Использование комбикормов различного состава и их влияние на микробиоту кишечника бройлеров тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 06.02.08, кандидат наук Никонов, Илья Николаевич

• Никонов, Илья Николаевич
• кандидат наук
• 2018

Оглавление диссертации кандидат наук Никонов, Илья Николаевич

СОДЕРЖАНИЕ

ВВЕДЕНИЕ

1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Состав и роль микробиоты желудочно-кишечного тракта птицы

1.2. Влияние компонентов комбикормов биологически-активных веществ на состояние миробиоты кишечника птицы

2. МАТЕРИАЛ И МЕТОДИКА ИССЛЕДОВАНИЙ

2.1. Методика проведения научно-хозяйственных опытов

2.2. Методика Т-КРЬР- анализа микрофлоры желудочно-кишечного тракта птицы

2.3. Методики N08- (высокопроизводительное секвенирование) и количественного ПЦР-анализа микрофлоры желудочно-кишечного тракта птицы

3. РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЙ

3.1. Продуктивность, переваримость и использование питательных веществ корма бройлерами, состояние микрофлоры желудочно-кишечного тракта при использовании в рационе кормов, содержащих кукурузу и пшеницу

(опыт 1)

3.2. Продуктивность, переваримость и использование питательных веществ корма бройлерами, состояние микрофлоры желудочно-кишечного тракта при использовании в рационе кормов, содержащих кукурузу и ячмень (опыт 2)

3.3. Продуктивность, переваримость и использование питательных веществ корма бройлерами, состояние микрофлоры желудочно-кишечного тракта при использовании в рационе кормов, содержащих соевый и подсолнечный шрота (опыт 3)

3.4. Экологические индексы биоразнообразия

3.5. Результаты корреляционного анализа

3.6. Производственная проверка результатов исследования

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

ПРЕДЛОЖЕНИЯ ПРОИЗВОДСТВУ

ПЕРСПЕКТИВЫ ДАЛЬНЕЙШЕЙ РАЗРАБОТКИ ТЕМЫ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

ПРИЛОЖЕНИЕ

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Использование комбикормов различного состава и их влияние на микробиоту кишечника бройлеров»

ВВЕДЕНИЕ

Актуальность темы. Современное птицеводство отличается высокой индустриализацией отрасли, использованием закрытых помещений с регулируемым микроклиматом, автоматизацией технологических процессов. Благодаря успехам генетики и селекции, скорость анаболических процессов у современных кроссов птицы становится всё выше, и лимитирующим фактором развития отрасли оказывается способность пищеварительной системы птицы с соответствующей скоростью вовлекать питательные вещества, сосредоточенные в комбикорме, в биосинтетические процессы внутри организма. Основные затраты (68-72%) современной птицефабрики составляют затраты на корма, поэтому биологические особенности сельскохозяйственной птицы, как конвертора растительных полимеров, требуют функциональной поддержки пищеварительной системы, особенно - коррекции микрофлоры желудочно-кишечного тракта.

Проблема исследования экосистемы микроорганизмов, населяющих пищеварительный тракт птицы, весьма актуальна. Важная роль микроорганизмов желудочно-кишечного тракта (ЖКТ) птицы общепризнана: именно они обеспечивают организм хозяина некоторыми питательными компонентами за счет использования собственных ферментов (амилаз, целлюлаз и других), а также антибиотическими веществами, белками, гормонами, витаминами и рядом других соединений (Тимошко М.А, 1990; Тараканов Б.В., 2006).

Поскольку макроорганизм и его микрофлора - единая экологическая система, находящаяся в состоянии динамического равновесия, а микроорганизмы участвуют в метаболических процессах, состав его микробиома относительно постоянен. Между тем, на микробиоту, колонизирующую пищеварительный тракт птицы, способны оказывать влияние ряд факторов: возраст, состав кормов, антибиотики и другие вещества (Biggs P. et al., 2007; Chichlowski M., McBride B.W., 2007; Stanley D. et al., 2014). С этих позиций микрофлора пищеварительного тракта выступает в качестве высокочувствительной индикаторной системы, которая реагирует составом микробиома на происходящие

изменения. В связи с этим, актуальным является вопрос изучения влияния различной структуры комбикормов на качественный и количественный состав микробиоты кишечника птицы.

Уникальные возможности перед исследователем, изучающим состав микробиома кишечника птицы, открывают современные молекулярно-генети-ческие методы, которые продемонстрировали, что в нем обнаруживаются представители до 140 родов бактерий, из которых только 10% идентифицированы по гену 16S рРНК, а остальные принадлежат к новым видам или даже новым родам (Amit-Romach E. et а1., 2004; Apajalahti J. et а1., 2004, Manukyan V.A., et а!., 2014).

Степень разработанности темы исследований. Изучению переваримости и использования питательных веществ комбикормов различной структуры посвящены многолетние исследования специалистов птицеводов (Фиси-нин В.И. и др., 2009, 2013, 2016; Егоров И.А. и др., 2010, 2017; Ленкова Т.Н. и др. 2013, 2015).

Большинство сведений о микрофлоре, населяющей кишечник птицы, получено с использованием классических методов микробиологии, согласно которым основу микробного сообщества составляют бифидобактерии, стрептококки, лактобактерии, лактат-ферментирующие бактерии, эубактерии, бактероиды и энтеробактерии (Грозина А.А., 2014).

Однако данные о состоянии микробиоты кишечника бройлеров на фоне изменения структуры комбикормов немногочисленны и носят разрозненный характер. Поэтому выполненная работа направлена на восполнение пробелов по оценке действия изменений в структуре комбикормов на микрофлору кишечника бройлеров.

Цель и задачи исследований. Целью диссертационной работы являлось изучение состава микрофлоры желудочно-кишечного тракта цыплят-бройлеров на фоне применения комбикормов различной структуры и питательности. Для достижения указанной цели были поставлены следующие задачи:

- изучить основные зоотехнические показатели цыплят-бройлеров на фоне применения комбикормов различной структуры;

- определить переваримость и использование питательных веществ комбикорма организмом цыплят-бройлеров;

- исследовать состояние микробиоты кишечника цыплят-бройлеров на фоне применения комбикормов различного состава и питательности с использованием различных молекулярно-генетических подходов (Т-КРЬР-анализ, N08, ПЦР в реальном времени);

- определить экономическую эффективность использования кормовой добавки Целлобактерин-Т в рационе цыплят-бройлеров для нормализации микрофлоры кишечника и повышения переваримости компонентов комбикормов.

Научная новизна работы. Впервые проведен комплексный анализ состояния микробиоценозов кишечника цыплят-бройлеров с применением различных молекулярно-генетических подходов на фоне изменений в структуре комбикормов. Определены структурные изменения в микробиоте с применением экологических подходов на основе индексов: показатель доминирования Симпсона, показатель сходства по Серенсену, показатели видового биоразнообразия (по Маргалефу и Менхинику), индекс выровненности по Пи-елу, Шенноновский показатель биоразнообразия. Материалы исследований вошли в разработку, удостоенную Премии Правительства Российской Федерации в области науки и техники за 2017 год.

Теоретическая и практическая значимость работы. Проведенные исследования по изучению микрофлоры кишечника бройлеров на фоне комбикормов различной структуры состоят в расширении и углублении знаний об обмене веществ у птицы, использовании ею питательных веществ кормов. Установлена связь структуры микробиоценозов с физиологическими особенностями пищеварения и зоотехническими показателями, что позволяет разработать способы регулирования микробиологических процессов в желудочно-кишечном тракте, направленные на повышение эффективности использования корма и продуктивности бройлеров.

На основании исследований и производственных проверок установлена целесообразность использования кормовой добавки Целлобактерин-Т с ферментативной и пробиотической активностями для повышения переваримости некрахмалистых полисахаридов, повышения усвояемости компонентов комбикорма и нормализации микрофлоры кишечника при изменении структуры комбикормов.

Материалы исследований были использованы при разработке методических рекомендаций «Руководство по использованию биопрепаратов и кормовых добавок для обеспечения здоровья и повышения продуктивности бройлеров (Сергиев Посад, ГНУ ВНИТИП, 2013), «Методика проведения научных и производственных исследований по кормлению сельскохозяйственной птицы. Молекулярно-генетические методы определения микрофлоры кишечника» (Сергиев Посад, ГНУ ВНИТИП, 2013), а также методического руководства «Молекулярно-генетические методы определения микрофлоры кишечника и установление нормы ее содержания в желудочно-кишечном тракте цыплят-бройлеров» (Сергиев Посад, ФГБНУ ВНИТИП, 2015), «Наставления по использованию нетрадиционных кормов в рационах птицы» (Сергиев Посад, ФГБНУ ВНИТИП, 2016).

