Частота обнаружения труднокультивируемых микроорганизмов - возбудителей инфекций респираторного тракта у детей и взрослых и оптимизация способа их детекции тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.02.03, кандидат наук Сперанская, Елена Валентиновна

• Сперанская, Елена Валентиновна
• кандидат наук
• 2015

Оглавление диссертации кандидат наук Сперанская, Елена Валентиновна

СОДЕРЖАНИЕ

ВВЕДЕНИЕ

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Характеристика труднокультивируемых возбудителей воспалительных заболеваний органов дыхания

1.1.1. Mycoplasma pneumoniae

1.1.2. Бактерии рода Chlamydophila

1.1.2.1. Chlamydophila pneumoniae

1.1.2.2. Chlamydophila psittaci

1.1.3. Legionella pneumophila

1.1.4. Moraxella (Branhamella) catarrhalis

1.1.5. Вирусы группы герпеса

1.1.5.1. Herpes simplex //// (HSVI/II)

1.2. Лабораторная диагностика заболеваний органов дыхания

1.2.1. Традиционные методы лабораторной диагностики, применяемые для выявления труднокультивируемых возбудителей воспалительных заболеваний органов дыхания

1.2.2. Современные молекулярно-биологические методы в диагностике бронхолегочных инфекций

ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ

ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ

2.1. Объекты и объем исследований

2.2 Исследуемый материал

2.3. Выделение ДНК из исследуемого материала

2.4. Выделение ДНК из смеси субстратов

2.5. Постановка ПЦР

2.7. Выявление продуктов амплификации методом электрофореза в агарозном геле

2.8. Учет результатов электрофореза

2.9. Иммунологические исследования

2.10. Статистический анализ результатов

2.11. Нормативно-методические документы

ГЛАВА 3. ВЫБОР НАИБОЛЕЕ ИНФОРМАТИВНОГО СУБСТРАТА ДЛЯ ИССЛЕДОВАНИЯ НА КОНТАМИНИРОВАННОСТЬ ТРУДНОКУЛЬТИВИРУЕМЫМИ ВОЗБУДИТЕЛЯМИ ВОСПАЛИТЕЛЬНЫХ ЗАБОЛЕВАНИЙ ОРГАНОВ ДЫХАНИЯ

ГЛАВА 4. ОПТИМИЗАЦИЯ СПОСОБА ПЦР-ДЕТЕКЦИИ РЕДКО ВСТРЕЧАЮЩИХСЯ ВОЗБУДИТЕЛЕЙ ИНФЕКЦИЙ РЕСПИРАТОРНОГО

ТРАКТА И ЭФФЕКТИВНОСТЬ ЕГО ИСПОЛЬЗОВАНИЯ

ГЛАВА 5. ЧАСТОТА ОБНАРУЖЕНИЯ ТРУДНОКУЛЬТИВИРУЕМЫХ ВОЗБУДИТЕЛЕЙ ИНФЕКЦИЙ РЕСПИРАТОРНОГО ТРАКТА У ДЕТЕЙ

ГЛАВА 6. ЧАСТОТА ОБНАРУЖЕНИЯ ТРУДНОКУЛЬТИВИРУЕМЫХ ВОЗБУДИТЕЛЕЙ БРОНХОЛЕГОЧНЫХ ИНФЕКЦИЙ У ВЗРОСЛЫХ

ГЛАВА 7. АЛГОРИТМ МОЛЕКУЛЯРНОЙ ДЕТЕКЦИИ ТРУДНОКУЛЬТИВИРУЕМЫХ ВОЗБУДИТЕЛЕЙ ЗАБОЛЕВАНИЙ ОРГАНОВ ДЫХАНИЯ

ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ

ПЕРСПЕКТИВНЫЕ НАПРАВЛЕНИЯ ДАЛЬНЕЙШЕЙ РАЗРАБОТКИ ТЕМЫ

БЛАГОДАРНОСТИ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Частота обнаружения труднокультивируемых микроорганизмов - возбудителей инфекций респираторного тракта у детей и взрослых и оптимизация способа их детекции»

ВВЕДЕНИЕ

Актуальность работы.

Инфекционные воспалительные болезни органов дыхания (БОД), включая внебольничные пневмонии (ВП), остаются одной из ведущих причин заболеваемости, госпитализации и смертности и представляют собой постоянную сложную проблему современного здравоохранения как в индустриально развитых, так и развивающихся странах [11, 17, 18, 27]. Согласно официальной статистике в Российской Федерации ежегодно регистрируется около 500 тыс. случаев пневмоний, хотя их предполагаемое число составляет около 1,5 млн. [17,18]. Отдельную проблему представляют БОД в закрытых воинских коллективах, где уровни заболеваемости превышают показатели среди гражданского населения в несколько раз [9].

Поражения органов дыхания могут быть вызваны различными видами бактерий и вирусов, колонизирующими верхние и нижние дыхательные пути. Наряду с традиционными этиологическими агентами {Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, вирусами гриппа) большую роль приобретают так называемые атипичные, труднокультивируемые патогены, такие как Mycoplasma pneumoniae, Chlamydophila pneumoniae, Legionella pneumophila, а также вирусы группы герпеса {Cytomegalovirus (CMV), Herpes simplex //// (HSV I/II)) [4, 8, 9, 10, 11, 19, 25, 63, 75]. Этиологическая роль данных возбудителей в развитии респираторных инфекций и необходимость их индикации и идентификации отражена в новых нормативных документах: МУ 3.1.2.3047-13 «Эпидемиологический надзор за внебольничными пневмониями»; МУК 4.2.3115 -13 «Лабораторная диагностика внебольничных пневмоний», СП 3.1.2.3116-13 "Профилактика внебольничных пневмоний". На фоне снижения иммунного статуса населения возрастает роль этих возбудителей в формировании патологии органов дыхания [1, 11, 17, 19]. По данным литературы на их долю приходится до 30 % случаев заболеваний респираторного тракта, при этом частота их выявления при различных нозологических формах у разных авторов существенно варьирует

[34, 66, 83,87, 159, 171, 185].

Следует отметить, что труднокультивируемые возбудители традиционными методами (бактериологическими, иммунологическими, серологическими) детектируются недостаточно надежно, так как они являются микроорганизмами, требовательными к условиям культивирования, обладают высокой антигенной изменчивостью, поэтому, несмотря на значительные затраты времени и средств, в 30-70% случаев этиологический фактор установить не удается [27, 64, 82, 93, 115, 131].

Методы, основанные на амплификации нуклеиновых кислот (МАНК) и широко используемые в настоящее время для детекции большинства инфекционных агентов, являются наиболее предпочтительными для выявления труднокультивируемых возбудителей заболеваний органов дыхания, так как позволяют исследовать любой биологический субстрат, обладают высокой чувствительностью, специфичностью, скоростью получения результата [20, 36, 57, 76, 140]. Современные мультиплексные диагностические ПЦР (полимеразная цепная реакция) тест-системы позволяют выявлять одновременно несколько (3-9) инфекционных агентов в одной пробирке [124, 146, 150, 165, 178].

Степень разработанности темы исследования.

В настоящее время существенное место в этиологии болезней органов дыхания (БОД) принадлежит группе труднокультивируемых микроорганизмов (С. pneumoniae, С. psittaci, М. pneumoniae, L. pneumophila, CMV и др.). Существенный вклад в изучение роли данных возбудителей в развитии БОД внесли как отечественные - Тартаковский И.С., 2000; Шахгильдян В.И., 2003; Синопальников А.И., 2006; Чучалин А.Г., 2010 и др., так и зарубежные - Baer G., 2003; Gaillat J., 2005; Cunha В.А., 2010 и др. исследователи. В последние годы за рубежом и в Российской Федерации в этиологической диагностике заболеваний респираторного тракта широко используются молекулярно-биологические методы, главным образом, различные варианты полимеразной цепной реакции

(ПЦР) [20, 74, 100, 123]. Разработаны, сертифицированы и производятся ПЦР-диагностикумы для выявления возбудителей инфекционных заболеваний органов дыхания.

Однако обследования обширных контингентов больных разных возрастных групп с различными формами патологий органов дыхания на широкий спектр труднокультивируемых возбудителей с использованием метода ПЦР в Российской Федерации не проводились. До сих пор отсутствует универсальный информативный субстрат для исследования. Исследуют различные биологические субстраты: образцы мокроты, мазков из зева, носоглотки, бронхоальвеолярного лаважа (БАЛ), плевральной жидкости, биопсийного материала [41, 140].

Возрастающие темпы роста заболеваемости БОД, широкий спектр как традиционных, так и «атипичных» труднокультивируемых возбудителей, генетическая изменчивость патогенов, сложность этиологической структуры при БОД, включая внебольничную пневмонию (ВП), требуют широкого внедрения в лабораторную практику молекулярно-генетических методов исследования для решения диагностических, клинических и эпидемиологических задач.

Целью исследования являлась оптимизация способа детекции труднокультивируемых возбудителей БОД (Mycoplasma pneumoniae, Chlamydophila pneumoniae, Chlamydophila psittaci, Legionella pneumophila, Moraxella catarrhalis), а также вирусов группы герпеса и оценка частоты их обнаружения в зависимости от возраста больных и нозологической формы заболевания.

Задачи исследования:

1. Определить наиболее информативный биологический субстрат для ПЦР-диагностики труднокультивируемых возбудителей воспалительных заболеваний органов дыхания.

2. Создать эффективный и экономически оправданный способ ПЦР-детекции редко встречающихся труднокультивируемых возбудителей БОД.

3. Определить частоту выявления М pneumoniae, С. pneumoniae, С. psittaci, L. pneumophila, М. catarrhalis, Cytomegalovirus, Herpes simplex I/H у детей разных возрастных групп и взрослых (организованных и неорганизованных) с различными воспалительными заболеваниями респираторного тракта.

4. Разработать оптимальный алгоритм молекулярной детекции М. pneumoniae, С. pneumoniae, С. psittaci, L. pneumophila, М. catarrhalis, Cytomegalovirus, Herpes simplex //// типов у больных разных возрастных групп с воспалительными бронхолегочными заболеваниями.

Научная новизна работы.

