Изучение полиморфизма микросателлитных маркеров шестой и девятой хромосом крупного рогатого скота черно-пестрой породы тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.00.23, кандидат биологических наук Шмидт, Татьяна Юрьевна

• Шмидт, Татьяна Юрьевна
• кандидат биологических наук
• 2001

Оглавление диссертации кандидат биологических наук Шмидт, Татьяна Юрьевна

ВВЕДЕНИЕ

1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1 Генетические маркеры в селекции животных

1.2 Генетическое картирование генома крупного рогатого скота

1.3 Генетические карты сельскохозяйственных животных

1.4 Использование микросателлитных маркеров для поиска ассоциации с локусами хозяйственно-полезных признаков

2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЙ

2.1 Использованные материалы и объекты исследований

2.2 Выделение ДНК 4g

2.3 Электрофоретическое разделение ДНК

2.4 Амплификационный анализ образцов ДНК

2.5 Определение полиморфизма микросателлитных маркеров

2.6 Препаративное выделение ДНК-фрагментов из геля с помощью раствора гуанидинизотиоцианата

2.7 Клонирование продуктов амплификации в pGEM-T - векторе

2.8 Определение нуклеотидной последовательности

2.9 Статистическая обработка данных

3. РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЙ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ

3.1 Формирование базы данных микросателлитных маркеров шестой и девятой хромосом крупного рогатого скота

3.2 Изучение полиморфизма микросателлитных маркеров. Попу-ляционно-генетические параметры ^

3.3 Исследование полиморфизма микросателлитных маркеров девятой хромосомы

3.4 Исследование полиморфизма микросателлитных маркеров шестой хромосомы

3.5 Определение новых аллелей локусов BMS2819, BMS360 и AFR

3.6 Соотношение фактических и теоретически ожидаемых генотипов исследованных животных

3.7 Уровень гетерозиготности изучаемых маркеров

3.8 Ретроспективный анализ генотипов быков

3.9 Определение связи альтернативных аллелей, изучаемых микросателлитных локусов, наследованных потомками быков Иона 103 и Погожего4131 с признаками молочной продуктивности.

ВЫВОДЫ

ПРАКТИЧЕСКИЕ ПРЕДЛОЖЕНИЯ

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Изучение полиморфизма микросателлитных маркеров шестой и девятой хромосом крупного рогатого скота черно-пестрой породы»

Актуальность исследований. Изучение структурно-функциональной организации генома сельскохозяйственных животных является одним из необходимых условий повышения эффективности их селекции посредством установления ассоциативных связей локусов генома с хозяйственно-полезными признаками. Хромосомную локализацию отдельных локусов, определяющих эти признаки, можно установить, используя генетическое сцепление с маркерами (Ron М. et al., 1995). Основой для сцепленного картирования высокого разрешения, которое в свою очередь может быть использовано для позиционного клонирования генов хозяйственно-полезных и физиологически важных признаков, являются насыщенные маркерами генетические карты (Fries R. et al., 1990).

С открытием новых методов определения полиморфизма на уровне ДНК появилась возможность поиска сцепления между ДНК-маркерами и локусами количественных признаков (quantitative trait loci - QTL). В настоящее время среди ДНК-маркеров наиболее распространенными являются микросателлитные последовательности.

За последнее время с помощью микросателлитов удалось осуществить маркировку некоторых важных генетических локусов, связанных с продуктивностью и болезнями генетического происхождения (George М. et al., 1993; Georges М. et al., 1995; Vilkki H.J. et al., 1997; Coppieters W.J. et al., 1998; Ohba Y. et al., 2000;).

Исследования, проведенные M. Georges с соавторами в 1995 году, легли в основу работ по генетическому картированию локусов, влияющих на молочную продуктивность крупного рогатого скота. В результате генотипирования быков голштинской породы было показано наличие на пяти хромосомах - 1, 6, 9, 10, и 20 микросателлитных маркеров, ассоциированных с молочной продуктивностью (Georges М. et al., 1995).

Несмотря на то, что количественные признаки контролируются множеством генов, продуктивные качества во многом определяются мажорными генами. Картирование таких генов позволит проводить генотипирование родоначальников линий в рамках маркер-направленной селекции (marker-assisted selection - MAS) для осуществления контроля передачи определенного генетического материала в поколениях и, соответственно, решения главной задачи практической селекции - подбора и отбора организмов при формировании хозяйственно-ценных групп животных. (Smith С., Simpson S.P.1986, Soller М., Beckman J.C. 1982).

Основным требованием, предъявляемым к маркерам, используемым для изучения ассоциации с локусами хозяйственно-полезных признаков, является высокий уровень полиморфизма.

Следует отметить, что при изучении генетики количественных признаков, полученные результаты правомочны только для конкретно изученных популяций (пород) и не допускают однозначного переноса на другие объекты. Поэтому прежде чем приступить к поиску локусов, отвечающих за формирование хозяйственно-полезных признаков, необходимо изучить полиморфизм маркеров, непосредственно в той популяции животных, в которой будут проводиться последующие исследования связи ДНК-маркеров с локусами, имеющими хозяйственное значение.

Исходя из вышеизложенного, целью настоящей работы было изучение уровня полиморфизма микросателлитных маркеров шестой и девятой хромосом крупного рогатого скота черно-пестрой породы.

Для достижения поставленной цели решались следующие задачи:

1. Сформировать совокупную базу данных по известным микросателлитным маркерам 6 и 9 хромосом крупного рогатого скота. Отобрать информативные маркеры для использования их в анализах ассоциации с локусами хозяйственно-полезных признаков.

2. Провести генотипирование коров черно-пестрой породы дочерей быков производителей ИонаЮЗ и Погожего4131, используя отобранные микросателлитные маркеры б и 9 хромосом.