Методология и методы исследований. Объектом исследования служили цыплята кросса «Кобб 500» с суточного до 36-суточного возраста. Исследования, представленные в диссертации, проводились в соответствии с методологией, принятой при изучении вопросов питания, обмена веществ и здоровья сельскохозяйственной птицы (Сергиев Посад, ГНУ ВНИТИП, 2013).

В ходе выполнения работы использовали общие методы научного познания: анализ, сравнение, обобщение; экспериментальные методы: наблюдение, сопоставление; специальные методы: зоотехнические, физиологические, биохимические, гистологические, экономические. Полученные экспериментальные данные обрабатывали методом вариационной статистики, руководствуясь

методическими указаниями (Сергиев Посад, ГНУ ВНИТИП, 2013), на персональном компьютере с использованием программного обеспечения Micrsoft Excel.

Положения, выносимые на защиту:

- состав и структура микробиоты кишечника у цыплят-бройлеров на фоне применения комбикормов различной структуры;

- зоотехнические и физиологические показатели у цыплят-бройлеров при смене структуры и питательности комбикорма;

- результаты поиска взаимосвязей между микрофлорой кишечника и основными зоотехническими и физиологическими показателями бройлеров;

- экономическая эффективность использования кормовой добавки Целлобак-терин-Т на фоне комбикорма с высоким уровнем некрахмалистых полисахаридов.

Степень достоверности и апробация результатов. Исследования выполнены на высокопродуктивном кроссе бройлеров «Кобб 500» с использованием современных методик сбора и обработки информации; биохимические исследования выполнены на сертифицируемом оборудовании в Испытательном центре ФНЦ «ВНИТИП» РАН, молекулярно-генетические исследования выполнены в лаборатории ООО «БИОТРОФ». Статистическая обработка полученных экспериментальных данных, их производственная проверка подтверждают обоснованность и достоверность основных выводов и предложений производству, сформулированных в диссертации.

Основные положения диссертационной работы доложены и обсуждены на: семинарах по повышению квалификации специалистов птицеводческих предприятий (Сергиев Посад, 2013-2017г.г.), XVIII международной конференции Российского отделения Всемирной научной ассоциации по птицеводству «Инновационное обеспечение яичного и мясного птицеводства России» (19-22 мая 2015 года, г. Сергиев Посад), XXV World's Poultry Congress (05-09 сентября 2016 года, Пекин, Китай), научно-практической (очно-заочной) конференции с международным участием «Современные тенденции

научного обеспечения в развитии АПК: фундаментальные и прикладные исследования» (26 октября 2017 года, г. Омск).

Публикации результатов исследований. По материалам диссертации опубликовано 9 научных работ, в том числе в журналах, рекомендованных ВАК РФ - 8. Все публикации выполнены в рамках гранта российского научного фонда по научному проекту «Современные представления о микрофлоре кишечника птицы при различных рационах питания: молекулярно-генетиче-ские подходы» № 14-16-00140.

Структура и объем диссертации. Диссертационная работа изложена на 133 страницах машинописного текста, включает 26 таблиц, 13 рисунков, состоит из введения, обзора литературы, материала и методов исследований, результатов собственных исследований и их обсуждения, выводов, предложений производству, списка литературы, включающего 143 источников, в том числе 104 на иностранных языках.

1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Состав и роль микробиоты желудочно-кишечного тракта птицы

Современное птицеводство характеризуется высоким уровнем индустриализации, что подразумевает высокую концентрацию поголовья на сравнительно небольших производственных площадях, использование безоконных птичников с регулируемым микроклиматом, автоматизацию технологических процессов и т.д. (Фисинин В.И, 2009). При этом основные производственные затраты (68-72%) в мясном птицеводстве приходятся на корма (А§§геу Б.Е. et а!., 2010). Благодаря успехам генетической селекции птицы, скорость метаболических процессов у современных мясных кроссов становится все выше, и лимитирующим фактором развития птицеводства оказывается способность пищеварительной системы птицы обеспечить высокий уровень и физиологическую эффективность метаболизации питательных веществ рационов. За последние 50 лет в мире достигнут значительный прогресс по скорости роста бройлеров и эффективности использования ими кормов (Havenstein О.Б. et а!., 2003, Панин И.Г. и др., 2011), причем этот генетический прогресс привел к изменениям в физиологии питания современной мясной птицы и составе микрофлоры ее желудочно-кишечного тракта (ЖКТ) (ЬитрИш Б.Б., et а!., 2010, Подобед Л.И. и др., 2017). Поэтому для реализации своего генетического потенциала продуктивности она требует адекватной функциональной поддержки пищеварительного тракта и, в частности, регуляции состава его микрофлоры.

Известно, что состав кормов оказывает непосредственное влияние на качественные и количественные характеристики микробного сообщества желудочно-кишечного тракта. Несбалансированное кормление бройлеров приводит к нежелательным изменениям микробиоценоза, что является причиной снижения продуктивности и возникновения ряда заболеваний вследствие нарушения процессов пищеварения (Панин И.Г. и др., 2011).

В связи с этим, на протяжении последних десятилетий изучение роли микроорганизмов желудочно-кишечного тракта цыплят-бройлеров в пищеварении и обмене веществ вызывает повышенный интерес как ученых, так и практиков-птицеводов, поскольку результаты этих исследований способствуют организации более рационального и полноценного кормления и других мероприятий, необходимых для повышения продуктивности и улучшения состояния здоровья птицы (Ленкова Т.Н. и др. 2013, 2015, Манукян В.А., 2015, 2016).

Некоторые сведения о составе и роли микрофлоры желудочно-кишечного тракта (ЖКТ) сельскохозяйственных птиц были получены с помощью классических методов микробиологии (Тимошко М.А., 1990, Engberg R.M. et al., 2000, Тараканов Б.В., 2006).

Одним из наиболее перспективных на сегодняшний день является Т-RFLP-анализ (Terminal restriction fragment length polymorphism) - молеку-лярно-генетический метод, основанный на анализе полиморфизма длин ам-плифицированных рестрикционных фрагментов ДНК микроорганизмов. Он предназначен для определения количества, относительной численности и таксономической принадлежности всех бактерий микробной экосистемы. Это дает возможность широкого и глубокого сравнительного изучения микробиологических сообществ в их развитии и изменении.

В России метод T-RFLP в связи с высокой стоимостью оборудования для анализа, а также отсутствием квалифицированных кадров используется в основном лишь для анализа почвы и кала человека.

В связи с этим сотрудниками лаборатории молекулярно-генетических исследований научно-производственной компании «БИОТРОФ» впервые в России на основе анализа зарубежных исследований методика Т-RFLP была модифицирована для изучения микрофлоры желудочно-кишечного тракта сельскохозяйственных птиц (Егоров И.А. и др., 2010, Егорова Т.А. и др. 2016).

Известно, что в просвете кишечника птицы, на всём его протяжении от ротовой полости до края клоаки, обитает многочисленное разнотипное сообщество, состоящее из бактерий, грибковых, одноклеточных и вирусных микроорганизмов.

Считается, что количество бактериальных клеток ЖКТ превышает количество клеток самого организма птицы в пропорции, примерно, 10:1.

Последние исследования кишечника позволили сделать предположение, что желудочно-кишечный тракт птицы (на примере бройлеров) содержит около 640 разновидностей бактериальных микроорганизмов. Численность и разнообразие кишечной микрофлоры варьируют в разных отделах кишечника, и очевидно, что отделы, имеющие менее благоприятные условия (желудок) или более быстрое прохождение содержимого кишечника (двенадцатиперстная кишка), имеют меньшее число бактерий (Фисинин В.И. и др, 2016).

Принято считать, что развитие микрофлоры ЖКТ цыплёнка начинается в момент его вывода. Это происходит благодаря поступлению бактериальных микроорганизмов в пищеварительную трубку из окружающего воздуха, корма и от людей, работающих с цыплятами после вывода.

