Локализация и свойства автолитических ферментов Lysobacter sp. - продуцента внеклеточных бактериолитических ферментов тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.00.04, кандидат биологических наук Ситкин, Борис Викторович

• Ситкин, Борис Викторович
• кандидат биологических наук
• 2004

Оглавление диссертации кандидат биологических наук Ситкин, Борис Викторович

СПИСОК ПРИНЯТЫХ СОКРАЩЕНИЙ.

ВВЕДЕНИЕ.

ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.

ГЛАВА 1. Распространенность бактериолитических ферментов в природе.

ГЛАВА 2. Структура клеточной стенки бактерий - субстрата бактериолитических ферментов.

2.1. Клеточная стенка грамположительных бактерий.

2.2. Клеточная стенка грамотрицательных бактерий.

2.3. Строение пептидогликана бактерий.

ГЛАВА 3. Субстратная специфичность бактериолитических ферментов.

ГЛАВА 4. Бактериолитические ферменты бактерий.

4.1. Внеклеточные бактериолитические ферменты.

4.2. Автолитические ферменты бактерий.

4.2.1. Физиологическая роль ферментов.

4.2.2. Спектр и субклеточная локализация автолититических ферментов бактерий.

4.2.3. Свойства автолитических ферментов.

4.2.4. Регуляция и контроль активности автолитических ферментов.

4.3. Взаимосвязь биосинтеза внутриклеточных и внеклеточных бактериолитических ферментов.

ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ

ГЛАВА 5. Материалы и методы.

5.1. Материалы.

5.2. Микроорганизмы и условия их культивирования.

5.3. Субклеточное фракционирование.

5.4. Солюбилизация автолитических ферментов из фракции клеточных стенок и мембран.

5.5. Определение ферментативных активностей клеточных фракций.

5.5.1. Определение глюкозо-6-фосфатдегидрогеназной активности.

5.5.2. Определение лактатдегидрогеназной активности.

5.5.3. Определение активности циклической фосфодиэстеразы.

5.5.4. Определение автолитической активности.

5.6. Турбидиметрический метод определения автолитической активности ферментных препаратов.

5.7. Определение белка.

5.8. Электрофоретический анализ автолитических ферментов клеточных фракций Lysobacter sp. XL 1 и XL 2.

5.8.1. Электрофоретический анализ в анодной системе.

5.8.2. Электрофоретический анализ в катодной системе.

5.9. Выделение пептидогликана бактерии Lysobacter sp. XL 1.

5.10. Определение состава пептидогликана Lysobacter sp. XL 1.

5.11. Определение конфигурации диаминопимелиновой кислоты в пептидогликане Lysobacter sp. XL 1.

5.12. Элюция автолитических ферментов из ПААГ.

5.13. Определение субстратной специфичности автолитических ферментов.

5.13.1. Обнаружение ферментов с глюкозаминидазной активностью.

5.13.2. Обнаружение ферментов с мурамидазной активностью.

5.13.3. Обнаружение ферментов с амидазной и эндопептидазной активностями.

5.14. Осаждение белков цитозоля сульфатом аммония.

5.15. Ионообменная хроматография элюата из ПААГ на SP-сефадексе С-50.

5.16. Определение молекулярной массы цитозольной эндопептидазы А7.

5.16.1. Гельфильтрация.

5.16.2. Электрофорез в присутствии SDS-Na.

5.17. Характеристика ферментных препаратов, содержащих эндопептидазы

As, Aj и 1Ч-ацетилмурамоил-Ь-аланин амидазу Аб.

5.17.1. Определение оптимального значения рН для действия автолитических ферментов.

5.17.2. Определение оптимального значения концентрации буфера для действия автолитических ферментов.

5.17.3. Определение влияния температуры на активность автолитических ферментов.

5.17.4. Определение термостабильности ферментных препаратов.

ГЛАВА 6. Результаты исследования и их обсуждение.

6.1. Химическая структура пептидогликана Lysobacter sp. XL 1.

6.2. Автолитические ферменты активного штамма Lysobacter sp. XL 1, не секретирующего внеклеточные бактериолитические ферменты.

6.3. Субстратная специфичность автолитических ферментов по отношению к пептидогликану бактерии Lysobacter sp. XL 1.

6.4. Определение свойств наиболее активных автолитических ферментов цитозоля Lysobacter sp. XL 1.

6.4.1. Оптимум рН действия эндопептидазы А5 и Ы-ацетилмурамоил-Ь-аланин амидазы Аб.

6.4.2. Зависимость активности эндопептидазы А5 и М-ацетилмурамоил-L-аланин амидазы Аб от ионной силы раствора.

6.4.3. Оптимум температуры реакции эндопептидазы А и ]Ч-ацетилмурамоил-1^аланин амидазы Аб.

6.4.4. Термостабильность эндопептидазы А5 и ацетилмурамоил-1^аланин амидазьт Аб.

6.5. Автолитические ферменты активного штамма Lysobacter sp. XL 1, секретирующего внеклеточные бактериолитические ферменты.

6.6. Сравнение субстратной специфичности автолитического фермента А и внеклеточного фермента JIi.

6.7. Автолитические ферменты малоактивного штамма

Lysobacter sp. XL 2.

6.8. Выделение, очистка и свойства цитозольной эндопептидазы Ау.

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Локализация и свойства автолитических ферментов Lysobacter sp. - продуцента внеклеточных бактериолитических ферментов»

Актуальностьпроблемы. Внутриклеточные бактериолитические автолитические) ферменты, разрушающие ковалентные связи в пептидогликане — основном структурном компоненте клеточной стенке эубактерии, играют важную роль в процессах роста и деления бактериальной клетки. Они являются жизненно необходимыми для любой эубактерии. Кроме того, некоторые эубактерии в определенных условиях продуцируют не только автолитические, но и внеклеточные бактериолитические ферменты, которые необходимы им для завоевания экологической ниши и обеспечения их клеток пищей и энергией. В этом случае в клетках эубактерий идет параллельный синтез и передвижение через цитоплазматическую мембрану к месту своего действия как автолитических ферментов, которые могут локализоваться в мембране, периплазме и клеточной стенке, так и внеклеточных бактериолитических ферментов, секретируемых в окружающую среду. В связи с этим встает вопрос о механизме и регуляции процесса одновременного функционирования этих ферментов, о том могут ли автолитические ферменты являться предшественниками внеклеточных бактериолитических ферментов?

К настоящему времени опубликовано большое количество работ, посвященных выделению и характеристике как внеклеточных, так и внутриклеточных бактериолитических ферментов эубактерий. Однако, до сих пор в литературе нет сведений по сравнительному изучению у одной и той же бактерии вне- и внутриклеточных бактериолитических ферментов, в которых они были бы достаточно полно исследованы.

Автолитические ферменты хорошо изучены у многих представителей грамположительных бактерий (Shockman, Holtje, 1994), у грамотрицательных, за исключением Escherichia coli (Holtje, Tuomanen, 1991), их подробно не изучали.

Грамотрицательная бактерия Lysobacter sp. (ранее определенная как Xanthomonas campestris) относится к числу таких бактерий, которые в определенных условиях продуцируют внеклеточные бактериолитические ферменты: мурамидазу, эндопептидазу

JIi и К-ацетилмурамоил-Ь-аланин амид азу JI2. Эти ферменты входят в состав применяемого в медицине антибактериального препарата лизоамидаза (Машковский, 1998), поэтому их свойства хорошо изучены. Все они являются положительно заряженными низкомолекулярными белками, проявляющими наибольшую активность в среде с низкой ионной силой и высоким значением рН (Степная и др., 1999).

Ранее в цитозоле этой бактерии был обнаружен автолитический фермент с глюкозаминидазной активностью, не выявленный среди внеклеточных бактериолитических ферментов (Цфасман и др., 2000). Его физико-химические свойства существенно отличались от свойств внеклеточных ферментов Lysobacter sp. Однако, подробный анализ автолитических ферментов этой бактерии не проводили. Вместе с тем изучение автолитических ферментов Lysobacter sp. в сравнении с ее уже изученными внеклеточными бактериолитическими ферментами позволит приблизиться к пониманию механизма функционирования этих двух "пулов" бактериолитических ферментов у одной бактерии.

Цель работы - изучение автолитических ферментов бактерии Lysobacter sp.

Задачи работы:

1. Изучение химической структуры пептидогликана бактерии Lysobacter sp. -субстрата ее автолитических ферментов.

2. Выявление автолитических ферментов бактерии и установление их локализации.

3. Определение субстратной специфичности автолитических ферментов бактерии Lysobacter sp. по отношению к связям пептидогликана.

4. Выделение и очистка наиболее активных автолитических ферментов бактерии.

5. Изучение свойств автолитических ферментов Lysobacter sp. и сравнение их со свойствами изученных ранее внеклеточных бактериолитических ферментов этой бактерии.

Научная новизна работы. Установлена химическая структура пептидогликана грамотрицательной бактерии Lysobacter sp.

