Механизм накопления белков в ядрышке тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.03.04, кандидат биологических наук Мусинова, Яна Рафаеловна

• Мусинова, Яна Рафаеловна
• кандидат биологических наук
• 2012

Оглавление диссертации кандидат биологических наук Мусинова, Яна Рафаеловна

Оглавление

Список условных обозначений

Введение

Цель и задачи исследования

Научная новизна

Практическое значение

Обзор литературы

1. Ядрышко

1.1. Структурная организация ядрышка

2. Белки ядрышка

2.1. Фибрилларин как маркерный белок ПФК

2.2. В23 как маркерный белок ГК

3. Динамика белков ядрышка

4. Инактивация транскрипции рДНК: сегрегация ядрышка

5. Hub-белки ядрышка

6. Сигналы ядрышковой локализации (NoLS)

Материалы и методы

Результаты

1. Все известные NoLS обогащены положительно заряженными аминокислотами

2. Уровень накопления химерных белков в ядрышке зависит от аминокислотного состава искусственных NoLS

3. Гистон Н2В как модель для анализа сигналов ядрышковой локализации в системе in vivo

4. Избыток гистона Н2В накапливается в ядрышке

5. Гистон H2B-EGFP взаимодействует с ядрышком и хроматином посредством различных механизмов

6. Гистон Н2В локализуется в компартментах ядрышка, оккупированных белками гранулярного компонента

7. Картирование активности сигнала ядрышковой локализации в гистоне Н2В

8. Заключение

Выводы

Список цитируемой литературы

Список условных обозначений

Для аминокислот и их производных использовались обозначения, рекомендуемые комиссией по номенклатуре Международного союза чистой и прикладной химии (ШРАС)и Международного союза биохимиков (IUP).

В работе использовались также следующие сокращения и обозначения:

ПААГ полиакриламидный гель

ПЦР полимеразная цепная реакция

ТЕМЕД N, N, N', N'- тетраметилэтилендиамин

ЭДТА этилендиаминтетраацетат

(E)GFP зеленый флуоресцирующий белок (green fluorescent protein) mCherry белковый тэг, флуоресцирующий в красном спектре NLS сигнал ядерной локализации (nuclear localization signal) NoLS сигнал ядрышковой локализации (nucleolar localization signal) PMSF фенил-метилсульфонил-фторид (phenylmethanesulfonylfluoride)

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Механизм накопления белков в ядрышке»

Введение

Известно, что нормальное функционирование интерфазного ядра (как и других органоидов эукариотической клетки, ограниченных липидными мембранами) обеспечивается механизмами, контролирующими селективный транспорт молекул между цитозолем и внутренним компартментом. В интерфазных ядрах роль своеобразного «молекулярного сита» выполняет ядерная оболочка, в которую встроены специализированные структурные комплексы - ядерные поры. Именно в ядерных порах локализована система нуклеоплазматического транспорта белков и рибонуклеопротеиновых частиц. Показано, что макромолекулы, импортирующиеся в ядро или экспортирующиеся из ядра в цитозоль, несут специальные сигналы, которые узнаются белками комплексов ядерных пор. В случае импортируемых макромолекул эти сигналы обозначаются как сигналы ядерной локализации (Nuclear Localization Signal, NLS) После вхождения в ядро импортированные белки (например, белки хроматина, факторы транскрипции и процессинга РНК и многие другие) перераспределяются по ядерным субдоменам. В настоящее время в интерфазных ядрах описано несколько структурно-функциональных субдоменов: ядрышки, тела Кахаля (Cajal bodies), интерхроматиновые гранулы (nuclear speckles), протеасомы, тельца, Polycomb bodies, стрессовые белки (PML bodies) и некоторые другие (Мао et al., 2011).

Поскольку субдомены ядра не имеют ограничивающих мембран, очевидно, что поддержание их устойчивого структурно-функционального состояния требует наличия специальных механизмов, кардинально отличающихся от механизмов, обеспечивающих общий гомеостаз ядра и других мембранных органелл клетки. При этом необходимо учитывать, что большинство ядерных белков (за исключением коровых гистонов и ламинов) являются высоко динамичными, т.е. связаны со своими сайтами не стабильно, а только на протяжении небольшого времени, называемого «временем удержания».

Вопрос о том, каков механизм «узнавания» импортированными белками мест своей локализации в сложной системе интерфазного ядра, остается открытым.

Наиболее значимые факты, проливающие свет на эту проблему, получены при анализе белков ядрышка. В ряде работ показано, что для белков, участвующих в синтезе и процессинге рибосомной РНК, существует особый класс аминокислотных последовательностей, которые обеспечивают их накопление в ядрышке. Эти последовательности принято называть сигналами ядрышковой локализации (Nucleolar Localization Signal, NoLS). В настоящее время большое количество таких сигнальных последовательностей обнаружено в белках вирусов, растений, животных и грибов. Интересно, что некоторые NoLS перекрываются с хорошо известными NLS (Kubota et al, 1999; Rowland and Yoo,2003; Zemach et al, 2006; Melen et al, 2007; Wang et al, 2010).

Состав последовательности NLS хорошо известен, и это позволяет достаточно точно предсказывать их присутствие в белках (Cokol et al, 2000). В отличие от NLS, предсказание NoLS представляет сложную проблему. Недавно было показано, что NoLS некоторых клеточных и вирусных белков обогащены аргининами (Reed et al,2006), однако, существование NoLS без аргининов говорит о том, что данная структура не является универсальной (Favre et al, 1994; Shu-Nu et al, 2000). Можно допустить, что консенсуса сигнальных последовательностей для различных белков вообще не существует, а механизм взаимодействия NoLS с компонентами ядрышка не требует какой-либо определенной последовательности аминокислот.

Подводя итог сказанному, можно констатировать, что проблема специфического накопления и удержания специфических белков в субдоменах ядра до настоящего времени остается не решенной. Выяснение природы этих механизмов чрезвычайно важно для понимания принципов организации, функционирования и формирования ядерных субдоменов, не содержащих мембран.

Целью данной работы стало изучение механизмов накопления белков в ядрышке за счет специализированных сигнальных последовательностей - сигналов ядрышковой локализации (МоЬБ).

Цель и задачи исследования.

В связи с заявленной целью в работе были последовательно поставлены следующие конкретные задачи:

1. Разработать метод количественной оценки эффективности действия сигналов, обеспечивающих накопление белков в ядрышке.

2. Изучить эффективность накопления искусственных сигналов ядрышковой локализации (1ЧоЬ8) в зависимости от состава аминокислотных остатков.

3. Выявить в гистоне Н2В мотивы, обладающие свойствами сигнала ядрышковой локализации (1МоЬ8).

4. Изучить динамику передислокаций гистона Н2В-ЕСРР из ядрышка в хроматин ядер культивируемых клеток.

5. Определить возможный молекулярный механизм взаимодействия гистона Н2В с компонентами ядрышка.

