Исследование роли В-лимфоцитов в лёгочной патологии мышей при экспериментальной туберкулёзной инфекции тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 14.03.09, кандидат наук Дятлов Александр Валерьевич

• Дятлов Александр Валерьевич
• кандидат наук
• 2018

Оглавление диссертации кандидат наук Дятлов Александр Валерьевич

Оглавление

Введение

Актуальность темы исследования

Степень разработанности темы исследования

Цель исследования

Задачи исследования

Научная новизна исследования

Теоретическая и практическая значимость исследования

Личный вклад автора

Внедрение результатов исследования

Методология и методы исследования

Положения, выносимые на защиту

Степень достоверности исследования и апробация результатов

Глава 1. Обзор литературы

1.1. Туберкулёз: особенности патогенеза и иммунного ответа

1.1.1. Первичное заражение клеток хозяина

1.1.2. Т-клеточный ответ

1.1.3. Туберкулёзная гранулёма

1.2. Разнообразие В-лимфоцитов

1.2.1. Лимфоциты В1

1.2.2. Лимфоциты В2

1.2.3. Плазмобласты и плазматические клетки

1.2.4 Регуляторные В-клетки

1.3. В-клетки в ответе на микобактерии и другие внутриклеточные патогены

1.3.1. Влияние В-лимфоцитов и антител на другие клетки иммунной системы при туберкулёзе

1.3.2. Антитела и внутриклеточные патогены

1.3.3. Роль антител, выработанных при ответе на заражение микобактериями

1.3.4. Цитокины В-лимфоцитов

1.3.5. В-клеточные фолликулы (третичные лимфоидные органы)

Глава 2. Материалы и методы

2.1 Лабораторные животные

2.2 Культуры микобактерий

2.3 Заражение животных

2.4 Определение количества микобактерий в органах заражённых животных

2.5 Антигены

2.6 Среды и растворы

2.7 Получение суспензии клеток лёгкого

2.8 Получение лёгочных В-лимфоцитов

2.9 Получение суспензии клеток селезёнки и В-клеток из селезёнки, плевральной полости и лимфоузлов

2.10 Получение лёгочных макрофагов

2.11 Измерение количества N0, производимого лёгочными макрофагами

2.12 Определение активности аргиназы

2.13 Выделение РНК и получение кДНК

2.14 Полимеразная цепная реакция в реальном времени

2.15 Приготовление гистологических срезов и планиметрия

2.16 Иммунохимическая окраска срезов

2.17 Иммунофлуоресцентная окраска срезов

2.18 Проточная цитофлуориметрия

2.19 Определение антител, производимых лёгочными В-лимфоцитами в культуре

2.20 Создание гибридом и анализ антител

2.21 Продукция цитокинов лёгочными В-лимфоцитами

2.22 Оценка антиген-представляющей функции В-лимфоцитов

2.23 Статистическая обработка результатов

Глава 3. Результаты и обсуждение

3.1 При туберкулёзе В-клетки накапливаются в лёгких и формируют в них В-клеточные фолликулы

3.2 В- и Т-лимфоциты пролиферируют в фолликулах

3.3 Характеристика поверхностного фенотипа В-лимфоцитов

3.3.1 Общая характеристика

3.3.2 Лёгочные лимфоциты В2 не несут маркёра СБ23

3.4 В-лимфоциты способствуют частичной поляризации макрофагов по пути М2

3.5 Функциональная характеристика лёгочных В-клеток

3.5.1 Лёгочные В-лимфоциты производят провоспалительные 1Ь-6 и 1Ь-11 и не производят классических про- (Т№-а и Ш№у) и противовоспалительных (1Ь-10 и ТОБ-Р) цитокинов

3.5.2 Лёгочные В-лимфоциты способны эффективно выполнять роль АПК

3.5.3 Исследование антител, производимых лёгочными В-лимфоцитами

Глава 4. Заключение

Выводы

Список сокращений

Список литературы

Введение

Актуальность темы исследования

На сегодняшний день туберкулёз (ТБ) является одной из десяти наиболее частых причин смерти людей. В 2015 году количество новых случаев заболевания туберкулёзом по всему миру по данным Всемирной Организации Здравоохранения (ВОЗ) составляло 10,4 млн., а смертность от туберкулёза составила 1,8 млн. человек в том числе 0,4 млн. случаев среди ВИЧ-положительных (вирус иммунодефицита человека) (World Health Organisation, 2016). Россия является одной из 3-х стран с наибольшей встречаемостью ТБ с множественной и широкой лекарственной устойчивостью (МЛУ, ШЛУ) (World Health Organisation, 2016). К сожалению, до настоящего времени не существует высокоэффективных методов терапии, позволяющих гарантированно справляться с инфекцией у пациентов с иммунодефицитами и в случаях заражения штаммами ШЛУ. В этих случаях к категории «лечение выбора» относятся многочисленные хирургические методы, которые существенно повышают успех лечения, но, как правило, ведут к потере значительных участков лёгкого. Главным фактором патогенеза ТБ считается избыточное, плохо контролируемое воспаление лёгочной ткани, приводящие к её разрушению (Vyas and Goswami, 2017). Толчком к развитию воспаления является иммунный ответ на возбудителя, который необходим для защиты хозяина, но должен оставаться под жёстким контролем, чтобы не закончится развитием тяжёлой патологии. Подобная ситуация делает изучение патогенеза туберкулёза, и в особенности его иммунологических аспектов, весьма важной научной и практической проблемой.

Степень разработанности темы исследования

ТБ является инфекционным заболеванием, вызываемым факультативным внутриклеточным патогеном Mycobacterium tuberculosis. Попавшие в

дыхательные пути микобактерии поглощаются лёгочными макрофагами, которые пытаются уничтожить патоген. Помимо этого, макрофаги осуществляют функцию антиген-представляющих клеток (АПК) и представляют фрагменты антигенов (АГ) микобактерий Т-лимфоцитам в контексте молекул главного комплекса гистосовместимости второго класса (MHC II). Т-клетки, в свою очередь, в ответ на представление АГ и стимуляцию выделяют цитокины, активирующий защитные механизмы макрофагов, в частности интерферон-у (IFN-y). Этот цикл является наиболее изученным механизмом защиты против микобактерий, и традиционно считается основным. В последние годы появилось довольно много сведений о спорной роли IFN-y в защите против туберкулёза. В том числе обсуждается вопрос о патогенном эффекте чрезмерного количества этого цитокина, секретируемого Т-лимфоцитами CD4+ непосредственно в лёгких и при этом отмечается важности продукции IFN-y клетками селезёнки (Sakai et al., 2016). Не меньшее внимание вызывает участие в механизмах ответа на микобактерии клеток Th17 (T-helper 17) и Treg (регуляторные Т-клетки) (Kozakiewicz, Chen, et al., 2013; Slight, Rangel-Moreno, et al., 2013). Таким образом, расширяется представление о роли Т-лимфоцитов в противотуберкулёзном ответе, и о регуляции этого звена иммунитета.

Традиционно считается, что В-клетки и антитела не играют большой роли в борьбе с M. tuberculosis (Russell, 2007). Тем не менее, за последние десять лет интерес к В-клеткам при туберкулёзе возрос. Показано, что В-лимфоциты инфильтрируют лёгочную ткань и образуют там скопления - В-фолликулы (подробнее см. список сокращений «В-фолликулы»), похожие на лимфоидные фолликулы, вторичных лимфоидных органов. Такие образования в литературе были названы индуцируемыми лимфоидными фолликулами, эктопическими лимфоидными фолликулами, третичными лимфоидными органами, или просто В-фолликулами (Kahnert et al., 2007). Подобные скопления, располагающиеся вблизи туберкулёзных гранулём, были описаны как в моделях на животных (Phuah et al., 2012), так и у пациентов (Ulrichs et al., 2004; Tsai et al., 2006). Роль В-

фолликулов при этом остаётся малоизученной. В частности, остаётся непонятным, продуцируют ли фолликулярные В-клетки антитела к микобактериям, и следует ли считать появление в лёгочной ткани плотных В-клеточных инфильтратов компонентом патологии или защитной реакцией. Прямых экспериментальных данных мало, и гипотезы основываются преимущественно на наблюдениях, сделанных на других внутриклеточных патогенах, или на общих сведениях относительно антиген-представляющих и регуляторных функций В-клеток. В нескольких работах, выполненных на мышах, и посвящённых изучению роли антител, показано, что пассивная иммунизация моноклональными антителами против ряда компонентов клеточной стенки M. tuberculosis оказывала защитный эффект против ТБ-инфекции (Reljic et al., 2006; Balu et al., 2011). В других работах адаптивный перенос В-клеток мышам, не имеющим собственных, снижал уровень туберкулёзной патологии (Maglione, Xu and Chan, 2007). Тем не менее, результаты более поздних исследований на животных и на человеке не позволяют однозначно определить роль В-клеток в туберкулёзной патологии.

В связи с этим, изучение В-клеточного звена иммунного ответа, роли лёгочных В-лимфоцитов при туберкулёзе, и определение, их возможной регуляторных функций, остаётся актуальной проблемой.

Цель исследования

Изучить роль В-клеток, инфильтрирующих лёгочную ткань, в иммунном ответе и патологии лёгких при туберкулёзной инфекции у мышей.

Задачи исследования

1. Оценить динамику накопления В-лимфоцитов и формирования В-клеточных фолликулов в лёгких чувствительных к туберкулёзу мышей

линии I/St при аэрозольном заражении вирулентным штаммом M. tuberculosis H37Rv.

2. Охарактеризовать поверхностный фенотип лёгочных В-лимфоцитов.

3. Исследовать влияние лёгочных В-лимфоцитов на поляризацию лёгочных макрофагов.

4. Определить профиль ключевых для противотуберкулёзного ответа цитокинов, синтезируемых лёгочными В-клетками.

5. Оценить способность лёгочных В-лимфоцитов представлять антигены M. tuberculosis специфичным Т-лимфоцитам.

6. Определить состав подклассов и специфичность иммуноглобулинов, продуцируемых лёгочными В-лимфоцитами при туберкулёзе.

Научная новизна исследования

Было показано, что В-клетки мышей линии I/St, чувствительной к туберкулёзу, пролиферируют внутри лёгочных фолликулов. Это подтверждает гипотезу о том, что В-клеточные фолликулы при туберкулёзе выполняют функцию третичных лимфоидных органов.

Впервые подробно охарактеризован поверхностный фенотип популяции лёгочных В-клеток при туберкулёзе. Описан её суб-популяционный состав, сходный с классическими лимфоцитами В1 и В2 лимфоидных органов.

Впервые показано, что лёгочные клетки В2 не несут характерный для других лимфоцитов В2 поверхностный маркёр CD23, являющийся низко аффинным Fc-рецептором к IgE. Отсутствие маркера CD23 не связанно ни с активацией В-лимфоцитов, ни с их дифференцировкой в плазматические клетки. Кроме того, они не несут поверхностного IgE. Данный фенотип описан впервые и является уникальным.

Впервые определён спектр цитокинов, производимых В-клетками, инфильтрирующими лёгочную ткань при туберкулёзе. Основными секретируемыми цитокинами оказались про-воспалительные 1Ь-6 и 1Ь-11.

Впервые было показано, что лёгочные В-клетки при туберкулёзе способны эффективно выполнять роль антиген-представляющих клеток для специфичных к антигенам микобактерий Т-лимфоцитов.

Впервые получена панель гибридом из В-клеток, инфильтрирующих лёгкие мышей, заражённых туберкулёзом. Впервые изучены свойства антител, синтезируемых лёгочными В-клетками при туберкулёзе, а именно: их изотипический состав и специфичность. Показано, что большая часть клонов легочных В-лимфоцитов продуцируют антитела, не реагирующие с микобактериями.

Теоретическая и практическая значимость исследования

Описан состав поверхностных маркеров, характеризующих лёгочную популяцию В-лимфоцитов при туберкулёзе. Произведено сравнение с другими популяциями В-клеток и найдены ключевые различия. Показано, что лёгочные В2 лимфоциты лишены поверхностного маркера СЭ23 и не несут поверхностного 1§Б. Данный фенотип является уникальным для туберкулёзной патологии и описан впервые.

Произведена оценка состава противовоспалительных цитокинов и антител, вырабатываемых лёгочными В-клетками при туберкулёзе. Выявлены основные характеристики антител, включая состав подклассов и их специфичность.

Выявлено что, приток В-лимфоцитов в лёгкие и образование ими фолликулов имеет скорее патогенный, а не защитный характер.

Полученные результаты имеют прогностическое значение при оценке путей развития туберкулёзной патологии в клинике. Полученные результаты используются в курсах лекций для студентов биологического факультета

Московского Государственного Университета им. М. В. Ломоносова и в образовательных программах ординаторов и аспирантов ФГБНУ «ЦНИИТ».

Личный вклад автора

Научные результаты, содержащиеся в диссертации, получены при личном участии автора и представляют собой законченное самостоятельное научное исследование. Автор принимал непосредственное участие в постановке задач, планировании и выполнении экспериментов, и обработке данных. Автор осуществлял заражение мышей бактериями M. tuberculosis H37Rv, ставил эксперименты с применением иммунологических и молекулярно-биологических методов, обрабатывал полученные результаты, участвовал в написании статей и подготовке рукописи диссертационной работы. Опубликованные и представленные на научных конференциях данные включены Дятловым А. В. в диссертацию.

