Анализ ассоциации одиночных замен нуклеотидов с признаками яйца домашней курицы тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.02.07, кандидат наук Баркова, Ольга Юрьевна

• Баркова, Ольга Юрьевна
• кандидат наук
• 2013

Оглавление диссертации кандидат наук Баркова, Ольга Юрьевна

СОДЕРЖАНИЕ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

ВВЕДЕНИЕ

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1.0рганизация генома домашней курицы

1.1.1 Особенности кариотипа

1.1.2. Особенности молекулярной организации генома

1.2. Эволюция образования специфических генов яйца

1.3.0бзор генов влияющих на образование яичной скорлупы домашней курицы

1.4. Поиск генов, оказывающих влияние на признаки качества

яиц у домашней курицы

1.4.1. Картирование (.ТГЬ, влияющих на качество яиц

1.4.2. Установление локализации ОТЬ 8Т53

1.4.3. Выявление критического интервала для 5т53

1.4.4. Анализ экспрессии генов-кандидатов признака толщина скорлупы яйца домашней курицы

1.4.5. Выявление аллельных вариантов последовательности С11523433 и изучение их влияния на признак толщина скорлупы домашней курицы

1.4.6. Перспективы развития исследований ОТЬ 8Т53

1.5.Роль комплексов конденсина I и кондепсина II в структурной и

функциональной организации хромосом

ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛ И МЕТОДЫ

2.1 Материал и методы

2.2. Дизайн олнгонуклеотидов-праймеров для амплификации областей гена С11523443, 2_1, 3_2 и последовательности Г814491030, находящимся гене МСАРв отвечающими за признаки яйца домашней курицы

2.3.Молекулярный анализ ¡п 8Шсо последовательности СЯ 523443

2.4. Генотипирование

ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ

3.1. Молекулярный анализ т вШсо последовательности С1*523443

3.2. Гснотипированнс линий УК-72, УК-73 и межлинейного гибрида СБ кур породы Род Айлснд

3.3. Описательная статистика породы Род Айленд признака толщина скорлупы

3.4. Дисперсионный анализ влияния генотипов на признаки яйца кур вКР 21

3.5. Дисперсионный анализ влияния генотипов на признаки яйца кур.

^14991030

ГЛАВА4.0БСУЖДЕНИЕ

4.1. Исследования, выявляющие ассоциацию гена не - ЭМС I комплекса конденсина, субъединицы С (]ЧСАРС) с признаками сельскохозяйственных животных

4.2. Идентификация рядом с последовательностью СИ523443 оказывающий сильное влияние на толщину яйца домашней курицы

4.3. Молекулярный анализ т бШсо последовательности СИ 523443

4.4. Влияние 21 на признаки яйца домашней курицы

4.5 Выявление однонуклеотидных полиморфных сайтов

4.6. Перспективы практического применения результатов исследования С>ТЬ хозяйственно-полезных признаков у домашней курицы

ВЫВОДЫ

ПРАКТИЧЕСКИЕ ПРЕДЛОЖЕНИЯ

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

AT - пара нуклеотидов аденин-тимин

ГЦ - пара нуклеотидов гуанин-цитозин

кДНК - комплементарная дезоксирибонуклеиновая кислота

мРНК - матричная рибонуклеиновая кислота

пг - пикограмм

п.н. - пара нуклеотидов

ПЦР - полимеразная цепная реакция

т.п.н. - тысяча пар нуклеотидов

сМ - сантиморган

ЭДТА - этилендиаминтетраацетат

ЯОР - район ядрышкового организатора

AW33 - масса белка в яйце на 33-й неделе жизни курицы-несушки

ВАС - искусственная бактериальная хромосома

BS А - бычий сывороточный альбумин

EST - экспрессирующаяся нуклеотидная последовательность

FISH - флуоресцентная гибридизация ДНК-ДНК in situ

FITC - флуоресциин-изотиоцианат

FLpter - фракционное расстояния от теломера короткого плеча

хромосомы (выражается в долях единицы)

GGA4 - хромосома курицы

GTP - гуанозин-трифосфат

HSA4 - хромосома человека

ORF - открытая рамка считывания

QTL - локус количественного признака

RBG - репликационная R-окраска хромосом

SDS - додецилсульфат натрия

БМ5 - локус однонуклеотидного полиморфомизма

8Т53 - толщина скорлупы яйца на 53-й неделе жизни курицы-

несушки

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Анализ ассоциации одиночных замен нуклеотидов с признаками яйца домашней курицы»

ВВЕДЕНИЕ

Актуальность проблемы. Идентификация генов, оказывающих влияние на проявление хозяйственно важных признаков, является одной из важнейших задач геномики сельскохозяйственных видов. Большинство таких признаков характеризуется широкой вариабельностью экспрессии генов, находящихся в определенных локусах, называемых QTL (quantitative trait loci -локусы количественных признаков) Эти локусы полиморфны и ассоциированы с вариациями фенотипических проявлений признаков, таких, как яйценоскость, вес тела и т. п- (Cheng H.H. et al., 1997). Характеристика районов хромосом, несущих QTL может быть применена в MAS (marker assisted selection - маркерная селекция) для увеличения эффективности селекции (Grisart В. et al., 2002).

В птицеводческой отрасли бой и трещины скорлупы яйца домашней курицы обуславливают значительные экономические потери (Hamilton, R. N. G. et al., 1979). Тонкая скорлупа увеличивает риск появления трещин, что в свою очередь приводит к бактериальному загрязнению яйц (Messens, W. et al., 2007). Полноценное развитие птичьего эмбриона напрямую зависит от крепкой скорлупы обеспечивающей механическую и антибактериальную защиту яйца, предотвращает от избыточной потери влаги и служит первоначальным источником кальция для развития скелета эмбриона птенца (Karlsson, О. et al., 2008). Таким образом, качество скорлупы яйца является важным критерием в разведении домашней курицы. Важнейшими экономическими показателями в птицеводстве также являются яйценоскость и масса яйца кур несушек.

В предшествующие годы проведен ряд экспериментов по позиционному клонированию района хромосомы 4 домашней курицы, содержащего QTL толщины скорлупы на 53 неделе жизни (ST53). Методом гибридологи-

ческого анализа косегрегации микросателлитных ДНК-маркеров и количественных признаков определены маркеры интервалов генетической карты (районов хромосом), контролирующих QTL ST53 (Wardecka et.al. 2003). С использованием баз данных компьютерной сети Интернет показана локализация количественного признака ST53 в пределах интервала, ограниченного микросателлитными локусами MCW0114 и ADL0241. Определены координаты тринадцати клонов, имеющих гомологию последовательностей ДНК вставки с микросателлитными локусами MCW0114 и ADL0241. Проверка клонов на предмет наличия искомой последовательности методом ПЦР с использованием праймеров для микросателлитных локусов MCW0114 и ADL0241 позволила установить соответствие девяти ВАС-клонов локусу MCW0114 и четырех В АС-клонов локусу ADL0241. Методом флуоресцентной гибридизации ДНК-ДНК in situ (FISH) установлена внутрихромосомная локализация ВАС-клонов, содержащих микросателлитные локусы. Установлено следующее положение микросателлитных маркеров локуса ST53 на GGA4 (хромосома курицы 4): MCW0114 - 17.834.202-17.834.699 п.н. и ADL0241 - 16.643.314-16.643.645 п.н. Полученный интервал величиной 1,2 млн.п.н. является критическим для признака ST53(Стекольникова и др. 2004).

Идентифицировано 20 генов, являющихся позиционными кандидатами для признака ST53. У кур неспециализированной породы польская зелепоио-гая были выявлены достоверные (Р < 0,01) двукратные различия между группами с тонкой и толстой скорлупой яйца по уровню экспрессии последовательности CR523443. Коэффициент корреляции между уровнем экспрессии этой последовательности и толщиной скорлупы составил 0,85 (Химанина и др. 2008.).

Получены последовательности 6 пар праймеров для амплификации последовательностей вне и внутри EST CR523443, удовлетворяющих условиям секвенирования. В результате с помощью секвепировапия этих областей выявлено 6 сайтов однонуклеотидного полиморфизма (SNP) в

пределах данной последовательности, из них 5 - вне CR523443 (S2_l, S3_l, S3_2, S3 3 и S3_4) и 1 — в внутри ее (S6_l). Для всех обнаруженных SNP выявлены сайты связывания транскрипционных факторов, присутствующие только в одном из аллельных вариантов, что дает основания считать их rSNP - регуляторными мононуклеотидными полиморфными сайтами. Методом ПЦР с использованием аллелеспецифических прайме-ров проведен анализ связи обнаруженных в представленной работе rSNP с толщиной скорлупы яйца у домашней курицы. Выявлены достоверные различия по частотам аллелей полиморфных сайтов ST2_1, ST3_1, ST3_2 и ST3_3 в группах кур породы род-айленд с толстой и тонкой скорлупой яйца. При проведении попарного сравнения влияния rSNP на толщину скорлупы яйца обнаружен аддитивный эффект в случаях пар ST2_1/ST3_1, ST2_1/ST3_2, ST2_1/ST3_3, ST2_1/ST6_1, ST3_1/ST3_2, ST3_1/ST6_1, ST3_2/ST3_3, ST3_2/ST6_1 и ST3_3/ST6_1 (Баркова О. Ю. и др. 2011).

