Генетический анализ нового семейства регуляторных генов у Drosophila melanogaster тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.00.26, кандидат биологических наук Головнина, Елена Александровна

  • Головнина, Елена Александровна
  • кандидат биологических науккандидат биологических наук
  • 1999, Москва
  • Специальность ВАК РФ03.00.26
  • Количество страниц 122
Головнина, Елена Александровна. Генетический анализ нового семейства регуляторных генов у Drosophila melanogaster: дис. кандидат биологических наук: 03.00.26 - Молекулярная генетика. Москва. 1999. 122 с.

Оглавление диссертации кандидат биологических наук Головнина, Елена Александровна

ОГЛАВЛЕНИЕ

ВВЕДЕНИЕ

1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Механизмы репрессии

1.1.1. Репрессия транскрипции в гетерохроматине

1.1.2 Репрессия транскрипции в эухроматине

1.2. Организация транскрипционных комплексов в эухроматине

1.2.1. Характеристика инсуляторов дрозофилы

1.2.1.1 Характеристика ses/ses' элементов

1.2.1.2. Характеристика зи(Н\\г)-связывающего домена

1.2.2. Возможные механизмы действия инсуляторов

2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

2.1. Генетические методы

2.1.1. Мутации Drosophila melanogaster, использованные в работе

2.1.2. Линии Drosophila melanogaster, использованные в работе

2.1.3. Способы получения Su(mg) мутаций

2.1.4.Определение хромосомы, на которой находится Su(mg) мутация

2.1.5. Локализация Su(mg) мутаций с помощью метода рекомбинационого картирования

2.1.6. Локализация Su(mg) мутаций с помощью цитологического анализа политенных хромосом

2.1.7. Очистка линий с Su(mg) мутациями от лишних копий Р элемента

2.1.8. Получение ревертантов Su(mg) мутаций под действием Р элемента

2.1.9. Создание комбинаций мутаций и их анализ

2.1.10. Фенотипический анализ проявления комбинаций мутаций

2.2 Биохимические методы

2.2.1. Выделение ДНК дрозофилы

2.2.2. Выделение фрагментов ДНК из геля при помощи Gene-Clean

2.2.3. Блот-гибридизация по Саузерну

2.2.4. Гибридизация на фильтрах

2.2.5. Молекулярное клонирование

2.2.5.1. Получение геномных библиотек

2.2.5.2. Выделение рекомбинантных клонов из геномной библиотеки

2.2.5.3. Выделение ДНК рекомбинантного фага

2.2.6. Трансформация бактериальных клеток плазмидами

2.2.7. Выделение ДНК плазмид методов щелочного лизиса

2.2.8. Метод PCR (ПЦР)

2.2.9. Секвенирование плазмид и PCR продуктов

2.2.10. In situ гибридизация ДНК с политенными хромосомами

3. РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЯ

3.1. Способы получения Su(mg) мутаций

3.1.1. Получение Su(mg) мутаций в Р-М гибридном дисгенезе

3.1.2. Получение Su(mg) мутаций с помощью конструкций на основе Р элемента

3.2. Локализация Su(mg) мутаций

3.2.1. Рекомбинационное картирование Su(mg) мутаций

3.2.2. Анализ Su(mg) мутаций с помощью блот гибридизации по Саузерну

3.3. Влияние Su(mg) мутаций на взаимодействие mod(mdg4)luI с мутациями, индуцированными МДГ4

3.4. Анализ зависимости эффекта Su(mg) мутаций от окружающих последовательностей

3.5. Анализ влияния Su(mg) мутаций на транскрипцию генов yellow и cut

3.6. Мутации Su(mg) не являются модификаторами эффекта положения и не относятся к генам группы Polycomb

3.7. Влияние мутаций Su(mg) на трансвекцию между аллелями в локусеyellow

3.8. Анализ взаимодействия мутаций в локусах Su(mg), su(Hw) и mod(mdg4)

3.9. Мутации Su(mg)!'7, Su(mg)3'3 и Su(mg)3~4 индуцированы инсерцией Р элемента

3.9.1, Анализ мутаций Su(mg) " и Su(mg)3'4

3.9.2. Анализ мутации Su(mg)1'7

3.10. Большинство Su(mg) мутаций индуцировано hobo элементом

3

3.11. Клонирование и молекулярный анализ мутацииSu(mg) '

4. ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ

4.1. Функции Su(mg) генов в регуляции транскрипции

4.2. Роль мобильных элементов в индукции Su(mg) мутаций

ВЫВОДЫ

СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННОЙ ЛИТЕРАТУРЫ

Рекомендованный список диссертаций по специальности «Молекулярная генетика», 03.00.26 шифр ВАК

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Генетический анализ нового семейства регуляторных генов у Drosophila melanogaster»

ВВЕДЕНИЕ

Гены эукариот имеют сложно устроенные регуляторные области, содержащие большое количество регуляторных элементов. Одним из регуляторных элементов, обеспечивающих правильное взаимодействие между энхансером и промотором, является инсулятор.

