Антагонистические взаимоотношения в смешанных культурах метанотрофных бактерий: Цитофизиологические и биохимические аспекты тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.00.07, кандидат биологических наук Пашкова, Наталья Игоревна
- Специальность ВАК РФ03.00.07
- Количество страниц 134
Оглавление диссертации кандидат биологических наук Пашкова, Наталья Игоревна
Содержание
стр.
Введение 5 Обзор литературы
Глава 1. Метанотрофные бактерии
1.1. Характеристика метанотрофных бактерий
1.2. Роль метанотрофных бактерий в природе
1.3. Биотехнологичесий потенциал метанотрофов
1.4. Смешанные культуры метанотрофов 22 Глава 2. Взаимоотношения в сообществах микроорганизмов
2.1. Типы межпопуляционных взаимоотношений микроорганизмов
2.2. Роль межмикробных взаимодействий в функционировании популяций микроорганизмов
2.3. Внеклеточные вещества, участвующие в антагонистических взаимодействиях микроорганизмов
2.3.1. Антибиотики
2.3.2. Литические ферменты
2.3.3. Бактериоцины
Глава 3. Материалы и методы
3.1. Микроорганизмы и условия их культивирования
3.2. Получение суммарных экзометаболитов метанотрофных бактерий
3.3. Определение спектра бактериолитической активности Pseudomonas
sp.(ЛМ7)
3.4. Индуцированный автолиз клеток метанотрофных бактерий
3.5. Электронномикроскопические методы
3.6. Методы изучения динамики роста популяций
3.7. Определение влияния экзометаболитов метанотрофных бактерий
на рост тест-культур
3.8. Методы выделения и очистки литического комплекса, секретируемого Pseudomonas sp. (J1M7)
3.9. Определение литической активности
3.10. Определение протеолитической активности
3.11. Электрофорез в ПААГ
3.12. Выявление литической активности ферментов литического комплекса
с помощью электрофореза
3.13. Выявление протеолитической активности ферментов литического комплекса с помощью электрофореза
3.14. Идентификация белка-бактериоцина в геле после электрофореза культуральной жидкости Methylobacter bovis 98
3.15. Методы определения свойств антимикробных соединений
3.16. Определение содержания белка и углеводов
Результаты
Глава 4. Антагонистические взаимоотношения между метанотрофными бактериями
4.1. Изучение взаимоотношений между различными штаммами метанотрофных бактерий
4.2. Выявление природы вещества с ингибирующей активностью, секретируемого в культуральную жидкость Methylocystis minimus 33
Глава 5. Взаимоотношение метанотрофных и гетеротрофных бактерий: бактериолизис
5.1. Спектр литического действия Pseudomonas sp. (ЛМ7) в отношении метанотрофных бактерий
5.2. Межпопуляционные взаимоотношения в смешанных культурах метанотрофных и литических бактерий
5.3. Исследование литического комплекса, секретируемого Pseudomonas
sp. (Л М7)
5.4. Особенности процессов лизиса клеток метанотрофных бактерий под действием Pseudomonas sp.(HM7)
Обсуждение результатов
Выводы
Список литературы
114
Рекомендованный список диссертаций по специальности «Микробиология», 03.00.07 шифр ВАК
Фенотипическое разнообразие и функциональный потенциал метано- и метилотрофных бактерий семейства Beijerinckiaceae2009 год, кандидат биологических наук Воробьев, Алексей Викторович
Аэробное окисление метана в покрывающей почве полигона твердых бытовых отходов2007 год, кандидат биологических наук Каллистова, Анна Юрьевна
Ацидофильные метанотрофные бактерии2005 год, доктор биологических наук Дедыш, Светлана Николаевна
Новые умеренно галоалкалофильные и термофильные метанотрофы2006 год, кандидат биологических наук Ешинимаев, Булат Цыденжапович
Галоалкалофильные метанотрофы: Выделение и характеристика2000 год, кандидат биологических наук Калюжная, Марина Георгиевна
Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Антагонистические взаимоотношения в смешанных культурах метанотрофных бактерий: Цитофизиологические и биохимические аспекты»
Введение
Метанотрофные бактерии (метанотрофы) по ряду физиолого-биохимических свойств представляют собой уникальную группу микроорганизмов. Потребляя метан в качестве единственного источника углерода и энергии, они являются единственными известными представителями микробного мира, замыкающими углеродный цикл на уровне метана. Метанотрофы привлекают внимание исследователей в связи с важной экологической ролью. Обладая своеобразными биохимическими механизмами окисления метана и последующей его ассимиляцией, а также часто способностью к азотфиксации, метанотрофные бактерии активно участвуют в биосинтезе органического вещества на Земле. Они вносят значительный вклад в снижение "парникового эффекта" и следовательно, принимают участие в формировании климата планеты (Hanson, 1992).
Кроме того, метанотрофы обладают большим биотехнологическим потенциалом как продуценты белка, полисахаридов, поли-(3-гидроксибутирата, применяются для снижения метанообильности угольных шахт. Этим микроорганизмам свойственна биокаталитическая способность к трансформации широкого перечня органических соединений, что позволяет использовать их для ремедиации загрязнённых экосистем (Alvarez-Cohen, 1993; Hanson & Hanson, 1996).
В последние годы одним из важнейших направлений микробиологии является исследование взаимоотношений между организмами в сообществах. Ранее микробиологи концентрировали внимание на выделении и изучении чистых культур микроорганизмов, хотя в природе они в большинстве случаев обитают в многовидовых сообществах. Взаимодействия между компонентами таких сообществ сложны и многообразны. Ещё начиная с работ Л.Пастера внимание бактериологов привлекали явления активного угнетения одних микроорганизмов другими - процессы микробного антагонизма (Егоров, 1994). При изучении метаболических взаимодействий были обнаружены и охарактеризованы такие важные факторы регуляции микробных ассоциаций, как антибиотики, литические ферменты и бактериоцины. Кроме теоретического интереса исследования метаболических межмикробных взаимодействий постепенно приобрели и большое практическое значение.
Не являются исключением в этом отношениии и метанотрофные бактерии. Известно, что связанные с жизнедеятельностью метанотрофов природные и многие биотехнологические процессы осуществляются ассоциациями и смешанными культурами. С учётом этого исследования взаимоотношений метанотрофных бактерий между собой и с другими микроорганизмами приобретают особую важность. Для понимания процессов, происходящих в природных ассоциациях метанотрофных бактерий, а также для конструирования стабильных биотехнологически значимых консорциумов на основе метанотрофных культур, необходимо изучение антагонистических взаимодействий между различными представителями этой группы бактерий. Несмотря на обширные сведения о биологии метанотрофных бактерий, проблема межмикробных взаимоотношений в данной группе бактерий остаётся не изученной и затрагивается лишь в единичных работах. Так, Graham с соавторами (1993) показали конкурентные взаимоотношения между представителями I и II типов метанотрофов, были выявлены факторы, влияющие на конкуренцию. В нашей лаборатории впервые были начаты исследования метаболических взаимодействий между разными штаммами метанотрофов, в результате которых было обнаружено преобладание антагонистических взаимоотношений (Старостина с соавт., 1994).
К настоящему времени детально исследованы положительные взаимоотношения между метанотрофами и гетеротрофами. Метанотрофные бактерии в процессе жизнедеятельности выделяют в окружающую среду органические вещества, которые утилизируются гетеротрофами-спутниками, тем самым устраняется автоингибирование метанотрофных бактерий (Малашенко с соавт., 1978).
