Научное обоснование механизма развития эпидемического процесса ВИЧ-инфекции на основе молекулярно-генетических исследований тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 14.02.02, доктор медицинских наук Зверев, Сергей Яковлевич

• Зверев, Сергей Яковлевич
• доктор медицинских наук
• 2010

Оглавление диссертации доктор медицинских наук Зверев, Сергей Яковлевич

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ.

ВВЕДЕНИЕ.

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1. ПРОЯВЛЕНИЯ ЭПИДЕМИЧЕСКОГО ПРОЦЕССА ВИЧ-ИНФЕКЦИИ В РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ.

2. БИОЛОГИЧЕСКИЙ ФАКТОР ЭПИДЕМИЧЕСКОГО ПРОЦЕССА ВИЧ-ИНФЕКЦИИ

2.1. ВИРУС ИММУНОДЕФИЦИТА ЧЕЛОВЕКА ПЕРВОГО ТИПА

2.1.1. Организация генома ВИЧ-1, характеристика вирусных белков.

2.1.2. Подтипы ВИЧ-1: классификация и распространение.

2.2. МУТАЦИИ ГЕНОВ ХЕМОКИНОВОЙ СИСТЕМЫ РЕГУЛЯЦИИ, ОКАЗЫВАЮЩИЕ ВЛИЯНИЕ НА ВОЗМОЖНОСТЬ ИНФИЦИРОВАНИЯ ВИЧ

2.2.1. Хемокиновые рецепторы как корецепторы проникновения ВИЧ-1 в клет

2.2.2. Хемокиновая система регуляции и ВИЧ-инфекция.

3. ПУТИ И ФАКТОРЫ ПЕРЕДАЧИ ВИЧ.

ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ.

2.1. Материалы.

2.2. Методы.

ГЛАВА 3. ПРОЯВЛЕНИЯ ЭПИДЕМИЧЕСКОГО ПРОЦЕССА ВИЧ

ИНФЕКЦИИ В ПЕРМСКОМ КРАЕ, 1988 - 2008 гг.

ГЛАВА 4. ХАРАКТЕРИСТИКА ВАРИАНТОВ ВИРУСА ИММУНОДЕФИЦИТА ЧЕЛОВЕКА ПЕРВОГО ТИПА (ВИЧ-1), ЦИРКУЛИРУЮЩИХ СРЕДИ ПАЦИЕНТОВ ПЕРМСКОГО КРАЯ, 1988

ГЛАВА 5. ХАРАКТЕРИСТИКА ВОСПРИИМЧИВОСТИ К ВИЧ-1 ЖИТЕЛЕЙ

ПЕРМСКОГО КРАЯ НА ОСНОВЕ ИЗУЧЕНИЯ ПОЛИМОРФИЗМА ГЕНОВ ССЯ5, ССЯ2 И ИХ СОЧЕТАНИЙ.

5.1. Эпидемиологическая характеристика вспышки ВИЧ-инфекции в г. Лысьва. Формирование и характеристика групп для проведения исследований.

5.2. Характеристика распространения мутантных аллелей генов ССЇ12 и ССЯ5 в группах доноров и ВИЧ-инфицированных ПИН.

5.3. Характеристика распространения мутантных аллелей генов ССИ2 и ССЯ5 в группе «контактных» ПИН.

5.4. Сравнительная характеристика распределений мутантных аллелей генов ССІ12, ССЯ5 и полиморфизма ССК5-59029А/0 в группах доноров, ВИЧинфицированных и «контактных» ПИН.

ГЛАВА 6. ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКАЯ ОЦЕНКА ГЕРОИНА И «ХАНКИ» КАК ФАКТОРОВ ПЕРЕДАЧИ ВИЧ-1 ПРИ РЕАЛИЗАЦИИ СВЯЗАННОГО С ИХ ИНЪЕКЦИОННЫМ УПОТРЕБЛЕНИЕМ ПАРЕНТЕРАЛЬНОГО ПУТИ ЗАРАЖЕНИЯ.

6.1. Изучение стабильности ВИЧ-1 в препаратах героина и его влияния на вирусную активность.

6.2. Изучение стабильности ВИЧ-1 в препаратах «ханки» и ее влияния на вирусную активность.

ГЛАВА 7. ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКАЯ ДИАГНОСТИКА В ОЧАГАХ ВИЧ-ИНФЕКЦИИ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ РЕЗУЛЬТАТОВ МОЛЕКУЛЯРНО

ГЕНЕТИЧЕСКИХ ИССЛЕДОВАНИЙ.

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Научное обоснование механизма развития эпидемического процесса ВИЧ-инфекции на основе молекулярно-генетических исследований»

Эпидемическая ситуация по ВИЧ-инфекции в Российской Федерации остается напряженной, несмотря на произошедшее в 2002 — 2004 гг. снижение количества вновь регистрируемых случаев заболевания. По данным Федерального Научно-методического Центра по профилактике и борьбе со СПИД на 31.12.2009 года в России официально зарегистрировано 529 353 случая ВИЧ-инфекции. Прогноз развития эпидемии этого заболевания для нашей страны остается крайне неблагоприятным. Отсутствие до настоящего времени препаратов для специфической профилактики, дорогостоящее лечение и социально-экономические последствия дают веские основания считать борьбу с ВИЧ-инфекцией одной из приоритетных задач здравоохранения [33, 34,48].

Успешная борьба с любой инфекционной патологией, в том числе и с ВИЧ-инфекцией, во многом определяется правильностью эпидемиологической диагностики- с выявлением факторов, детерминирующих заболеваемость. Одним из ведущих факторов развития эпидемического процесса является биологический, представленный взаимодействием популяций' микро- и макроорганизмов. Этот фактор в основном и определяет внутренние механизмы развития инфекционной заболеваемости [3]. Достижения в области использования моле-кулярно-генетических методов исследований применительно к нуждам эпидемиологии позволили получить более полные характеристики популяций паразита и хозяина, изучить особенности их взаимодействия, улучшить эпидемиологическую диагностику, включая дифференциацию путей передачи, возбудителя инфекции [51, 60, 58, 31]. Такого рода исследования проведены в эпидемиологии парентеральных вирусных гепатитов, инфекции НТЬУ—1/2 [5], клещевого энцефалита [18], энтеровирусных инфекций [29]. Активно проводятся молекулярно-генетические исследования и в отношении ВИЧ-инфекции.

Многочисленными исследованиями различных авторов установлено, что среди лиц, инфицированных ВИЧ-1, основным фактором риска заражения которых являлось внутривенное употребление наркотиков; в России, большинстве республик бывшего СССР и многих странах Восточной Европы в основном циркулируют вирусы трех разных подтипов, но наиболее широкое распространение получил вариант ВИЧ-1 подтипа А [9, 10, 11, 12, 180, 181, 199, 4, 163, 59, 79, 80, 22, 23, 15].

Однако в недавних работах [238, 52] было продемонстрировано, что популяция вирусов подтипа А, циркулирующих на территории России, гетерогенна: широкое распространение получили варианты ВИЧ-1, содержащие характеристические замены в 77-м кодоне (V77I) протеазы и в 62-м положении обратной транскриптазы (A62V). Эти замены были описаны в литературе как вторичные мутации устойчивости ВИЧ-1 к ингибиторам ферментов, применяющимся для высокоактивной антиретровирусной терапии [253, 149].

Существующие литературные данные демонстрируют распространение [26, 27, 11, 23, 54, 15, 55, 180] и генетическую изменчивость [5, 59, 22] подтипов ВИЧ-1 на территории России в целом или в отдельных субъектах Российской Федерации в определенные периоды времени. Детального же изучения' распространения вариантов ВИЧ-1 среди инфицированных лиц и изучения их динамической генетической изменчивости на различных этапах развития эпидемического процесса с момента регистрации первого случая заболевания в сопоставлении с характером проявлений эпидемического процесса не проводилось, хотя этот вопрос представляет несомненный научно-практический интерес.

Начиная с 1996 года в литературе стали появляться сообщения об устойчивости некоторых людей к заражению ВИЧ-1, обусловленной их генетическими особенностями. Приводились данные, что мутации в генах различных хемокиновых рецепторов, используемых вирусом в качестве корецепторов при проникновении в клетку, влияют на вероятность заражения. Первой обнаруженной мутацией была делеция в гене CCR5. Установлено, что люди, гомозиготные по этой делеции, обладают повышенной устойчивостью к заражению ВИЧ-1 [108, 175]. Позднее появились сообщения о других мутациях, потенциально способных влиять на вероятность заражения. Однако данные о возможной роли большинства мутаций в инфицировании ВИЧ-1 (за исключением мутации в гене СС115) носят противоречивый характер, а связь между сочетаниями мутаций в разных генах хемокиновых рецепторов и возможностью инфицирования ВИЧ-1 изучена недостаточно. Кроме того, как правило, все включенные в исследования пациенты были инфицированы ВИЧ-1 подтипа В либо в результате половых контактов, либо через контаминированную вирусом донорскую кровь или ее компоненты [277, 242]. В связи с этим представляло интерес выяснить возможное влияние мутаций в генах хемокиновой системы или их сочетаний на вероятность заражения лиц, практикующих внутривенное применение психоактивных веществ, наиболее распространенным в России ВИЧ-1 варианта ГО11-А подтипа А.

