Биологические свойства вирусов высокопатогенного гриппа птиц, выделенных на территории Российской Федерации в 2014-2017 гг. тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 06.02.02, кандидат наук Алтунин Дмитрий Александрович

• Алтунин Дмитрий Александрович
• кандидат наук
• 2019

Оглавление диссертации кандидат наук Алтунин Дмитрий Александрович

ВВЕДЕНИЕ

1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Классификация и номенклатура вируса гриппа птиц

1.2. Структура вируса гриппа птиц

1.3. Изменчивость вируса гриппа птиц

1.4. Экология вируса гриппа птиц

1.5. История вируса гриппа птиц

1.5.1. Распространение вируса И5Ш

1.5.2. Распространение вирусов И5Кх

1.5.3. Распространение вируса ВПГП в России

1.6. Патогенез

1.7. Диагностика гриппа птиц

1.8. Профилактика и контроль заболевания

1.9. Заключение по обзору литературы

2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

2.1. Методы

2.1.1. Выделение и культивирование вируса гриппа птиц

2.1.2. Определение титра инфекционности ВГП

2.1.3. Определение среднего времени гибели эмбрионов

2.1.4. Инактивация и контроль авирулентности ВГП

2.1.5. Получение положительной и нормальной

(отрицательной) сывороток крови кур к ВГП

2.1.6. Получение 1%-ной суспензии эритроцитов петуха

2.1.7. Определение гемагглютинирующей активности и идентификация ВГП в РТГА

2.1.8. Определение титра антител к ВГП в сыворотках

крови птиц в РТГА

2.1.9. Определение нейраминидазного подтипа вируса гриппа в реакции

торможения нейраминидазной активности

2.1.10. Обнаружение вируса гриппа в РДП

2.1.11. Выявление антител к ВГП в сыворотках крови птиц в РДП

2.1.12. Индикация генома ВГП типа А подтипа H5 и проверка на отсутствие контаминации образца посторонними вирусами и микоплазмами (методами ПЦР и ОТ-ПЦР)

2.1.13. Молекулярно-генетические методы исследований

2.1.14. Определение индекса патогенности вируса гриппа

2.1.15. Определение стерильности

2.1.16. Статистическая обработка результатов

2.2. Материалы

2.2.1. Вирус

2.2.2. Куриные эмбрионы

2.2.3. Лабораторные животные

2.2.4 Вакцины

2.2.5 Химические реагенты

2.2.6 Растворы, буферные смеси и ферменты

2.2.7 Оборудование

3. РЕЗУЛЬТАТЫ СОБСТВЕННЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ

3.1. Изучение биологических свойств ряда изолятов ВГП, полученных в Российской Федерации в период 2014-2017 гг

3.1.1.Выделение вируса гриппа птиц

3.1.2.Определение типовой специфичности по гемагглютинину выделенных ВГП, в период 2014-2017 гг

3.1.3. Определение типовой специфичности по нейраминидазе ВГП, выделенных в период 2014-2017 гг

3.1.4. Определение инфекционной активности изолятов

3.2. Определение стерильности изолятов ВГП

3.2.1.Определение стерильности изолятов ВГП микробиологическими

методами

3.2.2.Подтверждение отсутствия контаминации изолятов ВГП молекулярно-генетическими методами

3.3.Изучение биологических свойств ВГП при инфицировании кур

3.4.Изучение биологических свойств ВГП при инфицировании утят

3.5.Изучение биологических свойств ВГП при инфицировании индюшат

3.6.Изучение протективных свойств отечественных серийных вакцин в отношении ВГП подтипов И5Ш и И5Ш, выделенных в 2015-2016 гг

4. ОБСУЖДЕНИЕ

5. ЗАКЛЮЧЕНИЕ (ВЫВОДЫ)

6. ПРАКТИЧЕСКИЕ ПРЕДЛОЖЕНИЯ

7. СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

ПРИЛОЖЕНИЯ

144

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Биологические свойства вирусов высокопатогенного гриппа птиц, выделенных на территории Российской Федерации в 2014-2017 гг.»

ВВЕДЕНИЕ

Актуальность темы. Грипп птиц - острая контагиозная болезнь, характеризующаяся общим угнетением, отеками, поражением органов дыхания и пищеварения, вызываемая вирусом рода Influenzavirus A семейства Orthomyxoviridae [245]. Впервые данную болезнь описал Регшпсйо у цыплят в Италии в 1878 г., а вирусная природа заболевания установлена лишь в 1901 г. [154, 187].

Дикие птицы водного и околоводного комплекса являются резервуаром вируса гриппа А [94]. Известно 105 видов диких птиц, принадлежащих к 26 семействам, от которых был выделен вирус [33, 111]. Штаммы вируса гриппа, выделенные от домашних птиц, по признаку вирулентности можно разделить на две обширные группы [44]. Высоковирулентные штаммы, вызывающие острую генерализованную болезнь со смертностью в стаде до 100%, в большинстве случаев относятся к подтипам Н5 и Н7 [44]. Все остальные подтипы вируса, как правило, вызывают легкое респираторное или бессимптомное заболевание, и классифицируются как низковирулентные [44, 203].

Быстрая и точная диагностика гриппа птиц является решающим условием организации необходимых мер борьбы с этим заболеванием [3, 4, 18, 44]. В настоящее время лабораторная диагностика гриппа птиц включает: выделение вируса в эмбрионах СПФ-кур, идентификацию изолированного вируса и определение его вирулентности [4, 44, 88, 227]. Широко применяемые молекулярно-генетические методы с использованием специфичных праймеров, такие как ПЦР и нуклеотидное секвенирование, позволяют выявить и идентифицировать геном вируса, а также на основании анализа аминокислотной последовательности сайта расщепления гемагглютинина НАо предположить потенциальную вирулентность вируса [44, 78, 152, 211, 212]. Важную роль играют и серологические методы диагностики [44, 180]. Традиционно, для диагностики гриппа птиц применяют реакцию торможения гемагглютинации, несмотря на кажущуюся простоту, реакция обладает высокой чувствительностью, и достоверно оценивает уровень специфических антител в сыворотке крови

больных или вакцинированных птиц, а также позволяет обнаружить и идентифицировать гемагглютинирующий агент при его выделении [3, 4, 49, 157, 244].

За последнее десятилетие зарегистрировано множество вспышек высокопатогенного гриппа среди птиц в ряде стран Северной и Южной Америки, Европы, Азии и Африки [13, 36, 210, 264]. В последнее время отмечено, наряду с возрастанием количества вспышек болезни, значительное расширение круга хозяев вируса и увеличение стоимости осуществляемых ветеринарно-санитарных мероприятий [45, 48, 228]. Так, например, только в Италии в течение 1999-2000 гг. при эпизоотии ВПГП подтипа Н7Ш было уничтожено 14 млн. птиц [59, 188]. Подсчет экономического ущерба также должен включать и убытки национальной и международной торговли. Особое внимание привлекает вирус гриппа А птиц подтипа Н5№, получивший эпизоотическое распространение в странах Азии в течение 1996-2005 гг., и впоследствии распространившийся в страны Европы и Африки [36, 159].

В последние годы в Российской Федерации эпизоотическая ситуация по высокопатогенному гриппу птиц значительно усложнилась [13, 23, 145, 261]. Так, в средине июля 2005 года в Новосибирской области были установлены первые случаи высокопатогенного гриппа среди домашних и диких птиц, и впоследствии в течение 2005 - 2007 гг. заболевание регистрировали в ряде населенных пунктов и птицехозяйств Сибирского, Уральского, Южного и Центрального федеральных округов [2, 6, 12, 15, 24, 43, 46, 112]. Появление и распространение нового эпизоотического штамма вируса подтипа Н5Ш потребовало изучения его биологических свойств, а также совершенствования лабораторной диагностики заболевания [4, 44].

Цели и задачи исследования. Целью настоящей работы являлось изучение биологических свойств российских изолятов вируса гриппа птиц Н5Ши Н5Щ, полученных в РФ в 2014-2017 гг. Для достижения поставленной цели были определены следующие задачи:

- получить изоляты вируса ВПГП из проб биоматериала от домашних и диких птиц;

- установить типовую специфичность полученных изолятов;

- определить инфекционную активность изолятов титрованием в развивающихся куриных эмбрионах (СПФ-РКЭ);

- изучить патогенные свойства изолятов ВПГП Н5Ш, И5№ и Н5Ш при экспериментальном заражении цыплят, утят и индюшат, охарактеризовать клиническую и патологоанатомическую картину болезни у разных видов домашних птиц;

- провести депонирование некоторых изолятов вируса ВПГП в Коллекцию штаммов микроорганизмов ФГБУ «ВНИИЗЖ»;

- изучить протективные свойства серийно выпускаемых в РФ вакцин в отношении новых изолятов вируса.

Научная новизна.

1. Получены современные данные о биологических свойствах 9 изолятов ВГП с разными антигенными формулами, относящихся к разным генетическим линиям. Все изоляты являются высоковирулентными для домашних птиц, что подтверждено экспериментально. Вирусы ВПГП Н5Щ, широко распространившиеся на территории РФ в 2016-2017 гг., также как и вирус ВПГП Н5№, вызваший локальные вспышки, обладают более выраженными патогенными свойствами и вызывают болезнь с менее продолжительным инкубационным периодом по сравнению с вирусами, изолированными в 2014-2015 гг.

2. Показана эффективность существующих в РФ вакцин в отношении изученных изолятов ВПГП Н5М и Н5Ш.

Теоретическая и рактическая значимость исследований.

1. Разработаны, одобрены Ученым советом и утверждены директором ФГБУ «ВНИИЗЖ» следующие документы:

- «Методические рекомендации по выделению вирусов гриппа птиц и ньюкаслской болезни в развивающихся куриных эмбрионах»;

- «Методические рекомендации по выявлению генома вируса гриппа птиц подтипа Н9 методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени»;

- «Методические рекомендации по получению рибонуклеопротеина вируса гриппа птиц и поликлональных антител».

2. Данные о биологических свойствах штаммов вируса гриппа А, полученных в 2014-2017 гг., включая информацию о сравнительном изучении патогенности для разных видов домашних птиц с описанием клинических признаков и патологоанатомических изменений, могут быть полезными для ветеринарных специалистов государственной ветеринарной службы и птицеводческих хозяйств.

3. Полученные в ходе выполнения работы штаммы вируса гриппа А можно использовать в качестве диагностических и вакцинных антигенов и получения диагностических сывороток к ним.

4. Результаты проведенных исследований послужили основой для составления Стандартов ФГБУ «ВНИИЗЖ» на депонированные в Коллекцию учреждения штаммы вируса ВПГП.

5. Получен патент № 2 647 566 - 2018 на изобретение «Штамм A/goose/Kalmykia/813/16 H5N8 вируса гриппа птиц Influenza virus avicum типа А подтипа H5 для контроля антигенной и иммуногенной активности вакцин против гриппа птиц и для изготовления биопрепаратов для диагностики и специфической профилактики гриппа птиц типа А подтипа Н5».

Основные положения, выносимые на защиту:

1. Результаты изучения биологических свойств российских изолятов вируса гриппа А H5N1, H5N2 и H5N8, полученных в 2014-2017 гг.

2. Протективный потенциал вакцин в отношении изолятов вируса гриппа А птиц Н5Ми H5N8.

Апробация работы. Достоверность экспериментальных данных подтверждена соответствующими статистическими критериями и комиссионными испытаниями. Результаты исследований по теме диссертации доложены и обсуждены на заседаниях ученого совета ФГБУ «ВНИИЗЖ» (2015-2017гг.), Международной научно-практической конференции молодых ученых "Достижения молодых ученых в ветеринарную практику" (г. Владимир, 2016 г.).

