Исследование прионных свойств белка PrP в дрожжах Saccharomyces cerevisiae тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.00.15, кандидат биологических наук Рубель, Александр Анатольевич
- Специальность ВАК РФ03.00.15
- Количество страниц 167
Оглавление диссертации кандидат биологических наук Рубель, Александр Анатольевич
Список сокращений.
Введение.
1. Обзор литературы.
1.1. Прионы млекопитающих.
1.1.1. История открытия прионов и прионная концепция.
1.1.2. Экспериментальные данные, подтверждающие прионную концепцию.
1.1.3. Механизм прионизации.
1.1.4. Структурные особенности и функции белка РгР.
1.1.5. Формы прионных заболеваний.
1.1.6. Штаммы PrPSc.
1.1.7. Механизмы транспорта PrPSc.
1.1.8. Механизм, лежащий в основе нейродегенерации.
1.1.9. Детекция прионных заболеваний на ранних стадиях.
1.1.10. Подходы к терапии и потенциальные лекарства от прионных болезней.
1.2. Прионоподобные факторы низших эукариот.
1.2.1. Белок Ure2 - Фактор [ URE3].
1.2.2. Белок Sup35 - фактор
1.2.3. Структурные особенности прион-формирующих доменов дрожжевых прионов.
1.2.4. Фактор [PZ/V4"] и взаимодействие прионов.
1.2.5. Варианты дрожжевых прионов.
1.2.6. Влияние шаперонов и других белков на дрожжевые прионы.
1.3. Дрожжи как модель для исследования амилоидозов млекопитающих.
2. Материалы и методы.
2.1. Штаммы и плазмиды, использованные в работе.
2.1.1. Штаммы дрожжей Saccharomyces cerevisiae и бактерии Escherichia coli.
2.1.2. Плазмиды.
2.2. Среды и условия культивирования.
2.3. Генетические методы.
2.4. Молекулярно-биологические методы.
2.5. Выделение белка из дрожжей.
2.6. Дифференциальное центрифугирование.
2.7. Анализ устойчивости белков к действию протеиназы-К.
2.8. Белковый электрофорез и «Вестерн-блот» гибридизация.
2.9. Флуоресцентная микроскопия.
2.9.1. Метод флуоресцентного анализа агрегатов PrP-GFP.
2.9.2. Окраска компартментов дрожжевой клетки флуоресцентными красителями.
2.9.3. Восстановление флуоресценции после фотовыжигания (FRAP).
2.10. Анализ токсичности агрегатов PrP-GFP.
2.11. Статистическая обработка результатов.
3. Результаты.
3.1. Анализ агрегации белков РгР и PrP-GFP в дрожжах.
3.1.1. Биохимический анализ агрегатов белков РгР(23-231) и PrP-GFP.
3.1.2. Цитологическая характеристика агрегатов белка PrP-GFP.
3.1.3. Расчет доли мобильной фракции (Mf) для агрегатов PrP-GFP.
3.1.4. Анализ токсичности агрегатов белка PrP-GFP.
3.2.1. Конструирование дрожжевого штамма, продуцирующего химерный белок PrP-Sup35MC, на фоне делеции хромосомной копии гена SUP35.
3.2.2. Анализ эффектов продукции химерного белка PrP-Sup35MC в дрожжах S.cerevisiae.
3.2.3 Биохимический анализ белка PrP-Sup35MC из штаммов [РгР5"1"] и prps'].
3.2.4. Влияние сверхпродукции белков РгР и PrP-GFP на агрегацию РгР-Sup35MC.
3.2.5. Характер наследования фактора [РгР54] в мейозе и возможность его передачи путём цитодукции.
3.3. Эффекты дрожжевого шаперона Hspl04 на РгР-опосредованную агрегацию в дрожжах.
3.3.1. Влияние сверхпродукции и инактивации дрожжевого шаперона Hspl04 на фактор [РгР*+].
3.3.2. Эффекты шаперона Hspl04 на агрегацию белков РгР и PrP-GFP в дрожжах.
4. Обсуждение.
4.1. Характеристика агрегатов белков РгР и PrP-GFP.
4.2. Биохимический и фенотипический анализ агрегации и характер наследования PrP-Sup35MC в дрожжах S. cerevisiae.
4.3. Новая функция шаперона Hsp 104.
Рекомендованный список диссертаций по специальности «Генетика», 03.00.15 шифр ВАК
Прионные и неприонные амилоиды дрожжей Saccharomyces cerevisiae0 год, кандидат биологических наук Вишневская, Александра Борисовна
Исследование полимеризации прионных белков дрожжей in vivo методом полуденатурирующего электрофореза2006 год, кандидат биологических наук Александров, Илья Михайлович
Характеристика нового нехромосомного детерминанта [NSI+]дрожжей Saccharomyces cerevisiae2013 год, кандидат наук Нижников, Антон Александрович
Идентификация и анализ взаимодействия прионов и амилоидов в протеоме дрожжей Saccharomyces cerevisiae2016 год, доктор наук Галкин Алексей Петрович
Взаимодействие между N- и C-доменами белка Sup35 в процессе прионизации в дрожжах Saccharomyces cerevisiae2010 год, кандидат биологических наук Сопова, Юлия Викторовна
Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Исследование прионных свойств белка PrP в дрожжах Saccharomyces cerevisiae»
Актуальность проблемы. Целая группа неизлечимых смертельных заболеваний млекопитающих связана с накоплением в тканях головного мозга высокомолекулярных агрегатов белка, получившего название РгР (от Prion Protein). К этой группе относятся: губчатая энцефалопатия крупного рогатого скота или «Коровье бешенство», «скрэпи» овец, «изнуряющая болезнь» лосей и оленей, а также, такие болезни человека как «Куру», болезнь Крейцфельдта-Якоба, фатальная семейная бессонница, болезнь Герстманна-Штрауслера-Шейнкера и другие заболевания. Прионные заболевания могут возникать спонтанно, для некоторых форм выявляется наследственная предрасположенность, кроме того, выделяют инфекционные формы заболеваний (по: Prusiner, 1995).
Согласно гипотезе выдвинутой Стенли Прусинером, причиной прионных заболеваний является превращение мономерной протеазочуствительной конформации белка РгРс (от cellular) в олигомерную PrPSc (от scrapie) изоформу, устойчивую к воздействию температуры, химических агентов и протеолитических ферментов. Такая аномальная конформация белка является своеобразной матрицей для вновь синтезируемых молекул и может наследоваться (по: Prusiner, 1998). Несмотря на то, что гипотеза Прусинера получила экспериментальные подтверждения и является общепризнанной, факторы, контролирующие прионизацию РгР или блокирующие болезнетворные агрегаты, до сих пор не охарактеризованы. В настоящий момент исследования проводятся в основном на лабораторных животных, с использованием клеточных культур или в системе in vitro. Недостатком вышеперечисленных подходов, проводимых в системе in vivo, является значительная длительность, высокая стоимость проводимых экспериментов, и, главное, невозможность проводить масштабный поиск факторов, контролирующих процесс прионизации и амилоидогенеза. В свою очередь, данные, полученные в системе in vitro, не всегда отражают процессы, реально происходящие в живой клетке.
В 1999 году в работе Ма и Линдквист, было показано, что продукция мышиного РгР в цитоплазме дрожжей приводит к образованию агрегатов, сходных по биохимическим характеристикам с агрегатами РгР, выявляемыми в мозге больных млекопитающих (Ma and Lindquist, 1999). Дрожжи, как один из самых простых и наиболее изученных генетических объектов, предоставляют уникальные преимущества для поиска факторов, регулирующих прионнную конверсию РгР. К сожалению, сама по себе агрегация РгР в дрожжах не имеет видимого фенотипического проявления, что существенно затрудняет исследования. Остаётся открытым вопрос, проявляют ли полимеры РгР прионные свойства в гетерологичной системе, то есть, способны ли они передавать свою конформацию в ряду клеточных поколений, или образуются в клетке de novo.
Цель и задачи исследования. Целью данной работы является анализ агрегации и оценка прионных свойств белка РгР млекопитающих в дрожжевой системе.
В соответствии с целью были поставлены следующие задачи:
1. проанализировать биохимические и физические характеристики агрегатов, формируемых белками РгР и PrP-GFP в дрожжах Saccharomyces cerevisiae;
2. провести цитологический анализ агрегатов PrP-GFP в дрожжевой клетке;
3. оценить «токсичность» PrP-содержащих агрегатов для дрожжевых клеток;
4. разработать систему для фенотипического анализа агрегации РгР в дрожжах и исследовать возможность прионной конверсии этого белка в гетерологичной системе;
5. оценить эффекты дрожжевого шаперона Hspl04 на агрегацию белка РгР и PrP-содержащих гибридных белков в дрожжевой клетке.
