Молекулярные и клеточные механизмы регенерации эластического хряща мышей рода Acomys тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 00.00.00, кандидат наук Билялов Айрат Ильдарович

• Билялов Айрат Ильдарович
• кандидат наук
• 2024

Оглавление диссертации кандидат наук Билялов Айрат Ильдарович

ВВЕДЕНИЕ

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1 Современное представление о регенерации тканей животных

1.2 Мыши рода Лсвту8

1.2.1 Общая информация о мышах рода Лсвту8

1.2.2 Регенераторные способности мышей рода Лсвту8

1.2.2.1 Травматизация кожи

1.2.2.2 Травматизация скелетной мышечной ткани

1.2.2.3 Повреждение почки и мочевыводящих путей

1.2.2.4 Повреждение спинного мозга

1.2.3 Причины повышенной способности к регенерации

1.3 Ушная раковина как модель изучения процессов регенерации

1.3.1 Структура и регенерация хряща

ГЛАВА 2 МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

2.1 Объект исследования

2.2 Дизайн эксперимента

2.2.1 Травматизация ушной раковины

2.2.2 Полное удаление ушной раковины

2.3 Методы исследования

2.3.1 Макроскопический анализ

2.3.2 Приготовление гистологических образцов

2.3.3 Окрашивание гематоксилином и эозином

2.3.4 Окрашивание по методу Маллори

2.3.5 Окрашивание орсеином

2.3.6 Иммуногистохимические методы

2.3.7 Транскриптомный анализ

2.3.7.1 Пробоподготовка тканей

2.3.7.2 Подготовка библиотек и секвенирование

2.3.7.3 Биоинформатическая обработка полученных данных

2.3.8 Статистическая обработка данных

ГЛАВА 3 РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЯ

3.1 Восстановление целостности ушной раковины

3.1.1 Регенерация округлого дефекта ушной раковины

3.1.1.2 Макроскопическая характеристика регенерации

3.1.1.3 Микроскопическая характеристика регенерации

3.1.2 Полное удаление ушной раковины

3.1.2.1 Макроскопическая характеристика регенерации

3.1.2.1 Микроскопическая оценка регенерации

3.1.2 Заключение к разделу

3.2 Секвенирование одиночных клеток

3.2.1 Круглый дефект ушной раковины

3.2.2. Ампутация ушной раковины

3.2.2 Заключение к разделу

3.3 Репаративный хондрогенез мышей Лсвту8 саЫгипш

3.3.1 Гистологический анализ

3.3.2 Транскриптомный анализ хрящевой ткани

3.3.3 Заключение к разделу

3.4 Транскриптомный анализ иммунных клеток

3.4.1 Заключение к разделу

3.5 Металлотионеины - универсальный клеточный ответ

3.5.1 Заключение к разделу

ВЫВОДЫ

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

ПРИЛОЖЕНИЯ

ВВЕДЕНИЕ

Актуальность проблемы

Регенерация - это основа жизни и существования всех живых организмов. Тысячи клеток нашего тела отмирают, и на смену им за счет физиологической регенерации появляются новые клетки. Выделяют физиологическую и репаративную регенерацию, первая характеризуется постоянным восстановлением тканей, клеток и внутриклеточных структур в процессе нормальной жизнедеятельности организма, вторая в результате патологических изменений [Das, 2020]. Следует признать, что многие процессы восстановления клеток и тканей млекопитающих являются ограниченными и неполноценными, в отличие от других классов, например, представителей класса земноводных (саламандры), способных полностью восстанавливать утерянные конечности [Joven, 2019; Arenas Gómez, 2021].

В случае, когда репаративная регенерация у млекопитающих заканчивается формированием части идентичной погибшей ткани, говорят о полной регенерации или реституции. В другом - возникает неполная регенерация (субституция) [Саркисов, 1999]. В зоне повреждения образуется неспецифическая для данного органа ткань, которая в дальнейшем подвергается рубцеванию. При этом оставшиеся структуры компенсаторно увеличиваются в своей массе, т.е. гипертрофируются [Непомнящих, 1998]. Возникает регенерационная гипертрофия, которая и является выражением сущности неполной регенерации с потерей биологических функций данного участка [Marongiu, 2017].

Наибольшим потенциалом к регенерации обладает эпителиальная ткань, далее мышечная, причем скелетные мышцы восстанавливаются лучше, чем гладкие, а сердечная имеет ограниченный потенциал к регенерации [Исламов, 1994; Киясов, 2022]. Способности восстановления нервной ткани активно изучается [Gerber, 2018; Huang, 2023; Mahdian, 2023]. Среди разновидностей соединительных тканей наблюдаются отличия в способностях регенерации, так костная ткань и кровь способны к самообновлению и восстановлению своих

структур, а хрящевая ткань обладает низким потенциалом к регенерации [Саркисов, 1999; Пресняков, 2021].

Хрящ лишен обширной сосудистой сети и состоит из уникального типа клеток, называемых хондроцитами, которые проявляют ограниченные способности к пролиферации и миграции [Shiromoto, 2022]. Отсутствие адекватного кровоснабжения ограничивает доставку питательных веществ, факторов роста, кислорода и клеток к поврежденному участку, препятствуя началу процесса восстановления. В результате хондроциты сталкиваются с микросредой, характеризующейся отсутствием факторов, необходимых для клеточной пролиферации и восстановления объема и структуры ткани [Newton, 2010; Слесаренко, 2012; Зар, 2019; Liu, 2021]. К тому же хондроциты имеют ограниченную способностью к пролиферации и миграции. Эти покоящиеся клетки находятся в лакунах хряща и обладают низким митотическим потенциалом, что приводит к замедлению скорости их обновления и снижению способности восстанавливать поврежденные участки [Космачева, 2008; Akkiraju, 2015]. Более того, присущая зрелым хондроцитам фенотипическая стабильность препятствует их способности трансформироваться в репаративные клетки-предшественники, которые могли бы участвовать в процессах репаративного хондрогенеза [Liu, 2021].

По этой причине гистотипическое восстановление целостности суставного хряща, хряща перегородки носа, трахеи, а также эластической хрящевой ткани ушной раковины в большинстве случаев не происходит: дефекты этих структур заполняются плотной волокнистой соединительной тканью, которая не обладают необходимыми биомеханическими свойствами [Mobasheri, 2009; Nims, 2016; Пресняков, 2022].

Патологией суставного хряща в современном мире страдают миллионы людей, особенно в странах с высокой продолжительностью жизни. Риск возникновения повреждения хряща увеличивается при малоподвижном образе жизни и травмах, а также у пожилых людей. Развивающееся при этом воспаление проявляется болью; нарушается нормальное функционирование хрящевой ткани, а

высвобождение интерлейкина-^ и фактора некроза опухоли еще больше ускоряет данный процесс, приводит к апоптозу хондроцитов. В течение многих десятилетий прошлого века велись разработки основополагающих аспектов влияния на регенерацию хрящевой и костной тканей с целью максимально полного восстановления их структуры и функции. Однако до сих пор эта проблема не нашла окончательного решения. Многочисленные публикации порой носят противоречивый характер. В настоящее время не существует эффективных фармакологических средств, способствующих заживлению дефектов хряща.

Изучение механизмов репаративной регенерации у животных (млекопитающих), обладающих способностями к восстановлению тканей без развития рубца, поможет раскрыть закономерности репаративного гистогенеза, что может подтолкнуть к улучшению уже имеющихся или созданию новых генно-клеточных препаратов и лекарственных изделий, направленных на индукцию хондрогенеза в поврежденных тканях [Grol, 2018; Wasyleczko, 2020; Пресняков, 2021]. Одним из таких животных является мышь рода Acomys. Это представитель класса млекопитающих, который обладает повышенной способностью к регенерации и восстановлению функциональности тканей без развития фиброза [Nguyen, 2023]. В частности, в случае полнослойного удаления кожного лоскута, этапы свертывания крови и образования струпа (корочка, покрывающая поверхность раны) проходят быстрее в сравнении с обычными лабораторными мышами, и более 50% площади раны может быть закрыто струпом в течение 24 часов после нанесения травмы [Gaire, 2021]. Клетки эпидермиса активно пролиферируют сразу после повреждения, эпидермальные слои утолщаются в краях дефекта, при этом скорость миграции клеток заметно выше, чем в коже мышей линии Balb/c и крыс линии Wistar [Yoon, 2020; Gaire, 2021].

Одной из моделей повреждения тканей для комплексной оценки регенеративных способностей является травматизация ушной раковины [Rai, 2014; Hassan, 2022]. В этой модели, помимо восстановления кожного лоскута, окружающего раковину, оценивается и восстановление целостности эластической хрящевой ткани [Oh, 2018; Li, 2019].

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Молекулярные и клеточные механизмы регенерации эластического хряща мышей рода Acomys»

Цель работы

На модели повреждения ушной раковины охарактеризовать этапы репаративного хондрогенеза у мышей Лcomys cahirinus и выявить молекулярно-генетические маркеры, характерные для данного процесса.

Задачи исследования

1. Провести сравнительный морфологический анализ репаративного хондрогенеза эластического хряща у мышей Лсоту8 cahirinus и мышей линии Ва1Ь/с после повреждения ушной раковины.

2. С помощью иммуногистохимического анализа охарактеризовать особенности репаративного хондрогенеза эластического хряща мышей рода Лсоту8 cahirinus.

3. С помощью транскриптомного анализа выявить молекулярно-генетические маркеры хрящевой ткани у мышей Лттуз cahirinus в ходе репаративного хондрогенеза.

4. Выявить особенности и отличия иммунного ответа на повреждение ушной раковины у мышей Лттуз cahirinus и мышей линии Ба1Ь/е.

Положения, выносимые на защиту:

1. Эластический хрящ мышей Лттуз cahirinus способен к полной регенерации, как после частичной травматизации, так и после полной ампутации ушной раковины, путем накопления и пролиферации мелких упорядоченных хондроцитов с проксимального конца дефекта, с активной экспрессией белка SOX10, который является маркером клеток нейроэктодермального происхождения.

2. В клетках хрящевой ткани в группе Лттуз cahirinus наблюдается многократное повышение уровней экспрессии уникальных маркеров (МтрЗ, Мтр10, М11 и Mt2), участвующих в репаративном хондрогенезе.

3. Воспалительный ответ на повреждение у мышей Лттуз cahirinus характеризуется дифференциальной экспрессией 5 генов (М2 Яр128, Кр$23, Rabep1, Slc9a9) и отсутствием активации провоспалительных метаболических

путей в иммунном кластере на 6 час, повышением количества иммунных клеток на 2 сутки и разрешением процесса на 5 сутки после травматизации ушной раковины.

Научная новизна исследования

В работе впервые продемонстрированы возможности восстановления части ушной раковины мышей Acomys cahirinus после ее полной ампутации.

Впервые был проведен транскриптомный анализ на уровне единичных клеток ушной раковины мышей рода Acomys cahirinus и мышей линии Balb/c.

Принципиально новыми данными являются демонстрация экспрессии клетками хрящевой ткани уникальных маркеров и белков: Sox10 (SRY-related HMG-box) - маркер нейроэктодермальных клеток; Mmp3 (matrix metalloproteinase-3) и Mmp10 (matrix metalloproteinase-10) - белки семейства матриксных металлопротеиназ, которые участвуют в ремоделирование межклеточного матрикса в ходе репаративного хондрогенеза.

Выраженной новизной является открытие уникального клеточного ответа на повреждение тканей мышей рода Acomys cahirinus в виде гиперэкспрессии генов, кодирующих семейство белков металлотионеинов 1 и 2 типа, которые обладают высокой антиоксидантной активностью.

Теоретическая и практическая значимость работы

В ходе работы были продемонстрированы уникальные способности Acomys cahirinus к регенерации тканей после повреждения. Данных животных можно использовать, как новый модельный объект, для изучения процессов репаративного хондрогенеза.

Раскрываются уникальные молекулярные механизмы, способствующие ускоренной и качественной регенерации тканей ушной раковины, в том числе и эластического хряща.

Понимание молекулярных механизмов, определяющих полное восстановление эластического хряща, является фундаментальной основой для создания генно-клеточных лекарственных препаратов или медицинских изделий

для стимуляции процессов репаративного гистогенеза у других видов млекопитающих, в том числе и человека.

Достоверность и апробация работы

В работе были использованы современные общепризнанные гистологические, иммуногистохимические, морфометрические методы исследования, обладающие высокой степенью воспроизводимости, а также технологии РНК секвенирования одиночных клеток. Для теоретического обоснования и сравнительного анализа привлечено большое количество отечественных и зарубежных источников литературы. Результаты исследования представлены и обсуждены на Международной научно-практической конференции «Современная морфология и ее интеграция с клиническими дисциплинами», Бухара (2022); Ежегодной конференции Московского общества медицинских генетиков с международным участием, Москва (2022); XIII Международной конференции «Биоинформатика регуляции и структуры генома / Системная биология», Новосибирск (2022); «Инновационные технологии в исследованиях, диагностике и преподавании», Санкт-Петербург (2022); V Национальном конгрессе по регенеративной медицине, Москва (2022); III Всероссийской конференции "Высокопроизводительное секвенирование в геномике", Новосибирск (2022); IV Конгрессе Ортобиология «Patient cases — от теории к практике», Москва (2023); XI Московской конференции по вычислительной молекулярной биологии, Москва (2023); II OIC Youth Scientific Congress Казань, (2023); Всероссийской с международным участием школы-конференции студентов, аспирантов и молодых ученых «материалы и технологии XXI века», Казань (2023).

Личный вклад автора.

По теме диссертации автором проанализированы данные отечественной и зарубежной литературы. Автор принимал непосредственное участие в

планировании, проведении экспериментальной и аналитической части работы. Представленные результаты получены лично автором на всех этапах работы. Автором проведен анализ полученных результатов эксперимента, обобщение и формулирование выводов. На основании полученных результатов автором опубликован ряд статей, а материалы диссертации были доложены на научных конференциях.

Связь работы с научными программами

Диссертационная работа выполнена в рамках программы грантовой поддержки проектов и исследовательских программ по отдельным направлениям Федеральной научно-технической программы развития генетических технологий (№ 075-15-2021-1344) «Регуляторная транскриптомика для оценки потенциала модификации генома и изучения регенерации в животноводстве» и программы стратегического академического лидерства ПРИОРИТЕТ-2030 Казанского (Приволжского) федерального университета.

Публикации

Материалы диссертации нашли отражение в 11 научных публикациях: из них 4 статьи в рецензируемых журналах, рекомендованных Высшей аттестационной комиссией, а также индексируемых в базе данных Scopus и Web of Science, и 7 тезисов научных докладов на международных и всероссийских конференциях.

Объем и структура диссертации.

Материал диссертационной работы изложен на 136 страницах машинописного текста. Диссертация состоит из введения, обзора литературы, описания материалов и методов исследования, результатов и их обсуждения, выводов, списка цитированной литературы, списка сокращений и приложений. Работа содержит 44 рисунка и 4 таблицы в основном тексте и 2 таблицы в приложениях. Список литературы включает 34 отечественных и 204 зарубежных источников.

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1 Современное представление о регенерации тканей животных

Регенерация - это способность живых организмов восстанавливать повреждённые ткани и клетки. Регенерация может быть физиологической, характеризующейся заменой клеток и тканей в процессе жизнедеятельности организма, и репаративной, которая осуществляется в ответ на повреждение [Литвицкий, 2010; Струков, 2021].

Клетка является основной единицей регенерации тканей. Соответственно, регенерация может происходить на нескольких уровнях биологической организации. В одном случае небольшая травма требует восстановления одной клетки, либо части клетки (например, разорванного аксона) [Huebner, 2009]. В другом случае тяжелая травма требует замены всего органа de novo через скоординированный морфогенез миллионов клеток в различные типы тканей (например, конечность после ампутации) [McCusker, 2015; Arenas Gómez, 2017]. Где-то посередине находится регенерация изменчиво сложных структур с многоклеточной архитектурой и множеством функциональных единиц (например, травма ушной раковины и спинного мозга) [Almazan, 2021; Costachescu, 2022]. Регенерация во всех этих примерах тесно связана с регулируемой активацией, скоординированным ростом и дифференцировкой клеток, будь то стволовые или дифференцированные клетки, которые подвергаются дедифференцировке или перепрограммированию [Парамонова, 2022].

Практически все млекопитающие обладают свойствами полной физиологической и частично репаративной регенерации. Так, представители грызунов способны к восстановлению кончиков пальцев [Yu, 2019; Dolan, 2022], олени-самцы могут ежегодно восстанавливать свои рога [Yates, 2012; Li, 2014], сердце новорожденных мышей может восстанавливаться после повреждения до седьмого постнатального дня [Porrello, 2011].

Эпителиальные ткани млекопитающих, такие как эпидермис и слизистые оболочки, демонстрируют непрерывное замещение и обновление, хотя это

свойство присуще всем животным, поэтому не считается необычным регенераторным процессом [Maurizi, 2021].

Но следует признать, что многие восстановительные процессы млекопитающих являются ограниченными и неполноценными в отличие от представителей других классов животных [Исламов,1994; Галченко, 2022].

Многие механизмы и процессы регенерации уже изучены на модельных животных разных классов, таких как Данио-рерио, Аксолотль, представителях грызунов (мыши и крысы) [McCuske, 2011; Kaplan, 2015; Lebedeva, 2020].

Рыбы вида Данио-рерио, могут восстанавливать утраченные плавники, а также структуру тканей сердца [Gemberling, 2013]. Процесс регенерации травмированного плавника происходит за счет образования бластемы [Murciano, 2002]. Бластема - это гетерогенная недифференцированная клеточная масса, которая путем миграции и пролиферации временно образуется в месте повреждения и в дальнейшем подвергается морфогенезу с образованием поврежденного или недостающего органа [Dawson, 2018]. Бластема образуется в месте повреждения путем дедиференцировки клеток мезенхимальнго происхождения [Tamura, 2010]. Одним из главных условий формирования бластемы является ее иннервация и покрытие эпидермисом зоны повреждения. Во время формирования выростов проксимальные бластемные клетки постепенно покидают зону и подвергаются дифференцировке, что приводит к замещению поврежденных структур тканей [Тирас, 2015; Seifert, 2018].

В ответ на повреждение повышается экспрессия ключевых компонентов сигнального пути Wnt/ß-катенина и активин-ßA путей, которые детектируются через 3 часа после ампутации, с последующим усилением активности ретиноевой кислоты, инсулиноподобного фактора роста и фактора роста фибробластов [Jazwinska, 2007; Stoick-Cooper, 2007; Blum, 2012]. Активин представляет собой секретируемый лиганд, который сигнализирует через серин-треонинкиназный комплекс, состоящий из рецептора типа I ActBIB (Alk4) и рецептора типа II ActRIIa или ActRIIB [Jazwinska, 2007]. Передача сигналов ActßA необходима для последующего роста и поддержания массы клеток бластемы. Блокирование

данного сигнала с помощью двух специфических химических ингибиторов SB431542 и SB505124, приводит к раннему и полному блоку регенерации [Jazwinska, 2007].

Ретиноевая кислота (РК) - это органическое вещество, метаболит витамина A1 [Blum, 2012]. Экспрессия РК повышается в течение первых нескольких часов после ампутации плавника в мезенхиме культи, где она контролирует передачу сигналов факторов роста фибробластов (FGF), Wnt/ß-катенина и инсулиноподобных фактор роста (IGF) [Zhao, 2009].

Во время формирования бластемы клетки мезенхимы на расстоянии одного-двух сегментов проксимальнее плоскости ампутации начинают пролиферировать и мигрировать в дистальном направлении, образуя бластему [Hou, 2020]. Экспрессия семейств ферментов ацетальдегиддегидрогеназы-2 (aldh1a2) в этой области позволяет предположить, что образование бластемы требует высоких уровней РК при локальном расположении клеток [Mathew, 2009]. Таким образом, РК играет активную роль в индукции дифференцировки клеток мезенхимы в бластеме.

