Эволюционная изменчивость гемагглютинина вирусов гриппа B, циркулировавших в России в период с 2004 по 2012 гг. тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.02.02, кандидат наук Прокопец, Александра Владимировна

• Прокопец, Александра Владимировна
• кандидат наук
• 2013

Оглавление диссертации кандидат наук Прокопец, Александра Владимировна

ОГЛАВЛЕНИЕ

ВВЕДЕНИЕ

Глава 1: ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1 Система глобального надзора за гриппом

1.2 Механизмы изменчивости вирусов гриппа В

1.2.1 Инсерции и делеции

1.2.2.Реассортанты

1.2.3 Межтиповая реассортация

1.3 Эволюция вирусов гриппа В Викторианской и Ямагатской линий

1.3.1 Антигенные свойства и распространение вирусов гриппа В Викторианской и Ямагатской линий в мире

1.3.2 Молекулярная эволюция гемагглютинина вирусов гриппа В

1.4 Рецепторная специфичность и системы выделения для вирусов гриппа В

1.5 ЗАКЛЮЧЕНИЕ

Глава 2: МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

2.1 Материалы

2.1.1 Вирусы

2.1.2 Сыворотки

2.1.3 Среды

2.1.4 Системы для выделения и накопления вирусов

2.2 Методы

2.2.1 Выделение вирусов гриппа

2.2.2 Выделение вирусов гриппа на клетках МЕ)СК

2.2.3 Накопление вируссодержащей культуральной жидкости

2.2.4 Накопление вируссодержащей аллантоисной жидкости

2.2.5 Выделение вирусов гриппа на куриных эмбрионах

2.2.6 Реакция гемагглютинации (РГА)

2.2.7 Реакция торможения гемагглютинации (РТГА)

2.2.8 Идентификация вируса

2.2.9 Получение гипериммунных крысиных антисывороток

2

2.2.10 Антигенный анализ

2.2.11 Антигенная картография

2.2.12 Молекулярно-биологические методы

2.2.12.1 Выделение вирусной РНК

2.2.12.2 Синтез кДНК и ПЦР

2.2.12.3 Секвенирование

2.2.12.4 Филогенетический анализ

2.2.13 Статистическая обработка результатов

Глава 3: СОБСТВЕННЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ

3.1 ЭВОЛЮЦИОННАЯ ИЗМЕНЧИВОСЬ ВИРУСОВ ГРИППА В

3.1.1 Интенсивность циркуляции и антигенный анализ вирусов гриппа В, выделенных в России в 2004-2012 гг

3.1.2 Циркуляция представителей 2-х эволюционных линий вирусов гриппа В в эпидемический сезон 2004-2005 гг. Появление возбудителей, подобных антигенному варианту В/Малайзия/2506/04 и их дальнейшее распространение в 2005-2007 гг

3.1.3 Распространение вирусов гриппа В Ямагатской линии, подобных эталонному штамму В/Бангладеш/3333/07- возбудителей эпидемии гриппа 2007-2008 гг

3.1.4 Антигенный дрейф вирусов гриппа В Викторианской линии, циркулировавших в 2008-2012 гг

3.1.5 Возвращение вирусов гриппа В Ямагатской группы в эпидемический сезон 2011-2012 гг

3.1.6 Изучение антигенных свойств вирусов гриппа В Ямагатской и Викторианской линий с использованием крысиных антисывороток, полученных к современным вирусам гриппа В, выделенным на куриных эмбрионах (КЭ) и культуре клеток МГ)СК (МБСК)

3.1.7 ЗАКЛЮЧЕНИЕ

3.2 СОВРЕМЕННЫЕ ПОДХОДЫ К ПРОВЕДЕНИЮ И ПРЕДСТАВЛЕНИЮ РЕЗУЛЬТАТОВ АНТИГЕННОГО АНАЛИЗА

3.2.1 Сравнение способности крысиных и хорьковых антисывороток выявлять антигенный дрейф у современных вирусов гриппа В в РТГА

3.2.2 Антигенные карты вирусов гриппа В Ямагатской и Викторианской линий 2004-2012 гг. выделения

3.2.3 ЗАКЛЮЧЕНИЕ

3.3 ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ГЕТЕРОГЕННОСТЬ ВИРУСОВ ГРИППА В

В ПЕРИОД С 2004 ПО 2012 гг

3.3.1 Молекулярно-генетическая характеристика вирусов гриппа В Викторианской линии разновидности В/Шандонг/7/97, В/Малайзия/2506/04 и В/Брисбен/60/08

3.3.2 Анализ аминокислотного состава НА вирусов гриппа В Ямагатской линии в период с 2004 по 2012 годы

3.3.3 Регистрация реассортантных штаммов вируса гриппа В

3.3.4 ЗАКЛЮЧЕНИЕ

ОБСУЖДЕНИЕ

ВЫВОДЫ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

ПРИЛОЖЕНИЕ

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Эволюционная изменчивость гемагглютинина вирусов гриппа B, циркулировавших в России в период с 2004 по 2012 гг.»

ВВЕДЕНИЕ

Актуальность темы.

Грипп и другие острые респираторные вирусные инфекции (ОРВИ) продолжают занимать первое место в структуре всех инфекционных заболеваний человека. Ежегодный экономический ущерб от гриппа в России, в среднем, составляет примерно 75-86% от экономических потерь, наносимых инфекционными заболеваниями. Масштабы гриппозных эпидемий выдвигают необходимость борьбы с этой инфекцией в число наиболее актуальных проблем современной медицины [Карпова JI.C. с соавт., 2010; Киселев О.И. с соавт., 2010; Львов Д.К. с соавт., 2010; Слёпушкин А.Н., 2003; Pariani et al., 2012; www.52.rospotrebnadzor.ru: www.who.int1.

Эпидемический процесс при гриппе, начиная с 1977 года характеризуется одновременной циркуляцией вирусов гриппа А двух антигенных подтипов и вируса гриппа типа В. Для вирусов гриппа В двух последних десятилетий характерно появление в циркуляции представителей антигенно отличных эволюционных ветвей - Викторианской (эталон В/Виктория/2/87) и Ямагатской (эталон В/Ямагата/16/88) [Иванова В.Т., 1998; Иванова В.Т. с соавт., 2003; Матюшина P.O., 2007; Kanegae et al., 1990; . Che et al., 2003; Hay et al., 2001; McCullers et al., 2004; Shih et al., 2005].

Дивергентный характер эволюции вирусов гриппа В отразился на интенсивности циркуляции этого возбудителя среди населения: если до 1988 года эпидемии гриппа В регистрировались примерно один раз в 3-4 года, то в настоящее время они возникают практически ежегодно [Иванова В.Т., 1998; Литвинова О.М. с соавт., 2001; Коновалова Н.И., 2009; Belshe, 2010; Hemphill et al., 2003].

Удельный вес вирусов гриппа В в этиологической структуре гриппозных эпидемий в различных странах довольно высок [Иванова В.Т. с

5

соавт., 2009; Львов Д.К. с соавт., 2010; Соминина А.А. с соавт., 2012; Belshe, 2010; Camillioni et al., 2010; Chan et al., 2004; Dapat et al., 2009; Goni et al., 2007; Jian et al., 2008], а заболевания, вызываемые этими возбудителями, могут протекать тяжело не только у детей, но и у взрослых, сопровождаясь развитием большого числа осложнений [Афанасьева О.И., 2009; Ambrose & Levin, 2012; Hite et al., 2007; Liu et al., 2012; Peltola et al., 2003; Seale et al., 2009; Zaraket et al., 2009].

Причиной постоянной циркуляции вирусов гриппа среди населения являются непрерывные антигенные изменения этих возбудителей преимущественно в молекуле гемагглютинина (НА). Вирусы гриппа В не имеют природного резервуара, поэтому не способны к реассортации с вирусами гриппа животных и не вызывают пандемий, а их успешное выживание происходит за счет смены представителей 2-х эволюционных ветвей и возникновения реассортантов между ними [Lindstrom et al., 1999; Nerome et al., 2002; Ivshina et al., 2004; McCullers et al., 2004; Chi et al., 2005; Shih et al., 2005].

Выраженная изменчивость вирусов гриппа затрудняет создание эффективных лечебных, профилактических и диагностических средств. Этим обусловлена важность непрерывного этиологического мониторинга, изучения процессов эволюционной изменчивости возбудителей гриппозной инфекции, проводимых на базе Национальных центров по гриппу [Соминина А.А. с соавт., 2012; Ambrose & Levin, 2012; Belshe, 2010].

В связи с вышеизложенным изучение особенностей циркуляции вирусов гриппа В, их антигенных и молекулярно - биологических свойств является актуальным и имеет не только теоретический интерес, но и важно с практической точки зрения.

Цель исследования: изучение антигенных и молекулярно-биологических свойств вирусов гриппа В, циркулировавших в России в

период с 2004 по 2012 гг., и выявление направления изменчивости у представителей 2-х эволюционных ветвей этого возбудителя.