3. Дать оценку уровня полиморфизма, степени гетерозигот-ности выбранных микросателлитных маркеров шестой и девятой хромосом.

4. Реконструировать генотипы быков-производителей по данным их потомков. Верифицировать родословные коров изучаемых групп с помощью микросателлитных маркеров.

5. Выяснить ассоциацию альтернативных аллелей, изучаемых микросателлитных локусов, наследованных потомками быков ИонаЮЗ и Погожего4131, с признаками молочной продуктивности.

Научная новизна работы. Сформирована база данных генетических маркеров шестой и девятой хромосом крупного рогатого скота, включающая маркеры с уровнем гетерозиготности выше 50%. Подготовленная база данных содержит сведения о хромосомной локализации, числе выявленных аллелей и их размерах, сведения о праймерах, используемых для детекции конкретного локуса.

Впервые проведено генотипирование коров черно-пестрой породы отечественной селекции с использованием микросателлит-ных маркеров BMS360, ВМ415, AFR227, CSN3, ВМС4203 шестой и ВМ7209, BMS2819, BMS2295, BMS1967 девятой хромосом. Изучено распространение и частота встречаемости различных аллельных вариантов исследуемых микросателлитных локусов у коров, происходящих от быков ИонаЮЗ и Погожего4131 черно-пестрой породы, принадлежащих ГУП ПНО «Пойма». Определен уровень полиморфизма и степень гетерозиготности выбранных микросателлитных маркеров и дана оценка возможности их использования для последующего анализа сцепления с локусами количественных признаков.

Установлено, что изученные микросателлитные последовательности могут быть использованы в селекционной практике в качестве маркеров для работы с линиями, верификации родословных и ретроспективного анализа генотипа родителей.

Положения, выносимые на защиту.

1 .Сформированная база данных микросателлитных маркеров шестой и девятой хромосом крупного рогатого скота позволяет вести целенаправленный отбор маркеров для использования их в работах по поиску локусов, участвующих в формировании хозяйственно значимых признаков.

2.Высокий уровень полиморфизма микросателлитных маркеров BMS360, ВМ415, AFR227, CSN3, ВМС4203 шестой и ВМ7209, BMS2819, BMS2295, BMS1967 девятой хромосом крупного рогатого скота черно-пестрой породы позволяет использовать их в последующих анализах ассоциации с локусами хозяйственно-полезных признаков.

3.Определение аллельного полиморфизма позволяет использовать микросателлитные маркеры для ретроспективного анализа генотипов родителей и верификации родословных.

4. Гаплотипы изучаемых микросателлитных маркеров шестой и девятой хромосом, сопряженные с признаками молочной продуктивности, исследованных животных, могут быть использованы при отборе животных с желательным генотипом до оценки их по собственной продуктивности, и при подборе животных для заказного спаривания.

Научно-практическая значимость работы. Созданная база данных по генетическим маркерам шестой и девятой хромосом в выбранной конфигурации предоставляет возможность выполнять сортировку и выборку маркеров по всему созданному массиву данных, а также позволяет вести отбор микросателлитных маркеров для их использования в дальнейшем при поиске ассоциации с локу-сами хозяйственно-значимых признаков. Результаты исследований, направленные на изучение полиморфизма микросателлитных маркеров BMS360, ВМ415, AFR227, CSN3, ВМС4203 шестой и ВМ7209, BMS2819, BMS2295, BMS1967 девятой хромосом, могут быть использованы для поиска локализации локусов, ответственных за формирование признаков молочной продуктивности.

Данные, полученные при изучении сопряженности различных аллельных вариантов исследуемых микросателлитных маркеров с признаками молочной продуктивности, свидетельствуют о том, что альтернативные аллели изучаемых локусов ассоциируются с разным количественным проявлением величин признаков молочной продуктивности. Это в дальнейшем может быть использовано для селекционной работы с линиями, популяциями и породами при отборе животных с желательным генотипом еще в раннем возрасте, до проведения оценки по собственной продуктивности, и при подборе животных для заказного спаривания.

1.ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

Заключение диссертации по теме «Биотехнология», Шмидт, Татьяна Юрьевна

выводы

1. Сформирована база данных микросателлитных маркеров шестой и девятой хромосом крупного рогатого скота, содержащая сведенья о хромосомной локализации, числе выявленных аллелей и их размерах, структуре праймеров, используемых для детекции конкретного локуса. Проведен отбор потенциально вероятных генетических маркеров для начального этапа работ по выявлению локусов хозяйственно-полезных признаков, локализованных на шестой и девятой хромосомах.

2. В результате генотипирования коров черно-пестрой породы потомков ИонаЮЗ и Погожего4131 с использованием девяти отобранных микросателлитных маркеров было обнаружено 79 аллелей: 7 аллельных вариантов локуса ВМ7209, 13 - BMS2819, 7 - BMS2295, 11 - BMS1967, 13 - BMS360, 8 - ВМ415, 10 -AFR227, 3 - CSN3 и 7 - ВМС4203.

3. Уровень гетерозиготности всех исследованных микросателлитов превысил 50%, за исключением CSN3 у коров, принадлежащих группе ИонаЮЗ. По оценке информационной ценности полиморфизма локусы ВМ7209, BMS2819, BMS2295, BMS1967, BMS360, ВМ415, AFR227, CSN3 и ВМС4203 являются достаточно информативными для изучения ассоциации с локусами хозяйственно-значимых признаков.

4. У исследованных коров черно-пестрой породы, происходящих от быков ИонаЮЗ и Погожего4131, были обнаружены ранее не зарегистрированные аллели: 120 п.н. локуса BMS2819, 108 п.н. -BMS360 и 122 п.н. - AFR227.

