Индукция ATM/ATR сигнального каскада в ответ на ДНК - повреждающее действие Helicobacter pylori тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.00.07, кандидат биологических наук Аникеенок, Марина Олеговна

• Аникеенок, Марина Олеговна
• кандидат биологических наук
• 2009

Оглавление диссертации кандидат биологических наук Аникеенок, Марина Олеговна

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ.

ВВЕДЕНИЕ.

1 ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.

1.1 Н. pylori.

1.1.1 История открытия Н. pylori.

1.1.2 Характеристика Н. pylori.

1.1.3 Распространение Н. pylori.

1.1.5 Основные гены, определяющие патогенность Н. pylori.

1.1.5 Воспалительный процесс вызванный Н. pylori.

1.2 Сигнальные пути, активируемые в клетке инфекцией Н. pylori.

1.2.1 Митоген активируемые (МА) протеинкиназы.

1.2.2 Белок CagA.

1.2.3 Фенотип «колибри».

1.3 Н. pylori как индуктор развития аденокарциномы.

1.3.1 Cag - индуцированное образование АФК и повреждение ДНК в клетках хозяина.

1.4 Активация ATM/ATR - каскада как индикатор повреждения ДНК.

1.4.1 ATM киназа.

1.4.2 Субстраты ATM.

1.4.3 ATR и ДНК-ПК.

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Индукция ATM/ATR сигнального каскада в ответ на ДНК - повреждающее действие Helicobacter pylori»

Актуальность проблемы. Онкологические заболевания являются одной из основных причин смерти во всем мире, и их частота неуклонно растет. XXI век ознаменовался бурным прогрессом в познании природы злокачественных новообразований, их причин и способов предотвращения. Аденокарцинома желудка — один из наиболее распространенных типов рака в мире. Это определяет актуальность поиска причин образования предраковых патологий желудка.

Известны три основные этиологические группы агентов, вызывающие развитие рака: канцерогенные вещества, физические и биологические факторы. Роль канцерогенов химической природы, а также различного вида облучений в повреждении ДНК, мутациях и развитии злокачественных новообразований неоспорима. В месте с тем, в этиологии злокачественных опухолей важную роль играют такие факторы, как инфекционные агенты различной природы. Пятая часть раковых заболеваний во всем мире возникает в результате хронических инфекций, основными возбудителями которых являются вирусы гепатита В (рак печени), вирусы папилломы человека (рак шейки матки), Helicobacter pylori (рак желудка), шистосомы (рак мочевого пузыря), печеночные двуустки (рак желчных протоков) и вирус иммунодефицита человека (ВИЧ) (саркома Капоши и лимфомы). По классификации ВОЗ, все эти агенты относятся к биологическим канцерогенам [Баженов, Баженова, 2006]. Достаточно изучена природа вирусного канцерогенеза, в то время как механизм развития рака в результате бактериальной инфекции до конца не ясен.

Существует убедительные доказательства того, что бактериальные инфекции ассоциируются с развитием различных типов рака. Например, Salmonella typhi ассоциируется с раком желчного пузыря [Vaishnavi et al., 2005; Lax, Thomas 2002; Dutta, 2002; Shukla, 2000], Streptococcus bovis - с раком толстой кишки [Biarc et al., 2004; Gold et al., 2004; Ellmerich et al., 2000; Zarkin et al., 1990], и Chlamydia pneumoniae — с раком легких [Littman et al., 2004; Koyi et al., 2001; Anttila et al., 2003]. Важные механизмы, с помощью которых бактериальные агенты могут вызывать канцерогенез, включают хроническую инфекцию и иммунную реакцию [Kuper et al., 2000]. Было показано, что некоторые бактерии выделяют токсины, нарушающие клеточный цикл, в результате чего изменяется характер роста клеток [Liftman et al., 2004; Koyi et al., 2001]. В результате повреждений ДНК, аналогичных тем, которые вызывают канцерогенные вещества, нарушается контроль нормального клеточного деления и апоптоза [Nougayrede et al., 2005; Lara-Tejero et al., 2000].

В настоящее время доказана роль Н. pylori в патогенезе гастрита, дуоденита, язвенной болезни желудка и двенадцатиперстной кишки, лимфомы желудка и рака желудка [Григорьев, 1999]. В то же время вопрос об абсолютной роли Н. pylori в возникновении рака желудка остается спорным, и многие специалисты не согласны с ведущей ролью этой бактерии в инициации канцерогенеза. Такие противоречия объясняются тем, что практически не изучено действие патогена непосредственно на ДНК хозяина и молекулярный статус клетки в отсутствии иммунных реакций, влияния другой микрофлоры и т. д. Понимание тонких молекулярных механизмов атаки Н. pylori на эукариотические клетки, повреждения клеточного материала, в том числе и ДНК, а также влияния на сигнальные каскады клетки позволит правомерно говорить о данной бактерии как об опасном канцерогене. Актуальность таких исследований несомненна, а установление факта генотоксичности инфекции Н. pylori обосновывает необходимость в информировании населения и проведении масштабной эрадикации данного патогена.

Цель и задачи исследования. Целью настоящего исследования явилось установление генотоксического потенциала Н. pyloriсвязанного с активацией ATM протеинкиназы и ее субстратов в ответ на инфекцию, вызванную данным патогеном в культуре клеток аденокарциномы желудка и карциномы эндометрия человека.

В связи с поставленной целью решались следующие задачи:

1. Оценить генотоксический потенциал штаммов Helicobacter pylori дикого типа и дефектного по островку патогенности APAI прямым методом ДНК-комет.

2. Установить возможность активации ключевых киназ: атаксия-телеангиэктазия, мутантная (ATM), и относящаяся к атаксии-телеангиэктазии (ATR) клеточного ответа в ответ на двунитевые разрывы ДНК в клетках HeLa и AGS после инфекции Helicobacter pylori.

3. Охарактеризовать спектр известных субстратов ATM/ATR киназ, активированных инфекцией Helicobacter pylori.

4. Идентифицировать белки, фосфорилированные ATM киназой после инфекции Helicobacter pylori; проанализировать степень активации ее известных субстратов и новых белков, впервые идентифицированных как субстраты ATM киназы.

5. Выявить возможное участие киназ ATM и ДНК-зависимой протеинкиназы (ДНК-ПК) в активации митоген активированных (МА) белков стрессового ответа и формировании фенотипа «колибри».

Научная новизна. Впервые получены данные об активации ATM/ATR сигнального каскада, ключевого в ответе на появление двунитевых разрывов ДНК, после инфекции штаммами Н. pyori Р12 дикого типа и мутанта Н. pylori APAI, дефектного по островку патогенности, в культуре клеток аденокарциномы желудка (AGS) и карциномы эндометрия человека (HeLa). Впервые приведены результаты, указывающие на активацию целого ряда субстратов ATM киназы в ответ на инфицирование хеликобактером. С помощью молекулярных методов и методов биоинформатики впервые проведен системный анализ белков, фосфорилированных после инфицирования Н. pylori. В ходе работы идентифицированы новые, неизвестные субстраты ATM киназы, фосфорилированные после инфицирования Н. pylori. Впервые с помощью прямого метода ДНК-комет получены свидетельства наличия ДНК-повреждающего действия штамма

H. pylori APAI, что позволило показать наличие генотоксического потенциала бактерии вне зависимости от присутствия островка патогенности. Установлено, что ATM киназа принимает участие в формировании фенотипа «колибри», а также взаимодействует с внеклеточной сигнал-регулируемой киназой (ERK) - белком стрессового ответа клетки. Представленные результаты вносят вклад в понимание роли инфекции Н. pylori в молекулярном ответе атакованной клетки и ее последующей неопластической трансформации на пути развития аденокарциномы желудка.

