Исследование структурных свойств полимеров амилоид β пептида и лизоцима методами силовой спектроскопии и атомно-силовой микроскопии тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 02.00.06, кандидат физико-математических наук Украинцев, Егор Владиславович

• Украинцев, Егор Владиславович
• кандидат физико-математических наук
• 2007

Оглавление диссертации кандидат физико-математических наук Украинцев, Егор Владиславович

1 Введение

2 Литературный обзор

2.1 Методы исследования: атомно-силовая микроскопия, силовая спектроскопия и молекулярная динамика.

2.1.1 Атомно-силовая микроскопия.

2.1.2 Силовая спектроскопия.

2.1.3 Молекулярная динамика.

2.2 Объекты исследования: амилоид (3 пептид и лизоцим. Их структура, и свойства.

2.2.1 Амилоид (3 пептид.

2.2.2 Лизоцим.

2.3 Влияние поверхности на конформацию молекулы. Влияние химической сорбции на конформацию молекулы.

2.3.1 Влияние поверхности на конформацию молекул амилоид (3 пептида и их агрегацию.

2.3.2 Влияние поверхности на конформацию молекул СМА и их агрегацию.

2.3.3 Влияние химической сорбции на конформацию молекулы

2.4 Взаимодействие молекул, находящихся в состоянии с неправильной укладкой и их агрегация

2.4.1 Исследование взаимодействия двух молекул, находящихся в состоянии с неправильной укладкой

2.4.2 Переход молекул полимеров из нативной конформа-ции в состояние с неправильной укладкой приводит к последующей агрегации.

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Исследование структурных свойств полимеров амилоид β пептида и лизоцима методами силовой спектроскопии и атомно-силовой микроскопии»

Цель и задачи исследования

1. Определить причины (изменение температуры, рН, вида поверхности и типа сорбции) и следствия (возникновение сильного межмолекулярного взаимодействия, образование фибрилл и других типов агрегатов) изменения структурных свойств амилоид (3 пептида и лизоцима: конформационного перехода молекул из нативпого состояния в состояние с неправильной укладкой.

2. Изучить конформационные переходы в биомакромолекулах с помощью атомно-силовой микроскопии и силовой спектроскопии.

3. На атомно-силовом микроскопе и на Атомных весах™ изучить межмолекулярное взаимодействие полимеров, находящихся в иативном состоянии и состоянии с неправильной укладкой на примере амилоид /3 пептида и лизоцима.

4. Определить факторы (температуры, рН, вид поверхности и тип сорбции), которые влияют на коиформацию молекул.

5. Изучить последствия изменения молекулами копформации на взаимодействие молекул между собой на примере амилоид (3 пептида лизоцима.

6. Исследовать аргегацию молекул лизоцима на различных поверхностях (слюда, золото, графит) и при различных типах сорбции (физическая или химическая).

7. Исследовать вляиние вида поверхности и типа сорбции на температуру конформационного перехода в лизоциме.

Научная новизна диссертации

Методами силовой спектроскопии и атомно-силовой микроскопии определены условия, при которых происходит переход молекул полимеров амилоид /? пептида и лизоцима из нативного состояния в состояние с неправильной укладкой.

Впервые при помощи силовой спектроскопии и атомно-силовой микроскопии изучено межмолекулярпое взаимодействие полимеров амилоид /? пептида и лизоцима, находящихся в состоянии с неправильной укладкой.

Обнаружено влияние близости поверхности и химической прививки на конформацию молекулы.

Обнаружено, что оба эти фактора могут приводить к изменению кон-формации молекулы.

Обнаружено что молекулы полимеров, привитые к поверхности, могут агрегировать и образовывать фибриллы.

Обнаружено, что химическая прививка молекул лизоцима к поверхности золота и физическая собрция молекул лизоцима на поверхность графита приводит к понижению температуры конформационного перехода из пативпого состояния в состояние с неправильной укладкой по крайней мере до комнатной температуры (при рН 3 буферного раствора, в котором находится белок).

Практическая значимость работы

Одна из актуальных на сегодняшний день проблем, стоящая перед физиками, заключается в том, что неизвестен механизм взаимодействия молекул, находящихся в состоянии с неправильной укладкой. Эту проблему нужно решать, т.к. больше половины нервных заболеваний связано с неправильным складыванием белковых молекул.