Задачи исследования.

1. Определить удельный вес вирусов гриппа В в структуре вирусной популяции в эпидемические по гриппу сезоны в России в период с 2004-2012 гг.

2. Изучить антигенные свойства гемагглютинина российских вирусов гриппа В 2004-2012 гг. выделения, определить их эволюционные связи с эталонными и эпидемическими штаммами, циркулировавшими в мире в разные годы.

3. Определить основные аминокислотные позиции в молекуле гемагглютинина, изменения в которых повлияли на антигенные свойства современных российских вирусов гриппа В с помощью серологических и молекулярно-генетических методов.

4. Выявить направленность антигенного дрейфа вирусов гриппа В Викторианской и Ямагатской разновидностей, циркулировавших в России в период с 2004-2012 гг.

5. Адаптировать метод антигенной картографии для анализа эволюционной изменчивости современных российских изолятов вируса гриппа В с использованием крысиных сывороток.

Научная новизна работы.

Впервые проанализировано свыше 900 штаммов вируса гриппа В, изолированных на территории России в 49 опорных базах Национального центра по гриппу на базе ФГБУ «НИИ гриппа» Минздрава России в период с 2004 по 2012 гг. Продемонстрирована смена представителей эволюционных ветвей за 8 эпидемических сезонов. Определено преобладание вирусов

7

гриппа В Викторианской разновидности в период с 2004 по 2012 годы с достоверностью Р=0,95. Определены направления изменчивости представителей 2-х эволюционных ветвей этого возбудителя.

Зарегистрирована циркуляция на территории России реассортантного вируса гриппа В - штамма В/С.Петербург/14/06, содержащего НА Викторианской и ЫА Ямагатской ветвей, а также реассортантов между филогенеическими группами «Малайзия/2506» и «Брисбен/60» внутри одной (Викторианской) ветви - штаммов В/С.Петербург/27/12 и

В/С.Петербург/44/12.

Впервые в России был применен метод антигенной картографии для анализа эволюционной изменчивости современных вирусов гриппа В Ямагатской и Викторианской групп, показана возможность использования крысиных сывороток.

Практическая значимость работы.

В период с 2004 по 2012 гг. производилась изоляция и идентификация вирусов гриппа, на основании которых была определена этиология эпидемий гриппа в России. В результате проведенных исследований проведено типирование свыше 900 вирусов гриппа В. Изучение антигенных и молекулярно-биологических свойств этих изолятов позволило установить основные направления изменчивости представителей двух эволюционных ветвей, что важно для заблаговременного обновления штаммового состава гриппозных диагностикумов и вакцин.

Установлено несоответствие вакцинных штаммов, рекомендованных Всемирной организацией здравоохранения, подготовленных на основе референс-вирусов В/Шанхай/361/02, В/Малайзия/2506/04, В/Флорида/4/06 циркулировавшим изолятам в 2005-2006, 2007-2008, 2008-2009 эпидемических сезонах

[www.hpa.org.uk/web/HP Aweb&HPAwebStandard/HPAweb_C/l 195733812968# north0506].

В рамках сотрудничества со Всемирной организацией здравоохранения (ВОЗ) 125 вирусов гриппа В за восьмилетний период передано в референс-лаборатории (CDC&P, Атланта, Джорджия, США и NIMR, Лондон, Англия) с целью международного мониторинга за гриппом, два из которых -В/Челябинск/306/07 и В/Новосибирск/2/12 были выбраны ВОЗ в качестве репрезентативных штаммов [MRC., National Institute for Medical Research., WHO Influenza Centre., 2007. - http://www.nimr.mrc.ac.Uk/wic/report/l.

На основании проведенных исследований 6 изолятов (В/Хабаровск/14/05, В/Астрахань/1/07, В/СПб/40/09 - вирусы Викторианской линии, В/Хабаровск/36/05, В/Флорида/4/06, В/Висконсин/1/10 - вирусы Ямагатской линии) были выбраны и использованы в качестве диагностических штаммов в коммерческих наборах, изготовляемых ООО «ППДП».

Основные положения, выносимые на защиту.

1. На территории России в период с 2004 по 2012 годы ежегодно циркулировали вирусы гриппа В одновременно с вирусами гриппа А, удельный вес вирусов гриппа В в составе вирусной популяции колебался от 8 до 50,3% и составил, в среднем, 1/3 (939 штаммов) от общего количества (2817 штаммов) выделенных вирусов гриппа.

2. За исследуемый период наблюдалась как поочередная, так и одновременная циркуляция в течение одного эпидемического сезона представителей двух эволюционных ветвей вируса гриппа В -Ямагатской и Викторианской. Выявлена более активная циркуляция на территории России вирусов гриппа В Викторианской линии.

3. Определены аминокислотные позиции в НА1, изменения в которых повлияли на антигенные характеристики вирусов. Аминокислотные

замены затронули все известные для вирусов гриппа В антигенные сайты: 120-петля, 150-петля, 160-петляи 190-спираль.

4. Для вирусов гриппа В Ямагатской и Викторианской линий выявлены антигенные сайты, наиболее подверженные позитивной селекции, это 150-петля и 160-петля у Ямагатской группы, 120-петля и 160-петля у Викторианской группы.

5. Использованный для анализа современных российских вирусов гриппа В модифицированный метод антигенной картографии позволяет наглядно оценить эволюционные тенденции в изменчивости большого количества вирусных изолятов.

Личный вклад автора состоит в самостоятельном выполнении работы по типированию и изучению антигенных свойств вирусов, анализу первичных последовательностей молекулы НА, построению антигенных карт. Секвенирование штаммов и филогенетический анализ выполнены сотрудниками лаборатории молекулярной вирусологии и генной инженерии НИИ гриппа. Все материалы, представленные в диссертационной работе, обобщены и проанализированы автором.

Все исследования входили в плановую научную тематику лаборатории эволюционной изменчивости вирусов гриппа ФБГУ «НИИ гриппа» МЗ РФ и были поддержаны международным грантом МНТЦ № 3070 «Дальнейшее усовершенствование надзора за гриппом в России. Вклад в глобальную подготовку к пандемии гриппа».

Апробация материалов диссертации. Материалы диссертации были представлены на Седьмой Всероссийской медико-биологической конференции молодых исследователей «Человек и его здоровье» СПб., 2004 г.; Международной научной конференции «Актуальные вирусные инфекции - теоретические и практические аспекты» СПб., 2004 г.; конференции "Preparedness to the influenza pandemic - an international outlook" СПб., 2007.;

«Актуальные вопросы клинической и экспериментальной медицины» СПб., 2008 г.; Всероссийском Конгрессе по инфекционным болезням СПб., 2009 г.; Options for the control of influenza VII, Hong Kong, China, 2010 г.; 2-nd International Influenza Meeting, Munster, Germany, 2010 г.; на X научно-практической конференции МЧС РФ «Проблемы прогнозирования чрезвычайных ситуаций. Оценка рисков возникновения чрезвычайных ситуаций» Москва, 2010 г.; Всероссийской международной конференции молодых ученых «Проблемы биомедицинской науки третьего тысячелетия» СПб, 2010 г.; Всероссийской научной конференции молодых ученых, посвященной 120-летию НИИЭМ СЗО РАМН, СПб., 2010 г.. Результаты исследований были представлены Комиссии по вакцинным и диагностическим штаммам вируса гриппа и использованы в производстве вакцин и диагностических препаратов МЗ РФ.

Публикации. По результатам диссертации опубликовано 16 печатных работ, в том числе 5 статей в журналах, рекомендованных ВАК, 11 тезисов докладов на конференциях.

Структура и объем диссертации. Диссертация состоит из введения, обзора литературы, описания материалов и методов, 3 глав собственных исследований, их обсуждения и выводов. Список литературы включает 156 источников. Из них 42 на русском и 114 на иностранных языках. Диссертация изложена на 178 страницах машинописного текста, включая 20 таблиц и 10 рисунков.

Глава 1: ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

Роды Influenzavirus А, Influenzavirus В И Influenzavirus С

подразделяются на основании отсутствия антигенной кросс-реактивности между внутренними белками. Вирусы гриппа В поражают в основном человека и в редких случаях морских млекопитающих. Они не имеют природного резервуара и различных типов НА и NA, поэтому не способны к реассортации с вирусами гриппа животных, следовательно, не обладают пандемическим потенциалом. Основным механизмом изменчивости для вирусов гриппа В является антигенный дрейф.

Вирусы гриппа В обладают дивергентным характером эволюции. С 1988 года в мире циркулируют 2 эволюционные ветви. Эталон В/Виктория/2/87 стал родоначальником Викторианской линии, а эталонный штамм В/Ямагата/16/88 - Ямагатской.

