Эколого-функциональная роль микроорганизмов техногенно-нарушенных почвогрунтов: на примере Дамбукинского золотоносного узла тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.00.16, кандидат биологических наук Римкевич, Ольга Вячеславовна

• Римкевич, Ольга Вячеславовна
• кандидат биологических наук
• 2006

Оглавление диссертации кандидат биологических наук Римкевич, Ольга Вячеславовна

ВВЕДЕНИЕ

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Микробно-растительные взаимодействия в биоценозах и их практическое использование

1.1.1. Микроорганизмы почвы

1.1.2. Роль корневых выделений растений во взаимоотношениях с микроорганизмами

1.1.3. Механизмы положительного влияния микроорганизмов на растения

1.1.3.1. Механизмы прямой стимуляция роста растений микроорганизмами

1.1.3.2. Пути опосредованной стимуляции роста растений микроорганизмами

1.1.3.3. Молекулярно-генетические взаимодействия микроорганизмов с растениями

1.1.4. Факторы, влияющие на колонизацию корневой поверхности растений микроорганизмами

1.1.5. Практическое использование микробно-растительных взаимодействий

1.1.5.1. Микробные препараты в растениеводстве

1.1.5.2. Микробно-растительные взаимодействия в очистке окружающей среды

1.2. Воздействие и экологические проблемы россыпной добычи золота на окружающую среду

1.2.1. Последствия россыпной золотодобычи

1.2.2. Естественное возобновление почвенно-растительного покрова на нарушенных территориях

1.2.3. Рекультивация и восстановление почвенно-растительного покрова на нарушенных территориях

ГЛАВА 2. ОБЪЕКТЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ

2.1. Объекты исследования

2.2. Методы исследования

2.2.1. Отбор проб для микробиологического анализа

2.2.2. Выделение микроорганизмов

2.2.3. Учет численности основных физиологических групп микроорганизмов

2.2.4. Фенотипическая характеристика

2.2.5. Молекулярно-генетические методы исследования

2.3. Модельные эксперименты 75 РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ

ГЛАВА 3. МИКРООРГАНИЗМЫ ОТВАЛОВ РОССЫПНОГО

ЗОЛОТА И ИХ ЭКОЛОГИЧЕСКИЕ ФУНКЦИИ

3.1. Количественный анализ микроорганизмов

3.2. Таксономический анализ микробных комплексов

3.2.1. Таксономический анализ сапротрофного бактериального комплекса

3.2.1.1. Фенотипическая идентификация

3.2.1.2. Идентификация на основе анализа нуклеотидных последовательностей гена 16S рРНК

3.2.1.3. Анализ структуры сапротрофного бактериального комплекса

3.2.2. Таксономический анализ фосфатмобилизующего бактериального комплекса

3.2.2.1. Экофизиологическая роль фосфатмобилизующих бактерий

3.2.2.2. Бактерии литотрофной составляющей трансформации фосфора

3.2.2.3. Бактерии гетеротрофной составляющей трансформации фосфора

3.2.2.4. Молекулярно-генетическая идентификация фосфатмобилизующих бактерий

3.2.2.5. Фенотипическая характеристика фосфатмобилизующих микроорганизмов

3.2.3. Сравнительный анализ структуры сапротрофного и фосфатмобилизующего бактериальных комплексов

ГЛАВА 4. БИОТЕХНОЛОГИЧЕСКИЙ ПОТЕНЦИАЛ ФОСФАТМОБИЛИЗУЮЩИХ БАКТЕРИЙ

4.1. Оценка фосфатмобилизующей и окислительной способности изучаемых штаммов бактерий

4.2. Динамика образования изучаемыми бактериями подвижного фосфора в почвогрунте

4.3. Влияния фосфатмобилизующих бактерий на прорастание семян

4.4. Характеристика биотехнологических свойств фосфатмобилизующих бактерий

ВЫВОДЫ

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Эколого-функциональная роль микроорганизмов техногенно-нарушенных почвогрунтов: на примере Дамбукинского золотоносного узла»

Актуальность проблемы. В настоящее время установлены биотические взаимоотношения между микроорганизмами и растениями, которые носят либо антагонистический характер, либо характер ассоциативного (симбиотического) сосуществования. Хорошо известны антагонистические взаимоотношения между растениями и патогенными микроскопическими грибами (Schultze, Kondorosi, 1998; Borowich, 2000), мутуалистические - между ризобиями и бобовыми растениями (Тильба, Голодяев, 1995; Игнатов, 1998; Karpati, Sik, 1992; Matthew, Kent, 2001). Микроорганизмы либо создают оптимальные условия для развития растений, либо являются фитопатогенными (Воронин, 1998; Zak el al, 1994; Garland, 1996; Glick et. al., 1997). Практически не изучены функциональные взаимоотношения в системе «почва-микроорганизмы-растение» на техногенно-нарушенных землях, когда структурные компоненты системы (растения, микроорганизмы) находятся в экстремальных условиях существования, так как произошло нарушение их естественного местообитания. Изучение данной проблемы весьма актуально для Амурской области, на территории которой более 130 лет ведется отработка месторождений и россыпепроявлений золота, занимающих около 155 тыс. км2 из 361 тыс. км площади всей области (Доклад ., 2002). Изучение структуры микробного комплекса и функциональных взаимоотношений в системе «почва-микроорганизмы-растение» является фундаментальной основой для понимания процессов восстановления техногенно-нарушенных экосистем и создания новых технологий биорекультивации.

Цель и задачи исследования. Целью исследований явилось изучение структуры микробных комплексов почвогрунтов и прикорневой зоны пионерных растений, выявление функциональных отношений в системе «почва-микроорганизмы-растение» на примере техногенно-нарушенных земель Дамбукинского золотоносного узла.

В задачи исследования входило:

1. Изучить количественный состав эколого-функциональных групп микроорганизмов почвогрунтов и корневой зоны пионерных растений гале-эфельных отвалов россыпной добычи золота на первых этапах почвообразовательного процесса.

2. Провести таксономический анализ сапротрофного микробного комплекса на основе фенотипических признаков и молекулярно-генетических методов исследования.

3. Установить филогенетическое положение бактерий сапротрофного комплекса и количественное распределение филогенетических групп бактерий в почвогрунтах и корневой зоне пионерных растений.

4. Определить экофизиологическую роль фосфатмобилизующих бактерий, свободноживущих и ассоциированных с растениями, провести идентификацию и филогенетический анализ штаммов.

5. Установить биотехнологический потенциал фосфатмобилизующих бактерий.

Научная новизна. Впервые был применен комплексный подход в исследовании функциональных отношений в системе «почва-микроорганизмы-растения» на техногенных отвалах после россыпной добычи золота. Впервые изучено таксономическое разнообразие свободноживущих и ассоциативных бактерий в нарушенных почвогрунтах с применением современных молекулярно-генетических методов исследования. Выявлены представители редко встречающихся видов {Acinetobacter Iwoffii и Planococcus aminovorans), имеющих высокую адаптивную способность к воздействию экологических факторов. Впервые установлена специфичность распространения и высокий биотехнологический потенциал бактерий, участвующих в трансформации минеральных и органических соединений фосфора и выполняющих средообразующую функцию в почвогрунтах, нарушенных в результате золотодобычи.

