Эпидемиологическая характеристика сальмонеллеза на территории Кемеровской области и совершенствование мероприятий по его профилактике тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 14.02.02, кандидат наук Медведева Нина Владимировна

• Медведева Нина Владимировна
• кандидат наук
• 2016

Оглавление диссертации кандидат наук Медведева Нина Владимировна

ВВЕДЕНИЕ

ГЛАВА 1. СОВРЕМЕННАЯ ЭПИДЕМИОЛОГИЯ САЛЬМОНЕЛЛЕЗА (ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ)

1.1 Современные особенности эпидемического процесса сальмонеллеза

1.2 Распространенность сальмонеллеза в мире, смертность, экономический ущерб

1.3 Современные особенности этиологии сальмонеллеза

1.3.1 Генетическая гетерогенность сальмонелл

1.4 Источники, пути и факторы передачи возбудителя сальмонеллеза

1.4.1 Источники возбудителя сальмонеллеза

1.4.2 Пути и факторы распространения сальмонеллеза

1.5 Факторы и группы риска заболевания сальмонеллезом

1.6 Вспышечная заболеваемость, обусловленная сальмонеллами

1.7 Пути профилактики сальмонеллеза в настоящее время

ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ

2.1 Программа и план исследования

2.2 Общая характеристика территории наблюдения

2.3 Изучаемое явление

2.4 Материалы исследования

2.5 Методы исследования

2.5.1Стандартное эпидемиологическое определение случая сальмонеллеза

2.5.2 Ретроспективный эпидемиологический анализ

2.5.3 Аналитическое эпидемиологическое исследование

2.5.4 Молекулярно-генетический метод

2.5.5 Метод бактериологического мониторинга

2.5.6 Метод определения устойчивости сальмонелл к воздействию высоких температур

2.5.7 Статистические методы

ГЛАВА 3. ОСОБЕННОСТИ ПРОЯВЛЕНИЙ ЭПИДЕМИЧЕСКОГО ПРОЦЕССА САЛЬМОНЕЛЛЕЗА НА ТЕРРИТОРИИ КЕМЕРОВСКОЙ

ОБЛАСТИ

3.1 Анализ многолетней динамики заболеваемости сальмонеллезом

3.1.1 Внутригодовая динамика заболеваемости сальмонеллезом

3.1.2 Этиологическая структура сальмонеллеза

3.1.3 Заболеваемость сальмонеллезом на административных территориях

Кемеровской области

ГЛАВА 4. ХАРАКТЕРИСТИКА ВОЗБУДИТЕЛЕЙ САЛЬМОНЕЛЛЕЗА, ЦИРКУЛИРУЮЩИХ НА ТЕРРИТОРИИ КЕМЕРОВСКОЙ ОБЛАСТИ

4.1 Структура возбудителей сальмонеллеза

4.2 Чувствительность Salmonella spp. к антибактериальным препаратам

4.3 Молекулярно-генетическая характеристика возбудителей сальмонеллеза

4.4 Определение устойчивости возбудителей сальмонеллеза к воздействию

высоких температур

ГЛАВА 5. ИСТОЧНИКИ, ПУТИ И ФАКТОРЫ ПЕРЕДАЧИ ВОЗБУДИТЕЛЕЙ САЛЬМОНЕЛЛЕЗА

5.1 Источники возбудителя сальмонеллеза

5.2 Пути и факторы передачи возбудителя инфекции

ГЛАВА 6. ПРОФИЛАКТИКА САЛЬМОНЕЛЛЕЗА НА ТЕРРИТОРИИ КЕМЕРОВСКОЙ ОБЛАСТИ

6.1 Принципы и подходы к профилактике сальмонеллеза

6.2 Мероприятия по совершенствованию надзора за сальмонеллезом на

территории Кемеровской области

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

ВЫВОДЫ

ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

ПРИЛОЖЕНИЯ

ВВЕДЕНИЕ

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Эпидемиологическая характеристика сальмонеллеза на территории Кемеровской области и совершенствование мероприятий по его профилактике»

Актуальность темы исследования

Одной из наиболее частых причин возникновения бактериальной диареи в мире являются возбудители сальмонеллеза [131,171].

По заключению экспертов Всемирной организации здравоохранения (ВОЗ) сальмонеллез как зоонозная инфекция не имеет себе равных по сложности эпизоотического и эпидемического процессов и борьбы с ним [73]. Европейским парламентом и Советом Европейского сообщества подчеркивается, что сальмонеллез является одной из главных причин случаев зоонозов у человека [76].

Широкому распространению сальмонеллеза в мире способствуют непрерывно текущие процессы глобализации, изменение технологии производства продуктов питания, интенсивный рост международного товарообмена, миграции и туризма [5, 62, 129, 138].

Для большинства регионов Российской Федерации проблема профилактики сальмонеллеза продолжает оставаться высоко актуальной на протяжении многих лет, поскольку динамика заболеваемости характеризуется отсутствием тенденции к снижению [189]. Параллельно с этим наблюдается существенный рост экономических затрат: в таблице рейтинговой оценки экономического ущерба, нанесенного инфекционными болезнями в 2005 - 2014 годах в Российской Федерации, рейтинг сальмонеллеза поднялся с 13-го на 6 пункт [189].

Важными причинами возросших материальных затрат стали формирование множественной лекарственной устойчивости сальмонелл, сужение перечня

препаратов выбора, использование дорогостоящих антибиотиков в терапии [13, 90].

Таким образом, рост интенсивности проявлений эпидемического процесса, появление полирезистентных возбудителей сальмонеллеза, риск возникновения вспышек и внутрибольничных инфекций обусловливают необходимость постоянного эпидемиологического наблюдения за этой группой инфекций, определения молекулярно-генетических свойств штаммов, ответственных за рост заболеваемости, поиск оптимальных путей профилактики.

Степень разработанности темы

Эпидемиологии сальмонеллеза посвящено большое количество исследований [25, 62, 77, 157]. Изучены этиологические, клинико-эпидемиологические особенности сальмонеллеза, вызванного разными вариантами сальмонелл [6, 9, 188], эпидемиология госпитального сальмонеллеза [19], закономерности формирования вспышек [31], генетическая гетерогенность изолятов Salmonella spp. [25, 44, 196], антимикробная резистентность [8], образование биопленок [29], взаимосвязь маркеров патогенности сальмонелл с антибиотикорезистентностью [46], лабораторная диагностика [34], роль отдельных категорий источников возбудителя инфекции, путей и факторов передачи [21, 37]. Однако продолжающийся рост заболеваемости сальмонеллезом, эволюция эпидемического процесса под влиянием новых технологий производства продуктов питания, социально-экономических условий, процессов глобализации, региональных условий определяют необходимость изучения закономерностей развития эпидемического процесса,

совершенствование эпидемиологического надзора, поиск эффективных путей профилактики.

Цель исследования

Совершенствование эпидемиологического надзора и путей профилактики сальмонеллеза на основе изучения закономерностей развития эпидемического процесса в современных условиях.

Задачи исследования

- изучить уровни, динамику, структуру, заболеваемости сальмонеллезом на территории Кемеровской области;

- выявить группы и время риска заболеваемости сальмонеллезом;

- установить доминирующие и минорные клоны сальмонелл, определяющие заболеваемость;

- определить роль различных источников, путей и факторов передачи сальмонеллеза;

- научно обосновать направления совершенствования эпидемиологического надзора и меры по снижению заболеваемости сальмонеллезом населения Кемеровской области.

Научная новизна

Выявлены особенности эпидемического процесса сальмонеллеза, проявившиеся изменениями тенденции заболеваемости, структуры серологических групп сальмонелл, превалирующих факторов передачи возбудителей инфекции.

Определены доминирующие на территории Кемеровской области клоны Salmonella. spp.: S. enteritidis (JEGX01.0001 - JEGA26.0001), S. infantis (JFXX01.0015 - JFXA26.0011), S. typhimurium (JPXX01.0020 - JPXA26.0014), имеющие наибольшее эпидемиологическое значение.

Установлена терморезистентность доминирующего серовара S. enteritidis.

Показана актуальность «молочного» фактора в распространении возбудителей сальмонеллеза.

Предложены пути оптимизации эпидемиологического надзора за сальмонеллезом и снижения заболеваемости.

Теоретическая и практическая значимость работы

В процессе исследования были выявлены новые закономерности развития эпидемического процесса сальмонеллеза, особенности распространения возбудителей инфекции на территории Кемеровской области и изучены их свойства: определена молекулярно-генетическая структура доминирующих клонов S. enteritidis, выявлена высокая устойчивость к нагреванию. Научно обосновано направление эффективных мер профилактики сальмонеллеза и

снижения заболеваемости.

Результаты исследования внедрены в практику работы ФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Кемеровской области» (акт внедрения № 3629-ЭО от 25.11.2013). Разработана и внедрена в медицинских организациях Кемеровской области унифицированная форма «Эпидемиологический анамнез больного острой кишечной инфекцией (ОКИ) и сальмонеллезом» (акт внедрения Департамента охраны здоровья населения Кемеровской области № 2787 от 08.08.2014).

Для оптимизации работы в очаге инфекционного заболевания с фекально-оральным механизмом передачи возбудителя разработана и внедрена в практику ФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Кемеровской области» «Карта эпидемиологического обследования очага кишечных инфекций» (акт внедрения № 503 от 26.03.2015).

Методология и методы исследования

Методология исследования включала комплексную эпидемиологическую оценку проявлений эпидемического процесса сальмонеллеза на территории Кемеровской области. Использованы современные эпидемиологические, молекулярно-генетические, статистические методы исследования.

Положения, выносимые на защиту

1. Эпидемический процесс сальмонеллеза на территории Кемеровской области определяется циркуляцией преимущественно одного серовара

S. enteritidis (генотип: JEGX01.0001 - JEGA26.0001) с высокой интенсивностью проявлений и вовлечением в процесс распространения возбудителей инфекции «молочного» фактора передачи.

2. Оптимизация эпидемиологического надзора и профилактики сальмонеллеза должна включать широкое применение молекулярно-генетического мониторинга, определение терморезистентности Salmonella spp., установление активного межведомственного взаимодействия, разработку новых подходов к процессу приготовления молока и молочных продуктов в условиях циркуляции терморезистентных сальмонелл.

Степень достоверности и апробация результатов

Достоверность результатов исследования, выводов и положений, выносимых на защиту, основывается на достаточном по объему репрезентативном материале, использовании современных методов исследования и методов статистической обработки данных. Комиссия, сформированная в соответствии с приказом ректора ГБОУ ВПО КемГМА Минздрава России № 498 от 12 ноября 2015 г., подтверждает подлинность первичных материалов, а также личный вклад автора.

Диссертационная работа апробирована на совместном заседании кафедр эпидемиологии, биологии с основами генетики и паразитологии, инфекционных болезней ГБОУ ВПО «Кемеровская государственная медицинская академия» Министерства здравоохранения Российской Федерации.

Результаты работы обсуждены и доложены на заседаниях V Ежегодного Всероссийского Конгресса по инфекционным болезням (г. Москва, 2013 г.), Всероссийской научно-практической конференции с международным участием

«Эпидемиология в XXI веке: новые горизонты профилактики» (г. Кемерово, 2013 г.), Всероссийской научно-практической конференции с международным участием «Новые технологии специфической и неспецифической профилактики инфекционных болезней» (г. Владивосток, 2014 г.), VII Ежегодного Всероссийского Конгресса по инфекционным болезням (г. Москва, 2015 г.), Российской научно-практической конференции «Итоги и перспективы изучения проблем инфекционных и паразитарных болезней» (г. Пермь, 2015 г.), областных днях специалиста - врача-инфекциониста и врача-эпидемиолога (г. Кемерово, 2013 - 2015 г. г.).

Публикации

Фрагменты данного исследования опубликованы в 19 печатных работах в России и за рубежом, в том числе в 3 изданиях, рекомендованных ВАК Минобрнауки РФ для публикации основных положений диссертаций на соискание ученой степени.

Объем и структура диссертации

Работа изложена на 153 страницах компьютерного текста, иллюстрирована 35 таблицами, 23 рисунками.

