Изучение молекулярно-генетических основ остеоартрита у женщин с недифференцированной дисплазией соединительной ткани тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.02.07, кандидат наук Шаповалова Дарья Алексеевна

• Шаповалова Дарья Алексеевна
• кандидат наук
• 2020

Оглавление диссертации кандидат наук Шаповалова Дарья Алексеевна

ВВЕДЕНИЕ

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Современные представления об этиологии остеоартрита

1.2. Распространенность остеоартрита и его клинических форм

1.3. Патогенез остеоартрита

1.4. Диагностика остеоартрита

1.5. Роль недифференцированной дисплазии соединительной ткани в формировании остеоартрита

1.6. Генетические факторы остеоартрита

1.7. Эпигенетические факторы развития остеоартрита

1.7.1. Роль микроРНК в патогенезе остеоартрита

ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ

2.1. Материалы исследования

2.2. Методы исследования

2.2.1. Выделение геномной ДНК

2.2.2. Полимеразная цепная реакция синтеза ДНК

2.2.3. ПЦР в режиме реального времени (Реал тайм ПЦР)

2.2.4. Конкурентная аллель-специфичная ПЦР (КАБР)

2.2.5. Анализ полиморфизма длин рестрикционных фрагментов

2.2.6. Электрофорез в полиакриламидном геле

2.2.7. Секвенирование ДНК по Сэнгеру

2.2.8. Статистическая обработка и программное обеспечение

ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ

3.3.1. Исследование и анализ ассоциаций полиморфных вариантов генов-кандидатов с остеоартритом и дисплазией соединительной

ткани

3.3.2. Репликативное исследование локусов, ассоциированных с остеоартритом по результатам полногеномного анализа ассоциаций (GWАS)

3.3.3. Поиск ассоциаций полиморфных локусов, расположенных в сайтах связывания микроРНК, с остеоартритом и дисплазией соединительной ткани

3.3.4. Валидация полученных ассоциаций исследованных локусов на независимой выборке женщин

3.3.5. Анализ гаплотипов исследованных локусов и поиск ассоциаций с развитием остеоартрита и недифференцированной дисплазии соединительной ткани

3.3.6. Мета-анализ и обобщение результатов исследования

3.3.7. Оценка диагностической значимости исследованных маркеров

Заключение

ВЫВОДЫ

Список сокращений и условных обозначений

Список литературы

Приложение А - Электрофореграммы генотипирования полиморфных

вариантов исследованных кандидатных генов

Приложение Б - Результаты распределения частот аллелей и генотипов

полиморфных локусов генов-кандидатов развития остеоартрита

Приложение В - Результаты распределения частот аллелей и генотипов полиморфных локусов, ассоциированных с остеоартритом по результатам

полногеномного анализа ассоциаций GWАS

Приложение Г - Результаты распределения частот аллелей и генотипов

полиморфных локусов сайтов связывания микроРНК

Приложение Д - Результаты исследования локусов на независимой

выборке женщин для валидации значимых ассоциаций

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Изучение молекулярно-генетических основ остеоартрита у женщин с недифференцированной дисплазией соединительной ткани»

ВВЕДЕНИЕ Актуальность темы

Остеоартрит (МКБ10: M15-M19) - заболевание суставов, характеризующееся клеточным стрессом и деградацией экстрацеллюлярного матрикса, развивающееся при макро- и микроповреждениях, которые активируют аномальный адаптивный восстановительный ответ, включая провоспалительные иммунные механизмы, формирующееся в результате взаимодействия возрастных, гормональных, воспалительных,

иммунологических, генетических и средовых факторов. Вклад генетического компонента варьирует от 40% до 65% в зависимости от наличия данной патологии у ближайших родственников, локализации пораженного сустава, пола и этнический принадлежности. Изменения, которые изначально развиваются на молекулярном уровне (аномальный метаболизм в тканях сустава), в последующем приводят к анатомическим и физиологическим нарушениям (деградация хряща, ремоделирование кости, образование остеофитов, индукция субклинического воспаления и утрата нормальной функции сустава) и формированию клинических симптомов заболевания (Алексеева и др., 2019).

Более 20% населения мира страдают ОА, 80% этих людей испытывают затруднения в движении, а 25% - ограничения в повседневной жизненной активности (Bomеr, 2016). Распространенность ОА возрастает с увеличением возраста, достигая пика в промежутке 65-74 лет, при этом до 45-летнего возраста заболевание чаще встречается среди мужчин, а после 54 лет - среди женщин.

Несмотря на то, что ОА является наиболее распространенным заболеванием суставов, приводящим к инвалидности, до сих пор нет доступного и эффективного лечения, кроме дорогостоящей хирургической замены сустава на терминальной стадии болезни. ОА чаще всего диагностируется при наличии клинических проявлений, характерных для выраженных морфологических

изменений в хряще и существует проблема раннего выявления деструктивно-дистрофических поражений сустава. В связи с этим необходимы новые подходы к диагностике заболевания и чрезвычайно важен поиск прогностически значимых маркеров, чтобы выявить предрасположенность к заболеванию, на самых ранних этапах жизни человека. У пациентов с ОА часто встречаются различные фенотипические признаки недифференцированной дисплазии соединительной ткани (нДСТ), которые не укладываются в структуру наследственных синдромов, и характеризуются генетической неоднородностью и многообразием клинических проявлений. Учитывая, что при ОА и нДСТ выявляются изменения структуры соединительной ткани деструктивного характера, можно предположить существование общих патогенетических звеньев формирования данных патологий.

В последнее десятилетие, благодаря технологии полногеномных исследований ассоциаций (GWАS) сотен тысяч однонуклеотидных полиморфных вариантов (ОНП) с привлечением больших выборок (>100 тысяч образцов) в рамках международных консорциумов, достигнут значительный прогресс в выявлении генетической предрасположенности к ОА, однако существует и множество невыясненных ключевых вопросов (Хусаинова и др., 2017). Проблема сочетания ОА нДСТ чрезвычайно актуальна, представляет собой как фундаментальную, так и практическую задачу, решение которой будет способствовать разработке подходов ранней диагностики ОА, основанных на понимании молекулярного патогенеза заболевания.

Степень разработанности исследования

Исследование генетических основ остеоартрита проводится большим количеством исследователей по всему миру, но, несмотря на это, в понимании молекулярного патогенеза заболевания остается много невыясненных моментов. Недифференцированная дисплазия соединительной ткани как фактор, способствующий развитию заболевания, рассматривается в ряде работ отечественных ученых. Такие исследования проводились, в том числе, на базе Института Биохимии и генетики УФИЦ РАН совместно с Башкирским медицинским университетом. Было обнаружено, что признаки дисплазии соединительной ткани широко встречаются у пациенток с терапевтической патологией, были выявлены ассоциации дисплазии соединительной ткани в целом и ее отдельных фенотипических признаков с развитием остеоартрита и его клиническим течением. Было изучено несколько биохимических показателей и генетических локусов генов, кодирующих структурные компоненты и ферменты метаболизма соединительной ткани, и выявлены некоторые закономерности риска развития раннего остеоартрита у женщин.

Проведен ряд полногеномных исследований ассоциаций (GWАS) и определены локусы, значимые для развития остеоартрита в европейских и азиатских популяциях. Многие полученные на сегодняшний день результаты носят противоречивый характер и необходимо проведение репликативных исследований в различных популяционных выборках для валидации выявленных ранее генетических предикторов остеоартрита.

Таким образом, проведенные ранее исследования вносят вклад в понимание молекулярно-генетических основ остеоартрита, однако проблема определения диагностики значимых генетических и, особенно, эпигенетических маркеров риска развития заболевания в отдельности и в сочетании с фоновой патологией по-прежнему остается актуальной.

Цель исследования

Поиск генетических и эпигенетических маркеров формирования предрасположенности к остеоартриту различных локализаций с учетом наличия признаков недифференцированной дисплазии соединительной ткани в целом, а так же особенностей популяционной структуры народов, проживающих в Волго-Уральском регионе России и разработка прогностических моделей диагностики риска развития данной группы патологий.

Задачи исследования

1. Поиск ассоциаций полиморфных вариантов генов ферментов катаболизма соединительной ткани (ММР1, ММР3, ММР13, АОАМТБ5), основных белков хрящевой и костной тканей (СОЫА1, СОЬ2А1), белков, участвующих в хондрогенезе (АОС1, ЮХ9) с развитием остеоартрита (ОА) и нДСТ в отдельности и в коморбидном состоянии, локализации ОА, степени выраженности нДСТ у женщин с учетом их этнического происхождения.

2. Репликативный анализ ассоциаций локусов, значимых для развития ОА, по данным полногеномного анализа ассоциаций (GWАS), расположенных вблизи генов DOT1L, АLDH1А2, ОЖ3, 0^801, АSTN, FILIP1, NCOА3, ВША, CHST11, с остеоартритом в целом и его различных локализаций, а также с ОА в сочетании с признаками нДСТ у женщин с учетом их этнической принадлежности.

3. Поиск ассоциаций полиморфных вариантов сайтов связывания микроРНК в таргетных генах с остеоартритом и нДСТ, в отдельности и в коморбидном состоянии, с учетом степени тяжести нДСТ, локализации ОА и этнической принадлежности женщин.

4. Валидизация статистически значимых результатов исследования на независимой выборке женщин.

5. Мета-анализ и обобщение результатов исследования в объединенной выборке женщин.

6. Разработка прогностических моделей диагностики остеоартрита и нДСТ, в отдельности и в коморбидном состояниях, на основе клинических предикторов и генетических маркеров полиморфных вариантов кандидатных генов, репликативного анализа ассоциаций GWАS локусов и сайтов связывания микроРНК.

Научная новизна

Впервые проведено комплексное исследование генетических и эпигенетических факторов формирования ОА в целом и с учетом локализации патологического процесса, а также наличия нДСТ с использованием трех подходов - ген - кандидатного, репликации результатов полногеномного анализа ассоциаций (GWАS) и изучения сайтов связывания микроРНК в генах, вовлеченных в патогенез ОА. Также впервые применена методика сопоставления результатов нескольких алгоритмов статистического анализа полученных данных - метода попарного сравнения, множественной логистической регрессии и мета-анализа. Впервые в России выявлен эпигенетический маркер формирования остеоартрита у женщин из Волго-Уральского региона - локус ¥813317 сайта связывания микроРНК гена ЕОЕШ.

Научно-практическая значимость работы

Представленные в работе результаты вносят значительный вклад в понимание фундаментальных основ патогенеза и молекулярно-генетических механизмов формирования ОА и нДСТ в отдельности и в коморбидном состоянии. Выявлены прогностически значимые маркеры развития патологий, что послужит основой для разработки диагностического комплекса, позволяющего определить риск развития ОА у женщин с нДСТ с целью

проведения профилактики, ранней диагностики и превентивного лечения для каждого пациента в рамках реализации концепции персонализированной медицины. Созданные клинико-генетические модели диагностики риска развития остеоартрита будут внедрены в практику.

Методология и методы исследования

В основе методологии данного исследования лежит комплексное исследование остеоартрита с учетом локализации патологического процесса и коморбидности с недифференцированной дисплазией соединительной ткани с применением нескольких молекулярно-генетических подходов: изучение генов-кандидатов развития остеоартрита, локусов, ассоциированных с заболеванием по результатам полногеномного анализа ассоциаций (GWАS) и изучение сайтов связывания микроРНК в таргетных генах, вовлеченных в метаболизм соединительной ткани, а также использование адекватных и современных методов статистической обработки полученных результатов. Для проведения молекулярно-генетических исследований использованы репрезентативные выборки женщин с учетом их этнической принадлежности, были выбраны современные методы анализа генома человека: выделение геномной ДНК-фенол-хлороформной экстракцией, полимеразной цепной реакции синтеза ДНК в реальном времени с использованием технологии TаqMаn и KАSP, секвенирования ДНК. Особенностью исследования является то, что выборка имеет значительный размер и сформирована из больных, проживающих на территории Волго-Уральского региона Российской Федерации. Проведение данного исследования одобрено этическим комитетом ФГБНУ ИБГ УФИЦ РАН. В работе использованы общенаучные эмпирические (эксперимент, наблюдение, описание), теоретические (анализ, синтез, обобщение) и специальные методы (изучение литературных источников, молекулярно-генетические методы, методы статистического анализа).

