Генетическое разнообразие и анализ количественных признаков грибов рода Pleurotus тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.02.12, кандидат биологических наук Сиволапова, Анастасия Борисовна
- Специальность ВАК РФ03.02.12
- Количество страниц 109
Оглавление диссертации кандидат биологических наук Сиволапова, Анастасия Борисовна
Оглавление
ВВЕДЕНИЕ
Глава 1. Обзор литературы
1.1. Культивирование высших базидиальных грибов
1.2. Грибы рода Pleurotus
1.3. Видовая идентификация
1.4. Применение молекулярно-генетических подходов в таксономии грибов
1.5. Генетика количественных признаков 23 Глава 2. Материалы и методы
2.1. Объекты исследования 2
2.2. Культивирование штаммов вешенки
2.3. Получение плодовых тел P. djamor и P. sajor-caju in vitro
2.3.1. Подготовка посевного материала
2.3.2. Субстраты
2.3.3. Оценка урожайности
2.4. Определение факторов половой (гомогенной) несовместимости и отбор гаплоидных тестеров типов
спаривания для видов P. sajor-caju и P. ostreatus
2.5. Молекулярно-генетические методы при оценке генетического разнообразия рода вешенка
2.5.1. Подбор геноспецифических праймеров 3
2.5.2. Экстрагирование ДНК
2.5.3. ПЦР со специфичными праймерами
2.5.4. Секвенирование ДНК
2.5.5. Обработка результатов секвенирования
2.6. Анализ количественных признаков Pleurotus ostreatus 38 2.6.1. Получение плодовых тел P. ostreatus
2.6.2. Определение цвета шляпки
2.6.3. Оценка интенсивности плодоношения (урожайности) 39 2.6.3. Измерение скорости роста дикарионов
2.6.5. Составление генетической карты Pleurotus ostreatus
2.6.6. Статистическая обработка данных 41 Глава 3. Результаты и обсуждение
3.1. Культивирование P. sajor-caju и P. djamor
в лабораторных условиях
3.1.1. Получение плодовых тел P. djamor и P. sajor-caju
3.1.2. Оценка урожайности штаммов
P. sajor-caju и P. djamor
3.1.3. Получение тестерных штаммов
для вида P. sajor-caju
3.2. Генотипирование штаммов и видов
рода Pleurotus
3.2.1. ПЦР-диагностика 4
3.2.2. Секвенирование ITS-последовательностей
3.3. Установление таксономического статуса P. sajor-caju
3.3.1. Морфология плодовых тел культивируемых видов вешенки Pleurotus pulmonarius
и P. sajor-caju
3.3.2. Молекулярная идентификация вида P. sajor-caju
на основе ITS и IGS последовательностей кластера генов рРНК
3.3.2. Анализ половой совместимости между штаммами
P. sajor-caju и P. pulmonarius
3.4. Анализ количественных признаков Pleurotus ostreatus
3.4.1. Получение экспериментальной популяции
Pleurotus ostreatus
3.4.2. Оценка урожайности исследуемых штаммов P. ostreatus
3.4.3. Определение цвета плодовых тел Р. оБ^еаШБ
3.4.4. Определение скорости вегетативного роста
3.4.5. Построение генетической карты Р. оьггеМж
3.4.6. Изучение локусов количественных признаков (С)ТЬ), ответственных за урожайность, скорость вегетативного роста и цвет шляпок
плодовых тел Р. 081геа1т
Глава 4. Заключение
ВЫВОДЫ
Список литературы
ПРИЛОЖЕНИЕ
Рекомендованный список диссертаций по специальности «Микология», 03.02.12 шифр ВАК
Грибы рода Pleurotus: генотипирование и анализ локусов половой совместимости2015 год, кандидат наук Шнырева Анастасия Андреевна
Создание исходного материала для селекции гибридных штаммов Pleurotus (Fr.) P. Kumm. на основе метода отбора гаплотипов с повышенной активностью лакказ2009 год, кандидат биологических наук Копыльцов, Сергей Васильевич
Новая технология культивирования высших базидиомицетов в искусственно замкнутой экосистеме2011 год, кандидат биологических наук Калашников, Андрей Анатольевич
Экологические аспекты интенсивного культивирования грибов рода Pleurotus в Приамурье2010 год, кандидат биологических наук Азарова, Василина Александровна
Совместное культивирование видов рода Pleurotus (Fr.) P. Kumm. с дрожжами2011 год, кандидат биологических наук Новосёлова, Дарья Николаевна
Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Генетическое разнообразие и анализ количественных признаков грибов рода Pleurotus»
Введение
Актуальность исследования. Грибы съедобного культивируемого рода Pleurotus, относящиеся к отделу Basidiomycota, давно привлекли к себе интерес со стороны производителей, благодаря своим прекрасным вкусовым качествам, относительной простоте культивирования, а также благодаря богатому набору биологически активных веществ, перспективных для использования в фармакологии. В настоящее время, в связи с развитием биотехнологических подходов к культивированию грибов, стало возможным создание современной индустриальной отрасли, занимающейся производством лекарственных препаратов на основе базидиомицетов (Краснопольская, 1998).
