Эпидемиологическая оценка бактериофагов как факторов эволюции госпитальных штаммов и средств борьбы с внутрибольничными инфекциями тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 14.02.02, кандидат наук Асланов, Батырбек Исмелович

• Асланов, Батырбек Исмелович
• кандидат наук
• 2016

Оглавление диссертации кандидат наук Асланов, Батырбек Исмелович

ОГЛАВЛЕНИЕ

ВВЕДЕНИЕ

Глава 1 БАКТЕРИОФАГИ: ФАКТОРЫ ЭВОЛЮЦИИ ВОЗБУДИТЕЛЕЙ ВНУТРИБОЛЬНИЧНЫХ ИНФЕКЦИЙ И ЭФФЕКТИВНЫЕ АНТИБАКТЕРИАЛЬНЫЕ СРЕДСТВА (обзор литературы)

1.1 Роль бактериофагов в эволюции бактерий

1.2 Использование бактериофагов в качестве антибактериального средства

1.3 Достоинства бактериофагов как терапевтических препаратов

1.4 Недостатки фаготерапии

1.5 Бактериофаги как профилактические препараты

1.6 Определение фагорезистентности как условие эффективности фаготерапии

1.7 Применение бактериофагов для биологической дезинфекции

1.8 Бактериофаги для борьбы с бопленками

1.9 Примененин отдельных компонентов и ферментов бактериофагов

1.10 Антимикробные пептиды

Глава 2 МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

Глава 3 ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКАЯ ОЦЕНКА ЭКОЛОГИИ

БАКТЕРИОФАГОВ В УСЛОВИЯХ СТАЦИОНАРОВ

3.1 Циркуляция в стационарах бактериофагов Pseudomonas aeruginosa

3.2 Циркуляция в стационарах бактериофагов Staphylococcus aureus

3.3 Циркуляция в стационарах бактериофагов E.coli

3.4 Циркуляция в стационарах бактериофагов Enterococcus spp

3.5 Циркуляция в стационарах бактериофагов Klebsiella spp

3.6 Циркуляция в стационарах бактериофагов Proteus spp

3.7 Совместная циркуляция бактерий и бактериофагов в одной экологической нише

3.8 Формирование и функционирование паразитарных экосистем

с участием бактериофагов

Глава 4 ФОРМИРОВАНИЕ И ФУНКЦИОНИРОВАНИЕ ПАРАЗИТАРНЫХ ЭКОСИСТЕМ С УЧАСТИЕМ БАКТЕРИОФАГОВ В СТАЦИОНАРНЫХ УСЛОВИЯХ

4.1 Изучение роли бактериофагов в усилении патогенного потенциала бактерий - возбудителей внутрибольничных инфекций

4.2 Изучение роли бактериофагов в росте антибиотикорезистентности госпитальных штаммов

4.3 Изучение роли бактериофагов в повышении способности возбудителей внутрибольничных инфекций к эпидемическому распространению

4.4 Изучение роли бактериофагов в саморегуляции эпидемического процесса внутрибольничных инфекций

Глава 5 ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКАЯ ОЦЕНКА БАКТЕРИОФАГОВ КАК

СРЕДСТВ БОРЬБЫ С ВНУТРИБОЛЬНИЧНЫМИ ИНФЕКЦИЯМИ

5.1 Принципы рациональной фаготерапии и фагопрофилактики

5.2 Изучение противоэпидемического потенциала вирулентных бактериофагов

5.3 Изучение эффективности бактериофагов для предотвращения формирования биопленок и их деструкции

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

ВЫВОДЫ

ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ

ПЕРСПЕКТИВЫ ДАЛЬНЕЙШЕЙ РАЗРАБОТКИ ТЕМЫ ИССЛЕДОВАНИЯ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

ПРИЛОЖЕНИЯ

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Эпидемиологическая оценка бактериофагов как факторов эволюции госпитальных штаммов и средств борьбы с внутрибольничными инфекциями»

ВВЕДЕНИЕ

Актуальность темы исследования

Инфекции, связанные с оказанием медицинской помощи (ИСМП) являются одной из самых актуальных проблем современного здравоохранения в силу широкого распространения, негативных последствий для здоровья пациентов, персонала медицинских учреждений и экономики государства. Пациенты с ИСМП находятся в стационаре в 2-3 раза дольше, чем аналогичные пациенты без признаков инфекции. Это является причиной роста стоимости лечения в 3-4, а риска летального исхода - в 5-7 раз (Покровский В.И. и соавт., 2012).

Изучение проблемы ИСМП, в особенности внутрибольничных инфекций (ВБИ), неразрывно связано с необходимостью изучения биологических свойств их возбудителей, в частности вопросов эволюции госпитальных штаммов.

Бактериофаги (фаги) играют чрезвычайно важную роль в эволюции бактерий и в реализации их патогенного потенциала. Бактериофаги могут осуществлять горизонтальный генетический обмен между штаммами микробов путем ли-зогенной конверсии или трансдукции. В ходе лизогенной конверсии может происходить изменение биологических свойств бактериальной клетки вследствие заражения ее умеренным бактериофагом. Некоторые фаги передают бактериям гены, повышающие вирулентность микроорганизмов, способность их к адаптации к условиям окружающей среды, играя, тем самым, важную роль в их эволюции (Brüssow H. et а1., 2004).

Феномен фаговой трансдукции может сопровождаться, в частности, приобретением бактериями генов устойчивости к антибактериальным препаратам (Schicklmaier P. et а1., 1995; Brüssow H. et а1., 2004; Mazaheri Nezhad Fard R. et а1., 2011; Varga M. et а1., 2012).

Подобные изменения биологических свойств бактерий под воздействием бактериофагов могут сопровождаться ростом патогенного потенциала микробов и их способности к эпидемическому распространению, а также снижением эффективности антибиотикотерапии вызванных ими инфекционных заболеваний.

Эти обстоятельства диктуют необходимость глубокого изучения вопросов эволюции возбудителей ИСМП под влиянием бактериофагов.

Вместе с тем, бактериофаги могут быть использованы как эффективные средства лечения и профилактики ИСМП. Это особенно актуально в виду угрожающих масштабов распространения антибиотикорезистентности у возбудителей ИСМП. При сохранении нынешней тенденции ситуация в борьбе с инфекционными заболеваниями в скором времени может стать такой же, какой была до открытия антибиотиков. В этой связи ВОЗ и органы здравоохранения во всем мире привлекают внимание к необходимости скорейшего решения проблемы лекарственной устойчивости, призывая, в том числе, всемерно поддерживать усилия по разработке новых решений для борьбы с инфекционными заболеваниями в условиях спада темпа разработок новых антибиотиков многими фармацевтическими компаниями.

В сложившихся условиях одним из эффективных компонентов борьбы с бактериальными инфекциями, в тот числе вызванными антибиотикорезистентны-ми штаммами, может явиться использование бактериофагов.

Степень разработанности темы исследования

В настоящее время известно, что бактериофаги вносят существенный вклад в эволюционные процессы бактерий. В частности, в ходе лизогенизации бактерии умеренные фаги встраиваются как профаг в бактериальный геном. Считается, что профаги составляют значительную часть генома, приобретенной многими бактериями в ходе горизонтального генетического обмена (Brüssow H. et а!., 2004). Известна роль бактериофагов в формировании патогенных свойств у многих патогенных и условно-патогенных бактерий. К настоящему времени изучено множество бактериофагов, играющих значительную роль в кодировании факторов вирулентности у бактерий (Elsabbagh H. et а!., 1993; Dobrindt U. et а!., 2003; Tóth I. et а!., 2003; Brüssow H. et а1., 2004; Hagan E.C. et а1., 2010; Yasmin A. et а1., 2010; Toba F.A. et а!., 2011).

Фаговая трансдукция описана у многих бактерий (Brussow H. et al., 2004; Schicklmaier P. et а!., 1995). Известно множество примеров передачи бактериофагами генов устойчивости к антибиотикам. Например, бактериофаги мети-циллинорезистентных штаммов Staphylococcus aureus могут передавать гены устойчивости к пенициллину и тетрациклину (Varga M. et а!., 2012), а фаги энтерококков способны переносить гены устойчивости к тетерациклину и гентамици-ну (Mazaheri Nezhad Fard R. et а!., 2011).

Несмотря на широкое разнообразие исследований по участию фагов в кодировании факторов вирулентности у бактерий, отсутствуют исследования по изучению фагоопосредованной эволюции госпитальных штаммов - возбудителей ВБИ. Наибольшее распространение вирулентные и антибиотикорезистентные варианты возбудителей могут получать в относительно замкнутых искусственных экосистемах, в частности в госпитальной среде. Стационары представляют собой своеобразные резервуары, в которых, благодаря широким возможностям циркуляции различных штаммов бактерий и возможностям для горизонтального генетического обмена, формируются новые варианты возбудителей, в том числе госпитальные штаммы, обладающие повышенным патогенным потенциалом развития инфекционного процесса, способностью к адаптации к условиям окружающей среды медицинских учреждений и, соответственно, способностью к эпидемическому распространению. В этой связи изучение вопросов эволюции госпитальных штаммов возбудителей ВБИ под влиянием бактериофагов приобретает высокую актуальность.

Бактериофаги, как средства для лечения и профилактики инфекционных заболеваний, привлекают к себе внимание с момента их открытия. К настоящему времени в отечественной и зарубежной медицинской и научной практике накоплен обширный опыт применения бактериофагов в качестве антибактериальных препаратов (Кисина В.И. и соавт., 1996; Перепанова Т.С., 1996; Лазарева Е.Б. и соавт., 2001; Акимкин В.Г., Покровский В.И., 2002; Хайруллин И.Н. и соавт., 2002; Асланов Б. И. и соавт., 2003; Лазарева Е.Б., 2003; Дарбеева О.С. и соавт., 2004; Парфенюк Р.Л., 2004; Бондаренко А.В. и соавт., 2005; Мирошников К.А. и

соавт., 2006; Захарова Ю.А. и соавт., 2007; Акимкин В.Г. и соавт., 2010; Дроздова О.М., Брусина Е.Б., 2010; Дрюккер В.В., Горшкова А.С., 2012; Зуева Л.П. и соавт., 2012; Зурабов А.Ю. и соавт., 2012; Loeffler J.M. et al., 2001; Gorski A. et al., 2003; Rhoads D.D. et al., 2009; Wright A. et al., 2009; Kutateladze M., Adamia R., 2010; Sarker S.A, 2012; Barbier F. et al., 2013; Hoe S. et al., 2013; McCallin S., et al., 2013; Sulakvelidze A., 2013).

Несмотря на данное обстоятельство, крайне мало исследований по оценке эпидемиологической эффективности применения бактериофагов против ИСМП. Из существующих работ можно отметить исследования по нозокомиальному сальмонеллезу у взрослых (Акимкин В.Г., Покровский В.И., 2002), элиминации P.aeruginosa из внешней среды стационара (Дроздова О.М., Брусина Е.Б., 2010), элиминации K.pneumoniae из отделения реанимации новорожденных (Власова А.В., 2013).

Кроме того, не существует четко сформулированных принципов рациональной фаготерапии и фагопрофилактики с использованием исключительно вирулентных бактериофагов. Разработка концепции рациональной фаготерапии особенно важна в свете представленных выше эволюционных механизмов формирования патогенного потенциала бактерий под влиянием умеренных фагов.

Большую актуальность в настоящее время приобретает проблема формирования биопленок возбудителями ВБИ. Особого внимания заслуживает вопрос о возможности применения бактериофагов для борьбы с ними. К настоящему времени имеется ряд работ по оценке эффективности фагов против формирования биопленок (Lu T. K., Collins J. J., 2007; Weiling Fu et al., 2010; Chibeu A. et al., 2012; Liao K.S. et al., 2012; Seth A.K. et al., 2013). Наибольшую важность представляет возможность использования фагов для борьбы с биопленками на устройствах для инвазивных медицинских манипуляций, в частности, сосудистых и мочевых катетерах. Несмотря на проводимые исследования, направленные на решение проблемы биопленок бактерий - возбудителей ВБИ, этот вопрос остается крайне актуальным.

Цель: оценка роли бактериофагов в эволюции возбудителей внутриболь-ничных инфекций и противоэпидемического потенциала бактериофагов.

Задачи:

1. Выявить экологические закономерности циркуляции бактериофагов возбудителей ВБИ в стационарах различного профиля и влияние этого явления на формирование саморегулирующихся паразитарных экосистем «пациенты-бактерии-фаги» .

2. Оценить распространенность фагоопосредованных генов вирулентности в популяциях возбудителей ВБИ, циркулирующих в стационарах различного профиля.

3. Провести оценку распространенности генов вирулентности в популяциях бактериофагов, циркулирующих в стационарах различного профиля.