Впервые на примере Lysobacter sp. проведено сравнение вне- и внутриклеточных бактериолитических ферментов у одной и той же бактерии. При этом в клетках Lysobacter sp. XL 1, не секретирующих внеклеточные бактериолитические ферменты, обнаружено 9 внутриклеточных (автолитических) ферментов. В условиях секреции внеклеточных ферментов в клетках Lysobacter sp. XL 1 выявлен дополнительный автолитический фермент. В клетках Lysobacter sp. XL 2, утративших способность секретировать внеклеточную эндопептидазу, этот дополнительный автолитический фермент не обнаружен. Показано, что спектр этих ферментов Lysobacter sp. включает в себя глюкозаминидазы, мурамидазы, 1Ч-ацетилмурамоил-1^аланин амидазы и эндопептидазы. Он существенно отличается от спектра внеклеточных бактериолитических ферментов по количеству, субстратной специфичности и свойствам.

Установлено, что автолитические ферменты присутствуют в цитозоле клеток, в периплазме и во фракции клеточных стенок и мембран.

Показано, что спектр и уровень активности автолитических ферментов изменяется в процессе роста бактерии.

Получен очищенный препарат цитозольной эндопептидазы, выявленной только в клетках Lysobacter sp. XL 1, секретирующих внеклеточные бактериолитические ферменты. Показано, что этот фермент имеет ряд свойств, аналогичных свойствам внеклеточной эндопептидазы Ль Это и тот факт, что цитозольная эндопептидаза отсутствует в клетках Lysobacter sp. XL 2, утративших способность секретировать внеклеточную эндопептидазу Ль позволило предположить, что цитозольная эндопептидаза может являться предшественником внеклеточной эндопептидазы.

Научно-практическое значение. Полученные в работе новые данные расширяют наше представление о механизме функционирования внутриклеточных и внеклеточных бактериолитических ферментов бактерий. Настоящая работа по своему характеру относиться к разряду фундаментальных исследований. Однако, полученные результаты имеют также и практическое значение, так как они могут быть использованы для оптимизации условий секреции внеклеточных бактериолитических ферментов Lysobacter sp. XL 1, выяснения перспективности обогащения автолитическими ферментами медицинского препарата лизоамидаза, и как следствие - улучшение его качества и бактериолитических свойств.

ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ ГЛАВА 1. Распространенность бактериолитических ферментов в природе.

Бактериолитическими ферментами принято называть ферменты, способные разрушать клеточные стенки бактерий и, тем самым, вызывать лизис бактериальной клетки.

Еще в начале XX века ученые обратили внимание на способность выделений и экстрактов тканей животных лизировать суспензии некоторых грамположительных бактерий. Так, в 1909 г русский ученый Н. Лященко впервые описал бактериолитические свойства белка куриного яйца и предположил, что это может быть связано с присутствием в нем специфического энзима (Егоров, 1986). Спустя 13 лет английский микробиолог А. Флеминг открыл и выделил из некоторых биологических жидкостей и тканей человека лизоцим - бактериолитический фермент, разрушающий клеточные стенки бактерий (Fleming, 1922) С тех пор и до настоящего времени ведется интенсивная работа по изучению бактериолитических ферментов.

Сейчас известно, что способность продуцировать и использовать бактериолитические ферменты является одной из общих черт всех живых организмов, от вирусов до человека (Salton, 1957; Kato et al., 1960; Hash et al., 1964; Ghuysen et al., 1966; Tsugita, 1971; Imoto et al., 1972; Головина, 1972; Головина и др., 1973; Fermor, Wood, 1981; Звягинцева, 1981; Бухарин, Усвяцов, 1981; Кузнецов и др., 1982; Valinger et al., 1982; Taylor, 1983; Кулаев и др., 1984; Mollner et al., 1984; Захарова, Павлова, 1985; Holtje, Tuomanen, 1991; Shockman, Holtje, 1994; Holtje, 1995; Степная и др., 1999; Smith et al., 2000).

Наиболее распространенными и изученными бактериолитическими ферментами растительного, грибного и животного происхождения являются лизоцимы. Они были обнаружены в молоке, слизи, моче и тканях животных, а также в некоторых тканях растений и грибов (Salton, 1957; Hash et al., 1964; Imoto et al., 1972; Hara, Matsushima,

1972; Phillips, 1974; Fermor, Wood, 1981; Taylor, 1983). Кроме лизоцимов, в сыворотках человека и некоторых млекопитающих также были обнаружены бактериолитические М-ацетилмурамоил-Ь-аланин амидазы (Valinger et al., 1982; Mollner et al., 1984).

Принято считать, что бактериолитические ферменты растений, животных и других высших организмов являются частью их иммунной системы и выполняют защитные функции (Imoto et al., 1972; Strominger, Tipper, 1974; Valinger et al., 1982).

Самый широкий спектр бактериолитических ферментов обнаружен у бактерий. Бактериолитические ферменты бактерий по функции и локализации принято разделять на две группы. Первую группу составляют внутриклеточные (автолитические) ферменты, выявленные у всех изученных бактерий. Они играют ключевую роль в росте и делении бактериальной клетки и поэтому являются для них жизненно необходимыми (De Boer et al., 1990; Holtje, Tuomanen, 1991; Shockman, Holtje, 1994; Holtje, 1995; Blackman et al., 1998; Smith et al., 2000). К этой группе также относятся литические ферменты бактериальных спор, которые активируются в период их прорастания (Gombas, Labbe, 1981; Makino et al., 1994; Sekiguchi et al., 1995; Atrih et al., 1998; Boland et al., 2000; Smith et al., 2000).

Вторая группа - это внеклеточные бактериолитические ферменты. Способность секретировать внеклеточные бактериолитические ферменты широко распространена как у грамотрицательных, так и у грамположительных бактерий. У грамотрицательных бактерий наибольшее количество активных культур встречается среди представителей рода Pseudomonas, а у грамположительных - Bacillus, Staphylococcus, Streptomyces и Clostridium (Звягинцева, 1981; Shockman, Holtje, 1994; Smith et al., 2000). Внеклеточные бактериолитические ферменты бактерий, с одной стороны выполняют защитные функции, а с другой - являются факторами агрессии и участвуют в завоевании бактерией-продуцентом области обитания и в снабжении ее пищей (Strominger, Ghuysen, 1967; Кулаев и др., 1984; Степная и др., 1999).

Особую группу составляют бактериолитические ферменты, гены которых локализованы на хромосомах бактериофагов. Эти ферменты, экспрессируемые бактериофагами на поздних этапах их развития, необходимы для разрушения клеточной стенки бактерии-хозяина и освобождения зрелых инфекционных фаговых частиц. Наиболее изученными ферментами этого класса являются: лизоцим бактериофага лямбда Е. coli (Black, Hogness, 1969), лизоцим бактериофага Т4 (Szewczyk, Skorko, 1983) и М-ацетилмурамоил-Ь-аланин амидаза бактериофага Т7 (Kleppe et al., 1977).

ГЛАВА 2. Структура клеточной стенки бактерий - субстрата бактериолитических ферментов.

Специфическим субстратом бактериолитических ферментов являются клеточные стенки бактерий. Они представляют собой многокомпонентную структуру, защищающую содержимое бактериальной клетки и осуществляющую ее связь с внешней средой (Koch, 1995).

Клеточные стенки бактерий интенсивно изучались на протяжении нескольких десятков лет. За этот период накоплен большой фактический материал по структуре и функциям бактериальных клеточных стенок, который изложен в ряде обзоров (Salton, 1952; Rogers et al., 1980; Archibald et al., 1993; Salton, 1994; Labishinski, Maidhof, 1994; Koch, 1995).

По способности окрашиваться по Граму все эубактерии принято разделять на грамположительные, которые окрашиваются по Граму, и грамотрицательные бактерии -неокрашиваемые по Граму. Такое различие связано с принципиально разным строением клеточных стенок у этих бактерий (рис. 1а,б). а. б.

Рис. 1. Структура клеточной стенки микроорганизмов (White, 1995). а. Структура клеточной стенки грамположительных бактерий.

Р, Pr, Pg, Pw, Pm - белки, PI - фосфолигхид, G1 - гликолипид, PG - пептидогликан, SP -тейхоевые кислоты, тейхуроновые кислоты, полисахариды, aLTA, LTAt, LTAx, dLTAx — липотейхоевые кислоты, L - липиды. б. Структура клеточной стенки грамотрицательных бактерий.

LPS - липополисахарид, О - О-антигенный специфический полисахарид, С - кор, А -липид А, Р - порин, PL - фосфолипид, MLP - липопротеин, Рг - белок, от - внешняя мембрана, pg - пептидогликан, cm - цитоплазматическая мембрана.

Заключение диссертации по теме «Биохимия», Ситкин, Борис Викторович

выводы

1. Установлена химическая структура пептидогликана бактерии Lysobacter sp.

