Биологические свойства и анализ полных геномов российских изолятов вируса африканской чумы свиней, выделенных в 2013-2014 гг. тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.02.02, кандидат наук Шевченко, Иван Вячеславович

• Шевченко, Иван Вячеславович
• кандидат наук
• 2017

Оглавление диссертации кандидат наук Шевченко, Иван Вячеславович

ОГЛАВЛЕНИЕ

1. ВВЕДЕНИЕ

2. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

2.1 Эпизоотология АЧС

2.2 Устойчивость вируса АЧС

2.3 Патогенез, клинические признаки и патологоанатомические изменения

2.4 Иммунитет и вакцинопрофилактика АЧС

2.5 Классификация и таксономия

2.6 Структура вириона

2.7 Морфогенез вируса АЧС

2.8 Структура генома вируса АЧС

2.9 Анализ структуры генома вируса АЧС

2.10 Заключение по обзору литературы

3. СОБСТВЕННЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ И ОБСУЖДЕНИЕ

3.1 Материалы

3.2 Методы

3.3. Результаты собственных исследований и обсуждение

3.3.1 Изучение культуральных свойств изолятов вируса АЧС

3.3.2 Биопробы на естественно восприимчивых животных

3.3.2.1 Биопроба на свиньях с заражением штаммом Ставрополь 01/08

3.3.2.2 Биопроба на свиньях с заражением вирусом изолята Kashino 04/13

3.3.2.3 Биопроба на свиньях с заражением вирусом изолята Odintsovo 02/14

3.3.3 Сравнительный анализ результатов биопроб

3.3.4 Полногеномное секвенирование

3.3.5 Сравнительный анализ нуклеотидных последовательностей

3.3.6 Усовершенствование схемы первичной оценки и группирования изолятов ВАЧС

4. ЗАКЛЮЧЕНИЕ

4.1 Выводы

5. СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

6. СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

7. СПИСОК ИЛЛЮСТРИРОВАННОГО МАТЕРИАЛА

8. ПРИЛОЖЕНИЯ

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Биологические свойства и анализ полных геномов российских изолятов вируса африканской чумы свиней, выделенных в 2013-2014 гг.»

1. ВВЕДЕНИЕ

Актуальность темы исследования. Африканская чума свиней (АЧС, Pestis africana suum) - контагиозная вирусная болезнь животных, поражающая диких кабанов, бородавочников и домашних свиней всех пород и возрастов. У зараженных животных болезнь может протекать в сверхострой и острой формах, с явлениями геморрагической лихорадки, а также в хронической и инаппарантной с умеренным проявлением клинических признаков или полным отсутствием таковых. Уровень смертности может достигать ~ 100%.

Эффективных мер специфической профилактики и лечения АЧС на сегодняшний день не разработано. Наиболее действенными и результативными средствами контроля распространения болезни являются ранняя диагностика, политика стемпинг-аута в очагах инфекции и строгое карантинирование неблагополучных территорий [24, 26, 89, 168].

Как сама болезнь, так и применяемые меры борьбы оказывают значительное социально-экономическое воздействие на эндемичные по АЧС территории и страны. По этой причине АЧС была включена Всемирной организацией здравоохранения животных (МЭБ) в список «А» Международной классификации заразных болезней животных, вспышки которых подлежат обязательной нотификации [176, 177, 198].

К антропогенным факторам заноса АЧС на новые территории относятся нелегальный импорт свинины и продуктов её переработки. В природе вирус АЧС (ВАЧС) передается при прямом контакте больных и здоровых животных и распространяется механическими переносчиками (грызуны и мелкие хищники), а также трансмиссивно мягкими клещами рода Ornithodoros. В организме клещей вирус АЧС может размножаться, накапливаясь в титре >104 ГАдЕ50/см3 [24, 26, 103, 126, 128, 152, 178, 200].

Вирус АЧС высокоустойчив в окружающей среде, хорошо переносит длительное замораживание (более 10 лет) и способен сохраняться в жидкостях организма, свинине и продуктах её переработки, что делает возможным перенос

возбудителя с контаминированными продуктами свиноводства на значительные расстояния от первоначального места вспышки [28, 30, 50, 51, 79].

Особенности эпизоотологии, патогенеза и иммуногенеза определяются уникальными свойствами вируса АЧС. Для него характерны гемадсорбирующая активность, эволюционное разнообразие в природе и высокая генетическая и антигенная гетерогенность популяции, что обусловлено уникальностью строения его генома и особенностями работы его ферментов [28, 30, 79].

Первые исследования по изучению вируса АЧС в СССР были выполнены во институтах ВИЭВ и ВНИИВВиМ и нашли отражение в работах Я.Р. Коваленко, М.А. Сидорова, Л.Г. Бурбы, В.Н. Сюрина, А.Я. Самуйленко, Б.В. Соловьёва, Н.В. Фоминой, Н.А. Власова и других исследователей. Они определили ключевые характеристики вируса, моменты, влияющие на его репродукцию и вирулентность, структуру вируса и характеристики течения болезни, разработали методы культивирования вируса и подходы к его серотиповой классификации, что явилось основой для выполнения нашей работы [7, 18, 19, 20, 21, 22, 57].

Размер генома вируса АЧС варьирует в пределах 170-193 т.п.о., а число кодируемых им открытых рамок считывания (ОРС) от 151 до 167. Основной причиной этого служит изменение числа ОРС в составе мультигенных семейств. По данным В. Lamarche и А. Showalter с соавт. особенности строения и работы вирусных полимеразы X и лигазы также приводят к быстрому накоплению и закреплению ошибок в геноме вируса при его репарации [155, 201]. Число точечных мутаций в геноме вируса АЧС значительно увеличивается при ествественном пассировании вируса в организме клещей О. швиЪМа [47, 170].

Многочисленные литературные данные свидетельствуют о гетерогенности состава популяции вируса АЧС. В известных случаях заноса АЧС на новые территории, когда не удавалось немедленно локализовать вспышку, а вирус АЧС циркулировал в дикой природе, как правило, регистрировалось изменение его вирулентности и антигенных свойств, сопровождающееся гетерогенностью состава вновь сформировавшейся вирусной популяции [28, 82, 104, 168, 206].

Исследования, выполненные F. Boinas et al. (2004) по изучению 10 полевых изолятов ВАЧС, выделенных из клещей Ornithodoros на фермах Португалии в 1988-1993 гг., позволили обнаружить одновременное присутствие 2 вирусных вариантов; один вариант вируса АЧС был патогенен для домашних свиней и вызывал гемадсорбцию в чувствительных культурах клеток, в то время как второй вариант вируса не обладал гемадсорбирующей активностью. Вероятность контактной передачи для негемадсорбирующего вируса АЧС была в 2 раза ниже, по сравнению с вирулентным гемадсорбирующим [104].

Во время вспышки АЧС в Бразилии в 1978 г. смертность животных на поражённых фермах в июне достигала 41,5%, а спустя 1 месяц снизилась до 0,16%. В ходе исследований патологического материала также удалось установить наличие одновременной независимой циркуляции 2 вариантов ВАЧС: средне- и низковирулентного [206].

В Португалии в 1960 г. был выделен высоковирулентный гемадсорбирующий изолят вируса АЧС Lisbon 60, вызывающий гибель зараженных животных; а спустя 8 лет в той же местности был выделен низковирулентный негемадсорбирующий изолят NH/P68, введение которого вызывало формирование протективного иммунитета к последующему заражению вирулентным изолятом Lisbon 60 [190].

Многообразие генетических вариантов вируса АЧС является неотъемлемым свойством этого возбудителя, а также одной из причин отсутствия эффективных вакцин против данной болезни. На сегодняшний день на основании анализа нуклеотидной последовательности гена B646L, кодирующего основной капсидный протеин вируса АЧС vp72, дифференцируют 23 генотипа вируса [73, 185]. Существование нового, XXIII генотипа вируса было установлено по новейшим данным, полученным J. E. Achenbach et al. (2016) [145].

Разработанная во ВНИИВВиМ методология серологической классификации вируса АЧС позволила распределить большинство известных изолятов на 9 сероиммунотипов [1, 44, 53].

Наличие в популяциях высокопатогенных и низкопатогенных вирусных вариантов снижает вирулентность популяции в целом. Снижение вирулентных свойств при длительной персистенции вируса в дикой природе и высокой плотности популяции больных особей является следствием саморегуляции паразитарной системы, к тому же возникновение низко чувствительных к вирусам особей животных обуславливает персистенцию в условиях, когда они являются единственными естественными природными резервуарами для вируса (Беляков В.Д., 1983).

Исходя из вышеизложенного, разработка и совершенствование эффективных мер борьбы с АЧС требуют дальнейшего всестороннего изучения болезни и её возбудителя. Для создания средств специфической профилактики, диагностики и борьбы с АЧС первостепенным является вопрос группирования и классификации изолятов, в частности, генотипирования и сероиммунотиповой идентификации изолятов вируса, выделенных в очагах болезни. На необходимость изучения и паспортизации полевых изолятов вируса АЧС неоднократно указывалось на совещаниях экспертов ФАО и МЭБ по АЧС, поэтому в РФ возникла и была сформулирована на уровне Федеральной целевой программы необходимость создать методы установления путей распространения АЧС, классификации изолятов и изучения факторов патогенности [53, 139, 140, 185, 190].

Степень разработанности темы. На сегодняшний день определены общая структура генома возбудителя АЧС и функции большинства вирусных генов. В их числе структурные белки вириона, белки прикрепления, вирусные гомологи клеточных белков, ДНК-полимераза Х, М1^-подобный белок, нуклеазы и другие вирусспецифические ферменты [52, 78, 81, 82, 87, 130, 135, 148, 157, 209].

Кроме того, V. О^опдеП et б!. (2015) в своём исследовании установили, что делеция 6 генов в составе мультигенных семейств МОБ 360 и 505 приводит к получению авирулентного для свиней штамма вируса АЧС [70]. Идентификация генов, ответственных за вирулентность ВАЧС, делает возможным создание его

делетированных мутантных вариантов, и, следовательно, разработку и испытание экспериментальных вакцин на их основе [112, 169, 190].

Тем не менее, функции некоторых генов на настоящее время полностью не изучены, в том числе функции генов, входящих в состав мультигенных семейств [74, 114, 148, 190, 216].

