Эпидемиология и профилактика внутрибольничных инфекций, вызванных бактериями рода acinetobacter тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 14.02.02, кандидат наук Шмакова Мария Александровна

• Шмакова Мария Александровна
• кандидат наук
• 2019

Оглавление диссертации кандидат наук Шмакова Мария Александровна

ВВЕДЕНИЕ

ГЛАВА 1. СОВРЕМЕННЫЕ ВЗГЛЯДЫ НА ВНУТРИБОЛЬНИЧНЫЕ ИНФЕКЦИИ, ВЫЗВАННЫЕ БАКТЕРИЯМИ РОДА ЛСШЕТОБЛСТЕЯ (обзор литературы)

1.1 Эпидемиологическое значение

1.1.1 Распространенность внутрибольничных инфекций, вызванных бактериями рода Лс1пв1оЪас1вт

1.1.2 Летальность

1.1.3 Экономический ущерб

1.2 Географические особенности распространения Лапв^Ъа^вт ярр

1.3 Общая характеристика Лс1пв1оЪас1вт ярр

1.4 Экология возбудителя

1.5 Устойчивость к антимикробным препаратам

1.6 Механизм передачи возбудителя

1.7 Факторы риска

1.8 Клинические формы инфекции

1.9 Пути профилактики

ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ

2.1 Программа и план исследования

2.2 Изучаемое явление

2.3 Материалы исследования

2.4 Методы исследования

2.4.1 Проспективное эпидемиологическое наблюдение

2.4.2 Ретроспективный эпидемиологический анализ

2.4.3 Микробиологические методы исследования

2.4.4 Молекулярно-генетический анализ

2.4.5 Статистические методы исследования

ГЛАВА 3. НЕКОТОРЫЕ ЗАКОНОМЕРНОСТИ РАЗВИТИЯ ЭПИДЕМИЧЕСКОГО ПРОЦЕССА ВНУТРИБОЛЬНИЧНЫХ ИНФЕКЦИЙ, ВЫЗВАННЫХ БАКТЕРИЯМИ РОДА ACINETOBACTER

3.1 Распространенность Acinetobacter spp. в медицинских организациях Кемеровской области

3.2 Многолетняя динамика частоты инфицирования пациентов Acinetobacter spp. в медицинских организациях Кемеровской области

3.3 Внутригодовая динамика эпидемического процесса, вызванного Acinetobacter spp

3.4 Цикличность проявлений эпидемического процесса, вызванного Acinetobacter spp

3.5 Частота инфицирования Acinetobacter spp. пациентов на административных территориях Кемеровской области в 2018 году

3.6 Распространенность Acinetobacter spp. в зависимости от профиля отделений в медицинских организациях Кемеровской области в 2012-2016 г. г

ГЛАВА 4. ФАКТОРЫ РИСКА ИНФИЦИРОВАНИЯ ПАЦИЕНТОВ БАКТЕРИЯМИ РОДА ACINETOBACTER

4.1 Риск инфицирования Acinetobacter spp. пациентов, находившихся на лечении в отделениях неврологии и нейрохирургии

4.2 Факторы риска инфицирования бактериями рода Acinetobacter пациентов с поражением структур головного мозга, находившихся на лечении в отделениях неврологии и нейрохирургии в 2017-2018 г.г

4.3 Факторы риска инфицирования пациентов ОРИТ бактериями рода Acinetobacter

4.4 Распространенность Acinetobacter spp. в больничной среде

ГЛАВА 5. ХАРАКТЕРИСТИКА ПОПУЛЯЦИИ ACINETOBACTER SPP. В НАБЛЮДАЕМЫХ МЕДИЦИНСКИХ ОРГАНИЗАЦИЯХ

5.1 Чувствительность Acinetobacter spp. к антибиотикам

5.2 Устойчивость выделенных Acinetobacter baumannii к дезинфицирующим средствам

5.3 Молекулярно-генетическое типирование штаммов Acinetobacter baumannii, выделенных от пациентов с неврологическим дефицитом

ГЛАВА 6. ПРОФИЛАКТИКА ВНУТРИБОЛЬНИЧНЫХ ИНФЕКЦИЙ, ВЫЗВАННЫХ БАКТЕРИЯМИ РОДА ACINETOBACTER

6. 1 Основные принципы профилактики

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

ВЫВОДЫ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ

ПЕРСПЕКТИВЫ ДАЛЬНЕЙШЕЙ РАЗРАБОТКИ ТЕМЫ

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

ПРИЛОЖЕНИЕ

ВВЕДЕНИЕ

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Эпидемиология и профилактика внутрибольничных инфекций, вызванных бактериями рода acinetobacter»

Актуальность проблемы

Ежегодно в мире регистрируется 1 миллион (от 600 000 до 1 400 000) случаев инфекций, вызванных Лат^а^ет ярр. [176]. Несмотря на совершенствование эпидемиологического надзора и контроля за инфекциями, связанными с оказанием медицинской помощи (ИСМП), снижение агрессивности медицинских технологий и увеличение их эпидемиологической безопасности, частота присоединения внутрибольничных инфекций, вызванных этими микроорганизмами, растёт [16, 48, 62]. Лс1пе1оЬас1ет Ьаишаппи входит в число возбудителей, требующих особого внимания из-за глобального распространения антибиотикоустойчивых штаммов и возрастающей угрозы для пациентов [98, 197].

Актуальность внутрибольничных инфекций, вызванных ЛсШоЬа^ет Ъаишаппи, определяется повсеместным распространением, значительным адаптационным резервом, высокой скоростью формирования госпитальных клонов и риском неблагоприятных исходов лечения [5, 35, 188]. ЛсШоЬа^ет ЬаишаппИ поражает преимущественно пациентов, нуждающихся в интенсивной терапии, вызванные им инфекции характеризуются высокой летальностью, достигающей 75% при сепсисе [139, 142, 148]. Негативной тенденцией является увеличение роли других представителей рода ЛсШоЬа^ет в этиологии внутрибольничных инфекций, что свидетельствует об активных эволюционных процессах и вероятном изменении характера и интенсивности проявлений эпидемического процесса вну-трибольничных инфекций [47, 76, 178].

Бурный прогресс медицинских технологий, внедрение принципиально новых материалов и устройств, увеличение доли пациентов, требующих интенсивной терапии, рост резистентности к антимикробным средствам определяют необходимость изучения особенностей эпидемического процесса, вызванного данным

возбудителем, оценки риска инфицирования различных категорий пациентов и разработки профилактических мер, учитывающих особенности и эпидемический потенциал ЛcinвtoЪactвт spp.

Степень разработанности темы

Изучению инфекций, вызванных бактериями рода Лств^Ъа^вт spp, посвящено значительное количество исследований. Подробно описаны микробиологические свойства, экология, эволюция возбудителя, его генетическое разнообразие, отражены особенности клиники инфекций, некоторые закономерности эпидемического процесса. Однако анализ имеющейся информации свидетельствует о недостаточной изученности факторов риска, особенностей эпидемического процесса, обусловленных медицинскими технологиями, что крайне важно для дифференциации профилактических и противоэпидемических мер, разработки эффективных превентивных стратегий и управления риском внутрибольничного инфицирования, обеспечения качества и безопасности медицинской помощи.

Цель исследования

Совершенствование путей профилактики внутрибольничных инфекций, вызванных бактериями рода Лств^Ъа^вт, на основе изучения закономерностей развития эпидемического процесса.

Задачи исследования

1. Изучить уровни, динамику, структуру проявлений эпидемического процесса, вызванного бактериями рода Лств^Ъа^вт.

2. Установить группы, факторы риска внутрибольничного инфицирования, вызванного бактериями рода Лств^Ъа^вт.

3. Выявить медицинские технологии, определяющие высокий риск внутри-больничного инфицирования, вызванного бактериями рода Лств^Ъа^вт.

4. Установить доминирующие клоны Лств^Ъа^вт spp., определяющие вну-трибольничное инфицирование в группах риска и дать их характеристику.

5. Научно обосновать меры профилактики внутрибольничных инфекций, вызванных бактериями рода Лс1пе1оЬас1ет.

Научная новизна исследования

Выявлены особенности эпидемического процесса внутрибольничных инфекций, вызванных бактериями рода Лсте^Ьа^ет, определяющиеся медицинскими технологиями интенсивной терапии, наличием поражения структур головного мозга у пациентов, закономерностями клональной структуры и антимикробной резистентности возбудителей.

Доказан высокий риск инфицирования Лс1пе1оЬас1ет ярр. в отделениях нейрохирургии, неврологии, реанимации и интенсивной терапии, ожоговых отделениях. Установлено, что пациенты с полным параличом взора, нарушением сознания и оценкой по шкале инсульта более 20 баллов имели максимально высокие шансы инфицирования бактериями рода Лс1пе1оЬас1ет ярр.

Выявлены медицинские технологии высокого риска инфицирования бактериями рода ЛсШоЬа^ет 8рр., к которым относятся искусственная вентиляция легких, ингаляции лекарственных препаратов через небулайзер и катетеризация мочевого пузыря более 7 суток.

Определены доминирующие клоны бактерий рода ЛсШоЬа^ет, имеющие наибольшее эпидемиологическое значение в группах риска.

Предложены пути и компоненты профилактики внутрибольничных инфекций, вызванных бактериями рода Лс1пе1оЬас1ет, основанные на применении муль-тимодальной стратегии.

Теоретическая и практическая значимость работы

В процессе исследования были выявлены новые закономерности развития эпидемического процесса внутрибольничных инфекций, вызванных бактериями рода Лс1пе1оЬас1ет, особенности распространения возбудителей инфекции на территории Кемеровской области и изучены их свойства; выявлены группы и факторы риска, определена молекулярно-генетическая структура доминирующих клонов Лс1пе1оЬас1ет в популяции групп риска, подтверждено широкое распростра-

нение карбапенемрезистентных штаммов, установлены механизмы резистентности. Научно обоснованы меры профилактики внутрибольничного инфицирования Лств^Ъа^вт spp.

Результаты исследования использованы при подготовке клинических рекомендаций «Профилактика инфекций области хирургического вмешательства» (утверждены НП «Национальная ассоциация специалистов по контролю инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи» (НП «НАСКИ»), протокол №15 от 12 апреля 2018 г.), методических рекомендаций «Эпидемиология и профилактика инфекций, вызванных бактериями рода Лств^Ъа^вт» (утверждены 8 февраля 2019 г. Департаментом охраны здоровья населения Кемеровской области) и внедрены в практику работы медицинских организаций Российской Федерации: акты внедрения №№ 641, 642 (ГАУЗ КО «Областная клиническая больница им С.В. Беляева» г. Кемерово), №№ 369, 370 (ГОБУЗ «Мурманская областная клиническая больница им. Баяндина», г. Мурманск), №№ 687, 689 (ГБУЗ НО «Нижегородская областная детская клиническая больница», г. Нижний Новгород); в учебный процесс: акты внедрения № 431, 432 кафедр эпидемиологии, госпитальной хирургии, акушерства и гинекологии имени профессора Г.А. Ушаковой ФГБОУ ВО «Кемеровский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской Федерации, г. Кемерово.