Практическая значимость работы.

В лабораторных модельных экспериментах изучен биотехнологический потенциал фосфатмобилизующих бактерий. Создана коллекция активных бактериальных штаммов, которые могут быть использованы в рекультивационных технологиях обработки нарушенных почвогрунтов. На основе выделенных штаммов рекомендовано разработать биопрепараты для обработки семян растений перед внесением в рекультивируемые грунты.

Положения, выносимые на защиту.

1. На начальных этапах почвообразования в системе «растения-микроорганизмы» устанавливаются специфические биотические отношения, определяющие селективное участие растений в формировании микробного комплекса прикорневой зоны. В состав микробного комплекса данного экотопа входят виды (Acinetobacter Iwoffii, Planococcus aminovorans), обладающие высокой степенью устойчивости к воздействию неблагоприятных экологических факторов среды обитания: низкое содержание органических соединений в почвогрунтах, недостаточная обеспеченность подвижными формами фосфора.

2. Фосфатмобилизующие микроорганизмы играют ведущую роль в формировании функциональных взаимоотношений в системе «почва-микроорганизмы-растение». Специфичность распространения данной группы бактерий определяется тем, что в почвогрунтах распространены виды, использующие широкий набор минеральных субстратов для мобилизации фосфора, тогда как в прикорневой зоне пионерных растений присутствуют виды, трансформирующие органофосфатные соединения и фосфаты кальция.

Апробация работы. Основные положения работы представлены на VI Международном симпозиуме «Проблемы устойчивого развития регионов в XXI веке (Биробиджан, 2002); региональной научной конференции студентов, аспирантов и молодых учёных «Будущее амурской науки» (Благовещенск, 2002); II Международной конференции «Ресурсовоспроизводящие, малоотходные и природоохранные технологии освоения недр» (Москва, 2003); Международном симпозиуме «Геотехнология: нетрадиционные способы освоения полезных ископаемых» (Москва, 2003); VI, XI и IX молодёжных школах-конференциях по актуальным проблемам химии и биологии (Владивосток, 2000, 2003 и 2005); региональной конференции молодых учёных «Проблемы экологиии и рационального природопользования Дальнего Востока» (Владивосток, 2004); VII региональной конференции по актуальным проблемам экологии, морской биологии и биотехнологии (Владивосток, 2004); III региональной школе-семинаре молодых учёных, аспирантов и студентов Дальнего Востока «Территориальные исследования дальнего Востока» (Биробиджан, 2005).

Работа проводилась на базе: лаборатории микробиологии Амурского филиала Ботанического сада-института ДВО РАН; лаборатории микробиологии и биохимии Института геологии и природопользования ДВО РАН, г. Благовещенск; отдела «Всероссийская коллекция микроорганизмов» Института биохимии и физиологии микроорганизмов им. Г.К. Скрябина РАН, г. Пущино.

Публикации. По материалам диссертации опубликовано 12 работ.

Заключение диссертации по теме «Экология», Римкевич, Ольга Вячеславовна

ВЫВОДЫ

1. В результате изучения эколого-функциональных групп микроорганизмов установлено селективное участие различных видов растений на качественный и количественный состав микроорганизмов прикорневой зоны, что объясняется формированием специфических условий обитания и взаимоотношения в системе «растения-микроорганизмы».

2. Установлено преобладание олигонитрофильных микроорганизмов и бактерий, использующих минеральные формы азота, что указывает на недостаточную обеспеченность субстрата органическими соединениями и указывает на неблагоприятность почвогрунтов как среды обитания организмов.

3. Выявлено таксономическое разнообразие бактерий сапротрофного комплекса, относящихся к 12 родам (Acinetobacter, Agrococcus, Bacillus, Kocuria, Lactobacillus, Micrococcus, Paracoccus, Planococcus, Serratia, Sporolactobacillus, Sporosarcina, Staphylococcus). Выделены представители редко встречающихся родов бактерий, являющихся кислото- и щелочно-толерантными формами (Acinetobacter Iwoffii и Paracoccus aminovorans), что определяет их высокую адаптивную способность к воздействию экологических факторов.

4. На основании данных филогенетического анализа сапротрофного бактериального комплекса установлено преобладание видов, относящихся к двум классам (.Proteobacteria и Bacilli). Преобладающими видами, выделенными как из почвогрунтов, так и прикорневой зоны, являются виды Acinetobacter Iwoffii, Paracoccus aminovorans, Micrococcus luteus, которые обладают высокой степенью устойчивости и длительным сохранением метаболической активности в неблагоприятных условиях окружающей среды.

5. Установлено, что фосфатмобилизующие микроорганизмы составляют до 10% от всей численности бактерий сапротрофного блока. Выявлена некоторая специфичность распространения данной группы микроорганизмов: виды Paenibacillus chitinolyticus и Paracoccus aminovorans присутствуют только в почвогрунтах и используют широкий набор минеральных субстратов для мобилизации фосфора (ортофосфаты кальция, железа, алюминия), тогда как виды Brachybacterium rhamnosum и Staphylococcus saprophyticus обнаружены только в прикорневой зоне пионерных растений и мобилизуют фосфор органофосфатных соединений.

6. В лабораторных модельных экспериментах изучен биотехнологический потенциал выделенных штаммов фосфатмобилизующих бактерий. Установлено, что штаммы Paracoccus aminovorans, Paenibacillus chitinolyticus, Brachybacterium rhamnosum и Acinetobacter Iwoffii выполняют активную средообразующую функцию, что определяет их высокой потенциал использования в технологических процессах рекультивации нарушенных почвогрунтов. Указанные виды обладают также выраженным комплексным положительным эффектом воздействия на прорастание семян пионерных растений.

РЕКОМЕНДАЦИИ ПРОИЗВОДСТВУ

В технологиях обработки нарушенных почвогрунтов, минимально обеспеченных подвижными соединениями фосфора, используют внесение биопрепаратов. Для составления бактериальных препаратов рекомендуется испытать активные штаммы фосфатмобилизующих бактерий Paracoccus aminovorans, Paenibacillus chitinolyticus, Brachybacterium rhamnosum и Acinetobacter Iwoffii.

Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Римкевич, Ольга Вячеславовна, 2006 год

1. Агафонов Е.В., Стукалов М.Ю., Агафонова J1.H. Влияние минеральных и бактериальных удобрений на урожайность гороха на чернозёме обыкновенном // Агрохимия. 2001. № 8. С. 42-46.

2. Аристовская Т.В. Микробиология процессов почвообразования. Л. : Наука, 1980.- 186 с.

3. Бабьева И.П., Агре Н.С. Практическое руководство по биологии почв. -М.: Издательство МГУ, 1971. 140с.

4. Бабьева И.П., Зенова Г.М. Биология почв. М. : Издательство МГУ, 1989. -336 с.

5. Баканчикова Т.И., Макинькова А.Г., Павлова-Иванова Л.К., Майсурян

6. A.Н. Участие генов хемотаксиса в установлении ассоциативных взаимоотношений между Azospirillum brasilense и пшеницей // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 1989. № 4. С. 2429.

7. Воронин A.M. Ризосферные бактерии рода Pseudomonas, способствующие росту и развитию растений // Соровский образовательный журнал. 1998. № 10. С. 25-31.

