Изучение механизма ядерно-цитоплазматического транспорта белка YB1 тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 00.00.00, кандидат наук Мордовкина Дарья Алексеевна
- Специальность ВАК РФ00.00.00
- Количество страниц 204
Оглавление диссертации кандидат наук Мордовкина Дарья Алексеевна
Оглавление
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
ВВЕДЕНИЕ
ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1. Ядерно-цитоплазматичский транспорт белков
1.1 Ядерный поровый комплекс (ЯПК)
1.2 Система Ran
1.3 Ядерный импорт
1.4 Ядерный экспорт
1.5 Модели транспорта макромолекул через ЯПК
1.6 Транспортные сигналы
1.7 Транспортные белки
1.7.1 Импортины
1.7.2 Экспортины
1.7.3 Двунаправленные транспортные факторы
1.8 Альтернативные пути транспорта
1.9 Экспорт мРНК
1.10 Регуляция ядерно-цитоплазматического транспорта
1.11 Заключение
2. Мультифункциональный белок YB-1
2.1 Структурно-функциональная оранизация YB-1
2.2 Взаимодействие YB-1 с нуклеиновыми кислотами
2.3 Функции YB-1 в цитоплазме
2.4 Секреция YB-1
2.5 ФункцииYB-1 в ядре
2.6 Внутриклеточная локализация YB-1 и регуляция его ядерно-цитоплазматического перехода
2.6.1 Частичный протеолиз и отщепление сигнала удержания в цитоплазме
83
2.6.2 Регуляция локализации за счет взаимодействия с длинными некодирующими РНК (днРНК)
2.6.3 Взаимодействие с цитоплазматическими белками
2.6.4 Посттрансляционные модификации YB-1
2.6.5 Влияние фосфорилирования по S102
2.7 Участие YB-1 в онкогенезе
2.8 Заключение
3. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ 102 3.1.1. Реактивы и кооммерческие наборы
3.1.2. Список праймеров для получения ПЦР-фрагментов
3.1.3. Буферы и растворы
3.1.4. Антитела, используемые в работе 105 3.2. Методы
3.2.1. Трансформация клеток E. coli
3.2.2. Выделение плазмидной ДНК
3.2.3. Минипрепаративное выделение плазмидной ДНК из E. coli
3.2.4. Электрофорез нуклеиновых кислот в геле агарозы
3.2.5. Проведение полимеразной цепной реакции (ПЦР)
3.2.6. Обработка генетических конструкций эндонуклеазами рестрикции
3.2.7. Лигирование кДНК YB-1 (1-324)(P201A,Y202A) и YB-1 (1-219) (P201A,Y202A) в вектор pET-3-1
3.2.8. Выделение рекомбинантного YB-1 и его мутантных форм
3.2.9. Выделение белков GST-cNLS, GST-M9NLS и GST-M9MNLS из E. coli
110
3.2.10. Электрофорез белков в полиакриламидном геле в присутствии SDS
110
3.2.11. Имунологический анализ белковых препаратов (имуноблотиг)
3.2.12. Культивирование эукариотических клеток HeLa, Vero, Hek293
3.2.13. Имунофлуоресцентное окрашивание клеток
3.2.14. Микроскопическое исследование препаратов
3.2.15. Получение лентивирусных частиц
3.2.16. Инфекция клеток HeLa лентивирусными частцами, отбор стабильно трансфецированных клеток
3.2.17. Получение цитоплазматического лизата для pull-down 114 3.2. 18. Получение ретикулоцитного лизата для реакции ядерного импорта
114
3.2.19. Получение цитоплазматического лизата клеток HeLa для реакции ядерного импорта
3.2.20 Реакция ядерного импорта in vitro
3.2. 21. Pull-down белков
3.2.22. Гибридзация in situ
4. РЕЗУЛЬТАТЫ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ
4.1.Подбор условий для изучения транспорта укороченной (1-219) и полноразмерной форм белка HA-YB-1 в транспортной системе из пермеабилизованных клеток HeLa
4.2. Импорт белка HA-YB-1 (1-219) в транспортной системе в присутствии субстратов импортина-ß! и транспортина 1 в качестве конкурентов
4.3. Импорт укороченной (1-219) и полноразмерной (1-324) форм НА-YB-l в
присутствии ингибиторов импортина-ßl и транспортина 1 в транспортной
системе
4.4. Мутации в сигнале ядерной локализации белка YB-1 приводят к нарушению его ядерно-цитоплазматического транспорта
4.5. YB-1 взаимодействует с транспортином
4.6. Ингибирование РНК-полимеразы II индуцирует накопление YB-1 в ядрах
4.7. Ингибирование РНК-полимеразы II влияет на распределение поли (A +) РНК в цитоплазме
4. 8. Ингибирование РНК-полимеразы II вызывает фосфорилирование YB1
по Ser
ВЫВОДЫ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
ActD - актиномицин Д (actinomycin D) AP - аланин/пролин богатый домен
cNLS - классический сигнал ядерной локализации (classical NLS) CSD - домен холодового шока (cold shock domain) CTD - С-концевой домен (C-terminal domain)
DAPI - флуоресцентный краситель, связывающийся с А-Т богатыми регионами ДНК
DRB - 5,6-dichloro-1-beta-D-ribofuranosylbenzimidazole
FBS - фетальная бычья сыворотка (felal bovine serum)
GST - глутатион^-трансфераза (glutathione-S-transferase)
HA - фрагмент белка гемагглютинина вируса гриппа (hemagglutinin)
NES - сигнал экспорта из ядра (nuclear export signal)
NLS - сигнал ядерной локализации (nuclear localization signal)
RNAPII - РНК-полимераза II
а.о. - аминокислотный остаток
днРНК — длинные некодирующие РНК
мРНП - матричные рибонуклеопротеиды
ПТМ - посттрансляционная модификация
ЯПК — ядерный поровый комплекс
ВВЕДЕНИЕ
Актуальность темы исследования и степень ее разработанности
Y-бокс-связывающий белок (YB-1) — это многофункциональный ядерно-цитоплазматический белок позвоночных. В структуре YB-1 выделяют три домена: неструктурированные N- и С-концевые домены и эволюционно-консервативный домен холодового шока (CSD, cold shock domain), имеющий структуру Р-бочонка. YB-1 способен связываться с ДНК и РНК и взаимодействовать с множеством клеточных белков. Эти свойства YB-1 объясняют множество функций белка в цитоплазме и ядре клетки. YB-1 участвует в регуляции транскрипции многих генов, репарации ДНК. Связываясь с мРНК в момент ее синтеза, он сопровождает ее на всех стадиях созревания и функционирования: белок регулирует альтернативный сплайсинг некоторых пре-мРНК, участвует в упаковке мРНК, тем самым регулируя ее трансляционную активность и стабильность.
Такая многофункциональность YB-1 определяет его участие в регуляции многих клеточных процессов, таких как клеточный рост, дифференцировка, апоптоз, ответ на стресс, иммунном ответе, развитии множественной лекарственной устойчивости. Кроме того, увеличение количества YB-1 и его ядерную локализацию связывают с развитием злокачественных опухолей.
Один из способов регуляции функций YB-1 — изменение его внутриклеточной локализации. В нормальных условиях роста клеток большая часть YB-1 локализуется в цитоплазме, но в некоторых случаях наблюдается переход белка в ядро. Так, YB-1 переходит в ядро на границе G1 и S фаз и G2 и M фаз и этот переход необходим для прохождения клеток по циклу. При действии ДНК-повреждающих препаратов или УФ-облучении также наблюдается переход YB-1 в ядро, где он принимает участие в репарации ДНК.
В раковых клетках очень часто наблюдается повышенное содержание YB-1 и/или изменение его внутриклеточной локализации в сторону увеличения ядерной фракции (Janz et al., 2002; Kamura et al., 1999; Shibahara et al., 2001; Kohno et al., 2003; Kuwano et al., 2003; Xu et al., 2009; Kosnopfel et al., 2014; Maurya et al., 2017;
Kuwano et al., 2019; Johnson et al., 2019). Во многих видах рака повышенная экспрессия YB-1 коррелирует с множественной лекарственной устойчивостью и плохим прогнозом (Bargou et al., 1997; Janz et al., 2002; Kosnopfel et al., 2014; Johnson et al., 2019). Вероятно, такие изменения являются не просто следствием раковой трансформации, а одной из его причин. Участие YB-1 в онкогенезе обусловлено различными молекулярными механизмами (Lasham et al., 2013; Maurya et al., 2017). Так, модулируя активность различных сигнальных каскадов (PI3K/Akt/mTOR, Ras/Raf/MER/ERK, MARK) YB-1 влияет на пролиферативную способность клеток. YB-1 может стимулировать пролиферацию клеток за счет активации транскрипции белков, участвующих в делении клеток (циклины А и В1, ДНК-топоизомераза IIa, ДНК-полимераза a, CDC6 (Cell division control protein 6) (Basaki et al., 2010; En-Nia et al., 2005; Jurchott et al., 2003; Shibao et al., 1999). Влияя на экспрессию генов, связанных с ангиогенезом (VEGF-A, FDGF-b, IL-8, CXCL-2) YB-1 усиливает ангиогенез в опухолях. Ингибируя функции белков-супрессоров опухолей RB (Retinoblastoma protein, белок ретинобластомы) и p53, YB-1 способствует беспрепятственному прохождению клетками контрольных точек клеточного цикла и приобретению репликативного бессмертия (Homer et al., 2005; Zhang et al., 2003). YB-1 способен ингибировать BAX-, CASP7- и FAS-опосредованные пути апоптоза, что позволяет раковым клеткам избежать запрограммированной гибели (Lasham et al., 2000). Регулируя экспрессию STAT3, CD44, CCL5, CCL2, YB-1 способствует развитию воспаления. А участвуя в регуляции экспрессии Snail и Twist1, YB-1 спсособствует инвазии и метастазированию раковых клеток (Evdokimova et al., 2009). Кроме того, YB-1 может стимулировать метастазирование за счет транскрипционной активации гена металлопротеиназы 2 и стимуляции активности металлопротеиназы MT1-MMP (Lovett et al., 2010; Mertens et al., 1998). Эти ферменты расщепляют белки внеклеточного матрикса и облегчают миграцию клеток опухоли в ткани. Также с ядерной локализацией YB-1 связывают развитие множественной лекарственной устойчивости.
Важную роль в онкогенных свойствах YB-1 играет его фосфорилирование по серину 102. При фосфорилировании YB-1 переходит из цитоплазмы в ядро, где индукцирует экспрессию генов ростовых факторов, таких как EGFR (Stratford et al., 2007), HER-2 (Shibata et al, 2013), PCNA (Ise et al., 1999), циклин A, циклин B (Jurchott et al., 2003) и белков, связанных с возникновением лекарственной устойчивости (Vaiman et al., 2006; Kuwano et al., 2019).
Таким образом, функции YB-1 весьма разнообразны и проявляются как в цитоплазме, так и в ядре. Причем увеличение содержания YB-1 в клетке и его переход в ядро может приводить к ряду событий, способствующих росту, размножению, развитию множественной лекарственной устойчивости и стимуляции метастазирования раковых клеток. Однако, внутриклеточные процессы, регулирующие переход YB-1 в ядро и обратно, особенно при раковом перерождении клеток, почти не изучены.
В то время как накапливается все больше данных о переходе YB-1 в ядро при различных физиологических и стрессовых условиях, патологических процессах, транспортный фактор, отвечающий за транслокацию белка в ядро так и не определен. Достаточно давно было высказано предположение, что локализация YB-1 в клетке определяется его связыванием с мРНК. Однако экспериментальных данных, способных однозначно подтвердить или опровергнуть это предположение все еще недостаточно. Влияние фосфорилирования серина 102, локализованного в домене холодового шока YB-1 на его свойства, изучается давно. Однако, существующие экспериментальные данные в влиянии фосфорилирования YB-1 на его внутриклеточную локализацию крайне противоречивы.
Рекомендованный список диссертаций по специальности «Другие cпециальности», 00.00.00 шифр ВАК
Изучение связи между фосфорилированием белка YB-1 и его транспортом в ядро2022 год, кандидат наук Согорина Екатерина Михайловна
Поиск ферментов, контролирующих ядерно-цитоплазматическое распределение белка YB-1 в клетках млекопитающих2007 год, кандидат биологических наук Сорокин, Алексей Витальевич
Интеграция сигналов ядерной и ядрышковой локализации в составе функциональных доменов белков2019 год, кандидат наук Лисицына Ольга Михайловна
Идентификация участков протимозина альфа, обеспечивающих транспорт белка в ядро дрожжей S. cerevisiae2001 год, кандидат химических наук Шакулов, Виталий Рустэмович
Роль белка PCID2 в транспорте мРНК у Drosophila melanogaster2021 год, кандидат наук Глухова Анна Анатольевна
Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Изучение механизма ядерно-цитоплазматического транспорта белка YB1»
Цель работы
Цель данной работы заключалась в выяснении молекулярных механизмов, обеспечивающих ядерный транспорт YB-1 и его регуляцию. В связи с этим были поставлены следующие задачи.
Основные задачи работы:
1. Определить транспортный фактор, необходимый для импорта YB-1:
а) Подобрать условия для проведения реакции импорта YB-1 в ядро в модельной системе;
б) Исследовать транспорт белка YB-1 в ядро в модельной системе в присутствии конкурирующих субстратов или в условиях ингибирования основных транспортных белков;
в) Исследовать в модельной системе транспорт белка YB-1 с мутациями в сигнале ядерной локализации, потенциально нарушающими взаимодействие с транспортным фактором;
г) Определить какой транспортный фактор взаимодействует с YB-1.
2. Выяснить, может ли снижение уровня мРНК в клетке вследствие остановки транскрипции (ингибирование РНК-полимеразы II) быть причиной накопления YB-1 в ядре;
3. Выяснить, влияет ли фосфорилирование YB-1 по Ser 102 на его транспорт в ядро в условиях остановки транскрипции (ингибирование РНК-полимеразы II) и снижения уровня мРНК.
Научная новизна
В данной работе было показано, что YB-1 образует комплекс с транспортином 1 за счет белок-белковых взаимодействий. Получена линия клеток HeLa, экспрессирующая YB-1 с flag-мотивом и стрептавидин-связывающей последовательностью под контролем индуцибельного промотора. Подобраны условия для импорта в ядро полноразмерной (1-324) и укороченной (1-219) форм YB-1 в модельной транспортной системе. Было обнаружено, что транспорт укороченной формы белка YB-1 (1-219) наблюдается в транспортной системе, собранной из клеток, выращенных в стандартных условия культивирования клеток (10% сыворотки), а транспорт полноразмерной формы белка YB-1 (1-324) осуществляется в транспортной системе, собранной из клеток, выращенных в условиях голодания по сыворотке. Показано, что различия в транспорте
укороченной и полноразмерной форм YB-1 в транспортной системе нельзя объяснить простым изменением количества транспортных факторов. Было установлено, что транспорт белка YB-1 нарушается в присутствии конкурента и ингибитора транспортина 1, но не импортина-Р1. Было выявлено, что замены в сигнале ядерной локализации YB-1 (Р195А, Y196A) приводят к нарушению транспорта как полноразмерной, так и укороченной форм белка. Таким образом, в ходе исследования были получены данные, позволяющие идентифицировать транспортный фактор, обеспечивающий ядерный импорт YB-1 как транспортин 1. Установлено, что переход белка YB-1 в ядро может быть стимулирован не только повреждением ДНК, но и ингибированием РНК-полимеразы II. Показано, что ингибирование РНК-полимеразы II приводит к активации АкЬкиназы (увеличение фосфорилирования) и увеличению уровня фосфорилирования YB-1. Обнаружено, что ингибиторы киназ (кофеин, ингибитор широкого спектра киназ и вортманин, ингибитор сигнального каскада РВК/Ак) препятствуют транслокации YB-1 в ядро при ингибировании транскрипции, но не влияют на уровень мРНК в цитоплазме. Проведенные исследования позволили предложить новый принципиальный механизм регуляции транспорта YB-1 в нормальных условиях и в условиях остановки транскрипции (ингибирование РНК-полимеразы II). В нормальных условиях роста YB-1 располагается преимущественно в цитоплазме и взаимодействует с РНК. При остановке транскрипции, осуществляемой РНК-полимеразой II, наблюдается быстрое фосфорилирование YB-1 (в том числе, Акь киназой) и постепенное снижение уровня мРНК в цитоплазме, после чего фосфорилированный белок переходит в ядро.
Научная и практическая значимость работы
Полученные в ходе работы данные значительно расширяют имеющиеся представления о механизме ядерно-цитоплазматического транспорта YB-1 и его сложной многоуровневой регуляции. Обнаруженные молекулярные механизмы регуляции внутриклеточной локализации YB-1 могут помочь в разработке терапевтических подходов для лечения онкологических заболеваний, при которых
переход белка YB-1 в ядро является критическим этапом патогенеза и/или приводит развитию множественной лекарственной устойчивости. При дальнейшем развитии тематики могут быть найдены или спроектированы химические соединения, препятствующие переходу белка YB-1 в ядро. Таким образом, настоящее исследование может иметь большое практическое значение как для фундаментальной, так и для прикладной науки.
Личный вклад автора
Личный вклад автора заключается в работе с литературными источниками, планировании и проведении экспериментов, анализе полученных результатов, подготовке материалов к печати и написании диссертации. Основные результаты диссертационной работы получены лично автором или при его непосредственном участии. Выделение белков было выполнено совместно с к.б.н. Е.Р. Ким. Работы с эукариотическими клетками проводились совместно с к.б.н. Е.Р. Ким и Кретовым
Д.А.
Методология и методы исследования
Для получения плазмидных конструкций использовали стандартные методы генной инженерии. Белки выделены с использованием хроматографических методов с чистотой, пригодной для дальнейших экспериментов. Для изучения ядерного импорта белков использовалась система на основе пермеабилизованных клеток (in vitro transport assay). Исследования проводились на клеточных культурах HeLa (клетки аденокарциномы шейки матки), Vero (клетки эпителия почки африканской зеленой мартышки), MCF-7 (клетки инвазивной аденокарциномы протоков молочной железы). Внутриклеточная локализация белков определялась методом флуоресцентного окрашивания клеток. Поли-(А+)-РНК детектировалась методом гибридизации in situ с использованием флуоресцентно-меченного олиго^Т-зонда.
Положения, выносимые на защиту
Основные положения, выносимые на защиту:
1. Транспорт YB-1 в ядро осуществляется транспортином-1.
2. Переход YB-1 в ядро может вызываться снижением уровня мРНК в клетке (ингибирование РНК-полимеразы II), а не только повреждением ДНК.
3. Ингибирование транскрипции (ингибирование РНК-полимеразы II) сопровождается увеличением уровня фосфорилирования YB-1 и Akt-киназы.
4. Ингибиторы киназ (кофеин и вортманин) препятствуют транслокации YB-1 в ядро при ингибировании транскрипции, но не влияют при этом на уровень мРНК в цитоплазме.
Степень достоверности и апробация результатов
Результаты работы неоднократно представлялись на российских и международных конференциях. По материалам диссертации опубликовано 5 статей в ведущих научных журналах, рекомендованных ВАК. Материалы диссертации были представлены на 16-, 22-, 23- Международных пущинских школах-конференцях молодых ученых (Россия, Пущино, 2012, 16-21 апреля, 2018, 23-27апреля, 2019, 15-19 апреля), 25th Wilhelm Bernhard workshop on the cell nucleus (Россия, Нижний Новгород, 2017, 19-22 июня), 26th Wilhelm Bernhard workshop on the cell nucleus (Франция, Дижон, 2019, 20-23 мая), 1-st Cold Shock Protein Symposium (Германия, Магдебург, 2019, 12-15 сентября 2019)
ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
Пространственное разделение репликации ДНК и транскрипции генов в ядре и трансляции мРНК в цитоплазме позволило эукариотической клетке иметь еще один уровень регуляции экспрессии генетической информации. Компартментализация в эукариотической клетке подразумевает необходимость существования системы, осуществляющей транспорт макромолекул между ядром и цитоплазмой. Эта система состоит из ядерного порового комплекса (ЯПК), являющегося селективным фильтром, и белков-кариоферинов (транспортные факторы), непосредственно узнающих определенные мотивы в макромолекулах и осуществляющие их перенос из одного компартмента клетки в другой.
