Механизмы антагонистического действия бактерий на фитопатогенные грибы в ризосфере овощных культур тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.00.07, кандидат биологических наук Шапошников, Александр Иванович

• Шапошников, Александр Иванович
• кандидат биологических наук
• 2003

Оглавление диссертации кандидат биологических наук Шапошников, Александр Иванович

Введение.

1. Обзор литературы

1.1. Ризосфера - зона формирования специфических микробных сообществ.

1.2. Механизмы биологического контроля фитопатогенов штаммами РвРЯ.

1.2.1. Конкуренция за экологические ниши и источники питания.

1.2.2. Паразитизм и хищничество.

1.2.3. Синтез соединений, обладающих антибиотической активностью. 22 ^ 1.2.4. Индуцирование системной устойчивости.

1.3. Колонизация корней ризобактериями и ее роль в биоконтроле.

1.4. Биологический контроль фитопатогенов в теплицах.

2. Материалы и методы

2.1. Микробиологические объекты.

2.2. Растительны й материал.

2.3. Питательные среды для культивирования микроорганизмов.

2.4. Выделение изолятов ризобактерий из почв и тепличного субстрата госклуоо1.

2.5. Определение антифунгальных свойств ризобактерий.

2.6. Анализ действия летучих метаболитов ризобактерий на развитие фитопатогенных грибов.

2.7. Биоконтрольные эксперименты.

2.8. Хроматографический анализ корневых выделений.

2.9. Выделение и хроматографический анализ водорастворимых антифунгальных метаболитов.

2.10. Изучение колонизационной активности ризобактерий в гнотобиотических системах.

2.11. Получение дал-маркированных производных исследуемых штаммов.

2.12. Изучение приживаемости ризобактерий в ризосфере в условиях теплиц.

2.13. Статистическая обработка результатов.

3. Результаты и обсуждение

3.1. Отбор биоконтрольных штаммов из почв и тепличных субстратов.

3.1.1. Отбор ризобактерий, обладающих антифунгальной активностью, из почв и тепличных субстратов.

3.1.2. Биоконтрольные эксперименты.

3.1.3. Идентификация ризобактерий.

3.2. Колонизация ризобактериями корней овощных культур.

3.2.1. Изучение колонизационной активности ризобактерий в гнотобиотической системе.

3.2.2. Получение ^¿-маркированных производных исследуемых штаммов.

3.2.3. Изучение приживаемости ризобактерий в ризосфере овощных культур в промышленных теплицах.

3.3. Продуцирование ризобактериями соединений, обладающих антифунгальной активностью.

3.3 .1. Анализ корневых выделений огурцов и томатов, выращиваемых в минеральном тепличном субстрате.

3.3.2. Антифунгальная активность ризобактерий при росте на экстрактах корней и отдельных компонентах корневых выделений.

3.3.3. Действие летучих метаболитов ризобактерий на развитие фитопатогенных грибов.

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Механизмы антагонистического действия бактерий на фитопатогенные грибы в ризосфере овощных культур»

Актуальность темы исследования. В настоящее время актуальным способом борьбы с фитопатогенной микрофлорой является использование ризобактерий, обладающих способностью активно заселять ризосферу и ри-зоплану растений, используя питательные вещества, поставляемые растениями в составе корневых экзометаболитов (Kapulnik, 1996; Whipps, 2001). Такие бактерии (PGPR - от англ. "plant growth-promoting rhizobacteria") способны контролировать развитие фитопатогенов в ризосфере растений как за счет конкуренции за экологическую нишу - источники углерода и энергии (Lugtenberg et al., 1999; Bolwerk et al., 2003), так и продуцируя различные ан-тифунгальные метаболиты (Thomashow, Weller, 1996) или гидролитические ферменты, разрушающие клеточные стенки грибов (Shapira et al., 1989; Dunne et al., 1998). Биологический контроль фитопатогенов является активно развивающейся областью биотехнологии. В частности, на протяжении последних 10 лет был получен положительный опыт биологического контроля фитопатогенов в промышленных теплицах, проводите я работа по поиску новых биоконтрольных агентов для создания эффективных биопрепаратов на основе штаммов PGPR. (Paulitz, Bélanger, 2001).

Для максимального проявления штаммами PGPR биоконтрольных функций необходимо, чтобы большая часть корневых экзометаболитов была представлена в формах, доступных для их эффективной утилизации (Кравченко, 2000). Этого можно достичь направленным отбором из различных источников (почвы, тепличные субстраты) штаммов, обладающих высоким сродством к корневым выделениям растений определенных генотипов, производя затем среди этих штаммов скрининг тех, которые обладают необходимыми нам свойствами (Кравченко и др., 2002). Необходимым этапом скрининга штаммов PGPR является оценка их способности колонизировать корневую систему растений, успешно конкурируя с другими представителями комплекса ризосферной микрофлоры, и невоспроизводимые результаты, в ряде случаев получаемые в полевых опытах, могут объясняться неадекватной колонизацией корневой системы бактериальными штаммами (Schippers et al., 1987).

Таким образом, скрининг биоконтрольных штаммов PGPR является комплексной областью исследований и должен включать в себя как лабораторное изучение механизмов антагонистической активности ризобактерий, так и изучение поведения штаммов PGPR в реальных условиях ризосферы.

Цели и задачи исследований. Целью настоящей работы являлась селекция ризобактерий, обладающих высокой антагонистической активностью по отношению к фитопатогенным грибам и изучение основных механизмов биоконтрольного действия отобранных штаммов.

В соответствии с поставленной целью были определены следующие задачи:

1. Из почв и минерального тепличного субстрата (rockwool) выделить штаммы ризобактерий, обладающих антифунгальной активностью по отношению к широкому спектру фитопатогенных грибов in vitro и в реальных условиях ризосферы овощных культур.

2. Изучить в гнотобиотических условиях колонизационную активность выделенных биоконтрольных штаммов в ризосфере огурцов и томатов и отобрать штаммы с высокой колонизационной активностью.

3. Изучить динамику колонизации исследуемыми штаммами ризосферы огурцов и томатов при выращивании растений на минеральном субстрате в промышленных теплицах.

4. Изучить продуцирование ризобактериями водорастворимых анти-фунгальных метаболитов и оценить влияние на антифунгальную активность состава корневых выделений огурцов и томатов.

5. Изучить влияние летучих метаболитов исследуемых штаммов на рост мицелия фитопатогенных грибов.

Научная новизна. Создана новая коллекция перспективных штаммов ризобактерий, выделенных из почв северо-западного региона России, почв

Крыма и минерального тепличного субстрата, обладающих широким спектром антифунгальной активности по отношению к различным видам фитопа-тогенных грибов и активно колонизирующих корневую систему огурцов и томатов. Впервые изучена приживаемость ризобактерий в ризосфере огурцов и томатов, выращиваемых на минеральном субстрате в условиях промышленных теплиц. Впервые проведен анализ качественного и количественного состава органических кислот в корневых выделениях огурцов и томатов, выращиваемых на минеральном тепличном субстрате. Методом высокоэффективной жидкостной хроматографии (HPLC) проведен анализ водорастворимых антифунгальных метаболитов исследуемых ризобактерий.

Практическая значимость. В результате проведенных исследований создана коллекция ризобактерий, способных осуществлять биологический контроль фитопатогенных грибов и обладающих высокой колонизационной активностью в ризосфере огурцов и томатов в условиях промышленных теплиц агрофирмы «Выборжец».

Апробация работы. Материалы диссертации представлены на Всероссийской конференции «Сельскохозяйственная микробиология в XIX-XXI веках», 14-19 июня 2001 г., первой региональной конференции молодых ученых «Стратегия взаимодействия микроорганизмов и окружающая среда», 2627 марта 2002 г., на 11й1 International Congress on Molecular Plant-Microbe Interactions, St.-Petersburg, Russia, July 18-26, 2003.

Публикации. По материалам диссертации опубликовано 5 печатных работ.

1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.

Заключение диссертации по теме «Микробиология», Шапошников, Александр Иванович

ВЫВОДЫ.

1. Выделены новые штаммы ризобактерий рода Pseudomonas из почв и минерального тепличного субстрата, обладающие широким спектром анти-фунгальной активности по отношению к различным видам фитопатогенных грибов, высокой приживаемостью в ризосфере огурцов и томатов и понижающие уровень поражения томатов фитопатогеном Fusarium solani в 2.5-3 раза и огурцов фитопатогеном Pythium sp. в 2 раза при выращивании растений в минеральном субстрате.

