Биосурфактанты актинобактерий рода Rhodococcus: индуцированный биосинтез, свойства, применение тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.00.07, доктор биологических наук Куюкина, Мария Станиславовна

• Куюкина, Мария Станиславовна
• доктор биологических наук
• 2006

Оглавление диссертации доктор биологических наук Куюкина, Мария Станиславовна

Введение Обзор литературы

Глава 1. Характеристика биосурфактантов, продуцируемых 17 микроорганизмами

1.1. Физико-химические свойства и классификация микробных 17 сурфактантов. Эволюционная конвергентность признака сурфактантной активности.

1.2. Биологические свойства алканотрофных актинобактерий и 37 способность к синтезу поверхностно-активных веществ

1.2.1. Поглощение и транспорт гидрофобных соединений в клетки 38 родококков. Участие биосурфактантов.

1.2.2. Окислительная трансформация углеводородов

1.3. Метаболические пути и механизмы регуляции биосинтеза 46 сурфактантов

1.4. Методы выделения и очистки биосурфактантов

Глава 2. Промышленный потенциал микробных сурфактантов. 65 Использование биосурфактантов в технологиях биоремедиации загрязненных экосистем

Глава 3. Возможные физиологические роли и биологическая активность микробных сурфактантов

1.1. Физиологические функции биосурфактантов

1.2. Антибиотическая активность

1.3. Некоторые аспекты воздействия биосурфактантов на высшие 91 организмы

Экспериментальная часть

Глава 4. Объекты и методы исследования

4.1. Микроорганизмы, условия их выделения и культивирования

4.2. Генетический анализ с использованием полимеразной цепной реакции

4.3. Иммобилизация клеток родококков на органические и минеральные носители

4.4. Выделение поверхностно-активных веществ (биосурфактантов)

4.5. Определение поверхностной, межфазной и эмульгирующей активности

4.6. Структурный анализ биосурфактантов

4.7. Выделение и структурная идентификация гликолипидного 113 комплекса

4.8. Изучение токсичности и биодеградабельности

4.9. Определение биологической активности

4.10. Определение нефтеотмывающей активности

4.11. Фракционный анализ нефтепродуктов

4.12. Математическое моделирование процесса нефтеотмывания

4.13. Опыты по биоремедиации нефтезагрязненной почвы

4.14. Статистическая обработка результатов исследования 124 Результаты и обсуждение

Глава 5. Распространенность признака сурфактантной 125 активности среди актинобактерий рода Rhodococcus. Характеристика поверхностно-активных свойств алканотрофных родококков

5.1. Скрининг потенциальных продуцентов биосурфактантов среди 125 природных изолятов актинобактерий

5.2. Сравнительная характеристика поверхностно-активных и 129 эмульгирующих свойств представителей разных видов родококков

Глава 6. Оптимизация процессов биосинтеза и выделения 138 сурфактантов алканотрофных родококков

6.1. Изучение динамики биосинтеза сурфактантов родококками в 138 условиях роста на углеводородсодержащих средах. Поиск эффективных индукторов процесса биосинтеза

6.2. Моделирование ферментационного процесса получения 144 биосурфактантов

6.3. Иммобилизация родококков - продуцентов бисурфактантов на 150 природные и синтетические носители

6.4. Оригинальный метод выделения Rhodococcus-сурфактантов

Глава 7. Физико-химическая характеристика Rhodococcus- 162 биосурфактантов

7.1. Поверхностная и межфазная активность очищенных

ЛЛог/ососсш'-биосурфактантов

7.2. Эмульгирующая активность /гЛо^ососсш'-биосурфактантов

7.3. Гидрофильно-липофильный баланс

7.4. Качественный состав биосурфактантных комплексов

7.5. Молекулярная структура гликолипидов GL1-GL

7.6. Устойчивость ЛАо^ососсия-биосурфактантов к физико- 189 химическим воздействиям

7.7. Оценка возможности использования Rhodococcus- 192 биосурфактантов в качестве гидрофобизаторов природных и синтетических носителей

Глава 8. Биологические свойства гликолипидных Rhodococcus- 195 биосурфактантов

8.1. Токсикологическая характеристика Rhodococcus- 196 биосурфактантов

8.2. Активность Rhodococcus-^ иосурфактантов в отношении 198 микроорганизмов

8.3. Воздействие Rhodococcus-биосур^актаятов на высшие организмы

8.3.1. Иммуномодулирующая активность

8.3.2. Противовоспалительная активность

8.3.3. Аллергенность

8.3.4. Влияние на центральную нервную систему

Глава 9. Оценка возможности использования Rhodococcus- 208 биосурфактантов для биоремедиации нефтезагрязненных почв и грунтов.

9.1. Изучение эффективности и экологической безопасности 208 применения биосурфактантов для интенсификации процессов восстановления нефтезагрязненных почв

9.2. Создание олеофильного биопрепарата на основе Rhodococcus- 223 сурфактантов

9.3. Разработка биотехнологии восстановления нефтезагрязненных 228 почв и грунтов

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Биосурфактанты актинобактерий рода Rhodococcus: индуцированный биосинтез, свойства, применение»

Актуальность проблемы. В настоящее время заметно устойчивое повышение интереса к поверхностно-активным веществам биогенного происхождения (биоПАВ, биосурфактантам) как экологически безопасным и экономически эффективным поверхностно-активным агентам многоцелевого назначения с эмульгирующей, солюбилизирующей, антиадгезивной, детергентной активностью. Это обусловлено требованиями экологической безопасности, которые предусматривают постепенное выведение из промышленных производств высокотоксичных химических препаратов (Экологическая доктрина РФ, 2002; Design for the Environment, 1998), в частности, сурфактантов - как правило, продуктов нефтеоргсинтеза. Большое внимание уделяется изучению возможности получения новых соединений на основе биологического синтеза. При этом обеспечение биобезопасности в сфере биотехнологии требует всестороннего изучения как биологических агентов, так и продуктов биосинтеза (Шевелуха, 2002; Walsh et al., 2001; Renault, 2002; Parales et al., 2006).

Биосурфактанты имеют существенные преимущества перед синтетическими сурфактантами, как то: низкая токсичность, высокая биоде-градабельность, устойчивая активность в экстремальных условиях среды, улучшенные функциональные характеристики, возможность получения на возобновляемых источниках сырья (Desai, Banat, 1997; Makkar, Cameotra, 2002). Следует отметить, что среди биосурфактантов продукты микробного синтеза наиболее перспективны в плане биотехнологического применения, поскольку для культивирования продуцентов используются относительно простые по составу минеральные среды и доступные источники углерода. При этом возможность управления ферментационным процессом биосинтеза позволяет увеличивать выход продукта без значительных материальных и энергетических затрат (Елисеев, Кучер, 1991; Kosaric, 1992). Возможность in situ продуцирования биосурфактантов микроорганизмами важна для биотехнологии защиты окружающей среды, например, в процессах ремедиации почв и вод, загрязненных органическими поллютантами и тяжелыми металлами (Christofi, Ivshina, 2002). В последние годы наряду с традиционным использованием биосурфактантов в качестве эмульгаторов и солюбилизаторов гидрофобных веществ данные соединения привлекают все большее внимание как возможные агенты биомедицины, обладающие выраженной физиологической активностью (Kitamoto et al., 2002; Cameotra, Makkar, 2004: Ryll et al., 2006).

Продуценты биосурфактантов обнаруживаются среди представителей трех доменов Bacteria, Archaea, Eucarya и выделяются из различных природных источников (почв, кернов, морской и пресной воды, донных отложений). По данным R.M. Maier (2003), биосурфактанты филогенетически отдаленных микроорганизмов функционально конвергентны, что свидетельствует об их существенной роли в жизнедеятельности продуцентов. Отсутствие генетического (структурно-регуляторного) и фенотипического (по молекулярному строению) родства биосурфактантов указывает на независимое эволюционное развитие данного признака (Bodour et al., 2003). Биосурфактанты, синтезируемые бактериями разных видов в пределах одного рода, часто несхожи в структурном и функциональном отношении (Maier et al., 2000; Nielsen et al., 2002; Kuiper et al., 2004). Все это значительно затрудняет направленный поиск новых продуцентов по их таксономической принадлежности или на основании использования молекулярно-генетических методов. Несмотря на то, что сегодня расшифрованы генетические детерминанты синтеза отдельных биосурфактантов (Sullivan, 1998), пока не созданы молекулярные маркеры для их in situ детекции. В связи с этим в настоящее время безальтернативным остается функциональный подход к поиску продуцентов биосурфактантов, который предусматривает скрининг поверхностной активности выделенных чистых культур. Сегодня появляются все новые данные о микроорганизмах, обладающих сурфактантной способностью (Турковская и др., 2001; Denger et al., 1995; Deziel et al., 1996; HauBler et al., 1998; Kim et al., 2002a; Benincasa et al., 2004; Gunther et al.,

2005). Однако до сих пор не разработан методологический подход к осуществлению направленного поиска продуцентов биосурфактантов; не определены четкие критерии оценки их функциональной активности, физико-химических и биологических свойств; не решены проблемы моделирования ферментационного процесса получения биосурфактантов с заданными свойствами; недостаточно изучены особенности физиологии продуцентов и механизмы синтеза поверхностно-активных метаболитов.

Биосурфактанты характеризуются высоким структурным разнообразием - от низкомолекулярных глико- и фосфолипидов до сложных высокомолекулярных биополимеров полисахаридной, липидной и белковой природы, что обусловливает широкий спектр их функциональных особенностей (Rosenberg, Ron, 1999). В плане практического применения интенсивно изучаются (Lang, Wullbrandt, 1999; Otto et al., 1999; Spoechner et al., 1999; Maier, Soberon-Chavez, 2000; Nunez et al., 2004) гликолипидные биосурфактанты, представляющие собой комплексы на основе моно- и дисахаров, соединенных посредством сложноэфирной связи с жирными кислотами (рамнолипиды псевдомонад, маннозилэритритол- и софоролипиды дрожжей). Известно (Draper, 1998), что клетки коринеформных и нокардиоформных актинобактерий характеризуются повышенным (30-60%) содержанием липидов, преимущественно высокомолекулярных а-разветвленных Р-гидроксилированных жирных (миколовых) кислот, которые присутствуют в свободном состоянии и входят в состав гликолипидов клеточной оболочки. Детально изучены поверхностные трегалозокориномиколаты, известные как «корд-фактор» и «лизо-корд-фактор», в 1930-х г.г. в клетках Mycobacterium tuberculosis (Noll et al., 1956). Ди- и монокориномиколаты трегалозы позднее обнаружены у других патогенных микобактерий (включая так называемых «мягких» оппортунистических патогенов группы М. avium - М. intracellular), нокардий (Nocardia asteroides) и коринебактерий (Corynebacterium diphtheriae, С. matruchotii, С. xerosis) (Margaritis et al., 1979; Cooper, Zajic, 1980; Retzinger et al., 1981; Shimakata, Minatogawa, 2000; Puech et al., 2001; Fujita et al., 2005). Выявленная сурфактантная активность данных гликолипидов свидетельствует об их практической значимости, однако явная или потенциальная патогенность штаммов-продуцентов и высокая токсичность синтезируемых гликолипидов (Watanabe et al., 1992; Sakaguchi et al., 2000) ограничивают их применение. В этой связи актуален поиск продуцентов гликолипидных сурфактантов среди представителей непатогенных актинобактерий.

Перспективным объектом при скрининге новых продуцентов биосурфактантов являются непатогенные актинобактерии рода Rhodococcus, обладающие уникальными биологическими свойствами и широкими катаболическими способностями (Ившина и др., 1987; Ившина, 1997; Van der Geize et al., 2004). Известно (Коронелли и др., 1993; Пирог и др., 2004; Goclik et al., 1990; Lang, Philp, 1998; Rapp, Gabriel-Jurgens, 2003), что отдельные представители родококков при росте на жидких углеводородах продуцируют сурфактанты гликолипидной природы. Однако подавляющее большинство работ в этом направлении посвящено изучению представителей одного вида родококков - R. erythropolis. С использованием генофонда Региональной профилированной коллекции алканотрофных микроорганизмов (акроним ИЭГМ; www.iegm.ru/iegmcol), включающего наиболее полное собрание актинобактерий известных видов Rhodococcus, выделенных из разнообразных природных субстратов контрастных эколого-географических зон (Каталог штаммов, 1994; Ivshina, 2001), представлялось возможным провести сравнительное исследование проявления сурфактантной активности в пределах данного рода, изучить зависимость выраженности данного признака от местообитания родококков, отобрать активные штаммы-продуценты биосурфактантов.

Цель настоящей работы - изучение особенностей процесса синтеза биосурфактантов актинобактериями рода Rhodococcus, поиск новых продуцентов биосурфактантов с широким спектром функциональной активности.

Для достижения указанной цели были поставлены следующие задачи:

1. Исследовать поверхностно-активные и эмульгирующие свойства представителей разных видов родококков. Отобрать штаммы-активные продуценты биосурфактантов.

2. Разработать оптимальные условия биосинтеза и эффективные способы выделения и очистки биосурфактантов.

3. Изучить структурные и функциональные особенности Rhodococcus-биосурфактантов.

4. Исследовать токсичность и биологическую активность полученных биосурфактантов.

5. Оценить возможность использования Rhodococcus-биосурфактантов для биоремедиации нефтезагрязненных почв и грунтов.

Научная новизна работы. Проведены комплексные исследования процесса биосинтеза сурфактантов актинобактериями рода Rhodococcus. Установлено, что синтез биосурфактантов клетками родококков индуцируется в присутствии углеводородного субстрата. Выявлена прямая зависимость сурфактантной активности родококков от длины углеродной цепи и степени гидрофобности углеводородов в ряду Сю—*►С]б- Разработан научно-методологический подход к оптимизации процесса биосинтеза сурфактантов, основанный на использовании избыточной по фосфору и лимитированной по азоту минеральной среды с w-гексадеканом либо н-додеканом в качестве источника углерода и пониженной (24°С) температуры культивирования продуцентов. Обоснована возможность интенсификации процесса биосинтеза сурфактантов с использованием клеток родококков, иммобилизованных на природных и синтетических носителях. Предложен оригинальный метод выделения биосурфактантов, предусматривающий использование метил-трет-бутилового эфира и ультразвуковой обработки (23 кГц, 10 мин) экстрагируемого материала.

