Механизмы транскрипционной регуляции гепатоцитарного ядерного фактора 4 тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.00.03, кандидат биологических наук Альперн, Даниил Валерьевич

• Альперн, Даниил Валерьевич
• кандидат биологических наук
• 2008

Оглавление диссертации кандидат биологических наук Альперн, Даниил Валерьевич

ОГЛАВЛЕНИЕ.

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ.

ВВЕДЕНИЕ.

Цели и задачи исследования.

Научная новизна и практическая ценность работы.

ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.И

Гепатоцитарный ядерный фактор HNF4a.

Структура и функции HNF4a.

Структура белка.

Структура гена и изоформы.

Модуляция транс-активационных функций изоформ.

Функции HNF4a.

Метаболизм.

Клеточная адгезия и морфогенная активность.

Регуляция клеточного цикла.

Дифференцировочный фактор.

Диабет.

Гепатоканцерогенез.

Специфичность экспрессии и роль HNF4a на отдельных этапах онтогенеза.

Ранний эмбриогенез.

Поздний эмбриогенез и взрослый организм.

Регуляция экспрессии гена HNF4a.

Регуляция активности промотора Р1.

Регуляция активности промотора Р2.

Факторы, участвующие в регуляции экспрессии HNF4a.

Печеньспецифические факторы транскрипции.

HNF1.

С/ЕВР.

FoxA (HNF3).

HNF6 (Onecut).

COUP-TF.

GATA.

Нетканеспецифические аспекты регуляции активности HNF4a.

Опухолевый супрессор р53.

Участие белка р53 в процессе клеточной дифференцировки.

Последствия инактивации р53 у мышей.

Негативная регуляция АФП белком р53.

Негативная регуляция экспрессии HNF4aPl белком р53.

Трансформирующий фактор роста (TGFP).

TGFP лиганд.

Рецепторы TGFP.

Белки Smad.

TGFP сигнальный путь.

Альтернативные сигнальные пути.

TGFp-зависимая регуляция экспрессии HNF4a.

Кооперация р53 и TGFP сигнальных путей.

МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ.

Список использованных растворов и сред.

Животные.

Клеточные линии.

Плазмидные конструкции.

Трансформация клеток Е. Coli.

Трансфекция и инфекция клеток линии HepG2.

Анализ активности репортерного гена люциферазы.

Выделение РНК.

Выделение высокомолекулярной геномной ДНК.

Выделение препаративных количеств плазмидной ДНК.

Полимеразная цепная реакция (ПЦР) с обратной транскрипцией (ОТ).

Клонирование промоторного участка Р2 гена HNF4a мыши.

Клонирование промоторного участка Р2 гена HNF4a человека и направленный мутагенез.

Электрофорез нуклеиновых кислот в агарозном геле.

Иммунофлуоресцентное окрашивание препаратов.

Вестерн-Блот гибридизация.

РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ.

В печени взрослых р53~/ мышей происходит активация экспрессии эмбриональной изоформы HNF4a7.

Инактивация р53 в культуре клеток HepG2 при помощи ми-РНК приводит к индукции экспрессии HNF4aP2.

Снижение уровня р53 вызывает активацию промотора Р2 в культуре клеток

IIepG2.

Биоинформатический анализ нуклеотидной последовательности промоторного элемента Р2 гена HNF4a мыши и человека.

Действие цитокинов TGFpi и TGF02 проводит к изменению баланса экспрессируемых изоформ HNF4a в культуре клеток HepG2.

Компоненты TGFP сигнального пути активируют промотор Р2 напрямую, в то время как репрессия промотора Р1 происходит опосредованно дополнительными факторами.

Факторы TGFpi и TGFP2 способны активировать экспрессию репортерного гена под контролем Р2 промотора HNF4a мыши.

Ингибирование передачи сигнала от рецептора TGFP препятствует подавлению синтеза HNF4aPl и активации HNF4aP2.

Направленный мутагенез предполагаемого сайта связывания Smad в промоторе Р2 гена HNF4a человека не приводит к изменению активности этого промотора под действием TGFP2.

Ингибирование МЕК сигнального пути блокирует TGFp-зависимое подавление экспрессии изоформ HNF4aPl, но не влияет на активацию HNF4aP2.

Возможная кооперация р53 и TGFp-сигнальных путей в регуляции транскрипции

HNF4a.

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Механизмы транскрипционной регуляции гепатоцитарного ядерного фактора 4»

Формирование органов и тканей многоклеточного организма происходит в результате процессов деления и последующей специализации определенных групп клеток. Эти процессы регулируются в пространстве и времени. Переход клеток из менее специализированных типов в более специализированные называется клеточной дифференцировкой. Он сопровождается различными изменениями, которые можно оценивать физическими или биохимическими параметрами. Меняется размер клеток, их форма, полярность, степень подвижности и уровень метаболической активности. Процесс дифференцировки клеток может приводить к значительному изменению их морфологических или биохимических показателей, однако, за редким исключением, он не затрагивает изменений в последовательности ДНК. Таким образом, все указанные изменения происходят в результате модификации генетической программы клетки. Она характеризуется активностью определенной группы генов, которые позволяют клетке выполнять свои специализированные функции, в то же время гены, активность которых не востребована в данный момент в конкретном типе клеток, оказываются заблокированными. Изменение генетической программы или спектра экспрессирующихся в клетке генов может приводить к ее переходу в другой тип или утрате дифференцировки.

В процессе развития организма дифференцировка клеток происходит в результате действия на клетку внешних сигналов в виде ростовых факторов, которые активируют внутриклеточные сигнальные каскады реакций. В свою очередь эти каскады приводят к модуляции транскрипции определенной группы генов, которые формируют так называемые регуляторные сети. Сложная система иерархических взаимодействий в этих сетях может выражаться в том, что изменение уровня транскрипции одного или нескольких генов приводит к модификации всей генетической программы клетки.

По мере повышения специализации в клетке начинается экспрессия так называемых тканеспецифических генов, которая являются одним из основных критериев уровня дифференцировки. Эти гены отвечают за синтез белков, обеспечивающих функционирование данного типа клеток в структуре ткани и органа. Регуляцию их экспрессии осуществляют тканеспецифические факторы транскрипции, которые в свою очередь контролируются общими транскрипционными сигналами.

Дифференцировка клетки обычно сопровождается постепенным снижением числа активных генов. В то же время происходит увеличение активности отдельных генов, выполняющих специализированные функции. Этот процесс контролируетсявнутриклеточной системой регуляторов экспрессии генов, которые осуществляют тонкую настройку транскрипционной программы клетки при помощи сети тканеспецифических факторов транскрипции.

Регуляторная сеть гепатоспецифических ядерных факторов (ГЯФ, HNF -Hepatocyte nuclear factors) является одной из наиболее изученных моделей тканеспецифической регуляции экспрессии генов. Гепатоцитарные ядерные факторы играют центральную роль в установке и поддержании дифференцировки гепатоцитов. Они не только контролируют экспрессию гепатоспефических генов, но и регулируют процессы пролиферации и морфогенеза. Группа ГЯФ включает в себя пять семейств транскрипционных факторов HNF1, Fox A, HNF4, HNF6 и С/ЕВР, экспрессия которых выявляется не только в клетках печени, однако именно в них достигается максимальный уровень синтеза представителей всех семейств. Вероятно, тканевая специфичность экспрессии генов печени достигается в результате одновременного действия нескольких факторов [Лазаревич, 2000].