Инсулятор - это цис-регуляторный элемент, который блокирует взаимодействие между энхансером и промотором, если он расположен между ними. При этом ни энхансер, ни промотор сами по себе не теряют своей функциональной активности. В настоящее время наиболее изученным инсулятором является зи(Нш)-связьшающий район, который входит в состав ретротранспозона МДГ4 Drosophila melanogaster. зи(Н\у)-связывающий район состоит из 12 октамерных сайтов связывания для белка su(Hw); уменьшение числа сайтов связывания приводит к ослаблению инсуляторной функции. Было показано, что введение мутации su(Hw) приводит к супрессии мутантного фенотипа, из чего следует, что белок su(Hw) ответствен за мутантный фенотип, возникающий вследствие внедрения инсулятора. Другим белком, участвующим в работе инсулятора, является modifier of mdg4,

lui

mod(mdg4). Мутация в этом гене, mod(mdg4) , в случае одних генов ослабляет инсуляцию вызванную зи(Н\у)-инсулятором, а в случае других генов приводит к полному ингибированию транскрипции. Предполагается, что белок mod(mdg4) связывается с

lui

белком su(Hw) и участвует в инсуляции. В мутации mod(mdg4) белок mod(mdg4) теряет способность взаимодействовать с белком su(Hw). В результате этого белок su(Hw) начинает в некоторых случаях напрямую ингибировать некоторые промоторы. Остается открытым вопрос какие другие белки участвуют в данном процессе. Целью данной работы является получение мутаций в генах, которые могут либо взаимодействовать с su(Hw)/mod(mdg4) белковым комплексом, либо определять характер взаимодействия белка su(Hw) с промотором теки yellow, который прямо ингибируется su(Hw) инсулятором

в присутствии мутации mod(mdg4) . Для решения этой проблемы была использована чувствительная генетическая система: линия дрозофилы содержащая три мутации индуцированные инсерцией МДГ4 в локусах yellow, scute и cut. В результате мобилизации транспозиций мобильных элементов были получены мутации в генах Suppressor of modifier of mdg4 (Su(mg)), которые супрессируют частично или полностью действие lui

мутации mod(mdg4) . Мутации в генах Su(mg) имеют доминантный эффект, и в большинстве не влияют на жизнеспособность и не имеют самостоятельного фенотипического проявления. В данной работе был проведен анализ генетических характеристик Su(mg) мутаций, выяснение локализации и природы Su(mg) мутаций для клонирования в дальнейшем соответствующих генов.

Похожие диссертационные работы по специальности «Молекулярная генетика», 03.00.26 шифр ВАК

Заключение диссертации по теме «Молекулярная генетика», Головнина, Елена Александровна

выводы

1) Получены мутации в 13 локусах дрозофилы, который супрессируют ингибирующие действие инсулятора su(Hw) на промотор гена yellow в присутствии мутации mod(mdg4)1"1. Таким образом, получен новый класс регуляторных мутаций у Drosophila melcmogaster.

2) Показано, что мутации в четырех Su(mg) генах супрессируют действие мутации mod(mdg4)lul на три мутации вызванные инсерцией МДГ4. Можно предположить, что белковые продукты этих генов взаимодействуют непосредственно с su(Hw) инсулятором.

3) Показано, что большинство Su(mg) мутаций полученных в результате активации Р элемента, не связаны с его инсерцией. Предварительные результаты предполагают, что большинство Su(mg) мутаций вызваны инсерцией hobo элемента.

3 э

4) Проведено клонирование Su(mg) ' мутации, которая индуцирована инсерцией Р элемента в 61А районе третьей хромосомы. Зонд полученный на основе ДНК, примыкающей к Р элементу, выявил гибридизацию с транскриптом неизвестного гена на стадии куколки.

Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Головнина, Елена Александровна, 1999 год

СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННОЙ ЛИТЕРАТУРЫ

1. Alatortsev V.E., Kramerova I.A., Frolov M.V., Lavrov S.A., Westphal E.D. Vinculin gene is non-essential in Drosophila melanogaster. IIFEBS Lett. 1997. V.413. P.197-201.

2. Alfert M. Composition and structure of giant chromosomes. // Int. Rev. Cytol. 1956. V.3. P.131-135.

3. Ashburner M. Drosophila: A Laboratory Manual. // Cold Spring Harbor Laboratory.Cold Spring Harbor. N.Y. 1989.

4. Blackman R.K., Koehler M. D.,. Grimaila R, Gelbart W.M.. Identification of a fully-funtional hobo transposable element and its use for germ-line transformation of Drosophila. II EMBO J. 1989. V.8. P.211-217.

5. Blackman R. K., Koehler M. D., Grimaila R., Gelbart W.M. Mobilization of hobo elements residing within the decapentaplegic gene complex : suggestions of a new hybrid dysgenesis system in Drosophila melanogaster. II Cell. 1987. V.49. P.497-505.

6. Biessmann H, Molecular analysis of the yellow gene (y) region of Drosophila melanogaster. II Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1985. V.82. N.21. P.7369-7373.

7. Bornemann D., Miller E., Simon J. The Drosophila Polycomb group gene Sex comb on midleg (Scm) encodes a zinc finger protein with similarity to polyhomeotic protein. // Development. 1996. V.122. P.1621-1630

8. Boulikas T. Nature of DNA sequences at the attachment regions of genes to the nuclear matrix. // J. Cell Biochem. 1993. V.52. P.14-22.

9. Brunk B.P., Martin E.C., Adler P.N. Molecular genetics of the Posterior sex combs/Suppressor 2 of zeste region of Drosophila: aberrant expression of the Suppressor 2 of zeste gene results in abnormal bristle development. // Genetics. 1991. V.128. P.l 19-132.

lO.Bunker C.A., Kingston R.E. Transcriptional repression by Drosophila and mammalian Polycomb group proteins in transfected mammalian cells. // Mol. Cell Biol. 1994. V.14. P.1721-1732.

1 l.Busturia A., Bienz M. Silencers in abdominal-B, a homeotic Drosophila gene. // EMBO J. 1993. V.12. P.1415-1425.

12.Cai H.N.,. Levine M. Modulation of enhancer-promoter interactions by insulators in the Drosophila embryo. // Nature. 1995. V.376. P.533-536.

13.Cai H. N.,. Levine M. The gypsy insulator can function as a promoter-specific silencer in the Drosophila embryo. // EMBO J. 1997. V.16. P. 1732-1741.

14.Calvi B.R., Gelbart W.M. The basis for the germlin specificity of the hobo transposable element in Drosophila melanogaster. II EMBO J. 1994. V.13. P.1636-1644.