Впервые показано, что представители R. ruber синтезируют биосурфактанты гликолипидной природы, в составе которых наряду с трегалозодимиколатом (С40), обнаруживаются диацилтрегалоза (С 15.17) и моноацилтрегалоза (С]2-1б)- Доминирующим компонентом гликолипидного комплекса является моноацилтрегалоза, содержащая смесь насыщенных и моноеновых ацильных остатков и характеризующаяся более выраженной полярностью по сравнению с таковой трегалозомономиколатов, выделенных ранее из коринебактерий, микобактерий и представителей R. erythropolis. В результате детального изучения термодинамических параметров гликолипидных комплексов из клеток R. ruber получены новые данные о выраженной гидрофобной природе /?/го</ососсмя-биосурфактантов, их высокой адсорбционной и эмульгирующей активности, компактности пространственной структуры сурфактантных молекул в сорбционном слое и монодисперсности образуемых ими мицелл. Данные характеристики сопоставимы с таковыми известных синтетических сурфактантов гликолипидной природы. При изучении биологически активных свойств Rhodococcus-биосурфактантов выявлено их лио-, термо- и ксеропротекторное действие в отношении бактериальных клеток. Установлено, что Rhodococcus-биосурфактанты обладают выраженной иммуномодулирующей и противовоспалительной активностью.

Теоретическое и практическое значение работы. Полученные данные расширяют представление о физиологической роли биосурфактантов и механизмах процесса их биосинтеза актинобактериями рода Rhodococcus. Разработан научно-методологический подход к осуществлению направленного поиска продуцентов биосурфактантов и получения поверхностно-активных соединений с широким спектром функциональной активности. Установлена экологическая приуроченность родококков с высокой сурфактантной активностью к нефтезагрязненным местообитаниям, обоснована целесообразность проведения направленного поиска продуцентов биосурфактантов в местах углеводородных скоплений.

Отобраны штаммы родококков - активные продуценты, оптимизированы условия их культивирования, обеспечивающие высокий выход биосурфактантов. Обоснована целесообразность использования Rhodococcus-биосурфактанта в качестве лиопротектора при долговременном хранении культур актинобактерий. По данным исследования влияния Rhodococcus-биосурфактантов на процессы десорбции и мобилизации нефтепродуктов в модельной почве разработана математическая модель фильтрации гидрофобных веществ в пористой среде под воздействием сурфактантов. На основе Rhodococcus-б иосурфактантов разработан, апробирован и запатентован (Патент РФ № 2180276) эффективный биопрепарат нового состава и новой (олеофильной) формы, пригодный для очистки нефтезагрязненных грунтов в регионах с холодными климатическими условиями, а также способ биоремедиации почв и грунтов, загрязненных нефтью и нефтепродуктами (Патент РФ № 2193464), прошедший апробацию на территории Пермского края и Удмуртской Республики. Разработан Регламент применения технологии биоремедиации нефтезагрязненных почв и грунтов с использованием олеофильного биопрепарата, согласованный с ФГУ «Центр государственного санитарно-эпидемиологического надзора Пермской области» и главным управлением природных ресурсов и охраны окружающей среды МПР России по Пермскому краю. Результаты диссертационной работы используются в лекционных и практических курсах для магистрантов Пермского государственного университета.

Основные положения, выносимые на защиту

1. Актинобактерии рода Rhodococcus синтезируют биосурфактанты гликолипидной природы при росте на жидких углеводородах. Биосурфактанты, продуцируемые представителями R. ruber, содержат трегалозодимиколат, диацилтрегалозу и моноацилтрегалозу доминирующий компонент, характеризующийся более выраженной полярностью по сравнению с таковой трегалозомономиколатов, выделенных из коринебактерий, микобактерий и представителей R. erythropolis.

2. Биосурфактанты, синтезируемые клетками R. ruber, обладают выраженными поверхностными и межфазными свойствами, эмульгирующей и нефтеотмывающей способностью, низкой токсичностью и высокой биологической активностью.

3. Применение Rhodococcus-биосурфжтатов способствует повышению биодоступности нефтяных углеводородов для почвенных микроорганизмов вследствие их десорбции и мобилизации в почвенной среде и обеспечивает эффективное восстановление нефтезагрязненных почв и грунтов.

Связь работы с крупными программами. Работа проводилась в течение 1993-2006 гг. в соответствии с планом НИР ИЭГМ УрО РАН (номер госрегистрации темы НИР 01980 004406), а также в рамках ГНТП РФ «Средства обеспечения исследований по физико-химической биологии и биотехнологии»; ГНТП РФ «Биотехнология защиты окружающей среды»; Региональной комплексной научно-технической программы «УРАЛ»; инициативных совместных научных проектов с Напиер университетом (Эдинбург, Великобритания) при поддержке Королевского научного общества Великобритании (The Royal Society, UK) и Международной программы НАТО (NATO Science Programme and Cooperation Partners); Государственного контракта на выполнение НИР по заказу Минпромнауки РФ в рамках приоритетного направления научно-технического прогресса «Новые направления биотехнологии и обеспечение биобезопасности»; совместного проекта с Исследовательским центром оценки и ремедиации загрязненных земель (Contaminated Land Assessment and Remediation Research Centre - CLARRC), Эдинбургский университет, Великобритания, поддерживаемого Научной программой компании "Ford Motors" в области защиты окружающей среды (Conservation and Environmental Grants); Программы фундаментальных исследований Президиума РАН «Молекулярная и клеточная биология»; Целевой программы Президиума УрО РАН поддержки междисциплинарных проектов, выполняемых в содружестве с учеными СО

РАН; международного научного проекта, поддерживаемого грантом ИНТАС 01-2151; проекта РФФИ № 04-04-97518-рофи.

Апробация работы. Материалы диссертации доложены и обсуждены на II-IV Международных конференциях «Проблемы загрязнения окружающей среды», Москва-Пермь, 1993; Санкт-Петербург, 1995; Москва, 1998; Волгоград-Пермь, 2001; Пермь-Казань, 2005; II и IV Международных симпозиумах по микробиологии подземных экосистем, Бат, 1993; Ваил, 1999; Международной конференции памяти акад. А.А. Баева, Москва, 1996; Международной конференции «Экологически чистые технологические процессы в решении проблем охраны окружающей среды», Иркутск, 1996; I и II Международных конференциях «Микробное разнообразие: состояние, стратегия сохранения, экологические проблемы», Пермь, 1996; Пермь-Казань, 2005; Международной конференции «Загрязненные земли и грунтовые воды - новые направления», Портсмут, 1996; Международном конгрессе по нефтяному загрязнению почвы, Лондон, 2001; Международной конференции ISC-UNIDO «Новые технологии для очистки нефтезагрязненных вод, почв, переработки и утилизации нефтешламов», Москва, 2001; Международной конференции «Микробиология и биотехнология XXI столетия», Минск, 2002; XII Международном симпозиуме по биоповреждениям и биодеградации, Прага, 2002; Межрегиональном совещании «Проблемы биоремедиации в XXI веке», Красноярск, 2002; Конгрессе Европейских микробиологов FEMS, Любляна, 2003; Мадрид, 2006; II Европейской конференции по биоремедиации, Ханья, 2003; Международной конференции «Современное состояние и перспективы развития микробиологии и биотехнологии», Минск, 2004; Всероссийском симпозиуме «Биотехнология микробов», Москва, 2004; X Международном симпозиуме по микробной экологии, Канкун, 2004; III Международном конгрессе «Биотехнология: состояние и перспективы развития», Москва, 2005; VIII Всероссийской конференции по биомеханике, Н. Новгород, 2006.

Публикации. Материалы диссертационной работы обобщены в 48 печатных работах, в том числе 22 экспериментальных статьях, 2 обзорах, 21 материале конференций и 3 патентах на изобретение РФ.

Объем и структура работы. Работа изложена на 295 страницах, содержит 37 таблиц, 42 рисунка и состоит из введения, литературного обзора, описания объектов и методов исследования, 5 глав результатов собственных исследований, заключения, выводов, списка цитируемой литературы, включающего 478 наименований, в том числе 64 на русском и 414 на английском языках.

Место проведения работы. Работа является частью исследований, выполняемых в лаборатории алканотрофных микроорганизмов ИЭГМ УрО РАН (зав. лабораторией - чл.-корр. РАН, д.б.н., профессор И.Б. Ившина) по изучению, сохранению и использованию биоразнообразия углеводород-окисляющих актинобактерий природных биоценозов. Фрагменты работы, связанные с практическим использованием полученных биосурфактантов в коллекционном деле и биотехнологии защиты окружающей среды, выполнены при участии сотрудников лаборатории, к.б.н., с.н.с. Т.Н. Каменских, к.х.н., с.н.с. В.В. Гришко, вед. технолога М.И. Рычковой и магистрантов кафедры микробиологии и иммунологии Пермского государственного университета JI.B. Костиной, А.В. Криворучко, А.Ю. Гаврина. Изучение процесса биосинтеза сурфактантов в условиях хемостата, а также токсикологические исследования проведены соискателем на базе Напиер университета (Эдинбург, Великобритания) при участии профессора N. Christofi, д-ра J.C. Philp и S.A. Dunbar. Исследования по биоремедиации нефтезагрязненных почв и грунтов выполнены в сотрудничестве с лабораторией охраны окружающей среды ООО «ПермНИПИнефть» (зав. лабораторией - к.г.-м.н. С.М. Костарев), Удмуртским государственным научно-исследовательским институтом сельского хозяйства (зам. директора по научной работе - к.с.-х.н. А.В. Леднев) и Исследовательским центром оценки и ремедиации загрязненных земель (CLARRC) при Эдинбургском университете, Великобритания директор - д-р C.J. Cunningham). Определение молекулярной структуры гликолипидного компонента биосурфактанта с помощью ЯМР-спектро-скопии и ионной масс-спектрометрии высокого разрешения проведено на базе Германского исследовательского центра биотехнологии (Брауншвейг) под руководством профессора S. Lang и д-ра V. Wray. Изучение экотоксично-сти биосурфактантов выполнено совместно с сотрудниками лаборатории водной токсикологии НИИ биологии Иркутского государственного университета (зав. лабораторией - д.б.н., профессор Д.И. Стом). Проверка биологической и иммуномодулирующей активности биосурфактантных препаратов проведена на кафедре фармакологии с курсом клинической фармакологии и иммунологии Пермской государственной фармацевтической академии (зав. кафедрой, д.м.н., профессор В.В. Юшков). При разработке модели фильтрации нефти в почве под действием биосурфактантов использовано программное обеспечение, предоставленное кафедрой теоретической механики Пермского государственного технического университета (зав. кафедрой - д.т.н., профессор Ю.И. Няшин). Хромато-масс-спектро-метрическое определение структуры нефтяного загрязнения в процессе биоремедиации почвы выполнено на базе аналитической лаборатории ИЭГМ УрО РАН (зав. лабораторией - к.г.-м.н. М.А. Шишкин). Эксперименты по использованию биосурфактантов в качестве гидрофобизаторов при разработке носителей для иммобилизации клеток углеводородокисляющих бактерий проведены совместно с сотрудниками лаборатории криохимии (биополимеров Института элементоорганических соединений им. А.Н. Несмеянова РАН, Москва (зав. лабораторией - д.х.н., профессор В.И. Лозинский).

Автор выражает искреннюю благодарность всем участникам работы, чей вклад адекватно отражен в совместных публикациях. Глубокую благодарность и признательность автор выражает своему Учителю чл.-корр. РАН, профессору Ирине Борисовне Ившиной, инициатору исследований биологии алканотрофных родококков, частью которых является настоящая работа.

ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

Заключение диссертации по теме «Микробиология», Куюкина, Мария Станиславовна

242 ВЫВОДЫ

1. Изучены поверхностно-активные и эмульгирующие свойства актинобактерий рода Rhodococcus. Установлена экологическая приуроченность родококков с высокой сурфактантной активностью к нефтезагрязненным местообитаниям, обоснована целесообразность проведения направленного поиска активных продуцентов биосурфактантов в местах углеводородных скоплений. Выделены и охарактеризованы штаммы родококков - активные продуценты биосурфактантов.

2. Подобраны оптимальные условия синтеза биосурфактантов, предусматривающие использование избыточной по фосфору и лимитированной по азоту минеральной среды с я-гексадеканом либо н-додеканом, пониженной (24°С) температуры культивирования, а также иммобилизацию клеток родококков на природных (гидрофобизованный древесный опил) и синтетических (криогель поливинилового спирта) носителях. Разработан эффективный способ выделения Rhodococcus-биосурфактантов, предусматривающий использование метип-трет-бутилового эфира в качестве экстрагента и ультразвуковую обработку экстрагируемого материала.

3. Выявлено, что представители R. ruber синтезируют гликолипидный комплекс, содержащий трегалозодимиколат (С40), диацилтрегалозу (С13.15) и моноацилтрегалозу (Сю-м) - доминирующий компонент, характеризующийся более выраженной полярностью по сравнению с таковой трегалозомономиколатов, выделенных из коринебактерий, микобактерий и представителей R. erythropolis.

4. Показано, что биосурфактанты, синтезируемые представителями R. ruber, характеризуются низкой токсичностью, выраженными поверхностными и межфазными свойствами, эмульгирующей и нефтеотмывающей способностью, а также высокой биологической (ксеро-, термопротекторной, иммуномодулнрующей, противовоспалительной) активностью.

5. На основе полученных Л/гог/ососсмя-биосурфактантов разработана экологически безопасная технология биоремедиации нефтезагрязненных почв и грунтов, пригодная для использования в условиях умеренного и холодного климата.

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

В результате проведенных исследований установлено, что характерной особенностью актинобактерий рода Rhodococcus, растущих в присутствии жидких углеводородов, является сурфактантная активность, то есть способность снижать поверхностное натяжение среды культивирования до значений < 30 мН/м. Данная активность родококков обусловлена синтезом биосурфактантов гликолипидной природы, содержащих трегалозу в качестве гидрофильной части молекулы и варьирующих по структуре видоспеци-фических жирноацильных компонентов. Исследование поверхностно-активных свойств большого массива представителей известных видов Rhodococcus, выделенных из разнообразных природных и техногенных источников и поддерживаемых в Региональной профилированной коллекции алканотрофных микроорганизмов ИЭГМ, выявило отсутствие у родококков видовой и наличие экологически обусловленной специфичности в проявлении сурфактантной активности. Показано, что районы природных и антропогенных углеводородных скоплений могут служить источником новых штаммов актинобактерий - активных продуцентов биосурфактантов.

