Изучение двух групп уникальных - ΦKZ-подобных и Т7-подобных бактериофагов Pseudomonas aeruginosa тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.00.03, кандидат биологических наук Буркальцева, Мария Владленовна

• Буркальцева, Мария Владленовна
• кандидат биологических наук
• 2005

Оглавление диссертации кандидат биологических наук Буркальцева, Мария Владленовна

ВВЕДЕНИЕ.

ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.б

1. Pseudomonas aeruginosa как условный патоген.б

2. Классификация бактериофагов P. aeruginosa.

2.1. Морфология бактериофагов P. aeruginosa.

2.2. Гомология геномов бактериофагов P. aeruginosa.

3. Модульная теория и эволюция бактериофагов.

3.1. Модульная теория эволюции.

3.2. Супергруппы бактериофагов.

3.2.1. Фаги-трапспозоны.

3.2.2. Т4-подобные бактериофаги.

3.2.3. Т7-подобныс бактериофаги.

4. Фаготерапия.

4.1. Использование бактериофагов Р. aeruginosa в фаготерапии.

4.2. Проблемы использования живых вирулентных бактериофагов в фаготерапии.

4.2.1. Общая и специализированная траисдукция.

4.2.2. Фаговая конверсия.

4.2.3. Псевдолизогения.

5. Бактериофаг <}>KZ Р. aeruginosa.

5.1. Биологические свойства бактериофага <}>KZ.

5.2. Структура частицы бактериофага <}>KZ.

5.3. Геном фага <}>KZ.

5.3.1. Основные свойства и организация генома <}>KZ.

5.3.2. Предполагаемые промоторы и терминаторы.

5.3.3 Внрус-кодирусмые тРНК.

5.4. Предполагаемые генные продукты бактериофага <}>KZ.

5.4.1. Сходство генных продуктов фага <}>KZ с известными белками.

5.4.2. Интрон-кодируемые эндонуклеазы.

5.4.3. Генные продукты, вовлеченные в метаболизм иуклеотндов.

5.4.4. Репликация ДНК.

5.4.5. Белки фага <}>KZ, родственные белкам других бактериофагов.

5.4.6. Белки фаговой частицы <}>KZ.

5.5. Бактериофаги группы <J)KZ.

ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ

МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ.

РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ.

1. ФК^-ПОДОБ11ЫЕ БАКТЕРИОФАГИ.

1.1. Сравнение биологических свойств фагов.

1.1.1. Бактериофаги и их происхождение.

1.1.2. Выделение новых фК2-подобных бактериофагов.

1.1.3. Фенотип негативных колоний фагов.

1.1.4. Сравнение морфологии фаговых частиц.

1.1.5. Псевдолизогения.

1.1.6. Спектр литическои активности. 1.1.7. Способность к общей транедукции.

1.1.8. Инактивация сывороткой.

1.2. Сравнение геномов фК2-подобных фагов.

1.2.1. Сравнение размеров геномов.

1.2.2. Сравнение рестрикциопиых профилей ДНК.

1.2.3. Определение гомологии ДНК.

1.3. Сравнение полипептидного состава зрелых частиц.

1.4. Некоторые особенности предполагаемых генных продуктов фага <J>KZ.

1.5. Обсуждение.

1.5.1.Эволюция группы ф^-нодобиых бактериофагов.

1.5.2. Возможность использования фК2-подобных фагов в фаготерапии.

2. БАКТЕРИОФАГ фКМУ.

2.1. Биологические свойства фага фКМ V.

2.1.1. Выделение фага фКМУ и внешние признаки негативных колоний.

2.1.2. Морфология фаговых частиц.

2.1.3. Спектр литической активности.

2.1.4. Рост и развитие фага.

2.2. Изучение генома фага фКМУ.

92.2.1. Размер и GC-состав генома.

2.2.2. Рестрикционный анализ ДНК.

2.2.3. Характеристика генома фКМУ, полученная па основе анализа полной последовательности ДНК.

2.3. фКМУ-подобные бактериофаги.

2.3.1. Выделение новых фКМУ-подобных бактериофагов.

2.3.2. Морфология фаговых частиц. ш 2.3.3. Изучение генома новых фКМУ-подобных бактериофагов.

2.3.4. Спектр литической активности.

2.3.5. Феномен взаимодействия фКМУ-подобных и некоторых фК2-подобных фагов.

2.4. Обсуждение.

2.4.1. Эволюция фКМУ-подобных фагов.

2.4.2. Возможное практическое применение фагов вида фКМУ.

ВЫВОДЫ.

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Изучение двух групп уникальных - ΦKZ-подобных и Т7-подобных бактериофагов Pseudomonas aeruginosa»

В последнее время резко увеличилось количество сообщений о появлении клинических изолятов патогенных бактерий с множественной устойчивостью к антибиотикам (multi-drug-resistant bactcria). Как следствие этого возникла идея возрождения фаготерапии как метода лечения бактериальных инфекций. Однако введение фаготерапии в широкую практику ограничивается определенной опасностью при использовании бактериофагов (фаговая конверсия, транедукция и распространение островков патогенности и др.). Поэтому во всех работах, где рассматривается возможность применения фаготерапии, считается обязательным всестороннее изучение используемых бактериофагов, вплоть до определения полной последовательности геномов.

Среди патогенных бактерий особое значение имеют бактерии Pseudomonas aeruginosa. Они являются причиной раневых и ожоговых инфекций, осложнений после хирургических операций и поражений различных органов при иммунодефнцитиых состояниях и др. P. aeruginosa колонизирует легкие больных^наследственным заболеванием' г? кистозным фиброзом, что в конечном итоге приводит к летальному исходу. Этот вид микроорганизмов является этиологическим агентом 15-20% всех впутрнболышчных инфекции. Такая частая встречаемость P. aeruginosa среди клинических изолятов вызвана устойчивостью бактерий данного вида ко многим широко используемым антибиотикам а также их способностью легко и быстро образовывать бионленки, непроницаемые для антибиотиков и ферментов, а также генетических векторов, несущих гены, комплемептирующне дефектный ген CFTR (cystic fibrosis transmembrane conductance regulator gene) при кнетозном фиброзе.

В настоящей работе мы провели детальное исследование двух групп бактериофагов P. aeruginosa, представляющих большой научный и практический интерес.

