Эволюция генетического разнообразия популяций человека по генам, ассоциированным с иммунозависимыми фенотипами тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.02.07, кандидат наук Попович, Анастасия Андреевна

• Попович, Анастасия Андреевна
• кандидат наук
• 2017

Оглавление диссертации кандидат наук Попович, Анастасия Андреевна

ОГЛАВЛЕНИЕ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

ВВЕДЕНИЕ

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Происхождение и расселение современного человека

1.2. Генетическое разнообразие населения Северной Евразии

1.3. Генетические исследования иммунозависимых заболеваний

1.4. Эволюция генетического разнообразия и болезни человека

1.4.1. Представления о роли эволюционных факторов в развитии заболеваний человека

1.4.2. Поиск сигналов отбора в популяциях человека

1.4.3. Изменчивость частот аллелей в генах иммунного ответа

ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

2.1. Характеристика популяционных групп

2.2. Характеристика БМР маркеров

2.3. Методы исследования

2.3.1. Полимеразная цепная реакция в реальном времени

2.3.2. Масс-спектрометрия MALDI-TOF

2.4. Статистический анализ полученных данных

ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ

3.1. Генетическое разнообразие и дифференциация исследованных популяций человека по генам, ассоциированным с иммунозависимыми фенотипами

3.1.1. Генетическое разнообразие в популяциях

3.1.2. Генетическая дифференциация популяций

3.1.3. Генетические взаимоотношения между популяциями и связь главных компонент аллельных частот с климато-географическими факторами

3.1.4. Исследование популяций по структуре их предковых компонентов . 76 3.2. Связь генетической структуры изученных популяций человека по генам, ассоциированным с иммунозависимыми фенотипами, с климато-

географическими характеристиками и с уровнем инфекционной и паразитарной нагрузки

3.2.1. Исследование корреляции генетического разнообразия с климато-географическими факторами

3.2.2. Исследование корреляции генетического разнообразия с распространенностью инфекционных и паразитарных заболеваний

3.2.3. Исследование корреляции генетического разнообразия с видовым разнообразием гельминтов

3.3. Оценка селективной нейтральности исследованных генетических маркеров

3.3.1. Тесты, направленные на отдельные

3.3.2. Тесты, направленные на структуру неравновесия по сцеплению и вариабельность гаплотипов

3.4. Сравнительный анализ полученных данных

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

ВЫВОДЫ

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

ПРИЛОЖЕНИЕ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

БК - болезнь Крона

ДНК - дезоксирибонуклеиновая кислота мтДНК - митохондриальная ДНК МФЗ - многофакторные заболевания ПЦР - полимеразная цепная реакция РА - ревматоидный артрит СД1 - сахарный диабет первого типа СКВ - системная красная волчанка СС - системный склероз

AMOVA (Analysis of Molecular Variance) - анализ молекулярной дисперсии ddNTP (Dideoxynucleoside triphosphate) - дидезоксинуклеозидтрифосфат dNTP (Deoxynucleoside triphosphate) - дезоксинуклеозидтрифосфат EHH (Extended Haplotype Homozygosity) - тест на протяженность гомозиготных гаплотипов

GWAS (Genome-Wide Association Study) - полногеномный анализ ассоциаций HapMap (Haplotype Map) - проект построения карты гаплотипов человеческого генома

HGDP (Human Genome Diversity Project) - проект по изучению разнообразия человеческого генома

HLA (Human Leukocyte Antigen) - главный комплекс гистосовместимости IgE (Immunoglobulin Е) - иммуноглобулин Е

IHS (Integrated Haplotype Score) - интегрированный гаплотипический балл MALDI (Matrix Assisted Laser Desorbtion/Ionization) - матрично-активированная лазерная десорбция/ионизация

PC1 (First principal component) - первая главная компонента

PC2 (Second principal component) - вторая главная компонента

SNP (Single nucleotide polymorphism) - однонуклеотидный полиморфизм

STR (Short tandem repeat) - микросателлиты

Th1 (Type 1 T-helper) - Т-хелперы 1-го типа

Th17 (Type 17 T-helper) - Т-хелперы 17-го типа Th2 (Type 2 T-helper) - Т-хелперы 2-го типа Th22 (Type 22 T-helper) - Т-хелперы 22-го типа Th9 (Type 9 T-helper) - Т-хелперы 9-го типа TOF (Time Of Flight) - время пролета Treg (Regulatory T cells) - регуляторные Т-клетки

XP-ЕНН (Cross-Population Extended Haplotype Homozygosity) - кросс-популяционный тест на протяженность гомозиготных гаплотипов

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Эволюция генетического разнообразия популяций человека по генам, ассоциированным с иммунозависимыми фенотипами»

ВВЕДЕНИЕ

Анализ генетической структуры популяций человека используется для исследования генетического разнообразия и дифференциации населения и позволяет реконструировать генетическую историю, миграции и расселение современного человека, изучать действие естественного отбора в ходе адаптации популяций к условиям среды обитания. В настоящее время подобные исследования осуществимы с использованием результатов таких крупных международных проектов, как Haplotype Map (HapMap), «1000 геномов», Human Genome Diversity Project (HGDP). Суммарный вывод данных работ заключается в том, что генетическая дифференциация популяций человека связана с их географической локализацией. Показано уменьшение генетического разнообразия в популяциях по мере географического отдаления от Африки, что согласуется с гипотезой недавнего африканского происхождения современного человека [Ashraf Q., Galor O., 2013; Rosenberg N.A., Kang J.T., 2015; López S. et al., 2016]. Для наиболее территориально отдаленных популяций выявлены большие генетические различия. При этом, человек характеризуется высоким уровнем внутрипопуляционного разнообразия и низким уровнем межпопуляционной дифференциации (10-15%) [Elhaik E., 2012; Степанов В.А., 2016].

Исследование генетического разнообразия служит основой для выявления роли генетической компоненты в развитии болезней человека. Одним из направлений современной генетики человека и медицинской генетики является анализ многофакторных заболеваний (МФЗ), учитывая их распространенность в мире и ведущую роль в заболеваемости и смертности населения. Понимание генетических причин таких МФЗ, как аллергические, сердечно-сосудистые, аутоиммунные, инфекционные, психиатрические и другие комплексные заболевания, может быть основой для профилактики, диагностики и лечения данных заболеваний. Болезни иммунной природы составляют существенную группу МФЗ, поэтому анализ их генетических механизмов ведется особенно активно, в том числе и российскими учеными

[Фрейдин М.Б., Пузырев В.П., 2010; Степанов В.А. и др., 2013а; Огородова Л.М. и др., 2013; Карунас А.С., Хуснутдинова Э.К., 2013; Куликов Е.С. и др., 2014; Фрейдин М.Б. и др., 2015].

Можно ожидать, что исторически сложившееся клинальное изменение уровня гетерозиготности в популяциях человека отражается и на популяционных различиях в генетической составляющей болезней. Однако, в процессе расселения из Африки современный человек столкнулся с новыми факторами среды обитания, сформировавшими условия для адаптивной эволюции генетического разнообразия. Если генетическая компонента болезней характеризуется адаптивной значимостью, то, вероятно, в связи с влиянием естественного отбора может наблюдаться отклонение в географической структурированности генетического разнообразия по данным локусам [Степанов В.А., 2016]. Примером такого отклонения в ряду МФЗ служат полиморфные генетические маркеры, задействованные в развитие иммунозависимых заболеваний.

Показано, что вариабельность данных болезней в популяциях и этнических группах, вероятно, обусловлена различиями по уровню инфекционной и паразитарной нагрузки. Инфекционные агенты и паразиты являются одним из немаловажных факторов естественного отбора, оказывая селективное давление и на человека. В настоящее время проведены многочисленные межвидовые и внутривидовые исследования, показавшие влияние естественного отбора на гены иммунного ответа, выявлена связь однонуклеотидного полиморфизма (SNP) данной группы генов с уровнем инфекционной и паразитарной нагрузки [Le So^f P.N. et al., 2006; Barreiro L.B., Quintana-Murci L., 2010; Lachance J., Tishkoff S.A., 2013; Karlsson E.K. et al., 2014; Vatsiou A.I., et al., 2016].

Современными исследователями представлен ряд гипотез и концепций, объясняющих вариабельность заболеваний в популяциях и связанных с ними генетических маркеров, ключевыми из которых являются гипотезы канализации/деканализации, «экономных генов» и «предковой

предрасположенности» [Neel J.V., 1962; Di Rienzo A., Hudson R.R., 2005; Gibson G., 2009]. В отношении генов иммунного ответа предложена гипотеза, согласно которой, в процессе миграции популяций человека за пределы Африки на территорию с умеренным и арктическим климатом и с другим уровнем паразитарных и инфекционных заболеваний могло происходить снижение действия направленного отбора на аллели SNP, адаптивные для африканских популяций и связанные с защитой организма от паразитарных инвазий [Le So^f P.N., 2000]. Данное изменение, вероятно, привело к увеличению частоты альтернативного аллеля в мигрирующих популяциях. Подобное преобразование, могло способствовать распространению иммунозависимых болезней в популяциях, расположенных за пределами Африки.

Этнические группы Северной Евразии, особенно Дальнего Востока и Сибири, проживают на территории, где преобладает холодный, умеренный и арктический климат. В популяциях Северной Евразии проведены обширные исследования по изменчивости аутосомных маркеров, маркеров X-хромосомы, Y-хромосомы и митохондриальной ДНК (мтДНК), описавшие структуру генофонда населения Северной Евразии с высоким меж- и внутрипопуляционным генетическим разнообразием [Степанов В.А., 2002; Голубенко М.В. и др., 2002; Хитринская И.Ю. 2003с, 2014; Балановская Е.В., Балановский О.П., 2007; Деренко М.В., Малярчук Б.А. 2010; Харьков В.Н., 2012; Yunusbayev B. et al, 2012; Губина М.А. и др., 2013а, 2013b; Хуснутдинова Э.К. и др., 2014; Балановский О.П. и др., 2015]. Однако роль естественного отбора и адаптивной эволюции в формировании генетических характеристик популяций человека, проживающих на территории Северной Евразии, изучена слабо.

Мы предполагаем, что приспособительная эволюционная изменчивость могла привести к формированию особенностей структуры генофонда популяций Северной Евразии, специфических частот встречаемости заболеваний, в том числе и иммунозависимых, и связанных с ними полиморфных ДНК-маркеров. Следовательно, Северная Евразия

является интересным объектом для исследования генетической структуры популяций по генам, ассоциированным с иммунозависимыми фенотипами. Степень научной разработанности темы исследования Проведены многочисленные исследования ассоциации частот аллелей генов иммунозависимых фенотипов в различных популяциях, как при анализе отдельных генетических маркеров, так и в составе полногеномных исследований [Abecasis G.R. et al., 2010; Frazer K.A. et al., 2007; Cann H.M. et al., 2002; Martin A.M. et al., 2003; Yunusbayev B. et al, 2012; Хуснутдинова Э.К. и др., 2014]. Показано действие отбора по полиморфизму генов иммунного ответа [Walsh E.C. et al., 2006; Barreiro L.B., Quintana-Murci L., 2010; Sabeti et al., 2006, Hancock et al., 2010; Saeb A.T., Al-Naqeb D., 2016]. В отношении к микроэволюционным процессам представлены различные концепции и гипотезы, объясняющие вероятные механизмы действия естественного отбора в популяциях человека [Neel J.V., 1962; Le Souëf P.N. 2000; Di Rienzo A., Hudson R.R., 2005; Gibson G., 2009].

Учитывая большое число этнических групп, проживающих на территории Северной Евразии, анализ генетической структуры популяций Северной Евразии совместно с мировыми популяциями по SNP, задействованных в развитии иммунозависимых фенотипов, для обнаружения влияния естественного отбора по данным генетическим маркерам, является актуальным и в настоящее время.

Цель исследования

Оценить роль адаптивной эволюции генетического разнообразия в формировании генетической структуры популяций человека по полиморфизму генов, ассоциированных с иммунозависимыми фенотипами.

Задачи исследования 1. Оценить генетическое разнообразие популяций Северной Евразии по генам, ассоциированным с иммунозависимыми фенотипами.

2. Проанализировать генетическую дифференциацию мировых популяций по исследованным генетическим маркерам на основе собственных данных и данных из международных проектов.

3. Оценить связь частот аллелей генов, ассоциированных с иммунозависимыми фенотипами, и общего генетического разнообразия с климато-географическими факторами, распространенностью инфекционных и паразитарных заболеваний.

4. Выявить генетические маркеры, подверженные действию естественного отбора в ходе расселения современного человека.

Научная новизна

В работе впервые в широком спектре популяций Северной Евразии совместно с мировыми популяциями проведено исследование частот аллелей генов, ассоциированных с иммунозависимыми фенотипами, с помощью молекулярно-генетических и биоинформационных методов анализа. Значительный охват населения различных регионов мира позволил наиболее детально описать картину адаптивного изменения частот аллелей в процессе расселения современного человека по территории земного шара. В ходе выполнения работы рассмотрена гипотеза канализации/деканализации геном-феномных отношений по генам, ассоциированным с иммунозависимыми фенотипами. Получены новые данные о роли адаптивной эволюции в формировании генетического разнообразия. Выявлена роль климато-географических факторов, инфекционной и паразитарной нагрузки в распределении аллельных вариантов генов. Результаты данного исследования показали действие естественного отбора по изученным генетическим маркерам. Теоретическая и практическая значимость

Теоретическая значимость работы заключается в выявлении генетических механизмов адаптации популяций человека к изменяющимся условиям окружающей среды, расширении представлений о генетическом разнообразии населения Северной Евразии. Практическая значимость исследования заключается в возможности использования полученных данных в области

молекулярной эпидемиологии распространенных заболеваний, в ассоциативных исследованиях и при разработке генетических тест-систем для болезней, связанных с нарушениями иммунного ответа.