Кроме того, в последнее время все чаще предлагается использовать грибы рода Pleurotus в процессах биологической переработки отходов сельского хозяйства, а также бумажного и текстильного производств в силу того, что эти грибы обладают комплексом лигнинолитических ферментов. Самым распространенным культивируемым видом является вешенка устричная (обыкновенная) - Pleurotus ostreatus (Fr.) Kumm., однако в настоящее время производители все чаще стараются ввести в культуру более экзотичные виды вешенок, такие как Pleurotus djamor (Rumph.) Boedijn или Pleurotus sajor-caju (Fr.) Singer. Эти виды привлекли внимание благодаря своей способности к плодоношению в условиях повышенных температур.
Несмотря на повышенный интерес к грибам рода Pleurotus, в России работа по маркированию, улучшению и введению новых штаммов в культуру практически не ведется. Для успешного промышленного культивирования грибов необходимо также иметь штаммы с хорошей и стабильной урожайностью, поэтому анализ количественных признаков (QTL, quantitative trait loci), ответственных за продуктивность и качество плодовых тел является важной как практической, так и теоретической задачей.
Цель работы - изучение генетического разнообразия различных видов и штаммов рода Pleurotus, оценка их урожайности и сравнительная характеристика скорости вегетативного мицелиального роста, а также поиск генетических маркеров хозяйственно полезных признаков для вида Р. ostreatus.
Для достижения данной цели были поставлены следующие задачи:
1. оценить урожайность культивируемых штаммов P. sajor-caju, Р. djamor и P. ostreatus и подобрать наиболее перспективные субстраты и условия для плодоношения этих видов;
2. провести генотипирование 17 штаммов, относящихся к 6 видам вешенки - P. ostreatus, P. pulmonarius, P. djamor, P. sajor-caju, P. eryngii и Р. calyptratus;
3. подтвердить таксономический статус P. sajor-caju;
4. построить подробную генетическую карту P. ostreatus на основе SNP-маркеров (single nucleotide polymorphism, однонуклеотидные замены) для анализа локусов количественных признаков;
5. провести маркирование и анализ локусов количественных признаков P. ostreatus таких как урожайность, скорость мицелиального роста, цвет шляпки плодового тела;
6. определить типы спаривания штаммов экспериментальной гибридной ВКК-популяции P. ostreatus и установить положение локусов типов спаривания P. ostreatus на генетической карте.
Научная новизна и практическая значимость работы. В ходе настоящей работы была проведена оценка генетического разнообразия культивируемых видов и штаммов рода вешенка, а также разрешен вопрос о таксономическом статусе вида P. sajor-caju (Fr.) Singer, прежде вызывавший множество споров среди микологов.
Впервые была получена подробная генетическая карта P. ostreatus с
плотностью молекулярных маркеров, достаточной для эффективного поиска
б
локусов количественных признаков данного гриба. Впервые были выявлены и проанализированы локусы количественных признаков, ответственных за скорость вегетативного роста дикариотического мицелия вешенки обыкновенной, а также найдены генетические области, контролирующие цвет шляпки плодовых тел P. ostreatus, и области, оказывающие влияние на продуктивность штаммов.
Результаты данного исследования имеют практическую значимость, прежде всего, для селекционеров, которые занимаются выведением новых коммерческих сортов видов рода вешенка.
Апробация работы. Основные результаты исследования были представлены на Юбилейной конференции, посвященной 100-летию со дня рождения М. В. Горленко, «Высшие базидиальные грибы: индивидуумы, популяции, сообщества» (Москва, 2008); 2-ом Съезде микологов России (Москва, 2008); на Международном конгрессе «XVI Congress of European Mycologists» (Халкидики, Греция, 2011), на XII Международной молодежной научной конференции «Биотехнология в растениеводстве, животноводстве и ветеринарии» (Москва, 2012), на Международной конференции студентов, аспирантов и молодых ученых «Ломоносов-2012» (Москва, 2012).
Публикации. По теме диссертации опубликовано 9 печатных работ, из них 3 - статьи в журналах из списка рекомендованных ВАК, 6 - материалы конференций.
Структура и объем диссертации. Текст диссертации изложен на 106 страницах, состоит из введения, 4-х глав, выводов и списка литературы. Список литературы включает 94 источника, из них 84 на английском языке. Приложение содержит 6 таблиц.
