Конъюгаты борфторидных комплексов дипиррометена с аминокислотами: получение и физико-химические свойства тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 02.00.04, кандидат наук Ксенофонтова Ксения Витальевна

• Ксенофонтова Ксения Витальевна
• кандидат наук
• 2021

Оглавление диссертации кандидат наук Ксенофонтова Ксения Витальевна

Введение

1. Литературный обзор

1.1. Биоконъюгация

1.1.1. Биоконъюгация как понятие и процесс

1.1.2. Области применения биоконъюгатов

1.2. Аминокислоты

1.3. БОВ1РУ

1.3.1. Реакционноспособные по отношению к аминогруппам BODIPY

1.3.2. Реакционноспособные по отношению к карбоксильным группам БОБ1РУ

1.3.3. Реакционноспособные по отношению к сульфгидрильным группам БОБ1РУ

1.4. Конъюгаты аминокислота - БОЭ1РУ

2. Экспериментальная часть

2.1. Реактивы

2.2. Оборудование

2.3. Синтез BODIPY-прекурсоров

2.4. Синтез BODIPY-конъюгатов

2.4.1. Синтез BODIPY-конъюгатов, в которых аминокислота присоединена к флуорофору через а-аминогруппу

2.4.2. Синтез BODIPY-конъюгатов, в которых аминокислота присоединена к флуорофору через а-карбоксильную группу

2.4.3. Синтез BODIPY-конъюгатов, в которых аминокислота присоединена к флуорофору через радикал

2.5. Квантовохимическое моделирование

2.6. Расчет диаграмм равновесий в водных растворах аминокислот

2.7. Расчет фотофизических характеристик

3. Результаты и их обсуждение

3.1. Получение BODIPY-конъюгатов

3.1.1. Выбор оптимальной структуры BODIPY-прекурсора по результатам квантовохимического моделирования

3.1.2. Равновесия в водных растворах аминокислот

3.1.3. Синтез BODIPY-конъюгатов

3.2. Спектральные свойства BODIPY-конъюгатов

3.2.1. Спектры поглощения и испускания BODIPY-конъюгатов

3.2.2. Трехмерные спектры флуоресценции BODIPY-конъюгатов

3.3. Квантовохимическое исследование BODIPY-конъюгатов

Заключение

Список сокращений и условных обозначений

Список литературы

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Конъюгаты борфторидных комплексов дипиррометена с аминокислотами: получение и физико-химические свойства»

Введение

Актуальность и степень разработанности темы исследования:

Область создания флуоресцентных маркеров для биообъектов находится на передовом крае современной химической науки и смежных областей знания. Такие соединения находят свое применение для целей визуализации отдельных биомолекул, органелл и целых клеток [1-5], а также процессов с их участием [6, 7].

В этой связи неудивительно, что развитие химии борфторидных комплексов дипиррометена (BODIPY) вызывает особый интерес у сотен исследователей по всему миру. Данный класс соединений обладает рядом практически ценных свойств - высокой устойчивостью, большими молярными коэффициентами поглощения, высокими квантовыми выходами флуоресценции, относительно небольшими стоксовыми сдвигами, узкими пиками поглощения и испускания и, кроме того, легкостью модификации структуры, - выгодно выделяющих BODIPY-флуорофоры на фоне других органических люминофоров [8, 9].

Интересным с фундаментальной и прикладной сторон является получение конъюгатов борфторидных комплексов дипиррометена с различными биомолекулами, в том числе аминокислотами. Аминокислоты, являясь активными фрагментами биоконъюгатов, с одной стороны, служат модельными аналогами таких более сложных биологических объектов, как пептиды и белки, а с другой стороны, наделяют целевые молекулы рядом уникальных фотофизических и биохимических свойств. Конъюгаты типа аминокислота - BODIPY могут быть использованы для визуализации различных биохимических процессов, включая взаимодействие белков с другими биомолекулами, для отслеживания локализации и динамики белков, для мониторинга активности ферментов и т.п.

Важно отметить, что на сегодняшний день в научной литературе существует крайне ограниченное число работ [10-17], посвященных получению и исследованию конъюгатов типа аминокислота - BODIPY. В настоящей работе предпринята попытка восполнить этот пробел в данной области химической науки.

Цели и задачи исследования:

Целью работы является установление зависимости между строением и спектральными свойствами новых конъюгатов борфторидных комплексов дипирроме-тена с аминокислотами, различающихся способом присоединения аминокислотного фрагмента к остову флуорофора.

Для достижения поставленной цели решались следующие задачи:

• разработка оптимальной методики направленного синтеза конъюгатов борфторидных комплексов дипиррометена с аминокислотами, различающихся способом присоединения аминокислотного фрагмента к остову флуорофора;

• синтез конъюгатов борфторидных комплексов дипиррометена с аминокислотами, различающихся способом присоединения аминокислотного фрагмента к остову флуорофора;

• исследование спектральных свойств синтезированных конъюгатов посредством совокупности спектральных методов исследования: спектроскопии поглощения, двумерной (2D) и трехмерной (3D) спектроскопии флуоресценции;

• квантовохимическое моделирование структур и спектров поглощения рассматриваемых конъюгатов.

Научная новизна исследования:

Предложен простой и достаточно эффективный подход к синтезу конъюгатов борфторидных комплексов дипиррометена с аминокислотами, различающихся способом присоединения аминокислотного фрагмента к остову флуорофора. На основе разработанной методики успешно синтезированы 13 новых конъюгатов борфторидных комплексов дипиррометена с аминокислотами, которые можно разделить на три группы в зависимости от способа присоединения аминокислотного фрагмента к остову флуорофора. В первую группу входят конъюгаты ArgN-BOD-

AspN-BODIPY, CysN-BODIPY, GluN-BODIPY, HisN-BODIPY, LysN-BODIPY, MetN-BODIPY, TrpN-BODIPY и TyrN-BODIPY, в которых аминокислота присоединена к флуорофору через аминогруппу, во вторую - конъюгаты CysC-BODIPY и GluC-BODIPY, в которых аминокислота присоединена к флуорофору через карбоксильную группу, и в третью - конъюгаты GluR-BODIPY и LysR-BODIPY, в ко-

торых аминокислота присоединена к флуорофору через радикал.

Впервые исследованы спектральные свойства конъюгатов борфторидных комплексов дипиррометена с аминокислотами, различающихся способом присоединения аминокислотного фрагмента к остову флуорофора. Полученные спектры поглощения и 2D- и BD-спектры флуоресценции, а также ряд важнейших фотофизических характеристик позволили установить закономерности изменения спектральных свойств конъюгатов от их строения.

Впервые определены структурные, энергетические и спектральные характеристики конъюгатов борфторидных комплексов дипиррометена с аминокислотами, различающихся способом присоединения аминокислотного фрагмента к остову флуорофора. Установлен механизм тушения флуоресценции в конъюгатах, обусловленный фотоиндуцированным переносом электрона.

Теоретическая и практическая значимость работы:

Результаты расширяют имеющиеся представления о получении, свойствах и дальнейшем применении конъюгатов борфторидных комплексов дипиррометена с аминокислотами, различающихся способом присоединения аминокислотного фрагмента к остову флуорофора.

Предложенный подход к направленному синтезу конъюгатов борфторидных комплексов дипиррометена с аминокислотами, различающихся способом присоединения аминокислотного фрагмента к остову флуорофора, является простым (одностадийный процесс) и достаточно эффективным (выходы продуктов реакции достигают количественных значений) способом получения соединений такого типа. Разработанная нами методика может быть легко перенесена на более крупные биологические объекты - пептиды и белки.

Синтезированные конъюгаты, в силу присущих им уникальных спектральных характеристик, а также свойств водорастворимости и биодоступности, могут быть использованы для визуализации различных биологических молекул, включая белки и ферменты, а также для отслеживания их метаболизма и взаимодействий с другими биомономерами, биоолигомерами и биополимерами in vitro и in vivo. К другим перспективным областям применения данного класса координационных

соединений можно отнести доставку лекарственных средств и визуализацию процессов коагуляции крови.

Методология и методы исследования:

Для подтверждения структуры, чистоты и исследования свойств синтезированных соединений был задействован широкий спектр современных методов физико-химического анализа. Спектры ядерного магнитного резонанса (ЯМР) на ядрах 1H и 11B были получены на ЯМР-спектрометре Bruker Avance III 500. Инфракрасные (ИК) спектры были получены на ИК-Фурье спектрометре Bruker VERTEX 80v. Масс-спектры были получены на времяпролетном масс-спектрометре с матричной лазерной десорбционной ионизацией (MALDI TOF) Shimadzu AXIMA Confidence. Спектры поглощения и двумерные спектры флуоресценции были получены на спектрофлуориметре «СОЛАР» СМ2203. Трехмерные спектры флуоресценции были получены на флуоресцентном спектрофотометре Agilent Cary Eclipse. Квантовохимические расчеты были проведены в программном пакете PC GAMESS v. 12.

Положения, выносимые на защиту:

На защиту выносятся следующие основные положения и результаты:

• разработан оптимальный метод одностадийного направленного синтеза конъюгатов борфторидных комплексов дипиррометена с аминокислотами, различающихся способом присоединения аминокислотного фрагмента к остову флуоро-фора;

• синтезированы и идентифицированы 13 новых конъюгатов борфторидных комплексов дипиррометена с аминокислотами, различающихся способом присоединения аминокислотного фрагмента к остову флуорофора: ArgN-BODIPY, AspN-BODIPY, CysN-BODIPY, GluN-BODIPY, HisN-BODIPY, LysN-BODIPY, MetN-BOD-IPY, TrpN-BODIPY, TyrN-BODIPY, CysC-BODIPY, GluC-BODIPY, GluR-BODIPY и LysR-BODIPY;

• всесторонне изучены спектральные свойства синтезированных конъюгатов с использованием комплекса современных физико-химических методов исследования, включающих как экспериментальные подходы, так и компьютерное модели-

рование.

Степень достоверности и апробация результатов работы:

Достоверность результатов работы подтверждается воспроизводимостью экспериментальных данных, полученных с использованием ряда современных физико-химических методов анализа, а также согласованностью выводов, сделанных на основе сравнительного анализа экспериментальных, расчетных и литературных данных.

