Локализация в политенных хромосомах Drosophila melanogaster некоторых trans- регуляторных факторов транскрипции тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.00.15, кандидат биологических наук Котликова, Ирина Витальевна

• Котликова, Ирина Витальевна
• кандидат биологических наук
• 2003

Оглавление диссертации кандидат биологических наук Котликова, Ирина Витальевна

Введение.

Глава 1. Организация хроматина и регуляция транскрипции у дрозофилы (обзор литературы).

1.1 Структура интерфазного хроматина, ремоделинг и транскрипция.

1.1.1 АТФ-зависимая мобилизация нуклеосом.

1.1.2 "Язык" ковалентных гистоновых модификаций.

1.1.3 ДНК-связывающие транскрипционные факторы и коактиваторы транскрипции.

1.1.4 Политенная хромосома как модель интерфазной.

1.2 Дозовая компенсация - уникальный пример хромосомоспецифичной регуляции транскрипции.

1.2.1 Феномен дозовой компенсации.

1.2.2 Гены дозовой компенсации у дрозофилы.

1.2.3 Комплекс дозовой компенсации.

1.2.4 Предполагаемые механизмы действия комплекса дозовой компенсации.

1.2.5 Почему X?.

1.2 .6 Сборка и распространение комплекса дозовой компенсации по Х-хромосоме.

1.2.7 Эволюция MSL - комплекса.

1.3 Broad Complex - ключевой транскрипционный фактор метаморфоза дрозофилы.

1.3.1 Вг-С - ключевой ген метаморфоза дрозофилы.

1.3.2 Молекулярная организация локуса. Белки BR-C.

1.3.3 Br-С и регуляция метаморфоза. Предполагаемые механизмы.

1.3.3.1 Экспрессия гена.

1.3.3.2 Корреляция между генетическими функциями гена и белковыми изоформами BR-С.

1.3.3.3 Br-С и транскрипция регулируемых генов.

1.3.3.4 Роль продуктов гена Br-С в некоторых процессах метаморфоза.

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Локализация в политенных хромосомах Drosophila melanogaster некоторых trans- регуляторных факторов транскрипции»

Транскрипция ДНК - сложнейший процесс, осуществляемый в интерфазном ядре. В настоящее время у эукариот выявлено и биохимически охарактеризовано большое количество полипептидов, непосредственно связанных с работой РНК-полимеразного комплекса. Однако in vivo ситуация более сложная, так как должна решаться проблема корректного взаимодействия РНК-полимеразы с ДНК-матрицей, организованной у эукариот в виде сложной хроматиновой структуры. Решение данной проблемы, по-видимому, заключено в функциях специфических белковых факторов, взаимодействующих с определенными последовательностями ДНК в промоторных областях генов и/или ремоделирующих и модифицирующих хроматин локально и на протяжении значительных участков. Предполагается, что суммарное действие этих факторов в ядре обеспечивает время- и местоспецифичность процесса транскрипции.

К сожалению, наши знания о механизмах действия этой обширной группы белков и их взаимодействиях друг с другом и РНК-полимеразной машиной остаются неполными, несмотря на наблюдаемый в последние годы прорыв в данной области исследований.

Дрозофила является одним из наиболее удобных модельных объектов для изучения транскрипционного процесса у эукариот. Это обусловлено, с одной стороны, достаточно обширной базой накопленных данных, касающихся организации генома, с другой -неплохой изученностью функций и взаимодействий многих генов и их роли в таких сложных биологических процессах, как эмбриогенез, метаморфоз, определение пола, ответ на стресс и т.д. Кроме того, дрозофила, как и другие представители отряда двукрылых, характеризуется наличием в ряде личиночных тканей уникальных многонитчатых интерфазных хромосом, цитологические работы с которыми позволяют in situ локализовать на хромосоме определенную последовательность ДНК и определить область взаимодействия исследуемого белка относительно видимых хроматиновых структур или районов локализации других белков. Это дает исследователям мощный инструмент для изучения роли транс-регуляторных белков в глобальных изменениях транскрипционной активности, имеющих место в таких процессах, как дозовая компенсация или гормональная индукция метаморфоза дрозофилы.

Целью данной работы было выявление закономерностей распределения в политенных хромосомах дрозофилы транс-регуляторных белков BR-C - продуктов ключевого гена экдизонового каскада, и белков MSL (Male-Specific-Lethal), обеспечивающих гипер-транскрипцию Х-хромосомы гетерогаметного пола дрозофилы. Для понимания роли разных белков группы BR-C в процессе гормонально-индуцируемого изменения транскрипционной активности в ходе метаморфоза мы предполагали исследовать стадия- и локус-специфичные особенности связывания этих белков с хроматином. Анализ локализации в хромосомах белков MSL в норме и под воздействием определенных 4 факторов был направлен на решение некоторых вопросов, касающихся Х-специфичного взаимодействия комплекса с хроматином и его участия в регуляции транскрипции X-сцепленных генов.

Были поставлены следующие конкретные задачи:

1) Провести анализ локализации белков Broad-Complex в политенных хромосомах личинок третьего возраста и в момент формирования пупариума с использованием антител против домена, общего для всех белков данной группы, и против доменов, характеризующих отдельные изоформы.

2) Выяснить, коррелирует ли экдизон-нечувствительный период на стадии предкуколочного развития с временной утратой связи белков Broad-Complex с хроматином.

3) Проанализировать этапы взаимодействия белков MSL с сайтами-мишенями на X-хромосоме в условиях наличия в ядре нефункционального комплекса или сниженных количеств функциональных белков.

4) Исследовать случаи аутосомного связывания белков комплекса дозовой компенсации (ДК) и факторы, влияющие на данный тип взаимодействия белков MSL с хроматином.

5) Сравнить паттерны локализации в хромосомах белков комплекса дозовой компенсации, белков ISWI и JIL1, задействованных в реорганизации хроматина в ходе транскрипции, и гистона Н4, ацетилированного по 16-му остатку лизина.

6) Проанализировать распределение в политенных хромосомах самцов и самок дрозофилы РНК-геликазы MLE.

Научная новизна. Впервые проведен анализ распределения разных изоформ BR-C в политенных хромосомах слюнных желез D. melanogaster с использованием антител против разных доменов белков этой группы. Показано, что в состав хроматина политенных хромосом даной ткани входят все известные формы белков BR-C. Характер распределения по хромосомам белков данной группы предполагает их участие в регуляции транскрипции большинства генов, активных в ходе метаморфоза.

Цитологически подтверждено существование на Х-хромосоме сайтов повышенной аффинности к комплексу ДК. Получены данные, свидетельствующие об основной роли данных сайтов на первых этапах взаимодействия комплекса с Х-хромосомой. Выдвинуто предположение, что дальнейшее распространение комплекса по целой хромосоме не является простейшим последовательным сайт за сайтом связыванием с районами, расположенными рядом с сайтами его первичной нуклеации.

Проведен полный анализ аутосомной локализации белков MSL. На основании полученных результатов сделан вывод о наличии на всех хромосомах множества сайтов, аффинных к анализируемому белковому комплексу. Количество комплексов ДК в ядре, повидимому, является критичным для корректного, хромосомо-специфичного, взаимодействия с хроматином.

Впервые проанализирована локализация комплекса ДК относительно транскрипционно-активных районов Х-хромосомы и относительно сайтов локализации белков J1L1 hISWI.

Практическая ценность. Проведенные исследования локализации в политенных хромосомах дрозофилы белков BR-C и комплекса ДК позволяют решить некоторые вопросы, касающиеся механизма действия транскрипционных факторов, участвующих в регуляции экспрессии множества генов в экдизоновом каскаде и в хромосомо-специфичной регуляции генов у самцов дрозофилы. Полученная информация важна в понимании функций белковых комплексов, отвечающих за глобальные процессы генной регуляции у эукариот. Апробация работы. Основные результаты данной работы были представлены в стендовых сообщениях на Всероссийском симпозиуме по структуре и функциям клеточного ядра, (1921 октября 1999г., Санкт-Петербург, Россия); на Международном симпозиуме по исследованию инактивации Х-хромосомы у млекопитающих (6-12 сентября 1999г., Новосибирск, Россия); на 14th International Chromosome Conference (4-8 сентября 2001г., Wiirzburg, Germany); на отчетной сессии Института цитологии и генетики СО РАН (2002). Публикации.