Обзор литературы

Заключение диссертации по теме «Молекулярная биология», Буркальцева, Мария Владленовна

выводы

На основании изложенных выше результатов можно сделать следующие выводы:

1. Исследовано 15 гигантских (¡»^-подобных фагов (из них 11 новых), выделенных в различных регионах; показано, что эти фаги широко распространены в природе и проявляют значительное сходство по многим признакам (широкий спектр литической активности, внешний вид негативных колоний, особенности роста и развития, морфология фаговой частицы, размер генома и др.).

2. На основании проведенных исследований: сравнения морфологии фаговых частиц, спектра литической активности, инактивации сывороткой, рестрикциоппого и гибридизационного анализов фаговой ДНК, анализа полипептндиого состава зрелых фаговых частиц и др. проведена классификация (¡»KZ-иодобиых фагов. Сделан вывод, что фаги этой группы являются филогенетически родственными и представлены тремя видами: <J)KZ, Lin68 и EL нового рода <{>KZ семейства Myoviridae. Доминирующим в природных популяциях является вид $KZ. (11 фагов).

3. Отсутствие гомологии ДНК фагов вида EL с видами (¡>KZ и Lin68 и ее крайне низкий уровень у фагов вида (¡>KZ и Lin68 свидетельствуют о том, что дивергенция трех видов (¡>KZ-no;io6iibix фагов произошла достаточно давно.

4. Впервые выделен Т7-подобный фаг, активный на бактериях P. aeruginosa - фаг фКМУ. Этот фаг имеет ряд уникальных свойств: очень высокую скорость роста, рост на бактериях, утративших способность поддерживать рост других фагов, что может следовать из особых свойств собственной PIIK-иолимеразы фКМУ, имеющей гомологию с РПК-иолимеразой фага Т7 Е. coli. Помимо РНК-полимеразы еще 10 из 48 предполагаемых генных продуктов фага фКМУ, в том числе белки, участвующие в репликации ДНК и некоторые структурные белки имеют сходство па аминокислотном уровне с белками Т7-иодобпых фагов эптеробактерпй.

5. Исследовано 8 новых фКМУ-подобных фагов, выделенных в различных регионах. Все фКМУ-иодобпые фаги по совокупности генетических и фепотипических признаков отнесены к одному новому виду фКМУ семейства Рос1о\чги1ас.

6. Устойчивость ДНК фКМУ к очень большому количеству эпдонуклеаз рестрикции свидетельствует о длительной эволюции и миграции этого бактериофага среди бактерий-хозяев, имеющих различные системы рестрикции. Сравнение всех изученных фКМУ-подобных фагов по характеру рестрикции показало чрезвычайную ограниченность разнообразия данного признака (всего 3 варианта рестрикционного профиля) у этой группы фагов, что доказывает исчерпанность возможности их мутационной изменчивости.

7. Особенности роста и развития фК2-подобиых фагов и фагов вида фКМУ делают их перспективными для использования в фаготерапии. Они взаимодополияют друг друга в практическом отношении и могут быть использованы в оптимальных фаготерапевтнческих смесях. Способность фагов изученных групп продуцировать свон собственные РНК-полимеразу или тРНК, а также различные литические ферменты делают нх привлекательным объектом для молекулярной биологии и биотехнологии.

Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Буркальцева, Мария Владленовна, 2005 год

1. Ахвердяп В.З., Биднснко Е.М., Фрейзоп Е.В. (1988). Сравнительная характеристика группы (¡iKZ-подобиых вирулентных фагов Pseudomonas aeruginosa. Микробиологическая промышленность. Отечественный производственный опыт. № б. С. 1-5.

2. Ахвердян В.З., Лобанов А.О., Хренова Е.А., Крылов В.Н. (1998а). Рекомбинацноппое происхождение природных фагов-транспозопов родственных видов группы ВЗ, активных па бактериях вида Pseudomonas aeruginosa. Генетика. Т. 34. № 5. С. 697 700.

3. Ахвердяп В.З., Хренова Е.А., Богуш В.Г., Герасимова Т.В., Кирсанов Н.Б., Крылов В.Н. (1984). Широкая распространенность трапепозоппых фагов в природных популяциях Pseudomonas aeruginosa. Генетика. Т.20. № 10, С.1612-1619.

4. Ахвердян В.З., Хренова Е.А., Лобанов А.О., Крылов В.Н. (19986). Выявление роли дивергенции в эволюции фагов-транспозопов группы Pseudomonas aeruginosa. Генетика. Т. 34. № 6. С. 846-849.

5. Ахвердян В.З., Хренова Е.А., Реулец, М.А., Герасимова Т.В., Крылов В.Н. (1985). Характеристика фагов-транспозопов Pseudomonas aeruginosa, относящихся к двум группам, различимым по ДНК-ДНК-гомологии. Генетика. Т. 21. № 5. С. 735 — 747.

6. Беляков В.Д., Ряпнс Л.А., Илюхин В.И. (1990). Псевдомопады и пеевдомопозы. М., Медицина. С. 224.

7. Бпдненко Е.М., Ахвердяп В.З., Хренова Е.А., Япепко A.C., Крылов В.Н. (1989), Генетический контроль морфогенеза фага-траиспозопа D3112 Pseudomonas aeruginosa. Генетика, Т. 25. № 12. С. 2126 2137.

8. Герасимов В.А., Япепко A.C., Ахвердян В.З., Крылов В.Н. (1996). Взаимодействие фагов-транспозопонов Pseudomonas aeruginosa', генетический анализ признака подавления профагом D3112 развития фага В39. Генетика. Т.32. № 8. С. 1068 -1073.

9. Горбунова С.А., Ахвердян В.З., Черсмухпна Л.В., Крылов В.Н. (1985), Эффективный метод трапедукцпн вирулентным фагом рП6 с использованием специфических мутантов Pseudomonasputida PpGl. Генетика. Т. 21. № 5. С. 872 874.

10. Джусупова А.Б., Плотникова Т.Г., Крылов В.Н. (1982).Выявленне транедукции вирулентным бактериофагом (¡)KZ хромосомальных маркеров Pseudomonas aeruginosa в присутствии плазмиды RMS148. Генетика. Т. 18. № 11. С. 1799-1802.

11. Доув У. (1975). Биологические выводы. В кн: Фаг лямбда (Ред. Хсрши Л.Д.), N1., Мир, с. 379.

12. Кочеткова В.Л., Мамонтов Л.С., Московцсва P.J1., Ерастова E.JI., Трофимов Е.И., Попов М.И., Джубалиева С.К. (1989). Фаготерапия послеонерациопных гпойно-восиалительпых осложнений у онкологических больных. Сов. Мед. Т. 6. С. 23 26.

