Обработка информации биосенсорных систем на основе бактерий-нефтедеструкторов тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 05.13.01, кандидат биологических наук Лагунова, Наталия Леонидовна

• Лагунова, Наталия Леонидовна
• кандидат биологических наук
• 2009

Оглавление диссертации кандидат биологических наук Лагунова, Наталия Леонидовна

Список сокращений.

Введение.

Глава I. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1. Технологии защиты и очистки окружающей среды от загрязнения нефтью и нефтепродуктами.

1.1. Нефть и нефтепродукты как наиболее распространенные и опасные загрязнители.

1.2. Методы рекультивации окружающей среды от нефти и нефтепродуктов.

1.2.1. Механические методы.

1.2.2. Термические методы.

1.2.3. Физико-химические методы. Применение сорбентов.

Сорбенты.

1.2.4. Микробиологические методы. Биоремедиация.

Биостимуляция (внесение удобрений, биостимуляторов, биоэмульгаторов)

Фитобиоремедиация.

Биоаугментация.

Биопрепараты.

2. Общие закономерности биодеградации углеводородов нефти.

2.1. Основные пути биодеградации нефтекомпонентов.

2.1.1. Биодеградацш алканов.

2.1.2. Биодеградация полиароматических углеводородов.

2.2. Катаболические плазмиды биодеградации. Плазмиды биодеградации нафталина.

3. Методы контроля загрязнения окружающей среды нефтью и нефтепродуктами.

3.1. Стандартные (физико-химические) методы.

3.2. Биоаналитические методы.

3.2.1. Биосенсорные технологии.

3.2.2. Электрохимические микробные биосенсоры для определения нефтекомпонентов.

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Обработка информации биосенсорных систем на основе бактерий-нефтедеструкторов»

Загрязнение окружающей среды нефтью и продуктами ее переработки представляет особую опасность, что связано с большими масштабами добычи, транспортировки, переработки энергоносителей и несовершенством технологических процессов. Потери нефти только в России достигают 50 млн.т/год, из них более трети - за счет аварийных ситуаций; при переработке нефти ежегодно образуется 700 тыс.т отходов [57].

Углеводороды нефти (УВН) приводят в негодность огромные массивы сельскохозяйственных почв вследствие уменьшения их плодородия и негативных изменений в почвенном биоценозе, являются основными загрязнителями внутренних водоемов и морей, создавая различные формы загрязнения - плавающие на воде нефтяные пятна, осевшие на дно тяжелые фракции. Компоненты тяжелых фракций нефти (нафталин, фенантрен) и в особенности их метаболиты, диол- и эпоксипроизводные, представляют собой высокоактивные соединения, являющиеся канцерогенами и мутагенами [239,243], т.к. способны образовывать ковалентные связи с ДНК. Именно поэтому нефть и нефтепродукты (НП) относятся к приоритетным загрязнителям биосферы.

Перспективным способом очистки почв и вод от НП считается биоремедиация, осуществляемая путем стимуляции аборигенной микрофлоры, селекции и последующей интродукции нефтедеструкторов, фиторемедиации и биоаугментации [311]. Ведущая роль в разложении нефтекомпонентов (НК) принадлежит микроорганизмам-нефтедеструкторам родов Pseudomonas и Rhodococcus, широко распространенным в биогеоценозах и отличающихся выраженной способностью к биодеградации УВН в связи с наличием у них широкого набора ферментных систем (ФС) [143,297].

Необходимо отметить, что широкому практическому использованию микроорганизмов предшествует стадия фундаментальных исследований, направленная на изучение физиолого-биохимических свойств бактериальных клеток и закономерностей функционирования входящих в них ФС. Большинство современных исследований, в том числе биологических, основано на системном подходе к изучаемым проблемам. Обработка информации при таком подходе позволяет провести комплексное исследование проблемы микробной деградации УВН в экосистемах. С этих позиций становится возможным оценить влияние на интенсивность процессов биоокисления нефти и НП биотических и абиотических факторов: присутствия плазмид деградации, состава микробной популяции, физических и химических свойств ксенобиотиков, колебаний рН среды и температуры, высокой засоленности почв и естественной солености морских акваторий [12,221,264,320].

Для решения данных задач необходима разработка методов и алгоритмов определения метаболической активности клеток [45] и прогнозирования поведения ФС в реальных условиях. Наиболее перспективными сейчас являются методы биофизической и биохимической диагностики, в частности, биосенсорные технологии, сочетающие чувствительность методов биотестирования и операционные характеристики физико-химических сенсоров [79,140,145,260,269]. В связи с этим представляется актуальным применить биосенсорные технологии для изучения закономерностей функционирования бактерий-деструкторов УВН и оценить влияние на эти процессы факторов различной природы.

Цель исследования: исследовать зависимость дыхательной активности микро-организмов-нефтедеструкторов родов Pseudomonas и Rhodococcus и их ассоциаций от эндо- и экзогенных факторов путем обработки информации биосенсорных систем для совершенствования средств оценки биокаталитических свойств микроорганизмов в условиях биоремедиации.

Задачи исследования:

• Разработать лабораторную модель биосенсорной установки на основе иммобилизованных микробных клеток, позволяющую проводить визуализацию, трансформацию и обработку информации по дыхательной активности аэробных бактерий-деструкторов УВН.

• На основе сравнительного изучения профилей субстратной специфичности ФС бактериальных штаммов проанализировать влияние коньюгативных плазмид деградации нафталина (эндогенный фактор) на изменение окислительного потенциала бактериальных хозяев.

• Оценить изменение окислительной активности нефтедеструкторов p. Pseudomonas и Rhodococcus в результате воздействия факторов экзогенного характера (природы доступного субстрата, повышенной осмолярности среды, колебаний рН и влажности, низких положительных температур) для прогнозирования деградативных свойств нефтедеструкторов в условиях биоремедиации.

• Обработать информацию профилей субстратной специфичности искусственно составленных ассоциаций микроорганизмов и оценить кооперативный эффект при совместном окислении штаммами УВН в присутствии экстремального фактора и без него.

• Выявить корреляцию между результатами биосенсорных исследований по определению окислительной активности природных и модифицированных штаммов и величинами удельных активностей ключевых ФС этих штаммов, а также их ростовыми и культуральными характеристиками.

• Применить биосенсорные системы для постановки длительного контролируемого экологического эксперимента, натурной концептуальной моделью которого будут иммобилизованные штаммы микроорганизмов и их ассоциации с правом выбора анализируемого фактора в качестве лимитирующего и обработать информацию по трансформации биокаталитических свойств нефтедеструкторов.

Научная новизна работы

Показано, что биосенсорная регистрация дыхательной активности иммобилизованных клеток микроорганизмов обеспечивает оперативность и надежность получаемых данных и является эффективным инструментом оценки деградативных свойств аэробных штаммов в отношении широкого круга УВН и их производных.

Впервые установлено, что биосенсорная оценка субстратной специфичности искусственно составленных микробных ассоциаций позволяет регистрировать возникающий в ассоциациях кооперативный эффект, а также антагонистические взаимодействия микроорганизмов.

Впервые показана возможность использования биосенсорных технологий для экспертного анализа результатов модифицирования нефтедеструкторов плазмидами биодеградации.

Определено, что обработка информации биосенсорных систем может быть использована для экологического мониторинга факторов окружающей среды при оценке их воздействия на окисляющую способность бактерий-деструкторов. Впервые такой подход применен для исследования возникновения адаптаций бактериальных клеток к ряду экзогенных факторов.

Впервые показана принципиальная возможность использования биосенсорных систем для постановки длительного контролируемого экологического эксперимента, натурной концептуальной моделью которого являются иммобилизованные штаммы микроорганизмов и их ассоциации с правом выбора анализируемого фактора в качестве лимитирующего. Установлено, что обработка информации биосенсорных систем позволяет регистрировать происходящие при этом направленные сукцессионные изменения в микробоценозе и может лежать в основе метода характеристики биохимического поведения нефтедеструкторов и их ассоциаций в условиях биоремедиации.

Практическая значимость работы

Развит экспрессный, аналитический и безреагентный способ скрининга нефтедеструкторов для быстрой и комплексной оценки эффективности бактериальных штаммов и прогнозирования их полезных свойств в условиях биоремедиации.

Результаты создают основы для использования микробных сенсоров в прикладных исследованиях трансформаций биохимического поведения модифицированных штаммов, а также искусственно составленных ассоциаций в условиях изменения доступности ростовых субстратов и постоянного воздействия абиогенных факторов в течение длительного времени биоремедиации. Это позволит избежать незапланированных потерь активности интродуцируемых биопрепаратов в конкретных условиях.

Выявленные в работе закономерности функционирования биосенсоров на основе бактерий родов Pseudomonas и Rhodococcus могут быть использованы в качестве научной основы при разработке микробных биосенсоров на основе других аэробных микроорганизмов-деструкторов УВН.

Макет микробного биосенсора на основе микроорганизмов-нефтедеструкторов характеризуется экспрессностыо, высокой чувствительностью и низким пределом обнаружения токсичных поллютантов. Он может быть использован для количественного определения селективного или совокупного содержания ароматических УВ в реальных образцах посредством одновременного измерения проб двумя сенсорами, модифицированными штаммами с отличающимися окислительными характеристиками в отношении аналитов-НК. Разработанная установка может служить прототипом опытного образца прибора для серийного освоения, а также применяться в учебном процессе, что позволит усовершенствовать экспериментальную и приборную базу университетов и повысить качество образования.

Внедрение.

Результаты исследований внедрены на кафедрах химии и биотехнологии ГОУ ВПО Тульского государственного университета; в ГУП ТО НИИ новых медицинских технологий (г.Тула); в Институте теоретической и экспериментальной биологии РАН (г.Пущино).