15.Campuzano S., Carramolino L., Cabrera C., Ruiz-Gomez M., Villares R... Molecular genetics of the achaete-scute gene complex of D. melanogaster. II Cell. 1985 .V.44. P.327-338.

16.Chan C.S., Rastelli L., Pirrotta V. A Polycomb response element in the Ubx gene that determins an epigenetically inherited state of repression. // EMBO J. 1994. V.13. P.2553-2564.

17.Chang M., Jaehning J.A. A multiplicity of mediators: alternative forms of transcription complexes communicate with transcriptional regulators. // Nucleic Acids Res. 1997. V.25. P.4861-4865.

18.Chiang A., Connor M., Paro R., Simon J., Bender W. Discrete Polycomb-binding sites in each parasegmental domain of the bithorax complex. // Dev. Suppl. 1995. V.121. P.1681-1689.

19.Chung J. H., Whiteley M., Felsenfeld G. A 5' element of the chicken ¿-Globin domain serves as an insulator in human erythroid cells and protects against position effect in Drosophila. II Cell. 1993. V.74. P.505-514.

20.Cleard F, Matsarskaia M, Spierer P. The modifier of position-effect variegation Suvar(3)7 of Drosophila: there are two alternative transcripts and seven scattered zinc fingers, each preceded by a tryptophan box. //Nucleic. Acids Res. 1995. V.ll. P.796-802.

21.Cleard F., Delattre M., Spierer P. SU(VAR)3-7, a Drosophila heterochromatin-associated protein and companion of HP1 in the genomic silencing of position-effect variegation. // EMBO J. 1997. V.16. P.5280-5288.

22.Corces V. G., Geyer P. K. Interactions of retrotransposons with the host genome : the case of the gypsy element of Drosophila. II Trends in Genetics. 1991. V.7. P.86-90.

23.Corces V. G. Chromatin insulators. Keeping enhancers under control. // Nature. 1995. V.376. P.462-463.

24.Cress W. D., Triezenberg S. J. Critical structure elements of the VP16 transcriptional activation domain. // Science. 1991. V.251. P.87-90.

25.DeCamillis M., Cheng N.S., Pierre D., Brock H.W. The polyhomeotic gene of Drosophila encodes a chromatin protein that shares polytene chromosome-binding sites with Polycomb. // Genes Dev. 1992. V.6. P.223-232

26.Dimitri P., Pisano C. Position effect variegation in Drosophila melanogaster: relationship between suppression effect and the amount of Y chromosome. // Genetics. 1989. V.122. P.793-800.

27.Dorer D.R., Henikoff S. Transgene repeat arrays interact with distant heterochromatin and cause silencing in cis and trans. // Genetics. 1997. V.147. P.l 181-1190.

28.Dorer, D. R.,. Henikoff S. Expansions of transgene repeats cause heterochromatin formation and gene silencing in Drosophila. II Cell. 1994 V.77. P.993-1002.

29.Dorn R., Krauss V., Reuter G., Sauweber H. The enhancer of the position-effect variegation of Drosophila E(var)3-93D codes for a chromatin protein containing a conserved domain common to several transcriptional regulators. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1993. V.90. P.l 1376-11380.

30.Dorsett D. Distance-independent inactivation of an enhancer by the suppressor of Hairy-wing DNA-binding protein of'Drosophila. // Genetics. 1993. V.134. N4. P.l 135-1144.

31.Dorsett D. Potentiation of a polyadenylation site by a downstream protein-DNA interaction. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1990 .V.87. P.4373-4377.

32.Dunaway M., Hwang J.Y., Xiong M., Yuen H.L. The activity of the scs and scs' insulator elements is notdependent on chromosomal context. // Mol.Cell.Biol. 1997. V.17. P.182-189.

33.Dura J.M., Ingham P. Tissue- and stage-specific control of homeotic and segmentation gene expression in Drosophila embryos by the polyhomeotic gene. // Development. 1988. V.103. P.733-741.

34.Eggleston, W.B., Rim N.R. and Lim J.K.. Molecular characterization of /zo&o-mediated inversions in Drosophila melanogaster. II Genetics. 1996 .V.144. P.647-656.

35.Eissenberg J. C. Position effect variegation in Drosophila: towards a genetics of chromatin assembly. //Bioessays. 1989. V.ll. P.14-17.

36.Eissenberg J.C., James T.C., Foster-hartnett T., Ngan V., Elgin S.C.R. Mutation ina heterochromatin-specific chromosomal protein is associated with suppression of position effect variegation in Drosophila melanogaster. II Proc. Nat. Acad. Sci. USA. 1990. V.87. P.9923-9927.

37.Eissenberg J.C., Morris G.D., Reuter G., Hartnett T. The heterochromatin-associated protein HP-1 is an essential protein in Drosophila wiht dosage-dependent effects on position effect variegation. // Genetics. 1992. V.131. P.345-352.

38.Farkas G., Gausz J., Galloni M., Reuter G., Gyurkovics H., Karch F. The Trithorax-like gene encodes the Drosophila GAGA factor. //Nature. 1994. V.371. P.806-808.

39.Fauvarque M.O., Dura J.-M. Polymeotic regulatory sequences induse developmental regulator-dependent variegation and targeted P-element insertions in Drosophila. II Genes. Dev. 1993. V.7. P.1508-1520.

40.Festenstein R., Tolaini M., Corbella P., Mamalaki C., Partington J., Fox M., Miliou A., Jonrs M., Kioussis D. Locus control region function and heterochromstin-indused position effect variegation.//Science. 1996. V.271. P.1123-1125.

41.Franke A., DeCamillis M., Zink D, Cheng N., Brock H.W., Paro R. Polycomb and polyhomeotic are constituents of a multimeric protein complex in chromatin of Drosophila melanogaster. // EMBO J. 1992. V.l 1. P.2941-2950.