Положения, выносимые на защиту

1. Локус rs1107946 (COL1А1) является диагностически значимым генетическим маркером нДСТ, rs13317 (ЕОЕШ) - ОА у женщин из Волго-Уральского региона России.

2. Локусы тт (АСАЫ), ю9659030 (СОЫА1), ™7639618 (ВША) ассоциированы с ОА в сочетании с нДСТ.

3. Локусы к13317 (РвРШ) и к229069 (АВАМТБ5) ассоциированы с развитием гонартроза, ™1061237, т1107946 (COL1А1) и ™835487 (СИБТ1) - с развитием коксартроза, ^ТК-полиморфизм (АСАЫ) - с развитием полиостеоартроза.

4. Локусы т6854081 (ЕОЕШ) и т4836732 (АБТШ) являются этноспецифичными маркерами риска развития остеоартрита у женщин татарской этнической принадлежности.

5. Разработана прогностическая модель развития ОА на основе клинических и генетических предикторов.

Степень достоверности и апробация результатов

Достоверность определяется достаточным количеством материалов исследования (417 женщин), 100 из них представляют репрезентативную выборку женщин с диагнозом ОА для валидации результатов исследования. Выборка подразделена на группы сравнения в зависимости от локализации патологического процесса при ОА, наличия фенотипических проявлений нДСТ и этнического происхождения.

Исследование выполнено с применением адекватных и современных методов исследования генома человека и соответствующими поставленным задачам методами статистической обработкой данных. Полученные в ходе исследования результаты апробированы на многочисленных конференциях,

таких как «Международный конгресс по остеопорозу, остеоартриту и другим метаболическим заболеваниям скелета» (Казань, 2016), IX Всероссийской научно-практической конференции с международным участием «Молекулярная диагностика 2017», Москва, XI научной конференции «Генетика человека и патология» (Томск, 2017), «Еш"opеаn Humаn Gеnеtics Confеrеncе» (Копенгаген, 2017) конгрессе «Актуальные вопросы фундаментальной и клинической медицины» (Томск, 2018), научно-практической конференции «Новые концепции диагностики и лечения остеоартрита» (Астрахань, 2018), «Актуальные вопросы внутренней патологии. Дисплазия соединительной ткани» (Омск, 2018), «Российском конгрессе лабораторной медицины» (Москва, 2018), «II международном конгрессе ассоциации ревмоортопедов» (Москва, 2018), «VII съезде Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы» (Санкт Петербург, 2019), «V Российском конгрессе лабораторной медицины» (Москва, 2019), VIII Всероссийской научно-практической конференции «Актуальные вопросы внутренней патологии. Дисплазии соединительной ткани» совместно с научно-практической конференцией «Вся жизнь - делу врачевания и просвещения» (Омск, 2019).

Личное участие автора в получении результатов

Автор работы участвовал во всех стадиях исследовательской работы: в формулировании цели и задач, разработке схемы и порядка проведенных исследований, выборе методик работы, статистическом анализе полученных данных. Автором исследования проведен анализ образцов ДНК 417 пациентов с остеоартритом, нДСТ и контрольной выборки с применением современных и адекватных методик молекулярно-генетических исследований. Автор принимал непосредственное участие в анализе баз данных и публикаций для подбора условий проведения всех этапов ПЦР-диагностики, в том числе конкурентной

аллель-специфичной ПЦР (KASP), которая применяется для диагностики остеоартрита в России впервые. Автор лично провел комплексную статистическую обработку полученных результатов с применением методик и программных продуктов, максимально обеспечивающих решение поставленных задач - Stаtisticа 6.0, МеёСа1е, Hаlpoviеw 4.2, Plink 1.07. Автор лично написал рукопись данной работы и непосредственно участвовал в подготовке материалов к публикациям и их написании, а так же представил результаты на научных конференциях.

Публикации

По теме диссертации опубликовано 12 научных работ, из которых 4 в рецензируемых научных изданиях, рекомендованных ВАК, в том числе 2 статьи, индексируемые в международных базах Wеb of Sciеncе или Scopus.

Соответствие диссертации паспорту научной деятельности

Диссертационная работа "Исследование молекулярно-генетических основ остеоартрита у женщин с недифференцированной дисплазией соединительной ткани" соответствует формуле специальности 03.02.07 - "Генетика". В работе исследованы генетические аспекты развития остеоартрита, а также обнаружены клинические и молекулярно-генетические предикторы развития данного заболевания у лиц проживающих на территории Республики Башкортостан.

Структура и объем работы

Диссертация изложена на 174 страницах машинописного текста, состоит из введения, обзора литературы, материалов и методов, исследований и обсуждений, заключения и выводов, библиографического списка и приложений. Работа иллюстрирована 8 рисунками, содержит 94 таблицы, и 5 приложений. Список литературы включает 161 источник, среди них 29 - отечественных, 132 -зарубежных.

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Современные представления об этиологии остеоартрита

В настоящее время ОА рассматривается как гетерогенное заболевание, на развитие которого влияет множество факторов, которые подразделяют на системные (пол, раса, генетическая предрасположенность, гормональный статус, минеральная плотность костной ткани - МПКТ), локальные (травмы, аномалии развития костно-мышечной системы, травмы, слабость мышц, нарушение оси сустава, гипермобильность, дисплазия суставов) и средовые (ожирение, специфическая спортивная нагрузка и профессиональные факторы) (Кашеварова и др., 2014).

Общепринятой является классификация ОА на две основные формы: первичный (идиопатический) и вторичный, возникающий на фоне различных заболеваний. Исследования вклада различных факторов риска в развитие первичного остеоартрита, необходимо для лучшего понимания этиологии данного заболевания.

Определение остеоартрита неоднократно подвергалось изменениям, по мере исследования различных этиологических факторов и механизмов патогенеза заболевания. В 2015 г. Международное общество по изучению остеоартрита (Ostеoаrthritis Rеsеаrch Sociеty Шегпайопа1, ОАЕ31) предложило новое определение ОА как заболевания суставов, характеризующегося клеточным стрессом и деградацией экстрацеллюлярного матрикса, развивающимися при макро- и микроповреждениях, которые активируют анормальный адаптивный восстановительный ответ, включая провоспалительные иммунные механизмы (Алексеева и др., 2019).

Начало изучения остеоартрита относится к 1839 г., когда профессор Со1^ описал это заболевание как «дегенеративно-пролиферативное». В дальнейшем были изучены морфологические изменения хряща, а в 1908 г. Wolеmbеrg и Hoffе

впервые представили рентгенологическую характеристику этой болезни. В 1909 г. появляется термин «дегенеративный артрит» с акцентом на первичное поражение хряща, однако, уже в 1995 г. группа ученых под руководством профессора К.Е. КеиАпег, созданная для изучения проблемы остеоартрита, подчеркивала патогенетическую гетерогенность болезни, а также видение ее как органной патологии, т. е. болезни всего сустава, включая хрящ, подлежащую субхондральную кость, синовиальную оболочку, капсулу, мышцы и связки.

Большое внимание в исследовании ОА сегодня уделяется роли иммунитета. С углублением знаний этой области, остеоартрит стал рассматриваться как процесс, при котором воспаление, как ответная реакция хондроцитов и синовиоцитов на продукты распада молекул внеклеточного матрикса при деградации хряща, протекает с низкой степенью интенсивности, и показано, что иммунный ответ играет важную роль в прогрессировании данной патологии ^е et а1, 2019). В связи с этим оправданно изменение прежнего названия болезни «остеоартроз» на современное «остеоартрит» (Ширинский и др., 2019).

Активно изучается связь дефицита витамина Д с прогрессированием симптомов остеоартрита. Показана его эффективность в снижении синовита коленного сустава и уменьшении процессов воспаления при лечении пациентов с ОА коленного сустава (Золотовская, Давыдкин, 2019).

В ряде исследований было показано что высокий уровень МПКТ положительно коррелирует с ОА тазобедренного сустава, колена, позвоночника и кистей рук (Hаrdcаst1е., 2015).

Исследования роли гендерных различий в риске развития ОА показывают более высокую распространенность данной патологии среди женщин, что можно объяснить комплексом взаимодействий генов, а также системных и средовых факторов. Для женщин характерно более выраженное проявление симптомов ОА по сравнению с мужчинами (Mig1iore et а1., 2018).

Высокий индекс массы тела (более 25-30 кг/м2) является сильным фактором риска развития ОА коленного сустава по результатам недавнего мета-анализа (Silverwood et al., 2015).

Структурные аномалии суставов могут увеличить риск развития ОА. Вариация формы головки бедренной кости, как сообщалось, Gregory с соавт, значительно увеличивает риск возникновения как коксартроза так и гонартроза (Gregory et al., 2007). Дисплазия тазобедренного сустава также считается значительным фактором риска, для развития ОА, в более раннем возрасте (Terjesen, 2011). Нарушение оси суставов, такие как варусная или вальгусная деформации также повышают риск развития ОА (Sharma et al., 2010).

У лиц с семейным анамнезом, риск развития остеоартроза выше популяционного, что подтверждает роль наследственности в развитии данного заболевания. При этом генетическая изменчивость определяет вариацию в степени тяжести течения заболевания, и возраста манифестации (Warmer, Valdes, 2016).

Различные факторы риска ОА формируют определенные фенотипы ОА, которые отличаются патогенезом и клиническими проявлениями.

Значительный прогресс в понимании разнообразных механизмов развития ОА привел к необходимости создания классификации, основанной на фенотипировании пациентов, в зависимости от преобладающих патофизиологических изменений, не только с целью индивидуального подбора терапии, но и разработки профилактических методов с учетом фенотипически детерминированных факторов риска (Лила, 2019).

№lson (2018) предлагает изучать фенотипы ОА в зависимости от типа прогрессирования или характера исследуемой терапии и популяции (№lson еt а1, 2012). В недавно опубликованном систематическом обзоре были выделены шесть фенотипов ОА: 1) фенотип минимального заболевания суставов с незначительными симптомами и дискомфортом в течение длительного периода;

2) фенотип хронической боли; 3) фенотип биомеханических нарушений; 4) воспалительный фенотип; 5) метаболический фенотип; 6) фенотип измененного метаболизма кости и хряща (Ое11Ъо1а еt а1., 2016). В 2018 помимо шести выделенных ранее фенотипов ОА был приведен еще один - так называемый комплексный фенотип (Ве11Ъо1а, Stеultjеns, 2018). Существуют и другие точки зрения в отношении фенотипирования. Так, профессор F. БегепЬаиш предлагает два концептуальных подхода: консервативный, или движение «сверху-вниз» («top-down»), который основан на уже известных фактах о заболевании и другой подход, описываемый автором как движение «снизу-вверх» (<^ер-ир») и заключающийся в поиске фенотипа не исходя из априорного знания, а на основе сложных статистических методов - кластерного распределения крупных массивов данных с целью их упорядочивания, идентификации и группировки новых методик, проверки сформулированных гипотез (ВегепЬаит, 2019).

Таким образом, новые технологии молекулярной биологии в сочетании с биоинформатикой, вероятно, будут способствовать лучшему пониманию патофизиологических механизмов ОА.

1.2. Распространенность остеоартрита и его клинических форм

ОА - самое частое заболевание суставов, которым страдает более 10% населения земного шара, 81 млн больных ОА зарегистрировано в пяти развитых странах (Германия, Италия, Франция, Великобритания, Испания) и более 380 млн. - в России, Бразилии, Индии и Китае (Алексеева и др., 2019).

В последние годы наблюдается рост заболеваемости среди лиц трудоспособного возраста. Значимое влияние на сложившуюся ситуацию оказывают медицинские, демографические и социально-экономические факторы (Кабалык и др., 2018). В России по данным официальной статистики, в период с 2013 по 2017 число больных ОА увеличилось на 3,7% (Балабанова, Дубинина, 2019).

