Механизмы взаимодействия интегразы ВИЧ-1 с ДНК и иммуноглобулинами ВИЧ-инфицированных больных тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.00.04, кандидат химических наук Баранова, Светлана Владимировна

• Баранова, Светлана Владимировна
• кандидат химических наук
• 2009

Оглавление диссертации кандидат химических наук Баранова, Светлана Владимировна

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ.

ВВЕДЕНИЕ.

1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.

ИНТЕГРАЗА ВИРУСА ИММУНОДЕФИЦИТА ЧЕЛОВЕКА.

1.1 Вирус иммунодефицита человека.

1.1.1 Общая характеристика ВИЧ.

1.1.2 Цикл репликации ретровируса ВИЧ.

1.2 Интеграза ВИЧ-1.

1.2.1 Строение и каталитические свойства ИН ВИЧ-1.

1.2.1.1 Строение каталитического домена.

1.2.1.2 Строение N-концевого домена.

1.2.1.3 Строение С-концевого домена.

1.2.1.4 Строение мутантных белков, содержащих два домена интегразы.

1.2.1.5 Структура полного фермента.

1.2.2 Взаимодействие интегразы ВИЧ-1 с олигонуклеотидами и ДНК.

1.2.2.1 Взаимодействие интегразы с ДНК.

1.2.2.1.1 Домены интегразы, отвечающие за связывание ДНК.

1.2.2.1.2 Взаимодействие интегразы с вирусной ДНК.

1.2.2.1.3 Взаимодействие интегразы с клеточной ДНК.

1.2.2.2 Взаимодействие ИН ВИЧ-1 с олигонуклеотидами.

1.2.3 Олигомеризация ИН ВИЧ-1.

1.2.3.1 Роль олигомерного состояния ИН во взаимодействии с ДНК.

1.2.4 Реакция интеграции вирусной ДНК.

1.3 Подходы к изучению механизмов узнавания ДНК ДНК-зависимыми ферментами.

1.3.1 Типы взаимодействий при узнавании ДНК различными белками и ферментами.

2. ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ.

2.1 Реактивы и материалы.

2.2 Методы.

2.2.1 Элекгрофоретический анализ белков.

2.2.2 Окраска ПААГ нитратом серебра.

2 2 3 Опоеделение концентрации белков.

2.2.4 Концентрирование препаратов белка.

2.2.5 Отжиг комплементарных цепей олигонуклеотидов.

2.2.6 Получение меченого субстрата.

2.2.7 Получение Р32-меченых олигонуклеотидов с помощью Т4-полинуклеотидкиназы

2.2.8 Анализ влияния различных олигонуклеотидов на реакцию З'-процессинга.

2.2.9 Подготовка препаратов ИН для измерения методом МУРР.

2.2.10 Измерение спектров малоуглового рентгеновского рассеяния.

2.2.11 Определение олигомерных форм ИН электрофорезом в ПААГ.

2.2.12 Разделение иммуноглобулинов из крови ВИЧ-инфицированных больных.

2.2.13 Иммобилизация белка на BrCN-сефарозу.

2.2.14 Аффинная хроматография AT на ИН-сефарозе.

2.2.15 «Кислотный шок» препаратов антител.

2.2.16 Хроматография на колонке с иммобилизованными AT против легких цепей IgG человека.

2.2.17 Определение протеолитической активности антител.

2.2.18 Определение субстратной специфичности иммуноглобулинов.

2.2.19 Влияние ионов двухвалентных металлов на каталитическую активность антител

2.2.20 Определение типа протеолитической активности иммуноглобулинов с помощью ингибиторного анализа.

2.2.21 Определение оптимального значения рН реакции гидролиза интегразы.

2.2.22 Определение кинетических параметров реакции гидролиза субстрата антителами

2.2.23 Тестирование ИН-гидролизующей активности AT после электрофореза.

2.2.24 Модификация продуктов гидролиза ИН ВИЧ-антителами.

2.2.25 Метод MALDI-TOF.

3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ.

3.1 Взаимодействие интегразы с различными олигонуклеотидами.

3.1.1 Взаимодействие ИН со «стандартным» субстратом.

3.1.2 Взаимодействие фермента с различными олигонуклеотидами.

3.1.2.1 Взаимодействия интегразы ВИЧ-1 с неспецифическими одноцепочечными олигонуклеотидами.

3.1.2.2 Сродство ИН к неспецифическим ДНК-дуплексам.

3.1.2.3 Активация ИН специфическими олигонуклеотидами.

3.1.2.4 Сродство ИН к специфическим олигонуклеотидам.

3.1.2.5 Сродство ИН к специфическим ДНК дуплексам.

3.1.2.6 Термодинамическая модель взаимодействия ИН ВИЧ-1 со специфической последовательностью ДНК.

3 2 Влияние нуклеотидов на олигомерное состояние интегразы

3.2.1 Подбор условий проведения экспериментов методом МУРР.

3.2.3 Анализ взаимодействия ИН ВИЧ-1 с ДНК методом МУРР.

3.2.4 Кинетическая схема олигомеризации ИН.

3.2.5 Анализ кинетической схемы олигомеризации ИН.

3.2.6 Расчет радиуса инерции олигомерных форм ИН-ON.

3.2.7 Определение количества олигомерных форм ИН.

3.2.8 Гипотетическая схема взаимодействия интегразы со специфическими и неспецифическими ON.

3.3 Иммуноглобулины крови ВИЧ-инфицированных больных.

3.3.1 Выделение иммуноглобулинов класса G и М из крови ВИЧ-инфицированных больных.

3.3.2 Доказательства принадлежности каталитической активности непосредственно иммуноглобулинам.

3.3.3 Анализ сродства AT к интегразе и их субстратная специфичность.

3.3.4 Определение типа протеолитической активности AT.

3.3.5 Влияние ионов двухвалентных металлов на каталитическую активность AT.

3.3.6 Определение рН-оптимума гидролиза ИН антителами.

3.3.7 Определение кинетических параметров реакции гидролиза интегразы иммуноглобулинами.

3.3.8 Анализ продуктов гидролиза интегразы иммуноглобулинами классов G и М.

3.3.8.1 Определение продуктов гидролиза ИН электрофорезом в ПААГ.

3.3.8.2 Анализ продуктов гидролиза методом масс-спектрометрии.

ВЫВОДЫ.