42.Franke A., Messmer S., Paro R. Mapping functional domains of the polycomb protein of Drosophila melanogaster. II Chromosome Res. 1995. V.3 P.351-360.

43.Gall J. On the submicroscopic structure of chromosomes. // In Mutation, Brook-haven Symp. Biol. 1956. V.8.P.17.

44.Gause M., Hovhannisyan H., Kan T., Kuhfittig S., Mogila V.,Georgiev P. hobo induced rearrangements in the yellow locus influence the insulation effect of the gypsy su(Hw)-binding region in Drosophila melanogaster. // Genetics. 1998. V.149. P.1393-1405.

45.Gaszner M., Vazquez J., Schedl P. Characterizstion of the scs element [abstract]. // 37th Annual National Drosophila Confrrence. 1995.

46.Georgiev P.G., and Corces V.G. The su(Hw) protein bound to gypsy sequences in one chromosome can repress enhancer-promoter interactions in the paired gene located in the other homolog. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1995 .V.92. P.5184-5188.

47.Georgiev P.G, Korochkina S.E, Georgieva S.G, Gerasimova T.I. Mitomycin C induces genomic rearrangements involving transposable elements in Drosophila melanogaster. // Mol .Gen. Genet. 1990. V.220. P.229-233.

48.Georgiev P.G., Gerasimova T.I. Novel genes influencing the expression of the yellow locus and mdg4 {gypsy) in Drosophila melanogaster. II Mol. Gen. Genet. 1989 .V.220. P.121-126.

49.Georgiev P., Kozycina M.. Interaction between mutations in the suppressor of Hairy wing and modifier of mdg4 genes of Drosophila melanogaster affecting the phenotype of gypsy-induced mutations. // Genetics. 1996. V.142. P.425-436.

50.Gdula D.A., Gerasimova T.I., and Corces V.G. Genetic and molecular analysis of the gypsy chromatin insulator of Drosophila. II Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1996. V.93. P.9378-9383.

51.Gerasimova T.I., and Corces V.G. Boundary and insulator elements in chromosomes. // Curr. Opin. Genet. Dev. 1996 .V.6. P.185-192.

52.Gerasimova, T.I., Gdula D.A., Gerasimov D.V., Simonova O., and Corces V.G. A Drosophila protein that impacts directionality on a chromatin insulator is an enhancer of position-effect variegation. // Cell. 1995 .V.82. P.587-597.

53.Geyer P.K., Green M.M., Corces V.G. Mutant gene phenotypes mediated by a Drosophila melanogaster retrotransposon require sequences homologous to mammalian enhancers.// Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1988b. V.85. P.8593-8597.

54.Geyer P.K., Green M.M, Corces V.G. Reversion of a gypyy-induced mutation at the yellow (y) locus of Drosophila melanogaster is associated with the insertion of a newly defined transposable element. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1988a. V.85. P.3938-3942.

55.Geyer P.K., Green M.M, Corces V.G. Tissue-specific transcriptional enhancers may act in trans on the gene located in the homologous chromosome : the molecular basis of transvection in Drosophila. //EMBO.J. 1990. V.9. P.2247-2256.

56.Geyer P.K., Corces V.G. DNA position-specific repression of transcription by a Drosophila zinc finger protein.// Genes Dev. 1992. V.6. P. 1865-1873.

57.Geyer P.K.,. Corces V.G. Separate regulatory elements are responsible for the complex pattern of tissue-specific and developmental transcription of the yellow locus in Drosophila melanogaster. II Genes and Dev. 1987. V.l. P.996-1004.

58.Geyer P.K., Spana C. and Corces V.G. On the molecular mechanism of gypsy-induced mutations at the yellow locus of Drosophila melanogaster. II EMBO J. 1986. V.5. P.2657-2662.

59.Geyer P.K. The role of insulator elements in defining domains of gene expression. // Curr. Opin. Genet. Dev. 1997. V.7. P.242-248.

60.Gill G. and Ptashne M. Negative effect of the transcriptional activator GAL4. // Nature. 1988. V.324. P.721-724.

61.Gindhart J.G., Kaufman T.C. Identification of Polycomb and trithorax group responsive elements in the regulatory region of the Drosophila homeotic gene Sex combs reduced. II Genetics. 1995. V.139. P.797-814.

62.Grigliatti T. Position-effect variegation-an assay for nonhistone chromosomal proteins and chromatin assembly and modifying factors. // Methods Cell Biol. 1991. V.35. P.587-627.

63.Harrison D.A., Gdula D.A., Coyne R.S., Corces V.G. A leucine zipper domain of the suppressor of Hairy-wing protein mediates its repressive effect on enhancer function. // Genes Dev. 1993 .V.7. P.1966-1978.

64.Hart C.M., Zhao K., Laemmli U.K. The scs' boundary element: characterization of boundary element-associated factors. // Mol. Cell. Biol. 1997. V.17. P.999-1009.

65.Hatzopoulos P., Monastirioti M., Yannopoulos G. and Lovis C.. The instability of the TE-like mutation dp(2;2)GYL of Drosophila melanogaster is intimately associated with the hobo element. // EMBO J. 1987 .V.6. P.3091-3096.

66.Heitz E. Das heterochromatin der Moose. // Jb. Wiss. Bot. 1928. V.69. P.762-818.

67.Henikoff S. Position-effect variegation after 60 years. // Trends Genet. 1990. V.6. P.422-426.

68.H0 Y.T., Weber S.M., Lim J.K. Interacting hobo transposons in an inbred strain and interaction regulation in hybrids of Drosophila melanogaster. II Genetics. 1993 .V.134. P.895-908.