4. Оценить влияние генов вирулентности, кодируемых бактериофагами в составе паразитарных экосистем, на изменение патогенного и эпидемического потенциала возбудителей ВБИ.

5. Разработать и обосновать принципы рационального применения бактериофагов для борьбы с ВБИ.

6. Оценить эпидемиологическую эффективность рационального использования бактериофагов в стационарах различного профиля.

7. Оценить эффективность литических бактериофагов для профилактики и деструкции формирования биопленок P.aeruginosa.

Научная новизна

Впервые выявлены экологические аспекты циркуляции различных видов бактериофагов в госпитальных условиях и сформулирована теория формирования саморегулирующихся устойчивых паразитарных экосистем «пациенты -бактерии-фаги». Впервые сформулированы положения теории формирования, функционирования и саморегуляции таких экосистем.

Впервые проведена оценка влияния бактериофагов, входящих в указанные экосистемы, на формирование патогенного и эпидемического потенциала госпитальных штаммов - возбудителей ВБИ.

Впервые разработаны и обоснованы рациональные принципы эффективного использования бактериофагов для противоэпидемических целей в рамках борьбы с внутрибольничными инфекциями.

Теоретическая и практическая значимость

В результате использования совокупности методов получены новые теоретические знания об экологических закономерностях циркуляции бактериофагов в стационарах, сосуществование которых с госпитальными штаммами может приводить к формированию устойчивых паразитарных экосистем. Выявлено, что указанное явление играет значительную роль в эволюции госпитал ь-ных штаммов.

Учитывая высокую актуальность ВБИ и глобальное распространение резистентности к антибиотикам, возникает необходимость в использовании дополнительных средств борьбы с бактериальными инфекциями в госпитальных условиях. Такими дополнительными, а в ряде случаев альтернативными или единственными средствами являются бактериофаги, применение которых может быть высокоэффективным способом борьбы с ВБИ. Использование на практике разработанных подходов позволяет добиться значительного эпидемиологического эффекта в отношении ВБИ в стационарах различного профиля.

Методология и методы исследования

Структура и организация работы были определены ее целью, которая, с одной стороны, заключалась в оценке роли бактериофагов в эволюции госпитальных штаммов, а с другой - в оценке эпидемиологической эффективности рациональной фаготерапии. Данная работа представляет собой совокупность эпидемиологических, микробиологических, молекулярно-генетических и статистических

методов. Основными методологическими характеристиками работы являются целостность, комплексность, системность, объективность и валидность.

Исследование проводилось в ряде лечебно-профилактических организаций различного профиля: травматологических, урологических, хирургических, гинекологических, онкологических, ожоговых стационарах, отделениях реанимации новорожденных. Помимо пациентов, в указанных стационарах проводилось исследование биологического материала, полученного от людей из внебольничной популяции.

География исследований достаточно широка: проводилась изучение биологических свойств возбудителей ВБИ, выделенных из образцов биологического материала, полученных из ряда регионов России.

В работе обобщен обширный объем данных, полученных за многолетний период с 1997г. по 2016 гг.

Положения, выносимые на защиту:

1. В стационарах, наряду с циркуляцией штаммов-возбудителей ВБИ, происходит интенсивная циркуляция их бактериофагов, что приводит к формированию паразитарных экосистем «пациент-возбудитель инфекции-бактериофаг».

2. Бактериофаги в составе паразитарных экосистем играют значительную роль в эволюции госпитальных штаммов, приводящей к усилению их патогенного и эпидемического потенциала.

3. Рациональная модель использования бактериофагов с лечебной и противоэпидемической целями - применение исключительно литических фагов, не содержащих генов вирулентности.

4. Рациональная фаготерапия является высокоэффективным способом борьбы с ВБИ в условиях неуклонно растущей резистентности к антибиотикам. Рациональное использование бактериофагов позволяет добиться значительного противоэпидемического эффекта.

Степень достоверности результатов исследования

В ходе выполнения работы был использован комплекс современных и оригинальных методов и способов сбора, описания и анализа данных.

Достоверность и обоснованность научных положений, выводов и рекомендаций обеспечены системным подходом, обширностью и разнообразием материала, накопленным за длительный период, и применением современных эпидемиологических, микробиологических, молекулярно-генетических и статистических методов. На обширном фактическом материале с эпидемиологических позиций изучены фагоопосредованные механизмы формирования патогенного и эпидемического потенциала госпитальных штаммов; выдвинуты положения теории формирования тройственных паразитарных систем в стационарах, дополняющие теорию саморегуляции эпидемического процесса бактериальных инфекций; разработана концепция рациональной фаготерапии и оценена эпидемиологическая эффективность применения бактериофагов для борьбы с ВБИ.

Апробация результатов исследования

Основные положения диссертационной работы были представлены на научных мероприятиях Всероссийского и международного уровней: VIII съезде Всероссийского общества эпидемиологов, микробиологов и паразитологов (Москва, 2002 г.); 3-й Российской научно-практической конференции с международным участием «Современные проблемы эпидемиологии, диагностики и профилактики внутрибольничных инфекций» (Санкт-Петербург, 2003); Научно-практической конференции с международным участием «Современные средства иммунодиагностики, имунно- и экстренной профилактики актуальных инфекций», Санкт-Петербург, 2004; Российской научно-практической конференции «Узловые вопросы борьбы с инфекцией» (Санкт-Петербург, 2004); Всероссийской научной конференции «Эпидемиология, лабораторная диагностика и профилактика вирусных инфекций» (Санкт-Петербург, 2005); 7-м Северо-Балтийском Международном конгрессе по инфекционным заболеваниям (7th Nordic-Baltic Congress on Infectious Diseases) «Current Challenges and New Opportunities», Лат-

вия (Рига, 2006); IX съезде Всероссийского научно-практического общества эпидемиологов, микробиологов и паразитологов (Москва, 2007); Российской научно-практической конференции «Инфекции, вызываемые условно-патогенными микроорганизмами» (Москва, 2007); Всероссийской научной конференции «Проблемы современной эпидемиологии. Перспективные средства и методы лабораторной диагностики и профилактики актуальных инфекций» (Санкт-Петербург, 2009); Научно-практической конференции «Актуальные проблемы медицины и биологии» (Санкт-Петербург, 2010); II Международном конгрессе «Стратегия и тактика борьбы с внутрибольничными инфекциями на современном этапе развития медицины» (Москва, 2011); Всероссийском ежегодном конгрессе «Инфекционные болезни у детей: диагностика, лечение и профилактика» (Санкт-Петербург, 2011); I конференции «Профилактическая медицина-2011» (Санкт-Петербург,

2011); II конференции «Профилактическая медицина-2012» (Санкт-Петербург,

2012); Всероссийской научной конференции «Отечественная эпидемиология в XXI веке: приоритетные направления развития и новые технологии в диагностике и профилактике болезней человека» (Санкт-Петербург, 2012); X съезде Всероссийского научно-практического общества эпидемиологов, микробиологов и паразитологов (Москва, 2012); 15-м Международном конгрессе по инфекционным заболеваниям (15th International Congress on Infectious diseases) (Таиланд, Бангкок, 2012); Всероссийской научно-практической конференции по медицинской микробиологии и клинической микологии (XV Кашкинские чтения) (Санкт-Петербург,

2012); Всероссийской научно-практической конференции по медицинской микробиологии и клинической микологии (XVI Кашкинские чтения) (Санкт-Петербург,

2013); VI международном Конгрессе «Рациональная фармакотерапия 2013» (Санкт-Петербург, 2013); Научно-практической конференции «От эпидемиологии к диагностике актуальных инфекций: подходы, традиции, инновации» (Санкт-Петербург, 2014); научно-практической конференции «Современные возможности бактериофаготерапии» (Пермь, 2014); Всероссийской научно-практической конференции специалистов по контролю инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи (Москва, 2014); Второй научно-практической конференции с

международным участием «Бактериофаги: теоретические и практические аспекты применения в медицине, ветеринарии и пищевой промышленности» в рамках Третьего Санкт-Петербургского международного экологического форума «Окружающая среда человека: фундаментальные, клинические и экологические аспекты современной микробиологии» (Санкт-Петербург, 2014); Республиканской конференции «Вопросы эпидемиологии и профилактики инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи» (Сыктывкар, 2014); Медицинском форуме «Беломорские зори» (Архангельск, 2014); Научно-практической конференции «Актуальные вопросы инфекционной патологии» (Екатеринбург, 2014); Областной научно-практической конференции «Бактериофаги в борьбе с инфекциями в медицинских организациях» (Нижний Новгород, 2014); Региональной конференции «Профилактика инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи» (Калининград, 2014); Всероссийской научно-практической конференции с международным участием специалистов по контролю инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи (Москва, 2015); Всероссийской научно-практической конференции с международным участием специалистов по контролю инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи (Казань, 2016).

Результаты диссертационной работы внедрены и реализованы:

- в практической деятельности: часть собранной в ходе исследования коллекции фагов и бактерий использованы в разработке нового уникального препарата «Дифаг», обладающего широким антибактериальным спектром в отношении инфекций, вызванных Acinetobacter baumannii и Pseudomonas aeruginosa (Акт внедрения ФГУП НПО «Микроген» Минздрава России от 28.10.2015 г.);

- в системе додипломной и последипломной подготовки на кафедре эпидемиологии, паразитологии и дезинфектологии ФГБОУ ВО «Северо-Западный государственный медицинский университет имени И.И. Мечникова» Министерства здравоохранения Российской Федерации (191015, Санкт-Петербург, ул. Кирочная, д. 41, тел: [phone]) (Акт внедрения от 22.11.2016 г.);

- при разработке методических документов: методических рекомендаций «Принципы использования бактериофагов для борьбы с инфекциями, связанными

с оказанием медицинской помощи» (утверждены Первым заместителем Председателя Комитета по здравоохранению Правительства Санкт-Петербурга, 2013 г.); федеральных клинических рекомендаций «Рациональное применение бактериофагов в лечебной и противоэпидемической практике» (согласованы Профильной комиссией Минздрава России по эпидемиологии (протокол №3 от 21.04.2014); утверждены на общем собрании членов некоммерческого партнерства «Национальная ассоциация специалистов по контролю инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи» (НП «НАСКИ») (протокол №5 от 21.04.2014 г.); федеральных клинических рекомендаций «Принципы организации периоперационной антибиотикопрофилактики в учреждениях здравоохранения» (согласованы Профильной комиссией Минздрава России по эпидемиологии (протокол №4 от 20.11.2014 г.); утверждены на общем собрании членов НП «НАСКИ» (протокол №6 от 19.11.2014 г.); федеральных клинических рекомендаций «Эпидемиологическое наблюдение за инфекциями, связанными с оказанием медицинской помощи» (согласованы Профильной комиссией Минздрава России по эпидемиологии (протокол №4 от 20.11.2014 г.); утверждены на общем собрании членов НП «НАСКИ» (протокол №6 от 19.11.2014 г.);

- при подготовке учебников: «Эпидемиология» (СПб., 2005); «Эпидемиология» (М., 2013); методических разработок к практическим занятиям и лекциям по госпитальной эпидемиологии;

- при выполнении государственных заданий: «Изучение эпидемиологии, микробиологический мониторинг внутрибольничный грибковой инфекций, актуальных госпитальных штампов возбудителей внутрибольничных инфекций»; «Эндолизины бактериофагов ЕПеюсоссш faecium: эволюция и биотехнологический потенциал».

Апробация диссертационной работы проведена на совещании кафедры эпидемиологии, паразитологии и дезинфектологии ФГБОУ ВО «Северо-Западный государственный медицинский университет имени И.И. Мечникова» Минздрава России (протокол совещания № 8 от 30 июня 2016 г.).

Организация и проведение диссертационного исследования одобрены Комитетом по вопросам этики при ФГБОУ ВО «Северо-Западный государственный медицинский университет имени И.И. Мечникова» Минздрава России (протокол №5 от 11.05.2016 г.).

По материалам диссертации опубликованы 42 научные работы, в том числе 24 статьи в журналах, входящих в перечень научных рецензируемых изданий, рекомендованных ВАК Министерства образования и науки Российской Федерации, оформлен 1 патент на изобретение.

Личное участие автора в получении результатов

Автором лично были определены цель и задачи, разработана методология и этапы комплексного научного исследования, выполнены сбор данных, систематизация, логическое построение работы и анализ полученных результатов, сформулированы научные положения, выводы и практические рекомендации.

Автор принимал непосредственное участие в сборе штаммов микроорганизмов и бактериофагов; организовывал выполнение всех запланированных исследований; проводил самостоятельно и совместно эпидемиологические, бактериологические и молекулярно-генетические исследования; самостоятельно разработал положения теории формирования и саморегуляции тройственных паразитарных экосистем; разработал принципы рационального применения бактериофагов с лечебной и противоэпидемической целями.

