Микробиология нозокомиальной синегнойной инфекции: мониторинг распространенности, биологические особенности возбудителя и новые подходы к диагностике тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.02.03, кандидат наук Кузнецова, Марина Валентиновна

• Кузнецова, Марина Валентиновна
• кандидат наук
• 2015

Оглавление диссертации кандидат наук Кузнецова, Марина Валентиновна

СОДЕРЖАНИЕ

ВВЕДЕНИЕ

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Этиологическое значение Pseudomonas aeruginosa и разнообразие нозологических форм

синегнойной инфекции

1.2. Микробиологическая характеристика Р. aeruginosa

1.2.1. Общая характеристика микроорганизма

1.2.2. Продукция факторов патогенности и антибактериальных веществ

1.2.3. Подвижность и пленкообразующая способность

1.2.4. Pseudomonas aeruginosa в планктонной и пленочной смешанной культуре in vitro (антагонистическая активность)

1.2.5. Влияние экзопродуктов Р. aeruginosa на функциональную активность нейтрофилов

1.2.6. Распространенность фенотипов резистентности

1.2.6.1. Молекулярная эпидемиология бактерий Р. aeruginosa, продуцирующих карбапенемазы

1.3. Методы микробиологического анализа для идентификации, типирования и оценки

патогенного потенциала Pseudomonas aeruginosa

1.3.1. Бактериологический метод

1.3.2. Молекулярные технологии, используемые для генотипической характеристики Pseudomonas aeruginosa

1.3.2.1. Идентификация и прямая детекция

1.3.2.2. Методы генетического типирования

1.3.3.3. Генотипы вирулентности и антибиотикоустойчивости

ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ

ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ

2.1. Анализ медицинской документации

2.2. Бактериальные штаммы

2.3. Среды и условия культивирования

2.4. Молекулярно-генетические исследования

2.4.1. Идентификация/детекция бактерий

2.4.2. Генетическая детерминация эффекторов TTSS

2.4.3. Определение детерминант антибиотикоустойчивости

2.4.4. Проведение секвенирующей реакции

2.4.5. Методы генетического типирования

2.5. Фенотипические методы определения факторов патогенное™

2.5.1. Определение степени гидрофобности поверхности бактериальных клеток (ВАТН-тест)

2.5.2. Определение адгезивных свойств

2.5.3. Определение биопленкообразующей способности

2.5.4. Определение экзопродуктов

2.5.5. Определение гемолитической активности

2.6. Фенотипическая оценка антибиотикоустойчивости

2.7. Оценка интенсивности биолюминесценции

2.8. Экстракция АТФ из клеток в составе биопленок и определение концентрации

внутриклеточного АТФ

2.9. Экспериментальные процедуры по изучению антагонистической активности P. aeruginosa

и оценке ее роли в межвидовых взаимоотношениях

2.9.1. Оценка антагонистической активности супернатантов P. aeruginosa

2.9.2. Определение токсичности супернатантов P. aeruginosa

2.9.3. Оценка влияния супернатантов P. aeruginosa на планктонные и биопленочные культуры Е. coll

2.9.4. Совместное культивирование P. aeruginosa и Е. coli

2.10. Оценка апоптоза, некроза и продукции активных форм кислорода нейтрофилов

2.11. Микроскопические методы оценки биопленок (атомно-силовая и лазерная сканирующая

конфокальная микроскопия)

2.12. Статистические методы

ГЛАВА 3. МОНИТОРИНГ PSEUDOMONAS AERUGINOSA В СТАЦИОНАРАХ РАЗЛИЧНОГО ПРОФИЛЯ ВЗРОСЛОЙ И ПЕДИАТРИЧЕСКОЙ МЕДИЦИНСКОЙ СЕТИ

3.1. Инфицированность пациентов и частота встречаемости P. aeruginosa в спектре микробных

культур

3.2. Распространенность P. aeruginosa в стационарах хирургического профиля

3.2.1. Частота выделения P. aeruginosa от пациентов, госпитализированных в хирургические стационары различного профиля

3.2.2. Характеристика антибиотикоустойчивости изолятов P. aeruginosa

3.2.3. Микробные ассоциации с участием P. aeruginosa при гнойно-септических осложнениях у пациентов стационаров хирургического профиля

3.2.4. Роль P. aeruginosa в этиологии инфицированных ожоговых ран

3.3. Особенности циркуляции P. aeruginosa в акушерских стационарах

ГЛАВА 4. МОЛЕКУЛЯРНЫЕ МЕТОДЫ В ИДЕНТИФИКАЦИИ/ДЕТЕКЦИИ, ТИПИРОВАНИИ И ОЦЕНКЕ КЛИНИЧЕСКОЙ ЗНАЧИМОСТИ НОЗОКОМИАЛЬНЫХ ШТАММОВ P. AERUGINOSA

4.1. Сравнительный анализ применения культурального и молекулярно-генетического методов

для определения видовой принадлежности P. aeruginosa

4.2. Применение ПЦР-анализа для контроля обсемененности объектов внешней среды

4.3. Генотипирование нозокомиальных культур P. aeruginosa

4.3.1. Сравнительная оценка диагностической значимости RAPD- и Rep-ПЦР при генотипировании клинических изолятов P. aeruginosa

4.3.2. Эпидемиологическая характеристика (основные геномоварианты) P. aeruginosae, циркулирующих в ЛПУ различного профиля

4.3.3. Генетическое разнообразие />/аохл-50-Пке как основа выявления родства изолятов

P. aeruginosa

4.4. Молекулярные механизмы устойчивости нозокомиальных штаммов P. aeruginosa к бета-

лактамным антибиотикам

4.4.1. Распространенность оксациллиназ с БЛРС-фенотипом

4.4.2. Поиск и изучение генов, кодирующих металло-бета-лактамазы

4.5. Генетические профили цитотоксичности штаммов P. aeruginosa

4.6. Использование мультилокусной ПЦР-тест системы в оценке клинико-

эпидемиологической значимости изолятов P. aeruginosa

ГЛАВА 5. ХАРАКТЕРИСТИКА БИОЛОГИЧЕСКИХ СВОЙСТВ НОЗОКОМИАЛЬНЫХ ШТАММОВ P. AERUGINOSA

5.1. Разнообразие фенотипов клинических штаммов P. aeruginosa

5.2. Оценка пигментообразования штаммами P. aeruginosa

5.3. Комплексная оценка гемолитической активности P. aeruginosa

5.3.1. Внеклеточные факторы гемолитической активности

5.3.2. Клеточно-ассоциированный гемолиз

5.4. Особенности формирования биопленок нозокомиальными штаммами P. aeruginosa

5.4.1. Взаимосвязь гидрофобных свойств поверхности, адгезивной активности и биопленкообразующей способности клеток бактерий

5.4.2. Биопленкообразующая способность как маркер госпитальности клинических изолятов

5.5. Оценка потенциальной патогенности клинических штаммов P. aeruginosa

биолюминесцентным методом

5.6. Модификация биологических свойств клинических штаммов P. aeruginosa при

многократных пересевах и хранении на искусственных питательных средах

ГЛАВА 6. ХАРАКТЕРИСТИКА СИМБИОТИЧЕСКИХ/АНТАГОНИСТИЧЕСКИХ ВЗАИМООТНОШЕНИЙ P. AERUGINOSA И КЛИНИЧЕСКИ ЗНАЧИМЫХ УПМ В ПЛАНКТОНЕ И БИОПЛЕНКЕ (in vitro)

6.1. Изучение межвидовых взаимодействий нозокомиальных штаммов в биопленках

6.1.1. Влияние супернатантов УПМ на пленкообразующую способность P. aeruginosa

6.1.2. Формирование смешанных биопленок P. aeruginosa с представителями других таксонов УПМ

6.2. Влияние экзометаболитов P. aeruginosa на планктонные и пленочные культуры Е. coli.All

6.3. Характер взаимоотношений P. aeruginosa и Е. coli при совместном культивировании в

планктоне и биопленке

6.4. Влияние супернатантов смешанной культуры Р. aeruginosa и Е. coli на апоптоз, некроз и

окисислительную активность нейтрофилов

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

ВЫВОДЫ

ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ

СПИСОК УСЛОВНЫХ СОКРАЩЕНИЙ

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Микробиология нозокомиальной синегнойной инфекции: мониторинг распространенности, биологические особенности возбудителя и новые подходы к диагностике»

ВВЕДЕНИЕ

Актуальность темы исследования. Pseudomonas aeruginosa (синегнойная палочка) является хорошо известным возбудителем инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи (ИСМП), у ослабленных больных с тяжелой соматической или хирургической патологией и остается наиболее важным микроорганизмом, ответственным за развитие легочной патологии при муковисцидозе. Как отмечают многие исследователи, синегнойная палочка занимает особое место в развитии инфекционных осложнений в отделениях реанимации и интенсивной терапии (ОРИТ), доминируя в этиологии нозокомиальной пневмонии, связанной, в основном, с искусственной вентиляцией легких (ИВЛ), и определяя высокий уровень атрибутивной летальности (Torres A., Carlet J., 2001; Lyczak J.B. et al., 2002; Зубков M.H., 2003; Сидоренко C.B., 2003,2005; Руднов В.A. и соавт., 2005,2011 ; Решедько Г.К. и соавг., 2006; Govan J.R. et al., 2007; Vincent J.L. et al., 2009; Kohlenberg A. et al., 2010; Bertrand X., Dowzicky M.J., 2012 и др.).

Способность P. aeruginosa колонизировать практически любой орган или ткань и вызывать разнообразные инфекционные процессы, в том числе с летальным исходом, связана со значительным арсеналом факторов вирулентности. Часть из них ассоциирована с клеточной стенкой (жгутики, пили, «непилевые» адгезины, альгинат, липополисахарид), другие - являются экстрацеллюлярными продуктами (экзотоксин А, гемолизины, протеазы, пиоцианин, пиовердин и др.) (Berka R.M., Vasil M.L., 1982; Frank D.W., 1997; Van Delden С., Iglewski B.H., 1998; Armstrong S. et al., 2002; Davey M. et al., 2003; Шагинян И.А., Чернуха М.Ю., 2005; Filloux А., 2011 и др.). Продукция большинства из них контролируется регуляторным комплексом «quorum sensing» (QS), включающим межклеточные сигнальные системы, что позволяет бактериям продуцировать эти факторы скоординированно. Под контролем этой системы находится синтез практически всех внеклеточных энзимов, проявляющих токсические свойства, и образование биопленок, обеспечивающих им защиту от антибактериальных препаратов (АБП), а также влияния иммунной системы макроорганизма. Высокая резистентность к различным классам антимикробных препаратов является важным свойством P. aeruginosa, которое обеспечивается, прежде всего, за счет особенности строения клеточной стенки, ферментативной продукции и систем активного выброса (эффлюкс-систем) антибиотиков (Livermore D.M., 2002; Queenan A.M., Bush К., 2007).

Популяции синегнойной палочки гетерогенны по способности к синтезу и секреции различных метаболитов, и принято считать, что нозокомиальные эковары отличает повышенная вирулентность. Однако остается до конца не выясненным, что обеспечивает ее рост: расширение спектра экспрессируемых факторов патогенности или увеличение активности тех из них,

которые потенцируются в специфических условиях внутрибольничной среды. Эффективность микробиологического мониторинга в стационарах различного профиля в значительной степени зависит от используемых при этом диагностических тестов. Из многочисленных свойств синегнойной палочки в лабораторной практике в лучшем случае определяют пигментообразование, гемолитическую и фосфолипазную активность при культивировании на соответствующих агаризованных средах, учитывая лишь факт наличия того или иного признака. Такой подход не позволяет оценить истинный уровень вирулентности изолята и делает невозможным сравнительный анализ циркулирующих штаммов. Многочисленными исследованиями установлена многофакторность процесса биопленкообразования у P. aeruginosa (O'Toole G.A., Kolter R., 1998; Klausen M. et al., 2003; Ghafoor A. et al., 2011; Маянский A.II, и соавт., 2012 и др.), но его значение в контексте внутрибольничной природы изолятов до конца не определено.

Пациенты с иммунодефицитными состояниями особенно уязвимы в отношении полиэтиологичных инфекций, частота возникновения которых превышает 50% (Шпрыкова О.В., 2004; Ustin J.S., Malangoni M.A., 2011 и др.). Развитие микст-инфекции зачастую определяется возможностью межвидового взаимодействия и зависит, прежде всего, от антагонистической активности бактерий, входящих в сообщество (Бухарин О.В. и соавт., 2005, 2007). В ассоциациях с другими грамотрицательными и грам положительным и бактериями или грибами P. aeruginosa занимает различные позиции (Tomlin K.L., 2001; Bandara II.M. et al., 2010; Yang L. et al., 2011; Machado I.M. et al., 2012; Conway С.A. et al., 2012). Большая часть исследователей рассматривает процессы, происходящие в смешанной культуре, либо только в планктоне, либо только в биопленке (Chu W. et al., 2012; Machado I.M. et al., 2012). Единичные исследования посвящены влиянию экзопродуктов в составе супернатантов Р. aeruginosa на рост в планктоне и биопленкообразование Е. coli, и наоборот (Valle J. et al., 2006; Lopes S.P. et al., 2011 ). В доступной литературе не обнаружено информации о смешанной культуре Е. coli и внутрибольничной Р. aeruginosa с различной предоминантной формой существования («биопленочная» или «планктонная»), тогда как преимущественный фенотип может влиять на физиологическую адаптацию микроорганизмов в многовидовых сообществах. Пока недостаточно данных, связанных с влиянием внеклеточных факторов Р. aeruginosa на зрелую/сформированную биопленку других видов бактерий (Irïe Y. et al., 2005; Qin Zh. et al., 2009).

Для оценки антимикробных свойств экзометаболитов используют подход, основанный на их способности ингибировать биолюминесценцию бактерий-мишеней (Simon L. et al., 2001; Zrimec M.B. et al., 2004; Несчисляев В.А. и соавт., 2002; Дерябин Д.Г., 2009). Включение полного люкс-оперона в Е. coli (Данилов B.C. и соавт., 2002) позволяет по биолюминесценции оценить бактериальную метаболическую активность одного из членов ассоциации в смешанной культуре.

Но использование биолюминесценции как показателя антагонистических взаимоотношений в многовидовых биопленках не показано.

Использование клеточных моделей для изучения взаимодействия бактерий в смешанных культурах показывает, что их уровень цитотоксичности выше по сравнению с моновидовым действием. В доступной литературе чаще описано влияние на клетки макроорганизма «чистых» экзопродуктов P. aeruginosa. Выявлено, что пиоцианин усиливает апоптоз нейтрофилов in vitro (Usher L.R. et al., 2002) и in vivo (Allen L. et al., 2005). Кроме этого, обнаружено, что экзополисахарид P. aeruginosa Psl, участвующий в формировании биопленки, угнетает комплемент-опосредованную опсонизацию бактерий, снижает продукцию реактивных кислородных радикалов нейтрофилами и, соответственно, их фагоцитарную активность (Mishra М. et al., 2012). Показана индукция апоптоза нейтрофилов периферической крови после введения липополисахарида Е. coli in vivo (Chikayama Y. et al., 2002). Можно полагать, что от присутствия в среде экзометаболитов микробного происхождения, синтез которых может изменяться в смешанных культурах, зависит функциональная активность нейтрофилов и других эффекторов иммунитета.

Идентификация синегнойной палочки в практических бактериологических лабораториях осуществляется культуральным методом согласно Приказу Минздрава СССР от 22.04.85 г. №535 и «Методическим рекомендациям ...» МЗ РСФСР от 03.06.1986 г. Для видовой идентификации P. aeruginosa с помощью ПЦР используют различные генетические мишени: tax А, gyrB, cfiC, algD, oprl и oprL (Da Silva Filho L.V., 1999; Khan A.A., Cerniglia C.E., 1994; Lavenir R. et al., 2007; Motoshima M. et al., 2007 и др.). В целом проблема привлечения современных технологий для генотипической характеристики нозокомиальных изолятов P. aeruginosa далека от своего решения: нет единого мнения и регламентирующих документов, определяющих обязательные ДНК-мишени и соответствующие праймеры для идентификации и типирования P. aeruginosa.