2. Показано, с помощью ¿^-маркированных производных исследуемых ризобактерий, что выделенные штаммы способны эффективно приживаться в ризосфере огурцов и томатов в условиях минерального субстрата промышленных теплиц, успешно конкурируя с аборигенной микрофлорой.

3. Установлено, что исследуемые штаммы при интродукции в ризосферу огурцов и томатов способны снижать до двух раз численность грибной микрофлоры в минеральном тепличном субстрате по сравнению с неиноку-лированным контролем.

4. Показано, что уровень антифунгальной активности ризобактерий при утилизации органических кислот был выше, чем при утилизации Сахаров. При росте на корневых экстрактах огурцов и томатов антифунгальная активность штаммов находилась на уровне, сравнимом с активностью на органических кислотах.

5 Показано, что в корневых выделениях 4-х дневных проростков огурцов и томатов, выращиваемых в тепличном субстрате, содержится повышенное количество органических кислот, являющихся оптимальным питательным субстратом для биоконтрольных штаммов Pseudomonas.

6. Проведен анализ водорастворимых экзометаболитов, продуцируемых исследуемыми штаммами ризобактерий. Выявлены метаболиты, обладающие антифунгальной активностью.

7. Показано, что исследуемые штаммы ризобактерий способны инги-бировать рост мицелия фитопатогенных грибов за счет продуцирования летучих цианидов.

ЗАКЛЮЧЕНИЕ.

Одними из наиболее интересных для практического применения являются ризобактерии, обладающие широким спектром защитных функций по отношению к растениям - штаммы PGPR (Plant Growth-Promoting Rhizobacteria). Для лучшего использования их антагонистических свойств следует учитывать их зависимость от состава корневых экссудатов в ризосфере и подбирать сорта растений с благоприятным соотношением индивидуальных компонентов корневых выделений. Применение метода «активной селекции» дает возможность выделять из почв и тепличных субстратов бактериальные изоляты с активным хемотаксисом к корневым выделениям конкретного растения и проводить скрининг конкретных сортов растений, применяемых в качестве реципиента, и отбираемых штаммов. Коллекция ризо-бактериальных штаммов, выделенных в настоящей работе, состояла из бактерий рода Pseudomonas. По результатам тестирования набора бактериальных изолятов были отобраны штаммы с сильным антифунгальным эффектом in vitro против широкого спектра грибных патогенов. Высокая ферментативная активность ризобактерий может играть существенную роль в ограничении роста грибной биомассы в зоне корневой поверхности. Некоторые из отобранных изолятов продуцируют протеазу, липазу и летучий биоцид - цианид, за счет которого данные штаммы оказались способны ингибировать рост мицелия фитопатогенных грибов без прямого контакта с фитопатогеном.

Наличие антифунгальной активности in vitro является необходимым, но не достаточным условием для скрининга биоконтрольных штаммов ризобактерий. Только изучение способности тестируемых штаммов контролировать фитопатогены непосредственно в реальных условиях ризосферы может дать ответ на вопрос, являются ли они в действительности перспективными биоконтрольными агентами. Проведенные биоконтрольные эксперименты показали, что штаммы с широким спектром антифунгальной активности in vitro способны оказывать биоконтрольное действие в ризосфере растений, снижая уровень поражения томатов фитопатогеном Fusarium sotaní в 2.5-3 раза и огурца фитопатогеном Pythium sp. в 2 раза.

Приживаемость и стабильность развития интродуцируемых ризобакте-рий в зоне корня играет значительную роль в эффективности их действия. Часто невоспроизводимые результаты, получаемые в полевых опытах, объясняются неадекватной колонизацией корневой системы бактериальными штаммами. Выделенные методом «активной селекции» ризобактерии в большинстве случаев обладают высокой колонизирующей активностью, необходимой для эффективной защиты корней от фитопатогенов. Однако, все штаммы, выделенные методом «активной селекции» из минерального тепличного субстрата (rockwool), показали низкую конкурентоспособность по отношению к высокоактивному штамму-колонизатору корней Р. fluorescens PCL1500 в гнотобиотических опытах и это указывают на то, что наличие у ризобактерий активного хемотаксиса по отношению к корневым выделениям не является гарантией их высокого колонизационного потенциала.

Анализ конкурентоспособности ризобатерий в гнотобиотических экспериментах является лишь первым этапом в изучении их колонизационных свойств. Штаммы PGPR и в полевых или тепличных условиях должны обладать способностью приживаться в ризосфере растений, сохраняя свою численность в достаточных для проявления биоконтрольного эффекта пределах. Получение дал-маркированных производных штаммов PGPR позволило изучить приживаемость этих штаммов на корнях огурцов и томатах при их выращивании на минеральном субстрате rockwool в теплицах агрофирмы «Вы-боржец» (Санкт-Петербург). Результаты проведенных экспериментов показали, что биоконтрольные штаммы PGPR Р. brassicacearum RV513, Р. brassica-cearum RV604 и Р. corrúgala RV802 способны хорошо приживаться в ризосфере тестируемых овощных культур при их выращивании в минеральном субстрате rockwool в условиях промышленных теплиц, сохраняя и через 4 недели вегетации растений численность, составляющую от общей численности бактерий 14-21% для огурцов и 3-4% для томатов. Можно предположить, что такой уровень численности является достаточным для проявления биоконтрольного эффекта. Так, установлено, что штамм Р. Ьгаззкасеагит ЯУ604 при его интродукции в ризосферу огурца и томатов способен влиять на численность грибной микрофлоры в тепличном субстрате госкшоо!, понижая ее в 2 раза в течение 20 сут вегетации растений.

При утилизации ризобактериями компонентов корневых экзометаболи-тов состав органики оказывает влияние на эффективность синтеза антифун-гальных веществ. Максимальные величины зон подавления патогенов исследуемыми штаммами были отмечены при выращивании бактерий на органических кислотах и корневых выделениях огурца и томатов, а хроматографи-ческий анализ выявил наличие в культуральных жидкостях исследуемых штаммов водорастворимых антифунгальных метаболитов, интенсивность продукции которых зависела от доступных бактериям источников углерода.

Изменение динамики состава доминирующих компонентов в экссудатах различных видов растений может влиять на уровень колонизационной и антифунгальной активности штаммов РОРИ. в ризосфере. В корневых выделениях 4-х суточных проростков огурца и томатов, выращиваемых на минеральном субстрате госк\уоо1, количество органических кислот возрастает в 2.0-2.5 раз, тогда как при проращивании семян на бумаге такого увеличения не происходит. Таким образом, при культивировании растений на минеральном субстрате можно ожидать формирования в ризосфере огурца и томатов условий, благоприятных для колонизационной активности и проявления антифунгальных свойств интродуцируемых биоконтрольных штаммов уже в первые дни культивирования растений.

Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Шапошников, Александр Иванович, 2003 год

1. Адамовская В.Г., Клечковская Е.А., Молодченкова О.О., Вовчук C.B. Изменение протеиназно-ингибиторной системы озимой пшеницы под действием салициловой кислоты и Fusarium // Физиол. раст. 2000. Т.47. №2. С. 210-215.

2. Аркадьева З.А. Взаимодействие кукурузы с некоторыми бактериями корневой микрофлоры //Микробиология. 1963. Т.32. №1. С. 79-85.

3. Берестецкий O.A. Фитотоксины почвенных микроорганизмов и их экологическая роль // Фитотоксические свойства микроорганизмов / Л., 1978. С. 7-30.

4. Берестецкий O.A., Шерстобоев Н. К., Шерстобоева Е. В., Патыка В. Ф. Модифицированный метод накопительных культур для выделения симбиотрофных азотфиксирующих микроорганизмов // Микробиол. ж. 1986. Т.48. №2. С. 85-88.

5. Брынза А.И., Фока Е.Е., Плачинта Т.В. Фитотоксичность и гидролитическая активность грибов рода Fusarium, выделенных с озимой пшеницы на разных фазах развития // Болезни сельскохозяйственных культур и их антагонисты / Кишинев. 1982. С. 15-21.

6. Возняковская Ю.М. Микрофлора растений и урожай. Л.: Колос, 1969. 238 с.