Объем и структура диссертации

Диссертация изложена на 226 страницах текста и состоит из введения, обзора литературы, главы материалов и методов, 3 глав собственных исследований, заключения, выводов, практических рекомендаций, списка литературы, включающего 92 источника отечественных и 169 иностранных авторов. Работа иллюстрирована 31 рисунком и 56 таблицами.

Глава 1

БАКТЕРИОФАГИ: ФАКТОРЫ ЭВОЛЮЦИИ ВОЗБУДИТЕЛЕЙ ВНУТРИБОЛЬНИЧНЫХ ИНФЕКЦИЙ И ЭФФЕКТИВНЫЕ АНТИБАКТЕРИАЛЬНЫЕ СРЕДСТВА (обзор литературы)

Последние годы характеризуются бурным возрождением интереса к применению бактериофагов (фагов) для лечения и профилактики инфекционных процессов различной этиологии. Современная информация о биологии фагов, накопившаяся к сегодняшнему дню, позволила наметить новые тенденции в применении как самих бактериофагов, так и препаратов, полученных на их основе. Несмотря на то, что изучение возможности применения бактериофагов в клинической медицине ведется во многих странах мира, Россия сохраняет лидирующие положение как производитель этих препаратов. В данном обзоре предпринята попытка обобщить накопленный опыт по изучению фагов как факторов эволюции бактерий и применения бактериофагов для диагностики, лечения и профилактики.

1.1 Роль бактериофагов в эволюции бактерий

Всестороннее изучение бактериофагов предоставило возможность решения широкого спектра задач в вирусологии, микробиологии, молекулярной биологии и других областях фундаментальных и прикладных исследований. Исследования с использованием фагов позволили более широко рассмотреть взаимоотношения вируса с клеткой-хозяином.

Вирусы бактерий были открыты независимо в 1915 году Frederick Twort и в 1917 Félix d'Herelle, последний и ввёл в научный обиход термин - бактериофаги. В настоящее время термин «бактериофаги» используют не только для обозначения вирусов, поражающих эукариоты, но и археи. Хотя из-за существенных раз-

личий в последнем случае правильнее говорить о «вирусах архей» или «архей-фагах» ("Archaeal phages," "Archaeal viruses,") [152].

Frederick Twort и его брат, доктор C.C. Twort пытались найти способ культивирования вирусов на искусственных питательных средах. Они работали с вирусом вакцины против оспы, которая часто была инфицирована стафилококками. Случайно был выявлен фактор, обладающий способностью лизиро-вать стафилококки, который можно было передать от одной культуры к другой. В дальнейшем удалось показать, что выделенный агент проходит через непроницаемые для бактерий фильтры и требует для своего размножения живые бактериальные клетки. Результаты были опубликованы в 1915 году в журнале Lancet как информация о заразном бактериолитическим агенте «contagion the bacteriolytic agent».

d'Herelle первым установил, что неизвестный литический агент является вирусом, предложил для его обозначения термин "bacteriophage" - бактериофаг и указал на возможность его применения для лечения инфекционных заболеваний.

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Асланов, Батырбек Исмелович, 2016 год

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

1. Акимкин, В.Г. Бактериофаги: исторические и современные аспекты их применения: опыт и перспективы / В.Г. Акимкин, О.С. Дарбеева, В.Ф. Колков // Клиническая практика. - 2010. - № 4. - С. 48-54.

2. Акимкин, В.Г. Нозокомиальный сальмонеллез взрослых / В.Г. Акимкин, В.И. Покровский. - М. : Издательство РАМН, 2002. - 136 с.

3. Алешкин, В.А. Бактериофаги в России: прошлое, настоящее и будущее / В.А. Алешкин, А.В. Алешкин, С.С. Афанасьев // Материалы международной научно-практической конференции «Бактериофаги: Теоретические и практические аспекты применения в медицине, ветеринарии и пищевой промышленности». - Ульяновск : УГСХА им. П.А. Столыпина, 2013. - Т. I. - С. 139-144.

4. Ан, Р.Н. Фагопрофилактика госпитального сальмонеллёза. Экспериментальное обоснование и эпидемиологическая эффективность : автореф. дис. ... канд. мед. наук : 14.02.02 / Ан Розалия Николаевна. - Л., 1986. - 21 с.

5. Антибиотикоустойчивость бактериальных патогенов: эволюционные механизмы и клиническая значимость / Н.К. Фурсова [и др.] // Материалы международной научно-практической конференции «Бактериофаги: Теоретические и практические аспекты применения в медицине, ветеринарии и пищевой промышленности». - Ульяновск : УГСХА им. П.А. Столыпина, 2013. - Т. I. - С. 77-82.

6. Асланов, Б.И. Бактериофаги - эффективные антибактериальные средства в условиях глобальной устойчивости к антибиотикам / Б.И. Асланов // Медицинский совет. Гастроэнтерология. - 2015. - № 13. - С. 106-110.

7. Асланов, Б.И. Бактериофаги как факторы формирования госпитальных штаммов и средства борьбы с внутрибольничными инфекциями / Б.И. Асланов [и др.] // Инфекции в хирургии. - 2009. - Т. 7, № 1. - С. 25-29.

8. Асланов, Б.И. Биологическое значение циркуляции бактериофагов в урологическом стационаре / Б.И. Асланов, А.И. Архангельский, А.А. Долгий // Медицинский академический журнал. - 2010. - Т. 10, № 5. - С.84.

9. Асланов, Б.И. Обоснование применения бактериофага для борьбы с синегнойной инфекцией в травматологическом стационаре : автореф. дис. ... канд. мед. наук : 14.00.30 / Асланов Батырбек Исмелович. - СПб., 2001. - 20 с.

10. Асланов, Б.И. Оценка возможностей генетического обмена между штаммами, циркулирующими в урологических стационарах, с участием бактериофагов / Б.И. Асланов, А.А. Долгий, Л.П. Зуева // Инфекция и иммунитет. -2014. - Т. 4, № 1. - С. 63-64.

11. Асланов, Б.И. Пути рационального использования синегнойных бактериофагов в лечебной и противоэпидемической практике / Б.И. Асланов, Р.Х. Яфаев, Л.П. Зуева // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 2003. - № 5. - С. 72-76.

12. Асланов, Б.И. Роль бактериофагов в формировании госпитальных штаммов в урологических стационарах / Б.И. Асланов, А.А. Долгий // Материалы науч.-практ. конференции «Актуальные проблемы медицины и биологии». -СПб. : СПбГМА им. И.И. Мечникова, 2010. - С. 97-99.

13. Бактериофаги - факторы эволюции госпитальных штаммов и средства борьбы с инфекциями / Л.П. Зуева [и др.] // Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы. - 2012. - № 1. - С. 9-13.

14. Бактериофаги для купирования вспышки, вызванной Staphylococcus aureus, в отделении реанимации новорожденных / Б.И. Асланов [и др.] // Медицинский альманах. - 2015. - № 5. - С. 115-118.

15. Бактериофаги для предотвращения формирования биопленок Pseudomonas aeruginosa / Б.И. Асланов [и др.] // «Бактериофаги: теоретические и практические аспекты применения в медицине, ветеринарии и пищевой промышленности»: материалы Третьей науч.-практ. конф. - М., 2016. - С. 58.

16. Власова, А. В. Фагирование в комплексном подходе к элиминации мультирезистентных штаммов K. pneumoniae из отделения реанимации новорож-

денных / А. В. Власова, Н. Ю. Горячева, Е. Л. Христофорова // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. - 2013. - № 1. - С. 36-42.

17. Влияние бактериофагов на микрофлору толстой кишки / А.М. Затевалов [и др.] // Материалы международной научно-практической конференции «Бактериофаги: Теоретические и практические аспекты применения в медицине, ветеринарии и пищевой промышленности». - Ульяновск : УГСХА им. П.А. Столыпина, 2013. - Т. II. - С. 9-14.

18. Генетические особенности возбудителей инфекций мочевыводящих путей / А.А. Долгий [и др.] // Профилактическая медицина - 2012 : материалы науч. конф. - СПб., 2012. - С. 210-212.

19. Генетические особенности основных возбудителей инфекций мочевыводящих путей / Б.И. Асланов [и др.] // Профилактическая и клиническая медицина. - 2013. - № 1 (46). - С. 69-74.

20. Генетическое разнообразие Acinetobacter baumannii в отделении ожоговой реанимации / А.П. Соломенный [и др.] // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 2006. - № 2. - С. 25-30.

21. Гончаров, А.Е. Перспективы применения адаптированных бактериофагов Acinetobacter для профилактики гнойно-септических инфекций в ожоговом стационаре / А.Е. Гончаров, Б.И. Асланов, Р.Х. Яфаев // Проблемы охраны здоровья населения и окружающей среды : сб. научных трудов СПбГМА им. И.И Мечникова. -СПб. : СПбГМА им. И.И. Мечникова, 2002. - С. 32-33.

22. Гончаров, А.Е. Стихийная циркуляция бактериофагов как возможное условие формирования госпитальных штаммов Acinetobacter baumannii / А.Е. Гончаров, А.П. Соломенный, Б.И. Асланов // Медицинский академический журнал. Приложение № 5. - 2004. - Т. 3. - С.83.

23. Дарбеева, О.С. Бактериофаги. Общая и санитарная микробиология с техникой микробиологических исследований / О.С. Дарбеева, Е.Л. Жиленков; под. ред. А.С. Лабинской, Л.П. Блинковой, А.С. Ещиной. - М. : Медицина, 2004. -576 с.

24. Долгий, А.А. Эпидемиологические особенности формирования госпитальных штаммов в урологических отделениях : автореф. дис. ... канд. мед. наук : 14.02.02 / Долгий Алексей Алексеевич. - СПб., 2013. - 24 с.

25. Дрогалина, Н.А. Селекция бактериофагов и фагоустойчивых аттенуи-рованных штаммов Salmonella typhimurium для производства лечебно-профилактического препарата против сальмонеллеза кур : автореф. дис. ... канд. биол. наук : 16.00.03 / Дрогалина Наталья Александровна. - М., 2008. - 21 с.

26. Дроздова, О.М. Применение бактериофагов в эпидемиологической практике: взгляд через столетие / О.М. Дроздова, Е.Б. Брусина // Эпидемиология и инфекционные болезни. - 2010. - № 5. - С. 20-24.

27. Дрюккер, В.В. Бактериофаги и их функционирование в биоплёнках / В.В. Дрюккер, А.С. Горшкова // Известия Иркутского государственного университета. Серия «Биология. Экология». - 2012. - Т. 5, № 3. - С. 8-16.

28. Зуева, Л.П. Современный взгляд на роль бактериофагов в эволюции госпитальных штаммов и профилактике ИСМП / Л.П. Зуева, Б.И. Асланов,

B.Г. Акимкин // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. - 2014. - №1 (74). -

C. 43-49.

29. Зуева, Л.П. Современный взгляд на роль бактериофагов в эволюции госпитальных штаммов и профилактике инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи / Л.П. Зуева, Б.И. Асланов, В.Г. Акимкин // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 2014. - № 3. - С. 100-107.

30. Зуева, Л.П. Эпидемиологическая диагностика : монография / Л. П. Зуева, С. Р. Еремин, Б. И. Асланов. - 2-е изд., перераб. и доп. - СПб. : Фолиант, 2009. - 312 с.

31. Иванов, А.В. Клиническое применение бактериофагов: Практическое руководство / А.В. Иванов. - СПб. : Перохимфарм, 2000. - 41 с.

32. Идентификация фрагмента острова высокой патогенности иерсиний у госпитальных штаммов энтеробактерий / А.Е. Гончаров [и др.] // Профилактическая и клиническая медицина. - 2013. - № 1 (46). - С. 66-68.

33. Изучение клинической эффективности препаратов бактериофагов при лечении энтеральных и гнойно-воспалительных заболеваний / Н.Н. Ворошилова [и др.] // Материалы Всероссийской конференции «Актуальные вопросы разработки и применения иммунобиологических и фармацевтических препаратов». -Уфа, 2000. - С. 87-94.

34. Катаева, Л. В. Оценка литической активности некоторых бактериофагов / Л.В. Катаева, А.А. Вакарина, Н.Ф. Нижегородцева // Материалы международной научно-практической конференции «Бактериофаги: Теоретические и практические аспекты применения в медицине, ветеринарии и пищевой промышленности». - Ульяновск : УГСХА им. П.А. Столыпина, 2013. - Т. II. - С. 15-22.

35. Каттер, Э. Бактериофаги. Биология и практическое применение / Э. Каттер, А. Сулаквелидзе. - М. : Научный мир, 2012. - 640 с.

36. Колоджиева, В.В. Клинико-микробиологическая характеристика гнойно-септических инфекций в акушерско-гинекологической практике / В.В. Колод-жиева, Б.И. Асланов // Медицинский академический журнал. Приложение № 5. -2004. - Т. 3. - С. 150-151.