Исследователи сообщили о фундаментальной роли передачи сигналов IGF в формировании базального слоя посредством паракринной активации рецепторов IGF в раневом эпидермисе [Chablais, 2010]. Igf2b вырабатывается и секретируется мезенхимными клетками культи, демонстрируя важность взаимодействий между мезенхимой и формирующимся раневым эпидермисом. К тому же передача сигналов от РК необходима для активации индукции IGF2b экспрессии в мезенхимальных клетках [Chablais, 2010].

Результаты исследований показывают, что передача сигналов РК, FGF и Wnt/ß-катенина посредством взаимного стимулирования регулирует пролиферацию бластемы [Daponte, 2021].

В совокупности экспрессия данных факторов стимулирует образование бластемы. Блокада этих сигнальных путей приводит к неправильному заживлению ран [Gemberling, 2013].

Образование бластемы - это только первый шаг в регенерации плавников Данио-рерио, далее они должны вырасти до соответствующего размера. Рост

тканей происходит в результате двух процессов: поддержания пролиферативного компартмента на дистальном конце регенерата и дифференцировки более проксимальных клеток. Пролиферативный компартмент поддерживается за счет сигнальных взаимодействий между мезенхимой и базальным эпидермисом [Lee, 2009].

Пролиферация кардиомиоцитов происходит с низкой скоростью в физиологическом состоянии Danio rerio, но резко увеличивается в ответ на повреждение тканей [Poss, 2002]. Имеются доказательства того, что немышечные клетки создают среду, которая обеспечивает эту реакцию. Повреждение части сердечной мышцы инициирует реакцию в масштабах всего органа, определяемую как индуцированная экспрессия фермента, синтезирующего ретиноевою кислоту (raldh2) уже через один час после травмы в эндокарде [Kikuchi, 2011]. В течение одного или двух дней после травмы эпикард, внешняя оболочка сердца, демонстрирует аналогичную реакцию на индукцию raldh2 [Lepilina, 2006]. Затем эпикардиальные клетки делятся и окружают регенерирующую мышцу, где они высвобождают сигналы, способствующие пролиферации кардиомиоцитов [Lien, 2006; Kim, 2010]. Одним из них является фактор роста фибробластов, который важен для васкуляризации регенерата, что в итоге способствует восстановлению мышц [Kikuchi, 2011].

У земноводных, которые, как и рыбы, являются анамниями, развитие происходит без образования амниотической оболочки, также наблюдаются процессы повышенной полной регенерации утраченных тканей [Нечаев, 2014]. Причем процессы, лежащие в основе способности к восстановлению, различны у некоторых таксономических групп, например, саламандры могут восстанавливать утраченные части тела на всех этапах жизненного цикла, а регенерация у лягушек ограничивается только ранними этапами развития [Ли, 2012; Lee-Liu, 2017]. Судя по всему, такие различия связаны со строением иммунной системы и организации иммунологического ответа этих животных, который и способен инициировать процессы регенерации и не препятствовать им [Kumar, 2014].

Скорость регенерации конечностей саламандры варьируется в зависимости от вида и стадии развития. Основной регенераторной массой клеток в данном случае также является бластема. Во время процесса восстановления утраченной конечности наблюдается втяжение периферических нервных волокон после ампутации, а затем они вновь врастают в бластему, выделяя факторы, необходимые для индукции регенерации [Tassava, 1993]. Ключевым этапом, который следует за ампутацией, является формирование раневого эпидермиса, покрывающего поврежденное место [Gerber, 2018]. Под раневым эпидермисом клетки культи, как и в случае с Данио-рерио, начинают мигрировать, пролиферировать и образовывать бластему. Ко второй неделе после ампутации бластема заметно увеличивается в размерах, а к третьей неделе можно различить начальные стадии сгиба локтя и форму кисти. Таким образом, через один месяц после ампутации конечность саламандры может восстановить свою морфологическую форму и сложные функции [Gerber, 2018].

Недавние результаты исследования секвенирования одиночных клеток (scRNA-seq) позволили получить представление о роли иммунных клеток, эпидермальных клеток и других структур, участвующих в процессах регенерации раны [Leigh, 2018]. Исследователи описали разнообразие иммунных клеток, локализующихся в месте травмы и проникающих в развивающуюся бластему. Их данные демонстрируют различные классы клеток врожденного и адаптивного иммунитета, включая CD4+ регуляторные Т-клетки (T-регуляторы), которые участвуют в регенерации мышц [Burzyn, 2013], а также в регенерации спинного мозга, сердца и сетчатки у рыб вида Данио-рерио [Hui, 2017].

Т-регуляторы выступают в роли контрольных клеток регенерации, подавляя индукцию и пролиферацию эффекторных Т-клеток, а также стимулируя выработку факторов роста (нейротрофина-3) [Hui, 2017; Guo, 2020]. Таким образом, прослеживается корреляция между уровнем иммунного ответа, типом преобладающих иммунокомпетентных клеток, качеством и скоростью восстановления тканей после повреждения.

Клетки соединительной ткани были описаны как клетки, сохраняющие позиционную память, что подтверждает теорию, согласно которой они являются основной движущей силой регенерации конечностей [Muneoka, 1986; Bryant, 2018]. Механизмы, с помощью которых клетки сохраняют память о своей клеточной идентичности и своем расположении вдоль осей развития в ходе дифференцировки, до сих пор неизвестны.

Интересной гипотезой является представление о том, что у низших позвоночных (рыбы и земноводные) способность к регенерации развита лучше, чем у высших (рептилии, птицы и млекопитающие), так как водная, а позднее и сухопутная (у рептилий) жизнь накладывали особенный «отпечаток» на генотип этих животных [Arellano, 2019]. У низших позвоночных существует необходимость в сложных процессах дифференцировки после эмбрионального развития -метаморфозы [Brown, 2007]. Вероятно, те гены, которые отвечают за этапы «взросления», могут «включаться» при необходимости, например, при утрате части тела, запуская тем самым процессы регенерации: пролиферацию, дифференцировку стволовых клеток или клеток предшественников. Так как у высших позвоночных отсутствуют дополнительные этапы постэмбриональной дифференцировки и развития, то у них нет необходимости хранить и активировать отвечающие за этот процесс гены [Hassnain, 2017].

Недавние исследования подтверждают, что у амниотов утеряны некоторые гены, имеющиеся у анамниотов и участвующие в процессах регенерации. К ним относятся, например, ген кодирующий белок аргиназу (Argl) у Xenopus sp. (лягушка из семейства Пиповые), который экспрессируется на стадиях эмбриона и личинки, но отсутствует при метаморфозе и постметаморфозных процессах [Hassnain, 2017]. Ген Argl, необходимый для регенерации у анамниотов, отсутствует у высших позвоночных и людей [Diez-Fernandez, 2018].

Аргиназа, как и противовоспалительные цитокины (IL-4, IL-13 и IL-10), участвует в поляризации макрофагов до альтернативного противовоспалительного фенотипа М2 [Homa, 2021]. М2а макрофаги подавляют воспалительную реакцию, блокируя формирование М1 популяции либо через цитокины рекрутированных

ими Тх2-лимфоцитов, либо за счет вырабатываемого хемокина CCL17, который совместно с интерлекином-10 ингибирует дифференцировку макрофагов в направлении семейства М1 [Goetz, 2023]. Клетки М2а фенотипа считают типичными репаративными макрофагами, которые участвуют в процессах восстановления целостности тканей [Mantovani, 2004].

Многие ткани млекопитающих также обладают высокой способностью к восстановлению. К ним относят кости, скелетные мышцы, периферические нервы. Одним из ярких примеров регенерации у млекопитающих является восстановление целостности рогов оленей и лосей, которые на пике роста могут иметь скорость более 2.5 см в сутки [Price, 2004]. Кровеносные сосуды также обладают высокой способностью к росту и восстановлению целостности [Бокерия, 2018].

Степень регенерации тканей млекопитающих напрямую зависит от многих факторов, в частности васкуляризации, наличия новых сосудов в области повреждения [Деев, 2011]. В дополнении к обеспечению оксигенации и питательных веществ, ангиогенез способствует миграции макрофагов и других фагоцитарных клеток, которые не только удаляют клеточный и тканевый «дебрис», но также стимулируют деление клеток-предшественников посредством секреции различных цитокинов и факторов роста [Деев, 2012].

Однако скорость и качество регенерации тканей млекопитающих отличается от низших представителей позвоночных. В одних случаях репаративная регенерация заканчивается формированием части идентичной погибшей ткани, что говорит о полной регенерации или реституции. В других случаях возникает неполная регенерация (субституция). В зоне повреждения образуется неспецифическая для данного органа ткань, которая в дальнейшем подвергается рубцеванию. При этом оставшиеся структуры компенсаторно увеличиваются в своей массе (гипертрофируются). Возникает регенерационная гипертрофия, которая и является выражением сущности неполной регенерации [Саркисов, 1999].

В связи с эти возникает вопрос, почему одни организмы способны быстро и качественно восстанавливать клетки и ткани, а другие нет? Одна точка зрения состоит в том, что регенерация является фундаментальным свойством всех

организмов, однако она была частично утрачена в ходе эволюции у многих видов в результате естественного отбора, поскольку могла либо вредить, либо могла быть просто нейтральной к процессам выживания и размножения.

Если это действительно так, то все примеры регенерации должны быть похожи друг на друга, по крайней мере у позвоночных. Восстановление сложных тканей, таких как конечностей и хвоста, происходит за счет быстрого заживления кожных ран, дедифференцировки мезодермальных клеток и высвобождения стволовых клеток для образования бластемы, пролиферации бластемы, индукции сигнальных путей и перераспределения тканей в проксимальной и дистальной последовательности [^ееёе11, 2010].

Бластема является центральным звеном в процессах регенерации. Однако и здесь есть ряд нерешенных вопросов. Являются ли клетки бластемы однородной популяцией плюрипотентных предшественников или сложной смесью клеток, каждой из которых уже определена своя роль для формирования определенной ткани? Как поддерживается высокопролиферативная популяция данных клеток во взрослой ткани? И как в итоге бластема дифференцируется и преобразуется в идеальную копию недостающей части ткани? Существуют ли подобный клеточный пул у взрослых млекопитающих? Это центральные вопросы регенерации. С этой точки зрения ясно, что любая попытка стимулировать регенерацию млекопитающих должна быть сосредоточена на точном определении того, что такое бластема, образуется ли бластема у млекопитающих и как можно способствовать ее образованию в месте повреждения?

Среди млекопитающих наблюдаются единичные и уникальные примеры, обладающие ускоренной регенерацией. Колючие мыши или мыши рода Лсвту8 являются одними из немногих представителей класса млекопитающих с повышенной способностью к регенерации, к восстановлению функциональности тканей без развития фиброза.

Сравнение и изучение способностей к восстановлению тканей Лсвту8 с другими млекопитающими даст возможность определить клеточные и молекулярные сигналы, управляющие процессами регенерации тканей.

1.2 Мыши рода Acomys

1.2.1 Общая информация о мышах рода Acomys

Африканские колючие мыши (Acomys) - это уникальные «предсоциальные» грызуны, обитающие в Африке, на Ближнем Востоке и в Южной Азии [Haughton, 2016].

Всех грызунов рода Acomys в совокупности называют «колючими мышами» из-за наличия выступающих шиповатых волосков в области спины [Asher, 2010]. Acomys получил свое название от греческого «aсme», что означает «острие», и «mus» что означает «мышь». Международный союз охраны природы в настоящее время выделяет 18 видов мышей рода Acomys, которые широко распространены в засушливых районах мира, включая Африку, Ближний Восток и Южную Азию [Haughton, 2016]. Исторически так сложилось, что колючие мыши служили моделью для изучения физиологической адаптации организма к образу жизни в пустыни [Shkolnik, 1969; Orci, 1970,].

Также Acomys оказались одной из лабораторных моделей изучения сахарного диабета 2 типа, вызванного диетой, в результате развития гипергликемии при беременности (гестационный диабет) [Султанова, 2022]. Для проведения данных исследований использовались несколько видов колючих мышей (например, Acomys cahirinus, Acomys russatus, Acomys dimidiatus, Acomys subspinosus).

Acomys являются членами семейства Muroidea, чья таксономическая группа составляет почти треть всего разнообразия млекопитающих, и члены которой образуют самое специфичное семейство млекопитающих на земле [Steppan, 2004]. Мышей рода Acomys традиционно относили к подсемейству Murinae, но результаты молекулярной филогенетики говорят о другом: последние данные объединяют грызунов рода Acomys, а также Deomis, Uranomis, Phohuronomis в их собственное отдельное подсемейство - Deomyinae [Steppan, 2005].

Колючие мыши широко распространены на территории полусухих и засушливых регионов Африки, Ближнего Востока и Азии. Acomys cahirinus встречается по всему Ближнему Востоку, а также имеются данные, что некоторые популяции были замечены на окраинах пустынь Израиля. Acomys kempi и Acomys

percivali встречаются в полупустынях Кении, и оба вида предпочитают горные местности с множеством щелей для укрытия [Лавренченко, 2010]. Учитывая их пристрастие к скалистым выступам, необходимо воссоздать похожие условия в помещениях вивария лабораторий.

Продолжительность жизни мышей рода Acomys составляет от 2 до 4 лет, в неволе они могут прожить и до 7 лет. Колючие мыши проявляют половой диморфизм, причем самцы немного крупнее самок [Young, 2007]. На 14%-ной белковой диете, дополненной семенами подсолнечника, 6-месячный взрослый Acomys cahirinus обычно весит от 30 до 50 грамм. На модифицированных диетах они способны набирать вес и до 100 грамм [Young, 2007]. Длина тела взрослого представителя Acomys (от носа до крестца) варьируется от 9 до 13 см, при этом хвост, чешуйчатый с мелкими волосками, немного меньше или равен 100% длины тела. Взрослый Acomys cahirinus имеет светло-коричневую шерсть, игольчатые волоски располагаются в нижней трети спины до хвоста. Acomys kempi напоминает Acomys cahirinus, но имеет немного более темную шерсть с красноватым оттенком и с такими же игольчатыми волосками. Acomys percivali, напротив, сохраняет серую шерсть даже после наступления половой зрелости, однако иголки покрывают практически всю заднюю поверхность от хвоста и до шеи [Билялов, 2022].

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Билялов Айрат Ильдарович, 2024 год

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

1. Архипов С.А. и др. Разнонаправленные эффекты Н2О2 на макрофаги и фибробласты в условиях моделирования окислительного стресса in vitro // Современные наукоемкие технологии. 2010. №8. С. 76-77.

2. Бекетов Е.Е. и др. Современное состояние тканевой инженерии для восстановления хрящевой ткани // Гены и Клетки. 2019. Т. 14, №2. - С. 12-20.

3. Билялов А.И. У мышей рода Acomys после травмы восстанавливается эластический хрящ ушной раковины // Гены и Клетки. 2022. Т. 17, №1. С. 42-47.

4. Бокерия Л.А. и др. Генная терапия препаратом "Неоваскулген" в лечении пациентов с хронической ишемией нижних конечностей // Ангиология и сосудистая хирургия. 2018. Т. 24, №S3. С. 63-64.

5. Брехов В.Л. Новый биологически безопасный стимулятор остео- и хондрогенеза // Нанотехнологии и охрана здоровья. 2010. №1. С. 36-40.

6. Галченко Л.И., Калягин А.Н., Павлюк И.А. Регенерация печени при травмах, резекциях и некоторых очаговых поражениях // Современные проблемы науки и образования. 2022. №1. С. 76-82.

7. Деев Р.В. и др. Современные представления о клеточной гибели // Гены и клетки. 2018. Т.13, №1. С.6-19.

8. Деев Р.В. Патогистологическая характеристика мышц у пациентов с хронической артериальной недостаточностью нижних конечностей // Архив патологии. 2022. Т. 84, №1. С. 5-13.

9. Деев Р.В. и др. Первый в Европе геннотерапевтический препарат Неоваскулген: от фундаментальных исследований к рутинной клинической практике // Клеточная трансплантология и тканевая инженерия. 2012. Т. 7, №2. С. 14-15.

10. Деев Р.В. и др. Теоретические и практические аспекты применения препарата на основе нуклеиновой кислоты, кодирующей эндотелиальный сосудистый фактор роста ("Неоваскулген") // ANGIOLOGIA.ru. 2011. №1. С. 43-50.

11. Зар В.В. и др. Регенерация суставного хряща при экспериментальном остеоартрозе после инъекции комплексного полиакриламидно-гиалуронового геля // Opinion Leader. 2019. Т. 8, №26. С. 68-73.

12. Исламов Р.Р., Киясов А.П. Необратимые ишемические повреждения в скелетной мышце отсеченной конечности, зависящие от продолжительности ишемии и температуры // Морфология. 1994. Т. 106. С. 145-150.

13. Киясов А.П. Homo sapiens под микроскопом // Издательство Казанского университета. 2022. 428 с.

14. Космачева С.М., Волк М.В., Евстратенко Т.А. Рост мезенхимальных стволовых клеток пуповинной крови человека in vitro и их дифференцировка в хондроциты и остеобласты // Клеточные технологии в биологии и медицине. 2008. №1. С. 34-38.

15. Лавренченко Л.А. Млекопитающие слоновьего заказника Бабилле (Восточная Эфиопия) // Русский териологический журнал. 2010. Т. 9, №2. С. 47-60.

16. Ли В., Ху М., Тон Ч. Антиоксидантные свойства гликопептидов кожного секрета гигантской китайской саламандры // Тихоокеанский медицинский журнал 2012. Т. 1, №7. С. 57-59.

17. Литвицкий П.Ф. Патофизиология // ГЭОТАР-Медиа. 2010. 496 c.

18. Непомнящих Л.М. и др. Морфогенез важнейших общепатологических процессов в органах и тканях человека и животных: 5 научных открытий в области биологии и медицины // Бюллетень экспериментальной биологии и медицины Российская академия медицинских наук. 1998. С. 75.

19. Нечаев В.А. Земноводные (Amphibia) побережья залива Восток Японского моря // Биота и среда заповедников Дальнего Востока. 2014. №1. С. 100-101.

20. Парамонова Н.М. Регенерация как естественное индуцированное перепрограммирование? // Гены и Клетки. 2022. Т. 17, №3. С. 173.

21. Пресняков Е.В. и др. Влияние ген-активированного материала на регенерацию гиалинового хряща и субхондральной кости в эксперименте in vivo // Гены и Клетки. 2022. Т. 17, №3. С. 190-191.

22. Пресняков Е.В. и др. Индукция хондрогенеза in vivo под влиянием гидрогелевого ген-активированного материала на основе гиалуроновой кислоты и плазмидной днк с геном VEGF // Гены и клетки. 2021. Т. 16, №2. С. 47-53.

23. Проскурнина Е.В. и др. Внутриклеточный гомеостаз активных форм кислорода сперматозоидов: опыт применения хемилюминесценции // Технологии живых систем. 2022. T. 19, №1. С. 38-44.

24. Пяткова Е.В. и др. Особенности структуры хряща ушной раковины в различные возрастные периоды // Медицина и образование в Сибири. 2014. №3. С. 88.

25. Саркисов Д.С. Общая патология - теоретический фундамент медицины // Российские медицинские вести. 1999. №2. С. 5-12.

26. Слесаренко Н.А., Широкова Е.О. Репаративный остео- и хондрогенез в условиях индуцированного остеоартроза у лабораторных животных // Российский ветеринарный журнал. Мелкие домашние и дикие животные. 2012. №1. С. 6-8.

27. Степанов А.В. и др. Изучение роли фибронектин III-подобных доменов gp130 в активации рецептора // Бюллетень экспериментальной биологии и медицины. 2016. Т. 161, №1. С. 84-87.

28. Струков А.И. Патологическая анатомия: учебник // ГЭОТАР-Медиа. 2021. 880 с.

29. Султанова К.Н. и др. Сравнение гисто- и органогенеза поджелудочной железы человека, белой лабораторной мыши и иглистой мыши (Acomys) // Гены и Клетки. 2022. Т. 17, №2. С. 14-19.