Тем не менее, наряду с положительным влиянием со стороны гетеротрофных спутников в метанокисляющих культурах нередко наблюдаются и явления антагонизма, приводящие к ингибированию роста, лизису метанотрофов. В результате возникающих между бактериями антагонистических взаимоотношений происходят срывы биотехнологических процессов культивирования. Так, из смешанной метанотрофной культуры Methylomonas meihanica 12 был выделен контаминант Pseudomonas sp. (ЛМ7), лизировавший клетки метанотрофов (Старостина с соавт., 1990). До начала настоящей работы не проводились систематические исследования взаимодействий негативного типа в смешанных культурах и ассоциациях метанотрофных бактерий.
Целью данной работы явилось изучение биохимических и цитофизиологических особенностей антагонистических взаимоотношений в смешанных культурах метанотрофных бактерий как между различными метанотрофными штаммами, так и между метанотрофами и гетеротрофами. В связи с этим были поставлены следующие задачи:
■ исследовать динамику межпопуляционных взаимодействий антагонистического типа в выбранных модельных системах "метанотроф + метанотроф" и "метанотрофные бактерии + гетеротрофные литические бактерии";
■ выявить природу антимикробных агентов, участвующих в исследуемых антагонистических взаимодействиях, и частично охарактеризовать их свойства.
Обзор литературы.
Похожие диссертационные работы по специальности «Микробиология», 03.00.07 шифр ВАК
Сравнительное изучение тонкого строения мембран и поверхностных структур метанотрофных бактерий1984 год, кандидат биологических наук Сузина, Наталья Егоровна
Разнообразие и функциональная активность метилотрофного сообщества гидротерм восточного побережья озера Байкал2009 год, кандидат биологических наук Зеленкина, Татьяна Савельевна
Характеристика антагонистической активности бактерий при межмикробных взаимодействиях2009 год, кандидат биологических наук Семёнов, Александр Васильевич
Метанотрофы источников кальдеры вулкана Узон, Камчатка2013 год, кандидат биологических наук Тихонова, Екатерина Николаевна
Выделение и характеристика сериновой протеиназы BACILLUS BREVIS, лизирующей клетки дрожжей CANDIDA UTILIS1984 год, кандидат биологических наук Калебина, Татьяна Сергеевна
Заключение диссертации по теме «Микробиология», Пашкова, Наталья Игоревна
Выводы.
1. Антагонистический характер взаимоотношений между различными метанотрофными бактериями обусловлен участием секреторных белков -бактериоцинов, продуцируемых некоторыми штаммами этих бактерий.
2. Идентифицированы и частично охарактеризованы бактериоцины метанотрофных культур Methylocystis minimus 33 и Methylobacter bovis 98, представляющие собой секреторные белки с молекулярной массой 8-кДа и 70-кДа, соответственно.
3. Изучен спектр бактерполитической активности культуры Pseudomonas sp. (JIM7) -гетеротрофного литического спутника метанотрофных бактерий. Выявлено, что подавляющее большинство исследованных метанотрофных штаммов в той или иной степени подвергались лизису. Степень лизиса метанотрофов I типа выше, чем II типа.
4. При исследовании динамики взаимодействующих популяций в двухкомпонентной культуре "метанотрофные бактерии + литические бактерии" обнаружено, что рост литических бактерий сопровождался лизисом чувствительных бактерий. При этом, литический процесс в клетках-мишенях начинался с деградации внутриклеточного содержимого.
5. В трёхкомпонентной культуре, включающей метанотрофы I типа, II типа и литические бактерии, популяция метанотрофных бактерий I типа подвергалась интенсивному лизису и почти полной элиминации из смешанной культуры.
6. Получен внеклеточный ферментный комплекс Pseudomonas sp. (ЛМ7), лизирующий метанотрофные бактерии, в состав которого входят, главным образом, литические протеиназы. Выделен и детально изучен наиболее активный компонент комплекса -литическая протеиназа IV, которая по свойствам является металлопротеиназой.
Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Пашкова, Наталья Игоревна, 1998 год
Список литературы
Бабусенко Е.С., Эль-Регистан Г.И., Градова Н.Б., Козлова АН., Осипов Г.А., Зайцев С.А. (1992) Исследование влияния внеклеточных метаболитов на развитие метанокисляющей культуры Methylococcus capsulatus. Т.28. В.5. С.752-759.
Бизюлявичус Г.С., Авиженис В.Ю., Кислухина О.В. (1976) Разделение ферментного комплекса лизосубтилина Г10х на компоненты. Микробиол.пром. № 8. С.12-14.
Борзенков И.А., Телитченко М.М., Милёхина Е.И., Беляев С.С., Иванов М.В. (1991) Метанокисляющие бактерии и их активность в пластовых водах нефтяных месторождений Татарской АССР. Микробиология. Т.60. С. 558-564.
Боровикова В.П., Аксёновская В.Е., Лавренова Г.И., Кислухина О.В., Калунянц К.А., Степанов В.М. (1980) Выделение и характеристика литического фермента из Bacillus subtilis 797. Биохимия. Т.45.Вып.8. С.1524-1533.
Ваксман З.А. (1947) Антагонизм микробов и антагонистические вещества. -Гос.изд.ин.лит., Москва.
Гальченко В.Ф., Абрамочкина Ф.Н., Безрукова Л.В., Соколова E.H., Иванов М.В. (1988) Видовой состав метанотрофной микрофлоры Чёрного моря. Микробиология. Т.57.Вып.2. С.305-312.
Гальченко В.Ф., Андреев Л.В., Троценко Ю.А. (1986) Таксономия и идентификация облигатных метанотрофных бактерий.- ОНТИ НЦБИ АН СССР, Пущино.
Гальченко В.Ф., Нестеров А.И. (1981) Нумерический анализ белковых электрофореграмм облигатных метанотрофных бактерий. Микробиология. Т.50. В.6. С.973-979.
Гаузе Г.Ф. (1959) Лекции по антибиотикам. - Медгиз, Москва.
Гаязов P.P., Старостина Н.Г., Сузина Н.Е., Мшенский Ю.Н. (1990) Влияние состава газовой фазы на рост и метаболизм Methylomonas methanica. Прикл.биохимия и микробиология. Т.26. С.520-525.
Герхардт И.Н. и др. (ред.) (1984) Методы общей бактериологии. Т.2,- Мир, Москва. С.295-296.
Глемжа A.A., Люджюс Л.Л., Петрова Л.И. (1985) Микробные ферменты в народном хозяйстве. - Мокслас, Вильнюс.
Гринберг Т.А., Дерябин В.В., Пирог Т.П., Малашенко Ю.Р. (1990) Микробный синтез экзополисахаридов на основе Сj - С2 - соединений. Прикл. биохимия и микробиология. Т.26. Вып.4. С.445-455.
Громов Б.В. (1985) Строение бактерий. - изд.ЛГУ , Ленинград.
Громов Б.В., Павленко Г.А. (1989) Экология бактерий. - изд. ЛГУ, Лениниград.
Даныш Т.В., Гайда A.B., Монастырский В.А. (1989) Определение протеиназ микроорганизмов с помощью азофибрина. Прикл. биохимия и микробиология. Т.25. С.715-720.
Дедыш С.Н., Паников Н.С. (1997) Влияние конг^ентрации метана на скорость его бактериального окисления. Микробиология. Т.66. № 4. С.563-568.
Дробот В.И. (1988) Использование нетрадиционного сырья в хлебопекарной промышленности. - Киев.
; Егоров Н.С. (1994) Основы учения об антибиотиках. - Высшая Школа , Москва. t Егоров Н.С., Ландау Н.С. (1982) Биосинтез биологически активных соединений смешанными культурами микроорганизмов. Прикл.биохимия и микробиология. Т. 18. Вып.6. С.835-849.
Заварзин Г.А. (1976) Экстенсивная микробиология. Изв.АН СССР. Сер.биол. 1976. № 1. С.121-134.
