Модуляция активности транскрипционных регуляторов p53 и NF-kB в условиях микоплазменной инфекции как фактор, способствующий трансформации эукариотических клеток и опухолевой прогрессии тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.02.03, доктор биологических наук Логунов, Денис Юрьевич

• Логунов, Денис Юрьевич
• доктор биологических наук
• 2011

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Модуляция активности транскрипционных регуляторов p53 и NF-kB в условиях микоплазменной инфекции как фактор, способствующий трансформации эукариотических клеток и опухолевой прогрессии»

АКТУАЛЬНОСТЬ ПРОБЛЕМЫ.10

ЦЕЛЬ И ЗАДАЧИ ИССЛЕДОВАНИЯ.13

НАУЧНАЯ НОВИЗНА И ПРАКТИЧЕСКАЯ ЗНАЧИМОСТЬ.14

ГЛАВА 1.16

ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.16

1.1. Общая характеристика микоплазм.16

1.1.1. Классификация, структурная организация и физиология микоплазм. 16

1.1.2. Адгезия микоплазм на клетки хозяина.26

1.1.3. Особенности взаимодействия микоплазм с клеткой хозяина и его иммунной системой.30

1.2. ОПУХОЛЕВЫЙ СУПРЕССОР Р53.36

1.2.1 Биологическая роль р53.36

1.2.2. Характеристика гена р53.37

1.2.3. Структурно-функциональная организация белка р53.38

1.2.4. Регуляция активности р53.39

1.2.5. Транскрипционная активность р53.45

1.2.6. Транскрипционные мишени белка р53.48

1.2.7. Инфекционные агенты и их влиянте на активность р53.51

1.3 .ТРАНСКРИПЦИОННЫЙ ФАКТОР ОТ-КВ И ЕГО РОЛЬ В РЕАЛИЗАЦИИ РАЗЛИЧНЫХ КЛЕТОЧНЫХ ФУНКЦИЙ.54

1.3.1. Строение и функции транскрипционного фактора ОТ-кВ.54

1.3.2. Пути активации транскрипционного фактора ОТ-кВ.60

1.3.3. Роль №ЧсВ в формировании и прогрессии опухолей.67

1.3.3.1. Хронические инфекции, воспаление и их ассоциация с опухолевым ростом.67

1.4. МИКОПЛАЗМЕННАЯ ИНФЕКЦИЯ И ЕЕ ВЛИЯНИЕ НА АКТИВНОСТЬ ОТ-кВ И р53.70

ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ.72

2.1. Материалы.72

2.1.1. Вирусы и бактериальные штаммы.72

2.1.2. Клеточные линии.72

2.1.3. Плазмидные векторы.73

2.1.4. Ферменты и другие реактивы.73

2.1.5. Лабораторные животные.74

2.1.6. Лабораторное оборудование.74

2.2. Методы.75

2.2.1. Подготовка компетентных клеток Е. coli штамма DH5a.75

2.2.2. Трансформация компетентных клеток Е. coli штамма DH5a.76

2.2.3. Выделение аналитических количеств плазмидной ДНК.76

2.2.4. Выделение тотальной ДНК.76

2.2.5. Выделение и очистка плазмидной ДНК.77

2.2.6. Рестрикционный анализ ДНК специфическими эндодезоксирибонуклеазами.78

2.2.7. Фракционирование фрагментов ДНК методом электрофореза в агарозном геле.78

2.2.8. Препаративное разделение фрагментов ДНК и элюция их из геля.78

2.2.9. Лигирование фрагментов ДНК.79

2.2.10. Выделение, наращивание и видовая идентификация микоплазм.79

2.2.11. Выделение фракции липид-ассоциированных мембранных белков микоплазм.80

2.2.12. Экспериментальное заражение культур клеток микоплазмой.81

2.2.13. Полимеразная цепная реакция.82

2.2.14. ПЦР в режиме реального времени.82

2.2.15. Измерение активности ферментов микоплазмы в культуральной среде83

2.2.16. Измерение активности ß-галактозидазы.84

2.2.17. Иммуноблотинг.84

2.2.18. Метод окраски клеток метиленовым голубым.84

2.2.19. Определение количества живых клеток по реакции с субстратом МТТ84

2.2.20. Получение лентивируса методом котрансфекции.85

2.2.21. Выделение тотальной РНК из культуры клеток.85

2.2.22. Реакция обратной транскрипции.86

2.2.23. Измерение активности каспаз-3/7.87

2.2.24. Измерение уровня митохондриального трансмембранного потенциала (А\|/ш).87

2.2.25. Измерение концентрации цитокинов.87

2.2.26. Трансфекция клеток линии 293 для получения рекомбинантных аденовирусов.88

2.2.27. Накопление вирусов.88

2.2.28. Очистка и концентрирование аденовирусов.89

2.2.29. Титрование вирусов.89

2.2.30. Выделение вирионной ДНК.90

2.2.31 Определение активности секретируемой щелочной фосфатазы.90

2.2.32 Анализ включения 5-ВгсШ.91

2.2.33. Получение образцов простаты.91

ГЛАВА 3.93

РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЯ.93

3.1. Экспериментальное заражение и идентификация микоплазм в культурах клеток.93

3.2. Влияние микоплазменной инфекции на активность транскрипционного фактора р53.96

3.2.1 Изучение влияния различных видов микоплазм на транскрипционную активность р53.96

3.2.2 Микоплазменная инфекция ингибирует р53-зависимую остановку клеточного цикла и р53-зависимый апоптоз.100

3.2.3. Микоплазменная инфекция способствует КаБ-опосредованной трансформации крысиных эмбриональных фибробластов.104

3.2.4. Изменение профиля экспрессии генов в клетках инфицированных микоплазмой.109

3.3 Влияние микоплазмённой инфекции на активность транскрипционного фактора NF-kB.112

3.3.1. Различные виды микоплазм приводят к активации NF-kB в клетках при взаимодействии с Толл-рецептором 2.112

3.3.2 Определение возможных сочетаний Толл-подобных рецепторов, вызывающих активацию транскрипционного фактора NF-kB после взаимодействия M.arginini или ее структурными компонентами.114

3.3.3. Микоплазмы и их липид-ассоциированные мембранные белки повышают выживаемость клеток линии 293, экспрессирующих Толл-подобные рецепторы 2/6, при действии химиотерапевтических препаратов.118

3.3.4. Блокирование функциональной активности NF-kB в клетках, инфицированных микоплазмой, приводит к отмене их устойчивости к химиотерапевтическим препаратам.121

3.3.5. Анализ экспрессии Толл-подобных рецепторов 2 и 6 в различных опухолевых линиях клеток.123

3.3.6. M.arginini и ее структурные компоненты активируют NF-kB подавляют апоптоз в опухолевых клетках, экспрессирующих Толл-подобные рецепторы 2/6, при действии химиотерапевтических препаратов.124

3.3.7. Изучение кинетики роста опухолевых клеток WEHI-3B при инфекции M.arginini или добавлении ее структурных компонентов в эксперименте in vitro . 128

3.3.8. Влияние микоплазмённой инфекции клеток WEHI-3B на прогрессию мышиной миеломоноцитарной лейкемии в экспериментах in vivo.131

3.3.9. Влияние диациллипопептида M.arginini на пролиферацию и резистентность к химиотерапевтическим препаратам опухолевых клеток WEHI-ЗВ в экспериментах in vivo.132

3.3.10. Изучение влияния структурного компонента M.arginini (R-Pam2) на продукцию факторов, стимулирующих пролиферацию клеток мышиной миеломоноцитарной лейкемии WEHI-3B in vivo.137

3.4 Экспрессия TLR2 на поверхности лейкозных клеток человека повышает их резистентность к химиотерапии.146

3.5 Персистенция микоплазм в опухолях простаты.151

3.5.1 Детекция микоплазмы в ткани простаты пациентов с подозрением на рак простаты.153

3.5.3Соотношение между уровнем простатического специфического антигена и присутствием М. hominis в ткани простаты.160

3.6. Определение влияния микоплазменной инфекции на резистентность простатных клеток к действию химиотерапевтических препаратов.163

3.7 Изучение влияния микоплазменной инфекции на метаболизм клеток. 165

3.8 Активация NF-KB ассоциирована с подавлением транскрипционной активности р53.168

3.9. Изучение радиопротективных свойств диациллипопептида R-Pam2 . 170

ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ.174

ВЫВОДЫ.189

СПИСОК ИСПОЛЬЗУЕМОЙ ЛИТЕРАТУРЫ.189

Всі - белок B-клеточной лимфомы ВН - BCL-2-гомологичный домен CARD - домен, привлекающий каспазу C-IAP1 - белок, ингибитор апоптоза СК2 - казеин-киназой-П CMV - цитомегаловирус DD — «домен смерти»