Работа выполнялась при поддержке грантов РФФИ 04-04-96705 «Изучение процессов окисления ксенобиотиков бактериальными штаммами на основе их дыхательной активности», 2004-2005г., 06-04096318 «Особенности механизмов биодеградации углеводородов нефти бактериями родов Pseudomonas и Rhodococcus», 2006г. и 08-04-99019-рофи «Изучение метаболических особенностей и генетических систем биодеградации микроорганизмов-нефтедеструкторов и разработка на их основе подходов к созданию новых биопрепаратов и технологий биоремедиации почв, загрязненных нефтью и НП», 2009-20Юг.; в рамках ФЦП "Интеграг{ия" (проект JI0145), НОЦ «Экобиотехнология» (2005-РИ-16.0/ 025/026 ФЦНТП «Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития науки и техники» на 20022006г., госконтракт 02.438.11.7021.), программы ФА по образованию «Развитие научного потенциала высшей школы (2006-2008г.)», РНП 2.1.1.7789.

Апробация работы и публикации

Результаты работы были представлены и обсуждены на: IV Региональной научно-практической конференции «Современные проблемы экологии и рационального природопользования в Тульской области» (Тула, 2004); IX и X Международной Пу-щинской школе-конференции молодых ученых «Биология - наука XXI века» (Пущи-но, 2005, 2006); IV Международной научной конференции «Химия, хим. технология и биотехнология на рубеже тысячелетий» (Томск, 2006); II Всероссийской научно-технической Интернет-конференции «Современные проблемы экологии и безопасности» (Тула, 2006); Всероссийской научно-технической конференции «Современные проблемы экологии» (Москва-Тула, 2006); V Съезде Общества биотехнологов России им. Ю.А.Овчинникова (Москва, 2008); X Юбилейном международном форуме «Высокие технологии XXI века» (Москва 2009).

По теме диссертации опубликовано 4 статьи (в журналах, рекомендованных ВАК), 8 сообщений в тезисной форме и в виде материалов конференций.

Заключение диссертации по теме «Системный анализ, управление и обработка информации (по отраслям)», Лагунова, Наталия Леонидовна

выводы

Обработка информации биосенсорных систем по дыхательной активности микроорганизмов обеспечивает оперативность и надежность получаемых данных и может лежать в основе экспресс-метода характеристики биохимического поведения нефтедеструкторов и их ассоциаций, а также оценки результатов модифицирования штаммов катаболическими плазмидами. Биосенсорные системы применимы для быстрой и комплексной оценки эффективности бактериальных препаратов и прогнозирования их полезных свойств в реальных условиях биоремедиации. Разработана лабораторная модель биосенсора для определения концентрации нафталина и фенантрена на основе P. sp. 142NF(pNF142) и P. chlororaphis PCL1391(pOV17), которая характеризуется высокой операционной стабильностью, экспрессностью измерений и низким пределом обнаружения токсичных поллю-тантов (330 и 25нМ соответственно).

На эффективность деструкции УВН плазмидосодержащими бактериями оказывает влияние как катаболическая плазмида, так и бактериальный хозяин, причем две структурно аналогичные плазмиды, отличающиеся уровнем активности оксидаз, могут обуславливать различные физиолого-биохимические признаки трансконью-гантов. Сочетание бактериального хозяина P. chlororaphis PCL1391 и катаболиче-ской плазмиды pOV17 является наилучшим из исследованных, этот штамм предложен для использования в рецепторных элементах биосенсоров для количественного анализа совокупного содержания поллютантов ароматической природы.

Штамм P. putida BS3701(pBS1141,pBS1142) обладает лучшими окислительными характеристиками среди 5 плазмидосодержащих штаммов.

Бактерии рода Rhodococcus характеризуются более высокой выживаемостью, чем псевдомонады, благодаря низкому уровню эндогенного дыхания, выраженной толерантности к периодам голода и отсутствия влаги, токсичности субстратов, повышенной осмолярности среды, низких положительных температур и колебаниям рН бактериального окружения, тогда как бактерии рода Pseudomonas способны адаптироваться к экстремальным условиям.

Показана высокая корреляция между результатами биосенсорных исследований по определению окислительной активности природных и модифицированных штаммов и величинами удельных активностей ключевых ФС этих штаммов, определенных спектрофотометрически. Коэффициент корреляции между величинами, полученными двумя способами, равен 0,98.

• Оценен кооперативный эффект 5 составленных ассоциаций микроорганизмов при совместном окислении штаммами УВН в присутствии и без экстремального фактора. Комбинации X5+BS3701 и S67+BS3701 признаны наилучшими из исследованных. Высокая степень кооперации микроорганизмов в ассоциации S67+BS3701 сохраняется в присутствии соли.

• Показана возможность использования биосенсорных технологий для постановки длительного контролируемого экологического эксперимента в целях быстрой и качественной индукции ФС нефтедеструкторов, для экспертного анализа возможной трансформации окислительных свойств штаммов, включающего исследование жизнеспособности культур при смене доступных ростовых субстратов, связанную с этим стабильность поддержания плазмид биодеградации, а также направленность сукцессионных изменений в составе микробного сообщества в течение длительного времени.

Заключение.

Получены профили субстратной специфичности пяти искусственно составленных ассоциаций микроорганизмов и оценен кооперативный эффект при совместном окислении штаммами УВН в присутствии экстремального фактора и без него.

Комбинации Rh. sp. Х5+Р. putida BS3701 и Rh. sp. S67 +P. putida BS3701 признаны наилучшими из исследованных. Высокая степень кооперации микроорганизмов в ассоциации Rh. sp. S67+P. putida BS3701 сохраняется в присутствии соли. Ассоциация была жизнеспособна и давала стабильные ответы на субстраты-УВН в присутствии 3% раствора хлорида натрия в течение 20 дней. В ассоциации зарегистрированы направленные сукцессионные изменения, выраженные в колебании численности Р. putida BS3701(pBS1141,pBS1142). Таким образом, биосенсорные технологии возможно применить для экспертного анализа эффективности бактериальных препаратов и прогнозирования их полезных свойств в реальных условиях биоремедиации.

Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Лагунова, Наталия Леонидовна, 2009 год

1. Адаптивные реакции микроорганизмов. Режим доступа http://vet-fak.nsau.edu.ru/new/microbiology/stu/bacter/ecologia/adaptmo.htm.

2. Акатова Е.В., Алтынцева О.В., Плотникова Е.Г., Сахаровский В.Г. Деградация нафталина в условиях высокой солености среды сообществом микроорганизмов. Мат.конф. Режим доступа http://bioscience.ru/Conference/Ecology 2004/Biotex.

3. Альтернативные методы исследований (экспресс-методы) для токсиколого-гигиенической оценки материалов, изделий и объектов окружающей среды / Под ред. Л.Г.Подуновой. М.: Фед.центр Госсанэпиднадзора Минздрава РФ. 1999. 107с.

4. Арзамасцев А.А. Скорость эндогенного дыхания клеток Pseudomonas II Микробиология. 1988. Т.57. Вып.6. С.977-982.

5. Арляпов В.А. Применение низкоселективных биосенсоров для определения биохимического потребления кислорода и селективного анализа многокомпонентных смесей. Дисс. канд. хим. наук. Москва. 2009. 189 с.

6. Аушева Х.А. Разработка новой формы биопрепарата для очистки водных объектов от тонких нефтяных пленок. Автореф. канд. тех. наук. Москва. 2007. 21 с.

7. Ахметов Л.И. Роль горизонтального переноса плазмид биодеградации в микробной деструкции полициклических ароматических углеводородов. Автореф. канд. биол. наук. Пущино. 2006. 22 с.

8. Ахметов Л.И., Иванова У.С., Пунтус И.Ф., Есикова Т.З. с соавт. Горизонтальный перенос плазмиды биодеградации нафталина в процессе микробной деструкции дизельного топлива и нефти в открытом проточном биореакторе. Биотехнология. 2006. № 4. С.79-86.

9. Ю.Балашова Н.В., Кошелева И.А., Филонов А.Е. с соавт. Штамм Pseudomonas putida BS3701 деструктор фенантрена и нафталина // Микробиология. 1997. Т.66. С.488-493.

10. П.Барышникова Л.М., Аминов Р.И., Окороков J1.A., Головлев E.JI. Транспорт глюкозы и кинетика роста Rhodococcus minimus. Микробиология. 1985. Т.54. Вып.6. С.905-909.

11. Белоусова Н.И., Шкидченко А.Н. Деструкция нефтепродуктов различной степени конденсации микроорганизмами при пониженных температурах // Прикл. био-хим. и микробиол. 2004. Т.40. № 3. С.312-316.

12. Берман С.С., Соколова И.М., Матвеева И.А., Петров А.А. О составе насыщенных углеводородов фракции 150-175°С нефтей парафинового основания // Нефтехимия. Т.24. 1984. №6. С.743-747.

13. Борисов И.А. Лобанов А.В., Решетилов А.Н., Курганов Б.И. Количественный анализ калибровочных зависимостей биосенсоров // Прикл. биохим. и микробиол. 2000. Т.36. № 3. С.256-262.

14. Воронин A.M. Биология плазмид // Успехи микробиологии. 1983. Вып. 18. С.143-163.

15. Булатов А.И., Макаренко П.П., Шеметов В.Ю. Охрана окружающей среды в нефтегазовой промышленности. М.: Недра, 1997. 483с.

16. Бутаев A.M., Кабыш Н.Ф. О роли углеводородокисляющих микроорганизмов в процессах самоочищения прибрежных вод Дагестанского побережья Каспийского моря от нефтяного загрязнения // Вестник Дагестанского Науч. Центра РАН. 2002. №11. С.24-36.

17. Буткова О.Л., Гончаров А.И. Содержание нефтепродуктов индикатор качества подземных и поверхностных вод//Партнеры и конкуренты. 2001. №1. С.32-35.

18. Варфоломеев С.Д., Гуревич К.Г. Биокинетика: Практический курс. М.гФаир-Пресс. 1999. 720 с.

19. Варфоломеев С.Д., Евдокимов Ю.М., Островский М.А. Сенсорная биология, сенсорные технологии и создание новых органов чувств человека // Вестник российской академии наук. 2000. Т.70. № 2. С.99-108.