Научная новизна

Предложен метод количественной оценки эффективности тестируемой последовательности в качестве 1ЧоЬ8. Показано, что эффективность искусственных сигналов ядрышковой локализации зависит от величины и плотности суммарного заряда аминокислотных остатков. Показано наличие в гистоне Н2В участка, обладающего свойствами сигнала ядрышковой локализации. Этот участок включает также сигнал ядерной локализации. Детально изучена динамика передислокаций гистона ШВ-ЕСРР в ядрах культивируемых клеток. Показано, что депонирование избыточного белка в ядрышках является временным событием, по-видимому, связанным с медленным обменом гистонов в хроматине. На основании полученных данных предложена гипотеза,

согласно которой накопление гистона Н2В-ЕОРР в ядрышке определяется электростатическими взаимодействиями N01^ с компонентами, содержащими РНК.

Практическое значение

Знания о механизме накопления белков в ядрышке могут быть использованы при разработке методов направленного транспорта веществ. В частности, это может иметь значение для поиска новых, более специфических противоопухолевых препаратов, цитотоксическая активность которых связана с подавлением транскрипции рибосомальных генов.

Заключение диссертации по теме «Клеточная биология, цитология, гистология», Мусинова, Яна Рафаеловна

Выводы

1. Разработан метод количественной оценки эффективности действия сигналов, обеспечивающих накопление ядерных белков в ядрышке.

2. Показано, что эффективность действия искусственных сигналов ядрышковой локализации (№>Ь8) зависит от величины заряда и от плотности расположения положительно заряженных аминокислот в последовательности.

3. Показано наличие в гистоне Н2В участка, обладающего свойствами сигнала ядрышковой локализации (1ЧоЬ8).

4. Изучена динамика передислокаций гистона ШВ-ЕвРР в ядрах культивируемых клеток НеЬа. Показано, что накопление «избыточного» белка в ядрышках является временным событием, по-видимому, связанным с медленным обменом гистона Н2В в хроматине.

5. На основании полученных данных предложена гипотеза, согласно которой накопление гистона Н2В в ядрышке определяется электростатическими взаимодействиями с компонентами, содержащими РНК.

8. Заключение

Согласно опубликованным данным, существует отдельный класс последовательностей, которые обеспечиваю накопление белков в ядрышке - сигналы ядрышковой локализации (NoLS). В настоящее время большое количество таких сайтов описано в белках вирусов, растений, животных и грибов (табл. 2). Все известные NoLS обогащены положительно заряженными аминокислотами, однако четкой структуры последовательности данного сигнала пока не выявлено. В случае гистона H2B-EGFP мы определили участок, который может потенциально выполнять роль NoLS. Действительно, искусственный белок содержащий сигнал NoLS из гистона локализуется в ядрышке, что может объяснить накопление гистонов в этом субдомене ядра. Накопление белка в ядрышке, как мы полагаем, определяется не непосредственно функционированием белка в том или ином компартменте ядрышка (такой типа накопления принято называть накоплением, сопряженным с функционированием, activity-dependent retention). Накопление, не сопряженное с функционированием (activity-independent retention), может обладать особыми свойствами, что в литературе до сих пор еще не обсуждалось. Сигналы, обеспечивающие не сопряженное с функционированием накопление, мы первоначально называли неспецифическими, так как предполагалось, что такой сигнал может быть характерен для белков с принципиально разными функциями.

Наличие неспецифического NoLS в гистоне не удивительно. Этот участок обогащен положительно заряженными аминокислотами, что характерно для классических сигналов ядерной локализации. Белки, транспортирующиеся в ядро, содержат аминокислотную последовательность, которая играет роль сигнала ядерной локализации (NLS). Наиболее хорошо изученный транспортный сигнал импорта ядерных белков - это классический сигнал ядерной локализации (NLS), который состоит

105 либо из одной или двух участков основных аминокислот. (Lange et al, 2007). Структурные исследования выявили многие ключевые особенности NLS (Conti and Kuriyan,2000; Fontes et al,2000). В частности, выявлено, что классические NLS могут включать мотив, который состоит из лизина в начале участка и двух лизинов или аргининов, между которыми может находиться любая аминокислота - K(K/R)X(K/R).

Согласно опубликованным данным, некоторые известные NoLS перекрываются с хорошо известными NLS (Kubota et al, 1999; Rowland and Yoo,2003; Zemach et al, 2006; Melen et al, 2007; Wang et al, 2010). В нашем случае y гистона H2B-EGFP присутствует участок, который функционально ведет себя как NLS и одновременно может выступать в качестве сигнала ядрышковой локализации.

Состав последовательности NLS хорошо известен, и это позволяет достаточно точно предсказывать их присутствие в белках (Cokol et al, 2000). В отличие от классического NLS, предсказание сигналов ядрышковой локализации представляет сложную проблему. Недавно было показано, что некоторые клеточные и вирусные NoLS обогащены аргининами (Reed et al,2006). Однако существование NoLS без аргининов говорит о том, что данная структура не является универсальной (Favre et al, 1994; Shu-Nu et al, 2000). На самом деле, вполне возможно, что такого консенсуса не существует, и физический механизм NoLS не требует какой-либо четкой последовательности аминокислот. Учитывая тот факт, что все сигналы ядрышковой локализации обогащены положительно заряженными аминокислотами и несут собой положительный заряд (табл. 2), можно предположить, что основной механизм реализации активности данного типа сигналов связан с электростатическим взаимодействием. Если это предположение верно - то последовательность аминокислот не столь важна, в отличие от аминокислотного состава сигнала. Если ядрышко обогащено отрицательно заряженными компонентами, все белки с положительными заряженными участками будут неспецифически накапливаться в ядрышке. Конечно, на накопление может сильно влиять окружающие участки белка, включая наличие отрицательно заряженных мотивов, а так же общий отрицательный заряд белка. В случае гистона, который обогащен основными аминокислотами - эта проблема не возникает. Действительно, мы обнаружили, что предпологаемый NoLS (28-35) представляет собой только часть сигнала ядрышковой локализации (21-35). Основываясь на наших данных участок NoLS с наибольшим положительным сигналом (плотностью заряда) будет давать наибольший вклад в накопление белка в ядрышке, в то время как окружиющие участки будут только усиливать это накопление. Наше исследование показывает, что экспериментальное определение таких сигналов, как и выявление границ сигналов невозможно без количественной оценки активности NoLS, что существенно отличает данный тип сигналов от других известных мотивов.

Очень мало известно о том, как NoLS взаимодействует с ядрышком. Накопление белка в ядрышке может быть связано с электростатическим взаимодействием положительно заряженных NoLS с отрицательно заряженными нуклеиновыми кислотами и белками. К примеру, было показано, что кластеры основных аминокислот способствуют связыванию белком РНК и ядрышковой локализации рибосомального белка L22 (Houmani and Ruf,2009). Кроме того, было показано, что некоторые NoLS могут взаимодействовать с мажорным ядрышковым белком В23 (Wang et al, 2010,Lechertier et al,2007; Endo et al,2009). Факт наличия в B23 длинных отрицательно заряженных участков 120EEDAESEDEEEED132 и

161DEDDDDDDEEDDDEDDDDDDFDDEEАЕЕ188 позволяет предположить, что такого рода взаимодействия могут иметь электростатическую природу, как в случае взаимодействия с РНК. Также необходимо отдавать отчет, что не все механизмы накопления белков в ядрышке опосредованы NoLS. Например, было показано, что РНК связывающие мотивы отвечают за накопление нуклеолина в ядрышке (SchmidtZachmann and Nigg, 1993).