13. Крылов B.II. (1985). Современные проблемы бактсриофагии//Успсхи микробиологии. Т. 20. С. 22-53.

14. Крылов В.И. (2001). Фаготерапия с точки зрения генетики бактериофага: надежды, перспективы, проблемы безопасности, ограничения. Генетика. Т. 37. № 7. С. 869 -887.

15. Крылов В.И., Ахвсрдян В.З., Богуш В.Г., Хренова Е.Л., Рсулец М.Л. (1985). Модульная структура геномов фагов-транспозонов Pseudomonas aeruginosa// Генетика. Т. 21. №5. С. 724-734.

16. Крылов В.И., Ахвердян В.З., Хренова Е.А., Чсрсмухииа JI.B., Тяглов Б.В. (1986а). Два типа молекулярной структуры (состава) генома в пределах одного вида бактсриофагов-транспозонов Pseudomonas aeruginosa. Генетика. Т. 22. № 11. С. 2637 -2648.

17. Крылов В.II., Джусунова А.Б., Ахвердян В.З., Хренова Е.А., Алышкпп А.Ф., Копылова Ю.И. (1989). Изучение морфологии частиц и структуры геномов бактериофагов Pseudomonasputida с целыо их классификации. Генетика. Т. 25. № 9. С. 1559 1557.

18. Крылов В.П., Жазыков И.Ж. (1978). Бактериофаг (¡>KZ Pseudomonas aeruginosa -возможная модель для изучения генетического контроля морфогенеза. Генетика. Т. 14. № 4. С. 678-685.

19. Крылов В.П., Смирнова Т.А., Ребентиш Б.А., Мииенкова И.Б. (1978). Структура частицы бактериофага <J>KZ. Вопросы вирусологии. № 5. С. 568 571.

20. Крылов В.IL, Шарибжанова Т.О., Ахвердян В.З. (1992). Характеристика гомологичных участков в геномах группы умеренных бактериофагов Pseudomonas aeruginosa разных видов. Генетика. Т. 28. № 3. С. 33-42.

21. Крылов B.IL, Янеико A.C., Черемухина Л.В. (19866). Различия в аллельиом состоянии генов, контролирующих специфичность адсорбции в группе фагов-трапепозонов Pseudomonas aeruginosa. Генетика. Т. 22. № 7. С. 1093 — 1098.

22. Литвин В.Ю., Гннцбург А.Л., Пушкарева В.И. и др. (1998). Эпидемиологические аспекты экологии бактерий. М., Фармарус-Приит. С. 256.

23. Мейпслл Г. (1976). Бактериальные нлазмиды. М., С. 172 190.

24. Митькина Л.Н., Крылов B.II. (1999). Природные межвидовые гибриды фагов-трапсиозопов Pseudomonas aeruginosa//Генетика. Т. 35. N 9. С. 1182-1190.

25. Митькина Л.Н., Крылов В.Н. (2000). Свойства природных межвидовых гибридов фагов-транспозоиов Pseudomonas aeruginosa: особенности транспозиции фага PL24// Генетика. Т. 36. №10. С. 1-9.

26. Плотникова Т.Г., Джусупова А.Б., Хренова Е.А., Крылов В.Н. (1982). Генетическое и феногснстнческое изучение группы ts-мутантов фага (¡)KZ Pseudomonas aeruginosa PAOl. Генетика. Т. 18. № 11. С. 1793 1798.

27. Тяглов Б.В., Крылов В.Н., Плотникова Т.Г., Минаев И.Е., Псрмогоров В.И. (1980). Некоторые физико-химические свойства бактериофага (¡)KZ. Молекулярная биология. 1980. Т. 14. Выи. 5. С. 1019- 1022.

28. Фрейзон Е.В., Конылова Ю.И., Черемухина Л.В., Крылов B.IL (1989). Влияние плазмид IncP-2-группы па рост бактериофагов Pseudomonas aeruginosa. Генетика. Т. 25. № 7. С. 1168- 1178.

29. Хренова Е.Л., Лхвердян В.З., Крылов O.II. (1984). Родство бактериофагов <j)KZ и 21 Pseudomonas aeruginosa, обладающих уникальной нуклеонротеидпой структурой в головке. Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. № 5. С. 31-34.

30. Шарибжанова Т.О., Лхвердян В.З., Крылов D.H. (1992). Сравнительное изучение гомологии геномов и морфологии бактериофагов Pseudomonas aeruginosa для выявления филогенетического родства и экспресс-классификации. Генетика. Т. 28. № 3. С. 24 32.

31. Яковлев С.В., Яковлева В.П. (2001).//Лнтимикробная химиотерапия в таблицах. Consilium medicum, Т. 1. № 3. С. 3-50

32. Яковлева O.II., Романова Ю.М., Петровская В.Г. (1983). -Журнал микробиол. №9. С. 40-46.

33. Яненко Л.С., Беккаревич Л.О., Герасимов В.Л., Крылов В.П. (1988). Генетическая карта бактериофага-транспозона D3112 Pseudomonas aeruginosa. Генетика, Т. 24, № 12, С. 2120-2126.

34. Лскегтапп II.-W. and М. DuBow, (1987), Viruses of Prokaryotes, V. II, CRC Press, Boca Raton, Florida, P. 1 161

35. Лскегтапп II.-W., Cartier C., Slopek S., and Vieu J.-F. (1988). Morphology of Pseudomonas aeruginosa typing phages of the Lindberg set// Ann.Inst. Pasteur/Virol. V. 139. P. 389-404.

36. Лскегтапп II.-W., Kasatiya S.S., Kawata Т., (1984), Classification of Vibrio Bacteriophages, Intervirology, V. 22, P. 61 -71.

37. Лскегтапп H.-W. and Krisch U.M." (1997). Л catalogue of T4-type bacteriophages. Arch. Virol. V. 142. P. 2329 2345.

38. Adams M. (1959). Bacteriophages. Intersciences Publishers Inc., New York. Intcrscienccs Publishers Ltd. London.

39. Ahearn, D.G., Borazjani, R.N., Simmons, R.B., & Gabriel, M.M. (1999) Primary adhesion of Pseudomonas aeruginosa to inanimate surfaces including biomaterial Methods Enzymol. V.310. P. 551 -557.

40. Alisky, J., K. Iczkowski, A. Rapoport and N. Troitsky (1998). Bacteriophages show Promise as Antimicrobial Agents. Journal of Infection. V. 36. P. :5 15.