Похожие диссертационные работы по специальности «Микология», 03.02.12 шифр ВАК
Сравнительный анализ природных популяций Pleurotus pulmonarius (Fr.) Quel2006 год, кандидат биологических наук Штаер, Оксана Васильевна
Влияние биологически активных компонентов и минеральных солей на рост и развитие мицелия гриба вешенки обыкновенной Pleurotus ostreatus Fr. Kumm2002 год, кандидат биологических наук Польских, Светлана Валерьевна
Микроморфология и ультраструктура агарикоидных грибов на разных стадиях жизненных циклов2005 год, доктор биологических наук Камзолкина, Ольга Владимировна
Усовершенствование технологических процессов выращивания вешенки обыкновенной: Pleurotus ostreatus (Jacq.: Fr.) Kumm.2013 год, кандидат сельскохозяйственных наук Сметанина, Лариса Геннадиевна
Эколого-биологическая характеристика рудеральных видов агарикоидных грибов лесостепи правобережного Поволжья (Пензенская область) и перспективы их использования1998 год, кандидат биологических наук Иванова, Вера Анатольевна
Заключение диссертации по теме «Микология», Сиволапова, Анастасия Борисовна
выводы
1. Показано, что из четырех исследованных штаммов Р. яа/ог-ссуи и Р. фатог наилучшим плодоношением характеризуется штамм Р. фатог 21 (34 г грибов на 100 г субстрата), тогда как выход плодовых тел у штаммов Р. ш}ог-са}и С8-32 и Р. фатог Н составил 28 и 32 г грибов на 100 г субстрата соответственно. Оптимальным субстратом для культивирования обоих видов является подготовленная стандартным способом лузга.
2. Анализ вариабельности 1Т8-последовательностей рДНК у 17 штаммов, относящихся к 6 видам рода Р1еигоШ, показал наличие полиморфизма по длине транскрибируемых спейсерных участков генов рРНК; степень гомологии анализируемых фрагментов варьировала в пределах от 0.836 (между видами Р. са1ур&аШя С2 и Р. риЫопапш 27.4) до 1.0 (между видами Р. Бщог-ссуи С8-32 и Р. ри1топаг1ш 06-1).
3. Проведенный молекулярно-генетический анализ вариабельной 1Т8-последовательности локуса генов рРНК и мон-мон скрещивания показали, что вид Р. йсуог-ссуи является самостоятельным видом, репродуктивно изолированным от сходного по морфологии близкородственного вида Р. ргАтопапж.
4. На основе 384 8ЫР-маркеров и данных генотипирования 186 штаммов экспериментальной ВКК-популяции построена подробная генетическая карта для Р. ОБ^есйш-, все маркеры были распределены по 11 группам сцепления, соответствующим 11 хромосомам.
5. Хозяйственно важные количественные признаки Р. о$1геаЫ$ — цвет шляпки плодового тела и скорость вегетативного мицелиального роста -находятся под генетическим контролем сложной полигенной системы. В ходе анализа количественных признаков обнаружено 6 (^ТЪ-локусов, контролирующих цвет шляпки плодовых тел, и 12 С)ТЪ-локусов, контролирующих скорость колонизации субстрата мицелием гриба.
6. Были проанализированы аллели локусов половой совместимости (тМА и тсйЕ) у гибридного потомства ВКК-популяции, что позволило определить положение тМА и тШВ локусов на полученной генетической карте Р.овЬгеаХш.
Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Сиволапова, Анастасия Борисовна, 2013 год
Список литературы
Алтухов Ю.П. Вид и видообразование // Соросовский Образовательный Журнал. — 1997. — № 4. — С. 2—10.
Гарибова Л. В. , Лекомцева С. Н. Основы микологии. Морфология и систематика грибов и грибоподобных организмов. М.: Товарищество научных изданий КМК. 2005. - 220 с.
Гарибова Л. В., Завьялова Л. А., Инсарова И. Д. Методологические подходы к изучению макромицетов, используемых в биотехнологиях // Труды международной конф., посвященной 100-летию начала работы профессора А. С. Бондарцева в БИН им. В. Л. Комарова РАН «Грибы в природных и антропогенных экосистемах».- 2005.- Т.1.- С. 145-149.
Гарибова Л.В., Сидорова И.И. Грибы. Энциклопедия природы России. М.: 1997.-352 с.
Дудка И.А., Вассер С.П. Справочник миколога и грибника. Киев: Наукова думка, - 1987.-536 с.
Дьяков Ю. Т. Критерии биологического вида у грибов (с обзором таксономической структуры ризоктониеподобных грибов) // Микология и фитопатология. - 1993. - Т. 27. - И 6. - С. 68-82.
Краснопольская Л. М. Грибы класса Ваз1с1ютусе1е8 - источники лекарственных веществ // Сборник трудов международной конференции, посвященной 80-летию каф. Микологии и альгологии МГУ и 90-летию со дня рождения М.В. Горленко «Современные проблемы микологии, альгологии и фитопатологии». - 1998. - С.230-232.
Шнырева А. В., Белоконь Ю. С. Белоконь М. М., Алтухов Ю. П. Внутривидовое генное разнообразие вешенки устричной, РЬигоШя оз&еШш, изученное по совокупности аллозимных генов // Генетика. - 2004. - Т. 40. -N8.-0. 1068-1080.
Шнырева А.В., Дружинина И.С., Дьяков Ю.Т. Генетическая структура комплекса Pleurotus ostreatus sensu lato на территории Московской области // Генетика, т. 34, № 12, 1998. - С.1610-1618.