2. В клетках Lysobacter sp. XL 1, не секретирующих внеклеточные бактериолитические ферменты обнаружено 9 внутриклеточных (автолитических) ферментов. В этих же клетках, в условиях секреции внеклеточных бактериолитических ферментов, выявлен дополнительный автолитический фермент.

3. В клетках Lysobacter sp. XL 2, утративших способность секретировать внеклеточную эндопептидазу, этот дополнительный автолитический фермент не обнаружен.

4. Автолитические ферменты Lysobacter sp. XL 1 и Lysobacter sp. XL 2 выявлены во всех клеточных фракциях: цитозоле, периплазме и во фракции клеточных стенок и мембран. Показано, что большая часть автолитических ферментов локализована в цитозоле.

5. Спектр и уровень активности автолитических ферментов зависит от стадии роста культуры.

6. Определена субстратная специфичность автолитических ферментов Lysobacter sp. XL 1. Среди них выявлены глюкозаминидазы, мурамидазы, Г^-ацетилмурамоил-Ц-аланин амидазы и эндопептидазы. Свойства автолитических ферментов Lysobacter sp. XL 1 были близки между собой и отличались от свойств внеклеточных бактериолитических ферментов.

7. Получен очищенный препарат цитозольной эндопептидазы, выявленной только в клетках Lysobacter sp. XL 1, секретирующих внеклеточные бактериолитические ферменты, и охарактеризованы его свойства. Сходство свойств этого фермента со свойствами внеклеточной эндопептидазы Lysobacter sp. XL 1 и отсутствие его в клетках Lysobacter sp. XL 2, позволяет выдвинуть предположение о том, что данный фермент является препробелком внеклеточной эндопептидазы.

6.9. Заключение.

В настоящей работе было проведено изучение автолитических ферментов грамотрицательной бактерии Lysobacter sp. При этом в клетках Lysobacter sp. XL 1, не секретирующих внеклеточные бактериолитические ферменты, обнаружено 9 автолитических ферментов различной локализации. Шесть из них были выявлены в цитозоле (Ai-A$), один в периплазме (Ag) и два во фракции клеточных стенок и мембран (А9, Аю). В условиях секреции внеклеточных ферментов в клетках Lysobacter sp. XL 1 выявлен дополнительный цитозольный автолитический фермент А7. В клетках Lysobacter sp. XL 2, утративших способность секретировать внеклеточную эндопептидазу JIi, этот дополнительный автолитический фермент не обнаружен.

При переходе культуры от логарифмической к стационарной стадии роста наблюдались изменения в спектре и в уровне активности отдельных автолитических ферментов бактерии. Возможно, это обусловлено тем, что на разных стадиях роста бактериальной клетке необходимы различные автолитические ферменты.

Установлена химическая структура пептидогликана - субстрата автолитических ферментов Lysobacter sp. XL 1. Показано, что пептидогликан бактерии в соответствии с существующей классификацией может быть отнесен к А1у типу, который характерен для большинства изученных грамотрицательных бактерий. Знание структуры пептидогликана Lysobacter sp. XL 1 позволило определить субстратную специфичность у большинства обнаруженных автолитических ферментов бактерии по отношению к связям этого полимера. Оказалось, что ферменты Ai, Ag, Аю - глюкозаминидазы, А4, Ад - мурамидазы, A3, Аб - М-ацетилмурамоил-1^-аланин амидазы и А5, А7 - эндопептидазы. Следует отметить, что среди внеклеточных ферментов не выявлено глюкозаминидаз.

Показано, что свойства наиболее активных автолитических ферментов бактерии (А5 и Аб) значительно отличались от свойств внеклеточных бактериолитических ферментов. Так, эти автолитические ферменты проявляли максимальную активность в широком диапазоне концентраций буфера, при слабо щелочной реакции среды, при невысокой температуре, а также являлись термолабильными белками. Внеклеточные ферменты, в отличие от внутриклеточных ферментов, наоборот проявляли максимальную активность в среде с пониженной ионной силой, при достаточно высокой температуре и являлись термостабильными белками.

Получен очищенный препарат цитозольной эндопептидазы А7, выявленной только в клетках Lysobacter sp. XL 1, секретирующих внеклеточные бактериолитические ферменты. Показано, что этот фермент имеет ряд свойств аналогичных свойствам внеклеточной эндопептидазы JIi. Это и тот факт, "то цитозольная эндопептидаза отсутствует в клетках Lysobacter sp. XL 2, утративших способность секретировать внеклеточную эндопептидазу Ль позволило предположить, что цитозольная эндопептидаза может являться предшественником внеклеточной эндопептидазы.

Интересно, что молекулярная масса цитозольной эндопептидазы А7 (40-45 кДа) почти в 2 раза больше молекулярной массы внеклеточной эндопептидазы Ль Возможно внеклеточная эндопептидаза Лг является продуктом протеолитического расщепления цитозольной эндопептидазы А7.

К настоящему моменту уже известна N-концевая аминокислотная последовательность внеклеточной эндопептидазы Ль Сравнение полученной последовательности с белковыми последовательностями, представленными в базе данных DNASTAR в системе ATLAS (http://vms.mips. biochem. mpg. del mips/programs/atlas, html) показало высокую степень гомологии с N-концевой последовательностью а-литической протеиназы из Lysobacter enzymogenes (ЕС 3.4.21.12). Сравнение аминокислотной последовательности пептидов, полученных из эндопептидазы Лх (в сумме 62 аминокислотных остатка), с аминокислотной последовательностью а-литической протеиназы из Lysobacter enzymogenes (198 аминокислотных остатка) также выявило их большую гомологию (92%) со структурой соответствующих участков аминокислотной последовательности а-литической протеиназы. Это позволило идентифицировать внеклеточную бактериолитическую эндопептидазу JIi бактерии Lysobacter sp. XL1 как а-литическую протеиназу (ЕС 3.4.21.12) (Муранова и др., 2004).

Известно, что внеклеточная а-литическая протеиназа из Lysobacter enzymogenes имеет молекулярную массу 19 кДа и обладает М-ацетилмурамоил-Ь-аланин амидазной и эндопептидазной активностями. По этим свойствам фермент идентичен эндопептидазе Лг. а-Литическая протеиназа Lysobacter enzymogenes синтезируется в цитозоле клеток бактерии в виде препробелка с молекулярной массой 40 кДа. То есть зрелый белок, также как и в нашем случае, имел молекулярную массу вдвое меньше, чем предшественник. Однако, авторами не было показано, обладал ли цитозольный препробелок ферментативной активностью (Epstein, Wensink, 1997).

Возможно, что цитозольная эндопептидаза А7 является препробелком внеклеточной эндопептидазы Л1 и обладает при этом ферментативной активностью.

Чтобы окончательно выяснить, является ли А7 предшественником внеклеточной эндопептидазы Лг необходимо выделить фермент А7 в электрофоретически гомогенном виде в достаточном для установления аминокислотной последовательности этого белка количестве и сравнить аминокислотные последовательности ферментов А7 и Л]. Однако, это исследование будет являться задачей наших будущих исследований.

Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Ситкин, Борис Викторович, 2004 год

1. Бегунова Е.А., Степная О.А., Лысанская В.Я., Кулаев И.С. 2003. Специфичность действия ферментов препарата лизоамидаза на клеточные стенки Staphylococcus aureus 209 Р. Биохимия, 68: 896-901.

2. Бухарин О.Б., Усвяцов. 1981. Лизоцимная активность микроорганизмов. Антибиотики, 10: 782-793.

3. Головина И.Г., Гужова Э.П., Богданова Т.И., Логинова Л.Г. 1972. О литических ферментах, образуемых термофильным актиномицетом Mictomonospora vulgaris DA II-4. Микробиология, 42: 620-624.

4. Головина И.Г. 1973. Литические ферменты микроорганизмов. Успехи микробиологии, 8:108-136.

5. Доссон Р., Эллиот Д., Эллиот У., Джонсон К. 1991. Справочник биохимика. Мир, Москва, 544 с.

6. Дэвис Р., Ботстайн Д., Рот Дж. 1984. Методы генетической инженерии. Мир, Москва, 142 с.

7. Егоров Н.С. 1986. Основы учения об антибиотиках. Высшая школа, Москва, 447 с.

8. Захарова И.Я., Павлова И.Н. 1985. Литические ферменты микроорганизмов. Наукова думка, Киев, 216 с.

9. Звягинцева И.С. 1981. Внеклеточные гидролазы грамотрицательных и грамположительных микроорганизмов. Успехи микробиологии, 16: 81-103.

10. Клесов А.А. 1984. Ферментативный катализ. Изд-во МГУ, Москва, 216 с.

11. Кузнецов В.Д., Гуреева М.Н., Шпокенс А.П., Уискуренас А.П. 1982. Образование литических ферментов актиномицетами. Изв. АН СССР. Биология, 3: 440-443.

12. Кулаев И.С., Северин А.И., Абрамочкин Р.В. 1984. Бактериолитические ферменты микробного происхождения в биологии и медицине. Вестн. АМН СССР, 8: 64-69.