41. Altschul S. F., Madden, T. L., Schaffcr, A. A., Zhang, J., Zhang, Z., Miller, W., and Lipman, D. J. (1997). Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs. Nucleic Acids Res. V. 25. P. 3389-3402.

42. Autexicr C., Wragg-Legare S. and DuBow M.S. (1991). Characterization of the Pseudomonas aeruginosa transposable phage D3112 left end regulatory region. Biochim. Biophys. Acta. V. 1088. P. 147 150.

43. Bairoch, A. and Apweiler, R. (2000). The SWISS-PROT protein sequence database and its supplement TrEMBL in 2000. Nucleic Acids Res. V. 28. P. 45-48.

44. Barrow, P. A. and Soothill, J. S. (1997). Bacteriophage therapy and prophylaxis: rediscovery and renewed assessment of potential. Trends Microbiol. V. 5. P. 268-271.

45. Barrow, P., Lovell, M., and Bcrchicri, A., Jr. (1998). Use of lytic bacteriophage for control of experimental Escherichia coli septicemia and meningitis in chickens and calves. Clin.Diagn.Lab Immunol. V. 5. P. 294-298.

46. Bartlett D.H., Wright M.E, Silverman M. (1988) Variable expression of extracellular polysaccharide in the marine bacterium Pseudomonas aeruginosa is controlled by genome rearrangement // Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. V. 85. P. 3923 3927.

47. Bateman A., Birney, E., Durbin, R., Eddy, S.R., Howe, K.L, & Sonnhammer, E.L. (2000) The Pfam protein families database. Nucleic Acids Res. V. 28. P. 263-266.

48. Bcscmcr J. and Borodovsky, M. (1999) Heuristic approach to deriving models for gene finding. Nucleic Acids Res. V. 27. P. 3911-3920.

49. Black, L.W., Show, M.K., & Steven, A.C. (1994) Morphogenesis of T4 head In "Molecular biology of bacteriophage T4" (J.D. Karam, Ed.), pp. 218-258. Am. Soc. Microbiiol., Washington, DC.

50. Braid M.D., Silhavy J.L., Kitts C.L., Cano R.J., Howe M.M. (2004). Complete Genomic Sequence of bacteriophage B3, a Mu-likc phage of Pseudomonas aeruginosa. J. Baceriol., V. 186. № 19. P. 6560-6574.

51. Borodovsky M., and Mclninch, J. (1993) Recognition of genes in DNA sequence with ambiguities. Biosystems. V. 30. P. 161-171.

52. Botstcin D. (1980). A theory of modular evolution for bacteriophages. Ann. N.Y. Acad. Sci. V. 354. P. 484-490

53. Botstcin D. and Herskowitz J. (1974). Properties of hybrids between Salmonella phage P22 and coliphage lambda. Nature. 251:584.

54. Bodcy G.P., Dolivar R., Fainstcin V., Jadeja 1 (1983). //Infections causcd by Pseudomonas acruginisa. Rev. Inf. Dis., V. 5. № 2. P. 279 313.

55. Brussow, H., & Desiere, F. (2001) Comparative phage genomics and the evolution of Siphoviridac: insights from dairy phages. Mol. Microbiol. V. 39 P. 213-223.

56. Brussow H., Bruttin A., Desiere F. (1998). Molecular ecology and evolution of Streptococcus thermophilic bacteriophages. Virus Genes. V.16. P. 95 109.

57. Buck G.A., Cross R.E., Wong T.P., Loera J., Groman N. (1985). DNA relationships among some tox-bearing corynebacteriophages. //Infect. Immun.V. 49. N. 3. P.679-84.

58. Campbell A. (1977). Defective bacteriophages and incomplete prophages. In: Comprehensive virology. Eds.Fraenkel-Conrat II., Wagner R.R. N.Y. Plenum Press. V. 8. P. 259/

59. Campbell A. and Botstcin D. (1983). Evolution of the lambdoid phages. In: Lambda II (Hcndrix R.W. et.al. Eds). Cold Spring Harbor Laboratory , Cold Spring Harbor, NY, P. 365380.

60. Campbell J.I.A., Albrechtsen M., Sorcnsen J. (1995). Large Pseudomonas phages isolated from barley rhizosphere// FEMS Microbiology Ecology. V. 18 . P. 63-74.

61. Carlton RM (1999). Phage therapy: past history and future prospects. Arch Immunol Ther Exp (Warsz). V. 47. P. 267-74.

62. Cerritelli, N1. E. and Studier, F. W. (1996). Purification and characterization of T7 head-tail connectors expressed from the cloned gene. J.Mol.Biol. V. 258. P. 299-307.

63. Chu F.K., Malcy G.F., Malcy F., & Belfort, M. (1984) Intervening sequence in the thymidylatc synthase gene of bacteriophage T4. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, V. 81. P. 30493053.

64. Cianciotto N.P., Groman N.B. (1997). Characterization of bacteriophages from tox-containing, non-toxigenic isolates of Coryncbactcrium diphthcriac.il Microb. Pathog. V.22 N6. P.343-51.

65. Classification and Nomenclature of Viruses, Ed. R.J. Francki, C.M. Fauquet, D.L. Knudson, F. Brown, (1991), Arch.Virol., Sup.2, P. ,159- 166.

66. Clyman, J., Quirk, S., & Belfort, M. (1994) Mobile introns in the T-evcn phages. In "Molecular biology of bacteriophage T4" (J.D. Karam, Ed.), P. 83-88. Am. Soc. Microbiiol., Washington, DC.

67. Costerton J.W. (1984), The etiology and persistence of cryptic bacterial infections: a hypothesis. Rev. Infectious diseases. V. 6. P.608-616.

68. Davis R.W., Ilyman R.W. (1971). A study in evolution: the DNA base sequence homology between coliphage T7 and T3. J. Mol. Boil. V. 62. P. 287 301.

69. Davis, B.M., Lawson, E.H., Sandkvist, M., Ali, A., Sozhamannan, S., & Waldor, M.K. (2000) Convergence of the secretory pathways for cholera toxin and the filamentous phage, CTXPhi. Science, V. 288. P. 333-335.

70. DeVault J.D., Berry A., Misra T., Darzins A., Chakrabarty A.M. (1989). Enviromental sensory signals and microbial pathogenesis: Pseudomonas aeruginosa infection in cystic fibrosis // Bio/Technology. V. 7. P. 352 357.