Шнырева А.В., Штаер О.В. Дифференциация близкородственных видов Pleurotus pulmonarius и P. ostreatus с помощью скрещиваний и молекулярных маркеров II Генетика, 2006. Т. 42, № 5. С. 667-674.
Arnau J., Housego A., Oliver R. The use of RAPD markers in the genetic analysis of the plant pathogenic fungus Cladosporium fulvum II Curr. Genet. - 1994. -N25.-P. 438-444.
Baars J., Sonnenberg A., Mikosch Т., Griensven L. Development of a sporeless strain of oyster mushroom Pleurotus ostreatus. In: Science and cultivation of edible fungi. Vol. 1. Rotterdam, The Netherlands: A. A. Balkema. - 2000. - P. 317-323.
Bonatti M., Karnopp P., Soares H. M., Furlan S. A. Evaluation of Pleurotus ostreatus and Pleurotus sajor-caju nutritional characteristics when cultivated in different lignocellulosic wastes // Food Chemistry. - 2004. - Vol. 88(3). - P. 425428.
Callac P., Desmerger C., Kerrigan R., Imbernon M. Conservation of genetic linkage with map expansion in distantly related crosses of Agaricus bisporus II FEMS Microbiol. Lett. - 1997. -N146. - P. 235-240.
Chahal D. S. Production of protein-rich mycelial biomass of a mushroom, Pleurotus sajor-caju, on corn stover // Journal of Fermentation and Bioengineering. - 1989. - Vol. 68(5). - P. 334-338.
Chang, S.T. World production of cultivated and medicinal mushrooms in 1997 with emphasis on Lentinus edodes // International Journal of Medicinal Mushrooms. -1999. - N 1. - P. 291 - 300.
Chiu S-W. Nuclear changes during fungal development. In: Patterns in fungal development. Cambridge, United Kingdom: Cambridge University Press. - 1996. -P. 105-125.
Chiua S.W., Chana Y.H., Lawa S.C., Cheunga K.T., Mooreb D. Cadmium and manganese in contrast to calcium reduce yield and nutritional values of the edible mushroom Pleurotus pulmonarius II British Mycological Society. - 1998.
Cihangir N., Saglam N. Removal of cadmium by Pleurotus sajor-caju Basidiomycetes // Acta biotechnol. - 1999. - Vol. 19. -N 2. - P. 171-177.
Clemengon H. Cytology and plectology of the Hymenomycetes. Berlin: Gebriider Borntraeger. - 2004. - P. 191-227.
Corner EJ.H. The agaric genera Lentinus, Panus, and Pleurotus with particular reference to Malaysian species // Beihefte zur Nova Hedwigia. - 1981. - V. 69. -P. 1-169.
Curreli N., Rescigno A., Rinaldi A., Pisu B., Sollai F., Sanjust E. Degradation of juglone by Pleurotus sajor-caju II Mycol. Res. - 2004. - Vol. 108(Pt 8). - P. 913918.
Curreli N., Sollai F., Massa L., Comandini O., Rufo A., Sanjust E., Rinaldi A., Rinaldi A. C. Effects of plant-derived naphthoquinones on the growth of Pleurotus sajor-caju and degradation of the compounds by fungal cultures // J. Basic. Microbiol. - 2001. - Vol. 41(5). - P. 253-259.
Debets F., Swart K., Hoekstra R., Bos C. Genetic maps of eight linkage groups of Aspergillus nzgerbased on mitotic mapping // Curr. Genet. - 1993. - N23. - P. 47-53.
Dellamatrice P. M., Monteiro R. T. R., Kamida H. M., Nogueira N. L., Rossi M. L., Blaise C. Decolourization of municipal effluent and sludge by Pleurotus sajor-caju and Pleurotus ostreatus II World J. Microbiol. Biotechnol. - 2005. - Vol. 21. -N8-9. - P. 1363-1369.
Dempster A. P., Laird N. M., Rubin D. B. Maximum likelihood from incomplete data via the EM algorithm // Journal of the Royal Statistical Society. Series B (Methodological). - 1977. - Vol. 39. -Nl. - P. 1-38.
DOE Joint Genome Institute, www.jgi.doe.gov.
Eger G. Biology and breeding of Pleurotus II The biology of cultivation of edible mushrooms. N.Y.: Academic Press. -1978. -P. 497-519.
Espinosa-Valdemar R. M., Turpin-Marion S., Delfín-Alcalá I., Vázquez-Morillas A. Disposable diapers biodégradation by the fungus Pleurotus ostreatus II Waste Manag. -2011. - 31(8).-P. 1683-1638.
Falconer D., Mackey T. Introduction to quantitative genetics. India: Dorling Kindersley Pvt. Ltd. - 2009. - 464 p.
Fan J., Chee M., Gunderson K. Highly parallel genomic assays // Nat. Rev. Genet. - 2006. - Vol. 7. - N8. - P. 632-644.