20. Ветрова А.А., Нечаева И.А., Игнатова А.А., Пунтус И.Ф., Аринбасаров М.У. с соавт. Влияние катаболических плазмид на физиологические параметры бактерий рода Pseudomonas и эффективность биодеструкции нефти // Микробиология. 2007. Т.76. №3. С.310-316.

21. Ветрова А.А., Овчинникова А.А., Филонов А.Е., Пунтус И.Ф., Воронин A.M. Деструкция нефти бактериями рода Pseudomonas, содержащими различные плазмиды биодеградации // Известия ТулГУ. Естественные науки. Тула: Изд-во ТулГУ. 2008. Вып. 2. С.200-207.

22. Волкова О.В., Анохина Т.О., Пунтус И.В., Кочетков В.В. с соавт. Влияние плазмид биодеградации нафталина на физиологические характеристики ризосферных бактерий рода Pseudomonas II Прикл. биохим. и микробиол. 2005. Т.41. №5. С.525-529.

23. Глик Б., Пастернак Дж. Молекулярная биотехнология. Принципы и применение. Пер. с англ. М.:Мир. 2002. С.127-128.

24. Гузев B.C., Халимов Е.М., Волде М.И., Куличевская И.С. Регуляторный эффект глюкозы на углеводородокисляющие микроорганизмы почвы // Микробиология. 1997. Т.66. №2. С.154-159.

25. Демидиенко А .Я., Демурджан В.М. Пути восстановления нефтезагрязненных почв черноземной зоны Украины // Восст. нефтезаг. почв, экосистем. М.:Наука, 1988. С.197-206.

26. Дерффель К. Статистика в аналитической химии. Пер. с нем. М.: Мир. 1994. 268 е., ил.

27. Дорохова Е.Н., Прохорова Г.В. Задачи и вопросы по аналитической химии. М.: Мир. 2001. 267с., ил.

28. Другов Ю.С., Родин А.А. Экологические анализы при разливах нефти и нефтепродуктов. Практическое руководство. СПб. 2000. 248с.

29. Иванова Е.С., Есикова Т.З., Гафаров А.Б., Шкидченко А.Н. Мониторинг ин-тродуцированных микроорганизмов-нефтедеструкторов в открытых системах // Биотехнология. 2006. № 3. С.74-78.

30. Игнатова А.А., Ветрова А.А., Лисов А.В., Филонов А.Е. с соавт. Динамика численности и взаимодействие псевдомонад, стимулирующих рост растений и разрушающих нафталин в ризосфере горчицы белой // Биотехнология. 2006. №6. С.35-43.

31. Исмаилов Н.М., Ахмедов А.Г., Ахмедов В.А. Рекультивация нефтезагрязнен-ных земель сухих субтропиков Азербайджана // Восст. нефтезаг. почв, экосистем. М.:Наука. 1988. С.206-221.

32. Киреева Н.А. Микробиологические процессы в нефтезагрязненных почвах. Автореф. д-ра биол. наук. СПб. 1996. 25 с.

33. Китова А.Е., Кувичкина Т.Н. с соавт. Биосенсор реакторного типа на основе клеток Rhodococcus erythropolis HL РМ-1 для определения 2,4-динитрофенола // Прикл. биохим. и микробиол. 2002. Т.5. №38. С.585-590.

34. Кобзев Е.Н. Биодеструкция нефти и нефтепродуктов микробными ассоциациями в модельных системах. Дисс. канд. биол. наук. Оболенск. 2002. 179 с.

35. Колпакова С.Д., Колпакова Г.А. Исследование особенностей динамики развития бактериальной популяции в условиях слабого стационарного магнитного поля //

36. Вестник СамГУ. Естественнонаучная серия. Самара: Изд-во СамГУ. 2005. №5(39). С.179-187.

37. Коронелли Т.В. Принципы и методы интенсификации биологического разрушения углеводородов в окружающей среде // Прикл. биохим. и микробиол. 1996. Т.32. Вып.6. С.579-585.

38. Кочетков В.В. Плазмиды биодеградации нафталина у бактерий рода Pseudomonas. Дисс. канд. биол. наук. Пущино. 1985. 145 с.

39. Кузнецов А.Е., Градова Н.Б. Научные основы экобиотехнологии. М.:Мир. 2006. 504 е., ил.

40. Кузнецов Б.А., Хлупова М.Е., Шлеев С.В. с соавт. Электрохимический метод измерения метаболической активности и количества клеток // Прикл. биохим. и микробиол. 2006. Т.42. № 5. С.599-608.

41. Левчук А.А., Булыга И.М., Измалкова Т.Ю., Севастьянович Я.Р., Кошелева И.А., с соавт. Характеристика Nah-плазмид группы 1псР-9 природных штаммов Pseudomonas И Молекулярная биология. 2006. №5. С.835-843.

42. Макаренко А.А. Биосенсоры для детекции сульфоароматических и феноль-ных соединений на основе бактерий родов Comamonas и Pseudomonas деструкторов л-толуолсульфоната и фенола. Автореф. канд. биол. наук. Саратов. 2007. 24 с.

43. Маркарова М.Ю. Использование углеводородокисляющих бактерий для восстановления нефтезагрязненных земель в условиях Крайнего севера // Ин-т экологии и генетики микроорганизмов УрО РАН. 1987. 157с.

44. Месяц С.П. Восстановление нарушенных земель при освоении газовых месторождений Севера // Тезисы докладов III Межд. конференции "Освоение Севера и проблемы рекультивации". Сыктывкар, 1996. С.41-42.

45. Милехина Е.И., Борзенков И.А., Звягинцева И.С. с соавт. Эколого-физиологические особенности аэробных эубактерий нефтяных месторождений Татарстана // Микробиология. 1998. Т.67. С.208-214.

46. Мусаев И.А., Курашова Э.Х., Симанюк Р.Н., с соавт. Исследование углеводородов западносибирской нефти // Нефтехимия. Т.25. 1985. №3. С.315-321.

47. Оборин А.А., Калачникова И.Г., Масливец Т.А., Базенкова Е.И. с соавт. Биологическая рекультивация нефтезагрязненных земель в условиях таёжной зоны // Восст. нефтезагр. почв, экосистем. М.:Наука, 1988. С.140-159.

48. Общая токсикология / Под ред. А.О.Лойта. СПб.: ЭЛБИ-СПб. 2006. 224с.

49. Основные методики определения концентраций масел и нефтепродуктов в воде. Режим доступа http://www.prpc.ru/actual/south/examinat.

50. Пат. RU 2111246, С1, МКИ 6 C12N1/20. Дербышев В.В., Глухов Н.Н., Клыков С.П. и др. Способ получения биомассы аэробнорастущих микроорганизмов. Опубл. 1998.05.20.

51. Пат. RU 2292391, С2 МПК C12N1/20 Воробьев А.В., Руднева О.А., Марченко С.А. и др. Штамм бактерий Pseudomonas putida, используемый для очистки почв,грунтовых и поверхностных вод от тринитротолуола. Опубл. 2007.01.27.

52. Пат. RU 2312891, С1, МПК C12N1/20. Филонов А.Е., Кошелева И.А., Шкид-ченко А.Н., Пырченкова И.А. и др. Ассоциация штаммов бактерий, продуцирующих биоэмульгаторы, для деградации нефти и нефтепродуктов в почвах, пресной и морской воде. Опубл. 2007.12.20.

53. Петров А.А. Химия алканов. М., 1986. 394 с.

54. Пиковский Ю.И. Природные и техногенные потоки углеводородов в окружающей среде. М.: Изд-во МГУ. 1993. 182 с.

55. Плешакова Е.В., Позднякова Н.Н., Турковская О.В. Получение нефтеокис-ляющего биопрепарата путем стимуляции аборигенной углеводородокисляющей микрофлоры // Прикл. биохим. и микробиол. 2005. Т.41. №6. С.634-639.

56. Плотникова Е.Г., Алтынцева О.В., Кошелева И.А., Пунтус И.Ф., с соавт. Бактерии деструкторы полициклических ароматических углеводородов, выделенные из почв и донных отложений района солеразработок // Микробиология. 2001. Т.70. №1. С.61-69.

57. Плотникова Е.Г., Рыбкина Д.О., Демаков В.А. Штамм бактерий Rhodococcus ruber деструктор полихлорированных бифенилов. Патент № 2262531. Опубликован 20.10.2005 г.

58. Понаморева О.Н., Алферов В.А. с соавт. Количественное определение крахмала в муке с помощью микробного сенсора // Известия ТулГУ. Тула: Изд-во ТулГУ. 2004. №4. С.112-119.

59. Попов Е.И., Амбросов В.А. Применение культивирования с подпиткой субстратом для оптимизации роста E.coli НВ 1100 продуцента рестриктазы. В кн.: Теория и практика управляемого культивирования микроорганизмов, ч. 2. Киев:Наукова думка. 1981.335с.

60. Применение ГХ-МС в национальных лабораториях. Режим доступа http://www.disbak.ru/php/content.

61. Пурмаль А.П. Антропогенная токсикация планеты // Соросовский образовательный журнал. 1998. №9. С.39-51.

62. Пырченкова И.А., Гафаров А.Б., Пунтус И.Ф., Филонов А.Е., Воронин A.M. Выбор и характеристика активных психротрофных микроорганизмов-деструкторов нефти // Прикл. биохим. и микробиол. 2006. Т.42. № 3. С.298-305.

63. Рабкина Е.В. Поверхностный метод сбора нефти из вод со льдом // Сборник тез. докл. междунар. конф. "Новые технологии для очистки нефтезагрязнённых вод, почв, переработки и утилизации нефтешламов". 10-11 декабря 2001г., г.Москва. С.48-49.

64. Рафикова Г.Ф., Григориади А.С. Экология и деструкционная активность микроорганизмов, окисляющих углеводороды нефти // Сборник тезисов III Межд. молод, школы-конференции «Актуальные аспекты современной микробиологии». 22-23 ноября 2007г, Москва. 147с.