Личный вклад соискателя. Диссертационная работа выполнена автором самостоятельно. Автор выражает искреннюю благодарность за практическую и консультативную помощь при выполнении диссертационной работы, которую оказывали к.в.н. Чвала И.А., к.б.н. Сосипаторова В.Ю. к.б.н. Андриясов А.В., к.б.н. Зиняков Н.Г., к.б.н. Андрейчук Д.Б., д.б.н. Мудрак Н.С., к.б.н. Циванюк М.А., а также сотрудники референтной лаборатории вирусных болезней птиц, лаборатории эпизоотологии и мониторинга и лаборатории профилактики болезней птиц ФГБУ «ВНИИЗЖ».

Соответствие диссертации паспорту научной специальности. В диссертации представлены результаты исследований биологических свойств изолятов вируса ВГП, что соответствует 1, 2, 4, 5, 8, 9 пунктам паспорта специальности 06.02.02 -ветеринарная микробиология, вирусология, эпизоотология, микология с микотоксикологией и иммунология.

Публикация научных исследований. По теме диссертации опубликовано 7 научных работ, в том числе 3 работ опубликованы в изданиях, рекомендованных ВАК РФ.

Структура и объем работы. Диссертация изложена на 157 страницах компьютерного текста и включает введение, обзор литературы, материалы и методы, результаты собственных исследований, обсуждение, заключение (выводы), практические предложения, список литературы и приложения. Список литературы состоит из 256 источников, в том числе 229 зарубежных авторов. Работа иллюстрирована 16 таблицами, 12 рисунками и дополнена приложенной аннотацией документов.

Автор выражает глубокую благодарность научному руководителю - доктору ветеринарных наук Ирзе Виктору Николаевичу, за неоценимую помощь, а также всему коллективу «Референтной лаборатории вирусных болезней птиц».

Исследования по диссертационной работе выполнены в 2014-2017 гг. в ФГУ Федеральный центр охраны здоровья животных.

ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ 1.1 Классификация и номенклатура вируса гриппа птиц

Согласно современной классификации вирусов, созданной Международным комитетом по таксономии вирусов, к семейству Orthomyxoviridae относят 7 семейств: Thogotovirus, Quaranjavirus, Isavirus, Alphainfluenzavirus (Influenzavirus A), Betainfluenzavirus (Influenzavirus B), Gammainfluenzavirus (Influenzavirus C) и Deltainfluenzavirus (Influenzavirus D) [245]. Представители данного семейства имеют РНК-содержащий геном, заключенный в липопротеидную оболочку [60]. Вирусы родов Thogotovirus и Quaranjavirus являются возбудителями болезней клещей [218, 243], представители Isavirus вызывают болезни рыб [81], вирусы рода Betainfluenzavirus (вирус гриппа типа В) и Gammainfluenzavirus (вирус гриппа типа С) вызывают сезонные инфекции у людей [138, 267], однако известны случаи выделения вируса гриппа В от морских котиков [139], а вирусы типа С свиней [142]. Последний род который был отнесен к семейству Orthomyxoviridae - это Deltainfluenzavirus (вирус гриппа типа D), представители данного семейства вызывают инфекции у крупнорогатого скота и свиней [60, 170]. Только вирусы семейства Alphainfluenzavirus вызывают заболевание под названием - грипп птиц [33]. К данному заболеванию чувствительны не только птицы, возбудителя выделяли от многих видов млекопитающих, а также человека, соответственно заболевание представляет угрозу не только для сельского хозяйства, но и для общественного здравоохранения [30, 45, 67, 93, 94, 127, 156, 167, 238, 258, 267, 268].

Подтип вируса гриппа птиц определяют поверхностные гликопротеины -гемагглютинин (HA) и нейраминидаза (NA) [7]. От птиц было выделено 16 подтипов гемагглютинина (H1- H16) и 9 подтипов нейраминидазы (N1- N9), еще 2 подтипа HA (H17 и H18) и NA (N10 и N11) были выделены от травоядных летучих мышей в Гватемале [25, 33, 153, 168, 184].

Согласно международным стандартам, номенклатура вируса гриппа включает в себя: тип вируса гриппа (A, B, C или D), вид животного от которого был выделен вирус (если вирус выделен от человека, то этот пункт пропускают),

географическую локацию, порядковый номер, год выделения, в конце, в скобках, указывается подтип изолята (пример - А/§оове/Оиап§ёоп§/1/96 (Н5Ш)) [29].

Вирусы гриппа птиц значительно различаются по вирулентности, МЭБ предложена система, классифицирующая вирусы на высокопатогенные и низкопатогенные вирусы гриппа птиц [44]. Высокопатогенные - это изоляты, выделенные от домашней птицы с внутривенным индексом патогенности (1УР1) у 6-недельных цыплят 1,2 и больше, или приводят к повышенному падежу (более 75%) у 4-8-недельных цыплят, зараженных внутривенно [44]. Вирусы подтипов Н5 и Н7, 1УР1 которых не превышает 1,2, или вызывающие падеж менее 75% в тесте на летальность (внутривенно), должны подвергаться секвенированию на наличие основных множественных аминокислот в месте расщепления НА0; если рисунок аминокислот сходен с тем, что наблюдается в других ранее выделявшихся вирусах высокопатогенного гриппа птиц, исследуемый изолят должен признаваться как, вирус высокопатогенного гриппа птиц [44]. Вирусы низкопатогенного гриппа птиц - это все вирусы гриппа птиц типа А, которые не относятся к числу вирусов высокопатогенного гриппа птиц [44, 203].

1.2 Структура вируса гриппа птиц

Вирион вируса гриппа, структуированно представлены внутренним комплесом - рибонуклеопротеином (РНП), и внешним - липопротеиновой оболочко, которая представлена сферической или филаментозной формами диаметром 100±20 нм, длина нитевидной формы может достигать 4 мкм [151]. Генетический материал вируса закодирован в 8 сегментах негативно заряженной одноцепочечной спирально-закрученной РНК, которая входит в состав РНП [161]. Каждый сегмент кодирует, как минимум один структурный белок: 1 сегмент -белок основной полимеразы 2 (РВ2), 2 сегмент - белок основной полимеразы 1 (РВ1), 3 сегмент - белок кислой полимеразы (РА), 4 сегмент - гемагглютинин (НА), 5 сегмент - нуклеопротеин (ИР), 6 сегмент - нейраминидазе (ИА), 7 сегмент - матричные белки (М1 и М2), 8 сегмент - белок N81 и белок ядерного экспорта -ИЕР (N82) [190, 267]. Сегменты упакованы в липопротеидную оболочку,

покрытую изнутри матриксным белком (М1), на поверхности которой расположены внешние белки: НА, ИА и небольшое количество М2 и ИЕР. К внутренним белкам относятся ИР, М1 и полимеразный комплекс (РВ1, РВ2 и РА) [7, 190, 199, 267]. Раннее полагалось, что белки №1 и №2 являются неструктурными компонентами и их можно обнаружить только в инфицированной клетке, но с появлением спецефической антисыворотки к белку №2 удалось установить, что данный белок в малых колличествах содержится в созревших вирионах [176]. Последние исследования по изучению строения ВГП и его состава показали, что белок №1, который ранее считали неструктурным, обнаружили в очищенных вирионах [176, 235].

Как было сказано выше, снаружи вирус покрывают гликопротеины гемагглютинин и нейраминидаза, они имеют нитевидную и грибовидную формы, соответственно, их длина, составляет около 12 нм [101]. Гемагглютинин является наиболее важным антигеном и представлен тримером, состоящим из 3 мономеров массой 75 кД, весьма вариабелен и полифункционален: связывается с сиаловой кислотой рецепторов эпителиальных клеток; принимает роль в слиянии оболочки вириона с мембранами клетки; обладает протективными свойствами, способствуя выработке вируснейтрализующих антител [101, 191, 205, 206, 267, 328]. Нейраминидаза есть тетрамер, состоящий из четырёх мономеров массой 200-250 кД, как и НА, обладает вариабельностью и выполняет несколько функций: участвует в отпочковывании (высвобождению) созревших вирусных частиц из зараженной клетки; отщепляет остатки нейраминовой кислоты муцинов респираторного тракта, тем самым облегчая движение вируса к клетке-мишени; стимулирует выработку нейтрализующих антител, они не так эффективно предотвращают инфекцию, как антитела к НА, но сдерживают ее развитие, препятствуя высвобождению вируса из зараженных клеток [21, 101, 140, 191]. Стоит отметить, что вируснейтрализующие антитела вырабатываются не только на НА и ИА, но и на консервативные внутренние антигены М и ИР, но гораздо в меньшем колличестве [248].

1.3 Изменчивость вируса гриппа птиц

Вирусы гриппа А птиц склонны к изменению фенотипа и генотипа. благодаря мутациям и отсутствия механизма контролирующего сборку вириона, следовательно, они не способны исправлять ошибки, возникающие во время репликации, сегментированному генному, приводящему к реассортации, а также благодаря рекомбинации [33].

Антигенный дрейф - непрерывный процесс в результате, которого возникают точечные мутации в вирусном геноме во время репликации [53]. Этот процесс характерен для всех генов вируса, но чаще всего мутации происходят на сайтах связывания антител с НА и КА [240]. Отсутствие механизма корректировки этих мутаций приводит к накоплению изменений аминокислотной последовательности до такой степени, что антитела хозяина не распознают вирус гриппа [94]. Варианты вируса, которые не были нейтрализованы антителами, сохраняются благодаря естественному отбору как более приспособленные [94]. Гемагглютинин вируса гриппа характеризуется более высокими уровнями изменчивости, по отношению к нейраминидазе [101]. Стоит отметить, что большая часть мутаций, которые относятся к антигенному дрейфу, в НА происходит по ограниченному числу позиций [101]. Антигенный дрейф более характерен для вирусов гриппа людей, менее характерен для вирусов свиного и лошадиного гриппа и еще менее характерен для вирусов гриппа птиц [142]. Антигенный дрейф оказывает существенное влияние на эффективность вакцин против сезонного гриппа людей [94]. Влияние антигенного дрейфа было проиллюстрировано в 1997/1998 гг. и 2003/2004 гг. в Европе и Америке, когда в сезон гриппа наблюдались особенно серьезные вспышки из-за плохо подобранного состава вакцины [94, 240].

Процесс антигенного сдвига (или шифта) возможен благодаря сегментированному генному вируса гриппа птиц [240]. Процесс возможен, когда два (или более) генотипически разных вируса гриппа инфицируют одну клетку хозяина, в которой происходит обмен сегментами [240]. В результате появляются новые варианты вирусов, состоявшие из различных сегментов родительских

вирусов и которые, скорее всего, будут иммунологически наивны к популяции, в которой сформировался новый вирус [160, 240]. Птицы являются основным резервуаром для вируса гриппа птиц и представляют неограниченные возможности для образования новых вариантов вируса посредством антигенного шифта [240]. Во время миграционных процессов концентрация птиц в местах стоянок или гнездования достигает высоких уровней, в данных условиях птица может быть инфицирована сразу несколькими вирусами и как следствие -формирование новых вариантов вирусов, которые потенциально могут преодолевать межвидовой барьер [46, 57, 111, 215].

В результате реассортации вируса гриппа птиц с вирусом, циркулировавшим в популяции людей, возможно формирование нового вируса способного вызывать пандемию, так было с вирусами вызывавшие пандемии в 1957, 1968 и 2009 гг. [242]. Данные генетических исследований указывают на то, что сегменты генов НА, КА и РВ1, пандемического штамма И2К2 1957 г., и сегменты НА и РВ1, пандемического штамма И3К2 1968 г., имели птичье происхождение, а остальные сегменты, вероятнее всего, происходили от штамма вызвавшего пандемию в 1918 г. [108, 167, 208]

Так как свиньи восприимчивы как к вирусам гриппа птиц, так и к вирусам, циркулирующих среди людей, именно их рассматривают в качестве промежуточных хозяев, в которых наиболее вероятна реассортация вирусных сегментов и появление нового варианта вируса, обладающего повышенными вирулентными свойствами и способностью передаваться от человека к человеку [242]. Так было в 2009 г., когда в Мексике начали регистрировать первые случаи заболевания людей новым варианта вируса гриппа НШ1, который перешел в человеческую популяцию от свиней [267]. Пандемический штамм Н1Шрёш09 включал в себя сегменты вирусов циркулирующих среди свиней, птиц и людей. Вирус ВПГП Н5Ш, который в 1997 г. преодолел межвидовой барьер от птицы к человеку, сформировался благодаря множеству реассортаций [90, 267].