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Механизмы взаимодействия интегразы ВИЧ-1 с ДНК и иммуноглобулинами ВИЧ-инфицированных больных»

Взаимодействие белков с нуклеиновыми кислотами лежит в основе многих жизненно важных процессов живых организмов. Изучение механизма узнавания ДНК ферментами, а также механизма функционирования последних, позволяет проводить исследование таких важнейших процессов, как окислительный стресс, старение, патогенез, канцерогенез, генетический контроль, поддержание стабильности клеточного генома, его организации и эволюции. Интерес к ДНК-зависимым ферментам актуален еще и потому, что многие из них являются мишенями для большого числа антивирусных, антибактериальных и антираковых препаратов.

Вирус иммунодефицита человека входит в семейство ретровирусов и является возбудителем одного из самых опасных заболеваний современного общества - синдрома приобретенного иммунодефицита. Одним из направлений химиотерапии ВИЧ-инфекции является использование ингибиторов ключевых ферментов жизненного цикла ВИЧ -интегразы, обратной транскриптазы и протеазы.

Обратная транскриптаза катализирует реакцию синтеза одноцепочечной вирусной ДНК по матрице РНК. Затем с помощью этого же фермента достраивается вторая цепь ДНК. Интеграза ВИЧ осуществляет процесс встраивания двухцепочечной ДНК вируса в геном клетки хозяина, что вызывает хроническую инфекцию организма. Протеаза ВИЧ необходима для разделения длинной белковой цепочки на составные части в процессе репликации вируса.

Несмотря на то, что многие аспекты функционирования одного из ключевых ферментов вируса - интегразы достаточно хорошо изучены, все известные исследования в большинстве своем носят качественный характер, а многие количественные аспекты механизма узнавания и расщепления вирусной ДНК остаются невыясненными. Более того, с практической точки зрения такое изучение важно для поиска специфических ингибиторов интегразы.

Цель настоящей работы заключалась в анализе закономерностей взаимодействия интегразы ВИЧ-1 с ДНК и иммуноглобулинами ВИЧ-инфицированных больных. Для этого необходимо было решить следующие задачи:

1. изучение на количественном уровне характер специфических и неспецифических взаимодействий ИН ВИЧ-1 с ДНК с помощью метода последовательного усложнения структуры ДНК-лиганда. Оценка относительного вклада различных специфических и неспецифических взаимодействий ИН с ДНК в обеспечение специфичности действия фермента;

2. определение зависимости олигомерного состояния и активности интегразы от длины и структуры специфических и неспецифических олигонуклеотидов. Установление механизма образования олигомерной каталитически активной формы гЬрпмрнтя

3. проведение исследования протеолитической активности у иммуноглобулинов классов IgG и IgM из крови ВИЧ-инфицированных больных, гидролизующих ИН:

- проверить выполнимость критериев отнесения каталитической активности антител крови ВИЧ-инфицированных больных непосредственно к иммуноглобулинам;

- изучить ферментативные свойства исследуемых абзимов (рН- и металл-зависимость, субстратная специфичность, кинетические параметры реакции гидролиза);

- определить сайт, по которому происходит расщепление интегразы иммуноглобулинами.

1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ Интеграза вируса иммунодефицита человека

Заключение диссертации по теме «Биохимия», Баранова, Светлана Владимировна

выводы

1. Впервые показано, что специфические олигонуклеотиды, соответствующие 3'-концевой последовательности расщепляемой цепи вирусной ДНК, активируют интегразу (ИН) вируса иммунодефицита человека (ВИЧ). Методом малоуглового рентгеновского рассеяния показано, что под действием олигонуклеотидов образуются димерные и тетрамерные формы. Сделано предположение, что активная форма ИН, катализирующая полную реакцию интеграции, является тетрамерным комплексом со специфическими и неспецифическими ДНК; описан путь образования каталитического тетрамера, обеспечивающий специфичность действия ИН.

2. Впервые проведен детальный термодинамический и кинетический анализ закономерностей взаимодействия интегразы ВИЧ со специфическими и неспецифическими ДНК. Показано, что ИН ВИЧ-1 взаимодействует преимущественно с сахарофосфатным остовом одной из цепей любой ДНК более эффективно, чем со второй. Эффективность взаимодействия зависит от последовательности, длины и гибкости ДНК и примерно на порядок выше для специфической по сравнению с неспецифической ДНК. Высокая специфичность действия фермента обеспечивается не стадией коплексообразования, а взаимной конформационной адаптацией ИН и ДНК, которая обуславливает возрастание скорости реакции в случае специфической ДНК примерно на 7-8 порядков. Оценен относительный вклад различных звеньев ДНК в ее сродство к ферменту; взаимодействие интегразы со специфической и неспецифическими ДНК описано с помощью термодинамических моделей.

3. Впервые показано, что поликлональные IgG и IgM крови ВИЧ-инфицированных больных содержат небольшую фракцию антител, которые, в отличие от классических протеаз, с высокой эффективностью гидролизуют только интегразу ВИЧ, но не другие белки. Доказано, что протеолитическая активность иммуноглобулинов крови ВИЧ-инфицированных больных является их собственным свойством. Впервые показано, что суммарный пул антител может содержать в различном соотношении абзимы с активными центрами, подобными тиоловым, сериновым и металлопротеазам. Показано, что каталитические свойства антител и классических протеаз человека (сродство к субстратам, металл- и рН-зависимость, субстратная специфичность) существенно различаются. Установлено, что иммуноглобулины ВИЧ-инфицированных больных гидролизуют интегразу в центральном и С-концевом доменах белковой молекулы.