8. Брезгунов В.Н., Завальский Л.Ю., Лазарев А.В., Попов В.Г. Хемотаксис бактерий // Успехи современной биологии. 1989. № 23. С. 3-28.

9. Варфоломеев С.А. Фитогормоны и их роль в повышении эффективности бобово-ризобиального симбиоза / С.А. Варфоломеев. Калуга, 1992. - 19 с.

10. Васильев И.А., Капанин В.П., Ковтонюк Г.П., Мельников В.Д., Лужнов

11. B.Л., Данилов А.П., Сорокин А.П. Минерально-сырьевая база Амурской области на рубеже веков. Благовещенск, 2000. - 168 с.

12. Ю.Васильев С.В. Воздействие нефтегазодобывающей промышленности на лесные и болотные экосистемы. Новосибирск : Наука. Сиб. отд-ние, 198.- 136 с.

13. П.Гаврилова Е.А., Круглова Ю.В., Таранькина И.Г. Влияние растений и микрофлоры ризосферы на деградацию базудина в почве // Сельскохозяйственная микробиология и охрана окружающей среды. 1983. С. 67-70.

14. Галлиев С.Н. Биологическая рекультивация нарушенных земель. -Екатеринбург, 1996. 236 с.

15. Гаузе Г.Ф., Преображенская Т.П., Свешникова М.А., Терехова Л.П., Максимова Т.С. Определитель актиномицетов. М.: Наука, 1983. - 245с.

16. Генетика симбиотической азотфиксации с основами селекции / отв. ред. И.А. Тихонович. СПб. : Наука, 1998. - 208 с.

17. Голов Г.В. Закономерности фиксации и растворения фосфатов в некоторых почвах Зейско-буреинской равнины // Проблемы сельского хозяйства Приамурья. 1969. Т. 2, С. 47-51.

18. Голов Г.В. Почвы и экология агрофитоценозов Зейско-Буреинской равнины / отв. ред. В.И. Голов, В.И. Ознобихин. Владивосток : Дальнаука, 2001. - 162 с.

19. Голов Г.В., Тильба В.А., Салманов М.Д. Эффективность применения удобрений при интенсивном возделывании сои // Сиб. вестник с.-х. науки. 1971. №3. С. 26-30.

20. Головлев E.JI. Другое состояние неспорулирующих бактерий // Микробиология. 1998. Т. 67, С. 281-286.

21. Громов Б.В., Павленко Г.В. Экология бактерий: учеб. пособие. Л. : Изд-во ЛГУ, 1989.- 248 с.

22. Громовых Т.И., Литовка Ю.А., Садыкова B.C., Габидулина И.Г. Биологические особенности нового штамма Streptomyces lateritius 19/97-М, перспективного для использования в растениеводстве // Биотехнология. 2005. № 5. С. 37-40.

23. Гузева И.С. Развитие микроорганизмов на поверхности почвы : дис. . канд. биол. Наук / МГУ. -М., 1978. 130 с.

24. ГОСТ 12038-84. Издания. Семена сельскохозяйственных культур. М : Межгос. совет по стандартизации, метрологии и сертификации ; М. : Изд-во стандартов, 1984. - 4 с.

25. ГОСТ 26207-84. Издания. Определение подвижных форм фосфора и калия. М : Межгос. совет по стандартизации, метрологии и сертификации ; М.: Изд-во стандартов, 1984. - 4 с.

26. Дебабов В.Г. Жизнь бактерий за стенами лабораторий // Молекулярная биология. 1999. Т. 33, № 6. С. 1074-1084.

27. Добровольская Т.Г. Структура бактериальных сообществ / Т.Г. Добровольская, Д.Г. Звягинцев. М. : Академкнига. 2002. - 283 с.

28. Добровольский Г.В., Умаров М.М. Почва, микробы и азот в атмосфере // Природа. 2004. № 6. С. 15-22.

29. Доклад о состоянии окружающей природной среды в амурской области за 2001 год / Отв. за выпуск J1.A. Новикова. Благовещенск : Комитет природных ресурсов по Амурской области, 2002. 108 с.

30. Дофлинг К. Гормоны растений. Системный подход. М. : Мир, 1985 -304 с.

31. Дубинина Г.А., Грабович М.Ю. Выделение чистых культур Thiospira и изучение их серного метаболизма // Микробиология. 1983. Т. 52, № 1. С. 5-12.

32. Дятлова К.Д. Микробные препараты в растениеводстве // Соровский образовательный журнал. 2001. Т.7, № 5. С. 17-22.

33. Елинов Н.П. Основы биотехнологии: Для студентов институтов, аспирантов и практических работников. СПб.: Наука, 1995. 600 с.

34. Ермаков Е.И., Степанова О.А. Изучение микроорганизмов ризосферы растений в ризотроне // Микробиология. 1992. Т. 61, Вып. 5. С. 916-923.

35. Звягинцев Д.Г. Методы почвенной микробиологии и биохимии. М. : Изд-во МГУ, 1980. - 233 с.40.3вягинцев Д.Г. Почва и микроорганизмы. М.: Изд-во МГУ, 1987. 256 с.

36. Игнатов В.В. Биологическая фиксация азота и азотфиксаторы // Соровский образовательный журнал. 1998. № 9. С. 28-33.

37. Ильинская О.Н., Колпаков А.И., Шмидт М.А., Дорошенко Е.В., Мулюкин А.Н., Эль-Регистан Г.И. Роль бактериальных ауторегуляторов роста группы алкилоксибензолов в ответе стафилококков на стрессовые воздействия //Микробиология. 2002. Т. 71, № 1. С. 23-29.

38. Исмаилов Н.М., Пиковский Ю.И. Современное состояние методов рекультивации нефтезагрязнённых земель // Восстановление нефтезагрязнённых почвенных экосистем. 1998. С. 222-236.

39. Капанин В.П., Громаковский И.Ю. Минерально-сырьевая база Амурской области: перспективы развития // Минеральные ресурсы России. 2002. Т. 1, №2. С. 26-33.

40. Катола В.М., Макеева Т.Б., Римкевич О.В., Комогорцева Ю.В., Литвиненко И.С., Радомская В.И., Радомский С.М.

41. Электронномикроскопический анализ морфофизиологического состояния бактерий в местах колонизации // Бюл. физиол. и пат. дых. 2005. Вып. 21. С. 79-83.

42. Катола В.И., Сорокина А.И., Римкевич О.В. Изменение морфологии бактерий в присутствии техногенных отходов золотодобычи / В сб.: Сборник научных трудов, посвященный 70-летию ДальЗНИВИ / отв. ред Ю.А. Гаврилов. С. 58-63. Благовещенск, 2005. 179 с.

43. Кацы Е.И. Генетико-биологические и экологические аспекты подвижности и хемотаксиса у фитопатогенных, симбиотических и ассоциированных с растениями бактерий // Успехи современной биологии. 1996. Т. 116, Вып. 5. С. 579-592.

44. Кацы Е.И. Молекулярно-генетические процессы, влияющие на ассоциативные взаимодействия почвенных бактерий с растениями / отв. ред. В.В. Игнатов. Саратов : Изд-во Сарат. ун.-та, 2003. - 172 с.