Впервые разработан способ эффективный ПЦР-детекции редко встречающихся труднокультивируемых микроорганизмов в различных биологических субстратах от детей и взрослых с бронхолегочной патологией (патент на изобретение №2406088 от 10.12.2010г. «Способ выявления редких и труднокультивируемых форм возбудителей воспалительных заболеваний органов дыхания (Cytomegalovirus, Chlamydophila pneumoniae, Chlamydophila psittaci, Legionella pneumophila, Moraxella catarrhalis) с использованием метода ПЦР»).

Впервые проведено крупномасштабное обследование больных разных возрастных групп с различными бронхолегочными инфекциями, проживающих в условиях промышленного мегаполиса, на широкий спектр труднокультивируемых возбудителей бактериальной и вирусной природы с применением метода ПЦР.

Получены новые знания о частоте обнаружения отдельных видов труднокультивируемых микроорганизмов у детей разных возрастных групп и взрослых с различными нозологическими формами инфекционных заболеваний органов дыхания.

Впервые разработана новая медицинская технология «Комплексное ПЦР-обследование пациентов с инфекционно-аллергическими заболеваниями органов дыхания» (разрешение на применение ФС № 2009/084 от 21.04.09 г.

Минсоцздрава РФ), позволяющая сокращать себестоимость исследования и повышать эффективность выявления инфекционных агентов.

Теоретическая и практическая значимость исследования.

Получены новые знания о частоте обнаружения труднокультивируемых микроорганизмов при бронхолегочных заболеваниях, которые могут явиться дополнительным вкладом в изучение этиопатогенеза и развития инфекционного процесса БОД.

Показано, что частота выявления труднокультивируемых микроорганизмов - возбудителей БОД - зависит от вида возбудителя, контингента и возраста обследуемых лиц, нозологической формы заболевания.

Разработанный способ ПЦР-детекции труднокультивируемых возбудителей БОД позволяет повысить эффективность и достоверность диагностических исследований, уменьшить их продолжительность и снизить стоимость в 3,8 - 7,6 раза.

Установлено, что идентификация «атипичных» микроорганизмов в режиме сопровождения лечебного процесса способствует оперативной коррекции антибактериальной и иммуномодулирующей терапии, позволяет сократить сроки пребывания больного в стационаре.

Разработанный способ выявления труднокультивируемых возбудителей заболеваний органов дыхания, защищенный патентом №2406088, внедрен в диагностическую работу ряда лечебных учреждений г. Нижнего Новгорода и Нижегородской области.

Результаты выполненного исследования использованы при разработке медицинской технологии «Комплексное ПЦР-обследование пациентов с инфекционно-аллергическими заболеваниями органов дыхания» (Разрешение на применение медицинской технологии ФС № 2009/084 от 21.04.09 Минсоцздрава РФ), методических рекомендаций «Выявление редких труднокультивируемых форм возбудителей воспалительных заболеваний органов дыхания с использованием метода ПЦР» (МР 4.2.0060-12, 2012 г.), методических

рекомендаций «Алгоритм выявления широкого спектра возбудителей воспалительных заболеваний органов дыхания» (рекомендованы для использования на региональном уровне письмом Роспотребнадзора №01/8010-1226 от 18.07.2012).

Основные положения, выносимые на защиту:

1. Способ выявления труднокультивируемых микроорганизмов, основанный на методе «двойных минипулов» (защищенный патентом №2406088), позволяет осуществлять экономически оправданный скрининг больных с разными типами патологии респираторного тракта и уменьшает стоимость и продолжительность диагностических исследований.

2. Нозологическая форма БОД, контингент и возраст обследуемых лиц, специфика возбудителя определяют частоту выявления труднокультивируемых микроорганизмов - возбудителей БОД.

3. Доминирующими возбудителями в этиологической структуре БОД из числа труднокультивируемых микроорганизмов являются у детей - M.pneumoniae, у организованных взрослых - M.pneumoniae и С. pneumonia.

Связь работы с научными программами и собственный вклад автора в исследования.

Исследования осуществлялись в рамках отраслевых программ: «Научные аспекты обеспечения санитарно-эпидемиологического благополучия в РФ на 2006-2010 гг.» (раздел НИР «Изучение распространения и особенностей циркуляции атипичных и труднокультивируемых возбудителей воспалительных и инфекционно-аллергических заболеваний дыхательной системы» (№ гос. регистрации 01200612239)) и «Научные исследования и разработки с целью обеспечения санитарно-эпидемиологического благополучия и снижения инфекционной заболеваемости в Российской Федерации» на 2011-2015гг. (техническое задание от 11.01.2011г. «Изучение персистенции вирусов группы герпеса (I, II, III, IV, V, VI, VII типов) и бактерий рода Mycoplasma у детей с использованием молекулярно-генетических методов. Разработка алгоритма

мониторинга активной репликации герпесвирусов у детей различных возрастных групп» (№ гос. регистрации 01201175712)). Один из разделов работы выполнялся в рамках задания Министерства обороны РФ «Исследование особенностей эпидемиологии и течения внебольничных пневмоний у военнослужащих на современном этапе» (2003-2007гг.).

Личное участие соискателя в получении результатов, изложенных в диссертации, заключалось в выполнении молекулярно-генетических исследований, теоретическом обобщении результатов, статистической обработке данных. Соискатель в соавторстве разработал медицинскую технологию (разрешение на применение медицинской технологии ФС № 2009/084), методические рекомендации MP 4.2.0060-12, методические рекомендации «Алгоритм выявления широкого спектра возбудителей воспалительных заболеваний органов дыхания» (письмо Роспотребнадзора №01/8010-12-26 от 18.07.2012). Полученные соискателем результаты послужили материалом для разработки и получения патента на изобретение №2406088 «Способ выявления редких и труднокультивируемых форм возбудителей воспалительных заболеваний органов дыхания (Cytomegalovirus, Chlamydophila pneumoniae, Chlamydophila psittaci, Legionella pneumophila, Moraxella catarrhal is) с использованием метода ПЦР».

Степень достоверности и апробация работы.

О достоверности полученных результатов свидетельствует достаточный объем выборки анализируемых групп, большое количество проведенных исследований (исследованы пробы различных клинических субстратов от 1841 пациента с бронхолегочной патологией и 449 лиц групп сравнения, проведено 31843 ПЦР-исследования), использование сертифицированных молекулярно-генетических, иммунологических методов, которые характеризуются высокой чувствительностью и специфичностью.

Диссертация апробирована на совместном заседании Ученого совета и Межлабораторного научного семинара ФБУН «ННИИЭМ им. академика И.Н.

Блохиной» Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека (Протокол № 8 от 30.10.14 г.).

Результаты работы доложены и обсуждены на VII Российском съезде инфекционистов «Новые технологии в диагностике и лечении инфекционных болезней», г.Н.Новгород, 2006г.; Втором Всероссийском форуме «Здоровье нации - основа процветания России», г. Москва, 2006г.; научной конференции, посвященной 85-летию со дня рождения академика РАМН И.Н. Блохиной, г.Н.Новгород, 2006г.; IV Всероссийской научно-практической конференции «Молекулярная диагностика - 2007», г. Москва, 2007г.; Юбилейной Всероссийской научно-практической конференции, посвященной 90-летию Нижегородского научно-исследовательского института эпидемиологии и микробиологии имени академика И.Н.Блохиной и 20-летию Приволжского окружного центра по профилактике и борьбе со СПИД, г. Н.Новгород, 2009г.; научно-практической конференции молодых ученых «Инновационные технологии в противоэпидемической защите населения», г. Н.Новгород, 2011 г; V Ежегодном Всероссийском Конгрессе по инфекционным болезням, г. Москва, 2013 г.

Публикации

По теме диссертации опубликовано 17 печатных работ, среди них 5 - в рецензируемых изданиях; 9 - в материалах конференций; 1 - патент на изобретение; 1 - медицинская технология; 2 - методические рекомендации.

Объем и структура диссертации

Диссертационная работа изложена на 132 страницах печатного текста и состоит из введения, обзора литературы, 5 глав описания результатов собственных исследований, заключения, выводов, практических рекомендаций, перспективных направлений дальнейшей разработки темы, списка сокращений и списка литературы. Диссертация иллюстрирована 13 рисунками и 8 таблицами. Список литературы содержит 200 источников, из них 20 отечественных и 180 зарубежных.

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Характеристика трудиокультивируемых возбудителей воспалительных заболеваний органов дыхания

В настоящее время существенное место в этиологии инфекционных заболеваний органов дыхания принадлежит группе трудиокультивируемых микроорганизмов (облигатных и факультативных внутриклеточных паразитов), устойчивых к ß-лактамным антибиотикам: С. pneumoniae, С. psittaci, С. trachomatis, М. pneumoniae, L. pneumophila и др. В частности, на их долю суммарно приходится от 8 до 30% случаев внебольничных пневмоний (ВП). Этиологическая роль данных возбудителей в развитии респираторных инфекций и необходимость их индикации и идентификации отражена в новых нормативных документах: МУ 3.1.2.3047-13 «Эпидемиологический надзор за внеболышчными пневмониями»; МУК 4.2.3115-13 «Лабораторная диагностика внебольничных пневмоний», СП 3.1.2.3116-13 "Профилактика внебольничных пневмоний".

Этиологическая расшифровка болезней органов дыхания (БОД), включая пневмонии - одна из существенных проблем диагностики в связи с использованием различных субстратов и методов исследований, сложностью интерпретации результатов, недостаточной чувствительностью классических бактериологических методов. Уровень диагностических ошибок при ВП достигает 40%. Возрастающие темпы роста заболеваемости БОД, широкий спектр как традиционных, так и «атипичных» возбудителей, генетическая изменчивость патогенов, увеличение численности иммуннокомпроментированных лиц (люди пожилого и старческого возраста, больные диабетом, онкологическими заболеваниями, получающие кортикостероиды и иммунодепрессанты), сложность этиологической структуры и многофакторность развития эпидемического процесса при БОД требуют широкого внедрения в лабораторную практику молекулярно-генетических методов исследования для решения диагностических, клинических и эпидемиологических задач.

По данным литературы ведущим возбудителем БОД из числа

труднокультивируемых является Mycoplasma pneumoniae [54, 58, 62, 82, 172].

