Магнитотактические бактерии водоемов Нижней Волги тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.00.18, кандидат биологических наук Чертов, Николай Владимирович

• Чертов, Николай Владимирович
• кандидат биологических наук
• 2000

Оглавление диссертации кандидат биологических наук Чертов, Николай Владимирович

ВВЕДЕНИЕ.

Глава 1 КРУГОВОРОТ ЖЕЛЕЗА В ПРИРОДЕ И МАГНИТОТАКТИ

ЧЕСКИЕ БАКТЕРИИ (ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ).

1.1. Свойства железа и его значение для жизнедеятельности микроорганизмов.

1.2. Биогенез соединений железа.

1.2.1. Образование бактериями магнитных железосодержащих минералов.

1.2.2. Биоиндуцированная минерализация соединений железа.

1.2.3. Биоконтролируемая минерализация соединений железа.

1.3. Магнитотактические бактерии.

1.3.1. Систематика магнитотактических бактерий.

1.3.2. Особенности строения и физиология клеток магнитотактических бактерий.

1.3.3. Экология магнитотактических бактерий.

Глава 2 ОБЪЕКТЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЙ.

Глава 3 ВЫДЕЛЕНИЕ МАГНИТОТАКТИЧЕСКИХ БАКТЕРИЙ МЕТОДОМ МОДЕЛЬНЫХ СИСТЕМ.

3.1. Физико-химические параметры исследуемых природных водоемов.

3.2. Физико-химические параметры модельных систем.

3.3. Микробиоценозы модельных систем.

Глава 4 МАГНИТОТАКТИЧЕСКИЕ БАКТЕРИИ В МИКРОБИОЦЕНОЗАХ ИЛОВЫХ ОТЛОЖЕНИЙ ИССЛЕДУЕМЫХ ВОДО

ЕМОВ.

4.1. Выделение чистой культуры магнитотактических бактерий.

4.2. Биоминерализация соединений железа полученной культуры магнитотактических бактерий.

4.3 Установление таксономического статуса выделенных бактерий

Заключение диссертации по теме «Гидробиология», Чертов, Николай Владимирович

выводы

1. Анализ физико-химических параметров исследованных модельных систем показал, что они изменяются в весьма широких пределах и не всегда способствуют процессу бйоминерализации соединений железа вследствие низкой концентрации общего железа, как в воде, так и в иле, и слабой намагниченности илов.

2. Сообщество микроорганизмов, выделенное из природного материала озера Белячное и обладающее высокими магнитными параметрами, включает 23 вида бактерий, в том числе представителей рода АциазртПит (синоним Ма^еШБртПит), способных к внутриклеточной биоминерализации соединений железа.

3. Процесс биоминерализации соединений железа происходит только в озере Белячное, чему способствуют низкое содержание растворенного органического вещества, повышенные концентрации железа (0,5-1,7 мг/л в воде и л

1205-7400 мг/кг в иле), высокие магнитные параметры (%пар 54,2x10" см /г, л л

1нас72,3х 10° Гсхсм /г) и наличие магнитотактических бактерий.

4. Выделенная культура магнитотактических бактерий обладает способностью к магнитотаксису.

5. Показана способность магнитотактических бактерий к внутриклеточной биоминерализации соединений железа в виде магнетита (Бе304) и гематита (Ре2Оэ).

6. На основе филогенетического анализа выделенные магнитотактические бактерии идентифицированы как Ма^е^ртИит magnetotacticum штамм N7.

Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Чертов, Николай Владимирович, 2000 год

1. Аветикян Г.Б., Кукушкин Ю.Н. Магнитные свойства простых и комплексных соединений. Л.: Изд-во ЛГУ. 1984. 43 с.

2. Алейников И.Н. Биогенный магнетит. Препринт: Пущино. 1986. 4 с.

3. Бабанин В.Ф., Трухин В.И., Карпачевский Л.О., Иванов A.B., Морозов В.В. Магнетизм почв. Ярославль: Изд-во ЯГТУ. 1995. 223 с.

4. Берри Л., Мейсон Б., Дитрих Р. Минералогия. М.: Мир. 1987. 591 с.

5. Биогенный магнетит и магниторецепция. Новое в биомагнетизме: в 2-х т. // Под ред. Дж. Киршвинка, Д. Джонса, Б. Мак-Фаддена. М.: Мир. 1989.