Диссертация состоит из введения, литературного обзора, главы,

описывающей материалы и методы исследования, 4 глав собственных исследований, заключения, выводов, практических рекомендаций, трех приложений. Библиографический указатель содержит 227 литературных источников, в том числе 127 - зарубежных авторов.

Диссертация выполнена в соответствии с планом научно-исследовательской работы ГБОУ ВПО «Кемеровская государственная медицинская академия» Министерства здравоохранения Российской Федерации, номер государственной регистрации 0120.0511051.

Личный вклад

Автором определены цель, задачи, объем, программа, выбраны объекты и методы исследования, собраны исходные данные, организовано проведение молекулярно-генетических исследований культур Salmonella spp. и их устойчивости к нагреванию, разработан алгоритм анализа информации. Автор лично провела статистическую обработку, анализ результатов лабораторных, эпидемиологических исследований, модернизировала организацию эпидемиологического мониторинга за сальмонеллезом и острыми кишечными инфекциями, сформулировала основные положения, выводы диссертации и подготовила диссертационную работу. В целом, личный вклад в выполнение творческой части исследования составляет 90 %.

ГЛАВА 1. СОВРЕМЕННАЯ ЭПИДЕМИОЛОГИЯ САЛЬМОНЕЛЛЕЗА

(ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ)

1.1 Современные особенности эпидемического процесса сальмонеллеза

Постоянный рост миграционных процессов и значительное увеличение международного туризма приводят к изменению интенсивности проявлений эпидемического процесса [221], особенно в сторону ускорения распространения инфекционных заболеваний, в том числе диарейных [41, 222]. Ежегодно в мире насчитывается 232 млн. мигрантов, что составляет 3 % населения планеты [1] и 1 млрд. туристов, число которых за последние 10 лет возросло в 2,5 раза [5].

Экономические реформы 90-х годов XX в., в результате которых произошел резкий переход от советской распределительной системы обеспечения продуктами питания к рыночной, привели к максимальному освобождению участников рынка от внешнего контроля. В 2002 г. ГОСТы на продукты питания были заменены техническими регламентами [89], а на время их разработки производители могли соблюдать требования ГОСТ добровольно или руководствоваться менее строгими техническими условиями (ТУ). С появлением рынка и извлечением прибыли из оборота производители и ритейлеры были ориентированы на снижение себестоимости продуктов питания. Поэтому особенностью современного питания стал возросший риск приобретения потребителями некачественных, опасных для здоровья продуктов [24].

Применение в производстве продуктов питания различных добавок (эмульгаторов, консервантов, усилителей вкуса, красителей) с целью удлинения сроков реализации, удешевления себестоимости продукта могло привести и к эволюции возбудителей инфекций с пищевым путем заражения [24].

Анализ опубликованных работ свидетельствует об изменении этиологической структуры диарейных инфекций [82, 99, 207]. Авторы сообщают о быстрых темпах адаптации возбудителей кишечных инфекций к условиям обитания и способам воздействия со стороны человека, развитии устойчивости к дезинфектантам, антибиотикам, генетической неоднородности [62, 44], что способствует образованию новых эпидемических вариантов возбудителей инфекционных болезней и изменению клинических проявлений вызываемых ими заболеваний [105,191].

В последнее десятилетие в структуре бактериальных диарейных инфекций установлено преобладание сальмонеллеза над шигеллезом [92], увеличение частоты сальмонеллезно-ротавирусных микст-инфекций [2], рост интенсивности проявлений эпидемического процесса сальмонеллеза [56, 77], отмечено его лидерство во вспышечной заболеваемости [55, 98], обусловленной пищевым путем передачи возбудителя инфекции [64].

Увеличилась распространенность Salmonella spp. с множественной лекарственной устойчивостью (МЛУ) [212], участились вспышки [106], вызванные этими штаммами, возросла летальность [111, 162]. Показано, что применение антибактериальных препаратов (АБП) при лечении сальмонеллеза может приводить к формированию длительного носительства возбудителя инфекции [2, 143].

1.2 Распространенность сальмонеллеза в мире, смертность, экономический

ущерб

Сальмонеллез относится к числу убиквитарных бактериальных кишечных инфекций, наиболее распространенных в регионах с развитым животноводством и сельским хозяйством [16, 85, 128].

Парадоксально, но наиболее высока заболеваемость сальмонеллезом в экономически развитых странах [77, 217]. Сезонность остается преимущественно летне-осенней [6, 202, 203, 214].

В мире ежегодно регистрируется около 100 млн. случаев заболевания сальмонеллезом, 155 тыс. из которых заканчиваются летальным исходом [123]. В странах Восточной и Северо-Восточной Азии смертность от сальмонеллеза значительно выше, чем в странах Европы, Северной Америки и Океании [161].

После продолжительного снижения заболеваемости сальмонеллезом в странах Евросоюза (в 2004 г. заболеваемость регистрировалась на уровне 108 0/0000, а в 2009 г. - 21,6 0/0000), в последние годы в ряде стран этого региона отмечается ее рост. Так, в Дании уровень заболеваемости сальмонеллезом возрос с 31 0/0000 в 2006 г. до 67 0/0000 в 2008 г., на Мальте с 16 0/0000 до 39 0/0000 [161]. Снижение уровня заболеваемости сальмонеллезом наблюдалось и в России с 80,1 0/0000 в 1999 г. до 35,9 0/0000 в 2011 г. [18], однако с 2005 г. тенденция поменяла свое направление (Т = + 2,8 %) [20]. Сохраняется высокий уровень заболеваемости сальмонеллезом в Греции (около 103 0/0000), Германии (около 52 0/0000) [199], в Канаде с 2003 по 2009 г. г. зарегистрирован трехкратный прирост заболеваемости [145].

Центры по контролю за болезнями (СDC) сообщают, что ежегодное число заболевших сальмонеллезом в США может достигать 1 млн. человек (до 40 тыс. случаев согласно официальной статистики, что меньше реальной заболеваемости в 30 раз) [185, 197], а число погибших до 400 человек [159, 182]. За период с 1990 по 2007 годы в Соединенных Штатах от сальмонеллеза скончалось 1372 человека, из них 61 человек (4,4 %) - дети первого года жизни и 342 (29,4 %) - лица в возрасте 75 - 84 лет [123]. Экономический ущерб от сальмонеллеза только в США ежегодно составляет от 1,6 до 5,3 млрд. долларов [201], в том числе прямые медицинские затраты на лечение пациентов - около 365 млн. долларов [119, 142].

В настоящее время сальмонеллез продолжает оставаться одной из самых распространенных кишечных инфекций в России, уступая по частоте встречаемости только ротавирусной инфекции [44, 84]. Ежегодно в РФ

регистрируется до 50 тыс. случаев заболевания сальмонеллезом, показатель заболеваемости в среднем составляет 33,0 0/0000. Основная группа риска - дети в возрасте от 0 до 2 лет [26]. Рост заболеваемости сальмонеллезом отмечен и в странах ближнего зарубежья [81, 97].

1.3 Современные особенности этиологии сальмонеллеза

Сальмонеллез - полиэтиологичная инфекция, в структуру возбудителей которой входит более 2500 серотипов бактерий рода Salmonella семейства Enterobacteriaceae [34], из них около 200 имеют значение в патологии человека, 50 играют наиболее существенную роль [109, 123].

В основу классификации сальмонелл положены их метаболические особенности, согласно которым род Salmonella представлен двумя видами S. enterica и S. bongori [23]. Сальмонеллы вида S. enterica делятся на несколько подвидов и обозначаются символами I, II, IIIa, IIIb, IV, VI. Вид S. bongori имеет символ V. Деление на подвиды имеет эпидемиологическое значение, поскольку основным естественным резервуаром сальмонелл I и II подвидов являются теплокровные животные; IIIa, IIIb, IV, VI, и вида S. bongori - хладнокровные [23, 34].

Возбудитель сальмонеллеза хорошо сохраняется во внешней среде [95]. Экспериментально установлено, биопленки сальмонелл, сформированные на аппаратных носителях при инкубации 24 часа, требовали 32-х кратного увеличения минимальной бактерицидной концентрации дезинфицирующего средства, содержащего четвертично-аммониевые соединения [29].

В большинстве случаев сальмонеллы умеренно устойчивы к воздействию высоких температур, в жидкой среде при нагревании до 700С они погибают в

через 5-10 мин, а при кипячении - моментально [34], однако встречаются терморезистентные варианты [77, 170]. Возбудитель сальмонелл еза -внутриклеточный паразит [117, 152], способный вызывать реконструкцию эндосомальной системы в пораженных клетках [155].

Сальмонеллы могут изменять свои свойства, участвуя в межвидовом генетическом обмене [14, 15, 16], приобретать устойчивость к антибактериальным препаратам, которая обусловлена наличием R-плазмиды, получившей название R-фактора [13, 23, 46].

Важной негативной особенностью возбудителя сальмонеллеза является его способность к внутрибольничному распространению в стационарах различного профиля и формированию внутрибольничных вспышек [72, 93]. Присоединение сальмонеллеза к уже имеющейся патологии приводит к утяжелению основного заболевания, определяет летальный исход у 5,6 % заболевших взрослых пациентов и 30 % заболевших детей [19]. У 17 % детей раннего возраста сальмонеллез протекает с синдромом гемоколита [91].

Доминирующее значение в этиологии сальмонеллеза во всем мире имеют серологические варианты S. enteritidis и S. typhimurium [9, 40, 198]. Однако могут складываться условия для циркуляции того или иного серовара возбудителя, характерного для данной территории. По информации CDC ведущее место среди циркулирующих серотипов сальмонелл в США занимают S. enteritidis (22 %), S. newport (14 %), S. typhimurium (13 %) [79, 123], а наиболее часто встречающиеся возбудители сальмонеллеза у людей S. enteritidis, S. typhimurium, S. newport, S. heidelberg, S. javiana, S. montevideo, S. oranienburg, S. saintpaul. По данным Национальной Ветеринарной лаборатории (NVSL) у животных чаще обнаруживаются S. typhimurium, S. newport, S. heidelberg, S. agona, S. montevideo, S. anatum, S. derby, S. kentucky, S. choleraesuis, S. dublin, S. senftenberg [116].

В России с начала 80-х годов прошлого века в этиологической структуре сальмонеллеза доминирует S. enteritidis (81 - 83 %), однако в последние годы появились данные о возрастающей роли сальмонелл группы С [47, 48, 77], в

частности & infantis, что может свидетельствовать о формировании новых резервуаров возбудителей в природе, не имевших большого значения в предыдущие годы [27, 49, 50]. По данным референс-центра по мониторингу за сальмонеллезами с 2008 года увеличилась частота выделения & infantis из пищевых продуктов и окружающей среды, что может рассматриваться как предвестник осложнения эпидемиологической ситуации [27, 40].

1.3.1 Генетическая гетерогенность сальмонелл

Широкое использование молекулярных методов для субвидового типирования бактериальных патогенов, вызывающих «пищевые» заболевания, в том числе сальмонеллезы, привело к созданию сети PulseNet (США), которая объединила национальные лаборатории здравоохранения и гигиены питания координируемые CDC. Эти лаборатории проводят стандартизованное молекулярное типирование изолятов бактерий, вызывающих «пищевые» заболевания, методом PFGE (электрофорез в пульсирующем электрическом поле), оперативно обмениваются полученными данными. Благодаря анализу и обмену информацией между ними возможна быстрая верификация эпидемиологической связи отдельных, на первый взгляд «спорадических», случаев заболеваний по их ассоциации с определенным субтипом патогена, типом продукта и т. д. с последующей реализацией оперативных противоэпидемических мероприятий [79, 107, 136].

При определении генетической гетерогенности Salmonella spp., выделенных от больных, из объектов окружающей среды, продуктов питания в 16 субъектах Российской Федерации установлено, что в большинстве случаев этиологическим агентом является S. enteritidis. Выявлены 40 различных генотипов этого серовара

с преобладанием генотипа Ш0Х01.0001 - Ш0А26.0001 (в 60 % случаев) без ассоциации с какой-либо территорией [25].