Одним из важных аспектов канцерогенеза наряду с нарушением механизмов регуляции клеточной смерти (апоптоза) и размножения (пролиферации), является утрата опухолевыми клетками дифференцировочного статуса. Так же, как и дифференцировка, обратно направленный процесс происходит в результате изменения спектра экспрессирующихся в клетке генов, которое обусловлено нарушением скоординированной работы факторов транскрипции.

Дедифференцировка опухолевых клеток, наблюдаемая в процессе гепатоканцерогенеза, ассоциирована с подавлением экспрессии целого ряда генов, кодирующих функциональные белки печени, компоненты межклеточных и адгезионных контактов, опухолевые супрессоры, а также тканеспецифические транскрипционные факторы.

Множество исследований демонстрирует, что гепатоцитарный ядерный фактор HNF4a играет одну из ключевых ролей в регуляции дифференцировки клеток печени. Сайты связывания этого транскрипционного фактора выявлены приблизительно в половине активно транскрибирующихся генов печени и поджелудочной железы человека [Odom et al., 2004]. Он регулирует экспрессию большинства остальных ГЯФ и играет решающую роль в развитии и нормальном функционировании печени и поджелудочной железы [Parviz et al., 2003 ; Kyrmizi et al., 2006]. Кроме того, эксперименты, проведенные в нашей лаборатории, показывают, что нарушение экспрессии HNF4a является важным этапом прогрессии гепатоцеллюлярных карцином, а восстановление его экспрессии вкультуре клеток дедифференцированной гепатокарциномы (ГК) мыши приводит к частичной реверсии злокачественного фенотипа [Lazarevich et al., 2004].

Регуляция экспрессии гена HNF4a другими гепатоцитарными ядерными факторами на разных этапах развития активно изучается. Однако до сих пор остается неясным, чем определяется нарушение экспрессии HNF4a, а также других тканеспецифических транскрипционных факторов в опухолях, и участвуют ли в этом процессе нетканеспецифические сигнальные каскады, особенно те из них, изменение активности которых происходит на разных стадиях канцерогенеза.

Экспрессия гена HNF4a осуществляется с двух независимых промоторов, в результате чего образуются две группы изоформ HNF4aP2 и HNF4aPl. Изоформы HNF4aP2 экспрессируются в эмбриональной печени и в норме не обнаруживаются после рождения, их замещают изоформы HNF4aPl. В то же время, экспрессия HNF4aP2 может происходить на ранних этапах гепатоканцерогенеза и свидетельствует о начальных этапах процесса дедиффереицировки [Lazarevich et al., 2004 ; Флейшман и др., 2008].

Существуют немногочисленные указания на то, что в регуляции экспрессии HNF4a могут участвовать различные нетканеспецифические факторы. К их числу относится онкосупрессор р53, белок, мутации которого часто встречаются в различных типах опухолей. Являясь транскрипционным фактором, р53 играет важнейшую роль в регуляции клеточного цикла и индукции апоптоза при повреждении ДНК [Bargonetti and Manfredi, 2002]. Есть данные о том, что инактивация гена р53 может приводить к блоку дифференцировки гепатоцитов [Dumble et al., 2001].

Цитокины семейства трансформирующих факторов роста р (TGF|3) являются вероятными кандидатами на роль связующего звена между печеньспецифическими и общими сигнальными путями, задействованными в процессе канцерогенеза. Факторы этого семейства участвуют в поддержании морфологических и дифференцировочных свойств, а также в контроле пролиферации и апоптоза как в печени, так и в других эпителиальных тканях [Thiery, 2002].

Роль TGFP в канцерогенезе двойственна. TGFpi был открыт как фактор, стимулирующий рост опухолей, но в дальнейшем было показано, что на некоторые виды опухолей он может оказывать супрессирующее действие [Massague, 1998]. Результаты недавних исследований свидетельствуют о том, что действие цитокинов TGF|3 на опухолевые клетки зависит от стадии канцерогенеза и особенностей исходной ткани, из которой произошла опухоль [Rossmanith and Schulte-Hermann, 2001 ; Breuhahn et al., 2006 ; Fransvea et al., 2008].

Цели и задачи исследованияЦелью настоящей работы являлось исследование механизмов регуляции транскрипции центрального фактора гепатоцитарной дифференцировки НЫР4а при гепатоканцерогенезе и проверка предположения об участии факторов р53 и ТСРр в этом процессе. В ходе работы планировалось выяснить возможное место компонентов общих сигнальных путей р53 и ТСРр в регуляции системы тканеспецифической экспрессии генов печени.

Указанная цель подразумевала решение следующих задач:1. Анализ спектра экспрессии гепатоспецифических транскрипционных факторов в печени мышей, нокаутных по гену р53.

2. Создание линии клеток Нер02 с инактивированным р53 и анализ ассоциированного с этим изменения спектра экспрессии гепатоспецифических генов, определяющих уровень дифференцировки клеток.

3. Исследование механизмов дифференциальной регуляции альтернативных промоторов гена НИР4а при подавлении экспрессии гена р53 и индукции ТОрр-зависимого сигнального пути в клетках гепатомы человека Нер02.

4. Изучение механизмов ТОрр-зависимого переключения экспрессии изоформ гена НЫР4а на этой модели.

Научная новизна и практическая ценность работыВ настоящей работе представлено исследование влияния факторовнетканеспецифических сигнальных путей на экспрессию центрального регулятора дифференцировки гепатоцитов ЬЮТ4а.

Многочисленные исследования показывают, что прогрессия гепатокарцином может быть связана с нарушением функций гепатоцитарных транскрипционных факторов. Одним из важнейших ГЯФ является 1-ЮТ4а, который рассматривается как ключевой регулятор гепатоцитарной дифференцировки. В нашей лаборатории было показано, что подавление экспрессии НИР4а является частым событием при прогрессии гепатокарцином, а его экзогенная экспрессия в клетках дедифференцированной гепатокарциномы мыши вызывает реверсию злокачественного фенотипа. Кроме того, активация экспрессии эмбриональных изоформ НИР4аР2 в печени может свидетельствовать о ранних этапах опухолевой трансформации. В последние годы появились данные о нарушении экспрессии 1ЮТ4а в карциномах почки и кишечника, чтопозволяет рассматривать этот фактор как потенциальный опухолевый супрессор для некоторых типов эпителиальных тканей.

За последнее десятилетие накоплено большое количество данных о механизмах взаимной регуляции между гепатоцитарными ядерными факторами. Однако до сих пор остается актуальным вопрос о взаимодействии сети ГЯФ с общими сигнальными каскадами. Существуют указания на то, что именно HNF4a может выступать в качестве связующего звена между сетью тканеспецифических регуляторов транскрипции и общими клеточными сигнальными путями. Частным случаем этой проблемы является вопрос о механизмах подавления активности HNF4a в канцерогенезе, которое происходит в результате нарушения внутриклеточных каскадов сигнальных реакций.