Результаты исследования имеют междисциплинарное значение и могут быть применены в планировании и развитии дальнейших задач эволюционной, популяционной и медицинской генетики. Материалы работы могут быть использованы в учебном процессе медико-биологических факультетов ВУЗов. Методология диссертационного исследования

Основу методологии диссертации составили анализ генетического разнообразия популяций человека, анализ ассоциаций генетических маркеров с заболеваниями, исследования по выявлению действия естественного отбора. В работе использованы такие молекулярно-генетические методы, как полимеразная цепная реакция в режиме реального времени, MALDI-TOF масс-спектрометрия. Проведен статистический анализ полученных данных совместно с данными из проектов «1000 геномов» и HGDP. Положения, выносимые на защиту

1. Популяции Северной Евразии характеризуются высоким уровнем генетической дифференциации по генам, ассоциированным с иммунозависимыми фенотипами. В отличие от данных по условно-нейтральным маркерам, по полиморфизму генов иммунозависимых фенотипов наблюдается рост генетического разнообразия по мере удаления от Экватора в ходе расселения современного человека по земному шару.

2. Общий уровень генетического разнообразия по полиморфным генетическим маркерам, ассоциированным с иммунозависимыми фенотипами, а также частоты аллелей отдельных маркеров коррелируют с изменением климато-географических факторов, с уровнем инфекционной и паразитарной нагрузки.

3. Некоторые гены, ассоциированные с иммунозависимыми фенотипами, находятся под действием естественного отбора.

Степень достоверности полученных результатов

Достоверность полученных результатов работы обосновывается большим объемом исследуемых популяционных выборок, использованием современных экспериментальных методов (полимеразная цепная реакция в режиме реального времени, MALDI-TOF масс-спектрометрия) и методов статистического анализа полученных данных.

Апробация диссертационной работы

Основные положения диссертационной работы были представлены на международной научной конференции молодых ученых «Актуальные проблемы медицинской генетики» (Томск, 2016); X научной конференции «Генетика человека и патология: проблемы эволюционной медицины» (Томск, 2014); VIII всероссийской научно-практической конференции с международным участием «Молекулярная диагностика» (Москва, 2014); международной конференции «Высокопроизводительное секвенирование в геномике» (Новосибирск, 2013); международной конференции «Проблемы генетики населения и этнической антропологии» (Москва, 2013).

Декларация личного участия автора

Личный вклад автора заключается в поиске и анализе литературы по теме исследования, проведении экспериментальной работы и в статистическом анализе результатов совместно с данными, полученными из проектов «1000 геномов» и ИОЭР, в написании диссертационной работы.

Публикации

По теме диссертационной работы опубликовано 1 4 работ (4 статьи в журналах, рекомендованных ВАК, 1 статья в сборнике, 8 тезисов в материалах зарубежных и отечественных конференций, зарегистрирована 1 база данных).

Объем и структура диссертации

Диссертация изложена на 211 страницах машинописного текста и содержит введение, обзор литературы, материалы и методы, результаты и обсуждение, заключение, выводы, список литературы, приложение. Работа

иллюстрирована 29 таблицами и 26 рисунками. Список литературы состоит из 324 источников, из них 67 отечественных.

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ 1.1. Происхождение и расселение современного человека

Происхождение современного человека является предметом активных научных дискуссий. Широко распространена гипотеза недавнего африканского происхождения (моноцентрическая модель), согласно которой современные люди появились в Восточной Африке приблизительно 200-100 тыс. лет назад и далее постепенно заселили другие континенты (рис. 1) [Henn B.M. et al., 2012; Weaver T.D., 2012; Poznik G.D. et al., 2013]. Противоположная данной модели -мультирегиональная, которая предполагает, что происходил одновременный и постепенный переход от Homo erectus к Homo Sapiens на разных континентах [Wolpoff M.H. et al., 2000; Wu X.Z., 2006].

Рисунок 1 - Расселение популяций современного человека из Африки [Cavalli-Sforza L.L., Feldman M.W., 2003].

Существенные генетические доказательства выдвинуты в поддержку модели африканского происхождения. Первые данные, согласующиеся с моноцентрической моделью, представлены на основе исследования мтДНК. Эволюция митохондриального генома посредством накопления новых мутация

позволила выявить типы мтДНК (гаплогруппы), определить их линии-основатели, узнать регион и вероятное время происхождения данных основателей. Показано, что за пределами Африки гаплотипы мтДНК относятся к макрограплогруппам М или N, возраст которых составляет примерно 60-65 тыс. лет [Macaulay V. et al., 2005]. М и N происходят от группы L3, возникшей приблизительно 80 тыс. лет назад [Metspalu M. et al., 2004]. L3 вместе с другими представителями макрогруппы L в основном распространены в Африке, но также встречается на Ближнем Востоке и в Европе [Richards M. et al., 2000]. Это позволило предположить, что Африка является территорией происхождения современного человека.

Дальнейшие результаты анализа генетических маркеров мтДНК, Y-хромосомы и аутосомной ДНК также свидетельствуют в поддержку моноцентрической модели [Hawks J., 2001; Rosenberg N.A. et al., 2002; Caramelli D. et al., 2003; Zhivotovsky L.A., et al., 2003]. Данная гипотеза происхождения современного человека подкрепляется большей степенью генетического разнообразия и меньшей протяженностью блоков сцепления в геноме у африканцев [Jakobsson M. et al., 2008; Li J.Z. et al., 2008]. Постепенное падение генетического разнообразия по мере увеличения географического отдаления от Африки связано с процессами миграции, дрейфом генов и частичной изоляции популяций расстоянием [Li J.Z. et al., 2008; Pemberton T.J. et al., 2013; Henn B.M. et al., 2016].

Согласно одним данным, Homo sapiens покинул Африку примерно 100130 тыс. лет назад, согласно другим - миграция произошла значительно позже (60-50 тыс. лет назад) и около 50-45 тыс. лет назад человек достиг Австралии [Petraglia M. et al., 2009; Petraglia M.D. et al., 2010; Fernandes V. et al., 2012; Mellars P. et al., 2013]. В поддержку более ранней миграции из Африки выступают результаты археологических исследований: обнаружены каменные орудия труда в Индонезии, созданные более 74 тыс. лет назад, и ископаемые останки Homo sapiens в пещере Фуянь (Китай) возрастом около 80-120 тыс. лет [Petraglia M. et al., 2007; Liu W. et al., 2015]. Многие результаты генетических

исследований, основанные на анализе ДНК-маркеров, свидетельствуют о более поздней миграции человека из Африки [Zhivotovsky L.A. et al., 2000; Underhill P.A. et al., 2007; Shi W. et al., 2010; Pagani L. Et al., 2015]. Полногеномные исследования не дают однозначного ответа и не исключают малочисленную раннюю миграцию [Malaspinas A.S. et al., 2016; Mallick S. et al., 2016; Pagani L. et al., 2016].

Заселение Европы Homo Sapiens происходило в результате нескольких событий. В целом, на формирование структуры генофонда популяций европейцев оказали воздействие три значительные миграции: в эпоху верхнего палеолита (40 тыс. лет назад), затем около 18 тыс. лет назад и в постледниковый период (10 тыс. лет назад) [Barbujani G., Bertorelle G., 2001]. Сравнительно недавно (около 15-14 тыс. лет назад) произошло заселение Америки, которое связано с культурой Кловис [Jenkins D.L. et al., 2012].

В настоящее время проведены многочисленные работы, изучающие взаимоотношения современного человека и ископаемых гоминид посредством генетического и археологического исследований. В частности, в 2010 году опубликовано результаты анализа генома трех неандертальцев (Homo Neanderthalensis) из пещеры Виндия в Хорватии, а также Денисовского человека [Green R.E. et al., 2010; Reich D. et al., 2010]. Исследование ДНК архаичных людей выявило небольшой уровень метисации с человеком современного типа. В настоящее время показано, что геном современных неафриканцев содержит 1,5-2,1% примеси генома неандертальцев [Prüfer K. et al., 2014]. Более подробное исследование позволило предположить, что скрещивание с Homo Neanderthalensis, скорее всего, происходило в период выхода Homo Sapiens из Африки (около 47-65 тыс. лет назад) [Sankararaman S. et al., 2012].

Показано, что геномы древних евразийцев по сравнению с геномом современного человека содержат сегменты ДНК архаичных людей с меньшим числом рекомбинаций. Секвенирование Homo Sapiens, жившего 45 тыс. лет назад в Сибири, выявило наличие сегментов ДНК Homo Neanderthalensis в 1,8-

4,2 раза больше, чем у современных людей [Fu Q. et al., 2014]. У неафриканцев с более высокой частотой встречаются сегменты ДНК от неандертальца с Кавказа, чем от неандертальцев из Сибири или из Хорватии, что указывает на поток генов от Homo Neanderthalensis на территории Западной Азии [Prüfer K. et al., 2014]. К настоящему времени остается неясным, как часто происходила метисация между Homo Neanderthalensis и Homo Sapiens.

Анализ генома предков меланезийцев выявил наличие 4-6% генома Денисовского человека [Reich D. et al., 2011]. Обнаружен вклад ДНК Денисовского человека в геном американских индейцев и азиатов (примерно 0,2%), что может быть связано с потоком генов от предков современных меланезийцев [Prüfer K. et al., 2014]. Перенос генов также происходил среди архаичных представителей рода Homo, в частности показано, что 0,5% генома Денисовского человека получено от Homo Neanderthalensis и 0,5-8% от неизвестного Homininae [Prüfer K. et al., 2014].

Сложность истории архаических людей также очевидна при анализе самого древнего Homininae: Sima de los Huesos, жившего примерно 400 тыс. лет назад на севере Испании. Анализ митохондриального генома выявил наличие общего предка у Sima de los Huesos с Денисовским человеком, но не с Homo Neanderthalensis [Meyer M. et al., 2014]. При этом ареал обитания Sima de los Huesos находится далеко за пределами нахождения останков Денисовского человека, что может говорить о потоке генов между различными архаичными видами, являющимися предковыми для Homo Neanderthalensis, Денисовского человека и других представителей рода Homo.

Исследование генетических взаимоотношений современных и предковых популяций на основе митохондриальной и ядерной ДНК продемонстрировало генетическое родство как представителей Homo Neanderthalensis, так и популяций современного человека (рис. 2). Обнаружены различия в кластеризации Денисовского человека при анализе мтДНК и ядерной ДНК. В первом случае Денисовский человек противопоставлен современным популяциям и неандертальцам, во втором - наблюдается родство в большей

степени с Homo Neanderthalensis, чем с современными популяциями, что может свидетельствовать об более обособленном существовании Homo Sapiens.

Рисунок 2 - Дендограммы, характеризующие генетические связи между современными популяциями человека и ископаемыми гоминидами [Prüfer K. et al., 2014]. А - дендограмма, на основе последовательности митохондриальной ДНК; приведены значения апостериорной вероятности, которые составили меньше 1. В - дендограмма, на основе последовательности ядерной ДНК; в узлах дендограммы приведены значения, составившие менее 100% из 1000 бутстреп-реплик. Altai - неандерталец из Денисовой пещеры в России, Mezmaiskaya - из пещеры Мезмайская в России, Feldhofer - из грота Фельдгофер в Германии, Sidron - из пещеры Эль Сидрон в Испании, Vindija -из пещеры Виндия в Хорватии, Denisovan - Денисовский человек.

Таким образом, генетический анализ совместно с археологическими данными свидетельствуют о многообразии событий в процессе происхождения и расселения современного человека. Результаты работ, полученные в настоящее время, расширяют наше понимание генетической истории человечества. В частности, анализ секвенирования полных геномов как

ископаемых гоминид, так и современных людей, раскрывает процесс заселения континентов Homo Sapiens, показывает возможные взаимоотношения между представителями рода Homo. При этом, несмотря на быстрые темпы развития в данной области, еще остается много нерешенных вопросов.

1.2. Генетическое разнообразие населения Северной Евразии

Расселение людей по территории Земного шара способствовало адаптации к новой среде обитания и отразилось на генетической структуре популяций человека. Наиболее очевидна адаптация к новым климатическим условиям, в частности к умеренному и субарктическому климату Сибири и Дальнего Востока, которая могло привести к формированию особой структуры генофонда популяций, проживающих на данной территории.

Анализ генетической структуры популяций Северной Евразии, включая коренных жителей Сибири и Дальнего Востока, активно проводится с использованием различных ДНК-маркеров. В настоящее время известно, что вариабельность полиморфных ДНК-маркеров обусловлена различными микроэволюционными факторами, связана с этнической принадлежностью человека, географическим происхождением и территориальным расположением популяций. В частности, распространенность многих гаплогрупп мтДНК в популяциях варьирует зависимости от территории проживания: гаплогруппы H, K, J, N1a, N1c, T, I, V, R1, X, U, W встречаются в Западной Евразии, характерны для народов Северной Европы, а восточно-евразийские гаплогруппы E, A, D, B, G, C, M7-M11, №а, Z - для народов Северо-Восточной и Восточной Сибири [Torroni A. et al., 2001; Finnila S. 2001; Малярчук Б.А., Деренко М.В., 2006; Деренко М.В., Малярчук Б.А, 2010].

Популяции Северной и Восточной Азии характеризуются значительным вкладом западно-евразийского компонента, частота которого снижается в направление запад-восток, так, согласно данным одного исследования, в алтайской и западно-саянской группах он составляет 33,4 и 21,8, соответственно [Деренко М.В., 2010]. К популяциям Северо-Востока Азии и

Центральной Сибири частота западно-евразийского компонента падает до 6% [Деренко М.В., 2010]. По сравнению с другими регионами Азии популяции Северной Азии характеризуются высокой межэтнической дифференциацией, а популяции Сибири - высоким генетическим разнообразием [Денисова Г.А., 2008; Деренко М.В., 2009; Деренко М.В., Малярчук Б.А., 2010].