Полученные данные позволяют утверждать, что наличие некоторых типов NLS может автоматически приводить к накоплению белка в ядрышке. Именно такая ситуация наблюдается в случае гистона Н2В. Нельзя исключить, что присутствие в ядрышке огромного количества разнообразных белков как раз и связано с тем, что присутствие NLS (или других участков, обогащенных положительно-заряженными аминокислотами) может вести к ядрышковой локализации.

Аккумуляция белка в ядрышке, вызванная наличием NoLS, может быть биологически значимой. В случае белка, функционирующего в ядрышке, неспецифическое накопление в пределах этой структуры повысит вероятность случайного взаимодействия со специфическими сайтами связывания. В других случаях ядрышковая локализация может быть либо безразличной в функциональном плане, либо даже вредной (если белок функционирует вне ядрышка). Накопление гистона HI в ядрышке на стадии Gi (Stoldt et all,2007) может иметь именно такую природу (начало его экспрессии до начала синтеза ДНК ведет к появлению в клетке свободного, не связанного с хроматином гистона, который не специфически накапливается в ядрышке). В любом случае, накопление белка в ядрышке не следует автоматически считать функционально-значимым, по крайней мере, до получения экспериментального доказательства обратного.

Следствием высказанного предположения является возможность накопление в ядрышке белков, функционирование которых протекает вне ядрышка. Примерами такого типа белков могут быть гистон Н2В и, возможно, hTERT (Yang et all, 2002). К сожалению, доказательство отсутствия функции практически невозможно и всегда остается вероятность, что когда-нибудь функция будет найдена. В других случаях ядрышковая локализация может быть либо безразличной в функциональном плане, либо даже вредной (если белок функционирует вне ядрышка).

Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Мусинова, Яна Рафаеловна, 2012 год

Список цитируемой литературы

1. Льюин Б., Кассимерис Л., Лингаппа В.П., Плоппер Д, (2011). Клетки. Изд. Бионом. Лаборатория знаний.

2. Ahmad Y, Boisvert FM, Gregor P, Cobley A, Lamond AI (2009) NOPdb: Nucleolar Proteome Database - 2008 update. Nucleic Acids Res 37:181-184

3. Andersen JS, Lam YW, Leung AK, Ong SE, Lyon CE, Lamond AI, Mann M (2005) Nucleolar proteome dynamics. Nature 433:77-83

4. Annilo T, Karis A, Hoth S, Rikk T, Kruppa J, Metspalu A (1998) Nuclear import and nucleolar accumulation of the human ribosomal protein S7 depends on both a minimal nuclear localization sequence and an adjacent basic region. Biochem Biophys Res Commun 249: 759-766

5. Antoine M, Reimers K, Dickson C, Kiefer P (1997) Fibroblast growth factor 3, a protein with dual subcellular localization, is targeted to the nucleus and nucleolus by the concerted action of two nuclear localization signals and a nucleolar retention signal. J Biol Chem 272:29475-29481

6. Aris J.P., Blobel G. (1991) Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 88:931-935.

7. Axton R, Wallis J, Taylor H, Hanks M, Forrester L (2008) Aminopeptidase О contains a functional nucleolar localization signal and is implicated in vascular biology. J Cell Biochem 103: 1171-1182

8. Baserga S.J., Yang X.D., Steitz J.A. (1991) EMBO (Eur. Mol. Biol. Organ.) J. 10:2645-2651.

9. Biggiogera M., Fakan S., Kaufmann S.H., Black A., Shaper J.H., Busch H. (1989) J Histochem Cytochem 37:1371-1374

10. Birbach A, Bailey ST, Ghosh S, Sehmid JA (2004) Cytosolie, nuclear and nucleolar localization signals determine subcellular distribution and activity of the NF- kappaB inducing kinase NIK. J Cell Sci 117: 3615-3624

11. Birney E, Kumar S, Krainer AR.(1993)Analysis of the RNA-recognition motif and RS and RGG domains: conservation in metazoan pre-mRNA splicing factors.Nucleic Acids Res 21(25):5803-16.

12. Boisvert FM, van Koningsbruggen S, Navascues J, Lamond AI (2007) The multifunctional nucleolus. Nat Rev Mol Cell Biol 8:574-585

13. Bouche G, Caizergues-Ferrer M, Bugler B, Amalric F.(1984) Interrelations between the maturation of a 100 kDa nucleolar protein and pre rRNA synthesis in CHO cells.Nucleic Acids Res 12(7):3025-35.

14. Bouvet P., Diaz J.-J., Kindbeiter K., Madjar J.-J., Amalric F. (1998) J. Biol. Chem. 273:19025-19029.

15. Boyne JR, Whitehouse A(2006) Nucleolar trafficking is essential for nuclear export of intronless herpesvirus mRNA. Proc Natl Acad Sci USA 103: 15190-15195

16. Cappai R., Osborn A.H., Handman E. (1994) Mol. Biochem. Parasitol. 64:353355.

17. Carmo-Fonseca M, Mendes-Soares L, Campos I (2000) To be or not to be in the nucleolus. Nat Cell Biol 2:E107-E112

18. Caron E, Cote C, Parisien M, Major F, Perreault C (2006) Identification of two distinct intracellular localization signals in STT3-B. Arch Biochem Biophys 445: 108-114

19. Caron E, Côté C, Parisien M, Major F, Perreault C. Identification of two distinct intracellular localization signals in STT3-B.(2006)Arch Biochem Biophys;445(l):108-14.

20. Casafont I., Bengoechea R., Navascues J., Pena E., Berciano M.T., Lafarga M. (2007) J Struct Biol 159:451-461

21. Catez F, Erard M, Schaerer-Uthurralt N, Kindbeiter K, Madjar JJ, Diaz JJ (2002) Unique motif for nucleolar retention and nuclear export regulated by phosphorylation. Mol Cell Biol 22: 1126-1139

22. Chang J. H„ Lin J. Y., Wu M. H., Yung B. Y. (1998) Evidence for the ability of nucleophosmin/B23 to bind ATP Biochem. J. 329: 539-544

23. Chang J. H., Olson M. O. (1989) A single gene codes for two forms of rat nucleolar protein B23 mRNA. J. Biol. Chem. 264: 11732-11737.