1. Alekseyenko А.А., Belyaeva E.S., Demakova O.V., Kotlikova I.V., Noethiger R., Zhimulev I.F. Dosage compensation and manifestation of intercalary heterochromatin characteristics in polytene chromosomes of Drosophila melanogaster !h Abstracts of International Symposium on X chromosome Inactivation in Mammals - Novosibirsk. 1999. P. 94-95.

2. Котликова И.В., Демакова O.B., Жимулев И.Ф. Особенности локализации белков дозовой компенсации на политенных хромосомах Drosophila melanogaster // Цитология. 2000. Т. 42. С. 288-289.

3. Алексеенко А.А., Беляева Е С., Демакова О.В., Котликова И.В., Жимулев И.Ф. Явление дозовой компенсации и проявление свойств интеркалярного гетерохроматина в политенных хромосомах Drosophila melanogaster II Цитология. 2000. Т. 42. С. 256-257.

4. Похолкова Г.В., Демакова О.В., Котликова И.В., Мюга Б., Перроне Ф., Гонзи-Требуль Г., Беляева Е.С., Лепезант Ж.А., Жимулев И.Ф. Изменение активности пуфов у мутантов по Broad-Complex ключевому гену в каскаде генной активности, индуцированной стероидным гормоном экдизоном у дрозофилы. Цитология. 2000. Т. 42. С. 302.

5. Kotlikova I.V., Demakova O.V., Kelley R.L., Kuroda M.I., Zhimulev I.F. The spreading of Dosage Compensation Complex (DCC) on the X-chromosome of Drosophila melanogaster!I Chromosome Research. 2001. V. 9, SI, P. 123.

6. Alekseyenko A.A., Demakova O.V., Belyaeva E.S., Makarevich G.F., Kotlikova I.V., Nothiger R., Zhimulev I.F. Dosage compensation and intercalary heterochromatin in X chromosomes of Drosophila melanogaster II Chromosoma. 2002. V. 111 (2). P. 106-113

7. Gonzy G., Pokholkova G.V., Peronnet F., Mugat В., Demakova O.V., Kotlikova I.V., Lepesant J. A., Zhimulev I.F. Isolation and characterization of novel mutations of the Broad-Complex, a key regulatory gene of ecdysone induction in Drosophila melanogaster II Insect. Biochem. Mol. Biol. 2002. V.32(2). P. 121-132

8. Demakova О. V., Kotlikova I. V., Gordadze P. R., Alekseyenko A. A., Kuroda M. I., Zhimulev I. F. The MSL complex levels are critical for its correct targeting to the chromosomes in Drosophila melanogaster II Chromosoma. 2003. V. 112 (3). P.

Объем работы. Диссертация состоит из введения, обзора литературы, описания материалов и методов, результатов, обсуждения, а также выводов и списка цитируемой литературы, в который входит 263 ссылки. Работа изложена на 149 страницах машинописного текста, содержит 33 рисунка и 11 таблиц.

Заключение диссертации по теме «Генетика», Котликова, Ирина Витальевна

Выводы:

1. Показано, что в ядрах слюнной железы личинок третьего личиночного возраста представлены все изоформы белков BR-С. Характер локализации изоформ Zl, Z3 и Z4 в политенных хромосомах предполагает их совместное действие в регуляции транскрипции множества генов в ходе метаморфоза личинки в имаго.

2. Обнаружено, что на стадии предкуколки белки BR-С демонстрируют типичный паттерн распространения в хромосомах. Таким образом, резистентность слюнных желез к воздействию гормона между основными экдизоновыми пиками не связана с утратой хроматином данной группы транскрипционных факторов.

3. Сравнительный анализ сайтов связывания белков ДК позволил заключить, что связывание и распространение комплекса в Х-хромосоме определяется различной аффинностью отдельных районов к белкам MSL: это относится как к сайтам первичной нуклеации комплекса, так и ко всем остальным районам.

4. Показано, что на всех хромосомах существует значительное число районов, компетентных к связыванию с белками MSL. Выдвинуто предположение, что Х-хромосома конкурирует с аутосомными районами за белки ДК и для взаимодействия комплекса с последними необходимо избыточное количество белков MSL в ядре.

5. Анализ распространения в Х-хромосоме гистона H4AcLysl6, ISWI и JIL1 показал неполное перекрывание паттернов локализации данных белков и комплекса MSL. Полученные данные свидетельствуют, в частности, о том, что белки ДК взаимодействуют не со всеми транскрипционно-активными районами Х-хромосомы.

6. Геликаза MLE в ядрах самцов и самок дрозофилы взаимодействует с множеством транскрипционно-активных районов всех хромосом независимо от других белков комплекса ДК.

Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Котликова, Ирина Витальевна, 2003 год

1. Ананьев Е.В., Барский В.Е. Электронно-микроскопическая карта политенных хромосом слюнных желез дрозофилы (D. melanogaster) IIМ.: Наука, 1985.

2. Власова И.Е., Умбетова Г.Х., Беляева Е.С., Жимулев И.Ф. Выявление транскрипционно // активных районов в политенных хромосомах Drosophila melanogaster методомиммунофлуоресцентной локализации гибридов ДНК-РНК // Генетика. 1985. Т. 21. N 3. С. 424-432.

3. Власова И.Е., Умбетова Г.Х., Циммерман В.Г. и др. Иммунофлуоресцентная локализация гибридов ДНК-РНК в политенных хромосомах Drosophila melanogaster // Доклады АН СССР. 1984. Т. 274, N 1. С. 189-192.

4. Жимулев И.Ф. Политенные хромосомы: морфология и структура // Новосибирск: Наука, 1992.

5. Жимулев И.Ф. Хромомерная организация политенных хромосом // Новосибирск: Наука, 1994.

6. Колесникова Т.Д., Коряков Д.Е., Семешин В.Ф., Беляева Е.С., Жимулев И.Ф. Межлинейные различия в морфологии прицентромерного района политенной X-хромосомы в слюнных железах Drosophila melanogaster II Генетика. 2001. Т.37. N.12. С. 1632-1641.

7. Умбетова Г.Х. Иммунофлуоресцентная локализация транскрипционно активных районов в политенных хромосомах Drosophila melanogaster // Дис. канд. биол. наук. -Новосибирск, 1991

8. Aalfs J. D., Kingston R. E. What does chromatin remodeling mean? // Trends Biochem Sci. 2000. Nov; V. 25 (11). P. 548-55.

9. Akhtar A., Becker P. B. Activation of transcription through histone H4 acetylation by MOF, an acetyltransferase essential for dosage compensation in Drosophila // Mol. Cell. 2000.V. 5(2). P. 367-75.

10. Akhtar A., Zink D., Becker P.B. Chromodomains are protein-RNA interaction modules.// Nature 2000. V. 407(6802) P. 405-409

11. Amrein H. Multiple RNA-protein interactions in Drosophila dosage compensation // Genome Biol. 2000. V. 1(6) p,

12. Amrein H., Axel R. Genes expressed in neurons of adult male Drosophila // Cell 1997. V. 88(4). P.459-469

13. Anderson S.F., Schlegel B.P., Nakajima Т., Wolpin E.S., Parvin J.D. BRCA1 protein is linked to the RNA polymerase II holoenzyme complex via RNA helicase A // Nat. Genet. 1998. V. 19(3). P. 254-6

14. Andres A.J., Thummel C.S. Hormones, puffs and flies: the molecular control of metamorphosis by ecdysone.// Trends Genet. 1992 V.8(4). P. 132-138131

15. Andres A.J., Fletcher J.C., Karim F.D., Thummel C.S. Molecular analysis of the initiation ofinsect metamorphosis: a comparative study of Drosophila ecdysteroid-regulated transcription // Dev. Biol. 1993. V. 160(2). P.388-404

16. Andrulis E.D., Guzman E., Doring P. et al. High resolution of Drosophila Spt5 and Spt6 at heat shock genes in vivo: roles in promoter proximal pausing and transcription elongation // Genes & Development. 2000. V. 14. P. 2635-2649.

