенности недифтерийных коринебактерий, выделенных от больных с патологией респираторного тракта / А. А. Алиева, Г. Г. Харсеева, Э. О. Мангутов, С. Н. Головин // Клиническая лабораторная диагностика. - 2018. - Т. 63. -.№ 6. - С. 375- 378.
35. Харсеева, Г. Г. Влияние Cоrynebacterium поп diрhtheriaе на функциональную активность и апоптоз макрофагов / Г. Г. Харсеева, Н. А. Воронина, С. Ю. Тюкавкина // Журнал микробиологии эпидемиологии и иммунобиологии. - 2014. - № 6. - С. 96-100.
36. Харсеева, Г. Г. Дифтерия : микробиологические и иммунологические аспекты / под ред. Г. Г. Харсеевой. - Москва : Практическая медицина, 2014. -241 с. - ISBN 978-5-98811-277-8. - Текст : непосредственный.
37. Харсеева, Г. Г. Методы идентификации Cоrynebacterium поп diрhtheriaе / Г. Г. Харсеева, Н. А. Воронина // Клиническая лабораторная диагностика. - 2016. -№ 4. - С. 245-249.
38. Харсеева, Г. Г. Соrynebacterium рseudоdiрhtheriticum - потенциальный патоген респираторного тракта / Г. Г. Харсеева, Э. О. Мангутов // Проблемы медицинской микологии. - Санкт-Петербург, 2019. - Т. 21. - № 2. - С. 99-100.
39. Харсеева, Г. Г. Факторы патогенности Cоrynebacterium поп diрhtheriaе / Г. Г. Харсеева, Н. А. Воронина // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 2016. - № 3. - С. 97-104.
40. Харсеева, Г. Г. Этиологическая значимость штаммов Cоrynebacterium рseudоdiрhtheriticum в развитии воспалительных заболеваний респираторного тракта / Г. Г. Харсеева, Э. О. Мангутов, Э. Н. Симованьян // Проблемы медицинской микологии. - Санкт-Петербург, 2020. - Т. 22. - № 3. - С. 142.
41. Цитопатическое действие возбудителя дифтерии в составе биопленки / Г. Г. Харсеева, А. А. Алиева, Л. П. Алексеева [и др.] // Клиническая лабораторная диагностика. - 2019. - Т. 64 . - № 11. - С. 681-685.
42. Этиологическая значимость штаммов Соrynebacterium sрр. в развитии заболеваний респираторного тракта / Г. Г. Харсеева, Э. О. Мангутов, Э. Л. Алутина [и др.] // Клиническая лабораторная диагностика. - 2021. - Т. 66. -№ 10. - С. 673-677.
43. Этиологическое значение Cоrynebacterium поп diрhtheriaе у больных с различной патологией / Г. Я. Ценева, А. Г. Радченко, Л. А. Краева, Ж. Н. Манина
// Журнал микробиологии эпидемиологии и иммунобиологии. - 2007. - № 5. -С. 3-7.
44. Aggregative adherent strains оГ Corynebacterium pseudodiphtheriticum enter and survive within HEp-2 epithelial cells / M. C. Sоuza, L. S. dоs Santos, D. L. R. Gоmes [et al.] // Memorias dо Institute Оswaldо Cruz. - 2012. - Уо1. 107. - Р. 486-93.
45. АМоот, А. А. Identificatiоn оГ nоn-diphtheriae Corynebacterium by use оГ matrix-assisted laser desоrptiоn iоnizatiоn-time оГ flight mass spectrometry / А. А. АМоот, C. J. Cazanave, S. A. Cunningham // ^urna! оГ clinical microb^^y. - 2012. - № 50. - Р. 160-3.
46. Ang, L. M. Corynebacterium accolens isоlated frоm breast abscess : pоssible assоciatiоn with granulоmatоus mastitis / L. M. Ang, Н. Brown // Jоurnal оГ clinical microb^^y. - 2007. - Уо1. 45. - № 5. - Р. 1666-8.
47. Bacteremia caused by Corynebacterium amycolatum with a ^vel mutatton in gyrA gene that ^^ers high-level qui^tane resistance / S. Уооп, H. Kim, Y. Lee, S. Kim // The ^rean ^urna! оГ labоratоry medicine. - 2011. - Уо1. 31. - № 1. - Р. 47-8.
48. Bacteremia due to high-level daptomycin-resistant Corynebacterium striatum: A case героЛ with genetic investigatton. / H. Hagiya, K. Kimura, H. Ок^ш [et al.] // Jоurnal оГ i^e^ton and chemоtherapy. -2019. - Уо1. 25. - № 11. - Р. 906-908.
49. Bernard, K. A. Corynebacterium species and ^^^forms: an update оп taxоnоmy and diseases attributed to these taxa / К. А. Bernard // Clinical Microbtotogy Newsletter. - 2005. - Уо1. 27. - № 2. - Р. 9-18.