Ядерно-цитоплазматический транспорт крайне важен для правильного функционирования клетки. Нарушение его регуляции является одним из признаков различных патологических процессов, в частности онкологических заболеваний. Зачастую причиной неконтролируемого роста клеток опухолей является накопление в цитоплазме транскрипционных факторов, которые теряют возможность выполнять в ядре функции белков-супрессоров, а неправильная локализация онкобелков может приводить к их неадекватной активации.
YB-1 — многофункциональный ДНК- и РНК-связывающий белок. Он участвует во множестве клеточных процессов, благодаря способности взаимодействовать с ДНК, РНК и множеством клеточных белков (Kohno et al., 2003). YB-1 принимает участие практически во всех ДНК-зависимых процессах. Так, связываясь с регуляторными последовательностями в ДНК, YB-1 влияет на экспрессию различных генов на уровне транскрипции (Kohno et al., 2003; Eliseeva et al., 2011). YB-1 способен узнавать поврежденные участки ДНК и взаимодействовать со многими белками, участвующими в репарации, что обуславливает участие YB-1 в этом процессе (Eliseeva et al., 2011). YB-1 взаимодействует с мРНК на всех этапах ее жизни и регулирует многие мРНК-зависимые процессы. Было показано, что YB-1 принимает участие в альтернативном сплайсинге некоторых мРНК (^а^ку et al., 2001). В цитоплазме
YB-1, взаимодействуя с мРНК, регулирует ее трансляционную активность, стабильность и локализацию (Davydova et al., 1997; Evdokimova et al., 2001; Ruzanov et al., 1999).
Участие YB-1 в таком широком спектре важных клеточных процессов в ядре и цитоплазме клеток определяет необходимость строгой регуляции его ядерно-цитоплазматического распределения. Обзор литературы будет состоять из двух частей, одна из которых будет посвящена ядерно-цитоплазматическому транспорту клетки, а другая — функциям YB-1 в клетке.
1. Ядерно-цитоплазматичский транспорт белков
Ядерно-цитоплазматический транспорт макромолекул — это сложный процесс, требующий участия большого количества белков. Транспорт молекул между ядром и цитоплазмой происходит через сложно организованную многокомпонентную структуру — ядерный поровый комплекс (ЯПК), находящийся в ядерной мембране. Направленность ядерно-цитоплазматического транспорта определяет маленький белок ГТФаза Ran. Большая часть белков неспособна самостоятельно проходить через ядерный поровый комплекс, их транспорт обеспечивают специальные белки-переносчики — кариоферины. Кариоферины, участвующие в транспорте белков в ядро (импорте) называются импортинами. Кариоферины, обеспечивающие экспорт макромолекул из ядра (экспорт) называются экспортинами. Для того, чтобы перемещаться между ядром и цитоплазмой, белок должен обладать специальными аминокислотными мотивами (сигналами локализации), которые и узнают белки кариоферины. Рассмотрим каждого участника сложного процесса ядерно-цитоплазматического транспорта отдельно.
1.1 Ядерный поровый комплекс (ЯПК)
Клеточное ядро, где хранится большая часть генетической информации клетки, сформировано ядерной оболочкой (мембраной), состоящей из внешней и внутренней ядерных мембран. Ядерная мембрана представляет собой физический
барьер, разделяющий содержимое клетки на 2 больших компартмента. Внешняя мембрана переходит в эндоплазматический ретикулум (Callan et al., 1949), а внутренняя мембрана ассоциирована с сетью промежуточных филаментов, называемых ядерной ламиной (Field and Dacks, 2009). В определенных точках внешняя и внутренняя ядерные мембраны соединяются большими макромолекулярными структурами, называемыми ядерными поровыми комплексами (ЯПК). Таким образом, транспорт через ядерную мембрану физически возможен только через ЯПК. ЯПК — это сложный белковый комплекс, погруженный в ядерную мембрану, выступающий в ядерное и цитоплазматическое пространство, имеющий в центре водный канал. Однако важно отметить, что ЯПК представляет собой не просто канал, он является полупроницаемым фильтром, обеспечивающим селективный обмен молекул между ядром и цитоплазмой (Strambio-De-Castillia et al., 2010). ЯПК имеет форму цилиндра диаметром 100-150 нм и высотой 50-70 нм. Его молекулярная масса составляет приблизительно 125 000 кДа (Lim et al., 2008; Grossman et al., 2012). ЯПК - довольно консервативный макромолекулярный комплекс среди млекопитающих (Cronshaw et al., 2002; Rout et al., 2000; Grossman et al., 2012). В структуре ЯПК можно выделить три части: центральная коровая часть в форме тора), окруженную ядерной мембранной, и две асимметричные части, (филаменты, выступающие в ядро и цитоплазму) (рис. 1) (Schwartz, 2005). Центральная коровая часть, через которую проходит центральный канал, через который осуществляется транспорт молекул, образован тремя кольцеобразными структурами: цитоплазматическое кольцо, центральное кольцо и ядерное кольцо. От коровой части в ядро и цитоплазму выступает по 8 филаментов, причем ядерные филаменты формируют структуру, называемую ядерной корзиной. Несмотря на большие размеры, ЯПК сформирован относительно небольшим количеством типов белков-нуклеопоринов (Nups), в его состав входит около 30 различных белков (Neumann et al., 2010; Hoelz et al., 2011). Однако нуклеопорины представлены во множестве копий, их общее число достигает 500-1000 индивидуальных белков в полном ЯПК (Hoelz et al., 2011).
о о я
I 5< я и
и
а
Барьерные (FG) нуклеопорины
Поддержи в аю щие нуклеопорины Мембранные нуклеопорины
Цито плазматические филаменты
Цито плазматическое кольцо
Ядерная мембрана
Ядерные филаменты
Ядерная корзина
Ядерное кольцо
Рисунок 1. Схематичное изображение строения ЯПК. Рисунок с изменениями из Azimi and Mofrad, 2013.
Центральное кольцо центральной коровой части сформировано тремя группами нуклеопоринов: мембранные, поддерживающие и барьерные FG-нуклеопорины. Каждая группа имеет уникальные структурные особенности, необходимые для выполнения функций. Мембранные нуклеопорины содержат трансмембранные альфа-спирали, благодаря которым белок закрепляется в мембране и формирует внутреннюю часть поры. Таким образом, мембранные нуклеопорины прикрепляют ЯПК к ядерной мембране (Devos et al., 2006; Mitchell et al., 2010). Поддерживающие нуклеопорины формируют остов ЯПК, соединяя мембранные и барьерные нуклеопорины. Для поддерживающих нуклеопоринов характерны а-соленоидные и ß-пропеллерные укладки. Конформационная подвижность этих нуклеопоринов позволяет большим субстратам проходить через центральный канал ядерной поры (Debler et al., 2008). Барьерные или FG-нуклеопорины формируют внутренний слой центрального канала ядерной поры. Эти нуклеопорины действуют как селективный пропускной фильтр ядерного
транспорта. FG-нуклеопорины содержат множественные повторы фенилаланина и глутамина (FG), которые образуют внутренне неупорядоченные регионы. Такие мотивы образуют неструктурированную сеть, выстилающую центральный канал. Эта сеть обеспечивает низкоафинные, но очень специфичные взаимодействия с транспортными рецепторами, переносящими субстраты через ядерную пору. FG-повторы также создают барьер для свободной диффузии больших макромолекул через ЯПК (Grossman et al., 2012).
Асимметричные цитоплазматические и ядерные нуклеопорины являются важным компонентом в определении направленности ядерно-цитоплазматического транспорта. Асимметричные нуклеопорины делятся на цитоплазматические нуклеопорины (цитоплазматические филаменты) и ядерные нуклеопорины, формирующие ядерную корзину. Эти нуклеопорины специфически взаимодействуют с комплексами субстрат-импортин и субстрат-экспортин. Для транспортных белков, обеспечивающие импорт, свойственна более высокая аффиность к ядерным нуклеопоринам, а для экпортинов - к цитоплазматическим ( Shah and Forbes, 1998; Shah et al., 1998; Ben-Efraim et al., 2001; Pyhtila et al., 2003).
1.2 Система Ran
Ядерно-цитоплазматический транспорт, а именно связывание и высвобождение субстратов кариоферинами, контролируется малой Ras-подобной GTPазой Ran и требует гидролиза GTP (Stochaj and Rother, 1999). Ran -небольшой белок с молекулярной массой 25 ^a, может находится в двух различных нуклеотид-связанных состояниях (RanGDP и RanGTP). Ran гидролизует GTP очень медленно. Этот процесс регулируется белками: белком Ran-GAP1 (RanGTPase activating protein 1, белок активирующий RanGTPазу) и белком RanBP1 (белок, активирующий Ran-GAP1). Эти белки значительно увеличивают скорость гидролиза GTP белком Ran (Bischoff et al., 1995). Другой белок, RanGEF (Ran regulatory protein RanGTP exchange factor, RCC1) ускоряет обмен нуклеотидов, восстанавливая пул RanGTP. RanGAP1 локализуется исключительно
в цитоплазме (Hopper et al., 1990), RanBPl преимущественно локализован в цитоплазме (Kunzler et al., 2000), в то время как RanGEF находится в ядре. Вследствие этой строгой ядерной локализации RanGEF и цитоплазматического RanGAPl, Ran в комплексе с GTP локализуется в основном в ядре, а RanGDP (Ran в комплексе с GDP) в цитоплазме (Bourne et al., 1991; Moore et al., 1998; Cook et al., 2007). Этот градиент RanGTP определяет направление ядерно-цитоплазматического транспорта (Kalab et al., 2006; Stewart, 2007).
1.3 Ядерный импорт
Рассмотрим принципиальную схему ядерного импорта (рис. 2). Начальной стадией процесса транспорта белков в ядро является узнавание импортином сигнала ядерной локализации в белке-субстрате (Cingolani et al., 2002; Lee et al., 2003; Lee et al., 2006). Затем образовавшийся комплекс импортин-субстрат связывает RanGDP и поступает в ЯПК. После этого за счет взаимодействия импортина с компонентами ЯПК происходит физическое перемещение комплекса импортин-субстрат в ядро. Когда транслокация через пору завершена, RanGTP в ядре связывается с импортином и стимулирует диссоциацию комплекса и высвобождение субстрата. Импортин в комплексе с RanGTP возвращается в цитоплазму. В цитоплазме белок RanGAP1 стимулирует гидролиз GTP GTPазой Ran, что позволяет импортину вступить в новый транспортный цикл. Отдельно стоит сказать, об импортине-ßL Основное отличие этого импортина от других заключается в том, что он связывается свои субстраты при помощи адапторных белков импортинов-а. Распознавание белка-субстрата импортином-а и гетеродимеризация с импортином-ß! является начальной стадией ядерного импорта для этого импортина (Fried and Kutay, 2003; Cook et al., 2007; Stewart, 2007). В остальном, общая схема ядерного импорта применима ко всем импортинам. Импортин-а возвращается обратно в цитоплазму при помощи экспортина CAS, а импортин-ß! возвращается в цитоплазму вместе с RanGTP.
1.4 Ядерный экспорт
Процесс ядерного экспорта осуществляется по тем же принципам, что и импорт: экспортины, например, CRM1 узнают специфические последовательности в белках-субстратах (Bednenko et al., 2003; Arnaoutov et al., 2005) (рис 3.). Аффиность CRM1 к большинству сигналов экспорта довольно низкая, но высокие концентрации RanGTP в ядре способствуют увеличению аффиности сигнала экспорта к экспортину за счет кооперативности связывания CRM1 с обоими лигандами (субстрат и RanGTP) (Kehlenbach et al., 2001; Nemergut et al., 2002; Englmeier et al., 2001; Lindsay et al., 2001). Комплекс для экспорта перемещается через ЯПК, взаимодействуя с FG-нуклеопоринами (Yang et al., 2004). В цитоплазме CRM1 связывается с цитоплазматическими филаментами ЯПК (Fornerod et al., 1997; Hutten and Kehlenbach, 2006; Kehlenbach et al., 1999; Askjaer et al., 1999; Bernad et al., 2004), а при взаимодействии с RanGAP происходит гидролиз GTP, который приводит к диссоциации комплекса. После диссоциации субстрат высвобождается в цитоплазму (Dong et al., 2009a; Dong et al., 2009b).
Рисунок 2. Принципиальная схема импорта белков (на примере импортина-01). В
цитоплазме белок, содержащий N11,Б, узнается адапторным белком импортином-а (1тра). Затем
импортин-а связывается с импортином-ß! (Impß1). Этот тримерный комплекс перемещается через ЯПК в ядро клетки. В ядре импортин-ß! связывается с RanGTP и это приводит к высвобождению импортируемого белка и импортина-а. Импортин-а связывается со своим собственным экспортным рецептором CAS в присутствии RanGTP. Экспорт импортина-ß! происходит независимо от импортина-а. В цитоплазме две молекулы RanGTP, используемые для экспорта импортинов, переводятсся в RanGDP-связанную форму с помощью белка RanGAP. RanGEF в ядре переводит Ran из GDF-связанной формы в GTF-связанную формую. Далее импортины могут участвовать в следующем раунде импорта (Рисунок с изменениями из Pannek and Stade, 2005).
Цитоплазма (Низкий уровень
RanGTP) mes
(Высокий уровень RanGTP)
Рисунок 3. Принципиальная схема экспорта белков (на примере экспортина CRM1). В
ядре NES-содержащнй белок узнается экспортнном Crml в присутствии RanGTP. Образовавшийся комплекс перемещается через ЯПК в цитоплазму, где RanGTP преобразуется в RanGDP с помощью RanGAP. Гидролиз GTP приводит к высвобождению белка-субстрата. Затем Crml возвращается в ядро, чтобы участвовать в следующем раунде экспорта. В ходе экспорта количество RanGTP в ядре снижается. Восполнение потерь RanGTP осуществляется за счет импорта RanGDP в ядро, где он преобразуется в RanGTP с помощью белка RanGEF. Цитоплазматический RanGDP транспортируется в ядро специфическим переносчиком, ядерным транспортным фактором-2 (NTF2) (Рисунок с изменениями из Pannek and Stade, 2005).
1.5 Модели транспорта макромолекул через ЯПК
На данный момент существует несколько моделей, описывающих механизм селективного транспорта через ЯПК (Wente and Rout, 2010; Schmidt and Görlich, 2016; Stanley et al., 2017).
Модель «виртуальных ворот» (virtual gate model) предполагает, что FG-домены нуклеопоринов не образуют контактов между собой, но функционируют как «щетка», не позволяя случайным макромолекулам пройти через ЯПК. Считается, что транспортные факторы преодолевают этот барьер, связываясь с мотивами FG (Rout et al., 2003).
Модель обратимого коллапса (reverse collapse model) (Lim et al., 2007) похожа на модель «виртуальных ворот» тем, что также постулирует, что «щетки» FG отталкивают случайные молекулы, но дополнительно предполагает, что домены FG сжимаются при связывании с транспортными факторами, как бы «протаскивая» транспортные комплексы через барьер. Тем самым транспортные факторы могут формировать свой собственный канал в центральной области ЯПК, проходя через FG-нуклеопорины. Эта модель предложена на основе эксперимента, в котором низкие концентрации импортина-ß! приводили к разрушению взаимодействия между FG доменами. Однако в клетке концентрация транспортных факторов гораздо выше, чем в эксперименте, что должно было бы приводить к постоянному разрушению FG доменов и невозможности «протаскивания» транспортных комплексов.
Модель «гидрофобного геля» («hydrophobic gel» model) (Ribbeck and Görlich, 2002), или модель «насыщения» («saturated model») (Frey and Görlich, 2007; Frey et al., 2006), подразумевает, что остатки фенилаланина в FG-нуклеопоринах взаимодействуют друг с другом и формируют плотный гель из FG-нуклеопоринов. Транспортные факторы, связываясь с этим «гелем» «растворяют» его, что облегчает их транслокацию через ЯПК.
«Модель уменьшения размерности» («reduction of dimensionality» model) предполагает, что FG-нуклеопорины формируют слой, покрывающий внутреннюю стенку центрального канала, где несвязанные молекулы могут
перемещаться только через узкую ограниченную часть канала и где транспортные факторы проникают в слой нуклеопоринов, связываются с ними, получая доступ ко всему объему канала (Peters, 2005).
Селективная фазовая модель (Ribbeck and Görlich, 2001) предполагает, что барьер в ЯПК сформирован за счет взаимодействующих FG-повторов, которые образуют «молекулярное сито». В результате чего образуется сито-подобный гидрогель (селективная фаза), который позволяет проходить небольшим молекулам, но подавляет потоки свободных макромолекул. Комплексы кариоферин-субстрат проходят через него за счет взаимодействия кариоферина с FG-повторами. Таким образом, кариоферины могут временно «открывать» отдельные участки молекулярного барьера (Ribbeck and Görlich, 2001; Kustanovich and Rabin, 2004). Эта модель находит подтверждение в ряде экспериментальных работ (Frey and Görlich, 2007; Frey and Görlich, 2009; Patel et al., 2007; Frey et al., 2006; Milles and Lemke, 2011; Yang et al., 2004; Kubitscheck et al., 2005; Hülsmann et al., 2012).
Кап-центрическая модель (Kap-centric model, kap от kariopherin) принимает во внимание экспериментальные данные о том, что кариоферины в высоких концентрациях могут взаимодействовать с FG-нуклеопоринами и модулировать их свойства (Kapinos et al., 2014). Эта модель постулирует, что часть кариоферинов сильно связана с нуклеопоринами (мотивами FG) в ЯПК и участвует в формировании селективного барьера. Предполагается, что наличие сильно связанных с ЯПК кариоферинов, облегчает прохождение по каналу кариоферинов, переносящих субстраты, так как ЯПК-ассоциированные кариоферины занимают излишние сайты связывания на нуклеопоринах, которые могли бы замедлять перемещение через ЯПК транспортных комплексов. С точки зрения этой модели, одних только доменов FG не должно хватать для формирования барьера селективности. Однако это утверждение противоречит экспериментальным данным о эффективной селективности гидрогелей, полученных из доменов FG в отсутствии кариоферинов (Frey and Görlich, 2009; Labokha et al., 2013; Schmidt and Görlich, 2015).
«Модель леса» (forest model) основана на наблюдении, что дрожжевые ЯПК имеют структурно неоднородные домены FG. Предполагается, что отдельные домены FG не смешиваются и локализуются ограниченными отдельными группами, формируя трубчатую структуру канала или даже отдельные зоны движения (Yamada et al., 2010). Однако, эта модель противоречит данным о том, что селективность структур, состоящих из однородных доменов FG совпадает с селективностью интактных ЯПК.
Модель кольцевого цикла (ring cycle model) или модель «изменения размера пор» (model of poredilatation) (Melcak et al., 2007; Solmaz et al., 2013) предполагает, что комплекс Nup62/58/54, образующий кольцевой каркас в ЯПК, ограничивает прохождение свободных макромолекул, но при связывании кариоферинов с FG-доменами происходят конформационные перестройки, приводящие к расширению канала. Эта модель была построена на основании анализа четвертичных структур в различных кристаллах Nup58, Nup54 и Nup62. Однако недавние биохимический анализ (Ulrich et al., 2014) и анализ кристаллических структур (Chug et al., 2015; Stuwe et al., 2015) показали, гетеротримерный комплекс Nup62/58/54 очень стабилен и не образует предполагаемых ранее структурных конформаций.
В настоящее время обсуждается, какая из моделей правильно описывает фундаментальные принципы работы селективного барьера ЯПК. Однако, вероятно, только эксперименты в контексте реальных ЯПК могут дать ответ на вопрос: какая из моделей более полно и правильно описывает этот процесс.