Методология и методы исследования

Методологической основой диссертационного исследования послужили труды отечественных и зарубежных авторов в области эпидемиологии, основные положения теорий эпидемического процесса. При разработке дизайна исследования использованы общенаучные подходы и методы, включающие эпидемиологический (описательное и аналитическое исследования), микробиологический (бактериологический с определением чувствительности к антимикробным средствам), статистический, молекулярно-генетический (типирование методом RAPD-ПЦР с выявлением вариабельного сегмента интегронов I класса; МЬУЛ типирование по восьми хромосомным локусам; реакции на наличие рекомбинационно-активной

части интегрона 1-го класса (гена интегразы), а также интегрон-ассоциированных генов антимикробной устойчивости).

Положения, выносимые на защиту

1. Высокий риск внутрибольничного инфицирования бактериями рода Лс1пе1оЬас1ет определяется наличием поражения структур головного мозга у пациентов, применяемыми инвазивными технологиями интенсивной терапии и особенностями возбудителей.

2. Профилактика внутрибольничных инфекций, вызванных Лс1пе1оЬас1ет 8рр., основана на применении мультимодальной стратегии, включающей эпидемиологический мониторинг; идентификацию и оценку риска инфицирования пациентов и формирования госпитального клона; коррекцию медицинских технологий с минимизацией риска инфицирования; оценку эффективности обеспечения эпидемиологической безопасности медицинской помощи.

Степень достоверности и апробация результатов

Достоверность результатов исследования, выводов и положений, выносимых на защиту, основывается на достаточном по объему репрезентативном материале, использовании современных методов исследования и методов статистической обработки данных. Комиссия, сформированная в соответствии с приказом ректора ФГБОУ ВО «Кемеровский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской Федерации № 467 от 6 мая 2019 г., подтверждает подлинность первичных материалов, а также личный вклад автора. Диссертационная работа апробирована на совместном заседании кафедр эпидемиологии; микробиологии, иммунологии и вирусологии; биологии с основами генетики и паразитологии; инфекционных болезней ФГБОУ ВО «Кемеровский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской Федерации.

Результаты работы обсуждены и доложены на конференциях:

• межрегиональной научно-практической конференции молодых ученых и студентов с международным участием «Проблемы медицины и биологии» (г. Кемерово, 2017, 2018 г.г.);

• ежегодной Всероссийской научно-практической конференции с международным участием «Риск-ориентированные технологии в обеспечении эпидемиологической безопасности медицинской деятельности» (г. Пермь, 2017 г.);

• ежегодной Всероссийской научно-практической конференции с международным участием «Новые технологии в диагностике, лечении и профилактике: ИСМП, инфекции, паразитозы» (г. Тюмень, 2018 г.);

• II Всероссийской научно-практической конференции молодых ученых «Научно-практические аспекты эпидемиологии инфекционных и неинфекционных болезней» (г. Москва, 2018 г.);

• Всероссийской научно-практической конференции с международным участием «Актуальные проблемы эпидемиологии инфекционных и неинфекционных болезней» (г. Москва, 2018 г.);

• межрегиональной научно-практической конференции, посвященной 55-летию медико-профилактического факультета КемГМУ «Актуальные вопросы Госсанэпиднадзора в Сибири» (г. Кемерово, 2018 г.);

• международной научно-практической конференции молодых ученых и студентов «Проблемы медицины и биологии» (г. Кемерово, 2019 г.).

Фрагменты результатов данного исследования опубликованы в 13 печатных работах, в том числе в 3 изданиях, рекомендованных ВАК Минобрнауки РФ для публикации основных положений диссертаций на соискание ученой степени кандидата медицинских наук.

Объём и структура диссертации

Работа изложена на 124 страницах компьютерного текста, иллюстрирована 18 таблицами, 16 рисунками. Диссертация состоит из введения, обзора литературы по теме исследования, главы, описывающей материалы и методы исследова-

ния, 4 глав собственных исследований, заключения, выводов, практических рекомендаций, 1 приложения. Библиографический указатель содержит 199 литературных источников, в том числе 164 - зарубежных авторов. Диссертация выполнена в соответствии с планом научно-исследовательской работы ФГБОУ ВО «Кемеровский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской Федерации, номер государственной регистрации 0120.0511051.

Личный вклад автора

Автором определены цель, задачи, объем, программа, выбраны объекты и методы исследования, собраны исходные данные, разработан алгоритм анализа информации, организован сбор культур Лс1пе1оЬас1ет Ьаишаппи для проведения молекулярно-генетических исследований. Автор лично провела статистическую обработку, анализ результатов лабораторных и эпидемиологических исследований, на основании которых разработаны методические рекомендации для оптимизации системы мер профилактики внутрибольничных инфекций, вызванных бактериями рода Лс1пе1оЬас1ет. Диссертант лично сформулировала основные положения, выводы диссертации, подготовила основные публикации и диссертационную работу. В целом, личный вклад в выполнение творческой части исследования - в пределах 90%.

ГЛАВА 1. СОВРЕМЕННЫЕ ВЗГЛЯДЫ НА ВНУТРИБОЛЬНИЧНЫЕ ИНФЕКЦИИ, ВЫЗВАННЫЕ БАКТЕРИЯМИ РОДА ACINETOBACTER

(обзор литературы)

1.1 Эпидемиологическое значение

1.1.1. Распространенность внутрибольничных инфекций, вызванных бактериями рода Acinetobacter

Acinetobacter spp. входит в число шести наиболее актуальных возбудителей для населения развитых стран и представляет серьезную угрозу для пациентов [98, 197]. Согласно имеющимся исследованиям, Acinetobacter baumannii является третьим по частоте после Pseudomonas aeruginosa и Klebsiella pneumoniae грамот-рицательным возбудителем ИСМП как среди взрослых, так и детей [19, 26]. Эпидемиологическое значение определяется высокой экологической пластичностью Acinetobacter spp. и способностью быстро формировать госпитальные клоны, возрастающей проблемой мультирезистентности к антимикробным препаратам, тяжестью присоединяющихся инфекций и высоким риском неблагоприятных исходов [5, 35, 188].

Ежегодно в мире регистрируется 1 миллион (от 600 000 до 1 400 000) случаев инфекций, вызванных Acinetobacter spp. [176], что составляет 1,8% всех случаев внутрибольничных инфекций [185]. Распространенность их варьируется в зависимости от географического положения региона и социально-экономического статуса пациента [56, 95, 116]. Acinetobacter baumannii - патоген, преимущественно связанный с оказанием медицинской помощи. Множество публикаций подтверждают его способность вызывать как отдельные случаи заболеваний, так и вспышки внутрибольничных инфекций [59, 161]. Самая высокая частота наблюдается в отделениях реанимации и интенсивной терапии (ОРИТ) [57, 74]. Чаще всего Acinetobacter baumannii вызывает инфекции, связанные с искусственной

вентиляцией легких (ИВЛ) [46, 78]. Частота их составляет 4,2-8,8 на 1000 дней ИВЛ, однако по оценкам некоторых исследователей может достигать 18 на 1000 [114]. Катетер-ассоциированные инфекции кровотока, вызванные Acinetobacter baumannii, встречались с частотой 2,0 на 1000 дней катетеризации, инфекции мо-чевыводящих путей - 0,75 на 1000 дней катетеризации [125]. В обзоре 5000 инфекций мочевыводящих путей в отделениях интенсивной терапии исследователи выявили, что 1,6% случаев были вызваны Acinetobacter spp.; 95% этих инфекций были связаны с мочевыми катетерами [108].

По данным отечественных исследователей частота выделения штаммов ацинетобактерий из биоматериала от пациентов ОРИТ за период с 2010 по 2015 год возросла с 15,8% до 21,7% [2]. В своих исследованиях И.В. Чеботарь с соавт. отмечают стойкую тенденцию к повышению частоты инфицирования грамотри-цательной неферментирующей флорой, прежде всего бактериями рода Acinetobacter [49]. Acinetobacter baumannii отвечают за 2-10% всех случаев, связанных с грамотрицательными инфекциями [62]. Анализируя частоту инфекций, вызванных Acinetobacter spp., следует отметить отсутствие унификации к подходам регистрации [114], трудности дифференциации инфицирования от колонизации [187], а также преобладание в публикациях показателей структуры (доли) над частотой инфекций, вызванных Acinetobacter spp. [72].

1.1.2. Летальность

Инфекции, обусловленные Acinetobacter baumannii, характеризуются высокой летальностью, достигающей 75% при сепсисе [139, 142, 148], 52 % - при ИВЛ-ассоциированной пневмонии [62, 167], 73 % - при менингите у нейрохирургических больных [197]. Карбапенемрезистентные штаммы Acinetobacter baumannii (CRAB) обусловливали более высокий уровень летальности по сравнению с карбапенемчувствительными Acinetobacter baumannii (CSAB). [73, 104, 166]. Септический шок развивался у трети пациентов с бактериемией, вызванной Acinetobacter spp. [140]; летальность находилась в пределах от 20 до 60 % [58]. Однако, по мнению некоторых авторов, летальность, связанную с самой бактериемией, трудно определить в условиях множественных сопутствующих заболеваний [122].

Инфекция кровотока вследствие пневмонии, вызванной Acinetobacter spp., чаще сопровождалась более высокой летальностью, чем бактериемия, связанная с кате-тер-ассоциированной инфекцией (39 против 4% соответственно) [159]. Wieland K. et al. в систематическом обзоре 150 вспышек, вызванных Acinetobacter baumannii, в период с 2000 по 2015г.г. выявили, что большинство из них произошло в ОРИТ и сопровождалось 47% летальностью в сравнении с 23% на вспышках, вызванных Pseudomonas aeruginosa [199]. Вспышка среди новорожденных детей была сопряжена с 58% летальностью [57].

1.1.3. Экономический ущерб

Оценка экономического ущерба весьма затруднительна из-за разных подходов к расчету показателей и регистрации инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи (ИСМП), вызванных Acinetobacter spp. При оценке стоимости затрат на лечение Acinetobacter - ИСМП у пациентов после краниотомии Hweidi I.M. et al. определили стоимость одного случая в $7 899,08 и установили, что в среднем дополнительные дни пребывания в больнице составили 23,17. Кроме того, Acinetobacter baumannii и Staphylococcus aureus были определены в качестве преобладающих возбудителей инфекций области хирургического вмешательства у 39,1% и 26,1% пациентов соответственно [122]. Blumberg et al. определил стоимость затрат на лечение Acinetobacter - инфекций области хирургического вмешательства в $16,242 [158]. По данным Nelson R.E. et al., изучивших финансовое бремя тремя различными методами, стоимость составила от $33 510 до $129 917 [88].

