Биопленки Staphylococcus aureus: структурно-функциональные характеристики и взаимоотношения с нейтрофилами тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.02.03, кандидат наук Чеботарь, Игорь Викторович

• Чеботарь, Игорь Викторович
• кандидат наук
• 2014

Оглавление диссертации кандидат наук Чеботарь, Игорь Викторович

ОГЛАВЛЕНИЕ

стр.

ВВЕДЕНИЕ

ОСНОВНАЯ ЧАСТЬ

Глава 1. Обзор литературы

1.1. Определение понятия биопленки

1.2. Этапы эволюции стафилококковых биопленок

1.3. Структура биопленок Staphylococcus aureus

1.4. Влияние факторов внешней среды на

биопленки Staphylococcus aureus

1.5. Генетический контроль биопленочного процесса

у золотистого стафилококка

1.6. Биопленки Staphylococcus aureus и иммунная система

1.7. Антибиотикорезистентность биопленочных стафилококков

1.8. Методы исследования стафилококковых биопленок

и диагностика биопленочного процесса

1.9. Стратегия управления стафилококковым

биопленочным процессом

Глава 2. Материалы и методы

2.1. Объем исследований

2.2. Материал для исследований

2.3. Моделирование биопленок

2.4. Люминол-зависимая хемилюминесценция нейтрофилов

2.5. Идентификация видовой принадлежности стафилококков

2.6. Лазерная сканирующая конфокальная микроскопия

2.7. Сканирующая электронная микроскопия

2.8. Трансмиссивная электронная микроскопия

2.9. Лазерное угловое динамическое светорассеяние в оценке размера наночастиц

2.10. Оценка интенсивности биопленкообразования

2.11. Идентификация биохимической природы внеклеточного биопленочного матрикса

2.12. Идентификация биохимической природы везикулярных структур

2.13. Определение количества колониеобразующих единиц

2.14. Количественное определение белка по методу Брэдфорд

2.15. Водоподготовка

2.16. Статистическая обработка результатов

2.17. Программное обеспечение, использованное в

настоящем исследовании

Глава 3. Собственные исследования

3.1. Методический алгоритм для идентификации и количественной оценки стафилококковых биопленок

3.2. Структурные изменения биопленок Staphylococcus aureus

в условиях контакта с нейтрофилами человека

3.3. Нейтрофил-стимулирующие свойства биопленок Staphylococcus aureus

3.4. Экспрессия AgrA в условиях нейтрофил-опосредованного разрушения биопленок Staphylococcus aureus

3.5. Исследование везикулярных наноструктур в системе «нейтрофил - биопленка Staphylococcus aureus»

3.6. Новый метод исследования биопленочной антибиотикорезистентности

3.7. Формирование биопленок Staphylococcus aureus на

поверхностях синтетических эндопротезов

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ И УСЛОВНЫХ ОБОЗНАЧЕНИЙ

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Биопленки Staphylococcus aureus: структурно-функциональные характеристики и взаимоотношения с нейтрофилами»

ВВЕДЕНИЕ

Актуальность темы диссертационного исследования

Течение инфекционных болезней может протекать с осложнениями из-за формирования в организме микробных биопленок [6, 29, 52, 85, 118, 146, 148]. Биопленки являются формой микробных сообществ, фиксированных на поверхностях и состоящих из микробных клеток и ассоциированного с ними внеклеточного матрикса [329]. Инфекции, патогенез которых детерминируется микробными биопленками, называются биопленочными инфекциями [221, 286]. С биопленочными инфекциями связаны многие хронические заболевания - муковисцидозная пневмония, средний отит, патология зубов и околозубных тканей, остеомиелит, инфекции мочевыводящих путей и пр. [28, 148]. До 80 % всех бактериальных инфекций человека связаны с образованием биопленок [286]. Часто биопленки развиваются на поверхности медицинских устройств -протезов, катетеров, имплантов - и являются этиопатогенетической основой развития так называемых девайс-ассоциированных инфекций. В Германии, одной из немногих стран, где ведется статистический учет девайс-ассоциированных инфекций, количество подобных заболеваний превышает 100 000 случаев в год [229, 331]. В Западной Европе и США ежегодно регистрируется более 500 000 случаев катетер-ассоциированных инфекций [5]. Каждое осложнение в виде катетер-ассоциированной инфекции удорожает лечение одного больного на сумму от 33000 до 65000 долларов США [253, 266]. В итоге на лечение и борьбу с осложнениями биопленочных катетер-ассоциированных инфекций система здравоохранения США вынуждена тратить около 2 миллиардов долларов в год [195, 283]. Не случайно многие из последних рекомендаций Центра контроля и профилактики заболеваний США

(CDC), касающиеся бактериальных инфекций, акцентируют внимание на проблемах, связанных с биопленками1.

Стафилококки - актуальные возбудители оппортунистических гнойно-воспалительных заболеваний - являются бактериями, способными к формированию биопленок. Прежде всего, это касается Staphylococcus aureus [69, 176, 230, 258]. Известно, что от 67 % до 78 % клинических изолятов S. aureus могут формировать биопленки [205, 309]. Среди метициллин-резистентных золотистых стафилококков процент биопленкообразующих штаммов in vitro доходит до 96 % [100]. Формирование биопленок с участием S. aureus и Staphylococcus epidermidis может играть решающую роль в патогенезе остеомиелита, синуситов и риносинуситов, эндокардитов, отитов, муковисцидоза, септических артритов, хронической раневой инфекции [95, 127, 175, 188, 214, 221, 293]. Особую роль стафилококковые биопленки играют в развитии инфекций, связанных с имплантами: они обнаруживаются у 1,5-2,5 % больных с первично имплантантированными коленным или тазобедренным суставами, причем в 22-23,6 % случаев от них выделяется S. aureus [254, 269]. Перечисленные факты доказывают важность проблемы биопленок S. aureus для современного здравоохранения. Исследования, направленные на описание структурно-функциональных характеристик биопленок золотистого стафилококка, анализ их взаимоотношений с организмом человека, а также обоснование методов диагностики и лечения стафилококковых биопленочных инфекций являются актуальными направлениями современной медицинской науки.

1 - информация с сайта Centers of Disease Control and Prevention, URL: http://stacks.cdc.gov/cbrowse/?parentId=cdc%3al 00&pid=cdc%3al 00&type=l &fac etRange=960

Степень разработанности темы диссертационного исследования

Одни из первых работ, в которых была описана сложность межклеточных контактов внутри бактериальных колоний, принадлажат отечественному микробиологу Н.Д. Иерусалимскому [19]. Однако, доказательства патогенетической роли микробных сообществ - биопленок - появились лишь около 30 лет назад в работах Т. Мэриэ, Д. Костертона и Д. Неллигана [226, 227]. Основоположниками учения о медицинских бипленках считаются Джон Костертон (автор более 400 работ о биопленках), Томас Мэриэ (автор более 100 работ) и Карла Арсиола (автор более 150 работ). В их работах описаны фундаментальные принципы строения и физиологии микробных биопленок.

В России несколько научных коллективов активно занимаются проблемами биопленок. Научно-исследовательская работа, посвященная проблеме биопленок, проводится на базах ГУ НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Н.Ф. Гамалеи РАМН (под руководством A.JI. Гинцбурга), Санкт-Петербургского государственного университета (под руководством д.б.н. О.В. Рыбальченко), Самарского государственного медицинского университета (под руководством Жесткова A.B.) и других научных коллективов.

Существенный вклад в исследование биопленок внесли зарубежные ученые. Об этом говорит статистика электронного ресурса PubMed: в 2012 году по теме биопленок в зарубежных странах было опубликовано более 3000 научных работ. Работы Дитриха Мака и Ганса-Курта Флемминга посвящены исследованию биопленочного матрикса [171, 230]. Ким Льюис известен своими работами о биопленочной антибиотикорезистентности [27, 218]. Джефф Лейд изучает взаимоотношения биопленок с эффекторами иммунной системы [190]. Анна Донгари работает в области исследований, посвященных взаимодействиям между иммунной системой и биопленками [144]. Ультраструктура бактериальных биопленок и роль биопленкообразования в

симбиотических и антагонистических отношениях микробиоты кишечника человека, исследованные с помощью различных методов электронной микроскопии, отражены в новейшем обзоре Рыбальченко О.В. и Бондаренко В.М. [49]. Приведенная информация свидетельствует о большом интересе научно-медицинского сообщества к проблеме биопленочных процессов.

В большинстве работ, посвященных медицинским биопленкам, в качестве объекта исследования используют микроорганизмы, не относящиеся к роду Staphylococcus. В знаниях о стафилококковых биопленках имеется существенный пробел, касающийся структурно-функциональных особенностей биопленок золотистого стафилококка, которые можно было бы использовать в качестве основы для разработки методов диагностики и управления стафилококковым биопленочным процессом. Вопросы взаимоотношения биопленочных стафилококков с организмом человека, проблемы диагностики и фармакологического контроля стафилококковых биопленочных процессов являются малоизученными направлениями современной медицинской микробиологии.

Цель и задачи исследования

Цель исследования:

Охарактеризовать структурно-функциональные свойства биопленок Staphylococcus aureus для обоснования рациональных подходов к диагностике и управлению стафилококковыми биопленочными инфекциями.

Задачи исследования:

1. На основе изучения морфо-функциональных и физико-химических свойств биопленок S. aureus разработать и апробировать диагностический алгоритм для идентификации и количественной оценки стафилококковых биопленок.

2. Описать феноменологию и изучить механизмы структурных изменений в биопленке S. aureus, возникающих при взаимодействии с нейтрофилами в условиях in vitro.

3. Охарактеризовать нейтрофил-стимулирующие свойства биопленок S. aureus.

4. Проанализировать структурно-функциональные особенности дериватов, образующихся в результате взаимодействия нейтрофилов с биопленкой S. aureus.

5. Исследовать структурно-функциональные особенности липидных дериватов, образующихся в результате взаимодействия нейтрофилов с биопленкой S. aureus.

6. Разработать и апробировать способ, сочетающий в себе (1) определение чувствительности биопленочных микробов к антимикробным препаратам и (2) избирательную оценку фильтрующей способности биопленок в

у

отношении противомикробных агентов.

7. Исследовать возможность образования биопленки S. aureus на поверхности синтетических макропористых сетчатых эндопротезов, применяемых в хирургии для пластики брюшной стенки.

Научная новизна

Впервые была показана возможность использования метода масс-спектрометрии для идентификации видовой принадлежности биопленочных стафилококков из моновидовой стафилококковой биопленки. Охарактеризованы структурно-функциональные признаки биопленок S. aureus, которые могут быть использованы для подтверждения наличия биопленки и оценки интенсивности биопленкообразования. В частности, лимитированные микроколебания клеток в стафилококковой биопленке описаны в качестве нового критерия наличия межклеточного биопленочного матрикса. Оптимизирована методика выявления ультрамикроструктур межклеточного биопленочного матрикса биопленок S. aureus при помощи сканирующей электронной микроскопии. Впервые была доказана необходимость применения различных методов для оценки интенсивности биопленкообразования на разных сроках культивирования биопленок. Показано, что вновь разработанный способ количественного учета стафилококков был оптимальным методом для количественной оценки ранних биопленок (менее 24 часов). Подтверждено, что метод количественной оценки биопленок на основе спектрофотометрического исследования элюатов красителя, смытого с предварительно окрашенной биопленки, был неэффективен для ранних (менее 24 часов) и оптимален для более зрелых биопленок (24 часа и более).

Вскрыты механизмы нейтрофил-зависимой деструкции биопленок S. aureus, которые связаны с разрушением протеино-нуклеотидного биопленочного матрикса ферментами нейтрофилов. Было обнаружено, что нейтрофилы, разрушая биопленку, не обеспечивают полного киллинга биопленочных стафилококков. Впервые охарактеризовано явление высвобождения стафилококков из разрушаемых нейтрофилами биопленок и их трансформации в жизнеспособные планктонные (плавающие) бактерии, что в

и

условиях реальной патологии может привести к диссеминации возбудителя в организме и генерализации инфекционного процесса.

Впервые проанализированы особенности стимуляции люминол-зависимой хемилюминесцении нейтрофилов человека в реакциях с биопленками S. aureus: биопленочные стафилококки обладали пониженной способностью индуцировать эту реакцию по сравнению с планктонными стафилококками. Было выявлено, что это снижение связано с наличием в биопленке внеклеточного протеино-нуклеотидного матрикса.

Впервые описаны особенности коррелирующей с вирулентностью стафилококка экспрессии гена AgrA при взаимодействии между биопленкой S. aureus и нейтрофилами человека. Доказано, что стафилококки, трансформируясь в планктонные формы, демонстрировали усиление экспрессии AgrA, что было новым свидетельством повышения вирулентности стафилококков, высвобождавшихся из биопленки.

Впервые обнаружены и охарактеризованы наноразмерные везикулы, которые появляются в инкубационной среде при взаимодействии биопленки S. aureus с нейтрофилами человека. Везикулы обладали способностью разрушать биопленки S. epidermidis, что, по-видимому, было связано с присутствием в их составе протеинов, дестабилизирующих биопленочный матрикс.

С помощью вновь предложенного метода оценки антибиотикорезистентности биопленочных бактерий был доказан факт снижения скорости фильтрации антибиотика (пефлоксацин) через биопленку по сравнению с фильтрацией через слой адгезированных между собой планктонных стафилококков. Это явление сопровождалось повышением выживаемости биопленочных стафилококков при обработке терапевтическими концентрациями пефлоксацина и рассматривалось в качестве механизма снижения чувствительности биопленочных стафилококков (S. aureus) к антибиотикам.

Была установлена способность S. aureus к формированию биопленок на поверхности синтетических эндопротезов, применяемых в отечественной

хирургии для пластики брюшной стенки (полипропилен, поливинилиденфторид, комплекс «полипропилен-поливинилиденфторид» и реперен). Это стало свидетельством универсальности биопленкообразования золотистым стафилококком, который способен закрепляться и размножаться на разнообразных полимерных поверхностях.