На территорию Российской Федерации в 2007 году из Грузии был занесён вирус АЧС 8 сероиммунотипа, II генотипа, по нуклеотидной структуре схожий с вирусом, циркулирующим в Мозамбике и Мадагаскаре [73, 149, 198].

Ранее проводимые исследования российских полевых изолятов вируса АЧС, выделенных при вспышках от домашних свиней и диких кабанов в 2007-2009 гг., выполненные В.М. Балышевым с соавт. показали, что на территорию РФ был занесён и продолжил циркулировать высоковирулентный вирус АЧС, вызывающий гибель 100% восприимчивых животных на 3-7 сутки после заражения [5].

Аналогичные результаты получили С.А. Белянин с соавт. (2011), в их исследованиях смертность среди экспериментально заражённых животных составила 100% на 6-11 сутки после заражения [10]. Исследования вируса АЧС изолятов 2012 г., проведённые М.В. Болговой с соавт. (2011), также подтвердили их высокую вирулентность [6].

В зарубежной литературе сведения о высокой вирулентности российских изолятов вируса АЧС приводятся в работах D. Chapman, L. Dixon и официальных сводках European Food Safety Authority (EFSA) [35, 131, 138].

Основным методом для изучения основ патогенности и вирулентности вируса АЧС является сравнительный анализ изменений в геномной последовательности различных вирусных изолятов и соотнесение их с функциональной картой генома ВАЧС [80, 104, 112].

Дальнейшее изучение свойств выделяемых вирусных изолятов АЧС основано на совокупности исследований как их биологических свойств, так и генетической структуры, поскольку сопоставление изменений в вирусном геноме выделенных изолятов с изменениями их биологических свойств позволяет

установить причины, генетически обуславливающие изменение вирулентности, клинических проявлений и антигенную вариабельность вируса.

Для определения вариабельности генома решающее значение имеют данные, получаемые в ходе полногеномного секвенирования [90, 91, 92, 136]. На настоящий момент в базах данных GenBank опубликовано только 18 полногеномных последовательностей различных вирусных изолятов АЧС, однако, эти данные открывают возможность для проведения их филогенетического анализа, установления эволюционных связей, обнаружения изменений и особенностей геномов и предсказанных аминокислотных последовательностей кодируемых ими белков, а также определения эволюционного давления и внутригенотипового распределения вирусных изолятов [137, 141, 174, 185, 225].

В частности, C. Gallardo et al (2014) с использованием данных, полученных в результате полногеномного секвенирования, удалось обнаружить новый тандемный повтор GGAATATATA, возникший в интергенном регионе I73R-I329L, наличие которого позволяет проводить дифференциацию современных российских и европейских изолятов вируса АЧС [136, 169].

Следовательно, работа по анализу структуры генома новых изолятов вируса АЧС и установлению их биологических свойств является актуальной.

Цели и задачи исследований. Основной целью данной работы являлось определение полных нуклеотидных последовательностей геномов полевых изолятов вируса африканской чумы свиней, выделенных на территории Российской Федерации и проведение сравнительного анализа биологических свойств и выявленных отличий.

Для достижения поставленной цели необходимо было решить следующие задачи:

а) изучить основные биологические свойства выделенных изолятов и отобрать изоляты вируса АЧС с отличающимися от штамма Ставрополь 01/08 биологическими свойствами;

б) подобрать методы очистки вируса АЧС и выделения его ДНК, пригодной для полногеномного секвенирования;

в) определить полные нуклеотидные последовательности генома вируса АЧС выбранных изолятов;

г) провести сравнительный анализ структуры геномов вируса АЧС выбранных изолятов с геномом изолята Georgia 2007/1;

д) провести сравнительный анализ выявленных изменений в геномах изолятов со степенью изменения их биологических свойств;

е) определить маркерные области в геноме вируса АЧС, по которым возможно проводить внутригенотиповую дифференциацию изолятов вируса АЧС, циркулирующего на территории РФ.

Научная новизна результатов исследований.

Для сравнительного анализа отличий в геноме впервые определены биологические свойства вируса АЧС изолятов Kashino 04/13 и Odintsovo 02/14, установлены основные параметры развития болезни: длительность сроков проявления признаков болезни и наступления гибели животных, сроки наступления гибели, а также характерные патологоанатомические признаки.

Впервые определены и опубликованы в базе данных GenBank полноразмерные нуклеотидные последовательности геномов изолятов Kashino 04/13 и Odintsovo 02/14 под номерами KJ747406.1 и KP843857.1, соответственно.

Проведенный сравнительный анализ позволил выявить достоверные различия в нуклеотидных последовательностях геномов изолятов Kashino 04/13 и Odintsovo 02/14, затрагивающие области генов и мультигенных семейств, ответственных за вирулентность вируса и репродукцию в организме клещей; в том числе структурные белки, гомологи клеточных белков, ферменты обмена нуклеиновых кислот, а также вспомогательные протеины, учавствующие в сборке вириона.

Впервые обнаружена встройка, представляющая собой прямой тандемный повтор в интергенном регионе 9R/10R длиной 17 нуклеотидов. Проведен анализ пространственно-временного распространения современных российских и европейских изолятов вируса АЧС, имеющих в геноме встройки в интергенных регионах 9R/10R и I73R/I329. Установлены предположительные географические

регионы возникновения встроек в геноме циркулирующего вируса. Показана возможность проведения внутригенотиповой дифференциации и отслеживания динамики распространения вируса АЧС по наличию данных встроек.

Теоретическая и практическая значимость работы. Полные геномные последовательности российских изолятов вируса АЧС Kashino 04/13 и Odintsovo 02/14 могут быть использованы для изучения молекулярно-биологических свойств вируса АЧС.

Вирус АЧС изолята Odintsovo 02/14 детально охарактеризован и депонирован в КШМ ФГБУ «ВНИИЗЖ».

Усовершенствована разработанная А. Казаковой и А. Варенцовой схема систематизации выделяемых изолятов вируса АЧС на основе анализа нуклеотидных последовательностей генов и интергенных регионов.

Разработаны гармонизированные с требованиями МЭБ к референтным лабораториям «Методические рекомендации по наработке ДНК вируса африканской чумы свиней в первичной культуре клеток макрофагов свиньи для последующего пиросеквенирования»; «Методические рекомендации по получению препаратов ДНК вируса африканской чумы свиней из цельной крови свиней для высокопроизводительного полногеномного секвенирования»; «Методические рекомендации по оценке клинических признаков и патологоанатомических изменений при экспериментальном заражении вирусом африканской чумы свиней»; «Методические рекомендации по выявлению генома вируса африканской чумы свиней методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени», утвержденные в ФГБУ «ВНИИЗЖ» 9 октября 2015 г.; 9 октября 2015 г.; 9 октября 2015 г.; 25 декабря 2015г., соответственно.

Методология и методы исследования. Методология проведенных исследований включает стандартные процедуры с использованием различных материалов и естественно восприимчивых животных. В работе использовали молекулярно-биологические (ПЦР, пиросеквенирование, сравнительный анализ нуклеотидных последовательностей), вирусологические (вирусовыделение, культивирование вируса, титрование вируса, постановка биопроб), а также

традиционные методы исследований - очистка вируса и выделение недеградированной вирусной ДНК.

Положения, выносимые на защиту:

а) биологические свойства вируса АЧС изолятов Kashino 04/13 и Odintsovo 02/14 отличаются от таковых штамма Ставрополь 01/08;

б) определены и депонированы в базе данных GenBank полные нуклеотидные последовательности генома вируса АЧС изолятов Kashino 04/13 и Odintsovo 02/14 под номерами KJ747406.1 и KP843857.1, соответственно;

в) в геноме изолята Odintsovo 02/14 присутствует дополнительный прямой тандемный повтор GGAATATATA, отсутствующий в геномах изолятов ВАЧС Kashino 04/13 и Georgia 2007/1;

г) в геноме изолята Kashino 04/13 присутствует дополнительный прямой тандемный повтор GATAGTAGTTTAGTTAA, отсутствующий в геномах изолятов ВАЧС Odintsovo 02/14 и Georgia 2007/1.

Исследования по диссертационной работе выполнены в 2013-2015 гг. в Федеральном государственном бюджетном учреждении «Федеральный центр охраны здоровья животных» (ФГБУ «ВНИИЗЖ»).

Личный вклад автора. Диссертационная работа выполнена автором самостоятельно. Автор выражает свою искреннюю благодарность сотрудникам ФГБУ «ВНИИЗЖ»: к.б.н. Варенцовой А.А., к.б.н. Елсуковой А.А., к.б.н. Зинякову Н.Г, к.в.н. Першину А.С., к.б.н. Ремыге С.Г., к.в.н. Шевцову А.А., вед. биологу Жукову И.Ю, к.в.н. Иголкину А.С. за помощь в проведении отдельных этапов работы, проф. Рахманову А.М., и проф. Груздеву К.Н. за консультативную помощь и содействие в выполнении работы и сотрудникам ИАЦ Россельхознадзора за предоставленный иллюстративный материал по эпизоотической ситуации в РФ.

Степень достоверности и апробация результатов. Материалы диссертационной работы доложены и обсуждены на заседаниях Ученого совета и методической комиссии ФГБУ «ВНИИЗЖ» (2013-2015 гг.), на заседаниях НТС (Научно-технического совета) Россельхознадзора (2014-2015 гг.), 4 и 5

международном ветеринарном конгрессе (Казань, 2014 г и Москва, 2015 г.) на УП-УШ-Х ежегодной встрече Европейской исследовательской группы Epizone (2013, 2014, 2016 гг.), на 18-й Международной научно-методической конференции по патологической анатомии животных (г. Москва, 2014 г.), на 17-й Международной конференции по вирусологии и инфекционным болезням (г. Лондон, 2015 г.), на 6 Международном ветеринаром конгрессе (с. Сочи, 2016).

Публикации. По материалам диссертационной работы опубликовано 13 научных работ, в том числе 5 статей - в изданиях по перечню ВАК Министерства образования и науки РФ для докторских и кандидатских диссертаций.

Объем и структура диссертации. Диссертация изложена на 145 страницах компьютерного текста и содержит следующие разделы: введение, обзор литературы, результаты собственных исследований и их обсуждение, заключение, приложения; иллюстрирована 20 таблицами и 21 рисунком. Список использованной литературы включает 225 источников, из них 161 иностранный. В приложении представлены копии титульных листов документов, подтверждающих достоверность результатов работы, ее научную новизну и практическую значимость.

2. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

2.1 Эпизоотология АЧС

Значимость для экономики. АЧС наносит существенный социально-экономический ущерб свиноводству вновь поражаемых и эндемичных по АЧС стран и регионов. Причем урон наносится как интенсивному, так и экстенсивному производствам свинины. Поскольку в рамках реализации политики стемпинг-аута поголовье уничтожается, вспышки АЧС приводят к значительному экономическому ущербу для поражённых свинокомплексов, а также для частного сектора, который не способен поддерживать на высоком уровне биобезопасность; применять эффективные и, как правило, высокозатратные меры борьбы без государственной поддержки. Например, на Мадагаскаре и в Кот-д'Ивуаре эпизоотия АЧС привела к потере почти 50% свинопоголовья [42].

Так, например, усреднённый общий ущерб на один очаг в 2010 году в РФ по данным В.М. Гулёнкина с соавт. составил более 37 млн. руб, а общий экономический ущерб, причинённый стране по состоянию на начало 2013 г. по данным В.В. Макарова с соавт. превысил 1 миллиард долларов США [13, 25].

В свою очередь, урон для свиноводства приводит к снижению продовольственной безопасности страны, особенно тех стран, где свинина -основной источник животного белка, а выращивание КРС затруднено.

Наконец, важную составляющую в причиняемом АЧС ущербе играет потеря страной возможностей международной торговли мясом и продуктами свиноводства. Для ликвидации развившейся эпизоотии АЧС приходится реализовывать дорогостоящие многолетние госпрограммы по искоренению болезни [30, 152, 171].

Историческая справка. Первый случай АЧС был описан в Кении в 1920 г., как острая геморрагическая лихорадка, приводящая к гибели до 100% поражённых свиней. В 1921 г. Р.Ю. Монтгомери был установлен возбудитель болезни - вирус, обнаруженный у диких бородавочников. Дальнейшие

исследования показали, что вирус длительно присутствует у диких животных на территории южной и восточной Африки [84, 171].

У. МюИаиё е1 а1 провели филогенетический анализ более 700 изолятов ВАЧС и установили, что для современных штаммов вируса ближайшим общим предком является вирус, существовавший 300 лет назад, в начала 18 века [166].

Естественными носителями вируса АЧС являются кустарниковые свиньи и дикие африканские бородавочники РИасосковгш africanus, в организме которых вирус способен бессимптомно персистировать неограниченное время. Вирус присутствует в организме этих животных в малых титрах 1-2 ГадЕ50/см3. Большинство авторов соглашается, что контактная передача вируса от бородавочника к свинье в полевых условиях невозможна, в то время, как возможность заражения домашних свиней при поедании трупов бородавочников и скрещивании, представляется вероятной [153].

В роли вектора распространения и резервуара возбудителя выступают питающиеся кровью бородавочников аргасовые клещи рода Ornithodoros. Клещи Ornithodoros moubata способны передавать вирус свиньям при укусе, а внутри их популяции - трансовариально, трансстадиально и при половом контакте. Вместе клещи и бородавочники образуют устойчивый сильватический цикл в большинстве регионов Африки [47, 67, 153, 198, 202].

Так, в восточной и южной Африке заражение домашних свиней от бородавочников происходит преимущественно при укусах клещей или поедании их трупов. Для западной части Африканского континента, где численность клещей рода Ornithodoros низка, наиболее характерен алиментарный путь заражения домашних свиней, а также передача вируса при непосредственном контакте между свиньями [30, 127, 198, 212].

За последние 20 лет болезнь распространилась в пределах африканского континента, поразив центральную и западную его части, откуда продвинулась на острова Индийского океана, охватив в 1998 году Мадагаскар, а в 2007 - Маврикий [73, 198].

Распространение АЧС в мире. Первый случай выноса АЧС за пределы Африки произошёл в 1957 г. в Португалии, когда необеззараженные пищевые отходы с самолёта были скормлены свиньям в близлежащем городе Лиссабон. Несмотря на принятые меры к быстрой ликвидации вспышки, в 1960 г. в Лиссабоне вновь зарегистрировали АЧС, и Пиренейский полуостров оставался неблагополучным по АЧС вплоть до середины 90-ых годов. Из Португалии АЧС распространилась в Испанию, где в 1963 г. была установлена роль аргасовых клещей вида Ornithodoros как переносчиков и природного резервуара заболевания в Европе и Африке. Далее АЧС поразила Францию (1964), Италию (1967), Мальту (1978), Бельгию (1985) и Голландию (1986). Впоследствии заболевание было искоренено во всех странах, кроме итальянского острова Сардиния, остающегося стационарно неблагополучным по АЧС и по сей день. АЧС регистрировали также в странах Карибского бассейна - Кубе (1971), Доминиканской республике (1978), Гаити (1979) и Южной Америке (Бразилия, 1978), куда она была занесена, предположительно, из Испании с пищевыми отходами пассажирских авиалиний или ввозимыми туристами продуктами из свинины [84, 171, 178, 198].

АЧС в России. В апреле 2007 г. АЧС появилась в Грузии и быстро распространилось по её территории. По данным ФАО, возбудитель АЧС был занесён в страну на грузовом корабле через черноморский порт Поти с инфицированными мясопродуктами, часть которых была скормлена свиньям. Неэффективность принятых мер борьбы и особенности свиноводства в Грузии, заключающиеся в традиционном свободном выпасе свиней и кормлении их отходами, привели к нарастанию эпизоотии и распространению АЧС в близлежащие страны: Армению и Азербайджан [2, 41, 124, 138].

В ноябре 2007 г. первый случай АЧС был зарегистрирован в России, когда в Шатойском ущелье Республики Чечня был обнаружен павший кабан [149]. При проведении отстрелов в Республике Чечня весной 2008 г. обследование трупов кабанов выявило наличие у них вируса АЧС. По результатам секвенирования генома было установлено, что вспышка вызвана изолятом вируса II генотипа,

схожим с изолятами, ранее циркулировавшими на Мадагаскаре, в Мозамбике и Замбии [14].

В мае 2008 г. АЧС впервые была официально зарегистрирована у домашних свиней на фермах с открытым типом содержания в Р. Северная Осетия-Алания. В июне 2008г. был зарегистрирован первый выносной случай АЧС в Оренбургскую область, а к октябрю 2008 г. очаги АЧС были обнаружены в Ставропольском и Краснодарском краях, а также Республиках Северного Кавказа, сопредельных с Грузией. Развилась масштабная эпизоотия АЧС и началось формирование «южной» эндемичной зоны, включающей преимущественно регионы СевероКавказского и Южного федеральных округов. В 2011 году к ней добавилась «северная» эндемичная зона, в состав которой вошли регионы из Центрального и Северо-Западного округов (рисунок 1). Обе зоны сохраняются и по сей день.

Рисунок 1 - эпизоотическая ситуация по АЧС в Российской Федерации

По состоянию на 31.12.2016 г. всего с момента заноса на территорию России была зарегистрировано 1112 вспышек АЧС, эндемичными по заболеванию остаются 5 федеральных округов: Северо-Кавказский, Южный, Центральный, Приволжский и Северо-Западный [63].

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Шевченко, Иван Вячеславович, 2017 год

6. СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

1. Актуальные вопросы ветеринарной вирусологии: материалы. научно-практ. конф. ВНИИВВиМ «Классическая чума свиней - неотложные проблемы науки и практики», Покров, 9-11 ноября 1994 г. - Покров, 1995. - 124 с.

2. Африканская чума свиней в России: текущая ситуация и меры борьбы / А.С. Иголкин [и др.] // Актуальные проблемы биологии, биотехнологии, экологии и биобезопасности: Междунар. научно-практ. конф. - Кордай, 2015. - С. 129-133.

3. АЧС в Российской Федерации. Риски при АЧС [Электронный ресурс]. -Режим доступа: http://fsvps.ru/fsvps-docs/ru/iac/asf/publications/asf_risk.pdf (проверено 11.01.17).

4. Ашмарин, И.П. Быстрые методы статистической обработки и планирование экспериментов / И.П. Ашмарин, Н.Н. Васильев, В.А. Амбросов. - Л.: Изд-во Ленингр. ун-та, 1974. - 76 с.

5. Биологические свойства вируса африканской чумы свиней, выделенного в Российской Федерации / В.М. Балышев [и др.] // Ветеринария. - 2010. - № 7. - С. 25-27.

6. Биологические свойства изолятов вируса африканской чумы свиней, выделенных в Российской Федерации в 2012 г. / М.В. Болгова [и др.] // Актуальные вопросы ветеринарной биологии. - 2013. - № 4. - С. 26.

7. Бурба, Л.Г. Патоморфология экспериментальной африканской чумы свиней / Л.Г. Бурба // Тез. докл. Научно-произв. конф. «Болезни свиней». - Киев, 1967. -С. 22-24.

8. Варенцова, А.А. Анализ структуры генов изолятов вируса африканской чумы свиней, выделенных на территории Российской Федерации: дис. ... канд. биол. наук / Варенцова Алиса Алексеевна. - Владимир, 2014. - 140 с.

9. Варенцова, А.А. Создание клонотеки, кодирующей иммунологически значимые белки полевого изолята вируса африканской чумы свиней / А.А. Варенцова, И.В. Шевченко, Н.Г. Зиняков // Инновационное развитие науки в

обеспечении биологической безопасности: сб. материалов 2-й Междунар. науч. конф. молодых ученых. - Гвардейский, Казахстан, 2014. - С. 64-67.

10. Вирулентность изолятов вируса АЧС / С.А. Белянин [и др.] // Ветеринария Кубани. - 2011. - № 5. - С. 9-10.

11. Выявление клинико-анатомических, гистологических изменений при АЧС и локализации вируса в органах инфицированных животных / И.Ю. Жуков [и др.] // Российский ветеринарный журнал Сельскохозяйственные животные. - 2015. - № 3. - С. 36-39.

12. ГОСТ 28573-90. Свиньи. Методы лабораторной диагностики африканской чумы. - М.: Стандартинформ, 2005. - 10 с.

