Характеристика антиоксидантного потенциала лактобацилл и установление возможных молекулярно-генетических факторов его реализации тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 00.00.00, кандидат наук Марсова Мария Викторовна

• Марсова Мария Викторовна
• кандидат наук
• 2022

Оглавление диссертации кандидат наук Марсова Мария Викторовна

СОДЕРЖАНИЕ

СОДЕРЖАНИЕ

Список сокращений

ВВЕДЕНИЕ

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1. Лактобациллы: классификация, механизмы антиоксидантной активности и возможности применения для профилактики невралгических заболеваний на моделях паркинсонизма

1.1. Классификация лактобацилл

1.2. Экология лактобацилл, их адаптация к различным нишам

1.3. Физиологические и биохимические свойства лактобацилл

1.4. Геном лактобацилл

1.5. Источники выделения лактобацилл для научных и практических целей

1.6. Антиоксидантные свойства лактобацилл

1.6.1. Основные механизмы осуществления АОА лактобацилл

1.6.2. Механизмы сигнальной трансдукции собственной АО системы организма хозяина

1.7. Ферменты с антиоксидантной активностью и кодирующие их гены

1.7.1. Ферменты синтеза и метаболизма глутатиона

1.7.2. Ферменты тиоредоксиновой системы

1.7.3. Ферменты NADH -оксидаза (NOX), и NADH -пероксидаза (NPR)

1.7.4. Каталазы

1.7.5. Супероксиддисмутазы и металлопротеины

1.7.6. Неферментативные антиоксиданты

1.7.7. Структуры с хелатирующей активностью

1.7.8. Гены с проявлением антиоксидантных свойств через сигнальные пути №12, pmk и микроб-ассоциированных молекулярных паттернов

(МАМРБ)

1.7.9. Другие метаболиты, обладающие антиоксидантными свойствами

1.8. Окислительный стресс

1.8.1. Окислительный стресс и механизмы его развития

1.8.2. Окислительный стресс в развитии заболеваний

1.8.3. Окислительный стресс и нейродегенерация

1.8.4. Окислительный стресс и антиоксиданты в патогенезе Болезни Паркинсона

1.9. Модели изучения окислительного стресса

1.9.1. Модели паракват-индуцированного окислительного стресса in vivo

1.9.2. Биолюминесцентные тест-системы на основе штаммов E. coli

1.9.3. Модель паракват-индуцированного ОС свободноживущей почвенной нематоды C. elegans

1.9.4. Модель паракват- индуцированного паркинсонизма мышей и крыс

1.9.5. Модель МФТП-индуцированного паркинсонизма мышей

1.9.6. Модель паркинсонизма крыс, индуцированного 6-гидроксидофамином

1.10. Изучение антиоксидантного потенциала лактобацилл в моделях профилактики нейродегенеративных заболеваний

1.11. Лактобациллы, как важный элемент в формировании антиоксидантного потенциала микробиома

1.11.1. Общая характеристика микробиома ЖКТ человека

1.11.2. Лактобациллы в составе микробиома. Численность, видовой состав

1.11.3. Примеры использования лактобацилл для коррекции микробиома в профилактике нейродегенерации

1.11.4. Снижение окислительного стресса через восстановление

кишечного барьера при применении препарата лактобацилл в модели

индуцированного 5-фторурацилом мукозита кишечника мышей

ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

2.1. Коллекция лактобацилл

2.2. Скрининг штаммов из коллекции лактобацилл на антиоксидантную активность

2.2.1. Скрининг штаммов из коллекции лактобацилл на антиоксидантную активность при помощи биолюминесцентных тест-систем на основе рекомбинантных штаммов E. coli

2.2.2. Реактивы, питательные среды и условия роста бактериальных культур

2.2.3. Получение надосадочной культуральной жидкости лактобацилл

2.2.4. Биолюминесцентные тест-системы

2.2.5. Стандартизация методики применения биолюминесцентного метода определения антиоксидантной активности

2.2.6. Проведение биолюминесцентного анализа

2.3. Определение общего количества антиоксидантов

2.3.1. Определение количества АО прямого действия методом ТЕАС (Trolox equivalent antioxidant capacity)

2.3.2. Модель паракват-индуцированного окислительного стресса у свободноживущей почвенной нематоды Caenorhabditis elegans

2.3.3. Раствор «8»-среда

2.3.4. Приготовление чашек с агаром NGM (Nematode Growth Medium)

2.3.5. Культуры и штаммы

2.3.6. Получение бактериального газона E. coli OP50

2.3.7. Получение бактериального газона с лактобациллами

2.3.8. Получение синхронизированной колонии нематод C. elegans

2.3.9. Определение медианной продолжительности жизни C. elegans

2.3.10. Определение лактобацилл в микробиоте нематод

2.5. Модель паракват-индуцированного паркинсонизма мышей

2.5.1. Характеристика модели паракват-индуцированного паркинсонизма мышей

2.5.2. Животные и препараты

2.5.3. Схема эксперимента паракват-индуцированного паркинсонизма мышей

2.5.4. Определение моторных дисфункций

2.5.5. Определение протекторной активности L. fermentum LfU21 в отношении дофаминовых нейронов

2.5.6. Смертность и изменения внутренних органов мышей в модели паракват-индуцированного паркинсонизма

2.6. Модель паракват-индуцированного паркинсонизма крыс

2.6.1. Животные и препараты

2.6.2. Схема эксперимента паракват-индуцированного паркинсонизма крыс

2.6.3. Определение моторных дисфункций

2.6.4. Определение моторных дисфункций в тесте «Открытое поле» (ОП)

2.6.5. Определение моторных дисфункций в тесте «Сужающаяся дорожка» (СД)

2.6.6. Морфологическое исследование тонкой кишки крыс

2.6.7. Смертность и изменения внутренних органов крыс в модели паракват-индуцированного паркинсонизма

2.7. Модель 6-ГДА-индуцированного паркинсонизма крыс

2.7.1. Животные и препараты

2.7.2. Схема проведения эксперимента с 6-гидроксидофамин-индуцированной моделью болезни Паркинсона

2.7.3. Определение моторных дисфункций

2.7.4. Определение моторных дисфункций в тесте «Открытое поле» (ОП)

2.7.5. Определение моторных дисфункций в тесте «Сужающаяся дорожка» (СД)

2.7.6. Определение когнитивных нарушений в тесте «УРПИ» - условный рефлекс пассивного избегания

2.7.7. Измерение эвакуаторной активности тонкой кишки

2.8. Проверка АО активности и эффективности L. brevis 47f

2.8.1. Проверка АО активности и эффективности L. brevis 47f на модели индуцированного 5-фторурацилом мукозита кишечника мышей

2.8.2. Животные

2.8.3. Лекарственные формы и препараты

2.8.4. Дизайн эксперимента

2.8.5. Получение образцов плазмы крови и ткани кишечника

2.8.6. Микроморфометрия срезов слизистой оболочки кишки

2.8.7. Иммуногистохимическое выявление пролиферативного антигена Ki-67 в кишечнике мышей, получавших L. brevis 47f и 5-фторурацил

2.8.8. Измерение уровня МДА

2.8.9. Определение содержания малонового диальдегида (МДА) в крови

2.8.10. Определение содержания МДА в ткани кишечника

2.9. Идентификация и биоинформатическая характеристика генов в геномах отобранных штаммов, кодирующих продукты с потенциально антиоксидантными свойствами

2.9.1. Секвенирование геномов штаммов лактобацилл

2.9.2. Сборка и аннотация геномов

2.9.3. Анализ геномов Limosilactobacillus (Lactobacillus) fermentum LfU21 и Levilactobacillus (Lactobacillus) brevis 47f, а так же их особенностей, потенциально влияющих на антиоксидантные свойства

2.9.4. Референсный каталог генов и их продуктов. Алгоритмы составления и применение

2.9.5. Сравнительный анализ геномов

2.9.6. Гены, способные влиять на АО активность штамма, выявленные в результате автоматической аннотации генома

2.9.7. Окружение генов, способных влиять на АО активность штамма120

2.9.8. Сравнительный анализ аминокислотных последовательностей . 120 ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ

3.1. Изучение антиоксидантных свойств лактобацилл при помощи биосенсоров на основе рекомбинантных штаммов E. coli

3.1.1. Изучение антиоксидантных свойств лактобацилл при помощи биосенсоров на основе рекомбинантных штаммов E. coli

3.1.2. Стандартизация методики применения биолюминесцентного метода определения антиоксидантной активности. Оптимальная концентрация индукторов биолюминесценции

3.1.3. Оптимальное время инкубации биосенсоров

3.1.4. Оптимальный уровень рН исследуемых растворов

3.1.5. Оптимальные концентрации стандартных антиоксидантов

3.1.6. Результаты биолюминесцентного анализа

3.1.7. Критерии отбора штаммов для исследования

3.1.8. Наличие/отсутствие антиоксидантных свойств, обусловленных АО прямого действия методом ТЕАС

3.2. АО активность штаммов в моделях окислительного стресса in vivo

3.2.1. Изучение антиоксидантных свойств лактобацилл на модели паракват-индуцированного ОС у свободноживущей почвенной нематоды C. elegans

3.2.2. Методика получение бактериального газона с лактобациллами

3.2.3. Изменение медианной продолжительности жизни MLS нематод

3.2.4. Результаты определения живых бактерий в микробиоте нематод

3.3. Изучение антиоксидантных свойств лактобацилл на модели параква-

индуцированного паркинсонизма мышей

3.3.1. Определение моторных дисфункций

3.3.2. Определение протекторной активности L. fermentum LfU21 в отношении дофаминовых нейронов

3.3.3. Смертность мышей в модели паракват-индуцированного паркинсонизма

3.3.4. Изменения внутренних органов мышей в модели паракват-индуцированного паркинсонизма

3.4. Изучение антиоксидантных свойств лактобацилл на модели паракват-индуцированного окислительного стресса крыс

3.4.1. Смертность и изменения внутренних органов крыс в модели паракват-индуцированного паркинсонизма

3.4.2. Определение моторных дисфункций крыс

3.4.3. Морфологическое исследование тонкой кишки крыс

3.4.4. Изучение антиоксидантных свойств лактобацилл на модели 6-ГДА-индуцированного паркинсонизма крыс

3.4.5. Определение моторных дисфункций в тесте «Открытое поле» (ОП) и в тесте «Сужающаяся дорожка» (СД)

3.4.6. Определение когнитивных нарушений в тесте «УРПИ» - условный рефлекс пассивного избегания

3.4.7. Измерение эвакуаторной активности тонкой кишки

3.5. Изучение антиоксидантных свойств лактобацилл на модели индуцированного 5-фторурацилом мукозита кишечника мышей. 142 3.5.1.Экспериментальная модель мукозита кишечника мышей, индуцированного инъекциями 5-фторурацила

3.5.2. Влияние препарата L. brevis 47f, ребамипида и 5-ФУ на морфологию эпителия кишки

3.5.3. Иммуногистохимическое выявление пролиферативного антигена Ki-67 в кишечнике мышей в модели 5-ФУ индуцированного мукозита

3.5.4. Изменение уровня МДА в плазме крови

3.5.5. Изменение уровня МДА в тканях кишечника мышей

3.6. Результаты генетического исследования лактобацилл

3.6.1. Характеристики геномов исследованных штаммов лактобацилл

3.6.2. Результаты анализа нуклеотидной последовательности штамма L. fermentum LfU21 на наличие генов, влияющих на проявление антиоксидантных свойств

3.6.2.1. Гены ферментов-антиоксидантов

3.6.2.2. Гены синтеза и транспорта глутатиона в геноме штамма L.

fermentum LfU21

143

3.6.2.3. Гены белков тиоредоксинового комплекса в геноме штамма L. fermentum LfU21

3.6.2.4. Гены транспорта и метаболизма ионов тяжелых металлов

3.6.2.5. Гены эстеразы феруловой кислоты

3.6.2.6. Гены, определяющие воздействия на сигнальные пути Nrf2, pmk и микроб-ассоциированных молекулярных паттернов (МАМРs)

3.6.2.7. Гены, влияющие на особенности белкового профиля культуральной жидкости

3.6.2.8. Результаты сравнительного анализа геномов L. fermentum

3.6.3. Результаты анализа нуклеотидной последовательности штамма Levilactobacillus brevis 47f на наличие генов, влияющих на проявление антиоксидантных свойств

3.6.3.1. Гены ферментов-антиоксидантов каталаза и супероксиддисмутаза

3.6.3.2. Гены синтеза и метаболизма глутатиона

3.6.2.3. Гены белков тиоредоксинового комплекса

3.6.3.4. Гены эстеразы феруловой кислоты

3.6.3.5. Гены активного транспорта метаболитов

3.6.3.6. Гены, определяющие взаимодействие по Nr/2-сигнальному пути

3.6.3.7. Другие оксидазы/оксидоредуктазы

4. ЗАКЛЮЧЕНИЕ

ВЫВОДЫ

ПУБЛИКАЦИИ ПО ТЕМЕ ДИССЕРТАЦИИ

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

ПРИЛОЖЕНИЕ

Приложение

Приложение

Приложение

Приложение

Приложение 5. Благодарности

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Характеристика антиоксидантного потенциала лактобацилл и установление возможных молекулярно-генетических факторов его реализации»

ВВЕДЕНИЕ

Актуальность темы исследования.

Лактобациллы являются одними из наиболее часто используемых в пищевой и фармацевтической промышленности пробиотических бактерий. Они входят в состав функциональных пищевых продуктов, биологически активных добавок и лекарственных средств, все чаще используются в комплексном лечении начальных стадий различных заболеваний [Nowak A., 2018; Novik, G., 2020]. За счет продукции, выделения и метаболизма ряда биологически-активных веществ - незаменимых аминокислот, витаминов, пептидов сигнальных молекул, лактобациллы обладают антиоксидантными, антимутагенными и противоопухолевыми свойствами, препятствуют развитию аллергии и заболеваний ЖКТ [Sharma M. et al., 2016; Nowak A, 2018].

В соответствии с современными представлениями, значительная часть протекающих в организме человека патологических процессов индцируется воздействием избыточного количества активных форм кислорода (АФК). В небольших количествах АФК образуются в процессе нормальной жизнедеятельности клетки, одако, при избыточной продукции приводят к повреждению белков и клеточных структур и образованию продуктов свободнорадикального окисления (СРО) биомолекул - белков, липидов, нуклеиновых кислот [Cabello-Verrugio C, 2017; Pisoschi AM, 2021]. Окислительный стресс (ОС) развивающийся в результате избыточного образования АФК, является универсальным механизмом повреждения клеточных структур и общим патологическим процессом для всех типов воспаления, неконтролируемое образование и накопление радикалов и окисленных молекул приводит к повреждению и даже гибели клеток.

Обладающие антиоксидантными (АО) свойствами вещества способствуют поглощению АФК, препятствуют образованию продуктов СРО и участвуют в сохранении нормального окислительно-восстановительного баланса организма. Известно, что некоторые виды пробиотических бактерий, прежде всего бифидо- и лактобацилл, обладают выраженными

антиоксидантными свойствами и, являясь естественными симбионтами человека, могут успешно использоваться качестве источника антиоксидантов (АО). Такие бактерии, за счет комплекного действия на организм хозяина, имеют ряд преимуществ и могут быть эффективно использованы для повышения антиоксидантного статуса организма [Mishra V., 2015; Feng T., et.al., 2020].

Применение препаратов-пробиотиков, кроме ожидаемой пользы, может вызывать ряд побочных явлений. В том числе - увеличение частоты аллергической сенсибилизации и аутоиммунных расстройств, изменение микроэкологического баланса, влияние на экспрессию генов и активация сигнальных путей, связанных с различными хроническими заболеваниями, особенно у лиц с ослабленным иммунитетом. Эти нежелательные эффекты ограничивают использование пробиотиков и требуют более ответственного отношения к их исследованию и применению [Snydman, et al., 2008; Gratz et al., 2010]. Более того, традиционный способ введения пробиотиков может не дать необходимой концентрации метаболитов для достижения желаемого эффекта in vivo. Применение метабиотиков может быть более предпочтительно, благодаря известной химической структуре, эффективной дозе, обеспечению безопасности и более длительному сроку годности [Шендеров, 2013; Suez J, 2019]. Термин «метабиотики» относится к структурным компонентам пробиотических микроорганизмов, их метаболитов или сигнальных молекул с определенной химической структурой. Применение метабиотиков может оптимизировать специфические для хозяина физиологические, регуляторные, метаболические функции и поведенческие реакции, связанные с активностью принимающей местной микробиоты [Nataraj B.H., 2020].