Теоретическая и практическая значимость работы

Результаты настоящего исследования вносят существенный вклад в изучение структурно-фунциональных характеристик биопленок, сформированных золотистыми стафилококками, дополняют научные представления о морфологии и физиологии биопленок, позволяют обосновать новые походы к диагностике и лечению биопленочных процессов. Научно обоснована и подтверждена концепция о том, что разрушение биопленок S. aureus нейтрофилами создает условия для диссеминации стафилококков в организме. Выявлены ранее неизвестные закономерности изменений экспрессии agr-системы, контролирующей вирулентность золотистого стафилококка, которые происходили в процессе нейтрофил-опосредованного разрушения биопленок S. aureus. Расширены представления о функциях внеклеточного матрикса, обеспечивающих защиту биопленочных стафилококков за счет подавления кислород-зависимой биоцидности нейтрофилов. Исследование фильтрации антибиотика через биопленку S. aureus позволило установить связь между замедлением проникновения антибиотика сквозь биопленку и устойчивостью биопленочных стафилококков к его действию. Получено представление о том, что золотистый стафилококк проявляет универсальность в использовании синтетических поверхностей для формирования на них биопленок, что продемонстрировано на моделях эндопротезов, изготовленных из различных материалов.

Предложен и апробирован новый алгоритм исследования стафилококковых биопленок, включающий набор методик, направленных на

идентификацию биопленочного стафилококка, обнаружение специфичных для биопленки структур, а также на количественную оценку интенсивности биопленкообразования.

Установленное матрикс-зависимое подавление хемилюминесценции нейтрофилов демонстрирует возможность использования биопленочных компонентов (матрикс) для создания новых препаратов, ингибирующих фагоцитарные реакции.

Обнаружены и охарактеризованы везикулы с антибиопленочным эффектом в отношении биопленок S. epidermidis, которые могут стать прототипом нового класса антибиопленочных препаратов.

Предложен новый метод, который позволяет производить одновременную оценку (1) резистентности биопленочных бактерий к противомикробному препарату и (2) избирательную оценку фильтрующей способности биопленки в отношении этого препарата.

Выявленная способность клеток S. aureus к формированию биопленок на поверхности эндопротезов (полипропилен, поливинилиденфторид, реперен, полипропилен-поливинилиденфторид) должна учитываться при имплантации эндопротезов в контаминированные раны.

Методология и методы исследования

Методология настоящего исследования спланирована, исходя из современных принципов научного познания [25, 26]. Методология организована адекватно поставленной цели. Предметом исследования стали проблемы, связанные со стафилококковыми биопленочными процессами. Анализ научной литературы, посвященной проблеме стафилококковых биопленок, проведен на основе формально-логических методов исследования. Планирование и проведение исследований, направленных на решение поставленных задач, осуществлялось на основе общенаучных и специфических методов.

Основными объектами исследования являлись биопленки, образованные золотистыми стафилококками S. aureus, биопленочный матрикс, биопленочные золотистые стафилококки, планктонные стафилококки, нейтрофилы крови человека, везикулярные структуры из реакционной смеси биопленок S. aureus и нейтрофилов., В основу дизайна исследования были положены два типа экспериментов. Первый был основан на регистрации морфологических и функциональных параметров (и их изменений) нативных биопленок S. aureus и биопленок, подвергавшихся воздействию со стороны клеточных (нейтрофилы) и неклеточных (ферменты, антибиотики, окислители) агентов. Второй тип экспериментов был основан на регистрации морфо-функциональных параметров (и их изменений) нейтрофилов человека в реакциях с биопленками S. aureus и отдельными компонентами биопленок (бактериальные клетки, внеклеточный биопленочный матрикс).

В работе применялись следующие методы исследования: бактериологические методы, гистологические методы, биохимические методы, иммунологические методы, центрифугирование, спектрофотометрия, методы сепарации клеток крови, цитологические методы, методы традиционной световой микроскопии, исследование хемилюминесценции, лазерная

сканирующая конфокальная микроскопия, электронная трансмиссионная и электронная сканирующая микроскопия, масс-спектрометрия, измерение размера и заряда наночастиц методом лазерного углового динамического светорассеяния. Результаты анализировались при помощи статистических методов.

Использованные аппараты и оборудование: цетрифуги, ламинарные шкафы, лабораторная посуда, холодильники, термостаты, сухожаровые шкафы, автоклавы, световые микроскопы, дозаторы пипеточные автоматические, фото- и видеокамеры, денситометр DensiLaMeter II (производство «ERBA Lachema»), хемилюминометр Luminoskan Ascent (производство «Thermo Scientific»), спектрофотометр СФ-46 (производство . «ЛОМО»), прибор для измерения размера наночастиц Beckman Coulter Submicron Particle Size Analyzer (Model N5 Analazer, производство «Beckman Coulter»), лазерные сканирующие микроскопы LSM 510 Meta (производство «Zeiss») и TCS SP5 (производство «Leica Microsystems»), масс-спектрометр Microflex (производство «Bruker Daltonics»), сканирующий электронный микроскоп JSM 6390А (производство «JEOL»), трансмиссивный электронный микроскоп Morgagni 268D (производство «FEI») и другие устройства и инструменты.

Использованные реактивы: питательные среды для культивирования микроорганизмов, красители, ферменты, наборы солей, компаунды, солевые растворы для культивирования клеток, средства для фракционирования клеток, антикоагулянты, фиксативы, тест-системы для идентификации стафилококков (API Staph, производство «BioMerieux») и другие.

Использованные информационные средства: программные пакеты Statistica, пакеты программ, входящие в комплект использованного оборудования (LAS AF Lite, Zeiss LSM Image Browser и другие), международные компьютерные базы данных и информационные научные ресурсы (PubMed, Scirus, ScienceDirect, Gene, Protein и другие).

Личное участие автора в получении результатов

Участие автора заключалось в выборе темы диссертации, формулировке цели и задач, а также обосновании дизайна исследования. Диссертация представляет собой обобщение и анализ результатов, полученных автором лично. Автором проводилась статистическая обработка полученных результатов, а также сопоставление результатов исследования с данными научной литературы.

Отдельные эксперименты были выполнены совместно с сотрудниками Нижегородской государственной медицинской академии (экспрессия генов изучалась совместно с научным сотрудником группы постгеномных технологий НИИ ПФМ, к.б.н. Е.Л. Гурьевым, трансмиссивная электронная микроскопия выполнялась совместно с заведующей отделом электронной микроскопии ЦНИЛ, к.б.н. М.Л. Бугровой, моделирование биопленок осуществлялось совместно с ассистентами кафедры микробиологии и иммунологии, к.б.н. Н.И. Евтеевой, Е.И. Рудневой и Е.Д. Кончаковой), Института теоретической и экспериментальной биофизики РАН (сканирующая электронная микроскопия выполнялась совместно с д.б.н., профессором А.Г. Погореловым), Института биофизики клетки РАН (лазерная сканирующая микроскопия проводилась совместно с В.А. Яшиным), НИИ педиатрии Научного центра здоровья детей РАМН (масс-спектрометрия выполнялась совместно с д.м.н., профессором H.A. Маянским, клиническим ординатором Г.Г. Ломинадзе, врачами-бактериологами

A.B. Лазаревой и В.П. Чистяковой), ГБУЗ ГО Городской больницы № 35 г. Нижнего Новгорода (исследование биопленкообразования на эндопротезах проводилось совместно с врачами-хирургами, д.м.н. В.В. Паршиковым, к.м.н.

B.Г. Фирсовой, A.A. Самсоновым, В.А. Ходаком, И.Ю. Лазаревым) при непосредственном участии автора. Написание программы для ЭВМ «Подсчет микробов в кластерах» осуществлялось совместно с A.A. Таланиным. Вклад

коллег отражен в соавторстве в ряде работ, опубликованных в периодических научных изданиях

Автор выражает искреннюю благодарность научному консультанту, д.м.н., профессору А.Н. Маянскому за ценные советы на всех этапах выполнения работы.

Положения, выносимые на защиту

1. Количественная оценка ранних этапов биопленкообразования возможна с использованием методов учета, позволяющих подсчитать количество бактерий на микроскопическом уровне.

2. Биопленки S. aureus разрушаются под воздействием нейтрофилов человека. Процесс разрушения сопровождается высвобождением биопленочных стафилококков и трансформацией их в жизнеспособные планктонные (плавающие) формы с одновременным повышением экспрессии AgrA, ассоциированного с проявлением их вирулентности.

3. Способность стимулировать респираторный взрыв нейтрофилов у биопленочных стафилококков выражена слабее, чем у планктонных (небиопленочных) стафилококков.

4. При взаимодействии нейтрофилов человека и биопленок S. aureus в реакционной среде появляются наноразмерные везикулы, структурообразующими компонентами которых служат фосфолипиды и протеины, обладающие биологической активностью, которая проявляется в способности разрушать биопленки S. epidermidis.

5. Скорость фильтрации антибиотиков через биопленки S. aureus достоверно ниже, чем через эквивалентный по количеству бактерий слой небиопленочных стафилококков.

Степень достоверности и апробация результатов исследования

О достоверности результатов работы свидетельствует использование современных адекватных методов исследования, которые характеризуются высокой чувствительностью, объективностью, а также поддерживаются программным обеспечением, позволяющим проводить статистический анализ больших массивов данных. Использование указанных методов, а также корректной статистической обработки позволило количественно оценить объем стафилококковых биопленок, восстановить трехмерную структуру стафилококковых биопленок, визуализировать наноразмерные структуры (матрикс), на основе которых идентифицируются биопленки, обнаружить и охарактеризовать везикулярные структуры, образующиеся при взаимодействии стафилококковых биопленок с нейтрофилами, исследовать биохимические характеристики матрикса биопленок, исследовать состояние кислород-зависимого метаболизма нейтрофилов при контакте со стафилококковыми биопленками, оценить экспрессию гена AgrA у стафилококков и исследовать антибиотикорезистентность биопленочных стафилококков. Основные феномены, обнаруженные и изученные в ходе исследования, были воспроизведены в опытах с разными штаммами золотистого стафилококка.

Диссертация апробировалась на заседании кафедры микробиологии и иммунологии ГБОУ ВПО «Нижегородская государственная медицинская академия» Минздрава России 21 января 2013 года (протокол № 27) и на расширенном заседании проблемной комиссии «Иммунология, инфекционная патология и эпидемиология» ГБОУ ВПО «Нижегородская государственная медицинская академия» Минздрава России 19 июня 2013 года (протокол № 11).

Основные результаты диссертации докладывались и обсуждались на 8-й Всероссийской конференции «Актуальные вопросы герниологии» (Москва, 2011), Приволжской региональной научно-практической конференции «Актуальные вопросы хирургии, травматологии, ортопедии и интенсивной

терапии» (Саранск, 2011), XIII Всероссийском научном форуме «Мать и дитя» (Москва, 2012), V Общероссийском научно-практическом семинаре «Репродуктивный потенциал России: версии и контрверсии» (Сочи, 2012).

Внедрение результатов работы

Разработанные методы исследования биопленок используются для изучения катетеров и эндопротезов в хирургической практике в ГБУЗ ГО Городская больница № 35 (Нижний Новгород), на кафедре госпитальной хирургии им. Б.А. Королева ГБОУ ВПО «Нижегородская государственная медицинская академия» Минздрава России. Результаты исследования используются в лекциях и на практических занятиях при обучении студентов и клинических ординаторов на кафедре микробиологии и иммунологии ГБОУ ВПО «Нижегородская государственная медицинская академия» Минздрава России.

Публикации

Результаты проведенного диссертационного исследования в полном объеме изложены в 21 научной работе, опубликованной автором, из которых 15 работ опубликованы в изданиях, включенных в Перечень ведущих рецензируемых научных журналов и изданий ВАК, и 6 работ опубликованы в сборниках материалов конференций и конгрессов. Получено Свидетельство Федеральной службы по интеллектуальной собственности, патентам и товарным знакам (Роспатент) о государственной регистрации программы для ЭВМ «Подсчет микробов в кластерах» (№ 2010613048 от 07.05.2010 года).

Объем и структура диссертации

Диссертация изложена на 239 страницах машинописного текста и состоит из введения, основного текста (обзор литературы, глава, посвященная описанию материалов и методов исследований, и 7 глав собственных исследований), заключения, списка сокращений и условных обозначений, списка литературы. Диссертация иллюстрирована 11 таблицами и 39 рисунками. Библиографический указатель включает 347 источников литературы, в том числе 61 ссылку на отечественных авторов и 286 ссылок на зарубежных авторов.

Глава 1. Обзор литературы 1.1. Определение понятия биопленки

Для выживания и размножения в организме человека микробы применяют разнообразные приёмы. Одной из таких стратегий является особая структурно-функциональная организация микробов в сообществах, которые получили название биопленок. Биопленка (англ. Ыо/Ит) - «слой бактериальных клеток, прикрепленных к поверхности и друг к другу, заключенных в биополимерный матрикс» [48, 21]. Существут и более детальные толкования. Например, биопленка - это «постоянно обновляющееся сообщество микробов, закрепившихся на биогенном или абиогенном субстратах и окруженных внеклеточным полимерным матриксом, который предохраняет их от вредных воздействий и является одним из факторов межклеточного взаимодействия» [36, 320]. Боп1ап и Соз1ег1оп (2002) считают, что. микробные биопленки - это «образованные оседлыми (сессильными) микробами сообщества, характеризующиеся тем, что клетки, прикрепленные к субстрату или к поверхности друг друга, погружены в матрикс, образованный внеклеточными полимерными субстанциями; при этом микробы проявляют особый фенотип, зависящий от фазы роста и экспрессии генов» [148]. Однако, все существующие определения сходны в том, что биопленка содержит три обязательных атрибута: (1) поверхность (интерфаза), на которой локализуется биопленка, (2) совокупность микроорганизмов и (3) внеклеточный матрикс, объединяющий микроорганизмы в единую систему.