1.1.1. Mycoplasma pneumoniae

M. pneumoniae — уникальная безусловно-патогенная бактерия представитель класса Mollicutes, порядка Mycoplasmatales, семейства Mycoplasmataceae, наиболее известная как возбудитель респираторного микоплазмоза. Микроорганизм был открыт М. Eaton в 1944 году и долго фигурировал под названием «агента Итона». Считали, что это вирус, так как он проходил через бактериальные фильтры и не культивировался на обычных питательных средах. Лишь в 1962 г. «агент Итона» получил статус одного из видов микоплазм [13].

М. pneumoniae, как и все микоплазмы, отличается мельчайшими размерами. Объем ее клетки составляет менее 5% от среднего объема клетки типичных бактерий. Небольшие размеры не позволяют обнаруживать М. pneumoniae с помощью световой микроскопии, по этой же причине возбудитель не вызывает помутнения жидких питательных сред. Типичные колонии М. pneumoniae редко превышают 100 мкм в диаметре и требуют изучения их морфологии под стереомикроскопом. М. pneumoniae, располагая минимальным для клеток количеством генетического материала (её ДНК примерно в пять раз меньше, чем у Escherichia coli), обладают ограниченными биосинтетическими возможностями, поэтому их приходится культивировать на сложных питательных средах, обогащенных предшественниками нуклеиновых кислот, белков и липидов [13,186].

Микоплазмы не имеют возможности синтезировать пептидогликан клеточной стенки, так как в их геноме нет генов, ответственных за этот процесс. Отсутствие регидной клеточной стенки обусловливает плеоморфизм клеток, что делает невозможным отнести их ни к коккам, ни к палочкам. Это же свойство обеспечивает резистентность микоплазм к антибактериальным препаратам, подавляющим синтез клеточной стенки, прежде всего к пенициллину и другим ß-

лактамам [14].

Другой характерной особенностью М. pneumoniae, как и всех представителей рода Mycoplasma, является потребность в стеролах (холестерине и его производных). В инфицированных тканях микоплазмы добывают стеролы непосредственно из клеточных мембран, внедряясь в их структуру или даже сливаясь с ними. Это свойство относит микоплазм к «мембранным паразитам» и наделяет их способностью к длительной персистенции в организме хозяина, позволяя таким образом «ускользать» от фагоцитоза [13, 14].

М pneumoniae передается преимущественно воздушно-капельным путем, источником инфекции является человек. Инфицированию способствует скученное размещение людей, находящихся в закрытых и полузакрытых организованных коллективах (семья, школа, воинский контингент) [54, 62]. С помощью культуральных и молекулярно-биологических методов установлено длительное бессимптомное носительство М pneumoniae, что также способствует распространению возбудителя [65].

Исследования, проводимые в Северной Америке и Европе, показали, что заболеваемость респираторным микоплазмозом носит цикличный характер. Ее повышение регистрируется каждые 3—5 лет [65, 113].

Хотя заболеваемость респираторным микоплазмозом не имеет ярко выраженного сезонного характера, в умеренных климатических условиях доля больных с микоплазменной внеболышчной пневмонией больше летом за счет низкой распространенности других респираторных патогенов в это время [147]. Вспышки респираторных заболеваний, вызванных М. pneumoniae, обычно бывают летом или в начале осени [60].

М. pneumoniae является этиологическим агентом до 40% и более случаев внебольничной пневмонии у детей, из них как минимум 18% случаев требуют госпитализации [58, 62, 82, 90, 185]. Несмотря на то, что М. pneumoniae не считается неонатальным патогеном, D. Ursi с соавторами обнаружили с помощью ПЦР М. pneumoniae в назофаренгиальном аспирате младенцев с врожденной

пневмонией и предположили, что в данном случае не исключалась трансплацентарная передача возбудителя [181].

Несмотря на то, что большинство случаев инфицирования М. pneumoniae взрослых носит легкий или бессимптомный характер, М. pneumoniae является важной причиной бактериальной пневмонии у взрослых. Исследования, проводимые в Израиле и Китае среди госпитализированных взрослых с внебольничной пневмонией, показали схожие результаты. По их данным М pneumoniae ответственна за 29% случаев заболеваний, являясь первым (Китай) или вторым после S. pneumoniae (Израиль) по частоте патогеном [38, 147] . По данным Templeton К.Е. с соавторами (Нидерланды) М. pneumoniae обнаруживалась с помощью МАНК у 12% взрослых с инфекциями нижних дыхательных путей [172]. Французские исследователи детектировали М pneumoniae методом ПЦР у 7,3% взрослых с внебольничной пневмонией и у 2,3% - с острым бронхитом [66].

При респираторном микоплазмозе инфекционный процесс, как правило, ограничивается острым катаром верхних дыхательных путей (фарингит, ларингофарингит, трахеит). S. Esposito с соавторами установили острую М. pneumoniae - инфекцию у 44 из 184 детей с нестрептококковым фарингитом [59]. При микоплазменной инфекции реже поражаются глубокие отделы респираторного тракта (бронхит, пневмония), но и в таких случаях интоксикация обычно бывает умеренной, симптомы нарастают медленно, часто сохраняясь на протяжении нескольких недель и даже месяцев. Больных беспокоят боль в горле, охриплость, лихорадка, кашель - вначале непродуктивный, а позднее с малым количеством мокроты, головная боль, миалгии [13, 62]. Нередко больные переносят заболевание на ногах (отсюда термин «ходячая пневмония»). Как упоминалось ранее, М. pneumoniae может быть причиной тяжелой, требующей госпитализации пневмонии, особенно у детей младше 5 лет и пожилых лиц [50, 147, 185].

Клинические проявления заболеваний респираторного тракта

микоплазменной этиологии не имеют достоверных отличий от подобных заболеваний, вызываемых различными респираторными вирусами и бактериями, например S. pneumoniae, а так же другими атипичными возбудителями, в первую очередь С. pneumoniae. Термином «атипичная пневмония» обозначаются главным образом микоплазменные пневмонии, хотя это выражение начали использовать задолго до открытия самого микроорганизма. Так стали называть случаи заболевания, когда отсутствовала реакция в ответ на классическую антимикробную терапию.

М. pneumoniae может присутствовать в респираторном тракте вместе с другими патогенами и есть свидетельства, что она способна предшествовать инфекционному процессу другой (вирусной или бактериальной) этиологии и активизировать его. Возможным объяснением такого синергетического эффекта может быть снижение иммунитета и изменение нормальной микрофлоры дыхательных путей вследствие наличия микоплазм [54, 82, 113, 194].

Концепция, что хроническая М. pneumoniae - инфекция может играть роль в патогенезе астмы, известна давно. Вопрос, является ли М. pneumoniae главной причиной астмы, или же микоплазменная инфекция - всего лишь кофактор в её развитии, дискутируется [105, 106, 168, 175]. В литературе, посвященной лечению астмы, имеются данные об успешном применении макролидов у пациентов с подтвержденной М. pneumoniae - инфекцией [107].

Примерно у 6-7% пациентов с пневмониями, вызванными М. pneumoniae, могут возникать расстройства со стороны ЦНС [163]. Это могут быть энцефалиты, параличи черепно-мозговых нервов, мозжечковый синдром, асептический менингит или менингоэнцефалит, кома, когнитивные расстройства и др. [29, 31, 89, 118, 174]. Обнаружение жизнеспособных М. pneumoniae или их ДНК в нервной ткани служит убедительным доказательством повышенной инвазивности этих бактерий и возможности дистантных осложнений при поражениях респираторного тракта [52,89, 112].

Имеются сообщения о септических артритах с обнаружением М. pneumoniae

непосредственно в синовиальной жидкости, особенно у пациентов с гипогаммаглобулинемией [48, 155].

Рядом исследователей были описаны перикардиты, миокардиты и ряд других кардиологических осложнений, ассоциированных с М. pneumoniae [136, 163, 170, 174]. Сообщалось о фатальных случаях диссеминированного внутрисосудистого свертывания в результате молниеносной микоплазменной инфекции [42]. M.L. Higuchi с группой исследователей сообщают об обнаружении М. pneumoniae в атеросклеротических бляшках и стенотичных сердечных клапанах и высказывают предположение, что М. pneumoniae наряду с С. pneumoniae может быть связана с риском эмболизации и инфаркта миокарда [84, 85].

У детей М. pneumoniae может вызывать конъюнктивиты, передние увеиты, оптические нейропатии и другие глазные заболевания [138, 158].

1.1.2. Бактерии рода Chlamydophila

1.1.2.1. Chlamydophila pneumoniae

В 1983 г. в США от больного фарингитом был выделен инфекционный агент, который оказался идентичным выделенному от ребенка с трахомой в 1965 г. на Тайване атипичному хламидийному штамму. Все последующие изоляты были получены от больных с заболеваниями респираторного тракта (пневмонией, бронхитом, синуситом, фарингитОхМ и др.), среди которых было выявлено немало лиц с антителами против вновь обнаруженных хламидий. Последние получили рабочее название TWAR (The Taiwan Acut Respiratory agent), а в 1989 J.T. Grayston предложил видовое название - Chlamydia pneumoniae, подчеркивающее важность данного вида хламидий в патологии легких человека [73]. По современной классификации семейство Chlamydiaceae включает два рода, собственно Chlamydia и новый род Chlamydophila, в который перешли виды Chlamydia pneumoniae, Chlamydia psittaci и Chlamydia pecorum.

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Сперанская, Елена Валентиновна, 2015 год

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

1. Бартлетт Д. Д. Инфекции дыхательных путей. Пер. с англ. - 2-е изд. /Д. Д. Бартлет - М.: Бином. - 2000. - 192с.

2. Белоцерковская Ю. Г. Роль Chlamydophila pneumoniae в бронхолегочной патологии человека / Ю. Г. Белоцерковская, А. И. Синопальников // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. - 2008. - Т. 10.-№1.-С. 15-24.

3. Булгакова В.А. Хламидийная и микоплазменная инфекции при атопической бронхиальной астме у детей/В.А. Булгакова, И.В.Зубкова//Инфекционные болезни.- 2008.- Т.6.- №3.- с.56-60.

4. Вишнякова Л.А. Роль Streptococcus pneumoniae, Mycoplasma pneumoniae и Chlamydia pneumoniae при внебольничной пневмонии у детей/ Л.А.Вишнякова, М.А. Никитина, С.И. Петрова и др.// Пульмонология.-2005.-№3. - с.43-47.