5. Показана возможность использования микросателлитных маркеров для выполнения работ по генотипированию крупного рогатого скота, для паспортизации животных и установления родства, а также для отбора продолжателей линий - ремонтных быков с определенным генотипом. 6. Установлено, что наиболее желательным гаплотипом микросателлитных локусов шестой и девятой хромосом, у дочерей ИонаЮЗ является: BMS2295 - 112, AFR227 - 110 и CSN3 - 218 п.н., у коров, принадлежащих группе Погожего4131 - BMS2819 - 100, BMS2295 - 122, BMS360 - 102, ВМ415 - 163, AFR227 - 110 и CSN3 - 220 п.н., так как эти аллельные варианты связаны с более высокой молочной продуктивностью.

ПРАКТИЧЕСКИЕ ПРЕДЛОЖЕНИЯ

Сформированная база данных генетических маркеров шестой и девятой хромосом может быть рекомендована для отбора маркеров и их дальнейшего использования при анализе ассоциации с локусами хозяйственно-значимых признаков.

Микросателлитные маркеры BMS360, ВМ415, AFR227, CSN3, ВМС4203 шестой и ВМ7209, BMS2819, BMS2295, BMS1967 девятой хромосом, могут быть использованы для поиска локусов, участвующих в формировании хозяйственно-полезных признаков.

Генотипирование животных с помощью микросателлитных маркеров может быть осуществлено с целью контроля записей о происхождении в раннем возрасте и их своевременной корректировке.

При отборе ремонтных быков-производителей и при подборе животных для заказного спаривания целесообразно учитывать наследование желательных аллелей микросателлитных маркеров сопряженных с признаками продуктивности.

Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Шмидт, Татьяна Юрьевна, 2001 год

1. Айала Ф., Кайгер Дж. Современная генетика. М.: Мир, 1988. Т.З.-С. 335.

2. Бадашкеева А.Г. и Кнорре Д.Е. Олиго- и полинуклеотидные зонды. Методы молекулярной гибридизации // Молекулярная биология. 1991. -№25(2).- С. 309-324.

3. Глазко В.И., Созинов И.О. Генетика изоферментов животных и растений. К.: Урожай, 1993. - С. 528

4. Гловер Д. Клонирование ДНК. Методы. М.: Мир, 1988. - С. 538.

5. Животовский JI.A. Популяционная биометрия. М.: Наука, 1991.-С. 271.

6. Животовский JI.A. Статистические методы анализа частот генов в природных популяциях. Итоги науки и техники. Общая генетика. М.: ВИНИТИ, 1983. - №8. - С. 76-104.

7. Захаров И.А. Генетические карты с.-х. животных. Информационно-справочные материалы. Ин-т общей генетики им. Н.И.Вавилова РАН. 1995. - Вып. 2. - С.34 .

8. Захаров И.А. Генетическое картирование генома крупного рогатого скота // Цитология и генетика. 1992. - № 26(5). - С.67-72.

9. Захаров И.А. Компьютерная база данных по генетическим картам сельскохозяйственных животных. Тезисы докладов II международной конференции "Молекулярно-генетические маркеры животных". Киев. 1996. - С.8.

10. Ю.Захаров И.А., Никифоров B.C., Степанюк Е.В. Генетическое картирование сельскохозяйственных животных // Успехи современной генетики. 1993. - Вып. 18. - С. 36-74.

11. ГЛакин Г.Ф. Биометрия. М.: Высш. шк., 1990. - С. 352.

12. Левонтин Р. Генетические основы эволюции. М.: Мир, 1978. -С. 351.

13. Ли Ч. Введение в популяционную генетику. М.: Мир, 1978. - С. 526.

14. Маниатис Т., Фрич Э., Сэмбрук Дж. Молекулярное клонирование. М.: Мир, 1984. С. 479.

15. Марзанов Н. С. Физиологические маркеры крови овец и коз: теоретические и прикладные аспекты их применения // Реф. докт. дисс., Дубровицы, 1994.

16. Меркурьева Е. К., Абрамова З.В., Бакай А.В. и др. Генетика. -М.: Агропромиздат, 1991. С.446.

17. Меркурьева Е.К. Генетические основы селекции в скотоводстве. -М:. Колос, 1977.-С.240.

18. Попов Н.А. и др. План племенной работы с крупным рогатым скотом черно-пестрой породы ГУП ПНО «Пойма» Луховицкого района Московской области на 2000-2007 гг.

19. Свердлов Е.Д. Очерки современной молекулярной генетики // Молекулярная генетика. Микробиология и вирусология. 1995. -N2.-С. 3-15.

20. Серебровский А.С. Геногеография и генофонд сельскохозяйственных животных // Науч. слово. 1928. №. 8. - С. 7-42.

21. Сингер М., Берг П. Гены и геномы. М.: Мир, 1998. С. 197-216.

22. Сулимова Г.Е. Полиморфизм длин рестрикционных фрагментов ДНК у сельскохозяйственных животных // Успехи современной генетики. 1993. С. 3-30.

23. Чиряева О.Г. Исследование цитохимической неоднородности хромосом крупного рогатого скота (Bos taurus L.) и проблема их идентификации // Реф. канд. дисс., Ленинград, 1988.

24. Aasland M, Vage D.I, Lien S, Klungland H. Resolution of conflicting assignments for the bovine casein kinase II alpha (CSNK2A2) gene // Anim.Genetics. 2000. - V.31 (2). - P. 131 -134.

25. Andersson L, Haley C.S, Ellegren et al. Genetic mapping of quantitetive trait loci for growth and fatness in pig // Science. 1994. -V. 263. P.1771-1774.

