β-ксилозидаза из Aspergillus awamori: свойства и использование в ферментативном синтезе тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.00.04, кандидат биологических наук Энейская, Елена Владимировна

  • Энейская, Елена Владимировна
  • кандидат биологических науккандидат биологических наук
  • 2006, Гатчина
  • Специальность ВАК РФ03.00.04
  • Количество страниц 107
Энейская, Елена Владимировна. β-ксилозидаза из Aspergillus awamori: свойства и использование в ферментативном синтезе: дис. кандидат биологических наук: 03.00.04 - Биохимия. Гатчина. 2006. 107 с.

Оглавление диссертации кандидат биологических наук Энейская, Елена Владимировна

ОГЛАВЛЕНИЕ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

1. ВВЕДЕНИЕ

1.1. Актуальность проблемы

1.2. Цели и задачи исследования

1.3. Основные положения, выносимые на защиту

1.4. Научная новизна полученных результатов

1.5. Теоретическое и практическое значение работы

1.6. Апробация работы

2. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

2.1. Гликозидгидролазы, механизм действия

2.2. Ксиланы - природные субстраты Р-ксилозидаз

2.3. р-Ксилозидазы микроорганизмов, физико-химические 23 характеристики

2.4. Структурно-функциональные исследования Р-ксилозидаз

2.5. Трансгликозилирование, ферментативный синтез 33 гликоконьюгатов

3. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

3.1. Субстраты для измерения ферментативной активности

3.2. Методы измерения ферментативной активности

3.3. Выделение Р-ксилозидазы из мицелиального гриба Aspergillus 40 awamori

3.4. Выделение Р-ксиланазы из мицелиального гриба Trichoderma 42 reesei (семейство 11)

3.5. Выделение Р-ксиланазы из мицелиального гриба Aspergillus orizae (семейство 10)

3.6. Методы определение чистоты и молекулярной массы 43 ферментов

3.7. Методы определения частичной аминокислотной 43 последовательности Р-ксилозидазы

3.8. Методы исследования физико-химических свойств (3- 44 ксилозидазы

3.9. Методы определения кинетических характеристик и констант 46 ингибирования реакций гидролиза, катализируемых ферментами

ЗЛО. Определение стереохимии ферментативного гидролиза рксилозидазы методом 'Н ЯМР спектроскопии

3.11. Исследование трансгликозилирующей активности (3- 48 ксилозидазы

3.12. Исследование влияния рН и концентрации и-НФК и МУФК2 49 на выход продуктов трансгликозилирования

3.13 Препаративный синтез «-НФК2.3 и МУФК3.

3.14. Препаративный синтез и-НФК4.

3.15. Характеристика структуры продуктов трансгликозилирования 51 методом ЯМР

3.16. Характеристика структуры продуктов трансгликозилирования 52 методом масс-спектрометрии

3.17. Исследование характера действия ксиланаз семейств 10 и 11 по 53 отношению к ферментативно синтезированным гс-НФК2-б и МУФК2

4. | РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ

4.1. Выделение и физико-химические свойства Р-ксилозидазы из 54 мицелиального гриба Aspergillus awamori

4.2. Исследование первичной структуры р-ксилозидазы 57 4.3.Определение констант ионизации каталитических групп Р- 59 ксилозидазы

4.4. Исследование стереохимии гидролиза и характера действия |3- 60 ксилозидазы

4.5. Исследование трансгликозилирующей активности р~ 62 ксилозидазы

4.6. Характеристика структуры продуктов трансгликозилирования 69 методами ЯМР и масс-спектрометрии

4.7. Анализ кинетических характеристик реакции гидролиза, 77 катализируемой {З-ксилозидазой

4.8. Анализ констант ингибирования реакции гидролиза, 82 катализируемой (З-ксилозидазой

4.9. Исследование продуктов реакции трансгликозилирования, 84 катализируемой изучаемой [З-ксилозидазой из мицелиального гриба Aspergillus awamori, в качестве субстратов для эндо-ксиланаз семейств 10 и

5. ВЫВОДЫ

6. Список опубликованных по теме работ

7. БЛАГОДАРНОСТИ

Рекомендованный список диссертаций по специальности «Биохимия», 03.00.04 шифр ВАК

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «β-ксилозидаза из Aspergillus awamori: свойства и использование в ферментативном синтезе»