5. Волков И.К. Moraxella catarrhalis при хронических и рецидивирующих заболеваниях органов дыхания у детей/ И. К. Волков, Л.К. Катосова, Н. Ю. Щербакова и др.// Антибиотики и химиотерапия: ежемесячный научно-практический журнал/ Государственный НЦ по антибиотикам (М.). -М.: Медицина, 2004. -Том 49, № 8/9. -С. 43-47.

6. Гранитов В.Н. Герпесвирусная инфекция.- М.: Мед.книга.-2001.- 80 с.

7. Егоров А.М. Хламидии: молекулярная организация клетки и некоторые особенности патогенеза инфекций/ А.М. Егоров, Ю.О. Сазыкин // Антибиотики и химиотерапия. -2000. -Т. 45, №4. -С. 3-5.

8. Исаков В.А. Герпесвирусные инфекции человека./В.А. Исаков, Е.И. Архипова, Д.В. Исаков //СПб.: СпецЛит. - 2006. - 303 с.

9. Казаков С.П. Особенности диагностики и лечения атипичных легочных заболеваний в Российском госпитале в Косово/С.П.Казаков, Ю.В. Папенко, Б. Хоркаи//Военно-медицинский журнал.-2004.-№3-С. 38-39.

Ю.Каражас H.B. Эпидемиологическая характеристика цитомегаловирусной инфекции и пневмоцитоза как оппортунистических инфекций. Автореф. дис. .. .д-ра мед.наук. - М. - 2002. - 40 с.

П.Карапетян Т. А. Внебольничная пневмония сегодня/ Т. А. Карапетян//Вестник Санкт-Петербургского университета Серия 11: Медицина.-2008.- № 1 .-С. 1-14.

12.Катосова JT.K. Этиологическая диагностика острых пневмоний у детей/JT.К. Катосова, Т.В. Спичак, С.С. Ким и др.// Вопросы диагностики в педиатрии.-2009.-№2.- с.27-31.

И.Маянский А.Н. Микробиология для врачей / А.Н.Маянский. - H.H.: НГМА.-2001.-394 с.

М.Тартаковский И.С. Современные подходы к диагностике атипичных пневмоний / И.С. Тартаковский // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. -2000. - Т. 2. - №1. -С. 60-68.

15.Темежникова Н. Д. Лабораторная диагностика легионеллеза / Н. Д. Темежникова // Клиническая лабораторная диагностика. - 2008. - №11. - С. 34-39.

16.Трубников Г.В. Внебольничная пневмония с атипичной (миоплазменной и хламидийной инфекцией)/ Г.В. Трубников, И.Г. Полякова, Л.Ю. Бутакова// Терапевтический архив,- 2009.- Т. 81.- №1.- с. 16-20.

17.Чучалин А.Г. Пневмония / А.Г. Чучалин, А.И. Синопальников, Л.С Страчунский. - М.: МИА. - 2006. - 464 с.

18.Чучалин А.Г. Внебольничная пневмония у взрослых. Практические рекомендации по диагностике, лечению и профилактике. Пособие для врачей/ А.Г. Чучалин, А.И. Синопальников, P.C. Козлов, И.Е. Тюрин. С.А. Рачина. - М.2010.-60 с.

19.Шахгильдян В.И. Клиническая характеристика, диагностика и лечение цитомегаловирусной инфекции //Мед. кафедра. - 2003. - №1. - С. 51-59.

20.Яцишина С.Б. Разработка и применение ПЦР с гибридизационно-флуоресцентной детекцией для обнаружения Legionella pneumophila/ С. Б. Яцишина, С. А. Портенко, Т. С. Астахова и др.// Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии: двухмесячный научно-практический журнал. -М.: С-ИНФО, 2008. -№2. -С. 29-37.

21.Abuhammour W.M. Moraxella catarrhalis bacteremia: a 10-year experience/ W.M. Abuhammour, N.M. Abdel-Haq, B.I. Asmar et al.//South. Med. J.-1999.-Vol. 92.-P. 1071-1074.

22.Albert-Weissenberger C. Legionella pneumophila—a human pathogen that co-evolved with fresh water protozoa/ C. Albert-Weissenberger, C. Cazalet, C. Buchrieser//Cell. Mol. Life Sci.-2007. -Vol.64.-P.432-448.

23.Allice Т. Qvantitation of cytomegalovirus DNA by real time plymerase chein reaction in peripheral blood specimens of patient with solid organ transplants: comparison with end-point PCR and pp65 antigen test / T. Alice, M. Enrietto, F. Pittaluga et al. // J. Med. Virol. - 2006. - Vol. 78, № 7. - P. 915-922.

24.Apfalter P. Comparison of a new quantitative ompA-based real-Time PCR TaqMan assay for detection of Chlamydia pneumoniae DNA in respiratory specimens with four conventional PCR assays / P. Apfalter, W. Barousch, M. Nehr et al. // J. Clin. Microbiol. - 2003. - V. 41.- №2. - P. 592-600.

25.Baer G. Role of Chlamydia pneumoniae and Mycoplasma pneumoniae as causative agents of community-acquired pneumonia in hospitalised children and adolescents / G. Baer, G. Engelcke, M. Abele-Horn et al. // Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. -2003. - V.22. -№12. - P. 742-745.

26.Ballard A. L. Detection of Legionella pneumophila using a real-time PCR hybridization assay/ A. L. Ballard, N. K. Fry, L.Chan et al. // J. Clin..Microbiol. - 2000.- Vol.38.-P. 4215-4218.

27.Bartlett J.G. Practice guidelines for management of community acquired pneumonia in adults. Guidelines from the infectious diseases of America/ J.G.

Bartlett, S.F. Dowell, L.A. Mandell et al. // Clin. Infect. Diseases. - 2000. -V.31. - P.347-382.

28.Beersma M. F. Evaluation of 12 commercial tests and the complement fixation test for Mycoplasma pneumoniae-specific immunoglobulin G (IgG) and IgM antibodies, with PCR used as the "gold standard"/ M. F. Beersma, K. Dirven, A. P. van Dam et al.//J. Clin. Microbiol.-2005.-Vol.43.-P.2277-2285.

29.Behan P. O. Neurological aspects of mycoplasmal infection/ P. O. Behan, R. G. Feldman, J. M. Segerra et al.//Acta Neurol. Scand.-1986.-Vol.74.-P.314-322.

30.Benkel D.H. Outbreak of Legionnaires' disease associated with a display whirlpool spa/ D.H. Benkel, E.M. McClure, D. Woolard et al.// Int J Epidemiol. -2000.- Vol. 29.-№6.-P. 1092-1098.

3 l.Bitnun A. Acute childhood encephalitis and Mycoplasma pneumoniae/ A. Bitnun, E. L. Ford-Jones, M. Pétrie et al.// Clin. Infect. Dis. - 2001. Vol.32.- P. 16741684.

32.Blanchard E. Asthma and Mycoplasma pneumoniae/ E. Blanchard, C. Raherison // Rev. Mai. Respir. -2010.- Vol. 27.-№8.-P.890-897.

33.Blasi F. Epidemiology of Chlamydia pneumonia / F. Blasi, P. Tarsia, C.Arosio et al. // Clin. Microbiol. Infect. - 1998. - V. 4. - P. 1-6.

34.Blasi F. Atypical pathogens and respiratory tract infections/ F. Blasi // ERJ.-2004.- vol. 24.- № 1.- P. 171 -182.

35.Boelen E. Chlamydia pneumoniae infection of brain cells: an in vitro study/ E. Boelen, H. W. Steinbusch, A. J. van der Ven et al. // Neurobiol. -2007. -Vol. 28.P.524-532.

36.Boman J. Rapid diagnosis of respiratory Chlamydia pneumoniae infection by nested touchdown polymerase chain reaction compared with culture and antigen detection by EIA/ J. Boman, A. Allard, K. Persson, et al. // J. Infect. Dis. - 1997. -Vol.175.- P.1523-1526.

37.Boman J. Molecular diagnosis of Chlamydia pneumoniae infection/ J. Boman, C.A. Gaydos, T.C. Quinn// J. Clin. Microbiol.-1999.-Vol.37.-№12.-P. 3791-3799.

38.Cao B. Viral and Mycoplasma pneumoniae community-acquired pneumonia and novel clinical outcome evaluation in ambulatory adult patients in China/B. Cao, L.L. Ren, F. Zhao et al.// Eur. J. Clin. Microbiol. Infec.t Dis.- 2010.-Vol.29.-

P. 1443-1448.

39.Carroll K.C. Laboratory Diagnosis of Lower Respiratory Tract Infections: Controversy and Conundrums/ K.C. Carroll//J. Clin. Microbiol.- 2002.-Vol. 40(9).-P. 3115-3120.

40.Cheeran M.C.J. Neuropathogenesis of Congenital Cytomegalovirus Infection: Disease Mechanisms and Prospects for Intervention/ M.C.J. Cheeran, J. R. Lokensgard, M.R. Schleiss//Clin. Microbiol. Rev.-2009.-Vol. 22.-№l.-P.99-l26.

41.Cho M. Comparison of Sputum and Nasopharyngeal Swab Specimens for Molecular Diagnosis of Mycoplasma pneumoniae, Chlamydophila pneumoniae, and Legionella pneumophila/ M. Cho, H. Kim, D. An et al. // Ann. Lab. Med. -2012.- Vol. 32.- № 2.- P. 133-138.

42.Chryssanthopoulos C. Fatal disseminated intravascular coagulation caused by Mycoplasma pneumoniae/ C. Chryssanthopoulos, M. Eboriadou, K. Monti et al.// Pediatr. Infect. Dis. J.-2001.-Vol.20.-P.634-635.

43.Cianciotto N.P. Pathogenicity of Legionella pneumophila/ N.P. Cianciotto//Int. J. Med. Microbiol. - 2001.-Vol. 291.-№5.-P. 331-43.

44.Coombes B.K. cDNA array analisis of altered gene expression in human endothelial cells in response to Chlamydia pneumoniae infection/B.K. Coombes, J.B. Mahony//Infect. Immun.-2001 - V. 69. - №3. - P. 1420-1427.

45.Corey L. Maternal and Neonatal HSV Infections/ L.Corey, A.Wald// N. Engl. J. Med.-2009.-Vol.361 .-№ 14.-P. 1376-1385.