26. Andersson-Eklund L.& J.Rendel. Linkage between amylase-llocus and a major gene for milk fat content in cattle // Anim.Genet. 1993. -V. 24.-P. 101-103.

27. Ansari H.A, Pearce P.D, Macher D.W. et al. Regional assignment of conserved referenca loci anchors unassigned linkage and syntenic groups to ovine chromosomes // Genomics. 1993. - V. 24. - P. 451445.

28. Ansari H.A, Pearce P.D, Maher D.W. et al. Resolving ambiquities in the karyotype of domestic sheep (Ovis aries). // Chromosoma. -1992.-V.102. P.304-307.

29. Archibald A.L, Haley J.F, Brown S. et al. The PiGMaP consortium lineage map of the pig (Sus scrofa) // Mamm. Genome. 1995. - V.6. -P. 157-175.

30. Ashwell M.S., J. Da, P.M. Vanraden et al. Detection of putative loci affecting conformational type traits in an elite population of United States Holsteins using microsatellite markers // J. Dairy Sci.- 1998. -V. 8.-P. 1120-1125.

31. Ashwell M.S., Van Tassell C.P. Detection of putative loci affecting milk, health, and type traits in a US Holstein population using 70 microsatellite markers in a genome scan // J. Dairy Sci. 1999. - V. 82(11).-P. 2497-2502.

32. Band M, Ron M. Isolation of polymorphic AGC repeats located 3' to bovine SINEs//Animal Genetics. 1994. -V. 25. - P. 281-283.

33. Barendse W., Armitage S.M., Kossarek L.M. et al. A genetic map of the bovine genome // Nature genet. 1994 V.6. - P. 227-235.

34. Barendse W., Vainman D., Kemp S.I. et al. A medium density genetic linkage map of the bovine genome // Mamm. genome. -1997,- Y.6. P. 21-28.

35. Basedow M., Barre-Dirie A., Looft C. et al. The evaluation of genetic diversity of German cattle breeds using microsatellites and AFLP-markers // Anim.Genetics. 1998. - V. 29(1). - P.l 1.

36. Bishop M.D., Kappes S.M., Keele J.W. et al. A genetic lineage map for cattle // Genetics. 1994. - V. 136. - P. 619-639.

37. Blaho J.A. and Wells R.D. Left-handed Z-DNA and genetic recombination // Progress in Nucleic Acid Research and Molecular biology. 1989.- V.37.- P. 107-126.

38. Botstein D. White R. L., Skolnicr M., Davies R. W. Construction of a genetic map in man using restriction fragment length polymorphisms // American Journal of Human Genetics. 1980. - V.32. - P.314-331.

39. Bovenhuis H., van Arendonk J. A.M., Korver, S. Associations between milk protein polymorphisms and milk production traits // J. Dairy Sci. 1992. - V.75. - P.2549 - 2559.

40. Braaten D.C., J.R. Thomas, R.D. Little, et al. Locations and contexts of sequences that hybridize to poly(dG-dT)(dC-dA) in mammalian ri-bosomal DNAs and two X-linked genes // Nucleic Acids Res. 1988. -V.16.-P.865.

41. Broad Т.Е., Hill D.E. Mapping the sheep genome: practice, progress and promise // Brit. vet. J. 1994. - V. 150. - P.237-252.

42. Builtkamp J., Schwaiger F.W., Solinas-Toldo S. et al. The bovine interleukin-4 gene: genomic organization, localization and evolution //Mamm. Genome.- 1995. V.6. -P.350-356.

43. Charlier С., Coppieters W., Farnir F. et al. The mh gene causing double-muscling in cattle maps to bovine Chromosome 2 // Mamm. Genome. 1995.- V.6. - P. 788-792.

44. Charlier C., Denys В., Belanche J.I. et al. Microsatellite mapping of the bovine roan locus: A major determinant of White Heifer Disease //Mamm. Genome. 1996. V.7. - P. 138-142.

45. Chowdhary B.P., Fronicke L., Gustavsson I. Et al. Comparative analysis of the cattle and human genomes: detection of ZOO-FISH and gene mapping-based chromosomal homologies // Mamm. Genome. 1996. - V. 7(4). - P. 297-302.

46. Cocket N.E., Jackson S.P., Shay D. et al. Chromosomal localization of the callipyge gene in shep (Ovis aries) using bovine DNA markers // Proc. Natl. Acad. Sci. 1994. - V. 91. - P.3019-3023.

47. Collins F.S. Positional cloning: Let's not call it reverse anymore // Nature Genetics.- 1992. V. 1. - P. 3-9.

48. Coppieters W., J. Riquet, J. Arrauz et al. A QTL with major effect in milk yield and composition maps to bovine chromosome 14. // Mamm. Genome. 1998. V.9. - P. 540-544.

49. Coppieters W., Riquet J., Grisart В., et al. Analysis of whole genome scan for milk trait QTL in dairy cattle // Anim.Genetics. -1998. V.29 (Suppl. 1).-P.61.

50. Crawford A.M., Dodds K.G., Ede A.J. et al. An autosomal genetic linckage map of the sheep genome // Genetics. 1995. - V.140. - P. 703-724.

51. Dietrich W.F., Miller J.С., Steen R.G. et al. A genetic linkage map of the mouse with 4006 simple sequence length polymorphisms // Nature Genetics. 1994. - V.7. - P. 220-245.

52. Dodgson J.B., Cheng H.H., Okimoto R. DNA marker technology: a revolution in animal genetics // Poult. Sci. 1997. - V.76(8). - P. 1108-1114.