1.2 Географические особенности распространения Acinetobacter spp.

Географическое распространение ИСМП, вызванных Acinetobacter spp, подробно изучено Hurley J.C. на примере ИВЛ-ассоциированной пневмонии в мета -анализе 117 исследований, охвативших период более 29 лет [114]. Частота их варьировала от 1,2 [0,8-2,1] на 1000 дней ИВЛ в Северной Америке до 8,8 [19, 59, 73, 133, 188] - на Ближнем Востоке. Автор отмечает более чем пятикратное различие частоты инфекций, вызванных Acinetobacter spp, наблюдаемое в сообщени-

ях из разных частей мира, что, по его мнению, не может быть объяснено только различиями в характере патологии, видах и условиях оказания медицинской помощи. Hurley J.C. отмечает сложность получения представлений об истинной распространенности ИСМП, вызванных Acinetobacter spp., в мире из-за сезонных колебаний [114, 136,172, 181], сложной эпидемиологии возбудителя и различиях в подходах к учету ИСМП.

Сезонные колебания частоты внутрибольничных пневмоний и инфекций кровотока, вызванных бактериями рода Acinetobacter, впервые были задокументированы в данных National Nosocomial Infections Surveillance System (NNIS) и позднее в The Surveillance Network-USA database [136]. Рост заболеваемости ИСМП, вызванных бактериями рода Acinetobacter, приходится на сезон с высокой температурой воздуха. Perenvich et al. в семилетнем наблюдении в медицинском центре Мэриленда показал, что при увеличении температуры на каждые 100 F происходил 17% рост заболеваемости ИСМП, вызванных этим возбудителем [181].

Peleg A.Y. и Seifert H. в обзоре глобальной эпидемиологии Acinetobacter baumannii отмечают, что основная проблема широкого распространения этого возбудителя обусловлена мультирезистентными штаммами [151]. Молекулярно-генетические исследования свидетельствуют, что первоначально в Европе, главным образом в Англии, Франции, Германии, Италии, Испании и Нидерландах имели место изолированные вспышки ИСМП, вызванные одним-двумя клонами Acinetobacter baumannii [67, 105, 193]. В дальнейшем через колонизированных пациентов происходил межбольничный перенос эпидемических клонов возбудителя с последующим эпидемическим распространением Acinetobacter baumannii из южных в североевропейские страны, такие как Бельгия и Германия. Автор приводит в качестве примера распространение так называемого Юго-Восточного клона и Oxa-23 клонов 1 и 2 в Юго-Восточной Англии, распространение клона Acinetobacter baumannii с множественной лекарственной устойчивостью в Португалии [47, 89, 118], межбольничное распространение клонa Acinetobacter baumannii, продуцирующего VEB-1 ESBL, в общей сложности из 55 медицинских

центров в северной и юго-восточной Франции [191] и распространение резистентного к амикацину клона Acinetobacter baumannii, наблюдаемого в девяти больницах в различных регионах Испании [177]. В дополнение к этим вспышкам были зарегистрированы три международных клона Acinetobacter baumannii (так называемые европейские клоны I, II и III) [111]. Считают, что основной вклад в межконтинентальное распространение мультирезистентных Acinetobacter baumannii между Европой и другими странами внесли авиаперелеты [151]. Детальное изучение эволюции глобально распространенных клонов Acinetobacter baumannii представлено в работе Hamidian M. et al. [101].

В Северной Америке в 1991 и 1992 годах вспышки инфекций, вызванных резистентными к карбапенемам Acinetobacter baumannii, наблюдались в больницах в Нью-Йорке вслед за резко возросшим использованием имипенема. О подобных вспышках часто сообщалось во многих других регионах США [108]. Позднее широкое распространение в США мультирезистентных Acinetobacter baumannii было связано с пациентами из зон боевых конфликтов в Ираке и Афганистане или после стихийных бедствий, таких как землетрясение в Мармаре в Турции [62, 151]. Вспышки Acinetobacter baumannii с множественной лекарственной устойчивостью в канадских больницах, по-видимому, встречаются реже, чем в сопоставимых учреждениях в США, но о них все же сообщалось [151].

Анализируя данные различных исследований, Peleg A.Y. и Seifert H. приходят к заключению, что частота резистентных штаммов Acinetobacter baumannii к меропенему, имипенему, цефтазидиму, пиперациллин-тазобактаму, ципрофлокса-цину и гентамицину в Латинской Америке, по-видимому, является одной из самых высоких в мире. Данные о распространенности инфекций, вызванных муль-тирезистентными штаммами Acinetobacter в Африке, в настоящее время в значительной степени ограничены Южной Африкой, хотя имеются отдельные сообщения из других стран [66]. Достаточно широко распространены мультирезистент-ные штаммы Acinetobacter и в Азиатском регионе [147]. Что касается Австралии, то эпидемический процесс инфекций, вызванных Acinetobacter, развивался иначе. Первоначально вспышки не были связаны с больницами, и развивались среди

населения. Возбудитель при этом отличался достаточно хорошей чувствительностью к антибиотикам [60]. И только значительно позднее появились сообщения о вспышках ИСМП [151].

1.3 Общая характеристика Аст&оЪаавг 8рр.

Род ЛcinetoЬacter представлен более чем 50 видами [149], большинство из которых для человека не патогенны. За прошедшие 10 лет число известных видов Лсте^Ьа^ег удвоилось. Чаще всего инфекции вызывает Лсте^Ьа^ег Ьаитаппи, затем следуют Лсте^Ьа^ег са1соасеЫсш и Лсте^Ьа^ег ¡моАи [43,78, 113], в редких случаях - Лсте^Ьа^ег Наето1у^сш, Лсте^Ьа^ег ]оНтопи, Лсте^Ьа^ег ]ипи, ЛcinetoЬacter nosocomia¡is, Лсте^Ьа^ег рШи, Лсте^Ьа^ег schindleri, и Лсте^Ьа^ег ursingii, Лсте^Ьа^ег seifertii [42, 63, 65, 90, 120, 173, 194]. Родовой термин отражает отсутствие флагеллярных органелл движения — жгутиков [49]. Род Лсте^Ьа^ег включает строго аэробные неферментирующие каталазопози-тивные оксидазонегативные грамотрицательные неподвижные бактерии-прототрофы, форма которых в зависимости от фазы и условий роста может быть кокковидной либо коккобациллярной (длина до 1,5 мкм). Нуклеоид представлен единичной циркулярной хромосомой, которая имеет объем порядка 3,5-3,9 МБ и включает у ЛcinetoЬacter Ьаитаппи от 3469 до 3913 генов, кодирующих от 3367 до 3824 белков [82]. У ацинетобактерий обнаружено 23 вида плазмид с емкостью от 2,7 до 94,4 КБ [188].

Строение клеточной стенки бактерий рода ЛcinetoЬacter типично для гра-мотрицательных бактерий, однако окрашивание их затруднено из-за способности удерживать кристаллы при окрашивании в фиолетовый цвет [188]. Ацинетобакте-рии могут продуцировать слизь, спор не образуют. Жгутиков не имеют, но обладают твичинг-подвижностью. Гемолитическую активность проявляют лишь виды комплекса Лсте^Ьа^ег Наето1у^сш. Растут на простых питательных средах. При росте на плотных средах образуют гладкие выпуклые колонии диаметром до 2-3 мм, некоторые штаммы могут продуцировать слизь, бледно-желтый и светлосерый пигмент.

1.4 Экология возбудителя

ЛсШоЪа^вт — убиквитарные свободноживущие почвенные и водные сапрофиты. Их резервуар находится в природе. Ацинетобактерии обитают в самых разных типах почв: от лесных до илисто-болотистых (в том числе загрязненных углеводородами), а также в свежей пресной и морской воде. Помимо почвы и воды они присутствуют в неочищенных стоках, корнях растений, цветочном нектаре, членистоногих; обнаруживаются на продуктах питания, таких, как овощи, рыба, мясо, сыр, молоко, вегетируют в организме животных [164, 187]. Лс1пв1оЪас1вт ярр. является частью нормальной микрофлоры кожи, слизистых оболочек, глотки, пищеварительного тракта и дыхательных путей человека [132, 165]. У здоровых людей присутствует на коже лба, носа, уха, обитают во влажных местах, таких как подмышечные впадины, пах и межпальцевые промежутки ног, на конъюнктиве. Видовой состав ацинетобактерий, вегетирующих на коже, сильно различается в зависимости от образа жизни, географической зоны, и представлен Лс1пв1оЪас1вг Лст&оЪа&вг ]октопи, Лс1пв1оЪас1вг Иавто1уИсш, Лст&оЪа&вг са1соасвИсш, Лапв^Ъа^вт. ]ип\\, Лс1пв1оЪас1вт Ъаитаппи [53, 62, 132].

Ацинетобактерии заселяют любые биотопы с минимально подходящими для них условиями и контаминируют самые разнообразные объекты и материалы [188]. Они характеризуются универсальностью метаболической активности, что обеспечивает их широчайшую экологическую пластичность [49]. Способность доминировать во многих экологических нишах позволила некоторым авторам сравнивать популяционную стратегию ацинетобактерий с распространением сорняков [103, 186].

В качестве источника питания эти микроорганизмы способны использовать многочисленные субстраты: от простых углеводов и нефти до тканей организма человека. И хотя температурный оптимум для клинических изолятов составляет 37-38°С, они могут расти и размножаться в психрофильных условиях. Некоторые виды ацинетобактерий за счет продукции полиуретаназы и фенолгидроксилазы

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Шмакова Мария Александровна, 2019 год

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

1. Антибиотикорезистентность нозокомиальных штаммов Асте^Ъа^ет spp. в стационарах России: результаты многоцентрового эпидемиологического исследования «МАРАФОН» 2013-2014 гг. / М. В. Сухорукова, М. В. Эйдельш-тейн, Е. Ю. Склеенова и др. // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. - 2017. - Т. 19, № 1. - С. 42-48.

2. Ацинетобактерии и их этиологическая роль в развитии гнойно-воспалительных заболеваний у пациентов реанимационного профиля / Т. В. Черненькая, А. К. Шабанов, Д. А. Косолапов и др. // Медицинский алфавит. -2017. -Т. 1, № 7 (304). - С. 40-43.

3. Богомолова, Н. С. Проблема лечения гнойно-воспалительных осложнений, обусловленных Асте1:оЬас1ег / Н. С. Богомолова, Л. В. Большаков, С. М. Кузнецова // Анестезиология и реаниматология. - 2014. - № 1. - С. 26-32.

4. Брусина, Е. Б. Инфекции, связанные с оказанием медицинской помощи в хирургии: тенденции и перспективы профилактики / Е. Б. Брусина, О. В. Ко-валишена, А. М. Цигельник // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. - 2017. -Т. 16, № 4 (95). - С. 73-80.

5. Брусина, Е. Б. Эпидемиология инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи, вызванных возбудителями группы сапронозов / Е. Б. Брусина // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. - 2015. - Т. 14, № 2 (81). - С. 50-57.