Анализ популяций по ДНК-маркерам Y-хромосомы выявил распространенность гаплогрупп E, J, G, K2, I, R1 и N на территории Восточной Европы, показал низкую частоту гаплогрупп C, Q, R2, характерных для населения Восточной и Южной Азии [Balanovsky O. et al., 2008]. У народов Средней Азии распространены гаплогруппы С, J2, R1, R1a, R2, O, E, L [Степанов В.А. и др. 2006; Wells R.S. et al., 2001]. Популяции Сибири характеризуются более низким показателем генетического разнообразия по сравнению с другими этническими группами Евразии и высокой частотой гаплогрупп N1c1, E, С3^ С3, N1b, Q^3 и R1a^ [В.Н. Харьков и др., 2011, 2013, 2014; Степанов В.А., 2002].

Как известно, полиморфизмы Y-хромосомы и мтДНК позволяют проанализировать генетические особенности популяций отдельно по мужской и по женской линии. Только с помощью аутосомных маркеров, например, таких как однонуклеотидный полиморфизм, полиморфизм Alu-инсерций и аутосомные микросателлиты (STR) есть возможность исследовать генетическую структуру популяций в целом.

Анализ полиморфизма Alu-повторов у коренных народов Северной Евразии осуществлялся уже в течение длительного времени [Степанов В.А. и др., 1999; Хитринская И.Ю. и др., 2003a; 2014 Салимова А.З. и др., 2005]. При исследовании данных аутосомных маркеров выявлено высокое генетическое разнообразие в популяциях Средней Азии, согласно одним данным оно составило 0,448, согласно другим - 0,375; у народов Волго-Уральского региона и Северного Кавказа генетическое разнообразие составило 0,393 и 0,418 [Хуснутдинова Э.К. и др., 2006; Хитринская И.Ю. и др., 2003b]. Оценка межпопуляционных различий показала высокие значения для популяций

Волго-Уральского региона (4,7%), для народов Средней Азии и Северного Кавказа коэффициент генной дифференциации составил 2,1% и 2,0% [Хуснутдинова Э.К. и др., 2006]. Анализ 27 популяций Северной Евразии, принадлежащим к 12 этническим группам, обнаружил высокие показатели Fst (7,5%), при этом отдельно европеоиды и монголоиды характеризуются сходным уровнем межпопуляционного генетического разнообразия (3,1% и 3,8%) [Хитринская И.Ю. и др., 2014].

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Попович, Анастасия Андреевна, 2017 год

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

1. Алтухов Ю.П. Генетические процессы в популяциях / Ю.П. Алтухов. - 3-е изд. перераб. и доп. - М.: ИКЦ Академкнига, 2003. - 431с.

2. Бабушкина Н.П. Ассоциация полиморфных вариантов генов подверженности бронхиальной астме / Н.П. Бабушкина, Е.Ю. Брагина, С.В. Буйкин и др. // Медицинская генетика. - 2015. - Т. 14. - № 5. - С. 2836.

3. Балановская Е.В. Русский генофонд на русской равнине / Е.В. Балановская, О.П. Балановский. - М.: Луч, 2007. - 416 с.

4. Балановский О.П. Генофонд Европы / Балановский О.П. - М.: Товарищество научных изданий КМК, 2015. - 354 с.

5. Батожаргалова Б.Ц. Генетические особенности у больных с бронхиальной астмой и у здоровых подростков бурятской популяции. I. Анализ полиморфных вариантов генов ГСЕК2, АБКБ2, N082, N083, 08ТМ1, Т№А / Б.Ц. Батожаргалова, Н.В. Петрова, Е.Е. Тимковская и др. // Вестник НГУ. Серия: Биология, клиническая медицина. - 2013а. - Т.11 -Вып. 2. - С. 80-90.

6. Батожаргалова Б.Ц. Генетические особенности у больных с бронхиальной астмой и у здоровых подростков бурятской популяции. II. Анализ полиморфных вариантов гена 08ЭМБ и межгенных взаимодействий / Б.Ц. Батожаргалова, Н.В. Петрова, Е.Е. Тимковская и др. // Вестник НГУ. Серия: Биология, клиническая медицина. - 2013Ь. - Т.11 - Вып. 2. - С. 91-98.

7. Бисюк Ю.А. Иммунитет к эндотоксину и Asp299Gly полиморфизм гена ТЬЯ-4 у взрослых больных с ранним и поздним началом бронхиальной астмы / Ю.А. Бисюк, А.И. Курченко, В.Е. Кондратюк и др. // Запорожский медицинский журнал. - 2015. - № 3. - С. 86-90.

8. Боринская С.А. Гены и традиции питания / С.А. Боринская, А.И. Козлов, Н.К. Янковский // Этнографическое обозрение. - 2009. - № 3. - С. 117137.

9. Боринская С.А. Сочетание генетических и гуманитарных (кросс-культурных) методов для выявления генов человека, вовлеченных в процесс адаптации к эволюционно новым факторам внешней среды / С.А. Боринская, Н.К. Янковский //Генетика. - 2015. - V. 51. - № 4. - С. 479490.

10. Брагина Е.Ю. Анализ генов цитокиновой сети в развитии «обратной» коморбидности для бронхиальной астмы и туберкулеза / Е. Ю. Брагина, М. Б. Фрейдин, Н. П. Бабушкина и др. // Медицинская генетика. - 2017. -Т. 16. - № 1. - С. 20-24.

11. Габаева М.В. Ассоциация полиморфных маркеров Ile50Val и Gln576Arg гена IL4RA и Glu237Gly гена FCER1B с атопической бронхиальной астмой у бурят / М.В. Габаева, О.Е. Воронько, С.В. Лемза и др. // Медицинская генетика. - 2011. - Т. 10. - № 2. - С. 30-35.

12. Галимова Э.С. Генетический анализ HLA-C, HCR И CDSN генов главного комплекса гистосовместимости у больных псориазом в России / Э.С. Галимова В.Л. Ахметова, Э.К. Хуснутдинова и др. // Аллергология и иммунология. - 2007. - Т. 8. - № 1. - С. 267.

13. Голубенко М.В. Территориальная дифференциация генофонда народов Сибири и Средней Азии по рестрикционному полиморфизму митохондиральной ДНК / М.В. Голубенко, Е.Р. Еремина, В.Н. Тадинова и др. // Медицинская генетика - 2002. - Т. 1. - № 3.- С.124-128.

14. Гончарова И.А. Полиморфизм генов-модификаторов иммунного ответа при заболеваниях печени различной этиологии / И.А. Гончарова, Х. Гамаль Абд Ель-Азиз Наср, Е.В. Белобородова // Медицинская генетика. - 2010. - Т. 9. - №12. - С. 20-24.

15. Гончарова И.А. Разработка панели генетических маркёров фиброгенеза и оценка её информативности для русского населения г. Томска / И.А. Гончарова, А.Н. Кучер, Н.В. Тарасенко и др. // Медицинская генетика. -2015. - Т. 14. - №. 8. - C. 7-12.

16. Губина М.А. Гаплотипическое разнообразие мтДНК и У-хромосомы в популяциях Алтай-Саянского района / М.А. Губина, Л.Д. Дамба, В.Н. Бабенко и др. // Генетика. - 2013. - Т. 49. - № 3. - С. 376-391.

17. Губина М.А. Полиморфизм митохондриальной ДНК в популяциях коренных жителей Дальнего Востока / М.А. Губина, Л.А. Гырголькау, В.Н. Бабенко и др. // Генетика. - 2013. - Т. 49. - № 7. - С. 862-876.

18. Гусева И.А. Молекулярно-генетическая характеристика раннего ревматоидного артрита / И.А. Гусева, Н.В. Демидова, Н.Е. Сорока и др. // Молекулярная медицина. - 2016.- Т. 12. - № 1. - С. 15-21.

19. Данилко К.В. Связь полиморфизма генов PADI4 И PTPN22 с развитием ревматоидного артрита / К.В. Данилко, Л.Ш. Назарова, Р.Р. Хабибуллина и др. // Медико-биологические аспекты мультифакториальной патологии: сб. науч. трудов. - Курск: КГМУ, 2016. - С. 45-46.

20. Денисова Г.А. Изменчивость митохондриальной ДНК в популяциях коренного населения Южной и Центральной Сибири: автореф. дис. .. .кандидата биол. наук. - Магадан, 2008. - 23 с.

21. Деренко М.В. Изменчивость пятнадцати аутосомных микросателлитных локусов ДНК в пяти популяциях коренного населения Южной Сибири / М.В. Деренко, J. Czarny, Б.А. Малярчук // Молекулярная биология. -2007. - T. 41. - № 4. - C. 593-600.

22. Деренко М.В. Молекулярная филогеография коренного населения Северной Азии по данным об изменчивости митохондриальной ДНК / М.В. Деренко // Вестник ДВО РАН. - 2010. - № 4. - С. 3-11.

23. Деренко М.В. Молекулярная филогеография населения Северной Евразии по данным об изменчивости митохондриальной ДНК // М.В. Деренко, Б.А. Малярчук - Магадан: СВНЦ ДВО РАН, 2010. - 376 с.

24. Евдокимова Т.А. Влияние хронической описторхозной инвазии на клиническое течение и иммунный ответ при атопической бронхиальной астме у детей / Т.А. Евдокимова, Л.М. Огородова // Педиатрия. - 2005.-№ 6. - С. 12-17.

25. Животовский Л.А. Популяционная биометрия / Л.А. Животовский. - М: Наука, 1991. - 271 с.

26. Иванова О.Н. Ассоциация полиморфизма гена РТРК22 с сахарным диабетом 1 типа в различных популяциях РФ / О.Н. Иванова, С.А. Прокофьев, Н.Б. Смирнова и др. // Сахарный диабет. - 2013. -№. 2. - С. 410.

27. Карунас А.С. Полногеномный анализ ассоциаций бронхиальной астмы в Волго-Уральском регионе России / А.С. Карунас, Б.Б. Юнусбаев, Ю.Ю. Федорова и др. // Молекулярная биология. - 2011. - Т. 45. - № 6. - С. 9921003.

28. Карунас А.С. Генетика аллергических заболеваний / А.С. Карунас, Хуснутдинова Э.К. // Уфа: Гилем, 2013. - 304 с.

29. Корниенко И.В. Исследование аллельного полиморфизма молекулярно-генетических индивидуализирующих систем на основе тетрануклеотидных тандемных повторов LPL, vWA и ТН01 среди населения России / И.В. Корниенко, Е.Ю. Земскова, С.А. Фролова и др. // Судебно-медицинская экспертиза. - 2002. - Т. 45. - №5. - С.12-14.

30. Куликов Е.С. Динамика генной экспрессии у больных тяжелой терапевтически резистентной астмой на фоне терапии / Е.С. Куликов, Л.М. Огородова, М.Б. Фрейдин и др. // Бюллетень сибирской медицины. -2014. - Т. 13. - № 1. - С. 47-55.

31. Кутлина Т.Г. Анализ полиморфного локуса ^1837253 гена TSLP у больных бронхиальной астмой / Т.Г. Кутлина, М.М. Шаймухаметова, Д.О. Каримов и др. // Медицина труда и экология человека. - 2015. - № 4. - С. 170-174.

32. Кучер А.Н. Изменчивость полиморфных вариантов генов интерлейкинов и их рецепторов у представителей четырех этнических групп сибирского региона / А.Н. Кучер, Бабушкина Н.П., Е.Ю. Брагина и др. // Медицинская генетика - 2009. - Т.8 - №. 10. - С. 43-52.

33. Кучер А.Н. Изменчивость полиморфных вариантов генов-кандидатов заболеваний сердечно-сосудистой системы у представителей четырех этнических групп сибирского региона / А.Н. Кучер, Бабушкина Н.П., Маркова В.В. и др. // Медицинская генетика - 2010. - Т.9 - №. 5. - C. 2434.

34. Малярчук Б.А. Филогеографические аспекты изменчивости митохондриального генома человека / Б.А. Малярчук, М.В. Деренко // Вестник ВОГиС. - 2006. - Т.10. - № 1. - С. 41-56.

35. Огородова Л.М. Влияние инвазии Opistorchis felineus на иммунный ответ при бронхиальной астме / Л.М. Огородова, М.Б. Фрейдин, А.Э. Сазонов и др. // Бюллетень сибирской медицины. - 2010. - Т. 9. - № 3. - С. 85-90.

36. Огородова Л.М. Молекулярно-генетические аспекты различных фенотипов хронической обструктивной болезни легких и бронхиальной астмы / Л.М. Огородова, Б.А. Черняк, О.В. Козина и др. // Пульмонология. - 2013. - № 1. - С. 5-11.

37. Пасечник О.А. Изучение распространенности полиморфизмов генов иммунного ответа у жителей Омской области / О.А. Пасечник, Е.А. Вильмс, Н.Д. Пиценко и др. // Современные проблемы науки и образования. - 2015. - № 5. - C. 141.

38. Ребриков Д.В. ПЦР «в реальном времени» / Д.В. Ребриков, Г.А. Саматов, Д.Ю. Трофимов // М.: Бином, 2009. - 223 с.

39. Салимова А.З. Изучение этнотерриториальных групп казахов по данным полиморфизма ДНК ядерного генома / А.З. Салимова, И.А. Кутуев, Р.И. Хусаинова и др. // Генетика. - 2005. - Т. 41. - № 7. - С. 973-980.

40. Степанов В.А. Анализ генетического разнообразия популяций Северной Евразии по аутосомным микросателлитным локусам / В.А. тепанов, М.Г. Спиридонова, В.Н. Тадинова и др. // Генетика- 2003. - Т. 39. - № 10. - С. 1381.

41. Степанов В.А. Анализ полиморфизма Alu-инсерций в городской и сельской русской популяции Сибири / В.А. Степанов, В.П. Пузырев, М.Г. Спиридонова и др. // Генетика. - 1999. - Т.35. - № 8. - С.1138-1143.