Научная новизна работы. Показано, что при продукции белков РгР и PrP-GFP в дрожжах S. cerevisiae образуются высокомолекулярные белковые агрегаты, сходные по биохимическим характеристикам с агрегатами белка PrPSc в мозге больных млекопитающих (устойчивость к действию высоких концентраций протеиназы-К и детергентам (SDS и саркозилат натрия)). Показано, что агрегаты PrP-GFP различаются по размеру и морфологии. Установлено, что в клетках дрожжей могут формироваться агрегаты, различающиеся по морфологии и динамике восстановления. Агрегаты PrP-GFP имеют цитоплазматическую локализацию и не колокализуются с клеточными компартментами: ядром, митохондриями, вакуолью, эндосомами. Показано, что агрегаты PrP-GFP, как и агрегаты РгР, не токсичны для дрожжевых клеток. Впервые показано, что РгР сохраняет прионные свойства в гетерологичной системе. На основании этого можно заключить, что: либр факторы, с контролирующие прионную конверсию РгР, представлены у эволюционно удалённых эукариотических организмов, либо стабильное воспроизведение прионной изоформы не требует наличия дополнительных факторов. Показано, что Hspl04 не расщепляет агрегаты РгР, PrP-GFP и PrP-Sup35MC на
V. олигомерные зёрна. Вместе с тем, выявлена новая функция дрожжевого шаперона Hspl04 — участие в регуляции экспрессии генов на посттранскрипционном уровне.
Практическая значимость. Использование химерного белка PrP-GFP даёт возможность оценивать с помощью флуоресцентной микроскопии эффект действия отдельных агентов, способствующих или препятствующих агрегации белка РгР. Получена система, позволяющая на фенотипическом уровне (рост -отсутствие роста дрожжей на селективной среде без аденина) наблюдать конформационные переключения последовательности РгР. Данная тест-система может быть использована для масштабного поиска факторов, взаимодействующих с белком РгР или регулирующих его конформационные переключения в системе in vivo. Выявлена новая функция дрожжевого шаперона Hspl04. Результаты, представленные в диссертационной работе, могут быть использованы при чтении курсов лекций: «Молекулярная биология», «Молекулярная генетика», «Белки теплового шока», «Прионы», «Механизмы модификаций», входящих в учебный план кафедры генетики и селекции СПбГУ.
Апробация работы. Результаты работы были представлены на международных конференциях по прионной биологии (Хингстон, Великобритания, 2005; Турин, Италия, 2006; Эдинбург, Великобритания, 2007); Международных конференциях по генетике и молекулярной биологии дрожжей (Гётеборг, Швеция, 2003; Мельбурн, Австралия, 2007); 3-ем съезде Вавиловского общества генетиков и селекционеров «Генетика в XXI веке: современное состояние и перспективы развития», (Москва, 2004); 2-ой конференции Московского общества генетиков и селекционеров «Актуальные проблемы генетики» (Москва, 2003).
Диссертация апробирована на научных семинарах лаборатории генетики животных и лаборатории физиологической генетики кафедры генетики и селекции СПбГУ.
Публикации. По материалам диссертации опубликовано 8 работ.
Объем и структура диссертации. Диссертационная работа состоит из «Введения», «Списка сокращений», «Обзора литературы», «Материалов и методов», «Результатов» «Обсуждения», «Заключения», «Выводов», «Списка литературы», состоящего из 269 источников. Работа изложена на 167 страницах машинописного текста и содержит 39 рисунков и 13 таблиц.
Похожие диссертационные работы по специальности «Генетика», 03.00.15 шифр ВАК
Роль взаимодействий между амилоидогенными белками в возникновении и токсичности амилоидов гентингтина человека у дрожжей Saccharomyces cerevisiae2018 год, кандидат наук Серпионов, Генрих Владимирович
Прионный детерминант [PSI+] дрожжей Saccharomyces cerevisiae: структурная организация и механизмы поддержания2004 год, кандидат физико-математических наук Крындушкин, Дмитрий Сергеевич
Поиск структурного гена нехромосомного детерминанта [ISP+] с помощью скрининга инсерционного банка генов у дрожжей Saccharomyces cerevisiae2010 год, кандидат биологических наук Рогоза, Татьяна Михайловна
Исследование динамики полимеризации прионных белков дрожжей in vivo методом полуденатурирующего электрофореза2006 год, кандидат биологических наук Александров, Илья Михайлович
Роль аминокислотных повторов прионного домена белка Sup35 в вариабельности цитоплазматического детерминанта (PSI+) дрожжей Saccharomyces cerevisiae2006 год, кандидат биологических наук Шкундина, Ирина Семеновна
Заключение диссертации по теме «Генетика», Рубель, Александр Анатольевич
выводы
1. Белки РгР и PrP-GFP формируют в дрожжах амилоидоподобные агрегаты, сходные по биохимическим характеристикам с агрегатами PrPSc в мозге больных млекопитающих.
2. Белок PrP-GFP формирует в дрожжах несколько типов агрегатов, которые различаются по физическим и морфологическим свойствам, имеют цитоплазматическую локализацию, и не ко-локализуются с эндосомами, вакуолями, митохондриями и ядром.
3. Агрегаты РгР и PrP-GFP не токсичны для дрожжевых клеток.
4. Разработана система для фенотипического анализа РгР-опосредованной агрегации химерного белка PrP-Sup35MC, который выполняет функции фактора терминации трансляции eRF3.
5. Химерный белок PrP-Sup35MC может быть представлен в дрожжах в двух альтернативных изоформах - [РгР^] и \prps~~[, которые стабильно наследуются в ряду клеточных поколений. Белок PrP-Sup35MC в изоформе соответствует всем основным характеристикам дрожжевого приона и имеет повышенную устойчивость к воздействию протеиназы-К.
6. Дрожжевой шаперон Hspl04 не расщепляет агрегаты PrP, PrP-GFP и РгР-Sup35MC на олигомерные зёрна и не контролирует передачу прионного фактора [РгР5"1"] в ряду клеточных поколений.
7. Выявлена новая функция шаперона Hspl04 - регуляция экспрессии генов на посттранскрипционном уровне.
БЛАГОДАРНОСТИ
В заключение хотел бы выразить искреннюю признательность научным руководителям Сергею Георгиевичу Инге-Вечтомову и Алексею Петровичу Галкину за неоценимую помощь в выполнении работы на всех этапах, всем сотрудникам, студентам и аспирантам лаборатории генетики животных и кафедры генетики и селекции, в целом, за создание дружественной атмосферы и помощь в работе, особенно, Алсу Сайфитдинову, Викторию Наволоцкую, Сергея Задорского, Юлию Сопову, Елену Андрееву, Артёма Ладу, Вениамина Старцева, Ирину Петрову, Антона Нижникова, а также, сотрудника Технического Университета (Атланта, США) - Юрия Олеговича Чернова за плодотворное сотрудничество.
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
В нашей работе мы показали, что агрегаты РгР, а также химерных белков, содержащих последовательность РгР, обладают типичными свойствами амилоидных полимеров. Более того, гибридный белок PrP-GFP формирует в дрожжевых клетках несколько типов агрегатов, различающихся по морфологическим и физическим свойствам. Для анализа наследования различных типов PrP-содержащих агрегатов нами была разработана система, позволяющая выявлять конформационные изменения РгР на фенотипическом уровне. Мы показали, что химерный белок, содержащий последовательность РгР, а также, репортерную дрожжевую последовательность Sup35MC, может быть представлен в дрожжах в двух альтернативных изоформах [PrPs+] и \prps~\, которые стабильно наследуются в ряду клеточных поколений. Белок РгР-Sup35MC в изоформе [PrPS+] соответствует всем основных характеристикам дрожжевого приона. Показано, что шаперон Hspl04, который контролирует олигомеризацию всех известных дрожжевых прионов, не расщепляет РгР-содержащие амилоидные агрегаты на олигомерные зёрна. Вместе с тем, выявлена новая функция Hspl04 - участие в регуляции экспрессии генов на посттранскрипционном уровне.
Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Рубель, Александр Анатольевич, 2008 год
1. Галкин А.П., Миронова Л.Н., Журавлева Г.А., Инге-Вечтомов С.Г. Прионы дрожжей, амилоидозы млекопитающих и проблема протеомных сетей. // Генетика. 2006. - Т. 42. № 11. - С. 1-13.