13. Машковский М.Д. 1998. Лекарственные средства. "Торсинг", Харьков, т.2, изд. 13: 117-118.

14. Муранова Т.А., Красовская Л.А., Цфасман И.М., Степная О.А., Кулаев И.С. 2004.

15. Структурные исследования и идентификация внеклеточной бактериолитической эндопептидазы Л1 Lysobacter sp. XL 1. Биохимия, 69: 617-622.

16. Наумова И.Б. 1978. Тейхоевые кислоты в регуляции биохимических процессов у микроорганизмов. Биохимия, 43: 195-207.

17. Наумова А.Б., Шашков А.С. 1997. Анионные полимеры клеточных стенок грамположительных бактерий. Биохимия, 62: 947-982.

18. Остерман Л.А. 1981. Хроматография белков и нуклеиновых кислот. Наука, Москва, 536 с.

19. Полевая Л.К. 1982. Гомология лизоцимов бактериального и животного происхождения. Молекулярная биология, 16:1211-1222.

20. Степная О.А., Северин А.И., Кудрявцева А.И., Крупянко В.И., Козловский А.Г., Кулаев И.С. 1992. Ферменты бактериолитического комплекса лизоамидаза. Некоторые свойства бактериолитической протеиназы Лг. Прикладная биохимия и микробиология, 228: 666-673.

21. Степная О.А., Бегунова Е.А., Цфасман И,М., Кулаев И.С. 1996а. Бактериолитический ферментный препарат лизоамидаза: выделение и некоторые физико-химические свойства внеклеточной мурамидазы бактерии Xanthomonas sp. Биохимия, 61: 648-655.

22. Степная О.А., Цфасман И.М., Ледова Л.А., Петрикевич С.Б., Бегунова Е.А., Кулаев И.С. 1996в. Бактериолитический ферментный препарат лизоамидаза. Очистка и некоторые свойства бактериолитической пептидазы Li. Биохимия, 61: 656-663.

23. Степная О.А., Ледова Л.А., Кулаев И.С. 1999. Бактериолитические ферменты. Успехи биологической химии. 39: 327-354.

24. Стрешинская Г.М., Наумова И.Б., Панина Л.И. 1979. Химический состав клеточной стенки Streptomyces chrysomallus, образующего антибиотик аурантин. Микробиология, 48: 814-819.

25. Цфасман И.М., Степная О.А., Бажанова Н.В., Кулаев И.С. 2000. Внутриклеточная глюкозаминидаза бактерии Xanthomonas campestris ИБФМ В-124: очистка и некоторые свойства. Биохимия, 65:1225-1230.

26. Archibald A.R. 1980. Receptors and recognition. In: Virus receptors, ser. B, 7, (Randall L.L., Philipson L., eds), Chapman and Hall, London: 7-26.

27. Aksnes L., Grov A. 1974. Studies on the bacteriolytic activity of Streptomyces albus culture filtrates. 1. The effect of variations in cultivation conditions and the screening of various enzyme specificities. Acta Chem. Scandinavica, 28:185-192.

28. Archibald A.R., Amstrong J.J., Baddiley J., Hay J.B. 1961. Teichoic acids and the structure of bacterial cell wall. Nature, 191: 570-572.

29. Archibald A.R. 1974. The structure, biosynthesis and function of teichoic acid. Adv. Microb. Physiol., 11:53-59.

30. Archibald A.R., Hancock I.C., Harwood C.R. 1993. Cell wall struchure, synthesis and turnover. In: Bacillus subtilis and other gram-positive bacteria (Hoch J.A., Losick R., eds), American Society for Microbiology, Washington D.C.: 381-410.

31. Atrih A., Foster S.J. 1999. The roles of peptidoglycan structure and structural dynamics during dormancy and germination. Antonie Leeuwenhoek, 75: 299-307.

32. Atrin A., Bacher G., Allmanier G., Williamson M.F., Foster S.J. 1999. Analysis of peptidoglycan structure from Bacillus subtilis 168 and the role of PBP 5 in its maturation. J. bacterilogy, 181:3956-3968.

33. Baddiley J. 1972. Teichoic acids in cell walls and membranes of bacteria. Essays Biochem., 8: 35-77.

34. Baddiley J., Hancock I.C., Scherwood P.M.A. 1973. X-ray photoelectron studies of magnesium ions bound to the cell walls of gram-positive bacteria. Nature, 243: 43-45.

35. Baddiley J. 1988. The function of teichoic acids in walls and membranes of bacteria. In: The Roots of Mordern Biocemistry (Kleinkauf von Dohren, Jaenicke S., eds.), Walter de Gruyter and C°, Berlin-New York: 223-229.

36. Ballardie F.W., Capon B. 1972. 3,4-Dinitrophenyl tetra-N-acetyl-p-D-chitotetraoside a good chromophoric substrate for hen's egg-white lysozyme. J. Chem. Soc. Commun, 14: 828-829.

37. Benz R. 1994. Uptake of solutes through bacterial outer membranes. In: New Comprehensive Biochemistry. Bacterial cell wall (Ghuysen J.-M., Hakenbeck R., eds), Elsevier Science B.V., Amsterdam, The Netherlands: 397-424.

38. Bernadsky G., Beveridge T.J., Clarke A.J. 1994. Analysis of the sodium dodecyl sulfate-stable peptidoglycan autolysins of select gram-negative phatogens by using renaturing polyacrylamide gel electrophoresis. J. Bacteriol., 176:5225-5232.

39. Beveridge T.J. 1981. Ultrastructure chemistry and function of the bacterial wall. Intern. Rev. Cytol., 72: 229-317.

40. Beveridge T J. 1999. Structure of gram-negative cell walss and their derived membrane vesicles. J. Bacteriol., 181: 4725-4733.

41. Black L.W., Hogness D.S. 1969. The lysozyme of baceriophage lambda. I. Purification and molecular weight. J. Biol. Chem., 244:1968-1975.

42. Blackmail S.A., Smith T.J., Foster S.J. 1998. The role of autolysins during vegetative growth of Bacillus subtilis 168. Microbiology, 144: 73-82.

43. Boland F.M., Atrin A., Chirakkal H., Foster S.J., Moir A. 2000. Complete spore-cortex hydrolysis during germination of Bacillus subtilis 168 requires Sle В and Ype B. Microbiology, 146: 57-64.

44. Braun V., Sieglin U. 1970. The covalent murein-lipoprotein structure of Escherichia coli cell wall. Eur. J. Biochem., 13: 336-346.

45. Braun V., Wu H.C. 1994. Lipoproteins, structure, function, biosynthesis and model to protein export. In: New Comprehensive Biochemistry. Bacterial cell wall (Ghuysen J.-M., Hakenbeck R., eds), Elsevier Science B.V., Amsterdam, The Netherlands: 319-342.

46. Briese Т., Hakenbeck R. 1985. Interaction of the pneumococcal amidase with lipoteichoic acid and choline. Eur. J. Biochem., 146: 417-427.

47. Broun W.C., Wilson C.R., Lukehart S. 1976. Analysis of autolysins in temperature-sensitive mutant of Bacillus subtilis. J. Bacteriol., 125:166-173.

48. Brown W.C. 1973. Rapid methods to extracting autolysins from Bacillus subtilis. Appl. Microbiol., 25: 295-300.

49. Buist G., VenemaG., Kok J. 1998. Autolysis of Lactococcus lactis is influenced by proteolysis. J. Bacteriol., 180: 5947-5953.

50. Burget I.D.J., Murray R.G.E. 1974. Septum formation in Escherichia coli: characterization of septae structure and the effects of antibiotics on cell division. J. Bacteriol., 119: 20522056.

51. Chaloupka J., Kreckova P., Richova L. 1962a. Changes in the character of the cell wall in growth of Bacillus megaterium cultures. Folia Microbiol. (Prague), 7, 269-274.

52. Chaloupka J., Kreckova P., Richova L. 1962b. The mucopeptide turnover in the cell walls of growing cultures of Bacillus megaterium K.M. Experientia, 18: 362-364.

53. Chatterjee A.N., Park J.T. 1964. Biosynthesis of cell wall mucopeptide by a particulate fraction from Staphylococcus aureus. Proc. Nat. Acad. Sci. USA, 54: 9-16.

54. Cleveland R.F., Wicken A.J., Daneo-Moore L., Shockman G.D. 1976. Inhibition of wall autolysis in Streptococcus faecalis by lipoteichoic acid and lipids. J. Bacteriol., 126: 192197.

55. Cornett J.B., Johnson C.A., Shockman G.D. 1979. Release of autolytic enzyme from Streptococcus faecalis cell wall by treatment with dilute alcali. J. Bacteriol., 138: 699-704.

56. Costerton J.W., Ingram J.M., Cheng L. 1974. Structural and function of the cell envelope of gram-negative bacteriae. Bacteriol. Rev., 81: 87-110.

57. Coyette J., Shockman G.D. 1973. Some properties of the autolytic N-acetylmuramidase of Lactobacillus acidophilus. J. Bacteriol., 114:34-41.