Практическая значимость. Проведенные исследования намечают новое направление в предотвращении развития онкологических патологий эпителиальной этиологии, связанных с инфекцией Н. pylori. Особое значение имеет обнаруженный факт наличия генотоксических изменений ДНК эпителиальных клеток при инфицировании штаммом Н. pylori APAI, дефектным по островку патогенности и свидетельствующий об отсутствии связи повреждений ДНК эпителия человека и генетических детерминант патогенности, известных на сегодняшний день для хеликобактера. В ходе экспериментальной работы разработана и опробована оригинальная методика цитометрического определения фосфорилированной формы ATM киназы, позволяющая оценить уровень активации киназ после инфицирования.

Полученные результаты вносят вклад в понимание молекулярных механизмов клеточного ответа на инфекцию Н. pylori и впервые демонстрируют наличие фосфорилирования субстратов ATM, среди которых обнаружены не только известные белки клеточного цикла, но и новый сплайсинг-фактор. Данные результаты имеют фундаментальное значение для развития молекулярно-биологических методов анализа и борьбы с инфекцией Н. pylori. Возможность идентификации активированных белков с помощью MALDI-анализа после двухмерного электрофореза позволяет упростить и удешевить процедуру идентификации, исключив использование широкого спектра дорогостоящих антител.

Связь работы с научными программами и собственный вклад автора в исследования. Работа проводилась в соответствии с тематическим планом НИР КГУ 1.15.06 «Механизмы регуляции функциональной активности клетки». Исследования автора по тематике работы поддержаны аналитической федеральной программой «Развитие научного потенциала высшей школы», гранты № 2.1.1.1005, 2.1.1.3222, 2.1.1./920 и РФФИ 07-0401051. Авторские исследования получили персональную поддержку фонда Палаты депутатов г. Берлина (2006-2007гг.), что позволило на базе Института Инфекционной Биологии Макса Планка, (Берлин, Германия) провести цитометрические исследования, MALDI-анализ и иммунологический анализ, а также детекцию повреждений ДНК методом ДНК-комет. Научные положения диссертации и выводы базируются на результатах собственных исследований автора.

Апробация работы. Основные положения диссертации доложены и обсуждены на конференциях НОЦ КГУ Казанского государственного университета «Материалы и технологии XXI века» (Казань, 2003, 2004), Междисциплинарной конференции с международным участием «Новые биокибернетические и телемедицинские технологии XXI века для диагностики и лечения заболеваний человека» (Петрозаводск, 2003), IX Всероссийской научно-практическая конференции «Молодые ученые в медицине», (Казань, 2004), IV съезд Российского общества биохимиков и молекулярных биологов (Новосибирск, 2008), международной конференции "Modern biology Bionews" (Казань, 2008), а также на итоговых конференциях КГУ (2008-2009).

Положения, выносимые на защиту: 1. Длительное инфицирование клеток AGS мутантным штаммом Н. pylori APAI, дефектным по островку патогенности, приводит к появлению двойных разрывов ДНК атакованной клетки.

2. Инфицирование Н. pylori Р12 культуры клеток AGS и HeLa приводит к активации ATM протеинкиназы и не приводит к фосфорилированию ATR протеинкиназы.

3. В результате запуска ATM сигнального каскада инфекцией Н. pylori активируются субстраты ATM киназы — белки чекпоинт 1 (Chkl), чекпоинт 2 (Chk2), репликационный белок 32А (RPA32A) и гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин F (hnRNP F).

4. В качестве субстрата ATM киназы, активированной в ответ на инфицирование Н. pylori, впервые идентифицирован новый белок -сплайсинг-фактор аргинин/серин 3.

5. ATM протеинкиназа вносит вклад в формирование фенотипа «колибри» — характерного морфологического изменения клеток эпителия человека при инфицировании их Н. pylori Р12.

6. Ингибирование фосфорилирования ATM протеинкиназы приводит к снижению, или к полному отсутствию активации белка стрессового ответа клетки ERK.

Публикации. По теме диссертации опубликовано 9 научных работ.

Структура и объем диссертации. Работа изложена на 113 страницах, содержит 3 таблицы и 27 рисунков и состоит из введения, обзора литературы, описания материалов и методов, результатов исследований, обсуждения результатов, выводов и списка литературы, включающего 235 источников, из них 210 на иностранном языке.

Заключение диссертации по теме «Микробиология», Аникеенок, Марина Олеговна

выводы

1. Штамм хеликобактера, дефектный по островку патогенности, обладает генотоксическим эффектом.

2. Установлено, что инфекция Н. pylori активирует ключевую ATM киназу клеточного ответа на двунитевые разрывы ДНК в эпителиальных клетках желудка и эндометрия, независимо от наличия белка CagA.

3. Активированная ATM киназа фосфорилирует белок Chk2, регулирующий остановку клеточного цикла и RPA32A, участвующий в репарации ДНК.

4. Идентифицированы новые субстраты ATM киназы, фосфорилируемые ею в ответ на инфицирование хеликобактером: гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин F и сплайсинг фактор аргинин/серин 3.

5. ATM киназа взаимодействует белком ERK 1,2, который принимает участие в формировании фенотипа «колибри», классического морфологического ответа на инфицирование хеликобактером.

Заключение

В 2003 г. исполнилось 20 лет с тех пор, когда впервые удалось выделить культуру бактерий Н. pylori. С того времени установлено, что Н. pylori является причиной развития хронического гастрита, важнейшим фактором патогенеза язвенной болезни двенадцатиперстной кишки и желудка [Webb et al., 1996; Ивашкин, 2000; Goldblum et al., 2002]. Гиперплазия и метаплазия желудочного эпителия, как последствия Н. pylori инфекции, значительно увеличивают риск развития рака желудка и MALT-лимфомы [Kuipers, 1998].

Многочисленные эпидемиологические исследования выявили широкое распространение Н. pylori-инфекции - ей подвержено около 60% населения планеты, а ряд исследователей называет ее наиболее частой инфекцией человека наряду со Strepococcus mutans, вызывающим кариес [Graham, 1997].

Вместе с тем, как оказалось, лишь у небольшой части инфицированных носителей Н. pylori возникают язвы и опухоли верхних отделов желудочно-кишечного тракта. Данное обстоятельство стало причиной многочисленных споров и дискуссий о хеликобакторе, как причине злокачественных новообразований.

Исследования последних лет, направленные на изучение патогенеза Н. pylori, определили, что степень риска заболевания определяют специфические взаимодействия между самим патогеном и организмом-носителем. Эти взаимодействия, в свою очередь, напрямую зависят от штамм—специфических бактериальных факторов и эффекторов, непосредственно индуцированных у носителя. В настоящее время к главным факторам патогенности Н. pylori относят как свойства самих бактерий (колонизация слизистой оболочки желудка, адгезивность к желудочному эпителию, внутриклеточную пенетрацию, цитотоксины, островок патогенности, специфическую реакцию на стресс), так и ответную реакцию макроорганизма на инфицирование (иммунный ответ, процессы апоптоза и пролиферации в слизистой оболочке гастродуоденальной зоны, изменение моторной функции желудка) [Voland, 2003].

