Аллельный полиморфизм и альтернативный сплайсинг в формировании полиморфности цитокиновой сети тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 14.03.09, доктор биологических наук Силков, Александр Николаевич

• Силков, Александр Николаевич
• доктор биологических наук
• 2013

Оглавление диссертации доктор биологических наук Силков, Александр Николаевич

ОГЛАВЛЕНИЕ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

ВВЕДЕНИЕ

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Цитокиновая сеть - сложная система регуляторных белков

1.2. Генетический полиморфизм белков цитокиновой сети

1.2.1. Функциональная значимость аллельного полиморфизма цитокинов

1.2.2. Аллельные варианты генов цитокинов в качестве биологических макеров предрасположенности и прогноза

1.2.3. Аллельные варианты цитокинов как составной копонент персонифицированной медицины

1.3. Альтернативный сплайсинг - молекулярный механизм формирования полиморфное™ цитокиновой сети

1.3.1. Распространенность альтернативного сплайсинга

1.3.2. Варианты образования сплайс-форм транскриптов цитокинов и их рецепторов

1.3.3. Регуляторный потенциал сплайс-вариантов цитокинов и рецепторов

1.3.4. Характеристики сплайс-вариантов некоторых цитокинов

ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

2.1. Выделение и культивирование мононуклеарных клеток периферической крови человека

2.2. Определение уровня продукции цитокинов МНК ПК in vitro на электрохемилюминометре

2.3. Иммуноферментный анализ концентрации цитокинов

2.4. Выделение ДНК

2.5. Выделение суммарной клеточной РНК

2.6. Реакция обратной транскрипции (ОТ)

2.7. Полимеразная цепная реакция (ПЦР)

2.8. Электрофоретическое разделение фрагментов ДНК

2.9. Элюция из фрагментов ДНК из ПААГ

2.10. Секвенирование и анализ последовательностей

2

2.11. Гидролиз ДНК эндонуклеазами рестрикции

2.12. Генотипирование ИЛ-lß по полиморфизмам +3954С/Т и -31С/Т методом ПЦР с последующей рестрикцией продукта амплификации

2.13. Генотипирование IL2 по полиморфизма м -675G/A, -475 А/Т и +114G/T методом ПЦР с последующей рестрикцией продукта амплификации

2.14. Генотипирование ИЛ-18 по полиморфизмам -607С/А и -137 G/C методом аллель специфической ПЦР

2.15. Генотипирование промоторного региона гена TNF

2.16. Статистический анализ результатов

ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЯ

3.1. Результаты исследования продукции цитокинов у носителей разных аллельных вариантов генов в норме

3.1.1. Изучение продукции IL-lß в культуре МНК у носителей разных аллельных вариантов гена IL1B в норме

3.2. Исследование частот аллелей и генотипов генов цитокинов при патологии

3.2.1. Частоты аллелей и генотипов полиморфных вариантов +39540Т и -310Т гена IL1B у больных РМЖ и в популяционной выборке женщин г. Новосибирска

3.2.2. Частоты аллелей и генотипов полиморфизмов-675G>A, -475 А>Т и+114G>T гена IL2 у больных РМЖ и в популяционной выборке женщин г. Новосибирска

3.2.3. Частоты аллелей и генотипов полиморфизмов -6070А и -137G>C гена IL18 у больных РМЖ и в популяционной выборке женщин г. Новосибирска

3.2.4. Анализ распределения полиморфных вариантов гена IL1B у условно здоровых доноров и больных РА

3.2.5. Анализ распределения полиморфных вариантов гена TNF среди здоровых доноров и больных РА

3.3. Изучение частоты встречаемости полиморфных вариантов генов провоспалительных цитокинов TNF-ct, IL-lß в группах больных ревматоидным артритом, с разной эффективностью терапии инфликсимабом

3.3.1. Изучение ассоциации полиморфных вариантов гена TNF-a с эффективностью терапии инфликсимабом у больных РА

3.3.2. Изучение ассоциации полиморфных вариантов гена IL1B с эффективностью терапии инфликсимабом у больных РА

3.4. Результаты исследования тканеспецифичности и онтогенетических особенностей экспрессии сплайс-вариантов МРНК цитокинов

3.4.1. Альтернативный сплайсинг мРНК IL-4 у человека

3.4.2. Альтернативный сплайсинг мРНК гена IL-6 у человека

3.4.3. Сплайс-варианты мРНК лейкемия-ингибирующего фактора (LIF) в различных фетальных тканях человека

3.4.4. Сплайс-варианты мРНК фактора стволовых клеток (SCF) в различных фетальных тканях человека

ГЛАВА 4. ОБСУЖДЕНИЕ ПОЛУЧЕННЫХ РЕЗУЛЬТАТОВ

4.1. Исследование продукции цитокинов у носителей разных аллельных вариантов генов в норме

4.2. Ассоциация полиморфных вариантов генов цитокинов с предрасположенностью к развитию рака молочной железы

4.3. Аллельный полиморфизм генов цитокинов при ревматоидном артрите

4.4. Изучение ассоциации полиморфных вариантов гена TNF-a с эффективностью терапии инфликсимабом у больных РА

4.5. Исследование экспрессии сплайс-вариантов мРНК генов цитокинов у человека

4.5.1. Альтернативный сплайсинг IL-4 и IL-6 у человека

4.5.2. Альтернативный сплайсинг факторов роста LIF и SCF у человека

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

ВЫВОДЫ

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

ACR - Американская коллегия ревматологии DAS - индекс активности болезни EST -экспрессирующиеся последовательности EULAR - Европейская противоревматическая лига HLA - человеческие лейкоцитарные антигены IFN - интерферон Ig - иммуноглобулин IL - интерлейкин

МНС — главный комплекс гистосовместимости

mIL - интерлейкин мыши

Ra - рецепторный антагонист

rhIL - рекомбинантный интерлейкин человека

SNP - единичный нуклеотидный полиморфизм

Th - Т-хелперы

TNFRI, TNFRII - ген, кодирующий рецептор фактора некроза опухоли I, II типов

TNF-a - фактор некроза опухоли альфа АПК - антиген-презентирующие клетки АС - альтернативный сплайсинг БА - бронхиальная астма

ДНК - дезоксирибонуклеиновая кислота

ЕРО - эритропоэтин

ИФА - иммуноферментный анализ

КМ - костный мозг

КонА - конканавалин А

ЛПС - липополисахарид

МАТ - моноклональные антитела

МНК ПК - мононуклеарные клетки периферической крови мРНК - матричная рибонуклеиновая кислота ОТ - обратная транскрипция п.о. - пары оснований

ПДРФ - полиморфизм длин рестрикционных фрагментов

ПЦР - полимеразная цепная реакция

РА - ревматоидный артрит

СОЭ - скорость оседания эритроцитов

СРБ - С-реактивный белок

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Аллельный полиморфизм и альтернативный сплайсинг в формировании полиморфности цитокиновой сети»

ВВЕДЕНИЕ

Актуальность исследования.

Для современной иммунологии система цитокиновой регуляции является одним из активно исследуемых направлений, которое, несмотря на значительные успехи, до сих пор не раскрыто полностью. Повышенный интерес к цитокиновой сети определяется ее значимостью в обеспечении межклеточной передачи сигналов не только в пределах иммунной системы, но и в отношении самых разных клеток и систем организма. Причина неполной изученности определяется сложностью организации цитокиновой регуляторной сети и значительной плейотропностью эффектов, оказываемых цитокинами на разные типы клеток - мишеней [22]. И универсальность, и сложность организации системы цитокиновой регуляции являются следствием многообразия регуляторных белков и их эффектов. Полиморфность цитокиновой сети формируется различными путями и определяется на генетическом уровне и на уровне транскриптов. Одним из механизмов является генетический (аллельный) полиморфизм генов цитокинов и их рецепторов.

Обычно аллельные варианты генов цитокинов являются результатом мутаций в некодирующих областях генов и встречаются достаточно часто, при этом они могут иметь влияние на продукцию и функциональную активность белков цитокиновой сети. Это влияние может быть опосредовано через изменение функциональных сайтов, контролирующих транскрипцию, созревание и транспортировку соответствующих мРНК [63, 139]. Например, полиморфизм внутри 5' и 3' фланкирующих регуляторных районов или внутри интронов может влиять на уровни транскрипции и трансляции, стабильность РНК и механизмы сплайсинга пре-мРНК [144]. Многие из известных аллельных вариантов различаются по уровню экспрессии

соответствующего гена, определяя тем самым уровень продукции цитокина и соответственно уровень его эффектов [63, 139]. В последнее время накапливается все больше данных, свидетельствующих о том, что аллельный полиморфизм генов цитокинов, вносит существенный вклад в экспрессию конечных продуктов самих белков, влияя тем самым и на процессы, которые регулируют эти медиаторы. Таким образом, формируется механизм, связывающий генетические варианты цитокинов с физиологическими и патологическими особенностями их продукции в норме и при различных заболеваниях и обосновывающий практическое использование цитокинов. С одной стороны это практическое использование выражается в разработке цитокиновых и антицитокиновых методов терапии иммунозависимых заболеваний, а с другой, в попытках использования генетического полиморфизма цитокинов „ в качестве биомаркеров, ассоциированных с предрасположенностью или особенностями течения этих заболеваний. Следует сказать, что скорость «трансляции» молекулярно-биологических знаний в практическую медицину увеличивается с каждым годом, отражая явную тенденцию развития биомедицинских исследований и подходов к терапии с перспективой их слияния в единое направление, которое в настоящее время обозначается как «персонифицированная медицина». Следовательно, изучение влияния аллельного полиморфизма генов цитокинов на уровень продукции самих медиаторов и исследование эффективности антицитокиновой терапии в зависимости от аллельного полиморфизма генов цитокинов и их рецепторов представляются актуальными научными и практическими задачами, которые раскрывают механизмы одного из основных путей формирования полиморфности системы цитокинов. На роль второго основного пути формирования полиморфности системы цитокинов, как уже отмечалось, может в полной мере претендовать альтернативный

сплайсинг транскриптов (пре -мРНК).

8

Общее количество генов, обнаруженное в геноме человека, в

процессе выполнения полногеномного секвенирования по разным

подсчётам не превышает 30-40 тысяч, в то же время база

экспрессирующихся последовательностей человека на порядок больше.