Риск развития остеоартрита выше среди женщин и увеличивается с возрастом. По разным оценкам, около 80% всех случаев заболевания остеоартритом приходится на гонартроз (Wаllаcе еt а!., 2017). ОА тазобедренных суставов диагностируется значительно реже, чем ОА коленных суставов и кистей (Нийег, В1егта-7е1ш^"а, 2019). Причем многие исследователи не находят значимых гендерных различий в частоте встречаемости данной локализации, однако в ряде работ продемонстрировано, что распространенность рентгенологического ОА тазобедренных суставов выше у мужчин, чем у женщин (р<0,0001) (Ьа^^епсе еt а!., 2008). Распространенность ОА суставов кистей варьирует от 2,0 до 16,3%, при этом у пациентов старше 70 лет рентгенологический ОА наблюдается более чем в 90% случаев, а симптоматический - значительно реже еt а!., 2002).

Эпидемиология остеоартрита имеет особенности в разных странах. Распространенность заболевания не показала особых различий по частоте поражения кистей, коленей и тазобедренного сустава среди европейских и американских популяций (№1боп еt а!., 2011). Однако мужчины и женщины Китая имели более низкую распространенность рентгенологического и симптоматического ОА кистей рук и рентгенологического ОА тазобедренного сустава, по сравнению с европейцами (7еп§ еt а1., 2008). По другим данным, заболеваемость ОА выше у лиц азиатской расы, чем у белых американцев (Не, 2018). Общая распространенность ОА находится в диапазоне от 20,5% до 68,0% и большинство азиатских популяций имеют ОА коленного сустава в диапазоне от 13,1% до 71,1% в различных азиатских странах (7атп еt а1., 2019). Обследование более чем 26000 жителей Англии в возрасте 50 лет показало, что глобальная распространенность остеоартрита коленного сустава составила 3,8%, а остеоартрита тазобедренного сустава - 0,85%, остеоартрит был на 11-месте среди причин инвалидности (А11еп, Оо^ЬНу, 2015). Распространенность симптоматического ОА коленного сустава составила, 7% среди лиц старше 45 лет

в рамках проекта по остеоартриту округа Джонстон. Около 9% участников исследования округа Джонстон имели симптоматический ОА тазобедренного сустава (Nеogi, 2013). Каждый четвертый человек в возрасте 55 лет и старше из Великобритании сообщал о значительном приступе боли в колене, почти половина из них (12,5%) сообщили о нетрудоспособности (Реа1 е1 а1., 2001). Согласно базам данных здравоохранения Канады (США) за 18 летний период общий показатель заболеваемости остеоартритом как мужчин, так и женщин составил 14,6% на 2000 год, при этом наблюдалось постоянное увеличение частоты заболевания на 2,5-3,3% в год до 2009 года (Ялкшап е1 а1., 2014). Среди лиц 56-84 лет из Швеции, распространенность рентгенологического и симптоматического остеоартрита коленного сустава составила 25,4% и 15,4% соответственно (ТигМе,шс7 е1 а1., 2015). Показано, что симптоматический ОА поражает одного из восьми мужчин и женщин США (27-31 млн) (Nеogi, 2013). В Голландии у лиц старше 45 лет отмечается увеличение распространенности рентгенографического ОА коленного сустава, более заметное увеличение с возрастом у женщин, чем у мужчин (уап Бааве е1 а1., 1989). Исследователи из Швеции предполагают увеличение клинически диагностированного ОА любой локализации с 26,6% в 2012 году до 29,5% к 2032 среди лиц в возрасте 45 лет и старше е1 а1., 2014).

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Шаповалова Дарья Алексеевна, 2020 год

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

1. Алексеева, Л.И. Зайцева, Е.М. Роль субхондральной кости при остеоартрозе. / Л.И. Алексеева, Е.М. Зайцева. // Научно-Практическая Ревматология. - 2009. - № 4. - С. 41-48.

2. Алексеева, ЛИ. Остеоартрит: эпидемиология, классификация, факторы риска и прогрессирования, клиника, диагностика, лечение / Алексеева Л.И., Таскина ЕА, Кашеварова Н.Г. // Современная ревматология. - 2019. - Т. 13.

- № 2. - С. 9-21.

3. Балабанова, Р.М., Дубинина, Т.В. Динамика пятилетней заболеваемости болезнями костно-мышечной системы и их распространенности среди взрослого населения России за 2013 - 2017 гг./ Р.М. Балабанова, Т.В. Дубинина. // Современная ревматология. - 2019. - Т. 13. - № 12. - С. 11-17.

4. Галушко, Е.А. Остеоартроз в амбулаторной практике/ Е.А. Галушко, Ш.Ф. Эрдес, Л.И. Алексеева. // Современная ревматология. - 2008. - Т. 12. - № 4.

- С. 66-70.

5. Долгова, Е.А. Биомаркеры остеоартрита (обзор литературы) / Е.А. Долгова, В.Н. Сороцкая, Д.Р. Ракита // Вестник новых медицинских технологий.

- 2012. - Т. 19. - № 1.

6. Земцовский, Э.В. Недифференцированные дисплазии соединительной ткани. Попытка нового осмысления концепции/ Э.В. Земцовский // Мед. вест. Север. Кавказа. - 2008. - Т. 2. - № 10. - С. 8-14.

7. Золотовская И. А., Давыдкин И. Л. Витамин D-прогностический маркер риска развития обострения у пациентов старше 60 лет с остеоартритом коленного сустава (результаты наблюдательной программы ДИАНА) //Терапевтический архив. - 2019. - Т. 5. - С. 103.

8. Кабалык, М.А. Распространенность остеоартрита в России: региональные аспекты динамики статистических показателей за 2011-2016 гг./

М.А. Кабалык. // Научно-практическая ревматология. - 2018. - T. 56. - № 4. - С. 416-422.

9. Кадурина, Т.И. Дифференцированная и недифференцированная дисплазия соединительной ткани/ Т.И. Кадурина, В.Н. Горбунова. // Дисплазия соединительной ткани: руководство для врачей С-Пб: ЭЛБИ-СПб. - 2009. - С. 2933.

10. Кадурина, Т.И. Оценка степени тяжести недифференцированной дисплазии соединительной ткани у детей / Т.И. Кадурина, Л.Н. Аббакумова. // Медицинский вестник Северного Кавказа. - 2008. - Т. 10. - № 2. - С.15-20.

11. Кашеварова, Н.Г. Факторы риска прогрессирования остеоартроза коленных суставов / Н.Г. Кашеварова, Л.И. Алексеева. // Научно-практическая ревматология. - 2014. - T.52. - № 5. C. 553-561.

12. Лила, A.M. Современные подходы к фенотипированию остеоартрита / A.M. Лила, Л.И. Алексеева, K.A. Телышев. // Современная ревматология. - 2019. - Т. 13. - № 2. - С. 4-8.

13. Мазуров, В.И. Факторы риска и некоторые аспекты патогенеза остеоартрита / В.И. Мазуров, А.С. Трофимова, Е.А. Трофимов. // Вестник СевероЗападного государственного медицинского университета им. ИИ Мечникова. -2016. - Т. 8. - № 2. - C. 116-124.

14. Макарова, М. В. Ультразвуковая сонография и магнитно-резонансная томография в выявлении дегенеративных изменений при рентгенологически нулевой стадии остеоартроза коленных суставов/ М.В. Макарова, А.В. Агапитов, А.В. Юницына, и др. // Вестник новых медицинских технологий. Электронное издание. - 2014. - № 1. - С.1-7.

15. Насонова, В.А. Клиническая ревматология / В.А. Насонова, М.Г. Астапенко.// - М. - 1989. - 592 с.

16. Раймуев, К.В. Провоспалительные и противовоспалительные цитокины в патогенезе остеоартрита/ К.В. Раймуев, А.М. Ищенко, М.Е.

Малышев. // Вестник Северо-Западного государственного медицинского университета им. И.И. Мечникова. - 2018. - Т. 10. - № 3. - С. 19-27.

17. Селезнева, Л.И. Анализ ассоциаций полиморфизмов и гаплотипов 5-региона гена COLI А1 c риском развития остеопоретических переломов у женщин Волго-Уральского региона России / Селезнева Л.И., Хусаинова Р.И., Нурлыгаянов Р.З. // Генетика человека. - 2008. - Т. 44. - № 2. - С. 219-225.

18. Тюрин, А.В. Роль фенотипов дисплазии соединительной ткани в оценке риска развития соматической патологии / А.В. Тюрин, Р.А. Давлетшин, Р.М. Муратова // Казанский медицинский журнал. - 2014. - Т. 95 - № 4. - С. 501505.

19. Тюрин, А.В. Поиск ассоциаций полиморфных вариантов гена рецептора витамина D (VDR) с остеоартритом и дисплазией соединительной ткани/ А.В. Тюрин, Р.И. Хусаинова, Н.Н. Хуснутдинова, и др. // Медицинская генетика. - 2014а. - Т. 13. - № 9. - С. 18-27.

20. Тюрин, А.В. Клинические особенности и молекулярно-генетические аспекты остеоартроза у больных с дисплазией соединительной ткани. / А.В. Тюрин. // Автореферат диссертации на соискание ученой степени кандидата медицинских наук. Москва. - 2015. - С. 1-23.

21. Тюрин, А.В. Поиск маркеров генетической предрасположенности к развитию гипермобильности суставов и остеоартрита у больных из республики Башкортостан / А.В. Тюрин, Р.И. Хусаинова, Л.З. Лукманова, // Молекулярная медицина. - 2016. - Т. 14. - № 6. - С.41-47.

22. Тюрин, А.В., Роль полиморфных вариантов генов матриксных металлопротеиназ в формировании нарушения гомеостаза соединительной ткани и патологии опорно-двигательного аппарата / А.В. Тюрин, Д.А. Шаповалова, Л.З. Лукманова, // Клиническая медицина. - 2018. - Т. 96. - № 8. - С. 754-761.

23. Тябут, Т.Д., Каратыш О.М. Недифференцированная дисплазия соединительной ткани / Т.Д. Тябут, О.М. Каратыш // Современная ревматология. - 2009. - № 2. - С. 19-23.

24. Хусаинова Р. И. Генетические маркеры остеоартрита у женщин с недифференцированной дисплазией соединительной ткани/ Р. И. Хусаинова, А. В. Тюрин, Д. А. Шаповалова, и др.// Генетика человека. - 2017. - V. 53. - P. 816826.

25. Четина, Е.В. Признаки дифференциации хондроцитов при формировании ранних повреждений хряща у пожилых людей. / Е.В. Четина. // Научно-практическая ревматология. - 2011. - № 1. - C. 33-39.

26. Шаповалова Д.А. Современные представления о генетике остеоартроза/ Д.А. Шаповалова, А.В. Тюрин, Э.К. Хуснутдинова, Р.И. Хусаинова // Медицинская генетика. - 2017. - Т. 16. - №. 2. - С. 3-10.

27. Шаповалова, Д.А. Роль полиморфного локуса VNTR гена аггрекана в развитии остеоартроза у женщин. / Д.А. Шаповалова, А.В. Тюрин, С.С. Литвинов, и др. // Вавиловский журнал генетики и селекции. - 2018. - T. 22. - № 7. - C. 865-872.

28. Ширинский В.С. Воспаление и иммунитет: роль в патогенезе остеоартрита/ В.С. Ширинский, Е.В. Казыгашева, И.В. Ширинский // Медицинская иммунология. - 2019. Т. 21. - № 1. - C. 39-48.

29. Яковлев, В.М. Системные дисплазии соединительной ткани: актуальность проблемы в клинике внутренних болезней / В.М. Яковлев, Г.И. Нечаева // Сибирский медицинский журнал. - 2011. - Т. 26. - № 3. - С. 9-13.

30. Äkhtar, N. MicroRNА-27b К^иЫеБ Ше Expression of Matrix Mеtalloprotеinasе 13 in Нитап Ostеoarthritis Chondrocy^s/ N. АШаг, Z. Rashееd, S. Ramamurthy, еt а1. // Ärthritis & Rhеumatism. - 2010. - V. 62. - № 5. - P. 13611371.

31. Allen, K.D. Epidemiology of Osteoarthritis: State of the evidence/ K.D. Allen, Y.M. Golightly, C. Hill, et al.// Curr Opin Rheumatol. - 2015. - V. 27. - № 3. -P. 276-283.