1.1 Система глобального надзора за гриппом

Система глобального надзора за гриппом была создана в 1952 году и объединяет 83 страны. Всемирной организацией здравоохранения (ВОЗ) было принято решение о создании сети вирусологических лабораторий для изучения вируса гриппа с целью снижения заболеваемости и смертности от этой инфекции, а также для подготовки к следующей пандемии. В программе ВОЗ задействовано 110 национальных лабораторий, в обязанности которых входит первичная характеристика изолятов и передача их в один из сотрудничающих с ВОЗ центров [Соминина с соавт., 2012].

В России существуют два Национальных центра: в Санкт - Петербурге

на базе ФГБУ «НИИ гриппа» Минздрава России и в Москве на базе ФГБУ

«НИИ вирусологии им. Д.И. Ивановского» Минздрава России. НИИ гриппа

был организован академиком A.A. Смородинцевым в марте 1967 года. На

базе института был создан Национальный центр по гриппу (НЦГ),

12

признанный ВОЗ в 1971 году одним из участников Глобальной сети надзора за гриппом. Деятельность НЦГ при НИИ гриппа основана на взаимодействии с 49 опорными базами (ОБ) в составе ФГБУ "Центры гигиены и эпидемиологии", расположенных в различных регионах РФ. Основная задача Национальных центров и ОБ - обеспечение оперативного эпидемического надзора за ситуацией по гриппу в глобальном масштабе, определение заноса эпидемий (пандемий) на территорию России, лабораторная расшифровка их этиологии с целью своевременной организации и проведения противоэпидемических и лечебно-профилактических мероприятий среди населения [Маринич и др., 2003; Слепушкин, 2003; Соминина и др., 2012].

1.2 Механизмы изменчивости вирусов гриппа В

Вирусы гриппа являются наиболее распространенными возбудителями инфекционных заболеваний человека. Они принадлежат к семейству Orthomyxoviridae, в которое входит еще пять родов, из которых три рода -вирусы гриппа А, В и С (соответственно роды influenzavirus а, Influenzavirus В, Influenzavirus с) [Медицинская вирусология, 2008].

Вирусы гриппа очень быстро эволюционируют, причем наиболее вариабельными являются поверхностные белки вируса НА и NA. Внутренние белки (в частности, NP и матриксный белок М) подвергаются меньшей изменчивости и являются относительно консервативными.

Гемагглютинин является мишенью для вируснейтрализующих антител, играющих основную роль в защите от гриппозной инфекции. В настоящее время известно 17 антигенных подтипов НА вируса гриппа A [Sun et al., 2013].

Антитела к нейраминидазе не нейтрализуют вирус (если не вводятся в очень высоких концентрациях), однако, они значительно замедляют освобождение вируса из инфицированных клеток. В настоящее время

известно 10 антигенных подтипов нейраминидаз. [Грипп: эпидемиология, диагностика лечение и профилактика, 2012].

В отличие от вирусов гриппа А, вирусы гриппа В содержат только один тип гемагглютинина и нейраминидазы. Вирусы гриппа В поражают в основном человека и в редких случаях морских млекопитающих [Osterhaus et al., 2000].

Для вирусов гриппа В не характерен такой вид антигенной изменчивости, как шифт, в основе которого лежит реассортация генов, кодирующих поверхностные и внутренние белки, относящихся к различным подтипам вируса гриппа А. Результатом антигенного шифта у вирусов гриппа А является появление так называемых пандемических вирусов [Palese & Bouvier, 2008; Treanor, 2004, Киселев с соавт., 2010; Киселев, 2011].

Основным механизмом изменчивости вирусов гриппа В является антигенный дрейф. Антигенный дрейф обусловлен точечными мутациями, делециями и инсерциями, приводящими к аминокислотным изменениям белков вируса, а, следовательно, и к изменению его антигенных свойств [Nakagawa N.et al., 2001; Nerome et al., 1998; Nerome et al., 2002; Verhoeyen M. et. al., 1983].

Мутации возникают в результате ошибок при репликации вирусного генома. Примерно 10% вирусного потомства в каждом репликационном цикле рибонуклеиновой кислоты имеют мутации. Направленный отбор в вирусной популяции происходит под действием антител в организме хозяина [Ferguson N.M. et al., 2003; Moorman J.P., 2003]. Степень влияния аминокислотных мутаций на антигенные свойства вируса зависит от их количества, локализации и качественных характеристик аминокислотных замен.

Отдельные гены вируса гриппа накапливают мутации с постоянной скоростью, что позволило ввести термин «молекулярные часы» вируса гриппа [Kendal et.al., 1990].

Скорость эволюции гена, кодирующего НА и НА1 белка у вирусов гриппа В ниже, чем у вирусов гриппа A(H3N2), но выше, у чем A(H1N1) [Belshe, 2010; Hay et al.. 2001; Chen & Holmes., 2008; Chi et al., 2005; Kristal et al., 1983; McCullers et al., 1999 Иванова В.Т. с соавт., 2001]. Nobusawa и Sato предполагают, что меньшая скорость мутаций у вируса гриппа В может быть связана с более «точной» работой его полимеразного комплекса [Nobusawa and Sato, 2006; Chen & Holmes. 2008].

После формирования двух антигенно различных Ямагатской и Викторианской групп вируса гриппа В в 1988 году, штаммы Викторианской линии были изолированы повсеместно в период с 1987 по 1989 годы, в то время как вирусы Ямагатской линии доминировали в 90-х гг. [Гринбаум и др., 1994; Иванова и др., 1993; Иванова В.Т. с соавт., 2001; Ларионова Н.В. с соавт., 2006; Ambrose C.S. & Levin M.J., 2012; Barr et al., 2006; Hemphill M.L. et al., 1993]. Возможно, в различные периоды времени дрейфовые изменения в молекуле НА1 у вирусов Ямагатской и Викторианской линий происходят с разной скоростью. Так, по данным McCullers и соавторов [McCullers et al., 2004], изменения в НА1 вирусов гриппа В Ямагатской линии в период 19901999 годы происходили быстрее, чем в НА1 Викторианской линии, как на аминокислотном, так и на нуклеотидном уровнях. Скорость эволюции для НА1 вируса гриппа В Ямагатской ветви составляла 3,3x10' аминокислотных замен в год, для НА вируса гриппа В Викторианской ветви - 2,13x10"3 аминокислотных замен в год. Большинство аминокислотных замен происходит в областях, соответствующих антигенным сайтам гемагглютинина вируса гриппа А НЗ - А, В, D и Е [Tsuchiya et al., 2001].

1.2.1 Инсерции и делеции

Предполагают, что наиболее важным механизмом изменчивости для вирусов гриппа В являются систематические инсерции и делеции. В глобулярной части молекулы НА нуклеотидные делеции и инсерции

15

особенно часто встречаются в положениях 532-540 и приводят к аминокислотным заменам. Такое явление обладает цикличностью [Nakagawa et al., 2001; Nerome et al., 1998; Nerome et al., 2002; Verhoeyen et. al., 1983].

Механизм ротации делеций-инсерций хорошо объясняет появление Ямагатского штамма в 1988 году. С учетом ротации по делециям/инсерциям в 1988 году эволюционные пути разошлись в двух направлениях. У изолятов 1988-1996 года Ямагатской группы наблюдается 6 нуклеотидных делеций, а у изолятов 1993-1997 года Викторианской группы в положениях 532-534 и 538-540 есть все нуклеотиды. Шесть делеций у штаммов 1988 года указывает на их происхождение от минорной ветви Ямагатской группы с репрезентативным штаммом B/England/222/82, обладающим делецией в 6 нуклеотидов.

Цикличность инсерций/делеций может играть важную роль в модификации изменчивости вирусов гриппа В. Это может быть одним из механизмов для выживания вирусов гриппа В в течение долгого времени, несмотря на то, что они обладают одним типом НА и NA [Nerome et al., 2002]. Для вирусов гриппа типа А такой механизм изменчивости как систематические инсерции и делеции не типичен и обнаружен только у одного из лабораторных вариантов штамма A/PR/8/34.

1.2.2 Реассортанты

Теоретически возможно предположить, что у реассортантов существует некоторое селективное преимущество за счет изменения анигенных свойств или обладания новой NA, что приводит к преимуществу такой комбинации при распространении вируса. Следовательно, при оценке эволюции вируса гриппа важно принимать во внимание не только НА, но и другие гены, в частности, NA [McCullers et al., 1999].

Одним из механизмов избегания иммунного ответа хозяина является

социркуляция нескольких антигенных вариантов в один эпидемический

16

сезон [Nerome et al., 2002]. С появлением 2-х антигенно различных групп зарегистрировано много случаев реассортации между антигенными вариантами вирусов гриппа В [Lindstrom et al., 1999; Литвинова и др., 2001; Ivshina et al., 2004; McCullers et al., 2004; Chi et al., 2005; Shih et al., 2005]. Реассортантные вирусы стали регистрировать еще в 1990-х годах [Tsai et al., 2006].