69.Holdridge C., and Dorsett D. Repression of hsp70 heat shock gene transcription by the suppressor of Hairy-wing protein of Drosophila melanogaster. II Mol. Cell. Biol. 1991 .V.ll. P.1894-1900.

70.Hoover K.K., Gerasimova T.I., Chien A.J., Corces V.G. Dominant effects of suppressor of Hairy-wing mutations on gypsy-induced alleles offorked and cut in Drosophila melanogaster. II Genetics. 1992 .V.132. P.691-697.

71.Jack J., DeLotto Y. Structure and regulation of a complex locus: the cut gene of Drosophila. II Genetics. 1995. V.139 N4. P.1689-1700.

72Jack J.W. Molecular organization of the cut locus of Drosophila melanogaster. II Cell .1985. V.42. N3. P.869-876.

73Jack J., Dorsett D., Delotto Y., Liu S. Expression of the cut locus in the Drosophila wing margin is required for cell type specification and is regulated by a distant enhancer. // Development. 1991 .V.113. P.735-747.

74Jackson J.D., Petrykowska H., Philipsen S., Miller W., Hardison R. Role of DNA sequences outside the cores of Dnase hypersensitive sites (HSs) in functions of the beta-globin locus control region. Domain opening and synergism between HS2 and HS3. // J. Biol. Chem. 1996. V.271. P.11871-11878 .

75 James T.C., Eissenberg J.C., Craig C., Diettich V., Hobson A., Elgin S.C.R. Distribution patters of HP-1, a heterochromatin-saaociated nonhistone chromosomal protein of Drosophila. II Europ. J. Cell Biol. 1989. V.50. P.170-180.

76 Johnson-Schlitz, D., and J. K. Lim. Cytogenetics of Notch mutations arising in the unstable X chromosome Uc of Drosophila melanogaster.ll Genetics. 1987 .V.115. P.701-709.

77.Kanno M., Hasegava M., Ishida A., Isono K., Taniguchi M. Mel-18, a Polycomb group-related mammalian gene, encodes a transcriptional negativ regulator with tumor supressiv activity. // EMBO J. 1995. V.14. P.5672-5678.

78.Kassis J.A. Unusial properties of regulatory DNA from the Drosophila engrailad gene: three "pairing-sensitive" sites within a 1.6 kb region. // Genetics. 1994. V.136. P.1025-1038.

79.Kelley R.L., Kuroda M.I. Equality for X chromosomes. // Science. 1995. V.270. P.1607-1610.

80.Kellum R., Schedl P. A position-effect assay for boundaries of higher order chromosomal domains. // Cell. 1991 .V.64. P.941-950.

81.Kellum R., Schedl P. Agroup of scs elements function as domain boundaries in an enhancer-blocking assay. //Mol. Cell Biol. 1992. V.12. P.2424-2431.

82.Kim J., Shen B., Rosen C., Dorsett D. The DNA-binding and enhancer-blocking domains of \heDrosophila suppressor of Hairy-wing protein. // Mol.Cell.Biol. 1996. V.16. N7. P.3381-3392.

83.Larsson J., Zhang J., Rasmuson-Lestander A. Mutations in the Drosophila melanogaster gene encoding S-adenosyl methionine synthetase suppress position-effect variegation. // Genetics. 1996. V.143. P.887-896.

84.Laverty T.R.,. Lim J.K. Site-specific instability in Drosophila melanogaster : evidence for transposition of destabilizing element. // Genetics. 1982. V.101. P.461-476.

85.Levis R., Hazelrigg T., Rubin G.M. Separable cis-acting control elements for expression of the white gene of Drosophila. IIEMBO J. 1985. V.4. P.3489-3499.

86.Lewis E.B. A gene complex controlling segmentation in Drosophila. II Nature. 1978. V.276. P.565-570.

87.Lifton R.P. Goldberg M.L. Karp R.W, Hogness D.S. The organization of the histone genes in Drosophila melanogaster. functional and evolutionary implications. // Cold Spring Harb. Symp. Quant Biol. 1978. V.42 P.1047-1051.

88.Lim J.K. Intrachromosomal rearrangements mediated by hobo transposons in Drosophila melanogaster. II Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1988. V.85. P.9153-9157.

89.Lim J.K., Simmons M.J. Gross chromosome rearrangements mediated by transposable elements in Drosophila melanogaster. II BioEssays. 1994. V.16. P.269-275.

90.Lima-de-faria A., Jaworska H. Late. DNA synthesis in heterochromatin // Nature. 1968. V.217. P.138-142.

91.Lindsley D.L., Zimm G.G. The Genome of Drosophila melanogaster.il Academic Press. San Diego. 1992.

92.Liu S., McCleod E., Jack J. Four distinct regulatory regions of the cut locus and thear effect on celltipe specification in Drosophila. II Genetics 1991. V.127. P.151-159.

93.Locke J., Kotarski M.A., Tartof K.D. Dosage-dependent modifiers of position effect variegation in Drosophila and a mass action model that explains their effect. // Genetics. 1988. V.120. P.181-198.

94.Locke J., Hanna S., Kong. D. Evidence of mobilization of hobo transpozonsin a P-element mutagenesis screen. // Genom 1993 V.36. P.l 138-1147.

95.Lorentz A., Ostermann K., Fleck O., Schmidt H. Switching gene swi6, involved in repression of silent mating-type loci in fission yeast, encodes a homologue of chromatin-associated proteins from Drosophila and mammals. II Gene. 1994. V.27. N.143(1). P.139-143.

96.Lyubomirskaya N.V., Arkhipova I.R., Ilyin Yu.V. Transcription of Drosophila mobile element gypsy (mdg4) in heat-shocked cells. // FEBS. Lett. 1993. V.325. N°3. P.233-236.