Таким образом, исследование возможных механизмов регуляции экспрессии HNF4a представляет не только теоретическое, но практическое значение.

В нашей работе мы показали, что экспрессия гена HNF4a может изменяться при инактивации опухолевого супрессора р53. Ранее были опубликованы данные о том, что в печени нокаутных по гену р53 мышей может происходить накопление недодифференцированных клеток-предшественников гепатоцитов. В ходе нашего исследования мы выяснили, что инактивация р53 повышает уровень экспрессии эмбриональных изоформ HNF4a в печени взрослой мыши и в культуре клеток гепатомы человека. Мы продемонстрировали, что подавление функции р53 в клетках гепатомы человека приводит к активации альтернативного промотора Р2 гена HNF4a.

Мы показали, что при активации TGFP-сигнальиого пути в культуре гепатомы человека происходит переключение экспрессии изоформ HNF4a со взрослых на эмбриональные, свидетельствующее о снижении уровня дифференцировки. Кроме этого мы выяснили, что этот процесс связан с индукцией одного из важнейших клеточных сигнальных путей - MAP киназного каскада.

Выявление механизмов регуляции экспрессии гена HNF4a представляется важным для разработки новых подходов для терапии опухолей печени, а также для понимания фундаментальных основ процесса дифференцировки в ходе эмбрионального развития животных и человека.

Заключение диссертации по теме «Молекулярная биология», Альперн, Даниил Валерьевич

выводы

1. Впервые показано, что инактивация онкосупрессора р53 может индуцировать транскрипцию эмбриональных Р2 изоформ центрального регулятора дифференцировки гепатоцитов НЫР4а в печени взрослых мышей.

2. Инактивация р53 в клетках гепатомы человека Нер02 вызывает повышение активности промотора Р2 гена НЫР4а.

3. В клетках гепатомы Нер02 факторы ТОИР регулируют баланс изоформ НМР4а за счет активации Р2 и подавления Р1 промоторов этого гена.

4. ТОрр-зависимое подавление активности промотора Р1 происходит только после синтеза регуляторных белков, оказывающих репрессирующее действие на Р1. Активация Р2 промотора происходит без дополнительного белкового синтеза.

5. Нарушение сайта связывания ТОрр-респонсивного регулятора транскрипции белка 8тас14 в промоторе Р2 не отражается на ТОрр-зависимой активации Р2.

6. ТОрр-зависимое подавление экспрессии НЫР4аР1 связано с активацией МАРК сигнального каскада.

7. ТОрр-индуцированная репрессия промотора Р1 ассоциированна с подавлением транскрипции гена С/ЕВРа, одного из ключевых активаторов экспрессии НЫР4аР1.

Заключение

Настоящее исследование было посвящено изучению роли опухолевого супрессора р53 и ТОБр в регуляции экспрессии гена ЬЮТ4а, кодирующего центральный регулятор дифференцировки гепатоцитов. Оба указанных фактора регулируют нормальный клеточный рост, а нарушения функций сигнальных путей, регулируемых ТОРр или р53, увеличивают вероятность возникновения опухолей.

Транскрипционный фактор р53 функционирует как опухолевый супрессор, влияя на ' экспрессию генов регуляторов клеточного цикла, а также различных дифференцировочных факторов [ТакеЬауаэЫ-Зигик! е/ а1, 2003]. Его инактивация наблюдается более чем в половине всех опухолей.

Ранее было показано, что в печени мышей, нокаутных по р53, значительно повышается количество овальных клеток, морфологически схожих с гепатобластами — эмбриональными низкодифференцированпыми предшественниками гепатоцитов [ЭшпЫе е1 а1., 2001].

Цитокины семейства ТОРр известны своим плейотропным эффектом - они играют важную роль в регуляции клеточного цикла и таких процессах, как пролиферация клеток, дифференцировка, апоптоз и формирование внеклеточного матрикса [Мо^акаБ е/ а1, 2001]. Их роль в канцерогенезе противоречива, однако большинство исследователей сходится во мнении, что ТОРр подавляет рост и способность клеток к метастазироваиию в дифференцированных опухолях, но оказывает противоположное действие на низкодифференцированные инвазивные опухоли [Мигаока-Соок е^ а1., 2005]. Показано, что экспрессия ТОРр 1 ассоциирована с прогрессией гепатокарцином и индукцией эпителиально-мезенхимального перехода [Ргапзуеа е( а1, 2008].

Целью нашей работы стало исследование возможной роли р53 и ТОРр в регуляции экспрессии гена Н№4а. Мы показали, что в печени р53/" мышей происходит индукция экспрессии эмбриональных изоформ гена 1ШР4а, НЫР4аР2, наряду с репрессией взрослых Н№4аР1. Эксперименты на клетках гепатомы человека Нер02, в которых экспрессия р53 была подавлена при помощи малых интерферирующих РНК, подтвердили данные об активации транскрипции изоформ НЫР4аР2 в отсутствие р53. Мы предположили, что эффект, оказываемый р53 на уровень РГЫР4аР2. может быть связан с его действием на альтернативный промотор этого гена. Для проверки этой гипотезы мы клонировали фрагмент регуляторного района Р2 гена НЫР4а размером 934 п. о. в экспрессирующий вектор с люциферазным репортером и обнаружили, что в отсутствие р53 его активность увеличивается в 3 раза.

Таким образом, нами был сделан вывод о том, что изменение активности одного из важнейших регуляторов клеточного цикла р53 может приводить к нарушению реализации дифференцировочной программы гепатоцитов, которое обусловлено изменением экспрессии важнейшего регулятора дифференцировки НИР4а [Альперн и др., 2008].

Мы также показали, что индукция экспрессии эмбриональных изоформ гена НЫР4а может происходить под действием цитокинов семейства ТОРр. ТОрр-зависимая активация сигнальных каскадов в клетках линии гепатомы человека НерС2 приводит к переключению экспрессии изоформ гена НМЧа с взрослых на эмбриональные. Эксперименты по ингибированию цитоплазматического белкового синтеза показали, что при индукции ТОРр-сигнального пути активация экспрессии НИР4аР2 изоформ происходит без участия дополнительно синтезируемых регуляторов транскрипции, в то время как подавление экспрессии взрослых ЬЮТ4аР1 изоформ требует дополнительного белкового синтеза. Мы показали, что в результате действия ТОРр происходит активация промоторов Р2 гена НЫР4а как мыши, так и человека, а ингибирование киназного домена рецептора ТйРр первого типа (ТрЫ) подавляет активацию Р2 промотора и блокирует переключение экспрессии изоформ гена 1ЮТ4а. Предположение о том, что ТОРР-индуцированное подавление транскрипции изоформ НЫР4аР1 происходит в результате накопления в клетке эмбриональных изоформ 1ГЫР4аР2 по механизму негативной авторегуляции было опровергнуто с помощью экспериментов по трансфекции вектора, кодирующего НЫР4а7, в клетки гепатомы человека Нер02 и анализа уровня транскрипции изоформ НЫР4а.