В течение начала-середины 1990-х реассортантные вирусы, обладающие Ямагатским НА и Викторианской NA такие, как B/Johannesburg/15/94, циркулировали в различных частях мира, их циркуляция продолжалась несколько лет [Hay et al., 2001; Tsai et al., 2006]. Так, в период с 1989 по 1997 в США был выделен ряд реассортантных вирусов гриппа В, у которых НА принадлежал к В/Ямагата/16/88-подобным штаммам, a NA к эталону В/Виктория/2/87. Один вирус - В/Мемфис/3/93 обладал НА, принадлежащим вирусу В/Пекин/93, a NA подобной вирусу В/Виктория/2/87 [McCullers et al., 1999].

Случаи реассортации регистрировались вновь в 2001 году вследствие появления и широкого распространения в 2002 году вирусов Викторианской линии [WHO, 2004; Chi et al., 2003; Li et al., 2008; Tsai et al., 2006]. Однако, появившиеся реассортантные штаммы обладали уже Викторианским НА и Ямагатской NA. В течение 2002 года реассортантные вирусы были широко распространены. Появившийся в 2002 году вирус В/Тегеран/80/02 доминировал в течение 2003 года. Гемагглютинин штамма был более близок к НА вируса В/Шандонг/7/97, чем к вирусу В/Гонконг/330/01, a NA близка к NA штамма В/Сычуань/379/99-подобным вирусам [Lin et al., 2004; Xu et al., 2004]. Эти две различные генетические реассортантные варианты демонстрируют стратегии для эволюции вирусов гриппа В в природе [Tsai et al., 2006].

Для вирусов гриппа В характерна реассортация и по внутренним генам [Li et al., 2008; Lin et al., 2004; Matsuzaki et al., 2004; McCullers et al., 2004; Nakagawa et al., 2008; Nerome et al., 2002; Xu et al., 2004], которая может

17

происходить как между эволюционными группами, так и внутри группы. В работе McCullers с соавторами была проанализирована структура генов вирусов, изолированных в период с 1979 по 2003 годы. Линию I представляют все ранние вирусы и их гены до дивергенции, линию II -Ямагата-подобный НА и все гены этой группы, линию III - Виктория-подобный НА и все гены этой группы. При филогенетическом анализе и построении филогенетических деревьев в качестве примера линии I был выбран вирус В/Россия/69, линии II - вирус В/Ямагата/16/88, линии III -вирус В/Виктория/2/87 [McCullers et al., 2004]. На основании анализа 32 штаммов можно выделить как минимум 15 генотипов (рис.1).

Из этих комбинаций становится очевидно, что реассортация вирусов гриппа В исключительно широко распространена. Из 256 возможных комбинаций для Ямагатской линии известны 47. При этом не встречаются вирусы, у которых ген NP Викторианской линии сочетается с генами РВ2, NA и М Ямагатской линии; ген РВ1 Викторианской линии не встречается с генами РВ2, РА, НА, NP, NA и М Ямагатской линии [McCullers et al., 2004; Nerome et al., 2002].

Существует предположение, что вирусы гриппа В «выжили» за счет частой реассортации внутренних генов между 2-мя эволюционными ветвями. Возникновение большинства новых филогенетических групп связано с реассортацией, которая может включать в себя родительские вирусы из различных антигенных линий (Ямагатской или Викторианской) или одной линии. Более того, некоторые реассортанты включают в себя новую комбинацию сегментов НА и NA с потенциально важным влиянием на распространение вируса. Например, группа вирусов В/Брисбен/32/02 (Викторианская ветвь) является реассортантами, сочетающими сегменты РВ1, РВ2, НА и NP, принесенные из этой линии от В/Шандонг/7/97-подобных вирусов, а РА, сегменты NA, М и NS, унаследованы от В/Сычуань/379/99-подобных вирусов Ямагатской линии [Chen & Holmes, 2008].

Линия I

B/Russia/69

B/Singapore/222/79 B/Norway/1/84 B/Yam/16/88 B/Memphis/3/89 B/Houston/1/91

B/Guandong/8/93 B/Memphis/5/93 B/Guandong/5/93 B/Nanchang/6/96

B/Nanchang/630/94 B/Beijing/243/97 B/Los Angeles/1/02 B/Chiba/447/98 B/Memphis/13/03

Рисунок 1. Генотипы вирусов гриппа В [по материалам McCullers J. А. et al., 2004].

Не все изменения в антигенной группе могут быть связаны с

реассортацией. Например, прямая филогенетическая связь между антигенно

отличными В/Пекин/184/93-подобными и В/Панама/45/90-подобными

вирусами показывает, что они эволюционировали в результате дрейфа без

19

помощи реассортации, а В/Малайзия/2506/04-подобные вирусы произошли напрямую от группы В/Гонконг/330/01-подобных вирусов (хотя последний вирус сам является реассортантом) [Chen & Holmes, 2008].

1.2.3 Межтиповая реассортации

Хотя вирусы гриппа А и В социркулируют в человеческой популяции, межтиповых реассортантов в природе обнаружено не было [Wanitchang et al., 2012]. В лабораторных условиях проводились попытки создания реассортантов А/В типа. Так, в работе Flandorfer с соавторами был предложен рекомбинант вирусов гриппа A/WSN/33 (WSN), несущих NA вируса гриппа В/Ямагата/16/88. Также сконструирован рекомбинант вируса гриппа А, экспрессировавший химерный НА, в котором эктодомен получен из НА вируса В/Ямагата/16/88, тогда как цитоплазматический и трансмембранный домены получены из НА вируса A/WSN/33. Таким образом, отсутствие реассортации в природе между вирусами гриппа А и В не может быть объяснено несовместимостью гликопротеинов. Возможно, единственным объяснением этому феномену может быть функциональная несовместимость транскрипции и репликации РНК между вирусами гриппа А и В [Flandorfer et al., 2003].

В работе Iwatsuki-Hiromoto с соавторами [Iwatsuki-Hiromoto et al., 2008] был сконструирован полимеразный комплекс А/В типа, содержащий РВ1, РВ2, РА и нуклеопротеин каждого из 2-х вирусных типов и была оценена их полимеразная активность с промотором А типа. По результатам исследования можно говорить об ограниченной совместимости между полимеразными компонентами обоих типов.

Были идентифицированы регионы в генах РНК вирусов гриппа типа А, которые являются необходимыми для их включения в вирионы. Возможно, несовместимость в этих последовательностях между сегментами вирусной

РНК отвечает за отсутствие межтиповых реассортантов в природе [Iwatsuki-Hiromoto et al., 2008].

Таким образом, с одной стороны реассортация может приводить к появлению более стабильных и инфекционных генотипов. Реассортантные филогенетические группы часто становятся доминантными в вирусной популяции, подтверждая, что реассортация может иногда влиять на вирусное распространение [Chen & Holmes, 2008]. С другой стороны, реассортация случайна и не направлена. Этот вывод подтверждается существованием сравнительно большого числа возможных комбинаций генов вируса [McCullers et al., 2004].

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Прокопец, Александра Владимировна, 2013 год

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

1. Афанасьева О.И. Клиника, иммунопатогенез и противовирусная терапия современного гриппа у детей: дис. док. мед. наук: 2012 / О.И. Афанасьева. - СПб, 2012. - 259 с.

2. Беляев А.Л., Слепушкин А.Н., Феодоритова Е.Л. Эпидемическая ситуация по гриппу и ОРВИ в сезоне 2005-2006 гг. // Здравоохранение. -2006. -№10. - С.157-164.

3. Бурцева Е.И, Иванова В.Е., Оскерно Т.А., Слепушкин А.Н. Свойства вирусов гриппа А и В, выделенных на куриных эмбрионах и в культуре клеток МОСКУ/Вопр. вирусол. - 2001. - Т. 46.№1 - С. 29-33.

4. Бурцева Е.И., Шевченко Е.С., Ленева И.А., Меркулов Л.Н., Оскерко Т.А., Шляпникова О.В., Заплатников А.Л., Шустер A.M., Слепушкин А.Н. Чувствительность к ремантадину и арбидолу вирусов гриппа, вызвавших эпидемические подъемы заболеваемости в России в сезоне 2004-2005 гг. // Вопр. вирусол. - 2007. - Т.52. №2 - С.24-29.

5. Выделение вирусов гриппа в клеточных культурах и куриных эмбрионах и их идентификация: Метод, рекомендации. Соминина A.A., Бурцева Е.И., Лобова Т.Г. и др. М.: 2006.

6. Говоркова Е. А. Селекция клетками хозяина антигенных вариантов гемагглютинина вируса гриппа и выбор оптимальных систем для культивирования //Вопр. вирусол. - 1999. - Т.44.№ 5. - С. 199-206.

7. Гринбаум Е.Б., Литвинова О.М., Банников А.И. и др. Полиморфизм популяции современных вирусов гриппа А и В человека // Вестник РАМН. -№9/2.- 1994. -С.36-40.