24. Chen D, Huang S (2001) Nucleolar components involved in ribosome biogenesis cycle between the nucleolus and nucleoplasm in interphase cells. J Cell Biol 153:169-176

25. Cheng G, Brett ME, He B (2002) Signals that dictate nuclear, nucleolar, and cytoplasmic shuttling of the gamma(l)34.5 protein of herpes simplex virus type 1. J Virol 76:9434-9445

26. Cmarko D., Verschure P.J., Rothblum L.I., Hernandez-Verdun D., Amalric F., van Driel R., Fakan S. (2000) Histochem Cell Biol 32:181-187

27. Cochrane A, Perkins A, Rosen C (1990) Identification of sequences important in the nucleolar localization of human immunodeficiency virus Rev: relevance of nucleolar localization to function. J Virol 64 : 881-885

28. Cokol M, Nair R, Rost B (2000) Finding nuclear localization signals. EMBO Rep 1:411-415

29. Condemine W, Takahashi Y, Le Bras M, de The H (2007) A nucleolar targeting signal in PML-I addresses PML to nucleolar caps in stressed or senescent cells. J Cell Sci 120: 3219-3227

30. Conti E, Kuriyan J. (2000) Crystallographic analysis of the specific yet versatile recognition of distinct nuclear localization signals by karyopherin alpha. Structure. 2000 Mar 15;8(3):329-38.

31. D'Amours D., Stegmeier F., Amon A. (2004) Cdcl4 and condensin control the dissolution of cohesin-independent chromosome linkages at repeated DNA. Cell 117:455^469

32. Dang CV, Lee WM (1989) Nuclear and nucleolar targeting sequences of c-erb-A, c-myb, N-myc, p53, HSP70, and HIV tat proteins. J Biol Chem 264: 18019-18023

33. David E., McNeil J.B., Basile V., Pearlman R.E. (1997) Mol. Biol. Cell. 8:1051-1061

34. Dousset T, Wang C, Verheggen C, Chen D, Hernandez-Verdun D, Huang S (2000) Initiation of nucleolar assembly is independent of RNA polmerase I transcription. Mol Biol Cell 11:2705-2717

35. Dumbar T. S., Gentry G. A., Olson, M. O. (1989) Biochemistry 28: 9495-9501.

36. Ekman D, Light S, Bjorklund AK, Elofsson A (2006) What properties characterize the hub proteins of the protein-protein interaction network of Saccharomyces cerevisiae? Genome Biol 7: R45

37. Emmott E, Dove BK, Howell G, Chappell LA, Reed ML, Boyne JR, You JH, Brooks G, Whitehouse A, Hiscox JA(2008) Viral nucleolar localisation signals determine dynamic trafficking within the nucleolus. Virology 380: 191-202

38. Emmott E, Hiscox JA.(2009) Nucleolar targeting: the hub of the matter.EMBO Rep.(3):231-238.

39. Endo A, Kitamura N, Komada M (2009) Nucleophosmin/B23 regulates ubiquitin dynamics in nucleoli by recruiting deubiquitylating enzyme USP36. J Biol Chem 284:27918-27923

40. Escande-Geraud ML, Azum MC, Tichadou JL, Gas N.(1985)Correlation between rDNA transcription and distribution of a 100 kD nucleolar protein in CHO cells.Exp Cell Res 161(2):353-63.

41. Fatica A., Tollervey D. (2002) Making ribosomes. Curr Opin Cell Biol 14:313—

318

42. Favre D, Studer E, Michel MR (1994) Two nucleolar targeting signals present in the N-terminal part of Semliki Forest virus capsid protein. Arch Virol 137:149-155

43. Fontes MR, Teh T, Kobe B. (2000) Structural basis of recognition of monopartite and bipartite nuclear localization sequences by mammalian importin-alpha. J Mol Biol. 2000 Apr 14;297(5):1183-94.

44. Fromont-Racine M., Senger B., Saveanu C., Fasiolo F. (2003) Ribosome assembly in eukaryotes.Gene 313:17-42

45. Fujiwara T, Suzuki S, Kanno M, Sugiyama H, Takahashi H, Tanaka J (2006) Mapping a nucleolar targeting sequence of an RNA binding nucleolar protein, Nop25. Exp Cell Res 312:1703-1712

46. Gautier T., Fomproix N., Masson C., Azum-Gelade M.C., Gas N., Hernandez-Verdun D. (1994) Fate of specific nucleolar perichromosomal proteins during mitosis: cellular distribution and association with U3 snoRNA. Biol Cell 82:81-93

47. Gebrane-Younes J., Sirri V., Junera H.R., Roussel P., Hernandez-Verdun D. (2005) In: Hemmerich P, Diekmann S (eds) Visions of the cell nucleus. ASP, CA pp 120-135

48. Girard J.P., Feliu J., Caizergues-Ferrer M., Lapeyre B. (1993) Study of multiple fibrillarin mRNAs reveals that 3' end formation in Schizosaccharomyces pombe is sensitive to cold shock. Nucleic Acids Res. 21:1881-1887.

49. Godin KS, Varani G.(2007)How arginine-rich domains coordinate mRNA maturation events.RNA Biol. 4(2):69-75.Review.

50. Golding M, Ruhrberg C, Sandle J, Gullick WJ (2004) Mapping nucleolar and spliceosome localization sequences of neuregulinl-beta3. Exp Cell Res 299: 110-118

51. Goodier JL, Ostertag EM, Engleka KA, Seleme MC, Kazazian HH (2004) A potential role for the nucleolus in LI retrotransposition. Hum Mol Genet 13: 1041-1048

52. Goyal P, Pandey D, Behring A, Siess W (2005) Inhibition of nuclear import of LIMK2 in endothelial cells by protein kinase C-dependent phosphorylation at Ser-283. J Biol Chem 280:27569-27577

53. Goyal P, Pandey D, Siess W (2006) Phosphorylation-dependent regulation of unique nuclear and nucleolar localization signals of LIM kinase 2 in endothelial cells. J Biol Chem 281:25223-25230

54. Guillot P.V., Martin S., Pombo A. (2005) In: Hemmerich P, Diekmann S (eds) Visions of the cell nucleus. ASP, CA, pp 95-105

55. Gunawardena SR, Ruis Bl, Meyer JA, Kapoor M, Conklin KF (2008) NOM1 targets protein phosphatase i to the nucleolus. J Biol Chem 283: 398^404

56. Guo H, Ding Q, Lin F, Pan W, Lin J, Zheng A (2009) Characterization of the nuclear and nucleolar localization signals of bovine herpesvirus-1 infected cell protein 27. Virus Res 145: 312-320

57. Guo Y, Dallmann K, Kwang J (2003) Identification of nucleolus localization signal of betanodavirus GGNNV protein alpha. Virology 306:225-235

58. Hadjiolov AA (1985) The nucleolus and ribosome biogenesis. Springer, Berlin Heidelberg New York, pp 1-268

59. Hadjiolova KV, Hadjiolov A, Bachelerie J-P (1995) Actinomycin D stimulates the transcription of rRNA minigenes transfected into mouse cells. Applications for the in vivo hypersensitivity of rRNA gene transcription. Eur J Biochem 228:605-615

60. Hahn MA, Marsh DJ (2007) Nucleolar localization of parafibromin is mediated by three nucleolar localization signals. FEBS Lett 581: 5070-5074

61. Hatanaka M (1990) Discovery of the nucleolar targeting signal. Bioessays 12:

143-148

62. Haupt S, Stroganova T, Ryabov E, Kim S, Fraser G, Duncan G, Mayo M, Barker H, Taliansky M (2005) Nucleolar localization of potato leafroll virus capsid proteins. J Gen Virol 86:2891-2896

63. Hebert MD, Matera AG (2000) Self-association of coilin reveals a common theme in nuclear body localization. MolBiolCell 11:4159-4171

64. Heidelberg de la Cruz J., Kressler D., Linder P. (2004) Landes Biosciences/eurekah.com, Austin, pp 258-285

65. Henderson J, Amizuka N, Warshawsky H, Biasotto D, Lanske B, Goltzman D, Karaplis A (1995) Nucleolar localization of parathyroid hormone-related peptide enhances survival of chondrocytes under conditions that promote apoptotic cell death. Mol Cell Biol 15: 4064-4075

66. Henriquez R., Blobel G., Aris J.P. (1990) Isolation and sequencing of NOP 1. A yeast gene encoding a nucleolar protein homologous to a human autoimmune antigen. J. Biol. Chem. 265:2209-2215.