Gardes M., Brunes T.D. ITS primers with enhanced specificity for basidiomycetes application to the identification of mycorrhizae and rusts // Mol. Ecol. - 1993. -Vol. 2.-P. 130-138.
Gonzalez P., Labarère J. Phylogenetic relationships of Pleurotus species according to the sequence and secondary structure of the mitochondrial small-subunit rRNA V4, V6 and V9 domains // Microbiology. - 2000. - N 146. - P. 209-221.
Goyal R., Grewal R. B., Goyal R. K. Nutritional attributes of Agaricus bisporus and Pleurotus sajor caju mushrooms // Nutr. Health. - 2006. - Vol. 18(2). - P. 179-184.
Gunde-Cimerman N., Cimerman A. Pleurotus fruiting bodies contain the inhibitor of 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenyme A reductase-lovastatin // Exp Mycol. -1995.-Vol. 19.-P. 1-6.
Guzmán G., Montoya L., Salmones D., Bandala V. M. Studies of the genus Pleurotus (Basidiomycotina), II. P. djamor in Mexico and in other Latin-American
96
countries, taxonomic confusions, distribution and semi-industrial culture // Crypt. Bot. - 1993. -N3. - P. 213-220.
Hall T. BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT // Nucleic Acids Symposium Series. - 1999. - Vol. 41.-P. 95-98.
Hawksworth D. L., Pegler D. N., Kirk P. M., Sutton B. C. Dictionary of the Fungy 8th ed. - 1995. - CAB International, University Press, Cambridge. - 616 p.
Hibbett D. S., Pine E. M., Langer E., Langer G., Donoghue, M. Evolution of gilled mushrooms and puffballs inferred from ribosomal DNA sequences // Proceedings of the National Academy of Sciences . - 1997. - N 94. - P. 1200212006.
Hibbett D. S., Vilgalys R. Evolutionary relationships of Lentinus to the Polyporaceae: evidence from restriction analysis of enzymatically amplified ribosomal DNA // Mycologia. - 1991. - 83(4). - P. 425-439.
Hilber O. Valid, invalid and confusing taxa of the genus Pleurotus II Mushroom Science.-1989.-V. 12.-P. 241-248.
Hopple J., Vilgalys R. Phylogenetic relationships among coprinoid taxa and allies based on data from restriction site mapping of nuclear rDNA // Mycologia. - 1994. -86(1).-P. 96-107.
http://supfam.org/SUPERFAMILY/index.html
Hulbert S., Ilott T., Legg E., Lincoln S., Lander E., Michelmore R. Genetic analysis of the fungus, Bremia lactucae, using restriction fragment length polymorphisms // Genetics. - 1988. -N120. - P. 947-958.
Idowu O. Evaluation of different substrates and combinations on the growth of Pleurotus pulmonarius (Fries) Quelet (sajor-caju) II Nigerian Journal of Horticultural Science. - 2003. - Vol.8
Ikekawa T., Nakamishi M., Uchara N., Chavava G., Fukuoka F. Antitumor action of some Basidiomycetes, especially Phellinus linteus II Gann. - 1968. - N 59. - P. 155-157.
Ikekawa T., Nakamishi M., Uchara N., Chavava G., Fukuoka F. Antitumor activity of aqueous extracts of edible mushrooms // Cancer Res. - 1969. - N 29. - P. 734735.
Index Fungorum. - www.indexfungorum.org.
Jain S. K., Gujral G. S., Bisaria R., Vasudevan P. Cultivation of Pleurotus sajor-caju on aquatic weeds // Aquatic Botany. - 1988. - Vol. 30(3). - P. 245-251.
James T. Y., Srivilai P., Kiies U., Vilgalys R. Evolution of the bipolar mating system of the mushroom Coprinellus disseminatus from its tetrapolar ancestors involves loss of mating-type-specific pheromone receptor function // Genetics. -2006.-N 172.-P. 1877-1891.
James T., Moncalvo J., Li S., Vilgalys R. Polymorphism at the ribosomal DNA spacer and its relation to breeding structure of the widespread mushroom Schizophyllum commune // Genetics. - 2001. - N 157. - P. 149-161.
Kalmi E., Sargin S. Cultivation of two Pleurotus species on wheat straw substrates containing olive mill waste water // International Biodeterioration & Biodégradation. - 2004. - Vol. 53(1). - P. 43-47.
Kashangura C., Hallsworth J., Mswaka A. Phenotypic diversity amongst strains of Pleurotus sajor-caju: implications for cultivation in arid environments // Mycological research. - 2006. - Vol. 110. -N 3. - P. 312-317.
Kerrigan R., Royer J., Bailer L., Kohli Y., Horgen P., Anderson J. Meiotic behavior and linkage relationships in the secondarily homothallic fungus Agaricus bisporus II Genetics. - 1993. - N133. - P. 225-236.