8. Грипп и другие респираторные вирусные инфекции: эпидемиология, профилактика, диагностика и терапия / Под ред. О.И. Киселева, И.Г. Маринича, A.A. Сомининой - СПб., 2003. - с. 244.

9. Иванова В.Т. Особенности эволюции вирусов гриппа в период 19861998 гг. (циркуляция, молекулярно-биологические свойства, структура): Автореф. дис. д-ра биол. наук.- Москва, 1998.-55с.

10. Иванова В.Т., Бурцева Е.И., Слепушкин А.Н. и др. Распространение и свойства эпидемических штаммов вирусов гриппа А и В, вызвавших подъемы заболеваемости в России в 1999-2002 гг. // Вопр. вирусол. - 2003. -Т.48.№4. - С.11-15.

11. Иванова В.Т., Бурцева Е.И., Слепушкин А.Н., Оскерко Т.А., Загорская Ю.В., Шевченко Е.С., Машкова С.А., Феодоритова Е.Л. Особенности вирусов гриппа, обусловивших эпидемический подъем заболеваемости в России в 2002-2003 гг. Возврат циркуляции вирусов гриппа, подобных В/Виктория/2/87 // Вопр. вирусол. - 2004. - Т.49.№3. - С. 12-17.

12. Иванова В.Т., Курочкина Я.Е., Бурцева Е.И. и др. Распространение и биологические свойства эпидемических штаммов вирусов гриппа А и В, циркулировавших в сезон 2006-2007 гг. в России // Вопр. вирусол. - 2008. -Т.53.№5. - С. 19-23.

13. Иванова В.Т., Матюшина P.O., Слепушкин Е.И. и др. Эпидемические штаммы вирусов гриппа А и В в сезоне 2005-2006 гг. в России // Вопр. вирусол. - 2008. - №4. - С. 13-18.

14. Иванова В.Т., Ракутина P.O., Слепушкин А.Н. и др. Свойства эпидемических штаммов вирусов гриппа А и В, циркулировавших в эпидемическом сезоне 2004-2005 гг. в России // Вопр. вирусол. - 2006. -Т.51.№6. - С.27-30.

15. Иванова В.Т., Слепушкин А.Н., Бурцева Е.И. и др. Эволюция вирусов гриппа В в конце XX века // Вопр. вирусол. - 2001. -Т.46.№6. - С.7-11.

16. Иванова В.Т., Трушакова C.B., Оскерко Т.А. и др. Характеристика циркулировавших в России в сезон 2007-2008 гг. эпидемических штаммов вирусов гриппа А и В // Вопр. вирусол. - 2009. - Т.54.№5. - С.28-33.

17. Иванова В.Т., Яхно М.А., Оскерко Т.А., Голубева Л.И., Джапаридзе Н.И., Слепушкин А.Н. Характеристика эпидемических штаммов вирусов гриппа В, вызвавших эпидемию 1990-1991 гг. в СССР // Вопр. вирусол. -1993. -№2. - С.83-85.

18. Каверин Н.В., Руднева И.А., Тимофеева Т.А., Игнатьева A.B. Антигенная структура гемагглютинина вируса гриппа А // Вопр. вирусол. -2012. -Приложение 1. Специальный выпуск, посвященный 120-й годовщине со дня открытия вирусов русским ученым Д.Н. Ивановским - С.148-158.

19. Карпова Л.С., Маринич И.Г., Смородинцева Е.А., Столяров К.А. Особенности эпидемий в сезон 2005-2006 годов // Эпидемиол. и вакцинопроф. - 2007. - №2(33). - С.6-9.

20. Карпова Л.С., Маринич И.Г., Столяров К.А., Поповцева Н.М. Анализ эпидемии гриппа А/Калифорния/07/2009 (HlNl)v в России в сезон 2009-2010 гг. // Эпидемиол. и вакцинопроф. - 2010. - №52(3). - С.23-30.

21. Киселев О.И. Геном пандемического вируса гриппа A/H1N1-2009.-M.: Издательство «Димитрейд График Групп», 2011. - 164 с.

22. Киселев О.И., Ершов Ф.И., Быков А.Т., Покровский В.И. Пандемия гриппа 2009/2010: противовирусная терапия и тактика лечения.-СПб.: Издательство «НИИ гриппа СЗО РАМН», 2010. - 97 с.

23. Коновалова Н.И. Эволюционная изменчивость вирусов гриппа А, циркулировавших в России в 1997-2007 гг: Автореф. дис. канд. мед.. наук.-Санкт-Петербург, 2007. - 30с.

24. Коновалова Н.И., Еропкин М.Ю., Гудкова Т.М. и др. Этиологическая характеристика эпидемий гриппа 2006-2009 гг. в Российской Федерации (по данным НИИ гриппа СЗО РАМН) // Вопр. вирусол. - 2010. -Т.55.№4. - С.9-16.

25. Ларионова Н.В., Киселева И.В., Исакова И.Н. и др. Фенотипические особенности эпидемических штаммов вируса гриппа типа В, выделенных в разные годы // Вопр. вирусол. - 2006. -Т.51.№5. - С.38-42.

26. Литвинова О.М., Коновалова Н.И., Лобова Т.Г. Вирусологический анализ вирусов гриппа, циркулировавших в России в 1998-2004 гг. // Материалы международной научной конференции «Актуальные вирусные инфекции - теоретические и практические аспекты». СПб., 2-5 ноября 2004 г. -С.26.

27. Литвинова О.М., Смородинцева Е.А., Деева Э.Г., Лобова Т.Г., Коновалова Н.И. Этиология современного гриппа // Эпидемиол. и вакцинопроф. -2001. - №1. - С.5-9.

28. Лобова Т.Г., Прокопец A.B., Комиссаров А.Б. и др. Эволюционная изменчивость вирусов гриппа В, циркулировавших в Российской Федерации с 2005 по 2012 гг. // Вопр. вирусол. - 2012. -Т.57.№6. - С.22-26.

29. Львов Д.К., Бурцева Е.И., Лаврищева В.В. Информация Центра экологии и эпидемиологии гриппа Института вирусологии им. Д.И. Ивановского РАМН об итогах эпидемического сезона 2009-2010 гг. по

гриппу и ОРВИ (с 40-й недели 2009 г. по 22-ю неделю 2010 г.) в мире и в России // Вопр. вирусол. - 2011. - Т.56.№1. - С.44-49.

30. Львов Д.К., Бурцева Е.И, Щелканов М.Ю. и др. Распространение нового пандемического вируса гриппа A(HlNl)v в России // Вопр. вирусол. -2010. —Т.55. №2. - С.4-9.

31. Маринич И.Г., Карпова Л.С., Смородинцева Е.А. и др. Ситуация по гриппу в мире и в России во втором полугодии 2004 и в первом полугодии 2005 года // Эпидемиол. и вакцинопроф. - 2005. - №4(23). - С.8-13.

32. Маринич И.Г., Карпова Л.С., Сысоева Т.И., Пелих М.Ю. Ситуация по гриппу в мире и в России во втором полугодии 2007 - первом полугодии 2008 года // Эпидемиол. и вакцинопроф. - 2009. - №1(44). - С.8-14.

33. Маринич И.Г., Кондратьев В.А., Житенев Д.Ф. Организация и практическая реализация системы эпидемического надзора за гриппом и острыми респираторными заболеваниями (ОРЗ) в России // Грипп и другие респираторные вирусные инфекции: эпидемиология, профилактика, диагностика и терапия. - СПб., 2003. - С. 147-156.

34. Маринич И.Г., Соминина A.A., Карпова Л.С. и др. Информация о ситуации по гриппу в мире и России со второго полугодия 2002 г. по сентябрь 2003г. // Эпидемиол. и вакцинопроф. - 2003. -№6(13). - С. 13-20.

35. Матюшина P.O. Особенности современных эпидемических штаммов вирусов гриппа А и В: Автореф. дис. канд. мед.. наук.- Санкт-Петербург, 2007.-24с.

36. Медицинская вирусология: Руководство / Под ред. Д.К. Львова. - М: ООО «Медицинское информационное агентство», 2008. - с.656

37. Слепушин А.Н. Всемирная программа ВОЗ по эпидемиологическому надзору и борьбе с гриппом// Вопр. вирусол. - 2003. - Т.48.№ 1. - С. 46-48.

38. Смолоногина Т.А. Изучение формирования сывороточных антител к нейраминидазе сезонных, пандемического и потенциально пандемического вирусов гриппа А в эксперименте и клинических наблюдениях: дис. ...канд. биол. наук: защищена 23.12.09 / Т.А. Смолоногина. - СПб, 2011. - 191 с.

39. Соминина А.А., Грудинин М.П., Еропкин М.Ю. и др. Развитие надзора за гриппом в России в системе национального центра ВОЗ по гриппу // Вопр. вирусол. - 2012. - Т.57.№ 6. - С. 17-21.

