Изучение эпитопов, узнаваемых нейтрализующими ВИЧ-1 моноклональными антителами 2F5 и 2G12, с помощью пептидных фаговых библиотек тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.00.03, кандидат биологических наук Туманова, Ольга Юрьевна

• Туманова, Ольга Юрьевна
• кандидат биологических наук
• 2004

Оглавление диссертации кандидат биологических наук Туманова, Ольга Юрьевна

Список принятых сокращений

Введение

Научная новизна и практическая ценность работы

Публикации и апробация работы

Глава 1. Обзор литературы

1.1. Фаговый дисплей. История возникновения и области применения

1.2. Фаговый дисплей природных пептидов

1.2.1. Картирование эпитопов моноклональных и поликлональных антител

1.2.2. Получение иммуногенов

1.3. Фаговый дисплей рандомизованных пептидов

1.3.1. Комбинаторные фаговые пептидные библиотеки

1.3.2. Картирование эпитопов природных антигенов и поиск их пептидных имитаторов

1.3.3. Идентификация пептидных лигандов

1.3.4. Определение субстратных последовательностей дляпротеаз

1.4. Пептиды, связывающиеся с антителами, и структурные основы пептидного узнавания

1.5. Увеличение эффективности отбора пептидов из фаговых пептидных библиотек

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Изучение эпитопов, узнаваемых нейтрализующими ВИЧ-1 моноклональными антителами 2F5 и 2G12, с помощью пептидных фаговых библиотек»

Вакцина, способная предотвратить заражение вирусом иммунодефицита человека или снизить уровень прогрессии заболевания у ВИЧ-1 инфицированных пациентов, является крайне необходимой для здравоохранения. Эффективная вакцина должна включать компоненты, способные индуцировать как клеточный, так и гуморальный иммунный ответ (McMichael and Rowland-Jones, 2001; Montefiori and Evans, 1999; Parren et al, 1999). В последние годы значительные успехи достигнуты в разработке вакцин, индуцирующих клеточный иммунный ответ, однако не получено вакцинных кандидатов, которые воспроизводимо стимулировали бы в организме образование антител, нейтрализующих первичные изоляты ВИЧ-1 различных субтипов (Amara et al, 2001; Montefiori and Evans, 1999; Parren et al, 1999). To, что антитела с таким широким спектром нейтрализующей активности действительно существуют, продемонстрировано на примере нескольких моноклональных антител человека, полученных из трансформированных вирусом Эпштейна-Барра мононуклеарных клеток периферической крови ВИЧ-инфицированных пациентов (Buchacher et al., 1994). Моноклональные антитела, такие как МКА 2F5 и 2G12, нейтрализуют большинство первичных изолятов ВИЧ-1 in vitro, активируют систему комплемента по классическому пути и вызывают антителозависимую клеточную цитотоксичность (Muster et al., 1993а; Parren et al, 1999; Trkola et al., 1995). Более того, эти антитела сами по себе или в комбинации друг с другом, защищают макак от передачи SHIV (Baba et al., 2000; Parren et al., 2001). Для моноклональных антител 2G12 и 2F5 в комплексе с другими антителами имеется опыт применения для пассивной иммунотерапии больных СПИДом в клиниках США и Европы. В связи с этим, эпитопы, узнаваемые МКА 2F5 и 2G12, вызывают значительный интерес у разработчиков вакцины против ВИЧ (Burton and Moore, 1998; Nabel, 2001; Parren et al, 1999). Существует мнение, что вакцина против этого патогена должна включать эпитопы для вышеперечисленных МКА или их пептидные имитаторы (Trkola et al, 1995). Интерес к имитаторам обусловлен тем, что они могли бы индуцировать образование антител, нейтрализующих первичные изоляты ВИЧ-1, относящиеся к различным генетическим субтипам. Поэтому изучение антигенной структуры белков gp41 и gpl20, а также получение пептидов-имитаторов эпитопов, узнаваемых МКА 2F5 и 2G12, является важной фундаментальной задачей и имеет большое значение для разработки новых профилактических средств против данного заболевания.

Одним из методов получения пептидов-имитаторов и изучения не только линейных, но и конформационных эпитопов вирусных белков является использование фаговых пептидных библиотек. Каждая такая библиотека содержит пептиды определенной длины и случайного аминокислотного состава, экспонированные на поверхности нитчатого бактериофага в составе одного из белков оболочки. Библиотеки сконструированы таким образом, что чужеродный пептид, находясь на N-конце рекомбинантного белка, располагается на поверхности вириона и доступен для взаимодействия с белком-лигандом, использующимся для аффинной селекции. В исследованиях по локализации вирусных антигенных детерминант в качестве белков-лигандов выступают моноклональные антитела. Таким образом, использование метода аффинной селекции позволяет отобрать из фаговой пептидной библиотеки варианты пептидов, соответствующие антигенным детерминантам или имитирующие их по связыванию с антителами. Пептиды, имитирующие эпитопы, узнаваемые нейтрализующими антителами, при иммунизации могут индуцировать образование антител, обладающих нейтрализующей активностью даже относительно "escape''-вариантов вируса (Roccasecca etal., 2001).

Целью данной работы было получение и исследование коллекции пептидов, специфично взаимодействующих с нейтрализующими ВИЧ-1 моноклональными антителами 2F5 и 2G12, узнающими эпитопы на поверхности гликопротеинов gp41 и gpl20.

Для этого необходимо было решить следующие задачи:

- провести аффинную селекцию фаговой пептидной библиотеки с моноклональными антителами 2F5 и 2G12; подтвердить специфичность взаимодействия пептидов, экспонируемых на поверхности отобранных в результате аффинной селекции бактериофагов, с изучаемыми МКА методом ИФА, и определить аминокислотные последовательности таких пептидов;

- изучить иммуногенные свойства представленных в составе нитчатого бактериофага пептидов, взаимодействующих с МКА 2F5, и определить нейтрализующую активность антисывороток против пептидов-имитаторов эпитопа 2F5 in vitro',

- на основании состава отобранных по связыванию с МКА 2G12 пептидов, определить значимые для взаимодействия с МКА аминокислотные остатки, и предложить вариант локализации конформационного эпитопа, узнаваемого этим МКА, на поверхности гликопротеина gpl20 ВИЧ-1.