Таким образом, высокая распространенность и атрибутивная летальность от внутрибольничного инфицирования P. aeruginosa в сочетании с недостаточно информативной лабораторной оценкой биологических особенностей нозокомиальных изолятов, необходимость внедрения новых технологий микробиологического анализа в диагностику синегнойной инфекции, назревшая потребность в уточнении роли микробного фактора в развитии инфекционного процесса послужили основанием для проведения настоящего исследования.

Цель исследования: комплексная оценка фено- и генотипических особенностей нозокомиальных штаммов P. aeruginosa с использованием традиционных и новых технологий микробиологического анализа как основы совершенствования диагностики и мониторинга госпитальной синегнойной инфекции.

Задачи исследования:

1. Оценить многолетнюю динамику распространенности P. aeruginosa, определить ее место в общей таксономической структуре микроорганизмов, изолированных в терапевтических, хирургических и акушерских стационарах, а также определить значимость возбудителя при развитии основных клинических форм инфекции. Проанализировать особенности циркуляции P. aeruginosa в детской и взрослой клинике.

2. Оценить целесообразность молекулярно-генетических подходов при определении видовой принадлежности, антибиотикоустойчивости, цитотоксичности изолятов в клинической практике, а также оптимизировать методы их детекции/идентификации и генотипирования для повышения эффективности мониторинга синегнойной инфекции.

3. Дать характеристику биологических свойств нозокомиальных штаммов P. aeruginosa в зависимости от профилизации стационара и исследуемого клинического материала с количественной оценкой продукции гшоцианина, пиовердина, гемолизинов, учитывая влияние различных факторов и сроков хранения культур.

4. Оценить биопленкообразующую способность P. aeruginosa in vitro в зависимости от функциональных особенностей штаммов и некоторых абиотических факторов. Установить наиболее информативные показатели, характеризующие клинико-эпидемиологическую значимость изолятов, и предложить интегральный критерий для оценки их потенциальной патогенности.

5. В экспериментальных условиях изучить характер симбиотических/антагонистических взаимоотношений P. aeruginosa с клинически значимыми условно-патогенными микроорганизмами (УПМ) в планктоне и биопленках. Оценить влияние супернатантов смешанной культуры на апоптоз, некроз и окислительную активность нейтрофилов человека in vitro.

Научная новизна работы. Впервые на основе комплексного ретроспективного сравнительного анализа официальных статистических данных охарактеризованы особенности циркуляции штаммов P. aeruginosa в детской (акушерской и подростковой) и взрослой (терапевтической и хирургической) клинике. Предложена принципиальная схема, определяющая значимость эндогенного и экзогенного инфицирования пациентов разных возрастных групп в зависимости от профиля стационара.

Дополнены данные по частоте встречаемости у штаммов P. aeruginosa генов, кодирующих эффекторЕз1 секреторной системы третьего типа (TTSS), в зависимости от характера и структуры ЛПУ (поликлинические и нозокомиальные изоляты, ОРИТ и «неОРИТ»), биологического материала, присутствия металло-бета-лактамаз (МБЛ). Показана возможность использования

мультиплексной ПЦР для одновременной идентификации и детекции маркеров антибиотикоустойчивости и цитотоксичности с целыо определения эпидемиологической/клинической значимости изолятов.

С использованием комплекса современных лабораторных тестов изучены внутриболышчные штаммы P. aeruginosa и представлена сравнительная характеристика данных о гемолитической активности, продукции пиоцианина и пиовердина, способности к адгезии и биопленкообразованию, в том числе с оценкой корреляционных связей между признаками. Обоснована необходимость использования количественных характеристик таких показателей. Впервые проведена оценка вклада экзометаболитных и клегочно-ассоциированных факторов в гемолитическую активность клинических изолятов, предложен термин «гемолитический профиль» культуры. Изучена взаимосвязь разных факторов, определяющих пленкообразующую способность P. aeruginosa. Впервые на основе ряда признаков с использованием рутинных и специальных методов, включающих атомно-силовую, лазерную сканирующую конфокальную микроскопию и АТФ-метрию, сформулирована гипотеза о предоминантной форме существования P. aeruginosa- «планктонной» или «биопленочной». Показано, что определяемая в биопленках концентрация внутриклеточного АТФ, характеризующая энергетический статус клеток в определенной фазе формирования биопленки, является важнейшим критерием для отбора штаммов с преимущественной «биопленочной» формой существования.

Предложены и апробированы оригинальные тесты и дополнительные критерии для микробиологической характеристики этиопатогенов: 1) метод оценки потенциальной патогенности изолятов P. aeruginosa, основанный на изменении свечения люминесцентного тест-штамма при действии их экзометаболитов; 2) способ оценки характера межмикробных взаимоотношений в смешанных культурах, основанный на сравнении полученной экспериментально и теоретически рассчитанной биомассы многовидовой биопленки; 3) способ контроля бактериальной обсемененности объектов окружающей среды в медицинских учреждениях, основанный на молекулярио-генетическом анализе. Впервые предложено использовать сравнение нуклеогидных последовательностей гена Ыаохмоьи (SLST) для определения родства штаммов в локальных исследованиях (в ЛПУ замкнутого контура).

Впервые проанализирован характер взаимодействия P. aeruginosa в смешанной культуре с учетом ее предоминантной формы существования, которая определяется значительной гетерогенностью, присущей внутрибольничным популяциям данного вида. При этом выявлены однонаправленные эффекты у всех изученных штаммов P. aeruginosa при росте в смешанной культуре, а именно снижение общего уровня пиоцианина и пиовердина, подавление метаболического обмена Е. coli, повышение биомассы биопленки в соответствии с детерминированной формой существования. Установлено, что в смешанном биопленочном

сообществе биологическая активность ассоциантов подчиняется общим закономерностям, описанным для монокультур. Впервые определен характер межвидовых взаимоотношений в планктонных и пленочных культурах P. aeruginosa и Е. coli с использованием биолюминесцентного анализа. Показано, что антагонистическая активность Р. aeruginosa в отношении ассоцианта в планктоне сохраняется и в биопленке, способствуя выживанию клеток синегнойной палочки. Более того, при любом типе взаимоотношений с участием Р. aeruginosa, последняя, как правило, занимает «выгодное» положение в различных экологических нишах.

Впервые изучено модифицирующее влияние ассоциантов на повреждающее действие (апоптоз и некроз нейтрофилов) культуральных супернатантов Р. aeruginosa in vitro, что, скорее всего, отражает эффекты при микст-инфекции in vivo.

Теоретическая значимость работы. Результаты проведенных исследований позволили сформулировать концепцию, дополняющую существующую гипотезу о роли микробного фактора в развитии инфекционного процесса, обусловленного Р. aeruginosa. Фенотипическое разнообразие, опосредованное гетерогенностью популяций Р. aeruginosa, благоприятствует колонизации различных биотопов макроорганизма, определяет многообразие нозологических форм синегнойной инфекции, течение инфекционного процесса - хроническое или острое, либо присутствие инфекта в микробиоте факультативных видов в качестве комменсалов. Характер межвидовых взаимоотношений с сопутствующей, как правило, также условно патогенной микрофлорой, детерминирован не только высокой антагонистической активностью Р. aeruginosa в отношении ассоциантов, но и различными стратегиями выживания с учетом предоминантной формы существования, позволяющим бактериям данного вида занимать наиболее «выгодное» положение в смешанных сообществах. Многокомпонентные биопленки с участием Р. aeruginosa отличаются массивностью и часто превосходят совокупные параметры моновидовых биопленок ассоциантов. Однако в их структуре жизнеспособность сохраняет преимущественно синегнойная палочка, используя и/или уничтожая «сожителей» за счет ими же спровоцированной гиперпродукции входящих в матрикс экзометаболитов, которые обеспечивают ее высокий антагонистический потенциал. Можно полагать, что наиболее тяжелое течение и моно-, и микст-инфекций связано с участием особых высоковирулентных клонов Р. aeruginosa, которые могут формироваться в ЛПУ, либо попадать в них извне. При этом возникновение смешанных инфекций связано с присоединением Р. aeruginosa к УПМ, первично инфицировавшим тот или иной биотоп, но не наоборот. Поэтому, как правило, P. aeruginosae препятствуют развитию других микроорганизмов, однако, легко входят в ассоциации и могут присоединяться к текущему инфекционному процессу. Это определяет и высокую долю полимикробных инфекций с участием Р. aeruginosa.

Практическая значимость работы. Получены данные, характеризующие распространенность и особенности циркуляции штаммов P. aeruginosa в разных возрастных группах. По результатам исследований создана электронная база основных фенотипов, профилей антибиотикорезистентности и генотипов P. aeruginosae, циркулирующих в стационарах г. Перми, способствующая осуществлению эпиднадзора на территориальном уровне. Определены основные механизмы устойчивости к бета-лактамным антибиотикам в стационарах взрослой и детской медицинской сети. Предложены необходимые бактериологические, биохимические и молекулярно-генетические тесты для комплексной оценки патогенного потенциала P. aeruginosa, оптимизированы подходы для типирования (определения родства) штаммов и разработан алгоритм их использования в системе эпиднадзора за госпитальными инфекциями на примере данного возбудителя. Предложен способ оценки межмикробных взаимоотношений в смешанных биопленочных культурах, который поможет прогнозировать характер развития инфекционного процесса при микст-инфекциях. Использование подхода с применением молекулярно-генетического анализа для контроля обсемененности внешней среды лечебных учреждений повысит его качество. С учетом того, что в хирургических стационарах г. Перми циркулируют штаммы P. aeruginosa генотипа ехоЦ^/Ыамтг, предложена мультиплексная ПЦР для выявления эпидемически значимых нозокомиальных изолятов. Для определения возможного развития микст-инфекции целесообразно оценивать и прогнозировать характер взаимоотношений P. aeruginosa в смешанных культурах in vitro с учетом изменения биолюминесценции тест-штамма, отражающей энергетический статус ассоцианта.

Основные положения, выносимыс на защиту:

1. Современной особенностью нозокомиальной синегнойной инфекции является неравнозначность роли P. aeruginosa во взрослой и неонатальной клинике. Сохраняется приоритет возбудителя в ИСМП в хирургических стационарах взрослой сети, с доминированием в этиологии пневмоний, раневых, ожоговых и урологических инфекций, в том числе в составе ассоциаций с К. pneumoniae, A. bawnannii и Е. coli. В учреждениях родовспоможения P. aeruginosa не играет существенной роли ни в качестве колонизирующего микроорганизма, ни в качестве этиопатогена у новорожденных.

2. Диагностическая чувствительность и специфичность культурального метода и молекулярно-генетических технологий для идентификации P. aeruginosa сопоставимы и взаимозаменяемы в клинической практике. Методы молекулярной детекции маркеров цитотоксичности TTSS exoS и e.xoU, антибиотикорезистентности biasim и intl, а также генотипнрования rep-ПЦР и SLST blaoxA-so оптимальны для быстрой оценки локальной эпидемиологической ситуации.

3. Для характеристики гемолитической активности нозокомиальных штаммов Р. aeruginosa целесообразно анализировать «гемолитический профиль» культуры, складывающийся из термолабильного и термостабильного экзометаболитных компонентов, а также самостоятельно значимого клеточно-ассоциированного гемолиза. Штаммовые фенотипические характеристики, основанные на спектрофотометрическом количественном анализе факторов патогенности, коррелируют с предлагаемым индексом потенциальной патогенности, определяемым по изменению биолюминесценции тест-культуры Е. coli lux+.

4. Массивность биопленки, жизнеспособность и энергетический статус входящих в нее клеток, наряду с другими морфо-функциональными особенностями, в том числе адгезивная активность и гидрофобность, а также их изменения в разных условиях обитания отражают адаптационные возможности Р. aeruginosa и являются важнейшим критерием для отбора штаммов с преимущественной «планктонной» или «биопленочной» формой существования.

5. Различные стратегии выживания Р. aeruginosa, обусловленные значительной гетерогенностью внутрибольничных популяций, зависят от ее антагонистической активности, предоминантной формы существования и отражаются на характере взаимоотношений с ассоциантами в планктонных и биопленочных смешанных культурах.

Связь работы с научными программами. Диссертация выполнена в соответствии с планом научно-исследовательской работы ГБОУ ВПО «Пермская государственная медицинская академия им. ак. Е.А. Вагнера» Министерства здравоохранения Российской Федерации (ректор — заслуженный деятель науки РФ, д.м.н., профессор И.П. Корюкина) на кафедре микробиологии и вирусологии с курсом клинической лабораторной диагностики (№ Государственной регистрации темы 01.2.00709668) в рамках комплексной темы НИР «Общественное здоровье и научные основы обеспечения санэпидблагополучия в Пермском крае» и в лаборатории молекулярной микробиологии и биотехнологии ФГБУН Института экологии и генетики микроорганизмов УрО РАН (директор - д.м.н., член-корр. В.А. Демаков). Исследования выполнены при финансовой поддержке Министерства образования и науки РФ (Государствешп>ш заказ № 01200709668 по теме «Научные основы обеспечения и эпидемиологические механизмы профилактики различных инфекционных заболеваний» на 201213 гг.). Работа также поддержана Российским фондом фундаментальных исследований (Грант №07-04-96093-р_урал_а «Исследование детерминант устойчивости сапрофитных грамотрицательных бактерий почвенной среды и факультативных комменсалов человека, с оценкой их перспективности для конструирования векторов клонирования», Грант №14-0401300 «Влияние экзопродуктов смешанных культур Pseudomonas aeruginosa и Escherichia coli на функциональную активность нейтрофилов»).

Личный вклад автора. При планировании, организации и проведении исследований по всем разделам работы доля личного участия автора составляла не менее 80%. Автору принадлежит формулирование проблемы, постановка цели, задач и дизайна исследования, анализ фактического материала и обобщение результатов, подготовка научных публикаций и патентов.

Ряд экспериментальных исследований был выполнен на базе лабораторий ФГБУН ИЭГМ УрО РАН. Автор благодарит за предоставленную возможность и содействие сотрудников и заведующих лабораториями: д.м.н., профессора Ткаченко А.Г., д.м.н., профессора Ширшева С.В., чл.-корр., д.б.н., профессора Ившину И.Б., а также Авдееву Н.С. (зав. референс-лабораторией, созданной на базе ГБУЗ ПК ГКБ №7 г. Перми, главного бактериолога г. Перми) и Проворову С.В. (зав. лабораторией ООО «ПРО-МЕД») за предоставленные данные по распространенности, возбудителя и помощь в сборе культур Р. aeruginosa, к.б.н. Эйдельштейна М.В. (зав. лабораторией антибиотикорезистентности НИИ антимикробной химиотерапии, ГБОУ ВПО «СГМА» МЗ РФ) за помощь в работе и ценные советы по интерпретации результатов молекулярно-генетических исследований.

Степень достоверности и апробация работы. Достоверность результатов исследования подтверждается анализом многолетней медицинской документации референс-лаборатории и других практических лабораторий города, значительным объемом собственных исследований, выполненных с применением современных, адекватных поставленным задачам бактериологических и молекулярно-генетических методов, использованием референтных штаммов, полученных из различных коллекций. Основные феномены, обнаруженные и изученные в ходе экспериментального исследования, были воспроизведены в опытах с разными клиническими штаммами Р. aeruginosa. Полученные результаты обработаны с использованием лицензионных программ и современных методов статистического анализа.