В литературных источниках существует множество данных о роли ТОРр1 в дифференцировке гепатоцитов, в то время как действие ТОРр2 на активацию ТОРР-сигнального пути считается схожим. В то же время данные, полученные в нашей лаборатории, свидетельствуют о том, что прогрессия гепатокарцином ассоциирована именно с гиперэкспрессией ТОРр2. По этой причине мы сфокусировали дальнейшие исследования по ТОРр-зависимой регуляции экспрессии НИР4а именно на ТОРр2.

В поисках возможного механизма активации промотора Р2 при индукции ТОРр-зависимого сигнального пути мы проанализировали последовательность Р2 на наличие потенциальных сайтов связывания различных транскрипционных факторов. В проксимальной части Р2 был обнаружен сайт связывания белков Бтас!, основных эффекторных молекул классического ТОРр-индуцируемого сигнального пути. Мы предположили, что активация промотора Р2 под действием ТОРр2 может происходить именно в результате 8тас1-сигиалыюго пути и связывания комплекса этих белков с промотором. Однако эксперименты по направленному мутагенезу сайта связывания Бшас! не подтвердили это предположение.

В литературных источниках встречается все больше упоминаний о возможности ТОРр-зависимой активации реакций МАР-киназного каскада, посредством которого происходит регуляция экспрессии большого числа ТОРР-респонсивных генов. Мы решили изучить возможность активации МАР-киназ под действием ТОРр2 в исследуемой системе. Оказалось, что под действием ингибитора фосфорилирования киназы ЕШС происходит блокирование сигнала от ТОРР2 к Р1 промотору гена НЫР4а, и ТОРр~ зависимого подавления синтеза изоформ НЫР4аР 1 не наблюдается. Важно отметить, что ТОРр-зависимая активация изоформ РПчГР4аР2 не зависит от активности МАР-киназного каскада.

Существуют указания на то, что ТОРр-зависимое подавление активности промотора Р1 может быть связанно с кооперативным вкладом р53 и ТОрр-сигнального пути в регуляцию транскрипции гена НЫР4а. Однако это предположение нуждается в дополнительной экспериментальной проверке. Кроме того, остается открытым вопрос о возможной роли Бтас! белков в активации Р2 промотора, а также поиск непосредственного транскрипционного репрессора промотора Р1. Мы ожидаем, что проводимые в нашей лаборатории эксперименты по инактивации компонентов сигнального каскада 8тас1 белков помогут дать ответ на эти вопросы.

Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Альперн, Даниил Валерьевич, 2008 год

1. Альперн Д.В., Макарова М.В., Чернобельская О.А., Флейшман Д.И.,Лазаревич Н.Л. (2008). "р53 и TGFP регулируют экспрессию эмбриональной изоформы HNF4a в клетках гепатомы человека." Российский Биотерапевтический Журнал 7(3): 62-70.

2. Лазаревич Н.Л. (2004). "Молекулярные механизмы прогрессии опухолей печени." Успехи биологической химии 44: 365-418.

3. Лазаревич Н.Л. (2003). "Изменения спектров экспрессии генов при гепатоканцерогенезе и прогрессии опухолей печени." Автореферат диссертации на соискание ученой степени доктора биологических наук, Москва, МГУ.

4. Лазаревич Н.Л. (2000). "Молекулярные механизмы экспрессии гена альфа-фетопротеина." Биохимия 65(1): 117-33.

5. Лазаревич Н.Л.,Альперн Д.В. (2008). "Гепатоцитарный ядерный фактор 4 (PINF4) в развитии и канцерогенезе эпителиальных тканей." Молекулярная биология 42(5): 786797.

6. Лазаревич Н.Л.,Флейшман Д.И. (2008). "Тканеспецифические транскрипционные факторы в прогрессии эпителиальных опухолей." Биохимия 73(5): 713-734.

7. Овчинников Д.А. (2004). "Факторы, влияющие на пролиферацию и апоптоз в мышиных гепатокарциномах различного уровня дифференцировки." Автореферат диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук, Москва, МГУ.

8. Флейшман Д-И-, Морозова О.В.,Лазаревич Н.Л. (2008). "Экспрессия тканеспецифических генов в гепатокарциномах мыши различного уровня дифференцировки." Вестник Онкологического Научного Центра 19(2): 22-27.

9. Abelev G.I., Eraiser T.L. (1999). "Cellular aspects of alpha-fetoprotein reexpression in tumors." Semin Cancer Biol 9(2): 95-107.

10. Abelev G.I., Lazarevich N.L. (2006). "Control of differentiation in progression of epithelial tumors." Adv Cancer Res 95: 61-113.

11. Akhurst R.J., Derynck R. (2001). "TGF-beta signaling in cancer—a double-edged sword." Trends Cell Biol 11(11): S44-51.

12. Almog N., Rotter V. (1997). "Involvement of p53 in cell differentiation and development." Biochim BiophysActa 1333(1): Fl-27.

13. Anastasiadis A.G., Lemm I., Radzewitz A., Lingott A., Ebert Т., Ackermann R., Ryffel G.U.,Schulz W.A. (1999). "Loss of function of the tissue specific transcription factor

14. HNF1 alpha in renal cell carcinoma and clinical prognosis." Anticancer Res 19(3A): 210510.

15. Ang S.L., Rossant J. (1994). "HNF-3 beta is essential for node and notochord formation in mouse development." Cell 78(4): 561-74.

16. Ang S.L., Wierda A., Wong D., Stevens K.A., Cascio S., Rossant J.,Zaret K.S. (1993). "The formation and maintenance of the definitive endoderm lineage in the mouse: involvement of HNF3/forkhead proteins." Development 119(4): 1301-15.

17. Atfi A., Baron R. (2008). "p53 brings a new twist to the Smad signaling network." Sci Signal 1(26): pe33.

18. Bailly A., Torres-Padilla M.E., Tinel A.P., Weiss M.C. (2001). "An enhancer element 6 kb upstream of the mouse HNF4alphal promoter is activated by glucocorticoids and liver-enriched transcription factors." Nucleic Acids Res 29(17): 3495-505.

19. Bargonetti J., Manfredi J.J. (2002). "Multiple roles of the tumor suppressor p53." Curr Opin Oncol 14(1): 86-91.

20. Bartoov-Shifman R., Hertz R., Wang H., Wollheim C.B., Bar-Tana J.,Walker M.D. (2002). "Activation of the insulin gene promoter through a direct effect of hepatocyte nuclear factor 4 alpha." J Biol Chem 277(29): 25914-9.

21. Bhowmick N.A., Zent R., Ghiassi M., McDonnell M., Moses H.L. (2001). "Integrin beta 1 signaling is necessary for transforming growth factor-beta activation of p38MAPK and epithelial plasticity." J Biol Chem 276(50): 46707-13.

22. Bissell D.M., Roulot D., George J. (2001). "Transforming growth factor beta and the liver." Hepatology 34(5): 859-67.

23. Bressac B., Galvin K.M., Liang T.J., Isselbacher K.J., Wands J.R., Ozturk M. (1990). "Abnormal structure and expression of p53 gene in human hepatocellular carcinoma." Proc Natl Acad Sci USA 87(5): 1973-7.