17. Angelov D., Vitolo J.M., Mutskov V., Dimitrov S., Hayes J.J. Preferential interaction of the core histone tail domains with linker DNA // Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2001. V. 98(12). P. 6599-604

18. Aratani S., Fujii R., Oishi Т., Fujita H., Amano Т., Ohshima Т., Hagiwara M., Fukamizu A., Nakajima T. Dual roles of RNA helicase A in CREB-dependent transcription // Mol. Cell. Biol. 2001. V. 21(14). P. 4460-9 л/^

19. Armstrong J.A., Emerson B.M. Transcription of chromatin: these are complex times // Curr. Opin. Genet. Dev. 1998. V.8(2). P. 165-72. Review.

20. Ashburner M. Puffing patterns in Drosophila melanogaster and related species // in: Results and problems of cell differentiation, Berlin, Heidelberg, New York, Springer, 1972, V.4. P. 101-151.

21. Ashburner M., Bonner J.J. The induction of gene activity in drosophilia by heat shock // Cell 1979Jun;V. 17(2). P. 241-54

22. Ashburner M., Chihara C., Meltzer P., Richards G. Temporal control of puffing activity in polytene chromosomes // Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol. 1974 V. 38. P. 655—662

23. Austin R.J., Biggin M.D. Purification of the Drosophila RNA polymerase II general transcription factors // Proc Natl Acad Sci U S A 1996. V. 93(12). P. 5788-92

24. Badenhorst P., Voas M., Rebay I., Wu C. Biological functions of the ISWI chromatin remodeling complex NURF // Genes Dev. 2002. V. 16(24). P. 3186-98

25. Baker B.S., Gorman M., Marin I. Dosage compensation in Drosophila // A. Rev. Genet. 1994 V. 28. P. 491-521

26. Bashaw G.J., Baker B.S. The msl-2 dosage compensation gene of Drosophila encodes a putative DNA-binding protein whose expression is sex specifically regulated by Sex-lethal // Development 1995. V. 121(10). P. 3245-58.

27. Bashaw G.J., Baker B.S. Dosage compensation and chromatin structure in Drosophila // Curr. Opin. Genet. Dev. 1996. V. 6(4). P. 496-501

28. Bashaw G.J., Baker B.S. The regulation of the Drosophila msl-2 gene reveals a function for Sex-Lethal in translational control // Cell 1997. V. 89(5). P. 789-98

29. Bayer C.A., Holley В., Fristrom J.W. A switch in broad-complex zinc-finger isoform expression is regulated posttranscriptionally during the metamorphosis of Drosophila imaginal discs // Dev. Biol. 1996 V. 177(1). P. 1-14

30. Bayer C.A., von Kalm L., Fristrom J.W. Relationships between protein isoforms and genetic functions demonstrate functional redundancy at the Broad-Complex during Drosophila metamorphosis // Dev. Biol. 1997 V. 187(2). P. 267-282

31. Belote J.M., Lucchesi J.C. Male-specific lethal mutations in Drosophila melanogaster // r Genetics 1980. V. 96(1). P. 165—Щ- ^

32. Belyaeva E.S., Aizenzon M.G., Semeshin V.F., Kiss I.I., Koczka K., Baritcheva E.M., Gorelova ^ T.V., Zhimulev I.F. Cytogenetic analysis of the 2B3-4?2B11 region of the X-chromosome of ¥

33. Belyaeva E.S., Vlassova I.E., Biyasheva Z.M., Kakpakov V.T., Richards G., Zhimulev I.F. ^ Cytogenetic analysis of the 2B3-4-2B11 region of the X chromosome of Drosophila^ melanogaster // Chromosoma 1981. V. 84(2). P. 207-219 |

34. Bernstein M., Cline T.W. Differential effects of Sex-lethal mutations on dosage compensation ^ early in Drosophila development // Genetics 1994. V. 136(3). P.1051-61 ^

35. Bhadra U., Pal-Bhadra M., Birchler J.A. Role of the male specific lethal (msl) genes in \ modifying the effects of sex chromosomal dosage in Drosophila // Genetics 1999. V. 152(1). P. 1 249-68 ^

36. Bienz M., Muller J. Transcriptional silencing of homeotic genes in Drosophila // Bioessays Л 1995. V. 17(9). P. 775-84 ^

37. Bjorklund S., Almouzni G., Davidson I., Nightingale K.P., Weiss K. Global transcription regulators of eukaryotes // Cell 1999. V. 96(6) P. 759-67

38. Bone J.R., Kuroda M.I. Dosage compensation regulatory proteins and the evolution of sex chromosomes in Drosophila // Genetics 1996. V. 144(2). P. 705-713

39. Bone J.R., Lavender J., Richman R., Palmer M.J., Turner B.M., Kuroda M.I. Acetylated histone H4 on the male X chromosome is associated with dosage compensation in Drosophila // Genes Dev. 1994. V. 8(1). P. 96-104

40. Brehm A., Langst G., Kehle J., Clapier C.R., Imhof A., Eberharter A., Muller J., Becker P.B. dMi-2 and ISWI chromatin remodelling factors have distinct nucleosome binding and mobilization properties // EMBO J. 2000. V.19(16). P.4332-41

41. Brennan C.A., Li T.R., Bender M., Hsiung F., Moses K. Broad-complex, but not ecdysone receptor, is required for progression of the morphogenetic furrow in the Drosophila eye // Development 2001. V. 128(1). P. 1-11.

42. Burke T.W., Kadonaga J.T. The downstream core promoter element, DPE, is conserved from Drosophila to humans and is recognized by TAFII60 of Drosophila // Genes Dev. 1997. V. 11(22). P.3020-31

43. Burtis КС, Thummel CS, Jones CW, Karim FD, Hogness DS. The Drosophila 74EF early puff contains E74, a complex ecdysone-inducible gene that encodes two ets-related proteins // Cell 1990. V. 61(1). P.85-99

44. Drosophila melanogaster//Chromosoma 1980. V. 81(2). P. 281-306

45. Cavalli G., Paro R. Chromo-domain proteins: Linking chromatin structure to epigenetic regulation// Curr. Opin. Cell Biol. 1998. V. 10(3). P. 354-360

46. Champlin D.T., Frasch M., Saumweber H., Lis J. Characterization of a Drosophila protein associated with boundaries of transcriptionally ative chromatin // Genes & Development. 1991. V.5. P. 1611-1621.

47. Champlin D.T., Lis J.T. Distribution of B52 within a chromosomal locus depends on the level of transcription // Molecular Biology of the Cell. 1994. V. 5. P. 71-79.

48. Chang K.A, Kuroda M.I. Modulation of MSL 1 abundance in female Drosophila contributes to the sex specificity of dosage compensation // Genetics 1998. V. 150(2). P. 699-709

49. Chao A.T., Guild G.M. Molecular analysis of the ecdysterone-inducible 2B5 'early' puff in Drosophila melanogaster// EMBO J. 1986. V. 5. P.143--150

50. Chen Q., Dowhan D.H., Liang D., Moore D.D., Overbeek P.A. CBP/p300 coactivation of crystallin gene expression // J. Biol. Chem. 2002. V. 277(27). P. 24081-9

51. Chen Wr, Zollman S., Couderc J.L., Laski F.A. The BTB domain of brie a brae mediates dimerization in vitro // Mol. Cell. Biol. 1995. V. 15(6). P.3424-9

52. Cherbas L., Lee K., Cherbas P. Identification of ecdysone response elements by analysis of the Drosophila Eip28/29 gene // Genes Dev. 1991. V. 5(1). P. 120-31

53. Cheung P., Allis C.D., Sassone-Corsi P. Signaling to chromatin through histone modifications // Cell 2000. V. 103(2). P. 263-71

54. Clapier C.R., Langst G., Corona D.F., Becker P.B., Nightingale K.P. Critical role for the histone H4 N terminus in nucleosome remodeling by ISWI // Mol. Cell Biol. 2001. V.21(3). P. 875-83.