В исследовании А. Волк и соавт. (Wolc A. et all. 2012) была использована математическая модель Bayes-B, для идентификации хромосомных районов, обуславливающих изменчивость веса яйца курицы. Генотипиро-вание осуществлялось с помощью SNP чипа 60К. Всего выявлено 24.425 SNP на поголовье 2900 кур. В результате проделанной работы, ими был выявлен мажорный QTL маркированный rs 14491030 на хромосоме 4, оказывающий сильное влияние на вес яйца домашней курицы. Он ассоциировал с генетической изменчивостью веса яйца до 38,5 % (Р < 0,03). Генетическая архитектура этого признака характеризовались ограниченным количеством QTLs с относительно большим эффектом и многих QTLs с малым эффектом. Связь данного региона на хромосоме 4 с весом яйца ранее была упомянута у Tuiskula-Haavisto (2002).

Представленная работа посвящена поиску связи аллельных вариантов 8ЫР2-1 и 8№3-1, расположенных рядом с последовательностью 011523443, и 8М5 гз14991030 с признаками яйца домашней курицы. Цели и задачи исследования.

Целыо данной работы является выявление маркеров (8№>) количественных признаков качества яйца и изучение связи аллелей маркеров с признаками яйца на 30-ой, и 60-ой педеле жизни курицы-несушки.

Для достижения указанной цели были поставлены следующие задачи:

1.Выполнить молекулярно - генетический анализ ¡п бШсо последовательности СЯ523443

2.Выполнить молекулярно - генетический анализ т бШсо локализацию последовательности гэ 14491030 в четвертой хромосоме кур.

3.Определить связь 8МР-2_1, 8КР-3_2 и ^14991030 с признаками яйца домашней курицы.

4.Рассчитать частоты встречаемости аллелей 8№* и эффект замещения выявленных аллелей полиморфных сайтов в трех линиях кур.

5.Предварительно определить ген ответственный за наблюдаемую связь эффектов 8ЫР - маркеров с признаками качества яйца

Научная новизна работы. Выявлено достоверное влияние аллели 8ЫР2_1 па толщину скорлупы, массу яйца 60 педель, яйценоскость 60 недель. С)ТЬ, маркированный 8КР2_1, имеет плейотропный эффект на признаки качества яйца. Для признака толщина скорлупы аллель Т 8ЫР2_1 является доминантной по отношению к аллели С. Замещение аллеля С на Т приводит к увеличению толщины скорлупы и яйценоскости кур, но к уменьшению массы яйца.

Анализ т бШсо показал что 8МР ге 14491030 находится в гене ЫСАРО (не -8МС субъединице САР-в комплекса конденсииа I) в позиции 78775527 п. н. Аллели ге 1499103 0 гена ЫСАРО имеют достоверную связь с массой и процентом скорлупы, а также с толщиной скорлупы домашней курицы. Замеще-

ние аллеля в на А приводит к увеличению массы, толщины скорлупы и процента массы скорлупы по отношению к массе яйца. При этом, достоверного отрицательного влияния на изученные признаки замены аллеля в на А не выявлено. Таким образом, гб 14491030 может быть рекомендован для использования в селекции кур несушек.

Теоретическая и практическая ценность работы. По результатам исследований будут созданы методические указания для практического использования полученных результатов для предварительного отбора родительских особей с заведомо благоприятным генотипам по хозяйственно-важным признакам, отбор потомства с первых дней жизни до проявления данных признаков) имеющим важное экономическое значение, таким как толщина скорлупы, масса яйца и яйценоскость у домашней курицы. Полученные результаты могут быть использованы в практической деятельности соответствующих учреждений РАСХН - в ГНУ « Всероссийский научно-исследовательский и технологический институт птицеводства» (ВНИТИП), ГНУ « Всероссийский НИИ птицеперерабатывающей промышленности» ( ВНИИПП), ГНУ « Всероссийский институт генетики и разведения сельскохозяйственных животных» (ВНИИГРЖ), в Сибирском НИИ птицеводства, а также в преподавании в Российском государственном аграрном университете( МСХА им. К,А, Тимирязева, Москва), в Санкт-Петербургском государственном аграрном университете (Пушкин), в Санкт-Петербургском государственном университете.

Выявленные мажорные С^ТЬ (локусы количественных признаков) могут быть использованы для оптимизации системы молекулярных маркеров для маркерной селекции домашней курицы и геномной селекции по хозяйственно-полезным признакам качества яйца. Для селекции по признакам качества яйца в России геномная селекция позволит добиться существенного

прогресса в биотехнологии птицеводства и избежать необходимости приобретения кроссов из зарубежных стран.

Апробация работы. Материалы работы были представлены на третьем ежегодном всемирном конгрессе сельского хозяйства ( Китай, 2013). Результаты периодически докладывались на семинарах отдела молекулярной генетики и биотехнологии ГНУ ВНИИГРЖ РАСХН. Исследования проводили в соответствии с планом научно-исследовательской работы ГНУ ВНИИГРЖ РАСХН по теме «Разработать систему молекулярно-генетических маркеров, обеспечивающих повышение эффективности селекции сельскохозяйственных животных» (номер государственной регистрации 01.200.118843).

Публикация результатов. Материалы, представленные в диссертации, были опубликованы в научных журналах «Известия СПб ГАУ» и "Генетика". Всего по теме работы опубликовано 3 печатные работы, из них 2 статьи и 1 тезис.

Структура и объем диссертации. Диссертация изложена на 117 страницах машинописного текста, включает 15 таблиц, 12 рисунков и состоит из следующих разделов: «Введение», «Обзор литературы», «Материал и методы», «Результаты», «Обсуждение», «Выводы», «Практические предложения» и «Список литературы». Список цитированной литературы насчитывает 8 русских и 147 иностранных названий.

Основные положения, выносимые на защиту:

1. Молекулярно - генетический анализ т бШсо последовательности С11523443.

2. Молекулярно - генетический анализ т эШсо расположения гэ 1449103 0 в гене МСАРв, расположенным в четвертой хромосоме курицы

3. Связь 8№-2_1, 8№-3_2 с признаками яйца домашней курицы.

4. Связь гб 14491030 в гене ЫСАРв с признаками яйца домашней курицы.

5. Анализ частот встречаемости аллелей 8КР и эффект замещения выявленных полиморфных сайтов в трех линиях кур и межлинейном гибриде СО породы Род Айленд.

6. Предварительно определенные гены - кандидаты, ответственные за наблюдаемую связь 8№2-1-маркера, расположенным рядом с последовательностью СЯ523443, с эффектами на признаки качества яйца.

^ ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Организация генома домашней курицы 1.1.1. Особенности кариотипа

Домашняя курица - Gallus gallas - единственный представитель класса птиц, являющийся одновременно и модельным объектом, и важным сельскохозяйственным животным. Кариотип домашней курицы состоит из 78 хромосом, 16 из которых макро-, а 62 — микрохромосомы (Bitgood, Somes, 1990).

В результате исследований в области цитогенетики с использованием различных методов дифференциального окрашивания хромосом на большом количестве видов было обнаружено, что для представителей класса Aves характерен уникально высокий для позвоночных животных эволюционный консерватизм кариотипов (Takagi, Sasaki, 1974; Stock et al., 1974; Au et al., 1975; de Lucca, Chamma, 1977; de Boer, van Brink, 1982).

У большинства видов птиц кариотип состоит из 39^Ю пар хромосом, из которых 6-8 пар размером 3-8 мкм называют макрохромосомами. Эти хромосомы легко идентифицировать без применеиия техник дифференциального окрашиваеия. Остальные хромосомы являются трудноидентифици-руемыми микрохромосомами, их размеры приблизительно 0.3-3 мкм (Bitgood, Shoffner, 1990; Matzke et al., 1990). Следует отметить, что деление хромосом на макро- и микрохромосомы имеет условный характер, т.к. на стадии прометафазы у курицы, например, все хромосомы по размеру образуют единый непрерывный ряд (Shoffner, 1974).

По другой систематике у кур хромосомы делятся на три груп-пы:макрохромосомы- GGA1-5 - 50-200 Mb; средние или промежуточные -GGA6-10- 20-40 М.Ь. и 28 микрохромосомы - GGA11-38- в среднем 12 М.Ь. Авторы (Masabanda J.S. et al.,2004; Axelsson E.,2005) предложил делить хромосомы кур на 4 класса: A. GGA 1-10, Z,W; В. 11-16; С. 17-32; D. 33-38.

Само понятие микрохромосомы введено Ohno S. ( Ohno S., 1961) в 1961 году и в дальнейшем было показано, что они ведут себя как обычные хромосомы, а не «хромосомоиды»: при репликации включают НЗ тимидин как и макрохромосомы (Shmid W, 1971), сходны с макро- по структуре и поведению в митозе и мейозе (Ford, 1964), одинаково с макро- окрашиваются по Фельгену и значит содержат ДНК (Bloom S et al., 1969), при изучении си-иаптонемалыюго комплекса в микрохромосомах обнаруживаются центромеры (Kaelbling M et al., 1983; Hutchison, 1987), структура мейотических бивалентов - одинакова в макро- и микрохромосомах ( Hutchison, 1987),

В настоящее время на основании данных физического картирования около 200 кодирующих последовательностей ДНК, называемых маркерами первого типа, показано, что около двух третей генов локализуются на микрохромосомах (Smith J. et al., 2000). Эти результаты стали главным доказательством генетической активности микрохромосом. Микрохромосомы содержат ядрышкообразующий район, гены главного комплекса гистосовместимости (Dominguez-Steglich et al., 1990), ген фактора роста нервов (Dominguez-Steglich et al., 1990), онкогены и некоторые другие гены (Ponce de Leon, Burt, 1993).