45. Колешко О.И., Зайко С.М. Экология почвенных микроорганизмов. Минск, 1974.- 191 с.

46. Крупская JI.T. Охрана и рациональное использование земель на горных предприятиях Приамурья и приморья. Хабаровск, 1992. 175 с.

47. Кулаев И.С. Бактериолитические ферменты микробного происхождения в биологии и медицине // Соровский образовательный журнал. 1997. № 3. С. 23-31.

48. Курдиш И.К., Антонюк Т.С., Чуйко Н.В. Влияние некоторых факторов внешней среды на хемотаксис Bradyrhizobium japonicum // Микробиология. 2001. Т. 70, № 1. С. 106-110.

49. Лобакова Е.С., Дольникова Г.А., Корженевская Т.Г. Особенности цианобактериально-бактериальных комплексов микросимбионтов растительных синцианозов // Микробиология. 2001. Т. 70, № 1. С. 128134.

50. Логинов О.Н., Бойко Т.Ф., Костюченко В.П., Комаров С.И., Подцепихин Л.К., Галимзянова Н.Ф. О биологической очистке технологических отвалов от нефтепродуктов // Почвоведение. 2002. № 4. С. 481-486.

51. Мавроди Д.В., Ксензенко В.Н., Чатуев Б.М. Структурно-функциональная организация генов Pseudomonas fluorescens, кодирующих ферменты биосинтеза феназин-1-карбоновой кислоты // Молекулярная биология. 1997. Т.31,С. 76-82.

52. Мельников В.Д., Полеванов В.Д. Золотоносные районы и узлы амурской области. Благовещенск : Амургеолком, 1995. С. 121-127.

53. Мельников В.Д. Минеральные ресурсы Амурской области. Благовещенск : АИППК, 1997. 16 с.

54. Методы общей бактериологии / отв. ред. Ф.М. Герхард. М. : Мир, 1983. -536 с.

55. Методы почвенной микробиологии и биохимии / отв. ред. Д.Г. Звягинцев. М.: Изд-во МГУ, 1991. - 303 с.

56. Мишке И.В. Микробные фитогормоны в растениеводстве. Рига : Зинатне, 1988.- 151 с.

57. Мишустин Е.Н. Микроорганизмы почвы и плодородие. М. : Изд-во АН СССР, 1956.-243 с.

58. Молекулярные основы взаимоотношений ассоциативных микроорганизмов с растениями / отв.ред. В.В. Игнатов. М.: Наука, 2005. -262 с.

59. Муратова А.Ю, Турковская О.В., Антонюк Л.П., Макаров О.Е., Позднякова Л.И., Игнатов В.В. Нефтеокисляющий потенциал ассоциативных ризобактерий рода Azospirillum // Микробиология. 2005. Т. 74, С. 1243-1256.

60. Муронец Е.М., Белавина Н.В., Митронова Т.Н., Каменева С.В. Синтез индолилтрёхуксусной кислоты сапрофитной ассоциативной бактерией Agrobacterium radiobacter II Микробиология. 1997. Т. 66, № 4. С. 506-513.

61. Назаров А.В., Иларионов С.А. Потенциал использования микробно -растительного взаимодействия для биоремедиации // Биотехнология. 2005. № 5. С. 54-62.

62. Нефедова Л.И., Устинников Б.А., Цурикова Н.В., Ермакова Г.Н., Кичаков

63. H.А. Микробные ферментные препараты и их применение в пищевой и перерабатывающей промышленности // Хранение и переработка сельхозсырья. 1996. № 5. С. 38-39.

64. Осипов С.В. Начальные этапы лесообразовательного процесса на дражных и гидравлических полигонах Буреинского нагорья / В сб.: Материалы между нар. конф. «Классификация и динамика лесов Дальнего Востока». Владивосток: Дальнаука, 2001. С. 163-166.

65. Оценка воздействия россыпной золотодобычи на окружающую среду (Уруша Ольдойский золотоносный узел) / отв.исп. Ю.Ф. Сидоров. -Благовещенск : Комитет природных ресурсов по Ам.обл., 2001. - 310 с.

66. Порфирьева О.В., Юсупова Д.В., Зоткина Н.Л., Соколова Р.Б., Габдрахимова Л.А. Хитинолитический комплекс Serratia marcescens и особенности его биосинтеза // Микробиология. 1997. Т. 66, № 3. С. 347353.

67. Римкевич О.В., Павлова Л.М., Файзулин В.В. Микробные сообщества пионерной растительности техногенных отвалов / В сб.: Труды региональной научной конференции «Будущее амурской науки». С. 335341. Благовещенск: 8-10 февраля 2002 г. 394 с.

68. Рой А.А., Рева О.Н., Курдиш И.К., Смирнов В.В. Биологические свойства• фосфагмобилизующего штамма Bacillus subtilis ИМВ В-7023 // Прикладная биохимия и микробиология. 2004. Т. 40, № 6. С. 551-557.

69. Рубинчик Г.Ф., Таджиев А.Т., Беглов Б.М. Взаимодействие природных фосфатов с окисленным сульфолигнином // Химическая промышленность. 2003. Т. 80, № 6. С. 34-37.9 78.Рунков JI.B. Фитогормоны регуляторы роста растений / отв. ред. JI.B.

70. Рунков. М.: Наука, 1980. - 114 с.

71. Самцевич С.А. Микроорганизмы почвы и растение / отв. ред. С.А. Самцевич. Минск : Наука и техника, 1972. - 244 с.• 80.Слабова О.И. Устойчивость олиготрофов к стрессовым факторам //

72. Микробиология. 1988. Т. 57, № 4. с. 697-699.

73. Смирнов В.В., Киприанова Е.А. Бактерии рода Pseudomonas. Киев : Наук, думка, 1990. С.84-111.

74. Суржко Л.Ф., Финкелыптейн З.И., Баскунов Б.П., Янкевич М.И., Яковлев

75. В.И., Головлева Л.А. Утилизация нефти в почве и воде микробными клетками // Микробиология. 1995. Т. 65, № 3. С. 393-398.

76. Суховицкая Л.А., Мохова С.В., Сафронова Г.В., Чернецова И.Б., Мельникова Н.В. Бактериальный препарат ризобактерин: штаммпродуцент, получение, итоги применения // Биотехнология. 2001. № 2. С. 57-64.

77. Тен Х.М. Микробиологические процессы в почвах островов притихоокеанской зоны. М. : Паука, 1977. - 180 с.

78. Теппер Е.З. Практикум по микробиологии : учебное пособие для вузов / Е.З. Теппер, В.К. Шильникова, Г.И. Переверзева ; отв. ред. В.К. Шильникова. М.: Дрофа, 2004. - 256 с.

79. Тильба В.А., Бегун С.А. Опыт применения нитрагина под сою // Сиб. вестник с.-х. науки. 1974. № 6. С. 12-17.

80. Тильба В.А., Голодяев Г.П. Микробиологические исследования некоторых почв под посевами сои на Дальнем Востоке // Науч.-техн. Бюл. СО ВАСХНИЛ. 1995. Вып. 3-4. С. 10-17.

81. Тихонович И.А., Проворов Н.А. Симбиогенетика микробно-растительных взаимодействий// Симбиогенетика. 2003. Т. 1, № 0. С. 36-46.