2. Завалишин И.А., Шитикова И.Е., Жученко Т.Д. Прионы и прионные болезни // Клин, микробиол. и антимикроб, химиотерап. 2000. — Т. 2. - №2. - С. 12— 19.
3. Захаров И.А., Кожин С.А., Кожина Т.Н., Фёдорова И.В. Сборник методик по генетике дрожжей-сахаромицетов. Л.: Наука. 1984. - 143 с.
4. Зуев В.А. Прионы новый класс возбудителей инфекционных заболеваний // Антибиотики и химиотерапия. - 1999. - №10. - С. 33-38.
5. Инге-Вечтомов С.Г. Идентификация некоторых групп сцепления у Петергофских генетических линий дрожжей // Генетика. 1971. - Т. 7. - С. 113-124.
6. Инге-Вечтомов С.Г. Цитогены и прионы: цитоплазматическая наследственность без ДНК? // Соросовский образов, журнал. 1996. - №5. -С. 11-18.
7. Инге-Вечтомов С.Г., Андрианова В.М // Рецессивные суперсупрессоры у дрожжей // Генетика. — 1970. Т. 6. — С. 103-116.
8. Маниатис Т., Фрич Э., Сэмбрук Д. Молекулярное клонирование: Перевод с англ. М: Мир. 1984. - 479 с.
9. Плохинский Н.А. Алгоритмы биометрии. М.: изд-во МГУ. — 1967. 26 с.
10. Ю.Рубель А.А., Сайфитдинова А.Ф., Лада А.Г., Нижников А.А., Инге-Вечтомов
11. С.Г., Галкин А.П. Дрожжевой шаперон Hspl04 регулирует экспрессию генов на посттранскрипционном уровне // Мол. биол. 2008. - Т. 42. - №1. — С. 123-130.
12. Телков М.В., Сургучев А.П. Характеристика транскриптов генов supl и sup2 у дрожжей сакхаромицетов // Докл. Акад. Наук СССР. 1986. — Т. 290. -№4.
13. Терентьев П. В., Ростова Н.С. Практикум по биометрии. JL: изд-во ЛГУ. — 1977.-152 с.
14. Шкундина И.С., Тер-Аванесян М.Д. Прионы // Успехи биол. химии. 2006. -Т. 46.-С. 3-42.
15. Штейн Г.И. Лазерная сканирующая конфокальная микроскопия: методическое пособие микроскопия СПб: ИНЦ РАН. - 2004. - 32 с.
16. Abid К., Soto С. The intriguing prion disorders // Cell. Mol. Life Sci. 2006. -Vol. 63.-P. 2342-2351.
17. Aguzzi A., Heppner F.L. Pathogenesis of prion diseases: a progress report // Cell Death Differ. 2000. - Vol. 7. - №10. - P. 889-902.
18. Aguzzi A., Polymenidou M. Mammalian prion biology: one century of evolving concepts // Cell. 2004. - Vol. 116. - №2. - P. 313-327.
19. Aguzzi A., Sigurdson C., Heikenwalder M. Molecular mechanisms of prion pathogenesis // Annu. Rev. Pathol. Mech. Dis. 2008. - Vol. 3. - P. 11-40.
20. Alper Т., Cramp W.A., Haig D.A., Clarke MC. Does the agent of scrapie replicate without nucleic acid? // Nature. 1967. - Vol. 214. - P. 764-766.
21. Apetri A.C., Maki К., Roder H., Surewicz W.K. Early Intermediate in Human Prion Protein Folding As Evidenced by Ultrarapid Mixing Experiments // J. Am. Chem. Soc.-2006.-Vol. 128.-P. 11673-11678.
22. Apetri A.C., Surewicz W.K. Kinetic intermediate in the folding of human prion protein // J. Biol. Chem. 2002. - Vol. 277. - P. 44589-44592.
23. Apodaca J., Kim I., Rao H. Cellular tolerance of prion protein PrP in yeast involves proteolysis and the unfolded protein response // Biochem Biophys Res Commun. -2006. Vol. 347. - №1. - P. 319-326.
24. Bagriantsev S., Liebman S.W. Specificity of prion assembly in vivo. PST^. and [PIPt] form separate structures in yeast // J Biol Chem. 2004. - Vol. 279. -№49.-P. 51042-51048.
25. Bagriantsev S.N., Kushnirov V.V., Liebman S.W. Analysis of amyloid aggregates using agarose gel electrophoresis // Methods Enzymol. — 2006. Vol. 412. - P. 33-48.
26. Bainbridge J., Walker K.B. The normal cellular form of prion protein modulates T cell responses // Immunol. Lett. 2005. - Vol. 96. - №1. - P. 147-150.
27. Bartz J.C., Dejoia C., Tucker Т., Kincaid A.E., Bessen R.A. Extraneural prion neuroinvasion without lymphoreticular system infection // J. Virol. 2005. - Vol. 79. — P. 11858-11863.
28. Bartz J.C., Kramer M.L., Sheehan M.H., Hutter J.A., Ayers J.I., Bessen R.A., Kincaid A.E. Prion interference is due to a reduction in strain-specific PrPSc levels. J. Virol. 2007. - Vol. 81. - P. 689-697.
29. Baskakov I.V. The reconstitution of mammalian prion infectivity de novo I IFEBS J. 2007. - Vol. 274. - P. 576-587.
30. Bate C., Salmona M., Diomede L., Williams A. Squalestatin cures prion-infected neurons and protects against prion neurotoxicity // J. Biol. Chem. 2004. - Vol. 279.-№15.-P. 14983-14990.
31. Bessen RA, Marsh RF. Distinct PrP properties suggest the molecular basis of strain variation in transmissible mink encephalopathy // J Virol. 1994. - Vol. 68. -№12.-P. 7859-7868.
32. Blattler Т., Brandner В., Raeber A.J. Klein M.A., Voigtlander Т., Weissmann C., Aguzzi A. PrP-expressing tissue required for transfer of scrapie infectivity from spleen to brain // Nature. 1997. - V. 389. - P. 69-73.
33. Bolton D.C., Bendheim P.E., Marmorstein A.D., Potempska A. Isolation and structural studies of the intact scrapie agent protein // Arch Biochem Biophys. — 1987 Vol. 258. - №2. - P. 579-590.
34. Bonneaud N., Ozier-Kalogeropoulos O., Li G.Y., Labouesse M., Minvielle-Sebastia L., Lacroute F. A family of low and high copy replicative, integrative and single-stranded S. cerevisiae/E. coli shuttle vectors // Yeast. 1991. - Vol. 7. - P. 609-615.
35. Bons N., Mestre-Frances N., Belli P., Cathala F., Gajdusek D.C., Brown P. Natural and experimental oral infection of nonhuman primates by bovine spongiform encephalopathy agents // Proc Natl Acad Sci USA. 1999. - Vol. 96. -P. 4046-4051.
36. Borchsenius A.S., Wegrzyn R.D., Newnam G.P., Inge-Vechtomov S.G., Chernoff Y.O. Yeast prion protein derivative defective in aggregate shearing and production of new "seeds" // EMBO J. 2001. - Vol. 20. - №2. - P. 6683-6691.
37. Bosl В., Grimminger V., Walter S. The molecular chaperone Hspl04 a molecular machine for protein disaggregation // J Struct Biol. - 2006. - Vol. 156. -№1. - P. 139-148.
38. Brachmann A., Baxa U., Wickner R.B. Prion generation in vitro: amyloid of Ure2p is infectious // EMBO J. 2005. - Vol. 24. - №17. - p. 3082-3092.
39. Bradford M.M. A rapid and sensitive method for the quantitation of microgram quantities of protein utilizing the principle of protein-dye binding // Anal. Biochem. 1976. - Vol. 72. - P. 248-254.
40. Bradley M.E., Edskes H.K., Hong J.Y., Wickner R.B., Liebman S.W. Interactions among prions and prion "strains" in yeast // Proc Natl Acad Sci USA. 2002. -Vol. 99.-P. 16392-16399.
41. Bradley M.E., Liebman S.W. Destabilizing interactions among PSf. and [P/TV*] yeast prion variants //Genetics. 2003. - Vol. 165. - №4. - P. 1675-1685.
42. Brown D.R, Qin K, Herms J.W., Madlung A., Manson J., Strome R., Fraser P.E., Kruck Т., von Bohlen A., Schulz-Schaeffer W., Giese A., Westaway D., Kretzschmar H. The cellular prion protein binds copper in vivo // Nature. 1997. -Vol. 390.-P. 684—687.
43. Brown D.R., Hafiz F., Glasssmith L.L., Wong B-S., Jones I.M., Clive C., Haswell S.J. Consequences of manganese replacement of copper for prion protein function and proteinase resistance // EMBO. 2000. - Vol. 19. - P. 1180-1186.