24. Breuhahn K., Longerich T., Schirmacher P. (2006). "Dysregulation of growth factor signaling in human hepatocellular carcinoma." Oncogene 25(27): 3787-800.

25. Briancon N., Weiss M.C. (2006). "In vivo role of the HNF4alpha AF-1 activation domain revealed by exon swapping." EMBOJ25(6): 1253-62.

26. Brown K.A., Pietenpol J.A., Moses H.L. (2007). "A tale of two proteins: differential roles and regulation of Smad2 and Smad3 in TGF-beta signaling." J Cell Biochem 101(1): 9-33.

27. Budanov A.V., Sablina A.A., Feinstein E., Koonin E.V.,Chumakov P.M. (2004). "Regeneration of peroxiredoxins by p53-regulated sestrins, homologs of bacterial AhpD." Science 304(5670): 596-600.

28. Bulla G.A.,Fournier R.E. (1994). "Genetic analysis of a transcriptional activation pathway by using hepatoma cell variants." Mol Cell Biol 14(11): 7086-94.

29. Calvisi D.F., Factor V.M., Loi R., Thorgeirsson S.S. (2001). "Activation of beta-catenin during hepatocarcinogenesis in transgenic mouse models: relationship to phenotype and tumor grade." Cancer Res 61(5): 2085-91.

30. Cartharius K., Freeh K., Grote K., Klocke B., Haltmeier M., Klingenhoff A., Frisch M., Bayerlein M., Werner T. (2005). "Matlnspector and beyond: promoter analysis based on transcription factor binding sites." Bioinformatics 21(13): 2933-42.

31. Chao C., Saito S., Kang J., Anderson C.W., Appella E.,Xu Y. (2000). "p53 transcriptional activity is essential for p53-dependent apoptosis following DNA damage." EMBO J 19(18): 4967-75.

32. Chen C.A., Okayama H. (1988). "Calcium phosphate-mediated gene transfer: a highly efficient transfection system for stably transforming cells with plasmid DNA." Biotechniques 6(7): 632-8.

33. Chen W., Fu X., Sheng Z. (2002). "Review of current progress in the structure and function of Smad proteins." Chin Med J (Engl) 115(3): 446-50.

34. Chiba N., Suwa T., Ilori M., Sakuma M., Kitajima M. (2004). "Advanced gastric endocrine cell carcinoma with distant lymph node metastasis: a case report and clinicopathological characteristics of the disease." Gastric Cancer 7(2): 122-7.

35. Cicchini C., Filippini D., Coen S., Marchetti A., Cavallari C., Laudadio I., Spagnoli F.M., Alonzi T.,Tripodi M. (2006). "Snail controls differentiation of hepatocytes by repressing HNF4alpha expression." J Cell Physiol 209(1): 230-8.

36. Cicchini C., Laudadio I., Citarella F., Corazzari M., Steindler C., Conigliaro A., Fantoni A., Amicone L.,Tripodi M. (2008). "TGFbeta-induced EMT requires focal adhesion kinase (FAK) signaling." Exp Cell Res 314(1): 143-52.

37. Clotman F., Libbrecht L., Gresh L., Yaniv M., Roskams T., Rousseau G.G.,Lemaigre F.P. (2003). "Hepatic artery malformations associated with a primary defect in intrahepatic bile duct development." J Hepatol 39(5): 686-92.

38. Coffinier C., Barra J., Babinet C.,Yaniv M. (1999). "Expression of the vHNF 1 /HNF1 beta homeoprotein gene during mouse organogenesis." Mech Dev 89(1-2): 211-3.

39. Cordenonsi M., Dupont S., Maretto S., Insinga A., Imbriano C.,Piccolo S. (2003). "Links between tumor suppressors: p53 is required for TGF-beta gene responses by cooperating with Smads." Cell 113(3): 301-14.

40. Cordenonsi M., Montagner M., Adorno M., Zacchigna L., Martello G., Mamidi A., Soligo S., Dupont S.,Piccolo S. (2007). "Integration of TGF-beta and Ras/MAPK signaling through p53 phosphorylation." Science 315(5813): 840-3.

41. Dell H., Hadzopoulou-Cladaras M. (1999). "CREB-binding protein is a transcriptional coactivator for hepatocyte nuclear factor-4 and enhances apolipoprotein gene expression." J Biol Chem 274(13): 9013-21.

42. Derynck R.,Zhang Y.E. (2003). "Smad-dependent and Smad-independent pathways in TGF-beta family signalling." Nature 425(6958): 577-84.

43. Drewes T., Senkel S., Holewa B., Ryffel G.U. (1996). "Human hepatocyte nuclear factor 4 isoforms are encoded by distinct and differentially expressed genes." Mol Cell Biol 16(3): 925-31.

44. Dumble M.L., Knight B., Quail E.A., Yeoh G.C. (2001). "Hepatoblast-like cells populate the adult p53 knockout mouse liver: evidence for a hyperproliferative maturation-arrested stem cell compartment." Cell Growth Differ 12(5): 223-31.

45. Duncan S.A., Nagy A., Chan W. (1997). "Murine gastrulation requires HNF-4 regulated gene expression in the visceral endoderm: tetraploid rescue of Hnf-4(-/-) embryos." Development 124(2): 279-87.

46. Engel M.E., McDonnell M.A., Law B.K., Moses H.L. (1999). "Interdependent SMAD and JNK signaling in transforming growth factor-beta-mediated transcription." J Biol Chem 274(52): 37413-20.

47. Esteve P.O., Chin H.G., Pradhan S. (2005). "Human maintenance DNA (cytosine-5)-methyltransferase and p53 modulate expression of p53-repressed promoters." Proc Natl Acad Sci USA 102(4): 1000-5.

48. Ferrer J. (2002). "A genetic switch in pancreatic beta-cells: implications for differentiation and haploinsufficiency." Diabetes 51(8): 2355-62.

49. Fransvea E., Angelotti U., Antonaci S., Giannelli G. (2008). "Blocking transforming growth factor-beta up-regulates E-cadherin and reduces migration and invasion of hepatocellular carcinoma cells." Hepatology 47(5): 1557-66.

50. Galarneau L., Pare J.F., Allard D., Hamel D., Levesque L., Tugwood J.D., Green S.,Belanger l. (1996). "The alpha 1-fetoprotein locus is activated by a nuclear receptor of the Drosophila FTZ-F1 family." Mol Cell Biol 16(7): 3853-65.

51. Garrison W.D., Battle M.A., Yang C., Kaestner K.H., Sladek F.M., Duncan S.A. (2006). "Hepatocyte nuclear factor 4alpha is essential for embryonic development of the mouse colon." Gastroenterology 130(4): 1207-20.

52. Hatzis P., Kyrmizi I., Talianidis I. (2006). "Mitogen-activated protein kinase-mediated disruption of enhancer-promoter communication inhibits hepatocyte nuclear factor 4alpha expression." Mol Cell Biol 26(19): 7017-29.