67. Hernandez-Verdun D, June'ra HR (1995) The nucleolus. In: Principles of medical biology, cellular organels, vol 2. Jai Press, Greenwich, pp 73-92

68. Hernandez-Verdun D. (2004). Behavior of the nucleolus during mitosis. In: The nucleolus. New York: Kluwer Academic/Plenium Publishers. 41—57.

69. Hernandez-Verdun D. (2005) Nucleolus: from structure to dynamics. Histochem Cell Biol. 2006 Jan;125(l-2): 127-37

70. Hernandez-Verdun D. (2006) The nucleolus: a model for the organization of nuclear functions. Histochem Cell Biol. 2006 Aug;126(2): 135-48. Epub 2006 Jul 12. Review.

71. Hingorani K., Szebeni A., Olson M. O. (2000) Mapping the functional domains of nucleolar protein B23. J. Biol. Chem. 275, 24451-24457.

72. Hiscox JA (2007) RNA viruses: hijacking the dynamic nucleolus. Nat Rev Microbiol 5: 119-127

73. Horke S, Reumann K, Schweizer M, Will H, Heise T (2004) Nuclear trafficking of La protein depends on a newly identified nucleolar localization signal and the ability to bind rna. J Biol Chem 279: 26563-26570

74. Houmani JL, Ruf IK. (2009) Clusters of basic amino acids contribute to RNA binding and nucleolar localization of ribosomal protein L22. PLoS One. 2009;4(4):e5306. Epub 2009 Apr 23.

75. Huang HS, Pozarowski P, Gao Y, Darzynkiewicz Z, Lee EY (2005) Protein phosphatase-1 inhibitor-3 is co-localized to the nucleoli and centrosomes with PPlgammal and PPlalpha, respectively. Arch Biochem Biophys 443: 33-44

76. Huang N., Negi S., Szebeni A., Olson M. O. (2005) Protein NPM3 interacts with the multifunctional nucleolar protein B23/nucleophosmin and inhibits ribosome biogenesis. J. Biol. Chem. 280: 5496-5502.

77. Inagaki Y, Mitsutake V, Igarashi Y (2006) Identification of a nuclear localization signal in the retinitis pigmentosa-mutated RP26 protein, ceramide kinase-like protein. Biochem Biophys Res Commun 343:982-987

78. Itahana K., Bhat K. P., Jin A., Itahana Y., Hawke D., Kobayashi R., Zhang, Y. (2003). Tumor suppressor ARF degrades B23, a nucleolar protein involved in ribosome biogenesis andcell proliferation. Mol. Cell 12: 1151-1164

79. Jansen R.P., Hurt E.C., Kern H., Lehtonen H., Carmo-Fonseca M., Lapeyre B., Tollervey D. (1991). Evolutionary conservation of the human nucleolar protein fibrillarin and its functional expression in yeast. J. Cell Biol. 113:715-729

80. Jarrous N, Wolenski JS, Wesolowski D, Lee C, Altman S (1999) Localization in the nucleolus and coiled bodies of protein subunits of the ribonucleoprotein ribonuclease P. J Cell Biol 146: 559-572

81. Kakuk A, Friedlander E, Vereb J, Lisboa D, Bagossi P (2008) Nuclear and nucleolar localization signals and their targeting function in phosphatidylinositol 4- kinase PI4K230. Exp Cell Res 314: 2376-2388

82. Kim SH, Macfarlane S, Kalinina NO, Rakitina DV, Ryabov EV, Gillespie T, Haupt S, Brown JW, Taliansky M (2007) Interaction of a plant virus-encoded protein with the major nucleolar protein fibrillarin is required for systemic virus infection. Proc Natl Acad Sci USA 104: 11115-11120

83. Kimura H, Cook P (2001) Kinetics of core histones in living human cells: little exchange of H3 and H4 and some rapid exchange of H2B. J Cell Biol 153:1341-1353

84. Korgaonkar C, Hagen J, Tompkins V, Frazier AA, Allamargot C, Quelle FW, Quelle DE (2005) Nucleophosmin (B23) targets ARF to nucleoli and inhibits its function. Mol Cell Biol 25: 1258-1271

85. Krasowski MD, Reschly EJ, Ekins S (2008) Intrinsic disorder in nuclear hormone receptors. J Proteome Res 7: 4359-4372

86. Kubota S, Copeland T, Pomerantz R (1999) Nuclear and nucleolar targeting of human ribosomal protein S25: common features shared with HIV-1 regulatory proteins. Oncogene 18: 1503-1514

87. Kubota S, Duan L, Furuta R, Hatanaka M, Pomerantz R (1996) Nuclear preservation and cytoplasmic degradation of human immunodeficiency virus type 1 Rev protein. J Virol 70:1282-1287

88. Kundu-Michalik S, Bisotti M, Lipsius E, Bauche A, Kruppa A, Klokow T, Kammler G, Kruppa J (2008) Nucleolar binding sequences of the ribosomal protein S6e family reside in evolutionary highly conserved peptide clusters. Mol Biol Evol 25:580-590

89. Kurki S., Peltonen K., Latonen L., Kiviharju T. M., Ojala P. M., Meek D., Laiho M. (2004) Nucleolar protein NPM interacts with HDM2 and protects tumor suppressor protein p53 from HDM2-mediated degradation. Cancer Cell 5: 465-475.

90. Kuroda TS, Maita H, Tabata T, Taira T, Kitaura H (2004) A novel nucleolar protein, PAPA-1, induces growth arrest as a result of cell cycle arrest at the G1 phase. Gene 340:83-98

91. la Cour T, Kiemer L, Molgaard A, Gupta R, Skriver K, Brunak S (2004) Analysis and prediction of leucine-rich nuclear export signals. Protein Eng Des Sel 17: 527536

92. Lange A, Mills RE, Lange CJ, Stewart M, Devine SE, Corbett AH (2007) Classical nuclear localization signals: definition, function, and interaction with importin alpha. J Biol Chem 282: 5101-5105

93. Lapeyre B., Mariotinni P., Mathieu D., Ferrer P., Amaldi F., Amalric F., Caizergues-Ferrer M. (1990) Mol. Cell. Biol. 10:430^134.