Более 40 генов вирулентности Н. pylori собраны в одном из сегментов хромосомы бактерии, вследствие чего данный участок получил название островка патогенности. Его маркером считается иммунодоминантный белок с молекулярной массой 120-140 кД, кодируемый цитотокин-ассоциированным геном A—cagA. Кроме того, островок патогенности содержит гены IV типа системы секреции — обязательного атрибута вирулентности. Островок патогенности присутствует у 60-70% штаммов Н. pylori. Именно с CagA ассоциируется развитие аденокарциномы желудка. CagA транслоцируется в эпителиальные клетки организма-носителя, где подвергается Src-зависимому фосфорилированию и активизирует эукариотическую фосфотазу (SHP-2), приводя к дефосфорилированию протеинов эпителиальных клеток хозяина с их последующими морфологическими изменениями — формированию фенотипа «колибри».

Воспаление, индуцированное Н. pylori, может приводить к различным формам повреждений и разрушению эпителиальных клеток. Вместе с тем, активированные воспалительным процессом нейтрофилы генерируют активные формы кислорода и азота, которые могут вызывать окислительное повреждение ДНК, или разрушение самих клеток. Однако, эти реактивные радикалы повреждают ткани организма-носителя, не имея разрушительного потенциала для инфицирующих бактерий.

Накоплено большое количество эпидемиологических данных о связи бактериальной инфекции с развитием злокачественных новообразований, но, процессы, происходящие на молекулярном уровне и повреждающие ДНК в клетке, атакованной патогеном, практически не изучены.

Непосредственная причинно-следственная связь между Н. pylori инфекцией и аденокарциномой желудка была продемонстрирована в различных исследованиях in vivo [Honda et al., 1998; Sugiyama et al., 1998; Watanabe et al, 1998].

Необходимо учитывать, что бактерия Н. pylori является не единственным фактором, влияющим на состояние слизистой оболочки желудка. Поэтому представляется более корректным изучение возможности индукции повреждений ДНК эукариотических клеток при Н. pylori инфекции в модельных системах in vitro.

Детекция активации компонентов механизма ответа клетки на повреждения ДНК, позволяет сделать вывод о генотоксичности исследуемого объекта. Ключевыми белками клетки, активирующимися в ответ на двойные разрывы ДНК, являются ATM и ATR киназы, которые, в свою очередь, активируют множество различных каскадов, приводящих к апоптозу, репарации и остановке клеточного цикла.

Инициация ATM/ATR сигнальных каскадов изучена достаточно хорошо. Однако, в литературе отсутствуют данные о запуске данных сигнальных путей в ответ на инфекцию Н. pylori. В то же время по образованию активных форм данных киназ и их субстратов можно судить о произошедшем повреждении геномного материала при инфицировании Н. pylori.

ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ 2 МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЙ

2.1 Бактериальные штаммы и клеточные культуры

Клетки инфицировали штаммом Н. pyori Р12 cag+, vac+, дикого типа, выделенные из биоптата пациента с язвой двенадцатиперстной кишки [Schmitt, Haas, 1994], и мутантом Н. pylori APAI, дефектным по наличию островка патогенности [Odenbreit et al., 2001]. В работе были использованы две линии опухолевых клеток человека: HeLa (карцинома эндометрия) и AGS (АТСС CRL 1739 аденокарцинома желудка) (коллекция Института инфекционной биологии Макса Планка, Берлин, Германия).

2.2 Питательные среды и условия культивирования

Бактерии выращивали при 37 °С на GC-arape, содержащим 10 мкг/мл ванкомицин, в микроаэрофильных условиях.

Клетки культивировали в 6 - луночных плашках со средой RPMI 1640 (Invitrogen, Германия), содержащей 10% эмбриональной телячьей сыворотки о

FCS) (Biochrom, Германия), в атмосфере 5% СОг при 37 С. За 18 ч до инфицирования среду меняли среду на новую, не содержащую сыворотку.

2.3 Используемые антитела

Основные сведения об антителах, использованных в работе, представлены в таблице 1.

Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Аникеенок, Марина Олеговна, 2009 год

1. Аруин, Л. И. Морфологическая диагностика болезней желудка и кишечника Текст. / Л. И. Аруин, Л. Л. Каппулер, В. А. Исаков. — Хабаровск: Триада, 1998.- 187с.

2. Аруин, Л. И. Рак желудка Текст. / Л. И. Аруин, В. В. Власов // Рос. журн. гастроэнтерол., гепатол. и колопроктол. 1999. - Т.5. - С.23-25.

3. Аруин, Л. И. Хронический гастрит Текст. / Л. И. Аруин, П. Я. Григорьев, В. А. Исаков, Э. П. Яковенко. — Амстердам: Академический медицинский центр Амстердама, 1993. 362с.

4. Баженов, Л. Г. Регрессия злокачественных опухолей с помощью микроорганизмов и перспективы использования этого феномена в медицинской практике Текст. / Л. Г. Баженов, Т. Л. Баженова // Новые технологии в медицине. — СПб.: 2005. С. 111-113.

5. Баранская, Е. К. Язвенная болезнь и инфекция Helicobacter pylori Текст./ Е. К. Баранская // БОП. 2000. - Т.1. - С. 8-14.

6. Григорьев, П. Я. Показания и методы исследования больных на Helicobacter pylori Текст. / П. Я. Григорьев, В. Г. Жуховицкий, Э. П. Яковенко, Е. В. Таланова // Российский Гастроэнтерологический журнал. -1999. Т.1. - С.53-57.

7. Ивашкин, В. Т. Гастроэнтерология XXI века Текст. / В.Т. Ивашкин, Т. Л. Лапина // РМЖ. 2000. - Т. 8. - С. 697-703.

8. Комарова, Е. А. Супрессия р53: новый подход к преодолению побочных эффектов противоопухолевой терапии Текст. / Е. А. Комарова, А. В. Гудков // Биохимия. 2000.- Т. 65. - С. 48-56.

9. Кононов, А. В. Местный иммунный ответ на инфекцию Helicobacter pylori Текст./ А. В. Кононов // Рос. журн. гастроэнтерол., гепатол. и колопроктол. 1999. - Т. 2. -С.715-722.

10. Минушкин, О. Н. Некоторые аспекты взаимосвязи геликобактерной инфекции, полипоза и рака желудка Текст. / О. Н. Минушкин, С. Г. Бурков, Е. Г. Бурдина, А. М.Сербов // Рос. журн. гастроэнтерол., гепатол. и колопроктол. -2001. Т.З. - С.7-10.

11. Михельсон, В. М. Дефекты репарации ДНК и хромосом при наследственных заболеваниях человека Текст. / В. М. Михельсон // Успехи соврем, генет. 1979. - Т.8. - С.51-83.

12. Новикова, Л. Д. Экологические аспекты формирования хронического гастрита у детей Текст./ Л. Д. Новикова, Г. А. Метальникова, П. Г. Мальков // Материалы V сессии по изучению Helicobacter pylori, Омск, 1997. — С. 44— 45.

13. Окороков, А. Н. Диагностика болезней внутренних органов Текст. / А. Н. Окороков; Т. 1. Москва: Мед. лит, 1999. - 576с.

14. Островский, И. М. Роль хеликобактериоза в поражении желудка и двенадцатиперстной кишки Текст./ И. М. Островский // Терап. архив. —1998. Т.2. - С.73-76.

15. Пиманов, С. И. Эзофагит, гастрит и язвенная болезнь Текст. / С. И. Пиманов. Москва: Мед кн., 2000. — 377с.