Похожие диссертационные работы по специальности «Другие cпециальности», 00.00.00 шифр ВАК
Активация и транспорт в ядро МАР-киназы под действием эпидермального фактора роста (ЭФР) в клетках с различными мутациями рецептора ЭФР1999 год, кандидат биологических наук Арнаутов, Алексей Михайлович
Характеристика новых модульных нанотранспортёров для доставки эмиттеров электронов Оже в ядра клеток-мишеней2021 год, кандидат наук Карягина Татьяна Сергеевна
Молекулярный механизм вовлечения фактора Paip2 в процесс экспрессии генов у Drosophila melanogaster2019 год, кандидат наук Качаев Заур Мозырович
Влияние многофункционального белка YB-1 на лекарственную устойчивость и метастатическую активность клеток рака молочной железы2013 год, кандидат наук Моисеева, Наталья Ивановна
Контроль трансляции РНК нуклеопротеидных комплексов, участвующих в межклеточной транслокации вирусного генома2000 год, кандидат биологических наук Козловский, Станислав Владимирович
Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Мордовкина Дарья Алексеевна, 2022 год
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ:
1. Adam S.A., Marr R.S. and Gerace L.: Nuclear protein import in permeabilized mammalian cells requires soluble cytoplasmic factors // J Cell Biol. -1990. -Vol. 111. -№ 3. -P. 807-16.
2. Adam E.J. and Adam S.A.: Identification of cytosolic factors required for nuclear location sequence-mediated binding to the nuclear envelope // J Cell Biol. -1994. -Vol. 125. -№ 3. -P. 547-55
3. Aksu M., Trakhanov S. and Görlich D.: Structure of the exportin Xpo4 in complex with RanGTP and the hypusine-containing translation factor eIF5Aa // Nat Commun. -2016. -Vol. 7. -P. 11952.
4. Aksu M., Pleiner T., Karaca S., Kappert C., Dehne H-J., Seibel K., Urlaub H., Bohnsack M.T. and Görlich D.: Xpo7 is a broad-spectrum exportin and a nuclear import receptor // J Cell Biol. -2018. -Vol. 217. -№ 7. -P. 2329-2340.
5. Alefantis T., Flaig K.E., Wigdahl B. and Jain P.: Interaction of HTLV-1 Tax protein with calreticulin: implications for Tax nuclear export and secretion // Biomed Pharmacother. -2007. -Vol. 61. -№ 4. -P. 194-200.
6. Alemasova E.E., Pestryakov P.E., Sukhanova M.V., Kretov D.A., Moor N.A., Curmi P.A., Ovchinnikov L.P. and Lavrik O.I.: Poly(ADP-Ribosyl)Ation as a New Posttranslational Modification of YB-1 // Biochimie. -2015. -Vol. 119. -P. 36-44.
7. Alemasova E.E., Moor N.A., Naumenko K.N., Kutuzov M.M., Sukhanova M.V., Pestryakov P.E. and Lavrik O.I.: Y-Box-Binding Protein 1 as a Non-Canonical Factor of Base Excision Repair // Biochimica et Biophysica Acta. -2016. -Vol. 1864. -№ 12. -P. 1631-1640.
8. Alemasova E.E., Naumenko K.N., Moor N.A. and Lavrik O.I.: Y-Box-Binding Protein 1 Stimulates Abasic Site Cleavage // Biochemistry (Mosc.). -2017. -Vol. 82. -№ 12. -P. 15211528.
9. Alemasova E.E., Naumenko K.N., Kurgina T.A., Anarbaev R.O. and Lavrik, O.I.: The Multifunctional Protein YB-1 Potentiates PARP1 Activity and Decreases the Efficiency of PARP1 Inhibitors // Oncotarget. -2018. -Vol. 9. -№ 34. -P. 23349-23365.
10. Ali M.K., Kim J., Hamid F.B. and Shin C.G.: Knockdown of the host cellular protein transportin 3 attenuates prototype foamy virus infection // Biosci Biotechnol Biochem. -2015. -Vol. 79. -№ 6. -P. 943-51.
11. Alidousty C., Rauen T., Hanssen L., Wang Q., Alampour-Rajabi S., Mertens P.R., Bernhagen J., Floege J., Ostendorf T. and Raffetseder U.: Calcineurin-mediated YB-1 dephosphorylation regulates CCL5 expression during monocyte differentiation // J Biol Chem. -2014. -Vol. 289. -№ 31. -P. 21401-12.
12. Argentaro A., Sim H., Kelly S., Preiss S., Clayton A., Jans D.A. and Harley V.R.: A SOX9 defect of calmodulin-dependent nuclear import in campomelic dysplasia/autosomal sex reversal // J Biol Chem. -2003. -Vol. 278. -№ 36. -P. 33839-47.
13. Arnaoutov A., Azuma Y., Ribbeck K., Joseph J., Boyarchuk Y., Karpova T., McNally J. and Dasso M.: Crml is a mitotic effector of Ran-GTP in somatic cells // Nat Cell Biol. - 2005. 7. -P. 626-632.
14. Askjaer P., Bachi A., Wilm M., Bischoff F.R., Weeks D.L., Ogniewski V., Ohno M., Niehrs C., Kjems J., Mattaj I.W. et al. .: RanGTP-regulated interactions of CRM1 with nucleoporins and a shuttling DEAD-box helicase // Mol Cell Biol. -1999. -Vol. 19. -P. 6276-6285.
15. Astanehe A., Finkbeiner M.R., Hojabrpour P., To K., Fotovati A., Shadeo A., Stratford A.L., Lam W.L., Berquin I.M., Duronio V. and Dunn S.E.: The transcriptional induction of PIK3CA in tumor cells is dependent on the oncoprotein Y-box binding protein-1 // Oncogene. -2009. -Vol. 28. -№ 25. -P. 2406-18.
16. Astanehe A., Finkbeiner M.R., Krzywinski M., Fotovati A., Dhillon J., Berquin I.M., Mills G.B., Marra M.A. and Dunn S.E.: MKNK1 is a YB-1 target gene responsible for imparting trastuzumab resistance and can be blocked by RSK inhibition // Oncogene. -2012. -Vol. 31. -№ 41. -P. 4434-46.
17. Azimi M.M. and Mofrad M.R.K.: Higher Nucleoporin-Importinß Affinity at the Nuclear Basket Increases Nucleocytoplasmic Import // PLOS ONE. -2013. -Vol. .-№ . -P.
18. Bader A.G. and Vogt P.K.: Inhibition of protein synthesis by Y box-binding protein 1 blocks oncogenic cell transformation // Mol Cell Biol. -2005. -Vol. 25. -№ 6. -P. 2095106.
19. Bader A.G. and Vogt P.K.: Phosphorylation by Akt Disables the Anti-Oncogenic Activity of YB-1 // Oncogene. -2008. -Vol. 27, 1179-1182.
20. Ban Y., Tan P., Cai J., Li J., Hu M., Zhou Y., Mei Y., Tan Y., Li X., Zeng Z., Xiong W., Li G., Li X., Yi M. abd Xiang B.: LNCAROD is stabilized by m6A methylation and promotes cancer progression via forming a ternary complex with HSPA1A and YBX1 in head and neck squamous cell carcinoma // Mol Oncol. -2020. -Vol. 14. -№ 6. -P. 1282129.
21. Bargou R.C., Jürchott K., Wagener C., Bergmann S., Metzner S., Bommert K., Mapara M.Y., Winzer K.J., Dietel M., Dörken B. and Royer H.D.: Nuclear localization and increased levels of transcription factor YB-1 in primary human breast cancers are associated with intrinsic MDR1 gene expression // Nat Med. -1997. Vol. 3. -P. 447-450.
22. Basaki Y., Hosoi F., Oda Y., Fotovati A., Maruyama Y., Oie S., Ono M., Izumi H., Kohno K., Sakai K., Shimoyama T., Nishio K. and Kuwano M.: Akt-dependent nuclear localization of Y-box-binding protein 1 in acquisition of malignant characteristics by human ovarian cancer cells // Oncogene. -2007. -Vol. 26. -№ 19. -P. 2736-46.
23. Basaki Y., Taguchi K., Izumi H., Murakami Y., Kubo T., Hosoi F., Watari K., Nakano K., Kawaguchi H., Ohno S., Kohno K., Ono M. and Kuwano M.: Y-box binding protein-1 (YB-1) promotes cell cycle progression through CDC6-dependent pathway in human cancer cells // Eur J Cancer. -2010. -Vol. 46. -P. 954-965.
24. Baumhardt J.M., Walker J.S., Lee Y., Shakya B., Brautigam C.A., Lapalombella R., Grishin N. and Chook Y.M.: Recognition of nuclear export signals by CRM1 carrying the oncogenic E571K mutation // Mol Biol Cell. -2020. -Vol. 31. -№ 17. -P. 1879-1891.
25. Beals C.R., Clipstone N.A., Ho S.N. and Crabtree G.R. Nuclear localization of NF-ATc by a calcineurin-dependent, cyclosporin-sensitive intramolecular interaction // Genes Dev. -1997. -Vol. 11. -P. 824-834.
26. Becker S., Corthals G.L., Aebersold R., Groner B., Muller C.W.: Expression of a tyrosine phosphorylated, DNA binding Stat3beta dimer in bacteria // FEBS Lett. -1998. -Vol. 441. -P. 141-147.
27. Bednenko J., Cingolani G. and Gerace L.: Nucleocytoplasmic transport: navigating the channel // Traffic. -2003. -Vol. 4. -P. 127-135.
28.Beg A.A., Ruben S.M., Scheinman R.I., Haskill S., Rosen C.A. and Baldwin A.S. Jr.: I kappa B interacts with the nuclear localization sequences of the subunits of NF-kappa B: a mechanism for cytoplasmic retention // Genes Dev. -1992. -Vol. 6. -P. 1899-1913.
29. Belfield J.L., Whittaker C., Cader M.Z., Chawla S.: Differential effects of Ca2+ and cAMP on transcription mediated by MEF2D and cAMP-response element-binding protein in hippocampal neurons // J Biol Chem. -2006. -Vol. 281. -№ 38. -P. 27724-32.
30. Ben-Efraim I. and Gerace L.: Gradient of increasing affinity of importin beta for nucleoporins along the pathway of nuclear import // J Cell Biol. -2001. -Vol. 152. -№ 2M -P. 411-7.
31. Ben-Yaakov K., Dagan S.Y., Segal-Ruder Y., Shalem O., Vuppalanchi D., Willis D.E., Yudin D., Rishal I., Rother F., Bader M., Blesch A., Pilpel Y., Twiss J.L. and Fainzilber M.: Axonal transcription factors signal retrogradely in lesioned peripheral nerve // EMBO J. -2012. -Vol. 31. -№ 6. -P. 1350-63.
32. Bernad R., van der Velde H., Fornerod M. and Pickersgill H.: Nup358/RanBP2 attaches to the nuclear pore complex via association with Nup88 and Nup214/CAN and plays a supporting role in CRM1-mediated nuclear protein export // Mol Cell Biol. -2004. -Vol. 24. -P. 2373-2384.
33. Bhullar J. and Sollars V.E.: YBX1 expression and function in early hematopoiesis and leukemic cells // Immunogenetics. -2011. -Vol. 63. -№ 6. -P. 337-50.
34. Bischoff F.R., Krebber H., Smirnova E., Dong W. and Ponstingl H.: Co-activation of RanGTPase and inhibition of GTP dissociation by Ran-GTP binding protein RanBP1 // EMBO J. -1995. -Vol. 14. -P. 705-715.
35. Blenkiron C., Hurley D.G., Fitzgerald S., Print C.G. and Lasham A.: Links between the oncoprotein YB-1 and small non-coding RNAs in breast cancer // PLoS One. -2013. -Vol. 8. -№ 11. -e80171.
36. Bogerd H.P., Fridell R.A., Benson R.E., Hua J. and Cullen B.R.: Protein sequence requirements for function of the human T-cell leukemia virus type 1 Rex nuclear export signal delineated by a novel in vivo randomization-selection assay // Mol Cell Biol. -1996. -Vol. 16. -№ 8. -P. 4207-14.
37. Bohnsack M.T., Czaplinski K. and Gorlich D.: Exportin 5 is a RanGTP-dependent dsRNA-binding protein that mediates nuclear export of pre-miRNAs // RNA. -2004. -Vol. 10. -P. 185-191.
38. Bohnsack M.T., Czaplinski K. and Gorlich D.: Exportin 5 is a RanGTP-dependent dsRNA-binding protein that mediates nuclear export of pre-miRNAs // RNA. -2004. -Vol. 10. -P. 185-191.
39. Bordeaux J., Forte S., Harding E., Darshan M.S., Klucevsek K., Moroianu J.: The l2 minor capsid protein of low-risk human papillomavirus type 11 interacts with host nuclear import receptors and viral DNA // J Virol. -2006. -Vol.80. -№ 16. -P. 8259-62.
40. Boruchowicz H., Hawkins J., Cruz-Palomar K. and Lippe R.: The XPO6 Exportin Mediates Herpes Simplex Virus 1 gM Nuclear Release Late in Infection // J Virol. -2020. -Vol. 94. -№ 21. -e00753-20.
41. Bourgeois B., Hutten S., Gottschalk B., Hofweber M., Richter G., Sternat J., Abou-Ajram C., Gobl C., Leitinger G., Graier W.F., Dormann D. and Madl T.: Nonclassical nuclear localization signals mediate nuclear import of CIRBP // Proc Natl Acad Sci USA. -2020. -Vol. 117. -№ 15. -P. 8503-8514.
42. Bourne H.R., Sanders D.A. and McCormick F.: The GTPase superfamily: conserved structure and molecular mechanism // Nature. -1991. -Vol. 349. -P. 117-127.
43. Bouvet P., Matsumoto K. and Wolffe A.P.: Sequence-specific RNA recognition by the Xenopus Y-box proteins. An essential role for the cold shock domain // J Biol Chem. -1995. -Vol. 270. -№ 47. -P. 28297-303.
44. Bouvet P. and Wolffe A.P.: A role for transcription and FRGY2 in masking maternal mRNA within Xenopus oocytes // Cell. -1994. -Vol. 77. -№ 6. -P. 931-41.
45. Brass A.L., Dykxhoorn D.M., Benita Y., Yan N., Engelman A., Xavier R.J., Lieberman J. and Elledge S.J.: Identification of host proteins required for HIV infection through a functional genomic screen // Science. -2008. -Vol. 319. -№ 5865. -P. 921-6.
46. Breitkopf D.M., Jankowski V., Ohl K., Hermann J., Hermert D., Tenbrock K., Liu X., Martin I.V., Wang J., Groll F., Grone E., Floege J., Ostendorf T., Rauen T. and Raffetseder U.: The YB-1:Notch-3 axis modulates immune cell responses and organ damage in systemic lupus erythematosus // Kidney Int. -2020. -Vol. 97. -№ 2. -P. 289303.
47. Briggs L.J., Johnstone R.W., Elliot R.M., Xiao C.Y., Dawson M., Trapani J.A., Jans D.A.: Novel properties of the protein kinase CK2-site-regulated nuclear- localization sequence of the interferon-induced nuclear factor IFI 16 // Biochem J. -2001. -Vol. 353. -Pt 1. -P. 69-77.
48. Bunn C.F., Neidig J.A., Freidinger K.E., Stankiewicz T.A., Weaver B.S., McGrew J. and Allison L.A.: Nucleocytoplasmic shuttling of the thyroid hormone receptor alpha // Mol Endocrinol. -2001. -Vol. 15. -№ 4. -P. 512-33.
49. Buschbeck M. and Ullrich A.: The unique C-terminal tail of the mitogen-activated protein kinase ERK5 regulates its activation and nuclear shuttling // J Biol Chem. -2005. -Vol. 280. -№ 4. -P. 2659-67.
50. Butterfield-Gerson K.L., Scheifele L.Z., Ryan E.P., Hopper A.K. and Parent L.J.: Importin-beta family members mediate alpharetrovirus gag nuclear entry via interactions with matrix and nucleocapsid // J Virol. -2006. -Vol. 80. -№ 4. -P. 1798-806.
51. Caceres J.F., Screaton G.R. and Krainer A.R.: A specific subset of SR proteins shuttles continuously between the nucleus and the cytoplasm // Genes Dev. -1998. -Vol. 12. -№ 1. -P. 55-66.
52. Calado A., Treichel N., Muller E.C., Otto A. and Kutay U.: Exportin-5-mediated nuclear export of eukaryotic elongation factor 1A and tRNA // EMBO J. -2002. -Vol. 21. -P. 6216-6224.
53. Callan H.G., Randall J.T. and Tomlin S.G.: An electron microscope study of the nuclear membrane // Nature. -1949. -Vol. 163. -P. 280
54. Caly L., Wagstaff K.M. and Jans D.A.: Nuclear trafficking of proteins from RNA viruses: potential target for antivirals? // Antiviral Res. -2012. -Vol. 95. -P. 202-206.
55.Camus V., Stamatoullas A., Mareschal S., Viailly P.J., Sarafan-Vasseur N., Bohers E., Dubois S., Picquenot J.M., Ruminy P., Maingonnat C., Bertrand P., Cornic M., Tallon-Simon V., Becker S., Veresezan L., Frebourg T., Vera P., Bastard C., Tilly H. and Jardin F.: Detection and prognostic value of recurrent exportin 1 mutations in tumor and cellfree circulating DNA of patients with classical Hodgkin lymphoma // Haematologica. -2016. -Vol. 101. -№ 9. -P. 1094-101.
56. Cansizoglu A.E., Lee B.J., Zhang Z.C., Fontoura B.M. andChook Y.M.: Structure-based design of a pathway-specific nuclear import inhibitor // Nat Struct Mol Biol. -2007. -Vol. 14. -№ 5. -P. 452-4.
57. Capowski E.E., Esnault S., Bhattacharya S. and Malter J.S.: Y box-binding factor promotes eosinophil survival by stabilizing granulocyte-macrophage colony-stimulating factor mRNA // J Immunol. -2001. -Vol. 167. -№ 10. -P. 5970-6.
58. Carden S., van der Watt P., Chi A., Ajayi-Smith A., Hadley K. and Leaner V.D.: A tight balance of Karyopherin P1 expression is required in cervical cancer cells // BMC Cancer. -2018. -Vol. 18. -№ 1. -P. 1123.
59. Carlon-Andres I., Lagadec F., Pied N., Rayne F., Lafon M.E., Kehlenbach R.H. and Wodiich H.: Nup358 and Transportin 1 Cooperate in Adenoviral Genome Import // J Virol. -2020. -Vol. 94. -№ 10. -e00164-20.
60. Carmody S.R. and Wente S.R.: mRNA nuclear export at a glance // J Cell Sci. -2009. -Vol. 122. -Pt. 12. -P. 1933-7.
61. Castellana B., Aasen T., Moreno-Bueno G., Dunn S.E., Ramón y Cajal S.: Interplay between YB-1 and IL-6 promotes the metastatic phenotype in breast cancer cells // Oncotarget. -2015. -Vol. 6. -№ 35. -P. 38239-56.
62. Cingolani G., Bednenko J., Gillespie M. T. and Gerace L.: Molecular basis for the recognition of a nonclassical nuclear localization signal by importin beta // Mol. Cell. -2002. -Vol. 10. -P. 1345-1353.
63. Ciufo L.F. and Brown J.D.: Nuclear export of yeast signal recognition particle lacking srp54p by the Xpo1p/Crm1p NES-dependent pathway // Curr Biol. -2000.-Vol. 10. -R882.
64. Chan C.K. and Jans D.A.: Synergy of importin alpha recognition and DNA binding by the yeast transcriptional activator GAL4 // FEBS Lett. -1999. -Vol. 462. -№ 1-2. -P. 221-4.
65.Chan C.K. and Jans D.A.: Enhancement of MSH receptor- and GAL4-mediated gene transfer by switching the nuclear import pathway // Gene Ther. -2001. -Vol. 8. -№ 2. -P. 166-71.
66. Chang Y.W., Mai R.T., Fang W.H., Lin C.C., Chiu C.C. and Wu Lee Y.H.: YB-1 disrupts mismatch repair complex formation, interferes with MutSa recruitment on mismatch and inhibits mismatch repair through interacting with PCNA // Oncogene. -2014. -Vol. 33. -№ 43. -P. 5065-77.
67. Chansky H.A., Hu, M, Hickstein, D.D and Yang, L.: Oncogenic TLS/ERG and EWS/Fli-1 fusion proteins inhibit RNA splicing mediated by YB-1 protein // Cancer Res. -2001. -Vol. 61. -P. 3586-3590.