46.Cunha B.A. Legionnaires' disease: clinical differentiation from typical and other atypical pneumonias/ B.A. Cunha// Infect. Dis. Clin. North. Am.- 2010.-V61. 24.-P. 73-105.

47.Daoud A. Neonatal meningitis due to Moraxella catarrhalis and review of the literature/A. Daoud, F. Abuekteish, H. Masaadeh et al.//Ann. Trop. Paediatr.-1996.-Vol. 16.-P. 199-201.

48.Davis C.P. Isolation of Mycoplasma pneumoniae from synovial fluid samples in a patient with pneumonia and polyarthritis/ C.P. Davis, S. Cochran, J. Lisse et al.// Arch. Intern. Med.-1988.-Vol.l48.-P.969-970.

49.Daxboeck F. Laboratory diagnosis of Mycoplasma pneumoniae infection/ F. Daxboeck, R.Krause, C.Wenisch// Clin. Microbiol. Infect.-2003.-Vol.9.-P.263-273.

50.Daxboeck F. A case of lung transplantation following Mycoplasma pneumoniae infection/ F. Daxboeck, G. Brunner, H. Popper et al.// Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis.-2002.-Vol.21 .-P.318-322.

51.Den Boer J.W. Diagnosis of Legionella infection in Legionnaires' disease/ J.W. Den Boer, E.P. Yzerman// Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis.- 2004.-Vol. 23.- P. 871-878.

52.Dionisio D. Encephalitis caused directly by Mycoplasma pneumoniae / D. Dionisio, M. Valassina, S. Mata et al.//Scand. J. Infect. Dis.-1999.-Vol. 31.-P.506-509.

53.Dorigo-Zetsma J.W. Molecular detection of Mycoplasma pneumoniae in adults with community-acquired pneumonia requiring hospitalization/ J.W. Dorigo-Zetsma, R.P. Verkooyen, H.P. van Helden et al.//J. Clin. Microbiol. -2001. - Vol. 39.- P. 1184-1186.

54.Dorigo-Zetsma J. W. Results of molecular detection of Mycoplasma pneumoniae among patients with acute respiratory infection and in their household contacts reveals children as human reservoirs/ J. W. Dorigo-Zetsma, B. Wilbrink, H. van der Nat et al.//J. Infect. Dis.-2001.-Vol.l83.-P.675-678.

55.Dorigo-Zetsma J. W. Demonstration by a nested PCR for Mycoplasma pneumoniae that M. pneumoniae load in the throat is higher in patients hospitalised for M. pneumoniae infection than in non-hospitalised subjects/ J. W. Dorigo-Zetsma, S. A. Zaat, A. J. Vriesema et al.// J. Med. Microbiol.-1999. -Vol.48.-P.l 115-1122.

56.Dorigo-Zetsma J. W. Comparison of PCR, culture, and serological tests for diagnosis of Mycoplasma pneumoniae respiratory tract infection in children/ J. W. Dorigo-Zetsma, S. A. Zaat, P. M. Wertheim-van Dillen et al.// J. Clin. Microbiol. -1999. Vol. 37.-P.14-17.

57.Dumke R. Sensitive Detection of Mycoplasma pneumoniae in Human Respiratory Tract Samples by Optimized Real-Time PCR Approach/ R. Dumke, N. Schurwanz, M. Lenz et al.//J. Clin. Microbiol.-2007.-Vol.45.-P.2726-2730.

58.Esposito S. Characteristics of Streptococcus pneumoniae and atypical bacterial infection in children 2-5 years of age with community-acquired pneumonia/ S. Esposito, S. Bosis, R. Cavagna et al.// Clin. Infect. Dis.- 2002.-Vol.35.- №11.-P.1345-1352.

59.Esposito S. Emerging role of Mycoplasma pneumoniae in children with acute pharyngitis/ S. Esposito, R. Cavagna, S. Bosis et al. //Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis.- 2002.Vol.21.-P.607-610.

60.Feikin D.R. An outbreak of acute respiratory disease caused by Mycoplasma pneumoniae and adenovirus at a federal service training academy: new implications from an old scenario/ D.R. Feikin, J.F. Moroney, D.F. Talkington et al.//Clin. Infect. Dis.-1999.-Vol.29.-P.1545-1550.

61.Fernandez M. Community acquired pneumonia in a hospitalized community: etiological study / M. Fernandez, M. Zagolin, M. Ruiz et al. // Rev. Med. Chil. -2003.-V. 131.- P. 498-504.

62.Ferwerda A. Respiratory tract infections by Mycoplasma pneumoniae in children: a review of diagnostic and therapeutic measures/ A. Ferwerda, H. A. Moll, R. de Groot// Eur. J. Pediatr.- 2001.-Vol. 160.-P.483-491.

63.Fields B. S. Legionella and Legionnaires' disease: 25 years of investigation/ B.S. Fields, R.F. Benson, R.E. Besser//Clin. Microbiol. Rev.-2002.-Vol. 15.-P. 506526.

64.File T.M. Community-acquired pneumonia/T.M. File//Lancet.-2003.-Vol. 362.-P. 1991-2001.

65.Foy H.M. Infections caused by Mycoplasma pneumoniae and possible carrier state in different populations of patients/ H.M. Foy//Clin. Infect. Dis.-1993.-Vol. 17(Suppl. 1).-P.S37-S46.

66.Gaillat J. Community epidemiology of Chlamydia and Mycoplasma pneumoniae in LRTI in France over 29 months /J. Gaillat, A. Flahault, B. deBarbeyrac et al.// Eur. J. Epidemiol. - 2005. Vol. 20.-P. 643-651.

67.Garbino J. Prospective epidemiologic survey of patients with community-acquired pneumonia requiring hospitalization in Switzerland/J. Garbino, R. Sommer, A. Gerber et al.//Int. J. Infect. Dis.-2002.- V.6. - №4. - P. 288-293.

68.Gnarpe H. Chlamydia pneumoniae and myocarditis/ H. Gnarpe, J. Gnarpe, B. Gastrin// Scand. J. Infect. Dis. -1997.-Vol.l04.-P.50-52.

69.Goldstein E.J.C. Moraxella catarrhalis, a Human Respiratory Tract Pathogen/ E.J.C. Goldstein, T.F. Murphy, G. I. Parameswaran// Clin. Infect. Dis.-2009.-Vol. 49.-№l.-P. 124-131.

70.Gonzales R. Uncomplicated acute bronchitis / R. Gonzales, M.A. Sande // Ann. Intern. Med. - 2000. - V. 133. - P. 981-991.

71.Graffelman A. W. Pathogens involved in lower respiratory tract infections in general practice/ A. W. Graffelman, A. Knuistingh Neven, S. le Cessie et al.// Br. J. Gen. Pract.- 2004.-Vol. 54.-P.15-19.

72.Grayston J. Background and current knowledge of Chlamydia pneumoniae and atherosclerosis/J. Grayston // J. Infect. Dis. - 2000.-Vol. 181(Suppl. 3).-P.S402-S410.

73.Grayston J. T. A new respiratory tract pathogen: Chlamydia pneumoniae strain TWAR / J. T. Grayston, L. A. Campbell, C. C. Kuo et al. // J. Infect. Dis.C. H. -1990.-Vol. 161.P.618-625.

74.Gullsby K. Simultaneous detection of Chlamydophila pneumoniae and Mycoplasma pneumoniae using molecular beacons in a duplex real-time PCR/ K. Gullsby, M. Storm, K. Bondeson// J. Clin. Microbiol.- 2008.- Vol. 46.- №2.-P.727-731.

75.Guthrie R. Community- acquired lower respiratory tract infections: etiology and treatment/R. Guthrie// Chest.-2001.-Vol.120.- №6.-P. 2021-2034.

76.Haaheim H. Laboratory diagnosis of respiratory diseases: PCR versus serology / H. Haaheim, L. Vorland, T.J. Gutteberg // Nucleosides Nucleotides Nucleic Acids.-2001.- V. 20.-№4-7.-P. 1255-1258.

77.Hahn D.L. Chlamydia pneumoniae, astma, and COPD: what is the evidence? // Ann.Allergy Asthma Immunol. - 1999. -V. 83. - №4. - P. 271-288.

78.Hammerschlag M. Pneumoniae due Chlamydia pneumoniae in Children: Epidemiology, Diagnosis, and Treatment//Pediatric Pulmonology.-2003.-Vol.36.-P.384-390.

79.Hardegger D. Rapid detection of Mycoplasma pneumoniae in clinical samples by real-time PCR//J. Microbiol. Methods-2000. - V.41. - P. 45-51.

80.Heath P. T. Epidemiology and bacteriology of bacterial pneumonias / P. T. Heath //Paediatr. Respir. Rev. -2000.Vol. 1.-P.4-7.

81.Heiniger N. A Reservoir of Moraxella catarrhalis in Human Pharyngeal Lymphoid Tissue /N. Heiniger, V. Spaniol, R.Troller et al.// J Infect Dis.- 2007.-Vol. 196.-№7.-P. 1080-1087.

82.Heiskanen-Kosma T. Etiology of childhood pneumonia: serologic results of a prospective, population-based study/ T. Heiskanen-Kosma, M. Korppi, C. Jokinen et al.//Pediatr. Infect. Dis. J. -1998. Vol.l7.-P.986-991.

83.Heiskanen-Kosma T. Chlamydia pneumoniae is an important cause of community-acquired pneumonia in school-aged children: serological results of a prospective, population-based study/ T. Heiskanen-Kosma, M. Korppi, A. Laurila et al. //Scand. J. Infect. Dis. -1999.-Vol. 31.-P.255-259.

84.Higuchi M.L. Mycoplasma pneumoniae and Chlamydia pneumoniae in calcified nodules of aortic stenotic valves/ M.L. Higuchi, M.H. Higuchi-Dos-Santos, H. Pierri et aI.//Rev. Inst. Med. Trop. Sao Paulo.- 2002.-Vol.44.-P.209-212.

85.Higuchi M.L. Detection of Mycoplasma pneumoniae and Chlamydia pneumoniae in ruptured atherosclerotic plaques/ M.L. Higuchi, N. Sambiase, S. Palomino et al.// Braz. J. Med. Biol. Res.-2000.-Vol.33.-P. 1023-1026.