В качестве психотропных веществ, используемых потребителями инъекционных наркотиков, на территории России в основном используются героин и получаемый кустарным способом жидкий опийсодержащий экстракт маковой соломки (так называемая «ханка»). Вероятность заражения ВИЧ-1 наркопотребителей при использовании этих веществ существует при условии использования общих шприцев или игл, в которых остаются небольшие количества крови, а также при применении общей емкости для их промывания, что достаточно часто встречается в практике наркопотребления среди ПИН [43]. Кроме того, нередки ситуации, когда наркопотребители контролируют качество готового для инъекционного использования психотропного вещества по отсутствию гемолиза добавленной в него цельной крови. При условии попадания в кустарно изготовленный препарат крови инфицированного раствор наркотика становится кон-таминированным ВИЧ. Однако практически не изучено, как влияют готовые для инъекционного введения героин и «ханка» на инфекционность вируса, как долго они сохраняют ее и как в этих условиях реализуется механизм заражения.

В связи с вышеизложенным представляет несомненный интерес изучение проявлений эпидемического процесса ВИЧ-инфекции во взаимосвязи с его биологическим фактором с использованием молекулярно-генетических методов исследований.

Цель исследования

Обосновать механизм развития эпидемического процесса ВИЧ-инфекции на основе молекулярно-генетических данных по характеристике его паразитарной системы и дать рекомендации по оптимизации системы эпидемиологического надзора.

Задачи исследования:

1. Изучить проявления эпидемического процесса ВИЧ-инфекции на территории Пермского края за 1988 - 2008 гг.

2. Определить подтипы вариантов ВИЧ-1, выделенных на территории Пермского края в различные периоды развития эпидемического процесса и в разных группах риска инфицирования. Изучить их генетическую изменчивость в области C2-V3 gpl20 гена env.

3. Изучить риск инфицирования вариантом IDU-A подтипа А ВИЧ-1 лиц, практикующих внутривенное введение психоактивных веществ в зависимости от мутаций генов хемокиновых рецепторов CCR 5, CCR 2 и их сочетаний.

4. Выявить основные факторы риска, способствующие реализации механизма заражения при внутривенном употреблении психоактивных веществ. Изучить действие растворов героина и «ханки» на инфекционность ВИЧ-1, исследовать их влияние на размножение вируса в условиях in vitro.

5. Оценить возможность использования молекулярно-генетических исследований по определению подтипа вируса для слежения за развитием эпидемического процесса на территории и расшифровки отдельных эпидемических очагов ВИЧ-инфекции.

6. Обосновать механизм развития эпидемического процесса ВИЧ-инфекции и оценить значение молекулярно-генетических исследований в системе эпидемиологического надзора. Дать рекомендации по совершенствованию эпидемиологического надзора за ВИЧ-инфекцией.

Научная новизна работы Впервые проведен анализ проявлений эпидемического процесса ВИЧ-инфекции в многолетней динамике в сопоставлении с генетической характеристикой возбудителя инфекции. Получены приоритетные данные о распространении генетических вариантов ВИЧ-1 в отдельно взятом субъекте Российской Федерации на протяжении 20-летнего периода при различных типах эпидемического процесса.

Впервые изучена паразитарная система эпидемического процесса ВИЧ-инфекции, его биологический фактор: популяции микроорганизма и макроорганизма во взаимодействии друг с другом. На основании данных молекулярно-генетических исследований по выявлению мутаций или их сочетаний в генах хемокиновых рецепторов ССЫ5 и ССЫ2 установлен риск инфицирования вирусом иммунодефицита человека 1-го типа потребителей инъекционных наркотиков.

Впервые получены данные о влиянии вида наркотического средства, используемого внутривенно потребителями психоактивных веществ, на механизм заражения при ВИЧ-инфекции. Доказано сохранение инфекционности вируса в растворах героина и «ханки» в течение длительного времени.

Впервые показана возможность использования данных молекулярно-генетических исследований по определению вторичных мутаций устойчивости вируса в качестве дополнительного объективного инструмента в эпидемиологической диагностике при обследовании эпидемических очагов ВИЧ-инфекции.

Практическая значимость

Разработанные подходы и полученные данные позволят оптимизировать систему эпидемиологического надзора за ВИЧ-инфекцией.

Для оптимизации информационной подсистемы рекомендовано внедрить молекулярно-генетический мониторинг с целью слежения за циркулирующими вариантами ВИЧ-1 и изучения динамики их генетической изменчивости, для оценки устойчивости популяции к инфицированию.

Для повышения качества эпидемиологической диагностики в рамках диагностической подсистемы рекомендовано использовать результаты молеку-лярно-генетического мониторинга при работе в очагах ВИЧ-инфекции для установления источника возбудителя инфекции, путей и факторов передачи, а также временных и пространственных границ очагов.

Определение ро/-генотипа вируса по наличию/отсутствию мутаций У77—»1/А62—>У у лиц, инфицированных подтипом ГОИ-А ВИЧ-1, дает дополнительную объективную информацию, позволяющую осуществлять качественную эпидемиологическую диагностику в очагах инфекции.

Полученные результаты о длительном сохранении инфекционных свойств ВИЧ-1 в растворах героина и «ханки» могут быть использованы для информационно-просветительской работы среди населения, особенно среди потребителей инъекционных наркотиков.

Внедрение в практику

Результаты исследований внедрены в практику работы ГУЗ «Пермский краевой Центр по профилактике и борьбе со СПИДом и инфекционными заболеваниями».

Материалы исследований использовались при разработке методических рекомендаций «Новые технологии в организации эпидемиологического надзора за ВИЧ-инфекцией в условиях наркозависимого типа эпидемического процесса» (Ч. 2. — Пермь, 2002. — 38 е.), которые были внедрены в работу лечебно-профилактических учреждений Пермского края.

Материалы диссертационной работы используются в учебном процессе при чтении лекций и проведении практических занятий со студентами и интернами на кафедре эпидемиологии, а также включены в программы последипломного образования врачей-эпидемиологов на ФПК и ППС ГОУ ВПО ПГМА им. ак. Е.А. Вагнера Росздрава.

Основные положения, выносимые на защиту 1. Развитие эпидемического процесса ВИЧ-инфекции на территории Пермского края в 1988 - 2008 гг. было обусловлено преимущественной циркуляцией варианта ВИЧ-1 с генотипом gagA/envA (ГОЦ-А). Заражение этим вариантом происходило при реализации парентерального, гетеросексуального и вертикального путей передачи, за исключением полового в популяции мужчин, имеющих секс с мужчинами. Генетическая изменчивость области С2 — УЗ gpl20 гена епу вирусов этого варианта была различной в отдельные периоды развития эпидемического процесса, характеризующегося разной интенсивностью.

2. На риск инфицирования ВИЧ-1 варианта ГОЦ-А при парентеральном пути передачи среди потребителей инъекционных наркотиков оказывают влияние гомозиготное состояние аллеля ССГ15Л32 и сочетание мутантных аллелей ССЫ5Д32 и СС112-641 в гетерозиготном состоянии на фоне полиморфного варианта ССЯ5-59029А/ССК5-59029А.

3. Интенсивность эпидемического процесса ВИЧ-инфекции среди потребителей инъекционных наркотиков зависит от вида используемого ими психоактивного вещества и определяется различным влиянием кустарно приготовленных героина и "ханки" на инфекционность и репликацию ВИЧ-1.

4. Использование молекулярно-генетических методов исследования для изучения биологического фактора эпидемического процесса в системе эпидемиологического надзора за ВИЧ-инфекцией позволяет оптимизировать эпидемиологическую диагностику в части слежения за ходом развития эпидемического процесса на территории (дифференциация завозных случаев) и расшифровки эпидемических очагов с определением источника возбудителя инфекции, путей и факторов инфицирования и уровня восприимчивости контактных лиц.

Заключение диссертации по теме «Эпидемиология», Зверев, Сергей Яковлевич

ВЫВОДЫ.