Причины этого многообразия кроются в посттранскрипционных

событиях, наиболее значимое из которых - сплайсинг пре-мРНК.

Альтернативный сплайсинг пре-мРНК, благодаря комбинированию

порядка и количества экзонов, наряду с альтернативной инициацией

транскрипции и альтернативным полиаденилированием позволяет

продуцировать различные зрелые транскрипты от одного единственного

гена без изменения его геномной организации. Белки, образующиеся

вследствие трансляции альтернативно сплайсированных мРНК, могут

выполнять как сходные, так и различные функции. Сплайсинг

транскриптов некоторых генов может происходить по-разному в

зависимости от типа ткани, стадии развития организма, пола [23].

Альтернативный сплайсинг активно участвует в формировании

полиморфизма системы цитокиновой регуляции, а изоформы белков

цитокинов значительно расширяют регуляторные функции различных

цитокинов, поскольку обладают свойствами отличными (или

противоположными) от полноразмерных белков [273, 46, 295]. Этот

факт может серьезно дополнить современное представление о

цитокиновой регуляции гемо - и иммунопоэза, а также может дать в

руки клинических иммунологов специфические биологические

препараты с новыми свойствами [46]. Не смотря на достаточно активное

исследование сплайс-вариантов цитокинов у человека, ряд вопросов

остается не выясненным. В частности, на сегодня систематизированных

данных по тканеспецифичности образования сплайс-форм транскриптов

оказывается недостаточно, хотя они являются фактически единственным

путём выяснить физиологическую роль изоформ этих медиаторов. А

изучение тканеспецифического распределения различных изоформ

9

мРНК цитокинов в онтогенезе может во многом поменять наши взгляды на регуляцию иммунных и дифференцировочных процессов. Таким образом, изучение альтернативного сплайсинга и генетического полиморфизма цитокинов является актуальным фундаментальным и перспективным практическим направлением исследований.

Цель и задачи исследования

Цель работы: Охарактеризовать вклад аллельного полиморфизма и альтернативного сплайсинга в формирование структурного и функционального многообразия в системе цитокинов.

Задачи исследования

1. Изучить связь генетического полиморфизма с продукцией IL-1(3, IL-2, и TNF-a в норме.

2. Провести сравнительное исследование частот встречаемости аллелей и генотипов IL18, IL1B, IL2 в норме и при раке молочной железы у женщин.

3. Провести сравнительное исследование частот аллельных вариантов генов TNF и IL1В в норме и при ревматоидном артрите и их ассоциации с эффективностью анти-TNF терапии инфликсимабом у больных ревматоидным артритом.

4. Изучить спектр изоформ мРНК гена IL4 и выполнить количественный анализ их уровня в фетальных тканях человека. Охарактеризовать эффекты внешних цитокиновых стимулов на формирование сплайс-форм мРНК IL-4 в мононуклеарных клетках периферической крови человека in vitro.

5. Изучить тканеспецифичность образования сплайс-вариантов мРНК гена IL6 в фетальных тканях человека и их спектр в мононуклеарных клетках человека in vitro.

6. Изучить сплайс-варианты мРНК генов LIF и SCF в фетальных тканях и в мононуклеарных клетках человека на разных стадиях онтогенеза.

Научная новизна работы

Впервые получены данные о взаимосвязи аллельных вариантов гена TNF в позициях -238G>A и -8570Т с уровнем его спонтанной и стимулированной Кон А продукции МНК ПК условно здоровых доноров.

Впервые выявлено сочетание генотипов -238GG/-308GG/-857CC/-1031NC, носители которого, среди условно здоровых доноров, характеризуются наименьшей продукцией TNF-a как интактными, так и митоген-стимулированными мононуклеарными клетками в культуре при сравнении с группой носителей остальных генотипов.

Впервые получены данные по ассоциации аллельных вариантов генов TNF в позиции -8570Т и IL1B в позиции -31 Т>С с эффективностью антицитокиновой терапии инфликсимабом у больных ревматоидным артритом. Показано, что генотип СС и аллель С полиморфизма промотора гена TNF в позиции -8570Т чаще представлены у больных с неэффективной терапией. Установлено, что генотип -31 TT гена IL1B чаще встречается у больных с эффективной терапией.

В результате исследования генетического полиморфизма цитокинов IL-lß (+39540Т) и IL-18 (-137G>C и -6070А) впервые установлена их ассоциация с предрасположенностью к развитию рака молочной железы в исследованной популяции жительниц Юго-Западной Сибири.

Впервые продемонстрирована экспрессия мРНК IL-4alt3 и мРНК IL-68254 в мононуклерных клетках человека. Экспрессия изоформ мРНК IL-4 и IL-6 в фетальных тканях человека имеет тканеспецифический характер.

Впервые исследована экспрессия сплайс-вариантов мРНК генов SCF и LIF в фетальных тканях человека и выявлена ее тканеспецифичность. Кроме того показано, что спектр и частота выявления сплайс-вариантов мРНК генов SCF и LIF в мононуклеарных клетках максимальны в период внутриутробного развития и в период новорожденности осуществляя вклад в реализацию системных эффектов этих ростовых факторов на разных стадиях онтогенеза.

Теоретическая и практическая значимость работы.

Получены данные о влиянии аллельного полиморфизма промотора гена TNF в позициях -238 и -857 на уровень продукции конечного белка мононуклеарными клетками, что является одной из причин индивидуальных различий в выраженности иммунных реакций, регулируемых данным медиатором, у носителей этих генотипов в норме и может являться одним из молекулярных механизмов их участия в патологических процессах. Выявлено изменение частоты встречаемости этих аллельных вариантов гена TNF у больных РА, по сравнению с группой популяционного контроля, что может являться маркером предрасположенности к указанному заболеванию. Установлено, что эффективность терапии инфликсимабом зависит от аллельного полиморфизма генов TNF и 1Ь1В,локализованнных соответственно в позициях -857 и -31, что определяет перспективность их исследования в качестве биологических маркеров при разработке комплексных критериев прогноза эффективности терапии инфликсимабом у конкретного пациента. Получено положительное решение по заявке на изобретение №2011128114 «Способ прогнозирования эффективности лечения ревматоидного артрита моноклональными антителами к ФНО-а на основе аллельного полиморфизма промотора гена ФНО».

Результаты сравнительного исследования полиморфизма генов цитокинов в норме и при раке молочной железы обосновывают использование полиморфизмов генов 1ЫВ и 1Ы8 в качестве биологических маркеров при разработке комплексных критериев прогноза риска развития рака молочной железы, а также особенностей его течения у жительниц Западносибирского региона.

Исследование сплайс-вариантов мРНК показало, что экспрессия генов 1Ь-4, 1Ь-6, БСБ и ЬШ в клетках человека происходит с участием альтернативного сплайсинга и может изменяться под действием внешних сигналов, в том числе цитокиновых. Для всех исследованных цитокинов наблюдается тканеспецифическая экспрессия изоформ, которая имеет качественные и количественные различия. В частности в период фетального развития человека, установлено, что экспрессия изоформ мРНК БСР и ЬШ может быть доминантной и имеет значение для тканеспецифической регуляции и для онтогенеза тканей. Факт экспрессии генов цитокинов в виде нескольких форм существенно дополняет и органично вписывается в понимание функционирования иммунной системы. Полученные данные свидетельствуют о возможности непосредственного участия изоформ цитокинов в иммунном ответе. Выяснение спектра экспрессирующихся изоформ цитокинов в различных тканях может быть полезным для определения их роли в норме и патологии.

Результаты исследования раскрывают значимость генетического полиморфизма и альтернативного сплайсинга транскриптов в формировании общей полиморфности цитокиновой регуляторной сети.

Основные положения, выносимые на защиту.

1. Аллельные варианты генов цитокинов, ассоциированные с изменением уровня продукции конечного белка, могут

являться патогенетическим фактором ревматоидного артрита и рака молочной железы.

2. Эффективность терапии ревматоидного артрита моноклональными антителами против TNF-a связана с аллельным полиморфизмом в позиции -857 промотора гена TNF.

3. Спектр, баланс и уровень сплайс-вариантов мРНК цитокинов в фетальных тканях человека и в мононуклеарных клетках периферической крови характеризуется тканеспецифичностью и может изменяться под действием внешних сигналов, например при стимуляции клеток митогенами или другими цитокинами.

4. Аллельный полиморфизм и альтернативный сплайсинг являются молекулярными механизмами обеспечивающими формирование количественного уровня и качественного состава белков цитокиновой сети.

Апробация материалов диссертации (устные доклады).

Материалы диссертации доложены и обсуждены на: 1) Международной научно-практической школе-конференции «Цитокины. Воспаление. Иммунитет», (Новосибирск, 2002г.,) 2) 6-й отчетной конференции ГУ НИИКИ СО РАМН (Новосибирск, 2003г.), 3) 7-ом Всероссийском научном форуме с международным участием имени академика В.И. Иоффе «Дни иммунологии в Санкт-Петербурге» (Санкт-Петербург, 2003 г.), 4) 8-ом всероссийского научном форуме с международным участием имени В.И. Иоффе «Дни иммунологии в Санкт-Петербурге» (Санкт-Петербург, 2004г.), 5) 12-ом всероссийском научном форуме с международным участием имени В.И. Иоффе «Дни иммунологии в Санкт-Петербурге» (Санкт-Петербург, 2008г.), 6)Всероссийской научной конференции «Молекулярно-генетичекие

основы функционирования цитокиновой сети в норме и при патологии» (Новосибирск, 2010г.), 7)международном конгрессе ЕиЪАЯ 2010 (Италия, Рим, 2010), 8)8-й отчетной научной конференции НИИКИ СО РАМН (2011г.), 9)международном конгрессе ЕЦЪАК 2012 (Германия, Берлин, 2012). 10) Расширенном семинаре ФГБУ «НИИКИ» СО РАМН (Заседании проблемной комиссия № 55.07 «Иммунология» ) 20 сентября 2012г.

Публикации.

По теме диссертации опубликовано 24 научных работы, в том числе 10 статей в журналах, рекомендованных ВАК для публикации материалов диссертационных работ. Получено положительное решение о выдаче патента на изобретение «Способ прогнозирования эффективности лечения ревматоидного артрита моноклональными антителами к ФНО-а на основе аллельного полиморфизма промотора гена ФНО» №2011128114 от 20.01.2013, Бюл. № 2.