42. Степанов В.А. Генетическое разнообраие популяций человека и проблемы эволюционной медицины / В.А. Степанов / Генетика человека и патология. Проблемы эволюционной медицины. - 2014. - Вып 10 - С 10-17.

43. Степанов В.А. Деканализация иммунного ответа при расселении современного человека: связь генетического разнообразия в генах иммунной системы с климато-геграфическими факторами / В.А. Степанов, П. Канделария, С. Кхо и др. // Медицинская генетика. - 2013а.

- №4 - С. 8-18.

44. Степанов В.А. Мультиплексное генотипирование однонуклеотидных полиморфных маркеров методом MALDI-TOF масс-спектрометрии: частоты 56 SNP в генах иммунного ответа в популяциях человека / Степанов В.А., Трифонова Е.А / Молекулярная биология. - 2013b. -Т. 47.

- № 6. - С. 976-986.

45. Степанов В.А. Характеристика популяций Российской Федерации по панели пятнадцати локусов, используемых для ДНК-идентификации и в судебно-медицинской экспертизе / В.А. Степанов, О.П. Балановский, А.В. Мельников и др. // Acta Naturae. - 2011. - Т. 3. - № 2. - С. 59-71.

46. Степанов В.А. Эволюция генетического разнообразия и болезни человека. / В.А. Степанов // Генетика. - 2016. - Т. 52. - № 7. - С. 852-864.

47. Степанов В.А. Эволюция и филогеография линий Y-хромосомы человека / В.А. Степанов, В.Н. Харьков, В.П. Пузырев // Вестник ВОГиС. - 2006. -Т. 10. - № 1. - С. 57-73.

48. Степанов В.А. Этногеномика населения Северной Евразии / В.А. Степанов. - Томск: Печатная мануфактура, 2002. - 244 с.

49. Суслова Т.А. Генетическая предрасположенность к ревматоидному артриту: роль генов и гаплотипов HLA класса II / Т.А. Суслова, А.Л.

Бурмистрова, Е.Б. Хромова и др.// Иммунология. - 2008. - Т. 29. - № 3. -С. 137-140.

50. Туракулов Р.И. Аллельный полиморфизм коротких тандемно повторяющихся последовательностей локусов HUMF13A01 и HUMCD4 в русских популяциях Москвы и Томска / Р.И. Туракулов, Д.А. Чистяков, О.Н. Одинокова и др. // Генетика. - 1997a. - Т. 33. - № 7. - С. 979-985.

51. Туракулов Р.И. Аллельный полиморфизм тетрануклеотидного тандемного повтора SE33 среди удэгейцев и в двух городских популяциях России / Р.И. Туракулов, Д.А. Чистяков, О.Н. Одинокова и др. // Молекуляр. биология. - 1997b. - Т.31. - №6. - С.978-984.

52. Фрейдин М.Б. Патогенетика аллергических болезней / М.Б. Фрейдин, Л.М. Огородова, В.П. Пузырев - Новосибирск: Издательство СО РАН, 2015. - 149 с.

53. Фрейдин М.Б. Синтропные гены аллергических заболеваний / М.Б. Фрейдин, В.П. Пузырев // Генетика. - 2010. - Т. 46. - № 2. - С.255-261.

54. Харьков В.Н. Генофонд бурят: клинальная изменчивость и территориальная подразделенность по маркерам Y-хромосомы / В.Н. Харьков, К.В. Хамина, О.Ф. Медведева и др. // Генетика. - 2014. - T. 50. -№ 2. - С. 203-213.

55. Харьков В.Н. Разнообразие генофонда хакасов: внутриэтническая дифференциация и структура гаплогрупп Y-хромосомы / В.Н. Харьков, К.В. Хамина, О.Ф. Медведева и др. // Молекулярная биология. - 2011. -Т. 45. - № 3. - С. 446-458.

56. Харьков В.Н. Структура генофонда тувинцев по маркерам Y-хромосомы / В.Н. Харьков, К.В. Хамина, О.Ф. Медведева и др. // 2013. - Генетика. - Т. 49. - № 12. - С. 1416-1425.

57. Харьков В.Н. Структура и филогеография генофонда коренного населения Сибири по маркерам Y-хромосомы: автореф. дис. ... д-ра биол. наук / Харьков В.Н. - Томск, 2012. - 45 с.

58. Хедрик Ф. Генетика популяций / Ф. Хедрик. - М.: Техносфера, 2003. - 592 с.

59. Хитринская И.Ю. А1и-повторы в геноме человека / И.Ю. Хитринская, В.А. Степанов, В.П. Пузырев // Молекулярная биология. - 2003а. - Т. 37. - № 3. - С. 382-391.

60. Хитринская И.Ю. Генетическая дифференциация населения Средней Азии по данным аутосомных маркеров / И.Ю. Хитринская, В.А. Степанов, В.П. Пузырев и др. // Генетика. - 2003Ь. - Т. 39. - № 10. - С. 1389-1397.

61. Хитринская И.Ю. Генетическое разнообразие и взаимоотношения популяций Северной Евразии по полиморфным инсерциям А1и-элемента / И.Ю. Хитринская, В.Н. Харьков, М.И. Воевода и др. // Молекулярная биология. - 2014. - Т. 48. - № 1. - С. 69-80.

62. Хитринская И.Ю. Генетическое разнообразие коренного населения Сибири и Средней Азии: автореф. дис. ... кандидата биол. наук. - Томск, 2003с. - 22 с.

63. Хуснутдинова Э.К. Полногеномный анализ популяций Евразии / Э.К. Хуснутдинова, С.С. Литвинов, Б.Б. Юнусбаев и др. // Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине: сб. трудов. - Казань: Изд-во Казанского (Приволжского) Федерального Университета, 2014. - С. 31.

64. Хуснутдинова, Э.К. Этногеномика и филогенетические взаимоотношения народов Евразии / Э.К. Хуснутдинова, И. А. Кутуев, Р.И. Хусаинова и др. // Вестник ВОГИС. - 2006. - Т. 10. - № 1. - С.24-40.

65. Чередниченко А.А. Корреляция полиморфных вариантов генов иммунного ответа в популяциях человека с климатическими и географическими факторами / А.А. Чередниченко, Е.А. Трифонова, К.В. Вагайцева и др. // Генетика человека и патология. Проблемы эволюционной медицины. - 2014. - Вып. 10. - С. 80-83.

66. Чистяков Д.А. Распределение аллелей микросателлитных локусов HUMCYAR04 и D19S253 в популяционных выборках двух городов России / Д.А. Чистяков, М.В. Челнокова, И.А. Ефремов и др. // Генетика. - 1997. - Т.33. - №2. - С.262-268.

67. Шмальгаузен И.И. Факторы эволюции (теория стабилизирующего отбора) / И.И. Шмальгаузен. - М.-Л.: Изд-во АН СССР, 1946. - 396 с.

68. A Catalog of Published Genome-Wide Association Studies (Электронный ресурс) - URL: https://www.genome.gov/gwastudies/ (дата последнего обращения 03.04.2017).

69. Abecasis G.R. A map of human genome variation from population-scale sequencing / G.R. Abecasis, D. Altshuler, A. Auton et al. // Nature. - 2010. -V. 467. - N 7319. - P. 1061-1073.

70. Alexander D.H. Enhancements to the ADMIXTURE algorithm for individual ancestry estimation / D.H. Alexander, K. Lange // BMC Bioinformatics. - V. 12.

71. Al-Kholy W. TNF-a - 308 G > A and IFN-y + 874 A > T gene polymorphisms in Egyptian patients with lupus erythematosus / W. Al-Kholy, A. Elsaid, A. Sleem et al. // Meta Gene. - 2016. - V. 9. - P. 137-141.

72. Allen J.E. Diversity and dialogue in immunity to helminthes / J.E. Allen, R.M. Maizels // Nat. Rev. Immunol. - 2011. - V. 11. - N 6. - P. 375-388.

73. Al-Muhsen S. IL-4 receptor alpha single-nucleotide polymorphisms rs 1805010 and rs1801275 are associated with increased risk of asthma in a Saudi Arabian population / S. Al-Muhsen, A. Vazquez-Tello, A. Alzaabi et al. // Ann. Thorac. Med. - 2014. - V. 9. - N 2. - P. 81-86.

74. Andiappan A.K. Investigating highly replicated asthma genes as candidate genes for allergic rhinitis / A.K. Andiappan, D. Nilsson, C. Hallden et al. // BMC Med. Genet. - 2013. - V. 14. - P. 51.

75. Anuradha R. Interleukin 1 (IL-1) and IL-23-mediated expansion of filarial antigen-specific Th17 and Th22 cells in filarial lymphedema / R. Anuradha,

P.J. George, V. Chandrasekaran et al. // Clin. Vaccine Immunol. - 2014. - V. 21. - N 7. - P. 960-965.

76. Arlequin ver 3.5.2.2 (Электронный ресурс) - URL: http://cmpg.unibe.ch/software/arlequin35/ (дата последнего обращения 07.05.2017).

77. Ashraf Q. The 'Out of Africa' Hypothesis, Human Genetic Diversity, and Comparative Economic Development / Q. Ashraf, O. Galor // Am. Econ. Rev. - 2013. - V. 103. - N 1. - P. 1-46.

78. Ates O. Tumor necrosis factor-alpha and interleukin-10 gene promoter polymorphisms in Turkish rheumatoid arthritis patients / O. Ates, G. Hatemi, V. Hamuryudan et al. // Clin. Rheumatol. - 2008. - V. 27. - N 10. - P. 12431248.

79. Balanovsky O. Two sources of the Russian patrilineal heritage in their Eurasian context / O. Balanovsky, S. Rootsi, A. Pshenichnov et al. // Am. J. Hum. Genet. - 2008. - V. 82. - N 1. - P. 236-250.

80. Barbujani G. Genetics and the population history of Europe / G. Barbujani, G. Bertorelle // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 2001. - V. 98. - N 1. - P. 22-25.

81. Barnes K.C. African Americans with asthma: genetic insights / K.C. Barnes, A.V. Grant, N.N. Hansel et al. // Proc. Am. Thorac. Soc. - 2007. - 4. - N 1. -P. 58-68.

82. Barreiro L.B. From evolutionary genetics to human immunology: how selection shapes host defence genes / L.B. Barreiro, L. Quintana-Murci // Nat. Rev. Genet. - 2010. - V. 11. - N 1. - P. 17-30.

83. Barrett J.C. Genome-wide association defines more than 30 distinct susceptibility loci for Crohn's disease / J.C. Barrett, S. Hansoul, D.L. Nicolae et al. // Nat. Genet. - 2008. - V. 40. - N 8. - P. 955-962.

84. Basu K. Adrenergic beta(2)-receptor genotype predisposes to exacerbations in steroid-treated asthmatic patients taking frequent albuterol or salmeterol / K. Basu, C.N. Palmer, R. Tavendale et al. // J. Allergy Clin. Immunol. - 2009. -V.

85. Baye TM. Differences in candidate gene association between European ancestry and African American asthmatic children / T.M. Baye, M. Butsch Kovacic, J.M. Biagini Myers et al. // PLoS One. - 2011. - V. 6. - N 2. -e16522.

86. Beecham A.H. Analysis of immune-related loci identifies 48 new susceptibility variants for multiple sclerosis / A.H. Beecham, N.A. Patsopoulos, D.K. Xifara et al. // Nat. Genet. - 2013. - V. 45. - N 11. - P. 1353-1360.

87. B0nnelykke K. A genome-wide association study identifies CDHR3 as a susceptibility locus for early childhood asthma with severe exacerbations / K. B0nnelykke, P. Sleiman, K. Nielsen et al. // Nat. Genet. - 2014. - V. 46. - N 1. - P. 51-55.

88. B0nnelykke K. Meta-analysis of genome-wide association studies identifies ten loci influencing allergic sensitization / K. B0nnelykke, M.C. Matheson, T.H. Pers et al. // Nat. Genet. - 2013. - V. 45. - N 8. - P. 902-906.

89. Bottema R.W. Interleukin 13, CD14, pet and tobacco smoke influence atopy in three Dutch cohorts: the allergenic study / R.W. Bottema, N.E. Reijmerink, M. Kerkhof et al. // Eur. Respir. J. - 2008. - V. 32. - N 3. - P. 593-602.

90. Bouchery T. The Differentiation of CD4(+) T-Helper Cell Subsets in the Context of Helminth Parasite Infection / T. Bouchery, R. Kyle, F. Ronchese et al. // Front. Immunol. - 2014. - V. 5. - N 487.

91. Cagliani R. Pathogen-driven selection in the human genome / R. Cagliani, M. Sironi // Int. J. Evol. Biol. - 2013. - V. 2013.

92. Cameron L. Th2 cell-selective enhancement of human IL13 transcription by IL13-1112C>T, a polymorphism associated with allergic inflammation / Cameron, R.B. Webster, J.M. Strempel et al. //J. Immunol. 2006. - V. 177. - N 12. - P. 8633-8642.

93. Cann H.M. A human genome diversity cell line panel / H.M. Cann, C. de Toma, L. Cazes et al. // Science. - 2002. - V. 296. - N 5566. - P. 261-262.

94. Caramelli D. Evidence for a genetic discontinuity between Neandertals and 24,000-year-old anatomically modern Europeans / D. Caramelli, C. Lalueza-

Fox, C. Vernesi et al. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 2003. - V. 100. - N 11. - P. 6593-6597.

95. Cashdan E. Biogeography of human infectious diseases: a global historical analysis / E. Cashdan // PLoS One. - 2014. - V. 9. - N 10. - e106752.

96. Cavalli-Sforza L.L. The application of molecular genetic approaches to the study of human evolution / L.L. Cavalli-Sforza, M.W. Feldman // Nat. Genet. -2003. - V. 33. - P. 266-275.

97. Ceccarelli F. Genetic Factors of Autoimmune Diseases / F. Ceccarelli, N. Agmon-Levin, C. Perricone // J. Immunol. Res. - 2016. - V. 2016.