Диссертация апробировалась на заседании кафедры микробиологии и вирусологии с циклом КЛД ГБОУ ВПО «ПГМА им. ак. Е.А. Вагнера» МЗ РФ 27 марта 2014 г. (протокол № 9), межкафедральном научном координационном совете по проблемам общественного здоровья и санитарно-эпидемиологического обеспечения населения ГБОУ ВПО «ПГМА им. ак. Е.А. Вагнера» МЗ РФ 11 апреля 2014 г. (протокол № 1) и проблемной комиссии ФГБУН ИЭГМ УрО РАН 25 апреля 2014 г. (протокол №3). Основные результаты диссертации докладывались и обсуждались на научно-практической конференции «Современные проблемы эпидемиологии» (Н.Новгород, 2007), Международной конференции «Генетика и биотехнология XXI века. Фундаментальные и прикладные аспекты» (Минск, 2008), VII Международной конференции «Загрязнение окружающей среды, адаптация, иммунитет» (Пермь-Н.Новгород, 2008), VII Всероссийской конференции по проблеме «Персистенция микроорганизмов» (Оренбург, 2009),

Краевой конференции «Проблема синегнойной инфекции в реанимационных отделениях ЛПУ» (Пермь, 2009), Российских выставках «Медицина и здоровье» (Пермь, 2012, 2013), научно-практических конференциях по медицинской микологии - XV и XVII Кашкинские чтения (Санкт-Петербург, 2012, 2014), а также представлены на X, XII и XIV Международных конгрессах по антимикробной терапии MAKMAX/ESCMID (Москва, 2008, 2010, 2012) и 4th Congress of European Microbiologists (Geneva, 2011).

Оптимизированные методы идентификации/детекции и генотипирования изолятов P. aeruginosa используются в референс-лаборатории Пермского края на базе ГБУЗ ПК «Городская клиническая больница №7», ГБУЗ «Ордена «Знак Почета» Пермская краевая клиническая больница», МБУЗ «Городская больница №1 имени академика Вагнера Евгения Антоновича» г. Березники. Результаты выполненных исследований используются в лекционном курсе и на практических занятиях при обучении студентов и клинических интернов на кафедре микробиологии и вирусологии с курсом КЛД ГБОУ ВПО «ПГМА им. ак. Е.А. Вагнера» МЗ РФ.

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Кузнецова, Марина Валентиновна, 2015 год

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

1. Абаев, Ю.К. Госпитальная инфекция у новорожденных / Ю.К. Абаев // Дет. хирургия. -2006. - № 5. - С.36-41.

2. Белобородова, II.В. Микробные биопленки / Н.В. Белобородова, И.Т. Байрамов // Гнойно-септические заболевания у детей. Мат. V Моск. конф. с участием регионов России и стран СНГ. - М.: НЦ ССХ им. A.M. Бакулева РАМН, 2009. - С.7-38.

3. Белокрысенко, С.С. Выделение и сравнительная оценка методов идентификации клинических штаммов Stenotrophomonas maltophilia / С.С. Белокрысенко, А. Дадха Теграни // Клин. лаб. диагностика. - 2004. - № 6. - С. 37-38.

4. Бережанский, Б.В. Катетер-ассоциированные инфекции кровотока / Б.В. Бережанский, A.A. Жевнерев // Клин, микробиол. антимикроб, химиотер. - 2006. - Т. 8, № 2. - С. 130-144.

5. Брусина, Е.Б. Внутрибольничные инфекции, обусловленные формированием госпитального штамма / Е.Б. Брусина, И.П. Рычагов // Сгерилиз. госпи г. инф. — 2006. — № 2. — С. 32-34.

6. Бухарин, О.В. Ассоциативный симбиоз / О.В. Бухарин, Е.С. Лобакова, Н.В. Немцева, C.B. Черкасов - Екатеринбург: УрО РАН, 2007. - 264 с.

7. Бухарин, О.В. Механизмы выживания бактерий / О.В. Бухарин, А.Л. Гинцбург, Ю.М. Романова. - М.: Медицина, 2005. - 367 с.

8. Бухарин, О.В. Характеристика антагонистической активности пробиотических бактерий при их взаимодействии / О.В. Бухарин, A.B. Семенов, C.B. Черкасов // Клин, микробиол. антимикроб, химиотер. - 2010. - Т. 12, № 4. - С. 347-352.

9. Влияние бактериальных ауторегуляторных молекул (гомосеринлактонов и алкилоксибензолов) на окислительный метаболизм клеточных эффекторов естественного иммунитета / Д.Г. Дерябин, Т.Г. Свиридова, Г.И. Эль-Регистан, В.А. Черешнев // Микробиология. -2013.-Т. 82, №2.-С. 147.

10. Воропаева, С.Д. Микрофлора женских половых путей и ее чувствительность к антибактериальным препаратам / С.Д. Воропаева // Гинекология: реф. журнал. — 2005. - № 11.-С. 64-70.

11. Гельфанд, Б.Р. Этиологическая и нозологическая структура госпитальных инфекций в отделении реанимации хирургического профиля / Б.Р. Гельфанд, Б.З. Белоцерковский, Т.В. Попов//Инфекции в хирургии.-2003.-Т. 1,№4.-С. 2-10.

12. Генотипические особенности штаммов Pseudomonas aeruginosa, циркулирующих в хирургическом стационаре / Л.Р. Аветисян [и др.] // Журн. микробиол. - 2009. -№ 5. - С. 33-38.

13. Гординская, H.A. Фенотипические и молекулярно-генетические особенности возбудителен раневой ожоговой инфекции / Н.А Гординская, Е.В. Сабирова, II.В. Абрамова // Клин, микробиол. антимикроб, химиотер. - 2012. - Т. 14, № 4. - С. 342-346.

14. Громашевский, Л.В. Избранные труды. В трех томах. / Л.В. Громашевский. - Киев: Здоров'я, 1987.

15. Дерябин, Д.Г. Бактериальная биолюминесценция: фундаментальные и прикладные аспекты / Д.Г. Дерябин. - М.: Наука, 2009. - 246 с.

16. Ермолов, A.C. Микробная этиология гнойно-септических осложнений в различных хирургических подразделениях стационара / A.C. Ермолов, Д.Д. Меньшиков, H.A. Карасев // Стерил. госпит. инфек. - 2007. - Т. 2, № 4. - С. 39-43.

17. Ефременко, E.H. Гетерогенные биокатализаторы на основе иммобилизованных клеток микроорганизмов: фундаментальные и прикладные аспекты: автореф. дис. ... док. биол. наук: 03.00.02; 03.00.23 / Ефременко Елена Николаевна. - Москва, 2009. - 51 с.

18. Ждашок, A.C. Нозокомиальная пневмония у травматологических больных: результаты проспективного наблюдательного исследования / A.C. Ждашок, О.У. Стецюк, О.В. Сивая // Клин, микробиол. антимикроб, химиотер. - 2010. - Т. 12, № 2. - С. 106-116.

19. Захарова, И.Н. Инфекции мочевой системы у детей: современные представления об этиологии / И.Н. Захарова // Нефрол. диализ. - 2001. - Т. 3, № 1. - С. 20-23.

20. Зоркин, С.Н. Взгляд на антибактериальную терапию у детей с урологической патологией / С.Н. Зоркин, Л.К. Катосова, 3.11. Музыченко // Лечащий врач. - 2010. - № 8. - С. 6-10.

21. Зубков, М.Н. Диагностика и антимикробная терапия катетер-ассоциированных инфекций кровотока / М.Н. Зубков // Хирургия. - 2008. - № 1. - С. 18-22.

22. Зубков, М.Н. Неферментирующие бактерии: классификация, общая характеристика, роль в патологии человека. Идентификация Pseudomonas spp. и сходных микроорганизмов / М.Н Зубков // Инф. антимикроб, тер. - 2003. - Т. 5, № 1. - С. 1-16.

23. Зуева, Л.П. Эпидемиологическая диагностика/ Л.П. Зуева, Р.Х. Яфаев, С.Р. Еремин. -СПб: ГОУ ВПО СПбГМА им. И.И. Мечникова МЗ России, 2003.-264 с.

24. Иванов, Д.В. Особенности антибиотикочувствительности важнейших грамотрицательных возбудителей нозокомиальных инфекций / Д.В. Иванов, Н.Д. Бунятян, Д.Б. Утешев // Вест. Росс, гос. мед. ун-та. - 2009. - № 2. - С. 26-29.

25. Ильина, Т.С. Системы коммуникаций у бактерий и их роль в патогенности / Т.С. Ильина, Ю.М. Романова, А.Л. Гинцбург // Мол. генетика, микробиол. вирусол. - 2006. - № 3. - С. 22-29.

26. Илюкевич, Г.В. Синегнойная инфекция в ОРИТ: современное состояние проблемы / Г.В Илюкевич, В.М. Смирнов, H.H. Левшина // Медицинские новости. - 2008. - 6 с.

27. Инфекции в ОРИТ России: результаты национального многоцентрового исследования /

B.А. Руднов [и др.] // Клин, микробиол. антимикроб, химиотер. - 2011. - Т. 13, № 4. - С. 294-303.

28. Исследование распространенности метало-бета-лактамаз в Российской Федерации / Черкашин Е.А. [и др.] // Вестн. Моск. ун-та. Сер. Химия. - 2006. - № 47 (3). - С. 83-86.

29. Ковалева, Е.П. Внутриболышчные инфекции в педиатрии / Е.П. Ковалева, H.A. Семина // Эпидемиол. инф. бол. - 2002. - № 5. - С. 4-6.

30. Козлов, P.C. Нозокомиальные инфекции: эпидемиология, патогенез, профилактика, контроль / P.C. Козлов // Клин, микробиол. антимикро. химиотер. - 2000. - Т. 2. № 1. - С. 16-30.

31. Красовский, С.А. Остеопороз, частота деформаций позвонков и периферических переломов, уровень костных биохимических маркеров и витамина D у взрослых больных муковисцидозом / С.А. Красовский, И.А. Баранова, Н.В. Демин // Материалы X Национального конгресса «Муковисцидоз у детей и взрослых». - 2011. - С. 52-62.

32. Крутиков, М.Г. Контроль инфекции в ожоговом стационаре [Электронный ресурс] / М.Г. Крутиков // Комбустология. - 2003. 14; hUp://\v\vw.burn.ru/all/number/show/?id=3531.

33. Крючкова, Т.П. Микробиологический мониторинг и эпидемиологический надзор за внутрибольничными инфекциями в стационарах Краснооктябрьского района г. Волгограда: дис.... канд. мед.наук: 03.00.07 / Крючкова Татьяна Петровна - Волгоград, 2005. - 123 с.

34. Кузнецова, О.П. Инфекции мочевыводящих путей (I часть) / О.П. Кузнецова, П.А. Воробьев, C.B. Яковлев // Рус. мед. журнал. - 1997. - Т. 5, № 2. - С. 81-90.

35. Лещенко, И.А. Ретроспективный анализ причин и тяжести микробных кератитов, связанных с ношением контактных линз / И.А. Лещенко // Совр. оптометрия. - 2011. — № 9. -

C. 22-24.

36. Лопаткин, H.A. Неосложненные и осложненные инфекции мочеполовых путей. Принципы антибактериальной терапии / H.A. Лопаткин, И.И. Деревянко // Рус. мед. журнал. - 1997. - Т. 5, №24.-С. 1579-1588.

37. Лопухов, Л.В. Полимеразная цепная реакция в клинической микробиологической диагностике / Л.В. Лопухов, М.В. Эйделыптейн // Клин, микробиол. антимикроб, химиотер. -2000.-Т. 2, № 3. - С. 96-100.

38. Магданова Л.А., Голясная Н.В. Гетерогенность как адаптивное свойство бактериальной популяции / Л.А. Магданова, Н.В. Голясная // Микробиология. -2013. - Т. 82, № 1. - С. 3-13.

39. Маркович, II.И. Эпидемиолого-микробиологические и организационные ресурсы повышения эффективности эпидемиологического надзора и контроля за гнойно-септическими инфекциями новорожденных и родильниц: автореф. дис. ... док. мед. наук: 14.02.02 / Маркович Нина Ивановна. - Пермь, 2011. - 49 с.

40. Маянский, А.Ы. Pseudomonas aeruginosa: характеристика биопленочного процесса / A.II. Маянский // Мол. генетика микробиол. вирусол. - 2012. -№ 1. - С. 3-8.

41. Маянский, А.Н. Межвидовые взаимодействия бактерий и образование смешанной (полимикробной) биопленки / А.Н. Маянский, И.В. Чеботарь, II.И. Евтеева // Журн. микробиол. -2012.-№ 1.-С. 93-101.

42. Методика изучения адгезивного процесса микроорганизмов / В.И. Брилис [и др.] // Лаб. дело. - 1986. - № 4. - С. 210-212.

43. Методические указания МУК 4.2.1890-04 «Определение чувствительности микроорганизмов к антибактериальным препаратам» (утв. Главным государственным санитарным врачом РФ 4 марта 2004 г.). 158 с.

44. Милько, Е.С. Морфологические и физиолого-биохимические особенности диссоциантов Pseudomonas aeruginosa / Е.С. Милько, Л.П. Мартынкина // Микробиология. - 1996. - Т. 65, № 5. -С. 352-356.

45. Мингболатова, П.А. Влияние бактериального агента на цилиарную активность слизистой оболочки среднего уха / П.А. Мингболатова // Рос. оториноларингол. - 2008. — № 6. — С. 83-88.

46. Мороз, А.Ф. Синегнойная инфекция / А.Ф. Мороз, Н.Г. Анциферова, Н.В. Баскакова // Под ред. А.Ф. Мороз. - М.: Медицина, 1988. - 256 с.

47. Мусина, Л.Т. Этиология и нозология внутрибольничных гнойно-воспалительных заболеваний у новорожденных детей / Л.Т. Мусина, H.A. Семина, Гладкова К.К. // Рос. вестн. перинатол. педиат. - 1995. - Т. 40, № 1. - С. 39-42.

48. Неферментирующие грамотрицательные возбудители нозокомиальных инфекций в ОРИТ России: проблемы антибиотикорезистентности / Г.К. Решедько [и др.] // Клин, микробиол. антимикроб, химиотер. - 2006. - Т. 8, № 3. - С. 243-259.

49. Николаев, Ю.А. Биопленка - "город микробов" или аналог многоклеточного организма? / Ю.А. Николаев, В.К. Плакунов // Микробиология. -2007. - Т. 76, № 2. - С. 149-163.

50. Николаев, Ю.А. Регуляция адгезии у бактерий Pseudomonas fluorescens под влиянием дистантных межклеточных взаимодействий / Ю.А. Николаев // Микробиология. — 2000. - Т. 69, № 3. - С. 356-361.

51. Нозокомиальная пневмония у взрослых. Российские национальные рекомендации. Под ред. А.Г. Чучалина, Б.Р. Гельфанда. - М., 2009. - 91 с.

52. Нозокомиальная пневмония, связанная с искусственной вентиляцией легких (НПивл), у хирургических больных / Б.Р. Гельфанд [и др.]. - М., 2000. - 43 с.

53. Об унификации микробиологических методов исследования, применяемых в клинико-диагностических лабораториях лечпрофучреждений. Приказ МЗ СССР №535 от 22.04.85 г.

54. Олигонуклеотидный микрочип для идентификации генов карбапенемаз молекулярных классов А, В и D / М.М. Уляшова [и др.] // Acta Naturae. -2010. -№ 3. - С. 116-125.

55. Особенности микрофлоры нижних дыхательных путей у различных возрастных групп детей больных муковисцидозом / И.А. Шагинян [и др.] // Материалы X Национального конгресса «Муковисцидоз у детей и взрослых», 2011. - С. 64-71.

56. Персистенция штаммов Pseudomonas aeruginosa среди пациентов ФНЦ трансплантологии и искусственных органов / JI.P. Аветисян [и др.] // Журн. микробиол. - 2012. - № 4. - С. 99-104.

57. Подзолкова, II.М. Тяжелые бактериальные инфекции в акушерстве и гинекологии / ILM. Подзолкова, Т.Н. Никитина // Инф. антимикроб, тер. - 2004. - Т. 6, № 3. - С. 89-92.

58. Полное строение липополисахарида Pseudomonas aeruginosa иммунотипа 5 / O.B. Быстрова [и др.] // Биохимия. - 2004. -№ 69. - С. 211-217.

59. Распространенность и молекулярная эпидемиология грамотрицательных бактерий, продуцирующих металло-Р-лактамазы, в России, Белоруссии и Казахстане / М.В. Эйдельштейн [и др.] // КМАХ. - 2012. - Т. 14, №2.-С. 132-152.

60. Реброва, О.Ю. Статистический анализ медицинских данных. Применение пакета прикладных программ STATISTICA / О.Ю. Реброва. - М.: Медиа-Сфера, 2006. - 312 с.