37. Крылов, В.Н. Роль горизонтального переноса генов бактериофагами в возникновении патогенных бактерий / В.Н. Крылов // Генетика. - 2003. - № 5. -С. 595-620.

38. Лазарева, Е.Б. Бактериофаги для лечения и профилактики инфекционных заболеваний / Е.Б. Лазарева // Антибиотики и химиотерапия. - 2003. - Т. 48, № 1. - С. 36-40.

39. Микробиологическая диагностика инфекций мочевых путей у женщин при беременности и использование препаратов бактериофагов при данной патологии : методические рекомендации / Ю.А. Захарова [и др.]. - Пермь, 2007. - 29 с.

40. Милютина, Л.Н. Современная стратегия и тактика этиотропной терапии острых кишечных инфекций у детей / Л.Н. Милютина, Н.В. Воротынцева // Антибиотики и химиотерапия. - 1993. - Т. 38, № 1. - С. 46-48.

41. Михайлова, Е.Г. Применение препаратов с бактериофагами в комплексной восстановительной терапии хронического генерализованного пародон-

тита : автореф. дис. ... канд. мед. наук : 14.03.11 / Михайлова Екатерина Григорьевна. - М., 2011. - 20 с.

42. Национальная концепция профилактики инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи, и информационный материал по ее положениям / В.И. Покровский [и др.]. - Н. Новгород : Ремедиум-Поволжье, 2012. - 84с.

43. О роли бактериофагов в формировании патогенного потенциала и эволюции госпитальных штаммов / Б.И. Асланов [и др.] // Профилактическая медицина - 2011 : материалы науч. конф. - СПб., 2011. - С. 27-29.

44. Обоснование мониторинга чувствительности к дезинфектантам микроорганизмов, циркулирующих в стационарах / Л.П. Зуева [и др.] // Дезинфекционное дело. - 2011. - № 2. - С. 45-48.

45. Оришак, Е.А. Антибиотикорезистентность и фагорезистентность условно-патогенных микроорганизмов при дисбактериозе толстого кишечника / Е.А. Оришак, А.Г. Бойцов, Л.Ю. Нилова // Профилактическая и клиническая медицина. - 2008. - № 4. - С. 167-170.

46. Оценка спектра генов вирулентности у инфекционных агентов - штаммов Pseudomonas spр. / Б.И. Асланов [и др.] // Профилактическая и клиническая медицина. - 2013. - № 1 (46). - С. 63-65.

47. Парфенюк, Р.Л. Микробиологические основы пероральной фаготерапии гнойно-воспалительных заболеваний : автореф. дис. ... канд. биол. наук : 03.00.07 / Парфенюк Римма Леонтьевна. - М., 2004. - 24 с.

48. Пептидогликанлизирующие ферменты бактериофагов - перспективные противобактериальные агенты / К.А. Мирошников [и др.] // Успехи биологической химии. - 2006. - Т. 46. - С. 65-98.

49. Перепанова, Т.С. Комплексное лечение и профилактика госпитальной инфекции мочевых путей: автореф. дис. ... д-ра мед. наук : 14.00.40 / Перепанова Тамара Сергеевна. - М., 1996. - 57 с.

50. Перспективы использования бактериофагов в качестве биологически активных добавок к пище / Х.М. Галимзянов [и др.] // Астраханский медицинский журнал. - 2008. - Т. 3, № 1. - С. 80-85.

51. Перспективы применения бактериофагов в профилактике и лечении нозокомиальных осложнений в хирургии / В.В. Слободенюк [и др.] // Материалы международной научно-практической конференции «Бактериофаги: Теоретические и практические аспекты применения в медицине, ветеринарии и пищевой промышленности». - Ульяновск : УГСХА им. П.А. Столыпина, 2013. - Т. I. -С. 68-72.

52. Перспективы фаготерапии госпитальных инфекций в условиях формирования антибиотикорезистентности / А.А. Долгий [и др.] // Инфекция и иммунитет. - 2012. - Т. 2, № 1-2. - С. 471.

53. Подходы к слежению за метициллин-резистентными золотистыми стафилококками в травматологическом стационаре / В.Ю. Хорошилов [и др.] // Профилактическая и клиническая медицина. - 2012. - № 2 (43). - С. 65-67.

54. Препарат поливалентного бактериофага против синегнойной палочки, штаммы бактериофага Bacteriophagum Pseudomonas aeruginosa СПбГМА им. И.И. Мечникова №05, №03, №06 и №07, используемые при приготовлении поливалентного препарата против синегнойной палочки : пат. №2186574 Рос. Федерация МПК7 A61K35/66 A61K35/74, C12N1/20, A61P31/04 / Р.Х. Яфаев, Б.И. Асланов, Л.П. Зуева ; заявитель и патентообладатель Яфаев Р.Х., Асланов Б.И., Зуева Л.П. - № 2001102027/13 ; заявл. 24.01.2001 ; опубл. 10.08.2002, Бюл. № 22.

55. Препараты бактериофагов для лечения инфекций, вызванных условно-патогенными бактериями / Н.Н. Ворошилова [и др.] // Материалы межрегиональной научно-практической конференции «Госпитальная инфекция в реанимации и интенсивной терапии». - Уфа, 1996. - С. 10.

56. Принципы организации периоперационной антибиотикопрофилакти-ки в учреждениях здравоохранения. Федеральные клинические рекомендации [Электронный ресурс] / Б.И. Асланов [и др.]. - М., 2014. - 42 с. - Режим доступа: http: //nasci .ru/_resources/directory/19 8/common/2014_9_PAP_new.pdf.

57. Принципы рационального использования бактериофагов для борьбы с инфекциями, связанными с оказанием медицинской помощи. Методические рекомендации / Б.И. Асланов [и др.]. - СПб., 2013. - 29 с.

58. Проблемы организации дезинфекционно-стерилизационных мероприятий в учреждениях здравоохранения. Пути решения / И.Г. Техова [и др.] // Дезинфекционное дело. - 2011. - № 2. - С. 18-22.

59. Профилактика и лечение гнойно-воспалительных осложнений в раннем послеоперационном периоде у больных с рубцовым стенозом трахеи на основе микробиологического мониторинга / А.В. Бондаренко [и др.] // Антибиотики и химиотерапия. - 2005. - Т. 50, № 2-3. - С. 42-47.

60. ПЦР-идентификация фрагментов генов островов патогенности в ме-тициллинрезистентных штаммах Staphylococcus aureus / А.Е. Гончаров, Л.П. Зуева, А.Н. Суворов, Б.И. Асланов [и др.] // Эпидемиология и инфекционные болезни. - 2013. - № 1. - С. 19-23.

61. Рабинович, О.Ф. Ликопоид в комплексной терапии орального дисбио-за / О.Ф. Рабинович, И.М. Рабинович, Е.С. Абрамова // Стоматология. - 2013. -Т. 92, № 1. - С. 40-42.

62. Равин, В.К. Лизогения / В.К. Раввин. - М. : Наука, 1971. - 134 с.

63. Разгулин, С.А. Туляремийный бактериофаг: выделение и основные биологические свойства / С.А. Разгулин, А.А. Григорьев // Медицинский альманах. - 2011. - № 5. - С. 198-201.

64. Разработка стартовой схемы применения антибиотиков в отделении реанимации новорожденных / А.В. Любимова [и др.] // Профилактическая и клиническая медицина. - 2011. - Т. 2 (39), № 2. - С. 61-63.

65. Разработка твердых лекарственных форм на основе комплексных поливалентных бактериофагов / Н.А. Ковязина [и др.] // Материалы международной научно-практической конференции «Бактериофаги: Теоретические и практические аспекты применения в медицине, ветеринарии и пищевой промышленности». - Ульяновск : УГСХА им. П.А. Столыпина, 2013. - Т. I. - С. 134-140.

66. Распространенность островов патогенности, несущих ген токсина стафилококкового септического шока (TSST-1), среди штаммов золотистого стафилококка, выделенных у пациентов стационаров и здоровых носителей / А.Е. Гончаров [и др.] // Профилактическая и клиническая медицина. - 2012. - № 3 (44). - С. 55-58.

67. Распространенность паразитарных заболеваний среди коренного населения Чукотского автономного округа / В.Н. Федоров [и др.] // Санитарный врач. - 2013. - № 9. - С. 70-72.

68. Рациональное применение бактериофагов в лечебной и противоэпидемической практике. Федеральные клинические рекомендации / Б.И. Асланов [и др.]. - М., 2014. - 54 с.

69. Роль бактериофагов в горизонтальном генетическом обмене среди возбудителей инфекций в стационаре / Б.И. Асланов [и др.] // Профилактическая и клиническая медицина. - 2012. - № 4 (45). - С. 38-41.

70. Романова, Ю.М. Бактериальные биопленки как естественная форма существования бактерий в окружающей среде и организме хозяина / Ю.М. Романова, А.Л. Гинцбург // Журнал Микробиологии. - 2011. - № 3. -С. 99-109.

71. Саморегуляция паразитарных систем / В.Д. Беляков [и др.]. - М. : Медицина, 1987. - 239 с.

72. Создание отечественной коллекции бактериофагов и принципы разработки лечебно-профилактических фаговых препаратов / А.Ю. Зурабов [и др.] // Биомедицина. - 2012. - № 1. - С. 134-138.

73. Специализированный продукт питания «Фудфаг» в профилактике пищевых инфекций / А.В. Алешкин [и др.] // Материалы международной научно -практической конференции «Бактериофаги: Теоретические и практические аспекты применения в медицине, ветеринарии и пищевой промышленности». - Ульяновск : УГСХА им. П.А. Столыпина, 2013. - Т. I. - С. 94-99.

74. Способность к формированию биопленок в искусственных системах у различных штаммов Salmonella typhimurium / Ю.М. Романова [и др.] // Журнал микробиологии, эпидемиологии, иммунологии. - 2006. - № 4. - С. 38-42.

75. Умеренный легионеллезный бактериофаг: обнаружение и свойства / И.П. Погорельский [и др.] // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 2008. - № 4. - С. 86-88.

76. Фаготерапия воспалительных урогенитальных заболеваний у женщин / В.И. Кисина [и др.] // Вестник дерматологии и венерологии. - 1996. - № 5. -С. 45-48.

77. Фаготерапия и фагопрофилактика острых кишечных инфекций у детей : методические рекомендации / Н.В. Воротынцева [и др.]. - М., 1991. - 29 с.

78. Хайруллин, И.Н. Роль микрофлоры хирургического отделения в развитии послеоперационных осложнений хирургических ран и их коррекция с помощью бактериофагов : автореф. дис. ... канд. мед. наук : 14.00.27 / Хайруллин Ильдар Нургалиевич. - Казань, 2003. - 19 с.

79. Хайруллин, И.Н. Эффективность применения специфических бактериофагов в лечении и профилактике хирургических послеоперационных инфекций / И.Н. Хайруллин, О.К. Поздеев, Р.Ш. Шаймарданов // Казанский медицинский журнал. - 2002. - № 4. - С. 258-261.

80. Чеботарь, И.В. Антибиотикорезистентность биопленочных бактерий / И.В. Чеботарь [и др.] // Клиническая микробиология и антимикробная химиоте-рапмя. - 2012. - Т. 14, №1. - С. 51-58.

81. Чувствительность нозокомиальной микрофлоры, циркулирующей в трансплантационной клинике, к лечебным бактериофагам / Н.И. Габриэлян [и др.] // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 2004. - № 6. -С. 6-10.

82. Эволюция госпитальных штаммов - роль бактериофагов / А.А. Долгий [и др.] // Инфекционные болезни. - 2011. - Т. 9, Приложение №3. - С. 8-9.

83. Эндолизин бактериофага spz7: влияние эффекторов на каталитическую активность фермента в лизисе грамотрицательных микроорганизмов / Н.Л. Клячко [и др.] // Вестник Московского университета. Серия 2. Химия. -2010. - № 3, Т. 51. - С. 222-226.

84. Эпидемиологические особенности формирования патогенных свойств E.coli в урологическом стационаре / Б.И. Асланов [и др.] // Профилактическая и клиническая медицина. - 2012. - № 1 (42). - С. 117-121.

85. Эпидемиологические особенности формирования патогенных свойств Enterococcus faecalis и Enterococcus faecium в урологическом стационаре / Б.И. Асланов [и др.] // Профилактическая и клиническая медицина. - 2012. -№ 2 (43). - С. 52-57.

86. Эпидемиологические особенности формирования патогенных свойств Escherichia coli в урологическом стационаре / Б.И. Асланов [и др.] // Профилактическая и клиническая медицина. - 2012. - № 1 (42). - С. 117-121.

87. Эпидемиологические особенности формирования патогенных свойств Klebsiella sp. и Pseudomonas sp. в урологическом стационаре / Б.И. Асланов [и др.] // Профилактическая и клиническая медицина. - 2012. - № 3 (44). - С. 50-54.