65. Решетилов А.Н. Биосенсоры в России: монография / А.Н. Решетилов, В.А. Алферов, Т.А. Решетилова, О.Н. Понаморева. Тула: Изд-во ТулГУ. 2007. 111с.

66. Решетилов А.Н. Микробные, ферментные и иммунные биосенсоры для экологического мониторинга и контроля биотехнологических процессов // Прикл. биохим. и микробиол. 2005. Т.41. №5. С.504-513.

67. Рождественский Ю.Ф., Сарапульцев И.Е. О применении взрывов в качестве метода рекультивации залитых нефтью болот в ПО "Ноябрьскнефтегазгеология" //

68. Тезисы докладов III Межд. конференции "Освоение Севера и проблемы рекультивации". Сыктывкар, 1996. С.34-35.

69. Российская И.В. Биосенсорные системы на основе бактерий-деструкторов е-капролактама и их применение для экологического контроля и биотехнологических исследований. Дисс. канд. хим. наук. Москва. 2008. 127 с.

70. Российская И.В., Есикова Т.З., Понаморева О.Н., Решетилов А.Н. Биосенсорная оценка катаболической активности штаммов-деструкторов s-капролактама с различными сочетаниями «САР-плазмида бактериальный хозяин» // Биотехнология. 2008. № 4. С.44-47.

71. Рыбчин В.Н. Основы генетической инженерии. СПб: Изд-во СПбГТУ. 2002.

72. Семенчук И.Н., Таранова Л.А. с соавт. Влияние различных способов иммобилизации на стабильность микробного биосенсора на основе Pseudomonas rathonis Т при детекции поверхностно-активных веществ // Прикл. биохим. и микробиол. 2000. Т.36. №1. С.80-84.

73. Современная микробиология. Прокариоты. В 2-х томах: Пер.с англ./ Под ред. Й.Ленгелера, Г.Древса, Г.Шлегеля. М.:Мир. 2005. 1152 с.

74. Содержание нефтяных углеводородов и других загрязняющих веществ в водах Черного и Печорского морей. 1999-2003гг. Режим доступа http://esimo.oceanog-raphy.ru/esp2/index/index/espid/5/sectionid/8/menuid/4.

75. Соловьев В.И., Кожанова Г.А., Гудзенко Т.В. с соавт. Биоремедиация как основа восстановления нефтезагрязненных почв // Проблемы сбора, переработки и утилизации отходов: сб.науч.статей. ОдессаЮЦНТЭИ. 2001. С.339-345.

76. Справочник химика / Под ред. Грива З.И., Коц В.А., Пиастро В.Д. Т.2. 1167с.

77. Стабликова Е.В., Селезнева М.В., Дульгенов А.Н. Иванов В.Н. Применение препарата "Лестран" для очистки почвы от углеводородов нефти // Прикл. биохим. и микробиол. 1996. Т.32. №2. С.219-223.

78. Тарасович Ю.И. Природные сорбенты в процессах очистки воды. Киев: Нау-кова думка. 1987. 286 с.

79. Телеграф информационного интернет-издания «Вокруг света». Режим доступа http://vmw.vokrugsveta.rU/print/telegraph/theory/5 86/.

80. Технологии восстановления почв, загрязненных нефтью и нефтепродуктами. Справочник. М.:РЭФИА. 2001. 185 с.

81. Титок М.А. Плазмиды грамположительных бактерий. Автореф. докт. биол. наук. Минск. 2004. 36 с.

82. Турковская О.В, Дмитриева Т.В., Муратова А.Ю. Штамм Pseudomonas aeruginosa продуцент биоПАВ // Прикл. биохим. и микробиол. 2001. Т.37. №1. С.80-85.

83. Филонов А. Е., Ахметов JI. И., Пунтус И. Ф., Есикова Т. 3. с соавт. Конструирование и мониторинг маркированных плазмидосодержащих штаммов-деструкторов нафталина в почве // Микробиология. 2005. Т.74. № 4. С.526-532.

84. Филонов А.Е., Кошелева И.А., Самойленко В.А., Шкидченко А.Н. и др. Биопрепарат для очистки почв от загрязнений нефтью и нефтепродуктами, способ его получения и применения. Заявка №2007125403 о выдаче патента РФ на изобретение, 05.07.2007.

85. Филонов А.Е., Нечаева И.А., Гафаров А.Б., Аринбасаров М.У. с соавт. Биодеградация нефти психротрофными микроорганизмами-деструкторами и ее адсорбция растительным сорбентом в жидкой минеральной среде // Биотехнология. 2007. №2. С.31-39.

86. Фомин С. Вода. Контроль химической, бактериальной и радиационной безопасности по международным стандартам. Энциклопед. спр. Зе изд. М. 2000. 840с.

87. Холоденко В.П., Чугунов В.А., Жиглецова С.К., Родин В.Б. с соавт. Разработка биотехнологических методов ликвидации нефтяных загрязнений окружающей среды//Рос. Хим. Ж. 2001. T.XLV. С.135-141.

88. Цавкелова Е.А., Климова С.Ю., Чердынцева Т.А., Нетрусов А.И. Микроорганизмы продуценты стимуляторов роста растений и их практическое применение //

89. Прикл. биохим. и микробиол. 2006. Т.42. №2. С.133-143.

90. Штруппе Х.Г., Янке X., Дойч К., Грунов С. Общая физико-химическая характеристика и структурно-групповой углеводородный состав вакуумного газойля (350-540°С) промышленной западносибирской нефти // Нефтехимия. Т.27. 1987. №1. С.3-12.

91. Экологические катастрофы. Режим доступа http://www.rosbalt.ru/.

92. Ягафарова Г.Г. Разработка биотехнологии очистки воды и почвы от некоторых хлорорганических соединений и углеводородов нефти. Дисс. д-ра техн. наук. Уфа. 1994. 258с.

93. Ягафарова Г.Г., Скворцова И.И. Новый нефтеокисляющий штамм бактерий Rhodococcus erythropolis II Прикл. биохим. и микробиол. 1996. Т.32. №2. С.224-227.

94. Янкевич М.И., Хадеева В.В. с соавт. Комплексная биотехнология очистки воды промышленных предприятий от нефтезагрязнений // Тез. докл. III Междунар. конф. "Освоение Севера и проблемы рекультивации". Сыктывкар, 1996. С.234-235.

95. Abed R.M.M., Safi N.M.D., Koster J., deBeer К., etc. Microbial diversity of a heavily polluted microbial mat and its community changes following degradation of petroleum compounds // Appl. Environ. Microbiol. 2002. V.68. P.1674-1683.

96. Alexander M. Biodegradation and bioremediation. 2nd ed. Academic Press, London. 1999. 134p.

97. Alkorta I., Garbisu C. Phytoremediation of organic contaminants in soils // Bio-res. Technol. 2001. V.79. P.273-276.

98. Annweiler E., Materna A., Safmowski M., Kappler A., etc. Anaerobic degradation of 2-methylnaphthalene by a sulfate-reducing enrichment culture // Appl. Environ. Microbiol. 2000. V.66. P.5329-5333.

99. Anokhina Т.О., Volkova O.V., Puntus I.F., Filonov A.E., V.V. Kochetkov, etc. Plant growth-promoting Pseudomonas bearing catabolic plasmids: naphthalene degradation and effect on plants // Process Biochemistry. 2006. V.41. P.2417-2423.

100. Aronstein B.N., Alexander M. Surfactants at low concentrations stimulate biodeg-radation of sorbed hydrocarbons in samples of aquifer sands and soil slurries // Environ. Toxicol. Chemistry 1992. V.ll. №9. P.1227-1233.

101. Atlas R.M. Bioremediation of petroleum pollutants // Int. Biodet. Biodeg. 1995. V.35.P.317-327.

102. Beam H.W., Perry J J. Microbial degradation and assimilation of n-alkyl-substituted cycloparaffms // J. Bacteriol. 1974. V.118. №2. P.394-399.

103. Beyersdorf-Radeck В., Riedel K., Karlson U., Bachmann T.T., etc. Screening of xenobiotic compounds degrading microorganisms using biosensor techniques // Microbiol. Res. 1998. V.153. №3. P.239-245.

104. Bhushan В., Halasz A., Spain J.C., etc. Initial reaction(s) in biotransformation of CL-20 is catalyzed by salicylate 1-monooxygenase from Pseudomonas sp. strain ATCC 29352 // Appl. Environ. Microbiol. 2004. V.70. P.4040-4047.

105. Biocatalysis/Biodegradation Database: Microbial biocatalytic reactions and biodegradation pathways primarily for xenobiotic, chemical compounds. University of Minnesota. Режим доступа http://umbbd.msi.umn.edu/.

106. Bloemberg G.V., Lugtenberg B.J. Molecular basis of plant growth promotion and biocontrol by rhizobacteria // Current Opinion Plant Biol. 2001.V.4. № 4. P.343-350.

107. Bogardt A.H., Hemmingsen B.B. Enumeration of phenantrene degrading bacteria by an overlayer technique and its use in evaluation of petroleum contaminated sites // Appl. Environ. Microbiol. 1992. V.58. №8. P.2579-2582.

108. Booth I.R., Jones M.A., NcLaggan D., Nikolaev Y., Ness L., etc. Bacterial ion channels. In eds: Konings W.N.,etc. / Handbook of biological physics. Amsterdam:Elsevier. V.2. P.693-729.

109. Boronin A.M., Filonov A.E., Gayazov R.R., Kulakova A.N., etc. Growth and plasmid-encoded naphthalene catabolism of Pseudomonas putida in batch culture // FEMS Microbiol. Lett. 1993. V.113. P.303-308.

110. Bosch R., Garcia-Valdes E., Moore E.R.B. Complete nucleotide sequence and evolutionary significance of a chromosomally encoded naphthalene degradation lower pathway from Pseudomonas stutzeri AN10 // Gene. 2000. V.245. P.65-74.

111. Bosch R., Garcia-Valdes E., Moore E.R.B. Genetic characterization and evolutionary implications of a chromosomally encoded naphthalene degradation upper pathway from Pseudomonas stutzeri AN10 // Gene. 1999. V.236. P.149-157.