61. Резистентность к антибиотикам грамотрицательных возбудителей нозокомиальных инфекций в ОРИТ многопрофильных стационаров России / Г.К. Решедько [и др.] // Клин, микробиол. антимикроб, химиотер. - 2008. - Т. 10, № 2. - С. 163-179.

62. Романова, Ю.М. Бактериальные биопленки как естественная форма существования бактерий в окружающей среде и организме хозяина / Ю.М. Романова, A.JI. Гинцбург // Журн. микробиол. - 2011 .-№ 3. - С. 99-109.

63. Руднов, В.А. Современное клиническое значение синегнойной инфекции и возможности ее терапии у пациентов отделений реанимации / В.А. Руднов // Инф. антимикроб, тер. - 2002. - Т. 4, №5.-С. 170-177.

64. Руднов, В.А. Антибиотикотерапия госпитальных инфекций, вызванных Р. aeruginosa / В.А. Руднов // Рус. мед. журнал. - 2005. - Т. 13, № 7. - С. 485-490.

65. Самсыгина, Г.А. Антибактериальная терапия сепсиса у детей (пособие для врачей) Комиссия по антибиотикополитике МЗ РФ и РАМН / Г.А Самсыгина. — М., 2003. - 12 с.

66. Самсыгина, Г.А. Госпитальные пневмонии у детей: этиология и клшшко-морфологические особенности / Г.А. Самсыгина, Т.А. Дудина, М.В. Чебышева // Педиатрия. - 2001. - № 1. — С. 58.

67. Сенсорные биолюминесцентные системы на основе /ztv-оперонов разных видов люминесцентных бактерий / B.C. Данилов [и др.] // Вестник МГУ. Серия Биология. -2002. —№ 3. - С. 20-24.

68. Сергевнин, В.И. Вопросы эпидемиологии гнойно-септических инфекций новорожденных /

B.И. Сергевнин // Глав. мед. сестра. - 2014. - № 3. - С. 80-85.

69. Сидоренко, С.В. Клиническое значение Pseudomonas aeruginosa / C.B. Сидоренко // Клин, фармакол. и тер. - 2003. - Т. 12, № 2. - С. 1 -7.

70. Сидоренко, С.В. Госпитальные инфекции, вызванные Р. aeruginosa. Распространение и клиническое значение антибиотикорезистентности / С.В. Сидоренко, С.П. Резван, Г.А. Стерхова,

C.А. Грудинина// Антиб. химиотер. - 1999. -№ 3. - С. 25-34.

71. Слабенко, Э.В. Микробиологическая и молекулярно-генетическая характеристика штаммов Р. aeruginosa — возбудителя внутрибольничных пневмоний у пациентов с черепно-мозговыми травмами: автореф. дис.... канд. мед. наук: 03.00.07 / Слабенко Эллада Владимировна. - Владивосток, 2007. - 25 с.

72. Способ определения антагонистической активности пробиотиков / В.А. Несчисляев [и др.] // Патент на изобретение РФ №2187801 от 10.07.2000. Бюл. № 23, 2002.

73. Справочник биохимика: пер. с англ. / Р. Досон, Д. Эллиот, У Эллиот, К. Джонс. — М.: Мир, 1991.-544 с.

74. Страчунский, JI.C., Сравнительная активность антисинегнойных антибиотиков в отношении нозокомиальных штаммов Р. aeruginosa, выделенных в отделениях реанимации и интенсивной терапии России / JI.C. Страчунский, Г.К. Решедько, О.У. Стецюк, исследовательская группа POCHET // Клин, микробиол. антимикроб, химиотер. — 2003. — № 5. — С. 35-46.

75. Структура возбудителей и их антибиотикорезистентность при инфекциях нижних конечностей у больных сахарным диабетом / В.В. Привольнев [и др.] // Клин, микробиол. антимикроб, химиотер. - 2009. - Т. 11, № 1. - С. 86-89.

76. Телятицкий, II.И. Нозокомиальная инфекция у новорожденных детей / II.И. Телятицкий, IO.K. Абаев // Мед. журнал. - 2010. - № 2. - С. 27-32.

77. Туркутюков, В.Б. Особенности формирования биологических пленок штаммами Р. aeruginosa при внутрибольничных пневмониях / В.Б. Туркутюков, Э.В. Слабенко, Д.В. Фомин // Дальневост. мед. журнал. - 2008. - № 1. - С. 59-61.

78. Фельдблюм, И.В. Сравнительная оценка различных подходов к изучению заболеваемости гнойно-септическими инфекциями среди родильниц в акушерских стационарах / И.В. Фельдблюм, Ю.А. Захарова, С.Г. Деменко // Мед. альманах - 2011. - № 5 (18). - С. 209-212.

79. Фельдблюм, И.В. Эпидемиологическая диагностика внутрибольничных гнойно-септических инфекций синегнойной этиологии на основе внутривидового типирования возбудителя / И.В. Фельдблюм, Ю.А. Захарова, A.M. Николаева, О.С. Федотова // Журн. микробиол.-2013.-№ 1.-С. 14-20.

80. Фоминых, С.Г. Раневые инфекции: значение микробиологического мониторинга при составлении больничного формуляра антимикробных препаратов / С.Г. Фоминых // Клинич. микробиол. антимикроб, химиотер.-2011.-Т. 13, №4.-С. 368-375.

81. Хайдуков, С.В. Цитометрический анализ в клинической иммунологии / С.В. Хайдуков, А.В. Зурочка, В.А. Черешнев // Екатеринбург: УрО РАН. 2011. - 220 с.

82. Цветкова, Н.А. Изучение частоты адаптивных мутантов и гетерогенности популяции клеток штаммов Pseudomonas aeruginosa АТСС 27853 и с фенотипом мелких колоний в результате действия ципрофлоксацина / Н.А. Цветкова, И.М. Гузачева, II.B. Голясная, J1.A. Беляева//Фунд. исследования.-2013.-№ 11 (ч.4).-С. 706-710.

83. Шагинян, И.А. Роль и место молекулярно-генетических методов в эпидемиологическом анализе внутрибольничной инфекции / И.А. Шагинян // Клинич. микробиол. антимикроб, химиотер. - 2000. - Т. 2, № 3. - С. 82-95.

84. Шагинян, И.А., Чернуха М.Ю. Нефермептирующие грамотрицательные бактерии в этиологии внутрибольничных инфекций: клинические, микробиологические и эпидемиологические особенности / И.А. Шагинян, М.Ю. Чернуха // Клин, микробиол. антимикроб, химиотер. -2005. -№ 7 (3). - С. 271-285.

85. Шаимова, В.А. Бактериальный кератит. Клинико-иммунологические особенности течения, прогноза, лечения разных форм заболевания (диссертация канд. мед. наук) / В.А. Шаимова. — Челябинск: УГМАДО, 2007.

86. Шаталова, Е.В. Взаимное влияние возбудителей при смешанной инфекции ожоговой травмы / Е.В. Шаталова, В.В. Вельский // Журн. микробиол. - 1999. -№ 4. - С. 3-7.

87. Шевченко, О.В. Металло-[3-лактамазы: значение и методы выявления у грамотрицательных неферментирующих бактерий / О.В. Шевченко, М.В. Эйделыптейн, М.Н. Степанова // Клин, микробиол. антимикроб, химиотер. - 2007. - Т. 9, № 3. - С. 211-218.

88. Шкарин, В.В. Эпидемиологический надзор за внутриболышчными инфекциями: учебное пособие / В.В. Шкарин, О.В. Ковалишена, А.С. Благонравова. - Н.Новгород: НижГМА, 2009. -124 с.

89. Шпрыкова, О.Н. Микробиологические и эпидемиологические особенности микробных ассоциаций при гнойно-септических инфекциях: автореф. дне. ... кан. мед. наук: 14.00.30 / Шпрыкова Ольга Николаевна. - Н.Новгород, 2004. — 23 с.

90. Этиология и микробиологическая диагностика нозокомиальных пневмоний у новорожденных / Г.Б. Фадеева [и др.] // Антиб. химиотер. - 2001. - Т. 46, № 5. - С. 17-22.

91. Этиология ИВЛ-ассоциированных пневмоний у недоношенных новорожденных / Мархулия Х.М. [и др.] // Педиатрия. - 2005. - № 3. - С. 36-40.

92. Этиология тяжелых госпитальных инфекций в отделениях реанимации и антибиотикорезистентность среди их возбудителей / С.В. Сидоренко [и др.] // Антиб. химиотер. - 2005. - № 50(2-3). - С. 33-41.

93. (ß/a.sub.VIM-2) cassette-containing novel integrons in metallo-(beta)-lactamase-producing Pseudomonas aeruginosa and Pseudomonas putida isolates disseminated in a Korean hospital / K. Lee [et al.] И Antimicrob. Agents. Chemother. - 2002. - V. 46. - P. 1053-1058.

94. 4-Hydroxy-2-nonylquinoline: a novel iron chelator isolated from a bacterial cell membrane / P. W. Royt [et al.] // Bioorganic Chemistry. - 2001. - V. 29. - P. 387-397.

95. A highly conserved repeated DNA element located in the chromosome of Streptococcus pneumoniae / B. Martin [et al.] II Nucleic Acids Res. - 1992. - V. 20. - P. 3479-3483.

96. A highly selective PCR protocol for detecting 16s rRNA genes of the genus Pseudomonas (sensu stricto) in environmental samples / F. Widmer \et al.] II Appl. Environ. Microbiol. — 1998. - V. 64(7). — P.2545-2553.

97. A novel extracellular phospholipase С of Pseudomonas aeruginosa is required for phospholipid Chemotaxis / A.P. Barker [et al.] И Mol. Microbiol. - 2004. - V. 53 (4). - P. 1089-1098.

98. A prolonged outbreak of Pseudomonas aeruginosa in a neonatal intensive care unit: did staff fingernails play a role in disease transmission? / R.L. Moolenaar [et al.] И Infect. Control IIosp. Epidemiol. - 2000. - V. 21. - P. 80-85.

99. A tandem repeats database for bacterial genomes: application to the genotyping of Yersiniapestis and Bacillus anthracis / P. Le Fleche [et al.] II BMC Microbiol. - 2001. - V. 1. - P. 2.

100. A universal primer multiplex PCR method for typing of toxinogenic Pseudomonas aeruginosa / II. Shi [et al.] // Appl. Microbiol. Biotechnol. - 2012. - V. 95(6). - P. 1579-1587.

101. Abdel-Mawgoud, A.M. Rhamnolipids: diversity of structures, microbial origins and roles / A.M. Abdel-Mawgoud, F. Lepine, E. Deziel // Appl. Microbiol. Biotechnol. - 2010. - V. 86 (5). - P. 13231336.

102. Adaptive response of single and binary Pseudomonas aeruginosa and Escherichia coli biofilms to benzalkonium chloride / I.M. Machado [et al.] II J. Basic Microbiol. - 2012. - V. 52(1). - P. 43-52.

103. Al-Bakri, A.G. Immigration and emigration of Burkholderia cepacia and Pseudomonas aeruginosa between and within mixed biofilm communities / A.G. Al-Bakri, P. Gilbert, D.G. Allison // J. Appl. Microbiol. - 2004. - V. 96(3). - P. 455-463.

104. Allison, D.G. The biofilm matrix /D.G. Allison //Biofouling. - 2003,- V. 19.-P. 139-150.

105. American Medical Association from the Centers for disease control and prevention. «Pseudomonas aeruginosa respiratory tract infections associated with contaminated ultrasound gel used for transesophageal echocardiography» // JAMA. - 2012. - V. 307(21). - P. 2248-2250.

106. An outbreak of imipenem-resistant Pseudomonas aeruginosa in an intensive care unit / S. Majumdar [et al.] II J. IIosp. Infect. -2004. - V. 58. - P. 160-161.

107. Antibiotic exposure and resistance development in Pseudomonas aeruginosa and Enterobacter species in intensive care units / D.S. Ong [et al.] II Crit. Care. Med. - 2011. - V. 39(11). - P. 2458-2463.

108. Antibiotic resistance pattern of Pseudomonas aeruginosa isolated from patients of lower respiratory tract infection / P. Tripathi [et al.] // Afr. J. Microbiol. Res. - 2011. - V. 5(19). - P. 29552959.

109. Antibiotic susceptibility and genotype patterns of Escherichia coli, Klebsiella pneumonia and Pseudomonas aeruginosa isolated from urinary tract infected patients / M.I. Abou-Dobara [et al.] II Pol. J. Microbiol. - 2010. - V. 59 (3). - P. 207-212.

110. Antifungal mechanisms by which a novel Pseudomonas aeruginosa phenazine toxin kills Candida albicans in biofilms / D.K. Morales [et al.] II Mol. Microbiol. -2010. -V.78. - P.1379-1392.

111. Armstrong, S. Insight into the catalytic mechanism of Pseudomonas aeruginosa Exotoxin A. Studies of toxin interaction with eukaryotic elongation factor-2 / S. Armstrong, S.P. Yates, A.R. Merrill // J. Biol. Chem. - 2002. - V. 277 (48). - P. 46669-46675.

112. Bacterial community morphogenesis is intimately linked to the intracellular redox state/ L.E. Dietrich [etal.]HL Bacteriol.-2013.- V. 195.-P. 1371-1380.

113. Baker, G.C. Review and re-analysis of domain-specific 16S primers / G.C. Baker, J.J. Smith, D.A. Cowan // J. Microbiol. Methods. - 2003. - V. 55(3). - P. 541-555.

114. Banin, E. Iron and Pseudomonas aeruginosa biofilm formation / E. Banin, M.L. Vasil, E.P. Greenberg.//Proc.Natl. Acad. Sei. U.S.A. -2005.- V. 102(31).-P. 11076-11081.

115. Banning, N. Persistence of biofilm associated Escherichia coli and Pseudomonas aeruginosa in groundwater and treated effluent in a laboratory model system / N. Banning, S. Toze, B.J. Mee // Microbiology. - 2003. - V. 149 (1). - P 47-55.

116. BdlA, a Chemotaxis regulator essential for biofilm dispersion in Pseudomonas aeruginosa / R. Morgan [el al.] II J. Bacteriol. - 2006. - V. 188. - P. 7335-7343.

117. Beare, P.A. Siderophore mediated cell signalling in Pseudomonas aeruginosa: divergent pathways regulate virulence factor production and siderophore receptor synthesis / P.A. Beare, R.J. For, L.W. Martin, I.L. Lamont // Mol. Microbiol. - 2003. - V. 47. - P. 195-207.

118. Berg, II.C. The rotary motor of bacterial flagella / II.C. Berg // Ann. Rev. Biochem. - 2003. -V. 72.-P. 19-54.

119. Berka, R.M. Phospholipase C (heat-labile hemolysin) of Pseudomonas aeruginosa: purification and preliminary characterization / R.M. Berka, M.L. Vasil // J. Bacteriol. - 1982. - V. 152 (1). - P. 239245.

120. Bertrand, X. Antimicrobial susceptibility among gram-negative isolates collected from intensive care units in North America, Europe, the Asia-Pacific Rim, Latin America, the Middle East, and Africa between 2004 and 2009 as part of the Tigecycline evaluation and surveillance trial / X. Bertrand, M.J. Dowzicky // Clin. Ther. - 2012. - V. 34.-P. 124-137.

121. Bester, E. Planktonic cell yield is linked to biofilm development / E. Bester, E.A. Edwards, G.M. Wolfaardt//Can. J. Microbiol.-2009.- V. 55(10).-P. 1195-1206.

122. Bhargava, N. N-acyl homoserine lactone mediated interspecies interactions between A. baumannii and P. aeruginosa / N. Bhargava, P. Sharma, N. Capalash // Biofouling. - 2012. - V. 28(8). - P.813-822.

123. Biedenbach, D.J. Occurrence and antimicrobial resistance pattern comparisons among bloodstream infection isolates from the SENTRY Antimicrobial Surveillance Program (1997-2002) / D.J. Biedenbach, G.J. Moet, R.N. Jones // Diagn. Microbiol. Infect. Dis. - 2004. -V. 50(1). - P. 59-69.