13. Гулёнкин, В.М. Оценка экономического ущерба от африканской чумы свиней / В.М. Гулёнкин, Н.С. Бардина, А.А. Шевцов // Ветеринария. - 2011. -№10. - С. 10-12.

14. Диагностика и мониторинг при вспышках АЧС в республиках Кавказа / В.В. Куриннов [и др.] // Ветеринария. - 2008. - №10. - С. 20-25.

15. Казакова, А.С. Конструирование продуцентов рекомбинантных белков р72, р30 и р54 вируса африканской чумы свиней: дис. ... канд. биол. наук / Казакова Анна Сергеевна. - Покров, 2013. - 125 с.

16. Казакова, А.С. Сравнительный анализ последовательности гена, кодирующего гликопротеин р54, вируса африканской чумы свиней / А.С. Казакова // Ветеринарная медицина XXI века: инновации, опыт, проблемы и пути их решения: материалы Междунар. научно.-практ. конф. / УГСХА. - Ульяновск, 2011. - С. 100-103.

17. Клинико-анатомическое проявление африканской чумы свиней при заражении разными методами вирусом, выделенным от дикого кабана / И.В. Шевченко [и др.] // Современные проблемы патологической анатомии, патогенеза и диагностики болезней животных: материалы 18-й Междунар. научно-методич. конф. - М., 2014. - С. 82-84.

18. Коваленко Я.Р. Африканская чума свиней и пути её распространения // Малоизученные заболевания сельскохозяйственных животных. - М., 1967. - С. 22-43.

19. Коваленко Я.Р., Бурба Л.Г., Сидоров М.А. Патологоанатомические изменения при африканской чуме свиней // Ветеринария. - 1964. - № 6. - С. 3440.

20. Коваленко Я.Р., Бурба Л.Г., Сидоров М.А. Пути заражения свиней вирусом африканской чумы // Труды Всесоюзного Института экспериментальной ветеринарии. - М., 1965. - Т. XXXI. - С. 336-342.

21. Коваленко, Я.Р. Африканская чума свиней / Я.Р. Коваленко. - М.: Колос, 1965. - 126 с.

22. Коваленко, Я.Р. Африканская чума свиней : [монография] / Я.Р. Коваленко, М.А. Сидоров, Л.Г. Бурба. - М.: Колос, 1972. - 199 с.

23. Конструирование библиотеки генов, кодирующих иммунологически значимые белки вируса АЧС изолята Krasnodar 06/12 / А.А. Варенцова [и др.] // Актуальные проблемы гуманитарных и естественных наук. - 2014. - № 5-1. - С. 28-35.

24. Макаров, В. В. Африканская чума свиней / В.В. Макаров. - М.: РУДН, 2011. - 268 с.

25. Макаров, В.В. Африканская чума свиней: эпизоотический полиморфизм и контроль. Часть 3. Экономика и экстраполяция на РФ / В.В. Макаров, В.А. Грубый // Ветеринария сегодня. - 2013. - №4. - С. 8-11.

26. Макаров, В.В. Вирус африканской чумы свиней // В.В. Макаров // Ветеринарная практика. - 2011. - №3. - С. 10-16.

27. Макаров, В.В. Гирусы / В.В. Макаров, В.М. Бондаренко // Бюллетень Оренбургского научного центра УрО РАН. - 2012. - № 2. - С. 1-13.

28. Макаров, В.В. Иммунологическая концепция африканской чумы // В.В. Макаров // Ветеринарная практика. - 2013. - №3. - С. 7-22.

29. Макаров, В.В. Система «клещи рода ОгшШоёогоБ-вирус Африканской чумы свиней»: биоэкология, вирусология, эпизоотология / В.В. Макаров, О.И. Сухарев, О.Б. Литвинов // Ветеринарная патология. - 2011. - № 3. - С. 18-29.

30. Макаров, В.В. Эпизоотологическая характеристика вируса АЧС / В.В. Макаров, О.И. Сухарев, И.В. Цветнова // Ветеринарная практика. - 2013. - №1. -С. 6-16.

31. Методические рекомендации по выделению и титрованию вируса африканской чумы свиней в культуре клеток лейкоцитов свиней / А.А. Варенцова [и др.] // ФГБУ «ВНИИЗЖ». - Владимир, 2014. - 21 с.

32. Методические рекомендации по выделению и титрованию вируса африканской чумы свиней в культуре клеток костного мозга свиней / А.А. Варенцова [и др.] // ФГБУ «ВНИИЗЖ». - Владимир, 2014. - 21 с.

33. Методические рекомендации по выявлению генома вируса африканской чумы свиней методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени / А.А. Елсукова [и др.] // ФГБУ «ВНИИЗЖ». - Владимир, 2015. - 31 с.

34. Методические рекомендации по идентификации вирусов с ДНК-геномом методом пирофосфатного секвенирования / Н.Г. Зиняков [и др.] // ФГБУ «ВНИИЗЖ». - Владимир, 2015. - 31 с.

35. Методические рекомендации по наработке ДНК вируса африканской чумы свиней в первичной культуре клеток макрофагов свиньи для последующего пиросеквенирования / И.В. Шевченко [и др.] // ФГБУ «ВНИИЗЖ». - Владимир, 2015. - 13 с.

36. Методические рекомендации по оценке клинических признаков и патологоанатомических изменений при экспериментальном заражении вирусом африканской чумы свиней / А.С. Першин [и др.] // ФГБУ «ВНИИЗЖ». -Владимир, 2015. - 21 с.

37. Методические рекомендации по получению препаратов ДНК вируса африканской чумы свиней из цельной крови свиней для высокопроизводительного полногеномного секвенирования / И.В. Шевченко [и др.] // ФГБУ «ВНИИЗЖ». - Владимир, 2015. - 13 с.

38. Методические рекомендации по получению типоспецифической сыворотки крови свиней для постановки реакции задержки гемадсорбции / А.А. Варенцова [и др.] // ФГБУ «ВНИИЗЖ». - Владимир, 2015. - 26 с.

39. Методические указания по выявлению вируса африканской чумы свиней в пробах крови и патологических материалов, отобранных от павших или вынужденно убитых свиней, в реакции прямой иммунофлуоресценции (РПИФ) / В.Л. Гаврилова [и др.] // ФГБУ «ВНИИЗЖ». - Владимир, 2013. - 18 с.

40. Методические указания по изоляции вируса африканской чумы свиней в культуре клеток альвеолярных макрофагов свиней / А.А. Варенцова [и др.] // ФГБУ «ВНИИЗЖ». - Владимир, 2013. - 14 с.

41. О реализации плана мероприятий по предупреждению распространения и ликвидации вируса африканской чумы свиней на территории Российской Федерации в 2013 году / И.В. Шевченко [и др.] // Ветеринария Кубани. - 2014. - № 5. - С. 21-23.

42. Остерман Л. А. Методы исследования белков и нуклеиновых кислот: Электрофорез и ультрацентрифугирование (практическое пособие) / Л.А. Остерман. - М.: Наука, 1981. - 288 с.

43. Патоморфологические изменения у домашних свиней при остром и подостром течении африканской чумы свиней / Е.В. Рыжова [и др.] // Российский ветеринарный журнал. Сельскохозяйственные животные. - 2012. - № 1 - С. 10-13.

44. Получение типовых задерживающих гемадсорбцию референс-сывороток к вирусу африканской чумы свиней / В.М. Балышев [и др.] // Вопросы нормативно-правового регулирования в ветеринарии. - 2015. - № 2. - С. 23-25.

45. Популяционная структура вируса африканской чумы свиней по признаку количественной гемадсорбции / В.В. Макаров [и др.] // Вопросы вирусологии. -1991. - Т. 4. - С. 321-324.

46. Природная очаговость африканской чумы свиней / В.В. Макаров [и др.] // Ветеринарная патология. - 2011. - № 3. - С. 9-18.

47. Природная очаговость африканской чумы свиней : учеб. пособие для вузов / В.В. Макаров, Ф.И. Василевич, Б.В. Боев, О.И. Сухарев ; МГАВМиБ, РУДН. - М.: ЗооВетКнига, 2014 - 65 с.

48. Пузанкова О.С. и др. Репродукция изолята Антоново 07/14 вируса африканской чумы свиней in vivo и in vitro // Ветеринария. - 2016. - №. 5. - С. 1824.

49. Рисунок 3. Повторное секвенирование («ре-секвенирование») генома [Электронный ресурс]. - Режим доступа: http://biomolecula.ru/content/778 (проверено 11.01.17).

50. Середа А.Д., Балышев В.М. Антигенное разнообразие вирусов африканской чумы свиней // Вопросы вирусологии. - 2011. - Т. 56. - № 4. - С. 38-42.

51. Середа А.Д., Власов Н.А., Макаров В.В. Физико-химический полиморфизм вирусной популяции и дефектные интерферирующие частицы вируса африканской чумы свиней // Вестник Россельхозакадемии. - 1997. - № 5. - С. 6770.

52. Середа А.Д., Колбасов Д.В. Белки вируса африканской чумы свиней // Научный журнал КубГАУ. - 2012. - Vol. 77. - №. 3. - P. 1-17.

53. Сероиммунологическая классификация природных изолятов вируса африканской чумы свиней / И.Ф. Вишняков [и др.] // Актуальные вопросы ветеринарной вирусологии: материалы научно-практ. конф. ВНИИВВиМ «Классическая чума свиней - неотложные проблемы науки и практики». -Покров, 1995. - С.141-143.

54. Сошникова, Л.А. Многомерный статистический анализ / Л.А. Сошникова, В.Н. Тамашевич. - М.: Юнита-Дана, 1999. - 350 с.

55. Сравнительный анализ нуклеотидных последовательностей интергенного региона 173R/1329L кавказских, российских и европейских изолятов вируса АЧС / И.В. Шевченко [и др.] // Ветеринария и кормление. - 2015. - № 2. - С. 26-27.

56. Сюрин В.Н. и др. Вирусные болезни животных / В.Н. Сюрин, А.Я. Самуйленко, Б.В. Соловьёв, Н.В. Фомина. - М.: ВНИТИБП, 1998. - 928 с.

57. Сюрин, В.Н. Африканская чума свиней // Лабораторная диагностика вирусных болезней животных. М.: Колос, 1972. - 416 с.

58. Территория распространения АЧС в Европейской части РФ [Электронный ресурс]. - Режим доступа: http://fsvps.ru/fsvps-docs/ru/iac/asf/2014/12-26/09.pdf (проверено 11.01.17).