Гибридомы из лёгочных В-лимфоцитов а также анализ антител был осуществлён к. м. н., с. н. с. отдела иммунологии ФГБНУ «ЦНИИТ» Авдиенко В. Г. Авдиенко В. Г является соавтором соответствующей публикации.

Внедрение результатов исследования

Результаты диссертационного исследования, проведённого Дятловым А. В. используются в лекционном курсе для ординаторов и аспирантов, обучающихся в ФГБНУ «ЦНИИТ», а также внедрены в работу отдела иммунологии ФГБНУ «ЦНИИТ», о чём свидетельствуют соответствующие акты о внедрении: «Использование полученной подробной характеристики лёгочных В-лимфоцитов и данных об их влияния на противотуберкулёзный иммунитет при создании учебных курсов для ординаторов и аспирантов, обучающихся на базе ФГБНУ «ЦНИИТ» и «Использование полученной подробной характеристики лёгочных В-лимфоцитов и данных об их влияния на противотуберкулёзный иммунитет при

планировании дальнейших исследований противотуберкулёзного иммунного ответа, а также при создании диагностических подходов и противотуберкулёзных препаратов».

Методология и методы исследования

В качестве основного метода исследования использовали экспериментальную модель туберкулёза in vivo после аэрозольного заражения бактериями M. tuberculosis штамма H37Rv мышей линий I/St, CBA и CBA/N.

Выделение клеток лёгкого производили методом ферментативной дезинтеграция лёгочной ткани нуклеаз-протеазным комплексом ферментов. Обогащение популяции В-клеток осуществляли путём мечения В-клеток антителами против CD 19, связанными с магнитными бусами, с последующим выделением на магнитных колонках. В-клеточные гибридомы получали из очищенных магнитной сепарацией В-клеток лёгких традиционными методами слияния с миеломой с последующим клонированием лимитирующими разведениями. Фенотипическую характеристику В-лимфоцитов лёгких, селезёнки и плевральной полости изучали при помощи проточной цитофлуорометрии. Иммунологические характеристики изучали с использованием метода ELISA (enzyme-linked immunosorbent assay, твердофазный иммуноферментный анализ), qPCR (полимеразная цепная реакция в реальном времени) при помощи антиген-специфических пролиферативных тестов и при помощи специфических тестов, оценивающих активность ферментов; подклассы и специфичность антител, производимых В-клетками, определяли методом ELISA. Структуру лёгочной ткани оценивали гистологически и иммуногистохимически на криосрезах лёгкого.

Положения, выносимые на защиту

Методами in vivo и in vitro изучено влияние основных иммунологических характеристик В-лимфоцитов лёгких и морфологии их расположения на течение туберкулёзной патологии.

1. В-клеточные фолликулы в очагах туберкулёзного воспаления нужно рассматривать как третичный орган иммунной системы.

2. Образование В-клеточных фолликулов в очаге патологии и инфильтрация В-клеток с изменённым фенотипом является негативным фактором при развитии туберкулёзного процесса. В-клеточный иммунный ответ в лёгких не оказывает существенного влияния на подавление размножения патогена, и не снижает, а скорее увеличивает, уровень воспаления.

3. Основная популяция В-клеток в инфицированных туберкулёзом лёгких состоит из клеток, близких по фенотипу к классическим лимфоцитам В2, но отличающихся от них отсутствием рецептора CD23. Среди лёгочных В-лимфоцитов отсутствуют клетки, несущие связанный с мембраной IgE. Данный фенотип является уникальным для туберкулёзной патологии и ранее описан не был.

4. Основными цитокинами, секретируемыми лёгочными В-клетками является про-воспалительные IL-6 и IL-11.

5. Лёгочные В-лимфоциты при туберкулёзе способны эффективно выполнять роль антиген-представляющих клеток для специфичных к антигенам микобактерий Т-лимфоцитов.

6. Большая часть клонов В-лимфоцитов, полученных из поражённого ТБ лёгкого, продуцируют антитела, не реагирующие с микобактериями. Роль этих антител в туберкулёзной патологии остаётся неясной.

Степень достоверности исследования

Достоверность результатов диссертационного исследования подтверждается достаточным количеством наблюдений, позволяющим определять существенность полученных экспериментальных данных с использованием методов математической статистики. В работе использованы современные экспериментальные методы исследования, которые соответствуют поставленным целям и задачам. Научные положения и выводы, сформулированные в диссертации, логически вытекают из результатов проведённых комплексных иммунологических исследований, включающих анализ методом проточной цитофлуорометрии, специализированные тесты, определяющие активность ферментов, методы иммуногистохимии и морфологии, а также молекулярно-биологические тесты (ELISA, qPCR). Все исследования проведены с использованием современного сертифицированного и поверенного оборудования и международных протоколов. Полученные данные обрабатывались при помощи общепринятых статистических подходов, компьютерных программ Excel и Prism и представлены в виде фотографий, графиков и таблиц. Методы статистики включали критерии ANOVA, t-тест Стьюдента, критерий F Фишера. Статистически достоверными считались различия при p < 0,05.

Публикации

Материалы диссертации опубликованы в 7 научных работах, из них 3 в журналах, рекомендованных ВАК, и 4 в тезисах научных конференций.

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Исследование роли В-лимфоцитов в лёгочной патологии мышей при экспериментальной туберкулёзной инфекции»

Апробация работы

Результаты исследований обсуждены: (1) на научно-практической конференции молодых учёных с международным участием, посвящённой всемирному дню борьбы с туберкулёзом, 2014; (2) на XXII международной научной конференции студентов, аспирантов и молодых учёных «Ломоносов»,

2015; (3) на конкурсе молодых учёных в рамках IV Конгресса Национальной Ассоциации Фтизиатров, 2015; (4) на международной школе в Германии «12th Spring School on Immunology»; (5) на международных школах и форумах «Форум Кох-Мечников» по туберкулёзу, 2016, 2017; (6) на международной конференции EMBO "Tuberculosis 2016".

Апробация диссертации состоялась 19.09.2017г. на совместном заседании отделов иммунологии и микробиологии ФГБНУ «ЦНИИТ» (протокол №1).

Глава 1. Обзор литературы

l.l. Туберкулёз: особенности патогенеза и иммунного ответа

Туберкулёз (от лат. tuberculum — «бугорок») — широко распространённое в мире инфекционное заболевание человека и животных, вызываемое различными видами микобактерий из группы Mycobacterium tuberculosis complex (M. tuberculosis и другими близкородственными видами), также называемыми палочками Коха (Kumar and Robbins, 2007).

По данным ВОЗ за 2015 год смертность от туберкулёза составила 1,8 млн человек, среди них 0,4 млн случаев среди людей положительных по ВИЧ. Количество новых случаев заболевания туберкулёзом за 2015 год составило 10,4 млн., а снижение заболеваемости туберкулёзом в среднем по миру по сравнению с 2014 годом оценивается всего в 1,5%. При этом, в соответствии со «Стратегией ВОЗ по ликвидации туберкулёза к 2035 году» к 2020 году необходимо добиться ежегодного снижения заболеваемости туберкулёзом на 5%. Это ставит большие задачи как для практической медицины, так и для исследователей (World Health Organisation, 2016).

l.l.l. Первичное заражение клеток хозяина

Заражение туберкулёзом, как правило, происходит при вдыхании микрочастиц мокроты с микобактериями, выделяемых при кашле больного активной формой туберкулёза. Представления учёных о процессах, происходящих на ранней стадии инфекции, вызванной M. tuberculosis (Mtb), основываются преимущественно на экспериментах, сделанных на мышах (Saunders et al., 2000; Seiler et al., 2003; Williams et al., 2004; Davis and Ramakrishnan, 2009; Kang et al., 2011; Kapina et al., 2011), морских свинках (Hoff et al., 2011), кроликах (Marakalala et al., 2016), обезьянах (Phuah et al., 2016) и рыбах Danio rerio (Davis et al., 2002; Davis and Ramakrishnan, 2009; Cambier et al., 2014). Попав в дыхательные пути, микобактерия связывается с рецепторами,

распознающими характерные молекулярные структуры патогенов - рецепторами паттернов патогенности (PRR), в том числе Толл-подобными рецепторами (TLR), на поверхности альвеолярных и интерстициальных макрофагов, а также на дендритных клетках. Взаимодействие с рецепторами приводит к поглощению (фагоцитозу) микобактерий фагоцитами и образованию особых органелл -фагосом, внутри которых находятся микобактерии, отделённые от цитозоля инфицированной клетки мембраной.

Показано, что Mtb способны привлекать макрофаги с пониженной бактерицидностью и избегать контактов с высоко бактерицидными макрофагами (Cambier et al., 2014). Это достигается работой двух механизмов. Во-первых, на клеточной стенке Mtb находятся молекулы PDIM (phthiocerol dimycoceroserate), которые экранируют молекулы микобактерий, распознаваемые хозяином как патогенный сигнал (PAMP), что препятствует передаче сигнала через рецепторы и тормозит привлечение макрофагов, способных производить активные формы азота (АФА). Во-вторых, привлечение слабо бактерицидных макрофагов осуществляется за счёт связывания CCR2 (хемокинового рецептора 2) на их поверхности с фенольными гликолипидами микобактерий. Эти взаимодействия объясняют тот факт, что бактерии M. tuberculosis гораздо более эффективно инфицируют относительно стерильную ткань лёгкого, нежели верхние дыхательные пути, где находится большая часть микробов, попавших из окружающей среды (локальная микробиота). Нестерильные условия верхних дыхательных путей обеспечивают высокую бактерицидность резидентных макрофагов, активируя их TLR-зависимым способом, что делает верхние дыхательные пути неблагоприятной средой для колонизации M. tuberculosis (Cambier et al., 2014).

Первое, с чем сталкивается патоген, при попадании в фагосому -супероксидный взрыв, то есть выработка клетками хозяина активных форм кислорода (АФК). Эксперименты с использованием различных линий макрофагов

in vitro показали, что АФК не оказывают значительного бактерицидного эффекта на вирулентные штаммы микобактерий туберкулёза (Chan et al., 1992). Описано несколько способов ухода Mtb от действия супероксида, одним из которых является производство собственных медь- и цинк-зависимых супероксид-дисмутаз (CuZn-СОД), часть которых способствует выживаемости Mtb внутри вакуолей макрофагов экспериментальных животных (Dussurget et al., 2001; Piddington et al., 2001). В частности, была описана СОД, являющаяся гомологом человеческой цинк-зависимой СОД, сравнимая с ней по эффективности (Spagnolo et al., 2004).

Для успешного уничтожения внутриклеточных микобактерий необходимо слияние инфицированных фагосом с лизосомами, что приводит к неблагоприятному для микобактерий снижению рН (Soldati Т., Neyrolles O. 2012. Mycobacteria and the intraphagosomal environment: take it with a pinch of salts. Traffic, 13:1042-1052). Бактерии Mtb способны блокировать созревание фагосомы, препятствуя закислению её содержимого, которое в норме обеспечивается работой АТФ-зависимой протонной помпы - V-АТФазы. Для этого Mtb блокирует везикулярный транспорт V-АТФазы от аппарата Гольджи к фагосоме и встраивание её в фагосомальную мембрану при помощи тирозин фосфатазы PtpA (Sturgill-Koszycki et al., 1994; Mwandumba et al., 2004; Wong et al., 2011).

Кроме того, M. tuberculosis способна препятствовать слиянию фагосомы с лизосомой при помощи ряда своих молекул. В частности, липоарабиноманнан (LAM) клеточной стенки микобактерий блокирует поступление Ca2+ в фагосому, нарушая кальмодулин-зависимое производство фосфатидилинозитол (3,4,5)-трифосфата (PI3P) и препятствуя слиянию фагосомы с поздней эндосомой (Vergne, Chua and Deretic, 2003). Для более эффективной работы LAM необходимо наличие функционального LprG - липопротеина, связывающегося с LAM (Shukla et al., 2014). Другой компонент клеточной стенки Mtb - маннозо-связанный липоарабиноманнан, способен блокировать кальций-кальмодулин-зависимое

привлечение в фагосому киназы PI3P, препятствуя привлечению антигена ранних эндосомы 1 (EEA1) - другого компонента, необходимого для слияния фагосмы с лизосомой (Fratti et al., 2001; Deretic et al., 2006). M. tuberculosis способна производить собственную фосфатазу - SapM, которая разрушает PI3P, избежавший действия маннозо-связанного LAM (Saleh and Belisle, 2000; Deretic et al., 2006). Суммарный эффект описанных механизмов приводит к блокировке формирования фаголизосомы (Russell, 2011).

На сегодняшний день описано не только размножение микобактерий внутри фагосом, работой которых они способны манипулировать, но и способность Mtb выходить в цитоплазму макрофага и размножаться в ней (Pai et al., 2016). Проникновение в цитоплазму характерно для патогенных штаммов микобактерий (Russell, 2016; Simeone et al., 2016), и обеспечивается секреторной системой ESX-1 (типа VII), в частности её белками CFP-10 и ESAT-6, являющихся фактором вирулентности (Arend et al., 2002; van der Wel et al., 2007; Houben et al., 2012).