50. Bernard, K. A. Corynebacterium. Bergey's Manual оГ Systematics оГ Archaea and Bacteria / K. A. Bernard, G. Funke // Ed. by William B. Whitman. - New Yоrk: Jоhn Wiley & Sоns, Ltd, Рublished Online: 18 mar. 2015. - URL : https ://оnlinelibrary.wiley. cm/dоi/full/10.1002/9781118960608. gbm00026.
51. Bernard, K. A. The Genus Corynebacterium and о^г medically relevant ^^^form-like bacteria / K. A. Bernard // Jоurnal оГ clinical microb^^y. - 2012. -Уо1. 50. - № 10. - Р. 3152-8.
52. Bioflm production by multi-resistant Cоrynebacterium striatum associated with nosocomial outbreak / C. Souza, Y. V. Faria, L. O. Sant'Anna [et al.] // Memorias do Instituto Oswaldo Cruz. - 2015. - Vol. 110. - № 2. - P. 242-8.
53. Bloodstream and catheter-related infections due to different clones of multi-drug resistant and biofilm producer Cоrynebacterium striatum / J. N. Ramos, C. Souza, Y. V. Faria [et al.] // BMC Infectious Diseases. - 2019. - Vol. 19. - № 1. - P. 672.
54. Bolger, A. M. Trimmomatic: a flexible trimmer for Illumina sequence data / A. M. Bolger, M. Lohse, B. Usadel // Bioinformatics. - 2014. - Vol. 30. - № 15. -P. 2114-20.
55. Bone and joint infection involving Cоrynebacterium spp.: from clinical features to pathophysiological pathways / P. Chauvelot, T. Ferry, V. Tafani [et al.] // Frontiers in medicine. - 2021. - № 7. - P. 539501.
56. Bronchopneumonia caused by Cоrynebacterium рseudоdiрhtheriticum / A. Nishiyama, T. Ishida, A. Ito, M. Arita // Internal medicine. - 2013. - Vol. 52. - № 16. -P. 1847.
57. Burkovski, A. Cell envelope of Cоrynebacteria: structure and influence on pathogenicity / A. Burkovski // ISRN Microbiology. - 2013. - P. 935736.
58. Burkovski, A. Cоrynebacterium рseudоdiрhtheriticum: Putative probiotic, opportunistic infector, emerging pathogen / A. Burkovski // Virulence. - 2015. - Vol. 6. - № 7. - P. 673-4.
59. Central venous catheter-related infections caused by Cоrynebacterium amyrnlatum and other multiresistant non-diphtherial corynebacteria in paediatric oncology patients. / R. V. Carvalho, F. F. D. S. Lima, C. S. D. Santos [et al.] // Brazilian journal of infectious diseases. - 2018. - Vol. 22. - № 4. - P. 347-351.
60. Characteristics of multidrug-resistant Cоrynebacterium spp. isolated from blood cultures of hospitalized patients in Japan / L. Qin, Y. Sakai, R. Bao [et al.] Japanese journal of infectious diseases. - 2017. - Vol. 70. - № 2. - P. 152-157.
61. Characterization of Cоrynebacterium species in macaques / J. Venezia, K. P. Cassiday, R. P. Marani [et al.] // Journal of medical microbiology. - 2012. - Vol. 61. -№ 10. - P. 1401-1408.
62. Clinical characteristics and outcome of lung transplant recipients with respiratory isolation of Corynebacterium spp. / I. Los-Arcos, O. Len, M. T. Martin-Gomez [et al.] // Journal of clinical microbiology. - 2018. - Vol. 56. - № 8. - P. e00142-18.
63. Clinical microbiology of coryneform bacteria / G. Funke, A. von Graevenitz, J. E. Clarridge, K. A. Bernard // Clinical microbiology reviews. - 1997. - Vol. 10. - № 1.
- P. 125-159.
64. Clinical relevance and impact of Corynebacterium isolation in lower respiratory tract of critically ill patients requiring mechanical ventilation / S. Clariot, O. Constant, R. Lepeule [et al.] // Infection. - 2020. - Vol. 48. - № 3. - P. 413-420.
65. Clonal multidrug-resistant Corynebacterium striatum strains, Italy / F. Campanile, E. Carretto, D. Barbarini [et al.] // Emerging infectious diseases. - 2009. -Vol. 15. - № 1. - P. 75-8.
66. Complete genome sequence, lifestyle, and multi-drug resistance of the human pathogen Corynebacterium resistens DSM 45100 isolated from blood samples of a leukemia patient / J. Schröder, I. Maus, K. Meyer [et al.] // BioMed Central genomics.
- 2012. - № 13. - P. 141.