16. Решетников, О. В. Серодиагностика хеликобактериоза в семьях Новосибирска Текст. / О. В Решетников, С. JI. Курилович // Рос. журн. гастроэнтерол., гепатол. и колопроктол. 1997. - Т.5. - С. 233-234.

17. Сиппонен, П. Гастрит-атрофический гастрит-кишечная метаплазия: обратима ли эта последовательность Текст. / П. Сиппонен, К. Сеппала // Рос. журн. гатроэнтерол., гепатол. и колопроктол. 1999. - Т.2. - С.30-35.

18. Чумаков, П. М. Функция р53: выбор между жизнью и смертью Текст. / П. М. Чумаков // Биохимия. 2000. -Т. 65. - С. 34-47.

19. Щербаков, П. JI. Эпидемиология инфекции Н. pylori. Текст. / Helicobacter pylori: революция в гастроэнтерологии / В. Т. Ивашкин, Ф. Мегро, Т. Л. Лапина.- Москва: Триада X, 1999. - С.14-20.

20. Abraham, R. T. Cell cycle checkpoint signaling through the ATM and ATR kinases/ R.T. Abraham // Genes Dev. 2001. - V.l5. - P.2177-2196.

21. Abraham, R. T. Mammalian target of rapamycin: immunosuppressive drugs uncover a novel pathway of cytokine receptor signaling Text. / R. T. Abraham // Curr. Opin. Immunol. 1998. - V. 10. - P. 330-336.

22. Agami, R. Distinct initiation and maintenance mechanisms cooperate to induce G1 cell cycle arrest in response to DNA damage Text. / R. Agami, R. Bernards // Cell. 2000. - V. 102. - P. 55-66.

23. Arlett, C. F. As assessment of the radiosensitivity of ataxia-telangiectasia heterozygotes Text. / C. F. Arlett, A. Priestly // Kroc Found Ser. 1985. - V. 19. P.101-109.

24. Armstrong, J. A. Response of Campylobacter pylori to antibiotics, bismuth and an acid-reducing agent in vitro an ultrastructural study Text. / J. A. Armstrong, S. H. Wee, C. S. Goodwin, D. H. Wilson // J Med Microbiol. - 1987. -V. 24.-P. 343-350.

25. Atherton, J. С. H. pylori virulence factors Text. / J. C. Atherton // Br Med Bull. 1998. - V.54. - P. 105-120.

26. Bakkenist, C. J. DNA damage activates ATM through intermolecular autophosphorylation and dimer dissociation Text. / C. J. Bakkenist, M. B. Kastan // Nature. 2003. - V.421. - P.499-506.

27. Bartek, J. Mammalian Gl- and S-phase checkpoints in response to DNA damage Text. / J. Bartek, J. Lukas // Curr. Opin. Cell Biol. 2001. - V. 13. - P. 738-747.

28. Binz, S. K. Replication protein A phosphorylation and the cellular response to DNA damage. Text. / S. K. Binz, A. M. Sheehan, S. M. Wold // DNA Repair. 2004.-V.3.-P. 1015-1024.

29. Bizzozero, G. Uber die schlauchformigen Drusen den Magen-Darms Kanals und die Besichungen ehres Epithelis zu dem oberflachenepitel der Scheimhcuit Text. / G. Bizzozero // Arch. Mikr. Anat. 1893. - V.42. - P.83-96.

30. Bjorkholm, B. Helicobacter pylori entry into human gastric epithelial cells: a potential determinant of virulence, persistence, and treatment failures

31. Text. / В. Bjorkholm, V. Zhukhovitsky, С. Lofman, К. Hulten, H. Enroth, M. Block, R. Rigo, P. Falk, L. Engstrand // Helicobacter. 2000. - V.5. - P. 148-154.

32. Blaser, M. J. Parasitism by the "slow" bacterium Helicobacter pylori leads to altered gastric homeostasis and neoplasia Text. / M. J. Blaser, J. Parsonnet //J Clin Invest. 1994. - V.94. - P.4-8.

33. Bode, G. The coccoid forms of Helicobacter pylori. Criteria for their viability Text. / G. Bode, F. Mauh, P. Malfertheiner // Epidemiol Infect. 1993. -V.lll.-P. 483-490.

34. Bomgarden, R. D. A novel protein activity mediates DNA binding of an ATR-ATRIP complex Text. / R. D. Bomgarden, D. Yean, M. C. Yee, K. A. Cimprich // J. Biol. Chem. 2004. - V. 279. - P. 13346-13353.

35. Brown, E. J. ATR disruption leads to chromosomal fragmentation and early embryonic lethality Text. / E. J. Brown, D. Baltimore // Genes Dev. 2000. - V.14. - P.397-402.

36. Brown, K. D. The mismatch repair system isrequired for S-phase checkpoint activation Text. / K. D. Brown, A. Rathi, R. Kamath, D. I. Beardsley, Q. Zhan, J. L. Mannino, R. Bacekaran // Nat. Genet. 2003. - V.33. - P. 80-84.

37. Christmann, M. Mechanisms of human DNA repair: an update Text. / M. Christmann, M. T. Tomicic, W. P. Roos, B. Kaina // Toxicology. — 2003. -V.193. — P.31-34.

38. Churin, Y. The Helicobacter pylori CagA protein targets the c-Met receptor and enhances the motogenic response Text. / Y. Churin, L. Al-Ghoul, O. Kepp, T. F. Meyer, W. Birchmeier, M. Naumann // J. Cell Biol. 2003. - V.161. -P. 249-255.

39. Concannon, P. ATM heterozigosity and cancer risk Text. / P. Concannon // Nat. Genet. 2002. - V.32. - P. 89-90.

40. Correa, P. Carcinogenesis, apoptosis and cell proliferation Text. / P. Correa, M. J. S. Miller// Brit Med Bull. 1998. - V.54. - P. 151-162.

41. Correa, P. Human gastric carcinogenesis: a multistep and multifactorial process-First American Cancer Society Award Lecture on Cancer Epidemiology and Prevention Text. / P. Correa // Cancer Res. 1992. - V.52. - P.6735-6740.

42. Correa, P. Human gastric carcinogenesis: A multistep and multifactorial process Text. / P. Correa II Cancer Res. 1992. - V.52. - P. 6735-6740.

43. Correa, P. Phenotypic and genotypic events in gastric carcinogenesis Text. / P. Correa, Y. Shiao//Cancer Res. 1994.-V.4.-P.1941-1943.

44. Correa, P. The new era of cancer epidemiology Text. / P. Correa // Cancer Epidemiol Biomarkers Prev. 1991. - V. 1. - P. 5-11

45. Court, M. The effect of gender on Helicobacter felis mediated gastritis, epithelial cell proliferation and apoptosis in the mouse model Text. / M. Court,

46. P. A. Robinson, M. F. Dixon, A. H. T. Jeremy, J. E. Crabtree // J. Pathol. 2003. -V.211.-P. 303-313.

47. Covacci, A. Helicobacter pylori virulence and genetic geography Text. / A. Covacci, J. L. Telford, G. Giudice, J. Parsonnet, R. Rappuoli // Science. 1999. - V.284. - P.1328-1333.

48. Crabtree, J. E. Epithelial cell signalling in Helicobacter pylori infection Text. / J. E. Crabtree, M. Naumann // Curr. Signal Transduction Ther. —2006. — V.l.-P. 53-65.