Результатом работы системы ESX-1 является нарушение целостности мембраны фагосом и попадание ДНК, продуктов жизнедеятельности и разрушения бактерий, а также живых бактерий в цитоплазму макрофага, что приводит к представлению микобактериальных антигенов в контексте MHC I (van der Wel et al., 2007; Houben et al., 2012) и повышению уровня интерферонов первого типа. Это, в свою очередь, снижает уровень активации воспалительного ответа по типу Т-хелперов 1го типа (Th1), что в свою очередь приводит к более активному размножению микобактерий и более быстрой смерти заражённых мышей (Manca et al. 2001; Manzanillo et al. 2012; Mayer-Barber et al. 2014; Pandey et al. 2009; Stanley et al. 2007). Было показано, что ограничение излишней продукции интерферонов первого типа путём IL-1-индуцированного производства эйкозаноидов приводит к улучшению контроля над инфекцией (Mayer-Barber et al., 2014).

С одной стороны, Mtb способны выживать и размножаться внутри макрофагов, за счёт предотвращения созревания фагосомы и процессирование антигенов, а также блокируя апоптоз, что создаёт нишу, где Mtb сохраняет метаболическую активность (Behar, Divangahi and Remold, 2010). С другой стороны, для M. tuberculosis благоприятен сценарий, при котором по достижении определённой численности бактерий внутри макрофага, последний погибает по некротическому пути (Gil et al., 2006). В ряде работ было показано, что микобактерии вирулентного штамма M. tuberculosis H37Rv способны блокировать апоптоз и индуцировать некроз. Gan с соавторами показали, что они обладает способностью путём протеолиза нарушать структуру белка аннексин-1, необходимого для индукции апоптоза (Gan et al., 2008). Другой группой авторов было показано, что на поздней стадии инфекции, бактерии H37Rv способствуют снижению уровня синтеза простагландина Е и повышению уровня липоксина A4. Это подавляет процессы репарации мембраны, блокирует апоптоз и стимулирует некроз. Некроз макрофагов препятствует специфической активации Т-клеток и провоцирует неспецифическое воспаление, которое особенно вредно для лёгочной ткани в силу её тонкой структуры и архитектуры, необходимой для газообмена и циркуляции воздуха и крови (Chen et al., 2008; Divangahi et al., 2009).

1.1.2. Т-клеточный ответ

Дендритные клетки отвечают за начальную активацию Т-клеточного иммунного ответа, представляя антигены Mtb в составе MHC классов I и II в лимфатических узлах (Jo et al., 2007; Wolf et al., 2008; Samstein et al., 2013), после чего Т-лимфоциты мигрируют в область первичного заражения - в лёгкое. Распознав антигенные пептиды на поверхности заражённых макрофагов, специфические Т-лимфоциты активируют макрофаги, секретируя цитокины 1-ого типа: IFN-y, IL-2 и TNF-а. Это запускает в макрофагах бактерицидные механизмы, в частности, продукцию индуцируемой NO-синтазы (iNOS), фермента, необходимого для формирования активных форм азота, которые, на ряду с

активными формами кислорода, токсичны для Mtb (Green, Difazio and Flynn, 2013). Макрофаги по принципу положительной обратной связи активируют Т-клетки, синтезируя IL-12. Этот цикл приводит к замедлению роста численности микобактерий и, иногда, к даже её снижению, но полное уничтожение патогена происходит далеко не всегда (Cooper et al., 1993, 1997).

Производимый Т-клетками, и в первую очередь CD4+, IFN-y необходим для сдерживания диссеминации бактерий и их размножения при внелёгочном туберкулёзном процессе (Sakai et al., 2016); это подтверждается наблюдениями на людях (Dorman and Holland, 2000; Carneiro-Sampaio and Coutinho, 2007) и на обезьянах (Lin et al., 2012; Yao et al., 2014). Тем не менее, недавние исследования подвергли сомнению защитную роль IFN-y, выделяемого Т-клетками CD4+ непосредственно в лёгочной ткани при туберкулёзе, и заставили пересмотреть вопрос регуляции Т-клеточного иммунитета при данном заболевании. Было показано, что IFN-y, производимый Т-клетками CD4+, обеспечивает только 30% снижения бактериальной нагрузки в лёгких, но более 80% снижения бактериальной нагрузки в селезёнке в первые полтора месяца после заражения мышей. Усиление продукции IFN-y Т-клетками CD4+ приводит к ранней смерти заражённых мышей из за прогрессирования лёгочной патологии. Рецептор PD-1 осуществляет негативную регуляцию экспрессии IFN-y CD4+ Т-клетками, что позволяет избежать летальной патологии (Sakai et al., 2016). Необходимы дополнительные исследования для того, чтобы определить какой противотуберкулёзный механизм Т-клеток CD4+ является основным.

1.1.3. Туберкулёзная гранулёма

При туберкулёзе гранулёма окружает область, заражённую бактериями, отделяя её от здоровых тканей, препятствуя диссеминации бактерий и обеспечивая микроокружение для эффективного локального взаимодействия клеток иммунной системы. В модели туберкулёза на обезьянах с использованием генетически различных штаммов Mtb было показано, что большая часть

туберкулёзных очагов являются результатом размножения единственной бактерии (Russell et al. 2009). Рост Mtb внутри гранулём подавляет бактерицидная активность макрофагов, а также формирование внутри гранулёмы области с пониженным содержанием питательных веществ и кислорода (Orme and Basaraba, 2014).

В соответствии с классическими представлениями о течении туберкулёзной патологии, в центре первичной гранулёмы находится ядро из инфицированных макрофагов, окружённое здоровыми макрофагами, гранулоцитами и эпителиоидными клетками, производными макрофагов, похожими по свойствам на клетки эпителия и способными плотным слоем окружать область заражения. Макрофаги внутри гранулёмы способны сливаться в многоядерные гигантские клетки и превращаться в пенистые макрофаги, содержащие жировые вакуоли (Peyron et al., 2008; Caceres et al., 2009). В работе Lay с соавторами было показано, что пенистые макрофаги теряют способность к фагоцитозу из-за утраты рецепторов фагоцитоза, однако, сохраняют некоторую антиген-представляющую активность (Lay G., et al., 2007). Роль жиросодержащих макрофагов при туберкулёзе не однозначна. С одной стороны, в них успешно выживают микобактерии, которые, вырабатывая индукторы образования гранулём, стимулируют миграцию новых фагоцитов и создают себе благоприятную среду обитания (Geisel R. E., et al., 2005, Hunter R. L., et al., 2006). С другой стороны, способность пенистых макрофагов представлять продукты микобактерий Т-клеткам может использоваться хозяином в качестве защитного механизма, обеспечивающего антиген-специфическую активацию Т-клеток, дальнейшее созревание гранулёмы и ограничение диссеминации инфекции (Russell et al., 2009).

В классической картине патогенеза туберкулёза В-лимфоцитам отводится крайне скромное место. Это связанно, в первую очередь, с тем, что в соответствии с теорией дихотомии гуморального и клеточного иммунного ответа, борьбу с

внутриклеточными патогенами, к которым относится Mtb, осуществляет клеточный иммунитет, в первую очередь Т-клетки, а В-клетки скорее влияют на внеклеточные патогены, продуцируя антитела. При этом было замечено, что при туберкулёзе происходит инфильтрация В-клетками лёгочной ткани с образованием скоплений. Экспериментальная часть нашей работы посвящена подробной характеристике В-клеток, инфильтрирующих лёгочную ткань при туберкулёзе, а также определению их влияния на патологический процесс.

1.2. Разнообразие В-лимфоцитов

Внутри популяции В-клеток выделяют две основные субпопуляции, В1 и В2, которые различаются по поверхностному фенотипу, происхождению, анатомическому расположению в организме и выполняемым функциям. Кроме того, выделяют ряд функциональных фенотипов В-лимфоцитов: плазмобласты, плазматические клетки, В-клетки памяти, фолликулярные В-клетки, В-клетки маргинальной зоны селезёнки и регуляторные В-клетки.

1.2.1. Лимфоциты В1

Клетки В1 являются основным источником естественных (врождённых) антител, которые не требуют для своего синтеза развития адаптивного иммунного ответа. Врождённые АТ являются поли-реактивными и отчасти ауто-реактивными. Они играют важную роль в раннем иммунном ответе на многие бактериальные и вирусные антигены и требуют связывания компонентов системы комплемента с антигенами для эффективного удаления последних. Системы активации врождённого иммунитета способны быстро мобилизовать клетки В1 вне зависимости от их специфичности, что подчёркивает сходство данной В-клеточной популяции с клетками врождённого иммунитета (Martin and Kearney, 2001).

У клеток В1 стабильно повышена экспрессия генов, активность которых характерна для плазматических клеток, в том числе blimp1 и xbp1 (Tumang et al.,

2005). Это может служить объяснением спонтанного непрерывного выделения ими естественных антител класса IgM. Клетки В1 вносят важный вклад в борьбу с кишечными патогенами, дифференцируясь в lamina propria слизистой кишечника в плазматические клетки, производящие антитела класса IgA (Kroese et al., 1989).

В1 клетки развиваются в эмбриональной печени из гематопоэтических стволовых клеток, а затем существуют на периферии, как самоподдерживающаяся популяция (Wardemann et al., 2002; Baumgarth, 2011; Kyaw et al., 2011). Они встречаются преимущественно в перитонеальной и плевральной полостях, и составляют больше половины от всех В-клеток перитонеальной полости у мышей (Choi et al., 2012). Клетки В1 в малых количествах также обнаруживаются в селезёнке, составляя примерно 5% всех В-клеток данного органа. Популяции клеток В1 перитонеальной и плевральной полостей различаются. Клетки В1 перитонеальной полости имеют более высокий уровень поверхностного IgM и маркера B7.1, способны дольше выживать в культуре и спонтанно секретируют IgM (Tumang et al., 2004).

Клетки В1 имеют больший размер по сравнению с клетками В2 и обладают поверхностным фенотипом B220(CD45)loIgMhiIgDloCD9+CD43+CD23lo/- (Hardy and Hayakawa, 2001; Berland and Wortis, 2002; Won and Kearney, 2002; Abrahao et al., 2003). Кроме того, перитонеальные Клетки В1 несут на своей поверхности миелоидный маркёр CD11b. В зависимости от экспрессии на поверхности клеток молекулы CD5, среди клеток В1 выделяют популяции В1а (CD5+) и Bib (CD5-). На сегодняшний день о клетках Bib известно довольно мало и не ясно, являются ли они отдельной субпопуляцией или отражением дифференцировки клеток В1а. В поддержку теории о двух независимых популяциях служат результаты ряда работ (Hippen, Tze and Behrens, 2000; Alugupalli, 2008; Colombo et al., 2011; Cunningham et al., 2014; Ray et al., 2015). Например, было показано, что при инфекции, вызванной пневмококком или Streptococcus pneumoniae, клетки Bia

отвечают за выработку врождённых антител против инфекции, а В1Ь - за адаптивный гуморальный ответ и формирование клеток памяти после вакцинации полисахаридами пневмококка (Haas et al., 2005). Кроме того, для лимфоцитов В1Ь описано наличие длительной Т-независимой В-клеточной памяти в модели заражения Borrelia hermsii (Т-независимая В-клеточный ответ и память не требуют участия Т-лимфоцитов в своём формировании). Их образование из лимфоцитов B1b, производящими антитела класса IgM, не сопровождается соматической гипермутацией и переключением классов антител (Alugupalli et al., 2004).

1.2.2. Лимфоциты В2

К клеткам В2 относятся классические фолликулярные В-клетки и В-клетки маргинальной зоны селезёнки. Лимфоциты В2 обладают фенотипом B220(CD45R)hiIgMhi/loIgD+CD9-CD43-CD23hi (Hardy and Hayakawa, 2001; Berland and Wortis, 2002; Won and Kearney, 2002; Abrahao et al., 2003). Они составляют большую часть В-клеток селезёнки и лимфоузлов. Клетки В2 имеют время жизни всего в несколько дней, и их популяция постоянно поддерживается новыми мигрантами из костного мозга. Лимфоциты В2 циркулируют в крови и лимфе, встречая антигены во вторичных лимфоидных органах: селезёнке, лимфоузлах и Пейеровых бляшках (Murphy, 2012).

Фолликулярные В-клетки являются наиболее распространёнными В-клетками в организме. Циркулируя в крови или находясь в лимфоидных фолликулах вторичных лимфоидных органов (Nutt et al., 2015), они обеспечивают производство большей части высоко аффинных антител в ответ на попадание инфекции (Murphy, 2012). Их ответ на антиген является Т-зависимым (требует для формирования участия Т-лимфоцитов) (Kurosaki, Kometani and Ise, 2015).

В-клетки маргинальной зоны селезёнки отделяются от остальных клеток В2 только на поздних стадиях дифференцировки и также вносят свой вклад в производство естественных антител. Как следует из названия, они находятся в

маргинальной зоне селезёнки, богатой кровеносными сосудами, что позволяет им быстро отвечать на антигены различных типов, находящиеся в кровотоке (Cerutti, Cols and Puga, 2013). Они могут проходить как Т-зависимую, так и Т-независимую активацию, но преимущественно следуют по пути Т-независимой активации (Nutt et al., 2015).