Список литературы диссертационного исследования кандидат химических наук Баранова, Светлана Владимировна, 2009 год

1. Varmus H. Retroviruses // Science. 1988. V. 240. P. 1427-1428;

2. Лоуи Д.Р. Трансформация и онкогенез: ретровирусы // Вирусология. М. «Мир». 1989. Т.1.С. 433-474;

3. Rabson А.В., Martin М.А. Molecular organization of AIDS retrovirus // Cell. 1985. V. 40. P. 447—480;

4. Katz R., Skalka A. The retroviral enzymes //Annu.Rev. Biochem. 1994. V. 63. P. 133173;

5. Litvak S., Sarih-Cottin L., Foumier M., Andreola M., Tarrago-Litvak L. Priming of HIV replication by tRNA: role of RT // Trends. Biochem. Sci. 1994. V. 19. P. 114-118;

6. Brown P.O., Bowerman H.E., Varmus H.E., Bishop J.M. Retroviral integration: structure of the intial covalent product and its precursor, and a role for the viral integrase protein // Proc. Natl. Acad.Sci. USA. 1989. V. 86. P. 2525-2529;

7. Fujivara Т., Mizunchi K. Retroviral DNA integration: structure of the integration intermediate//Cell. 1988. V. 55. P. 497-504;

8. Hazuda D.J., Wolfe A.L., Hastings J.C., Robbins H.L., Graham P.L., La Femina R.L., Emini E.A. Viral long terminal repeat binding characteristics of the HIV-1 integrase // J. Biol. Chem. 1994. V. 269. P. 3999-4004;

9. Sardana V.V., Schlabach A.J., Graham P., Bush B.L., Condra J.H., Culberson J.C., Gotlib L., Graham D.J., Kohl N.F., La Femina R.L., Schneider C.L., Wolanski B.S., Wollgang

10. J.M., Emini Е.А. HIV-1 protease inhibitors: evaluation of resistance engendered by amino acid substitutions in the enzyme's substrate binding site // Biochemistry. 1994. V. 33. P. 2004-2010;

11. Hansen M.S.T., Carteau S., Hoffmann C„ Li L., Bushman F. Retroviral cDNA integration: mechanism, applications and inhibition // Genet Eng. 1998. V. 20. P. 41-61;

12. Grandgenett D.P., Vora A.C., Schiff R.D. A 32,000-dalton nucleic acid-binding protein from avian retravirus cores possesses DNA endonuclease activity // Virology. 1978. V. 89. P. 119-32;

13. Dyda F., Hickman В., Jenkins T.M., Engelman A., Craigie R., Davies D.R. Crystal structure of the catalytic domain of HIV-1 integrase: similarity to other polynucleotidyl transferases//Science. 1994. V. 266. P. 1981-1986;

14. Ariyoshi M., Vassylyev D.G., Iwasaki H., Nakamura H., Shinagawa H., Morikawa K. Atomic structure of the RuvC resolvase: a holliday junction-specific endonuclease from E. coli // Cell. 1994. V. 78. P. 1063-1072;

15. Rice P.A., Baker T.A. Comparative architecture of transposase and integrase complexes//Nat. Struct. Biol. 2001. V. 8. P. 302-307;

16. Haren L., Ton-Hoang В., Chandler M. Integrating DNA: Transposases and Retroviral lntegrases//Annu. Rev. Microbiol. 1999. V. 53. P. 245-281;

17. Engelman A., Craigie R. Efficient magnesium-dependent human immunodeficiency virus type 1 integrase activity // J. Virol. 1995. V. 69. P. 5908-5911;

18. Агапкина Ю.Ю., Приказчикова T.A., Смолов M.A., Готтих М.Б. Структура и функции интегразы ВИЧ-1 // Успехи биологической химии. 2005. Т. 45. С. 87 -122;

19. Wang C.Y., Yang C.F., Lai М.С., Lee Y.H., Lin Т.Н. Molecular dynamics simulation of a leucine zipper motif predicted for the integrase of human immunodeficiency virus type I // Biopolymers. 1994. V. 34. P. 1027-1036;

20. Vink С . Groeneqer A A., Plasterk R. Identification of the catalytic and DNA-binding1.Oregion of the human immunodeficiency virus type 1 integrase protein // Nucleic Acids Res. 1993. V. 21. P. 1419-1425;

21. Polard P., Chandler M. Bacterial transposases and retroviral integrase // Mol. Microbiol. 1995. V. 15. P. 13-23;

22. Plasterk R.H.A. The HIV integrase catalytic core // Struct. Biol. 1995. V. 2. P. 87-90;

23. Lee S.P., Xiao J., Knutson J.R., Lewis M.S., Han M.K. Zn2+ promotes the self-association of human immunodeficiency virus type-1 integrase in vitro II Biochemistry. 1997. V. 36. P. 173-180;

24. Sluis-Cremer N. Tachedjian G. Modulation of the oligomeric structures of HIV-1 retroviral enzymes by synthetic peptides and small molecules // Eur. J. Biochem. 2002. V. 269. P. 5103-5111;

25. Engelman A., Craigie R. Identification of conserved amino acid residues critical for human immunodeficiency virus type 1 integrase function in vitro И J. Virol. 1992. V. 66. P. 6361-6369;

26. Bujacz G., Alexandratos J., Qing Z.-L., Clement-Mella C., Wlodawer A. The catalytic domain of human immunodeficiency virus integrase: ordered active site in the F185H mutant II FEBS Lett. 1996. V. 398. P. 175-178;

27. Leavitt A.D., Shiue L., Varmus H.E. Site-directed mutagenesis of HIV-1 integrase demonstrates effects on integrase functions in vitro II J. Biol. Chem. 1993. V. 268. P. 21132119;

28. Yang W., Steitz T.A. Recombining the structure of HIV-1 integrase, RuvC and RNase H // Structure. 1995. V. 3. P. 131-134;

29. Goldgur Y., Dyda F., Hickman A.B., Jenkins T.M., Craigie R., Davies D.R. Three new structures of the core domain of HIV-1 integrase: an active site that binds magnesium // Proc. Natl. Acad. Sci USA. 1998. V. 95. P. 9150-9154;

30. Lovell S., Goryshin I.Y., Reznikoff W.R., Rayment I. Two-metal active site binding of a Tn5 transposase synaptic complex// Nature Struct. Biol. 2002. V. 9. P. 278-281;

31. Mizuuchi K. Polynucleotidyl transfer reaction in site-specific DNA recombination // Genes Cells. 1997. V. 2. P. 1-12;

32. Mizuuchi K. Polynucleotidyl transfer reaction in transpositional DNA recombination // J. Biol. Chem. 1992. V. 267. P. 21273-21276;

33. Wang J.-Y., Ling H, Yang W., Craigie R. Structure of a two-domain fragment of HIV-1 integrase: implications for domain organization in the intact protein IIEMBO J. 2001. V. 20. P. 7333-7343;

34. Zheng R., Jenkins T.M., Craigie R. Zinc folds the N-terminal domain of HIV-1 integrase, promotes multimerization, and enhances catalytic activity // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1996. V. 93. P. 13659-13664;

35. Vincent K.A., Ellison V., Chow S.A., Brown P.O. Characterization of human immunodeficiency virus type 1 integrase expressed in Escherichia со//' and analysis of variants with amino-terminal mutations // J. Virol. 1993. V. 67. P. 425-437;