Третий механизм, благодаря которому вирус гриппа птиц мутирует - это рекомбинация. Рекомбинации вируса гриппа происходит двумя путями:

негомологичная рекомбинация, при которой происходит обмен между двумя различными сегментами и гомологичная рекомбинация [68]. Считается, что негомологичная рекомбинация генов HA и NP, вируса НПГП, стала причиной возникновения вируса ВПГП H7N3, который вызвал вспышку среди цыплят в 2002 г. в Чили [195]. Два года спустя похожий сценарий произошел в Британской Колумбии, вирус H7N3 обрел вирулентные свойства за счет негомологичной рекомбинации [130]. Исследования in vitro, с использованием куриных эмбрионов, показали возможность повышения вирулентности вируса посредствам негомологичной рекомбинации [68, 130, 150, 195]. Эти данные позволяют сделать заключение, что негомологичная рекомбинация играет важную роль в изменение патогенности циркулирующих штаммов. Факт гомологичной рекомбинации пока не доказан полностью, однако генетический анализ, проведенный китайскими учеными, показал наличие идентичных мозаичных генов PA у 3 вирусов НПГП A/H9N2, выделенных от мертвых цыплят [177]. Полный анализ последовательностей трёх вирусов H9N2, выделенных в Китае от мертвых цыплят, после дифференциации методом бляшек, показал, что все три изолята имели схожие мозаичные гены PA, полученные от вирусов H9N2 и H5N1 [177].

1.4 Экология вируса гриппа птиц

Главные представители экологической ниши и генофонда ВГП - это дикие птицы водного (отряд гусеобразные Anesriformes) и околоводного (отряд ржанкообразные Charadriformes) комплексов, которые являются основным источником распространения вируса [213, 215]. Тем не менее, вирус выделяли от множества видов птиц (более 100), млекопитающих, в том числе человека [111, 267].

Чаще всего вирус гриппа птиц выделяли от представителей семейства утиных (Anatidae), особенно от крякв (Anas platyrchynchos), важно отметить, что данный вид является самым распространенным в большей части Евразии и Северной Америке [84, 144]. Особое значение имеет тот факт, что представители данного семейства, как и другие птицы отряда гусеобразных, являются дальними

мигрантами, которые способны преодолевать расстояния в несколько тысяч километров, перенося и распространяя вирус в окружающую среду [10, 84, 92, 223, 251]. У водоплавающих птиц вирус преимущественно реплицируется в желудочно-кишечном тракте и в меньшей степени в дыхательных путях, соответственно инфицирование осуществляется фекально-оральным и/или аэрогенным путями [144]. Жизненный цикл представителей данных отрядов тесно связан с водой, во время миграций на водоемах возникает высокая плотность представителей орнитофауны из различных регионов [92]. Данные условия позволяют обмениваться вирусами гриппа птиц и приводят к возникновению новых вариантов и их распространению [213]. Стоит отметить сезонность данного заболевания, его пик приходится на позднюю осень [213, 222]. Возможно, это связано с тем, что осенью в популяции птиц находится большое количество молодняка, у которого отсутствует специфические антитела, противостоящие вирусу [144]. У взрослых особей, как правило, инфекция, вызванная низкопатогенными штаммами, протекает без ярких признаков заболевания [144]. При изучении инфекционного процесса у диких малых лебедей (Су§пш со1итЫапш Ъетски) и крякв, зараженных естественным путём, наблюдали только незначительную потерю массы [86, 117].

Водная среда является оптимальной для сохранения и передачи вируса, в пресной воде он способен сохранять инфекционную активность до 4 дней при 22°С, более 30 дней при 0°С и еще более продолжительное время в замерзшей почве или во льду [5]. Исследователи полагают, что инфицирование может происходить следующим образом: зараженные птицы выделяют вирус в окружающую среду, контаминируя почву и воду, вирионы в замороженном состояние сохраняются в течение всей зимы, а весной, вернувшиеся в места гнездования дикие птицы, вновь заражаются вирусом [5]. Заражение могут провоцировать поведенческие реакции птиц, а именно - чистка оперенья клювом, сорбированные на перьях вирусы попадают в организм птицы и приводят к инфицированию [105]. Также есть данные, что вирусы гриппа могут

сорбироваться не только на перьях птиц, но и в меху млекопитающих, обитающих в водоемах [5].

Прямое или косвенное взаимодействие диких и домашних птиц может приводить к расширению круга хозяев [267]. Особую опасность представляют перепела, так как в их организме клетки содержат рецепторы двух типов (а-2,3 и а-2,6-связанные сиаловые кислоты), соответственно они восприимчивы к большему разнообразию ВГП, чем другие виды птиц [32]. В случае инфицирования несколькими разными вирусами, перепела могут выступать в роли «смешивающего сосуда» и способствовать образованию новых вариантов вируса [32, 201].

Для человека эндемичны вирусы гриппа птиц с подтипами Н1, Н2 и Н3, долгое время было принято считать, что другие подтипы вируса гриппа птиц не вызывает болезни у человека, но всё изменилось в 1997 г., когда в Гонконге 6 из 18 человек погибли после инфицирования ВПГП с подтипом Н5Ш [73]. Также известны спорадические случаи заражения человека подтипами Н5И1, Н5И6, Н6Ш, Н7И2, Н7№, Н7И4, Н7И7, Н7И9, Н9И2, Н10И7 и Н10И8, впрочем, широкого распространения они не получили [31, 42, 67, 232, 258]. Дело в том, что подтипы, которые эндемичны для людей (Н1, Н2, Н3), распознают специфические рецепторы клеток, содержащие в составе а-2,6-связанную сиаловую кислоту, в то время как высоковирулентные вирусы (Н5 и Н7) распознают клеточные рецепторы с а-2,3-связаной сиаловой кислотой [42]. Есть данные, объясняющие высокую смертность людей от вируса гриппа Н5Ш и объясняющие неэффективную передачу от человека к человеку [48, 238]. Дело в том, что клетки с а-2,6-галактозными рецепторами имеются по всему дыхательному тракту от носа и до легких, но клетки с а-2,3-галактозными рецепторами тоже есть в легких, они выстилают альвеолы и область вокруг них [48, 238]. Таким образом, Н5Ш преимущественно заражает клетки нижних дыхательных путей и вызывает тяжелые повреждения в легких, но вызывает незначительные изменения в верхних дыхательных путях [75, 116]. Еще одним препятствием для вируса гриппа птиц на пути в преодолении межвидового барьера и адаптации к новому

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Алтунин Дмитрий Александрович, 2019 год

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

1. Анализ штаммов вируса гриппа И5К8, вызвавших вспышки в России в 2016-2017 гг. / В.Ю. Марченко, И.М. Суслопаров, Н.Ю. Сапронова [и др.] // Пробл. особо опасных инф. - 2017. - №3. - С. 68-74.

2. Биологические свойства вируса гриппа птиц подтипа Н5Ш, выделенного в Российской Федерации в 2006 году / И.А. Чвала, Т.Б. Манин, В.В. Дрыгин [и др.] // Ветеринарная патология. - 2007. - № 4. - С. 118 -121.

3. Болезни домашних и сельскохозяйственных птиц: пер. с англ./ под ред. Б. У. Кэлнека, Х. Д. Барнса - М., Аквариум, 2003. - С. 672 - 693.

4. Ветеринарные правила лабораторной диагностики гриппа А птиц: Приказ МСХ РФ от 3.04.2006 г. № 105 // Вет. консультант. - 2006. - № 12. - С. 8-9.

5. Выделение вируса гриппа А с оперения водоплавающих птиц во время осенней миграции // М.А. Гуляева, К.А. Шаршов, И.А. Соболев [и др.] // Юг России: экология, развитие. - 2018. - Т. 13, № 3. - С. 134-141.

6. Выделение и изучение вируса гриппа птиц А/Н5№, вызвавшего вспышки болезни в Алтайском крае в 2014 г. / Ил.А. Чвала, А.В. Андриясов, Н.Г. Зиняков, Д.А. Алтунин [и др.] // Ветеринария сегодня. - 2017. - № 1. - С. 2329.

7. Жирнов, О.П. Белки вируса гриппа. Включение вновь синтезированных вирусных белков в вирионы / О.П. Жирнов, А.Г. Букринская // Вопросы вирусологии. - 1982. - № 5. - С. 549-556.

8. Изучение особенностей патологического процесса у кур, вызванного изолятом вируса гриппа птиц АМиск/АИа^469/14Н5№ / В.Ю. Сосипаторова, Д.А. Алтунин, М.А. Циванюк, И.А. Чвала // Ветеринария сегодня. - 2016. - № 1. - С. 51-54.

9. Изучение циркуляции вируса гриппа птиц на территории Убсунурского миграционного очага Республики Тыва / М.С. Волков, А.В. Варкентин, В.Н. Ирза, Ил.А. Чвала, А.Э. Меньщикова, А.В. Андриясов, М.А. Циванюк [и др.] // Ветеринария сегодня. - 2016. - № 4. - С. 8-18.

10.Львов, Д.К. Ильичев В.Д. Миграции птиц и перенос возбудителей инфекции. Эколого-географические связи птиц с возбудителями инфекции. / Д.К. Львов, В.Д. Ильичев. - М.: Наука. - 1979. - 270 с.[11]

11.Методы лабораторной диагностики вирусных болезней животных / В.Н. Сюрин, Р.В. Белоусова, Б.В. Соловьев, Н.В. Фомина. - М.: Агропромиздат. -1986. - 351 с.

12. О циркуляции вирусов гриппа А и падеже птиц на юге Центральной Сибири / А.П. Савченко, В.И. Емельянов, П.А. Савченко [и др.] // Бюллетень ВСНЦ СО РАМН. - 2012. - № 5(87). - С. 310-315.

13. Обзор эпидемиологической ситуации по высокопатогенному вирусу гриппа птиц в России в 2018 г. / В.Ю. Марченко, Н.И. Гончарова, В.А. Евсеенко [и др.] // Проблемы Особо Опасных Инфекций. - 2019. - № 1. - С. 42-49.

14. Особенности инфекции гриппа А у молодняка водоплавающих птиц, вызванной А/сЫскеп/Рптогвку/85/08 Н5Ш/ И.А.Чвала, Л.Ю. Абрамова, Ю.Ю. Бабин [и др.]//Ветеринария. - 2010. - №12. - С. 28-30.

15. Особенности течения инфекции гриппа А у уток-крякв, вызванной А/сЫскеп/Рптогеку/85/08 Н5Ш / И.А. Чвала, Л.О. Щербакова, Л.Ю. Абрамова [и др.]//Ветеринария. - 2009. - № 10. - С. 25 -26.

16.Первый прорыв нового для России генотипа 2.3.2. высоковирулентного вируса гриппа А/Н5Ш на Дальнем Востоке / Д.К. Львов, М.Ю. Щелканов, Н.А. Власов // Вопросы вирусологии. - 2008. - № 5 - С. 4 -8.

17.Сюрин, В.Н. Ветеринарная вирусология: учебн. пособие / В.Н. Сюрин, Р.В. Белоусова, Н.В. Фомина. - М.: Колос, 1984. - 376 с.

18. Сюрин, В.Н. Диагностика вирусных болезней животных: Справочник / В.Н. Сюрин, Р.В. Белоусова, Н.В. Фомина // - М.: Агропромиздат, 1991. - 528 с.