1.2.3. Плазмобласты и плазматические клетки

Плазмобласты - короткоживущие В-клетки, способные к пролиферации и производящие антитела с низкой аффинностью (Murphy, 2012). Они возникают на ранней стадии инфекции, в ходе как Т-независимого ответа, так и при вне-фолликулярной Т-зависимой активации (Nutt et al., 2015).

Плазматические клетки - это долгоживущие В-лимфоциты не способные к пролиферации и специализирующиеся на производстве антител с высокой аффинностью (Murphy, 2012). Они появляются на сравнительно поздней стадии инфекции и синтезируют большие количества антител с более высокой аффинностью по сравнению с плазмобластами, что обусловлено процессом созреванием аффинитета в зародышевых центрах (Nutt et al., 2015). Плазматические клетки чаще всего образуются в ходе Т-зависимой активации в зародышевых центрах, однако могут формироваться и в ходе Т-независимой активации (Bortnick et al., 2012).

1.2.4 Регуляторные В-клетки

Регуляторные В-клетки (Breg) - разновидность В-лимфоцитов, обладающая иммуносупрессорными свойствами, которые, путём производства цитокинов IL-10, IL-35, и TGF-ß, ограничивают действие провоспалительных лимфоцитов, способное нанести вред организму (Rosser and Mauri, 2015). Breg способны направлять дифференцировку Т-клеток по регуляторному пути путём прямого взаимодействия (Rosser and Mauri, 2015). На сегодняшний день не описано общего способа определить Breg-клетки. Описано много разновидностей Breg, выполняющих различные регуляторные функции, как у человека, так и у мышей

(Rosser and Mauri, 2015). Не известно, связаны ли различные типы Breg общим происхождением, и как конкретно осуществляется дифференцировка по пути Breg-клеток. Есть данные о том, что практически все типы В-клеток способны дифференцироваться в Breg (Rosser and Mauri, 2015).

1.3. В-клетки в ответе на микобактерии и другие внутриклеточные патогены

В последние годы появляется всё больше данных о том, что В-клетки могут влиять на иммунный ответ при туберкулёзе, взаимодействуя с различными клетками иммунной системы (Kozakiewicz, Phuah, et al., 2013; Chan et al., 2014). Проведены клинические исследования, в которых было показано, что больные лёгочным туберкулёзом имеют пониженное содержание В-лимфоцитов в периферической крови по сравнению со здоровыми людьми носителями латентной инфекции (Corominas et al., 2004; Hernandez et al., 2010). В-лимфоциты мигрируют в лёгочную ткань в ответ на туберкулёзную инфекцию и формируют вокруг гранулём скопления, похожие на В-фолликулы вторичных лимфоидных органов (Achkar, Chan and Casadevall, 2015). Помимо производства антител, В-клетки могут выступать в качестве АПК, а также продуцировать цитокины, оказывая таким образом влияние на другие типы клеток и на развитие патологии.

1.3.1. Влияние В-лимфоцитов и антител на другие клетки иммунной системы при туберкулёзе

Макрофаги играют двойственную роль при туберкулёзе. С одной стороны они являются основными клетками, уничтожающими микобактерии, а с другой именно в макрофагальных фагосомах микобактерии размножаются (Pandey and Sassetti, 2008). Известно, что разные субпопуляции макрофагов оказывают различное влияние на патологический процесс (Gordon and Taylor, 2005; Martinez et al., 2008). Для успешной борьбы с инфекцией, вызванной микобактериями, важно соблюдение баланса между эффективным противотуберкулёзным ответом,

и чрезмерным воспалением, которое может быть более вредным для организма хозяина, нежели сама инфекция (Orme, Robinson and Cooper, 2014). В связи с этим особый интерес вызывает способность макрофагов приобретать про- или противовоспалительный фенотип, соответственно, М1 или М2 в зависимости от полученного извне сигнала (Lugo-villarino et al., 2013). Макрофаги М2 подавляют воспаление, хуже фагоцитируют антигены и менее эффективны при борьбе с туберкулёзной инфекцией (Martinez, Helming and Gordon, 2009). Условия поляризации макрофагов описаны в многочисленных обзорах (Murray and Wynn, 2011), и здесь мы не будем касаться подробностей этого процесса. Отметим только, каким образом поляризация макрофагов и ответ на ТБ связан с работой В-лимфоцитов.

Wong с соавторами показали, что В-лимфоциты способны оказывать влияние на поляризацию макрофагов. В экспериментах по совместному культивированию перитонеальных макрофагов с лимфоцитами В1 или В2 было показано, что клетки В1 способствуют поляризации макрофагов по пути М2 и повышению у них экспрессии генов противовоспалительных цитокинов (Wong et al., 2010). Это подтверждалось и тем, что макрофаги мышей линии VHl2f, для которой характерно повышенное количество клеток В1, были сильнее поляризованы по пути М2, нежели макрофаги мышей контрольной группы. При этом в макрофагах было повышено производство IL-10 (Wong et al., 2010). Как было сказано ранее, макрофаги могут сливаться в гигантские многоядерные клетки при туберкулёзе (Helming and Gordon, 2007; Russell et al., 2009). В опытах на перитонеальных макрофагах показано, что они сливаются и образуют многоядерные клетки в присутствии лимфоцитов В1 (Bogsan et al., 2005). Вместе с тем показано, что у мышей СВА/J обнаруживается больше пенистых макрофагов, чем у мышей CBA/J-xid с дефицитом В-лимфоцитов на 40-й день после заражения штаммом M. tuberculosis Erdman (Junqueira-Kipnis et al., 2005). Однако остаётся неизвестным, связано ли это с формированием В-клеточных фолликулов и, вообще, расположенных вблизи гранулём В-лимфоцитов.

Обращаясь к роли антител в борьбе с туберкулёзом, следует сказать, что исследования в этой области можно разделить на два основных направления: пассивная иммунизация антителами, и исследования антител, синтезируемых в организме экспериментальных животных и человека.

Ряд исследований показал защитную роль пассивной иммунизации моноклональными АТ при туберкулёзе. Например, введение моноклональных антител против LAM снижает бактериальную нагрузку в лёгких и селезёнке, замедляет потерю веса и, что наиболее важно, положительно сказывается на выживаемости животных в модели внутривенного заражения мышей M. tuberculosis (Hamasur et al., 2004). Введение моноклональных антител против LAM приводит также к уменьшению скорости размножения микобактерий внутри легочных гранулём при аэрозольном заражении мышей (Teitelbaum et al., 1998). Кроме того, показано, что интраназальное введение моноклональных антител против гепарин-связывающего гемагглютинина сильно снижает уровень диссеминации M. tuberculosis (Pethe et al., 2001).

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Дятлов Александр Валерьевич, 2018 год

Список литературы

1. Abrahâo, T. B. et al. (2003) 'Morphological characterization of mouse B-1 cells.', Immunobiology, 208(4), pp. 401-11. doi: 10.1078/0171-2985-00287.

2. Achkar, J. M., Chan, J. and Casadevall, A. (2015) 'B cells and antibodies in the defense against Mycobacterium tuberculosis infection.', Immunological reviews. NIH Public Access, 264(1), pp. 167-81. doi: 10.1111/imr.12276.

3. Agarwal, S. et al. (2014) 'Inhibition of the Classical Pathway of Complement by Meningococcal Capsular Polysaccharides', The Journal of Immunology, 193(4), pp. 1855-1863. doi: 10.4049/jimmunol.1303177.

4. Allman, D. and Pillai, S. (2008) 'Peripheral B cell subsets', Current Opinion in Immunology, pp. 149-157. doi: 10.1016/j.coi.2008.03.014.

5. Alugupalli, K. R. et al. (2004) 'B1b Lymphocytes Confer T Cell-Independent Long-Lasting Immunity', Immunity, 21(3), pp. 379-390. doi: 10.1016/j.immuni.2004.06.019.

6. Alugupalli, K. R. (2008) 'A distinct role for B1b lymphocytes in T cell-independent immunity.', Current topics in microbiology and immunology, 319, pp. 10530. Available at: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/18080416 (Accessed: 19 January 2017).

7. Apt, A. S. and Kramnik, I. (2009) 'Man and mouse TB: contradictions and solutions.', Tuberculosis (Edinburgh, Scotland), 89(3), pp. 195-8. doi: 10.1016/j.tube.2009.02.002.

8. Arend, S. M. et al. (2002) 'Tuberculin Skin Testing and In Vitro T Cell Responses to ESAT-6 and Culture Filtrate Protein 10 after Infection with Mycobacterium marinum or M. kansasii, The Journal of Infectious Diseases, 186(12), pp. 1797-1807. doi: 10.1086/345760.

9. Armstrong, J. A. and Hart, P. D. (1975) 'Phagosome-lysosome interactions in cultured macrophages infected with virulent tubercle bacilli. Reversal of the usual nonfusion pattern and observations on bacterial survival.', The Journal of experimental

medicine, 142(1), pp. 1-16. Available at: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/807671 (Accessed: 23 August 2017).

10. Balu, S. et al. (2011) 'A Novel Human IgA Monoclonal Antibody Protects against Tuberculosis', J Immunol, 186(5), pp. 3113-3119. doi: 10.4049/jimmunol.1003189.A.

11. Barr, T. A. et al. (2012) 'B cell depletion therapy ameliorates autoimmune disease through ablation of IL-6-producing B cells.', The Journal of experimental medicine, 209(5), pp. 1001-10. doi: 10.1084/jem.20111675.

12. Baumgarth, N. (2011) 'The double life of a B-1 cell: self-reactivity selects for protective effector functions.', Nature reviews. Immunology, 11(1), pp. 34-46. doi: 10.1038/nri2901.

13. Behar, S. M., Divangahi, M. and Remold, H. G. (2010) 'Evasion of innate immunity by Mycobacterium tuberculosis: is death an exit strategy?', Nature Reviews Microbiology, 8(9), pp. 668-74. doi: 10.1038/nrmicro2387.

14. Benard, A. et al. (2017) 'B Cells Producing Type I Interferon Modulate Macrophage Polarization in Tuberculosis.', American journal of respiratory and critical care medicine, p. rccm.201707-14750C. doi: 10.1164/rccm.201707-14750C.

15. Berland, R. and Wortis, H. H. (2002) 'Origins and functions of B-1 cells with notes on the role of CD5', Annual Review of Immunology, 20(1), pp. 253-300. doi: 10.1146/annurev.immunol.20.100301.064833.

16. Beyazova, U. et al. (1995) 'Humoral immune response in infants after BCG vaccination.', Tubercle and lung disease: the official journal of the International Union against Tuberculosis and Lung Disease, 76(3), pp. 248-53. Available at: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/7548909 (Accessed: 29 August 2017).

17. Birmann, B. M. et al. (2004) 'Serologic Assessment of Type 1 and Type 2 Immunity in Healthy Japanese Adults', Cancer Epidemiol Biomarkers Prev, 13(8), pp. 1385-91. Available at: http://cebp.aacrjournals.org/content/cebp/13/8/1385.full.pdf (Accessed: 30 May 2017).

18. Blander, S. J. and Horwitz, M. A. (1991) 'Vaccination with the major secretory protein of Legionella induces humoral and cell-mediated immune responses and

protective immunity across different serogroups of Legionella pneumophila and different species of Legionella.', Journal of immunology (Baltimore, Md.: 1950), 147(1), pp. 285-91. Available at: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/1711078 (Accessed: 15 August 2017).

19. Bogsan, C. S. B. et al. (2005) 'B-1 cells are pivotal for in vivo inflammatory giant cell formation.', International journal of experimental pathology, 86(4), pp. 257-65. doi: 10.1111/j.0959-9673.2005.00433.x.

20. Böhm, S., Kao, D. and Nimmerjahn, F. (2014) 'Sweet and Sour: The Role of Glycosylation for the Anti-inflammatory Activity of Immunoglobulin G', in. Springer, Cham, pp. 393-417. doi: 10.1007/978-3-319-07911-0_18.

21. Bortnick, A. et al. (2012) 'Long-lived bone marrow plasma cells are induced early in response to T cell-independent or T cell-dependent antigens.', Journal of immunology (Baltimore, Md.: 1950). NIH Public Access, 188(11), pp. 5389-96. doi: 10.4049/j immunol. 1102808.

22. Bowe, F. et al. (2004) 'Mucosal vaccination against serogroup B meningococci: induction of bactericidal antibodies and cellular immunity following intranasal immunization with NadA of Neisseria meningitidis and mutants of Escherichia coli heat-labile enterotoxin.', Infection and immunity, 72(7), pp. 4052-60. doi: 10.1128/IAI.72.7.4052-4060.2004.

23. Boyer, J. L. et al. (2010) 'Protective Immunity Against a Lethal Respiratory Yersinia pestis Challenge Induced by V Antigen or the F1 Capsular Antigen Incorporated into Adenovirus Capsid', Human Gene Therapy, 21(7), pp. 891-901. doi: 10.1089/hum.2009.148.

24. Caceres, N. et al. (2009) 'Evolution of foamy macrophages in the pulmonary granulomas of experimental tuberculosis models.', Tuberculosis (Edinburgh, Scotland), 89(2), pp. 175-82. doi: 10.1016/j.tube.2008.11.001.