124. Biochemical sequence analyses of GES-1, a novel class A extended-spectrum b-lactamase, and the class 1 integron In52 from Klebsiella pneumonia / L. Poirel [et al.] // Antimicrob. Agents Chemother.

- 2000. - V. 44. - P. 622-632.

125. Biofilm formation by Escherichia coli is stimulated by synergistic interactions and co-adhesion mechanisms with adhercnce-proficient bacteria / M.H. Castonguay [et al.] II Res. Microbiol. — 2006. — V. 157(5).-P. 471-478.

126. Biofilm formation by Pseudomonas aeruginosa wild type, fiagella and type IV pili mutants / M. Klausen [et al.] //Mol. Microbiol.-2003. - V. 48(6). - P. 1511-1524.

127. Bitsori, M. Pseudomonas aeruginosa urinary tract infection in children: risk factors and outcomes / M. Bitsori, S. Maraki, S. Koukouraki, E. Galanakis // J. Urol. - 2012. - V. 187(1). - P. 260-264.

128. Bjarnsholt, T. Biofilm infections / T. Bjarnsholt // Springer. - 2011. - 314 p.

129. Blanc, D.S. Ribotyping of Pseudomonas aeruginosa-, discriminatory power and usefulness as a tool for epidemiological studies / D.S. Blanc, II.II. Siegrist, R. Sahli, P. Francioli // J. Clin. Microbiol.

- 1993,-V. 31.-P. 71-77.

130. BOX-PCR-based identification of bacterial species belonging to Pseudomonas syringae — P. viridijlava group / A.S.A. Marques [et al.] II Genet. Mol. Biol. - 2008. - V. 31. - P. 1415-1422.

131. Bradford, P.A. Extended-spectrum b-lactamases in the 21s1 Century: characterization, epidemiology, and detection of this important resistance threat / P. A. Bradford // Clin. Microbiol. - 2001. -V. 14.-P. 933-951.

132. Broad-spectrum biofilm inhibition by a secreted bacterial polysaccharide / J. Valle [et al.] II Proc. Natl. Acad. Sci. USA. -2006.-V. 103.-P. 12558-12563.

133. Burn wound infections / D. Church [et al.] II Clin. Microbiol. Rev. - 2006. - V. 19. - P. 403-434.

134. Bush, K. Updated functional classification of b-lactamases / K. Bush, G.A. Jacoby //Antimicrob. Agents. Chemother. - 2010. -V. 54. - P. 969-976.

135. Caiazza, N. Inverse regulation of biofilm formation and swarming motility by Pseudomonas aeruginosa PA14 /N. Caiazza, J. Merritt, J. Brothers, G. O'Toole // J. Bacteriol. - 2007. - V. 189(9). -P. 3603-1362.

136. Calfee, M.W. Interference with Pseudomonas Quinolone signal synthesis inhibits virulence factor expression by Pseudomonas aeruginosa / M.W. Calfee, J.P. Coleman, E.C. Pesci // Proc. Natl. Acad. Sei. USA. - 2001. - V. 98. - P. 11633-11637.

137. Can laboratory reference strains mirror 'real-world' pathogenesis? / C.A. Fux [at al.] II Trends. Microbiol. - 2005. - V. 13. - P. 58-63.

138. Capturing interaction between insoluble pyridinium-type polymer and bacterial cells / N. Kawabata [et al.] II Agr. Biol. Chem. - 1987. - V. 51(4). - P. 1085-1090.

139. Caspase-mediated proteolysis during apoptosis: insights from apoptotic neutrophils / D.M. Sanghavi [el al.] II FEBS. Lett. - 1998. -V. 422. - P. 179-184.

140. Cell-mediated cleavage of Pseudomonas exotoxin between Arg279 and Gly280 generates the enzymatically active fragment which translocates to the cytosol / M. Ogata [et al.] II J. Biol. Chem. -1992.-V. 267.-P. 25396-25401.

141. Chacko, B. Early onset neonatal sepsis / B. Chacko, I. Sohi // Indian J. Pediatr. - 2005. - V. 72. -P. 23-26.

142. Characterization and use of a DNA probe as an epidemiological marker for Pseudomonas aeruginosa/J.W. Ogle [et al.] Hi. Infect. Dis. - 1987. - V. 155.-P. 119-126.

143. Characterization of Pseudomonas aeruginosa isolates: occurrence rates, antimicrobial susceptibility patterns, and molecular typing in the global SENTRY antimicrobial surveillance program, 1997-1999 / A.C. Gales [el al.] II Clin. Infect. Dis. - 2001. - V. 15, N 32(2). - P. 146-155.

144. Characterization of the metallo-beta-lactamase determinant of Acinetobacter baumannii AC-54/97 reveals the existence of 6/aIMP allelic variants carried by gene cassettes of different phylogeny / M.L. Riccio [et al.] II Antimicrob. Agents Chemother. - 2000. - V. 44. - P. 1229-1235.

145. Characterization of unusual bacteria isolated from respiratory secretions of cystic fibrosis patients and description of Inquilinus limosus gen. nov., sp. nov. / T. Coenye [et al.] II J. Clin. Microbiol. - 2002. -V. 40.-P. 2062-2069.

146. Characterization of VIM-2, a carbapenem-hydrolyzing metallo-beta-lactamase and its plasmid-and integron-borne gene from a Pseudomonas aeruginosa clinical isolate in France / L. Poirel [et al.] II Antimicrob. Agents. Chemother. - 2000. - V. 44. - P. 891-897.

147. Chastre, J. Ventilator-associated pneumonia / J. Chastre, J.Y. Fagon // Am. J. Respir. Crit. Care Med.-2002.-V. 165.-P. 867-903.

148. Chromosomal ß-lactamase is packaged into membrane vesicles and secreted from Pseudomonas aeruginosa / O. Ciofu [et al.] II J. Antimicrob. Chemother. - 2000. - V. 45. - P. 9-13.

149. Clinical-epidemiological characteristics and outcome of patients with catheter-related bloodstream infections in Europe (ESGNI-006 Study) / P. Munoz [et al.] II Clin. Microbiol. Infect. - 2004. - V. 10. -P. 843-845.

150. Cloning and characterization of (6/a.sub.VIM), a new integron-borne metallo-(beta)-lactamase gene from a Pseudomonas aeruginosa clinical isolate / L. Lauretti [et al.] II Antimicrob. Agents. Chemother. - 1999. - V. 43. - P. 1584-1590.

151. Common virulence factors for bacterial pathogenicity in plants and animals / L.G. Rahme [et al.] II Science. - 1995. - V. 268. - P. 1899-1902.

152. Comparative diffusion assay to assess efficacy of topical antimicrobial agents against Pseudomonas aeruginosa in burns care / F. Aujoulat [et al.] II Ann. Clin. Microbiol. Antimicrob. - 2011. -V. 10.-P. 27.

153. Comparison of cell surface hydrophobicity and biofilm formation among ESBL-and non-ESBL-producing Pseudomonas aeruginosa clinical isolates / F. Norouzi [et al.] II Afric. J. Microbiol. Res. -2010.-V. 4(11).-P. 1143-1147.

154. Comparison of virulence factors in Pseudomonas aeruginosa strains isolated from contact lens-and non-contact lens-related keratitis / M.H. Choy [et al.] II J. Med. Microbiol. - 2008. - V. 57(12). -P. 1539-1546.

155. Complete genome sequence of Pseudomonas aeruginosa PAOl, an opportunistic pathogen / C.K. Stover [et al.] II Nature. - 2000. - V. 406(6799). - P. 959-964.

156. Contamination of a milk bank pasteuriser causing a Pseudomonas aeruginosa outbreak in a neonatal intensive care unit / C. Gras-Le Guen [et al.] II Arch. Dis. Child. Fetal. Neonatal. - 2003. -V. 88.-P. 434-535.

157. Control of Candida albicans metabolism and biofilm formation by Pseudomonas aeruginosa phenazines / D.K. Morales [et al.] II mBio. -2013. - V. 4. (1). - P. 1-9.

158. Convenient test for screening metallo-b-lactamase-producing gram-negative bacteria by using thiol compounds / Y. Arakawa [et al.] II J. Clin. Microbiol. - 2000. - V. 38. - P. 40-43.

159. Conway, C.A. Classics in infectious diseases. On the blue and green coloration that appears on bandages. By Carle Gessard (1850-1925) / C.A. Conway, N. Esiobu, J.V. Lopez // Rev. Infect. Dis. -1984 -V. 6.-P. 775-776.

160. Conway, C.A. Co-cultures of Pseudomonas aeruginosa and Roseobacter denitrificans reveal shifts in gene expression levels compared to solo cultures / C.A. Conway, N. Esiobu, J.V. Lopez // Sei. World Journal. - 2012. doi: 10.1100/2012/120108.

161. Cooperation and virulence in acute Pseudomonas aeruginosa infections / F. I-Iarrison [et al.] // BMC Biology. - 2006. - V. 4. - P. 21.

162. Cornelis, G.R. The type III secretion injectisome, a complex nanomachine for intracellular "toxin" delivery / G.R. Cornelis // Biol. Chem. - 2010. - V. 391. - P. 745-751.

163. Correlation between virulence factors and in vitro biofilm formation by Escherichia coli / P. Naves [et al.] II Microb. Pathog. - 2008. - V. 45. - P. 86-91.

164. Costerton, J.W. Bacterial biofilms: a common cause of persistence infections / J.W. Costerton, P.S. Stewart, E.P. Greenberg // Science. - 1999. - V. 284(5418). - P. 1318-1322.

165. Cystic Fibrosis Foundation Patient Registry. Annual Data Report. Bethesda, MD. 2011. Cystic Fibrosis Foundation.

166. Danese, P.N Exopolysaccharide production is required for development of Escherichia coli K-12 biofilm architecture / P.N. Danese, L.A. Pratt, R. Kolter // J. Bacteriol. - 2000. - V. 182. - P. 3593-3596.

167. Das, T. M. Pyocyanin promotes extracellular DNA release in Pseudomonas aeruginosa / T. Das, M. Manefield // PLoS One. - 2012. - V. 7(10). e46718.

168. Davey, M. Rhamnolipid surfactant production affects biofilm architecture in Pseudomonas aeruginosa PAOl / M. Davey, N. Caiazza, G. O'Toole //J. Bacteriology. -2003. -V. 185(3). - P. 10271036.

169. Davies, D.G. A fatty acid messenger is responsible for inducing dispersion in microbial biofilms / D.G. Davies, C.N. Marques//J. Bacteriol. - 2009. - V. 191.-P. 1393-1403.

170. Dawson, S.L. A comparative evaluation of five typing techniques for determining the diversity of fluorescent pseudomonads / S.L. Dawson, J.C. Fry, B.N. Dancer // J. Microbiol Meth. - 2002. - V. 50. - P. 9-22.

171. Dent, A. Descriptive and molecular epidemiology of Gram-negative bacilli infections in the neonatal intensive care unit / A. Dent, P. Toltzis // Curr. Opin. Infect. Dis. - 2003. - V. 16(3). - P. 279283.

172. Detection of Salmonella serovars from clinical samples by enrichment broth cultivation-PCR procedure / G.G. Stone // J. Clin. Microbiol. - 1994. - V. 32. - P. 1742-1749.

173. Development of a multilocus sequence typing scheme for the opportunistic pathogen Pseudomonas aeruginosa / B. Curran [et al.] II J. Clin. Microbiol. - 2004. - V. 42(12). - P. 5644-5649.

174. Deziel, E. Initiation of biofilm formation by Pseudomonas aeruginosa 57RP correlates with emergence of hyperpiliated and highly adherent phenotypic variants deficient in swimming, swarming, and twitching motilities / E. Deziel, Y. Comeau, R. Villemur // J. Bacteriol. - 2001. - V. 183. - P. 11951204.

175. Direct detection and identification of Pseudomonas aeruginosa in clinical samples such as skin biopsy specimens and expectorations by multiplex PCR based on two outer membrane lipoprotein genes, oprl and oprL / D. De Vos [et al.] II J. Clin. Microbiol. - 1997. - V. 35(6.) - P. 1295-1299.

176. Discriminatory power of three DNA-based typing techniques for Pseudomonas aeruginosa / II. Grundmann [et al.] Hi. Clin. Microbiol. 1995. -V. 33(3). - P. 528-534.

177. Dissemination of IMP-6 metallo-ß-lactamase-producing Pseudomonas aeruginosa sequence type 235 in Korea / Y. Seok [et al.] II J. Antimicrob. Chemother. - 2011. - V. 66. - P. 2791-2796.

178. Distribution of catabolic pathways in some hydrocarbon degrading bacteria from a subsurface polluted soil / L. Cavalca [et al.] II Res. Microbiol. - 2000. - V. 151. - P. 877-887.

179. Diverse mobilized class 1 integrons are common in the chromosomes of pathogenic Pseudomonas aeruginosa clinical isolates / E. Martinez [el al.] II Antimicrob. Agents Chemother. - 2012. - V. 56(4). -P. 2169-2172.

180. DNA microarray based detection of nosocomial pathogenic Pseudomonas aeruginosa and Acinetobacter baumannii / K.C. Keum [et al.] / Mol. Cell Probes. - 2006. - V. 20. - P. 42-50.

181. DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful genetic markers / J.G. Williams [et al.] //Nucleic. Acids Res. - 1990. -V. 18. - P. 6531-6535.

182. Domenighini, M. Three conserved consensus sequences identify the NAD-binding site of ADP-ribosylating enzymes, expressed by eukaryotes, bacteria and T-even bacteriophages / M. Domenighini, R. Rappuoli // Mol. Microbiol. - 1996. - V. 21. - P. 667-674.

183. Donlan, R.M. Biofilms and device-associated infections / R.M. Donlan // Emerg. Infect. Dis. -2001.-V. 7.-P. 277-281.

184. Doyle, T.B. The complex flagellar torque generator of Pseudomonas aeruginosa / T.B. Doyle, A.C. Hawkins, L.L. McCarter//J. Bacteriol.-2004. - V. 186.-P. 6341-6350.

185. Driscoll, J.A. The epidemiology, pathogenesis and treatment of Pseudomonas aeruginosa infections / J.A. Driscoll, S.L. Brody, M.II. Kollef// Drugs. -2007. - V. 67. - P. 351-368.

186. Emergence of multi-drug-resistant Pseudomonas aeruginosa isolates in neonatal septicemia / R. Moniri [et al.] // J. Infect. Dis. Antimicrob. Agents. - 2005. - V. 22. - P. 39-44.

187. Endemicity, molecular diversity and colonisation routes of Pseudomonas aeruginosa in intensive care units / X. Bertrand [et al] II Int. Care Med. - 2001. - V. 27. - P. 1263-1268.

188. European Centre for Disease Prevention and Control. European Antimicrobial Resistance Surveillance Network (EARS-Net) (Internet). Solna, Sweden: European Centre for Disease Prevention and Control, 2012. Available from: http://www.ecdc.europa.eu/en/activitics/surveillance/ears-net.

189. Evaluation of a nine-locus variable-number tandem-repeat scheme for typing of Pseudomonas aeruginosa / J.F. Turton [et al.] II Clin. Microbiol. Inf. - 2010. - V. 16(8). - P. 1111-1116.

190. Evaluation of the DiversiLab System for detection of hospital outbreaks of infections by different bacterial species / A.C. Fluit [et al.] // J. Clin. Microbiol. 2010. - V. 48(11). - P. 3979-3989.

191. Evaluation of the polymorphisms associated with tandem repeats for Pseudomonas aeruginosa strain typing / L. Onteniente [et al.] II J. Clin. Microbiol. - 2003. - V. 41(11). - P. 4991-4997.

192. Examination of the behavior of Escherichia coli in biofilms established in laboratory-scale units receiving chlorinated and chloraminated water / M.N.B. Momba [et al.] II Water Res. - 1999. -V. 33(13).-P. 2937-2940.

193. Exopolysaccharides from Burkholderia cenocepacia inhibit neutrophil Chemotaxis and scavenge reactive oxygen species / J. Bylund [et al.] II J. Biol. Chem. - 2006. - V. 281(5). - P. 2526-2532.