44. Brown D.R., Nicholas R.S., Canevari L. Lack of prion protein expression results in a neuronal phenotype sensitive to stress // J. Neurosci. Res. — 2002. Vol. 67. — P. 211-224.
45. Brown J.C., Lindquist S.L. GAR+.: a novel type of prion involved in glucose signaling and environmental sensing // Yeast genetics and molecular biology meeting University of Toronto, Ontario, Canada. 2008. — P. 73.
46. Buchholz C.J., Bach P., Nikles D., Kalinke U. Prion protein-specific antibodies for therapeutic intervention of transmissible spongiform encephalopathies // Expert Opin Biol Ther. 2006. - Vol. 6. - №3. - P. 293-300.
47. Bueler H., Fischer M., Lang Y., Bluethmann H., Lipp H.P., DeArmond S.J., Prusiner S.B., Aguet M., Weissmann C. Normal development and behavior of mice lacking the neuronal cell-surface PrP protein // Nature. 1992. — Vol. 356. — P. 577-582.
48. Caramelli M., Ru G., Acutis P., Forloni G. Prion diseases: current understanding of epidemiology and pathogenesis, and therapeutic advances // CNS Drugs. — 2006. Vol. 20. - № 1. - P. 15-28.
49. Castilla J., Saa P., Hetz C., Soto C. In vitro generation of infectious scrapie prions //Cell. 2005. - Vol. 121.-№2. -P. 195-206.
50. Caughey B, Raymond GJ, Bessen RA. Strain-dependent differences in beta-sheet conformations of abnormal prion protein // J Biol Chem. 1998. -V. 273. - №48. -P. 32230-32235.
51. Caughey В., Baron G.S. Prions and their partners in crime // Nature. 2006. - Vol. 443.-№19.-P. 803-810.
52. Caughey В., Caughey W.S., Kocisko D.A. Lee K.S., Silveira J.R., Morrey J.D. Prions and Transmissible Spongiform Encephalopathy (TSE) Chemotherapeutics: A Common Mechanism for Anti-TSE Compounds? // Acc. Chem. Res. 2006. -Vol. 39.-P. 646-653.
53. Caughey B.W., Dong A., Bhat K.S. Ernst D., Hayes S.F., Caughey W.S. Secondary structure analysis of the scrapie-associated protein PrP 27-30 in water by in-frared spectroscopy // Biochemistry. 1991. - Vol. 30. - P. 7672-7680.
54. Chernoff Y.O. Amyloidogenic domains, prions and structural inheritance: rudiments of early life or recent acquisition? Curr Opin Chem Biol. 2004. - Vol. 8.-P. 665-671.
55. Chernoff Y.O. Mutation processes at the protein level: Is Lamarck back? // Mutat Res. 2001. - Vol. 488. - P. 39-64.
56. Chernoff Y.O., Galkin A.P., Lewitin E., Chernova T.A., Newnam G.P., Belenkiy S.M. Evolutionary conservation of prion-forming abilities of the yeast Sup35 protein // Mol Microbiol. 2000. - Vol. 35. - №4. - P. 865-876.
57. Chernoff Y.O., Lindquist S.L., Ono В., Inge-Vechtomov S.G., and Liebman S. W. Role of the chaperone protein Hsp 104 in propagation of the yeast prion-like factor PST. // Science. 1995. - Vol. 268. - P. 880-884.
58. Chernoff Y.O., Newnam G.P., Kumar J., Allen K., Zink A.D. Evidence for a protein mutator in yeast: role of the Hsp70-related chaperone ssb in formation, stability, and toxicity of the PS7. prion // Mol.Cell Biol. 1999. - Vol. 19. - P. 8103-8112.
59. Choi C. J., Kanthasamy A., Anantharam V., Kanthasamy A.G. Interaction of metals with prion protein: Possible role of divalent cations in the pathogenesis of prion diseases // NeuroToxicology. 2006. - Vol. 27. - P. 777-787.
60. Ciechanover A., Brundin P. The ubiquitin proteasome system in neurodegenerative diseases: sometimes the chicken, sometimes the egg // Neuron. 2003. - Vol. 40. - №2. - P. 427-446.
61. Cohen F.E., Pan K.M., Huang Z. Structural clues to prion replication // Science. -1994.-Vol. 264.-P. 530-531.
62. Cohen F.E., Prusiner S.B. Pathologic conformations of prion proteins // Annu. Rev. Biochem. 1998. - Vol. 67. - P. 793-819.
63. Collin P., Beauregard P.B., Elagoz A., Rokeach L.A.A non-chromosomal factor allows viability of Schizosaccharomyces pombe lacking the essential chaperone calnexin // J Cell Sci. 2004. - Vol. 117. - P. 907-918
64. Conde J., Fink G.R. A mutant of Saccharomyces cerevisiae defective for nuclear fusion // Proc Natl Acad Sci USA. 1976. - Vol. 73. - №10. - P. 3651-3655.
65. Coustou V., С. Deleu, S. Saupe and J. Begueret. The protein product of the het-s heterokaryon incompatibility gene of the fungus Podospora anserina behaves as a prion analog // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1997. - Vol. 94. - P. 9773-9778.
66. Cox B.S. PS7., a cytoplasmic suppressor of super-suppressor in yeast // Heredity. 1965. - Vol. 20. - P. 505-521.
67. Cuille J., Chelle P.L. Experimental transmission of trembling to the goat // C. R. Seances Acad. Sci. 1939. - Vol. 208. - P. 1058-1060.
68. Cuille J., Chelle P.L. Pathologie animale. La maladie dite tremblant du mouton estelle inoculable? // Compt. Rend. Acad. Sci. 1936. - Vol. 203. - P. 1552-1554.
69. Dandoy-Dron F., Bogdanova A., Beringue V., Bailly Y., Tovey M.G., Laude H., Dron M. Infection by ME7 prion is not modified in transgenic mice expressing the yeast chaperone Hspl04 in neurons // Neurosci Lett. 2006. - Vol. 405. - №3. -P.181-185.
70. Deleault N.R., Lucassen R.W., Supattapone S. RNA molecules stimulate prion protein conversion // Nature. 2003. - Vol. 425. - №6959. - P. 717-720.
71. DePace AH, Santoso A, Hillner P, Weissman JS. A critical role for amino-terminal glutamine/asparagine repeats in the formation and propagation of a yeast prion// Cell. 1998. - Vol. 93. -№7. - P. 1241-1252.
72. Derkatch I.L, Chernoff Y.O., Kushnirov V.V., Inge-Vechtomov S.G., Liebman S.W. Genetics and variability of PSI. prion factors in Sacchoromyces cerevisiae II Genetics. 1996. - Vol. 144. -P. 1375-1386.
73. Derkatch I.L., Bradley L., Zhou M.P., Chernoff Y.O., S.W. Liebman. Genetic and environmental factors affecting the de novo appearance of the PSI*. prion in Saccharomyces cerevisiae И Genetics. 1997. - Vol. 147. - P. 507-519.
74. Derkatch I.L., Bradley M.E., Hong J.Y., Liebman S.W. Prions affect the appearance of other prions: the story of Р/Л^. // Cell. -2001. Vol. 106. - №2. -P. 171-182.
75. Derkatch I.L., Bradley M.E., Masse S.V., Zadorsky S.P., Polozkov G.V., Inge-Vechtomov S.G., Liebman S.W. Dependence and independence of PST4". and [PIN*]: a two-prion system in yeast? // EMBO J. 2000. - Vol. 19. - №9. - P. 1942-1952.
76. Derkatch I.L., Liebman SW. Prion-Prion interactions, edited by Chernoff Y.O. // Medical Intelligence Unit/ Landes Bioscience. Protein-based inheritance. 2007. -P. 39-46.
77. Dickinson A. G., Meikle V. M. H., Fraser H. Identification of a gene which controls the incubation period of some strains of scrapie in mice // J. Сотр. Path. 1968. - Vol. 78. - P. 293-299.
78. Eaglestone S.S., Ruddock L.W., Cox B.S., Tuite M.F. Guanidine hydrochloride blocks a critical step in the propagation of the prion-Hke determinant P57 . of Saccharomyces cerevisiae // Proc Natl Acad Sci USA. 2000. - Vol. 97. - P. 240-244.
79. Fai Мок S.W., Thelen K.M., Riemer C., Baier M. Simvastatin prolongs survival times in prion infections of the central nervous system // Biochem. Biophys. Res. Commun. 2006. - Vol. 348. - №2. - P. 697-702.