Заварзин Г.А. (1989) Микробное сообгцество в настоящем и прошлом. Микробиол.ж. Т.51. № 6. С.3-15.
Заварзин Г.А. (1997) Эмиссия метана с территории России. Микробиология. Т.66. С.669-673.
Захарова И Я., Павлова И.Н. (1985) Литические ферменты микроорганизмов.-Наукова Думка, Киев.
а Звягинцев Д.Г. (1986) Экологическая роль микробных метаболитов.- изд.МГУ , Москва.
Звягинцева И.С. (1981) Внеклеточные гидролазы грамотргщательных и грамположительных микроорганизмов. Успехи микробиол. Т. 16. С.81-103.
Зобнина В.П., Амиров Э.Я., Бабусенко Е.С., Бутова И.А., Тюрин B.C. (1987) Состав биоценозов в процессах на природном газе. В кн.: Биофизика микробных популяций. - Тезисы конфер., Красноярск, с. 73.
Иванова Т.И., Нестеров А.И. (1988) Образование органических экзометаболитов различными культурами облигатных метанотрофов. Микробиология. Т.57. Вып.4. С.600-605.
Квасников Е.И., Тиньянова Н.З. (1981) Литические свойства некоторых споровых термофильных бактерий. Микробиол.ж. Т.43. № 2. С.152-155.
Килочек Т.П., Бабенко Ю.С. (1992) Исследование роста, биохимических процессов и биосинтеза литических ферментов Streptomyces recifensis var. lyticus. Биотехнология. № 2. С. 10-13.
Кислухина О.В., Шевчук М.П. (1976) Бактериолитическое действие нейтральной протеиназы Bacillus subtilis. Микробиол.промышленность. №11. С. 10-12.
Кислухина О.В., Калунянц К.А., Аленова Д.Ж. (1990) Ферментативный лизис микроорганизмов.- Рауан, Алма-Ата. С.30-55; 133-138.
Кожевин П.А. (1989) Микробные популяции в природе. - изд. МГУ, Москва.
Красильников H.A. (1958) Антагонизм микробов и антибиотические вещества. - Москва.
Криштаб Г.П. (1986) Пути устранения действия ингибиторов синтеза биомассы на природном углеводородном газе. - Автореф. дис... к.б.н., Киев.
Крупянко В.И., Кудрявцева А.И., Валиахметов А Я., Северин А.И., Абрамочкин Г.В., Зякун A.M., Лысогорская E.H., Филиппова И.Ю., Кулаев И.С., Степанов В.М. 1989. Биохимия. Т.54. № 7. С. 1140 - 1149.
Кулаев И. С., Северин А. И., Абрамочкин Р. В. (1984) Бактериолитические ферменты микробного происхождения в биологии и медгщине. Вестн. АМН СССР. № 8. С.64-69.
Куприянова-Ашина Ф.Г., Колпаков А.И., Луцкая А.Ю., Эль-Регистан Г.И., Козлова А.Н., Дужа М.В. (1995) Действие мембранотропных физиологически активных веществ на рост культуры Saccharomyces cerevisiae. Микробиология. Т.64. № 5. С. 596-600.
Курдиш И.К., Кигель Н.Ф., Егоров О.В. (1991) Физиологическая активность метанотрофных бактерий при их взаимодействии с горными породами. Микробиол.ж. Т.53. № 1. С.92-98.
Ламбина В.А., Афиногенова A.A., Ромбай Пенабад С., Коновалова С.М., Андреев Л.В. (1983) Новый вид экзопаразитических бактерий рода Micavibrio, поражающий грамотрицателъные бактерии. Микробиология. Т.52. Вып.5. С.777-780.
в Ландау Н.С., Милованова И.И., Буяк Л.И., Лотова И.Б., Егоров Н.С. (1987) Роль микробного полисахарида в межпопуляционных взаимодействиях внутри модельной ассоциации бактерий. Микробиололгия. Т.23. С.64-70.
Ланчини Д., Паренти Ф. (1985) Антибиотики. - Мир, Москва. »Малашенко Ю.Р., Романовская В.А., Троценко Ю.А. (1978) Метанокисляющие микроорганизмы,- Наука, Москва.
Моносов Э.З., Нетрусов А.И. (1976) Локализация энергогенераторов у метанокисляющих бактерий. Микробиология. Т.45. С.598-601.
Мучник Ф.В., Малашенко Ю.Р., Соколов И.Т., Богаченко В.Н. (1981) Математическая модель трофических связей некоторых микробных ассоциаций, с. 6975. В кн.: Микробные сообщества и их функционирование в почве. - Киев.
Мякенький В.И., Курдиш И.К., Демченко В.Б., Петух А.П., Шмиголь A.B., Трунов Л.Ф. (1992) Эффективность микробиологического окисления метана в выработанных пространствах угольных шахт. Микробиол.ж. Т.54. № 1. С.67-73.
Намсараев Б.Б., Заварзин Т.А. (1972) Трофические связи в культуре, окисляющей метан. Микробиология. Т.41. Вып.6. С.999-1006.
Никитин Д.И., Никитина Э.С. (1978) Процессы самоочищения окружающей среды и паразитизм бактерий. - Наука, Москва.
Одум Ю. (1975) Основы экологии. - Мир, Москва.
Омельченко М.В., Васильева Л.В., Заварзин Г.А., Савельева Н.Д., Лысенко A.M., Митюшина Л.Л., Хмеленина В.Н., Троценко Ю.А. (1996) Новый психрофильный метанотрофpodaMethylobacter. Микробиология. Т.65. С.384-389.
Рой A.A., Кистень А.Г., Курдиш И.К. (1998) Физиологическая активность метанотрофов в смешанных культурах с типичными представителями микрофлоры угольных шахт. Микробиол.ж. Т.60. С.24-30.
Романовская В.А., Столяр С.М., Малашенко Ю.Р. (1991) Систематика метилотрофных бактерий. - Наукова Думка, Киев.
Романовская В.А., Титов А.Т., Харченко И.В., Угрюмова H.A. (1992) Взаимозависимость монокультур в микробных ассоциациях Methylococcus capsulatus и Frauteria aurantia. Микробиол.ж. Т.54. № 2. С.3-9.
Савельев Е.П., Петров Г.И. (1978) Молекулярные аспекты строения клеточной стенки бактерий. Успехи биол.химии.Т.19. С. 106-129.
Северина Л.О. (1995) Бактериальные S-слои. Микробиология. Т.64. № 6. С.725-
733.
Старостина Н.Г., Сузина Н.Е., Фихте Б.А. (1990) Лизис метанотрофных бактерий под действием бактериального контаминанта. Микробиология. Т.59. № 4. С.609 - 615.
Старостина Н.Г., Сузина Н.Е., Фихте Б.А. (1992) Цитологическое исследование литических процессов в смешанных популяциях метанотрофных бактерий. Микробиология. Т.61. С.223-231.
Старостина Н.Г., Пашкова H.H., Горкина Н.Б., Циоменко А.Б. (1994) Межмикробные взаимодействия среди метанотрофов. Микробиология. Т.63. С. 545552.
Старостина Н.Г., Кощаев А.Г., Ратнер E.H., Циоменко А.Б. (1997) Характеристика гидрофобности клеточной поверхности метанотрофных бактерий по их способности к адгезии на углеводородах. Микробиология. Т. 50. С.973-978.
Стейниер Р., Эдельберг Э., Ингрэм Дж. (1979) Мир микробов. Т. 1. - Мир, Москва.
Степная O.A., Северин А.И., Кудрявцева А.И., Крупянко В.И., Козловский А.Г., Кулаев И.С. (1992) Ферменты бактериолитического препарата лизоамидаза. Некоторые свойства бактериолитической протеиназы Л2. Прикл.биохимия и микробиол. Т.28. В.5. С.666-673.