1. В многолетней динамике развития эпидемического процесса ВИЧ-инфекции на территории Пермского края установлено 4 периода. В 1988 - 1996 гг. заболеваемость носила спорадический характер, а заражение происходило преимущественно половым, как гомо-, так и гетеросексуальным, путем. В 1997 - 2001 гг. произошло резкое увеличение интенсивности эпидемического процесса, обусловленное стремительным распространением вируса среди потребителей инъекционных наркотиков, что привело к формированию наркозависимого типа эпидемического процесса. Снижение заболеваемости в 2002 - 2004 гг. было обусловлено возрастанием роли гетеросексуального, менее активного, пути передачи среди женщин и снижением внутривенного потребления наркотиков среди мужчин, что привело к формированию смешанного типа эпидемического процесса. Последовавший рост заболеваемости (2005 - 2008 гг.) при сохранившемся смешанном типе эпидемического процесса обусловлен активизацией и парентерального, связанного с внутривенным введением наркотиков, и гетеросексуального путей передачи.

2. Основная роль в развитии эпидемического процесса ВИЧ-инфекции на территории Пермского края в 1988 - 2008 гг. принадлежала варианту вируса с генотипом gagA/envA (ГОи-А) ВИЧ-1, суммарная доля которого в этиологической структуре составила 98,7%. Заражение этим вариантом ВИЧ-1 происходило при реализации всех путей передачи, за исключением полового в популяции мужчин, имеющих секс с мужчинами, где циркулировал ВИЧ-1 подтипа В.

3. Генетическая изменчивость наиболее вариабельного участка генома ВИЧ-1 - области С2 - УЗ gpl20 гена епу вирусов варианта Юи~А, выделенных у пациентов в период низкой интенсивности и смешанном типе эпидемического процесса достоверно (р < 0,001) выше таковой у вирусов, выделенных у пациентов при высокой интенсивности и наркозависимом типе эпидемического процесса.

4. Популяция вирусов доминирующего в Пермском крае ВИЧ-1 варианта ТРЦ-А гетерогенна: происходит одновременная циркуляция четырех его ро1-генотипов, отличающихся по наличию/отсутствию вторичных мутаций устойчивости N11—в протеазе и А62—>У в обратной транскриптазе гена ро1 у никогда не леченых пациентов. Три из них имеют мутантные /?с>/-генотипы: Ми^л с мутацией в протеазе, Ми^зу, с мутацией в обратной транскриптазе, Ми^ттуАбгу с обеими мутациями и четвертый, не имеющим мутаций, дикого типа. Данные о /^/-генотипе ВИЧ-1 варианта ГОИ-А, которым инфицированы пациенты, могут быть использованы как дополнительный объективный инструмент при проведении эпидемиологических обследований очагов ВИЧ-инфекции.

5. Различная восприимчивость потребителей инъекционных наркотиков ю ВИЧ-1 варианта ГОЦ-А при парентеральном, связанном с инъекционным употреблением психотропных веществ, пути передачи генетически детерминирована и определяется гомозиготным состоянием аллеля ССК5Д32 и сочетанием мутантных аллелей ССЯ5Д32 и ССК2-641 в гетерозиготном состоянии на фоне полиморфного варианта ССК5-59029А/СС115-59029А.

6. В условиях эксперимента доказано, что лабораторный штамм ВИЧ-1/ III В в растворе героина с концентрацией 25 мкг/мл, обычно используемой потребителями инъекционных наркотиков внутривенно, сохраняет инфекцион-ность при комнатной температуре в течение 20 дней. При низких инфекционных дозах вируса и пониженной плотности клеток в присутствии героина происходит незначительное увеличение скорости размножения вируса.

7. Инфекционные свойства лабораторного штамма ВИЧ-1/ III В в растворе «ханки» сохраняются в течение 8 дней при комнатной температуре. В отличие от героина, «ханка» не оказывает какого-либо влияния на вирусную репликацию.

8. Более высокая интенсивность эпидемического процесса ВИЧ-инфекции среди ПИН на территориях, где наркопотребление связано с героином, по сравнению с территориями, где потребители инъекционных наркотиков используют «ханку», обусловлена различным влиянием героина и «ханки» на ин-фекционность ВИЧ-1.

9. Данные молекулярно-генетических исследований по определению генотипа ВИЧ-1 могут быть дополнительно использованы при обследовании эпидемических очагов ВИЧ-инфекции для уточнения источника возбудителя инфекции и путей передачи, а также для выявления завозных случаев ВИЧ-инфекции с других территорий.

10. Полученные результаты по возможностям использования молекулярно-генетических исследований для оценки биологического и социального факторов эпидемического процесса явились основанием для внедрения их в информационную и диагностическую подсистемы существующей системы эпидемиологического надзора за ВИЧ-инфекцией.

Список литературы диссертационного исследования доктор медицинских наук Зверев, Сергей Яковлевич, 2010 год

1. Апрятин С.А. Исследование мутаций del32 и шЗОЗ в гене, кодирующем корецептор ВИЧ-1 - CCR5, влияющих на устойчивость к заражению, и вариантов ВИЧ-1, циркулирующих в разных регионах России: автореф. дис. . канд. биол. наук. — Москва. — 2003. — 16С.

2. Асеев М.В., Шави А., Дин М., Баранов B.C. /Популяционные особенности частот мутации гена хемокинового рецептора CCR-5, определяющего чувствительность к вирусу СПИДа. //Генетика. 1997. - Т.ЗЗ. - С. 17241726. \

3. Беляков В.Д. /Проблема саморегуляции паразитарных систем и механизм развития эпидемического процесса. //Вестник АМН СССР. — 1983. №5. — С. 3-9.

4. Бобкова М.Р. Молекулярно-генетические методы в изучении эпидемиологии инфекций, возбудители которых передаются парентеральным путем: автореф. дис. . доктора биол. наук. Москва. -2002.-44 С.

5. Бобков А.Ф. Молекулярно-биологические подходы к изучению инфекции, вызываемой вирусом иммунодефицита человека: автореф. дис. . доктора биол. наук. Москва. 1994. - 48 С.

6. Галеева А.Р., Хуснутдинова Е.К., Сломинский П.А., Лимборская С.А. /Распространенность делеции 32 пн в гене рецептора хемокинов CCR5 в популяциях волго-уральского региона// Генетика. 1998. — Т.34. - С. 11601162.

7. ВИЧ-инфекция в наркологической практике. /Должанская H.A., Бузина Т.С., М.-2003, 213 С.

8. Зверев В.В., Саранков Ю.А. /ВИЧ-инфекция и наркомания. //Вопросы наркологии. 1999. - №1. - С. 17-22.

9. Змушко Е.И., Белозеров Е.С. ВИЧ-инфекция. СПБ.: 2000 г. 260 С.

10. Генетическая изменчивость наиболее вариабельного участка генома ВИЧ-1 области С2 - УЗ gp 120 гена ет вирусов варианта ГОЦ-А,, выделенных уинфицированных ВИЧ-1 лиц в России //Вопр. вирусол. 1998. - № 1. - С. 30-32.

11. Казеннова Е.В. Молекулярно-эпидемиологический анализ вариантов вируса иммунодефицита человека первого типа (ВИЧ-1), циркулирующих в России: автореф. дис. . доктора биол. наук, Москва, 2005. — 52 С.

12. Кошкина Е.А. /Эпидемиологические аспекты наркологии //Вопросы наркологии. 2004 - № 2. - С. 18-21.

13. Ладная H.H., Покровский В.В., Бобков А.Ф., Селимова Л.М., Савченко И.Г., Казеннова Е.В., Карасева Н.Г., Кравченко A.B., Бочкова М.С. /Распространение субтипов ВИЧ-1 в России. //Эпидемиология и инфекционные болезни. 1998, - №3. - С. 19-23.

14. Ладная H.H. Распространение различных субтипов ВИЧ на территории Российской Федерации: автореф. дис. . канд. биол. наук, Москва. 2000. -24 С.

15. Лобзин Ю.В., Жданов К.В., Пастушенков В.Л. ВИЧ-инфекция: клиника, диагностика, лечение. М.:2003. 144 С.

16. Казеннова Е.В. Молекулярно-эпидемиологический анализ вариантов вируса иммунодефицита человека первого типа (ВИЧ-1), циркулирующих в России: автореф. дис. . доктора биол. наук, Москва, 2005. — 52 С.

17. Кошкина Е.А. /Эпидемиологические аспекты наркологии //Вопросы наркологии. 2004 - № 2. - С. 18-21.

18. Ладная H.H., Покровский В.В., Бобков А.Ф., Селимова Л.М., Савченко И.Г., Казеннова Е.В., Карасева Н.Г., Кравченко A.B., Бочкова М.С. /Распространение субтипов ВИЧ-1 в России. //Эпидемиология и инфекционные болезни. 1998. - №3. - С. 19-23.