194. ExoU expression by Pseudomonas aeruginosa correlates with acute cytotoxicity and epithelial injury / V. Finck-Barbancon [et al.] II Mol. Microbiol. - 1997. - V. 25(3). - P. 547-557.

195. ExoY, an adenylate cyclase secreted by the Pseudomonas aeruginosa type III system / T.L. Yahr [et al.] // Proc. Natl. Acad. Sei. USA. - 1998. - V. 95. - P. 13899-13904.

196. Filloux, A. Protein secretion systems in Pseudomonas aeruginosa: an essay on diversity, evolution and function / A. Filloux // Front Microbiol. - 2011. - V. 2. - P. 155.

197. First identification of Pseudomonas aeruginosa isolates producing a KPC-type carbapenem-hydrolyzing-lactamase / M.V. Villegas [et al.] II Antimicrob. Agents Chemother. - 2007. - V. 51. - P. 1553-1555.

198. FitzSimmons, S.C. The changing epidemiology of cystic fibrosis / S.C. FitzSimmons // J. Pediatr. - 1993. -V. 122.-P. 1-9.

199. Fluit, A.C. Antimicrobial resistance in European isolates of Pseudomonas aeruginosa. European SENTRY Participants / A.C. Fluit, J. Verhoef, F.J. Schmitz // Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. - 2000. -V. 19(5).-P. 370-374.

200. Foglia, E. A. Ventilator-associated pneumonia in neonatal and pediatric intensive Care Unit patients / E. Foglia, M.D. Meier, A. Elward // Clin. Microbiol. Rev. - 2007. - V. 20(3). - P. 409-425.

201. Frank, D.W. The exoenzyme S regulon of Pseudomonas aeruginosa / D.W. Frank // Mol. Microbiol. - 1997. - V. 26. - P. 621 -629.

202. Functional analysis of genes for biosynthesis of pyocyanin and phenazine-l-carboxamide from Pseudomonas aeruginosa PAOl / D.V. Mavrodi [et al.] II J. Bacteriol. - 2001. - V. 183(21). - P. 64546465.

203. Gales, A.C. Antimicrobial resistance among Gram-negative bacilli isolated from Latin America: results from SENTRY antimicrobial surveillance program (Latin America, 2008-2010) / A.C. Gales, M. Castanheira, R.N. Jones, H.S. Sader// Diagn. Microbiol. Infect. Dis. -2012. - V. 73(4). - P. 354-360.

204. Gales, A.C. Global assessment of the antimicrobial activity of polymyxin B against 54 731 clinical isolates of Gram-negative bacilli: report from the SENTRY antimicrobial surveillance programme

(2001 -2004) / A.C. Gales, R.N. Jones, U.S. Sader // Clin. Microbiol. Infect. -2006. -V. 12(4)-P. 315321.

205. Gao, A. Population biology of Propionibacterium acnes and Pseudomonas aeruginosa in ophthalmic infections and the development of novel diagnostic tools / A. Gao // A thesis submitted in fulfilment for the Degree of Doctor of Philosophy in Microbiology. 2009.

206. Genetic features of Pseudomonas aeruginosa isolates from cystic fibrosis patients compared with those of isolates from other origins / P. Lanotte [et al.] II J. Med. Microbiol. - 2013. - V. 62, N 7. -P. 1015-1024.

207. Genomic analysis reveals that Pseudomonas aeruginosa virulence is combinatorial / D. Lee [et al.] II Genome Biol. - 2006. - V. 7(10). - P. 90.

208. Genotypic and phenotypic analysis of type III secretion system in a cohort of Pseudomonas aeruginosa bacteremia isolates: evidence for a possible association between O serotypes and exo genes / P. Berthelot [et al.] II J. Infect. Dis. - 2003. - V. 188. - P. 512-518.

209. Genotyping of Pseudomonas aeruginosa strains isolated from burn patients by RAPD-PCR / F. Nanvazadeh [et al.] II Burns. - 2013. - V. 39(7). - P. 1409-1413.

210. Gerber, N.N. Microbial phenazines. Handbook of Microbiology, Volume III: Microbial Products // CRC Press, eds. Laskin A. I.; Lechevalier II. A., 1973. - P.329-332.

211. GES-2, a class A b-lactamase from Pseudomonas aeruginosa with increased hydrolysis of imipenem / L. Poirel [et al.] II Antimicrob. Agents Chemother. - 2001. - V. 45. - P. 2598-2603.

212. GES-18, a new carbapenem-hydrolyzing GES-type ß-lactamase from Pseudomonas aeruginosa that contains Ile80 and Serl70 residues / C. Bebrone [et al.] II Antimicrob. Agents Chemother. - 2013. -V. 57.-P. 396-401.

213. Ghafoor, A. Role of exopolysaccharides in Pseudomonas aeruginosa biofilm formation and architecture / A. Ghafoor, I.D Hay., B.H.A. Rehm // Appl. Environ. Microbiol. - 2011. - V. 77(15). -P. 5238-5246.

214. Gibson, J. Pseudomonas aeruginosa - Candida albicans interactions: localization and fungal toxicity of a phenazine derivative / J. Gibson, A. Sood, D.A. Hogan // J. Appl. Environ. Microbiol. -2009. - V. 75(2). - P. 504-513.

215. Girlich, D. Biochemical characterization of the naturally occurring oxacillinase OXA-50 of Pseudomonas aeruginosa / D. Girlich, T. Naas, P. Nordmann // Antimicrob. Agents. Chemother. - 2004. -V. 48. - P. 2043-2048.

216. Goel, V. Ventilator associated pneumonia in a medical intensive care unit: Microbial aetiology, susceptibility patterns of isolated microorganisms and outcome / V. Goel, S.A. Hogade, S.G. Karadesai // Ind. J. Anaesthesia. - 2012. - V. 56(6). - P. 558-562.

217. Govan, J.R.W. Evolving epidemiology of Pseudomonas aeruginosa and the Burkholderia cepacia complex in cystic fibrosis lung infection / J.R.W. Govan, A.R. Brown, A.M. Jones // Future Microbiol. -2007,- V. 2.-P. 153-164.

218. Govan, J.R.W. Microbial pathogenesis in cystic fibrosis: mucoid Pseudomonas aeruginosa and Burkholderia cepacia / J.R.W. Govan, V. Deretic // Microbiol. Rev. - 1996. - V. 60(3). - P. 539-574.

219. Hassan, U.M. Mechanism of the antibiotic action pyocyanine / U.M. Hassan, I. Fridovich // J. Bactcriol. — 1980. - V. 141.-P. 156-163.

220. Ilauser, A.R. PepA, a secreted protein of Pseudomonas aeruginosa, is necessary for cytotoxicity and virulence / A.R. Hauser, P.J. Kang, J.N. Engel // Mol. Microbiol. - 1998. - V. 27. - P. 807-818.

221. Hemolytic Phospholipase C inhibition protects lung function during Pseudomonas aeruginosa infection / M.J. Wargo [et al.] II Am. J. Respir. Crit. Care Med. - 2011. - V. 184(3). - P. 345-354.

222. Hentzer, M. Alginate overproduction affects Pseudomonas aeruginosa biofilm structure and function / M. Hentzer, G.M. Teitzel, G.J. Balzer // J. Bacteriol. - 2001. - V. 183, N. 18. - P. 5395-5401.

223. I lovey, A.K. Analyses of the DNA-binding and transcriptional activation properties of ExsA, the transcriptional activator of the Pseudomonas aeruginosa exoenzyme S regulon / A.K. Ilovey, D.W. Frank // J. Bacteriol. - 1995. - V. 177. - P. 4427-4436.

224. Howe, T.R. Isolation and characterization of alkaline protease-deficient mutants of Pseudomonas aeruginosa in vitro and in a mouse eye model / T.R. Howe, B.II. Iglewski // Infect. Immun. - 1984. -V. 43.-P. 1058-1063.

225. Ilueck, C.J. Type III protein secretion systems in bacterial pathogens of animals and plants / C.J. Ilueck // Microbiol. Mol. Biol. Rev. - 1998. - V. 62. - P. 379-433.

226. Huey, B. Hypervariable DNA fingerprinting in Escherichia coli: minisatellite probe from bacteriophage M13 / B. I-Iuey, J. Hall // J. Bacteriol. - 1989. - V. 171(5). - P. 2528-2532.

227. IBC-1, a novel integron-associated class A -lactamase with extended-spectrum properties produced by an Enterobacter cloacae clinical strain / P. Giakkoupi [et al.] II Antimicrob. Agents Chemother. - 2000. - V. 44. - P. 2247-2253.

228. Identification of Pseudomonas aeruginosa by a duplex real-time polymerase chain reaction assay targeting the ecfX and the gyrB genes / S.N. Anuj [et al.] II Diagn. Microbiol. Infect. Dis. - 2009. -V. 63(2).-P. 127-131.

229. Identification of type II and type III pyoverdine receptors from Pseudomonas aeruginosa / M. De Chial [et al.] 11 Microbiology. - 2003. - V. 149 . - P. 821 -831.

230. Impact of Pseudomonas aeruginosa genomic instability on the application of typing methods for chronic cystic fibrosis infections / J.L. Fothergill [et al.] II J. Clin. Microbiol. - 2010. - V. 48(6). -P. 2053-2059.

231. Improved reliability of Pseudomonas aeruginosa PCR detection by the use of the species-specific ecßCgene target / R. Lavenir [et al.] II J. Microbiol. Methods. - 2007. - V. 70(1). - P. 20-29.

232. Indole production promotes Escherichia coli mixed-culture growth with Pseudomonas aeruginosa by inhibiting quorum signaling / W. Chu [et al.] II Appl. Environ. Microbiol. - 2012. - V. 78, N 2. -P. 411-419.

233. Induction of neutrophil apoptosis by the Pseudomonas aeruginosa exotoxin pyocyanin: a potential mechanism of persistent infection / L.R. Usher [et al.] II J. Immunol. - 2002. - V. 168(4). - P. 18611868.

234. Induction of phenazine biosynthesis in cultures of Pseudomonas aeruginosa by L-N-(3-oxohexanoyl) homoserine lactone / P. Stead [et al.] II FEMS Microbiol. Lett. - 1996. - V. 140(1). -P. 15-22.

235. Inflammatory neutrophils retain susceptibility to apoptosis mediated via the Fas death receptor / S.A. Renshaw [et al.] II J. Leukocyte Biol. - 2000. - V. 67(5). - P. 662-668.

236. Influence of the MexAB-OprM multidrug efflux system on quorum sensing in Pseudomonas aeruginosa / K. Evans [et al.] II J. Bacteriol. - 1998. - V. 180, N. 32. - P. 5443-5447.

237. Initial Pseudomonas aeruginosa infection in patients with cystic fibrosis: characteristics of eradicated and persistent isolates / G.A. Tramper-Stranders [et al.] II Clin. Microbiol. Infect. - 2012. -V. 18(6).-P. 567-574.

238. Interaction of Pseudomonas aeruginosa alkaline protease and elastase with human polymorphonuclear leukocytes in vitro / A. Kharazmi [et al.] II Infect. Immun. - 1984. - V. 43. - P. 161165.

239. International Pseudomonas aeruginosa Typing Study Group. A multicenter comparison of methods for typing strains of Pseudomonas aeruginosa predominantly from cystic fibrosis // J. Infect. Dis. - 1994.-V. 169.-P. 134-142.

240. International study of the prevalence and outcomes of infection in intensive care units. EPIC II Group of Investigators / J.L. Vincent [et al.] II JAMA. - 2009. - V. 302(21). - P. 2323-2329.

241. Intracellular targeting of exoenzyme S of Pseudomonas aeruginosa via type III dependent translocation induces phagocytosis resistance, cytotoxicity and disruption of actin microfilaments / E. Frithz-Lindsten [et al.] II Mol. Microbiol. - 1997. - V. 25. P. 1125-1139.

242. Irie, Y. Pseudomonas aeruginosa rhamnolipids disperse Bordetella bronchiseptica biofilms / Y. Irie, G.A. O'Toole, M.II. Yuk // FEMS Microbiol. Lett. - 2005. - V. 250(2). - P. 237-243.

243. Iron acquisition from Pseudomonas aeruginosa siderophores by human phagocytes: an additional mechanism of host defense through iron sequestration? / B.E. Britigan [et al.] II Infect. Immun. - 2000. -V. 68(3).-P. 1271-1275.

244. Izdebska-Szymona, K. Comparison of some adhesive properties of Pseudomonas aeruginosa strains isolated from respiratory and urinary tract infections / K. Izdebska-Szymona, D. Laziuk // Acta Microbiol. Pol. - 1988. -V. 37(3-4). - P. 281-293.

245. Jaffe, R.I. Real-time identification of Pseudomonas aeruginosa direct from clinical samples using a rapid extraction method and polymerase chain reaction (PCR) / R.I. Jaffe, J.D. Lane, C.W. Bates // J. Clin. Lab. Anal.-2001.-V. 15.-P. 131-137.

246. Jeffreys, A.J. Individual-specific 'fingerprints' of human DNA / A.J. Jeffreys, V. Wilson, S.L. Thein // Nature. - 1985. - V. 316. - P. 76-79.

247. Jin, Y. Biofilm formation of Candida albicans is variably affected by saliva and dietary sugars / Y. Jin, L.P. Samaranayake, Y. Samaranayake // Arch. Oral Biol. - 2004. - V. 49(10). - P. 789-798.

248. Johnson, M.K. Production and properties of heat-stable extracellular hemolysin from Pseudomonas aeruginosa / M.K. Johnson, D. Boese-Marrazzo // Infect. Immun. — 1980. — V. 29(3). — P. 1028-1033.

249. Joo, E.J. Clinical predictors of Pseudomonas aeruginosa bacteremia among Gram-negative bactcrial infections in non-neutropenic patients with solid tumor / E.J. Joo , C.I. Kang , Y.E. Ha . // J. Infect. - 2011. - V. 63(3). - P. 207-214.

250. Jovcic, B. Emergence of NDM-1 metallo-beta-lactamase in Pseudomonas aeruginosa clinical isolates from Serbia / B. Jovcic, Z. Lepsanovic, V. Suljagic // Antimicrob. Agents. Chemother. - 2011. -V. 55(8).-P. 3929-3931.

251. Kaiser, K. Correlation of Vibrio flscheri bacteria test data with bioassay data for other organisms / K. Kaiser// Environmental Health Perspective. - 1998. -V. 106. - P. 583-591.

252. Kaponis, A. Septic shock in obstetrics and gynecology / A. Kaponis, T. Filindris, G. Decavalas // In book: Severe sepsis and septic shock, www.intechopen.com.

253. Karatan, E. Signals, regulatory networks, and materials that build and break bacterial biofilms / E. Karatan, P. Watnick // Microbiol. Mol. Biol. Rev. - 2009. - V. 73(2). - P. 310-347.

254. Kashkouli, M.B. Bilateral Pseudomonas aeruginosa endophthalmitis following bilateral simultaneous cataract surgery / M.B. Kashkouli, S. Salimi, II. Aghaee // Ind. J. Ophthalmol. - 2007. -V. 55.-P. 374-375.

255. Kaufman, M.R. Pseudomonas aeruginosa mediated apoptosis requires the ADP-ribosylating activity of ExoS / M.R. Kaufman, J. Jia, L. Zeng // Microbiology. - 2000. - V. 146(10). - P. 2531-2541.

256. Kerr, J. Phenazine pigments, antibiotics and virulence factors / J. Kerr // The infectious disease review - microbes of man, animals and the environment. - 2000. - V. 2(4). - P. 184-194.

257. Khan, A.A. Detection of Pseudomonas aeruginosa from clinical and environmental samples by amplification of the exotoxin A gene using PCR / A.A. Khan, C.E. Cerniglia // Appl. Environ. Microbiol. - 1994. - V. 60. - P. 3739-3745.

258. Khare, E. Dual activity of pyocyanin from Pseudomonas aeruginosa - antibiotic against phytopathogen and signal molecule for biofilm development by rhizobia / Khare E., Arora N.K. // Can. J. Microbiol. - 2011. - V. 57(9). - P. 708-713.