Структура и объем диссертации.

Диссертация изложена на 224 страницах машинописного текста, состоит из обзора литературы, описание материалов и методов исследования, результатов собственных исследований, обсуждения, заключения и выводов. Библиографический указатель включает 300 источников, из них 270 зарубежных. Работа иллюстрирована 13 рисунками и 36 таблицами.

Личный вклад автора в проведение исследования

Результаты, представленные в данной работе, получены лично автором, а также в сотрудничестве с В.А. Садовской, О.П. Яценко, Е.П. Горевой, Н.С. Шкаруба. Исследование выполнено на базе лаборатории молекулярной иммунологии ФГБУ «НИИКИ» СО РАМН.

Секвенирование неизвестных последовательностей полученных фрагментов ДНК было осуществлено сотрудниками ИХБФМ СО РАН.

Автор выражает благодарность сотрудникам лаборатории клеточных биотехнологий ФГБУ «НИИКИ» СО РАМН за любезно предоставленные для исследований образцы фетальных тканей человека (руководитель лаборатории д.м.н. Селедцова Г.В.).

Большую признательность автор выражает научному консультанту работы профессору, д.м.н. C.B. Сенникову за конструктивные предложения по содержанию работы и подробное обсуждение полученных результатов, а также всем сотрудникам лаборатории молекулярной иммунологии ФГБУ «НИИКИ» СО РАМН за благожелательное отношение в ходе выполнения работы.

Заключение диссертации по теме «Клиническая иммунология, аллергология», Силков, Александр Николаевич

выводы

1. Формирование полиморфности цитокиновой сети происходит с участием аллельных вариантов генов цитокинов, о чем свидетельствуют результаты исследования их ассоциации с уровнем продукции конечных белков и развитием заболеваний, а также с участием альтенативного сплайсинга, что подтверждается тканеспецифичностью экспрессии сплайс-форм мРНК ряда цитокинов и изменением их спектра в онтогенезе и под действием внешних факторов.

2. Аллельный полиморфизм промотора гена TNF в позициях -238 и -857 является функционально значимым. У условно здоровых доноров носителей генотипа -857СС снижена КонА-стимулированная продукция TNF-a в культурах МНК ПК, а у носителей генотипа -238GG снижена спонтанная продукция и повышен индекс стимуляции, по сравнению с носителями альтернативных аллельных вариантов.

3. Показано, что среди условно здоровых доноров носители сочетания генотипов гена TNF -238GG/-308GG/-857CC/-103 INC, характеризуются статистически значимо наименьшей спонтанной и митоген-стимулированной продукцией TNF-a, а носители сочетания -31ТТ/+3954СТ гена IL1B демонстрировали сниженную стимуляцию митогеном КонА продукции IL-lß в сравнении с носителями сочетания -31ТС/+3954СТ. Это указывает на участие аллельного полиморфизма генов в формировании индивидуальных особенностей уровня продукции цитокинов.

4. Аллельные варианты цитокинов IL-lß и IL-18 имеют значимую ассоциацию с предрасположенностью к развитию рака молочной железы и особенности распределения частот генотипов в группах больных, различающихся по типу выявленного рака и характеру роста опухоли, что свидетельствует о прогностической значимости аллельных вариантов IL1B +3954, IL18 -137 и IL18 -607 при раке молочной железы в исследованной популяции жительниц Юго-Западной Сибири.

5. Повышение частоты генотипа GG и аллеля G в позиции -238 и снижение частоты аллеля С в позиции -857 промотора гена TNF у больных ревматоидным артритом, по сравнению с группой популяционного контроля, указывает на ассоциированность этих аллельных вариантов промотора гена TNF с заболеванием.

6. Генотип СС и аллель С в позиции -857 промотора гена TNF чаще представлены у больных с неэффективной терапией инфликсимабом, а генотип -31 TT гена IL1B чаще встречается у больных с эффективной терапией инфликсимабом, что свидетельствует о влиянии генетического фактора на эффективность данного метода терапии.

7. В фетальных тканях человека альтернативный сплайсинг мРНК генов IL4 и IL6 такнеспецифичен. Экспрессия сплайс-вариантов мРНК: IL-4 и IL-452; IL-6, IL-652 и-IL-68254 имеет качественные и количественные отличия в разных типах тканей.

8. В мононуклеарных клетках, культивированных в присутствии rhIL-18 была обнаружена не описанная ранее у человека

179 изоформа мРНК интерлейкина-4 со сплайсированным третьим экзоном - 1Ь-4аН;3, что свидетельствует об изменении сплайсинга транскриптов гена 1Ь4 под действием внешних сигналов.

В интактных мононуклеарных клетках человека обнаружены сплайс-варианты мРНК: 1Ь-6, 1Ь-652 и 1Ь-68284. В процессе культивирования клеток происходит изменение спектра сплайс-вариантов мРНК, изоформа 1Ь-68284 исчезает, указывая на зависимость сплайсинга от микроокружения клеток.

Неоднородность экспрессии сплайс-форм как в пределах одной ткани разных индивидов, так и в разных тканях одного организма отражает тканеспецифический характер регуляции альтернативного сплайсинга транскриптов ЬШ и ЭСБ в фетальных тканях человека. В мононуклеарных клетках крови человека разнообразие сплайс-форм мРНК и уровень экспрессии генов ЬШ и БСР снижается при переходе от пренатального в постнатальный период развития, что отражает снижение системных эффектов этих цитокинов во взрослом организме.

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

В результате проведения исследований продемонстрирована связь уровня продукции ТЫБ-а МНК ПК с генотипами промотора гена ГМ\ Так носители генотипа -23800 характеризовались относительно низкой спонтанной продукцией ТЫБ-а в культурах МНК ПК в сравнении с гетерозиготами -238СА, в тоже время стимуляция клеток митогеном КонА вызывала у носителей генотипа -23800 более выраженное усиление продукции этого цитокина. Носители генотипа -857СС характеризовались более низкой продукцией ТЫБ-а в культурах МНК при обработке клеток КонА в сравнении с носителями альтернативного аллеля. Кроме того, было выявлено, что носители сочетания генотипов -23800/-30800/-857СС/-103ШС, характеризуются наименьшей продукцией ТЫТ-а как интактными, так и стимулированными КонА и ЛПС мононуклеарными клетками в культуре при сравнении с носителями остальных генотипов. Также комбинация генотипов гена 1Ь1В -31ТТ/+3954СТ характеризуется сниженной КонА -стимулированной продукцией 1Ь-1(3 в сравнении с сочетанием -31ТС/+3954СТ. Полученные результаты свидетельствуют о наличии связи полиморфизма генов цитокинов с уровнем" продукции конечного белка.

Учитывая полученные данные, о различии уровня продукции цитокинов у носителей разных аллельных вариантов их генов, можно предположить, что генетический полиморфизм является одним из факторов предрасположенности к развитию заболеваний. Мы провели проверку этого предположения для таких патологий как рак молочной железы и ревматоидный артрит.

Исследование частот аллелей и генотипов 1Ь1В при РМЖ, показало статистически значимое увеличение гомозигот +3954ТТ в 2,5

171 раза в подгруппе больных РМЖ с дольковой формой рака по сравнению с контрольной группой и в 3 раза по сравнению с подгруппой больных РМЖ с протоковой формой рака. Для гена IL2 выявлно наличие минорной ассоциации полиморфизма +114G>T, в группе РМЖ наблюдался повышенный уровень гетерозиготного носительства в сравнении с популяционным контролем. Исследование полиморфизма промотора гена IL 18 выявило ассоциацию гомозигот GG и СС в позиции -137 с предрасположенностью к раку молочной железы. По однонуклеотидному полиморфизму -607С>А выявлено достоверное увеличение гомозигот СС, снижение гомозигот АА и частоты минорного аллеля А у больных РМЖ по сравнению с контролем. А также у больных РМЖ с дольковой формой рака показано статистически достоверное увеличение частоты гетерозигот -607СА в 1,5 раза по сравнению с подгруппой больных РМЖ с протоковой формой рака. Тем самым было показано наличие ассоциации генетического полиморфизма исследованных цитокинов с предрасположенностью к развитию РМЖ и формой выявляемого рака.

В исследовании у больных РА показано изменение частоты встречаемости генотипов промотора гена TNF, а именно, достоверно чаще встречается генотип -238GG (характеризующийся сниженной спонтанной продукцией TNF-a в культурах МНК ПК в сравнении с гетерозиготами -238GA, но более выраженным усилением продукции этого цитокина в ответ на стимуляцию митогеном КонА) и аллель G в позиции -238G>A промотора гена TNF. Было показано, что аллель С в позиции -857С>Т промотора гена TNF встречается в группе больных РА статистически значимо реже в сравнении с группой популяционного контроля, отметим, что в норме гомозиготные носители этого аллеля (-857СС) характеризовались пониженным уровнем продукции TNF-a в культурах МНК ПК при обработке клеток митогеном КонА в сравнении с носителями альтернативного аллеля. Важно отметить, что распределение частот генотипов полиморфизма -8570Т в группе больных ревматоидным артритом имело отклонение от ожидаемого в соответствии с равновесием Харди-Вайнберга, что свидетельствует о наличии факторов, влияющих на частоту аллелей и генотипов в группе больных. Таким образом, можно заключить, что среди больных РА, достоверно чаще встречаются индивиды, имеющие генетическую предрасположенность к повышенному стимулированному уровню продукции TNF-a, а для индуцибельных цитокинов, к которым относится TNF-a, особое значение имеет именно уровень стимулированной продукции, что согласуется с современными представлениями о патогенезе этого заболевания и о роли TNF-a в его развитии.

