Информационная система фотограмметрического моделирования микрообъектов для биологических исследований тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 05.25.05, кандидат технических наук Ходжер, Татьяна Андреевна

• Ходжер, Татьяна Андреевна
• кандидат технических наук
• 2008

Оглавление диссертации кандидат технических наук Ходжер, Татьяна Андреевна

ВВЕДЕНИЕ.

ГЛАВА 1. АНАЛИЗ ПРЕДМЕТНОЙ ОБЛАСТИ. ТЕОРЕТИЧЕСКИЕ ОСНОВЫ ФОТОГРАММЕТРИЧЕСКОЙ ОБРАБОТКИ СТЕРЕОСНИМКОВ, ПОЛУЧЕННЫХ НА РЭМ.

1.1. Анализ предметной области, формулировка требований предъявляемых к модели информационной системы сбора, анализа и хранения первичного биологического материала.

1.2. Теоретические основы фотограмметрической обработки стереопар, полученных с помощью растрового электронного микроскопа.

ГЛАВА 2. ПРОЕКТИРОВАНИЕ ИНФОРМАЦИОННОЙ СИСТЕМЫ ФОТОГРАММЕТРИЧЕСКОГО МОДЕЛИРОВАНИЯ МИКРООБЪЕКТОВ ДЛЯ БИОЛОГИЧЕСКИХ ИССЛЕДОВАНИЙ. НАБОР МЕТОДОВ ОПРЕДЕЛЕНИЯ ПАРАМЕТРОВ ДЛЯ ФОТОГРАММЕТРИЧЕСКОЙ ОБРАБОТКИ РЭМ-СТЕРЕОПАРЫ.,.

2.1. Модель информационной системы фотограмметрического моделирования микрообъектов для биологических исследований.

2.2. Технология получения стереопары на растровом электронном микроскопе (с увеличением до 500х).

2.2.1. Подготовка образцов исследования.

2.2.2. Условия получения информативной РЭМ-стереопары.

2.2.3. Метод получения стереопары на растровом электронном микроскопе (с увеличением до 500х).

2.2.4. Захват и перенос РЭМ-стереопары микрообъекта с микроскопа на персональный компьютер.

2.3. Определение входных параметров для фотограмметрической обработки РЭМ-стереопары.

2.3.1. Метод вычисления фокусного расстояния.

2.3.2. Метод определения опорных данных А г для внешнего ориентирования модели, формируемой по РЭМ-стереопаре.

2.4. Влияние суммарных ошибок при получении РЭМ-снимков.

2.4.1. Увеличение.

2.4.2. Дисторсия микроскопа.

ГЛАВА 3. ПРОГРАММНАЯ РЕАЛИЗАЦИЯ ИНФОРМАЦИОННОЙ СИСТЕМЫ ФОТОГРАММЕТРИЧЕСКОГО МОДЕЛИРОВАНИЯ МИКРООБЪЕКТОВ ДЛЯ БИОЛОГИЧЕСКИХ ИССЛЕДОВАНИЙ.

3.1. Проектирование информационной системы.

3.2. Модуль программной системы «РА-ЗБМ/Входные данные». Определение < входных параметров РЭМ-снимков.

3.3. Цифровая фотограмметрическая система г-брасе 1.2. Основные функциональные блоки.

3.4. Модуль программной системы «РА-ЗБМ/Работа с 3-Б моделью».

ГЛАВА 4. ПРАКТИЧЕСКОЕ ПРИМЕНЕНИЕ ИНФОРМАЦИОННОЙ СИСТЕМЫ ФОТОГРАММЕТРИЧЕСКОГО МОДЕЛИРОВАНИЯ

МИКРООБЪЕКТОВ ДЛЯ БИОЛОГИЧЕСКИХ ИССЛЕДОВАНИИ НА ОЗЕРЕ БАЙКАЛ.

4.1. Задача воссоздания рельефа поверхностного слоя чешуи байкальского омуля (COREGONUS AUTUMNALIS МЮЯАТОШ ОБОЯСО.