Степная O.A., Бегунова Е.А., Цфасман И.М., Кулаев И.С. (1996) Бактериолитический ферментный препарат лизоамидаза. Выделение и определение некоторых физико-химических свойств внеклеточной мурамидазы бактерий рода Xanthomonas. Биохимия. Т.61. В.4. С.648-655.
Степная O.A., Бегунова Е.А., Цфасман И.М., Кулаев И.С. (1996) Бактериолитический ферментный препарат лизоамидаза. Очистка и некоторые свойства бактериолитической пептидазы Л1. Биохимия. Т.61. В.4. С.656-663.
Сузина Н.Е., Фихте Б.А. 1986. Улътраструктурная организация метанотрофных бактерий - ОНТИ НЦБИ АН СССР, Пущино.
Таусон Е.Л. (1986) Бактериолитические ферменты Pseudomonas lytica ВКМ В 1454Д. - Автореф. дис... к.б.н., Пущино.
Тирранен Л.С. (1989) Роль летучих метаболитов в межмикробном взаимодействии. - Наука, Новосибирск.
Филатова О.В., Симаров Б.В., Кучко В.В., Румянцева М.Л., Митрофанов В.Б. (1982) Получение протопластов у клубеньковых бактерий люцерны Rhizobium meliloti. Изв.Акад.Наук. Биология. №1. С. 140-143.
Франклин Т., Сноу Дж. (1984) Биохимия антимикробного действия. - Мир, Москва.
Хохлов A.C. (1988) Низкомолекулярные микробные ауторегуляторы. - Наука, Москва.
Хмеленина В.Н., Старостина Н.Г., Цветкова М.Г., Соколов А.П., Сузина Н.Е., Троценко Ю.А. (1996) Метанотрофные бактерии солёных водоёмов Украины и Тувы. Микробиология. Т.65. № 5. С.696-703.
Четина Е.В., Троценко Ю.А. (1984) Оценка перевариваемости биомассы метанотрофными бактериями. Прикл. биохимия и микробиология. Т.20. Вып.5. С.645-652.
Шишкина В.Н., Троценко Ю.А. (1986) Уровни ассимиляции углекислоты метанотрофными бактериями. Микробиология. Т.55. № 3. С.377-381.
Шишкина В.Н., Троценко Ю.А. (1988) Влияние глюкозы на рост и метаболизм облигатных метанотрофов. Микробиология. Т.57. № 6. С.917-922.
Шмакова З.Ф., Зенькович Н.С., Савельев Е.П. (1978) Литические ферменты, продуцируемые Actinomyces levoris. Микробиология. Т.47. С.479-484.
Щёкина Е.В., Григорьева С.П., Полумиенко А.Л. (1983) Получение клеточных лизатов дрожжей с целью выделения крупных фрагментов митохондриалъной ДНК. Прикл.биохим. и микробиол. Т. 19. В.2. С. 240-243.
Эль-Регистан Г.И., Бабаян T.JI. (1987) Явление автолиза у микроорганизмов: обзор информ. - ЦБНТИ Минмедбиопрома СССР. Вып.2, Москва.
Adamsen A.P.S., King G.M. (1993) Methane consumption in temperate and subarctic forest soils: rates, vertical zonation, and responses to water and nitrogen. Appl. Env. Microbiol. V.59. P.485-490.
Aoki K., Hatakyama S., Shinke R., Nishira H. (1985) Lytic enzyme toword aniline-assimilating Rhodococcus erythropolis AN-13: screening and production. Agric Biol. Chem. V.49. № 7. P.2003-2009.
Audy P., Grenier J., Asselin A. (1989) Lysozyme activity in animal extracts after sodium dodecyl sulfate - polyacrylamide gel electroforesis. Comp.Biochem.Physiol. V.92B. №3. P.523-527.
Alexander M. (1971) Microbial Ecology. Willey, New York, p.300-326.
Ali D., Lacroix C., Thuault D., Bourgeois C.M., Simard R.E. (1995) Characterization of diacetin B, a bacteriocin from Lactococcus lactis bv.diacetylactis UL720. Can. J.Microbiol. V.41. P.832-841.
Alllison G.E., Fremaux C., Klaenhammer T.R. (1994) Expansion of bacteriocin activity and host range upon complimentation of two peptides encoded within the lactacin F operon. J.Bacteriol. V.176. P.2235-2241.
Alvarez-Cohen L. (1993) Application of methanotrophic bacteria for the bioremediation of chlorinated organics. In: J.C.Murrell & H.P.Kelley (ed.), Microbial growth on Ci compounds. Intercept Press, Ltd., Andover, UK.
Anthony C. (1991) Assimilation of carbon in methylotrophs, p.79-100. In: Goldberg I.& Rokem J.S. (ed.), Biology of methylotrophs. Butterworth-Heinemann, Stoneham, Mass.
Ash K. (1996) Antibiotic resistence: the new apocalypse? Trends Microbiol. V.4. № 10. P.371-372.
Baquero F., Moreno F. (1984) The microcins (review). FEMS Microbiol.Lett. V.23. P.117-124.
» Behmlander R.M., Dworkin M. (1991) Extracellidar fibrils and contact-mediated cell interactions inMyxococcus xanthus. J. Bacteriol. V.173. P.7810-7821.
, Beppu T. (1992) Secondary metabolites as chemical signals for cellular differentiation. Gene. V.115. P.159-165.
* Berlutti F., Thaller M.C., Rossolini G.M., Pantanella F., Schippa S., Pezzi R. (1996) Production of bacteriolytic enzymes as a tool for characterizing enterococci. J. Appl. Bacteriol. V.80. P.447-452.
Best D.J., Higgins I.J. (1981) Methane oxidizing activity and membrane morphology in a methanol-grown obligate methanotroph, Methylosinus trichosporium OB3b. J.Gen.Microbiol. V.125. P.73-84.
Betina V. (1983) The chemistry and biology of antibiotics. - Elsevier scientific publishing company.
a Beveridge T.J., Makin S.A., Kadurugamuwa J.L , Li Z. (1997) Interaction between biofilms and the environment. FEMS Microbiol. Rev. V.20. P.291-303.
Bodrossy L., Holmes E.M., Holmes A.J., Kovacs K.L., Murrell J.C. (1997) Analysis of 16s rRNA and methane monooxygenase gene sequences reveals a novel group of thermotolerant and thermophilic methanotrophs, Methylocaldum gen. nov. Archiv. Microbiol. V. 168. P.493-503.
Bowman J.P., Sly L.I., Stackebrandt E. (1995) The phylogenetie position of the familyMethylococcciceae. Int.J. Syst.Bacteriol. V.45. P. 182-185.
Braun V., Pilsl H., Gross P. (1994) Colicins: structures, modes of action, transfer through membranes, and evolution. Arch. Microbiol. V. 161. P. 199-206.
Brusseau G.A., Bulygina E., Hanson R.S. (1994) Phylogenetie analysis and development of probes for differentiating me thy lo trophic bacteria. Appl. Env. Microbiol. V.60. P.626-636.
» Bull A.T. (1985) Mixed culture and mixed substrate systems. Compr.Biotechnol. V. 1. P.281-299.
Bull A.T., Slater J.H. (1982) Microbial interactions and community structure. - In: Microbial interactions and communities. - London.
Bulygina E.S., Chumakov K.M., Netrusov A.I. (1993) Systematics of Gram-negative methylotrophic bacteria based on 5S rRNA sequence, p.275-283. In: Murrell & Kelley D.P. (ed.). Microbial growth on Ci compounds. Intercept Press, Ltd., Andover, United Kingdom.