7. Воробьев Н.И., Белимов A.A., Кожемяков А.П. Применение дисперсионного анализа в изучении механизма взаимодействия растений и корневых диазотрофов. Программа для ЭВМ «ДИАНА-3» // Бюлл. ВНИ-ИСХМ. 1989. №52, С. 6-11.

8. Геллер И.А., Калмыкова H.A. Фитотоксичные микроорганизмы в различных типах почв и их роль в процессах окультуривания // Фитоток-сические свойства микроорганизмов. Л., 1978. С. 76-80.

9. Долгих Ю.Р., Грачева Н.П. Микрофлора ризосферы риса и ее связь с корневыми выделениями // Повышение плодородия почв рисовых полей/М.: Наука, 1977. С. 144-150.

10. Доспехов Б.А. Методика полевого опыта / М.: Колос, 1979. 417 с.

11. Епанчинов A.B. Влияние удобрений на биологические процессы прикорневой зоны кукурузы // Физиол. и биох. культ, раст. 1978. Т. 10. №6. С. 623-628.

12. Жулин И.Б., Игнатов В.В. Хемотаксис у Azospirillum brasilense по отношению к аминокислотам // Микробиология. 1986. Т.55 №2. С. 340342.

13. Звягинцев Д.Г. Динамика микробных популяций в почвах // Структура и функции микробных сообществ почв с различной антропогенной нагрузкой. Киев, 1982.

14. Звягинцев Д.Г., Кожевин П.А., Кириллова И.П. Экологическая характеристика ризосферы // Проблемы почвоведения. М.: Наука, 1982. С. 66-70.

15. Звягинцев Д. Г. Почва и микроорганизмы / М.: Изд-во Моск. ун-та, 1987. 256с.

16. Климашевский Э.Л. Оценка кислотоустойчивости растений // Диагностика устойчивости растений к стрессовым воздействиям / Л.: ВИР, 1988. С. 97-100.

17. Кожевин П.А. Микробные популяции в природе. М.: МГУ. 1989. 171 с.

18. Кононова С.А., Скворцова И.М., Макаров O.E. и др. Полисахаридные комплексы, выделяемые Azospirillum brasilense и их возможная роль во взаимодействии бактерий с корнями пшеницы // Микробиология. 1995. Т.64. №6. С. 762-768.

19. Костычев С П. Физиология растений // М.-Л. Сельхозгиз. 1933. 375с.

20. Кравченко Л.В. и др. Влияние корневых экзометаболитов пшеницы с различной плоидностью генома на рост Azospirillum brasilense // Микробиология. 1993. Т.62. №.5. С. 863-868.

21. Кравченко Л.В. Роль корневых экзометаболитов в интеграции микроорганизмов с растениями // Автореф. дисс. д.б.н. / М., 2000. 52 с.

22. Кравченко Л.В., Азарова Т.С., Леонова-Ерко Е.И. и др. Корневые выделения томатов и их влияние на рост и антифунгальную активность штаммов Pseudomonas II Микробиология. 2003. Т.72. №1. С. 48-53.

23. Красильников Н. Ф. Микроорганизмы почвы и высшие растения. М.: Изд-во АН СССР, 1958. 463 с.

24. Лилли И., Барнетт Г. Физиология грибов / М.: Изд-во Иностранной литературы, 1953. 531с.

25. Лукин С. А., Прозоров А. А. Конъюгация между азоспириллами в ризосфере ячменя и в почве // Микробиология. 1994. Т. 63. Вып. 2. С. 254-247.

26. Лутова JI.А., Проворов H.A., Тиходеев О.Н. и др. Генетика развития растений / Под ред. чл.-кор. РАН С.Г. Инге-Вечтомова. СПб.: Наука, 2000. - 539с.

27. Николаев Ю.А., Проссер Дж.И. Внеклеточные факторы, влияющие на адгезию Pseudomonas fluorescens на стекле // Микробиология. 2000а. Т.69. №2. С. 231-236.

28. Николаев Ю.А., Проссер Дж.И. Свойства адгезина и антиадгезина Pseudomonas fluorescens // Микробиология. 20006. Т.69. №2. С. 237242.

29. Озерецковская О.Л., Ильинская Л.И., Васюкова Н.И. Механизмы индуцирования элиситорами системной устойчивости растений к болезням // Физиол. раст. 1994. Т.41. №4. С. 626-633.

30. Олескин A.B., Ботвинко И.В., Цавкелова Е.А. Колониальная организация и межклеточная коммуникация у микроорганизмов // Микробиология. 2000. Т.69. №3. С. 309-327.

31. Рыбчин В Н. Основы генетической инженерии / СПб. Изд-во СПбГТУ, 2002. 522с.

32. Семак H.H., Матвеев В.Ю., Панасенко В.И., Котусов В.В. Зависимость агглютинации Azospirillum brasilense Sp7 лектином пшеницы от фазы роста культуры // Прикл. биохимия и микробиол. 1986. Т.22. №3. С. 396-399.

33. Смирнов, A.M. Рост и метаболизм изолированных корней в стерильной культуре // М.: Наука, 1970. 455с.

34. Смирнов В.В., Киприанова Е.А., Бойко О.И., Колесова Э.А., Гарагуля А.Д. Влияние ионов железа на антифунгальную активность бактерий рода Pseudomonas II Микробиол. журн. 1991. Т.53. №3. С. 80-87.

35. Соловова Т.К., Калаптур О.В., Чумаков М.И. Анализ прикрепления аг-робактерий к корням пшеницы и риса // Микробиология. 1999. Т.68. №1. С. 76-82.

36. Стейниер Р., Эдельберг Э., Ингрэм Дж. Мир микробов. Том 2 / М.: Изд. Мир, 1979.-336с.

37. Тамбиев А.Х. Реакционная способность экзометаболитов растений. М.: МГУ, 1984. 72с.

38. Умаров М.М. Ассоциативная азотфиксация / М.: Изд. Моск. Ун-та, 1986.- 131с.

39. Феофилова Е.П. Трегалоза, стресс и анабиоз // Микробиология. 1992. Т.61. №5. С. 739-753.

40. Шабарова З.А., Богданов А.А., Золотухин А.С. Химические основы генетической инженерии / М.: Изд-во МГУ, 1994. 224с.

41. Шахназарова В.Ю., Струнникова O.K., Вишневская Н.А. Влияние влажности на развитие Fusarium culmorum в почве // Микол. и фитопа-тол. 1999. 33(1): 53-59.

42. Эмсли Дж. Элементы / М.: Мир, 1993. 256с.

43. Abdel-Nasser M., Noawad H. Changes in number of microorganisms during decomposition of root exudates in soil // Zbl. Bacteriol. 1975. V.ll. P. 738744.

44. Ahl P., Voisard C., De'fago G. Iron-bound siderophores, cyanic acid, and antibiotics involved in suppression of Thielaviopsis basicola by a Pseudomonas fluorescens strain //J. Phytopathol. 1986. V.166. P. 121-134.

45. Alexandre G., Jacoud C., Faure D., Bally R. Population dynamics of a motile and non-motile Azospirillum lipoferum strain during rice colonization and motility variation in the rhizosphere // FEMS Microbiol. Ecol. 1996. V. 19. P. 271-278.

46. Aliken R.M., Smucker A.J.M. Root system regulation of whole plant growth // Annu. Rev. Phytopathol. 1996. V.34. P. 325-346.

47. Altschul S.F., Madden T.L., Schaffer A.A. et al. Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs // Ncleic Acids Res. V.25. P. 3389-3402.

48. Arnitis R. Strategies for reducing use of plant protection products // Bull. OEPP. 1997. V.27. N2-3. P. 211-212.

49. Barber D.A., Lynch J.M. Microbial growth in the rhizosphere // Soil Biol. Biochem. 1977. V.9. N5. P. 305-308.

50. Bashan Y., Levanony H., Klein E. Evidence for a weak active external adsorption of Azospirillum brasilense Cd to wheat roots // J. Gen. Microbiol. 1986. V.132.P. 3069-3073.

51. Bashan Y., HolguinG. Anchoring of Azospirillum brasilense to polystyrene and wheat roots // J. Gen. Microbiol. 1993. V.139. N2. P. 379-385.

52. Bashan Y., de Bashan L.E. Protection of tomato seedlings against infection by Pseudomonas syringae pv. tomato by using the plant growth-promoting bacterium Azospirillum brasilense II Appl. Environ. Microbiol. 2002. V.68. N6. P. 2637-2643.