1.1. Актуальность проблемы Углеводы играют существенную роль в мириадах биологических структур, процессов. Офомное количество различных олигосахаридных обнаруженных в природе, происходит из рациональной организации ферментативного образования и разрыва гликозидных связей. Гликозидная связь является одной из наиболее прочных связей, существующих в природе. Период ее естественного распада составляет более 5 миллионов лет. Гликозидгидролазы ферменты, способные ускорить гидролиз гликозидной связи более чем в 10 раз, являются одними из наиболее эффективных из существующих катализаторов. Поэтому интерес к реакциям ферментативного гидролиза природных полимеров обусловлен не только фундаментальными, но и прикладными задачами. Ксилан основной структурный полисахарид клеток растений, зторой по распространенности после целлюлозы полисахарид в природе. Ксилан представляет собой полимер, состоящий, в основном, из цепей |3-Dостатков, соединенных 1-4-гликозидными связями ксилопиранозных Основными компонентами ксиланолитической системы, определяющими скорость гидролиза ксилана, являются два типа ферментов: эндо-ксиланазы (1,4-Р-В-ксиланогидролазы К.Ф. 3.2.1.8.), гидролизующие ксилан до коротких ксилоолигосахаридов, и Р-ксилозидазы (1,4-Р-В-ксилогидролазы К.Ф. 3.2.1.37), расщепляющие короткие ксилоолигосахариды до ксилозы и являющиеся ключевыми ферментами полной деградации ксилана (CoUinset al., 2005). Огромный интерес к изучению системы ферментов, участвующих в метаболизме этого полимера, связан с их широким применением в биотехнологии. Эти ферменты используют в целлюлозно-бумажной, текстильной и пищевой промышленности (Beg et ah, 2001). Ин1енсивное использование эндо-ксиланаз и Р-ксилозидаз в промышленном производстве постоянно стимулирует два основных направления исследований поиск новых источников ферментов и подробное изучение их ферментативных свойств, дающее возможность более эффективно использовать данные ферменты в биотехнологических процессах. Второе направление возможного использования гликозидгидролаз в биотехнологии основывается на том факте, что многие представители этого класса ферментов обладают не только гидролитической, но и трансгликозилирующей синтазной активностью, и способны осуществлять ферментативный синтез различных гликоконьюгатов. Одним из примеров применения трансгликозилирующей активности гликозидгидрола:[ является ферментативный синтез олигосахаридов, содержащих хромофорные или флуоресцентные группы (Zeng et al., 2000; Mala et al., в 1999). синтезе и для Гликозидгидролазы подобных являются эффективным их инструментом высокой олигосахаридов благодаря рода селективности используются стереоспецифичности. Такого субстраты исследований щирокого круга гликаназ (Honda et al., 2000), традиционный метод измерения ферментативной активности которых основывается на регистрации восстанавливающих концов олигосахаридов, образующихся в процессе гидролиза полимера. Данный метод имеет недостаточную чувствительность для детальных исследований ферментов, и использование таких полимерных субстратов активности гликаназ препятствует в связи со изучению сложностью трансгликозилирующей различия продуктов гидролиза и продуктов трансгликозилирования. Метод ферментативного синтеза различных гликоконьюгатов имеет неоспоримые преимущества в сравнении с органическим, который является гораздо более дорогостоящим, трудоемким и экологически вредным. На сегодняшний день описано более сотни различных экзо-гликозидаз, выделенных из широкого круга микроорганизмов и успешно применяемых в ферментативном синтезе новых биологически активных веществ. Получение данных о взаимосвязи строения активного центра ферментов и их способности к проведению трансгликозилирующей реакции, несомненно, важно, так как не только дает возможность эффективно использовать трансгликозидазы в ферментативном синтезе, но и позволяет получить новую информацию о механизме действия гликозидгидролаз в целом. В данной работе подробно изучены кинетические параметры физико-химические свойства, и трансгликозилирующая реакции гидролиза активность фермента Р-ксилозидазы из мицелиального гриба Aspergillus awamori, описан ферментативный синтез «ара-нитрофенил