Основные результаты работы были представлены на следующих научных конференциях: IX Региональной студенческой научной конференции «Фундаментальные науки - специалисту нового века» (г. Иваново, 2012 г.), Региональной студенческой научной конференции Дни науки-2015 «Фундаментальные науки - специалисту нового века» (г. Иваново, 2015 г.), VII Конференции молодых ученых по общей и неорганической химии (г. Москва, 2017 г.), VIII Всероссийской молодежной школе-конференции «Квантово-химические расчеты: структура и реакционная способность органических и неорганических молекул» (г. Иваново, 2017 г.), Всероссийской школе-конференции «Фундаментальные науки - специалисту нового века» (Студенческая научная конференция «Дни науки ИГХТУ») (г. Иваново, 2017 г.), Всероссийской научной конференции «Фундаментальные науки - специалисту нового века» (Студенческая научная школа-конференция «Дни науки в ИГХТУ») (г. Иваново, 2018 г.), Кластере конференций 2018 (г. Суздаль, 2018 г.), the Eighth international workshop «Organic electronics of highly-correlated molecular systems» (г. Суздаль, 2018 г.), the Fifth international scientific conference «Advances in synthesis and complexing» (г. Москва, 2019 г.), XII Всероссийской школе-конференции молодых ученых «Теоретическая и экспериментальная химия жидкофазных систем» (Крестовские чтения - 2019) (г. Иваново, 2019 г.).

Публикации:

Основные результаты работы представлены в 5 статьях, опубликованных в журналах из Перечня рецензируемых научных изданий, и 11 тезисах докладов, опубликованных в сборниках трудов научных конференций различного уровня.

Личный вклад автора:

Заключается в изучении литературных источников по теме диссертационного исследования, планировании и проведении большинства экспериментальных и теоретических исследований, обработке, анализе и интерпретации всех полученных результатов. Постановка цели и задач работы, обсуждение результатов и формулировка выводов проводились совместно с научным руководителем.

Структура и объем диссертации:

Диссертация состоит из введения, литературного обзора, экспериментальной части, результатов и их обсуждения, заключения, списка сокращений и условных обозначений, списка литературы, включающего 191 цитируемую публикацию. Работа изложена на 134 страницах и содержит 48 рисунков и 10 таблиц.

Благодарности:

Автор выражает искреннюю благодарность своему научному руководителю, д.х.н., доценту, профессору кафедры неорганической химии (КНХ) Ивановского государственного химико-технологического университета (ИГХТУ) Румянцеву Евгению Владимировичу, за ценные советы и всестороннюю помощь на всех этапах планирования и проведения исследований. Автор также выражает благодарность к.х.н. Кочергиной Л.А., к.х.н., доценту, доценту кафедры аналитической химии (КАХ) ИГХТУ Черникову В.В., к.х.н., н.с. КАХ ИГХТУ Крутовой О.Н., к.х.н., м.н.с. Института химии растворов им. Г. А. Крестова Российской академии наук (ИХР РАН) Ксенофонтову А.А., к.ф.-м.н., с.н.с. ИХР РАН Ходову И.А., к.х.н., проректору по научной работе ИГХТУ Марфину Ю.С., м.н.с. КНХ ИГХТУ Молчанову Е.Е., м.н.с. КНХ ИГХТУ Меркушеву Д.А. и в целом всему коллективу лаборатории Координационной химии линейных олигопирролов КНХ ИГХТУ за поддержку и помощь на различных этапах исследования.

1. Литературный обзор

1.1. Биоконъюгация

1.1.1. Биоконъюгация как понятие и процесс

Биоконъюгация - это процесс образования посредством ковалентной связи сложного соединения между как минимум двумя молекулами, причем хотя бы одна из них должна иметь биологическое происхождение [18] (рисунок 1.1).

Рисунок 1.1 - Схема процесса образования биоконъюгата Таким образом, биоконъюгаты являются уникальными синтетическими молекулами, которые сочетают в себе свойства, присущие каждому входящему в их состав компоненту. В качестве классического примера биоконъюгата можно привести комплексы антитело - флуорофор [19-21], которые широко применяются для специфического взаимодействия через сайты связывания антигена на антителе и дальнейшего обнаружения за счет флуоресцентной метки различных биомолекул, что, безусловно, нехарактерно для немодифицированных антител.

В основе процесса создания биоконъюгатов лежит ряд базовых принципов [18, 22-24], строгое соблюдение которых гарантирует простоту, эффективность и контролируемость синтеза.

Дизайн перспективных биоконъюгатов начинается с выбора характеристик, которыми должна обладать целевая молекула, и только потом подбора конкретных соединений, необходимых для ее создания. В целом, свойства, которыми может быть наделен биоконъюгат, ограничены только воображением исследователя и доступностью компонентов для сборки.

Разнообразие стратегий синтеза биоконъюгатов для конкретных применений так же велико, как и число реакций и компонентов, с помощью которых эти соединения можно получить. Для каждой области использования направленно создаются конъюгаты с определенным набором физических, химических и биологических свойств. При этом каждый активный компонент и функциональный спейсер играет свою, строго определенную, роль. Кроме того, не менее важны условия среды как во время проведения конъюгации, так и в месте функционирования конечной молекулы.

В настоящий момент сформировался определенный пул сфер применения и надежных стратегий синтеза целевых конъюгатов, которые могут стать отправной точкой для исследователя, начавшего работать в области биоконъюгации. В таблице 1.1 приведены основные из них [18].

Таблица 1.1 - Примеры биоконъюгатов и компонентов для их сборки по некоторым сферам применения [18]

Применение Компоненты Конъюгаты

Иммуноанализ Антитела, ферменты, биотин, стрептавидин, антигены, реак-ционноспособные флуоресцентные красители, реакцион-носпособные фикобилипроте-ины, хелаты лантанидов, квантовые точки и др. Антитело - фермент / флуоро-фор / фикобилипротеин / хелат лантанида / квантовая точка, биотинилированное антитело - стрептавидин - фермент / флуорофор, стрептавидин -квантовая точка и др.

Биоимиджинг Антитела, ферменты, реакци-онноспособные флуоресцентные красители, биотин, стреп-тавидин, активированные на-ночастицы, олигонуклеотиды, пептиды, флуоресцентные белки и др. Антитело - фермент / флуоро-фор, биотинилированное антитело, стрептавидин - флуоро-фор и др.

Продолжение таблицы 1.1

Применение Компоненты Конъюгаты

Проточная ци-тометрия Антитела, реакционноспособ-ные флуоресцентные красители, фикобилипротеины, био-тин, стрептавидин, квантовые точки, активированные нано-частицы и др. Антитело - флуорофор / фико-билипротеин / квантовая точка / наночастица, биотин - антитело, стрептавидин - флуоро-фор / фикобилипротеин и др.

Количественный анализ белков, ДНК Антитела, реакционноспособ-ные флуоресцентные красители, флуоресцентные белки, биолюминесцентные ферменты, хелаты лантанидов, фикобилипротеины и др. Антитело - фермент / флуоро-фор / квантовая точка / хелат лантанида / фикобилипротеин, биотинилированное антитело, стрептавидин - флуорофор / фермент и др.

Создание вакцин Белки-носители, гаптены, антигены, пептиды, углеводы и др. Поперечно сшитые белки, белок-носитель - пептид / углевод / гаптен, полимеризован-ные антигены и др.

Отслеживание опухолей Антитела, полимеры, дендри-меры, химиотерапевтические препараты, токсины, ферменты, гаптены и др. Антитело - лекарство / фермент, антитело - полимер - лекарство, гаптен - лекарство и др.

Таким образом, составными частями любого конъюгата являются биомоле-

кулы - антитела, ферменты, белки, пептиды, углеводы и др. - и модифицирующие их свойства соединения - флуоресцентные красители, квантовые точки, наноча-стицы, лекарственные средства и др.

Совершенно очевидно, что для успешного осуществления биоконъюгации необходимы знания об особенностях химической структуры и функциях как молекул биологического происхождения, так и соединений, выступающих в качестве вспомогательных. Но все-таки ключом к созданию перспективного биоконъюгата

служит понимание того, как модификация биомолекулы повлияет на ее активность.

1.1.2. Области применения биоконъюгатов

В настоящее время можно выделить несколько основных областей применения биоконъюгатов (рисунок 1.2). К ним можно отнести количественный анализ биомолекул; детектирование, отслеживание и визуализацию биомолекул; очистку от примесей; катализ, модификацию биомолекул; таргетную терапию, диагностику in vivo; создание вакцин [18]. Остановимся на каждой области более подробно.

Одной из самых популярных областей применения биоконъюгатов служит область создания конъюгатов для количественного анализа целевых молекул, находящихся в сложной смеси [20, 21, 25, 26]. Зачастую подобные конъюгаты включают в себя два компонента. Первым компонентом является биомолекула (антитела, белки, пептиды и др.), способная селективно связывать молекулы-мишени, вторым - молекула (флуоресцентные метки, ферменты, хемилюминесцентные соединения и др.), позволяющая детектировать молекулы-мишени. Такой подход позволяет создать систему для количественного анализа практически любого биологически активного компонента смеси.

Следующей важной областью применения биоконъюгатов является детектирование, отслеживание и визуализация биомолекул [27-29]. Во многом эта область схожа с первой, за исключением того, что здесь принципиально важно только отследить молекулу-мишень. Так же, как и в предыдущем случае, такие конъюгаты являются двухкомпонентными, причем первым компонентов преимущественно являются антитела или их фрагменты, а в качестве второго компонента может выступать широкий ряд соединений - флуоресцентные и радиоактивные метки, ферменты, высококонтрастные вещества, наночастицы, углеродные нанотрубки, квантовые точки и др. Конъюгаты, сконструированные для данной сферы, позволяют визуализировать биомолекулы в клетках, тканях и организмах in vitro и in vivo. Кроме того, многочисленные исследования в области создания биоконъюгатов для детектирования, отслеживания и визуализации биомолекул, привели к стремитель-

Рисунок 1.2 - Ключевые области применения биоконъюгатов (изображения взяты из [18])

ному развитию таких ключевых для клеточной биологии методов, как флуоресцентная микроскопия [30, 31], иммуноокрашивание [32], высокосодержательный скрининг [33] и др.