58. Croux C., Canard В., Goma G., Soucaille P. 1992. Purification and characterization of an extracellular muramidase of Clostridium acetobutylicum ATCC-824 that acts on non-N-acetylated peptidoglycan. Appl. Env. Microbiol., 58:1075-1081.

59. Croux C., Ronda C., Lopez R., Garcia J.L. 1993. Role of the C-terminal domain of the lysozyme of Clostridium acetobutylicum ATCC 824 in a chimeric pneumococcal-clostridial cell wall lytic enzyme. FEBS, 336:111-114.

60. Croux C., Ronda C., Lopez R., Garcia J.L. 1998. Interchange of functional domains switches enzyme specificity: construction of a chimeric pneumococcal-clostridial cell wall lytic enzyme. Mol. Microbiol., 9:1019-1025.

61. De Boer PA., Cook W.R., Rothfield L.1.1990. Bacterial cell divisioin. Annu. Rev. Genet., 24: 249-274.

62. Duez C., Lakaye В., Houba S., Dusart J., Ghuysen J.M. 1990. Cloning, nucleotide sequence and amplified expression of the gene encoding the extracellular metallo (Zn) DD-peptidase of Streptomyces albus G. FEMS Microbiol. Lett., 59: 215-219.

63. Dijkstra A.J., Keck W. 1996. Peptidoglycan as barrier to transenvelope transport. J. Bacteriol., 178: 5555-5562.

64. Doyle R.J., Koch A.L. 1987. The function of autolysins in the growth and division of Bacillus subtilis. Crit. Rev. Microbiol., 15: 169-222.

65. Doyle R.J., Chaloupka J., Vinter V. 1988. Turnover of cell walls in microorganisms. Microbiol. Rev., 52:554-567.

66. Duong F., Eichler J., Price A., Leonard M.R., Wickner W. 1997. Biogenesis of the Gram-negative bacterial envelope. Cell, 91:567-573.

67. Ehlert K., Holtje J.V., Templin M.F. 1995. Cloning and expression of a murein hydrolase lipoprotein from Escherichia coli. Mol. Microbiol., 16: 761-768.

68. Engel H., Smink A.J., Van Wijngaarden L., Keck W. 1992. Murein-metabolizing enzymes from Escherichia coli: on the existence of a second lytic transglycosylase. J. Bacteriol., 175:120-210.

69. Epstein D.M., Wensink P.C. 1988. The a-lytic protease gene of Lysobacter enzymogenes. J. Biol. Chem., 263:16586-16590.

70. Fan D.P. 1970. Cell wall binding properties of the Bacillus subtilis autolysin(s). J. Bacteriol., 103: 488-493.

71. Fan D.F., Beckman M.M. 1971. Mutant of Bacillus subtilis demonstrating requirement of lysis for growth. J. Bacteriol., 105: 629-636.

72. Fan D.P., Beckman M.M. 1972. New centrifugation technique for isolating enzymes from large cell structure: isolation and characterization of two Bacillus subtilis autolysins. J. Bacteriol., 109:1258-1265.

73. Fan D.P., Beckman M.M. 1973a. Micrococcus lysodeikticus bacterial wall as a substrate specific for the autolytic glycosidase of Bacillus subtilis. J. Bacterid., 114: 804-813.

74. Fan D.P., Beckman B.E. 1973b. Structural difference between walls from hemispherical caps and partial septa of Bacillus subtilis. J. Bacteriol., 114: 790-797.

75. Fairbanks J., Steck Т., Wallach D. 1971. Electrophoretic analysis of the major polypeptides of the human erythrocyte membrane. Biochemistry, 10: 2606-2617.

76. Fein J.E., Rogers H.J. 1976. Autolytic enzymes-deficient mutants of Bacillus subtilis 168. J. Bacteriol., 127:1427-1442.

77. Fein J.E. 1979. Possible involvement of bacterial autolytic enzymes in flagellar morphogenesis. J. Bacteriol., 137: 933-946.

78. Fermor T.R., Wood DA. 1981. Degradation of bacteria by Agaricus bisporus and other fungi. J. Gen. Microbiol., 126: 377-388.

79. Fischer W. 1994. Lypoteichoic acids and lipoglycans. In: New Comprehensive Biochemistry. Bacterial cell wall (Ghuysen J.-M., Hakenbeck R., eds), Elsevier Science B.V., Amsterdam, The Netherlands: 199-216.

80. Fleming A. 1922. Proc. R. Soc. (London, ser. B), 93: 306-317.

81. Formanek M., Formanek K.S., Wawra H. 1974. A three-dimensional atomic model of the murein layer of bacteria. Eur. J. Biochem., 46: 279-294.

82. Formanek M., Schleifer R.H., Seidle H.P., Lindemann R., Zundel G. 1976. Three-dimensional structure of peptidoglycan of bacterial cell walls: infrared investigation. FEBS Lett., 70:150-154.

83. Formanek M. 1985. Three-dimensional model of the carbohydrate moieties of murein and pseudomurein. Z. Naturforsch, 40:555-561.

84. ForsbergC.W., Rogers H.J. 1974. Characterization of Bacillus licheniformis 6346 mutants with have altered lytic enzymes activities. J. Bacteril., 118: 358-368.

85. Foster S.J. 1992. Analysis of the autolysins of Bacillus subtilis 168 during vegetative growth and differentiation by using renaturing polyacrylamide gel electrophoresis. J. Bacterid., 174: 464-470.

86. Ghuysen J.M., Tipper D.T., Birge C.H., Strominger J.L. 1963. Structure of the cell wall of Staphylococcus aureus strain Copenhagen. Preparetion of fragments of enzymatic hydrolysis. Biochim. Biophys. Acta, 2:1110-1119.

87. Ghuysen J.M., Tipper D.T., Strominger J.L. 1966. Enzymes that degrade bacterial cell wall. In: Methods in Enzymology (Colowick S.P. and Kaplan N.O., eds), Acad. Press, New York, 8: 685-699.

88. Ghuysen J.M. 1968. Use of bacteriolytic enzymes in determination of wall structure and they role in cell metabolism. Вас. Rev., 32:425-464.

89. Ghuysen J.M. 1991. Serine beta-lactamases and penicillin-binding proteins. Annu. Rev. Microbiol., 45: 37-67.

90. Ghuysen J.M., Brasseur J.L., Joris В., Shockman G.D. 1994. Binding site-shaped repeated sequences of bacterial wall peptidoglycan hydrolases. FEBS Lett., 342: 23-28.

91. Glauner В., Holtje J,V., Schwarz U. 1988. Composition of the murein of Escherichia coli. J. Biol. Chem., 263:10088-10095.

92. Gombas D.E., LabbeRG. 1981. Extraction of spore-lytic enzyme from Clostridium perfingens spores. J.Gen. Microbiol., 126: 37-44.

93. Goodell E.W. 1985. Recycling of murein by Escherichia coli. J. Bacteriol., 163: 305-310.

94. Goodwin S.D., Shedlarski J.C. 1975. Purification of cell wall peptidoglycan of dimorphic bacterium Caulobacter crescentus. Arch. Biochem. Biophys, 170: 23-36.

95. Groicher K.H., Firek В .A., Fujimoto D.F., Bayles K.W. 2000. The Staphylococcus aureus lrg AB operon modulates murein hydrolase activity and penicillin tolerance. J. Bacteriol., 2000,182:1794-1801.

96. Hara S., Matsushima I. 1972. Stadies on the substrate specificity of egg white lysozyme. A comparative study of the substrate specificity of lysozyme from different sources. J. Biochem., 72: 993-1000.

97. Hase S., Matsushima I. 1977. The structure of the branching point between acidic polysaccharide and peptidoglycan in Micrococcus lysodeikticus cell wall. J.Biochem., 81: 1181-1186.

98. Hash J.H., Wishnick M., Miller PA. 1964. Formation of «protoplasts» of Staphylococcus aureus with a fungal N-acetylhexosaminidase. J. Bacteriol. 87: 432-437.

99. Haska I. 1972. Purification and properties of lytic enzymes from Myxococcus virescenens. Physiol. Plant, 27:139-142.

100. Heidrich С., Ursinus A., Berger J., Schwarz H., Hcltje J.V. 2002. Effects of multyple deletions of murein hydrolases on viability, septum cleavage and sensitivity to large toxic molecules in Escherichia coli. J. Bacteriol., 184: 6093-6099.

101. Hendersen ТА., Templin M, Young K.D. 1995. Indntification and cloning of the gene encoding penicillin-binding protein 7 of Escherichia coli. J. Bacteriol., 177: 2074-2079.

102. Higgins M.L., Pooley H.M., Shockman G.D. 1970. Site of initiation of cellular autolysis in Streptococcus faecalis as seen by electron microscopy. J. Bacteriol., 103: 504512.