Похожие диссертационные работы по специальности «Биохимия», 03.00.04 шифр ВАК

Заключение диссертации по теме «Биохимия», Энейская, Елена Владимировна

1. Р-Ксилозидаза, выделенная из мицелиального гриба Aspergilius awamori,

имеет молекулярную массу 250±5 кДа и состоит из двух одинаковых

субъединиц. На основании анализа аминокислотной последовательности

Р-ксилозидазы фермент классифицирован как представитель 3 семейства

гликозидгидролаз. 2. Р-Ксилозидаза катализирует реакцию гидролиза с сохранением

конфигурации при аномерном центре гликоновой части субстрата, р Ксилозидаза является экзо-действующей гликозидгидролазой. 3. Р-Ксилозидаза катализирует реакцию трансгликозилирования. Продукты

реакции трансгликозилирования представляют по своей структуре

линейные Р-1-4- ксилоолигосахариды со степенью полимеризации 2 - 6 . 4. Анализ значений каталитической эффективности (^са/^м) реакций

гидролиза ксилоолигосахаридов со степенью полимеризации 2 - 6 ,

катализируемых Р-ксилозидазой, и констант ингибирования реакции

гидролиза позволяет предположить наличие только одного сайта

щ связывания для гликонового остатка и одного сайта связывания для

агликона в активном центре фермента. 5. Специфичные хромофорные и флуоресцентные субстраты, полученные

методом ферментативного синтеза с помощью описанной в этой работе Р ксилозидазы из Aspergilius awamori, позволяют детально изучать субсайтную структуру и каталитические функции эндо- и экзо-ферментов,

способных гидролизовать ксилоолигосахариды. 6. Модифицированные ксилоолигосахариды со степенью полимеризации 2 и

3 являются эффективными субстратами для измерения ксиланазной

активности и могут быть использованы в промышленном производстве

ферментных ксиланазных препаратов и в биотехнологических процессах.7. Список опубликованных но теме работ

1. Родионова Н.А., Дубовая Н.В., Энейская Е.В., Мартинович Л,И.„ Грачева

И.М., Безбородов A.M. 2000. Очистка и характеристика эндо-1,4-Р ксиланазы из Geotrichum candidum ЗС. Прикладная биохимия и

микробиология, т. 36, JV» 5, с. 535-540. 2. Borriss R., Krah М., Brumer Н. 3rd., Kerzhner М.А., Ivanen D.R., Eneyskaya

E.V., Elyakova L.A., Shishlyannikov S.M., Shabalin K.A., Neustroev K.N. 2003. Enzymatic synthesis of 4-methylumbelliferyl (l-->3)-beta-D-

glucooligosaccharides-new substrates for beta-l,3-l,4-D-glucanase. Carbohydr. Res. 338(14): 1455-67. 3. Eneyskaya E.V., Brumer H. 3rd., Backinowsky L.V., Ivanen D.R.,

Kulminskaya A.A., Shabalin K.A., Neustroev K.N. 2003. Enzymatic synthesis

of beta-xylanase substrates: transglycosylation reactions of the beta-]<:ylosidase

from Aspergillus sp. Carbohydr Res. 338(4): 313-25. 4. Eneyskaya E.V., Ivanen D.R., Shabalin K.A., Kulminskaya A.A.,

Backinowsky L.V., Brumer Iii. H., Neustroev K.N. 2005. Chemo-enzymatic

synthesis of 4-methylumbeIliferyl beta-(l—>4)-D-xylooligosides: new

substrates for beta-D-xylanase assays. Org. Biomol. Chem. 3(1): 146-51. 5. Golubev A.M., Brandao Neto J.R., Eneyskaya E.V., Kulminskaya A.V.,

Kerzhner M.A., Neustroev K.N., Polikaфov I. 2000. Purification, crystallization and preliminary X-ray study of beta-xylosidase from

Trichoderma reesei. Acta Crystallogr. D. Biol. Crystallogr. 56 ( Pt 8): 1058-60. 6. Golubev A.M., Nagem R.A., Brandao Neto J.R., Neustroev K.N., Eneyskaya

E.V., Kulminskaya A.A., Shabalin K.A., Savel'ev A.N., РоИкафоу I .2004. Crystal structure of alpha-galactosidase from Trichoderma reesei and its

complex with galactose: implications for catalyticmechanism. J.Mol.Biol. 28;339(2): 413-22. 7. Rojas A.L., Fischer H., Eneyskaya E.V., Kulminskaya A.A., Shabalin K.A.,