30. Тирас Х.П. и др. Формирование регенерационной бластемы у планарии Girardia tigrina // Фундаментальные исследования. 2015. Т. 7, №3. С. 493-500.

31. Устименко Ю.Д., Шубина Т.П. Спинной мозг и спинномозговые нервы у животных // Вестник науки. 2020. Т. 1, №5. С. 96-100.

32. Учасова Е.Г. и др. Интерлейкин-33 и фиброз: современный взгляд на патогенез // Медицинская иммунология. 2018. Т. 20, №4. С. 477-484.

33. Чижик С.А., Трушко А.В., Вежхольский К.А. Структура и упругие свойства хряща на микро- и наноуровне // Российский журнал биомеханики. 2008. Т. 12, № 2. С. 13-22.

34. Яременко О.Б., Анохина Г.А., Бурьянов А.А. Сустав. Хрящ. Коллаген // Травма. 2020. Т. 21, №4. С. 6-12.

35. Abnave P., Ghigo E. Role of the immune system in regeneration and its dynamic interplay with adult stem cells // Semin Cell Dev Biol. 2019. Vol. 87. P. 160-1686

36. Akkiraju H, Nohe A. Role of Chondrocytes in Cartilage Formation, Progression of Osteoarthritis and Cartilage Regeneration // J Dev Biol. 2015. Vol. 3, No. 4. P. 177-192.

37. Alderson N.L. et al. FA2H-dependent fatty acid 2-hydroxylation in postnatal mouse brain // J Lipid Res. 2006. Vol. 47, No. 12. P. 2772-2780.

38. Almazan E.P., Ryan J.F., Rouhana L. Regeneration of Planarian Auricles and Reestablishment of Chemotactic Ability // Front Cell Dev Biol. 2021. Vol. 9. P. 777951.

39. Arellano J. et al. Neural interrelationships of autonomic ganglia from the pelvic region of male rats // Auton Neurosci. 2019. Vol. 217. P. 26-34.

40. Arenas Gómez C.M. et al. Limb regeneration in a direct-developing terrestrial salamander, Bolitoglossa ramosi (Caudata: Plethodontidae): Limb regeneration in plethodontid salamanders // Regeneration (Oxf). 2017. Vol. 4, No. 4. P. 227-235.

41. Arenas Gómez C.M., Echeverri K. Salamanders: The molecular basis of tissue regeneration and its relevance to human disease // Curr Top Dev Biol. 2021. Vol. 145. P. 235-275.

42. Asher R.J., Helgen K.M. Nomenclature and placental mammal phylogeny // BMC Evol Biol. 2010. Vol. 20. No. 10. P. 102-115.

43. Banerjee D., Onosaka S., Cherian M.G. Immunohistochemical localization of metallothionein in cell nucleus and cytoplasm of rat liver and kidney // Toxicology. 1982. Vol. 24, No. 2. P. 95-105.

44. Bar Oz M. et al. Acetylation reduces SOX9 nuclear entry and ACAN gene transactivation in human chondrocytes // Aging Cell. 2016. Vol. 15, No. 3. P. 499-508.

45. Batista M.A. et al. Nanomechanical phenotype of chondroadherin-null murine articular cartilage // Matrix Biol. 2014. Vol. 38. P. 84-90.

46. Benjamin M., Ralphs J.R. Biology of fibrocartilage cells // Int Rev Cytol. 2004. Vol. 233. P. 1-45.

47. Blum N., Begemann G. Retinoic acid signaling controls the formation, proliferation and survival of the blastema during adult zebrafish fin regeneration // Development. 2012. Vol. 139, No. 1. P. 107-116.

48. Bock F.J., Riley J.S. When cell death goes wrong: inflammatory outcomes of failed apoptosis and mitotic cell death // Cell Death Differ. 2023. Vol. 30. P. 293-303

49. Bonnemann C.G. et al. A mutation in the alpha 3 chain of type IX collagen causes autosomal dominant multiple epiphyseal dysplasia with mild myopathy // Proc Natl Acad Sci USA. 2000. Vol. 97. P. 1212-1217.

50. Boot-Handford R.P., Tuckwell D.S. Fibrillar collagen: the key to vertebrate evolution? A tale of molecular incest // Bioessays. 2003. Vol. 25, No. 2. P. 142-151.

51. Brant J.O. et al. A comparative analysis of gene expression profiles during skin regeneration in Mus and Acomys // PLoS ONE. 2015. Vol. 10, No. 11. P. 0142931.

52. Brant J.O. et al. Cellular events during scar-free skin regeneration in the spiny mouse, Acomys // Wound Repair. Regen. 2017. Vol. 24. P. 75-88.

53. Brant J.O. et al. Comparative transcriptomic analysis of dermal wound healing reveals de novo skeletal muscle regeneration in Acomys cahirinus // PLoS ONE. 2019. Vol. 14. P. 0216228

54. Braun W. et al. Comparison of the NMR solution structure and the x-ray crystal structure of rat metallothionein-2 // Proc Natl Acad Sci USA. 1992. Vol. 89, No. 21. P.10124-10128.

55. Brown D.D., Cai L. Amphibian metamorphosis // Dev Biol. 2007. Vol. 306, No. 1. P. 20-33.

56. Brunjes P.C. The precocial mouse, Acomys cahirinus // Psychobiology (Austin, Tex). 1990. Vol. 18. P. 339-350

57. Brunjes P.C., Korol D.L., Stern K.G. Prenatal neurogenesis in the telencephalon of the precocial mouse Acomys cahirinus // Neurosci Lett. 1989. Vol. 107. P. 114-119.

58. Bryant S.V., Gardiner D.M. Regeneration: sooner rather than later // Int J Dev Biol. 2018. Vol. 62. P. 363-368.

59. Buchanan J.L. Types of Fibrocartilage // Clin Podiatr Med Surg. 2022. Vol. 39, No. 3. P. 357-361.

60. Burzyn D. et al. A special population of regulatory T cells potentiates muscle repair // Cell. Vol. 2013. Vol.155. P. 1282-1295.

61. Carlsen S., Nandakumar K.S., Holmdahl R. Type IX collagen deficiency enhances the binding of cartilage-specific antibodies and arthritis severity // Arthritis Res Ther. 2006. Vol. 8. P. 1-8.

62. Chablais F., Jazwinska A. IGF signaling between blastema and wound epidermis is required for fin regeneration // Development. 2010. Vol. 137, No. 6. P. 871-879.

63. Chargé S.B. Rudnicki M.A. Cellular and molecular regulation of muscle regeneration // Physiol. Rev. 2004. Vol. 84. P. 209-238.

64. Chen S.H., Chen L., Russell D.H. Metal-induced conformational changes of human metallothionein-2A: a combined theoretical and experimental study of metal-free and partially metalated intermediates // J Am Chem Soc. 2014. Vol. 136, No. 26. P.9499-9508.

65. Costâchescu B. et al. Novel Strategies for Spinal Cord Regeneration // Int J Mol Sci. 2022. Vol. 23, No. 9. P. 4552.

66. Creutzfeldt W. et al. Vascular basement membrane thickness in muscle of spiny mice and activities of glycolysis and gluconeogenesis in the liver of animals with spontaneous and experimental diabetes and of untreated human diabetics // Diabetologia. 1971. Vol. 6. 356-360.

67. Czarny-Ratajczak M. et al. A mutation in COL9A1 causes multiple epiphyseal dysplasia: Further evidence for locus heterogeneity // Am J Hum Genet. 2001. Vol. 69. P. 969-980.

68. Daponte V., Tylzanowski P., Forlino A. Appendage Regeneration in Vertebrates: What Makes This Possible? // Cells. 2021. Vol. 10, No. 2. P. 242.

69. Das D., Fletcher R.B., Ngai J. Cellular mechanisms of epithelial stem cell self-renewal and differentiation during homeostasis and repair // Wiley Interdiscip Rev Dev Biol. 2020. Vol. 9, No. 1. P. 361.

70. Dateki S. ACAN mutations as a cause of familial short stature // Clin Pediatr Endocrinol. 2017. Vol. 26, No. 3. P. 119-125.

71. Dawson L.A. et al. Blastema formation and periosteal ossification in the regenerating adult mouse digit // Wound Repair Regen. 2018. Vol. 26, No. 3. P. 263-27

72. Decker R.S. Articular cartilage and joint development from embryogenesis to adulthood // Semin Cell Dev Biol. 2017. Vol. 62. P. 50-56.

73. Dickinson H., Walker D.W. Managing a colony of spiny mice (Acomys cahirinus) for perinatal research. Aust NZ Council Care Anim Res Training (ANZCCART) // News. 2007. Vol. 20. P. 4-11.

74. Diez-Fernandez C. et al. Mutations and common variants in the human arginase 1 (ARG1) gene: Impact on patients, diagnostics, and protein structure considerations // Hum Mutat. 2018. Vol. 39, No. 8. P. 1029-1050.

75. Dolan C.P. et al. Mouse Digit Tip Regeneration Is Mechanical Load Dependent // J Bone Miner Res. 2022. Vol. 37, No. 2. P. 312-322.

76. Donoghue P.C., Graham A., Kelsh R.N. The origin and evolution of the neural crest. Bioessays. 2008;30(6):530-541. doi:10.1002/bies.20767

77. Du Y. et al. Macrophage polarization: an effective approach to targeted therapy of inflammatory bowel disease // Expert Opin Ther Targets. 2021. Vol. 25, No. 3. P. 191209.

78. D'Udine B., Gerosa E., Drewett R.F. Maternal behavior and the milk ejection reflex in a precocial murid (Acomys cahirinus) // Behav Neural Biol. 1980. Vol. 28. P. 378-381.

79. Duverger O., Morasso M.I. Epidermal patterning and induction of different hair types during mouse embryonic development // Birth Defects Res C Embryo Today. 2009. Vol. 87. P. 263-272.

80. Eyre D.R. et al. Covalent Cross-linking of the NC1 Domain of Collagen Type IX to Collagen Type II in Cartilage // J Biol Chem. 2004. Vol. 279. P. 2568-2574.

81. Eyre D.R. et al. Recent developments in cartilage research: Matrix biology of the collagen II/IX/XI heterofibril network // Biochem Soc Trans. 2002. Vol. 30. P. 893-899.

82. Favre B., Begre N., Borradori L. A recessive mutation in the DSP gene linked to cardiomyopathy, skin fragility and hair defects impairs the binding of desmoplakin to epidermal keratins and the muscle-specific intermediate filament desmin // Br J Dermatol. 2018. Vol. 179, No. 3. P. 797-799.

83. Gaire J. et al. Spiny mouse (Acomys): an emerging research organism for regenerative medicine with applications beyond the skin // npj Regen Med . 2021. Vol. 6, No. 1. P. 21-41.

84. Gawriluk T.R. et al. Comparative analysis of ear-hole closure identifies epimorphic regeneration as a discrete trait in mammals // Nat Commun. 2016. Vol. 7. P. 11164.

85. Gemberling M. et al. The zebrafish as a model for complex tissue regeneration // Trends Genet. 2013. Vol. 29, No. 11. P. 611-620.

86. Gerber T. et al. Single-cell analysis uncovers convergence of cell identities during axolotl limb regeneration // Science. 2018. Vol. 362, No. 6413. P. 0681.

87. Godwin J.W., Rosenthal N. Scar-free wound healing and regeneration in amphibians: immunological influences on regenerative success // Differentiation; research in biological diversity. Vol. 87. P. 66-75.

88. Goetz C. et al. Phenotyping of M1 and M2a Macrophages and Differential Expression of ACE-2 on Monocytes by Flow Cytometry: Impact of Cell Culture Conditions and Sample Processing // Methods Mol Biol. 2023. Vol. 2593. P. 197-212.

89. Grabowska I. et al. Progression of inflammation during immunodeficient mouse skeletal muscle regeneration // J Muscle Res Cell Motil. 2015. Vol. 36, No. 6. P. 395404.

90. Grol M.W., Lee B.H. Gene therapy for repair and regeneration of bone and cartilage // Curr Opin Pharmacol. 2018. Vol. 40. P. 59-66.

91. Gumulec J. et al. Insight to physiology and pathology of zinc(II) ions and their actions in breast and prostate carcinoma // Curr Med Chem. 2011. Vol. 18, No. 33. P. 5041-5051.

92. Guo B. et al. Collagen triple helix repeat containing 1 (CTHRC1) activates Integrin P3/FAK signaling and promotes metastasis in ovarian cancer // J Ovarian Res. 2017. Vol. 10. P. 69-79.

93. Guo R. et al. T cell regeneration: an update on progress and challenges // Blood Sci. 2020. Vol. 2, No. 1. P. 22-26.

94. Harn H.C. et al. Symmetry breaking of tissue mechanics in wound induced hair follicle regeneration of laboratory and spiny mice // Nat Commun. 2021. Vol. 12. P.2595.

95. Hassan T.A. et al. Auricular cartilage regeneration using different types of mesenchymal stem cells in rabbits // Biol Res. 2022. Vol. 55, No. 1. P.40.

96. Hassnain Waqas S.F. et al. Adipose tissue macrophages develop from bone marrow-independent progenitors in Xenopus laevis and mouse // J Leukoc Biol. 2017. Vol. 102, No. 3. P. 845-855.

97. Haughton C.L., Gawriluk T.R., Seifert A.W. The Biology and Husbandry of the African Spiny Mouse (Acomys cahirinus) and the Research Uses of a Laboratory Colony // J Am Assoc Lab Anim Sci. 2016. Vol. 55, No. 1. P. 9-17.

98. He C. et al. ADM scaffolds generate a pro-regenerative microenvironment during full-thickness cutaneous wound healing through M2 macrophage polarization via lamtor1 // Front. Physiol. 2018. Vol. 9. P. 657.

99. Healy C., Uwanogho D., Sharpe P.T. Regulation and role of Sox9 in cartilage formation // Dev Dyn. 1999. Vol. 215, No. 1. P. 69-78.

100. Homa J., Klosowska A., Chadzinska M. Arginase Activity in Eisenia Andrei Coelomocytes: Function in the Earthworm Innate Response // International Journal of Molecular Sciences. 2021. Vol. 22, No. 7. P. 3687-3696.

101. Hou W. et al. CD44 is a prognostic biomarker and correlated with immune infiltrates in gastric cancer // BMC Med Genomics. 2022. Vol. 31, No. 1. P. 225-237.

102. Hou Y. et al. Cellular diversity of the regenerating caudal fin. // Sci Adv. 2020. Vol. 6, No. 33. P. 2084.

103. Hu H. et al. Endogenous Repair and Regeneration of Injured Articular Cartilage: A Challenging but Promising Therapeutic Strategy // Aging Dis. 2021. Vol. 12, No. 3. P. 886-901.

104. Huang, W. et al. Collagen for neural tissue engineering: Materials, strategies, and challenges // Materials today. 2023 Vol. 20. P. 100639.

105. Huebner E.A., Strittmatter S.M. Axon regeneration in the peripheral and central nervous systems // Results Probl Cell Differ. 2009. Vol. 48. P. 339-351.

106. Hui P. et al. Zebrafish regulatory T cells mediate organ-specific regenerative programs // Dev Cell. 2017. Vol. 43. P. 659-672.

107. Inoue M. et al. Endothelial cell-selective adhesion molecule modulates atherosclerosis through plaque angiogenesis and monocyte-endothelial interaction // Microvasc Res. 2010. Vol. 80, No. 2. P. 179-187.

108. Irvine G.W. et al. Metalation kinetics of the human a-metallothionein 1a fragment is dependent on the fluxional structure of the apo-protein // Chemistry. 2015. Vol. 21, No. 3. P. 1269-1279.

109. Ito M. et al. Wnt-dependent de novo hair follicle regeneration in adult mouse skin after wounding // Nature. 2006. Vol. 447. No. 316-320.

110. Jazwinska A., Badakov R., Keating M.T. Activin-betaA signaling is required for zebrafish fin regeneration // Curr Biol. 2007. Vol. 17, No. 16, P. 1390-1395.

111. Jiang T.X. et al. Comparative regenerative biology of spiny (Acomys cahirinus) and laboratory (Mus musculus) mouse skin // Exp. Dermatol. 2019. Vol. 28. P. 442-449.

112. Joven A., Elewa A., Simon A. Model systems for regeneration: salamanders // Development. 2019. Vol. 146, No. 14. P. 167700.

113. Kaplan H.M., Mishra P., Kohn J. The overwhelming use of rat models in nerve regeneration research may compromise designs of nerve guidance conduits for human // J Mater Sci Mater Med. 2015. Vol. 26, No. 8. P.226-232

114. Kavitha S.V., George S.D. Metallothioneins: Emerging Modulators in Immunity and Infection // Int J Mol Sci 2017 Vol. 18, No. 10. P. 2197.

115. Kikuchi K. et al. Retinoic acid production by endocardium and epicardium is an injury response essential for zebrafish heart regeneration // Dev Cell. 2011. Vol. 20, No. 3. P. 397-404.

116. Kim D. et al. Identifying oligodendrocyte enhancers governing Plp1 expression // Hum Mol Genet. 2021. Vol. 16, No. 30. P. 2225-2239.

117. Kim J. et al. PDGF signaling is required for epicardial function and blood vessel formation in regenerating zebrafish hearts // Proc Natl Acad Sci USA. 2010. Vol. 107, No. 40. P. 17206-17210.

118. Koudouna E. et al. Three-dimensional architecture of collagen type VI in the human trabecular meshwork // Mol Vis. 2014. Vol. 20. P. 638-648.

119. Kubota S. et al. Novel transcription factor-like function of human matrix metalloproteinase 3 regulating the CTGF/CCN2 gene // Molecular and Cellular Biology. 2008. Vol. 28, No. 7. P. 2391-2413.

120. Kuivaniemi H., Tromp G. Type III collagen (COL3A1): Gene and protein structure, tissue distribution, and associated diseases // Gene. 2019. Vol. 707. P. 151-171.

121. Kumar A. et al. Molecular basis for the nerve dependence of limb regeneration in an adult vertebrate // Science. 2014. Vol. 2017. Vol. 318. P. 772-777.

122. Kutaish H. et al. Bengtsson L, Matthias Tscholl P, et al. Hyaline Cartilage Microtissues Engineered from Adult Dedifferentiated Chondrocytes: Safety and Role of WNT Signaling // Stem Cells Transl Med. 2022. Vol. 11, No. 12. P. 1219-1231.

123. Lai C.S. et al. Type II Collagen from Cartilage of Acipenser baerii Promotes Wound Healing in Human Dermal Fibroblasts and in Mouse Skin // Mar Drugs. 2020. Vol. 18. P. 511.

124. Lamers W.H. et al. Perinatal development of the liver in rat and spiny mouse // Eur J Biochem. 1985. Vol. 146. P. 475-480.

125. Le Douarin N.M. et al. Neural crest cell plasticity and its limits // Development. 2004. Vol. 131, No. 19. P. 4637-4650.

126. Leahy D.J. et al. Structure of a fibronectin type III domain from tenascin phased by MAD analysis of the selenomethionyl protein // Science. 1992. Vol. 258, No. 5084. P. 987-991.

127. Lebedeva L. et al. Zebrafish (Danio rerio) as a Model for Understanding the Process of Caudal Fin Regeneration // Zebrafish. 2020. Vol. 17, No. 6. P. 359-372.

128. Lee S.J. et al. Metallothionein-3 regulates lysosomal function in cultured astrocytes under both normal and oxidative conditions // Glia. 2010. Vol. 58, No. 10. P.1186-1196.

129. Lee Y. et al. Maintenance of blastemal proliferation by functionally diverse epidermis in regenerating zebrafish fins // Dev Biol. 2009. Vol. 331, No. 2. P. 270-280.

130. Lee-Liu D. et al. The African clawed frog Xenopus laevis: A model organism to study regeneration of the central nervous system // Neurosci Lett. 2017. Vol. 652. P. 8293.