Cardy D.L.N, Laidler V., Salmond G.P.C., Murrell J.C. (1991) Molecular analysis of the methane monooxygenase (MMO) gene cluster of Methylosinus trichosporium OB3b. Mol.Microbiol. V.6. P.335-342.
Cavard D., Oudega B. (1992) General introduction to the secretion of bacteriocins, p.297-306. In: James R., Lazdunski C., Pattus F. Bacteriocins, Microcins and Lantibiotics. NATO ASI Series, V.65. Springer-Verlag Berlin Heidelberg.
Chan S.I., Nguyen H.-H.T., Shiemke A.K., Lidstrom M.E. (1993) Biochemical and biophysical studies towards characterization of the membrane-associated methane monooxygenase, p. 93-107. In: Murrell & Kelley D.P. (ed.). Microbial growth on Ci compounds. Intercept Press, Ltd., Andover, United Kingdom.
Chu K.N., Alvarezcohen L. (1996) Trichloroethylene degradation by methane-oxidizing cultures grown with various nitrogen-sourses. Water Env. Research. V.68. P.76-82.
Cowan D.A., Daniel R.M. (1982) Purification and some properties of an extracellular protease (caldolysin) from an extreme thermophile. Biochimica et Biophysica Acta. V.705. №3. P.293-305.
Dagley S. (1978) Determinants of biodegradability. Q. Rev. Biophys. V.ll. P. 577602.
Dalton H. (1980) Oxydation of hydrocarbons by methane monooxygenases from a variety of microbes. Adv. Appl. Microbiol. V.26. P.71-87.
Dalton H. (1992) Methane oxidation by methanotrophs: physiological and mechanistic implications, p.85-114. In: Murrel J.C., Dalton H.(ed.) Methane and methanol utilizers. Plenum Press, New York.
Dalton H., Mann N.H., Mc Pheat W. (1983) Problems associated with genetic analysis of methanotrophs. Ann. Microbiol. V.33. №3. P.3-7.
Davis B.J. (1964) Disk electrophoresis-II. Method and application to human serum proteins. Ann.N.Y.Acad. Sci. V.121. P.404-427.
Desai A.J., Dhala S.A. (1969) Purification and properties of proteoliyic enzymes from thermophilic actinomycetes. J.Bacteriology. V.100. №1. P. 149-155.
DiSpirito A.A., Gulledge J., Murrell J.C., Shiemke A.K., Lidstrom M.E., Krema C.L. (1992) Trichloroethylene oxydation by the membrane associated methane monooxygenase in type I, II, and type Xmethanotrophs. Biodégradation. V.2. P. 151-164.
Dolan M.E., McCarthy P.L. (1995) Methanotrophic chloroethene transformation capasities and 1,1-dichloroethene transformation product toxicity. Env. Sci. Technol. V.29. № 11. P.2741-2747
Ensley B.S. (1991) Biochemical diversity of trichloroethylene metabolism. Annu.Rev.Microbiol. V.45. P.283-299.
Eroshin Y.K., Harwood J.H., Pirt S.J. (1968) Influence of amino acids, carboxylic acids and sugars on the growth of Methylococcus capsidatus on methane. J.Appl.Bacteriology. V.31. P.560-567.
Fath M.J., Skvirsky R., Gilson L., Mahanty H., Kotler R. (1992) The secretion of colicin V, p.331-351. In: James R., Lazdunski C., Pattus F. Bacteriocins, Microcins and Lantibiotics. NATO ASI Series, V.65. Springer-Verlag Berlin Heidelberg.
Fennell D.E., Underhill S.E., Jewell W.J. (1992) Methanotrophic attached -film reactor development and biofilm characteristics. Biotech. Bioeng. V.40. P.1218-1232.
Foster S.J. (1992) Analysis of the autolysins of Bacillus subtilis 168 during vegetative growth and differentiation by using renaturingpolyacrilamide gel electroforesis . J.Bacteriol. V.174. №2. P.464-470.
Fox B.G., Borneman J.G., Wackett L.P., Lipscomb J.D. (1990) Haloalkene oxidation by the soluble methane monooxygenase from Methylosinus trichosporium OB3b: mechanistic and environmental implications. Biochemistry. V.29. P.6419-6427.
t Fredrickson A.G. (1977) Behavior of mixed cultures of microorganisms. Ann.Rev.Microbiol. V.31. P.63-87.
Fredrickson A.G., Stephanopoulos G. (1981) Microbial competition. Science. V.213. P.972-979.
Gerritse J., Visser J., Gottschal J.C. (1995) Complete degradation of tetrachloroethene by combining anaerobic dechlorinating and aerobic methanotrophic enrichment cultures. Appl. Microbiol. Biotechnol. V. 43. № 5. P.920-928.
Ghuysen J.M., Tipper D.J., Strominger J.L. (1966) Enzymes that degrade bacterial cell walls. Methods Enzymol. V.8. P.685-699.
Gonzalez-Pastor J.E., San Millan J.L., Moreno F. (1994) The smallest known gene. Nature. V.369. P.281.
Gorg A., Postel W., Weser J. (1987) Sci. Tools. V.32. P.5-9.
Graham D.W., Chaudhary J.A., Hanson R.S., Arnold R.G. (1993) Factors affecting competition between type I and type II methanotrophs in two-organism, continuous-flow reactors. Microb. Ecol. V.25. P. 1-17.
Grant W.D., Lesley L.R., Prosser B.A., Asher R.A. (1986) Production of bacteriolytic enzymes and degradation of bacteria by filamentous fungi. J.Gen. Microbiol. V.132. № 8. P.2353-2358.
Grant W.D., Prosser B.A., Wakefield St. J. (1991) Cytolysis of Bacillus subtilis by Fusarium oxysporum. J.Gen.Microbiol. V.134. № 2. P.287-291.
Green G., Dichs L.M.T., Bruggeman G., Vandamme E.J., and Chikindas M L. (1997) J. Appl.Microbiol. V.83. P. 127-132.
Griffin P. J., Fogarty W.M. (1973) Physicochemicalproperties of the native, zinc- end manganese-prepared me talloprotease of Bacillus polymyxa. Y.26. № 2. P. 191-195.
Guerrero R., Pedros-Alio C., Esteve I., Mas J., Chase D., Margulis L. (1986) Predatory prokaryotes: prédation and primary consumption evolved bacteria. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. V.83. P.2138-2142.
Hara S., Matsushima I. (1992) Studies on the substrate specifitcity of egg white lysozyme. IV. A comparative study of the substrate spesificities of lyzozyme from different sources. J.Biochem. V.72. P.993-1000.
Hanna ML., Taylor R.T. (1996) Attachment/detachment and trichloroethylene degradation-longevity of a resting cell Methylosinus trichosporium OB3b filter. Biotech. Bioeng. V.51. № 6. P.659-672.
Hanson R.S. (1980) Ecology and diversity of methanotrophic organisms. Adv. Appl. Microbiol. V.26. P.3-39.
Hanson R.S., Netrusov A.I., Tsuji K. (1991) The obligate methanotrophic bacteria Methylococcus, Methylomonas, Methylosinus and related bacteria, p.2350-2365. In: Balows A., Truper H.G., Dworkin M., Harder W., Schleifer K.H. (ed.), The prokaryotes. SpringerVerlag, New York.
Hanson R.S. (1992) Introduction, p. 1-22. In: Murrel J.C., Dalton H.(ed.) Methane and methanol utilizers. Plenum Press, New York.
> Hanson R.S., Bratina B.J., Brusseau G.A. (1993) Phylogeny and ecology of methylotrophic bacteria, p.283-302. In: Murrell J.C. & Kelly D.P. (ed.), Microbial growth on Ci compounds, UK.