6. Брода Э. Эволюция биоэнергетических процессов. М.: Мир. 1978. 304 с.

7. Верховцева Н.В. Образование бактериями магнетита и магнитотак-сис // Успехи микробиологии. М.: Наука. 1992. Т.25. С.51-79.

8. Верховцева Н.В. Трансформация соединений железа гетеротрофными бактериями // Микробиология. 1995 . Т.64. Вып.4 С.473^478.

9. Верховцева Н.В., Глебова И.Н. Особенности накопления железа бактериями по данным магнитных измерений И Биофизика. 1993. Т. 33. №1. С. 150- 163.

10. Гаранин В.К., Кудрявцева Г.П. Применение электронно-зондовых приборов для изучения минерального вещества // М.: Недра. 1977. 261с.

11. Гаузе Г.Ф., Преображенская Т.П., Свешникова М.А., Терехова Л.П., Максимова Т.С. Определитель актиномицетов. М.: Изд-во Наука. 1983.244с.

12. Горленко В.М., Дубинина Г.А., Кузнецов С.И. Экология водных микроорганизмов. М.: "Наука". 1977. 289 с.

13. Грицаенко Г.С., Звягин Б.Б., Боярская Р.В., Горшков А.И., Самотоин H.H., Фролова К.Е. Методы электронной микроскопии минералов // М. Наука. 1969.309 с.

14. Дубинина Г.А. Биология железобактерий и их геохимическая деятельность // Дис. докт. биол. наук. М. 1977. T.I.

15. Дубинина Г.А., Чурикова В.В., Грабович М.Ю., Черных H.A., Райхин-штейн М.В., Петухова Н.Е. Выделение и характеристика Aquaspirillum denitrificans sp. nov. //Микробиология. 1989. T.58. № 6. С. 1014-1020.

16. Жолкевич В.Р., Волков Д.И., Прудников В.И., Жегловская И.Л. К вопросу о природе связей между дыханием и энергопотреблением физиологическими процессами. // Докл. АН СССР. 1971. Т.179. №5. С.1210-1213.

17. Заварзин Г.А. Микробное сообщество в прошлом и настоящем // Микробиол. журнал. 1989. Т.51. №6. С.3-14.

18. Заварзин Г.А. Развитие микробных сообществ в истории земли // Проблемы до антропогенной эволюции биосферы. М.: Наука. 1993. С. 112-222.

19. Иванов Д.Н., Лернер Л.А. Атомно-адсорбционный метод определения микроэлементов в почвах и растениях // Под ред. д. с/х. н. проф. Важенина Г.И. М.: Колос. 1974.

20. Ионы металлов в биохимических системах // Под ред. X. Зигеля. М.: Мир. 1982. 168 с.

21. Количественный электронно-зондовый микроанализ. Под ред. Скотт В., Г. Лав // М. Мир. 1971. 260 с.

22. Кораго A.A. Введение в биоминералогию. С-Пб.: Недра. 1992. 280 с.

23. Красильников Н.А. Лучистые грибки. М.: Изд-во Наука. 1970. 531 с.

24. Кузнецов С.И., Дубинина Г.А. Методы изучения водных организмов. М.: Наука. 1989. 288с.

25. Лутаускас А.Ю., Микульскене А.И., Шляужене Д.Ю. Каталог мик-ромицетов биодеструкторов полимерных материалов. М.: Наука. 1987.338 с.

26. Новицкий Ю.И. Магнитная восприимчивость корней бобов, выросших в постоянном магнитном поле / Магнитное поле в медицине. Фрунзе. 1974. С.136-138.

27. Овсянников В.М. Геоэкология: магнитобиогеохимические методы исследования окружающей среды. // Научные и технические аспекты охраны окружающей среды. Под. ред. Ю.М Арский. М. 1999. С. 229.

28. Осипов Г.А. Способ определения родового (видового) состава ассоциаций микроорганизмов. Патент РФ №2086642, Класс С12К 1/00, 1/20, С12С>, 1/04, Опубликовано 10.08.97. Бюллетень №22. По заявке №057595/13 от 24.12.93.