40. Соминина А.А., Киселев О.И., Литвинова О.М. и др. Анализ эпидемии гриппа, сезон 2004-2005 гг., по результатам исследований выделенных вирусов и дифференциальной лабораторной диагностики ОРВИ // Грипп, гриппоподобные заболевания, их профилактика и лечение / Под ред. В.И. Покровского и др. - СПб., 2005. - С.39-56.

41. Соминина А.А., Киселев О.И., Маринич И.Г. и др. Этиологический мониторинг за гриппом и другими ОРЗ в России в сезон 2003-2004 годов // Эпидемиол. и вакцинопроф. - 2004. - №6(19). - С.5-11.

42. Соминина А.А., Лонская Н.И., Еропкин М.Ю. и др. К вопросу о штаммовой композиции гриппозных вакцин на предстоящий эпидемический сезон 2005 - 2006 годов // Эпидемиол. и вакцинопроф. -2005. - №4(23). - С.З-7.

43. Abed Y., Coulthart М.В., Li Y., Boivin G. Evolution of Surface and Nonstructural-1 Genes of Influenza В Viruses Isolated in the Province of Quebec, Canada, during the 1998-2001 Period // Virus Genes. - 2003. -№.27:2. - P. 125135.

44. Air G.M., Gibbs A.J., Laver W.G., Webster R.G. Evolutionary changes in influenza В are not primarily governed by antibody selection // Proc. Natl. Acad. Sci.- 1990. - V.87. - P.3884-3888.

45. Ambrose C.S., Levin M.J. The rationale for quadrivalent influenza vaccines // Human Vaccines and Immunotherapeutic. - 2012. - V.8. - P.81-88.

46. Annual report NIMR. August 2001 to July 2002: 4-5. Available at: http://www.nimr.mrc.ac.uk/documents/about/ANNUAL REPORT 200223.pdf [accessed on 25.03.2013].

47. Annual report NIMR. August 2003 to July 2004: 3-4. Available at: http://www.nimr.mrc.ac.uk/documents/about/annual_report_2003_2004.pdf [accessed on 25.03.2013].

48. Annual report NIMR. September 2005: 4 Available at: http://www.nimr.mrc.ac.ukydocuments/about/interimreport sep 2005.pdf [accessed on 25.03.2013].

49. Annual report NIMR. September 2006: 4-5. Available at: http://www.nimr.mrc.ac.ukydocuments/about/interim report sep 2006.pdf [accessed on 25.03.2013].

50. Annual report NIMR. March 2007: 18; 20. Available at: http://www.nimr.mrc.ac.uk/documents/about/interim report mar 2007.pdf [accessed on 25.03.2013].

51. Annual report NIMR. September 2007: 5; 20; 22. Available at: http://www.nimr.mrc.ac.uk/documents/about/interim report sep 2007.pdf [accessed on 25.03.2013].

52. Annual report NIMR. September 2008: 4-5; 19; 22. Available at: http://www.nimr.mrc.ac.uk/documents/about/interim report sept 2008.pdf [accessed on 25.03.2013].

53. Annual report NIMR. September 2009: 26; 29. Available at: http://www.nimr.mrc.ac.uk/documents/about/interim report sep 2009.pdf [accessed on 25.03.2013].

54. Annual report NIMR. September 2010: 6-7; 40-42; 48-50. Available at: http://www.nimr.mrc.ac.uk/documents/about/interim-report-sep-2010.pdf [accessed on 25.03.2013].

55. Annual report NIMR. February 2011: 5-6; 49-67; 59-61. Available at: http://www.nimr.mrc.ac.uk/documents/about/interim-report-feb-2011 .pdf [accessed on 25.03.2013].

56. Annual report NIMR. February 2012: 54-55; 57-58. Available at: http://www.nimr.mrc.ac.uk/documents/about/interim-report-feb-2012.pdf [accessed on 25.03.2013].

57. Annual report NIMR. September 2012: 7-9; 54-81. Available at: http://www.nimr.mrc.ac.uk/documents/about/Interim Report September 2012 2. pdf [accessed on 25.03.2013].

58. Ansaldi F., Bacilieri S., Amicizia D. et al. Antigenic characterization of influenza B virus with a new microneutralization assay: comparison to hemagglutination and sequence analysis // J. of Med. Virol. - 2004. - V.74. -P.141-146.

59. Barnett J.L., Yang J., Cai Z. et al. AntigenMap 3D: an online antigenic cartography resource // Bioinformatics. - 2012. - May 1; 28 (9): 1292-3.

60. Barr I.G., Komadina N., Durrant C. et al. Circulation and antigenic drift in human influenza B viruses in SE Asia and Oceania since 2000 // Communicable Deseases Intelligence. Quarterly report. - 2006. - V.30.№3. - P.350-357.

61. Belshe R. The need for quadrivalent vaccine against seasonal influenza // Vaccine. - 2010. - V.28S. - P.D45-D53.

62. Blyth .C.C., Foo H., van Hal S.J. et al. Influenza outbreaks during World Youth day 2008 mass gathering // Emerging Infect. Dis. - 2010. - V.16.№5. -P.809-815.

63. Boom R., Sol C.J.A., Salimans M.M.H. Rapid and simple method for purification of nucleic acid // J. of Clin. Microbiol. - 1990. - V.28.№3. - P.495-503.

64. Camillioni B., Neri M., Lepri E. et al. An influenza B outbreak during the 2007/2008 winter among appropriately immunized elderly people living in a nursing home // Vaccine. - 2010. - V.28. - P.7536-7541.

65. Chan C., Chan Y., Shieh H. et al. Philogenetic analysis of influenza B virus in Taiwan 1997 to 2001 // J. Microbiol. Immunol. Infect. - 2004. - V.37. - P.135-144.

66. Che X.S., Bolar T.V., Zhao P. et al. Cocirculation and Evolution of Two Lineages of Influenza B Viruses in Europe and Israel in the 2001-2002 Season // J. of Clinic. Microbiol. - 2003. - V.41 №12. - P.5770-5773.

67. Chen Z., Aspelund A., Jin H. Stabilizing the glycosylation pattern of influenza B hemagglutinin following adaptation to growth in eggs // Vaccine -2008. —V.26 — P.361-371.

68. Chen R., Holmes E.C. The Evolutionary Dynamics of Human Influenza B Virus // J. of Mol. Evol. - 2008. - V.66 - P.655-663.

69. Chen J.-M., Guo Y.-J., Wu K.-Y. et al. Exploration of the emergence of the Victoria lineage of influenza B virus // Arch. Virol. - 2007. - V.157. - P.415-422.

70. Chi X.S., Bolar T.V., Zhao P. Cocirculation and evolution of two lineages of influenza B viruses in Europe and Israel in the 2001-2002 season // J. of Clinic. Microbiol. - 2003. - V.41 №12. - P.5770-5773.

71. Chi X.S., Hu A., Bolar T.V. et al. Detection and Characterization of New Influenza B Virus Variants in 2002 // J. of Clinic. Microbiol. - 2005. - V.43 №5. -P.2345-2349.

72. Colman P.M., Varghese J.N., Laver W.G. Structure of the catalytic and antigenic sites of influenza virus NA // Nature. - 1983. - V.303. - P.41-44.

73. Dapat C., Saito R., Kyaw Y. et al. Epidemiology of human influenza A and B viruses in Myanmar from 2005 to 2007 // Intervirol. - 2009. - V.52. -P.310-320.

74. Ferguson N.M., Galvani A.P., Bush R.M. Ecological and immunological determinants of influenza evolution // Nature. - 2003. - V.422. - P.428-433.

75. Flandorfer A., Garcia-Sastre A., Basler C.F., Palese P. Chimeric Influenza A Viruses with a Functional Influenza B Virus Neuraminidase or Hemagglutinin // J. of Virol. - 2003. - V.77.№17. - P.9116-9123.

76. Goni N., Baz M., Ruchansky D. et al. Influenza B viruses isolated in Uruguay during the 2002-2005 seasons: Genetic relations and vaccine strain match //Virus Research. -2007. -V.123. -P.100-104.

77. Govorkova E.A., Murti G., Meignier B. et al. African Green Monkey Kidney (Vero) Cells Provide an Alternative Host Cell System for Influenza A and B Viruses // J. of Virol. -1996. - V.70.№8. - P.5519-5524.

78. Hay A.J., Gregory V., Douglas A.R., Lin Y.P. The evolution of human influenza viruses // Phil.Trans.R.Soc.Lond.B. - 2001. - V.356. - P.1861-1870.

79. Hemphill M.L., Rota P.A., Ivanova V.T. et al. Antigenic and genetic analyses of influenza type B viruses isolated in Russia, 1987-91 // Epidemiol. Infect. -1993. - V.l 11. -P.539-546.