Зоб птицы быстро колонизируется бактериальными организмами в течение первых 24 часов после вывода цыплят. Кроме того, за этот период микроорганизмы эпифитной микрофлоры из ротового отверстия продвигаются по всему желудочно-кишечному тракту и достигают слепых отростков толстого кишечника. Это возможно только за счёт того, что в желудке суточного цыплёнка ещё нет характерного и достаточного кислотного барьера, а активность пепсина в желудке, способного затормозить развитие микрофлоры, ещё очень низка.

Через три дня после вылупления цыплёнка число бактериальных микроорганизмов в тонком и толстом кишечнике увеличивается примерно в 10 раз. К 2-х недельному возрасту микрофлора тонкого кишечника полностью стабилизируется по видовому и количественному составу, а к 30 суткам жизни заканчивает формирование микрофлора слепых отростков.

Естественно, что сроки и характер формирования биоценоза ЖКТ птицы существенно меняется в зависимости от фона микроорганизмов воздуха и оборудования птичника, где содержатся цыплята. Ещё больший эффект на формирование микрофлоры ЖКТ оказывают: использование антибиотиков, про-биотиков, подкислителей, состав кормового рациона и микробиологические характеристики питьевой воды (Руководство...: Сергиев Посад, 2013). По своему влиянию на организм птицы всю микрофлору желудочно-кишечного тракта можно разделить на нормальную, условно-патогенную и патогенную (Современные представления о микрофлоре., 2017).

Нормальная микрофлора (симбионтная) помогает пищеварительной системе птицы переваривать питательные вещества корма в пристеночной области кишечника и служит барьером от негативного влияния патогенной флоры.

Условно-патогенная флора в клинически здоровом организме со стабильным ценозом работает так же, как и нормальная. Однако, при нарушении установившегося сообщества флоры и на фоне значительной гибели микроорганизмов первой группы, условно-патогенная флора (например, кишечная палочка) начинает превалировать над нормальной и быстро приобретает свойства патогенной.

Патогенная микрофлора является главной причиной желудочно-кишечных расстройств. При попадании в организм на фоне ослабленной группы нормальной микрофлоры, она начинает превалировать над последней, вызывая срыв пищеварения, образование большого количества непереваренных остатков. Её токсины разрушают всасывающую поверхность кишечника и в значительном количестве всасываются в кровь, вызывая острые отравления.

У птицы в любом её клиническом состоянии в просвете пищеварительного канала всегда присутствуют все три указанные группы микроорганизмов. Однако у клинически здоровой птицы нормальная микрофлора занимает главенствующее положение по количеству и активности, условно-патогенная -

проявляет весьма умеренную активность, а патогенная - присутствует только в малых количествах (Современные представления о микрофлоре..., 2017).

При любых кормовых нарушениях: частой и резкой смене состава рациона, попадании в комбикорм компонентов с высокой бакобсеменённостью, частиц помёта, не свойственных птице кормовых компонентов, а также при массовом поступлении с воздухом, кормом и водой болезнетворного начала состав и соотношение отдельных групп микроорганизмов существенно меняется.

Кроме классификации микроорганизмов по их влиянию на организм хозяина важно учитывать их дифференциацию по дислокации и поведению в пищеварительном канале. Согласно современным представлениям все микроорганизмы делятся на 2 группы - резидентную (облигатную) микрофлору и транзитную (факультативную) (Современные представления о микрофлоре., 2017).

Резидентная микрофлора ассоциируется с энетроцитами тонкого и толстого кишечника, формируя на их поверхности специфическую биоплёнку. Эта биоплёнка состоит из ассоциированных микроорганизмов (индигенных бактерий), муцина, бактериального полисахарида. Такая колониальная ассоциация выделяет органические кислоты, перекись водорода, лизоцим, бактерициды, благодаря которым воздействует на транзитную флору, а в её составе - на патогенные и условно-патогенные микроорганизмы. В результате транзитная флора не смешивается с облигатной.

Микрофлора отдельных частей желудочно-кишечного тракта птицы формирует для каждого конкретного органа специфический биоценоз - биотоп. Условно можно считать, что у птицы существует биотоп ротовой полости, зоба, желудка и 12-типерстной кишки, тонкого кишечника, толстого кишечника (Фисинин В.И., Лаптев Г.Ю и др., 2017).

Микрофлора ротовой полости - самая непостоянная по составу часть микрофлоры желудочно-кишечного тракта даже у взрослой птицы с полностью

сформированным биоценозом. Она всецело зависит от поступления микро-биоты с кормом, водой и воздухом. В её составе превалируют молочно-кислые бактерии, грибки и кокковые формы (Л.И. Подобед, Г.Ю. Лаптев и др., 2017).

В зобу птицы превалирующее положение занимают молочно-кислые бактерии, которые участвуют в переваривании пищевой массы и обеспечивают образование молочной кислоты, способствующей подкислению рН в железистом и мускульном желудке. В мускульном желудке и двенадцатиперстной кишке значительной оказывается популяция только молочно-кислых бактерий, как самых устойчивых к кислой среде. Только в условиях расстройства пищеварения с падением рН и активности пепсина в этих отделах развивается патогенная микрофлора (кишечная палочка, энтерококки и клостридии) (Л.И. Подобед, Г.Ю. Лаптев и др., 2017).

По мере удаления от желудка и с повышением рН микрофлора тонкого кишечника постепенно меняется. В подвздошной и ободочной кишках превалирующее положение в составе резидентной флоры остаётся за лактобактери-ями, однако постепенно существенную роль в микробиологическом процессе начинают играть энтерококки и пропионово-кислые бактерии. В транзитной части биоценоза превалирует кишечная палочка, клостридии, эубактерии, фу-зобактерии.

В толстом кишечнике наступает настоящее царство бифидобактерий с сохранением существенного влияния лактобактерий и бактероидов. Транзитная флора представлена, в основном, теми же видами, что и в тонком кишечнике. Однако общая концентрация микрофлоры толстого кишечника в десятки раз превышает таковую в кишечнике тонком (Л.И. Подобед, Г.Ю. Лаптев и др., 2017).

В каждом отделе ЖКТ птицы, от ротовой полости до края клоаки, обитают многочисленные сообщества разнотипных микроорганизмов: бактерии, грибковые, одноклеточные и вирусные микроорганизмы. Микрофлора кишечника является одной из самых плотных микробных экосистем в мире (по числу

организмов на единицу количества субстрата): у птицы размеры бактериальной кишечной популяции составляют от 107 до 1011 организмов/г кишечного химуса (Apajalahti J. et al., 2004), причем количество клеток в микробных популяциях ЖКТ примерно вдесятеро превышает количество клеток организма птицы-хозяина.

Видовой и численный состав микробных сообществ разных отделов ЖКТ зависит, прежде всего, от рН химуса и концентрации кислорода. По мере продвижения химуса вниз по кишечной трубке снижается парциальное давление кислорода и повышается рН химуса, в результате чего возникает «этажность» расселения различных видов бактерий: выше всего располагаются аэробы, ниже - факультативные анаэробы и еще ниже - строгие анаэробы (Salminen S. et al., 19950.

В 12-перстной и тощей кишках птицы доминируют лактобациллы, энтерококки и энтеробактерии. Плотность микробной популяции здесь достигает 103-105 клеток/г химуса, что связано с высокой скоростью прохождения химуса по тонкому кишечнику, а также с бактериостатическим эффектом желчных кислот (Hassef D. and Cohen M., 1989; Salanitro J.P., et al., 1978). В подвздошной кишке количество бактерий выше и составляет примерно 106 клеток/г химуса, причем полостной микрофлоры здесь больше, чем пристеночной. Количество аэробных и анаэробных бактерий к этому «этажу» выравнивается, и основными представителями микрофлоры подвздошной кишки являются Enterococcus, E. coli, Bacteroides, Bifidobacterium (Максимов В.И. и др., 1998). Самая высокая плотность микробной популяции - в толстом кишечнике, включая слепые кишки: 1010-1011 клеток/г химуса. Здесь преобладает группа факультативно и строго анаэробных бактерий: представители родов Bacterioides и Bifidobacterium, на долю которых приходится 90% всей популяции этого отдела, а также клостридии (Шендеров Б.А., 1998; Torok V.A. et al., 2011).