Установление рост-зависимой динамики синтеза биосурфактантов клетками родококков, а также стимулирующего влияния на данный процесс избыточного содержания фосфатов в среде, азотного лимитирования, снижения температуры культивирования и иммобилизации клеток на органические носители позволило оптимизировать условия культивирования штаммов-продуцентов с целью повышения выхода биосурфактантов. Эффективное выделение клеточно-связанных биосурфактантов обеспечило использование метил-трет-бутилового эфира в качестве экстрагента и ультразвуковой обработки экстрагируемого материала. В процессе детального изучения выделенных Д/шг/ососсия-биосурфактантов получены новые данные о термодинамических свойствах, определяющих их функциональные характеристики (поверхностную, межфазную, эмульгирующую, гидрофобизующую активность) и возможные области применения.

Полученные нами и другими исследователями сведения о многообразии физиологических функций биосурфактантов - от участия в процессе потребления жидких углеводородов до формирования устойчивости бактериальных клеток к неблагоприятным воздействиям окружающей среды - свидетельствуют об их существенной роли в жизнедеятельности микроорганизмов-продуцентов. Следует отметить, что выявленные биологически активные свойства /г/го^/ососсия-биосурфактантов, в частности термо- и ксеропротекторное действие, требуют дальнейшего углубленного исследования. Необходимы новые подходы для расшифровки механизмов физиологической активности биосурфактантов, базирующиеся на молекулярно-генетических технологиях. Эти фундаментальные исследования станут возможными только после создания генетически маркированных мутантных штаммов родококков, не способных к синтезу биосурфактантов, сравнение которых с родительским фенотипом поможет пролить свет на участие поверхностно-активных метаболитов в физиологических процессах и экологическом поведении бактерий-продуцентов. В дальнейшей разработке нуждается выявленный факт, что /?/гой?ососс«5-биосурфактанты обладают иммуномодулирующей и противовоспалительной активностью.

Основными итогами проведенных исследований являются доказательство многообразия проявления сурфактантной активности у актинобактерий рода Rhodococcus и создание практически-ориентированного подхода к получению на основе непатогенных штаммов бактерий эффективных биосурфактантов с широким спектром функциональных возможностей. Обозначены перспективные области возможного применения Rhodococcus-биосур^жтттов в качестве биопротекторов и биостимуляторов, эмульгирующих и гидрофобизующих агентов при создании перспективных биотехнологий, а также нефтеотмывающих препаратов, пригодных для биоремедиации окружающей среды [17, 20, 23, 27,37].

Список литературы диссертационного исследования доктор биологических наук Куюкина, Мария Станиславовна, 2006 год

1. Абрамзон А. А. Поверхностно-активные вещества. Синтез, анализ, свойства, применение / А. А. Абрамзон, Л. П. Зайченко, С. И. Файнгольд. Л.: Химия, 1988. - 200 с.

2. Аристархова В. И. Нокардиоподобные микроорганизмы / В. И. Аристархова. М.: Наука, 1989. - 248 с.

3. Балаян А. Э. Способ биотестирования нефтепродуктов / А. Э Балаян, Д И. Стом, М. Н. Саксонов // Патент на изобретение РФ № 2152612. Зарегистр. в Госреестре изобретений 10.07.2000.

4. Батраков С. Г. Липиды микобактерий. III. Мономиколат трегалозы из Mycobacterium paraffinicum / С. Г. Батраков, О.А. Мухитдинова, Т. В. Коронелли, Л. Д. Бергельсон // Биоорган, химия. 1979. - Т. 5. № 1.-С. 83-91.

5. Боголюбов А. Н. Задачи по математической физике / А. Н. Боголюбов, В. В. Кравцов . М.: Изд-во МГУ, 1998.

6. Веслополова Е. М. Микрометод определения численности колониеобразующих микроорганизмов / Е. М. Веслополова //Микробиология. 1995. Т. 64. № 2. - С. 279-284.

7. Ю.Волков В. Я. К вопросу о физиологических и физико-химических механизмах устойчивости микроорганизмов к замораживанию и высушиванию / В. Я. Волков // Микробиология. 1994. - Т. 63. № 1.-С. 5-16.

8. И.Голубев В. И. Pseudozyma fusiformata ВКМ Y-2821 продуцент антифунгального гликолипида / В. И. Голубев, Т. В. Кулаковская, Е. В. Голубева // Микробиология. - 2001. - Т. 70. № 5. С. 642646.

9. Гринберг Т. А. Биополимеры, используемые для увеличения нефтеотдачи пластов / Т. А. Гринберг, Т. П. Пирог, А. М. Полищук, Н. В. Краснопевцева // Микробиол. журн. 1990. - Т. 52. №2.-С. 100-112.

10. Дымшиц В. А. Двухфазное культивирование Streptomyces levoris. Выбор органической фазы и ее влияние на жизнедеятельность культуры / В. А. Дымшиц, В. Г. Гильманова, В. JI. Древецкая, И. М. Печерский //Биотехнология. 1994. - № 5. - С. 20-22.

11. Егоров Н. С. Биосинтез биологически активных веществ иммобилизованными клетками микроорганизмов / Н. С. Егоров, Н. С. Ландау, Е. А. Борман, И. Б. Котова //Прикл. биохим. микробиол. 1984. - Т. 20. Вып. 5. - С. 579-592.

12. Елисеев С. А. Нефтеотмывающий биоэмульгатор, образуемый Bacillus species! С. А. Елисеев, Р. И. Вильданова-Марцишин, А. Н. Шульга, 3. В. Шабо, А. А. Туровский // Микробиол. журн. 1991. -Т. 53, № 6. - С.61-66.

13. Елисеев С. А. Поверхностно-активные вещества и биотехнология / С. А. Елисеев, Р. В. Кучер. Киев: Наук, думка, 1991. - 116 с.

14. Ившина И. Б. Бактерии рода Rhodococcus (иммунодиагностика, детекция, биоразнообразие)/Дис. .докт. биол. наук. / И. Б. Ившина. Пермь, 1997. - 197 с.

15. Ившина И. Б. Фенотипическая характеристика алканотрофных родококков из различных экосистем / И. Б. Ившина, М. В. Бердичевская, Л. В. Зверева, J1. В. Рыбалка, Е. А. Еловикова //Микробиология. 1995. - Т. 64. № 4. - С. 507-513.

16. Ившина И. Б. Селективное выделение пропанокисляющих родококков с использованием антибиотических веществ / И. Б. Ившина, М. С. Куюкина //Микробиология. 1997. - Т. 66. № 4. -С. 494-500.

17. Ившина И. Б. Бактерии рода Rhodococcus грунтовых вод района нефтяных месторождений Пермского Предуралья / И. Б. Ившина, А. А. Оборин, О. А. Нестеренко, С. А. Касумова //Микробиология.- 1981.-Т. 50. Вып. 4.-С. 709-717.

18. Ившина И. Б. Пропанокисляющие родококки / И. Б. Ившина, Р. А. Пшеничнов, А. А. Оборин Свердловск: УНЦ АН СССР, 1987.- 125 с.

19. Каплин В. Н. Нетрадиционная иммунология инфекций / В. Н. Каплин Пермь: Изд-во Пермской гос. мед. академии, 1996. - 163 с.

20. Каталог штаммов Региональной профилированной коллекции алканотрофных микроорганизмов / Под ред. И.Б. Ившиной. М.: Наука, 1994.- 163 с.

21. Квасников Е. И. Микроорганизмы деструкторы нефти в водных бассейнах / Е. И. Квасников, Т. М. Клюшникова - Киев: Наук, думка, 1981.-131 с.

22. Кислухина О. В. Определение способности микроорганизмов диспергировать нефтепродукты / О. В. Кислухина, О. Ж. Хамроев, Г. Н. Морщакова, М. Б. Биттеева // Экология. 1993. - № 3. -С. 81-84.

23. Козляк Е. И. Физико-химические основы иммобилизации клеток методом сорбции (обзор) / Е. И. Козляк, М. М. Якимов, И. Б. Уткин, И. С. Рогожин, 3. Г. Соломон, А. М. Безбородое //Прикл. биохим. микробиол. 1991. - Т. 27. Вып. 6. - С. 788-803.

24. Коллинз Р. Течения жидкостей через пористые материалы / Р. Коллинз. М.: Мир, 1964.

25. Кондрашенко В. М. Препарат для очистки воды и почвы от нефти и нефтепродуктов / В. М. Кондратенко, В. П. Холоденко, И. А. Дунайцев, 3. М. Ермоленко, В. А. Чугунов, И. И. Мартовецкая, Р. И. Миронова, Н. А. Жиркова // Патент РФ № 2191753 от 27.10.2002.

26. Коронелли Т. В. Проникновение углеводородов в клетки микроорганизмов / Т. В. Коронелли // Успехи микробиол. 1980.- № 15.-С. 99-111.

27. Коронелли Т. В. Липиды микобактерий и родственных микроорганизмов / Т. В. Коронелли. М.: МГУ, 1984. - 158 с.

28. Коронелли Т. В. Принципы и методы интенсификации биологического разрушения углеводородов в окружающей среде / Т. В. Коронелли // Прикл. биохим. микробиол. 1996. - Т. 32. № 6. -С. 579-585.

29. Коронелли Т. В. Видовая структура углеводородокисляющих бактериоценозов водных экосистем разных климатических зон / Т. В. Коронелли, С. Г. Дермичева, В. В. Ильинский, Т. И. Комарова, О. В. Поршнева // Микробиология. 1994. - Т. 63, вып. 5. - С. 917922.

30. Коронели Т. В. Интродукция бактерий рода Rhodococcus в тундровую почву, загрязненную нефтью / Т. В. Коронели, Т. И. Комарова, В. В. Ильинский, Ю. И. Кузьмин, Н. Б. Кирсанов, А. С. Яненко // Прикл. биохим. микробиол. 1997. - Т. 33, № 2. - С. 198201.

31. Коронелли Т. В. Полярные липиды углеводородокисляющих бактерий / Т. В. Коронелли, Т. И. Комарова, С. Г. Юферова, В. В. Ильинский, О. Б. Чивкунова, Б. В. Розынов // Микробиология. -1993. Т. 62, Вып. 2. - С. 231-236.

32. Коронелли Т. В. Поверхностно-активные свойства некоторых штаммов углеводородокисляющих бактерий / Т. В. Коронелли, С. Г. Юферова // Вестн. Моск. ун-та. Серия 16. Биология. 1990. № 1.- С.14-18.

33. Кошелев А. В. Ускоренный тест прогнозирования выживаемости лиофилизированных культур метанотрофных бактерий / А. В. Кошелев, А. И. Нестеров // Микробиология. 1987. - Т. 56. Вып. З.-С. 492-496.

34. Куюкина М. С. Влияние состава клеточных липидов на формирование неспецифической антибиотикорезистентности алканотрофных родококков/ М. С. Куюкина, И. Б. Ившина, М. И. Рычкова, О. Б. Чумаков / Микробиология. 2000. - Т. 69. № 1. - С. 62-69.

35. Лакин Г. Ф. Биометрия / Г. Ф. Лакин. М.: Высш. шк., 1990. - 352с.

36. Ланге К. Поверхностно-активные вещества: синтез, свойства, анализ, применение / К. Ланге. М.: Высш. школа, 2004. - 240 с.

37. Ландау Л. Д. Гидродинамика / Л. Д. Ландау, Е. М. Лифшиц. М.: Наука, 1988.

38. Лесин В. В. Основы методов оптимизации / В. В. Лесин, Ю. П. Лисовец. М.: Изд-во МАИ, 1995.-341 с.

39. Линник Ю. В. Метод наименьших квадратов и основы математико-статистической теории обработки наблюдений / Ю. В. Линник. М.: Физматгиз, 1962.

40. Методические рекомендации по оценке аллергенных свойств фармакологических средств. М.: МЗ СССР, Фарм. комитет, 1988. -37 с.

41. Методические рекомендации по оценке иммунотоксических свойств фармакологических средств. М.: МЗ СССР, Фарм. комитет, 1999. 39 с.

42. Методическое руководство по биотестированию воды. РД 118-0290. М., 1991.-48 с.

43. Методы общей бактериологии. М.: Мир, 1983. - Т.1, 2.

44. Назина Т. Н. Образование нефтевытесняющих соединений микроорганизмами из нефтяного месторождения Дацин (КНР) / Т. Н. Назина, Д. Ш. Соколова, А. А. Григорьян, Я.-Ф. Сюэ, С. С. Беляев, М. В. Иванов // Микробиология. 2003. - Т. 72. № 2. - С. 206-211.

45. Нестеренко О. А. Нокардиоподобные и коринеподобные бактерии / О. А. Нестеренко, Е. И. Квасников, Т. М. Ногина. Киев: Наук, думка, 1985. - 336 с.

46. Нестеренко О. А. Ассимиляция углеводородов микроорганизмами рода Nocardia и группы «rhodochrous» / О. А.Нестеренко, С. А. Касумова, Е. И. Квасников // Микробиол. журн. 1979. - Т. 41. № 2.-С. 110-114.

47. Позмогова И. Н. Возможные пути окисления жидких н-алканов микроорганизмами / И. Н. Позмогова //Успехи микробиол. 1968. -Вып. 5. - С. 62-89.

48. Полубаринова-Кочина Т. П. Теория движения грунтовых вод / Т.П. Полубаринова-Кочина. М.: Высшая шк. - 1977.

49. Синицын А. П. Иммобилизованные клетки микроорганизмов / А. П. Синицын, Е. И. Райнина, В. И. Лозинский, С. Д. Спасов. М.: Изд-во МГУ, 1994. 288 с.

50. Скрябин Г. К. Использование микроорганизмов в органическом синтезе / Г. К. Скрябин, Л. А. Головлева. М.: Наука, 1976. - 336 с.

51. Стабникова Е. В. Применение биопрепарата "Лестан" для очистки почвы от углеводородов нефти / Е. В. Стабникова, М. В. Селезнева, А. Н. Дульгеров, В. Н. Иванов // Прикл. биохим. микробиол. 1996. - Т. 32. № 2. - С. 219-223.

52. Старостина Н. Г. О прогнозировании устойчивости микроорганизмов к процессу иммобилизации в полиакриламидном геле / Н. Г. Старостина, К. А. Луста, Б. А. Фихте // Прикл. биохим. микробиол. 1983. - Т. 19. № 3. - С. 369-371.