Еще одной важной областью применения биоконъюгатов служит очистка многокомпонентных смесей от примесей, проявляющих биологическую активность. В ее основе лежат принципы аффинной хроматографии [34-36]. Отделение целевой примесной биомолекулы от смеси достигается за счет ее специфического взаимодействия с соответствующим природным или синтетическим аффинным ли-гандом, иммобилизованном на инертной твердой подложке. Данный подход широко используется при хроматографическом разделении веществ [37, 38] и исследованиях в области протеомики [39].

Другой обширной областью применения биоконъюгатов служит катализ жидкофазных реакций и модификация биологически активных молекул. Их отличительной особенностью является использование так называемых иммобилизованных реакторов [40] - закрепленных на инертной твердой подложке молекул со специфическими реакционноспособными группами. Такие конъюгаты позволяют либо катализировать определенные, важные с точки зрения биохимии, процессы (расщепление пептидных связей в белках, гидролиз гликозидных связей в углеводах и др.), либо направленно модифицировать или синтезировать биомолекулы для конкретных целей. Так, биоконъюгаты такого типа нашли свое применение в про-теомике и биотехнологии [41-43], производстве (например, биодизельного топлива [44]), органическом синтезе [45-47], экологии [48-50].

Без преувеличения, самой значимой областью применения биоконъюгатов является таргетная терапия и диагностика in vivo. «Идеальный» биоконъюгат для данной области - это комплекс, состоящий из специфического по отношению к молекуле-мишени компонента и лекарственного средства или эффекторной молекулы, который позволяет точечно воздействовать на опухолевые клетки, патогенные микроорганизмы и пр., не поражая при этом нормальные клетки и не нарушая работу организма в целом. Конъюгаты, отвечающие этим требованиям, применяются как для таргетной терапии раковых заболеваний [51-54], так и для обнаруже-

ния и визуализации опухолевых клеток in vivo [27, 55-57] и количественной оценки содержания маркеров заболевания и концентрации лекарственных средств в сыворотке крови in vitro [58]. Важно отметить, что конъюгированные лекарственные средства имеют ряд других преимуществ перед классическими препаратами, помимо их адресной доставки: повышенная химическая стабильность, увеличенный период полувыведения из организма, уменьшение побочных эффектов, большая растворимость в воде и др. [59, 60].

Другой не менее важной областью применения биоконъюгатов является создание вакцин на их основе [61-64]. Иммуногенные конъюгаты представляют собой усовершенствованную форму классических вакцин, в составе которых вместо ослабленных вирусов или бактерий присутствуют комплексы гаптен - носитель, которые формируют защитный иммунитет за счет использования ключевых пептидных последовательностей или других эпитопов вирусов или бактерий. В качестве носителей в таких системах выступают реакционноспособные чужеродные белки, синтетические полимеры, мицеллы и др., способные связывать несколько молекул гаптенов, которые представляют собой белковые фрагменты, небольшие пептидные последовательности, углеводы и др. иммуногенные компоненты целевого патогена.

Таким образом, биоконъюгация затронула многие важнейшие области современной науки, начиная с относительно простых биохимических исследований и заканчивая диагностикой и терапией смертельных заболеваний. Работа исследователей, направленная на создание новых функциональных конъюгатов, открывает, без преувеличения, безграничные перспективы для развития количественного анализа, детектирования, очистки, синтеза, визуализации, терапии, диагностики и практически любой другой мыслимой сферы.

Значительная часть существующих на настоящий момент биоконъюгатов содержит в своем составе молекулу белковой природы и люминофор, что обеспечивает эффективность мониторинга множества биохимических процессов in vitro и in vivo. Ввиду этого целью настоящей работы стала разработка и исследование спектральных свойств новых конъюгатов типа аминокислота - BODIPY. Как уже было

сказано ранее в разделе 1.1.1, для успешного осуществления биоконъюгации необходимы знания об особенностях химической структуры и функциях каждого активного компонента будущей сложной структуры. В связи с этим следует остановиться на каждой группе соединений, участвующих в интересующем нас процессе конъюгации, в отдельности.

1.2. Аминокислоты

Белковые молекулы являются, пожалуй, самыми частыми мишенями для модификации или конъюгации [22, 24, 65]. Обнаружение, анализ и отслеживание биологических молекул, используя при этом соответствующим образом измененные белки, - это основные области применения модифицированных и конъюгирован-ных систем. Возможность синтеза маркированных белков, обладающих специфичностью к другой молекуле, является ключевым моментом для большей части биологических исследований, клинической диагностики и терапии человека.

Пептиды и белки состоят из аминокислот, соединенных вместе жесткой пла-нарной пептидной (амидной) связью, которая образуется в ходе взаимодействия а-аминогруппы одной аминокислоты и а-карбоксильной группы другой аминокислоты (рисунок 1.3).

Пептидная связь

ОН

он

+ Н90

Пептидная группа

Рисунок 1.3 - Схема процесса образования пептидной связи Последовательность и свойства входящих в состав белков аминокислот определяют их структуру, реакционную способность и функции. Каждая аминокислота состоит из основной аминогруппы и кислотной карбоксильной группы, связанных с центральным а-атомом углерода (см. рисунок 1.3). Кроме того, с а-углеродным

атомом соединены атом водорода и боковая цепь, являющаяся уникальной для каждой аминокислоты. Существует 20 протеиногенных аминокислот, каждая из которых содержит свою собственную боковую цепь определенной химической структуры, заряда, способностью к образованию водородных связей, гидрофильности (или гидрофобности) и реакционной способности. Боковые цепи не участвуют в образовании полипептидных цепей и, таким образом, могут свободно взаимодействовать со своим окружением.

Единой классификации аминокислот не существует. В основу имеющихся классификаций заложен, как правило, всего один признак из ряда.

Строев [66] придерживается классификации, в основу которой положено строение бокового радикала аминокислоты: I. Ациклические соединения:

1. Алифатические незамещенные аминокислоты (моноаминомонокарбо-новые кислоты): глицин Gly, аланин Ala, валин Val, лейцин Leu, изолейцин Ile.

2. Алифатические замещенные аминокислоты:

а) гидроксиаминокислоты: серин Ser, треонин Thr;

б) тиоаминокислоты: цистеин Cys, метионин Met;

в) карбоксиаминокислоты (моноаминодикарбоновые кислоты): ас-парагиновая кислота Asp, глутаминовая кислота Glu, аспарагин Asn, глутамин Gln;

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Ксенофонтова Ксения Витальевна, 2021 год

Список литературы

1. Kowada, T. BODIPY-based probes for the fluorescence imaging of biomolecules in living cells / T. Kowada, H. Maeda, K. Kikuchi // Chemical Society Reviews. - 2015.

- Vol. 44, N 14. - P. 4953 - 4972.

2. Iqbal, Z. Phthalocyanine-biomolecule conjugated photosensitizers for targeted photodynamic therapy and imaging / Z. Iqbal, J. Chen, Z. Chen, M. Huang // Current Drug Metabolism. - 2015. - Vol. 16, N 9. - P. 816 - 832.

3. Carreon, J. R. Cyanine dye conjugates as probes for live cell imaging / J. R. Carreon, K. M. Stewart, K. P. Mahon, S. Shin, S. O. Kelley // Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters. - 2007. - Vol. 17, N 18. - P. 5182 - 5185.

4. Kaul, Z. An antibody-conjugated internalizing quantum dot suitable for long-term live imaging of cells / Z. Kaul, T. Yaguchi, J. I. Harada, Y. Ikeda, T. Hirano, H. X. Chiura,

5. C. Kaul, R. Wadhwa // Biochemistry and Cell Biology. - 2007. - Vol. 85, N 1. - P. 133

- 140.

5. Hong, H. In vivo targeting and imaging of tumor vasculature with radiolabeled, antibody-conjugated nanographene / H. Hong, K. Yang, Y. Zhang, J. W. Engle, L. Feng, Y. Yang, T. R. Nayak, S. Goel, J. Bean, C. P. Theuer, T. E. Barnhart, Z. Liu, W. Cai // ACS Nano. - 2012. - Vol. 6, N 3. - P. 2361 - 2370.

6. Yan, Y. Analysis of protein interactions using fluorescence technologies / Y. Yan, G. Marriott // Current Opinion in Chemical Biology. - 2003. - Vol. 7, N 5. - P. 635 -640.

7. Fokin, V. V. Click imaging of biochemical processes in living systems / V. V. Fokin // ACS Chemical Biology. - 2007. - Vol. 2, N 12. - P. 775 - 778.

8. Boens, N. Fluorescent indicators based on BODIPY / N. Boens, V. Leen, W. Dehaen // Chemical Society Reviews. - 2012. - Vol. 41, N 3. - P. 1130 - 1172.

9. Sakamoto, R. New aspects in bis and tris(dipyrrinato)metal complexes: Bright luminescence, self-assembled nanoarchitectures, and materials applications / R. Sakamoto, T. Iwashima, M. Tsuchiya, R. Toyoda, R. Matsuoka, J. F. Kögel, S. Kusaka, K. Hoshiko, T. Yagi, T. Nagayama, H. Nishihara // Journal of Materials Chemistry A. -

2015. - Vol. 3, N 30. - P. 15357 - 15371.

10. Guzow, K. Synthesis and photophysical properties of a new amino acid possessing a BODIPY moiety / K. Guzow, K. Kornowska, W. Wiczk // Tetrahedron Letters. - 2009.

- Vol. 50, N 24. - P. 2908 - 2910.

11. Sueyoshi, K. Hydrophobic labeling of amino acids: Transient trapping-capillary/microchip electrophoresis / K. Sueyoshi, K. Hashiba, T. Kawai, F. Kitagawa, K. Otsuka // Electrophoresis. - 2011. - Vol. 32, N 10. - P. 1233 - 1240.

12. Mendive-Tapia, L. Spacer-free BODIPY fluorogens in antimicrobial peptides for direct imaging of fungal infection in human tissue / L. Mendive-Tapia, C. Zhao, A. R. Akram, S. Preciado, F. Albericio, M. Lee, A. Serrels, N. Kielland, N. D. Read, R. Lavilla, M. Vendrell // Nature Communications. - 2016. - Vol. 7. - P. 10940.