55. Clapier C.R., Nightingale K.P., Becker P.B. A critical epitope for substrate recognition by the nucleosome remodeling ATPase ISWI // Nucleic Acids Res. 2002. V.30(3). P. 649-55

56. Cline T.W., Meyer B.J. Vive la difference: males vs females in flies vs worms // A. Rev. Genet. 1996. V. 30. P. 637-702

57. Copps K., Richman R., Lyman L.M., Chang K.A., Rampersad-Ammons J., Kuroda M.I. Complex formation by the Drosophila MSL proteins: role of the MSL2 RING finger in protein complex assembly // EMBO J. 1998. V. 17(18). P.5409-17

58. D'Avino P.P., Crispi S., Cherbas L., Cherbas P., Furia M. The moulting hormone ecdysone is able to recognize target elements composed of direct repeats // Mol. Cell Endocrinol. 1995. V.113(l). P. 1-9

59. Deng W.M., Bownes M. Two signalling pathways specify localised expression of the Broad-Complex in Drosophila eggshell patterning and morphogenesis // Development 1997. V. 124(22). P. 4639-47

60. Deuring R., Fanti, L., Armstrong J.A., Sarte M. et al. The ISWI chromatin-remodeling protein is required for gene expression and the maintenance of higher order chromatin structure in vivo // Molec. Cell 2000. V. 5(2).P. 355--365

61. DiBello P.R., Withers D.A., Bayer C.A., Fristrom J.W., Guild G.M. The Drosophila Broad-Complex encodes a family of related proteins containing zinc fingers // Genetics 1991. V. 129. P.385-397

62. DiBartolomeis S.M., Tartof K.D., Jackson F.R. A superfamily of Drosophila satellite related (SR) DNA repeats restricted to the X chromosome euchromatin // Nucleic Acids Res. 1992. V. 20(5). P. 1113-6

63. Dubrovsky E.B., Dretzen G., Berger E.M. The Broad-Complex gene is a tissue-specific modulator of the ecdysone response of the Drosophila hsp23 gene // Mol. Cell Biol. 1996. V. 16(11). P. 6542-52

64. Dubrovsky E.B., Dubrovskaya V.A., Berger E.M. Selective binding of Drosophila BR-C isoforms to a distal regulatory element in the hsp23 promoter // Insect Biochem. Mol. Biol. 2001. V. 31(12). P. 1231-9

65. Eberharter A, Ferrari S, Langst G, Straub T, Imhof A, Varga-Weisz P, Wilm M, Becker PB. Acfl, the largest subunit of CHRAC, regulates ISWI-induced nucleosome remodelling // EMBO J. 2001. V. 20(14). P. 3781-8

66. Edmondson D.G, Roth S.Y. Chromatin and transcription // FASEB J. 1996. V. 10(10). P. 117382

67. Eisen A., Utley R.T., Nourani A., Allard S., Schmidt P., Lane W.S., Lucchesi J.C., Cote J. The yeast NuA4 and Drosophila MSL complexes contain homologous subunits important for transcription regulation // J. Biol. Chem. 2001. V. 276(5). P. 3484-91

68. Eisen A., Sattah M., Gazitt Т., Neal K., Szauter P., Lucchesi J. A novel DEAD-box RNA helicase exhibits high sequence conservation from yeast to humans // Biochim. biophys. Acta1998. V. 1397(2). P. 131-136

69. Ekwall K., Javerzat J.P., Lorentz A., Schmidt H., Cranston G., Allshire R. The chromodomain protein Swi6: a key component at fission yeast centromeres // Science 1995. V. 269(5229). P. 1429-31

70. Emery I.F., Bedian V., Guild G.M. Differential expression of Broad-Complex transcription factors may forecast tissue-specific developmental fates during Drosophila metamorphosis // Development 1994. V. 120(11). P. 3275-3287

71. Farkas G., Leibovitch B.A., Elgin S.C. Chromatin organization and transcriptional control of gene expression in Drosophila // Gene 2000. V. 253(2). P. 117-36. Review.

72. Featherstone M. Coactivators in transcription initiation: here are your orders // Curr. Opin. Genet. Dev. 2002. V. 12(2). P. 149-55

73. Fitzsimons H.L., Henry R.A., Scott M.J. Development of an insulated reporter system to search for cis-acting DNA sequences required for dosage compensation in Drosophila // Genetica1999. V. 105(3). P. 215-26

74. Flaus A., Owen-Hughes T. Mechanisms for ATP-dependent chromatin remodelling // Curr. Opin. Genet. Dev. 2001. V. 11(2). P. 148-54. Review.

75. Fleischmann G., Pflugfelder G., Steiner E.K. et al. Drosophila DNA topoisomerase I is associated with transcriptionally active regions of the genome // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1984. V. 81. P. 6958-6962.

76. Fletcher J.C, Thummel CS. The ecdysone-inducible Broad-complex and E74 early genes interact to regulate target gene transcription and Drosophila metamorphosis // Genetics 1995. V. 141(3). P.1025-35

77. Franke A., Baker B.S. The roXl and roX2 RNAs are essential components of the compensasome, which mediates dosage compensation in Drosophila // Mol. Cell. 1999. V. 4(1). P. 117-22.

78. Franke A., Dernburg A., Bashaw G.J., Baker B.S. Evidence that MSL-mediated dosage compensation in Drosophila begins at blastoderm // Development 1996. V. 122(9). P. 2751-60.

79. Fukunaga A., Tanaka A., Oishi K. Maleless, a recessive autosomal mutant of Drosophila melanogaster that specifically kills male zygotes // Genetics 1975. V. 81. P. 135-141

80. Fyodorov D.V, Kadonaga J.T. Dynamics of ATP-dependent chromatin assembly by ACF // Nature 2002. V. 418(6900). P. 897-900

81. Gebauer F., Merendino L., Hentze M.W., Valcarcel J. The Drosophila splicing regulator sex-lethal directly inhibits translation of male-specific-lethal 2 mRNA // RNA. 1998.V. 4(2). P. 14250.

82. Ghosh S., Chatterjee R.N., Bunick D., Manning J.E., Lucchesi J.C. The LSPl-alpha gene of Drosophila melanogaster exhibits dosage compensation when it is relocated to a different site on the X chromosome // EMBO J. 1989. V. 8(4). P. 1191-6

83. Gibson T.J., Thompson J.D. Detection of dsRNA-binding domains in RNA helicase A and Drosophila maleless: implications formonomeric RNA helicases //Nucleic Acids Res. 1994. V. 22(13). P. 2552-6

84. Gorman M., Baker B.S. How flies make one equal two: dosage compensation in Drosophila // Trends Genet. 1994. V. 10(10). P. 376-80. Review.

85. Gorman M., Franke A., Baker B.S. Molecular characterization of the male-specific lethal-3 gene and investigations of the regulation of dosage compensation in Drosophila // Development 1995. V. 121(2). P. 463-475

86. Gorman M., Kuroda M.I., Baker B.S. Regulation of the sex-specified binding of the maleless dosage compensation protein to the male X-chromosomes in Drosophila // Cell 1993. V. 72(1). P. 39-49

87. Goto H., Yasui Y., Nigg E.A., Inagaki M. Aurora-B phosphorylates Histone H3 at serine 28 with regard to the mitotic chromosome condensation // Genes Cells 2002. V. 7(1). P. 11-7

88. Green G.R. Phosphorylation of histone variant regions in chromatin: unlocking the linker? // Biochem. Cell Biol. 2001. V. 79(3). P. 275-87

89. Grunstein M. Histone acetylation in chromatin structure and transcription // Nature. 1997. V. 389(6649). P. 349,52. Review.

90. Gu W., Wei X., Pannuti A., Lucchesi J.C. Targeting the chromatin-remodeling MSL complex of Drosophila to its sites of action on the X chromosome requires both acetyl transferase and ATPase activities // EMBO J. 2000. V. 19(19). P. 5202-11.