Как и у других позвоночных животных, в геноме птиц имеются короткие последовательности, характеризующиеся высоким содержанием ГЦ-пар оснований - так называемые CpG-островки - короткие (около 1 т.п.н.) неме-тилированные блоки нуклеотидов, располагающиеся у 5' концов большинства генов позвоночных (McQueen et al., 1996). С помощью метода гибридизации in situ было показано, что CpG-островки сконцентрированы в основном в микрохромосомах; в макрохромосомах их значительно меньше (почти в шесть раз). Такое различие в содержании CpG-островков, возможно, связано с более низкой концентрацией генов в группе макрохромосом (McQueen et al., 1998).

Все изложенные выше факты дают веские основания считать микрохромосомы настоящими хромосомами, отличающимися от макрохромосом только по размеру и характеру компактизации.

Современные расчеты показывают , что микрохромосомы составляют всего 24,7% общей физической длины хромосом самок. Для сравнения хромосома 1- 22,0%, хромосома 2-16,0%, хромосомаЗ-12,2%, 4-9,6%, 5- 5,6%, 63,7%, 7-3,6%, 8- 2,5 %. У самцов Z- 8,4% (хромосома 1 здесь 20,5%) , а мик-ро-22,1% ( Smith J., Burt D., 1998). По данным TCGSC 2004 ( Nature,2004) микрохромосомы составляют 18% генома самок и содержат 31% генов курицы.

Таким образом, все перечисленные особенности геномов птиц придают результатам исследований по картированию и изучению экспрессии генов особое биологическое значение. Поиск возможного функционального сходства с геномами млекопитающих поможет объяснить общие закономерности контроля биологически важных признаков у теплокровных живот-ных(Сазанов A.A. 2009)

1.1.2. Особенности молекулярной организации генома

Класс птиц отличается наибольшей консервативностью величины геномов среди позвоночных животных. Содержание ДНК на клеточное ядро варьирует для изученных в этом отношении видов птиц от 2.5 до 3.0 пг. Гаплоидный геном птиц в 2.75 раза меньше, чем у млекопитающих и состоит в среднем из 1.2х109 п.н. Столь низкое содержание ДНК в геномах птиц связано с «необходимостью полета», а высокий эволюционный консерватизм этого показателя объясняют монофилетическим происхождением класса птиц(КасИ etal., 1993).

В геномах различных видов птиц, наиболее изученных с точки зрения молекулярной генетики, очень высокое содержание уникальных последова-

тельностей (80-84%), в то время как у млекопитающих этот класс последовательностей составляет лишь 65-70% генома (Oloffson, Bernardi, 1983; Stevens, 1986). Следует подчеркнуть, что содержание сателлитной ДНК в геноме домашней курицы не превышает 3%, (на долю других типов повторов приходится 17-22%) а у млекопитающих число последовательностей, характеризующихся высокой повторяемостью в геноме, составляет около 35% от всего генома (Oloffson, Bernardi, 1983). В 1972 году Брауном и Джонсом (Brown, Jones, 1972, цит. по: Shoffner, 1974) было показано, что у домашней курицы и японского перепела сателлитная ДНК локализуется в основном в микрохромосомах и в W-хромосоме. Микрохромосомы у Gallus gallus являются в основном обогащены ГЦ-парами оснований (Родионов 1985, 2001; Сазанова, 2001; Сазанов, и соавт., 2003), хотя в литературе имеются данные о том, что в некоторых микрохромосомах центромерные районы являются АТ-обогащенными (Fillon et al., 1998). Полученная с использованием АТ-специфических флуорохромов (акрихин-иприт, Хехст 33258, ДАПИ) неоднородная флуоресценция хромосом домашней курицы была недостаточно информативна для анализа Q-исчерченности хромосом.

Теломерные канонические повторы 5' TTAGGG-3' локализуются на хромосомах птиц (макро- и микро- ) , а также интерстициально (e.g.lq) и центромерно (Meyne et al., 1989; Schmid,1994 ). В дальнейшем на микрохромосомах идентифицировано три типа локализации теломерных повторов-только теломер, теломер плюс центромер, полное покрытие всех хромосом.

Идентифицировано три типа теломерных пучков: класс I, класс II, класс III, различающиеся по структуре, размеру и хромосомной локализации. Класс I - 0,5-10 т.п.н., интерстециально локализуются , не укорачиваются с возрастом. Класс II- 10-40 т.п.н.,с терминальной локализацией , укорочением с возрастом, набором TFR (terminal restriction fragment). На этом классе повторов наблюдается возрастное укорочение и связь с теломеразной активно-стыо.Класс III - от сотен т.п.н. до 1-2 мега. п.п., встречаются у кур и больше

чем у других объектов, например, у мышей 150 т.п.н. ( по ряду данных этот класс- артефакт «недореза» - (Venkatasen, 1998). Считается, что именно этот класс теломерных повторов связан с микрохромосомами и предохраняет их от «эрозии».

Курица играет ведущую роль в качестве модельного организма во многих областях биологических исследований, ведущих ко многим открытиям в ряде областей, в частности, в иммунологии, исследовании рака и биологии развития (Brown et al., 2003). Недавние усилия привели к расширению геномных ресурсов, от поколения физических и генетических карт (Groenen et al., 2000; Wallis, JW. et al., 2004), секвенировапия крупно- масштабных библиотек к ДНК (Boardman et al., 2002; ITabbard et al.,2005; Caldwell et al., 2005) до полного секвенировапия генома G. gallus (Hiller et al., 2004)одного из трех секвенированных до настоящего времени.. Около 1 gigabase последовательности, по оценкам, содержит около 20,000-23,000 белок-кодирующих генов, подавляющее большинство из которых имеют материальное доказательства в виде клонов кДНК . Это дало возможность консолидировать курицу как выдающуюся модель организма в разных биологических областях науки.(Tickle, 2004).

Полный сиквенс генома дает отправную платформу для будущего постгеномного исследования биологии птицы, но требует связанных с ним генетических ресурсов. Они включают в себя EST и кДНК библиотеки, которых в настоящее время насчитывается более 580000, которые, по оценкам, составляют 90% всех куриных белок- кодирующих генов и соответствуют более 70.000 различным транскрипционным изоформам курицы (Hubbard et al., 2005). Всего у кур идентифицировано 2,8 миллиона SNPs ( Robb E.R. et al., 2011). Эти ресурсы активно используются, чтобы найти и охарактеризовать данные гены в геноме курицы, и выявить генетическую структуру 18632 генов которые представленны в настоящее время в Ensembl (Eyras et al.,2005).

1.2.Эволюция образования специфических генов яйца птицы.

Яйцо домашней птицы вызывало научный интерес на протяжении десятилетий, в связи с его важностью для воспроизводства птицы, а также широкого применения в фармацевтической, косметической и пищевой промышленности. Резко возросли данные о белках яйца вследствие недавнего развития производительных методов, используемых в сочетании с недавно доступным геномным сиквенсом домашней курицы(Сопзогйит ICGS 2004). С помощью протеомной и транскриптомной техники были определены более чем несколько сотен белковых компонентов яичного белкаф'Ambrosio С. et al., 2008; Mann К. 2007; Guerin-Dubiard С. et al., 2006; Raikos V. et al., 2006;), яичного желтка (Farinazzo A. et al., 2009; Mann К. et al., 2008), желточной мембраны (Mann К. 2008), а также более 500 белков матрицы яичной скорлупы G. Gallus (Mann К. et al., 2006; Jonchere V. et al., 2010;). Эти исследования дают на сегодняшний день наиболее полный набор данных о белках яиц и предлагают базовую информацию для дальнейшего эволюционного и функционального исследования по изучению яйца птицы. Например, многие из многочисленных компонентов белка в яйце являются повсеместно встречающимися белками (таких как актин, убиквитин, и гистоны) (D'Ambrosio С. et al., 2008; Mann К. 2007; Mann К. et al.,2006). В общем, эти неспецифические яичные белки широко распространены у всех позвоночных, в том числе у костных рыб и млекопитающих, предполагая эволюционный консерватизм и общие функции у этих животных. Тем не менее, было выделено много белков, которые обнаружены только в репродуктивных органах домашней курицы, которые играют важную роль во время развития эмбриона, такие как яичный альбумин (Woo S.L. et al., 1981), вителлогенины (Wallace R.A. 1985), овокаликсин-36 (Gautron J. et al.,2007), и овоклеидин-116 (Hincke М.Т. et al., 1999).

Эволюция этих специфических белков связана с исключительным положением яйца птицы в эволюции воспроизводства позвоночных. Обзор эволюции яйцеспецифических белков, оценивает значение генов участвующих в дивергенции для поддержания специфики птичьего яйца, предполагает новые сведения о развитии репродуктивной системы у позвоночных.

Так как яйцо является специфическим органом репродуктивной системы птиц, что предполагает образование новых генов, которые должны укреплять защиту и питание ооцитов / эмбрионов в ходе ее развития в яйце. Путем геномного сравнения сформулирована гипотеза происхождения специфических генов G. gallus образующих яйцо при отсутствии ортологов у других неяцекладущих животных.