, Hanson R.S., Hanson T.E. (1996) Methanotrophic bacteria. Microbiol.Rev. V.60. №2. P.439-471.
Harber C.L., Allen L.N., Zhao S., Hanson R.S. (1983) Methylotrophic bacteria: biochemical diversity and genetics. Science. V.221. P. 1147-1153.
Harkness R.E., Olschlager T. (1991) The biology of colicin M. FEMS Microbiol.Rev. V.88. P.27-42.
Hastings J.W., Sailer M., Johnson K., Roy K.L., Vederas J.C., Stiles M.E. (1991) Characterization of leucocin A-UAL 187 and cloning of the bacteriocin gene from Leuconostoc gelidium. J.Bacteriol. V.173. P.7491-7500.
Hayashi K., Kasumi T., Kubo N., Tsumura N. (1981) Purification and characterization of the lytic enzyme produced by Streptomyces rutgersensis H-46. Agr.Biol.Chem. V.45. № 10. P.2289-2300.
Hechard Y., Derijard D.B., Letellier F., Cenatiampo Y. (1992) Characterization and purification of mesentericin Y 105, and anti-Listeria bacteriocin from Leuconostoc mesenteroides. J. Gen. Microbiol. V.138. P.2725-2731.
Hernandez-Chico C., Mayo O., Vizan J.L., Lavina M., Moreno F. (1992) Uptake and mode of action of the peptide antibiotic microcin B17, p. 15-17. In: James R., Lazdunski C., Pattus F. Bacteriocins, Microcins and Lantibiotics. NATO ASI Series, V.65. Springer-Verlag Berlin Heidelberg.
Henderson J.T., Chopko A.L., Van Wassenaar P.D. (1992) Purification and primary structure of pediocin PA-1 produced by Pediococcus acidilactici PAC-1.0. Arch. Biochem. Biophys. V.295. P.5-12.
Higgins I.J., Best D.J., Hammond R.C. (1980) New findings in methane-utilizing bacteria highlight their importance in the biosphere and their commercial potential. Nature. V.286. № 5773. P.561-564.
Higgins I.J., Best D.J., Hammond R.C., Scott D. (1981) Methane - Oxidizing microorganisms. Microbiol.Rev. V.45. № 4. P.556-590.
Hinks R.P., Daneo-Moore L., Shockman G.D. (1978) J. Bacteriology. V. 133. № 2. P. 822-829.
Hollji N., Tomas A. (1975) Bioligical effects of lipoteichoic acids. J.Bacteriol. V.124.
P. 1023.
Holmes A.J., Owens N.P.J., Murrel J.C. (1996) Molecular analysis of enrichment cultures of marine methane oxidizing bacteria. J. Exp.Mar. Biol. Ecol. V.203. P.27-38.
Hou C.T., Patel R.N., Laskin A.I. (1980) Epoxidation and ketone formation by Ci -utilizing microbes. Adv. Appl. Microbol. V.26. P.41-69.
Hou C.T. (1984) Microbial utilization of gaseous alkanes. Ann. Reports on Fermentation Processes. V.7.
Hrsak D. (1995) Biodégradation of undecylbenzenesulphonate by mixed methane-oxidizing culture. Env. Pollution. V.89. P.285-292.
Hurst A. (1981) Nisin. Adv.Appl. Microbiol. V.27. P.85-123.
Jack R.W., Tagg J.R., Ray B. (1995) Bacteriocins of gi-am-positive bacteria. Microbiol.Rev. V.59. № 2. P. 171-200.
Jake K.S., Lazdunski C. (1992) Immunity to colicins, p. 163-170. In: James R., Lazdunski C., Pattus F. Bacteriocins, Microcins and Lantibiotics. NATO ASI Series, V.65. Springer-Verlag Berlin Heidelberg.
Joergenson L. (1985) Methane oxydation by Methylosinus trichosporium measured by membrane inlet mass spectrometry, p.287-294. In: Poole R.K., Dow C.S. (ed.) Microbial gas metabolism. New York, Academic.
Kalmokoff M.L., Teather R.M. (1997) Isolation and characterization of a bacteriocin (Butyrivibriocin AR10) from the ruminai anaerobe Butyrivibrio fibrisolvens AR10: evidance in support of the widespread occurrence of bacteriocin-like activity among ruminai isolates of B. fibrisolvens. Appl. Env. Microbiol. V.63. P.394-402.
Kanamoto T., Eifuku-Koreeda H., Inoue M. (1996) Isolation and properties of bacteriolytic enzyme-producing cocci from the human mouth. FEMS Micpobiol. Lett. V. 144. P.135-140.
King G.M. (1992) Ecological aspects of methane oxidation, a key determinant of global methane dynamics. Adv. Microb. Ecol. V.12. P.432-468.
King G.M. (1994) Associations of methanotrophs with the roots and rhizomes of aquatic vegetation. Appl. Env. Microbiol. Y.60. P.3220-3227.
Koh S.-C., Bowman J.P., Sayler G.S. (1993) Soluble methane monooxygenase production and trichloroethylene degradation by a type I methanotroph, Methylomonas methanica 68-1. Appl. Env. Microbiol. V. 59. P.960-967.
o Kaprelyants A.S., Kell D.B. (1996) Do bacteria need to communicate with each other for growth? Trends in Microbiol. V.4. № 6. P.237-242.
Konisky J. (1982) Colicins and other bacteriocins with established modes of action. Ann .Rev. Microbiol. Y.36. P. 125-144.
Klaenhammer T.R. (1993) Genetics of bacteriocins produced by lactic acid bacteria. FEMS Microbiol. Rev. V.12. P.39-86.
Lache M., Hearn W., Zyskind J., Tipper D., Strominger J. (1969) Specificity of a bacteriolytic enzyme from Pseudomonas aeruginosa. J.Bacteriology. V.100. №1. P.254-259.
Laemmli U.K. (1970) Cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage T4. Nature. V.227. P.680-685.
Lamb S.C., Garver J.C. (1980) Batch- and continuous culture studies of a methane-utilizing mixed culture. Biotech. Bioeng. V.22. № 10. P.2097-2118.
Leadbetter E.R., Foster J.W. (1958) Studies on some methane-utilizing bacteria. Arch. Microbiol. V.30. P.91-118.
Leduc M., Heijenoort J. (1980) Autolysis E.coli. J.Bacteriology. V.142. №1. P.52-59. Lee J. J., Fredrick J.F. (1987) Endocytobiology III. Annals of the New Jork Akademy of Sciences. V. 503. P.238-250.
Lelieveld J., Crutzem P. J., Bruhl C. (1993) Climate effects of atmospheric methane. Chemosphere. V.26. P.739-768.
Li E., Yousten A.A. (1975) Metalloprotease from Bacillus thuringiensis. Appl. Microbiol. V.30. № 3. P.354-361.
Lidstrom M.E., Connor M.E., Fulton C.L., Wopat A.S. (1983) Methylobacterium ethanolycum a syntrophic association of methylotrophic bacteria. J.Gen. Microbiol. V.129. P.3139-3148.
Lidstrom M.E., Wopat A.S. (1984) Plasmids in methanotrophic bacteria: isolation, characterization andDNA hybridization analysis. Arch. Microbiol. V.54. P.951-956.
Lidstrom M.E., Stirling D.I. (1990) Methylotrophs: genetics and commercial applications. Ann.Rev.Microbiol. V.44. P.27-58.
Lidstrom M.E. (1991) The aerobic methylotrophic bacteria, p.431-445. In Balows A., TruperH.G., DworkinM., Harder W., Schleifer K.-H. (ed.) The prokaryotes. Springer-Verlag, New York.