4.2. Определения пространственной структуры раковины байкальской остракоды для создания электронных коллекций.

4.3. Моделирования байкальских коловраток на примере Кеяатеыа Сосньеашб.

4.4. Решение задачи воссоздания ЦМР байкальских аэрозолей.

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Информационная система фотограмметрического моделирования микрообъектов для биологических исследований»

Актуальность темы. Использование современных информационных технологий в биологии существенно расширяет возможности традиционных подходов при изучении микромира: позволяет получать новую информацию об объекте исследования, осуществлять моделирование микрообъектов живой природы с сохранением их истинных размеров и форм, проводить компьютерную видовую диагностику в 3-D режиме и накапливать информацию о их биоразнообразии. Одним из перспективных методов моделирования трехмерной формы микрообъектов является фотограмметрический метод, предлагающий бесконтактную, неразрушающую реконструкцию образца на основе снимков высокого разрешения. Несмотря на то, что первые исследования в этом направлении начались в 70-80 годах прошлого века, микроскопия до сих пор остается актуальной областью для использования фотограмметрических методов. Большой вклад в развитие этого направления внесли работы Е.И. Калантарова, В.Н. Мельник, В.Н. Соколова, JI.K. Трубиной, А. Boyde, М. Ritter и др.

Создание информационной системы фотограмметрического моделирования микрообъектов, позволяющей получать, хранить и анализировать информацию о форме, рельефе поверхности и пространственных параметрах, необходимо в первую очередь для исследований, связанных с приспособительной изменчивостью, функциональной морфологией, с поиском принципиально новых ключевых признаков и с экологией микромира.

Таким образом, актуальной является задача построения специализированной информационной системы для создания цифровых 3-х мерных моделей микрообъектов живой природы с возможностью анализа их формы, сравнительной характеристикой ныне живущих организмов с их предками, сохранением информации о биоразнообразии биологических микрообъектов, в том числе и эндемичных видов, обитающих в оз. Байкал. 4

Целью диссертационной работы стала разработка информационной системы фотограмметрического моделирования микрообъектов для биологических исследований.

Достижение цели потребовало решения следующих задач:

1. Разработать модель информационной системы создания З-О модели микрообъекта (увеличение до 500х) основанную на методах фотограмметрического моделирования по стереопарам высокого разрешения;

2. Унифицировать и разработать методы получения стереопары микрообъекта на растровом электронном микроскопе (РЭМ) и определить входные параметры для построения цифровой матрицы рельефа микрообъекта;

3. Осуществить программную реализацию полуавтоматического восстановления цифровой модели рельефа микрообъекта;

4. Применить созданную информационную систему для решения ряда биологических и экологических задач.

Научная новизна работы заключается в следующем:

1. Предложена оригинальная модель информационной системы, позволяющая создавать, хранить и анализировать 3-0 модели микрообъектов (с увеличением до 500х) с последующим использованием полученной информации при решении некоторых биологических и экологических задач.

2. Унифицированы и разработаны методы получения стереопары микрообъекта на растровом электронном микроскопе и определения входных параметров для фотограмметрического построения цифровой 3-О модели микрообъекта (увеличение до 500х).

3. Впервые получены цифровые 3-х мерные модели байкальских видов микрообъектов: коловратки, остракоды; реализован алгоритм решения задачи подсчета возраста байкальского омуля; получены цифровые 3-0 модели байкальских аэрозолей.

Практическая значимость. Созданная информационная система на основе фотограмметрических методов и методов растрово-электронной микроскопии может быть использована специалистами, изучающими микрообъекты живой природы. В частности, система уже используется при решении задач функциональной морфологии, приспособительной изменчивости, систематики для определения видовой принадлежности при исследовании биоразнообразия оз. Байкал.