36. Turner B.G., Summers M.F. Structural biology of HIV//J. Mol. Biol. 1999. V. 285. P.1.32;

37. Cai M., Zheng R., Caffrey M., Graigie R., Clore G.M., Granenborn A.M. Solution structure of the N-terminal zinc binding domain of HIV-1 integrase // Nature Struct. Biol. 1997. V. 4. P. 567-577;

38. Woerner A.M., Marcus-Sekura C.J. Characterization of a DNA binding domain in the C-terminus of HIV-1 integrase by deletion mutagenesis // Nucleic Acids Res. 1993. V. 21. P. 3507-3511;

39. Katzman M., Sudol M. Mapping viral DNA specificity to the central region of integrase by using functional human immunodeficiency vims type 1/visna virus chimeric proteins // J. Virol. 1998. V. 72. P. 1744-1753;

40. Puras Lutzke R.A., Vink C., Plasterk R. Characterization of the minimal DNA-binding domain of the HIV integrase protein // Nucleic Acids Res. 1994. V. 22. P. 4125-4131;

41. Lodi P.J., Ernst J.A., Kuszewski J., Hickman A.B., Engelman A., Craigie R. Clore G.M., Gronenborn A.M. Solution structure of the DNA-binding domain of HIV-1 integrase // Biochemistry. 1995. V. 34. P. 9826-9833;

42. Зенгер В. Принципы структурной организации нуклеиновых кислот // М. «Мир».1987.

43. Luca L.D., Pedretti A., Vistoli G., Barreca M.L., Villa L., Monforte P., Chimirria A. Analysis of the full-length integrase-DNA complex by a modified approach for DNA docking // Biochem. Biophys. Res. Commun. 2003. V. 310. P. 1083-1088;

44. Podtelezhnikov A.A., Gao K., Bushman F.D., McCammon J.A. Modeling HIV-1 integrase complexes based on their hydrodynamic properties // Biopolymers. 2003. V. 68. P. 110-120;

45. Karki R.G., Tang Y., Burke T.R., Nicklaus M.C. Model of full-length HIV-1 integrase complexed with viral DNA as template for anti-HIV drug design // J. Comput.-Aided Mol. Design. 2004. V.18. P. 739-760;

46. Wijitkosoom A., Tonmunphean S., Truong T.N., Hannongbua S. Structural and dynamical properties of a full-length HIV-1 integrase: molecular dynamics simulations // J. Biomol. Struct. Dyn. 2006. V. 23. P. 613-24;

47. Mazumder A., Neamati N. Pilon A.A., Sunder S., Pommier Y. Chemical trapping of ternary complexes of HIV-1 integrase, Me2+ and DNA substrates // J. Biol. Chem. 1996. V. 271. P. 27330-27338;

48. LaFemina R.L., Callahan P.L., Cordingley M.G. Substrate specifity of recombinant human immunodeficiency virus integrase protein // J. Virol. 1991. V. 65. P. 5624-5630;

49. Khan E., Mack J.P.G., Katz R.A., Kulkosky J., Skalka A.M. Retroviral integrase domains: DNA binding and the recognition of LTR sequences // Nucleic Acids Res. 1991. V. 19. P. 851-860;

50. Engelman A., Hickman A.B., Craigie R. The core and carboxyl-terminal domains of the integrase protein of human immunodeficiency virus type 1 each contribute to nonspecific DNA binding // J. Virol. 1994. V. 68. P. 5911-5917;

51. Gerton J.L., Brown P.O. The core domain of HIV-1 integrase recognizes key features of its DNA substrates // J. Biol. Chem. 1997. V. 272. P. 25809-25815;

52. Schauer M., Billich A. The N-terminal region of HIV-1 integrase is required for integration activity, but not for DNA binding // Biochem. Biophys. Res. Commun. 1992. V. 185. P. 874-880;

53. Woerner A.M., Klutch M., Levin J.G., Marcus-Sekura C.J. Localization of DNA binding activity of HIV-1 integrase to the C-terminal half of the protein // AIDS Res. Hum. Retroviruses. 1992. V. 8. P. 297-304;

54. Shibagaki Y., Holmes M.L., Appa R.S., Chow S.A. Characterization of feline immunodeficiency virus integrase and analysis of functional domains //Virology. 1997. V. 230. P. 1-10;

55. Sherman P.A., Dickson M.L., Fyfe J.A. Human immunodeficiency virus type 1 integrase protein: DNA sequence requirements for cleaving and joining reaction // J. Virol. 1992 V 66 P 3593-3601:

56. Vink С., van Gent D.C., Elgersma Y., Plasterk R.H. Human immunodeficiency virus integrase protein requires a subterminal position of its viral DNA recognition sequence for efficient cleavage // J. Virol. 1991. V. 65. P. 4636-4644;

57. Mazumder A., Pommier Y. Processing of deoxyuridine mismatches and abasic sites by human immunodeficiency virus type-1 integrase // Nucleic Acids. Res. 1995. V. 23. P. 28652871;

58. Scottoline B.P., Chow S., Ellison V., Brown P.O. Disruption of the terminal base pairs of retroviral DNA during integration // Genes & Development. 1997. V. 11. P. 371-382;

59. Bushman F.D., Craigie R. Integration of human immunodeficiency virus DNA: adduct interference analysis of required DNA sites // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1992. V. 89. P. 34583462;

60. Bushman F.D., Craigie R. Activities of human immunodeficiency virus (HIV) integration protein in vitro: specific cleavage and integration of HIV DNA // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1991. V. 88. P. 1339-1343;

61. Sherman P., Fyfe J.A. Human immunodeficiency virus integration protein expressed in Escherichia coli possesses selective DNA cleaving activity // Proc. Natl. Acad. Sci. USA.1990. V. 87. P. 5119-5123;

62. Katzman M., Sudol M. Influence of subterminal viral DNA nucleotides on differential susceptibility to cleavage by human immunodeficiency virus type 1 and visna virus integrases // J. Virol. 1996. V. 70. P. 9069-9073;

63. Wang Т., Balakrishnan M., Jonsson C.B. Major and minor groove contacts in retroviral integrase LTR interactions // Biochemistry. 1999. V. 38. P. 3624-3632;