В рамках определения гетерогенности популяции enteritidis Ф. Н. Шубиным и соавт. выявлены 9 основных плазмидных типов серовара. Наиболее часто (в 97 % случаев) обнаруживались плазмиды вирулентности массой 38 Мёа, получившие трансрегиональное распространение в Сибири, на Дальнем Востоке и Европейской части РФ. Установлено, для этого генотипа характерна широкая циркуляция на предприятиях птицеводства, участие в формировании заболеваемости населения [96]. Вместе с тем, требует ответа вопрос о причастности enteritidis с плазмидами вирулентности массой 38 Мёа к генотипу Ш0Х01.0001 - Ш0А26.0001.

Еще большая гетерогенность доказана в популяции 5. typhimurium - 56 плазмидных типов, из которых бактерии с плазмидами вирулентности массой 60 Мёа выделены из различных проб продуктов питания, от 21,9 % больных на территории Сибири и Дальнего Востока. Сальмонеллы одного и того же плазмидного типа имели разную чувствительность к антибиотикам [60], а из 11 изученных генов резистинтности штаммов 5. typhimurium 5 отвечали за продукцию Р-лактамаз расширенного спектра действия [13].

Известно, что определение сальмонелл - одно из основных условий оценки микробиологической безопасности продуктов питания и качества сырья. С этой целью совершенствуются ускоренные скрининговые методы оценки пищевых продуктов, подготовки образцов проб к исследованию, автоматизации процесса выделения матричной ДНК с помощью робототехники [45]. Использование анализа кривых плавления ампликонов позволило существенно ускорить и упростить тестирование ДНК 5. enteritidis, 5. infantis, 5. virchow в рамках ПЦР, показало 100 % специфичность тестов, целесообразность использования методики в клинической практике [3].

Разработана современная тест система на основе ИФА для скринингового выявления антител к липополисахариду бактерии 5. dublin в сыворотке крови

крупного рогатого скота [71], программное обеспечение для универсальной системы анализа и интерпретации данных секвенирования [87].

Таким образом, исследователи приходят к заключению, что с целью комплексного изучения эпидемиологии сальмонеллеза в настоящее время назрела необходимость широкого внедрения методов генетической детекции, стандартизованного молекулярно-генетического типирования, создания единой базы данных циркулирующих штаммов сальмонелл. По их мнению применение молекулярно-генетических методов исследования должно рассматриваться не как альтернатива, а как обязательное дополнение к регламентированным схемам диагностики острых кишечных инфекций [63].

1.4 Источники, пути и факторы передачи возбудителя сальмонеллеза

1.4.1 Источники возбудителя сальмонеллеза

Основной резервуар возбудителей сальмонеллеза - сельскохозяйственные животные. Исследователи отмечают, что в последние 10 лет произошли изменения в картине нозологического профиля первичных сальмонеллезов -сероварианты enteritidis и infantis стали доминировать как поливидовые возбудители сальмонеллеза среди животных [58].

Источники возбудителя инфекции - животные, рептилии, а также человек (в том числе бактерионосители) [112, 199]. После перенесенного заболевания 1 % взрослых и 5 % детей могут выделять возбудителей инфекции более 1 года [199].

Домашняя птица чаще является источником S. enteritidis, S. typhimurium, S. infantis, S. pullorum; крупный рогатый скот - S. typhimurium, S. newport, S. dublin; овцы и козы - S. typhimurium, S. abortusovis, S. dublin, S. anatum, S. montevedeo; свиньи - S. typhimurium, S. choleraesuis; лошади - S. typhimurium, S. newport, S. anatum, S. enteritidis и S. illa 18:z4z24 [116, 135].

Куры могут быть источником большого количества сероваров сальмонелл [125, 157, 216, 224], однако преимущественно выделяют S. enteritidis [172, 223]. При этом у них нередко отсутствуют клинические признаки болезни [137].

Возраст птицы, по-видимому, тоже имеет значение [192]. Исследователями показаны значительные отличия в восприимчивости к Salmonella spp. у цыплят разного возраста. Суточные цыплята легко восприимчивы к болезни, у старых кур, наоборот - заболевание протекает преимущественно бессимптомно [121, 133, 134, 178]. Выявленные эндогенный и экзогенный пути заражения сальмонеллезом птиц делают проблематичной санацию птицепоголовья и обеспечение защиты, особенно птенцов. Растет вирулентность циркулирующих штаммов сальмонелл, инфицирующая доза может составлять всего несколько десятков микробных клеток [59].

В настоящее время все большее значение в распространении зоонозов приобретают домашние животные. Часто источником возбудителей инфекции являются птицы и грызуны. Более трети животных приобретается через сеть зоомагазинов, которые в свою очередь играют роль в распространении случаев заболеваний, как места накопления патогенов [140, 200].

По информации CDC в США ежегодно насчитывается от 50 до 80 тыс. случаев заболевания сальмонеллезом, связанным с передачей возбудителя инфекции от рептилий человеку [185]. В организме рептилий сальмонеллы вызывают в основном бессимптомное носительство, в то время как для теплокровных животных и человека они остаются серьезными патогенами и вызывают инфекционный процесс [185, 182, 43]. Особенно это актуально для детей раннего возраста, которые играя с черепахами, интенсивно контактируют с ними, пробуют на вкус. Часто террариум с черепахами содержит некоторое

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Медведева Нина Владимировна, 2016 год

- С. 7-11.

11. Брико, Н. И. Эпидемиология / Н. И. Брико, В. И. Покровский. - М. : ГЭОТАР-Медиа, 2015. - 368 с.

12. Бровкина, А. Н. Контроль возбудителей острых кишечных инфекций на основе ПЦР - РТ / А. Н. Бровкина // Научный журнал КубГАУ. - 2011. - № 72.

- С. 1-10.

13. Выявление генов резистентности бета лактамаз расширенного спектра продуцирующих S. typhimurium, выделенных от больных острыми кишечными инфекциями Хорезмской области Республики Узбекистан / Г. К. Абдухалимова, М. Д. Ахмедова, А. А. Ибрагимов и др. // Материалы VII Ежегодного Всероссийского конгресса по инфекционным болезням с междунар. участием, 30 апреля-1 марта. - М., 2015. - С. 3-4.

14. Генетические маркеры патогенности Salmonella spp. и антибиотико резистентность / А. Р. Мавзютов, Р. Т. Мурзабаева, Р. Г. Назмутдинова и др. // Материалы II Ежегодного Всероссийского конгресса по инфекционным болезням, 29-31 марта. - М., 2010. - С. 181-182.

15. Генетические маркеры патогенности Salmonella spp. и клинические особенности сальмонеллеза у взрослых / А. Р. Мавзютов, Р. Т. Мурзабаева, Р. Г. Назмутдинова и др. // Материалы II Ежегодного Всероссийского конгресса по инфекционным болезням, 29-31 марта. - М., 2010. - С. 182-183.

16. Генетические механизмы биоразнообразия Salmonella enteritidis и клинические особенности сальмонеллеза / А. Р. Мавзютов, Р. Т. Мурзабаева, Р. Г. Назмутдинова и др. // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 2010. - № 5. - С. 70-73.

17. Голубева, А. О. Особенности иммунного ответа примикст-сальмонеллезах у детей / А. О. Голубева, Л. Н. Милютина // Материалы III Ежегодного Всероссийского конгресса по инфекционным болезням, 28-30 марта.

- М., 2011. - С. 84.

18. Приказ от 28 января 2014 г. N 52 «Об утверждении статистического инструментария для организации Федеральной службой по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека федерального статистического наблюдения за заболеваемостью населения инфекционными и паразитарными болезнями и профилактическими прививками» [Электронный ресурс]/ ФСГС. - М., 2014. - URL: http://docs.cntd.ru/document/499072921 (дата обращения 21.11.2015).

19. Демин, И. А. Госпитальный сальмонеллез, вызванный Salmonella Infantis / И. А. Демин, Е. Б. Брусина // Эпидемиология и инфекц. болезни. - 2006.

- № 1. - С. 21-24.

20. Дехтерева, Н. В. Характеристика эпидемиологического процесса острых кишечных инфекций на территории Кировской области в 1994-2009 годах / Н. В. Дехтерева, М. С. Григорович, А. В. Окатова // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. - 2010. - № 6. - С. 28-33.

21. Загайнова, А. В. Разработка подходов к оценке риска возникновения бактериальных кишечных инфекций, распространяемых водным путем / А. В. Загайнова, Ю. А. Рахманин // Мир науки, культуры, образования. - 2011. - № 4 -С. 286-273.

22. Зайнулин, Л. И. Антигенные свойства изолированных клеточных структур сальмонелл / Л. И. Зайнулин, Р. М. Ахмадеев // Ученые записки казанской государственной академии ветеринарной медицины им Н. Э. Баумана. -2013. - № 216. - С. 119-123.

23. Замай, Т. Н. Новый перспективный способ идентификации возбудителя сальмонеллеза / Т. Н. Замай, А. Б. Салмина, О. С. Замай // Вестник новых медицинских технологий. - 2011. - Т. 18, № 4. - С. 37-40.

24. Зарубина, Н. Н. Трансформация практик питания в современной России: детерминанты / Н. Н. Зарубина // Вестник МГИМО Университета. - 2014. - № 6. - С. 199 - 208.

25. Изучение генетической гетерогенности изолятов Salmonella spp., Shigella spp., выделенных в очагах групповой и спорадической заболеваемости в Российской Федерации / Н. Е. Харитонова, К. В. Кулешов, С. Ш. Рожнова и др. // Молекулярная диагностика 2014 : материалы VIII Рос. науч.-практ. конф. с междунар. участием, 18-20 марта. - М., 2014. - Т. 1. - С. 372-373.

26. Информационный бюллетень референс-центра по мониторингу за сальмонеллезами № 26 / состав. Н. К. Акулова; ФБНУ Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии Роспотребнадзора. - М., 2014. - 66 с.

27. Информационный бюллетень референс-центра по мониторингу за сальмонеллезами № 25 / состав. Н. К. Акулова; ФБНУ Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии Роспотребнадзора. - М., 2013. - 69 с.

28. Исследование фармокинетики сальмонеллезных бактериофагов в организме цыплят кросса ИЗА. Бактериофаги : теоретические и практические аспекты применения в медицине, ветеринарии и пищевой промышленности / В. Г. Пугачева, О. Д. Тотменина, О. И. Тимакова и др. // Международная научно-практическая конференция, апрель 2013 г. - Ульяновск, 2013. - Т. 2. - С. 186.

29. К вопросу о чувствительности: устойчивость биопленок сальмонелл к действию дезинфектантов / В. Ф. Мариевский, В. А. Бубало, Н. М. Кролевецкая и др. // Запорожский медицинский журнал. - 2013. - № 5. - С. 80-83.

30. Кириллова, Т. А. Клинико-эпидемиологические особенности сальмонеллеза, вызванного Salmonella oranienburg / Т. А. Кириллова, В. А. Хабудаев, В. Т. Киклевич // Материалы IV Ежегодного Всероссийского конгресса по инфекционным болезням, 26-27 марта. - М., 2012. - С. 178.

31. Клинико-эпидемиологический анализ вспышки сальмонеллеза в г. Сургуте / О. В. Козловская, В. А. Савин, Л. Л. Катанахова и др. // Материалы IV Ежегодного Всероссийского конгресса по инфекционным болезням, 26-27 марта.

- М., 2012. - С. 190.

32. Ковалишена, А. Я. Эколого-эпидемиологические особенности госпитальных инфекций и многоуровневая система эпидемиологического надзора : автореф. дис. ... д-ра мед. наук: 14.00.30 / О. В. Ковалишена. - Н. Новгород, 2009. - 50 с.

33. Кулуев, Б. Р. Опыт молекулярно-генетической диагностики острых кишечных инфекций / Б. Р. Кулуев, Д. Я. Хайдарова, Д. Н. Дубровская // Медицинский вестник Башкортостана. - 2012. - Т. 7, № 1. - С. 59-63.

34. Лабораторная диагностика сальмонеллезов, обнаружение сальмонелл в пищевых продуктах и объектах окружающей среды : метод. указания МУ 4.2.2723-10 / разр. С. Ш. Рожнова, А. Т. Подколзин. - М. : Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека, 2010. - 144 с.