Научная повшна и практическая ценность работы

В данной работе проведено изучение эпитопов поверхностных гликопротеинов gpl20 и gp41 ВИЧ-1, узнаваемых МКА 2G12 и 2F5, с использованием комбинаторных фаговых библиотек. Применение метода аффинной селекции позволило отобрать из представительной пептидной фаговой библиотеки варианты пептидов, соответствующих антигенным детерминантам или имитирующих их по связыванию с изучаемыми антителами 2F5 и 2G12.

Получена коллекция пептидов, специфично взаимодействующих с МКА 2F5. Все отобранные пептиды отличаются в различной степени по аминокислотной последовательности от природного 2Р5-эпитопа (A/ELDKWA/G/N), но сохраняют способность связываться с исследуемым антителом, т.е. являются имитаторами этого эпитопа. Впервые для иммунизации животных использовали нитчатые бактериофаги, в составе минорного белка которых экспонированы пептиды-имитаторы 2Р5-эпитопа RDWSFDRWSLSEFWL, GRSFLDRWSKVPRDP, YFCYANCDKWVLKGD,

RNVPPIFNDVYWIAF. Показана вируснейтрализующая активность сывороток кроликов и мышей, иммунизированных вышеперечисленными бактериофагами, in vitro.

Рассмотрены возможные варианты состава эпитопа, узнаваемого МКА 2G12. На основании определенных аминокислотных последовательностей пептидов, взаимодействующих с МКА 2G12, впервые предсказаны а. о., являющиеся значимыми для распознавания МКА 2G12 эпитопа, расположенного на поверхности белка gpl20 ВИЧ-1 и, возможно, входящие в его состав. Проведен сравнительный анализ аминокислотных последовательностей белка gpl20 из изолятов и штаммов ВИЧ-1, чувствительных и устойчивых к нейтрализации МКА 2G12. Показано, что предсказанные нами а.о., являются достаточно консервативными у изолятов, нейтрализуемых этим антителом. Высказана гипотеза о том, что устойчивость к нейтрализации обусловлена конформационными изменениями в области эпитопа, связанными с вариабельностью а.о. Ser393, П1Г394, Trp395> Thr415 и Pro4i7 Отмечена значимость гликозилирования остатков аспарагина в положениях 295, 332 и 392 для формирования исследуемого эпитопа.

Полученные данные об иммуногенности пептидов-имитаторов 2F5-эпитопа, экспонируемых на поверхности нитчатого бактериофага, и результаты локализации эпитопа, узнаваемого МКА 2G12, в будущем могли бы быть полезны для создания вакцины против ВИЧ.

Публикации и апробация работы

По материалам диссертации получено два патента РФ, опубликовано три печатные работы и 8 тезисов. Материалы исследований по теме диссертации были представлены на следующих международных конференциях: Хш and XIth Symposium on HIV Infection, 1999, 2001, Toulon, France; «ВИЧ/СПИД и родственные проблемы» 1999, 2000, С.-Петербург, Россия; "Conference for young scientists, PhD students and students on molecular biology and genetics", dedicated to the golden jubilee of the double helix and 30 anniversary of the Institute of molecular biology and genetics NAS of Ukraine, September 25-27,2003, Kyiv, Ukraine.

Вклад автора

Аффинная селекция фаговой пептидной библиотеки с МКА 2G12 и 2F5, наработка индивидуальных фаговых клонов, подбор условий и изучение взаимодействия отобранных бактериофагов с МКА 2G12 и 2F5 в ИФА, определение нуклеотидных последовательностей одноцепочечной фаговой ДНК в области встраивания рандомизованного олигонуклеотида, а также исследование взаимодействия сывороток иммунизированных животных с рекомбинантным белком gp41 ВИЧ-1 выполнены лично автором. Иммунизация лабораторных животных проводилась автором совместно с в.н.с. Института клинической иммунологии СО РАМН (г. Новосибирск), д.м.н. Орловской И.А. и сотрудником ГНЦ ВБ «Вектор» Азаевым М.Ш. Исследование вируснейтрализующей активности сывороток иммунизированных животных в реакции нейтрализации ВИЧ-1 in vitro проводилось Проняевой Т.Р., н.с. лаборатории ретровирусов ГНЦ ВБ «Вектор» (руководитель - Покровский А.Г.). Предсказание локализации конформационного эпитопа, узнаваемого MICA 2G12, выполнено сотрудником ИЦиГ СО РАН к.б.н. Иванисенко В.А при участии автора, а также лично автором с использованием алгоритма, описанного в работе (Enshell-Seijffers et al, 2003).

Работа выполнена при финансовой поддержке гранта ГНТП России «Новейшие методы биоинженерии» по направлению «Белковая инженерия»: «Исследование механизмов белок белковых взаимодействий с использованием комбинаторных библиотек пептидов на основе нитевидных бактериофагов» (1997-1999); договоров 16/1998, 3/1999 и 3/2000 межведомственной научно-технической программы «Вакцины нового поколения и медицинские диагностические системы будущего».

Заключение диссертации по теме «Молекулярная биология», Туманова, Ольга Юрьевна

выводы

1. Методом аффинной селекции получены две коллекции нитчатых бактериофагов, включающие 115 и 80 фаговых клонов, экспонирующих пептиды, которые взаимодействуют с вируснейтрализующими моноклональными антителами 2F5 и 2G12 к белкам gp41 и gpl20 ВИЧ-1, соответственно. Показано взаимодействие этих пептидов с МКА 2F5 и 2G12 в ИФА.

2. Определен аминокислотный состав 64 пептидов, отобранных по связыванию с МКА 2F5, и выявлена гомология аминокислотных последовательностей большинства исследованных пептидов с фрагментом 662-671 а.о. белка gpl60 ВИЧ-1. Все отобранные пептиды отличаются в различной степени по аминокислотной последовательности от природного 2Р5-эпитопа (A/ELDKWA/G/N), но сохраняют способность связываться с исследуемым антителом и являются имитаторами этого эпитопа.

3. Впервые показаны иммуногенные свойства пептидов-имитаторов 2Р5-эпитопа RDWSFDRWSLSEFWL, GRSFLDRWSKVPRDP, YFCYANCDKWVLKGD, RNVPPIFNDVYWIAF, представленных в составе нитчатых бактериофагов. Продемонстрирована вируснейтрализующая активность сывороток кроликов и мышей, иммунизированных вышеперечисленными бактериофагами, in vitro.