29. Осипов Г.А., Назина Т.Н., Иванова А.Е. Изучение видового состава микробного сообщества заводняемого нефтяного пласта методом хромато-масс-спектрометрии // Микробиология. 1994. Т.63. Вып. 5. С.876-882.

30. Павлович С.А. Магниточувствительность и магнитовосприимчи-вость микроорганизмов. М.: Наука и техника. 1985. 110 с.

31. Панников Н.С. Кинетика роста микроорганизмов. М.: Наука. 1992.311с.

32. Перельман А.И. Геохимия. М.: Высшая школа. 1989. 528с.

33. Пидопличко Н.М. Грибная флора грубых кормов. Киев.: Изд-во Академии Наук Украинской ССР. 1953. 485 с.

34. Сергеева Н.Е. Введение в электронную микроскопию минералов // М. Изд-во МГУ. 1977. 144 с.

35. Сигалевич П.А. Состав популяций магнитотропных бактерий из различных источников //Микробиология. 1991. Т.60. Вып.1. С. 184-187.

36. Сигалевич П.А., Кузнецов A.A. Распространенность магнитотропных бактерий // Изв. АН СССР. Сер. биол. 1986 №5 С.797-800.

37. Слободкин А.И., Ерощев-Шак В.А., Кострикина H.A., Лаврушин

38. B.Ю., Дайняк Л.Г., Заварзин Г.А. Образование магнетита термофильными анаэробными микроорганизмами // Микробиология. 1995. № 5.1. C.694—697.

39. Успенский Е.Е. Физико-химические условия среды как основа микробиологических процессов // М. Изд-во Академии наук СССР. 1963. 259 с.

40. Справочник физических констант горных пород // Под ред. С. Кларка. М.: Мир. 1969. 543 с.

41. Турова Е.С., Осипов Г.А. Изучение структуры микробного сообщества, активного в биотрансформации минералов железа в каолине // Микробиология. 1996. Т.65. №5. С.682-689.

42. Филина Н.Ю. Биология и экология бактерий, образующих магнито-упорядоченные соединения железа // Автореферат на соискание степени к. б.н. М. 1998. 24 с.

43. Червинец В.М., Новицкий Ю.И., Павлович С.А. Магнитная восприимчивость микроорганизмов // Журнал гигиен., эпидемиол., микро-биол и иммунол. 1979. № 3.230 с.

44. Чухров Ф.В., Ермилова Л.И., Горшков А.И. и др. Экспериментальные данные об условиях образования окислов железа // Гипергенные окислы железа в геологических процессах. М.: Наука. 1975. с 11-33.

45. Шабарова З.А., Богданов А.А., Золотухин А.С. Химические основы генетической инженерии. М.: МГУ. 1994. С. 73-78.

46. Adamkewicz V.W., Authier A., Dumont S., Garzon S., Leduc S., Mor-ency D., Nakhostin N., Strykowski H. A simple procedure for enriching and cultivating magnetic bacteria in low agar-mud medium // J. of Mi-crob. Methods. 1991. V.13. P.255-258.

47. Andersen N. S., Rippeis B. Diagenesis of magnetic minerals in the recent sediments of eutrophic like. // Limnol. and Oceanogr. 1988. 33. №6. pt.2. p. 1476-1492.

48. Archibald F. Lactobacillus plantarum an organisms not requiring iron // FEMS Microbiol. Lett. 1983. V.19. №1. P.29-32.

49. Barksdale L. Corynebacterium diphtherial and its relative // Bacter. Rev. 1970. V.34. №4. P.378-422.

50. Bazylinski D.A. Heywood R.B., Mann S., Frankel R.B. Fe304 and Fe3S4 in a bacterium//Nature. 1993b. №366. P.218.

51. Bazylinski D.A. Moskowitz B.M. Microbial biomineralization of magnetic iron minerals: microbiology, magnetism and environmental significance // Review in Mineralogy. Ed. By Jill Banheld, K.N. Nealson. V.35. P. 181-223.

52. Bazylinski D.A. Structure and function of the bacterial magnetosome // ASMNews. 1995. №61. P.337-343.

53. Bazylinski D.A., Frankel R.B., Garratt-Reed A.J., Mann S. Biomineralization of iron sulfides in magnetotactic bacteria from sulfidic environments. In Frankel R.B., Blakemore R.P. (eds) // Iron Biominerals. Plenum Press. New York. 1990. P.239-255.