98. Chai H.C. Genetic risk factors of systemic lupus erythematosus in the Malaysian population: a minireview / H.C. Chai, M.E. Phipps, K.H. Chua // Clin. Dev. Immunol. - 2012. - V. 2012.

99. Chai H.C. Insight into gene polymorphisms involved in toll-like receptor/interferon signalling pathways for systemic lupus erythematosus in South East Asia / H.C. Chai, K.H. Chua, S.K. Lim // J. Immunol. Res. -2014. -V. 2014.

100. Chao K. Imbalances of CD4(+) T-cell subgroups in Crohn's disease and their relationship with disease activity and prognosis / K. Chao, S. Zhang, J. Yao et al. // J. Gastroenterol. Hepatol. - 2014. - V. 29. - N 10. - P. 1808-1814.

101. Chatila T.A. Interleukin-4 receptor signaling pathways in asthma pathogenesis / T.A. Chatila // Trends. Mol. Med. - 2004. - V. 10. - N 10. - P. 493-499.

102. Chiang C.H. The association between the IL-4, ADRß2 and ADAM 33 gene polymorphisms and asthma in the Taiwanese population / C.H. Chiang, M.W. Lin, M.Y. Chung et al. // J. Chin. Med. Assoc. - 2012. - V. 75. - N 12. - P. 635-643.

103. Chou H.T. Association of IL4R gene polymorphisms with asthma / H.T. Chou, S. Zhang, Chao K. et al. // PLoS Genet. - 2015. - V. 11. - N 4. - e70902.

104. Chuang Y.H. Gene therapy for allergic diseases / Y.H. Chuang, Y.H. Yang, S.J. Wu et al. // Curr. Gene Ther. -2009. - V. 9. - N 3. - P. 185-191.

105. Chung S.A. Differential genetic associations for systemic lupus erythematosus based on anti-dsDNA autoantibody production / S.A. Chung, K.E. Taylor, R.R. Graham et al. // PLoS Genet. - 2011. - V. 7. - N 3. - e1001323.

106. Coelho P.R.P. Racial differences in disease susceptibilities: intestinal worm infection in the early twentieth-century American south / P.R.P. Coelho, R.A. McGuire // Soc. Hist. Med. - 2006 - V. 19. - N 3. - P. 461-482.

107. Cordell H.J. International genome-wide meta-analysis identifies new primary biliary cirrhosis risk loci and targetable pathogenic pathways / H.J. Cordell, Y. Han, G.F. Mells et al. // Nat. Commun. - 2015. - V. 6..

108. Cotsapas C. Immune-mediated disease genetics: the shared basis of pathogenesis / C. Cotsapas, D.A. Hafler // Trends Immunol. - 2013. - V. 34. -N 1. - P. 22-26.

109. Cotsapas C. Pervasive sharing of genetic effects in autoimmune disease / C. Cotsapas, B.F. Voight, E. Rossin et al. // PLoS Genet. - 2011. - V. 7. - N 8. -e1002254.

110. De Jager P.L. Meta-analysis of genome scans and replication identify CD6, IRF8 and TNFRSF1A as new multiple sclerosis susceptibility loci / P.L. De Jager, X. Jia, J. Wang et al. // Nat. Genet. - 2009. - V. 41. - N 7. - P. 776-782.

111. Dhiman N. Associations between SNPs in toll-like receptors and related intracellular signaling molecules and immune responses to measles vaccine: preliminary results / N. Dhiman, I.G. Ovsyannikova, R.A. Vierkant et al. // Vaccine. - 2008. -V. 26. - N 14. - P. 1731-1736.

112. Di Rienzo A. An evolutionary framework for common diseases: the ancestral-susceptibility model / A. Di Rienzo, R.R. Hudson // Trends Genet. - 2005. - V. 21. - N 11. - P. 596-601.

113. Dieude P. Independent replication establishes the CD247 gene as a genetic systemic sclerosis susceptibility factor / P. Dieude, C. Boileau, M. Guedj et al. // Ann. Rheum. Dis. - 2011. - V. 70. - N 9. - P. 1695-1696.

114. Dobson R. A Risk Score for Predicting Multiple Sclerosis / R. Dobson, S. Ramagopalan, J. Topping et al. // PLoS One. - 2016. - V. 11. - N 11. -e0164992.

115. Donfack J. Variation in conserved non-coding sequences on chromosome 5q and susceptibility to asthma and atopy / J. Donfack, D.H. Schneider, Z. Tan et al. // Respir. Res. - 2005. - V. 6. - N 1.

116. Dong M. Multiple genetic variants associated with primary biliary cirrhosis in a Han Chinese population / M. Dong, J. Li, R. Tang et al. // Clin. Rev. Allergy Immunol. - 2015. - V. 48. - N 2-3. - P. 316-321.

117. El Sherbini H.M. Human leukocyte antigen and autoantibodies association with juvenile systemic lupus erythematosus / H.M. El Sherbini, A.K. El Garf, S.S. El Din Mahmoud // Egypt. J. Immunol. - 2009. - V. 16. - N 2. - P. 107114.

118. Elhaik E. Empirical distributions of F(ST) from large-scale human polymorphism data / E. Elhaik // PLoS One. - 2012. - V. 7. - N 11. -e49837.

119. Enattah N.S. Identification of a variant associated with adult-type hypolactasia / N.S. Enattah, T. Sahi, E. Savilahti et al. // Nat Genet. - 2002. - V. 30. - N 2. - P. 233-237.

120. Eriksson A. Detecting and Removing Ascertainment Bias in Microsatellites from the HGDP-CEPH Panel / A. Eriksson, A. Manica // G3 (Bethesda). -2011. - V. 1. - N 6. - P. 479-488.

121. Esfahanian F. Th1/Th2 cytokines in patients with Graves' disease with or without ophthalmopathy / F. Esfahanian, E. Naimi, F. Doroodgar et al. // Iran. J. Allergy Asthma Immunol. - 2013. - V. 12. - N 2. - P. 168-175.

122. Excoffier L. Analysis of molecular variance inferred from metric distances among DNA haplotypes: application to human mitochondrial DNA restriction data / L. Excoffier, P.E. Smouse, J.M. Quattro // Genetics. - 1992. - V. 131. -N 2. - P. 479-491.

123. Faustman D. TNF receptor 2 pathway: drug target for autoimmune diseases / D. Faustman, M. Davis // Nat. Rev. Drug Discov. - 2010. - V. 9. - N 6. - P. 482-493.

124. Fay J.C. Hitchhiking under positive Darwinian selection / J.C. Fay, C.I. Wu // Genetics. - 2000. - V. 155. - N 3. - P. 1405-1413.

125. Fernandes V. The Arabian cradle: mitochondrial relicts of the first steps along the southern route out of Africa / V. Fernandes, F. Alshamali, M. Alves et al. // Am. J. Hum. Genet. - 2012. - V. 90. - N 2. - P. 347-355.

126. Fernando D. Toxocara seropositivity in Sri Lankan children with asthma / D. Fernando, P. Wickramasinghe, G. Kapilananda et al. // Pediatr. Int. - 2009. -V. 51. - N 2. - P. 241-245.

127. Ferreira M.A. Genome-wide association analysis identifies 11 risk variants associated with the asthma with hay fever phenotype / M.A. Ferreira, M.C. Matheson C.S. Tang et al. // J. Allergy Clin. Immunol. - 2014. - V. 133. - N 6. - P. 1564-1571.

128. Festen E.A. A meta-analysis of genome-wide association scans identifies IL18RAP, PTPN2, TAGAP, and PUS10 as shared risk loci for Crohn's disease and celiac disease / E.A. Festen, P. Goyette, T. Green et al. // PLoS Genet. -2011. - V. 7. - N 1. - e1001283.

129. Finnila S. Phylogenetic network for European mtDNA / S. Finnila, M.S. Lehtonen, K. Majamaa // Am. J. Hum. Genet. - 2001. - V. 68. - N 6. - P. 1475-1484.

130. Flohr C. Do helminth parasites protect against atopy and allergic disease? / C. Flohr, R.J. Quinnell, J. Britton // Clin. Exp. Allergy. - 2009. - V. 39. - N 1. -P. 20-32.

131. Frazer K.A. A second generation human haplotype map of over 3.1 million SNPs / K.A. Frazer, D.G. Ballinger, D.R. Cox et al. // Nature. - 2007. - V. 449. - N 7164. - P. 851-861.

132. Fu Q. Genome sequence of a 45,000-year-old modern human from western Siberia / Q. Fu, H. Li, P. Moorjani et al. // Nature. - 2014. - V. 514. - N 7523.

- p. 445-449.

133. Fu Y.X. Statistical tests of neutrality of mutations / Y.X. Fu, W.H. Li // Genetics. - 1993. - V. 133. - N 3. - P. 693-709.

134. Fumagalli M. Human genome variability, natural selection and infectious diseases / M. Fumagalli, M. Sironi // Curr Opin Immunol. 2014. - V. 30. - P. 9-16.

135. Fumagalli M. The landscape of human genes involved in the immune response to parasitic worms / M. Fumagalli, U. Pozzoli, R. Cagliani et al. // BMC. Evol. Biol. - 2010. - V. 10. - P. 264.

136. Gabriel S. SNP Genotyping Using the Sequenom MassARRAY iPLEX Platform / S. Gabriel, L. Ziaugra, D. Tabbaa et al. // Curr. Protoc. Hum. Genet. 2009. V. 60. P. 2.12.1-2.12.18.

137. Galaine J. Interest of Tumor-Specific CD4 T Helper 1 Cells for Therapeutic Anticancer Vaccine / J. Galaine, C. Borg, Y. Godet et al. // Vaccines (Basel). -2015. - V. 3. - N 3. - P. 490-502.

138. Ge L. Association between polymorphisms of interleukin 10 with inflammatory biomarkers in East Chinese Han patients with rheumatoid arthritis / L. Ge, Y. Huang, H. Zhang et al. // Joint Bone Spine. - 2015. - V. 82.

- N 3. - P. 182-186.

139. Gibson G. Decanalization and the origin of complex disease / G. Gibson // Nat. Rev. Genet. - 2009. - V. 10. - N 2. - P. 134-140.

140. Gold D.R. Population disparities in asthma / D.R. Gold, R. Wright // Annu. Rev. Public Health. - 2005. - V. 26. - P. 89-113.

141. Gossner A.G. Relationship between susceptibility of Blackface sheep to Teladorsagia circumcincta infection and an inflammatory mucosal T cell response / A.G. Gossner, V.M. Venturina, D.J. Shaw et al. // Vet Res. - 2012. -V. 28. - N 43.

142. Graham R.R. Genetic variants near TNFAIP3 on 6q23 are associated with systemic lupus erythematosus / R.R. Graham, C. Cotsapas, L. Davies et al. // Nat. Genet. - 2008. - V. 40. - N 9. - P. 1059-1061.

143. Granada M. A genome-wide association study of plasma total IgE concentrations in the Framingham Heart Study / M. Granada, J.B. Wilk, M. Tuzova // J. Allergy Clin. Immunol. - 2012. - V. 129. - N 3. - P. 840-845. -e21.

144. Green R.E. A draft sequence of the Neandertal genome / R.E. Green, J. Krause, A.W. Briggs et al. // Science. - 2010. - V. 328. - N 5979. - P. 710-722.

145. Gregersen P.K. REL, encoding a member of the NF-kappaB family of transcription factors, is a newly defined risk locus for rheumatoid arthritis / P.K. Gregersen, C.I. Amos, A.T. Lee et al. // Nat Genet. - 2009. - V. 41. - N 7. - P. 820-823.

146. Grennan D.M. Family and twin studies in systemic lupus erythematosus / D.M. Grennan, A. Parfitt, N. Manolios et al. // Dis. markers - 1997. - V. 13. - N 2. -P. 93-98.

147. Guerra S.G. The genetics of lupus: a functional perspective / S.G. Guerra, T.J. Vyse, D.S. Cunninghame Graham // Arthritis Res. Ther. - 2012. - V. 14. - N 3. - P. 211.

148. Guibas G.V. Relationship of Allergy with Asthma: There Are More Than the Allergy "Eggs" in the Asthma "Basket" / G.V. Guibas, A.G. Mathioudakis, M. Tsoumani // Front. Pediatr. - 2017. - V. 5.

149. Hancock A.M. Adaptations to new environments in humans: the role of subtle allele frequency shifts / A.M. Hancock , G. Alkorta-Aranburu, D.B. Witonsky et al. // Philos. Trans. R. Soc. Lond. B. Biol. Sci. - 2010. - V. 365. - N 1552. -P. 2459-2468.

150. Hawks J. The Y chromosome and the replacement hypothesis / J. Hawks // Science. - 2001. - V. 293. - N 5530. - P. 567.

151. Heinzmann A. Association study suggests opposite effects of polymorphisms within IL8 on bronchial asthma and respiratory syncytial virus bronchiolitis /

A. Heinzmann, I. Ahlert, T. Kurz et al. // J. Allergy Clin. Immunol. - 2004. -V. 114. - N 3. - P. 671-676.

152. Henn B.M. Distance from sub-Saharan Africa predicts mutational load in diverse human genomes / B.M. Henn, L.R. Botigue, S. Peischl et al. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 2016. - 113. - N 4. - E440-449.

153. Henn B.M. The great human expansion / B.M. Henn, L.L. Cavalli-Sforza, M.W. Feldman // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 2012. - V. 109. - N 44. - P. 17758-17764.

154. Hinds D.A. A genome-wide association meta-analysis of self-reported allergy identifies shared and allergy-specific susceptibility loci / D.A. Hinds, G. McMahon, A.K. Kiefer et al. // Nat. Genet. - 2013. - V. 45. - N 8. - P. 907911.

155. Hirota T. Genome-wide association study identifies three new susceptibility loci for adult asthma in the Japanese population / T. Hirota, A. Takahashi, M. Kubo et al. // Nat. Genet. - 2011. - V. 43. - N 9. - P. 893-896.