94. Lechertier T, Sirri V, Hernandez-Verdun D, Roussel P(2007) AB23-interacting sequence as a tool to visualize protein interactions in a cellular context. J Cell Sci 120: 265275

95. Li YP, Busch RK, Valdez BC, Busch H (1996) C23 interacts with B23, a putative nucleolar-localization-signal-binding protein. Euro J Biochem 237: 153-158

96. Lin J, Jin R, Zhang B, Chen H, Bai YX, Yang PX, Han SW, Xie YH, Huang PT, Huang C, Huang JJ (2008) Nucleolar localization of TERT is unrelated to telomerase function in human cells. J Cell Sci 121:2169-2176

97. Lindstrom MS, Zhang Y (2008) Ribosomal protein S9 is a novel B23/NPM-binding protein required for normal cell proliferation. J Biol Chem 283:15568-15576

98. Lippincott-Schwartz J, Snapp E, Kenworthy A (2001) Studying protein dynamics in living cells. Nat Rev Mol Cell Biol 2:444-456

99. Liu J, Du X, Ke Y (2006) Mapping nucleolar localization sequences of 1A6/DRIM. FEBS Lett 580: 1405-1410

100. Liu JL, Lee LF, Ye Y, Qian Z, Kung HJ (1997) Nucleolar and nuclear localization properties of a herpesvirus bZIP oncoprotein, MEQ. J Virol 71:3188-3196

101. Lixin R, Efthymiadis A, Henderson B, Jans DA (2001) Novel properties of the nucleolar targeting signal of human angiogenin. Biochem Biophys Res Commun 284:185-93

102. Lohrum MA, Ashcroft M, Kubbutat MH, Vousden KH (2000) Identification of a cryptic nucleolar-localization signal in MDM2. Nat Cell Biol 2: 179-181

103. Louvet E, Junera HR, Le Panse S, Hernandez-Verdun D (2005) Dynamics and compartmentation of the nucleolar processing machinery. Exp Cell Res 304:457-470

104. Lunde BM, Moore C, Varani G.(2007)RNA-binding proteins: modular design for efficient fiinction.Nat Rev Mol Cell Biol (6):479-90. Review.

105. Mao YS, Zhang B, Spector DL.( 2011) Biogenesis and function of nuclear bodies. Trends Genet. Aug;27(8):295-306.

106. Mears WE, Lam V, Rice SA (1995) Identification of nuclear and nucleolar localization signals in the herpes simplex virus regulatory protein ICP27. J Virol 69:935-947

107. Melen K, Kinnunen L, Fagerlund R, Ikonen N, Twu KY, Krug RM, Julkunen I (2007) Nuclear and nucleolar targeting of influenza A virus NS1 protein: striking differences between different virus subtypes. J Virol 81:5995-6006

108. Mo YY, Wang C, Beck WT (2000) A novel nuclear localization signal in human DNA topoisomerase I. J Biol Chem 275: 41107-41113

109. Musinova YR, Lisitsyna OM, Golyshev SA, Tuzhikov AI, Polyakov VY, Sheval EV (2011) Nucleolar localization/retention signal is responsible for transient accumulation of histone H2B in the nucleolus through electrostatic interactions. Biochim Biophys Acta 1813:27-38

110. Myre MA, O'Day DH (2002) Nucleomorphin. A novel, acidic, nuclear calmodulin-binding protein from Dictyostleium that regulates nuclear number. J Biol Chem 277:19735-19744

111. Nagahama M, Hara Y, Seki A, Yamazoe T, Kawate Y, Shinohara T, Hatsuzawa K, Tani K, Tagaya M (2004) NVL2 is a nucleolar AAA-ATPase that interacts with ribosomal protein L5 through its nucleolar localization sequence. Mol Biol Cell 15:5712-5723

112. Niedick I, Froese N, Oumard A, Mueller PP, Nourbakhsh M, Hauser H, Koster M.(2004) Nucleolar localization and mobility analysis of the NF-kappaB repressing factor NRF. J Cell Sci 117(Pt 16):3447-58. Epub 2004 Jun 29.

113. Niewmierzycka A., Clarke S. (1999). S-Adenosylmethionine-dependent methylation in Saccharomyces cerevisiae. Identification of a novel protein arginine methyltransferase. J. Biol. Chem. 274:814-824.

114. Nishimura Y, Ohkubo T, Furuichi Y, Umekawa H (2002) Tryptophans 286 and 288 in the C-terminal region of protein B23.1 are important for its nucleolar localization. Biosci Biotechnol Biochem 66: 2239-2242

115. Ochs R.L., Lischwe M.A., Shen E., Caroll R.E., Busch H. (1985a) Nucleologenesis: composition and fate of prenucleolar bodies. Chromosoma 92:330—

116. Okuda M., Horn H. F., Tarapore P., Tokuyama Y., Smulian A. G., Chan P. K., Knudsen E. S., Hofmann I. A., Snyder J. D., Bove K. E. (2000) Nucleophosmin/B23 is a target of CDK2/cyclin E in centrosome duplication. Cell 103: 127-140.

117. Okuwaki M., Tsujimoto M., Nagata K. (2002) The RNA binding activity of a ribosome biogenesis factor, nucleophosmin/B23, is modulated by phosphorylation with a cell cycle-dependent kinase and by association with its subtype. Mol Biol Cell 13:2016-2030

118. Ou Y., Fritzler M.J., Valdez B.C., Rattner J.B. (1999) Mapping and characterization of the functional domains of the nucleolar protein RNA helicase II/Gu. Exp. Cell Res. 247:389-398

119. Pederson T (1998) The plurifimctional nucleolus. Nucleic Acids Res 26:38713876

120. Phair RD, Misteli T (2000) High mobility of proteins in the mammalian cell nucleus. Nature 404:604-609

121. Pih K.T., Yi M.J., Liang Y.S., Shin B.J., Cho M.J., Hwang I., Son D. (2000) Molecular cloning and targeting of a fibrillarin homolog from Arabidopsis.Plant Physiol. 123:51-58.