80. Fernandez-Bellot E., Guillemet E., Baudin-Baillieu A., Gaumer S., Komar A.A., Cullin C. Characterization of the interaction domains of Ure2p, a prion-like protein of yeast // Biochem J. 1999. - Vol. 338. - Pt.2. - P. 403-407.
81. Fernandez-Bellot E., Guillemet E., Cullin C. The yeast prion URE3. can be greatly induced by a functional mutated URE2 allele // EMBO J. 2000. - Vol. 19.-№13.-P. 3215-3222.
82. Ferreira P.C., Ness F., Edwards S.R., Cox B.S., Tuite M.F. The elimination of the yeast PS/ . prion by guanidine hydrochloride is the result of Hspl04 inactivation // Mol.Microbiol. 2001. - Vol.40. - P. 1357-1369.
83. Frolova L., Le Goff X., Zhouravleva G., Davydova E., Philippe M., Kisselev L. Eukaiyotic polypeptide chain release factor eRF3 is an eRFl- and ribosome-dependent guanosine triphosphatase // RNA. 1996. - Vol. 2. - №4. - P. 334341.
84. Gabriel J.M., Oesch В., Kretzschmar H., Scott M.? Prusiner S.B. Molecular cloning of a candidate chicken prion protein // Proc Natl Acad Sci USA. 1992. -Vol. 89.-№19.-P. 9097-9101.
85. Gajdusek D.C. Transmissible and non-transmissible amyloidoses: autocatalytic post-translational conversion of host precursor protein to beta-pleated sheet configurations // J. Neuroimmunol. 1988. - Vol. 20. - P. 95-110.
86. Gajdusek D.C., Gibbs C.J., Alpers M. Experimental transmission of a kuru- like syndrome to cnimpanzees // Nature. 1966. - Vol. 209. - P. 794-796.
87. Gajdusek D.C., Zigas V. Degenerative disease of the central nervous system in New Guinea: The endemic occurrence of "kuru" in the native population //N Engl J Med. 1957. - Vol. 257. - P. 974-978.
88. Gallie D.R., Sleatl D.E., Watts J.W., Turner P.C., Wilsonl M.A. The 54eader sequence of tobacco mosaic virus RNA enhances the expression of foreign genetranscripts in vitro and in vivo // Nucleic Acids Research. 1987. - V. 15. - P. 3257-3273.
89. Ganusova E.E., Ozolins L.N., Bhagat S., Newnam G.P., Wegrzyn R.D., Sherman M.Y., Chernoff Y.O. Modulation of prion formation, aggregation, and toxicity by the actin cytoskeleton in yeast // Mol Cell Biol. 2006. - Vol. 26. -№2.-P. 617-629.
90. Gibbs C.J., Bolis C.L. Normal isoform of amyloid protein (PrP) in brains of spawning salmon // Mol Psychiatry. 1997. - Vol. 2. - №2. - P. 146-147.
91. Gibbs C.J., Gajdusek D.C., Asher D.M., Alpers M.P., Beck E., Daniel P.M., Matthews W.B. Creutzfeldt-Jakob disease (spongiform encephalopathy): transmission to the chimpanzee // Science. 1968. - Vol. 161. - №839. - P. 388389.
92. Glover J.R., Kowal A.S., Schirmer E.C., Patino M.M., Liu J.J., Lindquist S. Self-seeded fibers formed by Sup35, the protein determinant of PS71"., a heritable prion-like factor of Saccharomyces cerevisiae // Cell. 1997. - Vol. 89. - P. 811— 819.
93. Glover J.R., Lindquist S. Hspl04, Hsp70 and Hsp40: a novel chaperone system that rescues previously aggregated proteins // Cell. 1998. - Vol. 94. - №1. — P. 73-82.
94. Goldring E.S., Grossman L.I., Krupnick D., Cryer D.R., Marmur J. The petite mutation in yeast. Loss of mitochondrial deoxyribonucleic acid during induction of petites with ethidium bromide // J Mol Biol. 1970. - Vol. 52. - №2. - P. 323335.
95. Griffith J.S. Self-replication and scrapie // Nature. 1967. - Vol. 215. - P. 1043-1044.
96. Hadlow W. J. Scrapie and kuru // Lancet. 1959. - Vol. 2. - P. 289-290.
97. Hanahan D., Techniques for Transformation of E. coli, DNA cloning: a practical approach . Glover, D.M., ed., IRL Press Limited, Oxford, England 1985. - Vol. l.-P. 109-135.
98. Harrison P.M., Gerstein M. A method to assess compositional bias in biological sequences and its application to prion-like glutamine/asparagine-rich domains in eukaryotic proteomes // Genome Biol. 2003. - Vol. 4. - №6. - P. R40.
99. Hasek, Streiblova Yeast Protocols I.H. Evans Methods in cell and molecular biology, edited by I.H.Evans // Humana Press Inc., Totowa NJ. 1996. - P. 391— 405.
100. Heikenwalder M., Julius C., Aguzzi A. Prions and peripheral nerves: a deadly rendezvous // J Neurosci. 2007. - Vol. 85. - P. 2714-2725.
101. Hill A.F., Joiner S., Linehan J. Desbruslais M., Lantos P.L., Collinge J. Speciesbarrier-independent prion replication in apparently resistant species // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2000. - Vol. 97. - P. 10248-10253.
102. Horiuchi M., Priola S.A., Chabry J., Caughey B. Interactions between heterologous forms of prion protein: binding, inhibition of conversion, and species barriers // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2000. - Vol. 97. - P. 5836-5841.
103. Inoue H., Nojima H., Okayama H. High Efficiency transformation of Esherichia coli with plasmids. Gene. 1990. - Vol. 96. - P. 23-28.
104. Jensen R, Sprague GF Jr, Herskowitz I. Regulation of yeast mating-type interconversion: feedback control of HO gene expression by the mating-type locus // Proc Natl Acad Sci USA. 1983. - Vol. 80. - №10. - P. 3035-3039.
105. Jones G.W., Tuite M.F. Chaperoning prions: the cellular machinery for propagating an infectious protein? // Bioessays. 2005. - Vol. 27. - №8. - P. 823-832.
106. Jung G., Masison D.C. Guanidine hydrochloride inhibits Hspl04 activity in vivo: a possible explanation for its effect in curing yeast prions // Curr.Microbiol. -2001.-Vol. 43. — P. 7-10.
107. Kaiser C., Michaelis S., Mitchell A. Methods in yeast genetics. N.Y.: Cold Spring Harbor Lab. Press. 1994. - 234 p.
108. Kimberlin R.H., Hall S.M., Walker C.A. Pathogenesis of mouse scrapie. Evidence for direct neural spread of infection to the CNS after injection of sciatic nerve // J Neurol Sci. 1983. - Vol. 61. - №3. - P. 315-325.
109. King C.Y., Diaz-Avalos R. Protein-only transmission of three yeast prion strains // Nature. 2004. - Vol. 428. - №6980. - P. 319-323.
110. Kitamoto Т., Muramoto Т., Mohri S, Doh-Ura K., Tateishi J. Abnormal isoform of prion protein accumulates in follicular dendritic cells in mice with Creutzfeldt-Jakob disease // J Virol. 1991. - Vol. 65. - № 11. - P. 6292-6295.
111. Kocisko D.A., Caughey В. Mefloquine, an antimalaria drug with antiprion activity in vitro, Lacks Activity in vivo II J. Virol. 2006. - Vol. 80. - №2. - P. Ю44-1046.
112. Kocisko D.A., Come J.H., Priola S.A. Chen J., Caughey B. Cell-free formation of protease-resistant prion protein // Nature. 1994. - Vol. 370. - P. 471^474.
113. Kocisko D.A., Vaillant A., Arnold K.M. Bertholet N., Race R.E., Olsen E.A., Juteau J.M., Caughey B. Potent antiscrapie activities of degenerate phosphorothioate oligonucleotides // Antimicrob. Agents Chemother. 2006. -Vol. 50. -№3. - P. 1034-1044.
114. Korth C., May B.C., Cohen F.E., Prusiner S.B. Acridine and phenothiazine derivatives as pharmacotherapeutics for prion disease // Proc Natl Acad Sci USA. 2001. - Vol. 98. - P. 9836-9841.
115. Krobitsch S., Lindquist S. Aggregation of huntingtin in yeast varies with the length of the polyglutamine expansion and the expression of chaperone proteins // Proc Natl Acad Sci USA. 2000. - Vol. 97. - №4. - P. 1589-1594.
116. Kryndushkin D.S., Alexandrov I.M., Ter-Avanesyan M.D., Kushnirov V.V. Yeast PS74". prion aggregates are formed by small Sup35 polymers fragmented by Hspl04 // J Biol Chem. 2003. - Vol. 278. - №49. - P. 49636^19643.