DD - регион, гомологичный домену смерти

DISC - сигнальный комплекс, индуцирующий смерть

ELKS23 - белок богатый глютамином (Е), лейцином (L), лизином (К) и сериуом

S)

FADD - ФНО-ассоциированный «домен смерти»

HBV - вирус гепатита В

НСС - злокачественная гепатома

HCV - вирус гепатита С

HLH - домен типа «спираль-петля спираль»

IkB - ингибитор «каппа-би»

ПСК - IkB киназа

IRAK - киназа, ассоциированная с рецептором ИЛ-1 INK - киназа Януса

LMP1 - латентный мембранный белок-1

MALP - макрофаг-активирующий липопептид микоплазм

МСР-1 - моноцитарный хемоатрактантный белок 1

МПМ - макрофагальный воспалительный белок 1

MLOs - микоплазма-подобные организмы

MnSOD - марганец супероксиддисмутазы

MyD88 - белок 88 первичного ответа миелоидной дифференциации NBD -NEMO-связывающий домен NEMO - эссенциальный модулятор NF-kB NES - сигнал ядерного экспорта

NF-кВ - ядерный фактор «каппа-би»

NGF - фактор роста нервов

NIK - NF-kB-индуцирующая киназа

NLS - сигнал ядерной локализации

OD - оптическая плотность

ONPG - О-нитрофенил-Ь-О-галактопиранозидаза

PEST - пролин (Р), глутамин (Е), серин (S) богатый домен

РКС - протеинкиназа С

RHD - REL гомологичный домен

ROS - активные формы кислорода

SDS - натрия додецилсульфат

SOD - супероксиддисмутазы

ТАВ1 - ТАКІ-связывающий белок 1

ТАЕ - трис-ацетатный буфер

ТАКІ - трансформирующий ростовой фактор -ß-активируемая киназа 1

TCR - Т-клеточный рецептор

TD - трансактивационный домен

TLR - Толл-подобный рецептор

TNF - фактор некроза опухоли

TRADD - белок, ассоциированный с «доменом смерти» рецептора ФНО

TRAF - фактор, ассоциированный с рецептором ФНО

TRAIL - лиганд, вызывающий апоптоз, связанный с ФНО

XIAP - Х-связанный ингибитор белков апоптоза

ZF - домен типа «цинковый палец»

ВВЕДЕНИЕ

АКТУАЛЬНОСТЬ ПРОБЛЕМЫ

Микоплазмы (класс Mollicutes) - мельчайшие патогенные бактерии, характерной особенностью которых является отсутствие клеточной стенки. Представители данного семейства являются причиной различных заболеваний респираторного и урогенитального тракта, а также острых и хронических заболеваний суставов у человека и животных [Прозоровский C.B., Раковская И.В., 1995]. Одной из особенностей микоплазм является их способность персистировать in vivo в течение длительного периода без каких-либо клинических проявлений. Такая способность микоплазм обусловлена рядом особенностей, которые позволяют им эффективно «ускользать» от иммунной системы хозяина. Для микоплазм свойственна молекулярная мимикрия и фенотипическая пластичность, которые приводят к тому, что микоплазмы не эффективно распознаются и элиминируются иммунной системой хозяина. Это позволяет микоплазмам сохраняться в организме хозяина в течение длительного времени, что часто может являться причиной хронических заболеваний [Barile M., 1993, Razin S.,1991,1998]. Другой характерной особенностью микоплазм является их способность к длительному персистированию in vitro - в культурах эукариотических клеток. Являясь облигатными мембранными паразитами, они сохраняются в клеточных культурах в течение десятков лет. Эта способность микоплазм создает уникальную модель для наблюдений и исследований взаимодействия прокариотических и эукариотических клеток.

В настоящее время, считается, что патогены, вызывающие хронические заболевания, ассоциированные с хроническим воспалением, являются одним из ключевых факторов, влияющих на опухолевую прогрессию [Coussens L., 2002, DeMarzo А., 2004, 2007, Gupta S., 2004, Karin M., 2006, Nelson W., 2003, Platz E., 2004, Sfanos K., 2008, Sutcliffe S., 2008, Wagenlehner F., 2007]. Примерами таких патогенов являются: вирус Эпштейна-Барр (назофарингеальная карцинома); вирусы гепатита В и С (гепатоцеллюлярная карцинома); папилломавирус человека (аногенитальные опухоли); паразит Clonorchis sinensis (холангиокарцинома) [Parkin D., 1993, Ames В., 1995, Karin M., 2006, Keam S.5 2008, Mantovani F., 2001, Mager D., 2006], среди патогенов бактериальной природы - Helicobacter pylori (мукоза-ассоциированные опухоли и аденокарцинома желудка) [Correa Р., 2007, Ito М., 2009 , Malfertheiner Р., 2005, Marshall В., 2005]. Еще целый ряд патогенов бактериальной природы в настоящее время подозреваются в качестве этиологических факторов различных опухолевых заболеваний: Salmonella typhi (опухоли желчного пузыря); Streptococcus bovis (опухоли кишечника); Bartonella sp. (гемангиомы) [Dehio С., 2005, Elimerich S., 2000, Mager D., 2006, Tewari M., 2010]. Хроническая природа микоплазменной инфекции позволяет предположить, что она также может являться источником хронического воспалительного процесса и ассоциированных с ним проканцерогенных эффектов в условиях in vivo. Дополнительными аргументами в пользу этого предположения являются такие эффекты in vitro, сопровождающие хроническую микоплазменную инфекцию, как повышение генетической нестабильности в инфицированных культурах [Allison А., 1966, Chernova О., 1996, Patón G., 1965], иммортализация и злокачественная трансформация клеток [Patón G., 1965, Cimolai N., 2001, Feng S. 1999 , Namiki K., 2009, Logunov D., 2008, Pehlivan M., 2005, Zhang B. 1996, Zhang C. 2004, 2006, Каган Г., 1975]. Также показано, что сами микоплазмы и их структурные компоненты способны блокировать апоптоз, повышать инвазивность клеток опухоли и стимулировать прогрессию опухолевого заболевания [Каган Г., 1975, Ketcham С., 2005, Pehlivan М., 2005, Gerlic М., 2007, Gong М., 2008, Ushio S., 1995, Щебляков Д., 2008]. Последнее, по-видимому, связано с активацией основного провоспалительного и анти-апоптотического транскрипционного фактора NF-kB в результате взаимодействия структурных микоплазменных белков (липопептидов) с рецепторами врожденного иммунитета - TLR2/6.[Логунов Д., 2009]

На сегодняшний день, несмотря на значительный интерес со стороны ученых и наличие большого числа научных фактов, механизмы, характеризующие опухолестимулирующую и трансформирующую активность микоплазм, остаются практически неизученными.

Известно, что одними из ключевыми клеточных факторов, активность которых изменяется более чем в 90% опухолевых клеток, являются NF-kB и р53. При этом активность NF-kB в опухолях повышается, а функция р53 подавляется. NF-kB, контролирует экспрессию значительного числа генов, продукты которых важны для выживания опухолевых клеток и для опухолевой прогрессии. В списке таких генов цитокины (IL-1,6, TNFa и др.); хемокины (КС-1, MIP-2, Grol); ростовые и ангиогенные факторы (GM-CSF, VEGF, IL-6); протеазы (ММР-9); анти-апоптотические факторы (Bcl-2, Bcl-XL, c-FLIP); проинфламаторные ферменты (СОХ-2, iNOS); гены, стимулирующие j прогрессию клеточного цикла (циклин Dl) [Karin М., 2006]. р53, наоборот, является главным опухолевым супрессором, основными функциями которого являются поддержка генетической стабильности и супрессия аберрантной активности онкогенов.

В нашей работе было проведено изучение влияния различных видов микоплазм на активность ключевых стресс-активируемых транскрипционных факторов р53 и NF-kB, а также оценен вклад подавления их активности в трансформирующую и опухолестимулирующую активность микоплазм. Получение новых данных, связанных с изучением трансформирующей активности микоплазм, а также влияния ее компонентов на прогрессию опухолевого заболевания, имеет существенное значение для понимания механизма взаимодействия бактериальных патогенов с клетками хозяина, а также для выяснения роли хронических бактериальных инфекции в прогрессии опухолевых заболеваний. Поэтому изучение описанных свойств микоплазм в настоящее время представляет научный и практический интерес.