6. Воробьева, О. Н. Этиология гнойно-септических процессов у ожоговых больных / О. Н. Воробьева, Л. И. Денисенко, Н. М. Жилина // Бюллетень СО РАМН. - 2010. - Т. 30, № 6. - С. 57-63.

7. Генерация антибиотикотолерантных бактерий при гематологических и онкологических заболеваниях, сопровождающихся иммунокомпрометацией: новая проблема инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи / А. В.

Тутельян, В. М. Писарев, Н. З. Минаева и др. // Вестник РАМН. - 2016. - Т. 71, № 3. - С. 183-189.

8. Генетическое разнообразие Acinetobacter baumannii в отделении ожоговой реанимации / А. Л. Соломенный, Р. Х. Яфаев, А. Е. Гончаров и др. // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 2006. - № 2. - С. 25-30.

9. Гончаров, А. Е. Генотипический анализ карбапенем-устойчивого штамма Acinetobacter baumannii / А. Е. Гончаров, М. И. Еремеева, Н. А. Зубарева и др. // Пермский медицинский журнал. - 2011. - Т. XXVIII, № 6. - С. 95-99.

10. Горбич, Ю. Л. Клинические особенности Acinetobacter baumannii ассоциированных инфекций / Ю. Л. Горбич, И. А. Карпов // Клиническая инфекто-логия и паразитология. - 2012. - № 1 (01). - С. 35-34.

11. Гординская, Н. А. Особенности нозокомиальных штаммов Acinetobac-ter spp. в травматологической клинике / Н. А. Гординская, Е. В. Сабирова // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. - 2013. - Т. 15, № 2. -С. 143-146.

12. Госпитальный штамм - непознанная реальность / Н. И. Брико, Е. Б. Брусина, Л. П. Зуева и др. // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. - 2013. - № 1 (68). - С. 30-35.

13. Дормантное состояние микроорганизмов и профилактика инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи / А. В. Тутельян, А. М. Гапонов, В. М. Писарев и др. // Терапевтический архив. - 2015. - Т. 87, № 11. - С. 103-108.

14. Зуева, Л. П. Современный взгляд на роль бактериофагов в эволюции госпитальных штаммов и профилактике ИСМП / Л. П. Зуева, Б. И. Асланов, В. Г. Акимкин // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. - 2014. - № 1 (74). - С. 4349.

15. Изменение антибиотикорезистентности нозокомиальной микрофлоры: результаты внедрения стратегии контроля антимикробной терапии в многопрофильном стационаре / В. Г. Гусаров, Е. В. Нестерова, Н. Н. Лашенкова и др. // Эпидемиология и инфекционные болезни. - 2015. - Т. 20, № 5. - С. 11-18.

16. Инфекции, связанные с оказанием медицинской помощи: современная доктрина профилактики. Часть 2. Основные положения / Е. Б. Брусина, Л. П. Зуева, О. В. Ковалишена и др. // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. - 2018. - Т. 17, № 6 (103). - С. 4-10.

17. Мартынова, А. М. Особенности распространения заболеваний, вызванных Асте^Ъа^ет spp. в детском многопрофильном стационаре / А. М. Мартынова, Г. В. Ющенко // Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы. - 2015. - № 3. - С. 11-15.

18. Микробиологический пейзаж и антибактериальная терапия при инфицированном панкреонекрозе / Т. Н. Малородова, Ю. И. Афанасьев, Т. Г. Покровская и др. // Научные ведомости Белгородского государственного университета. Серия: Медицина. Фармация. - 2014. - № 11-1 (182). - С. 45-49.

19. Микробная колонизация и госпитальные инфекции у недоношенных детей в нейрохирургическом стационаре / М. В. Нароган, Л. Д. Ворона, В. Л. Пет-раки и др. // Вестник РУДН. Серия: Медицина. - 2013. - № 5, прил. - С. 66-72.

20. Национальная концепция профилактики инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи, и информационный материал по ее положениям: монография / В. И. Покровский, В. Г. Акимкин, Н. И. Брико и др. - Нижний Новгород: Ремедиум Приволжье, 2012. - 84 с.

21. Новицкая, Н. В. Возбудители раневых инфекций в ожоговом отделении многопрофильного стационара / Н. В. Новицкая, Е. Б. Брусина, И. А. Демин // Медицина в Кузбассе. - 2005. - № 3. - С. 56-58.

22. Определитель нетривиальных патогенных грамотрицательных бактерий (аэробных и факультативно анаэробных): справочник / Р. Вейант, У. Мосс, Р. Уивер и др.; пер. с англ. А. М. Деминой и др.; под ред. В. А. Курчавова, Г. А. Осипова. - М.: Мир, 1999. - 790 с.

23. Опыт применения микробиологических методов исследований при инфекционных осложнениях тяжелых травм / С. А. Свистунов, А. А. Кузин, Т. Н. Суборова и др. // Инфекция и иммунитет. - 2016. - Т. 6, № 4. - С. 373-378.

24. Появление интегрон-позитивного полирезистентного штамма Acinetobacter baumannii в российских стационарах / А. П. Соломенный, А. Ю. Максимов, А. И. Саралов и др. // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 2008. - № 4. - С. 89-91.

25. Профилактика катетер-ассоциированных инфекций кровотока и уход за центральным венозным катетером (ЦВК). Клинические рекомендации. - Нижний Новгород: Ремедиум Приволжье, 2017. - 44 с.

26. Роль Acinetobacter spp. в этиологии инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи, у пациентов хирургического стационара / С. А. Свистунов,

A. А. Кузин, Т. Н. Суборова и др. // Медицина в Кузбассе. - 2013. - Т. 12, № 2. -С. 59-62.

27. Сепетлиев, Д. Статистические методы в научных медицинских исследованиях / под ред. А. М. Меркова; авторезир. пер. с болгар. - М. : Медицина, 1968. - 422 с.

28. Соломенный, А. П. Генетическая вариабельность резистентных инте-гронов энтеробактерий / А. П. Соломенный, Я. Э. Ляпунов, Р. З. Кузяев // Бюллетень экспериментальной биологии и медицины. - 2011. - № 5. - С. 556-559.

29. Соломенный, А. П. Генотипический анализ нозокомиальных штаммов Acinetobacter baumannii / А. П. Соломенный, Н. А. Зубарева, А. Е. Гончаров // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. - 2015. - Т. 17, № 4. - С. 297-300.

30. Спектр антибиотикорезистентности и распространенности ОХА-карбапенемаз среди штаммов АсШоЬа^ег Ьаитати, выделенных у пациентов хирургических и реанимационных отделений в Москве / О. А. Крыжановская, А.

B. Лазарева, И. В. Чеботарь и др. // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 2016. - № 1. - С. 40-45.

31. Тапальский, Д. В. Чувствительность госпитальных изолятов Acineto-bacter baumannii к антибиотикам и их комбинациям / Д. В. Тапальский, А. В. Моз-гова, А. И. Козлова // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. - 2014. - Т. 16, № 2. - С. 37.

32. Управление риском инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи (риск-менеджмент) / Е. Б. Брусина, О. Л. Барбараш // Медицинский альманах. - 2015. - № 5 (40). - С. 22-25.

33. Федотова, О. С. Микробиологические аспекты получения препарата бактериофага против Acinetobacter baumannii / О. С. Федотова, Ю. А. Захарова // Медицинский альманах. - 2018. - № 1 (52). - С. 126-129.

34. Шагинян, И. А. Неферментирующие грамотрицательные бактерии в этиологии внутрибольничных инфекций: клинические, микробиологические и эпидемиологические особенности / И. А. Шагинян, М. Ю. Чернуха // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. - 2005. - Т. 7, № 3. - С. 271-285.

35. Эпидемиологическая безопасность, важнейшая составляющая обеспечения качества и безопасности медицинской помощи / Н. И. Брико, Е. Б. Брусина, Л. П. Зуева и др // Вестник Росздравнадзора. - 2014. - № 3. - С. 27-32.

36. A cold hard menace: A contaminated ice machine as a potential source for transmission of carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii / A. Kanwar, T. N. Domitrovic, S. Koganti, et al. // Am J Infect Control. - 2017. - Vol. 45, № 11. - P. 1273-1275.

37. A large sustained endemic outbreak of multiresistant Pseudomonas aeruginosa: a new epidemiological scenario for nosocomial acquisition / C. Suarez, C. Pena, O. Arch, et al. // BMC Infect Dis. - 2011. - Vol. 11. - P. 272.

38. A model-based strategy to control the spread of carbapenem-resistant En-terobacteriaceae: simulate and implement / M. F. DalBen, E. T. Mendes, M. L. Moura, et al. // Infect Control Hosp Epidemiol. - 2016. - Vol. 37, № 11. - P. 1315-1322.

39. A multifaceted intervention strategy for eradication of a hospital-wide outbreak caused by carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae in Southern Israel / A. Borer, S. Eskira, R. Nativ, et al. // Infect Control Hosp Epidemiol. - 2011. -Vol. 32, № 12. - P. 1158-1165.

40. A Novel Phage PD-6A3, and Its Endolysin Ply6A3, With Extended Lytic Activity Against Acinetobacter baumannii / M. Wu, K. Hu, Y. Xie, et al. // Front Microbiol. - 2019. - Vol. 9. - P. 3302.

41. A Retrospective Cohort Study of Risk Factors for Surgical Site Infection Following Liver Transplantation / R. A. Oliveira, J. M. P. Mancero, D. F. Faria, et al. // Prog Transplant. - 2019 - 1526924819835831.

42. A retrospective study of the incidence, clinical characteristics, identification, and antimicrobial susceptibility of bacteremic isolates of Acinetobacter ursingii / C. H. Chiu, Y. T. Lee, Y. C. Wang, et al. // BMC Infect Dis. - 2015. - Vol. 15. - P. 400.

43. Acinetobacter calcoaceticus from a fatal case of pneumonia harboring blaNDM-1 on a widely distributed plasmid / P. Li, C. Yang, J. Xie, et al. // BMC Infect Dis. - 2015. - Vol. 15. - P. 131.

44. Acinetobacter in veterinary medicine, with an emphasis on Acinetobacter baumannii / J. H. van der Kolk, A. Endimiani, C. Graubner, et al. // J Glob Antimicrob Resist. - 2019. - Vol. 16. - P. 59-71.

45. Acinetobacter Infections and Outcomes at an Academic Medical Center: A Disease of Long Term Care / J. Townsend, A. N. Park, R. Gander, et al. // Open Forum Infect Dis. - 2015. - Vol. 2, № 1. - P. ofv023.

46. Acinetobacter infections prevalence and frequency of the antibiotics resistance: comparative study of intensive care units versus other hospital units / J. Uwingabiye, M. Frikh, A. Lemnouer, et al. // Pan Afr Med J. - 2016. -Vol. 23. - P. 191.