35. Левенцова, А. Е. Случай острой почечной недостаточности у больного сальмонеллезом / А. Е. Левенцова // Материалы III Ежегодного Всероссийского конгресса по инфекционным болезням, 28-30 марта. - М., 2011. - С. 209.

36. Мандрыко, В. А. Определение серогруппового разнообразия культивируемых форм сальмонелл в воде прибрежной зоны Черного моря / В. А. Мандрыко // Ветеринарная патология. - 2013. - № 2 (44). - С. 22-26.

37. Мезенцев, С. В. Распространение сальмонелл в продуктах животноводства / С. В. Мезенцев, В. В. Разумовская // Вестник алтайского государственного аграрного университета. - 2014. - № 7. - С. 118-122.

38. Мерков, А. М. Санитарная статистика / А. М. Мерков, Л. Е. Поляков.

- Л. : Медицина, 1974. - 385 с.

39. Методические рекомендации по определению устойчивости шигелл к воздействию высоких температур [Электронный ресурс] / разраб. в Московском научно-исследовательском институте эпидемиологии и микробиологии им. Г. Н.

Габричевского МЗ РСФСР. - М., 1985. - URL: http://base.consultant.ru/cons/cgi/online.cgi?req=doc;base=ESU;n=20620 (дата

обращения 21.11.2015).

40. Милютина, Л. Н. Клинические особенности сальмонеллеза Infantis у детей / Л. Н. Милютина // Материалы VI Ежегодного Всероссийского конгресса по инфекционным болезням, 24-26 марта. - М., 2014. - С. 200.

41. Миндлина, А. Я. Основные направления оптимизации эпидемиологического надзора на современном этапе / А. Я. Миндлина, Р. В. Полибин // Актуальные проблемы эпидемиологии на современном этапе : материалы Всерос. науч.-практ. конф. с междунар. участием, посвящ. 80-летию каф. эпидемиологии и доказат. медицины, 13-14 октября / сост. Р. В. Полибин; под ред. В. И. Покровского, Н. И. Брико. - М., 2011. - С. 273-274.

42. Миндлина, А. Я. Эпидемиологические особенности антропонозных инфекций различной степени управляемости и научное обоснование оптимизации надзора на современном этапе : дис. д-ра мед. наук : 14.02.02 / А. Я. Миндлина. -М., 2014. - 432 с.

43. Михайленко, В. В. К вопросу сальмонеллеза змей / В. В. Михайленко, Р. Н. Мещеряков // Ученые записки Государственной академии ветеринарной медицины им. Н. Э. Баумана. - 2010. - № 201. - С. 84-88.

44. Молекулярная эпидемиология зоонозного сальмонеллеза на юге Западной Сибири / Ф. Н. Шубин, Н. А. Кузнецова, А. В. Раков и др. // Национальные приоритеты России. - 2011. - № 2 (5). - С. 164-165.

45. Морозова, Е. Н. Совершенствование методики обнаружения сальмонелл с помощью ПЦР / Е. Н. Морозова, В. В. Светличкин // Молекулярная диагностика 2014 : материалы VIII Рос. науч.-практ. конф. с междунар. участием, 18-20 марта. - М., 2014. - Т. 2. - С. 407-408.

46. Назмутдинова, Р. Г. Взаимосвязь генетических маркеров патогенности

5. Enteritidis с антибиотикорезистентностью культур / Р. Г. Назмутдинова, Р. Т. Мурзабаева, А. Р. Мавзютов // Медицинский вестник Башкортостана. - 2011. - Т.

6, № 5. - С. 77-80.

47. О санитарно-эпидемиологической обстановке в Российской Федерации в 2009 году : государственный доклад / Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека. - М.: Федеральный центр гигиены и эпидемиологии Роспотребнадзора, 2010. - 456 с.

48. О санитарно-эпидемиологической обстановке в Российской Федерации в 2010 году : государственный доклад / Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека. - М. : Федеральный центр гигиены и эпидемиологии Роспотребнадзора, 2011. - 321 с.

49. О состоянии санитарно-эпидемиологического благополучия населения в Российской Федерации в 2011 году: государственный доклад / Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека. - М. : Федеральный центр гигиены и эпидемиологии Роспотребнадзора, 2012. - 316 с.

50. О состоянии санитарно-эпидемиологического благополучия населения в Российской Федерации в 2012 году: государственный доклад / Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека. - М. : Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека, 2013. - 176 с.

51. О состоянии санитарно-эпидемиологического благополучия населения в Российской Федерации в 2014 году : государственный доклад. - М. : Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека, 2015. - 206 с.

52. Определение чувствительности микроорганизмов к антибактериальным препаратам : метод. указания МУК 4.2.1890-04 / Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека. -М. : Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека, 2004. - 66 с.

53. Опыт применения молекулярно-биологического метода с детекцией продуктов амплификации в режиме реального времени в диагностике острых кишечных инфекций / М. Г. Вершинина, Е. Ю. Калугина, О. В. Акимова и др. //

Молекулярная диагностика 2014 : материалы VIII Рос. науч.-практ. конф. с междунар. участием, 18-20 марта. - М., 2014. - Т. 1. - С. 357-358.

54. Павлова, И. Б. Биохимические свойства сальмонелл при обитании их в водной среде / И Б. Павлова, В. С. Зуев // Ветеринарная патология. - 2007. - № 1 -С. 81-85.

55. Петухова, Д. Н. Эффективность применения различных методов лабораторных исследований в очагах групповой заболеваемости острыми кишечными инфекциями в учреждениях Роспотребнадзора 2011 - 2012 гг. / Д. Н. Петухова, А. Г. Подколозин, Д. Е. Курочкина // Молекулярная диагностика 2014 : материалы VIII Рос. науч.-практ. конф. с междунар. участием, 18-20 марта. - М., 2014. - Т. 1. - С. 370-371.

56. Печеник, А. С. Региональные особенности эпидемического процесса острых кишечных инфекций / А. С. Печеник // Медицинский альманах. - 2011. -№ 5 (18). - С. 195-198.

57. Печеник, А. С. Эволюция эпидемического процесса острых кишечных инфекций и пути оптимизации эпидемиологического надзора : дис. ... канд. мед. наук : 14.02.02 / А. С. Печеник. - Кемерово, 2012. - 194 с.

58. Пименов, Н. В. Лечение и профилактика сальмонеллеза голубей и животных зоопарков с использованием фаготерапии и пробиотика / Н. В. Пименов, В. В. Субботин, Н. В. Данилевская // Российский ветеринарный журнал. Мелкие домашние и дикие животные. - 2013. - № 6. - С. 6-8.

59. Пименов, Н. В. Эффективность оздоровительных мероприятий против сальмонеллеза птиц в условиях зоопарка / Н. В. Пименов // Российский ветеринарный журнал. Мелкие домашние и дикие животные. - 2012. - № 3 - С. 22-24.

60. Плазмидная характеристика и антибиотикорезистентность штаммов Salmonella typhimurium, выделенных из пищевых продуктов, и ее отражение в эпидемиологии сальмонеллеза в Сибири и на Дальнем Востоке / Н. А. Кузнецова, И. Т. Синянский, Ф. Н. Шубин и др. // Молекулярная диагностика 2014 :

материалы VIII Рос. науч.-практ. конф. с междунар. участием, 18-20 марта. - М., 2014. - Т. 1. - С. 378-379.

61. Показатели здравоохранения области 2011-2013 гг. // Информационный бюллетень Кемеровского областного информационно-аналитического центра ДОЗН КО. - Кемерово, 2014. - 82 с.

62. Покровский, В. И. Глобализация и эпидемический процесс / В. И. Покровский, Н. И. Брико // Эпидемиология и инфекц. болезни. - 2010. - № 4. - С. 4-10.

63. Порядок применения молекулярно-генетических методов при обследовании очагов острых кишечных инфекций с групповой заболеваемостью : метод. указания МУК 4.2.2746-10 / Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека. - М.: Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека, 2010. -18 с.

64. Постановление Главного государственного санитарного врача Российской Федерации от 19.03.2010 № 21 «О профилактике острых кишечных инфекций» [Электронный ресурс] // Российская газ. - 2010. - 30 апр. - Федер. вып. № 5172. - URL: http://www.rg.ru/2010/04/30/profilaktika-dok.html (дата обращения 06.11.2015).

65. Постановление Главного государственного санитарного врача Российской Федерации от 26 апреля 2010 года N 36 «Об утверждении СП 3.1.7.2616-10» (с изменениями на 21 января 2011 года) [Электронный ресурс] / Г. Онищенко. - М., 2011. - URL: http://docs.cntd.ru/document/902215409 (дата обращения 12.02.2015).

66. Постановление Главного государственного санитарного врача РФ от 16 декабря 2013 г. N 65 «Об утверждении СП 3.1/3.2.3146-13» [Электронный ресурс] / А. Попова; Министерство здравоохранения // Российская газета. - 2014. - 6 мая. - Федер. выпуск № 6372. - URL: http://base.garant.ru/70642564/ (дата обращения 12.02.2015).

67. Приказ Минздрава СССР от 04.10.1980 № 1030 «Об утверждении форм первичной медицинской документации учреждений здравоохранения» (с изменениями на 31 декабря 2002 года) [Электронный ресурс] / Минздрав СССР. -М, 2002. - URL: http://docs.cntd.ru/document/9042149 (дата обращения 12.02.2015).

68. Приказ ФМБА РФ от 02 февраля 2011 года № 31 «О введении новых форм федерального статистического наблюдения за заболеваемостью населения инфекционными и паразитарными болезнями и профилактическими прививками и о внесении изменений в приказ ФМБА России от 24 декабря 2010 г. № 979» [Электронный ресурс] / Минздравсоцразвитие ФМБА РФ. - М., 2011. - URL: http://docs.cntd.ru/document/902262298 (дата обращения 12.02.2015).

69. Применение методов математической статистики при проведении эпидемиологического анализа : пособие / под ред. В. В. Далматова. - Омск, 2002. - 80 с.

70. Пропедевтика детских болезней: учебник для педиатр. фак. мед. вузов / состав. С. Дж. Боконбаева, Х. М. Счастливая, Н. М. Алдашева и др. - Бишкек : Кыргызско-Российский Славянский университет (КРСУ), 2008. - 259 с.

71. Разработка и применение иммуноферментного анализа для выявления антител Salmonella Dublin в сыворотке крови крупного рогатого скота / Ю. Ю. Наумова, О. П. Бьядовская, Н. Б. Шадрова и др. // Молекулярная диагностика -2014 : материалы Всерос. науч.-практ. конф. с междунар. участием. - М., 2014. -Т. 2. - С. 498-499.

72. Результаты многолетнего наблюдения за антибиотикочувствительностью основных возбудителей внебольничных кишечных инфекций у детей / С. В. Халиулина, В. Р. Анохин, Ю. Р. Урманчеева и др. // Практическая медицина. - 2014. - № 7 (83). - С. 76-80.

73. Рождественская, Т. Н. Профилактика сальмонеллеза птиц / Т. Н. Рождественская, С. С. Яковлев, Е. В. Кононенко // Farm Animals. - 2012. - № 1 -С. 54-56.

74. Руженцева, Т. А. Распространенность сердечно-сосудистых осложнений при острых кишечных инфекциях вирусно-бактериальной этиологии

у детей / Т. А. Руженцева // Международный журнал прикладных и фундаментальных исследований. - 2014. - № 3-1. - С. 136-137.

75. Руженцева, Т. А. Распространение инфекционной кардиомиопатии при сальмонеллезе у детей / Т. А. Руженцева, Л. Н. Милютина // Материалы VI Ежегодного Всероссийского конгресса по инфекционным болезням, 24-26 марта. - М., 2014. - С. 269.

76. Сальмонеллез у детей до года / О. В. Подшибякина, С. П. Кокарева, Л. А. Агишева и др. // Материалы VII Ежегодного Всероссийского конгресса по инфекционным болезням. - М., 2014. - С. 271.

77. Сергевнин, В. И. Эпидемиология острых кишечных инфекций / В. И. Сергевнин. - Пермь : ГОУ ВПО им. акад. Е. А. Вагнера Росздрава, 2008. - 280 с.