Современные молекулярно-генетические методы анализа микробиома -ПЦР в реальном времени, NGS, T-RFLP - позволили получить новые представления о реальном таксономическом разнообразии микробных популяций

ЖКТ (Xiang Zhu Y. et al., 2002; Amit-Romach E. et al., 2004; Грозина А.А. 2015 (дис.)). В кишечнике птицы на настоящее время обнаружено порядка 800 видов микроорганизмов из почти 300 родов (Xiao Y.P. et al., 2017), причем выделить и культивировать лабораторно можно лишь менее 10% этого биоразнообразия (Torok V.A. et al., 2008). Более того, многие виды и даже роды кишечных микроорганизмов, обнаруженные метагеномными методами, до сих пор остаются не идентифицированными (Torok V.A., et al., 2011).

Кишечную микрофлору можно разделить на три группы, различающиеся по своим физиологическим взаимоотношениям с организмом хозяина: нормальная, условно-патогенная и патогенная микрофлора. Условно-патогенная микрофлора при наличии адекватной популяции нормальной микрофлоры также функционирует как нормальная, а в случае гибели существенной части нормальной популяции ее доля сильно увеличивается, и она начинает действовать как патогенная. При этом следует понимать, что в кишечнике всегда присутствуют представители всех этих трех групп; у клинически здоровой птицы нормальная микрофлора доминирует по размерам популяции и по активности, а патогенная присутствует в незначительных количествах. Еще одна классификация микрофлоры - деление на облигатную (резидентную) и факультативную (транзитную) флору: облигатная микрофлора образует устойчивые колонии, прикрепленные к кишечному эпителию, тогда как транзитные виды обитают преимущественно в просвете кишечника (Современные представления о микрофлоре., 2017).

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Никонов, Илья Николаевич, 2018 год

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

1. Бурмистров, В.А. Нормальная микрофлора и ее значение для здоровья человека. Препараты для профилактики и лечения дисбактериозов/В. А. Бурмистров. - Новосибирск: Вектор-Вита, 2009. - 19 с.

2. Горская, Е. М. Механизмы развития микроэкологических нарушений в кишечнике и новые подходы к их коррекции: автореф. дис. ... д-ра мед. наук: 03.00.07/Горская Елена Михайловна. - М., 1994.-27 с.

3. Грозина, А.А. Влияние состава рациона на микробиологические показатели желудочно-кишечного тракта цыплят-бройлеров при скармливании препаратов Стафак-110 и Целлобактерин-Т: дис. ... канд. биол. наук: 06.02.08/Грозина Алена Андреевна. - Сергиев Посад, 2015. - 181 с.

4. Грозина, А.А. Состав микрофлоры желудочно-кишечного тракта у цыплят-бройлеров при воздействии пробиотика и антибиотика (по данным T-RFLP - RT-PCR)/А.А. Грозина//Сельскохозяйственная биология. -2014. - №6. - С. 46-58.

5. Егоров, И. T-RFLP - анализ микрофлоры кишечника - основа выбора кормовых добавок для птицы / И. Егоров, Г. Лаптев, И. Никонов, Л. Кря-жевских // Птицеводство. - 2010. - № 9. - С. 25.

6. Егоров, И. А. Возрастные изменения секреторной функции поджелудочной железы и микрофлоры кишечника у цыплят родительских форм и гибридов мясных кур / И. А. Егоров, В. Г. Вертипрахов, А. А. Грозина, Г. Ю. Лаптев, И. Н. Никонов, Н. И. Новикова, Л. А. Ильина, Е. А. Йыл-дырым, В. А. Филиппова, А. В. Дубровин, В. А. Манукян, Т. Н. Ленкова //Сельскохозяйственная биология. - 2017. - Т. 52. - № 4. - С. 757-766.

7. Егорова, Т.А. Влияние пробиотиков на основе Saccharomyces sp. и Bacillus subtilis на бактериальное сообщество слепых отростков кишечника и продуктивность цыплят - бройлеров / Т.А. Егорова, Т.Н. Ленкова, Л.А. Ильина и др. // Сельскохозяйственная биология. - 2016. -Т. 51. - № 6. -С. 891 - 902.

8. Зон, Г. Аутохтоная микрофлора птицы / Г. Зон// Птицеводство. - 1992. -№6. - С. 20-22.

9. Ильина, Л.А. Метагеномный пейзаж желудочно-кишечного тракта куриных эмбрионов с использованием метода T-RFLP /Л.А. Ильина, Е.А. Йылдырым, И.Н. Никонов, В.А. Филиппова, Г.Ю. Лаптев и др.//Доклады РАН. - 2016. - T. 466, № 4. - С. 482.

10.Ильина, Л.А. Микрофлора in ovo: возможности молекулярно-биологиче-ского метода T-RFLP/Л.А. Ильина, Е.А. Йылдырым, Н.И. Новикова, И.Н. Никонов, В.А. Филиппова и др.// Вестник российской сельскохозяйственной науки. - 2015. - №6. - С.6-8.

11. Использование пробиотиков, пребиотиков и симбиотиков в птицеводстве: методические рекомендации / Ш.А. Имангулов, И.А. Егоров, Т.Н. Ленкова и др. - Сергиев Посад, 2008. - 43 с.

12. Корнилова, В. Пробиотик споронормин для роста бройлеров/В. Корнилова, М. Маслов, Н. Белова// Птицеводство. - 2007. - №3. - С.28.

13. Ленкова, Т. Больше полезной микрофлоры с пробиотиком / Т. Ленкова, Т. Егорова, И. Меньшенин // Комбикорма. - 2013. - № 10. - С. 79 - 81.

14.Ленкова, Т.Н. Больше полезной микрофлоры - выше продуктивность / Т.Н. Ленкова, Т.А. Егорова, И.Г. Сысоева и др. // Птицеводство. - 2015.

- № 5. - С. 7 - 10.

15.Ленкова, Т.Н. Новый пробиотик А2 / Т.Н. Ленкова, Т.А. Егорова, И.А. Меньшенин // Птицеводство. - 2013. - № 4. - С. 23

- 26.

16.Максимов, В.И. Лактулоза и микроэкология толстой кишки/ В.И. Максимов, В.Е. Родомин, В.М. Бондаренко//Журнал микробиологии. - 1998. - №5. - С. 101-107.

17.Манукян, В.А. Питательные вещества и иммунитет птицы. / В.А. Ма-нукян // - Животноводство России. - 2016. - № S.1. - С.21-22.

18. Манукян, В.А. Ценный природный корм. / В.А. Манукян // - Животноводство России. - 2015. - № S.1. - С.47-48.

19. Методика проведения научных и производственных исследований по кормлению сельскохозяйственной птицы. Молекулярно-генетические методы определения микрофлоры кишечника / Егоров И.А., Манукян В.А., Ленкова Т.Н., Околелова Т.М., Лукашенко В.С., Шевяков А.Н. и др. // Российская академия сельскохозяйственных наук, Государственное научное учреждение Всероссийский научно-исследовательский и технологический институт птицеводства Россельхозакадемии. - Сергиев Посад, 2013. - 51 с.

20.Молекулярно-генетические методы определения микрофлоры кишечника и установление нормы ее содержания в желудочно-кишечном тракте цыплят-бройлеров. методическое руководство / Лаптев Г.Ю., Новикова Н.И., Ильина Л.А., Йылдырым Е.А. и др. // Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Всероссийский научно-исследовательский и технологический институт птицеводства"; ООО "БИОТРОФ+". - Сергиев Посад, 2015. - 31 с.

21.Мэгарран, Э. Экологическое разнообразие и его измерение / Э. Мэгарран // - М.: Мир, 1992. - 184 с.

22. Наставления по использованию нетрадиционных кормов в рационах птицы/Егоров И.А., Ленкова Т.Н., Манукян В.А., Околелова Т.М., Ше-вяков А.Н. и др. - Метод. указания; под общ. ред. В.И. Фисинина; 2-е изд., перераб. и доп. - Сергиев Посад: ВНИТИП, 2016. - 59 с.

23.Ноздрин, Г. А. Применение пробиотиков для ускорения роста и развития цыплят/ Г. А. Ноздрин. // Актуальные вопросы ветеринарии. Новосибирск, 2001. - С. 97-98.

24.Павлова, Н. Значение нормальной микрофлоры пищеварительного тракта птиц для их организма/Н. Павлова, Ф. Киржаев, Р. Лапис-кайте//БИО. - 2002. -№1. -С. 4-7.