Научная обоснованность и достоверность результатов соискателя подтверждаются хорошим соответствием результатов многократных экспериментов на тестовых образцах с данными натурных экспериментов, а также опытом успешного применения разработанной информационной системы при исследовании биоразнообразия микромира оз. Байкал (остракоды, коловратки, чешуя байкальского омуля) и байкальских аэрозолей.

Структура работы. Диссертационная работа объемом (125 страниц, 42 рисунка, 4 таблицы) состоит из введения, четырех глав, заключения, списка литературы и трех приложений. Список литературы включает 118 наименований, в том числе 54 на иностранном языке.

Заключение диссертации по теме «Информационные системы и процессы, правовые аспекты информатики», Ходжер, Татьяна Андреевна

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

В диссертационной работе создана информационная система, позволяющая получать, обрабатывать, анализировать и хранить первичную биологическую информацию, что весьма актуально для накопления научных знаний о биологических микрообъектах при исследовании их морфологической изменчивости, систематики, экологии микромира и создании электронных коллекций и атласов-определителей.

Основные научные выводы работы заключаются в следующем:

1. Предложена и описана модель информационной системы фотограмметрического моделирования микрообъектов для получения, сбора и хранения первичных биологических данных на основе фотограмметрических методов и методов растрово-электронной микроскопии.

2. Унифицированы методы определения корректных параметров съемки на растровом электронном микроскопе для формирования стереопары микрообъекта (метод получения стереопары на РЭМ с увеличением до 500х; метод вычисления фокусного расстояния) и предложен новый метод определения опорных данных для фотограмметрического восстановления цифровой модели микрообъекта по РЭМ-стереопаре.

3. Выполнено проектирование и реализован комплекс прикладных программ, включающий базовый модуль - цифровую фотограмметрическую систему Ъ-8расе 1.2 (Ше-версия) и разработанные модули «РА-ЗБМ/ Входные данные», «РА-ЗБМ/ Работа с З-О моделью», обеспечивающие полуавтоматизированный процесс моделирования микрообъекта и анализ его цифровой З-Б модели.

4. Проведена апробация созданной информационной системы на конкретных примерах байкальских микрообъектов: воссоздание рельефа гиалодентинового слоя чешуи байкальского омуля (с возможностью определения возраста рыбы); создание трехмерной поверхности раковины байкальской остракоды (для создания электронных коллекций); моделирование байкальских коловраток (функциональная морфология; приспособительная изменчивость, поиск принципиально новых ключевых признаков); восстановление ЗБ модели байкальских аэрозолей (уточнение источников происхождения).

5. Создана первая версия биологической коллекции цифровых трехмерных изображений байкальских микрообъектов.

Список литературы диссертационного исследования кандидат технических наук Ходжер, Татьяна Андреевна, 2008 год

1. Агапов C.B. Фотограмметрия сканерных снимков, Москва «Картоцентр»—«Геодезиздат», 1996г., 176с.

2. Бримблкумб П. Состав и Химия атмосферы, М: Мир, 1988г., 351с.

3. Валендик Э.Н. Экологические аспекты лесных пожаров в Сибири // Сибирский экологический журнал.-1996.-№8.-С.1-8.

4. Ван Мальдерен, 1994, Ван Григен, Ходжер Т.В. Буфетов Н.С., Куценогий К. П. Анализ индивидуальных аэрозольных частиц в Сибирском регионе. Предварительные результаты // Оптика атмосферы и океана.-1994.-Том 7.-№8.-С. 1154-1162.

5. Гельман Р.Н., Никитин М.Ю., Дунц A.J1. Опыт использования и калибровки цифровых камер при совместной аэрофотосъемке с АФА // Геодезия и картография, № 1, 1999г. С. 25-31.

6. Гельман Р.Н., Никитин М.Ю., Констандогло Ю.В. Аэровидеосъемка : Области применения, методика фотограмметрической обработки // Геодезия и картография, № 6, 2001г. С. 25-31.