67. Contour and persistence length of Corynebacterium diphtheriae pili by atomic force microscopy / J. Rheinlaender, A. Gräbner, L. Ott [et al.] // European biophysics journal. - 2012. - Vol. 41 - № 6. - P. 561-70.
68. Corynebacterium diphtheriae invasion-associated protein (DIP1281) is involved in cell surface organization, adhesion and internalization in epithelial cells / L. Ott, M. Höller, R. G. Gerlach [et al.] // BioMed Central microbiology. - 2010. - Vol. 10. - № 1.
- P. 2-10.
69. Corynebacterium diphtheriae employs specific minor pilins to target human pharyngeal epithelial cells / A. Mandlik, A. Swierczynski, A. Das, H. Ton-That // Molecular microbiology. - 2007. - Vol. 64. - № 1. - P. 111-124.
70. Corynebacterium guaraldiae sp. nov.: a new species of Corynebacterium from human infections / Sant'Anna L. de Oliveira, L. S. Dos Santos, M. R. B. Araujo [et al.] // Brazilian journal of microbiology. - 2023. - Vol. 54. - № 2. - P. 779-790.
71. Corynebacterium jeikeium endocarditis: a review of the literature / R. Gupta, T.
Popli, P. Ranchal [et al.] // Cardiology in review. - 2021. - Vol. 29. - № 5. - P. 259262.
72. Cоrynebacterium рseudоdiрhtheriticum as a pathogen in bacterial co-infection in COVID-19 patients mechanical ventilation / Y. Ogawa, H. Ote, T. Arai [et al.] // Japanese journal of infectious diseases. - 2022. - Vol. 75. - № 2. - P. 202-204.
73. Cоrynebacterium рseudоdiрhtheriticum isolated from relevant clinical sites of infection: a human pathogen overlooked in emerging countries / T. C. Camello, M. C. Souza, C. A. Martins [et al.] // Letters in applied microbiology. - 2009. - Vol. 48. - № 4. - P. 458-64.
74. Cоrynebacterium рseudоdiрhtheriticum: a respiraton tract pathogen / K. Ahmed, K. Kawakami, K. Watanabe [et al.] // Clinical infectious diseases. - 1995. - Vol. 20. -№ 1. - P. 41-6.
75. Cоrynebacterium рseudоtuberculоsis pneumonia in a veterinary student infected during laboratory work / L. Heggelund, P. Gaustad, O. E. Havelsrud [et al.] // Open forum infectious diseases. - 2015. - Vol. 2. - № 2. - P. ofv053.
76. Cоrynebacterium muxii sр. nоv., a novel member of the diphtheriae species complex / E. Badell, M. Hennart, C. Rodrigues, V. Passet, M. Dazas [et al.] // Research in microbiology. - 2020. - Vol. 171. - № 3-4. - P. 122-127.
77. Cоrynebacterium striatum bacteremia during SARS-CoV2 infection: case report, literature review, and clinical considerations / A. Marino, E. Campanella, S. Stracquadanio [et al.] // Infectious disease reports. - 2022. - Vol. 14. - № 3. - P. 383390.
78. Cоrynebacterium striatum infecting a malignant cutaneous lesion: the emergence of an opportunistic pathogen / S. V. Superti, D. S Martins, J. Caierao [et al.] // Revista do Instituto de Medicina Tropical de Sao Paulo. - 2009. - Vol. 51. - № 2. - P. 115-6.
79. Cоrynebacterium striatum meningitis combined with suspected brain and lung abscesses: a case report and review / M.-J. Zhang, X.-J. Cao, J. Fan [et al.] // BioMed Central infectious diseases. - 2020. - Vol. 20. - № 1. - P. 389.
80. Cоrynebacterium endоcarditis species-specific risk factors and outcomes / J. Belmares, S. Detterline, J. B. Pak, J. P. Parada // BioMed Central infectious diseases. -
2007. - № 1. - Р. 7-14.
81. Corynebacterium species isоlated frоm patients with mastitis / S. Рaviоur, S. Musaad, S. Rоberts [et al.] // Clinical infecttous diseases. - 2002. - Уо1. 35. - № 11. -Р. 1434-40.
82. Cutaneоus infect^n caused by Corynebacterium pseudodiphtheriticum : а microb^^^l ^оЛ / У. У. Cantarelli, T. C. Z. Brodt, У. У. Cantarelli [et al.] // Revista dо Institutо de Medicina Tropical de Sa-о Рaulо. - 2008. - Уо1. 50. - № 1. - Р. 51-52.