131. Lefebvre V., Angelozzi M., Haseeb A. SOX9 in cartilage development and disease // Curr Opin Cell Biol. 2019. Vol. 61. P. 39-47.

132. Leigh N.D. et al. Transcriptomic landscape of the blastema niche in regenerating adult axolotl limbs at single-cell resolution // Nat Commun. 2018. Vol. 9. P. 5153.

133. Lepilina A. et al. A dynamic epicardial injury response supports progenitor cell activity during zebrafish heart regeneration // Cell. 2006. Vol. 127, No. 3. P. 607-619.

134. Lettmann S. et al. Col6a1 null mice as a model to study skin phenotypes in patients with collagen VI related myopathies: Expression of classical and novel collagen VI variants during wound healing // PLoS ONE. 2014. Vol. 9. P. 105686.

135. Li C. et al. Deer antler--a novel model for studying organ regeneration in mammals // Int J Biochem Cell Biol. 2014. Vol. 56. P. 111-122.

136. Li X.S. et al. Regenerative medicine of tissue engineering : auricular cartilage regeneration and functional reconstruction // Journal of clinical otorhinolaryngology, head, and neck surgery. 2019. Vol. 33, No. 6. P. 567-571.

137. Liacini A. et al. Induction of matrix metalloproteinase-13 gene expression by TNF-alpha is mediated by MAP kinases, AP-1, and NF-kappaB transcription factors in articular chondrocytes // Exp Cell Res. 2003. Vol. 288, No. 1. P. 208-217.

138. Lian C. et al. Collagen type II suppresses articular chondrocyte hypertrophy and osteoarthritis progression by promoting integrin ß1-SMAD1 interaction // Bone Res. 2019. Vol.7. P. 1-15.

139. Lian H. et al. Collagen type II is downregulated in the degenerative nucleus pulposus and contributes to the degeneration and apoptosis of human nucleus pulposus cells // Mol Med Rep. 2017. Vol. 16. P. 4730-4736.

140. Lien C.L. et al. Gene expression analysis of zebrafish heart regeneration // PLoS Biol. 2006. Vol. 4, No. 8. P. 260.

141. Liu R.M., Desai L.P. Reciprocal regulation of TGF-ß and reactive oxygen species: A perverse cycle for fibrosis // Redox Biol. 2015. Vol. 6. P. 565-577.

142. Liu Y. et al. Enhancing Stem Cell Therapy for Cartilage Repair in Osteoarthritis-A Hydrogel Focused Approach // Gels. 2021. Vol. 7, No. 4. P. 263-270.

143. Liu Y., Shah K.M., Luo J. Strategies for Articular Cartilage Repair and Regeneration // Front Bioeng Biotechnol. 2021. No. 9. P. 770655.

144. Lohiniva J. et al. Splicing mutations in the COL3 domain of collagen IX cause multiple epiphyseal dysplasia // Am J Med Genet. 2000. Vol. 90. P. 216-222.

145. Luo Y. et al. The minor collagens in articular cartilage // Protein Cell. 2017. Vol. 8. P. 560-572.

146. Ma S.C. et al. Claudin-5 regulates blood-brain barrier permeability by modifying brain microvascular endothelial cell proliferation, migration, and adhesion to prevent lung cancer metastasis // CNS Neurosci Ther. 2017. Vol. 23, No. 12. P. 947-960.

147. Maden M. et al. Perfect chronic skeletal muscle regeneration in adult spiny mice, Acomys cahirinus // Sci. Rep. 2008. Vol. 8. P. 8920.

148. Mahdian M. et al. Nerve regeneration using decellularized tissues: challenges and opportunities // Frontiers in neuroscience. 2023. Vol. 17. P. 1295563.

149. Mantovani A. et al. The chemokine system in diverse forms of macrophage activation and polarization // Trends Immunol. 2004. Vol. 25, No. 12. P. 677-686.

150. Marongiu F. et al. Hyperplasia vs hypertrophy in tissue regeneration after extensive liver resection // World J Gastroenterol. 2017. Vol. 23, No. 10. P. 1764-1770.

151. Mathew L.K. et al. Comparative expression profiling reveals an essential role for raldh2 in epimorphic regeneration // J Biol Chem. 2009. Vol. 284, No. 48. P.33642-33653.

152. Maurizi E. et al. Regenerative Medicine of Epithelia: Lessons From the Past and Future Goals // Front Bioeng Biotechnol. 2021. Vol. 9. P. 652214.

153. McAlinden A. et al. Molecular properties and fibril ultrastructure of types II and XI collagens in cartilage of mice expressing exclusively the al(IIA) collagen isoform // Matrix Biol. 2014. Vol. 34. P. 105-113.

154. McCusker C., Bryant S.V., Gardiner D.M. The axolotl limb blastema: cellular and molecular mechanisms driving blastema formation and limb regeneration in tetrapods // Regeneration (Oxf). 2015. Vol. 2, No. 2. P. 54-71.

155. McCusker C., Gardiner D.M. The axolotl model for regeneration and aging research: a mini-review // Gerontology. 2011. Vol. 57, No. 6. P. 565-571.

156. Mescher A.L., Neff A.W. Regenerative capacity and the developing immune system // Adv. Biochem. Eng. Biotechnol. 2005. Vol. 93. P. 39-66.

157. Mittal M. et al. Reactive oxygen species in inflammation and tissue injury // Antioxid Redox Signal. 2014. Vol. 20, No. 7. P. 1126-1167.

158. Mobasheri A. et al. Mesenchymal stem cells in connective tissue engineering and regenerative medicine: applications in cartilage repair and osteoarthritis therapy // Histol Histopathol. 2009. Vol. 24, No. 3. P. 347-366.

159. Moleirinho A. et al. Gains, Losses and Changes of Function after Gene Duplication: Study of the Metallothionein Family // PLOS ONE. 2020. Vol. 6, No. 4. P. 18487-18499.

160. Morrison P., Dieterich R., Preston D. Breeding and reproduction of 15 wild rodents maintained as laboratory colonies // Lab Anim Sci. 1976. Vol. 26. P. 237-243.

161. Müller J. Functional metal ions in nucleic acids // Metallomics. 2010. Vol. 2, No. 5. P. 318-327.

162. Muneoka K., Fox W.F., Bryant S.V. Cellular contribution from dermis and cartilage to the regenerating limb blastema in axolotls // Dev Biol. 1986. Vol. 116. P. 256260.

163. Murciano C. et al. Ray-interray interactions during fin regeneration of Danio rerio // Dev Biol. 2002. Vol. 252, No. 2. P. 214-224.

164. Murphy G. Tissue inhibitors of metalloproteinases // Genome Biol. 2011. Vol. 12, No. 11. P. 233-241.

165. Murphy M.P. et al. Articular cartilage regeneration by activated skeletal stem cells // Nat Med. 2020. Vol. 26, No. 10. P. 1583-1592.

166. Musaro A. The basis of muscle regeneration // Adv Biol. 2014. Vol. 21, No 7. P. 612471

167. Musumeci G. et al. Characterization of apoptosis in articular cartilage derived from the knee joints of patients with osteoarthritis // Knee Surg Sports Traumatol Arthrosc. 2011. Vol. 19, No. 2. P. 307-313.

168. Newton Ede M.P., Khan W. The challenges of cartilage repair and the potential of stem cell applications // J Stem Cells. 2010. Vol. 5, No. 4. P. 167-175.

169. Nguyen E.D. et al. GENOME REPORT: Chromosome-scale genome assembly of the African spiny mouse (Acomys cahirinus) // Preprint bioRxiv. 2023. 2023. 04.03.535372.

170. Nims R.J. et al. Continuum theory of fibrous tissue damage mechanics using bond kinetics: application to cartilage tissue engineering // Interface Focus. 2016. Vol. 6, No. 1. P. 20150063.

171. Nossin Y. et al. The Releasate of Avascular Cartilage Demonstrates Inherent Pro-Angiogenic Properties In Vitro and In Vivo // Cartilage. 2021. Vol. 13, No. 2. P. 559S-570S.

172. Oh S.J. et al. Auricular Cartilage Regeneration with Adipose-Derived Stem Cells in Rabbits // Mediators Inflamm. 2018. Article. 4267158.

173. Okamura D.M. et al. Scarless repair of acute and chronic kidney injury in African Spiny mice (Acomys cahirinus) // bioRxiv. 2018. Article. 315069

174. Orci L. et al. The kidney of spiny mice (Acomys cahirinus): electron microscopy of glomerular changes associated with ageing and tubular glycogen accumulation during hyperglycemia // Diabetologia. 1970. Vol. 6. P. 343-355.

175. Pap T., Korb-Pap A. Cartilage damage in osteoarthritis and rheumatoid arthritis-two unequal siblings // Nat Rev Rheumatol. 2015. Vol. 11, No. 10. P. 606-615.

176. Park S. et al. PECAM-1 regulates proangiogenic properties of endothelial cells through modulation of cell-cell and cell-matrix interactions // Am J Physiol Cell Physiol. 2010. Vol. 299, No. 6. P. 1468-1484.

177. Parsons P. et al. Type IX collagen interacts with fibronectin providing an important molecular bridge in articular cartilage // J Biol Chem. 2011. Vol. 286. P. 34986-34997.

178. Pictet R. et al. Ultrastructural studies of the hyperplastic islets of langerhans of spiny mice (Acomys cahirinus) before and during the development of hyperglycemia // Diabetologia. 1967. Vol. 3. P. 188-211.

179. Porrello E.R. et al. Transient regenerative potential of the neonatal mouse heart // Science. 2011. Vol. 331. P. 1078-1080.

180. Poss K.D., Wilson L.G., Keating M.T. Heart regeneration in zebrafish // Science. 2002. Vol. 298, No. 5601. P. 2188-2190.

181. Price J., Allen S. Exploring the mechanisms regulating regeneration of deer antlers // Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci. 2004. Vol. 359, No. 1445. P. 809-822.

182. Pyagay P. et al. Collagen triple helix repeat containing 1, a novel secreted protein in injured and diseased arteries, inhibits collagen expression and promotes cell migration // Circ Res. 2015. Vol. 96. P. 261-268.

183. Rai M.F., Sandell L.J. Regeneration of articular cartilage in healer and non-healer mice // Matrix Biol. 2014. Vol. 39. P.50-55.

184. Reed C.C., Iozzo R.V. The role of decorin in collagen fibrillogenesis and skin homeostasis // Glycoconj J. 2002. Vol. 19, No. 4. P. 249-255.

185. Rossi E., Bernabeu C., Smadja D.M. Endoglin as an Adhesion Molecule in Mature and Progenitor Endothelial Cells: A Function Beyond TGF-ß // Front Med (Lausanne). 2019. Vol. 30, No. 6. P. 10-19.

186. Ruan J. et al. Novel Myh11 Dual Reporter Mouse Model Provides Definitive Labeling and Identification of Smooth Muscle Cells-Brief Report // Arterioscler Thromb Vasc Biol. 2021. Vol. 41, No. 2. P. 815-821.

187. Ruttkay-Nedecky B. et al. The role of metallothionein in oxidative stress // Int J Mol Sci. 2013. Vol. 14, No. 3. P.6044-6066.

188. Sandoval A.W., Maden M. Regeneration in the spiny mouse, Acomys, a new mammalian model // Curr Opin Genet Dev. 2020. Vol. 64. P. 31-36.

189. Seifert A.W. et al. Skin shedding and tissue regeneration in African spiny mice (Acomys) // Nature. 2012. Vol. 489. P. 561-565.

190. Seifert A.W., Maden M. New insights into vertebrate skin regeneration // Intl Rev Cell Mol Biol. 2014. Vol. 310. P. 129-169.

191. Seifert A.W., Muneoka K. The blastema and epimorphic regeneration in mammals // Dev Biol. 2018. Vol. 433, No. 2. P. 190-199.

192. Shafrir E., Ziv E., Kalman R. Nutritionally induced diabetes in desert rodents as models of type 2 diabetes // ILAR J. 2006. Vol. 47. P. 212-224.

193. Shiromoto Y. et al. Increased migratory activity and cartilage regeneration by superficial-zone chondrocytes in enzymatically treated cartilage explants // BMC Musculoskelet Disord. 2022. Vol. 23, No. 1. P. 256-259

194. Shkolnik A., Borut A. Temperature and water relations in 2 species of spiny mice (Acomys) // J Mammal. 1969. Vol. 50. P. 245-255.

195. Simkin J. et al. Macrophages are necessary for epimorphic regeneration in African spiny mice // Elife. 2017. Vol. 6. P. 24623.

196. Siqueira Mietto B. et al. Role of IL-10 in Resolution of Inflammation and Functional Recovery after Peripheral Nerve Injury // J Neurosci. 2015. Vol. 35, No. 50. P. 16431-16442.

197. Smirnova E.V. et al. Comprehensive Atlas of the Myelin Basic Protein Interaction Landscape // Biomolecules. 2021. Vol. 11, No. 11. P. 1628-1641.

198. Stephens W.Z. et al. Epithelial-myeloid exchange of MHC class II constrains immunity and microbiota composition // Cell Rep. 2021. Vol. 2, No. 37. P. 109916.

199. Steppan S., Adkins R., Anderson J. Phylogeny and divergence-date estimates of rapid radiations in muroid rodents based on multiple nuclear genes // Syst Biol. 2004. Vol. 53. P. 533-553.

200. Steppan S.J. et al. Multigene phylogeny of the Old World mice, Murinae, reveals distinct geographic lineages and the declining utility of mitochondrial genes compared to nuclear genes // Mol Phylogenet Evol. 2005. Vol. 37. P. 370-388.

201. Stoick-Cooper C.L. et al. Distinct Wnt signaling pathways have opposing roles in appendage regeneration // Development. 2007. Vol. 134, No. 3. P. 479-489.

202. Stöve J. et al. Interleukin-lbeta induces different gene expression of stromelysin, aggrecan and tumor-necrosis-factor-stimulated gene 6 in human osteoarthritic chondrocytes in vitro // Pathobiology. 2000. Vol. 68, No. 3. P. 144-149.

203. Streeter K.A. et al. Molecular and histologic outcomes following spinal cord injury in spiny mice, Acomys cahirinus // J. Comp. Neurol. 2019. Vol. 528, No. 9. P.1535-1547.

204. Su H. et al. The biological function and significance of CD74 in immune diseases // Inflamm Res. 2017. Vol. 66, No. 3. P. 209-216.

205. Takebe T. et al. Human elastic cartilage engineering from cartilage progenitor cells using rotating wall vessel bioreactor // Transplant Proc. 2012. Vol. 44, No. 4. P. 11581161.

206. Tamura K., Ohgo S., Yokoyama H. Limb blastema cell: a stem cell for morphological regeneration // Dev Growth Differ. 2010. Vol. 52, No. 1. P. 89-99.

207. Tassava R.A. et al. The wound epithelium of regenerating limbs of Pleurodeles waltl and Notophthalmus viridescens: studies with mAbs WE3 and WE4, phalloidin, and DNase 1 // J Exp Zool. 1993. Vol. 267. P. 180-187.

208. Taylor S.E. et al. Identification of Human Juvenile Chondrocyte-Specific Factors that Stimulate Stem Cell Growth // Tissue Eng Part A. 2016. Vol. 22, No. 7. P. 645-653.

209. Thirumoorthy N. et al. Metallothionein: an overview // World J Gastroenterol. 2007. Vol. 13, No. 7. P.993-996.

210. Toma J.S. et al. Peripheral Nerve Single-Cell Analysis Identifies Mesenchymal Ligands that Promote Axonal Growth // eNeuro. 2020. Vol. 7, No. 3. P. 123-129.

211. Tweedell K.S. The urodele limb regeneration blastema: the cell potential // Scientific World Journal. 2010. Vol. 10. P. 954-971.

212. Uezumi A. et al. Mesenchymal progenitors distinct from satellite cells contribute to ectopic fat cell formation in skeletal muscle // Nat. Cell Biol. 2010. Vol.12, 143-152.

213. Vasak M., Hasler D.W. Metallothioneins: new functional and structural insights // Curr Opin Chem Biol. 2000. Vol. 4, No. 2. P. 177-183.

214. Velling T. et al. Polymerization of type I and III collagens is dependent on fibronectin and enhanced by integrins alpha 11beta 1 and alpha 2beta 1 // J Biol Chem. 2002. Vol. 277, No. 40. P. 37377-37381.

215. Vickaryous M.K., Hall B.K. Human cell type diversity, evolution, development, and classification with special reference to cells derived from the neural crest // Biol Rev Camb Philos Soc. 2006. Vol. 81, No. 3. P. 425-455.

216. Wang C. et al. Type III collagen is a key regulator of the collagen fibrillar structure and biomechanics of articular cartilage and meniscus // Matrix Biol. 2020. Vol.85. P. 4767.

217. Wang J., Pan W. The biological role of the collagen alpha-3 (Vi) chain and its cleaved c5 domain fragment endotrophin in cancer // OncoTargets Ther. 2020. Vol. 13. P. 5779-5793.

218. Wasyleczko M., Sikorska W., Chwojnowski A. Review of Synthetic and Hybrid Scaffolds in Cartilage Tissue Engineering // Membranes (Basel). 2020. Vol. 10, No. 11. P. 348-359.

219. Wei H. et al. Differential expression of metallothioneins (MTs) 1, 2, and 3 in response to zinc treatment in human prostate normal and malignant cells and tissues // Mol Cancer. 2008. Vol. 7. P. 7-16.

220. Westacott C.I. et al. Tumor necrosis factor alpha can contribute to focal loss of cartilage in osteoarthritis // Osteoarthritis Cartilage. 2000. Vol. 8, No. 3. P. 213-221.

221. Wilusz R.E. et al. The structure and function of the pericellular matrix of articular cartilage // Matrix Biol. 2014. Vol. 39. P. 25-32.

222. Wong V.W. et al. Focal adhesion kinase links mechanical force to skin fibrosis via inflammatory signaling // Nat. Med. 2012. Vol. 18. P. 148-152.

223. Wu J.J. et al. Type III collagen, a fibril network modifier in articular cartilage // J Biol Chem. 2010. Vol. 285. P. 18537-18544.

224. Wuelling M., Vortkamp A. Chondrocyte proliferation and differentiation // Endocr Dev. 2011. Vol. 21. P. 1-11.

225. Xu G. et al. MT1G inhibits the growth and epithelial-mesenchymal transition of gastric cancer cells by regulating the PI3K/AKT signaling pathway // Genet Mol Biol. 2022. Vol. 45, No. 1. P. 20210067.

226. Xu Y. et al. Enhanced acyl-CoA: cholesterol acyltransferase activity increases cholesterol levels on the lipid droplet surface and impairs adipocyte function // J Biol Chem. 2019. Vol. 294, No. 50. P. 19306-19321.

227. Yamaguchi Y. et al. L-MPZ, a novel isoform of myelin P0, is produced by stop codon readthrough // J Biol Chem. 2012. Vol. 287, No. 21. P. 17765-17776.

228. Yao X. et al. Kidney fibrosis induced by various irrigation pressures in mouse models of mild and severe hydronephrosis // Int Urol Nephrol. 2019. Vol. 51, No. 2. P. 215-222.

229. Yates C.C., Hebda P., Wells A. Skin wound healing and scarring: fetal wounds and regenerative restitution // Birth Defects Res C Embryo Today. 2012. Vol. 96, No. 4. P. 325-333.

230. Yoon J.H. et al. Comparative Proteomic Analysis in Scar-Free Skin Regeneration in Acomys cahirinus and Scarring Mus musculu // Sci Rep. 2020. Vol. 10, No. (1). P. 166.

231. Young D.A. The precocial mouse, Acomys cahirinus // Animal Model. 2007. Vol. 5. P. 16-21.

232. Young R.B. Breeding and fertility of the Egyptian spiny mouse, Acomys cahirinus: effect of different environments // Lab Anim. 1976. Vol. 10. P. 15-24.