Kim S. H., Han A., Kronstad J., Breuil C. Differentiation of sapstain fungi by restriction fragment length polymorphism patterns in nuclear small subunit ribosomal DNA // Microbiology Letters. - 1999. -N 177. - P. 151-157/
Kurtzman R.H., Zadrazil F. Physiological and taxonomic considerations for cultivation of Pleurotus mushrooms // Tropical Mushrooms: Biological Nature and Cultivation Methods. Eds. Chang S.T., Quimio T.H. Hong Kong: Chinese Univ. Press.-1982.-P. 299-348.
Lakshmi B., Tilak J. C., Adhikari S., Devasagayam T. P. A., Janardhanan K. K. Inhibition of lipid peroxidation induced by y-radiation and AAPH in rat liver and brain mitochondria by mushrooms // Current Science. - 2005. - V. 88. - № 3. - P. 484-488.
Lakshmi B., Tilak J. C., Adhikari S., Devasagayam T. P. A., Janardhanan K. K. Inhibition of lipid peroxidation induced by g-radiation and AAPH in rat liver and brain mitochondria by mushrooms // Current Science. - 2005. - Vol. 88. - N 3. - P. 484-488.
Larraya L., Perez G., Iribarren I., Blanco J., Alfonso M., Pisabarro A., Ramirez L. Relationships between monokaryotic growth rate and mating type in the edible basidiomycete Pleurotus ostreatus II Microbiology. - 2001. - P. 3385-3390.
Larraya L., Perez G., Penas M., Baars J., Mikosch T., Pisabarro A., Ramirez L. Molecular karyotype of the white rot fungus Pleurotus ostreatus II Microbiology. -1999.-P. 3413-3417.
Larraya L., Perez G., Ritter E., Pisabarro A., Ramirez L. Genetic Linkage Map of the Edible Basidiomycete Pleurotus ostreatus // Appl. Environ. Microbiol. - 2000. -N66(12).-P. 5290-5300.
Lee S.B., Milgroom M.G., Taylor J.W. A rapid, high yield mini-prep method for isolation of total genomic DNA from fungi // Fungal Genetics and Biology. -1988.-N35.-P. 23-24.
Liu J., Hodson M., Hall B., Loss of the flagellum happened only once in the fungal lineage: phylogenetic structure of kingdom Fungi inferred from RNA polymerase II subunit genes // Evolutionary Biology. - 2006. - 6(74). - P. 3-40.
Lucas E. H., Montesano R., Pepper M. S., Hafner M., Sablon E. Tumor inhibitors in Boletus edulis and other holobasidiomycetes // Antibiotics Chemotherapy. -1957.-Vol. 7.-P. 1-4.
Mackey T. Mutation and the origin of quantitative variation. In: Evolution and Animal Breeding. Wallingford, UK: C.A.B. International. - 1989. - P. 113-119.
Madan M., Vasudevan P., Sharma S. Cultivation of Pleurotus sajor-caju on different wastes // Biological Wastes. - 1987. - Vol. 22(4). - P. 241-250.
Madan M., Vasudevan P., Sharma S. Cultivation of Pleurotus sajor-caju on different wastes // Biological Wastes. - 1987. - Vol. 22(4). - P. 241-250.
MapQTL® 6.0, Kyazma, 2009; http://www.kyazma.nl/
Martin F., Selosse M., Tacon F. The nuclear r DNA intergenic spacer of the ectomycorrhizal basidiomycete Laccaria bicolor: structural analysis and allelic polymorphism//Microbiology. - 1999.-N 145.-P. 1605-1611.
Martin K., Rygiewicz T. Fungal-specific PCR primers developed for analysis of the ITS region of environmental DNA extracts // Microbiology. - 2005. - 5(28). -P. 1-11.
May B., Henley C., Fisher C., Royse D. Linkage relationships of 19 allozyme encoding loci within the commercial mushroom genus Pleurotus II Genome. -1988.-N30.-P. 888-895.
Mukhopadhyay R., Chatterjee S., Chatterjee B. P., Guha A. K. Enhancement of biomass production of edible mushroom Pleurotus sajor-caju grown in whey by plant growth hormones // Process Biochemistry. - 2005. - Vol. 40(3-4). - P. 12411244.
Ngai P.H., Ng T.B. A ribonuclease with antimicrobial, antimitogenic and antiproliferative activities from the edible mushroom Pleurotus sajor-caju II Peptides. - 2004. - Vol. 25(1). - P. 11-17.
Nicholl D. B. G., Petersen R. H. Phenetic placticity in Pleurotus djamor II Mycotaxon. -2000. - Vol. 76. - P. 17-37.
Okuda Y., Murakami S., Matsumoto T. A genetic linkage map of Pleurotus pulmonarius based on AFLP markers, and localization of the gene region for the sporeless mutation // Genome. - 2009. - N52(5). - P. 438-446.