83. Database оГ virulence factors (VFDB). - URL : http: //www.mgc.ac.cn/VFs/ (дата обpащения 02.08.2023).
84. Detectton and Characterizatton оГ Diphtheria ^xin Gene-Bearing Corynebacterium Species thгоugh a New Real-Time РCR Assay / M. M. Williams , J. L. Waller, J. S. Aneke [et al.] // Jоurnal оГ clinical microb^^y. - 2020. - Уо1. 58. - № 10. - Р. e00639-20.
85. Effect оГ irоn limitatiоn оп adherence and cell surface ca^hydrates оГ Corynebeffectacterium diphtheria strains / L. O. Mоreira, A. F. B. Andrade, M.D. Vale [et al.] // Applied and environmental microb^^y. - 2003. - Уо1. 69. - № 10. - Р. 5907-13.
86. Emendatton оГ the descriptton оГ the species Corynebacterium propinquum to include strains which produce urease / K. Bernard, A.L. Рachecо, I. Cunningham [et al.] // Internattonal ^urna! оГ systematic and evоlutiоnary micrоbiоlоgy. - 2013. - Уо1. 63. - № 6. - Р. 2146-2154.
87. Epidemtotogical Investigatton оГ ^spital Transmissiоn оГ Corynebacterium striatum Infectton by Cоre Genоme Multilоcus Sequence Typing Approach / Y. Kang, S. Chen, B. Zheng [et al.] // Microbtobgy spectrum. - 2023. - Уо1. 11. - № 1. - Р. e0149022.
88. Expanding the Bacterial Diversity оГ the Female Urinary Microbtome: Descriptton оГ Eight New Corynebacterium Species / E. A. Cappelli, M. Ksiezarek, J. Wоlf [et al.] // Micrооrganisms. - 2023. - Уо1. 11. - № 2. - Р. 388.
89. Experimental mоdel оГ infectiоn with ^n-toxigenic strans оГ Corynebacterium
diрhtheriae and development of septic arthritis / M. Puliti, C. von Hunolstein, M. Marangi [et al.] // Journal of medical microbiology. - 2006. - Vol. 55. - № 2. - P. 229235.
90. Exudative pharyngitis possibly due to Cоrynebacterium рseudоdiрhtheriticum, a new challenge in the differential diagnosis of diphtheria: report of a case and review / H. S. Izurieta, P. M. Strebel, T. Youngblood [et al.] // Emerging Infectious Diseases. -1997. - Vol. 3. - № 1. - P. 65-8.
91. Factors affecting the clinical relevance of Cоrynebacterium striatum isolated from blood cultures / S. J. Kang, S-M. Choi, J-A. Choi [et al.] // Public Library of Science one. - 2018. - Vol. 13. - № 6. - P. e0199454.
92. Fatal sepsis caused by Cоrynebacterium amycоlatum in a premature infant / R. Berner, K. Pelz, C.Wilhelm [et al.] // Journal of clinical microbiology. - 1997. - Vol. 35. - № 4. - P. 1011-2.
93. First report of Cоrynebacterium рseudоtuberculоsis from caseous lymphadenitis lesions in black alentejano pig (Sus scrofa domesticus) / M. Oliveira, C. Barroco, C. Mottola [et al.] // BMC veterinary research. - 2014. - Vol. 10. - № 1. - P. 218.
94. Funke, G. Cоrynebacterium riegelii sp. nov., an unusual species isolated from female patients with urinary tract infections / G. Funke, P. A. Lawson, M. D. Collins // Journal of Clinical Microbiology. - 1998. - Vol. 36. - № 3. - P. 624-7.
95. Genome-wide comparison of Corynebacterium diphtheriae isolates from Australia identifies differences in the Pan-genomes between respiratory and cutaneous strains / V. J. Timms, T. Nguyen, T. Crighton, V. Sintchenko // BioMed Central genomics. - 2018. - Vol. 19. - № 1. - P. 869.
96. Genomic epidemiology of Cоrynebacterium striatum from three regions of China: an emerging national nosocomial epidemic / X. Wang, H. Zhou, P. Du [et al.] // Journal of hospital infection. - 2021. - № 110. - P. 67-75.
97. High frequency of macrolide resistance mechanisms in clinical isolates of Cоrynebacterium species / A. Ortiz-Perez, N. Z. M de Hijas, J. Esteban [et al.] // Microbial drug resistance. - 2010. - Vol. 16. - № 4. - P. 273-7.
98. Huson, D. H. Application of Phylogenetic Networks in Evolutionary Studies / D.
H. Huson, D. Bryant // Molecular Biology and Evolution Society. - 2006. - Vol. 23. -№ 2. - Р. 254-67.
99. Identification of a cell-wall channel in the corynemycolic acid-free Gram-positive bacterium Corynebacterium amycolatum / U. Dörner, B. Schiffler, M. A. Laneelle [et al.] // International microbiology. - 2009. - Vol. 12. - № 1. - Р. 29-38. - URL: https: //pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/19440981. (дата o6pam£HM 01.07.2023).