7. Гоулдстейн Д., Ньюбери Д., Эчлин П. Джой Д., Фиори Ч., Лифшиц Э. Растровая электронная микроскопия и рентгеновский микроанализ, Кн.1. М.: Мир, 1984. 303 стр.

8. Денисов О. Д. Maya 6.5 в упражнениях. Трехмерная анимация от замысла к видео. СПб.: Питер; Киев: Издательская группа BHV, 2006. -336 с.

9. Зданович В.Г. Вопросы дешифрования и фотограмметрической обработки аэроснимков. Л.: Изд. Академии наук, 1963г., 136с.

10. Ивлев Л.С., Довгалюк Ю.А. Физика атмосферных аэрозольных систем. С.-Пб.: СПбГУ, 1999. 256 с.

11. Иноземцев Д.П. Цифровая фотограмметрия оперативный способ развития геодезического обоснования в городах // Геодезия и картография, № 8, 2001 г, С. 35-38

12. Исидоров В.А. Экологическая химия. С.-Пб.: Химиздат, 2001. 304 с.

13. Кадничанский С.А., Хмелевский С.И. Обзор цифровых фотограмметрических систем //Ежегодный обзор ГИС-ассоциации, N 5, 1999.

14. Калантаров Е.И. Фотограмметрическое инструментоведение М.: Недра, 1986 г., 126 стр.

15. Калантаров Е.И., Сагандыкова М.Ж. Фотограмметрическая обработка электронно-микроскопических стереоснимков // Известия вузов. "Геодезия и аэрофотосъемка", 1983, N 2, с. 82-85.

16. Калантаров Е.И., Сагандыкова М.Ж. Фотограмметрическая калибровка электронных микроскопов // Известия вузов" Геодезия и аэрофотосъемка", 1983, N4, с. 76-80.

17. Келль Л.Н., Корнилов Ю.Н., Пономарев Е.В., Черкасов И. А. Фотограмметрия, М.: Недра, 1989 г., 319 стр.

18. Китов А.Д. Компьютерный анализ и синтез геоизображений, Новосибирск: Издат-во СО РАН, 2000, С.218.

19. Книжников Ю.Ф., Гельман Р.Н. Влияние угла засечки на точность автоматических стереоизмерений // Геодезия и картография, № 1, 1998, С.33-35

20. Книжников Ю.Ф. Гельман Р.Н. Использование цифровой фотограмметрической системы для определения скорости движения льда в горном леднике // Геодезия и картография, № 3, 1998

21. Книжников Ю.Ф., Гельман Р.Н. Компьютерная система для измерения цифровых стереопар при решении нетопографических задач и научных исследованиях // Геодезия и аэросъемка, № 2, 1999г, С. 136-149

22. Книжников Ю.Ф., Гельман Р.Н. Особенности применения цифровых фотограмметрических систем для изучения движения горных ледников // Геодезия и картография, № 3, 1998 С. 44-48

23. Книжников Ю.Ф., Кравцова В.И. Аэрокосмические исследования динамики географических явлений., МГУ, 1991, 205 с.

24. Козлов М.В., Прохоров А.В. Введение в математическую статистику, Издательство Московского университета, 1987г., 264с.

25. Кондратьев К.Я. Аэрозоль и климат. Л.: Гидрометеоиздат, 1991. -541с.

26. Куценогий К.П., Валендик Э.Н., Буфетов Н.С., Барышев В.Б. Эмиссии крупного лесного пожара в Сибири // Сибирский экологический журнал.-1996. -№8. С. 93-101.

27. Куценогий К.П., Куценогий П.К. Аэрозоли Сибири. Итоги семилетних исследований // Сибирский экологический журнал. 2000. - Т. VII.- №1. -С. 11-20.

28. Куштин И.Ф., Бруевич П.Н., Лысков Г.А. Справочник техника -фотограмметриста, М. : Недра, 1988г., 320 стр.

29. Куштин И.Ф., Фотограмметрия снимка и стереоскопических моделей, Издательство «Недра», 1984г., 168 стр. М.