54. Bazylinski D.A., Frankel R.B., Jannasch H.W. Anaerobic magnetite production by a marine magnetotactic bacterium // Nature. 1988. V.334. №6182. P.518-519.

55. Bell P.E. Mills A.L., Hermann S. Biogeochemical conditions favouring magnetite formations during anaerobic iron reduction. // Appl. And Environ. Microbiol. 1987. V.53. №11. P.2610-2616.

56. Berner R.A. Thermodynamic stability of sedimentary iron sulfides // Amer. j. sci. 1967. V.265. № 9. P.775-785.

57. Blakemore R.P. Blakemore N.A. Magnetotactic magnetogens // Iron Biominerals. Plenum Press. New York. 1990. P.51-67.

58. Blakemore R.P. Frankel R.B. Magnetic navigation in bacteria I I Sei. Am. 1981. V.245.№6.P. 58-65.

59. Blakemore R.P. Magnetotactic bacteria // Ann. Rew. Microbiol. 1982. V36. P.217-238.

60. Blakemore R.P. Magnetotactic bacteria // Science. 1975. V.190. №4212. P.377-379.

61. Blakemore R.P., Blakemore N.A., Bazylinski D.A., Moench T.T. Magnetotactic bacteria // Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. 1989. P.1882-1889.

62. Blakemore R.P., Frankel R.B., Kalmijn A.J. South-seeking magnetotactic bacteria in the southern in hemisphere // Nature. 1980. №236. P.384-385.

63. Blakemore R.P., Maratea D., Wolfe R.S. Isolation and pure culture of a freshwater magnetic spirillum in chemically defined medium // J. Bacte-riol. 1979. Y.140. №2. P.720-729.

64. Blakemore R.P., Short K.A., Bazylinski D.A., Rosenblatt C., Frankel R.B. Microaerobic conditions are required for magnetite formation within Aquaspirillum magnetotacticum // Geom. J. 1981. V.4. №1.P.53-71.

65. Bobbie R.J., White D.C. Characterization of bentic microbial community structure by high resolution gas chromatography of fatty acid methyl esters // Appl Environ. Microbial. 1980. V.39. P.1212-1222.

66. Brosius J., Palmer J.L., Kennedy H.P., Noller H.F.: Complete nucleotide sequence of 16S ribosomal RNA gene from Escherichia coli. Proc. Natl. Acad. Sei. USA 75, 4801-4805 (1978)

67. Butler R.F. Banerjee S.K. Theoretical single-domain grain size range in magnetite and titanomagnetite // J. Geophys. 1975. №80. P.4049-4058.

68. Byers B.R., Arseneaux J.E.L. Microbial transport and utilization of iron // Microorganisms and minerals/ Ed. E.D. Weinberg, N.Y. Basel. Marsel: Dekker, Inc. 1977. V.3. P.215-249.

69. Carlile M.J. Zoned migration of magnetotactic bacteria // J. of Magnetism and Magn. Matter. 1987. V.67. P.1671-1680.

70. Carlile M.J., Dudeney A.W. Zonation in migrating magnetococci // J. of anaerobic microorganisms. New York: A Willey interscience publication. 1993. P.305-331.

71. Chang S-BR, Kirschvink J.L. Magnetofossils, the magnetization of sediments, and the evolution of magnetite biomineralization // Ann Rew. Earth Planet Sci. 1989. V.17. P.169-195.

72. Clark R.L. Environmental magnetism in Australia and Papua New Guinea. // EOS. 1989. November 28.

73. Coughlan M.P. The role of iron in microbial metabolism // Sci. Prog. Oxf. 1971. V.59. №233. P. 1-23.

74. Delong E.F., Frankele R.B., Bazylinski D.A. Multiple evolution origina of magnetotaxis in bacteria // Science. 1993. V.259. P.803-806.

75. Fernando N.V., Erkel G.A., Mo vat H.Z. The fine structure of connective tissues // Exp. Molec. Pathol. 1964. V.3 P.535-554.

76. Flitter W., Rowley D.A., Halliver B. Super oxide-depended formation of hydroxyl radicals in the present of iron salts. What is the physiological iron chelator? // FEBS Letters. 1983. V.158. №2. P.310-312.