19. Ладная H.H. Распространение различных субтипов ВИЧ на территории Российской Федерации: автореф. дис. . канд. биол. наук, Москва. 2000. -24 С.

20. Лобзин Ю.В., Жданов К.В., Пастушенков В.Л. ВИЧ-инфекция: клиника, диагностика, лечение. М.:2003. 144 С.

21. Маниатис Т., Фрич Э., Сэмбрук Дж. Методы генетической инженерии. Молекулярное клонирование. Москва, «Мир», 1984. 477 С.

22. Марьяндышев А.О., Тунгусова О.С., Баранов A.A. /Молекулярная эпидемиология туберкулеза в Баренц-регионе Российской Федерации //Медицинский академический журнал. 2007. - №4. — С. 59-70.

23. Наумов О.Ю. Факторы риска распространения ВИЧ-инфекции в условиях наркозависимого типа эпидемического процесса: автореф. дис. .канд. мед. наук, Пермь. 2004. - 26 С.

24. Онищешсо Г.Г., Наркевич М.И. /Новые стратегии в предупреждении распространения ВИЧ-инфекции в России. //Журн. микробиол. 2000. - № 4.-С. 5-9.

25. Онищенко Г.Г. /Современные направления в профилактике инфекционных болезней. //Эпидемиология и инфекционные болезни. 2001. - № 1. - С. 4 -7.

26. Остапович A.B. Совершенствование эпидемиологического надзора и контроля за ВИЧ-инфекцией на муниципальном уровне: автореф. дис. . канд. мед. наук, Пермь. 2005. - 24 С.

27. Покровский В.В., Серветский K.JI. /Передача ВИЧ при грудном вскармливании и гетеросексуальных контактах. //Журн. микробиол. — 1988 №5. - С. 59-62.

28. Покровский В.В., Ерамова И.Ю., Кузнецова И.И. /Передача ВИЧ от ребенка матери во время кормления грудью. //Журн. микробиол. 1990 -№3. - С. 23-26.

29. Покровский В.В., Ерамова И.Ю., Деулина М.О., Липетиков В.В., Слюсарева Л.А., Чемизова Н.М., Савченко С.П. /Внутрибольничная вспышка ВИЧ-инфекции в Элисте. //Журн. микробиол. 1990. - №4. - С. 17-23.

30. Покровский В.В., Юрин О.Г., Кравченко A.B., Потекаев Н.С. /Первый случай ВИЧ-инфекции у гражданина СССР. //Журн. микробиол. 1992 -№11.-С. 19-22.

31. Покровский В.В. Эпидемиология и профилактика ВИЧ-инфекции и СПИД. Москва, «Медицина», 1996.-248 С.

32. Покровский В.В., Савченко И.Г., Ладная H.H., Буравцова У.В., Бочкова М.С. //ВИЧ-инфекция. Информационный бюллетень № 8. Российский научно-методический центр по профилактике и борьбе со СПИДом, Москва, 1997.

33. Покровский В.В., Савченко И.Г. /Пути передачи ВИЧ-инфекции и профилактика инфицирования. //Врач. 1998. - № 7. - С. 7-8.

34. Покровский В.В. ,Савченко И.Г., Ладная H.H., Буравцова Е.В., Бочкова М.С., Арзамасцев В.П., Корнеева М.И. //ВИЧ-инфекция. Информационный бюллетень №14. Российский научно-методический центр по профилактике и борьбе со СПИДом, Москва. 1998.

35. Покровский В.В., Ладная H.H., Соколова Е.В., Буравцова Е.В. //ВИЧ-инфекция. Информационный бюллетень №24. Российский научно-методический центр по профилактике и борьбе со СПИДом, Москва, -2002.

36. Покровский В.В., Ладная H.H., Соколова Е.В., Буравцова Е.В. //ВИЧ-инфекция. Информационный бюллетень №25. Российский научно-методический центр по профилактике и борьбе со СПИДом, Москва. -2002.

37. Покровский В.В. /Эпидемия ВИЧ-инфекции в России — куда идешь? //Эпидемиология и инфекционные болезни. 2004. № 4. - С. 4-6.

38. Покровский B.B. /ВИЧ-инфекция наступает. //Терапевтический архив. -2004. №4. -С. 9-14.

39. Покровский В.В., Ладная H.H., Соколова Е.В., Буравцова Е.В. //ВИЧ-инфекция. Информационный бюллетень №26. Российский научно-методический центр по профилактике и борьбе со СПИДом, Москва. -2004.

40. Покровский В.В., Ладная H.H., Соколова Е.В., Буравцова Е.В. //ВИЧ-инфекция. Информационный бюллетень №33. Российский научно-методический центр по профилактике и борьбе со СПИДом, Москва. -2009.

41. Ряпис Л.А., Филатов H.H., Салова- Н.Я. /Молекулярная эпидемиология инфекционных болезней. //Журнал микробиол. 2003. - № 5. - С. 49-54.

42. Суханова А.Л. Изменчивость гена POL вариантов вируса иммунодефицита человека первого типа (ВИЧ-1) подтипа* А, циркулирующих в России: автореф. . дис. канд. биол. наук, Москва. 2006. - 24 С.

43. Толстов Я.Л., Абдала Н., Диже Г.П, Козлов А.П., Хеймер Р. /Экспериментальное изучение' жизнеспособности ВИЧ-11 в шприцах, содержащих экстракт мака. //Рус. Журн. «ВИЧ/СПИД и родственные проблемы». 2004. - № 1. - С. 59-65.

44. Троценко O.E. ВИЧ-инфекция/СПИД в Дальневосточном федеральном округе Российской Федерации: автореф. . дис. доктора мед. наук, Москва. -2005.-47 С.

45. Турбина Г.И., Кириллова Л.Д., Гараев М.М. /Молекулярно-эпидемиологическая характеристика вариантов ВИЧ-1, изолированных на территории Липецкой области //Журн. микробиол. 2007. - № 3. - С. 7477.

46. Фельдблюм И.В., Коровка В.Г., Исаева Н.В., Девятков М.Ю., Наумов О.Ю. /Факторы риска распространения ВИЧ-инфекции в Пермской области //Материалы научной сессии ПГМА, Пермь. 2002. - С. 7-9.

47. Фельдблюм И.В., Подлужная М.Я., Остапович A.B. /Эпидемиология ВИЧ-инфекции и организационно-методические основы профилактики намуниципальном уровне. //Пермь, ГОУ ВПО ПГМА Росздрава, 2006. 143 С.

48. Фролов А.Ф. /Молекулярная эпидемиология — неотъемлемая часть эпидемиологии инфекционных болезней. //Журн. АМН Украины. — 2005. -№ 3. С. 555-569.

49. Яковлев А.А., Туркутюков В.Б., Колпаков С.Л. /Современные направления в эпидемиологии. //Тихоокеанский медицинский журнал. — 2003. № 4. С. 79-81.

50. Aarons Е., Fernandez М., Rees A., McClure М., Weber J. /СС-chemokine receptor 5 genotypes and in vitro susceptibility to HTV-1 of a cohort of British HIV-exposed uninfected homosexual men //AIDS. -1997. -V.ll. -P.688-689.

51. Aiken C, Konner J, Landau NR, Lenburg ME, Trono D. /Nef induces CD4 endocytosis: Requirement for a critical dileucine motif in the membrane-proximal CD4 cytoplasmic domain //Cell. 1994. - V.76. - P.853-864

52. Alkhatib G., Combadiere C., Broder CC., Feng Y., Kennedy PE., Murphy PM., Berger EA. /СС CKR5: A RANTES, MlP-la, MIP-ip receptor as a fusion cofactor for macrophage-tropic HIV-1// Science. -1996. -V.272. -P.1955-1958.

53. Band L, Pert A, Williams W. /Central {¿-opioid receptors mediate suppression of natural killer activity in vivo. //Prog Neuroendocrininnunol. 1992. - 5. - P. 95101.

54. Benkirane M., Jin DY., Chun RF., Koup RA, Jeang KT. /Mechanism of transdominant inhibition of CCR5-mediated HIV-1 infection by ccr5delta32 //J. Biol. Chem. 1997. - Y. 272. - P. 30603-30606.

55. Berger EA, Murphy PM, Farber JM. /A new classification for HIV-1. //Nature. -1998.-V. 391.-P. 240.

56. Berson J., Doms RW. /Structure-function of the HIV-1 coreceptors //Semin. Immunol. 1998. - V.10. - P. 237-248.

57. Berger EA., Murphy PM., Farber JM. /Chemokine receptors as HIV-1 coreceptors: role in viral entry, tropism and disease// Ann Rev Immunol. 1999. -V.17.-P. 657-700.