47. Acinetobacter pittii isolated more frequently than Acinetobacter baumannii in blood cultures: the experience of a French hospital / H. Pailhoriès, C. Tiry, M. Eveil-lard, et al. // J Hosp Infect. - 2018. - Vol. 99, № 3. - P. 360-363.

48. Acinetobacter spp. are associated with a higher mortality in intensive care patients with bacteremia: a survival analysis / A. C. Leäo, P. R. Menezes, M. S. Oliveira, et al. // BMC Infect Dis. - 2016. - Vol. 16, № 1. - P. 386.

49. Acinetobacter: микробиологические, патогенетические и резистентные свойства / И. В. Чеботарь, А. В. Лазарева, Я. К. Масалов, и др. // Вестник Российской академии медицинских наук. - 2014. - Т. 69, № 9-10. - С. 39-50.

50. Adegoke, A. A. Ubiquitous Acinetobacter species as beneficial commensals but gradually being emboldened with antibiotic resistance genes / A. A. Adegoke, T. Mvuyo, A. I. Okoh // J Basic Microbiol. - 2012. - Vol. 52, № 6. - P. б20-б21.

51. Adewoyin, M. A. The natural environment as a reservoir of pathogenic and non-pathogenic Acinetobacter species / M. A. Adewoyin, A. I. Okoh // Rev Environ Health. - 2018. - Vol. 33, № 3. - P. 2б5-212.

52. Aerosolization of Acinetobacter baumannii in a trauma ICU / L. S. Munoz-Price, Y. Fajardo-Aquino, K. L. Arheart, et al. // Crit Care Med. - 2013. - Vol. 41, № 8. - P. 1915-1918.

53. Al Atrouni A. Reservoirs of Non-baumannii Acinetobacter Species / A. A. Atrouni, M. L. Joly-Guillou, M. Hamze, et al. // Front Microbiol. - 201б. - Vol. 1. - P. 49.

54. An assay for determining minimal concentrations of antibiotics that drive horizontal transfer of resistance / J. Jutkina, C. Rutgersson, C. F. Flach, et al. // Sci Total Environ. - 201б. - Vol. 548-549. - P. 131-138.

55. An effective intervention to limit the spread of an epidemic carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae strain in an acute care setting: from theory to practice / P. Ciobotaro, M. Oved, E. Nadir, et al // Am J Infect Control. - 2011. - Vol. 39, № 8. -P. б11-б11.

56. An outbreak due to multirésistant Acinetobacter baumannii in burn unit: Risk factors for acquisition and management / A. E. Simor, M. Lee, M .Vearncombe, et al. // Infect Control Hosp Epidemiol. - 2002. - Vol. 23, № 5. - P. 2б1-2б1.

51. An outbreak of bloodstream infection due to extensively resistant Acinetobacter baumannii among neonates / A. Ulu-Kilic, A. Gundogdu, F. Cevahir, et al. // Am J Infect Control. - 2018. - Vol. 46, № 2. - P. 154-158.

58. Analysis of clinical manifestations and risk factors of mortality in Acinetobacter baumannii bloodstream infection / Y. Zhang, H. Zhou, H. Cai, et al. // Zhonghua Nei Ke Za Zhi. - 201б. - Vol. 55, № 2. - P. 121-12б.

59. Analysis of penicillin-binding proteins (PBPs) in carbapenem resistant Acinetobacter baumannii / J. Vashist, V. Tiwari, R. Das, et al. // Indian J Med Res. - 2011. - Vol. 133. - P. 332-338.

60. Anstey, N. M. Community-acquired Acinetobacter pneumonia in the Northern Territory of Australia / N. M. Anstey, B. J. Currie, K. M. Withnall // Clin Infect Dis. - 1992. - Vol. 14. - P. 83-91.

61. Anticipating the Unpredictable: A Review of Antimicrobial Stewardship and Acinetobacter Infections / E. Wenzler, D. A. Goff, R. Humphries, et al. // Infect DisTher. - 2017. - Vol. 6, № 2. - P. 149-172.

62. Antunes, Luisa C. S. Acinetobacter baumannii: evolution of a global pathogen / Luisa C. S. Antunes, P. Visca Kevin, J. Towner // Pathogens and Disease. -2014. - Vol. 14, № 3. - P. 291-301.

63. Bacteremia caused by Acinetobacter ursingii / J. Loubinoux, L. Mihaila-Amrouche, A. Le Fleche, et al. // J Clin Microbiol. - 2003. - Vol. 41, № 3. - P. 13371338.

64. Bacteria contamination of touch surfaces in Polish hospital wards / A. Ro-zanska, D. Romaniszyn, A. Chmielarczyk, et al. // MedPr. - 2017. - Vol. 68, № 4. - P. 459-467.

65. Bacterial identification, clinical significance, and antimicrobial susceptibilities of Acinetobacter ursingii and Acinetobacters chindleri, two frequently misiden-tified opportunistic pathogens / L. Dortet, P. Legrand, C. J. Soussy, et al. // J Clin Microbiol. - 2006. - Vol. 44, № 12. - P. 4471-4478.

66. Bacterial isolates of blood cultures in patients with suspected septicaemia in Ilorin, Nigeria / S. O. Samuel, A. Fadeyi, A. A. Akanbi, et al. // Afr J Med Med Sci. -2006. - Vol. 35, № 2. - P. 137-141.

67. Bergogne-Berezin, E. Acinetobacter spp. as nosocomial pathogens: microbiological, clinical, and epidemiological features / E. Bergogne-Berezin, K. J. Towner // Clin Microbiol Rev. - 1996. - Vol. 9, № 2. - P. 148-165.

68. Bhargava, N. Quorum sensing in Acinetobacter: an emerging pathogen. / N. Bhargava, P. Sharma, N. Capalash // Crit Rev Microbiol. - 2010. - Vol. 36, № 4. -P. 349-360.

69. Biofilm contamination of high-touched surfaces in intensive care units: epidemiology and potential impacts / D. M. Costa, K. Johani, D. S. Melo, et al. // Lett Appl Microbiol. - 2019. - Vol. 68, № 4. - P. 269-276.

70. Biofilm formation by Acinetobacter baumannii strains isolated from urinary tract infection and urinary catheters / N. K. Pour, D. H. Dusane, P. K. Dhakephal-kar, et al. // FEMS Immunol Med Microbiol. - 2011. - Vol. 62, № 3. - P. 328-338.

71. Biology of Acinetobacter baumannii: Pathogenesis, Antibiotic Resistance Mechanisms, and Prospective Treatment Options [Electronic resource] / Ch-R. Lee, J. H. Lee, M. Park, et al. // Front Cell Infect Microbiol. - 2017. - Vol. 7. -| URL: https://doi.org/10.3389/fcimb.2017.00055 (accessed 26.04.2019).

72. Bloodstream infections at a tertiary level paediatric hospital in South Africa / H. Lochan, V. Pillay, C. Bamford, et al. // BMC Infect Dis. - 2017. - Vol. 17, № 1. -P. 750.

73. Carbapenem resistance and mortality in patients with Acinetobacter baumannii infection: systematic review and meta-analysis / E. V. Lemos, F. P. de la Hoz, T. R. Einarson, et al. // Clin Microbiol Infect. - 2014. - Vol. 20. - P. 416-423.

74. Carbapenem resistance in Acinetobacter baumannii: laboratory challenges, mechanistic insight sand therapeutic strategies / I. Abbott, G. M. Cerqueira, S. Bhuiyan, et al. // Expert Rev Anti-Infect Ther. - 2013. - Vol. 11, № 4. - P. 395-409.

75. Carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii (CRAB) Recovered from Burn Patients / H. Adibhesami, M. Douraghi, H. Zeraati, et al. // J Pharm Pharm Sci. -2016. - Vol. 19, № 83 - P. 339-348.

76. Characteristics of invasive Acinetobacter species isolates recovered in a pediatric academic center / A. L. Jain, C. M. Harding, K. Assani, et al. // BMC Infect Dis. - 2016. - Vol. 16, № 1. - P. 346-355.

77. Clinical and in vitro efficacy of colistin plus vancomycin and rifampin against colistin-resistant Acinetobacter baumannii causing ventilator-associated pneu-

monia / A. Oliva, A. Cipolla, V. Vullo, et al. // New Microbiologica. - 2017. - Vol. 40, № 3. - P. 205-207.

78. Clinical and Pathophysiological Overview of Acinetobacter Infections: a Century of Challenges / D. Wong, T. B. Nielsen, R. A. Bonomo, et al. // Clin Microbiol Rev. - 2017. -Vol. 30, № 1. - P. 409-447.

79. Clonal spread of Acinetobacter baumannii sequence type 25 carrying blaOXA-23 in companion animals in France / A. Lupo, P. Châtre, C. Ponsin, et al. // Antimicrob Agents Chemother. - 2016. - Vol. 61, № 1. - AAC.01881-16.

80. Colistin resistance of Acinetobacter baumannii: clinical reports, mechanisms and antimicrobial strategies / Y. Cai, D. Chai, R .Wang, et al. // J Antimicrob Chemother. - 2012. - Vol. 67, № 7. - P. 1607-1615.

81. Colonization pressure as a risk factor for colonization by multiresistant Acinetobacter spp. and carbapenem-resistant Pseudomonas aeruginosa in an intensive care unit / M. F. DalBen, M. Basso, C. P. Garcia, et al. // Clinics (Sao Paulo). - 2013. -Vol. 68, № 8. - P. 1128-1133.

82. Complete Genome Sequence of ZW85-1 / X. Wang, Z. Zhang, Q. Hao, et al. //Genome Announc. - 2014. - Vol. 2, № 1. - P. 3-13.

83. Contribution of resistance-nodulation-cell division efflux systems to antibiotic resistance and biofilm formation in Acinetobacter baumannii / E. J. Yoon, Y. N. Chabane, S. Goussard, et al. // MBio. - 2015. - Vol. 6, № 2. - pii: e00309-15.

84. Control of an outbreak of carbapenem-resistant Pseudomonas aeruginosa in a haemato-oncology unit / M. Nagao, Y. Iinuma, J. Igawa, et al. // J Hosp Infect. -2011. - Vol. 79, № 1. - P. 49-53.

85. Control of carbapenemase-producing Klebsiella pneumoniae: a region-wide intervention / C. Gagliotti, V. Cappelli, E. Carretto, et al. // Euro Surveill. - 2014. - Vol. 19. - P. 671-677.

86. Control of Carbapenem-resistant Enterobacteriaceae, Acinetobacter bau-mannii, and Pseudomonas aeruginosa in Healthcare Facilities: A Systematic Review and Reanalysis of Quasi-experimental Studies / S. Tomczyk, V. Zanichelli, M. L. Grayson, et al. // Clin Infect Dis. - 2019. - Vol. 68, № 5. - P. 873-884.