4. На основании аминокислотных последовательностей 66 пептидов, взаимодействующих с МКА 2G12, впервые предсказаны аминокислотные остатки (Ьеиз42, Ьеиз9о, Phe39i, Ser393, П1Г394, Т1Р395, Th^is, Leu4i6 и РЮ417), являющиеся значимыми для распознавания МКА 2G12 эпитопа, расположенного на поверхности белка gpl20 ВИЧ-1 и, возможно, входящие в его состав. Выявлена значимость гликозилирования остатков аспарагина в положениях 295, 332 и 392 для формирования исследуемого эпитопа.

5. На основании выравнивания аминокислотных последовательностей белка gpl20 из изолятов и штаммов ВИЧ-1, чувствительных и устойчивых к нейтрализации МКА 2G12, показано, что предсказанные нами а.о., являются достаточно консервативными у изолятов, нейтрализуемых этим антителом.

Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Туманова, Ольга Юрьевна, 2004 год

1. Ерошкин A.M. 1988. Матрица сходства аминокислот для поиска антигенноблизких фрагментов в неродственных белках. Молекуляр. биология 22:635-644.

2. Змушко Е.И. и Белозеров Е.С. 2000. Этиология, в ВИЧ-инфекция: руководство для врачей. СПб.: Питер, 9-25.

3. Ильичев А.А., Миненкова О.О., Татьков С.И., Карпышев Н.Н., Ерошкин A.M., Петренко В.А., Сандахчиев Л.С. 1989. Получение жизнеспособного варианта фага М13 со встроенным чужеродным пептидом в основной белок оболочки. Докл. АН СССР 307:481-483.

4. Карпенко Л.И., Веремейко Т.А., Туманова О.Ю., Пика И.С., Чикаев Н.А., Меламед Н.В., Нагайцева Н.В. , Кувшинов В.Н., Рязанкин И.А., Ильичев А.А. 2004. Проблемы презентации эпитопов ВИЧ с помощью HBcAg. Вестник РАМН (в печати).

5. Краевский А.А. 1998. Возможности химиотерапии СПИДа. Вестник РАН 68: 798- 812.

6. Максютов А.З. и Загребельный С.И. 1993. Антигенные детерминанты белков. Гуморальный иммунный ответ. Молекулярная биология. 27: 980-991.

7. Agadjanyan M., Luo P., Westerink M.A., Carey L., Hutchins W., Steplewski Z., Weiner D.B., Keiber-Emmons T. 1997. Peptide mimicry of carbohydrate epitopes on human immunodeficiency virus. Nat Biotechnol. 15: 547-551.

8. Altschuh D., Dubs M.-C., Weis E., Zeder-Lutz G., Van Regenmortel М.Н.У. 1992. Biochemistry 31: 6298-6304.

9. Armbruster C., Stiegler G.M., Vcelar B.A., Jager W., Michael N.L., Vetter N., Katinger H.W.D. A phase I trial with two human monoclonal antibodies (hMAb 2F5, 2G12) against HIV-1 .AIDS 16:227-233.

10. Atassi M.Z. 1967. Specific cleavage of tryptophyl peptide bonds with periodate in sperm whale myoglobin. Arch. Biochem. Biophys. 120: 56.

11. Atassi M.Z., Perlstein M.T., Habeeb A.F. 1971. Conformational studies on modified proteins and peptides: IV. Conformation of lysozyme derivatives modified at tyrosine or at tryptophan residues. J. Biol. Chem. 246: 3291-3296.

12. Atassi M.Z. and Samplin B.J. 1968. Immunochemistry of sperm whale myoglobin: I. The specific interaction of some tryptic peptides and of peptides containing all the reactive regions of the antigen. Biochemistry 7: 688-698.

13. Atassi M.Z. and Singhal R.P. 1970. Immunochemistry of sperm whale myoglobin: 8. Specific interaction of peptides obtained by cleavage at proline peptide bonds. Biochemistry 9:3854-3861.

14. Baribaud F., Pohlmann S., Doms R. W. 2001. The role of DC-SIGN and DC-SIGNR in HIV and SIV attachment, infection, and transmission. Virology 286:1-6.

15. Bass S.H., Green R., Wellis J.A. 1990. Hormone phage: An enrichment method for variant proteins with altered binding properties. Proteins 8: 309-314.

16. Berkowitz S.A. and Day L.A. 1976. Mass, Length, composition and structure of the filamentous bacteriophage fd. J. Mol. Biol. 102:531-547.

17. Berger E. A. 1997. HIV entry and tropism: the chemokine receptor connection. AIDS Suppl. A: S 3-16.

18. Bonnicastle L.L., Mehroke J.S., Rashed M., Gong X., Scott J.K. 1996. Probing the basis of antibody reactivity with a panel of constrained peptide libraries displayed by filamentous phage. J. Mol. Biol. 259: 747-762.

19. Burton D. R. 1997. A vaccine for HIV type 1: the antibody perspective. Proc. Natl. Acad. Sci U. S. A. 94: 10018-10023.

20. Burton D.R. and Moore J.P. 1998. Why do we not have HIV vaccine and how can we make one? Nat. Med. 4: 495-498.

21. Chakrabarti P. and Janin J. 2002. Dissecting protein-protein recognition sites. Proteins: Struct. Funct. Genet. 47: 334-343.

22. Chan D. C. and Kim P. S. 1998. HIV entry and its inhibition. Cell 93: 681-684.

23. Chan D.C., Fass D., Berger J.M., Kim P.S. 1997. Core structure of gp41 from the HIV envelope glycoprotein. Cell 89: 263-273.

24. Christian R.B., Zuckermann R.N., Kerr J.M., Wang L., Malcolm B.A. 1992. Simplified methods for construction, assessment, and rapid screening of peptide libraries in bacteriophage Ml3. J. Mol. Biol. 227:711-718.

25. Cloutier S.M., Ribeiro Chagas J., Mach J.-P., Gygi C.M, Leisinger H.-J., Deperthes D. 2002. Substrate specificity of human kallikrein 2 (hK2) as determined by phage display technology. Eur. J. Biochem. 269: 2747-2754.

26. Coombs G.S., Bergstrom R.C., Pellequer J.L., Baker S.I., Navre M., Smith M.M., Tainer J.A., Madison E.L., Corey D.R. 1998. Substrate specificity of prostate-specific antigen (PSA). Chem. Biol. 5: 475-488.