В связи с активной разработкой и применением в современной терапии «биологических терапевтических агентов», в том числе рекомбинантных белков и блокирующих моноклональных антител, одной из актуальных научных и практических задач является поиск подходов для индивидуального прогноза эффективности применения цитокиновых и антицитокиновых стратегий терапии. В этой связи вполне логичным кажется исследование и всесторонняя, в том числе генетическая, характеристика мишени антицитокиновой терапии с целью выявления потенциальных маркеров пригодных для подобного прогноза. В проведенном исследовании попытка решения такой задачи предпринята в отношении анти-ФНО терапии ревматоидного артрита, одной из причин неэффективности которой может быть различный уровень TNF-a у больных РА, и как следствие, превалирование в патогенезе этого заболевания другого цитокина. В ходе работы, получены данные, что аллель С и гомозиготый по этому аллелю генотип промотора гена TNF в позиции -8570Т, ассоциированный с пониженным уровнем стимулированной КонА продукции TNF-a, чаще представлен у больных с неэффективной терапией инфликсимабом. Кроме того, установлено, что генотип -31 TT гена IL1B чаще встречается у больных с эффективной терапией, что может косвенно свидетельствовать о роли этого цитокина в развитии заболевания.

Таким образом, аллельный полиморфизм гена TNF в позиции -857 влияет на уровень продукции конечного медиатора мононуклеарными клетками и может являться одним из факторов ассоциированности с РА и с эффективностью применения терапии блокаторами TNF-a (в частности инфликсимаба) у пациентов с этим заболеванием. Следовательно, полиморфизм -857С>Т промотора гена TNF может рассматриваться в качестве потенциального молекулярного маркера неэффективной терапии ревматоидного артрита анти-TNF-a антителами. Также в качестве генетического маркера может служить полиморфизм гена IL1B в позиции -31, так как показана ассоциация генотипа -31 TT с эффективной терапией ингибиторами TNF-a (в частности инфликсимабом).

Блок исследований, связанный с генетическим полимрфизмом, позволил проиллюстрировать его влияние на уровень продукции цитокинов или количественное разнообразие в цитокиновой сети. Качественное разнообразие, формирующее полиморфность на структурном уровне, было исследовано нами во втором блоке, посвященном изучению альтернативно-сплайсированных вариантов мРНК цитокинов.

Результаты исследований сплайс-вариантов мРНК позволяют сказать, что в фетальных тканях человека экспрессия гена IL4 происходит с участием альтернативного сплайсинга и имеет тканеспецифический характер, поскольку в некоторых тканях обнаруживался только полноразмерный вариант (в образцах тканей сердечной мышцы и лёгкого), в других - только альтернативный (IL-482в образцах тканей ребра и скелетной мышцы), в третьей группе (образцы тканей яичника и мозга) - оба сплайс-варианта. Кроме того, в фетальных тканях, имеющих непосредственное отношение к гемопоэзу и иммунопоэзу показано, что экспрессия полноразмерного варианта в тимусе в среднем на 1-2 порядка выше, чем в печени и селезёнке. Количественный анализ мРНК IL-452 показал, что в печени его в среднем в 2-5 раз больше чем в селезёнке или тимусе. Эти данные позволяют говорить о тканеспецифической регуляции альтернативного сплайсинга гена IL-4 и предполагать о возможном регуляторном влиянии этих изоформ, учитывая тот факт, что их биологические эффекты на функциональную активность клеток могут носить различный характер. Также представляют определенный интерес и обнаруженные факты, что в интактных мононуклеарных клетках и клетках культивированных в присутствии rhIL-18 был обнаружен дополнительный фрагмент кДНК соответствующий не описанной ранее у человека изоформы матричной РНК интерлейкина-4 со сплайсированным третьим экзоном IL-4alt3. Эти данные говорят, что иммунорегуляторные молекулы (в частности IL-18) могут влиять на альтернативный сплайсинг этого гена в клетках.

Для гена IL6 человека также получен ряд интересных данных, говорящих в пользу возможного участия изоформ этого гена в регуляции. В частности показано, что в фетальных тканях человека экспрессия гена интерлейкина-6 происходит с участием альтернативного сплайсинга с образованием сплайс вариантов мРНК уровень экспрессии, которых имеет качественные и количественные отличия. Кроме того, в мононуклеарных клетках человека были обнаружены мРНК IL-6, мРНК IL-682 и мРНК IL-68284, ранее обнаруживаемая только в клетках ткани легкого и фибробластах. В процессе культивирования МНК ПК человека происходит изменение спектра экспрессируемых сплайс-вариантов мРНК интерлейкина-6: изоформа мРНК 1Ь-68284 исчезает.

В отношении цитокинов 8СР и ЫР, относящихся к факторам роста, выполняющим важную роль в регуляции эмбриональных стволовых клеток и низкодифференцированных клеток иммунной системы также получены данные демонстрирующие, что сплайсинг их транскриптов на разных этапах онтогенеза носит тканеспецифический характер. Показана избирательная экспрессия сплайс-форм мРНК ЬШ в зависимости от типа фетальных тканей человека, при этом типы преобладающей изоформы в тканях мозга, печени, тимуса и селезенки отличаются, что указывает на различные биологические функции изоформ ЫР. Неоднородность экспрессии сплайс-форм как в пределах одной ткани разных индивидов, так и в разных тканях одного организма отражает тканеспецифический характер регуляции альтернативного сплайсинга транскриптов БСР в фетальных тканях человека. В мононуклеарных клетках крови человека разнообразие сплайс-форм мРНК и уровень экспрессии генов 8СР и ПР снижается при переходе от пренатального в постнатальный период развития, что отражает снижение системных эффектов этих цитокина во взрослом организме.

Исходя из полученных данных, что экспрессия генов ряда цитокинов у человека происходит участием альтернативного сплайсинга, качественно и количественно различается в разных тканях, можно говорить о тканеспецифической регуляции альтернативного сплайсинга транскриптов этих генов и о возможных тканеспецифических эффектах изоформ цитокинов, имеющих важное значение в онтогенетическом становлении иммунной системы и других систем в организме.

Обобщая оба блока исследований можно говорить, что аллельный полиморфизм генов и альтернативный сплайсинг транскриптов цитокинов являются двумя весьма важными факторами, которые формируют сруктурное и функциональное многообразие в системе цитокиновой регуляции. В частности, генетический полиморфизм оказывает преимущественное влияние на количественный (уровень цитокинов), а альтернативный сплайсинг преимущественно на качественный (спектр цитокинов) уровни формирования полиморфности в регуляторной цитокиновой сети.

Список литературы диссертационного исследования доктор биологических наук Силков, Александр Николаевич, 2013 год

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

Андреев С. М., Башкатова Ю. Н., Петрухина А. О., Дубинкин И. В., и др. IL-452 человека: структура и количественный анализ // Иммунология №1, 2010 стр. 18-25

Баранов B.C. Молекулярная медицина: молекулярная диагностика, превентивная медицина и генная терапия // Молекулярная биология. - 2000. -Т. 34. - № 4. - С. 684-695. B.C.

Баранов, Е.В. Баранова Геном человека, эпигенетика многофакторных болезней и персонифицированная медицина // Биосфера 2012, Т. 4 № 1, С. 75-85.

Бережная Н.М., Чехун В.Ф. Система интерлейкинов и рак.

- Киев ДИА, 2000. С. 224

Голованова О. В., Коненков В. И., Шевченко А. В. и др. Полиморфизм гена TNF (С-308А, G-863A, G-238A) у больных раком молочной железы // Иммунология. — 2009.

— №2. —С. 92—95.

Гуськова Л.В. Экспрессия генов цитокинов в клетках эритроидного ряда. Автореф. дис. канд. биол. наук . -Новосибирск.: 1995 .

Инжелевская Т.В. Продукция гемо- иммунорегуляторных цитокинов клетками эритроидного ряда мыши и человека. Автореф. дис. канд. мед. наук. -Новосибирск.: 2001. - 20 с.

Казюкова Т.В., Левина A.A., Сергеева А.И., Самсыгина Г.А. и др. Феррокинетика и цитокины в раннем онтогенезе

человека // Педиатрия. -2008. -Т87. -№1 -с 7-17.

Кетлинский С.А., Симбирцев A.C., Воробьев A.A. Эндогенные иммуномодуляторы. -С-Пб.: Гиппократ, 1992. -256 с.

Коненков В. И., Голованова О. В., Прокофьев В. Ф., Шевченко А. В., Распределение аллельных вариантов промоторных участков генов цитокинов и гена фактора роста сосудистого эндотелия среди здоровых людей и пациентов с ревматоидным артритом в популяции европеоидного населения России // Вестник Российской академии медицинских наук .-2010.-N9.-C. 9-14

Коненков В. И., Прокофьев В. Ф., Шевченко А. В. И др. Комплексный анализ полиморфизма в промоторных участках генов цитокинов IL-lb Т-31С, IL-6 G-174C, TNFa G-238A, TNFa G-308A, TNFa C-863A, IL-4 C-590T и IL-10 C-592А в прогнозе эффекта от лечения ревматоидного артрита // Медицинская иммунология -2010, Т. 12, № 4-5, с. 361-374

Коненков В.И. Цитокиновые полигенные комплексы -маркеры индивидуальной настройки состояния цитокиновой сети здорового человека и пациентов с заболеваниями различной природы // Аллергология и иммунология -2011.-N 2.-С.191-194.

Коненков В.И., Шевченко A.B., Прокофьев В.Ф., Голованова О.В. Полиморфизм генов цитокинов как один из факторов демографической структуры европеоидного населения Сибири. // Иммунология, 201 l.-N 2.-С.60-65

Коробко Д.С., Кудрявцева Е.А., Малкова H.A., Филипенко

182

M.JI. Связь полиморфизмов генов цитокинов со скоростью прогрессирования рассеянного склероза. // Журнал неврологии и психиатрии имени С.С. Корсакова. -2012.-N 2.-С.9-15.

15. Крысов C.B. Курамшин Д.Х. Силков А.Н. Сенников C.B. Козлов В.А. Использование электрохемилюминесцентного метода для детекции цитокинов в различных средах // Клиническая лабораторная диагностика. -2000. -с. 39-43.

16. Крысов C.B. Продукция цитокинов эритроидными ядросодержащими клетками фетальной печени человека. Дисс. канд. биол. наук. -Новосибирск.: 2001. - 119 с.

17. Кукес В.Г. , Сычев Д.А., Игнатьев И.В. Фармакогенетика -персонифицированная медицина // Вестник московского городского научного общества терапевтов. -2010. - №2 -С. 56.