49. Crespi, M. Helicobacter pylori and gastric cancer: an overrated risk? Text. / M. Crespi, F. Citarda // Scand. J. Gastroenterol. 1996. - V.3. - P. 10411046.

50. Delgado, J. D. Optical and electronic fin dings in Helicobacter pylori infection of antral mucosa Text. / J. D. Delgado, R. Rivera, J. Rios // Rev. exp. Enferm. 1990. - V.78. - P.84-85.

51. Ding, S. Z. Helicobacter pylori and mitogen-activated protein kinases regulate the cell cycle, proliferation and apoptosis in gastric epithelial cells Text. /

52. S. Z. Ding, M. F. Smith, J. B. Goldberg // J Gastroenterol Hepatol. 2008. - V.23. — P.67-78.

53. Donahue, J. P. Analysis of iceAl transcription in Helicobacter pylori Text. / J. P. Donahue, R. M. Peek, L.-J. van Doom, S. A. Thompson, Q. Xu, M. J. Blaser, G. G. Miller // Helicobacter. 2000. - V.5. - P. 1-12.

54. Dunn, В. E. Helicobacter pylori Text. / В. E. Dunn, H. Cohen, M. J. Blaser// Clin Microbiol Rev. 1997. - V.l 0. - P.720-741.

55. Dutta, U. Typhoid carriers among patients with gallstones are at increased risk for carcinoma of the gallbladder Text. / U. Dutta, P. K. Garg, R. Kumar, R. K. Tandon // Am J Gastroenterol. 2000. - V.95. - P.784-787.

56. Ellmerich, S. Promotion of intestinal carcinogenesis by Streptococcus bovis Text. / S. Ellmerich, M. Scholler, B. Duranton, F. Gosse, M. Galluser, J. P. Klein, F. Raul // Carcinogenesis. 2000. - V.21. - P.753-756.

57. Farinati, F. Oxidative DNA damage accumulation in gastric carcinogenesis Text. / F. Farinati, R. Cardin, P. Degan, M. Rugge, F. D. Mario, P. Bonvicini, R. Naccarato // Gut. 1998. - V.42. - P.351-356.

58. Fei, P. P53 and radiation responses Text. / P. Fei, W. S. El-Deiry // Oncogene. 2003. - V.22. - P.5774—5783.

59. Figura, N. Are Helicobacter pylori differences important in the development of Helicobacter /ту/оп-related diseases? Text. / N. Figura // Ital J Gastroenterol Hepatol. 1997. - V.29. - P.367-374.

60. Figura, N. Determinants of pathogenicity of Helicobacter pylori Text. / N. Figura // J Chemother. 1999. - V. 11. - P.22.

61. Figura, N. Helicobacter pylori exotoxins and gastroduodenal diseases associated with cytotoxic strain infection Text. / N. Figura // Aliment Pharmacol Ther. 1996. - V. 10. - P.79-96.

62. Fontham, E. Т. H. Preventive Nutrition Text. / Eds. A. Bendich, R. J. Deckelbaum. Totowa, New Jersey: Humana Press. 1997. - P.33-55.

63. Freston, J. N. Helicobacter pylori, acid, gastritis, atrophy and progression to cancer: a critical view Text. / J. N. Freston // Helicobacter pylori. Basic Mechanisms to Clinical Cure. London: Kluwer Acad. Publishers. 1996. - P.245-246.

64. Fung, W. P. Endoscopic, histological and ultrasrtructural correlations in chronic gastritis Text. / W. P. Fung, J. M. Papadimitriou, L. R. Matz // Am. J. Gastroenterol. 1979. - V.71. - P.269-279.

65. Garneau, D. Heterogeneous Nuclear Ribonucleoprotein F/H Proteins Modulate the Alternative Splicing of the Apoptotic Mediator Bcl-x Text. / D. Garneau, T. Revil, J. Fisette, B. Chabot // J. Biol. Chem.- 2005. V.280. -P.22641-22650.

66. Gately, D. P. Characterization of ATM expression, localization, and associated DNA-dependent protein kinase activity Text. / D. P. Gately, J. C. Hittle, G. K. Chan, T. J. Yen // Mol. Biol. Cell. 1998. - V.9. - P. 2361-2374.

67. Genta, R. M. Helicobacter pylori as promoter intestinal metaplasia and gastric cancer: an alluring hypothesis in search of evidence Text. / R. M. Genta // Eur. J. Gastroenterol. Hepatol. 1995. - V.l. - P. 25-30.

68. Gold, J. S. Association of Streptococcus bovis bacteremia with colonic neoplasia and extracolonic malignancy Text. / J. S. Gold, S. Bayar, R. R. Salem // Arch Surg. 2004. - V.139. - P.760-765.

69. Graham, D. Y. Can therapy even be denied for Helicobacter pylori infection? Text. / D. Y. Graham // Gastroenterology. 1997. - V.113. - P.113-117.

70. Han, J. A MAP kinase targeted byendotoxin and hyperosmolarity in mammalian cells Text. / J. Han, J. D. Lee, L. Bibbs, R. J. Ulevitch // Science. -1994. V.265. -P.808-811.

71. Handa, O. CagA protein of Helicobacter pylori: A hijacker of gastricepithelial cell signaling Text. / O. Handa, Y. Naito, T. Yoshikawa // Biochemical pharmacology. -2007. -V.73. P. 1697- 1702.

72. Handa, О. Cytotoxin-associated gene product A of Helicobacter pylori induced cellular response in rat gastric epithelial cell Text. / O. Handa, Y. Naito, T. Ishii, H. Tsuboi, S. Adachi, T. Takagi // Digestion. 2006. - V.73. - P.69-75.

73. Handa, O. Helicobacter pylori Cag A induces mitochondria dependent production of reactive oxygen species in gastric epithelial cell Text. / O. Handa, Y. Naito, T. Ishii, H. Tsuboi, S. Adachi, T. Takagi // Gastroenterology. -2006.-V.130.-P.523.

74. Hatakeyama, M. Helicobacter pylori CagA a bacterial intruder conspiring gastric carcinogenesis Text. / M. Hatakeyama // Int. J. Cancer. - 2006. - V.119. -P.1217-1223.

75. Hatakeyama, M. Oncogenic mechanisms of the Helicobacter pylori CagA protein Text. / M. Hatakeyama // Nat Rev. 2004. - V.4. - P.688-694.

76. Higashi, H. SHP-2 tyrosine phosphatase as an intracellular target of Helicobacter pylori CagA protein Text. / H. Higashi, R. Tsutsumi, S. Muto, T. Sugiyama, T. Azuma, M. Asaka, M. Hatakeyama. // Science. 2002. - V.295. — P.683-686.

77. Hill, M. J. Mechanisms of gastric carcinogenesis Text. / M. J. Hill // Europ. J. Cancer Prev. 1994. - V.3 - P.25-29.

78. Hirao, A. DNA-damage induced phosphorylation of p53 by the checkpoint kinase Chk2 Text. / A. Hirao, Y. Y. Kong, S. Matsuoka, A. Wakeham,

79. J. Ruland, H. Yoshida, D. Liu, S. J. Elledge, T. W. Мак // Science. 2000. -V.287. -P.1824-1827.

80. Holton, J. Helicobacter pylori therapy advances and opportunities Text. / J. Holton, D. Vaira, M. Menegatti, M. Miglioli. - Milano: Mosby-Wolfe, 1998. -P.53-67.