103. Holtje J.V. 1975. Novel type of murein transglycosylase in Escherichia coli. J. Bacteriol., 124:1067-1076.

104. Holtje J.V., Tomasz A. 1975. Lypoteichoic acid: a specific inhibition of autolysin in Pneumococcus. Proc. Nat. Acad. Sci. USA, 72:1690-1694.

105. Holtje J.V., Glauner B. 1990. Structure and metabolism of the murein sacculus. Res. Microbiol., 141: 75-89.

106. Holtje J.-V., and Tuomanen E.I. 1991. The murein hydrolases of Escherichia coli: properties, function and impact on the course of infection in vivo. J. Gen. Microbiol., 137: 441-454.

107. Holtje J.V. 1995. From growth to autolysis: the murein hydrolases in Escherichia coli. Arch. Microbiol., 164: 243-254.

108. Holtje J.V., 1998. Growth of the stress-bearing and shape-maintaining murein sacculus of Escherichia coli. Microbiol. Mol. Biol. Rev., 62:181-203.

109. Honore N., Nicolas M.H., Cole S.T. 1986. Inducible cephalosporinase production in clinical isoletes of Enterobacter cloacae is controlled by a regulatory gene that has been deleted from Escherichia coli. EMBO J., 5:3709-3714.

110. Huang J.Z., Schell MA. 1990. Evidence that extracellular export of the endoglucanase encoded by egl Pseudomonas solanacearum occurs by a two-step process involving a lipoprotein intermediate. J. Biol. Chem., 265: 11628-11632.

111. Huang J.Z., Schell MA. 1992. Role of the two component leader sequence and mature acid sequences in extracellular export of endoglucanase EGL from Pseudomonas solanacearum. J. Bacterid., 174: 1314-1323.

112. Imoto Т., Jonson L.N. North A.C.T., Phillips D.C., Rupley JA. 1972. Vertebrate lysozyme. In: The enzymes (Boyer P.D., ed), New York-London: Acad. Press, 7: 665-868.

113. Irhuma A., Gallagher J., Hackett T.J., McHale A.P. 1991. Studies on N-acetylglucosaminidase activity produced by Streptomyces hydroscopicus. Biochim. Biophys. Acta, 1074:1-5.

114. Ishikawa S., Hara Y., Ohnishi R., Sekiguchi J. 1998. Regulation of a new cell wall hydrolase gene cwlF, which affects cell separation in Bacillus subtilis. J. Bacteriol., 180: 2549-2555.

115. Iversen O.J., Grov A. 1973. Studies of lysostaphin. Separation and characterization on three enzymes. Eur. J. Biochem., 38: 293-300.

116. Kamamura Т., Shockman G.D. 1983. Purification and some properties of the endogenous, autolytic N-acetylmuramylhydrolase of Streptococcus faecium, a bacterial glycoenzyme. J. Biol. Chem., 258: 9514-9521.

117. Kariyama R., Shockman G.D. 1992. Extracellular and cellular distribution of muramidase-2 and muramidase-1 of Enterococcus hirae ATCC 9790. J. Bacteriol., 174, 3236-3241.

118. Kato К., Matsubara Т., Mori J., Kotani S. 1960. «Protoplasts» formation in Staphylococcus aureus using the lytic enzyme produced by a Flavobacterium. Biken'S J., 3: 201-203.

119. Kato K., Umemoto Т., Fukuhara H., Sagawa H., Kotani S. 1981. Variation in dibasic amino acid in the wall peptidoglycan of bacteria of genus Fusobacterium. FEMS Microbiol., Lett., 10: 81-85.

120. Kawata S., Takemura Т., Takase Y., Yokogawa K. 1984. Purification and characterization of N-acetyl-muramyl-L-alanine amidase from Streptomyces globisporus 1829. Agr. Biol. Chem., 48: 261-269.

121. Keck W., Van Leeuwen A.M., Leuber M., Goodell E.W. 1990. Cloning and characterization of mep A, the structural gene of the penicillin-insensitive murein hydrolase from Escherichia coli. Mol. Microbiol., 4: 209-219.

122. Kehoe MA. 1994. Cell-wall-associated proteins in Gram-positive bacteria. In: New Comprehensive Biochemistry. Bacterial cell-wall (Ghuysen J.-M., Hakenbeck R., eds), Elsevier Science B.V., Amsterdam, The Netherlands: 217-261.

123. Kim S.Y., Ohk S.H., Bai D.H., Yu J.H. 1999. Purification and properties of bacteriolytic enzymes from Bacillus licheniformis YS-1005 against Streptococcus mutants. Bioscience biotechnology and biochemistry, 63: 73-77.

124. Kleppe Y., Jensen H.B., Pryme I.F. 1977. Purification and characterization of the lytic enzyme N-acetylmuramyl-L-alanine amidase of Bacteriophage T-7. Eur. J. Biochem., 76: 317-326.

125. Koch A.L. 1995. Bacterial growth and form. Chapmen and Hall, New York, 385 p.

126. Koch A.L. 2000. The exoskeleton of bacterial cells (the sacculus): still a highly specific target for antibacterial agents that will last for a long time. Crit. Rev. Microbiol., 25: 275307.

127. Kohlrausch U., Holtje J.V. 1991. Murein and murein precursor analysis during antiobiotic-induced lysis of Escherichia coli. J. Bacteriol., 173: 3425-3431.

128. Komatsuzawa H., Sugai M., Nakashima S., Suginaka H. 1995. Alteration of bacteriolytic enzymes profile of Staphylococcus aureus during growth. Microbiol. Immunol., 39: 629-633.

129. Komatsuzawa H., Sugai M., Nakashima S., Yamada A., Matsumoto Т., Oshida Т., Suginaka H. 1997. Subcelullar localization of the major autolysin ATL and its processed proteins in Staphylococcus aureus. Microbiol. Immunol., 41:469-479.

130. Korat В., MotH H., Keck W. 1991. Penicillin-binding protein 4 of Escherichia coli: molecular cloning of the dac В gene, controlled overexpression and alterations in murein composition. Mol. Microbiol., 5: 675-684.

131. Romberg A., Horecker B.L. 1955 Glucose-6-phosphate dehydrogenase. In: Methods in Enzymology (Colowick S.P., Kaplan, N.O., eds), Acad. Press, New York, 2: 323-325.

132. Romberg A. 1955. Lactic dehydrogenes. In: Methods in Enzymology (Colowick S.P., Kaplan, N.O., eds), Acad. Press, New York, 2:441-443.

133. Kulakauskas S., Wikstrom P.M., Berg D.E. 1991. Efficient introduction of cloned mutant alleles into the Esherichia coli chromosome. J. Bacteriol., 173: 2633-2638.

134. Ruroda A., Sekiguchi J. 1990. Cloning, sequencing and genetic mapping of a Bacillus subtilis cell wall hydrolase gene. J. Gen. Microbiol., 136: 2209-2216.

135. Ruroda A., Sekiguchi J. 1991. Molecular cloning and sequencing of a major Bacillus subtilis autolysins gene. J. Bacteriol., 173: 7304-7312.

136. Ruroda A., Sugimoto Y., Funahashi Т., Sekiguchi J. 1992. Genetic structure, isolation and characterization of a Bacillus licheniformis cell wall hydrolases. Mol. Gen. Genet., 234: 129-137.

137. Kuroda A., Sekiguchi J. 1993. High-level transcription of the major Bacillus subtilis autolysin operon depends on expression of the sigma D gene and is affected by a sin (aD) mutation. J. Bacteriol., 175: 795-801.

138. Labischinski H., Maidhof H. 1994. Bacterial peptidoglycan: overview and evolving concepts. In: New Comprehensive Biochemistry. Bacterial cell-wall (Ghuysen J.-M., Hakenbeck R., eds), Elsevier Science B.V., Amsterdam, The Netherlands: 23-28.

139. Laemmli U.K. 1970. Cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage T-4. Nature, 277: 680-685.

140. Lederer E., Adam A., Ciorbaru R., Petit J.F., Wietzerbin J. 1975. Cell walls of mycobacteria and related organisms: chemistry and immunostimulant properties. Mol. Cell Biochem., 7: 87-104.

141. Leyh-Bouille M., Ghuysen J.M., Tripper D.J., Strominger J.L. 1966. Structure of the cell wall of Micrococcus lysodeikticus I. Study of the structure of the glycan. Biochemistry, 10: 3079-3090.

142. Lindsay В., Glaser L. 1976. Characterization of the N-acetylmuramic acid L-alanine amidase from Bacillus subtilis. J. Bacteriol., 127: 803-811.

143. Lopez R., Garcia E., Garcia O., Garcia J.P. 1997. The pneumococcal cell wall degrading enzymes: a modular design to create new lysins? Microb. Drug Resist., 2: 199211.

144. Lowry O.H., Rosebrough N.J., Farr A.L., Randall R.J. 1951. Protein measurement with the Folin phenol reagent. J. Biol. Chem., 193: 265-275.

145. Makino S., Ito N., Inoue Т., Miyata S., Moriyama R. 1994. A spore-lytic enzyme released from Bacillus cereus spores during germination. Microbiology, 140: 1403-1410.