91. Gu W., Szauter P., Lucchesi J.C. Targeting of MOF, a putative histone acetyl transferase, to the^ X chromosome of Drosophila melanogaster // Dev. Genet. 1998. V. 22(1). P. 56-64 ^

92. Guay P.S, Guild G.M. The ecdysone-induced puffing cascade in Drosophila salivary glands: a Broad-Complex early gene regulates intermolt and late gene transcription // Genetics. 1991. V. 129(1). P. 169-75

93. Guermah M., Tao Y., Roeder R.G. Positive and negative TAF(II) functions that suggest a dynamic TFIID structure and elicit synergy with traps in activator-induced transcription. Mol. Cell Biol. 2001. V. 21(20). P. 6882-94

94. Gustafsson C.M, Samuelsson T. Mediator-a universal complex in transcriptional regulation // Mol. Microbiol. 2001. V. 41(1). P. 1-8

95. Hamiche A., Kang J.G., Dennis C., Xiao H., Wu C. Histone tails modulate nucleosome mobility and regulate ATP-dependent nucleosome sliding by NURF // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2001. V. 98(25). P. 14316-21

96. Hassan A.H., Neely K.E., Vignali M., Reese J.C., Workman J.L. Promoter targeting of chromatin-modifying complexes // Front Biosci. 2001. V. 6. P. 1054-64.

97. Hassan A.H, Neely K.E, Workman J.L. Histone acetyltransferase complexes stabilize swi/snf binding to promoter nucleosomes // Cell. 2001. V. 104(6). P. 817-27.

98. Havas K., Whitehouse I., Owen-Hughes T. ATP-dependent chromatin remodeling activities // Cell Mol. Life Sci. 2001. V. 58(5-6). P. 673-82

99. Hayes J.J., Hansen J.C. Nucleosomes and the chromatin fiber // Curr. Opin. Genet. Dev. 2001. V. 11(2). P. 124-9. Review.

100. Hiebert J.C, Birchler J.A. Effects of the maleless mutation on X and autosomal gene expression in Drosophila melanogaster // Genetics. 1994. V. 136(3). P. 913-926

101. Hill R.J., Mott M.R., Steffensen D.M. The preparation of polytene chromosomes for localization of nucleic acid sequences, proteins, and chromatin conformation // Int. Rev. Cytol. 1987. V.108. P. 61-118

102. Hill R.J., Segraves W.A., Choi D., Underwood P.A., MacAvoy E. The reaction with polytene chromosomes of antibodies raised against Drosophila E75A protein // Insect Biochem. Molec. Biol. 1993. V. 23(1). P. 99-104

103. Hodgetts R.B., Clark W.C., O'Keefe S.L., Schouls M., Crossgrove K., Guild G.M., von Kalm L. Hormonal induction of Dopa decarboxylase in the epidermis of Drosophila is mediated by the Broad-Complex // Development. 1995. V. 121(11). P. 3913-22

104. Hoffmann A., Chiang C.M., Oelgeschlager Т., Xie X., Burley S.K., Nakatani Y., Roeder R.G. A histone octamer-like structure within TFIID // Nature. 1996. V. 380(6572). P. 356-9

105. Huet F., Ruiz C., Richards G. Puffs and PCR: the in vivo dynamics of early gene expression during ecdysone responses in Drosophila// Development. 1993. V. 118(2). P. 613-627

106. Ish-Horowicz D., Pinchin S.M., Gausz J., Gyurkovics H., Bencze G., Goldschmidt-Clermont M., Holden J.J. Deletion mapping of two D. melanogaster loci that code for the 70,000 dalton heat-induced protein // Cell. 1979. V.17(3). P. 565-71

107. Jacobson R.H., Ladurner A.G., King D.S., Tjian R. Structure and function of a human TAFII250 double bromodomain module // Science 2000 May 26;288(5470): 1422-5

108. Jamrich M., Greenleaf A.L., Bautz E.K.F. Localization of RNA-polymerase in Drosophila melanogaster polytene chromosomes// Proc. Nat. Acad. Sci. USA. 1977. V. 74. P. 2079-2083.

109. Jenuwein T, Allis CD. Translating the histone code // Science. 2001. V. 293(5532). P. 107480

110. Jiang C., Lamblin A.F., Steller H., Thummel C.S. A steroid-triggered transcriptional hierarchy controls salivary gland cell death during Drosophila metamorphosis // Mol. Cell. 2000. V. 5(3)P. 445-55

111. Jin Y., Wang Y., Walker D.L., Dong H., Conley C., Johansen J., Johansen K.M. JIL-1: a novel chromosomal tandem kinase implicated in transcriptional regulation in Drosophila // Mol. Cell. 1999. V. 4(1). P. 129-35

112. Jin Y., Wang Y., Johansen J., Johansen K.M. JIL-1, a chromosomal kinase implicated in regulation of chromatin structure, associates with the male specific lethal (MSL) dosage compensation complex // J. Cell Biol. 2000. V. 149(5). P. 1005-1010

113. Jones D.O., Cowell I.G., Singh P.B.Mammalian chromodomain proteins: their role in genome organisation and expression // Bioessays. 2000. V. 22(2). P. 124-37. Review.

114. Kal A.J., Mahmoudi Т., Zak N.B., Verrijzer C.P. The Drosophila brahma complex is an essential coactivator for the trithorax group protein zeste // Genes Dev. 2000. V. 14(9). P. 105871

115. Kaplan C.D., Morris J.R. Wu C., Winston F. Spt5 and Apt6 are associated with active transcription and have characteristics of general elongation factors in D. melanogaster // Genes & Development. 2000. V. 14. P. 2623-2634.

116. Karim F.D., Guild G.M., Thummel C.S. The Drosophila Broad-Complex plays a key role in controlling ecdysone-regulated gene expression at the onset of metamorphosis // Development. 1993. V. 118(3). P. 977-88

117. Karim F.D., Thummel C.S. Temporal coordination of regulatory gene expression by the steroid hormone ecdysone // EMBO J. 1992. V. 11(11). P. 4083-93

118. Kelley R.L., Kuroda M.I. Noncoding RNA genes in dosage compensation and imprinting // Cell. 2000. V. 103(1). P. 9-12.

119. Kelley R.L., Meller V.H., Gordadze P.R., Roman G., Davis R.L., Kuroda M.I. Epigenetic spreading of the Drosophila dosage compensation complex from roX RNA genes into flanking chromatin // Cell. 1999. V. 98(4). P. 513-22

120. Kelley R.L., Solovyeva I., Lyman L.M., Richman R., Solovyev V., Kuroda M.I. Expression of msl-2 causes assembly of dosage compensation regulators on the X chromosomes and female lethality in Drosophila // Cell. 1995. V. 81(6). P. 867-77.

121. Kelley R.L., Wang J., Bell L., Kuroda M.I. Sex lethal controls dosage compensation in Drosophila by a non-splicing mechanism // Nature. 1997. V. 387(6629). P. 195-9.

122. Kernan M.J., Kuroda M.I., Kreber R., Baker B.S., Ganetzky B. napts, a mutation affecting sodium channel activity in Drosophila, is an allele of mle, a regulator of X chromosome transcription // Cell. 1991. V. 66(5). P. 949-59

123. Kim Y.-J., Bjorklund, Li Y., Sayre M. H., Kornberg R. D. A multiprotein Mediator of transcriptional activation and its interaction with the C-terminal repeat domain of RNA polymerase II // Cell. 1994. V. 77. P. 599-608

124. Kingston R.E., Narlikar G.J. ATP-dependent remodeling and acetylation as regulators of chromatin fluidity// Genes Dev. 1999. V. 13(18). P. 2339-52. Review.

125. Kiss I., Beaton A.H., Tardiff J., Fristrom D., Fristrom J.W. Interactions and developmental effects of mutations in the Broad-Complex of Drosophila melanogaster // Genetics. 1988. V. 118. P. 247-259

126. Koonin E.V., Zhou S., Lucchesi J.C. The chromo superfamily: new members, duplication of the chromo domain and possible role in delivering transcription regulators to chromatin // Nucleic Acids Res. 1995. V. 23(21). P. 4229-33.