112. Bredford M.M. Rapid and sensitive method for the quantitationof microgram quantity of protein utilizing the principle of proteindye binding // Ann. Biochem. 1976. V.72. P.248-254.

113. BRENDA: The Comprehensive Enzyme Information System. Режим доступа http://www.brenda-enzymes.info/.

114. Brucheim P., Bredholt H., Eimhjellen K. Bacterial degradation of emulsified crude oil and the effect of various surfactants // Can. J. Microbiol. 1997. V.43. №1. P. 17-22.

115. Bruheim P., Eimhjellen K. Chemically emulsified crude oil as substrate for bacterial oxidation: differences in species response // Can. J. Microbiol. 1998. V.44. №2. P. 195199.

116. Burd G., Ward O.P. Involvement of a surface-active high molecular weght factor in degradation of polycyclic aromatic hydrocarbons by Pseudomonas marginalis // Can. J. Microbiol. 1996. V.42. №8. P.791-797.

117. Candidus S., VanPee K.H., Lingens F. The catechol 2,3-dioxygenase gene of Rhodococcus rhodochrous CTM nucleotide sequence, comparison with isofunctional dioxygenases and evidence for anactive-site histidine // Microbiology. 1994. V.140. P.321-330.

118. Canosa I., Sanchez-Romero J.M., Yuste L., Rojo F. A positive feedback mechanism controls expression of AlkS, the transcriptional regulator of the Pseudomonas oleo-vorans alkane degradation pathway // Mol. Microbiol. 2000. V.35. P.791-799.

119. Carmichael L.M., Pfaender F.K. Polynuclear aromatic hydrocarbon metabolism in soils: relationship to soil characteristics and preexposure // Environ. Toxicol. Chem. 1997. V. 16. №4. P.666-675.

120. Cavalca L., Dell'Amico E., Andreoni V. Intrinsic bioremediability of an aromatic hydrocarbon-polluted groundwater: diversity of bacterial population and toluene monoxy-genasegenes // Appl. Microbiol. Biotechnol. 2004. V.64. V.576-587.

121. Chang B.V., Chang I., Yuan S. Anaerobic degradation of phenanthrene and pyrene in mangrove sediment // Bull, of Environ. Contam. and Toxic. 2008. V.80. №2. P.145-149.

122. Chang S., Jang J.K., Gil G.C., Kim M., etc. Continuous determination of biochemical oxygen demand using microbial fuel cell type biosensor // Biosensors & Bioelec-tronics. 2004. V.19. №6. P.607-613.

123. Chee G.J., Nomura Y., Karube I. Biosensor for the estimation of low biochemical oxygen demand // Analytica Chimica Acta. 1999. V.379. P. 185-191.

124. Chen C.I., Taylor R.T. Thermophyllic biodegradation of BTEX by two consortia of anaerobic bacteria // Appl. Microbiol. Biotechnol. 1997. V.48. №1. P.121-128.

125. Compant S., Duffy В., Nowak J., etc. Use of plant growth-promoting bacteria for biocontrol of plant diseases: principles, mechanisms of action, and future prospects // Appl. Environ. Microbiol. 2005. V.71. № 9. P.4951-4959.

126. D'Souza S.F. Microbial biosensors // Biosensors & Bioelectronics. 2001. V.16. P.337-353.

127. Daane L.L., Harjono I., Zylstra G.J., Haggblom M.M. Isolation and characterization of polycyclic aromatic hydrocarbon-degrading bacteria associated with the rhizosphere of salt marsh plants // Appl. Env. Microbiol. 2001. V.67. № 6. P.2683-2691.

128. De Bont J.A.M. Solvent-tolerant bacteria in biocatalysis // Trends Biotechnol. 1998. V.16.P.493-499.

129. Delille D., Pelletier E., Delille В., Coulon F. Effect of nutrient enrichments on the bacterial assemblage of Antarctic soils contaminated by diesel or crude oil // Polar. Record 2003. Y.39. №4. P.309-318.

130. Dennis J., Zylstra G. Complete sequence and genetic organization of pDTGl, the 83 kilobase naphthalene degradation plasmid from Pseudomonas putida strain NCIB 9816-4 II J. Mol. Biology. 2004. V. 341. №3. P.753-768.

131. Denome S.A., Stanley D.C., Olson E.S., Young K.D. Metabolism of dibenzothio-phene and naphthalene in Pseudomonas strains: complete DNA sequence of an upper naphthalene catabolic pathway 11 J. Bacteriol. 1993. V.175. P.6890-6901.

132. Desomer J., Vereecke D., Crespi M., Van Montagu M. The plasmid-encoded chloramphenicol-resistance protein of Rhodococcus fascians is homologous to the transmembrane efflux proteins // Mol. Microbiol. 1992. V.6. P.2377-2385.

133. Dobbelaere S., Vanderleyden J., Okon Y. Plant growth-promoting effects of di-azotrophs in the rhizosphere // Crit. Rev. Plant Sci. 2003. V.22. P. 107-149.

134. Dua R.D., Meera S. Purification and characterization of naphthalene oxygenase from Corynebacterium renale II Eur. J. Biochem. 1981. V.120. P.461-465.

135. Duncan K., Levetin E., Wells H., Jennings E., etc. Managet bioremediation of soil contaminated with crude oil. Soil chemistry and microbial ecology three years later // Appl. Biochem. Biotechnol. 1997. V.63. P.879-889.

136. Dunn N.W., Gunsalus I.C. Transmissible plasmid coding early enzymes of naphthalene oxidation in Pseudomonas putida // J. Bacteriol. 1973. V.l 14. P.974-979.

137. Duque E., Segura A., Mosqueda G., Ramos J.L. Global and cognate regulators control the expression of the organic solvent efflux pumps TtgABC and TtgDEF of Pseudomonas putida II Mol. Microbiol. 2001. V.39. P.l 100-1106.

138. Ensley B.D., Gibson D.T. Naphthalene dioxygenase: purification and properties of a terminal oxygenase component // J. Bacteriol. 1983. V.155. P.505-511.

139. Ensley B.D., Haigler E.B. Naphthalene dioxygenase from Pseudomonas NCIB 9816 //Methods Enzymol. 1990. V.188. P.46-52.

140. Eulberg D., Golovleva L.A., Schlomann M. Characterization of catechol catabolic genes from Rhodococcus erythropolis 1CP // J. Bacteriol. 1997. V.179. P.370-381.

141. Evans C., Herbert D., Tempest D. The continiuous cultivation of microorganisms // Methods in Microbiology. 1970. V.2. № 4. P.277-327.

142. Fan S., Scow K.M. Biodegradation of trichloroethylene and toluene by indigenous microbial populations in soil // Appl: Environ. Microbiol. 1993. V.59. №6. P.1911-1918.

143. Flyvbjerg J., Jorgensen C., Arvin E., Jensen В., Olsen S.K. Biodegradation of or-tho-cresol by a mixed culture of nitrate-reducing bacteria on toluene growing // Appl. Environ. Microbiol. 1993. V.59. №7. P.2286-2292.

144. Fuenmayor S.L., Wild M., Boyes A.L., Williams P.A. A gene cluster encoding steps in conversion of naphthalene to gentisate in Pseudomonas sp. strain U2 // J. Bacteriol. 1998. V.180. P.2522-2530.

145. Fukumori F., Hirayama H., Takami H., Inoue A., Horikoshi Y. Isolation and transposon mutagenesis of a Pseudomonas putida KT2442 toluene-resistant variant: involvement of an efflux system in solvent resistance // Extremophiles. 1998. V.2. P.395-400.

146. Furtado M.A.L. The effect of a syntetic surfactant on the rate of degradation of a model petroleum in marine enviroments // Int. Biodeterior. Biodegrad. 1996. V.37. №1. P. 122-125.

147. Galinski E.A., Truper H.G. Microbial behavior in salt-stressed ecosystems // FEMS Microbiol. Rev. 1994. V.15. P.95-108.

148. Gao Y., Zhu L. Plant uptake, accumulation and translocation of phenanthrene and pyrene in soils // Chemosphere. 2004. V.55. P.l 169-1178.

149. Geerdinc M.J., van Loosdrecht M.C.M., Luyben K.C.A.M. Model for microbial degradation of nonpolar organic contaminants in a soil slurry reactor // Environ. Sci. Tech-nol. 1996. V.30. №3. P.779-786.

150. Ghosh B.B., Banerjee A.K. Hydrocarbon utilization by Aeromonas, Arthrobacter, Brevibacterium, Corynebacterium, Micrococcus, Mycobacterium, Nocardia and Serratia spp II Curr. Sci. 1983. V.51. №22. P. 1072-1075.

151. Gibson D.T., Resnick S.M., Lee K., Brand J.M., Torok D.S., etc. Desaturation, dioxygenation, and monooxygenation reactions catalyzed by naphthalane dioxygenase from Pseudomonas sp. strain 9816-4 // J. Bacteriol. 1995. V.177. P.2615-2621.

152. Golovleva L.A., Aharonson N., Greenhaigh R., Sethunathan N., Vonk J.W. The role and limitations of microorganisms in the conversion of xenobiotics // Pure and Appl. Chem. 1990. V. 62. №2. P.351-364.

153. Grant W.D., Mwatha W.E. Bacteria from alkaline, saline environments. In: Hat-tori Т., Ishida Y., Maruyama Y., Morita R.Y., and Uchida A. (ed.) Recent advances in microbial ecology. Tokyo:Scient. Societ. Press. 1989. P.64-67.

154. Griffith G.R., Ruettinger R.T., McKenna E.J., Coon M.J. Fatty acid omega-hydroxylase (alkane hydroxylase) from Pseudomonas oleovorans II Methods Enzymol. 1978. V.53.P.356-360.

155. Grund E., Denecke В., Eichenlaub R. Naphthalene degradation via salicylate and genetisate by Rhodococcus sp. strain B4 // Appl. Environ. Microbiol. 1992. V.58. P.1874-1877.