86.Hindiyeh M. Laboratory diagnosis of atypical pneumonia/ M. Hindiyeh, K. C. Carroll//Semin. Respir. Infect.-2000.-Vol. 15.-P.101-113.

87.Howard L.S. Microbiological profile of community-acquired pneumonia in adults over the last 20 years/ L.S. Howard, M. Sillis, M.C. Pasteur et al.// J. Infect. -2005.-Vol. 50.-№2.-P. 107-113.

88.1even M. Currently used nucleic acid amplification tests for the detection of viruses and atypicals in acute respiratory infections/M. Ieven// J. Clin. Virol. -2007.- Vol. 40.-№4.P.259-76.

89.1even M. Fatal encephalitis caused by Mycoplasma pneumoniae diagnosed by the polymerase chain reaction/ M.Ieven, Demey, D. Ursi et al.//Clin. Infect. Dis.-1998.-Vol.27.-P. 1552-1553.

90.Ieven M. Detection of Mycoplasma pneumoniae by two polymerase chain reactions and role of M. pneumoniae in acute respiratory tract infections in pediatric patients / M. Ieven, D. Ursi, H. Van Bever et al. Hi. Infect. Dis.-1996.-Vol.173.- P.1445-1452.

91.Ioannidis J. P. Spectrum and significance of bacteremia due to Moraxella catarrhalis/ J. P. Ioannidis, M. Worthington, J. K. Griffiths et al.// Clin. Infect. Dis. -1995.-Vol.21.-P. 390-397.

92.Javarama V. Development of models and detection methods for different forms of cytomegalovirus for the evaluation of viral inactivation agents./ V.Javarama, G.Marcello, A.Ohagen et all // Transfusion.-2006.-V.46.-№9.- P. 1580-1588.

93.Johansson N. Etiology of Community-Acquired Pneumonia: Increased Microbiological Yield with New Diagnostic Methods/N. Johansson, M. Kalin, A. Tiveljung-Lindell et al.// Clin. Infect. Dis. -2010.-Vol.50.-№2. -P. 202-209.

94.Johnston S.L. Chlamydophila pneumoniae and Mycoplasma pneumoniae: a role in asthma pathogenesis? / S.L. Johnston, R.J. Martin// Am. J. Respir. Clin. Med.-

2005.-Vol. 172.-№9.-P. 1078-1089.

95.Jokinen C. Microbial etiology of community-acquired pneumonia in the adult population of 4 municipalities in eastern Finland/C. Jokinen, L. Heiskanen, H. Juvonen et al.//Clin. Infect. Dis.-2001.-Vo.32.-№8.-P. 1141-1154.

96.Kais M. Quantitative detection of Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, and Moraxella catarrhalis in lower respiratory tract samples by realtime PCR/ M. Kais, C. Spindler, M. Kaiin et al.// Diagn. Microbiol. Infect. Dis.-

2006.-Vol. 55.-№3.-P. 169-178.

97.Karalus R. Moraxella catarrhalis: a review of an important human mucosal pathogen/ R. Karalus, A. Campagnari//Microbes Infect. - 2000.- Vol.2.-P. 547559.

98.Karim A. Legionnaire's disease associated with acute encephalitis and arrhythmia/ A. Karim, S. Ahmed, L. J. Rossoff//Crit. Care Med.-2002.-Vol.30.-P. 1028-1029.

99.Kerdsin A. Development of triplex SYBR green real-time PCR for detecting Mycoplasma pneumoniae, Chlamydophila pneumoniae, and Legionella spp. without extraction of DNA/ A. Kerdsin, R. Uchida, C. Verathamjamrus et al.// Jpn. J. In fee. t Dis.- 2010.-Vol.63 .-№3 .-P. 173-180.

100. Khanna M. The Pneumoplex assays, a multiplex PCR-enzyme hybridization assay that allows simultaneous detection of five organisms, Mycoplasma pneumoniae, Chlamydia(Chlamydophila) pneumoniae, Legionella pneumophila, Legionella micdadei, and Bordetella pertussis, and its real-time counterpart/ M. Khanna, J. Fan, K. Pehler-Harrington et al.// J. Clin. Microbiol.-2005.-Vol.43.-P.565-571.

101. Knezevic A. Disseminated Neonatal Herpes Caused by Herpes Simplex Virus Types 1 and 2/ A. Knezevic, J. Martic, M. Stanojevic et al. // Emerg. Infect. Dis.-

2007.-Vol. 13.-№2.-P.302-304.

102. Korppi M. Role of Moraxella (Branhamella) catarrhalis as a respiratory pathogen in children/M. Korppi, M.L. Katila, J. Jääskeläinen et al.// Acta Paediatr. -1992.-Vol. 81.-№12.-P.993-996.

103. Korppi M. Incidence of community-acquired pneumonia in children caused by Mycoplasma pneumoniae: serological results of a prospective, population-based study in primary health care / M. Korppi, T. Heiskanen-Kosma, M. Kleemola// Respirology.-2004.-Vol. 9.-P. 109-114.

104. Korppi M. How to diagnose Mycoplasma pneumoniae etiology in a child with pneumonia?/M. Korppi//Eur. J. Pediatr.-201 l.-Vol. 170.-№12.-P. 1619.

105. Korppi M. Bacterial infections and pediatric asthma/M. Korppi// Immunol. Allergy Clin. North. Am.-2010.- Vol.30.-№4.-P.565-574.

106. Kraft M. Detection of Mycoplasma pneumoniae in the airways of adults with chronic asthma/ M. Kraft, G. H. Cassell, J. E. Henson et al. // Am. J. Respir. Crit. Care Med. - 1998.-Vol. 158.-P. 998-1001.

107. Kraft M. Mycoplasma pneumoniae and Chlamydia pneumoniae in asthma: effect of clarithromycin/M. Kraft, G.H. Cassell, J. Pak et al.// Chest-2002.-Vol. 121.-P. 1782-1788.

108. Ksouri H. Analysis of cytomegalovirus (CMV) viremia using the pp65 antigenemia assay, the amplicor CMV test, and a semi-quantitative polymerase chain reaction test after allogenic marrow transplantation/ H.Ksouri, H.Eljed, A.Greco et al.//Transpl. Infect. Dis.-2007.-V9.-№l.-P. 16-21.

109. Kuoppa Y. Quantitative detection of respiratory Chlamydia pneumoniae infection by rial-time PCR / Y. Kuoppa, J. Boman, L. Scott et al. // J. Clin. Microbiol. - 2002. - V.40. - P. 2273-2274.

110. Kuroki H. Characterization of children with Mycoplasma pneumoniae infection detected by rapid polymerase chain reaction technique / H. Kuroki, M. Morozumi, N. Chiba, K. Ubukata // J. Infect. Chemother. - 2004. - V. 10. - №1. - P. 65-67.

111. Kurz H. Epidemiology and morbidity of mycoplasma as causative agent for community-acquired pneumonia in hospitalized children in a Community Hospital in Vienna / H. Kurz, , H. Göpfrich// Wien Med Wochenschr.- 2011.-Vol. 161 .-№7-8.-P. 180-183.

112. Launes J. Direct invasion of the brain parenchyma by Mycoplasma pneumoniae/ J. Launes, A. Paetau, K. Linnavuori et al.// Acta Neurol. Scand.-1997,-Vol. 95.-P.374.

113. Layani-Milon M. P. Incidence of upper respiratory tract Mycoplasma pneumoniae infections among outpatients in Rhone-Alpes, France, during five successive winter periods/ M. P. Layani-Milon, I. Gras, M. Valette, J. et al.//J. Clin. Microbiol.-1999. -Vol.37. -P. 1721-1726.

114. Leesik H. Microbial pathogens of adult community-acquired pneumonia in Southern Estonia/H. Leesik, U. Ani, A. Juhani et al.//Medicina (Kaunas)-2006.-Vol.42(5).-P.3 84-394.

115. Lidman C. Limited value of routine microbiological diagnostics in patients hospitalized for community-acquired pneumonia/ C. Lidman, L.G. Burman, A. Lagergren et al.// Scand. J. Infect. Dis.- 2002.-Vol. 34.-№12.-P.873-879.

116. Lieberman D. Nasopharyngeal versus Oropharyngeal Sampling for Isolation of Potential Respiratory Pathogens in Adults/ D. Lieberman, E. Shleyfer, H. Castel et al.//J. Clin. Microbiol.- 2006.- V. 442.-P. 525-528.

117. Limaye A.P. CMV in critically ill patients: pathogen or bystander?/A.P. Limaye, M. Boeckh// Rev. Med. Virol. -2010.-Vol.20.-№6.-P. 372-379.

118. Lin W. C. Mycoplasma pneumoniae encephalitis in childhood/ W.C. Lin, P.I. Lee, C.Y. Lu et al.//J. Microbiol. Immunol. Infect.-2002.-Vol.35.-P.173-178.

119. Lin C. Nested PCR-linked capillary electrophoresis and single-strand conformation polymorphisms for detection of macrolide-resistant Mycoplasma pneumoniae in Beijing, China/ C. Lin, S. Li, H. Sun et al.// J.Clin. Microbiol. -2010.- Vol. 48.- №12.-P.4567-72.

120. Liu F.C. Rapid diagnosis of Mycoplasma pneumoniae infection in children by polymerase chain reaction/ F.C. Liu, P.Y. Chen, F.L. Huang et al. // J. Microbiol. Immunol. Infect. - 2007. Vol. 40. - №6.- P.507-12.

121. Loens K. Development of conventional and real-time NASBA for the detection of Legionella species in respiratory spesimens/ K. Loens, T. Beck, H. Goossens et al.//J. Microbiol. Methods. - 2006.- Vol.67.- №3.- P.408-415.

122. Loens K. Development of Conventional and Real-Time Nucleic Acid Sequence-Based Amplification Assays for Detection of Chlamydophila pneumoniae in Respiratory Specimens/ K. Loens, T. Beck, H. Goossens et al.// J. Clin. Microbiol. - 2006.-Vol. 44.-P. 1241-1244.

123. Loens K. Evaluation of different nucleic acid amplification techniques for the detection of M. pneumoniae, C. pneumoniae and Legionella spp. in respiratory spesimens from patients with community-acquired pneumonia/ K. Loens, T. Beck, D. Ursi et al. // J. Microbiol. Methods. - 2008.- Vol.73.- №3.- P.257-262.