233. Young W. Spinal cord regeneration // Cell Transplant. 2014. Vol. 23, N. 4. P. 573611.

234. Yu L. et al. BMP9 stimulates joint regeneration at digit amputation wounds in mice // Nat Commun. 2019. Vol. 10, No. 1. P. 424.

235. Yushchuk O. et al. Characterization of the Post-Assembly Line Tailoring Processes in Teicoplanin Biosynthesis // ACS Chem Biol. 2016. Vol. 11, No. 8. P. 2254-2264.

236. Zhang X, et al. Keratin 6, 16 and 17—Critical Barrier Alarmin Molecules in Skin Wounds and Psoriasis // Cells. 2019. Vol. 8. P. 807-825.

237. Zhao X., Duester G. Effect of retinoic acid signaling on Wnt/beta-catenin and FGF signaling during body axis extension // Gene Expr Patterns. 2009. Vol. 9, No. 6. P. 430435.

238. Zhu Y. et al. Type IIA procollagen containing the cysteine-rich amino propeptide is deposited in the extracellular matrix of prechondrogenic tissue and binds to TGF-01 and BMP-2 // J Cell Biol. 1999. Vol. 144. P. 1069-1080.

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

АФК - активные формы кислорода

ВКМ - внеклеточный матрикс

ДНК - дезоксирибонуклеиновая кислота

ДЭ - дифференциальная экспрессия

МТ1 - металлотионеин1

МТ2 - металлотионеин 2

РК - ретиноевая кислота.

Acan - агрекан

Aldh1a2 - семейство ферментов ацетальдегиддегидрогеназы-2 Argl - аргиназа 1

BMP2 - костный морфогенетический белок 2

Chad - хондроадгерин

Cldn5 - клаудин 5

Col1a1 - коллаген 1 типа

Col5a3 - коллаген 5 типа

Cthrc1 - повтор тройной спирали 1 коллагена

Dcn - декорин

Dsp - десмоплакин

Eln - эластин

Eng - эндоглин

Esam - молекула адгезии эндотелиальных клеток

Fa2h - 2-гидроксилаза жирных кислот

Fgf - фактор роста фибробластов

Igf - инсулиноподобный фактор роста

Il1b - интерлейкин 1 бета

Il6 - интерлейкин 6

LEF1 - лимфоидный энхансер-связывающий фактор Mbp - основной белок миелина

Mfap4 - гликопротеин 4, связанный с микрофибриллами

MMP-13 - матриксная металлопротеиназа 13 MMP3 - матриксная металлопротеиназа 3 MMP9 - матриксная металлопротеиназа 9 Mpp - миелиновый протеолипидный белок Mpz - нулевой миелиновый белок Myh11 - миозин 11

Notch1 - трансмембранный рецепторный белок-1

Pecam1 - молекула адгезии тромбоцитов/эндотелиальных клеток 1

Robo1 - кольцевой гомолог 1

scRNA-seq - секвенирование одиночных клеток

Soat1 - стерол-О-ацилтрансфераза

Sox2 - транскрипционный фактор-2

Sox9 - транскрипционный фактор-9

Timp1 - тканевой ингибитор металлопротеиназ-1

Tnf - фактор некроза опухоли

UMAP - алгоритм машинного обучения, выполняющий нелинейное снижение размерности (uniform manifold approximation and projection) VEGFR - рецептор фактора роста сосудов

ПРИЛОЖЕНИЯ

Таблица 1. Гены, определяющие принадлежность клеточного типа (округлый дефект).

Номер кластера Гены

1 Col8a1, Sparc, Eln, Gpc6, Col2a1, Bgn, Gsn, Wifl, Acan, Col9a3, Wwp2, Col27a1, Colllal, Thbsl, Glis3, Abi3bp, Pcdh9, Sox5, Lox, Unc5c, Xyltl, Zfhx4, Kcnmal, Lrpl, Zbtb20, Clu, Ccn2, Ccdc80, Cytll, Chill, Smoc2, Collla2, Boc, Colecl2, Sox9, Ppplrlb, Fzd9, Vim, Prdml6, Sdk2, Fgfrl, Fbnl, Mgp, Samd4, Setbpl, Iqsecl, l52040lA03Rik, Haplnl, Zfp385b, Serpine2, Timp3, Cst3, Col6a3, Col6a2, Msmp, Mecom, Raphl, Slc9a9, Ccdc88a, Reck, Npas3, Ldlrad3, Adamtsl3, Trabd2b, Snedl, Bmper, Cspg4, Col9al, Prkgl, Zfp52l, Fap, Zfpm2, Bnc2, Prkca, Pcolce2, Col6al, Scara3, Pdzrn3, Comp, Sobp, Stk32b, Bmp5, Fndc3b, Dkk3, Lsamp, Snorc, Gm38825, Loxl4, Dock8, Lrp6, Fchsd2, Klfl2, Lefl, Gfpt2, Clec3a, Adamtsl2, Cnmd, Lmcdl, Prrxl, Corin, Dipk2a, Fnl, Trf, Susd5, Myold, Fbn2, Tenm3, Prkdl, Edil3, Farpl, Meltf, Zfhx3, Dgat2, Msi2, Chad, Etv5, Maged2, Lhfp, App, Mob3b, Cpe, Cemip, Pdzrn4, Navl, Col9a2, Fgf2, Ank2, Npsrl, Neol, 0lfrl306, Pitpncl, Igfl, Nrep, Fgfr3, Sashl, Plcel, Trpsl, Dap, Luzp2, Abtb2, Crispldl, Klhl29, Fmod, Mfge8, Sox6, Meis2, Hrctl, A330008Ll7Rik, Dab2, Colla2, Anol, Chstll, Meisl, Thrb, Pam, Cpne8.

2 Krtl4, Krt5, Coll7al, Gripl, Sox6, Fcgbp, Trp63, Slc24a3, Itga6, Dst, Tnfrsfl9, Dsp, Neatl, Frmd4b, Lama3, Maml3, Gm269l7, Cdhl3, Ptpnl3, Antxrl, Slc6a6, Krtl5, Pkpl, Itgb4, Lrp4, Dsc3, Pbxl, Sema3d, Bclllb, Rorl, Maf Slco3al, Klf5, Clca3a2, Iffo2, Mef2a, 26l0035Dl 7Rik, Nfia, Efna5, Sfn, Ahcyl2, Ppplrl4c, Wls, Anxa2, P3h2, Sema3c, Fgfr2, Mcc, Nxn, Pdzrn4, Ssbp2, Robol, Sh3dl9, Btbdll, Rad5lb, Kif2la, Tmem45a, Znrf3, Syne2, Col4a6, Thsd4, Spred2, Ust, Gnal4, Atplb3, Pou3fl, Itpr2, Slc38a2, Ptpnl4, Tgfbi, Rplp0, Perp, Gml7l67, Gata3, Ly6d, Tenm4, 1700025G04Rik, Hlf mt-Col, Pou2f3, Il20ra, Egfr, Slc22a4, Dsg3, Tiaml, Cxadr, Serpinb7, Il1rl2, Gm15987, Peli2, Jag2, Cers6, Asapl, Affl, Tspear, Abcc5, Sult5a1, Rapgef4, Rora, Lypd6b, Igfbp3, Sh3rf2, Lrchl, Aqp3, Med13l, Extl, Magil, Stox2, Mapkbpl, Psd3, Robo2, Tns4, Ndfip2, Fgfr3, Atplal, Krt16, Serpinb2, Sema5a, Malatl, Ptma.

3 Krt15, Tenm2, Adgrl2, Krt17, Slc6a6, Fst, Aldh3a1, Moxdl, Ptprk, Anxa8, Adgra3, Adgrl3, Enoxl, Foxpl, Lrigl, Nebl, Lgr5, Efnb2, Perp, Nfib, Barx2, Dsp, Scel, Sostdcl, Mitf Col17a1, Krt5, Lgr4,

Alcam, Dst, Tfap2b, Cachd1, Egfr, Hr, Trim29, Bcl11a, Cldn1, Afdn, Dsg3, Sox9, Zfp36l2, Net1, Lgr6, Runx1, Kank1, Casz1, Vdr, Aqp3, Trp63, Itgb8, App, Pof1b, Cxcl14, Aopep, Naaladl2, Sema3e, Cadm1, Etl4, Tcf12, Adamts17, Ank, Auts2, Gm17167, Krt79, Adamtsl1, Slit3, Cst6.

4 Abca1, Cxcl12, Ebf1, Ldb2, H2-Q10, Fabp4, Ablim1, Scarb1, Ptprm, Mecom, Ebf3, Epas1, Plcb4, Pecam1, Fli1, Ptprg, Flt1, Tshz2, C130074G19Rik, H2-D1, Rasa4, Adgrl4, Mctp1, Ptprb, Prex2, Cdh13, Tspan7, Ltbp4, Igfbp7, Cyyr1, Adamts9, Aqp1, Elk3, Abcg2, Adgrf5, Plvap, Tcf4, Cd36, Cav1, Arhgap31, Prkch, Vwf, Sparcl1, Vim, Cavin1, Tjp1, Col15a1, Hspb1, Dach1, Eng, Dock9, Tspan13, Apbb2, Itm2b, Ets2, Erg, Tmsb4x, Kdr, Ehd4, Pkp4, Kitl, Shank3, Dock4, Col4a1, Rasgrf2, Igf2, Ets1, Pde2a, Egfl7, Heg1, Timp2, Sema7a, Tacr1, Mef2c, Gm9844, Pdia5, Fkbp1a, 4931406P16Rik, Gda, Rbpms, Lifr, Ablim3, Plxnd1, She, Ccdc85b, Sncaip, Nrp1, Entpd1, Gnas, Cldn5, Meox2, Rgl1, Ly6e, Tek, St6galnac3, Slc9a3r2, Cdh5, Tpm4, Arpc1b, Ece1, Emcn, Itpr1, Timp4, Sema6a, Slc28a2, Hoxd8, Wwtr1, S1pr1, Podxl, Elmo1, Itpkb, Arhgap29, Jam2, Ndrg1, Tmcc3, Mrtfb, Zeb1, Col4a2, Ddit4, Fgd5, Arhgef3, Snrk, Tspan12, Zfp36l1, Pcdh17, Dnm3, Esam, Afap1l1, Msn, Ctnnal1, Thbd, Myrip, Cmah, Plekhg1, Lrrc8c, Klf7, Ccser1, Pakap.1, Ppp2r5a, Ralgapa1, Clic4, Dipk2b, Fam171a1, Fcho2, Pdgfd, Npdc1, Mest, Zfp423, Chn2, Hip1, Dysf, Fam13c, Rasip1, Klf6, Pitpnc1, Pdlim1, Sorbs2, Plcg1, Cd93, Robo4, Ccdc85a, Ahnak, Zfp521, Ybx1, Magi1, 9530026P05Rik, Gm15013, Stox2.

5 Col1a1, Coch, Postn, Col1a2, Col3a1, Lama2, Col12a1, Dcn, Cntn1, Trps1, Zeb2, Meis2, Igfbp4, Col6a3, Slit3, Tcf4, Enpp2, Robo2, Timp2, Nav3, Dkk2, Col6a2, Runx1t1, Aebp1, Slit2, Igfbp5, Tbx15, Col5a1, Aspn, Cdh11, Igf1, Abca8a, Cped1, Zbtb20, Igsf10, Col6a1, Plpp3, Apcdd1, Olfml3, Gldn, Abca9, Fgfr1, Fn1, Svep1, Srpx, Prrx1, Pcolce, Twist1, Nbl1, Prr16, Ptprd, Sema3a, Serpinf1, Col5a2, Tmem132c, Pdgfra, Mmp2, Meis1, Hpse2, Tshz3, Vcan, Spon1, Ccbe1, Pid1, Lrp1, Twist2, Mmp14, Fbn1, Adamts2, Pth1r, Nbea, Adcy2, Meox2, Nrp1, Vim, Fam102b, Abca8b, Rspo3, Frem1, Syne1, Nrp2, Tgfbr3, Rbms3, Pde7b, Adgrl3, Igfbp3, Pde4d, Fmod, Thsd4.

б Krt10, Krt2, Dsg1a, Dsp, Krt1, Perp, Pkp1, Dsc3, Skint5, Calm4, Clip4, Slco3a1, Plxdc2, Pof1b, Mpp7, Abca12, Slc24a3, Sbsn, Esrp1, Chl1, Sfn, Jup, Clca3a2, Serpinb3b, Scel, Ptpn13, Map2, Tiam1, Grhl1, Nipal2, Sppl3, Sema3d, Itprid2, Klf3, Dsc1, Skint10, Ikzf2, Nectin1, Trp63, Kif21a, Ghr, Fam83b, Lrp4, Srgap2, Klf5,

Ppl, Pou2f3, Tnik, Tprg, Maf, Dlg2, Il20rb, Elovl4, Dsglb, Micul, Arl15, Krtdap, Gm26917, Dmkn, Ankrd35, Sptlc3, Pak3, Lrrcl, Anxa8, Itpr3, Lgals3, Gata3, Serpinb5, Tspan5, Acsll, Sh3d19, Cdhl, Lypd6b, Mcc, Caszl, Tancl, Tmem45a, Pou3f1, Atp2b4, Gng12, Rail4, Gml5987, Ppp2r3a, Neatl, Plekhnl, Trim29, Afdn, Gltp, Tspan9, Znrf2, Rgs20, Iffo2, Bclllb, Sgmsl, Cobl, Skint6, Ly6d, Gadll, Klf4, Gan, Neol, Sltm, Gm2l64, Rapgefll, Tmprss4, Hal, Rora, Ppplrl4c, Dabl, Ptgsl, Dip2b, Lipm, Nhsll, Sh3gl2, Agpat4, Clca2, Paqr5, Cpeb2, Sdcl, Evpl, RablO, Tenm4, Sh3rf2, Cttnbp2, Slc22a23, Grhl3, Sptbn2, Pdzd2, Hlf Notch2, Sdrl6c5, Cers6, Aloxl2e, Lypd3, Ankrdll, Cdl09, Ybx3, Bboxl, Vpsl3a, Tuftl, Fnbpl, Acap2, Krt24, Stiml, Clec2g, Exph5, Sdc4, Nectin4, Pon2, Endou, Map3kl, Faml35a, 4833423E24Rik, Itm2b, Vtila, Ggct, Ptprf, Ephb6, Chitl, Ctnndl, Npl, Ahnak2, Fam83g, Mark2, Vgll4, Psenl, Memol, Maml3, Ube2e2, Klfl2, Cmssl, Phactr2, Plekha5, Sox6, Ust, Lars2, Smyd3, Lgals7, mt-Col, Jarid2, Mboat2, Hs6st3, Abtb2.

7 Abi3bp, Thbsl, Igfbp5, Ccn2, Dcn, Biccl, Mgp, Timp3, Sparc, Itgbll, Angptl7, Colla2, Zfhx4, Thbs4, Col5a2, Chill, Adamtsl3, Colecl2, Setbpl, Col8al, Comp, Bgn, Chad, Bnc2, Mecom, Col3al, Collal, Ogn, Lrpl, Timp2, Igfl, Gpm6b, Wifl, Coll2al, Fmod, Zbtb20, Gsn, Mfap4, Ltbp4, Lrp6, Zfhx3, Colllal, Fbnl, Clu, Zfp52l, Trf, Crispldl, Prelp, Fgfrl, Aspn, Kcnmal, Fap, Dab2, Sox5, Fat4, Pcolce, Aebpl, Col5al, Fndcl, Col6a3, Prkdl, Reck, Plcel, Hrctl, Pdzrn3, Ank2, Cp, Boc, Pcdh9, Cdon, Plpp3, Klhl29, Smocl, Tgfbr3, Fthl, Pcsk5, Tsc22d3, Gas6, Gm38825, Prkgl, Postn, Pam, Pde4d.

8 Gphn, Gml5564, Wdr92, Camkld, Gml995l, Gm424l8, Il3lra, Gm8579, E3300l7A0lRik, Slc22a28, Lars2, Jarid2, AY036118, Peakl, Rftnl, Cd46, Cepll2, Lztfll, Zc3h7a, Trpm3, Herc6, Prdml2, 6530413G14Rik, Zfp950, Tmem56, Snx29, Tbcld22a, Zmym5, Zfp608, Slc22a30, Gml0739, Gm20594, Filipll, Tbcld30, Zfp872, Snx27, Filipl, Nrgl, Marchl, Cnnl, Hexb, Olfm3, Wdrl9, Zfp809, Cmssl, Gml6845, Abil, Hbb-bs.

9 Dock2, Cd74, Arhgapl5, Elmol, Lcpl, H2-Abl, Arhgap26, H2-Ebl, Ankrd44, Prkcb, Dennd4a, Cd44, Lyz2, Lyn, H2-Aa, Grap2, Dockl0, Inpp5d, Ripor2, Atp8b4, Fam49b, Pagl, Srgn, Gprl4l, Stkl7b, Apbblip, Sorll, Ptk2b, Illb, Fyb, Laptm5, Runx3, Ppmlh, Cxcl2, Corola, Plek, Cytip, Cd244a, Itk, Prexl, Plcl2, Pik3apl, St8sia4, Lcp2, Pik3cd, Rin3, Faml07b, Gab2, Skapl, Dock8, Runxl, Nr4a3, Ubash3b, Mcll, Sh3kbpl, Antxr2, Rab8b, Dleu2, Maltl, Ptprj, Cd247, Picalm, Dock5, Cythl, Diaphl, Abr, Flil,

Rasgeflb, Cmip, Pip4k2a, Il1r2, Mrcl, Mxdl, Atp2b1, Lyst, Zfp36, Akap13, mt-Co3, Skap2, Rasa2, Slc7a11, Etsl, Fnbpl, Pidl, Themis, Zeb2, Etv6, Zebl, Alcam, Tox, Slc8al, Lncpint, Mbnll, Inpp4b, Dock4, Rabgapll, Ill2rb2, Sgms2, Actb, Ctnnd2, St6galnac3, Cacnale, Pcdh7, Cacnb2.

10 Mpz, Mbp, Zeb2, Qk, Slc35fl, Grik2, Cdhl9, Scn7a, Dmd, Plpl, Adam23, Gpm6b, Sgcd, Celf2, Reln, Sorbsl, Kcnal, Pax3, Gas7, Abca8a, Dagl, Zfp536, Fmnl2, Col28al, Gatm, Limchl, Col5a3, Frmd3, SoxlO, Lgi4, Gldn, Snca, Gml0863, Prx, Mal, Sema3b, Nr4a2, Nrnl, Adamts20, Cadm4, Ugt8a, Kcna2, Sorcsl, Vim, Cep85l, Fxydl, Tmemll7, Galntl7, Gulpl, Cadm2, Tenm3, Utrn, Mlip, Magi2, Apod, Ntngl, Ly6h, Tanc2, Lama2, Secisbp2l, Gfap, Zfp462, Frmd4a, Ctnna3, Csmdl, Nrcam, Hcnl, Nfl, Ptprj, Itgb8, Deptor, Nkain2, Pcdh9, Cadml, Arhgap24, Slit2, Cdh2, Teadl, Ehbpl, Fthl, Agapl, Etvl, Xkr4, Prex2, Dlgapl, Prnp, Adgrl3, Fut8, Auts2, Tmtc2, Illrapll, Dlcl, Ptprzl, Chll, Faml35b.