81. Honda, S. Development of Helicobacter pylori-induced gastric carcinoma in Mongolian gerbils Text. / S. Honda, T. Fujioka, M. Tokieda, R. Satoh, A. Nishizone, M. Nasu // Cancer Res. 1998. - V.58. - P.4255-4259.

82. Huang, L. Radiation-induced genomic instability and its implications for radiation carcinogenesis Text. / L. Huang, A. R. Shyder, W. F. Morgan // Oncogene. 2003. - V.22. - P.5848-5854.

83. Hunter, T. When is a lipid kinase not a lipid kinase? When it is a protein kinase Text. / T. Hunter // Cell. 1995. - V.83. - P. 1-4.

84. IARC Working Group on the Evaluation of Carcinogenic Risk to Humans. Text. // Schistosomes, Liver Flukesand Helicobacter pylori. Lyon, France. - 1994. - V.61. - P. 177-240.

85. Iftode, C. Replication protein A (RPA): the eukaryotic SSB Text. / C. Iftode, Y. Daniely, J. A. Borowiec // CRC Crit. Rev. Biochem. 1999. - V.34. -P. 141-180.

86. Iliakis, G. DNA damage checkpoint control in cells exposed to ionizing radiation Text. / G. Iliakis, Y. Wang, J. Guan, H. Wang // Oncogene. -2003. V.22. - P.5834-5847.

87. Iliakis, G. DNA damagecheckpoint control in cells exposed to ionizing radiation Text. / G. Iliakis, Y. Wang, J. Guan, H. Wang // Oncogene. -2003. V.22. - P.5834-5847.

88. Kaufmann, W. К. Cell cycle checkpoints and DNA repairpreserve the stability of the human genome Text. / W. K. Kaufmann // Cancer Metastasis Rev. 1995.- V.14. - P.31-41.

89. Kim, S. T. Involvment of the cohesin protein Smsl in ATM-dependent and independent response to DNA damage Text. / S. T. Kim, M. B. Kastan //Genes Develop. 2002. - V.16. - P.560-570.

90. Kimura, S. H. Cyclin G1 associates with MDM2 and regulates accumulation and degradation of p53 protein Text. / S. H. Kimura, H. Nojima // Genes Cell. 2007. - V.7. - P. 869-880.

91. Kolman, A. Propylene oxide and epichlorohydrin induce DNA strand bre-aks in human diploid fibroblasts Text. / A. Kolman, I. Spivak M. Naslund, M. Dusinska, B. Cedervall // Environ. Mol. Mutagen. 1997. - V.30. - P.40-46.

92. Koster, E. De. Helicobacter pylori: the link with gastric cancer Text. / E. De. Koster, M. Buset, E. Fernandes, M. Deltenre // Europ. J. Cancer Prev. — 1994.-V.3.-P.247-257.

93. Koyi, H. An association between chronic infection with Chlamydia pneumoniae and lung cancer. A prospective 2-year study Text. / H. Koyi, E. Branden, J. Gnarpe, H. Gnarpe, B. Steen // APMIS. 2001. - V.109. - P.572-580.

94. Krienitz, W. Uber das Auftreten von spirocheten vershiedener form im Mageninhalt bei Carcinoma Ventriculi Text. / W. Krienitz // Dtsch. Med. Wschr. 1906. - V.22. - P.872-882.

95. Kuchino, Y. Misreading of 8-hydroxydeoxyguanosine-containing DNA in vitro DNA replication Text. / Y. Kuchino, F. Mori, H. Kasai, S. Nishimura, H. Inoue, S. Iwai, E. Ohtsuka // In: Proceedings of the Nucleic Acids Symposium Series. 1986. - P. 157-158.

96. Kuipers, E. J. Review article: Relationship between Helicobacter pylori, atrophic gastritis and gastric cancer Text. / E. J. Kuipers // Aliment. Pharmacol. Ther. 1998. - V.12. - P.25-36.

97. Kuper, H. Trichopoulos D: Infections as a major preventable cause of human cancer Text. / H. Kuper, H. O. Adami // J Intern Med. 2000. - V.248. -P.171-83.

98. Kurz, E. U. Doxorubicin activates ATM-dependent phosphorylation of multiple downstream targets in part through the generation of reactive oxygen species Text. / E. U. Kurz, P. Douglas, L. Miller // J Biol Chem. 2004. - V.279. -P. 53272-53281.

99. Kyriakis, J. M. Mammalian mitogen-activated protein kinase signal transduction pathways activated by stress and inflammation Text. / J. M. Kyriakis, J. Avruch // Physiol. Rev. 2001. - V.81. - P.807—869.

100. Kyriakis, J. M. The stress-activated protein kinase subfamily of c-Jun kinases Text. / J. M. Kyriakis, P. Banerjee, E. Nikolakaki, T. Dai, E. A. Rubie, M. F. Ahmad, J. Avruch, J. R. Woodgett //Nature. 1994. - V. 369. - P.l56.

101. Ladeira, M. S. DNA damage in patients infected by Helicobacter pylori Text. / M. S. Ladeira, M. A. Rodrigues, D. M. Salvadori, D. M. Queiroz, D. V. Freire-Maia // Cancer Epidemiol Biomarkers Prev. 2004 - V. 13. - P.631-637.

102. Laemmli, K. U. Cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage T4 Text. / K. U. Laemmli // Nature. 1970. - V.227. -P.680 - 685.

103. Lara-Tejero, M. A bacterial toxin that controls cell cycle progression as a deoxyribonuclease I-like protein Text. / M. Lara-Tejero, J. E. Galan // Science. 2000. - V.290. - P.354-357.

104. Lavin, M. F. The genetic defect in ataxia-telangiectasia Text. / M. F. Lavin, Y. Shiloh // Annu. Rev. Immunol. 1997. - V.l5. - P. 177-202.

105. Lax, A. J. How bacteria could cause cancer: one step at a time Text. / A. J. Lax, W. Thomas // Trends Microbiol. 2002. - V.l0. - P.293-299.

106. Lee, В. M. Benzoa.pyrene diol-epoxide-I-DNA and oxidative DNA adducts associated with gastric adenocarcinoma [Text] / В. M. Lee, J. J. Jang, H. S. Kim // Cancer Lett. 1998. - V.125. - P.61-68.

107. Lee, J. S. hCdsl-mediated phosphorylation of BRCA1 regulates the DNA damage response Text. / J. S. Lee, К. M. Collins, A. L. Brown, С. H. Lee, J. H. Chung //Nature. 2000. - V.404. - P.201-204.

108. Lee, S. H. The role of the 34-kDa subunit of human replication protein A in simian virus 40 DNA replication in vitro Text. / S. H. Lee, D. K. Kim,//J. Biol. Chem. — 1995. — V.270. P.12801-12807.

109. Lehmann, A. R. Replication of damaged DNA in mamalian cells: new solutions to the old problem Text. / A. R. Lehmann // Mutat. Res. — 2002. — V.59. -P.23-34.

110. Leunk, R. D. Cytotoxic activity in broth-culture filtrates of Campylobacter pylori Text. / R. D. Leunk, P. T. Johnson, В. C. David, W. G. Kraft, D. R. Morgan // J Med Microbiol. 1988. - V.26. - P.93-99.

111. Li, C. Mechanical stress-activated PKC delta regulates smooth muscle cell migration Text. / C. Li, F. Wernig, M. Leitges, Y. Hu, Q. Xu // FASEB J.2003. V.17. - P.2106-2108.