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Чеботарь, Игорь Викторович, 2014 год

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

1. Акатов, А.К. Стафилококки / А.К. Акатов, B.C. Зуева. - М.: Медицина, 1983.- 256 с.

2. Антибактериальные лекарственные средства. Методы стандартизации препаратов / под ред. Р.У. Хабриева. - М.: Медицина, 2004. - 944 с.

3. Антибиотикорезистентность биопленочных бактерий. / И.В. Чеботарь, А.Н. Маянский, Е.Д. Кончакова и др. // Клин, микробиол. антимикроб, химиотер. - 2012. - Том 14, № 1. - С. 51-58.

4. Берд, Р. Явления переноса / Р. Берд, В. Стюарт, Е. Лайфут. - М.: Химия, 1974. - 688 с.

5. Бережанский, Б.В. Катетер-ассоциированные инфекции кровотока / Б.В. Бережанский, A.A. Жевнарев // Клин, микробиол. антимикроб, химиотер.

- 2006. - Том 8, №2. - С. 130-144.

6. Биопленки патогенных бактерий и их роль в хронизации инфекционного процесса. Поиск средств борьбы с биопленками / Ю.М. Романова, Л.В. Диденко, Э.Р. Толордава, А.Л. Гинцбург // Вестн РАМН. - 2011. - №10. -С. 31-39.

7. Гланц, С. Медико-биологическая статистика / С. Гланц. - М.: Практика, 1999.- 459 с.

8. Голуб, A.B. Бактериальные биопленки - новая цель терапии? / A.B. Голуб // Клин, микробиол. антимикроб, химиотер. - 2012. - Том 14, №1.

- С. 23-28.

9. Гостев, В.В. Бактериальные биопленки и инфекции / В.В. Гостев, C.B. Сидоренко // Журн. инфектологии. - 2010. - Том 2, № 3. - С. 4-15.

Ю.Дерябин, Д.Г. Сравнение эффективности трех тест-систем для идентификации стафилококков: ПБДС (Россия), STAPHYtest-16 (Чехия)

и API-Staph (Франция) / Д.Г. Дерябин, Н.П. Фот // Клин. лаб. диагност. -2004. -№4. -С.42-45.

11. Дерябин, Д.Г. Стафилококки: экология и патогенность / Д.Г. Дерябин. -Екатеринбург: УроРАН, 2000. - 240 с.

12. Десятникова, И.Б. Способ лечения эвентрации в гнойную рану / И.Б. Десятникова, М.А. Сидоров, A.C. Берлин // Научно-медицинский вестник центрального Черноземья. - 2007. - №29. - С. 104-105.

13. Долгушин, И.И. Нейтрофилы и гомеостаз / И.И. Долгушин, О.В. Бухарин. - Екатеринбург: Изд-во УрОРАН, 2001. - 284 с.

14. Долгушин, И.И. Нейтрофильные внеклеточные ловушки и методы оценки функционального статуса нейтрофилов / И.И. Долгушин, Ю.М. Андреева, А.Ю. Савочкина. - М.: Изд-во РАМН, 2009. - 208 с.

15. Долгушин, И.И. Нейтрофильные внеклеточные ловушки: метод обнаружения и оценка эффективности улавливания бактерий / И.И. Долгушин, Ю.С. Андреева // Журн. микробиол. - 2009. - № 2. - С. 65-67.

16. Долгушин, И.И. Роль нейтрофилов в регуляции антимикробной резистентности // И.И. Долгушин // Вестник РАМН. - 2002. - № 3. - С. 1621.

17. Долгушин, И.И. Секреторные продукты нейтрофилов и иммунный ответ / И.И. Долгушин, A.B. Зурочка, A.B. Власов // Иммунология. - 1990. -№3.- С. 35-37.

18. Заславская, М.И. Реактивность нейтрофилов на фоне зимозан-индуцированной дестабилизации крови : автореф. дис. ... канд. биол. наук: 14.00.16, 14.00.36 / Заславская Майя Исааковна. - Казань, 1994. -20 с.

19. Иерусалимский, Н. Д. Физиология развития чистых бактериальных культур: автореф. дис. ... д-ра биол. наук / Иерусалимский Николай Дмитриевич. - М., 1952. - 38 с.

20. Изучение строения биопленок, образуемых бактериями Salmonella typhimurium на абиотических поверхностях, методами световой и трансмиссивной микроскопии / Т.А. Смирнова, JI.B. Диденко, И.Г. Тиганова и др. // Биотехнология. - 2009. - № 5. - С. 16-23.

21. Ильина, Т.С. Биопленки как способ существования бактерий в окружающей среде и организме хозяина: феномен, генетический контроль и системы регуляции их развития / Т.С. Ильина, Ю.М. Романова, А.Л. Гинцбург // Генетика. - 2004. - Том 40, № 11. - С. 14451456.

22. Ильина, Т.С. Системы коммуникации у бактерий и их роль в патогенности / Т.С. Ильина, Ю.М. Романова, А.Л. Гинцбург // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. - 2006. - №3. - С. 22-29.

23. Иммунобиологические особенности бактериальных клеток медицинских биопленок / В.А. Бехало, В.М. Бондаренко, Е.В. Сысолятина, Е.В. Нагурская // Журн. микробол. - 2010. - №4. - С. 97-105.

24. Кнорре, Д. Г. Биологическая химия / Д.Г. Кнорре, С.Д. Мызина. - М.: Высшая школа, 2000. - 479 с.

25. Кохановский, В.П. Философия и методология науки / В.П. Кохановский. - Ростов-на-Дону: Феникс, 1999. - 576 с.

26. Купцов, В.И. Философия и методология науки / В.И. Купцов. - М.: Аспект Пресс, 1996. - 252 с.

27. Льюис, К. Персистирующие клетки и загадка выживания биопленок / К. Льюис // Биохимия. - 2005. - Том 70, № 2, - С. 327-336.

28. Лямин, A.B. Методы выявления биопленок в медицине: возможности и перспективы / A.B. Лямин, Е.А. Боткин, A.B. Жестков // Клин, микробиол. антимикроб, химиотер. -2012. - Том 14, №1. - С. 17-22.

29. Лямин, A.B. Проблемы в медицине, связанные с бактериальными биопленками / A.B. Лямин, Е.А. Боткин, A.B. Жестков // Клин, микробиол. антимикроб, химиотер. - 2012. - Том 14, №4. - С. 268-274.

30. MALDI-TOF масс-спектрометрия в рутинной работе микробиологической лаборатории / H.A. Маянский, А.Н. Калакуцкая, О.В. Мотузова и др. // Вопр. диагностики в педиатрии. - 2011. - Том 3, №5.-С. 20-25.

31. Матульская, Л.И. Определение кислой ДНКазы в лимфоцитах и нейтрофилах человека / Л.И. Матульскаят-О.М. Фаломеева // Лаб. дело. -1980. -№10. - С. 586-588.

32. Маянский, А.Н. Реактивная хемилюминесценция в системе фагоцитоза / А.Н. Маянский, А.Л. Невмятуллин, И.В. Чеботарь // Журнал микробиол. -1987. - №7. - С.109-115.

33. Маянский, А.Н. Лекции по иммунологии / А.Н. Маянский. - Нижний Новгород: Изд-во НГМА, 2005. - 272 с.

34. Маянский, А.Н. Очерки о нейтрофиле и макрофаге / А.Н. Маянский, Д.Н. Маянский. - Новосибирск: Наука, 1989. - 340 с.

35. Маянский, А.Н. Патогенетическая микробиологи / А.Н. Маянский. -Нижний Новгород: Изд-во НГМА, 2006. - 520 с.

36. Маянский, А.Н. Стафилококковые биопленки: структура, регуляция, отторжение / Маянский, А.Н., Чеботарь И.В. // Журн. микробиол. - 2011. №1. - С. 101-108.

37. Маянский, А.Н. Функциональное зондирование нейтрофилов: проблемы и перспективы / А.Н. Маянский, A.JI. Невмятуллин // Клин. лаб. диагност. - 1997. - №5. - С. 24-27.

38. Мельников, Н.И. «Ферменты патогенности" и токсины бактерий / Н.И. Мельников, В.Н. Мельников, М.Г. Гимранов - М.: Медицина, 1969. - 252 с.

39. Невмятуллин, А. J1. Реактивная хемилюминесценция нейтрофилов человека в системах со стафилококками : автореф. дис. ... канд. мед. наук : 14.00.36 / Невмятуллин Абуалисина Летфуллович. - Челябинск, 1988.-20 с.

40. Образование биопленок - пример «социального» поведения бактерий / Ю.М. Романова, Т.А. Смирнова, А.Л. Андреев и др. // Микробиология. -2006. - Том 75, №4. - С. 556-561.

41. Определение гемоглобина с использованием додецедилсульфата натрия /

A.A. Ахрем, Г.М. Андреюк, С.Н. Киселева и др. // Лаб. дело. - 1989. -№5.-С. 13-15.

42. Пинегин, Б.В. Макрофаги: свойства и функции / Б.В. Пинегин // Иммунология. - 2009. - №4. - С. 241-249.

43. Пинегин, Б.В. Нейтрофилы: структура и функция / Б.В. Пинегин, А.Н. Маянский // Иммунология. - 2007. - №6. - С. 374-382.

44. Плакунов, В.К. Персистенция и адаптивный мутагенез в биопленках /

B.К. Плакунов, Е.А. Стрелкова, М.В. Журина // Микробиология. - 2010. -Том 79, №4. - С. 447-458.

45. Подавление бактериальных биопленок при гнойно-некротических осложнениях синдрома диабетической стопы методом ультразвуковой кавитации / Б.В. Рисман, О.В. Рыбальченко, В.М. Бондаренко, A.B. Рыжанкова // Журн. микробиол. - 2011. - №4. - С. 14-19.

46. Подосинников, И.С. Метод определения хемотаксичекой активации лейкоцитов / И.С. Подосинников, Л.Г. Нилова, И.Б, Бабаченко // Лаб. дело. - 1981. №8. - С. 468-470.

47. Практическое руководство по антиинфекционной химиотерапии / под ред. Л.С. Страчунского, Ю.Б. Белоусова, С.Н. Козлова. - Смоленск: НИИАХ СГМА, 2002. - 586 с.

48. Романова, Ю.М. Бактериальная биопленка как естественная форма существования бактерий в окружающей среде и организме хозяина / Ю.М. Романова, А.Л. Гинцбург // Журн. микробиол. - 2011. - №3. - С. 99-109.

49. Рыбальченко, О.В. Образование биопленок симбионтными представителями микробиоты кишечника как форма существования бактерий / О.В.Рыбальченко, В.М. Бондаренко // Вестник Санкт-Петербургского университета. - 2013. - Cep.l 1, Вып.1. - С. 179-186.

50. Рыбальченко, О.В. Электронно-микроскопическое исследование межклеточных взаимодействий микроорганизмов при антагонистическом характере взаимоотношений / О.В. Рыбальченко // Микробиология. - 2006. -Том 75, №4.-С. 550-555.

51. Современные технологии исследования бактериальных биопленок / И.В. Чеботарь, А.Г. Погорелов, В.А. Яшин и др. // СТМ. - 2013. - Том 5, № 1. - С.14-20.

52. Структурно-функциональная характеристика бактериальных биопленок / Т.А. Смирнова, Л.В. Диденко, P.P. Азизбекян, Ю.М. Романова // Микробиология. - 2010. - Том 79, № 4. - С. 435-446.

53. Технология определения и роль внеклеточных ловушек в антимикробной защите / И.И. Долгушин, Ю.С. Шишкова, А.Ю. Савочкина и др. // Вестник РАМН. - 2010. - № 4. - С. 26-30.

54. Тец, Г.В., Артеменко K.JI. Совместное действие антибиотиков и дезоксирибонуклеазы на бактерии / Г.В. Тец, K.J1. Артеменко // Антибиотики и химиотерапия. - 2006. - Том 51, №53. - С. 3-6.

55. Флуер, Ф.С. Стафилококковые энтеротоксины, их свойства и роль в качестве факторов патогенности / Ф.С. Флуер // Журн. Микробиол. -2012. - №2. - С. 99-108.

56. Флуер, Ф.С. Стафилококковый токсин синдрома токсического шока / Ф.С. Флуер // Журн. микробиол. - 2007. - № 5. - С. 106-114.

57. Чеботарь, И.В. Лабораторная диагностика клинически значимых биопленочных процессов / И.В. Чеботарь, Е.Л. Гурьев // Вопр. диагностики в педиатрии. - 2012. - №4. - С. 15-20.

58. Чеботарь, И.В. Механизмы антибиопленочного иммунитета / И.В. Чеботарь // Вестник РАМН. - 2012. - № 12. - С.22-29.

59. Чеботарь, И.В. Нейтрофилзависимое разрушение биопленок, образованных Staphylococcus aureus / И.В. Чеботарь, Е.Д. Кончакова, Н.И. Евтеева // Журн. микробиол. - 2012. - №1. - С. 10-15.

60. Чеботарь, И.В. Новый метод количественного учета кокков в надклеточных образованиях - кластерах и биопленке / И.В. Чеботарь, А.А. Таланин, Е.Д. Кончакова // СТМ. - 2010. - № 3. - С. 14-17.

61. Штейн, Г.И. Руководство по конфокальной микроскопии / Г.И. Штейн. -Санкт-Петербург: СПб ИНЦ РАН, 2007. - 77 с.

62. A novel mechanism of rapid nuclear neutrophil extracellular trap formation in response to Staphylococcus aureus / F.H. Pilsczek, D. Salina, K.K. Poon et al. // J. Immunol. - 2010. - Vol. 185, №12. - P. 7413-7425.

63. A novel Staphylococcus aureus biofilm phenotype mediated by the fibronectin-binding proteins, FnBPA and FnBPB / E. O'Neill, C. Pozzi, P. Houston et al. // J. Bacteriol. - 2008. - Vol.190, №11. - P. 3835-3850.