53. Тихонов А. Н. Уравнения математической физики / А. Н. Тихонов, А. А. Самарский. М.: Изд-во МГУ, 1999

54. Томашевський В. Ф. Изучение гидрофильно-липофильного баланса ряда поверхностно-активных веществ / В. Ф. Томашевський, М. X. Глузман, С. С. Ляшенко, Р. Г. Заславська // Фармацевтичний журнал. -1971. Т. 26. № 6. - С. 33-37.

55. Турковская О. В. Штамм Pseudomonas aeruginosa продуцент биоПАВ / О. В. Турковская, Т. В. Дмитриева, А. Ю. Муратова // Прикл. биохим. микробиол. -2001. - Т. 37. № 1. - С. 80-85.

56. Шевелуха В. С. Биотехнология и биобезопасность/ В. С. Шевелуха // Сельскохозяйственная биология. 2002. - № 3. - С. 3-15.

57. Экологическая доктрина Российской федерации. 2002.

58. Экспериментальное изучение иммунотропной активности фармакологических препаратов. (Методические рекомендации одобрены ФГК МЗ России в 1998 г.) // Ведомости фармакологического комитета. 1999. - № 1. - С. 31-36.

59. Abbanat D.R. Sulphonolipids are molecular determinants of gliding motility / D. R. Abbanat, E. R. Leadbetter, W. Godchaux III, A. Escher // Nature. 1986. - V. 24. - P. 367-369.

60. Adamczak M. Influence of medium composition and aeration on the synthesis of biosurfactants produced by Candida antarctica / M. Adamczak, W. Bednarski // Biotechnol. Lett. 2000. - V. 22. - P. 313316.

61. Adeyeye С. M. Effect of non-ionic surfactant concentration and type on the formation and stability of W/O/W multiple emulsions: Microscopic and conductometric evaluations/ С. M. Adeyeye, J. C. Price // Drug Dev. Ind. Pharm. 1991. - V. 17. - P. 725-736.

62. Aislabie J.M. Hydrocarbon spills on Antarctic soils: effects and management / J. M. Aislabie, M. R. Balks, J. M. Foght, E. J. Waterhouse // Env. Sci. Technol. 2004. - V. 38. - P. 1265-1274.

63. Alon R. N. Esterase from the oil-degrading Acinetobacter Iwoffii RAG-1: sequence analysis and over-expression in Escherichia coli / R. N. Alon, D. L. Gutnick // FEMS Microbiol. Lett. 1993. - V. 112. - P. 275-280.

64. Alvarez H. M. Identification of phenyldecanoic acid as a constituent of triacylglycerols and wax ester produced by Rhodococcus opacus PD630

65. Н. М. Alvarez, Н. Luftmann, R. A. Silva, А. С. Cesari, A. Viale, М. Waltermann, A. Steinbuchel // Microbiology. 2002. - V. 148. - P. 1407-1412.

66. Arino S. Production of new extracellular glycolipids by a strain of Cellulomonas cellulans (Oerskovia xanthineolytica) and their structural characterization / S. Arino, R. Marchal, J.-P. Vandecasteele // Can. J. Microbiol. 1998. - V. 44. - P. 238-243.

67. Arino S. Identification and production of a rhamnolipid biosurfactant by a Pseudomonas species / S. Arino, R. Marchal, J.-P. Vandecasteele // Appl. Microbiol. Biotechnol. 1996. - V. 45. - P. 162-168.

68. Askolin S. Overproduction, purification, and characterization of the Trichoderma reesei hydrophobin HFBI / S. Askolin, T. Nakari-Setala, M. Tenkanen // Appl. Microbiol.Biotechnol. 2001. - V. 57. - P. 124130.

69. Atlas R. M. Response of microbial populations to environmental disturbance / R. M. Atlas, H. A. Horowitz, M. Krichevsky, A. K. Bej // Microb. Ecol. -1991. V. 22. - P. 249-256.

70. Auger R. L. Effect of nonionic surfactant on bacterial metabolism of naphthalene: assessment of toxicity and overflow metabolism potential / R. L. Auger, A. M. Jacobson, M. M. Domach // J. Hazard. Mater. -1995.-V. 43.-P. 263-272.

71. Azad A. K. Gene knockout reveals a novel gene cluster for the synthesis of a class of cell wall lipids unique to pathogenic mycobacteria / A. K. Azad, T. D. Sirakova, N. D. Fernandes, P. E. Kolattukudy// J. Biol. Chem. 1997.-V. 272.-P. 16741-16745.

72. Azuma I. Development of immunoadjuvants or immunotherapy of cancer /1. Azuma, T. Seya // Int. Immunopharmacol. 2001. - V. 1. -P. 1249-1259.

73. Bacterial Nomenclature Up-to-Date http://www.dsmz.de/-microorganisms.

74. Bai G. Influence of rhamnolipid biosurfactant on the transport of bacteria through a sandy soil / G. Bai, M. L. Brusseau, R. M. Miller // Appl. Environ. Microbiol. 1997. - V. 63. - P. 1866-1873.

75. Balks M. R. Effects of hydrocarbon spills on the temperature and moisture regimes of cryosols on the Ross Sea region / M. R. Balks, R. F. Paetzold, J. M. Kimble, J. Aislabie, I. В Campbell. // Antarctic Sci. -2002.-V. 14.-P. 319-326.

76. Banat I. M. Biosurfactant production and possible uses in microbial enhanced oil recovery and oil pollution remediation: a review /1. M. Banat // Bores. Technol. 1995. - V. 51. - P. 1 -12.

77. Banat I. M. Potential commercial application of microbial surfactants / I. M. Banat, R. S. Makkar, S. S. Cameotra // Appl. Microbiol. Biotechnol. 2000. - V. 53. - P. 495-508.

78. Banat I. M. Biosurfactant production and use in oil tank clean-up /1. M. Banat, N. Samarah, M. Murad, R. Home, S Benerjee // World J. Microbiol. Biotechnol. 1991. - V. 7. - P. 80-84.

79. Barkay T. Enhanced solubilization and biodegradation of polyaromatic hydrocarbons by the bioemulsifier alasan / T. Barkay, S. Navon-Venezia, E. Ron, E. Rosenberg // Appl. Environ. Microbiol. 1999. -V. 65.-P. 2697-2702.

80. Bartha R. Biotechnology of petroleum pollutant biodegradation / R. Bartha // Microb. Ecol. 1986. - V. 12. - P. 155-172.

81. Beal R. Role of rhamnolipid biosurfactants in the uptake and mineralization of hexadecane in Pseudomonas aeruginosa / R .Beal, W. B. Betts //J. Appl. Microbiol. 2000. - V. 89. - P. 158-168.

82. Beebe J. L. Extracellular lipid of Thiobacillus thiooxidans / J. L. Beebe, W. W. Umbreit. //J. Bacterid. 1971. - V. 108. - P. 612-614.

83. Bekierkunst A. Supression of urethan-induced lung adenomas in mice treated with trehalose-6,6-dimycolate (cord factor) and living bacillus

84. Calmette Guerin / A. Bekierkunst, I. S. Levij, E Yarkoni // Science. -1971.-V. 174.-P. 1240-1242.

85. Beney L. Influence of the fluidity of the membrane on the response of microorganisms to environmental stresses / L Beney., P Gervais. // Appl. Microbiol. Biotechnol. 2001. - V. 57. - P. 34-42.

86. Bernhard W., Haslam P. L., Floros J. From birds to humans. New concepts on airways relative to alveolar surfactant // Am. J. Respir. Cell Mol. Biol. 2004. - V. 30. - P. 6-11.

87. Beven L. Effect of natural amphipathic peptides on viability, membrane potential, cell shape and motility of mollicutes / L. Beven., H. Wroblewski//Res. Microbiol. 1997.- V. 148.-P. 163-175.

88. Beveridge T. J. Structures of gram-negative cell walls and their derived membrane vesicles / T. J. Beveridge // J. Bacteriol. 1999. - V. 181.-P. 4725-4733.

89. Billingsley K. A. Remediation of PCBs in soil by surfactant washing and biodegradation in the wash by Pseudomonas sp. LB400 / K. A. Billingsley, S. M. Backus, S. Wilson, A. Singh, O. P. Ward // Biotechnol. Lett. 2002. - V. 24. - P. 1827-1832.

90. Bisht K. J. Enzyme-mediated regioselective acylations of sophorolipids / K. J. Bisht, R. Gross, D. Kaplan // Org. Chem. 1999. -V. 64.-P. 780-789.

91. Bisht K. S. Glycolipids from Candida bombicola: polymerization of 6-o-acryl sophorolipid deriva tive / K. S. Bisht, W. Gao, R. A. Gross // Macromolecules. 2000. - V. 33. - P. 6208-6210.

92. Bodour A. A. Distribution of biosurfactant-producing bacteria in undisturbed and contaminated arid southwestern soils / A. A. Bodour K. P. Drees, R. M. Maier // Appl. Environ. Microbiol. 2003. - V. 69. -P. 3280-3287.

93. Bouchez-Naitali M. Diversity of bacterial strains degrading hexadecane in relation to the mode of substrate uptake / M. Bouchez-Naitali, H. Rakatozafy, R. Marchal, J. Y. Leveau, J. P.Vandecasteele // J. Appl. Microbiol. 1999. - V. 86. - P. 421-428.

94. H.Bradford M. M. A rapid and sensitive method for the quantitation of microgram quantities of protein utilizing the principle of protein-dye binding / M. M. Bradford // Anal. Biochem. 1976. - V. 72. - P. 248254.

95. Bredholt H. Emulsification of crude oil by an alkane-oxidizing Rhodococcus species isolated from seawate / H. Bredholt, K. Josefsen,

96. A. Vataland, P. Bruheim, К. R. Eimhjellen // Can. J. Microbiol. 1998. - V. 44. - P. 330-340.

97. Bruheim P. Effects of surfactant mixtures, including Corexit 9527, on bacterial oxidation of acetate and alkanes in crude oil / P. Bruheim, H. Bredholt, K. Eimhjellen // Appl. Environ. Microbiol. 1999. - V. 65. -P. 1658-1661.

98. Bryant R. D. The role of Thiobacillus albertis glycocalyx in the adhesion of cells to elemental sulfur / R. D. Bryant, J. W. Costerton, E. J. Laishley // Can. J. Microbiol. -1984. V. 30. - P. 81-90.

99. Bury S. J. Effect of micellar solubilization on biodegradation rate of hydrocarbons/ S. J. Bury, C. A. Miller// Environ. Sci. Technol. 1993. -V. 27.-P. 104-110.

100. Caiazza N. C. Rhamnolipids modulate swarming motility patterns of Pseudomonas aeruginosa / N. C. Caiazza, R. M. Q. Shanks, G. A. O'Toole // J. Bacterid. 2005. - V. 187. - P. 7351 -7361.

101. Cameotra S. S. Recent applications of biosurfactants as biological and immunological molecules / S. S. Cameotra, R. S. Makkar // Curr. Opin. Microbiol. 2004. - V. 7. - P. 262-266.

102. Carrillo C. Molecular mechanism of membrane permeabilization by the peptide antibiotic surfactin / C. Carrillo, J. A. Teruel, F. J. Aranda, A. Ortiz // Biochim. Biophys. Acta. 2003. - V. 1611. - P. 91-97.

103. Catalogue of Strains of the Regional Specialized Collection of Alkanotrophic Microorganisms. 2006. www.iegm.ru/iegmcol.

104. Cavanagh J. E. Analysis of microbial hydrocarbon degradation using TLC-FID / J. E. Cavanagh, A. L. Juhasz., P. D. Nichols, P.D. Franzmann, T. A. McMeekin. // J. Microbiol. Methods. 1995. - V. 22. -P. 119-130.

105. Chayabutra C. Polyhydroxyalkanoic acids and rhamnolipids are synthesized sequentially in hexadecane fermentation by Pseudomonas aeruginosa ATCC 1014 / C. Chayabutra, L. K. Ju // Biotechnol. Prog. -2001.-V. 17.-P. 419-423.

106. Chayabutra C. Rhamnolipid production by Pseudomonas aeruginosa unger denitrification: effects of limiting nutrients and carbon substrates / C. Chayabutra, J. Wu, L. K. Ju // Biotechnol. Bioeng. 2001. - V. 72. -P. 25-33.

107. Chen J.-H. Trace metal mobilization in soil by bacterial polymers / J.-H Chen., D. R. Czajka, L. W. Lion, M. L. Shuler, W. С Ghiorse // Environ. Health Perspect. 1995. - V. 103. Suppl. 1. - P. 53-58.

108. Chen К. C. Decolorization of azo dye using PVA-immobilized microorganisms / К. C. Chen, J. Y. Wu, С. - C. Huang, Y. - M. Liang, S. - C. J. Hwang // J. Biotechnol. - 2003. - V. 101. - P. 241-252.

109. Chevalier Y. New surfactants: new chemical functions and molecular architectures / Y. Chevalier // Curr. Opin. Colloid Interface Sci. 2002. -V. 7.-P. 3-11.

110. Christofi N. Microbial surfactants and their use in field studies of soil remediation / N. Christofi, I. B. Ivshina // J. Appl. Microbiol. 2002. -V. 93.-P. 915-929.

111. Chiou С. T. Partition equilibria of nonionic organic compounds between soil and organic matter and water / С. T. Chiou, P. E. Porter,

112. D. W. Schmeddling // Environ. Sci. Technol. 1983. - V. 17. - P. 227231.

113. Chun J. Phylogeny of mycolic acid-containing actinomycetes / J. Chun, S. 0. Kang, Y. C. Hah, M. Goodfellow // J. Ind. Microbiol. -1996.- V. 17.-P. 205-213.

114. Churchill P. Surfactant-enhanced bioremediation / P. Churchill, R. Dudley, S. A. Churchill // Waste Manag. 1995. - V. 15. - P. 371-377.

115. Cirigliano M. C. Purification and characterization of liposan, a bioemulsifier from Candida lipolytica / M. C. Cirigliano, G. M. Carman // Appl. Environ. Microbiol. 1984. - V. 50. - P. 846-850.

116. Cooper D. G. Enhanced production of surfactin from Bacillus subtilis by continuous product removal and metal cation additions / D. G. Cooper, C. R. MacDonald, S. F. B. Duff, N. Kosaric // Appl. Environ. Microbiol. 1981. - V. 42. - P. 408-412.

117. Cooper D. G. Surface-active compounds from microorganisms / D. G. Cooper, J. E. Zajic // Appl. Microbiol. 1980. - V. 26. - P. 229-252.