25.Панин, А.Н. Современный подход к регуляции безопасности пробиотиков / А.Н. Панин, Н.И. Малик, О.С. Илаев и др. // Ветеринария. - 2011. - № 11. - С. 41 - 44.

26. Подобед, Л.И., Оптимизация пищеварения и протеиновое питание сельскохозяйственной птицы. / Л.И. Подобед, Г.Ю. Лаптев, Е.А. Капитонова, И.Н. Никонов - СПб: РАЙТ ПРИНТ ЮГ, 2017. - 348 с.

27.Руководство по использованию биопрепаратов и кормовых добавок для обеспечения здоровья и повышения продуктивности бройлеров / методические рекомендации // Егоров И.А., Манукян В.А., Игнатова Г.В., Околелова Т.М., Егорова Т.В. и др. Государственное научное учреждение Всероссийский научно-исследовательский и технологический институт птицеводства Россельхозакадемии, Государственное научное учреждение Всероссийский научно-исследовательский ветеринарный институт птицеводства Россельхозакадемии. - Сергиев Посад, 2013.- 75 с.

28. Современные представления о микрофлоре кишечника птицы при различных рационах питания: молекулярно-генетические подходы / В. И. Фисинин, Г.Ю. Лаптев, И.А. Егоров и др. - Сергиев Посад, 2017. - 263 с.

29. Современные представления о микрофлоре кишечника птицы при различных рационах питания: молекулярно-генетические подходы/Фиси-нин В.И., Лаптев Г.Ю., Егоров И.А., Грозина А.А., Ленкова Т.Н. и др. -Сергиев Посад: ВНИТИП, 2017. - 263 с.

30. Соколова, К.Я. Дисбактериозы /К.Я. Соколова, И.В. Соловьева. - Нижний Новгород: НГМА, 1999. - 199 с.

31.Степаненко И.П. Влияние пробиотического препарата стрептобифида форте на иммуногенез и формирование кишечного микробиоценоза цыплят: дис. ... канд. биол. наук: 16.00.03/Степаненко Иван Петрович. -М., 2001. - 150 с.

32.Тараканов Б. В., Николичева Т. А. Биология целлюлозолитических бактерий, используемых для приготовления пробиотика целлобактерина // Доклады РАСХН, 2000, № 3, С. 32-44.

33.Тараканов, Б.В. Методы исследования микрофлоры пищеварительного тракта сельскохозяйственных животных и птицы / Б.В. Тараканов. - М., 2006. - 128 с.

34.Тимошко, М.А. Микрофлора пищеварительного тракта сельскохозяйственных животных/М.А. Тимошко. - Кишинев: Штиница, 1990. 161 с.

35.Фисинин, В.И. Изменения бактериального сообщества в желудочно-кишечном тракте кур в онтогенезе/В.И. Фисинин, Г.Ю. Лаптев, И.Н. Никонов, Л.А. Ильина, Е.А. Йылдырым и др.//Сельскохозяйственная биология. - 2016. - Т. 51, №6. - С. 883-890.

36. Фисинин, В.И. Кишечный иммунитет у птиц: факты и размышления/ В.И. Фисинин, П. Сурай// Сельскохозяйственная биология. - 2013. -№4.-С. 3-19.

37. Фисинин, В.И. Птицеводство России - стратегия инновационного раз-вития/В.И. Фисинин. - М., 2009. - 149 с.

38.Чахава, О.В. Микробиологические и иммунологические основы гното-биологии/О.В. Чахава, Е.М. Горская, С.З. Рубан. - М.: Медицина, 1982. - 159 с.

39.Шендеров, Б.А. Медицинская микробная экология и функциональное питание. Т. 1: Микрофлора человека и животных и ее функции/Б.А. Шен-деров. - М.: «Грантъ», 1998. - 288 с.

40.Aggrey, S.E. Genetic properties of feed efficiency parameters in meat-type chickens/S.E. Aggrey, A.B. Karunah, B. Sebastian, N.B. Anthony//Genet. Sel. Evol. - 2010. - V. 42. - P. 25.

41.Albazaz Rojan, I., Buyukunal bal Emel B. Microflora of Digestive Tract in Poultry/ I. Albazaz Rojan, B. Buyukunal bal Emel //KSU Doga Bil. Derg., -2014. - № 17(1). - Р. 39-42.

42.Alemka, A. Purified chicken intestinal mucin attenuates Campylobacter jejunipathogenicity in vitro/ A. Alemka, S. Whelan, R. Gough, M. Clyne, M.E. Gallagher, S. Carrington, B. Bourke // J. Med. Microbiol.. - 2010. - № 9. - Р. 898-903.

43.Amit-Romach, E. Microflora ecology of the chicken intestine using 16S ribo-somal DNA primers/E. Amit-Romach, D. Sklan, Z. Uni// Poult. Sci. - 2004.-V. 83, No 7. - P. 1093-1098.

44. Antonissen, G. Microbial shifts associated with necrotic enteritis/G. Antonis-sen, V. Eeckhaut, K. van Driessche, L. Onrust, F. Heasebrouck et al.//Avian Pathol. - 2016. - V. 45, No 3. - P. 308-312.

45.Apajalahti, J. Characteristics of the gastrointestinal microbial communities, with special reference to the chicken/J. Apajalahti, A. Kettunen, H. Gra-ham//World's Poult. Sci. J. - 2004. - V. 60. - P. 223-232.

46.Barnes E. M., Mead G.C., Barnum D.A., Harry E.G. The intestinal flora of the chicken in the period 2 to 6 weeks of age, with particular reference to the anaerobic bacteria // Poult Sci., 1972, № 13, P. 311-326.

47.Beal, R. K. Cross-reactive cellular and humolar immune responses to Salmonella enterica serovar Typhimurium and Enteritidis are associated with protection to heterologous re-challenge/ R. K. Beal // Veter. Immunol. & Immunopathol. - 2006. - Vol. 114. - No1/2. - P. 84-93.

48.Bederska-Lojewska, D. Rye non-starch polysaccharides: their impact on poultry intestinal physiology, nutrients digestibility and performance indices - a review/D. Bederska-Lojewska, S. Swi^tkiewicz, A. Arczewska-Wlosek, T. Schwarz//Ann. Anim. Sci. - 2017. - V. 17, No 2. - P. 351-369.

49. Bedford, M. Removal of antibiotic growth promoters from poultry diets: implications and strategies to minimize subsequent problems/M. Bed-ford//World's Poult. Sci. J. - 2000. - V. 56. - P. 347-365.

50. Bedford, M.R. Exogenous enzymes and their effects on intestinal microbiol-ogy/M.R. Bedford, A.J. Cowieson//Anim. Feed Sci. Technol. - 2012. - V. 173, No 1-2. - P. 76-85.

51.Bedford, M.R. The role of carbohydrases in feedstuff digestion/M.R. Bed-ford//Poultry Feedstuffs: Supply, Composition and Nutritive Value; J. McNab, K.N. Boorman, Eds. - Edinburgh (UK): CAB Intl., 2001. - P. 319336.

52.Bentley-Hewitt, K.L. Lactobacilli survival and adhesion to colonic epithelial cell lines is dependent on long chain fatty acid exposure/K.L. Bentley-Hewitt, A. Narbad, G. Majsak-Newman, M.R. Philo, E.K. Lund//Eur. J. Lipid Sci. Technol. - 2017. - V. 119, No 11. - P. 1700062.

53.Bhatnagar, A. Bacterial flora from the respiratory tract of pigs/ A. Bhatnagar, N.B. Singh, B.S. Malik//Indian Vet. J. - 1972. -V. 49, No 3. - P. 234-236.

54.Biggs, P. Effects of several oligosaccharides on growth performance, nutrient digestibility, and cecal microbial populations in young chicks/P. Biggs, C.M. Parsons, G.C. Fahey//Poult. Sci. - 2007. -V.86. - P.2327-2336.

55.Blajman, J.E. Impact of lyophilized Lactobacillus salivarius DSPV 001P administration on growth performance, microbial translocation, and gastrointestinal microbiota of broilers reared under low ambient temperature/J.E. Blajman, C.A. Olivero, M. Fusari, J.A. Zimmerman, E. Rossler et al.//Res. Vet. Sci. - 2017. - V. 114. - P. 388-394.