27. Cortese R., Monaci P., Nicosia A., Luzzago A., Feleci F., Galfre G., Pessi A., Tramontano A., and Sollazzo M. 1995. Identification of biologically active peptides using random libraries displayed on phage. Curr. Opin. Biotechnol. 6: 73-80.

28. Craig L., Sanschgrin P.C., Rozek A., Lackie S., Kuhn L.A., Scott J.K. 1998. The role of structure in antibody cross-reactivity between peptides and folded proteins. J. Mol. Biol. 281 : 183-201.

29. Cunto-Amesty G., Dam Т.К., Luo P., Monzavi-Karbassi В., Brewers C.F., Van Cott T.C., Keiber-Emmons T. 2001. Directing the immune response to carbohydrate antigens. J. Biol. Chem. 276: 30490-30498.

30. Cwirla S.E., Balasubramanian P., Duffin D.J., Wagstrom C.R., Gates C.M., Singer S.C., Davis A.M., Tansik R.L., Mattheakis L.C., Boytos C.M. 1997. Peptide agonist of the thrombopoietin receptor as potent as the natural cytokine. Science 276: 1696-1699.

31. Cwirla S.E., Peters E.A., Barret R.W., Dower W.J. 1990. Peptides of phage: A vast library of peptides for identifying ligands. Proc. Natl Acad. Sci. U.S.A. 87: 6378-6382.

32. Dalgleish A.G., Chanh T.C., Kennedy R.C., Kanda P., Clapham P.R., Weiss R.A. 1988. Neutralization of diverse HIV-1 strains by monoclonal antibodies raized against a gp41 synthetic peptide. Virology 165: 209-215.

33. Daniels D.A. and Lane D.P. 1994. The characterization of p53 binding phage isolated from phage peptide display libraries. J. Mol. Biol. 243: 639-652.

34. De la Cruz V., Laa A., McCutchan T. 1988. Immunigenicity and epitope mapping og foreign sequences via a genetically engineered filamentous phage. J. Biol. Chem. 263: 4318-4322.

35. Delmastro P., Meola A., Monaci P., Cortese R., Galfre G. 1997. Immunogenicity of filamentous phage displaying peptide mimotopes after oral administration. Vaccine. 15: 1276-1285.

36. Demendel C., Lafaye P., Mazie J.C. 1996. Reproducing the immune response against the Plasmodium vivax merozoite surface protein 1 with mimotopes selected from a phage-displayed library. Mol. Immunol. 33: 909-916.

37. Demendel C., Rouyre S., Alzari P.M., Nato F., Longacre S., Lafaye P., Mazie J.C. 1998. Phage-displayed mimotopes elisit monoclonal antibodies spesific for a malaria vaccine candidate. Biol Chem. 379: 65-70.

38. Devlin J.J., Panganiban L.C., Devlin P.E. 1990. Random peptide libraries: A source of specific protein binding molecules. Science 249: 404-406.

39. Dong X.N., Xiao Y., Chen Y.H. 2001. ELNKWA-epitope specific antibodies induced by epitope-vaccine recognize ELDKWA- and other two neutralizing-resistant mutated epoitopes on HIV-1 gp41. Immunol. Lett. 75: 149-152.

40. Doorbar J. and Winter G. 1994. Isolation of a peptide antagonist to the thrombin receptor using phage display. J. Mol. Biol. 244: 361-369.

41. D'Souza M.P., Milman G., Bradac J.A., McPhee D., Hanson C.V., Hendry R.M. 1995. Neutralization of primary HIV-1 isolates by anti-envelope monoclonal antibodies. AIDS 9: 867-874.

42. Dyson M. and Murray K. 1995. Selection of peptide inhibitors of interactions involved in complex protein assemblies: Association of the core and surface antigens of hepatitis В virus. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 92: 2194-2198.

43. Earl P.L., Broder C.C., Doms R.W., Moss B. 1997. Epitope map of human immunodeficiency virus type 1 gp41 derived from 47 monoclonal antibodies produced by immunization with oligomeric envelope protein. J. Virol. 71: 2674-2684.

44. Eckert D.M. and Kim P.S. 2001. Mechanisms of viral membrane fusion and its inhibition. Annu. Rev. Biochem. 70: 777-810.

45. Evans D.J., McKeating J., Meredith J.M., Burke K.L., Katrak K., John A., Ferguson M., Minor P.D., Weiss R.A., Almond J.W. 1989. An engineered poliovirus chimaera elicits broadly reactive HIV-1 neutralizing antibodies. Nature, 339: 385-8, 340.

46. Fack F., Hugle-Dorr В., Song D., Queitsch I., Petersen G., Bautz E.K. 1997. Epitope mapping by phage display: random versus gene-fragment libraries. J. Immunol. Methods 206: 43-52.

47. Feinberg H., Mitchell D.A., Drickamer K., Weis W.I. 2001. Structural basis for selective recognition of oligosaccharides by DC-SIGN and DC-SIGNR. Science 294: 2163-2166.

48. Folgori A., Tafi R., Meola A., Felici F., Galfre G., Cortese R., Monaci P., Nicosia A. 1994. A general strategy to identify mimotopes of pathological antigens using only random peptide libraries and human sera. EMBO Journal. 13: 2236-2243.

49. Gainor В., Putterman C., Valadon P., Spatz L., Scharff M.D., Diamond B. 1997. Peptide inhibition of glomerular deposition of an anti-DNA antibody. Proc. Natl Acad. Sci. USA 94: 1955-1960.

50. Gauduin M.C., Parren P.W.H.I., Weir R., Barbas C.F., Burton D.R., Koup R.A. 1997. Passive immunization wiyh a human monoclonal antibody protects hu-PBL-SCID mice against challenge by primary isolates of HIV-1. Nat. Med. 3: 1389-1393.

51. Geysen H.M., Rodda S.J., Mason T.J. 1986. A priori delineation of peptide which mimics a discontinuous antigenic determinant. Mol Immunol 149: 3903-3913.

52. Glaser F., Steinberg D.M., Vakser I.A., Ben-Tal N. 2001. Residue frequencies and pairing preferences at protein- protein interfaces. Proteins: Struct. Fund. Genet. 43: 89-102.

53. Glucksman M.J., Bhattacharjee S., Makowsky L. 1992. Three-dimensional structure of a cloning vector: X-ray diffraction studies of filamentous bacteriophage M13 at 7 A resolution. J. Mol Biol 226:455-470.