124. Loens K. Development of Real-Time Multiplex NASBA(R) for the Detection of Mycoplasma pneumoniae, Chlamydophila pneumoniae and Legionella spp. in Respiratory Specimens / K. Loens, T. Beck, D. Ursi et al. // J. Clin. Microbiol.-2008.-Vol. 46.-№ 1 .-P. 185-191.

125. Loens K. Detection of Mycoplasma pneumoniae by real-time nucleic acid sequence-based amplification / K. Loens, M. Ieven, D. Ursi et al. // J. Clin. Microbiol. -2003. - V. 41. - №9. - P. 4448-4450.

126. Lui G. Role of "atypical pathogens" among adult hospitalized patients with community-acquired pneumonia /G. Lui, M. Ip, N. Lee et al.//Respirology - 2009 -Vol.14.-№8, P. 1098-1105.

127. Luna C.M. Community-acquired pneumonia: etiology, epidemiology and outcome at a Teaching Hospital in Argentina/ C.M. Luna,A. Famiglietti, R. Absi et al. // Chest- 2000.-Vol.l 18.- №5.-P. 1344-1354.

128. Mackenzie G.A. Epidemiology of nasopharyngeal carriage of respiratory bacterial pathogens in children and adults: cross-sectional surveys in a population

with high rates of pneumococcal disease/ G.A. Mackenzie, A.J Leach, J.R Carapetis et al.// BMC Infect. Dis. -2010.-Vol.10.-P.304.

129. Maltezou H. C. Mycoplasma pneumoniae and Legionella pneumophila in community-acquired lower respiratory tract infections among hospitalized children: diagnosis by real time PCR/ H. C. Maltezou, B. La-Scola, H. Astra et al. //Scand. J. Infect. Dis.-2004.-Vol.36.- P.639-642.

130. Matsushima T. Etiology and management of community-acquired pneumonia in Asia/ T. Matsushima, N. Miyashita, T.M. File// Curr. Opin. Infect.Dis.-2002.-Vol. 15. - №2.-P. 157-162.

131. Marrie T. J. Ambulatory patients with community-acquired pneumonia: the frequency of atypical agents and clinical course/ T. J. Marrie, R. W. Peeling, M. J. Fine et al. // Am. J. Med.- 1996.-Vol. 101.-P.508-515.

132. McDonough E. A. A multiplex PCR for detection of Mycoplasma pneumoniae, Chlamydophila pneumoniae, Legionella pneumophila, and Bordetella pertussis, in clinical specimens/ E.A. McDonough, C.P. Barrozo, K.L. Russell et al.//Mol. Cell. Probes.-2005.-Vol.l9.-P.314-322.

133. Mcintosh K. Community-acquired pneumonia in children/ K. McIntosh//N. Engl. J. Med.-2002.-Vol.346.-P.429-437.

134. Mclver C.J. Divelopment of multiplex PCRs for detection of common viral pathogens and agents of congenital infections/C.J. Mclver, C.F. Jacques, S.S. Show et al.// J.Clin.Microbiol.-2005.-V43.-№10.-P.5102-5110.

135. Mérault N. Specific Real-Time PCR for Simultaneous Detection and Identification of Legionella pneumophila Serogroup 1 in Water and Clinical Samples/ N. Mérault, C. Rusniok, S. Jarraud et al.// Appl. Environ. Microbiol. -2011.-Vol. 77.-P. 1708-1717.

136. Meseguer M.A. Mycoplasma pneumoniae pericarditis and cardiac tamponade in a ten-year-old girl/ M.A. Meseguer, J.A. Perez-Molina, J. Fernandez-Bustamante et al.//Pediatr. Infect. Dis. J.-1996.-Vol.l5.-P.829-831.

137. Michelow I. C. Epidemiology and clinical characteristics of community-acquired pneumonia in hospitalized children / I. C.Michelow, K. Olsen, J. Lozano et al.// Pediatrics. - 2004. -Vol. 113.-P.701-707.

138. Milla E. Bilateral optic papillitis following Mycoplasma pneumoniae pneumonia/ E. Milla, L. Zografos, B. Piguet// Ophthalmologica-1998.-Vol.212.-P.344-346.

139. Morozumi M. Simultaneous detection of pathogens in clinical samples from patients with community-acquired pneumonia by real-time PCR with pathogen-specific molecular beacon probes / M. Morozumi, E. Nakayama, S. Iwata et al.// J. Clin. Microbiol. - 2006. Vol.44.-P. 1440-1446.

140. Murdoch D.R. Nucleic acid amplification tests for the diagnosis of pneumoniae // Clin. Infect. Dis. - 2003. - V. 36. - P. 1162-1170.

141. Murdoch D.R. Diagnosis of Legionella infection/ D.R. Murdoch// Clin. Infect. Dis.-2003.-Vol.36.-P.64-69.

142. Murphy T.F. Lung infections. 2. Branhamella catarrhalis: Epidemiological and clinical aspects of a human respiratory tract pathogen/ T.F. Murphy// Thorax. -1998.-Vol.53.-P. 124-128.

143. Neumayer U. Moraxella catarrhalis endocarditis: report of a case and literature review/ U. Neumayer, H. K. Schmidt, K. P. Mellwig et al.// J. Heart Valve Dis.- 1999.-Vol. 8.-P. 114-117.

144. Nozava N. Real time PCR assay using specimens filter disks as a template for detection cytomegalovirus in urine / N. Nozava, S. Koyano, Y. Yamamoto et al.// J.Clin.Microbiol.-2007.-V.45.-№4.-P. 1305-1307.

145. Oosterheert J.J. Impact of Rapid Detection of Viral and Atypical Bacterial Pathogens by Real-Time Polymerase Chain Reaction for Patients with Lower Respiratory Tract Infection/J.J. Oosterheert, A.M. van Loon, R. Schuurman et al.//Clin. Infect Dis.-2005.-Vol.41.-№10.-P.1438-1444.

146. Pinar A. Rapid detection of bacterial atypical pneumonia agents by multiplex PCR / A. Pinar, N. Bozdemir, T. Kocagoz, R. Alacam // Cent. Eur. J. Public. Health. - 2004. - V. 12. -№1. - P. 3-5.

147. Porath A. The epidemiology of community-acquired pneumonia among hospitalized adults/ A. Porath, F. Schlaeffer, D. Lieberman// J. Infect. - 1997.-Vol.34.-P.41-48.

148. Principi N. Role Mycoplasma pneumoniae and Chlamydia pneumoniae in children with community-acquired lower respiratory tract infections/N. Principi, S. Esposito, F.Blasi et al.//Clin. Infect. Dis.-2001.-Vol.32.-P.1281-1289.

149. Pumannova M. Comparison of quantitative competitive polymerase chain reaction-enzyme-linked immunosorbent assay with LightCycler-based polymerase chain reaction for measuring cytomegalovirus DNA in patients after hematopoietic stem cell transplantation/ M.Pumannova, K.Roubalova, A.Vitek et al.//Diagn. Microbio.l Infect. Dis.-2006.-V.54.-№32.-P.l 15-120.

150. Puppe W. Evaluation of a multiplex reverse transcriptase PCR ELISA for the detection of nine respiratory tract pathogens/ W. Puppe, J.A. Weigl, G. Aron et al.// J. Clin. Virol.- 2004.- Vol. 30.- № 2.- P. 165-174.

151. Qasem J.A. Polymerase chain reaction as a sensitive and rapid method for specific detection of Mycoplasma pneumoniae in clinical samples/ J.A. Qasem, Z.U. Khan, G. Shiji et al.//Microbiol. Res.-2002.-Vol.157.-P. 77-82.

152. Raggam R. B. Single-run, parallel detection of DNA from three pneumonia-producing bacteria by real-time polymerase chain reaction/ R. B. Raggam, E. Leitner, J. Berg et al. // J. Mol. Diagn.- 2005.-Vol.7.-P.133-138.

153. Rakovskaya I.V. Application of different methods in the diagnosis of respiratory mycoplasmosis/ I.V. Rakovskaya, L.G. Gorina, N.A. Zigangirova et al. // Zh. Microbiol. Epidemiol. Immunobiol.- 2002.- №5.- P.57-62.

154. Revello M. Diagnosis and management of human cytomegalovirus infection in the mother, fetus and newborn infant / M. Revello, G.Gerna // Clin. Microbiol. Rev.-2002.-V. 10.-P. 680-715.

155. Roifman C.M. Increased susceptibility to Mycoplasma infection in patients with hypogammaglobulinemia/ C.M. Roifman, C.P. Rao, H.M. Lederman et al.// Am. J. Med.-1986.-Vol. 80.-P.590-594.

156. Saikku P. Chlamydia pneumoniae and cardiovascular diseases/ P. Saikku// Clin. Microbiol. Infect.- 1996.-Vol. l(Suppl. 1).- P.S19-S22.

157. Saikku P. Atypical respiratory pathogens/ P. Saikku//Clin. Microbiol. Infect.-1997-Vol. 3.-P.599-604.

158. Salzman M.B. Ocular manifestations of Mycoplasma pneumoniae infection/ Salzman M.B., S.K. Sood, M.L. Slavin et al.// Clin. Infect. Dis.-1992.-Vol.14.-P.l 137-1139.

159. Schneeberger P.M. Diagnosis of atypical pathogens in patients hospitalized with community-acquired respiratory infection / P.M. Schneeberger, J.W. Dorigo-Zetsma, A. van der Zee et al. // Scand. J. Infect. Dis. - 2004.- V. 36. -№4.-P. 269-273.

160. Sethi S. New strains of bacteria and exacerbations of chronic obstructive pulmonary disease / S. Sethi, N. Evans, B.J. Grant et al. // N. Engl. J. Med.-2002.-Aug 15; 347(7):465-71.

161. Shen Z. The detection and clinical features of human cytomegalovirus infection in infants/ Z. Shen, S.Q. Shang, C.C. Zou et al.//Pediatr. Pathol.-2010.-Vol. 29(6).-P. 393-400.

162. Smith L.G.. Mycoplasma pneumonia and its complications/ L.G. Smith// Infect. Dis. Clin. North. Am.-2010.- Vol. 24.-№l.-P.57-60.