Овокаликсин-36 (ОСХ-36) недавно был идентифицирован как новый специфический белок яичной скорлупы G. gallus (Gautron J. et al.,2007). Он выявлен только в тех регионах яйцевода, где происходит формирование скорлупы и включен в оболочки мембран, преимущественно во внутренней части кальцинированной яичной скорлупы. (Gautron J. et al.,2007). Сравнение сиквенса геномов показывает, что ОСХ-36 относится к антибактериальным белкам подсемейства BPI / LBP / PLUNC с 20 -27 процентным сходством между ОСХ-36 и тремя BPI / LBP / PLUNC членами надсемейства (BPIL3, LPLUNC3, и LPLUNC4). Авторы определили ортологию между ОСХ-36 Gallas gallus и генами других млекопитающих (BPI / LBP / PLUNC). В геноме домашней курицы ген ОСХ-36 находится в тандеме образуемом (ющих) кластером генов BPI / LBP / PLUNC (кластеров генов) на хромосоме 20 (, и это, в частности),) рядом с генами BPIL3, LPLUNC3, и LPLUNC4. Анализ синтении показывает, во-первых, что по крайней мере один PLUNC ген присутствует в геноме предков позвоночных и, во-вторых, что BPI / LBP / PLUNC кластеры генов сохраняются у амниот (включая птиц-G. gallus , Meleagris gallopavo. При дальнейшем поиске при помощи TBLASTN (Altschul S.F. et al.,1997), авторы не нашли аналога ОСХ-36 у

млекопитающих или костистых рыб, предполагая, снова уникальную роль ОСХ-36 в G. gallus. Таким образом, предполагается, что скорлупообразую-щий специфический ген ОСХ-36 возникает из тандема дублирования предков BPI / LBP / PLUNC генов после эволюционной дивергенции птиц и млекопитающих.

Кроме того, еще один яйце-специфический ген TENP (белок данного гена концентрируется в яичном белке и в яичной скорлупе) также локализованы в той же синтенной группе в генома птиц (также для М. gallopavo генома). Филогенетическое и геномное сравнение показывают, что ген TENP у Galliformes является ортологичным к BPIL1 млекопитающих, который экс-прессируется на высоком уровне в миндалинах, особенно в гипертрофических миндалинах человека (Andrault J.B. et al., 2003). Скорее всего наблюдается случай функциональной дивергенции после дубликации генов TENP и BPIL1, экспрессия гена TENP различается у млекопитающих по сравнению с BPIL1 у Galliformes.

У млекопитающих, BPI / LBP / Plunc белки, являются ключевыми компонентами врожденной иммунной системы, хорошо известны за их участие в антибактериальном иммунном ответе. (Bingle С. et al., 2004). Таким образом, потенциальная роль ОСХ-36 и TENP предположительно связана с врожденной защитой яйца от патогенных факторов. Специфическая экспрессия обоих генов в яйце птицы, особенно уникальная дубликация ОСХ-36 в Galliformes, показывает, как яйцекладущие птицы расширяли свои антимикробные свойства для защиты яйца благодаря адаптивному процессу дубликации.

Другой пример касается конкретной дубликации генов овальбумина домашней курицы. Овальбумин является основным протеином яичного белка и синтезируется в яйцеводе курицы (Palmiter R.D. et al., 1988), который потребляется развивающимися эмбрионами птиц в качестве дополнительного к желтку источника питания. Две разновидности протеина овальбумина, названы овальбумин X и овальбумина Y и также сосредоточены в яичном бел-

ке (Mann К. 2007). Анализ выявил, что эти три белка относятся к овальбу-мин- связанным семействам серпин белков (SERPINB) (Silverman G.A. et al., 2001). SERPINB белки ингибируют серин и / или папаин схожие цистеин протеиназы и защищают клетки от экзогенных и эндогенных протеиназ-опосредованных травм (Silverman G.A. 2004). Овальбумин является одним из немногих членов этой семьи, которая не является ингибитором протеазы. Это связано с отклонениями в последовательности по сравнению с консенсусной последовательностью белков SERPINB (Benarafa С. et al.,2005). Нет экспериментальных данных о протеазо- ингибирующей активности овальбумина X и У. Данные заимствованые из онлайновой базы данных TreeFam (http://www.treefam.org/cgi-bin/TFinfo.pl?ac=TF352619) предполагают, что овальбумин и гены овальбумина X и Y специфически дублируются у G. gallas и образуют монофилетическую группу. В геномах G. gallus а М. gallopavo гены X, Y и овальбумина тандемно локализованы в пределах генного кластера SERPINB (содержащие 10 SERPINB генов) на хромосоме 2. В геноме человека, это скопление генного кластера SERPINB который разделен на два локуса на хромосомах 6 и 18. В недавних эволюционных исследованиях (Izuhara К. et al.,2008) предположили, что первое событие дубликации генов SERPINB произошло 450 миллионов лет назад (до расхождения костистых рыб и тетрапод), дальнейшие события дублирования дало в результате по меньшей мере шесть генов, прежде чем произошло расхождение птиц и млекопитающих, и, совсем недавно, события линии-независимой дубликации возможно произошли у костистых рыб и птиц (что дало образование трем яйцеспецифическим генам овальбумина) и млекопитающих (ведущие к трем генам связанных с плоскоклеточным раком), соответственно . Эти данные показывают, что для защиты организма у различных животных произошло усложнение серин- протеиназных ингибиторов. В частности, после дубликации у птиц, овальбумин потерял протеазоингибирующую активность (Huntington J.A. et al., 2001), в то время как паралоги генов Y и X имеют ре-

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Баркова, Ольга Юрьевна, 2013 год

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

1. Баркова О. Ю. Создание системы генотипирования Gallus gallus по аллелям rSNP (регуляторных мононуклеотидных полиморфных сайтов), оказывающих влияние на толщину скорлупы яйца./ Баркова О. Ю., Сазанова А.Л., Благовещенский И.Ю. Фомичев К.В. Сазанов A.A. Малевски Т // Генетика. -2011 - Т. 47. №2. - С. 241-248.

2. Родионов A.B. Цитогенетика доместицированных птиц: физические и генетические карты хромосом и проблема эволюции кариотипа / Родионов A.B. // Автореф. дисс. на соиск. уч. ст. докт. биол. наук. СПб: СПбГУ. -2001. -42 С.

3. Родионов А. В. Цитохимический анализ молекулярной гетерогенности хромосом курицы/ Родионов А. В. // Дисс. На соиск. уч. ст. канд. биол. наук. Л: ВНИИРГЖ. -1985.

4. Сазанов А.А, Сравнительное композиционное картирование хромосом курицы и перепела / Сазанов A.A., Сазанова А.Л., Козырева A.A., Смирнов А.Ф., Андреоцци Л., Федерико К., Мотта С., Сакконе С., Бернарди Г. //Генетика. - 2003 - Т. 39-С. 819 - 825.

5. Сазанов A.A. Молекулярно-цитогенетический анализ генома птиц/ Сазанов A.A. // Дисс. на соиск. уч. степени д.б.н. ГНУ ВНИИГРЖ РАСХН. -2004. -275 с.

6. Сазанова А.Л. Эволюционный консерватизм и композиционная гете-генность хромосом птиц /Сазанова А.Л. //Дисс. на соиск. уч. степени к.б.н.// СПбГУ.-2001.-167 С

7. Стекольникова В.А. Позиционное клонирование локусов количественных признаков домашней курицы /Стекольникова В.А. // Дисс. на соиск. уч. Степени канд.биол.наук.ГНУ ВНИИГРЖ РАСХН. - 2006. -127 с.

8. Химанипа, Ю.А. Анализ экспрессии генов-кандидатов признака толщина скорлупы яйца домашней курицы./ Ю.А. Химанина, АЛ. Сазанова, В.А. Стекольникова, Т. Малевски, К. Ящак, А.А. Сазанов // Сельскохозяйственная биология. - 2008 - №6. - С. 40-43.

9. Abasht, В. Fatness QTL on chicken chromosome 5 and interaction with sex/ Abasht В., Pitel F., Lagarrigue S., Le Bihan-Duval E., Le Roy P., Demeure O., Vig-noles F., Simon J., Cogburn L., Aggrey S., Vignal A., Douaire M. //Genet Sel Evol. -2006-V. 38-P. 297-311

10. Addadi. L. Interactions between acidic matrix macromolecules and calcium phosphate ester crystals: relevance to carbonate apatite formation in biomineraliza-tion./ J. Moradian-Oldak, F. Frolow, L. Addadi, S. Weiner// Proc Biol Sci. -1992 -V. 22-P. 47-55.

11. Altschul, SF. Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs./SF. Altschul, TL. Madden, AA. Schaffer, J. Zhang, Z. Zhang, W. Miller, DJ. Lipman // Nucleic Acids Res- 1997-V. 25-P. 3389- 3402.

12. Anderson, DE. Condensin and cohesin display different arm conformations with characteristic hinge angles./DE. Anderson, A. Losada, HP. Erickson, T. Hirano // J Cell Biol-2002-V. 156-P. 419-424.

13. D'Ambrosio, C. Exploring the G. gallus egg white proteome with combinatorial peptide ligand libraries./C. D'Ambrosio, S. Arena, A. Scaloni, L. Guerrier, E.

Boschetti, ME. Mendieta, A. Citterio, PG. // J. Proteome Res -2008-V. 7-P. 34613474.

14. Andrault, JB. Expansion of the BPI family by duplication on human chromosome 20: characterization of the RY gene cluster in 20ql 1.21 encoding olfactory transporters/antimicrobial-like peptides./ JB. Andrault, I. Gaillard, D. Giorgi, S. Rouquier // Genomics- 2003-V.82- P. 172 -184.

15. Arias, J. L. Biomineralization and eggshells: cell-mediated acellular compartments of mineralized extracellular matrix. /JL. Arias, DJ Fink, SQ Xiao, AH Heuer, AL Caplan//Int Rev Cytol. -1993- V.50 P.145:217.

16. Axelsson, E. Comparison of the chicken and turkey genomes reveals a higher rate of nucleotide divergence on microchromosomes than macrochromosomes./E. Axelsson, MT. Webster, NG. Smith, DW. Burt, H. Ellegren // Genome Res.- 2005 -V. 15(1 )-P. 120-125.

17. Babin, PJ. Conservation of a vitellogenin gene cluster in oviparous vertebrates and identification of its traces in the platypus genome./PJ. Babin // Gene -2008-V. 413-P.76- 82.