54. Greenwood J., Willis A., Perham R. 1991. Multiple display of foreign peptides on a filamentous bacteriophage: Peptides from Plasmodium falciparum circumsporozoite protein as antigens. J. Mol Biol 220: 821-827.

55. Grihalde N.D., Chen Y.C., Golden A., Gubbins E., Mandecki W. 1995. Epitope mapping of anti-HIV and anti-HCV monoclonal antibodies and characterization of epitope mimics using a filamentous phage peptide library. Gene 166: 187-195.

56. Guesdon J.L., Ternynck Т., Avrameas S. 1979. The use of avidin-biotin interaction in immunoenzymatic techniques. J. Histochem. Cytochem. 27: 1131-1139.

57. Habeeb A.F. and Atassi M.Z., 1971. Enzymic and immunochemical properties of lysozyme:

58. V. Derivatives modified at lysine residues by guanidination, acetylation, succinylation ormaleylation. Immunochemistry 8:1047.

59. Hanes J. and Pluckhun A. 1997. In vitro selection and evolution of functional proteins by using ribosome display. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 94: 4937-4942.

60. Healy J., Murayama O., Maeda Т., Yoshino K., Sekiguchi K., Kikuchi M. 1995. Peptide ligands for integrin alpha v beta 3 selected" from random phage display libraries. Biochemistry 34: 3948-3955.

61. Ho J., MacDonald K.S., Barber B.H. 2002. Construction of recombinant targeting immunogens incorporating an HIV-1 neutralizing epitope into sites of differing conformational constraint. Vaccine 20:1169-1180.

62. Ishikawa D., Taki T. 1999. Biocombinatorial chemistry, a novel approach using phage-displayed libraries in glycobiology. Sppesial reference to glyco-replica peptides. Trends in Glycoscience and Glycotechnology 11: 277-285.

63. Jelinek R., Terry T.D., Gesell J.J., Malik P., Perham R.N., Opella S.J. 1997. NMR sructure of the principal neutralizing determinant of HIV-1 displayed in filamentous bacteriophage coat protein. J. Mol. Biol 266: 649-655.

64. Jellis C.L., Cradick T.G., Rennet P., Salinas P., Boyd J., Amirault Т., Gray G.S. 1993. Defining critical residues in the epitope for a HIV-neutralizing monoclonal antibody using phage display and peptide array technologies. Gene 137: 63-68.

65. Jones S. and Thornton J.M. 1997. Analysis of protein-protein interaction sites using surface patches. J. Mol Biol. 272: 121-132.

66. Karlsson G.B., Gao F., Robinson J., Hahn В., Sodroski J. 1996. Increased envelope spike density and stability are not required for the neutralization resistance of primary human immunodeficiency viruses. J. Virol 70: 6136-6142.

67. Kay B.K., Adey N.B., He Y.-S., Manfredi J.P., Mataragnon A.H. Fowlkes D.M. 1993. An M13 library displaying 38-amino-acid peptides as a source of novel sequences with affinity to selected targets. Gene 128: 59-65.

68. Keiber-Emmons Т., Luo P., Qiu J., Agadjanyan M., Carey L., Hutchins W., Westerink M.A., Steplewski Z. 1997. Peptide mimicry of adenocarcinoma-assosiated carbohydrate antigens. Hybridoma 16: 3-10.

69. Kishchenko G., Batliwala H., Makowski L. 1994. Structure of a foreign peptide displayed on the surface of bacteriophage M13. J. Mol. Biol. 241: 208-213.

70. Klasse P.J. and Moore J.P. 1996. Quantitative model of antibody- and soluble CD4-mediated neutralization of primary isolates and T-cell line-adapted strains of human immunodeficiency virus type I. J. Virol. 70: 3668-3677.

71. Koivunen E., Gay D.A., Ruoslahti E. 1994. Selection of peptides binding to the alpha 5 beta 1 integrin from phage display library. J. Biol. Chem. 268: 20205-20210.

72. Kozak S.L., Piatt E.J., Madani N., Ferro F.E. J., Peden K., Kabat D. 1997. CD4, CXCR-4, and CCR-5 dependencies for infections by primaiy patient and laboratoiy-adapted isolates of human immunodeficiency virus type 1. J. Virol. 71: 873-882.

73. Kretz K., Callen W., Hedden V. 1994. Cycle sequencing. PCR Methods Appl. 3: 107-112.

74. Krook M., Mosbach K., Lindbladth C. 1994. Selection of peptides with affinity for single-stranded DNA using a phage display library. Biochem. Biophys. Res. Commun. 204: 849854.

75. Ku J. and Schultz P.G. 1995. Alternate protein frameworks for molecular recognition. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 92: 6552-6556.

76. Kwong P.D., Wyatt R., Majeed S., Robinson J., Sweet R.W., Sodroski J., Hendrickson W.A. 2000. Structures of HIV-1 gpl20 envelope glycoproteins from laboratory-adapted and primary isolates. Structure 8: 1329-1339.

77. Kwong P.D., Wyatt R., Robinson J., Sweet R.W., Sodroski J., Hendrickson W.A. 1998. Structure of an HIV gpl20 envelope glycoprotein in complex with the CD4 receptor and a neutralizing human antibody. Nature 393: 648-659.

78. Lener D., Benarous R., Calogero R.A. 1995. Use of a constraind phage displayed-peptide library for the isolation of peptides binding to HIV-1 nucleocapsid protein (NCp7). FEBS Lett. 361: 85-88.

79. Lerner R.A. 1982. Tapping the immunological repertoire to produce antibodies ofpredetermined specificity. Nature 299: 593-596.

80. Levitan B. 1998. Stochastic modeling and optimizaion of phage display. J. Mol. Biol. 277: 893-916.

81. Li H., Liu Z.Q., Ding J., Chen Y.H. 2002. Recombinant multi-epitope vaccine induce predefined epitope-specific antibodies against HIV-1. Immunol Lett. 84: 153-157.

82. Liao M., Lu Y., Xiao Y., Ding J., Dierich M.P., Chen Y.H. 2000. Induction of high level of specific antibody response to the neutralizing epitope ELDKWA on HIV-1 gp41 by peptide-vaccine. Peptides 21: 463-468.