118. Cooper D. G. Production of surface-active lipids by Corynebacterium lepus / D. G. Cooper, J. E. Zajic, D. F Gerson // Appl. Environ. Microbiol. 1979. - V. 37. - P. 4-10.

119. Cooper D. G. Isolation and identification of biosurfactants produced during anaerobic growth of Clostridium pasteuranum / D. G. J. Cooper, J. E. Zajic, D. F. Gerson, К. I. Manninen // Ferment Technol. 1980. -V.58.-P. 83-86.

120. Dahrazma B. Extraction of copper from a low-grade ore by rhamnolipids / B. Dahrazma, C. N. Mulligan // Pract. Periodical Haz. Toxic Radioactive Waste Mgmt. 2004. - V. 8. - P. 166-172.

121. Damjanovic V. Predicting the stability of freeze-dried Lacto-bacillus bifidus by the accelerated storage test / V. Damjanovic, D. Radulovic // Cryobiology. 1968. - V. 5. - P. 101-104.

122. Reuss, С. Syldatk // Appl. Microbiol. Biotechnol. 1999. - V. 51. - P. 40-45.

123. Datta A. K. Isolation and purification of trehalose 6-mono- and 6,6-di-corynomycolates from Corynebacterium matruchotii. Structural characterization by 1H NMR / A. K. Datta, K. Takayama // Carbohydrate Res. 1993. - V. 245. - P. 151-158.

124. Davey M. E. Rhamnolipid surfactant production affects biofilm architecture in Pseudomonas aeruginosa PAOl / M. E. Davey, N. C. Caiazza, G. A. O'Toole // J. Bacteriol. 2003. - V. 185. - P. 10271036.

125. Deleu M. Interfacial and emulsifying properties of lipopeptides from Bacillus subtilis / M. Deleu, H. Razafindralambo, Y. Popineau, P. Jacques, P. Thonart, M. Paquot // Colloids Surfaces A: Physicochem. Engineer. Aspects. 1999. - V. 152. - P. 3-10.

126. Denger K. New halo- and thermotolerant fermenting bacteria producing surface-active compounds / K. Denger, B. Schink // Appl. Microbiol. Biotechnol. 1995. - V. 44. - P. 161-166.

127. De Philippis R. Exocellular polysaccharides from cyanobacteria and their possible applications / R. De Philippis, M. Vincenzini // FEMS Microbiol. Rev. 1998. - V. 22. - P. 151-175.

128. Desai J. D. Microbial production of surfactants and their commercial potential / J. D. Desai, I. M. Banat // Microbiol. Mol. Biol. Rev. 1997. -V.61.-P. 47-64.

129. Deshpande M. Evaluation of sophorolipid biosurfactant production by Candida bombicola using animal fat / M. Deshpande, L. Daniels // Biores. Technol. 1995. - V. 54. - P. 143-150.

130. Deshpande S. Surfactant selection for enhancing ex situ soil washing / S. Deshpande, B. J. Shiau, D. Wade, D. A. Sabatini, J. H. Harwell // Wat. Res. 1999. - V. 33, - P. 351-360.

131. Deziel E. Biosurfactant production by a soil Pseudomonas strain growing on polysyclic aromatic hydrocarbons / E. Deziel, G. Paquette, R. Villemur, F. Lepine, J. Bisaillon // Appl. Environ. Microbiol. 1996. -V. 62.-P. 1908-1912.

132. Design for the Environment Program. Cleaner Technologies Substitutes Assessment: Professional Fabricare Processes. U. S. Environmental Protection Agency. EPA 744-B-98-001, 1998.

133. Dhariwal K. R. Detection of trehalose monomycolate in Mycobacterium leprae grown in armadillo tissues / K. R. Dhariwal, Y. M. Yang, H. M. Fales, M. B. Goren // J. Gen. Microbiol. 1987. - V. 133.-P. 201-209.

134. Doong R. A. Solubilization and mineralization of polycyclic aromatic hydrocarbons by Pseudomonas putida in the presence of surfactant R. - A. Doong, W. - G. Lei // J. Hazard. Mater. - 2003. - V. B96.-P. 15-27.

135. Drews G. Mikrobiologisches Praktikum, 2nd edition / G. Drews. -Springer-Verlag, Berlin, 1974.

136. Dubois M. Colorimetric method for the determination of sugars and related substances / M. Dubois, K. A. Gilles, J. K. Hamilton, R. A. Rebers, F. Smith // Anal. Chem. 1956. - V. 28. - P. 350.

137. Duvnjak Z. Production and release of surfactant by Corynebacterium lepus in hydrocarbon and glucose media / Z. Duvnjak, N. Kosaric // Biotechnol. Lett. 1985. - V. 7. - P. 793-796.

138. EPA National Contingemcy Plan. Product Schedule. U.S. Environment Protection Agency, Washington, 2005.

139. Erler S. T. Oil/water and pre-emulsified oil/water (PIT) dispersions in a stirred vessel: Implications for fermentations / S. T. Erler, A. W. Nienow, A. W. Pacek // Biotechnol. Bioeng. 2003. - V. 82. - P. 543551.

140. Espuny M. J. Nutritional requirements of a biosurfactant producing strain Rhodococcus sp. 51T7 / M. J. Espuny, S. Egido, I. Rodon, M. E. Mercade, A. Manresa // Biotechnol. Lett. 1996. - V. 18. - P. 521-526.

141. Fernandes P. J. Construction of Rhodococcus random mutagenesis libraries using Tn5 transposition complexes / P. J. Fernandes, J. A. C. Powell, J. A. C. Archer // Microbiology. 2001. - V. 147. - P. 25292536.

142. Fiechter A. Biosurfactants: moving towards industrial application / A. Fiechter // Trends Biotechnol. 1992a. - V. 10. - P. 208-217.

143. Fiechter A. Integrated systems for biosurfactant synthesis / A. Fiechter // Pure Appl. Chem. 19926. - V. 64. - P. 1739-1743.

144. Finnerty W. The biology and genetics of the genus Rhodococcus! W. Finnerty // Ann. Rev. Microbiol. 1992. - V. 46. - P. 193-218.

145. Finnerty W. Biosurfactants in environmental biotechnology / W. Finnerty // Curr. Opin. Biotechnol. 1994. - V. 5. - P. 291-295.

146. Fletcher P. D. I. Surfactant Science / P. D. I. Fletcher, R. Strey // Curr. Opin. Colloid Interface Sci. 2002. - V. 7. - P. 1-2.

147. Fluharty A. L. A mannose- and erythritol-containing glycolipid from Ustilago maydis / A. L. Fluharty, J. S. O'Brien // Biochemistry. 1969. -V. 8.-P. 2627-2632.

148. Fought J. Effect of emulsan on biodegradation of crude oil in pure and mixed cultures / J. Fought, D. Gutnick, W. Westlake // Appl. Environ. Microbiol. 1989. - V. 55. - P. 36-42.

149. Fujita Y. Direct molecular mass determination of trehalose monomycolate from 11 species of mycobacteria by MALDI-TOF mass spectrometry / Y. Fujita, T. Naka, T. Doi, I. Yano // Microbiology. -2005.-V. 151.-P. 1443-1452.

150. Fujita Y. Intact molecular characterization of cord factor (trehalose 6,6'-dimycolate) from nine species of mycobacteria by MALDI-TOF mass spectrometry / Y. Fujita, T. Naka, M. McNeil, I. Yano // Microbiology. 2005. - V. 151. - P. 3403-3416.

151. Garon D. Influence of surfactants on solubilization and fungal degradation of fluorine / D. Garon, S. Krivobok, D. Wouessidjewe, F. Seigle-Murandi //. Chemosphere. 2002. - V. 47. - P. 303-309.

152. Georgiou G. Surface-active compounds from microorganisms / G. Georgiou, S. C. Lin., M. M. Sharma // Biotechnology. - 1992. - V. 10. -P. 60-65.

153. Gerard J. Massetolides A-H antimycobacterial cyclic depsipeptides produced by two pseudomonads isolated from marine habitats / J. Gerard, R. Lloyd, T. Barsby, P. Haden, M. T. Kelly., R. J Andersen. // J. Nat. Prod. 1997. - V. 60. - P. 223-229.

154. Gerson D. F. Surfactant production from hydrocarbons by Corynebacterium lepus sp. nov. / D. F. Gerson, J. E. Zajic // Devel. Ind. Microbiol. 1978. - V. 19. - P. 577-599.

155. Godchaux W. Defects in gliding motility in mutants of Cytophaga johnsonae lacking a high-molecular-weight cell surface polysaccharide / W. Godchaux, III, M. A. Lynes, E. R. Leadbetter // J. Bacteriol. -1991.-V. 173.-P. 7607-7614.

156. Goel S. K. Selecting the optimal linear alcohol ethoxylate for enhancing oily soil removal / S. K. Goel // J. Surfactants Detergents. -1998.-V. 1.N. 2.-P. 213-219.

157. Goldman S. Emulsan in Acinetobacter calcoaceticus RAG-1 / S. Goldman, Y. Shabtai, C. Rubinovitz, E. Rosenberg, D. L. Gutnick // Appl. Environ. Microbiol. 1982. - V. 44. - P. 165-170.

158. Goodfellow M. The actinomycete-genus Rhodococcus: a home for the "rhodochrous" complex / M. Goodfellow, G. Alderson // J. Gen. Microbiol. -1977. V. 100. - P. 99-122.

159. Goodfellow M. The genera Nocardia and Rhodococcus / M. Goodfellow, D. E Minnikin. // The Prokaryotes. Eds: M. P. Starr, H. Stolp, H. G. Truper, A. Balows, H. G. Schlegel. Springer-Verlag, Berlin, Heidelberg, New York, 1981. V. 2. - P. 2016-2026.

160. Grangemard I. Lichenysin: A more efficient cation chelator than surfactin / I. Grangemard, J. Wallach, R. Maget-Dana, F. Peypoux // Appl. Biochem. Biotechnol. 2001. - V. 90. - P. 199-210.

161. Grimberg S. Quantifying the biodegradation of phenanthrene by Pseudomonas stutzeri P16 in the presence of a nonionic surfactant / S. Grimberg, W. Stringfellow, M. Aitken // Appl. Environ. Microbiol. -1996.-V. 62.-P. 2387-2392.

162. Guerra-Santos L. Pseudomonas aeruginosa biosurfactant production in continuous culture with glucose as carbon source / L. Guerra-Santos, O. Kappeli, A. Fiechter // Appl. Environ. Microbiol. 1984. - V. 48. -P. 301-305.

163. Guerra-Santos L. Dependence of Pseudomonas aeruginosa continuous culture biosurfactant production on nutritional and environmental factors / L. Guerra-Santos, O. Kappeli, A. Fiechter // Appl. Microbiol. Biotechnol. 1986. - V. 24. - P. 443-448.

164. Guha S. Biodegradation kinetics of phenanthrene partitioned into the micellar phase of non-ionic surfactants / S. Guha, P. Jaffe // Environ. Sci. Technol. 1996. - V. 30. - P. 605-611.

165. Gunther N. W. Production of rhamnolipids by Pseudomonas chlororaphis, a nonpathogenic bacterium / N. W. Gunther, A. Nunez, W. Fett, D. K. Y. Solaiman // Appl. Environ. Microbiol. 2005. - V. 71.-P. 2288-2293.

166. Gupta G. Toxicity of methyl tertiary butyl ether to Daphnia magna and Photobacterium phosphoreum / G. Gupta, J. Y. Lin // Bull. Environ. Contam. Toxicol. 1995. - V. 55. - P. 618-620.

167. Haba E. Screening and production of rhamnolipids by Pseudomonas aeruginosa 47T2 NCIB 40044 from waste frying oils / E. Haba, M. J. Espuny, M. Busquets, A. Manresa // J. Appl. Microbiol. 2000. - V. 88.-P. 379-387.

168. Haferburg D. Antiviral activity of rhamnolipids from Pseudomonas aeruginosa / D. Haferburg, R. Hommel, H. P. Kleber, S. Klug, G. Schuster, H. J. Zchienger // Acta Biotechnol. 1987. - V. 7. - P. 353356.

169. Harvey S. Enhanced removal of Exxon Valdez spilled oil from Alaskan gravel by a microbial surfactant / S. Harvey, I. Elashi, J. J.

170. Valdes, D. Kamely, A. M. Chakrabarty // Biotechnology. 1990. - V. 8.-P. 228-230.

171. Haskins R. H. Biochemistry of the Ustilaginales. I. Preliminary cultural studies of Ustilago zeae / R. H. Haskins // Can. J. Res. 1950. -V. 28.-P. 213-223.

172. Haskins R. H. Biochemistry of the Ustilaginales. XI. Metabolic products of Ustilago zeae in submerged culture / R. H. Haskins, J. A. Thorn, B. Boothroyd // Can. J. Microbiol. 1955. - V. 1. - P. 749-756.

173. HauJ31er S. Purification and characterization of a cytotoxic exolipid of Burkholderia pseudomallei / S. HauBler, M. Nimtz, T. Domke, V. Wray, I. Steinmetz // Infect. Immun. 1998. - V. 66. - P. 1588-1593.

174. Hayes M. E. Microbial surfactants / M. E. Hayes, E. Nestaas, K. R. Hrebenar // Chemtech. 1986. - V. 4. - P. 239-243.

175. Heerklotz H. Detergent-like action of the antibiotic peptide surfactin on lipid membranes / H. Heerklotz, J. Seelig // Biophys. J. 2001. - V. 81.-V. 1547-1554.

176. Herman D. C. Rhamnolipid (biosurfactant) effects on cell aggregation and biodegradation of residual hexadecane under saturated flow conditions / D. C. Herman, Y. Zhang, R. M. Miller // Appl. Environ. Microbiol. 1997. - V. 63. - P. 3622-3627.

177. Hermann T. Industrial production of amino acids by coryneform bacteria / T. Hermann //J. Biotechnol. 2003. - V. 104. - P. 155-172.

178. Hewald S. Genetic analysis of biosurfactant production in Ustilago maydis / S. Hewald, K. Josephs, M. Bolker // Appl. Environ. Microbiol. -2005.-V. 71.-P. 3033-3040.

179. Hildebrand P. D. Role of the biosurfactant viscosin in broccoli head rot caused by a pectolytic strain of Pseudomonas Jluorescens / P. D. Hildebrand, P. G. Braun, К. B. McRae, X. Lu // Can. J. Plant Pathol. -1998.-V. 20.-P. 296-303.