В силу широкого распространения пробиотиков и обнаружения нежелательных побочных эффектов, требования к разрабатываемым пробиотическим препаратам все более ужесточаются [Suez J, 2019]. Необходимым условием является детальное изучение используемых бактерий, их генетики, в том числе определение нуклеотидной последовательности ДНК,

идентификация активных метаболитов и их взаимодействия с организмом человека [Doran S, 2015; Shokryazdan P, 2017; Sharifi-Rad J, 2020]. Определение молекулярных механизмов и активных молекул, обеспечивающих антиоксидантное действие лактобацилл, позволит применять конкретные штаммы для лечения и профилактики определенных нозологий, снижать вероятность появления нежелательных побочных явлений и повысить эффективность терапии. Результаты исследования могут служить информационной базой для разработки препаратов следующего поколения -фармабиотиков, которые включают в себя не только живые пробиотические микроорганизмы, но и любые клеточные компоненты или бактериальные метаболиты с доказанным клиническим эффектом [Nataraj B.H. et.al., 2020].

Степень научной разработанности проблемы.

Начиная с проектов «Микробиом человека» и MetaHIT в начале 21-го века и по сей день, микробиоте человека и возможностям ее модуляции уделяется огромное внимание [Young VB., 2016; Gotschlich EC, 2019; Malla MA, 2019; Lynch SV, 2019]. Все болшее число исследовательских проектов и работ посвящено изучению взаимосвязи между микро- и макроорганизмами. Известно, что антиоксидантная активность лактобацилл в организме хозяина обеспечена не только синтезом веществ с антиоксидантной активностью, но и сложными механизмами взаимодействия бактерий с организмом хозяина через нейроэндокринную и иммунную системы [Maldonado Galdeano C, 2019; Den H, 2020]. Доказано значительное влияние лактобацилл на композицию микробиоты и ее способность поддерживать нормальную проницаемость слизисто-эпителиального барьера кишечника, что также оказывает влияние на уровень хронического воспаления в организме и его антиоксидантный потенциал потенциал [Guarner F.J., 2007; Plaza-Diaz J, 2014; Sánchez B, 2017; La Fata G, 2018].

Отдельные штаммы коммерческих бактерий, таких как лактобациллы, бифидобактерии и энтерококки, обладают АО свойствами и способны

противостоять экзогенным АФК [Kullisaar et al., 2012; Mishra V. et.al., 2015]. Антиоксидантная и сопутствующая противовоспалительная активность лактобацилл была показана на модельных организмах и в исследованиях на здоровых добровольцах [Songisepp E., 2005; Korpela K., 2018; Oh J.H., 2019].

Цель и задачи исследования.

Цель данной работы - Охарактеризовать антиоксидантные свойства отдельных штаммов лактобацилл из коллекции ИОГен РАН, включая наличие в геномах генов с антиоксидантной активностью и исследование эффективности in vivo на моделях паркинсонизма и мукозита кишечника.

Для достижения поставленной цели были определены следующие задачи:

1. С помощью биолюминесцентных тест-систем на основе рекомбинантных штаммов E. coli К12 провести скрининг коллекции лактобацилл и выявить штаммы, обладающие повышенной антиоксидантной активностью.

2. Исследовать способность отобранных штаммов лактобацилл проявлять антиоксидантную активность на модели паракват-индуцированного окислительного стресса у нематоды C. elegans и выбрать 1 -2 штамма для дальнейших исследований in vivo.

3. Установить наличие в геномах отбранных штаммов факторов, способных влиять на проявление антиоксидантных свойств в различных моделях.

4. Изучить антиоксидантное и протекторное действие отобранных штаммов, используя модели паракват-индуцированного окислительного стресса (индуцированного паркинсонизма) индуцированного 5-фторурацилом мукозита кишечника.

Научная новизна исследования.

В работе впервые исследован антиоксидантный потенциал штаммов из

коллекции лактобацилл ИОГен РАН, выделенных из различных биотопов здоровых людей и впервые показана эффективность применения биолюминесцентных тест-систем на основе рекомбинантных штаммов E. coli К12 для такого исследования.

При помощи геномного и сравнительного геномного анализа выявлен ряд характерных молекулярно-генетических факторов, способных влиять на антиоксидантной активности исследованных штаммов.

Выявлены не охарактеризованные ранее штаммы лактобацилл, перспективные для разработки препаратов с таргетной антиоксидантной активностью, проявляемой в отношении активных форм кислорода.

Впервые показана высокая эффективность антиоксидантного действия отобранных штаммов в предотвращении негативных последствий воздействия индуцированного окислительного стресса на модельных животных -почвенных нематодах Caenorhabditis elegans, мышах Balb/c, мышах C57/BL6 и крысах Вистар.

Теоретическая и практическая значимость работы.

Выявление закономерностей в проявлении АО свойств штаммов пробиотических микроорганизмов имеет большую практическую и научную значимость.

Применение пробиотических бактерий и продуктов на их основе для повышения антиоксиданотого статуса организма, имеет ряд преимуществ перед другими способами, но в то же время, требует стандартизации по основным заявленным фармакологическим свойствам, установления молекулярной природы действующего начала и определяния соответствующих генетических факторов. Выявление отдельных генов и их кластеров, способных влиять на проявление антиоксидантных свойств лактобацилл, поможет более оперативно и менее затратно анализировать штаммы-кандидаты для создания фармацевтических препаратов на их основе. Полученные данные позволят

оценивать антиоксидантный потенциал штаммов, не прибегая к дорогостоящим и продолжительным исследованиям in vivo, а также рекомендовать их применение в профилактических или лечебных схемах для конкретных нозологий.

Таким образом, изучение генетических особенностей штаммов рода Lactobacillus, проявляющих антиоксидантные свойства in vitro и in vivo, представляется перспективной задачей для определения потенциала их использования в качестве физиологичных и безопасных лекарственных средств, а также является необходимой предпосылкой для дальнейших фундаментальных и прикладных исследований.

Методология и методы исследования.

В работе применен комплексный подход к определению АО активности лактобацилл, включая генетический анализ и исследования на различных моделях in vitro и in vivo. В работе осуществлен анализ научной литературы по тематике исследования. Направленные на решение поставленных задач исследования осуществлялись с спользованием современных молекулярно-генетических, биологических и биоинформатических подходов, применялись стандартные и адаптированные к предмету исследования экспериментальные модели и статистические методы исследований.

Основные положения, выносимые на защиту.

1. Биолюминесцентные сенсорные системы на основе рекомбинантных штаммов Escherichia coli К12 позволяют проводить скрининг коллекций лактобацилл для выявления штаммов с повышенной антиоксидантной активностью.

2. Обнаруженные в результате анализа геномов Limosilactobacillus fermentum LfU21 и Levilactobacillus brevis 47f комплексы генов, выявляют молекулярно-генетические основы их антиоксидантного действия.

3. Антиоксидантное действие штамма лактобацилл L. fermentum LfU21

выражается в увеличении продолжительности жизни нематоды Caenorhabditis elegans, снижении смертности и повреждений внутренних органов (легких, печени и нейронов черной субстанции мозга) грызунов (мышей линии С57/НЬ6 и крыс Вистар) в моделях индуцированного паракватом окислительного стресса.

4. Антиоксидантное действие штамма LevUactobacШus brevis 47f выражается в сохранении гистологической структуры кишечника и снижении уровня малонового диальдегида в крови и тканях кишечника в модели индуцированного 5-фторурацилом мукозита мышей C57/BL6.

Степень достоверности и апробация результатов.

Работа выполнена в Федеральном государственном бюджетном учреждении науки Институт Общей генетики им. Н.И. Вавилова Российской академии наук. Часть экспериментальных работ при участии с НИИ Фармакологии им. В.В. Закусова, Институтом проблем экологии и эволюции им. А.Н. Северцова РАН, Институтом биологии гена РАН, Отделом исследований мозга ФГБНУ Научного центра неврологии, лабораторией механизмов гибели опухолевых клеток НИИ Канцерогенеза, НИМЦО им. Н.Н. Блохина в рамках совместных научных работ и проектов.

Достоверность полученных результатов обеспечивается соблюдением современных международных рекомендаций при проведении исследовательских работ и статистической обработки экспериментальных данных.

Результаты диссертационной работы были представлены на лабораторных семинарах, на заседаниях аттестационной аспирантской комиссии ИОГен РАН, а так же в материалах девяти всероссийских и международных научных и научно-практических конференций.

Объем и структура диссертации.

Диссертация изложена на 229-и страницах машинопечатного текста и

включает введение, обзор литературы, описание использованных материалов и примененных методов, полученные результаты и их обсуждение. Список литературы включает 333 источника. Работа иллюстрирована 30-ю рисунками, дополнена 19-ю таблицами и списком сокращений, содержит Приложение, содержащее 4 объемные таблицы и Благодарности.

Личный вклад автора.

Автор принимал личное участие на всех этапах выполнения работы, включая планирование и осуществление экспериментов, оценку и интерпретацию их результатов, составление литературного обзора. В процессе работы непосредственно автором осуществлялся анализ научной литературы и информации из открытых баз данных, проведение сравнительного геномного анализа, планирование и выполнение экспериментальной части работ. В частности: подготовка, проведение и статистическая обработка результатов скрининговых исследований в биолюминесцентных тест-системах; планирование, подготовка, проведение и статистическая обработка результатов в модельной системе индуцированного окислительного стресса C.elegans. Работа по изучению свойств штамма LmosUactobacШш fermentum ЬШ21 в модели паракват-индуцированного окислительного стресса мышей (модель паркинсонизма) проводилась совместно с институтом фармакологии им. Закусова, институтом Биологии гена и Институтом проблем экологии и эволюции им. А.Н. Северцова, участие автора заключалось в планировании эксперимента, координации работ и проведении поведенческих тестов. Работа по изучению активности штамма LevUactobacШus brevis 471 в модели индуцированного 5-фторурацилом мукозита кишечника мыши была проведена совместно с лабораторией механизмов гибели опухолевых клеток НИИ Канцерогенеза, НИМЦО им. Н.Н. Блохина; участие автора заключалось в анализе содержания маркера окислительного стресса малонового диальдегида в крови и статистическая обработка полученных результатов. Работа по изучению АО активности штамма LmosUactobacШus fermentum Ыи21 в модели

паракват-индуцированного окислительного стресса крыс и 6-ГДА индуцированного паркинсонизма проводилась в сотрудничестве с Отделом исследований мозга ФГБНУ Научного центра неврологии. Часть работы была выполнена совместно с д.б.н. Полуэктовой Е.У., к.б.н. Мавлетовой Д.А., к.б.н. Ковтуном А.С. Автор лично проводил обработку полученных результатов для представления в виде тезисов и докладов на научных конференциях, принимал участие в написании научных обзоров, статей и патентов по результатам экспериментальной деятельности.

Публикации

По материалам диссертационной работы опубликовано 7 статей в международных рецензируемых научных журналах, 9 тезисов в материалах всероссийских и международных научных конференций, зарегистрировано 4 патента на изобретения.

Заключение диссертации по теме «Другие cпециальности», Марсова Мария Викторовна

ВЫВОДЫ

1. Исследование коллекции лактобацилл (коллекция ИОГен РАН) при помощи биолюминесцентных тест-систем на основе рекомбинантных штаммов E. coli К12, позволило отобрать 11 штаммов лактобацилл, культуральные жидкости которых обладают повышенной антиоксидантной активностью.

2. Использование модели паракват-индуцированного окислительного стресса нематоды C. elegans, показало способность отобранных штаммов лактобацилл влиять на медианную продолжительность жизни модельного организма и отобрать штамм с высокой АО активностью для дальнейших исследований в моделях in vivo.

3. Установлено, что геномы отобранных штаммов Limosilactobacillus fermentum LfU21 и Levilactobacillus brevis 47f содержат гены белков, потенциально влияющих на проявление наблюдаемых антиоксидантных свойств. А именно: геном штамма L. fermentum LfU21 содержит все гены белков тиоредоксинового комплекса (trxA и trxC, tpx (ahpC), ahpF, nrdH), что в целом не характерно для L. fermentum; белков транспорта (cydC, cydD,) и синтеза глутатиона (ghsF(AB)) редко встречающихся у L. fermentum; а так же, содержит большее количество генов метаболизма, транспорта и связывания ионов тяжелых металлов (copA, copB и другие) и металл-зависимых транскрипционных факторов (в том числе copR, сорУ/tcrY), чем другие штаммы L. fermentum. При этом большая часть выявленных генов составляет гипотетические опероны, что может влиять на активность проявления антиоксидантных свойств.

Геном штамма L. brevis 47f содержит большее количество генов, способных влиять на проявление АО активности, чем геномы других штаммов L. brevis. В том числе, редко встречающиеся (не характерные) гены метаболизма глутатиона: глутаредоксин-подобного белка NrdH (nrdH) и глутатион редуктазы (AAX72_04860), большее количество генов оксидаз/оксидоредуктаз (5) и редко встречающиеся гены липидкиназы и пермеазы (в 4-х геномах из 90 доступных).

Выявленные генетические особенности исследованных штаммов могут служить базой для проведения дальнейших исследований с использованием омиксных технологий.

3. Способность культуры штамма L. fermentum LfU21 проявлять антиоксидантную активность in vivo продемонстрирована в моделях паракват-индуцированного ОС нематоды Caenorhabditis elegans, что выражалось в увеличении продолжительности жизни на 20-35%; в моделях ОС грызунов (мышей линии C57/BL6 и крыс Вистар), что выражалось в снижении смертности и повреждений внутренних органов (легких, печени и нейронов черной субстанции мозга) грызунов.

4. Способность культуры штамма L. brevis 47f проявлять антиоксидантную активность in vivo продемонстрирована в модели индуцированного 5-фторурацилом мукозита кишечника мышей линии Balb/c, что проявлялось в снижении концентрации маркера окислительного стресса малонового диальдегида (МДА) на 40% в плазме крови и на 50% в тканях кишечника, а так же в сохранении гистологической структуры кишечного эпителия, проявляющегося в сохранении структуры эпителиоцитов, высоты ворсинок и количества бокаловидных клеток слизистой оболочки.

5. Отобранные штаммы Limosilactobacillus fermentum LfU21 и Levilactobacillus brevis 47f, благодаря генетическим особенностям, выявленным в результате проделанной работы, способны проявлять высокий уровень антиоксидантной активности in vivo и могут рассматриваться, как перспективные кандидаты для разработки препаратов-фармабиотиков и функциональных продуктов питания, предназначенных для профилактики и комплексной терапии различных состояний и расстройств, ассоциированных с развитием окислительного стресса.

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Марсова Мария Викторовна, 2022 год

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

1. Abilev S.; Marsova M.; Poluektova E. Development of New Methods for Screening and Selection of Probiotic Lactobacillus Strains with Antioxidant Properties. International Scientific Conference on Probiotics and Prebiotics Budapest, Hungary, IPC2015.

2. Abraham S., Soundararajan C. C., Vivekanandhan S., Behari M. Erythrocyte antioxidant enzymes in Parkinson's disease. Indian Journal of Medical Research. 2005;121(2): 111-115. PMID: 15756044

3. Achuthan AA. Antioxidative potential of lactobacilli isolated from the gut of Indian people. Mol Biol Rep. 2012. 39:7887-7897/ doi.: 10.1007/s11033-012-1633-9

4. Agim Z. S., Cannon J. R. Dietary factors in the etiology of Parkinson's disease. BioMedResearch International. 2015. 2015:16. doi: 10.1155/2015/672838.672838

5. Al-Madboly, L.A.; Ali, S.M.; Fakharany, E.M.E.; Ragab, A.E.; Khedr, E.G.; Elokely, K.M. Stress-based production, and characterization of glutathione peroxidase and glutathione S-transferase enzymes from Lactobacillus plantarum. Front. Bioeng. Biotechnol. 2020, 8, 78. doi: 10.3389/fbioe.2020.00078.