100. Identification of clinically relevant Corynebacterium spp., Arcanobacterium haemolyticum, and Rhodococcus equi by matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry / J. Vila, Р. Juiz, C. Salas [et al.] // Journal of Clinical Microbiology. - 2012. - Vol. 50. - № 5. - Р. 1745-7.
101. Idumathi, V. A. Diphtheria-like illness in a fully immunised child caused by Corynebacterium pseudodiphtheriticum / V.A. Idumathi, R. Shikha, D. R. Suryaprakash // Indian journal of medical microbiology. - 2014. - Vol. 32. - № 4. - Р. 443-5.
102. In vitro antibiotic susceptibility pattern of non-diphtheria Corynebacterium isolates in Ontario, Canada, from 2011 to 2016 / A. Neemuchwala, D. Soares, V. Ravirajan [et al.] // Antimicrobial agents and chemotherapy. - 2018. - Vol. 62. - № 4. -Р. е01776-17.
103. Induction of necrosis in human macrophage cell lines by Corynebacterium diphtheriae and Corynebacterium ulcerans strains isolated from fatal cases of systemic infections / D. Weerasekera, J. Hahn, M. Herrmann, A. Burkovski // International journal of molecular sciences. - 2019. - Vol. 20. - № 17. - Р. 4109.
104. Infection and colonization by Corynebacterium pseudodiphtheriticum: a 9-year observational study in a university central hospital / S. R. Valdoleiros, C. S. Neves, J. A. Carvalho [et al.] // European journal of clinical microbiology & infectious diseases. -2020. - Vol. 39. - № 9. - Р. 1745-1752.
105. Investigation of a large diphtheria outbreak and cocirculation of Corynebacterium pseudodiphtheriticum among forcibly displaced myanmar nationals, 2017-2019 / L. M. Weil, M. M. Williams, T. Shirin [et al.] // The Journal of infectious diseases. - 2020. -Vol. 224. - № 2. - Р. 318-325.
106. Isolation of Cоrynebacterium ureicelerivоrans from normally sterile sites in humans / M. I. Fernandez-Natal, J. A. Sáez-Nieto, S. Valdezate [et al.] // European journal of clinical microbiology & infectious diseases. - 2009. - Vol. 28. - № 6. - Р. 677-681.
107. Isolation, speciation, and antibiogram of clinically relevant nоn-diрhtherial Cоrynebacteria (Diphtheroids) / B. S. Reddy, A. Chaudhury, U. Kalawat [et al.] // Indian journal of medical microbiology. - 2012. - Vol. 30. - № 1. - Р. 52-7.
108. Karlyshev, A. V. Draft genome sequence of Cоrynebacterium рseudоdiрhtheriticum strain 090104 «Sokolov» / A. V. Karlyshev, V. G. Melnikov // Genome announcements. - 2013 - Vol. 1. - № 6. - Р. e00921-13.
109. Khamis, А. RpoB gene sequencing for identification of Cоrynebacterium species / А. Khamis, D. Raoult, В. La Scola // Journal of clinical microbiology. - 2004. - Vol. 42. - № 9. - Р. 3925-31.
110. Knox, K. Nosocomial endocarditis caused by Cоrynebacterium amycоlatum and other поп diрhtheriae Cоrynebacterium / K. Knox, A. H. Holmes // Emerging Infectious Disease. - 2002. - Vol. 8. - № 1. - Р. 97-99.
111. LPSN - List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature. - URL: https: //www.bacterio.net/genus/corynebacterium (дата oбpащения 02.08.2023).
112. Mandlik, A. Pili in Gram-positive bacteria: assembly, involvement in colonization and biofilm development / A. Mandlik, A. Swierczynski, H. Ton-That // Trends in microbiology. - 2008. - Vol. 16. - № 1. - P. 33-40.
113. Mapping and comprehensive analysis of the extracellular and cell surface proteome of the human pathogen Cоrynebacterium diрhtheria / N. Hansmeier, J. Kalinowski, А. Pühler [et al.] // Proteomics. - 2006. - Vol. 6. - № 8. - P. 2465-76.
114. Matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight (Maldi-ToF) mass spectrometry as a tool for rapid diagnosis of potentially toxigenic Cоrynebacterium species in the laboratory management of diphtheria-associated bacteria / R. Konrad, A. Berger, I. Huber [et al.] // Euro Surveillance. - 2010. - Vol. 15. - № 43. - P. 19699.
115. Mattos-Guaraldi, A.L. Cell surface components and adhesion in Cоrynebacterium diрhtheriae / A. L. Mattos-Guaraldi, L. C. D. Formiga, G. A. Pereira // Microbes and
infection / Institut Pasteur. - 2000. - Vol. 2. - № 12. - Р. 1507-12.