180. Hodgson J. Tween 80 enhanced TNT mineralization by Phanerochaete chrysosporum / J. Hodgson, D. Rho, S. R. Guiot, G. Ampleman, S. Thiboutot, J. Hawaii // Can. J. Microbiol. 2000. -V. 46.-P. 110-118.

181. Hommel R. K. Production of sophorose lipid by Candida (Torulopisis) apicola grown on glucose / R. K. Hommel, L. Weber, A. Weiss, U. Himmelreich, 0. Rilke, H. P. Kleber // J. Biotechnol. -1994.-V. 33.-P. 147-155.

182. Hong K. J. Removal of cadmium and lead from soil using asecin as a biosurfactant / K. J. Hong, Y. K. Choi, S. Tokunaga, Y. Ishigami, T. Kajiuchi // J. Surfactant Deterg. 1998. - V. 2. - P. 247-250.

183. Hong K. J. Evaluation of remediation process with plant-derived biosurfactant for recovery of heavy metals from contaminated soils / K. J. Hong, S. Tokunaga, T. Kajiuchi // Chemosphere. 2002. - V. 49. -P. 379-387.

184. Horowitz S. Isolation and characterization of a surfactant produced by Bacillus licheniformis 86 / S. Horowitz, J. N. Gilbert, W. M. Griffin // J. Ind. Microbiol. 1990. - V. 6. - P. 243-248.

185. Hua Z. Influence of biosurfactants produced by Candida antarctica on surface properties of microorganism and biodegradation of zi-alkanes / Z. Hua, J. Chen, S. Lun, X. Wang // Water Res. 2003. - V. 37. - P. 4143-4150.

186. Hug H. The functional role of lipids in hydrocarbon assimilation / H. Hug, H. W. Blanch, A. Fiechter // Biotechnol. Bioengineer. 1974. -V. 16.-P. 965-985.

187. Inoh Y. MEL-A dramatically increases gene transfection via membrane fusion / Y. Inoh, D. Kitamoto, N. Hirashima, M. Nakanishi // J. Control. Release. 2004.' - V. 94. - P. 423^31.

188. Isoda H. Differentiation of human promyelocyte leukemia cell line HL60 by microbial extracellular glycolipids / H. Isoda, H. Shinmoto, D. Kitamoto, M. Matsumura, T. Nakahara // Lipids. 19976. - V. 32. - P. 263-271.

189. Isoda H. The neurite-initiating effect of microbial extracellular glycolipids in PC 12 cells / H. Isoda, H. Shiumoto, M. Matsumura, T. Nakahara // Cytotechnology. 1999. - V. 31. - P. 163-170.

190. Jahan K. Selection of non-ionic surfactants in enhancing biodegradation of phenanthrene in soil / K. Jahan, T. Ahmed, W. J. Maier // Water Environ. Res. 1997. - V. 69. - P. 317-325.

191. Jain D. K. Effect of addition of Pseudomonas aeruginosa UG2 inocula or biosurfactant on biodegradation of selected hydrocarbons in soil / D. K. Jain, H. Lee, J. T. Trevors // J. Ind. Microbiol. 1992. - V. 10.-P. 87-93.

192. Javaheri M. Anaerobic production of a biosurfactant by Bacillus licheniformis JF-2 / M. Javaheri, G. E. Jenneman, M. J. Mclnerney, R. M. Knapp // Appl. Environ. Microbiol. 1985. - V. 50. - P. 698-700.

193. Johri A. K. Bioengineered emulsans from Acinetobacter calcoaceticus RAG-1 transposon mutants / A. K. Johri, W. Blank, D. L. Kaplan // Appl. Microbiol. Biotechnol. 2002. - V. 59. - P. 217-223.

194. Jones G. E. Surface-active substances produced by Thiobacillus thiooxidans / G. E. Jones, R. L. Starkey // J. Bacteriol. 1961. - V. 82. -P. 788-789.

195. Juck D. Polyphasic microbial community analysis of petroleum hydrocarbon-contaminated soils from two northern Canadian communities / D. Juck, T. Charles, L. G. Whyte, C. W. Greer // FEMS Microbiol. Ecol. 2000. - V. 33. - P. 241-249.

196. Kalyanpur M. Downstream processing in the biotechnology industry / M. Kalyanpur // Mol. Biotechnol. 2002. - V. 22. - P. 87-97.

197. Kaplan N. Acinetobacter calcoaceticus BD4 emulsan: reconstitution of emulsifying activity with pure polysaccharide and protein / N. Kaplan, Z. Zosim, E. Rosenberg // Appl. Environ. Microbiol. 1987. -V. 53.-P. 440-446.

198. Kappeli 0. Partition of alkane by an extracellular vesicle derived from hexadecane-grown Acinetobacter / 0. Kappeli, W. R. Finnerty // J. Bacteriol. 1979. - V. 140. - P. 707-712.

199. Kates M. Techniques of Lipidology. 2nd ed. / M. Kates. Elsevier, New York, 1988.

200. Kato M. Antibody formation to trehalose-6,6'-dimycolate (cord factor) of Mycobacterium tuberculosis / M. Kato // Infect. Immun. -1972.-V. 5.-P. 203-212.

201. Khadikar P. V. QSAR study on solubility of alkanes in water and their partition coefficients in different solvent systems using PI index / P. V. Khadikar, D. Mandloi, A. V. Bajaj, S. Joshi // Bioorg. Med. Chem. Lett. 2003. - V. 13. - P. 419-422.

202. Kierszenbaum F. Macrophage activation by cord factor (trehalose 6,6'-dimycoIate) enhanced association with and intracellular killing of Trypanozoma cruzi / F. Kierszenbaum, A. Zenian, J. J. Wirth // Infect. Immunol. 1984. - V. 43. - P. 531-535.

203. Kikuchi T. Enhancement of plasminogen activation by surfactin C: augmentation of fibrinolysis in vitro and in vivo / T. Kikuchi, K. Hasumi // Biochim. Biophys. Acta. 2002. - V. 1596. - P. 234-245.

204. Kim H. S. Production and properties of lipopeptide biosurfactant from Bacillus subtilis C9 / H. S. Kim, B. D. Yoon, С. H. Lee, H. M. Oh, T. Katsuragi, Y. Tani //J. Ferment. Bioeng. 1997. - V. 84. - P. 41-46.

205. Kim J. S. Microbial glycolipid production under nitrogen limitation and resting cell conditions / J. - S. Kim, M. Powalla, S. Lang, F. Wagner, H. Lunsdorf, V. Wray // J. Biotechnol. - 1990. - V. 13. - P. 257-266.

206. Kitamoto D. Extracellular accumulation of mannosylerythritol lipids by a strain of Candida Antarctica / D. Kitamoto, S. Akiba, C. Hioki, T. Tabuchi // Agric. Biol. Chem. 1990. - V. 54. - P. 31 -36.

207. Kitamoto D. Production of mannosylerythritol lipids as biosurfactants by resting cells of Candida antartica / D. Kitamoto, T. Fuzishiro, H. Yanagishita, T. Nakane, T. Nakahara // Biotechnol. Lett. 1992. - V. 14.-P. 305-310.

208. Kitamoto D. Formation of giant vesicles from diacylmannosylerythritols and their binding to concanavalin A / D. Kitamoto, S. Ghosh, O. G. Y. Nakatani // Chem. Comm. 2000. -V. 10.-P. 861-862.

209. Kitamoto D. Functions and potential applications of glycolipid biosurfactants from energy-saving materials to gene delivery carriers / D. Kitamoto, H. Isoda, T. Nakahara // J. Biosc. Bioengin. - 2002. -V. 94.-P. 187-201.

210. Kosaric N. Biosurfactants in industry / N. Kosaric // Pure Appl. Chem. 1992. - V. 64. - P. 1731-1737.

211. Kosaric N. Biosurfactants and their application for soil bioremediation / N. Kosaric // Food Technol. Biotechnol. 2001. - V. 39. - P. 295304.

212. Kosaric N. The role of nitrogen in multiorganism strategies for biosurfactant production / N. Kosaric, W. L. Cairns, N. С. C. Gray, D. Stechey, J. Wood // JAOCS. 1984. - V. 61. - P. 1735-1743.

213. Kracht M. Antiviral and hemolytic activities of surfactin isoforms and their methyl ester derivatives / M. Kracht, H. Rokos, M. Ozel, M. Kowall, G. Pauli, J. Vater // J. Antibiot. (Tokyo). 1999. - V. 52. - P. 613-619.

214. Kretschmer A. Chemical and physical characterization of interfacial-active lipids from Rhodococcus erythropolis grown on «-alkanes / A. Kretschmer, H. Bock, F. Wagner // Biochim. Biophys. Acta. 1983. -V. 753.-P. 306-313.

215. Kretschmer A. Characterization of biosynthetic intermediates of trehalose dicorynomycolates from Rhodococcus erythropolis grown on л-alkanes / A. Kretschmer, F. Wagner // Appl. Environ. Microbiol. -1982.-V.44.-P. 864-870.

216. Kulakovskaya Т. V. ATP leakage from yeast cells treated by extracellular glycolipids of Pseudozyma fusiformata / Т. V. Kulakovskaya, E. V. Kulakovskaya, W. I. Golubev // FEMS Yeast Research. 2003. - V. 3. - P. 401-404.

217. Kwok S. Avoiding false positives with PCR / S. Kwok, R. Higuchi // Nature. 1989. - V. 389 - P. 237-238.

218. Lafrance P. Mobilisation and co-transport of pyrene in the presence of Pseudomonas aeruginosa UG2 biosurfactants in sandy soil columns / P. Lafrance, M. Lapointe // Ground Water. Monitor. Remed. 1998. -V. 18.-P. 139-147.

219. Laha S. Inhibition of phenanthrene mineralization by nonionic surfactants in soil water system / S. Laha, R. Luthy // Environ. Sci. Technol. 1991. - V. 25. - P. 1920-1930.

220. Laha S. Effect of nonionic surfactants on the solubilisation and mineralisation of phenanthrene in soil-water system / S. Laha, R. G. Luthy // Biotechnol. Bioeng. 1992. - V. 40. - P. 1367-1380.

221. Lang S. Biological amphiphiles (microbial biosurfactants) / S. Lang // Curr. Opin. Colloid Interface Sci. 2002. - V. 7. - P. 12-20.

222. Lang S. Production of native and modified sophorose lipids / S. Lang, A. Brakemeier, R. Heckmann, S. Spockner, U. Rau // Chimica Oggi (Chem. Today). 2000. - V. 18. N. 10. - P. 76-79.

223. Lang S. Surface-active lipids in rhodococci / S. Lang, J. C. Philp // Antonie van Leeuwenhoek Int. J. Gen. Mol. Microbiol. 1998. - V. 74. -P. 59-70.

224. Lang S., Wagner F. Biological activities of biosurfactants / S. Lang, F. Wagner // Biosurfactants Production, Properties and Application. Ed. N. Kosaric. Surfactant Science Series. Marcel Dekker Inc., New York, 1993. - V. 48.

225. Lang S. Rhamnose lipids biosynthesis, microbial production and application potential / S. Lang, D. Wullbrandt // Appl. Microbiol. Biotechnol. - 1999. - V. 51. - P. 22-32.

226. Lechevalier M. P. Biology of actinomycetes not belonging to genus Streptomyces / M. P. Lechevalier, H. Lechevalier // Biology of Industrial Microorganisms / Eds: A.L. Demain, N.A. Solomon, Menlo Park, CA: Benjamin/Cummings, 1985. P. 315-358.

227. Lee В. H. Natural ferric ionophores total synthesis of schizokinen, schizokinen-a, and arthrobactin / В. H. Lee, M. J. Miller // J. Org. Chem.- 1983.-V. 48.-P. 24-31.

228. Le Floch S. A field experimentation on bioremediation: BIOREN / S. Le Floch, F. X. Merlin, M. Guillerme, C. Dalmazzone, P. Le Corre // Environ. Technol. 1999. - V. 20. - P. 897-907.

229. Lemieux R. U. Biochemistry of the ustilaginales. II. Isolation and partial characterization of ustilagic acid / R. U. Lemieux, J. A. Thorn, C. Brice, R. H. Haskins // Can. J. Chem. 1951. - V. 29. - P. 409-414.

230. List of Prokaryotic Names with Standing in Nomenclature http://www.bacterio.net.

231. Liu W. H. Bioconversion of cholesterol to cholest-4-en-3-one in aqueous / organic solvent two-phase reactors / W. - H. Liu, W. - C. Horng, M. - S. Tsai // Enzyme Microb. Technol. - 1996. - V. 18. - P. 184-189.

232. Liu Z. Biodegradation of naphthalene in aqueous nonionic surfactant system / Z. Liu, A. M. Jacobson, R. G. Luthy // Appl. Environ. Microbiol. 1995. - V. 61. - P. 145-161.

233. Lozinsky V. I. Cryogels on the basis of natural and synthetic polymers: preparation, properties and applications / V. I. Lozinsky // Russ. Chem. Rev. 2002. - № 6. - P. 489-511.

234. Macdonald C. R. Surface-active lipids from Nocardia erythropolis grown on hydrocarbons / C. R. Macdonald, D. G. Cooper, J. E. Zajic // Appl. Environ. Microbiol. 1981.-V. 41.-P. 117-123.

235. Macnaughton S. J. Micribial population changes during bioremediation of an experimental oil spill / S. J. Macnaughton, J. R. Stephen, A. D. Venosa, G. A. Davis, Y. J. Chang, D. C. White // Appl. Environ. Microbiol. - 1999. - V. 65. - P. 3566-3574.

236. Maier R. M. Biosurfactants: evolution and diversity in bacteria / R. M Maier// Adv. Appl. Microbiol. 2003. - V. 52. - P. 101-121.

237. Maier R. M. Remediation of metal-contaminated soil and sludge using biosurfactant technology / R. M. Maier, J. W. Neilson, J. F. Artiola, F. L. Jordan, E. P. Glenn, S. M. Descher // Int. J. Occup. Med. Environ. Health.-2001.-V. 14.-P. 241-248.

238. Maier R. M. Pseudomonas aeruginosa rhamnolipids: biosynthesis and potential applications / R. M. Maier, G. Soberon-Chavez // Appl. Microbiol. Biotechnol. 2000. - V. 54. - P. 625-633.

239. Makkar R. Biosurfactant production by a thermophilic Bacillus subtilis strain / R. Makkar, S. Cameotra // J. Ind. Microbiol. Biotechnol. 1997.-V. 18.-P. 37-42.