112. Liftman, A. J. Chlamydia pneumoniae infection and risk of lung cancer Text. / A. J. Littman, E. White, L. A. Jackson, M. D. Thornquist, C. A. Gaydos, G. E. Goodman, T. L. Vaughan // Cancer Epidemiol Biomarkers Prev. —2004. V.13. - P. 1624-1630.

113. Liu, Q. Chkl is an essential kinase that is regulated by Atr and required for the G2/M DNA damage checkpoint Text. / Q. Liu, S. Guntuku, X. S. Cui, S. Matsuoka, D. Cortez, K. Tamai, G. Luo, S. Carattini-Rivera, F. DeMayo,

114. A. Bradley, L. A. Donehower, S. J. Elledge // Genes Dev. 2000. - V.14. -P.1448-1459.

115. Lukas, J. Mammalian cell cycle checkpoints: signalling pathways and their organization in space and time Text. / J. Lukas, C. Lukas, J. Bartek // DNA Repair (Amst.). 2004. - V.3. - P.997-1007.

116. Lydall, D. Yeast checkpoint genes in DNA damage processing: implications for repair and arrest Text. / D. Lydall, T. Weinert // Science. 1995. — V.270. -P.1488-1491.

117. Maeda, S. Structure of cag pathogenicity island in Japanese Helicobacter pylori isolates Text. / S. Maeda, H. Yoshida, T. Ikenoue, K. Ogura, F. Kanai, N. Kato, Y. Shiratori, M. Omata // Gut. 1999. - V.44. - P.336-341.

118. Marshall, B. J. Pyloric Campylobacter infection and gastroduodenal disease Text. / B. J. Marshall, D. B. McGechie, P. A. Rogers, R. J. Glancy // Med J Aust. 1985. - V.142. - P.439-444.

119. Maser, R. S. Connecting chromosomes, crisis, and cancer Text. / R. S. Maser, R. A. DePinho // Science. 2002. - V.297. - P.565—569.

120. Mimuro, H. Grb2 is a key mediator of Helicobacter pylori CagA protein activities Text. / H. Mimuro, T. Suzuki, J. Tanaka, M. Asahi, R. Haas, C. Sasakawa // Mol Cell. 2002. - V.10. - P.745-755.

121. Nakoyma, H. RecQ family helicases: roles as the tumor suppressor proteins Text. / H. Nakoyma // Oncogene. 2002. - V.21. -P.9008-9021.

122. Naumann, M. Helicobacter /ту/on-induced pithelial cellsignalling in gastric carcinogenesis Text. / M. Naumann, J. E. Crabtree // Trends Microbiol. — 2004.-V.12.-P. 29-36.

123. Neel, B. G. SH2 domain containing tyrosine phosphatases in cell signaling Text. / B. G. Neel, H. Gu, L. Pao // Trends Biochem Sci. 2003. — V.28. - P.284-293.

124. Norbury, C. J. DNA damage-induced apoptosis Text. / C. J. Norbury, B. Zhivotovsky // Oncogene. 2004. - V.23. - P.3797-3808.

125. Nougayrede, J. P. Cyclomodulins: bacterial effectors that modulate the eukaryotic cell cycle Text. / J. P. Nougayrede, F. Taieb, J. De Rycke, E. Oswald // Trends Microbiol. 2005. - V.13. - P. 103-110.

126. Oderda, G. Mucus gel layer adherent to gastric mucosa in children with Helicobacter pylori gastritis Text. / G. Oderda, D. Dellollio, O. Form, L. Farina, K. Tavassoli, N. Ansaldi // Eur. J. Gastroenterol. Hepatoe. 1991. — V.3. -P.58-63.

127. Owen, R. F. Helicobacter species classification and identification Text. /R. F. Owen//Br Med Bull. - 1998. - V.54. - P.17-30.

128. Parsonnet, J. Risk for gastric cancer in people with cagA positive or cagA negative Helicobacter pylori infection Text. / J. Parsonnet, G. D. Friedman, N. Orentreich, H. Vogelman // Gut. 1997. - V.40. - P.297-301.

129. Peek, R. M. Helicobacter infection and gastric neoplasia Text. / R. M. Peek, J. E. Crabtree //J. Pathol. 2006. - V.208. - P.233-248.

130. Peek, R. M. Helicobacter pylori and gastrointestinal tract adenocarcinomas Text. / R. M. Peek, M. J. Blaser // Nat. Rev. Cancer. 2002. -V.2. - P.28-37.

131. Periti, P. Managing Helicobacter pylori infection in the new millenium: a review Text. / P. Periti, F. Tonelli, L. Capurso, P. Nicoletti // J. Chemotherapy. 1999. - Vol.11. - P.35-55.

132. Philips, A. V. RNA processing and human disease Text. / A. V. Philips, T. A. Cooper // Cell Mol Life Sci. 2000. - V. 57. - P. 235-249.

133. Pomorski, T. Helicobacter pylori-induced prostaglandin E(2) synthesis involves activation of cytosolic phospholipase A(2) in epithelial cells Text. / T. Pomorski, T. F. Meyer, M. Naumann // J. Biol. Chem. 2001. - V.276. -P.804-810.

134. Poundeyr, R. E. The prevalence of Helicobacter pylori infection in different countries Text. / R. E. Poundeyr, D. Ng // Aliment. Pharmacol. Ther. -1995. — V.9. P.33-39.

135. Pretolani, S. Epidemiology. In: Helicobacter pylori Text. / S. Pretolani, R. Bonvicini, G. Gasbarrini // An atlas. Ed. By London / P. Malrertheiner, P. Michetti, A. Price. 1997. - P.21-22.

136. Prokopcova, J. The role of ATM in breast cancer development Text. / J. Prokopcova, Z. Kleibl, С. M. Banwell, P. Pohlreich // Breast Cancer Res Treat. -2006. V.104. -P.121-128.

137. Pryor, J. L. Immunodetection after complete destaining of coomassie blue-stained proteins on immobilon-PVDF Text. / J. L. Pryor, W. Xu, D. W. Hamilton // Analytical biochemistry. 1992. - V.202. - P. 100-104.

138. Pulverer, B. ATMachine Text. / B. Pulverer // Nature Cell Biol. -2003. V.5. - P.96.

139. Reed, P. I. Helicobacter pylori and gastric cancer Text. / P. I. Reed // Europ. J. Cancer Prev. 1996. - V.5. - P.49-55.

140. Rohde, M. A novel sheathed surface organelle of the Helicobacter pylori cag type IV secretion system Text. / M. Rohde, J. Puis, R. Buhrdorf, W. Fischer, R. Haas // Mol Microbiol. 2003. - V.49. - P.219-234.

141. Sasajima, K. Intestinal metaplasia and adenocarcinoma induced in the stomach of rats by N-propyl-N-nitro-Nitrosoguanidine Text. / K. Sasajima, T. Kawachi, N. Marsukura // Jpn. Cancer Res Clin.Oncol. 1979. - V.94. - P.201-207.

142. Schmitt, W. Genetic analysis of the Helicobacter pylori vacuolating cytotoxin: structural similarities with the IgA protease type of exported protein Text. / W. Schmitt, R. Haas // Mol. Microbiol. 1994. - V.12. - P.307-319.

143. Scott, D. The life and death of Helicobacter pylori Text. / D. Scott, D. Weeks, K. Melchers, G. Sachs // Gut. 1998. - V.43. - P.56-60.

144. Segal, E.D. Helicobacter pylori attachment to gastric cells induces cytoskeletal rearrangements and tyrosine phosphorylation of host cell proteins Text. / E. D. Segal, S. Falkow, L. S. Tompkins // Proc Natl Acad Sci USA.1996.-V.93.-P.1259-1264.