19. Характеристика изолятов вируса гриппа подтипа Н5Ш, выделенных в 2006 и 2007 годах на территории ЮФО России / И.А. Чвала, Т.Б. Манин, И.П. Пчелкина [и др.] // Российский ветеринарный журнал.

Сельскохозяйственные животные. Спец. вып., посвящ. 50-летию ФГУ "ВНИИЗЖ". - 2008. - С. 66 -69.

20. Чвала, И.А. Биологические свойства изолята вируса гриппа птиц A/Duck/Novosibirsk/2/2005 H5N1 / И.А Чвала, В.В. Дрыгин // Ветеринарная патология. - 2006. - № 4. - C. 60 -63.

21.Штыря, Ю.А. Нейраминидаза вируса гриппа: структура и функции / Ю.А. Штыря, Л.В. Мочалова, Н.В. Бовин // Avta Naturae. - 2009. - № 2. - С. 2834.

22.Щелканов М.Ю. Эволюция высоковирулентного вируса гриппа А (H5N1) в экосистемах Северной Евразии (2005-2009 гг.): автореф. дис. ... д-ра биол. наук. - М., 2010. - 53 с.

23. Эволюция вируса гриппа A/H5N1 (1996-2016) / М.Ю. Щелканов, И.М. Кириллов, А.М. Шестопалов [и др.] // Вопросы Вирусологии. - 2016. - № 61(6). - С. 245-256.

24.Экология и эволюция высокопатогенного вируса гриппа H5N1 в России (2005-2012 гг.) / К.А. Шаршов, В.Ю. Марченко, А.К. Юрлов [и др.] // Бюллетень ВСНЦ СО РАМН. - 2012. - №5(87). - С. 393-396.

25.A distinct lineage of influenza A virus from bats / S. Tong, Y. Li, P. Rivailler [ et al] / Proc Natl. Acad. Sci. USA -2012. - Vol. 109. - Р. 4269-4271.

26.A novel highly pathogenic H5N8 avian influenza virus isolated from a wild duck in China / S. Fan, L. Zhou, D. Wu. [et al] // Influenza Other Respir Viruses. -2014. - Vol. 8. - P. 646-653.

27.A novel influenza A virus mitochondrial protein that induces cell death / W. Chen, P.A. Calvo, D. Malide [et al] // Nature medicine. - 2001. - Vol. 7. - P. 1306-1312.

28.A revised system of nomenclature for influenza viruses / Bull World Health Org. - 1971. - Vol. 45. - P. 119-124.

29.A revision of the system of nomenclature for influenza viruses: a WHO memorandum / Bull World Health Org. - 1980. - Vol. 58. - P. 585-591.

30.Abdelwhab, E.M. Prevalence and control of H7 avian influenza viruses in birds and humans / E.M. Abdelwhab, J. Veits, T.C. Mettenleiter // Epidemiol. Infect. -2014. - Vol. 142(5). - P. 921.

31.Acute renal failure as the cause of death in chickens following intravenous inoculation with avian influenza virus A/Chicken/Alabama/7395/75 (H4N8) / D.E. Swayne, M.J. Radin, T.M. Hoepf [et al] // Avian. Dis. - 1994. - Vol. 38. -P. 151-157.

32.Alexander, D.J. A review of avian influenza in different bird species / D.J. Alexander // Vet. Microbiol. - 2000. - Vol. 74. - P. 3-13.

33.Alexander, D.J. An overview of the epidemiology of avian influenza / D/J/ Alexander // Vaccine. - 2007. - Vol. 25(30). - P. 5637-5644.

34.Alexander, D.J. Ecology of avian influenza in domestic birds / D.J. Alexander // Proceedings of the International Symposium on Emergence and Control of Zoonotic Ortho- and Paramyxovirus Diseases. - 2001. - P. 25-34.

35.Alexander, D.J. Highly pathogenic avian influenza oubreaks in Europe, Asia, and Africa since 1959, excluding the Asian H5N1 virus outbreaks / Alexander, D.J. Capua I, Koch G // In: Swayne D.E. (ed) avian influenza, 1st edn. Blackwell Publishing, Ames. - 2008. - P. 217-237.

36.Alexander, D.J. Summary of avian influenza activity in Europe, Asia, Africa, and Australasia, 2002-2006 / D.J. Alexander // Avian Dis. - 2007b. - Vol. 51. - P. 161-166.

37.Alexander, DJ. Avian influenza-Historical aspects / D.J. Alexander // Proceedings of the Second International Symposium on Avian Influenza. - 1986. - P. 4-13.

38.An evaluation of avian influenza diagnostic methods with domestic duck specimens / E. Spackman, M.J. Pantin-Jackwood, D.E. Swayne [et al] // Avian. Dis. - 2009. - Vol. 53. - P. 276-280.

39.An outbreak of highly pathogenic H5N1 avian influenza in Korea, 2008 / H.R. Kim, C.K. Park, Y.J. Lee [et al] // Vet. Microbiol. 2010. - Vol. 141. - P. 362-366.

40.Association of RIG-I with innate immunity of ducks to influenza / M.R. Barber, J. Aldridge, R.G. Webster [et al] // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 2010. - Vol. 107. - P. 5913-5918.

41.Avian flu: H5N1 virus outbreak in migratory waterfowl / H. Chen, G.J. Smith, S.Y. Zhang [et al] // Nature. - 2005. - Vol. 436. - P. 191-192. [46]

42.Avian flu: influenza virus receptors in the human airway / K. Shinya, M. Ebina, S. Yamada [et al] // Am. J. Trop. Med. Hyg. - 2006. - Vol. 75(2). - P. 327-332.

43.Avian influenza (H5N1) outbreak among wild birds, Russia, 2009 / K. Sharshov, N. Silko, I. Sousloparov [et al] // Emerg. Infect. Dis. - 2010. - Vol. 16. - P. 349351.

44.Avian influenza // OIE. Manual of Diagnostic Tests and Vaccines for Terrestrial Animals 2014. - Vol. 1. Chap. 2.3.4. Режим доступа: http: //www. oie. int/fileadmin/Home/eng/Health_standards/tahm/2.03.04_ AI.pdf. (проверено 13.08.19 г.).

45.Avian influenza in birds and mammals / C.J. Cardona, Z. Xing, C.E. Sandrock [et al] // Comp. Immunol. Microbiol. Infect. Dis. - 2009. - Vol. 32(4). - P. 255273.

46.Avian influenza in Russia in 2005-2008: some epidemiological aspect and control strategies /V.N. Irza, T.B. Manin, A.V. Frolov [et. al.] // 7th Symposium on Avian Influenza: Avian influenza in poultry and wild birds / Athens, Georgia, USA. -2009. - P. 69.

47.Avian influenza virus (H5N1) in chickens in India / S. Nagarajan, H.V. Murugkar, C. Tosh [et al] // Vet. Rec. - 2009. - Vol. 164. - P. 128.

48.Avian Influenza Virus Transmission to Mammals / S. Herfst, M. Imai, Y. Kawaoka [et al] // Influenza Pathogenesis and Control. - 2014. - Vol. 1. - P. 137155.

49.Beard, C.W. Hemagglutination-inhibition, in Isolation and Identification of Avian Pathogens / C.W. Beard // S.B. Hitcher, C.H. Domermuth, H.G. Purchase, J.E. Williams (ed.). Kennett Square, PA: American Association of Avian Pathologists. - 1980. - P. 331-336.

50.Beard, C.W. Isolation of two turkey influenza viruses in Oregon / C.W. Beard, D.H. Helfer // Avian Dis. - 1972. - Vol. 16. - P. 1133-1136.

51.Becker, W.B. The isolation and classification of tern virus: influenza virus A/tern/South Africa/1961 / W.B. Becker // J. Hyg. - 1966. - N 64. - P. 309-320.

52.Biological characterizations of H5Nx avian influenza viruses embodying different neuraminidases / Y. Yu, Z. Zhang, H. Li [et al] // Front. Microbiol. -2017. - Vol. 8. - P. 1064.

53.Boni, M.F. Vaccination and antigenic drift in influenza / M.F. Boni // Vaccine. -2009. - Vol. 26. - P. 8-14.

54.Brown, J.D. Experimental infection of swans and geese with highly pathogenic avian influenza virus (H5N1) of asian lineage / J.D. Brown, D.E. Stallknecht D.E., Swayne D.E. // Emerg. Infect. Dis. - 2008. - Vol. 14(12). - P. 1835-1841.

55.Burnet, F.M. Influenza virus on the developing egg. I. Changes associated with the development of an egg-passage strain of virus / F.M. Burnet // Br. J. Exp. Pathol. - 1936. - Vol. 17. - P. 282-293.

56.Burnet, F.M. The differentiation of the viruses of fowl plague and Newcastle disease: experiments using the technique of chorioallantoic membrane inoculation of the developing egg / F.M. Burnet, J.D. Ferry // Br. J. Exp. Pathol. -1934. - Vol. 15. - 56-64.

57.Can Preening Contribute to Influenza A Virus Infection in Wild Waterbirds? / M. Delogu, M.A.D. Marco, L.D. Trani [et al] // PLoS. One. - 2010. - Vol. 5. - P. e11315.

58.Capua, I. Clinical traits and pathology of avian influenza infections, guidelines for farm visit and differential diagnosis / I. Capua, C. Terregino // Capua I., Alexander D.J. (eds) In: Avian influenza and newcastle disease—a field and laboratory manual, 3rd edn. - Springer, Milan. - 2009. - P. 45-71.

59.Capua, I. The avian influenza epidemic in Italy, 1999-2000: a review / I. Capua, S. Maragon // Avian. Pathol. - 2000. - Vol. 29. - P. 289-294.

60.Characterization of a Novel Influenza Virus in Cattle and Swine: Proposal for a New Genus in the Orthomyxoviridae Family / B.M. Hause, E.A. Collin, R. Liu [et al] // mBio. - 2014. - Vol. 5(2). - P. e00031-14.

61.Characterization of avian H5N1 influenza viruses from poultry in Hong Kong / K.F. Shortridge, N.N. Zhou, Y. Guan [et al] // Virology. - 1998. - Vol. 252. - P. 331-342.

62.Characterization of H5N1 influenza A viruses isolated during the 2003-2004 influenza outbreaks in Japan / M. Mase, K. Tsukamoto, T. Imada [et al] // Virology. - 2005. - Vol. 332. - P. 5398-5404.

63.Characterization of H5N1 influenza viruses that continue to circulate in geese in southeastern China / R.G. Webster, Y. Guan, M. Peiris // Virol. - 2002. - Vol. 76.

- P.118-126.

64.Characterization of highly pathogenic avian influenza virus A(H5N6), Japan, November 2016 / M. Okamatsu, M. Ozawa, K. Soda [et al] // Emerg. Infect. Dis.

- 2017. - Vol. 23. - P. 691-695.

65.Characterization of highly pathogenic H5N1 avian influenza A viruses isolated from South Korea / C.W. Lee, D.L. Suarez, T.M. Tumpey [et al] // J. Virol. -2005. - Vol. 79. - P. 3692-3702.

66.Characterization of low-pathogenic H5 subtype influenza viruses from Eurasia: implications for the origin of highly pathogenic H5N1 viruses / L. Duan, L. Campitelli, X.H. Fan [et al] // J. Virol. - 2007. - Vol. 81. - P. 7529-7539.

67.Characterization of the surface proteins of influenza A (H5N1) viruses isolated from humans in 1997-1998 / C. Bender, H. Hall, J. Huang [et al] // Virology. -1999. - Vol. 254. - P. 115-123.

68.Chare, E.R. Phylogenetic analysis reveals a low rate of homologous recombination in negative-sense RNA viruses / E.R. Chare, E.A. Gould, E.C. Holmes // J. Gen. Virology. - 2003. - P. 2691-2703.