32. Arseni, L. From Structure to Phenotype : Impact of Collagen Alterations on Human Health/ L. Arseni, A. Lombardi, D. Orioli. // International journal of molecular sciences. - 2018. - V.19. - № 5. - C. 1407.

33. Bartel, D.P. MicroRNAs: Genomics , Biogenesis , Mechanism , and Function Genomics : The miRNA Genes/ D.P. Bartel, R. Lee, R. Feinbaum. // cell. -2004. - V. 116. - № 2. - P. 281-297.

34. Berenbaum, F. Deep phenotyping of osteoarthritis: a step forward/ F. Berenbaum. // Ann Rheum Dis. - 2019. - V. 78. - № 1. - P. 3-5.

35. Beyer, C. et al. Signature of circulating microRNAs in osteoarthritis/ C. Beyer, A. Zampetaki, N. Lin, et al. // Ann Rheum Dis. - 2015. - V. 74. - № 3. - P.e18.

36. Bijsterbosch, J. Association study of candidate genes for the progression of hand osteoarthritis/ J. Bijsterbosch, M. Kloppenburg, M. Reijnierse, et al. // Osteoarthr. Cartil. - 2013. - V. 21. - № 4. - P. 565-569.

37. Bomer, N. Translating genomics into mechanisms of disease: Osteoarthritis / N. Bomer. // Best Practice & Research Clinical Rheumatology. - 2016. - V. 2. - № 6. - P. 1-9.

38. Bravata, V. DVWA gene polymorphisms and osteoarthritis/ V. Bravata, L. Minafra, G.I. Forte, et al. // BMC research notes. - 2015. - V. 8. - № 1. - P. 1-9.

39. Buckley, M.G. Mast cell activation in arthritis: detection of alpha- and beta-tryptase, histamine and eosinophil cationic protein in synovial fluid / Buckley M.G., Walters C., Wong W.M., et al.// Clinical Science. - 1997. - V. 93. - P. 363-370.

40. Castano Betancourt, M.C. Genome-wide association and functional studies identify the DOT1L gene to be involved in cartilage thickness and hip osteoarthritis/ M.C. Castano Betancourt, F. Cailotto, H.J. Kerkhof, et al. // Proc. Natl. Acad. Sci. - 2012. - V. 109. - № 21. - P. 8218-8223.

41. Castano-Betancourt, M.C. Novel Genetic Variants for Cartilage Thickness and Hip Osteoarthritis/ M.C. Castano-Betancourt, D.S. Evans, Y.F.M. Ramos, et al. // PLoS genetics. - 2016. - V. 12. - № 10. - P. 1-22.

42. Chapman, K. Valdes, A.M. Genetic factors in OA pathogenesis/ K. Chapman, A.M. Valdes. // Bone. - 2012. - V. 51. - № 2. - P. 258-264.

43. Choi, W. Critical role for arginase II in osteoarthritis pathogenesis/ W. Choi, J. Yang, W. Kim, et al. // Annals of the rheumatic diseases. - 2019. - V. 78. № 3. - P. 421-428.

44. Choi, W. The CH25H-CYP7B1-RORa axis of cholesterol metabolism regulates osteoarthritis./ W. Choi, G. Lee, W. Song, et al. // Nature. - 2019a. - V. 566. P. 254-258.

45. Courties, A. Metabolic syndrome-associated osteoarthritis./ A. Courties, J. Sellam, F. Berenbaum, // Curr. Opin. Rheumatol. - 2017. - V.29. P. 214-222.

46. Day-williams, A.G. A. Variant in MCF2L Is Associated with Osteoarthritis/ A.G. Day-williams, L. Southam, K. Panoutsopoulou, et al. // Am. J. Hum. Genet. - 2011. - V. 89. - № 3. - P. 446-450.

47. de Lange-Brokaar, B.J.E. Characterization of synovial mast cells in knee osteoarthritis : association with clinical parameters/ B.J.E. de Lange-Brokaar, M. Kloppenburg, S.N. Andersen, et al. // Osteoarthritis and cartilage. - 2016. - V. 24. - № 4. - P. 664-671.

48. de Souza, T.B. Association Between the Aggrecan Gene and Rheumatoid Arthritis/ T.B. de Souza, E.F. Mentz, C. V Brenol, et al. // The Journal of rheumatology. -2008. - V. 35. - № 12. - P. 2325-2328.

49. Dean, G. Mast cells in the synovium and synovial fluid in osteoarthrhis. Rheumatology./ G. Dean, J.A. Hoyland, J. Denton et al. // Br J Rheumatol. - 1993. -V. 32. - № 8. - P. 671-675.

50. Dell'Isola, A.D. Identification of clinical phenotypes in knee osteoarthritis: a systematic review of the literature/ A.D. Dell'Isola, R. Allan, S.L. Smith, et al. // BMC Musculoskelet. Disord. - 2016. - V. 17. - № 1. - P. 425.

51. Dell'Isola, A.D., Steultjens, M. Classification of patients with knee osteoarthritis in clinical phenotypes: Data from the osteoarthritis initiative/ A.D. Dell'Isola, M. Steultjens. // PLoS One. - 2018. - V. 13. - № 1. - P. 1-18.

52. Díaz-prado, S. Characterization of microRNA expression profiles in normal and osteoarthritic human chondrocytes/ S. Díaz-prado, C. Cicione, E. Muiños-lópez, et al. // BMC Musculoskeletal Disorders. - 2012. - V. 13. - № 1. - P. 1-14.

53. Doege, K.J. A Human-specific Polymorphism in the Coding Region of the Aggrecan Gene variable number of tandem repeats produce a range of core protein sizes in the general population./ K.J. Doege, S.N. Coulter, L.M. Meek, e al. // The Journal of Biological Chemistry. - 1997. - V. 272. - № 21. - P. 13974-9.

54. Dole, N.S., Delany, A. M. MicroRNA variants as genetic determinants of bone mass/ N.S. Dole, A.M. Delany // Bone. - 2016. - V. 84. - P. 57-68.

55. Enoksson, M. Mast Cells as Sensors of Cell Injury through IL-33 Recognition/ M. Enoksson, K. Lyberg, P.G. Fallon, et al. // J Immunol. - 2011. - V. 186. - № 4. - P. 2523-2558.

56. Evangelou, E. A meta-analysis of genome-wide association studies identifi es novel variants associated with osteoarthritis of the hip/ E. Evangelou, H.J. Kerkhof, U. Styrkarsdottir, et al. // Annals of the rheumatic diseases. - 2014. - V. 73. - № 12. -P. 2130 - 36.

57. Evangelou, E. Large-scale analysis of association between GDF5 and FRZB variants and osteoarthritis of the hip, knee, and hand. Arthritis Rheum./ E. Evangelou, K.Chapman, I. Meulenbelt, et al. // Arthritis Rheum. - 2009. - V. 60. - № 6. -P. 1710-1721.

58. Evangelou, E. The DOT1L rs12982744 polymorphism is associated with osteoarthritis of the hip with genome-wide statistical signi fi cance in males Letters/ E.

Evangelou, A.M. Valdes, M.C. Castano-betancourt, et al.// Ann Rheum Dis. - 2013. -V. 72. - № 7. - P. 1264 - 65.

59. Fan, Q. Microarray study of gene expression profile to identify new candidate genes involved in the molecular mechanism of leptin- induced knee joint osteoarthritis in rat/ Q. Fan, Z. Liu, C. Shen, et al. // Hereditas. - 2018. - V. 155. - № 1. - P. 1-9.

60. Fan, Y. Genome-wide expression and methylation profiling reveal candidate genes in osteoarthritis./ Y. Fan, J. Chen, Y. Yang, et al. // Clinical and Experimental Rheumatology. - 2017. - V. 35. - № 6. - P. 983-990.

61. Galli, S.J. Tsai M. IgE and mast cells in allergic disease./ S.J. Galli, M. Tsai. // Nature Medicine. - 2012. - V. 18. - P. 693-704.

62. Gaudenzio, N. Different activation signals induce distinct mast cell degranulation strategies./ N. Gaudenzio, R. Sibilano, T. Marichal, et al.// Journal of Clinical Investigation. - 2016. - V. 126. - № 10. - P. 3981-3998.

63. Gibson, B.G., Briggs, M.D. The aggrecanopathies ; an evolving phenotypic spectrum of human genetic skeletal diseases/ B.G. Gibson, M.D. Briggs. // Orphanet J. Rare Dis. - 2016. - V. 11. - № 1. - P. 86.

64. Goedeke, L. Fernandez-Hernando, C. Regulation of cholesterol homeostasis./ L. Goedeke, C. Fernandez-Hernando. // Cell. Mol. Life Sci. - 2012. - V. 69. - № 6. - P. 915-930.

65. Gregory, J.S. Early identification of radiographic osteoarthritis of the hip using an active shape model to quantify changes in bone morphometric features: can hip shape tell us anything about the progression of osteoarthritis?/ J.S. Gregory, J.H. Waarsing, J. Day, et al. // Arthritis Rheum. - 2007. - V. 56. №. 11. - P. - 3634e43.

66. Gu, J. Aggrecan variable number of tandem repeat polymorphism and lumbar disc degeneration: a meta-analysis/ Gu, J., Guan, F., Guan, G. et al. // Spine. -2013. - V. 38. - № 25. - P. 1600-1607.

67. Gu, J. Association of ADAMTS5 gene polymorphisms with Osteoarthritis in Chinese Han population : a community-based case - control study/ J. Gu, J. Rong, F. Guan. // Rheumatology international. - 2013. - V. 1. - P. 2893-2897.

68. Hardcastle, S.A. Osteoarthritis and bone mineral density: are strong bones bad for joints? / S.A. Hardcastle, P. Dieppe, C.L. Gregson, et al. // Bone key Rep. -2015. - V. 4. - P. 624.

69. Haugen, I.K. Prevalence, incidence and progression of hand osteoarthritis in the general population: the Framingham Osteoarthritis Study./ I.K. Haugen, M. Englund, P. Aliabadi, et al. // Ann Rheum Dis. - 2011. - V. 70. - № 9. - P. 1581-6.

70. He, Q.Q. Zhang J. Prevalence of osteoarthritis and association between smoking patterns and osteoarthritis in China: a cross-sectional study/ Q.Q. He, J. Zhang. // Frontiers of Nursing. - 2018. - V. 5. - № 2. - P.111-118.

71. Higgins, J.P.T., Thompson, S.G. Quantifying heterogeneity in a meta-analysis/ J.P.T. Higgins, S.G. Thompson. // Statistics in medicine. - 2002. - V.21. - № 11. P.1539-58.

72. Hong, Z.L., Wang, Z.G. MiRNA-140 is a negative feedback regulator of MMP-13 in IL-1 b -stimulated human articular chondrocyte C28 / I2 cells/ Z.L. Hong, Z.G. Wang. // Inflammation research. - 2012. - V. 61. - №. 5. - P. 503-509.

73. Horton, Jr W.E. An association between an aggrecan polymorphic allele and bilateral hand osteoarthritis in elderly white men: data from the Baltimore Longitudinal Study of Aging (BLSA)./ Jr W.E. Horton, M. Lethbridge-Cejku, M.C. Hochberg, et al. // Osteoarthritis Cartilage. - 1998. - V. 6. - № 4. - P. 245-51.

74. Hunter, D.J., Bierma-Zeinstra, S. Seminar Osteoarthritis/ D.J. Hunter, S. Bierma-zeinstra. // Lancet. - 2019. - V. 393. - P. 1745-59/

75. Iliopoulos, D. Integrative microRNA and proteomic approaches identify novel osteoarthritis genes and their collaborative metabolic and inflammatory networks. / D. Iliopoulos, K.N. Malizos, P. Oikonomou, et al.// PLoS One. - 2008. -V. 3. - № 11. - P.3740.

76. Jones, S.W. The identification of differentially expressed microRNA in osteoarthritic tissue that modulate the production of TNF-alpha and MMP13 / S.W. Jones, G. Watkins, N.L. Good, et al. // Osteoarthritis and Cartilage. - 2009. - V. 17. -№ 4. - P. 464-472.