Физическая и химическая прививка молекул к поверхности является важным фактором, определяющим копформацию молекул. Поэтому важно знать, как будут меняться свойства макромолекулярного полимерного комплекса при его закреплении на поверхности. Изменение свойств полимеров при физической сорбции и ковалентной иммобилизации пока еще не достаточно изучено. Большинство процессов в организме человека происходят на различных поверхностях, например мембранах клеток, поэтому очень важно знать, как различаются свойства молекул в объеме и на поверхности.

На защиту выносятся следующие результаты и положения

1. Определены условия (температура, рН, вид поверхности и тип сорбции), при которых амилоид (3 пептид и лизоцим переходят из па-тивной конформации в состояние с неправильной укладкой.

2. Обнаружено, что амилоид (3 пептид, химически сорбированный на поверхность слюды, изменяет свою копформацию при повышении кислотности среды с рНб.б до рН3.7 при комнатной температуре.

3. Обнаружено, что лизоцим, физически сорбированный на графит, химически сорбированный на слюду или золото, изменяет свою кон-формацию при повышении кислотности среды с рН4.5 до рНЗ.О при комнатной температуре.

4. Обнаружено, что лизоцим, физически сорбированный на слюду и слюду, обработанную 3-аминопропилсилатраном, изменяет свою кон-формацию (при рНЗ.О) при повышении температуры до 50 °С.

5. Этот конформационный переход происходит иод действием различных факторов, таких как понижение рН, повышение температуры, близость поверхности из-за физической сорбции и химической прививки.

6. Вследствии этого конформационного перехода происходит резкое увеличение вероятности взаимодействия двух молекул между собой по сравнению с нативной конформацией (в которой молекулы между собой почти не взаимодействуют), например, сила взаимодействия двух молекул равна F ~ 40 пН для амилоид /3 пептида и F ~ 110 пН для лизоцима.

7. Меж молекулярное взаимодействие молекул, находящихся в состоянии с неправильной укладкой, приводит к агрегации амилоид/? пептида и лизоцима. При этом могут образовываться линейные фибриллы и порообразные агрегаты.

8. Обнаружено формирование фибрилл лизоцима на твердой подложке в условиях, при которых они не образуются в растворе.

9. Обнаружено формирование фибрилл лизоцима, химически привитого к поверхности золота и отсутствие агрегации лизоцима, физически сорбированного на поверхность золота.

10. Обнаружено, что химическая прививка молекул лизоцима к поверхности золота и физическая собрция молекул лизоцима на поверхность графита приводит к понижению температуры конформационного перехода из нативного состояния в состояние с неправильной укладкой по крайней мере до комнатной температуры.

11. Обнаружено, что физическая собрция молекул лизоцима на поверхность слюды и слюды со слоем 3-амииопропилсилатрана приводит к понижению температуры конформационного перехода из натив-ного состояния в состояние с неправильной укладкой по крайней мере до 50 °С.

Личный вклад автора

Все экспериментальные измерения поверхностей образцов па атомио-силовом микроскопе и сил взаимодействия методом силовой спектроскопии выполнены автором лично. Автор принимал участие в измерении сил взаимодействия па Атомных весах™. Все образцы приготовлены автором (кроме некоторых этапов, таких как напыление золота и синтез веществ). Анализ и интерпретация экспериментальных данных проведены автором лично.

Публикации

По теме диссертации опубликовано 3 статьи. Результаты представлены на двух международных конференциях и российской конференции. Публикации

1. Е.В. Украинцев, Г.А. Киселев, А.А. Кудринский, Г.В. Лисичкин, И.В. Яминский, Формирование фибрилл лизоцима на твердой подложке в условиях, при которых они не образуются в растворе // Высокомолекулярные соединения, серия Б, — 2007, — том 49, — N.1, - с.125-129. Принята к печати 24.08.2006 г.

2. Украинцев Е.В., Киселев Г.А., Багров Д.В., Горелкин П.В., Кудринский А.А., Лисичкин Г.В., Яминский И.В, Атомные весы: новые возможности исследования взаимодействия молекул // Датчики и системы, 2007, —N.1, — с. 18-21. Номер подписан в печать 22.10.2006 г.