122. Puvion-Dutilleul F, Puvion E, Bachellerie J-P (1997) Early stages of pre-rRNA formation within the nucleolar ultrastructure of mouse cells studied by in situ hybridization with 5yETS leader probe. Chromosoma 105:496-505

123. Puvion-Dutilleul F., Bachellerie J-P., Puvion E. (1991) Nucleolar organization of HeLa cells as studied by in situ hybridization. Chromosoma 100:395-409

124. Quaye IK, Toku S, Tanaka T (1996) Sequence requirement for nucleolar localization of rat ribosomal protein L31. Eur J Cell Biol 69:151 -155

125. Rao MR, Kumari G, Balasundaram D, Sankaranarayanan R, Mahalingam S (2006) A novel lysine-rieh domain and GTP binding motifs regulate the nucleolar retention of human guanine nucleotide binding protein, GNL3L. J Mol Biol 364: 637-654

126. Reed ML, Dove BK, Jackson RM, Collins R, Brooks G, Hiscox JA(2006) Delineation and modelling of a nucleolar retention signal in the coronavirus nucleocapsid protein. Traffic 7: 833-848

127. Rowland R, Yoo D (2003) Nucleolar-cytoplasmic shuttling of PRRSV nucleocapsid protein: a simple case of molecular mimicry or the complex regulation by nuclear import, nucleolar localization and nuclear export signal sequences. Virus Res 95:23-33

128. Rowland RR, Kerwin R, Kuckleburg C, Sperlich A, Benfield DA(1999) The localisation of porcine reproductive and respiratory syndrome virus nucleocapsid protein to the nucleolus of infected cells and identification of a potential nucleolar localization signal sequence. Virus Res 64: 1-12

129. Rowland RR, Schneider P, Fang Y, Wootton S, Yoo D, Benfield DA(2003) Peptide domains involved in the localization of the porcine reproductive and respiratory syndrome virus nucleocapsid protein to the nucleolus. Virology 316: 135-145

130. Sandeep S. Olson O. J., (2006) Effects of interphase and mitotic phosphorylation on the mobility and location of nucleolar protein B23. Journal of Cell Science 119: 3676-3685

131. Scheer U, Benavente R (1990) Functional and dynamic aspects of the mammalian nucleolus. Bioessays 12:14-21

132. Scheer U., Hock R. (1999) Structure and function of the nucleolus. Curr Opin Cell Biol 11:385-390

133. Scheer U., Thiry M., Goessens G. (1993) Structure, function and assembly of the nucleolus. Trends Cell Biol 3:236-241

134. Schimmang T., Tollervey D., Kern H., Frank R., Hurt E.C. (1989) A yeast nucleolar protein related to mammalian fibrillarin is associated with small nucleolar RNA and is essential for viability. EMBO (Eur. Mol. Biol. Organ.) J. 8:4015-4024

135. Schmidt-Zachmann MS, Nigg EA (1993)Protein localization to the nucleolus: a search for targeting domains in nucleolin. J Cell Sci 105: 799-806

136. Scott MS, Boisvert FM, McDowall MD, Lamond AI, Barton GJ (2010) Characterization and prediction of protein nucleolar localization sequences. Nucleic Acids Res 38:7388-7399

137. Scott MS, Troshin PV, Barton GJ (2011) NoD: a Nucleolar localization sequence detector for eukaryotic and viral proteins. BMC Bioinformatics 12:317

138. Sharma P, Ikegami M (2009) Characterization of signals that dictate nuclear/nucleolar and cytoplasmic shuttling of the capsid protein of Tomato leaf curl Java virus associated with DNA beta satellite. Virus Res 144:145-153

139. Shaw P.J., Jordan E.G. (1995) The nucleolus. Annu Rev Cell Dev Biol 11:93121

140. Sheng Z, Lewis JA, Chirico WJ (2004) Nuclear and nucleolar localization of 18-kDa fibroblast growth factor-2 is controlled by C-terminal signals. J Biol Chem 279: 4015340160

141. Sheval E, Dudnik O, Abramchuk S, Polyakov V (2009) Perichromosomal layer proteins associate with chromosome scaffold and nuclear matrix throughout the cell cycle. Biologicheskie membrany 26:126-142

142. Sheval EV, Polzikov MA, Olson MO, Zatsepina OV. (2005) A higher concentration of an antigen within the nucleolus may prevent its proper recognition by specific antibodies. Eur J Histochem. 2005 Apr-Jun;49(2):l 17-23.

143. Sheval EV, Polyakov VY. (2006) Visualization of the chromosome scaffold and intermediates of loop domain compaction in extracted mitotic cells. Cell Biol Int. 2006 Dec;30(12): 1028-40. Epub 2006 Aug 24.

144. Shu-Nu C, Lin CH, Lin A (2000) An acidic amino acid cluster regulates the nucleolar localization and ribosome assembly of human ribosomal protein L22. FEBS Lett 484:22-28

145. Singh R, Paik J, Gunjan A (2009) Generation and management of excess histones during the cell cycle. Front Biosci 14:3145-3158

146. Siomi H, Shida H, Maki M, Hatanaka M (1990) Effects of a highly basic region of human immunodeficiency virus Tat protein on nucleolar localization. J Virol 64:1803-1807

147. Siomi H, Shida H, Nam SH, Nosaka T, Maki M, Hatanaka M. (1988) Sequence requirements for nucleolar localization of human T cell leukemia virus type I pX protein, which regulates viral RNA processing. Cell 55:197-209

148. Sirri V., Urcuqui-Inchima S., Roussel P., Hernandez-Verdun D., (2007). Nucleolus: the fascinating nuclear body. Histochem Cell Biol. 2008 Jan;129(l): 13-31

149. Snaar S., Wiesmeijer K., Jochemsen A.G., Tanke H.J., Dirks R.W. (2000) Mutational analysis of fibrillarin and its mobility in living human cells. J Cell Biol 151:653662

150. Sollner-Webb B., Tycowski K.T., Steitz J.A. (1996) In: Ribosomal RNA: structure, evolution processing, and function in protein biosynthesis. CRC Press, New York, pp 469-490

151. Song Z, Wu M (2005) Identification of a novel nucleolar localization signal and a degradation signal in Survivin-deltaEx3: a potential link between nucleolus and protein degradation. Oncogene 24: 2723-2734

152. Stark LA, Dunlop MG (2005) Nucleolar sequestration of RelA (p65) regulates NF-kappaBdriven transcription and apoptosis. Mol Cell Biol 25: 5985-6004

153. Stegh AH, Schickling O, Ehret A, Scaffidi C, Peterhansel C, Hofmann TG, Grummt I, Krammer PH, Peter ME. DEDD, a novel death effector domain-containing protein, targeted to the nucleolus.(1998) EMBO J.;17(20):5974-86.

154. Stoldt S, Wenzel D, Schulze E, Doenecke D, Happel N (2007) G1 phase-dependent nucleolar accumulation of human histone Hlx. Biol Cell 99:541-552

155. Stoldt S., Wenzel D., Schulze E., Doenecke D., Happel N. (2007) G1 phase-dependent nucleolar accumulation of human histone Hlx, Biol. Cell 99 541-552.