18. Bardet, C. MEPE evolution in mammals reveals regions and residues of prime functional importance./C. Bardet, S. Delgado, JY. Sire// Cell Mol Life Sci-2010-V.67-P. 305-320.

19. Becvar, J. The binding of flavin derivatives to the riboflavin-binding protein of egg white: a kinetic and thermodynamic study./ Becvar J, Palmer G // J Biol Chem- 1982-V. 257-P. 5607-5617.

20. Benarafa, C. The ovalbumin serpins revisited: perspective from the G. gallus genome of clade B serpin evolution in vertebrates./ C. Benarafa, E. Remold-O'Donnell// Proc Natl Acad Sci U S A -2005-V. 102- P. 11367- 11372.

21. Bravvand, D. Loss of egg yolk genes in mammals and the origin of lactation and placentation./ D. Brawand, W. Wahli, H. Kaessmann // PLoS Biol -2008-V. 6 -P. 63.

22. Breed, WG. Egg maturation and fertilization in marsupials./ Breed, WG. //Reprod Fertil Dev -1996-V. 8 -P. 617 643.

23. Brown, W. The chicken as a model for large-scale analysis of vertebrate gene function./ W. Brown , SJ. Hubbard,C. Tickle, SA.Wilson // Nature Rev Genetics.- 2003-V.4-P.87-98.

24. Bingle, CD. Meet the relatives: a family of BPI- and LBP-related proteins./ CD. Bingle, CJ. Craven// Trends Immunol- 2004-P.25-V. 53- 55.

25. Bitgood, J..T. Cytology and cytogenetics./ J.J. Bitgood, R.N. Shoffner.// In: Crawford R.D. (Ed.) Poultry Breeding and Genetics. Amsterdam: Elsevier, -1990 -P. 401-427.

26. Bitgood ,J.J., Somes R.G. Linkage relationships and gene mapping. /J.J. Bitgood, R.G. Somes.// In: Crawford R.D. (Ed.) Poultry Breeding and Genetics. Amsterdam: Elsevier, - 1990 -P. 469^495.

27. Bitgood, J.J. Gene map of the chicken (Gallus gallus).// J.J. Bitgood, R.G. Somes.//In: O'Brien S. (Ed.) Genetic Maps 6th ed. Cold Spring Harbor Laboratory Press, - 1993 -P. 4333-4342.

28. Bloom, S. Ammoniacal silver staining of embryonic chicken cells and chromosomes./SE. Bloom, EG. Buss // Poult Sci. -1969 -V.48(3)-P. 1114-1116.

29. Boardman, P. A comprehensive collection of chicken cDNAs./P. Board-man, J. Sanz-Ezquerro, I. Overton, D. Burt, E. Bosch,W. Fong //Current Biology.-2002-V. 12-P. 1965-1969.

30. Caldwell ,RB. Full-length cDNAs from chicken bursal lymphocytes to facilitate gene function analysis./RB. Caldwell, AM. Kierzek,H. Arakawa, Y. Bezzu-bov, J. Zaim, P. Fiedler P // Genome Biol.- 2005-V. 6 - P.6-12.

31. Cheng, H.H. Development of a genetic map of the chicken with markers of high utility./ H.H. Cheng, I. Levin, R.L. Vallejo, H. Khatib, J.B. Dodgson, L.B. Crittenden, J. Hillel // Poultry Science. -1997 -V. 74. № 11. - P. 1855-1874.

32. Chowdhary, B.P. HSA4 and GGA4: remarkable conservation despite 300-Myr divergence./ B.P. Chowdhary, T. Raudsepp // Genomics. -2000 -V. 64. - P. 102-105.

33. Clement, W. DNA replication patterns in the chromosomes of the domestic fowl./WM Jr Clement // Cytologia.-1971 -V.8-P. 168-172.

34. Consortium ICGS. Sequence and comparative analysis of the G. gallus genome provide unique perspectives on vertebrate evolution. Nature 2004.

35. Dantzer, V. Comparative biology of the vertebrate placenta—a workshop report./V.Dantzer,L.Paulesu //Placenta- 2002-V. 23 -P. 133 -135.

36. Dej KJ. Mutations in the Drosophila condcnsin subunit dCAP-G: Defining the role of condensin for chromosome conden- sation in mitosis and gene expression in interphase./ KJ. Dej, C. Ahn, TL. O'rr-Weaver// Genetics-2004-V. 168-P. 895906.

37. Dominguez-Steglich, M. The dystrophin gene is autosomally located on a microchromosome in chicken./ M. Dominguez-Steglich, G. Meng, T. Bettecken, C.R. Muller, M.Schmid // Genomics. - 1990 -V. 8 - P. 536-540.

38. Dunn IC. Polymorphisms in eggshell organic matrix genes are associated with eggshell quality measurements in pedigree Rhode Island Red hens. / IC . Dunn, NT. Joseph, M. Bain, A. Edmond, PW. Wilson, P. Milona, Y. Nys, J. Gautron, M. Schmutz, R. Preisinger, D. Waddington. // Anim Genet. - 2009. -V. 40(1) - P. 1101 14.

39. Dunn IC. Genetic variation in eggshell crystal size and orientation is large and these traits are correlated with shell thickness and are associated with eggshell matrix protein markers. / IC Dunn, AB. Rodríguez-Navarro, K. Mcdade, M Schmutz, R Preisinger, D Waddington, PW Wilson, MM. Bain //Anim Genet. -2012.-V. 43(4) - P. 410-418.

40. Dumont, JN. Egg envelopes in vertebrates./ JN. Dumont, AR. Brummett AR// Dev Biol- 1985-V. 1-P. 235-288.

41. Esteller M. Non-coding RNAs in human disease./M. Esteller// Nat. Rev. Genet. -2011-V. 18. -P. 861- 872.

42. Eyras E. Gene finding in the chicken genome./E. Eyras, A. Reymond, R. Castelo, JM. Bye, F. Camara, P. Flicek//BMC Bioinformatics.- 2005-V.6-P.131.

43. Farinazzo, A. G. gallus egg yolk cytoplasmic proteome, mined via combinatorial peptide ligand libraries./A. Farinazzo, U. Restuccia U, A. Bachi, L. Guerrier, F. Fortis, E. Boschetti, E. Fasoli , A. Citterio,PG. Righetti// J Chromatogr A-2009-V. 12 -P. 1241-1252.

44. Fillon, V. Identification of 16 chicken microchromosomes by molecular markers using two-colour fluorescence in situ hybridization (FISH)./ V. Fillon, M. Morrison, R. Zoorob, Ch. Auffray, M. Douaire, J. Gellin, A. Vignal // Chromosome Researsh. -1998 -V. 6 -P. 307-313.

45. Ford, E. Testicular chromosomes of gallus domesticus./ E. Ford E, D.Wollam // Chromosoma, -1964-V. 15-P.568-578.

46. Fulton, JE. Variation in the ovocaIyxin-32 gene in commercial egg-laying chickens and its relationship with egg production and egg quality traits./JE. Fulton, M. Soller, AR. Lund, J. Arango, E. Lipkin// Anim Genet.- 2012 -V.-P. 102-113.

47. Garcia-Ruiz, J. M. Investigations on protein crystal growth by the gel acupuncture method. / J. M. Garcia-Ruiz, A. Morena //Acta Crystallogr D Biol Crystal-logr. -1994 -V. 50-P. 484-90.

48. Gautron, J. Soluble matrix of hen's eggshell extracts changes in vitro the rate of calcium carbonate precipitation and crystal morphology ./Gautron J, Bain M, Solomon S, Nys Y. Br// Poult Sci. -1996-V.37-P.853-866.

49. Gautron, J. Ovocalyxin-32, a novel G. gallus eggshell matrix protein: isolation, amino acid sequencing, cloning, and immunocytochemical localization./ J.Gautron, MT. Hincke, K. Mann, M. Panheleux, M. Bain, MD. McKee, SE. Solomon, Y. Nys Hi Biol Chem- 2001 -V. 276- P. 39243- 39252.

50. Gautron, J. Cloning of ovocalyxin-36, a novel G. gallus eggshell protein related to lipopolysaccharide-binding proteins, bactericidal permeability-increasing proteins, and plunc family proteins./J. Gautron, E. Murayama, A.Vignal, M. Moris-son, MD. McKee, S. Rehault, V. Labas, M. Belghazi, ML. Vidal, Y. Nys, MT. Hincke Hi Biol Chem -2007 -V. 282-P. 5273- 5286.

51. Gauthier, J. The early evolution of the Amniota./ J. Gauthier, AG. Kluge, T. Rowe // Benton MJ Amphibians, Reptiles, Birds: The Phylogeny and Classification of the Tetrapods -1988-V. 1 -P. 103-155.

52. Geinian, TM. Isolation and characterization of a novel DNA methyltransfe-rase complex linking DNMT3B with components of the mitotic chromosome condensation machinery./TM. Geiman, , UT. Sankpal, AK. Robertson,Y. Chen, M. Ma-zumdar, JT. Heale, JA. Schmiesing, W. Kim, K. Yokomori,YM. Zhao, KD. Robertson // Nucl Acids Res-2004 -V 32- P. 2716-2729.

53. Gerlich, D. Condensin I stabilizes chromosomes mechanically through a dynamic interaction in living cells./D. Gerlich, T. Hirota, B. Koch, J-M. Peters, Ellenberg// J Curr Biol-2006-V. 16- P. 333-344.

54. Green, LC. Contrasting roles of condensin I and II in mitotic chromosome formation./LC. Green, P. Kalitsis, TM. Chang, M. Cipetic, JH. Kim,0. Marshall, L. Turnbull, CB. Whitchurch, P.Vagnarelli, K. Samejima // J Cell Sci-2012 -V.125 -P. 1591-1604.