6. Alam A., Broms J.E., Kumar R., Sjostedt A. The Role of ClpB in Bacterial Stress Responses and Virulence. // Front Mol Biosci. 2021. 8:668910. Published 2021 Apr 22. doi:10.3389/fmolb.2021.668910]

7. Alhaj, O.A.; Kanekanian, A.D.; Peters, A. C.; Tatham, A.S. Hypocholesterolemic Effect of Bifidobacterium animalis Subspecies. Lactis (Bb12) and Trypsin Casein Hydrolysate. Food Chem. 2010, 123, 430-435. doi: 10.1016/j.foodchem.2010.04.061

8. Archibald, F.S.; Fridovich, I. Manganese and defenses against oxygen toxicity in Lactobacillus plantarum. J. Bacteriol. 1981, 145, 442-451. doi: 10.1128/jb.145.1.442-451.1981.

9. Aryantini N.P., Prajapati J.B., Urashima T. and Fukuda K. Complete Genome Sequence of Lactobacillus fermentum MTCC 25067. (Formerly TDS030603), a Viscous Exopolysaccharide-Producing Strain Isolated from Indian Fermented Milk. // Genome Announc. 2017. 5 (13), e00091-17 doi: 10.1128/genomeA.00091-17

10. Attia H.N., Maklad Y.A. Neuroprotective effects of coenzyme Q10 on Paraquat-induced Parkinson's disease in experimental animals. //Behav. pharmacol. 2018. 29, 79-86. doi: 10.1097/FBP.0000000000000342.

11. Averina OV, Poluektova EU, Marsova MV, Danilenko VN. Biomarkers and utility of the antioxidant potential of probiotic Lactobacilli and Bifidobacteria as representatives of the human gut microbiota. Biomedicines. 2021;9(10):1340. doi: 10.3390/biomedicines9101340

12. Azuma, Y.; Shinohara, M.; Wang, P.-L.; Hidaka, A.; Ohura, K. Histamine inhibits chemotaxis, phagocytosis, superoxide anion production, and the production of TNFa and IL-12 by macrophages via H2-receptors. Int Immunopharmacol. 2001, 1,18671875. doi: 10.1016/s1567-5769(01)00112-6.

13. Baltazar M.T., Dinis-Oliveira R.J., Carvalho F. Pesticides exposure as etiological factors of Parkinson'sdisease and other neurodegenerative diseases—A mechanistic approach. // Toxicology Letters 230 (2014) 85-103. doi: 10.1016/j.toxlet.2014.01.039

14. Banks, W.A.; Erickson, M.A. The blood-brain barrier and immune function and

dysfunction. // Neurobiol. Dis. 2010, 37, 26-32; doi: 10.1016/j.nbd.2009.07.031

15. Barboza JL, Okun MS, Moshiree B The treatment of gastroparesis, constipation and small intestinal bacterial overgrowth syndrome in patients with Parkinson's disease. Review. Expert Opin Pharmacother. 2015; 16(16):2449-64. doi: 10.1517/14656566.2015.1086747.

16. Barynin VV, Whittaker MM, Antonyuk SV, Lamzin VS, Harrison PM, Artymiuk PJ, Whittaker JW. Crystal structure of manganese catalase from Lactobacillus plantarum. Structure. 2001 Aug;9(8):725-38. doi: 10.1016/s0969-2126(01)00628-1.

17. Beach NK, Myers KS, Owen BR, Seib M, Donohue TJ, Noguera DR. Exploring the Meta-regulon of the CRP/FNR Family of Global Transcriptional Regulators in a Partial-Nitritation Anammox Microbiome. // mSystems. 2021 Oct 26;6(5):e0090621. doi: 10.1128/mSystems.00906-21.

18. Bel-Rhlid R., Durga J., Kunz T., Antonius J., Schmitt J. WO 2013190068 A1. Probiotic and polyphenol against neurodegeneration. 2012

19. Ben M. D., Bongiovanni R., Tuniz S., et al. Earliest mechanisms of dopaminergic neurons sufferance in a novel slow progressing ex vivo model of Parkinson disease in rat organotypic cultures of substantia nigra. International Journal of Molecular Sciences. 2019;20(9):p. 2224. doi: 10.3390/ijms20092224.

20. Berman S. B., Hastings T. G. Dopamine oxidation alters mitochondrial respiration and induces permeability transition in brain mitochondria: implications for Parkinson's disease. Journal of Neurochemistry. 1999;73:1127-1137. doi: 10.1046/j.1471-4159.1999.0731127.x.

21. Bhathena, J.; Kulamarva, A.; Urbanska, A.M.; Martoni, C.; Prakash, S. Microencapsulated bacterial cells can be used to produce the enzyme feruloyl esterase: preparation and in-vitro analysis. Appl Microbiol Biotechnol. 2007, 75, 1023-1029. doi: 10.1007/s00253-007-0908-x.

22. Bhattacharya M, et al. Interaction analysis of TcrX/Y two component system from Mycobacterium tuberculosis. Biochimie, 2010 Mar;92(3):263-72. doi: 10.1016/j.biochi.2009.11.009.

23. Blekhman R, Tang K, Archie EA, et al. Common methods for fecal sample storage in field studies yield consistent signatures of individual identity in microbiome sequencing data. Sci Rep. 2016;6:31519. doi.: 10.1038/srep31519

24. Braak H., Rüb U., Gai W. P., Del Tredici K. Idiopathic Parkinson's disease: Possible routes by which vulnerable neuronal types may be subject to neuroinvasion by an unknown pathogen. //J. Neural Transm. 2003. 110, 517-536. doi: 10.1007/s00702-002-0808-2.

25. Brandt K., Nethery M. A., O'Flaherty S., Barrangou R. Genomic characterization of Lactobacillus fermentum DSM 20052 / BMC Genomics. 2020; 21: 328. Published online 2020 Apr 29. doi: 10.1186/s12864-020-6740-8

26. Braune, A.; Blaut, M. Bacterial species involved in the conversion of dietary flavonoids in the human gut. Gut Microbes. 2016,7, 216-234. doi: 10.1080/19490976.2016.1158395.

27. Bron, P.A.; Wels, M.; Bongers, R.S.; van Bokhorst-van de Veen, H.; Wiersma, A.; Overmars, L.; Marco, M.L.; Kleerebezem, M. Transcriptomes reveal genetic signatures underlying physiological variations imposed by different fermentation

conditions in Lactobacillus plantarum. PLOS ONE. 2012, 7, 38720. doi: 10.1371/journal.pone.0038720.

28. Bruno-Bárcena, J.M.; Andrus, J.M.; Libby, S.L.; Klaenhammer, T.R.; Hassan, H.M. Expression of a heterologous manganese superoxide dismutase gene in intestinal lactobacilli provides protection against hydrogen peroxide toxicity. Appl Environ Microbiol. 2004,70, 4702-4710. doi: 10.1128/AEM.70.8.4702-4710.2004.

29. Burger-van Paassen, N.; Vincent, A.; Puiman, P.J.; Van Der Sluis, M.; Bouma, J.; Boehm, G.; van Goudoever, J.B.; Van Seuningen, I.; Renes, I.B. The regulation of intestinal mucin MUC2 expression by short-chain fatty acids: Implications for epithelial protection. Biochem. J. 2009, 420, 211-219. doi: 10.1042/BJ20082222

30. Cabello-Verrugio C, Simon F, Trollet C, Santibañez JF. Oxidative Stress in Disease and Aging: Mechanisms and Therapies 2016. Oxid Med Cell Longev. 2017;2017:4310469. doi: 10.1155/2017/4310469

31. Cabreiro F, Au C, Leung KY, Vergara-Irigaray N, Cochemé HM, Noori T, et al. Metformin retards aging in C. elegans by altering microbial folate and methionine metabolism. Cell. 2013.153: 228-239. doi: 10.1016/j.cell.2013.02.035.

32. Calabrese, V. et al. Aging and Parkinson's Disease: Inflammaging, Neuroinflammation and Biological Remodelling As Key Factors in Pathogenesis. // Free Radic. Biol. Med. 2017. 115, 80-91. doi: 10.1016/j.freeradbiomed.2017.10.379.

33. Cani P.D. Human gut microbiome: Hopes, threats and promises. Gut. 2018;67:1716-1725. doi: 10.1136/gutjnl-2018-316723.

34. Caplice E., Fitzgerald G.F. Food fermentations: role of microorganisms in food production and preservation // Int. J. Food Microbiol. 1999. V. 50 (1-2). P. 131-149. doi: 10.1016/s0168-1605(99)00082-3.

35. Caputi V, Giron MC. Microbiome-Gut-Brain Axis and Toll-Like Receptors in Parkinson's Disease.// Int J Mol Sci. 2018 Jun 6;19(6). doi: 10.3390/ijms19061689.

36. Cárdenas N, Laiño JE, Delgado S, Jiménez E, Juárez del Valle M, Savoy de Giori G, Sesma F, Mayo B, Fernández L, LeBlanc JG, Rodríguez JM. Relationships between the genome and some phenotypical properties of Lactobacillus fermentum CECT 5716, a probiotic strain isolated from human milk. // Appl Microbiol Biotechnol. 2015 May;99(10):4343-53. doi: 10.1007/s00253-015-6429-0.

37. Cassani E., Privitera G., Pezzoli G., Pusani C., Madio C., Iorio L., Barichella M. Use of probiotics for the treatment of constipation in Parkinson's disease patients. Minerva Gastroenterol. Dietol. 2011;57:117-121. PMID: 21587143

38. Carocho M., Ferreira I.C.F.R. A review on antioxidants, prooxidants and related controversy: Natural and synthetic compounds, screening and analysis methodologies and future perspectives. // Food and Chemical Toxicology 51 (2013) 15-25. doi: 10.1016/j.fct.2012.09.021.

39. Chakraborti S. et al. (eds). Paraquat-Induced Oxidative Stress and Lung Inflammation Oxidative Stress in Lung Diseases. 2020. https://doi.org/10.1007/978-981-32-9366-3_11

40. Chang, L.; Karin, M. Mammalian MAP kinase signalling cascades. Nature, 2001, 410, 37-40. doi: 10.1038/35065000.

41. Chang, O. K.; Seol, K.-H.; Jeong, S.-G.; Oh, M.-H.; Park, B.-Y.; Perrin, C.; Ham, J.-S. Casein hydrolysis by Bifidobacterium longum KACC91563 and antioxidant

activities of peptides derived therefrom.J. Dairy Scien. 2013,96, 5544-5555. doi: 10.3168/jds.2013-6687

42. Chaturvedi R. K., Shukla S., Seth K., et al. Neuroprotective and neurorescue effect of black tea extract in 6-hydroxydopamine-lesioned rat model of Parkinson's disease. Neurobiology of Disease. 2006;22(2):421-434. doi: 10.1016/j.nbd.2005.12.008.

43. Cheah KY, Howarth GS, Yazbeck R, Wright TH, Whitford EJ, et al. Grape seed extract protects IEC-6 cells from chemotherapy-induced cytotoxicity and improves parameters of small intestinal mucositis in rats with experimentally- induced mucositis. Cancer Biol. Ther. 2009, 8, 382-390. doi: 10.4161/cbt.8.4.7453.

44. Chen H, Zheng X, Zheng Y. Age-associated loss of lamin-B leads to systemic inflammation and gut hyperplasia. Cell. 2014.159: 829-843. doi: 10.1016/j.cell.2014.10.028.

45. Cheng H, Donahue JL, Battle SE, Ray WK, Larson TJ. Biochemical and Genetic Characterization of PspE and GlpE, Two Single-domain Sulfurtransferases of Escherichia coli. The Open Microbiology Journal. 2008 ;2:18-28. DOI: 10.2174/1874285800802010018.

46. Chesney JA, Eaton JW, Mahoney JR (1996) Bacterial glutathione: a sacrificial defense against chlorine compounds. J Bacteriol 178:2131-2135. doi: 10.1128/jb.178.7.2131-2135.1996.

47. Chia SJ, Tan EK, Chao YX. Historical Perspective: Models of Parkinson's Disease. Review. Int J Mol Sci. 2020 Apr 2;21(7):2464. doi: 10.3390/ijms21072464.

48. Choi, S.S.; Kim, Y.; Han, K.S.; You, S.; Oh, S.; Kim, S.H. Effects of Lactobacillus strains on cancer cell proliferation and oxidative stress in vitro. Lett. Appl. Microbiol. 2006, 42, 452-458. doi: 10.1111/j.1472-765X.2006.01913.x.

49. Cicenia A, Scirocco A, Carabotti M, Pallotta L, Marignani M, Severi C. Postbiotic activities of lactobacilli-derived factors. Review. // J Clin Gastroenterol. 2014 Nov-Dec;48 Suppl 1:S18-22. doi: 10.1097/MCG.0000000000000231.PMID: 25291118

50. Clemente, J.C.; Ursell, L.K.; Parfrey, L.W.; Knight, R. The impact of the gut microbiota on human health: An integrative view. // Cell 2012, 148, 1258-1270. doi: 10.1016/j.chom.2018.05.012.

51. Colle D, Farina M, Ceccatelli S, Raciti M. Paraquat and Maneb Exposure Alters Rat Neural Stem Cell Proliferation by Inducing Oxidative Stress: New Insights on Pesticide-Induced Neurodevelopmental Toxicity. // Neurotox Res. 2018 Jun 1. doi: 10.1007/s12640-018-9916-0.

52. Cryan, J.F.; Dinan, T.G. Mind-altering microorganisms: The impact of the gut microbiota on brain and behaviour. // Nat. Rev. Neurosci. 2012, 13, 701-712; doi: 10.1038/nrn3346.

53. Culotta VC, Daly MJ. Manganese complexes: diverse metabolic routes to oxidative stress resistance in prokaryotes and yeast. Review.// Antioxid Redox Signal. 2013 Sep 20;19(9):933-44. doi: 10.1089/ars.2012.5093.

54. Den H, Dong X, Chen M, Zou Z. Efficacy of probiotics on cognition, and biomarkers of inflammation and oxidative stress in adults with Alzheimer's disease or mild cognitive impairment - a meta-analysis of randomized controlled trials. Review. // Aging (Albany NY). 2020 Feb 15;12(4):4010-4039. doi:

10.18632/aging.102810.

55. Danilenko V.N., Devyatkin A. V., Marsova M. V., Shibilova M. U., Ilyasov R. A., Shmyrev V.I. Common Inflammatory Mechanisms in COVID-19 and Parkinson's Diseases: The Role of Microbiome, Pharmabiotics and Postbiotics in Their Prevention. Journal of Inflammation Research. 2021 Nov 30;14:6349-6381. doi: 10.2147/JIR.S333887.

56. Das DJ, Shankar A, Johnson JB, Thomas S. Critical insights into antibiotic resistance transferability in probiotic Lactobacillus. Review. Nutrition. 2020 Jan;69:110567. doi: 10.1016/j.nut.2019.110567. Epub 2019 Aug 13.PMID: 31733594

57. Das NK, Schwartz AJ, Barthel G, Inohara N, Liu Q, Sankar A, Hill DR, Ma X, Lamberg O, Schnizlein MK, Arqués JL, Spence JR, Nunez G, Patterson AD, Sun D, Young VB, Shah YM. Microbial Metabolite Signaling Is Required for Systemic Iron Homeostasis. // Cell Metab. 2020 Jan 7;31(1):115-130.e6. doi: 10.1016/j.cmet.2019.10.005

58. De Angelis M, Gobbetti M. Environmental stress responses in Lactobacillus: a review. Review. Proteomics. 2004 Jan;4(1):106-22. doi: 10.1002/pmic.200300497.PMID: 14730676

59. De Montijo-Prieto S., Castro D.J, Reina J.C, Jimenez-Valera M., Ruiz-Bravo A.. Draft genome sequence of Lactobacillus plantarum C4 (CECT 9567), a potential probiotic strain isolated from kefir. Arch Microbiol. 2019 Apr;201(3):409-414. doi: 10.1007/s00203-019-01629-9.

60. Deo, D.; Davray, D.; Kulkarni, R. A diverse repertoire of exopolysaccharide biosynthesis gene clusters in Lactobacillus revealed by comparative analysis in 106 sequenced genomes. Microoorganisms.2019, 7, 444. doi: 10.3390/microorganisms7100444.