77. Frankel R.B. Anaerobes pumping iron // Nature. 1987. V.330. №6145. P.208.

78. Frankel R.B. Magnetic guidance of organism // Annu. Rev. Biophys. And Bioeng. 1984. V.13. P.85-103.

79. Frankel R.B. Magnetite and magnetotacxis in bacteria and algae // Biophys. Eff. Steady Magn. Fields. Berlin. 1986. P. 173-179.

80. Frankel R.B., Bazylinski D.A., Johnson M., Taylor B.L. Magneto-aerotaxis in marine, coccoid bacteria // Biophys. J. 1997. №73. P.994-1000.

81. Frankel R.B., Blakemore R.P. Navigational compass in magnetic bacteria // J. Magn. Magnet. Mater. 1980. V. 15-18. p.m. P. 1562-1564.

82. Frankel R.B., Blakemore R.P., Torres de Araujo F.F., Esquivel D.M.S., Danon J. Magnetotactic bacteria at the geomagnetic equator // Science. 1981. V.212. № 4500. P.1259-1270.

83. Frankel R.B., Blakemore R.P., Wolfe R.S. Magnetite in freshwater magnetotactic bacteria // Science. 1979. V.203. №4387. P.1355-1356.

84. Gould J.L. Kirschvink J.L. Deffeyes K.S. Pigeons have magnets // Science. 1978. V. 201. №43.60. P.1027-1028.

85. Griffiths E. Iron in biological systems // Iron and inflection / Ed. J.J. Bullen, E. Griffiths. Chichester. New York: A Willey-Intercience Publication. 1987. P.l-25.

86. Halliwell B., Gutteridge J.M.C. Free radicals in biology and medicine. -Oxford: Clarendon press. 1985. P.346.

87. Harrison P.M. Iron Storage in bacteria // Nature. 1979. V.279. №5708. P.15.

88. Heywood R.B., Bazylinski D.A., Garratt-Reed A., Mann S., Frankel R.B. Controlled biosynthesis greigite (Fe3S4) in magnetotactic bacteria // Nature. 1990. V.77. №11. P. 133-136.

89. Ibers J.A., Holm R.H. Modeling coordination sites in metallobio-molecules // Science. 1980. V.209. №4458. P.223-235.

90. Isaac L., Ware G.C. The flexibility of bacterial cell walls // J. Appl. Bac-teriol. 1974.V.37. №3. P.335-339.

91. Jones J.G., Davison W., Gardener S. Iron reduction by bacteria: range of organisms involved and reduced // FEMS Microbiol. Lett. 1984a. V.21. №1. P.133-136.

92. Jones J.G., Gardener S., Simon B.M. Reduction of ferric iron by hetero-trofic bacteria in lake sediments // J. Gen. Microbiol. 1984b. V.130. pt.l. P.45-51.

93. Kirschvink J.L. South- seeking magnetotactic bacteria // J. Exp. Biol. 1980. №86. P.345-347.

94. Kirschvink J.L. Biogenic ferrimagnetism: a new biomagnetism 11 Bio-magnetism. Anterdisciplinary approach. New York, LondomPlenum Press. 1983. V.66.P.501-531.

95. Lepp H. Geochemistry of iron. New York: A Willey and Sons Inc. 1975.

96. Light P.A., Clegg R.A. Metabolism in iron-limited growth // Microbial iron metabolism / Ed. J.B. Neilands. New York, London: Academic press, inc. 1974. P.35-64.

97. Lins de Barros H.G.P., Esquivel D.M.S. Magnetotactic microorganisms found in muds from Rio de Janeiro // Magnetite biomineralization and magnetoreception in organisms. A new biomagnetism. New York, London: Plenum press. 1985. V.5. P. 289-309.

98. Lovley D.R. Dissimilatory Fe(III) and Mn(IV) reduction // Microbiol. Rew. 1991. V.55. P.259-287.

99. Lovley D.R. Magnetite formation during microbial dissimilatory iron reduction // Iron biominerals. New York : Plenum press. 1990. P. 151-166.

100. Lovley D.R. Microbial Fe (III) reduction in subsurface environments // FEMS Microb. Rev. 1997. V.20. P.305-313.

101. Lovley D.R. Microbial oxidation of organic matter coupled to the reduction of the Fe(III) and Mn(IV) oxides. Catena. 1992. V.21. P.101-114.