156. Hirschfield G.M. Primary biliary cirrhosis associated with HLA, IL12A, and IL12RB2 variants / G.M. Hirschfield, X. Liu, C. Xu et al. // N. Engl. J. Med. -2009. - V. 360. - N 24. - P. 2544-2555.

157. Hotez P.J. Helminth infections: the great neglected tropical diseases / P.J. Hotez, P.J. Brindley, J.M. Bethony et al. // J. Clin. Invest. - 2008. - V. 118. -N 4 -P. 1311-1321.

158. Hu D. Investigation of association between IL-8 serum levels and IL8 polymorphisms in Chinese patients with sepsis / D. Hu, H. Wang, X. Huang et al. // Gene. - 2016. - V. 594. - N 1. - P. 165-170.

159. Hua L. Four-locus gene interaction between IL13, IL4, FCER1B, and ADRB2 for asthma in Chinese Han children / L. Hua, X.B. Zuo, Y.X. Bao et al. // Pediatr. Pulmonol. - 2016. - V. 51. - N 4. - P. 364-371.

160. Hudson R.R. Evidence for positive selection in the superoxide dismutase (Sod) region of Drosophila melanogaster / R.R. Hudson, K. Bailey, D. Skarecky // Genetics. - 1994. - V. 136. - N 4. - P. 1329-1340.

161. Ingram C.J. A novel polymorphism associated with lactose tolerance in Africa: multiple causes for lactase persistence? / C.J. Ingram, M.F. Elamin, C.A. Mulcare et al. // Hum. Genet. - 2007. - V. 120. - N 6. - P. 779-788.

162. Jacobson E.M. The HLA gene complex in thyroid autoimmunity: from epidemiology to etiology / E.M. Jacobson, A. Huber, Y. Tomer // J. Autoimmun. - 2008. - V. 30. - N 1-2. - P. 58-62.

163. Jafari N. Perspectives on the use of multiple sclerosis risk genes for prediction / N. Jafari, L. Broer, C.M. van Duijn et al. // PLoS One. - 2011. - V. 6. - N 12. - e26493.

164. Jakobsson M. Genotype, haplotype and copy-number variation in worldwide human populations / M. Jakobsson, S.W. Scholz, P. Scheet et al. // Nature. -2008. - V. 451. - N 7181. - P. 998-1003.

165. Järvinen T.M. Polymorphisms of the ITGAM gene confer higher risk of discoid cutaneous than of systemic lupus erythematosus / T.M. Järvinen, A. Hellquist, S. Koskenmies et al. // PLoS One. - 2010. - V. 5. - N 12. - e14212.

166. Jenkins D.L. Clovis age Western Stemmed projectile points and human coprolites at the Paisley Caves / D.L. Jenkins, L.G. Davis, T.W. Stafford et al. // Science. - 2012. - V. 337. - N 6091. - P. 223-228.

167. Jiang Y. Meta-analysis of 125 rheumatoid arthritis-related single nucleotide polymorphisms studied in the past two decades / Y. Jiang, R. Zhang, J. Zheng et al. // PLoS One. - 2012. - V. 7. - N 12. - e51571.

168. Kanzler H. Therapeutic targeting of innate immunity with Toll-like receptor agonists and antagonists / H. Kanzler, F.J. Barrat, E.M. Hessel // Nat. Med. 2007. - 13. - N 5. - P. 552-559.

169. Karam R.A. Association between genetic polymorphisms of beta2 adrenergic receptors and nocturnal asthma in Egyptian children / R.A. Karam, N.A. Sabbah, H.E. Zidan et al. // J. Investig. Allergol. Clin. Immunol. - 2013. - V. 23. - N 4. - P. 262-266.

170. Karlsson E.K. Natural selection and infectious disease in human populations / E.K. Karlsson, D.P. Kwiatkowski, P.C. Sabeti // Nat. Rev. Genet. - 2014. - V. 15. - N 6. - P. 379-393.

171. Kemppinen A. Genome-wide association studies in multiple sclerosis: lessons and future prospects / A. Kemppinen, S. Sawcer, A. Compston // Brief. Funct. Genomics. -2011. - V. 10. - N 2. - P. 61-70.

172. Kljaic-Bukvic B. Genetic variants in endotoxin signalling pathway, domestic endotoxin exposure and asthma exacerbations / B. Kljaic-Bukvic, M. Blekic, N. Aberle et al. // Pediatr. Allergy Immunol. - 2014. - V. 25. - N 6. - P. 552557.

173. Kurreeman F.A. Use of a multiethnic approach to identify rheumatoid-arthritis-susceptibility loci, 1p36 and 17q12 / F.A. Kurreeman, E.A. Stahl, Y. Okada et al. // Am. J. Hum. Genet. - 2012. - V. 90. - N 3. - P. 524-532.

174. Lachance J. Population Genomics of Human Adaptation / J. Lachance, S.A. Tishkoff // Annu. Rev. Ecol. Evol. Syst. - 2013. - V. 44. - P. 123-143.

175. Lamason R.L. SLC24A5, a putative cation exchanger, affects pigmentation in zebrafish and humans / R.L. Lamason, M.A. Mohideen, J.R. Mest et al. // Science. - 2005. - V. 310. - N 5755. - P. 1782-1786.

176. Le Souef P.N. Evolution and respiratory genetics / P.N. Le Souef, P. Candelaria, J. Goldblatt // Eur. Respir. J. - 2006. - V. 28. - N 6. - P. 12581263.

177. Le Souef P.N. Evolutionary adaptation of inflammatory immune responses in human beings / P.N. Le Souef, J. Goldblatt, N.R. Lynch // Lancet. - 2000. -V.356. - N 9225. - P. 242-244.

178. Lessard C.J. Identification of a Systemic Lupus Erythematosus Risk Locus Spanning ATG16L2, FCHSD2, and P2RY2 in Koreans / C.J. Lessard, S. Sajuthi, J. Zhao et al. // Arthritis Rheumatol. - 2016. - V. 68. - N 5. - P. 11971209.

179. Lessard C.J. The genomics of autoimmune disease in the era of genome-wide association studies and beyond / C.J. Lessard, J.A. Ice, I. Adrianto et al. // Autoimmun. Rev. - 2012. - V. 11. - N 4. - P. 267-275.

180. Li J.Z. Worldwide human relationships inferred from genome-wide patterns of variation / J.Z. Li, D.M. Absher, H. Tang et al. // Science. - 2008. - V. 319. -N 5866. - P. 1100-1104.

181. Li L. Using eQTL weights to improve power for genome-wide association studies: a genetic study of childhood asthma / L. Li, M. Kabesch, E. Bouzigon et al. // Front. Genet. - 2013. - V. 4. - P. 103.

182. Licona-Limon P. Th9 Cells Drive Host Immunity against Gastrointestinal Worm Infection / P. Licona-Limon, J. Henao-Mejia, A.U. Temann et al. // Immunity. - 2013. - V. 39. - N 4. - P. 744-757.

183. Liebert A. In Vitro Functional Analyses of Infrequent Nucleotide Variants in the Lactase Enhancer Reveal Different Molecular Routes to Increased Lactase Promoter Activity and Lactase Persistence / A. Liebert, B.L. Jones, E.T. Danielsen et al. // Ann. Hum. Genet. - 2016. - V. 80. - N 6. - P. 307-318.

184. Lin R.J. Relationship between signal transducers and activators of transcription 6 gene polymorphism and genetic susceptibility of bronchial asthma in children / R.J. Lin, D.X. Liu, A.H. Sui // Journal of Applied Clinical Pediatrics - 2012. - N 27. - P. 1258-1260.

185. Liphaus Bde L. Analysis of human leukocyte antigens class II-DR in Brazilian children and adolescents with systemic lupus erythematosus / L. Liphaus Bde, A.C. Goldberg, M.H. Kiss et al. // Rev. Hosp. Clin. Fac. Med. Sao Paulo. -2002. - V. 57. - N 6. - P. 277-282.

186. Liu W. The earliest unequivocally modern humans in southern China / W. Liu, M. Martinon-Torres, Y.J. Cai et al. // Nature. - 2015. - V. 526. - N. 7575. - P. 696-699.

187. Liu X. Genome-wide meta-analyses identify three loci associated with primary biliary cirrhosis / X. Liu, P. Invernizzi, Y. Lu et al. // Nat. Genet. - 2010. -V.42. - N 8. - P. 658-660.

188. Loisel D.A. IFNG genotype and sex interact to influence the risk of childhood asthma / D.A. Loisel, Z. Tan, C.J. Tisler // J. Allergy. Clin. Immunol. - J. Allergy Clin. Immunol. - 2011. - V. 128. - N 3. - P. 524-531.

189. López S. Human Dispersal Out of Africa: A Lasting Debate / S. López, L. van Dorp , G. Hellenthal // Evol. Bioinform. Online. - 2016. - V. 11. - Suppl 2. -P. 57-68.

190. López-Tello A. Association of HLA-DRB1*16 with chronic discoid lupus erythematosus in Mexican mestizo patients / A. López-Tello, A.A. Rodríguez-Carreón, F. Jurado et al. // Clin. Exp. Dermatol. - 2007. - V. 32. - N 4. - P. 435-438.

191. Lustigman S. A research agenda for helminth diseases of humans: the problem of helminthiases / S. Lustigman, R.K. Prichard, A. Gazzinelli et al.// PLoS Negl. Trop. Dis. - 2012. - V. 6. - N 4. - e1582.

192. Macaulay V. Single, rapid coastal settlement of Asia revealed by analysis of complete mitochondrial genomes / V. Macaulay, C. Hill, A. Achilli et al. // Science. - 2005. - V. 308. - N 5724. - P. 1034-1036.

193. Maes T. Gene therapy for allergic airway diseases / T. Maes, K.G. Tournoy, G.F. Joos // Curr. Allergy Asthma Rep. - 2011. - V. 11. - N 2. - P. 163-172.

194. Maier L.M. IL2RA genetic heterogeneity in multiple sclerosis and type 1 diabetes susceptibility and soluble interleukin-2 receptor production / L.M. Maier, C.E. Lowe, J. Cooper et al. // PLoS Genet. - 2009. - V. 5. - N 1. -e1000322.

195. Maizels R.M. T-cell regulation in helminth parasite infections: implications for inflammatory diseases / R.M. Maizels, M. Yazdanbakhsh // Chem. Immunol. Allergy. - 2008. - V. 94. - P. 112-123.

196. Malaspinas A.S. A genomic history of Aboriginal Australia / A.S. Malaspinas, M.C. Westaway, C. Muller et al. // Nature. - 2016. - V. 538. - N 7624. - P. 207-214.

197. Mallick S. The Simons Genome Diversity Project: 300 genomes from 142 diverse populations / S. Mallick, H. Li, M. Lipson et al. // Nature. - 2016. - V. 538. - N 7624. - P. 201-206.

198. Martin A.M. Population frequencies of single nucleotide polymorphisms (SNPs) in immuno-modulatory genes / A.M. Martin, G. Athanasiadis, J.D. Greshock et al. // Hum. Hered. - 2003. - V. 55. - N 4. - P. 171-178.

199. Martin J.E. Identification of CSK as a systemic sclerosis genetic risk factor through Genome Wide Association Study follow-up / J.E. Martin, J.C. Broen, F.D. Carmona et al. // Hum. Mol. Genet. - 2012. - V. 21. - N 12. - P. 28252835.

200. McDonald J.H. Adaptive protein evolution at the Adh locus in Drosophila / J.H. McDonald, M. Kreitman // Nature. - 1991. - V. 351. - N 6328. - P. 652654.

201. McSorley H.J. Helminth infections and host immune regulation / H.J. McSorley, R.M. Maizels // Clin. Microbiol. Rev. - 2012. - V. 25. - N 4. -P. 585-608.

202. Mellars P. Genetic and archaeological perspectives on the initial modern human colonization of southern Asia / P. Mellars, K.C. Gori, M. Carr et al. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 2013. - V. 110. - N 26. - P. 10699-10704.

203. Mells G.F. Genome-wide association study identifies 12 new susceptibility loci for primary biliary cirrhosis / G.F. Mells, J.A. Floyd, K.I. Morley et al. // Nat. Genet. - 2011. - V. 43. - N 4. - P. 329-332.

204. Mendez-Samperio P. Molecular events by which dendritic cells promote Th2 immune protection in helmith infection / P. Mendez-Samperio // Infect. Dis. (Lond.). - 2016. - V. 48. - N 10. - P. 715-720.

205. Metspalu M. Most of the extant mtDNA boundaries in south and southwest Asia were likely shaped during the initial settlement of Eurasia by anatomically modern humans / M. Metspalu, T. Kivisild, E. Metspalu et al. // BMC Genet. -2004. - V. 5. - P. 26.

206. Meyer M. A mitochondrial genome sequence of a hominin from Sima de los Huesos / M. Meyer, Q. Fu, A. Aximu-Petri et al. // Nature. -2014. - V. 505. -N 7483. - P. 403-406.

207. Micheal S. IL-4 gene polymorphisms and their association with atopic asthma and allergic rhinitis in Pakistani patients / S. Micheal, K. Minhas, M. Ishaque et al. // J. Investig. Allergol. Clin. Immunol. - 2013. - V. 23. - N 2. - P. 107-111.

208. Moens L. Cytokine-Mediated Regulation of Plasma Cell Generation: IL-21 Takes Center Stage / L. Moens, S.G. Tangye // Front Immunol. - 2014. - V. 5.

209. Moffatt M.F. A large-scale, consortium-based genomewide association study of asthma / M.F. Moffatt, I.G. Gut, F. Demenais et al. // N. Engl. J. Med. -2010. - V. 363. - N 13. - P. 1211-1221.