61. Duar RM, Lin XB, Zheng J, Martino ME, Grenier T, Pérez-Muñoz ME, Leulier F, Gänzle M, Walter J. Lifestyles in transition: evolution and natural history of the genus Lactobacillus. Review. // FEMS Microbiol Rev. 2017 Aug 1;41(Supp_1):S27-S48. doi: 10.1093/femsre/fux030.PMID: 28673043

62. Dias V., Junn E., Mouradian M.M. The role of oxidative stress in Parkinson's disease. //Journal of Parkinson's Disease. 2013. 3. 461-491. doi: 10.3233/JPD-130230.

63. Diaz-Ropero MP, Martin R, Sierra S, Lara-Villoslada F, Rodriguez JM, Xaus J, et al. Two Lactobacillus strains, isolated from breast milk, differently modulate the immune response. J Appl Microbiol. 2007;102(2):337-343. 10.1111 / j.1365-2672.2006.03102.x.

64. Doron S, Snydman DR. Risk and safety of probiotics. Review.// Clin Infect Dis. 2015 May 15;60 Suppl 2(Suppl 2):S129-34. doi: 10.1093/cid/civ085.

65. Dubbs, J.M.; Mongkolsuk, S. Peroxiredoxins in bacterial antioxidant defense. SubcellBiochem. 2007, 44, 143-193.

66. Efler P., Kilstrup M., Johnsen S., Svensson B., Hägglund P. Two Lactococcus lactis thioredoxin paralogues play different roles in responses to arsenate and oxidative stress/ Microbiology. 2015 Mar;161(Pt 3):528-38. doi: 10.1099/mic.0.000029.

67. Enami A., Masuda N., Yamamura J., Mizutani M., Yasojima H., Shikata A., Masaoka M., Takada S., Bamba N., Yamamoto M., Abe M., Makihara K. Therapeutic effect of rebamipide for oral mucositis associated with FEC therapy for breast cancer. Gan To Kagaku Ryoho. 2014, 41, 11, 1407-1412

68. Evans M.D. Repair of Oxidatively-Modified DNA. Brenner's Encyclopedia of Genetics (Second Edition) 2013, Pages 144-147

69. Eschenburg,S., Kabsch,W., Healy,M.L. and Schonbrunn,E. A new view of the mechanisms of UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase (MurA) and 5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate synthase (AroA) derived from X-ray structures of their tetrahedral reaction intermediate states./ J. Biol. Chem. 2003. 278 (49), 4921549222. doi: 10.1074/jbc.M309741200.

70. Ewaschuk, J.B.; Diaz, H.; Meddings, L.; Diederichs, B.; Dmytrash, A.; Backer, J.; Looijer-van Langen, M.; Madsen, K.L. Secreted bioactive factors from Bifdobacteriuminfantis enhance epithelial cell barrier function. // Am. J. Physiol. Gastrointest. Liver Physiol. 2008, 295, 1025-1034. doi: 10.1152/ajpgi.90227.2008

71. Falony G, Joossens M, Vieira-Silva S, Wang J, Darzi Y, et.al. Population-level analysis of gut microbiome variation. // Science. 2016 Apr 29;352(6285):560-4. doi: 10.1126/science. aad3503.

72. Fang X. Microbial treatment: The potential application for Parkinson's disease. Neurol. Sci. 2019;40:51-58. doi: 10.1007/s10072-018-3641-6.

73. de Farias C. C., Maes M., Bonifacio K. L., et al. Highly specific changes in antioxidant levels and lipid peroxidation in Parkinson's disease and its progression: disease and staging biomarkers and new drug targets. Neuroscience Letters. 2016;617:66-71. doi: 10.1016/j.neulet.2016.02.011.

74. Fedoce, A.D.G.; Ferreira, F.; Bota, R.G.; Bonet-Costa, V.; Sun, P.Y.; Davies, K.J.A. The role of oxidative stress in anxiety disorder: cause or consequence? Review. Free Radic Res. 2018, 52, 737-750. doi: 10.1080/10715762.2018.1475733.

75. Feng T.; Wang, J. Oxidative stress tolerance and antioxidant capacity of lactic acid bacteria as probiotic: a systematic review. Gut Microbes. 2020, 12, e1801944. doi: 10.1080/19490976.2020.1801944.

76. Ferrante R.J., Browne S.E., Shinobu L.A. et al. Evidence of increased oxidative damage in both sporadic and familial amyotrophic lateral sclerosis. // Journal of neurochemistry, 1997, vol. 69, no. 5, pp. 2064-2074; doi: 10.1046/j.1471-4159.1997.69052064.x.

77. Fetissov SO, Averina OV, Danilenko VN. Neuropeptides in the microbiota-brain axis and feeding behavior in autism spectrum disorder. Review // Nutrition. 2018. Oct. 27; 61:43-48

78. Fei Q, McCormack AL, Di Monte DA & Ethell DW. Paraquat neurotoxicity is mediated by a Bak-dependent mechanism. J Biol Chem. 2008. 283, 3357-3364. doi: 10.1074/jbc.M708451200.

79. Firuzi, O.; Miri, R.; Tavakkoli, M.; Saso, L. Antioxidant Therapy: Current Status and Future Prospects. Current Medicinal Chemistry, 2011, 18, 3871-3888 3871 09298673/11 Bentham Science Publishers Ltd. doi: 10.2174/092986711803414368.

80. Forsyth, C.B.; Shannon, K.M.; Kordower, J.H.; Voigt, R.M.; Shaikh, M.; Jaglin, J.A.; Estes, J.D.; Dodiya, H.B.; Keshavarzian, A. Increased intestinal permeability

correlates with sigmoid mucosa alpha-synuclein stainingand endotoxin exposure markers in early Parkinson's disease// PLoS ONE 2011, 6. doi: 10.1371/journal.pone.0028032.

81. Gagnon, M;, Savard, P.; Riviére, A.; LaPointe, G.; Roy, D. Bioaccessible antioxidants in milk fermented by Bifidobacterium longum subsp. longum strains. Biomed. Res. Int.2015. e169381. doi: 10.1155/2015/169381.

82. Ganesh BP, Hall A, Ayyaswamy S, Nelson JW, Fultz R, Major A, Haag A, Esparza M, Lugo M, Venable S, Whary M, Fox JG, Versalovic J. Diacylglycerol kinase synthesized by commensal Lactobacillus reuteri diminishes protein kinase C phosphorylation and histamine-mediated signaling in the mammalian intestinal epithelium. //Mucosal Immunol. 2018 Mar;11(2):380-393. doi: 10.1038/mi.2017.58

83. Gao, J.; Li, Y.; Wan, Y.; Hu, T.; Liu, L.; Yang, S.; Gong, Z.; Zeng, Q. A novel postbiotic from Lactobacillus rhamnosus GG with a benefcialefect on intestinal barrier function. Front. Microbiol. 2019, 10, 477. doi: 10.3389/fmicb.2019.00477

84. Garber J.C., Guide for the Care and Use of Laboratory Animals. Eighth Edition THE NATIONAL ACADEMIES PRESS. PMID: 21595115

85. García-Giménez JL, Markovic J, Dasí F, Queval G, Schnaubelt D, Foyer CH, Pallardó FV. Nuclear glutathione. Review.//Biochim Biophys Acta. 2013 May;1830(5):3304-16. doi: 10.1016/j.bbagen.2012.10.005. Epub 2012 Oct 13.PMID: 23069719

86. Gawkowski D, Chikindas ML. Non-dairy probiotic beverages: the next step into human health. Review. // Benef Microbes. 2013 Jun 1;4(2):127-42. doi: 10.3920/BM2012.0030.

87. Gazerani P. Probiotics for Parkinson's Disease. Review. //Int J Mol Sci. 2019 Aug 23;20(17):4121. doi: 10.3390/ijms20174121.

88. Georgescu D., Ancusa O.E., Georgescu L.A., Ionita I., Reisz D. Nonmotor gastrointestinal disorders in older patients with Parkinson's disease: Is there hope? Clin. Interv. Aging. 2016;11:1601-1608. doi: 10.2147/CIA.S106284.

89. Gevers D, Knight R, Petrosino JF, et al. The Human Microbiome Project: a community resource for the healthy human microbiome. PLoS Biol. 2012; 10(8):e1001377. https://doi.org/10.1371/journal.pbio.1001377

90. Ghosh, S.; Whitley, C.S.; Haribabu, B.; Jala, V.R. Regulation of Intestinal Barrier Function by Microbial Metabolites. Cellul. Molec, Gastroenter. Hepatol. 2021, 11, 1463-1482. doi: 10.1016/j.jcmgh.2021.02.007.

91. Gillet S., Matroule J.-Y., Functional Diversity of Bacterial Strategies to Cope With Metal Toxicity. Microbial Diversity in the Genomic Era, 2019

92. Glorieux, C.;Calderon, P.B. Catalase, a remarkable enzyme: targeting the oldest antioxidant enzyme to find a new cancer treatment approach. Biol Chem. 2017, 398, 1095-1108. doi: 10.1515/hsz-2017-0131.

93. Gopalakrishna, R., Jaken, S. Protein kinase C signaling and oxidative stress.// Free Radic Biol Med. 2000, 28, 1349-136. doi: 10.1016/S0891-5849(00)00221-5

94. Gotschlich EC, Colbert RA, Gill T. Methods in research: Past, present, and future. Review. // Best Pract Res Clin Rheumatol. 2019 Dec;33(6):101498. doi: 10.1016/j.berh.2020.101498.

95. Götz M. E., Gerstner A., Harth R., et al. Altered redox state of platelet coenzyme Q10 in Parkinson's disease. Journal of Neural Transmission. 2000;107(1):41-48. doi: 10.1007/s007020050003.

96. Grathwohl, S. A., Steiner, J. A., Britschgi, M. & Brundin, P. Mind the gut: Secretion of a-synuclein by enteric neurons. //Journal of Neurochemistry 2013. 125, 487-490. doi: 10.1111/jnc.12191.

97. Greifova, G.; Body, P.; Greif, G., Greifova, M.; Dubnickova, M. Human phagocytic cell response to histamine derived from potential probiotic strains of Lactobacillus reuteri. // Immunobiol.2018, 223, 11, 618-626. doi: 10.1016/j.imbio.2018.07.007.

98. Guarner F.J Studies with inulin-type fructans on intestinal infections, permeability, and inflammation. Review. // Nutr. 2007 Nov; 137 (11 Suppl):2568S-2571S. doi: 10.1093/jn/137.11.2568S.

99. Guo, Q.; Li, S; Xie, Y.; Zhang, Q.; Liu, M.; Xu, Z.; Sun, H.; Yang, Y. The NAD+-dependent deacetylase, Bifidobacterium longum Sir2 in response to oxidative stress by deacetylating SigH (gh) and FOXO3a in Bifidobacterium longum and HEK293T cell respectively. Free Radic. Biol. Med. 2017, 108, 929-939. doi: 10.1016/j.freeradbiomed.2017.05.012.

100. Haddadi R, Nayebi AM, Eyvari Brooshghalan S. Silymarin prevents apoptosis through inhibiting the Bax/caspase-3 expression and suppresses toll like receptor-4 pathway in the SNc of 6-OHDA intoxicated rats. Biomed Pharmacother. 2018 Aug;104:127-136. doi: 10.1016/j.biopha.2018.05.020.

101. Hall AB, Tolonen AC, Xavier RJ. Human genetic variation and the gut microbiome in disease. Nat Rev Genet. 2017. https://doi.org/10.1038/nrg.2017.63

102. Hallet B., Arciszewska L.K., Sherratt D.J. Reciprocal control of catalysis by the tyrosine recombinases XerC and XerD: an enzymatic switch in site-specific recombination. // Mol. Cell. 1999. 4:949-959. doi: 10.1016/s1097-2765(00)80224-5.

103. Hasman H.. The tcrB gene is part of the tcrYAZB operon conferring copper resistance in Enterococcus faecium and Enterococcus faecalis./ Microbiology (Reading). 2005 Sep;151(Pt 9):3019-3025. doi: 10.1099/mic.0.28109-0.

104. Higuchi, M.; Yamamoto, Y.; Kamio, Y. Molecular biology of oxygen tolerance in lactic acid bacteria: functions of NADH oxidases and Dpr in oxidative stress, J. Biosci Bioeng. 2000, 90, 484-493. PMID: 16232897

105. Hirasawa M, Kurita-Ochia T. Probiotic Potential of Lactobacilli Isolated from Saliva of Periodontally Healthy Individuals. // Oral Health Prev Dent. 2020;18(1):563-570. doi: 10.3290/j.ohpd.a44693.

106. Hu X, Ouyang S, Xie Y, Gong Z, Du J. Characterizing the gut microbiota in patients with chronic kidney disease. //Postgrad Med. 2020 Aug;132(6):495-505. doi: 10.1080/00325481.2020.1744335

107. Huang CS, Moore WR, Meister A (1988) On the active site thiol of y-glutamylcysteine synthetase: relationships to catalysis, inhibition, and regulation. Proc Natl Acad Sci USA 85:2464-2468. doi: 10.1073/pnas.85.8.2464.

108. Huang, G.; Pan, H.; Zhu, Z.; Li, Q. The complete genome sequence of Bifidobacterium longum LTBL16, a potential probiotic strain from healthy centenarians with strong antioxidant activity. Genomics. 2020, 112, 769-773. doi:

10.1016/j.ygeno.2019.05.015.

109. Ilson, D.H. Advances in the treatment of gastric cancer. //Curr Opin Gastroenterol, 2018, 34(6), 389 465-468. https://doi.org/10.1097/MOG.0000000000000475

110. Isobe C., Abe T., Terayama Y. Levels of reduced and oxidized coenzyme Q-10 and 8-hydroxy-2'-deoxyguanosine in the cerebrospinal fluid of patients with living Parkinson's disease demonstrate that mitochondrial oxidative damage and/or oxidative DNA damage contributes to the neurodegenerative process. Neuroscience Letters. 2010;469(1):159-163. doi: 10.1016/j.neulet.2009.11.065.

111. Jaenicke E., Büchler K., Markl J., Decker H., Barends T.R.M.Cupredoxin-like domains in haemocyanins. Biochem J (2010) 426 (3): 373-378. https://doi.org/10.1042/BJ20091501

112. Jäkälä P., Vapaatalo H. Antihypertensive Peptides from Milk Proteins. Review. // Pharmaceuticals (Basel). 2010 Jan 19;3(1):251-272. doi: 10.3390/ph3010251

113. Jang S. Y., Heo J., Park M.R., Song M-H., N.Kim J., Jo S.H., Jeong D.-Y., Lee H. K., Kim Y.and Oh S. Genome Characteristics of Lactobacillus fermentum Strain JDFM216 for Application as Probiotic Bacteria. Review. // J. Microbiol. Biotechnol. (2017), 27(7), 1266-1271. https://doi.org/10.4014/jmb.1703.03013

114. Jarocki VM, Reid CJ, Chapman TA, Djordjevic SP. Escherichia coli ST302: Genomic Analysis of Virulence Potential and Antimicrobial Resistance Mediated by Mobile Genetic Elements. // Front Microbiol. 2020 Jan 21;10:3098. doi: 10.3389/fmicb.2019.03098.

115. Jia, F.F; Zhang, L.J; Pang, X.H; Gu, X.X. et al. Complete genome sequence of bacteriocin-producing Lactobacillus plantarum KLDS1.0391, a probiotic strain with gastrointestinal tract resistance and adhesion to the intestinal epithelial cells. Genomics. 2017, 109, 5-6, 432-437.

116. Jiang T, Sun Q, Chen S. Oxidative stress: A major pathogenesis and potential therapeutic target of antioxidative agents in Parkinson's disease and Alzheimer's disease. Review. // Prog Neurobiol. 2016 Dec;147:1-19. doi: 10.1016/j.pneurobio.2016.07.005.

117. Jing Wang, Wei Zhang, Sixin Wang, Yamin Wang, Xu Chu, Haifeng Ji. Lactobacillus plantarum Exhibits Antioxidant and Cytoprotective Activities in Porcine Intestinal Epithelial Cells Exposed to Hydrogen Peroxide.// Oxid Med Cell Longev. 2021 Jul 30;2021:8936907. doi: 10.1155/2021/8936907.