25. Cambier, C. J. et al. (2014) 'Mycobacteria manipulate macrophage recruitment through coordinated use of membrane lipids.', Nature. Nature Publishing Group, 505(7482), pp. 218-22. doi: 10.1038/nature12799.

26. Carneiro-Sampaio, M. and Coutinho, A. (2007) 'Immunity to microbes: lessons from primary immunodeficiencies.', Infection and immunity. American Society for Microbiology (ASM), 75(4), pp. 1545-55. doi: 10.1128/IAI.00787-06.

27. Casadevall, A. (2003) 'Antibody-Mediated Immunity against Thinking Comes Full Circle GUEST COMMENTARY Antibody-Mediated Immunity against Intracellular Pathogens: Two-Dimensional Thinking Comes Full Circle', 71(8). doi: 10.1128/IAI.71.8.4225.

28. Casadevall, A. and Pirofski, L.-A. (2012) 'A new synthesis for antibody-mediated immunity.', Nature immunology, 13(1), pp. 21-8. doi: 10.1038/ni.2184.

29. Casadevall, A. and Pirofski, L. anne (2006) 'A Reappraisal of Humoral Immunity Based on Mechanisms of Antibody-Mediated Protection Against Intracellular Pathogens', Advances in Immunology, pp. 1-44. doi: 10.1016/S0065-2776(06)91001-3.

30. Casanova, J.-L. and Abel, L. (2002) 'Genetic dissection of immunity to mycobacteria: the human model.', Annual review of immunology, 20, pp. 581-620. doi: 10.1146/annurev.immunol.20.081501.125851.

31. Cerutti, A., Cols, M. and Puga, I. (2013) 'Marginal zone B cells: virtues of innate-like antibody-producing lymphocytes.', Nature reviews. Immunology, 13(2), pp. 11832. doi: 10.1038/nri3383.

32. Chan, J. et al. (1992) 'Killing of virulent Mycobacterium tuberculosis by reactive nitrogen intermediates produced by activated murine macrophages.', The Journal of experimental medicine. The Rockefeller University Press, 175(4), pp. 1111-22. Available at: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/1552282 (Accessed: 13 July 2017).

33. Chan, J. et al. (2014) 'The role of B cells and humoral immunity in Mycobacterium tuberculosis infection', Semin Immunol, 26(6), pp. 588-600. doi: 10.1016/j.surg.2006.10.010.Use.

34. Chang-hong, S. et al. (2008) 'Immune responses and protective efficacy of the gene vaccine expressing Ag85B and ESAT6 fusion protein from Mycobacterium tuberculosis.', DNA and cell biology, 27(4), pp. 199-207. doi: 10.1089/dna.2007.0648.

35. Chen, M. et al. (2008) 'Lipid mediators in innate immunity against tuberculosis:

opposing roles of PGE2 and LXA4 in the induction of macrophage death.', The Journal of experimental medicine. The Rockefeller University Press, 205(12), pp. 2791-801. doi: 10.1084/jem.20080767.

36. Choi, Y. S. et al. (2012) 'B-1 cells in the bone marrow are a significant source of natural IgM.', European journal of immunology, 42(1), pp. 120-9. doi: 10.1002/eji.201141890.

37. Colombo, M. J. et al. (2011) 'B1b lymphocyte-derived antibodies control Borrelia hermsii independent of Fca/^ receptor and in the absence of host cell contact', Immunologic Research, 51(2-3), pp. 249-256. doi: 10.1007/s12026-011-8260-8.

38. Cooper, A. M. et al. (1993) 'Disseminated tuberculosis in interferon gamma gene-disrupted mice.', The Journal of experimental medicine. The Rockefeller University Press, 178(6), pp. 2243-7. Available at: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/8245795 (Accessed: 27 June 2017).

39. Cooper, A. M. et al. (1997) 'Interleukin 12 (IL-12) is crucial to the development of protective immunity in mice intravenously infected with mycobacterium tuberculosis.', The Journal of experimental medicine. The Rockefeller University Press, 186(1), pp. 39-45. Available at: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/9206995 (Accessed: 27 June 2017).

40. Corominas, M. et al. (2004) 'B-lymphocytes and co-stimulatory molecules in Mycobacterium tuberculosis infection.', The international journal of tuberculosis and lung disease : the official journal of the International Union against Tuberculosis and Lung Disease, 8(1), pp. 98-105. Available at: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/14974752 (Accessed: 29 August 2017).

41. Costello, A. M. et al. (1992) 'Does antibody to mycobacterial antigens, including lipoarabinomannan, limit dissemination in childhood tuberculosis?', Transactions of the Royal Society of Tropical Medicine and Hygiene, 86(6), pp. 686-92. Available at: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/1287946 (Accessed: 21 August 2017).

42. Cowan, C. et al. (2005) 'Anti-LcrV antibody inhibits delivery of Yops by Yersinia pestis KIM5 by directly promoting phagocytosis.', Infection and immunity, 73(9), pp.

6127-37. doi: 10.1128/IAI.73.9.6127-6137.2005.

43. Cruz, A. T. and Starke, J. R. (2007) 'Clinical manifestations of tuberculosis in children.', Paediatric respiratory reviews, 8(2), pp. 107-17. doi: 10.1016/j.prrv.2007.04.008.

44. Cunningham, A. F. et al. (2014) 'B1b Cells Recognize Protective Antigens after Natural Infection and Vaccination', Frontiers in Immunology, 5, p. 535. doi: 10.3389/fimmu.2014.00535.

45. Davis, J. M. et al. (2002) 'Real-time visualization of mycobacterium-macrophage interactions leading to initiation of granuloma formation in zebrafish embryos.', Immunity, 17(6), pp. 693-702. Available at: http : //www. ncbi.nlm. nih. gov/pubmed/12479816.

46. Davis, J. M. and Ramakrishnan, L. (2009) 'The Role of the Granuloma in Expansion and Dissemination of Early Tuberculous Infection', Cell, 136(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3134310/), pp. 37-49. doi: 10.1016/j.cell.2008.11.014.

47. Dayal, R. et al. (2008) 'Serological diagnosis of tuberculosis.', Indian journal of pediatrics, 75(12), pp. 1219-21. doi: 10.1007/s12098-008-0222-3.

48. Deretic, V. et al. (2006) 'Mycobacterium tuberculosis inhibition of phagolysosome biogenesis and autophagy as a host defence mechanism', Cellular Microbiology, 8(5), pp. 719-727. doi: 10.1111/j.1462-5822.2006.00705.x.

49. Divangahi, M. et al. (2009) 'Mycobacterium tuberculosis evades macrophage defenses by inhibiting plasma membrane repair.', Nature immunology. NIH Public Access, 10(8), pp. 899-906. doi: 10.1038/ni.1758.

50. Doffinger R, Patel S and Kumararatne DS (2005) 'Human immunodeficiencies that predispose to intracellular bacterial infections', Curr Opin Rheumatol. Jul;17, (4), pp. 440-6. doi: 00002281-200507000-00010 [pii].

51. Donald, P. R., Marais, B. J. and Barry, C. E. (2010) 'Age and the epidemiology and pathogenesis of tuberculosis', The Lancet, 375(9729), pp. 1852-1854. doi: 10.1016/S0140-6736(10)60580-6.

52. Dorman, S. E. and Holland, S. M. (2000) 'Interferon-gamma and interleukin-12 pathway defects and human disease.', Cytokine & growth factor reviews, 11(4), pp. 32133. Available at: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/10959079 (Accessed: 1 February 2017).

53. Dubois Cauwelaert, N. et al. (2016) 'Antigen presentation by B cells guides programing of memory CD4 + T-cell responses to a TLR4-agonist containing vaccine in mice', European Journal of Immunology, 46(12), pp. 2719-2729. doi: 10.1002/eji.201646399.

54. Dussurget, O. et al. (2001) 'Role of Mycobacterium tuberculosis copper-zinc superoxide dismutase.', Infection and immunity. American Society for Microbiology (ASM), 69(1), pp. 529-33. doi: 10.1128/IAI.69.1.529-533.2001.

55. Edelson, B. T. and Unanue, E. R. (2001) 'Intracellular antibody neutralizes Listeria growth.', Immunity, 14(5), pp. 503-12. Available at: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/11371353 (Accessed: 15 August 2017).

56. Fellmann, M. et al. (2015) 'High affinity targeting of CD23 inhibits IgE synthesis in human B cells.', Immunity, inflammation and disease. Wiley-Blackwell, 3(4), pp. 339-49. doi: 10.1002/iid3.72.

57. Fillatreau, S. (2011) 'Novel regulatory functions for Toll-like receptor-activated B cells during intracellular bacterial infection.', Immunological reviews, 240(1), pp. 5271. doi: 10.1111/j.1600-065X.2010.00991.x.

58. Flynn, J. L. et al. (1995) 'Tumor necrosis factor-alpha is required in the protective immune response against Mycobacterium tuberculosis in mice.', Immunity, 2(6), pp. 561-72. Available at: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/7540941 (Accessed: 19 December 2016).

59. Fratti, R. A. et al. (2001) 'Role of phosphatidylinositol 3-kinase and Rab5 effectors in phagosomal biogenesis and mycobacterial phagosome maturation arrest.', The Journal of cell biology. The Rockefeller University Press, 154(3), pp. 631-44. doi: 10.1083/jcb.200106049.

60. Freeman, A. F. and Olivier, K. N. (2016) 'Hyper-IgE Syndromes and the Lung',

Clinics in Chest Medicine, 37(3), pp. 557-567. doi: 10.1016/j.ccm.2016.04.016.

61. Froidure, A. et al. (2016) 'Asthma phenotypes and IgE responses', European Respiratory Journal, 47(1), pp. 304-319. doi: 10.1183/13993003.01824-2014.

62. Galen, J. E. et al. (2015) 'A bivalent typhoid live vector vaccine expressing both chromosome- and plasmid-encoded Yersinia pestis antigens fully protects against murine lethal pulmonary plague infection.', Infection and immunity. Edited by A. J. Bäumler, 83(1), pp. 161-72. doi: 10.1128/IAI.02443-14.

63. Gan, H. et al. (2008) 'Mycobacterium tuberculosis blocks crosslinking of annexin-1 and apoptotic envelope formation on infected macrophages to maintain virulence.', Nature immunology. NIH Public Access, 9(10), pp. 1189-97. doi: 10.1038/ni.1654.

64. Garraud, O. et al. (2012) 'Revisiting the B-cell compartment in mouse and humans: more than one B-cell subset exists in the marginal zone and beyond.', BMC immunology, 13, p. 63. doi: 10.1186/1471-2172-13-63.

65. Gibson-Corley, K. N. et al. (2010) 'A deficiency in the B cell response of C57BL/6 mice correlates with loss of macrophage-mediated killing of Leishmania amazonensis.', International journal for parasitology, 40(2), pp. 157-61. doi: 10.1016/j.ijpara.2009.11.010.

66. Gibson-Corley, K. N. et al. (2014) 'An in vitro model of antibody-enhanced killing of the intracellular parasite Leishmania amazonensis.', PloS one. Edited by G. van Zandbergen, 9(9), p. e106426. doi: 10.1371/journal.pone.0106426.

67. Gil, O. et al. (2006) 'Intragranulomatous necrosis in lungs of mice infected by aerosol with Mycobacterium tuberculosis is related to bacterial load rather than to any one cytokine or T cell type', Microbes and Infection, 8(3), pp. 628-636. doi: 10.1016/j.micinf.2005.08.014.

68. Giri, P. K., Verma, I. and Khuller, G. K. (2006) 'Enhanced immunoprotective potential of Mycobacterium tuberculosis Ag85 complex protein based vaccine against airway Mycobacterium tuberculosis challenge following intranasal administration.', FEMS immunology and medical microbiology, 47(2), pp. 233-41. doi: 10.1111/j. 1574-

695X.2006.00087.x.

69. Gomez, G. et al. (2013) 'Host-Brucella interactions and the Brucella genome as tools for subunit antigen discovery and immunization against brucellosis', Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, 3. doi: 10.3389/fcimb.2013.00017.

70. Gonzalez-juarrero, M. et al. (2001) 'Temporal and Spatial Arrangement of Lymphocytes within Lung Granulomas Induced by Aerosol Infection with Mycobacterium tuberculosis', 69(3), pp. 1722-1728. doi: 10.1128/IAI.69.3.1722.

71. Gordon, S. and Taylor, P. R. (2005) 'Monocyte and macrophage heterogeneity', Nature Reviews Immunology, 5(12), pp. 953-964. doi: 10.1038/nri1733.

72. Green, A. M., Difazio, R. and Flynn, J. L. (2013) 'IFN-y from CD4 T cells is essential for host survival and enhances CD8 T cell function during Mycobacterium tuberculosis infection.', Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950), 190(1), pp. 270-7. doi: 10.4049/jimmunol.1200061.

73. Grover, A. et al. (2006) 'A multivalent combination of experimental antituberculosis DNA vaccines based on Ag85B and regions of difference antigens.', Microbes and infection, 8(9-10), pp. 2390-9. doi: 10.1016/j.micinf.2006.04.025.

74. Guirado, E. et al. (2006) 'Passive serum therapy with polyclonal antibodies against Mycobacterium tuberculosis protects against post-chemotherapy relapse of tuberculosis infection in SCID mice', Microbes and Infection, 8(5), pp. 1252-1259. doi: 10.1016/j.micinf.2005.12.004.