97.Makunin I.V., Pokholkova G.V., Zakharkin S.O., Kholodilov N.G., Zhimulev. Isolation and characteristics of repeat DNA sequences from precentromere heterochromatin from the second chromosome of Drosophila melanogaster. II Dokl. Akad. Nauk. 1995. V.344. P.266-269.

98.Marlor R. L., Parkhurst S.M. and Corces V.G. The Drosophila melanogaster gypsy transposable element encodes putative gene products homologous to retroviral proteins. // Mol. Cell. Biol. 1986 .V.6. P.l 129-1134.

99.Martin E.C., Adler P.N. The Polycomb group gene Posterior Sex Combs encodes a chromosomal protein. // Development. 1993. V.l 17. P.641-655.

100.Martin M., Meng Y.B., Chia W. Regulatory elements involved in the tissue-spiecific expression ofth q yellow gene of Drosophila. II Mol. Gen. Genet. 1989. V.218. P.l 18-126.

101.Mazo A.M., Mizrokhi L.J., Karavanov A.A., Sedkov Y.A., Krichevskaya A.A. et al. Suppression in Drosophila: su(Hw) and su(f) gene products interact with a region of gypsy 0mdg4) regulating its transcriptional activity. // EMBO J. 1989. V.8. P.903-911.

102.Melnicova L., Kulikov A., Georgiev P. Interactions between cut wing mutations and mutations in zeste, and the enhancer of yellow and Polycomb group genes of Drosophila melanogaster. //Mol. Gen. Genet. 1996. V.252 P.230-236.

103.Messmer S., Franke A., Paro R. Analysis of the functional role of the Polycomb chromo domain in Drosophila melanogaster. I I Genes. Dev. 1992. V.6. P. 1241-1254.

104.Mihaly J., Hogga I., Gausz J., Gyurkovics H., Karch F. In situ dissection of the Fab-7 region of the bithorax complex into a chromatin domain boundary and a Polycomb-response element. //Development. 1997.V.124.P.1809-1820.

105.Mirkovitch J., Mirault M.E., Laemmli U.K. Organization of the higher order chromatin loop: specific attachment sites on nuclear scaffold. // Cell. 1984. V.39. P.223-132.

106.Mizrokhi L.J., Priimiagi A.F, Il'in lu.V, Gerasimova T.I, Georgiev G.P. Molecular mechanism of transposition memory in the mdg4-locus cut system of Drosophila melanogaster. II Dokl.Akad. Nauk. SSSR. 1985. V.285. N°6. P.1458-1460.

107.Mizrokhi L.J., Mazo A.M., Karavanov A.A., Sedkov Yu.A., Krichevskaia A.A. Interaction of products of su(Hw) and su(f) genes with MDG4 region regulating its transcription suppressesmutations in Drosophila caused by insertion of this gene. // Genetika. 1989. V.25. N°5. P.784-798.

108.Modolell J., Bender W., Meselson M.. Drosophila melanogaster mutations suppressible by the suppressor of Hairy-wing are insertions of a 7.3-kilobase mobile element. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1983 .V.80. P. 1678-1682.

109.Mogila V.A., Ladvishenko A.B., Simonova O.B., and Gerasimova T.I. Intragenic suppression: Stalker, a retrovirus-like transposable element, can compensate for a deficiency at the cut locus of Drosophila melanogaster. II Genetica 1992 T.86 P.305-311.

11 O.Moore G.D., Sinlair D.A., GrigliattinT.A. Histone gene mulyiplicity and position effect variegation in Drosophila melanogaster. II Genetics. 1983. V.105. P.327-344.

111.Morcillo P., C. Rosen, Dorsett D. Genes regulating the remote wing enhancer in the Drosophila cut locus. // Genetics. 1996. V.144. P.l 143-1154.

112.Morcillo P., Rosen C., Baylies M.K., Dorsett D. Chip, a widely expressed chromosomal protein required for segmentation and activity of a remote wing margin enhancer in Drosophila. 11 Genes Dev. 1997. V. 11. P.2729-2740.

113.Muller J. Transcriptional silencing by the Polycomb protein in Drosophila embrios. // EMBO J. 1995. V.14. P.1209-1220.

114.Nash W.G., Yarkin R.J. Genetic regulation and pattern formation: a study of the yellow locus in Drosophila melanogaster.il Genet. Res. 1974. V.24. P.19-26. 115.O'Brien T., Wilkins R.C., Giardina C., Lis J.T. Distribution of GAGA protein on Drosophila genes in vivo. // Genes Dev. 1995 V.9. P.1098-1110.

116.0rlando V., Paro R. Mapping Polycomb-repressed domains in the bithorax complex using in vivo formaldehyde cross-linked chromatin. // Cell. 1993. V.75 P.l 187-1198.

117.Painter T.S. A new method for the study of chromosome aberrations and the plotting of chromosome maps. // Sciens. 1933. V.78. P.585-586.

118.Pal-Bhadra M., Bhadra U., Birchler J.A. Cosuppression in Drosophila: gene silencing of Alcohol dehydrogenase by white-Adh transgenes is Polycomb dependent. // Cell. 1997. V.90. P.479-490.

119.Parkhurst S.M., Harrison D.A., Remington M.P., Spana C.R., Kelley L., Coyne R.S., Corces V.G. The Drosophila su(Hw) gene, which controls the phenotypic effect of the gypsy transposable element, encodes a putative DNA-binding protein. // Genes Dev. 1988. .V.2. P.1205-1215.

120.Parkhurst S., Corces V.G. Interactions among the gypsy element and the yellow and suppressor of Hairy-wing loci in Drosophila melanogaster. II Mol. Cell. Biol. 1986. V.6. P.47-53.

121.Paro R., Hogness D.S. The Polycomb protein shares a homologous domain with a heterochromatin-associated protein of Drosophila. II Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1991. V.88. P.263-267.