68. Chao T.H., Hayashi M., Tapping R.I., Kato Y. and Lee J.D.: MEKK3 directly regulates MEK5 activity as part of the big mitogen-activated protein kinase 1 (BMK1) signaling pathway // J Biol Chem. -1999. -Vol. 274. -№ 51. -P. 36035-8.
69. Chao H.M., Huang H.X., Chang P.H., Tseng K.C., Miyajima A. and Chern E.: Y-box binding protein-1 promotes hepatocellular carcinoma-initiating cell progression and tumorigenesis via Wnt/p-catenin pathway // Oncotarget. -2017. -Vol. 8. -№ 2. -P. 26042616.
70.Chatterjee M., Rancso C., Stühmer T., Eckstein N., Andrulis M., Gerecke C., Lorentz H., Royer H.D. and Bargou R.C.: The Y-box binding protein YB-1 is associated with progressive disease and mediates survival and drug resistance in multiple myeloma // Blood. -2008. -Vol. 111. -№ 7. -P. 3714-22.
71. Chattopadhyay R., Das S., Maiti A.K., Boldogh I., Xie J., Hazra T.K., Kohno K., Mitra S. and Bhakat K.K.: Regulatory role of human AP-endonuclease (APE1/Ref-1) in YB-1-mediated activation of the multidrug resistance gene MDR1 // Mol Cell Biol. -2008. -Vol. 28. -№ 23. -P. 7066-80.
72. Chen X., Vinkemeier U., Zhao Y., Jeruzalmi D., Darnell J.E. Jr., Kuriyan J.: Crystal structure of a tyrosine phosphorylated STAT-1 dimer bound to DNA // Cell. -1998. -Vol. 93. -P. 827-839.
73. Chen C.Y., Gherzi R., Andersen J.S., Gaietta G., Jürchott K., Royer H.D., Mann M. and Karin M.: Nucleolin and YB-1 are required for JNK-mediated interleukin-2 mRNA stabilization during T-cell activation // Genes Dev. -2000. -Vol. 14. -№ 10. -P. 1236-48.
74. Chen M., Nowak D.G., Narula N., Robinson B., Watrud K., Ambrico A., Herzka T.M., Zeeman M.E., Minderer M., Zheng W., Ebbesen S.H., Plafker K.S., Stahlhut C., Wang V.M.Y., Wills L., Nasar A., Castillo-Martin M., Cordon-Cardo C., Wilkinson J.E., Powers S., Sordella R., Altorki N.K., Mittal V., Stiles B.M., Plafker S.M., Trotman L.C.: The nuclear transport receptor Importin-11 is a tumor suppressor that maintains PTEN protein // J Cell Biol. -2017. -Vol. 216. -№.3. -P. 641-656.
75. Chen X., Li A., Sun B.-F., Yang Y., Han Y.-N., Yuan X., Chen R.-X., Wei W.-S., Liu Y., Gao C.-C., Chen Y.-S., Zhang M., Ma X.-D., Liu Z.-W., Luo J.-H., Lyu C., Wang H.-L., Ma J., Zhao Y.-L., Zhou F.-J., Huang Y., Xie D., Yang Y.-G.: 5-methylcytosine promotes pathogenesis of bladder cancer through stabilizing mRNAs // Nat Cell Biol. -2019. -Vol. 21. -№ 8. -P. 978-990.
76.Chernov K.G., Mechulam A., Popova N.V., Pastre D., Nadezhdina E.S., O.V. Skabkina, Shanina N.A., Vasiliev V.D., Tarrade A., Melki J., Joshi V., Baconnais S., Toma F., Ovchinnikov L.P. and Curmi P.A.: YB-1 promotes microtubule assembly in vitro through interaction with tubulin and microtubules // BMC Biochem. -2008. -Vol. 9. -№ 23.
77. Cho H., Park O.H., Park J., Ryu I., Kim J., Ko J. and Kim Y.K.: Glucocorticoid receptor interacts with PNRC2 in a ligand-dependent manner to recruit UPF1 for rapid mRNA degradation // Proc Natl Acad Sci USA. -2015. -Vol. 112. -№ 13. -P. E1540-9.
78. Chook Y.M. and Süel K.E.: Nuclear import by karyopherin-ßs: Recognition and inhibition // Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Cell Research. -2011. -Vol. 1813. -№ 9. -P. 1593-1606
79. Choong O.K., Chen C.Y., Zhang J., Lin J.H., Lin P.J., Ruan S.C., Kamp T.J. and Hsieh P.C.H.: Hypoxia-induced H19/YB-1 cascade modulates cardiac remodeling after infarction // Theranostics. -2019. -Vol. 9. -№ 22. -P. 6550-6567.
80. Choudhary C., Kumar C., Gnad F., Nielsen M.L., Rehman M., Walther T.C., Olsen J.V., Mann M.: Lysine acetylation targets protein complexes and co-regulates major cellular functions // Science. -2009. -Vol. 325. -№. 5942. -P. 834-40.
81. Christ F., Thys W., De Rijck J., Gijsbers R., Albanese A., Arosio D., Emiliani S., Rain J.C., Benarous R., Cereseto A. and Debyser Z.: Transportin-SR2 imports HIV into the nucleus // Curr Biol. -2008. -Vol. 18. -№ 16. -P. 1192-202.
82. Chua P.J., Lim J.P., Guo T.T., Khanna P., Hu Q., Bay B.H. and Baeg G.H.: Y-box binding protein-1 and STAT3 independently regulate ATP-binding cassette transporters in the chemoresistance of gastric cancer cells // Int J Oncol. -2018. -Vol. 53. -№ 6. -P. 2579-2589.
83. Chuderland D. and Seger R.: Protein-protein interactions in the regulation of the extracellular signal-regulated kinase // Mol Biotechnol. -2005. -Vol. 29. -№ 1. -P. 57-74.
84. Chuderland D., Konson A. and Seger R.: Identification and characterization of a general nuclear translocation signal in signaling proteins // Mol Cell. -2008. -Vol. 31. -№ 6. -P. 850-61.
85. Chug H., Trakhanov S., Hülsmann B.B., Pleiner T. and Görlich D.: Crystal structure of the metazoan Nup62^Nup58^Nup54 nucleoporin complex // Science. -2015. -Vol. 350. -№ 6256. -P. 106-10.
86. Cui W.Q., Wang S.T., Pan D., Chang B. and Sang L.X.: Caffeine and its main targets of colorectal cancer // World J Gastrointest Oncol. -2020. -Vol. 12. -№ 2. -P. 149-172.
87. Clancy J.W., Zhang Y., Sheehan C., D'Souza-Schorey C.: An ARF6-Exportin-5 axis delivers pre-miRNA cargo to tumour microvesicles // Nat Cell Biol. -2019. -Vol. 21. -№ 7. -P. 856-866.
88. Cobbold L.C., Spriggs K.A., Haines S.J., Dobbyn H.C., Hayes C., de Moor C.H., Lilley K.S., Bushell M. and Willis A.E.: Identification of internal ribosome entry segment (IRES)-trans-acting factors for the Myc family of IRESs // Mol Cell Biol. -2008. -Vol. 28. -№ 1. -P. 40-9.
89.Cobbold L.C., Wilson L.A., Sawicka K., King H.A., Kondrashov A.V., Spriggs K.A., Bushell M. and Willis A.E.: Upregulated c-myc expression in multiple myeloma by internal ribosome entry results from increased interactions with and expression of PTB-1 and YB-1 // Oncogene. -2010. -Vol. 29. -№ 19. -P. 2884-91.
90. Cohen S.B., Ma W., Valova V.A., Algie M., Harfoot R., Woolley A.G., Robinson P.J. and Braithwaite A.W.: Genotoxic stress-induced nuclear localization of oncoprotein YB-1 in the absence of proteolytic processing // Oncogene. -2010. -Vol. 29. -№ 3. -P. 403-10.
91. Coles L.S., Diamond P., Lambrusco L., Hunter J., Burrows J., Vadas M.A. and Goodall G.J.: A novel mechanism of repression of the vascular endothelial growth factor promoter, by single strand DNA binding cold shock domain (Y-box) proteins in normoxic fibroblasts // Nucleic Acids Res. -2002. -Vol. 30. -№ 22. -P. 4845-54.
92. Coles L.S., Bartley M.A., Bert A., Hunter J., Polyak S., Diamond P., Vadas M.A. and Goodall G.J.: A multi-protein complex containing cold shock domain (Y-box) and polypyrimidine tract binding proteins forms on the vascular endothelial growth factor
mRNA. Potential role in mRNA stabilization // Eur J Biochem. -2004. -Vol. 271. -№ 3. -P. 648-60.
93. Coles L.S., Lambrusco L., Burrows J., Hunter J., Diamond P., Bert A.G., Vadas M.A., Goodall G.J.: Phosphorylation of cold shock domain/Y-box proteins by ERK2 and GSK3beta and repression of the human VEGF promoter // FEBS Lett. -2005. -Vol. 579. -№ 24. -P. 5372-8.
94. Cong Z., Diao Y., Li X., Jiang Z., Xu Y., Zhou H., Qiang Y., Wu H. and Shen Y:. Long non-coding RNA linc00665 interacts with YB-1 and promotes angiogenesis in lung adenocarcinoma // Biochem Biophys Res Commun. -2020. -Vol. 527. -№ 2. -P. 545-552.
95. Conti E. and Izaurralde E.: Nucleocytoplasmic transport enters the atomic age // Curr Opin Cell Biol. -2001. -Vol. 13. -P. 310-319.
96. Conti E., Muller C.W. and Stewart M.: Karyopherin flexibility in nucleocytoplasmic transport // Curr Opin Struct Biol. -2006. -Vol. 16. -P. 237-244.
97. Cook, A., Bono, F., Jinek, M. and Conti, E.: Structural biology of nucleocytoplasmic transport // Annu. Rev. Biochem. -2007. -Vol. 76. -P. 647-671.
98. Côté J., Boisvert F.M., Boulanger M.C., Bedford M.T. and Richard S.: Sam68 RNA binding protein is an in vivo substrate for protein arginine N-methyltransferase 1 // Mol Biol Cell. -2003. -Vol. 14. -№ 1. -P. 274-87.
99. Craig E., Zhang Z.K., Davies K.P. and Kalpana G.V.: A masked NES in INI1/hSNF5 mediates hCRM1-dependent nuclear export: implications for tumorigenesis // EMBO J. -2002. -Vol. 21. -P 31-42.
100. Cronshaw J.M., Krutchinsky A.N., Zhang W., Chait B.T. and Matunis M.J.: Proteomic analysis of the mammalian nuclear pore complex // J Cell Biol. -2002. -Vol. 158. -P. 915-927.
101. Darnell J.E. Jr.: STATs and gene regulation // Science. -1997. -Vol. 277. -P. 16301635.
102. Das S., Chattopadhyay R., Bhakat K.K., Boldogh I., Kohno K., Prasad R., Wilson S.H. and Hazra T.K.: Stimulation of NEIL2-mediated oxidized base excision repair via YB-1 interaction during oxidative stress // J Biol Chem. -2007. -Vol. 282. -P. 2847428484.
103. Davies A.H., Barrett I., Pambid M.R., Hu K., Stratford A.L., Freeman S., Berquin I.M., Pelech S., Hieter P., Maxwell C. and Dunn S.E.: YB-1 evokes susceptibility to cancer through cytokinesis failure, mitotic dysfunction and HER2 amplification // Oncogene. -2011. -Vol. 30. -№ 34.- P. 3649-60.
104. Davies A.H., Reipas K.M., Pambid M.R., Berns R., Stratford A.L., Fotovati A., Firmino N., Astanehe A., Hu K., Maxwell C., Mills G.B. and Dunn S.E.: YB-1 transforms human mammary epithelial cells through chromatin remodeling leading to the development of basal-like breast cancer // Stem Cells. -2014. -Vol. 32. -№ 6. -P. 1437-50.
105. Davydova E.K., Evdokimova V.M., Ovchinnikov L.P. and Hershey J.W.: Overexpression in COS cells of p50, the major core protein associated with mRNA, results in translation inhibition // Nucleic Acids Res. -1997. -Vol. 25. -№ 14. -P. 2911-6.
106. De Houwer S., Demeulemeester J., Thys W., Taltynov O., Zmajkovicova K., Christ F. and Debyser Z.: Identification of residues in the C-terminal domain of HIV-1 integrase that mediate binding to the transportin-SR2 protein // J Biol Chem. -2012. -Vol. 287. -№ 41. -P. 34059-68.
107. De Iaco A. and Luban J.: Inhibition of HIV-1 infection by TNPO3 depletion is determined by capsid and detectable after viral cDNA enters the nucleus // Retrovirology. -2011. -Vol. 8. -P. 98.
108.De Iaco A., Santoni F., Vannier A., Guipponi M., Antonarakis S. and Luban J.: TNPO3 protects HIV-1 replication from CPSF6-mediated capsid stabilization in the host cell cytoplasm // Retrovirology. -2013. -Vol. 10. -P. 20.
109. de Souza-Pinto N.C., Mason P.A., Hashiguchi K., Weissman L., Tian J., Guay D., Lebel M., Stevnsner T.V., Rasmussen L.J. and Bohr V.A.: Novel DNA mismatch-repair activity involving YB-1 in human mitochondria // DNA Repair (Amst). -2009. -Vol. 8. -№ 6. -P. 704-19.
110.Deckert J., Hartmuth K., Boehringer D., Behzadnia N., Will C.L., Kastner B., Stark H., Urlaub H. and Luhrmann R.: Protein composition and electron microscopy structure of affinity-purified human spliceosomal B complexes isolated under physiological conditions // Mol Cell Biol. -2006. -Vol. 26. -№ 14. -P. 5528-43.
111. Debler E.W., Ma Y., Seo H.S., Hsia K.C., Noriega T.R., Blobel G. and Hoelz A.: A fence-like coat for the nuclear pore membrane // Mol Cell. -2008. -Vol. 32. -P. 815826.
112. Demeulemeester J., Blokken J., De Houwer S., Dirix L., Klaassen H., Marchand A., Chaltin P., Christ F. and Debyser Z.: Inhibitors of the integrase-transportin-SR2 interaction block HIV nuclear import // Retrovirology. -2018. -Vol. 15. -№ 1. -P. 5.
113. Deng S.J., Chen H.Y., Ye Z., Deng S.C., Zhu S., Zeng Z., He C., Liu M.L., Huang K., Zhong J.X., Xu F.Y., Li Q., Liu Y., Wang C.Y. and Zhao G.: Hypoxia-induced LncRNA-BX111 promotes metastasis andprogression of pancreatic cancer through regulating ZEB1 transcription // Oncogene. -2018. -Vol. 37. -P. 5811-5828
114. Desmond C.R., Atwal R.S., Xia J. and Truant R.: Identification of a karyopherin (31/p2 proline-tyrosine nuclear localization signal in huntingtin protein // J Biol Chem. -2012. -Vol. 287. -№ 47. -P. 39626-33.
115. Devos D., Dokudovskaya S., Williams R., Alber F., Eswar N., Chait B.T., Rout M.P. and Sali A.: Simple fold composition and modular architecture of the nuclear pore complex // Proc Natl Acad Sci USA. -2006. -Vol. 103. -P. 2172-2177.
116. Dey A., Robitaille M., Remke M., Maier C., Malhotra A., Gregorieff A., Wrana J.L., Taylor M.D., Angers S. and Kenney A.M.: YB-1 is elevated in medulloblastoma
and drives proliferation in Sonic hedgehog-dependent cerebellar granule neuron progenitor cells and medulloblastoma cells // Oncogene. -2016. -Vol. 35. -№ 32. -P. 4256-68.
117. Dhawan L., Liu B., Pytlak A., Kulshrestha S., Blaxall B.C. and Taubman M.B.: Y-box binding protein 1 and RNase UK114 mediate monocyte chemoattractant protein 1 mRNA stability in vascular smooth muscle cells // Mol Cell Biol. -2012. -Vol. 32. -№ 18. -P. 376875.
118. Dhillon J., Astanehe A., Lee C., Fotovati A., Hu K. and Dunn S.E.: The expression of activated Y-box binding protein-1 serine 102 mediates trastuzumab resistance in breast cancer cells by increasing CD44+ cells // Oncogene. -2010. -Vol. 29. -№ 47. -P. 6294-300.
119. Di Costanzo A., Troiano A., di Martino O., Cacace A., Natale C.F., Ventre M., Netti P., Caserta S., Pollice A., La Mantia G. and Calabro V.: The p63 protein isoform ANp63a modulates Y-box binding protein 1 in its subcellular distribution and regulation of cell survival and motility genes // J Biol Chem. -2012. -Vol. 287. -№ 36. -P. 30170-80.
120. di Martino O., Troiano A., Guarino A.M., Pollice A., Vivo M., La Mantia G. and Calabro V.: ANp63a controls YB-1 protein stability: evidence on YB-1 as a new player in keratinocyte differentiation // Genes Cells. -2016. -Vol. 21. -№ 6. -3. -P. 648-60.
121. Diaz-Griffero F.: The Role of TNPO3 in HIV-1 Replication // Mol Biol Int. -2012. -Vol. 2012. -P. 868597.
122. Diaz-Lagares A., Crujeiras A.B., Lopez-Serra P., Soler M., Setien F., Goyal A., Sandoval J., Hashimoto Y., Martinez-Cardús A., Gomez A., Heyn H., Moutinho C., Espada J., Vidal A., Paúles M., Galán M., Sala N., Akiyama Y., Martínez-Iniesta M., Farré L., Villanueva A., Gross M., Diederichs S., Guil S. and Esteller M.: Epigenetic inactivation of the p53-induced long noncoding RNA TP53 target 1 in human cancer // Proc Natl Acad Sci USA. -2016. -Vol. 113. -№ 47. -E7535-E7544.
123. Dimartino D., Colantoni A., Ballarino M., Martone J., Mariani D., Danner J., Bruckmann A., Meister G., Morlando M. and Bozzoni I.: The Long Non-coding RNA lnc-31 Interacts with Rock1 mRNA and Mediates Its YB-1-Dependent Translation // Cell Rep. -2018. -Vol. 23. -№ 3. -P. 733-740.
124. Dingwall C., Robbins J, Dilworth S.M., Roberts B., Richardson W.D.: The nucleoplasmin nuclear location sequence is larger and more complex than that of SV-40 large T antigen // J Cell Biol. -1988. -Vol. 107. -№3. -P. 841-849.
125. Dishinger J.F., Kee H.L., Jenkins P.M., Fan S., Hurd T.W., Hammond J.W., Truong Y.N., Margolis B., Martens J.R. and Verhey K.J.: Ciliary entry of the kinesin-2 motor KIF17 is regulated by importin-ß2 and RanGTP // Nature Cell Biology. -2010. -Vol. 12. -P. 703-710
126. Döhner K., Ramos-Nascimento A., Bialy D., Anderson F., Hickford-Martinez A., Rother F., Koithan T., Rudolph K., Buch A., Prank U., Binz A., Hügel S., Lebbink R.J., Hoeben R.C., Hartmann E., Bader M., Bauerfeind R. and Sodeik B.: Importin a1 is
required for nuclear import of herpes simplex virus proteins and capsid assembly in fibroblasts and neurons // PLoS Pathog. -2018. -Vol. 14. -№ 1. -e1006823.
127. Dong X., Biswas A., Suel K.E., Jackson L.K., Martinez R., Gu H. and Chook Y.M.: Structural basis for leucine-rich nuclear export signal recognition by CRM1 // Nature. -2009a. -Vol. 458. -P. 1136-1141.
128. Dong X., Biswas A. and Chook Y.M.: Structural basis for assembly and disassembly of the CRM1 nuclear export complex // Nat Struct Mol Biol. -2009b. -Vol. 16. P. 558-560.
129. Dong W., Wang H., Shahzad K., Bock F., Al-Dabet M.M., Ranjan S., Wolter J., Kohli S., Hoffmann J., Dhople V.M., Zhu C., Lindquist J.A., Esmon C.T., Grone E., Grone H.J., Madhusudhan T., Mertens P.R., Schluter D. and Isermann B.: Activated Protein C Ameliorates Renal Ischemia-Reperfusion Injury by Restricting Y-Box Binding Protein-1 Ubiquitination // J Am Soc Nephrol. -2015. -Vol. 26. -№ 11. -P. 2789-99.