Neustroev K.N., Craevich A.F., Golubev A.M., Polikaфov I. 2005. Structural

insights into the P-Xylosidase from Trichoderma reese obtained by

synchrotron small-angle x-ray scattering and circular dichroism spectroscopy. Biochemistry. [Epub ahead of print]

8. Savel'ev, A.N.; Ibatullin F.M., Eneyskaya E.V., Kachurin A.M., Neuslroev

F K.N., 1996. Enzymatic properties of a-D-galactosidase from Trichodeima

reesei. Carbohydrate Research 296: 261-273.БЛАГОДАРНОСТИ

Я хочу выразить особую благодарность своему научному

руководителю, безвременно погибшему к.б.н. Кириллу Николаевичу

Неустроеву за неоценимый опыт, переданный мне в процессе совместной

научной работы. Я выражаю благодарность всем сотрудникам лаборатории энзимологии

отделения молекулярной и радиационной биофизики ПИЯФ РАН за помощь

в работе над диссертацией. Особенно хочу поблагодарить к.б.н. Кульминскую А.А., Голубева A.M., к.б.н. Савельева А.Н. за критический

анализ ценные замечания в процессе подготовки диссертации. Я приношу благодарность нашим заграничным коллегам д-]зу Ниссе

Калкиннен (Финляндия) и д-ру Харри Брумеру (Швеция) за плодотворное

сотрудничество по теме данной работы и содействие в подготовке

щ публикаций. Работа выполнена при финансовой поддержке Программы

фундаментальных исследований «Молекулярная и клеточная биология»

Президиума РАН и Российского фонда фундаментальных исследований

(проекты 03-04-48756, 05-04-49216).

Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Энейская, Елена Владимировна, 2006 год

1. Родионова Н.А., Дубовая Н.В., Энейская Е.В., Мартинович Л.И.. Грачева ИМ., Безбородов A.M. 2

2. Очистка и характеристика эндо-1,4-Рксиланазы из Geotrichum candidum ЗС. Прикладная био>:имия и микробиология, т. 36, }к 5, с. 535-540.

3. Ajisaka К, Fujimoto Н, Miyasato М An alpha-L-fucosidase from Penicillium multicolor as a candidate enzyme for the synthesis of alpha (l->3)-linked fucosyl oligosaccharides by transglycosylation. Carbohydr. Res.- 1998.- V. 309, №1.-P. 125-9.

4. Allen J.D. Subsite mapping on enzymes: application to polysaccharide depolymerases. Methods Enzymol.- 1980.- V. 64,- P. 248-277.

5. Ashida H., Yamamoto K., Kumagai, H. 2

6. Enzymatic syntheses of T antigen-containing glycolipid mimicry using the transglycosylation activity of endo-a-N-acetylgalactosaminidase.Carbohydr. Res. 330: 487-493.

8. Purification and properties of an extracellular Pxylosidase from a newly Technology. 90: 33-38.

10. Synthesis of O-p-galactopyranosylL-serine derivatives using p-galactosidase in aqueous-organic reaction systems. J. Carbogydr. Chem. 18: 121-129. isolated Fusarium proliferatum. Bioresourse 95

11. Engineering of a glycosidase Family 7 cellobiohydrolase to more alkaline pH optimum: the pH behaviour of Trichoderma reesei Cel7A and its E223S/ A224H/L225V/T226A/D262G mutant. Biochem. J 356(Ptl): 19-30. 8. Beg Q.K., Kapoor M., Mahajan L., Hoondal G.S. 2

12. Microbial xylanases and their industrial applications: a review. 56(3-4): 326-38.

13. Belfaquih N., Penninckx M.J. 2000. A bifunctional beta-xylosidase-xylose isomerase from Streptomyces sp. EC

14. Enzyme Microb. Technol. 27(1-2): 114-121.

15. Biely P., Vrsanska M., Tenkanen M., Kluepfel D. 1

16. Endo-P-l-4-xylanase families: differences in catalytic properties. J. of Biotech. 57: 151-166.

17. Borriss R., Krah M., Brumer H. 3rd., Kerzhner M.A., Ivanen D.R., Eneyskaya E.V., Elyakova L.A., Shishlyannikov S.M., Shabalin K.A., Neustroev K.N. 2

18. Enzymatic synthesis of 4-methylumbelliferyl (1—>3)-beta-D- glucooligosaccharides-new substrates for beta-l,3-l,4-D-glucanase. Carbohydr. Res. 338(14): 1455-67.