13. Mendive-Tapia, L. Preparation of a Trp-BODIPY fluorogenic amino acid to label peptides for enhanced live-cell fluorescence imaging / L. Mendive-Tapia, R. Subiros-Funosas, C. Zhao, F. Albericio, N. D. Read, R. Lavilla, M. Vendrell // Nature Protocols.

- 2017. - Vol. 12, N 8. - P. 1588 - 1619.

14. Zhou, Z. A ratiometric fluorescent probe for monitoring leucine aminopeptidase in living cells and zebrafish model / Z. Zhou, F. Wang, G. Yang, C. Lu, J. Nie, Z. Chen, J. Ren, Q. Sun, C. Zhao, W.-H. Zhu // Analytical Chemistry. - 2017. - Vol. 89, N 21. -P. 11576 - 11582.

15. Wang, M. Synthesis and investigation of linker-free BODIPY-Gly conjugates substituted at the boron atom / M. Wang, G. Zhang, P. Bobadova-Parvanova, A. N. Merriweather, L. Odom, D. Barbosa, F. R. Fronczek, K. M. Smith, M. G. H. Vicente // Inorganic Chemistry. - 2019. - Vol. 58, N 17. - P. 11614 - 11621.

16. Subiros-Funosas, R. Fluorogenic Trp(redBODIPY) cyclopeptide targeting keratin 1 for imaging of aggressive carcinomas / R. Subiros-Funosas, V. C. L. Ho, N. D. Barth, L. Mendive-Tapia, M. Pappalardo, X. Barril, R. Ma, C.-B. Zhang, B.-Z. Qian, M. Sintes, O. Ghashghaei, R. Lavilla, M. Vendrell // Chemical Science. - 2020. - Vol. 11, N 5. -P. 1368 - 1374.

17. Wang, M. Linker-free near-IR aza-BODIPY-glutamine conjugates through boron functionalization / M. Wang, G. Zhang, N. Kaufman, P. Bobadova-Parvanova, F.

Fronczek, K. Smith, M. da G. H. Vicente // European Journal of Organic Chemistry. -2020. - Vol. 2020, N 8. - P. 971 - 977.

18. Hermanson, G. T. Introduction to bioconjugation 3rd ed. / G. T. Hermanson // Bioconjugate Techniques. - Elsevier Inc., 2013. - P. 1 - 125.

19. Coons, A. H. Immunological properties of an antibody containing a fluorescent group / A. H. Coons, H. J. Creech, R. N. Jones // Experimental Biology and Medicine. -1941. - Vol. 47, N 2. - P. 200 - 202.

20. Silverstein, A. M. Labeled antigens and antibodies: The evolution of magic markers and magic bullets / A. M. Silverstein // Nature Immunology. - 2004. - Vol. 5, N 12. - P. 1211 - 1217.

21. Specht, E. A. A Critical and comparative review of fluorescent tools for live-cell imaging / E. A. Specht, E. Braselmann, A. E. Palmer // Annual Review of Physiology. -2017. - Vol. 79. - P. 93 - 117.

22. Hermanson, G. T. Functional targets for bioconjugation 3rd ed. / G. T. Hermanson // Bioconjugate Techniques. - Elsevier Inc., 2013. - P. 127 - 228.

23. Hermanson, G. T. The reactions of bioconjugation 3rd ed. / G. T. Hermanson // Bioconjugate Techniques. - Elsevier Inc., 2013. - P. 229 - 258.

24. Chemistry of bioconjugates: Synthesis, characterization, and biomedical applications / ed. R. Narain. - Hoboken, NJ, USA: John Wiley & Sons, Inc., 2014. -483 p.

25. Leca-Bouvier, B. Biosensors for protein detection: A review / B. Leca-Bouvier, L. J. Blum // Analytical Letters. - 2005. - Vol. 38, N 10. - P. 1491 - 1517.

26. Goddard, J.-P. Recent advances in enzyme assays / J.-P. Goddard, J.-L. Reymond // Trends in Biotechnology. - 2004. - Vol. 22, N 7. - P. 363 - 370.

27. Luo, S. A review of NIR dyes in cancer targeting and imaging / S. Luo, E. Zhang, Y. Su, T. Cheng, C. Shi // Biomaterials. - 2011. - Vol. 32, N 29. - P. 7127 - 7138.

28. Liang, J. Specific light-up bioprobes based on AIEgen conjugates / J. Liang, B. Z. Tang, B. Liu // Chemical Society Reviews. - 2015. - Vol. 44, N 10. - P. 2798 - 2811.

29. Petryayeva, E. Quantum dots in bioanalysis: A review of applications across various platforms for fluorescence spectroscopy and imaging / E. Petryayeva, W. R.

Algar, I. L. Medintz // Applied Spectroscopy. - 2013. - Vol. 67, N 3. - P. 215 - 252.

30. Combs, C. A. Fluorescence microscopy: A concise guide to current imaging methods / C. A. Combs, H. Shroff// Current Protocols in Neuroscience. - 2017. - Vol. 79, N 1. - P. 2.1.1 - 2.1.25.

31. Shashkova, S. Single-molecule fluorescence microscopy review: Shedding new light on old problems / S. Shashkova, M. C. Leake // Bioscience Reports. - 2017. -Vol. 37, N 4. - P. BSR20170031.

32. Immunohistochemical staining methods 6th ed. / eds. C. R. Taylor, L. Rudbeck. -An Agilent Technologies Company, 2013. - 218 p.

33. Thomas, N. High-content screening: A decade of evolution / N. Thomas // Journal of Biomolecular Screening. - 2010. - Vol. 15, N 1. - P. 1 - 9.

34. Cuatrecasas, P. Protein purification by affinity chromatography. Derivatizations of agarose and polyacrylamide beads / P. Cuatrecasas // The Journal of Biological Chemistry. - 1970. - Vol. 245, N 12. - P. 3059 - 3065.

35. Hermanson, G. T. Immobilized affinity ligand techniques / G. T. Hermanson, A. K. Mallia, P. K. Smith. - San Diego: Academic Press, 1992. - 454 p.

36. Hage, D. S. Affinity chromatography: A review of clinical applications / D. S. Hage // Clinical Chemistry. - 1999. - Vol. 45, N 5. - P. 593 - 615.

37. Huse, K. Purification of antibodies by affinity chromatography / K. Huse, H.-J. Böhme, G. H. Scholz // Journal of Biochemical and Biophysical Methods. - 2002. -Vol. 51, N 3. - P. 217 - 231.

38. Gaberc-Porekar, V. Perspectives of immobilized-metal affinity chromatography / V. Gaberc-Porekar, V. Menart // Journal of Biochemical and Biophysical Methods. -2001. - Vol. 49, N 1 - 3. - P. 335 - 360.

39. Zhang, Q. Enrichment and analysis of nonenzymatically glycated peptides: Boronate affinity chromatography coupled with electron-transfer dissociation mass spectrometry / Q. Zhang, N. Tang, J. W. C. Brock, H. M. Mottaz, J. M. Ames, J. W. Baynes, R. D. Smith, T. O. Metz // Journal of Proteome Research. - 2007. - Vol. 6, N 6. - P. 2323 - 2330.

40. Matosevic, S. Fundamentals and applications of immobilized microfluidic

enzymatic reactors / S. Matosevic, N. Szita, F. Baganz // Journal of Chemical Technology & Biotechnology. - 2011. - Vol. 86, N 3. - P. 325 - 334.

41. Krenkova, J. Less common applications of monoliths: IV. Recent developments in immobilized enzyme reactors for proteomics and biotechnology / J. Krenkova, F. Svec // Journal of Separation Science. - 2009. - Vol. 32, N 5 - 6. - P. 706 - 718.

42. Ma, J. Recent advances in immobilized enzymatic reactors and their applications in proteome analysis / J. Ma, L. Zhang, Z. Liang, W. Zhang, Y. Zhang // Analytica Chimica Acta. - 2009. - Vol. 632, N 1. - P. 1 - 8.

43. Li, Y. High-efficiency nano/micro-reactors for protein analysis / Y. Li, L. Yan, Y. Liu, K. Qian, B. Liu, P. Yang, B. Liu // RSC Advances. - 2015. - Vol. 5, N 2. - P. 1331 - 1342.

44. Poppe, J. K. Enzymatic reactors for biodiesel synthesis: Present status and future prospects / J. K. Poppe, R. Fernandez-Lafuente, R. C. Rodrigues, M. A. Z. Ayub // Biotechnology Advances. - 2015. - Vol. 33, N 5. - P. 511 - 525.

45. Thompson, M. P. Biocatalysis using immobilized enzymes in continuous flow for the synthesis of fine chemicals / M. P. Thompson, I. Peñafiel, S. C. Cosgrove, N. J. Turner // Organic Process Research & Development. - 2019. - Vol. 23, N 1. - P. 9 - 18.

46. Miyazaki, M. Microchannel enzyme reactors and their applications for processing / M. Miyazaki, H. Maeda // Trends in Biotechnology. - 2006. - Vol. 24, N 10. - P. 463 -470.

47. Zhang, L. Sandwich-structured enzyme membrane reactor for efficient conversion of maltose into isomaltooligosaccharides / L. Zhang, Y. Su, Y. Zheng, Z. Jiang, J. Shi, Y. Zhu, Y. Jiang // Bioresource Technology. - 2010. - Vol. 101, N 23. - P. 9144 - 9149.

48. Qayyum, H. Remediation and treatment of organopollutants mediated by peroxidases: A review / H. Qayyum, H. Maroof, K. Yasha // Critical Reviews in Biotechnology. - 2009. - Vol. 29, N 2. - P. 94 - 119.

49. Bilal, M. Immobilized ligninolytic enzymes: An innovative and environmental responsive technology to tackle dye-based industrial pollutants - A review / M. Bilal, M. Asgher, R. Parra-Saldivar, H. Hu, W. Wang, X. Zhang, H. M. N. Iqbal // Science of the Total Environment. - 2017. - Vol. 576. - P. 646 - 659.

50. Fernández, L. Photodegradation of organic pollutants in water by immobilized porphyrins and phthalocyanines / L. Fernández, V. I. Esteves, Â. Cunha, R. J. Schneider, J. P. C. Tomé // Journal of Porphyrins and Phthalocyanines. - 2016. - Vol. 20, N 1 - 4. -P. 150 - 166.