64. Esposito D., Craigie R. Sequense specifity of viral end DNA binding by HIV-1 integrase reveals critical regions for protein DNA interactions // EMBO J. 1998. V. 17. P. 58325843:

65. Jenkins T.M., Esposito D., Engelman A., Craigie R. Critical contacts between HIV-1 integrase and viral DNA identified by structure-based analysis and photo-crosslinking // EMBO J. 1997. V. 16. P. 6849-6859;

66. Shih C.-C., Stoye J.S., Coffin J.M. Highly preferred targets for retrovirus integration // Cell. 1988. V. 53. P. 531-537;

67. Withers-Ward E.S., Kitamura Y., Barnes J.P., Coffins J.M. Distribution of targets for avian retrovirus DNA integration in vivo // Genes Dev. 1994. V. 8. P. 1473-1487;

68. Famet C.M., Wang В., Lipford J.R., Bushman F.D. Differential inhibition of HIV-1 preintegration complexes and purified integrase protein by small molecules // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1996. V. 93. P. 9742-9747;

69. Miller M.D., Bor Y.-C., Bushman F. Target DNA capture by HIV-1 integration complexes//Curr. Biol. 1995. V. 5. P. 1047-1055;

70. Kitamura Y., Lee Y.M.H., Coffin J.M. Nonrandom integration of retroviral DNA in vitro: Effect of CpG methylation // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1992. V. 89. P. 5532-5536;

71. Pryciak P.M., Varmus H.E. Nucleosomes, DNA-binding proteins, and DNA sequences modulate retroviral integration target site selection // Cell. 1992. V. 69. P. 769-780;

72. Fitzgerald M.L., Grandgenett D.P. Retroviral integration: in vitro host site selection by avian integrase//J. Virol. 1994. V. 68. P. 4314-4321;

73. Hong Т., Murphy E., Groarke J., Drlica K. Human immunodeficiency virus type 1 DNA integration: Fine structure target analysis using synthetic oligonucleotides // J. Virol. 1993. V. 67. P. 1127-1131;

74. Pmss D., Reeves R., Bushman F.D., Wolffe A.P. The influence of DNA and nucleosome structure on integration events directed by HIV integrase // J. Biol. Chem. 1994. V. 269. P. 25031-25041;

75. Craigie R. Hotspots and warm spots: integration specifity of retroelements//Trends Genet. 1992. V. 8. P. 187-190;

76. Katz R.A., Gravuer K., Skalka A.M. A preferred target DNA structure for retroviral integrase in vitro И J. Biol. Chem. 1998. V. 273. P. 24190-24195;

77. Kalpana G.V., Marmon S., Wang W., Crabtree G.R., Goff S.P. Binding and stimulation of HIV-1 integrase by a human homolog of yeast transcription factor SNF5 // Science. 1994. V. 266. P. 2002-2006;

78. Yoshinaga Т., Kimura-Ohtani Y., Fujiwara T. Detection and characterization of a functional complex of human immunodeficiency virus type 1 integrase and its DNA substrate by1.U

79. UV cross-linking // J. Virol. 1994. V. 68. P. 5690-5697;

80. Miller M.D., Farnet C.M., Bushman F.D. Human immunodeficiency virus type 1 preintegration complexes: studies of organization and composition // J. Virol. 1997. V. 71. P. 5382-5390;

81. Vink C., Lutzke R.A., Plasterck R.H. Formation of a stable complex between the human immunodeficiency virus integrase protein and viral DNA // Nucleic Acids Res. 1994. V. 22. P. 4103-4110;

82. Vora A.C, Grandgenett D.P. Assembly and catalytic properties of retrovirus integrase-DNA complexes capable of efficiently performing concerted integration // J. Virol.1995. V. 69. P. 7483-7488;

83. Bouziane M., Cherny D.I., Mouscadet J.-F., Auclair C. Alternate strand DNA triple helix-mediated inhibition of HIV-1 U5 long terminal repeat integration in vitro II J. Biol. Chem.1996. V. 271. P. 10359-10364;

84. Brodin P., Pinskaya M., Volkov E., Romanova E., Leh H., Auclair C., Mouscadet J.-F., Gottikh M. Branched oligonucleotide-intercalator conjugate forming a parallel stranded structure inhibits HIV-1 integrase // FEBS Lett. 1999. V. 460. P. 270-274;

85. Mazumder A., Neamati N., Ojwang J.O., Sunder S., Rando R.F., Pommier Y. Inhibition of the human immunodeficiency virus type 1 integrase by guanosine quartet structures // Biochemistry. 1996. V. 35. P. 13762-13771;

86. Пинская М.Д., Бродин П., Романов Е.А., Волков Е.М., Мускадет Ж.-Ф., Готтих М.Б. Ингибирование интеграции ДНК вируса иммунодефицита человека модифицированными олигонуклеотидами // Молекуляр. биология. 2000. Т. 34. С. 10391045;

87. Rando R.F., Ojwang J., Elbaggari A., Reyes G., Tinder R., McGrath M.S., Hogan M.E. Suppression of human immunodeficiency virus type 1 activity in vitro by oligonucleotides which form intramolecular tetrads//J. Biol. Chem. 1995. V. 270. P. 1754-1760;

88. Bishop J.S., Guy-Caffey J.K., Ojwang J.O., Smith S.R., Hogan M.E., Cossum P.A., Rando R.F., Chaudhary N. Intramolecular G-quartet motifs confer nuclease resistance to a potent anti-HIV oligonucleotide // J. Biol. Chem. 1996. V. 271. P. 5698-5703;

89. Агапкина Ю.Ю., Ташлицкий B.H., Депрез E., Брокон Ж.-С., Шугалий А.В., Маускадет Ж.-Ф., Готтих М.Б. Изучение взаимодействий гетероциклических оснований ДНК ВИЧ-1 с вирусной интегразой // Молекуляр. биология. 2004. Т. 38. С. 848-857;

90. Petit С., Schwartz О., Mammano F. Oligomerization within virions and subcellular localization of human immunodeficiency virus type 1 integrase // J. Virology. 1999. P. 50795088

91. Esposito D., Craigie R. HIV integrase structure and function //Adv. Virus Res. 1999. V. 52. P. 319-333;

92. Cherepanov P., Maertens G., Proost P., Devreese В., Van Beeumen J., Engelborgh Y., De Clercq E., Debyser Z. HIV-1 integrase forms stable tetramers and associates with LEDGF/p75 protein in human cells // J. Biol. Chem. 2003. V. 278. P. 372-381;