240. Makkar R. S. Production of biosurfactant at mesophilic and thermophilic conditions by a strain of Bacillus subtili/ R. S. Makkar, S. S. Cameotra // J. Ind. Microbiol. Biotechnol. 1998. - V. 20. - P. 4852.

241. Makkar R. S. An update on the use of unconventional substrates for biosurfactant production and their new applications / R. S. Makkar, S. S. Cameotra // Appl. Microbiol. Biotechnol. 2002. - V. 58. - P. 428434.

242. Makkar R. S. Comparison of synthetic surfactants and biosurfactants in enhancing biodegradation of polycyclic aromatic hydrocarbons / R. S. Makkar, K. J. Rockne // Environ. Toxicol. Chem. 2003. - V. 22. -P. 2280-2292.

243. Makula R. A. Isolation and characterization of an ornithine-containing lipid from Desulfovibrio gigas / R. A. Makula, W. R. Finnerty // J. Bacteriol. 1975. - V. 123. - P. 523-529.

244. Maneerat S. Production of biosurfactants using substrates from renewable-resources / S. Maneerat // Songklanakarin J. Sci. Technol. -2005.-V. 27.-P. 675-683.

245. Margaritis A. Production and surface-active properties of microbial surfactants / A. Margaritis, J. E. Zajic, D. F. Gerson // Biotech. Bioeng. 1979.-V.21.-P. 1151-1162.

246. Mata-Sandoval J. C. Effect of nutritional and environmental conditions on the production and composition of rhamnolipids by P. aeruginosa UG2 / J. C. Mata-Sandoval, J. Karns, A. Torrents // Microbiol. Res. 2001. - V. 155. - P. 249-256.

247. МсСгау J. Biosurfactant-enhanced solubilization of NAPL mixtures / J. McCray, G. Bai, R. Miller, M. Brusseau // J. Contam. Hydrol. -2001.-V. 48.-P. 45-68.

248. McInerney M. Properties of the biosurfactant produced by Bacillus licheniformis strain JF-2 / M. Mclnerney, M. Javaheri, D. P. Nagle // J. Ind. Microbiol. 1990. - V. 5. - P. 95-102.

249. Meylheuc T. Adsorption of biosurfactant on solid surfaces and consequences regarding the bioadhesion of Listeria monocytogenes L028 / T. Meylheuc, C. J. van Oss, M. N. Bellon-Fontaine // J. Appl. Microbiol. - 2001. - V. 91. - P. 822-832.

250. Miller. R. M. Biosurfactant-facilitated remediation of metal-contaminated soils / R. M. Miller. // Environ. Health Perspect. 1995. -V. 103. Suppl. l.-P. 59-62.

251. Mireles J. R. Salmonella enterica Serovar Typhimurium swarming mutants with altered biofilm-forming abilities: Surfactin inhibits biofilm formation/ J. R. Mireles, II, A. Toguchi, R. M. Harshey / J. Bacterid. -2001.-V. 183. P. 5848-5854.

252. Mishina M. Fatty acid composition of triglyceride and phospholipid from Candida tropicalis grown on «-alkanes / M. Mishina, M. Isurugi, A. Tanaka, S. Fukui // Agric. Biol. Chem. 1977. - V. 41. - P. 635640.

253. Moffitt M. C. The expansion of mechanistic and organismic diversity associated with non-ribosomal peptides / M. C. Moffitt, B. A. Neilan // FEMS Microbiol. Lett. 2000. - V. 191. - P. 159-167.

254. Moran A. C. Enhancement of hydrocarbon waste biodegradation by addition of a biosurfactant from Bacillus subtilis 09 / A. C. Moran, N. Olivera, M. Commendatore, J. L. Esteves, F. Sineriz // Biodegradation. -2000. -V. 11.-P. 65-71.

255. Mulligan C. N. Correlation of nitrogen metabolism with biosurfactant production by Pseudomonas aeruginosa / C. N. Mulligan, B. F. Gibbs // Appl. Environ. Microbiol. 1989. - V. 55. - P. 3016-3019.

256. Mulligan С. N. Remediation technologies for metal-contaminated soils and groundwater: an evaluation / C. N. Mulligan, R. N. Yong, B. F. Gibbs // Engineering Geology. 2001a. - V. 60. - P. 193-207.

257. Mulligan C. N. Surfactant-enhanced remediation of contaminated soil: a review / C. N. Mulligan, R. N.Yong, B. F. Gibbs // Engineering Geology. 20016. - V. 60. - P. 371-380.

258. Mulligan C. Metal removal from contaminated soil and sediments by the biosurfactant surfactin / C. Mulligan, R. Yong, B. Gibbs, S. James, H. P. J. Bennett // Environ. Sci. Technol. 1999. - V. 33. - P. 38123820.

259. Murygina V. Bioremediation of oil polluted aquatic systems and soils with novel preparation "Rhoder" / V. Murygina, M. Arinbasarov, S. Kalyuzhnyi // Biodegradation. 2000. - V. 11. - P. 385-389.

260. Nakata K. Two glycolipids increase in the bioremediation of halogenated aromatic compounds / K. Nakata // J. Biosc. Bioeng. -2000.-V. 89.-P. 577-581.

261. Navon-Venezia S. Alasan, a new bioemulsifier from Acinetobacter radioresistens / S. Navon-Venezia, Z. Zosim, A. Gottlieb, R. Legmann, S. Carmeli, E. Z. Ron, E. Rosenberg // Appl. Environ. Microbiol.1995.-V. 61.-P. 3240-3244.

262. Neu T. R. Significance of bacterial surface-active compounds in interaction of bacteria with interfaces / T. R. Neu // Microbiol. Rev.1996.- V. 60.-P. 151-166.

263. Nicolas J. P. Molecular dynamics simulation of surfactin molecules at the water-hexane interface / J. P. Nicolas // Biophys. J. 2003. - V. 85. -P. 1377-1391.

264. Nielsen Т. H. Viscosinamide, a new cyclic depsipeptide with surfactant and antifungal properties produced by Pseudomonas fluorescens DR54 / Т. H. Nielsen, C. Christophersen, U. Anthoni, J. Serensen // J. Appl. Microbiol. 1999. - V. 86. - P. 80-90.

265. Neilson J. W. Characterization of lead removal from contaminated soils by nontoxic soil-washing agents / J. W. Neilson, J. F. Artiola, R. M. Maier//J. Environ. Qual. 2003. - V. 32. - P. 899-908.

266. Noffz G. Neutrophils but not eosinophils are involved in growth supression of IL-4-secreting tumors / G. Noffz, Z. Qin, M. Kopf, T. Blankenstein // J. Immunol. 1998. - V. 160. - P. 345-350.

267. Noll H. The chemical structure of the cord factor of Mycobacterium tuberculosis / H. Noll, H. Bloch, J. Asselineau, E. Lederer // Biochim. Biophys. Acta. 1956. - V. 20. - P. 299-309.

268. Noordman W. H. Effects of rhamnolipid biosurfactants on removal of phenanthrene from soil / W. H. Noordman, W. Ji, M. L. Brusseau, D. B. Janssen // Environ. Sci. Technol. 1998. - V. 32. - P. 1806-1812.

269. Nunez A. LC/MS analysis and lipase modification of the sophorolipids produced by Rhodotorula bogoriensis / A. Nunez, R. Ashby, T. A. Fogilia, D. K. Solaiman // Biotechnol. Lett. 2004. -V. 26.-P. 1087-1093.

270. Page C. A. Biosurfactant solubilization of PAHs / C. A. Page, J. S. Bonner, S. A. Kanga, M. A. Mills, R. L. Autenrieth // Environ. Eng. Sci. 1999.-V. 16.-P. 465-474.

271. Parales R. E. Biodegradation, biotransformation, and biocatalysis (B3) / R. E. Parales, N. C. Bruce, A. Schmid, L. P. Wackett // Appl. Environ. Microbiol. 2002. - V. 68. - P. 4699-4709.

272. Park A. J. Enhancing solubilization of sparingly soluble organic compounds by biosurfactants produced by Nocardia erythropolis / A. J. Park, D. K. Cha, M. Holsen // Water Environ. Research. 1998. - V. 70.-P. 351-355.

273. Patel G. B. Archaeobacterial ether lipid liposomes (archaeosomes) as novel vaccine and drug delivery systems / G. B. Patel, G. D. Sprott // Crit. Rev. Biotechnol. 1999. - V. 19. - P. 317-357.

274. Pearson J. P. Roles of Pseudomonas aeruginosa las and rhl quorum-sensing systems in control of elastase and rhamnolipid biosynthesis genes / J. P. Pearson, E. C. Pesci, В. H. Iglewski // J. Bacteriol. 1997. - V. 179.-P. 5756-5767.

275. Persson A. Biosurfactant yield and nutrient consumption of Pseudomonas fluorescens 378 studied in a microcomputer controlled multifermentation system / A. Persson, G. Molin, N. Andersson, J. Sjoholm // Biotechnol. Bioeng. 1990. - V. 36. - P. 252-255.

276. Pesci E. C. Regulation of las and rhl quorum sensing in Pseudomonas aeruginosa / E. C. Pesci, J. P. Pearson, P. C. Seed, В. H. Iglewski // J. Bacteriol. 1997. - V. 179. - P. 3127-3132.

277. Peypoux F. Recent trends in the biochemistry of surfactin / F. Peypoux, J. M. Bonmatin, J. Wallach // Appl. Microbiol. Biotechnol. -1999.-V. 51.-P. 553-563.

278. Poremba K. Marine biosurfactants, III. Toxicity testing with marine microorganisms and comparison with synthetic surfactants / K. Poremba, W. Gunkel, S. Lang, F. Wagner // Z. Naturforsch. Sect. C. -1991.-V. 46.-P. 210-216.

279. Rapp P. Use of trehalose lipids in enhanced oil recovery / P. Rapp, H. Bock, E. Urban, F. Wagner, W. Gebetsberger, W. Schulz // DESCHEMAMonogr. Biotechnol.- 1977.-V. 81.-P. 177-185.

280. Rapp P. Formation, isolation and characterization of trehalose dimycolates from Rhodococcus erythropolis grown on и-alkanes / P.

281. Rapp, H. Воск, V. Wray, F. Wagner // J. Gen. Microbiol. 1979. - V. 115.-P. 491-503.

282. Rau U. Downstream processing of mannosylerythritol lipids produced by Pseudozyma aphidis /U. Rau, L. A. Nguyen, H. Roeper, H. Koch, S. Lang // Eur. J. Lipid Sci. Technol. 2005. - V. 107. - P. 373-380.

283. Reichardt C. Solvents and Solvent Effects in Organic Chemistry, 2nd ed. Verlag Chemie, Weinheim, 1988. Ch. 7.

284. Renault P. Genetically modified lactic acid bacteria: applications to food or health and risk assessment / P. Renault // Biochimie. 2002. -V. 84.-P. 1073-1087.

285. Retzinger G. S. The role of surface in the biological activities of trehalose 6,6'-dimicolate / G. S. Retzinger, S. C. Meredith, K. Takayama, R. L. Hunter, F. J. Kezdy // J. Biol. Chem. 1981. - V. 256. -P. 8208-8216.

286. Richter M. Streptofactin, a novel biosurfactant with aeral mycelium inducing activity from Streptomyces tendae Tu 901/8c / M. Richter, J. M. Willey, R. Submuth, G. Jung, H. P. Fiedler // FEMS Microbiol. Lett.- 1998.-V. 163.-P. 165-171.

287. Rinker K. D. Continuous culture as a tool for investigating the growth physiology of heterothrophic hyperthermophiles and extreme thermoacidophiles / K. D. Rinker, C. J. Han, R. M. Kelly // J. Appl. Microbiol. 1999. - V. 85. - P. 118S-127S.

288. Ristau E. Formation of novel anionic trehalose tetraesters from Rhodococcus erythropolis under growth-limiting conditions / E. Ristau, F. Wagner//Biotechnol. Lett. 1983. - V. 5. - P. 95-100.

289. Robbers J. E. Technique for the rapid determination of HLB and required-HLB values / J. E. Robbers, V. N. Bhatia // J. Pharm. Sciences. 1961. - V. 50. - P. 708-709.

290. Robinson K. G. Mineralisation enhancement of non-aqueous phase and soil-bond PCB using biosurfactant / K. G. Robinson, M. M. Ghosh, Z. Shi // Water Sci. Technol. 1996. - V. 34. - P. 303-309.

291. Roch F. Biodegradation of hydrophobic compounds in the presence of surfactants / F. Roch, M. Alexander // Environ. Toxicol. Chem. 1995. -V. 14.-P. 1151-1158.

292. Rodrigues L. Biosurfactants: potential applications in medicine / L. Rodrigues, I. M. Banat, J. Teixeira, R. Oliveira // J. Antimicrob. Chemother. 2006. Doi: 10.1093/jac/dkl024.

293. Ron E. Z. Natural roles of biosurfactants / E. Z. Ron, E. Rosenberg // Environ. Microbiol. 2001. - V. 3. - P. 229-236.

294. Rosenberg E. Exploiting microbial growth on hydrocarbon: new markets / E. Rosenberg I I Trends Biotechnol. 1993. - V. 11. - P. 419424.

295. Rosenberg E. Surface active polymers from the genus Acinetobacter / E. Rosenberg, E. Z. Ron // Biopolymers from renewable resources. Ed.

296. D.L. Kaplan, Springer, Berlin, Heidelberg, New York. 1998. -P. 281-291.

297. Rosenberg E. High- and low-molecular-mass microbial surfactants /

298. E. Rosenberg, E. Z. Ron // Appl. Microbiol. Biotechnol. 1999. -V. 52.-P. 154-162.

299. Rosenberg E. G. A. Inhibition of bacterial adherence to hydrocarbons and epithelial cells by emulsan / E. G. A. Rosenberg, M. Rosenberg // Infect. Immun. 1983. - V. 24. - P. 1024-1028.

300. Rosenkranz H. S. Predictions of the lack of genotoxicity and carcinogenicity in rodents of two gasoline additives: methyl- and ethyi-/-butyl ethers / H. S. Rosenkranz, G. Klopman // In Vitro Toxicol. -1991.-V.4.-P. 49-54.

301. Russell J. B. Strategies that ruminal bacteria use to handle excess carbohydrate / J. B. Russell // J. Animal Sci. 1998. - V. 76. - P. 19551963.