51. Lambert, J. M. Antibody-drug conjugates for cancer treatment / J. M. Lambert, A. Berkenblit // Annual Review of Medicine. - 2018. - Vol. 69, N 1. - P. 191 - 207.

52. Greco, F. Combination therapy: Opportunities and challenges for polymer-drug conjugates as anticancer nanomedicines / F. Greco, M. J. Vicent // Advanced Drug Delivery Reviews. - 2009. - Vol. 61, N 13. - P. 1203 - 1213.

53. Lee, J. J. A review on current nanomaterials and their drug conjugate for targeted breast cancer treatment / J. J. Lee, L. S. Yazan, C. A. C. Abdullah // International Journal of Nanomedicine. - 2017. - Vol. 12. - P. 2373 - 2384.

54. Goodarzi, N. A review of polysaccharide cytotoxic drug conjugates for cancer therapy / N. Goodarzi, R. Varshochian, G. Kamalinia, F. Atyabi, R. Dinarvand // Carbohydrate Polymers. - 2013. - Vol. 92, N 2. - P. 1280 - 1293.

55. Bagalkot, V. Quantum dot-aptamer conjugates for synchronous cancer imaging, therapy, and sensing of drug delivery based on bi-fluorescence resonance energy transfer / V. Bagalkot, L. Zhang, E. Levy-Nissenbaum, S. Jon, P. W. Kantoff, R. Langer, O. C. Farokhzad // Nano Letters. - 2007. - Vol. 7, N 10. - P. 3065 - 3070.

56. Herr, J. K. Aptamer-conjugated nanoparticles for selective collection and detection of cancer cells / J. K. Herr, J. E. Smith, C. D. Medley, D. Shangguan, W. Tan // Analytical Chemistry. - 2006. - Vol. 78, N 9. - P. 2918 - 2924.

57. Haque, A. Next generation NIR fluorophores for tumor imaging and fluorescence-guided surgery: A review / A. Haque, M. S. H. Faizi, J. A. Rather, M. S. Khan // Bioorganic and Medicinal Chemistry. - 2017. - Vol. 25, N 7. - P. 2017 - 2034.

58. Bogaards, A. In vivo quantification of fluorescent molecular markers in real-time: A review to evaluate the performance of five existing methods / A. Bogaards, H. J. C. M. Sterenborg, B. C. Wilson // Photodiagnosis and Photodynamic Therapy. - 2007. - Vol. 4, N 3. - P. 170 - 178.

59. Monfardini, C. Stabilization of substances in circulation / C. Monfardini, F. M.

Veronese // Bioconjugate Chemistry. - 1998. - Vol. 9, N 4. - P. 418 - 450.

60. Veronese, F. M. Bioconjugation in pharmaceutical chemistry / F. M. Veronese, M. Morpurgo // Il Farmaco. - 1999. - Vol. 54, N 8. - P. 497 - 516.

61. Tsaban, G. Indirect (herd) protection, following pneumococcal conjugated vaccines introduction: A systematic review of the literature / G. Tsaban, S. Ben-Shimol // Vaccine. - 2017. - Vol. 35, N 22. - P. 2882 - 2891.

62. Peltola', H. Worldwide Haemophilus influenzae type b disease at the beginning of the 21st century: Global analysis of the disease burden 25 years after the use of the polysaccharide vaccine and a decade after the advent of conjugates / H. Peltola' // Clinical Microbiology Reviews. - 2000. - Vol. 13, N 2. - P. 302 - 317.

63. Maiden, M. C. J. Meningococcal conjugate vaccines: New opportunities and new challenges / M. C. J. Maiden, B. G. Spratt // Lancet. - 1999. - Vol. 354, N 9179. - P. 615 - 616.

64. Bryant, K. A. Haemophilus influenzae type b-Neisseria meningitidis serogroups C and Y tetanus toxoid conjugate vaccine for infants and toddlers / K. A. Bryant, G. S. Marshall // Expert Review of Vaccines. - 2011. - Vol. 10, N 7. - P. 941 - 950.

65. Wong', S. S. Chemistry of protein and nucleic acid cross-linking and conjugation 2nd ed. / S. S. Wong, D. M. Jameson. - CRC Press, 2011. - 622 p.

66. Строев, Е. А. Биологическая химия / Е. А. Строев. - Москва: Высшая школа, 1986. - 479 с.

67. Young, V. R. Adult amino acid requirements: The case for a major revision in current recommendations / V. R. Young // The Journal of Nutrition. - 1994. - Vol. 124, suppl_8. - P. 1517S - 1523S.

68. Creighton, T. E. Proteins: Structures and molecular properties 2nd ed. / T. E. Creighton. - W. H. Freeman, 1992. - 512 p.

69. Lundblad, R. L. Chemical reagents for protein modification 4th ed. / R. L. Lundblad. - CRC Press, 2014. - 677 p.

70. Basle, E. Protein chemical modification on endogenous amino acids / E. Basle, N. Joubert, M. Pucheault // Chemistry & Biology. - 2010. - Vol. 17, N 3. - P. 213 - 227.

71. Koniev, O. Developments and recent advancements in the field of endogenous

amino acid selective bond forming reactions for bioconjugation / O. Koniev, A. Wagner // Chemical Society Reviews. - 2015. - Vol. 44, N 15. - P. 5495 - 5551.

72. Fennema's food chemistry 5th ed. / eds. S. Damodaran, K. L. Parkin. - CRC Press, 2017. - 1107 p.

73. Tanford, C. Hydrogen ion equilibria of ribonuclease / C. Tanford, J. D. Hauenstein // Journal of the American Chemical Society. - 1956. - Vol. 78, N 20. - P. 5287 - 5291.

74. Shewale, J. G. Effects of Fe3+ binding on the microenvironments of individual amino groups in human serum transferrin as determined by differential kinetic labeling / J. G. Shewale, K. Brew // Journal of Biological Chemistry. - 1982. - Vol. 257, N 16. -P. 9406 - 9415.

75. Nakamura, M. Detection of biotinylated proteins in polyacrylamide gels using an avidin-fluorescein conjugate / M. Nakamura, K. Tsumoto, K. Ishimura, I. Kumagai // Analytical Biochemistry. - 2002. - Vol. 304, N 2. - P. 231 - 235.

76. Beija, M. Synthesis and applications of rhodamine derivatives as fluorescent probes / M. Beija, C. A. M. Afonso, J. M. G. Martinho // Chemical Society Reviews. -2009. - Vol. 38, N 8. - P. 2410 - 2433.

77. Hama, Y. A target cell-specific activatable fluorescence probe for in vivo molecular imaging of cancer based on a self-quenched avidin-rhodamine conjugate / Y. Hama, Y. Urano, Y. Koyama, M. Kamiya, M. Bernardo, R. S. Paik, S. S. In, C. H. Paik, P. L. Choyke, H. Kobayashi // Cancer Research. - 2007. - Vol. 67, N 6. - P. 2791 - 2799.

78. Ferreira, S. Z. Synthesis of a new peptide-coumarin conjugate: A potential agent against cryptococcosis / S. Z. Ferreira, H. C. Carneiro, H. A. Lara, R. B. Alves, J. M. Resende, H. M. Oliveira, L. M. Silva, D. A. Santos, R. P. Freitas // ACS Medicinal Chemistry Letters. - 2015. - Vol. 6, N 3. - P. 271 - 275.

79. Marek, M. Biotin-pyrene conjugates with poly(ethylene glycol) spacers are convenient fluorescent probes for avidin and streptavidin / M. Mare k, K. Kaiser, H. J. Gruber // Bioconjugate Chemistry. - 1997. - Vol. 8, N 4. - P. 560 - 566.

80. De, M. Sensing of proteins in human serum using conjugates of nanoparticles and green fluorescent protein / M. De, S. Rana, H. Akpinar, O. R. Miranda, R. R. Arvizo, U. H. F. Bunz, V. M. Rotello // Nature Chemistry. - 2009. - Vol. 1, N 6. - P. 461 - 465.

81. Dennis, A. M. Quantum dot-fluorescent protein FRET probes for sensing intracellular pH / A. M. Dennis, W. J. Rhee, D. Sotto, S. N. Dublin, G. Bao // ACS Nano.

- 2012. - Vol. 6, N 4. - P. 2917 - 2924.

82. Bünzli, J.-C. G. Lanthanide luminescence for biomedical analyses and imaging / J.-C. G. Bünzli // Chemical Reviews. - 2010. - Vol. 110, N 5. - P. 2729 - 2755.

83. Loudet, A. BODIPY dyes and their derivatives: Syntheses and spectroscopic properties / A. Loudet, K. Burgess // Chemical Reviews. - 2007. - Vol. 107, N 11. -P. 4891 - 4932.

84. Wood, T. E. Advances in the chemistry of dipyrrins and their complexes / T. E. Wood, A. Thompson // Chemical Reviews. - 2007. - Vol. 107, N 5. - P. 1831 - 1861.

85. Ulrich, G. The chemistry of fluorescent BODIPY dyes: Versatility unsurpassed /

G. Ulrich, R. Ziessel, A. Harriman // Angewandte Chemie International Edition. - 2008.

- Vol. 47, N 7. - P. 1184 - 1201.

86. Fluorophores and their amine-reactive derivatives 11th ed. // Molecular probes handbook: A guide to fluorescent probes and labeling technologies / eds. I.D. Johnson, M.T.Z. Spence. - Thermo Fisher Scientific, 2010. - P. 10 - 96.

87. Treibs, A. Difluorboryl-Komplexe von Di- und Tripyrrylmethenen / A. Treibs, F.-

H. Kreuzer // Justus Liebigs Annalen der Chemie. - 1968. - Vol. 718, N 1. - P. 208 -223.

88. Lai, R. Y. Electrogenerated chemiluminescence 71. Photophysical, electrochemical, and electrogenerated chemiluminescent properties of selected dipyrromethene-BF2 dyes / R. Y. Lai, A. J. Bard // Journal of Physical Chemistry B. -2003. - Vol. 107, N 21. - P. 5036 - 5042.

89. Zhang, D. Development of excellent long-wavelength BODIPY laser dyes with a strategy that combines extending n-conjugation and tuning ICT effect / D. Zhang, V. Martín, I. García-Moreno, A. Costela, M. E. Pérez-Ojeda, Y. Xiao // Physical Chemistry Chemical Physics. - 2011. - Vol. 13, N 28. - P. 13026 - 13033.