18. Молчанов O.E., Карелин М.И., Жаринов Г.М. Современные тенденции применения препаратов рекомбинантного интерлейкина -2 в онкологии. // Цитокины и воспаление. 2002. Т. 1. № 3. С. 38-47.

19. Силков А.Н., Гавриленко В.А., Денисова В.В., Гришина Л.В., и др. Двойственность эффектов рекомбинантного IL-452 на мононуклеарные клетки периферической крови человека // БЭБиМ. - 2007. - Том 143, № 1. - С. 78-80

20. Силков А.Н., Инжелевская Т.В., Крысов C.B., Сенников C.B., Козлов В.А. Экспрессия сплайс-вариантов мРНК генов ИЛ-4 и ИЛ-6 в эритроидных клетках человека // Бюлл. СО

РАМН. - 2007. - № 4. - С. 129-131.

183

21. Симбирцев A.C. , Громова А.Ю. Функциональный полиморфизм генов регуляторных молекул воспаления // Цитокины и воспаление. 2005. Т. 4, № 1. С. 3-10.

22. Симбирцев A.C. Цитокины: классификация и биологические функции // Цитокины и воспаление, 2004, № 2, 16-22

23. Сингер М., Берг П. Гены и геномы . В 2-х т. Пер. с англ. -М.: Мир, 1998. Т. 2. - С. 104-125.

24. Степанов В.А. Геномы, популяции, болезни: этническая геномика и персонифицированная медицина // Acta Naturae 2010, T. 2 №4 (7), С. 18-34.

25. Субботин A.B., Глушков А.Н., Арефьева Е.Г., Шабалдин A.B. и др. Полиморфизм генов HLA DRB2 и генов цитокинов IL lß, IL Ira и их влияние на возникновение и течение рассеянного склероза. // Медицина в Кузбассе. -2004. №2,-с. 18-22.

26. Фрейдин М.Б., Пузырев В.П., Огородова JI.M. и др. Полиморфизм генов интерлейкинов и их рецепторов: популяционная распространенность и связь с атопической бронхиальной астмой. Генетика. 2002. Т. 38. № 12. С. 17101718.

27. Хрипко О. П., Якушенко Е. В., Сенникова Н. С., Хрипко Ю. И., и др. Аллельный полиморфизм промотора гена интерлейкина-18 при хроническом гепатите В // Эпидемиология и инфекционные болезни . — 2009 . — N 1 . — С. 18-21 .

28. Чешук В.Е., Ковальчук Е.В., Бережная Н.М. Влияние интерлейкина-2 и стероидных гормонов на рост эксплантатов рака молочной железы. // Онкология, 2003, Т.5, №1, 23-25,

29. Якушенко Е.В, Лопатникова Ю.А., Сенников С.В. Интерлейкин-18 и его роль в иммунном ответе // Медицинская иммунология. - 2005 . - Т. 7, № 4. - С. 355364.

30. Ярилин А.А. Иммунология. -М.: ГЭОТАР-Медиа, 2010. -С. 190-230,

31. Abraham LJ, Kroeger KM. Impact of the -308 TNF promoter polymorphism on the transcriptional regulation of the TNF gene: relevance to disease. // J Leukoc Biol. -1999. -V66. -N4. -p:562-566.

32. Agarwal P, Oldenburg M.C, Czarneski J.E, Morse R.M, Hameed M.R. Comparison study for identifying promoter allelic polymorphism in interleukin 10 and tumor necrosis factor alpha genes // Diagn Mol Pathol. -2000. -V. 9. -P. 158-64.

33. Aghajanova L. Leukemia inhibitory factor and human embryo implantation.// Ann. N.Y. Acad. Sci.-2004.- V.1034. P. 176-183.

34. Akashi K, Richie LI, Miyamoto T, Carr WH, Weissman IL.B lymphopoiesis in the thymus.//J Immunol. 2000 May 15;164(10):5221-6.

35. Akkad DA, Arning L, Ibrahim SM, Epplen JT. Sex specifically associated promoter polymorphism in multiple sclerosis affects interleukin 4 expression levels. // Genes Immun. -2007. -V8. -p

703-706.

36. Allen R.D. Polymorphism of the human TNF-alpha promoterrandom variation or functional diversity? // Mol Immunol. -1999. -V. 36. -P. 1017-27.

37. Alms W.J., Atamas S.P., Yurovsky V.V., White B. Generation of a variant of human interleukin-4 by alternative splicing // Mol Immunol. -1996. -V. 33. -P. 361-70.

38. Anderson D.M., Kumaki S., Ahdieh M., Bertles J., Tometsko M. Functional characterization of the human interleukin-15 receptor alpha chain and close linkage of IL15RA and IL2RA genes // J Biol Chem. -1995. -V. 270. -P. 29862-9.

39. Anderson, D. M., Lyman, S. D., Baird, A., Wignall, J et all. Molecular cloning of mast cell growth factor, a hematopoietin that is active in both membrane bound and soluble forms // Cell -1990. - V.63. P. 235-243

40. Araria-Goumidi L., Lambert J.C., Mann D.M., Lendon C., Frigard B. Association study of three polymorphisms of TGF-betal gene with Alzheimer's disease // J Neurol Neurosurg Psychiatry. -2002. -V. 73. -P. 62-4.

41. Arimitsu J, Hirano T, Higa S, Kawai M, et all. IL-18 gene polymorphisms affect IL-18 production capability by monocytes. // Biochem Biophys Res Commun. -2006 -V342. -N4.-p:1413-1416.

42. Arinobu Y., Atamas S.P., Otsuka T., Niiro H., Yamaoka K. Antagonistic effects of an alternative splice variant of human IL-4, IL-4delta2, on IL-4 activities in human monocytes and B cells

// Cell Immunol. -1999. -V. 191. -P. 161-7.

43. Arman A., Yilmaz B., Coker A., Inane N., Direskeneli H. Interleukin-1 receptor antagonist (IL-1RN) and interleukin-lB gene polymorphisms in Turkish patients with rheumatoid arthritis.// Clinical and Experimental Rheumatology. -2006. -Vol. 24. - p. 643-648.

44. Armitage R.J., Namen A.E., Sassenfeld H.M., Grabstein K.H. Regulation of human T cell proliferation by IL-7 // J Immunol. -1990. -V. 144. -P. 938-41.

45. Ashman L.K. // Int. J. Biochem. Cell. Biol. 1999. V. 31. № 10. P. 1037-1051

46. Atamas S.P. Alternative splice variants of cytokines: making a list // Life Sci. -1997. -V. 61. -P. 1105-12.

47. Atamas S.P., Choi J., Yurovsky V.V., White B. An alternative splice variant of human IL-4, IL-4 delta 2, inhibits Unstimulated T cell proliferation // J Immunol. -1996. -V. 156. -P. 435-41.

48. Atamas S.P., White B. Interleukin 4 in systemic sclerosis: not just an increase // Clin Diagn Lab Immunol. -1999. -V. 6. -P. 658-9.

49. Ates O, Hatemi G, Hamuryudan V, Topal-Sarikaya A. Tumor necrosis factor-alpha and interleukin-10 gene promoter polymorphisms in Turkish rheumatoid arthritis patients. Clin Rheumatol. 2008 0ct;27(10): 1243-8.

50. Auernhammer C.J.,Melmed S. Leukemia inhibitory factor-

Neuroimmune modulator of endocrine function.//Endocrine

187

Reviews- 2000.-V.21(3). P.313-345.

51. Avraham, H., Vannier, E., Cowley, S., Jiang, S. X., Chi, S., Dinarello, C. A., Zsebo, K. M., and Groopman, J. E. Effects of the stem cell factor, c-kit ligand, on human megakaryocyte cells. Blood - 1992. - V. 79. P. 365.

52. Ayroldi E., D'Adamio F., Zollo O., Agostini M., Moraca R. Cloning and expression of a short Fas ligand: A new alternatively spliced product of the mouse Fas ligand gene // Blood. -1999. -V. 94. -P. 3456-67.

53. Bach M.A., Roberts C.T. Jr, Smith E.P., LeRoith D. Alternative splicing produces messenger RNAs encoding insulin-like growth factor-I prohormones that are differentially glycosylated in vitro // Mol Endocrinol. -1990. -V. 4. -P. 899-904.

54. Barron C., Migliaccio A.R., Migliaccio G., Jiang Y., Adamson J.W., Ottolenghi S. Alternatively spliced mRNAs encoding soluble isoforms of the erythropoietin receptor in murine cell lines and bone marrow // Gene. -1994. -V. 147. -P. 263-8.

55. Barton A, Worthington J, Isaacs JD, Morgan AW, Wilson AG. Genotype at the sIL-6R A358C polymorphism does not influence response to anti-TNF therapy in patients with rheumatoid arthritis.// Rheumatology. - 2010. - Vol. 49. - p. 43-47.

56. Ba§tiirk B, Yava§?aoglu I, Vuru§kan H, Goral G, Oktay B, Oral HB. Cytokine gene polymorphisms as potential risk and protective factors in renal cell carcinoma. // Cytokine. -2005. -V30. -Nl. -p:41-45.

57. Bernard T., Gale R.E., Linch D.C. Analysis of granulocyte

colony stimulating factor receptor isoforms, polymorphisms and mutations in normal haemopoietic cells and acute myeloid leukaemia blasts // Br J Haematol. -1996. -V. 93. -P. 527-33.

58. Bessenyei B, M6rka M, Urbön L, Zeher M, Semsei I. Single nucleotide polymorphisms: aging and diseases. // Biogerontology. -2004. -V.5 -N5 -P :291-303.

59. Bhart B. Aggarwal, Ajoy Samanta, Marc Feldmann // TNFa. /Cytokine Reference. By ed. Oppenheim J.J. - Academic Press. -2001-Vol. 1 -p: 413-434.

60. Bi X, Zheng T, Lan Q, Xu Z, Chen Y, Zhu et all. Genetic polymorphisms in IL10RA and TNF modify the association between blood transfusion and risk of non-Hodgkin lymphoma. // Am J Hematol. -2012. -V 87. N8. -P:766-769.

61. Bianco B, Andrfi GM, Vilarino FL, Peluso C, Mafra FA, et all. The possible role of genetic variants in autoimmune related genes in the development of endometriosis. // Hum Immunol. -2012. -V.73. -N.3. -P.306-315.