156. Guerin W.F., Boyd S.A. Maintenance and induction of naphthalene degradation activity in Pseudomonas putida and an Alcaligenes sp. under different culture conditions // Appl. Environ. Microbiol. 1995. V.61. №11. P.4061-4068.

157. Gulensoy N., Alvarez P.J. Diversity and correlation of specific aromatic hydrocarbon biodegradation capabilities // Biodegradation. 1999. V.10. P.331-340.

158. Haigler B.E., Gibson D.T. Purification and properties of NADH-ferredoxinNAP reductase, a component of naphthalene dioxygenase from Pseudomonas sp. strain NCIB 9816 //J. Bacteriol. 1990. V.172. P.457-464.

159. Hamamura N., Yeager C.M., Arp D.J. Two distinct monooxygenases for alkane oxidation in Nocardiodes sp. strain CF8 // Appl. Environ. Microbiol. 2001. V.67. №11. P.4992-4998.

160. Hanrahan G., Patil D.G., Wang J. Electrochemical sensors for environmental monitoring: design, development and applications // J. Environ. Monit. 2004. V.6. №8. P.657-664.

161. Harder H., Kurzelseidel В., Hopner T. Hydrocarbons biodegradation in sediments and soils. Systematic examination of physical and chemical conditions // Erdol & Kohle Erdgas Petrochem. 1991. V.44. №2. P.59-62.

162. Hart S. In situ bioremediation: defining the limites // Environ. Sci. Technol. 1996. V.30. № 9. P.398-401.

163. Heipieper H.J., Weber F.J., Sikkema J., Keweloh H., de Bont J.A.M. Mechanisms of resistance of whole cells to toxic organic solvents // Trends Biotechnol. 1994. V.12. P.406-416.

164. Heiser D. Bioremediation of petroleum pollutants in cold environments // Restoration and Reclamation Review. On-Line Jour. 1999. V.5. Режим доступа ("http://hoticul-ture.cfans.umn.edu/vd/h5015/99fpapers/heiser.htm.

165. Hill K.E., Top E.M. Gene transfer in soil systems using microcosms // FEMS Microbiol. Ecol. 1998. V. 25. P.319-329.

166. Hubert C., Shen Y., Voordouw G. Composition of toluene-degrading communities from soil at different concentration of toluene // Appl. Environ. Microbiol. 1999. V.65. №7. P.3064-3070.

167. Ishige Т., Tani A., Sakai Y., Kato N. Long-chain aldehyde dehydrogenase that participates in n-alkane utilization and wax ester synthesis in Acinetobacter sp. strain M-l // Appl. Environ. Microbiol. 2000. V.66. P.3481-3486.

168. Isken S., de Bont J.A.M. The solvent efflux system of Pseudomonas putida S12 is not involved in antibiotic resistance // Appl. Microbiol. Biotechnol. 2000. V.54. P.711-714.

169. Issakov D.A., Iossel J.Y., Sakson V.M., Kazarov G.S., etc. Cleaning capillary/ porous media of oil and petroleum product contamination. Patent № 9802600, 22.01.98.

170. Jeffrey A.M., Yeh H.J., Jerina D.M., Patel T.R., etc. Initial reactions in the oxidation of naphthalene by Pseudomonas putida И Biochemistry. 1975. V.14. P.575-584.

171. Junker F., Ramos J.L. Involvement of the cis/trans isomerase Cti in solvent resistance of Pseudomonas putida DOT-TIE // J. Bacteriol. 1999. V.181. P.5693-5700.

172. Kamin H., White-Stevens R.H., Presswood R.P. Salicylate hydroxylase // Methods Enzymol. 1978. V.53. P.527-543.

173. Kampfer P., Steiof M., Becker P.M., Dott W. Characterization of chemohetero-trophic bacteria associated with the in situ bioremediation of a waste oil contaminated site // Microbial Ecoiogy. 1993. V.26. P.161-188.

174. Kaplan C.W., Kitts C.L. Bacterial succession in a petroleum land treatment unit // Appl. Environ. Microbiol. 2004. V.70. №3. P. 1777-1786.

175. Kato C., Inoue A., Horikoshi K. Isolating and characterizing deep-sea marine microorganisms // Trends Biotechnol. 1996. V.14. № 1. P.6-12.

176. Keren Embar K., Forgacs H., Sivan A. The effect of hydrophobic aggregates on the bioremediation of crude oil in soil // 12th International Biodeterioration and Biodegradation Symposium. July 14-18, Prague. 2002. P.42.

177. Kerry E. Bioremediation of experimental petroleum spills on mineral soils in the Vestfold Hills, Antarctica // Polar Biology. 1993. V.13. №3. P. 163-170.

178. Kieboom J., Dennis J J., de Bont J. A.M., Zylstra G.J. Identification and molecular characterization of an efflux pump involved in Pseudomonas putida S12 solvent tolerance // J. Biol. Chem. 1998. V.273. P.85-91.

179. Rniemeyer O., Heider J. Ethylbenzene dehydrogenase, a novel hydrocarbon-oxidizing molybdenum/iron-sulfur/heme enzyme // J. Biol. Chem. 2001. V.276. P.21381-21386.

180. Kostal J., Suchanek M., Klierova H., K. Demnerova, etc. Pseudomonas C12B, an SDS degrading strain, harbours a plasmid coding for degradation of medium chain length n-alkanes // Int. Biodet. Biodeg. 1998. V.42. P.221-228.

181. Kulakov L.A, Larkin M.J., Kulakova A.N. Cryptic plasmid pKA22 isolated from the naphthalene degrading derivative of Rhodococcus rhodochrous NCIMB13064 // Plasmid, 1997. V.38. P.61-69.

182. Kulakov L.A., Delcroix V.A., Larkin M.J., Ksenzenko V.N. Cloning of new Rhodococcus extradiol dioxygenase genes and study of their distribution in different Rhodococcus strains // Microbiology. 1998. V.144. P.955-963.

183. Kulakova A.N., Reid K.A., Larkin M.J., Allen C.R. Isolation of Rhodococcus rhodochrous NCIMB13064 derivatives with new biodegradative abilities // FEMS Microbiol. Lett. 1996. V.145. P.227-231.

184. Lanyon Y.H., Marrazza G., Tothill I.E., Mascini M. Benzene analysis in workplace air using an FIA-based bacterial biosensor // Biosens. Bioelectron. 2005. V.15. №20. P.2089-2096.

185. Laurie A.D., Lloyd-Jones G. The phn genes of Burkholderia sp. strain RP007 constitute a divergent gene cluster for polycyclic aromatic hydrocarbon catabolism // J. Bacteriol. 1999. V.181. P.531-540.

186. Lee J.H., Mitchell R.J., Kim B.C., Cullen D.C., Gu M.B. A cell array biosensor for environmental toxicity analysis // Biosens. Bioelectron. 2005. V.21. P.500-507.

187. Lee K., Gibson D.T. Toluene and ethylbenzene oxidation by purified naphthalene dioxygenase from Pseudomonas sp. strain NCIB 9816-4 // Appl. Environ. Microbiol. 1996. V.62. P.3101-3106.

188. Lee N., Hwang M., Jung G., Kim Y., Min K. Physical structure and expression of alkBA encoding alkane hydroxylase and rubredoxin reductase from Pseudomonas malto-philia И Biochem. Biophys. Res. Commun. 1996. V.218. P.17-21.

189. Lei Y., Chen W., Mulchandani A. Microbial biosensors. Review // Anal. Chim. Acta. 2006. V.568. P.200-210.

190. Li X.Z., Poole K. Organic solvent-tolerant mutants of Pseudomonas aeruginosa display multiple antibiotic resistance // Can. J. Microbiol. 1999. V.45. P.18-22.

191. Li Y.F., Li F.Y., Ho C.L., Liao V.H. Construction and comparison of fluorescence and bioluminescence bacterial biosensors for the detection of bioavailable toluene and related compounds //Environ. Pollut. 2008. V.152. №1. P.123-132.

192. Liu J., Mattiasson B. Microbial BOD sensors for wastewater analysis // Water Research. 2002. №36. P.3786-3802.

193. Liu L., Jiang C.Y., Liu X.Y., Wu J.F. Plant-microbe association for rhizoremedia-tion of chloronitroaromatic pollutants with Comamonas sp. strain CNB-1 //Environ. Microbiol. 2007. V.9.P.465-473.

194. Lovley D.R., Lloyd J.R. Microbes with a mettle for bioremediation // Nat. Biotechnol. 2000. V.18. P.600-601.

195. Масек Т., Mackova M., Kas J. Exploitation of plants for the removal of organics in environmental remediation // Biotechnol. Adv. 2000. V. 18. P.23-34.

196. MacNaughton S.J., Stephen J.R., Venosa A.D., Davis G.A., etc. Microbial population changes during bioremediation of an experimental oil spill // Appl. Environ. Microbiol. 1999. V.65. P.3566-3574.

197. Margesin R. Potential of cold-adapted microorganisms for bioremediation of oil-polluted alpine soils // Int. Biodet. Biodeg. 2000. V.46. P.3-10.

198. Margesin R., Schinner F. Biodegradation and bioremediation of hydrocarbons in extreme environments //Appl. Microbiol. Biotechnol. 2001. V.56. P.650-663.

199. Margesin R., Schinner F. Efficiency of indigenous and cold-adapted soil microorganisms for biodegradation of diesel oil in alpine soil // Appl. Environ. Microbiol. 1997. V.63. №7. P.2660-2664.

200. Margesin R., Schinner F. Potential of halotolerant and halophilic microorganisms for biotechnology // Extremophiles. 2001. V.5. P.73-83.

201. Marin M.M., Yuste L., Rojo F. Differential expression of the components of the two alkane hydroxylases from Pseudomonas aeruginosa И J. of Bacteriology. 2003. V.185. №10. P.3232-3237.

202. McKenna E.J., Coon MJ. Enzymatic omega-oxidation. IV. Purification and properties of the omega-hydroxylase of Pseudomonas oleovorans И J. Biol. Chem. 1970. V.245. P.3882-3889.