130. Dorfman J. and Macara I.G.: STRADalpha regulates LKB1 localization by blocking access to importin-alpha, and by association with Crm1 and exportin-7 // Mol Biol Cell. -2008. -Vol. 19. -P. 1614-1626.
131. Dormann D., Rodde R., Edbauer D., Bentmann E., Fischer I., Hruscha A., Than M.E., Mackenzie I.R., Capell A., Schmid B., Neumann M. and Haass C.: ALS-associated fused in sarcoma (FUS) mutations disrupt Transportin-mediated nuclear import // EMBO J. -2010. -Vol. 29. -№ 16. -P. 2841-57.
132. Dormann D., Madl T., Valori C.F., Bentmann E., Tahirovic S., Abou-Ajram C., Kremmer E., Ansorge O., Mackenzie I.R., Neumann M. and Haass C.: Arginine methylation next to the PY-NLS modulates Transportin binding and nuclear import of FUS // EMBO J. -2012. -Vol. 31. -№ 22. -P. 4258-75.
133. Dopie J., Skarp K.-P., Rajakyla E.K., Tanhuanpaa K., Vartiainen M.K.: Active maintenance of nuclear actin by importin 9 supports transcription // Proc Natl Acad Sci U S A. -2012. -Vol. 109. -№ 9. E544-52.
134. Du J., Zhang G., Qiu H., Yu H. and Yuan W.: A novel positive feedback loop of linc02042 and c-Myc mediated by YBX1 promotes tumorigenesis and metastasis in esophageal squamous cell carcinoma // Cancer Cell Int. -2020. -Vol. 20. -P. 75.
135. Durnberger G., Burckstummer T., Huber K., Giambruno R., Doerks T., Karayel E., Burkard T.R., Kaupe I., Muller A.C., Schonegger A., Ecker G.F., Lohninger H., Bork P., Bennett K.L., Superti-Furga G. and Colinge J.: Experimental characterization of the human non-sequence-specific nucleic acid interactome // Genome Biol. -2013. -Vol. 14. -№ 7. -R81.
136. Dutertre M., Sanchez G., De Cian M.C., Barbier J., Dardenne E., Gratadou L., Dujardin G., Le Jossic-Corcos C., Corcos L. and Auboeuf D.: Cotranscriptional exon skipping in the genotoxic stress response // Nat Struct Mol Biol. -2010. -Vol. 17. -№ 11. -P. 1358-66.
137. El-Naggar A.M., Somasekharan S.P., Wang Y., Cheng H., Negri G.L., Pan M., Wang X.Q., Delaidelli A., Rafn B., Cran J., Zhang F., Zhang H., Colborne S., Gleave M., Mandinova A., Kedersha N., Hughes C.S., Surdez D., Delattre O., Wang Y., Huntsman D.G., Morin G.B. and Sorensen P.H.: Class I HDAC inhibitors enhance YB-1 acetylation and oxidative stress to block sarcoma metastasis // EMBO Rep. -2019. -Vol. 20. -№ 12. -e48375.
138. Eliseeva I.A., Kim E.R., Guryanov S.G., Ovchinnikov L.P., Lyabin D.N.: Y-box-binding protein 1 (YB-1) and its functions // Biochemistry (Mosc). -2011. -Vol. 76. -№ 13. -P. 1402-33.
139. En-Nia A., Yilmaz E., Klinge U., Lovett D.H., Stefanidis I and Mertens P.R.: Transcription factor YB-1 mediates DNA polymerase alpha gene expression // J Biol Chem. -2005. -Vol. 280. -P. 7702-7711.
140. Englmeier L., Fornerod M., Bischoff F.R., Petosa C., Mattaj I.W. and Kutay U.: RanBP3 influences interactions between CRM1 and its nuclear protein export substrates // EMBO Rep. -2001. -Vol. 2. -P. 926-932.
141. Erickson E.S., Mooren O.L., Moore D., Krogmeier J.R. and Dunn R.C.: The role of nuclear envelope calcium in modifying nuclear pore complex structure // Can J Physiol Pharmacol. -2006. -Vol. 84. -P. 309-318.
142. Esnault S. and Malter J.S.: Hyaluronic acid or TNF-alpha plus fibronectin triggers granulocyte macrophage-colony-stimulating factor mRNA stabilization in eosinophils yet engages differential intracellular pathways and mRNA binding proteins // J Immunol. -2003. -Vol. 171. -№ 12. -P. 6780-7.
143. Evdokimova V.M., Wei C.L., Sitikov A.S., Simonenko P.N., Lazarev O.A., Vasilenko K.S., Ustinov V.A., Hershey J.W. and Ovchinnikov L.P.: The major protein of messenger ribonucleoprotein particles in somatic cells is a member of the Y-box binding transcription factor family // J Biol Chem. -1995. -Vol. 270. -№ 7. -P. 3186-92.
144. Evdokimova V.M., Kovrigina E.A., Nashchekin D.V., Davydova E.K., Hershey J.W. and Ovchinnikov L.P.: The major core protein of messenger ribonucleoprotein particles (p50) promotes initiation of protein biosynthesis in vitro // J Biol Chem. -1998. -Vol. 273. -№ 6. -P. 3574-81.
145. Evdokimova V., Ruzanov P., Imataka H., Raught B., Svitkin Y., Ovchinnikov L.P. and Sonenberg N.: The major mRNA-associated protein YB-1 is a potent 5' cap-dependent mRNA stabilizer // EMBO J. -2001. -Vol. 20. -P. 5491-5502.
146. Evdokimova V., Ruzanov P., Anglesio M.S., Sorokin A.V., Ovchinnikov L.P., Buckley J., Triche T.J., Sonenberg N. and Sorensen P.H.: Akt-mediated YB-1 phosphorylation activates translation of silent mRNA species // Mol Cell Biol. -2006. -Vol. 26. -№ 1. -P. 277-92.
147. Evdokimova V., Tognon C., Ng T., Ruzanov P., Melnyk N., Fink D., Sorokin A., Ovchinnikov L.P., Davicioni E., Triche T.J. and Sorensen P.H.B.: Translational
activation of snail1 and other developmentally regulated transcription factors by YB-1 promotes an epithelial-mesenchymal transition // Cancer Cell. -2009. -Vol. 15. -P. 402415.
148. Fagerlund R., Melen K., Kinnunen L., Julkunen I.: Arginine/lysine-rich nuclear localization signals mediate interactions between dimeric STATs and importin alpha 5 // J Biol Chem. -2002. -Vol. 277. -P. 30072-30078.
149. Fagerlund R., Kinnunen L., Kohler M., Julkunen I. and Melen K.: NF-{kappa}B is transported into the nucleus by importin {alpha}3 and importin {alpha}4 // J. Biol. Chem. -2005. -Vol. 280. -P. 15942-15951
150. Fang J., Hong H., Xue X., Zhu X., Jiang L., Qin M., Liang H. and Gao L.: A novel circular RNA, circFAT1(e2), inhibits gastric cancer progression by targeting miR-548g in the cytoplasm and interacting with YBX1 in the nucleus // Cancer Lett. -2019. -Vol. 442. -P. 222-232.
151. Fatima S., Wagstaff K.M., Lieu K.G., Davies R.G., Tanaka S.S., Yamaguchi Y.L., Loveland K.L., Tam P.P. and Jans D.A.: Interactome of the inhibitory isoform of the nuclear transporter Importin 13 // Biochim Biophys Acta Mol Cell Res. -2017. -Vol. 1864. -№ 3. -P. 546-561.
152. Feng W., Benko A.L., Lee J.H., Stanford D.R. and Hopper A.K.: Antagonistic effects of NES and NLS motifs determine S. cerevisiae Rna1p subcellular distribution // J Cell Sci. -1999. -Vol. 112. -Pt. 3. -P. 339-347.
153. Feng M., Xie X., Han G., Zhang T., Li Y., Li Y., Yin R., Wang Q., Zhang T., Wang P., Hu J., Cheng Y., Gao Z., Wang J., Chang J., Cui M., Gao K., Chai J., Liu W., Guo C., Li S., Liu L., Zhou F., Chen J. and Zhang H.: YBX1 is required for maintaining myeloid leukemia cell survival by regulating BCL2 stability in an m6A-dependent manner // Blood. -2021. -Vol. 138. № 1. -P. 71-85.
154. Fernandez J., Machado A.K., Lyonnais S., Chamontin C., Gartner K., Leger T., Henriquet C., Garcia C., Portilho D.M., Pugniere M., Chaloin L., Muriaux D., Yamauchi Y., Blaise M., Nisole S. and Arhel N.J.: Transportin-1 binds to the HIV-1 capsid via a nuclear localization signal and triggers uncoating // Nat Microbiol. -2019. -Vol. 4. -№ 11. -P. 1840-1850.
155.Ferreira A.R., Bettencourt M., Alho I., Costa A.L., Sousa A.R., Mansinho A., Abreu C., Pulido C., Macedo D., Vendrell I., Pacheco T.R., Costa L. and Casimiro S.: Serum YB-1 (Y-box binding protein 1) as a biomarker of bone disease progression in patients with breast cancer and bone metastases // J Bone Oncol. -2017. -Vol. 6. -P. 16-21.
156. Ferrigno P., Posas F., Koepp D., Saito H. and Silver P.A.: Regulated nucleo/cytoplasmic exchange of HOG1 MAPK requires the importin beta homologs NMD5 and XPO1 // EMBO J. -1998. -Vol. 17. -P. 5606-5614.
157. Field M.C. and Dacks J.B.: First and last ancestors: reconstructing evolution of the endomembrane system with ESCRTs, vesicle coat proteins, and nuclear pore complexes // Curr Opin Cell Biol. -2009. -Vol. 21. -P. 4-13.
158. Figueroa A.A., Fasano J.D., Martinez-Morilla S., Venkatesan S., Kupfer G. and Hattangadi S.M.: miR-181a regulates erythroid enucleation via the regulation of Xpo7 expression // Haematologica. -2018. -Vol. 103. -№ 8. -e341-e344.
159. Fineberg K., Fineberg T., Graessmann A., Luedtke N.W., Tor Y., Lixin R., Jans D.A., Loyter A.: Inhibition of nuclear import mediated by the Rev-arginine rich motif by RNA molecules // Biochemistry. -2003. -Vol. 42. -№ 9. -P. 2625-33.
160. Finkbeiner M.R., Astanehe A., To K., Fotovati A., Davies A.H., Zhao Y., Jiang H., Stratford A.L., Shadeo A., Boccaccio C., Comoglio P., Mertens P.R., Eirew P., Raouf A., Eaves CJ. and Dunn S.E.: Profiling YB-1 target genes uncovers a new mechanism for MET receptor regulation in normal and malignant human mammary cells // Oncogene. -2009. -Vol. 28. -№ 11. -P. 1421-31.
161. Fischer U., Huber J., Boelens W.C., Mattaj I.W. and Luhrmann R.: The HIV-1 Rev activation domain is a nuclear export signal that accesses an export pathway used by specific cellular RNAs // Cell. -1995. -Vol. 82. -P. 475-483.
162. Fomina E.E., Pestryakov P.E., Kretov D.A., Zharkov D.O., Ovchinnikov L.P., Curmi P.A. and Lavrik O.I.: Inhibition of Abasic Site Cleavage in Bubble DNA by Multifunctional Protein YB-1 // Journal of Molecular Recognition. -2015. Vol. 28. -№ 2. -P. 117-123.
163. Fontes M.R., Teh T. and Kobe B.: Structural basis of recognition of monopartite and bipartite nuclear localization sequences by mammalian importin-alpha // J Mol Biol. -2000. -Vol. 297. -№ 5. -P. 1183-94.
164. Fontoura B.M., Dales S., Blobel G. and Zhong H.: The nucleoporin Nup98 associates with the intranuclear filamentous protein network of TPR // Proc Natl Acad Sci USA. -2001. -Vol. 98. -№ 6. -P. 3208-13.
165. Fornerod M., Ohno M., Yoshida M. and Mattaj I.W.: CRM1 is an export receptor for leucine-rich nuclear export signals // Cell. -1997. -Vol. 90. -P. 1051-1060.
166.Fraser D.J., Phillips A.O., Zhang X., van Roeyen C.R., Muehlenberg P., En-Nia A. and Mertens P.R.: Y-box protein-1 controls transforming growth factor-beta1 translation in proximal tubular cells // Kidney Int. -2008. -Vol. 73. -P. 724-732.
167. Fried H. and Kutay U.: Nucleocytoplasmic transport: taking an inventory // Cell. Mol. Life Sci. -2003. -Vol. 60. -P. 1659-1688.
168. Friedrich B., Quensel C., Sommer T., Hartmann E. and Köhler M.: Nuclear localization signal and protein context both mediate importin alpha specificity of nuclear import substrates // Mol Cell Biol. -2006. -Vol. 26. -№ 23. -P. 8697-709.
169. Frey S., Richter R.P. and Gorlich D.: FG-rich repeats of nuclear pore proteins form a three-dimensional meshwork with hydrogel-like properties // Science. -2006. -Vol. 314. -P. 815-817.
170. Frey S. and Görlich D.: A saturated FG-repeat hydrogel can reproduce the permeability properties of nuclear pore complexes // Cell. -2007. -Vol. 130. -P. 512-523
171. Frey S. and Görlich D.: FG/FxFG as well as GLFG repeats form a selective permeability barrier with self-healing properties // EMBO J. -2009. -Vol. 28. -P. 25542567
172. Frohnert C., Hutten S., Wälde S., Nath A., Kehlenbach R.H.: Importin 7 and Nup358 promote nuclear import of the protein component of human telomerase // PLoS One. -2014. -Vol. 9. -№ 2. e88887.
173. Fronz K., Güttinger S., Burkert K., Kühn U., Stöhr N., Schierhorn A. and Wahle E.: Arginine methylation of the nuclear poly(a) binding protein weakens the interaction with its nuclear import receptor, transportin // J Biol Chem. -2011. -Vol. 286. -№ 38. -P. 3298694.
174.Frye B.C., Halfter S., Djudjaj S., Muehlenberg P., Weber S., Raffetseder U., En-Nia A., Knott H., Baron J.M., Dooley S., Bernhagen J. and Mertens P.R.: Y-box protein-1 is actively secreted through a non-classical pathway and acts as an extracellular mitogen // EMBO Rep. -2009. -Vol. 10. -№ 7. -P. 783-9.
175. Fujita T., Ito K., Izumi H., Kimura M., Sano M., Nakagomi H., Maeno K., Hama Y., Shingu K., Tsuchiya S., Kohno K. and Fujimori M.: Increased nuclear localization of transcription factor Y-box binding protein 1 accompanied by up-regulation of P-glycoprotein in breast cancer pretreated with paclitaxel // Clin Cancer Res. -2005. -Vol. 11. -№ 24. -Pt. 1. -P. 8837-44.
176. Fujiwara-Okada Y., Matsumoto Y., Fukushi J., Setsu N., Matsuura S., Kamura S., Fujiwara T., Iida K., Hatano M., Nabeshima A., Yamada H., Ono M., Oda Y. and Iwamoto Y.: Y-box binding protein-1 regulates cell proliferation and is associated with clinical outcomes of osteosarcoma // Br J Cancer. -2013. -Vol. 108. -№ 4. -P. 836-47.
177. Fukuda M., Asano S., Nakamura T., Adachi M., Yoshida M., Yanagida M. and Nishida E.: CRM1 is responsible for intracellular transport mediated by the nuclear export signal // Nature. -1997. -Vol. 390. -P. 308-311.
178. Fung H.Y., Fu S.C., Brautigam C.A. and Chook Y.M.: Structural determinants of nuclear export signal orientation in binding to exportin CRM1 // Elife. -2015. -Vol. 8. -№ 4. -e10034.
179. Fung H.Y., Fu S.C. and Chook Y.M.: Nuclear export receptor CRM1 recognizes diverse conformations in nuclear export signals // Elife. -2017. -Vol. 6. -e23961.
180.Gabriel G., Klingel K., Otte A., Thiele S., Hudjetz B., Arman-Kalcek G., Sauter M., Shmidt T., Rother F., Baumgarte S., Keiner B., Hartmann E., Bader M., Brownlee G.G.,
Fodor E. and Klenk H.D.: Differential use of importin-a isoforms governs cell tropism and host adaptation of influenza virus // Nat Commun. -2011. -Vol. 2. -P. 156.
181. Gadal O., Strauss D., Kessl J., Trumpower B., Tollervey D. and Hurt E.: Nuclear export of 60s ribosomal subunits depends on Xpo1p and requires a nuclear export sequence-containing factor, Nmd3p, that associates with the large subunit protein Rpl10p // Mol Cell Biol. -2001. -Vol. 21. -P. 3405-3415.
182. García-Aguirre I., Alamillo-Iniesta A., Rodríguez-Pérez R., Vélez-Aguilera G., Amaro-Encarnación E., Jiménez-Gutiérrez E., Vásquez-Limeta A., Samuel Laredo-Cisneros M., Morales-Lázaro S.L., Tiburcio-Félix R., Ortega A., Magaña J.J., Winder S.J. and Cisneros B.: Enhanced nuclear protein export in premature aging and rescue of the progeria phenotype by modulation of CRM1 activity // Aging Cell. -2019. -Vol. 18. -№ 5. -e13002.
183. García-Santisteban I., Arregi I., Alonso-Mariño M., Urbaneja M.A., Garcia-Vallejo J.J., Bañuelos S. and Rodríguez J.A.: A cellular reporter to evaluate CRM1 nuclear export activity: functional analysis of the cancer-related mutant E571K // Cell Mol Life Sci. -2016. -Vol. 73. -№ 24. -P. 4685-4699.
184. Gaudreault I., Guay D. and Lebel M.: YB-1 promotes strand separation in vitro of duplex DNA containing either mispaired bases or cisplatin modifications, exhibits endonucleolytic activities and binds several DNA repair proteins // Nucleic Acids Res. -2004. -Vol. 32. -№ 1. -P. 316-27.
185. Goldfarb D.S., Corbett A.H., Mason D.A., Harreman M.T. and Adam S.A.: Importin alpha: a multipurpose nuclear-transport receptor // Trends Cell Biol. -2004. -Vol. 14. -P. 505-514.
186. Golomb L., Bublik D.R., Wilder S., Nevo R., Kiss V., Grabusic K., Volarevic S., Oren M.: Importin 7 and exportin 1 link c-Myc and p53 to regulation of ribosomal biogenesis // Mol Cell. -2012. -Vol. 45. -№ 2. -P. 222-32.
187. Gong H., Gao S., Yu C., Li M., Liu P., Zhang G., Song J. and Zheng J.: Effect and mechanism of YB-1 knockdown on glioma cell growth, migration, and apoptosis // Acta Biochim Biophys Sin (Shanghai). -2020. -Vol. 52. -№ 2. -P. 168-179.
188. Gontan C., Güttler T., Engelen E., Demmers J., Fornerod M., Grosveld F.G., Tibboel D., Görlich D., Poot R.A. and Rottier R.J.: Exportin 4 mediates a novel nuclear import pathway for Sox family transcription factors // J Cell Biol. -2009. -Vol. 185. -№ 1. -P. 27-34.
189.Gorlich D., Dabrowski M., Bischoff F.R., Kutay U., Bork P., Hartmann E., Prehn S. and Izaurralde E.: A novel class of RanGTP binding proteins // J Cell Biol. -1997. -Vol. 138. -P. 65-80.
190. Görner W., Durchschlag E., Martinez-Pastor M.T., Estruch F., Ammerer G., Hamilton B., Ruis H., Schüller C.: Nuclear localization of the C2H2 zinc finger protein
Msn2p is regulated by stress and protein kinase A activity // Genes Dev. -1998. -Vol. 12. -№ 4. -P. 586-97.
191. Görner W., Durchschlag E., Wolf J., Brown E.L., Ammerer G., Ruis H., Schüller C.: Acute glucose starvation activates the nuclear localization signal of a stress-specific yeast transcription factor // EMBO J. -2002. -Vol. 21. -№ 1-2. -P. 135-44.