62. Bidwell J., Keen L., Gallagher G., Kimberly R., Huizinga T. Cytokine gene polymorphism in human disease: on-line databases // Genes Immun. -1999. -V. 1. -P. 3-19.

63. Bidwell J., Keen L., Gallagher G., Kimberly R., Huizinga T. Cytokine gene polymorphism in human disease: on-line databases, supplement 1 // Genes Immun. -2001. -V. 2. -P. 6170.

Bihl M.P., Heinimann K., Rudiger J.J., Eickelberg O., Perruchoud A.P. Identification of a novel IL-6 isoform binding to

the endogenous IL-6 receptor // Am J Respir Cell Mol Biol. -2002. -V. 27.-P. 48-56.

65. Blum H., Wolf M., Enssle K., Rollinghoff M., Gessner A. Two distinct stimulus-dependent pathways lead to production of soluble murine interleukin-4 receptor // J Immunol. -1996. -V. 157. -P. 1846-53.

66. Bondurant KL, Lundgreen A, Herrick JS, Kadlubar S, Wolff RK, Slattery ML.Interleukin genes and associations with colon and rectal cancer risk and overall survival. // Int J Cancer. -2012. -V. 6. doi: 10.1002.

67. Boue S., Letunik I., Bork P. Alternative splicing and evolution//BioEssays 25,2003 pi031-1034

68. Breitbart R.E., Andreadis A., Nadal-Ginard B. Alternative splicing: a ubiquitous mechanism for the generation of multiple protein isoforms from single genes // Annu Rev Biochem. -1987. -V. 56. -P. 467-95.

69. Brinkman BM, Zuijdeest D, Kaijzel EL, Breedveld FC, Verweij CL. Relevance of the tumor necrosis factor alpha (TNF alpha) -308 promoter polymorphism in TNF alpha gene regulation. // J Inflamm. 1995-1996. -V46. -Nl. -p:32-41.

70. Broudy V.C. Stem cell factor and hematopoiesis // Blood. -1997. - V. 90. No. 4. P. 1345-1364

71. Brull D.J., Montgomery H.E., Sanders J., Dhamrait S., Luong L. Interleukin-6 gene -174g>c and -572g>c promoter polymorphisms are strong predictors of plasma interleukin-6 levels after coronary artery bypass surgery // Arterioscler

Thromb Vase Biol. -2001. -V. 21. -P. 1458-63.

72. Buchs N, di Giovine FS, Silvestri T, Vannier E, Duff GW, Miossec P. IL-1B and IL-IRa gene polymorphisms and disease severity in rheumatoid arthritis: interaction with their plasma levels.// Genes and Immunity. - 2001. - Vol. 2. - p. 222-228.

73. Burch J.B, Davis D.L. Alternative promoter usage and splicing options result in the differential expression of mRNAs encoding four isoforms of chicken VBP, a member of the PAR subfamily of bZIP transcription factors // Nucleic Acids Res. -1994. -V. 22. -P. 4733-41.

Burstein S.A, Mei R.L, Henthorn J, Friese P. and Turner K. Leukemia inhibitory factor and interleukin-11 promote maturation of murine and human megakaryocytes in vivo.//J. Cell. Physiol.-1992.-V.153. P.305-312.

Bushley AW, Ferrell R, McDuffie K, Terada KY, ye all. Polymorphisms of interleukin (IL)-l alpha, IL-lbeta, IL-6, IL-10, and IL-18 and the risk of ovarian cancer. // Gynecol Oncol. -2004 -V95. -N3 -p:672-9.

Butcher C, Steinkasserer A, Tejura S, Lennard A.C. Comparison of two promoters controlling expression of secreted or intracellular IL-1 receptor antagonist // J Immunol. -1994. -V. 153. -P. 701-11.

77. Cantagrel A, Navaux F, Loubet-Lescoulie P, Nourhashemi F, et all.. Interleukin-1 beta, interleukin-1 receptor antagonist, interleukin-4, and interleukin-10 gene polymorphisms: relationship to occurrence and severity of rheumatoid arthritis. //

Arthritis Rheum. -1999. -V42. -N6. -p: 1093-1100.

191

74.

75.

76.

78. Caruana G., Cambareri A.C., Ashman L.K. Isoforms of c-KIT differ in activation of signalling pathways and transformation of NIH3T3 fibroblasts // Oncogene. -1999. -V. 18. -P. 5573-81.

79. Cascino I. I, Papoff G., Eramo A., Ruberti G. Soluble Fas/Apo-1 splicing variants and apoptosis // Front Biosci. -1996. -V. 1. -P. dl2-8.

80. Cascino I., Fiucci G., Papoff G., Ruberti G. Three functional soluble forms of the human apoptosis-inducing Fas molecule are produced by alternative splicing // J Immunol. -1995. -V. 154. -P. 2706-13.

81. Cay HF, Sezer I, Dogan S, Felek R, Asian M. Polymorphism in the TNF-alpha gene promoter at position -1031 is associated with increased circulating levels of TNF-alpha, myeloperoxidase and nitrotyrosine in primary Sjogren's Syndrome. // Clin Exp Rheumatol. -2012. May 18. [Epub]

82. Chabaud M., Fossiez F., Taupin J.L., Miossec P. Enhancing effect of IL-17 on IL-1-induced IL-6 and leukemia inhibitory factor production by rheumatoid arthritis synoviocytesand its regulation by Th2 cytokines.//! Immunol.-1998.-V.161. P.409-414.

83. Chan A.M., Rubin J.S., Bottaro D.P., Hirschfield D.W., Chedid M., Aaronson S.A. Identification of a competitive HGF antagonist encoded by an alternative transcript // Science. -1991. -V. 254. -P. 1382-5.

84. Chatzikyriakidou A, Georgiou I, Voulgari PV, Venetsanopoulou

AI, et all. Combined tumour necrosis factor-alpha and tumour

necrosis factor receptor genotypes could predict rheumatoid

192

arthritis patients' response to anti-TNF-alpha therapy and explain controversies of studies based on a single polymorphism.// Rheumatology. - 2007. - Vol. 46. - p. 1034-1035.

85. Cheong CY, Lufkin T. Alternative splicing in self-renewal of embryonic stem cells. // Stem Cells Int. -2011; 2011:560261.

86. Chilton P.M., Fernandez-Botran R. Regulation of the expression of the soluble and membrane forms of the murine IL-4 receptor // Cell Immunol. -1997. -V. 180. -P. 104-15.

87. Chomarat P., Banchereau J. An update on interleukin-4 and its receptor // Eur Cytokine Netw. -1997. -V. 8. -P. 333-44.

88. Chomczynski P., Sacchi N. Single-step method of RNA isolation by acid guanidinium thiocyanate-phenol-chloroform extraction // Anal Biochem. -1987. -V. 162. -P. 156-9.

89. Chopra R., Kendall G., Gale R.E., Thomas N.S., Linch D.C. Expression of two alternatively spliced forms of the 5' untranslated region of the GM-CSF receptor alpha chain mRNA // Exp Hematol. -1996. -V. 24. -P. 755-62.

90. Collins J.S., Perry R.T., Watson B. Jr, Harrell L.E., Acton R.T. Association of a haplotype for tumor necrosis factor in siblings with late-onset Alzheimer disease: the NIMH Alzheimer Disease Genetics Initiative // Am J Med Genet. -2000. -V. 96. -P. 82330.

91. Crawley E, Kon S, Woo P. Hereditary predisposition to low interleukin-10 production in children with extended oligoarticular juvenile idiopathic arthritis. // Rheumatology (Oxford). -2001. -V40. -N5. -p:574-578.

92. Cuchacovich M, Ferreira L, Aliste M, et al. Tumour necrosis factor-alpha (TNFalpha) levels and influence of -308 TNF-alpha promoter polymorphism on the responsiveness to infliximab in patients with rheumatoid arthritis.// Scand J Rheumatol. - 2004. -Vol. 33.-p. 228-32.

93. Cui J, Saevarsdottir S, Thomson B, Padyukov L, et all. Rheumatoid arthritis risk allele PTPRC is also associated with response to anti-tumor necrosis factor alpha therapy.// Arthritis Rheum. - 2010. - Vol. 62(7). - p. 1849-1861.

94. de Guia RM, Ramos JD. The -590C/TIL4 single-nucleotide polymorphism as a genetic factor of atopic allergy. // Int J Mol Epidemiol Genet. -2010. -Vl(l). -p:67-73.

95. de Moraes-Pinto M.I., Vince G.S., Flanagan B.F., Hart C.A., Johnson P.M. Localization of IL-4 and IL-4 receptors in the human term placenta, decidua and amniochorionic membranes // Immunology. -1997. -V. 90. -P. 87-94.

96. Deichmann K., Bardutzky J., Forster J., Heinzmann A., Kuehr J. Common polymorphisms in the coding part of the IL4-receptor gene // Biochem Biophys Res Commun. -1997. -V. 231. -P. 6967.

97. Diamant M., Rieneck K., Mechti N., Zhang X.G., Svenson M. Cloning and expression of an alternatively spliced mRNA encoding a soluble form of the human interleukin-6 signal transducer gpl30 // FEBS Lett. -1997. -V. 412. -P. 379-84.

98. DiSanto J.P., Dautry-Varsat A., Certain S., Fischer A., de Saint

Basile G. Interleukin-2 (IL-2) receptor gamma chain mutations in

X-linked severe combined immunodeficiency disease result in

194

the loss of high-affinity IL-2 receptor binding 11 Eur J Immunol. -1994. -V. 24.-P. 475-9.

99. DiSanto J.P, Rieux-Laucat F, Dautry-Varsat A, Fischer A, de Saint Basile G. Defective human interleukin 2 receptor gamma chain in an atypical X chromosome-linked severe combined immunodeficiency with peripheral T cells // Proc Natl Acad Sci USA. -1994. -V. 91. -P. 9466-70.

100. Dubois S, Magrangeas F, Lehours P, Raher S, Bernard J. Natural splicing of exon 2 of human interleukin-15 receptor alpha-chain mRNA results in a shortened form with a distinct pattern of expression // J Biol Chem. -1999. -V. 274. -P. 2697884.

101. Eisenberg S.P, Evans R.J, Arend W.P, Verderber E, Brewer M.T. Primary structure and functional expression from complementary DNA of a human interleukin-1 receptor antagonist//Nature. -1990. -V. 343. -P. 341-6.