58. Blahoutova V, Zajicova A, Wilczek H, Holan V. /Opioids and their immunomodulatory properties. //Cas. Lek. Cesk. 2003. - V. 142. - P. 244-247.

59. Bleul CC., Wu L., Hoxie JA., Springer TA, Mackay CR. /The HIV coreceptors CXCR4 and CCR5 are differentially expressed and regulated on human T lymphocytes //Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1997. - V.94. - P. 1925-1930.

60. Bobkov AF, Kazennova EV, Sukhanova AL, Bobkova MR, Pokrovsky VV, Zeman W, Kovtunenko NG, Erasilova IB. /An HIV type 1 subtype A outbreak among injecting drug users in Kazakhstan. //AIDS Res. Hum. Retroviruses. -2004.-V. 20.-P. 1134-1136.

61. Bowman EP. /Developmental switches in chemokine response profiles during B cell differentiation and maturation //J. Exp. Med. 2000. - V. 191. - P. 13031318.

62. Brenner BG, Wainberg MA. /The role of antiretrovirals and drug resistance in vertical transmission of HIV-1 infection.//Ann. NY. Acad. Sci. 2000. - V. 918. -P. 9-15.

63. Brodine SK., Starkey MJ., Shaffer RA. /Diverse HIV-1 subtypes and clinical, laboratory and behavioral factors in a recently infected US military cohort //AIDS. -2003. -V. 17. P. 2521-2527.

64. Brown SM, Stimmel B, Taub RN. /Immunologic dysfunction in heroin addicts. //Arch. Intern. Med. 1974. - 134. - P. 1001-1006.

65. Caceres CF, van Griensven GJP. /Male homosexual transmission of HIV-1. //AIDS. 1994.-8.-P. 1051-1061.

66. Capon DJ, Ward RH. /The CD4-gpl20 interaction and AIDS pathogenesis. Annu. Rev. Immunol. 1991. - 9. - P. 649-678.

67. Carrington M., Kissner T., Gerard B., Ivanov S, O'Brien SJ, Dean M. /Novel alleles of chemokine receptor gene CCR5 //Am. J. Hum. Genet. 1997. - V.61. -P. 1261-1267.

68. Carr JK, Salminen MO, Koch C, Gotte D, Artenstein AW, Hegerich PA, Louis D, Burke D, McCutchan FE. /Full-length sequence and mosaic structure of a human immunodeficiency virus type 1 isolate from Thailand. //J. Virol. 1996. -V. 70.-P. 5935-5943.

69. Carr JK, Salminen MO, Albert J, Sanders-Buell E, Gotte D, Birx DL, McCutchan FE. /Full genome sequences of human immunodeficiency virus type 1 subtypes G and A/G intersubtype recombinants. //Virology. 1998. — V. 247. -P. 22-31.

70. Zarandia M, Tsertsvadze T, Carr JK, Nadai Y, Sanchez JL, Nelson AK. /HIV-1 genetic diversity and genotypic drug susceptibility in the Republic of Georgia. //AIDS Res. Hum. Retroviruses. 2006. - V. 22. - P. 470-476.

71. Carr JK, Torimiro JN, Wolfe ND, Eitel MN, Kim B, Sanders-Buell E, Jagodzinski LL, Gotte D, Burke DS, Birx DL, McCutchan FE. /The AG recombinant IbNG and novel strains of group M HIV-1 are common in Cameroon. //Virology. 2001. - V. 286. - P. 168-181.

72. Centers for Disease Control. Kaposi's sarcoma and Pneumocystis Pneumonia among homosexual men. Morbidity and Mortality Weekly Report. Los Angeles. 1981.-V.30.-P. 305-307.

73. Centers for Disease Control. Persistent, generalized lymphadenopathy among homosexual males. Morbidity and Mortality Weekly Report. Los Angeles. -1982.-V. 31. -P. 249-252.

74. Centers for Disease Control. Update: AIDS — Europe. Morbidity and Mortality Weekly Report. Los Angeles. 1984. - V. 33. - P. 607-609.

75. Centers for Disease Control. Update: AIDS Europe. Morbidity and Mortality Weekly Report. Los Angeles. - 1985. - V. 34. - P. 471-475.

76. Cheingsong-Popov R, Chappey C, Callow D, Lister S, Bobkov A, Weber J. /V3 serotypes: distribution and correlation with genotypes. International Conference on AIDS. Yokogama, Japan, August 7-12, 1994, Abstract PC0430.

77. Chelli M., Alizon M. /Determinants of the trans-dominant negative effect of truncated forms of the CCR5 chemokine receptor //J. Biol. Chem. 2001. — V. 276.-P. 46975-46982.

78. Chuang LF, Chuang TK, Killam KF Jr, Qiu Q, Wang XR, Lin JJ, Kung HF, Sheng W, Chao C, Yu L /Expression of kappa opioid receptors in human andmonkey lymphocytes //Biochem. Biophys. Res. Commun. 1995. - V. 209. - P. 1003-1010.

79. Cladera J, Martin I, O'Shea P. /The fusion domain of HIV gp41 interacts specifically with heparan sulfate on the T-lymphocyte surface. //EMBO J. — 2001.-20.-P. 19-26.

80. Clapham PR, McKnight A. /HIV-1 receptors and sell tropism. //British Medical Bulleten. -2001. — V. 58.-P. 43-59.

81. Clavel F., Guetard F., Brun-Vezinet S., Chamaret S, Laurent A, Rouzioux C, Rey M, Katlama C, Rey F, Champelinaud JL, Montagnier L. /Isolation of a new human retrovirus from West African patients with AIDS //Science. 1986. - V. 233.-P. 343-346.

82. Clavel F, Guyader D, Guetard M, Salle M, Montagnier L, Alizon M. /Molecular cloning and polymorphism of the human immunodeficiency virus type 2. //Nature. 1986. - V. 324. - P. 591-695.

83. Clumeck N, Sonnet J, Tadman H. /AIDS in African patients. //N Eng J Med. -1984.-V. 310. -P. 492-497.

84. Cocchi F, DeVico AL, Garzino-Demo A, Cara A, Gallo RC, Lusso P. /The V3 domain of HIV-1 gpl20 envelope glycoprotein is critical for chemokine-mediated blockade of infection. //Nat. Med. 1996. - № 2. - P. 1244-1247.

85. Delwart E, Shpaer EG, Louwagie J, McCutchan FE, Grez M, Rubsamen-Waigmann H, Mullins JI. /Genetic relationships determined by a DNA heteroduplex mobility assay analysis of HIV-1 env genes. //Science. 1993. - V. 262.-P. 1257-1261.

86. Dragic T., Litwin V., Allaway G.P., Martin SR, Huang Y, Nagashima KA, Cayanan C, Maddon PJ, Koup RA, Moore JP, Paxton WA. /HIV-1 entry into

87. CD4+cells is mediated by the chemokine receptor CC-CKR-5 //Nature. 1996. -V.381.-P. 667-673.

88. Essex M. /Human immunodeficiency viruses of the developing world. //Adv. Virus Res. 1999. - V. 53. - P. 71-88.

89. Bobkov AF, Kazennova EV, Sukhanova AL, Bobkova MR, Pokrovsky VV, Zeman VV, Kovtunenko NG, Erasilova IB. /An HIV type 1 subtype A outbreak among injecting drug users in Kazakhstan. //AIDS Res. Hum. Retroviruses. -2004.-V. 20.-P. 1134-1136.

90. Fauci A. /Host factors and the pathogenesis of HIV-induced disease //Nature. -1996. V. 384. - P. 529-534.'

91. Ferdats A, Konicheva V, Dievberna I, Lilja E, Albert J. /An HIV type 1 outbreak among injecting drug users in Latvia. //AIDS Res Hum Retroviruses. 1999. — V. 15.-P. 1487-1490.

92. Foda M, Harada S, Maeda Y. /Role of V3 independent domens on a dualtropic human immunodeficiency virus typel (HIV-1) envelope gpl20 in CCR5 coreceptor utilization and viral infectivity. //Microbiol Immunol. 2001. - V. 45.-P. 521-5301

93. Feng Y., Broder C., Kennedy P., Berger E. /HIV-1 entry cofactor: Functional cDNA cloning of a seven-transmembrane G protein-coupled receptor //Science. -1996.-V. 272.-P. 872-877.

94. Freed EO, Martin MA. /The role of human immunodeficiency virus type 1 envelope glycoproteins in virus infection. //J Biol Chem. 1995. - V. 270. — P. 23883-23886.

95. Fritz CC, Green MR. /HIV Rev uses a conserved cellular protein export for the nucleocytoplasmic transport of viral RNAs. //Curr. Biol. 1996. - № 6. - P. 848-854.