53. Hatzis P., Talianidis I. (2001). "Regulatory mechanisms controlling human hepatocyte nuclear factor 4alpha gene expression." Mol Cell Biol 21(21): 7320-30.

54. Hayhurst G.P., Lee Y.H., Lambert G., Ward J.M., Gonzalez F.J. (2001). "Hepatocyte nuclear factor 4alpha (nuclear receptor 2A1) is essential for maintenance of hepatic gene expression and lipid homeostasis." Mol Cell Biol 21(4): 1393-403.

55. Hertz R., Magenheim J., Berman I., Bar-Tana J. (1998). "Fatty acyl-CoA thioesters are ligands of hepatic nuclear factor-4alpha." Nature 392(6675): 512-6.

56. Ho J., Benchimol S. (2003). "Transcriptional repression mediated by the p53 tumour suppressor." Cell Death Differ 10(4): 404-8.

57. Holewa B., Zapp D., Drewes T., Senkel S.,Ryffel G.U. (1997). "HNF4beta, a new gene of the HNF4 family with distinct activation and expression profiles in oogenesis and embryogenesis of Xenopus laevis." Mol Cell Biol 17(2): 687r94.

58. Hsu I.C., Tokiwa T., Bennett W., Metcalf R.A., Welsh J.A., Sun T.,Harris C.C. (1993). "p53 gene mutation and integrated hepatitis B viral DNA sequences in human liver cancer cell lines." Carcinogenesis 14(5): 987-92.

59. Hwang-Verslues W.W., Sladek F.M. (2008). "Nuclear receptor hepatocyte nuclear factor 4alphal competes with oncoprotein c-Myc for control of the p21/WAFl promoter." Mol Endocrinol 22(1): 78-90.

60. Janda E., Lehmann K., Killisch I., Jechlinger M., Herzig M., Downward J., Beug H.,Grunert S. (2002). "Ras and TGFbeta. cooperatively regulate epithelial cell plasticity and metastasis: dissection of Ras signaling pathways." J Cell Biol 156(2): 299-313.

61. Kaartinen V., Voncken J.W., Shuler C., Warburton D., Bu D., Heisterkamp N.,Groffen J. (1995). "Abnormal lung development and cleft palate in mice lacking TGF-beta 3 indicates defects of epithelial-mesenchymal interaction." Nat Genet 11(4): 415-21.

62. Kaestner K.H., Hiemisch H., Schutz G. (1998). "Targeted disruption of the gene encoding hepatocyte nuclear factor 3gamma results in reduced transcription of hepatocyte-specific genes." Mol Cell Biol 18(7): 4245-51.

63. Kaestner K.H., Katz J., Liu Y., Drucker D.J., Schutz G. (1999). "Inactivation of the winged helix transcription factor HNF3alpha affects glucose homeostasis and islet glucagon gene expression in vivo." Genes Dev 13(4): 495-504.

64. Kamiya A., Inoue Y.,Gonzalez F.J. (2003). "Role of the hepatocyte nuclear factor 4alpha in control of the pregnane X receptor during fetal liver development." Hepatology 37(6): 1375-84.

65. Kardassis D., Pardali K., Zannis V.I. (2000). "SMAD proteins transactivate the human ApoCIII promoter by interacting physically and functionally with hepatocyte nuclear factor 4." J Biol Chem 275(52): 41405-14.

66. Korchynskyi O., ten Dijke P. (2002). "Identification and functional characterization of distinct critically important bone morphogenetic protein-specific response elements in the Idl promoter." J Biol Chem 277(7): 4883-4891

67. Kretzschmar M., Liu F., Hata A., Doody J., Massague J. (1997). "The TGF-beta family mediator Smadl is phosphorylated directly and activated functionally by the BMP receptor kinase." Genes Dev 11(8): 984-95.

68. Kuo C.J., Conley P.B., Chen L., Sladek F.M., Darnell J.E., Jr., Crabtree G.R. (1992). "A transcriptional hierarchy involved in mammalian cell-type specification." Nature 355(6359): 457-61.

69. Kyrmizi I., Hatzis P., Katrakili N., Tronche F., Gonzalez F.J.,Talianidis I. (2006). "Plasticity and expanding complexity of the hepatic transcription factor network during liver development." Genes Dev 20(16): 2293-305.

70. Ladias J. A., Karathanasis S.K. (1991). "Regulation of the apolipoprotein AI gene by ARP-1, a novel member of the steroid receptor superfamily." Science 251(4993): 561-5.

71. Lastres P., Letamendia A., Zhang H., Rius C., Almendro N., Raab U., Lopez L.A., Langa C., Fabra A., Letarte M.,Bernabeu C. (1996). "Endoglin modulates cellular responses to TGF-beta I." J Cell Biol 133(5): 1109-21.

72. Lewis J., Burstein E., Reffey S.B., Bratton S.B., Roberts A.B.,Duckett C.S. (2004). "Uncoupling of the signaling and caspase-inhibitory properties of X-linked inhibitor of apoptosis." J Biol Chem 279(10): 9023-9.

73. Li J., Ning G., Duncan S.A. (2000). "Mammalian hepatocyte differentiation requires the transcription factor HNF-4alpha." Genes Dev 14(4): 464-74.

74. Li T.,Chiang J.Y. (2007). "A novel role of transforming growth factor betal in transcriptional repression of human cholesterol 7alpha-hydroxylase gene." Gastroenterology 133(5): 1660-9.

75. Lucas B., Grigo K., Erdmann S., Lausen J., Klein-Hitpass L.,Ryffel G.U. (2005). "HNF4alpha reduces proliferation of kidney cells and affects genes deregulated in renal cell carcinoma." Oncogene 24(42): 6418-31.

76. Luo K., Lodish H.F. (1997). "Positive and negative regulation of type II TGF-beta receptor signal transduction by autophosphorylation on multiple serine residues." EMBO J 16(8): 1970-81.

77. Macleod K.F., Sherry N., Hannon G., Beach D., Tokino T., Kinzler K., Vogelstein B.,Jacks T. (1995). "p53-dependent and independent expression of p21 during cell growth, differentiation, and DNA damage." Genes Dev 9(8): 935-44.

78. Maeda Y., Hwang-Verslues W.W., Wei G., Fukazawa T., Durbin M.L., Owen L.B., Liu X.,Sladek F.M. (2006). "Tumour suppressor p53 down-regulates the expression of the human hepatocyte nuclear factor 4alpha (HNF4alpha) gene." Biochem J400(2): 303-13.

79. Maeda Y., Seidel S.D., Wei G., Liu X., Sladek F.M. (2002). "Repression of hepatocyte nuclear factor 4alpha tumor suppressor p53: involvement of the ligand-binding domain and histone deacetylase activity." Mol Endocrinol 16(2): 402-10.

80. Magenheim J., Hertz R., Berman I., Nousbeck J., Bar-Tana J. (2005). "Negative autoregulation of HNF-4alpha gene expression by HNF-4alphal." Biochem J 388(Pt 1): 325-32.