81. Control of multidrug-resistant Acinetobacter baumannii in Hong Kong: Role of environmental surveillance in communal areas after a hospital outbreak / V. C. C. Cheng, S. C. Wong, J. H. K. Chen, et al. // Am J Infect Control. - 2018. - Vol. 46, № 1. - P. б0-бб.

88. Costs and Mortality Associated With Multidrug-Resistant Healthcare-Associated Acinetobacter Infections / R. E. Nelson, M. L. Schweizer, E .N. Perence-vich, et al. // Infect Control Hosp Epidemiol. - 201б. - Vol. 37, № 10. - P. 1212-1218.

89. Detection of antibiotic resistant Acinetobacter baumannii in various hospital environments: potential sources for transmission of Acinetobacter infections / Z. Shamsizadeh, M. Nikaeen, B. N. Esfahani, et al. // Environ Health Prev Med. - 2011. -Vol. 22. - P. 44.

90. Differences in phenotypic and genotypic traits against antimicrobial agents between Acinetobacter baumannii and Acinetobacter genomic species 13TU / J. H. Lee, C. H. Choi, H. Y. Kang, et al. // J Antimicrob Chemother. - 2001. - Vol. 59, № 4. - P. б33-б39.

91. Dissemination and characterization of, NDM-1-producing Acinetobacter pittii in an intensive care unit in China / J. Yang, Y. Chen, X. Jia, et al. // Clin Microbiol Infect. - 2012. - Vol. 18, № 12. - P. E506-E513.

92. Ebringer, A. An ante-mortem test for bovine spongiform encephalopathy involving "myelin-acinetobacter-neurofilaments" (MAN) tested in 12 strains of Acinetobacter bacteria // In: Multiple Sclerosis, Mad Cow Disease and Acinetobacter. -Springer, 2015. - P. 61-18.

93. Effect of daily chlorhexidine bathing on acquisition of carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii (CRAB) in the medical intensive care unit with CRAB endemicity / Y. K. Chung, J. S. Kim, S. S. Lee, et al. // Am J Infect Control. -2015. - Vol. 43, № 11. - P. 1111-1111.

94. Elkhatib, W. F. Integrons and antiseptic resistance genes mediate resistance of Acinetobacter baumannii and Pseudomonas aeruginosa isolates from intensive care unit patients with wound infections / W. F. Elkhatib, M. A. F. Khalil, H. M. Ashour // Curr Mol Med. - 2019. - Epub ahead of print.

95. EPIC II Group of Investigators. International Study of the Prevalence and Outcomes of Infection in Intensive Care Units / J. L. Vincent, J. Rello, J. Marshall, et al. // JAMA. - 2009. - Vol. 302, № 21. - P. 2323-2329.

96. Epidemiological evaluation of an Acinetobacter baumannii outbreak observed at an intensive care unit / T. K. Atik, B. Atik, O. Kilinç, et al. // Saudi Med J. -2018. - Vol. 39, № 8. - P. 767-772.

97. ESCMID-EUCIC clinical guidelines on decolonization of multidrug-resistant Gram-negative bacteria carriers / E. Tacconelli, F. Mazzaferri, A. M. de Smet, et al. // Clin Microbiol Infect. - 2019 - pii: S1198-743X(19)30025-4.

98. ESKAPE to ESCAPE, from KPC to CCC / F. G. De Rosa, S. Corcione, N. Pagani, et al. // Clin Infect Dis. - 2015. - Vol. 60, № 8. - P. 1289.

99. Espinal, P. Effect of biofilm formation on the survival of Acinetobacter baumannii on dry surfaces / P. Espinal, S. Marti, J. Vila // J Hosp Infect. - 2012. -Vol. 80, № 1. - P. 56-60.

100. European Centre for Disease Prevention and Control. Point prevalence survey of healthcare-associated infections and antimicrobial use in European acute care hospitals: protocol version 5.3. - Stockholm: ECDC; 2016.

101. Evolution of a clade of Acinetobacter baumannii global clone 1, lineage 1 via acquisition of carbapenem- and aminoglycoside-resistance genes and dispersion of ISAba1 / M. Hamidian, J. Hawkey, R. Wick, et al. // Microb Genom. - 2019. - Vol. 5, № 1. - e000242.

102. Extended-spectrum AmpC cephalosporinasein Acinetobacter baumannii: ADC-56 confers resistance to cefepime / G. B. Tian, J. M. Adams-Haduch, M. Taracila, et al. // Antimicrob Agents Chemother. - 2011. - Vol. 55, № 10. - P. 4922-4925.

103. Eze, E. C. Acinetobacter baumannii biofilms: effects of physicochemical factors, virulence, antibiotic resistance determinants, gene regulation, and future antimicrobial treatments / E. C. Eze, H.Y. Chenia, M. E. Zowalaty // Infect Drug Resist. -2018. - Vol. 11. - P. 2277-2299.

104. Factors associated with in-hospital mortality among critically ill surgical patients with multidrug-resistant Gram-negative infections / A. S. Jarrell, R. M. Curer, L. D. Berescu, et al. // J Crit Care. - 2018. - Vol. 43. - P. 321-326.

105. Fournier, P. E. The epidemiology and control of Acinetobacter baumannii in health care facilities / P. E. Fournier, H. Richet // Clin Infect Dis. - 2006. - Vol. 42, № 5. - P. 692-699.

106. Gao, J. G. Clinical manifestations and risk factors of poor prognosis of Acinetobacter baumannii intracranial infection / J. G. Gao, Y. Ye // Zhonghua Yi Xue Za Zhi. - 2018. - Vol. 98, № 37. - P. 2973-2977.

107. Garnacho-Montero, J. Managing Acinetobacter baumannii infections. / J. Garnacho-Montero, J. F. Tomtit // Curr Opin Infect Dis. - 2019. - Vol. 32, № 1. - P. 69-76.

108. Gaynes, R. National Nosocomial Infections Surveillance System. Overview of nosocomial infections caused by gram-negative bacilli / R. Gaynes, J. R. Edwards // Clin Infect Dis. - 2005. - Vol. 41, № 6. - P. 848-854.

109. Gaynes, R. Improving Outpatient Antibiotic Prescribing for Respiratory Tract Infections: Results of New Algorithms Used in European Trials / R. Gaynes, S. Levy // Infect Control Hosp Epidemiol. - 2015. - Vol. 36. - P. 725-729.

110. Genotyping of Acinetobacter baumannii in Nosocomial Outbreak and Surveillance / S. Vijayakumar, B. Veeraraghavan, A. K. Pragasam, et al. // Methods Mol Biol. - 2019. - Vol. 1946. - P. 17-22.

111. Goncharov, A. International epidemic clones of Acinetobacter baumannii in Russia / A. Goncharov, A. Solomennyi, T. Suborova // International journal of infectious diseases. - 2012. - Vol. 16, Suppl. 1. - P. E371.

112. Grochowalska, A. Analysis of Acinetobacter baumannii resistance patterns in patients with chronic obstructive pulmonarLinLiy disease (COPD) in terms of choice of effective empiric antibiotic therapy / A. Grochowalska, M. Koziol-Montewka, A. Sobieszczanska // Ann Agric Environ Med. - 2017. - Vol. 24, № 2. - P. 307-311.

113. High prevalence of OXA-143 and alteration of outer membrane proteins in carbapenem-resistant Acinetobacter spp. isolates in Brazil / A. K. Mostachio, A. S. Levin, C. Rizek, et al. // Int J Antimicrob Agents. - 2012. - Vol. 39, № 5. - P. 396-401.

114. Hurley, J. C. World-wide variation in incidence of Acinetobacter associated ventilator associated pneumonia: a meta-regression / J. C. Hurley // BMC Infect Dis. - 2016. - Vol. 16, № 1. - P. 577.

115. Ibrahim, M. E. Prevalence of Acinetobacter baumannii in Saudi Arabia: risk factors, antimicrobial resistance patterns and mechanisms of carbapenem resistance / M. E. Ibrahim // Ann Clin Microbiol Antimicrob. - 2019. - Vol. 18, № 1. - P. 1-12.

116. ICU-Associated Acinetobacter baumannii Colonisation/Infection in a High HIV Prevalence Resource-Poor Setting / N. B. Ntusi, M. Badura, H. Khalfey, et al. // PLoS One. - 2012. - Vol. 7, № 12. - e52452.

117. Identification of variable-number tandemrepeat (VNTR) sequences in Acinetobacter baumannii and interlaboratory validation of an optimized multiple-locus VNTR analysis typing scheme / C. Pourcel, F. Minandri, Y. Hauck, et al. // J Clin Microbiol. - 2011. - Vol. 49, № 4. - P. 539-548.

118. Identification of widespread, closely related Acinetobacter baumannii isolates in Portugal as a subgroup of European clone II / G. da Silva, L. Dijkshoorn, T. van der Reijden, et al. // Clin Microbiol Infect. - 2007. - Vol. 13, № 2. - P. 190-195.

119. Immunoprotective Efficacy of Acinetobacter baumannii Outer Membrane Protein, Fil F, Predicted Insilicoasa Potential Vaccine Candidate / R. Singh, N. Garg, G. Shukla, et al. // Front Microbiol. - 2016. - Vol. 7. - С. 158.

120. IMP-1-producing carbapenem-resistant Acinetobacter ursingii from Japan / S. Endo, M. Sasano, H. Yano, et al. // J Antimicrob Chemother. - 2012. - Vol. 67, № 10. - P. 2533-2534.

121. Impact of a hospital-wide multifaceted programme for reducing car-bapenem-resistant Enterobacteriaceae infections in a large teaching hospital in northern Italy / P. Viale, F. Tumietto, M. Giannella, et al. // Clin Microbiol Infect. - 2015. - Vol. 21 № 3. - P. 242-247.

122. Impact of appropriate antimicrobial therapy on mortality associated with Acinetobacter baumannii bacteremia: relation to severity of infection / Y. T. Lee, S. C. Kuo, S. P. Yang, et al. // Clin Infect Dis. - 2012. - P. 209-215.

123. Impact of expanded carbapenem resistant Enterobacteriacae (CRE) screening on rates of hospital acquired (HA) CRE infection / C. Passaretti, A. Neelakanta, M. Schmidt, et al // Open Forum Infectious Diseases. - 2016. - Vol. 3, № 1. - P. 1.

124. Incidence trends in pathogen-specific central line- associated bloodstream infections in US intensive care units, 1990-2010 / R. P. Fagan, J. R. Edwards, B. J. Park, et al. // Infect Control Hosp Epidemiol. - 2013. - Vol. 34, № 9. - P. 893-899.

125. Incidence, Microbiological Profile and Risk Factors of Healthcare-Associated Infections in Intensive Care Units: A 10 Year Observation in a Provincial Hospital in Southern Poland / M. Kolpa, M. Walaszek, A. Gniadek, et al. // Int J Environ Res Public Health. - 2018. - Vol. 15, № 1. pii: E112.