96. Fujikawa LS, Salahuddin SZ, Palestine AG, Masur H, Nussenblatt RB, Gallo RC. /Isolation of human T-lymphotropic virus type III from the tears of a patient with the acquired immunodeficiency syndrome. //Lancet. 1985. - Sep 7; 2(8454).-P. 529-530.

97. Goudsmit J, Kuiken CL, Nara PL. /Linear versus conformational variation of V3 neutralization domains of HIV-1 during experimental and natural infection.//AIDS. 1989. - № 3. - P. 119-123.

98. Gonzalez MA., Serrano F., Llorente M., Abad JL, Garcia-Ortiz MJ, Bernad A. /A hammerhead ribozyme targeted to the human chemokine receptor CCR5 //Biochem Biophys Res Commun. 1998. - V.251. - P. 592-596.

99. Gottlinger HG, Dorfman T, Sodroski JG, Haseltine WA. /Effect of mutations affecting the p6 gag protein on human immunodeficiency virus particle release. //ProcNatl Acad Sei USA. 1991.- V. 88.-P. 3195-3199.

100. Govitrapong P, Suttitum T, Kotchabhakdi N, Uneklabh T. /Alterations of immune functions in heroin addicts and heroin withdrawal subjects. //J Pharmacol Exp Ther. 1998. - № 2. - P. 883-889.

101. Guignard F, Combadiere C, Tiffany HL, Murphy PM. /Gene organization and promoter function for CC chemokine receptor 5 (CCR5) //J. Immunol. 1998. -V. 160. - P.985-992.

102. Gurtler LG, Hauser PH, Eberle J, von Brunn A, Knapp S, Zekeng L, Tsague JM, Kaptue L. /A new subtype of human immunodeficiency virus type 1 (MVP-5180) from Cameroon. //J. Virol. 1994.-V. 68.-P. 1581-1585.

103. Henin D, Smith TW, De Girolami U, Sughayer M, Hauw J J. /Neuropathology of the spinal cord in the acquired immunodeficiency syndrome. //Hum. Pathol. — 1992.-V. 10.-P. 1106-1114.

104. Ho DD, Byington RE, Schooley RT, Flynn T, Rota TR, Hirsch MS. /Infrequency of isolation of HTLV-III virus from saliva in AIDS. //N. Engl. J. Med. 1985. - V. 313. - P. 1606.

105. Ho DD, Rota TR, Hirsch MS. /Infection of human endothelial cells by human T-lymphotropic virus type I. // Proc Natl Acad Sei USA. 1984. - V. 23. - P. 7588-7590.

106. Ho DD, Schooley RT, Rota TR, Kaplan JC, Flynn T, Salahuddin SZ, Gonda MA, Hirsch MS. /HTLV-III in the semen and blood of a healthy homosexual man. //Science. 1984. - V. 226. - P. 451-453.

107. Hoffman NG, Seillier-Moiseiwitsch F, Ahn J, Walker JM, Swanstrom R. /Variability in the human immunodeficiency virus type 1 gp 120 Env protein linked to phenotype-associated changes in the V3 loop. //J. Virol. 2002. - V. 76.-P. 3852-3864.

108. Hu Q, Trent JO, Tomaras GD, Wang Z, Murray JL, Conolly SM, Navenot JM, Barry AP, Greenberg ML, Peiper SC. /Identification of ENV determinants in V3that influence the molecular anatomy of CCR5 utilization. //J Mol Biol. 2000. -V. 302.-P. 359-375.

109. Ioannidis JP.5 Rosenberg PS., Goedert JJ., O'Brien TR. /Effects of CCR5A32, CCR2-64I, and SDF1-3'A alleles on HIV-1 disease progression: an international meta-analysis of individual-patient data //Ann. Intern. Med. 2001. - V.136. — P.782-795.

110. Jacks T, Power MD, Masiarz FR, Luciw PA, Barr PJ, Varmus HE. /Characterization of ribosomal frame-shifting in HIV-1 gag-pol expression. //Nature. 1988. - V. 231. - P. 280-283.

111. Janssens W., Buve A., Nkengasong JN. /The puzzle of HIV-1 subtypes in Africa //AIDS.- 1997.-V. 11.-P. 705-711.

112. Iversen A.K., Shafer R.W., Wehrly K., Winters M.A., Mullins J.I., Chesebro B., Merigan T.C. /Multidrug-resistant human immunodeficiency virus type 1 strains resulting from combination antiretroviral therapy. //J. Virol. 1996. - V. 70. - P 1086-1090.

113. Karn J. /Tat, a novel regulator of HIV-1 transcription and latency. //HIV Sequence Compendium 2000, Los Alamos National Laboratory. 2000. - P. 218.

114. Kiessling AA, Fitzgarald LM, Zhang D, Chhay H, Brettler D, Eyre RC, Steinberg J, McGowan K, Byrn RA. /Human immunodeficiency virus in semen arises from a genetically distinct virus reservoir. //AIDS Res. Hum. Retroviruses. 1998. -V. 14. - P. 33-41.

115. Kikukawa R, Koyanagi Y, Harada S, Kobayashi N, Hatanaka M, Yamamoto N. /Differential susceptibility to the acquired immunodeficiency syndrome retrovirus in cloned cells of human leukemic T-cell line Molt-4. //J. Virol. -1986.-V. 57.-P. 1159-62.

116. Kimura M. /A simple method for estimating evolutionary rates of base substitutions through comparative studies of nucleoyide sequence. //J. Mol. Evol. 1980. - V. 16.-P. 111-120.

117. Kirchhoff F, Greenoigh NC, Brettler DB, Sullivan JL, Desrosiers RC. /Absence of intact nef sequences in a long-term survivor with nonprogressive HIV-1 infection. //N. Engl. J. Med. 1995. - V. 332. - P. 228-232.

118. Kiss A, Li L, Gettemeier T, Venkatesh LK. /Functional analysis of the interaction of the human immunodeficiency virus type 1 Rev nuclear export signal with its cofactors. //Virology. 2003. - V. 314. - P. 591-600.

119. Kitayama J., Mackay CR., Ponath PD., Springer TA. /The C-C chemokine receptor CCR3 participates in stimulation of eosinophil arrest on inflammatory endothelium in shear flow //J. Clin. Invest. 1998. - V. 101. - P. 2017-2024.

120. Klatzmann D, Champagne E, Chamaret S, Gruest J, Gruetard D, Hercend T, Gluckman JC, Montagnier L. /T-lymphocyte T4 molecule behaves as the receptor for human retrovirus LAV. Nature, 1984, 312: 767-768.

121. Kobyshcha Y, Sherbinskaya A, Khodakevich L /HIV infection among drug users in Ukraine beginning of the epidemic. //International Conference on AIDS, 11th, Vancouver, 1996. - Abstract 204.

122. Kuiken C., Leitner T., Foley B., Hahn B.5 Marx P., McCutchan F., Wolinsky S., Korber B. //HIV Sequence Compendium 2009. Los Alamos National Laboratory, Los Alamos, New Mexico 87545 U.S.A.

123. Kwong PD, Wyatt R, Robinson J, Sweet RW, Sodroski J, Hendickaon WA. /Sructure of an HIV gpl20 envelope glycoprotein in complex with the CD4. receptor and neutralizing human antibody. //Nature. 1998. - V. 393. - P. 649654.

124. Leitner T, Korovina G, Marquina S, Smolskaya T, Albert J. /Molecular epidemiology and MT-4 cell tropism of Russian HIV type 1 variant. //AIDS Res. Hum. Retrovirus. 1996. -№. 12. - P. 1595-1603.

125. Levy JA. /Features of human immunodeficiency virus infection and disease. //Pediatr. Res. 1993. - V. 33. - P. 63-69.

126. Levy JA, Greenspan D. /HIV in saliva. //Lancet. 1988. - Nov 26;2(8622). - P. 1248.

127. Littman D. /Chemokine receptors: keys to AIDS pathogenesis. //Cell. 1998. -V. 93.-P. 677-680.

128. Liuzzi G, Chirianni A, Clemenyti M, Bagnarelli P, Valenza A, Cataldo PT, Piazza M. /Analysis of HIV-1 load in blood, semen and saliva: evidence for different viral compartments in a cross sectial and longitudinal study. //AIDS. -1996.-№ 10.-P. 51-56.

129. Los Alamos National Laboratory. HIV sequence Database http://hiv-web.lanl.gov. Los Alamos, NM: Los Alamos National Laboratory.

130. Lukashov VV, Karamov EV, Eremin VF, Titov LP, Goudsmit J. /Extreme founder effect in an HIV type 1 subtype A epidemic among drug users in Svetlogorsk, Belarus. //AIDS Res. Hum. Retroviruses. 1998. - V. 14. - P. 1299-1303.