192. Grant C.E. and Deeley R.G.: Cloning and characterization of chicken YB-1: regulation of expression in the liver // Mol Cell Biol. -1993. -Vol. 13. -№ 7. -P. 4186-96.
193. Grespin M.E., Bonamy G.M.C., Roggero V.R., Cameron N.G., Adam L.E., Atchison A.P., Fratto V.M. and Allison L.A.: Thyroid hormone receptor alpha1 follows a cooperative CRM1/calreticulin-mediated nuclear export pathway // J Biol Chem. -2008. -Vol. 283. -№ 37. -P. 25576-25588.
194. Grossman E., Medalia O. And Zwerger M.: Functional architecture of the nuclear pore complex // Annu Rev Biophys. -2012. Vol. 41. -P. 557-584.
195. Grünwald M., Lazzaretti D. and Bono F.: Structural basis for the nuclear export activity of Importin13 // EMBO J. -2013. -Vol. 32. -№ 6. -P. 899-913.
196. Guarino A.M., Troiano A., Pizzo E., Bosso A., Vivo M., Pinto G., Amoresano A., Pollice A., La Mantia G. and Calabro V.: Oxidative Stress Causes Enhanced Secretion of YB-1 Protein that Restrains Proliferation of Receiving Cells // Genes (Basel). -2018. -Vol. 9. -№ 10. -P. 513.
197. Guay D., Gaudreault I., Massip L. and Lebel M.: Formation of a nuclear complex containing the p53 tumor suppressor, YB-1, and the Werner syndrome gene product in cells treated with UV light // Int J Biochem Cell Biol. -2006. -Vol. 38. -№ 8. -P. 1300-13.
198. Guay D., Garand C., Reddy S., Schmutte C. and Lebel M.: The human endonuclease III enzyme is a relevant target to potentiate cisplatin cytotoxicity in Y-box-binding protein-1 overexpressing tumor cells // Cancer Sci. -2008. -Vol. 99. -№ 4. -P. 762-9.
199. Guay D., Evoy A.A., Paquet E., Garand C., Bachvarova M., Bachvarov D. and Lebel M.: The strand separation and nuclease activities associated with YB-1 are dispensable for cisplatin resistance but overexpression of YB-1 in MCF7 and MDA-MB-231 breast tumor cells generates several chemoresistance signatures // Int J Biochem Cell Biol. -2008. -Vol. 40. -№ 11. -P. 2492-507.
200. Guo L., Kim H.J., Wang H., Monaghan J., Freyermuth F., Sung J.C., O'Donovan K., Fare C.M., Diaz Z., Singh N., Zhang Z.C., Coughlin M., Sweeny E.A., DeSantis M.E., Jackrel M.E., Rodell C.B., Burdick J.A., King O.D., Gitler A.D., Lagier-Tourenne C., Pandey U.B., Chook Y.M., Taylor J.P. and Shorter J.: Nuclear-Import Receptors Reverse Aberrant Phase Transitions of RNA-Binding Proteins with Prion-like Domains // Cell. -2018. -Vol. 173. -№ 3. -P. 677-692. -e20.
201. Güttinger S., Mühlhäusser P., Koller-Eichhorn R., Brennecke J., Kutay U.: Transportin2 functions as importin and mediates nuclear import of HuR // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. -2004. -Vol. 101. -P. 2918-2923.
202. Güttler T., Madl T., Neumann P., Deichsel D., Corsini L., Monecke T., Ficner R., Sattler M. and Görlich D.: NES consensus redefined by structures of PKI-type and Rev-type nuclear export signals bound to CRM1 // Nat Struct Mol Biol. -2010. -Vol. 17. -№ 11. -P. 1367-76.
203. Gwizdek C., Ossareh-Nazari B., Brownawell A.M., Evers S., Macara I.G. and Dargemont C.: Minihelix-containing RNAs mediate exportin-5-dependent nuclear export of the double-stranded RNA-binding protein ILF3 // J Biol Chem. -2004. -Vol. 279. -№ 2. -P. 884-91.
204.Ha B., Lee E.B., Cui J., Kim Y. and Jang H.H.: YB-1 overexpression promotes a TGF-ß1-induced epithelial-mesenchymal transition via Akt activation // Biochem Biophys Res Commun. -2015. -Vol. 458. -№ 2. -P. 347-51.
205. Hanssen L., Alidousty C., Djudjaj S., Frye B.C., Rauen T., Boor P., Mertens P.R., van Roeyen C.R., Tacke F., Heymann F., Tittel A.P., Koch A., Floege J., Ostendorf T. and Raffetseder U: YB-1 is an early and central mediator of bacterial and sterile inflammation in vivo // J Immunol. -2013. -Vol. 191. -№ 5. -P. 2604-13.
206. Harada M., Kotake Y., Ohhata T., Kitagawa K., Niida H., Matsuura S., Funai K., Sugimura H., Suda T. and Kitagawa M.: YB-1 promotes transcription of cyclin D1 in human non-small-cell lung cancers // Genes Cells. -2014. -Vol. 19. -№ 6. -P. 504-16.
207. Harel A. and Forbes D.J.: Importin beta: conducting a much larger cellular symphony // Mol Cell. -2004. -Vol. 16. -P. 319-330.
208.Harreman M.T., Kline T.M., Milford H.G., Harben M.B., Hodel A.E., Corbett A.H.: Regulation of nuclear import by phosphorylation adjacent to nuclear localization signals // J. Biol. Chem. -2004. -Vol. 279. -P. 20613-20621.
209. Hartley A.V., Wang B., Mundade R., Jiang G., Sun M., Wei H., Sun S., Liu Y. and Lu T.: PRMT5-mediated methylation of YBX1 regulates NF-kB activity in colorectal cancer // Sci Rep. -2020. -Vol. 10. -№ 1. P. 15934.
210. Hartmuth K., Urlaub H., Vornlocher H.P., Will C.L., Gentzel M., Wilm M. and Lührmann R.: Protein composition of human prespliceosomes isolated by a tobramycin affinity-selection method // Proc Natl Acad Sci USA. -2002. -Vol. 99. -№ 26. -P. 1671924.
211. Hasegawa S.L., Doetsch P.W., Hamilton K.K., Martin A.M., Okenquist S.A., Lenz J. and Boss J.M.: DNA binding properties of YB-1 and dbpA: binding to double-stranded, single-stranded, and abasic site containing DNAs // Nucleic Acids Res. -1991. -Vol. 19. -№ 18. -P. 4915-20.
212. Hattangadi S.M., Martinez-Morilla S., Patterson H.C., Shi J., Burke K., Avila-Figueroa A., Venkatesan S., Wang J., Paulsen K., Görlich D., Murata-Hori M. and Lodish H.F.: Histones to the cytosol: exportin 7 is essential for normal terminal erythroid nuclear maturation // Blood. -2014. -Vol. 124. -№ 12. -P. 1931-40.
213. Hayakawa H., Uchiumi T., Fukuda T., Ashizuka M., Kohno K., Kuwano M. and Sekiguchi M.: Binding capacity of human YB-1 protein for RNA containing 8-oxoguanine // Biochemistry. -2002. -Vol. 41. -№ 42. -P. 12739-44.
214. He X., Wang S., Li M., Zhong L., Zheng H., Sun Y., Lai Y., Chen X., Wei G., Si X., Han Y., Huang S., Li X., Liao W., Liao Y. and Bin J.: Long noncoding RNA GAS5 induces abdominal aortic aneurysm formation by promoting smooth muscle apoptosis // Theranostics. -2019. -Vol. 9. -№ 19. -P. 5558-5576.
215. Hedley M.L., Amrein H. and Maniatis T.: An amino acid sequence motif sufficient for subnuclear localization of an arginine/serine-rich splicing factor // Proc Natl Acad Sci USA. -1995. -Vol. 92. -№ 25. -P. 11524-8.
216. Henderson B.R. and Eleftheriou A.: A comparison of the activity, sequence specificity, and CRM1-dependence of different nuclear export signals // Exp Cell Res. -2000. -Vol. 256. -P. 213-224.
217. Hermert D., Martin I.V., Reiss L.K., Liu X., Breitkopf D.M., Reimer K.C., Alidousty C., Rauen T., Floege J., Ostendorf T., Weiskirchen R. and Raffetseder U.: The nucleic acid binding protein YB-1-controlled expression of CXCL-1 modulates kidney damage in liver fibrosis // Kidney Int. -2020. -Vol. 97. -№ 4. -P. 741-752.
218. Higashi K., Inagaki Y., Fujimori K., Nakao A., Kaneko H. and Nakatsuka I.: Interferon-gamma interferes with transforming growth factor-beta signaling through direct interaction of YB-1 with Smad3 // J Biol Chem. -2003. -Vol. 278. -№ 44. -P. 43470-9.
219. Higashi-Kovtun M.E., Mosca T.J., Dickman D.K., Meinertzhagen I.A., Schwarz T.L.: Importin-beta11 regulates synaptic phosphorylated mothers against decapentaplegic, and thereby influences synaptic development and function at the Drosophila neuromuscular junction // J Neurosci. -2010. -Vol. 30. -№ 15.-P. 5253-68.
220. Hill C.S.: Nucleocytoplasmic shuttling of Smad proteins // Cell Res. -2009. -Vol. 19. -№ 1. -P. 36-46.
221. Hill R., Cautain B., de Pedro N. and Link W.: Targeting nucleocytoplasmic transport in cancer therapy // Oncotarget. -2014. -Vol.5. -P. 11-28.
222. Hindley C.E., Lawrence F.J. and Matthews D.A.: A role for transportin in the nuclear import of adenovirus core proteins and DNA // Traffic. -2007. -Vol. 8. -№ 10. -P. 1313-22.
223. Hinze F., Drewe-Boss P., Milek M., Ohler U., Landthaler M. and Gotthardt M.: Expanding the map of protein-RNA interaction sites via cell fusion followed by PAR-CLIP // RNA Biol. -2018. -Vol. 15. -№ 3. -P. 359-368.
224. Ho J.H., Kallstrom G. and Johnson A.W.: Nmd3p is a Crm1p-dependent adapter protein for nuclear export of the large ribosomal subunit // J Cell Biol. -2000. -Vol. 151. -P. 1057-1066.
225. Hoelz A., Debler E.W. and Blobel G.: The structure of the nuclear pore complex // Annu Rev Biochem. -2011. -Vol. 80. -P. 613-643.
226. Hogarth C.A., Calanni S., Jans D.A. and Loveland K.L.: Importin alpha mRNAs have distinct expression profiles during spermatogenesis // Dev Dyn. -2006. -Vol. 235. -№ 1. -P. 253-62.
227. Hogarth C.A., Jans D.A. and Loveland K.L.: Subcellular distribution of importins correlates with germ cell maturation // Dev Dyn. -2007. -Vol. 236. -№ 8. -P. 2311-20.
228. Holaska J.M., Black B.E., Love D.C., Hanover J.A., Leszyk J. and Paschal B.M.: Calreticulin Is a receptor for nuclear export // J Cell Biol. -2001. -Vol. 152. -№ 1. -P. 127-40.
229. Holm P.S., Bergmann S., Jurchott K., Lage H., Brand K., Ladhoff A., Mantwill K., Curiel D.T., Dobbelstein M., Dietel M., Gansbacher B. and Royer H.D.: YB-1 relocates to the nucleus in adenovirus-infected cells and facilitates viral replication by inducing E2 gene expression through the E2 late promoter // J Biol Chem. -2002. -Vol. 277. -№ 12. -P. 10427-34.
230. Homer C., Knight D.A., Hananeia L., Sheard P., Risk J., Lasham A., Royds J.A. and Braithwaite A.W.: Y-box factor YB1 controls p53 apoptotic function // Oncogene. -2005. -Vol. 24. -P. 8314-8325.
231. Hopper A.K., Traglia H.M. and Dunst R.W.: The yeast RNA1 gene product necessary for RNA processing is located in the cytosol and apparently excluded from the nucleus // J Cell Biol. -1990. -Vol. 111. -P. 309-321.
232. Hornung T., O'Neill H.A., Logie S.C., Fowler K.M., Duncan J.E., Rosenow M., Bondre A.S., Tinder T., Maher V., Zarkovic J., Zhong Z., Richards M.N., Wei X., Miglarese M.R., Mayer G., Famulok M. and Spetzler D.: ADAPT identifies an ESCRT complex composition that discriminates VCaP from LNCaP prostate cancer cell exosomes // Nucleic Acids Res. -2020. -Vol. 48. -№ 8. -P. 4013-4027.
233. Hou P., Chen F., Yong H., Lin T., Li J., Pan Y., Jiang T., Li M., Chen Y., Song J., Zheng J. and Bai J.: PTBP3 contributes to colorectal cancer growth and metastasis via translational activation of HIF-1a // J Exp Clin Cancer Res. -2019. -Vol. 38. -№ 1. -P. 301.
234. Hu J., Liu L., Gong Y., Zhang L., Gan X., Luo X., Yu T., Zhong X., Deng X., Hu L., Zhang Z. and Dong X.: Linc02527 promoted autophagy in Intrahepatic cholestasis of pregnancy // Cell Death and Disease. -2018. -Vol. 9. -P. 979
235. Huang Y. and Steitz J.A.: SRprises along a messenger's journey // Mol Cell. -2005. -Vol. 17. -№ 5. -P. 613-5.
236. Huan W., Zhang J., Li Y. and Zhi K.: Involvement of DHX9/YB-1 complex induced alternative splicing of Krüppel-like factor 5 mRNA in phenotypic transformation of vascular smooth muscle cells // Am J Physiol Cell Physiol. -2019. -Vol. 317. -№ 2. C262-C269.
237.Huang S., Li X., Zheng H., Si X., Li B., Wei G., Li C., Chen Y., Chen Y., Liao W., Liao Y. and Bin J.: Loss of Super-Enhancer-Regulated circRNA Nfix Induces Cardiac Regeneration After Myocardial Infarction in Adult Mice // Circulation. -2019. -Vol. 139. -№ 25. -P. 2857-2876.
238. Huber J., Cronshagen U., Kadokura M., Marshallsay C., Wada T., Sekine M. and Lührmann R.: Snurportin1, an m3G-cap-specific nuclear import receptor with a novel domain structure // EMBO J. -1998. -Vol. 17. -№ 14. -P. 4114-26.
239. Hübner S., Xiao C.Y. and Jans D.A.: The protein kinase CK2 site (Ser111/112) enhances recognition of the simian virus 40 large T-antigen nuclear localization sequence by importin // J Biol Chem. -1997. -Vol. 272. -№ 27. -P. 17191-5.
240. Hung M.C. and Link W.: Protein localization in disease and therapy // J Cell Sci. -2011. -Vol. 124. -Pt 20. -P. 3381-92.
241. Hurt E., Hannus S., Schmelzl B., Lau D., Tollervey D. and Simos G.: A novel in vivo assay reveals inhibition of ribosomal nuclear export in ran-cycle and nucleoporin mutants // J Cell Biol. -1999. -Vol. 144. -№ 3. -P. 389-401.
242. Hutten S. and Kehlenbach R.H.: Nup214 is required for CRM1-dependent nuclear protein export in vivo. Mol Cell Biol. -2006. -Vol. 26. -P. 6772-6785.
243. Hutten S. and Kehlenbach R.H.: CRM1-mediated nuclear export: to the pore and beyond // Trends Cell Biol. -2007. -Vol. 17. -№ 4. -P. 193-201.
244. Hülsmann B.B., Labokha A.A. and Görlich D.: The permeability of reconstituted nuclear pores provides direct evidence for the selective phase model // Cell. -2012. -Vol. 150. -P. 738-751.
245. Hyogotani A., Ito K., Yoshida K., Izumi H., Kohno K. and Amano J.: Association of nuclear YB-1 localization with lung resistance-related protein and epidermal growth factor receptor expression in lung cancer // Clin Lung Cancer. -2012. -Vol. 13. -№ 5. -P. 375-84.
246. Hwang B., McCool K., Wan J., Wuerzberger-Davis S.M., Young E.W.K., Choi E.Y., Cingolani G., Weaver B.A. and Miyamoto S.: IPO3-mediated Nonclassical Nuclear Import of NF-kappaB Essential Modulator (NEMO) Drives DNA Damage-dependent NF-kappaB Activation // J Biol Chem. -2015. -Vol. 290. -№ 29. -P. 1796717984.
247. Ivanova I.G., Park C.V., Yemm A.I. and Kenneth N.S.: PERK/eIF2a signaling inhibits HIF-induced gene expression during the unfolded protein response via YB1-dependent regulation of HIF1a translation // Nucleic Acids Res. -2018. -Vol. 46. -№ 8. -P. 3878-3890.
248. Ise T., Nagatani G., Imamura T., Kato K., Takano H., Nomoto M., Izumi H., Ohmori H., Okamoto T., Ohga T., Uchiumi T., Kuwano M. and Kohno K.: Transcription factor Y-box binding protein 1 binds preferentially to cisplatin-modified DNA and
interacts with proliferating cell nuclear antigen // Cancer Res. -1999. -Vol. 59. -P. 342346.
249. Isgro T.A. and Schulten K.: Binding dynamics of isolated nucleoporin repeat regions to importin-beta // Structure. -2005. -Vol. 13. -P. 1869-1879.
250. Ito T., Kamijo S., Izumi H., Kohno K., Amano J. and Ito K.: Alteration of Y-box binding protein-1 expression modifies the response to endocrine therapy in estrogen receptor-positive breast cancer // Breast Cancer Res Treat. -2012. -Vol. 133. -№ 1. -P. 145-59.
251.Izaurralde E., Lewis J., Gamberi C., Jarmolowski A., McGuigan C. and Mattaj I.W.: A cap-binding protein complex mediating U snRNA export // Nature. -1995. -Vol. 376. -P. 709-712.
252. Izumi H., Imamura T., Nagatani G., Ise T., Murakami T., Uramoto H., Torigoe T., Ishiguchi H., Yoshida Y., Nomoto M., Okamoto T., Uchiumi T., Kuwano M., Funa K. and Kohno K.: Y box-binding protein-1 binds preferentially to single-stranded nucleic acids and exhibits 3'-->5' exonuclease activity // Nucleic Acids Res. -2001. -Vol. 29. -№ 5. -P. 1200-7.
253. Jady B.E., Ketele A. and Kiss T.: Dynamic association of human mRNP proteins with mitochondrial tRNAs in the cytosol // RNA. -2018. -Vol. 24. -№ 12. -P. 1706-1720.
254. Jain P., Kanagal-Shamanna R., Wierda W., Keating M., Sarwari N., Rozovski U., Thompson P., Burger J., Kantarjian H., Patel K.P., Medeiros L.J., Luthra R. and Estrov Z.: Clinical and molecular characteristics of XPO1 mutations in patients with chronic lymphocytic leukemia // Am J Hematol. -2016. -Vol. 91. -№ 11. -E478-E479.
255. Janz M., Jurchott K., Karawajew L. nand Royer H.D.: Y-box factor YB-1 is associated with the centrosome during mitosis // Gene Funct Dis. -2000. -Vol. 1. -P. 157-59.
256. Janz M., Harbeck N., Dettmar P., Berger U., Schmidt A., Jürchott K., Schmitt M. and Royer H.: Y-box factor YB-1 predicts drug resistance and patient outcome in breast cancer independent of clinically relevant tumor biologic factors HER2, uPA and PAI-1 // Int J Cancer. -2002. -Vol. 97. -P. 278-282.
257. Jardin F., Pujals A., Pelletier L., Bohers E., Camus V., Mareschal S., Dubois S., Sola B., Ochmann M., Lemonnier F., Viailly P.J., Bertrand P., Maingonnat C., Traverse-Glehen A., Gaulard P., Damotte D., Delarue R., Haioun C., Argueta C., Landesman Y., Salles G., Jais J.P., Figeac M., Copie-Bergman C., Molina T.J., Picquenot J.M., Cornic M., Fest T., Milpied N., Lemasle E., Stamatoullas A., Moeller P., Dyer M.J., Sundstrom C., Bastard C., Tilly H. and Leroy K.: Recurrent mutations of the exportin 1 gene (XPO1) and their impact on selective inhibitor of nuclear export compounds sensitivity in primary mediastinal B-cell lymphoma // Am J Hematol. -2016. -Vol. 91. -№ 9. -P. 923-30.