3. Y.L. Lyubchenko, A. Kransnoslobodtsev, L.S. Shlyakhtcnko, E. Ukraintsev, Т.О. Zaikova and J.F.W. Keana, Nanomedicine and protein misfolding diseases // Nanomedicine: Nanotechnology, Biology, and Medicine, — 2005, — v.l, — pp.300-305.

Тезисы докладов

1. 19th Annual Gibbs Conference on Biothermodynamics (США, 2005). Conformation-dependent interprotein interaction studied by AFM force spectroscopy. E.V. Ukraintsev, Т.О. Zaikova, J.F.W. Keana and Y.L. Lyubchenko;

2. 19th Annual Gibbs Conference on Biothermodynamics (США, 2005). Study of DNA-Sfi I complex stability using AFM force spectroscopy. A.V. Krasnoslobodtsev, L.S. Shlyakhtenko, E.V. Ukraintsev and Y.L. Lyubchenko;

3. International Conference on Nanoscience and Technology (Швейцария, 2006). Atomic balance observation of protein aggregation on a cantilever surface. G. Kiselev, A.Kudrinskii, E.Ukraintsev, I. Yaminsky, G.Lisichkin;

4. Третья Всероссийская конференция (с международным участием), Химия поверхности и нанотехнология (Россия, 2006). Изучение агрегации лизоцима, иммобилизованного на поверхности золота и слюды, с помощью кантилевера для атомно-силовой микроскопии. Е.В. Украинцев, Г.А. Киселев, А.А. Кудринский, Г.В. Лисичкин, И.В. Ямипский.

2 Литературный обзор

Заключение диссертации по теме «Высокомолекулярные соединения», Украинцев, Егор Владиславович

Выводы

На основе работы можно сделать следующие выводы:

• Обнаружено, что изменение структурных свойств амилоид j3 пептида и лизоцима (конформационпый переход молекул из нативного состояния в состояние с неправильной укладкой) происходит из-за изменения температуры, рН, вида поверхности и типа сорбции и приводит к изменению межмолекулярного взаимодействия и к образованию фибрилл и других типов агрегатов.

• Определены условия (повышение кислотности среды с рН6 до рНЗ, повышение температуры с 20 °С до 50 °С, близость поверхности и тип сорбции), при которых амилоид/? пептид и лизоцим переходят из нативной коиформации в состояние с неправильной укладкой.

• Вследствии конформационного перехода из иативной коиформации в состояние с неправильной укладкой происходит резкое увеличение вероятности взаимодействия двух молекул между собой по сравнению с нативной копформацией, в которой молекулы почти не взаимодействуют между собой, например, сила взаимодействия двух молекул в состоянии с неправильной укладкой равна F ~ 40 нН для амилоид (3 пептида и F ~ 110 пН для лизоцима.

• В экспериментах наблюдалось формирование фибрилл и иорооб-разных агрегатов лизоцима на твердой подложке в условиях, при которых они не образуются в растворе. Агрегация лизоцима связана с различием в межмолекулярном взаимодействии молекул, находящихся на поверхности (в состоянии с неправильной укладкой) и в растворе (в нативной конформации) при одинаковых параметрах среды (рНЗ, 20 °С).

• Обнаружено, что химическая прививка молекул лизоцима к поверхности золота и физическая сорбция молекул лизоцима на поверхность графита приводит к понижению температуры конформацион-ного перехода из нативного состояния в состояние с неправильной укладкой по крайней мере до комнатной температуры.

• Обнаружено, что физическая сорбция молекул лизоцима на поверхность слюды и слюды со слоем 3-аминопропилсилатрана приводит к понижению температуры копформационного перехода из нативного состояния в состояние с неправильной укладкой по крайней мере до 50 °С.

Благодарность

В заключение хочу выразить благодарность своему научному руководителю Игорю Владимировичу Яминскому, а также Киселеву Глебу, выполнявшему эксперименты на Атомных весах™, Алексею Кудринскому за помощь в приготовлении образцов, за синтез необходимых веществ и подготовку двух рисунков, Мешкову Георгию за всестороннюю помощь, Юрию Львовичу Любченко за руководство экспериментами по измерению сил межмолекулярного взаимодействия, Алексею Краснослободцеву и Людмиле Сергеевне Шляхтенко за проведение ряда экспериментов по измерению сил межмолекулярного взаимодействия. Хочу также выразить признательность всем студентам и аспирантам лаборатории зондо-вой микроскопии за дружеское участие и поддержку.