259. Kiewitz, C. Sequence diversity of Pseudomonas aeruginosa: Impact on population structure and genome evolution / C. Kiewitz, B. Tümmler // J. Bacteriol. - 2000. - V. 182. - P. 3125-3135.

260. Kimata, N. Pseudomonas aeruginosa isolated from marine environments in Tokyo Bay / N. Kimata, T. Nishino, S. Suzuki // Microb. Ecol. - 2004. - V. 47. - P. 41-47.

261. King, E.O. Two simple media for the demonstration of pyocyanin and fluorescein / E.O. King, M.K. Ward, D.E. Raney // J. Lab. Clin. Med. - 1954. - V. 44(2). - P. 301-307.

262. Klaenhammer, T. Genetics of bacteriocins produced by lactic acid bacteria / T. Klaenhammer // FEMS Microbiol. Rev. - 1993. - V. 12. - P. 39-86.

263. Koenig, S.M. Ventilator-associated pneumonia: diagnosis, treatment, and prevention / S.M. Koenig, J.D. Truwit // Clin Microbiol Rev. - 2006. - V. 19(4). - P. 637-657.

264. Kohlenberg, A. Outbreak of carbapenem-resistant Pseudomonas aeruginosa infection in a surgical intensive care unit / A. Kohlenberg, D. Weitzel-Kage, P. Van der Linden // J. FIosp. Infect. - 2010. -V. 74(4).-P. 350-357.

265. Kohler, T. Swarming of Pseudomonas aeruginosa is dependent on cell-to-cell signaling and requires flagella and pili / T. Kohler, L.K. Curty, F. Barja // J. Bacteriol. - 2000. - V. 182(21). - P. 59905996.

266. Kumarasamy, K.K. Emergence of a new antibiotic resistance mechanism in India, Pakistan, and the UK: a molecular, biological, and epidemiological study / K.K. Kumarasamy, M.A. Toleman, T.R. Walsh // The Lancet Inf. Dis. - 2010. - V. 10. - P. 597-602.

267. Lamont, I.L. Iron acquisition by Pseudomonas aeruginosa in the lungs of patients with cystic fibrosis / I.L. Lamont, A.F. Konings, D.W. Reid // BioMetals. - 2009. - V. 22(1). - P. 53-60.

268. Lanyi, B. Antigenic changes in Pseudomonas aeruginosa in vivo and after lysogenization in vitro / B. Lanyi, J. Lantos // Acta Microbiol. Hung. - 1976. - V. 23. - P. 337-351.

269. Lau, G.W. The role of pyocyanin in Pseudomonas aeruginosa infection / G.W. Lau, D.J. Hassett, II. Ran, F. Kong // Trends Mol. Med. - 2004. - V. 10(12). - P. 599-606.

270. Le Gall, F. Proposal of a quantitative PCR-based protocol for an optimal Pseudomonas aeruginosa detection in patients with cystic fibrosis / F. Le Gall, R. Le Berre, S. Rosec // BMC Microbiol.-2013.-V. 13.-P. 143.

271. Lee, II. Cellular ADP-ribosyltransferase with the same mechanism of action as diphtheria toxin and Pseudomonas toxin A / II. Lee, W.J. Iglewski // Proc. Natl. Acad. Sei. USA. - 1984. - V. 81. -P. 2703-2707.

272. Lee, J.Y. Selective advantages of two major clones of carbapenem-resistant Pseudomonas aeruginosa isolates (CC235 and CC641) from Korea: antimicrobial resistance, virulence and biofilm-forming activity / J.Y. Lee, K.R. Peck, K.S. Ko // J. Med. Microbiol. - 2004. - V. 53(1). - P. 73-81.

273. Leitao, J.I I. Effects of growth temperature on alginate synthesis and enzymes in Pseudomonas aeruginosa variants / J.II. Leitao, A.M. Fialho, I. Sa-Correia // J. General Microbiol. - 1992. - V. 138. -P. 605-610.

274. Leppla, S.H. The exotoxin of Pseudomonas aeruginosa: a proenzyme having an usual mode of activation / S.H. Leppla, O.C. Martin, L.A. Muel // Biochem. Biophys. Res. Commun. - 1978. - V. 81. -P. 532-538.

275. Lequette, Y. Timing and localization of rhamnolipid synthesis gene expression in Pseudomonas aeruginosa biofilms / Y. Lequette, E.P. Greenberg // J. Bacteriol. - 2005. - V. 187(1). - P. 37-44.

276. Lewenza, S. Interspecies communication between Burkholderia cepacia and Pseudomonas aeruginosa / S. Lewenza, M.B. Visser, P.A. Sokol // Can. J. Microbiol. - 2002. - V. 48. - P. 707-716.

277. Lewis, K. Multidrug tolerance of biofilms and persister cells / K. Lewis // Curr. Microbial. Immunol. - 2008. -V. 322. - P. 107-131.

278. Li, Z. Inhibitory action of metabolites of Pseudomonas aeruginosa against gram-negative bacteria / Z. Li, X. Wang, Y. Guo, J. Zhao // J. Jap. Ass. Infect. Diseases. - 1995. - V. 69(8). - P. 924-927.

279. Lin, H.H. Presence of the exoU gene of Pseudomonas aeruginosa is correlated with cytotoxicity in MDCK cells but not with colonization in BALB/c mice / H.II. Lin, S.P. Huang, II.C. Teng. // J. Clin. Microbiol. - 2006. - V. 44(12). - P. 4596-4597.

280. Liu, P.V. Changes in somatic antigens of Pseudomonas aeruginosa induced by bacteriophages / P.V. Liu // J. Infect. Dis. - 1969. - V. 119. - P. 237-246.

281. Liu, P.V. The roles of various fractions of Pseudomonas aeruginosa in its pathogenesis. 3. Identity of the lethal toxins produced in vitro and in vivo / P.V. Liu // J. Infect. Dis. - 1966. - V. 116(4). - P. 481 -489.

282. Liu, Y. Epidemiological investigation of Pseudomonas aeruginosa nosocomial bacteraemia isolates by PCR-based DNA fingerprinting analysis / Y. Liu, A. Davin-Regli, C. Bosi // J. Med. Microbiol. - 1996. - V. 45. - P. 369-365.

283. Livermore, D.M. Multiple mechanisms of antimicrobial resistance in Pseudomonas aeruginosa: our worst nightmare? / D.M. Livermore // Clin. Infect. Dis. - 2002. - V. 34. - P. 634-640.

284. Lomholt, J.A. Epidemic population structure of Pseudomonas aeruginosa: evidence for a clone that is pathogenic to the eye and that has a distinct combination of virulence factors / J.A. Lomholt // Infect. Immun. - 2001. - V. 69(10).-P. 6284-6295.

285. Longo, F. A new transcriptional repressor of the Pseudomonas aeruginosa quorum sensing receptor gene lasR / F. Longo, G. Rampioni, R. Bondi // PLOS ONE. - 2013. - 8(7). e69554.

286. Lopes, S.P. Role of planktonie and sessile extracellular metabolic by production Pseudomonas aeruginosa and Escherichia coli intra and interspecies relationships / S.P. Lopes, I.M. Machado, M.O. Pereira // J. Ind. Microbiol. Biotechnol. - 2011. - V. 38(10). - P. 133-140.

287. Loureiro, M.M. Pseudomonas aeruginosa: study of antibiotic resistance and molecular typing in hospital infection cases in a neonatal intensive care unit from Rio de Janeiro City, Brazil / M.M. Loureiro, B.A. De Moraes, V.L. Mendonca // Mem. Inst. Osvvaldo Cruz. - 2002. - V. 97. - P. 387394.

288. Loutit, J.S. Restriction enzyme and Southern hybridization analyses of Pseudomonas aeruginosa strains from patients with cystic fibrosis / J.S. Loutit, L.S. Tompkins // J. Clin. Microbiol. - 1991. — V. 29. - P. 2897-2900.

289. LRP 1 B functions as a receptor for Pseudomonas exotoxin / D.V. Pastrana [et al.] II Biochim. Biophys. Acta. - 2005. - V. 1741. - P. 234-239.

290. Luminescent method for the detection of antibacterial activities / L. Simon [et al.] II Appl. Microbiol. Biotechnol. - 2001. - V. 57(5-6). - P. 757-763.

291. Lyczak, J.B. Lung infections associated with cystic fibrosis / J.B. Lyczak, C.L. Cannon, G.B. Pier // Clin. Microbiol. Rev. - 2002. - V. 15. - P. 194-222.

292. Maier, R. Pseudomonas aeruginosa rhamnolipids: biosynthesis and potential applications / R. Maier, G. Soberon-Chavez // Appl. Microbiol. Biotechnol. - 2000. - V. 54. - P. 625-633.

293. Major sternal wound infection after open-heart surgery: a multivariate analysis of risk factors in 2,579 consecutive operative procedures / G. Ottino [et al.] II Ann. Thorac. Surg. - 1987. - V. 44. -P. 173-179.

294. Masaadeh, H.A. Incident of Pseudomonas aeruginosa in postoperative wound infection / H.A. Masaadeh, A.S. Jaran // Am. J. Infect. Dis. - 2009. - V. 5(1). - P. 1-6.

295. Masuda, N. Outer membrane proteins responsible for multiple drug resistance in Pseudomonas aeruginosa / N. Masuda, E. Sakagawa, S. Ohya // Antimicrob. Agents Chemother. - 1995. - V. 39. -P. 645-649.

296. Mayhall, C.G. The epidemiology of burn wound infections: then and now / C.G. Mayhall // Clin. Inf. Dis. - 2003. - V. 37. - P. 543-550.

297. McKnight, S.L. The Pseudomonas quinolone signal regulates rhl quorum sensing in Pseudomonas aeruginosa / S.L. McKnight, B.H. Iglewski, E.C. Pesci // J. Bacteriol. - 2000. - V. 182(10). - P. 27022708.

298. Medeiros, A.A. ß-Lactamase-mediated resistance to penems and carbapenems amongst Enterobacteriaceae / A.A. Medeiros, R.S. Hare // Amer. Soc. Microbiol. - 1986. - Washington, DC. abstr. 116. 26th Intersci. Conf. Antimicrob. Agents Chemother.

299. Medical microbiology / C. Mims [et al.] II University of Oxford. - 2004. - 660 pp.

300. Mchta M. Bacterial isolates from burn wound infections and their antibiograms: a eight-year study / M. Mehta, P. Dutta, V. Gupta // Indian J. Plast. Surg. - 2007. - V. 40. - P. 25-28.

301. Menestrina, G. Pore-forming peptides and protein toxins / G. Menestrina, M. Dalla Serra, P. Lazarovici (eds.), Taylor and Francis Group, London, UK. - 2003. - 315 pp.

302. Metallo-beta-lactamase-producing Pseudomonas spp. in Korea: high prevalence of isolates with VIM-2 type and emergence of isolates with IMP-1 type / K. Lee [et al.] И Yonsei Med. J. - 2009. -V. 50.-P. 335-339.

303. Michel-Briand, Y. The pyocins of Pseudomonas aeruginosa / Y. Michel-Briand, C. Baysee // Biochimie. - 2002. - V. 84(5-6). - P. 499-510.

304. Microbiology of sputum from patients at cystic fibrosis centers in the United States / J.L. Burns [el al.] II Clin. Infect. Dis. - 1998. - V. 27. - P. 158-163.

305. Modulation of Pseudomonas aeruginosa gene expression by host microflora through interspecies communication / K.M. Duan [et al.] II Mol. Microbiol. - 2003. - V. 50. - P. 1477-1491.

306. Molecular characterization of In50, a class 1 integron encoding the gene for the extended-spectrum beta-lactamase VEB-1 in Pseudomonas aeruginosa / T. Naas [et al.] II FEMS Microbiol. Lett. - 1999. -V. 176.-P. 411-419.

307. Molecular characterization of ß-lactamase gene, ¿/aGIM-1, encoding a new subclass of metallo-ß-lactamase / M. Castanheira [et al.] И Antimicrob. Agents Chemother. - 2004. - V. 48. - P. 4654-4661.

308. Molecular epidemiology and mechanisms of carbapenem resistance in Pseudomonas aeruginosa isolates from Spanish hospitals / O. Gutierrez [et al.] II Antimicrob. Agents. Chemother. - 2007. - V. 51. - P. 4329-4335.

309. Molecular epidemiology of Pseudomonas aeruginosa clinical isolates from Portuguese Central Hospital / A.P. Fonseca [et al.] И Folia Microbiol. - 2008. - V. 53(6). - P. 540-546.

310. Molecular identification and detection of virulence genes among Pseudomonas aeruginosa isolated from different infectious origins / V.S. Nikbin [el al.] II Iran. J. Microbiol. - 2012. V. 4(3). -P. 118-123.

311. Molecular mechanisms of bacterial virulence elucidated using a Pseudomonas aeruginosa-Caenorhabditis elegans pathogenesis model / S. Mahajan-Miklos [et al. ] II Cell. - 1999. - V. 96. - P. 4756.

312. Morrison, A.J. Epidemiology of infections due to Pseudomonas aeruginosa / A.J. Morrison, R.P. Wenzel // Rev. Infect. Dis. - 1984. - V. 6(3). - P. 627-642.

313. Multilocus sequence typing: a portable approach to the identification of cloncs with populations of pathogenic microorganisms / M.C. Maiden [el al.] II Proc. Nat. Acad. Sei. USA. - 1998. - V. 95(6). -P. 3140-3145.

314. Multiple phospholipid substrates of phospholipase C/sphingomyelinase HR2 from Pseudomonas aeruginosa / D.J. Lopez [et al.] II Chemistry. Physics. Lipids. -2011. - V. 164(1). - P. 78-82.

315. Multiplex PCR for rapid detection of genes encoding Class A carbapenemases / S.S. Hong [et al.] II Ann. Lab. Med. - 2012. - V. 32(5). - P. 359-361.

316. Multiresistant serotype 012 Pseudomonas aeruginosa', evidence for a common strain in Europe / T.L. Pitt [et al.] II Epidemiol. Infect. - 1989. - V. 103. - P. 565-576.

317. Murga, R. Quantitative analysis of biofilm thickness variability / R. Murga, P.S. Stewart, D. Daly // Biotechnol. Bioeng. - 1995. -V. 45(6). - P. 503-510.

318. Murray, T. Pseudomonas aeruginosa exhibits sliding motility in the absence of type IV pili and flagella / T. Murray, B. Kazmierczak // J. Bacteriol. - 2008. - V. 190(8). - P. 2700-2708.

319. Neonatal infections with Pseudomonas aeruginosa associated with a water-bath used to thaw fresh frozen plasma / G. Muyldermans [et al.] II J. Hosp. Infect. - 1998. - V. 39. - P. 309-314.

320. Netherlands reference laboratory for bacterial meningitis. Bacterial meningitis in the Netherlands: annual report 2006. Amsterdam, The Netherlands: AMC/RIVM, 2007. - 53 pp.

321. Newton, O. Young infant sepsis: aetiology, antibiotic susceptibility and clinical signs / O. Newton, M. English // Trans. R. Soc. Trop. Med. Ilyg. - 2007. - V. 101. - P. 959-966.

322. Nosocomial bloodstream infections in US hospitals: analysis of 24,179 cases from a prospective nationwide surveillance study / H. Wisplinghoff [et al.] II Clin. Infect. Dis. - 2004. - V. 39(3). - P. 309317.

323. Nosocomial pneumonia. Diagnostic and therapeutic considerations / G.D. Campbell [et al.] II Med. Clin. North. Am.-2001.-V. 85(1).-P. 179-114.

324. Novel acquired metallo-b-lactamase gene, A/aSIM-1, in a class 1 integron from Acinetobacter baumannii clinical isolates from Korea / K. Lee [et al.] II Antimicrob. Agents Chemother. - 2005. -V. 49.-P. 4485^491.

325. CT Toole, G.F. Biofilm formation as microbial development / G.F. CTToole, H.B. Kaplan, R. Kolter // Ann. Rev. Microbiol. - 2000. - V. 54. - P. 49-79.