83. Lu Y., Ding J., Chen Y.H. 2001. Immunogenicity and specificity of the candidate multi-epitope-vaccines against HIV-1. Immunopharmacol. Immunotoxicol. 23: 487-94.

84. Luzzago A., Felici F., Tramontano A., Pessi A., Cortese R. 1993. Mimicking of discontinuous epitopes by phage-displayed peptides. I. Epitope mapping of human H ferritin using a phage library of constrained peptides. Gene 128: 51-57.

85. Mattheakis L.C., Bhatt R.R., Dower W.J. 1994. An in vitro polysome display system for identifying ligands from very large peptide libraries. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 91: 90229026.

86. Matthews D.J. and Wells J.A. 1993. Substrate phage: Selection of protease substrates by monovalent phage display. Science 260: 1113-1117.

87. Matthews D.J., Goodman L.J., Gorman C.M., Wells J.A. 1994. A survey of furin substrate specificity using substrate phage display. Protein Sci. 3: 1197-1205.

88. McCafferty J., Griffiths A.D., Winter G., Chiswell D.J. 1990. Phage antibodies: Filamentous phage displaying antibody variable domains. Nature 348: 552-554.

89. McConnel S.J. and Hoess R.H. 1995. Tendamistat as a scaffold for conformationally constrained phage peptide libraries. J. Mol. Biol. 250: 460-470.

90. McDougal J.S., Kennedy M.S., Orloff S.L., Nicholson J.K., Spira T.J. 1996. Mechanisms of human immunodeficiency virus tipel (HIV-1) neutralization: irreversible inactivation of infectivity by anti-HIV-1 antibody. J. Virol. 70: 5236-5245.

91. McLafferty M.A., Kent R.B., Ladner R.C., Markland W. 1993. M13 bacteriophage displaing disulfide- constrained microproteins. Gene 128: 29-36.

92. McLain L. and Dimmock N.J. 1994. Single- and multi-hit kinetics of immunoglobulin G neutralization of human immunodeficiency virus type 1 by monoclonal antibodies. J. Gen. Virol 75: 1475-1460.

93. McMichael A.J. and Rowland-Jones S.L. 2001. Cellular immune responses to HIV. Nature 410: 980-987.

94. Means R.E., Greenough Т., Desrosiers R.C. 1997. Neutralization sensitivity of cell culture-passaged simian immunodeficiency virus. J. Virol. 71: 7895-7902.

95. Mennuni C., Santini C., Dotta F., Farilla L., Di Mario U., Fierabracchi A., Bottazzo G., Cortese R., Luzzago A. 1996. Selection of phage-displayed peptides mimicking type 1 diabetes-specific epitopes. J. Autoimmun. 9: 431-436.

96. Minnenkova O.O., Ilyichev A.A., Kishchenko G.P., Petrenko V.A. 1993. Design of specific immunogens using filamentous phage as the carrier. Gene 128: 85-88.

97. Mo H., Stamatatos L., Ip J.E., Barbas C.F., Parren P.W., Burton D.R., Moore J.P., Ho D. D. 1997. Human immunodeficiency virus type 1 mutants that escape neutralization by human monoclonal antibody IgGlbl2. J. Virol 71:6869-6874.

98. Montefiori D.C. and Evans T.G. 1999. Toward an HIV type 1 vaccine that generates potent, broadly cross-reactive neutralizing antibodies. AIDS Res. Hum. Retrovir. 15: 689698.

99. Moore J.P. and Ho D.D. 1993. Antibodies to discontinuous or conformationally sensitive epitopes on the gpl20 glycoprotein of human immunodeficiency virus type 1 are highly prevalent in sera of infected humans. J. Virol. 61: 863-875.

100. Moore J.P. and Ho D.D. 1995. HIV-1 neutralization: the consequences of viral adaptation to growth on transformed T cells. AIDS Suppl A: SI 17-S136.

101. Moore J.P. and Montefiori D.C. 1997. Neutralization assays using the BZ167 strain of human immunodeficiency virus type I. J. Infect. Dis. 176: 1410-1412.

102. Moore J.P. and Sodroski J. 1996. Antibody cross-competition analysis of the human immunodeficiency virus type 1 gpl20 exterior envelope glycoprotein. J. Virol. 70: 18631872.

103. Motti C., Nuzzo M., Meola A., Galfre G., Felici F., Cortese R., Nicosia A., Monaci P. 1994. Recognition by human sera and immunogenicity of HBsAg mimotopes selected from an M13 phage display library. Gene 146: 191-198.

104. Muster Т., Guinea R., Trkola A., Purtscher M., Klima A., Steindl F., Palese P., Katinger H. 1994. Cross-neutralizing activity against divergent human immunodeficiency virus type 1 isolates induced by the gp41 sequence ELDKWAS. J. Virol. 68: 4031-4034.

105. Muster Т., Steindl F., Purtscher M., Trkola A., Klima A., Himmler G., Ruker F., Katinger H. 1993a. A conserved neutralizing epitope on gp41 of human immunodeficiency virus type \.J. Virol 67: 6642-6647.

106. Nabel G.J. 2001. Challenges and opportunities for development of an AIDS vaccine. Nature 410: 1002-1007.

107. Nakai M. and Goto T. 1996. Ultrastructure and morphogenesis of human immunodeficiency virus. J. Electron Microsc. (Tokyo): 45:247-257.

108. Nord K., Gunneriusson E., Ringdahl J., Stahl S., Uhlen M., Nygren P.A. 1997. Binding proteins selected from combinatorial libraries of an alpha-helical bacterial receptor domain. Nat. Biotechnol. 15: 772-777.

109. Ohkubo S., Miyadera K., Sugimoto Y., Matsuo K., Wierzba K. Yamada Y. 1999. Identification of substrate sequences for membrane type-1 matrix metalloproteinase using bacteriophage peptide display library. Biochem. Biophys. Res. Commun. 266: 308-313.

110. Oldenburg K.R., Loganathan D., Goldstein I.J., Schultz P.G., Gallop M.A. 1992. Peptide ligands for a sugar-binding protein isolated from a random peptide library. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 89, 5393-5397.

111. Olofsson S. and Hansen J. E. 1998. Host cell glycosylation of viral glycoproteins—a battlefield for host defence and viral resistance. Scand. J. Infect. Dis. 30: 435-440.

112. О'Neil K.T., Hoess R.H., Jackson S.A., Ramachandran N.S., Mousa S.A., DeGrado W.F. 1992. Identification of novel peptide antagonists for GPIIb/IIIa from a conformationally constrained phage peptide library. Proteins 14: 509-515.