78. Смирнов, Д. Д. Опыт применения специфической профилактики сальмонеллоэнтеритидис инфекции у птиц / Д. Д. Смирнов, С. М. Салгереев // Ветеринарная патология. - 2010. - № 2. - С. 75 - 77.

79. Совершенствование системы мониторинга за острыми кишечными инфекциями в Российской Федерации / С. Ш. Рожнова, О. А. Христюхина, Н. К. Акулова и др. // Эпидемиология и инфекц. болезни. - 2014. - № 2. - С. 69-72.

80. Современные подходы к оценке факторов риска спорадической заболеваемости сальмонеллезами детей раннего возраста / А. А. Филиппова, Н. Н. Филатов, Е. Г. Симонова и др. // Медицинский альманах. - 2012. - № 3. - С. 61-64.

81. Современные эпидемиологические особенности сальмонеллезов в Узбекистане / О. М. Миртазаев, Н. А. Саттарова, Н. С. Саидкасимова и др. // Актуальные проблемы эпидемиологии на современном этапе : материалы Всерос. науч.-практ. конф. с междунар. участием, посвящ. 80-летию каф. эпидемиологии и доказат. медицины, 13-14 окт. / сост. Р. В. Полибин; под ред. В. И. Покровского, Н. И. Брико. - М., 2011. - С. 275-276.

82. Солодовников, Ю. П. Законы общей эпидемиологии кишечных инфекций / Ю. П. Солодовников, А. В. Иваненко, Ю. В. Устюжанин // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунологии. - 2008. - № 6. - С. 112-115.

83. Социально-гигиенический мониторинг. Анализ медико-демографических и социально-экономических показателей на региональном уровне : метод. рекомендации / Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека. - М. : Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека, 2010. - 53 с.

84. Сравнительный анализ этиологической структуры острых кишечных инфекций / А. У. Оганесян, Н. М. Гюлазян, З. У. Геворкян и др. // Материалы IV Ежегодного Всероссийского конгресса по инфекционным болезням, 26-28 марта. - М., 2012. - С. 282-283.

85. Структура кишечных инфекций у детей по результатам госпитализации в детскую городскую клиническую больницу № 3 г. Новосибирска / А. В. Васюнин, Е. И. Краснова, И. В. Куимова, и др. // Материалы VI Ежегодного Всероссийского конгресса по инфекционным болезням, 24-26 марта. - М., 2014. - С. 62-63.

86. Удавихина, Л. С. Современные тенденции в эпидемиологии сальмонеллеза, обусловленного Salmonella enteritidis, и роль отдельных пищевых продуктов и блюд в его распространении : автореф. дис. ... канд. мед. наук : 14.02.02 / Л. С. Удавихина. - Пермь, 2009. - 25 с.

87. Универсальная система анализа и интерпретация данных секвенирования / А. Д. Неверов, Е. Б. Лебедева, В. П. Чуканов и др. // Молекулярная диагностика 2014 : материалы VIII Рос. науч.-практ. конф. с междунар. участием, 18-20 марта. - М., 2014. - Т. 2. - С. 536.

88. Федеральный закон от 12.06.2008 № 88-ФЗ «Технический регламент на молоко и молочную продукцию» (с изменениями и дополнениями) [Электронный ресурс] // Российской газ. - 2008. - 20 июня. - N 131. - URL: http://base.garant.ru/12160959/#help#ixzz3s6uofMth (дата обращения 12.02.2015).

89. Федеральный закон от 27.12.2002 N 184-ФЗ (ред. от 13.07.2015) «О техническом регулировании» (с изм. и доп., вступ. в силу с 19.10.2015) [Электронный ресурс] - М., 2015. - URL:

http://www.consultant.ru/document/cons_doc_LAW_40241/ (дата обращения 12.02.2015).

90. Фенотипы резистентности Salmonella typhimurium, выделенных от больных острыми кишечными инфекциями Кашкадарьянской области Республики Узбекистан / Г. К. Абдухалимова, М. Д. Ахмедова, И. Ф. Ахмедов и др. // Материалы VII Ежегодного Всероссийского конгресса инфекционных болезней, 30 марта-1 апреля. - М., 2014. - С. 3.

91. Хаертынов, Х. С. Клинико-эпидемиологические особенности кишечных инфекций, протекающих с синдромом гемоколита, у детей / Х. С. Хаертынов, Д. Р. Семенова, К. В. Сушников // Казанский медицинский журнал. -

2013. - Т. 94, № 2. - С. 208-211.

92. Халиуллина, С. В. Антибиотикорезистентность копроштаммов шигелл и сальмонелл, выделенных от детей, больных ОКИ / С. В. Халиуллина, Н. С. Леонтьева // Практическая медицина. - 2010. - № 46. - С. 137.

93. Характеристика острых кишечных инфекций по данным инфекционного стационара и поликлиники / В. М. Агафонов, Л. И. Некрасов, Ю. С. Котюгина и др. // Материалы VII Ежегодного Всероссийского конгресса по инфекционным болезням. - М., 2014. - С. 7-8.

94. Чихарева, Е. Н. Распространенность острых кишечных инфекций у детей Мурманской области / Е. Н. Чихарева, О. Ю. Богданова // Успехи современного естествознания. - 2011. - № 8. - С. 76-77.

95. Чугунова, Е. О. Определение бактерий рода Salmonella в мясе и мясных полуфабрикатах / Е. О. Чугунова, Н. А. Татарникова // Пермский аграрный вестник. - 2013. - № 1. - С. 42-44.

96. Шубин, Ф. Н. Молекулярная эпидемиология сальмонеллеза в Сибири и на Дальнем Востоке: эпидемиологические и эпизоотические аспекты проблемы / Ф. Н. Шубин, Н. А. Кузнецова, А. В. Раков // Молекулярная диагностика 2014 : материалы VIII Рос. науч.-практ. конф. с междунар. участием, 18-20 марта. - М.,

2014. - Т. 1. - С. 376-377.

97. Шукюрова, Э. Некоторые аспекты эпидемиологии пищевых токсикоинфекций / Э. Шукюрова // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. -2010. - № 4. - С. 57-59.

98. Эпидемиологическая характеристика вспышек острых кишечных инфекций на территории республики Башкортостан в 2007 - 2011 гг. / Г. М. Шахиева, Т. Е. Ефимов, Т. В. Каданек и др. // Бюллетень Восточно-Сибирского научного центра СО РАМН. - 2014. - № 1 (95). - С. 94-101.

99. Этиологическая структура острых инфекционных диарей у детей и взрослых / С. В. Халиулина, В. А. Анохин, И. А. Гутор и др. // Практическая медицина. - 2012. - № 56. - С. 13-15.

100. Эффективность применения молекулярно-биологических методов при расшифровке вспышки острых кишечных инфекций / И. В. Бакштановская, Л. В. Катаева, Т. Ф. Степанова и др. // Молекулярная диагностика 2014 : материалы VIII Рос. науч.-практ. конф. с междунар. участием, 18-20 марта. - М., 2014. - Т. 1. - С. 363-364.

101. A multi-country outbreak of Salmonella Newport gastroenteritis in Europe associated with watermelon from Brazil, confirmed by whole genome sequencing: October 2011 to January 2012 / L. Byrne, I. Fisher, T. Peters et al. // Euro Surveill. -2014. - Vol. 19, № 31. - P. 6-13.

102. Acquisition of iron is required forgrowth of Salmonella spp. in Tomato Fruit / S. L. Nugent, F. Meng, G. B. Martin et al. // Appl. Environ. Microbiol. - 2015. -Vol. 81, № 11. - P. 3663-3670.

103. Additional observations and notes on the natural history of the prairie rattlesnake (Crotalus viridis) in Colorado / K. T. Fitzgerald, B. K. Shipley, K. L. Newquist et al. // Top. Companion Anim. Med. - 2013. - Vol. 28, № 4. - P. 167-176.

104. Addwebi, T. M. Contribution of Salmonella Enteritidis virulence factors to intestinal colonization and systemic dissemination in 1-day-oldchickens / T. M. Addwebi, D. R. Call, D. H. Shah // Poult. Sci. - 2014. - Vol. 93, № 4. - P. 871-881.

105. Ajene, A. N. Enteric pathogens and reactive arthritis: a systematic review of Campylobacter, salmonella and Shigella-associated reactive arthritis / A. N. Ajene,

C. L. Fischer Walker , R. E. Black // J. Health Popul. Nutr. - 2013. - Vol. 31, № 3. - P. 299-307.

106. An outbreak of foodborne salmonellosis in rural KwaZulu-Natal, South Africa / A. J. Niehaus, T. Apalata, Y. M. Coovadia et al. // Foodborne Pathog. Dis. -2011. - Vol. 8, № 6. - P. 693-697.

107. An outbreak of multiple serotypes of salmonella in New Zealand linked to consumption of contaminated tahini imported from Turkey / S. Paine, C. Thornley, M. Wilson et al. // Foodborne Pathog. Dis. - 2014. - Vol. 11, № 11. - P. 887-892.

108. Angamo, M. T. Assessment of Patterns of Drug use by using World Health Organization's Prescribing Patient Care and Health facility indicators in Selected Health Facilities in Southwest Ethiopia / M. T. Angamo, N. T. Wabe, N. J. Raju // JAPS. -2011. - Vol. 1, № 7. - P. 62-66.

109. Antagonistic activity of Lactobacillus acidophilus LA10 against Salmonella enteric serovar Enteritidis SE86 in mice / D. Scapin, W. F. Grando, E. M. Rossi et al. // Braz. J. Microbiol. - 2013. - Vol. 44, № 1. - P. 57-61.

110. Antimicrobial resistance and extended-spectrum ß-lactamases of Salmonella enterica serotypes isolated from livestock and processed food in Portugal: an update / R. Figueiredo, A. Henriques, R. Sereno et al. // Foodborne Pathog. Dis. -2015. - Vol. 12, № 2. - P. 110-117.

111. Antimicrobial Resistance in Developing Countries / A. J. Sosa, D. K. Byarugaba, C. F. Amabile-Cuevas et al. - New York: Springer Science + Business Media, 2010. - 548 p.

112. Backyard poultry flocks and salmonellosis: a recurring, yet preventable public health challenge / C. B. Behravesh, D. Brinson, B. A. Hopkins et al. // Clin. Infect. Dis. - 2014. - Vol. 58, № 10. - P. 1432-1438.

113. Bacterial pathogens isolated from raw meat and poultry compared with pathogens isolated from children in the same area of rural Thailand / L. Bodhidatta, A. Srijan, O. Serichantalergs et al. // Southeast Asian. J. Trop. Med. PublicHealth. - 2013. - Vol. 44, № 2. - P. 259-272.

115. Bacteriophage P22 to challenge Salmonella in foods / P. Zinno, C. Devirgiliis, D. Ercolini et al. // Int. J. Food Microbiol. - 2014. - Vol. 191. - P. 69-74.

116. Barrow, P. A. Overview of Salmonellosis [Электронный ресурс] / P. A. Barrow // The Merck Veterinary Manual. - URL: http://www.merckvetmanual.com/mvm/index.jsp (дата обращения 06.11.2015).

117. Baxter, M. A. Two-Component Regulators Control hilA Expression by Controlling fimZ and hilE Expression within Salmonella enteric Serovar Typhimurium / M. A. Baxter, B. D. Jones // Infect. Immun. - 2015. - Vol. 83, № 3. - P. 978-985.

118. Bevilacqua, P. D. An evaluation of microbial health risks to livestock fed with wastewater-irrigated forage crops / P. D. Bevilacqua, R. K. Bastos, D. D. Mara // Zoonoses Public Health. - 2014. - Vol. 61, № 4. - P. 242-249.

119. Brouhard, R. Salmonella Poisoning [Электронный ресурс] / R. Brouhard. - 2014. - URL: http://firstaid.about.com/od/infections/qt/06_salmonella (дата обращения 06.11.2015).

120. Bumann, D. Identification of Protective Antigens for Vaccination against Systemic Salmonellosis / D. Bumann // Front. Immunol. - 2014. - Vol. 5. - P. 381.