Список литературы диссертационного исследования кандидат физико-математических наук Украинцев, Егор Владиславович, 2007 год

1. Binnig G., Quate С. Atomic force microscope // Phys.Rev.Lett., — 1986,- v.56, pp.930-933.

2. M.O. Галлямов, И.В. Ямииский, Сканирующая зондовая микроскопия нуклеиновых кислот, Москва, 1998.

3. Bustamante С., Vesenka J., Tang C.L., Rees W., Guthod M., Keller R., Circular DNA molecules imaged in air by scanning force microscopy // Biochemistry, — 1992, — v.31, — pp.22-26.

4. Lin J.N., Drake В., Lea A.S., Hansma P.K., Andrade J.D., Direct observation of immunoglobulin adsorption dynamics using the atomic force microscope // Langmuir, — 1992, — v.6(2), — pp.509-511.

5. J.H. Hoh, J.-P. Revel, P.K. Hansma, Tip-sample interactions in atomic force microscopy: I. Modulating adhesion between silicon nitride and glass // Nanotechnology, — 1991, — v.2, — pp.119.

6. M. Rief, H. Clausen-Schaumann and H.E. Gaub, Sequence-dependent mechanics of single DNA molecules // Nature structural biology, — 1999,- v.6, N.4, - pp.346-349.

7. T. Strunz, K. Oroszlan, R. Schafer,H.-J. Giintherodt, Dynamic forcespectroscopy of single DNA molecules, // Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1999, - v.96, - p.11277-11282.

8. M. Ludwig, M. Rief, L. Schmidt, H. Li, F. Oesterhelt, M. Gautel, H.E. Gaub, AFM, a tool for single-molecule experiments // Applied Physics A, 1999, - v.68, - N.2, - pp.173-176.

9. Т.Е. Fisher, A.F. Oberhauser, M. Carrion-Vazquez, P.E. Marszalek and J.M. Fernandez, The study of protein mechanics with the atomic force microscope // Trends in Biochem. Sci., — 1999, — v.24, — pp.379-384.

10. S. Cocco, J.F. Marko, R. Monasson, Theoretical models for single-molecule DNA and RNA experiments: from elasticity to unzipping // arXiv : cond та£/0206238г;1Шшг2002.

11. P. Cluzel, A. Lebrun, C. Heller, R. Lavery, J.-L. Viovy, D. Chatenay, F. Caron, DNA: an extensible molecule // Science, — 1996, — v.271, — pp.792-794.

12. Т.Е. Fisher, P.E. Marszalek, A.F. Oberhauser, M. Carrion-Vazquez and J.M. Fernandez, The micro-mechanics of single molecules studied with atomic force microscopy // Journal of Physiology, — 1999, — v.520, — Ж1, pp.5—14.

13. P.E. Marszalek, H. Lu, H. Li, M. Carrion-Vazquez, A.F. Oberhauser, K. Schulten and J.M. Fernandez, Mechanical unfolding intermediates in titin modules // Nanture, 1999, - v.402, - pp. 100-104.

14. M.O. Piramowicz, P. Czuba, M. Targosz, K. Burda and M. Szymonski, Dynamic force measurements of avidin-biotin and streptavdin-biotin interactions using AFM // Acta biochimica Polonica, — 2006, — v.53, — N.l, pp.93-100.

15. Bustamante C.J., Marko J.F., Siggia E.D., and Smith S.B., Entropic elasticity of A-phage DNA // Science, 1994, - v.265, - p. 1599-1600.

16. M. C. Murphy, I. Rasnik, W. Cheng, T.M. Lohman, and T. Ha, Probing Single-Stranded DNA Conformational Flexibility Using Fluorescence Spectroscopy // Biophysical Journal, —2004, — v.86, — pp.2530-2537.