102. Elahi MM, Asotra K, Matata BM, Mastana SS. Tumor necrosis factor alpha -308 gene locus promoter polymorphism: an analysis of association with health and disease. // Biochim Biophys Acta. -2009. -VI792. -N3. -P:163-172.

103. Emery P, Du,rner T. Optimising treatment in rheumatoid arthritis: a review of potential biological markers of response. // Ann Rheum Dis. -2011. -V.70. -N.12. -P:2063-2070.

104. Emonts M, Hazes MJ, Houwing-Duistermaat JJ, van der Gaast-de Jongh CE, et all. Polymorphisms in genes controlling inflammation and tissue repair in rheumatoid arthritis: a case

control study.// BMC Medical Genetics. - 2011. - Vol. 12. - p.

195

105. Escary, J. L., J. Perreau, D. Dumenil, S. Ezine, and P. Brulet. Leukemia inhibitory factor is necessary for the maintenance of hematopoetic stem cells and thymocyte stimulation.// Nature.-1993.- 363:361.

106. Eskdale J., Gallagher G. A polymorphic dinucleotide repeat in the human IL-10 promoter // Immunogenetics. -1995. -V. 42. -P. 444-5.

107. Fernandes H., Koneru B., Fernandes N., Hameed M., Cohen M.C. Investigation of promoter polymorphisms in the tumor necrosis factor-alpha and interleukin-10 genes in liver transplant patients//Transplantation. -2002. -V. 73. -P. 1886-91.

108. Fionula M. Brennan, Iain B. Mclnnes. Evidence that cytokines play a role in rheumatoid arthritis.// J.Clin.Invest. - 2008 - Vol. 118(11)-p. 3537-45.

109. Fishman D, Faulds G, Jeffery R, Mohamed-Ali V, et all. The effect of novel polymorphisms in the interleukin-6 (IL-6) gene on IL-6 transcription and plasma IL-6 levels, and an association with systemic-onset juvenile chronic arthritis. // J Clin Invest. -1998. -V.102. -N7. -p:1369-1376.

110. Flannagan J.G., Chan D.C., Leder P. Transmembrane form of.the kit ligand growth factor is determined by alternative splicing and is missing in the Sid mutant // Cell - 1991. V. 64. P. 1025 - 1030.

111. Fonseca JE, Carvalho T, Cruz M, et al. Polymorphism at position -308 of the tumour necrosis factor alpha gene and rheumatoid arthritis pharmacogenetics.// Ann RheumDis. - 2005. - Vol. 64. -

p. 793-4.

112. Fonseca JE, Cavaleiro J, Teles J, et all. Contribution for new genetic markers of rheumatoid arthritis activity and severity: sequencing of the tumor necrosis factor-alpha gene promoter. // Arthritis Res Ther. - 2007. - Vol. 9(2). - R37.

113. Foster C.B., Lehrnbecher T., Samuels S., Stein S., Mol F. An IL6 promoter polymorphism is associated with a lifetime risk of development of Kaposi sarcoma in men infected with human immunodeficiency virus // Blood. -2000. -V. 96. -P. 2562-7.

114. Freeburn R.W., Gale R.E., Linch D.C. Activating point mutations in the betaC chain of the GM-CSF, IL-3 and IL-5 receptors are not a major contributory factor in the pathogenesis of acute myeloid leukaemia // Br J Haematol. -1998. -V. 103. -P. 66-71.

115. Fukumoto S., Yamada Y. // Connect. Tissue. Res. 2005. V.46. № 4-5. P. 220-226.

116. Fukunaga R., Seto Y., Mizushima S., Nagata S. Three different mRNAs encoding human granulocyte colony-stimulating factor receptor // Proc Natl Acad Sci USA. -1990. -V. 87. -P. 8702-6.

117. Furnham N., Ruffle S., Southan C. Splice variants: a homology modeling approach // Proteins. -2004. -V. 54. -P. 596-608.

118. Gabut M, Samavarchi-Tehrani P, Wang X, Slobodeniuc V, et all. An alternative splicing switch regulates embryonic stem cell pluripotency and reprogramming. // Cell. -2011. -VI47. -Nl. -p:132-146.

119. Gale R.E., Freeburn R.W., Khwaja A., Chopra R., Linch D.C. A

197

truncated isoform of the human beta chain common to the receptors for granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, interleukin-3 (IL-3), and IL-5 with increased mRNA expression in some patients with acute leukemia // Blood. -1998. -V. 91. -P. 54-63.

120. Galizzi J.P., Zuber C.E., Harada N., Gorman D.M., Djossou O. Molecular cloning of a cDNA encoding the human interleukin 4 receptor // Int Immunol. -1990. -V. 2. -P. 669-75.

121. Gautherot I., Burdin N., Seguin D., Aujame L., Sodoyer R. Cloning of interleukin-4 delta2 splice variant (IL-4delta2) in chimpanzee and cynomolgus macaque: phylogenetic analysis of delta2 splice variant appearance, and implications for the study of IL-4-driven immune processes // Immunogenetics. -2002. -V. 54. -P. 635-44.

122. Glare E.M., Divjak M., Rolland J.M., Walters E.H. Asthmatic airway biopsy specimens are more likely to express the IL-4 alternative splice variant IL-4delta2 // J Allergy Clin Immunol. -1999. -V. 104. -P. 978-82.

123. Gomes M, Coelho A, Araujo A, Teixeira AL, Catarino R, Medeiros R. Influence of functional genetic polymorphism (-590C/T) in non-small cell lung cancer (NSCLC)development: the paradoxal role of IL-4. // Gene. -2012. -V. 504. N1. -P. 111-115.

124. Gonullu G, Basturk B, Evrensel T, Oral B, et all. Association of breast cancer and cytokine gene polymorphism in Turkish women. // Saudi Med J.-2007. -V28. -N11. -p: 1728-1733.

125. Gordon W Duff. Evidence for genetic variation as a factor in maintaining health.// Am J Clin Nutr. - 2006. - Vol. 83. - 43IS-

126. Gothie E., Richard D.E., Berra E., Pages G., Pouyssegur J. Identification of alternative spliced variants of human hypoxia-inducible factor-1 alpha // J Biol Chem. -2000. -V. 275. -P. 69227.

127. Grasso L., Huang M., Sullivan C.D., Messier C.J., Kiser M.B. Molecular analysis of human interleukin-9 receptor transcripts in peripheral blood mononuclear cells. Identification of a splice variant encoding for a nonfunctional cell surface receptor // J Biol Chem. -1998. -V. 273. -P. 24016-24.

128. Grove J, Daly AK, Bassendine MF, Day CP. Association of a tumor necrosis factor promoter polymorphism with susceptibility to alcoholic steatohepatitis. // Hepatology. -1997. -V26. -Nl. -p:143-146

129. Guis S, Balandraud N, Bouvenot J, et al. Infl uence of -308 A/G polymorphism in the tumor necrosis factor alpha gene on etanercept treatment in rheumatoid arthritis.// Arthritis Rheum. -2007.-Vol. 57.-p. 1426-30.

130. Gupta S, Zink D, Korn B, Vingron M, Haas SA. Genome wide identification and classification of alternative splicing based on EST data. // Bioinformatics. -2004. -V20. -N16 -p:2579-2585.

131. Gurney A.L., Kuang W.J., Xie M.H., Malloy B.E., Eaton D.L., de Sauvage F.J. Genomic structure, chromosomal localization, and conserved alternative splice forms of thrombopoietin // Blood. -1995. -V. 85. -P. 981-8.

132. Haines B.P., Voyle R.B., Pelton T.A., Forrest R., Rathjen P.D.

Complex conserved organization of the mammalian leukemia inhibitory factor gene: regulated expression of intracellular and extracellular cytokines.// J. Immunol.-1999.-V. 162 P.4637-4646.

133. Hajeer AH, Lazarus M, Turner D, Mageed RA, et all. IL-10 gene promoter polymorphisms in rheumatoid arthritis. // Scand J Rheumatol. -1998. -V27. -N2. -p: 142-145.

134. Han TU, Bang SY, Kang C, Bae SC. TRAF1 polymorphisms associated with rheumatoid arthritis susceptibility in Asians and in Caucasians. Arthritis Rheum. -2009 -V60 -N9. -p:2577-84.

135. Hanke J, Brett D, Zastrow I, Aydin A, Delbruck S. Alternative splicing of human genes: more the rule than the exception? // Trends Genet. -1999. -V. 15. -P. 389-90.

136. Harris K.W, Winkelmann J.C. Enzyme-linked immunosorbent assay detects a potential soluble form of the erythropoietin receptor in human plasma // Am J Hematol. -1996. -V. 52. -P. 813.

137. Harrison P, Pointon J. J, Chapman K, Roddam A, Wordsworth B. P.. Interleukin-1 promoter region polymorphism role in rheumatoid arthritis: a meta-analysis of IL-1B-511A/G variant reveals association with rheumatoid arthritis.// Rheumatology. -2008.-Vol. 47. - p.1768-1770.

138. Haskill S, Martin G, Van Le L, Morris J, Peace A. cDNA cloning of an intracellular form of the human interleukin 1 receptor antagonist associated with epithelium // Proc Natl Acad Sci USA. -1991. -V. 88. -P. 3681-5.

139. Haukim N, Bidwell J.L, Smith A.J, Keen L.J, Gallagher G.

Cytokine gene polymorphism in human disease: on-line databases, supplement 2 // Genes Immun. -2002. -V. 3. -P. 31330.

140. He Y., Smith S.K., Day K.A., Clark D.E., Licence D.R., Charnock-Jones D.S. Alternative splicing of vascular endothelial growth factor (VEGF)-Rl (FLT-1) pre-mRNA is important for the regulation of VEGF activity // Mol Endocrinol. -1999. -V. 13.-P. 537-45.

141. Heaney M.L., Vera J.C., Raines M.A., Golde D.W. Membrane-associated and soluble granulocyte/macrophage-colony-stimulating factor receptor alpha subunits are independently regulated in HL-60 cells // Proc Natl Acad Sci U S A. -1995. -V. 92. -P. 2365-9.