53. Edfors-Lilja I., Gustafson U., Duval-Iflah et al. The porcine intestinal receptor for Escherichia coli K88ab, K88ac: Regional localization on chromosome 13 and influence of lgG response to the K88 antigen // Anim. Genet. 1995. - V.26. - P.237-242.

54. Editorial G. Genome Mapping in domestic animals // Br. Vet. J. -1994. -V.150. -P.215-217.

55. Ellegren H. Genome Analysis with Microsatellite Markers // Sweden. Uppsala .- 1993.-V.85 .

56. Ellegren H., Chrowdhary В., Johansson M. et al. Integrating the porcine physical and lineage map using cosmid- derived markers // Animal Genetics. 1994. - V. 25. - P. 155-164.

57. Ellegren H., Moore S., Robinson N. et al. Microsatellite evolution a reciprocal study of repeat lengths at homologous loci in cattle and sheep // Mol. Biol. Evol. - 1997. - V.14(8). - P. 854-860.

58. Fitzsimmons C.J., S.M. Schutz, R.O. Bergen, J.J. Mckimnon. A Potential association between the BM 1500 microsatellite and fat deposition in beef cattle // Mamm. Genome. 1998. - V.9. - P. 432434.

59. Fournier B.P., Schmutz S.M., Schimpf R.J. et al. A quantitetive trait loci for weaning weight in Bos taurus maps to chromosome 1 and 2 // Anim. Genet. 1998. - V. 29(Suppl. 1). - P. 64.

60. Fries R. Mapping the bovine genome: metodological aspects and strategy // Animal Genetics. 1993. - V. 24. - P. 111-116.

61. Fries R., Beckman J. S., Georges M., et al. The bovine gene map // Anim. Genet. 1989. - V.20. - P. 3-29.

62. Fries R., Eggen A., Stranzinger G. The bovine genome contains polymorphic microsatellites // Genomics. 1990. - V.8. - P. 403-406.

63. Fries R., Hediger R., Stranzinger G. Tentative chromosomal localization of the bovine major histocompatibility complex by in situ hybridization // Anim. Gent. 1986. - V. 17. - P. 287-294.

64. Fries R., Solinas Toldo S., Guawardana A. Chromosomal assignment of marker loci to monitor marker spacing. In: Gene mapping thechniques and applications. Eds. by B. L. Schook, H.A. Lewin, D. G. McLaren. Marsel Dekker, Inc., N. Y. 1991, P. 159-176.

65. Fris R., Eggen A., Womack J.E. The bovine genome map // Mammalian Genome. 1993. - V. 4. - P. 405-428.

66. Gao Q., Womack J.E. A genetic map of bovine chromosome 7 with an interspecific hybrid backcross panel // Mamm. Genome. 1997. -V.8(4). - P. 258-261.

67. Genzini E., Blasi M., Capuano M. et al. Amplification of seven microsatellites for parentage identification in Italian buffalo // Anim.Genetics. 1998. - V.29(l). -P. 10.

68. George M., R. Drinkwater, T. King et al. Microsatellite mapping of a gene affecting horn development in Bos taurus // Nature Genetics. -1993.- V. 4.-P.206-210.

69. Georges M., Dietz A.B., Mishra A. et al. Microsatellite mapping of the gene causing weaver disease in cattle will allow the study of an associated quantitative trait locus // Proc. Nat. Acad. Sci. 1993. USA. -V. 90.-P. 1058-1062.

70. Georges M., Gunawardana A., Threadgill D.W. et al. Characterization of a set of a variable number of tandem repeat markers conserved in Bovidae // Genomics. 1991.-V. 11. P. 24-32.

71. Georges M.D., Nielsen M., Mackinnnon M. et al. Mapping quantitative trait loci controlling milk production in dairy cattle by exploiting progeny testing // Genetics. 1995. - V.139. - P. 907-920.

72. Gillois M. Gene mapping today: applications to farm animals // Genet. Sel. Evol. 1991- V. 23 (Suppl.l). - P. 19-48.

73. Goldammer Т., Weikard R., Brunner R.M., Schwerin M. Generation of chromosome fragment specific bovine DNA sequences by microdissection and DOP-PCR // Mamm. genome. 1996. - V.6. - P.291-296.

74. Gortari M.J., Freking B.A., Kappes S.M. et al. Extensive genomic conservation of cattle microsatellite heterozygosity in sheep // Animal Genetics. 1997. - V.28. - P. 274-290.

75. Grisart В., Coppieters W., Arranz J.-J. et al. QTL mapping on candidate chromosomes 6, 14 and 20 using a red and white cattle granddaughter design // Anim. Genet. 1998. - V. 29 (Suppl.l). - P. 62.

76. Hanotte O., Okomo M., Bradley D. et al. Geographic distribution and frequency of taurine (Bos taurus) and zebu (Bos indicus) Y chromosome haplotypes amongst sub-Saharan African cattle breeds // Anim.Genetics. 1998. - V.29(l). - P. 9.

77. Hanslik S., harr В., Brem G., Schlotterer C. Microsatellite analysis substantial genetic differentiation between contemporary New World and Old World Holstein Friesian populations // Anim.Genetics. -2000. V.31(l). - P. 31-38.

78. Hayes H., Petit E., Dutrillaux B. Comparison of RBG-banded karyotypes of cattle, sheep and goats // Cytogenetics and Cell genetics. 1991. - V.57.-P. 51-55.

79. Hearne С. M., Chosn S., Todd J.A. Microsatellites for linkage analysis of genetic traits // Trends in Genetics. 1992. V.8. - P.288-294.

80. Hediger R, Ansari HA, Stranzinger G. Chromosome banding and gene localization support extensive conservation of chromosome structure between cattle and sheep // Cytogenetics and Cell genetics.- 1991.-V.57.-P. 51-55.