64. A simple in vitro model for growth control of bacterial biofilms / A.E. Hodgson, S.M. Nelson, M.R. Brown, P. Gilbert // J. Appl. Bacteriol. - 1995. -Vol. 79, №1. - P. 87-93.

65. A zinc-dependent adhesion module is responsible for intercellular adhesion in staphylococcal biofilms / D.G. Conrady, C.C. Brescia, K. Horii et al. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 2008. - Vol. 105, №49.-P. 19456-19461.

66. Activation of T Lymphocytes in Response to Persistent Bacterial Infection: Induction of CDllb and of Toll-Like Receptors on T Cells [ Электронный ресурс ] / D. Kotsougiani, M. Pioch, B. Prior et al. // Int. J. Inflam. - 2010. -Vol. 22, № 526740. - Режим доступа: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed.

67. Adherence of coagulase-negative staphylococci to plastic tissue culture plates: a quantitative model for the adherence of staphylococci to medical devices / G.D. Christensen, W. A. Simpson, J. J. Younger et al. // J. Clin. Microbiol. - 1985. - №22. - P. 996-1006.

68. Adverse effect of staphylococci slime on in vitro activity of glycopeptides / T. Mathur, S. Singhal, S. Khan et al. // Jpn. J. Infect. Dis. - 2005. - Vol. 58, №6. -P. 353-357.

69. Agarwal, A. Medical significance and management of staphylococcal biofilm / A. Agarwal, K.P. Singh, A. Jain // FEMS Immunol. Med. Microbiol. - 2010. -Vol.58, №2.-P. 147-160.

70. agr-Dependent interactions of Staphylococcus aureus USA300 with human polymorphonuclear neutrophils / Y.Y. Pang, J. Schwartz, M. Thoendel et al. // J. Innate Immun. - 2010. - Vol. 2, №6. - P. 546-559.

71. Allison, D.G. The biofilm matrix / D.G. Allison // Biofouling. - 2003. - Vol. 19, №2. - P. 139-150.

72. Al-Mutairi, D. Bacterial biofilms and the pathophysiology of chronic rhinosinusitis / D. Al-Mutairi, S.J. Kilty // Curr. Opin. Allergy Clin. Immunol. -2011.-Vol. 11, №1.-P. 18-23.

73. An endonuclease activity in human polymorphonuclear neutrophils that removes 8-hydroxyguanine residues from DNA+ / M.H. Chung, H.S. Kim, E. Ohtsuka et al. // Biochem. Biophys. Res. Commun. - 1991. - Vol. 178, №3. -P. 1472-1478.

74. Anderl, J.N. Role of antibiotic penetration limitation in Klebsiella pneumoniae biofilm resistance to ampicillin and ciprofloxacin / J.N. Anderl, M.J. Franklin, P.S. Stewart // Antimicrob. Agents Chemother. - 2000. - Vol. 44, №7.-P. 1818-1824.

75. Anderson, G.G., O'Toole GA. Innate and induced resistance mechanisms of bacterial biofilms / G.G. Anderson, G.A. O'Toole // Curr. Top. Microbiol. Immunol.- 2008. - № 322. - P. 85-105.

76. Antibacterial activity of Thymoquinone, an active principle of Nigella sativa and its potency to prevent bacterial biofilm formation / K. Chaieb, B. Kouidhi, H. Jrah et al. // BMC Complement. Altern. Med. - 2011. - Vol. 13, № 11. - P. 29.

77. Antibacterial and antibiofilm properties of yttrium fluoride nanoparticles / J. Lellouche, A. Friedman, A. Gedanken, E. Banin // Int. J. Nanomedicine. -2012. - Vol. 7.-P. 5611-5624.

78. Antibiofilm activity of GlmU enzyme inhibitorts against catheter-associated uropathogenes / E. Burton, P.V. Gawands, N. Yakandawala et al. // Antimicrob. Agents Chemother. - 2006. - Vol. 50, №5. - P. 1835-1840.

79. Antibiofilm activity of selected plant essential oils and their major components / A. Budzyriska, M. Wieckowska-Szakiel, B. Sadowska et al. // Pol. J. Microbiol. - 2011. - Vol. 60, №1. - P. 35-41.

80. Anti-biofilm compounds derived from marine sponges / S.D. Stowe, J.J. Richards, A.T. Tucker et al. // Mar. Drugs. - 2011. - Vol. 9, №10. - P. 20102035.

81. Antibiofilm properties of silver and gold incorporated PU, PCLm, PC and PMMA nanocomposites under two shear conditions [ Электронный ресурс ] / S.N. Sawant, V. Selvaraj, V. Prabhawathi, M. Doble // PLoS One. - 2013. -Vol. 8, №5. - ебЗЗ 11. - Режим доступа: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed.

82. Antibiotic resistance of bacterial biofilms / N. Ifoiby, T. Bjarnsholt, M. Givskov et al. // Int. J. Antimicrob. Agents. - 2010. - Vol. 35, №4. - P. 322332.

83. Antibiotic susceptibility assay for Staphylococcus aureus in biofilms developed in vitro / B. Amorena, E. Gracia, M. Monzon et al. // J. Antimicrob. Chemother. - 1999. - Vol. 44, p. 43-55.

84. Antibiotic susceptibility of coagulase-negative staphylococci isolated from very low birth weight babies: comprehensive comparisons of bacteria at different stages of biofilm formation [ Электронный ресурс ] / Y. Qu, A.J Daley, T.S Istivan et al. // Ann. Clin. Microbiol. Antimicrob. - 2010. - Vol. 9, №16. - Режим доступа: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed.

85. Aparna, M.S., Biofilms: microbes and disease / M.S. Aparna, S. Yadav // Braz. J. Infect. Dis. - 2008. - Vol. 12, №6. - P. 526-530.

86. Arciola, C.R. New trends in diagnosis and control strategies for implant infections / C.R. Arciola; L. Montanaro, J.W. Costerton // Int. J. Artif. Organs.-2011. - Vol. 34, №9.-P. 727-736.

87. Arciola, C.R., Detection of biofilm-forming strains of Staphylococcus epidermidis and S. aureus / C.R. Arciola, D. Campoccia, L. Montanaro // Expert. Rev. Mol. Diagn. - 2002. - Vol. 2, №5. - P. 478-484.

88. Are biofilms associated with an inflammatory response in chronic rhinosinusitis? / A.J. Wood, J. Fraser, S. Swi et al. // Int. Forum Allergy Rhinol.-2011. - Vol. l.-P. 335-339.

89. Arnold, J.W. Inhibition of cell-cell interactions in Myxococcus xanthus by congo red / J.W. Arnold, L.J. Shimkets // J. Bacteriol. - 1988. - Vol. 170, №12. - P. 5765-5770.

90. Aryl rhodanines specifically inhibit staphylococcal and enterococcal biofilm formation / T.J. Opperman, S.M. Kwasny, J.D. Williams et al. // Antimicrob. Agents Chemother. - 2009. - Vol. 50, №10. - P. 4357-4367.

91.Aslam, S., Darouiche R.O. Role of antibiofilm-antimicrobial agents in controlling device-related infections / S. Aslam, R.O. Darouiche // Int. J. Artif. Organs.-2011. - №9.-P. 752-758.

92. Association between methicillin susceptibility and biofilm regulation in Staphylococcus aureus isolates from device-related infections / E. O'Neill, C. Pozzi, P. Houston et al. // J. Clin. Microbiol. - 2007. - Vol. 45, №5. - P. 1379-1388.

93.AzaSite® inhibits Staphylococcus aureus and coagulase-negative Staphylococcus biofilm formation in vitro / E.C. Wu, R.P. Kowalski, E.G. Romanowski et al. // J. Ocul. Pharmacol. Ther. - 2010. - Vol. 26, №6. - P. 557-562.

94. Bacterial adhesion and biofilm formation on various double-J stents in vivo and in vitro / L. Cormio, J. Vuopio-Varkila, A. Siitonen et al. // Scand. J. Urol. Nephrol. - 1996. - Vol. 30, №1. - P. 19-24.

95. Bacterial joint infections in England and Wales: analysis of bacterial isolates over a four year period / M. Ryan, J.R. Kavanagh, P.G. Wall, B.L. Hazleman // Brit. J. Rheumatol. - 1997. - Vol. 36. - P. 70-73.

96. Bap, a Staphylococcus aureus surface protein involved in biofilm formation / C. Cucarella, C. Solano, J. Valle et al. // J. Bacteriol. - 2001. - Vol. 183, №9. -P. 2888-2896.

97. Baron, S. Medical Microbiology / S. Baron. - Galveston: University of Texas Medical Branch at Galveston, 1996. - 1273 p.

98. Bayles, K.W. The biological role of death and lysis in biofilm development / K.W. Bayles // Nat. Rev. Microbiol. - 2007. - Vol . 5, №9. - P. 721-726.

99. Behmlander, R.M. Biochemical and structural analyses of the extracellular matrix fibrils of Myxococcus Xanthus / R.M. Behmlander, M. Dworkin // J. Bacteriol. - 1994. - Vol . 176, №20. - P. 6295-6303.

100. Biofilm density and detection of biofllm-producing genes in methicillin-resistant Staphylococcus aureus strains / E.Szczuka, K. Urbanska, M. Pietryka, A. Kaznowski // Folia Microbiol. - 2013. - Vol. 58, №1. - P. 4752.

101. Biofilm development by clinical isolates of Staphylococcus spp. from retrieved orthopedic prostheses / J. Esteban, D. Molina-Manso, I. Spiliopoulou et al. // Acta Orthop. - 2010. - Vol. 81, №6. - P. 674-679.

102. Biofilm formation by Haemophilus influenzae isolated from adeno-tonsil tissue samples, and its role in recurrent adenotonsillitis / J. Galli, L. Calo, F. Ardito et al. // Acta Otorhinolaryngol. Ital. - 2007. - Vol. 27, №3. -P. 134-138.

103. Biofilm formation in medical device-related infection / D. Mack, H. Rohde, L.G. Harris et al. // Int. J. Artif. Organs. - 2006. - Vol. 29, №4. - P. 343-359.

104. Biofilm Production and Presence of ica and bap Genes in Staphylococcus aureus Strains Isolated from Cows with Mastitis in the Eastern Poland / P. Szweda, M. Schielmann, S. Milewski et al. // Pol. J. Microbiol.-2012. - Vol. 61, №1.-P. 65-69.

105. Biofilm: the microbial "bunker" for intravascular catheter-related infection / M. Morales, S. Mendez-Alvarez, J.V. Martin-Lopez et al. // Support. Care Cancer. - 2004. - Vol. 12, №10. - P. 701-707.

106. Biofllm-associated infections: antibiotic resistance and novel therapeutic strategies / F. Sun, F. Qu, Y. Ling et al. // Future Microbiol. -2013.-Vol. 8.-P. 877-886.

107. Biologic properties and vaccine potential of the staphylococcal poly-N-acetyl glucosamine surface polysaccharide / T. Maira-Litran, A. Kropec, D. Goldmann, G.B. Pier // Vaccine. - 2004. - Vol. 22, №7. - P. 872-879.

108. Black, W.P. Myxococcus xanthus Chemotaxis Homologs DifD and DifG Negatively Regulate Fibril Polysaccharide Production / W.P. Black, Z. Yang//J. Bacteriol. - 2004. - Vol. 186, №4.-P. 1001-1008.

109. Boles, B.R. Agr-mediated dispersal of Staphylococcus aureus biofilms [ Электронный ресурс ] / B.R. Boles, A.R. Horswill // PLoS Pathol. - 2008. -Vol. 4, №4. - el 000052. - Режим доступа: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed.

110. Boles, B.R. Staphylococcal biofilm disassembly / B.R. Boles, A.R. Horswill // Trends Microbiol. - 2011. - Vol. 19, №9. -P. 449-455.

111. Bradford, M. M. A Rapid and Sensitive Method for the Quantitation of Microgram Quantities of Protein Utilizing the Principle of Protein-Dye Binding / M.M. Bradford // Anal. Biochem. - 1976. №72. - P. 248-254.

112. Breed, R.S. The Number of Colonies Allowable on Satisfactory Agar Plates / R.S. Breed, W.D. Dotterrer // J. Bacteriol. - 1916. - Vol. 1, №3. - P. 321-331.

113. Brooks, J.L. Staphylococcal biofilms: quest for the magic bullet / J.L. Brooks, KK. Jefferson // Adv. Appl. Microbiol. - 2012. - №81. - P. 63-87.

114. Bykhovskaia, M. Synapsin regulation of vesicle organization and functional pools / M. Bykhovskaia // Semin. Cell. Dev. Biol. - 2011. - Vol. 22, №4. - P. 387-392.

115. Cell death in Streptococcus mutans biofilms: a link between CSP and extracellular DNA / A. Julie, J.P. Perry, D.G. Cvitkovitch, C.M. Levesque // FEMS Microbiol. Lett. - 2009. - Vol. 299, №2. - P. 261-266.

116. Characterisation and properties of ectosomes released by human polymorphonuclear neutrophils / O. Gasser, C. Hess, S. Miot et al. // Exp. Cell Res. - 2003. - Vol. 285, №2. - P. 243-257.

117. Chemiluminescence of human polymorphonuclear leucocytes after stimulation with whole cells and cell-wall components of Staphylococcus epidermidis / L. Martinez-Martinez, C.P. Timmerman, A. Fleer, J. Verhoef // J. Med. Microbiol. - 1993. - Vol. 39, №3. - P. 196-203.

118. Chen, L. The role of bacterial biofilm in persistent infections and control strategies / L. Chen, Y.M. Wen // Int. J. Oral. Sci. - 2011. - Vol. 3, №2.-P. 66-73.

119. Cheng Involvement of iron in biofilm formation by Staphylococcus aureus [ Электронный ресурс ] / M.H. Lin, J.C. Shu, H.Y. Huang, Y.C. // PLoS One. - 2012. - Vol. 7, №3. - e34388. - Режим доступа: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed.