55. Grisart B. Positional candidate cloning of a QTL in dairy cattle: identification of a missence mutations in the bovine DGAT1 gene with major effect on milk yield and composition / B. Grisart, W. Coopetees, F. Farnir, L. Karim , K. Ford, P. Bcrzi, N. Cambisario, M. Mni, S. Reid, P. Simon, R. Spelman, M. Georges, R. J. R. Snell // Genome Research. -2002. -V. 12. -P. 222-231.

56. Groencn, M. A. A consensus linkage map of the chicken genome./ M. A. Groenen, II. H. Cheng, N. Bumstead, B. F. Benkel, W. E. Briles, T. Burke, D. W. Burt, L. B. Crittenden, J. Dodgson, J. Hillel, S. Lamont, A. P. de Leon, M. Soller, H. Takahashi, A.Vignal // Genome Res. - 2000 -V.10 - P. 137-147.

57. Gudbjartsson, DF. Many sequence variants affecting diversity of adult human height./DF. Gudbjartsson, GB. Walters, G.Thorleifsson, H. Stefansson, BV. Halldorsson, P. Zusmanovich, P. Sulem, S. Thorlacius, A. Gylfason, S. Steinberg, A. Helgadottir, A. AIngason, V. Steinthorsdottir, E.I. Olafsdottir, GH. Olafsdottir, T. Jonsson, K. Borch-Johnsen, T. Hansen, G. Andersen, T. Jorgensen, O. Pedersen, KK. Aben, JA. Witjes, DW. Swinkels, M. den Heijer, B. Franke, ALM. Verbeek, DM. Becker, L.R. Yanek, LC. Becker, L. Tryggvadottir, T. Rafnar, J. Gulcher, LA. Kiemeney, A. Kong, U. Thorsteinsdottir, K. Stefansson // Nat Genet-2008 -V- 40-P609-615.

58. Guerin-Dubiard, C. Proteomic analysis of hen egg white./C. Guerin-Dubiard, M. Pasco, D. Molle, C. Desert, T. Croguennec, FJ. Nau // Agric Food Chem- 2006 -V.54 -P. 3901 -3910.

59. Hacring, CH. Molecular architecture of SMC proteins and the yeast cohesin complex./CH. Haering, J. Lowe, A. Hochwagen,K. Nasmyth// (2002) Mol Cell-2002-V. 9-P. 773-788.

60. Hamazume, Y. Characterization of hen egg white- and yolk-riboflavin binding proteins and amino acid sequence of egg white-riboflavin binding protein./Y. Hamazume, T. Mega, T. Ikenaka // J Biochem- 1984 -V.95-P 1633-1644.

61. Hamilton, R. N. G. Relationship between egg shell quality and shell breakage and factors that affect shell breakage in the field / R. N. G. Hamilton, , K. G. Hollands, P. W. Voisey, and A. A. Gründer // World's Poult. Sei. J. —1979. — V. 35-P. 177-190.

62. Hillier, LW. Sequence and comparative analysis of the chicken genome provide unique perspectives on vertebrate evolution./LW. Hillier,W. Miller,E. Bir-ney, W. Warren,RC. Hardison.CP. Ponting//Nature. -2004-V.432-P.695-716.

63. Hincke, M. T. Soluble protein constituents of the domestic fowl's eggshell./M.T. Hincke, A.M. Bernard, ER. Lee, CP. Tsang, R. Narbaitz// Br Poult Sci.-1992 -V. 33(3)-P. 505-516.

64. Hincke M. T. Purification and immunochemistry of a soluble matrix protein of the chicken eggshell (ovocleidin 17)./M. T. Hinckc, C. P. W. Tsang, M. Courtney, V. Hill, R. Narbaitz // Calcified Tissue International-1995-V. 56 (6) P 578-583.

65. Hincke, M.T. Molecular cloning and ultrastructural localization of the core protein of an eggshell matrix proteoglycan, ovocleidin-116./M.T. Hincke, J. Gau-tron, C.P. Tsang, MD. McKee,Y. Nys // J Biol Chem— 1999 -V. 274 -P.32915- -32923.

66. Hincke, M. T. Identification and localization of lysozyme as a component of eggshell membranes and eggshell matrix./MT. Hincke, J. Gautron, M. Panheleux, J.Garcia-Ruiz, MD. McKee,Y. Nys//Matrix Biol.- 2000-V. 19(5)-P. 443-453.

67. Hirano, T. Chromosome cohesion, condensation and separation./ T. Hira-no// Annu Rev Biochem-2000 V. - 69 P. -115-144.

68. Hirano, T. Condensins: Organizing and segregating the genome./T.Hirano // Curr Biol-2005 -V. 15 -P. 265-275.

69. Hirano, T. At the heart of the chromosome: SMC proteins in action./ T. Hirano// Nat Rev Mol Cell Biol-2006- V. 7 -P. 311-322.

70. Hirano, M. Positive and negative regulation of SMC-DNA interactions by ATP and accessory proteins./ M. Hirano, T. Hirano // EMBO J-2004-V.- 23-P. 2664-2673.

71. Hirano, T. A heterodimeric coiled-coil protein required for mitotic chromosome condensation in vitro./T. Hirano, TJ. Mitchison// Cell-1994-V. 79-P. 449-458.

72. Hirano, T. Condensins, chromosome condensation protein complexes containing XCAP-C, XCAP-E and a Xenopus homolog of the Drosophila Barren pro-tein./T. Hirano, R. Kobayashi, M. Hirano//Cell-1997- V. 89-P. 511-521.

73. Hirota, T. Distinct functions of condensin I and II in mitotic chromosome assembly./ T. Hirota, D. Gerlich, B. Koch, J. Ellenberg, JM. Peters //J Cell Sci-2004-V. 117-P. 6435-6445.

74. Horvat-Gordon, M. Ovocleidin (OC 116) is present in avian skeletal tis-sues./M. Horvat-Gordon, F. Yu, D. Burns, RM. Leach// Poult Sci- 2008-V. 87-P. 1618-1623.

75. Hudson DF. Molecular and genetic analysis of condensin function in vertebrate cells./ DF. Hudson, S. Ohta, T. Freisinger, F. Macisaac, L. Sennels, F. Alvcs, F. Lai, A. Kerr, J. Rappsilber, W. Earnshaw//Mol Biol Cell-2008-V. 19 -P. 30703079.

76. Huntington, JA. Structure and properties of ovalbumin./ JA, Huntington, PE Stein // J Chromatogr B Biomed Sci - 2001- V. 756 - P. 189 198.

77. Hutchison, N. Lampbrush chromosomes of the chicken, Gallus domesti-cus./N.Hutchison // J. J Cell Biol. -1987-V. 105(4)-P. 1493-1500

78. Huang, W. Genome - wide identification and initial characterization of bovine long non-coding RNAs from EST data./ W. Huang, N. Long N, H. Khatib // Anim. Genet.- 2012 -V. 43,- P. 674-682.

79. Hubbard, SJ. Transcriptome Analysis for the Chicken Based on 19,626 Finished cDNA Sequences and 485,337 Expressed Sequence Tags./SJ. Hubbard,DV. Grafham ,KJ. Beattie, IM. Overton, SR. McLaren, MD.Croning // Genome Res. -2005-V.15-P. 174-183.

80. Izuhara, K. Recent progress in understanding the diversity of the human ov-serpin/clade B serpin family./K. Izuhara, S. Ohta, S. Kanaji, H. Shiraishi, K. Arima // Cell Mol Life Sei- 2008- V65 P. 2541- 2553.

81. Ikeobi, CO. Quantitative trait loci affecting fatness in the chickcn./CO. Ikeobi, JA. Woolliams, DR. Morric // Anim Genet.- 2002- V. 33. -P. 428-435.

82. Jonchere, V. Gene expression profiling to identify eggshell proteins involved in physical defense of the G. gallus egg./V. Jonchere, S. Rehault-Godbert, C. Hennequet-Antier, C. Cabau, V. Sibut, LA. Cogburn LA, Y. Nys, J. Gautron// BMC Genomics- 2010 -P. 11-57.

83. Jing, C. Tazarotene-induced gene 1 (TIG1) expression in prostate carcinomas and its relationship to tumorigenicity./C. Jing, MA. El-Ghany, C. Beesley, CS. Foster CS, PS. Rudland, P. Smith,Y. Ke // J Natl Cancer Inst- 2002 -V. 94- P.- 482490.

84. Kadi, F. The compositional patterns of the avian genomes and their evolutionary implications./ F. Kadi, D. Mouchiroud, G. Sabeur, G. Bernardi // J. Mol. Evol.- 1993 -V. 37-P. 544-551.

85. Kaclbling, M. Synaptonemal complexes and the chromosome complement of domestic fowl, Gallus domesticus.//M.Kaelbling, NS.Fechheimer/ Cytogenet. Cell Genet.-1983 -V. 35-P. 87-92.

86. Kaelbling ,M. Synaptonemal complex analysis of chromosome rearrangements in domestic fowl, Gallus domesticus./M.Kaelbling, NS. Fechheimer //Cytogenet. Cell Genet.-1983-V. 36 -P. 567-572.

87. Karlsson, O. Eggshell structure, mode of development and growth rate in birds. / O. Karlsson, C. Lilja // Zoology -2008. -V.l 11 -P.494-502.

88. Kawasaki, K. Evolutionary genetics of vertebrate tissue mineralization: the origin and evolution of the secretory calcium-binding phosphoprotein family./K. Kawasaki, KM J Weiss// Exp Zoolog B Mol Dev Evol -2006;

89. Kimura, K. ATP-dependent positive supercoiling of DNA by 13S conden-sin: A biochemical implication for chromosome condensation./ K.Kimura,T. Hirano // Cell -1997- V. 90 - P. 625-634.