81. Hetzel D.J.S, Davis G.P, Corbet N, et al. Quantitetive trait loci (QTL) with differential effects on pre- and post-natal growth in Bos indicus x Bos taurus cattle // Anim. Genet. 1998. - V. 29(Suppl. 1). -P. 63.

82. Heyen D. W, Weller J. I, Ron M. et al. Genome scan for QTL influencing milk production and health traits in dairy cattle // Anim. Genet. 1998.-V. 29(Suppl. 1).-P. 61.

83. Hillel J. Map-based quantitative traits locus identification // Poult. Sci. 1997.-V.(68).-P.l 115-1120.

84. Hirano T, Kobayashi N, Nakamuru T, et al. Linkage analysis of meat quality in Wagyu // Anim. Genet. 1998. - V. 29(Suppl. 1). -P. 64.

85. Hors-Cayla M.C, Heuertz S , Van Cang N. Et al. Cattle gene mapping by somatic cell hybridization // Cytogenet. and Cell Genet.- 1979. V.25. - P.173-178.

86. Hudson T.J, Stein l.D, Gerrety S.S. et al. An STS-based map of the human genome // Sciece. 1995. -V.70. - P. 1945-1954.

87. Jorgenson C.B., Konfortov B.A., Barendse W., et al. Two polymorphic bovine microsatellite loci (AFR 227 and AFR 2215) // Anim.Genetics. -1995. V.26(2). - P. 132.

88. Kalm E., Reinsch N., Xu N., et al. Mapping quantitative trait loci on cattle chromosome 2, 5, 10, 16, 18 and 23 // Anim. Genet. 1998. -V. 29(Suppl. 1).-P. 62.

89. Kappes M. Steven, Keele J.W., Stone R.T. et al. A second-generation lineage map of bovine genome // Genome Res. 1997. -V.7(3). - P. 235-249.

90. Kemp S.J., Brezinsky L., Teale A.J. A panel of bovine , ovine and caprine polymorphic microsatellites // Anim. Genet.-1993. V.24. -P. 363-365.

91. Kemp S.J., Hishida O., Wambugu J. et al. A panel of polymorphic bovine, ovine and caprine microsatellite markers // Anim.Genetics.(submitted). 1995.

92. Kirkpatrick B.W. Identification of a conserved microsatelite site in the porcine and bovine insulin-like growth factor-I gene 5' flank // Animal genetics.- 1992. V.23.-P. 543-548.

93. Kuhn Ch., Freyer G., Weikard., et al. Detection of QTL for milk production traits in cattle by application of a specificially developed marker map of BTA6 // Anim.Genetics. -1999. V.30 (5). - P.333-340.

94. Kurnit D. M., Shafit B.R., Maio J.J. Multiple satellite deoxyribonucleic acids in the calf and their relation to the sex chromosomes//J. Mol. Biol. 1973. - V.81. - P.73-285.

95. Leyhe B. Anastassiadis C., Olsaker I., Heinleder S., Erhardt G. Genkartierung mittels Microsatellitentypisierung beim Rind im Rah-men des internationalen BovMap-Projektes.Vortragstagung der DGfZ undGfT am 20-21.9.95 in Hannover. 1-4. 1995.

96. Lien S., Gomez-Raya L., Steine Т., et al. // Associations between casein haplotypes and milk yield traits // J. Dairy Sci. 1995. - V.75. - P.2047 - 2056.

97. Lindersson M., L. Andersson-Eclund, D.-J. de Koning, et.al.Mapping of Serum Amylase-1 and quantitative trait loci for milk produktion traits to cattle chromosome 4 // J. Dairy Sci. 1998. -V.81. - P.1454-1461.

98. Ma R.Z., Beever J. E., Da Y. et al. A male linkage map of the cattle (Bos taurus) genome // J. of Heredity. -1996. V.87. - P.261-271.

99. Machugh D.E., Loftus R.T., Bradley D.G. et al. Microsatellite DNA variation with and among Europen cattle breeds // Proc. R. Soc. Lond. 1994. - V.256. - P.25-31.

100. Mapping and Sequencing the Human Genome. Human Genome project Information. Internet, genoml.htm.

101. Moazami-Goudarzi K., Laloe D., Furet J.P., Grosclaude F. Analysis of genetic relationships between 10 cattle breeds with 17 microsatellites // Anim.Genetics. 1997. - V.28. - P.338-345.

102. Mommens G., A. Van Zeveren., Peelman L.J. et al. Genetic distance between Bos taurus breeds and a possible phylogenetic tree with a Bison outgroup // Anim.Genetics. 1998. - V.29(l). P.10.

103. Montgomery G.W., Lord E.A. Penty J.M. The Booroola fecundity (FecB) gene maps to sheep chromosome 6 // Genomics. 1994. -V.22.-P. 148-153.

104. Moore S.S., Barendse W., Berger K.T. et al. Bovine et ovine DNA microsatellites from the EMBL and GENBANK databases // Animal Genetics. 1994. - V.23. - P. 463-467.

105. Moore S.S., Sargeant L.L., King T.J. et al. The conservation of dinucleotide microsatellites among mammalian genomes allows the use of heterologous PCR primer pairs in closely related species // Genomics. 1993. - V. 10. - P. 654-660.

106. Morton N.E. Sequential tests for the detection of linkage // Am. J. Hum. Genet. 1955.-V. 5.-P.277-318.

107. Nadesalingman J., Plante Y., Gibson J.P. Detection of QTL for milk production on Chromosomes 1 and 6 of Holstein cattle // Mamm. Genome. 2001. - V. 12 (1). - P. 27-31.