30. Лили Р.Д. Гистологическая техника и практические применения. М.: Мир. 1969. с.489.

31. Линник Ю.В. Метод наименьших квадратов и основы математико-статистической теории обработки наблюдений, М: Государственное издательство физико-математической литературы, 1962 г.,352 стр.

32. Лобанов А.Н. Фотограмметрия, М.: Недра, 1984 г., 552 стр.

33. Мельник В.Н. Фотограмметрическая обработка снимков, полученных на растровом электронном микроскопе // автореферат диссертации на соискание ученой степени кандидата технических наук, Москва, 1981

34. Мельник В.Н., Соколов В.Н., Щебатинов М.П., Иванчук О.М. Анализ погрешностей стереоизмерений в растровой электронной микроскопии // Изв. АН. Сер. физ. 1987 г . Т. 51, N 3 , С. 468-474.

35. Микеров В.И., Гонин Г.Б. Технические возможности и особенности цифровых аэросъемок // Геодезия и аэросъемка, № 7, 1997г, С. 34-37

36. Мина М. В., Клевезаль Г. А. Использование регистрирующих структур при исследовании сезонных ритмов роста животных. Рост животных. М.: Наука, 1976

37. Ромейс Б. Микроскопическая техника, Издательство иностранной литературы, 1954

38. Соколов В.Н. Количественный анализ микроструктуры горных пород по их изображениям в растровом электронном микроскопе // Соросовский Образовательный Журнал, N8, 1997, стр.72-78

39. Соколов В.Н., Лебедев A.A., Юрковец Д.И., Риман Д.В. Мельник В.Н. Метод трехмерной реконструкции микрорельефа поверхности твердых тел по их РЭМ стереоизображениям // Изв. АН. Сер. физ. 1995г. Т.59 N 2, С. 28-35.

40. Соколов В.Н., Мельник В.Н., Юрковец Д.И. Анализ РЭМ-стереоизображений ( Материалы симпозиума РЭМ 95)// Изв. АН. Сер. физ. 1996 г . Т. 60, N 2 , С. 55-65.

41. Трубина JI.K. Цифровая фотограмметрическая обработка снимков для получения геопространственных данных при оценке состояния экосистем // автореферат диссертации на соискание ученой степени доктора технических наук, Новосибирск, 2002, 35 с.

42. Трубина JI.K. Стереомодели в изучении биологических объектов, монография Новосибирск : СГГА, 2006. — 136 с.

43. Труды центрального научно-исследовательского института геодезии аэросъемки и картографии, М.: Геодезиздат, выпуск 113, 1956г., 75 с.

44. Тюфлин Ю.С. Информационные технологии с применением фотограмметрии // Геодезия и картография, 2000, N2 С. 39-44.

45. Тягун M.JI. Изучение структуры и роста чешуи байкальского омуля (Coregonus autumnalis migratorius Georgi). Автореферат диссертационной работы на соискание ученой степени канд. биол. наук. Иркутск, 2004.12 с.

46. Тягун М.Л., Ходжер Т.А., Грачев М.А. Тонкая структура гиалодентинового слоя чешуи байкальского омуля (Coregonus autumnalis migratorius Georgi) методом воссоздания трехмерного изображения по стереопаре// Вопросы ихтиологии (в печати)

47. Урмаев H.A. Исследование по математической картографии. М.: Геодезиздат, 1953г., 106 с.

48. Финковский В.Н., Мельник В.Н. Исследование геометрических искажений снимков полученных на растровом электронном микроскопе //Геодезия и картография, N6, 1977, С. 38 44.

49. Финковский В.Н., Мельник В.Н. Фотограмметрическая обработка снимков, полученных на растровом электронном микроскопе //Геодезия и картография, 1978 г., N9, С. 46 52.