121. Bumstead, N. Resistance to Salmonella gallinarium, S. pullorium and S. enteritidis in inbred lines of chickens / N. Bumstead, P. Barrow // Avian Dis. - 1993. -Vol. 37, № 1. - P. 189-193.

122. Characteristics of non- typhi Salmonella gastroenteritis associated with bacteremia in infants and young children / V. Shkalim, A. Amir, Z. Samra et al. // Infection. - 2012. - Vol. 40, № 3. - P. 285-289.

123. Cummings, P. L. The Burden of Salmonellosis in the United States [Электронный ресурс] / P. L. Cummings, F. Sorvillo, T. Kuo // Salmonella - A Dangerous Foodborne Pathogen. - 2012. - URL: http://cdn.intechopen.com/pdfs-wm/26420.pdf (дата обращения 06.11.2015).

124. Development of a Salmonella cross-protective vaccine for food animal production system / D. M. Heithoff, J. K. House, P. C. Thomson et al. // Vaccine. -2015. - Vol. 33, № 1. - P. 100-107.

125. Diseases of Poultry / M. S. Hofstad, B. H. John, B. W. Calnek et al. -Panima Education Book Agency, New Delhi, India; 1992. - P. 65-123.

126. Effects of transparent exopolymer particles and suspended particles on the survival of Salmonella enteric serovar Typhimurium in seawater / M. C. Davidson, T. Berardi, B. Aguilar et al. // FEMS Microbiol. Ecol. - 2015. - Vol. 91, № 3. - pii: fiv005.

127. Enteric Pathogens and Reactive Arthritis: A Systematic Review of Campylobacter, Salmonella and Shigella- associated Reactive Arthritis / A. N. Ajene, C. L. Fischer Walker, R. E. Black // J. Health Popul. Nutr. - 2013. - Vol. 31, № 3. - P. 299-307.

128. Environmental change and enteric zoonosis in New Zealand: a systematic review of the evidence / A. Lal, A. W. Lill, M. Mcintyre et al. // Aust. N. Z. J. Public Health. - 2015. - Vol. 39, № 1. - P. 63-68.

129. Epidemiology of travelers' diarrhea in Thailand / V. Chongsuvivatwong, S. Chariyalertsak, E. McNeil et al. // J. Travel. Med. - 2009. - Vol. 16, № 3. - P. 179-185.

130. Epidemiology, disease spectrum and economic burden of non-typhoidal Salmonella infections in Taiwan, 2006-2008 / P. L. Chen, C. Y. Li, T. H. Hsieh et al. // Epidemiol. Infect. - 2012. - Vol. 140, № 12. - P. 2256-2263.

131. Epple, H. J. Infectious enteritis / H. J. Epple, M. Zeitz // Internist (Berl). -2011. - Vol. 52, № 9. - P. 1038-1046.

132. Estimating the public health impact of setting targets at the European level for the reduction of zoonotic Salmonella in certain poultry populations / W. Messens, L. Vivas-Alegre, S. Bashir et al. // Int. J. Environ. Res. Public Health. - 2013. - Vol. 10, № 10. - P. 4836-4850.

133. Gene expression responses to a Salmonella infection in the chicken intestine differ between lines / S. van Hemert, A. J. Hoekman, M. A. Smits et al. // Vet. Immunol. Immunopatthol. - 2006. - Vol. 114, № 3-4. - P. 247-258.

134. Genetic control of resistance to salmonellosis and to Salmonella carrier-state in fowl: a review / F. Calenge, P. Kaiser, A. Vignal et al. // Genet. Selec. Evol. -2010. - Vol. 42. - P. 11.

135. Giaccone, V. Food as Cause of Human Salmonellosis [Электронный ресурс] / V. Giaccone, P. Gatellane, L. Alberghini // Salmonella - A Dangerous Foodborne Pathogen / ed. by Barakat S. M. Mahmoud. - 2012. - Ch. 3. - URL: http://www.docin.com/p-453756673.html (дата обращения 06.11.2015).

136. Global monitoring of Salmonella serovar distribution from the World Health Organization Global Foodborne Infections Network Country Data Bank: results of quality assured laboratories from 2001 to 2007 / R. S. Hendriksen, A. R. Vieira, S. Karlsmose et al. // Foodborne Pathog. Dis. - 2011. - Vol. 8, № 8. - P. 887-900.

137. Guard-Petter, J. The chicken, the egg and Salmonella enteritidis / J. Guard-Petter // Environ. Microbiol. - 2001. - Vol. 3, № 7. - P. 421-430.

138. Haeusler, G. M. Non-typhoidal Salmonella in children: microbiology, epidemiology and treatment / G. M. Haeusler, N. Curtis // Adv. Exp. Med. Biol. - 2013.

- Vol. 764. - P. 13-26.

139. Haley, B. J. Distribution, diversity, and seasonality of waterborne salmonellae in a rural watershed./ B. J. Haley, D. J. Cole, E. K. Lipp // Appl. Environ. Microbiol. - 2009. - Vol. 75, № 5. - P. 1248-1255.

140. Healthy animals, healthy people: zoonosis risk from animal contact in pet shops, a systematic review of the literature / K. D. Halsby, A. L. Walsh, C. Campbell et al. // PLoS One. - 2014. - Vol. 9, № 2. - e89309.

141. Highly drug-resistant Salmonella enterica serotype Kentucky ST198-X1: a microbiological study / S. Le Hello, D. Harrois, B. Bouchrif et al. // Lancet. Infect. Dis.

- 2013. - Vol. 13, № 8. - P. 672-679.

142. Hoffmann, S. Annual cost of illness and quality-adjustedlife year losses in the United States due to 14 foodborne pathogens / S. Hoffmann, M. B. Batz, J. G. Jr. Morris // J. Food Prot. - 2012. - Vol. 75, № 7. - P. 1292-1302.

143. Impact of antibiotics on the treatment of Shiga-toxin-producing Escherichia coli and Salmonella infections / J. Szych, T. Wotkowicz, R. La Ragione et al. // Curr. Pharm. Des. - 2014. - Vol. 20, № 28. - P. 4535-4548.

144. Increasing prevalence of multidrug-resistant non-typhoidal Salmonellae, Kenya, 1994-2003 / S. Kariuki, G. Revathi, N. Kariuki et al. // Int. J. Antimicrob. Agents. - 2005. - Vol. 25, № 1. - P. 38-43.

145. Integrated surveillance and potential sources of Salmonella enteritidis in human cases in Canada from 2003 to 2009 / A. Nesbitt, A. Ravel, R. Murray et al. // Epidemiol. Infect. - 2012. - Vol. 140, № 10. - P. 1757-1772.

146. Interactions of Salmonella with animals and plants / A. Wiedemann, I. Virlogeux-Payant, A. M. Chaussé et al. // Front. Microbiol. - 2015. - Vol. 5. - P. 791.

147. Isolation of Salmonella Species from Milk and Locally Processed Milk Products Traded for Human Consumption and Associated Risk Factors in Kanam, Plateau State, Nigeria / N. S. Karshima, V. A. Pam, S. I. Bata et al. // J. Anim. Prod. Adv. - 2014. - Vol. 3, № 3. - P. 69-74.

148. Jawale, C. V. An immunogenic Salmonella ghost confers protection againstinternal organ colonization and egg contamination / C. V. Jawale, J. H. Lee // Vet. Immunol. Immunopathol. - 2014. - Vol. 162, № 1-2. - P. 41-50.

149. Jawale, C. V. Characterization of adaptive immune responses induced by anew genetically inactivated Salmonella Enteritidis vaccine / C. V. Jawale, J. H. Lee // Comp. Immunol. Microbiol. Infect. Dis. - 2014. - Vol. 37, № 3. - P. 159-167.

150. Jean, S. S. High burden of antimicrobial resistance in Asia / S. S. Jean, P. R. Hsueh // Int. J. Antimicrob. Agents. - 2011. - Vol. 37, № 4. - P. 291-510.

151. Knott, L. Salmonella Gastroenteritis [Электронный ресурс] / L. Knott // PatientPlus. - 2013. - URL: http://www.patient co.uk (дата обращения 06.11.2015).

152. Kolodziejek, A. M. Salmonella modulation of the phagosome membrane, role of SseJ / A. M. Kolodziejek, S. I. Miller // Cell. Microbiol. - 2015. - Vol. 17, № 3. - P. 333-341.

153. Lakey, W. Salmonella enteric Serotype Arizonae Meningitis in a Neonate / W. Lakey, A. Girma, E. Triche // Case Rep. Pediatr. - 2013. - 813495.

154. LeJeune, J. Zoonoses: an occupational hazard for livestock workers and a public health concern for rural communities / J. LeJeune, A. Kersting // J. Agric. Saf. Health. - 2010. - Vol. 16, № 3. - P. 161-219.

155. Live Cell Imaging Reveals Novel Functions of Salmonella enterica SPI2-T3SS Effector Proteins in Remodeling of the Host Cell Endosomal System / R. Rajashekar, D. Liebl, D. Chikkaballi et al. // PLoS One. - 2014. - Vol. 9, № 12. -e115423.

156. Long-term dissemination of CTX-M-5-producing hypermutable Salmonella enteric serovar typhimurium sequence type 328 strains in Russia, Belarus, and Kazakhstan / V. K. Kozyreva, E. N. Ilina, M. V. Malakhova et al. // Antimicrob. Agents. Chemother. - 2014. - Vol. 58, № 9. - P. 5202-5210.

157. Lutful Kabir, S. M. Avian Colibacillosis and Salmonellosis: A Closer Look at Epidemiology, Pathogenesis, Diagnosis, Control and Public Health Concerns / S. M. Lutful Kabir // Int. J. Environ. Res. Public. Health. - 2010. - Vol. 7, № 1. - P. 89-114.

158. Maclennan, C. A. Vaccines against invasive Salmonella disease: current status and future directions / C. A. Maclennan, L. B. Martin, F. Micoli // Hum. Vaccin. Immunother. - 2014. - Vol. 10, № 6. - P. 1478-1493.

159. Markov model to estimate Salmonella morbidity, mortality, illness duration and cost / R. L. Herrick, S. G. Buchberger, R. M. Clark et al. // Health Econ. - 2012. -Vol. 21, № 10. - P. 1169-1182.

160. Martin, L. B. Vaccines for typhoid fever and other salmonelloses / L. B. Martin // Curr. Opin. Infect. Dis. - 2012. - Vol. 25, № 5. - P. 489-9910.

161. McKeown, P. Elucidating the Epidemiology of Human salmonellosis: The Value of Systematic Laboratory Characterisation of Isolates / P. McKeown, P. Garvey // Cormican Salmonella - Distribution, Adaptation, Control Measures and Molecular Technologies / ed. by B. A. Annous, J. B. Gurtler. - 2012. - Ch. 1. - P. 1-18.

162. Molbak, K. Human Health Consequences of Antimicrobial Drug-Resistant Salmonella and Other Foodborne Pathogens / K. Molbak // Clin. Infect. Dis. - 2005. -Vol. 41, № 11. - P. 1613-1620.

163. Multiple transmissible genes encoding fluoroquinolone and third-generation cephalosporin resistance co-located innon-typhoidal Salmonella isolated from food-producing animals in China / H. X. Jiang, L. Song, J. Liu et al. // Int. J. Antimicrob. Agents. - 2014. - Vol. 43, № 3. - P. 242-247.

164. Nagaraja, V. Systematic review with meta-analysis: the relationship between chronic Salmonella typhi carrier status and gall-bladder cancer / V. Nagaraja, G.D. Eslick // Aliment. Pharmacol. Ther. - 2014. - Vol. 39, № 8. - P. 745-750.

165. Nontyphoid salmonella infection: microbiology, clinical features, and antimicrobial therapy / H. M. Chen, Y. Wang, L. H. Su et al. // Pediatr. Neonatol. -2013. - Vol. 54, № 3. - P. 147-152.

166. Occurrence of Antimicrobial-Resistant Escherichia coli and Salmonella enterica in the Beef Cattle Production and Processing Continuum / J. W. Schmidt, G. E. Agga, J. M. Bosilevac et al. // Appl. Environ. Microbiol. - 2015. - Vol. 81, № 2. - P. 713-725.