210. Movahedi M. Gene polymorphisms of Interleukin-4 in allergic rhinitis and its association with clinical phenotypes / M. Movahedi, A.A. Amirzargar, R. Nasiri et al. // Am. J. Otolaryngol. - 2013. - V. 34. - N 6. - P. 676-681.

211. Munir S. Association analysis of GWAS and candidate gene loci in a Pakistani population with psoriasis / S. Munir, S. ber Rahman, S. Rehman // Mol. Immunol. - 2015. - V. 64. - N 1. - P. 190-194.

212. Nakamura M. Genome-wide association study identifies TNFSF15 and POU2AF1 as susceptibility loci for primary biliary cirrhosis in the Japanese population / M. Nakamura, N. Nishida, M. Kawashima et al. // Am. J. Hum. Genet. - 2012. - V. 91. - N 4. - P. 721-728.

213. Namjou B. The effect of inversion at 8p23 on BLK association with lupus in Caucasian population / B. Namjou, Y. Ni, I.T. Harley et al. // PLoS One. -2014. - V. 9. - N 12. - e115614.

214. Narozna B. Polymorphisms in the interleukin 4, interleukin 4 receptor and interleukin 13 genes and allergic phenotype: A case control study / B. Narozna, A. Hoffmann, P. Sobkowiak et al. // Adv. Med. Sci. - 2016. - V. 61. - N 1. -P. 40-45.

215. Nasiri R. Gene polymorphisms of interleukin-10 and transforming growth factor beta in allergic rhinitis / R. Nasiri, A. Hirbod-Mobarakeh, M. Movahedi et al. // Allergol. Immunopathol .(Madr.). - 2016. - V. 44. - N 2. - P. 125-130.

216. Nausch N. Regulatory and activated T cells in human Schistosoma haematobium infections / N. Nausch, N. Midzi, T. Mduluza et al. // PLoS One.

- 2011. - V. 6. - N 2. - e16860.

217. Neel J.V. Diabetes mellitus: a "thrifty" genotype rendered detrimental by "progress"? / J.V. Neel // Am. J. Hum. Genet. - 1962. - V. 14. - P. 353-362.

218. Nerup J. HL-A antigens and diabetes mellitus / J. Nerup, P. Platz, O.O. Andersen et al. // Lancet. - 1974. - V. 2. - N 7885. - P. 864-866.

219. Newth C.J. Fatal and near-fatal asthma in children: the critical care perspective / C.J. Newth, K.L. Meert, A.E. Clark et al. // J. Pediatr. - 2012. - V. 161. - N 2. - P. 214-221.

220. Norton H.L. Genetic evidence for the convergent evolution of light skin in Europeans and East Asians / H.L. Norton, R.A. Kittles, E. Parra et al. // Mol. Biol. Evol. - 2007. - V. 24. - N 3. - P. 710-722.

221. Nückel H. The IKZF3 (Aiolos) transcription factor is highly upregulated and inversely correlated with clinical progression in chronic lymphocytic leukaemia / H. Nückel, U.H. Frey, L. Sellmann et al. // Br. J. Haematol. -2009.

- v. 144. - N 2. - P. 268-270.

222. Ogbuanu I.U. Birth order modifies the effect of IL13 gene polymorphisms on serum IgE at age 10 and skin prick test at ages 4, 10 and 18: a prospective birth cohort study / I.U. Ogbuanu, W.J. Karmaus, H. Zhang et al. // Allergy Asthma Clin. Immunol. -2010. - V. 6. - N 1. - P. 1-13.

223. Oh H. NF-kB: roles and regulation in different CD4(+) T-cell subsets / H. Oh, S. Ghosh // Immunol. Rev. - 2013. - V. 252. - N 1. - P. 41-51.

224. Ounissi-Benkalha H. The molecular genetics of type 1 diabetes: new genes and emerging mechanisms / H. Ounissi-Benkalha, C. Polychronakos // Trends Mol. Med. - 2008. - V. 14. - N 6. - P. 268-275.

225. Pagani L. Genomic analyses inform on migration events during the peopling of Eurasia / L. Pagani, D.J. Lawson, E. Jagoda et al. // Nature. - 2016. - V. 538. -N 7624. - P. 238-242.

226. Pagani L. Tracing the route of modern humans out of Africa by using 225 human genome sequences from Ethiopians and Egyptians / L. Pagani, S. Schiffels, D. Gurdasani et al. // Am. J. Hum. Genet. - 2015. - V. 96. - N 6. -P. 986-991.

227. Pamuk O.N. BLK pathway-associated rs13277113 GA genotype is more frequent in SLE patients and associated with low gene expression and increased flares / O.N. Pamuk, H. Gurkan, G.E. Pamuk et al. // Clin. Rheumatol. - 2017. - V. 36 - N 1. - P.103-109.

228. Parkes M. Genetic insights into common pathways and complex relationships among immune-mediated diseases / M. Parkes 1, A. Cortes, D.A. van Heel et al. // Nat. Rev. Genet. - 2013. - V. 14. - N 9. - P. 661-673.

229. Patsopoulos N.A. Genome-wide meta-analysis identifies novel multiple sclerosis susceptibility loci / N.A. Patsopoulos, F. Esposito, J. Reischl et al. // Ann. Neurol. - 2011. - V. 70. - N 6. - P. 897-912.

230. Pellerin L. Regulatory T cells and their roles in immune dysregulation and allergy / L. Pellerin, J.A. Jenks, P. Begin et al. // Immunol. Res. - 2014. - V. 58. - N 2-3. - P. 358-368.

231. Pemberton T.J. Population structure in a comprehensive genomic data set on human microsatellite variation / T.J. Pemberton, M. DeGiorgio, N.A. Rosenberg // G3 (Bethesda). - 2013. - V. 3. - N 5. - P.891-907.

232. Petraglia M. Middle Paleolithic assemblages from the Indian subcontinent before and after the Toba super-eruption / M. Petraglia, R. Korisettar, N. Boivin et al. // Science. - 2007. - V. 317. - N 5834. - P. 114-116.

233. Petraglia M. Population increase and environmental deterioration correspond with microlithic innovations in South Asia ca. 35,000 years ago / M. Petraglia, C. Clarkson, N. Boivin et al. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 2009. - V. 106. -N 30. - P. 12261-12266.

234. Petraglia M.D. Out of Africa: new hypotheses and evidence for the dispersal of Homo sapiens along the Indian Ocean rim / M.D. Petraglia, M. Haslam, D.Q. Fuller et al. // Ann. Hum. Biol. - 2010. - V. 37. - N 3. - P. 288-311.

235. Pickrell J.K. Signals of recent positive selection in a worldwide sample of human populations / J.K. Pickrell, G. Coop, J. Novembre et al. // Genome Res. - 2009. - V. 19. - N 5. - P. 826-837.

236. Pino-Yanes M. Assessing the validity of asthma associations for eight candidate genes and age at diagnosis effects / M. Pino-Yanes, A. Corrales, J. Cumplido et al. // PLoS One. - 2013. - V. 8. - N 9. - e73157.

237. Population structure analyses (Электронный ресурс) - URL: https:// pophelper.com (дата последнего обращения 03.04.2017).

238. Poznik G.D. Sequencing Y chromosomes resolves discrepancy in time to common ancestor of males versus females / G.D. Poznik, B.M. Henn, M.C. Yee et al. // Science. - 2013. - V. 341. - N 6145. - P. 562-565.

239. Prüfer K. The complete genome sequence of a Neanderthal from the Altai Mountains / K. Prüfer, F. Racimo, N. Patterson et al. // Nature. - 2014. - V. 505. - N 7481. - P. 43-49.

240. Prugnolle F. Geography predicts neutral genetic diversity of human populations / F. Prugnolle, A. Manica, F. Balloux // Curr. Biol. - 2005a. - V. 15. - N 5. - P. R159-R160.

241. Prugnolle F. Pathogen-driven selection and worldwide HLA class I diversity / F. Prugnolle, A. Manica, M. Charpentier et al. // Curr. Biol. - 2005. - V. 15. -N 11. - P. 1022-1027.

242. Qian X. Association of STAT6 variants with asthma risk: a systematic review and meta-analysis / X. Qian, Y. Gao, X. Ye et al. // Hum. Immunol. - 2014. -V. 75. - N 8. - Р. 847-853.

243. Qiu L.J. Relationship between the IL-4 gene promoter -590C/T (rs2243250) polymorphism and susceptibility to autoimmune diseases: a meta-analysis / L.J. Qiu, J. Ni, H. Cen et al. // J. Eur. Acad. Dermatol. Venereol. - 2015. - V. 29. - N 1. - P. 48-55.

244. Qiu Y.Y. Association between beta2-adrenergic receptor genetic polymorphisms and total serum IgE in asthmatic patients of Chinese Han nationality / Y.Y. Qiu, X.L. Zhang, K.S. Yin // Respiration. - 2006. - V. 73. -N 2. - P. 180-184.

245. Radstake T.R. Genome-wide association study of systemic sclerosis identifies CD247 as a new susceptibility locus / T.R. Radstake, O. Gorlova, B. Rueda et al. // Nat Genet. - 2010. - V.42. - N 5. - P. 426-429.

246. Rahman A. Systemic lupus erythematosus / A. Rahman, D.A. Isenberg // N. Engl. J. Med. - 2008. - V. 358. - N 9. - P. 929-939.

247. Ramachandran S. Support from the relationship of genetic and geographic distance in human populations for a serial founder effect originating in Africa // S. Ramachandran, O. Deshpande, C.C. Roseman et. al. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. -2005. - V. 102. - N 44. - P. 15942-15947.

248. Ramos P.S. Genetic analyses of interferon pathway-related genes reveal multiple new loci associated with systemic lupus erythematosus / P.S. Ramos, A.H. Williams, J.T. Ziegler et al. // Arthritis Rheum. - 2011. - V. 63. - N 7. -P. 2049-2057.

249. Reich D. Denisova admixture and the first modern human dispersals into Southeast Asia and Oceania / D. Reich, N. Patterson, M. Kircher et al. // Am. J. Hum. Genet. - 2011. - V. 89. - N 4. P. 516-528.

250. Reich D. Genetic history of an archaic hominin group from Denisova Cave in Siberia / D. Reich, R.E. Green, M. Kircher et al. // Nature. - 2010. -V. 468. -N 7327. - P. 1053-1060.

251. Richards M. Tracing European founder lineages in the Near Eastern mtDNA pool // M. Richards, V. Macaulay, E. Hickey et al. // Am. J. Hum. Genet. -2000. -V. 67. - N5. - P. 1251-1276.

252. Robinson J. IMGT/HLA Database-a sequence database for the human major histocompatibility complex/ J. Robinson, M. J. Waller, P. Parham et al. // Nucleic Acids Res. - 2001. - V. 29. - N 1. - P. 210-213.

253. Rosenberg N.A. Genetic Diversity and Societally Important Disparities / N.A. Rosenberg, J.T. Kang // Genetics. - 2015 - V. 201. - N 1. - P. 1-12.

254. Rosenberg N.A. Genetic structure of human populations / N.A. Rosenberg, J.K. Pritchard, J.L. Weber et al. // Science. - 2002. - V. 298. - N 5602. - P. 2381-2385.

255. Sabeti P.C. Detecting recent positive selection in the human genome from haplotype structure / P.C. Sabeti, D.E. Reich, J.M. Higgins et al. // Nature. -2002. - V. 419. - N 6909. - P. 832-837.

256. Sabeti P.C. Genome-wide detection and characterization of positive selection in human populations / P.C. Sabeti, P. Varilly, B. Fry et al. // Nature. - 2007. -V. 449. - N 7164. - P. 913-918.

257. Sabeti P.C. Positive natural selection in the human lineage / P.C. Sabeti, S.F. Schaffner, B. Fry et al. // Science. - 2006. - V. 312. - N 5780. - P. 1614-1620.

258. Saeb A.T. The Impact of Evolutionary Driving Forces on Human Complex Diseases: A Population Genetics Approach / A.T. Saeb, D. Al-Naqeb // Scientifica (Cairo). - 2016. - V. 2016.

259. Sankararaman S. The date of interbreeding between Neandertals and modern humans / S. Sankararaman, N. Patterson, H. Li et al. // PLoS Genet. - 2012. -V. 8. - N 10. - e1002947.

260. Sarafino E.P. Genetic factors in the presence, severity, and triggers of asthma / E.P. Sarafino, J. Goldfedder // Arch. Dis. Child. - 1995. - V. 73. - N 2. - P. 112-116.

261. Sawcer S. Genetic risk and a primary role for cell-mediated immune mechanisms in multiple sclerosis / S. Sawcer, G. Hellenthal, M. Pirinen et al. // Nature. - 2011. - V. 476. - N 7359. - P. 214-219.

262. Scalapino K.J. CTLA-4: a key regulatory point in the control of autoimmune disease // K.J. Scalapino, D.I. Daikh // Immunol. Rev. - 2008. - V. 223. - P. 143-155.

263. Seldin M.F. The genetics revolution and the assault on rheumatoid arthritis / M.F. Seldin, C.I. Amos, R. Ward et al./ Arthritis and rheumatism. - 1999. - V. 42. - N 6. - P. 1071-1079.

264. Shi W. A worldwide survey of human male demographic history based on Y-SNP and Y-STR data from the HGDP-CEPH populations / W. Shi, Q. Ayub, M. Vermeulen et al. // Mol. Biol. Evol. - 2010. - V. 27. - N 2. -P. 385-393.

265. Shinoda K. Maintenance of pathogenic Th2 cells in allergic disorders / K. Shinoda, K. Hirahara, T. Nakayama // Allergol. Int. - 2017.

266. Simarro P.P. Estimating and mapping the population at risk of sleeping sickness / P.P. Simarro, G. Cecchi, J.R. Franco et al // PLoS Negl. Trop. Dis. -2012. - V. 6. - N 10. - e1859.

267. Singal D.P. Histocompatibility (HL-A) antigens, lymphocytotoxic antibodies and tissue antibodies in patients with diabetes mellitus / D.P. Singal, M.A. Blajchman // Diabetes. - 1973. - V. 22. - N 6. - P. 429-432.