117. Kunzi V., Glatzel M., Nakano M.Y., Greber U.F., Van Leuven F., Aguzzi A. Unhampered prion neuroinvasion despite impaired fast axonal transport in transgenic mice overexpressing four-repeat tau // J Neurosci. 2002. - №22. - P. 7471-7477.
118. Kushnirov V.V., Kryndushkin D.S., Boguta M., Smirnov V.N., Ter-Avanesyan M.D. Chaperones that cure yeast artificial PS7+. and their prion-specific effects // Curr Biol. 2000. - Vol. 10. - №22. - P. 1443-1446.
119. Kushnirov V.V., Ter-Avanesyan M.D. Structure and replication of yeast prions // Cell. 1998. - Vol. 94. - P. 13-16.
120. Kushnirov V.V., Ter-Avanesyan M.D., Surguchov A.P., Smirnov V.N., Inge-Vechtomov S.G. Localization of possible functional domains in sup2 gene productof the yeast Saccharomyces cerevisiae II FEBS Lett. 1987. - Vol. 215. - №2. -P. 257-260.
121. Kushnirov V.V., Ter-Avanesyan M.D., Telcov M.V., Surguchov A.P., Smirnov V.N., Inge-Vechtomov S.G. Nucleotide sequence of the SUP2 (SUP35) gene of Saccharomyces cerevisiae II Gene. 1988. — Vol. 66. — P. 45-54.
122. Lacroute F. Non-Mendelian mutation allowing ureidosuccinic acid uptake in yeast // J Bacterid.- 1971. -Vol. 106.-№2.-P. 519-522.
123. Laemmli U.K. Cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage T4 // Nature. 1970. - Vol. 227. - P. 680-685.
124. Lansbury P.T., Caughey B. The chemistry of scrapie reaction: the "ice 9" metaphor // Chem. Biol. 1995. - Vol. 2. - P. 1-5.
125. Legname G., Baskakov I.V., Nguyen H.O., Riesner D., Cohen F.E., DeArmond S J., Prusiner S.B. Synthetic mammalian prions // Science. 2004. - Vol. 305. - P. 673-676.
126. Liebman S.W., Sherman F. Extrachromosomal psi+ determinant suppresses nonsense mutations in yeast // J Bacteriol. 1979. - Vol. 139. - №3. - P. 1068- * 1071.
127. Lind K., Stahlberg A., Zoric N., Kubista M. Combining sequence-specific probes and DNA binding dyes in real-time PCR for specific nucleic acid quantification and melting curve analysis // BioTechniques. 2006. - Vol. 40. - P. 315-318.
128. Liu J.J., Lindquist S. Oligopeptide-repeat expansions modulate "protein-only" inheritance in yeast // Nature. 1999. - Vol. 400. - P. 573-576.
129. Ma J., Lindquist S. De novo generation of a PrPSc-like conformation in living cells // Nat Cell Biol. 1999. - Vol. 1 - P. 358-361.
130. Ma J., Lindquist S. Wild-type PrP and a mutant associated with prion disease are subject to retrograde transport and proteasome degradation // Proc Natl Acad Sci USA.-2001.-Vol. 98.-№26.-P. 14955-14960.
131. Maddelein M.L., Dos Reis S., Duvezin-Caubet S., Coulaiy-Salin В., Saupe S.J. Amyloid aggregates of the HET-s prion protein are infectious // Proc Natl Acad Sci USA. 2002. - Vol. 99. -№11. - P. 7402-7407.
132. Maddelein M.L., Wickner R.B. Two prion-inducing regions of Ure2p are nonoverlapping // Mol Cell Biol. 1999. - Vol. 19. - №6. - P. 4516-4524.
133. Madore N., Smith K.L., Graham C.H. Jen A., Brady K., Hall S., Morris R. Functionally different GPI proteins are organized in different domains on the neuronal surface // EMBO J. 1999. - Vol. 18. - P. 6917-6926.
134. Manson J., West J.D., Thomson V., McBride P., Kaufman M.H., Hope J. The prion protein gene: a role in mouse embryogenesis? // Development. 1992 - Vol. 115.-№1.-P. 117-122.
135. Manuelidis L. Vaccination with an attenuated Creutzfeldt-Jakob disease strain prevents expression of a virulent agent // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1998. -Vol. 95.-P. 2520-2525.
136. Marella M., Lehmann S., Grassi J., Chabry J. Filipin prevents pathological prion protein accumulation by reducing endocytosis and inducing cellular PrP release // J. Biol. Chem. 2002. - Vol. 277. - №28. - P. 25457-25464.
137. Masison D.C., Maddelein M.L., Wickner R.B. The prion model for URE3. of yeast: spontaneous generation and requirements for propagation // Proc Natl Acad Sci USA. 1997. - Vol. 94. - №23. - P. 12503-12508.
138. Masison D.C., Wickner R.B. Prion-inducing domain of yeast Ure2p and protease resistance of Ure2p in prion-containing cells. Science. 1995. - Vol. 270. - P. 93-95.
139. Mayer MP, Bukau B. Hsp70 chaperones: cellular functions and molecular mechanism // Cell Mol Life Sci. 2005. - Vol. 62. - №6. - P. 670-684.
140. McEwen B.S., Grafstein B. Fast and slow components in axonal transport of protein // J Cell Biol. 1968. - Vol. 38. - №3. - P. 494-508.
141. Meriin A.B., Zhang X., He X., Newnam G.P., Chernoff Y.O., Sherman M.Y. Huntington toxicity in yeast model depends on polyglutamine aggregation mediated by a prion-like protein Rnql // J Cell Biol. 2002. - Vol. 157. - №6. -P. 997-1004.
142. Michelitsch M.D., Weisman J.S. A census of glutamine/asparagines-rich regions: implications for their conserved function and the prediction of novel prions//Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2000. - Vol. 97.-P. 11910-11915.
143. Miele G., Alejo Blanco A.R., Baybutt H., Horvat S., Manson J., Clinton M. Embryonic activation and developmental expression of the murine prion protein gene // Gene Expr. 2003. -Vol. 11.-№1.-P. 1-12.
144. Montrasio F., Frigg R., Glatzel M., Klein M.A., Mackay F., Aguzzi A., Weissmann C. Impaired prion replication in spleens of mice lacking functional follicular dendritic cells // Science. 2000. - Vol. 288. - P. 1257-1259.
145. Morales R., Abid K., Soto C. The prion strain phenomenon: molecular basis and unprecedented features // Biochim Biophys Acta. 2007. - Vol. 1772. - №6. - P. 681-691.
146. Moriyama H., Edskes H.K., Wickner R.B. URE3. prion propagation in Saccharomyces cerevisiae: requirement for chaperone Hspl04 and curing by overexpressed chaperone Ydjlp // Mol Cell Biol. 2000. - Vol. 20. - P. 89168922.
147. Mastrangelo P., Westaway D. The prion gene complex encoding PrP and Doppel insights from mutational analysis // Gene — 2001. — Vol. 275. P. 1—18.
148. Narwa R., Harris D.A. Prion proteins carrying pathogenic mutations are resistant to phospholipase cleavage of their glycolipid anchors // Biochemistry. 1999. -Vol. 38. - P. 8770-8777.
149. Nasmyth K. Regulating the HO endonuclease in yeast // Curr Op in Genet Dev. — 1993.-Vol. 2.-P. 286-94.
150. Nelson R.J., Ziegelhoffer Т., Nicolet C., Werner-Washburne M., Craig E.A. The translation machinery and 70 kd heat shock protein cooperate in protein synthesis //Cell. 1992. -Vol. 71.-№1.-P. 97-105.
151. Newnam G.P., Wegrzyn R.D., Lindquist S.L., Chernoff Y.O. Antagonistic interactions between yeast chaperones Hspl04 and Hsp70 in prion curing // Mol Cell Biol. 1999. - Vol. 19. - №2. - P. 1325-1333.
152. Nicotera P. A route for neuroinvasion // Neuron. 2001. - Vol. 31. - P. 345-348.
153. Oesch В., Westaway D., Walchli M., McKinley M.P., Kent S.B., Aebersold R., Barry R.A., Tempst P., Teplow D.B., Hood L.E., et al. A cellular gene encodes scrapie PrP 27-30 protein // Cell. 1985. - Vol. 40. - P. 735-746.
154. Palmer M.S., Mahal S.P., Campbell T.A., Hill A.F., Sidle K.C., Laplanche J.L., Collinge J. Deletions in the prion protein gene are not associated with CJD // Hum. Mol. Genet. 1993. - Vol. 2. - P. 541-544.