Lipscomb J.D. (1994) Biochemistry of the soluble methane monoxygenase. Ann. Rev. Microbiol. V.48. P.371-399.
Lowry O.H., Rosebrough N.J., Farr A.L., Randall R.J. (1951) Protein measurement with the Folin phenol reagent. J.Biol.Chem. V.193. P.265-275.
Magnuson R, Solomon J., Grossman A.D. (1994) Biochemical and genetic characterization of a competence pheromone from B. subtilis. Cell. V.77. P.207-216.
Mancinelli R.L. (1995) The regulation of methane oxydation in soil. Ann. Rev. Microbiol. V.49. P.581-605.
Masaki H., Yajima S., Akutsu-Koide A., Ohta T., Uozumi T. (1992) Immunity spesifity and evolution of the nuclease-type E colicins, p.379-395. In: James R., Lazdunski C., Pattus F. Bacteriocins, Microcins and Lantibiotics. NATO ASI Series, V.65. Springer-Verlag Berlin Heidelberg.
McDonald I.R., Uchiyama H., Kambe S., Yagi O., Murrell J.C. (1997) The soluble methane monooxygenase gene cluster of the trichloroethylene-degrading methanotroph Methylocystis sp. strainM. Appl. Env. Microbiol. V.63. № 5. P.1898-1904.
McFarland M.J., Vogel C.M., Spain J.C. (1992) Methanotrophic cometabolism of trichloroethylene (TCE) in a two stage bioreactor system. Water Res. V.26. P.259-265.
McKellar R.C., Cholette H. (1984) Synthesis of extracellular proteinase by Pseudomonas fluor escens under conditions of limiting carbon, nitrogen, and phosphate. Appl. Env. Microbiol. V.47. № 6. P. 1224-1227.
Meghrous J., Euloge P., Junelles A.M., Ballonque J., Petitdemange H. (1990) Screening of bifidobacterium strains for bacteriocin production. Biotech. Lett. V.12. P.575-580.
Moat A.G., Foster J.W. (1988) Microbial physiology.-New Jork: Wiley.
Mock M., Pugsley A.P. (1982) The BtuB group Colplasmids and homology between the colicins they encode. J.Bacteriol. V. 150. P. 1069-1076.
Moreno F., San Millan J.L., I. del Castillo, Gomez J.M., Rodriguez-Sainz M.C., Gonzalez-Pastor J.E., Diaz-Guerra L. (1992) Escherichia coli genes regulating the production of microcins MccB 17 and MccC7, p.3-13. In: James R., Lazdunski C., Pattus F. Bacteriocins, Microcins and Lantibiotics. NATO ASI Series, V.65. Springer-Yerlag Berlin Heidelberg.
Mosier A., Schimel D., Valentine D., Bronson K., Parton W. (1991) Methane and nitrous oxide fluxes in native, fertilized and cultivated grasslands. Nature. V.350. P.330-332.
Murao S., Takahara J. (1974) Enzymes lytic against Pseudomonas aeruginosa produced by Bacillus subtilis YT-25. Agric.Biol.Chemistry. V.38. №12. P.2305-2316.
Murrell J.C. (1992) Genetics and molecular biology of methanotrophs. FEMS Microbiol. Rev. V.88. P.233-248.
Nakajima T., Uchiyama H., Yagi O., Nakahara T. (1992) Purification and properties of a soluble methane monooxygenase from Methylocystis sp. M. Biosci. Biotech. Biochem. V.56. P.736-740.
Nes IF., Diep D.B., Havarstein L.S., Brurberg MB., Eijsink V., Holo H. (1996) Biosynthesis of bacteriocins in lactic acid bacteria. Antonie Van Leeuwenhoek. V.70. P. 113128.
Nissen-Meyer J., Holo H., Havarstein L.S., Sletten K., Nes I.F. (1992) A novel lactococcal bacteriocin whose activity depends on the complementary action of two peptides. J.Bacteriol. V.174. P.5686-5692.
Nissen-Meyer J., Nes I.F. (1997) Ribosomally synthesized antimicrobial peptides: their function, structure, biogenesis, and mechanism of action. Arch. Microbiol. V.167. P. 67-77.
Oldenhuis R., Vink R.L.J.M., Janssen D.B., Witholt B. (1989) Degradation of chlorinated aliphatic hydrocarbons by Methylosinus trichosporium OB3b expressing soluble methane monooxygenase. Appl. Env. Microbiol. V. 55. P.2819-2826.
Omel'chenko M.V., Vasilyeva L.V., Zavarzin G.A. (1993) Psychrophilic methanotroph from tundra soil. Curr. Microbiol. V.27. P.255-259.
Ostlie H.M., Vegarud G., Langsrud T. (1995) Autolysis of lactococci: detection of lytic enzymes by polyacrilamide gel electrophoresis and characterization in buffer systems. Appl.Env.Microbiol. V.61. № 10. P.3598-3603.
Patel R.N., Hou C.T., Laskin A.I., Felix A., Deleranko P. (1980) Microbial oxidation of gaseous hydrocarbons: production of secondary alcohols from corresponding n-alkanes by methane-utilizing bacteria. Appl.Envir.Microbiol. V.39. № 4. P.720-726.
Porzio M.A., Pearson A.M. (1975) Izolation of an extracellular neutral proteinase from Pseudomonasfragi. V.384. P.235-241.
Pridmore D., Rekhif N., Pittet A.-C., Suri B., Mollet B. (1996) Variacin, a new lantionine-containing bacteriocin produced by Micrococcus varians: comparison to lactacin 481 of Lactococcus lactis. Appl. Env. Microbiol. V.62. P.1799-1802.
Proctor H.M., Norris J.R., Ribbons D.W. (1969) Fine structure of methane-utilizing bacteria. J. Appl. Bacteriol. V.32. P.118-121.
Pugsley A.P. (1984, a) The ins and outs of colicins. Part I: Production, and translocation across membranes. Microbiol. Sci. Y.l.P.168-175.
Pugsley A.P. (1984, 6) The ins and outs of colicins. Part II: Lethal action, immunity and ecological implications. Microbiol. Sci. V.l. P. 203-205.
Rogers H.J. (1970) Bacterial growth and the cell envelope. - Bacterid.Rev. V.134. P. 194-214.
Rogers H.J., Forsberg C.W. (1971) Role of autolysins in the killing of bacteria by some bactericidal antibiotics. V.108. P.1235-1243.
Roslev P., King G.M. (1994) Survival and recovery of methanotrophic bacteria starved under oxic and anoxic conditions. Appl. Environ. Microbiol. V.60. P.2602-2908.
» Rozenzweig R.F., Adams J. (1994) Microbial adaptation to a changeable environment: cell-cell interactions mediate physiological and genetic differentiation. BioEssays. V.16. № 10. P.715-717.
Sahl H-G., Jack R.W., Bierbaum G. (1995) Biosynthesis and biological activities of lantibiotics with uniquepost-translational modifications. Eur.J.Biochem. V.230. P.827-853.
Salton M.R.J. (1957) The properties of lysozyme and its action on microorganisms. Bacterial. Rev. .V.21. P.82-99.
Scolari G.L., Vescovo M., Caravaggi L., Bottazzi V. (1993) Antagonistic activity of Lactobacillus strains. Ann.Microbiol. Enzymol. V.43. P.85-90.
Scott D., Brannan J., Higgins I.J. (1981) The effect of growth conditions on intracytoplasmic membranes and methane monooxygenase activities in Methylosinus trichosporium OB3b. J. Gen.Microbiol. V.125. P.63-72.
Siegers K., Entian K.-D. (1995) Genes involved in immunity to the lantibiotic nisin produced by Lactococcus lactis. Appl. Env. Micribiol. V.61.№ 3. P. 1082-1089.