163. Smith R. Neurologic manifestations of Mycoplasma pneumoniae infections: diverse spectrum of diseases. A report of six cases and review of the literature/ R. Smith, L. Eviatar// Clin. Pediatr.-2000.-Vol.39.-P. 195-201.

164. Stefanou J. Moraxella catarrhalis endocarditis: case report and review of the literature/ J. Stefanou, A. V. Agelopoulou, N. V. Sipsas et al.// Scand. J. Infect. Dis.-2000.-Vol.32.-P. 217-218.

165. Strälin K. Design of a multiplex PCR for Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, Mycoplasma pneumoniae and Chlamydophila pneumoniae to be used on sputum samples/K. Strälin, A. Bäckman, H. Holmberg et al.// APMIS.-2005. -Vol.113.- P.99-111.

166. Strälin K. Etiologic diagnosis of adult bacterial pneumonia by culture and PCR applied to respiratory tract samples/ K. Strälin, E. Törnqvist, M. S. Kaltoft et al. //J. Clin. Microbiol.-2006.- Vol.44.- P.643-645.

167. Sundelof B. Chlamydia pneumoniae in Swedish patients/B. Sundelof, J. Gnarpe, H. Gnarpe et al.//Scand. J. Infect. Dis.-1993. -Vol.25.-P.429-433.

168. Sutherland E.R. Asthma and atypical bacterial infection/ E.R. Sutherland, R.J. Martin //Chest. -2007.- Vol. 132.-№6.-P. 1962-1966.

169. Sy M.G. Community- acquired Moraxella catarrhalis pneumonia in previously healthy children/M.G. Sy, J.L.Robinson//Pediatr.Pulmonol.- 2010.-Vol.45.- №7.- P.674-678.

170. Szymanski M. Mycoplasma pneumoniae pericarditis demonstrated by polymerase chain reaction and electron microscopy/M.Szymanski, M. Petric, F.E. Saunders et al.// Clin. Infect. Dis.-2002.-Vol.34.-P.E16-E17.

171. Tan J.S. Role of 'atypical' pneumonia pathogens in respiratory tract infections/ J.S. Tan // Can. Respir. J. - 1999.- Jan-Feb; 6 Suppl A:15A-9A.

172. Templeton K.E. Comparison and evaluation of real-time PCR, real-time nucleic acid sequence-based amplification, conventional PCR, and serology for diagnosis of Mycoplasma pneumoniae / K.E. Templeton, S.A. Scheltinga, A.W. Graffelman et al. // J. Clin. Microbiol. - 2003. - V. 41. - № 9. - P. 4366-4371.

173. Theiler R.N. Umbilical cord blood screening for cytomegalovirus DNA by quantitative PCR / R.N. Theiler, A.M. Caliendo, S. Pargman // J. Clin. Virol. -2006. - Vol. 37, № 4. - P. 313-316.

174. Thibodeau K.P. Atypical pathogens and challenges in community-acquired pneumonia/ K.P. Thibodeau, A.J. Viera//Am. Fam. Physician.-2004.-Vol. 69.-P. 1700-1706.

175. Thumereile C. Role of viruses and atypical bacteria in exacerbations of asthma in hospitalized children: a prospective study in the Nord-Pas de Calais region (France)/ C. Thumerelle, A. Deschildre, C. Bouquillon et al.// Pediatr. Pulmonol. - 2003. - Vol. 35.-P. 75-82.

176. Tondella M.L. Development and evaluation of real-time PCR-based fluorescence assays for detection of Chlamydia pneumoniae / M.L. Tondella, D.F. Talkington, B.P. Holloway et al. // J. Clin. Microbiol. - 2002. - V. 40. - P. 575-583.

177. Tong C.Y. Detection of Chlamydia pneumoniae and Chlamydia psittaci in sputum samples by PCR / C.Y. Tong, M. Sillis // J. Clin. Pathol. - 1993. - V. 46. -P. 313-317.

178. Tong C.Y. Multiplex polymerase chain reaction for the simultaneous detection of Mycoplasma pneumoniae. Chlamydia pneumoniae, and Chlamydia psittaci in respiratory samples/ C.Y.W. Ton, C. Donnelly, G. Harvey et al.// J. Clin. Pathol.-1999. -Vol.52.-P.257-263.

179. Trevejo R.T. Evaluation of the polymerase chain reaction in comparison with other diagnostic methods for the detection of Chlamydia psittaci / R.T. Trevejo, B.B. Chomel, P.H. Kass // J. Vet. Diagn. Invest. - 1999. - V.l 1. - №6. - P. 491496.

180. Ursi D. Detection of Mycoplasma pneumoniae in respiratory samples by realtime PCR using an inhibition control / D. Ursi, K. Dirven, K. Loens et al. // J. Microbiol. Methods. - 2003. - V. 55. - P. 149-153.

181. Ursi D. Congenital pneumonia due to Mycoplasma pneumoniae/ D. Ursi, J.P. Ursi, M. Ieven et al.// Arch. Dis. Child. Fetal Neonatal Ed. - 1995.- Vol. 72.-P. Fl 18-F120.

182. Varon E. Impact of antimicrobial therapy on nasopharyngeal carriage of Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, and Branhamella catarrhalis in children with respiratory tract infections/ E. Varon, C. Levy, F. de la Rocque et al.//Clin. Infect. Dis. - 2000.- Vol.31.-P. 477^81.

183. Verduin C.M. Moraxella catarrhalis: from emerging to established pathogen/C.M. Verduin, C. Hol, A.H. van Dijk et al.// Clin Microbiol Rev.-2002.-Vol.l5.-№l.-P. 125-44.

184. Verminnen K. Evaluation of a Chlamydophila psittaci infection diagnostic platform for zoonotic risk assessment/ K. Verminnen, B. Duquenne, D. De Keukeleire et al.// J. Clin. Microbiol. - 2008. - Vol. 46.- P.281-285.

185. Vervloet L.A. Infection by Mycoplasma pneumoniae and its importance as an etiological agent in childhood community-acquired pneumonias/ L.A. Vervloet, C. Marguet, P.A. Camargos // Braz. J. Infect. Dis. -2007.-Vol. 11.-№5.-P.507-14.

186. Waites K. B. Mycoplasma pneumoniae and its role as a human pathogen/ K. B. Waites, D.F. Talkington// Clin. Microbiol. Rev.-2004.- Vol.174.-P. 697-728.

187. Wang Y. A multiplex PCR-based reverse line blot hybridization (mPCR/RLB) assay for detection of bacterial respiratory pathogens in children with pneumonia/Y. Wang, F. Kong, Y. Yang et al.//Pediatr. Pulmonol.- 2007.-Vol. 43.- №2.- P. 150-159.

188. Wang G.C. Cytomegalovirus Infection and the Risk of Mortality and Frailty in Older Women: A Prospective Observational Cohort Study/ G.C. Wang, W.H.L. Kao, P. Murakami, et al.// Am. J. Epidemiol.-2010,-Vol. 171.-№1 O.P.I 144-1152.

189. Wellinghausen N. Low prevalence of Chlamydia pneumoniae in adults with community-acquired pneumonia/ N. Wellinghausen, E. Straube, H. Freidank et al.//Int. J. Med. Microbiol.-2006.-Vol.296.-P.485-491.

190. Welti M. Development of a multiplex real-time quantitative PCR assay to detect Chlamydia pneumoniae, Legionella pneumophila and Mycoplasma pneumoniae in respiratory tract secretions / M. Welti, K. Jaton, M. Altwegg et al. // Diagn. Microbiol. Infect. Dis. - 2003. - V. 45. - №2. - P. 85-95.

191. Wirth T. The rise and spread of a new pathogen: Seroresistant Moraxella catarrhalis/ T. Wirth, G. Morelli, B. Kusecek et al.//Genome Res.- 2007.-Vol.17.-№11.-P. 1647-1656.

192. Wood G. M. Moraxella catarrhalis: pathogenic significance in respiratory tract infections treated by community practitioners/ G.M. Wood, B.C. Johnson, J.G. McCormack// Clin. Infect. Dis.-1996.-Vol. 22.- P. 632-636.

193. Wright S.W. Prevalence of positive serology for acute Chlamydia pneumoniae infection in emergency department patients with persistent cough/S.W.Wright, K.M. Edwards, M.D. Decker et al.//Acad. Emerg. Med.-1997.-Vol.4.-P. 179-83.

194. Wubbel L. Etiology and treatment of community-acquired pneumonia in ambulatory children/ L. Wubbel, L. Muniz, A. Ahmed et al.// Pediatr. Infect. Dis. J. -1999.-Vol.18.-P.98-104.

195. Yamagishi Y. CMV DNA detection in dried blood spots for diagnosing congenital CMV infection in Japan./ Y. Yamagishi, H.Miyagawa, K.Wada et all.//J.Med. Virol.-2006.-V.78.-№6.-P.923-925.

196. Yamazaki T. Comparison of PCR for sputum samples obtained by induced cough and serological tests for diagnosis of Mycoplasma pneumoniae infection in children/ T.Yamazaki, M. Narita, N. Sasaki et al.// Clin. Vaccin. Immunol.-2006.- Vol. 13.-P. 708-710.

197. Yaradou D.F. Integrated real-time PCR for detection and monitoring of Legionella pneumophila in water systems/D.F. Yaradou, S. Hallier-Soulier, S. Moreau et al.//Appl. Environ. Microbiol.-2007.-Vol.73.-P. 1452-1456.

198. Yerly S. Cytomegalovirus quantification in plasma by an automated real-time PCR assay./ G.Shi, L. Perrin, C. Van Delden et al.//J.Clin.Virol.-2007.-V.8.-№4.-P. 298-303.

199. Yong S. F. Legionella species and serogroups in Malaysian water cooling towers: identification by latex agglutination and PCR-DNA sequencing of

(5 rK

isolates/S.F. Yong, F. N. Goh, Y. F. Ngeow//J. Water Health - 2010.-Vol. 8.-P.92-100.

200. Yu V. L. Distribution of Legionella species and serogroups isolated by culture in patients with sporadic community-acquired legionellosis: an international collaborative survey/ V.L.Yu, M.C. Pastoris, J.E. Stout et al. // J. Infect. Dis. -2002.-Vol. 186.-P. 127-128.