131. Luria S, Chambers I, Berg P. /Expression of the type 1 human immunodeficiency virus Nef protein in T cells prevents antigen receptor-mediated induction of interleukin 2 mRNA //Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1991. -V. 88. — P.5326-5330.

132. Magierowska M, Theodorou I, Debre P, Sanson F, Autran B, Rivière Y, Charron D, Costagliola D. /Combined genotypes of CCR5, CCR2, SDF1, and HLA genesthat influence the molecular anatomy of CCR5 utilization. //J Mol Biol. 2000. -V. 302.-P. 359-375.

133. Ioannidis JP., Rosenberg PS., Goedert JJ., O'Brien TR. /Effects of CCR5A32, CCR2-64I, and SDF1-3'A alleles on HIV-1 disease progression: an international meta-analysis of individual-patient data //Ann. Intern. Med. 2001. — V.136. -P.7B2-795.

134. Jacks T, Power MD, Masiarz FR, Luciw PA, Barr PJ, Varmus HE. /Characterization of ribosomal frame-shifting in HIV-1 gag-pol expression. //Nature. 1988. -V. 231. - P. 280-283.

135. Malim MH, Hanber J, Le SY, Maizel JV, Cullen BR. /The HIV-l rev trans-activator acts through a structured target sequence to activate nuclear export of unspliced viral mPNA. //Nature. 1989. - V. 338. - P. 254-257.

136. Mangano А., Корка J., Batalla M., Bologna R, Sen L. /Protective effect of CCR2-64I and not of CCR5-delta32 and SDFl-3'A in pediatric HIV-l infection //J. Acquir. Immune Defic. Syndr. 2000. - V.23. - P.52-57.

137. Milich L, Margolin B, Swanstrm R. /Patterns of amino acid variability in NSI-like and Si-like V3 sequences and a linked change in the CD4-binding domain of the HIV-l Env protein. //Virology. 1997. - V. 239. - P. 108-118.

138. Mas A., Espanol Т., Heredia A. Pedraza MA, Hernandez M, Caragol I, Fernando M, Bertran JM, Alcami J, Soriano V. /CCR5 genotype and HIV-l infection in perinatally-exposed infants. //J. Infect. 1999. - V.38. - P.9-11.

139. Mastro T.D., Kitayaporn D. /HIV type 1 transmission probabilities: estimates from epidemiological studies //AIDS Res. Hum. Retroviruses. 1998. — V. 14. -P. 223-227.

140. McDermott D.H., Zimmerman P.A., Guignard F., Kleeberger CA, Leitman SF, Murphy PM. /CCR5 promoter polymorphism and HIV-l disease progression.

141. Multicenter AIDS Cohort Study (MACS). //Lancet. 1998. - V. 352. - P. 866870.

142. Mellado M., Rodriguez-Frade J.M., Vila-Coro A.J., de Ana AM, Martínez-A C. /Chemokine control of HIV-1 infection //Nature. 1999. - V.400. - P.723-724."

143. Miller MD, Warmerdam MT, Gaston I, Greene WC, Feinberg MB. /The human immunodeficiency virus-1 nef gene product: A positive factor for viral infection and replication in primary lymphocytes and macrophages //J. Exp. Med. 1994. -V. 179.-P. 101-113.

144. Miller RH, Sarver N. /HIV accessory proteins as therapeutic targets. //Nat. Med. 1997. -№3.- P. 389-394.

145. Morikawa Y. /HIV capsid assembly. //Current HIV Research. 2003. - № 1. -P. 1-14.

146. Muesing MA, Smith DH, Cabradilla CD., Benton CV, Lasky LA, Capon DJ. /Nucleic acid structure and expression of the human AIDS/lymphadenopathy retrovirus //Nature. 1985. - V. 313. - P.450-458.

147. Naganawa S, Sato S, Nossik D, Takanashi K, Hara T, Tochicubo O, Kitamura K, Honda M, Nakasone T. /First report of CRF03AB recombinant HIV typel in injecting drug users in Ukraine. //AIDS Res. Hum. Retroviruses. 2002. - V. 18.-P. 1145-1149.

148. Näjera R, Delgado E, Perez-Alvarez L, Thompson MM. /Genetic recombination and its role in the development of the HIV-1 pandemic. //AIDS. 2002. - V. 16. -P 1-14.

149. Nath A, Conant K, Chen P, Scott C, Major EO. /Transient exposure to HIV-1 Tat protein results in cytokine production in macrophages and astrocytes. //J. Biol. Chem. 1999. -V. 274. - P. 17098-17102.

150. Nicolosi A, Autelitano M, Correa Leite ML, Osella AR, Lazzarin A. /The sexual transmission of the acquired immunodeficiency virus: the reasons for greater male-to-female than female-to-male transmission efficiency //Ann. Ig. 1994. -V. 6.-P. 641-648.

151. Novitsky VA, Montano MA, Essex M. /Molecular epidemiologyof an HIV-1 subtype A subcluster among injecting drug users in the southerv Ukraine. //AIDS Res. Hum. Retroviruses. 1998. - V. 14. - P. 1079-1085.

152. Nunez G, Urzua J. /Opioids and the immune system. //Rev. Med. Chil. 1999. -V. 127.-P. 341-348.

153. O'Brien TR., Winkler C., Dean M., Nelson JA, Carrington M, Michael NL, White GC. /HIV-1 infection in a man homozygous for CCR5 delta 32. //Lancet.-1997.-V. 349.-P. 1219-1224.

154. Ou C-Y, Takebe Y, Weniger BG, Luo CC, Kalish ML, Auwanit W, Yamazaki S, Gayle HD, Young NL, Schochotman G. /Independent introduction of two major HIV-1 genotypes into distinct high-risk populations in Thailand. //Lancet. 1993. - V. 341.-P. 1171-1174.

155. Pan LZ, Werner A, Levy JA. /Detection of plasma viremia in human immunodeficiency virus-infected individuals at all clinical stages. //J. Clin. Microbiol. 1993. - № 2. - P. 283-288.

156. Pang S, Shlesinger Y, Daar ES, Moudgil T, Ho DD, Chen ISY. /Rapid generation of sequence variation during primary HIV-1 infection. //AIDS. -1992.-V. 6.-P. 453-460.

157. Papa A., Papadimitriou E., Adwan G., Clewley JP, Malissiovas N, Ntoutsos I, Alexiou S, Antoniadis A. /HIV-1 co-receptor CCR5 and CCR2 mutations among Greeks //FEMS Microbiol. Lett. 2000. - V.28. - P.87-89.

158. Parada CA, Roeder RG. /Enhanced processivity of RNA polymerase II triggered by Tat-induced phosphorylation of its carboxy-terminal domain. //Nature. -1996.-V. 384. -P. 375-378.

159. Parkin NT, Chamorro M, Varmus HE. /Human immunodeficiency virus type 1 gag-pol frameshifting independent on mRNA secondary structure: demonstration by expression in vivo. //J. Virol. 1992. -V. 62. - P. 5147- 5151.

160. Parren RW, Moore JP, Burton DR, Sattentau QJ. /The neutralizing antibody response to HIV-1: viral evasion and escape from humoral immunity. //AIDS. —1999.-V. 13.-P. 137-162.

161. Peeters M, Sharp PM. /Genetic diversity of HIV-1: the moving target. //AIDS.2000.-V. 14.-P. 129-140.

162. Peeters M. /Recombinant HIV sequences: their role in global epidemic. //HIV Sequence Compendium 2000, Los Alamos National Laboratory, Los Alamos, NM.-2000.-P. 35-43.

163. Perelson AS, Essunger P, Cao Y Vesanen M, Hurley A, Saksela K, Markowitz M, Ho DD. /Decay characteristics of HIV-1 infected compartments during combination therapy. //Nature. 1997. - V. 387. - P. 188-191.

164. Plummer FA, Nagelkerke NJ, Moses S, Ndinya-Achola JO, Bwayo J, Ngugi E. /The importance of core groups in the epidemiology and control of HIV-1 infection//AIDS. 1991.-5.-P. 169-176.

165. Pollard VW, Malim MH. /The HIV-1 Rev protein. //Annu. Rev. Microbiol. -1998.-V. 52.-P. 491-532.

166. Polzer S, Dittmar MT, Schmitz H, Schreiber M. /The N-linked glycan gl5 within the V3 loop of the HIV-1 external glycoprotein gpl20 affects coreceptor usage, cell tropism, and neutralization. //Virology. 2002. - V. 304. - P. 70-80.

167. Poulin L., Evans L., Tang S., Barboza A, Legg H, Littman DR, Levy JA. /Several CD4 domains can play a role in human immunodeficiency virus infection of cells //J.Virol. 1991. - V.65. - P. 4893-4901.