155. Parsell D.A., Sanchez Y., Stitzel J.D., Lindquist S. Hsp 104 is a highly conserved protein with two essential nucleotide-binding sites // Nature. 1991. - Vol. 353. -P. 270-283.
156. Patel B.K., Liebman S.W. "Prion-proof' for PIN*.: infection with in vitro-made amyloid aggregates of Rnqlp-(132-405) induces [PIN*] II J Mol Biol. 2007. -Vol. 365. - №3. - P. 773-782.
157. Patino M.M., Liu J.J., Glover J.R. end Lindquist S. Support for the prion hypothesis for inheritance of a phenotypic trait in yeast // Science. 1996. - Vol. 273. - P. 622-626.
158. Paushkin S.V., Kushnirov V.V., Smirnov V.N. and Ter-Avanesyan M.D. Propagation of the yeast prion-like psi*. determinant is mediated by oligomerization of the St/Pii-encoded polypeptide chain release factor // EMBO J. -1996. -Vol. 15.-P. 3127-3134.
159. Perrier V., Kaneko K., Safar J., Vergara J., Tremblay P., DeArmond S.J., Cohen F.E., Prusiner S.B., Wallace A.C. Dominant-negative inhibition of prion replication in transgenic mice. Proc Natl Acad Sci USA. 2002. - Vol. 99. -№20.-P. 13079-13084.
160. Perutz M.F., Windle A.H. Cause of neural death in neurodegenerative diseases attributable to expansion of glutamine repeats // Nature. — 2001. Vol. 412. - P. 143-144.
161. Piccardo P., Manson J.C., King D., Ghetti В., Barron R.M. Accumulation of prion protein in the brain that is not associated with transmissible disease // PNAS. 2007. - Vol. 104. - №11. - P. 4712-4717.
162. Polymenidou M., Stoeck K., Glatzel M., Vey M., Bellon A., Aguzzi A. Coexistence of multiple PrPSc types in individuals with Creutzfeldt-Jakob disease // Lancet Neurol. 2005. - Vol. 4. - P. 805-814.
163. Prado M.A., Alves-Silva J., Magalhaes A.C., Prado V.F., Linden R., Martins V.R., Brentani R.R. PrPc on the road: trafficking of the cellular prion protein // J. Neurochem. 2004. - Vol. 88. - P. 769-781.
164. Priola S.A., Raines A., Caughey W.S. Porphyrin and phthalocyanine antiscrapie compounds // Science. 2000. - Vol. 287. - №5457. - P. 1503-1506.
165. Prusiner S.B. Molecular biology of prion diseases //Science. 1991. - Vol. 252. -P. 1515-1522.
166. Prusiner S.B. Novel proteinaceous infections particles cause scrapie // Science. -1982. Vol. 216. - P. 136-144.
167. Prusiner S.B. Prions // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1998. - Vol. 95. - №23. -P.13363-13383.
168. Prusiner S.B. Scrapie prions // Am. Rev. Microbiol. 1989. - Vol. 43. - P. 345374.
169. Prusiner S.B. The prion diseases // Sci Am. 1995. - Vol. 272. - P. 48-57.
170. Prusiner S.B., McKiniey M.P., Bowman K.A. Scrapie prions aggregate to form amyloid-like birefringent rods // Cell. 1983. - Vol. 35. - P. 349-358.
171. Prusiner S.B., Scott M.R. Genetics of prions // Annu Rev Genet. 1997. - Vol. 31.-P. 139-175.
172. Prusiner SB. Shattuck lecture-neurodegenerative diseases and prions // N Engl J Med. 2001. - Vol. 344. - №20. - P.l516-1526.
173. Raychaudhuri S., Fontanes V., Banerjee R., Bernavichute Y., Dasgupta A. Zuotin. A DnaJ molecular chaperone, stimulates cap-independent translation in yeast // Biochemical and Biophysical Research Communications. 2006. - Vol. 350.-P. 788-795.
174. Riek R., Hornemann S., Wider G., Billeter M., Glockshuber R., Wuthrich K. NMR structure of the mouse prion protein domain PrP(121-321) // Nature. 1996. -Vol. 382.-P. 180-182.
175. Riek R., Hornemann S., Wider G., Glockshuber R., Wiithrich K. NMR characterization of the full-length recombinant murine prion protein, mPrP(23-231) //FEBS Lett. 1997. - Vol. 413. -№2.-P. 282-288.
176. Ripaud L., Maillet L., Cullin C. The mechanisms of URE3. prion elimination demonstrate that large aggregates of Ure2p are dead-end products // EMBO J. -2003. Vol. 22. - №19. - P. 5251-5259.
177. Rivera-Milla E., Stuermer C.A., Malaga-Trillo E. An evolutionary basis for scrapie disease: identification of a fish prion mRNA // Trends Genet. 2003. -Vol. 19.-№2.-P. 72-75.
178. Roberts B.T., Moriyama H., Wickner R.B. URE3. prion propagation is abolished by a mutation of the primary cytosolic Hsp70 of budding yeast // Yeast. -2004.-Vol. 21.-№2.-P. 107-117.
179. Roberts B.T., Wickner R.B. Heritable activity: a prion that propagates by covalent autoactivation // Genes Dev. 2003. - Vol. 17. - №17. - P. 2083-2087.
180. Rose M.D., Winstone F., Hieter P. Methods in yeast genetics // CSHL Press. -1990.-198 p.
181. Ross ED, Edskes HK, Terry MJ, Wickner RB. Primary sequence independence for prion formation. Proc Natl Acad Sci USA. 2005. - Vol. 102. - №36. - P. 12825-12830.
182. Rossi G., Salmona M., Forloni G., Bugiani O.m Tagliavini F. Therapeutic approaches to prion diseases // Clin. Lab. Med. 2003. - Vol. 23. - №1. - P. 187208.
183. Saborio G.P., Permanne В., Soto C. Sesitive detection of pathological prion protein by cyclic amplification of protein misfolding // Nature. 2001. - Vol. 411. -P. 810-813.
184. Sachs A.B., Sarnow P., Hentze M.W. Starting at the beginning, middle, and end: translation initiation in eukaryotes // Cell. 1997. - Vol. 89. - P. 831-838.
185. Safar J, Wille H, Itri V, Groth D, Serban H, Torchia M, Cohen FE, Prusiner SB. Eight prion strains have PrPSc molecules with different conformations // Nat Med. 1998. - Vol. 4. - №10. - P. 1157-1165.
186. Sambrook J., Fritsch E.F., Maniatis T. Molecular cloning. A laboratory manual // New York: Cold Spring Harbor Lab. Press. 1989. - 1626 p.
187. Santuccione A., Sytnyk V., Leshchyns'ka I., Schachner M. Priori protein recruits its neuronal receptor NCAM to lipid rafts to activate p59fyn and to enhance neurite outgrowth // J. Cell. Biol. 2005. - Vol. 169. - P. 341-354.
188. Schirmer E.C, Lindquist S. Interactions of the chaperone Hspl04 with yeast Sup35 and mammalian PrP // Proc Natl Acad Sci USA. 1997. - Vol. 94. - P. 13932-13937.
189. Schlumpberger M., Prusiner S.B., Herskowitz I // Induction of distinct URE3. yeast prion strains // Mol Cell Biol. 2001. - Vol. 21. - №20. - P. 7035-7046.
190. Schwimmer C., Masison D.C. Antagonistic interactions between yeast PSt. and [URE3] prions and curing of [URE3] by Hsp70 protein chaperone Ssalp but not by Ssa2p // Mol Cell Biol. 2002. - Vol. 22. - P. 3590-3598.
191. Schwimmer C., Masison D.C. Antagonistic interactions between yeast PSI+. and [URE3] prions and curing of [URE3] by Hsp70 protein chaperone Ssalp but not by Ssa2p // Mol Ceil Biol. 2002. - Vol. 22. - №11. - P. 3590-3598.
192. Sherman F., Fink G.R., Hancks J.B. Methods in yeast genetics // N.Y.Cold Spring Harbor Lab. Press. 1986. - 367 p.
193. Shorter J., Lindquist S. Destruction or potentiation of different prions catalyzed by similar Hspl04 remodeling activities // Mol Cell. 2006. - Vol. 23. - №3. - P. 425-438.
194. Shorter J., Lindquist S. Hspl04 catalyzes formation and elimination of self-replicating Sup35 prion conformers // Science. 2004. - Vol. 304. - №5678. - P. 1793-1797.