В целом исследование молекулярных механизмов взаимоотношения микоплазм с клетками хозяина даст возможность адекватно оценить значение микоплазм при многих патологических процессах.

ЦЕЛЬ И ЗАДАЧИ ИССЛЕДОВАНИЯ

Цель: Изучить влияние различных видов микоплазм на активность ключевых стресс-активируемых транскрипционных факторов р53 и NF-kB и оценить взаимосвязь этого влияния с трансформирующими и опухолестимулирующими свойствами микоплазм. В процессе выполнения работы предстояло решить следующие задачи.

1. Отработать условия экспериментального заражения культур клеток различными видами микоплазм с последующей количественной оценкой микоплазм в инфицированных клетках.

2. Провести анализ способности микоплазм влиять на активность транскрипционного фактора р53 и р53-зависимые процессы - апоптоз и ■ арест клеточного цикла.

3. Оценить влияние микоплазм на активность транскрипционного фактора NF-kB в результате взаимодействия с различными Толл-подобными рецепторами в экспериментах in vitro.

4. Провести анализ экспрессии Толл-подобных рецепторов, участвующих в распознавании липопептидов микоплазм, в различных линиях опухолевых клеток и отобрать клеточные культуры, экспрессирующие специфические по отношению к микоплазме Толл-подобные рецепторы.

5. Изучить влияние Толл-рецептор-зависимой активации NF-kB в условиях микоплазменной инфекции на выживаемость отобранных клеточных культур, в условиях генотоксического стресса.

6. Изучить влияние микоплазмы на пролиферацию и резистентность к химиотерапии опухолевых клеток, экспрессирующих Толл-подобные рецепторы специфические к микоплазме, в экспериментах in vivo.

7. Провести анализ ассоциации микоплазменной инфекции с опухолевыми заболеваниями, основным этиологическим фактором которых считается хроническое воспаление.

НАУЧНАЯ НОВИЗНА И ПРАКТИЧЕСКАЯ ЗНАЧИМОСТЬ

В результате проведенной работы впервые была показана способность микоплазм подавлять активность транскрипционного фактора р53. Показано, что в результате ингибирования р53 в инфицированных клетках повышается устойчивость к апоптозу, а также ослабляется сенесенс-ассоциировааный арест и арест, вызванный генотоксическими агентами. Проведено полногеномное исследование изменения экспрессии генов. Показано, что в клетках, инфицированных микоплазмой, снижена экспрессия таких известных р53-респонсивных генов как BTG-2, р21 Cipl, TP53I3, MDM2, ATF3, Fas.

Впервые идентифицированы сочетания Толл-подобных рецепторов, специфически распознающих M.arginini и ее структурные компоненты, при взаимодействии с которыми наблюдали активацию транскрипционного фактора NF-kB. Полученные данные имеют принципиальное значение для понимания механизма распознавания системой врожденного иммунитета клеток M.arginini.

Впервые показана способность микоплазм и их липид-ассоциированных мембранных белков подавлять апоптоз (в опухолевых клетках), вызванный действием химиотерапевтических препаратов, в результате Толл-рецептор-зависимой активации транскрипционного фактора NF-kB .Такая активация NF-kB в инфицированных микоплазмой клетках является одной из причин снижения транскрипционной активности белка р53.

Впервые была показана способность микоплазм и их липид-ассоциированных мембранных белков приводить к подавлению апоптоза в опухолевых клетках при действии химиотерапевтических препаратов. В последующих экспериментах было показано, что TLR-зависимая активация NF-kB в инфицированных микоплазмой клетках является одной из причин снижения транскрипционной активности р53.

На модели мышиной миеломоноцитарной лейкемии WEHI-3B в эксперименте in vivo, впервые, показана способность M.arginini и ее структурных компонентов (диапдштпопептидов) повышать устойчивость опухолевых клеток, экспрессирующих Толл-подобный рецептор 2, к действию химиотерапевтических препаратов, а также стимулировать опухолевую прогрессию.

Для изучения механизма опухолестимулирующего действия микоплазменных диациллипопептидов проведно полногеномное исследование изменения экспрессии генов. Показано, что введение синтетического диациллипопептида микоплазм вызывает индукцию более 3000 генов, среди которых обнаружены гены МСР-1, МСР-3, Grol, RANTES, IL-1, IL-6, ФНОа, S100A9, SAA1, SAA3, продукты которых обладают опухолестимулирующей активностью.

В работе впервые было изучено влияние микоплазменной инфекции на метаболический профиль клетки-хозяина. Было показано, что наряду с известным по данным литературы снижением содержания аргинина, в инфицированных микоплазмой клетках существенно понижается содержание пролина. Недостаток этих двух аминокислот, по нашему мнению, может иметь существенное значение для жизнедеятельности клетки.

Результаты, полученные в данной работе, показывают, что сама микоплазма или ее антигены, которые, как известно, способны к длительной циркуляции в организме, могут негативно влиять на рост и устойчивость опухолевых клеток, экспрессирующих Толл-подобные рецепторы 2 и 6 к химиотерапии. Проведено эпидемиологическое исследование, которое выявило взаимосвязь микоплазменной инфекции (M.hominis) с раком простаты.

Полученные результаты показывают необходимость проведения дополнительных диагностических и профилактических мероприятий, направленных на идентификацию и лечение микоплазменных инфекций у больных при проведении курса химиотерапии опухоли.

Кроме того, полученные результаты показывают, что анти-апоптотическая активность микоплазменных диациллипопептидов может быть использована для создания радиопротективных средств.

Заключение диссертации по теме «Микробиология», Логунов, Денис Юрьевич

выводы

1. Впервые была показана способность микоплазм ингибировать активность транскрипционного фактора р53.

2. Проведено полногеномное исследование изменения экспрессии генов в клетках НСТ-116 инфицированных микоплазмой. Показано, что в этих клетках снижена экспрессия таких известных р53-респонсивных генов как BTG-2, p21 Cipl, TP53I3, MDM2, ATF3, Fas.

3. Впервые показана способность M.arginini активировать транскрипционный фактор NF-kB в результате взаимодействии со следующими сочетаниями Толл-подобных рецепторов: 2/6, 2/CD14, 1/2.

4. Установлено, что ТЫ12-зависимая активация NF-kB микоплазмами и их структурными компонентами способствует подавлению апоптоза и увеличению выживаемости опухолевых клеток (на 25-30%) при действии на них химиотерапевтических препаратов.

5. Впервые показано, что TLR-зависимая активация NF-kB в инфицированных микоплазмой клетках является одной из причин снижения транскрипционной активности р53.

6. На модели мышиной миеломоноцитарной лейкемии WEHI-3B в эксперименте in vivo впервые была показана способность M.arginini и ее структурных компонентов (диациллипопептидов) повышать пролиферацию и устойчивость к действию химиотерапевтических препаратов опухолевых клеток, экспрессирующих Толл-подобный рецептор 2.

7. В результате полногеномного исследования изменения экспрессии генов определен возможный механизм опухолестимулирующего действия микоплазменных диациллипопептидов. Показано, что введение синтетического диациллипопептида микоплазм вызывает индукцию более 3000 генов, среди которых обнаружены гены МСР-1, МСР-3, Grol, RANTES, IL-1, IL-6, ФНОа, S100A9, SAA1, SAA3, продукты которых обладают опухолестимулирующей активностью.

8. Проведено эпидемиологическое исследование, которое выявило взаимосвязь микоплазменной инфекции (M.hominis) с раком простаты. Показано, что М. hominis была детектирована в 3 раза чаще у пациентов с раком простаты по сравнению с пациентами, имеющими доброкачественные изменения в простате.

9. Впервые было изучено влияние микоплазменной инфекции на изменение метаболического профиля. Было показано, что в инфицированных микоплазмой клетках более чем в 2,5 раза снижается внутриклеточное содержание пролина.

Список литературы диссертационного исследования доктор биологических наук Логунов, Денис Юрьевич, 2011 год

1. Каган Г.Я., Раковская И.В., Моргунова Т.Д., Постникова З.А. Индукция лейкоза у мышей, резистентных к вирусу Раушера, при смешанной инфекции M.arthritidis и вирусом Раушера // Вопросы вирусологии, 1975, №2, С.-171-176.

2. Логунов Д.Ю., Щебляков Д.В., Шмаров М.М и соавт. Липид-ассоциированные мембранные белки M.arginini активируют NF-kB, взаимодействуя с TLR2/1, TLR2/6 и TLR2/CD14. Молекулярная генетика, микробиология и вирусология, 2009, №2, 25-57

3. Маниатис Т., Фрич Э., Сембрук Дж. Молекулярное клонирование. М.1984.