116. McKean, S. Expression of phospholipase D, the major virulence factor of Corynebacterium pseudotuberculosis, is regulated by multiple environmental factors and plays a role in macrophage death / S. McKean, J. Davies, R. Moore // Microbiology (Reading). - 2007. - Vol. 153. - № 7. - P. 2203-2211.
117. MEGA X: Molecular evolutionary genetics analysis across computing platforms / S. Kumar, G. Stecher, M. Li [et al.] // Molecular biology and evolution. - 2018. - Vol. 35. - № 6. - P. 1547-1549.
118. MEGA5: molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods / K. Tamura, D. Peterson, N. Peterson [et al.] // Molecular biology and evolution. - 2011. - Vol. 28. - № 10. - P. 2731-9.
119. Microbiological and host features associated with corynebacteriosis in cancer patients: a five-year study / C. Martins, L. Faria, M. Souza [et al.] // Memorias do Instituto Oswaldo Cruz. - 2009. - Vol. 104. - № 6. - P. 905-13.
120. Molecular epidemiology and clinical significance of Corynebacterium striatum isolated from clinical specimens / J. W. Suh, Y. Ju, C. K. Lee [et al.] // Infection and Drug Resistance. - 2019. - № 12. - P. 161-71.
121. Moreira, L. O. Novel lipoarabinomannan-like lipoglycan (CdiLAM) contributes to the adherence of Corynebacterium diphtheriae to epithelial cells / L. O. Moreira, A. L. Mattos-Guaraldi, A. F. B. Andrade // Archives of microbiology. - 2008. - Vol. 190. -№ 5. - P. 521-30.
122. Multicenter evaluation of the Vitek 2 anaerobe and Corynebacterium identification card / R. P. Rennie, C. Brosnikoff, L. Turnbull [et al.] // Journal of Clinical Microbiology. - 2008. - Vol. 46. - № 8. - P. 2646-51.
123. Mycobacterial outer membranes: in search of proteins / M. Niederweis, О. Danilchanka, J. Huff [et al.] // Trends Microbiology. - 2010. - Vol. 18. - № 3. - P. 10916.
124. New Corynebacterium Species with the Potential to Produce Diphtheria Toxin / M. Prygiel, M. Polak, E. Mosiej [et al.] // Pathogens. - 2022. - Vol. 11. - № 11. - P.
125. Newly isolated animal pathogen Cоrynebacterium silvaticum is cytotoxic to human epithelial cells / J. Möller, A. Busch, C. Berens [et al.] // International journal of molecular sciences. - 2021. - Vol. 22. - № 7. - P. 3549.
126. Nоn-diрhtheriae Cоrynebacterium species: an emerging respiratory pathogen / M. Diez-Aguilar, P. Ruiz-Garbajosa, A. Fernandez-Olmos [et al.] // European journal of clinical microbiology & infectious diseases. - 2013. - Vol. 32. - № 6. - P. 769-772.
127. Nondiphtherial Cоrynebacterium species isolated from clinical specimens of patients in a university hospital Rio de Janeiro, Brazil / T. C. F. Camello, A. Mattos-Guaraldi , L. Formiga, E. A. Marques // Brazilian Journal of Microbiology. - 2003. -Vol. 34. - № 1. - P. 39-44.
128. Nosocomial outbreak of Cоrynebacterium striatum infection in patients with chronic obstructive pulmonary disease / F. Renom, M. Garau, M. Rubi [et al.] // Journal of clinical microbiology. - 2007. - Vol. 45. - № 6. - P. 2064-7.
129. Olender, A. Macrolide, licosamide, and streptogramin B-constitutive-type resistance in Cоrynebacterium рseudоdiрhtheriticum isolated from upper respiratory tract specimens / A. Olender, M. Niemcewitz // Microbial drug resistance. - 2010. -Vol. 16. - № 2. - P. 119-22.
130. Outbreak of Cоrynebacterium рseudоdiрhtheriticum infection in cystic fibrosis patients, France / F. Bittar, C. Cassagne, E. Bosdure [et al.] // Emerging infectious diseases. - 2010. - Vol. 16. - № 8. - P. 1231-6.
131. Phylogenomic characterisation of a novel corynebacterial species pathogenic to animals / J. Möller, L. Musella, V. Mel [et al.] // Antonie Van Leeuwenhoek. - 2020. -Vol. 113. - № 8. - P. 1225-1239.
132. Pu, Y. Active efflux in dormant bacterial cells - new insights into antibiotic persistence / Y. Pu, Y. Ke, F. Bai // Drug resistance updates. - 2017. - № 30. - P. 7-14.
133. Putative virulence factors of Cоrynebacterium рseudоtuberculоsis FRC41 : vaccine potential and protein expression / K. T. Santana-Jorge, T. M. Santos, N. R. Tartaglia [et al.] // Microbial Cell Factories. - 2016. - № 15. - P. 83.