203. Meagher R.B. Phytoremediation of toxic elemental and organic pollutants // Curr. Opin. Plant Biol. 2000. V.3. P.153-162.

204. Menn F.M., Applegate B.M., Sayler G.S. NAH plasmid-mediated catabolism of anthracene and phenanthrene to naphthoic acids // Appl. Environ. Microbiol. 1993. V.59. P.1938-1942.

205. Miller K.J., Wood J.M. Osmoadaptation by rhizosphere bacteria // Annual Rev. Microbiol. 1996. V.50. P.101-136.

206. Miller R.M., Bartha R. Evidence from liposome encapsulation from transport-limited microbial metabolism of solid alkanes // Appl. Environ. Microbiol. 1989. V.55. P.269-274.

207. Mishra S., Jyot J., Kuhad R.C., Lai B. Evaluation of inoculum addition to stimulate in situ bioremediation of oily sludge-contaminated soil // Appl. Environ. Microbiol. 2001. V.67. P.l675-1681.

208. Mohn W.W., Stewart G.R. Limiting factors for hydrocarbon biodegradation at low temperature in Arctic soils // Soil Biol. Biochem. 2000. V.32. P.l 161-1172.

209. Moody J.D., Freeman J.P., Doerge D.R., Cerniglia C.E. Degradation of phenanthrene and anthracene by cell suspensions of Mycobacterium sp. strain PYR-1 // Appl. Environ. Microbiol. 2001. V.67. P.l476-1483.

210. Mosqueda G., Ramos J.L. A set of genes encoding a second toluene efflux system in Pseudomonas putida DOT-TIE is linked to the tod genes for toluene metabolism // J. Bacteriol. 2000. V.182. P.937-943.

211. Mueller J.G., Devereux R., Santavy D.L., Lantz S.E., etc. Phylogenetic and physiological comparisons of РАН-degrading bacteria from geographically diverse soils // Antonie van Leeuwenhoek. 1997. V.71. P.329-343.

212. Mulligan C.N., Yong R.N., Gibbs B.F. Surfactant-enhanced remediation of contaminated soil: a review // Eng. Geol. 2001. V.60. P.371-380.

213. Neumann G., Teras R., Monson L., Kivisaar M. Simultaneous degradation of atrazine and phenol by Pseudomonas sp. strain ADP: effects of toxicity and adaptation //

214. Appl. Environ. Microbiol. 2004. V.70. №4. P.1907-1912.

215. Nicholson C.A., Fathepure B.Z. Biodegradation of benzene by halophilic and halotolerant bacteria under aerobic conditions // Appl. Environ. Microbiol. 2004. V.70. №2. P.1222-1225.

216. Olusola Abayomi Ojo. Molecular strategies of microbial adaptation to xenobiot-ics in natural environment // Biotech, and Molec. Biol. Review. 2007. V.2. №1. P.1-13.

217. Oudot J., Dupont J., Haloui S., Roquebert M.F. Biodegradation potential of hydrocarbon assimilating tropical fungi // Soil Biol. Biochem. 1993. V.25. №9. P. 1167-1173.

218. Padan E., Schuldiner S. Molecular physiology of Na+/H+ antiporters key transporters in circulation of Na+ and H+ in cells // Biochim. Biophis. Acta. 1994. V.l 185. P.129-151.

219. Paitan Y., Biran D., Biran I., Shechter N., Babai R., Rishpon J., Ron E.Z. On-line and in situ biosensors for monitoring environmental pollution // Biotechnol. Adv. 2003. V.22. №1-2. P.27-33.

220. Park W., Jeon C.O., Cadillo H., DeRito C., Madsen E.L. Survival of naphthalene-degrading Pseudomonas putida NCIB9816-4 in naphthalene-amended soils: toxicity of naphthalene and its metabolites // Appl. Microbiol. Biotechnol. 2004. V.64. P.429-435.

221. Paulsen I.T., Brown M.H., Skurray R.A. Proton-dependent multidrug efflux systems //Microbiol. Rev. 1996. V.60. P.575-608.

222. Peterson J.A., Kusunose M., Kusunose E., Coon M.J. Enzymatic omega-oxidation. II. Function of rubredoxin as the electron carrier in omega-hydroxylation // J. Biol. Chem. 1967. V.242. P.4334-4340.

223. Pieper D.H., Reineke W. Engineering bacteria for bioremediation // Curr. Opin. Biotechnol. 2000. V.ll. P.262-270.

224. Pingsheng J., Wilson M. Enhancement of population size of a biological control agent and efficacy in control of bacterial speck of tomato through salicylate and ammonium sulfate amendments // Appl. Environ. Microbiol. 2002. V.34. P.1290-1294.

225. Pospisil M., Voldrich M., Marek M., Gerovsky M. Bioremediation of soil contaminated with polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs) // Int. Biodeterior. Biodegrad. 1996. V.37.№3. P. 259-264.

226. Prabhu Y., Phale P.S. Biodegradation of phenanthrene by Pseudomonas sp. strain PP2: novel metabolic pathway, role of biosurfactant and cell surface hydrophobicity in hydrocarbon assimilation // Appl. Microbiol. Biotechnol. 2003. V.61. P.342-351.

227. Ramos J.L., Duque E., Godoy P., Segura A. Efflux pumps involved in toluene tolerance in Pseudomonas putida DOT-TIE // J. Bacteriol. 1998. V.180. P.3323-3329.

228. Ramos J.L., Duque E., Rodriguez-Herva J.J., Godoy P., etc. Mechanisms for solvent tolerance in bacteria // J. Biol. Chem. 1997. V.272. P.3887-3890.

229. Raskin I. Role of salicylic acid in plants II Annual Rev. Plant Physiol. Plant Mol. Biol. 1990. V.43. P. 439-463.

230. Reshetilov A.N., Iliasov P.V. et al. Pseudomonas putida as a receptor element of microbial sensors for naphthalene detection // Process Biochemistry. 1997. V.32. № 6. P.487-493.

231. Reshetilov A.N., Trotsenko J.A., etc. Characteristics of Gluconobacter oxydans B-1280 and Pichia methanolica MN4 cell based biosensors for detection of ethanol // Process Biochemistry. 2001. V.36. P.1015-1020.

232. Resnick S.M., Gibson D.T. Regio- and stereospecific oxidation of fluorene, dibenzofiiran, and dibenzothiophene by naphthalene dioxygenase from Pseudomonas sp. strainNCIB 9816-4 //Appl. Environ. Microbiol. 1996. V.62. P.4073-4080.

233. Rishpon J. Electrochemical biosensors for environmental monitoring // Rev. Environ. Health. 2002. V.17. №3. P.219-247.

234. Rodrigues E.G.C., Menezes E.P., Santa-Anna L.M.M., etc. Oil degrading microorganisms // Int. Biodeterior. Biodegrad. 1996. V.37. №1. P.l 19-123.

235. Rodriguez-Mozaz S., Lopez de Alda M.J., Barcelo D. Biosensors as useful tools for environment alanalysis and monitoring // Anal. Bioanal. Chem. 2006. 17c.

236. Rodriguez-Valera F., Ventosa A., Juez G., Imhoff J.F. Variation of environmental features and microbial populations with salt concentrations in a multi-pond saltern // Mi-crob. Ecol. 1985. V.ll. P.107-115.

237. Rojas A., Duque E., Mosqueda G., Golden G., etc. Three efflux pumps are required to provide efficient tolerance to toluene in Pseudomonas putida DOT-TIE // J. Bacteriol. 2001. V. 183. P.3967-3973.

238. Rojo F. Specificity at the end of tunnel: understanding substrate length discrimination by the AlkB alkane hydroxylase // J. Bacteriol. 2005. V.187. P. 19-22.

239. Romine M.F., Fredrickson J.K., Li S.M.W. Induction of aromatic catabolic activity in Sphingomonas aromaticivorans strain F199 // J. Ind. Microbiol. Biotechnol. 1999. V.23. P.303-313.

240. Ron E.Z. Biosensing environmental pollution // Curr. Opin. Biotechnol. 2007. V.18. №3. P.252-258.

241. Rosenberg E., Ron E.Z. High- and low-molecular-mass microbial surfactants // Appl. Microbiol. Biotechnol. 1999. V.52. P. 154-162.

242. Rybnikova V.I., Tetakaeva E.A. Procedure for treatment of waste, geothermal and oil processing waters. Patent № 2108983, 20.04.98.

243. Sakaguchi Т., Kitagawa K., Ando Т., Murakami Y., etc. A rapid BOD sensing system using luminescent recombinants of Escherichia coli II Biosensors & Bioelectronics. 2003. V.19. №2. P.l 15-121.

244. Salt D.E., Smith R.D., Raskin I. Phytoremediation // Annu. Rev. Plant Physiol. Plant Mol. Biol. 1998. V.49. P.643-668.

245. Sanseverino J., Applegate B.M., King J.M.H., Sayler G.S. Plasmid-mediated mineralization of naphthalene, phenanthrene, and anthracene // Appl. Environ. Microbiol. 1993. V.59.P.1931-1937.

246. Sato S., Nam J., Kasuga K., Nojiri H., Yamane H., etc. Identification and characterization of genes encoding carbazole-l,9a-dioxygenase in Pseudomonas sp. strain CA10 // J. Bacteriol. 1997. V.179. P.4850-4858.

247. Sayler G.S., Rip S. Field applications of genetically engineered microorganisms for bioremediation processes // Curr. Opin. Biotechnol. 2000. V.l 1. P.286-289.

248. Schreiner A., Fuchs K., Lottspeich F., Poth H. Degradation of 2-methylaniline in Rhodococcus-rhodochrous -cloning and expression of 2 clustered catechol 2,3-dioxygenase genes from strain CTM11 J. Gen. Microbiol. 1991. V.l 37. P.2041-2048.