146. Margot P., Mauel C., Karamata D. 1994. The gene of the N-acetylglucosamidase, a Bacillus subtilis 168 cell wall hydrolase not involved in vegetative cell wall autolysis. Mol. Microbiol., 144:535-545.

147. Margot P., Pagni M., Karamata D. 1999. Bacillus subtilis 168 gene lyt F encodes a y-D-glutamate-meso-diaminopimelate muropeptidase expressed by the alternative gevetative sigma factor, cD. Microbiology, 145: 57-65.

148. Mauk J., Glaser L. 1970. Turnover of the cell wall of Bacillus subtilis W-23 during logariphmic growth. Biochem. Byophys. Res. Communs, 39: 699-706.

149. Mauk K., Chan L., Glaser L. 1971. Turnover of the cell wall of gram-positive bacteria. J. Biol. Chem., 246:1820-1827.

150. McDowell T.D., Lemanski C.L. 1988. Absence of autolytic activity (peptidoglycan nicking) in penicillin-induced nonlytic death in a group a Streptococcus. J. Bacteriol., 170: 1783-1788.

151. McLaughlan A.M., Foster S.J. 1998. Molecular characterization of an autolytic amidase of Listeria monocytogenes. EGD. Micribiol., 144:1359-1367.

152. Mesnage S., Fouet A. 2002. Plasmid-encoded autolysin in Bacillus anthracis: modular structure and catalytic properties. J. Bacteriol., 184: 331-334.

153. Mollner S., Braun V. 1984. Murein hydrolase (N-acetylmuramyl-L-alanine amidase) in human serum. Arch. Microbiol., 140: 171-177.

154. Moreillon P., Markiewicz Z., Nachman S., Tomasz A. 1990. Two bactericidal targets for penicillin in pneumococci: autolysis-dependent and autolysis-independent killin mechanisms. Antimicrob. Agents Chemother., 34:33-39.

155. Morrissey J. 1981. Silver stainig of proteins in polyacrylamide gels: increased sensitivity by a blue toning. Anal. Biochem., 117: 307-310.

156. Munoz E., Ghuysen J.M., Leyh-Bouille M., Petit J.F., Tinelli R. 1966. Structural variation in bacterial ceel wall peptidoglycans studied with Streptomyces F1 endo-N-acetylmuramidase. Biochemistry, 5: 3091-3098.

157. Murao S., Takahara G. 1973. Lytic enzymes for gram-negative bacteria prodused by Bacillus subtilis YT-25. Agr. Biol. Chem., 37: 2671-2673.

158. Naumova I.B. 1988. The teichoic acids of actinomycetes. Microbiol. Sci, 5: 275-279.

159. Navarre W.W., Schneewind O. 1999. Surface proteins of gram-positive bacteria and mechanisms of their targeting to the cell wall envelope. Microbiology And Molecular Biology Reviews, 63:174-229.

160. Neu H., Heppel LA. 1965. The release of enzymes from Escherichia coli by osmotic shock and during the formation of spheroplasts. J. Biol. Chem., 240: 3685-3692.

161. Nossal N.G., Heppel LA. 1966. The release of enzymes by osmotic shock from Escherichia coli in exponential phase. J. Biol. Chem., 241: 3055-3062.

162. Ohnishi R., Ishikawa S., Sekiguchi J. 1999. Peptidoglycan hydrolase Lyt F plays a role in cell separation with Cwl F during vegetative growth of Bacillus subtilis. J. Bacteriol., 181: 3178-3184.

163. Ornstein L., Devis B.J. 1964. Disc electrophoresis. I. Background and theory. Ann. N.Y. Acad. Sci., 121:321-403.

164. Park L.C., Shockman G.D., Higgins M.L. 1980. Growth of Streptococcus mutants protoplast is not inhibited by penicillin. J. Bacteriol., 143:1491-1497.

165. Park J.T. 1995. Why does Escherichia coli recycle its cell wall peptides? Mol. Microbiol., 17: 421-426.

166. Phillips D.C. 1965. The structure and function of lysozyme. Proc. Roy. Inst. Gt. Brit., 40:530 p.

167. Pink D., Moeller J., Quinn В., Jericho M., Beveridge T.J. 2000. On the architecture of the gram-negative bacterial murein sacculus. J. Bacteriol., 182: 5925-5930.

168. Pochlner J., Halter R., Beyreuther K., Meyer T.F. 1987. Gene structure and extracellular secretion of Neisseria gonorrhoeae IgA protease. Nature, 325: 458-462.

169. Pooley H.M. 1976. Turnover and spreading of old wall during surface growth of Bacillus subtilis. J. Bacteriol., 125:1127-1138.

170. Pooley H., Karamata D. 1984a. Flagellation and the control of autolysisns in Bacillus subtilis. In: Microbial, cell wall synthesis and autilysis (Nombela C., ed.), Elsevier Sciense B.V., Amsterdam, The Netherlands: 13-19.

171. Pooley H., Karamata D. 1984b. Genetic analysis of autol у sin-deficient and agellaless mutants of Bacillus subtilis. J. Bacteriol., 160:1123-1129.

172. Reevers P. 1994. Biosynthesis and assembly of lipopolysaccharide. In: New Comprehensive Biochemistry. Bacterial cell wall (Ghuysen J.-M., Hakenbeck R., eds), Elsevier Science B.V., Amsterdam, The Netherlands: 281-318.

173. Reisfeld RA., Lewis U.J., Williams D.E. 1962. Disk electrophoresis of basic protein and peptides on polyacrylamide gel. Nature, 195: 281.

174. Rhuland L.E., Work E., Denman R.F., Hoare D.S. 1955. The behavior of the isomers of a,£-diaminopimelic acid on paper chromatograms. J. Am. Chem. Soc., 77: 959-966.

175. Robinnson J.M., Hardman J.K., Sloan G.L. 1980. The characteristics of extracellular protein secretion by Staphylococcus staphylolyticus. J. Gen. Microbiol., 118: 529-533.

176. Rogers H.J. 1967. Killing of Staphylococci by penicillins. Nature, 213: 31-33.

177. Rogers H.J., McConnell M., Burdet G.D.J. 1970. The isolation and characterization of mutants of Bacillus licheniformis with disturbed morphology and cell division. J. Gen. Microbiol., 61:155-171.

178. Rogers H.J., Forsberg C.W. 1971. Role of autolysins in killing of bacteria by some bacterial antibiotics. J. Bacteriol., 108:1236-1243.

179. Rogers H.J., Pooley H.M., Thurman P.F., Taylor C. 1974. Wall and membrane growth in Bacilli and their mutants. Ann. Microbiol., 125:135-147.

180. Rogers H.J., Perkins H.R., Ward J.B., 1980. Microbial cell walls and membranes. Chapman and Hall, Ltd., London, United Kingdom, 564 p.

181. Rogers H.J., Taylor C., Rayter S., Ward J.B. 1984. Purification and properties of an autolytic endo-P-glucosaminidase and the N-acetylmuramyl-I^alanine amidase from Bacillus subtilis strain 168. J. Gen. Microbiol., 130: 2395-2402.

182. Salton M.R. 1952. The nature of the cell walls of some Gram-positive and Gram-negative bacteria. Biochim. Biophys. Acta., 9: 334-335.

183. Salton M.R.J. 1957. The properties of lysozyme and its action on microorganisms. Bacterial. Rev. 21: 82-99.

184. Salton M.R.J. 1994. The bacterial cell envelope a historical perspective. In: New Comprehensive Biochemistry. Bacterial cell wall (Ghuysen J.-M., Hakenbeck R., eds), Elsevier Science B.V., Amsterdam, The Netherlands: 1-22.

185. Sanz J.M., Diaz E., Garcia J.L. 1992. Studies on the structure and function of the N-terminal domain of the pneumococcal murein hydrolases. Mol. Microbiol., 6: 921-931.

186. Schindler CA., Schuhardt V.T. 1964. Lysostaphin: a new bacteriolytic agent for the staphylococcus. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 51: 414-421.

187. Schleifer K.N., Kandler O. 1972. Peptidoglycan types of bacterial cell wallsand their taxonomic implications. Bact. Rev, 36: 407-477.

188. Schleifer K.H., Joseph R. 1973. A directly cross-linked ^ornithine containing peptidoglycan in cell walls of Spirochaeta stenostera. FEBS Lett., 36: 83-86.

189. Schmelzer E., Weckesser J., Warth R., Mayer M. 1982. Peptidoglycan of Rhodopseudomonas viridis: partial lack of N-acetyl substitutionof glucosamine. J. Bacteriol., 88: 815-816.

190. Sekiguchi J., Akeo K., Yamamoto H., Khasov F.K., Alonso J.C., Kuroda A. 1995.

191. Nucleotide sequence and regulation of a new putative cell wall hydrolase gen, cwl D, which affects germination in Bacillus subtilis. J. Bacterilogy, 177:5582-5589.