93. Deprez E., Tauc P., Leh H., Mouscadet J.-F., Auclair C., Brochon J.-C. Oligomeric state of the HIV-1 integrase as measured by time-resolved fluorescence anisotropy // Biochemistry. 2000. V. 39. P. 9275-9284;

94. Faure A., Calmels C., Desjobert C., Castroviejo M., Caumont-Sarcos A., Tarrago-Litvak L., Litvak S.-, Parissi V. HIV-1 integrase crosslinked oligomers are active in vitro II Nucleic Acids. Res. 2005. V. 33. P. 977-986;

95. Vercammen J., Maertens G., Gerard M., De Clercq E., Debyser Z., Engelborghs Y. DNA-induced polymerization of HIV-1 integrase analyzed with fluorescence fluctuation spectroscopy // J. Biol. Chem. 2002. V. 277. P. 38045-38052;

96. Kulkosky J., Skalka M. Molecular mechanism of retroviral DNA integration // Pharmac. Ther. 1994. V. 61. P. 185-203;

97. Ellison V., Brown P.O. A stable complex between integrase and viral DNA ends mediates human immunodeficiency virus integration in vitro II Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1994. V. 91. P. 7316-7320;

98. Asante-Appiah E., Seeholzer S.H., Skalka A.M. Structural determinants of metal-induced conformational changes in HIV-1 integrase // J. Biol. Chem. 1998. V. 273. P. 3507835087;

99. Gao K., Butler S.L., Bushman F. Human immunodeficiency virus type 1 integrase: arrangement of protein domains in active cDNA complexes // EMBO J. 2001. V. 20. P. 35653576;

100. Li M., Craigie R. Processing of viral DNA ends channels the HIV-1 integration reaction to concerted integration // J. Biol. Chem. 2005. V. 280. P. 29334-29339;

101. Li M., Mizuuchi M., Burke T.R., Craigie R. Retroviral DNA integration: reaction pathway and critical intermediates // EMBO J. 2006. V. 25. P. 1295-1304;

102. Chen A., Weber I.T., Harrison R.W., Leis J. Identification of amino acids in HIV-1 and avian sarcoma virus integrase subsites required for specific recognition of the long terminal repeat ends //J. Biol. Chem. 2006. V. 281. P. 4173-4182;

103. Wielens J., Crosby I.Т., Chalmers D.K. A three-dimensional model of the human immunodeficiency virus type 1 integration complex // J. Comput. Aided Mol. Des. 2005. V. 19. P. 301-317;

104. Parissi V., Calmels C., De Soultrait V.R., Caumont A., Fournier M., Chaignepain S., Litvak S. Functional interactions of human immunodeficiency virus type 1 integrase with human and yeast HSP60 // J. Virol. 2001. V. 75. P. 11344-11353;

105. Невинский Г.А. Ропь спабых специфических и неспецифических взаимодействий в узнавании и превращении ферментами протяженных ДНК // Мопекуляр. биология. 2004. Т. 38. С. 756-785;

106. Невинский Г.А. Важная роль слабых взаимодействий при узнавании ферментами протяженных -молекул ДНК и РНК // Молекуляр. биология. 1995. Т. 29. С. 1637;

107. Nevinsky G.A., Veniaminova A.G., Levina A.S., Podust V.N., Lavrik O.I., Holler E. Structure-function analysis of mononucleotides and short oligonucleotides in the priming of enzymatic DNA synthesis // Biochmistry. 1990. V. 29. P. 1200-1207;

108. Лаврик О.И., Невинский Г.А. Белок-нуклеиновые взаимодействия в реакциях полимеризации, катализируемых ДНК-полимеразами про- и эукариот // Биохимия. 1989. Т. 54. С. 757-764;

109. Лаврик О.И., Невинский Г.А. Аффинная модификация ферментов: проблемы и перспективы // Итоги науки и техники. Сер. Биоорган, химия. 1987. Т. 13. М. ВИНИТИ. С. 3-172;

110. Knorre D.G., Lavrik O.I., Nevinsky G.A. Protein-nucleic acid interaction in reactions catalyzed with DNA polymerases // Biochimie. 1988. V. 70. P. 655-661;

111. Knorre D.G., Godovikova T.I., Nevinsky G.A. Evolutionary biochemistry and related areas of physicochemical biology // Bach institute of biochemistry and ANCO. 1995. P. 297320;

112. Ищенко А.А., Булычев Н.В., Максакова Г.А., Джонсон Ф., Невинский Г.А. Взаимодействие 8-оксогуанин-ДНК гликозилазы из Escherichia coli с одноцепочечными дезоксиолигонуклеотидами и их комплексами // Молекуляр. биология. 1998. Т. 32. С. 549558;

113. Белоглазова Н.Г., Лохова И.А., Максакова Г.А., Цветков И.В., Невинский Г.А. Апурин/апиримидиновая эндонуклеаза из плаценты человека. Узнавание ферментом апуринизированной ДНК// Молекуляр. биология. 1996. Т. 30. С. 220-230;

114. Колочева Т.И., Демидов С.А., Максакова Г.А., Невинский Г.А. Взаимодействие эндонуклеазы EcoRI с короткими специфическими и неспецифическими олигонуклеотидами // Молекуляр. биология. 1998. Т. 32. С. 865-872;

115. Bugreev D.V., Vasyutina E.L., Kolocheva T.I., Buneva V.N., Andoh Т., Nevinsky G.A. Interaction of human DNA topoisomerase I with specific sequence oligodeoxynucleotides // Biochimie. 1998. V. 80. P. 303-308;

116. Bugreeva I.P., Bugreev D.V., Nevinsky G.A. Formation of nucleoprotein RecA filament on single-stranded DNA. Analysis by stepwise increase in ligand complexity // FEBS J. 2005. V. 272. P. 2734-2745;

117. Handbook of Biochemistry and Molecular Biology. Nucleic Acids // New York. "CRC Press". 1975. V. 1. P. 589;

118. Горн В.В., Зарытова В.Ф., Потемкин Г.А., Средин Ю.Г., ПолищукА.С. Синтез 5'-фосфорилированных олигодезоксирибонуклеотидов фосфотриэфирным твердофазным методом в ручном и автоматическом вариантах // Биоорган, химия. 1986. Т. 12. С. 10541062;