Okuda Y., Ueda J., Obatake Y., Murakami S., Fukumasa Y., Matsumoto T. Construction of a Genetic Linkage Map Based on Amplified Fragment Length Polymorphism Markers and Development of Sequence-Tagged Site Markers for Marker-Assisted Selection of the Sporeless Trait in the Oyster Mushroom {Pleurotus eryngii) // Appl. Environ. Microbiol. - 2012. - Vol. 78. - N5. - P. 1496-1504
Orrego C. E., Jaramillo C. Cultivation the Edible Mushroom Pleurotus spp in the Urban Area of the City of Manizales. - National University Manizales. - 2005. -45 p.
Pant D., Reddy U., Adholeya A. Cultivation of oyster mushrooms on wheat straw and bagasse substrate amended with distillery effluent // World Journal of Microbiology and Biotechnology. - 2006. - Vol. 22. - N 3. - P. 267-275.
Pathak R., Joshi N., Dwivedi R.R. Eco-friendly production of Agaricus bisporus (white button mushroom) // Nat. Sci. - 2009. -N 6. - P.57-60.
Peberdy J., Hanifah A., Jia J-H. New perspectives on the genetics of Pleurotus. In: Mushroom biology and mushroom products. Hong Kong: The Chinese University Press.-1993.-P. 55-62.
Pegler D.N. The genus Lentinus II Kew Bulletin Additional Series. - 1983. - № 10.-P. 1-281.
Poppe J. Use of the agricultural waste materials in the cultivation of mushrooms // Mushroom Science. - 2000. - Vol. 15. - P. 3-23.
Ragunathan R., Swaminathan K. Biological treatment of a pulp and paper industry effluent by Pleurotus spp. // World Journal of Microbiology and Biotechnology. -2004. - Vol. 20. - N 4. - P. 389-393.
Raper J. R. Genetics of Sexuality in Higher Fungi. NY: Ronald Press. - 1966. -283 p.
Raper J.R. Genetics of sexuality in higher fungi. N.Y.: Rolland Press. - 1996. -283 p.
Reddy G. V., Kothari I. L., Mishra A., Patel C. R. Biotransformation of banana waste into protein by Pleurotus sajor-caju II Indian J. Exp. Biol. - 2000. - Vol. 38(8).-P. 845-848.
Royse D. J. Speciality mushrooms. In: Progress in new crops. Arlington, Va: ASHS Press. - 1996. - P 464-^75.
Royse, D., Sanchez J. Ground wheat straw as a substitute for portions of oak wood chips used in shiitake (Lentinula edodes) substrate formulae // Bioresource Technology. - 2007. -N98. - P. 2137-2141.
Royse, D.J. Influence of spawn rate and commercial delayed release of nutrient levels on Pleurotus cornucopiae yield, size and time to production // Applied Microbiology and Biotechnology. -2002.-AH7.-P. 191 -200.
Ruan-Soto F. ,Garibay-Orijel R., Cifuentes J. Process and dynamics of traditional selling wild edible mushrooms in Tropical Mexico // Journal of Ethnobiology and Ethnomedicine. - 2006.- N2:3.
Sagawa I., Nagata Y. Analysis of chromosomal DNA of mushrooms in genus Pleurotus by pulsed field gel electrophoresis // J. Gen. Appl. Microbiol. -1992.-N38.-P. 47-52.
Salmones D., Gaitan-Hernandez R., Perez R., Guzman G. Studies on genus Pleurotus. VIII. Interaction between mycelial growth and yield // Rev. Iberoam. Micol. - 1997. - Vol. 4. -N 14. - P. 6-173.
Salmones D., Mata G., Waliszewski K. N. Comparative culturing of Pleurotus spp. on coffee pulp and wheat straw: biomass production and substrate biodégradation // Bioresour Technol. - 2005. - Vol. 5. -N 96. - P. 537-44.
Sánchez C. Cultivation of Pleurotus ostreatus and other edible mushrooms // Applied Microbiology and Biotechnology. - 2010. - Vol. 85. - N5. - P. 13211337.
Sánchez C. Modern aspects of mushrooms culture technology // Appl. Microbiol. Biotechnol. - 2004. - N 64. - P. 756-762.
Selvakumar P., Rajasekar S., Periasamy K., Raaman. N. Isolation and characterization of melanin pigment from Pleurotus cystidiosus (teleomorph of Antromycopsismacrocarpa) // World Journal of Microbiology and Biotechnology. - 2008. - Vol. 24. - № 10. - P. 2125-2131.
Shapiro, S. S., Wilk, M. B. An analysis of variance test for normality (complete samples) // Biometrika . - 1965. - Vol. 52. - N3-4. - P. 591-611.
Skinner D., Budde A., Farman M., Smith J., Leung H. Genome organization of Magnaporthe grísea: genetic map, electrophoretic karyotype, and occurrence of repeated DNAs // Theor. Appl. Genet. - 1993. - N 87. - P. 545-557.
SPSS Statistics Standard, IBM, 2009; http://spss.ru/
Srivastava M. A Pink Coloured Pleurotus djamor (Rumph.) Boedijn from natural habitat of North Bihar, India // Current science. - 2001. - Vol.. 80. - N 3. - P. 337338.
Stamets P. Growing gourmet and medicinal mushrooms. - Oxford. - 1993. - 552 p.