90. Kolemen, S. Solid-state dye-sensitized solar cells using red and near-IR absorbing bodipy sensitizers / S. Kolemen, Y. Cakmak, S. Erten-Ela, Y. Altay, J. Brendel, M. Thelakkat, E. U. Akkaya // Organic Letters. - 2010. - Vol. 12, N 17. - P. 3812 - 3815.

91. Kalai, T. Synthesis of new, BODIPY-based sensors and labels / T. Kalai, K. Hideg // Tetrahedron. - 2006. - Vol. 62, N 44. - P. 10352 - 10360.

92. Sunahara, H. Design and synthesis of a library of BODIPY-based environmental polarity sensors utilizing photoinduced electron-transfer-controlled fluorescence ON/OFF switching / H. Sunahara, Y. Urano, H. Kojima, T. Nagano // Journal of the American Chemical Society. - 2007. - Vol. 129, N 17. - P. 5597 - 5604.

93. Hermanson, G. T. Fluorescent probes 3rd ed. / G. T. Hermanson // Bioconjugate techniques. - Elsevier Inc., 2013. - P. 395 - 463.

94. Thiol-reactive probes 11th ed. // Molecular probes handbook: A guide to fluorescent probes and labeling technologies / eds. I.D. Johnson, M.T.Z. Spence. -Thermo Fisher Scientific, 2010. - P. 97 - 121.

95. Click chemistry and other functional group modifications 11th ed. // Molecular probes handbook: A guide to fluorescent probes and labeling technologies / eds. I.D. Johnson, M.T.Z. Spence. - Thermo Fisher Scientific, 2010. - P. 122 - 150.

96. Rezende, L. C. D. de. A review of the synthetic strategies for the development of BODIPY dyes for conjugation with proteins / L. C. D. de Rezende, F. da S. Emery // Orbital: The Electronic Journal of Chemistry. - 2013. - Vol. 5, N 1. - P. 62 - 83.

97. Patent N 4774339 United States, Int. Cl. C07D 209/00, C07D 209/56. Chemically reactive dipyrrometheneboron difluoride dyes: N 83,458: Filed 10.08.1987: Date of Patent 27.09.1988 / Haughland R. P., Kang H. C.; Assignee Molecular Probes Inc. - 14 p.

98. Meltola, N. J. Hydrophilic labeling reagents of dipyrrylmethene-BF2 dyes for two-photon excited fluorometry: Syntheses and photophysical characterization / N. J. Meltola, R. Wahlroos, A. E. Soini // Journal of Fluorescence. - 2004. - Vol. 14, N 5. - P. 635 -647.

99. Wang, D. Carboxyl BODIPY dyes from bicarboxylic anhydrides: One-pot preparation, spectral properties, photostability, and biolabeling / D. Wang, J. Fan, X. Gao, B. Wang, S. Sun, X. Peng // The Journal of Organic Chemistry. - 2009. - Vol. 74, N 20. - P. 7675 - 7683.

100. Patent N 5274113 United States, Int. Cl. C07F 5/02, C07D 207/44, H01S 3/20.

Long wavelength chemically reactive dipyrrometheneboron difluoride dyes and conjugates: N 786,767: Filed 01.11.1991: Date of Patent 28.12.1993 / Kang H. C., Haughland R. P.; Assignee Molecular Probes Inc. - 21 p.

101. Meltola, N. J. Syntheses of novel dipyrrylmethene-BF2 dyes and their performance as labels in two-photon excited fluoroimmunoassay / N. J. Meltola, A. E. Soini, P. E. Hânninen // Journal of Fluorescence. - 2004. - Vol. 14, N 2. - P. 129 - 138.

102. Ziessel, R. Isocyanate-, isothiocyanate-, urea-, and thiourea-substituted boron dipyrromethene dyes as fluorescent probes / R. Ziessel, L. Bonardi, P. Retailleau, G. Ulrich // Journal of Organic Chemistry. - 2006. - Vol. 71, N 8. - P. 3093 - 3102.

103. Jagodinsky, J. C. Evaluation of fluorophore-tethered platinum complexes to monitor the fate of cisplatin analogs / J. C. Jagodinsky, A. Sulima, Y. Cao, J. E. Poprawski, B. N. Blackman, J. R. Lloyd, R. E. Swenson, M. M. Gottesman, M. D. Hall // JBIC Journal of Biological Inorganic Chemistry. - 2015. - Vol. 20, N 7. - P. 1081 -1095.

104. Dansen, T. B. Targeted fluorescent probes in peroxisome function / T. B. Dansen, E. H. W. Pap, R. J. A. Wanders, K. W. A. Wirtz // Histochemical Journal. - 2001. -Vol. 33, N 2. - P. 65 - 69.

105. Dansen, T. B. The role of peroxisomes in oxidative stress: PhD thesis in Biochemistry and Cell Biology / Tobias Bas Dansen; promotor K. W. A. Wirtz; co-promotor E. H. W. Pap. - Utrecht, the Netherlands, 2001. - 128 p.

106. Matsumoto, T. A thiol-reactive fluorescence probe based on donor-excited photoinduced electron transfer: Key role of ortho substitution / T. Matsumoto, Y. Urano, T. Shoda, H. Kojima, T. Nagano // Organic Letters. - 2007. - Vol. 9, N 17. - P. 3375 -3377.

107. Baruah, M. BODIPY-based hydroxyaryl derivatives as fluorescent pH probes / M. Baruah, W. Qin, N. Basaric, W. M. De Borggraeve, N. Boens // The Journal of Organic Chemistry. - 2005. - Vol. 70, N 10. - P. 4152 - 4157.

108. Baruah, M. Solvent and pH dependent fluorescent properties of a dimethylaminostyryl borondipyrromethene dye in solution / M. Baruah, W. Qin, C. Flors, J. Hofkens, R. A. L. Vallée, D. Beljonne, M. Van der Auweraer, W. M. De Borggraeve,

N. Boens // The Journal of Physical Chemistry A. - 2006. - Vol. 110, N 18. - P. 5998 -6009.

109. Sueyoshi, K. On-line sample preconcentration and separation technique based on transient trapping in microchip micellar electrokinetic chromatography / K. Sueyoshi, F. Kitagawa, K. Otsuka // Analytical Chemistry. - 2008. - Vol. 80, N 4. - P. 1255 - 1262.

110. Preciado, S. Synthesis of C-2 arylated tryptophan amino acids and related compounds through palladium-catalyzed C-H activation / S. Preciado, L. Mendive-Tapia, F. Albericio, R. Lavilla // The Journal of Organic Chemistry. - 2013. - Vol. 78, N 16. -P. 8129 - 8135.

111. Raghuwanshi, Y. Proteolytically stable cyclic decapeptide for breast cancer cell targeting / Y. Raghuwanshi, H. Etayash, R. Soudy, I. Paiva, A. Lavasanifar, K. Kaur // Journal of Medicinal Chemistry. - 2017. - Vol. 60, N 12. - P. 4893 - 4903.

112. Williams, D. B. G. Drying of organic solvents: Quantitative evaluation of the efficiency of several desiccants / D. B. G. Williams, M. Lawton // The Journal of Organic Chemistry. - 2010. - Vol. 75, N 24. - P. 8351 - 8354.

113. Molecular sieves - Technical information bulletin [Electronic resource] // Aldrich. - Mode of access: https://www.sigmaaldrich.com/chemistry/chemical-synthesis/learning-center/technical-bulletins/al-1430/molecular-sieves.html. - Date of access: 25.02.2020.

114. Haney, E. F. NMR of antimicrobial peptides 1st ed. / E. F. Haney, H. J. Vogel // Annual reports on NMR spectroscopy / ed. Elsevier Ltd. - 2009. - P. 1 - 51.

115. Kenkel, J. Analytical chemistry for technicians 4th ed. / J. Kenkel. - CRC Press, 2013. - 537 p.

116. CRC handbook of chemistry and physics 98th ed. / ed. J. R. Rumble. - CRC Press, 2017. - 2560 p.

117. European pharmacopoeia. Vol. 1 8th ed. - Strasbourg: Council of Europe, 2013. -1456 p.

118. Schmidt, M. W. General atomic and molecular electronic structure system / M. W. Schmidt, K. K. Baldridge, J. A. Boatz, S. T. Elbert, M. S. Gordon, J. H. Jensen, S. Koseki, N. Matsunaga, K. A. Nguyen, S. Su, T. L. Windus, M. Dupuis, J. A. Montgomery

// Journal of Computational Chemistry. - 1993. - Vol. 14, N 11. - P. 1347 - 1363.

119. Feller, D. The role of databases in support of computational chemistry calculations / D. Feller // Journal of Computational Chemistry. - 1996. - Vol. 17, N 13. - P. 1571 -1586.

120. Schuchardt, K. L. Basis Set Exchange: A community database for computational sciences / K. L. Schuchardt, B. T. Didier, T. Elsethagen, L. Sun, V. Gurumoorthi, J. Chase, J. Li, T. L. Windus // Journal of Chemical Information and Modeling. - 2007. -Vol. 47, N 3. - P. 1045 - 1052.

121. Sholl, D. S. Density functional theory: A practical introduction / D. S. Sholl, J. A. Steckel. - Hoboken, New Jersey: John Wiley & Sons, Inc., 2009. - 252 p.

122. Chai, J.-D. Long-range corrected hybrid density functionals with damped atomatom dispersion corrections / J.-D. Chai, M. Head-Gordon // Physical Chemistry Chemical Physics. - 2008. - Vol. 10, N 44. - P. 6615 - 6620.

123. Krishnan, R. Self-consistent molecular orbital methods. XX. A basis set for correlated wave functions / R. Krishnan, J. S. Binkley, R. Seeger, J. A. Pople // The Journal of Chemical Physics. - 1980. - Vol. 72, N 1. - P. 650 - 654.

124. Becke, A. D. Density-functional thermochemistry. III. The role of exact exchange / A. D. Becke // The Journal of Chemical Physics. - 1993. - Vol. 98, N 7. - P. 5648 -5652.

125. Becke, A. D. Density-functional exchange-energy approximation with correct asymptotic behavior / A. D. Becke // Physical Review A. - 1988. - Vol. 38, N 6. - P. 3098 - 3100.