71. DuBow M.S. (1987). Transposable Mu-like phages. In: Symonds N, Toussaint A, van de Putte, Howe MM (eds) Phage Mu. Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, NY, P. 201-213.

72. Endy, D., You, L., Yin, J., Molineux, I.J., (2000). Computation, prediction, and experimental tests of fitness for bacteriophage T7 mutants with permuted genomes. Proc. Natl. Acad. Sci. USA V. 97. P. 5375-5380.

73. Engel J. (1997) Versatile collagens in invertebrates. Science, V. 277. P. 1785-1786.

74. Ennifar E., "Nikulin A., Tishchenko S., Serganov A., Nevskaya N., Garber, M. Ehresmann B., Ehresmann C., Nikonov S., & Dumas P. (2000) The crystal structure of UUCG tetraloop. J. Mol. Biol., V. 304. P. 35-42.

75. Falquet, L., Pagni, M., Bucher, P., IIulo, N., Sigrist, C. J., Hofmann, K., and Bairoch, A. (2002). The PROSITE database, its status in 2002. Nucleic Acids Res. V. 30. P. 235-238.

76. Finlay B.B., Falkow S. (1989). //Common themes in microbial pathogenicity. Microbiol. Rev. V. 53. P. 210-230

77. Finlay B.B., Falkow, S. (1997). Common themes in microbial pathogenity revisited // Microbial Mol. Biol. Rev. V. 61. P. 136-169.

78. Foley, S., Bruttin, A., & Brussow, H. (2000) Widespread distribution of a group I intron and its three deletion derivatives in the lysin gene of Streptococcus thermophilic bacteriophages. J. Virol., V. 74. P. 611-618.

79. Garcia, L. R. and Molineux, I. J. (1995). Rate of translocation of bacteriophage T7 DNA across the membranes of Escherichia coli. J.Bacteriol. V. 177. P. 4066-4076.

80. Garcia E., Elliott J.M., Ramanculov E., Chain P.S., Chu M.C., Molineux I.J. (2003). The genome sequence of Yersinia pestis bacteriophage phiA1122 reveals an intimate history with the coliphage T3 and T7 genomes. J Bacteriol. Sep;185(17).:P. 5248-62.

81. Giamarcllou, H. (2000). Therapeutic guidelines for Pseudomonas aeruginosa infections. Int. J.Antimicrob.Agents V. 16. P. 103-106

82. Gill G.S., Hull R.C., Curtiss R. (1981). Mutator bacteriophage D108 and its DNA: an electron microscopic characterization. J. Virol., V. 35. № l.P. 420.

83. Goodrich-Blair II., Scarlato V., Gott J.M., Xu M.Q., & Shub, D.A. (1990) A self-splicing group I intron in the Bacillus subtilis bacteriophage SPOl.Cell, V. 63. P. 417-424.

84. Harshey R.M. (1971). Comparative modular structure among related phage DNAs Carnegie Inst Wash Ycarb, V. 70. P. 3.

85. Hendrix, R. W., Smith, M. C., Burns, R. N., Ford, M. E., and Hatfull, G. F. (1999). Evolutionary relationships among diverse bacteriophages and prophages: all the world's a phage. Proc.Natl.Acad.Sci. U.S.A V. 96. P. 2192-2197.

86. Ho T.D., Slauch J.M., (2001), Chorocterization of grvA, on ontivirulence gene on the gifsy-2 phage in Salmonella enterica serovor typhimurium., J. Boctcriol., V. 183 (2), P. 611 — 620.

87. Ilofmann, K., Buchcr, P., Folquet, L., & Boiroch, A. (1999) The PROSITE dotobose, its stotus in 1999. Nucleic Acids Res. V. 27. P. 215-219.

88. Hollowoy B.W., Egon J.B., Monk M., (1960). Lysogeny in Pseudomonas aeruginosa. Austrol. J. Exptl. Biol. And Med. Sei. V.38. P. 321.

89. Holloway B.W., Krishnapillai V. (1975). Bacteriophages and Bactcriocins. In: Gcnetics and Biochemistry of Pseudomonas. Eds. Clarke P.I I., Richmond M.I I., London, New York, Sydney, Toronto: Willey and Sons. P.99.

90. Howe M.M. (1987). Phage Mu: an overview. In: Phage Mu. Eds. Symonds N., Toussaint A., van de Putte, Howe M.M. Cold Spring Harbor Lab.oratory, NY, P. 25 39.

91. Jacoby G.A. (1984). //Antimicrocrobial drug resistencc// Ed. L.E. Bryan, New York, ,p. 497-514

92. Jacoby G.A., Sutton L. (1982). Restriction-modification systems determined by Pseudomonas plasmids. Plasmid. V. 8(2). P. 141-147.

93. Jacoby G.A., Sutton L., Knobel L., Mammen P. (1983). Properties of IncP-2 plasmids of Pseudomonas spp.// Antimicrob. Agents Chemother. V. 24. P. 168-175.

94. Jim D. Karan. (1994). Molecular Biology of Bacteriophage T4. ASM Press. Washington. P. 482-483.

95. Juhala, R.J., Ford, M.E., Duda, R.L., Youlton, A., Hatfull, G.F., & Hendrix., R.W. (2000) Genomic sequences of bacteriophages IIK97 and IIK022: pervasive genetic mosaicism in the lambdoid bacteriophages. J. Mol. Biol., V. 299. P. 27-51.

96. Kawakami Y., Mikoshiba F., Nagasaki S. Et al. (1972).- J. Antibiot. (Tokyo). V. 25. P. 607-609

97. Kessler C. and Manta V. (1990) Specificity endonucleases and DNA modification methyltransferases. Gene, V. 92. P. 1-248.

98. Kim J.S. and Davidson N. (1974). Electron microscope hctcroduplcx studies of sequence relations ofT2, T4 and T6 bacteriophage DNAs. Virology. V. 57. P. 93 111.

99. Kim, B.C., Kim, K., Park, E. IL, & Lim, C. J. (1997) Nucleotide sequence and revised map location of the arn gene from bacteriophage T4. Mol Cells V. 17. P. 694-696.

100. Korsten, K. II., Tomkievvicz, C., and Hausmann, R. (1979). The strategy of infection as a criterion for phylogcnetic relationships of non-coli phages morphologically similar to phage T7. J.Gen. Virol. V. 43. P. 57-73.7"

101. Kostyuchenko, V.A., Navruzbekov, G.A., Kurochkina, L.P., Strelkov S.V., Mcsyanzhinov, V.V., & Rossmann, M.G. (1999) The structure of bacteriophage T4 gene product 9: the trigger for tail contractioa Structure Fold. Des., V. 7. P. 1213-1222.