53. Baudoin E., Benizri E., Guckert A. Impact of growth stage on the bacterial community structure along maize roots, as determined by metabolic and genetic fingerprinting // Appl. Soil Ecol. 2002. V.19. N2. P. 135-145.

54. Bennet R.A., Lynch J.M. Colonization potential of bacteria in the rhizosphere//Curr. Microbiol. 1981. V.6. N3. P. 137-138.

55. Berg G., Roskot N., Steidle A. et al. Plant-dependent genotypic and pheno-typic diversity of antagonistic rhizobacteria isolated from different Verticil-lum host plants // Appl. Environ. Microbiol. 2002. V.68. N7. P. 3328-3338.

56. Bergman K., Gulash-Hofee M., Hovestadt R E. et al. Physiology of be-havorial mutants of Rhizobium meliloti: evidence for a dual chemotaxis pathway//J. Bacterid. 1988. V.170. P. 3249-3244.

57. Bloemberg G.V., O'Tool G.A., Lugtenberg B.J.J., Kolter R. Green fluorescent protein as a marker for Pseudomonas spp. // Appl. Environ. Microbiol. 1997. V.63. P. 4543-4551.

58. Bossier P., Verstraete W. Ecology of Arthrobacter JG9 detectable hydrox-amate siderophores in soil // Soil. Biol. Biochem. 1986. V.18. P. 487-492.

59. Bossier P., Hofte M., Verstraete W. Ecological significance of siderophores in soil // Adv. Microb. Ecol. 1988. V.10. P. 385-414.

60. Bowen G.D., Rovira A.D. Are modeling approaches useful in studies of rhi-zosphere biology? // Modern Methods in the Study of Microbial Ecology / Stockholm, 1973. P. 443-450.

61. Bowen G.D., Theodorou C. Growth of ectomycorrizial fungi around seeds and roots // Ectomycorrizae: Their Ecology and Physiology / New York: Acad. Press, 1973. P. 107-150.

62. Bowen G.D., Rovira A.D. Microbial colonization of plant roots // Ann. Rev. Phytopathology. 1976. V.U. P. 121-144.

63. Bowen G. D. Misconceptions, concepts and approaches in rhizosphere biology // Contemporary Microbial Ecology / Ed. D. C. Ellwood, J. N. Hedger et al., London: Academic Press, 1980. P. 283-304.

64. Brisbane P.G., Janik L.G., Tate M.E., Warren R.F.O. Revived structure for the phenazine antibiotic from Pseudomonas fluorescens 2-79 (NRRL B-15132) // Antimicrob. Agents Chemother. 1987. V.31. P. 1967-1971.

65. Brown M. E., Burlingham S. K., Jackson R. M. Studies on Azotobacter species in soil. II. Population of Azotobacter in the rhizosphere and effects of artificial inoculation // Plant Soil. 1962. V.17. P. 320-322.

66. Bull C.T., Weller D.M., Thomashow L.S. Relationship between root colonization and suppression of Gaeumannomyces graminis var. tritici by Pseudomonas fluorescens strain 2-79 // Phytopathology. 1991. V.81. P. 954-959.

67. Bultreys A., Gheysen I., Wathelet B. et al. High-Performance Liquid Chromatography analyses of pyoverdin siderophores differentiate among phytopathogenic fluorescent Pseudomonas species // Appl Environ. Microbiol. 2003. V.69. P. 1143-1153.

68. Chebotar V., Nakayama Y., Kang U.G., Gaali E.E., Akao S. Use of reporter gws-gene to study the colonization of rice by Azospirillum lipoferum II Soil Microorganisms. 1999. V.53. P. 13-18.

69. Chin-a-Woeng T.F.C., Bloemberg G.V., Lugtenberg B.G.G. Phenazines and their role in biocontrol by Pseudomonas bacteria I I New Phytologist. 2003. V.157.N3.P. 503-523.

70. Cook R.J., Rovira A.D. The role of bacteria in the biological control of Gae-umannomyces graminis by suppressive soils // Soil Biol. Biochem. 1976. V.8. P. 269-273.

71. Cook R.J., Thomashow L.S., Weller D.M. Fungal-bacterial interaction in the root region with special reference to antagonisms of weat-root-infecting fungi by Rhizobacteria // Perspect. Microbiol. Ecol. Proc. 4 Int. Symp. Ljubliana, 1986. pp. 401-405.

72. Corbell N., Loper J.E. A global regulator of secondary metabolite production in Pseudomonas fluorescens Pf-5 // J. Bacteriol. 1995. V.177. P. 62306236.

73. Cornish A.S., Page W.J. Role of molybdate and other transition metals in the accumulation of protochelin by Azotobacter vinelandii II Appl. Env. Microbiol. 2000. V.66. N4. P. 1580-1586.

74. Cox C.D., Graham R. Isolation of an iron-binding compounds from Pseudomonas aeruginosa II J. Bacteriol. 1979. V.137. P. 357-364.

75. Crowley D.E., Reid C.P.P., Szaniszlo P.J. Utilization of microbial siderophores in iron acquisition by oat // Plant Physiol. 1988. V.87. P. 680685.

76. Dekkers L.C. Isolation and Characterization of Novel Rhizosphere Colonization Mutant of Pseudomonas fluorescense WCS365. Phd Thesis. 1997. Leiden University.

77. Dekkers L.C., Bloemendaal C.J.P., de Weger L.A. et al. A two-component system plays an important role in the root-colonizing ability of Pseudomonas fluorescens strain WCS365 // MPMI. 1998b. V. 11. P. 45-56.

78. Delorme S., Lemanceau P., Christen R. et al. Pseudomonas lini sp. nov., a novel species from bulk and rhizosphic soils // Internat. J. Systematic. Evolution. Microbiol. 2002. V.52. P. 513-523.

79. Dijkstra A.F., Govaert J.M., Schölten G.H.N., van Elsas J.D. A soil chamber for studying the bacterial distribution in the vicinity of roots // Soil Biol. Bichem. 1987a. V.19. P. 351-352.

80. Dijkstra A.F., Schölten G.H.N., van Veen J.A. Colonization of wheat seedling (Triticum aestivum) roots by Pseudomonas fluorecens and Bacillus sub-tilis // Biol. Fertil. Soil. 1987b. V.4. P. 41-46.

81. Di Pietro A., Lorito M., Hayes C.K. et al. Endochitinase from Gliocladium virens: isolation, characterization and synergistic antifungal activity in combination with gliotoxin // Phytopathology. 1993. V.83. P.313-318.

82. Dong X. SA, JA, ethylene and disease resistance // Curr. Opin. Plant Biol. 1998. V.l. P. 316-323.

83. Dowling D.N., O'Gara. Metabolites of Pseudomonas involved in the biocontrol of plant disease // Trends Biotechnol. 1994. V.12. P. 133-141.

84. Duffy B.K., Simon A., Weller D.M. Combination of Trichoderma koningii with fluorescent Pseudomonads for control of take-all on wheat // Phytopathology. 1996. V.86. P. 188-194.

85. Duffy B.K., Defago G. Environmental factors modulating antibiotic and siderophore biosynthesis by Pseudomonas fluorescens biocontrol strains // Appl. Environ. Microbiol. 1999. V.65. P. 2429-2438.

86. Duffy B.K., Defago G. Controlling instability in gacS-gacA regulatory genes during inoculant production of Pseudomonas fluorescens biocontrol strains // Appl. Environ. Microbiol. 2000. V.66. P. 3142-3150.

87. Duijff B.J., Meijer J.W., Bakker P.A.H.M., Schippers B. Siderophore-mediated competition for iron and induced systemic resistance of Fusarium wilt of carnation by fluorescent Pseudomonas spp. // Neth. J. Plant Pathol. 1983. V.99. P. 277-289.

88. Dunlap C., Crowley J.J., Moenneloccoz Y. et al. Biological control of Py-thium ultimum by Stenotrophomonas maltophilia W81 is mediated by an extracellular proteolytic activity // Microbiology Uk. 1997. V.143. Part 12. P. 3921-3931.

89. Dunne C., Moenne L.Y., Mc Carthy J. et al. Combining proteolytic and phloroglucinol-producing bacteria for improved biocontrol of Pythium-mediated damping-off of sugar beet // Plant pathology. 1998. V.109. P. 299307.