127. Korge G. Direct correlation between a chromosome puff and the synthesis of a larval saliva protein in Drosophila melanogaster // Chromosoma 1977. V. 62(2)P. 155-174

128. Kornberg R.D., Lorch Y. Twenty-five years of the nucleosome, fundamental particle of the eukaryote chromosome // Cell. 1999. Y. 98(3)P. 285-94

129. Kouzarides T. Histone methylation in transcriptional control // Curr. Opin. Genet. Dev. 2002. V. 12(2). P. 198-209

130. Kucharova-Mahmood S., Raska I., Mechler B.M., Farkas R. Temporal regulation of Drosophila salivary gland degeneration by the Broad-Complex transcription factors // J. Struct. Biol. 2002. V. 140(1). P. 67-78

131. Kuroda M.I., Kernan M., Kreber R., Ganetzky В., Baker B.S. The Maleless protein associates with the X chromosome to regulate dosage compensation in Drosophila // Cell. 1991. V. 66. P. 935-947

132. Labrador M., Corces V.G. Phosphorylation of histone H3 during transcriptional activation depends on promoter structure // Genes Dev. 2003. V. 17(1). P. 43-8

133. Langst G., Becker P.B.Nucleosome mobilization and positioning by ISWI-containing chromatin-remodeling factors // J. Cell Sci. 2001. V. 114. P. 2561-8. Review.

134. Larsson J., Chen J.D., Rasheva V., Rasmuson-Lestander A., Pirrotta V. Painting of fourth, a chromosome-specific protein in Drosophila // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2001. V. 98(11). P. 6273-8

135. Lee C.G., Chang K.A., Kuroda M.I., Hurwit, J. The NTPase/helicase activities of Drosophila maleless, an essential factor in dosage compensation // EMBO J. 1997. V. 16(10). P. 2671—2681

136. Lee C.G, Hurwitz J. Human RNA helicase A is homologous to the maleless protein of Drosophila//J. Biol. Chem. 1993. V. 268(22). P. 16822-30

137. Lee T.I., Young R.A. Transcription of eukaryotic protein-coding genes // Annu. Rev. Genet. 2000. V. 34.P. 77-137

138. Lin R.J., Nagy L., Inoue S., Shao W., Miller W.H. Jr., Evans R.M. Role of the histone deacetylase complex in acute promyelocytic leukaemia // Nature. 1998. V. 391(6669). P. 811-4

139. Lindsley D.L., Zimm G.G. The genome of Drosophila melanogaster // Academic press INC. 1992.1133P.

140. Lis J.Т., Prestidge L., Hogness D.S. A novel arrangement of tandemly repeated genes at a major heat shock site in D. Melanogaster // Cell. 1978. 14(4):901-19 ^ \

141. Lis J.T., Neckameyer W., Dubensky R., Costlow N. Cloning and characterization of nine Vл)heat-shock-induced mRNAs of Drosophila melanogaster//Gene. 1981. V. 15(1). P. 67-80

142. Litt M.D., Simpson M., Gaszner M., Allis C.D., Felsenfeld G. Correlation between histone lysine methylation and developmental changes at the chicken beta-globin locus // Science. 2001. V. 293(5539). P. 2453-5

143. Loidl P. Histone acetylation: facts and questions // Chromosoma. 1994. Dec;103(7):441-9

144. Lucchesi J.C. Dosage compensation: roX marks the spot // Curr. Biol. 1999. V. 9(21). P. ^ v807.8 ' 1ii

145. Lucchesi J.C. Dosage compensation in Drosophila and the 'complex' world of transcriptional 1 ' regulation//BioEssays. 1996. 18(7):541-547

146. Lucchesi, J.C. Dosage compensation in flies and worms: the ups and downs of X-chromosome regulation. Curr. Opin. Genet. Dev. 1998. V. 8(2). P. 179-184

147. Lucchesi J.C., Manning J.E. Gene dosage compensation in Drosophila melanogaster II Adv. Genet. 1987. V. 24. P. 371-429

148. Luger K., Mader A.W., Richmond R.K., Sargent D.F., Richmond T.J. Crystal srtucture of the nucleosome core particle at 2.8 A resolution // Nature. 1997. V. 389 P. 251-260.

149. Lyman L.M., Copps K., Rastelli L., Kelley R.L., Kuroda M.I. Drosophila Male-Specific Lethal-2 protein: Structure/function analysis and dependence on MSL-1 for chromosome association//Genetics 1997. V. 147(4). P. 1743-1753

150. Makowski A.M., Dutnall R.N., Annunziato A.T. Effects of acetylation of histone H4 at lysines 8 and 16 on activity of the Hatl histone acetyltransferase // J. Biol. Chem. 2001. V. 276(47). P. 43499-502

151. Manning E.T., Ikehara Т., Ito Т., Kadonaga J., Kraus W.L. p300 forms a stable, template-committed complex with chromatin: role for the bromodomain // Mol. Cell Biol. 2001. V. 21(12). P. 3876-87

152. Marin I., Baker B.S. Origin and evolution of the regulatory gene male-specific lethal-3 // Mol. Biol. Evol. 2000. V. 17(8). P. 1240-50.

153. Marin I., Franke A., Bashaw G.J., Baker B.S. The dosage compensation system of Drosophila is co-opted by newly evolved X chromosomes // Nature. 1996. V. 383(6596). P. 160-3.

154. Matunis E.L., Matunis M.J., Dreyfuss G. Association of individual hnRNP proteins and snRNPs with nascent transcripts // The Journal of Cellular Biology. 1993. V. 121 (2).P. 219-228.

155. McDowell K.A., Hilfiker A., Lucchesi J.C. Dosage compensation in Drosophila: the X chromosome binding of MSL-1 and MSL-2 in female embryos is prevented by the early expression of the Sxl gene// Mech. Dev. 1996 V.57(l). P. 113-9.

156. McKenna N.J, O'Malley B.W. Minireview: nuclear receptor coactivators—an update// Endocrinology 2002 V.143(7). P.2461-5

157. Meller V.H., Gordadze P.R., Park Y., Chu X., Stuckenholz C., Kelley R.L., Kuroda M.I./^ Ordered assembly of roX RNAs into MSL complexes on the dosage-compensated X chromosome in drosophila// Curr Biol., 2000 V.10(3). P. 136-43

158. Meller V.H. Dosage compensation: making IX equal 2X //Trends Cell Biol. 2000. V.10(2).P.54-9

159. Meller V.H., Kuroda M.I. Sex and the single chromosome //Adv. Genet. 2002, V.46. P. 1 -24

160. Meller V.H., Wu K.H., Roman G., Kuroda M.I., Davis R.L. roXl RNA paints the X chromosome of male Drosophila and is regulated by the dosage compensation system // Cell, 1997. V.88(4). P.445—457

161. Mizuguchi G., Vassilev A., Tsukiyama Т., Nakatani Y., Wu C. ATP-dependent nucleosome remodeling and histone hyperacetylation synergistically facilitate transcription of chromatin // J. Biol. Chem. 2001. V.276(18).P.14773-83.

162. Morimoto R.I. Regulation of the heat shock transcriptional response: cross talk between a family of heat shock factors, molecular chaperones, and negative regulators // Genes Dev. 1998. V. 12(24).P.3788-96

163. Mott M.R., Hill R.J. The ultrastructural morphology of native salivary gland chromosomes of Drosophila melanogaster: the band-interband question // Chromosoma. 1986. V. 94. P. 403411.