145. Selbach, M. Src is the kinase of the Helicobacter pylori CagA protein in vitro and in vivo Text. / M. Selbach, S. Moese, C. R. Hauck, T. F. Meyer, S. Backert // J. Biol. Chem.- 2002. V.277. - P.6775-6778.

146. Selbach, M. Src is the kinase of the Helicobacter pylori CagA protein in vitro and in vivo Text. / M. Selbach, S. Moese, C. R. Hauck, T. F. Meyer, S. Backert // J Biol Chem. 2002. - V.277. - P.6775-6778.

147. Selbach, M. The Helicobacter pylori CagA protein induces cortactin dephosphorylationand actin rearrangement by c-Src inactivation Text. / M. Selbach, S. Moese, R. Hurwitz, C. R. Hauck, T. F. Meyer, S. Backert // EMBO J. -2003. V.22. — P.515-528.

148. Shiloh, Y. ATM and related protein kinases: safeguarding genome integrity Text. / Y. Shiloh // Nature Reviews. 2003. - V.3. - P. 155-168.

149. Shimoyama, T. Bacterial factors and immune pathogenesis in Helicobacter pylori infection Text. / T. Shimoyama, J. E. Crabtree // Gut. 1998. -V. 43.-P.2-5.

150. Shukla, V. K. Carcinoma of the gallbladder-is it a sequel of typhoid? Text. / V. K. Shukla, H. Singh, M. Pandey, S. K. Upadhyay, G. Nath // Dig Dis Sci. 2000. - V.45. -P.900-903.

151. Smith, G. C. The DNA-dependent protein kinase Text. / G. C. Smith, S. P. Jackson // Genes Dev. 1999. - V.l3. - P.916-932.

152. Solnick, J. V. Emergence of diverse Helicobacter species in the pathogenesis of gastric and enterohepatic diseases Text. / J. V. Solnick, D. B. Schauer // Clin Microbiol Rev. 2001. - V. 14. - P.59-97.

153. Steer, H. W. Ultrastructure of cell migration through the gastric epithelium and its relationship to bacteria Text. / H. W. Steer // J.Clin.Path. -1975.-V.28.-P.639.

154. Stein, M. c-Src/Lyn kinases activate Helicobacter pylori CagA through tyrosine phosphorylation of the EPIYA motifs Text. / M. Stein, F. Bagnoli, R. Halenbeck, R. Rappuoli, W. J. Fantl, A. Covacci // Mol. Microbiol. -2002.-V.43.-P.971-980.

155. Stiff, T. ATR-dependent phosphorylation and activation of ATM in response to UV treatment or replication fork stalling Text. / T. Stiff, S. Walker, K.

156. Cerosaletti, A. Goodarzi, E. Petermann, P. Concannon, M. Driscoll, P. Jeggo// The EMBO Journal. 2006. - V. 25. - P.5775-5782.

157. Suzuki, H. Oxidative stress in Helicobacter pylori associated gastroduodenal disease Text. / H. Suzuki, T. Hibi // J Clin Biochem Nutrit. -2006. — V.39. — P.56-63.

158. Taylor, A. M. R. Ataxia telangiectasia genes and predisposition to leukemia, lymphoma and breast cancer Text. / A. M. R. Taylor // Br. J. Cancer. -1992.-V.66.-P.5-9.

159. Taylor, A. M. R. Variant forms of ataxia-telangiectasia Text. / A. M. R. Taylor, E. Flude, B. Laher, M. Stacey, E. McKay, J. Watt, S. H. Green, A. E. Harding // J. Med. Genet. 1987. - V.24. - P.669-677.

160. Torres, A. Immunological adhesion molecules on gastric mucosa. Does H. pylori, and specifically cagA+ strains influence its expression? Text. / A. Torres, G. Perez-Perez, В. M. Goreia, J. Pajares // Gut. 1995. - V.37. - P.34.

161. Vaara, M. Polycations as outer membrane-disorganizing agents Text. / M. Vaara, T. Vaara // Antimicrob Agents Chemother. 1983. - V.24. -P.l 14-122.

162. Valerie, K. Regulation and mechanisms of mammalian double-strand break repair Text. / K. Valerie, L. Povirk // Oncogene. 2003. - V.22. - P.5792-5812.

163. Warren, J. R. Unidentified curved bacilli on gastric epithelium in active chronic gastritis Text. / J. R. Warren, B. J. Marshall //Lancet. 1983. -V.l. — P.1273—1275.

164. Watanabe, Т. Helicobacter pylori infection induced gastric cancer in Mongolian gerbils Text. / T. Watanabe, M. Tada, H. Sasaki // Gastroenterology. -1998. V.l 15. -P.642-648.

165. Webb, P. M. An apparent lack of association between Helicobacter pylori infection and risk of gastric cancer in China Text. / P. M. Webb, M. C. Yu, D. Forman // Int. J. Cancer. 1996. - V.67. - P.603-607.

166. Williams, C. L. Helicobacter pylori: bacteriology and laboratory diagnosis Text. / C. L. Williams // J Infect. 1997. - V.34. - P. 1-5.

167. Wilson, M. Bacterial perturbation of cytokine networks Text. / M. Wilson, R. Seymour, B. Henderson // Infect Immun. 1998. - V.66. - P.2401-2409.

168. Wold, M. S. Replication protein A: a heterotrimeric, single-stranded DNA-binding protein required for eukaryotic DNA metabolism Text. / M. S. Wold // Annu. Rev. Biochem. 1997. - V.66. - P.61-92.

169. Won, J. Small molecule-based reversible reprogramming of cellular lifespan Text. / J. Won, M. Kim, N. Kim, J. H. Ahn, W.G. Lee, S. S. Kim, K. Y. Chang, Y. W. Yi, Т. K. Kim // Nat. Chem. Biol. 2006. - V.2. - P.369-374.

170. Yoshida, N. Mechanisms involved in Helicobacter pylori-induced inflammation Text. / N. Yoshida, D. Granger, D. Evans, D. G. Evans, D. Y. Graham, D. C. Anderson, R. E. Wolf, P. R. Kvietys // Gastroenterology. 1993. -V.105. -P.1431-1440.

171. Zarkin, В. A. The triad of Streptococcus bovis bacteremia, colonic pathology, and liver disease Text. / B. A. Zarkin, K. D. Lillemoe, J. L. Cameron, P. N. Effron, Т. H. Magnuson, H. A. Pitt // Ann Surg. 1990. - V.211. - P.786-791.

172. Zarrilli, R. Molecular response of gastric epithelial cells to Helicobacter pylori-induced cell damage Text. / R. Zarrilli, V. Ricci, M. Romano // Cellular Microbiology. 1999. - V.l. - P.93-99.

173. Zernik-Kobak, M. Text. / M. Zernik-Kobak, K. Vasunia, M. Connelly, C. W. Anderson, K. Dixon // J. Biol. Chem. 1997. - V.272. -P.23896-23904.

174. Zhou, В. B. S. The DNA damage response: putting checkpoints in perspective Text. / В. B. S. Zhou, S. J. Elledge // Nature. 2000. - V. 408. -P.433-439.

175. Zvalova, D. p38/SAPK2 control gap junction closure in astrocytes Text. / D. Zvalova, J. Cordier, M. Mesnil, M. P. Junier, H. Chneiweiss // Glia. -2004. V.46. - P.323-333.