4. Прозоровский С.В., Раковская И.В., Вульфович Ю.В .Медицинская микоплазмология//Москва, 1995.

5. Чумаков П.М. Белок р53 и его универсальные функции в многоклеточном организме Успехи биологической химии, т. 47, 2007, с. 3-52

6. Щебляков Д.В., Логунов Д.Ю. и соавт. Роль Толл-подобных рецепторов в прогресии опухолей. Acta Naturae. 2010. С 14-19.

7. Adimoolam S., Ford J. M. p53 and DNA damage-inducible expression of the xeroderma pigmentosum group C gene. PNAS, 2002 vol. 99 no. 20 1298512990

8. Akira S., Takeda K. & Kaisho T. Toll-like receptors: critical proteins linking innate and acquired immunity // Nature Immunol, 2001, v.-2, pp.-675-680.

9. Allison A.C. and Paton G.R. Chromosomal abnormalities in human diploid cells infected with mycoplasma and their possible relevance to the aetiology of Down's syndrome (mongolism). Lancet, 1966. 2(7475): p. 122930.

10. Alltona K, Abhinav K. Jaina,b,l, Hans-Martin Herza, Wen-Wei Tsaia,b, Sung Yun Jungc, Jun Qinc, Andreas Bergmanna, Randy L. Johnsona,b, and Michelle Craig Bartona/ Trim24 targets endogenous p53 for degradation/ doil0.1073pnas.0813177106

11. Ames B. N., Gold, L. S. & Willett, W. C. The causes and prevention of cancer. Proc. Natl Acad. Sci. USA, 1995. 92: 5258-5265.

12. Arendt C.W., Albrecht B., Soos T.J. & Littman D.R. Protein kinase CO: signaling from the center of the T-cell synapse // Curr. Opin. Immunol, 2002, v.-14, pp.-323—330.

13. Asher, G., Shaul, Y. p53 proteasomal degradation: poly-ubiquitination is not the whole story. (2005) Cell Cycle, 4, 1015-1018.

14. Baek KH, Shin HJ, Yoo JK, Cho JH, Choi YH, Sung YC et al. (2003).p53 deficiency and defective mitotic checkpoint in proliferating T-lymphocytes increase chromosomal instability through aberrant exit from mitotic arrest. J Leukoc Biol 73: 850-861.

15. Barile M.F. and Rottem S. Mycoplasmas in cell cultures // Rapid Diagnosis of Mycoplasmas, New York: Plenum, 1993, pp.-155-193.

16. Baseman J. B., and J. G. Tully. Mycoplasmas: sophisticated, reemerging, and burdened by their notoriety // Emerging Infect. Dis, 1997, v.-3, pp.-21-32.

17. Berger J, Hauber J, Hauber R, Geiger R, Cullen BR Secreted placental alkaline phosphatase: a powerful new quantitative indicator of gene expression in eukaryotic cells.// Gene. 1988 Jun 15; 66 (1): 1-10.

18. Bharti A. C. & Aggarwal B. B. Chemopreventive agents induce suppression of nuclear factor-KB leading to chemosensitization // Ann. NY Acad. Sci., 2002, v.-973, pp.-392-395.

19. Birbach A. et al. Signaling molecules of the NF-kB pathway shuttle constitutively between cytoplasm and nucleus // J. Biol. Chem, 2002, v.-277, pp.-10842-10851.

20. Bonizzi G. and Karin M. The two NF-kB activation pathways and their role in innate and adaptive immunity // Trends Immunol, 2004, v.-25, pp.-280-288.

21. Bourdon JC, Fernandes K, Murray-Zmijewski F, Liu G, Diot A, Xirodimas DP, Saville MK, Lane DP. p53 isoforms can regulate p53 transcriptional activity. Genes Dev. 2005 Sep 15;19(18):2122-37. Epub 2005 Aug 30.;

22. Bove J. M. Molecular features of mollicutes // Clin. Infect. Dis, 1993, v.-17, pp.-10-Sl.

23. Bove J. M. Spiroplasmas: infectious agents of plants, arthropods and Vertebrates // Wien. Klin. Wochenschr, 1997, v.-109, pp.-604-612.

24. Dechend R. et al. The Bcl-3 oncoprotein acts as a bridging factor between nf-kb/Rel and nuclear co-regulators // Oncogene, 1999, v.-18, pp.-3316-3323.

25. Dehio C. Bartonella-host-cell interactions and vascular tumour formation. Nat Rev Microbiol, 2005. 3(8): p. 621-31.

26. Deveraux Q.L., Reed .J.C. LAP family proteins-suppressors of apoptosis // Genes Dev, 1999, v.-13, pp.-239-252.

27. DiDonato J.A., Hayakawa M., Rothwarf D.M., Zandi E. and Karin M.A. Cytokine-responsive IkB kinase that activates the transcription factor NF-kB // Nature, 1997, v.-388, pp.-548-554.

28. Dirksen L.B., Profit T., Hilbert H., Plagens H., Herrmann R., and Krause D.C. Nucleotide sequence analysis and characteriztion of the hmw gene cluster of Mycoplasma pneumoniae II Gene, 1996, v.-171, pp.-19-25.

29. Ditsworth D., Zong W.X. NF-kappaB: key mediator of inflammation-associated cancer // Cancer Biol Ther, 2004, v.-3(12), pp.-1214-6.

30. Donehower LA, Harvey M, Slagle BL, McArthur MJ, Montgomery CA Jr, Butel JS, Bradley A. Mice deficient for p53 are developmentally normal but susceptible to spontaneous tumours.//Nature. 1992 Mar 19;356(6366):215-21.

31. Dornan, D., Wertz, I., Shimizu, H., Arnott, D., Frantz, G.D., Dowd, P., O'Rourke, K., Koeppen, H., Dixit, V.M. (2004) Nature, 429, 86-92.

32. Drott JB, Alexeyev O, Bergstrom P, Elgh F, Olsson J.Propionibacterium acnes infection induces upregulation of inflammatory genes and cytokine secretion in prostate epithelial cells. BMC Microbiol. 2010 Apr 26;10:126

33. Dybvig K., and L. L. Voelker. Molecular biology of mycoplasmas // Annu. Rev. Microbiol, 1996, v.-50, pp.-25-57.

34. Efeyan, A. and M. Serrano. p53: guardian of the genome and policeman of the oncogenes. Cell Cycle, 2007. 6(9): p. 1006-10.59. el-Deiry WS.p21/p53, cellular growth control and genomic integrity. Curr Top Microbiol Immunol. 1998;227:121-37.

35. Elimerich, S.5 Scholler m., Duranton B, et al. Promotion of intestinal carcinogenesis by Streptococcus bovis. Carcinogenesis, 2000. 21(4): p. 753-6.

36. Falck J, Mailand N, Syljuäsen RG, Bartek J, Lukas J. The ATM-Chk2-Cdc25A checkpoint pathway guards against radioresistant DNA synthesis, Nature. 2001 Apr 12;410(6830):842-7.

37. Feng S.H. Lo S.C. Lipid extract of Mycoplasma penetrans proteinase Indigested lipid associated membrane proteins rapidly activates NF-kappa B and activator protein 1, Infect Immun, 1999, v.-67, pp.-2951-2956.

38. Feng, S.H., Tsai S, Rodriguez J., et al., Mycoplasmal infections prevent apoptosis and induce malignant transformation of interleukin-3-dependent 32D hematopoietic cells. Mol Cell Biol, 1999. 19(12): p. 7995-8002.

39. Gardella R. S., and R. A. Del Giudice. Growth of Mycoplasma hyorhinis cultivar alpha on semisynthetic medium // Appl. Environ. Microbiol, 1995, v.-61, pp.-1976-1979.

40. Geary S.J. and Gabridge M.G. Characterization of a human lung fibroblast receptor site for Mycoplasma pneumoniae // Isr J Med Sei, 1987, v.-23, pp.-462-468.

41. Geary S.J., Gabridge M.G., Intres R., Draper D.L., and Gladd M.F. Identification of mycoplasma binding proteins utilizing a 100 kilodalton lung fibroblast receptor // J Receptor Res, 1990, v.-9, pp.-465-478.

42. Gerlic M., Horowiwitz J., Farkash S. et al The inhibitory effect of Mycoplasma fermentas on tumour necrosis factor (TNF)-alfa-induced apoptosis in the membrane lipoproteins. 2007. 9(1): p. 142-153.

43. Gerondakis S., Grossmann M., Nakamura Y., Pohl T. & Grumont R. Genetic approaches in mice to understand Rel/NF-kB and IkB function: transgenics and knockouts // Oncogene, 1999, v.-18, pp.-6888-6895.