168. Rasola A., Gramaglia D., Baccaccio C., Comoglio PM. /Apoptosis enhancement by the HIV-1 Nef protein//J. Immunol. 2001. - V.166. - P. 81-88.

169. Robertson DL, Sharp PM, McCutchan FE, Hahn BH. /Recombination in HIV-1. //Nature. 1995. -V. 374. - P. 124-126.

170. Robertson DI, Anderson JP, Bradac JA, Carr JK, Foley B, Funkhouser RK, Gao F, Hahn BH, Kalish ML, Kuiken C, Learn GH, Leitner T, McCutchan F,

171. Osmanov S, Peeters M, Pieniazek D, Salminen M, Sharp PM, Wolinsky S, Korber B. /A reference guide to HIV-1 classification. //HIV Sequence Database, Los Alamos National Laboratory, Los Alamos, NM. 2000.

172. Romano-Spica V., Ianni A., Arzani D., Cattarini L, Majore S, Dean M. /Allelic distribution of CCR5 and CCR2 genes in an Italian population sample //AIDS Res. Hum. Retroviruses. 2000. - V.16. - P. 99-101.

173. Rosen CA, Pavlakis GN. /Tat and rev: Positive regulators of HIV gene expression. //AIDS. 1990. - № 4. - P. 499-509.

174. Rou S, Delling V, Chen CH, Rosen CA, Sonenberg N. /A bulge structure in HIV-1 TAR RNA is required for Tat binding and Tat mediated trans-activation. //Genes Dev. 1990. - № 4. - P. 1365-1371.

175. Ruben S, Perkin SA, Purseil R, Joung K, Sia R, Burghoff R, Haseltine WA, Rosen CA. /Structural and functional characterization of human immunodeficiency virus tat protein. //J. Virol. 1989. - V. 63. - P. 1-8.

176. Sallusto F., Schaerli P, Loetscher P, Schaniel C, Lenig D, Mackay CR, Qin S, Lanzavecchia A. /Rapid and coordinated switch in chemokine receptor expressing during dendritic cell maturation //Eur. J. Immunol. 1998. - V.28. -P. 2760-2769.

177. Sallusto F., Mackay CR., Lanzavecchia A. /The role of chemokine receptors in primary, effector, and memory immune response //Annu. Rev. Immunol. 2000. - V.18.-P. 593-620.

178. Shafer DA, Xie Y, Falek A. /Detection of opiate-enhanced increases in DNA damage, HPRT mutants, and the mutation frequency in human HUT-78 cells. //Environ. Mol. Mutagen. 1994. - № 1 - p. 37-44

179. Shao JM, Wang B, Zeng Y, Hell W, Wolf H. /Variation and shift of HIV-1 env found in IDUs of Dehong epidemic area in China. //Tenth International Conference on AIDS. Yokohama, Japan. August 7-12, 1994. Abstract 380A.

180. Schwartz O., Marechal O., Danos O., Heard JM. /Human immunodeficiency virus type 1 Nef increases the efficiency of reverse transcriptation in the infected cell //J.Virol. 1995. - V.69. - P. 4053-4059.

181. Singhai PC, Kapasi AA, Reddy K, Franki N, Gibbons N, Ding G. /Morphine promotes apoptosis in Jurkat cells. //J. Leukoc. Biol. 1999. - №4. - P. 650658.

182. Skowronski J, Parks D, Mariani R. /Altered T cell activation and development in transgenic mice expressing the HIV-1 nef gene //EMBO J. 1993. - V.12. - P. 703-713.

183. Struyf F., Thoelen I., Charlier N., Keyaerts E, Van der Donck I, Wuu J, Van Ranst M. /Prevalence of CCR5 and CCR2 HIV-coreceptor gene polymorphisms in Belgium. //Hum. Hered. 2000. - V.50. - P. 304-307.

184. Subbravanian RA, Cohen EA. /Molecular biology of the human immunodeficiency virus accessory proteins. //J. Virol. — 1994. V. 68. — P. 6831-6835.

185. Thomson MM, Najera R. Travel and the introduction of human immunodeficiency virus type 1 non-B subtype genetic forms into Western Countries. //Clin Infect Dis, 2001, 12: 1732-1737.

186. Trono D. /HIV accessory proteins: leading roles for the supporting cast. //Cell. — 1995.-V. 82.-P. 189-192.

187. Tschening C, Alaeus A, Fredriksson R, Bjorndal A, Deng H, Littman DR, Fenyo EM, Albert J. /Differences in chemokine coreceptor usage between genetic subtypes of HIV-1.//Virology. 1998.-V. 241.-P. 181-188.

188. Ulich C, Dunne А, Рапу E, Hooker CW, Gaynor RB, Harrich D. /Fanctional domens of tat required for efficient human immunodeficiency virus type 1 reverse transcription. //J. Virol. 1999. - V. 73. - P. 2499-2508.

189. Ustina V, Zilmer K, Tammao L, Raucas M, Andersson A, Lilja E, Albert J. /Epidemiology of HIV in Estonia. //AIDS Res. Hum. Retroviruses. 2001. - V. 17.-P. 81-85.

190. Venkatesan S., Petrovic A., Locati M., Kim YO, Weissman D, Murphy PM. /А membrane proximal basic domain and cysteine cluster in the C-terminal tail of

191. CCR5 constitute a bi-partite motif critical for cell surface expression //J. Biol. Chem. 2001. - V.276. - P. 40133-40145.

192. Willey RL., Rutledge RA., Dias S., et al. Identification of conserved and divergent domains within the envelope gene of the acquired immunodeficiency syndrome retrovirus// Proc Natl Acad Sei USA. -1986. -V.83. -P.5038-5042.

193. Webster NR. /Opioids and the immune system. //Br. J. Anaesth. 1998. - V. 81. -P. 835-836.

194. Wei X, Ghosh SK, Taylor ME, Johnson VA, Emini EA, Deutsch P, Lifson JD, Bonhoeffer S, Nowak MA, Hahn BH. /Viral dynamics in human immunodeficiency virus type 1 infection. //Nature. 1995. - V. 373. - P: 117122.

195. Wei BL, Arora VK, Foster JL, Sodora DL, Garcia JV. /In vivo-analysis of Nef function. //Current HIV Research. 2003. - V. 1. - P. 41-50.

196. Wofsy CB, Cohen JB, Hauer LB, Padian NS, Michaelis BA, Evans LA, Levy JA. /Isolation of AIDS-associated retrovirus from genital secretions of women with antibodies to the virus. //Lancet. 1986. - Mar 8; 1(8480). - P. 527-529.

197. Wolinsky SM, Wike CM, Korber B, Hutto C, Parks WP, Rosenblum LL, Kunstman KJ, Furtado MR, Munoz JL. /Selective transmission of humanimmunodeficiency virus type 1 variants from mother to infants. //Science. — 1992.-V. 255.-P. 1134-1137.

198. Wyatt R, Kwong PD, Desjardings E, Sweet RT, Pobinson J, Hendrickson WA, Sodroski JG. /The antigenic structure of the HIV gpl20 envelope glycoprotein. //Nature. 1998. - V. 393. - P. 705-711.

199. Yang R, Xia X, Kusagawa S, Zhang C, Ben K, Takebe Y. /On-going generation of multiple forms of HIV-1 intersubtype recombinants in the Yunnan Province of China. //AIDS. -2002. -V. 16. P. 1401-1407.

200. Yudin NS., Vinogradov SV., Potapova TA. /Distribution of CCR5-delta 32 gene deletion across the Russian part of Eurasia //Hum. Genet. 1998. - V.102. — P. 695-698.

201. Zapp ML, Green MR. /Sequence-specific RNA binding by the HIV-1 Rev protein. //Nature. 1989. - V. 342. - P. 714-716.

202. Zhang S, Feng Y, Narayan O, Zhao LJ. /Cytoplasmic retention of HIV-1 regulatory protein Vpr by protein-protein interaction with a novel cytoplasmic protein VprBP. //Gene. 2001. -V. 263. -P. 131-140.

203. Zhou YR, Rana TM. /A bimolecular mechanism of HIV-1 Tat protein interactin with RNA polymerase II transcription elongation complexes. //J. Mol. Biol. -2002. V. 320. - P. 925-942.

204. Zhu T, Mo H, Wang N, Nam DS, Gao Y, Koup RA, Ho DD. /Genotipic and phenotypic characterization of HIV-1 patients with primary infection. //Science. 1993.-V. 261. - P. 1179-1181.

205. Zou YR., Kottmann AH., Kuroda M., Taniuchi I, Littman DR. /Function of the chemokine receptor CXCR4 in hematopoesis and in cerebellar development //Nature. 1998. - V. 393. - P. 595-599.