302. Ryll R. Immunological properties of trehalose dimycolate (cord factor) and other mycolic acid-containing glycolipids a review / R. Ryll, Y. Kumazawa, I. Yano // Microbiol. Immunol. - 2001. - V. 45. -P. 801-811.

303. Sandberg K. L. Surfactant replacement therapy improves ventilation inhomogeneity in infants with respiratory distress syndrome / K. L.

304. Sandberg, D. P. Lindstrom, B. A. Sjoqvist, R. A. Parker, R. B.Cotton // Pediatr Pulmonol. 1997. - V. 24. - P. 337-343.

305. Schaffer C. The structure of secondary cell wall polymers: how Gram-positive bacteria stick their cell walls together / C. Schaffer, P. Messner // Microbiology. 2005. - V. 151. - P. 643-651.

306. Schmid A. Developments toward large-scale bacterial bioprocesses in the presence of bulk amounts of organic solvents / A. Schmid, A. Kollmer, R. G. Mathys, B. Witholt // Extremophiles. 1998a. - N. 2. -P. 249-256.

307. Schmid A. Effect of biosurfactant on two-liquid phase Pseudomonas oleovorans cultures and cell-free emulsions containing w-decane / A. Schmid, A. Kollmer, B. Witholt // Enzime Microbial Technol. 19986. -V. 22.-P.487-493.

308. Singer M. E. V. Physiology of biosurfactant synthesis by Rhodococcus species H13-A / M. E. V. Singer, W. R. Finnerty // Can. J. Microbiol. 1990. - V. 36. - P. 741-745.

309. Singh A. Biodegradation and Bioremediation / A. Singh, O. P. Ward. Springer, 2003. 309 pp.

310. Solaiman D. K. Production of sophorolipids by Candida bombicola grown on soy molasses as substrate / D. K. Solaiman, R. D. Ashby, A.

311. Nunez, Т. A. Fogilia // Biotechnol. Lett. 2004. - V. 26. - P. 12411245.

312. Sorkhoh N. A. Establishment of oil-degrading bacteria associated with cyanobacteria in oil-polluted soil / N. A. Sorkhoh, R. H. Al-Hasan, M. Khanafer, S. S. Radwan // J. Appl. Bacteriol. 1995. - V. 78. - P. 194199.

313. Spoeckner S. Glycolipids of the smut fungus Ustilago maydis from cultivation on renewable resources / S. Spoeckner, V.Wray, M. Nimtz, S. Lang // Appl. Microbiol. Biotechnol. 1999. - V. 51. - P. 33-39.

314. Spragg R. G. The future of surfactant therapy for patients with acute lung injury new requirements and new surfactants / R. G. Spragg // Biol. Neonate. - 2002. - V. 81. - P. 20-24.

315. Stackebrandt E. Proposal for a new hierarchic classification system, Actinobacteria classis nov / E. Stackebrandt, F. A. Rainey, N. L. Ward-Rainey // Int. J. Syst. Bacteriol. 1997. - V. 47. - P. 479-491.

316. Stackebrandt E. Evidence of phylogenetic heterogeneity within the genus Rhodococcus: revival of the genus Gordona (Tsukamura) / E. Stackebrandt, J. Smida, M. D. Collins // J. Gen. Appl. Microbiol. -1988.-V. 34.-P. 341-348.

317. Stein T. Bacillus subtilis antibiotics: structures, syntheses and specific functions / T. Stein // Mol. Microbiol. 2005. - V. 56. - P. 845-852.

318. Stelmak P. L. Bacterial adhesion to soil contaminants in the presence of surfactants / P. L. Stelmak, M. R. Gray, M. A. Pickard // Appl. Environ. Microbiol. 1999. - V. 65. - P. 163-168.

319. Sullivan E. R. Molecular genetics of biosurfactant production / E. R. Sullivan // Curr. Opin. Biotechnol. 1998. - V. 9. - P. 263-269.

320. Suzuki T. Trehalose lipid and branched-b-hydroxy fatty acids formed by bacteria grown on w-alkanes / T. Suzuki, K. Tanaka, J. Matsubara, S. Kimoshita//Agric. Biol. Chem. 1969. -V. 33. - P. 1619-1625.

321. Syldatk C. Production of biosurfactants / C. Syldatk, F. Wagner // Biosurfactants and Biotechnology. Eds. N. Kosaric, W. L. Cairns, N. C. C. Gray. Marcel Dekker Inc., New York. 1987. - P. 89-120.

322. Taylor W. H. Pathways for biosynthesis of a bacterial capsular polysaccharide. I. Characterization of the organism and polysaccharide / W. H. Taylor, E. Juni //J. Bacterid. 1961. - V. 81. - P. 688-693.

323. Tiehm A. Degradation of polycyclic aromatic hydrocarbons in the presence of synthetic surfactants / A. Tiehm // Appl. Environ. Microbiol. 1994. - V. 60. - P. 258-263.

324. Tiehm A. Surfactant-enhanced mobilization and biodegradation of polycyclic aromatic hydrocarbons in manufactured gas plant soil / A. Tiehm, M. Stieber, P. Werner, F. Frimmel // Environ. Sci. Technol. -1997.-V. 31.-P. 2570-2576.

325. Toguchi A. Genetics of swarming motility in Salmonella enterica serovar Typhimurium: critical role for lipopolysaccharide / A. Toguchi, M. Siano, M. Burkart, R. M. Harshey // J. Bacterid. 2000. - V. 182. -P. 6308-6321.

326. Toren A. The active component of the bioemulsifier alasan from Acinetobacter radioresistens KA53 is an OmpA-like protein / A. Toren, E. Orr, Y. Paitan, E. Z. Ron, E. Rosenberg // J. Bacteriol. 2002. -V. 184.-P. 165-170.

327. Tsuge K. Horizontal transfer of iturin A operon, itu, to Bacillus subtilis 168 and conversion into an iturin A producer / K. Tsuge, S. Inoue, Т. Ano, M. Itaya, M. Shoda // Antimicrob. Agents Chemother. -2005.-V. 49.-P. 4641-4648.

328. Tuleva В. K. Biosurfactant production by a new Pseudomonas putida strain / В. K. Tuleva, G. R. Ivanov, N. E.Christova // Z. Naturforsch. -2002.-V. 57.-P. 356-360.

329. Tuleva В. K. A model for diffusion controlled bioavailability of crude oil components / В. K. Tuleva, G. R. Ivanov, N. E. Christova // Biodegradation. 1998. - V. 8. - P. 287-296.

330. Urum К. Evaluation of biosurfactants for crude oil contaminated soil washing / K. Urum, T. Pekdemir // Chemosphere. 2004. - V. 57. -P. 1139-1150.

331. Van der Geize R. Harnessing the catabolic diversity of rhodococci for environmental and biotechnological applications / R. Van der Geize, L. Dijkhuizen // Cur. Opin. Microbiol. 2004. - V. 7. - P. 255-261.

332. Van Dyke M. I. Evaluation of microbial surfactants for recovery of hydrophobic pollutants from soil / M. I. Van Dyke, S. L.Gulley, H. Lee., J.T.Trevors//!Ind.Microbiol- 1993.-V. ll.-P. 163-170.

333. Van Hamme J. D. Recent advances in petroleum microbiology / J. D. Van Hamme, A. Singh, O. P. Ward // Microbiol. Mol. Biol. Rev. -2003.-V. 67.-P. 503-549.

334. Vollbrecht E. Microbial conversion of vegetable oils into surface-active di-, tri-, and tetrasaccharide lipids (biosurfactants) by the bacterial strain Tsukamurella spec. / E. Vollbrecht, U. Rau, S. Lang // Lipid. 1999. -V. 101.-P. 389-394.

335. Volkering F. Influence of nonionic surfactants on bioavailability and biodegradation of polycyclic aromatic hydrocarbons / F. Volkering, A. M. Breure, J. G. van Andel, W. H. Rulkens // Appl. Environ. Microbiol. 1995.-V. 61.-P. 1699-1705.

336. Vollenbroich D. Mechanism of inactivation of enveloped viruses by the biosurfactant surfactin from Bacillus subtilis / D. Vollenbroich, M. Ozel, J. Vater, M. Kamp, G. Pauli // Biologicals. 1997a. - V. 25. -P. 289-297.

337. Vollenbroich D. Antimycoplasma properties and application in cell culture of surfactin, a lipopeptide antibiotic from Bacillus subtilis / D. Vollenbroich, G. Pauli, M. Ozel, J. Vater // Appl. Environ. Microbiol. -19976.-V. 63.-P. 44-49.

338. Walsh U. F. Pseudomonas for biocontrol of phytopathogens: from functional genomics to commercial exploitation / U. F. Walsh, J. P.

339. Morrissey, F. O'Gara // Curr. Opin. Biotechnol. 2001. - V. 12. -P. 289-295.

340. Ward 0. Accelerated biodegradation of petroleum hydrocarbon waste / 0. Ward, A. Singh, J. Van Hamme // J. Ind. Microbiol. Biotechnol. -2003.-V. 30.-P. 260-270.

341. Warhurst A. W. Biotransformations catalyzed by the genus Rhodococcus / A. W. Warhurst, C. A. Fewson // Crit. Rev. Biochem. -1994.-V. 14.-P. 29-73.

342. Watanabe M. A new glycolipid from Mycobacterium avium -Mycobacterium intracellular complex / M. Watanabe, S. Kudoh, Y. Yamada, K. Iguchi, D. E. Minnikin I I Biochim. Biophys. Acta. 1992. -V. 1165.-P. 53-60.

343. Wei Y. H. Optimizing iron supplement strategies for enhanced surfactin production with Bacillus subtilis / Y. -H. Wei, L. F. Wang, J.-S. Chang // Biotechnol. Prog. - 20046. - V. 20. - P. 979-983.

344. Wick L. Y. Responses of Mycobacterium sp. LB501T to the low bioavailability of solid anthracene / L. Y. Wick, A. R de Munain., D. Springael, H. Harms // Appl. Microbiol. Biotechnol. 2002. - V. 58. -P. 378-385.

345. Wicke C. Production and structure elucidation of glycoglycerolipids from a marine sponge-associated Microbacterium species / L. Y. Wick, A. R. de Munain, D. Springael, H. Harms // J. Nat. Prod. 2000. - V. 63.-P. 621-626.

346. Wild. M. Selection and partial characterization of a Pseudomonas aeruginosa mono-rhamnolipid deficient mutant / M. Wild., A. D. Caro,

347. A. L. Hernaendez, R. M. Miller, G. Soberoen-Chaevez // FEMS Microbiol. Lett. 1997. - V. 153. - P. 279-285.

348. Wilson R. Overview of the preparation, use and biological studies on polyglycerol polyricinoleate (PGPR) / R. Wilson, B. J. Van Schie, D. Howes // Food Chem. Toxicol. 1998. V. 36. - P. 711-718.

349. Woese C. R. Towards a natural system of organisms: Proposal for the domains Archaea, Bacteria, and Eucarya / C. R. Woese, O. Kandler, M. L. Wheelis // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1990. - V. 87. - P. 45764579.

350. Woods N. R. The methabolism of propane in Rhodococcus rhodochrous PNKbl / N. R. Woods, J. C. Murrell // J. Gen. Microbiol. 1989.-V. 135.-P. 117-123.

351. World Directory of Collections of Cultures of Microorganisms. 5th ed./Eds. H. Sugawara, S. Miyazaki. WFCC-MIRCEN. World Data Centre for Microorganisms, 1999. 140 pp.

352. Wosten H. A. B. Surface-active proteins enable microbial aerial hyphae to grow into the air / H. A. B. Wosten, J. M. Willey // Microbiology. 2000. - V. 146. - P. 767-773.

353. Yakimov M. M. The potential of Bacillus licheniformis strains for in situ enhanced oil recovery / M. M. Yakimov, M. M. Amro, M. Bock, K. Boseker, H. L. Fredrickson, D. G. Kessel, K. N. Timmis // J. Petroleum Sci. Engin.- 1997.-V. 18.-P. 147-160.

354. Yarkoni E. Histopathology of tumor regression by cord factor, turpentine or endotoxin, dissociation of therapy and granuloma formation / E. Yarkoni, L. P. Ruco, H. J. Rapp, M. S. Meltzer// Eur. J. Cancer.- 1979.-V. 15.-P. 1401-1407.

355. Yasuda K. Complement activation by mycoloyl glycolipids from Mycobacterium tuberculosis and Rhodococcus ruber/ K. Yasuda // Osaka City Med. J. 1999. - V. 45. - P. 159-174.

356. Yeom I. Micellar solubilization of polynuclear aromatic hydrocarbons in coal tar contaminated soil /1. Yeom, M. Ghosh, С. Cox, K. Robinson // Environ. Sci. Technol. 1995. - V. 29. - P. 3015-3021.

357. Youssef N. H. Comparison of methods to detect biosurfactant production by diverse microorganisms / N. H. Youssef, К. E. Duncan, D. P. Nagle, K. N. Savage, R. M. Knappb, M. J. Mclnerney // J. Microbiol. Methods. 2004. - V. 56. - P. 339-347.

358. Yuan S. Biodegradation of polycyclic aromatic hydrocarbons by a mixed culture / S. Yuan, S. Wei, B. Chang // Chemosphere. 2000. -V. 41. - P. 1463-1468.

359. Zhang Y. Effect of rhamnolipids on the dissolution, bioavailability, and biodegradation of phenanthrene / Y. Zhang, W. Maier R., Miller // Environ. Sci. Technol. 1997. - V. 31. - P. 2211 -2217.

360. Zhang Y. Enhanced octadecane dispersion and biodegradation by Pseudomonas rhamnolipid surfactant (biosurfactant) / Y. Zhang, R. M. Miller // Appl. Environ. Microbiol. 1992. - V. 58. - P. 3276-3282.

361. Zhang C. Y. A pilot test of EOR by in situ microorganism fermentation in the Daqing oil field / C. Y. Zhang, J. C. Zhang // Dev. Petr. Sci. 1993. - V. 39. - P. 231-244.

362. Zhu X. Literature review on the use of commercial bioremediation agents for cleanup of oil-contaminated estuarine environments / X. Zhu, A. D. Venosa, M. T. Suidan // EPA/600/R-04/075. U.S. Environmental Protection Agency, Cincinnati, 2004. 56 pp.

363. Zhu X. The use of biosurfactants in flotation: application for the removal of metal ions / X. Zhu, A. D. Venosa, M. T. Suidan // Minerals Engineering.-2003.-V. 16.-P. 1231-1236.