19. Bravman Т., Mechaly A., Shulami S., Belakhov V., Baasov Т., Shoham G., Shoham Y. 2

20. Glutamic acid 160 is the acid-base catalyst of beta-xylosidase 96

21. Detailed kinetic analysis of a family 52 glycoside hydrolase: a beta-xylosidase from Geobacillus stearothermophilus. Biochemistry/. 42(35): 10528-36. H.Chanda S.K., Hirst E.L., Jones J.K.N. 1950. The constitution of xylan from 4 esperanto grass. J. Chem. Soc. 50: 1287-1289.

23. Xylanases, xylanase families and extremophilic xylanases. FEMS Microbiol. Reviews 29: 3-23.

25. Carbohydrate-Active Enzymus server. (http://afmb.cnrs-mrs.fr/-pedro/CAZY/db.html).

26. Czjzek M., David A.B., Bravman Т., Shoham G., Henrissat )3., Shoham Y. 2

27. Enzyme-Substrate Complex Structures of a GH39 beta-Xylosidase from Geobacillus stearothermophilus. J. Mol. Biol. [Hpub ahead of print]

29. Hemicellulases, theiroccurrence, purification, properties and mode of action. Adv. Carbohydr. Chem. Biochem. 32:277-352.

30. Davies G.J., Wilson K.S., Henrissat B. 1

31. Nomenclature for sugar-binding subsites in glycoside hydrolases, Biochem. J. 321: 557-559. 97

32. Xylan isolated from the stalks of Nicotiana tabacum, Agric. Biol, Chem. 40: 359-354. 21,Enzyme Nomenclature: Recommendations of the Nomenclature Committee of the International Union of Biochemistry and Molecular Biology on the Nomenclature a Classification of Enzymes, San Diego: Academic Press; 1992. 862 p.

33. Finch P., Yoon J.H. 1997. The effects of organic solvents, on the synthesis of galactose disaccharides using P- galactosidases. Carbohydr. Res. 303: 339-345.

34. Fujimoto H., Isomura M., Ajisaka K. 1

35. Syntheses of Alkyl p-DMannopyranosides and P-1,4-Linked Oligosaccharides Using P-Maanosidase from Rhizopus niveus. Biosi. Biotech. Biochem. 61(1): 164-165.

36. Garcia-Campayo V., Wood T.M. 1993 Purification and characterization of Pxylosidase from the anaerobic rumen fungus Neomallistrix frontalis Neomallistrix frontalis. Carbohyd. Res. 242: 229-245.

37. Golubev A.M., Brandao Neto J.R., Eneyskaya E.V., Kulminskaya Kerzhner M.A., and Neustroev K.N., РоИкафОУ I. study of 2000. A.V., Purification, from crystallization preliminary X-ray beta-xylosidase Trichoderma reesei. Acta Crystallogr. D. Biol. Crystallogr. 56 Pt 8): 1058-60.

38. Golubev A.M., Nagem R.A., Brandao Neto J.R., Neustroev K.N., Bneyskaya E.V., Kulminskaya A.A., Shabalin K.A., Savelev A.N., РоИкафОУ I .2

39. Crystal structure of alpha-galactosidase from Trichoderma reesei and its 98

40. Hayashi S., Ohno Т., Ito M., Yokoi H. 2

41. Purification and properties of the cell-associated beta-xylosidase from Aureobasidium. J. Ind. Microbiol. Biotechnol. 26(5):276-279.

42. Herrmann M.C., Vrsanska M., Jurickova M., Hirsch J., Biely P., Kubicek C.P. 1997. The P-D-xylosidase of Trichoderma reesi is multifunctional (i-D-xylan xylohydrolase. Biochem. J. 321: 375-381.

43. Interpretation of dependency of rate parameters on the degree of polymerization of substrate in enzyme-catalyzed reactions. Evaluation of subsite affinities of exo-enzyme. Biochem. Biophys. Res. Commun. 40: 1-6.

44. Hiromi K., Nitta Y., Numata C Ono S. 1

45. Subsite affinities of glucoamylase: examination of the validity of the subsite theory. Biochim. Biophys. Acta. 302: 362-375.