82. Троценко Ю.А., Иванова Е.Г., Доронина Н.В. // Микробиология. 2001. Т. 70, № 6. С. 725-736.

83. Турова Т.П. Мультикопийность рибосомных оперонов прокариот и её влияние на проведение филогенетического анализа // Микробиология. 2003. Т. 72, №4. С. 437-452.

84. Умаров М.М. Ассоциативная азотфиксация. М. : Изд-во МГУ, 1986. -132 с.

85. Умаров М.М., Шабаев В.П., Смолин В.Ю., Мамедов Н.М. Нитрогеназная активность в ризосфере и урожае тритикале при применении азотфиксирующих смешанных культур микроорганизмов // Почвоведение. 1993. №9. С. 70-75.

86. Фахрутдинов А.И. Микробиологическая и ферментативная активность почв и грунтов при рекультивации нефтезагрязнённых территорий : Дис. . канд. биол. Наук / МГУ. М., 2005. -128 с.

87. Федоненко Ю.П., Егоренкова И.В., Коннова С.А., Игнатов В.В. Участие липополисахаридов азоспирилл во взаимодействии с поверхностью корней пшеницы // Микробиология. 2001. Т. 70, № 3. С. 384-390.

88. Федорова JI.M. Динамика микробиологических процессов в почве и обусловливающие ее факторы. Таллин, 1976. - 154 с.

89. Холоденко В.П., Чугунов В.А., Жиглецова С.К., Родин В.Б., Ермоленко З.М., Фомиченков В.М. Разработка биотехнологических методов ликвидации нефтяных загрязнений окружающей среды // Рос. Хим. Журнал. 2001. Т. XLV, № 5. С. 6.

90. Цавкелова Е.А., Климова С.Ю., Чердынцева Т.А., Нетрусрв А.И. Микроорганизмы продуценты стимуляторов роста растений и их практическое применение (обзор) // Прикладная микробиология и биохимия. 2006. Т. 42, № 2. С. 133-143.

91. Чуйко Н.В., Курдиш И.К. Хемотаксисные свойства Bradyrhizobium japonicum в присутствии высокодисперсных материалов // Микробиология. 2004. Т. 73, № 3. С. 364-367.

92. Чумаков М.И. Механизм агробактериальной трансформации растений. Саратов : Слово, 2001. - 256 с.

93. Чумак Н.Е., Степная О.А., Черменская Т.С., Кулаев И.С., Несмеянова М.А. Особенности секреции бактериолитичнских ферментов и полисахарида у бактерий семейства Pseudomonadaceae И Микробиология. 1995. Т. 64, № 1. С. 55-62.

94. Шевелуха B.C., Калашникова Е.А., Дегтярёв С.В. Сельскохозяйственная биотехнология: учебн. пособ / отв. ред. B.C. Шевелуха. М.: Высш. шк., 1998. - 416 с.

95. Широких И.Г., Широких А.А., Родина И.А. Сортоспецифичность комплексов актиномидетов, ассоциированных с корнями ячменя в дерново-подзолистой почве // Микробиология. 2003. Т. 72, № 4. С. 563568.

96. Шляхов С.А. Техногенные поверхностные образования в местах золотодобычи на Буреинском нагорье. Владивосток : Дальнаука, 2002. -36 с.

97. Шопфер В.Х. Биохимия и физиология витаминов. М. : Мир, 1950. -131с.

98. Amann R.I., Lin С., Key R., Montgomery L., Stahl D.A. Diversity among Fibrobacter isolates: towards a phylogenetic classification. // Syst. Appl. Microbiol. 1992. № 15. P. 23-31.

99. Anderson В., Jones D., Burgess A. Cloning, expression and sequence analysis of Bartonella henselae gene encoding the HtrA stress response protein // Mol. Plant-Microbe Interact. 1996. Vol. 178, № 1. P. 35-38.

100. Anderson T.A., Guthrie E.A., Walton B.T. Bioremediation in the rhizosphere //Environ. Sci. Technol. 1993. Vol. 144, № 13. p. 2630-2636.

101. Atlas R.M., Bartha R. Microbial ecology: Fundamentals and applications. California : Benjamin / Cummings, 1997. - 533 p.

102. Bashan Y., Holguim G. Azospirillum plant relationships: environmental and physiological advances // Can. J. Microbiol. 1997. Vol.43, P. 103-121.

103. Bashan Y., Holguim G. Proposal for the division of plant growth-promoting rhizobacteria intfo two classifications: biocontrol-PGPB (plant growth-promoting bacteria) and PGPB // Soil Biol. Biochem. 1998. Vol. 30, № 8/9. P. 1225-1228.

104. Benizi E., Baudoin E., Di Battiosta-Leboef C., Guckett A. Des bacteries pour la sante des plantes // Biofutur 2001. № 210. P. 52-55.

105. Bergey's manual of determinative bacteriology. Eds. Holt J.G., Krieg N.R., Sneath P.H., Staley J.T., Williams S.T. 9th ed. Baltimore / Philadelphia /

106. Hong Hong / London / Munich / Sydney / Tokyo : Williams and Wilkins Co, 1994. 787 p.th

107. Bergey's manual of systematic bacteriology. 8 ed. Noel R., Krieg N.R., Holt J.G. Baltimore / London : Williams and Wilkins Co. Vol. 1, 1984. 964 P

108. Bergman В., Rai A.N., Johansson C., Soderback E. Cyanobacteria-plant symbiosis // Symbiosis. 1993. Vol. 14, P. 61-81.

109. Bochner B.R. New technologies to assess genotype-phenotype relationships //Nature Rev. Genet. 2003. Vol. 4, № 4. P. 309-324.

110. Bonner H. Liberation of organic substances from higher plant and there role in the soil sickness problem / H. Bonner // Bot. Rev. 1960. Vol. 26, P. 393-424.

111. Borowich J J. Influence of rhizobacterial culture media on plant growth and on inhibition if fimgal pathogens // Biocontrol. 2000. Vol. 45, № 3. P. 355371.

112. Bradley S.G. NA reassociation and base composition. In: Microbiological Classification and Identification / Edited by M. Goodfellow andR.G. Board London : Academic Press, 1980. P. 11-26.

113. Campbell R.E. Plant microbiology. London; Baltomor (MD) : Arnold, 1985. - 191 p.

114. Charles T.C. Sshouguang J., Nester E.W. Two-component sensory transduction systems in phytobacteria // Ann. Rev. Phytopathol. 1992. Vol. 30, P. 463-484.

115. Conrad R., Klose M., Claus P. Phosphate inhibits acetotrophic methanogenesis on Rice Roots // Appl. Environ. Microbiol. 2000. Vol. 66, № 2. P. 828-831.

116. Cooke T.J., Poli D.B., Sztein A.E., Cohen J.D. Evolutionary patterns in auxin action // Plant Mol. Diol. 2002. Vol. 49, №. 3/4. P. 319-338.

117. Costacurta A., Vanderleyden J. Synthesis of phytohormones by plant-associated bacteria // Crit. Rev. Microbiol. 1995. Vol. 21, № 1. P. 1-18.

118. Croes C., Moens S., Van Bastelaere E., Vanderleyden J., Michiels K. The polar Flagellum mediates Azospirillum brasilense adsorption to wheat root // J. Gen. Microbiol. 1993. Vol. 139, P. 2261-2269.