120. Chlorination of bacterial and neutrophil proteins during phagocytosis and killing of Staphylococcus aureus / A.L. Chapman, M.B. Hampton, R. Senthilmohan et al. // J. Biol. Chem. - 2002. - Vol. 277, №12. - P. 97579762.

121. Clinically Feasible Biofilm Susceptibility Assay for Isolates of Pseudomonas aeruginosa from Patients with Cystic Fibrosis / S.M. Moskowitz, J.M. Foster, J. Emerson, J.L. Burns // J. Clin. Microbiol. - 2004. - Vol. 42, №5. - P. 1915-1922.

122. Coenye, T. In vitro and in vivo model systems to study microbial biofilm formation / T. Coenye, H.J. Nelis // J. Microbiol. Methods. - 2010. -Vol. 83, №2.-P. 89-105.

123. Combating implant infections / C.R. Arciola, N. Balaban, L. Baldassarri et al. // Int. J. Artif. Organs. - 2008. - Vol. 31, №9. - P. 858-864.

124. Comparative antibody-mediated phagocytosis of Staphylococcus epidermidis cells grown in a biofilm or in the planktonic state / N. Cerca, K.K. Jefferson, R. Oliveira et al. // Infect. Immun. - 2006. - Vol. 74, №8. - P. 4849-4855.

125. Comparative proteome analysis of Staphylococcus aureus biofilm and planktonic cells and correlation with transcriptome profiling / A. Resch, S. Leicht, M. Saric et al. // Proteomics. - 2006. - Vol. 6, №6. - P. 1867-1877.

126. Control of glucose- and NaCl-induced biofilm formation by rbf in Staphylococcus aureus / Y. Lim, M. Jana, T.T. Luong, Ch.Y. Lee // J. Bacteriol. - 2004. - Vol. 186, №3. - P. 722-729.

127. Costerton, J. W. Bacterial biofilms: a common cause of persistent infections / J. W. Costerton, P.S. Stewart, E.P. Greenberg // Science. - 1999. -Vol. 284.-P. 1318-1322.

128. Costerton, J.W. Bacterial communications in implant infections: a target for an intelligence war / J.W. Costerton, L. Montanaro, C.R. Arciola // Int. J. Artif. Organs. - 2007. - Vol. 30, №9. - P. 757-763.

129. Costerton, J.W. Montanaro L, Arciola C.R. Biofilm in implant infections: its production and regulation / J.W. Costerton, L. Montanaro, C.R. Arciola // Int. J. Artif. Organs. - 2005. Vol. 28, №11. - P. 1062-1068.

130. Costerton, J.W.. Biofilm theory can guide the treatment of device-related orthopaedic infections / J.W. Costerton // Clin. Orthop. Relat. Res. -2005. -№437.-P. 7-11.

131. Danese, P.N. Antibiofilm approaches: prevention of catheter colonization / P.N. Danese // Chem. Biol. - 2002. - Vol. 9, №8. - P. 873-880.

132. Daptomycin antibiotic lock therapy in a rat model of staphylococcal central venous catheter biofilm infections / A.D. Van Praagh, T. Li, S. Zhang et al. // Antimicrob. Agents Chemother. - 2011. - Vol. 55, №9. - P. 40814089.

133. Dasgupta, M.K. Significance of biofllm-adherent bacterial microcolonies on Tenckhoff catheters of CAPD patients / M.K. Dasgupta, J.W. Costerton // Blood Purif. - 1989. - Vol. 7, №2-3. - P. 144-155.

134. de Carvalho, C.C. Assessment of three-dimensional biofilm structure using an optical microscope / C.C. de Carvalho, M.M. da Fonseca // Biotechniques. - 2007. - Vol. 42, №5. - P. 616-620.

135. Deatherage, B.L. Membrane vesicle release in bacteria, eukaryotes, and archaea: a conserved yet underappreciated aspect of microbial life / B.L. Deatherage, B.T. Cookson // Infect Immun. - 2012. - Vol. 80, №6. - P. 19481957.

136. Depolymerization of beta-l,6-N-acetyi-D-glucosamine disrupts the integrity of diverse bacterial biofilms / Y. Itoh, X. Wang, B.J. Hinnebusch et al. // J. Bacteriol. - 2005. - Vol. 187, № 1. - P. 382-387.

137. Destruction of bacterial biofilms by polymorphonuclear neutrophils: relative contribution of phagocytosis, DNA release, and degranulation / E. Meyle, P. Stroh, F. Günther et al. // Int. J. Artif. Organs. - 2010. - Vol. 33, №9.-P. 608-620.

138. Detection of icaA, icaD genes and biofilm production by Staphylococcus aureus and Staphylococcus epidermidis isolated from urinary tract catheterized patients / G.F. Gad, M.A. El-Feky, M.S. El-Rehewy et al. // J. Infect. Dev. Ctries. - 2009. - Vol. 3, №5. - P. 342-351.

139. Differential gene expression profiling of Staphylococcus aureus cultivated under biofilm and planktonic conditions / A. Resch, R. Rosenstein,

C. Nerz, F. Götz // Appl. Environ. Microbiol. - 2005. - Vol. 71, №5. - P. 2663-2676.

140. Differential Roles of Poly-N-Acetylglucosamine Surface Polysaccharide and Extracellular DNA in Staphylococcus aureus and Staphylococcus epidermidis / E.A. Izano, M.A. Amarante, W.B. Kher, J.B. Kaplan // Appl. Environ. Microdiol. - Biofilms. - 2008. - Vol. 74, №2. - P. 470-476.

141. Dinges, M.M. Exotoxins of Staphylococcus aureus / M.M. Dinges, P.M. Orwin, P.M. Schlievert // Clin. Microbiol. Rev. - 2000. - Vol. 13, №1. - P. 16-34.

142. Disinfection of meticillin-resistant Staphylococcus aureus and Staphylococcus epidermidis biofilms using a remote non-thermal gas plasma / J.J. Cotter, P. Maguire, F. Soberon et al. // J. Hosp. Infect. - 2011. - Vol. 78, №3. - P. 204-207.

143. Doering Anaerobic conditions induce expression of polysaccharide intercellular adhesin in Staphylococcus aureus and Staphylococcus epidermidis / S.E Cramton., M. Ulrich, F. Goetz, G. et al. // Infect. Immun. -2001. - Vol. 69, №6. - P. 4079-4085.

144. Dongari-Bagtzoglou, A. Pathogenesis of mucosal biofilm infections: challenges and progress / A. Dongari-Bagtzoglou // Expert. Rev. Anti. Infect. Ther. -2008. - Vol. 6, №2. - P. 201-208.

145. Donlan, R.M. Biofilm elimination on intravascular catheters: important considerations for the infectious disease practitioner / R.M. Donlan // Clin. Infect. Dis.-2011. - Vol. 52, №8.-P. 1038-1045.

146. Donlan, R.M. Biofilm formation: a clinically relevant microbiological process / R.M. Donlan // Clin. Infect. Dis. - 2001. - Vol. 33, №8. - P. 13871392.

147. Donlan, R.M. Biofilms: Microbial Life on Surfaces / R.M. Donlan // Emerg. Infect. Dis. - 2002. - Vol. 8, № 9. - P. 881-890.

148. Donlan, R.M. Biofilms: Survival Mechanisms of Clinically Relevant Microorganisms / R.M. Donlan, J.W. Costerton // Clin. Microbiol. Rev. -2002. - Vol. 15, №2. - P. 167-193.

149. Dubin, G. Extracellular proteases of Staphylococcus spp. / G. Dubin // Biol. Chem. - 2002. - Vol. 383, №7-8. - P. 1075-1086.

150. Dunne, W.M. Jr. Bacterial adhesion: seen any good biofilms lately? / W.M. Jr. Dunne // Clin. Microbiol. Rev. - 2002. - Vol. 15, №2. - P. 155-166.

151. Durack, DT. Experimental bacterial endocarditis. IV Structure and evolution of very early lesions / D.T. Durack // J. Pathol. - 1975. - Vol. 115.-P. 81-89.

152. Early biofilm formation on microtiter plates is not correlated with the invasive disease potential of Streptococcus pneumonia / A. Lizcano, T. Chin, K. Sauer et al. // Microb. Pathog. - 2010. - Vol. 48, №3-4. - P. 124-130.

153. Echlin, P. Handbook of Sample Preparation for Scanning Electron Microscopy and X-Ray Microanalysis / P. Echlin. - New York: Springer, 2009. - 329 p.

154. Ectosomes Released by Human Neutrophils Are Specialized Functional Units / C. Hess, S. Sadallah, A. Hefti et al. // J. Immunol. - 1999. - Vol. 163. -P. 4564-4573.

155. Edwards, S.W. Oxygen-dependent killing of Staphylococcus aureus by human neutrophils / S.W. Edwards, J.E. Say, C.A. Hart // J. Gen. Microbiol. -1987. - Vol. 133, №12. - P. 3591-3597.

156. Effect of farnesol on Staphylococcus aureus biofilm formation and antimicrobial susceptibility / M.A. Jabra-Rizk, T.F. Meiller, C.E. James, M.E.

Shirtliff // Antimicrob. Agents Chemother. - 2006. - Vol. 50, №4. - P. 14631469.

157. Effect of material characteristics and/or surface topography on biofilm development / W. Teughels, N. Van Assche, I. Sliepen, M. Quirynen // Clin. Oral Implants Res. - 2006. - Vol. 17, №2. - P. 68-81.

158. Effects of cranberry extracts on growth and biofilm production of Escherichia coli and Staphylococcus species / K.L. LaPlante, S.A. Sarkisian, S. Woodmansee et al. // Phytother. Res. - 2012. - Vol. 26, №9. - P. 13711374.

159. Elgalai, I. Comparison of adhesion of wound isolates of Staphylococcus aureus to immobilized proteins / I. Elgalai, H.A. Foster // J. Appl. Microbiol. -2003. - Vol. 94, №3. - P. 413-420.

160. Ellis, T.N. Virulence and immunomodulatory roles of bacterial outer membrane vesicles / T.N. Ellis, M.J. Kuehn // Microbiol. Mol. Biol. Rev. -2010. - Vol. 74. - P. 81-94.

161. Engineering approaches for the detection and control of orthopaedic biofilm infections / G.D. Ehrlich, P. Stoodley, S. Kathju et al. // Clin. Orthop. Relat. Res. - 2005. - Vol. 437. - P. 59-66.

162. Enterococcus faecalis produces abundant extracellular structures containing DNA in the absence of cell lysis during early biofilm formation [ Электронный ресурс ] / A.M. Barnes, K.S. Ballering, R.S. Leibman et al. // MBio. - 2012. - Vol. 3, №4:e00193-12. - Режим доступа: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed.

163. Enzymatic detachment of Staphylococcus epidermidis biofilms / J.B. Kaplan, C. Ragunath, K. Velliyagounder et al. // Antimicrob. Agents. Chemother. - 2004. - Vol. 48, №7. - P. 2633-2636.

164. Evaluation of different detection methods of biofilm formation in the clinical isolates / A. Hassan, J. Usman, F. Kaleem et al. // Braz. J. Infect. Dis. -2011. - Vol. 15, №4.-P. 305-311.

165. Ewetz, L. The relationship between luminol chemiluminescence and killing of staphylococcus aureus by neutrophil granulocytes / L. Ewetz, J. Palmblad, A. Thore // Blut. - 1981. - Vol. 43, №6. - P. 373-381.

166. Exosomes released from macrophages infected with intracellular pathogens stimulate a proinflammatory response in vitro and in vivo / S. Bhatnagar, K. Shinagawa, F.J. Castellino, J.S. Schorey // Blood. - 2007. - Vol. 110, №9. - P. 3234-3244.

167. Extracellular DNA in biofilms / L. Montanaro, A. Poggi, L. Visai et al. // Int. J. Artif. Organs. - 2011. - Vol. 34, №9. - P. 824-831.

168. Extracellular phospholipids of isolated bacterial communities / V.V. Tetz, V.P. Korobov, N.K. Artemenko et al. // Biofilms. - 2004. - Vol. 1, №3, - P.149-155.

169. Farber, B. F. Staphylococcus epidermidis extracted slime inhibits the antimicrobial action of glycopeptides antibiotics / B.F. Farber, M.H. Kaplan, A.G. Clogston // J. Infect. Dis. - 1990. - Vol. 161. - P. 37-40.

170. Fitzpatrick, F. Evidence for icaADBC-independent biofilm development mechanism in methicillin-resistent Staphylococcus aureus clinical isolates / F. Fitzpatrick, H. Humphreys, J.P. O'Gara // J. Clin. Microbiol. - 2005. - Vol. 43, №4. - P. 1973-1976.

171. Flemming, H.C. The biofilm matrix / H.C. Flemming, J. Wingender // Nat. Rev. Microbiol. - 2010. - Vol. 8, №9. - P. 623-633.

172. Francolini, I. Prevention and control of biofilm-based medical-device-related infections / I. Francolini, G. Donelli // FEMS Immunol. Med. Microbiol. - 2010. - Vol. 59, №3. - P. 227-238.

173. Frank, K.L. Poly-N-Acetylglucosamine Is Not a Major Component of the Extracellular Matrix in Biofilms Formed by icaADBC-Positive Staphylococcus lugdunensis Isolates / K.L. Frank, R. Patel // Infect. Immun. -2007. - Vol. 75, №10. - P. 4728-4742.

174. Gliding mutants of Mycoplasma mobile: relationships between motility and cell morphology, cell adhesion and microcolony formation / M. Miyata, H. Yamamoto, T. Shimizu et al. // Microbiology. - 2000. - Vol. 146, №6. - P. 1311-1320.

175. Goerke, C. Adaptation of Staphylococcus aureus to the cystic fibrosis lung / C. Goerke, C. Wolz // Int. J. Med. Microbiol. - 2010. - Vol. 300, №8. -P. 520-525.

176. Gotz, F. Staphylococcus and biofilms / F. Gotz // Mol. Microbiol. -2002. - Vol. 43. - P. 1467-1378.

177. Gram-positive bacteria produce membrane vesicles: proteomics-based characterization of Staphylococcus aureus-derived membrane vesicles / E.Y. Lee, D.Y. Choi, D.K. Kim et al. // Proteomics. - 2009. - Vol. 9. - P. 54255436.