258. Jayavelu A.K., Schnöder T.M., Perner F., Herzog C., Meiler A., Krishnamoorthy G., Huber N., Mohr J., Edelmann-Stephan B., Austin R., Brandt S., Palandri F.,
Schröder N., Isermann B., Edlich F., Sinha A.U., Ungelenk M., Hübner C.A., Zeiser R., Rahmig S., Waskow C., Coldham I., Ernst T., Hochhaus A., Jilg S., Jost P.J., Mullally A., Bullinger L., Mertens P.R., Lane S.W., Mann M. and Heidel F.H.: Splicing factor YBX1 mediates persistence of JAK2-mutated neoplasms // Nature. -2020. -Vol. 588. -№ 7836. -P. 157-163.
259. Jenkins R.H., Bennagi R., Martin J., Phillips A.O., Redman J.E. and Fraser D.J: A conserved stem loop motif in the 5'untranslated region regulates transforming growth factor-ß(1) translation // PLoS One. -2010. -Vol. 5. -№ 8. -e12283.
260. Johnson A.W., Lund E. and Dahlberg J.: Nuclear export of ribosomal subunits // Trends Biochem Sci. -2002. -Vol. 27. -№ 11. -P. 580-5.
261. Johnson T.G., Schelch K., Mehta S., Burgess A. and Reid G.: Why Be One Protein When You Can Affect Many? The Multiple Roles of YB-1 in Lung Cancer and Mesothelioma // Front. Cell Dev. Biol. -2019. -Vol. 7. -P. 221.
262. Julian L. and Olson M.F.: Rho-associated coiled-coil containing kinases (ROCK): structure, regulation, and functions // Small GTPases. -2014. -Vol. 5. -e29846.
263. Jung K., Wu F., Wang P., Ye X., Abdulkarim B.S. and Lai R.: YB-1 regulates Sox2 to coordinately sustain stemness and tumorigenic properties in a phenotypically distinct subset of breast cancer cells // BMC Cancer. -2014. -Vol. 14. -P. 328.
264. Jurchott K., Bergmann S., Stein U., Walther W., Janz M., Manni I., Piaggio G., Fietze E., Dietel M. and Royer H.: YB-1 as a cell cycle-regulated transcription factor facilitating cyclin A and cyclin B1 gene expression // J Biol Chem. -2003. -Vol. 278. -P. 27988-27996.
265. Kaffman A., Rank N.M., O'Shea E.K.: Phosphorylation regulates association of the transcription factor Pho4 with its import receptor Pse1/Kap121 // Genes Dev. -1998. -Vol. 12. -№ 17. -P. 2673-83.
266. Kalab P., Pralle A., Isacoff E.Y., Heald R. and Weis K.: Analysis of a RanGTP-regulated gradient in mitotic somatic cells // Nature. -2006. -Vol. 440. -P. 697-701.
267. Kalderon D., Richardson W.D., Markham A.F., Smith A.E.: Sequence requirements for nuclear location of simian virus 40 large-T antigen // Nature. -1984. -Vol. 311 (5981). -P. 33-38.
268. Kalluri R. and LeBleu VS.: The biology, function, and biomedical applications of exosomes // Science. -2020. -Vol. 367. -№ 6478. -eaau6977.
269. Kamura T., Yahata H., Amada S., Ogawa S., Sonoda T., Kobayashi H., Mitsumoto M., Kohno K., Kuwano M. and Nakano H.: Is nuclear expression of Y box-binding protein-1 a new prognostic factor in ovarian serous adenocarcinoma? // Cancer. -1999. -Vol. 85. -P. 2450-2454.
270. Kang Y., Hu W., Ivan C., Dalton H.J., Miyake T., Pecot C.V., Zand B., Liu T., Huang J., Jennings N.B., Rupaimoole R., Taylor M., Pradeep S., Wu S.Y., Lu C., Wen Y., Huang J., Liu J. and Sood A.K.: Role of focal adhesion kinase in regulating YB-1-
mediated paclitaxel resistance in ovarian cancer // J Natl Cancer Inst. -2013. -Vol. 105. -№ 19. -P. 1485-95.
271. Kapinos L.E., Schoch R.L., Wagner R.S., Schleicher K.D., Lim R.Y.: Karyopherin-centric control of nuclear pores based on molecular occupancy and kinetic analysis of multivalent binding with FG nucleoporins // Biophys. J. -Vol. 106. -P. 17511762.
272. Kappelmann-Fenzl M., Kuphal S., Krupar R., Schadendorf D., Umansky V., Vardimon L., Hellerbrand C. and Bosserhoff A.K.: Complex Formation with Monomeric alpha-Tubulin and Importin 13 Fosters c-Jun Protein Stability and Is Required for c-Jun's Nuclear Translocation and Activity // Cancers (Basel). -2019. -Vol. 11. -№ 11. -P. 1806.
273. Kar A.N., Vargas J.N.S., Chen C.Y., Kowalak J.A., Gioio A.E. and Kaplan B.B.: Molecular determinants of cytochrome C oxidase IV mRNA axonal trafficking // Mol Cell Neurosci. -2017. -Vol. 80. P. 32-43.
274. Kariminia A., Ivison S.M., Leung V.M., Sung S., Couto N., Rozmus J., Rolf N., Narendran A., Dunn S.E., Reid G.S. and Schultz K.R.: Y-box-binding protein 1 contributes to IL-7-mediated survival signaling in B-cell precursor acute lymphoblastic leukemia // Oncol Lett. -2017. -Vol. 13. -№ 1. -P. 497-505.
275. Katahira J.: mRNA export and the TREX complex // Biochim Biophys Acta. -2012. -Vol. 1819. -№ 6. -P. 507-13.
276. Kataoka N., Bachorik J.L. and Dreyfuss G.: Transportin-SR, a nuclear import receptor for SR proteins // J Cell Biol. -1999. -Vol. 145. -№ 6. -P. 1145-52.
277. Kato M., Wang L., Putta S., Wang M., Yuan H., Sun G., Lanting L., Todorov I., Rossi J.J. and Natarajan R.: Post-transcriptional up-regulation of Tsc-22 by Ybx1, a target of miR-216a, mediates TGF-{beta}-induced collagen expression in kidney cells // J Biol Chem. -2010. -Vol. 285. -№ 44. -P. 34004-15.
278. Kawaguchi A., Asaka M.N., Matsumoto K. and Nagata K.: Centrosome maturation requires YB-1 to regulate dynamic instability of microtubules for nucleus reassembly // Sci Rep. -2015. -Vol. 5. -P. 8768.
279. Kehlenbach R.H., Dickmanns A., Kehlenbach A., Guan T. and Gerace L.: A role for RanBP1 in the release of CRM1 from the nuclear pore complex in a terminal step of nuclear export // J Cell Biol. -1999. -Vol. 145. -P. 645-657.
280. Kehlenbach R.H., Assheuer R., Kehlenbach A., Becker J. and Gerace L.: Stimulation of nuclear export and inhibition of nuclear import by a Ran mutant deficient in binding to Ran-binding protein 1 // J Biol Chem. -2001. -Vol. 276. -P. 14524-14531.
281. Kennedy G. and Sugden B.: EBNA-1, a bifunctional transcriptional activator // Mol Cell Biol. -2003. -Vol. 23. -№ 19. -P. 6901-8.
282. Kim K., Choi J., Heo K., Kim H., Levens D., Kohno K., Johnson E.M., Brock H.W. and An W.: Isolation and characterization of a novel H1.2 complex that acts as a
repressor of p53-mediated transcription // J Biol Chem. -2008. -Vol. 283. -№ 14. P. 9113-26.
283. Kim E.R., Selyutina A.A., Buldakov I.A., Evdokimova V., Ovchinnikov L.P. and Sorokin A.V.: The proteolytic YB-1 fragment interacts with DNA repair machinery and enhances survival during DNA damaging stress // Cell Cycle. -2013. -Vol. 12. -№ 24. -P. 3791-803.
284. Kim Y.-K., Kim B., Kim V.N.: Re-evaluation of the roles of DROSHA, Export in 5, and DICER in microRNA biogenesis // Proc Natl Acad Sci USA. -2016. -Vol. 113. -№ 13. -P. 1881-9.
285. Kimura M., Morinaka Y., Imai K., Kose S., Horton P. and Imamoto N.: Extensive cargo identification reveals distinct biological roles of the 12 importin pathways // Elife. -2017. -Vol. 6. -e21184.
286. King H.A., Cobbold L.C., Pichon X., Poyry T., Wilson L.A., Booden H., Jukes-Jones R., Cain K., Lilley K.S., Bushell M. and Willis A.E.: Remodelling of a polypyrimidine tract-binding protein complex during apoptosis activates cellular IRESs // Cell Death Differ. -2014. Vol. 21. -№ 1. -P. 161-71.
287. Kino Y., Washizu C., Aquilanti E., Okuno M., Kurosawa M., Yamada M., Doi H. and Nukina N.: Intracellular localization and splicing regulation of FUS/TLS are variably affected by amyotrophic lateral sclerosis-linked mutations // Nucleic Acids Res. -2011. -39. -№ 7. -P. 2781-98.
288. Kishikawa T., Otsuka M., Yoshikawa T., Ohno M., Ijichi H. and Koike K.: Satellite RNAs promote pancreatic oncogenic processes via the dysfunction of YBX1 // Nat Commun. -2016. -Vol. 7. -P. 13006.
289. Kishikawa T., Otsuka M., Suzuki T., Seimiya T., Sekiba K., Ishibashi R., Tanaka E., Ohno M., Yamagami M. and Koike K.: Satellite RNA Increases DNA Damage and Accelerates Tumor Formation in Mouse Models of Pancreatic Cancer // Mol Cancer Res. -2018. -Vol. 16. -№ 8. -P. 1255-1262.
290. Kitamura R., Sekimoto T., Ito S., Harada S., Yamagata H., Masai H., Yoneda Y. and Yanagi K.: Nuclear import of Epstein-Barr virus nuclear antigen 1 mediated by NPI-1 (Importin alpha5) is up- and down-regulated by phosphorylation of the nuclear localization signal for which Lys379 and Arg380 are essential // J Virol. -2006. -Vol. 80. -№ 4. -P. 197991.
291. Kloks C.P., Spronk C.A., Lasonder E., Hoffmann A., Vuister G.W., Grzesiek S. and Hilbers C.W.: The solution structure and DNA-binding properties of the cold-shock domain of the human Y-box protein YB-1 // J Mol Biol. -2002. -Vol. 316. -№ 2. -P. 317-26.
292. Kobayashi J. and Matsuura Y.: Structural basis for cell-cycle-dependent nuclear import mediated by the karyopherin Kap121p // J Mol Biol. -2013. -Vol. 425. -№ 11. -P. 1852-1868.
293. Kobe B.: Autoinhibition by an internal nuclear localization signal revealed by the crystal structure of mammalian importin alpha // Nat. Struct. Biol. -1999. -Vol. 6. -P. 388397.
294. Köhler A. and Hurt E.: Exporting RNA from the nucleus to the cytoplasm // Nat Rev Mol Cell Biol. -2007. -Vol. 8. -№ 10. -P. 761-73.
295. Kohno K., Izumi H., Uchiumi T., Ashizuka M. and Kuwano M.: The pleiotropic functions of the Y-box-binding protein, YB-1 // Bioessays. -2003. -Vol. 25. -№ 7. -P. 691-8.
296. Koike K., Uchiumi T., Ohga T., Toh S., Wada M., Kohno K. and Kuwano M.: Nuclear translocation of the Y-box binding protein by ultraviolet irradiation // FEBS Lett. -1997. -Vol. 417. -№ 3. -P. 390-4.
297. Komeili A. and O'Shea E.K.: Roles of phosphorylation sites in regulating activity of the transcription factor Pho4 // Science. -1999. -Vol. 284. -P. 977-980.
298. Kondoh K., Terasawa K., Morimoto H. and Nishida E.: Regulation of nuclear translocation of extracellular signal-regulated kinase 5 by active nuclear import and export mechanisms // Mol Cell Biol. -2006. -Vol. 26. -№ 5. -P. 1679-90.
299. Kong X., Li J., Li Y., Duan W., Qi Q., Wang T., Yang Q., Du L., Mao H. and Wang C.: A novel long non-coding RNA AC073352.1 promotes metastasis and angiogenesis via interacting with YBX1 in breast cancer // Cell Death Dis. -2021. -Vol. 12. -№ 7. -P. 670.
300. König R., Zhou Y., Elleder D., Diamond T.L., Bonamy G.M., Irelan J.T., Chiang C.Y., Tu B.P., De Jesus P.D., Lilley C.E., Seidel S., Opaluch A.M., Caldwell J.S., Weitzman M.D., Kuhen K.L., Bandyopadhyay S., Ideker T., Orth A.P., Miraglia L.J., Bushman F.D., Young J.A. and Chanda S.K.: Global analysis of host-pathogen interactions that regulate early-stage HIV-1 replication // Cell. -2008. -Vol. 135. -№ 1. -P. 49-60.
301. König R., Stertz S., Zhou Y., Inoue A., Hoffmann H.H., Bhattacharyya S., Alamares J.G., Tscherne D.M., Ortigoza M.B., Liang Y., Gao Q., Andrews S.E., Bandyopadhyay S., De Jesus P., Tu B.P., Pache L., Shih C., Orth A., Bonamy G., Miraglia L., Ideker T., Garcia-Sastre A., Young J.A., Palese P., Shaw M.L. and Chanda S.K.: Human host factors required for influenza virus replication // Nature. -2010. -Vol. 463. -№ 7282. -P. 813-7.
302. Korge S., Maier B., Brüning F., Ehrhardt L., Korte T., Mann M., Herrmann A., Robles M.S. and Kramer A.: The non-classical nuclear import carrier Transportin 1 modulates circadian rhythms through its effect on PER1 nuclear localization // PLoS Genet. -2018. -Vol. 14. -№ 1. -e1007189.
303. Kosnopfel C., Sinnberg T. and Schittek B.: Y-box binding protein 1 - A prognostic marker and target in tumour therapy // European Journal of Cell Biology. -2014. -Vol. -№ 1-2. -P. 61-70.
304. Kosnopfel C., Sinnberg T., Sauer B., Niessner H., Schmitt A., Makino E., Forschner A., Hailfinger S., Garbe C. and Schittek B.: Human melanoma cells resistant to MAPK inhibitors can be effectively targeted by inhibition of the p90 ribosomal S6 kinase // Oncotarget. -2017. -Vol. 8. -№ 22. -P. 35761-35775.
305. Kosnopfel C., Sinnberg T., Sauer B., Niessner H., Muenchow A., Fehrenbacher B., Schaller M., Mertens P.R., Garbe C., Thakur B.K. and Schittek B.: Tumour Progression Stage-Dependent Secretion of YB-1 Stimulates Melanoma Cell Migration and Invasion // Cancers (Basel). -2020. -Vol. 12. -№ 8. -P. 2328.
306. Kossinova O.A ., Gopanenko A.V., Tamkovich S.N., Krasheninina O.A., Tupikin A.E., Kiseleva E., Yanshina D.D., Malygin A.A., Ven'yaminova A.G., Kabilov M.R. and Karpova G.G.: Cytosolic YB-1 and NSUN2 are the only proteins recognizing specific motifs present in mRNAs enriched in exosomes // Biochim Biophys Acta Proteins Proteom. -2017. -Vol. 1865. -№ 6. -P. 664-673.
307. Kosugi S., Hasebe M., Tomita M. and Yanagawa H.: Nuclear export signal consensus sequences defined using a localization-based yeast selection system // Traffic. -2008. -Vol. 9. -P. 2053-2062.
308. Kotake Y., Ozawa Y., Harada M., Kitagawa K., Niida H., Morita Y., Tanaka K., Suda T. and Kitagawa M.: YB1 binds to and represses the p16 tumor suppressor gene // Genes Cells. -2013. -Vol. 18. -№ 11. -P. 999-1006.
309. Krawczyk E., Hanover J.A., Schlegel R., Suprynowicz F.A.: Karyopherin beta3: a new cellular target for the HPV-16 E5 oncoprotein // Biochem Biophys Res Commun. -2008. -Vol.371. -№ 4. -P. 684-8.
310. Krishnan L., Matreyek K.A., Oztop I., Lee K., Tipper C.H., Li X., Dar M.J., Kewalramani V.N. and Engelman A.: The requirement for cellular transportin 3 (TNPO3 or TRN-SR2) during infection maps to human immunodeficiency virus type 1 capsid and not integrase // J Virol. -2010. -Vol. 84. -№ 1. -P. 397-406.
311. Kubitscheck U., Grünwald D., Hoekstra A., Rohleder D., Kues T., Siebrasse J.P. and Peters R.: Nuclear transport of single molecules: dwell times at the nuclear pore complex // J. Cell Biol. -2005. -Vol. 168. -P. 233-243.
312. Kumari P., Gilligan P.C., Lim S., Tran L.D., Winkler S., Philp R. and Sampath K.: An essential role for maternal control of Nodal signaling // Elife. -2013. -Vol. 2. -e00683.
313. Kunzler M. and Hurt E.C.: Cse1p functions as the nuclear export receptor for importin alpha in yeast // FEBS Lett. -1998. -Vol. 433. -P. 185-190.
314. Kunzler M., Gerstberger T., Stutz F., Bischoff F.R. and Hurt E.: Yeast Ran-binding protein 1 (Yrb1) shuttles between the nucleus and cytoplasm and is exported from the nucleus via a CRM1 (XPO1)-dependent pathway // Mol Cell Biol. -2000. -Vol. 20. -P. 4295-4308.
315. Kurisaki A., Kurisaki K., Kowanetz M., Sugino H., Yoneda Y., Heldin C.H. and Moustakas A.: The mechanism of nuclear export of Smad3 involves exportin 4 and Ran // Mol Cell Biol. -2006. -Vol. 26. -№ 4. -P. 1318-32.
316. Kutay U., Bischoff F.R., Kostka S., Kraft R. and Gorlich D.: Export of importin alpha from the nucleus is mediated by a specific nuclear transport factor // Cell. -1997. -Vol. 90. -P. 1061-1071.
317. Kustanovich T. and Rabin Y.: Metastable network model of protein transport through nuclear pores // Biophys. J. -2004. -Vol. 86. -P. 2008-2016.
318. Kuwano M., Uchiumi T., Hayakawa H., Ono M., Wada M., Izumi H. and Kohno K.: The basic and clinical implications of ABC transporters, Y-box-binding protein-1 (YB-1) and angiogenesis-related factors in human malignancies // Cancer Sci. -2003. -Vol. 94. -№ 1. -P. 9-14.
319. Kuwano M., Oda Y., Izumi H., Yang S.J., Uchiumi T., Iwamoto Y., Toi M., Fujii T., Yamana H., Kinoshita H., Kamura T., Tsuneyoshi M., Yasumoto K. and Kohno K.: The role of nuclear Y-box binding protein 1 as a global marker in drug resistance // Mol Cancer Ther. -2004. -Vol. 3. -№ 11. -P. 1485-92.
320. Kuwano M., Shibata T., Watari K.and Ono M.: Oncogenic Y-box binding protein-1 as an effective therapeutic target in drug-resistant cancer // Cancer Sci. -2019. -Vol. 110. -P. 1536-1543.
321. Kwon E., Todorova K., Wang J., Horos R., Lee K.K., Neel V.A., Negri G.L., Sorensen P.H., Lee S.W., Hentze M.W. and Mandinova A.: The RNA-binding protein YBX1 regulates epidermal progenitors at a posttranscriptional level // Nat Commun. -2018. -Vol. 9. -№ 1. -P. 1734.
322. la Cour T., Kiemer L., Molgaard A., Gupta R., Skriver K. and Brunak S.: Analysis and prediction of leucine-rich nuclear export signals // Protein Eng Des Sel. -2004. -Vol. 17. -P. 527-536.
323. Labokha A.A., Gradmann S., Frey S., Hülsmann B.B., Urlaub H., Baldus M., Görlich D.: Systematic analysis of barrier-forming FG hydrogels from Xenopus nuclear pore complexes // EMBO J. -2013. -Vol. 32. -№ 2. -P. 204-18.