44. Ghosh P.Process of protein transport by the type III secretion system. Microbiol Mol Biol Rev. 2004 Dec;68(4):771-95.

45. Ghosh S., May M.J., and Kopp E.B. NF-kB and Rel proteins: Evolutionarily conserved mediators of immune responses // Annu. Rev. Immunol, 1998, v.-16, pp.-225-260.

46. Gibson D. G. и соавторы Complete Chemical Synthesis, Assembly, and Cloning of a Mycoplasma genitalium Genome. Science 2008: Vol. 319. no. 5867, pp. 1215-1220

47. Gong M, Meng L, Jiang B, Zhang J, Yang H, Wu J, Shou C. p37 from Mycoplasma hyorhinis promotes cancer cell invasiveness and metastasis through activation of MMP-2 and followed by phosphorylation of EGFR. Mol Cancer Ther. 2008.7(3):530-7.

48. Gong M, Meng L, Jiang B, Zhang J, Yang H, Wu J, Shou C. p37 from Mycoplasma hyorhinis promotes cancer cell invasiveness and metastasis through activation of MMP-2 and followed by phosphorylation of EGFR. Mol Cancer Ther. 2008.7(3):530-7.

49. Graham F.L. and Prevec L. Manipulation of adenovirus vectors. // Methods in Mol.Biol., 1994, v.-7, pp.-109-127. (Ed.), The Humana Press Inc., Clifton, NJ.

50. Green M., Wold W.S.M. Human adenoviruses: growth, purification and transfection assay. Metotds Enzymology.,1980, v58, p.425-431.

51. Greenberg-Ofrath N., Y. Terespolosky, I. Kahane, and R. Bar. Cyclodextrins as carriers of cholesterol and fatty acids in cultivation of mycoplasmas, // Appl. Environ. Microbiol, 1993, v.-59, pp.-547-551.

52. Imler J. L. & Hoffmann J. A. Toll and Toll-like proteins: an ancient family of receptors signaling infection // Rev. Immunogenet, 2000, v.-2, pp.-294-304.

53. Inamine J.M., Denny T.P., Loechel S., Schaper U., Huang C.H., Bott K.F., and Hu P.C. Nucleotide sequence of the PI attachment-protein gene of Mycoplasma pneumoniae // Gene, 1988, v.-64, pp.-217-229.

54. Ito M., et al. Clinical prevention of gastric cancer by Helicobacter pylori eradication therapy: a systematic review. J Gastroenterol, 2009. 44(5): p. 36571.

55. Jacks T, Remington L, Williams BO, Schmitt EM, Halachmi S, Bronson RT, Weinberg RA. Tumor spectrum analysis in p53-mutant mice.//Curr Biol. 1994 Jan l;4(l):l-7.

56. Janssens S. & Tschopp J. Signals from within: the DNA-damage-induced NF-kB response // Cell Death Differ, 2006, v.-13, pp.-773-784.

57. Jemal A, et al. Cancer statistics. CA Cancer Clin, 2008. 58(2):71-96.

58. Jiang S, Zhang S, Langenfeld J, Lo SC, Rogers MB .Mycoplasma infection transforms normal lung cells and induces bone morphogenetic protein 2 expression by post-transcriptional mechanisms. J Cell Biochem. 2008 May 15;104(2):580-94.

59. Johnson C., Van Antwerp D. & Hope T. J. An N-terminal nuclear export signal is required for the nucleocytoplasmic shuttling of IkBa // EMBO J, 1999, v.-18, pp.-6682-6693.

60. Karen A. Boehme*,f, Roman Kulikov*, and Christine Blattner p53 stabilization in response to DNA damage requires Akt/PKB and DNA-PK PNAS June 3, 2008 vol. 105no. 22 7785-7790

61. Karen H. Vousden & Kevin M. Ryan p53 and metabolism Nature Reviews Cancer 9, 691-700 (October 2009)

62. Karin M., Greten F. NF-kB: Linking inflammation! and immuninity to cancer development and progression. Nature reviews Immunology, 2005. 5: 749-759.

63. Karin M., T. Lawrence, and V. Nizet, Innate immunity gone awry: linking microbial infections to chronic inflammation and cancer. Cell, 2006. 124(4): p. 823-35.

64. Karin M.NF-kappaB as a critical link between inflammation and cancer. Cold Spring Harb Perspect Biol. 2009 Nov;l(5):a000141.

65. Karin, M., Nuclear factor-kappaB in cancer development and progression. Nature, 2006. 441(7092): p. 431-6.

66. Keam, S.J. and D.M. Harper, Human papillomavirus types 16 and 18 vaccine (recombinant, AS04 adjuvanted, adsorbed) Cervarix. Drugs, 2008. 68(3): p. 359-72.

67. Kelliher M. A. et al. The death-domain kinase RIP mediates the TNF-inducedNF-kB signal // Immunity, 1998, v.-8, pp.-297-303.

68. Ketcham C.M., Anai S., Reutzel R., Sheng S., Schuster S.M., Brenes R.B., Agbandje-McKenna M., McKenna R., Rosser C.J., Boehlein S.K. p37 induces tumor invasiveness // Mol Cancer Ther, 2005, v.-4, pp.-1031-8.

69. Kim H, Rafiuddin-Shah M, Tu HC, et al. Hierarchical regulation of mitochondrion-dependent apoptosis by BCL-2 subfamilies. Nat Cell Biol 2006;8:1348-58.

70. Kim JE, Yoo C, Kim S, Lee DH, Kim SW, Lee JS, Suh C.Optimal timing of G-CSF administration for effective autologous stem cell collection. Bone Marrow Transplant. 2010 Aug 9.

71. Kim S, Takahashi H, Lin WW, Descargues P, Grivennikov S, Kim Y, Luo JL, Karin M. Carcinoma-produced factors activate myeloid cells through TLR2 to stimulate metastasis.Nature. 2009 Jan l;457(7225):102-6.

72. Koehler, J.E., et al., Isolation of Rochalimaea species from cutaneous and osseous lesions of bacillary angiomatosis. N Engl J Med, 1992. 327(23): p. 1625-31.

73. Krause D.C. Mycoplasma pneumoniae cytadherence: unraveling the tie that binds // Mol Microbiol, 1996, v.-20, pp.-247-253.

74. Krause D.C., Leith D.K., Wilson R.M., and Baseman J.B. Identification of Mycoplasma pneumoniae proteins associated with hemadsorption and virulence // Infect Immun, 1982, v.-35, pp.-809-817.

75. Krivan H.C., Olson L.D., Barile M.F., Ginsburg V., and Roberts D.D. Adhesion of Mycoplasma pneumoniae to sulfated glycolipids and inhibition by dextran sulfate // J Biol Chem, 1989, v.-264, pp.-9283-9288.

76. Ladefoged S. A., and G. Christiansen. Physical and genetic mapping of the genomes of five Mycoplasma hominis strains by pulse-field gel electrophoresis // J. Bacteriol, 1992, v.-174. pp.-2199-2207. *

77. Lamb A, Yang XD, Tsang YH, Li JD, Higashi H, Hatakeyama M, Peek RM, Blanke SR, Chen LF Helicobacter pylori CagA activates NF-kappaB by targeting TAK1 for TRAF6-mediated Lys 63 ubiquitination EMBO Rep. 2009 Nov; 10(11): 1242-9.

78. Lan J., Y.Xiong, Y. Lin, Bi-Cheng Wang, Ling-Ling Gong, Hui-Sen Xu, Guang-Song Guo Helicobacter pylori infection generated gastric cancer through p53-Rb tumor-suppressor systemmutation and telomerase reactivation JWorld J Gastroenterol 2003;9(l):54-58

79. Lane DP. Cancer. p53, guardian of the genome. Nature. 1992;358(6381):15-6.

80. Layh-Schmitt G. and Herrmann R. Spatial arrangement of gene products of the PI Operon in the membrane of Mycoplasma pneumoniae // Infect Immun, 1994, v.-62, pp.-974-979.

81. Lee J. and Tanya T. Pauli. ATM Activation by DNA Double-Strand Breaks Through the Mrel 1-Rad50-Nbsl Complex. Science. 2005 22;308(5721):551-4.

82. Lee S. H. & Hannink M. Characterization of the nuclear import and export functions of IkBe // J. Biol. Chem, 2002, v.-277, pp.-23358-23366.

83. Leng, R.P., Lin, Y., Ma, W., Wu, H., Lemmers, B., Chung, S., Parant, J.M., Lozano, G., Hakem, R., Benchimol, S. (2003) Cell, 112, 779-791.