178. Granules and secretory vesicles of the human neutrophil / N. Borregaard, L. Kjeldsen, K. Lollike, H. Sengelov // Clin. Exp. Immunol. -1995.-Vol. 101, №1.-P. 6-9.

179. Harraghy, N. Quorum-sensing systems in staphylococci as therapeutic targets / N. Harraghy, S. Kerdudou, M. Herrmann // Anal. Bioanal. Chem. -2007. - Vol. 387, №2. - P. 437-444.

180. Harriott, M.M. Ability of Candida albicans mutants to induce Staphylococcus aureus vancomycin resistance during polymicrobial biofilm formation / M.M. Harriott, M.C. Noverr // Antimicrob. Agents Chemother. -2010. - Vol. 54, №9. - P. 3746-3755.

181. Heparin stimulates Staphylococcus aureus biofilm formation / R.M. Shanks, N.P. Donegan, M.L. Graber et al. // Infect. Immun. - 2005, Vol. 73, №8. - P. 4596-4606.

182. Higgins, J.A. Fine-structural changes in rat liver microsomes treated with phospholipase C / J.A. Higgins // J. Cell Sei. - 1982. - №53. - P. 211225.

183. High-level antibiotic resistance in Pseudomonas aeruginosa biofilm: the ndvB gene is involved in the production of highly glycerol-phosphorylated ß-(1—^-glucans, which bind aminoglycosides / I. Sadovskaya, E. Vinogradov, J. Li et al. // Glycobiology. - 2010. - Vol. 20, №7. - P. 895-904.

184. High-level vancomycin-resistant Staphylococcus aureus isolates associated with a polymicrobial biofilm / L.M. Weigel, R.M. Donlan, D.H. Shin et al. // Antimicrob. Agents Chemother. - 2007. - Vol. 51, №1. - P. 231238.

185. Highlights of a new type of intercellular communication: microvesicle-based information transfer / E. Pap, E. Pallinger, M. Pasztoi, A. Falus // Inflamm. Res. - 2009. - Vol. 58, №1. - P. 1-8.

186. Host defence against Staphylococcus aureus biofilms by polymorphonuclear neutrophils: oxygen radical production but not phagocytosis depends on opsonisation with immunoglobulin G / P. Stroh, F. Günther, E. Meyle et al. // Immunobiology. - 2011. - Vol. 216, №3. - P. 351357.

187. Host defence against Staphylococcus aureus biofilms infection: phagocytosis of biofilms by polymorphonuclear neutrophils (PMN) / F. Günther, G.H. Wabnitz, P. Stroh et al. // Mol. Immunol. - 2009. - Vol. 46, №8-9. - P. 1805-1813.

188. Howell, W.R. Osteomyelitis: an update for hospitalists / W.R. Howell, C. Goulston //Hosp. Pract. - 2011. - Vol. 39, №1. - P. 153-160.

189. Hoyle, B.D. The biofilm glycocalyx as a resistance factor / B.D. Hoyle, J. Jass, J.W. Costerton // J. Antimicrob. Chemother. - 1990. - Vol. 26, №1. -P. 1-5.

190. Human leukocytes adhère to, penetrate, and respond to Staphylococcus aureus biofilms / J.G. Leid, M.E. Shirtliff, J.W. Costerton, P. Stoodley // Infect. Immun. - 2002. - Vol. 70. - P. 6339-6345.

191. Identification of Staphylococcus aureus proteins recognized by the antibody-mediated immune response to a biofilm infection / R.A. Brady, J.G. Leid, A.K. Camper et al. // Infect. Immun. - 2006. - Vol. 74, №6. - P. 34153426.

192. Impact of the agr quorum-sensing system on adherence to polystyrene in Staphylococcus aureus / C. Vuong, H.L. Saenz, F. Götz, M. Otto // J. Infect. Dis. - 2000. - Vol. 182, №6. - P. 1688-1693.

193. In Vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus lugdunensis Clinical Isolates / K.L. Frank, E.J. Reichert, K.E. Piper, R. Patel // Antinicrob. Agents Chemother. - 2007. - Vol. 51, №3. - P. 888-895.

194. Inactivation of traP has no effect on the Agr quorum-sensing system or virulence of Staphylococcus aureus / L.N. Shaw, I.-M. Jonsson, V.K. Singh et al. // Infect. Immun. - 2007. - Vol. 75, №9. - P. 4519-4527.

195. Increased resource use associated with catheter-related bloodstream infection in the surgical intensive care unit / J.B. Dimick, R.K. Pelz, R. Consunji et al. // Arch. Surg. - 2001. - Vol. 136. - P. 229-234.

196. Induction of Staphylococcus epidermidis biofilm formation via proteolytic processing of the accumulation-associated protein by staphylococcal and host proteases / H. Rohde, C. Burdeiski, K. Baktschi et al. // Mol. Microbiol. - 2005. - Vol. 55, №6. - P. 1883-1895.

197. Inhibition of early biofilm formation by glass-ionomer incorporated with Chlorhexidine in vivo: a pilot study / X. Du, X. Huang, C. Huang et al. // Aust. Dent. J. - 2012. - Vol. 57, №1. - P. 58-64.

198. Inhibition of staphylococcal biofilm formation by nitrite / S. Schlag, C. Nerz, T.A. Birkenstock et al. // J. Bacteriol. - 2007. - Vol. 189, №21. - P. 7911-7919.

199. Inhibitory effect of nicotine on chemiluminescence response of human polymorphonuclear leukocytes stimulated by opsonized zymosan in vitro / S. Sasagawa, H. Kameda, J. Sudo, T. Tanabe // J. Toxicol. Sei. - 1984. - Vol. 9, №1. - P. 1-9.

200. Interaction of quorum signals with outer membrane lipids: insights into prokaryotic membrane vesicle formation / L. Mashburn-Warren, J. Howe, P. Garidel et al. // Mol. Microbiol. - 2008. - Vol. 69, №2. - P. 491-502.

201. Interaction of Staphylococcus epidermidis from infected hip prostheses with neutrophil granulocytes / A. Augustinsson, A. Frydén, P.E. Lindgren et al. // Scand. J. Infect. Dis. - 2001. - Vol. 33, №6. - P. 408-412.

202. Interactions between human phagocytes and Candida albicans biofilms alone and in combination with antifungal agents / A. Katragkou, M.J. Kruhlak, M. Simitsopoulou et al. // J. Infect. Dis. - 2010. - Vol. 201, №12. -P. 1941-1949. ,

203. Interconnections between sigma B, agr, and proteolytic activity in Staphylococcus aureus biofilm maturation / K.J. Lauderdale, B.R. Boles, A.L. Cheung, A.R. Horswill // Infect. Immun. - 2009. - Vol. 77, №4. - P. 16231635.

204. Isolation and characterization of biofilm formation-defective mutants of Staphylococcus aureus / P.H. Tu Quoc, P. Genevaux, M. Pajunen et al. // Infect. Immun. - 2007. - Vol. 75, №3. - P. 1079-1088.

205. Jain, A. Biofilm production, a marker of pathogenic potential of colonizing and commensal staphylococci / A. Jain, A. Agarwal // J. Microbiol. Methods. - 2009. - Vol. 76, №1. - P. 88-92.

206. Johnson, K.J. Neutrophil activation and function in health and disease / K.J. Johnson, J. Varani, J.E. Smolen // Immunol. Ser. - 1992. - Vol. 57. - P. 1-46.

207. Johnson, M. Iron-regulated biofilm formation in Staphylococcus aureus Newman requires ica and the secreted protein Emp / M. Johnson, A. Cockayne, J.A. Morrissey // Infect. Immun. - 2008. - Vol. 76, №4. - P. 17561765.

208. Kaplan, J.B. Biofilm dispersal: mechanisms, clinical implications, and potential therapeutic uses / J.B. Kaplan // J. Dent. Res. - 2010. - Vol. 89, №3. -P. 205-218.

209. Kaplan, JB. Therapeutic potential of biofilm-dispersing enzymes / J.B. Kaplan // Int. J. Artif. Organs. - 2009. - Vol. 32, №9. - P. 545-554.

210. Kharazmi, A. Mechanisms involved in the evasion of the host defence by Pseudomonas aeruginosa / A. Kharazmi // Immunol. Lett. - 1991. - Vol. 30, №2.-P. 201-205.

211. Kiedrowski, M.R. New approaches for treating staphylococcal biofilm infections / M.R. Kiedrowski, A.R. Horswill // Ann. NY Acad. Sci. - 2011. -№1241.-P. 104-121.

212. Kong, K.F. Staphylococcus quorum sensing in biofilm formation and infection / K.F. Kong, C. Vuong, M. Otto // Int. J. Med. Microbiol. - 2006. -Vol. 296, №2-3.-P. 133-139.

213. Korkmaz, B. Neutrophil elastase, proteinase 3 and cathepsin G: physicochemical properties, activity and physiopathological functions / B. Korkmaz, T. Moreau, F. Gauthier // Biochimie. - 2008. - Vol. 90, №2. - P. 227-242.

214. Larson, D.A. Microbiology of sinusitis: does allergy or endoscopic sinus surgery affect the microbiologic flora? / D.A. Larson, J.K. Han // Curr. Opin. Otolaryngol. Head. Neck. Surg. -2011. - Vol. 19, №3. - P. 199-203.

215. Lewis, K. Multidrug tolerance of biofilms and persister cells / K. Lewis // Curr. Top. Microbiol. Immunol. - 2008. - Vol. 322. - P. 107-131.

216. Lewis, K. Pathogen resistance as the origin of kin altruism / K. Lewis // J. Theor. Biol. - 1998 - Vol. 193, №2. - P. 359-363.

217. Lewis, K. Persister cells / K. Lewis // Annu. Rev. Microbiol. - 2010. -Vol. 64. - P. 357-372.

218. Lewis, K. Persister cells and the riddle of biofilm survival / K. Lewis // Biochemistry. -2005. - Vol. 70, №2. - P. 267-274.

219. Loss of viability and induction of apoptosis in human keratinocytes exposed to Staphylococcus aureus biofilms in vitro / K.R. Kirker, P.R. Secor, G.A. James et al. // Wound Repair. Regen. - 2009. - Vol. 17, №5. - P. 690699.

220. Lowy, F.D. Staphylococcus aureus infections / F.D. Lowy // N. Engl. J. Med. - 1998. - Vol. 339, №8. - P. 520-532.

221. Lynch, A.S. Bacterial and fungal biofilm infections / A.S. Lynch, G.T. Robertson // Annu. Rev. Med. - 2008. - Vol. 59. - P. 415-428.

222. Lyon, G.J. Peptide signaling in Staphylococcus aureus and other Grampositive bacteria / G.J. Lyon, R.P. Novick // Peptides. - 2004. - Vol. 25, №9. -P. 1389-1403.

223. Lysozyme-coupled poly(poly(ethylene glycol) methacrylate)-stainless steel hybrids and their antifouling and antibacterial surfaces / S. Yuan, D. Wan, B. Liang et al. // Langmuir. - 2011. - Vol. 27, №6. - P. 2761-2774.

224. Mah, TF. Biofilm-specific antibiotic resistance / T.F. Mah // Future Microbiol. - 2012. - Vol. 7, №9. - P. 1061-1072.

225. Mann, E.E. Pseudomonas biofilm matrix composition and niche biology / E.E. Mann, D.J.Wozniak // FEMS Microbiol. Rev. - 2012. - Vol. 36, №4. -P. 893-916.

226. Marrie, T.J. A scanning and transmission electron microscopic study of the surfaces of intrauterine contraceptive devices / T.J. Marrie, J.W. Costerton // Am. J. Obstet. Gynecol. - 1983. - Vol. 146, №4. - P. 384-394.

227. Marrie, T.J. A scanning and transmission electron microscopic study of an infected endocardial pacemaker lead / T.J. Marrie, J. Nelligan, J.W. Costerton // Circulation. - 1982. - Vol. 66, №6. - P. 1339-1341.

228. Marrie, T.J. Scanning and transmission electron microscopy of in situ bacterial colonization of intravenous and intraarterial catheters / T.J. Marrie, J.W. Costerton // J. Clin. Microbiol. - 1984. - Vol. 19, №5. - P. 687-693.

229. Mashburn-Warren, L.M. Special delivery: vesicle trafficking in prokaryotes / L.M. Mashburn-Warren, M. Whiteley // Molecular Microbiology. - 2006. - Vol. 61, № 4. - P. 839-846.

230. Mechanisms of biofilm formation in Staphylococcus epidermidis and Staphylococcus aureus: functional molecules, regulatory circuits, and adaptive responses / D. Mack, P. Becker, I. Chatterjee et al. // Int. J. Med. Microbiol. - 2004. - Vol. 294. - P. 203-212.

231. Membrane Microparticles: Two Sides of the Coin / H. Benedicte, M.M. Carmen, K. Corinne, J.-M. Freyssinet // Physiology. - 2005. - №20. - P. 2227.

232. Membrane vesicles, current state-of-the-art: emerging role of extracellular vesicles / B. Gyorgy, T.G. Szabo, M. Pasztoi et al. // Cell Mol. Life Sci. - 2011. - Vol. 68,№16. - P. 2667-2688.

233. Methods for studying biofilms produced by Staphylococcus epidermidis / M.A. Deighton, J. Capstick, E. Domalewski, T. van Nguyen // Methods Enzymol. - 2001. - Vol. 336. - P. 177-195.

234. Microbial interactions in Staphylococcus epidermidis biofilms / D. Mack, A.P. Davies, L.G. Harris et al. // Anal. Bioanal. Chem. - 2007. - Vol. 387, №2.-P. 399-408.

235. Microbial linguistics: perspectives and applications of microbial cell-to-cell communication / R.J. Mitchell, S.K. Lee, T. Kim, C.M. Ghim // В MB Rep.-2011.- Vol. 44, №1.-P. 1-10.