Sohngen N.L. (1906) Uber bacterien, welche methan ab kohlenstoffnahrung and energiequelle gebrauchen. Parasitenkd. Infectionskr. Abt. 2. V.15. P.513-517.
Speitel G.E., Segar R.L. (1995) Cometabolism in biofilm reactors. Water Sci. Technol. V.31. № 1. P.215-225.
Strominger J.L.A, Ghuysen J.M. (1967) Mechanism of enzymatic bacteriolysis. Science. V.156. P.213-221.
Stolp H. (1988) Microbial ecology: organisms, habitats, activities. Cambridge University press. P. 183-214.
Sugai M., Akiyama T., Komatsuzawa H., Miyake J. (1990) Characterization of sodium dodecyl sulfate-stable Staphylococcus aureus bacteriolytic enzymes by polyacrylamide gel electrophoresis. ¿Bacterid. V.172. № 11. P.6494-6498.
Sugai M., Komatsuzawa H., Tomita Sh., Akiyama T., Miyake Y., Suginaka H. (1991) Detection of staphylococcal endo-[3-N-acetylglucosam i nidase using polyacrylamide gels. J. Microbiol. Methods. V.13. №1. P.ll-16.
Suzuki K., Uyeda M., Shibata M. (1985) Serratia marcescens-lytic enzymes produced by Micromonospora sp. strain №152. Agric.Biol.Chem. V.49. №6. P. 1719-1726.
, Swift S., Throup J.P., Williams P., Salmond G.P.C., Stewart G.S.A.B. (1996) Quorum sensing: a popidation-density component in the determination of bacterial phenotype. TiBS. V.21. № 6. P.214- 219.
Tagg J.R., Dajani A.S., Wannamaker L.W. (1976) Bacteriocins of gram-positive bacteria. Bacteriol.Rev. Y40. P.722-756.
Tahara T., Oshimura M., Umezawa C., Kanatani K. (1996) Isolation, partial characterization, and mode action of acidocin J1132, a two-component bacteriocin produced by Lactobacillus acidophilus JCM1132. Appl. Env. Microbiol. V.62. P.892-897.
Tomasz A., Waks S. (1975) Enzyme replacement in bacterium: phenotypic correction by the experimental introduction of the wild type enzyme into a live enzyme defective mutant Pneumococcus. Biochem.Biophys.Res.Com. V.65. P. 1311-1319.
Tominaga I.,Tsugisaka I. (1981) Investigation of the structure of Rhizopus delamar cell wall with lytic enzymes. Agric.Biol.Chem. V.45. No.6. P. 1569-1576.
Tichaczek P.S., Nissen-Meyer J., Nés IF., Vogel R.F., Hammes W.P. (1992) Characterization of the bacteriocin curvacin A from Lactobacillus curvatus LTH1174 and sakacin from L. sake LTH 673. Sys. Appl. Microbiol. V. 15. P.460-468.
Tschantz M.F., Bowman J.P., Donaldson T.L., Bienkowski P.R., Stronggunderson J.M., Palumbo A.V., Herbes S.E., Sayler G.S. (1995) Methanotrophic TCE biodégradation in a multistage bioreactor. Envir. Sci. Technol. V.29. № 8. P.2073-2082.
Tsien H.-C., Brusseau G.A., Wackett L.P., Hanson R.S. (1989) Biodégradation of trichloroethylene by Methylosinus trichosporium OB3b. Appl.Environ.Microbiol. V.55. P.3155-3161.
Tsien H.-C., Hanson R.S. (1992) Soluble methane monooxygenase component B gene probe for identification of methanotrophs that repidly degrade tri chlor oethylene. Appl. Env. Microbiol. V.58. P.953-960.
Uchiyama H., Oguri K, Yagi O., Kokufiita E. (1992) Trichloroethylene degradation by immobilized resting cells of Methylocystis sp. M in a gas solid bioreactor. Biotechnol. Lett. V.14. P.619-622.
Vary P.S., Johnson M.J. (1967) Cell yields of bacteria grown on methane. J. Appl. Microbiol. V. 15. P. 1473-1478.
Vecherskaya M.S., Galchenko V.F., Sokolova E.N., Samarkin V.A. (1993) Activity and species composition of aerobic methanotrophic communities in tundra soils. Curr. Microbiol. V.27. P.181-184.
Wang S.-L., Chang W.-T. (1997) Purification and characterization of two Afunctional chitinases/lysozymes extracellularly produced by Pseudomonas aeruginosa K-187 in a shrimp and crab shell powder medium. Appl.Env.Microbiol. V.63. № 2. P.380-386.
Ward DJ., Somkuti G.A. (1995) Characterization of a bacteriocin produced by Streptococcus thermophillus ST134. Appl. Microbiol. Biotechnol. V.43. P.330-335.
Wendlandt K.P., Brühl E. (1980) In: Abstr. 2nd Symp. Soc. Countries on Biotechnology, Leipzig, p. 113.
Whalen S.C., Reeburgh W.S. (1990) Consumption of atmospheric methane by tundra soils. Nature. V.346. P. 160-162.
s Wirth R., Muscholl A., Wanner G. (1996) The role of pheromones in bacterial interactions. Trends in Microbiol. V.4. № 3. P.96-103.
Whittenbury R. & Dalton H. (1981) The methylotrophic bacteria, p.894-902. In Starr M.P., Stolph H., Truper H.G., Balows A., Schlegel H.G. (ed.). The prokariotes. SpringerVerlag KG, Berlin.
Whittenbury R., Krieg N.R. (1984) Me thy lococcaceae f,dm. nov., p.256-262. In Krieg N.R., Holt J.G. (ed.). Bergey's manual of systematic bacteriology, v.l. The Williams & Wilkins Co., Baltimore.
Whittenbury R., Phillips K.S., Wilkinson J.G. (1970) Enrichment, isolation and some properties of methane utilizing bacteria. J.Gen.Microbiol. V.61. P.205-218.
Williams R.A. (1982) Genetic interactions between mixed microbial populations. London: Trans. Roy. Soc. B.297. № 1084. P.631.
Wodzinsky R.J. (1979) Introduction to extracellular enzymes: from the ribosome to the market place. II. Importance of extracellular enzymes. - Advan. Appl. Microbiol., ed. by D.Perelman. V.25. P. 1-6.
Wolf C.E., Gibbons W.R. (1996) Improved method for quantification of the bacteriocin nisin. J.Appl. Bacteriol. V.80. № 4. P.453-457.
Zusheng L.I., Clarke A.J., Beveridge T.J. (1996) A major autolysin of Pseudomonas aeruginosa: subcellular distribution, potential role in cell growth and division and secretion in surface membrane vesicles. J. Bacteriol. V.178. P.2479-2488.
Работа выполнена при частичной финансовой поддержке Российского фонда фундаментальных исследований (грант № 96-04-50298).
Выражаю большую благодарность д.б.н. А.Б. Циоменко и к.б.н. Н.Г. Старостиной за плодотворное руководство при выполнении работы. Искренне признательна к.б.н. Н.Б. Горкиной за сотрудничество при очистке литического комплекса, д.б.н. В.И. Крупянко за консультативную помощь при изучении свойств протеиназы IV. Спасибо Е.В. Михайлиной за техническую помощь при выполнении экспериментов, коллективу отдела биохимии микроорганизмов за моральную поддержку.
Обратите внимание, представленные выше научные тексты размещены для ознакомления и получены посредством распознавания оригинальных текстов диссертаций (OCR). В связи с чем, в них могут содержаться ошибки, связанные с несовершенством алгоритмов распознавания. В PDF файлах диссертаций и авторефератов, которые мы доставляем, подобных ошибок нет.