88. Эпидемиологическое наблюдение за инфекциями, связанными с оказанием медицинской помощи. Федеральные клинические рекомендации [Электронный ресурс] / Б.И. Асланов [и др.]. - М., 2014. - 58 с. - Режим доступа: http: //nasci .ru/_resources/directory/19 8/common/2014_7_Epid_nabl_new.pdf.

89. Эффективность применения бактериофагов в комплексном лечении больных с ожоговой травмой / Е.Б. Лазарева [и др.] // Антибиотики и химиотерапия. - 2001. - Т. 46, № 1. - С. 10-14.

90. Яковлев, В.П. Ципрофлоксацин в клинической практике / В.П. Яковлев, Е.Н. Падейская, С.В. Яковлев. - 2-е изд., испр. и доп. - М. : Вузовская книга, 2009. - 320 с.

91. Яфаев, Р.Х. Активность сульфадиазина серебра в отношении Acinetobacter baumannii, выделенных в ожоговых стационарах / Р.Х. Яфаев, А.Е. Гончаров, Б.И. Асланов // Антибиотики и химиотерапия. - 2005. - № 50(7). -С. 37-40.

92. Яфаев, Р.Х. Оценка перспектив использования бактериофага для борьбы с госпитальными синегнойными инфекциями / Р.Х. Яфаев, Б.И. Асланов //

Материалы VIII Съезда Всероссийского общества эпидемиологов, микробиологов и паразитологов. - М., 2002. - Т. 1. - С. 286-287.

93. A Yersinia pestis-specific, lytic phage preparation significantly reduces viable Y. pestis on various hard surfaces experimentally contaminated with the bacterium / M.H. Rashid [et al.] // Bacteriophage. - 2012. - Vol. 1, № 2(3). - Р. 168-177.

94. Abedon, S. Bacteriophage ecology. Population growth, evolution, and impact of bacterial viruses / S. Abedon. - Cambridge : Cambridge University Press, 2008.

- 526 p.

95. Abedon, S.T. Why bacteriophage encode exotoxins and other virulence factors / S.T. Abedon, J.T. Lejeune // Evolutionary Bioinformatics Online. - 2005. -Vol. 1. - P. 97-110.

96. Accessory cholera enterotoxin (Ace), the third toxin of Vibrio cholerae virulence cassette / M. Trucksis [et al.] // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America - 1993. - Vol. 90. - P. 5267-5271.

97. Ace, which encodes an adhesin in Enterococcus faecalis, is regulated by Ers and is involved in virulence / F. Lebreton [et al.] // Infecion and Immunity. - 2009.

- Vol. 77, № 7. - P. 2832-2839.

98. Acute renal tubular necrosis and death of mice orally infected with Esche-richia coli strains that produce Shiga-like toxin type II / E.A. Wadolkowski [et al.] // Infection and Immunity. - 1990. - Vol. 58. - P. 3959-3965.

99. Affolter, M. Curing and induction of the Fels 1 and Fels 2 prophages in the Ames mutagen tester strains of Salmonella typhimurium / M. Affolter, C. Parent-Vaugeois, A. Anderson // Mutation Research. Fundamental and Molecular Mechanisms of Mutagenesis. - 1983. - Vol. 110 - P. 243-262.

100. Allison, G.E. Serotype-converting bacteriophages and O-antigen modification in Shigella flexneri / G.E. Allison, N.K. Verma // Trends in Microbiology. - 2000.

- Vol. 8. - P. 17-23.

101. Allue-Guardia, A. Evolution of a self-inducible cytolethal distending toxin type-V-encoding-bacteriophage from Escherichia coli O157:H7 to Shigella sonnei /

A. Allue-Guardia, L. Imamovic, M. Muniesa // Journal of Virology. - 2013. - Vol. 87, № 24. - P. 13665-13675.

102. Analysis of genome plasticity in pathogenic and commensal Escherichia coli isolates by use of DNA arrays / U. Dobrindt [et al.] // Journal of Bacteriology. -2003. - Vol. 185, № 6. - P. 1831-1840.

103. Ashelford, K.E. Elevated Abundance of Bacteriophage Infecting Bacteria in Soil / K.E. Ashelford, M.J. Day, J.C. Fry // Applied and Environmental Microbiology. - 2003. - Vol. 69(1). - P. 285-289.

104. Bacterial viruses against viruses pathogenic for man? / R. Miedzybrodzki [et al.] // Virus Research. - 2005. - Vol. 110, № 1-2. - P. 1-8.

105. Bacericidal synBioergism between daptomycin and the phage lysin Cpl-1 in a mouse model of pneumococcal bacteraemia / J. Vouillamoz [et al.] // International journal of antimicrobial agents. - 2013. - Vol. 42, № 5. - P. 416-421.

106. Bacteriophage cocktail for the prevention of biofilm formation by Pseudomonas aeruginosa on catheters in an in vitro model system / F. Weiling [et al.] // Antimicrobial Agents and Chemotherapy. - 2010. - Vol. 54(1). - P. 397-404.

107. Bacteriophage infection and multiplication occur in Pseudomonas aeruginosa starved for 5 years. H.S. Schrader [et al.] // Canadian Journal of Microbiology. -1997. - Vol. 3. - P. 1157-1163.

108. Bacteriophage therapy for Staphylococcus aureus biofilm-infected wounds: a new approach to chronic wound care / A.K. Seth [et al.] // Plastic and Reconstructive Surgery. - 2013. - Vol. 131, № 2. - P. 225-234.

109. Bacteriophage therapy of venous leg ulcers in humans: results of a phase I safety trial / D.D. Rhoads [et al.] // Journal of Wound Care. - 2009. - Vol. 18. -P. 237-243.

110. Bacteriophages are synergistic with bacterial interference for the prevention of Pseudomonas aeruginosa biofilm formation on urinary catheters / K.S. Liao [et al.] // Journal of Applied Microbiology. - 2012. - Vol. 113, № 6. - P. 1530-1539.

111. Bacteriophages show promise as antimicrobial agents / J. Alisky [et al.] // The Journal of Infection. - 1998. - Vol. 36, № 1. - P. 5-15.

112. Bacteriophages with the ability to degrade uropathogenic Escherichia coli biofilms / A. Chibeu [et al.] // Viruses. - 2012. - Vol. 4, № 4. - P. 471-487.

113. Bacterophage therapy : a revitalized therapy against bacterial infectious diseases / S. Matsuzaki [et al.] // Journal of Infection and Chemotherapy. - 2005. -Vol. 11, № 5. - P. 211-219.

114. Barksdale, L. The fundamental contribution of phages to GAS evolution, genome diversification and strain amergence / L. Barksdale, S.B. Beres, J.M. Musser // Trends in Microbiology. - 2010. - Vol. 10. - P. 515-521.

115. Barondess, J.J. Bor gene of phage lambda, involved in serum resistance, encodes a widely conserved outer membrane lipoprotein / J.J. Barondess, J. Beckwith // Journal of Bacteriology. - 1995. - Vol. 177, № 5. - P. 1247-1253.

116. Biological inactivation of adhering Listeria monocytogenes by listeri-aphages and a quaternary ammonium compound / B. Roy [et al.] // Applied and Environmental Microbiology. - 1993. - Vol. 59, № 9. - P. 2914-2917.

117. Biotechnological exploitation of bacteriophage research / N.K. Petty [et al.] // Trends in biotechnology. - 2006. - Vol. 25, № 1. - P. 7-15.

118. Breaking free: "protein antibiotics" and phage lysis / T.G. Bernhardt [et al.] // Research in Microbiology. - 2002. - Vol. 153. - P. 493-501.

119. Broudy, T.B. The in vitro interaction of Streptococcus pyogenes with human pharyngeal cells induces a phage encoded extracellular DNase / T.B. Broudy, V. Pancholi, V.A. Fischetti // Infection and Immunity. - 2002. - Vol. 70 - P. 28052811.

120. Brüssow, H. Bacteriophage-host interaction: from splendid isolation into a messy reality / H. Brüssow // Current Opinion in Microbiology. - 2013. - Vol. 6, № 4. -P. 500-506.

121. Brüssow, H. Phages and the evolution of bacterial pathogens: from genomic rearrangements to lysogenic conversion / H. Brüssow, C. Canchaya, W.D. Hardt // Microbiology and Molecular Biology Reviews. - 2004. - Vol. 68, № 3. - P. 560-602.

122. Burke, J. Generalized transduction in Streptomyces coelicolor / J. Burke, D. Schneider, J. Westpheling // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 2001. - Vol. 98. - P. 6289-6294.

123. Canchaya, C. The impact of prophages on bacterial chromosomes / C. Canchaya, G. Foumous, H. Brussow // Molecular Microbiology. - 2004. - Vol. 53, № 1. - P. 9-18.

124. Carson, L. The use of lytic bacteriophages in the prevention and eradication of biofilms of Proteus mirabilis and Escherichia coli / L. Carson, S.P. Gorman, B.F. Gilmore // FEMS Immunology and Medical Microbiology. - 2010. - Vol. 59, № 3. - P. 447-455.

125. Chan, B.K. Phage cocktails and the future of phage therapy / B.K. Chan, S.T. Abedon, C. Loc-Carrillo // Future Microbiology. - 2013. - Vol. 8. - P. 769-783.

126. Chhibber, S. Co-therapy using lytic bacteriophage and linezolid: effective treatment in eliminating methicillin resistant Staphylococcus aureus (MRSA) from diabetic foot infections / S. Chhibber, T. Kaur, K. Sandeep // PLoS One. - 2013. - Vol. 8, № 2. - e56022.

127. Chhibber, S. Inhibiting biofilm formation by Klebsiella pneumoniae B5055 using an iron antagonizing molecule and a bacteriophage / S. Chhibber, D. Nag, S. Bansal // BMC Microbiology. - 2013. - Vol. 26, № 13. - P. 174.

128. Clark, C.A. The oac gene encoding a lipopolysaccaride O-antigen acetylase maps adjacent to the integrase-encoding gene on the genome of Shigella flexneri bacteriophage Sf6 / C.A. Clark, J. Beltrame, P.A. Manning // Gene. - 1991. - Vol. 107. -P. 43-52.

129. Cochran, P.K. Seasonal Abundance of lysogenic bacteria in a subtropical estuary / P.K. Cochran, J.H. Paul // Applied and Environmental Microbiology. - 1998. -Vol. 64(6). - P. 2308-2312.

130. Co-Evolutionary Dynamics of the Bacteria Vibrio sp. CV1 and Phages V1G, V1P1, and V1P2: Implications for Phage Therapy / C. Barbosa [et al.] // Microbial Ecology. - 2013. - Vol. 66, № 4. - P. 897-905.

131. Comparative genomics and transduction potential of Enterococcus faecalis temperate bacteriophages / A. Yasmin [et al.] // The Journal of Bacteriology. - 2010. -Vol. 192, № 4. - P. 1122-1130.

132. Comparison of in vitro and in vivo bacteriolytic activity of Escherichia coli phages: implication for phage therapy / S. Chibani-Chennoufi [et al.] // Antimicrobial Agents and Chemotherapy. - 2004. - Vol. 48(7). - P. 2558-2569.

133. Comparison of the Escherichia coli K-12 genome with sampled genomes of a Klebsiella pneumoniae and three Salmonella enterica serovars, Typhimurium, Typhi and Paratyphi / M. McClelland [et al.] // Nucleic Acids Research. - 2000. - Vol. 28, № 24. - P. 4974-4986.

134. Controlled clinical trial of a therapeutic bacteriophage preparation in chronic otitis due to antibiotic-resistant Pseudomonas aeruginosa: a preliminary report of efficacy / A. Wrigh [et al.] // Clinical otolaryngology. - 2009. - Vol. 34, № 4. - P. 349357.

135. Cooper, C.J. Stability and purity of a bacteriophage cocktail preparation for nebulizer delivery / C.J. Cooper, S.P. Denyer, J.Y. Maillard // Letters of Applied Microbiology. - 2014. - Vol. 58, № 2. - P. 118-122.

136. Current status and perspectives of phage therapy / J. Borysowski [et al.] // Advances in Clinical Experimental Medicine. - 2006. - Vol. 15. - P. 575-580.

137. Damien, M. On the interactions between virulent bacteriophages and bacteria in the gut / M. Damien, D. Laurent D // Bacteriophage. - 2012. - Vol. 2, № 4. -P. 229-233.

138. Danovaro, R. Viral Density and Virus-to-Bacterium Ratio in Deep-Sea Sediments of the Eastern Mediterranean / R. Danovaro, M. Serresi // Applied and Environmental Microbiology. - 2000. - Vol. 66(5). - P. 1857-1861.