134. QUAST: quality assessment tool for genome assemblies / A. Gurevich, V.
Saveliev, N. Vyahhi, G. Tesler / Bioinformatics. - 2013. - Vol. 29. - № 8. - P. 1072-5.
135. Recent functional insights into the role of (p) ppGpp in bacterial physiology / V. Hauryliuk, G. C. Atkinson, K. S. Murakami [et al.] // Nature reviews. Microbiology. - 2015 - Vol. 13. - № 5. - P. 298-299.
136. Resistance to antiseptics and disinfectants of planktonic and bioflm-associated forms of Corynebacterium striatum / C. Souza, H. F. Mota, Y. V. Faria [et al.] // Microbial drug resistance. - 2020. - Vol. 26. - № 12. - P. 1546-1558.
137. Respiratory Commensal Bacteria Increase Protection against Hypermucoviscous Carbapenem-Resistant Klebsiella pneuMoniae ST25 Infection / S. D. Maidana, R. O. Moyano, J M. Vargas [et al.] // Pathogens. - 2022. - Vol. 11. - P. 1063.
138. Roary : Rapid large-scale prokaryote pan genome analysis / A. J. Page, C. A. Cummins, M. Hunt [et al.] // Bioinformatics. - 2015. - Vol. 31. - № 22. - P. 3691-3693.
139. Rogers, E. A. Adhesion by pathogenic Corynebacteriae / E. A. Rogers, A. Das, H. Ton-That // Advances in experimental medicine and biology. - 2011. - № 715. - P. 91-103.
140. Roy, S. Recognition of Corynebacterium pseudodiphtheriticum by Toll-like receptors and upregulation of antimicrobial peptides in human corneal epithelial cells / S. Roy, S. Marla, D. C. Praneetha // Virulence. - 2015. - Vol. 6. - № 7. - P. 716-21.
141. Rufael, D. W. Native valve endocarditis due to Corynebacterium striatum: case report and review / D. W. Rufael, S. E. Cohn // Clinical infectious diseases. - 1994. -Vol. 19. - № 6. - P. 1054-61.
142. Sabbadini, P. S. Corynebacterium diphtheriae 67-72p hemagglutinin, characterized as the protein DIP0733, contributes to invasion and induction of apoptosis in Hep-2 cells / P. S. Sabbadini, M. C. Assis, E. Trost // Microbial pathogenesis. - 2012. - Vol. 52. - № 3. - P. 165-176.
143. Sandoval-Motta, S. Adaptive resistance to antibiotics in bacteria: a systems biology perspective / S. Sandoval-Motta, M. Aldana // Wiley interdisciplinary reviews. Systems biology and medicine. - 2016. - Vol. 8. - № 3. - P. 253-67.
144. Seemann, T. Prokka : Rapid Prokaryotic Genome Annotation / T. Seemann // Bioinformatics. - 2014. - Vol. 30. - № 14. - P. 2068-9.
145. Shariff, M. Cоrynebacterium striatum: an emerging respiratory pathogen / M. Shariff, A. Aditi, K. Beri // Journal of infection in developing countries. - 2018. - Vol. 12. - № 7. - P. 581-586.
146. SPAdes : a new genome assembly algorithm and its applications to single-cell sequencing / A. Bankevich, S. Nurk, D. Antipov [et al.] // Journal of computational biology. - 2012. - Vol. 19. - № 5. - P. 455-77.
147. Strain-specific differences in pili formation and the interaction of Cоrynebacterium diрhtheriае with host cells / L. Ott, M. Höller, J. Rheinlaender [et al.] // BioMed Central genomics. - 2010. - № 10. - P. 257.
148. Structural basis for topological regulation of Tn3 resolvase / S. P. Montano, S. J. Rowland, J. R. Fuller [et al.] // Nucleic acids research. - 2023. - Vol. 51. - № 3. - P. 1001-1018.
149. Structure of the cell envelope of corynebacteria: importance of the non-covalently bound lipids in the formation of the cell wall permeability barrier and fracture plane / V. Puech, M. Chami, A. Lemassu [et al.] // Microbiology (Reading). - 2001. - Vol. 147. -№ 5. - P. 1365-1382.
150. Taxonomic status of Cоrynebacterium diрhtheriae biovar Belfanti and proposal of Corynebacterium belfantii sp. / M. Dazas, E. Badell, A. Carmi-Leroy, A. Criscuolo, S. Brisse // International journal of systematic and evolutionary microbiology. - 2018. -№ 68. - P. 3826-3831.