164. Muchardt C., Yaniv M. ATP-dependent chromatin remodelling: SWI/SNF and Co. are on the job // J. Mol. Biol. 1999 V.293(2).P. 187-98

165. Myohanen S., Baylin S.B. Sequence-specific DNA binding activity of RNA helicase A to the pl6INK4a promoter // J. Biol. Chem. 2001. V.276(2). P.1634-42

166. Nakajima Т., Uchida C., Anderson S.F., Lee C.G., Hurwitz J., Parvin J.D., Montminy M. RNA helicase A mediates association of СВР with RNA polymerase II // Cell. 1997. V. 90(6). P. 1107-12

167. Nightingale K.P., Wellinger R.E., Sogo J.M., Becker P.B. Histone acetylation facilitates RNA polymerase II transcription of the Drosophila hsp26 gene in chromatin // EMBO J. 1998. V. 17(10). P.2865-76

168. Nielsen P.R., Nietlispach D., Mott H.R., Callaghan J., Bannister A., Kouzarides Т., Murzin A.G., Murzina N.V., Laue E.D. Structure of the HP1 chromodomain bound to histone H3 methylated at lysine 9 //Nature. 2002. V. 416(6876). P. 103-7

169. Nowak S.J., Corces V.G. Phosphorylation of histone H3 correlates with transcriptionally active loci // Genes & Development. 2000. V. 14. P. 3003-3013.

170. Palmer M.J., Richman R., Richter L., Kuroda M.I. Sex-specific regulation of the male-specific lethal-1 dosage compensation gene in Drosophila// Genes Dev. 1994. V. 8(6). P.698— 706

171. Pannuti A., Lucchesi J.C. Recycling to remodel: evolution of dosage-compensation complexes // Curr. Opin. Genet. Dev. 2000. V.10(6). P.644-50.

172. Park Y., Kuroda M.I. Epigenetic aspects of X-chromosome dosage compensation // Science. 2001. V. 293(5532).P.1083-5

173. Park Y., Kelley R.L., Oh H., Kuroda M.I., Meller V.H. Extent of chromatin spreading determined by roX RNA recruitment of MSL proteins // Science. 2002. V. 298(5598). P. 1620-3

174. Peterson C.L., Workman J.L. Promoter targeting and chromatin remodeling by the SWI/SNF complex // Curr. Opin. Genet. Dev. 2000. V. 10(2). P. 187-92

175. Pile L.A., Wassarman D.A. Chromosomal localization links the SIN3-RPD3 complex to the regulation of chromatin condensation, histone acetylation and gene expression // EMBO J. 2000. V. 19(22). P.6131-40.

176. Pointud J.C., Larsson J., Dastugue В., Couderc J.L. The BTB/POZ domain of the regulatory proteins Brie a brae 1 (BAB1) and Brie a brae 2 (BAB2) interacts with the novel Drosophila TAF(II) factor BIP2/dTAF(II)155 // Dev. Biol. 2001. V.237(2). P.368-80

177. Prakash S.K., Van den Veyver I.B., Franco В., Volta M., Ballabio A., Zoghbi H.Y. Characterization of a novel chromo domain gene in xp22.3 with homology to Drosophila msl-3. II Genomics. 1999. V. 59(1). P.77-84.

178. Qian S., Pirrotta V. Dosage compensation of the Drosophila white gene requires both the X chromosome environment and multiple intragenic elements // Genetics. 1995.V. 139(2). P.733-44

179. Rastelli L., Richman R., Kuroda M.I. The dosage compensation regulators MLE, MSL-1 and MSL-2 are interdependent since early embryogenesis in Drosophila // Mech. Dev. 1995. V. 53(2). P.223-33.

180. Rastelli L., Kuroda M.I. An analysis of maleless and histone H4 acetylation in Drosophila melanogaster spermatogenesis // Mech. Dev. 1998. V. 71(1,2). P.107—117

181. Reenan R.A., Hanrahan C.J., Barry G. The mle(napts) RNA helicase mutation in drosophila results in a splicing catastrophe of the para Na+ channel transcript in a region of RNA editing // Neuron. 2000. V. 25(1). P.139-49

182. Renault N., King-Jones K., Lehmann M. Downregulation of the tissue-specific transcription factor Fork head by Broad-Complex mediates a stage-specific hormone response // Development. 2001. V. 128(19). P.3729-37.

183. Restifo L.L., White K. Mutations in a steroid hormone-regulated gene disrupt the metamorphosis of the central nervous system in Drosophila // Dev. Biol. 1991. V. 148(1 ).P. 174194

184. Richards G. The radioimmune assay of ecdysteroid titres in Drosophila melanogaster // Mol. Cell Endocrinol. 1981. V.21(3). P.181-97

185. Richards G. Sequential gene activation by ecdysteroids in polytene chromosomes of Drosophila melanogaster // Roux. Arch. dev. Biol. 1982. V. 191(2). P.103--111

186. Richards G., Da Lage J.L., Huet F., Ruiz C. The acquisition of competence to respond to ecdysone in Drosophila is transcript specific//Mech. Dev. 1999. V. 82(1,2). P.131—139

187. Richards E.J., Elgin S.C. Epigenetic codes for heterochromatin formation and silencing: rounding up the usual suspects // Cell. 2002. V. 108(4). P.489-500

188. Richter L., Bone J.R., Kuroda M.I. RNA-dependent association of the Drosophila maleless protein with the male X chromosome // Genes Cells. 1996. V.l(3). P.325-36

189. Sandstrom D.J., Restifo L.L. Epidermal tendon cells require Broad Complex function for correct attachment of the indirect flight muscles in Drosophila melanogaster // J. Cell Sci. 1999. V. 112. P. 4051-65.

190. Sanjuan R., Marin I. Tracing the origin of the compensasome: evolutionary history of DEAH helicase and MYST acetyltransferase gene families// Mol. Biol. Evol. 2001.V.18(3).P.330

191. Santos-Rosa H., Schneider R., Bannister A.J., Sherriff J., Bernstein B.E., Emre N.C., Schreiber S.L., Mellor J., Kouzarides T. Active genes are tri-methylated at K4 of histone H3 // Nature. 2002. V. 419(6905) . P.407-11

192. Schutt C., Nothiger R. Structure, function and evolution of sex-determining systems in Dipteran insects // Development. 2000.V. 127(4). P.667-77.

193. Scott M.J., Pah L.L., Cleland S.B., Knox A.L., Heinrich J. MSL1 plays a central role in assembly of the MSL complex, essential for dosage compensation in Drosophila // EMBO J. 2000. V.19(l). P.144-55

194. Segraves W.A., Hogness D.S. The E75 ecdysone-inducible gene responsible for the 75B early puff in Drosophila encodes two new members of the steroid receptor superfamily // Genes Dev. 1990. V.4(2). P.204-19

195. Semeshin V.F., Baricheva E.M., Belyaeva E.S., Zhimulev I.F. Electron microscopical analysis of Drosophila polytene chromosomes. I. Mapping of the 87A and 87C heat shock puffs in development // Chromosoma. 1982. V. 87. P. 229-237.

196. Semeshin V.F., Baricheva E.M., Belyaeva E.S., Zhimulev I.F. Electron microscopical analysis of Drosophila polytene chromosomes. II. Development of complex puffs // Chromosoma. 1985a. V. 91. P. 210-233.

197. Semeshin V.F., Baricheva E.M., Belyaeva E.S., Zhimulev I.F. Electron microscopical analysis of Drosophila polytene chromosomes. III. Mapping of puffs developing from one band // Chromosoma. 1985b. V. 91. P. 234-250.