118. Jung KA, Kwak MK. The Nrf2 system as a potential target for the development of indirect antioxidants. Review. Molecules. 2010 Oct 20;15(10):7266-91. doi: 10.3390/molecules15107266.

119. Kawasaki S., Satoh T., Todoroki, M., Niimura Y. b-Type Dihydroorotate Dehydrogenase Is Purified as a H2O2-Forming NADH Oxidase from Bifidobacterium bifidum. // Appl. Environ. Microbiol.2009, 75, 629-636. doi: 10.1128/AEM.02111-08.

120. Kelly, S.M.; O'Callaghan, J.; Kinsella, M.; van Sinderen, D. Characterisation of a hydroxycinnamic acid esterase from the Bifidobacterium longum subsp. longum taxon. Front Microbiol. 2018, 9, e2690. doi: 10.3389/fmicb.2018.02690.

121. Kerksick, C.; Willoughby, D. The Antioxidant Role of Glutathione and N-Acetyl-Cysteine Supplements and Exercise-Induced Oxidative Stress.J. Intern. Soc. Spor.

Nutrit. 2005,2, 38-44. doi: 10.1186/1550-2783-2-2-38.

122. Kigerl K. A., Hall J.C.E., Wang L., Mo X., Yu Z., Popovich P. G. Gut dysbiosis impairs recovery after spinal cord injury.// J Exp Med (2016) 213 (12): 2603-2620. https://doi.org/10.1084/jem.20151345;

123. Kim J.S., Sung H.Y. Gastrointestinal Autonomic Dysfunction in Patients with Parkinson's Disease. J. Mov. Disord. 2015;8:76-82. doi: 10.14802/jmd.15008;

124. Kim H.J., Kim J.H., Moon W., Park J. et al. Rebamipide attenuates 5-fluorouracil-induced small intestinal mucositis in a mouse model. Biol. Pharm. Bull. 2015, 38, 2, 179-183. doi: 10.1248/bpb.b14-00400.

125. Kim, M.; Seo, D.H.; Park, Y.S.; Cha, I.T.; Seo, M.J. Isolation of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum producing C30 carotenoid 4,4'-diaponeurosporene and the assessment of its antioxidant activity. J. Microbiol. Biotechnol. 2019, 29, 19251930. doi: 10.4014/jmb.1909.09007.

126. Kleerebezem M, Vaughan EE. Probiotic and gut lactobacilli and bifidobacteria: molecular approaches to study diversity and activity. Review. // Annu Rev Microbiol. 2009;63:269-90. doi: 10.1146/annurev.micro.091208.073341.

127. Klijn, A.; Mercenier, A.; Arigoni, F. Lessons from the genomes of bifidobacteria. FEMS Microbiol. Rev. 2005, 29, 491-509.

128. Klimina KM, Kasianov AS, Poluektova EU, Emelyanov KV, Voroshilova VN, Zakharevich NV, Kudryavtseva AV, Makeev VJ, Danilenko VN. Employing toxin-antitoxin genome markers for identification of Bifidobacterium and strains in human metagenomes. PeerJ. 2019 Mar 4;7:e6554. doi: 10.7717/peerj.6554.

129. Krishna, S.G.; Zhao, W.; Grazziutti, M.L.; Sanathkumar, N.; Barlogie, B.; Anaissie E.J. Incidence and risk factors for lower alimentary tract mucositis after 1529 courses of chemotherapy in a 392 homogenous population of oncology patients: clinical and research implications. Cancer, 2011, 393 117(3), 648-655. doi: 10.1002/cncr.25633

130. Kock,H., Gerth,U. and Hecker,M. MurAA, catalysing the first committed step in peptidoglycan biosynthesis, is a target of Clp-dependent proteolysis in Bacillus subtilis. JOURNAL Mol. Microbiol. 2004. 51 (4), 1087-1102. doi: 10.1046/j.1365-2958.2003.03875.x.

131. Kodali, V.P.; Sen, R. Antioxidant and free radical scavenging activities ofanexopolysaccharide from aprobiotic bacterium. Biotechnol J.2008, 3, 245-51. doi: 10.1002/biot.200700208.

132. Kono, Y.; Fridovich, I. Isolation and characterization of the pseudocatalase of Lactobacillus plantarum. J Biolog Chem. 1983, 258, 10, 6015-6019. PMID: 6853475

133. Korpela K, Salonen A, Vepsalainen O, Suomalainen M, Kolmeder C, Varjosalo M, Miettinen S, Kukkonen K, Savilahti E, Kuitunen M, de Vos WM. Probiotic supplementation restores normal microbiota composition and function in antibiotic-treated and in caesarean-born infants. Clinical Trial. // Microbiome. 2018 Oct 16;6(1): 182. doi: 10.1186/s40168-018-0567-4.

134. Korver, S.K.; Gibson, R.J.; Bowen, J.M.; Coller, J.K. Toll-like receptor/interleukin-1 domain 385 innate immune signalling pathway genetic variants are candidate predictors for severe 386 gastrointestinal toxicity risk following 5-fluorouracil-based chemotherapy. Cancer Chemother 387 Pharmacol, 2019, 83(2),

217-236. https://doi.org/10.1007/s00280-018-3729-y.

135. Kovalzon VM, Moiseenko LS, Ambaryan AV, Kurtenbach S, Shestopalov VI, Panchin YV. Sleep-wakefulness cycle and behavior in pannexin1 knockout mice. Behav Brain Res. 2017 Feb 1;318:24-27. doi: 10.1016/j.bbr.2016.10.015.

136. Kovtun, A.S.; Averina, O.V.; Zakharevich, N.V.; Kasianov, A.S.; Danilenko, V.N. In silico Identification of Metagenomic Signature Describing Neurometabolic Potential of Normal Human Gut Microbiota. Russ. J. Genet. 2018, 54, 1101-1110.

137. Ksonzekova, P.; Bystricky, P.; Vlckova, S.; Patoprsty, V.; Pulzova, L. et al. Exopolysaccharides of Lactobacillus reuteri: their influence on adherence of E. coli to epithelial cells and inflammatory response.Carbohydr Polym. 2016, 141, 10-19. doi: 10.1016/j.carbpol.2015.12.037.

138. Kullisaar, T.; Songisepp, E.; Aunapuu, M; et al. Complete glutathione system in probiotic Lactobacillus fermentum ME-3. Appl Biochem Microbiol. 2010, 46, 481486. PMID: 21058502

139. Kumar A, Ganini D, Mason RP. Role of cytochrome c in a-synuclein radical formation: implications of a-synuclein in neuronal death in Maneb- and paraquat-induced model of Parkinson's disease. // Mol Neurodegener. 2016 Nov 24;11(1):70). doi: 10.1186/s13024-016-0135-y.

140. Kurata S., Nakashima T., Osaki T., Uematsu N., Shibamori M., Sakurai K., Kamiya S. Rebamipide protects small intestinal mucosal injuries caused by indomethacin by modulating intestinal microbiota and the gene expression in intestinal mucosa in a rat model. J. Clin. Biochem. Nutr., 2015, 56, 1, 20-27. doi: 10.3164/jcbn.14-67.

141. Kuter K, Nowak P, Golembiowska K, Ossowska K. Increased reactive oxygen species production in the brain after repeated low-dose pesticide paraquat exposure in rats. A comparison with peripheral tissues. // Neurochem. Res. 2010.35:1121-30. doi: 10.1007/s 11064-010-0163-x.

142. Kwak, W.; Kim, K.; Lee, C.; Lee, C.; Kang, J.; Cho, K.; Yoon, S.H.; Kang, D.K.; Kim, H.; Heo, J.; Cho, S. Comparative analysis of the complete genome of Lactobacillus plantarum GB-LP2 and potential candidate genes for host immune system enhancement. J. Microbiol. Biotechnol. 2016, 26, 684-692. doi: 10.4014/jmb.1510.10081.

143. La Fata G, Weber P, Mohajeri MH. Probiotics and the Gut Immune System: Indirect Regulation. Review. // Probiotics Antimicrob Proteins. 2018 Mar;10(1):11-21. doi: 10.1007/s12602-017-9322-6.

144. Laino J, Villena J, Kanmani P, Kitazawa H. Immunoregulatory Effects Triggered by Lactic Acid Bacteria Exopolysaccharides: New Insights into Molecular Interactions with Host Cells. // Microorganisms. 2016 Aug 15;4(3):27. doi: 10.3390/microorganisms4030027.

145. Lan J., Jiang D. H. Excessive iron accumulation in the brain: a possible potential risk of neurodegeneration in Parkinson's disease. Journal of Neural Transmission. 1997;104(6-7):649-660. doi: 10.1007/BF01291883.

146. Lavasani S, Dzhambazov B, Nouri M, Fak F, Buske S, Molin G, Thorlacius H, Alenfall J, Jeppsson B, Westrom B. A novel probiotic mixture exerts a therapeutic effect on experimental autoimmune encephalomyelitis mediated by IL-10 producing

regulatory T cells. // PLoS One. 2010 Feb 2; 5(2):e9009. doi: 10.1371/journal.pone.0009009.

147. Lawton T.J., Rosenzweig A.C. Research on Nitrification and Related Processes, Part B

Methods in Enzymology, 2011

148. LeBegue C, Love BL, Wyatt MD. Microbes as drugs: The potential of pharmabiotics. // J. Human Pharm. Drug Thera. 2019;40:102-106. doi: 10.1002/phar.2357.

149. Lebouvier, T. et al. Colonic biopsies to assess the neuropathology of parkinson's disease and its relationship with symptoms. //PLoS One. 2010. 5, 1-9; doi: 10.1371/journal.pone.0012728.

150. Lee JM, Hwang KT, Jun WJ, Park CS, Lee MY. Antiinflammatory effect of lactic acid bacteria: inhibition of cyclooxygenase-2 by suppressing nuclear factor-kappaB in Raw264.7 macrophage cells. // J Microbiol Biotechnol. 2008 Oct;18(10):1683-8. PMID: 18955820

151. Lee, J.; Hwang, K.-T.; Chung, M.-Y.; Cho, D.-H.; Park, C.-S. Resistance of Lactobacillus casei KCTC 3260 to reactive oxygen species (ROS): Role for a metal ion chelating effect. J Food Sci. 2005, 70, 8, 388-391. doi: 10.1111/j.1365-2621.2005.tb11524.x

152. Lehri B, Seddon AM, Karlyshev AV. Lactobacillus fermentum 3872 genome sequencing reveals plasmid and chromosomal genes potentially involved in a probiotic activity. // FEMS Microbiol Lett. 2015 Jun;362(11):fnv068. doi: 10.1093/femsle/fnv068.

153. Li, B.; Du, P.; Smith, E.E.; Wang, S.; Jiao, Y.; Guo, L.; Huo, G.; Liu, F. In vitro and in vivo evaluation of an exopolysaccharide produced by Lactobacillus helveticus KLDS1.8701 for the alleviative effect on oxidative stress. Food Funct. 2019, 10, 1707-1717. doi: 10.1039/c8fo01920g.

154. Li H., Xu H., Graham D.E., White R.H. Glutathione synthetase homologs encode alpha-L-glutamate ligases for methanogenic coenzyme F420 and tetrahydrosarcinapterin biosyntheses. // Proc Natl Acad Sci USA. 2003 Aug 19;100(17):9785-90. doi: 10.1073/pnas.1733391100.

155. Li J, Jia H, Cai X, Zhong H, Feng Q, Sunagawa S, et al. An integrated catalog of referencegenes in the human gut microbiome. Nat Biotechnol. 2014; 32:834-841. https://doi.org/10.1038/nbt.2942

156. Liddle R.A. Parkinson's disease from the gut. Brain Res. 2018;1693:201-206. doi: 10.1016/j.brainres.2018.01.010.

157. Lim, S.-D.; Kim, K.-S.; Do, J.-R. Physiological characteristics and production of vitamin K2 by Lactobacillus fermentum LC272 isolated from raw milk. Korean J. Food Sci. Anim. Resour. 2011, 31, 513-520. doi: 10.5851/kosfa.2011.31.4.513

158. Lin, J.; Zou, Y.; Cao, K.; Ma, C.; Chen, Z. The impact of heterologous catalase expression and superoxide dismutase overexpression on enhancing the oxidative resistance in Lactobacillus casei. J Ind Microbiol Biotechnol. 2016, 43, 703-711. doi: 10.1007/s10295-016-1752-8

159. Liu, H.; Wang, J.; He, T.; Becker, S.; Zhang, G.; Li, D.; Ma, X. Butyrate: A Double-Edged Sword for Health? Adv. Nutr. 2018, 9, 21-29. doi:

10.1093/advances/nmx009

160. Liu, Q.; Yu, Z.; Tian, F.; Zhao, J.; Zhang, H.; Zhai, Q.; Chen, W. Surface components and metabolites of probiotics for regulation of intestinal epithelial barrier. Microb. Cell Factories 2020, 19, 1-11. doi: 10.1186/s12934-020-1289-4.

161. Lloret A, Esteve D, Monllor P, Cervera-Ferri A, Lloret A. The Effectiveness of Vitamin E Treatment in Alzheimer's. Review.// Int J Mol Sci. 2019 Feb 18;20(4):879. doi: 10.3390/ijms20040879.

162. Lu J, Holmgren A. The thioredoxin antioxidant system. Review.// Free Radic Biol Med. 2014. 66:75-87. doi: 10.1016/j.freeradbiomed.2013.07.036.

163. Lue B.C. US 20160199425 A1 Treatment and Prophylaxis for Parkinson'sDisease. 2015.

164. Luti S, Mazzoli L, Ramazzotti M, Galli V, Venturi M, Marino G, Lehmann M, Guerrini S, Granchi L, Paoli P, Pazzagli L. Antioxidant and anti-inflammatory properties of sourdoughs containing selected Lactobacilli strains are retained in breads. Food Chem. 2020 Aug 30;322:126710. doi: 10.1016/j.foodchem.2020.126710.

165. Lynch SV, Ng SC, Shanahan F, Tilg H. Translating the gut microbiome: ready for the clinic? Review. // Nat Rev Gastroenterol Hepatol. 2019 Nov;16(11):656-661. doi:10.1038/s41575-019-0204-0.

166. Lyu C, Hu S, Huang J, Luo M, Lu T, Mei L, Yao S. Contribution of the activated catalase to oxidative stress resistance and gamma-aminobutyric acid production in Lactobacillus brevis. // Int J Food Microbiol. 2016 Dec 5;238:302-310. doi: 10.1016/j.ijfoodmicro.2016.09.023.

167. Mahdhi A, Leban N, Chakroun I, Chaouch MA, Hafsa J, Fdhila K, Mahdouani K, Majdoub H. Extracellular polysaccharide derived from potential probiotic strain with antioxidant and antibacterial activities as a prebiotic agent to control pathogenic bacterial biofilm formation.// Microb Pathog. 2017 Aug;109:214-220. doi: 10.1016/j.micpath.2017.05.046.

168. Main P.A., Angley M.T, O'Doherty C.E, Thomas P., Fenech M.. The potential role of the antioxidant and detoxification properties of glutathione in autism spectrum disorders: a systematic review and meta-analysis. Nutr Metab (Lond). 2012 Apr 24;9:35. doi: 10.1186/1743-7075-9-35.

169. Maldonado Galdeano C, Cazorla SI, Lemme Dumit JM, Vélez E, Perdigón G. Beneficial Effects of Probiotic Consumption on the Immune System. Review. // Ann Nutr Metab. 2019;74(2):115-124. doi: 10.1159/000496426.

170. Malla MA, Dubey A, Kumar A, Yadav S, Hashem A, Abd Allah EF. Exploring the Human Microbiome: The Potential Future Role of Next-Generation Sequencing in Disease Diagnosis and Treatment. Review. Front Immunol. 2019 Jan 7;9:2868. doi: 10.3389/fimmu.2018.02868.

171. Manning-Bog AB, McCormack AL, Li J, Uversky VN, Fink AL & Di Monte DA. The herbicide paraquat causes up-regulation and aggregation of alphasynuclein in mice: paraquat and alpha-synuclein. // J. Biol. Chem. 2002. 277, 1641-1644. doi: 10.1074/jbc.C100560200.