326. Ojeniyi, B. Polyagglutinability due to loss of 0-antigenic determinants in Pseudomonas aeruginosa strains isolated from cystic fibrosis patients / B. Ojeniyi, L. Baek, N. Iloiby // Acta Pathol. Microbiol. Scand. Sect. B. - 1985. - V. 93. - P. 7-13.

327. Olakanmi, O. Acquisition of iron bound to low molecular weight chelates by human monocyte-derived macrophages / O. Olakanmi, J.B. Stokes, B.E. Britigan // J. Immunol. - 1994. - V. 153. -P. 2691-2703.

328. Olive, D.M. Principles and applications of methods for DNA-based typing of microbial organisms / D.M. Olive, P. Bean // J. Clin. Microbiol. - 1999. - V. 37(6). - P. 1661 -1669.

329. Ortiz-Herrera, M. RAPD-PCR characterization of Pseudomonas aeruginosa strains obtained from cystic fibrosis patients / M. Ortiz-Herrera, A. Gerónimo-Gallegos, F. Cuevas-Schacht // Salud. Publica Méx. - 2004. - V. 46(2). - P. 149-157.

330. Ostroff, R.M. Molecular comparison of a nonhemolytic and a hemolytic phospholipase C from Pseudomonas aeruginosa / R. M. Ostroff, A.I. Vasil, M.L. Vasil // J. Bacteriol. - 1990. - V. 172. -P. 5915-5923.

331. O'Toole, G.A. Flagellar and twitching motility are necessary for Pseudomonas aeruginosa biofilm development / G.A. O'Toole, R. Kolter // Mol. Microbiol. - 1998. - V. 30. - P. 295-304.

332. Outbreak of infections caused by Pseudomonas aeruginosa producing VIM-1 carbapenemase in Greece / A. Tsakris [eí al.] II J. Clin. Microbiol. - 2000. - V. 38. - P. 1290-1292.

333. Outbreak of sternal surgical site infections due to Pseudomonas aeruginosa traced to a Scrub Nurse with Onychomycosis / S.A. McNeil [et al.] II Clinical Infectious Diseases. - 2001. - V. 33. -P. 317-323.

334. Outbreaks in neonatal intensive care units - they are not like others / P. Gastmeier [et al.] II Am. J. Infect. Control. -2007. - V. 35. - P. 172-176.

335. OXA-11, an extended-spectrum variant of OXA-IO (PSE- 2) b-lactamase from Pseudomonas aeruginosa /L.M.C. Hall [et al.] II Antimicrob. Agents. Chemother. - 1993. - V. 37. - P. 1637-1644.

336. OXA-14, another extended-spectrum variant of OXA-10 (PSE-2) b-lactamase from Pseudomonas aeruginosa / F.L. Danel [at al.] II Antimicrob. Agents Chemother. - 1995. - V. 39. - P. 1881-1884.

337. Pandita, A. Microbial keratitis in Waikato, New Zealand / A. Pandita, C. Murphy // Clin. Exp. Ophthalmol. - 2011. - V. 39 (5). - P. 393-397.

338. Parret, A. Bacteria killing their own kind: novel bacteriocins of Pseudomonas and other g-proteobacteria / A. Parret, R. De Mot // Trends Microbiol. - 2002. - V. 10(3). - P. 107-112.

339. Pathogenic phenotype and genotype of Pseudomonas aeruginosa isolates from spontaneous canine ocular infections / E.C. Ledbetter [et al.] II Invest. Ophthalmol. Vis Sei. - 2009. - V. 50(2). - P. 729736.

340. Pattern differentiation in co-culture biofilms formed by Staphylococcus aureus and Pseudomonas aeruginosa / L. Yang [et al.] II FEMS Immunol. Med. Microbiol. - 2011. - V. 62(3). - P. 339-347.

341. PCR identification of Pseudomonas aeruginosa and direct detection in clinical samples from cystic fibrosis patients / L.V. Da Silva Filho [et al.] Hi. Med. Microbiol. - 1999. - V. 48. - P. 357-361.

342. PCR typing of genetic determinants for metallo-beta-lactamases and integrases carried by gramnegative bacteria isolated in Japan, with focus on the class 3 integron / N. Shibata [et al.] II J. Clin. Microbiol. - 2003. - V. 41. - P. 5407-5413.

343. Pearson, J.P. Active efflux and diffusion are involved in transport of Pseudomonas aeruginosa cell-to-cell signals / J.P. Pearson, C. Van Delden, B.H. Iglewski // J. Bacteriol. - 1999. - V. 181(32). -P. 1203-1210.

344. Peek, M.E. Pyoverdine, the major siderophore in Pseudomonas aeruginosa, evades NGAL recognition / M.E Peek, A. Bhatnagar, N.A. McCarty, S.M. Zughaier// Int. Perspectives Inf. Dis. 2012. -ID 843509.- 10 p.

345. Pellett, S. Distribution of Pseudomonas aeruginosa in a riverine ecosystem / S. Pellett, D.V. Bigley, D.J. Grimes // Appl. Environ. Microbiol. - 1983. - V. 45. - P. 328-332.

346. Penetration of clinical isolates of Pseudomonas aeruginosa through MDCK epithelial cell monolayers / Y. Ilirakata [et al.] II J. Infect. Dis. - 2000. - V. 181 (2). - P. 765-769.

347. PER-1 is still widespread in Turkish hospitals among Pseudomonas aeruginosa and Acinetobacter spp. / F. Kolayli [et al.] II FEMS Microbiol. Lett. - 2005. - V. 249. - P. 241-245.

348. Permeabilization of biological and artificial membranes by a bacterial dirhamnolipid produced by Pseudomonas aeruginosa / M. Sanchez [et al.] II J. Colloid Interface Sei. - 2010. - V. 341(2). - P. 240247.

349. Petrova, O.E. A novel signaling network essential for regulating Pseudomonas aeruginosa biofilm development / O.E. Petrova, K. Sauer II PLoS Pathog. - 2009. - V. 5(11). el000668.

350. Phylogenetic affiliation of the pseudomonads based on 16S rRNA sequence / Y. Anzai [et al.] II Intern. J. Syst. Evolut. Microbiol. - 2000. - V. 50. - P. 1563-1589.

351. Pitt T.L. Pseudomonas, Burkholderia, and related genera. In Microbiology and microbial infections / B.I. Duerden (ed.), Oxford University Press Inc., New York, 1998. -V. 2. - P. 1109-1138.

352. PlcRl and PlcR2 are putative calcium-binding proteins required for secretion of the hemolytic phospholipase C of Pseudomonas aeruginosa / Cota-Gomez A. [et al.] II Infect. Immun. - 1997. -V. 65(7).-P. 2904-2913.

353. Poll, C.L. Genome fingerprinting by pulsed field gel electrophoresis and ribotyping to differentiate Pseudomonas aeruginosa serotype 011 strains / C.L. Poh, C.C. Yeo, L. Tay // Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. - 1992. - V. 11. - P. 817-822.

354. Poirel, L. Molecular analysis of metallo-beta-lactamase gene 6/aSPM-l-surrounding sequences from disseminated Pseudomonas aeruginosa isolates in Recife, Brazil / L. Poirel, M. Magalhaes, M. Lopes, P. Nordmann // Antimicrob. Agents Chemother. - 2004. - V. 48. - P. 1406-1409.

355. Population structure of Pseudomonas aeruginosa / L. Wiehlmann [et al.] II Proc. Natl. Acad. Sei. USA.-2007.-V. 104(19). - P. 8101-8106.

356. Population structure of Pseudomonas aeruginosa from five Mediterranean countries: evidence for frequent recombination and epidemic occurrence of CC235 / M. Maatallah [el al.] II PLoS One. - 2011. -V. 6(10). e25617.

357. Pore-forming activity of type III system-secreted proteins leads to oncosis of Pseudomonas aeruginosa-mtected macrophages / D. Dacheux [et al.] // Mol. Microbiol. - 2001. - V. 40(1). - P. 7685.

358. Potvin, E. Sigma factors in Pseudomonas aeruginosa / E. Potvin, F. Sanschagrin, R.C. Levesque // FEMS Microbiol. Rev. - 2008. - V. 32(1). - P. 38-55.

359. Predisposing factors and etiologic diagnosis of ulcerative keratitis / T. Sirikul [et al.] II Cornea. -2008. - V. 27(3). - P. 283-287.

360. Prevalence of type III secretion genes in clinical and environmental isolates of Pseudomonas aeruginosa / II. Feltman [et al.] II Microbiology. - 2001. - V. 147. - P. 2659-2669.

361. Price-Whelan, A. Rethinking 'secondary' metabolism: physiological roles for phenazine antibiotics / A. Price-Whelan, L.E.P. Dietrich, D.K. Newman // Nat. Chem. Biol. - 2006. - V. 2. - P. 7178.

362. Priyaja, P. Pyocyanin induced in vitro oxidative damage and its toxicity level in human, fish and insect cell lines for its selective biological applications / P. Priyaja, P. Jayesh, R. Philip, I.S. Bright Singh // Cytotechnology. - 2014. Aug 5. [Epub ahead of print].

363. Probiotic characteristics of newly isolated strains of Lactobacillus plantarum / B. Cisarova [et al.] II Acta Facult. Pharm. Univ. Comenianae. - 2009. - V. 56. - P. 54-66.

364. Prospective analysis of nosocomial infections in a burn care unit, Turkey / O. Oncul [et al.] II Ind. J. Med. Research. - 2009. - V. 130(6). - P. 758-764.

365. Pseudomonas aeruginosa bacteremia in immunocompromised children: analysis of factors associated with poor outcome / J.E. Fergie [et al.] II Clin. Infect. Dis. - 1994. - V. 18. - P. 390-394.

366. Pseudomonas aeruginosa bacteremia in patients with AIDS / M.H. Mendelson [el al.] II Clin. Infect. Dis. - 1994. - V. 18(6). - P. 886-895.

367. Pseudomonas aeruginosa elastase and elastolysis revisited: recent developments / A.C. Gales [et al.] II Mol. Microbiol. - 1991. - V. 5. - P. 2315-2321.

368. Pseudomonas aeruginosa extracellular products inhibit staphylococcal growth, and disrupt established biofilms produced by Staphylococcus epidermidis / Zh Qin [el al.] II Microbiology. - 2009. -V. 155(7).-P. 2148-2156.

369. Pseudomonas aeruginosa in a neonatal intensive care unit: molecular epidemiology and infection control measures / V. Crivaro [et al.] II BMC Infect. Dis. - 2009. - V. 9. - P. 70.

370. Pseudomonas aeruginosa inhibits in-vitro Candida biofilm development / H.M.H.N. Bandara [et al.] II BMC Microbiology. - 2010. - V. 10. - P. 125.

371. Pseudomonas aeruginosa lipopolysaccharide inhibits Candida albicans hyphae formation and alters gene expression during biofilm development / II.M. Bandara [et al.] II Mol. Oral. Microbiol. -2013.-V. 28 (l).-P. 54-69.

372. Pseudomonas aeruginosa outbreak associated with a contaminated blood-gas analyser in a neonatal intensive care unit / S.M. Garland [et al.]. //J. IIosp. Infect. - 1996.-V. 33.-P. 145-151.

373. Pseudomonas aeruginosa outbreak linked to mineral water bottles in a neonatal intensive care unit: fast typing by use of high resolution melting analysis of a variable-number tandem-repeat locus / F. Naze [et al.] II J. Clin. Microbiol. - 2010. - V. 48. - P. 3146-3152.

374. Pseudomonas aeruginosa outbreaks in the neonatal intensive care unit - a systematic review of risk factors and environmental sources / J.M.C. Jefferies [et al.] //J. Med. Microbiol. -2012. - V. 61. -P. 1052-1061.

375. Pseudomonas aeruginosa exotoxin pyocyanin causes cystic fibrosis airway pathogenesis / C.C. Caldwell [et al.] II Am. J. Pathol. - 2009. - V. 175, N 8. - P. 2473-2488.

376. Pseudomonas aeruginosa Psl polysaccharide reduces neutrophil phagocytosis and the oxidative response by limiting complement-mediated opsonization / M. Mishra [et al.] II Cell. Microbiol. - 2012. -V. 14.-P. 95-106.

377. Pseudomonas aeruginosa-mediated cytotoxicity and invasion correlate with distinct genotypes at the loci encoding Exoenzyme S / S.M. Fleiszig [et al.] II Infect. Immun. - 1997. - V. 65(2). - P. 579586.

378. Pukatzki, S. The human pathogen Pseudomonas aeruginosa utilizes conserved virulence pathways to infect the social amoeba Dictyostelium discoideum/ S. Pukatzki, R.H. Kessin, J.J. Mekalanos // Proc. Natl. Acad. Sei. USA. - 2002. - V. 99. - P. 3159-3164.

379. Purification and structural analysis of pyocyanin and 1-hydroxyphenazine / D. Watson [et al.] II Eur. J. Biochem. - 1986. -V. 159(2). - P. 309-313.

380. Pyocyanin production by Pseudomonas aeruginosa induces neutrophil apoptosis and impairs neutrophil mediated host defenses in vivo / L. Allen [et al.] II J. Immunol. - 2005. - V. 174. - P. 36433649.

381. Pyoverdin is essential for virulence of Pseudomonas aeruginosa / J.M. Meyer [et al.] II Infect. Immun. - 1996. - V. 64. - P. 518-523

382. Queenan, A.M. Carbapenemases: the versatile b-lactamases / A.M. Queenan, K. Bush // Clin. Microbiol. Rev. - 2007. - V. 20. - P. 440-458.

383. Quinolone signaling in the cell-to-cell communication system of Pseudomonas aeruginosa / E.C. Pesci [et al] // Proc. Natl. Acad. Sei. USA. - 1999. - V. 96. - P. 11229-11234.

384. Ramos, I. Phenazines affect biofilm formation by Pseudomonas aeruginosa in similar ways at various scales /1. Ramos, L.E.P. Dietrich, A. Price-Whelan, D.K. Newman // Res. Microbiol. - 2010. -V. 161.-P. 187-191.

385. Rao, Y.M. Oxidative-stress-induced production of pyocyanin by Xanthomonas campestris and its effect on the indicator target organism, Escherichia coli / Y.M. Rao, G.K. Sureshkumar // J. Ind. Microbiol. Biotechnol. - 2000. - V. 25(5). - P. 266-272.

386. Rapid and accurate detection of Pseudomonas aeruginosa by real-time polymerase chain reaction with melting curve analysis targeting gyrB gene / M. Motoshima [et al.] II Diagn. Microbiol. Infect. Dis. - 2007.-V. 58.-P. 53-58.

387. Rapid detection and identification of Pseudomonas aeruginosa and Escherichia coli as pure and mixed cultures in bottled drinking water using Fourier transform infrared spectroscopy and multivariate analysis / H.M. Al-Qadiri [et al.] // J. Agri. Food Chem. - 2006. - V. 54. - P. 5749-5754.

388. Rapid detection of carbapenemase genes by multiplex real-time PCR / J. Monteiro [et al.] II J. Antimicrob Chemother. - 2012. - V. 67(4). - P. 906-909.

389. Rapid detection of Pseudomonas aeruginosa from positive blood cultures by quantitative PCR / V. Cattoir [et al.] II Ann. Clin. Microbiol. Antimicrob. - 2010. -V. 9(21). - P. 1-5.

390. Rapid genotyping of Pseudomonas aeruginosa isolates harboured by adult and paediatric patients with cystic Fibrosis using repetitive-element based PCR assays / M.W. Syrmis [et al.] II J. Med. Microbiol. - 2004. - V.53. - P. 1089-1096.

391. Rapid identificationof 4-hydroxy-2-alkylquinolines produced by Pseudomonas aeruginosa using gas chromatography-electron-capture mass spectrometry / G. Taylor [et al.] II J. Chromatography B. -1995.-V. 664.-P. 458-462.

392. Rapid necrotic killing of polymorphonuclear leukocytes is caused by quorum-sensing controlled production of rhamnolipid by Pseudomonas aeruginosa / P.O. Jensen [el al.] II Microbiology. - 2007. -V. 153.-P. 1329-1338.