113. Pai E.F., Klein M.H., Chong P., Pedyczak A. 2000. World Intellectual Property Organization Patent WO-OO/61618.

114. Pantaleo G., Demarest J.F., Vaccarezza M., Graziosi C., Bansal G.P., Koeing S., Fauci A.S. 1995. Effect of anti-V3 antibodies on cell-free and cell-to-cell human immunodeficiency virus transmission. Eur. J.Immunol. 25: 226-231.

115. Parmley S.F. and Smith G.P. 1988. Antibody-selectable filamentous fd phage vectors: Affinity purification of target genes. Gene 73: 305-318.

116. Parren P.W.H.I., Gauduin M.C., Koup R.A., Poignard P., Sattentau Q.J., Fisicaro P., Burton, D.R. 1997. Relevance of the antibody response against human immunodeficiency virus type 1 envelope to vaccine design. Immunol. Lett. 58: 125-132.

117. Parren P.W.H.I., Moore J.P., Burton D.R., Sattentau Q.J. 1999. The neutralizing antibody response to HIV-1: viral evasion and escape from humoral immunity. AIDS Suppl A: SI 37-S162.

118. Parren P.W.H.I., Wang M., Trkola A., Binley J.M., Purtscher M., Katinger H., Moore J.P., Burton D.R 1998b. Antibody neutralization-resistant primary isolates of human immunodeficiency virus type 1. J. Virol. 72: 10270-10274.

119. Pessi A., Bianchi E., Crameri A., Venturini S., Tramontano A., Sollaso M. 1993. A designed metal-binding protein with a novel fold. Nature 362: 367-369.

120. Petit M.A., Jolivet-Reynaud C., Peronnet E., Michal Y., Trepo C. 2003. Mapping of a conformational epitope shared between El and E2 on the serum-derived human hepatitis С virus envelope. J. Biol Chem. 278: 44385-44392.

121. Phalipon A., Folgori A., Arondel J., Sgaramella G., Fortungo P., Cortese R., Sansonetti P.J., Felici F. 1997. Induction of anti-carbohydrate antibodies by phage library-selected peptide mimics. Eur. J. Immunol 27: 2620-2625.

122. Pinter A., Honnen W.J., Kayman S.C., Trochev O., Wu Z. 1998. Potent neutralization of primary HIV-1 isolates by antibodies directed against epitopes present in the V1/V2 domain of HIV-1 gpl20. Vaccine 16: 1803-1811.

123. Pohlmann S., Baribaud F., Doms R.W. 2001. DC-SIGN and DC-SIGNR: helping hands for HIV. Trends Immunol. 22: 643-646.

124. Poignard P., Fouts Т., Naniche D., Moore J. P., Sattentau Q.J. 1996a. Neutralizing antibodies to human immunodeficiency virus type-1 gpl20 induce envelope glycoprotein subunit dissociation. J. Exp. Med. 183: 473-484.

125. Poignard P., Klasse P.J., Sattentau Q.J. 1996b. Antibody neutralization of HIV-1. Immunol. Today 17: 239-246.

126. Poignard P., Olmann Saphire E., Parren P.W.H.I., Burton D.R. 2001. GP120: Biologic Aspects of Structural Features. Annu. Rev. Immunol. 19: 253-274.

127. Poignard P., Sabbe R., Picchio G.R., Wang M., Gulizia R.J., Katinger H., Parren P.W.H.I., Mosier D.E., Burton D.R. 1999. Neutralizing antibodies have limited effects on the control of established HIV-1 infection in vivo. Immunity 10: 431-438.

128. Purtscher M., Trkola A., Grassauer A.P.M., Schuiz, Klima A., Dopper S., Gruber G., Buchacher A., Muster Т., Katinger H. 1996. Restricted antigenic variability of the epitope recognized by the neutralizing gp41 antibody 2F5. AIDS 10: 587-593.

129. Rizzuto C.D., Wyatt R., Hernandez-Ramos N., Sun Y., Kwong P.D., Hendrickson W.A., Sodroski J. 1998. A conserved HIV gpl20 glycoprotein structure involved in chemokine receptor binding. Science 280: 1949-1953.

130. Robertson G.A., Kostek B.M., Schleif W.A., Lewis J.A., Eminl E.A. 1988. A microtiter cell-culture assay for the determination of anti-human immunodeficiency virus neutralizing antibody activity. J. Virol. Methods. 20: 195-202.

131. Salzwedel K., West J.T., Hunter E. 1999. A conserved tryptophan-rich motif in the membrane-proximal region of the human immunodeficiency virus type 1 gp41 ectodomain is important for Env-mediated fusion and virus infectivity. J. Virol. 73: 2469-2480.

132. Sattentau Q.J., Zolla-Pazner S., Poignard P. 1995. Epitope exposure on functional, oligomeric HIV-1 gp41 molecules. Virology 206: 713-717.

133. Sattentau Q.J. 1998. HIV gpl20: double lock strategy foils host defences. Structure 6: 945-949.

134. Schonning K., Lund O., Segaard L.O., Stig H.J. 1999. Stoichiometry of monoclonal antibody neutralization of T-cell line-adapted human immunodeficiency virus type 1. J. Virol. 73: 8364-8370.

135. Scott J.K. 1992. Discovering peptide ligands using epitope library. Trends Biochem. Sci., 17, 241-245.

136. Scott J.K., Loganathan D., Easley R, Gong X., Goldstein I., 1992. A family of concanavalin A-binding peptides from a hexapeptide epitope library. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89: 5398-5402.

137. Scott J.K. and Smith G.P. 1990. Searching for peptide ligands with an epitope library. Science 249: 386-390

138. Sibille P., Ternynck Т., Nato F., Buttin G., Strossberg D., Avrameas A. 1997. Mimotopes of polyreactive anti-DNA antibodies identified using phage-display peptide libraries. Eur. J. Immunol. 27: 1221-1228.

139. Smith G.P. Cloning in fuse vector: A laboratory manual. Division of Biological Sciences, University of Missoury, Columbia. 1992.

140. Smith G.P. and Petrenko V.A. 1997. Phage display. Chem. Rev. 97: 391-410.

141. Smith G.P., Patel S.U., Windass J.D., Thornton J.M., Winter G., Griffiths A.D. 1998. Small binding proteins selected from a combinatorial repertoire of knottins displayed on phage. J. Mol. Biol. 277: 317-332.