198. Semeshin V.F.', Andreyeva E.N., Shloma V.V., Saumweber H., Zhimulev I.F. Immunogold electron microscope localization of proteins in Drosophila polytene chromosomes: applications and limitations of the method // Chromosome Res. 2002. V. 10(5). P.429-33

199. Sharma A., Lakhotia S.C. In situ quantification of hsp70 and alpha-beta transcripts at 87A and 87C loci in relation to hsr-omega gene activity in polytene cells of Drosophila melanogaster. // Chromosome Res. 1995. V. 3(6). P.386-93

200. Sliter T.J., Gilbert L.I. Developmental arrest and ecdysteroid deficiency resulting from mutations at the dre4 locus of Drosophila // Genetics. 1992. V. 130(3). P.555-68

201. Silver L.M., Elgin S.C. Production and characterization of antisera against three individual NHC proteins; a case of a generally distributed NHC protein // Chromosoma. 1978. V.68(2):101-14

202. Singh P.B., Miller J.R., Pearce J., Kothary R., Burton R.D., Paro R., James T.C., Gaunt S.J. A sequence motif found in a Drosophila heterochromatin protein is conserved in animals and plants //Nucleic Acids Res. 1991. V. 19(4). P.789-94

203. Skaer R.J. Interband transcription in Drosophila // J. Cell. Sci. 1977. V. 26. P. 251-266.

204. Smith E.R., Allis C.D., Lucchesi J.C. Linking global histone acetylation to the transcription enhancement of X-chromosomal genes in Drosophila males // J. Biol. Chem. 2001. V. 276(34). P. 31483-6

205. Smith E.R., Pannuti A., Gu W., Steurnagel A., Cook R.G., Allis C.D., Lucchesi J.C. The drosophila MSL complex acetylates histone H4 at lysine 16, a chromatin modification linked to dosage compensation // Mol. Cell Biol. 2000. V.20(l). P.312-8

206. Sobel R.E., Cook R.G., Perry C.A., Annunziato A.T., Allis C.D. Conservation of deposition-related acetylation sites in newly synthesized histones H3 and H4 // Proc. Natl. Acad. Sci. U S A 1995. V. 92(4). P. 1237-41

207. Sorsa M., Sorsa V. Electron microscopic observations on interband fibrils in Drosophila salivary chromosomes // Chromosoma. 1967. V. 22. P. 32-41.

208. Steinemann M., Steinemann S., Turner B.M. Evolution of dosage compensation // Chromosome Res/1996. V. 4(3). P. 185-90

209. Sterner D.E., Berger S.L. Acetylation of histones and transcription-related factors // Microbiol. Mol. Biol. Rev. 2000. V. 64(2). P.435-59

210. Stewart M., Murphy С., Fristrom J.W. The recovery and preliminary characterization of X chromosome mutants affecting imaginal discs of Drosophila melanogaster // Dev. Biol. 1972. V. 27. P. 71—83

211. Stokes D.G., Tartof K.D., Perry R.P. CHD1 is concentrated in interbands and puffed regions of Drosophila polytene chromosomes // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1996. V. 93. P. 7137-7142.

212. Strahl B.D., Allis C.D. The language of covalent histone modifications // Nature. 2000. V. 403(6765). P.41-5.

213. Stuckenholz C., Kageyama Y., Kuroda M.I. Guilt by association: non-coding RNAs, chromosome-specific proteins and dosage compensation in Drosophila // Trends Genet. 1999. V. 15(11). P.454-8

214. Syntichaki P., Topalidou I., Thireos G. The Gcn5 bromodomain co-ordinates nucleosome remodelling //Nature. 2000. V. 404(6776). P. 414-7

215. Tsai C.-C., Kao H.-Y., Yao T.P. et al. SMRTER, a Drosophila nuclear receptor coregulator, reveals that EcR-mediated repression is critical for development // Molecular Cell. 1999. V. 4. P. 175-186.

216. Tsukiyama Т./Daniel C., Tamkun J., Wu C. ISWI, a member of the SWI2/SNF2 ATPase family, encodes the 140 kDa subunit of the nucleosome remodeling factor // Cell. 1995. V. 83(6). P.1021-6

217. Tupler R., Perini G., Green M.R. Expressing the human genome // Nature. 2001. V. 409(6822). P. 832-3

218. Tzolovsky G., Deng W.M., Schlitt Т., Bownes M. The function of the broad-complex during Drosophila melanogaster oogenesis // Genetics. 1999. V.153(3). P.1371-83

219. Urness L.D., Thummel C.S. Molecular interactions within the ecdysone regulatory hierarchy: DNA binding properties of the Drosophila ecdysone-inducible E74A protein // Cell. 1990. V. 63. P.47—61

220. Vallee B.L., Coleman J.E., Auld D.S. Zinc fingers, zinc clusters, and zinc twists in DNA-binding protein domains // Proc. Natl. Acad. Sci. U S A 1991. V. 88(3). P.999-1003

221. Vazquez J., Pauli D., Tissieres A. Transcriptional regulation in Drosophila during heat shock: a nuclear run-on analysis // Chromosoma. 1993. V. 102(4). P. 233-48

222. Vettesse-Dadey M., Grant P.A., Hebbes T.R. et al. Acetylation of histone H4 plays a primary role in enhancing transcription factor binding to nucleosomal DNA in vitro // EMBO J. 1996. V. 15. P. 2508-2518.

223. Vlassova I.E., Umbetova G.H., Zimmermann V.H., Alonso C., Belyaeva E.S., Zhimulev I.F. Immunofluorescence localization of DNA:RNA hybrids in Drosophila melanogaster polytene chromosomes // Chromosoma. 1985. V. 91. P. 251-258.

224. Vlassova I.E., Zhimulev I.F., Belyaeva E.S., Semeshin V.F. The effect of DRB and a-amanitin on the RNA synthesis in Drosophila melanogaster polytene chromosomes // Dros. Inform. Serv. 1987. V. 66. P. 151-154.

225. Wang Y., Zhang W., Jin Y., Johansen J., Johansen K.M. The JIL-1 tandem kinase mediates histone H3 phosphorylation and is required for maintenance of chromatin structure in Drosophila// Cell. 2001. V. 105(4). P.433-^143

226. Weeks J.R., Hardin S.E., Shen J., Lee J.M., Greenleaf A.L. Locus-specific variation in phosphorylation state of RNA polymerase II in vivo: correlations with gene activity and transcript processing // Genes Dev. 1993. V.7(12A). P.2329-44.

227. White D.A., Belyaev N.D., Turner B.M. Preparation of site-specific antibodies to acetylated histones // Methods, 1999, V.19(3). P. 417-24

228. Woodcock4OL., Dimitrov S. Higher-order structure of chromatin and chromosomes // Curr. i j Opin. Genet. d£v>200 1. V. 11 (2). P. 130-5 2. p^ f,

229. Woodcock C.L., Dimitrov S. Higher-order structure of chromatin and chromosomes // Curr. Opin. Genet. Dev. 2001. V.ll(2). P. 130-5

230. Yao T.P., Forman B.M., Jiang Z., Cherbas L., Chen J.D., McKeown M., Cherbas P., Evans R.M. Functional ecdysone receptor is the product of EcR and Ultraspiracle genes // Nature. 1993. V. 366(6454). P.476-9

231. Yasui D., Miyano M., Cai S., Varga-Weisz P., Kohwi-Shigematsu T. SATB1 targets chromatin remodelling to regulate genes over long distances // Nature. 2002. V.419(6907).P.641-5

232. Zhang S., Herrmann C., Grosse F. Nucleolar localization of murine nuclear DNA helicase II (RNA helicase A) // J. Cell Sci. 1999. V.l 12 ( Pt 16). P. 2693-703

233. Zeng L., Zhou1 MM Bromodomain: an acetyl-lysine binding domain // FEBS Lett. 2002. V. 513(1). P. 124-8

234. Zhimulev I. F. Genetic organization of polytene chromosomes // Adv Genet 1999. V.39. P 1-589

235. Zhimulev I.F., Belyaeva E.S. Detailed description of puffing patterns in the salivary gland chromosomes of normally developing larvae and prepupae of Drosophila melanogaster // D. I. S. 1999. V. 82. P. 9—20

236. Zhimulev I.F., Belyaeva E.S., Mazina O.M., Balasov M.L. Structure and expression of the BR-C locus in Drosophila melanogaster, Diptera: Drosophilidae // Europ. J. Ent. 1995. V.92(l). P. 263—270

237. Zhou X., Riddiford L.M. Broad specifies pupal development and mediates the 'status quo' action of juvenile hormone on the pupal-adult transformation in Drosophila and Manduca // Development. 2002. V. 129(9). P.2259-69

238. Zink В., Paro R. In vivo binding pattern of a trans-regulator of homoeotic genes in Drosophila melanogaster//Nature. 1989. V. 337. P. 468-471