139. de Roca, F.R. Cleavage specificity of Enterococcus faecalis EnpA (EF1473), a peptidoglycan endopeptidase related to the LytM/lysostaphin family of metallopeptidases / F.R. de Roca // Journal of Molecular Biology. - 2010. - Vol. 398, № 4. - P. 507-517.

140. Distribution of ribonucleic acid coliphages in raw sewage from treatment plants in Japan / K. Furuse [et al.] // Applied and Environmental Microbiology. -1981. - Vol. 41(5). - P. 1139-1143.

141. Edlin, G. Lambda lysogens of E. coli reproduce more rapidly than non-lysogens / G. Edlin, L. Lin,R. Kudrna // Nature. - 1975. - Vol. 255. - P. 735-737

142. Edlin, G. Reproductive fitness of P-1 lysogn, phage P-2 lysogen and Mu lysogen of Escherichia coli / G. Edlin, L. Lin, R. Bitner // Journal of Virology. - 1977. -Vol. 21. - P. 560-564.

143. Effect of phage on the infectivity of Vibrio cholerae and emergence of genetic variants / M.S. Zahid [et al.] // Infection and Immunity. - 2008. - Vol. 76(11). -P. 5266-5273.

144. Efficient transfer of antibiotic resistance plasmids by transduction within methicillin-resistant Staphylococcus aureus USA300 clone / M. Varga [et al.] // Federation of European Microbiological Societies (FEMS) Microbiology Letters. - 2012. -Vol. 332, № 2. - P. 146-152.

145. Elsabbagh, H. Nucleotide sequence of attP and cos sites of phage CTX and expression of cytotoxin in Pseudomonas aeruginosa PA158 / H. Elsabbagh, G. Xiong, F. Lutz // Molecular and General Genetics. - 1993. - Vol. 237, № 3. - P. 421-428.

146. Endemic bacteriophages: a cautionary tale for evaluation of bacteriophage therapy and other interventions for infection control in animals / A.M. Kropinski [et al.] // Virology Journal. - 2012. - Vol. 9. - P. 207.

147. Escherichia coli global gene expression in urine from women with urinary tract infection / E.C. Hagan [et al.] // PLoS Pathogens. - 2010. - Vol. 6, № 11. -e1001187.

148. Evolutionary relationships among diverse bacteriophages and prophages: all the world's a phage / R.W. Hendrix [et al.] // Proceedings of the National Academy of Sciences of the USA. - 1999. - Vol. 96, № 5. - P. 2192-2197.

149. Examination of diarrheagenicity of cytolethal distending toxin: suckling mouse response to the products of the cdtABC genes of Shigella dysenteriae / J. Okuda [et al.] // Infection and Immunity. - 1997. - Vol. 65, № 2. - P. 428-433.

150. Faruque, S.M. Phage-bacterial interactions in the evolution of toxigenic Vibrio cholera / S.M. Faruque, J.J. Mekalanos // Virulence. - 2012. - Vol. 3(7). -P. 556-565.

151. Fischetti, V.A. Bacteriophage lytic enzymes: novel anti-infectives / V.A. Fischetti // Trends in Microbiology. - 2005. - Vol. 13. - P. 491-496.

152. Forterre, P. Defining life: the virus viewpoint / P. Forterre // Origins of Life and Evolution of Biospheres. - 2010. - Vol. 40, № 2. - P. 151-160.

153. Freeman, V.J. Studies on the virulence of bacteriophage-infected strains of Corynebacterium diphtheriae / V.J. Freeman // Journal of Bacteriology. - 1951. -Vol. 61. - P. 675-688.

154. Functional expression of individual plasmid-encoded RNA bacteriophage MS2 genes / E. Remaut [et al.] // The EMBO journal. - 1982. - Vol. 1, № 2. - P. 205209.

155. Genomic analysis of uncultured marine viral communities / M. Breitbart [et al.] // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 2002. - Vol. 99(22). - P. 14250-14255.

156. Genomic diversity of enterohemorrhagic Escherichia coli O157 revealed by whole genome PCR scanning / M. Ohnishi [et al.] // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 2002. - Vol. 99(26). - P. 1704317048.

157. Ghannad, M.S. Bacteriophage: Time to Re-Evaluate the Potential of Phage Therapy as a Promising Agent to Control Multidrug-Resistant Bacteria / M.S. Channad, A. Mohammad // Iranian Journal of Basic Medical Sciences. - 2012. - Vol. 15, № 2. -P. 693-701.

158. Goncharov, A. Genotypic structure and susceptibility to antimicrobial agents of Acinetobacter baumannii and Pseudomonas aeruginosa in Russian burn intensive care units / A. Goncharov, A. Solomenny, B. Aslanov // International Journal of Antimicrobial Agents. - 2007. - Vol. 29, Supplement 2. - P. S655.

159. Groman, N.B. Studies of mono- and polylysogenic Corynebacterium diph-theriae / N.B. Groman, M. Eaton, Z.K. Booher / J. Bacteriol. - 1958. - Vol. 75, № 3. -P. 320-325.

160. Hennes, K.P. Significance of bacteriophages for controlling bacterioplank-ton growth in a gesotrophic lake / K.P. Hennes, M. Simon // Applied and Environmental Microbiology. - 1995. - Vol. 61(1). - P. 333-340.

161. High abundance of viruses found in aquatic environment / O. Bergh [et al.] // Nature. - 1989. - Vol. 340, № 6233. - P. 467-468.

162. Hodgson, D.A. Generalized transduction of serotype 1/2 and serotype 4b strains of Listeria monocytogenes / D.A. Hodgson // Mol. Microbiol. - 2000. -Vol. 35. - P. 312-323.

163. Hospital-acquired pneumonia and ventilator-associated pneumonia: recent advances in epidemiology and management / F. Barbier [et al.] // Current Opinion in Pulmonary Medicine. - 2013. - Vol. 19, № 3. - P. 216-228.

164. Hughes, K.A. Biofilm susceptibility to bacteriophage attack: the role of phage-borne polysaccharide depolymerase / K.A. Hughes, I.W. Sutherland, M.V. Jones // Microbiology. - 1998. - Vol. 144. - P. 3039-3047.

165. Hynes, W. L. Sequence analysis and expression in Escherichia coli of the hyaluronidase gene of Streptococcus pyogenes becteriophage H4489A / W.L. Hynes, J.J. Ferretti // Infection and Immunity. - 1989. - Vol. 57. - P. 533-539.

166. Identification of a novel lytic bacteriophage obtained from clinical MRSA isolates and evaluation of its antibacterial activity / F. Sahin [et al.] // Mikrobiyoloji b ü-lten. - 2013. - Vol. 47, №1. - P. 27-34.

167. Influence of bacteriophage preparations on intracellular killing of bacteria by human phagocytes in vitro / A. Kurzepa-Skaradzinska [et al.] // Viral Immunology. -2013. - Vol. 26, № 2. - P. 150-162.

168. Interaction of the transmembrane domain of lysis protein E from bacteriophage ^X174 with bacterial translocase MraY and peptidyl-prolyl isomerase SlyD / S. Mendel [et al.] // Microbiology. - 2006. - Vol. 152. - P. 2959-2967.

169. Isolation and lytic activity of the Listeria bacteriophage endolysin LysZ5 against Listeria monocytogenes in soya milk / H. Zhang [et al.] // Food Microbiology. -2012. - Vol. 31, № 1. - P. 133-136.

170. Isolation of temperate bacteriophage encoding the type III effector protein SopE from an epidemic Salmonella typhimurium strain / S. Mirold [et al.] // Proceedings of the National Academy of Sciences of the USA. - 1999. - Vol. 96. - P. 98459850.

171. Jassim, S.A. Novel phage-based bio-processing of pathogenic Escherichia coli and its biofilms / S.A. Jassim, A.S. Abdulamir, F. Abu Bakar // World Journal of Microbiology and Biotechnology. - 2012. - Vol. 28, № 1. - P. 47-60.

172. Jiang, S.C. Characterization of Marine Temperate Phage-Host Systems Isolated from Mamala Bay, Oahu, Hawaii / S.C. Jiang, C.A. Kellogg, J.H. Paul // Applied and Environmental Microbiology. - 1998. - Vol. 64(2). - P. 535-542.

173. Karaolis, D.K. A Vibrio cholerae pathogenicity island associated with epidemic and pandemic strains / D.K. Karaolis // Proceedings of the National Academy of Sciences of the USA. - 1998. - Vol. 95. - P. 3134-3139.

174. Kirby, A.E. Synergistic action of gentamicin and bacteriophage in a continuous culture population of Staphylococcus aureus / A.E. Kibry // PLoS One. - 2012. - Vol. 7, № 11. - e51017.

175. Krogfelt, K.A. Identification of coccoid Escherichia coli BJ4 cells in the large intestine of streptomycin-treated mice / K.A. Krogfelt, L.K. Poulsen, S. Molin // Infection and Immunity. - 1993. - Vol. 61. - P. 5029-5034.

176. Kutateladze, M. Bacteriophages as potential new therapeutics to replace or antibiotics / M. Kutateladze, R. Adamia // Trends in Biotechnology. - 2010. - Vol. 28, № 12. - P. 591-595.

177. Lemire, S. Bacteriophage crosstalk: coordination of prophage induction by trans-acting antirepressors / S. Lemire, N. Figueroa-Bossi, L. Bossi // PLoS Genetics. -2010. - Vol. 7, № 6. - e1002149.

178. Lenski, R. Constraints on the coevolution of bacteria and virulent phage: a model, some experiments, and predictions for natural communities / R. Lenski, B. Levin // The American Naturalist. - 1985. - Vol. 125, № 4. - P. 585-602.

179. Letarov, A. The bacteriophages in human- and animal body-associated microbial communities / A. Letarov, E. Kulikov // Journal of Applied Microbiology. -2009. - Vol. 107. - P. 1-13.

180. Loeffler, J.M. Phage lytic enzyme Cpl-1 as a novel antimicrobial for pneumococcal bacteremia / J.M. Loeffler, S. Djurkovic, V.A. Fischetti // Infection and Immunity. - 2003 - Vol. 71. - P. 6199-6204.

181. Loeffler, J.M. Rapid killing of Streptococcus pneumoniae with a bacteriophage cell wall hydrolase / J.M. Loeffler, D. Nelson, V.A. Fischetti // Science. - 2001. -Vol. 294. - P. 2170-2172.

182. Loeffler, J.M. Synergistic lethal effect of a combination of phage lytic enzymes with different activities on penicillin-sensitive and -resistant Streptococcus pneumoniae strains / J.M. Loeffler, V.A. Fischetti // Antimicrobial Agents and Chemotherapy. - 2003 - Vol. 47. - P. 375-377.

183. Loessner, M.J. Bacteriophage endolysins-current state of research and applications / M.J. Loessner // Current Opinion in Microbiology. - 2005. - Vol. 8. -P. 480-487.

184. Lu, T.K. Dispersing biofilms with engineered enzymatic bacteriophage / T.K. Lu, J.J. Collins // Proceedings of the National Academy of Sciences of the USA. -2007. - Vol. 104, № 27. - P. 11197-11202.

185. Lu, T.K. The next generation of bacteriophage therapy / T.K. Lu, M.S. Koeris // Current Opinion in Microbiology. - 2011. - Vol. 14, № 5. - P. 524-531.

186. Lukacik, P. Using a bacteriocin structure to engineer a phage lysin that targets Yersinia pestis / P. Lukacik, T.J. Barnard, S.K. Buchanan // Biochemical Society Transactions. - 2012. - Vol. 40, № 6. - P. 1503-1506.

187. Mapping the tail fiber as the receptor binding protein responsible for differential host specificity of Pseudomonas aeruginosa bacteriophages PaP1 and JG004 / S. Le [et al.] // PLoS One. - 2013. - Vol. 8, № 7. - e68562.

188. Mathias, C.B. Seasonal variations of virus abundance and viral control of the bacterial production in a backwater system of the Danube River / C.B. Mathias, A. Kirschner, B. Velimirov // Applied and Environmental Microbiology. - 1995. -Vol. 61(10). - P. 3734-3740.

189. Mazaheri Nezhad Fard, R. Bacteriophage-mediated transduction of antibiotic resistance in enterococci / R. Mazaheri Nezhad Fard, M.D. Barton, M.W. Heuzenroeder // Letter of Applied Microbiology. - 2011. - Vol. 52, № 6. -P. 559-564.

190. McNair, K. Phacts, a computational approach to classifying the lifestyle of phages / K. McNair, B.A. Bailey, R.A. Edwards // Bioinformatics. - 2012. - Vol. 28, № 5. - P. 614-618.

191. Molecular analysis of a cytotoxin-converting phage, phi CTX, of Pseudomonas aeruginosa: structure of the attP-cos-ctx region and integration into the serine tRNA gene / T. Hayashi [et al.] // Molecular Microbiology. - 1993. - Vol. 7, № 5. -P. 657-667.