11 Fgfbpl, Apoe, Acsbgl, Efnb2, Ctsl, Pabpcl, Cyp5l, Cebpb, Nfib, Gclc, Adgrl2, Acsl4, Vav3, Gjal, Gclm, Hspdl, Aldh3al, Egfr, Acbd6, Aqp3, Gsta3, Pparg, Igfbp2, Ar, Tfap2a, Slc25al, Dhcr24, Acaa2, Hadha, Lpcat3, Lgr6, Nampt, Clmp, Hacd2, Tln2, Dagl, D730045B0lRik, Prxl2a, Ak3, Hmgb3, Tfap2c, Carl2, Hmgcs2, Ucp2, Rbm47, Ppargclb, Apmap, Alad, Idhl, Bcllla, Anxa8, Jag2, Gpc4, Atp5b, Lrigl, Atp5g3, Sdcl, Tns3, Tomm70a, Bsg, Tmeml3l, Sema5a, Secisbp2l, Syncrip, Srsfl, Tecr, Hnrnpab, Set, Ptprk, Hr, Hnrnpa3, Grina, Arhgap24, Prlr, Nfix, Bzwl, Lama4, Eef2, Lrmda, Olfm3, Herc6, Hsp90abl, Auts2, Zfp36l2, Canx, Sntbl, Rps2, Ptma, Eif5a, Rpll3, H3f3b, Rps3al, Rpl5, Gml50l3, Eeflal, Gm269l7, Mtl, Rpl27a, Mycbp2, Gml4l64, Ybxl, Rpl8, 9330lllN05Rik, Rps8, Rps5, Rpll9, Immp2l.

12 Rgs5, Acta2, Ebfl, Zeb2, Igfbp7, Pde3a, Pdgfrb, Myhll, Tagln, Abcc9, Nr2f2, Cacnalc, Tpml, Notch3, Caldl, Mylk, Arhgap6, Prkgl, Des, Dlcl, Rbpms, Gml3889, Synpo2, Myolb, Col4al, Prrxl, Anol, Ebf2, Gucylal, Myl9, Ctnna3, Mef2c, Sept7, Pde5a, Mrvil, Mprip, Pten, Rcan2, Epasl, Bl30024Gl9Rik, Col4a2, Carmn, Pdela, Gucyla2, Cripl, Lbh, Uba2, Itga7, Pcdhl9, Trpc6, Rgs6, Adamtsl2, Pakap, Cacna2dl, Slc7a2, Arhgefl7, Tinagll, Kcnj8, Gucylbl, Jagl, Serpine2, Morrbid, Ptp4a3, Wtip, Adra2a, Rasllla, Angptl, Markl, Lgalsl, Pnpla2, Tpm2, Egflam, Atplb2, Mcam, Col5a3, Stum, Reml, Fxyd6, Stac, Lin7a, Dockl0, Nrpl, Vcl, Sgipl, Fermt2, Lamb2, Dgkb, Sox5, Itgal, Tnsl, Sema6d, Plcll, Tnfrsf2l, Frmd4a, Inpp4b, Arhgef7, Actb, Ctnnd2, Tlnl, Bcl2ll, Tpm4, Utrn, Dmd, Sema5a, Sparcll, Csmdl, Cacnb2,

Rbms3, B3galt1, Arhgap10, Sorbsl, Slc12a2, Kcnabl, Sorbs2, Mtl, Lpp.

13 mt-Col, mt-Co3, mt-Co2, mt-Cytb, mt-Ndl, mt-Nd4l, mt-Atpб, mt-Nd5, mt-AtpS, mt-Nd2, Gm4241S, mt-Nd4, Lars2, Gphn, Gm2бЯ17, Cmssl, AY03611S, Peakl, Gm1ЯЯ51, Jarid2, Krt14, Zc3h7a, Gm1007б.

14 Tecpr2, Gm102б0, RpllS, Lgals7, Rps20, GmЯ750, Rps5, Elovl3, Gm15013, Rps23, Rpl14, RplS, Uba52, Rpl1Я, Rpl13, Acadl, Csî6, RpsS, RpsЯ, Rplpl, Wdm, Rps10, Rplll, Rps13, Rpl27a, Rps3a1, Fau, Rplp2, Gm14^4, Ppia, Rp12Я, Rpl37, Fgfbpl, Tptl, Krt10, Atp5g3, Rpl32, Eeflal, Rpl15, Rpl5, Rps2, Rpl31, Rpl30, Rpl13a, H3f3a, Rps27, CoxSa, Mtl, RpllSa, Cd302, Tecr, Rps14, Fthl, Ptma, Fabp5, Apoe, Eifl, Nudcd3, Rpl10, Mif Rpl4, Rpsll, Rps26, ЯЗЗ0111Ш5^К Elovl4, Eif5a, RpsM, Rpl22, HspЯ0ab1, Tmsb4x, Hintl, Mgp, GmЯS44, Olfr275, Ybxl, Chchd10, Psma7, Cox4i1, Slc25a5, Cox5a, VampS, H2afz, Ctla4, Prdx5, Rpl2S, Rpl7a, Atp5b, Rpl34, Ssr4, Heph, S100a14, CdЯ, Chchd2, Atp5g1, Rps24, Gng5, S100a11, Rps2S, Map7, Atp5l, H3f3b, AM6, Slc25a3, Atp5j, Timm13, Btf3, Rps17, RpW, Rps21, Taldol, Ndufaб, Nme2, Gpx4, Fam25c, Hercб, Histlhle, Dynlll, Bsg, Rps2Я, Pfdn5, Cycl, S100aб, Gabarap, Pfnl, Cox6Ь1, Atpllc, S100a1б, Eißf Rpl35, Eif4a1, Hnrnpab, Cnbp, Psmbl, Atp5a1, Ppib, Gpxl, Oazl, MyW.

15 Fa2h, ElovW, Scdl, Dhcr24, Elovl3, Mgll, Soatl, Cers4, Secisbp2l, Hacd2, Fasn, Far2, Tecr, Cyp51, Acoxl, Sdr1бcб, Hsd17b12, Krt7Я, Msmol, Slc27a4, Hmgcsl, Fabp5, Mel, Acly, Mgstl, AM6, Acsl4, Acss2, AC14Я0Я0.1, Pankl, Crat, Lpcat3, Acacb, Hsd17b7, Cidea, Slc25a1, Acsl5, Pparg, Elovl5, Hmgcr, Cyb5b, Rbm47, Idil, Tmem10Я, Cyb5r3, Adipor2, Rarresl, Plin2, Pex3, Lss, Ar, Gm553S, Gk5, Atp5g3, Fdftl, Clmp, Cs, Acsbgl, Rdhll, Canx, Abhd5, Nrg4, Acerl, Gpam, Tmbimб, Zfp3S5b, Cdsl, Fdps, Hadh, Endodl, Cpeb2, Atl3, Cat, Sqle, Efr3a, Cebpb, Acat2, Psap, Dhrs7, Midlipl, Tmem15Я, ^Зб, Fam57b, Paqr7, Tmem5б, Acaa2, Taldol, Echdcl, Efnb2, S100a14, Cisdl, Gpx4, Adtrp, Apmap, Mdhl, Psapll, Hibadh, Mpc2, Abcd3, Aldoa, Prxl2a, Atp5b, Scp2, Bcap31, Pgrmcl, Pnpla3, Hspdl, Ermpl, Sdr^c5, Slc25a5, Glrx5, Nrp2, Rtn3, CoxSa, Nampt, Emb, Pxmp4, Tkt, Hacll, Pex1б, Cox4i1, Acaca, Hacd3, Tmcc3, Acol, Psph, Erg2S, C13007ЯG13Rik, Cesld, Hadha, Oxctl, Pmvk, Lhpp, TmemSбa, Scd3, Aacs, Ldlr, Egr3, H2afj, PexW, Pgd, Psme2, Pcx, Lpl, Acaala, Ak3, Chchd10, Sccpdh, Insigl, Alad, Vdacl, Acadm, Clintl, Mvd, AcadЯ, PnplaS, Acotl, Tlcd2, Apocl, Ctsd, Mpcl, Sgppl, AkrlclS, Ldah, Pgrmc2, Rmdn3, Tmem22Яa, Echsl, Fitm2,

Mc5r, Acot6, Lyst, Pdha1, Atp5d, Cyc1, Srebf2, Ubqln1, Ccdc47, Uqcrq, Scd4, Aadacl3, Dgat1, Decr1, Tbc1d20, Lpin1, Rdh12, Bscl2, Entpd5, Vmp1, Emc9, Acot4, Gm8298, Eci2, Ppara, Cebpa, Slc39a11, C2cd2, Ech1, Gk, Etfb, Idh1, Gm13219, Tmem97, Sdr42e1, Cyp2b19, Tlcd1, Atp5e, Acox1, Tex261, Alas1, Por, Pex5, Cdr2, Glrx, Dusp4, Psat1, Tomm40, Slc25a20, Arl6ip1, Dhrs3, Tfrc, Mospd1, Slc25a39, Gm16168, Bcat2, Cox7b, Awat1, Mocs2, Uqcr11, Clstn3, Bbof1, Aadac, Atp5o, Abhd4, Agpat1, Samm50, Hsdl2, Ldhb, Ndufb9, Ndufs7, Nadk, Atp5a1, Tmem135, S100a16, Stimate, G6pdx, Cox6a1, Apoe, Hsd17b4, Mdh2, Chchd2, Pygb, Hipk2, Cyb5a, Casz1, Fkbp5, Cox6c, Rab1b, Hlcs, Gja1, Lman2, Cox5b, Tmem14c, Mlf2, Hspa9, Aldoart1, Anxa5, Psma5, Cox6b1, Tmem164, Prdx1, Acsf2, Map1lc3a, Pex14, Auts2, Mettl9, Psmb2, Hspa4l, Cox5a, Tfap2a, Dgki, Grhl1, Prlr, Reep5, Atp5g2, Lrmda, Naaladl2, Atp5c1, Atpif1, Lama4, Ptprk, Fgfbp1, Tpi1, Dapk1, Srebf1, Rpl36, Prdx5, Psma7, Pcca, Vamp8, Pdss1, Aox4, Chchd3, Psme1, Eif5a, Prkar2a, Tanc2, mt-Nd4l, Rps19, Emp2, Ecpas, Elovl7, Arhgap24, mt-Cytb, Mtch2, Gdpd2, Nfia, mt-Nd2, Ubxn4, Thrb, Slc25a3, RplpO, mt-Nd4, mt-Nd5, Ppia, Jazf1, Gm10076, Tmed2, Ly6g6c, mt-Atp8, 1810037I17Rik, Bzw1, Sptssa, Rreb1, Sntb1, Rpl10a, Tenm4, Arid1b, Dag1, mt-Co1, mt-Co2, mt-Nd1, Nfib, Bsg, Prkn, Hnrnpab, Abca1, Sdc1, Sbsn, mt-Co3, Agpat3, Diaph2, AY036118, Elovl4, Olfm3.

1б Lor, Flg2, Spink5, Sbsn, Abca12, Dmkn, Tmprss11f March3, Hrnr, Gan, Eps8l1, Hal, Cyp2b19, Lypd5, Ano9, Atp6v1c2, Asprv1, Krt23, Serpinb7, Abca5, Ypel2, Elmod1, Krt77, Dsc1, Cdsn, C2cd2, Klk7, Slc22a23, Cpm, Agpat4, Plekhn1, Cgn, 2310050C09Rik, Grhl3, Card14, F3, Nccrp1, Gm94, Slc6a14, Lipm, Tuft1, Kprp, Crct1, Egr3, Skint11, Tead4, Nectin4, Sdr9c7, Serpina12, Vgll3, Abhd12b, Adgrf2, Arhgef37, Il1f5, Lipk, Adh6a, Anxa9, Tgm1, Atp10b, Gpld1, Rps6ka6, Pla2g2f Slc28a3, Cpa4, Hephl1, Cers3, Rnf227, Mpzl3, Arhgap40, Cnfn, Aloxe3, Nipal4, Cldn4, Fhdc1, Slc15a1, Klk5, Serpinb13, Ces2f AA986860, Slc46a2, Gsdma, Gprin2, Sigirr, BC016579, 2310046K23Rik, Acp7, Susd2, Bglap3, Atg9b, Il1f9, Phf24, Liph, Srpk1, Srcin1, Rab11fip1, Mboat2, Pof1b, Pcsk6, Krt80, Map2, Nrtn, Tprg, Nupr1, Krtdap, Myzap, Rnf39, Myo5b, Ano8, Ppl, Csta1, Cobl, Lrrc28, Psapl1, Eppk1, Ugcg, Bpifc, Ide, Asah2, Pdzk1ip1, Serpinb8, Casz1, Ggct, Tacstd2, Homer2, Pnpla3, Itprid2, Bicdl1, Cpeb2, Grhl1, Agpat5, Adgrf4, Laptm4b, Capn15, Ptgs1, Mxi1, Daam1, Fam3b, Skint10, Rab27b, Faah, Krt24, Abtb2, Plxdc2, Il18, Desi1, Shroom3, Nectin3, Klf3, Calm4, Sphk1, Arhgef5, Cyp4f39, Il22ra1, Tead3, Acpp, Dusp16, Osbpl1a, St14, Ehf, Ly6g6c, Acap2, Ank, Usp6nl, Ubtd1, Esrp1, Kifc3, Srgap2,

Rhbdl2, Acsbgl, Prkch, Sh3gl2, Fam234a, Errfil, Plekhgl, Prdml, 5430427M07Rik, Slc11a2, Epcam, Nlrc5, Lypdбb, Lipn, Exph5, Blmh, Adipor2, Mical2, Pcdhl, Fam12Яb, Arhgef10l, Rabgefl, Gltp, Pak3, Trim2, Chitl, Neatl, Ctnnbipl, Slc5a1, Я53005Я014Rik, Afap1l2, Teadl, Grk2, Lcelm, Tec, Zfandб, Mfsd14b, Atp13a5, Rassf5, Nhsll, Shb, Sh3bgrl2, Tspan5, Foxo3, Susdб, Dgat2, Acsll, Hopx, Notch2, ElovW, Elovl4, Esyt3, Rgs20, Sorbsl, Cdsl, Pacsin2, Ralgapa2, Kazn, ZdhhcЯ, Fam135a, Il34, Hspbl, Sgppl, Sgmsl, RabSb, Gramd3, Skint5, Arl5b, Hook3, Arhgap10, Ifrdl, RanbpЯ, Tgfa, Cmssl, Mtssl, Illrap, Ankrd35, Fmnl, Ube2e2, Plekha5, Lyst, Elovll, Clipl, March7, Mpp7, Rai14, Ybx3, Usp54, Afdn, Cdc14b, Fam25c, T^b, Crybgl, Clip4, Usp32, Ppp1r13b, Mreg, Mapk14, Gm2M4, Ncoal, Pon2, Ubash3b, Blnk, Rora, Sntbl, Lgalsl, Cythl, Cxadr, Cpeb4, Tex2б4, Pstpip2, Glccil, Cldnl, Myoб, HspbS, Il15, Scel, Ccserl, Mindy3, ZfyveЯ, Spns2, Ncoa2, AtpSal, Ubac2, Jup, Krt10, Ppfibp2, Gareml, Zranbl, Ddi2, Lmo7, Abhd17c, Strn, Clcn3, Dsgla, Kif13b, Cptlb, Amotll, Tmem45a, Tjp2, Fry, Nrdl, Fnbpl, Snx13, DockЯ, Klf4, Arhgap12, Pdzd2, Nek7, Slc45a4, Rmnd5a, Il20rb, Nebl, Kiflc, Mprip, Srgapl, Map2k4, Iffo2, Dsp, Zfand3, Slco3a1, Wdr2б, Cyth3, Lars2, Gas7, Arhgap23, Gng12, Pou2f3, Sh3rf2, Cdhl, Elovl7, Ctsa, Malatl, Kctd12, Wdfy3, Baiap2, Phlppl, Krt2, Dapll, Sipalll, Ppfibpl, Nipal2, Mycbp2, Tmccl, Ammecrl, Smap2, Jarid2, Clec2g, Gm1ЯЯ51, Pepd, Tsc22d2, Skintб, Huwel, Ankrd44, Acaca, Rafl, Rnfll, Flg, Perp, Cttnbp2, Kif21a, Ube2r2, Nfat5, Akap13, Rapgef5, Fam214a, Npepps, Retregl, Micul, Efna5, Itpr3, Chll, Cpe, Megß, Macfl, Dabl, Mcc, Robol, Hectdl, Piezol, Ahnak, Snx2Я, Tancl, Cstб, Crispld2, Dlg2, Frmpdl, Ankrd13c, Adgrl2, Rbbpб, Btbd3, Ube2h, Btc, Ctsl, Lrchl.

17 Rgs5, Esam, Acta2, Ptprb, Nr2f2, Des, Sox17, Gucylal, Cldn5, Adgrl4, Adgrf5, Myhll, Cdh5, Carmn, Egfl7, Mcam, Itga7, Rasa4, Epasl, AbccЯ, Ldb2, Cxcl12, Slprl, Mef2c, Pecaml, Hegl, Tagln, Sema7a, Tinagll, Ebfl, Lyбc1, Gm13SSЯ, Rbpms, Gja4, Tek, Podxl, Notch3, Plxndl, Mylk, She, Nos3, Sema3g, Jam2, SlcЯa3r2, Shank3, Fltl, Abliml, C130074G1ЯRik, Sparcll, Tpml, Ebf2, Ebf3, Pdgfrb, Zeb2, Synpo2, Pde3a, Cyyrl, Elk3, Tm4sf1, Myolb, Cavl, Kdr, Kitl, MyW, Abcg2, Plcb4, Caldl, Rcan2, Cacnalc, Tspan13, Eng, Mrvil, Sncaip, Fgd5, Entpdl, PcdhW, Ptp4a3, Tspan7, Prex2, Pakap.l, Fabp4, Flil, Arhgapб, Mecom, Igfbp7, Ptprm, Pik3r3, Chn2, Etsl, Col4a1, Erg, 4Я3140бP1бRik, B130024G1ЯRik, Grk5, Arhgap31, Ptprg, Itprl, Plvap, Rasgrf2, Tshz2, Ppplr^b, Cripl, Sox13, AdamtsЯ, Scarbl, Zebl, Prkgl, Iigpl, Akt3, Я53002бP05Rik, Gucy1a2, Lin7a, Pde5a, Vwf, Nrpl, Pdela, Snrk, Mctpl, Tcf4, Rhoj,

ЛрЬЬ2, Ргкек, Со14а2, Са1сг1, Шгп, Ооек4, Msrb3, 1/р366, К1/2, Cdh13, HspЬ1, Рйга5, Лrhgap29, \tga1, 8вша6а, И2-01, Ehd4, Еаш13с, Тгрсб, ИркЬ, ЕкЬр1а, Р\с\1, Plekhg1, Rgs6, Pdgfd, К1/7, Jag1, Ьтр1, Ооск9, Есе1, СИс4, Т]р1, Rftn1, В1с1, St6galnac3, СаУ1п1, Ркр4, Tsc22d1, Cd36, SorЬs2, Со118а1, Со115а1, СаспЬ2, Ут, Nhsl2, Мупр, МН;[Ь, Мрпр, ЬЛр4, Тт1, Ракар, Ьггс8с, Dysf, Ьатс1, MorrЬid, Cacna2d1, 1^.2, Е1то1, ОаЬ2, Sema6d, Тс/711, Лrhgap26, Samd12, Mast4, М3, Ыгг/ф! Та^1, Slc8a1, Лпо1, Р1хпа4, ЛЬса1, ЛУс1, Оппа3, N^1, Опад, Е^о2, Ету, Thsd7a, Лдр1, Dach1, Ыр, РНрпс1, Лrhgef3, Лdamts1, Sept7, Ptk2, ¥уп, Csmd1, Vegfc, 1прр4Ь, ZЬtЬ20, ЛсШ4, Ттр2, \l6st, N3с2, TmsЬ4x, 2р521, Лг115, Dmd, Zfp36l1, И2-0>10, Мар4к3, Maml2, DgkЬ, Slc12a2, Dnm3, ¥гу1, Magi1, Stox2, ЛсЛ, КспаЬ1,1Ш2Ь, 1§/Ьр3.

Таблица 2. Гены, определяющие принадлежность клеточного типа (ампутация ушной раковины).