59. Тимофеева, О.Ю. Критерии результативности в эксперименте: применение методов математической статистики: учебно-методич. пособие / О.Ю. Тимофеева.

- М.: АПКиППРО, 2008. - 36 с.

60. Филиппова, Н.А. Фауна СССР. Т. 4. Паукообразные / Н.А. Филиппова. - М.

- Л.: АН СССР, 1966. - 257 с.

61. Чемерис, А.В. Секвенирование ДНК / А.В. Чемерис, Э.Д. Ахунов, В.А. Вахитов. - М. : Наука, 1999. - 427 с.

62. Эпизоотическая ситуация по АЧС в популяции диких кабанов на территории Российской Федерации в 2007 - 2016 гг. [Электронный ресурс]. -Режим доступа: http://www.fsvps.ru/fsvps-docs/ru/iac/asf/2016/05-27/03.pdf (проверено 11.01.17).

63. Эпизоотическая ситуация по АЧС в Российской Федерации [Электронный ресурс]. - Режим доступа: https://fsvps.ru/fsvps-docs/ru/iac/asf/2016/12-31/03.pdf (проверено 11.01.17).

64. Эпизоотическая ситуация по АЧС на территории Российской Федерации в 2015 году [Электронный ресурс]. - Режим доступа: http://fsvps.ru/fsvps-docs/ru/iac/asf/2015/12-31/01.pdf (проверено 11.01.17).

65. A structural DNA binding protein of African swine fever virus with similarity to bacterial histone-like proteins / M.V. Borca [et al.] // Archives of Virology. - 1996. -Vol. 141, № 2. - P. 301-313.

66. African swine fever virus induces filopodia-like projections at the plasmamembrane / N. Jouvenet [et al.] // Cellular Microbiology. - 2006. - Vol. 8, № 11. - P. 1803-1811.

67. African swine fever virus DNA in soft ticks, Senegal / L. Vial [et al.] // Emerging infectious diseases. - 2007. - Vol. 13. - №. 12. - P. 1928.

68. African swine fever virus eradication in Africa / M.L. Penrith (et al) // Virus Research. - 2013. - Vol. 173, № 1. - P. 228-246.

69. African Swine Fever Virus Georgia 2007 with a Deletion of Virulence Associated Gene 9GL (B119L), when Administered at Low Doses, Leads to Virus Attenuation in Swine and Induces an Effective Protection against Homologous Challenge / V. O'Donnell [et al] // Journal of Virology. - 2015. - Vol. 89, №.16. - P. 8556-8566.

70. African swine fever virus Georgia isolate harboring deletions of MGF360 and MGF505 genes is attenuated in swine and confers protection against challenge with virulent parental virus / V. O'Donnell [et al.] // Journal of Virology. - 2015. - Vol. 89, № 11. - P. 6048-6056.

71. African swine fever virus infection of bone marrow: lesions and pathogenesis / J.C. Gomez-Villamandos [et al.] // Veterinary Pathology Online. - 1997. - Vol. 34, № 2. - P. 97-107.

72. African swine fever virus is enveloped by a two-membraned collapsed cisterna derived from the endoplasmic reticulum / G. Andres [et al.] // Journal of Virology. -1998. - Vol. 72, № 11. - P. 8988-9001.

73. African swine fever virus isolate, Georgia, 2007 / R.J. Rowlands [et al.] // Emerging Infectious Diseases. - 2008. - Vol. 14, № 12. - P. 1870-1874.

74. African swine fever virus multigene family 360 and 530 genes affect host interferon response / C.L. Afonso [et al.] // Virology. - 2004. - Vol. 78, № 4. - P. 18581864.

75. African swine fever virus multigene family 360 and 530 genes are novel macrophage host range determinants / L. Zsak [et al.] // Virology. - 1992. - Vol. 75, № 7. - P. 3066-3076.

76. African swine fever virus multigene family 360 genes affect virus replication and generalization of infection in Ornithodoros porcinus ticks / T.G. Burrage [et al.] // Journal Virology. - 2004. - Vol. 78, № 5. - P. 2445-2453.

77. African swine fever virus polyproteins pp220 and pp62 assemble into the core shell / G. Andres [et al.] // Journal of Virology. - 2002. - Vol. 76, № 24. - P. 1247312482.

78. African swine fever virus protein p17 is essential for the progression of viral membrane precursors toward icosahedral intermediates / C. Suarez [et al.] // Journal of Virology. - 2010. - Vol. 84, № 15. - P. 7484-7499.

79. African swine fever virus proteins involved in evading host defense systems / L.K. Dixon [et al.] // Veterinary Immunology and Immunopathology. - 2004. - Vol. 100, № 3. - P. 117-134.

80. African swine fever virus replication and genomics / L.K. Dixon [et al.] // Virus Research. - 2013. - Vol. 173, № 1. - P. 3-14.

81. African swine fever virus structural protein p54 is essential for the recruitment of envelope precursors to assembly sites / J.M. Rodriguez [et al.] // Journal of Virology. -2004. - Vol. 78, № 8. - P. 4299-4313.

82. African swine fever virus structural protein pE120R is essential for virus transport from assembly sites to plasma membrane but not for infectivity / G. Andres [et al.] // Journal of Virology. - 2001. - Vol. 75, № 15. - P. 6758-6768.

83. African swine fever virus uses macropinocytosis to enter host cells / E.G. Sanchez [et al.] // PLoS Pathogens. - 2010. - Vol. 8, № 6. - P. 27-54.

84. African swine fever: how can global spread be prevented? / S. Costard [et al.] // Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences. - 2009. - Vol. 364, № 1530. - P. 2683-2696.

85. An investigation into natural resistance to African swine fever in domestic pigs from an endemic area in southern Africa / M. L. Penrith [et al.] // Revue scientifique et technique OIE. - 2004. - Vol. 23, № 3. - P. 965-977.

86. Analysis of the complete nucleotide sequence of African swine fever virus / R.J. Yanez [et al.] // Virology. - 1995. - Vol. 208, № 1. - P. 249-278.

87. Andres, G. Assembly of African swine fever virus: role of polyprotein pp220 / G. Andres, C. Simon-Mateo, E. Vinuela // Journal of Virology. - 1997. - Vol. 71, № 3. -P. 2331-2341.

88. Angulo, A. Comparison of the sequence of the gene encoding African swine fever virus attachment protein p12 from field virus isolates and viruses passaged in cell

culture / A. Angulo, E. Vinuela E, A. Alcami // Virology. - 1992. - Vol. 66, № 1. - P. 3869-3872.

89. Animal Viruses Molecular Biology / L.K. Dixon [et al.]. - Norfolk, UK: Caister AP, 2008. - 531 p.

90. Application of Next-Generation Sequencing (NGS) Technologies to the African Swine Fever Virus (ASFV) [Электронный ресурс]. - Режим доступа: http://www.sidilv.org/index.php/component/docman/doc_download/76-report-borse-di-studio-claudia-torresi (проверено 11.01.17).

91. Application of next-generation sequencing technologies in virology / A.D. Radford [et al.] // Journal of General Virology. - 2012. - Vol. 98, № 9. - P. 1853-1868.

92. Applications of next-generation sequencing technologies to diagnostic virology / L. Barzon [et al.] // International Journal of Molecular Sciences. - 2011. - Vol. 12, № 11. - P. 7861-7884.

93. Asfarviridae Virus Taxonomy: Ninth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses / L.K. Dixon [et al.]. - London, UK: Elsevier, 2012. - 210 p.

94. ASFV p54 epitope mapping using polyclonal swine sera and monoclonal antibodies / V. Petrovan, M. Murgia, P. Wu [et al.] // North American PRRS Symposium 2015. - Chicago, 2015.

95. Beard W.A., Wilson S.H. DNA polymerases lose their grip // Nature Structural & Molecular Biology. - 2001. - Vol. 8., №. 11. - P. 915-917.

96. Black D.N., Brown F. Purification and physicochemical characteristics of African swine fever virus // Journal of General Virology. - 1976. - V. 32. - №. 3. - P. 509-518.

97. Blome S. Pathogenesis of African swine fever in domestic pigs and European wild boar / S. Blome, C. Gabriel, M. Beer // Virus Research. - 2013. - Vol. 173, № 1. -P. 122-130.

98. Blome, S. Modern adjuvants do not enhance the efficacy of an inactivated African swine fever virus vaccine preparation / S. Blome, C. Gabriel, M. Beer // Vaccine. - 2014. - Vol. 32, № 31. - P. 3879-3882.

99. Breese, S. S. Electron microscope observations of African swine fever virus in tissue culture cells / S.S. Breese, C.J. DeBoer // Virology. - 1966. - Vol. 28, № 3. - P. 420-428.

100. Brookes, S.M. Assembly of African swine fever virus: quantitative ultrastructural analysis in vitro and in vivo / S.M. Brookes, L.K. Dixon, R.M. Parkhouse // Virology. -1996. - Vol. 224, № 1. - P. 84-92.

101. Carrascosa, A.L. African swine fever virus attachment protein / A.L. Carrascosa , I. Sastre, E. Vinuela // Journal of virology. - 1991. - Vol. 65, № 5. - P. 2283-2289.

102. Characterization and molecular basis of heterogeneity of the African swine fever virus envelope protein p54 / F. Rodriguez [et al.] // Journal of Virology. - 1994. - Vol. 68, № 11. - P. 7244-7252.

103. Characterization of African swine fever virus Caucasus isolate in European wild boars / C. Gabriel [et al.] // Emerging Infectious Diseases. - 2011. - Vol. 17, № 12. - P. 2342-2345.

104. Characterization of pathogenic and non-pathogenic African swine fever virus isolates from Ornithodoros erraticus inhabiting pig premises in Portugal / F.S. Boinas [et al.] // Journal of General Virology. - 2004. - Vol. 85, № 8. - P. 2177-2187.

105. Cobbold, C. A virally encoded chaperone specialized for folding of the major capsid protein of African swine fever virus / C. Cobbold, M. Windsor, T. Wileman // Journal of Virology. - 2001. - Vol. 75, № 16. - P. 7221-7229.