90. Kimura , K. Dual roles of the IIS regulatory subcomplex in condensin functions./ Kimura K, Hirano T // Proc Natl Acad Sei- 2000- V. 97 -P. 1197211977.

91. Kiniura, K. Chromosome condensation by a human condensin complex in Xenopus egg extracts. / K. Kimura, O. Cuvier, T.Hirano// J Biol Chem - 2001- V. 276-P. 5417-5420.

92. Kluge, R. Quantitative trait loci for obesity and insulin resistance (Nobl, Nob2) and their interaction with the leptin receptor allele (Lper(A720T/Tl 0441)) in New Zealand obese mice./ R. Kluge, K. Giesen, G. Bahrenberg, L. Plum, JR. Or-tlepp, HG. Joost// Diabetologia -2000 - V.43- P. 1565-1572.

93. Losada, A. Dynamic molecular linkers of the genome: the first decade of SMC proteins./A. Losada,T. Hirano// Genes Dev-2005-V. 19-P. 1269-1287

94. Mann, K. The G. gallus egg yolk plasma and granule proteomes./ K. Mann, M. Mann //Proteomics -2008; V. 8. P. 178- 191.

95. Mann, K. Proteomic analysis of the G. gallus egg vitelline membrane./ K . Mann // Proteomics. - 2008 -V. 8 P.- 2322- 2332.

96. Mann, K. Proteomic analysis of the acid-soluble organic matrix of the G. gallus calcified eggshell layer./ K. Mann, B. Macek, JV. Olsen // Proteomics.- 2006-V. 6 P.- 3801- 3810.

97. Masabanda, J.S. Molecular cytogenetic definition of the chicken genome: the first complete avian karyotype./ JS.Masabanda, DW. Burt, PC .O'Brien, A. Vig-nal, V. Fillon, PS. Walsh, II. Cox, LIG. Tempest, J. Smith, F. Habermann, M. Schm-id, Y. Matsuda, MA.Ferguson-Smith, RP.Crooijmans, MA.Groencn, DK.Griffin//Genetics.-2004-V.-166(3)-P. 1367-1373.

98. Messcns, W. Eggshell penetration of various types of hens' eggs by Salmonella enterica serovar Enteritidis. / W. Messens, K. Griispeerdt, K. De Reu, B. De Ketelaere, K. Mertens, F. Bamelis, B. Kemp, J. De Baerdemaeker, E. Decuypere, and L. Herman // J. Food Prot. - 2007 -V. 70 - P. 623-628.

99. McQueen, II.A. CpG islands of chicken are concentrated on microchromosomes./ FLA. McQueen, J. Fantes, S.H. Cross, V.H. Clark, A.L. Archibald, A.P. Bird//Nat. Genet. - 1996-V. 12-P. 321-324.

100. McQueen, H.A. Chicken microchromosomes are hyperacetylated, early replicating, and gene rich./ H.A. McQueen, G. Siriaco, A.P. Bird // Genome Research -1998- V. 8 -P. 621-628.

101. Meyne,J. Conservation of the human telomere sequence (TTAGGG)n among vertebrates./ J. Meyne, RL. Ratliff, RK. Moyzis // Proc Natl Acad Sci U S A.-1989-V.86(18)-P.7049-7053

102. Mitsztal, I. Studies on the value of incorporating the effect of dominance in genetic evaluation of dairy cattle, beef cattle and swine. /1. Mitsztal, L. Varona, M. Culbertson // Biotechnol. Agro. Soc.Enveron.- 1998 - V. 2. № 4,- P. 227233.

103. Nasmyth, K. The structure and function of SMC and kleisin com-plexes./K. Nasmyth, CH. Haering// Annu Rev Biochcm.-2005 -V.74-P. 595-648.

104. Ncuwald, AF and Hirano T. HEAT repeats associated with conden-sins, cohesins and other chromosome-related complexes./ AF. Ncuwald, T. Hirano // Genome. - 2000- V. 10- P. 1445-1452.

105. Norioka, N. Comparison of the amino acid sequences of hen plasma-, yolk-, and white-riboflavin binding proteins./ N. Norioka, T. Okada, Y. Hamazume, T. Mega, T . Ikenaka // J Biochem. 1985- V 97- P. 19-28.

106. Oloffson, B. Organization of nucleotide sequences in the chicken genome./ B.Oloffson, G.Bernardi // Eur. J. Biochem. -1983 - V. 130 -P. 241-245.

107. Oliveira, RA. The condensin I subunit Barren/CAP-H is essential for the structural integrity of centromeric heterochromatin during mitosis./ RA. Oliveira, PA. Coelho, CE.Sunkel // Mol Cell Biol. -2005- V. 25 P. 8971-8984.

108. Ono, T. Differential contributions of condensin I and condensin II to mitotic chromosome architecture in vertebrate cells./ T.Ono, A. Losada, M. Hirano, MP. Myers, AF. Neuwald, T. Hirano//Cell-2003 -V 115. P. 109-121.

109. Onn, I. Reconstitution and subunit geometry of human condensin complexes./ Onn I, Aono N, Hirano M, Hirano 111 EMBO J- 2007 -V 26. P. 10241034

110. Ono, T. Spatial and temporal regulation of condensins I and II in mitotic chromosome assembly in human cells./ Ono T, Fang Y, Spector D, Hirano T// Mo I Biol Cell -2004- V. 15 P. 3296-3308.

111. Palmiter, RD. Steroid hormone regulation of ovalbumin and conal-bumin gene transcription: a model based upon multiple regulatory sites and intermediary proteins./ RD. Palmiter, ER. Mulvihill, JH. Shepherd, GS. McKnight // J Biol Chem -1981- V. 256.- P. 7910- 7916.

112. Pines M. Involvement of osteopontin in egg shell formation in the laying chicken./ Mark Pines 1, Viktor Knopov, Arie Bar// Matrix Biology -1995- V. 14(9)-P. 765-771.

113. Ponce de Leon, F.A. Physical map of the chicken./ F.A. Ponce de Leon, D.W. Burt // In: Manipulation of the avian genome. -1993 -P. 203.

114. Raikos, V. Separation and identification of hen egg protein isoforms using SDS-PAGE and 2D gel electrophoresis with MALDI-TOF mass spectrometry./ V. Raikos, R. Hansen, L. Campbell, SR. Euston // Food Chem- 2006-V 99. P. 72 -710

115. Ribeiro, S. Condensin regulates the stiffness of vertebrate centromeres./ S. Ribeiro, J. Gatlin, Y. Dong, A. Joglekar, L. Cameron, D. Hudson, C. Farr, B. McEwen, E .Salmon, W. Earnshaw // Mol Biol Cell - 2009-V. 20-P 23712380.

116. Robb, E.R. Chromosomal mapping and candidate gene discovery of chicken developmental mutants and genome-wide variation analysis of MHC con-genics./ EA.Robb,CL. Gitter.HH. Cheng,ME. Delany// Journal of Heredity -2011-V.102(2)-P.141-146.

117. Rothchild, I. The yolkless egg and the evolution of eutherian viviparity./ Rothchild I // Biol Reprod -2003-V. 68- P. 337 - 357.

118. Seipold, S.Non-SMC condensin I complex proteins control chromosome segregation and survival of proliferating cells in the zebrafish neural retina BMC./S. Seipold, FC. Priller, P. Goldsmith, WA. Harris, H. Baier, S. Abdelilah-Seyfried// Dev Biol-2009- P. 9.

119. Setoguchi, K. Cross-breed comparisons identified a critical 591 kb region for bovine carcass weight QTL (CW-2) on chromosome 6 and the Ile-442-Met substitution in NCAPG as a positional candidate./ K. Setoguchi, M. Furuta, T. Hirano, T. Nagao, T. Watanabe,Y. Sugimoto, A.Takasuga // BMC Genetics-2009 -P 10-43.

120. Schleiffer, A. Kleisins: A superfamily of bacterial and eukaryotic SMC protein partners. / Schleiffer A, Kaitna S, Maurer-Stroh S, Glotzer M, Nas-myth K, Eisenhaber F// Mol Cell-2003 -V.l 1-P. 571-575.

121. Schmid,M. Localization of the telomeric (TTAGGG)n sequence in chicken (Gallus domesticus) chromosomes./M. Schmid, I. Nand// Cytogenet Cell Genet.-1994-V.65(3)-P. 190-193.

122. Sharp R. M. Development of preferred orientation in the eggshell of the domestic fowl./R.M. Sharp, H. Silyn-Roberts // Biophys J. -1984 ~V.46(2)-P. 175-179.

123. Shoffner, R. N. Chromosomes o f Birds./ R. N. Shoffner // The Cell Nucleus. -1974 -V. 2 - P. 223-261.

124. Shmid , W. DNA replication patterns of the heterochromosomes in Gallus domesticus./W. Shmid // Cytogenetics. -1962-V.1-P.344-352.

125. Smith, J. Parameters of the chicken genome (Gallus gallus)./J.Smith, DW. Burt //Anim Genet.- 1998-V.29(4)-P.290-294.

126. Silverman, GA. The serpins are an expanding superfamily of structurally similar but functionally diverse proteins: evolution, mechanism of inhibition, novel functions, and a revised nomenclature./ GA. Silverman, PI. Bird, RW. Carrell, FC. Church, PB. Coughlin,PG. Gettins,JA. Irving, DA. Lomas, CJ. Luke, RW. Moyer, PA. Pemberton, E. Remold-O'Donnell Hi Biol Chem -2001 -V. 276 -P. 33293- 33296.