50. Ходжер Т.А. Исследование байкальских аэрозолей с помощью сканирующего электронного микроскопа // Пятая международная конференция «Естественные и антропогенные аэрозоли» Тезисы докладов; Санкт-Петербург. Санкт-Петербург, 2006г., С.78

51. Ходжер Т.А., Бычков И.В., Тягун M.JI. Использование методов цифровой фотограмметрии для воссоздания рельефа чешуи байкальского омуля // Вычислительные технологии, 2005, Т. 10., №4, С. 107 -110

52. Ходжер Т.В. Исследование состава атмосферных выпадений и их воздействия на экосистемы Байкальской природной территории // автореферат диссертации на соискание ученой степени доктора географических наук, 2005г.

53. Цифровая фотограмметрическая система ZSpace, версия 1.3 Руководство пользователя, М., 1999.

54. Чугунова Н. И. Руководство по методике определения возраста и роста рыб М.: АН СССР. 1959, 163с.

55. Шевченко В.П., Лисицын А.П., Виноградова А.А., Смирнов В.В., Серова В.В. Штайн Р. Аэрозоли Арктики результаты десятилетних исследований // Оптика атмосферы и океана. - 2000г., Том. 13, № 6 -7 .-С.551-576.

56. Юрченко В.И. Способ аналитической обработки неметрических снимков// Геодезия и картография. -2000.- N11 С. 23-30.

57. Юрченко В.И. Усовершенствование способа аналитической обработки неметрических снимков// Геодезия и картография. -2001.- N1 С. 33-36.

58. Anderson J. F., Kuhn M., Diebold U. Surface structure and morphology of Mg-segregated epitaxial Fe3 04 — 001 thin films on MgO ( 001) // Physical Review В 15 1997, VOL.56, N 15, pp. 9902 -9909

59. Bariani P., Chiffre L. De., Hansen H.N., Horsewell A. Investigation on the traceability of three dimensional scanning electron microscope measurements based on the stereo-pair technique // Precision Engineering, Vol. 29, 2005, p.219-228

60. Bethela E. W., Bastackyb S. J., Schwartza K. S. Interactive Stereo Electron Microscopy Enhanced with Virtual Reality // LBNL-48336, December 17, 2001

61. Boyde A. Improved digital SEM of cancellous bone: scanning direction of detection, through focus for in-focus and sample orientation // J. Anat., 2003, N 202, pp 183-194

62. Boyde A. Quantitative photogrammetric analysis and qualitative stereoscopic analysis of SEM images // J. Microscopy, 1973, N 98(3), P 452471

63. Burkhardt R. Vereinfachter numerischer Verzeichnungsausgleich fur Aufnahmen am Rasterelektronenmikroskop // Zeitschrift fur Vermessungswesen, 103 (1978), Heft 8, S.357-369.

64. Daniel P. Nicolella, Arthur E. Nicholls, James Lankford Machine vision photogrammetry: a technique for measurement of microstructural strain in cortical bone // Photogrammetric record, 1999, V16(N94), 695-704 p.

65. Davies P.A., Novovic M., Rändle V., Bowen P. Application of electron backscatter diffraction (EBSD) to fracture studies of ferritic steels // Journal of Microscopy, 2002, V. 205, N 3, p.278-284

66. Davies P. A., Rändle V. Combined application of electron backscatter diffraction and stereo-photogrammetry in fractography studies // Journal of Microscopy, Pt 1, 2001, Vol. 204, pp. 29-38.

67. Fait R., Malkusch W., Dimitropoulou C. Microvascular patterns of the human large intenstine: morphometric studies of vascular parameters in corrosion casts // Scanning Microscopy, 1998, Vol. 12, N 4, p. 641-651

68. Fuller K., Thong J.T.L., Breton B.C., Chambers T.J. Automated threedimensional characterization of osteoclastic resorption lacunae by stereoscopic scanning electron microscopy // J. Bone and Mineral Research, 1994, 9(1), p. 17-23

69. Ghosh, S.K., Nagaraja H. Scanning Electron Micrography and Photogrammetry // Photogrammetric Engineering and Remote Sensing, 1976, 42(5), pp. 649-657.