122.Peifer M., Bender W. Sequences of the gypsy transposon of Drosophila necessary for its effects on adjacent genes. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1988. V.85. P.9650-9654.

123.Peterson A.J., Kyba M., Bornemann D., Morgan K., Brock H.W., Simon J. A domain shared by the Polycomb group proteins Scm and ph mediates heterotypic and homotypic interactions. // Mol. Cel. Biol. 1997. V.17. P.6683-6692.

124.Pirrotta V. PcG complexes and chromatin silencing. // Curr. Opin. Genet. Dev. 1997. V.7. P.249-258.

125.Pirrotta V. Transvection and long-distance gene regulation. // Bioessays. 1990. V.12. P.409-414.

126.Pirrotta V., Rastelli L. White gene expression, repressive chromatin domains and homeotic gene regulation in Drosophila. II Bioessays. 1994. V.16. P.549-556.

127.Pirrotta V., Steller H., Bozzetti M.P. Multiple upstream regulatory elements control the expression of the Drosophila white gene. // EMBO J. 1985. V.4. P.3501-3508.

128.Platero J.S., Sharp E.J., Adler P.N., Eissenberg J.C., In vivo assey for protein-protein interactions using Drosophila chromosomes. // Chromosoma. 1996. V.104. P.393-404.

129.Platero J.S., Hartnett T., Eissenberg J.C. Functional analysis of the chromo domain of HP1. // EMBO J. 1995. V.15. N.14(16). P.3977-3986.

130.Poux S., Kostic C., Pirrotta V. Hunchback-independent silencing of late Ubx enhancers by a Polycomb Group Response Element. // EMBO J. 1996. V.15. P.4713-4722.

131.Ptashne M. How eukaryotic transcriptional activators work. //Nature. 1988.V.335. P.688-689.

132.Rastelli L., Chan C.S., Pirrotta V. Related chromosome binding sites for zeste, suppressors of zeste and Polycomb group proteins in Drosophila and their dependence on Enhancer of zeste function. //EMBO J. 1993. V.12. P. 1513-1522.

133.Reuter G., Hoffman H.J., Wolff I. Genetic study of position-effect variegation in Drosophila melanogaster: In(l)wm4 as a atandard rearrangement for the isolation and characterization of supressor and enhancer mutants // Biol. Zbl. 1983. V.102. P.281-298.

134.Reuter G., Spierer P. Position effect variegation and chromatin proteins. // BioEssays. 1992. V.14. №.9. P.605-612.

135.Reuter G., Werner W., Hoffmann H.J. Mutants affecting position-effect heterochromatinization in Drosophila melenogaster. II Chromosoma. 1982. V.85. P.539-551.

136.Reuter G., Wolff L., Friede B. Functional properties of the heterochromatic sequences inducing wm4 position-effect variegation in Drosophila melanogaster. II Chromosoma. 1985. V.93. P.132-139.

137.Ritossa F. New puff pattern induced by temperature shock and DMP in Drosophila. II Experientia 1962. V.18. P.571-176.

138.Romani S, Campusano S, Macagno E.R, Modolell J. Expression of achaete and scute genes in Drosophila imaginal discs and their function in sensory organ development. // Genes Dev. 1989. V.3. P.997-1007.

139.Roseman R.R., Pirrotta V., Geyer P.K. The su(Hw) protein insulates expression of the Drosophila melanogaster white gene from chromosomal position-effects. // EMBO J. 1993. V.12. N°2. P.435-442.

140.Roseman R.R., Swan J.M., Geyer P.K. A Drosophila insulator protein facilitates dosage compensation of the X chromosome min-white gene located at autosomal insertion sites. // Development. 1995. V.121. P.3573-3582.

141.Roseman R.R., Johnson E., Rodesch C., Bjerke M., Nagoshi R.N., Geyer P.K. A P element containing supressor of Hairy wing binding regions has novel properties for mutsgenesis in Drosophila Melanogaster. II Genetics. 1995. V.141. P.1061-1074. 142.Sambrook, J., Fritsch E.F. and Maniatis T. Molecular cloning : a Laboratory Manual. // Ed.2. Cold Spring Harbor Laboratory. Cold Spring Harbor. N.Y. 1989.

143.Samson M.L., Wegnez M. An approach to study the evolution of the Drosophila 5S ribosomal genes using P-element transformation. // J. Mol. Evol. 1989. V.28. P.517-523.

144.Schedl P., and Grosveld F. Domains and boundaries. In Chromatin Structure and Gene Expression. //Edited by Elgin SCR. Oxford : Oxford University Press. 1995 .P.172-196. 145.Scott K.S., Geyer P.K. Effects of the su(Hw) insulator protein on the expression ofthe divergently transcribed Drosophila yolk protein genes. // EMBO J. 1995. V.14. N°24. P.6258-6267.

146.Sheen, F.-M., Lim J.K., Simmons M.J. Genetic instability in Drosophila melanogaster mediated by hobo trasnposable elements. // Genetics. 1993. V.133. P.315-334. 147.Sigrist C.J., Pirrotta V. Chromatin insulator elements block the silencing of a target gene by the Drosophila polycomb response element (PRE) but allow trans interactions between PREs on different chromosomes. // Genetics. 1997. V.147. P.209-221. 148.Simon J., Chiang A., Bender W., Shimell M.J., O'Connor M. Elements of the Drosophila bithorax complex that mediate repression by Polycomb group products. // Dev. Biol .1993. V.158. P.131-144.

149.Smith P.A., Corces V.G. The suppressor of Hairy-wing protein regulates the tissue-specific expression of the Drosophila gypsy retrotransposon. // Genetics. 1995. V.139. №l. P.215-228

150.Smith P.A., Corces V.G. The suppressor of Hairy-wing binding region is required for gypsy mutagenesis. // Mol. Gen. Genet. 1992 .V.233. P.65-70.