80. Hensley S.E., Das S.R., Gibbs J.S. et al. Influenza A virus hemagglutinin antibody escape promotes neuraminidase antigenic variation and drug resistance // PLOS One. -2011. - Feb 22; 6(2): el5190.

81. HiromotoY., SaitoT., Lindstrom S. et al. Phylogenetic analysis of the three polymerase genes (PB1, PB2 and PA) of influenza B virus // J. of Gen. Virol. -2000. — V.81. - P.929-937.

82. Hite L.K., Glezen W.P., Demmler G.J., Monoz F.M. Medically attended pediatric influenza during the resurgence of the Victoria lineage of influenza B virus // International J. of Infec. Dis. - 2007. - V.l 1. - P.40-47.

83. Hoffmann E., Mahmood K., Chen Z. et al. Multiple Gene Segments Control the Temperature Sensitivity and Attenuation Phenotypes of ca B/Ann Arbor/1/66 // J. of Virol. - 2005. - V.79.№17. - P.l 1014-11021.

84. Ivshina A.V., Vodeiko G.M., Kuznetsov V.A. et al. Mapping of Genomic Segments of Influenza B Virus Strains by an Oligonucleotide Microarray Method //J. of Clin. Microbiol. -2004. -V.42 №12. -P.5793-5801.

85. Iwatsuki-Horimoto K., Hatta Y., Muramoto Y. et al. Limited compatibility between the RNA polymerase of influenza virus type A and B // Virus Research. -2008. - V.135. -P.161-165.

86. Jackson D., Elderfield R., Barclay W. Molecular studies of influenza B virus in the reverse genetics era // J. of Gen. Virol. - 2011. - V.92. - P. 1-17.

87. Jian J.-W., Chen G.-W., Lai C.-T. et al. Genetic and epidemiological analysis of influenza virus epidemics in Taiwan during 2003 to 2006 // J. of Clin. Microbiol. - 2008. - V.46 №4. - P.1426-1434.

88. Jian J.-W., Lai C.-T., Kuo C.-Y. et al. Genetic analysis evaluation of the reassortment of influenza B viruses isolated in Taiwan during the 2004-2005 and 2006-2007 epidemics // Virus Research. - 2008. - V. 131. - P.243-249.

89. Kanegae Y., Sugita S., Endo A. et al. Evolutionary Pattern of the Hemagglutinin Gene of Influenza B Viruses Isolated in Japan: Cocirculating Lineages in the Same Epidemic Season // J. of Virol. - 1990. - V.64.№6. -P.2860-2865.

90. Kendal A. P., Cox N. J., Harmon M. Antigenic and genetic variation of influenza A(H1N1) viruses // Applied virology research. Plenum Publishing Corporation. 1990. -V. 2. - P. 131-141.

91. Kinnunen L., Ikonen N., Poyry T., Pyhala R. Evolution of influenza B/Victoria/2/87-like viruses: occurrence of a genetically conserved virus under conditions of low epidemic activity // J. of Gen.Virol. - 1992. - V.73. - P.733-736.

92. Krystal M, Elliott R.M., Benz E.W. et al. Evolution of influenza A and B viruses: Conservation of structural features of the hemagglutinin genes // Microbiol. - 1982. - V.79. - P.4800-4804.

93. Krystal M., Young J., Palese P.et al. Sequential mutation in hemagglutinin of influenza B virus isolates: Definition of antigenic domains // Microbiol. - 1983. - V.80. -P.4527-4351.

94. Li W., Shih S., Huang Y. et al. Clinical and genetic characterization of severe influenza B-associated diseases during an outbreak in Taiwan // J. of Clin. Virol. - 2008. - V.42. - P.45-51.

95. Lin J., Chiu S., Shaw M.W. et al. Characterization of the epidemic influenza B viruses isolated during 2004-2005 season in Taiwan // Virus Research. - 2007. -V.124. -P.204-211.

96. Lin Y.P., Gregory V., Bennett M. et al. Genetic reassortment among recently circulating human influenza A and B viruses // International Congre'ss Series. -2004.-№.1263.-P.178-183.

97. Lin YP, Gregory V, Bennett M, Hay A. Recent changes among human influenza viruses // Virus Res. - 2004. - V. 103(1-2). - P.47-52.

98. Lindstrom S.S., HiromotoY., Nishimura H. et al. Comparative Analysis of Evolutionary Mechanisms of the Hemagglutinin and Three Internal Protein Genes

of Influenza B Virus: Multiple Cocirculating Lineages and Frequent Reassortment of the NP, M and NS Genes // J. of Virol. - 1999. - V.73.№5. - P.4413-4426.

99. Liu L., Denison A.M. et al. Myocardial injury and bacterial pneumonia contribute to the pathogenesis of fatal influenza B virus infection // J. Infect. Dis. -2012. - V.205. - P.895-905.

100. Lugovtsev V.Y., Smith D.F., Weir J.P. Changes of the receptor-binding properties of influenza B virus B/Victoria/504/2000 during adaptation in chicken eggs // Virology. - 2009. - V.394. - P.218-226.

101. Lugovtsev V.Y, Vodeiko G.M., Levandowski R.A. Mutational pattern f influenza B viruses adapted to high growth replication in embryonated eggs // Virus Research. - 2005. - V. 109 - P. 149-157.

102. Lugovtsev V.Y, Vodeiko G.M., Strupczewski C.M. et al. Generation of influenza B viruses with improved growth phenotype by substitution of specific amino acids of hemagglutinin // Virology. - 2007. - V.365. - P.315-323.

103. Matsuzuki Y., Sugawara K., Takashita E. et al. Genetic Diversity of Influenza B Virus: The Frequent Reassortment and Cocirculation of the Genetically Distinct Reassortant Viruses in a Community// J. of Med. Virol. -2004. - V.74. -P.132-140.

104. McCullers J.A., Saito T., Iverson A. Multiple Genotypes of Influenza B Virus Circulation between 1979 and 2003 // J. of Virol. - 2004. - V.78.№23. -P.12817-1282.

105. McCullers J.A., Want G .C. Reassortment and Insertion-Deletion Are Strategies for the Evolution of Influenza B Viruses in Nature // J. of Virol. -1999.

- V.73(9) - P.7343-7348.

106. Moorman J.P. Viral Characteristics of Influenza // Southern Med. J. - 2003.

- V.96 №8. -P.758-761.

107. Muyanga J., Matsuzaki Y., Sugawara K. et al. Antigenic and genetic analyses of influenza B viruses isolated in Lusaka, Zambia in 1999 // Arch. Virol.

- 2001. - V. 146. - P. 1667-1679.

108. Nakagawa T., Higashi N., Nakagawa N. Detection of antigenic variants of the influenza B virus by melting curve analysis with LGCreen // J. of Virol. Methods. - 2008. - V.148. - P.296-299.

109. Nakagawa N., Higashi N., Nakagawa T. Cocirculation of antigenic variants and the vaccine-type virus during the 2004-2005 influenza B virus epidemics in Japan // J. of Clin. Microbiol. - 2009. - V.47 №2. - P.352-357.

110. Nakagawa N., Kubota R., Morikawa S. et al. Characterization of new epidemic strains of influenza B virus by using neutralizing monoclonal antibodies //Journal of Medical Virology.- 2001.- V.65.- P.745-750.

111. Nakagawa N., Kubota R., Maeda A., Okuno Y. Influenza B Virus Victoria Group with a New Glycosylation Site Was Epidemic in Japan in the 2002-2003 Season // J. of Clin. Microbiol. - 2004. - V.42 №7. - P.3295-3297.

112. Nakagawa N., Kubota R, Nakagawa T., Okuno Y. Antigenic variants with amino acid deletions clarify a neutralizing epitope specific for influenza B virus Victoria group strains // J. of Gen. Virol. - 2001. - V.82. - P.2169-2172.

113. Nakagawa N., Nukuzuma S., Haratome S. et al. Emergence of an Influenza B Virus with Antigenic Change // J. of Clin. Microbiol. - 2002. - V.40.№8. -P.3068-3070.

114. Nakagawa N., Susuoki J., Kubota R et al. Discovery of the Neutralizing Epitope Common to Influenza B Virus Victoria Group Isolates in Japan // J. of Clin. Microbiol. - 2006. - V.44 №4. - P.1564-1566.

115. Nerome K., Nerome R. et al. Characteristic evolutionary mechanisms of the influenza B virus: It is dynamic deletion-insertion rotation mechanisms and frequent occurrence of genomic reassortment // Virus Research. - 2002. -№169. -P.171-185.

116. Nerome R, Hiromoto Y. et al. Evolutionary characteristics of influenza B virus since its first isolation in 1940: dynamic circulation of deletion and insertion mechanisms // Arch Virol. - 1998. - P.1569-1583.

117. Nobusawa E., Sato K. Comparison of the Mutation Rates of Human Influenza A and B Viruses // J. of Virol. - 2006. - V.80.№7. - P.3675-3678.