17. M.C. Williams, K. Pant, I. Rouzina and R.L. Karpel, Single molecule force spectroscopy studies of DNA denaturation by T4 gene 32 protein // Spectroscopy, 2004, - v.18, - pp.203-211.

18. B. Maier, D. Bensimon, and V. Croquette, Replication by a single DNA polymerase of a stretched single-stranded DNA // Proceedings of the National Academy of Sciences of USA, — 2000, — v.97, — N.22, — pp. 12002-12007.

19. C.G. Baumann, S.B. Smith, V.A. Bloomfield and C. Bustamante, Ionic effects on the elasticity of single DNA molecules // Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1997, - v.94, - pp.6185-6190.

20. J.-C. Meiners and S.R. Quake, Femtonewton Force Spectroscopy of Single Extended DNA Molecules // Physycal review letters, — 2000, — v.84, N.21, - pp.5014-5017.

21. W. Zhang, R. Barbagallo, C. Madden, C.J. Roberts, A. Woolford and S. Allen, Progressing single biomolecule force spectroscopy measurements for the screening of DNA binding agents // Nanotechnology, — 2005, — v.16, pp.2325-2333.

22. M. Rief, M. Gautel, A. Schemmel, and H.E. Gaub, The Mechanical Stability of Immunoglobulin and Fibronectin III Domains in the Muscle

23. Protein Titin Measured by Atomic Force Microscopy // Biophijsical Journal, 1998, - v.75, - pp.3008-3014.

24. F. Oesterhelt, M. Rief and H.E. Gaub, Single molecule force spectroscopy by AFM indicates helical structure of poly(ethylene-glycol) in water // New Journal of Physics, — 1999, — v.l, — pp.6.1-6.11.

25. M.S.Z. Kellermayer, L. Grama, A. Karsai, A. Nagy, A. Kahn, Z.L. Datki, and B. Penke, Reversible Mechanical Unzipping of Amyloid /?—Fibrils // The journal of biological chemystry, — 2005, — v.280, — N.9, — pp.8464-8470.

26. M.S.Z. Kellermayer, S.B. Smith, C. Bustamante, and H.L. Granzier, Mechanical Fatigue in Repetitively Stretched Single Molecules of Titin // Biophysical Journal, — 2001, — v.80, — pp.852-863.

27. H. Higuchi, Y. Nakauchi, K. Maruyama, and S. Fujime, Characterization of beta-connectin (titin 2) from striated muscle by dynamic light scattering // Biophys. J., 1993, - v.65, - pp.1906-1915.

28. M.S.Z. Kellermayer, S. Smith, C. Bustamante, and H. L. Granzier, Mechanical manipulation of single titin molecules with laser tweezers // Adv. Exp. Med. Biol, 2000, - v.481, - pp.111-128.

29. M.S.Z. Kellermayer, S. Smith, C. Bustamante, and H. L. Granzier, Complete Unfolding of the Titin Molecule under External Force // Journal of structural biology, — 1998, — v. 122, — pp. 197-205.

30. Y.L. Lyubchenko, A. Kransnoslobodtsev, L.S. Shlyakhtenko, E. Ukraintsev, Т.О. Zaikova and J.F.W. Keana, Nanomedicine and protein misfolding diseases // Nanomedicine: Nanotechnology, Biology, and Medicine, 2005, - v.l, - pp.300-305.

31. C. McAllister, M. Karymov, Y. Kawano, A.Y. Lushnikov, A. Mikheikin, V.N. Uversky and Y.L. Lyubchenko, Protein Interactions and Misfolding Analyzed by AFM Force Spectroscopy // Journal of Molecular Biology,- 2005, v.354, - N.5, - pp.1028-1043.

32. Pamela Y. Meadows, Jason E. Bemis, and Gilbert C. Walker, Single-Molecule Force Spectroscopy of Isolated and Aggregated Fibronectin Proteins on Negatively Charged Surfaces in Aqueous Liquids // Langmuir, 2003, - N.19, -pp.9566-9572.

33. M. Grandbois, M. Beyer, M. Rief, H. Clausen-Schaumann, H.E. Gaub, How Strong is a Covalent Bond? // Science, 1999, - v.283, - N.5408,- pp.1727-1730.

34. K.B. Шайтан, Конформацнонная подвижность белка с точки зренияфизики, Соросовский образовательный журнал, — 1999, — N.5, — с. 8-13.