69.Clade 2.3.4.4 avian influenza A (H5N8) outbreak in commercial poultry, Iran, 2016: the first report and update data / S.A. Ghafouri, A. GhalyanchiLangeroudi,

H. Maghsoudloo [et al] // Trop. Anim. Health. Prod. - 2017. - Vol. 49. - P. 10891093.

70.Co-circulation of genetically distinct highly pathogenic avian influenza A clade 2.3.4.4 (H5N6) viruses in wild waterfowl and poultry in Europe and East Asia, 2017-18 / M.J. Poen, D. Venkatesh, T.M. Bestebroer [et al] // Virus Evolution. -Vol. 5(1). - P. 004.

71.Combining spatial-temporal and phylogenetic analysis approaches for improved understanding on global H5N1 transmission / L. Liang, B. Xu, Y. Chen [et al] // PLoS. One. - 2010. - Vol. 5. - P. e13575.

72.Conserved and host-specific features of influenza virion architecture / E.C. Hutchinson, P.D. Charles, S.S. Hester [et al] // Nat. Commun. - 2014. - Vol. 5. -P. 4816.

73.Continued circulation in China of highly pathogenic avian influenza viruses encoding the hemagglutinin gene associated with the 1997 H5N1 outbreak in poultry and humans / A.N. Cauthen, D.E. Swayne, S. Schultz-Cherry [et al] // J. Virol. - 2000. - Vol. 74. - P. 6592-6599.

74.Continuing reassortant of H5N6 subtype highly pathogenic avian influenza virus in Guangdong / R. Yuan, Z. Wang, Y. Kang [et al] // Front. Microbiol. - 2016. -Vol. 7. - P. 520.

75.Couceiro, J.N. Influenza virus strains selectively recognize sialyloligosaccharides on human respiratory epithelium; the role of the host cell in selection of hemagglutinin receptor specificity / J.N. Couceiro, J.C. Paulson, L.G. Baum // Virus. Res. - 1993. - Vol. 29(2). - P. 155-165.

76.Dasen, C.A. Antibodies to influenza viruses (including the human A2/Asian/57 strain) in sera from Australian shearwaters (Puffinus pacificus) / C.A. Dasen, W.G. Laver // Bull Wold Health Org. - 1970. - Vol. 42. - P. 885-889.

77.Deduced amino acid sequences at the haemagglutinin cleavage site of avian influenza A viruses of H5 and H7 subtypes / G.W. Wood, J.W. McCauley, J.B. Bashiruddin [et al] // Arch. Virol. - 1993. - Vol. 130. - P. 209-217.

78.Detection of Hong Kong 97-like H5N1 influenza viruses from eggs of Vietnamese waterfowl / Y. Li, Z. Lin, J. Shi [et al] // Arch. Virol. - 2006b. - Vol. 151. - P. 1615-1624.

79.Development of a real-time reverse transcriptase PCR assay for type A influenza virus and the avian H5 and H7 hemagglutinin subtypes / E. Spackman, D.A. Senne, T.J. Myers // J. Clin. Microbiol. - 2002. - Vol. 40. - P. 3256-3260.

80.Different hemagglutinin cleavage site variants of H7N7 in an influenza outbreak in chickens in Leipzig, Germany / C. Rohm, J. Suss, V. Pohle [et al] // Virology. - 1996. - Vol. 218. - P.253-257.

81.Dinter, Z. Eine variante des virus der Geflugelpest in Bayern? / Z. Dinter // Tierarztl Umschau. - 1949. - Vol. 4. - P. 185-186.

82.Domestic ducks and H5N1 influenza epidemic, Thailand / T. Songserm, R. Jamon, N. Sae-Heng [et al] // Emerg. Infect. Dis. - 2006. - Vol. 12. - P. 575-581.

83.Downie, J.C. Isolation of a type A influenza virus from an Australian pelagic bird / J.C. Downie, W.G. Laver // Virology. - 1973. - Vol. 51. - P. 259-269.

84.Doyle, T.M. A hitherto unrecorded diseases of fowls due to a filter-passing virus / T.M. Doyle // J. Comp. Pathol. Theory. - 1927. - Vol. 40. - P. 144-169.

85.Duck migration and past influenza A (H5N1) outbreak areas / N. Gaidet, S.H. Newman, W. Hagemeijer [et al] // Emerg. Infect. Dis. - 2008. - Vol. 14. - P. 1164-1166.

86.Effects of influenza A virus infection on migrating mallard ducks / N. Latorre-Margalef, G. Gunnarsson, V.J. Munster [et al] // Proc. Biol. Sci. - 2009. - Vol. 276. - P. 1029-1036.

87.Emergence of multiple genotypes of H5N1 avian influenza viruses in Hong Kong SAR / Y. Guan, J.S. Peiris, A.S. Lipatov [et al] // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. -2002a. - Vol. 99. - P. 8950-8955.

88.Enhanced recovery of avian influenza virus isolates by a combination of chicken embryo inoculation methods / P.R. Woolcock, M.D. McFarland, S. Lai [et al] // Avian Dis. - 2001. - Vol. 45. - P. 1030-1035.

89.Establishment of multiple sublineages of H5N1 influenza virus in Asia: implications for pandemic control / H. Chen, G.J. Smith, K.S. Li [et al] // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 2006a. - Vol. 103. - P. 2845-2850.

90.European swine virus as a possible source for the next influenza pandemic / S. Ludwig, L. Stitz, O. Planz [et al] // Virology. - 1995. - Vol. 212. - P. 555-561.

91.Evidence for the introduction, reassortment, and persistence of diverse influenza A viruses in Antarctica / A.C. Hurt, Y.C. Su, M. Peck [et al] // J. Virol. - 2016. -Vol. 90. - P. 9674.

92.Evidence of infection with influenza viruses in migratory waterfowl / B.C. Easterday, D.O. Trainer, B. Tumova [et al] // Nature. - 1968. - Vol. 219. - P. 523-524.

93.Evolution and adaptation of H5N1 influenza virus in avian and human hosts in Indonesia and Vietnam / G.J. Smith, T.S. Naipospos, T.D. Nguyen [et al] // Virology. - 2006b. - Vol. 350. - P. 258-268.

94.Evolution and ecology of influenza A viruses / R. G. Webster, W.J. Bean, O.T. Gorman [et al] // Microbiol. Rev. - 1992. - Vol. 53. - P. 152-179.

95.Evolution, global spread, and pathogenicity of highly pathogenic avian influenza H5Nx clade 2.3.4.4 / D.H. Lee, K. Bertran, J.H. Kwon [et al] // J. Vet. Res. -2017. - Vol. 18(1). - P. 269-280.

96.Evolutionary dynamics and emergence of panzootic H5N1 influenza viruses / D. Vijaykrishna, J. Bahl, S. Riley [et al] // PLoS. Pathog. - 2008. - Vol. 4. - P. e1000161.

97.Feare, C.J. Captive rearing and release of Bar-headed Geese (Anser indicus) in China: a possible HPAI H5N1 virus infection route to wild birds / C.J. Fear, T. Kato, R. Thomas // J. Wildl. Dis. - 2010. - Vol. 46. - P. 1340-1342.

98.Feare, C.J. The role of wild birds in the spread of HPAI H5N1 / C.J. Feare // Avian. Dis. - 2007. - Vol. 51. - P. 440-447.

99.First reported incursion of highly pathogenic notifiable avian influenza A H5N1 viruses from clade 2.3.2 into European poultry / S.M. Reid, W.M. Shell, G. Barboi [et al] // Trans. And Emerg. Dis. - 2011. - Vol. 58. - P. 76-78.

100. Free-grazing ducks and highly pathogenic avian influenza, Thailand / M. Gilbert, P. Chaitaweesub, T. Premashthira [et al] // Emerg. Infect. Dis. - 2006a. -Vol. 12. - P. 227-234.

101. Gamblin, S.J. Influenza hemagglutinin and neuraminidase membrane glycoprotein / S.J. Gamblin, J.J. Skehel // J. Biol. Chem. - 2010. - Vol. 285. - P. 28403-28409.

102. Genesis of a highly pathogenic and potentially pandemic H5N1 influenza virus in eastern Asia / K.S. Li, Y. Guan, J. Wang [et al] // Nature. - 2004. - Vol. 430. - P. 209-213.

103. Genesis, evolution and prevalence of H5N6 avian influenza viruses in China / Y. Bi, Q. Chen, Q. Wang [et al] // Cell Host Microbe. - 2016. - Vol 20. -P. 810-821.

104. Genetic and phylogenetic characterizations of a novel genotype of highly pathogenic avian influenza (HPAI) H5N8 viruses in 2016/2017 in South Korea / Y.I. Kim, S.J. Park, H.I. Kwon [et al] // Infect. Genet. Evol. - 2017. - Vol. 53. -P. 56-67.

105. Genetic characterization of an H2N2 influenza virus isolated from a muskrat in Western Siberia / M. Gulyaeva, K. Sharshov, M. Suzuki // J. Vet. Med. Sci. - 2017. - Vol. 79(8). - P. 1461-1465.

106. Genetic characterization of H5N1 influenza viruses isolated from chickens in Indonesia in 2010 / C.A. Nidom, S. Yamada, R.V. Nidom [et al] // Virus Genes. - 2012. - Vol. 44. - P. - 459-465.

107. Geographic and temporal distribution of highly pathogenic avian influenza A virus (H5N1) in Thailand, 2004-2005: an overview / T. Tiensin, M. Nielen, T. Songserm [et al] // Avian Dis. - 2007. - Vol. 51. - P. 182-188.

108. Ghendon, Y. Introduction to pandemic influenza through history / Y. Ghendon // European Journal of Epidemiology . - 1994. - Vol. 10. - P. 451-453.

109. Global avian influenza outbreaks 2010-2016: a systematic review of their distribution, avian species and virus subtype / I.O. Chatziprodromidou, M. Arvanitidou, J. Guitian [et al] // Syst. Rev. - 2018. - Vol. 7. - P. 17.

110. Global avian influenza surveillance in wild birds: a strategy to capture viral diversity / C.C. Machalaba, S.E. Elwood, S. Forcella [et al] // Emerg. Infect. Dis. - 2015. - Vol. 21(4). - P. 1414-1415.

111. Global patterns of influenza virus in wild birds / B. Olsen, V.J. Munster, A. Wallensten [et al] // Science. - 2006. - Vol. 312. - P. 384-388.

112. H5N1 Influenza Virus, Domestic Birds, Western Siberia, Russia / A.M. Shestopalov, A.G. Durimanov, V.A. Evseenko [et al] // Emerg. Infect. Dis. -2006. - Vol. 12. - P. 1167-1169.

113. H5N1 influenza viruses: outbreaks and biological properties / G. Neumann, H. Chen, G.F. Gao [et al] // Cell. Res. - 2010. - Vol. 20(1). - P. 51-61.

114. H5N1 influenza: a protean pandemic threat / Y. Guan, L.L. Poon, C.Y. Cheung [et al] // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 2004. - Vol. 101. - P. 8156-8161.

115. Haemagglutination-inhibiting activity to type a influenza viruses in the sera of wild birds from the far east of the USSR / A.N. Slepuskin, T.V. Pysina, F.K. Gonsovsky [et al] // Bull World Health Org. - 1972. - Vol. 47. - P. 527-530.

116. Haemagglutinin mutations responsible for the binding of H5N1 influenza A viruses to human-type receptors / S. Yamada, Y. Suzuki, T. Suzuki [et al] // Nature. - 2006. - Vol. 444(7117). - P. 378-382.

117. Hampered foraging and migratory performance in swans infected with low-pathogenic avian influenza A virus / J.A. Gils, V.J. Munster, R. Radersma [et al] // PLoS. One. - 2007. - Vol. 2. - P. - e184.

118. Highly pathogenic avian influenza A (H5N8) virus in wild migratory birds, Qingha Lake, China / M. Li, H. Liu, Y. Bi [et al] // Emerg. Infect. Dis. - 2017. -Vol. 23(4). - P. 637-641.