118. Nunes B., Pechirra P., Canto e Castro L., Rebelo-de-Andrade H. Adaptive evolution on HA1 subunit of influenza B virus // International Congress Series. -2004. - V. 1263. - P.691-694.

119. Nunes B., Pechirra P., Coelho A. et al. Heterogeneous Selective Pressure Acting on Influenza B Victoria- and Yamagata-Like Hemagglutinins // J. Mol. Evol. - 2008. - V.68. - P.427-435.

120. Osterhaus A.D., Rimmelzwaan G.F., Martina B.E. et al. Influenza B Virus in Seal // Science. - 2000. - V.288. - P.1051-1053.

121. Oxford by J. S., Abbo H., Corcoran T. et al. Antigenic and Biochemical Analysis of Field Isolates of Influenza B Virus: Evidence for Intra- and Inter-epidemic Variation // J. gen. Virol. - 1983. - V.64. - P.2367-2377.

122. Oxford J. S., Schild G. C., Corcoran T. et al. A host-cell-selected variant of influenza B virus with a single nucleotide substitution in HA affecting a potential glycosylation site was attenuate in virulence for volunteers // Arch. Virol. - 1990. -V. 110.-P. 37-46.

123. Palese P., Bouvier N. The biology of influenza viruses // Vaccine. - 2008.-V.26S.-P. D49-D53.

124. Pariani E., Amendola A., Ebranati E. et al. Genetic drift influenza A(H3N2) virus hemagglutinin (HA) variants originated during the last pandemic turn out to be predominant in the 2011-2012 season in Northern Italy 11 Infection, Genetics and Evolution. - 2013. - V. 13 (1). - P.252-260.

125. Pechirra P., Nunes B., Coelho A. et al. Molecular characterization of the HA gene of influenza type B viruses // J. of Med. Virol. - 2005. - V.77. - P.541-549.

126. Peltola V., Ziegler T., Ruuskanen O. Influenza A and B infections in children // Clin. Infect. Dis. - 2003. - V.36. - P.299-305.

127. Pereira M.S., Chakraverty P. The laboratory surveillance of influenza epidemic in the United Kingdom 1968-1976 // J. Hyg. - 1977. - №79. - P.77-87.

128. Puzelli S., Frezza F., Fabiani C. et al. Changes in the Hemagglutinins and Neuraminidases of Human Influenza B Viruses Isolated in Italy During the 2001-

02, 2002-03, and 2003-04 Seasons // J. of Med. Virol. - 2004. - V.74(4). - P.629-640.

129. Rota P.A., Hemphill M.L., Whistler T. et al. Antigenic and genetic characterization of the hemagglutinins of recent cocirculation strains of influenza B virus // J. of Gen. Virol. - 1992. - V.73. - P.2737-2742.

130. Rota P. A., Wallis T. R., Harmon M. W., Rota J. S., Kendal A. P., Nerome K. Cocirculation of two distinct evolutionary lineages of influenza type B virus since 1983 // Virology. - 1990. - V. 175. - P. 65-68.

131. Roy T., Agrawal A.S., Mukherjee A. et al. Surveillance and molecular characterization of human influenza B viruses during 2006-2010 revealed co-circulation of Yamagata-like and Victoria-like strains in eastern India // Infect. Genet. Evol. -2011. - V. 11(7). -P.1595-1601.

132. Schweiger B. Molecular characterization of human influenza viruses—a look back on the last 10 years // Berl Munch Tierarztl Wochenschr. - 2006. - Mar-Apr; 119(3-4).-P. 167-178.

133. Schweiger B., Zadow I., Heckler R. Antigenic drift and variability of influenza viruses // Med. Microbiol. Immunol. - 2002. - V. 191. - P. 133-138.

134. Seale H., Weston K.M., Dwyer D.E. et al. The use of oseltamivir during an influenza B outbreak in a chronic care hospital // Influenza and other respiratory viruses. - 2009. - V.3.11. - P. 15-20.

135. Shaw M.W., Xu X., Li Y. et al. Reappearance and Global Spread of Variants of Influenza B/Victoria/2/87 Lineage Viruses in the 2000-2001 and 2001-2002 Seasons // Virology. - 2002. - №303. - P.l-8.

136. Shen J., Kirk B.D., Ma J., Wang Q. Diversifying Selective Pressure on Influenza B virus HA // J. of Med. Virol. - 2009. - V.81.№1. - P.l 14-124.

137. Shih S., Chen G., Yang C. et al. Laboratory-Based Surveillance and Molecular Epidemiology of Influenza Virus in Taiwan // J. of Clin. Microbiol. -2005. - V.43 №4. -P.1651-1661.

138. Smith J.D., Lapedes A.S., Jong J.C. et al. Mapping the Antigenic and Genetic Evolution of Influenza Virus // Science. - 2004. -V.305. - P.371-376.

139. Shtyrya Y.A., Mochalova L.V., Bovin N.V. Influenza Virus Neuraminidase: Structure and Function // Acta Nature. - 2009. - №2. - P.26-32.

140. Stray S.J., Pittman L.B. Subtype- and antigenic site-specific differences in biophysical influences on evolution of influenza virus hemagglutinin // Virol. J. -2012. - 9:91 (http://www.virologvi .com/content/9/1/91).

141. Sun X, Shi Y, Lu X. et al. Bat-Derived Influenza Hemagglutinin HI 7 Does Not Bind Canonical Avian or Human Receptors and Most Likely Uses a Unique Entry Mechanism // Cell Reports (2013), http://dx.d0i.0rg/l 0.1016/i .celrep.2013.01.025.

142. Suzuki Y., Nei M. Origin and Evolution of Influenza Hemagglutinin Genes // Mol. Biol. Evol. - 2002. - V.19(4). - P.501-509.

143. Tamura K, Peterson D, Peterson N, Stecher G, Nei M, Kumar S. MEGA5: molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance,and maximum parsimony methods. Mol Biol Evol. 2011 0ct;28(10):2731>9. Epub 2011 May 4. PubMed PMID: 21546353; PubMed Central PMCID: PMC3203626.

144. Treanor J. Influenza vaccine - outmaneuvering antigenic shift and drift // N. Engl. J. Med. -2004. -V. 350(3). - P. 218-220.

145. Tsai H., Wang H., Kiang D. et al. Increasing Appearance of Reassortant Influenza B Virus in Taiwan from 2002 to 2005 // J. of Clin. Microbiol. - 2006. -V.44 №8. - P.2705-2713.

146. Tsuchiya E., Sugawara K., Hongo S. et al. Antigenic structure of the hemagglutinin of human influenza A/H3N2 virus // J. Gen. Virol. - 2001. -V.82. -P.2472-2484.

147. Tung C., Goodman J.L., Lu H., Macken C.A. Homology model of the structure of influenza B virus HA1 // J. of Gen. Virol. - 2004. - V.85. - P.3249-3259.

148. Verhoeyen M., Rompuy L.V., Jou W.M. et al. Complete nucleotide sequence of the influenza B/Singapore/222/79 virus hemagglutinin gene and

comparison with the B/Lee/40 hemagglutinin // Nucleic Acids Research. -1983. -V.ll.№.14. — P.4703-4712.

149. Vodeiko G.M., Mclnnis J., Chizhikov V., Levandowski R.A. Genetic and phenotypic analysis of reassortants of high growth and low growth strains of influenza B virus // Vaccine. - 2003. - V.21. - P.3867-3874.

150. Wang Q., Cheng F., Lu M. et al. Crystal Structure of Unliganded influenza B virus Hemagglutinin // J. of Virol. - 2008. - V.82.№6. - P.3011-3020.

151. Wang Q., Tian X., Chen X., Ma J. Structural basis for receptor specificity of influenza B virus hemagglutinin // PNAS. - 2007. - V. 104 - P. 16874-16879.

152. Wanitchang A., Narkpuk J., Jaru-ampornpan et al. Inhibition of influenza A virus replication by influenza B virus nucleoprotein: an insight into interference between influenza A and B viruses // Virology. - 2012. - V.432. - P. 194-203.

153. Xu X., Lindstrom S.E., Shaw M.W. et al. Reassortment and evolution of current human influenza A and B viruses // Virus Research. - 2004. - №103-P.55-60.

154. Yang J.-R., Huang Y.-P., Chang F.-Y. et al. Phylogenetic and Evolutionary Histore of Influenza B Viruses, which Caused a Large Epidemic in 2011-2012, Taiwan // PLOS ONE. - 2012. - V.7(10). -P.l-10.

155. Zaraket H., Dbaibo G., Salam O. et al. Influenza virus infections in Lebanese children in the 2007-2008 season // Jpn. J. Infect. Dis. - 2009. - V.62. - P. 137138.

156. Zou S., Home J., Weber J.M. Evolution of the Hemagglutinin Gene of Influenza B Virus was Driven by Both Positive and Negative Selection Pressure // Virus Genes. -1997.- №14:3. -P.181-185.