119. Мудраковская А.В., Ямковой В.И. РНК-лигаза бактериофага Т4. VIII. Твердофазный ферментативный синтез олигорибонуклеотидов // Биоорган, химия. 1991. Т. 17. С. 819-822;

120. Koziolkiewicz М., Wilk A. Oligodeoxyn'bonucleotide phosphotriesters // Methods Mol. Biol. 1993. V. 20. P. 207-224;

121. Eritja R., Walker P.A., Randall S.K., Goodman M.F., Kaplan B.E. Synthesis of oligonucleotides containing the abasic site model compound 1,4-anhydro-2-deoxy-D-ribitol // Nucleosides & Nucleotides. 1987. V. 6. P. 803-814;

122. Nevinsky G.A., Kit Y., Semenov D.V., Khlimankov D., Buneva V.N. Secretory immunoglobulin A from human milk catalyzes milk protein phosphorylation // Appl. Biochem. Biotechnol. 1998. V. 75. P. 77-91;

123. Kanyshkova T.G., Babina S.E., Semenov D.V., Isaeva N., Vlassov A.V., Neustroev K.N., Kul'minskaya A.A., Buneva V.N., Nevinsky G.A. Multiple enzymic activities of human milk lactofemn // Eur. J. Biochem. 2003. V. 270. P. 3353-3361;

124. Невинский Г.А., Канышкова Т.Г., Бунева B.H., Природные каталитические антитела (абзимы) в норме и при патологии // Биохимия. 2000. Т.65. С. 1473-1487;

125. Андриевская О.А. РНК-гидролизующие антитела из сыворотки крови больных системной красной волчанкой. Диссертация на соискание уч. степени канд. хим. наук. 1998. Новосибирск;

126. Laemmli U.K. Cleavage of structural proteins during the assembly of head of bacteriophage T4//Nature. 1970. V. 227. P. 680-685;

127. Merril C.R., Goldman D., van Keuren M.L. Gel protein stains: silver stain // Methods Enzymol. 1984. V. 104. P. 441-447;

128. Остерман Л.А. Методы исследования белков и нуклеиновых кислот: Электрофорез и ультрацентрифугирование (практическое пособие) // М. "Наука". 1981. С. 90-94;

129. Фримелль Г. Иммунологические методы // М. «Медицина». 1987;

130. Досон Р., Эллиот Д., Эллиот У., Джонс К. Справочник биохимика // М. «Мир».1991;

131. Каггап P., Lindahl Т. Enzymatic excision of free hypoxanthine from polydeoxynucleotides and DNA containing deoxyinosine monophosphate residues // J. Biol. Chem 1978 V. 253. P. 5877-5879;

132. Маниатис Т., Фрич Э., Сэмбрук Д. Методы генетической инженерии. Молекулярное клонирование//М. «Мир». 1984. С. 132.

133. Фершт Э. Структура и механизм действия ферментов II М. «Мир». 1980. С. 109-210;

134. Корниш-Боуден Э. Основы ферментативной кинетики // М. «Мир». 1979;

135. Диксон М., Уэбб Э. Ферменты // М. «Мир». 1982. С. 1120;

136. Zhang X., Shi L„ Shu S., Wang Y.f Zhao K., Xu N., Liu S., Roepstorff P. An improved method of sample preparation on anchorchip targets for MALDI-MS and MS/MS and its application in the liver proteome project // Proteomics. 2007. V. 7. P. 2340-2349;

137. Кирпота O.O., Жарков Д.О., Бунева B.H., Невинский Г.А. Взаимодействие 8-оксогуанин-ДНК-гликозилазы человека с одно- и двухцепочечными ДНК И Молекуляр. биология. 2006. Т. 40. С. 1055-1063;

138. Бугреев Д.В., Бунева В.Н., Синицина О.И., Невинский Г.А. Механизм узнавания суперскрученной ДНК эукариотическими топоизомеразами первого типа I. Взаимодействие ферментов с неспецифическими олигонуклеотидами // Биоорган, химия. 2003. Т.29. С. 163-174;

139. Breslauer K.J., Frank R., Blocker H., Marky L.A. Predicting DNA duplex stability from the base sequence// Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1986. V. 83. P. 3746-3750;

140. Asante-Appiah E., Skalka A.M. A metal-induced conformational change and activation in HIV-1 integrase // J. Biol. Chem. 1997. V. 272. P. 16196-16205;

141. Yi J., Asante-Appiah E., Skalka A.M. Divalent cations stimulate preferential recognition of viral DNA end by HIV-1 integrase // Biochemistry. 1999. V. 38. P. 8458-8468;

142. Susk D., Oefner C. Structure of DNase I at 2,0 A resolution suggests a mechanism for binding to and cutting DNA // Nature. 1986. V. 321. P. 620-625.

143. Bera S., Vora A.C., Chiu R., Heyduk Т., Grandgenett D.P. Synaptic complex formation of two retrovirus DNA attachment sites by integrase: a fluorescnce energy transfer study// Biochemistry. 2005. V. 44. P. 15106-15114;

144. Свергун Д.И., Фейгин Jl.А. Рентгеновское и нейтронное малоугловое рассеяние // М. «Наука». 1986. С. 280;

145. Tuzikov F.V., Zinoviev V.V., Vavilin V.I., Malygin E.G. Small-angle X-ray scattering study of enzyme-substrate interaction in solution // Studia Biophisica. 1988. V. 125. P. 169-172;

146. Tuzikov F.V., Zinoviev V.V., Vavilin V.I., Malygin E.G. Application of the small-angle X-ray scattering technique for the study of the two-step equilibrium enzyme-substrate interactions// Biopolymers. 1996. V. 38. P. 131-139;

147. Tuzikov F.V., Tuzikova N.A., Galimov R.V., Panin L.E., Nevinsky G.A. General model to describe the structure and dynamic balance between different human serum lipoproteins and its practical application // Med. Sci. Monit. 2002. V. 8. P. 79-88;

148. Gill P.E., Murray W., Wrighe M.H. Practical optimization //Academic Press. London. New York. Toronto. Sydney. San Francisco. 1981;

149. Невинский Г.А., Семенов Д.В., Бунева B.H. Каталитически активные антитела (абзимы), индуцированные химически стабильными аналогами переходных состояний (обзор) // Биохимия. 2000. Т. 65. С. 1459-1472;

150. Невинский Г.А., Канышкова Т.Г., Семенов Д.В., Бунева В.Н. Каталитически активные антитела и их возможная биологическая функция // Докл. РАМН. 2001. Т. 2. С. 38-45;