119. Highly pathogenic avian influenza H5N1, Thailand, 2004 / T. Tiensin, P. Chaitaweesub, T. Songserm [et al] // Emerg. Infect. Dis. - 2005. - Vol. 11. - P. !664-1672.

120. Highly pathogenic avian influenza virus (H5N1) isolated from whooper swans, Japan / Y. Uchida, M. Mase, K. Yoneda [et al] // Emerg. Infect. Dis. -2008b. - Vol. 14. - P. 1427-1429.

121. Highly pathogenic avian influenza virus (H5N8) clade 2.3.4.4 infection in migratory birds, Egypt / A.A. Selim, A.M. Erfan, N. Hagag [et al] // Emerg. Infect. Dis. - 2017. - Vol. 23. - P. 1048-1051.

122. Highly pathogenic avian influenza virus (H5N8) in domestic poultry and its relationship with migratory birds in South Korea during 2014 / J. Jeong, H.M. Kang, E.K. Lee [et al] // Vet. Microbiol. - 2014. - Vol. 173. - P. 249-257.

123. Highly pathogenic avian influenza virus subtype H5N1 in Africa: a comprehensive phylogenetic analysis and molecular characterization of isolates / G. Cattoli, I. Monne, A. Fusaro [et al] / PLoS. One. - 2009. - Vol. 4. - P. e4842.

124. Highly pathogenic avian influenza viruses and generation of novel reassortants, United States, 2014-2015 / D.H. Lee, J. Bahl, M.K. Torchetti [et al] // Emerg. Infect. Dis. - 2016. - Vol. 22(7). - P. 1283-1285.

125. Highly pathogenic avian influenza viruses H5N2, H5N3, and H5N8 in Taiwan in 2015 / M.S. Lee, L.H. Chen, Y.P. Chen [et al] // Vet. Microbiol. -2016. - Vol. 187. - P. 50-57.

126. Highly pathogenic H5N1 influenza virus infection in migratory birds / J. Liu, H. Xiao, F. Lei [et al] // Science. - 2005. - Vol. 309. - P. 1206.

127. Hinshaw, V.S. Influenza A viruses: combinations of haemagglutinin and neuraminidase subtypes isolated from animals and other sources / V.S. Hinsaw, R.G. Webster, J. Rodriguez // Arch. Virol. - 1981. - Vol. 67. - P. 191-206.

128. Hirst, G.K. The agglutination of red cells by allantoic fluid of embryos infected with influenza virus / G.K. Hirst // Science. - 1941. - Vol. 94. - P. 2223.

129. Hirst, G.K. The quantitative determination of influenza virus and antibodies by means of red cellagglutination / G.K. Hirst // J. Exp. Med. - 1942. -Vol. 75(1). - P. 49-64.

130. Homologous recombination as an evolutionary force in the avian influenza A virus / C.Q. He, Z.X. Xie, G.Z. Han [et al] // Molec. Biol. Evol. - 2009. - Vol. 26. - P. 177-187.

131. Houser, K. Influenza Vaccines: Challenges and Solutions / K. Houser, K. Subbarao // Cell. Host. Microbe. - 2015. - Vol. 17. - P. 295-300.

132. Identification and subtyping of avian influenza viruses by reverse transcription-PCR / M.S. Lee, P.C. Chang, J.H. Shien [et al] // J. Virol. Meth. -2001. - Vol. 97. - P. 13-22.

133. Identification of the progenitors of Indonesian and Vietnamese avian influenza A (H5N1) viruses from southern China / J. Wang, D. Vijaykrishna, L. Duan [et al] // J. Virol. - 2008. - Vol. 82. - P. 3405-3414.

134. Identification of two novel reassortant avian influenza a (H5N6) viruses in whooper swans in Korea, 2016 / J. Jeong, C. Woo, H.S. Ip [et al] // Virol. J. -2017. - Vol. 14(1). - P. 60.

135. Identifying risk factors of highly pathogenic avian influenza (H5N1 subtype) in Indonesia / L. Loth, M. Gilbert, J. Wu [et al] // Prev. Vet. Med. -2011. - Vol. 102. - P. 50-58.

136. Influenza (H5N1) viruses in poultry, Russian Federation, 2005-2006 / A.S. Lipatov, V.A. Evseenko, H.L. Yen [et al] // Emerg. Infect. Dis. - 2007. - Vol. 13. - P. 539-546.

137. Influenza A(H5N8) virus isolation in Russia, 2014 / V.Y. Marchenko, I.M. Susloparov, N.P. Kolosova [et al] // Arch. Virol. - 2015. - Vol. 160. - P. 28572860.

138. Influenza B Virus in Seals / A.D. Osterhaus, G.F. Rimmelzwaan, B. Martina [et al] // Science. - 2000. - Vol. 288. - P. 1051-1053.

139. Influenza B virus in seals / A.D. Osterhaus, G.F. Rimmelzwaan, B.E. Martina [et al] // Science. - 2000. - Vol. 288(5468). - P. 1051-1053.

140. Influenza type A virus neuraminidase does not play a role in viral entry, replication, assembly, or budding / C. Liu, M.C. Eichelberger, R.W. Compans [et al] // J. Virol. 1995. - Vol. 69(2). - P. 1099-1106.

141. Intercontinental spread of Asian-origin H5N8 to North America through Beringia by migratory birds / D.H. Lee, M.K. Torchetti, K. Winker [et al] // J. Virol. - 2015. - Vol. 89. - P. 6521-6524.

142. Interspecies transmission of influenza C virus between humans and pigs / H. Kimura, C. Abiko, G. Peng [et al] // Virus Research. - 1997. - Vol. 48(1). - P. 71-79.

143. Intestinal excretion of a wild bird-origin H3N8 low pathogenic avian influenza virus in mallards (Anas platyrhynchos) / J.D. Brown, R.D. Berghaus, T.P. Costa [et al] // J. Wildl. Dis. - 2012b. - Vol. 48. - P.991-998.

144. Intestinal influenza: replication and characterization of influenza viruses in ducks / R.G. Webster, M. Yakhno, V.S. Hinshaw [et al] // Virology. - 1978. -Vol. 84. - P. 268-276.

145. Isolation and characterization of H5Nx highly pathogenic avian influenza viruses of clade 2.3.4.4 in Russia / V. Marchenko, N. Goncharova, I. Susloparov [et al] // Virology. - 2018. - Vol. 525. - P. 216-223.

146. Isolation of an H5N8 highly pathogenic avian influenza virus strain from wild birds in Seoul, a highly urbanized area in South Korea / J.H. Kwon, D.H. Lee, J.H. Jeong [et al] // J. Wildl. Dis. - 2017. - Vol. 53. - P. 630-635.

147. Johnson, D.C. An occurrence of avian influenza virus infection in laying chickens / D.C. Johnson, B.G. Maxfield // Avian. Dis. - 1976. - Vol. 20. - P. 422-424.

148. Johnson, F.B. Transport of viral specimens / F.B. Johnson // Clin. Microbiol. Rev. - 1990. - Vol. 3. - P. 120-131.

149. Kendal, A.P. New techniques in antigenic analysis with influenza viruses, in Basic and Applied Influenza Research / A.P. Kendal // A.S. Beare (ed.) nBoca Raton, FL: CRC Press. - 1982. - P. 51-78.

150. Khatchikian, D. Increased viral pathogenicity after insertion of a 28S ribosomal RNA sequence into the haemagglutinin gene of an influenza virus / D. Khatchikian, M. Orlich, R. Rott // Nature. - 1989. - Vol. 340. - P. 156-157.

151. Kilbourne, E.D. Genetic studies of influenza viruses. I. Viral morphology and growth capacity as exchangeable genetic traits. Rapid in ovo adaptation of early passage Asian strain isolates by combination with PR8 / E.D. Kilbourne, J.S. Murphy // J. Exp. Med. - 1960. - Vol. 111. - P. 387-406.

152. Lee, C.W. and Suarez, D. L. Application of real-time RT-PCR for the quantitation and competitive replication study of H5 and H7 subtype avian influenza virus / C.W. Lee, D.L. Suarez // J. Virol. Meth. - 2004. - Vol. 119. - P. 151-158.

153. Lee, C.W. Avian influenza virus / C.W. Lee, Y.M. Saif // Comp. Immunol. Microbiol. Infect. Dis. - 2009. - Vol. 32. - P. 301-310.

154. Lupiani, B. The history of avian influenza / B. Lupiani, S.M. Reddy // Comp/ Immunol. Microbiol. Infect. Dis. - 2009. - Vol. 32(4). - P. 311-323.

155. Lush, D. The chick red cell agglutination test with the Newcastle disease and fowl plague / D. Lush // J. Comp. Pathol. Theory. - 1942. - Vol. 53. - P. 157-160.

156. Lvov, D.K. Circulation of influenza viruses in natural biocoenosis / D.K. Lvov // Kurstak E, Maramovosch K, editors. Viruses and Environment. - New York, 1978. - P. 351-380.

157. Mahy, B.W.J Hemagglutination-inhibition / B.W.J. Mahy, H.O. Kangro // in Virology Methods Manual. London: Academic Press Ltd. - 1996. - P. 114116.

158. Mass illness of ducklings in Eastern Slovakia with clinical picture of infectious sinusitis / Z. Koppel, J. Vrtiak, M. Vasil [et al] // Veterinaria. - 1956. -Vol. 6. - P. 267-268.

159. Mass mortality among European common terns in South Africa in April -May 1961 / L.K. Smithies, D.B. Radloff, R.W. Friedell // Avian Dis. - 1969. -Vol. 13. - P. 603-606.

160. Mc Hardy, A.C. The role of genomics in tracking the evolution of influenza A virus / A.C. Mc Hardy, B. Adams // PLoS Pathogens. - 2009. - Vol. 5(10).

161. McCauley, J.W. Structure and function of the influenza virus genome / J.W. McCauley, B.W. Mahy // Biochem. J. - 1983. - Vol. 211. - P. 281-294.

162. McCown, M.F. The influenza A virus M2 cytoplasmic tail is required for infectious virus production and efficient genome packaging / M.F. McCown, A. Pekosz // J. Virol. - 2005. - Vol. 79(6). - P. 3595- 605.

163. Migration of waterfowl in the East Asian flyway and spatial relationship to HPAI H5N1 outbreaks / J.Y. Takekawa, S.H. Newman, X. Xiao [et al] // Avian. Dis. - 2010. - Vol. 54. - P. 466-476.

164. Molecular and antigenic evolution and geographical spread of H5N1 highly pathogenic avian influenza viruses in western Africa / M.F. Ducatez, C.M. Olinger, A.A. Owoade [et al] // J. Gen. Virol. - 2007. - Vol. 88. - P. 2297-2306.

165. Molecular epidemiological analysis of highly pathogenic avian influenza H5N1 subtype isolated from poultry and wild bird in Thailand / Y. Uchida, K. Chaichoune, W. Wiriyarat [et al] // Virus Res. - 2008a. - Vol. 138. - P. 70-80.

166. Molecular evolution and emergence of H5N6 avian influenza virus in central China / Y. Du, M. Chen, J. Yang [et al] // J. Virol. - 2017. - Vol. 91. - P. e00143-e00117.

167. Morens, D.M. The persistent legacy of the 1918 influenza virus / D.M. Morens, J.K. Taubenberger, A.S. Fauci // N. Engl. J. Med. - 2009. - Vol. 361. -P. 225-229.

168. New world bats harbordiverse influenza A viruses / S. Tong, X. Zhu, Y. Li [et al] // PLoS. P. - 2013. - Vol. 9(10). - P. e 003657.

169. Novel avian influenza A(H5N8) viruses in migratory birds, China, 20132014 / L.C. Zhou, J. Liu, E.L. Pei [et al] // Emerg. Infect. Dis. - 2016. - Vol. 22(6). - P. 1121-1123.

170. Novel Influenza D virus: Epidemiology, pathology, evolution and biological characteristics / S. Su, X. Fu, G. Li [et al] // Virulence. - 2017. - Vol. 8(8). - P. 1580-1591.