324. Ladomery M. and Sommerville J.: Binding of Y-box proteins to RNA: involvement of different protein domains // Nucleic Acids Res. -1994. -Vol. 22. -№ 25. -P. 5582-9.
325. Lai M.C., Lin R.I., Huang S.Y., Tsai C.W. and Tarn W.Y.: A human importin-beta family protein, transportin-SR2, interacts with the phosphorylated RS domain of SR proteins // J Biol Chem. -2000. -Vol. 275. -№ 11. -P. 7950-7.
326. Lai M.C., Lin R.I. and Tarn W.Y.: Transportin-SR2 mediates nuclear import of phosphorylated SR proteins // Proc Natl Acad Sci USA. -2001. -Vol. 98. -№ 18. -P. 10154-9.
327. Lai M.C., Kuo H.W., Chang W.C. and Tarn W.Y.: A novel splicing regulator shares a nuclear import pathway with SR proteins // EMBO J. -2003. -Vol. 22. -№ 6. -P. 1359-69.
328. Lam M.H., Briggs L.J., Hu W., Martin T.J., Gillespie M.T., Jans D.A.: Importin beta recognizes parathyroid hormone-related protein with high affinity and mediates its nuclear import in the absence of importin alpha // J Biol Chem. -1999a. -Vol. 274. -№ 11. -P. 7391-8.
329. Lam M.H., House C.M., Tiganis T., Mitchelhill K.I., Sarcevic B., Cures A., Ramsay R., Kemp B.E., Martin T.J., Gillespie M.T.: Phosphorylation at the cyclin-dependent kinases site (Thr85) of parathyroid hormone-related protein negatively regulates its nuclear localization // J Biol Chem. -1999b. -Vol. 274. -№ 26. -P. 18559-66.
330. Landau D.A., Carter S.L., Stojanov P., McKenna A., Stevenson K., Lawrence M.S., Sougnez C., Stewart C., Sivachenko A., Wang L., Wan Y., Zhang W., Shukla S.A., Vartanov A., Fernandes S.M., Saksena G., Cibulskis K., Tesar B., Gabriel S., Hacohen N., Meyerson M., Lander E.S., Neuberg D., Brown J.R., Getz G. and Wu C.J.: Evolution and impact of subclonal mutations in chronic lymphocytic leukemia // Cell. -2013. -Vol. 152. -№ 4. -P. 714-26.
331. Landsman D.: RNP-1, an RNA-binding motif is conserved in the DNA-binding cold shock domain // Nucleic Acids Res. -1992. -Vol. 20. -№ 11. -P. 2861-4.
332. Lange A., Mills R.E., Lange C.J., Stewart M., Devine S.E. and Corbett A.H.: Classical nuclear localization signals: definition, function, and interaction with importin alpha // J Biol Chem. -2007. -Vol. 282. -P. 5101-5105.
333. Lange A., Mills R.E., Devine S.E. and Corbett A.H.: A PY-NLS nuclear targeting signal is required for nuclear localization and function of the Saccharomyces cerevisiae mRNA-binding protein Hrp1 // J Biol Chem. -2008. -Vol. 283. -№ 19. -P. 12926-34
334. Lange A., McLane L.M., Mills R.E., Devine S.E. and Corbett A.H.: Expanding the definition of the classical bipartite nuclear localization signal // Traffic. -2010. -Vol. 11. -P. 311-323.
335. Larrieu D., Viré E., Robson S., Breusegem S.Y., Kouzarides T. and Jackson S.P.: Inhibition of the acetyltransferase NAT10 normalizes progeric and aging cells by rebalancing the Transportin-1 nuclear import pathway // Sci Signal. -2018. -Vol. 11. -№ 537. -eaar5401.
336. Larue R., Gupta K., Wuensch C., Shkriabai N., Kessl J.J., Danhart E., Feng L., Taltynov O., Christ F., Van Duyne G.D., Debyser Z., Foster M.P. and Kvaratskhelia M.: Interaction of the HIV-1 intasome with transportin 3 protein (TNPO3 or TRN-SR2) // J Biol Chem. -2012. -Vol. 287. -№ 41. -P. 34044-58.
337. Lasham A., Lindridge E., Rudert F., Onrust R. and Watson J.: Regulation of the human fas promoter by YB-1, Puralpha and AP-1 transcription factors. Gene. -2000. -P. 252. -P. 1-13.
338. Lasham A., Moloney S., Hale T., Homer C., Zhang Y.F., Murison J.G., Braithwaite A.W. and Watson J.: The Y-box-binding protein, YB1, is a potential negative regulator of the p53 tumor suppressor // J Biol Chem. -2003. -Vol. 278. -№ 37. -P. 35516-23.
339. Lasham A., Samuel W., Cao H., Patel R., Mehta R., Stern J.L., Reid G., Woolley
A.G., Miller L.D., Black M.A., Shelling A.N., Print C.G. and Braithwaite A.W.: YB-1, the E2F pathway, and regulation of tumor cell growth // J Natl Cancer Inst. -2012. -Vol. 104. -№ 2. -P. 133-46.
340. Lasham A., Print C.G., Woolley A.G., Dunn S.E. and Braithwaite A.W.: YB-1: oncoprotein, prognostic marker and therapeutic target? // Biochem. J. -2013. -Vol. 449. -№ 1. -P. 11-23.
341. Lau C.K., Delmar V.A., Chan R.C., Phung Q., Bernis C., Fichtman B., Rasala
B.A., Forbes D.J.: Transportin regulates major mitotic assembly events: from spindle to nuclear pore assembly // Mol Biol Cell. -2009. -Vol.20. -№18. -P. 4043-58.
342. Lee S.J., Sekimoto T., Yamashita E., Nagoshi E., Nakagawa A., Imamoto N., Yoshimura M., Sakai H., Chong K.T., Tsukihara T. And Yoneda Y.: The structure of importin-beta bound to SREBP-2: nuclear import of a transcription factor // Science. -2003. -Vol. 302. -P. 1571-1575.
343. Lee B.J., Cansizoglu A.E., Suel K.E., Louis T.H., Zhang Z. and Chook Y.M.: Rules for nuclear localization sequence recognition by karyopherin beta 2 // Cell. -2006. -Vol. 126. -P. 543-558.
344. Lee Y.J., Hsieh W.Y., Chen L.Y. and Li C.: Protein arginine methylation of SERBP1 by protein arginine methyltransferase 1 affects cytoplasmic/nuclear distribution // J Cell Biochem. -2012. Vol. 113. -№ 8. -P. 2721-8.
345. Lee Y., Jang A.R., Francey L.J., Sehgal A. and Hogenesch J.B.: KPNB1 mediates PER/CRY nuclear translocation and circadian clock function // Elife. -2015. -Vol 4. -e08647.
346. Leemann-Zakaryan R.P., Pahlich S., Grossenbacher D. and Gehring H.: Tyrosine Phosphorylation in the C-Terminal Nuclear Localization and Retention Signal (C-NLS) of the EWS Protein // Sarcoma. -2011. -Vol. 2011. -P. 218483.
347. Lei H., Xu H.Z., Shan H.Z., Liu M., Lu Y., Fang Z.X., Jin J., Jing B., Xiao X.H., Gao S.M., Gao F.H., Xia L., Yang L., Liu L.G., Wang W.W., Liu C.X., Tong Y., Wu Y.Z., Zheng J.K., Chen G.Q., Zhou L. and Wu Y.L.: Targeting USP47 overcomes tyrosine kinase inhibitor resistance and eradicates leukemia stem/progenitor cells in chronic myelogenous leukemia // Nat Commun. -2021. -Vol. 12. -№ 1. -P. 51.
348. Leisegang M.S., Martin R., Ramirez A.S. and Bohnsack M.T.: Exportin t and Exportin 5: tRNA and miRNA biogenesis - and beyond // Biol Chem. -2012. -Vol. 393. -№ 7. -P. 599-604.
349. Lenz J., Okenquist S.A., LoSardo J.E., Hamilton K.K. and Doetsch P.W.: Identification of a mammalian nuclear factor and human cDNA-encoded proteins that recognize DNA containing apurinic sites // Proc Natl Acad Sci USA. -1990. -Vol. 87. -№ 9. -P. 3396-400.
350. Levin A., Hayouka Z., Friedler A. and Loyter A.: Transportin 3 and importin a are required for effective nuclear import of HIV-1 integrase in virus-infected cells // Nucleus. -2010. -Vol. 1. -№ 5. -P. 422-31.
351. Li Q., Zhang X., Hu W., Liang X., Zhang F., Wang L., Liu Z.-J., Zhong Y.: Importin-7 mediates memory consolidation through regulation of nuclear translocation of training-activated MAPK in Drosophila // Proc Natl Acad Sci U S A. -2016. -Vol. 113. -№ 11. -P. 3072-7.
352. Li F., Ma Z., Liu H., Zhang Q., Cai X., Qu Y., Xu M. and Lu L.: Y-box Protein-1 Regulates the Expression of Collagen I in Hepatic Progenitor Cells via PDGFR-p/ERK/p90RSK Signalling // Stem Cells Int. -2017a. -Vol. 2017. -6193106.
353. Li D., Liu X., Zhou J., Hu J., Zhang D., Liu J., Qiao Y. and Zhan Q.: Long noncoding RNA HULC modulates the phosphorylation of YB-1 through serving as a scaffold of extracellular signal-regulated kinase and YB-1 to enhance hepatocarcinogenesis // Hepatology. -2017b. -Vol. 65. -№ 5. -P. 1612-1627.
354. Li J., Pu W., Sun H.-L., Zhou J.-K., Fan X., Zheng Y., He J., Liu X., Xia Z., Liu L., Wei Y.-Q., Peng Y.: Pin1 impairs microRNA biogenesis by mediating conformation change of XPO5 in hepatocellular carcinoma // Cell Death Differ. -2018. -Vol. 25. -№ 9. -P. 1612-1624.
355. Li D., Fu S., Wu Z., Yang W., Ru Y., Shu H., Liu X. and Zheng H.: DDX56 inhibits type I interferon by disrupting assembly of IRF3-IPO5 to inhibit IRF3 nucleus import // J Cell Sci. -2019. -Vol. 133. -№ 5. jcs230409.
356. Liang J., Ke G., You W., Peng Z., Lan J., Kalesse M., Tartakoff A.M., Kaplan F. and Tao T.: Interaction between importin 13 and myopodin suggests a nuclear import pathway for myopodin // Mol Cell Biochem. -2008. -Vol. 307. -№ 1-2. -P. 93-100.
357. Liang X.T., Pan K., Chen M.S., Li J.J., Wang H., Zhao J.J., Sun J.C., Chen Y.B., Ma H.Q., Wang Q.J. and Xia J.C.: Decreased expression of XPO4 is associated with poor prognosis in hepatocellular carcinoma // J Gastroenterol Hepatol. -2011. -Vol. 26. -№ 3. -P. 544-9.
358. Liang C., Ma Y., Yong L., Yang C., Wang P., Liu X., Zhu B., Zhou H., Liu X. and Liu Z.: Y-box binding protein-1 promotes tumorigenesis and progression via the epidermal growth factor receptor/AKT pathway in spinal chordoma // Cancer Sci. -2019. -Vol. 110. -№ 1. -P. 166-179.
359. Lim R.Y., Fahrenkrog B., Koser J., Schwarz-Herion K., Deng J. and Aebi U.: Nanomechanical basis of selective gating by the nuclear pore complex // Science. -2007. -Vol. 318. -P. 640-643.
360. Lim R.Y., Ullman K.S. and Fahrenkrog B.: Biology and biophysics of the nuclear pore complex and its components // Int Rev Cell Mol Biol. -2008. -P. 267:299-342.
361. Lim J.P., Nair S., Shyamasundar S., Chua P.J., Muniasamy U., Matsumoto K., Gunaratne J. and Bay B.H.: Silencing Y-box binding protein-1 inhibits triple-negative breast cancer cell invasiveness via regulation of MMP1 and beta-catenin expression // Cancer Lett. -2019. -Vol. 452. -P. 119-131.
362. Lin D.C., Hao J.J., Nagata Y., Xu L., Shang L., Meng X., Sato Y., Okuno Y., Varela A.M., Ding L.W., Garg M., Liu L.Z., Yang H., Yin D., Shi Z.Z., Jiang Y.Y., Gu W.Y., Gong T., Zhang Y., Xu X., Kalid O., Shacham S., Ogawa S., Wang M.R. and Koeffler H.P.: Genomic and molecular characterization of esophageal squamous cell carcinoma // Nat Genet. -2014. -Vol. 46. -№ 5. -P. 467-73.
363. Lin, Lu, Meng et al., 2018: Lin Z., Lu Y., Meng Q., Wang C., Li X., Yang Y., Xin X., Zheng Q., Xu J., Gui X., Li T., Pu H., Xiong W., Li J., Jia S. and Lu D.: miR372 Promotes Progression of Liver Cancer Cells by Upregulating erbB-2 through Enhancement of YB-1 // Mol Ther Nucleic Acids. -2018. -Vol. 11. -P. 494-507.
364. Lin F., Zeng Z., Song Y., Li L., Wu Z., Zhang X., Li Z., Ke X. and Hu X.: YBX-1 mediated sorting of miR-133 into hypoxia/reoxygenation-induced EPC-derived exosomes to increase fibroblast angiogenesis and MendoT // Stem Cell Res Ther. -2019. -Vol. 10. -№ 1. -P. 263.
365. Lindsay M.E., Holaska J.M., Welch K., Paschal B.M. and Macara I.G.: Ran-binding protein 3 is a cofactor for Crm1-mediated nuclear protein export // J Cell Biol. -2001. -Vol. 153. -P. 1391-1402.
366. Lipowsky G., Bischoff F.R., Schwarzmaier P., Kraft R., Kostka S., Hartmann E., Kutay U. and Görlich D.: Exportin 4: a mediator of a novel nuclear export pathway in higher eukaryotes // EMBO J. -2000. -Vol. 19. -№ 16. -P. 4362-71.
367. Liu, Su, Liu, 2013: Liu X., Su L. and Liu X.: Loss of CDH1 up-regulates epidermal growth factor receptor via phosphorylation of YBX1 in non-small cell lung cancer cells // FEBS Lett. -2013. -Vol. 587. -№ 24. -P. 3995-4000.
368. Liu Y., Zhao J., Zhang W., Gan J., Hu C., Huang G. and Zhang Y.: lncRNA GAS5 enhances G1 cell cycle arrest via binding to YBX1 to regulate p21 expression in stomach cancer // Sci Rep. -2015. -Vol. 5. -P. 10159.
369. Liu Q., Tao T., Liu F., Ni R., Lu C. and Shen A.: Hyper-O-GlcNAcylation of YB-1 affects Ser102 phosphorylation and promotes cell proliferation in hepatocellular carcinoma // Exp Cell Res. -2016. -Vol. 349. -№ 2. -P. 230-238.
370. Liu J., Sun X., Zhu H., Qin Q., Yang X. and Sun X.: Long noncoding RNA POU6F2-AS2 is associated with oesophageal squamous cell carcinoma // J Biochem. -2016. -Vol. 160. -№ 4. -P. 195-204.
371. Liu S., Marneth A.E., Alexe G., Walker S.R., Gandler H.I., Ye D.Q., Labella K., Mathur R., Toniolo P.A., Tillgren M., Gokhale P.C., Barbie D., Mullally A., Stegmaier K.
and Frank D.A.: The kinases IKBKE and TBK1 regulate MYC-dependent survival pathways through YB-1 in AML and are targets for therapy // Blood Adv. -2018a. -Vol. 2. -№ 23. -P. 3428-3442.
372. Liu X., Lin W., Shi X., Davies R.G., Wagstaff K.M., Tao T., Jans D.A.: PKA-site phosphorylation of importin13 regulates its subcellular localization and nuclear transport function // Biochem J. -2018b. -Vol. 475. -№. 16. -P. 2699-2712.
373. Liu J., Qu L., Wan C., Xiao M., Ni W., Jiang F., Fan Y., Lu C. and Ni R.: A novel P2-AR/YB-1/p-catenin axis mediates chronic stress-associated metastasis in hepatocellular carcinoma // Oncogenesis. -2020. -Vol. 9. -№ 9. -P. 84.
374. Liu X., Chen D., Chen H., Wang W., Liu Y., Wang Y., Duan C., Ning Z., Guo X., Otkur W., Liu J., Qi H., Liu X., Lin A., Xia T., Liu H.X. and Piao H.L.: YB1 regulates miR-205/200b-ZEB1 axis by inhibiting microRNA maturation in hepatocellular carcinoma // Cancer Commun (Lond). -2021. -Vol. 41. -№ 7. -P. 576-595.
375. Logue E.C., Taylor K.T., Goff P.H. and Landau N.R.: The cargo-binding domain of transportin 3 is required for lentivirus nuclear import // J Virol. -2011. -Vol. 85. -№ 24. -P. 12950-61.
376. Long J.C. and Caceres J.F.: The SR protein family of splicing factors: master regulators of gene expression // Biochem J. -2009. -Vol. 417. -№ 1. -P. 15-27.
377. Lott K. and Cingolani G.: The importin beta binding domain as a master regulator of nucleocytoplasmic transport // Biochim. Biophys. Acta. -2011. -Vol. 1813. -P. 15781592
378. Lovett D.H., Cheng S., Cape L., Pollock A.S., Mertens P.R.: YB-1 alters MT1-MMP trafficking and stimulates MCF-7 breast tumor invasion and metastasis // Biochem Biophys Res Commun. -2010. -Vol. 398. -№ 3. -P. 482-8.
379. Luban J.: HIV-1 infection: going nuclear with TNPO3/Transportin-SR2 and integrase // Curr Biol. -2008. -Vol. 18. № 16. -R710-3.
380. Luna R., Rondón A.G. and Aguilera A.: New clues to understand the role of THO and other functionally related factors in mRNP biogenesis // Biochim Biophys Acta. -2012. -Vol. 1819. -№ 6. -P. 514-20.
381. Lund E., Guttinger S., Calado A., Dahlberg J.E. and Kutay U.: Nuclear export of microRNA precursors // Science. -2004. -Vol. 303. -P. 95-98.
382. Machado A.M., Desler C., B0ggild S., Strickertsson J.A., Friis-Hansen L., Figueiredo C., Seruca R. and Rasmussen L.J.: Helicobacter pylori infection affects mitochondrial function and DNA repair, thus, mediating genetic instability in gastric cells // Mech Ageing Dev. -2013. -Vol. 134. -№ 10. -P. 460-6.
383. Maertens G.N., Cook N.J., Wang W., Hare S., Gupta S.S., Oztop I., Lee K., Pye V.E., Cosnefroy O., Snijders A.P., KewalRamani V.N., Fassati A., Engelman A. and Cherepanov P.: Structural basis for nuclear import of splicing factors by human Transportin 3 // Proc Natl Acad Sci USA. -2014. -Vol. 111. -№ 7. -P. 2728-33.
384. Maier E., Attenberger F., Tiwari A., Lettau K., Rebholz S., Fehrenbacher B., Schaller M., Gani C. and Toulany M.: Dual Targeting of Y-Box Binding Protein-1 and Akt Inhibits Proliferation and Enhances the Chemosensitivity of Colorectal Cancer Cells // Cancers (Basel). -2019.-Vol. 11. № 4. -P. 562.
385. Macara I.G.: Transport into and out of the nucleus // Microbiol Mol Biol Rev. -2001. -Vol. 65. -P. 570-594.
386. Macchi P., Brownawell A.M., Grunewald B., DesGroseillers L., Macara I.G. and Kiebler M.A.: The brain-specific double-stranded RNA-binding protein Staufen2: nucleolar accumulation and isoform-specific exportin-5-dependent export // J Biol Chem. -2004. -Vol. 279. -№ 30. -P. 31440-4.
Обратите внимание, представленные выше научные тексты размещены для ознакомления и получены посредством распознавания оригинальных текстов диссертаций (OCR). В связи с чем, в них могут содержаться ошибки, связанные с несовершенством алгоритмов распознавания. В PDF файлах диссертаций и авторефератов, которые мы доставляем, подобных ошибок нет.