35. A. Rubinstein, L. Kinarsky, Y. Lyubchenko and S. Sherman, High Temperature Molecular Dynamics Simulations of the Amyloid /3 (1-40) Peptide // The First Annual Nebraska EPSCoR Research Expo April 20, 2005.

36. B. Urbane, L. Cruz, F. Ding, D. Sammond, S. Khare, S. V. Buldyrev, H. E. Stanley, and N. V. Dokholyan, Molecular Dynamics Simulation of Amyloid (3 Dimer Formation // Biophysical Journal, — 2004, — v.87, —pp.2310-2321.

37. K. Shiraki, M. Kudou, S. Nishikori, H. Kitagawa, T. Imanaka and M. Takagi, Arginine ethylester prevents thermal inactivation and aggregation of lysozymc // Eur. J. Biochem., — 2004, — v.271, — pp.3242-3247.

38. V. N. Uversky, Protein folding revisited. A polypeptide chain at the folding misfolding - nonfolding cross-roads: which way to go? // Cell. Mol. Life Sci., - 2003, - v.60, - pp.1852-1871.

39. A.T. Petkova, Y. Ishii, J.J. Balbach, O.N. Antzutkin, R.D. Leapman, F. Delaglio, and R. Tycko, A Structural Model for Alzheimer's beta-Amyloid Fibrils Based on Experimental Constraints from Solid State

40. NMR // Proceedings of the National Academy of Sciences of USA, — 2002, v.99, - N.26, - pp.16742-16747.

41. Serpell L.C., Alzheimer's amyloid fibrils: structure and assembly // Diochim Biophys Acta, — 2000, — v.1502, — pp.16-30.

42. C.E. Giacomelli, W. Norde, Conformational Changes of the Amyloid /3-Peptide (1-40) Adsorbed on Solid Surfaces // Macromolecular Bioscience, 2005, - v.5, - N.5, - pp.401-407.

43. Dobson C.M., Principles of protein folding, misfolding and aggregation // Semin. Cell. Dev. Biol., 2004, - v.15, - pp.3-16.

44. Егоров В.В., Грудинииа Н.А., Соловьев К.В., Влияние пептида NTQATNRNTD иа аномальный фибриллогенез лизоцима // Электронный научный журнал «Исследовано в России», — 2006, — стр.2475-2481. http://zhurnal.ape.relarn.ru/articles/2006/256.pdf

45. W.B. Stine, Jr., K.N. Dahlgren, G.A. Krafft, and M.Jo LaDu, In Vitro Characterization of Conditions for Amyloid-/? Peptide Oligomerization and Fibrillogenesis // The journal of biological chemystry, — 2003, — v.278, N.13, - pp.11612 — 11622.

46. S.J. Wood, B. Maleeff, T. Hart and R. Wetzel, Physical, Morphological and Functional Differences between pH 5.8 and 7.4 Aggregates of the Alzheimer's Amyloid Peptide A/? // J. Mol. Biol, 1996, - v.256, -pp.870-877.

47. Christopher M. Yip and JoAnne McLaurin, Amyloid beta Peptide Assembly: A Critical Step in Fibrillogenesis and Membrane Disruption // Biophysical Journal, — 2001, — v.80, —pp.1359-1371.

48. Т. Kowalewski, D. Holtzman, In situ atomic force microscopy study of Alzheimer's ^-amyloid peptide on different substrates: New insights into mechanism of /?-sheet formation // Proc. Natl. Acad. Sci. USA, — 1999,- v.96, pp.3688-3693.

49. H.K.L. Blackley, G.H.W. Sanders, M.C. Davies, C.J. Roberts, S.J.B. Tendler and M.J. Wilkinson, In-situ Atomic Force Microscopy Study of ^-Amyloid Fibrillization Ц J. Mol. Biol., 2000, - v.298, - p.833-840.

50. И.Н. Сердюк, Физика и структурная биология в начале XXI века, курс лекций в Институте Белка РАН, г. Пущино, www. mbec. protres. ru

51. L.C. Serpell, M. Sundea, and C.C.F. Blakea, The molecular basis of amyloidosis // CMLS, Cell. mol. life sci., 1997, - v.53, - pp.871-887.