268. Soejima M. Evidence for recent positive selection at the human AIM1 locus in a European population / M. Soejima, H. Tachida, T. Ishida et al. // Mol. Biol. Evol. - 2006. - V. 23. - N 1. - P. 179-188.

269. Song G.G. Association between BLK polymorphisms and susceptibility to SLE: A meta-analysis / G.G. Song, Y.H. Lee // Z. Rheumatol. - 2017. - V. 76. - N 2. - P. 176-182.

270. Sotillo J. Th17 responses in Echinostoma caproni infections in hosts of high and low compatibility / J. Sotillo, M. Trelis, A. Cortes et al. // Exp. Parasitol. -2011. - V. 129. - N 3. - P. 307-311.

271. Stahl E.A. Genome-wide association study meta-analysis identifies seven new rheumatoid arthritis risk loci / E.A. Stahl, S. Raychaudhuri, E.F. Remmers et al. // Nat. Genet. - 2010. - V. 42. - N 6. - P. 508-514.

272. Sturm R.A. Human pigmentation genes under environmental selection / R.A. Sturm, D.L. Duffy // Genome Biol. - 2012. - V. 13. - N 9. - P. 248.

273. Suzuki Y. CD14 and IL4R gene polymorphisms modify the effect of day care attendance on serum IgE levels / Y. Suzuki, S. Hattori, Y. Mashimo et al. // J. Allergy Clin. Immunol. - 2009. - V. 123. - N 6. - P. 1408-1411.

274. Tachdjian R. Pathogenicity of a disease-associated human IL-4 receptor allele in experimental asthma / R. Tachdjian, C. Mathias, S. Al Khatib et al // J. Exp. Med. - 2009. - V. 206. - N 10. - P. 2191-2204.

275. Tajima F. Statistical method for testing the neutral mutation hypothesis by DNA polymorphism / F. Tajima // Genetics. - 1989. - V. 123. - N 3. - P. 585595.

276. Talaat R.M. Th1/Th2/Th17/Treg cytokine imbalance in systemic lupus erythematosus (SLE) patients: Correlation with disease activity / R.M. Talaat, S.F. Mohamed, I.H. Bassyouni et al. // Cytokine. - 2015. - V. 72. - N 2. - P. 146-153.

277. Tamura M. Members of a novel gene family, Gsdm, are expressed exclusively in the epithelium of the skin and gastrointestinal tract in a highly tissue-specific manner / M. Tamura, S. Tanaka, T. Fujii et al. // Genomics. -2007. - V. 89. -N 5. - P. 618-629.

278. Tang K. A new approach for using genome scans to detect recent positive selection in the human genome / K. Tang, K.R. Thornton, M. Stoneking // PLoS Biol. - 2007. - V. 5. - N 7. - e171.

279. Tang M.F. Genetic effects of multiple asthma loci identified by genomewide association studies on asthma and spirometric indices / M.F. Tang, H.Y. Sy , A.P. Kong et al. // Pediatr. Allergy Immunol. - 2016. - V. 27. - N 2. - P. 185194.

280. The 1000 Genomes Selection Browser 1.0 (Электронный ресурс) -http://hsb.upf.edu/ (дата последнего обращения 11.02.2017).

281. Thompson N.P. Genetics versus environment in inflammatory bowel disease: results of a British twin study / N.P. Thompson, R. Driscoll, R.E. Pounder // BMJ. - 1996. - V. 312. - N 7023. - P. 95-96.

282. Thomsen M. MLC typing in juvenile diabetes mellitus and idiopathic Addison's disease / M. Thomsen, P. Platz, O.O. Andersen et al. // Transplant. Rev. - 1975. - V. 22. - P. 125-147.

283. Thomson G. HLA disease associations: models for insulin dependent diabetes mellitus and the study of complex human genetic disorders / G. Thomson // Annu. Rev. Genet. - 1988. - V. 22. - P. 31-50.

284. Tishkoff S.A. Convergent adaptation of human lactase persistence in Africa and Europe / S.A. Tishkoff, F.A. Reed, A. Ranciaro et al. // Nat. Genet. - 2007. - V. 39. - N 1. - P. 31-40.

285. Torgerson D.G. Meta-analysis of genome-wide association studies of asthma in ethnically diverse North American populations / D.G. Torgerson, E.J. Ampleford, G.Y. Chiu et al. // Nat. Genet. - 2011. - V. 43. - N 9. - P. 887892.

286. Torroni A. A signal, from human mtDNA, of postglacial recolonization in Europe / A. Torroni, H.J. Bandelt, V. Macaulay et al. // Am. J. Hum. Genet. -2001. - V. 69. - N 4. - P. 844-852.

287. Travel Weather Averages (Weatherbase) (Электронный ресурс) URL: http://www.weatherbase.com/ (дата последнего обращения 31.05.2017).

288. Tsoi L.C. Identification of 15 new psoriasis susceptibility loci highlights the role of innate immunity / L.C. Tsoi, S.L. Spain, J. Knight et al. // Nat. Genet. -2012. - V. 44. - N 12. - P. 1341-1348.

289. Underhill P.A. Use of y chromosome and mitochondrial DNA population structure in tracing human migrations / P.A. Underhill, T. Kivisild // Annu. Rev. Genet. - 2007. - V. 41. - P. 539-564.

290. Vatsiou A.I. Changes in selective pressures associated with human population expansion may explain metabolic and immune related pathways enriched for signatures of positive selection / A.I. Vatsiou, E. Bazin, O.E. Gaggiotti // BMC Genomics. - 2016. - V. 17. - P. 504.

291. Veldhoen M. Transforming growth factor-beta 'reprograms' the differentiation of T helper 2 cells and promotes an interleukin 9-producing subset / M.

Veldhoen, C. Uyttenhove, J. van Snick et al. // Nat. Immunol. - 2008. - V. 9. -N 12. - P. 1341-1346.

292. Vercelli D. Discovering susceptibility genes for asthma and allergy / D.Vercelli // Nat. Rev. Immunol. - 2008. - V. 8. - N 3. - P. 169-182.

293. Vercelli D. Gene-environment interactions in asthma and allergy: the end of the beginning? / D.Vercelli // Curr. Opin. Allergy Clin. Immunol. - 2010. - V. 10. - N 2. - P. 145-148.

294. Vergara C. African ancestry is a risk factor for asthma and high total IgE levels in African admixed populations / C. Vergara, T. Murray, N. Rafaels et al. // Genet. Epidemiol. - 2013. - V. 37. - N 4. - P. 393-401.

295. Viatte S. Association of HLA-DRB1 haplotypes with rheumatoid arthritis severity, mortality, and treatment response / S. Viatte, D. Plant, B. Han et al. // JAMA. - 2015. - V. 313. - N 16. - P. 1645-1656.

296. Voight B.F. A map of recent positive selection in the human genome / B.F. Voight, S. Kudaravalli, X. Wen et al. // PLoS Biol. - 2006. - V. 4. - N 3. -e72.

297. Waddington C.H. Canalization of Development and the Inheritance of Acquired Characters / C.H. Waddington // Nature. - 1942. - V. 150. - N 3811. - P. 563-565.

298. Walsh E.C. Searching for signals of evolutionary selection in 168 genes related to immune function / E.C. Walsh, P. Sabeti, H.B. Hutcheson et al. // Hum. Genet. - 2006. - V. 119. - N 1-2. - P. 92-102.

299. Wang E.Y. Association of polymorphisms in interleukin (IL)-12A and -B genes with rheumatoid arthritis in a Chinese population / E.Y. Wang, Q. Yang, Z.G. Liao // Clin. Exp. Immunol. - 2015. - V. 180. - N 1. - P. 83-89.

300. Watterson G.A. The homozygosity test of neutrality / G.A. Watterson // Genetics. - 1978. - V. 88. - N 2. - P. 405-417.

301. Weaver T.D. Did a discrete event 200,000-100,000 years ago produce modern humans? / T.D. Weaver // J. Hum. Evol. - 2012. - V. 63. - N 1. - P. 121-126.

302. Weir B.S. Estimating F-statistics / B.S. Weir, W.G. Hill // Annu. Rev. Genet. -2002. - V. 36. - P. 721-750.

303. Wells R.S. The Eurasian heartland: a continental perspective on Y-chromosome diversity / R.S. Wells, N. Yuldasheva, R. Ruzibakiev et al. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 2001. - V. 98. - N 18. - P. 10244-10249.

304. Wilfing A. African-European differences in the capacity of T-cell cytokine production / A. Wilfing, S. Winkler, K. Schrattbauer et al. // Am. J. Trop. Med. Hyg. - 2001. - V. 65. - N 5. - P.504-509.

305. Wolpoff M.H. Multiregional, not multiple origins / M.H. Wolpoff, J. Hawks, R. Caspari // Am. J. Phys. Anthropol. - 2000. - V. 112. - N 1. - P. 129-136.

306. Wu X.Z. New arguments on continuity of human evolution in China / X.Z. Wu // Acta. Anth. Sin. - 2006. - V. 25. - N 1. - P. 17-25.

307. Yang W. Genome-wide association study in Asian populations identifies variants in ETS1 and WDFY4 associated with systemic lupus erythematosus / W. Yang, N. Shen, D.Q. Ye et al. // PLoS Genet. - 2010. - V. 6. - N 2. -e1000841.

308. Yang Z. Likelihood ratio tests for detecting positive selection and application to primate lysozyme evolution / Z. Yang // Mol. Biol. Evol. - 1998. - V. 15. -N 5. - P. 568-573.

309. Yunusbayev B. The Caucasus as an asymmetric semipermeable barrier to ancient human migrations / B. Yunusbayev, M. Metspalu, M. Jarve et al. // Mol. Biol. Evol. - 2012. - V. 29. - N 1. - P. 359-365.

310. Zhang Y. E26 transformation-specific-1 (ETS1) and WDFY family member 4 (WDFY4) polymorphisms in Chinese patients with rheumatoid arthritis / Y. Zhang, L. Bo, H. Zhang et al. // Int. J. Mol. Sci. - 2014. - V. 15. - N 2. - P. 2712-2721.

311. Zhang Y. Genetic and genomic approaches to asthma: new insights for the origins / Y. Zhang, M.F. Moffatt, W.O. Cookson // Curr. Opin. Pulm. Med. -2012. - V. 18. - N. 1. - P. 6-13.

312. Zhang Y.N. Association of CD14 C159T polymorphism with atopic asthma susceptibility in children from Southeastern China: a case-control study / Y.N. Zhang, Y.J. Li, H. Li et al. // Genet. Mol. Res. - 2015. - V.14. - N 2. - P. 4311-4317.

313. Zheng S.G. Regulatory T cells vs Th17: differentiation of Th17 versus Treg, are the mutually exclusive? / S.G. Zheng // Am. J. Clin. Exp. Immunol. - 2013.

- V. 2. - N 1. - P. 94-106.

314. Zhernakova A. Meta-analysis of genome-wide association studies in celiac disease and rheumatoid arthritis identifies fourteen non-HLA shared loci / A. Zhernakova, E.A. Stahl, G. Trynka et al. // PLoS Genet. - 2011. - V. 7. - N 2.

- e1002004.

315. Zhivotovsky L. A reference data base on STR allele frequencies in the Belarus population developed from paternity cases / L.A. Zhivitivsky, V.M. Veremeichyk, N.N. Kuzub et al. // Forensic Sci.Int.: Genetics. - 2009a. - V.3.

- N 3. - P.107-109.

316. Zhivotovsky L. An STR database on the Volga-Ural population / L.A. Zhivotovsky, V.L. Akhmetova, S.A. Fedorova et al. // Forensic Sci. Int.: Genetics. - 2009b. - V. 3. - N 4. - P.133-136.

317. Zhivotovsky L.A. Features of evolution and expansion of modern humans, inferred from genomewide microsatellite markers / L.A. Zhivotovsky, N.A. Rosenberg, M.W. Feldman // Am. J. Hum. Genet. - 2003. - V. 72. - N 5. - P. 1171-1186.

318. Zhivotovsky L.A. Human population expansion and microsatellite variation / L.A. Zhivotovsky, L. Bennett, A.M. Bowcock et al. // Mol. Biol. Evol. - 2000.

- V. 17. - N 5. - P. 757-767.

319. Zhou L. Plasticity of CD4+ T cell lineage differentiation / L. Zhou, M.M. Chong, D.R. Littman / Immunity. - 2009 - V. 30. - N 5. - P. 646-655.

320. Zhou X. HLA-DPB1 and DPB2 are genetic loci for systemic sclerosis: a genome-wide association study in Koreans with replication in North

Americans / X. Zhou, J.E. Lee, F.C. Arnett et al. // Arthritis Rheum. - 2009. -V. 60. - N 12. - P. 3807-3814.

321. Zhou X.J. Gene-gene interaction of BLK, TNFSF4, TRAF1, TNFAIP3, and REL in systemic lupus erythematosus / X.J. Zhou, X.L. Lu, S.K. Nath et al. // Arthritis Rheum. - 2012. - V. 64. - N 1. - P. 222-231.

322. Zhu J. Differentiation of effector CD4 T cell populations / J. Zhu, H. Yamane, W.E. Paul // Annu. Rev. Immunol. - 2010. - V. 28. - P. 445-489.

323. Zhu J. T helper 2 (Th2) cell differentiation, type 2 innate lymphoid cell (ILC2) development and regulation of interleukin-4 (IL-4) and IL-13 production / J. Zhu // Cytokine. - 2015. - V. 75. - N 1. - P. 14-24.

324. Zhu K.J. Meta-analysis of IL12B polymorphisms (rs3212227, rs6887695) with psoriasis and psoriatic arthritis / K.J. Zhu, C.Y. Zhu, G. Shi et al. // Rheumatol. Int. - 2013. - V. 33. - N 7. - P. 1785-1790.