171. Novel reassortant clade 2.3.4.4 highly pathogenic avian influenza A(H5N8) virus in wild aquatic birds, Russia, 2016 / D.H. Lee, K. Sharshov, D.E. Swayne [et al] // Emerg. Infect. Dis. - 2017. - Vol. 23(2). - P. 359-360.

172. Novel reassortant highly pathogenic avian influenza (H5N8) virus in Zoos, India / S. Nagarajan, M. Kumar, H.V. Murugkar [et al] // Emerg. Infect. Dis. -2017. - Vol. 23(4). - P. 717-719.

173. Novel reassortant influenza A(H5N8) viruses among inoculated domestic and wild ducks, South Korea, 2014 / E.K. Lee, H.M. Kang, B.M. Song [et al] // Emerg. Infect. Dis. - 2015. - Vol. 21. - P. 298-304.

174. Novel reassortant influenza A(H5N8) viruses in domestic ducks, eastern China / H. Wu, X. Peng, L. Xu [et al] // Emerg. Infect. Dis. - 2014. - Vol. 20(8). - P. 1315-1318.

175. Novel ressortant influenza A(H5N8) viruses, South Korea / Y.J. Lee, H.N. Kang, E.K. Lee [et al] // Emerg. Infect. Dis. - 2014. - Vol. 20. - P. 1087-1089.

176. O'Neill, R.E. The influenza virus NEP (NS2 protein) mediates the nuclear export of viral nucleoproteins / R.E. O'Neill, J. Talon, P. Palese // J. EMBO -1998. - Vol. 17. - P. 288-296.

177. Orlich, M. Nonhomologous recombination between the hemagglutinin gene and the nucleoprotein gene of an influenza virus / M. Orlich, H. Gottwald, R. Rott // Virology. - 1994. - Vol. 204. - P. 462-465.

178. Outbreaks among wild birds and domestic poultry caused by reassorted influenza A(H5N8) clade 2.3.4.4 viruses, Germany, 2016 / A. Pohlmann, E. Starick, T. Harder [et al] // Emerg. Infect. Dis. - 2017. - Vol. 23. - P. 633-636.

179. Palese, P. Orthomyxoviridae: The Viruses and Their Replication / P. Palese, M.L. Shaw // In: Knipe, D.M., Howley P.M. eds. - Fields. Virology. 5th Edition. - 2001. - P. 1647-1689.

180. Palmer D.F., Coleman M.T., Dowdle W.D., Schild G.O. Advanced laboratory techniques for influenza diagnosis, in Immunology series no. 6. Atlanta: U.S. Dept. of Health, Education, and Welfare.

181. Pantin-Jackwood, M.J. Pathogenesis and pathobiology of avian influenza virus infection in birds / M.J. Pantin-Jackwood, D.E. Swayne // Rev. Sci. Tech. -2009. - Vol. 28. - P. 113-136.

182. Pathobiology of triple reassortant H3N2 influenza viruses in breeder turkeys and its potential implication for vaccine studies in turkeys / S.P. Pillai, M. Pantin-Jackwood, S.J. Jadhao [et al] // Vaccine. - 2009. - Vol. 29. - P. 819-824.

183. Pathological lesions in the lungs of ducks infected with influenza A viruses / A.J. Cooley, H. Van Campen, M.S. Philpott [et al] // Vet. Pathol. - 1989. - Vol. 26. - P. 1-5.

184. Pereira, H.G. Avian influenza A viruses / H.G. Pereire, B. Tumova, V.G. Law // Bull. World Health Org. - 1965. - Vol. 32. - P. 855-860.

185. Perkins, L.E. Pathobiology of A/chicken/Hong Kong/220/97 (H5N1) avian influenza virus in seven gallinaceous species / L.E. Perkins, D.E. Swayne // Vet. Pathol. - 2001. - Vol. 38. - P. 149-164.

186. Perkins, L.E. Pathogenicity of a Hong Kong-origin H5N1 highly pathogenic avian influenza virus for emus, geese, ducks, and pigeons / L.E. Perkins, D.E. Swayne // Avian. Dis. - 2002a. - Vol. 46. - P. 53-63.

187. Perroncito, E. Epizoozia tifoide nei gallinacei / E. Perroncito // Annali. Accad. Agri. Torino. - 1878. - Vol. 21. - P. 87-126.

188. Petek, M. Current situation in Italy. - M. Petek // In: Proceedings of the First International Symposium on Avian Influenza. - 1982. - P. 31-34.

189. Phylogeographical characterization of H5N8 viruses isolated from poultry and wild birds during 2014-2016 in South Korea / B.M. Song, E.K. Lee, Y.N. Lee [et al] // J. Vet. Sci. - 2017. - Vol. 18. - P. 89-94.

190. Pinto, L.H. Influenza virus M2 protein has ion channel activity / L.H. Pinto, L.J. Holsinger, R.A. Lamb // Cell. - 1992. - Vol. 69. - P. 517-528.

191. Pleschka, S. Overview of influenza viruses / S. Pleschka // Curr. Top. Microbiol. Immunol. - 2013. - Vol. 370. - P. 1-20.

192. Poddar, S.K. Influenza virus types and subtypes detection by single step single tube multiplex reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) and agarose gel electrophoresis / S.K. Poddar // J. Virol. Meth. - 2002. - Vol. 99. - P. 63-70.

193. Predicting the global spread of H5N1 avian influenza / A.M. Kilpatrick, A.A. Chmura, D.W. Gibbons [et al] // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 2006. - Vol. 103. - P. 19368-19373.

194. Properties and dissemination of H5N1 viruses isolated during an influenza outbreak in migratory waterfowl in western China / H.L. Chen, Y.B. Li, Z.J. Li [et al] // J. Virol. - 2006b. - Vol. 80. - P. 5976-5983.

195. Recombination resulting in virulence shift in avian influenza outbreak, Chile / D.L. Suarez, D.A. Senne, J. Banks [et all] // Emerg. Infect. Dis. - 2004. -Vol. 10(4). - P. 693-699.

196. Reemerging H5N1 influenza viruses in Hong Kong in 2002 are highly pathogenic to ducks / K.M. Sturm-Ramirez, T. Ellis, B. Bousfield [et al] // J. Virol. - 2004. - Vol. 78. - P. 4892-4901.

197. Reintroduction of H5N1 highly pathogenic avian influenza virus by migratory water birds, causing poultry outbreaks in the 2010-2011 winter season in Japan / Y. Sakoda, H. Ito, Y. Uchida [et al] // J. Gen. Virol. - 2012. - Vol. 93.

- P. 541-550.

198. Roberts, D.H. The isolation of an influenza A virus and a mycoplasma associated with duck sinusitis / D.H. Roberts // Vet. Rec. - 1964. - Vol.76. - P. 470-473.

199. Roberts, P.C. The M1 and M2 proteins of influenza A virus are important determinants in filamentous particle formation / P.C. Roberts, R.A. Lamb, R.W. Compans // Virology. - 1998. - Vol. 240(1). - P. 127-37.

200. Role for migratory wild birds in the global spread of avian influenza H5N8 / Global Consortium for H5N8 and Related Influenza Viruses // Science. - 2016.

- Vol. 354(6309). - P. 213-217.

201. Role of quail in the interspecies transmission of H9 influenza A viruses: molecular changes on HA that correspond to adaptation from ducks to chickens / D.R. Perez, W. Lim, J.P. Seiler [et al] // J. Virol. - 2003. - Vol. 77(5). - P. 31483156.

202. Rott, R. Physikalisch-chemische und biologische eigenschaften des virus N und seine beziehung zur influenza A-untergruppe der myxoviren / R. Rott, W. Schafer // Zentr. Veterinarmed. - 1960. - Vol. 7. - P. 237-248.

203. Rott, R. The pathogenic determinant of influenza virus / R. Rott // Vet. Microbiol. - 1992. - Vol. (33). - P. 303-310.

204. Rowan, M.K. Mass mortality among European common terns in South Africa in April-May 1961 / M.K. Rowan // Bret. Birds. - 1962. - Vol. 55. - P. 103-114.

205. Shaw, M.L. Orthomyxoviridae. 6th ed. Volume 1 / M.L. Shaw, P. Palese // Lippincott Williams & Wilkins; Philadelphia, PA, USA. - 2013. - P. 1151-1185.

206. Skehel, J.J. Receptor binding and membrane fusion in virus entry: the influenza hemagglutinin / J.J. Skehel, D.C. Wiley // Annu. Rev. Biochem. - 2000.

- Vol. 69. - P. 531-569.

207. Slemons, R.D. Virus replication in the digestive tract of ducks exposed by aerosol to type-A influenza / R.D. Slemons, B.C. Easterday // Avian. Dis. - 1978.

- Vol. 22. - P. 367-377.

208. Smith, G.J. Dating the emergence of pandemic influenza viruses / G.J. Smith, J. Bahl, D. Vijaykrishna // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. - 2009. - Vol. 106.

- P. 11709-11712.

209. Smith, G.J. Nomenclature updates resulting from the evolution of avian influenza A(H5) virus clades 2.1.3.2a, 2.2.1, and 2.3.4 during 2013-2014 / G.J. Smith, D.O. Donis // Influenza Other Respir. Viruses. - 2015. - Vol. 9. - P. 271276.

210. Sonnberg, S. Natural history of highly pathogenic avian influenza H5N1 / S. Sonnberg, R.J. Webby, R.G. Webster // Virus. Res. - 2013. - Vol. 178(1). -P.63-77.

211. Spackman, E. Methods in Molecular Biolog Vol. 436 Avian influenza virus / E. Spackman // Humana Press Inc., Totowa (NJ). - 2008.

212. Spackman, E. Use of a novel virus inactivation method for a multicenter avian influenza real-time reverse transcriptase-polymerase chain reaction proficiency study / E. Spackman, D.L. Suarez // J. Vet. Diag. Invest. - 2005. -Vol. 17. - P. 76-80.

213. Spatial, temporal, and species variation in prevalence of influenza A viruses in wild migratory birds / V.J. Munster, C. Baas, P. Lexmond [et al] // PLoS. P. - 2007. - Vol. 3(5). - P. e61.

214. Spatio-temporal dynamics of global H5N1 outbreaks match bird migration patterns / Y. Si, A.K. Skidmore, T. Wang [et al] // Geospat. Health. - 2009. -Vol. 4. - P. 65-78.

215. Stallknecht, D.E. Ecology and epidemiology of avian influenza viruses in wild bird populations / D.E. Stallknecht // Proceedings of the Fourth International Symposium on Avian Influenza. - 1998. - P. 61-69.

216. Starick, E. Type- and subtype-specific RTPCR assays for avian influenza A viruses (AIV) / E. Starick, A. Romer-Oberdorfer, O. Werner // J. Vet. Med. B. Infect. Dis. Vet. Public Health. - 2000. - Vol. 47. - P. 295-301.

217. Steinhauer, D.A. Role of hemagglutinin cleavage for the pathogenicity of influenza virus / D.A. Steinhauer // Virology. - 1999. - Vol. 258(1). - P. 1-20.

218. Structures of human-infecting Thogotovirus fusogens support a common ancestor with insect baculovirus / R. Peng, S. Zhang, Y. Cui [et al] // Microbiology. - 2017. - Vol. 114(2). - P. 8905-8912.

219. Stubbs, E.L. Fowl pest / E.L. Stubs // J. Am. Vet. Med. Assoc. - 1926. -Vol. 21. - P. 561-569.

220. Suarez, D.L. Influenza A virus/ D.L. Suarez // D.E. Swayne (eds) Avian influenza, 1st edn. - Blackwell Publishing. Ames. - 2008. - P. 3-22.

221. Surveillance of H5 avian influenza virus in wild birds found dead / J.R. Happold, I. Brunhart, H. Schwermer // Avian. Dis. - 2008. - Vol. 52. - P. 100105.