151. Nevinsky G.A., Favorova О.О., Buneva B.N. Catalytic antibodies: New characters in the protein repertoire in protein-protein interactions // A molecular cloning manual (Golemis E., ed.). New York. Cold Spring Harbor Lab. Press. 2002. P. 523-534;

152. Nevinsky G.A., Buneva V.N. Human catalytic RNA- and DNA-hydrolyzing antibodies //J. Immunol. Methods. 2002. V. 269. P. 235-249;

153. Nevinsky G.A., Buneva, V.N. Catalytic antibodies in healthy humans and patients with autoimmune and viral pathologies // J. Cell. Mol. Med. 2003. V.7. P. 265-276;

154. Nevinsky G.A., Buneva V.N. Natural catalytic antibodies-abzymes // Catalytic antibodies. (Keinan E., ed.). VCH-Wiley press. 2005. Germany. P. 503-567;

155. Фаучи Э., Лэйн К., Внутренние болезни по Тинсли Р. Харрисону, гл. 308 // «Практика». 2002;

156. Одинцова Е.С., Харитонова М.А., Барановский А.Г., Сизякина Л.П., Бунева В.Н., Невинский Г.А. Протеолитическая активность IgG антител из крови больныхсиндромом приобретенного иммунодефицита человека // Биохимия. 2006. Т. 71. С. 320332;

157. Одинцова Е.С., Харитонова М.А., Барановский А.Г., Сизякина Л.П., Бунева В.Н., Невинский Г.А. ДНК-гидролизующие IgG антитела из крови больных синдромом приобретенного иммунодефицита человека // Молекуляр. биология. 2006. Т. 40. С. 857864;

158. Buneva V.N., Kanyshkova T.G., Vlassov A.V., Semenov D.V., Khlimankov D„ Breusova L.R., Nevinsky G.A. Catalytic DNA- and RNA-hydro!yzing antibodies from milk of healthy human mothers //Appl. Biochem. Biotechnol. 1998. V. 75. P. 63-76;

159. Андриевская O.A., Бунева B.H., Забара В.Г., Наумов В.А., Ямковой В.И., Невинский Г.А. Иммуноглобулины класса М из сыворотки крови больных системной красной волчанкой эффективно расщепляют РНК // Молекуляр. биология. 1998. Т. 32. С. 908-915;

160. Shuster A.M., Gololobov G.V., Kvashuk O.A., Bogomolova A.E., Smirnov I.V., Gabibov A.G. DNA hydrolyzing autoantibodies//Science. 1992. V. 256. P. 665-667;

161. Gabibov A.G., Gololobov G.V., Makarevich O.I., Schourov D.V., Chemova E.A., Yadav R.P. DNA-hydrolyzing autoantibodies //Appl. Biochem. Biotechn. 1994. V. 47. P. 293302;

162. Белки и пептиды. Под. ред. Иванова В.В., Липкина В.М. // М.: "Наука". 1995. Т. 1. С. 145-182;

163. Szentivanyi A. The beta-adrenergic theory of the atopic abnormality in bronhial asthma // J. Allergy. 1968. V. 42. P. 203-232;

164. Boushey H.A., Holtzman M.J., Shelter J.R., Nadel J.A. Bronhial hyperreactivity // Am. Rev. Respir. Dis. 1980. V. 121. P. 389-423;

165. Paul S., Erian P., Said S.!. Autoantibody to vasoactive intestinal peptide in human circulation // Biochem. Biophis. Res. Commun. 1985. V. 130. P. 479-485;

166. Paul S., Mei S., Mody В., Eklund S.H., Beach C.M., Massey R.J., Hamel F. Cleavage of vasoactive intestinal peptide at multiple sites by autoantibodies // J. Biol. Chem. 1991. V. 266. P. 16128-16134;

167. Paul S., Voile D.J., Beach C.M., Johnson D.R., Powell M.J., Massey R.J. Catalytic hydrolysis of vasoactive intestinal peptide by human autoantibody // Science. 1989. V. 244. P. 1158-1162;

168. Odintsova E.S., Buneva V.N., Nevinsky G.A. Casein-hydrolyzing activity of slgA antibodies from human milk // J. Mol. Recognit. 2005. V. 18. P. 413-421;

169. SavePev A.N., Kanyshkova T.G., Kulminskaya A.A., Buneva V.N., Eneyskaya E.V., Filatov M.V., Nevinsky G.A., Neustroev K.N. Amylolytic activity of IgG and slgA immunoglobulins from human milk // Clin. Chim. Acta. 2001. V. 314. P. 141-152;

170. Andrievskaia O.A., Buneva V.N., Zabara V.G., Naumov V.A., lamkovoi V.I., Nevinskii G.A. Catalytic heterogeneity of polyclonal RNA-hydrolyzing IgM from sera of patients with lupus erythematosus // Med. Sci. Monit. 2000. V. 6. P. 460-^470;

171. Bangale Y., Karle S., Planque S., Zhou Y.-X., Taguchi H., Nishiyama YM Li L., Kalaga R., Paul S. Phase autoantibodies in Fas-defective mice and patients with autoimmune disease 11FASEB J. 2003. V. 17. P. 628-635;

172. Li L., Paul S., Tyutyulkova S., Kazatchkine M.D., Kaveri S. Catalytic activity of anti-thyroglobulin antibodies // J. Immunology. 1995. V. 154. P. 3328-3332;

173. Catalytic antibodies. Edited by Keinan E. // Weinleim Wiley-VCH Vertag GmbH&Co. 2005. P. 1-586;

174. Paul S., Li L., Kalaga R„ Wilkins-Stevens P., Stevens F.J., Solomon A. Natural catalytic antibodies: peptide-hydrolyzing activities of Bence Jones proteins and VL fragment // J. Biol. Chem. 1995. V. 270. P. 15257-15261;

175. Bizub-Bender D., Kulkosky J., Skalka A.-M. Monoclonal antibodies against HIV type 1 integrase: clues to molecular structure //AIDS Res. Hum. Retroviruses. 1994. V. 10. P. 11051115;

176. Yi J., Arthur J.W., Dunbrack R.L.Jr., Skalka A.-M. An inhibitory monoclonal antibody binds at the turn of the helix-turn-helix motif in the N-terminal domain of HIV-1 integrase // J. Biol. Chem. 2000. V. 275. P. 38739-38748;