108. Nanda I., Deubelbeiss C., Guttenbach M. et al. Geterogeneities in the distribution of (GACA)n simple repeats in the karyotypes of primates and mouse// Human Genetics. 1990. - V.85. - P. 187-194.

109. Naylor L.H. and Clare E.M. d(TG)n-d(CA)n sequences upstream of the rat prolactin gene from Z-DNA and inhibit gene transcription // Nucleic Acid Res. 1990. -V. 18. P. 1595-1601.

110. Nei M. Molecular population genetics and evolution. Amsterdam: North-Holland, 1975. P.278.

111. Nonneman D., Koohmaraie M. Molecular cloning and mapping of the bovine and ovine skeletal muscle-specific calpains // Anim.Genetics. -1999. V.30(6). - P. 456-458.

112. O'Brien S.J. Mammalian genome mapping // Current opinion in Genetics and Development. 1991. - V. 1. - P. 105 -111.

113. O'Brien S.J., Womack J.E., Lyons L.A. et al. Anchored reference loci for comparative genome mapping in mammals // Nature Genet. 1993. V.3. -P.103-112.

114. Ohba Y., Kitagawa H., Kitoh K., et al. Homozygosity mapping of the locus responsible for renal tubular dysplasia of cattle on bovine chromosome 1 // Mamm. Genome. 2000. - V. 11 (4). - P. 316-319.

115. Ohba Y., Kitagawa H., Kunieda Т., et al. Mapping of a locus responsible for a new hereditary disease for renal tubular dysplasia in Japanese Black cattle // Anim. Genet. 1998. - V. 29(Suppl. 1). - P. 65.

116. Ott J. 1985. Analysis of human genetic linkage. Baltimore; L. The John Hopkins Univ. press, 220p.

117. Ott J., Donis-Keller H. Statistical methods in genetic mapping // Genomics. 1994. - V. 22. - P. 496.

118. Paszek A., Schook L.B., Louis C.F. et al. First international workshop on porcine chromosome 6. Report and abstracts // Anim. Genet. 1995.- V.26. -P.377-401.

119. Perret J., Shia J-C., Fris R., et al., A polymorphic satellite sequence maps to the pericentric region of the bovine Y chromosome // Genomics. 1990. V.6. - P. 482-490.

120. Piedrahita J. A., Weaks R., Petrescu A. et al. Genetic characterization of the bovine leukaemia inhibitory factor (LIF) gene: isolation and sequencing, chromosome assignment and microsatellite analysis // Anim. Genet. 1997. - V.28(l). - P. 14-20.

121. Polli M., Del Bo L., Ceriotti G. et al. Genetic distances of seven cattle breeds of the Italian Alpine area by microsatellites // Anim.Genetics. 1998. - V.29(l). - P.9.

122. Ponce de Leon F.A., Ambady S., Hawkins G.A. et al. Development of a bovine X chromosome linkage group and painting probes to assess cattle, sheep and geat X chromosome segment homologies // Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996. - V.93. - P.3450-3454.

123. Reading Conference (1976) Proceedings of the First International Conference for the Standardization of Banded Karyotypes of Domestic Animals, (ed. by C.E. Ford, D.L. Pollok & I. Gustavsson) // Hereditas. 1980.-V. 92.-P. 145-162.

124. Rohrer G.A., Alexander L.J., Hu Z. et al. A comprehensive map of the porcine genome // Genome Res. 1996. - V.6 - P.371-391.

125. Rohrer G.A., Alexander L.J., Keel J.W. et al., A mikrosatellite linkage map of the porcine genome // Genetics. 1994. - V.136.-P.231-245.

126. Ron M., Band M., A. Yanai et al. Mapping guantitative trait loci with DNA micrisatellites in a commercial dairy cattle population // Animal Henetics. 1994. - V.25. - P.259-264.

127. Ron M., Levin H., Da Y. et al. Prediction of informativeness for microsatellite markers among progeny of sires used for detection of economic trait loci ibvgftr54n dairy cattle // Anim. Genet. 1995. -V.26(6). - P. 439-441.

128. Sambrook J., Fritsh E. F., Maniatis S. T. Molecular cloning. A laboratory manual. Second edition. 1989.

129. Schafer R., Ali S. and Epplen J.T. The organization of the evolutionary conserved GAT A/GAGA repeats in the mouse genome // Chromosoma. 1986. V. -P.502-510.

130. Serebrovsky A. S, Wassina E.T. On the topographi of the sex -chromosome in fowls // J. Genet. 1926. -V. 17. - P. 211-216.

131. Sertedaki A, Lindsay S. CAC the neglected repet // BioEssays. -1996.-V. 18(3).- P. 237-242.

132. Smith C, Simpson S.P. The use of genetic polymorphisms in livestock improvement // J. Anim. Breed. Genet. 1986. - V.103. - P. 205-217.

133. Smith C.A.B. The development of human linkage analysis // Ann. Hum. Genet. 1986. - V.50. - P. 23-311.

134. Solinas-Toldo S, Lengauer C. and Fries R. Comparative Genome Map of human and Cattle // Genomics. 1995. - V.27. - P. 489-496.

135. Soller M. Genetic mapping of the Bovine Genome Using Deoxyribonucleic Acid-Level Markes to Identify Loci Affecting Quantitative Traits of Economic Importance // J. Dairy Sci. 1990. -V.73. - P.2682-2646.

136. Soller M, Beckman J.C. Restriction Fragment Lenght Polymorphisms and genetic improvement. Proceedings of the 2nd World Congress on Genetics Applied to livestock Production. 1982. V.6. P.396-404.