Номер кластера Гены

1 РЬар, Pecam1, ЛЬса1, ЛЬ1ш1, ЕаЬр4, Сууг1, LdЬ2, Лdgrl4, Лdgrf5, Emcn, Cd36, ГЫ1, PtprЬ, СХС112, Ptprm, Р1СЬ4, ScarЬ1, Rasa4, Mctp1, Р1СЬ1, Лdamts9, Ptprg, Cdh13, ЕЬА, Epas1, Dach1, Sele, Cmah, Tshz2, Р^х2, Egfl7, ЛЬcg2, РVwf, Tspan7, ПИ, Tafa2, Eng, Dock9, Jam2, ЫГ, Лrhgap31, Dnm3, SptЬn1, Ly6e, Mecom, С130074в19Пк, Ehd4, EЬf3, Ркр4, ТасН, Лдр1, Rasgrf2, Ccser1, Cdh5, Tm4sf1, Ccdc85a, Heg1, СоИ5а1, Сау1, Podxl, Lifr, Shank3, КШ, ЬркЬ, Myh9, Tspan13, Tek, Elk3, Саут2, MrttfЬ, Meox2, ЛЬ1Ш3, Selp, ^п2, Magi1, She, Garre1, Sparcl1, Cd34, Mef2c, РЫ^1, Tspan12, КЩ, Rgl1, Depp1, Cd93, ОрШЬр1, Саут1, ^31рг1, Ramp2, Лrhgap29, ЛрЬЬ2, Ets1, Gda, B2m, ^сс3, СаЬН, Т]р1, Sncaip, Щ27, Лfap1l1, N^1, Dock4, СоМа1, RЬpms, Ece1, РШ2, 1Ш2Ь, Rapgef5, Tnfsf10, Лrhgef3, Esam, Myrip, ОппаП, Dipk2Ь, Щш1, Entpd1, Fgd5, Mgll, Fam171a1, Лг115, , ЫЛр4, Ets2, Mast4, ТИ1, ИрЬ1, СШп5, Pde2a, Pcmtd1, Rasgrp3, IgfЬp7, Slco2Ь1, Erg, Sema6a, Snrk, Pdia5, Slc9a3r2, Лта3, Тс/4, ррр1г2, TmsЬ10, СИс4, Ыггс8с, Ирг1, Pcdh17, СоМа2, Рпр, Elmo1, SorЬs2, Rasal2, Vim, Tmod3, Sox17, Mmrn2, СаМ1, Pdlim1, Mest, Il6st, Stox2, ThЬd, FkЬp1a, Sema7a, Samd5, Pik3r3, Ecscr, Selenop, Rapge/4, FЬxl7, Smad1, Wwtr1, Etl4, RoЬo4, Ralgapa1, Myzap, Dys/, Mcf2l, Ррр3са, Лrhgap26, Тапс1, Ыс85Ь, Ррр2^а, Tpm4, М^1, ZeЬ1, Сг11, Nos3, Swap70, CryЬg3, Galnt15, Zfp423, Ыу6с1, Jcad, Tgtp1, Р1рр1, Оггр1, И^р1,

Klhl32, Ptk2, Fcho2, Atp8b1, H2-T3, Lmbrl, Ical, Atpllc, Tmsb4x, Fam13c, Gnai2, Syne2, Rasipl, Palmd, Plxndl, Sh3bp5, Pitpncl, Ushbpl, Coll8al, Samdl2, Timp4, Cd300lg, Grm8, Rhob, Csf2rb, Id3, Adgrgl, Sdcbp, Magi3, Rapgef2, Fbln2, Klf7, Icam2, Hrhl, Jam3, Adcy4, Arap3, Hifla, Lepr, Dgkh, Afdn, St6galnac3, Clecl4a, Pdgfd, Hoxd3, Ednrb, Luzpl, Exoc6, Plxna2, Ralb, 2900026A02Rik, Lrrfipl, Tnfrsf26, Msn, Rgs3, Ldlrad4, Thsdl, Pde8a, Apoldl, Gnas, Fryl, Ace, Acer2, Cdkl7, Parpl4, Hspa8, Arpclb, Clic5, Fzd6, Myctl, Flnb, Csgalnactl, Npdcl, Zfp366, Sh2d3c, Plau, Eepdl, Hipl, Casp8, Tnfrsfl0b, Soxl8, Txnip, Gimap5, Crip2, Pakap, Ifngrl, Thsd7a, Ddit4, Rbp7, H2-T-ps, Bcr, H2-T24, Rftnl, Epb4l, Tiel, Clqtnf9, Tsc22dl, Secl4ll, Plxna4, Sptlc2, Lpar6, Slcl2a7, Parvb, Cep85l, Cav2, Pxdn, Criml, Gngll, B4galt6, Pik3c2b, Navl, Gasklb, Socs3, Ehd2, Utrn, Fxyd5, Duspl, Sgkl, Selll3, Wdfy3, Ramp3, Gnaq, Lrrc32, Soxl3, Hspg2, Dock6, Foxol, Pltp, Yesl, Myolb, Hdac7, Arhgefl5, Gchl, Ppplrl6b, Cnn3, Ill5, St8sia4, Tspan9, Ybxl, Fnbpll, Peakl, Gbp4, Chp2, Ttc7b, Fmnl3, Btg2, Hoxd8, Aplnr, Slc39al0, Slfn2, Sema3g, Sox7, Nr5a2, Emll, Dennd5b, Cttnbp2nl, Tspan2, Dab2ip, Faml89al, Timp2, Psmb8, Dll4, Slfn5, Wipf3, Hspal2b, Ppplrl3b, Gpr4, Idl, Nedd9, Adamtsl, Adaml5, Bnip2, Gpcpdl, Akap6, Actnl, Fry, Nprl, Actb, Klf6, Bcl6b, St3gal6, Bmx, B3gnt2, Diaph2, Filipl, Dockl, Trim25, Tpm3, Lamcl, Serinc3, H3f3a, Bst2, Wasf2, Fzd4, Pdgfb, Arhgapl8, Ifitm3, Lbp, Cmip, Ccnyll, Rail4, Ahr, N4bpl, Samd9l, Wscdl, Nhsl2, Lhfpl2, Rubcn, Hecw2, Mpzll, Phldb2, Gadd45g, Vwa5a, Plcgl, Shroom4, Kank3, Cndpl, Gnbl, Nptn, Osbpl3, Myol0, Actgl, Jun, Synel, Igfbp3, 9530026P05Rik, H2-Dl

2 Abi3bp, Ccn2, Angptl7, Igfbp5, Thbsl, Biccl, Dcn, Itgbll, Adamtsl3, Chad, Mgp, Mfap4, Ogn, Zfhx4, Setbpl, Comp, Chill, Sparc, Colecl2, Crispldl, Col8al, Fmod, Colla2, Timp3, Bnc2, Thbs4, Bgn, Col5a2, Fndcl, Collal, Fap, Mecom, Clu, Zfhx3, Gsn, Kcnmal, Colllal, Prelp, Dab2, Plxdc2, Pam, Fnl, Sox5, Zfp52l, Boc, Zbtb20, Prkdl, Myold, Wifl, Gpm6b, Scara3, Cdon, Bmp5, Gulpl, Igfl, Plcel, Klfl2, Klhl29, Cytll, Lrpl, Coll2al, Pdzrn3, Lrp6, Galntl5, Col3al, Crispld2, Pdzrn4, Trabd2b, Timp2, Myoc, Sema3e, Smoc2, Erg, Fgfrl, Fat4, Rin2, Meisl, Fbnl, Edil3, Adamts6, Aspn, Lhfp, Smocl, Glis3, Ank2, Fstll, Pkdl, Tgfbr3, Dkk3, Snedl, Fchsd2, Samd4, Mmp2, Rbms3, Pcsk5, Sod3, Clec3a, Col6a3, Unc5c, Sobp, Pcdh9, Itga9, Dipk2a, Cemip, Ptgis, Ppplrlb, Rgs7bp, Col8a2, Fndc3b, Pdgfd, Tgfb3, Ghr, Ldlrad4, Flrt2, Cst3, Hivep2, Cpxm2, Trf, Bmper, Tenm3, Aebpl, Col5al, Ehbpl, Lmcdl, Enppl, Ccdc80, Apod, Lrba, Lox, Cpedl, Mxra8, Meis2, Thrb, Ccnl, Gas6, Raphl, Parp8, Ecm2, Cdkl4, Ccdc88a,

Nfix, Prrxl, Gem, Cilp2, Sox6, Arhgap21, Col6a2, Serpingl, Prdm16, Adamtsll, Prkca, Adamts3, Ralyl, Synel, Cnmd, Rora, Ltbp4, Sema3c, Mtusl, Ltbp3, Cpq, Dpysl3, Nrep, Col6a1, Serpinfl, Ecrg4, Grial, Pcolce, Cdknlc, Pcolce2, Aopep, Slc40al, Prkgl, Mrc2, Tns3, Reck, Ucma, Plpp3, Hrctl, Trpsl, Plod2, Dynclil, Wwp2, Sdc2, Ptprd, Aff3, AtplOa, Cdc42ep3, Sesn3, Sashl, Rtl4, Gpc6, Lspl, Gfpt2, Lparl, Daam2, Carmill, Fbn2, Haplnl, Penk, Creb3l2, Pde3b, Sgcd, Nox4, Pappa2, MirlOOhg, Ptn, Vcan, Mfge8, Wipfl, Pkd2, Gdf5, Synpo, Sdk2, Gasl, Bhlhe40, Coll6al, Maged2, Neol, Lum, Mme, Nrk, Syn3, Ust, Slc29al, Dock8, Fibin, Gml7l67, Tsc22d3, Cpne8, Pde4d, Cp, Prg4, Msmp, Postn.

3 Col8al, Gpc6, Eln, Acan, Wifl, Unc5c, Cytll, Col2al, Glis3, Sparc, Xyltl, Pcdh9, Kcnmal, Zfp385b, Wwp2, Pdzrn4, Col27al, Sox5, Colllal, Bgn, l52040lA03Rik, Adamtsl2, zfhx4, Gsn, Sdk2, Slc9a9, Smoc2, Prdml6, Ctnna2, Samd4, Ldlrad3, Edil3, Corin, Col9a3, Trabd2b, Boc, Bmper, Zbtb20, Npas3, Col9al, Klfl2, Sox6, Bmp5, Snedl, Collla2, Ralyl, Raphl, Iqsecl, Ccdc80, Lefl, Cnmd, Cst3, Ppplrlb, Meltf, Haplnl, Cemip, Mfge8, Zfpm2, Colecl2, Stk32b, Loxl4, Plcbl, Pde4dip, Thrb, Abtb2, Tenm3, Trf Adamtsl3, Dock8, Msmp, Setbpl, Fap, Chad, Sobp, Mecom, Lmcdl, Lox, Pdzrn3, Abi3bp, Scara3, Pam, Crispldl, Susd5, Sdc4, Lsamp, Fmod, Cpe, Comp, Fzd9, Prkca, Myold, Rabllfip4, Fndc3b, Fafl, Fgf2, Map2, Baiap2ll, Farpl, Msi2, Dipk2a, Ccdc88a, Nrep, Luzp2, Serpine2, Faml07a, Stardl3, Lrpl, Etv5, Chstll, Adamtsl4, Fchsd2, Scdl, Gfpt2, Fgfr3, Ghr, Trpm3, Gmds, Fbn2, Prkdl, Bnc2, Anol, Neol, Cspg4, Zfp52l, Prg4, Pparg, Sox9, Meisl, Clu, Tspanl8, Gml6070, Ank2, Rora, Mmpl6, Parp8, Fgfrl, Col9a2, Plod2, Tiam2, Clec3a, Prrxl, Snorc, Pitpncl, Pdgfc, Maml2, 26l 0035Dl 7Rik, Lhfp, Fbxl7, Aakl, Fbnl, Dkk3, D630045Jl2Rik, Ctdspl, Col6a2, Airn, Bcl2, Slcl2a2, Wsbl, Sema3e, Shroom4, Sl00b, Enppl, Trpsl, Grid2, Rin2, Reck, Pcolce2, Prkgl, Scin, Plcel, Zfhx3, Fnl, Scubel, Faml29a, Psd3, Pde3b, Carmill, Creb3l2, Grbl4, Meg3, Slc8a3, Meis2, Papss2, Hdac9, Cdol, Denndla, Ecm2, Mtusl, B3galtl, Gm49575, Crlf3, Klhl29, Sod3, Sashl, C4b, Nfia, Adk, Lrba, Zfp385c, Cpne8, Dgat2, Penk, Epha3, Itgal0, Nfat5, Serinc5, Tcf7l2, Trpv4, Col6al, Nrk, Fut8, Tox, Ccn2, Aff2, Prdm5, Ill6, Hmgclll, Glisl, Cpedl, Ankrd28, Slc38a2, Atp6v0a4, Atpl0a, Nebl, Col6a3, St3gal6, Frmd4b, Aopep, G0s2, Cab39l, Lrp6, Csrpl, Creb5, Stk26, Epyc, Cdon, Timp3, Matn3, Nr3c2, Ecrg4, Eps8, Mrc2, Npr2, Synpo, Sesn3, Rftn2, Slcla2, Ank, Sorbs2, Zmizl, Clcn4, Gm4788, Nfib, Pcsk6, 4933406Il8Rik, Famll4al, Hs3st3al, Maged2, Dap, Phldal, Dnml, Usp53, Galntl5, Grebll, Dynclil, Golph3, Nfatc2, Grbl0, Csgalnactl,

Dixdcl, Sipalll, Clmn, Tbx15, Atxnl, Tlel, Col5a2, Efr3b, Nfix, Sik2, Rflna, Prkn, Cacnale, Kcnqlotl, Tns3, Coblll, Bmprlb, Irsl, Akt3, Auts2, Tgfbr3, Thbsl, Xist, Cwc22, Malatl

4 Krt14, Krt5, Col17a1, Fcgbp, TnfrsfW, ^p63, Gripl, Dsp, Lama3, Slc24a3, Fgfr2, Dsc3, Dst, Sema3d, Itgaб, Sox6, Lrp4, Ptpn13, Pkpl, Krt15, RbbpS, Clca3a2, Mef2a, Itgb4, Thyl, Iffo2, Bclllb, Klf5, Tmem45a, Sfn, Serpinb2, Tenm4, Maml3, Thsd4, Perp, Sh3rf2, S^6, Ppp1r14c, Btbdll, Col4aó, Ahcyl2, Pou2f3, Kif21a, Tspear, Frmd4b, 1700025G04Rik, Crybgl, Il20ra, Ccnd2, Tns4, Serpinb7, Hlf Map7, Robol, Gm15ЯS7, Nxn, Wls, Cdh13, Anxa2, P3h2, Ago4, Slco3a1, Esrpl, Znrf3, Maf, Lyбd, Il1rl2, Lypdбb, Syne2, Igfbp3, Dsg3, Fat2, Jag2, Tiaml, Gnail, Rorl, Pard3, Nipal2, AnxaS, Mcc, Il20rb, Itga2, Celsrl, Gata3, Ssbp2, Sema3c, ЫЬ167, Ndfip2, Spred2, Itpr2, Antxrl, Slc22a4, Stox2, Tenm2, Ptpn14, Netl, Chll, Tgfbi, Atp1b3, Col7a1, Abcc5, Lamb3, Sh3dW, Wnt4, Slc3Sa2, Dennd2c, Pou3f1, Lamc2, Cxadr, Poflb, Grhl2, Egfr, Pik3c2g, Rbfoxl, Cdhl, Лбт, Cdcpl, 2610035D17Rík, Mapkbpl, Rapgefll, FamS3b, Cd10Я, Efna5, Rad51b, Wnt3, Ezr, Ikzf2, Pla2g4a, Map3k1, Itga3, Ahnak2, Diaph3, Ppp2r3a, Magil, Trim2Я, Col23a1, Adhбb, Aqp3, Sult5a1, Fgfr3, Exph5, Dsgla, Arhgef4, Kif13a, Jup, Cdh3, Map3k20, Nfix, Plec, Lrchl, Rnf43, Aff

5 Krt15, Tenm2, Adgrl3, Scel, Moxdl, Adgrl2, Krt17, Enoxl, Lgr5, Slcбaб, Aldh3a1, ^p63, Col17a1, Dsp, Naaladl2, Adgra3, Robo2, Ptprk, Barx2, Egfr, Lrigl, Krt5, Adamtsll, Sema3e, Pik3c2g, Nebl, Lgr4, Mitf Perp, Tfap2b, Dsg3, Kankl, Lgг6, Fst, Nhsll, Gripl, Bcllla, Efnb2, Afdn, AnxaS, Alcam, Mcc, Foxpl, Caszl, Sostdcl, Tenm4, Adh7, Tafal, Gnbll, Gli2, Trim2Я, Dsc3, Nfib, Cldnl, Dst, Hr, Poflb, ItgbS, Cachdl, Tns4, Netl, Sema5a, Adamts17, Efna5, Samd5, Magil, GalntlS, Cadml, Map3k20, Vdr, Cdhl, Clip4, Ctnnd2, Rapgef5, Pawr, Ccdc3, Tmem45a, Epb41l4b, Pcdh7, Ptprf, Etl4, Pdzd2, Ppp1r14c, Nxn, Crybgl, Postn, Aopep, Prickle2, App, GmЯ73, Golim4, Bach2, Bcam, Cablesl, Ssbp2, Car12, Il31ra, Esrpl, Tfap2a, Grhl2, Tiaml, Fzd7, Serpinb5, Map7, Iffo2, Cpaб, Fnbpll, SoxЯ, Maml3, Ankslb, Pkpl, Ptpn14, Hopx, Map3k1, Btbdll, Sh3rf1, Col4aб, Frem2, Syne2, Lhx2, Acpp, RbbpS, Epcam, Runxl, Criml, Aqp3, Kctdl, Plekha7, Bclllb, Camsap3, Patj, Lamb3, Plch2, Sorcs2, Pard3, Ahnak2, Mfap3l, Cyp4b1, Itga2, Fxyd3, HspbS, Stiml, Cxadr, Gasl, Milll, Cdh3, Tacc2, Kif21a, Rgs12, Ddrl, Hpgd, Ryk, Ptpn13, Dsg2, Itgb4, Fermtl, Prkci, Lypdбb, Arap2, Mir205hg, Zfp3бl2, Macfl, Ranbpl 7.

б Cd74, Dock2, Ptprc, Arhgap15, Stбgalnac3, Skapl, Lcpl, H2-Eb1, Illb, 5S30411N06Rík, Ikzfl, Ankrd44, Srgn, Cd247, AU020206,

Lyzl, Grap2, Elmol, H2-Aa, Atp8b4, Il7r, Dock10, Runxl, Prkcb, Pip4k2a, Apbblip, Cxcl2, Dennd4a, Cd44, Tox, Stk17b, Inpp5d, H2-Ab1, Lyn, Samsnl, Fnbpl, Ripor2, Arhgap26, Itk, Lcp2, Il23r, Fyb, Ikzf3, Itgae, Znrfl, Faml07b, Ptk2b, Rasgeflb, Cytip, Laptm5, Corola, Runx2, Plek, Etsl, Cd53, Icos, Pagl, Faml29a, Ipcefl, Sorll, Sh3kbpl, Mrcl, Rab8b, Gm26740, Emb, Fam49b, Maltl, Iqgap2, Picalm, Gng2, Atp2bl, Tnfaip3, Rgsl, Ctss, Ill8rl, Arhgap45, Blk, Antxr2, Prexl, Dock8, Cd3e, Diaphl, Camk4, Cd3g, Pik3apl, Cythl, Pik3cd, Myolf, Adaml9, Runx3, Skap2, Arhgap25, Nlrp3, Ppmlh, Gprl4l, Rftnl, Cd226, Arnt2, Rnfl49, Themis, St8sia4, Ptpn22, Ccnd3, Ssh2, Akapl3, Plcl2, Rapgef6, Cmip, Jaml, Denndlb, Tnfaip8, Fmnll, Cxcr6, Ccdc88c, Ppplrl6b, Tnfrsflb, Rcsdl, Tnik, Stk4, Mbnll, Ubash3b, Csf3r, Samhdl, Birc3, Mirl42hg, Pde4b, Ccr2, Arhgap30, Jakl, Raplb, StklO, Actr3, Tnf Lspl, Fcerlg, Itga4, Map3k5, Csflr, Ltb, Adaml2, Cd244a, Pik3r5, Rasgrpl, Flil, Fyn, Cyfip2, Prkcq, Celf2, Il2ra, Slc37a3, Cardll, Arhgdib, Cd82, Dock5, Spl00.