119. Cunningham S.D., Anderson T.A., Schwab A.P., Hsu F.C. Phytoremediation of soils contaminated with organic pollutants // Adv. Argon. (Year-Book). 1996. Vol. 56, P. 55-114.

120. Curt E.A., Truelove B. The rhizosphere. Berlin: Springer-Verlag, 1986. -288 p.

121. Derbyshire J.F., Greaves M.P. Bacteria and protozoa in the rhizosphere // Pest. Sci. 1973. Vol. 4, P. 349-360.

122. Dekkers L.C., Phoelich C.C., Van der Fits L., Lugtenberg B.J. A site-specific recombinase is required for competitive root colonization by Pseudomonas fluorescens WCS365 // Prog. Nat. Acad. Sci. USA. 1998. Vol. 95, № 12. P. 7051-7056.

123. Dobereiner J., Day J.M. Associative symbiosis in tropical grasses: Characterization of microorganisms and dinitrogen-fixing sites // Proc. Intern. Symp. N2-fixation. Washington, (D.C.), 1976. P. 518-537.

124. Dobereiner J. Isolation and identification of root associated diazotrophs // Plant and Soil. 1988. Vol. 110, P. 207-212.

125. Espinosa-Urgel M., Ramos J.L. Expression of a Pseudomonas putida aminotransferase involved in lysine catabolism is induced in the rhizosphere // Ibid. 2001. Vol. 67, № Ц. p. 5219-5224.

126. Espinosa-Urgel M. Genetic analysis of functions involved in adhesion of Pseudomonas putida to seeds // J. Bacterid. 2000. Vol. 182, № 9. P. 23632369.

127. Ferro A.M., Sims R.C., Bugbe B. Hycrest crested wheat drass accelerates the degradation of pentachlorophenol in soil // J. Environ. Qual. 1994. Vol. 23, № 2. P. 272-279.

128. Flor П.Н. Genetics of pathogeniciti in Melampsora lini И J. Agric. Res. 1946. Vol. 73, P. 335-357.

129. Foster R.C. The ultrastructure of the rhizoplana and rhizosphere // Ann. Rev. Phytopatol. 1986. Vol. 24, P. 211-234.

130. Fujii H., Chiou, T.J., Lin S.I., Aung, K., Zhu, J.K. A miRNA involved in phosphate-starvation response in Arabidopsis // Current Biology. 2005. Vol. 15, P. 2038-2043.

131. Garland J.L. Patterns of potential С source utilization by rhizosphere communities // Soil. Biol. Biochem. 1996. Vol. 28, №2. P. 223-230.

132. Garrity G.M., Winters M., Kuo A.W., Searles D.B. Taxonomic outline of the Procaryotes Bergey's manual of systematic bacteriology, 2nd Edition. / Edited by G.M. Garrity. New York: Springer-Verlag, 2002. Vol. 1, P. 1-3.

133. GenBank: http://www.ncib.nlm.nih.gov

134. Glick B.R., Bashan Y. Genetic manipulation of plant growth-promoting bacteria to enhance biocontrol of phitopathogens // Biotechnol. Adv. 1997. Vol. 15, P. 353-378.

135. Glick B.R. The enhancement of plant growth by free-living bacteria // 1995. Can. J. Microbiol. Vol. 41, P. 109-117.

136. Goodfellow M., Cross T. The biology of the actinomycetes. In: The Biology of the Actinomyces. Edited by M. Goodfellow, M. Mordarski, S.T. Williams. London : Academic Press, 1984. P. 7-164.

137. Goodfellow M., Minnikin D.E. Introduction to chemosystematics. In: Chemical Methods in Bacterial Systematic. Edited by M. Goodfellow and D.E. Minnikin. London : Academic Press, 1985. P. 1-15.

138. Goodfellow M., O'Donnell A.G. Roots of bacterial systematic. In: Handbook of New Bacterial Systematic. Edited by Goodfellow M. and O'Donnel A.G. London : Academic Press, 1994. P. 3-56.

139. Grimont P. A. Use of DNA Reassociation in bacterial classification // Can. J. Microbiol. 1988. № 34. P. 541-546.

140. Gunther Т., Dornberger U., Fritsche W. Effects of ryegrass on biodegradation of hydrocarbons in soil // Chemosphere. 1996. Vol. 33, № 2. P. 203-215.

141. Gransee A., Wittenmayer L. Qualitative and quantitative analysis of water-soluble root exudates in relation to plant species and development // Plant Nutrition and Soil Science. 2000. Vol. 163, № 4. P. 381-385.

142. Hartwig U.A. Joseph C.M., Phillips D.A. Flavonoids released naturally from alfalfa seeds enhance growth rate of Rhizobium meliloti II Plant Physiol. 1991. Vol. 95, №3. P. 797-809.

143. Herd S., Christensen M.J., Saunders K. Quantitative assessment of in planta distribution of metabolic activity and gene expression of an endophytic fungus//Microbiology. 1997. Vol. 143, P. 267-275.

144. Houghtpn J.E., Shanley M.S. Catabolic potencial of Pseudomonas'. A regulatory perspective//Biolog. degrad. 1994. P. 11-32.

145. Jana Т.К., Srivastava A.K., Cseiy K., Arora D.K. Influence of growth and environmental conditions on cell surface hydrophobicity of Pseudomonas fluorescens in non-specific adhesion // Can. J. Microbiol. 2000. Vol. 46, № 1. P. 28-37.

146. Jones D. Organic acids in the rhizosphere a critical review // Plant and Siol. 1998. Vol. 205, № 1. P. 24-44.

147. Karpati E., Sik T. Host plant specific chemotaxis of rhizobia // Acta Microbiol. (Hung). 1992. Vol. 39, № 3-4. P. 352-353.

148. Khammas K.M., Kaiser R. Pectin decomposition and associated nitrogen fixation by mixed culture of Azospirillum and Baccilus species // Can. J. Microbiol. 1992. Vol. 38, P. 794-797.

149. Kloepper J.W., Lifshitz R., Zablotowicz R. Free-living bacterial inocula for enhancing crop productivity // Trends Biotechnol. 1989. Vol. 7, P. 39-44.

150. Knee E.M., Gong F.C., Gao M., Teplitski M., Jopes A.R., Foxworthy A., Mort A.J., Bauer W.D. Root mucilage from pea and its utilization by rhizosphere bacteria as a sole carbon source // Mol. Plant-Microbe Interact. 2001. Vol. 14, №6. P. 775-784.

151. Kroppenstedt R.M. Fatty acid and menaquinone analysis of actinomycetes and related organisms. // Sos. Appl. Bacteriol. Tech. 1985. № 20. P. 173-197.

152. Kumar V., Kumar R., Narula N. Establishment of phosphate-solubilizing strains of Azotobacter chroococcum in the rhizosphere and their effect on wheat cultivars under green house conditions // Microbiol. Research. 2001. Vol. 156, №1. P. 87-93.

153. Lambrecht M., Okon Y., Vande Broek A., Vanderleyden J // Indol-3-acetic acid: a reciprocal signalling molecule in bacteria-plant interactions // Trends Microbiol. 2000. Vol. 8, № 7. P. 298-300.