236. Microplate Alamar blue assay for Staphylococcus epidermidis biofilm susceptibility testing / R.K. Pettit, C.A. Weber, M.J. Kean et al. // Antimicrob. Agents Chemother. - 2005. - Vol. 49, №7. - P. 2612-2617.

237. Millar, M.R. Influence of lysozyme on aggregation of Staphylococcus aureus / M.R. Millar, T. Inglis // J. Clin. Microbiol. - 1987. - Vol. 25, №9. -P. 1587-1590.

238. Minimum inhibitory concentration (MIC) versus minimum biofilm eliminating concentration (MBEC) in evaluation of antibiotic sensitivity of gram-negative bacilli causing peritonitis / F. Sepandj, H. Ceri, A. Gibb et al. // Perit. Dial. Int. 2004. - Vol. 24, №1. - P. 65-67.

239. Modulation of adherence of coagulase-negative staphylococci to Teflon catheters in vitro / A. Pascual, A. Fleer, N.A. Westerdaal, J. Verhoef// Eur. J. Clin. Microbiol. - 1986. - Vol. 5, №5. - P. 518-522.

240. Modulation of eDNA release and degradation affects Staphylococcus aureus biofilm maturation [ Электронный ресурс ] / E.E. Mann, K.C. Rice, B.R. Boles et al. // PLoS One. - 2009. - Vol. 4, №6. - e5822. - Режим доступа: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed.

241. Monoclonal antibodies to CNA, a collagen-binding microbial surface component recognizing adhesive matrix molecules, detach Staphylococcus aureus from a collagen substrate / L. Visai, Y. Xu, F. Casolini et al. // J. Biol. Chem. -2000. - Vol. 275, №51. - P. 39837-43985.

242. Murine immune response to a chronic Staphylococcus aureus biofilm infection / R. Prabhakara, J.M. Harro, J.G. Leid et al. // Infect. Immun. -2011.-Vol. 79, №4.- P. 1789-1796.

243. Neutrophil activation and function in health and disease / B. Amulic, C. Cazalet, G.L. Hayes et al. // Immunol. Ser. - 1992. - Vol. 57. - P. 1-46.

244. Neutrophil bactericidal activity against Staphylococcus aureus adherent on biological surfaces. Surface-bound extracellular matrix proteins activate intracellular killing by oxygen-dependent and -independent mechanisms / M. Hermann, M.E. Jaconi, C. Dahlgren et al. // J. Clin. Invest. - 1990. - Vol. 86, №3. - P. 942-951.

245. Neutrophil extracellular traps kill bacteria / V. Brinkmann, U. Reichard, C. Goosmann et al. // Science. - 2004. - Vol. 303. - P. 1532-1535.

246. Neutrophil extracellular traps: how to generate and visualize them / V. Brinkmann, B. Laube, U. Abu Abed et al. // J. Vis. Exp. - 2010. - Vol. 24, № 36.-P. 1724.

247. Neutrophil function: from mechanisms to disease / B. Amulic, C. Cazalet, G.L. Hayes et al. // Annu. Rev. Immunol. 2012. - Vol. 30. - P. 459489.

248. Njoroge, J. Jamming bacterial communication: new approaches for the treatment of infectious diseases / J. Njoroge, V. Sperandio // EMBO Mol. Med. - 2009. - Vol. 1, №4. - P. 201-210.

249. Noah, R.M. Evaluation of variable parameters in neutrophil function test using chemiluminescence assay / Noah, R.M., M.R. Jais, L.M. Noh // Malays. J. Pathol. - 1994. - Vol. 16, №2. - P. 157-160.

250. Novick, R.P. Autoinduction and signal transduction in the regulation of staphylococcal virulence / R.P. Novick // Mol. Microbiol. - 2003. - Vol. 48. -P. 1429-1449.

251. Novick, R.P. Quorum sensing in staphylococci / R.P. Novick, E. Geisinger // Annu. Rev. Genet. - 2008, - Vol. 42 - P. 541-564.

252. Optical sectioning of microbial biofilms / J.R. Lawrence, D.R. Korber, B.D. Hoyle et al. // J Bacteriol. - 1991. - Vol.173, №20. - P. 6558-6567.

253. Orsi, G.B. Hospital-acquired, laboratory-confirmed bloodstream infection: increased hospital stay and direct costs / Orsi G.B., L. Di Stefano, N. Noah // Infect. Control Hosp. Epidemiol. - 2002. - Vol. 23. - P. 190-197.

254. Orthopaedic biofilm infections / P. Stoodley, G.D. Ehrlich, P.P. Sedghizadeh et al. // Curr. Orthop. Pract. - 2011. - Vol. 22, №6. - P. 558-563.

255. Oscillation of enzyme networks in spleen triggered by an immunopotentiator, bestatin / T. Aoyagi, T. Wada, S. Ohuchi et al. // Biochem. Int. - 1984. - Vol. 9, №4. - P. 405-411.

256. O'Toole, G. Biofilm formation as microbial development / G. O'Toole, H.B. Kaplan, R. Kolter // Annu. Rev. Microbiol. - 2000. - Vol. 54. - P. 4979.

257. Otto, M. Quorum-sensing control in staphylococci - a target for antimicrobial drug therapy? / M. Otto // FEMS Microbiol. Lett. - 2004. - Vol. 241, №2.-P. 135-141.

258. Otto, M. Staphylococcal biofilms / M. Otto // Curr. Top. Microbiol. Immunol. - 2008. - Vol. 322. - P. 207-228.

259. Otto, M. Staphylococcal infections: mechanisms of biofilm maturation and detachment as critical determinants of pathogenicity / M. Otto // Annu. Rev. Med. - 2013. - Vol. 64. - P. 175-188.

260. Palmer, R.J. Jr. Modern microscopy in biofilm research: confocal microscopy and other approaches / R.J. Jr. Palmer, C. Sternberg // Curr. Opin. Biotechnol. - 1999. - Vol. 10, №3. - P. 263-268.

261. Patel, R. Biofilms and antimicrobial resistance / R. Patel // Clin. Orthop. Relat. Res. - 2005. - Vol. 437. - P. 41-47.

262. Penetration of antibiotics through Staphylococcus aureus and Staphylococcus epidermidis biofilms / R. Singh, P. Ray, A. Das, M. Sharma // J. Antimicrob. Chemother. -2010. - Vol. 65. - P. 1955-1958.

263. Peptide signaling in the staphylococci / M. Thoendel, J.S. Kavanaugh, C.E. Flack, A.R. Horswill // Chem. Rev. - 2011. - Vol. Ill, №1. - P. 117151.

264. Phagocytosis and oxidative-burst response of planktonic Staphylococcus epidermidis RP62A and its non-slime-producing variant in human neutrophils / M. Heinzelmann, D.O. Herzig, B. Swain et al. // Clin. Diagn. Lab. Immunol. - 1997. - Vol. 4, №6. - P. 705-710.

265. Photodynamic inactivation of Staphylococcus aureus and Escherichia coli biofilms by malachite green and phenothiazine dyes: an in vitro study / S.F. Vilela, J.C. Junqueira, J.O. Barbosa et al. // Arch. Oral Biol. - 2012. -Vol. 57, №6.-P. 704-710.

266. Pittet, D. Nosocomial bloodstream infection in critically ill patients: excess length of stay, extra costs and attributable mortality / D. Pittet, D. Tarara, R.P. Wenzel //JAMA. - 1994. - Vol. 271. - P. 1598-1601.

267. Poly-N-acetylglucosamine and poly(glycerol phosphate) teichoic acid identification from staphylococcal biofilm extracts using excitation sculptured TOCSY NMR / J.L. Wagstaff, I. Sadovskaya, E. Vinogradov et al. // Mol. Biosyst. - 2008. - Vol. 4, №2. - P. 170-174.

268. Poly-N-acetylglucosamine production in Staphylococcus aureus is essential for virulence in murine models of systemic infection / A. Kropec, T. Maira-Litran, K.K. Jefferson et al. // Infect. Immun. - 2005. - Vol. 73, №10. -P. 6868-6876.

269. Polysaccharide intercellular adhesin or protein factors in biofilm accumulation of Staphylococcus epidermidis and Staphylococcus aureus isolated from prosthetic hip and knee joint infections / H. Rohde, E.C. Burandt, N. Siemssen et al. // Biomaterials. - 2007. - Vol. 28, №9. - P. 17111720.

270. Potential use of poly-N-acetyl-beta-(l,6)-glucosamine as an antigen for diagnosis of staphylococcal orthopedic-prosthesis-related infections / I. Sadovskaya, S. Faure, D. Watier et al. // Clin. Vaccine Immunol. - 2007. -Vol. 14, №12. -P. 1609-1615.

271. Prevalence of Adhesion and Regulation of Biofilm-Related Genes in Different Clones of Staphylococcus aureus [ Электронный ресурс ] / S.S. Atshan, M. Nor Shamsudin, Z. Sekawi et al. // J. Biomed. Biotechnol. - 2012. - № 976972. - Режим доступа: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed.

272. Prevention and treatment of Staphylococcus biofilms / P. Speziale, L. Visai, S. Rindi et al. // Curr. Med. Chem. - 2008. - Vol. 15, №30. - P. 31853195.

273. Protective role of IL-lß against post-arthroplasty Staphylococcus aureus infection / N.M. Bernthal, J.R. Pribaz, A.I. Stavrakis et al. // J. Orthop. Res. - 2011. - Vol. 29, №10. - P. 1621-1626.

274. Protein A-mediated multicellular behavior in Staphylococcus aureus / N. Merino, A. Toledo-Arana, M. Vergara-Irigaray et al. // J. Bacteriol. -2009. - Vol. 191, №3. - P. 832-843.

275. Protein A-mediated multicellular behavior in Staphylococcus aureus / M. Vergara-Irigaray, J. Valle, C. Solano et al. // J. Bacteriol. - 2009. - Vol. 191, №3.-P. 832-843.

276. Quantitative analysis and cartography in scanning electron microscopy: application to the study of bacterial adhesion to respiratory epithelium / G.

Colliot, S. de Bentzmann, M.C. Plotkowski et al. // Microsc. Res. Tech. -1993. - Vol. 24, №6. - P. 527-536.

277. Quantitative analysis of adhesion and biofilm formation on hydrophilic and hydrophobic surfaces of clinical isolates of Staphylococcus epidermidis / N. Cerca, G.B. Pier, M. Vilanova et al. // Res. Microbiol. - 2005. - Vol. 156, №4.-P. 506-514.

278. Quantitative PCR analysis of genes expressed during biofilm development of methicillin resistant Staphylococcus aureus (MRSA) / S.S. Atshan, M.N. Shamsudin, A. Karunanidhi et al. // Infect. Genet. Evol. - 2013. - №18C. - P. 106-112.

279. Quorum sensing inhibitors increase the susceptibility of bacterial biofilms to antibiotics in vitro and in vivo / G. Brackman, P. Cos, L. Maes et al. // Antimicrob. Agents Chemother. - 2011. - Vol. 55, №6. - P. 2655-266.

280. Recurrent infections and immune evasion strategies of Staphylococcus aureus / H.K. Kim, V. Thammavongsa, O. Schneewind, D. Missiakas // Curr. Opin. Microbiol. - 2012. - Vol. 15, №1. - P. 92-99.

281. Roberts, P.J. Development, characterization, and subcellular location of DNAse activity in HL-60 cells and monocytes / P.J. Roberts // Blood. - 1990. -Vol. 75, №4.-P. 976-983.

282. Rochford, E.T. Influence of material on the development of device-associated infections / E.T. Rochford, R.G. Richards, T.F. Moriarty // Clin. Microbiol. Infect.-2012.-Vol. 18, №12.-P. 1162-1167.

283. Rogers, K.L. Coagulase-negative staphylococcal infections / K.L. Rogers, P.D. Fey, M.E. Rupp // Infect. Dis. Clin. North. Am. - 2009. - Vol. 23.-P. 73-98.

284. Role of biofilm-associated protein bap in the pathogenesis of bovine Staphylococcus aureus / C. Cucarella, M.A. Tormo, C. Ubeda et al. // Infect. Immun. - 2004. - Vol. 72, №4. - P. 2177-2185.

285. Role of persisters and small-colony variants in antibiotic resistance of planktonic and biofilm-associated Staphylococcus aureus: an in vitro study / R. Singh, P. Ray, A. Das, M. Sharma // J. Med. Microbiol. - 2009. - Vol. 58, №8.-P. 1067-1073.

286. Romling, U. Biofilm infections, their resilience to therapy and innovative treatment strategies / U. Romling, C. Balsalobre // J. Intern. Med. -2012. - Vol. 272, №6. - P. 541-561.

287. Sadallah, S. Ectosomes as modulators of inflammation and immunity / S. Sadallah, C. Eken, J.A. Schifferli // Clin Exp Immunol. - 2010. - Vol. 63. - P. 26-32.

288. Salvipisone and aethiopinone from Salvia sclarea hairy roots modulate staphylococcal antibiotic resistance and express anti-biofilm activity / E. Walencka, S. Rozalska, H. Wysokinska et al. // Planta Med. - 2007. - Vol. 73, №6.-P. 545-551.

289. Sanchez-Torres, V. GGDEF proteins Yeal, YedQ, and YfiN reduce early biofilm formation and swimming motility in Escherichia coli / V. Sanchez-Torres, H. Hu, T.K. Wood // Appl. Microbiol. Biotechnol. - 2011. -Vol. 90, №2.-P. 651-658.

290. SarA positively controls bap-dependent biofilm formation in Staphylococcus aureus / M.P. Trotonda, A.C. Manna, A.L. Cheung et al. // Ibid.-2005. - Vol. 187, №16.-P. 5790-5798.

291. Sass, P. Lytic activity of recombinant bacteriophage 011 and 012 endolysins on whole cells and biofilms of Staphylococcus aureus / P. Sass, G. Bierbaum // Appl. Environ. Microbiol. - 2007. - Vol. 73, №1. - P. 347-352.