126. Lee, C. Development of the Colle-Salvetti correlation-energy formula into a functional of the electron density / C. Lee, W. Yang, R. G. Parr // Physical Review B. -1988. - Vol. 37, N 2. - P. 785 - 789.

127. Weigend, F. Balanced basis sets of split valence, triple zeta valence and quadruple zeta valence quality for H to Rn: Design and assessment of accuracy / F. Weigend, R. Ahlrichs // Physical Chemistry Chemical Physics. - 2005. - Vol. 7, N 18. - P. 3297 -3305.

128. Weigend, F. Accurate Coulomb-fitting basis sets for H to Rn / F. Weigend //

Physical Chemistry Chemical Physics. - 2006. - Vol. 8, N 9. - P. 1057 - 1065.

129. Grimme, S. A consistent and accurate ab initio parametrization of density functional dispersion correction (DFT-D) for the 94 elements H-Pu / S. Grimme, J. Antony, S. Ehrlich, H. Krieg // The Journal of Chemical Physics. - 2010. - Vol. 132, N 15. - P. 154104.

130. Burke, K. Time-dependent density functional theory: Past, present, and future / K. Burke, J. Werschnik, E. K. U. Gross // The Journal of Chemical Physics. - 2005. -Vol. 123, N 6. - P. 062206.

131. Laurent, A. D. Dye chemistry with time-dependent density functional theory / A. D. Laurent, C. Adamo, D. Jacquemin // Physical Chemistry Chemical Physics. - 2014.

- Vol. 16, N 28. - P. 14334 - 14356.

132. Yanai, T. A new hybrid exchange-correlation functional using the Coulomb-attenuating method (CAM-B3LYP) / T. Yanai, D. P. Tew, N. C. Handy // Chemical Physics Letters. - 2004. - Vol. 393, N 1 - 3. - P. 51 - 57.

133. Tawada, Y. A long-range-corrected time-dependent density functional theory / Y. Tawada, T. Tsuneda, S. Yanagisawa, T. Yanai, K. Hirao // The Journal of Chemical Physics. - 2004. - Vol. 120, N 18. - P. 8425 - 8433.

134. Mennucci, B. Polarizable continuum model / B. Mennucci // Wiley Interdisciplinary Reviews: Computational Molecular Science. - 2012. - Vol. 2, N 3. -P. 386 - 404.

135. Zhang, Y. Theoretical design of a two-photon fluorescent probe for nitric oxide with enhanced emission induced by photoninduced electron transfer / Y. Zhang, J. Leng, W. Hu // Sensors. - 2018. - Vol. 18, N 5. - P. 1324.

136. Pan, Z.-H. A simple BODIPY-aniline-based fluorescent chemosensor as multiple logic operations for the detection of pH and CO2 gas / Z.-H. Pan, G.-G. Luo, J.-W. Zhou, J.-X. Xia, K. Fang, R.-B. Wu // Dalton Transactions. - 2014. - Vol. 43, N 22. - P. 8499

- 8507.

137. Bamesberger, A. Rational design of a rapid fluorescent approach for detection of inorganic fluoride in MeCN-H2O: A new fluorescence switch based on N-aryl-1,8-naphthalimide / A. Bamesberger, C. Schwartz, Q. Song, W. Han, Z. Wang, H. Cao // New

Journal of Chemistry. - 2014. - Vol. 38, N 3. - P. 884 - 888.

138. Pettersen, E. F. UCSF Chimera - A visualization system for exploratory research and analysis / E. F. Pettersen, T. D. Goddard, C. C. Huang, G. S. Couch, D. M. Greenblatt, E. C. Meng, T. E. Ferrin // Journal of Computational Chemistry. - 2004. -Vol. 25, N 13. - P. 1605 - 1612.

139. Chemcraft - Graphical software for visualization of quantum chemistry computations [Electronic resource] // Chemcraft. - Mode of access: http: //www. chemcraftprog.com/.

140. Васильев, В. П. Термодинамические свойства растворов электролитов / В. П. Васильев. - Москва: Высшая школа, 1982. - 320 с.

141. Lakowicz, J. R. Principles of fluorescence spectroscopy 3rd ed. / J. R. Lakowicz. -Springer, 2006. - 954 p.

142. Crosby, G. A. Measurement of photoluminescence quantum yields. Review / G. A. Crosby, J. N. Demas // The Journal of Physical Chemistry. - 1971. - Vol. 75, N 8. -P. 991 - 1024.

143. Fischer, M. Fluorescence quantum yield of rhodamine 6G in ethanol as a function of concentration using thermal lens spectrometry / M. Fischer, J. Georges // Chemical Physics Letters. - 1996. - Vol. 260, N 1 - 2. - P. 115 - 118.

144. Du, H. PhotochemCAD: A computer-aided design and research tool in photochemistry / H. Du, R.-C. A. Fuh, J. Li, L. A. Corkan, J. S. Lindsey // Photochemistry and Photobiology. - 1998. - Vol. 68, N 2. - P. 141 - 142.

145. Dixon, J. M. PhotochemCAD 2: A refined program with accompanying spectral databases for photochemical calculations / J. M. Dixon, M. Taniguchi, J. S. Lindsey // Photochemistry and Photobiology. - 2007. - Vol. 81, N 1. - P. 212 - 213.

146. Taniguchi, M. PhotochemCAD 3: Diverse modules for photophysical calculations with multiple spectral databases / M. Taniguchi, H. Du, J. S. Lindsey // Photochemistry and Photobiology. - 2018. - Vol. 94, N 2. - P. 277 - 289.

147. Taniguchi, M. Database of absorption and fluorescence spectra of >300 common compounds for use in PhotochemCAD / M. Taniguchi, J. S. Lindsey // Photochemistry and Photobiology. - 2018. - Vol. 94, N 2. - P. 290 - 327.

148. Strickler, S. J. Relationship between absorption intensity and fluorescence lifetime of molecules / S. J. Strickler, R. A. Berg // The Journal of Chemical Physics. - 1962. -Vol. 37, N 4. - P. 814 - 822.

149. Ксенофонтова, К. В. Квантовохимическое исследование структурных и энергетических параметров конъюгатов BODIPY с аминокислотами / К. В. Ксенофонтова, А. А. Ксенофонтов, Е. В. Румянцев // Тезисы докладов VII Конференции молодых ученых по общей и неорганической химии. - 2017. - С. 118 - 119.

150. Ксенофонтова, К. В. Структурные и энергетические параметры конъюгатов BODIPY с аминокислотами по данным квантовохимических расчетов / К. В. Ксенофонтова, А. А. Ксенофонтов, Е. В. Румянцев // Сборник статей VIII Всероссийской молодежной школы-конференции «Квантово-химические расчеты: структура и реакционная способность органических и неорганических молекул». -2017. - С. 147 - 151.

151. Ксенофонтова, К. В. Квантовохимическое исследование конъюгатов BODIPY с рядом аминокислот / К. В. Ксенофонтова, А. А. Ксенофонтов, Е. В. Румянцев // Сборник тезисов докладов Всероссийской школы-конференции «Фундаментальные науки - специалисту нового века» (Студенческая научная конференция «Дни науки ИГХТУ»). - 2017. - С. 28.

152. McQuarrie, D. A. Statistical Mechanics / D. A. McQuarrie. - University Science Books, 2000. - 641 p.

153. Гурвич, Л. В. Энергии разрыва химических связей. Потенциалы ионизации и сродство к электрону / Л. В. Гурвич, Г. В. Карачевцев, В. Н. Кондратьев, Ю. А. Лебедев, В. А. Медведев, В. К. Потапов, Ю. С. Ходеев. - Москва: Наука, 1974. -351 с.

154. Кочергина, Л. А. Стандартные энтальпии образования L-цистеина в водном растворе / Л. А. Кочергина, А. И. Лыткин, О. Н. Крутова, К. В. Дамрина (Ксенофонтова) // Известия высших учебных заведений. Серия: «Химия и химическая технология». - 2013. - Т. 56, № 9. - С. 38 - 41.

155. Кoчеpгина', Л. А. Стандартные энтальпии образования L-тирозина, D,L-

норлейцина, D,L-триптофана и D,L-a-аланил-D,L-норлейцина и продуктов их диссоциации в водном растворе / Л. А. Кoчеpгина, О. Н. Крутова, К. В. Дамрина (Ксенофонтова) // Журнал физической химии. - 2015. - Т. 89, № 5. - С. 760 - 763; Kochergina, L. A. Standard enthalpies of formation for L-tyrosine, DL-norleucine, DL-tryptophan, DL-a-alanyl-DL-norleucine, and products of their dissociation in an aqueous solution / L. A. Kochergina, O. N. Krutova, K. V. Damrina (Ksenofontova) // Russian Journal of Physical Chemistry A. - 2015. - Vol. 89, N 5. - P. 755 - 758.

156. Лыткин, А. И. Термодинамика растворения кристаллического L-метионина в воде / А. И. Лыткин, В. В. Черников, О. Н. Крутова, К. В. Дамрина (Kсенофонтова), И. А. Скворцов // Журнал физической химии. - 2016. - Т. 90, № 5. - С. 717 - 720; Lytkin, A. I. Thermodynamics of the dissolution of crystalline L-methionine in water / A. I. Lytkin, V. V. Chernikov, O. N. Krutova, K. V. Damrina (Ksenofontova), I. A. Skvortsov // Russian Journal of Physical Chemistry A. - 2016. - Vol. 90, N 5. - P. 969 -972.

157. Ksеnofontova, K. V. Novel BODIPY-conjugated amino acids: Synthesis and spectral properties / K. V. Ksеnofontova, A. A. Ksenofontov, I. A. Khodov, E. V. Rumyantsev // Journal of Molecular Liquids. - 2019. - Vol. 283. - P. 695 - 703.

158. Ksenofontova, K. V. Synthesis and study of spectral properties of amino acids -BODIPY conjugates / K. V. Ksenofontova, A. A. Ksenofontov, I. A. Khodov, E. V. Rumyantsev // Izvestiya Vysshikh Uchebnykh Zavedenii. Seriya Khimiya i Khimicheskaya Tekhnologiya (Russian Journal of Chemistry and Chemical Technology). - 2020. - Vol. 63, N 5. - P. 4 - 11.