77. Kämäräinen, O. P. Aggrecan core protein of a certain length is protective against hand osteoarthritis/ O.P. Kämärämen, S. Solovieva, T. Vehmas, et al. // Osteoarthritis and cartilage. - 2006. - V. 14. - № 10. - P. 1075-1080.

78. Kellgren, J.H., Lawrence J.S. Radiological assessment of osteoarthrosis./ J.H. Kellgren, J.S. Lawrence. // Ann Rheum Dis. - 1957. - V. 16. - № 4. - P. 494-502.

79. Kim, C. Prevalence of Radiographic and Symptomatic Hip Osteoarthritis in an Urban United States Community: The Framingham Osteoarthritis Study / C. Kim, K.D. Linsenmeyer, S.C. Vlad, et al. // Arthritis & Rheumatology. - 2014. - V. 66. - № 11. - P. - 3013-7.

80. Kirk, K.M. Osteoarthritis of the Hands, Hips and Knees in an Australian Twin Sample — Evidence of Association with the Aggrecan VNTR Polymorphism./ K.M. Kirk, K.J. Doege, J.Hecht et al. // Twin Res. - 2003. - V. 6. - № 1. - P. 62-6.

81. Kraus, V.B. Direct in vivo evidence of activated macrophages in human osteoarthritis./ V.B. Kraus, G. Mcdaniel, J.L. Huebner, et al. // Osteoarthritis Cartilage. - 2017. - V. 24. - № 9. - P. 1613-1621.

82. Lawrence, R.C. Estimates of the prevalence of arthritis and other rheumatic conditions in the United States./ R.C. Lawrence, D.T. Felson, C.G. Helmick, et al. PartII. Arthritis Rheum. // Arthritis & Rheumatism. - 2008. - V. 58. - № 1. - P. 26-35.

83. Le, L.T.T. The microRNA-29 family in cartilage homeostasis and osteoarthritis/ L.T.T. Le, T.E. Swingler, N. Crowe, et al. // J. Mol. Med. - 2016. - V. 94. - № 5. - P. 583-596.

84. Lee, H. Activation of Human Synovial Mast Cells From Rheumatoid Arthritis or Osteoarthritis Patients in Response to Aggregated IgG Through Fc Receptor

I and Fc Receptor II/ H. Lee, J. Kashiwakura, A. Matsuda, et al. // Arthritis & Rheumatism. - 2013. - V. 65. - № 1. - P. 109-119.

85. Leyland, K.M. The Natural History of Radiographic Knee Osteoarthritis A Fourteen-Year Population-Based Cohort Study/ K.M. Leyland, D.J. Hart, M.K. Javaid, et al. // Arthritis Rheum. - 2015. - V. 64. - № 7. - P. 2243-2251.

86. Li, J. miR-146a , an IL-1 b responsive miRNA , induces vascular endothelial growth factor and chondrocyte apoptosis by targeting Smad4/ J. Li, J. Huang, L. Dai, et al. // Arthritis Res. Ther. - 2012. - V. 14. - № 2. - P. R75.

87. Liang, Y. Prevalence of osteoarthritis in high altitude area of Tibet/ Y. Liang, Y. Mei, S. Guan, et al. // Annals of the Rheumatic. Diseases. - 2018. - V. 29. -№ 1. - P. S222.

88. Liu, B. Common variants in the GNL3 contribute to the increasing risk of knee osteoarthritis in Han Chinese population/ B. Liu, H. Cheng, W. Ma, et al. // Sci. Rep. - 2018. - № 8. - P. 1-7.

89. Liu-Bryan, R.. Terkeltaub R.. Emerging regulators of the inflammatory process in osteoarthritis / R. Liu-Bryan, R. Terkeltaub // Nat Rev Rheumatol. - 2015. -V. 11. - № 1. - P. 35-44.

90. Lu, J. MicroRNA-218-5p as a Potential Target for the Treatment of Human Osteoarthritis/ J. Lu, M. Ji, X. Zhang, et al. // Mol Ther. - 2017. - V. 25. - № 12. - P. 2676-2688.

91. Ludin, A. Injection of vascular endothelial growth factor into knee joints induces osteoarthritis in mice./ A. Ludin, J.J. Sela, A. Schroeder, et al. // Osteoarthritis and Cartilage. - 2013. - V. 21. - № 3. - P. 491-497

92. Lynch, J.A. Analysis of texture in macroradiographs of osteoarthritic knees, using the fractal signature/ J.A. Lynch, D.J. Hawkes, J.C. Buckland-Wright. // Physics in Medicine & Biology. - 1991. - V. 36. - № 6. - P. 709.

93. Mathew C.G.P. The Isolation of High Molecular Weight Eukaryotic DNA / C.G.P. Mathew, I.A. Pichel, J.P. Flórez Muñoz et al. // Methods Mol. Biol. - 1984. -Vol. 2. - P. 31-34.

94. Matsukawa, T. MicroRNA-125b regulates the expression of aggrecanase-1 (ADAMTS-4) in human osteoarthritic chondrocytes./ T. Matsukawa, T. Sakai, T. Yonezawa, et al. // Arthritis Res Ther. - 2013. - V.15. - № 1. - P.1-11.

95. Meulenbelt, I. Identification of DIO2 as a new susceptibility locus for symptomatic osteoarthritis/ I. Meulenbelt, J.L. Min, S. Bos, et al. // Human molecular genetics. - 2008. - V. 17. - № 12. - P. 1867-1875.

96. Meulenbelt, I. Large replication study and meta-analyses of DVWA as an osteoarthritis susceptibility locus in European and Asian populations/ I. Meulenbelt, K. Chapman, R. Dieguez-gonzalez, et al. // Human molecular genetics. - 2009. - V. 18. -№ 8. - P. 1518-1523.

97. Migliore, A., Is osteoarthritis a gender-specific disease?/ A. Migliore, G. Picarelli. // Italian Journal of Gender-Specific Medicine. - 2018. - V. 4. - №1. - P. 1320.

98. Mirzamohammadi, F., Papaioannou, G. microRNAs in Cartilage Development , Homeostasis , and Disease/ F. Mirzamohammadi, G. Papaioannou. // Current osteoporosis reports. - 2014. - V. 2. - P. 410-419.

99. Miyaki, S. MicroRNA-140 is expressed in differentiated human articular chondrocytes and modulates interleukin-1 responses/ S. Miyaki, T. Nakasa, S. Otsuki, et al. // Arthritis Rheum. - 2009. - V.60. - № 9. - P. 2723-2730.

100. Miyamoto, Y. Common variants in DVWA on chromosome 3p24.3 are associated with susceptibility to knee osteoarthritis/ Y. Miyamoto, D. Shi, M. Nakajima, et al. // Nat. Genet. - 2008. - V. 40. - № 8. - P. 994-998.

101. Mobasheri, A. The role of metabolism in the pathogenesis of osteoarthritis./ A. Mobasheri, // Nat. Rev. Rheumatol. - 2017. - № 13. - P. 302-311

102. Murphy, L.B. One in four people may develop symptomatic hip osteoarthritis in his orher life time/ L.B. Murphy, C.G. Helmick, T.A. Schwartz, et al. // Osteoarthritis Cartilage. - 2010. - № 18. - P. 1372-9.

103. Nakajima, M. New sequence variants in HLA class II/III region associated with susceptibility to knee osteoarthritis identified by genome-wide association study / M. Nakajima, A. Takahashi, I. Kou, et al // PLoS One. - 2010. - V. 5. - № 3. - P. 9723.

104. Nakamura, Y. Chondrocyte-specific microRNA-140 regulates endochondral bone development and targets Dnpep to modulate bone morphogenetic protein signaling / Y. Nakamura, J.B. Inloes, T. Katagiri, et al. // Mol Cell Biol. - 2011. - V. 31. - № 14. - P. 3019-3028.

105. Nelson, A.E. Differences in multijoint radiographic osteoarthritis phenotypes among African Americans and Caucasians: The Johnston County Osteoarthritis Project/ A.E. Nelson, J.B. Renner, T.A. Schwartz, et al. // Arthritis & Rheumatism. - 2011. - V. 63. - № 12. - P. 3843-3852.

106. Nelson, A.E. Osteoarthritis year in review 2017 : clinical/ A.E. Nelson. // Osteoarthritis and cartilage. - 2019. - V. 26. - № 3. - P. 319-325.

107. Neogi, T. The epidemiology and impact of pain in osteoarthritis/ T. Neogi. // Osteoarthritis and Cartilage. - 2013. - V. 21. - № 9. - P. 1145-1153.

108. Nishimura, R. Regulation of Cartilage Development and Diseases by Transcription Factors./ R. Nishimura, K. Hata, Y. Takahata, et al. // J Bone Metab. -2017. - V. 24. - № 3. - P. 147-153.

109. Nugent, M. MicroRNAs: exploring new horizons in osteoarthritis/ M. Nugent // Osteoarthritis Cartilage. - 2016. - V.24. - № 4. - P.573-80.

110. O'Neill, T.W. Update on the epidemiology, risk factors and disease outcomes of osteoarthritis/ T.W. O'Neill, P.S. McCabe, J. McBeth. // Best Pract. Res. Clin. Rheumatol. - 2018. - V. 32. - № 2. - P. 312-326.

111. Panoutsopoulou, K. Insights into the genetic architecture of osteoarthritis from stage 1 of the arcOGEN study/ K. Panoutsopoulou, L. Southam, K.S. Elliott, et al. // Ann Rheum Dis. - 2011. - V.70. - № 5. - P. 864-867.

112. Panoutsopoulou, K., Zeggini, E. Advances in osteoarthritis genetics/ K. Panoutsopoulou, E. Zeggini. // Journal of medical genetics. - 2013. - V.50. - № 11. -P. 715-724.

113. Park, S.J. MicroRNA-558 regulates the expression of cyclooxygenase-2 and IL-1b-induced catabolic effects in human articular chondrocytes/ S.J. Park, E.J. Cheon, H.A. Kim. // Osteoarthritis and Cartilage. - 2013. - V. 21. - № 7. - P. 981-989.

114. Peat, G. Knee pain and osteoarthritis in older adults: a review of community burden and current use of primary health care/ G. Peat, R. McCarney, P. Croft // Ann Rheum Dis. 2001. - V. 60. - № 2. - P.91e7/

115. Perera, R.S., Single Nucleotide Variants of Candidate Genes in Aggrecan Metabolic Pathway Are Associated with Lumbar Disc Degeneration and Modic Changes./ R.S. Perera, P.H. Dissanayake, U. Senarath, et al. // PLoS One. 2017. - V. 12. - № 1. - P. e0169835.

116. Rahman M.M. Osteoarthritis incidence and trends in administrative health records from British Columbia, Canada/ M.M. Rahman //The Journal of rheumatology. - 2014. - V. 41. - № 6. - P. 1147-1154.

117. Raghu, H. CCL2/CCR2, but not CCL5/CCR5, mediates monocyte recruitment, inflammation and cartilage destruction in osteoarthritis/ H. Raghu, C.M. Lepus, Q. Wang, et al. // Ann Rheum Dis. - 2017. - V. 76. - № 5. - P.914-922.

118. Ratnayake, M. Human Chondrocytes Respond Discordantly to the Protein Encoded by the Osteoarthritis Susceptibility/ M. Ratnayake, F. Ploger, M. Santibanez-Koref, et al. // PLoS One. - 2014. - V. 9. - № 1. - P. e86590.

119. Remst, D.F.G. Gene expression analysis of murine and human osteoarthritis synovium reveals elevation of transforming growth factor p-responsive

genes in osteoarthritis-related fibrosis / D.F.G. Remst, A.B. Blom, E.L. Vitters, et al. // Arthritis Rheumatol. - 2014. - V. 66. - № 3. - P. 647-656.

120. Reynard, L.N. Functional characterization of the osteoarthritis susceptibility mapping to CHST11—A bioinformatics and molecular study/ L.N. Reynard, M. Ratnayake, M. Santibanez-Koref, et al. //PloS one. - 2016. - V. 11. - № 7. - P. e0159024.