75. Haas, K. M. et al. (2005) 'B-1a and B-1b cells exhibit distinct developmental requirements and have unique functional roles in innate and adaptive immunity to S. pneumoniae.', Immunity, 23(1), pp. 7-18. doi: 10.1016/j.immuni.2005.04.011.

76. Hafner, L. M., Wilson, D. P. and Timms, P. (2014) 'Development status and future prospects for a vaccine against Chlamydia trachomatis infection', Vaccine, 32(14), pp. 1563-1571. doi: 10.1016/j.vaccine.2013.08.020.

77. Halle, S. et al. (2009) 'Induced bronchus-associated lymphoid tissue serves as a general priming site for T cells and is maintained by dendritic cells', J. Exp. Med, 206(12), pp. 2593-2601. doi: 10.1084/jem.20091472.

78. Hamasur, B. et al. (2004) 'A mycobacterial lipoarabinomannan specific monoclonal antibody and its F(ab') fragment prolong survival of mice infected with Mycobacterium tuberculosis.', Clinical and experimental immunology, 138(1), pp. 308. doi: 10.1111/j.1365-2249.2004.02593.x.

79. Hardy, R. R. and Hayakawa, K. (2001) 'B cell development pathways.', Annual review of immunology, 19, pp. 595-621. doi: 10.1146/annurev.immunol.19.1.595.

80. Heemskerk, D. et al. (2015) Tuberculosis in Adults and Children, Tuberculosis in Adults and Children. doi: 10.1007/978-3-319-19132-4.

81. Helming, L. and Gordon, S. (2007) 'The molecular basis of macrophage fusion.', Immunobiology, 212(9-10), pp. 785-93. doi: 10.1016/j.imbio.2007.09.012.

82. Hernandez, J. et al. (2010) 'Low number of peripheral blood B lymphocytes in patients with pulmonary tuberculosis.', Immunological investigations, 39(3), pp. 197205. doi: 10.3109/08820130903586346.

83. Hippen, K. L., Tze, L. E. and Behrens, T. W. (2000) 'CD5 maintains tolerance in anergic B cells.', The Journal of experimental medicine, 191(5), pp. 883-90. Available at: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/10704468 (Accessed: 19 January 2017).

84. Hoff, D. R. et al. (2011) 'Location of intra- and extracellular M. tuberculosis populations in lungs of mice and guinea pigs during disease progression and after drug treatment', PLoS ONE, 6. doi: 10.1371/journal.pone.0017550.

85. Hoffmann, E. M. and Houle, J. J. (1995) 'Contradictory roles for antibody and complement in the interaction of Brucella abortus with its host.', Critical reviews in microbiology, 21(3), pp. 153-63. doi: 10.3109/10408419509113538.

86. Houben, D. et al. (2012) 'ESX-1-mediated translocation to the cytosol controls virulence of mycobacteria', Cellular Microbiology, 14(8), pp. 1287-1298. doi: 10.1111/j.1462-5822.2012.01799.x.

87. Jia, J. et al. (2017) 'BCL6 mediates the effects of Gastrodin on promoting M2-like macrophage polarization and protecting against oxidative stress-induced apoptosis and cell death in macrophages', Biochemical and Biophysical Research Communications, 486(2), pp. 458-464. doi: 10.1016/j.bbrc.2017.03.062.

88. Jo, E. K. et al. (2007) 'Intracellular signalling cascades regulating innate immune responses to Mycobacteria: Branching out from Toll-like receptors', Cellular Microbiology, pp. 1087-1098. doi: 10.1111/j.1462-5822.2007.00914.x.

89. Johnson, C. M. et al. (1997) 'Mycobacterium tuberculosis aerogenic rechallenge infections in B cell-deficient mice.', Tubercle and lung disease: the official journal of the International Union against Tuberculosis and Lung Disease, 78(5-6), pp. 257-61. Available at: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/10209680 (Accessed: 2 November 2016).

90. Joller, N. et al. (2010) 'Antibodies protect against intracellular bacteria by Fc receptor-mediated lysosomal targeting.', Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 107(47), pp. 20441-6. doi: 10.1073/pnas.1013827107.

91. Jones, G. W. and Jones, S. A. (2015) 'Ectopic lymphoid follicles: Inducible centres for generating antigen-specific immune responses within tissues', Immunology, 147(2), pp. 141-151. doi: 10.1111/imm.12554.

92. Joosten, S. A. et al. (2016) 'Patients with Tuberculosis Have a Dysfunctional Circulating B-Cell Compartment, Which Normalizes following Successful Treatment.', PLoS pathogens. Public Library of Science, 12(6), p. e1005687. doi: 10.1371/journal.ppat.1005687.

93. Junqueira-Kipnis, A. P. et al. (2005) 'Interleukin-10 production by lung macrophages in CBA xid mutant mice infected with Mycobacterium tuberculosis.', Immunology, 115(2), pp. 246-252. doi: 10.1111/j.1365-2567.2005.02136.x.

94. Kahnert, A. et al. (2007) 'Mycobacterium tuberculosis triggers formation of lymphoid structure in murine lungs.', The Journal of infectious diseases, 195(1), pp. 4654. doi: 10.1086/508894.

95. Kang, D. D. et al. (2011) 'Profiling early lung immune responses in the mouse model of tuberculosis.', PloS one, 6(1), p. e16161. doi: 10.1371/journal.pone.0016161.

96. Kang, H., Remington, J. S. and Suzuki, Y. (2000) 'Decreased resistance of B cell-deficient mice to infection with Toxoplasma gondii despite unimpaired expression of

IFN-gamma, TNF-alpha, and inducible nitric oxide synthase.', Journal of immunology (Baltimore, Md.: 1950), 164(5), pp. 2629-34. Available at: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/10679102 (Accessed: 16 August 2017).

97. Kapina, M. a et al. (2011) 'Interleukin-11 drives early lung inflammation during Mycobacterium tuberculosis infection in genetically susceptible mice.', PloS one, 6(7), p. e21878. doi: 10.1371/journal.pone.0021878.

98. Karnowski, A. et al. (2012) 'B and T cells collaborate in antiviral responses via IL-6, IL-21, and transcriptional activator and coactivator, Oct2 and OBF-1.', The Journal of experimental medicine. The Rockefeller University Press, 209(11), pp. 204964. doi: 10.1084/jem.20111504.

99. Khan, S. A. et al. (2014) 'Vaccination of koalas (Phascolarctos cinereus) with a recombinant chlamydial major outer membrane protein adjuvanted with poly I:C, a host defense peptide and polyphosphazine, elicits strong and long lasting cellular and humoral immune responses.', Vaccine, 32(44), pp. 5781-6. doi: 10.1016/j.vaccine.2014.08.037.

100. Kocks, J. R. et al. (2009) 'Chemokine receptor CCR7 contributes to a rapid and efficient clearance of lytic murine gamma-herpes virus 68 from the lung, whereas bronchus-associated lymphoid tissue harbors virus during latency.', Journal of immunology (Baltimore, Md.: 1950), 182(11), pp. 6861-6869. doi: 10.4049/j immunol.0801826.

101. Kondratieva, E. et al. (2010) 'Host genetics in granuloma formation: human-like lung pathology in mice with reciprocal genetic susceptibility to M. tuberculosis and M. avium.', PloS one, 5(5), p. e10515. doi: 10.1371/journal.pone.0010515.

102. Kondratieva, E. V et al. (2007) 'I/St mice hypersusceptible to Mycobacterium tuberculosis are resistant to M. avium.', Infection and immunity, 75(10), pp. 4762-8. doi: 10.1128/IAI.00482-07.

103. Kondratieva, T. K. et al. (2010) 'B cells delay neutrophil migration toward the site of stimulus: tardiness critical for effective bacillus Calmette-Guerin vaccination

against tuberculosis infection in mice.', Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950), 184(3), pp. 1227-34. doi: 10.4049/jimmunol.0902011.

104. Kondratieva, T. K. et al. (2014) 'Formation of compact aggregates of B-lymphocytes in lung tissue during mycobacterial infection in mice depends on TNF production by these cells and is not an element of the host's immunological protection', Biochemistry (Moscow), 79(12). doi: 10.1134/S0006297914120098.

105. Kozakiewicz, L., Chen, Y., et al. (2013) 'B cells regulate neutrophilia during Mycobacterium tuberculosis infection and BCG vaccination by modulating the interleukin-17 response.', PLoS pathogens, 9(7), p. e1003472. doi: 10.1371/journal.ppat.1003472.

106. Kozakiewicz, L., Phuah, J. Y., et al. (2013) 'The Role of B Cells and Humoral Immunity in Mycobacterium tuberculosis Infection', The New Paradigm of Immunity to Tuberculosis SE -12, pp. 225-250. doi: 10.1007/978-1-4614-6111-1_12.

107. Kroese, F. G. et al. (1989) 'Many of the IgA producing plasma cells in murine gut are derived from self-replenishing precursors in the peritoneal cavity.', International immunology, 1(1), pp. 75-84. Available at: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/2487677 (Accessed: 20 January 2017).

108. Kubo, M. (2017) 'Innate and adaptive type 2 immunity in lung allergic inflammation', Immunological Reviews, 278(1), pp. 162-172. doi: 10.1111/imr. 12557.

109. Kumar, D., Kirimanjeswara, G. and Metzger, D. W. (2011) 'Intranasal administration of an inactivated Yersinia pestis vaccine with interleukin-12 generates protective immunity against pneumonic plague.', Clinical and vaccine immunology: CVI, 18(11), pp. 1925-35. doi: 10.1128/CVI.05117-11.

110. Kumar, V. and Robbins, S. L. (Stanley L. (2007) Robbins basic pathology. Saunders/Elsevier.

111. Kunnath-Velayudhan, S. et al. (2012) 'Proteome-scale antibody responses and outcome of Mycobacterium tuberculosis infection in nonhuman primates and in tuberculosis patients.', The Journal of infectious diseases, 206(5), pp. 697-705. doi: 10.1093/infdis/j is421.

112. Kurosaki, T., Kometani, K. and Ise, W. (2015) 'Memory B cells', Nature Reviews Immunology, 15(3), pp. 149-159. doi: 10.1038/nri3802.

113. Kyaw, T. et al. (2011) 'B1a B lymphocytes are atheroprotective by secreting natural IgM that increases IgM deposits and reduces necrotic cores in atherosclerotic lesions.', Circulation research, 109(8), pp. 830-40. doi: 10.1161/CIRCRESAHA. 111.248542.

114. Ladel, C. H. et al. (1997) 'Lethal tuberculosis in interleukin-6-deficient mutant mice', Infection and Immunity, 65(11), pp. 4843-4849.

115. Li, H. et al. (2017) 'Latently and uninfected healthcare workers exposed to TB make protective antibodies against Mycobacterium tuberculosis', Proceedings of the National Academy of Sciences, 114(19), pp. 5023-5028. doi: 10.1073/pnas.1611776114.

116. Li, J. S. et al. (2001) 'Outer membrane protein-specific monoclonal antibodies protect SCID mice from fatal infection by the obligate intracellular bacterial pathogen Ehrlichia chaffeensis.', Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950), 166(3), pp. 1855-62. Available at: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/11160232 (Accessed: 14 August 2017).

117. Li, J. S.-Y. and Winslow, G. M. (2003) 'Survival, replication, and antibody susceptibility of Ehrlichia chaffeensis outside of host cells.', Infection and immunity, 71, pp. 4229-4237. doi: 10.1128/IAI.71.8.4229-4237.2003.

118. Liang, P.-Y. et al. (2015) 'The pro-inflammatory and anti-inflammatory cytokine profile in peripheral blood of women with recurrent implantation failure', Reproductive BioMedicine Online, 31(6), pp. 823-826. doi: 10.1016/j.rbmo.2015.08.009.

119. Lin, P. L. et al. (2012) 'CD4 T cell depletion exacerbates acute Mycobacterium tuberculosis while reactivation of latent infection is dependent on severity of tissue depletion in cynomolgus macaques.', AIDS research and human retroviruses. Mary Ann Liebert, Inc., 28(12), pp. 1693-702. doi: 10.1089/AID.2012.0028.

120. Linge, I. A. et al. (2016) 'B-lymphocyte aggregation in the lung tissue is a pathogenic factor in experimental infection caused by Mycobacterium avium', Tuberculosis and Lung Diseases, pp. 2-7.

121. Lisi, L. et al. (2017) 'Expression of iNOS, CD163 and ARG-1 taken as M1 and M2 markers of microglial polarization in human glioblastoma and the surrounding normal parenchyma', Neuroscience Letters, 645, pp. 106-112. doi: 10.1016/j.neulet.2017.02.076.

122. Lu, L. L. et al. (2016) 'A Functional Role for Antibodies in Tuberculosis', Cell, 167(2), p. 433-443.e14. doi: 10.1016/j.cell.2016.08.072.

123. Lugo-villarino, G. et al. (2013) 'Emerging trends in the formation and function of tuberculosis granulomas', 3(January), pp. 1-9. doi: 10.3389/fimmu.2012.00405.