102. Lovley D.R. Organic matter mineralization with the reduction of ferric iron // Geomicrob. j. 1987c. Y.5. № 314. P.375-399.

103. Lovley D.R., Phillips EJ.P. Novel mode of microbial energy metabolism: organic carbon oxidation coupled to dissimilatory reduction of iron or manganese // Appl. Environ. Microbiol. 1988. V.54. №6. P.1472-1480.

104. Lovley D.R., Phillips E.Y.P. Reduction of uranium by Desulfovibrio desulfuricans //Appl. Environ. Microbiol. 1992. V.58. P.850-856.

105. Lovley D.R., Stolz J.F., Nord Jr.G.I., Phillips E.J.P. Anaerobic production of magnetite by a dissimilatory iron-reducing microorganism // Nature. 1987. V.330. P.252-254.

106. Lowenstam H.A. Lepidocrocite, an apatite mineral, and magnetite in teeth of chitons (Polyplacophora) // Science. 1967. V.156. P.1373-1375.

107. Lowenstam H.A. Magnetite in denticle capping in recent chitons (Polyplacophora) // Geolog. Soc. of Amer. Bui. 1962. V.73. №4. P.435-438.

108. Lowenstam H.A. Minerals formed by organisms // Science. 1981. V.211. P.1126-1131.

109. Lowenstam H.A., Weiner S. On the biomineralization. New York. Oxford. Univ. Press. 1989. P.324.

110. Lundren D.G. Dean W. Biogeochemistry of iron // Biogeochemical cycling of mineral forming elements. Amsterdam: Elsevier. 1979. P.211251.

111. Lundren D.G., Dean W. Biogeochemistry of iron // Biogeochemical cycling of mineral forming elements. Amsterdam : Elsevier. 1979. P.211-251.

112. Maher B.A. Inorganic formation of ultrafine-grained magnetite. In Frankel R.B., Blakemore R.P. (eds) // Iron Biominerals. Plenum Press. New York. 1990. P. 179-192.

113. Mann S. On the nature of boundare-organised biomineralization // J. Inorg. Chem. 1986. №28. P.263-971.

114. Mann S., Sparks N.H.C., Board R.G. Magnetotactic bacteria: microbiology, biomineralization, paleomagnetism, end biotechnology // Advan. In Microb. Physiol. 1990a. Y.31. P.125-181.

115. Mann S., Sparks N.H.C., Frankel R.B., Bazylinski D.A., Jannasch H.W. Biomineralization of ferromagnetic greigite (Fe3S4) and iron pyrite (FeS2) in magnetotactic bacteria // Nature. 1990b V.343 № 6255. P.258-261.

116. MannS., Sparks N.H.C., Couling S.B., Larcombe M.C., Frankel R.B. Cristallochemical characterization of magnetic spinels prepared from aqueous solution // J. Chem. Soc. Faraday Trans. 1989. V.85 P.3033-3044.

117. Maratea D., Blakemore R.P. Aquaspirillum magnetotacticum sp. nov. a magnetic spirillum // Internat. j of System. Bacteriol. 1981. V.31. №4. P.452-455.

118. Matitashvili E.A., Natojan D.A., Gendler T.S., Terzghalia T.V., Adamia R.S. Magnetotactic bacteria from freshwater lakes in Georgia // J. Bas. Microbiol. 1992. V.32. №3. P.185-192.

119. Matsunaga T., Tadakoro F., Nakamura N. Mass culture of magnetic bacteria and their application to flow type immunoassays // IEEE trans, on. magn. 1990. V.26. №5. P.1557-1559.

120. Moench T.T., Konetzka W.A. A novel method for the isolation and study of a magnetotactic bacterium // Arch. Microbial. 1978. V.119. №2. P.203-212.

121. Murray J.M. Iron oxides // Marine minerals . Washington : D.C. Mineral. Soc. Amer. 1979. P.47-98.

122. Myers C.R., Nealson K.N. Iron Mineralization by bacteria: metabolic coupling of iron reduction to cell metabolism in Alteromonas putrefaciens MR-1. In Frankel R.B., Blakemore R.P. (eds). // Iron Biominerals. 1990. P.131-149. Plenum Press. New York.