121. Reynard, L.N., Loughlin, J. The genetics and functional analysis of primary osteoarthritis susceptibility / L.N. Reynard, J. Loughlin. // Expert reviews in molecular medicine. - 2013. - V. 15. - № 2. - P. 1-16.

122. Rodriguez, E. The glycosaminoglycan attachment regions of human aggrecan./ E. Rodriguez, S.K. Roland, A. Plaas, et al. // J. Biol. Chem. - 2006. - V. 281. - № 27. P. 18444-50.

123. Rodriguez-Fontenla, C. Assessment of osteoarthritis candidate genes in a meta-analysis of nine genome-wide association studies/ C. Rodriguez-Fontenla, M. Calaza, E. Evangelou, et al. // Arthritis Rheumatol. - 2014. - V. 66. - № 4. - P. 940949.

124. Rodriguez-Lopez, J. Genetic variation including nonsynonymous polymorphisms of a major aggrecanase, ADAMTS-5, in susceptibility to osteoarthritis/ J. Rodriguez-Lopez, Z. Mustafa, M. Pombo-Suarez, et al. //Arthritis & Rheumatism: Official Journal of the American College of Rheumatology. - 2008. - V. 58. - № 2. -P. 435-441.

125. Roughley, P. The involvement of aggrecan polymorphism in degeneration of human intervertebral disc and articular cartilage/ P. Roughley, D. Martens, J. Rantakokko, et al. // Eur. Cell Mater. - 2006. - V. 11. - № 1. - P. 1-7.

126. Sharma L. Varus and valgus alignment and incident and progressive knee osteoarthritis./ L. Sharma, J. Song, D. Dunlop, et al.// Ann Rheum Dis. - 2010. - V. 69. - № 11. - P. 1940e5.

127. Shepherd, C. Functional Characterization of the Osteoarthritis Genetic Risk Residing at ALDH1A2 Identifies rs12915901 as a Key Target Variant/ C. Shepherd, D. Zhu, A.J. Skelton, et al. // Arthritis Rheumatol. - 2018. - V. 70. - № 10.

- Р. 1577-1587.

128. Shi, D. Association of single-nucleotide polymorphisms in HLA class II / III region with knee osteoarthritis/ D. Shi, Q. Zheng, D. Chen, et al. // Osteoarthritis and cartilage. - 2010 - V. 18. - № 11. - P. 1454-1457.

129. Silverwood, V. Current evidence on risk factors for knee osteoarthritis in older adults: a systematic review and meta-analysis./ Silverwood, V. Blagojevic-Bucknall M, Jinks C, et al. // Osteoarthritis Cartilage. - 2015. - V. 23. - № 4. - Р. -507e15.

130. Sniekers, Y. H. A role for subchondral bone changes in the process of osteoarthri- tis; a micro-CT study of two canine models/Y.H. Sniekers, F. Intema, F. Lafeber et al. // BMC Musculoskeletal Disorders. — 2008. — V. 9. - № 1. — P. 20.

131. Song, D. Combined bioinformatics analysis reveals gene expression and DNA methylation patterns in osteoarthritis/ D. Song, W. Qi, M. Lv, et al. // Mol Med Rep. - 2018. - V. 17. - № 6. - Р. 8069-8078.

132. Soria-valles, C. Reprogramming aging through DOT1L inhibition/ C. Soria-valles, F.G. Osorio, L. Carlos. // Cell Cycle. - 2015. - V. 14. - № 21. - P. 33453346.

133. Stefanson, Е. Genomewide Scan for Hand Osteoarthritis: A Novel Mutation in Matrilin-3/ Е. Stefa, H. Jo, T. Ingvarsson, et al. // Am J Hum Genet. - 2003.

- V. 72. - № 6. - P. 1448-1459.

134. Stempel, J. Development of articular cartilage and the metaphyseal growth plate: the localization of TRAP cells, VEGF, and endostatin / J. Stempel, H. Fritsch, K. Pfaller, et al. // J Anat. - 2011. - V. 218. - № 6. - Р. 608-18.

135. Styrkarsdottir, U. Severe osteoarthritis of the hand associates with common variants within the ALDH1A2 gene and with rare variants at 1p31/ U.

Styrkarsdottir, G. Thorleifsson, H.T. Helgadottir, et al. // Nat. Genet. - 2014. - V. 46. -№ 5. - P. 498-502.

136. Terjesen T. Residual hip dysplasia as a risk factor for osteoarthritis in 45 years follow-up of late-detected hip dislocation./ T. Terjesen // J Child Orthop. - 2011.

- V. 5. - № 6. P. 425e31.

137. Turkiewicz, A. Current and future impact of osteoarthritis on health care : a population-based study with projections to year 2032/ Turkiewicz A., Petersson I.F., Bjork J., et al. // Osteoarthritis and Cartilage. - 2014 - V. 22. - № 11. - P. 1826-1832.

138. Valdes, AM, Spector TD. Genetic epidemiology of hip and knee osteoarthritis./ A.M. Valdes, T.D. Spector. // Nat Rev Rheumatol. - 2011. - V.7 - №. 1. - P. 23e32.

139. Valdes, A.M. Genome-wide association scan identifies a prostaglandin-endoperoxide synthase 2 variant involved in risk of knee osteoarthritis. / A.M. Valdes, J. Loughlin, K.M. Timms, et al. // Am J Hum Genet. - 2008. - V. 82. - № 6. - P. 123140.

140. Van Saase, J.L. Epidemiology of osteoarthritis: Zoetermeer survey. Comparison of radiological osteoarthritis in a Dutch population with that in 10 other populations/ J.L. Van Saase. //Annals of the rheumatic diseases. - 1989. - V. 48. - №. 4. - P. 271-280.

141. Verma, P., Dalal, K. ADAMTS-4 and ADAMTS-5: key enzymes in osteoarthritis/ P. Verma, K. Dalal. // Journal of cellular biochemistry. - 2011. - V. 112.

- № 12. - P. 3507-3514.

142. Vieira, A.R. Interferon Regulatory Factor 6 (IRF6) and Fibroblast Growth Factor Receptor 1 (FGFR1) Contribute to Human Tooth Agenesis/ A.R. Vieira, A. Modesto, R. Meira, et al. // Am. J. Med. Genet. Part A. - 2007. - V. 143. - № 6. - P. 538-545.

143. Vonk, L.A. Overexpression of hsa-miR-148a promotes cartilage production and inhibits cartilage degradation by osteoarthritic chondrocytes./ L.A.

Vonk, A.H. Krаgtеn, W.J. Dhегt, еt а1. // Ostеoагthгitis end Cагtilаgе. - 2014. - V. 22. - № 1. - P. 145-53.

144. Wаllаcе, I.J. ^ее ostеoагthritis hаs doublеd in prеvаlеncе sincе thе mid-20th cеntury/ I.J. Wаllаcе, S. Worthington, D.T. Fеlson, еt а1. // Proc Nаtl Acаd Sci U S A. - 2017. - V. 114. - № 35. - P. 9332-933б.

145. Wаng, J.H. Histo^ dеаcеtylаsе inhibitor incгеаsе micгoRNA-14ба еxpгеssion аМ еппа^е nеgаtivе геgulаtion of intегlеukin-1bеtа sigmling in ostеoагthritis fibгoblаst-likе synoviocytеs./ J.H. Wаng, K.S. Shih, Y.W. Wu, еt а1. // Ostеoагthritis а^ Cагtilаgе. 2013. - V. 21. - № 12. - P.1987-1996.

146. Wаng, Q. IgE-mеdiаtеd mаst cеll аctivаtion pгomotеs inflаmшаtion end cагtilаgе dеstгuction in ostеoагthгitis/ Q. Wаng, C.M. Lеpus, H. RAghu, еt а1.// еLifе. -2019а. - V. 8. - P. е39905.

147. Wаng, T. Singte nuclеotidе polymoгphisms аnd ostеoаrthritis аn ovегviеw аnd а mеtа-аnаlysis/ T. Wаng, Y. Liаng, H. Li, еt а1. // Mеdicinе. - 2016. - V. 95. - № 7. - P. е2811.

148. Wаng, Y. Thе gеnеtic геlаtionship of SOX9 polymoгphisms with ostеoагthritis гisk in Chinеsе poputetion./ Y. Wаng, X Zhаng, X Niu, еt а1. // Mеdicinе (Bаltimoге). - 2019. - V. 98. - № 8. - P. е14096.

149. Wаrnеr, S.C., Vаldеs, A.M. Thе Gеnеtics of Ostеoаrthritis: A Rеviеw./ S.C. Wаrnеr , A.M. Vаldеs. // J. Funct. Morphol. Kinеsiol. - 2016. - V. 1. - № 1. - P. 140-153.

150. Xiе, J. Clin^l implorions of mаcrophаgе dysfunction in thе dеvеlopmеnt of ostеoагthritis of thе Ьпее./ J. Xiе, Z. Huаng, X. Yu, еt а1. // C^oki^ Growth Fаctoг Rеv. - 2019. - № 4. - P. 36-44.

151. Xiе, P. Associаtion of COL1A1 polymorphisms with ostеoporosis: а mеtа-аnаlysis of clinicаl studiеs./ P. Xiе, B. Liu, L. Zhаng, еt а1. // Int. J. Clin. Exp. Mеd. -2015. - V. 8. - № 9. - P.14764-14781.

152. Yang, C.Y. AD AMTS and ADAM metalloproteinases in osteoarthritis-looking beyond the 'usual suspects' / C.Y. Yang, A. Chanalaris, L. Troeberg // Osteoarthritis and cartilage. - 2017. - V. 25. - № 7. - P. 1000-1009.

153. Yang, H. Y. SMAD3 gene rs12901499 polymorphism increased the risk of osteoarthritis //Bioscience reports. - 2018. - V. 38. - № 3. - P.1-10.

154. Yu Y. Non-IgE mediated mast cell activation./ Y. Yu, B.R. Blokhuis, J. Garssen, et al. // European Journal of Pharmacology. - 2016. - V.778. - №2 5. P. 33-43.

155. Zamri, N.A.A. Prevalence, Risk Factors and Primary Prevention of Osteoarthritisin Asia: AScoping Review./ N.A.A. Zamri, S. Harith, N.A.M. Yusoff, et al. // Elderly Health Journal. - 2019. - V. 5. - № 1. - P.19-31.

156. Zeggini, E. Identification of new susceptibility loci for osteoarthritis (arcOGEN): a genome-wide association study./ E. Zeggini, K. Panoutsopoulou, L. Southam, et al. // Lancet. - 2012. - V. 380. - № 9844. - P. 815-823.

157. Zeng, Q.Y. Research article Rheumatic Diseases in China/ Q.Y. Zeng, R. Chen, J. Darmawan, et al. // Arthritis Research & Therapy. - 2008. - V. 10. - № 1. - P. 1-11.

158. Zhang, X. miR-146a facilitates osteoarthritis by regulating cartilage homeostasis via targeting Camk2d and Ppp3r2. / X. Zhang, C. Wang, J. Zhao, et al. // Cell Death. - 2017. - V.8. - № 4. - P.2734.

159. Zhang, Y. MicroRNA-21 controls the development of osteoarthritis by targeting GDF-5 in chondrocytes./ Y. Zhang, J. Jia, S. Yang, et al. // Exp Mol Med. 2014. - V. 28. - № 2. - P.e79.

160. Zhang, Y. Prevalence of symptomatic hand osteoarthritis and its impact on functional status among elderly: the Framingham Study/ Y. Zhang, J. Niu, M. Kelly-Hayes, et al. Am J Epidemiol. - 2002. - V. 156. - №. 11. - P. 1021 - 7.

161. Zhou, X. Genetic variation of aggrecanase-2 (ADAMTS5) in susceptibility to osteoarthritis./ X. Zhou, L. Jiang, Y. Zhang, et al. // Braz J Med Biol Res. - 2019. - V.52. - № 2. - P.e8109.