46. Honda Y., Tanimori S., Kirihata M., Kaneko S., Tokuyasu K., Hashimoto M, Watanabe Т., Fukamizo T. 2

47. Kinetic analysis of the reaction catalyzed by chitinase Al from Bacillus circulans WL-12 toward the novel substrates, partially N-deacetylated 476(3): 194-7.

49. Enzymatic-catalyzed synthesis of alkylglycosides in monophasic and biphasic systems. The reverse hydrolysis reaction. J. Biotech. 69: 145-149. 4-methylumbelliferylchitobiosides. FEBS. Lett. 99

50. High-efficiency synthesis of oligosaccharides with a truncated beta-galactosidase bifidum. Appl. Microbiol. Biotechnol. 57(5-6): 647-52.

51. Kaneko S., Kitaoka M., Kuno A., Hayashi K. 2000. methylumbelliferyl-beta-D-xylobioside xylobioside for sensitive and Syntheses of 4from Bifidobacterium 5-bromo-3-indolyl-beta-Dactivity on agar plates. detection of xylanase Biosci.Biotechnol.Biochem.64(4):741-5. 35.Kim Y., Lee S., Antony J. R., Warren В., Withers S.G. 2

52. Directed Evolution of a Glycosynthase from Agrobacterium sp. Increases Its Catalytic Activity Dramatically and Expands Its Substrate Repertoire. J. Biol. Chem. 279, Issue 41, 42787-42793.

53. Kitamoto N., Yoshino S., Ito M., Kimura Т., Ohmiya K., Tsukagoshi N. 1

54. Repression of the expression of genes encoding xylanolytic en2ymes in Aspergillus oryzae by introduction of multiple copies of the xynFl promoter. Appl. Microbiol. Biotechnol. 50(5): 558-63.

55. Kitpreechavanich characterization V., of Hayashi extracellular M., Nagai (B-xylosidase S. 1986. and Purification and from P-glucosidase Aspergillus fumigatus. Agric. Biol. Chem. 50 (7): 1703-1711.

57. Stereochemistry and the mechanism of enzymatic reactions. Biol. Revs. Cambridge. Phil. Soc. 28: 416-436.

59. Transglycosylation of p-Xylosidase from Aspergillus awamori K

60. Biosci. Biotechnol. Biochem. 61:20Ш-2014. 100

61. Characteristics of transxylosylation by beta-xylosidase from Aspergillus awamori K

62. Biochim Biophys Acta. [Epub ahead of print] 41,Laemmli U.K. 1

63. Clevage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage T

65. Lama L., Calandrelli V., Gambacorta A., Nicolaus B. 2

66. Purification and characterization of thermostable xylanase and P-xylosidase by thermophilic bacterium Bacillus thermantarcicus. Research in microbiology. 155: 283-289. 43.Li Y.K., Yao H.J., Pan I.H. 2

67. Mechanistic study of beta-xylosidase from Trichoderma koningii G-39. J. Biochem. (Tokyo). 127(2): 315-20.

68. Luthi E., Love D.R., McAnulty J., Wallace C Caughey P.A., Saal D., Bergquist P.L. 1

69. Cloning, sequence analysis and expression of genes encoding xyIandegrading enzymes from the thermophile Caldocellum saccharolyticum. Appl. Environ Microbiol. 56: 1017-1024.

70. Mackenzie L.F., Wang O., Antony R., Warren J., Withers S.G. 1

71. Glycosynthases: Mutant Glycosidases for Oligosaccharide Synthesis. J. Am. Chem. Soc. 120(22): 5583 5584.

72. Mala S., Dvorakova H., Hrabal R., Kralova B. 1

73. Towards regioselective synthesis of a-glucosidases with different substrate specificity. Carbohydr. Res. 322:209-218. 47.Man Peij N.N., Brinkmann J., Vrsanska M., Visser J., de Graaff L.H. 1997. beta-Xylosidase activity, encoded by xlnD, is essential for complete hydrolysis 101

74. Manzanares P., Ramon D., Querol A. 1

75. Screening of non-Saccharomyces wine yeasts for the production of beta-D-xylosidase activity. Int. J. Food Microbiol. 46(2): 105-12.