90. Elander R.P., James A.M., Hamiel R.H., Gorman M. Metabolism of tryptophans by Pseudomonas aureofaciens. VI: Production of pyrrolnitrin by selected Pseudomonas species // Appl. Microb. 1968. V.16. P. 753-758.

91. Emmennan A. Program to reduce the risks connected with the use of plant protection products in Sweden // Bull. OEPP. 1997. V.27. N2-3. P. 212-213.

92. Favrin R.J., Rahe J.E., Mauza B. Pythium spp. Associated with crown rot of cucumbers in British Columbia greenhouses // Plant Dis. V.72. P. 683-687.

93. Fernando W.G.D., Watson A.K., Paulitz T.C. The role of Pseudomonas spp. And competition for carbon, nitrogen and iron in the enhancement of ap-pressorium formation by Colletotrichum coccodes on velvetleaf //Eur. J. Plant Pathol. 1996. V.102. P. 1-7.

94. Folman L.B., Postma J., Van Veen J.A. Ecophysiological characterization of rhizosphere bacterial communities at different root locations and plant developmental stages of cucumber grown on rockwool // Microb. Ecol. 2001. V.42. P. 586-597.

95. Foster R.C., Rovira A.D. Ultrastructure of the wheat rhizosphere // New Phi-tol. 1976. V.76. P. 343-352.

96. Foster R.C. The ultrastructure of rhizoplane and rhizosphere // Ann. Rev. Phytopathol. 1986. V.24. P. 211-234.

97. Fravel D.R. Role of antibiosis in the biocontrol of plant diseases // Annu. Rev. Phytopathology. 1988. V.26. P. 75-91.

98. Fray R.G. Altering plant-microbe interaction through artificially manipulating bacterial quorum sensing // Annals of Botany. 2002. V.89. P. 245-253.

99. Freiberg C. Fellay R., Bairoch A. Broughton W.J., Rosental A., Perret X. Molecular basis of symbiosis between Rhizobium and legumes // Nature. 1997. V.387. P. 394-401.

100. Gaballa A., Abeysinghe P.D., Urich G. et al. Trehalose induces antagonism towards Pythium debaryanum in Pseudomonas fluorescens ATCC 17400 // Appl. Environ. Microbiol. 1997. V.63. P. 4340-4345.

101. Gafni R., Okon Y., Kapulnik Y., Fischer M. Adsorption of Azospirillum brasilense to corn roots // Soil. Biol. Biochem. 1986. V.18. N1. P. 69-75.

102. Gaffhey T.D., Lam S.T., Ligon J. et al. Global regulation of expression of antifungal factors by a Pseudomonas fluorescens biological control strain // Mol. Plant-Microbe Interact. 1994. V.7. P. 455-463.

103. Gamliel A., and Katan J. Influence of seed and root exudates on fluorescent pseudomonads and fungi in solarized soil // Phytopathology. 1992. V.82. P. 320-327.

104. Geels F.P., Schmidt E.D.L., Shipper B. The use of 8-hydroxyquinoline for the isolation and pre-qualification of plant-growth-stimulating rhizosphere pseudomonads//Biol. Fert. Soils. 1985. V.l. N4. P. 167-173.

105. Gibson J. Nutritional aspects of microbial ecology // Microbial ecology / Cambrige University press. 1957. P. 22-29.

106. Glandorf D.C.M., Verheggen P., Jansen T. et al. Effect of the genetically modified Pseudomonas putida WCS358r on the fungal rhizosphere microflora of field-grown wheat // Appl. Environ. Microbiol. 2001. V.67. P. 33713378.

107. Gomes N.C.M., Fagbola O., Costa R. et al. Dynamics of fungal communities in bulk and maize rhizosphere soil in the tropics // Appl. Environ. Microbiol. 2003. V.69. P. 3758-3766.

108. Griffiths B.S., Ritz K., Ebblewhite N., Dobson G. Soil microbial community structure: effects of substrate loading rates // Soil Biol. Biochem. 1999. V.31.P. 145-153.

109. Gross D.C. Regulation of syringomycin synthesis in Pseudomonas syringae pv. Syringae and defined conditions for its production // J. Appl. Bacteriol. V. 58. P. 1577-1582.

110. Grosskopf R., Stubner S., Liesack W. Novel euryarchaeotal lineages detected on rice roots and in the anoxic bulk soilmof flooded rice micricosms // Appl. Environ. Microbiol. 1998. V.64. P. 4983-4989.

111. Gupta C.P., Dubey R.C., Maheshwari D.K. Plant growth enhancement and suppression of Macrophomina phaseolina causing charcoal rot of peanut by fluorescent Pseudomonas II Biol. Fertil. Soils. 2002. V.35. N6. P. 399-405.

112. Gutterson N.I., Layton T.J., Ziegle J.S., Warren G.J. Molecular cloning of genetic determinants for inhibition of fungal growth by a fluorescent pseu-domonad//J. Bacteriol. 1986. V.165. P. 696-703.

113. Gutterson N.I., Howie W., Suslow T. Enhancing efficacious of biocontrol agents by the use of biotechnology // New Directions in Biocontrol / Baker R., Dunn P. New York: A. R. Liss, 1990. P. 749-765.

114. Haas D., Blumer C., Keel C. Biocontrol ability of fluorescent pseudomonads genetically dissected: importance of positive feedback regulation // Curr. Opin. Biothechnol. 2000. V.ll. P. 290-279.

115. Hadacek F., Kraus G.F. Plant root carbohydrates affect growth behavior of endophytic microfungi // FEMS Microb. Ecol. 2002. V.41. N2. P. 161-170.

116. Handelsman J., Stabb E.V. Biocontrol of soilborne plant pathogens // Plant Cell. 1996. V.8.P. 1855-1869.

117. Härtel P.G., Fuhrmann J.J., Johnson W.F. et al. Survival of a lacZY-containing Pseudomonas putida strain under stressful abiotic soil conditions // Soil Sei. soc. Am. J. 1994. V.58. N3. P. 770-776.

118. Haware M.P., Nene Y.L. et al. The role of chickpea root exudates in resistance to Fusarium wilt // Int. Chickpea Newlett. 1984. V.10. P. 12-13.

119. Heinrich D., Hess D. Chemotactic attraction of Azospirillum lipoferum by wheat roots and characterization of some attractants // Can. J. Microbiol. 1985. V.31.P. 26-31.

120. Hendrix Jr.F.F., Campbell W.A. Pythiums as plant pathogens // Annu. Rev. Phytopathol. V.ll. P. 77-98.

121. Hider R.C. Siderophore mediated absorption of iron // Structure and bonding. 1984. V.58. P. 25-87.

122. Hiltner L. Uber neuere Erfahrungen und Problem auf dem Gebeit der Bodenbakteriologie und unter besonderer Berücksichtigung der Grundun-gung und Brache // Arb Dtsch. Landwirt. Ges. 1904. V.98. P. 59-78.

123. Hoffland E. Quantitative evaluation of the role of organic acid exudation in the mobilization of rock phosphate by rape // Plant Soil. 1992. V.140. P.279-289.

124. Hajberg O., Schnider U., Winteler H., Sorensen J., Haas D. Oxygen-sensing reporter strain of Pseudomonas fluorescens for monitoring the distribution of low-oxygen habitats in soil // Appl. Environ. Microbiol. 1999. V.65. P. 4085-4093.

125. Homma Y. Mechanisms in biological control focused on the antibiotics pyrrolnitrin // Improving Plant Productivity with Rhizobacteria / Ed. M.H. Ryder P.V. Stephens G.D. Bowen. Adelaide, Australia: CSIRO Division of Soil, 1994. P. 100-103.

126. Howie W.J. Factors affecting colonization of wheat roots and suppression of take-all by pseudomonas antagonistic to Gaeumannomyces graminis var. tritici // Ph.D. Dissertation. Wash. State Univ.: Pullman, 1985.

127. Howie W.J., Cook R.J., Weller D.M. Effect of soil matrix potential and soil motility on wheat root colonization by fluorescent pseudomonads suppressive to take-all // Phytopathology. 1987. V.77. P. 286-292.

128. Howie W.J., Matsubara D., Gutterson N., Suslow T.V. Directed enhancement of biocontrol in Pseudomonas by constitutive antibiotic biosynthesis // Phytopathology. 1989. V.79. P. 1160-1163.