127. Silverman, GA. Human clade B serpins (ov-serpins) belong to a cohort of evolutionarily dispersed intracellular proteinase inhibitor clades that protect cells from promiscuous proteolysis./GA. Silverman, JC. Whisstock, DJ. Askew, SC Pak, CJ. Luke, S. Cataltepe, JA. Irving, PI. Bird // Cell Mol Life Sci- 2004- V.61-P. 301-325.

128. Smith, ED. More than blood, a novel gene required for mammalian postimplantation development./ED. Smith ED,Y. Xu, BN. Tomson, CG. Leung, Y. Fujikawa, SH. Orkin, JD. Crispino// Mol Cell Biol-2004-V. 24-P. 1168-1173.

129. Smith, J. Differences in gene density on chicken macrochromosomes and microchromosomes ./ J.Smith, C.K. Bruley, I.R. Paton, I. Dunn, C.T. Jones D. Windsor, D.R. Morrice, A.S. Law, J. Masabanda, A. Sazanov, D. Waddington, R. Fries, D.W. Burt // Animal Genetics. -2000 -V. 31- P. 96-103.

130. Smith, S. J. Obesity resistance and multiple mechanisms of triglyceride synthesis in mice lacking DGAT1./ S.J. Smith, S.Cases, D.R. Jensen, H.C. Chen, E.Sande, B.Tow, D.A.Sanan, J. Raber, R.H.Eckel, R.V.Farese // Nat. Genet. - 2000 -V. 25 - P. 87-90.

131. Soranzo, N. Meta-analysis of genome-wide scans for human adult stature identifies novel loci and associations with measures of skeletal frame size. /N.Soranzo, F. Rivadeneira, U. Chinappen-Horsley, I. Malkina, JB. Richards, N. Hammond, L. Stolk, A. Nica, M. Inouye, A. Hofman, J. Stephens, E. Wheeler , P. Arp, R. Gwilliam,PM. Jhamai, S. Potter, A. Chaney , MJR. Ghori, R. Ravindrara-jah,S. Ermakov,K. Estrada, H. Pols, FM. Williams, WL. McArdle, JB. van Meurs, RJF. Loos, ET. Dermitzakis , KR. Ahmadi, DJ. Hart, WH. Ouwehand, NJ. Wareham, I. Barroso,MS. Sandhu ,DP. Strachan ,G. Livshits,TD. Spector,AG. Uitterlin-den,P.Deloukas //Plos Genet-2009 -V 5: el000445.

132. Sutani, T. Fission yeast condensin complex: Essential roles of non-SMC subunits for condensation and cdc2 phosphorylation of Cut3/SMC4./T. Sutani, T. Yuasa, T. Tomonaga, N. Dohmae, K. Takio, M. Yanagida. // Genes Dev-1999- P. 13 -V. 2271-2283.

133. Takagi, N. A phylogenetic study of bird karyotypes./ N. Takagi, M. Sasaki //Chromosoma. -1974- V. 46 - P. 91-120.

134. Tatsuda, K. Genetic mapping of QTL affecting body weight in chickens using a F2 family./ K. Tatsuda, K. Fujinaka // British Poultry Science. -2001 -V. 42 -№ 3 - P. 333-337.

135. Tickle, C. The contribution of chicken embryology to the understanding of vertebrate limb development. /Tickle, C// Mech.Development- 2004-V.121-P.1019-1029.

136. Tuiskula-Haavisto, M. Genome-wide significant QTL for egg quality and production in egg-layers./ M.Tuiskula-Haavisto, M. Honkatukia, J. Vikki, D. De Konig, N. Schulman, A. Maki-Tanila // Proceeding of the 2th poultry Genetics Symposium, Godollo. - 2001 -P. 128.

137. Tuiskula-Haavisto, M. Mapping of quantitative trait loci affecting quality and production traits in egg layers./M. Tuiskula-Haavisto, M. Honkatukia, J. Vilkki // Poult. Sci.- 2002. -V. 81.- P.919-927.

138. Tullet, S. G. Occurrence of waxy-textured yolk in the egg of the domestic hen (Gallus domesticus)./S.G. Tullet, A.B. Gilbert ,M.A. Walker, D. Waddington, MM. Perry, SG.Tullett // Br Poult Sci.- 1987 -V. 28(1 )-P. 147-153.

139. Vallejo, R.L. Genetic mapping of quantitative trait loci affecting susceptibility to marek's disease virus induced tumors in f2 intercross chickens./ R.L. Vallejo, L.D. Bacon, H.C. Liu, R.L. Witter, M.A.M. Groenen, J. Hillel, H.H. Cheng //genetics. - 1998- V. 148-№ 1-P. 349-360

140. Van Kaam, J.B.C.H.M. Whole genome scan in chickens for quantitative trait loci affecting growth and feed efficiency./ J.B.C.H.M. Van Kaam, M.A.M. Groenen, H. Bovenhuis, A. Veenendaal, A.L.J. Vereijken, J.A.M. Van Arendonk//poultry science.-1999-V. 78-№ 1 -P. 15-23.

141. Venkatesan, RN. Telomerase expression in chickens: constitutive activity in somatic tissues and down-regulation in culture./ RN.Venkatesan, C.Price//Proc Natl Acad Sci U S A.-1998-V. 8;95(25)-P. 14763-14768.

142. Weikard, R. Metabolomic profiles indicate distinct physiological pathways affected by two loci with major divergent effect on Bos taurus growth and lipid deposition. / R.Weikard, E. Altmaier, K. Suhre, KM. Weinberger,HM. Ham-mon, E. Albrecht, K. Setoguchi,A. Takasuga, C. Kühn // Physiol Genomics-2010-V. 42A- P. 79-88.

143. Woo, SL. Complete nucleotide sequence of the G. gallus chromosomal ovalbumin gene and its biological significance. /SL. Woo, WG. Beattie, JF. Catterall, A. Dugaiczyk, R. Staden, GC. Brownlee, BW. O'Malley // Biochemistry -1981 -V.20-P.6437- 6446.

144. Wallace, RA. Vitellogcnisis and oocyte growth in nonmammalian vertebrates./RA. Wallace// Browder LW Developmental Biology- 1985- -V. 1 -P. 127-177

145. Wallis, JW. A physical map of the chicken genome./ JW. Wallis, J. Aerts, MA. Groenen, RP. Crooijmans, D. Layman, TA. Graves // Nature.-2004-V.432-P.761-764.

146. Wardecka, B. Relationship between microsatellitc marker alleles on chromosomes 1-5 originating from the Rhode Island Red and Green-legged Partri-genous breeds and egg production and quality traits in F(2) mapping population./ B. Wardecka, R. Olszewski, K. Jaszczak, G. Zieba, M. Pierzchala, K. Wicinska // J Appl Genet. - 2002 -V. 43- P. 319-329.

147. Wardecka, B. Preliminary mapping of QTL,s affecting egg quality on chromosomes 1-5 in chickens / B. Wardecka, R. Olszewski, K.Jaszczak, G. Zieba, M. Pierzchala // Czech J. Anim. Sei. - 2003. - V. 48. -P. 97-105.

148. Weedon, MN. Genome-wide association analysis identifies 20 loci that influence adult height./ MN. Weedon, H. Lango, CM. Lindgrcn, C.Wallace, DM. Evans, M. Mangino,RM. Freathy,JRB. Perry, S. Stevens, AS. Hall, NJ. Sama-ni, B. Shields, I. Prokopenko,M. Farrall, A. Dominiczak.// Nat Genet -2008, -P. 40, -V.575-583.

149. Wood, A J. Condensin and cohesin complexity: The expanding repertoire of functions./AJ. Wood, AF. Severson, BJ. Meyer// Nat Rev Genet-2010- V. 11 -P.391-404

150. Wolc, A. Genome-wide association analysis and genetic architecture of egg weight and egg uniformity in layer chickens./ A. Wolc, J Arango, P. Settar, JE. Fulton, NP. O'Sullivan, R. Preisinger, D. Habier, R. Fernando, DJ. Garrick, WG. Hill, JC. Dekkers // Anim Genet.- 2012- V.43-P. 87-96.

151. Xin Tian. What Makes an Egg Unique? Clues from Evolutionary Scenarios of Egg-Specific Genes/ Xin Tian, Joel Gautron, Philippe Mongetand Géraldine Pascal //Biology of Reproduction- 2010 -V. 83 -P. 893-900.

152. Xing, J. Recombinant eggshell ovocalyxin-32: expression, purification and biological activity of the glutathione S-transferase fusion protein. /J. Xing, O.Wellman-Labadie, J. Gautron, MT. Hincke //Comp Biochem Physiol B Biochem Mol Biol- 2007-V. 147-P.l 72- 177.

153. Yang, Z. PAML 4: phylogenetic analysis by maximum likelihood./ Z. Yang // Mol Biol Evol- 2007- V. 24-P. 1586-1591.

154. Yeong, FM. Identification of a subunit of a novel kleisin-p/SMC complex as a potential substrate of protein phosphatase 2A./ F.M.Yeong, H. 1 lom-

bauer, KS. Wendl, T. Hirota, 1. Mudrak, K. Mechtler,T. Loregger, A. MarchlerBauer, K.Tanaka, J-M. Peters // Curr Biol -2003 -V.13-P. 2058-2064.

155. Youssef, EM. Hypermethylation and silencing of the putative tumor suppressor Tazarotene-induced gene 1 in human cancers./EM. Youssef, XQ. Chen, E. Higuchi,Y. Kondo, G. Garcia-Manero, R. Lotan, JP. Issa // Cancer Res- 2004 -V 64 -P 2411- 2417.