124. Lund, F. E. and Randall, T. D. (2010) 'Effector and regulatory B cells: modulators of CD4+ T cell immunity.', Nature reviews. Immunology. Nature Publishing Group, 10(4), pp. 236-47. doi: 10.1038/nri2729.

125. Maglione, P. J. et al. (2008) 'Fc gamma receptors regulate immune activation and susceptibility during Mycobacterium tuberculosis infection.', Journal of immunology (Baltimore, Md.: 1950), 180(5), pp. 3329-38. Available at: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/18292558 (Accessed: 10 January 2017).

126. Maglione, P. J., Xu, J. and Chan, J. (2007) 'B cells moderate inflammatory progression and enhance bacterial containment upon pulmonary challenge with Mycobacterium tuberculosis.', Journal of immunology (Baltimore, Md.: 1950), 178, pp. 7222-7234. doi: 17513771.

127. Mahan, A. E. et al. (2016) 'Antigen-Specific Antibody Glycosylation Is Regulated via Vaccination', PLOS Pathogens. Edited by A. Trkola. Public Library of Science, 12(3), p. e1005456. doi: 10.1371/journal.ppat.1005456.

128. Malik, Z. A., Denning, G. M. and Kusner, D. J. (2000) 'Inhibition of Ca(2+) signaling by Mycobacterium tuberculosis is associated with reduced phagosome-lysosome fusion and increased survival within human macrophages.', The Journal of

experimental medicine, 191(2), pp. 287-302. Available at: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/10637273 (Accessed: 30 August 2017).

129. Marakalala, M. J. et al. (2016) 'Inflammatory signaling in human tuberculosis granulomas is spatially organized', Nature Medicine, 22(5), pp. 531-538. doi: 10.1038/nm.4073.

130. Martin, F. and Kearney, J. F. (2001) 'B1 cells: similarities and differences with other B cell subsets.', Current opinion in immunology, 13(2), pp. 195-201. Available at: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/11228413 (Accessed: 2 August 2017).

131. Martinez, A. N., Mehra, S. and Kaushal, D. (2013) 'Role of interleukin 6 in innate immunity to Mycobacterium tuberculosis infection.', The Journal of infectious diseases, 207(8), pp. 1253-61. doi: 10.1093/infdis/jit037.

132. Martinez, F. O. et al. (2008) 'Macrophage activation and polarization.', Frontiers in bioscience: a journal and virtual library, 13, pp. 453-61. Available at: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17981560 (Accessed: 6 February 2017).

133. Martinez, F. O., Helming, L. and Gordon, S. (2009) 'Alternative activation of macrophages: an immunologic functional perspective.', Annual review of immunology, 27, pp. 451-83. doi: 10.1146/annurev.immunol.021908.132532.

134. Mayer-Barber, K. D. et al. (2014) 'Host-directed therapy of tuberculosis based on interleukin-1 and type I interferon crosstalk', Nature, 511(7507), pp. 99-103. doi: 10.1038/nature13489.

135. McDonald, K. G., McDonough, J. S. and Newberry, R. D. (2005) 'Adaptive Immune Responses Are Dispensable for Isolated Lymphoid Follicle Formation: Antigen-Naive, Lymphotoxin-Sufficient B Lymphocytes Drive the Formation of Mature Isolated Lymphoid Follicles', The Journal of Immunology, 174(9), pp. 5720-5728. doi: 10.4049/jimmunol.174.9.5720.

136. Migliorini, P., Corradin, B. S. and Corradin, G. (1991) 'Macrophage NO2-production as a sensitive and rapid assay for the quantitation of murine IFN-y', Journal of Immunological Methods. Elsevier, 139(1), pp. 107-114. doi: 10.1016/0022-

1759(91)90357-L.

137. Ming Hu, J. et al. (2017) 'CD163 as a marker of M2 macrophage, contribute to predicte aggressiveness and prognosis of Kazakh esophageal squmous cell carcinoma', Oncotarget, 8(13), pp. 21526-21538. doi: 10.18632/oncotarget.15630.

138. Molnarfi, N. et al. (2013) 'MHC class II-dependent B cell APC function is required for induction of CNS autoimmunity independent of myelin-specific antibodies.', The Journal of experimental medicine, 210(13), pp. 2921-37. doi: 10.1084/jem.20130699.

139. Moyron-Quiroz, J. E. et al. (2004) 'Role of inducible bronchus associated lymphoid tissue (iBALT) in respiratory immunity', Nat.Med., 10(9), pp. 927-934. doi: 10.1038/nm1091.

140. Moyron-Quiroz, J. E. et al. (2004) 'Role of inducible bronchus associated lymphoid tissue (iBALT) in respiratory immunity', Nature Medicine, 10(9), pp. 927934. doi: 10.1038/nm1091.

141. Moyron-Quiroz, J. E. et al. (2006) 'Persistence and responsiveness of immunologic memory in the absence of secondary lymphoid organs.', Immunity, 25(4), pp. 643-54. doi: 10.1016/j.immuni.2006.08.022.

142. Murphy, K. M. (2012) 'Janeway's Immunobiology', Janeway's Immunology.

143. Murray, P. J. and Wynn, T. A. (2011) 'Obstacles and opportunities for understanding macrophage polarization.', Journal of leukocyte biology, 89, pp. 557563. doi: 10.1189/jlb.0710409.

144. Mwandumba, H. C. et al. (2004) 'Mycobacterium tuberculosis Resides in Nonacidified Vacuoles in Endocytically Competent Alveolar Macrophages from Patients with Tuberculosis and HIV Infection', The Journal of Immunology, 172(7). Available at: http://www.jimmunol.org/content/!72/7/4592.long (Accessed: 14 July 2017).

145. Nagabhushanam, V. et al. (2003) 'Innate inhibition of adaptive immunity: Mycobacterium tuberculosis-induced IL-6 inhibits macrophage responses to IFN-

gamma', J Immunol, 171(9), pp. 4750-4757. doi: 10.4049/jimmunol.171.9.4750.

146. Nikonenko, B. V. et al. (1996) 'Influence of the mouse Bcg, Tbc-1 and xid genes on resistance and immune responses to tuberculosis infection and efficacy of bacille Calmette-Guerin (BCG) vaccination', Clin Exp Immunol, 104(1), pp. 37-43.

147. Nikonenko, B. V. et al. (2000) 'Comparative analysis of mycobacterial infections in susceptible I/St and resistant A/Sn inbred mice', Tubercle and Lung Disease, 80(1), pp. 15-25. doi: 10.1054/tuld.1999.0225.

148. Niu, H. et al. (2011) 'Construction and evaluation of a multistage Mycobacterium tuberculosis subunit vaccine candidate Mtb10.4-HspX.', Vaccine, 29(51), pp. 9451-8. doi: 10.1016/j.vaccine.2011.10.032.

149. Nutt, S. L. et al. (2015) 'The generation of antibody-secreting plasma cells', Nature Reviews Immunology, 15(3), pp. 160-171. doi: 10.1038/nri3795.

150. Orme, I. M. and Basaraba, R. J. (2014) 'The formation of the granuloma in tuberculosis infection', Seminars in Immunology. Elsevier Ltd, 26(6), pp. 601-609. doi: 10.1016/j.smim.2014.09.009.

151. Orme, I. M., Robinson, R. T. and Cooper, A. M. (2014) 'The balance between protective and pathogenic immune responses in the TB-infected lung', Nature Immunology, 16(1), pp. 57-63. doi: 10.1038/ni.3048.

152. Pai, M. et al. (2016) 'Tuberculosis', Nature Reviews Disease Primers, 2, p. 16076. doi: 10.1038/nrdp.2016.76.

153. Palaniyandi, S. et al. (2015) 'Inhibition of CD23-mediated IgE transcytosis suppresses the initiation and development of allergic airway inflammation.', Mucosal immunology. NIH Public Access, 8(6), pp. 1262-74. doi: 10.1038/mi.2015.16.

154. Palma, C. et al. (2008) 'The LTK63 adjuvant improves protection conferred by Ag85B DNA-protein prime-boosting vaccination against Mycobacterium tuberculosis infection by dampening IFN-gamma response.', Vaccine, 26(33), pp. 423743. doi: 10.1016/j.vaccine.2008.05.050.

155. Pandey, A. K. and Sassetti, C. M. (2008) 'Mycobacterial persistence requires the utilization of host cholesterol.', Proceedings of the National Academy of

Sciences of the United States of America, 105(11), pp. 4376-80. doi: 10.1073/pnas.0711159105.

156. Parekh, R. et al. (1989) 'A comparative analysis of disease-associated changes in the galactosylation of serum IgG', Journal of Autoimmunity, 2(2), pp. 101114. doi: 10.1016/0896-8411(89)90148-0.

157. Peng, Y. et al. (2014) 'Characterization of a lipopolysaccharide-targeted monoclonal antibody and its variable fragments as candidates for prophylaxis against the obligate intracellular bacterial pathogen Coxiella burnetii.', Infection and immunity, 82(11), pp. 4530-41. doi: 10.1128/IAI.01695-14.

158. Pethe, K. et al. (2001) 'The heparin-binding haemagglutinin of M. tuberculosis is required for extrapulmonary dissemination.', Nature, 412(6843), pp. 190-194. doi: 10.1038/35084083.

159. Peyron, P. et al. (2008) 'Foamy macrophages from tuberculous patients' granulomas constitute a nutrient-rich reservoir for M. tuberculosis persistence.', PLoS pathogens, 4(11), p. e1000204. doi: 10.1371/journal.ppat.1000204.

160. Phuah, J. Y. et al. (2012) 'Activated B cells in the granulomas of nonhuman primates infected with Mycobacterium tuberculosis.', The American journal of pathology. Elsevier Inc., 181(2), pp. 508-14. doi: 10.1016/j.ajpath.2012.05.009.

161. Phuah, J. Y. et al. (2016) 'The Effects of B cell Depletion on early Mycobacterium tuberculosis infection in Cynomolgus Macaques', Infection and Immunity, (February), p. IAI.00083-16. doi: 10.1128/IAI.00083-16.

162. Pichugin, A. V et al. (1998) 'Capacity of murine T cells to retain long-term responsiveness to mycobacterial antigens is controlled by the H-2 complex.', Clinical and experimental immunology, 111(2), pp. 316-24. Available at: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/9486398 (Accessed: 17 January 2017).

163. Piddington, D. L. et al. (2001) 'Cu,Zn superoxide dismutase of Mycobacterium tuberculosis contributes to survival in activated macrophages that are generating an oxidative burst.', Infection and immunity. American Society for Microbiology (ASM), 69(8), pp. 4980-7. doi: 10.1128/IAI.69.8.4980-4987.2001.

164. Pitzalis, C. et al. (2014) 'Ectopic lymphoid-like structures in infection, cancer and autoimmunity', Nature review s.Immunology. Nature Publishing Group, 14(7), pp. 447-462. doi: 10.1038/nri3700; 10.1038/nri3700.

165. Portugal, S. et al. (2017) 'Atypical memory B cells in human chronic infectious diseases: An interim report', Cellular Immunology. doi: 10.1016/j.cellimm.2017.07.003.

166. Prados-Rosales, R. et al. (2014) 'Mycobacterial membrane vesicles administered systemically in mice induce a protective immune response to surface compartments of Mycobacterium tuberculosis.', mBio, 5(5), pp. e01921-14. doi: 10.1128/mBio.01921-14.

167. Quatromoni, J. G. et al. (2015) 'An optimized disaggregation method for human lung tumors that preserves the phenotype and function of the immune cells.', Journal of leukocyte biology. The Society for Leukocyte Biology, 97(1), pp. 201-9. doi: 10.1189/jlb.5TA0814-373.

168. Ray, A. et al. (2015) '2B4 Is Dispensable for T-Dependent B Cell Immune Responses, but Its Deficiency Leads to Enhanced T-Independent Responses Due to an Increase in Peritoneal Cavity B1b Cells', PLOS ONE. Edited by J. Bayry, 10(8), p. e0137314. doi: 10.1371/journal.pone.0137314.

169. Reljic, R. et al. (2006) 'Intranasal IFN-gamma extends passive IgA antibody protection of mice against Mycobacterium tuberculosis lung infection.', Clinical and experimental immunology, 143(3), pp. 467-73. doi: 10.1111/j. 1365-2249.2006.03012.x.

170. Ren, W. et al. (2013) 'Uncoupling of natural IgE production and CD23 surface expression levels.', PloS one. Public Library of Science, 8(4), p. e62851. doi: 10.1371/journal.pone.0062851.

171. Rook, G. A. and Hernandez-Pando, R. (1996) 'The pathogenesis of tuberculosis', Annual review of microbiology, 5(1), pp. 163-175. doi: 10.1146/annurev-pathol-011811-132434.

172. Rosser, E. C. and Mauri, C. (2015) 'Regulatory B Cells: Origin, Phenotype,

and Function', Immunity, 42(4), pp. 607-612. doi: 10.1016/j.immuni.2015.04.005.

173. Roy, E. et al. (2005) 'Therapeutic Efficacy of High-Dose Intravenous Immunoglobulin in Mycobacterium tuberculosis Infection in Mice', Infection and Immunity, 73(9), pp. 6101-6109. doi: 10.1128/IAI.73.9.6101-6109.2005.