192. Mu-like prophage in serogroup B Neisseria meningitidis coding for sur-faceexposed antigens / V. Masignami [et al.] // Infection and Immunity. - 2001. -Vol. 69. - P. 2580-2588.

193. Muniesa, M. Potential impact of environmental bacteriophages in spreading antibiotic resistance genes / M. Muniesa, M. Colomer-Lluch, J. Jofre // Future Microbiology. - 2013. - Vol. 8, № 6. - P. 739-751.

194. Nakayama, K. The complete nucleotide sequence of phi CTX, a cytotoxin-converting phage of Pseudomonas aeruginosa: implications for phage evolution and horizontal gene transfer via bacteriophages / K. Nakayama [et al.] // Molecular Microbiology. - 1999. - Vol. 31, № 2. - P. 399-419.

195. Nelson, D. Prevention and elimination of upper respiratory colonization of mice by group A streptococci by using a bacteriophage lytic enzyme / D. Nelson, L. Loomis, V.A. Fischetti // Proceedings of the National Academy of Sciences of the USA. - 2001. - Vol. 98. - P. 4107-4112.

196. Nemsadze, T.D. Sensitivity and resistance of aerobic bacteria isolated from patients with periodontitis towards antibiotics and bacteriophages (comparative analysis) / T.D. Nemsadze, D.D. Mshvenieradze, K.G. Apridonidze // Georgian Medical News. - 2006. - Vol. 132. - P. 36-40.

197. New insights into the possible role of bacteriophages in transplantation / A. Gorski [et al.] // Transplantation Proceedings. - 2003. - Vol. 35, № 6. - P. 23722373.

198. Newly introduced genomic prophage islands are critical determinants of in vivo competitiveness in the Liverpool Epidemic Strain of Pseudomonas aeruginosa /

C. Winstanley [et al.] // Genome research. - 2009. - Vol. 19, № 1. - P. 12-23.

199. Novel alternatives to antibiotics: bacteriophages, bacterial cell wall hydrolases, and antimicrobial peptides / A. Parisien [et al.] // Journal of Applied Microbiology. - 2008. - Vol. 104, № 1. - P. 1-13.

200. Novel bacteriophage lysin with broad lytic activity protects against mixed infection by Streptococcus pyogenes and methicillin-resistant Staphylococcus aureus /

D.B. Gilmer [et al.] // Antimicrobial Agents and Chemotherapy. - 2013. - Vol. 57, № 6. - P. 2743-2750.

201. Oral T4-like phage cocktail application to healthy adult volunteers from Bangladesh / S.A. Sarker [et al.] // Virology. — 2012. - Vol. 434, № 2. - P. 222-232.

202. Origins of highly mosaic mycobacteriophage genomes / M.L. Pedulla [et al.] // Cell. - 2003. - Vol. 113(2). - P.171-182.

203. Ormälä, A.M. Phage therapy: Should bacterial resistance to phages be a concern, even in the long run? / A.M. Ormälä, M. Jalasvuori // Bacteriophage. - 2013. -Vol. 3, № 1. - e24219.

204. Outbreaks in neonatal intensive care units - They are not like others / P. Gastmeier [et al.] // American Journal of Infection Control. - 2007. - Vol. 35, № 3. -P. 172-176.

205. Pathogenesis of renal disease due to enterohemorrhagic Escherichia coli in germ-free mice / K.A. Eaton [et al.] // Infection and Immunity. - 2008. - Vol. 76, №7. -P. 3054-3063.

206. Pathogenicity islands occurrence in epidemic MRSA strains from Russia and Kazakhstan / A. Goncharov [et al.] // International Journal of Infectious Diseases. -2013. - Vol. 16, Supplement 1. - P. 368.

207. Phage biocontrol of enteropathogenic and Shiga toxin-producing Escherichia coli during milk fermentation / D. Tomat [et al.] // Letter of Applied Microbiology. - 2013. - Vol. 57, № 1. - P. 3-10.

208. Phage lytic enzymes as therapy for antibiotic-resistant Streptococcus pneumoniae infection in a murine sepsis mode / I. Jado [et al.] // Journal of Antimicrobial Chemotherapy. - 2003. - Vol. 52, № 6. - P. 967-973.

209. Physiological state of Escherichia coli BJ4 growing in the large intestines of streptomycin-treated mice / L.K. Poulsen [et al.] // Journal of Bacteriology. - 1995. -Vol. 177. - P. 5840-5845.

210. Popoola, V. Decolonization to prevent Staphylococcus aureus transmission and infections in the neonatal intensive care unit / V. C. A. Milstone // Journal of Peri-natology. - 2014. - Vol. 34(11). - P. 805-810.

211. Pore formation by a two-component leukocidin from Staphylococcus aureus within the membrane of human polymorphonuclear leukocytes / V. Finck-Barbancon [et al.] // Biochimica et Biophysica Acta. - 1993. - Vol. 1182. - P. 275-282.

212. Potential of bacteriophages and their lysins in the treatment of MRSA: current status and future perspectives / J. Borysowski [et al.] // BioDrugs. - 2011. -Vol. 25, № 6. - P. 347-355.

213. Pretorius, G.H.J. Proteus mirabilis phages 5006M, 5006M HFT k and 5006M HFT ak: physical comparison of genome characteristics / G.H.J. Pretorius, W.F. Coetzee // Journal of General Virology. - 1980. - Vol. 49, № 1. - P. 33-39.

214. Production of cytolethal distending toxins by pathogenic Escherichia coli strains isolated from human and animal sources: establishment of the existence of a new cdt variant (Type IV) / I. Toth [et al.] // Journal of clinical microbiology. - 2003. -Vol. 41, № 9. - P. 4285-4291.

215. Prophage Genomics / C. Canchaya [et al.] // Microbiology and Molecular Biology Reviews. - 2003. - Vol. 67(2). - P. 238-276.

216. Pseudomonas aeruginosa bacteriophage PA10 requires type IV pili for infection and shows broad bactericidal and biofilm removal activities / S. Kim [et al.] // Applied and Environmental Microbiology. - 2012. - Vol. 78, № 17. - P. 6380-6385.

217. Quality-controlled small-scale production of a well-defined bacteriophage cocktail for use in human clinical trials / M. Merabishvili [et al.] // PLoS One. - 2009. -Vol. 4, № 3. - e4944.

218. Removal of group B streptococci colonizing the vagina and oropharynx of mice with a bacteriophage lytic enzyme / Q. Cheng [et al.] // Antimicrobial Agents and Chemotherapy. - 2005. - № 49. - P. 111-117.

219. Respirable bacteriophages for the treatment of bacterial lung infections / S. Hoe [et al.] // Journal of Aerosol Medicine and Pulmonary Drug Delivery. - 2013. -Vol. 26, № 6. - P. 317-35.

220. Results of bacteriophage treatment of suppurative bacterial infections in the years 1981-1986 / S. Slopek [et al.] // Archivum immunologiae et Therapiae Experimental. - 1987. - Vol. 35, № 5. - P. 569-583.

221. Role of DLP12 lysis genes in Escherichia coli biofilm formation / F.A. Toba [et al.] // Microbiology. - 2011. - Vol. 157. - P. 1640-1650.

222. Safety analysis of a Russian phage cocktail: from metagenomic analysis to oral application in healthy human subjects / S. McCallin [et al.] // Virology. - 2013. -Vol. 443, № 2. - P. 187-196.

223. Schicklmaier, P. Frequency of generalized transducing phages in natural isolates of the Salmonella typhimurium complex / P. Schicklmaier, H. Schmieger // Applied and Environmental Microbiology. - 1995. - Vol. 61. - P. 1637-1640.

224. Schuch, R. A bacteriolytic agent that detects and kills Bacillus anthracis / R. Schuch, D. Nelson, V.A. Fischetti // Science. - 2002. - Vol. 418, № 6900. - P. 884889.

225. Seasonal epidemics of cholera inversely correlate with the prevalence of environmental cholera phages / S.M. Faruque [et al.] // Proceedings of the National Academy of Sciences of the USA. - 2005. - Vol. 102, № 5. - P. 1702-1707.

226. Selection of an Escherichia coli O157:H7 bacteriophage for persistence in the circulatory system of mice infected experimentally / R. Capparelli [et al.] // Clinical Microbiology and Infection. - 2006. - Vol. 12, № 3. - P. 248-253.

227. Shaikh, N. Escherichia coli O157:H7 Shiga Toxin-Encoding Bacteriophages: Integrations, Excisions, Truncations, and Evolutionary Implications / N. Shaikh, P. Tarr // Journal of Bacteriology. - 2003. - Vol. 185(12). - P. 3596-3605.

228. Shen, Y. Rapid degradation of Streptococcus pyogenes biofilms by PlyC, a bacteriophage-encoded endolysin / Y. Shen [et al.] // Journal of Antimicrobial Chemotherapy. - 2013. - Vol. 68, № 8. - P. 1818-1824.

229. Some immunological changes in children with bacterial infections treated with bacteriophages / K.I. Pagava [et al.] // Georgian Medical News. - 2012. -Vol. 212. - P. 64-69.

230. Soothill, J. Use of bacteriophages in the treatment of Pseudomonas aeruginosa infections / J. Soothill // Expert Review of Anti-infective Therapy. - 2013. -Vol. 11, № 9. - P. 909-915.

231. Spatial distribution of Escherichia coli in the mouse large intestine inferred from rRNA in situ hybridization / L.K. Poulsen [et al.] // Infection and Immunity. -1994. - Vol. 62. - P. 5191-5194.

232. Spatial-distribution of viruses, bacteria and chlorophyll-a in neritic, oceanic and estuarine environments / W.P. Cochlan [et al.] // The Marine Ecology Progress Series. - 1993. - Vol. 92. - P. 77-87.

233. Stone, R. Bacteriophage therapy. Stalin's forgotten cure / R. Stone // Science. - 2002. - Vol. 298, № 5594. - P. 728-731.

234. Sulakvelidze, A. Using lytic bacteriophages to eliminate or significantly reduce contamination of food by foodborne bacterial pathogens / A. Sulakvelidze // Journal of the Science of Food and Agriculture. - 2013. - Vol. 93, № 13. - P. 31373146.

235. Summers, WC. Felix d'Herelle and the origins of molecular biology / W.C. Summers. - New Haven, Conn : Yale University Press, 1999. - 248 p.

236. Suttle, C.A. Dynamics and distribution of cyanophages and their effect on marine Synechococcus spp. / C.A. Suttle, A.M. Chan // Applied and Environmental Microbiology. - 1994. - Vol. 60. - P. 3167-3174.

237. Taylor, A.L. Bacteriophage - induced mutation in Escherichia coli / A.L. Taylor // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 1963. - Vol. 50. - P. 1043-1051.

238. The ability of flagellum-specific Proteus vulgaris bacteriophage PV22 to interact with Campylobacter jejuni flagella in culture / E.L. Zhilenkov [et al.] // Virology Journal. - 2006. - Vol. 3. - P. 50.

239. The origins and ongoing evolution of viruses / R.W. Hendrix [et al.] // Trends Microbiol. - 2000. - Vol. 8, № 11. - P. 504-508.

240. The phage lytic proteins from the Staphylococcus aureus bacteriophage vB_SauS-phiIPLA88 display multiple active catalytic domains and do not trigger staphylococcal resistance / L. Rodriguez-Rubio [et al.] // Public Library of Science One [Электронный ресурс]. - 2013. - Vol. 8, № 5. - е. 64671. - Режим доступа: http: //www.ncbi .nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3665550.

241. The pheV phenylalanine tRNA gene Klebsiella pneumoniae clinical isolates is an integration hotspot for possible niche-adaptation genomic islands / N. Chen [et al.] // Current Microbiology. - 2010. - Vol. 60, № 3. - P. 210-216.

242. The role of regulated clinical trials in the development of bacteriophage therapeutics / H.M. Parracho [et al.] // Journal of molecular and genetic medicine. -2012. - Vol. 6. - P. 279-286.

243. Therapeutic effectiveness of bacteriophages in the rescue of mice with extended spectrum beta-lactamase-producing Escherichia coli bacteremia / J. Wang [et al.] // International journal of molecular medicine. - 2006. - Vol. 17, № 2. - Р. 347-355.

244. Therapy of Experimental Pseudomonas Infections with a Nonreplicating Genetically Modified Phage / S. Hagens [et al.] // Antimicrobial Agents and Chemotherapy. - 2004. - Vol. 48, № 10. - P. 3817-3822.

245. Transcriptome of swarming Proteus mirabilis / M.M. Pearson [et al.] // Infection and immunity. - 2010. - Vol. 78, № 6. - P. 2834-2845.

246. Transduction of antibiotic resistance including imipenem resistance by wild type phages from nosocomial strains of Pseudomonas aeruginosa / J. Blahova [et al.] // Acta virologica. - 1997. - Vol. 41(5). - P. 293-296.