129. Howie W.J., Suslow T.V. Role of antibiotic synthesis in the inhibition of Py-thium ultimum in cotton spermosphere and rhizosphere by Pseudomonas fluorescens II Mol. Plant-Microbe Interact. 1991. V.4. P. 393-399.

130. Ikeda K., Toyota K., Kimura M. Effect of bacterial colonization of tomato roots on subsequent colonization by Pseudomonas fluorescens MelRC2Rif // Can. J. Microbiol. 1998. V.44. N7. P. 630-636.

131. Jaeger III C.H., Lindow S.E., Miller W., Clark E„ Firestone M.K. Mapping of sugar and amino acid availability in soil around roots with bacterial sensors of sucrose and tryptophan // Appl. Ebnviron. Microbiol. 1999. V.65. P. 2685-2690.

132. James D.W., Gutterson N.I. Multiple antibiotics produced by Pseudomonas fluorescens Hv37a and their differential regulation by glucose // Appl. Environ. Microbiol. 1986. V.27. P. 1183-1189.

133. Jijakli M.H., Lepoivre P. Characterization of an exo-beta-1,3-glucanase produced by Pichia anomala strain K, antagonist of Botrytis cinerea on apples //Phytopathology. 1998. V.88. P. 335-343.

134. Joergensen L. The Danish pesticide plan facts and reality // Bull. OEPP. 1997. V.27. N2-3. P. 206-207.

135. Johansson P.M., Wright S.A.I. Low-temperature isolation of disease-suppressive bacteria and characterization of a distinctive group of Pseudo-monads//Appl. Environ. Microbiol. 2003. V.69. P. 6464-6474.

136. Kandeler E., Marschner P., Tscherko D. et al. Microbial community composition and functional diversity in the rhizosphere of maize // Plant and Soil. 2002. V.238. N2. P. 301-312.

137. Kanner D., Gerber N.N., Bartha R. Pattern of phenazine pigment production by strain of Pseudomonas aeruginosa II J. Bacteriol. 1978. V.134. P. 690692.

138. Kapulnik Y. Plant growth promotion by rhizosphere bacteria // Plant Root: the hidden half Edited by Waisel Y., Eshel A., Kafkafi U. / Marcel Dekker Ink. New York, Basel, Hong Kong. 1996. P. 769-780.

139. Katznelson H. The "rhizosphere effect" on certain groups of soil microorganisms // Soil Sei. 1946. V.62. N5. P. 343-354.

140. Katznelson H. Nature and importance of the rhizosphere // Ecology of Soil Borne Plant Pathogens Prelude to Biological Control / Ed. K.Barker, W. C. Snyder. Berkeley: University of California Press. 1965. P. 187-209.

141. Kempf H.-J., Wolf G. Erwinia herbicola as biocontrol agent of Fusarium culmorum and Puccinia recóndita f. sp. triciti on wheat // Phytopathology. 1989. V.79. P. 990-994.

142. Kloepper J.W., Lifshitz R., Zabolotowicz R.M. Free-living bacterial inocula for enhancing crop productivity // Trends. Biotechnol. 1989. V.7. P. 39-43.

143. Kloepper J. W., Beauchamp C. J. A review of issues related to measuring colonization of plant roots by bacteria // Can. J. Microbiol. 1992. V.38. P. 1219-1232.

144. Koch B., Nielsen H.T., Sorensen D. et al. Lipopeptide production in Pseudomonas sp. Strain DSS73 is regulated by components of sugar beet exudates via Gac two-component regulatory system // Appl. Environ. Microbiol. 2002. V.68. P. 4509-4516.

145. Kraus J., Loper J.E. Lack of role for fluorescent sideropheore production in the biological control of Pythium dumping-off of cucumber by a strain of Pseudomonas putida II Phytopathology. 1992. V.82. P. 261-264.

146. Kraus J., Loper J.E. Characterization of a genomic region required for production of the antibiotic pyoluteorin by a biological control agent Pseudomonas fluorescens PF-5 // Appl. Environ. Microbiol. 1995. V.61. P. 849854.

147. Kruglov Y.V., Lisina T.O. Behavior of introduced Bacillus in the soil,tV*rhizosphere and rhizoplane // Proceedings of 11 International Congress on Molecular Plant-Microbe Interactions. 2003. St.-Petersburg, Russia. P. 328.

148. Leeman M., van Pelt J.A., Hendrickx M.J. et al. Biocontrol of Fusarium wilt of radish in commercial greenhouse trials by seed treatment with Pseudomonas fluorescens WCS374 // Phytopathology. 1995. V.85. N10. P. 1301-1305.

149. Leong J. Siderophores: their biochemistry and possible role in the biocontrol of plant pathogens // Ann Rev. Phytopathol. V.24. P. 187-209.

150. Lewis D.H. Symbiosis and mutualism: crisp concept and soggy semantics // The Biology of Mutualism: Ecology and evolution / Ed. D.H. Boucher. London, Sydney: Croom Helt, 1985. P. 29-39.

151. Lindow S.E. Methods of preventing frost injury caused by epiphytic ice-nucleation-active bacteria // Plant Disease. 1983a. V.67. P. 327-333.

152. Lindow S.E. The role of bacterial ice nucleation in frost injury to plants // Ann. Rev. Phytopathol. 1983b. V.21. P. 363-384.

153. Lindow S.E., Amy D.C., Upper C.D. Biological control of frost injury: an isolate of Erwinia herbicola antagonistic to ice nucleation active bacteria 11 Phytopathology. 1983. V.21. P. 1097-1102.

154. Long S.R. Genes and signals in the Rhizobium-legume symbiosis // Plant Physiol. 2001. V.125. P. 69-72.

155. Loper J.E., Haack C., Schroth M.N. Population dynamics of soil Pseudomonas in the rhizosphere of potato {Solanum tuberosum L.) // Appl. Environ. Microbiol. 1985. V.49. P. 416-422.

156. Lorito M., Peterbauer C., Hayes C.K., Harman G.E. Synergistic interaction between fungal cell wall degrading enzymes and different antifungal compounds enhances inhibition of spore germination // Microbiology. 1994. V.140. P. 623-629.

157. Lugtenberg B.J.J., de Weger L.A., Shippers B. Bacterization to protect seed and rhizosphere against disease // Seed Treatment: Progress and prospects. T. Vartin, ed. / British Crop Protection Council, Farnham, UK. 1994. P. 293302.

158. Lugtenberg B.J.J., Dekkers L.C. What makes Pseudomonas bacteria rhizosphere competent? I I Environ. Microbiol. 1999. V.l. P. 9-13.

159. Lugtenberg B.J.J., Kravchenko L.V., Simons M. Tomato seeds and root exudates sugars: composition, utilization by Pseudomonas biocontrol strains and role in rhizosphere colonization 11 Environ. Microbiol. 1999a. V.l. P. 439-445.

160. Lugtenberg B.J.J., Dekkers L., Bloemberg G.V. Molecular determinants of the rhizosphere colonization by pseudomonas // Annu. Rev. Phytopathol. 2001. V.39. P. 461-490.

161. Lumsden R.D., Carter J.P., Wipps J.M., Lynch J.M. Comparison of biomass and variable propagule measurements in antagonism of Trichoderma har-zianum against Pythium ultimum II Soil Biol. Biochem. 1989. V.21.

162. Lynch J.M. The rhizosphere I I Wiley-Interscience, Chichester, England. 1990.

163. Mahaffee W.F., Kloepper J.W. Temporal changes in the bacterial communities of soil, rhizosphere, and endorhiza associated with field-grown cucumber (Cucumis sativus L.) // Microb. Ecol. 1997. V.34. P. 210-223.

164. Maloney P.E., van Bruggen A.H.C., Hu S. Bacterial community structure in relation to the carbon environmemts in lettuce and tomato rhizospheres and a bulk soil // Microbial Ecology. 1997. V.34. P. 109-117.

165. Marugg J.D., de Weger L.A., Neilander H.B. et al. Isolation and analysis of genes involved in siderophore-biosynthesis in the plant growth-stimulating Pseudomonas putida strain WCS358 // J. Bacterid. 1985. V.164. P. 563570.

166. Mazzola M. Cook R.J., Thomashow L.S. et al. Contribution of phenazine antibiotic biosynthesis to the ecological competence of fluorescent pseudo-monads in soil habitats // Appl. Environ. Microbiol. 1992. V.58. P. 26122624.