Tamura K., Peterson D., Peterson N., Stecher G., Nei M., Kumar S. MEGA5: Molecular Evolutionary Genetics Analysis using Maximum Likelihood,
Evolutionary Distance, and Maximum Parsimony Methods // Molecular Biology and Evolution. - 2011. - N28. - P. 2731-2739.
Technelysium Pty Ltd; http://technelysium.com.au
Tommerup I.C., Barton J.E., O'Brien P.A. Realiability of RAPD fingerprinting of three basidiomycete fungi, Laccaria, Hydnangium and Rhyzoctonia II Mycol. Res. -1995.-99(2).-P. 179-186.
Tsang L. J., Reid I. D., Coxworth E. C. Delignification of wheat straw by Pleurotus spp. under mushroom-growing conditions // Applied and Environmental Microbiology. - 1987. - Vol. 53. - No 6. - P. 1304-1306.
Tzeng T., Lyngholm L., Ford C., Bronson C. A restriction fragment length polymorphism map and electrophoretic karyotype of the fungal maize pathogen Cochliobolus heterostrophus II Genetics. - 1988. -N130. - P. 81-96.
Van Ooijen J. JoinMap ® 4.0, 2006. Software for the calculation of genetic linkage maps in experimental populations. Kyazma B. V., Wageningen, Netherlands.
Van Ooijen J. MapQTL ® 6.0, 2004. Software for the calculation of quantitative trait loci in experimental populations. Kyazma B. V., Wageningen, Netherlands.
Vilgalys R., Sun B.L. Assessment of species distributions in Pleurotus based on trapping of airborne basidiospores // Mycologia. - 1994. - 86(2). - P. 270-274.
Wasser S.P., Weis A.L. Medicinal properties of substances occurring in higher Basidiomycetes Mushrooms: Current Perspectives (Review) // Intern. Journal of Medicinal Mushrooms. - 1999. - Vol. 1. - P. 31 -62.
Whisson S., Drenth A., Maclean D., Irwin J. Phytophthora sojae avirulence genes, RAPD, and RFLP markers used to construct a detailed genetic linkage map // Mol. Plant-Microbe Interact. - 1995. - N8. - P. 988-995.
White TJ, Bruns T, Lee S, Taylor J (1990) Amplification and direct sequencing of fungal ribosomal RNA genes for phylogenetics. In: PCR Protocols: a guide to methods and applications. NY: Academic Press. - P. 315-322.
104
Wright S. The theoretical variance within and among subdivisions of a population that is in a steady state // Genetics. - 1952. -N37. - P. 312-321.
Xu J., Horgen P., Anderson J. Somatic recombination in the cultivated mushroom Agaricus bisporus II Mycol. Res. - 1996. - N100. - P. 188-192.
Zervakis G. I., Venturella G., Papadopoulou K. Genetic polymorphism and taxonomic infrastructure uf the Pleurotus eringii species-complex as determined by RAPD analysis, isozyme profiles and ecomorphological characters // Microbiology. -2001. -N 147. - P. 3183-3194.
Zervakis G., Balis C. A pluralistic approach in the study of Pleurotus species with emphasis on compatibility and physiology of the European morphotaxa // Mycol. Res.-1996.- V. 100.-N6.-P. 717-731.
Zervakis G., Moncalvo J., Vilgalys R. Molecular phylogeny, biogeography and spetiation of the mushroom species Pleurotus cystidiosus and allied taxa // Microbiology. - 2004. -N 150. - P. 715-726.
Zhuang C. et al. Antitumor protein-conteining polysaccharides from a Chinese mushroom jengweigu or houbitake, Pleurotus sajor-caju (Fr.) Sing. // Biosci. Biotechnol. Biochem. - 1993. -N 57. - P. 901-906.
Благодарности. Я выражаю огромную благодарность своему научному руководителю, д. б. н., профессору Шныревой Алле Викторовне за терпение, неоценимую помощь и всестороннюю поддержку на всех этапах выполнения и написания работы. Искренне благодарю всех сотрудников лаборатории микологии Университета Вагенингена, в особенности Йохана Барса, Антона Сонненберга, Патрика Хендрикса и Брайана Лаврайссена за помощь в планировании и проведении большой части работы по анализу количественных признаков вешенки, а также за их гостеприимство и чувство юмора. Хочу поблагодарить д. б. н., профессора Гарибову Лидию Васильевну и Завьялову Людмилу Анатольевну за помощь в работе, ценные советы и рекомендации. Отдельное спасибо всем сотрудникам кафедры микологии и альгологии биологического факультета МГУ имени М. В. Ломоносова, а также моим друзьям и близким.
Обратите внимание, представленные выше научные тексты размещены для ознакомления и получены посредством распознавания оригинальных текстов диссертаций (OCR). В связи с чем, в них могут содержаться ошибки, связанные с несовершенством алгоритмов распознавания. В PDF файлах диссертаций и авторефератов, которые мы доставляем, подобных ошибок нет.