84. Levine AJ, W Hul and Z Feng The P53 pathway: what questions remain to be explored?. Cell Death and Differentiation (2006) 13, 1027-1036

85. Li Q. and Verma I.M. NF-kB regulation in the immune system // Nat. Rev. Immunol, 2002, v.-2, pp.-725-734.

86. Li Z., A. Rakkar,et al. Efficacy of multiple administration of a recombinant adenovirus expressing wild-type p53 in an immune-competent mouse tumor model. Gene Therapy. 1998, v5, 605-613.

87. Lim MK et al., Clonorchis sinensis infection and increasing risk of cholangiocarcinoma in the republic of Korea. Am. J. Trop. Med. Hyg., 75(1), 2006, pp. 93-96 .

88. Lin L., DeMartino G. N. & Greene W. C. Cotranslational biogenesis of NF-kB p50 by the 26S proteasome // Cell, 1998, v.-92, pp.-819-828.

89. Littman, A J., L.A. Jackson, and T.L. Vaughan, Chlamydia pneumoniae and lung cancer: epidemiologic evidence. Cancer Epidemiol Biomarkers Prev, 2005. 14(4): p. 773-8.

90. Mager, D.L., Bacteria and cancer: cause, coincidence or cure? A review. J Transl Med, 2006. 4: p. 14

91. Malfertheiner, P., et al., Helicobacter pylori eradication has the potential to prevent gastric cancer: a state-of-the-art critique. Am J Gastroenterol, 2005. 100(9): p. 2100-15

92. Manarin R, Pascutti MF, Ruffino JP, De Las Heras B, Boscä L, Bottasso O, Revelli S, Serra E. Benznidazole blocks NF-kappaB activationbut not AP-1 through inhibition of IKK. Mol Immunol. 2010 Sep;47( 15):2485-91.

93. Mantovani, F. and L. Banks, The human papillomavirus E6 protein and its contribution to malignant progression. Oncogene, 2001. 20(54): p. 7874-87.

94. Marshall, B.J. and H.M. Windsor, The relation of Helicobacter pylori to gastric adenocarcinoma and lymphoma: pathophysiology, epidemiology, screening, clinical presentation, treatment, and prevention. Med Clin North Am, 2005. 89(2): p. 313-44.

95. Massimi P, Shai A, Lambert P, Banks L. HPV E6 degradation of p53 and PDZ containing substrates in an E6AP null background. Oncogene. 2008 Mar 13;27(12):1800-4.

96. May M. J. & Ghosh S. Rel/NF-kB and IkB proteins: an overview // Semin. Cancer Biol, 1997, v.-8, pp.-63-73.

97. May M.J., D'Acquisto F., Madge L.A., Glockner J., Pober J.S., and Ghosh S. Selective inhibition of NF-kB activation by a peptide that blocks the interaction of NEMO with the IkB kinase complex // Science, 2000, v.-289, pp.-1550-1554.

98. McAllister-Lucas L. M. et al. Bimpl, a MAGUK family member linking protein kinase C activation to BcllO-mediated NF-kB induction // J. Biol. Chem, 2001, v.-276, pp.-30589-30597.

99. McCormick F. Interactions between adenovirus proteins and the p53 pathway: the development of ONYX-O15. Semin Cancer Biol. 2000 Dec;10(6):453-9. Review.

100. Menendez D., Alberto Inga:t: and Michael A. Resnick The expanding universe ofp53 targets. Nat Rev Cancer. 2009 Qct;9(10):724-37.

101. Miller B.S. and Zandi E. Complete reconstitution of human IkB kinase (IKK) complex in yeast. Assessment of its stoichiometry and the role of IKKy on the complex activity in the absence of stimulation // J. Biol. Chem, 2001, v.-276, pp.-36320-36326.

102. Moll UM, Schramm LM.p53~an acrobat in tumorigenesis. Crit Rev Oral Biol Med. 1998;9(l):23-37.

103. Mu HH, Humphreys J, Chan FV, Cole BC.TLR2 and TLR4 differentially regulate B7-1 resulting in distinct cytokine responses to the mycoplasma superantigen MAM as well as to disease induced by Mycoplasma arthritidis. Cell Microbiol. 2006 Mar;8(3):414-26.

104. Muhlradt P.F., Kiess M., Meyer H., Ssmuth R, and Jung G. Structure and specific activity of macrophage-stimulating lipopeptides from Mycoplasma hyorhinis // Infect Immun, 1998, v.-66, pp.-4804-4810.

105. Muhlradt P.F., Meyer H., and Jansen R. Identification of S-(2,3-dihydroxypropyl) cystein in a macrophage-activating lipopeptide from Mycoplasma fermentans // Biochemistry, 1996, v.-35, pp.-7781-7786.

106. Mummenbrauer, T., Janus, F., Muller, B., Wiesmuller, L., Deppert, W., Grosse,F. p53 Protein exhibits 3'-to-5' exonuclease activity (1996) Cell, 85, 1089-1099.

107. Murphy, M. et al. Transcriptional repression by wildtypep53 utilizes histone deacetylases, mediated by interaction with mSin3a. Genes Dev. 13, 2490-2501(1999)

108. Namiki K, Goodison S, Porvasnik s et al. Persistent exposure to Mycoplasma induces malignatant transformation of human prostate cells. PLoS One, 2009. 14(9):e6872.

109. Neimark H.C., and C.S. Lange. Pulse-field electrophoresis indicates full-length mycoplasma chromosomes range widely in size // Nucleic Acids Res, 1990, v.-18, pp.-5443-5448.

110. Nelson, W. G., De Marzo, A. M. Isaacs, W. B. Prostate cancer. N. Engl. Med.,2003. 349: 366-381.

111. Nelyudova AM, Tararova ND, Aksenov ND, Pospelov VA, Pospelova TV. (2004). Restoration of Gl/S arrest in ElA+c-Haras-transformed cells by Bcl-2 overexpression. Cell Cycle 11: 1427-1432

112. Oriel JD Role of genital Mycoplasma in nongonococcal uretritis and prostatis. Sex Transm Dis. 1963.10:263-270

113. Pahl H.L. Activators and target genes of Rel/NF-kappaB transcription factors // Oncogene, 1999, v.-18(49), pp.-6853-6866.

114. Parkin DM, Ohshima H, Srivatanakul P, Vatanasapt Cholangiocarcinoma: epidemiology, mechanisms of carcinogenesis and prevention. V.Cancer Epidemiol Biomarkers Prev. 1993 Nov-Dec;2(6):537-44.

115. Paton, G.R., J.P. Jacobs, and F.T. Perkins, Chromosome changes in human diploid-cell cultures infected with Mycoplasma. Nature, 1965. 207(992): p. 43-5.

116. Pehlivan M. Can mycoplasma-mediated oncogenesis be responsible for formation of conventional renal cell carcinoma? Urology, 2005. 65 (2): p. 411414.

117. Pereyre S., Pascal Sirand-Pugnet, Laure Beven, Alain Charron, h coaBT. Life on arginine for Mycoplasma hominis: clues from its minimal genome and comparison with other human urogenital Mycoplasmas. PLoS Genet 2009, 5(10): el000677.

118. Perkins N. D. & Gilmore T. D. Good cop, bad cop: the different faces of NF-kB // Cell Death Differ, 2006, v.-13, pp.-759-772.

119. Perkins N. D. Post-translational modifications regulating the activity and function of the nuclear factor kB pathway // Oncogene, 2006, v.-25, pp.-6717-6730.

120. Perkins ND. Integrating cell-signalling pathways with NF-kappaB and IKK function Nat Rev Mol Cell Biol. 2007 Jan;8(l):49-62.

121. Pilo P., et al., A metabolic enzyme as a primary virulence factor of Mycoplasma mycoides subsp. mycoides small colony. J Bacteriol, 2005. 187(19): p. 6824-31.

122. Platz, E. A. & De Marzo, A. M. Epidemiology of inflammation and prostate cancer. Urol., 2004. 171: p.36-40.

123. Popham P.L., Hahn T.W., Krebes K., and Krause D. Loss of HMW1 and HMW3 in noncytadhering mutants of Mycoplasma pneumoniae occurs posttranslationally I I Proc Natl Acad Sei USA, 1997, v.-94, pp.-13979-13984.

124. Potts JM, Sharma R, Pasqualotto F, Nelson D, Hall G, Agarwal A. Association of Ureaplasma urealyticum with abnormal reactive oxygen species levels and absence of leukocytospermia. J Urol. 2000 Jun;163(6):1775-8.