167. Meyer J.M., Abdallah M.A. The fluorescent pigment of Pseudomonas aeruginosa: biosynthesis, purification, and physico-chemical properties // J. Gen. Microbiol. 1978. V.107. P. 130-138.

168. Miyazaki H., Kato H., Nakazawa T, Tsuda M. A positive regulatory gene, pvdS, for expression of pyoverdin biosynthetic genes in Pseudomonas aeruginosa PAO //Mol. Gen. Genet. 1995. V.248. N1. P. 17-24.

169. Moulin F., Lemanceau P., Alabouvette C. Pathogenicity of Pythium species on cucumber in peat-sand, rockwool and hydroponics // Eur. J. Plant Pathol. 1994. V.100. P. 3-17.

170. Nakayama Т., Homma Y., Hashidoko Y. et al. Possible role of xanthobac-cins produced by Stenotrophomonas sp. Strain SB-K88 in suppression of sugar beet damping-off disease // Appl. Environ. Microbiol. 1999. V.65. P. 4334-4339.

171. Nautiyal C.S., Johri J.K., Singh H.B. Survival of the rhizosphere-competent biocontrol strain Pseudomonas fluorescens NBRI2650 in the soil and phyto-sphere // Can. J. Microbiol. 2002. V.48. P. 588-601.

172. Nehl D.B., Allen S.J., Brown J.F. Deleterious rhizosphere bacteria an integrating perspective // Appl. Soil Ecol. 1997. V.5. N1. P. 1-20.

173. Nelson E.B. Exudate molecules initiating fungal responses to seeds and roots // Plant and Soil. 1990. V.129. P. 61-73.

174. Newman E.I., Watson A. Microbial abundance in the rhizosphere: A computer model // Plant Soil. 1977. V.48. P. 17-56.

175. Nielsen Т.Н., Christophersen C., Anthoni U., Sorensen J. Viscosinamide, a new cyclic depsipeptide with surfactant and antifungal properties produced by Pseudomonas fluorescens DR54 // J. Appl. Microbiol. 1999. V.86. P. 8090.

176. Nielsen T.H., Serensen D., Tobiasen C. et al. Antibiotic and biosurfactant properties of cyclic lipopeptides produced by fluorescent Pseudomonas spp. from the sugar beet rhizosphere // Appl. Environ. Microbiol. 2002. V.68. N7. P. 3416-3423.

177. Nielsen T.H., S0rensen J. Production of cyclic lipopeptides by Pseudomonas fluorescens strains in bulk soil and in the sugar beet rhizosphere // Appl. Environ. Microbiol. 2003. V.69. N2. P. 861-868.

178. Ortas I. Determination of the extent of rhizosphere soil // Commun. Soil. Sci. Plant Anal. 1997. V.28. P. 1767-1776.

179. O'Sullivan D.J., O'Gara F. Traits of fluorescent Pseusomonas spp. involved in suppression of plant root pathogens // Microbiol. Rev. 1992. V.56. P. 662676.

180. Papen H., Werner D. Organic acid utilization, succinate excretion, encysta-tions and oscillating nitrogenase activity in Azospirillum brasilense under microaerobic conditions // Can. J. Microbiol. 1982. V.132. N1. P. 57-61.

181. Parke J.L. Root colonization by indigenous and introduced microorganisms / The Rhizosphere and Plant Growth / Eds. D. L. Keister P. Cregan B. Dordrecht, Kluver Academic Publisher. 1991. P. 33-42.

182. Paul E.A., and Clark F.E. Soil microbiology and biochemistry // Academic Presss, San Diego, Calif. 1996.

183. Paulitz T.C., Zhou T., Rankin L. Selection of rhizosphere bacteria for biological control of Pythium aphcmidermatum on hydroponically grown cucumber//Biol. Control. 1992. V.2. p. 226-237.

184. Paulitz T.C. Biological control of root pathogens in soilless and hydroponic systems//HortScience. 1997. V.32. P.193-196.

185. Paulitz T.C., Matta A. The role of the host in biological control of diseases // Integrated Pestand Disease Management in Greenhouse Crops / Eds. Albajes R., Gullino M L., van Lenteren J.C., Elad Y. Dordrecht, Kluwer. 1999. P. 394-410.

186. Paulitz T.C., Bélanger R.R. Biological control in greenhouse systems // Annu. Rev. Phytopathol. 2001. V.39. P. 103-133.

187. Polonenko D R., Mayfíeld C.I., Dumbroff E.B. Microbial responses to salt-induced osmotic stress. IV. A model of a root region // Plant Soil. 1984. V.80. N3.P. 363-371.

188. Polyanskay L.M., Vedina O.T., Lysak L.V., Zvyagintsev D.G. The growth-promotion effect of Beijerinckia mobilis and Clostridium sp. Cultures on some agricultural crops // Microbiology. 2002. V.71. N1. P. 109-115.

189. Postma J., Willemsen de Klein M.J.E.I.M., van Elsas J.D. Effect of the indigenous microflora on the development of root and crown rot caused by Pythium aphanidermatum in cucumber grown on rockwool 11 Phytopathology. 2000. V.90. P. 125-133.

190. Preston G.M., Haurbold B., Rainey P.B. Bacterial genomics and adaptation to the life on plants: implications for the evolution of pathogenecity and symbiosis // Curr. Opin. Microbiol. 1998. V.l. P. 589-597.

191. Raaijmakers J.M., Leeman M., van Oorschot M.M.P. et al. Dose-response relationships in biological control of Fusarium wilt of radish by Pseudomonas spp. //Phytopathology. 1995. V.85. P. 1075-1081.

192. Raaijmakers J.M., Vlami M., de Souza J.T. Antibiotic production by bacterial biocontrol agents // Antonie van Leeuwenhoek. 2002. V.81. N1-4. P. 537-547.

193. Ramos C., Molbak L., Molin S. Bacterial activity in the rhizosphere analyzed at the single-cell level by monitoring ribosome contents and synthesis rates // Appl. Environ. Microbiol. 2000. V.66. P. 808-809.

194. Rankin L., Paulitz T.C. Evaluation of rhizosphere bacteria for biological control of Pythium root rot of greenhouse cucumbers in hydroponic culture //Plant Dis. 1994. V.78. P. 447-451.

195. Rattink H., Postma J. Biological control of Fusarium wilt in carnations on a recirculation system by a nonpathogenic Fusarium oxysporum isolate // Meded. Fac. Landbouwwet. Rijksuniv. Gent. V.61. P. 491-498.

196. Rice P., Longden I., Bleasby A. EMBOSS: the European Molecular Biology Open Software Suite // Trends Genet. V.16. P. 276-277.

197. Riviere J., Chalvignac M. La rhizososphere // La vie dans les sols. Paris. 1971. P. 391-413.

198. Rodrigue A., Quentin Y., Lazdunski A. et al. Two-component systems in Pseudomonas aeruginosa: why so many? // Trends Microbiol. 2000. V.8. P. 498-504.

199. Ron E.Z., Rosenberg E. Natural roles of biosurfactants // Environ. Microbiol. 2001. V.3. P. 229-236.

200. Rosales A.M., Thomashow L., Cook RJ., Mew T.W. Isolation and identification of antifungal metabolites produced by rice-associated antagonistic Pseudomonas spp. // Phytopathology. 1995. V.85. P. 1028-1032.

201. Rouatt, J.W. Initiation of rhizosphere effect 11 Can. J. Microbiol. 1959. V.5. P. 67-71.

202. Rovira A. D. Plant root excretion in relation to the rhizosphere effect. II. // Plant Soil. 1956. V.7. P. 195-208.

203. Rovira A.D. Plant root exudates and their influence upon soil microorganisms // Ecology of soil-borne plant pathogens -prelude to biological control / Eds. Baker K.F., Snyder W.C. 1965. John Murray, London. P. 170-186.

204. RuizDuenas F.J., Martinez M.J. Enzymatic activities of Trametes versicolor and Pleurotus eryngii implicated in biocontrol of Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici // Current Microbiology. 1996. V.32. P. 151-155.

205. Ruy C.M., Farag M.A., Hu C.H. et al. Bacterial volatiles promote growth in Arabidopsis // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2003. V.100 N14. P. 8607.

206. Semenov A M, van Bruggen S.H, Zelenev V.V. Moving waves of bacteria populations and total organic carbon along roots of wheat // Microb. Ecol. 1999. V.37.P. 116-128.