154. Lane D.E. 16S/23S rRNA sequencing // Nucleic acid techniques in bacterial systematics / Eds. Stacebrandt E., Goodfellow M. New York : Wiley, 1991.-P. 115-147.

155. Lerouge I., Vanderleyden J. O-antigen variation: mechanisms and possible roles in animal/plant-microbe interactions // FEMS Microbiol. Rev. 2001. Vol. 26, №1. P. 17-47.

156. List of Bacterial Name with Standing in Nomenclature : 2003. -http ://www.bacterio.net

157. Lofre E., Lagares A., Mori G. Disruption of dTDP-rhamnose biosynthesis modifies lipopolysaccaride core, exopolysaccaride production, and root colonization in Azospirillum brasilense // FEMS Microbiol. Lett. 2004. Vol. 231, №2. P. 267-275.

158. Lugtenberg B.J., Chin-A-Woeng T.F., Bloemberg G.V. Microbe-plant interactions: principles and mechanisms // Ibid. 2002. Vol. 81, № %. P. 373383.

159. Lugtenberg B.J., Dekkers L., Bloemberg G.V. Molecular determinans of rhizosphere colonization by Pseudomonas I I Annu. Rev. Phytopathol. 2001. Vol. 39, P. 461-490.

160. Lugtenberg B.J., Dekkers L. What makes Pseudomonas bacteria rhizosphere competent? // Environ. Microbiol. 1999. Vol. 1, № 1. P. 9-13.

161. Lugtenberg B.J., de Weger L.A., Bennett J.W. Microbial stimulation of plant growth and protection from disease // Curr. Opin. Microbiol. 1991. Vol. 2, P. 457-464.

162. Lugtenberg B.J. Tomato seed and root exudate sugars: composition, utilization by Pseudomonas biocontrol strains and role in rhizosphere colonization //Environ. Microbiol. 1999. Vol. 1, № 5. P. 439-446.

163. Mahan M.J., Slauch J.M., Mekalonos J.J. Selection of bacterial virulence genes that are specifically induced in host tissues // Science. 1993. Vol. 259, № 5095. P. 686-688.

164. Marmur J. A. A procedure for the isolation of deoxyribonucleic acid from microorganisms // J. Mol. Biol. 1961. Vol. 3, P. 208-214.

165. Martinez E. Recent developments in Rhizobium genome I I Plant and soil. 1994. Vol. 161, P. 11-20.

166. Matthew R., Kent P.N. Rhizobitoxin production and symbiotic compatibility of Bradyrhizobium from Asian and North American lineages of Amphicarpaea // Can. J. Microbiol. 2001. Vol. 47, № 10. P. 889-894.

167. Michiels K., Vanderleyden J., Elmerich C. Genetics and molecular biology of Azospirillum II Azospirillum plant associations / Ed. Y. Okon. -Boca Raton: CRC, press, 1994. P. 41-56.

168. Nautiyal C. Shekhar F. Plant beneficial rhizosphere competent bacteria // Prog. Nat. Acad. Sci. India. B. 2000. Vol. 70, № 2. P. 107-123.

169. Nazina T.N., Rozanova E.P., Kuznetsov S.I. Microbial oil transformation processes accompanied by methane and hydrogen-sulfide formation // Geomicrobiol. J. 1985. Vol. 4, № 2. P. 103-130.

170. NCBI BLAST http:// www.ncbi.nim.nih.gov/blast

171. Nutman P.S. Genetic factors concerned in the symbiosis of clover and nodule bacteria // Nature. 1946. Vol. 157, № 3989. P. 463-465.

172. O'Connell K.P., Goodman R.M., Handeisman J. Engineering the rhizosphere: expressing a bias // Trends Biotechnol. 1996. Vol. 14, № 3. P. 8388.

173. Oger P.M., Mansouri П., Nesme X., Dessaux Y. Engineering root exudation of Lotus toward the production of two carbon compounds leads to the selection of distinct microbial populations in the rhizosphere // Microb. Ecol. 2004. Vol. 47, № 1. P. 96-103.

174. Patten C.L., Glick B.R. Bacterial biosynthesis of indol-3-acetic acid // Canad. J. Microbiol. 1996. Vol. 42, № 3. P. 207-220.

175. Paul E.A., Clark F.E. Occurrences and distribution of soil organics // Soil microbiology and biochemistry / Ed. E.A. Paul and F.E. Clark. San Diego : Acad. Press., 1989. - P. 81-84.

176. Pieta D., Pastucha A., Patkowska E. The role of the organic substance in the formation of microorganisms // Ann. Agric. Sci.-Ser. E. Plant Protec. 1999. Vol. 28, № */2. p 81-92.

177. Preston G.M., Bertrand N., Rainey P.B. Type III secreyion in plant-promoting Pseudomonas fluorescens WCS365 // Mol. Microbiol. 2001. Vol. 41, №5 P. 999-1014.

178. Rainey P.B. Adaptation Pseudomonas fluorescens to plant rhizosphere // Environ. Microbiol. 2000. Vol. 66, № 2. P. 243-257.

179. Ribosomal Database Project http://rdp.cme.msu.edu

180. Rodriguez-Valera F. Enviromental genomics, the big picture? // FENS Microbiol. Lett. 2004. Vol. 231, № 5. P. 153-158.

181. Rodriigues-Herva J.J., Reniero D., Galli E., Ramos J.L. Cell envelope mutants of Pseudomonas putida: physiological characterization and analysis of their ability to survive in soil // Environ. Microbiol. 1999. Vol. 1, № 6. P. 479488.

182. Roest C.M., Bloemendaal C.J., Wijffelman C.A., Lugtenberg B.J. Isolation and characterization of ropA homologous genes from Rhizobium leguminosarum biovars viciae and trifolii И J. Bacteriol. 1995. Vol. 177, № 17. P. 4985-4991.

183. Rossello-Mora R., Amann R. The species concept for prokaryotes. // FEMS Microbiol. Rev. 2001. № 25. P. 39-67.

184. Saitou N., Nei M. The neighbor-joining method: a new method for reconstructing phylogenetic trees. //Mol. Biol. Evol. 1987. № 4. P. 406-425.

185. Santamaria C.M., Temprano F., Rodriguez-Navarro D.N., Daza A. Coinoculation with Bacillus sp. CECT 450 improves nodulation in Phaseolus vulgaris L. //Can. J. Microbiol. 2001. Vol. 47, № 11. P. 1058-1062.

186. Sambruk J., Frisch E.F., Maniatis T. Molecuar cloning: a laboratory manual. N. Y.: Cold Spring Harbor, 1989. 279 p.

187. Sanchez-Contreras M., Martin B.A., Villacieros B.R., O'Gara F., Bonilla I., Rivilla R. Phenotipic selection and phase variation occur during alfalfa root colonization by Pseudomonas fluorescensV\\3 II J. Bacteriol. 2002. Vol. 184, №6. P. 1587-1596.

188. Savelkoul P.H., Aarts H.J., de Haas J., Dijkshoorn L., Duim В., Otsen M., Rademaker J.L., Schouls L., Lenstra JA. Amplified-fragment length polymorphism analysis: the state of an art. // J. Clin. Microbiol. 1999. № 37. P. 3083-3091.