102. Kovalyova IV, Kropinski AM. (2003). The complete genomic sequence of lytic bacteriophage gh-1 infecting Pseudomonas putida—evidence for close relationship to the T7 group. Virology. Jul V.5. № 311(2). P. 305-315.

103. Kropinski, A. M. (2000). Sequence of the genome of the temperate, serotype-converting, Pseudomonas aeruginosa bacteriophage D3. J.Bacteriol. V. 182. P. 6066-6074.

104. Krylov V.N. (1998). These puzzling pseudomonade transposon phages. Science in Russia. № 1. P. 38-44

105. Krylov, V.N., Smirnova, T.A., Minenkova, I.B., Plotnikova, T.G., Zhazikov, I.Z., & Khrenova, E.A. (1984) Pseudomonas bacteriophage cpKZ contains an inner body in its capsid. Can. J. Microbiol. V. 6. P. 758 -762.

106. Krylov V.N., Tolmacheva T.O., Akhvcrdian V.Z. (1993). DNA homology in species of bacteriophages active on Pseudomonas aeruginosa. Arch. Virol. V. 131. № 1 — 2. P. 141 -152.

107. Kutter E. (1997). Phage Therapy: Bacteriophages as Antibiotics, Evergreen State College, Olympia, WA 98505 -- Nov. 15,.

108. Kutter E., Gachechiladze K., Poglazov A., Marusich E., Shaidcr M., Aronsson P., Napuli A., Porter D. and Mesyanzhinov V. (1996). Evolution of T4-related phages. Virus Genes. V. 11. P. 285-297.

109. Kutter E., Kellenberger E., Carlson K. et al. (1994a). Effects of bacterial growth conditions and physiology on T4 infection. In: "Molecular biology of bacteriophage T4" Ed. Karam J.D. Amer. Soc. Microbiiol., Washington. P. 491-519.

110. Kuzio J., Kropinski A.M. (1983). O-antigcn conversion in Pseudomonas aeruginosa PAOl by bacteriophage D3. J. Bacteriol. V.155. P. 203-212.

111. Lambowitz A.M. and Belfort M. (1993) Introns as mobile genetic elements. Annu Rev Biochem. V. 62. P. 587-622.

112. Lanyi B., Bergan T. (1978). //Methods in microbiology. London, V. 10. P. 93-168

113. Lavigne R., Briers Y., Ilertveldt K., Robben J., Volckaert G. (2004) Identification and characterization of a highly thermostable bacteriophage lysozyme. Cell Mol. Life Sci. V. 61(21). P. 2753-2759.

114. Lecuit, M., Vandormael-Pournin, S., Lefort, J., Iluerre, M., Gounon, P., Dupuy, C., Babinet, C., & Cossart, P. (2001) A transgenic model for listeriosis: role of internalin in crossing the intestinal barrier. Science. V. 292. P. 1722-1725.

115. Le Minor ct al. (1984), Genus Salmonella. In: Bergey's Mamual of Systematic Bacteriology., P. 427-458, Williams & Wilkins, Baltimore.

116. Lecuit, M., Vandormael-Pournin, S., Lefort, J., Iluerre, M., Gounon, P., Dupuy, C., Babinet, C., & Cossart, P. (2001) A transgenic model for listeriosis: role of internalin in crossing the intestinal barrier. Science, V. 292. P. 1722-1725.

117. Leffers G., Rao V.B. (1996). A discontinuous headful packaging model for packaging less then heedful length DNA molecules by bacteriophage T4. J. Mol. Biol. V. 24. P. 838-845.

118. Leiman, P.G, Kostyuchenko, V.A., Shneider, M.M., Kurochkina, L.P., Mesyanzhinov, V.V., & Rossmann, M.G. (2000) Structure of bacteriophage T4 gene product 11, the interface between the baseplate and short tail fibers. J. Mol. Biol. V. 301. P. 975-985.

119. Levin, B.R., & Tauxe, R.V. (1996) Cholera: nice bacteria and bad viruses. Curr. Biol. V. 6. P. 1389-1391.

120. Lindberg R.B., Latta R.L., Brame R.C., and Moncriff J.A. (1964). Definitive bacteriophage typing system for Pseudomonas aeruginosa!I Bact. Proc. P.81

121. Lindberg R.B., Latta R.L. (1974). Phage typing of Pseudomonas aeruginosa: clinical and epidemiologic considerations. J. Infect. Dis. V. 130. P. 33 43.

122. Loayza D., Carpousis A.J. and Krisch II.M. (1991). Gene 32 transcription and mRNA processing in T4-related bacteriophages. Mol. Microbiol. V. 5. P. 715 725.

123. Loessner, M.J., Inman, R.B., Lauer, P., & Calendar, R. (2000) Complete nucleotide sequence, molecular analysis and genome structure of bacteriophage A118 of Listeria monocytogenes: implications for phage evolution. Mol Microbiol. V. 35. P. 324-340.

124. Lowe T.M. and Eddy S.R (1997) tRNAscan-SE: a program for improved detection of transfer RNA genes in genomic sequence. Nucleic Acids Res. V. 25. P. 955-964.

125. Lucchini, S., Desiere, F., & Brussow, II. (1999) Comparative genomics of Streptococcus thcrmophilus phage species supports a modular evolution theory. J Virol. V. 73. P. 8647-8656.

126. Maniatis T., Fritsch E.F., Sambrook J. (1989) Molecular cloning: a laboratory manual. N. Y.: Cold Spring Harbor Lab.

127. Martin D.W., Schurr M.J., Mudd M.H., Govan J.R.W., Holloway B.W., Deretic U. (1993) Mechanism of conversion to mucoidy in Pseudomonas aeruginosa infecting cystic fibrosis patients 11 Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. V. 90. № 18. P. 8377-8381.

128. Matsuzaki S., Inoue T., Kuroda M., Kimura S., Tanaka S. (1998). Cloning and sequencing of major capsid protein (mcp) gene of a vibrio-phage, KVP20, possibly related to T-even coliphages. Gene. V. 222. P. 25-30.

129. Matthews, D.A., Appelt, K„ Oatley, S.J., & Xuong, N.I I. (1990) Crystal structure of Escherichia coli thymidylate synthase containing bound 5-fluoro-2'-deoxyuridylate and 10-propargyl-5,8-dideazafolate. J. Mol. Biol. V. 214. P. 923-936.