76. Matsumura S., Sakiyama K., Toshima K. 1

77. Preparation of oi:tyl P-Dxylobioside and xyloside by xylanase- catalyzed direct transglycosylation reaction of xylan and octanol. Biotech. Let. 21: 17-22. 45O.McCarter J.D., Withers S.G. 1

78. Mechanisms of enzymatic glycosidase hydrolysis. Curr. Opin. Struct. Biol. 4: 885-892. 5LMurata Т., Hattori Т., Amarume S., Koichi A., Usui T. 2

79. Kinetic studies on endo-beta-galactosidase by a novel colorimetric assay and synthesis of Nacetyllactosamine-repeating oligosaccharide beta-glycosides using its transglycosylation activity. Eur. J. Biochem. 270(18): 3709-19. 52.0kuyama M., Mori H., Watanabe K., Kimura A., Chiba S. 2

80. Alphaglucosidase mutant catalyzes "alpha-glycosynthase"-type reaction. Biosci. Biotechnol.Biochem.66(4):928-933.

82. Enzyme-catalyzed synthesis of alkyl-|3-glucosides in a wayer-alcogol two-phase system. Biores. Technol. 77: 157-161.

83. Petzelbauer I., Reiter A., Splechtna В., Kosma P., Nidetzky B. 2

84. Transgalactosylation by thermostable beta-glycosidases from Pyrococcus furiosus and Sulfolobus solfataricus. Binding interactions of nucleophiles with 102

86. Chemistry of hemicelluloses: relationchip between hemicellulose structure and enzyme required for hydrolysis. Portland Press, London, 1-28.

87. Rizzatti A.C., Sandrim V.C.,. Jorge J.A., Terenzi H.F., Polizeli Mde L. 2

88. Influence of temperature on the properties of the xylanolytic enzymes of the thermotolerant fungus Aspergillus phoenicis. J. Ind. Microbiol. Biotechnol. 31(2): 88-93.

89. Rizzatti A.C., Jorge J.A., Terenzi H.F., Rechia C.G., Polizeli M.L. 2

90. Purification and properties of a thermostable extracellular beta-D-xylosidase produced by a thermotolerant Aspergillus phoenicis. J. Ind. Microbiol. Biotechnol. 26(3): 156-60.

91. Rojas A.L., Fischer H., Eneyskaya E.V., Kulminskaya A.A., Shabalin K.A., Neustroev K.N., Craevich A.F., Golubev A.M., РоИкафОУ I. 2

92. Structural insights into the P-Xylosidase from Trichoderma reese obtained by synchrotron small-angle x-ray scattering and circular dichroism spectroscopy. Biochemistry. .44: 15578-15584. 103

93. Xylanase from a newly isolated Fusarium verticillioides capable of utilizing com fiber xylan. Appl. Microbiol. Biotechnol. 56(f!-6):7626. 6O.Saha B.C. 2

94. Purification and characterization of an extracellular betaxylosidase from a newly isolated Fusarium verticillioides. J. Ind. Microbiol. Biotechnol. 27(4): 241-5.

95. Saverev, A.N.; Ibatullin F.M., Eneyskaya E.V., Kachurin A.M., Neustroev K.N., 1

96. Enzymatic properties of a-D-galactosidase from Trichoderma reesei. Carbohydrate Research 296: 261-273.

97. Shallom D., Leon M., Bravman Т., Ben-David A., Zaide G., Belakhov V., Shoham G., Schomburg D., Baasov Т., Shoham Y. 2

98. Biochemical characterization and identification of the catalytic residues of a family 43 betaD-xylosidase from Geobacillus stearothermophilus T-

99. Biochemistry. 2005. At» 44(1): 387-97.

100. Shinoyama, H., A. Ando, T. Fujii, and T. Yasui. 1991. The possibility enzymatic synthesis of a variety of ofAspergillus of P-xylosides using the transfer reaction niger P-xylosidase. Agric. Biol. Chem. 55: 849-850. of beta-xylosidase by yeast Cry]3tococcus

101. Purification podzolinus. Bioorg. Khim. 26(8): 613-616.

103. Catalytic mechanism of enzymic glycosyl transfer. Chem. Rev. 90: 1171-1202.

104. Somogyi M. 1952 Notes on sugar determination. J. Biol. Chem. 195: 19-23 104

105. Comparative study of new alpha-galactosidases in transglycosylation reactions, (arbohydr Res. 2000. 329(1): 65-73

106. Tuohy M.G., Puls J., Claeysens M., Vrsanska M., Couglan M.P. 1993. The xylan- degrading enzyme system of Talaromyces emersonii: novel enzymes with activity against aryl P-D-xylosides and unsubstituted xylans. 1993 Biochem.J. 290: 515-523. 69.Utt E.A., Eddy C.K., Keshav K.F., Ingram L.O. 1

107. Sequencing and expression of the Butyrivibrio fibrisolvens xylB gene encoding a novel bifunctional protein with P-D-xylosidase and a-arabinofuronasidase activites. Ap[)l. Environ Microbiol. 57: 1227-1234.