247. Use of bacteriophage in the treatment of experimental animal bacteremia from imipenem-resistant Pseudomonas aeruginosa / J. Wang [et al.] // International journal of molecular medicine. - 2006. - Vol. 17, № 2. - P. 309-317.

248. Variable assortment of prophages provides a transferable repertoire of pathogenic determinants in Salmonella / N. Figueroa-Bossi [et al.] // Molecular Microbiology. - 2001. - Vol. 39. - P. 260-271.

249. Vibrio cholerae produces s second enterotoxin, which affects intestinal tight junctions / A. Fasano [et al.] // Proceedings of the National Academy of Sciences of the USA. - 1991. - Vol. 88. - P. 5242-5246.

250. Virolysin, a virus-induced lysin: its appearance and function in phage-infected Staphylococci / D.J. Ralston [et al.] // Journal of General Microbiology. -1961. - Vol. 24. - P. 313-325.

251. Virolysin: a virus-induced lysin from staphylococcal phage lysates / D.J. Ralston [et al.] // Proceedings of the Society for Experimental Biology and Medicine. - 1955. - Vol. 89, № 4. - P. 502-507.

252. Viruses as Partners in spring bloom microbial trophodynamics / G. Bratbak [et al.] // Applied and Environmental Microbiology. - 1990. - Vol. 56(5). - P. 14001405.

253. Waldor, M.K. Lysogenic conversion by a filamentous phage encoding cholera toxin / M.K. Waldor, J.J. Mekalanos // Science. - 1996. - Vol. 272, № 5270. -P. 1910-1914.

254. Waterbury, J.B. Resistance to co-occurring phages enables marine Syn-echococcus communities to coexist with cyanophages abundant in seawater / J.B. Waterbury, F.W. Valois // Applied and Environmental Microbiology. - 1993. -Vol. 59. - P. 3393-3399.

255. Wiggins, B.A. Minimum bacterial density for bacteriophage replication: implications for significance of bacteriophages in natural ecosystems / B.A. Wiggins,

M. Alexander // Applied and Environmental Microbiology. - 1985. - Vol. 49(1). -P. 19-23.

256. Wittebole, X. A historical overview of bacteriophage therapy as an alternative to antibiotics for the treatment of bacterial pathogens / X. Wittebole, S. De Roock, S.M. Opal // Virulence. - 2014. - Vol. 5, № 1. - P. 226-235.

257. wksl3, a New biocontrol agent for Salmonella enterica serovars enteritidis and typhimurium in foods: characterization, application, sequence analysis, and oral acute toxicity study / H.W. Kang [et al.] // Applied and Environmental Microbiology. -2013. - Vol. 79, № 6. - P. 1956-1968.

258. Woods, D.R. Bacteriophage growth on stationary phase Achromobacter cells / D.R. Woods // Journal of General Virology- 1976. - Vol. 32. - P. 45-50.

259. Young, K.D. Lytic action of cloned ^X174 gene E / K.D. Young, R. Young // Journal of Virology. - 1982. - Vol. 44, № 3. - P. 993-1002.

260. Young, R. Phages will out: strategies of host cell lysis / R. Young, I.N. Wang, W.D. Roof // Trends in Microbiology. - 2000. - Vol. 8, № 33. - P. 120128.

261. Zhang, H. Phage inactivation of foodborne Shigella on ready-to-eat spiced chicken / H. Zhang, R. Wang, H. Bao // Poultry Science. - 2013. - Vol. 92, № 1. -P. 211-217.

ПРИЛОЖЕНИЯ Документы о внедрении

Акт внедрения в учебный процесс

Министерство здравоохранения Российской Федерации

(\( ¿тм-)})

федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Северо-Западный государственный медицинский университет имени И.И. Мечникова" Министерства здравоохранения Российской Федерации

(ФГБОУ ВО СЗГМУ им. И.И. Мечникова Минздрава России)

191015,Саикт-Петербург, ул. Кирочная, д.41 ОКПО 30625447, ОКАТО 40298564000, ОГРН 1117847434990. ИНН 7842461679. КПП 784201001

ОКВЭД80.3: 85 1:73.10; 75.21 тел : [phone]. факс: [phone] www.szgmu.ru

_№ _

На_от _

АКТ ВНЕДРЕНИЯ

в учебный процесс кафедры эпидемиологии, паразитологии и дезинфектологии медико-профилактического факультета федерального государственного бюджетного образовательного учреждения высшего образования "Северо-Западный государственный медицинский университет имени И.И. Мечникова" Министерства здравоохранения Российской Федерации результатов научной работы по результатам докторской диссертации на тему: «Эпидемиологическая оценка бактериофагов как факторов эволюции госпитальных штаммов и средств борьбы с внутрибольничными инфекциями» соискателя Асланова Батырбека Исмеловича.

Мы, нижеподписавшиеся, комиссия в составе: председателя проректора по медико-профилактическому направлению д.м.н. Мельцера A.B., заведующего кафедрой эпидемиологии, паразитологии и дезинфектологии з.д.н. РФ, профессора, д.м.н. Зуевой Л.П., заведующего учебной частью кафедры эпидемиологии, паразитологии и дезинфектологии доцента, к.м.н. Ивановой Т.Г. удостоверяем, что результаты диссертационного исследования на тему: «Эпидемиологическая оценка бактериофагов как факторов эволюции госпитальных штаммов и средств борьбы с внутрибольничными инфекциями» соискателя кафедры эпидемиологии, паразитологии и дезинфектологии Асланов Б.И. внедрены в практическое занятие «Организация борьбы с инфекционными заболеваниями в лечебно-профилактических учреждениях» для студентов 6 курса медико-профилактического факультета; в лекцию «Бактериофаги и их место в лечении и профилактике инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи» для интернов и ординаторов; в лекцию «Бактериофаги - эффективные противоэпидемические средства в условиях глобальной устойчивости к антибиотикам» для слушателей сертификационных циклов и циклов тематического усовершенствования.

Проректор по медико-профилактическому направлению д.м.н.

Заведующий кафедрой эпидемиологии, паразитологии и дезинфектологии з.д.н. РФ, профессор, д.м.н, Заведующий учебной частью кафедры эпидемиологии, паразитологии и дезинфектологии доцент, к.м.н

Министерство здравоохранения Российской Федерации

Национальная ассоциация специалистов по контролю инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи

Л

ФЕДЕРАЛЬНЫЕ КЛИНИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ

Рациональное применение бактериофагов в лечебной и противоэпидемической практике

УДК 616-036.22:614.2:576.858.9(07) ББК 51.9я7

Рациональное применение бактериофагов в лечебной и противоэпидемической практике. Федеральные клинические рекомендации Москва. 2014 - 54 с.

Утверждены: Протокол №5 от 21.04.2014 Общего собрания членов НП «НАСКИ» и протокол №3от21.04.2014заседания Профильной комиссии МЗ РФ по эпидемиологии в период проведения Всероссийской научно-практической конференции с 'международным участием "Новые технологии специфической и неспецифической профилактики инфекций", г. Владивосток, апрель 2014г.

Авторский коллектив:

Асланов Б.И.. Зуева Л.П.. Кафтырееа ЛА, Бойцов А.Г.. Акимкин В.Г., Долг™ АА, Брусина ЕБ., Дроздова О.М.

Разработчики:

• ГБОУ ВПО «Северо-Западный государственный медицинский университет имени И.И. Мечникова» Министерства здравоохранения Российской Федерации.

• ФБУН «Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии имени Пастера»,

• ГБОУ ВПО «Первый Московский государственный медицинский университет им. И.М. Сеченова» Министерства здравоохранения Российской Федерации.

• ГБОУ ВПО «Кемеровская государственная медицинская академия» Министерства здравоохранения Российской Федерации.

ISBN 978-5-906125-09-5

© Асланов Б.И., Зуева Л.П., Кафтырева Л А, Бойцов А.Г., Акимкин В.Г., Долгий А. А., Брусина Е.Б., Дроздова О.М.. 2014 © Издательство Ремедиум Приволжье, 2014

I

9785906125095

Федеральные клинические рекомендации «Принципы организации периоперационной антибиотикопрофилактики в учреждениях

здравоохранения»

Принципы организации периоперационной антибиотикопрофилактики в учреждениях здравоохранения. Федеральные клинические рекомендации [Электронный ресурс] / Б.И. Асланов [и др.]. - М., 2014. - 42 с. - Режим доступа:

http: //nasci .ru/_resources/directory/19 8/common/2014_9_PAP_new.pdf.

л

£

<u fi,

• 1—I

л

W.

r-,

o

(N O

O o

00 CJ"n

Ь

O o

<D

СЛ

<D O

S

o

сл <D

Национальная ассоциация специалистов по контролю инфекций, связанных с оказанием медицинской помошн (НП «НЛСКИ»)

ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКОЕ НАБЛЮДЕНИЕ ЗА ИНФЕКЦИЯМИ. СВЯЗАННЫМИ С ОКАЗАНИЕМ МЕДИЦИНСКОЙ ПОМОЩИ

Федеральные клинические рекомендации

Ноябрь, 2014

'ЗНИКМИОЛОГИЧССК

МСЛИ11ИИСКОЙ помощи. Федеральные к. Лаюрсккм «шпсти:

Асланов НИ.. Зуева Д.11.. Дюбимом Л.В.. К'п.тосовская Е И . Долгий Л.А, Осъмиржо Т.В.

- М, 2014. Як.

Г НОУ ВПО «Семеро- Западный государстве н иый медицинский университет имени НИ Мечникова» Министерства гдравоохраисиия Российской Федерации

Экспертный совет;

Брика Н И ni-xuK« РАН, д м.и , проф , ш кафедрой пнипкаипш к докжмтсльпой медицины ГЮУ ВПО ПМГМУ им И М. Ссчетюва» Мшпдрава России, главный «иоиипша специалист токдемиолог Минирма России. председатель МП «НЛСКИ» (Моста); Брусмна F,b. дм.я.. проф. м* кафедрой ГБОУ ВПО КемГМЛ Minrupaaa России, главный внештатный специалист лпилемиолот Minrupaaa а Кемеровской области (Кемерово); Ковйлипемй О Н • Я.м и . проф. кафедры интлемиолог ни ГНОУ ВПО Ниж! МЛ Мишдрааа России. исполнительный .1» рос тор HI1 «НЛСКИ» (Нижний Новгород). Ствсенко ВЛ. - дм. и.. проф.. та* кафедрой ктилемиолопги ГНОУ BÍIO ОГМЛ Мюпдрава Россия. главный внештатный специалист ктндемколог Митдроаа Омской области (Оме*). Фельдблюм И В хм и . проф . iaa кафедрой лпиеммодотии с курсом гкпмш и жндемиологии ФПК и ППС ГНОУ ВПО ПГМЛ им. академика Е.Л Вагнера Мюггдрааа России (Пермь); Шкарип В.В. член-корр РАН. д.м.н.. проф, прегядогт и таа.кафелрой жтидсмиолосии ГБОУ ВПО НкжГМЛ Минтдрава России (Нижний Новгород)

Авторы таявляют об отсутствии конфликта интересов

Согласованы Профильной комиссией Мин права России по "шиде миологи и 20 ноября 2014 г . протекал .VH

Утверждены na обекм собрании членов нем» «Национальная ассоциация специалистов по коягтролю инфекций, с медицинской immocui. (НП «НАСКИ») 19 112014 (Протокол Si6)

Всероссийской научно-практической специалистов по контролю инфекций, евганных с о Москва, 19-21 ноября 2014 г

международным участием

В клинических (методических) рекомендациях изложены основ«ые принципы оргаииммии и проведения игидемиа-югачесхого наблюдения м инфекциями. сватанными с окамнием медицинской помощи Прсднашачены .гая шиле миологов, врачей ралличиых специальностей, работаихпих а амбулаторно-полихлимических учреждениях, хирургически*, урологических, травматолсинчсских. гиисколошческих. ожоговых, терапевтических, педиатрических, инфекционных стационарах и отдс-тениях реанимации и интенсивной терапии ллв втрослых и детей.

О

сл ей Й

Рч i

"Л

4>

к я

о _

^ ^^^ ^ Комитет по здравоохранению Правительства Санкт-Петербурга

Медицинский информационно-аналитический центр (Ин Государственное бюджетное учрежаение высшего

- 4 профессионального образования

«Северо-Западный Государственный медицинский университет им. И.И. Мечникова» Министерства здравоохранения Российской Федерации

к

ч

ч

со Я

о и В

св о

-8- %

о о

5 я

Л 4> Н * эЯ О * и

се ю я я

к я

а я

я ч

се

со §

о

м

л г»

п Я

о Я

я се

о м

В се

»

о

я и

в Я Я

Я §

я

а я

а я

се

го

а К

а

Я и

се Сч

Ч Я

Я г