81. Massague J. (1998). "TGF-beta signal transduction." Annu Rev Biochem 67: 753-91.

82. Massague J.,Chen Y.G. (2000). "Controlling TGF-beta signaling." Genes Dev 14(6): 62744.

83. Massague J., Seoane J., Wotton D. (2005). "Smad transcription factors." Genes Dev 19(23): 2783-810.

84. Massague J., Wotton D. (2000). "Transcriptional control by the TGF-beta/Smad signaling system." EMBOJl9(S): 1745-54.

85. Mendel D.B., Hansen L.P., Graves M.K., Conley P.B., Crabtree G.R. (1991). "HNF-1 alpha and HNF-1 beta (vHNF-1) share dimerization and homeo domains, but not activation domains, and form heterodimers in vitro." Genes Dev 5(6): 1042-56. .

86. Missero C., Calautti E., Eckner R., Chin J., Tsai L.H., Livingston D.M., Dotto G.P. (1995). "Involvement of the cell-cycle inhibitor Cipl/WAFl and the ElA-associated p300 protein in terminal differentiation." Proc Natl Acad Sci USA 92(12): 5451-5.

87. Montoliu L., Blendy J.A., Cole T.J.,Schutz G. (1995). "Analysis of perinatal gene expression: hormone response elements mediate activation of a lacZ reporter gene in liver of transgenic mice." Proc Natl Acad Sci USA 92(10): 4244-8.

88. Morrisey E.E., Tang Z., Sigrist K., Lu M.M., Jiang F., Ip H.S.,Parmacek M.S. (1998). "GATA6 regulates HNF4 and is required for differentiation of visceral endoderm in the mouse embryo." Genes Dev 12(22): 3579-90.

89. Moustakas A., Heldin C.H. (2005). "Non-Smad TGF-beta signals." J Cell Sci 118(Pt 16): 3573-84.

90. Moustakas A., Souchelnytskyi S., Heldin C.H. (2001). "Smad regulation in TGF-beta signal transduction." J Cell Sci 114(Pt 24): 4359-69.

91. Muraoka-Cook R.S., Dumont N., Arteaga C.L. (2005). "Dual role of transforming growth factor beta in mammary tumorigenesis and metastatic progression." Clin Cancer Res 11(2 Pt 2): 937s-43s.

92. Nakhei H., Lingott A., Lemm I., Ryffel G.U. (1998). "An alternative splice variant of the tissue specific transcription factor HNF4alpha predominates in undifferentiated murine cell types." Nucleic Acids Res 26(2): 497-504.

93. Niehof M., Borlak J. (2008). "HNF4 alpha and the Ca-channel TRPC1 are novel disease candidate genes in diabetic nephropathy." Diabetes 57(4): 1069-77.

94. Niehof M., Borlak J. (2005). "RSK4 and PAK5 are novel candidate genes in diabetic rat kidney and brain." Mol Pharmacol 67(3): 604-11.

95. Oda H., Nozawa K., Hitomi Y., Kakinuma A. (1995). "Laminin-rich extracellular matrix maintains high level of hepatocyte nuclear factor 4 in rat hepatocyte culture." Biochem Biophys Res Commun 212(3): 800-5.

96. Ogden S.K., Lee K.C., Wernke-Dollries K., Stratton S.A., Aronow B.,Barton M.C. (2001). "p53 targets chromatin structure alteration to repress alpha-fetoprotein gene expression." J Biol Chem 276(45): 42057-62.

97. Oklu R., Hesketh R. (2000). "The latent transforming growth factor beta binding protein (LTBP) family." Biochem J352 Pt 3: 601-10.

98. Ozdamar B., Bose R., Barrios-Rodiles M., Wang H.R., Zhang Y., Wrana J.L. (2005). "Regulation of the polarity protein Par6 by TGFbeta receptors controls epithelial cell plasticity." Science 307(5715): 1603-9.

99. Pardali K., Moustakas A. (2007). "Actions of TGF-beta as tumor suppressor and pro-metastatic factor in human cancer." Biochim Biophys Acta 1775(1): 21-62.

100. Pearson G., Robinson F., Beers Gibson T., Xu B.E., Karandikar M., Berman K.,Cobb M.H. (2001). "Mitogen-activated protein (MAP) kinase pathways: regulation and physiological functions." Endocr Rev 22(2): 153-83.

101. Peinado H., Ballestar E., Esteller M.,Cano A. (2004). "Snail mediates E-cadherin repression by the recruitment of the Sin3A/histone deacetylase 1 (HDAC1)/HDAC2 complex." Mol Cell Biol 24(1): 306-19.

102. Perlman R., Schiemann W.P., Brooks M.W., Lodish H.F.,Weinberg R.A. (2001). "TGF-beta-induced apoptosis is mediated by the adapter protein Daxx that facilitates JNK activation." Nat Cell Biol 3(8): 708-14.

103. Piek E., Roberts A.B. (2001). "Suppressor and oncogenic roles of transforming growth factor-beta and its signaling pathways in tumorigenesis." Adv Cancer Res 83: 1-54.

104. Rana B., Xie Y., Mischoulon D., Bucher N.L., Farmer S.R. (1995). "The DNA binding activity of C/EBP transcription factor is regulated in the G1 phase of the hepatocyte cell cycle." J Biol Chem 270(30): 18123-32.

105. Roberts A.B. (2002). "The ever-increasing complexity of TGF-beta signaling." Cytokine Growth Factor Rev 13(1): 3-5.

106. Roberts A.B., Russo A., Felici A., Flanders K.C. (2003). "Smad3: a key player in pathogenetic mechanisms dependent on TGF-beta." Ann N YAcadSci 995: 1-10.

107. Rossmanith W., Schulte-Hermann R. (2001). "Biology of transforming growth factor beta inhepatocarcinogenesis." Microsc Res Tech 52(4): 430-6.

108. Runyan C.E., Schnaper H.W., Poncelet A.C. (2003). "Smad3 and PKCdelta mediate TGF-beta 1-induced collagen I expression in human mesangial cells." Am J Physiol Renal Physiol 285(3): F413-22.

109. Sablina A.A., Chumakov P.M., Kopnin B.P. (2003). "Tumor suppressor p53 and its homologue p73alpha affect cell migration." J Biol Chem 278(30): 27362-71.

110. Satohisa S., Chiba H., Osanai M., Ohno S., Kojima T., Saito T.,Sawada N. (2005). "Behavior of tight-junction, adherens-junction and cell polarity proteins during HNF-4alpha-induced epithelial polarization." Exp Cell Res 310(1): 66-78.

111. Sheahan S., Bellamy C.O., Dunbar D.R., Harrison D.J., Prost S. (2007). "Deficiency of G1 regulators P53, P21Cipl and/or pRb decreases hepatocyte sensitivity to TGFbeta cell cycle arrest." BMC Cancer 7: 215.

112. Shen C.N., Slack J.M., Tosh D. (2000). "Molecular basis of transdifferentiation of pancreas to liver." Nat Cell Biol 2(12): 879-87.

113. Shi Y., Massague J. (2003). "Mechanisms of TGF-beta signaling from cell membrane to the nucleus." Cell 113(6): 685-700.