123. Nakamura N., Matsunsga T. Use of bacteria for biosensing // Chem. Sensor Technol. 1989. V.2 P. 255-267.

124. Nealson K.H., Myers C.R. Iron reduction by bacteria: a potential role in genesis of banded iron formation // Amer. j. Sci. 1990. V.290. P. 35-45.

125. Nealson K.N. The microbial iron cycle // Microb. Geochem. London: Blackwell. 1983. P. 159-190.

126. Neilands J.B. Chemistry of iron in biological systems // Advan. Microb. Physiol. (Advaces in experimental medicine and biology)./ Ed. S.K. Dhar. New York, London: Plenum Press. 1973. V.40. P.13-42.

127. Neilands J.B. Iron absorption and transport in microorganisms // Ann. Rev. Nutr. 1981. V.l. P.27-46.

128. Neilands J.B. Iron and its role in microbial Physiology // Microbial iron metabolism / Ed. J.B. Neilands. New York, London: Academic press. 1974. P.4-31.

129. Neilands J.B. Sederofores: biochemical ecology and mechanism of iron transport in enterobacteria// Adv. Chem. Ser. 1977. V.162. P.3-32.

130. Nichols P.D., Mancuso C.A., White D.C. Measurement of methanotroph and methanogen signature phospholipids for use in assessment of biomass and community structure in model system // Org. Geochem. 1987. V.ll. №6. P.451-462.

131. Oberhack M., Sussmuth R., Frank H. Magnetotactic bacteria from freshwater // J. Naturforch. 1987. C.42. №3. P. 300-306.

132. Ofer S., Nowik I., Bauminger E.R., Papaefthymion G.C., Frankel R.B., Blakemore R.P. Magnetosome dynamics in magnetic bacteria // Boiph. J. 1984. V.46. №1. P.57-64.

133. Oldfield F. The source of fine-grained in sediments // Holocene. 1992. V.2. P.180-182.

134. Osipov G.A., Turova E.S. Studying species composition of microbial communities with the us of gas chromatography-mass spectrometry. Microbial community of kaolin // FEMS Microbial. Rev. 1997. V.20. P.437-446.

135. Paoletti L.S., Blakemore R.P. Iron reduction by Aquaspirillum magneto-tacticum // Current Microbiol. 1988. Y.17. №6. P.339-342.

136. Peterson N., Dobeneck T., Vali H. Fossil bacterial magnetite in deep-seq sediments from the south Atlantic Ocean // Nature. 1986. V.320. P.611.

137. Reynolds E.S. The use of lead citrate at height pH as an electron-cpaque stain in electron microscopy // J. Cell. Bioll. 1963. V.17. №1. P.208-211.

138. Rickard D.T. The chemistry of iron formation at low temperatures // Stockholm Contrib. Geol. 1969b. №20. P.67-95.

139. Sakaguchi T., Burgess J.G., Matsunaga T. Magnetite formation by a sulphate-reduction bacterium // Nature. 1993. V.365. P.18-22.

140. Schuler D., Kohler M. The isolation of new magnetic spirillum // Zbl. Microbiol. 1992. V.142. №1-2. P.150-151.

141. Sorensen T. A method of establishing groups of equal amplitude in plant sociology based on similarity of species content and application to analyses of the vegetation on Danish Conmons // Biol. Skr. 1948. № 55. 3. P.1-34.

142. Spring S., Amann R., Ludwig W., Schlefer K.H. Gemerden H., Petersen N. Dominating role of an unusual magnetotactic bacterium in the mi-croaerobic zone of a freshwater sediment // Appl. and Environ. Microbiol. 1993. V.59. №8. P.2397-2403.

143. Stackebrandt E., Goebel B.M. Taxonomic note: A place for DNA-DNA reassociation and 16S rRNA sequence analysis in the present speciesdefinition in bacteriology.// Int. J. Syst. Bacteriol. 1994, V. 44. N 4. P.846-849.

144. Stolz J.F. Magnetic bacteria and the microbial iron cycle // Trends in Microbial Ecol. 1993b. P.441-444.

145. Stolz J.F. Magnetosomes // J. of Gen. Microbiol. 1993a. V.139. P.1663-1670.

146. Stolz J.F. Magnetotactic bacteria: biomineralization, ecology, sediment magnetism, environmental indicator // In biomineralization processes of iron and manganese. Braunschweig: Catena. 1992. P. 133-145.