70. Hanchett V. E., Geiss R.H. Electron Microscopy of Carbon-Loaded Polymers // IBM J. RES. DEVELOP., 1983, VOL. 27 NO. 4, pp.348-355.

71. Hemmleb M. Photogrammetrische Auswertung elektronenmikroskopischer Bilddaten // Dissertation, eingereicht in der Fakultät 6 der Technische Universität Berlin, 2002, 142 s.

72. Hemmleb M., Albertz J. Microtopography The photogrammetric determination of friction surfaces // IAPRS International Archives of Photogrammetry and Remote Sensing, Vol. XXXIII, Amsterdam 2000

73. Hemmleb M, Albertz J. Photogrammetrische Auswertung Elektronenmikroskopischer Bilder Grundlagen und praktische Anwendungen //Photogrammetrie Fernerkundung Geoinformation, Heft 1 (1998), S.5-16

74. Hemmleb M., Albertz J., Schubert M., Gleichmann A., Köhler J.M. Digital microphotogrammetry with the Scanning Electron Microscope // International Archives of Photogrammetry and Remote Sensing, Vol. XXXI, Part B5, Vienna 1996, p. 225-230

75. Henri Veldhuis, George Vosselman The 3D reconstruction of straight and curved pipes using digital line Photogrammetry // Photogrammetric record, 1995, V15(N85), 147-148p.

76. Karara H.M. Non-Topographic Photogrammetry // Photogrammetric engineereing and remote sensing, 1976, N1, 37-47p.

77. Kammerud C., Abidi B., Huq S., Abidi M. 3d Nanovision for the Inspection of Micro-Electro-Mechanical Systems // The IEEE International Conference on Electronics, Circuits, and Systems, Gammarth, Tunisia, December 11-14 2005.

78. Kolednik 0., Stowe H.P. The stereophotogrammetric determination of the critical crack tip opening displacement // Enginering Fractum Mechanics, 1985, Vol. 21, No. l,pp. 145-155

79. Lacey A.J., Thacker N.A., Crossley S., Yates R.B. A multi-stage approach to thr dense estimation of disparity from stereo SEM images // Image and vision computing, 1998, N 16, 373-383p.

80. Lee H.S., Shin G.H., Park H.D. Digital Surface Modeling for Assessment of Weathering Rate of Weathered Rock in Stone Monuments // The International Archives of the Photogrammetry, Remote Sensing and Spatial Information Sciences, Vol. XXXIV, Part 5/W12

81. Lee R. M. A review of the methods of age and growth determination in fishes by means of scales // Fish Invest. 1920, Ser. II. V. 4. No 2. 32 pp.

82. M.C. van Wijk, H. Ziemann The use of Non-metric cameras in monitoring high speed processes // Photogrammetric engineereing and remote sensing, 1976, N1,91-103 p.

83. Marschall H., Danzer R. Three-Dimensional Analysis of Decorated Ceramic Fracture Surfaces by Automatic Stereophotogrammetry // J. Communications of the American Ceramic Society, 2002, 83 1. 223-225

84. Marschallinger R. Three-Dimensional Reconstruction and Modeling of Microstructures and Microchemistry in Geological Materials// Scanning, N 20, 65-73 (1998)

85. Maune D.F., Photogrammetric Self-Calibration of Scanning Electron Microscopes // Photogrammetric Engineering and Remote Sensing, 1976, 42(9), pp. 1161-1172.