189. Schleifer, К., Kandler, О. Peptidoglycan types of bacterial cell walls and their taxonomic implications. // Bacteriological Reviews. 1972. Vol. 36, № 4. P. 407-477.

190. Schloter M., Lebuhn M., Heulin Т., Hartmann A. Ecology and evolution of bacterial microdiversity. // FEMS Microbiol. Rev. 2000. № 24. P. 647-660.

191. Schneider E.A., Wightman F. Metabolism of auxin in higher plants // Annu. Rev. Physiol. 1974. Vol. 2, P. 487-513.

192. Schroth M.N., Hancock J.G. Disease suppressive soil and root-colonizing bacteria// Science. 1982. Vol. 216, P. 1376-1381.

193. Schultze M., Kondorosi A. Regulation of symbiotic root nodule development//Ann. Rev. Genet. 1998. Vol. 32, P. 33-57.

194. Schumann P., Rainey F.A., Burghardt J., Stackebrandt E., Weiss N. Reclassification of Brevibacterium oxydans (Chatelain, Second, 1966) as Microbacterium oxydans comb. nov. // Int. J. Syst. Bacteriol. 1999. № 49. P. 175-177.

195. Schumann, P., Weiss, N., Stackebrandt, E. Reclassification of Cellulomonas cellulans (Stackebrandt, Keddie, 1986) as Cellulosomicrobium cellulans gen. nov., comb. Nov. // Int. J. Syst. Bacteriol. 2001. № 51. P. 10071010.

196. Shurong X., Tandong Y., Lizhe A., Bingliang X.,Wang J. 16S rRNA sequences and differences in bacteria isolated from the Muztag Ata Glacier at increasing Depths // Appl. Environ. Microbiol. 2005. Vol. 71, № 8. P. 46194627.

197. Siciliano S.D., Germida J.J. Mechanisms of phytoremediation: Biochemical and ecological interactions between plants and bacteria // Environ. Rev. 1998. Vol. 6, № 1. P. 65-79.

198. Simons M., Permentier H.P., De Weger L.A., Wiffelman C.A., Lugtenberg В J.J. Amino acid synthesis is necessary for tomato root colonization by Pseudomonas fluorescens strain WCS365 // Mol. Plant-Microbe Interact. 1997. Vol. 10, № 2. P. 102-10

199. Soderberg K.H., Probanza A., Jumpponen A., Baath E. The microbial community in rhizosphere determined by community-level physiological profiles (CLPP) and direct soil- and cfu-PLFA techniques // Appl. Soil Ecol. 2004. Vol. 25, №2. P. 135-145.

200. Stackebrandt E., Goebel В. M. Taxonomic note: a place for DNA-DNA reassociation and 16S rRNA sequence analysis in the present species definition in bacteriology // Int. J. Syst. Bacteriol. 1994. № 44. P. 846-849.

201. Suzuki K., Goodfellow M., O'Donnel A.G. Cell envelopes and classification. In: Handbook of new bacterial systematic. Edited by Goodfellow M. and O'Donnel A.G. London : Academic Press, 1994. P. 195250.

202. Thomas-Bauzon D., Weinhard P., Villecourt P,m Balandreau J. The spermosphere model 1: Its use in growing, counting and isolating N2-fixing bacteria from the rhizosphere of rice // Canad. J. Microbiol. 1982. Vol. 28, № 8. P. 922-928.

203. Tompson J.H., Higgins D.G., Gibson T.J. CLUSTAL W: improving the sensitivity of progressive multiple sequence aligment throough sequence weight matrix choice //Nucleic. Acids. Res. 1994. Vol. 10, P. 21-132.

204. Tsolis R.M. Comparativ genome analysis of the alpha-proteobacteria: Relationships between plant and animal pathogens and host specificity // Prog. Nat. Acad. Sci. USA. 2002. Vol. 99, № 20. P. 12503-12505.

205. Ursing J.B., Rossello-Mora R.A., Garcia-Valdes E., Lalucat J. Taxonomic note: a pragmatic approach to the nomenclature of phenotypically similar genomic groups. // Int. J. Syst. Bacteriol. 1995. N 45. 604 p.

206. Vance D.B. Phytoremediation: Enhancing natural attenuation processes //Nat. Environ. J. -1996. Vol. 6, № 1. P. 30-31.

207. Vancura V. Root exudates of plant IV. Differences of chemical compositions of seeds and seeding exudates // Plant and Soil. 1972. Vol. 36, P. 272.

208. Vandamme P., Pot В., Gillins M., De Vos P., Kersters K., Swings J. Polyphasic taxonomy, a consensus approach to bacterial systematic. // Microbiol. Rev. 1996. № 60. P. 407-438.

209. Van de Peer Y., De Wachter R. TREECON for Windows: a software package for the construction and drawing of evolutionary trees for the Microsoft Windows environment. // Comput. Appl. Biosc. 1994. № 10. P. 569570.

210. Van der Hoist P.P.G., Gronlund M., Stougaard J., Spaink H.P. Symbiosis and defense: two sides of one coin // Biology of Plant-Microbe Interactions. 2004. Vol. 4, P. 245-251.

211. Vande Broek A., Lambrecht M., Vanderleyden J. Bacterial chemotaxis motility is important for the initiation of wheat root colonization by Azospirillum brasilense //Microbiology. 1998. Vol. 144, № 9. P. 2599-2606.

212. Vaneechoutte M. DNA fingerprinting teclmiques for microorganisms //Mol. Biothechnol. 1996. № 6. P. 115-142.

213. Versalovic J., Schneider M., de Bruijn F.J., Lupski J.R. Genomic fingerprinting of bacteria using repetitive sequence-based polymerase chain reaction//Meth. Cell. Mol. Biol. 1994. № 5. P. 25-40.

214. Versaw W.K., Chiou T.J., Harrison, M.J. Phosphate transporters of Medicago truncatula and arbuscular mycorrhizal // Plant and Soil. 2002. Vol. 244, P. 239-245.

215. Vos P., Hogers R., Bleeker M., Reijans M., Van de Lee Т., Homes M., Frijters A., Pot J., Peleman J., Kuiper M. AFLP: a new technique for DNA fingerprinting. //Nucl. Acids Res. 1995. № 23. P. 4407-4414.

216. Welsh J., McClelland M. Fingerprinting genomes using PCR with arbitrary primers//Nucl. Acids Res. 1990. № 18. P. 7213-7218.

217. Williams J.G.K., Kubelic A.R., Livak K.J., Rafalski J.A., Tingey S.V. DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers // Nucl. Acids Res. 1990. № 18. P. 6531-6535.

218. Yeole R.D., Dave B.P., Dube H.C. Siderophore production by fluorescens pseudomonas colonizizing roots of certain crop plants // Indian J. Exp. Biol. 2001. Vol. 39, № 5. P. 464-468.

219. Zak J.C., Willig M.R., Moorhead D.L., Wildman H.G. Functional diversity of microbial communities: A quantitative approach // Ibid. 1994. Vol. 26, №9. P. 1101-1108.

220. Zhulin I.B., Armitatage J.P. Motility, chemotaxis and methylation-independent chemotaxis in Azospirillum brasilense II J. Bacteriol. 1993. Vol. 175, № 4. P. 952-958.