147. Stolz J.F., Chang S.B.R., Kirshving J.L. Magnetotactic bacteria and singledomain magnetite in hemipelagic sediments //Nature. 1986. V.321. №6073. P.849-850.

148. Surr A.R. A low-viscosity epoxy resin embedding medium for electron microscopy // J. Ultrastruct. Res. 1969. V.26. P.31-43.

149. Thompson, J.D., Higgins, D.G., Gibson, T.J. CLUSTALW: improving the sensitivity of progressive multiple sequence alignmentthrough sequence weighting, positions-specific gap penalties and weight matrixchoice. Nucleic Acids Research. 1994. 22:4673-4680.

150. Tonomura A., Matsuda T., Tanabe M., Osakabe N., Endo J., Fukuhara A., Shinagawa K., Fujuwara H. Electron holography technique for investigating thin ferromagnetic films // Phys. Rev. B. 1982. V.25. № 11. P.6799-6804.

151. Towe K.M., Lowenstam H.A. Ultrastructure and development of iron mineralization stelleri (Mollusca) // J. Ultrast. Research. 1967. V.17. №1. P.l-13.

152. Van de Peer Y., De Wächter R. TREECON for Windows: a software package for the construction and drawing of evolutionary trees for the-106

153. Mierosoft Windows environment // Comput. Applic. Biosci. 1994. V. 10. P. 569-570.

154. Walcott C., Gould J.L. Kirschvink J.L. Bees have magnetic remanence // Science. 1978. V.205. №4410. P.1026-1028.

155. Walker M.M., Kirschvink J.L., Kobayashi-Kirschvink A. A mathematical model for magnetic navigation by animals // Biophys. Eff. Steady. Magn. Fields Proc. Berlin: Springer. 1986. Vll. P.207-211.

156. Weiberg E.D. Cellular regulation of iron assimilation // The quarterly review of biology. 1989. V.64. №3. P.261-290.

157. Weinberg E.D. Biosynthesis of secondary metabolites: role of trace metals // Advanced in microbial physiology / Ed. A.H. Rose, J.E. Wilkinson. London, New York: Academic press. 1970. V.4. P. 1-44.

158. Wolfe R.S. Iron and manganese bacteria // Principles and application in aquatic microbiology. New York : Willey & Sons. 1963. P. 82-97.

159. Yoch C.D., Carithers R.P. Bacterial iron-sulfur proteins // Microbial Rev. 1979. V.43. №3. P.384-421.

160. Zoeger J., Dunn J.R., Fuller M. Magnetic material in the head of the common pacific dolphin// Science. 1981. V.213. №4510. P.892-894.

161. СИСТЕМАТИКА МАГНИТОТАКТИЧЕСКИХ БАКТЕРИЙ Aquaspirillum masnetotacticum sp.nov. MS-1 Maratea, Blakemore, 1981.

162. Каждая клетка содержит окруженные бислойной мембраной кристаллы магнетита магнетосомы. Они кубооктаэдрической формы со сторонами 40-50 нм, собраны в одну или несколько линейных цепей. Число магнетосом в цепи

163. Обитает на границе ил вода в пресных и морских железосодержащих осадках, имеющих низкие значения окислительно-восстановительного потенциала.

164. Bilophococcus magnetotacticus gen. nov. sp. nov.

165. Moench,Konetzka, 1978; Moench, 1988.

166. Обитают в микроаэробных осадках пресных водоемов (либо близко к поверхности донных осадков или в их верхнем слое), предпочтение отдают се-диментам с высоким содержанием соединений серы. В чистой культуре пока не выделены Moench,1988.

167. Описанные ниже штаммы МТБ в Определитель бактерий Берги не вошли.

168. Magnetospirillum grvphiswaldence sp. now. MSR-1 Schleifer et al.,1991.

169. Бактерии были выделены из осадка эвтрофированной реки.

170. Штамм MG-Tl Matsunaga et al., 1990.

171. Штамм MV-1 Bazylinski et al.,1988.

172. Штамм RS-1 Sakaguchi et al.,1993.