167. Outbreak of Salmonella enterica serotype Infantis infection in humans linked to dry dog food in the United States and Canada, 2012 / M. Imanishi, D. S. Rotstein, R. Reimschuessel et al. // J. Am. Vet. Med. Assoc. - 2014. - Vol. 244, № 5. -P. 545-553.

168. Outbreak of salmonella newport infections linked to cucumbers - United States, 2014 / K. M. Angelo, A. Chu, M Anand et al. // MMWR Morb. Mortal. Wkly Rep. - 2015. - Vol. 64, № 6. - P. 144-147.

169. Padungtod, P. Salmonella in food animals and humansin northern Thailand / P. Padungtod, J. B. Kaneene // Int. J. Food Microbiol. - 2006. - Vol. 108, № 3. - P. 346-354.

170. Pesquero, M. A. Insect/Bacteria Association and Nosocomial Infection / M. A. Pesquero, L. C. Carneiro, D. J. Pires // Salmonella - A Diversified Superbug / ed. by Yashwant Kumar. - 2012. - Ch. 23. - P. 449-468.

171. Pfeiffer, M. L. The patient presenting with acute dysentery - a systematic review / M. L. Pfeiffer, H. L. DuPont, T. J. Ochoa // J. Infect. - 2012. - Vol. 64, № 4. -P. 374-386.

173. Prevalence and antimicrobial susceptibility of salmonellae isolates from reptiles in Taiwan / C. Y. Chen, W. C. Chen, S. C. Chin et al. // J. Vet. Diagn. Invest. -2010. - Vol. 22, № 1. - P. 44-50.

174. Prevalence and genetic characteristics of Salmonella in free-living birds in Poland / M. Krawiec, M. Kuczkowski, A Kruszewicz et al. // BMC Vet. Res. - 2015. -Vol. 11, № 1. - P. 15.

175. Prevalence of foodborne pathogens in retailed foods in Thailand / C. Ananchaipattana, Y. Hosotani, S. Kawasaki et al. // Foodborne Pathog. Dis. - 2012. -Vol. 9, № 9. - P. 835-840.

176. Prevalence of Salmonella enterica in Bulk Tank Milk from US Dairies as Determined by Polymerase Chain Reaction / J. S. Karns, J. S. Van Kessel, B. J. Mccluskey et al. // J. of Dairy Science. - 2005. - Vol. 88, № 10. - P. 3475-3479.

177. Prevalence of salmonella infection in dogs in maiduguri, northeastern Nigeria / S. M. Jajere, S. A. Onyilokwu, N. B. Adamu et al. // Int. J. Microbiol. - 2014. - 392548.

178. Proportion of circulating chicken heterophils and CXCLi2 expression in response to Salmonella enteritidis are affected by genetic line and immune modulating diet / S. B. Redmond, P. Chuammitri, C. B. Andreasen et al. // Vet. Immunol. Immunopathol. - 2011. - Vol. 140, № 3-4. - P. 323-328.

179. Purulent pericarditis and colonic infiltratingto Salmonella enteritidis complicated by acute intussusception in a case of IL-12Rß1deficiency / F. Ailal, A. Tazi, J. Bustamante et al. // Arch. Pediatr. - 2014. - Vol. 21, № 12. - P. 1348-1352.

180. Quantification and characterization of Salmonella spp. isolates insewage sludge with potential usage in agriculture / F. Jr. Krzyzanowski, L. Zappelini, S. Martone-Rocha et al. // BMC Microbiol. - 2014. - Vol. 14, № 1. - P. 263.

181. Rapid real-time PCR methods todistinguish Salmonella Enteritidis wildtype field isolates from vaccine strains Salmovac SE/Gallivac SE and AviPro

SALMONELLA VAC E / S. Maurischat, I. Szabo, B. Baumann et al. // J. Microbiol. Methods. - 2015. - Vol. 112. - P. 92-98.

182. Recent Multistate Outbreaks of Human Salmonella Infections Acquired from Turtles : A Continuing Public Health Challenge / J. R. Harris, K. P. Neil, C. B. Behravesh et al. // Clin. Infect. Dis. - 2010. - Vol. 50, № 4. - P. 554-559.

183. Recurrent Salmonellosis in a Child with Complete IL-12R01 Deficiency / M. F. Zahid, S. A. Ali, F. Jehan et al. // J. immunodefic. Disord. - 2014. - № 3. - pii: 1000109.

184. Regulation (EC) № 2160/2003 of the European Parliament and of the Council of 17 November 2003 on the control of salmonella and other specified foodborne zoonotic agents [Электронный ресурс] / European Union. - 2012. - URL: http://policy.mofcom.gov.cn/english/flaw!fetch.action?libcode=flaw&id= (дата обращения 21.11.2015).

185. Reptile-associated Salmonellosis [Электронный ресурс] / Wisconsin Department of Health Services // Division of public health, bureau of communicable disease. Communicable disease epidemiology section P-42082 (Rev.05/04). - 2015. -URL: https: //www. dhs. wisconsin. gov/ publications/ p4/ p42082.pdf (Accessed 10.07. 2015) (дата обращения 06.11.2015).

186. Reptile-associated Salmonellosis in Man, Italy / M. Corrente, M. Totaro, V. Martella et al. // Emerg. Infect. Dis. - 2006. - Vol. 12, № 2. - P. 358-359.

187. Reptile-Associated Salmonellosis in Minnesota, 1996-2011 / T. Whitten, J. B. Bender, K. Smith et al. // Zoonoses Public Health. - 2015. - Vol. 62, № 3. - P. 199208.

188. Risk factors associated with sporadic salmonellosis in children: a case-controlstudy in Lower Saxony, Germany, 2008-2011 / D. Ziehm, S. Rettenbacher-Riefler, L. Kreienbrock et al. // Epidemiol. Infect. - 2015. - Vol. 143, № 4. - P. 687694.

189. Risk factors for human salmonellosis originating from pigs, cattle, broiler / L. Mughini-Gras, R. Enserink, I. Friesema et al. // PLoS One. - 2014. - Vol. 9, № 2. -e87933.

190. Role of 30 k Daantigen of enteric bacterial pathogens as a possible arthritogenic factor in post-dysenteric reactive arthritis / M. Singh, N. K. Ganguli, H. Singh et al. // Indian. J. Pathol. Microbiol. - 2013. - Vol. 56, № 3. - P. 231-237.

191. Rupnik, M. Clostridium difficile infection: new developments in epidemiology and pathogenesis / M. Rupnik, M. H. Wilcox, D. N. Gerding // Nat. Rev. Microbiol. - 2009. - Vol. 7, № 7. - P. 526-536.

192. Rychlik, I. Gene expression in the chicken caecum in response to infections with non-typhoid Salmonella / I. Rychlik, M. Elsheimer-Matulova, K. Kyrova // Vet. Res. - 2014. - Vol. 45. - P. 119.

193. Sadkowska-Todys, M. Salmonellosis in Poland in 2012 / M. Sadkowska-Todys, M. P. Czarkowski // Przegl. Epidemiol. - 2014. - Vol. 68, № 2. - P. 243-248; 353-355.

194. Salmonella enteric serovar Enteritidis, England and Wales, 1945-2011 / C. R. Lane, S. LeBaigue, O. B. Esan et al. // Emerg. Infect. Dis. - 2014. - Vol. 20, № 7. -P. 1097-1104.

195. Salmonella Gastroenteritis During Childhood is a Risk Factor for Irritable Bowel Syndrome in Adulthood / C. Cremon, V. Stanghellini, F. Pallotti et al. // Gastroenterology. - Vol. 147, № 1. - P. 69-77.

196. Salmonella genomic island 1 and class 1 integron in Salmonella isolates from stray dogs / Y. C. Chang, H. L. Chuang, C. C. Chiu et al. // Afr. J. Microbiol. Res. - 2011. - Vol. 5, № 23. - P. 3907-3912.

197. Salmonella serotype Enteritidis [Электронный ресурс] / National Center for Emerging and Zoonotic Infectious Diseases // Centers for Disease Control and Prevention (CDC). - URL: http://www.cdc.gov/ncidod/dbmd/... (дата обращения 06.11.2015).

198. Salmonella vaccines: lessons from the mouse modelor bad teaching? / R. A. Strugnell, T. A. Scott, N. Wang et al. // Curr. Opin. Microbiol. - 2014. - Vol. 17. -P. 99-105.

199. Salmonellosis [Электронный ресурс] / Ministry of Health // Communicable Disease Control Manual. Wellington. - 2008. - URL:

https://www. health. govt. nz/system/files/documents/publications/cd-manual-salmonellosis-may2012.pdf (дата обращения 06.11.2015).

200. Sandhu, G. K. Level of awareness regarding some zoonotic diseases, among dog owners of Ithaca, new York / G. K. Sandhu, D. Singh // J. Family Med. Prim. Care. - 2014. - Vol. 3, № 4. - P. 418-423.

201. Schneider, K. R. Preventing Foodborne Illness: Salmonellosis [Электронный ресурс] / K. R. Schneider, R. G. Schneider, R. Silverberg // UF. - 2013.

- URL: http://edis.ifas.ufl.edu/fs269 (дата обращения 06.11.2015).

202. Seasonality in human salmonellosis: assessment of human activities and chicken contamination as driving factors / A. Ravel, E. Smolina, J. M. Sargeant et al. // Foodborne Pathog. Dis. - 2010. - Vol. 7, № 7. - P. 785-794.

203. Seasonality in human zoonotic enteric diseases: a systematic review / A. Lal, S. Hales, N. French et al. // PLoS One. - 2012. - Vol. 7, № 4. - e31883.

204. Serovar distribution, antimicrobial resistance profiles, and PFGE typing of Salmonella enterica strains isolated from 2007-2012 in Guangdong, China / B. Ke, J. Sun, D. He et al. // BMC Infect. Dis. - 2014. - Vol. 14. - P. 338.

205. Sette, A. Reverse vaccinology: developing vaccines in the era of genomics / A. Sette, R. Rappuoli. // Immunity. - 2010. - Vol. 33, № 4. - P. 530-4110.

206. Source attribution of human salmonellosis using a meta-analysis of case-control studies of sporadic infections / A. R. Domingues, S. M. Pires, T. Halasa et al. // Epidemiol. Infect. - 2012. - Vol. 140, № 6. - P. 959-969.

207. Stock, J. Rotavius infections / J. Stock // Med. Monatsschr. Pharm. - 2011.

- Vol. 34, № 1. - P. 4-13.

208. Subramoney, E. L. Non-typhoidal Salmonella infections in HIV-positive adults / E. L. Subramoney // S. Afr. Med. J. - 2015. - Vol. 105, № 10. - P. 805-807.

209. Survival of Salmonella enterica Serovar Infantis on and within Stored Table Eggs / A. Lublin, I. Maler, S. Mechani et al. // J. Food Prot. - 2015. - Vol. 78, № 2. - P. 287-292.

210. Systematic review and meta-analysis of non-typhoidal Salmonella cases that develop chronic sequelae / J. Keithlin, J. M. Sargeant, M. K. Thomas et al. // Epidemiol. infect. - 2014. - Vol. 30. - P. 1-19.

211. Tadesse, G. A meta-analysis of the proportion of animal Salmonella isolatesresistant to drugs used against human salmonellosis in Ethiopia / G. Tadesse // BMC Infect. Dis. - 2015. - Vol. 15. - P. 84.

212. Tadesse, G. A meta-analysis of the proportion of antimicrobial resistant human Salmonellaisolates in Ethiopia / G. Tadesse // BMC Pharmacol. Toxicol. - 2014.

- Vol. 15. - P. 51.

213. Takem, E. N. The association between malaria andnon-typhoid Salmonella bacteraemia in children in sub-Saharan Africa: aliterature review / E. N. Takem, A. Roca, A. Cunnington // Malar. J. - 2014. - Vol. 13: - P. 400.

214. The Changing Epidemiology of Salmonella: Trends in Serotypes Isolated from Humans in the United States, 1987-1997 / S. J. Olsen, R. Bishop, F. W. Brenner et al. // J. Infect. Dis. - 2001. - Vol. 183, № 5. - P. 753-761.