108. Vocadlo D.J., Davies G.J., Laine R., Withers S.G. 2

109. Catalysis by hen eggwhite lysozyme proceeds via a covalent intermediate. Nature. 412(6849): 8358.

110. Vocadlo D.J., MacKenzie L.F., He S., Zeikus G.J., Withers S.G. 1

111. Identification of glu-277 as the catalytic nucleophile of Thermoanaerobacterium saccharolyticum beta-xylosidase using electrospray MS. Biochem. J. 335 Pt 2): 449-55.

112. Vocadlo D.J., Wicki J., Rupitz K., Withers S.G. 2

113. Mechanism of Thermoanaerobacterium saccharolyticum Thermoanaerobacterium saccharolyticum beta-xylosidase: kinetic studies. Biochemistry. 41(31): 9727-35. 105

114. Production of beta-xylanase and beta-xylosidase by the extremely halophilic archaeon Halorhabdus utahensis. Extremophiles. 7(2): 87-93.

116. Agrobacterium tumefaciens betaglucosidase is also an effective beta-xylosidase, and has a high transglycosylation activity in the presence of alcohols. Biochim. Biophys .Acta. ll;1385(l):78-88.

117. Wattiez R., Hermans C Cruyt C Bernard A., Falmagne P. 2

118. Human bronchoalveolar lavage fluid protein two-dimensional database: study of interstitial lung diseases. Electrophoresis 21: 2703-2712.

120. Hemicelluloses. The carbohydrates. ACADEMIC Press, New york. 447-469.

121. Williams S.J., Stephen G., Withers. 1

122. Glycosil fluorides in enzymatic reactions. Carbohydrate Res. 327: 27-46.

123. Wong K.K.Y., Tan L.U.L., Saddler J.N. 1

124. Multiplicity of beta-1,4-xyIanase in microorganisms: functions and applications. Microbiol. Rev. 52(3): 305-317. 79.Xue Y., Shao W. 2

125. Expression and characterization of a thermostable betaxylosidase from the hyperthermophile, Thermotoga maritima. Biotechnol. Lett. 26(19): 151 l-15Yanai Т., Sato M. 2

126. Purification and characterization of an beta-D-xylosidase from Candida utilis IFO 0

127. Biosci. Biotechnol. Biochem. 65(3): 527-33. 106

128. Chemoenzymatic synthesis of a novel glycopeptide using a microbial endoglycosidase. Carbohydr. Res. 305: 415-422.

130. Purification and characterization of an beta-D-xylosidase from Candida utilis IFO 0

131. Biosci Biotechnol Biochem. 65(3): 527-33.

132. Yang J.K., Yoon H.J., Ahn H.J., Lee B.I., Pedelacq J.D., Liong E.C., Berendzen J., Laivenieks M., Vieille C Zeikus G.J., Vocadlo D.J., Withers S.G., Suh S.W. 2

133. Crystal structure of beta-D-xylosidase from Thermoanaerobacterium saccharolyticum, a family 39 glycoside hydrolase. J. Mol. Biol. 335(1): 155-65.

134. Zeng X., Yoshino R., Murata Т., Ajisaka K., Usui T. 2

135. Regioselective synthesis of p-nitrophenyl glycosides of beta-D-galactopyranosyl-disaccharides by transglycosylation with beta-D-galactosidases. Carbohydr. Res. 325(2): 1201.31. 107

Обратите внимание, представленные выше научные тексты размещены для ознакомления и получены посредством распознавания оригинальных текстов диссертаций (OCR). В связи с чем, в них могут содержаться ошибки, связанные с несовершенством алгоритмов распознавания. В PDF файлах диссертаций и авторефератов, которые мы доставляем, подобных ошибок нет.