137. Sonstegard T.S. Van Tassell C.P. Ashwell M.S.Investigation of quantitetive trait loci for 'dairy form' in one family of Holsteins // Anim. Genet. 1998.-V. 29(Suppl. 1).-P. 61.

138. Spelman R.J, Coppieters W, Karim L, et al. Quantitative trait loci analysis for five milk production traits on chromosome six inthe Dutch Holstein-Friesian population // Genetics. 1996. - V. 144. -P. 1799-1808.

139. Stallings R.L., Ford A.F., Nelson D. et al. Evolution and distribution of (GT)n repetitive sequences in mammalian genomes // Genomics.- 1991. V. 10. - P.807-815.

140. Steel M. R., George M. Generation of bovine multisite haplotypes using random cosmid clones // Genomics. 1991. - V. 10. - P.889-904.

141. Stone R.T. et al., A smalle insert bovine genomic library highly enric microsatellite repeat sequences // Mamm. Genome. - 1995. -V.6.-P. 714-724.

142. Sun H.S., Cai L., Davis S.K. et al. Comparative linkage mapping of human chromosome 13 and bovine chromosome 12 // Genomics. -1997. V.39(l). - P.47-54.

143. Threadgill D.S., Womack J.E. Syntenic conservation between humans and cattle. I. Human chromosome 9 // Genomics. 1990. -V.8. - P.22-28.

144. Threadgill D.W, Womack J.E Genomic analysis of the major bovine milk protein genes // NAR. 1990a.- V. 18(23). - P. 6935-42.

145. Vage D.I., Gomez-Raya L., Klungland H., et al. Mapping quantitative trait loci in Norwegian cattle // Anim. Genet. 1998. - V. 29(Suppl. 1).-P. 62.

146. Vainman D., Imam-Gahli M., Moazami-Goadarzi K. Et al. Conservation of a syntenic group of microsatellite loci between cattle and sheep // Mammalian genome. 1994. - V.5. - P.310-314.

147. Vainman D., Mercier D., Moazami-Goudarzi et al. A set of 99 cattle microsatellites: characterization, synteny mapping, and polymorphism // Mammalian genome. 1994. - V.5. - P.288-297.

148. Vainman D., Pailhoux E., Payen E. Et al. Evolutionary conservation of a microsatellite in the Wilms tumour (WT) gene: mapping in sheep and cattle // Cytogenet Cell. Genet. 1995. -V.70(1-2). - P.112-115.

149. Velmala R.J., Vilkki H.J., Elo K.T., et al. A search for quantitative trait loci for milk produktion traits on chromosome 6 in Finnish Ayrshire cattle // Anim. Genet. 1999. - V.30. - P.2136-2143

150. Velmala R.J., Vilkki H.J., Elo K.T., et al. Casein haplotypes and their association with milk produktion traits in Finnish Ayrshire cattle // Anim. Genet. 1995. - V.26. - P. 419-425.

151. Vilkki H.J., Koning D.J., Elo K. Et al. Multiple marker mapping of quantitative trait loci of Finnish dairy cattle by regression // J.Dairy Sci. 1997. - V.80(l). - P. 198-204.

152. Weber J.L. and P.E. May. Abudant class of human DNA polymorphisms which can be tyred using the polymerase chain reaction // Am. J. Human Genetics. 1989. - V.44.- P.388

153. Weber J.L. Informativeness of human (dC-dA)n(dC-dT)n polymorphism // Genomics. 1990. - V.7. - P. 524-530.

154. Weikard R., Goldammer Т., Kiihn Ch., et al. Targeted development of microsatellite markers from the defined region of bovine chromosome 6q21-31 //Mamm. Genome. 1997. - V.6. - P.836-840.

155. Weissenbach J., Gyapay G., Dib C. et al. A second-generation linkage map of the human genome // Nature. 1992. - V.359. -P.794-801.

156. Wilkins R.J., H.W. Davey. A polymorphic microsatellite in the bovine leptin gene // Anim. Genet. 1997. - V.28. - P. 370-383.

157. Williams J., Usha A.P., Urquhart B.G., Kirloy M. Verification of identity of bovine semen using DNA microsatellite markers // Vet. Rec.- 1997. V. 140.-P.446-449.

158. Wintero A.K., Fredholm M. and Thomsen P.D Variable (dG-dT)n-(dC-dA)n Sequences in the Porcine Genome // Genomics. -1992. V.12. -P.281-288.

159. Womack J.E. The goats and status of the bovine gene map // J. Dairy Sci. 1993.- V.76. - P.l 199-1203.

160. Womack J.E., Moll Y.D. Gene map of the cow: Conservation of linkage with mouse and man// J. Hered. 1986. - V.77. - P.2-7.

161. Zanotti M., Longeri M., Polli M., Ceriotti G. Mapping the bovine genome: microsatellite identification. Reproduction and Animal Breeding: Advances and Strategy. 1995. - P.65-75.1. БЛАГОДАРНОСТИ

162. Считаю своим долгом поблагодарить администрацию института в лице директора, академика РАСХН Бориса Дмитриевича Кальницкого за предоставленную возможность выполнения и защиты диссертационной работы.

163. Благодарю своего научного руководителя к.б.н. Шевченко Вилория Григорьевича за предложенную тему диссертационной работы, за помощь в обсуждении и оформлении полученных результатов, весь коллектив лаборатории за помощь и моральную поддержку.

164. Мне хотелось бы искренне поблагодарить Корохова Тимофея Николаевича за оказанную им помощь в обработке полученных результатов, за доброжелательное отношение ко мне, проявленный интерес к работе, и за моральную поддержку.

165. Особую благодарность я приношу Поповой Елене Алексеевне и своим родителям, без участия которых эта работа могла бы не состояться.