142. Smith G.P., 1985. Filamentous fusion phage: Novel expression vectors that display cloned antigens on the surface of the virion. Science 228: 1315-1317.

143. Smith G.P. and Scott J. 1993. Libraries of peptides and proteins displayed on filamentous phage. Meth. Enzymol. 217: 228-257.

144. Sparks A.B., Adey N.B., Cwirla S., Kay B. 1996. Phage display of peptides and proteins: a laboratory manual. / Eds Kay B.A, Winter J., McCafferty J. Acad. Press., pp. 227-253.

145. Taki Т., Ishikawa D., hamasaki H., Handa S. 1997. Preparation of peptides which mimic glycosphingolipids by using phage peptide library and their modulation on beta-galactosidase activity. FEBS Lett. 418: 219-223.

146. Thali M., Moore J.P., Furman C., Charles M., Ho D.D., Robinson J., Sodroski J. 1993. Characterization of conserved human immunodeficiency virus type 1 gpl20 neutralization epitopes exposed upon gpl20-CD4 binding. J. Virol 61: 3978-3988.

147. Trkola A., Dragic Т., Arthos J., Binley J.M., Olson W.C., Allaway G.P., Cheng-Mayer C., Robinson J., Maddon P.J., Moore J.P. 1996a. CD4-dependent, antibody-sensitive interactions between HIV-1 and its со- receptor CCR-5. Nature 384: 184-187.

148. Tsunetsugu-Yokota Y., Tatsumi M., Robert V., Devaus C., Sprite В., Chermann J.-C., Hirsch I., 1991. Expression of an immunogenic region of HIV by a filamentous bacteriophage vector. Gene 99: 323-326.

149. Ugolini S., Mondor I., Sattentau Q.J. 1999. HIV-1 attachment: another look. Trends in Microbiology 7: 144-149.

150. Ugolini S., Mondor I., Parren P.W.H. I., Burton D.R., Tilley S.A., Klasse P.J., Sattentau Q.J. 1997. Inhibition of virus attachment to CD4+ target cells is a major mechanism of T cell line-adapted HIV-1 neutralization./. Exp. Med. 186: 1287-1298.

151. Valadon P., Nussbaum G., Boyd L.F., Margulies D.H., Scharff M.D. 1996. Peptide libraries define the fine specificity of anti-polysaccharide antibodies to Cryptococcus neoformans. J. Mol. Biol. 261: 11-22.

152. Van Regenmortel M.H.V. 1996. Mapping epitope structure and activity: from one-dimensional prediction to four-dimensional description of antigenic specificity. Methods 9: 465-472.

153. Veronese F.D.M., Willis A.E., Boyer-Thompsom C., Apella E., Perham R.N. 1994. Structural mimicry and enhanced immunogenecity of peptide epitopes displayed on filamentous bacteriophage. J. Mol. Biol. 243: 167-172.

154. Wang L.-F., Du Plessis D.H., White J.R., Hyatt A.D., Eaton B.T. 1995. Use of a gene-targeted phage display random epitope library to map an antigenic determinant on the blue-tongue virus outer capsid protein VP5. J. Immunol. Methods 178: 1-12.

155. Wang N., Zhu Т., Ho D.D. 1995. Sequence diversity of VI and V2 domains of gpl20 from human immunodeficiency virus type 1: lack of correlation with viral phenotype. J. Virol. 69:2708-2715.

156. Willis A.E., Perham R.N., Wraith D. 1993. Immunological properties of foreign peptides in multiple display on a filamentous bacteriophage. Gene 128: 79-83.

157. Wyatt R. and J. Sodroski. 1998. The HIV-1 envelope glycoproteins: fusogens, antigens, and immunogens. Science 280: 1884-1888.

158. Wyatt R., Kwong P.D., Desjardins E., Sweet R.W., Robinson J., Hendrickson W.A., Sodroski J.G. 1998. The antigenic structure of the HIV gpl20 envelope glycoprotein. Nature 393:705-711.

159. Wyatt R., Kwong P.D., Hendrickson W.A., Sodroski. J.G. 2001. Structure of the Core of the HIV-1 gpl20 Exterior Envelope Glycoprotein. HIV Sequence Database.

160. Wyatt R., Moore J., Accola M., Desjardin E., Robinson J., Sodroski J. 1995. Involvement of the V1/V2 variable loop structure in the exposure of human immunodeficiency virus type 1 gpl20 epitopes induced by receptor binding. J. Virol. 69: 5723-5733.

161. Xiao Y., Dong X.N., Chen Y.H. 2000a. Induction of monoclonal antibody with predefined ELNKWA epitope specificity by epitope vaccine. Hybridoma 19: 347-50.

162. Xiao Y., Dong X.N., Chen Y.H. 2000b. Induction of high levels of antibodies recognizing the neutralizing epitope ELDKWA and the D- or K-position-mutated epitopes by candidate epitope vaccines against HIV-1. Int. Arch. Allergy Immunol. 122: 287-92.

163. Xiao Y., Zhao Y., Lu Y., Chen Y.H. 2000. Epitope-vaccine induces high levels of ELDKWA-epitope-specific neutralizing antibody. Immunol. Invest. 29: 41-50.

164. Xu D., Tsai C.J., Nussiniv R. 1997. Hydrogen bonds and salt bridges across protein-protein interfaces. Protein Eng. 10: 999-1012.

165. Yu M.W., Scott J.K., Fournier A., Talbot P.J. 2000. Characterization of murine coronavirus neutralization epitopes with phage-displayed peptides. Virology 271: 182-196.

166. Zhang H., Zhong Z., Pirofski L.A. 1997. Peptide epitopes recognized by a human anti-cryptococcal glucoronoxylomannan antibody. Infect. Immun. 65: 1158-1164.

167. Zwick M.B., Wang M., Poignard P., Stiegler G, Katinger H., Burton D.R., Parren P.W.H.I. 2001b. Neutralization Synergy of Human Immunodeficiency Virus Type 1 Primary Isolates by Cocktails of Broadly Neutralizing Antibodies. J. Virology 75: 12198-12208.

168. Zwick M.B., Shen J., Scott J.K. 1998. Phage-displayed peptide libraries. Current Opinion in Biotechnology 9: 427-436.