126. Incidence, risk factors and outcome of multi-drug resistant Acinetobacter baumannii nosocomial infections during an outbreak in a burn unit / A. L. Munier, L. Biard, M. Legrand, et al. // Int J Infect Dis. - 2019. - Vol. 79. - P. 179-184.

127. Influence of, ACB complex genospecies on clinical outcomes in a U.S. hospital with high rates of multidrug resistance / M. A. Fitzpatrick, E. Ozer, M. K. Bolon, et al. // J Infect. - 2015. - Vol. 70, № 2. - P. 144-152.

128. Infrequent air contamination with Acinetobacter baumannii of air surrounding known colonized or infected patients / C. Rock, A. D. Harris, J. K. Johnson, et al. // Infect Control Hosp Epidemiol. - 2015. - Vol. 36, № 7. - P. 830-832.

129. In-silico interaction studies suggest RND efflux pump mediates polymyxin resistance in Acinetobacter baumannii / P. Verma, P. Masuria, M. Tiwari, et al. // J Biomol Struct Dyn. - 2019. - Vol. 37, № 1. - P. 95-103.

130. Intestinal carriage of antibiotic resistant Acinetobacter baumannii among newborns hospitalized in Moroccan neonatal intensive care unit / B. Arhoune, B. Oumokhtar, F. Hmami, et al. // PLoS One. - 2019. - Vol. 14, № 1. - e0209425.

131. Israel Carbapenem-Resistant Enterobacteriaceae Working Group Containment of a country-wide outbreak of carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae in Is-

raeli hospitals via a nationally implemented intervention / M. J. Schwaber, B. Lev, A. Israeli, et al. // Clin Infect Dis. - 2011. - Vol. 52, № 7. - P. S4S-S55.

132. Jung, J. Acinetobacter species as model microorganisms in environmental microbiology: current state and perspectives / J. Jung, W. Park // Appl Microbiol Bio-technol. - 2015. - Vol. 99, № 6. - P. 2533-254S.

133. Karageorgopoulos, D. E. Current control and treatment of multidrug-resistant Acinetobacter baumannii infections / D. E. Karageorgopoulos, M. E. Falagas // Lancet Infect Dis. - 200S. - Vol. 8, № 12. - P. 751-7б2.

134. Lin, M. F. A method to assess influence of different medical tubing on biofilm formation by Acinetobacter baumannii / M. F. Lin, Y. Y. Lin, C. Y. Lan // J Mi-crobiol Methods. - 2019. - Vol. 1б0. - P. S4-S6.

135. McConnell, M. J. Acinetobacter baumannii: human infections, factors contributing to pathogenesis and animal models / M. J. McConnell, L. Actis, J. Pachón // FEMS Microbiol Rev. - 2013. - Vol. 37, № 2. - P. 130-155.

136. McDonald, L. C. National Nosocomial Infections Surveillance System Seasonal variation of Acinetobacter infections: 19S7-1996 / L. C. McDonald, S. N. Banerjee, W. R. Jarvis // Clin Infect Dis. - 1999. - Vol. 29, № 5. - P. 1133-1137.

137. Molecular epidemiological analysis of Acinetobacter baumannii strains isolated in patients with burn injury/ Yu. E. Skurikhina, T. D. Ibragimova, L. A. Sku-rikhina, et al. // Sovremennye tehnologii v medicine. - 201б. - Vol. 8, № 1. - P. 134139.

13S. Molecular epidemiology of Acinetobacter baumannii and Acinetobacter nosocomialis in Germany over a 5-year period (2005-2009) / X. Schleicher, P. G. Hig-gins, H. Wisplinghoff, et al. // Clin Microbiol Infect. - 2013. - Vol. 19, № 8. - P. 737742.

139. Mortality risk factors in patients with Acinetobacter baumannii ventilator-associated pneumonia / H. C. Chang, Y. C. Chen, M. C. Lin, et al. // J Formos Med Assoc. - 2011. - Vol. 110, № 9. - P. 5б4-571.

140. Multidrug Resistance Acinetobacter Bacteremia Secondary to Ventilator-Associated Pneumonia: Risk Factors and Outcome / E. Brotfain, A. Borer, L. Koyfman, et al. // J Intensive Care Med. - 2016. - Vol. 32, № 9. - P. 528-534.

141. Multidrug resistant Acinetobacter baumannii in veterinary medicine-emergence of an underestimated pathogen? / S. Müller, T. Janssen, L. H. Wieler // Berl Munch Tierarztl Wochenschr. - 2014. - Vol. 127, № 11-12. - P. 435-446.

142. Nosocomial bloodstream infections caused by gram-negative bacilli: epidemiology and risk factors for mortality / D. Lizaso, C. K. Aguilera, M. Correa, et al. // Rev Chilena Infectol. - 2008. - Vol. 25, № 5. - P. 368-373.

143. Nowak, P. Acinetobacter baumannii: biology and drug resistance - role of carbapenemases / P. Nowak, P. Paluchowska // Folia histochemical et cytobiologica. -2016. - Vol. 54, № 2. - P. 61-74.

144. Occupational transmission of Acinetobacter baumannii from a United States serviceman wounded in Iraq to a health care worker / T. J. Whitman, S. S. Qasba, J. G. Timpone, et al. // Clin Infect Dis. - 2008. - Vol. 47, № 4. - P. 439-443.

145. Occurrence of an Environmental Acinetobacter baumannii Strain Similar to a Clinical Isolate in Paleosol from Croatia / J. Hrenovic, G. Durn, I. Goic-Barisic, et al. // Appl Environ Microbiol. - 2014. - Vol. 80, № 9. - P. 2860-2866.

146. On behalf of the members of the Canadian Nosocomial Infection Surveillance Program. Results from the Canadian Nosocomial Infection Surveillance Program for detection of carbapenemase-producing Acinetobacter spp. in Canadian hospitals, 2010-2016 / D. A. Boyd, L. F. Mataseje, L. Pelude, et al. // J Antimicrob Chemother. -2019. - Vol. 74, № 2. - P. 315-320.

147. Outbreaks of imipenem-resistant Acinetobacter baumannii producing carbapenemases in Korea / S. H. Jeong, I. K. Bae, K. O. Park, et al. // J Microbiol. - 2006. - Vol. 44, № 4. - P. 423-431.

148. Park, J H. The impact of early adequate antimicrobial therapy on 14-day mortality in patients with monomicrobial Pseudomonas aeruginosa and Acinetobacter baumannii bacteremia / J. H. Park, S. H. Choi, J. W. Chung // J Infect Chemother. -2013. -Vol. 19, № 5. - P. 843-849.

149. Parte, A. C. LPSN - List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (bacterio.net), 20 years on // International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. - 2018. - Vol. 68. - P. 1825-1829.

150. Pathogenic Acinetobacter: from the Cell Surface to Infinity and Beyond / B. S. Weber, C. M. Harding, M. F. Feldman // J Bacteriol. - 2016. - Vol. 198, № 6. - P. 880-887.

151. Peleg, A. Y. Acinetobacter baumannii: emergence of a successful pathogen / A. Y. Peleg, H. SeiferVt, D. L. Paterson // Clin Microbiol Rev. - 2008. - Vol. 21, № 3. - P. 538-582.

152. Phenotypic and molecular characterization of Acinetobacter baumannii isolates causing lower respiratory infections among ICU patients / M. Jain, A. Sharma, M. K. Sen, et al. // Microb Pathog. - 2019. - Vol. 128. - P. 75-81.

153. Pneumonia in hospitalized neurologic patients: trends in pathogen distribution and antibiotic susceptibility / H. S. Lee, J. Moon, H. R. Shin, et al. // Antimicrob Resist Infect Control. - 2019 - Vol. 8. - P. 25.

154. Poirel, L. Multiplex PCR for detection of acquired carbapenemase genes / L. Poirel, T. R. Walsh, V. Cuvillier, et al. // Diagn Microbiol Infect Dis. - 2011. - Vol. 70, № 1. - P. 119-123.

155. Post, V. Detection of gene cassettes in Tn402-like class 1 integrons / V. Post, G. D. Recchia, R. M. Hall // Antimicrob Agents Chemother. - 2007. - Vol. 51, № 3. - P. 3467-346.

156. Potential role of active surveillance in the control of a hospital-wide outbreak of carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae infection / D. Ben-David, Y. Maor, N. Keller, et al. // Infect Control Hosp Epidemiol. - 2010. - Vol. 31. - P. 620626.

157. Potron, A. Emerging broad-spectrum resistance in Pseudomonas aerugino-sa and Acinetobacter baumannii: mechanisms and epidemiology / A. Potron, L. Poirel, P. Nordmann // Int J Antimicrob Agents. - 2015. - Vol. 45, № 6. - P. 568-585.

158. Predictors of increased cost and length of stay in the treatment of postoperative spine surgical site infection / T. J. Blumberg, E. Woelber, C. Bellabarba, et al. // Spine J. - 2018. - Vol. 18, № 2. - P. 300-306.

159. Predictors of mortality in Acinetobacter baumannii bacteremia / H. P .Chen, T. L. Chen, C. H. Lai, et al. // J Microbiol Immunol Infect. - 2005. - Vol. 38, № 2. - P. 127-136.

160. Prevalence and Mechanisms of Carbapenem Resistance in Acinetobacter baumannii: A Comprehensive Systematic Review of Cross-Sectional Studies from Iran / M. J. Nasiri, S. Zamani, F. Fardsanei, et al. // Microb Drug Resist. - 2019. - Epub ahead of print.

161. Prevalence of Acinetobacter baumannii bacteremia in intensive care units of Ibn Rochd University Hospital, Casablanca / A. E. Kettani, F. Maaloum, I. Diawara, et al. // Iran J Microbiol. - 2017. - Vol. 9, № 6. -P. 318-323.

162. Prevalence of digestive tract colonization of carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii in hospitals in Saudi Arabia / R. Aljindan, H. Bukharie, A .Alomar, et al. // J Med Microbiol. - 2015. - Vol. 64, Pt. 4. - P. 400-406.

163. Prevalence of extended-spectrum beta-lactamase genes in Acinetobacter baumannii strains isolated from nosocomial infections in Tehran, Iran / M. H. Abdar, M. Taheri-Kalani, K .Taheri, et al. // GMS Hyg Infect Control. - 2019. - Vol. 14. -Doc02.

164. Reservoirs of Acinetobacter baumannii outside the hospital and potential involvement in emerging human community-acquired infections / M. Eveillard, M .Kempf, O. Belmonte, et al. // Int J Infect Dis. - 2013. - Vol. 17. - P. 802-805.

165. Richards, A. M. Code blue: Acinetobacter baumannii, a nosocomial pathogen with a role in the oral cavity / A. M. Richards, Y. Abu Kwaik, R. J. Lamont // Mol Oral Microbiol. - 2015. - Vol. 30. - P. 2-16.