130. McLaughlin, J.R., Wong, H.C., Ting, Y,E., Van Arsdell, J.N., & Chang, S. (1986) Control of lysogeny and immunity of Bacillus subtilis temperate bacteriophage SP beta by its d gene. J. Bacteriol. V. 67. P. 952-959.

131. McPhcetcrs D.S., Gosch G. and Gold L. (1988). Nucleotide sequence of the bacteriophage T2 and T6 gene 32 mRNAs. Nucleic Acids Res. V. 16. P. 9341.

132. McShan W.M., Ferretti J.J. (1997). Genetic diversity in temperate bacteriophages of Streptococcus pyogenes: identification of a second attachment site for phages carrying the erythrogenic toxin A gene.// J. Bacteriol. V. 179 . P.6509-11

133. Mikkonen M., Alatossava T. (1995) A group I intron in the terminase gene of Lactobacillus delbrueckii subsp. lactis phage LL-H. Microbiology, V. 141. P. 2183-2190.

134. Miller J.H. (1972) Experiments in molecular genetics. N. Y.: Cold Spring Harbor1.b.

135. Miller R.V., Rubero V.J.R., Mucoid (1984). Conversion by Phages of Pseudomonas aeruginosa Strains from Patients with Cystic Fibrosis, J.Clin.Microbiol. V.19. P.717 719

136. Moller, S., Croning, M. D., and Apweiler, R. (2002). Evaluation of methods for the prediction of membrane spanning regions. Bioinformatics. V. 18. P. 218.

137. Monod, C., Repoila, F., Kutateladze, M., Tetart, F., & Krisch, H.M. (1997) The genome of the pseudo T-even bacteriophages, a diverse group that resembles T4. J. Mol. Bio. V. 267. P. 237-249.

138. Morgan A.F. (1979). Transduction of Pseudomonas aeruginosa with a mutant of bacteriophage E79. J. Bacteriol. V. 139. P. 137 140.

139. Morgan G.J., Hatfull G.F., Casjens S., and Hendrix R.W. (2002). Bacteriophage Mu genome sequence: analysis and comparison with Mu-like prophages in Haemophilus, Neisseria and Deinococcus. J. Mol. Biol. V. 317. P. 337 359.

140. Nida S.K., Ferretti J.J. (1982). Phage influence on the synthesis of extracellular toxins in group A streptococci.// Infect. Immun. V.36(2). P.745-50.

141. Nilsson A.S., Karlsson J.L., Haggard-Ljungquist E. (2004). Mol. Biol. Evol. V. 21(1). P. 1-13.

142. Pajunen M. I., Kiljunen S. J., and Skurnik, M. (2000). Bacteriophage phiYe03-12, specific for Yersinia enterocolitica serotype 03, is related to coliphages T3 and T7. J. Bacteriol. V. 182. P. 5114-5120.

143. Pajunen, M. I., Kiljunen, S. J., Soderholm, M. E., and Skurnik, M. (2001). Complete genomic sequence of the lytic bacteriophage ®Ye03-12 of Yersinia enterocolitica serotype 0:3. J.Bacteriol. V. 183. P. 1928-1937.

144. Pajunen, M.I., Elizondo, M.R., Skurnik, M., Kieleczawa, J., Molineux, I.J., (2003). Complete nucleotide sequence and likely recombinatorial origin of bacteriophage T3. J. Mol. Biol. V. 319. P. 1115-1132.

145. Rehmat S. and Shapiro J.A. (1983). Insertion and replication of the Pseudomonas aeruginosa mutator phage D3112. Mol. Gen. Genet. V. 192: P. 416-423.

146. Qiao X., Qiao J., Onodcra S., Mindich L. (2000). Characterization of phi 13, a bacteriophage related to phi6 and containing three ds RNA genomic segments. Virology. V. 275. P. 218-224.

147. Rao V.B., Thaker V., Black L.W. (1992). A phage T4 in vitro packaging system for cloning long DNA molecules. Gene. V. 113. P. 25 — 33.

148. Reese M. G. (2001). Application of a time-delay neural network to promoter annotation in the Drosophila melanogaster genome. Comput.Chem. 26, 51-56.

149. Rohwer F.L., Segall,A.M., Steward,G., Seguritan,V., Breitbart,M.,\Volven,F. and Azam,F (2000). The complete genomic sequence of the marine phage Roseophage SIOl shares homology with nonmarine phages. Limnol. Oceanogr. V. 45 (2). P. 408-418.

150. Salmon K.A., Freedman O., Ritchings B.W., and DuBow M.S. (2000). Characterization of the lysogcnic repressor (c) gene of the Psendomonas aeruginosa transposable bacteriophage D3112. Virology. V. 272. P. 85 97.

151. Salzbcrg S. L., Delcher A. L. Kasif, S. and White, O. (1998). Microbial gene identification using interpolated Markov models. Nucleic Acids Res. V. 26. P. 544-548.

152. Schacchtcr N., Mcdoff G., Eisenstain B (1993). //Mechanisms of microbial disease. Williams & Wilkins, Baltimore, Maryland, USA,

153. Scholl D., Kicleczawa J., Kemp P., Rush J., Richardson C.C., Merril C., Adhya S., Molincux I.J. (2004) Genomic analysis of bacteriophages SP6 and Kl-5, an estranged subgroup of the T7 supergroup. J. Mol. Biol. Jan V. 30 № 335(5). P.l 151 1171

154. Selick I I.E., Stormo G.D., Dyson R.L. and Alberts B.M. (1993). Analysis of five presumptive protein-coding sequences clustered between the primosome genes, 41 and 61, of bacteriophages T4, T2 and T6. J. Virol., V. 67. P. 2305-2316.

155. Shub, D., Coctzee, T., Hall, D.H., & Belfort, M. (1994a) The self-splicing introns of bacteriophage T4. In "Molecular biology of bacteriophage T4" (J.D. Karam, Ed.), P. 186-192 Am. Soc. Microbiiol., Washington, DC.

156. Shub, D.A, Goodrich-Blair, II., & Eddy, S.R. (1994b) Amino acid sequence motif of group I intron endonucleases is conserved in open reading frames of group II introns Trends Biochem. Sci., V. 19. P. 402-404.