172. Marsova M.V., Abilev S.K., Poluektova E.U., Danilenko V.N. A bioluminescent test system reveals valuable antioxidant properties of lactobacillus strains from

human microbiota. // World Journal of Microbiology and Biotechnology, 2018, 34:27. doi.org/10.1007/s11274-018-2410-2

173. Marsova M., Odorskaya M., Novichkova M., Polyakova V., Abilev S., Kalinina E., Shtil A., Poluektova E. and Danilenko V. The Lactobacillus brevis 47 f Strain Protects the Murine Intestine from Enteropathy Induced by 5-Fluorouracil. //Microorganisms, 2020, 8, 876; doi:10.3390/microorganisms8060876

174. Marsova M., Poluektova E., Odorskaya M., Ambaryan A., Revishchin A., Pavlova G. & Danilenko V. Protective effects of Lactobacillus fermentum U-21 against paraquat-induced oxidative stress in Caenorhabditis elegans and mouse models.// World Journal of Microbiology and Biotechnology volume 36, Article number: 104 (2020). https://doi.org/10.1007/s11274-020-02879-2

175. Matsui M, Tomita M, Kanai A. Comprehensive computational analysis of bacterial CRP/FNR superfamily and its target motifs reveals stepwise evolution of transcriptional networks. Genome Biol Evol. 2013;5(2):267-82. doi: 10.1093/gbe/evt004.

176. Maslowski, K.M.; Mackay, C.R. Diet, gut microbiota and immune responses. // Nat. Immunol. 2011, 12, 5-9; doi:10.1038/ni0111-5

177. Matsuura K, Kabuto H, Makino H, Ogawa N. Pole test is a useful method for evaluating the mouse movement disorder caused by striatal dopamine depletion. // J Neurosci Methods. 1997 Apr 25;73(1):45-8; doi: 10.1016/s0165-0270(96)02211-x.

178. Mazzeo, M.F.; Cacace, G.; Peluso, A.; Zotta, T.; Muscariello, L.; Vastano, V.; Parente, E.; Siciliano, R.A. Effect of inactivation of ccpA and aerobic growth in Lactobacillus plantarum: A proteomic perspective. J. Proteomics. 2012, 75, 13, 4050-4061. doi: 10.1016/j.jprot.2012.05.019.

179. Meister A, Anderson ME (1983) Glutathione. Ann Rev Biochem 52:711-760. doi: 10.1146/annurev.bi.52.070183.003431.

180. Meng Z., Dong Y., Gao H., Yao D., Gong Y., Meng Q., Zheng T., Cui X., Su X., and Tian Y. The effects of ®-3 fish oil emulsion-based parenteral nutrition plus combination treatment for acute paraquat poisoning. //J Int Med Res. 2019 Feb; 47(2): 600-614. doi: 10.1177/0300060518806110

181. Meng Gao, Jingjing Zhou, Zhengding Su, Yongqi Huang. Bacterial cupredoxin azurin hijacks cellular signaling networks: Protein-protein interactions and cancer therapy. Review. // Protein Sci. 2017 Dec;26(12):2334-2341. doi: 10.1002/pro.3310.

182. Mikelsaar M, Zilmer M. Lactobacillus fermentum ME-3 - an antimicrobial and antioxidative probiotic. Microb Ecol Health Dis. 2009;21(1):1-27. doi: 10.1080/08910600902815561

183. Miletic J., Drakulic D., Pejic S., et al. Prooxidant-antioxidant balance, advanced oxidation protein products and lipid peroxidation in Serbian patients with Parkinson's disease. International Journal of Neuroscience. 2018;128(7):600-607. doi: 10.1080/00207454.2017.1403916.

184. Mishra V., Shah C., Mokashe N., Chavan R., Yadav H., and Prajapati J. Probiotics as potential antioxidants: A Systematic Review. J. Agric. Food Chem. 26 Mar 2015: 1-48. doi: 10.1021/jf506326t;

185. Morishita, T.; Tamura, N.; Makino, T.; Kudo, S. Production of menaquinones by lactic acid bacteria. J. Dairy Sci. 1999, 82, 1897-1903. doi: 10.3168/jds.S0022-

0302(99)75424-X.

186. Mukdsi, M.C.; Cano, M.P.; González, S.N.; Medina, R.B. Administration of Lactobacillus fermentum CRL1446 increases intestinal feruloyl esterase activity in mice. Lett Appl Microbiol. 2012, 54, 18-25. doi: 10.1111/j.1472-765X.2011.03166.x.

187. Mukherjee A., Biswas A., Das S.K. Gut dysfunction in Parkinson's disease. // World J Gastroenterol. 2016 Jul 7;22(25):5742-52/ doi: 10.3748/wjg.v22.i25.5742

188. Muthukumaran K., Leahy S., Harrison K., Sikorska M., Sandhu J. K., Cohen J., Keshan C., Lopatin D., Miller H., Borowy-Borowski H., Lanthier P., Weinstock S., Pandey S. Orally delivered water soluble Coenzyme Q10 (Ubisol-Q10) blocks ongoing neurodegeneration in rats exposed to paraquat: Potential for therapeutic application in Parkinson's disease. BMC Neurosci, 2014, 15, 21. doi: 10.1186/14712202-15-21

189. Nakagawa, H.; Shiozaki, T.; Kobatake, E.; Hosoya, T.; Moriya, T.; Sakai, F.; Taru, H.; Miyazaki, T. Effects and mechanisms of prolongevity induced by Lactobacillus gasseri SBT2055 in Caenorhabditis elegans. Aging Cell. 2016, 15, 227-236. doi: 10.1111/acel.12431

190. Naraki, S.; Igimi, S.; Sasaki, Y. NADH peroxidase plays a crucial role in consuming H2O2 in Lactobacillus casei IGM394. Biosci Microbiota Food Health. 2020, 39, 45-56. doi: 10.12938/bmfh.19-027

191. Nataraj BH, Shivanna SK, Rao P, Nagpal R, Behare PV. Evolutionary concepts in the functional biotics arena: a mini-review. Review. //Food Sci Biotechnol. 2020 Sep 16;30(4):487-496. doi: 10.1007/s10068-020-00818-3.

192. Nguyen, P.T.; Nguyen, T.T.; Bui, D.C.; Hong, P.T.; Hoang, Q.K.; Nguyen, H.T. Exopolysaccharide production by lactic acid bacteria: the manipulation of environmental stresses for industrial applications. AIMS Microbiol. 2020, 6, 451469. doi: 10.3934/microbiol.2020027

193. Noureen S., Riaz A., Arshad M., Arshad N. In vitro selection and in vivo confirmation of the antioxidant ability of Lactobacillus brevis MG000874/ J. Appl. Microbiol. Volume126, Issue4 P.1221-1232 https://doi.org/10.1111/jam.14189

194. Nowak A, Paliwoda A, Blasiak J. Anti-proliferative, pro-apoptotic and anti-oxidative activity of Lactobacillus and Bifidobacterium strains: A review of mechanisms and therapeutic perspectives. Review. // Crit Rev Food Sci Nutr. 2019;59(21):3456-3467. doi: 10.1080/10408398.2018.1494539.

195. Novik, G.; Savich, V. Beneficial microbiota. Probiotics and pharmaceutical products in functional nutrition and medicine. Microbes Infect. 2020, 22, 8-18. doi: 10.1016/j.micinf.2019.06.004.

196. Obeid R. The metabolic burden of methyl donor deficiency with focus on the betaine homocysteine methyltransferase pathway. Nutrients. 2013. 5: 3481-3495. doi: 10.3390/nu5093481

197. Oberg, T. S.; Broadbent, J. R. Hydrogen Peroxide Resistance in Bifidobacterium Animalis Subsp. Lactis and Bifidobacterium Longum. Book Editor(s): Frans J. de Bruijn. 2016. Book Stress and Environmental Regulation of Gene Expression and Adaptation in Bacteria, &II, Chapter 10.6.

198. Oberg, T.S.; Warda, R.E.; Steele, J.L.; Jeff, R. Broadbent.Transcriptome analysis of Bifidobacterium longum strains that show a differential response to hydrogen

peroxide stress J. Biotechn. 2015, 212, 58-64.

199. O'Connor G, Jeffrey E, Madorma D, Marcillo A, Abreu MT, Deo SK, et al. Investigation of Microbiota Alterations and Intestinal Inflammation Post-Spinal Cord Injury in Rat Model. Journal of Neurotrauma. 2018;35: 2159-2166. pmid:29566601

200. Oh JH, Jang YS, Kang D, Chang DK, Min YW. Efficacy and Safety of New Probiotics for Unconstipated Irritable Bowel Syndrome: A Randomized, DoubleBlind, Placebo-Controlled Trial. Clinical Trial.// Nutrients. 2019 Nov 27;11(12):2887. doi: 10.3390/nu11122887.

201. Ollis D.L., Cheah E., Cygler M., Dijkstra B., Frolow F., Franken S.M., Harel M., Remington S.J., Silman I., Schrag,J. et al. The alpha/beta hydrolase fold. /Protein Eng 1992.5 (3), 197-211.

202. Paillusson, S., Clairembault, T., Biraud, M., Neunlist, M. & Derkinderen, P. Activity-dependent secretion of alpha-synuclein by enteric neurons. //J. Neurochem. 2013. 125, 512-517; doi: 10.1111/jnc.12131

203. Parashar A., Udayabanu M. Gut microbiota: Implications in Parkinson's disease. Parkinsonism Relat. Disord. 2017;38:1-7. doi: 10.1016/j.parkreldis.2017.02.002.

204. Paraskevas G. P., Kapaki E., Petropoulou O., Anagnostouli M., Vagenas V., Papageorgiou C. Plasma levels of antioxidant vitamins C and E are decreased in vascular parkinsonism. Journal of the Neurological Sciences. 2003;215(1-2):51-55. doi: 10.1016/S0022-510X(03)00184-9.

205. Park, C.-M.; Kim, G.-M.; Cha, G.-S. Biotransformation of Flavonoids by Newly Isolated and Characterized Lactobacillus pentosus NGI01 Strain from Kimchi. Microorganisms 2021, 9, 1075. doi: 10.3390/microorganisms9051075

206. Pechanova O, Simko F. Chronic antioxidant therapy fails to ameliorate hypertension: potential mechanisms behind. Review.// J Hypertens Suppl. 2009 Aug;27(6):S32-6. doi: 10.1097/01.hjh.0000358835.25934.5e.

207. Peng J., Stevenson F. F., Oo M. L., Andersen J. K. (2009). Iron-enhanced paraquat-mediated dopaminergic cell death due to increased oxidative stress as a consequence of microglial activation. Free Radic Biol Med, 46, 312-320. doi: 10.1016/j.freeradbiomed.2008.10.045.

208. Percario S., Barbosa A.S., Varela E.L.P., Gomes A.R.Q., Ferreira M.E.S., Moreira T.N.A., Dolabela M.F. Oxidative Stress in Parkinson's Disease: Potential Benefits of Antioxidant Supplementation. //Oxid Med Cell Longev. 2020; doi: 10.1155/2020/2360872

209. Perez-Pardo, P.; Dodiya, H.B.et al. Gut-brain and brain-gut axis in Parkinson's disease models: Effects of a uridine and fish oil diet. // Nutr. Neurosci. 2017, 1-12; doi: 10.1080/1028415X.2017.1294555.

210. Perez-Pardo, et al. PD The gut-brain axis in Parkinson's disease: Possibilities for food-based therapies.// Eur. J. Pharmacol. 2017, 817, 86-95. doi: 10.1016/j.ejphar.2017.05.042.

211. Persson T, Popescu BO, Cedazo-Minguez A. Oxidative stress in Alzheimer's disease: why did antioxidant therapy fail? Review. //Oxid Med Cell Longev. 2014;2014:427318. doi: 10.1155/2014/427318.

212. Petrof E.O.; Kojima K.; Ropeleski M. J.; Musch M. W.; Tao,Y.; De Simone C.; Chang E. B. Probiotics inhibit nuclear factor- KappaB and induce heat shock proteins

in colonic epithelial cells through proteasome inhibition, Gastroenterol. 2004, 127, 1474-87. doi: 10.1053/j.gastro.2004.09.001

213. Peiroten, A.; Alvarez, I.; Landete, J.M. Production of flavonoid and lignan aglycones from flaxseed and soy extracts by Bifidobacterium strains. Int J Food Sci Technol. 2020, 55, 2122-2131. doi.org/10.1111/ijfs.14459

214. Petrova M.I., Macklaim J.M., Wuyts S., Verhoeven T., Vanderleyden J., Gloor G.B., Lebeer S., Reid G. Comparative genomic and phenotypic analysis of the vaginal probiotic Lactobacillus rhamnosus GR-1 // Front. Microbiol., 9 (2018), p. 1278; doi: 10.3389/fmicb.2018.01278.

215. Petrova M.I., Reid G., ter Haar J.A. Lacticaseibacillus rhamnosus GR-1, a.k.a. Lactobacillus rhamnosus GR-1: Past and Future Perspectives. Review. // Trends in Microbiology. Special Issue: Regulation of Human Health by the Microbiota. Volume 29, Issue 8, August 2021, Pages 747-761. https://doi.org/10.1016/j.tim.2021.03.010

216. Pisoschi AM, Pop A, Iordache F, Stanca L, Predoi G, Serban AI. Oxidative stress mitigation by antioxidants - An overview on their chemistry and influences on health status. Review. // Eur J Med Chem. 2021 Jan 1;209:112891. doi: 10.1016/j.ejmech.2020.112891.

217. Pittman, M.S.; Robinson, H.C.; Poole, R.K. A bacterial glutathione transporter (Escherichia coli CydDC) exports reductant to the periplasm. J. Biol. Chem. 2005, 280, 37, 32254-32261.

218. Pizzo, S.V.; Kobatake, E.; Nakagawa, H.; Seki, T.; Miyazaki, T. Protective effects and functional mechanisms of Lactobacillus gasseri SBT2055 against oxidative stress. Plos 0NE.2017,12, e0177106. doi: 10.1371/journal.pone.0177106.

219. Plaza-Diaz J, Gomez-Llorente C, Fontana L, Gil A. Modulation of immunity and inflammatory gene expression in the gut, in inflammatory diseases of the gut and in the liver by probiotics. Review. // World J Gastroenterol. 2014 Nov 14;20(42):15632-49. doi: 10.3748/wjg.v20.i42.15632.

220. Polak-Berecka, M.; Wasko, A.; Szwajgier, D.; Chomaz, A. Bifidogenic and antioxidant activity of exopolysaccharides produced by Lactobacillus rhamnosus E/N cultivated on different carbon sources. Pol. J. Microbiol. 2013, 62, 181-188. PMID: 24053021

221. Pophaly, S.D.; Singh, R.; Pophaly, S.D.; Kaushik, J.K.; Tomar, S.K. Current status and emerging role of glutathione in food grade lactic acid bacteria. Microb. Cell. Fact.2012,11, 114. doi: 10.1186/1475-2859-11-114.

222. Pophaly, S.D.; Poonam, S.; Pophaly, S.D.; Kapila, S.; Nanda, D.K.; Tomar, S.K.; Singh, R. Glutathione biosynthesis and activity of dependent enzymes in food grade lactic acid bacteria harboring multidomain bifunctional fusion gene (gshF). J. Appl. Microbiol. 2017, 123, 194-203. doi: 10.1111/jam.13471.

223. Popova E. N., Gordeev I. G. Modern ideas about human microbiota. MICROBIOT / Monograph edited by E. L. Nikonov and E. N. Popova. Moscow. -2019. - Pp. 5-19

224. Pouchieu C, Piel C, Carles C, Gruber A, Helmer C, Tual S, Marcotullio E, Lebailly P, Baldi I. Pesticide use in agriculture and Parkinson's disease in the AGRICAN cohort study. // Int J Epidemiol. 2018 Feb 1; 47(1). 299-310; doi:

10.1093/ije/dyx225

225. Prasad K.N. Oxidative Stress, Pro-Inflammatory Cytokines, and Antioxidants Regulate Expression Levels of MicroRNAs in Parkinson's Disease. //Curr Aging Sci. 2017;10(3): 177-184. doi: 10.2174/1874609810666170102144233.

226. Prazdnova E.V.; Chistyakov V.A.; Churilov M.N.; Mazanko M.S.; Bren A.B.; Volski A.; Chikindas M.L. DNA-protection and antioxidant properties of fermentates from Bacillusamyloliquefaciens B-1895 and Bacillus subtilis KATMIRA1933 Article in letters in applied microbiology. 2015. Dec;61(6):549-54. doi: 10.1111/lam.12491.