125. Poyurovsky MV, Prives C. (2006). Unleashing the power of p53: lessons from mice and men. Genes Dev 20: 125-131.

126. Pyle L.E., L.N. Corcoran, B.G. Cocks, A.D. Bergemann, J.C. Whitley, and L. R. Finch. Pulsed-field electrophoresis indicates larger-thanexpected sizes for mycoplasma genomes // Nucleic Acids Res, 1988, v.-16, pp.-6015-6025

127. Rakoff-Nahoum S., Medzhitov R. Toll-like receptors and cancer // Nat Rev Cancer, 2009, v.-9(l), pp.-57-63.

128. Ravi R, Mookerjee B, van Hensbergen Y, Bedi GC, Giordano A, El-Deiry WS, Fuchs EJ, Bedi A. p53-mediated repression of nuclear factor-kappaB RelA via the transcriptional integrator p300.//Cancer Res. 1998 Oct 15;58(20):4531-6

129. Ray PS, Grover R, Das S.Two internal ribosome entry sites mediate the translation of p53 isoforms. EMBO Rep. 2006 Apr;7(4):404-10.

130. Razin S and Jacobs E. Mycoplasma adhesion // J Gen Microbiol, 1992, v.-138, pp.-407-422

131. Razin S. Molecular biology and genetics of mycoplasmas (Mollicutes) // Microbiol. Rev, 1985, v.-49, pp.-419^155.

132. Razin S. The genera Mycoplasma, Ureaplasma, Acholeplasma, Anaeroplasma, and Asteroleplasma // The prokaryotes 2nd, 1991, v.-2, p.-1937-1959.

133. Razin S. The mycoplasmas // Microbiol. Rev, 1978, v.-42, pp.-414-470.

134. Razin S., Yogev D., and Naot Y. Molecular biology and pathogenicity of mycoplasmas // Microbiol Rev, 1998, v.-63, pp.-1094-1156.

135. Razin S; Yogev D; Naot Y. Molecular biology and pathogenicity of mycoplasmas .Microbiology and molecular biology reviews : MMBR 1998. 62(4): 1094-156.

136. Richmond A. NF-kappa B, chemokine gene transcription and tumour growth // Nat Rev Immunol, 2002, v.-2(9), pp.-664-74.

137. Riley, T., Sontag, E., Chen, P. & Levine, A. Transcriptional control of human p53-regulated genes. Nature Rev. Mol. Cell Biol. 9, 402-412 (2008).

138. Roberts D.D., Olson L.D., Barile M.F., Ginsburg V., and Krivan H.C. Sialic acid-dependent adhesion of Mycoplasma pneumoniae to purified glycoproteins //J Biol Chem, 1989, v.-264, pp.-9289-9293

139. Robertson J. A., L.E. Pyle, G.W. Stemke, and L.R. Finch. Human ureaplasmas show diverse genome sizes by pulse-field electrophoresis // Nucleic Acids Res, 1990, v.-18, pp.-1451-1455

140. Rogers, A.B., et al., Helicobacter pylori but not high salt induces gastric intraepithelial neoplasia in B6129 mice. Cancer Res, 2005. 65(23): p. 1070915.

141. Rohaly G, Chemnitz J, Dehde S, Nunez AM, Heukeshoven J, Deppert W, Dornreiter I. A novel human p53 isoform is an essential element of the ATR-intra-S phase checkpoint. Cell. 2005 Jul 15;122(l):21-32.;

142. Romero-Arroyo C.E., Jordan J., Peacock S.J., Willby M.J., Farmer M.A., and Krause D.C. Mycoplasma pneumoniae protein P30 is required forcytadherence and associated with proper cell development // J Bacteriol, 1999, v.-181, pp.-1079-1087.

143. Rothwarf D.M. and Karin M. The NF-kB activation pathway: A paradigm in information transfer from membrane to nucleus // Science, 1999

144. Rottem S. and Naot Y. Subversion and exploitation of host cells by Mycoplasmas // Trends Microbiol, 1998, v.-6, pp.-436^t40.

145. Royds JA, Iacopetta B.p53 and disease: when the guardian angel fails.Cell Death Differ. 2006 Jun;13(6):1017-26.

146. Rozkovâ D, Novotnâ L, Pytlik R, Hochovâ I, Kozâk T, Bartûnkovâ J, Spisek R. Toll-like receptors on B-CLL cells: expression and functional consequences of their stimulation.Int J Cancer. 2010 Mar 1;126(5):1132-43.

147. Ruland J. et al. BcllO is a positive regulator of antigen receptor- induced activation of NF-kB and neural-tube closure // Cell, 2001, v.-104, pp.-33^12.

148. Sablina AA, Agapova LS, Chumakov PM, Kopnin BP. (1999). p53 does not control the spindle assembly cell cycle checkpoint but mediates G1 arrest in response to disruption of microtubule system. Cell Biol Int 23: 323-334.

149. Sablina AA, Chumakov PM, Levine AJ, Kopnin BP. p53 activation in response to microtubule disruption is mediated by integrin-Erk signaling. Oncogene. 2001 Feb 22;20(8):899-909

150. Sanin AV. Proliferation and splenic migration of mouse hematopoietic stem cells following a single injection of Mycoplasma arthritidis. Biull Eksp Biol Med. 1986 Jul;102(7):89-92.

151. Sarkaria, J.N., Busby, E.C., Tibbetts, R.S., Roos, P., Taya, Y., Karnitz, L.M., Abraham, R.T. Inhibition of ATM and ATR kinase activities by the radiosensitizing agent, caffeine. (1999) Cancer Res., 59, 4375-4382.

152. Sakuma T, Hué S, Squillace KA, Tonne JM, Blackburn PR, Ohmine S, Thatava T, Towers GJ, Ikeda Y. No evidence of XMRV in prostate cancer cohorts in the Midwestern United States. Retrovirology. 2011, 29;8-23.

153. Sato Y, Kamura T, Shirata N, Murata T, Kudoh A, Iwahori S, Nakayama S, Isomura H, Nishiyama Y, Tsurumi T. Degradation of phosphorylated p53 by viral protein-ECS E3 ligase complex. PLoS Pathog. 2009 Jul;5(7):e 1000530.

154. Schilling T, Schleithoff ES, Kairat A, Melino G, Stremmel W, Oren M, Krammer PH, Miiller M. Active transcription of the human FAS/CD95/TNFRSF6 gene involves the p53 family. Biochem Biophys Res Commun. 2009 Sep 18;387(2):399-404.

155. Sciarra A., Mariotti G., Salciccia S., et al. Prostate growth and inflammation. Steroid Biochemistry Molecular Biology, 2008.108: 254-260.

156. Serrano M, Lin AW, McCurrach ME, Beach D, Lowe SW. (1997). Oncogenic ras provokes premature cell senescence associated with accumulation of p53 and pl6INK4a. Cell 88: 593-602

157. Sfanos K.S., Sauvageot J.A Molecular Analysis of Prokaryotic and Viral DNA Sequences in Prostate Tissue from Patients with Prostate Cancer Indicates the Presence of Multiple and Diverse Microorganism. Prostate, 2008. 68: 306-320.

158. Shakhov A. et al. Methods for increasing and mobilizing hematopoietic stem cells.US2010/0055077 Al, Mar 4, 2010.

159. Sharpless NE, DePinho RA. p53: good cop/bad cop. Cell. 2002 Jul 12;110(1):9-12.

160. Shaulian E, Haviv I, Shaul Y, Oren M. Transcriptional repression by the C-terminal domain of p53.//Oncogene. 1995 Feb 16;10(4):671-80.

161. Sheppard HM, Corneillie SI, Espiritu C, Gatti A, Liu X.New insights into the mechanism of inhibition of p53 by simian virus 40 large T antigen. Mol Cell Biol. 1999 Apr; 19(4):2746-53.

162. Shih WJ., Collins J., Mitchell B. et al. Serum PSA and PAP measurements discriminating patients with prostate carcinoma from patients with nodular hyperplasia. J. Nate Med Assoc, 1994, 86: 667-670

163. Shimizu T., Kida Y., Kuwano K. A dipalmitoylated lipoprotein from Mycoplasma pneumoniae activates NF-kappa B through TLR1, TLR2, and TLR6.// J Immunol, 2005, v.-175(7), pp.-4641-4646.

164. Shimizu T., Kida Y., Kuwano K. L.Lipid-associated membrane proteins of Mycoplasma fermentans and M. penetrans activate human immunodeficiency virus long-terminal repeats through Toll-like receptors. // Immunology//2004, v.-113(l), pp.- 121-129.