156. Strouboulis J., WolVe A.P. (1996) unctional compartmentalization of the nucleus. J Cell Sci 109:1991-2000

157. Sullivan M., Higuchi T., Katis V.L., Uhlmann F. (2004) Cdcl4 phosphatase induces rDNA condensation and resolves cohesin-independent cohesion during budding yeast anaphase. Cell 117:471-482

158. Suzuki H, Arakawa Y, Ito M, Saito S, Takeda N (2007) MLF1-interacting protein is mainly localized in nucleolus through N-terminal bipartite nuclear localization signal. Anticancer Res 27: 1423-1430

159. Tamanini F, Kirkpatrick LL, Schonkeren J, van Unen L, Bontekoe C (2000) The fragile X-related proteins FXR1P and FXR2P contain a functional nucleolar- targeting signal equivalent to the HIV-1 regulatory proteins. Hum Mol Genet 9: 1487-1493

160. Thebault S, Basbous J, Gay B, Devaux C, Mesnard JM (2000) Sequence requirement for the nucleolar localization of human I-mfa domain-containing protein (HIC p40). Eur J Cell Biol 79: 834-838

161. Thirkettle HJ, Girling J, Warren AY, Mills IG, Sahadevan K (2009) LYRIC/AEG-1 is targeted to different subcellular compartments by ubiquitinylation and intrinsic nuclear localization signals. Clin Cancer Res 15: 3003-3013

162. Timmers AC, Stuger R, Schaap PJ, van "t Riet J, Raue HA (1999) Nuclear and nucleolar localization of Saccharomyces cerevisiae ribosomal proteins S22 and S25. FEBS Let. 452:335-340

163. Tokuyama Y., Horn H. F., Kawamura K., Tarapore P., Fukasawa K. (2001) Specific phosphorylation of nucleophosmin on Thr(199) by cyclin-dependent kinase 2-cyclin E and its role in centrosome duplication. J. Biol. Chem. 276: 21529-21537.

164. Tollervey D. (1996) Trans-acting factors in ribosome synthesis. Exp Cell Res 229:226-232

165. Tollervey D., Lehtonen H., Jansen R., Kern H., Hurt E.C. (1993) Temperature-sensitive mutations demonstrate roles for yeast fibrillarin in pre-rRNA processing, pre-rRNA methylation, and ribosome assembly. Cell. 72:443-457.

166. Torres H, Ramirez J (2009) A Chemokine Targets the Nucleus: Cxcll2-Gamma Isoform Localizes to the Nucleolus in Adult Mouse. PLoS One. 4:e7570

167. Torres-Rosell J., Machin F., Jarmuz A., Aragon L. (2004) Nucleolar segregation lags behind the rest of the genome and requires Cdcl4p activation by the FEAR network. Cell Cycle 3:496-502

168. Tsai RY, McKay RD (2002) A nucleolar mechanism controlling cell proliferation in stem cells and cancer cells. Genes Dev 16: 2991-3003

169. Tsukahara M, Suemori H, Noguchi S, Ji ZS, Tsunoo H (2000) Novel nucleolar protein, midnolin, is expressed in the mesencephalon during mouse development. Gene 254: 45-55

170. Turley S.J., Tan E.M., Pollard K.M. (1993) Molecular cloning and sequence analysis ofU3 snoRNA-associated mouse fibrillarin. Biochim. Biophys. Acta. 1216:119-122.

171. Tyc K., Steitz J. A. (1989) U3, U8 and U13 comprise a new class of mammalian snRNPs localized in the cell nucleolus. EMBO (Eur. Mol. Biol. Organ.) J. 8:3113-3119.

172. Ueki N, Kondo M, Seki N, Yano K, Oda T (1998) NOLP: identification of a novel human nucleolar protein and determination of sequence requirements for its nucleolar localization. Biochem Biophys Res Commun 252: 97-102

173. Ulanet D.B. Wigley F.M. Gelber A.C. Rosen A. (2003) Autoantibodies against B23, a nucleolar phosphoprotein, occur in scleroderma and are associated with pulmonary hypertension. Arthrits Rheum. 49(1): 85-92

174. Valdez BC, Perlaky L, Henning D, Saijo Y, Chan PK, Busch H (1994) Identification of the nuclear and nucleolar localization signals of the protein pi20. Interaction with translocation protein B23. J Biol Chem 26: 23776-23783

175. Viiri KM, Korkeamaki H, Kukkonen MK, Nieminen LK, Lindfors K (2006) SAP30L interacts with members of the Sin3A corepressor complex and targets Sin3A to the nucleolus. Nucleic Acids Res 34: 3288-3298

176. Viranaicken W, Gasmi L, Chaumet A, Durieux C, Georget V, Denoulet P, Larcher JC. (2011) L-I1G and L-NF90 traffic to the nucleolus granular component: alternatively-spliced exon 3 encodes a nucleolar localization motif. PLoS One. 2011;6(7):e22296. Epub2011 Jul 19.

177. Wang D., Baumann A., Szebeni A., Olson M. O. (1994) The nucleic acid binding activity of nucleolar protein B23.1 resides in its carboxyl-terminal end. J. Biol. Chem. 269: 30994-30998.

178. Wang H., Boisvert D., Kim K. K., Kim R. & Kim S. H. (2000) Crystal structure of a fibrillarin homologue from Methanococcus jannaschii, a hyperthermophile, at 1.6 A resolution. EMBO J. 19: 317-323.

179. Wang Y, Chen B, Li Y, Zhou D, Chen S.(2010)PNRC accumulates in the nucleolus by interaction with B23/nucleophosmin via its nucleolar localization sequence.Biochim Biophys Acta.

180. Weber JD, Kuo ML, Bothner B, DiGiammarino EL, Kriwacki RW, Roussel MF, Sherr CJ (2000) Cooperative signals governing ARF-MDM2 interaction and nucleolar localization of the complex. Mol Cell Biol 20:2517-2528

181. Winokur ST, Shiang R (1998) The Treacher Collins syndrome (TCOF1) gene product, treacle, is targeted to the nucleolus by signals in its C-terminus . Hum Mol Genet 7:1947-1952

182. Woo LL, Futami K, Shimamoto A, Furuichi Y, Frank KM (2006) The Rothmund-Thomson gene product RECQL4 localizes to the nucleolus in response to oxidative stress. Exp Cell Res 312: 3443-3457

183. Wu M. H., Yung B. Y. (2002) UV stimulation of nucleophosmin/B23 expression is an immediate-early gene response induced by damaged DNA. J. Biol. Chem. 277, 48234-48240.

184. Yang Y, Chen Y, Zhang C, Huang H, Weissman SM (2002) Nucleolar localization of hTERT protein is associated with telomerase function. Exp Cell Res 277: 201209

185. Yoo D, Wootton SK, Li G, Song C, Rowland RR(2003) Colocalization and interaction of the porcine arterivirus nucleocapsid protein with the small nucleolar RNA-associated protein fibrillarin. J Virol 77: 12173-12183

186. You JH, Howell G, Pattnaik AK, Osorio FA, Hiscox JA(2008) Amodel for the dynamic nuclear/nucleolar/cytoplasmic trafficking of the porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSV) nucleocapsid protein based on live cell imaging. Virology 378: 3447

187. Zatsepina OV, Dudnic OA, Todorov IT, Thiry M, Spring H, Trendelenburg MF. (1997) Experimental induction of prenucleolar bodies (PNBs) in interphase cells: interphase PNBs show similar characteristics as those typically observed at telophase of mitosis in untreated cells. Chromosoma. 1997 Jun;105(7-8):418-30.

188. Zemach A, Li Y, Ben-Meir H, Oliva M, Mosquna A, Kiss V, Avivi Y, Ohad N, Graft G (2006) Different domains control the localization and mobility of like heterochromatinproteinl in Arabidopsis nuclei. Plant Cell 18:133-145