227. Ricciardi, A.; Ianniello, R.G.; Parente, E.; Zotta, T. Factors affecting gene expression and activity of heme- and manga-nese-dependent catalases in Lactobacillus casei strains. Int J Food Microbiol. 2018, 280, 66-77.

228. Raveschot C., Cudennec B., Coutte F., Flahaut C., Fremont M., Drider D. Production of Bioactive Peptides by Lactobacillus Species: From Gene to Application. Review. // Front Microbiol. 2018 Oct 17;9:2354. doi: 10.3389/fmicb.2018.02354.

229. Ricciardi, A.; Ianniello, R.G.; Parente, E.; Zotta, T. Factors affecting gene expression and activity of heme- and manganese-dependent catalases in Lactobacillus casei strains. Int J Food Microbiol. 2018, 280, 66-77. doi: 10.1016/j.ijfoodmicro.2018.05.004.

230. Rice-Evans, C.A.; Miller, N.J.; Paganga, G. Structure-antioxidant activity relationships of flavonoids and phenolic acids. Free Radical Bio Med. 1996, 20, 933956. doi: 10.1016/0891-5849(95)02227-9.

231. Rochat T, Bermúdez-Humarán L, Gratadoux JJ, Fourage C, Hoebler C, Corthier G, Langella P. Anti-inflammatory effects of Lactobacillus casei BL23 producing or not a manganese-dependant catalase on DSS-induced colitis in mice. // Microb Cell Fact. 2007 Jul 20;6:22. doi: 10.1186/1475-2859-6-22.

232. Roche, H.M.; Terres, A.M.; Black, I.B.; Gibney, M.J.; Kelleher, D. Fatty acids and epithelial permeability: effect of conjugated linoleic acid in Caco-2 cells. Gut. 2001, 48, 797-802. doi: 10.1136/gut.48.6.797.

233. Rossi M, Amaretti A, Raimondi S. Folate production by probiotic bacteria. Review.// Nutrients. 2011 Jan;3(1):118-34. doi: 10.3390/nu3010118.

234. Ruiz, L. Gueimonde, M.; Ruas-Madiedo, P.; Ribbera, A.; de los Reyes-Gavilán, C.G.; Ventura, M. et al. Molecular clues to understand the aerotolerance phenotype of Bifidobacterium animalis subsp. lactis. Appl. Environ.Microbiol. 2012, 78, 644-650. doi: 10.1128/AEM.05455-11.

235. Saadat, R.Y.; Khosroushahi, Y.A.; Gargari, P.B. A comprehensive review of anticancer, immunomodulatory and health beneficial effects of the lactic acid bacteria exopolysaccharides. Carbohydr. Polym. 2019, 217, 79-89. doi: 10.1016/j.carbpol.2019.04.025.

236. Saeedi, B.J.; Liu, K.H.; Owens, J.A.; Hunter-Chang, S.; Camacho, M.C.; Eboka, R.U.; et al. Gut-Resident Lactobacilli Activate Hepatic Nrf2 and Protect Against Oxidative Liver Injury. Cell Metab. 2020, 31, 956-968. doi: 10.1016/j.cmet.2020.03.006.

237. Sánchez, A.;Vázquez, A. Bioactive peptides: A review. Food Qual. Safety. 2017, 1, 29-46. doi: 10.1093/fqsafe/fyx006

238. Sánchez B, Delgado S, Blanco-Míguez A, Lourenfo A, Gueimonde M, Margolles A. Probiotics, gut microbiota, and their influence on host health and disease. Review. Mol Nutr Food Res. 2017 Jan;61(1). doi: 10.1002/mnfr.201600240. Epub 2016 Oct 10.PMID: 27500859

239. Santos R, Ruiz de Almodóvar C, Bulteau AL, Gomes C.M. Neurodegeneration, neurogenesis, and oxidative stress. //Oxid Med Cell Longev. 2013; doi: 10.1155/2013/730581.

240. Schallert, T., Woodlee, M.T., and Fleming, S.M. (2002). Disentangling multiple types ofrecovery from brain injury. In: Krieglstein J, Klumpp S, editors. Pharmacology of Cerebral Ischemia 2002 Stuttgart: Medpharm Scientific Publishers; 201-216.

http://citeseerx.ist.psu.edu/viewdoc/download?doi=10.1.1.320.2956&rep=rep1&type =pdf

241. Schober A. Classic toxin-induced animal models of Parkinson's disease: 6-OHDA and MPTP. Cell Tissue Res. 2004; 318(1): 215-224. DOI: 10.1007/ s00441-004-0938-y.

242. Schramm F., Schroeder K., Jonas K. Protein aggregation in bacteria. // FEMS Microbiol Rev. 2020. 44. 54-72. doi: 10.1093/femsre/fuz026

243. Segata N, Waldron L, Ballarini A, Narasimhan V, Jousson O, Huttenhower C. Metagenomic microbial community profiling using unique clade-specific marker genes. Nature Methods. 2012;9(8):811-814. doi: 10.1038/nmeth.2066.

244. Serata, M.; Yasuda, E.; Sako, T. Effect of superoxide dismutase and manganese on superoxide tolerance in Lactobacillus casei strain Shirota and analysis of multiple manganese transporters. Biosci Microbiota Food Health. 2018, 37, 31-38. doi: 10.12938/bmfh.17-018.

245. Serata, M.; Iino, T.; Yasuda, E.; Sako, T. Roles of thioredoxin and thioredoxin reductase in the resistance to oxidative stress in Lactobacillus casei. Microbiology (Reading). 2012, 158,953-962. doi: 10.1099/mic.0.053942-0.

246. Serrano, L.M.; Molenaar, D.; Wels, M.; Teusink, B.; Bron, P.A.; de Vos, W.M.; Smid, E.J. Thioredoxin reductase is a key factor in the oxidative stress response of Lactobacillus plantarum WCFS1. Microb Cell Fact.2007, 6, 29. doi: 10.1186/14752859-6-29.

247. Seth, A.; Yan, F.; Polk, D. B.; Rao. R. K. Probiotics ameliorate the hydrogen peroxide-induced epithelial barrier disruption by a PKC- and MAP kinase-dependent mechanism. Am. J. Physiol. Gastrointest. Liver Physiol.2008, 294, 1060-1069. doi: 10.1152/ajpgi.00202.2007.

248. Shannon K.M., Keshavarzian A., Dodiya H.B., Jakate S., Kordower J.H. Is alpha-synuclein in the colon a biomarker for premotor Parkinson's Disease? Evidence from 3 cases. Mov. Disord. 2012;27:716-719. doi: 10.1002/mds.25020.

249. Sharifi-Rad J, Rodrigues CF, Stojanovic-Radic Z, Dimitrijevic M, Aleksic A, Neffe-Skocinska K, Zielinska D, Kolozyn-Krajewska D, Salehi B, Milton Prabu S, Schutz F, Docea AO, Martins N, Calina D. Probiotics: Versatile Bioactive Components in Promoting Human Health. Review. /*/ Medicina (Kaunas). 2020 Aug 27;56(9):433. doi: 10.3390/medicina56090433.

250. Sharma A, et al., ALS-associated mutant FUS induces selective motor neuron

degeneration through toxic gain of function.// Nat Commun. 2016; 7:10465. doi: 10.1038/ncomms 10465.

251. Shimamura, S.; Abe, F.; Ishibashi, N.; Miyakawa, H.; Yaeshima, T.; Araya, T.; Tomita, M. Relationshlp Between Oxygen Sensitivity and Oxygen Metabolism of Blfldobacterium Species. J Dairy Sci. 1992, 75, 3296-3306. doi: 10.3168/jds.S0022-0302(92)78105-3.

252. Shokryazdan P, Faseleh Jahromi M, Liang JB, Ho YW. Probiotics: From Isolation to Application. Review. // J Am Coll Nutr. 2017 Nov-Dec;36(8):666-676. doi: 10.1080/07315724.2017.1337529.

253. Smirnova GV, Krasnykh TA, Oktyabrsky ON (2001) Role of glutathione in the response of Escherichia coli osmotic stress. Biochemistry (Moscow) 66:973-978. doi: 10.1023/a:1012361323992.

254. Sommer, F.; Anderson, J.M.; Bharti, R.; Raes, J.; Rosenstiel, P. The resilience of the intestinal microbiota infuences health and disease. Nat Rev Microbiol. 2017, 15, 630-638. doi: 10.1038/nrmicro.2017.58.

255. Song M.K., Park M.Y, Sung M.K.J. 5-Fluorouracil-induced changes of intestinal integrity biomarkers in BALB/c mice. //Cancer Prev. 2013. V.18: 322-329. doi: 10.15430/jcp.2013.18.4.322.

256. Songisepp E, Kals J, Kullisaar T, Mändar R, Hütt P, Zilmer M, Mikelsaar M. Evaluation of the functional efficacy of an antioxidative probiotic in healthy volunteers. Clinical Trial. // Nutr J. 2005 Aug 4;4:22. doi: 10.1186/1475-2891-4-22.

257. Spielman L.J., Gibson D.L., Klegeris A. Unhealthy gut, unhealthy brain: The role of the intestinal microbiota in neurodegenerative diseases. Neurochem. Int. 2018;120:149-163. doi: 10.1016/j.neuint.2018.08.005.

258. Spyropoulos, B.G.; Misiakos, E.P.; Fotiadis, C.; Stoidis, C.N. Antioxidant properties ofprobiotics and their protective effects in thepathogenesis ofradiation-induced enteritis and colitis. Dig Dis Sci. 2011, 56, 285-294. doi: 10.1007/s10620-010-1307-1

259. Stavropoulou, E.; Bezirtzoglou, E. Probiotics in Medicine: A Long Debate. Front. Immunol. 2020, 11, e2192. doi: 10.3389/fimmu.2020.02192.

260. Stavrovskaya A.V., Voronkov D.N., Olshansky A.S., Gushchina A.S., Yamshikova N.G. [The relationship between the location of a lesion in the striatal dopaminergic innervation and its behavioral manifestation in a 6-hydroxydopamine-induced model of Parkinson's disease in rats]. Annals of clinical and experimental neurology 2021; 15(2): 42-49. (In Russ). DOI: 10.25692/ACEN.2021.2.6

261. Stehr,M., Schneider,G., Aslund,F., Holmgren,A. and Lindqvist,Y. Structural basis for the thioredoxin-like activity profile of the glutaredoxin-like NrdH-redoxin from Escherichia coli. J. Biol. Chem. 276 (38), 35836-35841 (2001).

262. Stringer A.M., Gibson R.J., Logan R.M., Bowen J.M., Yeoh A.S., Hamilton J., Keefe D.M. Gastrointestinal microflora and mucins may play a critical role in the development of 5-fluorouracil-induced gastrointestinal mucositis. Exp. Biol. Med. (Maywood). 2009, 234, 4, 430-441. doi: 10.3181/0810-RM-301.

263. Strozzi GP, Mogna L. Quantification of folic acid in human feces after administration of Bifidobacterium probiotic strains. J Clin Gastroenterol. 2008 Sep;42 Suppl 3 Pt 2:S179-84. doi: 10.1097/MCG.0b013e31818087d8.

264. Suez J, Zmora N, Segal E, Elinav E. The pros, cons, and many unknowns of probiotics. Review. // Nat Med. 2019 May;25(5):716-729. doi: 10.1038/s41591-019-0439-x.

265. Sun J, Hu XL, Le GW, Shi YH. Inhibition of Fe-induced colon oxidative stress by lactobacilli in mice. // World J Microbiol Biotechnol. 2013 Feb;29(2):209-16. doi: 10.1007/s11274-012-1172-5.

266. Sun M.F., Shen Y.Q. Dysbiosis of gut microbiota and microbial metabolites in Parkinson's Disease. Ageing Res. Rev. 2018;45:53-61. doi: 10.1016/j.arr.2018.04.004.

267. Sung H.Y., Park J.W., Kim J.S. The frequency and severity of gastrointestinal symptoms in patients with early Parkinson's disease. J. Mov. Disord. 2014;7:7-12. doi: 10.14802/jmd.14002.

268. Surya A, Liu X, Miller MJ. Glutathione Utilization in Lactobacillus fermentum CECT 5716. //J Agric Food Chem. 2018 Dec 5; 66(48):12651-12656. doi: 10.1021/acs.jafc.8b06136..

269. Tang W, Xing Z, Li C, Wang J, Wang Y. Molecular mechanisms and in vitro antioxidant effects of Lactobacillus plantarum MA2. // Food Chem. 2017 Apr 15;221:1642-1649. doi: 10.1016/j.foodchem.2016.10.124.

270. Tao, Y.; Drabik, K.A.; Waypa, T.S.; Musch, M.W.; Alverdy, J.C.; Schneewind, O.; Chang, E.B.; Petrof, E.O.Soluble factors from Lactobacillus GG activate MAPKs and induce cytoprotective heat shock proteins in intestinal epithelial cells. Am. J. Physiol. Cell Physiol. 2006, 290, 1018-1030.

271. Teame T, Wang A, Xie M, Zhang Z, Yang Y, Ding Q, Gao C, Olsen RE, Ran C, Zhou Z. Paraprobiotics and Postbiotics of Probiotic Lactobacilli, Their Positive Effects on the Host and Action Mechanisms: A Review. Review.// Front Nutr. 2020 Oct 22;7:570344. doi: 10.3389/fnut.2020.570344.

272. Tomaro-Duchesneau, C.; Malhotra, M.; Coussa-Charley, M.; Al-Salami, H.; Jones, M.; Labbe, A. Lactobacillus fermentum NCIMB 5221 has a greater ferulic acid production compared to other ferulic acid esterase producing Lactobacilli. Int. J. Probiotics Prebiotics. 2012,7, 23-32. http://hdl.handle.net/20.500.11937/47062

273. Tomusiak-Plebanek A, Heczko P, Skowron B, Baranowska A, Okon K, Thor PJ, Strus M. Lactobacilli with superoxide dismutase-like or catalase activity are more effective in alleviating inflammation in an inflammatory bowel disease mouse model. // Drug Des Devel Ther. 2018 Sep 28;12:3221-3233. doi: 10.2147/DDDT.S164559;

274. Trabelsi, I.; Ktari, N.; Ben Slima, S.; Triki, M.; Bardaa, S.; Mnif, H.; Ben Salah, R. Evaluation of dermal wound healing activity and in vitro antibacterial and antioxidant activities of a new exopolysaccharide produced by Lactobacillus sp.Ca6. Int J Biol Macromol. 2017, 103, 194-201. doi: 10.1016/j.ijbiomac.2017.05.017.

275. Tyagi N., Singh R. Paraquat-Induced Oxidative Stress and Lung Inflammation. //Oxidative Stress in Lung Diseases, pp 245-270, 2019. doi: 10.1007/978-981-32-9366-3_11;

276. Ulrich K, Jakob U. The role of thiols in antioxidant systems. Review. // Free Radic Biol Med. 2019 Aug 20;140:14-27. doi: 10.1016/j.freeradbiomed.2019.05.035.

277. Urquiaga I, Leighton F. Plant polyphenol antioxidants and oxidative stress. Review.// Biol Res. 2000;33(2):55-64. doi: 10.4067/s0716-

97602000000200004.PMID: 15693271

278. van der Pol A, van Gilst WH, Voors AA, van der Meer P. Treating oxidative stress in heart failure: past, present and future. Review.// Eur J Heart Fail. 2019 Apr;21(4):425-435. doi: 10.1002/ejhf.1320.

279. Vancamelbeke, M.; Vermeire, S. The intestinal barrier: a fundamental role in health and disease. Expert Rev. Gastroenterol Hepatol. 2017, 11, 821-834. doi: 10.1080/17474124.2017.1343143.

280. Ved R., Saha S., Westlund B., et.al Similar patterns of mitochondrial vulnerability and rescue induced by genetic modification of alpha-synuclein, parkin, and DJ-1 in Caenorhabditis elegans. // J Biol Chem. 2005 Dec 30;280(52):42655-42668;

281. Vernocchi P., Del Chierico F., Putignani L. Gut Microbiota Profiling: Metabolomics Based Approach to Unravel Compounds Affecting Human Health. Front. Microbiol. 2016;7 doi: 10.3389/fmicb.2016.01144.