249. Selifonov S.A., Grifoll M., Eaton R.W., Chapman P.J. Oxidation of naphtha-lenoaromatic and methyl-substituted aromatic compounds by naphthalene 1,2-dioxygenase //Appl. Environ. Microbiol. 1996. V.62. P.507-514.

250. Sheng X.F., He L.Y., Zhou L., Shen Y.Y. Characterization of Microbacterium sp. FlOa and its role in poly cyclic aromatic hydrocarbon removal in low-temperature soil 11 Can. J. Microbiol. 2009. V.55. №5. P.529-535.

251. Sikkema J., de Bont J.A.M., Poolman B. Mechanisms of membrane toxicity of hydrocarbons // Microbiol. Rev. 1995. V.59. P.201-222.

252. Smith C.A., Hyman M.R. Oxidation of methyl tert-butyl ether by alkane hydroxylase in dicyclopropylketone-induced and n-octane-grown Pseudomonas putida GPol / Appl. Environ. Microbiol. 2004. V.70. P.4544-4550.

253. Smith M.J., Lethbridge G., Burns R.G. Bioavailability and biodegradation of polycyclic aromatic hydrocarbons in soils // FEMS Microbiol. Lett. 1997. V.l52. №1. P.141-147.

254. Sole S., Alegret S. Environmental toxicity monitoring using electrochemical bio-sensing systems // Environ. Sci. Pollut. Res. Int. 2001. №4. P.256-264.

255. Sorensen S.J., Burmolle M, Hansen LH. Making biosense of toxicity: new developments in whole-cell biosensors // Curr. Opin. Biotechnol. 2006 V.l7. №1. P.l 1-16.

256. Tam N.F., Guo C.L., Yau W.Y., Wong Y.S. Preliminary study on biodegradation of phenanthrene by bacteria isolated from mangrove sediments in Hong Kong // Mar. Pollut. Bull. 2002. V.45.P.316-324.

257. Tani A., Ishige Т., Sakai Y., Kato N. Genetic structure and regulation of the alkane hydroxylase complex in Acinetobacter sp. strain M-l // J. Bacteriol. 2001. V.183. P.1819-1823.

258. Timur S., Pazarlioglu N., Pilloton R., Telefoncu A. Detection of phenolic coum-paunds by thick film sensors based on Pseudomonas putida // Talanta. 2003. №.61. P.87-93.

259. Tizzard A.C., Lloyd-Jones G. Bacterial oxygenases: In vivo enzyme biosensors for organic pollutants // Biosensors & Bioelectronics. 2007. V.22. P.2400-2407.

260. Tongpim S., Pickard M.A. Cometabolic oxidation of phenanthrene to phenanthrene trans-9,10-dihydrodiol by Mycobacterium strain SI growing on anthracene in the presence of phenanthrene // Can. J. Microbiol. 1999. V.45. P.369-376.

261. Treadway S.L., Yanagimachi K.S., Lankenau E., Lessard P.A., etc. Isolation and characterization of indene bioconversion genes from Rhodococcus strain 124 // Appl. Microbiol. Biotechnol. 1999. V.51. P.786-793.

262. Tsitko I.V., Zaitsev G.M., Lobanok A.G., Salkinoja-Salonen M.S. Effect of aromatic compounds on cellular fatty acid composition of Rhodococcus opacus II Appl. Environ. Microbiol. 1999. V.65. P.853-855.

263. Tsuda M., lino T. Naphthalene degrading genes on plasmid NAH7 are on a defective transposon II Mol. Gen. Genet. 1990. V. 223. P.33-39.

264. Uz I., Duan Y.P., Ogram A. Characterization of the naphthalene-degrading bacterium Rhodococcus opacus M213 //FEMS Microbiol. Lett. 2000. V.185. P.231-238.

265. Van Beilen J.B., Panke S., Lucchini S., Franchini A.G., etc. Analysis of Pseudomonas putida alkane degradation gene clusters and flanking insertion sequences: evolution and regulation of the alk genes //Microbiology. 2001. V.147. P.1621-1630.

266. Van Beilen J.B., Smits Т.Н., Roos F.F., Brunner T. Identification of an amino acid position that determines the substrate range of integral membrane alkane hydroxylases //J. Bacteriol. 2005. V.l 87. P.85-91.

267. Van Beilen J.B., Wubbolts M.G., Witholt B. Genetics of alkane oxidation by Pseudomonas oleovorans И Biodegradation. 1994. V.5. P.161-174.

268. Van Hamme J.D., Singh A., Ward O.P. Recent advances in petroleum microbiology // Microbiol. Mol. Biol. Rev. 2003. Vol.67. № 4. P.503-549.

269. Van Hamme J.D., Ward O.P. Influence of chemical surfactants on the biodegradation of crude oil by a mixed bacterial culture // Can. J. Microbiol. 1999. V.45. P.130-137.

270. Von Wallbrunn A., Richnow H.H., Neumann G., Meinhardt F. Mechanism of cis-trans isomerization of unsaturated fatty acids in Pseudomonas putida И J.Bacteriol. 2003. V. 185. P.1730-1733.

271. Walter M.V., Nelson E.C., Clayton M.J. Effect of surfactanat and bacterial amendments to enhance biodegradation of hydrocarbons // Abstr. Gen. Meet. Am. Soc. Microbiol. 1996. V. 96. P.437-442.

272. Wanekaya A.K., Chen W., Mulchandani A. Recent biosensing developments in environmental security // J. Environ. Monit. 2008. V.10. № 6. P.703-712.

273. Weber FJ., Isken S., de Bont J.A.M. Cis/trans isomerization of fatty acids as a defence mechanism of Pseudomonas putida strains to toxic concentrations of toluene // Microbiology. 1994. V.140. P.2013-2017.

274. Weber F.J., Ooijkaas L.P., Schemen R.M.W., Hartmans S. Adaptation of Pseudomonas putida S12 to high concentrations of styrene and other organic solvents // Appl. Environ. Microbiol. 1993. V.59. P.3502-3504.

275. Welbaum G., Sturz A.V., Dong Z., Nowak J. Fertilizing soil microorganisms to improve productivity of agroecosystems // Crit. Rev. Plant Sci. 2004. V.23. P. 175-193.

276. Werlen C., Jaspers M.C., van der Meer J.R. Measurement of biologically available naphthalene in gas and aqueous phases by use of a Pseudomonas putida biosensor // Appl. Environ. Microbiol. 2004. V.70. №1. P.43-51.

277. White-Stevens R.H., Kamin H. Studies of a flavoprotein, salicylate hydroxylase // J. Biol. Chem. 1972. V.247. P.2358-2370.

278. Whyte L.G., Bourbonniere L., Greer C.W. Biodegradation of petroleum hydrocarbons by psychrotrophic Pseudomonas strains possessing both alkane (alk) and naphthalene (nah) catabolic pathways // Appl. Environ. Microbiol. 1997. V.63. P.3719-3723.

279. Whyte L.G., Greer C.W., Inniss W.E. Assessment of the biodegradation potential of psychrotrophic microorganisms // Can. J. Microbiol. 1996. V.42. P.99-106.

280. Widada J., Nojiri H., Kasuga K., Yoshida Т., Habe H., etc. Molecular detection and diversity of polycyclic aromatic hydrocarbon-degrading bacteria isolated from geographically diverse sites // Appl. Microbiol. Biotechnol. 2002. V.58. P.202-209.

281. Willardson B.M., Wilkins J.F., Rand T.A., etc. Development and testing of a bacterial biosensor for toluene-based environmental contaminants // Appl. Environ. Microbiol. 1998. V.64. №3. P.1006-1012.

282. Willett H.A., Willett C.A. Oil absorption apparatus using kenaf fiber and core portions. Pat. USA 5271691, 20.10.96.

283. Yamamoto S., Katagiri M., Maeno H., Hayaishi O. Salicylate hydroxylase, a monooxygenase requiring flavin adenine dinucleotide // J. Biol. Chem. 1965. V.240. P.3408-3413.

284. Yang L., Lai C.-T., Shieh W.K. Biodegradation of dispersed diesel fuel under high salinity conditions // Water Res. 2000. V.34. P.3303-3314.

285. Yang Y., Chen R.F., Shiaris M.P. Metabolism of naphthalene, fluorene, and phenanthrene: preliminary characterization of a cloned gene cluster from Pseudomonas putida NCIB 9816//J. Bacteriol. 1994. V.176. P.2158-2164.

286. Yang Z., Suzuki H., Sasaki S., Karube I. Disposable sensor for biochemical oxygen demand //Appl. Microbiol. Biotechnol. 1996. V.46. №1. P. 10-14.

287. Yateem A., Balba M.T., Nawawy A.S., Al-Awandhi N. Plants-associated microflora and the remediation of oil-contaminated soil // Int. J. Phytorem. 2000. V.2. P. 183-191.

288. Yuste L., Rojo F. Role of the crc gene in catabolic repression of the Pseudomonas putida Gpol alkane degradation pathway // J. Bacteriol. 2001. V.l83. P.6197-6206.

289. Zhang X.X., Cheng S.P., Zhu C.J., etc. Microbial РАН-degradation in soil: degradation pathways and contributing factors // Pedosphere. 2006. V.16. №5. P.555-565.

290. Zhang Y.M., Miller R.M. Effect of a pseudomonas rhamnolipid biosurfactant on cell hydrophobicity and biodegradation of octadecane // Appl. Environ. Micriol. 1994. V.60. №6. P.2101-2106.

291. Zhao H., Chen D., Li Y., Cai B. Overexpression, purification and characterization of a new salicylate hydroxylase from the naphthalene-degrading Pseudomonas sp. strain ND6//Microbiol. Res. 2005. V.l60. P.307-313.

292. Zhenrong Qian, Tan T.C. Response characteristics of a dead-cell BOD sensor // Wat.Res. 1998. V.32. № 3. P.801-807.

293. Zylstra G J., Wang X.P., Kim E., Didolcar V.A. Cloning and analysis of the genes for polycyclic aromatic hydrocarbon degradation. In: Recombinant DNA Technology II. An. of the N.Y.Acad, of Sciences. 1994. V.721. P.386-398.