222. Surveillance of influenza A virus in migratory waterfowl in northern Europe / A. Wallensten, V.J. Munster, N. Latorre-Margalef [et al] // Emerg. Infect. Dis. - 2007. - Vol. 13(3). - P. 404-411.

223. Susceptibility of North American ducks and gulls to H5N1 highly pathogenic avian influenza viruses / J.D. Brown, D.E. Stallknecht, J.R. Beck [et al] // Emerg. Infect. Dis. - 2006. - Vol. 12. - P. 1663-1670.

224. Swayne, D.E. Influenza / D.E. Swayne, D.A. Halvorson // In: Saif YM, Glisson J.R., Fadly A.M., McDougald L.R., Nolan L. (eds) Diseases of poultry, 12th (edn.) Blackwell Publishing, Ames. - 2008. - P. 153-184.

225. Swayne, D.E. Influenza / D.E. Swayne, D.L. Suarez, L.D. Sims // Swayne D.E., Glisson J.R., McDougald L.R., Nolan L.K., Suarez D.L., Nair V. (eds)-Diseases of poultry, 13th edn. Wiley. Ames. - 2013. - P. 191-218.

226. Swayne, D.E. Influenza in Diseases of Poultry, 11th ed / D.E. Swayne, D.A. Halvorson // In: Y.M. Saif [et al] (ed.) Iowa State Press. - 2003. - P. 135160.

227. Swayne, D.E. Influenza, in Diseases of Poultry, 11th ed. / D.E. Swayne, D.A. Halvorson // Y.M. Saif, H.J. Barnes, J.R. Glisson, A.M. Fadly, L.R. McDougald, D.E. Swayne (ed.) - Ames: Iowa State University Press. - 2003. - P. 135-160.

228. Swayne, D.E. Pathobiology of avian influenza virus infections in birds and mammals / D.E. Swayne, M. Pantin-Jackwood // In: Swayne D.E. (ed). Avian influenza, 1st edn. Blackwell Publishing, Ames. - 2008. - P. 87-122.

229. Swayne, D.E. Pathogenicity of avian influenza viruses in poultry / D.E. Swayne, M. Pantin-Jackwood // Dev. Biol. - 2006. - Vol. 124. - P. 61-67.

230. Swayne, D.E. Understanding the complex pathobiology of high pathogenicity avian influenza viruses in birds / D.E. Swayne // Avian. Dis. -2007. - Vol. 51. - P. 242-249.

231. The amphipathic helix of influenza a virus M2 protein is required for filamentous bud formation and scission of filamentous and spherical particles / K.L. Roberts, G.P. Leser, C. Ma [et al] // J. Virol. - 2013. - Vol. 87(18). - P. 9973-9982.

232. The development and genetic diversity of H5N1 influenza virus in China, 1996-2006 / L. Duan, J. Bahl, G.J. Smith [et al] // Virology. - 2008. - Vol. 380. -P. 243-254.

233. The effective rate of influenza reassortment is limited during human infection / L.A. Sobel, M.T. McClain MT, G.J. Smith [et al] // PLoS. Pathog. -2017. - Vol. 13. - P. e1006203.

234. The evolution of H5N1 influenza viruses in ducks in southern China / H.I. Chen, G. Deng, Z. Li [et al] // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 2004. - Vol. 101(28). - P. 10452-10457.

235. The NS1 gene contributes to the virulence of H5N1 avian influenza viruses / Z. Li, Y. Jiang, A. Wang [et al] // J. Virol. - 2006. - Vol. 80. - p. 11115-11123.

236. The pathogenesis of low pathogenic avian influenza in mallards / M. Franca, D.E. Stallknecht, R. Poulson [et al] // Avian. Dis. - 2012. - Vol. 56. - P. 976-980.

237. The spread of the H5N1 bird flu epidemic in Asia in 2004 / R.G. Webster, Y. Guan, L. Poon [et al] // Arch. Virol. - 2005. - P. 117-129.

238. The viral polymerase mediates adaptation of an avian influenza virus to a mammalian host / G. Gabriel, B. Dauber, T. Wolff [et al] // Sci. USA. - 2005. -Vol. 102. - P. 6521-6524.

239. Todd, C. Fowl plague. A system of bacteriology / C. Todd, J.P. Rice // Virus Dis. - 1930. - Vol. 7. - P. 219-230.

240. Treanor, J. Influenza vaccine - outmaneuvering antigenic shift and drift / J. Treanor // The New England Journal of Medicine. - 2004. - Vol. 350(3). - P. 218-220.

241. Tsimokh, P.F. Haemagglutination reaction in infectious sinusitis of ducks / P.F. Tsimokh // Veterinaria. - 1961. - Vol. 38. - P. 63-65.

242. Turnova, B. Antigenic relationship between influenza A viruses of human and animal origin / B. Turnova, H.G. Pereira // Bulletin of the World Health Organization. - 1968. - Vol. 38(3). - P. 415-420.

243. Viral metagenomics reveals the presence of highly divergent quaranjavirus in Rhipicephalus ticks from Mozambique / H. Cholleti, J. Hayer, F.C. Mulandane [et al] // Infect. Ecol. Epidemiol. - 2018. - Vol. 8(1). P. 1478585.

244. Virus cultivation, detection, and genetics, in Principles of Virology: Molecular Biology, Pathogenesis, and Control of Animal Viruses, 2nd ed. / S.J. Flint, L.W. Enquist, V.R. Racaniello. - Washington, DC: ASM Press. - 2004.

245. Virus taxonomy: the database of the International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) / E.J. Lefkowitz, D.M. Dempsey, R.C. Hendrickson [et al] // Nucleic. Acids Res. - 2018. - Vol. 46. - P. 708-717.

246. Walker, R.V.L. Afilterable agent in ducks / Can. J. Comp. Med. Sci. -1953. - Vol. 17. - P. 248-250.

247. Webster, R.G. Preparation and properties of antibody directed specifically against the neuraminidase of influenza virus / R.G. Webster, W.G. Laver // J. Immunol. - 1967. - Vol. 99(1). P. 49-55.

248. What Lies Beneath: Antibody Dependent Natural Killer Cell Activation by Antibodies to Internal Influenza Virus Proteins / H.A. Vanderven, F.Ana-Sosa-Batiz, S. Jegaskanda [et al] // EBioMedicine. - 2016. - Vol. 8. - P. 277-290.

249. WHO/OIE/FAO H5N1 Evolution Working Group. Toward a unified nomenclature system for highly pathogenic avian influenza virus (H5N1) // Emerg. Infect. Dis. - 2008. - Vol. 14.

250. Whole-genome sequence of a reassortant H5N6 avian influenza virus isolated from a live poultry market in China, 2013 / X. Qi, L. Cui, H. Ge [et al] // Genome Announc. - 2014. - Vol. 2(5). - P. e00706.

251. Wild bird migration across the Qinghai-Tibetan plateau: a transmission route for highly pathogenic H5N1 / D.J. Prosser, P. Cui, J.Y. Takekawa [et al] // PLoS. One. - 2011. - Vol. 6. - P. e17622

252. Wild birds and increased transmission of highly pathogenic avian influenza (H5N1) among poultry, Thailand / J. Keawcharoen, J. van den Broek, A. Bouma [et al] // Emerg. Infect. Dis. - 2011. - Vol. 17. - P. 1016-1022.

253. Wild duck as long-distance vectors of highly pathogenic avian influenza virus (H5N1) / J. Keawcharoen, D. van Riel, G. van Amerongen [et al]// Emerg. Infect. Dis. - 2008. - Vol. 14(4). - P. 600-607.

254. Wild waterfowl migration and domestic duck density shape the epidemiology of highly pathogenic H5N8 influenza in the Republic of Korea / S.C. Hill, Y.J. Lee, B.M. Song [et al] // Infect. Genet. Evol. - 2015. - Vol. 34. -P. 267-277.

255. Wilkinson, L. The development of the virus concept as reflected in corpora of studies on individual pathogens. 2. The agent of fowl plague-A model virus? / L. Wilkinson, A.P. Waterson // Med. Hist. - 1975. - Vol. 19. - P. 52-72.

256. Wilkinson, L. The development of the virus concept as reflected in corpora of studies on individual pathogens. 2. The agent of fowl plague-A model virus? / L. Wilkinson, A.P. Waterson // Med. Hist. - 1975. Vol. 19. - P. 52-72.

257. Winkler, W.G. Influenza in Canada geese / W.G. Winkler, D.O. Trainer, B.C. Easterday // Bull World Health Org. - 1972. - Vol. 47. - P. 507-513.

258. Wong, S.S. Avian influenza virus infections in humans / S.S. Wong, K.Y. Yuen // Chest. - 2006. - Vol. 129. - P. 156-168.

259. Wood, G.W. Replication of influenza A viruses of high and low pathogenicity for chickens at different sites in chickens and ducks following intranasal inoculation / G.W. Wood, G. Parsons, D.J. Alexander // Avian Pathol. - 1995. - Vol. 24. - P. 545-551.

260. Woolcock, P.R. Commercial immunoassay kits for the detection of influenza virus type A: Evaluation of their use with poultry / P.R. Woolcock, C.J. Cardona // Avian Dis. - 2005. - Vol. 49. - P. 477-481.

261. World Animal Health Information Database (OIE. Country Information) Interface / OIE. - Paris, France, 2019. - URL: https://www.oie.int/wahis_2/public/wahid.php/Countryinformation/Countryreport s

262. World Hlth Org Global Influenza. P. Evolution of H5N1 avian influenza viruses in Asia / J.T. Aubin, S. Azebi, A. Balish [et al] // Emerg. Infect. Dis. -2005. - Vol. 11. - P. 1515-1521.

263. Wright, P.F. Orthomyxoviruses / P.F. Wright, G. Neumann, Y. Kawaoka // Fields Virology. - 2007. - P. 1691-1740.

264. Xu, X. Genetic characterization of the pathogenic influenza A/Goose/Guangdong/1/96 (H5N1) virus: similarity of its hemagglutinin gene to those of H5N1 viruses from the 1997 outbreaks in Hong Kong / X. Xu, N.J. Cox, Y. Guo // Virology. - 1999. - Vol. 261. - P. 15-19.

265. Yamane, I. Epidemics of emerging animal diseases and food-borne infection problems over the last 5 years in Japan / I. Yamane // Annals of the New York Academy of Sciences. - 2006. - Vol. 80. - P. 7976-7983.

266. Yoon, S.W. Evolution and ecology of influenza A viruses / S.W. Yoon, R.J. Webby, R.G. Webster // Curr. Top. Microbiol. Immunol. - 2014. - Vol. 385. - P. 359-375.

267. Zoonotic Potential of Influenza A Viruses: A Comprehensive Overview / A. Mostafa, E.M. Abdelwhab, T.C. Mettenleiter [et al] / Viruses. - 2018. - Vol. 10(9). - P. 497.

ПРИЛОЖЕНИЯ

Федеральная служба по ветеринарному и фитосанитарпоиу надзору Федеральное государственное бюджетное упреждение «Федеральный центр охраны здоровья животных» (ФГБУ «Ш1Ш13Ж»)

УТВЕРЖДАЮ

ра по качеству С.К. Старой 2016 г.

с..-'-»

МЕТОДИЧЕСКИЕ РЕКОМЕТ1ДАЦИИ

ПО ВЫДЕЛШШЮ ВИРУСОВ ГРИППА птиц И ИЬЮКАСЛСКОЙ КОЛКЗНИ В РАЗВИВАЮЩИХСЯ ЭМБРИОНАХ КУР

Антиры: Сосипаторова В.Ю. 4валг Ир. А. Алтуеттп ДА. Чвала И.А.

Рассмотрено и одобрено мстодкомиссией Протокол № Лу от «¿¿3» 2016 г.

Рассмотрено ученым советом л рекомендовано к утверждению Протокол № А от «.¿У» ^■Ши^ОХЬт.