56.Brisbin, J.T. Effects of lactobacilli on cytokine expression by chicken spleen and cecal tonsil cells/J.T. Brisbin, J. Gong, P. Parvizi, S. Sharif//Clin. Vaccine Immunol. - 2010. - V. 17, No 9. - P. 1337-1343.

57.Brisbin, J.T., Oral treatment of chickens with lactobacilli influences elicita-tion of immune responses. / J.T. Brisbin, J. Gong, S. Orouji, J. Esufali, A. I. Mallick, P. Parvizi, P. E. Shewen, S. Sharif // Clin. Vaccine Immunol., - 2011. - V. 18. - P. 1447-1455

58.Buclaw, M. Inulin in poultry production/M. Buclaw//World's Poult. Sci. J. -2017. - V.73, No 2. - P. 301-307.

59.Buhnik-Rosenblau, K. Indication for co-evolution of Lactobacillus johnsonii with its hosts/K. Buhnik-Rosenblau, V. Matsko-Efimov, M. Jung, H. Shin, Y. Danin-Poleg, Y. Kashi//BMC Microbiol. - 2012. - V. 12. - P. 149.

60. Callaway T. R., EdringtonT.S., Anderson R. C., Harvey R. B., Genovese K. J., Kennedy C. N., Venn D.W., Nisbet D. J. Probiotics, prebiotics and competitive exclusion for prophylaxis against bacterial disease // Anim. Health. Res. Rev., 2008, 9: 217-225 (doi: 10.1017/S1466252308001540).

61.Castanon, J.I.R. History of the use of antibiotics as growth promoters in European poultry feeds/J.I.R. Castanon//Poult. Sci. - 2007. - V. 86. - P. 24662471.

62.Chacher, M.F.A. Use of mannan oligosaccharide in broiler diets: an overview of underlying mechanisms/M.F.A. Chacher, Z. Kamran, U. Ahsan, S. Ahmad, K.C. Koutoulis, H.G. Kitab-Ud-Din, Ö. Cengiz//World's Poult. Sci. J. - 2017.

- V. 73, No 4. - P. 831-844.

63.Chee, S.H. Characterization and response of intestinal microflora and mucins to manno-oligosaccharide and antibiotic supplementation in broiler chick-ens/S.H. Chee, P.A. Iji, M. Choct, L.L. Mikkelsen, A. Kocher//Br. Poult. Sci.

- 2010. - V. 51, No 3.-P.368-380.

64.Chen, C.Y. Effect of supplementation of yeast with bacteriocin and Lactobacillus culture on growth performance, cecal fermentation, microbiota composition, and blood characteristics in broiler chickens/C.Y. Chen, S.W. Chen, H.T. Wang//Asian-Austral. J. Anim. Sci. - 2017. - V. 30, No 2. - P. 211-220.

65.Chichlowski, M. Metabolic and physiological impact of probiotics or direct-fed microbials on poultry/M. Chichlowski, J. Croom, B.W. McBride et al.//Intl. J. Poult. Sci. - 2007. -V. 6, No 10. - P. 694-704.

66. Choct, M. Chemical and physical characteristics of grains related to variability in energy and amino acid availability in poultry/M. Choct, R. Hughes//Crop Pasture Sci. - 1999. - V. 50. - P. 689-702.

67. Choct, M. Feed Non-Starch Polysaccharides: Chemical Structures and Nutritional Significance / M. Choct // Feed Milling International. - 1997. -No 6. -P. 13 - 26.

68.Choudhari, A. Prebiotics and probiotics as health promoters/A. Choudhari, S. Shinde, B.N. Ramteke//Vet. World. - 2008. - No 1. - P. 59-61.

69.Collado, M.C. Adhesion of selected Bifidobacterium strains to human intestinal mucus and the role of adhesion in enteropathogen exclusion/M.C. Collado, M. Gueimonde, M. Hernandez, Y. Sanz, S. Salminen//J. Food Prot. -2005. - V. 68, No 12. - P. 2672-2678.

70. Collins, M.D. Probiotics, prebiotics and, symbiotics: approaches for modulating the microbial ecology of the gut/M.D. Collins, G.R. Gibson//Amer. J. Clin. Nutr. - 1999. - V. 69. - P. 1052S-1057S.

71. Crisol-Martínez, E. Sorghum and wheat differentially affect caecal microbiota and associated performance characteristics of meat chickens/E. Crisol-Martínez, D. Stanley, M.S. Geier, R.J. Hughes, R.J. Moore//Peer J. - 2017. - V. 5. - P. e3071.

72.Dankowiakowska, A. Probiotics, prebiotics and synbiotics in poultry: mode of action, limitations, and achievements/A. Dankowiakowska, I. Kozlowska, M. Bednarczyk//J. Central Eur. Agric. - 2013. - V. 14. - P. 467-478.

73.Deng, P., Intestinal microbiome of poultry and its interaction with host and diet/ P. Deng, Yu. Zhongtang // Gut Microbesv., - 2014. - № 5(1). - P. 108119.

74.Esmaeilipour, O. Effects of diet acidification and xylanase supplementation on performance, nutrient digestibility, duodenal histology and gut microflora of broilers fed wheat based diet/ O. Esmaeilipour, H. Moravej, M.Shivazad et al.// Br. Poult. Sci. - 2012. - V. 53(2). - P.235-244.

75.Fuller, R. Probiotics in man and animals/R. Fuller//J. Appl. Bacterol. - 1989. - V. 66. - P. 806-830.

76.Fuller, R. The chicken gut microflora and probiotic supplements/R. Fuller//J. Poult. Sci. - 2001. - V. 38. - P. 189-196.

77. Garcia, V. Effect of formic acid and plant extracts on growth, nutrient digestibility, intestine mucosa morphology, and meat yield of broilers/V. Garcia, P. Catala-Gregori, F. Hernandez, M.D. Megias, J. Madrid//J. Appl. Poult. Res. -2007. - V. 16. - P. 555-562.

78. Geier, M.S. Indigestible carbohydrates alter the intestinal microbiota but not influence the performance of broiler chickens/M.S. Geier, V.A. Torok, G.E. Allison, Ophel-Keller K., R.J. Hughes//J. Appl. Microbiol. - 2009. - V. 106, No 5. - P. 1540-1548.

79. Gibson, G.R. Dietary modulation of the human colonic microbiota: introducing the concept of prebiotics/G.R. Gibson, M. Roberfroid//J. Nutr. - 1995. -V. 125. - V. 1401-1412.

80.Guardia, S. Effects of stocking density on the growth performance and digestive microbiota of broiler chickens/S. Guardia, B. Konsak, S. Combes, F. Levenez, L. Cauquil et al.//Poult. Sci. - 2011. - V. 90, No 9. - P. 1878-1889.

81.Hassanein, S.M. Effect of probiotic (Saccharomyces cerevisiae) adding to diets on intestinal microflora and performance of Hy-Line layers hens/S.M. Hassannein, N.K. Soliman//J. Amer. Sci. - 2010. - V. 6. - P. 159-169.

82.Hassef, D. Bacterial adaptation to oxidative stress: implications for pathogenesis and interaction with phagocytic cells/D. Hassef, M. Cohen//FASEB J. -1989. - V.3. - P. 2514-2582.

83.Havenstein, G.B. Growth, livability, and feed conversion of 1957 versus 2001 broilers when fed representative 1957 and 2001 broiler diets/G.B. Havenstein, P.R. Ferket, M.A. Qureshi//Poult. Sci. - 2003. - V. 73. - P. 1500-1508.

84.Huang, M.K. Effects of Lactobacilli and an acidophilic fungus on the production performance and immune responses in broiler chickens/M.K. Huang, Y.J. Choi, R. Houde, J.W. Lee, B. Lee, X. Zhao//Poult. Sci. - 2004. - V. 83. - P. 788-795.

85.Huang, R.L. Dietary oligochitosan supplementation enhances immune status of broilers/R.L. Huang, Y.L. Yin, M.X. Li et al.//J. Sci. Food Agric. - 2007. - V. 87. - P. 153-159.

86.Hübener, K. Bacterial responses to different dietary cereal types and xylanase supplementation in the intestine of broiler chicken/K. Hübener, W. Vahjen, P. Simon//Arch. Anim. Nutr. - 2002. - V. 56. - P. 167-187.