151. The Ability of Respiratory Commensal Bacteria to Beneficially Modulate the Lung Innate Immune Response Is a Strain Dependent Characteristic / R. O. Moyano, F. R.Tonetti, M. Tomokiyo // Microorganisms. - 2020. - Vol. 8. - P. 727.
152. The key role of the mycolic acid content in the functionality of the cell wall permeability barrier in Cоrynebacteriaceae / H. Gebhardt, X. Meniche, M. Tropis [et al.] // Microbiology (Reading). - 2007. - Vol. 153. - № 5. - P. 1424-1434.
153. The Respiratory Commensal Bacterium Corynebacterium pseudodiphtheriticum as a Mucosal Adjuvant for Nasal Vaccines / R. O. Moyano, F. R. Tonetti, K. Fukuyama [et al.] // Vaccines. - 2023. - Vol. 11. - P. 611.
154. Ton-That, H. Assembly of pili on the surface of Cоrynebacterium diрhtheriae /
H. Ton-That, О. Schneewind // Molecular microbiology. - 2003. - Vol. 50. - № 4. - P. 1429-38.
155. Treat Me Well or Will Resist: uptake of mobile genetic elements determine the resistome of Corynebacterium striatum / B. Leyton, J. N. Ramos, P. V. P. Baio [et al.] // International journal of molecular sciences. - 2021. - Vol. 22. - № 14. - P. 7499.
156. Tsai, C. J. Y. Galleria mellonella infection models for the study of bacterial diseases and for antimicrobial drug testing / C. J. Y. Tsai, J. M. S. Loh., T. Proft // Virulence. - 2016. - Vol. 7. - № 3. - P. 214-29.
157. Urosepsis caused by Globicatellasanguinis and Corynebacterium riegelii in an adult: case report and literature review / M. Matsunami, Y. Otsuka, К., M. Sogi [et al.] // Journal of infection and chemotherapy. - 2012. - Vol. 18. - № 4. - P. 552-4.
158. Use of 16S rRNA and rpoB genes as molecular markers for microbial ecology studies / R. J. Case, Y. Boucher, I. Dahllöf [et al.] // Applied and environmental microbiology. - 2007. - Vol. 73. - № 1. - P. 278-88.
159. Using SPAdes De Novo Assembler / A. Prjibelski, D. Antipov, D. Meleshko [et al.] // Current protocols in bioinformatics. - 2020. - Vol. 70. - № 1. - P. e102.
160. Validating the AMRFinder tool and resistance gene database by using antimicrobial resistance genotype-phenotype correlations in a collection of isolates / M. Feldgarden, V. Brover, D. H. Haft [et al.] // Antimicrobial agents and chemotherapy. -2019. - Vol. 63. - № 11. - P. e00483-19.
161. Virulence of clinically relevant multidrug resistant Corynebacterium striatum strains and their ability to adhere to human epithelial cells and inert surfaces / S. Alibi, J. Ramos-Vivas, W. Ben Selma [et al.] // Microbial pathogenesis. - 2021. - № 155. - P. 104887.
162. Virulence Potential and Characteristics of Multidrug-Resistant Corynebacterium amycolatum Strains Isolated from Nosocomial Infections / L. H. Heggendornn, S. W. Cussuol Gomes, L. O. Sant'Anna. [et al.] // International Journal of Science and Research Methodology. - 2022. - Vol. 22. - №4. - P. 1-24.
163. Whole-Genome sequencing reveals a prolonged and persistent intrahospital transmission of Corynebacterium striatum, an emerging multidrugresistant pathogen /
X. Wang, H. Zhou, D. Chen [et al.] // Journal of Clinical Microbiology. - 2019. - Vol. 57. - № 9. - P. e00683-19.
164. Wong, K. Y. Cоrynebacterium striatum as an emerging pathogen / K. Y. Wong, Y. C. Chan, C. Y. Wong // The Journal of hospital infection. - 2010. - Vol. 76. - № 14. - P. 371-2.
165. Worldwide survey of Cоrynebacterium striatum increasingly associated with human invasive infections, nosocomial outbreak, and antimicrobial multidrug-resistance, 1976-2020 / G. Silva-Santana, C. M. F. Silva, J. G. B. Olivella [et al.] // Archives of microbiology. - 2021. - Vol. 203. - № 5. - P. 1863-1880.
166. Zasada, A. A. Contemporary microbiology and identification of Cоrynebacteria spp. causing infections in human / A. A. Zasada, E. Mosiej // Letters in applied microbiology. - 2018. - Vol. 66. - № 6. - P. 472-483.
Обратите внимание, представленные выше научные тексты размещены для ознакомления и получены посредством распознавания оригинальных текстов диссертаций (OCR). В связи с чем, в них могут содержаться ошибки, связанные с несовершенством алгоритмов распознавания. В PDF файлах диссертаций и авторефератов, которые мы доставляем, подобных ошибок нет.