106. Cobbold, C. Biochemical requirements of virus wrapping by the endoplasmic reticulum: involvement of ATP and endoplas- mic reticulum calcium store during envelopment of African swine fever virus / C. Cobbold, S.M. Brookes, T. Wileman // Journal of Virology. - 2000. - Vol. 74, № 5. - P. 2151-2160.

107. Cohen, S. N. Nonchromosomal antibiotic resistance in bacteria: genetic transformation of Escherichia coli by R-factor DNA / S.N. Cohen, A.C. Chang, L. Hsu // Proceedings of the National Academy of Sciences. - 1972. - Vol. 79, № 8. - P. 21102114.

108. Comparative analysis of African swine fever virus genotypes and serogroups / A. Malogolovkin [et al.] // Emerging infectious diseases. - 2015. - Vol. 21. - №. 2. - P. 312.

109. Comparative analysis of clinical and biological characteristics of African swine fever virus isolates from 2013 year Russian Federation / N.N. Vlasova [et al.] // British Microbiology Research Journal. - 2015. - Vol. 5, № 3. - P. 203-215.

110. Comparative analysis of molecular and biological properties of African swine fever virus isolates collected in 2013 from Russian Federation / N. N. Vlasova [et al.] // EPIZONE: Abstracts 8th Annual EPIZONE Meeting "Primed for tomorrow". -Frideriksberg, 2014. -P. 85.

111. Comparative sequence analysis of genes encoding outer proteins of African swine fever virus isolates from different regions of Russian Federation and Armenia / N.N. Vlasova [et al.] // International Journal of Virology and Molecular Biology. - 2012. -Vol. 1, № 1. - P. 1-11.

112. Comparison of the genome sequences of non-pathogenic and pathogenic African swine fever virus isolates / D. Chapman [et al.] // Journal of General Virology. - 2008. - Vol. 89, № 2. - P. 397-408.

113. De Matos, A.P. African swine fever virus interaction with microtubules / A.P. de Matos, Z.G. Carvalho // Biologie Cellulaire. - 1993. - Vol. 78, № 3. - P. 229-234.

114. Deletion of African swine fever virus interferon inhibitors from the genome of a virulent isolate reduces virulence in domestic pigs and induces a protective response / Ana Luisa Reis [et al] // Vaccine. - 2016. - Vol. 34. - №. 39. - P. 4698-4705.

115. Description of a new population of fixed macrophages in the splenic cords of pigs / L. Carrasco [et al.] // Journal of Anatomy. - 1995. - Vol. 187, № 2. - P. 395.

116. Detection of African swine fever antibodies in experimental and field samples from the Russian Federation: Implications for control / L. Mur [et al.] // Transboundary and Emerging Diseases. - 2015.

117. Detection of african swine fever virus (ASFV) by direct inmunofluorescence (DIF) / VISAVET Center and Department of Animal Health. Universidad Complutense de Madrid - Madrid: 2013. - 3 p.

118. Development of a TaqMan® PCR assay with internal amplification control for the detection of African swine fever virus / D.P. King (et al.) // Journal of Virological Methods. - 2003. - V. 107. - №. 1. - P. 53-61.

119. Development of microscopic lesions in splenic cords of pigs infected with African swine fever virus / L. Carrasco [et al.] // Veterinary Research. - 1997. - Vol. 28, № 1. - P. 93-99.

120. Disruption of nuclear organization during the initial phase of African swine fever virus infection / M. Ballester [et al.] // Journal of Virology. - 2011. - Vol. 85, № 16. -P. 8263-8269.

121. Dixon, L.K. Molecular cloning and restriction enzyme mapping of an African swine fever virus isolate from Malawi / L.K. Dixon // The Journal of General Virology.

- 1988. - Vol. 69, № 1. - P. 1683-1694.

122. Double labeling immunohistological study of African swine fever virus-infected spleen and lymph nodes / I. Minguez [et al.] // Veterinary Pathology Online. - 1988. -Vol. 25, № 3. - P. 193-198.

123. Effects of chlorine, iodine, and quaternary ammonium compound disinfectants on several exotic disease viruses / J. Shirai [et al.] // The Journal of Veterinary Medical Science. - 2000. - Vol. 61, № 1. - P. 85-92.

124. Empress watch: FAO emergency prevention systems. African swine fever in Georgia [Электронный ресурс]. - Режим доступа: http://www.fao.org/docs/eims/upload/230205/EW_ASF_Georgia_Jun07.pdf (проверено 11.01.17).

125. Enhanced discrimination of African swine fever virus isolates through nucleotide sequencing of the p54, p72, and pB602L (CVR) genes / C. Gallardo [et al.] // Virus Genes. - 2009. - Vol. 38, № 1. - P. 85-95.

126. Epidemiology of African Swine Fever in Poland since the detection of the first case / Z. Pejsak [et al] // Polish journal of veterinary sciences. - 2014. - Vol. 17, №.4. -P. 665-672.

127. Epidemiology of African swine fever virus / S. Costard [et al.] // Virus Research.

- 2013. - Vol. 173, № 1. - P. 191-197.

128. Epidemiology of classical swine fever in Sardinia: a serological survey of wild boar and comparison with African swine fever / A. Laddomada [et al.] // Veterinary Record. - 1994. - Vol. 134, № 8. - P. 183-187.

129. Escribano, J. M. Antibody-mediated neutralization of African swine fever virus: Myths and facts / J.M. Escribano, I. Galindo, C. Alonso // Virus Research. - 2013. -Vol. 173, № 1. - P. 101-109.

130. Esteves, A. Two-dimensional analysis of African swine fever virus proteins and proteins induced in infected cells / A. Esteves, M.I. Marques, J.V. Costa // Virology. -1986. - Vol. 152, № 1. - P. 192-206.

131. European Food Safety Authority: Scientific Opinion on African Swine Fever [Электронный ресурс]. - Режим доступа: http://www.efsa.europa.eu/en/efsajournal/pub/1556.htm (проверено 11.01.17).

132. Experimental African swine fever: apoptosis of lymphocytes and virus replication in other cells / J.C. Gomez-Villamandos [et al.] // Journal of General Virology. - 1995. - Vol. 76, № 9. - P. 2399-2405.

133. Garcia-Escudero, R. Structure of African swine fever virus late promoters: requirement of a TATA sequence at the initiation region / R. Garcia-Escudero, E. Vinuella // Journal of Virology. - 2000. - Vol. 74, № 17. - P. 8176-8182.

134. General morphology and capsid fine structure of African swine fever virus particles / J.L. Carrascosa [et al.] // Virology. - 1984. - Vol. 132, № 1. - P. 160-172.

135. Generation of filamentous instead of icosahedral particles by repression of African swine fever virus structural protein pB438L / C. Epifano [et al.] // Journal of Virology. - 2006. - Vol. 82, № 23. - P. 11456-11466.

136. Genetic variation among African swine fever genotype II Viruses, Eastern and Central Europe / C. Gallardo [et al.] // Emerging Infectious Diseases. - 2014. - Vol. 20, № 9. - P. 1544-1547.

137. Genome-scale approaches to resolving incongruence in molecular phylogenies / A. Rokas [et al.] // Nature. - 2003. - Vol. 425, № 6960. - P. 798-804.

138. Genomic analysis of highly virulent Georgia 2007/1 isolate of African swine fever virus / D. Chapman [et al.] // Emerging Infectious Diseases. - 2011. - Vol. 17, № 4. - P. 599-605.

139. Genotyping field strains of African swine fever virus by partial p72 gene characterisation / A. Bastos [et al.] // Archives of Virology. - 2003. - Vol. 148, № 4. -P. 693-706.

140. Genotyping of African swine fever virus (ASFV) isolates associated with disease outbreaks in Uganda in 2007 / C. Gallardo [et al.] // African Journal of Biotechnology. -2013. - Vol. 10, № 17. - P. 3488-3497.

141. Gontcharov, A.A. Are combined analyses better than single gene phylogenies? A case study using SSU rDNA and rbcL sequence comparisons in the Zygnematophyceae (Streptophyta) / A.A. Gontcharov, B. Marin, M. Melkonian // Molecular Biology and Evolution. - 2004. - Vol. 21, № 3. - P. 612-624.

142. Hairpin loop structure of African swine fever virus DNA / A. Gonzalez [et al.] // Nucleic Acids Research. - 1986. - Vol. 14, № 17. - P. 6835-6844.

143. Heath, C.M. Aggresomes resemble sites specialized for virus assembly / C.M. Heath, M. Windsor, T. Wileman // Journal of Cell Biology. - 2001. - Vol. 153, № 3. -P. 449-455.

144. Hopp, T. P. Prediction of protein antigenic determinants from amino acid sequences / T.P. Hopp, K.R. Woods // Proceedings of the National Academy of Sciences. - 1981. - Vol. 78, № 6. - P. 3824-3828.

145. Identification of a New Genotype of African Swine Fever Virus in Domestic Pigs from Ethiopia / J.E. Achenbach [et al.] // Transboundary and emerging diseases. - 2016.

146. Identification of a variable region of the African swine fever virus genome that has undergone separate DNA rearrangements leading to expansion of minisatellite-like sequences / L.K. Dixon [et al.] // Journal of Molecular Biology. - 1990. - Vol. 216, № 3. - P. 677-688.

147. In vivo depletion of CD8+ T lymphocytes abrogates protective immunity to African swine fever virus / C.A. Oura [et al.] // Journal of General Virology. - 2005. -Vol. 86, № 9. - P. 2445-2450.

148. Inducible gene expression from African swine fever virus recombinants: analysis of the major capsid protein p72 / R. Garcia-Escudero [et al.] // Journal of Virology. -1998. - Vol. 72, № 4. - P. 3185-3195.

149. Information received on 04/12/2007 from Dr. Evgueny A. Nepoklonov, Deputy Head, Orlikov per., 1/11, Ministry of Agriculture and Food, Moscow, Russia [Электронный ресурс]. - Режим доступа: http: //www.oie.int/wahis_2/public/wahid.php/Reviewreport/Review?page_refer=MapE ventSummary&reportid=6546 (проверено 11.01.17).

150. Intracellular virus DNA distribution and the acquisition of the nucleoprotein core during African swinefever virus particle assembly: ultrastructural in situ hybridisation and DNasegold labelling / S.M. Brookes [et al.] // Virology. - 1998. -Vol. 249, № 1. - P. 175-188.