195. Shyng S.L., Huber M.T., Hams D.A. A prion protein cycles between the cell surface and an endocytic compartment in cultured neuroblastoma cells // J Biol Chem. 1993. - Vol. 268. -№21. - P. 15922-15928.220. Sigurdsson, 1954
196. Sikorski R.S., Hieter P. A system of shuttle vectors and yeast host strains designed for efficient manipulation of DNA in Saccharomyces cerevisiae // Genetics. 1989. - Vol. 122. - P. 19-27.
197. Silveira J.R., Raymond G.J., Hughson A., Race R.E., Sim V.L., Hayes S.F., Caughey B. The most infectious prion protein particles // Nature. 2005. - Vol. 437.-P. 257-261.
198. Simonic Т., Duga S., Strumbo В., Asselta R., Ceciliani F., Ronchi S. cDNA cloning of turtle prion protein // FEBS Lett. 2000. - Vol. 469. - №1. - P. 33-38.
199. Sondheimer N., Lopez N., Craig E.A., Lindquist S. The role of Sisl in the maintenance of the RNQ+. prion // EMBO J. 2001. - Vol. 20. - №10. - P. 2435-2442.
200. Stockel J., Safar J., Wallace A.C., Cohen F.E., Prusiner S.B. Prion protein selectively binds copper(II) ions // Biochemistry. 1998. - Vol. 37. - P. 7185— 7193.
201. Strumbo В., Ronchi S., Bolis L.C., Simonic T. Molecular cloning of the cDNA coding for Xenopus laevis prion protein // FEBS Lett. 2001. — Vol. 508. - №2. -P. 170-174.
202. Supattapone S., Wille H., Uyechi L., Safar J., Tremblay P., Szoka F.C., Cohen F.E., Prusiner S.B., Scott M.R. Branched polyamines cure prion-infected neuroblastoma cells // J. Virol. 2001. - Vol. 75. - №7. - P. 3453-3461.
203. Tanaka M., Chien P., Naber N., Cooke R., Weissman J.S. Conformational variations in an infectious protein determine prion strain differences // Nature. -2004. Vol. 428. - №6980. - P. 323-328.
204. Taneja V., Maddelein M.L., Talarek N., Saupe S.J., Liebman S.W. A non-Q/N-rich prion domain of a foreign prion, Het-s., can propagate as a prion in yeast // Mol Cell. 2007. - Vol. 27. - № 1. - P. 67-77.
205. Taylor K.L., Cheng N., Williams R.W., Steven A.C., Wickner R.B. Prion domain initiation of amyloid formation in vitro from native Ure2p // Science. -1999. Vol. 283. - №5406. - P. 1339-1343.
206. Thual C., Komar A.A., Bousset L., Fernandez-Bellot E., Cullin C., Melki R. Structural characterization of Saccharomyces cerevisiae prion-like protein Ure2 // J Biol Chem. 1999. - Vol. 274. - №19. - P. 13666-13674.
207. Tobler I., Gaus S.E., Deboer Т., Achermann P., Fischer M., Rulicke Т., Moser M., Oesch В., McBride P.A., Manson J.C. Altered circadian activity rhythms and sleep in mice devoid of prion protein // Nature. 1996. - Vol. 380. - P. 639-642.
208. Treiber C., Simons A., Multhaup G. Effect of copper and manganese on the de novo generation of protease-resistant prion protein in yeast cells // Biochemistry. -2006.-Vol. 45.-№21.-P. 6674-6680.
209. Tuite M.F. Yeast prions and their prion-forming domain // Cell. 2000. - Vol. 100.-№3.-P. 289-92.
210. Tuite M.F., Cox B.S. The Genetic Control of the Formation and Propagation of the PSI+. Prion of Yeast, edited by Chernoff Y.O. // Medical Intelligence Unit/ Landes Bioscience. Protein-based inheritance. 2007. — P. 14—30.
211. Tuite. M., Mundy, C.R., Cox, B.S. Agents that cause a high frequency of genetic change from psi+. to [psi-] in Saccharomyces cerevisiae // Genetics. 1981. — Vol. 98.-P. 691-711.
212. Turoscy V., Cooper T.G. Ureidosuccinate is transported by the allantoate transport system in Saccharomyces cerevisiae // J Bacteriol. 1987. - Vol. 169. — №6.-P. 2598-2600.
213. Uptain S.M., Lindquist S. Prions as protein-based genetic elements // Annu Rev Microbiol. 2002. - Vol. 56. - P. 703-741.
214. Vana K., Zuber C., Nikles D., Weiss S. Novel Aspects of Prions, Their Receptor Molecules, and Innovative Approaches for TSE Therapy // Cell. Mol. Neurobiol. -2007.-Vol. 27. -№1. P. 107-128.
215. Warner R.G., Hundt C., Weiss S., Turnbull J.E. Identification of the heparan sulfate binding sites in the cellular prion protein // J Biol Chem. 2002. - Vol. 277.-P. 18421-18430.
216. Wegrzyn R.D., Bapat K., Newnam G.P., Zink A.D., Chernoff Y.O. Mechanism of prion loss after Hspl 04 inactivation in yeast // Mol.Cell Biol. 2001. - Vol. 21. - P. 4656-4669.
217. Weissmann C. Molecular genetics of transmissible spongiform encephalopathies // J Biol Chem. 1999. - Vol. 274. - P. 3-6.
218. Weissmann С. The state of the prion // Nat Rev Microbiol. 2004. - V. 2. -№11.-P. 861-871.
219. Weissmann C., Aguzzi A. Approaches to therapy of prion diseases // Annu Rev Med. 2005. - Vol. 56. - P. 321-344.
220. Weissmann C., Enari M., Klohn P.C., Rossi D., Flechsig E. Transmission of prions // PNAS. 2002. - Vol. 99. - №4. - P. 16378-16383.
221. Whatley S.A., Powell J.F., Politopoulou G., Campbell I.C., Brammer M.J., Percy N.S. Regulation of intracellular free calcium levels by the cellular prion protein // Neuroreport. 1995. - Vol. 6. - №17. - P. 2333-2337.
222. White A.R., Hawke S.H. Immunotherapy as a therapeutic treatment for neurodegenerative disorders // J Neurochem. 2003. - Vol. 87. - №4. - P. 801808.
223. Wickner R.B. URE3. as an altered URE2 protein: evidence for a prion analog in Saccharomyces cerevisiae I I Science. 1994. - Vol. 264. - P. 566-569.
224. Wickner R.B., Edskes H.K., Roberts B.T., Baxa U., Pierce M.M., Ross E.D., Brachmann A. Prions: proteins as genes and infectious entities // Genes Dev. — 2004. Vol. 18. - №5. - P. 470^185.
225. Wickner R.B., Edskes H.K., Shewmaker F. How to find a prion: URE3., [PS7*] and p // Methods. 2006. - Vol. 39. - №1. - P. 3-8.
226. Wickner R.B., Edskes H.K., Shewmaker F., Nakayashiki T. Prions of fungi: inherited structures and biological roles // Nat Rev Microbiol. 2007. - Vol. 8. -P. 611-618.
227. Winklhofer K.F., Tatzelt J. Cationic lipopolyamines induce degradation of PrPSc in scrapie-infected mouse neuroblastoma cells // Biol Chem. 2000. - Vol. 381.-P. 463-469.
228. Yang W., Yang H., Tien P. In vitro self-propagation of recombinant PrPSc-like conformation generated in the yeast cytoplasm // FEBS Lett. 2006. — Vol. 580. — №17.-P. 4231^1235.
229. Zhou P., Derkatch I.L., Uptain S.M., Patino M.M., Lindquist S., Liebman S.W. The yeast non-Mendelian factor ETA+. is a variant of [PS7*], a prion-like form of release factor eRF3// EMBO J.- 1999. -Vol. 18.- №5. -P. 1182-1191.
230. Zhou W., Edelman G.M., Mauro V.P. Transcript leader regions of two Saccharomyces cerevisiae mRNAs contain internal ribosome entry sites that function in living cells // Proc Natl Acad Sci USA. 2001. - Vol. 98. - P. 15311536.
231. Zou W., Zheng J., Gray D.M., Gambetti P., Chen S.G. Antibody to DNA detect scrapie but not normal prion protein // Proc Acad Natl Sci USA. 2004. - Vol. 101.-P. 1380-1385.
Обратите внимание, представленные выше научные тексты размещены для ознакомления и получены посредством распознавания оригинальных текстов диссертаций (OCR). В связи с чем, в них могут содержаться ошибки, связанные с несовершенством алгоритмов распознавания. В PDF файлах диссертаций и авторефератов, которые мы доставляем, подобных ошибок нет.