165. Shmueli, A., Oren, M. Life, death, and ubiquitin: taming the mule. (2005) Cell, 121, 963-965.

166. Silverman N. & Maniatis T. NF-kB signaling pathways in mammalian and insect innate immunity // Genes Dev, 2001, v.-15, pp.-2321-2342.

167. Soussi T., P. May. Structural aspect of the p53 protein in relation to gene evolution: a second look. J.Mol. Biol. 1996, v260, p.623-637

168. Stevens M.K. and Krause D.C. Mycoplasma pneumoniae cytadherence phase-variable protein HMW3 is a component of the attachment organelle // J Bacteriol, 1992, v.-174, pp.-4265-4274.

169. Sun G., Xu X., Wang Y., Shen X., Chen Z., Yang J. Mycoplasma pneumoniae infection induces reactive oxygen species and DNA damage in A549 human lung carcinoma cells // Infect Immun, 2008, v.-76(10), pp.-4405-13.

170. Sun Z. et al. PKC-0 is required for TCR-induced NF-kB activation in mature but not immature T lymphocytes // Nature, 2000, v.-404, pp.-402^107.

171. Sun, G., et al., Mycoplasma pneumoniae infection induces reactive oxygen species and DNA damage in A549 human lung carcinoma cells. Infect Immun, 2008. 76(10): p. 4405-13.

172. Susan Elmore. Apoptosis: A Review of Programmed Cell Death. Toxicol Pathol. 2007; 35(4): 495-516.

173. Sutcliffe S. and Platz E. Iflammation and prostate cancer: A focus infections. J. Urology Repots, 2008. 9(3): p. 1527-2737.

174. Takeda K, Takeuchi O, Akira S. Recognition of lipopeptides by Toll-like receptors. Endotoxin Res., 2002, 8: p. 459-463. 31,39,41,45,47,51.

175. Tam W. F. & Sen R. IkB family members function by different mechanisms // J. Biol. Chem, 2001, v.-276, pp.-7701-7704.

176. Taylor WR, Stark GR. Regulation of the G2/M transition by p530ncogene. 2001 Apr 5;20(15):1803-15.

177. Tewari M, Mishra RR, Shukla HS. Salmonella typhi and gallbladder cancer: report from an endemic region. Tewari M, Mishra RR, Shukla HS. Hepatobiliary Pancreat Dis Int. 2010 0ct;9(5):524-30.

178. Tibbetts RS, Brumbaugh KM, Williams JM, Sarkaria JN, Cliby WA, Shieh SY, Taya Y, Prives C, Abraham RT A role for ATR in the DNA damage-induced phosphorylation of p53. Genes Dev. 1999 Jan 15; 13(2): 1527.

179. Truant R, Antunovic J, Greenblatt J, Prives C, Cromlish JA.Direct interaction of the hepatitis B virus HBx protein with p53 leads to inhibition by HBx of p53 response element-directed transactivation. J Virol. 1995 Mar;69(3): 1851 -9.

180. Tsai, S,, et al., Mycoplasmas and oncogenesis: persistent infection and multistage malignant transformation. Proc Natl Acad Sci USA, 1995. 92(22): p. 10197-201.

181. Tully J. G., and S. Razin (ed.). Molecular and diagnostic procedures in mycoplasmology, vol. II. Diagnostic procedures // Academic Press, Inc., San Diego, Calif, 1996.

182. Ushio, S., et al., Metastasis-promoting activity of a novel molecule, Ag 243-5, derived from mycoplasma, and the complete nucleotide sequence. Microbiol Immunol, 1995. 39(6): p. 393-400.

183. Van der Eb A.J., van Kesteren J.W., van Bruggen E.F.J. Structural properties of adenovirus DNAs. // Biochem. Biophys. Acta, 1969, v.- 182, pp.- 530-541.

184. Van Meir E.G., Polverini, P.J., Chazin, V.R., Su Huang, H.J., de Tribolet, N., Cavenee, W.K. (1994) Nat. Genet., 8, 171-176'

185. Verma I.M., Stevenson J.K., Schwarz E.M., Van Antwerp D. & Miyamoto S. Rel/NF-kB/IkB family: intimate tales of association and dissociation // Genes Dev, 1995, v.-9, pp.-2723-2735.

186. Vousden KH. p53: death star. Cell. 2000 Nov 22;103(5):691-4.

187. Wagenlehner FM, Elkahwaji JE, Algaba F, Bjerklund-Johansen T, Naber KG, Hartung R, Weidner W.The role of inflammation and infection in the pathogenesis of prostate carcinoma. BJU Int., 2007.100(4):733-7.

188. Walerych D, Kudla G, Gutkowska M, Wawrzynow B, Muller L, King FW, Helwak A, Boros J, Zylicz A, Zylicz M. Hsp90 chaperones wild-type p53 tumor suppressor protein. J. Biol. Chem. (2004) 279:48836-48845.

189. Wang C. et al. TAK1 is a ubiquitin-dependent kinase of MKK and IKK. Nature, 2001, v.-412, pp.-346-351.

190. Wassenaar T.M. and Gaastra W. Bacterial virulence: can we draw the line? // FEMS Microbiol Lett, 2001, V.-201, pp.-1-7.

191. Watanabe, T., et al., Helicobacter pylori infection induces gastric cancer in mongolian gerbils. Gastroenterology, 1998.115(3): p. 642-8.

192. Wei Chia-Lin, Qiang Wu, Vinsensius B. Vega, Kuo Ping Chiu h coaBT.A Global Map of p53 Transcription-Factor Binding Sites in the Human Genome Cell, Volume 124, Issue 1, 207-219, 13 January 2006

193. Willby M.J. and Krause D.C. Characterization of a Mycoplasma pneumoniae hmw3 mutant: implications for attachment organelle assembly // J Bacteriol, 2002, v.-184, pp.-3061-3068.

194. Woronicz J.D., Gao X., Cao Z., Rothe M., and Goeddel D.V. IkB kinase-P: NF-kB activation and complex formation with IkB kinase-a and NIK // Science, 1997, v.-278, pp.-866-869.

195. Wren B.W. Microbial genome analysis: insights into virulence, host adaptation and evolution //Nat Rev Genet, 2000, v.-l, pp.-30-39.

196. Wu Z. H., Shi Y., Tibbetts R. S. & Miyamoto S. Molecular linkage between the kinase ATM and NF-kB signaling in response to genotoxic stimuli. Science, 2006, v.-311, pp.-l 141-1146.

197. Xie W, Wang Y, Huang Y, Yang H, Wang J, Hu Z.Toll-like receptor 2 mediates invasion via activating NF-kappaB in MDA-MB-231 breast cancer cells. Biochem Biophys Res Commun. 2009 Feb 20;379(4):1027-32

198. Xiong Y, et al. p21 is a universal inhibitor of cycline kinases . Nature 1993, v366, p701-4

199. Yaswen P, Campisi J. (2007). Oncogene-induced senescence pathways weave an intricate tapestry. Cell 128: 233-234.

200. You, X.X., Y.H. Zeng, and Y.M. Wu, Interactions between mycoplasma lipid-associated membrane proteins and the host cells. J Zhejiang Univ Sci B, 2006. 7(5): p. 342-50.

201. Zandi E., Rothwarf D.M., Delhase M., Hayakawa M., and Karin M. The IkB kinase complex (IKK) contains two kinase subunits, IKKa and IKKf3, necessary for IkB phosphorylation and NF-kB activation // Cell, 1997, v.-91, pp.-243-252.

202. Zhang B, Shih JW, Wear DJ, Tsai S, Lo SC. High-level expression of H-ras and c-myc oncogenes in mycoplasma-mediated malignant cell transformation. Proc Soc Exp Biol Med, 1997. 214: p.359-408.

203. Zhang B, Shih JW, Wear DJ, Tsai S, Lo SC. High-level expression of H-ras and c-myc oncogenes in mycoplasma-mediated malignant cell transformation. Proc Soc Exp Biol Med, 1997. 214: p.359-408. 69,71,86.

204. Zhang, S., et al., Mycoplasma fermentans infection promotes immortalization of human peripheral blood mononuclear cells in culture. Blood, 2004. 104(13): p. 4252-9.

205. Zhang, S., S. Tsai, and S.C. Lo, Alteration of gene expression profiles during mycoplasma-induced malignant cell transformation. BMC Cancer, 2006. 6: p. 116

206. Zylicz M, King FW, Wawrzynow A. Hsp70 interactions with the p53 tumour suppressor protein. EMBO J. (2001) 20:4634-4638.