174. Rubin, E. J. (2009) 'The Granuloma in Tuberculosis — Friend or Foe ?', The New England journal of medicine, 360(23), pp. 2471-2473.

175. Russell, D. G. (2007) 'Who puts the tubercle in tuberculosis?', Nature reviews. Microbiology, 5(1), pp. 39-47. doi: 10.1038/nrmicro1538.

176. Russell, D. G. et al. (2009) 'Foamy macrophages and the progression of the human tuberculosis granuloma.', Nature immunology. NIH Public Access, 10(9), pp. 943-8. doi: 10.1038/ni.1781.

177. Russell, D. G. (2011) 'Mycobacterium tuberculosis and the intimate discourse of a chronic infection.', Immunological reviews, 240(1), pp. 252-68. doi: 10.1111/j.1600-065X.2010.00984.x.

178. Russell, D. G. (2016) 'The ins and outs of the Mycobacterium tuberculosis-containing vacuole.', Cellular microbiology, 18(8), pp. 1065-9. doi: 10.1111/cmi.12623.

179. Sakai, S. et al. (2016) 'CD4 T Cell-Derived IFN-y Plays a Minimal Role in Control of Pulmonary Mycobacterium tuberculosis Infection and Must Be Actively Repressed by PD-1 to Prevent Lethal Disease.', PLoS pathogens, 12(5), p. e1005667. doi: 10.1371/journal.ppat.1005667.

180. Saleh, M. T. and Belisle, J. T. (2000) 'Secretion of an acid phosphatase (SapM) by Mycobacterium tuberculosis that is similar to eukaryotic acid phosphatases.', Journal of bacteriology. American Society for Microbiology (ASM), 182(23), pp. 68503. Available at: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/11073936 (Accessed: 15 July 2017).

181. Samitas, K. et al. (2015) 'Anti-IgE treatment, airway inflammation and remodelling in severe allergic asthma: current knowledge and future perspectives', European Respiratory Review, 24(138), pp. 594-601. doi:

10.1183/16000617.00001715.

182. Samstein, M. et al. (2013) 'Essential yet limited role for CCR2 + inflammatory monocytes during Mycobacterium tuberculosis -specific T cell priming', eLife, 2, p. e01086. doi: 10.7554/eLife.01086.

183. Saunders, B. M. et al. (2000) 'Interleukin-6 induces early gamma interferon production in the infected lung but is not required for generation of specific immunity to Mycobacterium tuberculosis infection', Infection and Immunity, 68(6), pp. 33223326. doi: 10.1128/IAI.68.6.3322-3326.2000.

184. Seiler, P. et al. (2003) 'Early granuloma formation after aerosol Mycobacterium tuberculosis infection is regulated by neutrophils via CXCR3-signaling chemokines.', European journal of immunology, 33(10), pp. 2676-86. doi: 10.1002/eji.200323956.

185. Shen, P. et al. (2014) 'IL-35-producing B cells are critical regulators of immunity during autoimmune and infectious diseases.', Nature, 507(7492), pp. 366370. doi: 10.1038/nature12979.

186. Shen, P. and Fillatreau, S. (2015) 'Antibody-independent functions of B cells: a focus on cytokines.', Nature reviews. Immunology. Nature Publishing Group, 15(7), pp. 441-451. doi: 10.1038/nri3857.

187. Shepelkova, G. et al. (2016) 'Therapeutic Effect of Recombinant Mutated Interleukin 11 in the Mouse Model of Tuberculosis', Journal of Infectious Diseases, 214(3), pp. 496-501. doi: 10.1093/infdis/jiw176.

188. Shukla, S. et al. (2014) 'Mycobacterium tuberculosis lipoprotein LprG binds lipoarabinomannan and determines its cell envelope localization to control phagolysosomal fusion.', PLoS pathogens. Public Library of Science, 10(10), p. e1004471. doi: 10.1371/journal.ppat.1004471.

189. Simeone, R. et al. (2016) 'Perspectives on mycobacterial vacuole-to-cytosol translocation: the importance of cytosolic access', Cellular Microbiology, 18(8), pp. 1070-1077. doi: 10.1111/cmi.12622.

190. Slight, S. R., Rangel-Moreno, J., et al. (2013) 'CXCR5+ T helper cells

mediate protective immunity against tuberculosis.', The Journal of clinical investigation. American Society for Clinical Investigation, 123(2), pp. 712-26. doi: 10.1172/JCI65728.

191. Slight, S. R., Rangel-moreno, J., et al. (2013) 'CXCR5 + T helper cells mediate protective immunity against tuberculosis', 123(2), pp. 1-15. doi: 10.1172/JCI65728DS1.

192. Spagnolo, L. et al. (2004) 'Unique features of the sodC-encoded superoxide dismutase from Mycobacterium tuberculosis, a fully functional copper-containing enzyme lacking zinc in the active site.', The Journal of biological chemistry. American Society for Biochemistry and Molecular Biology, 279(32), pp. 33447-55. doi: 10.1074/jbc.M404699200.

193. Sturgill-Koszycki, S. et al. (1994) 'Lack of acidification in Mycobacterium phagosomes produced by exclusion of the vesicular proton-ATPase.', Science (New York, N.Y.), 263(5147), pp. 678-81. Available at: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/8303277 (Accessed: 14 July 2017).

194. Suga, M. et al. (1996) 'Effect of antibacterial antibody on bactericidal activities of superoxide and lysosomal enzyme from alveolar macrophages in rabbits.', Respirology (Carlton, Vic.), 1(2), pp. 127-32. Available at: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/9434328 (Accessed: 30 August 2017).

195. Sutherland, J. S. et al. (2014) 'Differential gene expression of activating Fcy receptor classifies active tuberculosis regardless of human immunodeficiency virus status or ethnicity', Clinical Microbiology and Infection, 20(4), pp. 0230-0238. doi: 10.1111/1469-0691.12383.

196. Teitelbaum, R. et al. (1998) 'A mAb recognizing a surface antigen of Mycobacterium tuberculosis enhances host survival.', Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 95(26), pp. 15688-15693. doi: 10.1073/pnas.95.26.15688.

197. Tjârnlund, A. et al. (2006) 'Polymeric IgR knockout mice are more susceptible to mycobacterial infections in the respiratory tract than wild-type mice.',

International immunology, 18(5), pp. 807-16. doi: 10.1093/intimm/dxl017.

198. Torrado, E. et al. (2013) 'Differential and site specific impact of B cells in the protective immune response to Mycobacterium tuberculosis in the mouse.', PloS one, 8(4), p. e61681. doi: 10.1371/journal.pone.0061681.

199. Tsai, M. C. et al. (2006) 'Characterization of the tuberculous granuloma in murine and human lungs: cellular composition and relative tissue oxygen tension.', Cellular microbiology, 8(2), pp. 218-32. doi: 10.1111/j.1462-5822.2005.00612.x.

200. Tumang, J. R. et al. (2004) 'Peritoneal and splenic B-1 cells are separable by phenotypic, functional, and transcriptomic characteristics.', European journal of immunology, 34(8), pp. 2158-67. doi: 10.1002/eji.200424819.

201. Tumang, J. R. et al. (2005) 'Spontaneously Ig-secreting B-1 cells violate the accepted paradigm for expression of differentiation-associated transcription factors.', Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950), 174(6), pp. 3173-7. Available at: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/15749846 (Accessed: 20 January 2017).

202. Tumanov, A. V et al. (2010) 'Cellular source and molecular form of TNF specify its distinct functions in organization of secondary lymphoid organs.', Blood. American Society of Hematology, 116(18), pp. 3456-64. doi: 10.1182/blood-2009-10-249177.

203. Turner, J. et al. (2001) 'The progression of chronic tuberculosis in the mouse does not require the participation of B lymphocytes or interleukin-4', Experimental Gerontology, 36(3), pp. 537-545. doi: 10.1016/S0531-5565(00)00257-6.

204. Ulrichs, T. et al. (2004) 'Human tuberculous granulomas induce peripheral lymphoid follicle-like structures to orchestrate local host defence in the lung.', The Journal of pathology, 204(2), pp. 217-28. doi: 10.1002/path.1628.

205. de Valliere, S. et al. (2005) 'Enhancement of Innate and Cell-Mediated Immunity by Antimycobacterial Antibodies', Infection and Immunity, 73(10), pp. 67116720. doi: 10.1128/IAI.73.10.6711-6720.2005.

206. Vergne, I., Chua, J. and Deretic, V. (2003) 'Tuberculosis toxin blocking phagosome maturation inhibits a novel Ca2+/calmodulin-PI3K hVPS34 cascade.', The

Journal of experimental medicine. The Rockefeller University Press, 198(4), pp. 6539. doi: 10.1084/jem.20030527.

207. Vinuesa, C. G. et al. (2005) 'Follicular B helper T cells in antibody responses and autoimmunity.', Nature reviews. Immunology, 5(11), pp. 853-65. doi: 10.1038/nri1714.

208. Vyas, S. P. and Goswami, R. (2017) 'Striking the right immunological balance prevents progression of tuberculosis.', Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.], 66(12), pp. 1031-1056. doi: 10.1007/s00011-017-1081-z.

209. Wahid, R. et al. (2012) 'Live oral typhoid vaccine Ty21a induces cross-reactive humoral immune responses against Salmonella enterica serovar Paratyphi A and S. Paratyphi B in humans.', Clinical and vaccine immunology : CVI, 19(6), pp. 82534. doi: 10.1128/CVI.00058-12.

210. Wahid, R. et al. (2014) 'Live oral Salmonella enterica serovar Typhi vaccines Ty21a and CVD 909 induce opsonophagocytic functional antibodies in humans that cross-react with S. Paratyphi A and S. Paratyphi B.', Clinical and vaccine immunology: CVI, 21(3), pp. 427-34. doi: 10.1128/CVI.00786-13.

211. Wardemann, H. et al. (2002) 'B-1a B cells that link the innate and adaptive immune responses are lacking in the absence of the spleen.', The Journal of experimental medicine, 195(6), pp. 771-80. Available at: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/11901202 (Accessed: 21 December 2016).

212. Weber, S. S. et al. (2012) 'Identification of protective B cell antigens of Legionella pneumophila.', Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950), 189(2), pp. 841-9. doi: 10.4049/jimmunol.1200794.

213. van der Wel, N. et al. (2007) 'M. tuberculosis and M. leprae Translocate from the Phagolysosome to the Cytosol in Myeloid Cells', Cell, 129(7), pp. 1287-1298. doi: 10.1016/j.cell.2007.05.059.

214. Williams, A. et al. (2004) 'Passive protection with immunoglobulin A antibodies against tuberculous early infection of the lungs', Immunology, 111(3), pp.

328-333. doi: 10.1111/j.1365-2567.2004.01809.x.

215. Winter, A. J. et al. (1989) 'Capacity of passively administered antibody to prevent establishment of Brucella abortus infection in mice.', Infection and immunity, 57(11), pp. 3438-44. Available at: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/2509362 (Accessed: 14 August 2017).

216. Wolf, A. J. et al. (2008) 'Initiation of the adaptive immune response to Mycobacterium tuberculosis depends on antigen production in the local lymph node, not the lungs.', The Journal of experimental medicine, 205(1), pp. 105-15. doi: 10.1084/jem.20071367.

217. Won, W.-J. and Kearney, J. F. (2002) 'CD9 is a unique marker for marginal zone B cells, B1 cells, and plasma cells in mice.', Journal of immunology (Baltimore, Md.: 1950), 168(11), pp. 5605-11. Available at: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/12023357 (Accessed: 16 January 2017).

218. Wong, D. et al. (2011) 'Mycobacterium tuberculosis protein tyrosine phosphatase (PtpA) excludes host vacuolar-H+-ATPase to inhibit phagosome acidification.', Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. National Academy of Sciences, 108(48), pp. 19371-6. doi: 10.1073/pnas.1109201108.

219. Wong, S.-C. et al. (2010) 'Macrophage polarization to a unique phenotype driven by B cells.', European journal of immunology, 40(8), pp. 2296-307. doi: 10.1002/eji.200940288.

220. World Health Organisation (2016) 'WHO Global Tuberculosis Raport'.

221. Yao, S. et al. (2014) 'CD4+ T cells contain early extrapulmonary tuberculosis (TB) dissemination and rapid TB progression and sustain multieffector functions of CD8+ T and CD3- lymphocytes: mechanisms of CD4+ T cell immunity.', Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950). NIH Public Access, 192(5), pp. 212032. doi: 10.4049/jimmunol. 1301373.

222. Zganiacz, A. et al. (2004) 'TNF-alpha is a critical negative regulator of type 1 immune activation during intracellular bacterial infection.', The Journal of clinical

investigation. American Society for Clinical Investigation, 113(3), pp. 401-13. doi: 10.1172/JCI18991.

223. Zhang, M. et al. (2011) 'B cell infiltration is associated with the increased IL-17 and IL-22 expression in the lungs of patients with tuberculosis.', Cellular immunology. Elsevier Inc., 270(2), pp. 217-23. doi: 10.1016/j.cellimm.2011.05.009.

224. Zimmermann, N. et al. (2016) 'Human isotype-dependent inhibitory antibody responses against Mycobacterium tuberculosis', EMBO molecular medicine. Wiley-Blackwell, 8(11), pp. 1325-1339. doi: 10.15252/emmm.201606330.