52. M. Zhu, P.O. Souillac, C. Ionescu-Zanetti, S.A. Carter, and A.L. Fink, Surface-catalyzed Amyloid Fibril Formation // The journal of biological chemystry, 2002, - v.277, - N.52, - pp.50914-50922.

53. Киселев Г.А., Багров Д.В., Горелкип П.В., Яминский И.В. Сенсор на основе атомно-силового микроскопа // Сенсор, — 2005, — N.4, — с.22.

54. M.Fisher, Proline to the rescue Proceedings of the National Academy of Sciences of USA, 2006, - vol.103, - no. 35, - pp. 13265-13266.

55. M. Stcfani, Protein misfolding and aggregation: new examples in medicine and biology of the dark side of the protein world // Biochimica et Biophysica Acta, — 2004, v.1739, — pp.5-25.

56. C. Exley, N.C. Price, S.M. Kelly and J. Derek Birchall, An interaction of /^-amyloid with aluminium in vitro // Federation of European Biochemical Societies, 1993, - v.324, - N.3, - pp.293-295.

57. M. Kawahara, K. Muramoto, K. Kobayashi, H.Mori, Y. Kuroda, Aluminum promotes the aggregation of Alzheimer's amyloid/^-protein in vitro // Biochemical and biophysical research communications, — 1994, v.198, - N.2, - pp.531-535.

58. Bieschke J., Zhang Q., Powers E.T., Lerner R.A., Kelly J.W., Oxidative metabolites accelerate Alzheimer's amyloidogenesis by a two-step mechanism, eliminating the requirement for nucleation // Biochemistry, 2005, - v.5, - N.44(13), - pp.4977-4983.

59. И. Яминский, Кристаллы из белка, // Наука и эюизнъ, — N.1, — 2004, с. 58-61.

60. I. V. Yaminsky, N. V. Gvozdev, М. I. Sil'nikova, and L. N. Rashkovich., Atomic Force Microscopy Study of Lysozyme Crystallization // Crystallography Reports, — 2002, — Vol. 47, — Suppl. 1, — pp. S149-S158.

61. C. Ray, J.R. Brown, B.B. Akhremitchev, Single-molecule Force Spectroscopy Measurements of "Hydrophobic Bond"between Tethered Hexadecane Molecules // J. Phys. Chem. В 2006, - 110(35), -pp.17578-17583.

62. R. Merkel, P. Nassoy, A. Leung, K. Ritchie, E. Evans, Energy landscapes of receptor-ligand bonds explored with dynamic force spectroscopy // Nature, 1999, - v.397, - pp.50-53.

63. A. Janshoff, M. Neitzert, Y. Oberdorfer, and H. Fuch, Force spectroscopyof molecular systems single molecule spectroscopy of polymers and biomolecules // Angew. Chem. Int. Ed, - 2000, - v.39, - pp.3212-3237.

64. A. Noy, D.V. Vezenov, and C.M. Lieber // Chemical force misroscopy, Annu. Rev. Mater. Sci., 1997, - v.27, - p.381-421.

65. J. Li, A Scanning Probe Study of Self-Assembled Alkylsilane Films, A thesis submitted to the Department of Chemistry in conformity with the requirements for the degree of Master of Science.

66. L.N. Arnaudov, Renko de Vries, Thermally Induced Fibrillar Aggregation of Hen Egg White Lysozyme // Diophys J., — 2005, — v.88., p.515-526.

67. К. Oura, V.G. Lifshits, А.А. Saranin, A.V. Zotov, M. Katayama. Surface Science — An introduction, Springer-Verlag, Berlin 2003. p.438.

68. L.S. Shlyakhtenko, V.N. Potaman, R.R. Sinden, A.A. Gall and Y.L. Lyubchenko // Nucleic Acids Research, — 2000, — v.28, — N.18, — pp.3472.

69. G.G. Stoney // Proc. R. Soc., bond., 1909, - Ser. A, - v.82, - p.172.

70. C. Czeslik and R. Winter, Effect of temperature on the conformation of lysozyme adsorbed to silica particles, jjPhys. Chem. Chem. Phys., — 2001, v.3, -pp.235-239.