159. Kочергина, Л. А. Стандартные энтальпии образования L-гистидина и продуктов его диссоциации в водных растворах / Л. А. Kочергина, О. Н. Крутова, К. В. Дамрина (Ксенофонтова!) // Материалы IX Региональной студенческой научной конференции «Фундаментальные науки - специалисту нового века». -2012. - Т. 1. - С. 20.

160. Черников, В. В. Стандартные энтальпии образования ряда аминокислот и дипептидов / В. В. Черников, О. Н. Крутова, К. В. Дамрина (Ксенофонтова) // Материалы Региональной студенческой научной конференции Дни науки-2015

«Фундаментальные науки - специалисту нового века». - 2015. - Т. 1. - С. 171.

161. Дамрина, Е. В. Синтез и физико-химическое исследование конъюгата BODIPY с лизином / Е. В. Дамрина, К. В. Ксенофонтова, Е. В. Румянцев // Сборник тезисов докладов Всероссийской школы-конференции «Фундаментальные науки -специалисту нового века» (Студенческая научная конференция «Дни науки ИГХТУ»). - 2017. - С. 19.

162. Ксенофонтова, К. В. Получение и исследование спектральных свойств конъюгатов BODIPY с лизином / К. В. Ксенофонтова, Е. Е. Молчанов, Е. В. Румянцев // Сборник тезисов докладов Всероссийской научной конференции «Фундаментальные науки - специалисту нового века» (Студенческая научная школа-конференция «Дни науки в ИГХТУ»). - 2018. - С. 518.

163. Ксенофонтова, К. В. Получение и исследование спектральных свойств конъюгатов BODIPY с рядом аминокислот / К. В. Ксенофонтова, Е. В. Румянцев // Кластер конференций 2018. - 2018. - С. 440 - 441.

164. КБепоЮ^оуа, К. V. Synthesis and spectral properties study of lysine-BODIPY conjugates / К. V. Кsenofontova, E. V. Rumyantsev // Book of abstracts of the Eighth international workshop «Organic electronics of highly-correlated molecular systems». -2018. - P. 46.

165. Кsenofontovа, К. V. Cysteine-BODIPY conjugates: Synthesis and spectral properties study / К. V. Кsenofontovа, E. V. Rumyantsev' // Book of abstracts of the Fifth international scientific conference «Advances in synthesis and complexing». - 2019. -Vol. 1. - P. 291.

166. Ксeнофонтова, К. В. Конъюгаты BODIPY с глутаминовой кислотой: синтез и исследование спектральных свойств / К. В. Ксeнофонтова, Е. В. Румянцев // XII Всероссийская школа-конференция молодых ученых «Теоретическая и экспериментальная химия жидкофазных систем» (Крестовские чтения). - 2019. -С. 92.

167. Amine-reactive probe labeling protocol [Electronic resource] // Thermo Fisher Scientific. - Mode of access: https://www.thermofisher.com/ru/ru/home/references/protocols/cell-and-tissue-

analysis/labeling-chemistry-protocols/amine-reactive-probe-labeling-protocol.html. -Date of access: 25.02.2020.

168. Gottschalk, A. Interaction between simple sugars and amino-acids / A. Gottschalk, S. M. Partridge // Nature. - 1950. - Vol. 165. - P. 684 - 685.

169. Timms, P. L. Boron-fluorine chemistry. II. Reaction of boron monofluoride with acetylenes / P. L. Timms // Journal of the American Chemical Society. - 1968. - Vol. 90, N 17. - P. 4585 - 4589.

170. Bañuelos, J. BODIPY dye, the most versatile fluorophore ever? / J. Bañuelos // The Chemical Record. - 2016. - Vol. 16, N 1. - P. 335 - 348.

171. Llano, R. S. Tailoring the photophysical signatures of BODIPY dyes: Toward fluorescence standards across the visible spectral region / R. S. Llano, E. A. Zaballa, J. Bañuelos, C. F. A. G. Durán, J. L. B. Vázquez, E. P. Cabrera, I. L. Arbeloa // Photochemistry and photophysics - Fundamentals to applications / ed. S. Saha. -IntechOpen, 2018. - P. 21 - 40.

172. Сергеев, Г. Б. Экспериментальные методы химической кинетики / Г. Б. Сергеев, В. В. Романов, М. Г. Кузьмин, Б. М. Ужинов, В. И. Найдич, М. Я. Мельников, Н. В. Фок, В. Л. Иванов, Н. Ф. Казанская, В. С. Гурман, В. А. Поляков, В. А. Батюк, И. А. Леенсон, Д. Н. Григорьева, Н. Г. Ковалев, Н. А. Садовский; ред. Н. М. Эмануэль, Г. Б. Сергеев. - Москва: Высшая школа, 1980. - 357 с.

173. Gregory, J. D. The stability of N-ethylmaleimide and its reaction with sulfhydryl groups / J. D. Gregory // Journal of the American Chemical Society. - 1955. - Vol. 77, N 14. - P. 3922 - 3923.

174. Hoagland, P. D. Preparation and properties of aminoacetylated P-casein / P. D. Hoagland, R. T. Boswell, S. B. Jones // Journal of Dairy Science. - 1971. - Vol. 54, N 11. - P. 1564 - 1566.

175. Wang, P. Phosphate-specific fluorescence labeling under aqueous conditions / P. Wang, R. W. Giese // Analytical Chemistry. - 1993. - Vol. 65, N 23. - P. 3518 - 3520.

176. Wang, P. Phosphate-specific fluorescence labeling with BO-IMI: Reaction details / P. Wang, R. W. Giese // Journal of Chromatography A. - 1998. - Vol. 809, N 1 - 2. -P. 211 - 218.

177. Baker, G. A. Effects of fluorescent probe structure on the dynamics at cysteine-34 within bovine serum albumin: Evidence for probe-dependent modulation of the cybotactic region / G. A. Baker, S. Pandey, M. A. ^ne, T. D. Maloney, A. M. Hartnett, F. V. Bright // Biopolymers. - 2001. - Vol. 59, N 7. - P. 502 - 511.

178. Taeye, B. De. Site-directed targeting of plasminogen activator inhibitor-1 as an example for a novel approach in rational drug design / B. De Taeye, G. Compernolle, P. J. Declerck // Journal of Biological Chemistry. - 2004. - Vol. 279, N 19. - P. 20447 -20450.

179. Lee, J.-J. BODIPY-diacrylate imaging probes for targeted proteins inside live cells / J.-J. Lee, S.-C. Lee, D. Zhai, Y.-H. Ahn, H. Y. Yeo, Y. L. Tan, Y.-T. Chang // Chemical Communications. - 2011. - Vol. 47, N 15. - P. 4508 - 4510.

180. Lavis, L. D. Bright ideas for chemical biology / L. D. Lavis, R. T. Raines // ACS Chemical Biology. - 2008. - Vol. 3, N 3. - P. 142 - 155.

181. &ueger, A. T. Fluorescent amino acids: Modular building blocks for the assembly of new tools for chemical biology / A. T. Krueger, B. Imperiali // ChemBioChem. - 2013. - Vol. 14, N 7. - P. 788 - 799.

182. Solomonov, A. V. Design and applications of dipyrrin-based fluorescent dyes and related organic luminophores: From individual compounds to supramolecular self-assembled systems / A. V. Solomonov, Y. S. Marfin, E. V. Rumyantsev // Dyes and Pigments. - 2019. - Vol. 162. - P. 517 - 542.

183. ^mkaew, A. BODIPY dyes in photodynamic therapy / A. ^mkaew, S. H. Lim, H. B. Lee, L. V. ^ew, L. Y. Chung, К. Burgess // Chemical Society Reviews. - 2013. -Vol. 42, N 1. - P. 77 - 88.

184. Marfin, Y. S. Interaction of BODIPY dyes with the blood plasma proteins / Y. S. Marfin, E. L. Aleksakhina, D. A. Merkushev, E. V. Rumyantsev, I. К. Tomilova // Journal of Fluorescence. - 2016. - Vol. 26, N 1. - P. 255 - 261.

185. Горощенко, Я. Г. Физико-химический анализ гомогенных и гетерогенных систем / Я. Г. Горощенко. - Киев: Наукова думка, 1978. - 490 с.

186. Кт^ш^, A. N. A novel BODIPY-dipyrrin fluorescent probe: Synthesis and recognition behaviour towards Fe(II) and Zn(II) / A. N. Кш-sunlu, E. Guler, H. I. Ucan,

R. W. Boyle // Dyes and Pigments. - 2012. - Vol. 94, N 3. - P. 496 - 502.

187. Antina, L. A. The influence of alkylation on the photophysical properties of BODIPYs and their labeling in blood plasma proteins / L. A. Antina, A. A. Ksenofontov, A. A. Kalyagin, P. S. Bocharov, N. V. Kharitonova, A. V. Kazak, E. V. Antina, M. B. Berezin // Journal of Molecular Liquids. - 2020. - Vol. 304. - P. 112717.

188. Meher, J. K. A reduced computational load protein coding predictor using equivalent amino acid sequence of DNA string with period-3 based time and frequency domain analysis / J. K. Meher, G. N. Dash, P. K. Meher, M. K. Raval // American Journal of Molecular Biology. - 2011. - Vol. 1, N 2. - P. 79 - 86.

189. Soltzberg, L. J. 3D Fluorescence characterization of synthetic organic dyes / L. J. Soltzberg, S. Lor, N. Okey-Igwe, R. Newman // American Journal of Analytical Chemistry. - 2012. - Vol. 3, N 9. - P. 622 - 631.

190. Генова, Ц. Матрицы возбуждения-испускания и синхронная флуоресцентная спектроскопия для диагностики рака желудочно-кишечного тракта / Ц. Генова, Е. Борисова, Н. Пенков, Б. Владимиров, А. Желяжкова, Л. Аврамов // Квантовая электроника. - 2016. - Т. 46, № 6. - С. 510 - 514.

191. Grigoryan, K. R. Fluorescence 2D and 3D spectra analysis of tryptophan, tyrosine and phenylalanine / K. R. Grigoryan, H. A. Shilajyan // Proceedings of Yerevan State University. - 2017. - Vol. 51, N 1. - P. 3 - 7.