114. Sladek F.M., Zhong W.M., Lai E., Darnell J.E., Jr. (1990). "Liver-enriched transcription factor HNF-4 is a novel member of the steroid hormone receptor superfamily." Genes Dev 4(12B): 2353-65.

115. Song Y.H., Ray K., Liebhaber S.A., Cooke N.E. (1998). "Vitamin D-binding protein gene transcription is regulated by the relative abundance of hepatocyte nuclear factors 1 alpha and lbeta." J Biol Chem 273(43): 28408-18.

116. Spagnoli F.M., Cicchini C., Tripodi M., Weiss M.C. (2000). "Inhibition of MMH (Met murine hepatocyte) cell differentiation by TGF(beta) is abrogated by pre-treatment with the heritable differentiation effector FGF1." J Cell Sci 113 ( Pt 20): 3639-47.

117. Spath G.F., Weiss M.C. (1997). "Hepatocyte nuclear factor 4 expression overcomes repression of the hepatic phenotype in dedifferentiated hepatoma cells." Mol Cell Biol 17(4): 1913-22.

118. Spath G.F., Weiss M.C. (1998). "Hepatocyte nuclear factor 4 provokes expression of epithelial marker genes, acting as a morphogen in dedifferentiated hepatoma cells." J Cell Biol 140(4): 935-46.

119. Sporn M.B., Roberts A.B. (1990). "TGF-beta: problems and prospects." Cell Regul 1(12): 875-82.

120. Stoffel M., Duncan S.A. (1997). "The maturity-onset diabetes of the young (MODY1) transcription factor HNF4alpha regulates expression of genes required for glucose transport and metabolism." Proc Natl Acad Sci USA 94(24): 13209-14.

121. Sund N.J., Ang S.L., Sackett S.D., Shen W., Daigle N., Magnuson M.A.,Kaestner K.H. (2000). "Hepatocyte nuclear factor 3beta (Foxa2) is dispensable for maintaining the differentiated state of the adult hepatocyte." Mol Cell Biol 20(14): 5175-83.

122. Takebayashi-Suzuki K., Funami J., Tokumori D., Saito A., Watabe T., Miyazono K., Kanda A.,Suzuki A. (2003). "Interplay between the tumor suppressor p53 and TGF beta signaling shapes embryonic body axes in Xenopus." Development 130(17): 3929-39.

123. Takiguchi M. (1998). "The C/EBP family of transcription factors in the liver and other organs." IntJExp Pathol 79(6): 369-91.

124. Tanaka K., Sato M., Tomita Y., Ichihara A. (1978). "Biochemical studies on liver functions in primary cultured hepatocytes of adult rats. I. Hormonal effects on cell viability and protein synthesis." JBiochem 84(4): 937-46.

125. Taraviras S., Monaghan A.P., Schutz G., Kelsey G. (1994). "Characterization of the mouse HNF-4 gene and its expression during mouse embryogenesis." Mech Dev 48(2): 67-79.

126. Thiery J.P. (2002). "Epithelial-mesenchymal transitions in tumour progression." Nat Rev Cancer 2(6): 442-54.

127. Thiery J.P., Sleeman J.P. (2006). "Complex networks orchestrate epithelial-mesenchymal transitions." Nat Rev Mol Cell Biol 7(2): 131-42.

128. Tian J.M.,Schibler U. (1991). "Tissue-specific expression of the gene encoding hepatocyte nuclear factor 1 may involve hepatocyte nuclear factor 4." Genes Dev 5(12A): 2225-34.

129. Timchenko N.A., Wilde M., Darlington G.J. (1999). "C/EBPalpha regulates formation of S-phase-specific E2F-pl07 complexes in livers of newborn mice." Mol Cell Biol 19(4): 2936-45.

130. Torres-Padilla M.E., Fougere-Deschatrette C.,Weiss M.C. (2001). "Expression of HNF4alpha isoforms in mouse liver development is regulated by sequential promoter usage and constitutive 3' end splicing." Mech Dev 109(2): 183-93.

131. Tronche F., Ringeisen F., Blumenfeld M., Yaniv M., Pontoglio M. (1997). "Analysis of the distribution of binding sites for a tissue-specific transcription factor in the vertebrate genome." JMol Biol 266(2): 231-45.

132. Tsai J.F., Chuang L.Y., Jeng J.E., Yang M.L., Chang W.Y., Hsieh M.Y., Lin Z.Y.,Tsai J.H. (1997). "Clinical relevance of transforming growth factor-beta 1 in the urine of patients with hepatocellular carcinoma." Medicine (Baltimore) 76(3): 213-26.

133. Vousden K.FI. (2000). "p53: death star." Cell 103(5): 691-4.

134. Wang L., Wu Q., Qiu P., Mirza A., McGuirk M., Kirschmeier P., Greene J.R., Wang Y., Pickett C.B.,Liu S. (2001). "Analyses of p53 target genes in the human genome by bioinformatic and microarray approaches." J Biol Chem 276(47): 43604-10.

135. Wilkinson D.S., Tsai W.W., Schumacher M.A., Barton M.C. (2008). "Chromatin-bound p53 anchors activated Smads and the mSin3A corepressor to confer transforming-growth-factor-beta-mediated transcription repression." Mol Cell Biol 28(6): 1988-98.

136. Wrana J.L., Attisano L., Wieser R., Ventura F., Massague J. (1994). "Mechanism of activation of the TGF-beta receptor." Nature 370(6488): 341-7.

137. Yang Z.Y., Perkins N.D., Ohno T., Nabel E.G., Nabel G.J. (1995). "The p21 cyclin-dependent kinase inhibitor suppresses tumorigenicity in vivo." Nat Med 1(10): 1052-6.

138. Yingling J.M., Wang X.F., Bassing C.H. (1995). "Signaling by the transforming growth factor-beta receptors." Biochim Biophys Acta 1242(2): 115-36.

139. Yue J., Mulder K.M. (2000). "Requirement of Ras/MAPK pathway activation by transforming growth factor beta for transforming growth factor beta 1 production in a Smad-dependent pathway." J Biol Chem 275(40): 30765-73.

140. Zaret K. (1994). "Genes that control the formation of the liver." Hepatology 19(3): 794-6.

141. Zavadil J., Bitzer M., Liang D., Yang Y.C., Massimi A., Kneitz S., Piek E.,Bottinger E.P. (2001). "Genetic programs of epithelial cell plasticity directed by transforming growth factor-beta." Proc Natl Acad Sci USA 98(12): 6686-91.

142. Zavadil J., Cermak L., Soto-Nieves N. Bottinger E.P. (2004). "Integration of TGF-beta/Smad and Jaggedl/Notch signalling in epithelial-to-mesenchymal transition." EMBOJ 23(5): 1155-65.

143. Zawel L., Dai J.L., Buckhaults P., Zhou S., Kinzler K.W., Vogelstein B.,Kern S.E. (1998). "Human Smad3 and Smad4 are sequence-specific transcription activators." Mol Cell 1(4):

144. Zhong W., Mirkovitch J., Darnell J.E., Jr. (1994). "Tissue-specific regulation of mouse hepatocyte nuclear factor 4 expression." Mol Cell Biol 14(11): 7276-84.611.7.