87. Jang, I.S. Effect of a commercial essential oil on growth performance, digestive enzyme activity and intestinal microflora population in broiler chickens/ I.S. Jang, Y.H. Ko, S.Y. Kang, C.Y. Lee//Anim. Feed Sci. Technol. - 2007. -V. 134. - P. 304-315.

88. Jiang, H.Q. Effect of stachyose supplementation on growth performance, nutrient digestibility and caecal fermentation characteristics in broilers/H.Q. Jiang, L.M. Gong, Y.X. Ma, Y.H. He, D.F. Li, H.X. Zhai//Br. Poult. Sci. -2006. - V. 47. - P. 516-522.

89.Kannan, M. Influence of prebiotics supplementation on lipid profile of broilers/M. Kannan, R. Karunakaran, V. Balakrishnan, T.G. Prabhakar//Intl. J. Poult. Sci. - 2005. - V. 4, No 12. -P. 994-997.

90.Kerr, A. K. A systematic review metaanalysis and metaregression on the effect of selected competitive exclusion products on Salmonella spp. prevalence and concentration in broiler chickens/ A. K. Kerr, A. M. Farrar, L. A. Waddell, W. Wilkins, B. J. Wilhelm, O. Bucher, R.W. Wills, R.H. Bailey, C. Varga, S. A. McEwe // Prev. Vet. Med.. - 2013. - V. 111. - P.112-125.

91.Khan, R.U. The application of probiotics in poultry production/R.U. Khan, S. Naz//World's Poult. Sci. J. - 2013. - V. 69, No 3. - P. 621-632.

92.Kizewetter-Swid, M. Bacterial microflora of the chicken embryos and newly hathed chicken/M. Kizewetter-Swid, M. Binek//J. Anim. Feed Sci. - 2008. -V. 17. - P. 224-232.

93.Knudsen, K.E. Fiber and nonstarch polysaccharide content and variation in common crops used n broiler diets/K.E. Knudsen//Poult. Sci. - 2014. - V. 93. - P. 2380-2393.

94.Latorre, J.D. Effects of the inclusion of a Bacillus direct-fed microbial on performance parameters, bone quality, recovered gut microflora, and intestinal morphology in broilers consuming a grower diet containing corn distillers dried grains with solubles/J.D. Latorre, X. Hernandez-Velasco, J.L. Vicente, R. Wolfenden, B.M. Hargis, G. Tellez//Poult. Sci. - 2017. - V. 96. - P. 27282735.

95.Lee, K.W. Effects of dietary essential oil components on growth performance, digestive enzymes and lipid metabolism in female broiler chickens/K.W. Lee, H. Evert, H.J. Kappert, M. Frehner, R. Losa, A.C. Beynen//Br. Poult. Sci. -2003. - V. 44. - P. 450-457.

96.Lee, K.-W. Essential ,oils in broiler nutrition/K.-W. Lee, H. Everts, A.C. Beynen//Intl. J. Poult. Sci. - 2004. - V. 3. - P. 738-752.

97.Li, X. Effects of supplementation of fructo-oligosaccharide and/or Bacillus subtilis to diets on performance and intestinal microflora in broilers/X. Li, L.Q. Liu, C.L. Xu//Arch. Tierz. - 2008. - V. 51. - P. 64-70.

98.Lin, S.Y. Effects of supplement with different level of bacillus coagulans as probiotics on growth performance and intestinal microflora populations of broiler chickens/S.Y. Lin, A.T.Y. Hung, J.J. Lu//J. Anim. Vet. Adv. - 2011. - V. 10, No 1. - P. 111-114.

99.Lumpkins, B.S. Evaluation of the bacterial community and intestinal development of different genetic lines of chickens/B.S. Lumpkins, A.B. Batal, M.D. Lee//Poult. Sci. - 2010. - V. 89. - P. 1614-1621.

100. Manukyan, V.A. Cellobacterin-T in broiler diets / V.A. Manukyan, G.Yu Laptev., I.N. Nikonov, G.V. Ignatova, G.T. Aidinyan // XIVth European Poultry Conference Conference Information and Proceedings. - Birger Svihus, Editor. - 2014. - P. 559.

101. Mitsch, P. CRINA poultry reduces colonization and proliferation of Clostridium perfringens in the intestine and faeces of broiler chickens/P. Mitsch, B. Kohler, C. Gabler, R. Losa, K. Zitterl-Eglseer//Proc. 11th Eur. Poultry Conf. - Bremen (Germany), 2002. - P. 6-10.

102. Molnar, A.K. Effect of different concentrations of Bacillus subtilis on growth performance, carcass quality, gut microflora and immune response of broiler chickens/A.K. Molnar, B. Podmaniczky, P. Kürti, I. Tenk, R. Glavits, G.Y. Virag, Z.S. Szabo//Br. Poult. Sci. - 2011. -V. 52, No 6. - P. 658-665.

103. Mountzouris, K.C. Effects of a multi-species probiotic on biomarkers of competitive exclusion efficacy in broilers challenged with Salmonel^ enter-itidis/K.C. Mountzouris, C. Balaskas, I. Xanthakos, A. Tzivinikou, K. Fegeros//Br. Poult. Sci. - 2009. - V. 50, No 4. - P. 467-478.

104. Mountzouris, K.C. Evaluation of the efficacy of a probiotic containing Lactobacillus, Bifidobacterium, Enterococcus, and Pediococcus strains in

promoting broiler performance and modulating caecal microflora composition and metabolic activities/K.C. Mountzouris, P. Tsirtsikos, E. Kalamara, S. Nitsch, G. Schatzmayr, K. Fegeros//Poult. Sci. - 2007. - V. 86, No 2. - P. 309-317.

105. Nakphaichit, M. The effect of including Lactobacillus reuteri KUB-AC5 during post-hatch feeding on the growth and ileum microbiota of broiler chickens/M. Nakphaichit, S. Thanomwongwattana, C. Phraephaisarn, N. Sakamoto, S. Keawsompong, J. Nakayama, S. Nitisinprasert//Poult. Sci. - 2011.

- V. 90. - P. 2753-2765.

106. Nhung, N.T. Antimicrobial resistance in bacterial poultry pathogens: A review/N.T. Hnung, N. Chansiripornchai, J.J. Carrique-Mas//Front. Vet. Sci.

- 2017. - V. 4. - P. 126.

107. O'Dea, E.E. Investigating the effects of commercial probiotics on broiler chick quality and production efficiency/E.E. O'Dea, G.M. Fasenko, G.E. Allison, D.R. Korver, G.W. Tannock, L.L. Guan//Poult. Sci. - 2006. -V. 85. - P. 1855-1863.

108. Ohashi, Y. Health-beneficial effects of probiotics: its mode of action/Y. Ohashi, U. Ushida//Anim. Sci. J. - 2009. - V. 80. - P. 361-371.

109. Patterson, J.A. Application of prebiotics and probiotics in poultry pro-duction/J.A. Patterson, K.M. Burkholder//Poultry Sci. - 2003. - V. 82. - P. 627-631.

110. Pilarski, R. Assessment of the effect of a-galactosides injected during embryogenesis on selected chicken traits/R. Pilarski, M. Bednarczyk, M. Lisowski, A. Rutkowski, Z. Bernacki, M. Wardenska, K. Gulewicz//Folia Biologica. - 2005. - V. 53, No 1-2. - P. 13-20.

111. Pourakbari, M. Probiotic level effects on growth performance, carcass traits, blood parameters, cecal microbiota, and immune response of broilers/M. Pourkbari, A. Seidavi, L. Asadpour, A. Martinez//Anais Acad. Bras. Ciênc. - 2016. - V. 88, No 2. - P. 1011-1021.

112. Rantala, M. Prevention of the growth of Salmonella infantis in chickens by flora of the alimentary tract of chickens/M. Rantala, E. Nurmi// Br. Poult. Sci. -1973. -V. 14, No 6. - P. 627-630.

113. Rebole, A., Effects of inulin and enzyme complex, individually or in combination, on growth performance, intestinal microflora, cecal fermentation characteristics, and jejunal histomorphology in broiler chickens fed a wheat-and barley-based diet/A. Rebole, L.T. Ortiz, M.I. Rodriguez, C. Alzueta, J. Trevino, S. Velasco//Poult. Sci. - 2010. - V. 89. - P.276-286.

114. Rehman, H. Indigenous bacteria and bacterial metabolic products in the gastrointestinal tract of broiler chickens/ H. Rehman, W. Vanjen, W. Awad et al.// Arch. Anim. Nutr. - 2007. - V. 61. - P. 319-335.