ПРИЛОЖЕНИЯ

Приложение А

Электрофореграммы генотипирования полиморфных вариантов исследованных кандидатных генов

Рисунок А1. Рестрикционный анализ полиморфного варианта тб2830585

(с.18410>А) гена АВАМГБ5

Рисунок А2. Рестрикционный анализ полиморфного варианта тб226794

(с.2075Т>С) гена АВАМГБ5

Рисунок А3. Электрофореграмма ПЦР анализа полиморфного варианта УЫТЯ

гена АСАМ

3.75 ■ 3.50 3.25 ■ 3.00 ■ 2.75 ■ • •• • •

А11е1е 2 РАМ (-)

1.50 ■ 1.25 • 1.00 ■ 0.75 ■ 0.50 0.25 • 0.00 • .........:........[.............[........:........]........] * •

0 1.0 0.1 0.2 0.3 0.4 0.5 0.6 0. 7 0.3 0.9 1.0 1.1 1.2 АИе1е 1 У1С (-) 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 2.0

Рисунок А4. Аллельная дискриминация КАБР

Приложение Б

Результаты распределения частот аллелей и генотипов полиморфных локусов

генов-кандидатов развития остеоартрита

Таблица Б1 - Последовательности праймеров и методы детекции исследованных полиморфных локусов

Локус (Ген) Последовательность праймеров (5'-3'), длина фрагмента, 1° отжига. Метод детекции Ссылка

Гены-кандидаты развития остеоартрита

VNTR (АСAN) 5'-ТАОАОООСТСТОССТСТООАОТТО- 3' 5'-АООТССССТАССОСАОАООТАОАА- 3' 1° отжига праймеров: 58 °С, длина ПЦР продукта варьировала от 1143-177° п.о. 6% ПААГ Doege K.J., 1997

rs226794 (ADAMTS5) 5'-ТССТССАСАТАСТССОСАСТ-3' 5-САААА ТСТОСТТТСТООСАА Т-3' 1° отжига праймеров: 59 °С Длина фрагмента - 33° п.н. ПЦР/ ПДРФ MbiI (BsrBI) Jiaao Gu., 2013

rs2830585 (ADAMTS5) 5'-ОССТООАСААСАОТОТОАОА-3' 5'-ООАОТОСАОТТТОССТАТСО-3' 1° отжига праймеров: 65°С Длина фрагмента - 31° п.н. ПЦР/ ПДРФ BsuRI (HAEIII) Jiaao Gu., 2013

rs1042667 (SOX9) Праймеры: ¥3, ССА ОАА СТССА ОСТССТА Ш, СТООТТООТССТСТСТТТС Зонды: ЕАМ-аавввСваАваТввс-ВНО-1 У1С-аавввСваСваТввс-ВН0-2 1° отжига праймеров: 62°С TaqMan ПЦР Собствeннaя pa3pa6oTKa

rs2229989 (SOX9) Праймеры: ¥3:ОААСОАОАОСОАОААОСО Ю:ООА О А ТОТОСОТСТОСТС Зонды: БАМ-авааСваСсаТссвва-ВНО-1 У1С-авааОваСсаСссвва-ВН0-2 1° отжига праймеров: 64°С TaqMan ПЦР Собствeннaя pa3pa6oTKa

га7217932 (SOX9) Праймеры: FJ: ААGGCTTАTTАTАTGTTАGАА ЕЛ: GTCCААGTTGАTTTTTTC Зонды: FАM-cаgCаctTcttGtаgа-BHQ-1 VIC-cаgCаctCcttGtаgа-BHQ-2 ^ отжига праймеров: 560С TаqMаn ПЦР Собственная разработка

6539153 (стт) Праймеры: FJ: CCААCTCCАTGАTCTCTG ЕЛ: TGАCCTCTCАCCTCАTАG Зонды: F АM-tcаgааGtcTааTtccctgt-BHQ-1 VIC-tcаgааGtcCааTtccctgt-BHQ-2 ^ отжига праймеров: 600C TаqMаn ПЦР Собственная разработка

т1107946 (COL1А1) GTCАGTTCCААGАGА[А/C]CCCCTCCC TААTАGG KАSPTM Собственная разработка

^1800012 (COL1А1) CCTGCCCАGGGАА TG[G/T]GGGCGGG АTGАGGGC KАSPTM Собственная разработка

Репликация полногеномного анализа ассоциаций GWАS

Ш836732 ^N2) GАGАGАCАGCАCCTА[C/T]TTTCTGАG GTCTААG KАSPTM Собственная разработка

^7639618 фША) CАTTGАCCCCTАCCА[C/T]АTААCАCАА CААCTC KАSPTM Собственная разработка

^11842874 (MCF2L) TААTGTАTGGTGАCА[А/G]GАGTCGGG АTGGGGC KАSPTM Собственная разработка

ш6976 (GLT8D1) ААCTGTTАCTTCCCА[C/T]GCАTGCTАT KАSPTM Собственная разработка

^2302061 (DOT1L) GCCCGGGАCCGCGАG[C/G]TCGАCCT CААGААTG KАSPTM Собственная разработка

^12982744 (DOT1L) TCGGCTGTGGGCАCC[C/G]GАCАTGT GGCTGGCG KАSPTM Собственная разработка

ш3204689 (АLDH1А) GGАGCTGGTАCАCTА[C/G]АGАTGTАG TААGААC KАSPTM Собственная разработка

^11177 GGCTTCTTGTGАCCC[C/T]GCTTTTTАG KАSPTM Собственная разработка

^9350591 ^ШР1/ SЕNP6) GTTGАCААCАTGААC[C/T]GGАGАCАА GАААTАА KАSPTM Собственная разработка

^6094710 GGGCTGTCTGCАCGT[А/G]CААTGTGT TTАTTGG KАSPTM Собственная разработка

го835487 (СНБТП) Праймеры: ¥3, О А СТСТОТСТОСА ТС А С А Е3, ООТСААСТООААТОТТСТО Зонды: ЕАМ-с§ШАа১Тасс1Сс1а«-ВН0-1 У1С-свШАааввСасс1Ша«-ВН0-2 1° отжига праймеров: 600С ТадМап ПЦР Собственная разработка

Полиморфные локусы сайтов связывания микроРНК

го9978597 (АБАМТ85) ТА ТТТОА ОООААА СА[О/Т]ОАА ТС А ТТО АТАААС КАБР™ Собственная разработка

™229069 (АБАМТБ5) АААААТСТОТТАТАС[С/О]ТАСТТАООТ ТТАТТА КАБР™ Собственная разработка

^229077 (АБАМТ85) АТААОСАААСАСААА[С/Т]ОСАТТТТАА АООСТТ КАБРТМ Собственная разработка

га1042673 (80X9) ТТООТАА ОСТТТА ТС[А/О]ТА ТА ТА ТА ТТ ТТТТА КАБРТМ Собственная разработка

га13317 ¥О¥Е1) ТОСАСТТАОААОСАС[С/Т]ООСААААС САТОССС КАБРТМ Собственная разработка

к4647940 ¥О¥ЕЕ1) АОТООСТСА ТССССА[С/О]ТОСА ТТСТ СССССТО КАБРТМ Собственная разработка

^9659030 (С0Ы1А1) АТОАСТТААААСААА[С/Т]АСТСТТААТ ААСАОТ КАБРТМ Собственная разработка

га3128575 (С0Ы0А1) А ТТТА ТТОАААААСТ[А/О]ТТАСА ОТТАА ТТАТТ КАБРТМ Собственная разработка

га1061947 (С0ЫА1) ТОССОСАОООСТООО[С/Т]ОООАОАО АСТОТТСТ КАБРТМ Собственная разработка

ю1061237 (С0ЫА1) ССАААСТОААССССС[А/С/Т]СААААОС СААААААТ КАБРТМ Собственная разработка

ю73611720 (ОБ¥5) ООАОАОТССАОАООС[О/Т]ОАОААОО СССАООТО КАБРТМ Собственная разработка

ю11540149 (УБЕ) ТОСТСТТСА ОТОООА[А/О]ААААСАСТ ТОТААОТ КАБРТМ Собственная разработка

к9509 (ММР9) СТСТСТТСТСАССТТ[С/Т]ОТТТТТТОТТ ООАОТ КАБРТМ Собственная разработка

га1042840 (ММР13) А ТТА ТТТАА ТТОТСС[А/О]ОТТТОТСТТ ООАТАТ КАБРТМ Собственная разработка

ш5854 (ММР1) ТОСАААОАТСТТТТС[С/Т]АОАОТАТОС ААСТСТ КАБРТМ Собственная разработка

к470215 (ММР1) ООТОТОА ОТССААА О[А/С/О/Т]А ООТО ТТТТССТОАА КАБРТМ Собственная разработка

т2239008 (ММР1) CTGАGААААTАGАCА[А/G]TTCTTCАG GААААCА KАSPTM Собственная разработка

2463018 ^тт) TАCCААGАTGCTGАT[А/G]GTCTTTCАG CCTCTG KАSPTM Собственная разработка

^1057972 (Ш5) TGGTАGGCTCCTGCC[А/T]GTGTGGАА CCАCTGА KАSPTM Собственная разработка

^6854081 (FGF2) GCTGCTTTАTАGTTC[G/T]CTGGCTААT GCАGCА KАSPTM Собственная разработка

^10793442 (1Ш239) CCАGАGTTTCААTTT[А/C]TCАGАGААT GTGААC KАSPTM Собственная разработка

ш1054204 (SPАЕC) АGАTTCTGGGGCTGT[C/G]TTАTGААА АTАTАGА KАSPTM Собственная разработка

Примечание: T отжига праймеров для локусов, генотипированных с использованием технологии KАSPTTM: 61-550C

локуса га226794 гена АDАMTS5

Группы сравнения п Частоты аллелей Частоты генотипов

317 G А GG GА АА

Контроль 161 276 (0,857) 46 (0,143) 116 (0,72) 44 (0,273) 1 (0,007)

Полиартроз 38 62 (0,816) 14 (0,184) 25 (0,658) 12 (0,316) 1 (0,026)

Гонартроз 81 132 (0,815) 30 (0,185) 52 (0,642) 28 (0,346) 1 (0,012)

Коксартроз 37 66 (0,892) 8 (0,108) 30 (0,81) 6 (0,163) 1 (0,027)

ОА в целом 156 260 (0,833) 52 (0,167) 107 (0,686) 46 (0,295) 3 (0,019)

Группы сравнения п Частоты аллелей Частоты генотипов

G А GG GА АА

нДСТ- 166 271 (0,842) 61 (0,158) 109 (0,657) 53 (0,319) 4 (0,024)

нДСТ+ 151 265 (0,877) 37 (0,123) 114 (0,755) 37 (0,245) 0

нДСТ+ легкая 116 200 (0,862) 32 (0,138) 84 (0,724) 32 (0,276) 0

нДСТ+ выраженная 28 51 (0,911) 5 (0,089) 23 (0,821) 5 (0,179) 0

Группы сравнения п Частоты аллелей Частоты генотипов

G А GG GА АА

ОА+НДСТ+ 93 163 (0,876) 23 (0,124) 70 (0,753) 23 (0,247) 0

ОА-нДСТ- 103 174 (0,845) 32 (0,155) 72 (0,699) 30 (0,292) 1 (0,009)

Группы сравнения п Частоты аллелей Частоты генотипов

G А GG GА АА

ОА+ русские 68 120 (0,882) 16 (0,178) 52 (0,766) 16 (0,234) 0

ОА- русские 49 85 (0,867) 13 (0,133) 36 (0,735) 13 (0,205) 0

ОА+ татары 53 89 (0,839) 17 (0,161) 37 (0,698) 15 (0,283) 1 (0,019)

ОА- татары 69 119 (0,862) 19 (0,138) 50 (0,725) 19 (0,275) 0

ОА+ другие этносы 35 51 19 18 15 2

и метисы (0,729) (0,271) (0,514) (0,429) (0,057)

ОА- другие этносы 43 72 14 30 12 1

и метисы (0,837) (0,163) (0,698) (0,279) (0,023)

Группы сравнения п Частоты аллелей Частоты генотипов

G А GG GА АА

нДСТ+ русские 51 97(0,951) 5 (0,049) 46 (0,502) 5 (0,098) 0

нДСТ- русские 66 108 (0,818) 24 (0,182) 42 (0,636) 24 (0,364) 0

нДСТ+ татары 63 108 (0,857) 18 (0,143) 45 (0,714) 18 (0,286) 0

нДСТ- татары 59 100 (0,845) 18 (0,155) 42 (0,712) 16 (0,271) 1 (0,017)