151.Soeller W.C., Oh C.E., Kornberg T.B. Isolation of cDNAs encoding the Drosophila GAGA transcription factor. // Mol. Cell. Biol. 1993. V.13. P.7961-7970 152.Spana C., Harrison D.A., Corces V.G. The Drosophila melanogaster suppressor of Hairy-wingprotein binds to specific sequences ofthe gypsyretrotransposon.// Genes. Dev. 1988.V.2. N°11. P.1414-1423.

153.Spana, C., Corces V.G. DNA bending is a determinant of binding specificity for a Drosophila zinc finger protein. // Genes Dev. 1990.V.4. P.1505-1515.

154.Spoffold J. B. Position-effect variegation in Drosophila. II In The genetics and biology of Drosophila. 1976. Vol. lc. Ashbumer, M. and Novitski, E. (ed). Academic Press, New York, P.955-1018.

155.Spradling A.C. Position effect variegation and genomic instability. // Cold Spring Harb. Symp. Quant Biol. 1993. V.58. P.585-596.

156.Spradling A.C. and Karpen, G.H. Syzty years of mystery. Perspectives. Anecdotal, historical and critical commentaries on genetics. // Genetics. 1990. V.126. P.779-784. 157.Streck R.D., Macgaffey J.E., Beckendorf S.K.. The structure of hobo transposable elements and thier insertion sites. // EMBO J. 1986. V.5. P.3615-3623. 158.Strutt H., Paro R. The polycomb group protein complex of Drosophila melanogaster has different compositions at different target genes. // Mol. Cell Biol. 1997. V.17. P.6773-6783. 159.Szabad J., Reuter G., Schroder M.B. The effects of two mutations connected with chromatin functions on female germ-line cells of Drosophila. II Mol. Gen. Genet. 1988. V.211. №1. P.56-62.

160.Tartof K.D. Position effect variegation in yeast. // Bioessays. 1994. V.16. P.713-714.

161.Tartof K.D., Hobbs C., Jones M. A structural basis for variegating position effects. // Cell. 1984. V.37. N.3. P.869-878.

162.Tchurikov N.A., Gerasimova T.I., Johnson T.K., Barbakar N.I., Kenzior A.L., Georgiev G.P. Mobile elements and transposition events in the cut locus of Drosophila melanogaster. // Mol.Gen.Genet. 1989. V.219. P.241-248.

163.Tulin A.V., Kogan G.L., Filipp D., Balakireva M.D., Gvozdev V.A. Heterochromatic Stellate gene cluster in Drosophila melanogaster. structure and molecular evolution. // Genetics. 1997. V.146. P.253-262.

164.Turner B.M. Histone H4, the cell cycle and a question of integrity. // Bioessays. 1995. V.17. №2. P.1013-1015.

165.Udvardy A., Schedl P. The dynamics of chromatin condensation-redistribution of topoisomerase 11 in the 87A7 heat shock locus during induction and recovery. // Mol. Cell. Biol. 1993. V.13.P.7522.

166.Van Lohuizen M., Frasch M., Wientjens E., Berns A. Sequence similarity between the mammalian bmi-1 proto-oncogene and the Drosophila regulatory genes Psc and Su(z)2. II Nature. 1991. V.353. P.353-355.

167.Vazquez J., Schedl P. Sequences required for enhancer blocking activity of scs are located within two nuclease-hypersensitive regions. // EMBO J. 1994. V.13. N°24. P.5984-5993.

168.Verreault A. and Thomas J. O. Chromatin structure of the b-globin chromasomal dimain in adult chicken erythrocytes. // Cold spring Harbor Symp. 1994. Quant. Biol. LV111. 15.

169.Wall G., Varga-Weisz P.D., Sandaltzopoulos R., Becker P.B. Chromatin remodeling by GAGA factor and heat shock factor at the hypersensitive Drosophila hsp26 promoter in vitro. //EMBO J. 1995. V.14. P.1727-1736.

170.Wilson C., Bellen H.J., Gehring W.J. Position effects on eukaryotic gene expression. // Annu. Rev. Cell Biol. 1990. V.6. P679-714.

171.Wreggett K.A., Hill F., James P.S., Hutchings A., Butcher G.W., Singh P.B. A mammalian homologue of Drosophila heterochromatin protein 1 (HP1) is a component of constitutive heterochromatin. // Cytogenet. Cell Genet. 1994. V.66. №2. P.99-103.

172.Wu C-T, Goldberg M.L. The Drosophila zeste gene and transvection. // Trends Genet. // 1989. V.5. P.189-194.

173.Yannopoulos G., Stamatis N., Monastirioti M., Hatzopoulos P., Louis C. hobo is responsible for the induction of hybrid dysgenesis by strains of Drosophila melanogaster bearing the male recombination factor 23.5MRF. II Cell. 1987. V.49. P.487-495.

174.Zhoa K., Hart C.M., Laemmli U.K. Visualization of chromosomal domains, with boundary element-associated factor BEAF-32. // Cell. 1995. V.81. P.879-889.

175.Zink D., Paro R. Drosophila Polycomb-group regulated chromatin inhibits the accessibility of a trans-activator to its target DNA. // EMBO J. 1995. V.14. P.5660-5671.

176.Zucherkandl E. A possible role of «inert» heterochromatin in cell differentiation. Action of and competition for locking molecules. // Biochimie. 1974. V.56. P.937-954.

Обратите внимание, представленные выше научные тексты размещены для ознакомления и получены посредством распознавания оригинальных текстов диссертаций (OCR). В связи с чем, в них могут содержаться ошибки, связанные с несовершенством алгоритмов распознавания. В PDF файлах диссертаций и авторефератов, которые мы доставляем, подобных ошибок нет.