282. Vendrik KEW, Ooijevaar RE, de Jong PRC, Laman JD, van Oosten BW, van Hilten JJ, Ducarmon QR, Keller JJ, Kuijper EJ, Contarino MF. Fecal Microbiota Transplantation in Neurological Disorders. Review. // Front Cell Infect Microbiol. 2020 Mar 24;10:98. doi: 10.3389/fcimb.2020.00098.

283. Vida C., Kobayashi H., Garrido A., et al. Lymphoproliferation impairment and oxidative stress in blood cells from early Parkinson's disease patients. International Journal of Molecular Sciences. 2019;20(3):p. 771. doi: 10.3390/ijms20030771.

284. Villeger R, Lopes A, Veziant J, Gagniere J, Barnich N, Billard E, Boucher D, Bonnet M. Microbial markers in colorectal cancer detection and/or prognosis. Review. //World J Gastroenterol. 2018 Jun 14;24(22):2327-2347. doi: 10.3748/wjg.v24.i22.2327.

285. Virgin HW. The virome in mammalian physiology and disease. Cell. 2014;157:142-150. https://doi.org/10.1016/j. cell.2014.02.032

286. Virtanen, T.; Pihlanto, A.; Akkanen, S.; Korhonen, H. Development of antioxidant activity in milk whey during fermentation with lactic acid bacteria. J Appl Microbiol.2007,102, 106-15. doi: 10.1111/j.1365-2672.2006.03072.x.

287. Wada, M.; Fukiya, S.; Suzuki, A.; Matsumoto, N.; Matsuo, M.; Yokota, A. Methionine utilization by bifidobacteria: Possible existence of a reverse transsulfuration pathway.Biosci. Microbiota Food Health. 2021,40, 80-83. doi: 10.12938/bmfh.2020-031.

288. Wang B.H., Yao M.F., Lv L.X., Ling Z.X., Li L.J. The Human Microbiota in Health and Disease. Eng.Prc. 2017;3:71-82. doi: 10.1016/J.ENG.2017.01.008.

289. Wang, L.-X.; Liu, K.; Gao, D.W.; Hao, J.-K. Protective effects of two Lactobacillus plantarum strains in hyperlipidemic mice. World J Gastroenterol. 2013, 28, 3150-3156.

290. Wang, Y.; Wu, Y.; Wang, Y.; Xu, H.; Mei, X.; Yu, D.; Wang Y.; Li, W. Antioxidant Properties of Probiotic Bacteria. Nutrients. 2017, 9, 521. doi: 10.3390/nu9050521.

291. Wang Y, Wu Y, Wang Y, Fu A, Gong L, Li W, Li Y. Bacillus amyloliquefaciens SC06 alleviates the oxidative stress of IPEC-1 via modulating Nrf2/Keap1 signaling pathway and decreasing ROS production. // Appl Microbiol Biotechnol. 2017 Apr;101(7):3015-3026. doi: 10.1007/s00253-016-8032-4.

292. Wang, Y.C.; Yu, R.C.; Chou, C.C. Antioxidative activities of soymilk fermented with lactic acid bacteria and bifidobacteria. Food Microbiol. 2006, 23, 128-135. doi: 10.1016/j.fm.2005.01.020.

293. Watson J. Oxidants, antioxidants and the current incurability of metastatic cancers. // Open Biol. 2013, 3 120-144; doi: 10.1098/rsob.120144.

294. Watterlot L, Rochat T, Sokol H, Cherbuy C, Bouloufa I, Lefevre F, Gratadoux JJ, Honvo-Hueto E, Chilmonczyk S, Blugeon S, Corthier G, Langella P, Bermudez-Humaran LG. Intragastric administration of a superoxide dismutase-producing recombinant Lactobacillus casei BL23 strain attenuates DSS colitis in mice.// Int J Food Microbiol. 2010 Nov 15;144(1):35-41. doi: 10.1016/j.ijfoodmicro.2010.03.037.

295. Wei TY, Fu Y, Chang KH, Lin KJ, Lu YJ, Cheng CM. Point-of-Care Devices Using Disease Biomarkers To Diagnose Neurodegenerative Disorders. // Trends Biotechnol. 2017 Dec 11. pii: S0167-7799(17)30302-5

296. Wheeler R, Chevalier G, Eberl G, Gomperts Boneca I. The biology of bacterial peptidoglycans and their impact on host immunity and physiology. Cell. Microbiol. 2014. 16: 1014-1023. doi: 10.1111/cmi.12304.

297. Wlodarska, M.;Luo, C.; Kolde, R.; d'Hennezel, E.; Annand, J.W. et al. Indoleacrylic acid produced by commensal Peptostreptococcus species suppresses inflammation. Cell Host Microbe.2017, 22, 25-37. doi: 10.1016/j.chom.2017.06.007.

298. Wu X, Teame T, Hao Q, Ding Q, Liu H, Ran C, Yang Y, Zhang Y, Zhou Z, Duan M, Zhang Z. Use of a paraprobiotic and postbiotic feed supplement (HWF) improves the growth performance, composition and function of gut microbiota in hybrid sturgeon (Acipenser baerii x Acipenser schrenckii). // Fish Shellfish Immunol. 2020 Sep;104:36-45. doi: 10.1016/j.fsi.2020.05.054.

299. Wu,Q. Food Science, Inner Mongolia Academy of Agricultural and Animal Husbandry Sciences, No. 22 Zhaojun Road, Hohhot, Inner Mongolia 010030.

300. Xiao, M.; Xu, P.; Zhao, J.; Wang, Z.; Zuo, F.; Zhang, J. et al. Oxidative stress related responses of Bifidobacterium longum subsp. longum BBMN68 at the proteomic level after exposure to oxygen. Microbiology.2011, 157, 1573-1588. doi: 10.1099/mic.0.044297-0.

301. Xing J, Wang G, Zhang Q, Liu X, Gu Z, Zhang H, Chen YQ, Chen W. Determining antioxidant activities of lactobacilli cell-free supernatants by cellular antioxidant assay: a comparison with traditional methods. // PLoS One. 2015 Mar 19;10(3):e0119058. doi: 10.1371/journal.pone.0119058.

302. Xiong, Z.Q.; Kong, L.H.; Wang, G.Q.; Xia, Y.J.; Zhang, H.; Yin, B.X.; Ai, L.Z. Functional analysis and heterologous expression of bifunctional glutathione synthetase from Lactobacillus. J. Dairy Sci. 2018, 101,6937-6945. doi: 10.3168/jds.2017-14142.

303. Xu Z, Wang T, Zhang S. Extracellular secretion of feruloyl esterase derived from Lactobacillus crispatus in Escherichia coli and its application for ferulic acid production. // Bioresour Technol. 2019 Sep;288:121526. doi: 10.1016/j.biortech.2019.121526.

304. Yadav M, Mandeep, Shukla P. Probiotics of Diverse Origin and Their Therapeutic Applications: A Review. Review. J Am Coll Nutr. 2020 Jul;39(5):469-479. doi: 10.1080/07315724.2019.1691957.

305. Yan S, Hui Y, Li J, Xu X, Li Q, Wei H. Glutamine relieves oxidative stress through PI3K/Akt signaling pathway in DSS-induced ulcerative colitis. // Iran J Basic Med Sci. 2020 Sep;23(9):1124-1129. doi: 10.22038/ijbms.2020.39815.9436.

306. Yang, Y.; Yin, J.; Liu, J.; Xu, Q.; Lan, T.; Ren, F.; Hao, Y. The copper homeostasis transcription factor CopR is involved in H2O2 stress in Lactobacillus plantarum CAUH2. Front. Microbiol. 2017, 8, e2015. doi: 10.3389/fmicb.2017.02015.

307. Young VB. Therapeutic manipulation of the microbiota: past, present, and considerations for the future. Review. Clin Microbiol Infect. 2016 Nov;22(11):905-909. doi: 10.1016/j.cmi.2016.09.001.

308. Yu, X.; Li, Y.; Wu, Q.; Shah, N.P.; Wei, H.; Xu, F. Genomic analysis for antioxidant property of Lactobacillus plantarum FLPL05 from chinese longevity people. Probiotics Antimicrob Proteins.2020, 12, 1451-1458. doi: 10.1007/s12602-020-09704-0.

309. Yuan K.T., Yu H.L., Feng W.D. et al. Bifidobacterium infantis has a beneficial effect on 5-fluorouracil-induced intestinal mucositis in rats. Benef. Microbes. 2014,6, 1-6. doi: 10.3920/BM2013.0095.

310. Zelante, T.; Iannitti, R.G.; Cunha, C.; De Luca, A.; Giovannini, G. et al. Tryptophan catabolites from microbiota engage aryl hydrocarbon receptor and balance mucosal reactivity via interleukin-22. Immunity. 2013, 39, 372-385. doi: 10.1016/j.immuni.2013.08.003.

311. Zhai, Z.; Yang, Y.; Wang, H.; Wang, G.; Ren, F;. Li, Z.; Hao, Y. Global transcriptomic analysis of Lactobacillus plantarum CAUH2 in response to hydrogen peroxide stress. Food Microbiol. 2020, 87, e103389. doi: 10.1016/j.fm.2019.103389.

312. Zhai, Z.; Yang, Y.; Wang, J.; Wang, G.; Ren, F.; Hao, Y. Complete genome sequencing of Lactobacillus plantarum CAUH2 reveals a novel plasmid pCAUH203 associated with oxidative stress tolerance. Biotech. 2019, 9, 116. doi: 10.1007/s13205-019-1653-4.

313. Zhang C., Bjorkman A., Cai K., Liu G., Wang C., Li Y., Xia H., Sun L., Kristiansen K., Wang J., Han J., Hammarstrom L., Pan-Hammarstrom Q. Impact of a 3-Months Vegetarian Diet on the Gut Microbiota and Immune Repertoire.// Front Immunol. 2018 Apr 27;9:908. doi: 10.3389/fimmu.2018.00908.

314. Zhao F, Wang W, Wang C, Siedlak SL, Fujioka H, Tang B, Zhu X. Mfn2 protects dopaminergic neurons exposed to paraquat both in vitro and in vivo: Implications for idiopathic Parkinson's disease. // Biochim Biophys Acta. 2017 Jun;1863(6):1359-1370; doi: 10.1016/j.bbadis.2017.02.016

315. Zhao, H.; Jiang, Z.; Chang, X.; Xue, H.; Yahefu, W.;Zhang, X. 4-Hydroxyphenylacetic Acid Prevents Acute APAP-Induced Liver Injury by Increasing Phase II and Antioxidant Enzymes in Mice. Frontiers in Pharmacology. 2018, 9, 653. doi: 10.3389/fphar.2018.00653.

316. Zheng J., Ruan L., Sun M., Ganzle M. A Genomic View of Lactobacilli and Pediococci Demonstrates that Phylogeny Matches Ecology and Physiology // American society for microbiology. 2015. V. 81 (20). P. 7233-7243 doi: 10.1128/AEM.02116-15

317. Zheng J., Wittouck S., Lebber S. et al. A taxonomic note on the genus

Lactobacillus: Description of 23 novel genera, emended description of the genus Lactobacillus Beijerinck 1901, and union of Lactobacillaceae and Leuconostocaceae // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2020. V. 70(4). P. 2782-2858. doi: 10.1099/ijsem.0.004107

318. Zhou Q, Zhang H, Wu Q, Shi J, Zhou S. Pharmacological manipulations of autophagy modulate paraquat-induced cytotoxicity in PC12 cells. Int J Biochem Mol Biol. 2017 Jun 15;8(2):13-22) PMC5498847, PMID: 28695042

319. Zhou, Y.-K.; Qin, H.-L.; Zhang, M.; Shen, T.-Y.; Chen, H.-Q.; Ma, Y.-L. Effects of Lactobacillus plantarum on gut barrier function in experimental obstructive jaundice. World J. Gastroenterol. 2012, 14, 3977-3991. doi: 10.3748/wjg.v18.i30.3977.

320. Zotta, T.; Parente, E.; Ricciardi, A. Aerobic metabolism in the genus Lactobacillus: impact on stress response and potential applications in the food industry. J Appl Microbiol. 2017, 122, 857-869. doi: 10.1111/jam.13399.

321. Zuo, F.L.; Yu, R.; Khaskheli, G.B.; Ma, H.Q.; Chen, L.L.; Zeng, Z.; Mao A.J.; Chen, S.W. Homologous overexpression of alkyl hydroperoxide reductase subunit C (ahpC) protects Bifidobacterium longum strain NCC2705 from oxidative stress. Res. Microbiol. 2014, 165581-165589.

322. Zuo, F.; Yu, R.; Xiao, M.; Khaskheli, G. B.; Sun, X.; Ma, H.; Ren, F. Zhang, B.; Chen, S. Transcriptomic analysis of Bifidobacterium longum subsp.longum BBMN68 in response to oxidative shock. Natur, Scien, Repor. 2018. 8, 17085.

323. Васенина Е.Е., Левин О.С. Окислительный стресс в патогенезе нейродегенеративных заболеваний: возможности терапии. //Современная терапия в психиатрии и неврологии. 2013. 3-4. с. 39-46

324. Даниленко В.Н., Ставровская А.В., Воронков Д.Н., Гущина А.С., Марсова М.В., Ямщикова Н.Г., Ольшанский А.С., Иванов М.В., Иллариошкин С.Н. Использование фармабиотика на основе штамма Lactobacillus fermentum U-21 с целью модуляции нейродегенеративного процесса при экспериментальном паркинсонизме. Анналы клинической и экспериментальной неврологии 2020; 14(1): 62-69. DOI: 10.25692/ACEN.2020.1.7

325. Зенков Н.К. и др. Редокс-чувствительная система keap1/Nrf2/ARE как фармакологическая мишень при сердечно-сосудистых заболеваниях // Сибирский научный медицинский журнал. 2015, 35, № 5, с. 5-25.

326. Каде А. Х., Кравченко С. В., Трофименко А. И., Поляков П. П., Липатова А. С., Ананьева Е. И., Чаплыгина К. Ю., Уварова Е. А., Терещенко О. А. Современные методы оценки уровня тревожности грызунов в поведенческих тестах, основанных на моделях без предварительного обусловливания. // Кубанский научный медицинский вестник. 2018; 25(6): 171-176. DOI: 10.25207 / 1608-6228-2018-25-6-171-176

327. Игонина Е.В, Марсова М.В, Абилев С.К. Lux-биосенсоры: скрининг биологически активных соединений на генотоксичность. // Экологическая генетика. 2016. DOI- 10.17816/ecogen14452-62

328. Котова В.Ю., Манухов И.В., Завильгельский Г.Б. Lux-биосенсоры для детекции SOS-ответа, теплового шока и окислительного стресса. // Биотехнология, 2009, № 6, С.16-25

329. Котова В.Ю; Манухов И.В.; Завильгельский Г.Б. Использование специфических индуцируемых Lux-биосенсоров для определения механизма токсичности наночастиц. // Нанотехника 2010, №4(24) С.35-38.

330. Плужников Н. Н. Микроэкология: фундаментальные и прикладные проблемы: Монография / Под ред. Плужникова Н. Н., Я. А. Накатиса, О. Г. Хурцилавы. — СПб.: Издательство СЗГМУ им. И. И. Мечникова, 2012 — 304 с., ил. ISBN 978-5-89588-047-0

331. Телетаева Г.М. Профилактика и лечение желудочно-кишечных осложнений лекарственной терапии (тошнота и рвота, мукозиты, диарея).// Практическая Онкология. 2009. Т. 10. No 3: 158-167

332. Ткачев В.О., Меньшикова Е.Б., Зенков Н.К. Механизм работы сигнальной системы NRF2/KEAP1/ARE. ОБЗОР // Биохимия. 2011, том 76, вып. 4, с. 502 -519. Источник: http: //naukarus .com/mehanizm-raboty-signalnoy-sistemy-nrf2-keapl-are-obzor

333. Червинец В.М., Червинец Ю.В., Зевалкина Е.В и др. Сравнительная характеристика лактобацилл, выделенных из фекалий здоровых людей, проживающих в Российской Федерации и Казахстане // Современные проблемы науки и образования. 2016. № 6.