215. The Home Environment and Salmonellosis in Children / G. E. Schutze, J. D. Sikes, R. Stefanova et al. // Pediatrics. - 1999. - Vol. 103, № 1. - E1.

216. The immunobiology of avian systemic salmonellosis / L. Chappell, P. Kaiser, P. Barrow et al. // Vet. Immunol. Immunopathol. - 2009. - Vol. 128, № 1-3. -P. 53-59.

217. The impact of socioeconomicstatus on foodborne illnessin high-income countries: a systematic review / K. L. Newman, J. S. Leon, P. A. Rebolledo et al. // Epidemiol. Infect. - 2015. - Vol. 143, № 12. - P. 2473-2485.

218. Thomas, J. L. Salmonella serotype diversity andseasonality in urban and rural streams / J. L. Thomas, R. M. Slawson, W. D. Taylor // J. Appl. Microbiol. - 2013.

- Vol. 114, № 3. - P. 907-922.

219. Townes, J. M. Reactive arthritis after enteric infections in the United States: the problem of definition / J. M. Townes // Clin. Infect. Dis. - 2010. - Vol. 50, № 2. - P. 247-254.

220. Travel-associated antimicrobial drug-resistant nontyphoidal Salmonellae, 2004-2009 / R. S. Barlow, E. E. Debess, K. L. Winthrop et al. // Emerg. Infect. Dis. -2014. - Vol. 20, № 4. - P. 603-611.

221. Tropical sprue: revisiting an under recognized disease / I. S. Brown, A. Bettington, M. Bettington et al. // Am. J. Surg. Pathol. - 2014. - Vol. 38, № 5. - P. 666672.

222. UNWTO Tourism Highlights 2011 Edition [Электронный ресурс] / UNWTO. Tourism Highlights. - 2011. - URL : http://kt.unwto.org/sites/all/files/docpdf/unwtohighlights11enhr_1.pdf (дата обращения 16.02.2012).

223. Wagenaar, J. A. Practical considerations of surveillance of Salmonella serovars other than Enteritidis and Typhimurium / J. A. Wagenaar, R. S. Hendriksen, J. Carrique-Mas // Rev. Sci. Tech. - 2013. - Vol. 32, № 2. - P. 509-519.

224. Wales, A. D. A critical review of Salmonella Typhimurium infection in laying Hens / A. D. Wales, R. H. Davies // Avian Pathol. - 2011. - Vol. 40, № 5. - P. 429-436.

225. Whiley, H. Salmonella and Eggs: From Production to Plate / H. Whiley, K. Ross // Int. J. Environ Res. Public. Health. - 2015. - Vol. 12, № 3. - P. 2543-2556.

226. Wierup, M. Estimation of costs for control of Salmonella in high-riskfeed materials and compound feed [Электронный ресурс] / M. Wierup, S. Widell // Infect. Ecol. Epidemiol. - 2014. - Vol. 4. - URL: http://www.infectionecologyandepidemiology.net/index.php/iee/article/view/23496/0 (дата обращения 05.11.2015).

227. Wigley, P. Salmonella enterica in the Chicken: How it has Helped Our Understanding of Immunology in a Non-Biomedical Model Species / P. Wigley // Front. Immunol. - 2014. - Vol. 5: - P. 482.

Приложение А

Таблица 19 - Результаты лабораторных исследований проб пищевого сырья и пищевых продуктов, объектов внешней среды на наличие Salmonella spp. проведенных в Кемеровской области в 2011 - 2014 гг.

Объект Количество Выделено Серологические группы

исследования исследованных проб культур сальмонелл

В а с ьн С ы с Q а с е и F Г} о

п у п у п у р м

р г р г р г

Пищевое сырье 3636 50 12 17 20 1

Продукты питания 72597 2 2

Вода (река) 22697 35 10 16 8 1

Стоки 8026 45 26 12 7

Смывы 21468 2 2

Всего 128424 134 48 49 35 2

Таблица 20 - Результаты лабораторных исследований проб пищевого сырья

проведенных в Кемеровской области в 2011 - 2014 гг.

Объект исследования 3636 проб пищевого сырья по Кемеровской области Количество культур / % не соответствующих нормативам проб Серологические группы

В С D про чие

Серологические типы

S. typhimurium сЗ Й о ад сЗ S. bredeney S. brandenburg S.derby S. infantis S. enteritidis

ИТОГО 50 3 4 1 1 3 17 20 1

г. Кемерово 633 пробы 6 культур/ 0,9 % Спинка цыпленка бройлера (г. Кемерово) 1

Полуфабрикат из птицы «Корден-блю» (г. Кемерово) 1

Мясная вырезка (г. Кемерово) 3

Фарш говяжий мясной (г. Кемерово) 1

г. Киселевск 198 проб 8 культур/ 4,0 % Мясо птицы замороженное (Кемеровский р-н, п. Яснрогорский) 1

Мясо свиное замороженное (Алтайский край) 1

Фарш мясной «Домашний» (г. Киселевск) 2

Полуфабрикат курица для гриля (г. Киселевск) 1

Котлеты мясные Домашние» (г. Киселевск) 1

Пельмени «Экстра» (г. Киселевск) 1

Хинкали «Сочинские» (г. Новосибирск) 1

г. Новокузнецк 508 проб 32 культуры/ 6,3 % Полуфабрикат мясной «Котлета пожарская» (Алтайский к-й) 1

Фарш мясной «Домашний» (г. Новокузнецк) 1

Хинкали Кавказские (г. Новокузнецк) 1

Пельмени «Русские» (г. Бийск) 3

Цыпленок бройлер (г. Новокузнецк) 1

Полуфабрикат из мяса цыпленка (Новосибирская ПФ) 1

Котлеты «Любимые» (г. Новокузнецк) 1

Полуфабрикат куриный окорочок (Алтайский к-й) 1 1

Полуфабрикат перец фаршированный (г. Ермолино) 2

Цыпленок для жарки (г. Новокузнецк) 1

Полуфабрикат «Люля-кебаб» (г. Ермолино) 4

Полуфабрикат «Зразы» мясные (г. Ермолино) 1

Пельмени «Русские» (г. Ермолино) 1

Мясные голубцы (г. Ермолино) 1

Мясные котлеты домашние (г. Ермолино) 1

Котлеты куриные (г. Ермолино) 2

Пельмени (г. Ермолино) 2

Мясные котлеты (г. Ермолино) 1

Мясной фарш (г. Ермолино) 1

Тушка бройлера (г. Омск) 1

Бедро цыпленка (г. Новокузнецк) 2

Мясо свинины (г. Новокузнецк) 1

г. Прокопьевск 243 пробы 1 культура/ 0,4 % Пельмени мясные «Домашние» (ООО Прокопьевский хладокомбинат) 1

г. Юрга 163 пробы 3 культуры/ 1,8 % Тушка бройлера (Украина) 1

Гуляш из говядины (г. Юрга, ООО Лента) 1

Крыло индейки (г. Санкт-Петербург) 1

Приложение Б

Таблица 21 - Заболеваемость сальмонеллезами среди населения Кемеровской

области в 1992 - 2014 гг. (0/оооо)

Годы Количество случаев Население Заболеваемость 95 % ДИ

1992 3564 3153230 113,0 109,35 116,80

1993 3813 3149500 121,0 117,26 124,97

1994 3848 3130800 122,9 119,06 126,85

1995 3180 3050600 104,2 100,06 107,93

1996 2334 3036100 76,87 73,79 80,06

1997 1932 3015700 64,04 61,24 66,99

1998 1379 2995600 46,03 43,64 48,53

1999 1804 2980600 60,5 57,76 63,38

2000 1810 2960300 61,14 58,36 63,38

2001 1775 2940800 60,36 57,58 63,23

2002 1374 2919200 47,07 44,61 49,62

2003 1117 2897600 38,55 36,32 40,88

2004 1007 2845319 35,39 33,24 37,65

2005 1097 2855043 38,42 36,18 40,76

2006 1280 2838533 45,04 42,66 47,63

2007 1703 2826295 60,26 57,43 63,19

2008 1440 2823539 51,0 48,40 53,70

2009 1504 2821859 53,3 50,64 56,06

2010 1898 2820636 67,29 64,30 70,39

2011 2099 2761255 76,02 72,80 79,34

2012 1864 2761255 67,8 64,72 70,91

2013 1188 2742450 43,32 40,89 45,85

2014 1085 2734075 39,68 37,36 42,12

Среднее за 23 года 1917 2915665 65,75 62,84 68,76

Годы Количество случаев Население Заболеваемость 95 % ДИ

1992 281 34902 805,1 714,03 904,51

1993 541 32167 1681,8 1544,14 1828,37

1994 489 27542 1775,5 1622,8 1938,43

1995 433 26858 1612,2 1464,95 1770,01

1996 311 25639 1213,0 1082,61 1354,61

1997 206 24473 841,7 731,12 964,28

1998 154 23447 656,8 557,43 768,68

1999 180 23725 758,7 652,24 877,46

2000 125 23450 533,0 443,89 634,78

2001 117 24013 487,2 403,12 583,66

2002 124 24676 502,5 418,13 598,85

2003 98 25935 377,9 306,88 460,31

2004 72 29834 241,3 188,88 303,83

2005 54 30255 178,5 134,11 232,82

2006 82 30605 267,9 213,15 332,46

2007 97 31838 304,7 247,13 371,54

2008 108 34050 317,2 260,26 382,82

2009 120 36501 328,8 272,65 392,99

2010 113 37433 301,9 248,85 362,82

2011 120 35169 341,2 282,98 407,87

2012 113 35169 321,3 264,87 386,17

2013 72 37598 191,49 149,87 241,1

2014 80 37037 216,0 171,31 268,76

Среднее за 23 года 178 30101 591,34 507,83 684,56

Годы Количество случаев Население Заболеваемость 95 % ДИ

1992 253 80443 314,5 276,99 355,67

1993 342 76155 449,1 402,84 499,17

1994 409 66245 617,4 559,17 680,03

1995 336 62488 537,7 481,87 598,20

1996 248 57127 434,1 381,86 491,51

1997 213 55784 381,8 332,35 436,58

1998 161 52221 308,3 262,58 359,69

1999 213 48805 436,4 379,89 498,99

2000 159 47024 338,1 287,68 394,85

2001 157 48520 323,6 275,01 378,23

2002 150 47916 313,0 265,02 367,25

2003 118 50782 232,4 192,37 278,21

2004 111 54174 204,9 168,59 246,69

2005 129 58296 221,3 184,78 262,88

2006 154 60202 255,8 217,04 299,48

2007 224 60733 368,8 322,18 420,31

2008 219 62387 351,0 306,15 400,64

2009 252 65892 382,4 336,75 432,59

2010 289 70564 409,6 363,78 459,49

2011 313 72354 432,6 386,08 483,15

2012 255 75354 338,4 298,19 382,50

2013 186 69974 265,8 229,02 306,82

2014 184 72329 254,4 219 293,87

Среднее за 23 года 221 61555 359,03 313,32 409,51

Годы Количество случаев Население Заболеваемость 95 % ДИ

1992 380 201121 188,9 170,44 208,91

1993 433 199959 216,5 196,65 237,91

1994 353 189960 185,8 166,96 206,24

1995 261 182286 143,2 126,35 161,63

1996 216 165711 130,3 113,55 148,93

1997 209 154981 134,9 117,20 154,42

1998 117 133147 87,87 72,68 105,30

1999 248 128658 192,8 169,53 218,28

2000 200 116205 172,1 149,10 197,66

2001 201 111433 180,4 156,32 207,08

2002 146 109655 133,1 112,44 156,56

2003 130 104957 123,9 103,49 147,06

2004 115 101033 113,8 93,98 136,61

2005 147 103550 142,0 119,95 166,83

2006 174 106129 164,0 140,51 190,18

2007 238 111498 213,5 187,22 242,33

2008 186 115541 161,0 138,69 185,83

2009 188 119984 156,7 135,10 180,74

2010 272 123574 220,1 194,75 247,85

2011 303 126603 239,3 213,17 267,82

2012 227 126603 179,3 156,75 204,18

2013 170 137795 123,4 105,53 143,36

2014 171 141155 121,1 103,68 140,71

Среднее за 23 года 221 135284 163,4 142,55 186,36