157. Shabalova, L.A., N.I. Kapranov, V.N. Krylov, T.O. Sharibjanova, V.Z. Akhverdian, L.K. Katosova, L.P. Klukina. 1992. Suscertibility of Pseudomonas aeruginosa in patients with

158. CF to Pseudomonas aeruginosa bacteriophage// Pediatric Pulmonology.Supplemcnt 8, September 1992. Sixth Annual North American Cystic Fibrosis Conference. Washington, DC. October 15-18, 1992. P. 295. Abstract 225.

159. Sjoberg, B.M., Hahne, S., Mathews, C.Z., Mathews, C.K., Rand, K.N., & Gait, M.J. (1986) The bacteriophage T4 gene for the small subunit of ribonucleotide reductase contains an intron. EMBOJ. V. 5. P. 2031-2036.

160. Slopek S., Kucharcwicz-Krukowska A; Weber-Dabrowska B; Dabrowski M (1985a). Results of bacteriophage treatment of suppurative bacterial infections. IV. Evaluation of the results obtained in 370 cases. Arch Immunol Ther Exp V. 33(2). P. 219-40.

161. Slopek S., Kucharcwicz-Krukowska A; Weber-Dabrowska B; Dabrowski M (1985b). Results of bacteriophage treatment of suppurative bacterial infections. V. Evaluation of the results obtained in children. Arch Immunol Ther Exp V. 33(2). P. 241-59.

162. Slopek S., B. Weber-Dabrowska, M. Dabrowski and A. Kucharcwica-Krukowska, (1987a). Results of Bacteriophage Treatment of Suppurative Bactcrial Infections in the Years 1981-1986. Arch. Immunol. Ther. Exp. V. 35. P. 569-583.

163. Slopek S. and A. Kucharcwica-Krukowska, (1987b). Immunogenic cffcct of bacteriophage in patients subjected to phage therapy. Arch Immunol Ther Exp V. 35(5). P. 55361.

164. Smith, M.C., Burns, N., Saycrs, J.R., Sorrell, J.A., Casjcns, S.R, & Ilendrix, R.W. (1998) Bacteriophage collagen. Scicnce, V. 279. P. 1834.

165. Smith, M.C., Burns, R.N., Wilson, S.E., & Gregory, M.A. (1999) The complete genome sequence of the Streptomyces temperate phage straight phiC31: evolutionary relationships to other viruses. Nucleic Acids Res., 27, 2145-2155.

166. Soothill J.S. (1992) Treatment of experimental infections of mice with bacteriophages. J. Med. Microbiol. V. 37(4). P. 258 261.

167. Soothill J.S. (1994). Bacteriophage prevents destruction of skin grafts by Pseudomonas aeruginosa. Burns. V. 20(3). P. 209 211.

168. Southern E.M. (1975). Detection of specific sequences among DNA fragments separated by gel electrophores. J. Mol. Biol. V. 98. P. 503.

169. Stanier R.J., Palleroni N.J., DoudorofT M. (1966). The aerobic pseudomonads: a taxonomic study. J. Gen Microbiol., V. 43, P. 159-271

170. Susskind M., Botstein D. (1978). Molecular genetics of bacteriophage P22. Microbiol. Rev. V. 42. P. 385 -413.

171. Tao, Y., Strelkov, S.V., Mesyanzhinov, V.V., & Rossmann, M.G. (1997) Structure of bacteriophage T4 fibritin: a segmented coiled coil and the role of the C-terminal domain. Structure, V. 5. P. 789-798.

172. Taylor A.L. (1963). Bactcriophage-induced mutation in E.coli. Proc. Nat. Acad. Sci. USA V. 50: P. 1043-1051.

173. Tetart F., Desplats C., Kutatcladze M., Monod C., Ackermann II.-W., Krisch H.M. (2001). Phylogeny of the major head and tail genes of the wide-ranging T4-type bacteriophages// J. Bacteriol. V. 183. (1). P. 358-366.

174. Ulycznyj P.I., Salmon K.A., Douillard II. and DuBow M.S. (1995). Characterization of the Pscudomonas aeruginisa transposable bacteriophage D3112 A and B genes. Biochim. Biophys. Acta. V. 1264. № 3. p. 249 253.

175. Valpucsta, J. M. and Carrascosa, J. L. (1994). Structure of viral connectors and their function in bacteriophage assembly and DNA packaging. Q.Rev.Biophys. V. 27. P. 107-155.

176. Vander Byl C., Kropinski A.M. (2000). Sequence of the genome of Salmonella bacteriophage P22. J. Bacterid. V.182. P. 6472-6481.

177. Van Ilultcn, M.C.W., Wittcveldt, J., Peters, S., Kloosterboer, N., Tarchini, R., Fiers, M., Sandbrink, H., Lankhorst, R.K. & Vlak, J.M. (2001) The white spot syndrome virus DNA genome sequence Virology, V. 286. P. 7-22.

178. Van Sindcrcn, D., Karsens, II., Kok, J., Terpstra, P., Ruiters, M.H., Vencma, G, & Nauta, A. (1996) Sequence analysis and molecular characterization of the temperate lactococcal bacteriophage rlt. Mol. Microbiol., V. 19. P. 1343-1355.

179. Wang P.W., Chu L. and Guttman D.S., (2004). Complete sequence and evolutionary genomic analysis of the Pseudomonas aeruginosa transposable bacteriophage D3112. J. Bacterid. V. 186. №2. P. 400-410.

180. Williams K.P., Kassavetis G.A., Hercndecn D.R., and Geiduschck E.P. (1994) Regulation of late-gene expression. In "Molecular biology of bacteriophage T4" (J.D. Karam, Ed.), P. 161-175. Am. Soc. Microbial., Washington, DC.

181. Yeh L.S., Hsu T. and Karam J.D. (1998). Divergence of a DNA replication gene clastcr in the T4-related bacteriophage RB69. J. Bacteriol. V. 180. P. 2005 2013.

182. Young K.K., Edlin G., Wilson G.G. (1982). Genetic analysis of bacteriophage T4 transducing bacteriophages. J. Virol. V. 41. P. 345 347.

183. Young, R. (1992). Bacteriophage lysis: mechanism and regulation. Microbiol. Rev. V. 56. P. 430-481

184. Young, R. and Blasi, U. (1995). Holins: form and function in bacteriophage lysis. FEMSMicrobiol.Rev. V. 17. P. 191-205.

185. Young K.K., Edlin G. (1983). Physical and general analysis of bacteriophage T4 generalized transduction. Mol. Gen. Genet. V. 192. P. 241 -246.