115. Rehman, H. Influence of fermentable carbohydrates on the intestinal bacteria and enteropathogens in broilers/H. Rehman, W. Vanjen, A. Kohl-Parizini, A. Ojaz, J. Zentek//World's Poult. Sci. J. - 2009. - V.65, No 1. -P.75-90.

116. Rigby, C. Some factors affecting Salmonella typhymurium infection and shedding in chickens raised on litter/C. Rigby, J. Pettit//Avian Dis. - 1979. -V. 23. - P. 442-455.

117. Rodriguez, M.L. Wheat- and barley-based diets with or without additives influence broiler chicken performance, nutrient digestibility and intestinal mi-croflora/ M.L. Rodriguez, A. Rebole, S. Velasco, L.T. Ortiz, J. Trevino, C. Alzueta//J. Sci. Food Agric. - 2011. - V. 92, No 1. - P. 184-190.

118. Rubio, L.A. Correlations between changes in intestinal microbiota composition and performance parameters in broiler chickens/L.A. Rubio, M.J. Peinado, R. Ruiz, E. Suarez-Pereira, C.O. Mellet, J.M.G. Fernandez//J. Anim. Physiol. Anim. Nutr. - 2014. - V. 99, No 3. - P. 418-423.

119. Ruiz, R. Effects of feed additives on ileal mucosa-associated microbiota composition of broiler chickens/R. Ruiz, M.J. Peinado, I. Aranda-Olmedo, L.

Abecia, E. Suarez-Pereira et al.//J. Anim. Sci - 2015. - V. 93, No 7. - P. 34103420.

120. Salanitro, J.P. Bacteria isolated from the duodenum, ileum, and cecum of young chicks/J.P. Salanitro, I.G. Blake, P.A. Muirehead, M. Maglio, J.R. Goodman//Appl. Environ. Microbiol. - 1978. - V. 35. - P. 782-790.

121. Saleh, A. Aspergillus niger reduces skeletal muscles protein breakdown and stimulates growth in broilers/A. Saleh, K. Hayashi//Res. Opinions Anim. Vet. Sci. - 2011. - V. 1. - P. 209-212.

122. Salminen, S. Gut flora in normal and disordered states/ S. Salminen, E. Isolauri, T. Onela// Chemotherapy. - 1995. - V. 41. -P.5-15.

123. Samli, H.E. Effects of Enterococcus faecium and dried whey on broiler performance, gut histomorphology and intestinal microbiota/H.E. Samli, N. Senkoylu, F. Koc, M. Kanter, A. Agma//Arch. Anim. Nutr. - 2007. - V. 61. - P. 42-49.

124. Scupham, A. J. Campylobacter colonization of the Turkeyintestine in the context of microbial community development / A. J. Scupham // Appl. Environ. Microbiol. - 2009. - № 75(11). - P. 3564-3571.

125. Servin, A.L. Adhesion of probiotic strains to the intestinal mucosa and interaction with pathogens/A.L. Servin, M.-H. Coconnier//Best Pract. Res. Clin. Gastroenterol. - 2003. - V. 17, No 5. - P. 741-754.

126. Shimizu, T. Complete genome sequence of Clostridiumperfringens, an anaerobic flesh-eater/T. Shimizu, K. Ohtani, H. Hirakawa, K. Ohshima, A. Yamashira et al.//Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 2002. - V. 99. - P. 996-1001.

127. Snel, J. Dietary strategies to influence the gastrointestinal microflora of young animals, and its potential to improve intestinal health/J. Snel, H.J.M. Harmsen, P.W.J.J. van der Wielen, B.A. Williams//Nutrition and Health of the Gastrointestinal Tract; Block M.C., Ed. - Wageningen (the Netherlands): Wageningen Academic Publishers, 2002. - P. 37-69.

128. Stanley, D. Intestinal microbiota associated with differential feed conversion efficiency in chickens/D. Stanely, S.E. Denman, R.J. Hughes, M.S. Geier, T.M. Crowley et al.//Appl. Microbiol. Biotechnol. - 2012. - V. 96. -P. 1361-1369.

129. Svihus, B. Function and nutritional roles of the avian caeca: A review/B. Svihus, M. Choct, H.L. Classen//World's Poult. Sci. J. - 2013. - V. 69, No 2.

- P. 2449-263.

130. Tellez, G. Utilizaton of rye as energy source affects bacterial translocation, intestinal viscosity, microbiota composition, and bone mineralization in broiler chickens//G. Tellez, J.D. Latorre, V.A. Kuttappan, M.H. Kogut, A. Wolfenden et al.//Frontiers in Genetics. - 2014. - V. 5. - Article 339.

131. Torok V. A., Ophel-Keller K., Hughes R. J., Forder R., Ali M., Macalpine R., Environment and age: impact on poultry gut microflora // Proceedings of the 19th Australian Poultry Science Symposium, Sydney, New South Wales, Australia, 12-14February. 2007, P. 149-152.

132. Torok, V.A. Application of methods for identifying broiler chicken gut bacterial species linked with increased energy metabolism/V.A. Torok, K. Ophel-Keller, M. Loo//Appl. Environ. Microbiol. - 2008. -V. 74, No 3. - P. 783-791.

133. Torok, V.A. Identification and characterization of potential performance-related gut microbiota in broiler chickens across various feeding trials/V.A. Torok, R.J. Hughes, L.L. Mikkelsen et al.// Appl. Environ. Microbiol. - 2011.

- V. 77, No 17. - P. 5868-5878.

134. van der Hoeven-Hangoor, E. Ileal microbiota composition of broilers fed various commercial diet compositions/E. van der Hoeven-Hangoor, J.M. van der Vossen, F.H. Schuren, M.W. Verstegen, J.E. de Oliveira, R.C. Montijn, W.H. Hendriks//Poult. Sci. - 2013. - V. 92. - P. 2713-2723.

135. van Krimpen, M.M. Effects of rye inclusion in grower diets on immune competence-related parameters and performance in broilers/M.M. van

Krimpen, M. Torki, D. Schokker//Poulry Sci. - 2017. - V. 96, No 9. - P. 3324-3337.

136. Vollard, E.J. Influence of amoxicillin, erythromycin and roxitromycin on colonization resistance and appearance of secondary colonization in healthy volunteers/ E.J. Vollard, H. Clasener//J. Antimicrob. Chemother. - 1987. -V.13. - P. 131-138.

137. Wei, S. Bacterial census of poultry intestinal microbiome / S.Wei, M. Morrison, Z. Yu. // Poult Sci.. -2013. - № 92. - P. 671-683.

138. Xiang Zhu, Y. 16SRNA- based analysis of microbiota from the cecum of broiler chickens/ Y. Xiang Zhu, T. Zhong, Y. Pandya et al.//Appl. Environ. Microbiol. - 2002. - V.68, No 1. - P.124-137.

139. Xiao, Y.P. Microbial community mapping in intestinal tract of broiler chicken/Y.P. Xiao, Y. Xiang, W.D. Zhou, J.G. Chen, K.F. Li, H. Yang//Poult. Sci. - 2017. - V. 96, No 5. - P. 1387-1393.

140. Yang, Y. Dietary modulation of gut microflora in broiler chickens: a review of the role of six kinds of alternatives to in-feed antibiotics/Y.Yang, P.A. Iji, M. Choct// World's Poult. Sci. J. - 2009. - V. 65, No 1. - P. 97-114.

141. Yin, Y. Exposure of different bacterial inocula to newborn chicken affects gut microbiota development and ileum gene expression/Y. Yin, F. Lei, L. Zhu, S. Li, Z. Wu et al.//ISME J. - 2010. - V. 4. - P. 367-376.

142. Yoruk, M.A. The effects of supplementation of humate and probiotic on egg production and quality parameters during the late laying period in hens/M.A. Yoruk, M. Gul, A. Hayirli, M. Macit//Poult. Sci. - 2004. - V. 83, No 1. - P. 84-88.

143. Zdunczyk, Z. Determinants and effects of postileal fermentation in broilers and turkeys part 1: gut microbiota composition and its modulation by feed additives/Z. Zdunczyk, J. Jankowski, S. Kaczmarek, J. Juskie-wicz//World's Poult. Sci. J. - 2015. - V.71, No 1. - P. 37-57.