192. Shockman G.D., Kolb J.J., Toennie S.G. 1958. Relations between bacterial cell wall synthesis, growth phase and autolysis. J. Biol. Chem., 230: 961-977.

193. Shockman G.D., Daneo-Moore L., Cornet J.B., Mychajlonka M. 1979. Does penicillin kill bacteria? Rev. Infect. Dis., 1: 787-796.

194. Shockman G.D. 1992. The autolytic (suicide) system of Enterococcus hirae: from lysine depletion autolysis to biochemical and molecular studies of the two muramidase of Enterococcus hirae ATCC 9790. FEMS Microbiol. Lett., 79: 261-267.

195. Shockman G.D., and Holtje J.-V. 1994. Microbiol peptidoglycan (murein) hydrolases. In: New Comprehensive Biochemistry. Bacterial Cell Wall (Ghuysen, J.M., and Hakenbeck, R. eds), Elsevier Sciense B.V., Amsterdam, The Netherlands: 131-165.

196. Shockman G.D., Daneo-Moore L., Karyama R., Massidda O. 1996. Bacterial walls, peptidoglycan hydrolases, autolysins and autolysis. Microb. Drug Resist., 2: 95-98.

197. Sinha R.K., Rosental R.S. 1980. Release of soluble peptidoglycan from growing gonococci: demonstration of anhydromuramyl-containing fragments. Infect. Immun., 29: 914-925.

198. Sleytr U.B., Messner P., Pim D., Sara M. 1993. Crysrtalline bacterial cell surface layers. J. Bacteriol., 10: 911-916.

199. Sleytr U.B. 1997. Basic and applied S-layer research: an overview. FEMS Microbiol. Rev., 20:5-12.

200. Smith T.J., Blackman SA., Foster S.J. 1996. Peptidoglycan hydrolases of Bacillus subtilis 168. Microb. Drug Resist., 2:113-118.

201. Smith T.J., Blackman SA., Foster S.J. 2000. Autolysins of Bacillus subtilis: multiple enzymes with multiple function. Microbiology, 146: 249-262.

202. Spackman D.H., Stein W.H., Moore S., 1958. Automatic recording apparatus for use in the chromatography of amino acids. Anal. Chem., 30:1190-1210.

203. Stevens L. 1996. Egg proteins: what are their functions? 79: 65-87.

204. Strominger J.L., Ghuysen J.M. 1967. Mechanisms of enzymatic bacteriolysis. Science, 156: 213-221.

205. Strominger J.L., Tipper D.J. 1974. Structure of bacterial cell wall: the lysozyme substrate. In: Lysozyme (Osserman E.F.,Canfield R.E., Beychok S. eds), Acad. Press, NewYork-London: 169-184.

206. Szewczyk В., Skorko R. 1983. Purification and some properties of bacteriophage T-4 particle associated lysozyme EC 3.2.1.17. Eur. J. Biochem., 133: 717-722.

207. Sugai M., Akiyama Т., Komatsuzawa H., Miyake Y., Suginaka H. 1990.

208. Characterization of sodium dodecyl sulfate-stable Staphylococcus aureus bacteriolytic enzymes by polyacrylamide gell electrophoresis. J. Bacteriol., 172: 6494-6498.

209. Sutcliffe I.C., Russel R.R. 1995. Lipoprroteins of gram-positive bacteria. J. Bacteriol., 177:1123-1128.

210. Taylor A., Das B.C., Van Heijenoort J. 1975. Bacterial cell wall peptidoglycan fragments produced by phage lambda or Vi II endolysin and containing 1,6-anhydro-N-acetylmuramic acid. J. Biochem., 53: 47-54.

211. Taylor P.W. 1983. Bactericidal and bacteriolytic activity of serum against gram-negative bacteria. Microbiol. Rev.,47: 46-83.

212. Tempest D.W. 1969. In: Microbial Growth (Meadow P.N., Pirt S.J., eds ), 19-th Symposium of the Socierty for Gen. Microbiol., Cambridge University Press, Cambige, UK: 87-111.

213. Tomasz A. 1968. Biological consequences of the replacement of choline by ethanolamine in the cell wall of pneumococcus: chain formation loss of transformability and loss of autolysis. Proc. Nat. Acad. Sci. USA, 59: 86-93.

214. Tomasz A., Albino A., Zanati E. 1970. Multiple antibiotic resistence in a bacterium with suppressed autolytic system. Nature, 227:138-140.

215. Tomioko S., Matsuhashi M. 1978. Purification of penicillin-insensitive DD-endopeptidase: a new cell wall peptidoglycan-hydrolysing enzymes in Escherichia coli and it's inhibition by deoxyribonucleic acids. Biochem. Biophys. Res. Commun., 84: 978-984.

216. Tripper D.J., Ghuysen J.M., Strominger J.L. 1965. Structure of the cell wall of Staphylococcus aureus, strain Copenhagen. III. Further studies of the disaccharides. Biochemistry, 4: 468-473.

217. Tsugita A. 1971. Phage lysozyme and other lytic enzymes. In: The enzymes (Boyer P.D., ed), New York-London: Acad. Press, 5: 343-413.

218. Uchido К., Aido К. 1979. Taxonomic significance of cell-wall acyl type in Corynebacterium-Micobacterium-Nocardia group by a glycolate test. J. Gen. Apll. Microbiol., 25:169-183.

219. Umemoto Т., Ota Т., Sagawa H., Kato K., Takasa H., Tsujimoto M., Kawasaki A., Ogawa Т., Harada K., Kotani S. 1981. Chemical and biological properties of a peptidoglycan isolated from Treponema palladium Uasan. Infect. Immun., 31:161-11 A.

220. Ursinus A., Holtje J.V. 1994. Purification and properties of a membrane-bound lytic transglycosylase from Escherichia coli. J. Bacteriol., 176: 338-343.

221. Valence F., Lortal S., 1995. Zymogram and preliminary characterization of Lactobacillus helveticus autolysins. Appl. Environ. Microbiol., 61:3391-3399.

222. Vallinger Z., Ladesic В., Tomasic J. 1982. Partial purification and characterization of N-acetylmuramyl-L-alanine amidase from human and mouse serum. Biochim. Biophis. Acta, 701: 63-71.

223. Vasstrand E.N., Jensen H.B., Miron Т., Hofstad T. 1982. Composition of peptidoglycan in Bacteroidacea: determination and distribution of lanthionine. Infect. Immun., 36:114-122.

224. Wadstrom Т., Hisatsune K. 1970. Bacteriolytic enzymes from Staphylococcus aureus: purification of an endo-p-N-acetylglucosaminidase. Biochem. J., 120: 725-734.

225. Vanderwinkel E., De Vlieghere M., De Tanhoffer L. 1981. Activity of N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase in phospholipid^ environments. Biochim. Biophys. Acta, 663: 46-57.

226. Vanderwinkel E., De Vlieghere M. 1985. Modulate of Escherichia coli N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase activity by phosphatidylglycerol. Biochim. Biophys. Acta, 838: 54-59.

227. Ward J.B. 1981. Teichoic and teichuronic acids: Biosynthesis, assembly and location. Microbiol. Rev., 45: 211-243.

228. Ward J.B., Williamson R. 1984. Bacterial autolysins: specificity and function. In: Microbial, cell wall synthesis and autolysis (Nombela C., ed.), Elsevier Sciense B.V., Amsterdam, The Netherlands: 159-166.

229. White D. 1995. The Physiology and Biochemistry of Prokaryotes. Oxford University Press, N.Y., 378 p.

230. Weibull 1953. The isolation of protoplasts from Bacillus megaterium by controlled treatment with lysozyme. J. Bacteriol., 66: 688-695.

231. Williamson R., Ward J.B. 1981. Deficiency of autolytic activity in Bacillus subtilis and Streptococcus pneumoniae is associated with a decreased permeability of the wall. J. Gen. Microbiol., 125: 325-334.

232. Wren B.V. 1991. A family of clostridial and streptococcal ligand-binding proteins with conserved C-terminal repeat sequences. Mol. Microbiol., 5: 797-803.

233. Yem D.W., Wu H.C. 1976. Purification and properties of (3-D-acetylglucosaminides from Escherichia coli. J. Bacteriol., 125:324-331.

234. Yokogawa K., Kawata S., Yoshimura Y. 1973. Lytic enzyme from Streptomyces globisporus 1829. Agr. Biol. Chem., 37: 799-808.

235. Yokogawa K., Kawata S., Takemura Т., Yoshimura Y. 1975. Purification and properties of lytic enzymes from Streptomyces globisporus 1829. Agr. Biol. Chem., 39: 1533-1543.

236. Yoshimoto Т., Tsuru D. 1972. Studies on bacteriolytic Enzymes. II. Purification and someproperties of two types of staphylolytic enzymes from Streptomyces griseus. J. Biochem., 72:379.390.

237. Yoshino S., Ogata S., Hayashida S. 1982. Some properties of autolysins of Clostridiumsaccharoperbutylacetonicum. Agr. Biol. Chem., 46:1243-1248.