7 och, Postn, Collal, Lama2, Cntnl, Slit3, Ccbel, Robo2, Colla2, Srpx, Nav3, Col3al, Dkk2, Abca9, Slit2, Enpp2, Tbxl5, Runxltl, Prrl6, Svepl, Meis2, Cdhll, Trpsl, Aebpl, Sema3a, Dcn, Apod, Igsfl0, Col6a3, Zeb2, Pbxl, Olfml3, Negrl, Apcddl, Frmpd4, Tmeml32c, Abca8a, Adcy2, Pard3b, Rbms3, Lvrn, Hpse2, Cachdl, Ptprd, Igfbp4, Celf2, Vcan, Tcf4, Sponl, Gli3, Aspn, Cpedl, Isml, Freml, Col5al, Nlgnl, Pidl, Lrmda, Hmcnl, Robol, Serpinfl, Twist2, Pdgfra, Pde7b, Magi2, Igfl, Gldn, Cyp26bl, Vegfc, Chrm2, Meisl, Tshz3, Fgfrl, Abca8b, Plpp3, Svil, Nbea, Prrxl, Ddr2, Adamts2, Naaladl2, Faml02b, Cpxm2, Meox2, Col6a2, Col6al, Antxrl, Foxp2, Col23al, Mmp2, Timp2, Tgfbr3, Slc27a6, Cacna2dl, Nhs, Adgrl3, Rspo3, Cdh4, Nrpl, Zbtb20, Aff3, Rorl, Crabpl, Pcolce, Dpyd, Lrpl, Phldb2, Cpq, Synel, Ntnl, Gpm6a, Ltbpl, Col5a2, Pcsk5, Fgf7, Dchs2, Arhgap42, Pricklel, Nrp2, Atrnll, Fbnl, Rora, Clqtnf7, Tnxb, Cd34, Gab2, Daam2, Twistl, Ank2, Ror2, Pdzrn3, Clmp, Nbll, Cyp7bl, Sdc2, Maspl, Pil6, Mmpl4, Dapkl, Itga8, Ncaml, Ndnf, Efempl, Axl, Coll6al, Dclkl, Fmnl2, Pcdh7, Ncam2, Epha7, Cdkl4, Pthlr, Lum, Biccl, Septinll, Cacnalc, Fnl, Lamc3, Cacnalg, Rnase4, Thbs2.

8 rtl0, Krt2, Krtl, Dsp, Abcal2, Dsgla, Pkpl, Perp, Dsc3, Sbsn, Clca3a2, Poflb, Skint5, Slc24a3, Scel, Esrpl, Clip4, Dmkn, Chll, Ptpnl3, Serpinb3b, Slco3al, Sema3d, Dscl, Calm4, Aox4, Grhll, Nipal2, Sptlc3, Dlg2, Sfn, Trp63, Tiaml, Jup, Mpp7, Elovl4, Krtdap, Tmem45a, Pou2f3, Spink5, Fam83b, Cobl, Dsglb, Ikzf2, Lrp4, Map2, Tacc2, Ppl, Il20rb, Plxdc2, Sppl3, Klf3, Lypd6b, Serpinb5, Caszl, Ankrd35, Cdhl, Tprg, Nectinl, Itprid2, Kif2la, Klf5,

Atp10b, Tenm4, GmЯ4, Lrrcl, Gm15ЯS7, Sh3rf2, AnxaS, Gata3, Srgap2, Iffo2, Pard3, Gan, Plekhnl, Pak3, Tmprss4, Skint10, Lyбd, Acsll, Lgals7.

9 ElovW, Hacd2, Cers4, Fgfbpl, Dhcr24, Fa2h, Acbdб, Apoe, Soatl, Arhgap24, Acsbgl, Cyp51, Far2, Hmgcsl, Tecr, Acoxl, Hsd17b12, Secisbp2l, Mgstl, Efnb2, Rbm47, Prlr, Ar, Nrg4, Plin2, Vav3, Egfr, Sdr1бcб, Gsta3, Msmol, Pparg, Clmp, Fasn, Acsl4, Sdr^c5, Lrmda, Slc27a4, Cesld, Acaa2, Nampt, Adgrl2, Nfib, Tkt, Adtrp, Krt7Я, Prxl2a, Mel, Gk5, Auts2, Lpcat3, Hmgcr, Acsl5, Igfbp2, Gjal, Hspdl, Gclc, Ucp2, Pankl, Adhl, Hadha, Cebpb, Idil, Ermpl, Hsd17b7, Sema5a, Tmem135, Oxctl, Slc25a1, Lgг6, Lama4, Car12, Efna5, Gclm, Aldh3a1, Cat, Tfap2a, Cdkб, Apmap, Atp5b, Fdftl, Ptprk, Immp2l, Idhl, AnxaS, Nfia, Slc^al, Mdhl, ^p63, Pabpcl, Tns3.

10 Rgs5, Acta2, AbccЯ, Myhll, Pde3a, Cacnalc, Ctnna3, Dgkb, Tagln, Arhgapб, Tpml, Caldl, Prkgl, Ebfl, Pdgfrb, Zeb2, Notch3, ЩЯ, Synpo2, Igfbp7, Mylk, Myolb, Gucylal, Ednra, Ebf2, Des, Rbpms, Dlcl, FutЯ, Gm13SSЯ, Gucy1a2, Dmd, Mrvil, Stac, Inpp4b, Rgsб, Ctnnd2, Pakap, Rcan2, Anol, Nr2f2, Pde5a, Kalrn, Flna, Ppp1r12a, Plcll, Itga7, Sgipl, Pdela, Kcnabl, Slc7a2, Egflam, EpsS, Adamts12, Mef2c, Pdella, Prrxl, Sparcll, Cacnb2, Stum, Col4a1, Cox4i2, SlcSal, Markl, Mast4, Tpm2, Arhgef17, Cacna2d1, Gucylbl, Angptl, Filipll, Rgs1б, Chsy3, Lingo2, Epasl, Lbh, T^c6, Itgal, Adra2a, Wtip, Sema5a, PcdhW, Serpine2, Septin7, Frmd4a, Tnsl, Vcl, Steap4, Mcam, Calcrl, Mprip, Rbms3, Lpp, Sox5, Ctsc, Col4a2, Pten, Magi2, Mustnl, KcnjS, Dock10, Id4, Rhoj, Arhgap42, Semaбd, Cripl, Tbcldl, Uba2, IWst, Itgbl, Lin7a, Gcnt2, Utrn, Pla2g7, Col4a4, Lhfp, Reml, Map3k20, Ppp1r12b, Carmn, Rgs4, Arhgap10, Rnf150, Aoc3, Fgfl, Pdlim3, Tinagll, Fermt2, Prkacb, Grk5, Rock2, Rockl, Mapre2, Ttll7, Cap2, Adcy3, Rasllla, Arhgef7, Nhsl2, Sorbsl, Gjcl, Sdc2, Jagl, Col5a3.

11 Lgals7, Rps27a, Rps12, RpsM, Krt10, Rplp2, Rplll, Rps26, Rpl32, Rps1Я, Rps20, RpsS, Uba52, Rpl23, Fau, Rps24, Krt2, Rpl37a, Fabp5, RpsЯ, Rps10, Rps23, Tptl, Rps14, Rpl34, Elovl3, Rpl27a, Krt14, Rpl30, Krtdap, Rps13, Rps15a, Rpl13, RpllSa, Rpl12, Rps5, Rps7, Rpl2S, RpslS, Rpl37, Rps3a1, RpW, Rpl14, RpllS, RplW, Rps3, Rplpl, Rp136, Rpl24, Rpl7, Rps27, Rps4x, Rpl15, Rpl13a, Rpsa, Rps25, Rp12Я, Rplp0, Rpl10, Cstб, Rpl41, Rackl, Rps2S, Ppia, Rp126, Rpl10a, Fam25c, Rps6, Rpl31, Cst3, RpW, Eeflal, Rps15, RplS, Rpl17, Rps2, Rpl5, Fgfbpl, Lor, Rpl35, Rps21, Rpl3, Rpl7a, S100a11, Rp13Я, Rpl3S, Rpsll, Rpl4, Krtl, Rpl3бa, S100aб,

Ifitm3, Elovl4, Perp, COX2, Naca, Ifitm2, Krt79, Sbsn, Rpl33a, Krt17, COX1, Tmsb4x, Eef1b2, LOC11S36S312, Rpl22, CoxSa, S100a3, ND4, H3f3a, H3c7, Etv3l, Tmem234a, Lyбgбc, Sdr16c3, Dmkn, Chchd10, Dapl1, Rps17, Erich3, Gm19931, mt-Atpб, Gm2б917, Nme2, Acbd6, Rpl21, Uqcr11, Rps29, Mif Atp3g3, Gsta3, Atp3l, Rpl23a, Cox6c, Gapdh, Cox7c, Mgst1, Cers4, Rpl27, H2az1, mt-Nd4, Tmsb10, Cox3b, S100a14, Jarid2, mt-Nd2.

12 Mpz, Pmp22, Ctnna3, Mbp, Sorcs1, Hcn1, Qk, Reln, Frmd3, Prx, Mlip, Nkain2, Gatm, Limch1, FutS, Mal, Ncmap, Secisbp2l, Col2Sa1, Magi2, Kcna1, Plp1, Gldn, Drp2, Sema3a, Il16, Arhgap24, UgtSa, Dmd, Arhgap19, Sgcd, Rasal2, Ank3, Cnp, Filip1, Smtn, Fmn2, Nek1, ItgbS, Ppp1r9a, Sema6d, Gas2l3, Nr4a2, Stxbp6, Peli2, Rhobtb3, Plekha4, Cldn19, Cryab, Celf2, Utrn, Art3, Shc4, Aatk, Ccser2, Lrrtm4, St6gal1, Scd2, Ptpre, Adamts20, Nfasc, Dag1, Megf9, EgflS, Ndrg1, Emid1, Mpdz, Cd9, Zfp336, Epb41l2, Bcas1, CepS3l, Snca, Lamb1, Ppm1l, Sfrp3, Vim, Cux1, D430041D03Rik, Anfn1, Vat1l, Gm1616S, Col24a1, Pllp, Gfra1, Kank4, Shtn1, Fa2h, Adgrb3, Tmem117, Elmo1, Dusp13, Cdkn1b, Nrcam, Ptprt, Sox10, Gng2, Col3a3, 9330039O14Rik, Fxyd6, Egfem1, Ptpdc1, Plekhb1, Cdh19, Sptbn3, Dlgap1, Hspa12a, Snx16, Mgat3, Pou3f1, Dock10, Sec14l3, Sh3tc2, Sema3b, Nrbp2, Gjc3, Kif1a, Cadm4, Tesk2, Slc9a3, Sdk1, Npr3, A330069K06Rik, Ptgds, Kcna2, Ston1, Dtna, Zeb2, Epha6, Arhgap39, Gm10S63, Xkr4, Fgf1, Cadm3, Mag, Ak3, Rasgef1c, Galnt16, B230206H07Rik, Prss12, Sh3gl3, Rap1gap, Cpeb1, Inka2, 2310014F06Rik, Arnt2, Plaat3, Slc36a2, Galnt17, Mboat2.

13 Csmd1, Cadm2, Scn7a, Cdh19, Grik2, Slc33f1, Frmd4a, Ank3, Adam23, Dmd, Zeb2, Dct, Nkain2, Gas7, Il1rapl1, Xkr4, Pax3, Galnt17, Stard13, Adgrb3, Fam133b, Fign, Gpm6b, AbcaSa, Gfra3, Fstl4, Lgi4, Ptprj, Tanc2, Lrrc4c, Gm1206S, Ntng1, Zfp336, Cdh2, Sgcd, Deptor, Celf2, Iqgap2, Lama2, Sorbs1, Col3a3, Cadm1, Fxyd1, Ntm, Matn2, Tyr, Nrcam, Adgrl3, Plp1, Sox10, Zfp462, Nrn1, L1cam, Rxrg, Qk, Snca, Dlgap1, Rasgef1c, Col2Sa1, AbcaSb, Art3, Lbh, Tnik, Adamts20, Reln, Opcml, Adam11, Gfap, Grik3, Afap1l2, Igsf11, Erbb3, Tyrp1, Gm10S63, Cadm4, Synpr, Trpm1, Fcgr2b, Cnksr2, Pex3l, Gas2l3, Gfra2, Ly6h, Kcna2, Sema3b, Ndnf, Pmel, Npy, EgflS, Kcna1, Gatm, Megf10, Tmod2, Entpd2, Insc, Frmd3, Prima1, Sema4f Hspa12a, Vwa1, Nkd2, Sv2c, Olfm1, Coro2b, Cnp, Slc24a3, Sdc3, Mal, Tenm1, Kcnip3, Gm2113, Disc1, Fxyd7, Shc4, Spata13, Kcnd3, Ptprz1, S1pr3, Tmem117, Slit2, Adgrg6, Ncam1, Fmnl2, Synm, Agap1, Gm4S76, Dock3, Macrod2, Arhgef26, Retreg1, Erbb4, Rarb, Gria4, Tmtc2, Dock3, Tafa3, Ctnna3, Thsd7a, Col16a1, Prex2, Dag1, Nes, Pdlim4, Dpp6,

Pcdhllx, Chll, Olfml2a, Tenm3, Dock7, Luzp2, Gulpl, Crppa, Dclkl, Asap2, 26l0307Pl6Rik, Epb4ll4b, Sntbl, Dst, Pde7b, Rassf4, Itih5, Pmp22.

14 Mmp3, Glis3, Col6a3, Acan, Gfpt2, Slc39al4, Col27al, Medag, Sdk2, Pdpn, Timpl, Haplnl, Chill, Fgf2, Ugdh, Col6a2, Bgn, Fnl, Serpinel, Prg4, Scara3, Sod3, Lrpl, Ccn2, Sdc4, Stk38l, Col6al, Trpm6, Sobp, Dclkl, Uapl, Lox, Phldal, Colecl2, Meltf, Sox5, Synpo, Enppl, Vcan, Ddr2, Cspg4, Fndc3b, Gpc6, Hmga2, Dcn, Creb3l2, Fgfrl, Chstll, Fbnl, Pcdh9, Atpl0a, Sppl, Aebpl, Sparc, Sbno2, Plod2, Colllal, Clu, Xyltl, Cxcll, Kcnmal, Itga5, Abi3bp, Mt2, Collla2, Col3al, Iqsecl, Kcnq5, Loxl4, Tiam2, Pcolce2, Cpe, Wwp2, Ptgs2, Samd4, Runxl, Nt5e, Edil3, Gsn, Pde4dip, Prrxl, Dab2, Zfp385b, Igf2bp2, Clic4, Sod2, Errfil, Raphl, Fap, Prkca, Smad3, Ier3, Ccdc80, Icaml, Adamts5, Cfb, Col5al, Ano6, Osmr, Col2al, Bhlhe40, Rrbpl, Mtl, Pmepal, Navl, Col5a2, Setbpl, Ccdc88a, Ankrd28, Pitpncl, Myold, Ill3ral, Cp, Cpne8, Cemip2, Ptx3, Smoc2, Bnc2, Baiap2ll, Empl, Erg, Fthl, Zebl, Fchsd2, Prelp, Slc4a7, Fmnl2, Ltbpl, Cd44, Snedl, Trpsl, Msn, Rcanl, Trf, Tnc, Hp, Ell2, Hbegf, Hspa5, Cytll, Pcsk5, Eln, Tnfaip6, Ifrdl, Itgav, Dpysl3, l52040lA03Rik.

15 Reln, Sema3a, Mmrnl, Gpm6a, Proxl, Pkhdlll, Tc2n, Chrm3, Flt4, Pgm5, Ntnl, Cldn5, Lyvel, Klhl4, Egfl7, Kdr, D5Ertd6l5e, Lyn, Rasgrf2, Stabl, Wipf3, Susd4, Ablim2, Pdpn, Kank3, Sh3gl3, Paldl, Tbxl, Slc45a3, Apba2, Scn5a, Slcl6al2, Nrxn3, Mfsd4a, Adgrg3, Dtxl, Calnl, Sema6a, Faml89a2, Pecaml, Ldb2, Shank3, Cldnll, Spns2, Lmo2, Afaplll, Palm, Zfpm2, Scnlb, Tiel, Lrgl, Podxl, Ptpre, Dock9, Angpt2, Cdh5, Arhgap29, Elk3, Pard6g, Calcrl, Rasgrp3, Il7, Tnfrsflla, Pde7b, Foxp2, Fgd5, Arap3, Fgl2, Dock4, Ccdcl4l, Plxna4, Apoldl, Elmol, Cyyrl, Tmod2, Itga9, Myzap, Stxbp6, Thsdl, Tmtcl, Abhdl7b, Rgs3, Clic5, Ugcg, Clca3al, Prkch, Nr2f2, Smadl, Klhl3, Adaml2, Lama4, Scn3a, Rhoj, Hs3stl, Agt, Prkag2, Dennd4a, Ptprb, Hmcnl, Tpcnl, Grk5, She, Prkcq, Adgrf5, Stox2, Tek, Cavin2, Ecscr, Tshz2, Zfp52l, Ppfibpl, Spsbl, Fxyd6, Galntl8, Tnfaip8l3, Tgm2, Nectin2, Lypd6, Gab2, Flil, Adm, Akapl2, Rasipl, Limchl, Dock6, Fzd6, Ston2, Prkcz, Magil, Kctdl2, Ppp3ca, Rbpms, Slprl, Dipk2b, Fgd6, Cdhl3, Fgfl2, Emcn, Etsl, Exoc6, Lbp, Sptbnl, Bcr, Fllr, Nxn.

16 Abcc9, Rgs5, Rcan2, Ebf2, Mrvil, Trpc3, Rgs6, Gucylal, Myhll, Ptprb, Gucylbl, Dgkb, Pcdhl9, Stum, Adgrl4, Egfl7, Notch3, Cyyrl, Soxl7, Cap2, Cd93, Rasgrf2, Cavin2, Acta2, Fltl, Rgs4, Pecaml, Fgd5, Gucyla2, Cacnalc, Adgrf5, Esam, Cdh5, Kalrn, Podxl, Pde3a, Slprl, Bmx, Myocd, Myolb, Calcrl, Rbpms, Lmodl,

Des, Epas1, Cldn3, Sema7a, Gja4, Nr2f2, Cxcl12, Sox13, Ly6c1, Kitl, Ctnna3, Ldb2, Heg1, Mylk, Entpd1, Tagln, Trpc6, Gm13SS9, Fut9, Afap1l1, Cd36, Tek, Pdgfrb, Mef2c, Chn2, Ebf3, Myl9, Morrbid, Synpo2, Eng, Mcam, Ebf1, Jam2, Plcb4, Kdr, Cd300lg, Dipk2b, Ablim3, Pakap, Abcg2, Tinagl1, Shank3, Prkg1, Sncaip, Pcp4l1, Arhgap6, Hspa12b, Ednra, Emcn, Pde1a, Tspan7, Sema3g, Tshz2, Ablim1, She, Filip1, Lin7a, Arhgap29, Ramp2, Ptprm, Tm4sf1, Pde3a, Apold1, Fam13c, Dach1, Clec14a, Sgip1, Sparcl1, Stac, Plcl1, Nrp1, Elk3, Anxa3, Zeb2, Pced1b, Mast4, Plxnd1, Adamts9, Rgs3, Snrk, Cacnb2, Tspan13, Cald1, Cdh13, Cbfa2t3, CcdcS3a, Vwf, Chn1, Arhgef17, Slfn3, StardS, Ptprg, Meox2, Slc9a3r2, Dock6, Gnb4, Tbc1d1, LrrcSc, C130074G19Rik, Tspan12, Dysf St6galnac3.