292. Scanning electron microscopy of bacterial biofilms on indwelling bladder catheters / L. Ganderton, J. Chawla, C. Winters et al. // Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. - 1992. - Vol. 11, №9. - P. 789-796.

293. Siddiqui, A.R. Chronic wound infection: facts and controversies / A.R. Siddiqui, J.M. Bernstein // Clin. Dermatol. - 2010. - Vol. 28, №5. - P. 519526.

294. Silver coordination polymers for prevention of implant infection: thiol interaction, impact on respiratory chain enzymes, and hydroxyl radical induction / O. Gordon, T. Vig Slenters, P.S. Brunetto et al. // Antimicrob. Agents Chemother. - 2010. - Vol. 54, №10. - P. 4208-4218.

295. Silver nanoparticles impede the biofilm formation by Pseudomonas aeruginosa and Staphylococcus epidermidis / K. Kalishwaralal, S. Barathmanikanth, S.R. Pandian et al. // Colloids Surf. B. Biointerfaces. -2010. - Vol. 79, №2. - P. 340-344.

296. Sinha, B. Staphylococcus aureus host cell invasion and post-invasion events / B. Sinha, M. Fraunholz // Int. J. Med. Microbiol. - 2010. - Vol. 300, №2-3.-P. 170-175.

297. Smith, A.W. Biofilms and antibiotic therapy: is there a role for combating bacterial resistance by the use of novel drug delivery systems? / A.W. Smith //.Adv. Drug Deliv. Rev. - 2005. - Vol. 7, №10. - P. 1539-1550.

298. Some bacterial parameters influencing the neutrophil oxidative burst response to Pseudomonas aeruginosa biofilms / E.T. Jensen, A. Kharazmi, N. H0iby, J.W. Costerton // APMIS. - 1992. - Vol. 100, №8. - P. 727-733.

299. Staphylococcus aureus autoinducer-2 quorum sensing decreases biofilm formation in an icaR-dependent manner / D. Yu, L. Zhao, T. Xue, B. Sun // BMC Microbiol. - 2012. - Vol. 12. - P. 288.

300. Staphylococcus aureus biofilm formation at the physiologic glucose concentration depends on the S. aureus lineage / S. Croes, R.H. Deurenberg, M.L. Boumans et al. // BMC Microbiol. - 2009. - №9. - P. 229.

301. Staphylococcus aureus biofilms prevent macrophage phagocytosis and attenuate inflammation in vivo / L.R. Thurlow, M.L. Hanke, T. Fritz et al. // J. Immunol. - 2011. - Vol. 186, №11. - P. 6585-6596.

302. Staphylococcus aureus biofilms: properties, regulation, and roles in human disease / N.K. Archer, M.J. Mazaitis, J.W. Costerton et al. // Virulence.-2011. - Vol. 2, №5.-P. 445-459.

303. Staphylococcus aureus develops an alternative, ica-independent biofilm in the absence of the arlRS two-component system / A. Toledo-Arana, N. Merino, M. Vergara-Irigaray et al. // J. Bacteriol. - 2005. - Vol. 187, №15. -P. 5318-5329.

304. Staphylococcus aureus produces membrane-derived vesicles that induce host cell death [ Электронный ресурс ] / M. Gurung, D.C. Moon, C.W. Choi et al. // Plos One. - 2011. - Vol. 6. - №11. - e27958. - Режим доступа: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed.

305. Staphylococcus aureus, but not Staphylococcus epidermidis, modulates the oxidative response and induces apoptosis in human neutrophils / A. Nilsdotter-Augustinsson, A. Wilsson, J. Larsson et al. // APMIS. - 2004. -Vol. 112, №2.-P. 109-118.

306. Staphylococcus epidermidis polysaccharide intercellular adhesin activates complement / E.G. Fredheim, H.N. Granslo, T. Fleegstad et al. // FEMS Immunol. Med. Microbiol. - 2011. - Vol. 63, №2. - P. 269-280.

307. Steinberg, D. The effect of extracellular polysaccharides from Streptococcus mutans on the bactericidal activity of human neutrophils / D. Steinberg, S. Poran, L. Shapira // Arch. Oral. Biol. - 1999. - Vol. 44, №5. - P. 437-444.

308. Study bioprospecting of medicinal plant extracts of the semiarid northeast: contribution to the control of oral microorganisms [ Электронный ресурс ] / M.S. Silva, D.O. Brandao, T.P. Chaves et al. // Evid. Based

Complement. Alternat. Med. - 2012. - № 681207. - Режим доступа: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed.

309. Study on biofilm-forming properties of clinical isolates of Staphylococcus aureus / Y. Taj, F. Essa, F. Aziz, S.U. Kazmi // J. Infect. Dev. Ctries. - 2012. - Vol. 6, №5. - P. 403-409.

310. Sun, D. Inhibition of biofilm formation by monoclonal antibodies against Staphylococcus epidermidis RP62A accumulation-associated protein / D. Sun, M.A. Accavitti, J.D. Bryers // Clin. Diagn. Lab. Immunol. - 2005. -Vol. 12, №1.-P. 93-100.

311. Survival strategies of infectious biofilms / C.A. Fux, J.W. Costerton, P.S. Stewart, P. Stoodley // Trends Microbiol. - 2005. - Vol. 13, №1. - P. 3440.

312. Susceptibility of staphylococcal biofilms to enzymatic treatments depends on their chemical composition / P. Chaignon, I. Sadovskaya, Ch. Ragunah et al. // Appl. Microbiol. Biotechnol. - 2007. - Vol. 75, №1. - P. 125-132.

313. Sutherland, I.W. The biofilm matrix - an immobilized but dynamic microbial environment / I.W. Sutherland // Trends Microbiol. - 2001. - Vol. 9, №5.-P. 222-227.

314. Tetz, G.V. Effect of DNase and antibiotics on biofilm characteristics / G.V. Tetz, N.K. Artemenko, V.V. Tetz // Antimicrob. Agents Chemother. -

2009. - Vol. 53, №3. - P. 1204-1209.

315. Tetz, V.V. Effect of extracellular DNA destruction by DNase I on characteristics of forming biofilms / V.V. Tetz, G.V. Tetz // DNA Cell Biol. -

2010. - Vol. 29, №8. - P. 399-405.

316. Tetz, V.V. The effect of antimicrobial agents and mutagen on bacterial cells in colonies / V.V. Tetz // Med. Microbiol. Lett. - 1996. - Vol. 5. - P. 426436.

317. Thakur, A. Effect of lysozyme on adhesion and toxin release by Staphylococcus aureus / A. Thakur, A. Chauhan, M.D. Willcox // Aust. N. Z. J. Ophthalmol. - 1999. - Vol. 27, №3-4. - P. 224-227.

318. The anchorless adhesin Eap (extracellular adherence protein) from Staphylococcus aureus selectively recognizes extracellular matrix aggregates but binds promiscuously to monomeric matrix macromolecules / U. Hansen, M. Hussain, D. Villone et al. // Matrix Biol. - 2006. - Vol. 25. - P. 252-260.

319. The antibiofilm effects of Byotrol™ G32 / N. Govindji, P. Wills, M. Upton et al. // J. Appl. Microbiol. - 2013. - Vol. 114, №5. - P. 1285-1293.

320. The application of biofilm science to the study and control of chronic bacterial infections / J.W. Costerton, R. Veeh, M. Shirtliff et al. // J. Clin. Invest. - 2003. - Vol. 112, №10. - P. 1466-1477.

321. The ica locus of Staphylococcus epidermidis encodes production of the capsular polysaccharide/adhesion / D. McKenney, J. Hübner, E. Muller et al. // Infect. Immun. - 1998. - Vol. 66, №10. - P. 4711-4720.

322. The intercellular adhesin involved in biofilm accumulation of Staphylococcus epidermidis is a linear beta-l,6-linked glucosaminoglycan: purification and structural analysis / D. Mack, W. Fischer, A. Krokotsch et al. //J. Bacteriol. - 1996. - Vol. 178, №1. - P. 175-183.

323. The MIQE guidelines: minimum information for publication of quantitative real-time PCR experiments / S.A. Bustin, V. Benes, J.A. Garson et al. // Clin. Chem. - 2009. - Vol. 55, №4. - P. 611-622.

324. The pathogenic role of Staphylococcus epidermidis capsular polysaccharide/adhesin in a low-inoculum rabbit model of prosthetic valve endocarditis / H. Shiro, G. Meluleni, A. Groll et al. // Circulation. - 1995. -Vol. 92. - P. 2715-2722.

325. The polymicrobial nature of biofilm infection / R. Wolcott, J.W. Costerton, D. Raoult, S.J. Cutler // Clin. Microbiol. Infect. - 2013. - Vol. 19, №2. - P. 107-112.

326. The role of biofilm infection in urology / P. Tenke, B. Kovacs, M. Jackel, E. Nagy // World J. Urol. - 2006. - Vol. 24, №1. - P. 13-20.

327. The role of Staphylococcus aureus surface protein SasG in adherence and biofilm formation / R.M. Corrigan, D. Rigby, P. Handley, T.J. Foster // Microbiology. - 2007. - / Vol. 153, №6. - P. 2435-2446.

328. The staphylococcus-specific gene rsr represses agr and virulence in Staphylococcus aureus / S. Tamber, D. Reyes, N.P. Donegan et al. // Infect. Immun. - 2010. - Vol. 78, №10. - P. 4384-4391.

329. Toluidine blue-mediated photodynamic effects on staphylococcal biofilms / M. Sharma, L. Visai, F. Bragheri et al. // Antimicrob. Agents Chemother. - 2008. - Vol. 52, №1. - P. 299-305.

330. Towards diagnostic guidelines for biofilm-associated infections / L. Hall-Stoodley, P. Stoodley, S. Kathju et al. // FEMS Immunol. Med. Microbiol. - 2012. - Vol. 65, №2. - P. 127-145.

331. Trampuz, A. Infections associated with orthopedic implants / A. Trampuz, A.F. Widmer // Curr. Opin. Infect. Dis. - 2006. - Vol. 19, №4. - P. 349-356.

332. Transmission Electron Microscopy of Lipid Vesicles for Drug Delivery: Comparison between Positive and Negative Staining / V. Bello, G. Mattei, P. Mazzoldi et al. // Microsc. Microanal. - 2010. - №16. - P. 456-461.

333. Ulrich, R.G. Evolving superantigens of Staphylococcus aureus / R.G. Ulrich // FEMS Immunol. Med. Microbiol. - 2000. - Vol. 27, №1. - P. 1-7.

334. Usnic acid, a natural antimicrobial agent able to inhibit bacterial biofilm formation on polymer surfaces / I. Francolini, P. Norris, A. Piozzi et

al. // Antimicrob. Agents Chemother. - 2004. - Vol. 48, № 11. - P. 43604365.

335. Vaccination with a recombinant fragment of collagen adhesin provides protection against Staphylococcus aureus - mediated septic death / I.M. Nilsson, J.M. Patti, T. Bremell et al. // J. Clin. Invest. - 1998. - Vol. 101, №12.-P. 2640-2649.

336. Vadyvaloo, V. Molecular genetics of Staphylococcus epidermidis biofilms on indwelling medical devices / V. Vadyvaloo, M. Otto // Int. J. Artif. Organs.-2005. - Vol. 28, №11.-P. 1069-1078.

337. Verschoor, C.P. The macrophage / C.P. Verschoor, A. Puchta, D.M. Bowdish // Methods Mol. Biol. - 2012. - Vol. 844. - P. 139-156.

338. Verstraelen, H. The biofilm in bacterial vaginosis: implications for epidemiology, diagnosis and treatment / H. Verstraelen, A. Swidsinski // Curr. Opin. Infect. Dis. -2013. - Vol. 26, №1. - P. 86-89.

339. Vinh, D.C. Device-related infections: a review / D.C. Vinh, J.M. Embil // J. Long. Term. Eff. Med. Implants. - 2005. - Vol. 15, №5. - P. 467-488.

340. Wall teichoic acids are dispensable for anchoring the PNAG exopolysaccharide to the Staphylococcus aureus cell surface / M. Vergara-Irigaray, T. Maira-Litran, N. Merino et al. // Microbiology. - 2008. - Vol. 154, №3.-P. 865-877.

341. Wang, X. The pgaABCD Locus of Escherichia coli Promotes the Synthesis of a Polysaccharide Adhesin Required for Biofilm Formation / X. Wang, J.F. Preston III, T. Romeo // J. Bacteriol. - 2004. - Vol. 186, №9. - P. 2724-2734.

342. What can we learn about biofilm/host interactions from the study of inflammatory bowel disease / A. Indriolo, S. Greco, P. Ravelli, S. Fagiuoli // J. Clin. Periodontol. -2011. - Vol. 38, № 11.-P. 36-43.

C!9

343. Yarwood, J.M. Quorum sensing in Staphylococcus infections / J.M. Yarwood, P.M. Schlievert 11 J. Clin. Invest. - 2003. - Vol. 112, №11. - P. 1620-1625.

344. Zdanowski, Z. Bacterial adherence to synthetic vascular prostheses and influence of human plasma. An in vitro study / Z. Zdanowski, E. Ribbe, C. Schalen // Eur. J. Vase. Surg. - 1993. - Vol. 7, №3. - P. 277-282.

345. Zdanowski, Z. Influence of some plasma proteins on in vitro bacterial adherence to PTFE and Dacron vascular prostheses / Z. Zdanowski, E. Ribbe, C. Schalen // APMIS. - 1993. - Vol. 101, №12. - P. 926-932.

346. Zimmerli, W. Pathogenesis of implant-associated infection: the role of the host / W. Zimmerli, P. Sendi // Semin. Immunopathol. - 2011. - Vol. 33, №3. - P. 295-306.

347. Zoubos, A.B. Orthopedics and biofilm - what do we know? A review / A.B. Zoubos, S.P. Galanakos, P.N. Soucacos // Med. Sei. Monit. - 2012. -Vol. 18, №6. - P. 89-96.