151. Intranuclear detection of African swine fever virus DNA in several cell types from formalin-fixed and paraffin-embedded tissues using a new in situ hybridisation protocol / M. Ballester [et al.] // Journal of Virological Methods. - 2010. - Vol. 168, № 1. - P. 38-43.

152. Introduction of African swine fever into the European Union through illegal importation of pork and pork products / S. Costard [et al.] // PloS One. - 2013. - Vol. 8, № 4. - P. 61-104.

153. Jori, F. Role of wild suids in the epidemiology of African swine fever // F. Jori, A.D. Bastos // EcoHealth. - 2009. - Vol. 6, № 2. - P. 296-310.

154. Kuznar, J. DNA-dependent RNA polymerase in African swine fever virus / J. Kuznar, M.L. Salas, E. Vinuela // Virology. - 1980. - Vol. 101, № 1. - P. 169-175.

155. Lamarche, B.J. ASFV DNA polymerase X is extremely error-prone under diverse assay conditions and within multiple DNA sequence contexts / B.J. Lamarche, S. Kumar, M.D. Tsai // Biochemistry. - 2006. - Vol. 45, № 49. - P. 14826-14833.

156. Localization of structural proteins in African swine fever virus particles by immunoelectron microscopy / J.L. Carrascosa [et al.] // Journal of Virology. - 1986. -Vol. 58, № 2. - P. 377-384.

157. Localization of the African swine fever virus attachment protein P12 in the virus particle by immunoelectron microscopy / A.L. Carrascosa [et al.] // Virology. - 1993. -Vol. 193, № 1. - P. 460-465.

158. Macrophage transcriptional responses following in vitro infection with a highly virulent African swine fever virus isolate / F. Zhang [et al.] // Journal of Virology. -2006. - Vol. 80, № 21. - P. 10514-10521.

159. Malmquist W.A. et al. Hemadsorption and cytopathic effect produced by African Swine Fever virus in swine bone marrow and buffy coat cultures // American Journal of Veterinary Research. - 1960. - V. 21. - P. 104-108.

160. Manual on Procedures for Disease Eradication by Stamping Out / W. Geering [et al.]. - Rome, Italy: Animal Production and Health Div., 2001. - 139 p.

161. Mardis, E.R. Next-generation DNA sequencing methods / E.R. Mardis // Annu. Rev. Genomics Hum. Genet. - 2008. - Vol. 9. - P. 387-402.

162. McVicar, J.W. Quantitative aspects of the transmission of African swine fever / J.W. McVicar // American Journal of Veterinary Research. - 1984. - Vol. 45, № 8. - P. 1535-1541.

163. Mebus, C. A. African Swine Fever / C.A. Mebus. - Sardinia, Spain, 1983. - 194 p.

164. MEGA4: molecular evolutionary genetics analysis (MEGA) software version 4.0 / K. Tamura [et al.] // Molecular Biology and Evolution. - 2007. - Vol. 24, № 8. - P. 1596-1599.

165. Megavirales, a proposed new order for eukaryotic nucleocytoplasmic large DNA viruses / P. Colson [et al.] // Archives of Virology. - 2013. - Vol. 158, № 12. - P. 25172521.

166. Michaud, V. Comprehensive phylogenetic reconstructions of African swine fever virus: Proposal for a new classification and molecular dating of the virus / V. Michaud, T. Randriamparany, E. Albina // PloS One. - 2013. - Vol. 8, № 7. - P. 62-69.

167. Molecular Cell Biology - 4th ed. / H. Lodish [et al.]. - New York: W. H. Freeman, 2000. - 1184 p.

168. Molecular characterization of African swine fever virus isolates originating from outbreaks in the Russian Federation between 2007 and 2011 / A. Malogolovkin [et al.] // Veterinary Microbiology. - 2012. - Vol. 158, № 3. - P. 415-419.

169. Molecular epidemiology of African swine fever virus studied by analysis of four variable genome regions / R.J. Nix [et al.] // Archives of Virology. - 2006. - Vol. 151, № 12. - P. 2475-2494.

170. Monoclonal antibodies of African swine fever virus: antigenic differences among field virus isolates and viruses passaged in cell culture / B. Garcia-Barreno [et al.] // Journal of Virology. - 1986. - Vol. 85, № 2. - P. 385-392.

171. Montgomery, R. On a form of swine fever occurring in British East Africa (Kenya Colony) / R. Montgomery // Journal of Comparative Pathology and Therapeutics. - 1921. - Vol. 31. - P. 159-191.

172. Mur, L. Risk of African swine fever introduction into the European Union through transport-associated routes: returning trucks and waste from international ships and planes / L. Mur, B. Martinez-Lopez, J.M. Sanchez-Vizcaino // BMC Veterinary Research. - 2012. - Vol. 8, № 1. - P. 149.

173. Nucleotide sequence analysis of the African swine fever virus isolates Kashino 04/13 and Odintsovo 02/14 / I. Shevchenko, A. Varentsova, A. Elsukova [et al.] // ICVID 2015 : 17th International Conference on Virology and Infectious Diseases. -London, 2015. -P. 350.

174. Obtaining maximal concatenated phylogenetic data sets from large sequence databases / M.J. Sanderson [et al.] // Molecular Biology and Evolution. - 2003. - Vol. 20, № 7. - P. 1036-1042.

175. OIE technical disease card for ASF [Электронный ресурс]. - Режим доступа: http: //www. oie. int/fileadmin/Home/eng/Animal_Health_in_the_World/docs/pdf/Diseas e_cards/AFRICAN_SWINE_FEVER. pdf (проверено 11.01.17).

176. OIE. Manual of Diagnostic Tests and Vaccines for Terrestrial Animals. Vol. 2 / OIE. - 7th ed. - Paris, 2012. - Chap. 2.8.1. - P. 1-13.

177. OIE-Listed diseases, infections and infestations in force in 2016 [Электронный ресурс]. - Режим доступа: http://www.oie.int/animal-health-in-the-world/oie-listed-diseases-2016 (проверено 11.01.17).

178. Ornithodoros porcinus ticks, bushpigs, and African swine fever in Madagascar / F. Roger [et al.] // Experimental & Applied Acarology. - 2001. - Vol. 25, № 3. - P. 263-269.

179. Oura, C.A. Virological diagnosis of African swine fever—comparative study of available tests / C.A. Oura, L. Edwards, C.A. Batten // Virus Research. - 2013. - Vol. 173, № 1. - P. 150-158.

180. Pan, I.C. Virulence in African swine fever: its measurement and implications /

1.C. Pan, W.R. Hess // American Journal of Veterinary Research. - 1984. - Vol. 45, №

2. - P. 361-366.

181. Passively transferred African swine fever virus antibodies protect swine against lethal infection / D.V. Onisk [et al.] // Virology. - 1994. - Vol. 198, № 1. - P. 350-354.

182. Pathogenesis of highly virulent African swine fever virus in domestic pigs exposed via intraoropharyngeal, intranasopharyngeal, and intramuscular inoculation, and by direct contact with infected pigs / B. Howey [et al.] // Virus research. - 2013. -Vol. 178. - №. 2. - P. 328-339.

183. Performance comparison of benchtop high-throughput sequencing platforms / N.J. Loman [et al.] // Nature Biotechnology. - 2012. - Vol. 30, № 5. - P. 434-439.

184. Perkel, J. Making contact with sequencing's fourth generation / J. Perkel // BioTechniques. - 2011. - Vol. 50, № 2. - P. 93-95.

185. Phylogenomic analysis of 11 complete African swine fever virus genozme sequences / E.P. De Villiers [et al.] // Virology. - 2010. - Vol. 400, № 1. - P. 128-136.

186. Porcine spleen diffuse congestion - lower is normal (African Swine fever) by DVM, PhD, DACVP Richard Jakowski [Электронный ресурс]. - Режим доступа: http://ocw.tufts.edu/Content/72/imagegallery/1362322/1368979/1377551 (проверено 11.01.17).

187. Proinflammatory cytokines induce lymphocyte apoptosis in acute African swine fever infection / F.J. Salguero [et al.] // Journal of Comparative Pathology. - 2005. -Vol. 132, № 4. - P. 289-302.

188. Purification and properties of African swine fever virus / A.L. Carrascosa [et al.] // Journal of Virology. - 1985. - Vol. 54, № 2. - P. 337-344.

189. Real-time DNA sequencing using detection of pyrophosphate release / M. Ronaghi [et al.] // Analytical Biochemistry. - 1996. - Vol. 242, № 1. - P. 84-89.

190. Related strains of African swine fever virus with different virulence: genome comparison and analysis / R. Portugal [et al.] // Journal of General Virology. - 2015. -Vol. 96, № 2. - P. 408-419.

191. Replication of African swine fever virus DNA in infected cells / G. Rojo [et al.] // Virology. - 1999. - Vol. 257, № 2. - P. 524-536.

192. Repression of African swine fever virus polyprotein pp220-encoding gene leads to the assembly of icosahedral core-less particles / G. Andres [et al.] // Journal of Virology. - 2002. - Vol. 76, № 6. - P. 2654-2666.

193. Rusk, N. Torrents of sequence / N. Rusk // Nature Methods. - 2011. - Vol. 8, № 1. - P. 44.

194. Salas, M. African swine fever virus morphogenesis / M.L. Salas, G. Andres // Virus Research. - 2013. - Vol. 173, № 1. - P. 29-41.

195. Sambrook, J. Molecular Cloning: A Laboratory Manual. - 2nd ed. / J. Sambrook, E.F. Fritsch, T. Maniatis. - N.Y.: Cold Spring Harbor, 1989.

196. Sanchez-Vizcaino J. M. African swine fever / J.M. Sanchez-Vizcaino // Diseases of Swine. - 9th ed. - Ames, Iova, 2006. - P. 93-102.

197. Sanchez-Vizcaino, J. M. African swine fever virus / J.M. Sanchez-Vizcaino, N. Marisa Arias // Diseases of Swine. - 10th ed. - West Sussex, UK: Wiley-Blackwell, 2012. - P. 396-404.

198. Sanchez-Vizcaino, J. M. African swine fever: an epidemiological update / J.M. Sanchez-Vizcaino, L. Mur, B. Martinez-Lopez // Transboundary and Emerging Diseases. - 2012. - Vol. 59, Suppl. 1. - P. 27-35.