86. New MeX Release: Version 4.2. // http://www.alicona.com

87. Niederoest M., Niederoest J., Skucka J. Shape from focus : fully automated 3D reconstruction and visualization of microscopic objects // ETH, Eidgenössische Technische Hochschule Zürich, Institute of Geodesy and Photogrammetry, 2003

88. Otto R. Kolbl Metric or Non-metric cameras // Photogrammetric engineereing and remote sensing, 1976, N1, 103-115 p.

89. Raspanti M., Binaghi E., Gallo I., Manelli A. A vision-based, 3D reconstruction technique for scanning electron microscopy: Direct comparison with atomic force microscopy// Microscopy Research and Technique, Vol. 67, Issue 1, 2005. Pages 1-7

90. Richards R.G., Wieland M., Textor M. Advantages of stereo imaging of metallic surfaces with low voltage backscattered electrons in a field emission scanning electron microscope // Journal of Microscopy, Vol. 1999, Pt 2, August 2000, pp. 115-123.

91. Ritter M., Sinram O., Albertz J., Hohenberg H., Quantative 3d reconstruction of BS // Microscope Microanal., 2003, Vol.9, P.476

92. Ritter, M., Sinram, O., Albertz, J., Hohenberg, H. Quantitative 3D Reconstruction of Biological Surfaces // Microscopy and Microanalysis, Vol. 9 (Suppl. 3), p. 476.

93. Scherer S. 3D Surface Analysis in Scanning Electron Microscopy // G.I.T. Imaging & Microscopy, 2002, N 3, p. 45-46

94. Scherrer S., Werth P., Pinz A., Tastsehl A., Kolednik O. Automatic surface reconstruction using SEM images based on a new computer vision approach// Electron Microscopy and Analysis, 161, 1999, pp. 107-110

95. Schwarz, H. Scherer, S. Going digital to provide 3D microscopy // 2003, VOL 11; PART l,p. 18-21

96. Schubert M., Gleichmann A., Hemmleb M., Albertz J., Kijhler J.M. Determination of the height of a microstructure sample by a SEM with a conventional and a digital photogrammetric method // Ultramicroscopy, 1996,Vol 63, p. 57-64

97. SEM Reconstruction of Surface Topography // http://www.samx.com/microanalysis/products/3DTOPx.html

98. Silva L., Petraglia A., Petraglia M. Stereo Vision System for Real Time Inspection and 3D Reconstruction // 7 International Symposium on Signal Processing and its Applications, Paris, France, July 1-4, 2003.

99. Stampfl J. Lokale Bruchzähigkeit metallischer Werkstoffe // Dissertation, Montanuniversität Leoben, 1996

100. Stampfl J., Scherer S., Kolednik O., Gruber M. Reconstruction of Surface Topographies by Scanning Electron Microscopy for Application in Fracture Research // Appl.Phys. A, 1996, V. 63, pp 341-346.

101. Stampfl J., Leitgeb R., Cheng Y. and Prinz F. Electro-discharge machining of mesoscopic parts with electroplated copper and hot-pressed silver tungsten electrodes // J. Micromech. Microeng., 2001,N 10, pp. 1-6.

102. Three dimensional surface reconstruction in Scanning Electron Microscopy //http://www.wemif.pwr.wroc.pl/zue/3drece/index.html

103. Tompson J. S. The periodic growth of scales in Gadidae as an index of age. //Marine Biological Assoc. №1. 109 p.

104. Tournas L., Tsakiri M., Kattis M. Displacement monitoring at the micron level using digital photogrammetry // 3rd IAG / 12th FIG Symposium, Baden, May 22-24, 2006

105. Trubina L.K., Guk A.P. Digital photogrammetry used to model biocenoses and surrounding objects // Proceeding of International Conference RDAMM 2001, V.6, Pt 2, pp 372 376.

106. Whaley R.A. An improved technique for cleaning fish scales. North American Journal of Fisheries Management. 1991. p. 234-236.

107. Wen-Jean Hsueh, Erik K. Antonsson Automatic high-resolution optoelectronic photogrammetric 3D surface geometry acquisition system // Machine Vision and Applications, 1997, N10, 98-113p.

108. Woods A., Holliman N., Merritt J. Stereoscopic Displays and Applications XIX (Proceedings Volume) // Proceedings of SPIE Vol. 6803 2008, 598 p.