нДСТ + другие этносы и метисы 37 60 (0,811) 14 (0,189) 23 (0,622) 14 (0,378) 0

нДСТ- другие этносы и метисы 41 63 (0,768) 19 (0,232) 25 (0,610) 13 (0,317) 3 (0,073)

Группы сравнения п Частоты аллелей Частоты генотипов

G А GG GА АА

ОА+ нДСТ+ русские 33 62 (0,939) 4(0,061) 29 (0,879) 4 (0,121) 0

ОА- нДСТ- ру^кие 31 50 (0,806) 12 (0,194) 19 (0,613) 12 (0,387) 0

ОА+ нДСТ+ татары 40 69 (0,863) 11 (0,137) 29 (0,879) 11 (0,121) 0

ОА- нДСТ- татары 47 80 (0,851) 12 (0,149) 34 (0,723) 12 (0,277) 0

ОА+ нДСТ+ другие этносы и метисы 20 32 (0,800) 8 (0,200) 12 (0,600) 8 (0,400) 0

ОА-нДСТ- другие этносы и метисы 26 44 (0,846) 8 (0,154) 19 (0,731) 6 (0,231) 1 (0,038)

локуса rs2830585 гена ADAMTS5

Группы сравнения n Частоты аллелей Частоты генотипов

317 C T CC CT TT

Контроль 161 284 (0,882) 38 (0,118) 126 (0,783) 32 (0,199) 3 (0,019)

Полиартроз 38 66 (0,868) 10 (0,132) 29 (0,763) 8 (0,211) 1 (0,026)

Гонартроз 81 144 (0,889) 18 (0,111) 63 (0,778) 18 (0,222) 0

Коксартроз 37 69 (0,932) 5 (0,068) 33 (0,892) 3 (0,081) 1 (0,027)

ОА в целом 156 279 (0,894) 33 (0,106) 125 (0,801) 29 (0,186) 2 (0,013)

Группы сравнения n Частоты аллелей Частоты генотипов

C T CC CT TT

нДСТ- 166 296 (0,892) 36 (0,108) 132 (0,795) 32 (0,193) 2 (0,012)

нДСТ+ 151 267 (0,884) 35 (0,116) 119 (0,788) 29 (0,192) 3 (0,020)

нДСТ+ легкая 116 209 23 94 21 1

(0,901) (0,099) (0,810) (0,181) (0,009)

нДСТ+ выраженная 28 44 (0,786) 12 (0,214) 18 (0,643) 8 (0,286) 2 (0,071)

Группы сравнения n Частоты аллелей Частоты генотипов

C T CC CT TT

ОА+нДСТ+ 93 166 (0,892) 20 (0,108) 74 (0,796) 18 (0,194) 1 (0,011)

ОА-нДСТ- 103 183 (0,888) 23 (0,112) 81 (0,786) 21 (0,204) 1 (0,010)

Группы сравнения n Частоты аллелей Частоты генотипов

C T CC CT TT

ОА+ русские 68 123 (0,904) 13 (0,096) 55 (0,809) 13 (0,191) 0

ОА- русские 49 81 (0,827) 17 (0,173) 33 (0,673) 15 (0,306) 1 (0,020)

ОА+ татары 53 96 (0,906) 10 (0,094) 44 (0,830) 8 (0,151) 1 (0,019)

ОА- татары 69 125 (0,906) 13 (0,094) 57 (0,826) 11 (0,159) 1 (0,014)

ОА+ другие этносы и метисы 35 60 (0,857) 10 (0,143) 26 (0,743) 8 (0,229) 1 (0,029)

ОА- другие этносы и метисы 44 78 (0,886) 8 (0,091) 36 (0,818) 6 (0,136) 1 (0,023)

Группы сравнения n Частоты аллелей Частоты генотипов

C T CC CT TT

нДСТ+ русские 51 89 (0,873) 13 (0,127) 38 (0,745) 13 (0,255) 0

нДСТ- русские 66 115 (0,871) 17 (0,129) 50 (0,758) 15 (0,227) 1 (0,015)

нДСТ+ татары 63 115 (0,913) 11 (0,087) 54 (0,857) 7 (0,111) 2 (0,032)

нДСТ- татары 59 106 (0,898) 12 (0,102) 47 (0,797) 12 (0,203) 0

нДСТ+ другие этносы и метисы 37 63 (0,851) 11 (0,149) 27 (0,730) 9 (0,243) 1 (0,027)

нДСТ- другие этносы и метисы 41 75 (0,915) 7 (0,085) 35 (0,854) 5 (0,122) 1 (0,024)

Группы сравнения n Частоты аллелей Частоты генотипов

C T CC CT TT

ОА+ нДСТ+ русские 33 60 (0,909) 6 (0,091) 27 (0,818) 6 (0,182) 0

ОА- нДСТ- русские 31 52 (0,839) 10 (0,161) 22 (0,710) 8 (0,258) 1 (0,032)

ОА+ нДСТ+ татары 40 72 (0,900) 8 (0,100) 33 (0,825) 6 (0,150) 1 (0,025)

ОА- нДСТ- татары 46 82 (0,891) 10 (0,109) 36 (0,783) 10 (0,217) 0

ОА+ нДСТ+ другие этносы и метисы 20 34 (0,850) 6 (0,150) 14 (0,700) 6 (0,300) 0

ОА-нДСТ- другие этносы и метисы 26 49 (0,942) 3 (0,058) 23 (0,885) 3 (0,115) 0

локуса го6539153 гена СИБТ11

Группы сравнения п Частоты аллелей Частоты генотипов

317 А О АА ОА ОО

Контроль 161 188 (0,584) 134 (0,416) 59 (0,366) 70 (0,435) 32 (0,199)

Полиартроз 38 48 (0,632) 28 (0,368) 15 (0,395) 18 (0,474) 5 (0,132)

Гонартроз 37 48 (0,649) 26 (0,351) 14 (0,378) 20 (0,541) 3 (0,081)

Коксартроз 81 95 (0,586) 67 (0,414) 26 (0,321) 43 (0,531) 12 (0,148)

ОА в целом 156 191 (0,612) 121 (0,388) 55 (0,353) 81 (0,519) 20 (0,128)

Группы сравнения п Частоты аллелей Частоты генотипов

А О АА ОА ОО

нДСТ- 166 192 (0,578) 140 (0,422) 56 (0,337) 80 (0,482) 30 (0,181)

нДСТ+ 151 187 (0,619) 115 (0,381) 58 (0,384) 71 (0,470) 22 (0,146)

нДСТ+ легкая 123 154 (0,626) 92 (0,374) 48 (0,390) 58 (0,472) 17 (0,138)

нДСТ+ выраженная 28 33 (0,589) 23 (0,411) 10 (0,426) 13 (0,464) 5 (0,179)

Группы сравнения п Частоты аллелей Частоты генотипов

А О АА ОА ОО

ОА+нДСТ+ 93 115 (0,618) 71 (0,382) 34 (0,366) 47 (0,505) 12 (0,129

ОА-нДСТ- 103 116 (0,563) 90 (0,437) 3 (0,340) 46 (0,447) 22 (0,214)

Группы сравнения п Частоты аллелей Частоты генотипов

А О АА ОА ОО

ОА+ русские 68 84 (0,618) 52 (0,382) 22 (0,324) 40 (0,588) 6 (0,088)

ОА- русские 49 57 (0,582) 41 (0,418) 19 (0,388) 19 (0,388) 11 (0,224)

ОА+ татары 53 67 (0,632) 39 (0,368) 22 (0,415) 23 (0,434) 8 (0,151)

ОА- татары 69 80 (0,580) 58 (0,420) 24 (0,348) 32 (0,464) 13 (0,188)

ОА+ другие этносы и метисы 35 40 (0,571) 30 (0,429) 11 (0,314) 18 (0,514) 6 (0,171)

ОА- другие этносы и метисы 66 80 (0,606) 52 (0,394) 26 (0,396) 28 (0,424) 12 (0,182)

Группы сравнения n Частоты аллелей Частоты генотипов

А G АА GА GG

нДСТ+ русские 51 61 (0,598) 41 (0,402) 18 (0,353) 25 (0,490) 8 (0,157)

нДСТ- русские 66 80 (0,606) 52 (0,394) 23 (0,348) 34 (0,515) 9 (0,136)

нДСТ+ татары 63 78 (0,619) 48 (0,381) 24 (0,381) 30 (0,476) 9 (0,143)

нДСТ- татары 59 69 (0,585) 49 (0,415) 22 (0,373) 25 (0,424) 12 (0,203)

нДСТ+ другие этносы и метисы 37 48 (0,649) 26 (0,351) 16 (0,432) 16 (0,432) 5 (0,135)

нДСТ- другие этносы и метисы 41 35 (0,427) 39 (0,476) 7 (0,171) 21 (0,512) 9 (0,220)

Группы сравнения n Частоты аллелей Частоты генотипов

А G АА GА GG

ОА+ нДСТ+ русские 93 115 (0,618) 71 (0,382) 34 (0,366) 47 (0,505) 12 (0,129)

ОА- нДСТ- русские 33 41 (0,621) 25 (0,379) 12 (0,364) 17 (0,515) 4 (0,121)

ОА+ нДСТ+ татары 40 48 (0,600) 32 (0,400) 14 (0,350) 20 (0,500) 6 (0,150)

ОА- нДСТ- татары 46 50 (0,543) 42 (0,457) 14 (0,304) 22 (0,478) 10 (0,217)

ОА+ нДСТ+ другие этносы и метисы 20 26 (0,650) 14 (0,350) 8 (0,400) 10 (0,500) 2 (0,100)

ОА-нДСТ- другие этносы и метисы 26 29 (0,558) 23 (0,442) 8 (0,308) 13 (0,500) 5 (0,192)

го1042667 гена 80X9

Группы сравнения п Частоты аллелей Частоты генотипов

317 С А СС СА АА

Контроль 161 136 (0,422) 186 (0,578) 33 (0,205) 70 (0,435) 58 (0,360)

Полиартроз 38 25 (0,329) 51 (0,671) 4 (0,105) 17 (0,447) 17 (0,447)

Гонартроз 80 55 (0,344) 105 (0,656) 9 (0,113) 37 (0,463) 34 (0,425)

Коксартроз 37 32 (0,432) 42 (0,568) 6 (0,162) 20 (0,541) 11 (0,297)

ОА в целом 155 112 198 19 74 62

(0,361) (0,639) (0,123) (0,477) (0,400)

Группы сравнения п Частоты аллелей Частоты генотипов

С А СС СА АА

нДСТ- 165 135 195 25 85 55

(0,409) (0,591) (0,152) (0,515) (0,333)

нДСТ+ 151 113 189 27 59 65

(0,374) (0,626) (0,179) (0,391) (0,430)

нДСТ+ легкая 116 88 144 21 46 49

(0,379) (0,621) (0,181) (0,397) (0,422)

нДСТ+ выраженная 28 19 (0,339) 37 (0,661) 6 (0,214) 7 (0,250) 15 (0,536)

Группы сравнения п Частоты аллелей Частоты генотипов

С А СС СА АА

ОА+нДСТ+ 94 64 (0,340) 124 (0,660) 12 (0,128) 40 (0,426) 42 (0,447)

ОА-нДСТ- 103 87 119 18 51 34

(0,422) (0,578) (0,175) (0,495) (0,330)

Группы сравнения п Частоты аллелей Частоты генотипов

С А СС СА АА

ОА+ русские 48 33 (0,344) 63 (0,656) 4 (0,083) 25 (0,521) 19 (0,396)

ОА- русские 30 21 (0,350) 39 (0,650) 4 (0,133) 13 (0,433) 13 (0,433)

ОА+ татары 28 24 (0,429) 32 (0,571) 5 (0,179) 14 (0,500) 9 (0,400)

ОА- татары 46 45 (0,489) 47 (0,511) 9 (0,196) 27 (0,587) 10 (0,217)