207. Seong K.-Y., Hofte M., Boelens J., Yerstraete W. Growth, survival, and root colonization of plant growth beneficial Pseudomonas fluorescens ANP15 and Pseudomonas 7NSK2 at different temperature // Soil Biol. Biochem. 1991. V.23. P. 423-428.

208. Shiomi Y, Nishiyama M., Onizuka T, Marumoto T. Comparison of bacterial community structures in the rhizoplane of tomato plants grown in soils suppressive and conductive towards bacterial wilt // Appl. Environ. Microb. 1999. V.65.P. 3996-4001.

209. Shapira R., Ordentlich A., Chet I., Oppenheim A.B. Control of plant diseases by chitinase expressed from cloned DNA in Escherichia coli // Phytopathology. 1989. V.79. P. 1246-1249.

210. Schippers B., Bakker A.W., Bakker P. A. Interaction of deleterious and beneficial rhizosphere microorganisms and the effect of cropping practices // Annu. Rev. Phytopathol. 1987. V.25. P. 339-358.

211. Schippers B., Bakker A.W., Bakker P.A.H.M., van Peer R. Beneficial and deleterious effect of HCN-producing pseudomonads on rhizosphere interasc-tions // Plant and Soil. 1990. V.129. P. 75-83.

212. Schmalenberger A., Tebbe C.C. Bacterial community composition in the rhizosphere of a transgenic, herbicide-resistant maize (Zea mays) and comparison to its non-transgenic cultivar Bosphore // FEMS Microbiol. Ecol. 2002. V.40. Nl.P. 29-37.

213. Schmidt-Eisenlohr H., Gast A., Baron C. Inactivation of gacS does not affect the competitiveness of Pseudomonas chlororaphis in the Arabidopsis thaliana rhizosphere // Appl. Environ. Microbiol. 2003. V.69. P. 1817-1826.

214. Serino L., Reimmann C., Viscas P., Beyeler M., Chiegsa V.D., Haas D. Biosynthesis of pyochelin and dihydroaeruginoic acid requires the iron-regulated pchDCBA operon in Pseudomonas aeruginosa // J. Bacteriol. 1997. V.179.N1.P. 248-257.

215. Simons M. et al. Gnotobiotic system for studying rhizosphere colonization by plant growth-promoting Pseudomonas bacteria 11 Mol. Plant-Microbe Interact. 1996. V.9. N7. P.600-607.

216. Singh T., Arora D.K. Motility and chemotactic response of Pseudomonas fluorescens toward chemoattractants present in the exudate of Macro-phominaphaseolina II Microbiol. Research. 2001. V.156. N4. P. 343-351.

217. Singh U.P., Sarma B.K., Singh D.P. Effect of plant growth-promoting Rhizobacteria and culture filtrate of Sclerotium rolfsii on phenolic and salicylic acid contents in chickpea (Cicer arietinum) // Curr. Microbiol. 2003. V.46. N2.P. 131-140.

218. Shiomi Y, Nishiyama M., Onizuka T, Marumoto T. Comparison of bacterial community structures in the rhizoplane of tomato plants grown in soils suppressive and conductive towards bacterial wilt // Appl. Environ. Microb. 1999. V.65. P. 3996-4001.

219. Short G.E., Lacy M.L. Carbohydrate exudation from Pea seeds: effect of cultivar, seed age, color, and temperature // Phytopathology. 1976. V. 66. P. 182-187.

220. Smith K.P., Goodman R.M. Host variation for interactions with beneficial plant-associated microbes // Annu. Rev. Phytopathol. 1999. V.37. P. 473491.

221. Spaink H.P. Root nodulation and infection factots produced by rhizobial bacteria//Annu. Rev. Microbiol. 2000. V.64. P. 180-201.

222. Stanghellini M.E., Rasmussen S.L. Hydroponics: A solution for zoosporic pathogens // Plant Dis. 1994. V.78. P. 1129-1138.

223. Tam L., Derry A.M., Kevan P.G., Trevors J.T. Functional diversity and community structure of microorganisms in rhizosphere and non-rhizosphere Canadian arctic soils // Biodiversity and Conservation. 2001. V.10. N11. P. 1933-1947.

224. Thomashow L.S., Weller D.M., Bonsall R.F., Pierson III L.S. Production of the antibiotic phenazine-l-carboxylic acid by fluorescent Pseudomonas species in the rhizosphere of wheat // Appl. Environ. Microbiol. 1990. V.56. P. 908-912.

225. Trolldenier G., Hecht-Buchhols Ch. Effect of aeration status of nutrient solution on microorganisms, mucilage and ultrastructure of wheat root // Plant Soil. 1984. V.80. P. 381-390.

226. Vance C.P., Graham P.H. Nitrogen fixation: Fundamentals and applications. Tikhonovich LA. et al., eds. / Kluewer Academic Publissers, Dordrecht. 1995. P. 77-86.

227. Vancura V. Fluorescent pseudomonads in the rhizosphere of plants and their relation to root exudates // Folia Microbiol. 1980. V.25. N2. P. 168-173.

228. Van de Broek A., Lambrecht M., Vanderleyden J. Bacterial chemotactic motility is important for the initiation of root colonization by Azospirillum brasilense II Microbiology. 1998. V.144. P. 2599-2606.

229. Vandenbergh P.A., Gonzalez C.F., Wright A.M., Kunka B.S. Iron-chelating compounds produced by soil pseudomonads: Correlation with fungal growth ingibition//Appl. Environ. Microbiol. 1983. V.46. P. 128-132.

230. Vandenbergh P.A., Gonzalez C.F. Method for protecting the growth of plants employing mutant siderophore producing strains of Pseudomonas putida.U.S. // patent No. 4 479 936. 1984.

231. Vesper S.J. Production of pili (fimbriae) by Pseudomonas fluorescens and a correlation with attachment to corn roots // Appl. Environ. Microbiol. 1987. V.53. P. 1397-1405.

232. Viswanathan R., Samiyappan R. Induced systemic resistance by fluorescent pseudomonads against red rot disease of sugarcane caused by Colletotrichum falcatum // Crop Protection. 2002. V.21. N1. P. 1-10.

233. Voisard C., Keel C., Haas D., Defago G. Cyanide production by Pseudomonas fluorescens helps suppress black root rot of tobacco under gnotobiotic conditions // EMBO J. 1989. V.8. P. 351-358.

234. Vrany, J. Vancura, V., Macura, J. The effect of foliar application of some readily metabolized substances, growth regulators and antibiotics on rhizosphere microflora // Folia microbial. 1962. V.7. N1. P. 61-70.

235. Walker R., Rossall S., Asher M.J.C. Colonization of the developing rhizosphere of sugar beet seedlings by potential biocontrol agents applied as seed treatments // J. Appl. Microbiol. 2002. V.92. N2. P. 228-237.

236. Wang Y., Brown H.N., Crowley D.E., Szaniszlo P.J. Evidence for direct utilization of siderophore, ferroxamin B, in axenically grown cucumber //

237. Wei G., Kloepper J.W., Tuzun S. Induction of systemic resistance of cucumber to Colletotrichum orbiculare by select strains of growth-promoting rhizobacteria 11 Phytopathology. 1991. V.81. P. 1508-1512.

238. Weller D.M., Raaijmakers J.M., McSpadden Gardner B.B., Thomashow L.S. Microbial populations responsible for specific soil suppressiveness to plant pathogens // Annu. Rev. Phytopathol. 2002. V.40. P. 309-348.

239. Whipps J.M. Microbial interactions and biocontrol in the rhizosphere // J. Experim. Botany. 2001. V.52. P. 487-511.

240. Wieland G., Neumann R., Backhaus H. Variation of microbial communities in soil, rhizosphere, and rhizoplane in response to crop species, soil type, and crop development // Appl. Environ. Microbiol. 2001. V.67. N12. P. 5849-5854.

241. Yague A. Programme for reducing the use of plant protection products in Spain // Bull. OEPP. 1997. V.27. N2-3. P. 213-214.

242. Yang C-H., Crowley D.E. Rhizosphere microbial community structure in relation to root location and plant iron nutritional status // Appl. Environ. Microbiol. 2000. V.66. P. 345-351.

243. Zhou T., Paulitz T.C. Induced resistance in biocontrol of Pythium apha-nidermatum by Pseudomonas spp. on cucumber // J. Phytopathol. 1994. V.142. P. 51-63.