199. Sanger, F. DNA sequencing with chain-terminating inhibitors / F. Sanger, S. Nicklen, A. Coulson // Proceedings of the National Academy of Sciences. - 1997. -Vol. 74, № 12. - P. 5463-5467.

200. Serological and immunohistochemical study of African swine fever in wild boar in Spain / J. Perez [et al.] // Veterinary Record. - 1998. - Vol. 143, № 5. - P. 136-139.

201. Showalter, A.K. A DNA polymerase with specificity for five base pairs / A.K. Showalter, M.D. Tsai // Journal of the American Chemical Society. - 2001. - Vol. 123, № 8. - P. 1776-1777.

202. Soft ticks as pathogen vectors: distribution, surveillance and control / Manzano-Román R. [et al.] // Parasitology. - INTECH Open Access Publisher, 2012. - P. 125162.

203. Spatiotemporal distribution of novel Russian isolates of African swine fever virus with and without the additional tandem repeat insertion in the intergenic region between genes 173R/1329L / A. Elsukova [et al.] // 10th International Congress for Veterinary Virology. - France, Monpellier, 2015. - P. 260.

204. Structure and expression in E. coli of the gene coding for protein p10 of African swine fever virus / M. Munoz [et al.] // Archives of Virology. - 1993. - Vol. 130, № 1. - P. 93-107.

205. Suarez, C. African swine fever virus polyprotein pp62 is essential for viral core development / C. Suarez, M.L. Salas, J.M. Rodriguez // Journal of Virology. - 2010. -Vol. 84, № 1. - P. 176-187.

206. T.R. Freitas,T. M. Lyra. 38 Brazilian Congress of Veterinary Medicine Conbravet, 1978, Florianopolis. - Florianopolis, 1978. - P 1-3.

207. Tandem Repeat Insertion in African swine fever virus, Russia, 2012 / K.V. Goller [et al.] // Emerging Infectious Diseases. - 2015. - Vol. 21, № 4. - P. 731.

208. The African swine fever virus nonstructural protein pB602L is required for formation of the icosahedral capsid of the virus particle / C. Epifano [et al.] // Journal of Virology. - 2006. - Vol. 80, № 24. - P. 12260-12270.

209. The African swine fever virus virion membrane protein pE248R is required for virus infectivity and an early postentry event / I. Rodriguez [et al.] // Journal of Virology. - 2009. - Vol. 83, № 23. - P. 12290-12300.

210. The CD2v protein of African swine fever virus interacts with the actin-binding adaptor protein SH3P7 / P. C. Kay-Jackson [et al]. // Journal of general virology. -2004. - Vol. 85. - №. 1. - P. 119-130.

211. The cellular immune recognition of proteins expressed by an African swine fever virus random genomic library / J.S. Jenson [et al.] // Journal of Immunological Methods. - 2000. - Vol. 242, № 1. - P. 33-42.

212. The distribution of African swine fever virus isolated from Ornithodoros moubata in Zambia / P.J. Wilkinson [et al.] // Epidemiology and Infection. - 1988. - Vol. 101, № 3. - P. 547-564.

213. The envelope of intracellular African swine fever virus is composed of a single lipid bilayer / P.C. Hawes [et al.] // Journal of Virology. - 2008. - Vol. 82, № 16. - P. 7905-7912.

214. The non-haemadsorbing African swine fever virus isolate ASFV/NH/P68 provides a model for defining the protective anti-virus immune response / A. Leitao [et al.] // Journal of General Virology. - 2001. - Vol. 81, № 1. - P. 513-523.

215. The nucleotide sequence of bacteriophage phi X174 / F. Sanger [et al.] // Journal of Molecular Biology - 1978. - Vol. 125, № 1. - P. 225-246.

216. The progressive adaptation of a Georgian isolate of African swine fever virus to Vero cells leads to a gradual attenuation of virulence in swine corresponding to major modifications of the viral genome / P.W. Krug [et al.] // Journal of Virology. - 2015. -Vol. 89, № 4. - P. 2324-2332.

217. Transcription and translation maps of African swine fever virus / M.L. Salas [et al.] // Virology. - 1986. - Vol. 152, № 1. - P. 228-240.

218. Transcriptional analysis of multigene family 110 of African swine fever virus / F. Almazan [et al.] // Journal of Virology. - 1992. - Vol. 66, № 11. - P. 6655-6667.

219. Transport of African swine fever virus from assembly sites to the plasma membrane is dependent on microtubules and conventional kinesin / N. Jouvenet [et al.] // Journal of Virology. - 2004. - Vol. 78, № 15. - P. 7990-8001.

220. Trautman R., Pan I.C., Hess W.R. Sedimentation coefficient of African swine fever virus // American journal of veterinary research. - 1980. - V. 41. - №. 11. - P. 1874-1878.

221. Vaccine Potential of Two Previously Uncharacterized African Swine Fever Virus Isolates from Southern Africa and Heterologous Cross Protection of an Avirulent European Isolate / R. Souto [et al.] // Transboundary and emerging diseases. - 2016. -Vol. 63, № 2. - P. 224-231.

222. Vinuela, E. African swine fever virus / E. Vinuella // Current Topics in Microbiology and Immunology. - 1985. - Vol. 116, № 1. - P. 151-170.

223. Virus association with lymphocytes in acute African swine fever / L. Carrasco [et al.] // Veterinary Research. - 1996. - Vol. 27, № 3. - P. 305-312.

224. Virus Taxonomy: VIIIth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses / ed. C. Fauquet [et al.] - Academic Press, 2005. - 1162 р.

225. Wetterstrand, KA. DNA Sequencing Costs: Data from the NHGRI Genome Sequencing Program (GSP) [Электронный ресурс]. - Режим доступа: www.genome.gov/sequencingcosts (проверено 11.01.17).

7. СПИСОК ИЛЛЮСТРИРОВАННОГО МАТЕРИАЛА

Рисунки:

1. эпизоотическая ситуация по АЧС в Российской Федерации (с. 17).

2. Патологоанатомические изменения при АЧС (с. 23).

3. Структура вириона вируса АЧС (с. 28).

4. Строение икосаэдрического капсида (с. 29).

5. Механизм сборки вириона вируса АЧС (с. 31).

6. Нормальное и аномальное протекание сборки вириона АЧС (с. 33).

7. Выявление структурных вариаций генома (с. 44)

8. Изменения характера гемадсорбции при культивировании изолята Odintsovo 02/14 на КК СП (увеличение х400) (с. 60).

9. Показатели температуры у поросят после экспериментального заражения штаммом ВАЧС Ставрополь 01/08 (с. 63).

10. Клинические и патоморфологические проявления АЧС у поросят после экспериментального заражения штаммом ВАЧС Ставрополь 01/08 (с. 66).

11. Показатели температуры у поросят после экспериментального заражения вирусом АЧС изолята Kashino 04/13 (с. 69).

12. Клинические и патоморфологические проявления АЧС у поросят после экспериментального заражения изолятом ВАЧС Kashino 04/13 (с. 71).

13. Показатели температуры у поросят после экспериментального заражения вирусом АЧС изолята Odintsovo 02/14 (с. 74).

14. Клинические и патоморфологические проявления АЧС у поросят после экспериментального заражения вирусом АЧС изолята Odintsovo 02/14 (с. 77).

15. Продолжительность жизни поросят после экспериментального заражения вирусом АЧС различных изолятов с использованием отличающихся доз (с. 78).

16. Электрофореграмма препаратов ДНК вируса АЧС (с. 89).

17. Карта изменений в геноме изолята КаБЫпо 04/13 (с. 93).

18. Карта изменений в геноме изолята Odintsovo 02/14 (с. 97).

19. Сравнение профилей гидрофильности белка E199L у различных изолятов

вируса АЧС (с. 98).

20. Карта регионов РФ, в которых обнаруживали изоляты ВАЧС, несущие встройки в интергенных регионах I73R/I329L и 9R/10R (с. 104).

21. Схема предварительной характеризации современных российских изолятов вируса АЧС. (с. 107).

Таблицы:

1. Изоляты вируса АЧС, использованные в работе (с. 50).

2. Структура праймеров для выявления фрагментов генома вируса АЧС (с. 54).

3. Основные характеристики репродукционной активности вируса АЧС на КК АМС к третьему пассажу (n=3) (с. 58)

4. Основные показатели репродукционной активности вируса АЧС изолята Odintsovo 02/14 в культуре клеток СП (n=3) (c. 59).

5. Результаты экспериментального заражения поросят штаммом ВАЧС Ставрополь 01/08 (с. 62).

6. Патологоанатомические изменения у поросят, заражённых штаммом ВАЧС Ставрополь 01/08 (с. 64).

7. Результаты экспериментального заражения поросят изолятом ВАЧС Kashino 04/13 (с. 68).

8. Клинические признаки и патологоанатомические изменения у поросят, заражённых вирусом АЧС изолята Kashino 04/13 (с. 70).

9. Результаты экспериментального заражения поросят изолятом ВАЧС Odintsovo 02/14 (с. 73).

10. Клинические признаки и патологоанатомические изменения у поросят, заражённых вирусом АЧС изолята Odintsovo 02/14 (с. 75).

11. Сравнительный анализ уровня накопления вируса АЧС изолята Odintsovo 02/14 в первичных культурах клеток (n=3) (с. 81).

12. Изменение титра вируса в вируссодержащей суспензии после процедуры «замораживания - оттаивания» (n=3) (с. 82).

13. Определение титра вируса АЧС после фракционирования в градиенте плотности сахарозы (n=3) (с. 84).

14. Соотношение коэффициентов поглощения для ДНК вируса АЧС при её выделении из различных источников (с. 87).

15. Сравнительный анализ нуклеотидных последовательностей геномов изолятов Kashino 04/13 и Georgia 2007/1 (с. 91).

16. Изменения нуклеотидной последовательности генов изолята Kashino 04/13 (с. 92).

17. Сравнительный анализ нуклеотидных последовательностей геномов изолятов Odintsovo 02/14 и Georgia 2007/1 (с. 94).

18. Изменения нуклеотидной последовательности генов изолята Odintsovo 02/14 (с. 95).

19. Наличие встройки в интергенном регионе I73R/I329L у изолятов 2007-2015 гг. (с. 100).

20. Наличие встройки в интергенном регионе 9R/10R у изолятов 2007-2015 гг. (с. 102).