166. Risk Factors and Impact on Clinical Outcome of Multidrug-Resistant Acinetobacter baumannii Acquisition in Cardiac Surgery Patients / M. D. Pierri, G. Crescenzi, F. Capestro, et al. // J Cardiothorac Vasc Anesth. - 2016. - Vol. 30, № 3. -P. 680-686.

167. Risk factors and outcomes of hospitalized patients with blood infections caused by multidrug-resistant Acinetobacter baumannii complex in a hospital of Northern China / N. Guo, W. Xue, D. Tang, et al. // Am J Infect Control. - 2016. - Vol. 44, № 4. - P. e37-e39.

168. Risk factors for acquisition and mortality of multidrug-resistant Acinetobacter baumannii bacteremia: A retrospective study from a Chinese hospital / H. Zhou, Y. Yao, B. Zhu, et al. // Medicine (Baltimore). - 2019. - Vol. 98, № 13. - e14937.

169. Risk factors for healthcare-associated urinary tract infection and their applications in surveillance using hospital administrative data: a systematic review / C. King, L. G. Alvarez, A. Holmes, et al. // J Hosp Infect. - 2012. - Vol. 82, № 4. - P. 219-226.

170. Sandvang, D. Characterization of integrons and antibiotic resistance genes in Danish multiresistant Salmonella enterica Typhimurium DT104 / D. Sandvang, F. M. Aarestrup, L. B. Jensen // FEMS Microbiol Lett. - 1997. - Vol. 157, № 8 - P. 177-181.

171. Santaji, S. Mechanisms of Antimicrobial Resistance in ESKAPE Pathogens / S. Santajit, N. Indractisawattana / Bio Med Research International. - Vol. 2016. - ID 2475067.

172. Seasonal and temperature-associated increases in gram-negative bacterial bloodstream infections among hospitalized patients / M. R. Eber, M Shardell, M L Schweizer, et al. // PLoS ONE. - 2011. - Vol. 6, № 9. - e25298.

173. Severe community-acquired bloodstream infection with Acinetobacter ursingii in person who injects drugs / H. J. Salzer, T. Rolling, S. Schmiedel, et al. // Emerg Infect Dis. - 2016. - Vol. 22, № 1. - P. 134-137.

174. Smith, M. G. Microbial synergy via an ethanol-triggered pathway / M. G. Smith, S. G. Des Etages, M. Snyder // Mol Cell Biol. - 2004. - Vol. 24, № 9. - P. 38743884.

175. Spellberg, B. "Airborne assault": a new dimension in Acinetobacter baumannii transmission / B. Spellers, R. A. Bonomo // Crit Care Med. - 2013. - Vol. 41. -P. 2042-2044.

176. Spellberg, B. The value of single-pathogen antibacterial agents / B. Spell-berg, J. H. Rex // Nat Rev Drug Discov. - 2013. - Vol. 12, № 12. - P. 963.

177. Spread of amikacin resistance in Acinetobacter baumannii strains isolated in Spain due to an epidemic strain / J.Vila, J. Ruiz, M. Navia, et al. // J Clin Microbiol. -1999. - Vol. 37. - P. 758-761.

178. Staring at the Cold Sun: Blue Light Regulation Is Distributed within the Genus Acinetobacter / A. Golic, M. Vaneechoutte, A. Nemec, et al. // Plots One. -2013. - Vol. 8, № 1. - e55059.

179. Successful containment of carbapenem-resistant Enterobacteriaceae by strict contact precautions without active surveillance / N. H. Kim, W. D. Han, K. H. Song, et al. // Am J Infect Control. - 2014. - Vol. 42, № 12. - P. 1270-1273.

180. Successful control of carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii in a Korean university hospital: a 6-year perspective / O. H. Cho, M. H. Bak, E. H. Baek, et al. // Am J Infect Control. - 2014. - Vol. 42, № 9. - P. 976-979.

181. Summer peaks in the incidences of gram-negative bacterial infection among hospitalized patients / E. N .Perencevich, J. C. McGregor, M .Shardell, et al. // Infect Control Hosp Epidemiol. - 2008. - Vol. 29, № 12. - P. 1124-1131.

182. Surgical site infections after craniotomy: a matched health-care cost and length of stay study / I. M. Hweidi, M. A. Barbarawi, L. I. Tawalbeh, et al. // J Wound Care. - 2018. - Vol. 27, № 12. - P. 885-890.

183. Survival of Acinetobacter baumannii on dry surfaces: comparison of outbreak and sporadic isolates / A. Jawad, H. Seifert, A. M. Snelling, et al. // J Clin Microbiol. - 1998. - Vol. 36, № 7. - P. 1938-1341.

184. Survival of ESKAPE pathogen Acinetobacter baumannii in water of different temperatures and pH / S. Dekic, J. Hrenovic, T. Ivankovic, et al. // Water Sci Tech-nol. - 2018. - Vol. 78, № 6. - P. 1370-1376.

185. Team and Participating NHSN Facilities. Antimicrobial-resistant pathogens associated with healthcare-associated infections: summary of data reported to the National Healthcare Safety Network at the Centers for Disease Control and Prevention,

2009-2010 / D. M. Sievert, P. Ricks, J. R. Edwards, et al. // Infect Control Hosp Epidemiol. - 2013. - Vol. 34, № 1. - P. 1-14.

186. The biology of habitat dominance; can microbes behave as weeds? / J. A. Cray, A. N. Bell, P. Bhaganna, et al. // Microb Biotechnol. - 2013. - Vol. 6, № 5. - P. 453-492.

187. The Ecology, Biology and Pathogenesis of Acinetobacter spp.: An Overview / H. J. Doughari, P. A. Ndakidemi, I. S. Human, et al. // Microbes Environ. - 2011.

- Vol. 26, № 2. - P. 101-112.

188. The European Nucleotide Archive (ENA). Genomes Pages - Plasmid [Electronic resource]. - URL: https://www.ebi.ac.uk/genomes/plasmid.html (accessed 26.04.2019).

189. Trauma is associated with a better prognosis in intensive care patients with Acinetobacter infections / A. C. Tonacio, M. S. Oliveira, L. M. Malbouisson, et al. // Infection. - 2014. - Vol. 42, № 1. - P. 89-95.

190. Urinary tract infection by Acinetobacter baumannii and Pseudomonas aeruginosa: evolution of antimicrobial resistance and therapeutic alternatives / G. Jiménez-Guerra, V. Heras-Cañas, M. Gutiérrez-Soto, et al. // J Med Microbiol. - 2018. -Vol. 67, № 6. - P. 790-797.

191. VEB-1 extended-spectrum beta-lactamase-producing Acinetobacter baumannii, France / T. Naas, B. Coignard, A. Carbonne, et al. // Emerg Infect Dis. - 2006.

- Vol. 12. - P. 1214-1222.

192. Vila, J. Porins efflux pumps and multidrug resistance in Acinetobacter baumannii. / J. Vila, S. Marti, J. Sanchez-Cespedes // J Antimicrob Chemother. - 2011.

- Vol. 55, № 3. - P. 947-953.

193. Villegas, M V. Acinetobacter outbreaks, 1977-2000 / M. V. Villegas, A. I. Hartstein // Infect Control Hosp Epidemiol. - 2003. - Vol. 24, № 4. - P. 284-295.

194. Visca, P. Acinetobacter infection an emerging threat to human health. / P. Visca, H. Seifert, K. J. Towner // IUBMB Life. - 2011. - Vol. 63, № 12. - P. 10481054.

195. Wareth, G. Acinetobacter baumannii - a neglected pathogen in veterinary and environmental health in Germany / G.Wareth, H. Neubauer, L. D. Sprague // Vet Res Commun. - 2019. - Vol. 43, № 1. - P. 1-6.

196. WHO. Antimicrobial resistance. Factsheet WHON 194 (Updated April 2014) [Electronic resource] - URL: http://www.who.int/mediacentre/factsheets/fs194/en/ (accessed 26.04.2019).

197. WHO. Global priority list of antibiotic-resistant bacteria to guide research, discovery, and development of new antibiotics [Electronic resource]. - 2017 - URL: https://www.who.int/medicines/publications/WHO-PPL-Short_Summary_25Feb-ET_NM_WHO.pdf?ua=1 (accessed 26.04.2019).

198. WHO. Guidelines on core components of infection prevention and control programmes at the national and acute health care facility level [Electronic resource]. -2017. - URL: http://www.who.int/gpsc/ipc-components-guidelines/en/ (accessed 22.01.2019).

199. Wieland, K. Nosocomial outbreaks caused by Acinetobacter baumannii and Pseudomonas aeruginosa: Results of a systematic review / K. Wieland, P. Chhat-wal, R. P. Vonberg // Am J Infect Control. - 2018. - Vol. 46, № 6. - P. 643-648.

ПРИЛОЖЕНИЕ

ПРИЛОЖЕНИЕ А

КАРТА ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКОГО НАБЛЮДЕНИЯ №_

Ф.И.О. больного

Отделение

Количество койко-дней

№ истории болезни Палата №

Возраст

Пол

Дата поступления

Диагнозы (МКБ -10): основной:

сопутствующие:

Материал на посев присоединения ИСМП

Дата бактериологического посева Культура Бессимптомное носительство возбудителя

Обращение за медицинской помощью в течение года

Применение антибиотиков в течение года

Медицинские технологии

Оперативное вмешательство (дата, № операционной):

Катетеризация центральных вен (сутки):

- подключичной

Катетеризация периферических вен (сутки):

- лучевой

Внутривенная инъекция (да/нет)

Внутримышечная инъекция (да/нет)

Люмбальная пункция (да/нет)

Внутривенная инфузия при помощи системы (да/нет)

Внутривенные инфузии через инфузомат (да/нет)

Катетеризация мочевого пузыря (сутки)

Катетеризация мочеточника (сутки)

ЭТН (часы)

ИВЛ (сутки)

Санация ТБД (да/нет)

CPAP (часы)

Бронхоскопия (количество процедур)

Ингаляция кислорода

Ингаляции лекарственных препаратов (да/нет)

Установка дренажей (да/нет)

Назначение антибиотиков

При поражении структур головного мозга

Наличие нарушения сознания

Оглушение

Сомноленция

Сопор

Баллы по шкале инсульта

Степень инвалидности по Ренкину (баллы)

Индекс мобильности по Ревермид (баллы)

Шкала Бартела (баллы)

Кома I

Кома II

Кома III

Гидроцефалия (да/нет)

Наличие шунта (да/нет)

Белок ликвор (мг/дл)

Цитоз ликвор (в п/з)

Эритроциты ликвор (в п/з)

Вентрикулосубглиальное дренирование (количество)

Вентрикулоперитонеальный дренаж (да/нет)

Наружное дренирование боковых желудочков (да/нет)

Ликвор (результаты микробиологического исследования)

Вентрикулярные пункции (количество)

Использование седативных лекарственных средств (да/нет)

Применение наркотических лекарственных средств (да/нет)

Применение миорелаксантов

Заключение:

Подпись

Дата заполнения