Higuchi T, Seki N, Kamizono S, Yamada A, et all. Polymorphism of the 5'-flanking region of the human tumor necrosis factor (TNF)-alpha gene in Japanese. // Tissue Antigens. -1998. -V51. -N6. -p:605-612.

Hobbs K, Negri J, Klinnert M, Rosenwasser LJ, Borish L. Interleukin-10 and transforming growth factor-beta promoter polymorphisms in allergies and asthma. // Am J Respir Crit Care Med. -1998 -V158. -pl958-1962.

Hodges D., Bernstein S.I. Genetic and biochemical analysis of alternative RNA splicing // Adv Genet. -1994. -V. 31. -P. 20781.

145. Homuth G, Teumer A, Volker U, Nauck M. A description of

large-scale metabolomics studies - Increasing value by

combining metabolomics with genome-wide SNP genotyping

201

142.

143.

144.

and transcriptional profiling. // J Endocrinol. -2012. -N10.

146. Hoogendoorn B. et all. Functional analysis of human promoter polymorphisms // Human Molecular Genetics. - 2003. - Vol. 12 (18).-p. 2249-2254.

147. Horiuchi T, Kiyohara C, Tsukamoto H, Sawabe T, et all. A functional M196R polymorphism of tumour necrosis factor receptor type 2 is associated with systemic lupus erythematosus: a case-control study and a meta-analysis. // Ann Rheum Dis. -2007 -V66. -N3. -p:320-324.

148. Hudson K.R., Vernallis A.B., Heath J.K. Characterization of the receptor binding sites of human leukemia inhibitory factor and creation of antagonists.//!. Biol. Chem.-1996.-V. 271. P.11971-11978.

149. Huizinga TW, Westendorp RG, Bollen EL, Keijsers V, et all. TNF-alpha promoter polymorphisms, production and susceptibility to multiple sclerosis in different groups of patients. // J Neuroimmunol. -1997. -V72. -N2. -p:149-153.,

150. Iannitti T, Palmieri B. Inflammation and genetics: an insight in the centenarian model. // Hum Biol. -2011 -V.83 -N4 -P. 531559.,

151. Ikebuchi K, Ihle J.N, Hirai Y, Wong G.G, Clark S.C, Ogawa M. Synergistic factors for stem cell proliferation: further studies of the target stem cells and the mechanism of stimulation by interleukin-1, interleukin-6, and granulocyte colony-stimulating factor // Blood. -1988. -V. 72. -P. 2007-14.

152.

Jiang Z.H, Wu J.Y. Alternative splicing and programmed cell

death 11 Proc Soc Exp Biol Med. -1999. -V. 220. -P. 64-72.

153. Juliá A, Ballina J, Cañete JD, Balsa A, et all. Genome-wide association study of rheumatoid arthritis in the Spanish population: KLF12 as a risk locus for rheumatoid arthritis susceptibility. Arthritis Rheum. 2008 Aug;58(8):2275-86.

154. Kaijzel EL, van Krugten MV, Brinkman BM, Huizinga TW, et all. Functional analysis of a human tumor necrosis factor alpha (TNF-alpha) promoter polymorphism related to joint damage in rheumatoid arthritis. // Mol Med. -1998. -V4. -p:724-733.

155. Kang C. P., Lee K. W., Yoo D. H, Kang C., Bae S. C. The influence of a polymorphism at position -857 of the tumour necrosis factor a gene on clinical response to etanercept therapy in rheumatoid arthritis.// Rheumatology. - 2005. - Vol. 44. - p. 547-552.

156. Karimabad MN, Arababadi MK, Hakimizadeh E, Daredori HY, Nazari M, et all. Is the IL-10 Promoter Polymorphism at Position -592 Associated with Immune System-Related Diseases? // Inflammation. -2012 . -N.ll.

157. Karjalainen J, Hulkkonen J, Nieminen MM, Huhtala H,et all. Interleukin-10 gene promoter region polymorphism is associated with eosinophil count and circulating immunoglobulin E in adult asthma. // Clin Exp Allergy. -2003. -V33. -Nl. -p:78-83.

158. Karras J.G., McKay R.A., Dean N.M., Monia B.P. Deletion of individual exons and induction of soluble murine interleukin-5 receptor-alpha chain expression through antisense oligonucleotide-mediated redirection of pre-mRNA splicing //

Mol Pharmacol. -2000. -V. 58. -P. 380-7.

203

Kato H., Youn H.Y., Ohashi T., Watari T., Goitsuka R. Identification of an alternatively spliced transcript of equine interleukin-1 beta//Gene. -1996. -V. 177. -P. 11-6.

160. Keller ET , Wanagat J, Ershler WB. Molecular and cellular biology of interleukin-6 and its receptor//Frontiers in Biosciens, 1996,l,p340-357

161. Kestler D.P., Agarwal S., Cobb J., Goldstein K.M., Hall RE. Detection and analysis of an alternatively spliced isoform of interleukin-6 mRNA in peripheral blood mononuclear cells // Blood. -1995. -V. 86. -P. 4559-67.

162. Kestler D.P., Goldstein K.M., Agarwal S., Fuhr J.E., Andrews R., Hall R.E. Hematopoietic differentiation activity of a recombinant human interleukin-6 (IL-6) isoform resulting from alternatively spliced deletion of the second exon // Am J Hematol. -1999. -V. 61. -P. 169-77.

163. Khan MW, Alam M. A survey of application: Genomics and genetic programming, a new frontier. // Genomics. -2012. -VI00 -N2. -P:65-71.

164. Kim N, Lee C. Bioinformatics detection of alternative splicing. // Methods Mol Biol. -2008. -V452. -p:179-197.

165. Klein S.C., Golverdingen J.G., Bouwens A.G., Tilanus M.G., de Weger R.A. An alternatively spliced interleukin 4 form in lymphoid cells // Immunogenetics. -1995. -V. 41. -P. 57.

166. Klein S.C., Golverdingen J.G., van Wichen D.F., Bouwens A.G., Stuij I. Expression of two interleukin 4 mRNA isoforms in B lymphoid cells // Cell Immunol. -1996. -V. 167. -P. 259-68.

167. Korte A., Kochling J., Badiali L., Eckert C., Andreae J. Expression analysis and characterization of alternatively spliced transcripts of human IL-7Ralpha chain encoding two truncated receptor proteins in relapsed childhood all // Cytokine. -2000. -V. 12. -P. 1597-608.

168. Korte A., Moricke A., Beyermann B., Kochling J., Taube T. Extensive alternative splicing of interleukin-7 in malignant hematopoietic cells: implication of distinct isoforms in modulating IL-7 activity // J Interferon Cytokine Res. -1999. -V. 19. -P. 495-503.

169. Kyung-A Lee, Chang-Seok Ki, Hye-Jin Kim, Kwang-Min Sohn, Jong-Won Kim, Won Ki Kang. Novel interleukin 1(3 polymorphism increased the risk of gastric cancer in a Korean population \\ J Gastroenterol. -2004. -N39. -P. 429^133

170. Lee E, Min HK, Oskeritzian CA, Kambe N, Schwartz LB, Wook Chang H. Recombinant human (rh) stem cell factor and rhIL-4 stimulate differentiation and proliferation of CD3+ cells from umbilical cord blood and CD3+ cells enhance FcepsilonRl expression on fetal liver-derived mast cells in the presence of rhIL-4. //Cell Immunol. 2003 Nov;226(l):30-6.

171. Lee JY, Goldman D, Piliero LM, Petri M, Sullivan KE. Interferon-gamma polymorphisms in systemic lupus erythematosus.// Genes Immun. -2001. -V. -N2. -N5. -p254-257.

172. Lee Y, Tsai J, Sunkara S, Karamycheva S, Pertea G, Sultana R, Antonescu V, Chan A, Cheung F, Quackenbush J. The TIGR Gene Indices: clustering and assembling EST and known genes and integration with eukaryotic genomes. // Nucleic Acids Res. -

2005. -V.33 -D71-74.

173. Lee YH, Ji D, Song GG. Tumor necrosis factor-alpha promoter -308 A/G polymorphism and rheumatoid arthritis susceptibility: a metaanalysis.// J Rheumatol. - 2007. - Vol. 34. - p. 43-9.

174. Li Kam Wa TC, Mansur AH, Britton J, et all. Association between - 308 tumour necrosis factor promoter polymorphism and bronchial hyperreactivity in asthma. // Clin Exp Allergy. -1999 -V29. -N9. -p: 1204-8.

175. Licastro F, Chiappelli M, Ianni M, Porcellini E.et all. Tumor necrosis factor-alpha antagonists: differential clinical effects by different biotechnological molecules.W Int J Immunopathol Pharmacol.- 2009.- vol.22(3).- P.567-572,

176. Linker-Israeli M, Wallace DJ, Prehn J, Michael D, et all. Association of IL-6 gene alleles with systemic lupus erythematosus (SLE) and with elevated IL-6 expression. // Genes Immun. -1999. -VI. -Nl. -p:45-52.

177. Liu C, Batliwalla F, Li W, Lee A, et all. Genome-Wide Association Scan Identifies Candidate Polymorphisms Associated with Differential Response to Anti-TNF Treatment in Rheumatoid Arthritis.// Mol Med. - 2008. - Vol. 14(9-10). - p. 575-81.

178. Liu C, Cheng J, Mountz J.D. Differential expression of human Fas mRNA species upon peripheral blood mononuclear cell activation // Biochem J. -1995. -V. 310 ( Pt 3). -P. 957-63.

179. Liu C, Hart R.P, Liu X.J, Clevenger W, Maki R.A, De Souza E.B. Cloning and characterization of an alternatively processed

human type II interleukin-1 receptor mRNA // J Biol Chem. -1996. -V. 271.-P. 20965-72.

180. Lo D, Sprent J. Exogenous control of I-A expression in fetal thymus explants.//J Immunol. 1986 Sep 15; 137(6): 1772-5.

181. Lokker N.A., Godowski P.J. Generation and characterization of a competitive antagonist of human hepatocyte growth factor, HGF/NK1 // J Biol Chem. -1993. -V. 268. -P. 17145-50.

182. Lopez A.J. Alternative splicing of pre-mRNA: developmental consequences and mechanisms of regulation // Annu Rev Genet. -1998. -V. 32. -P. 279-305.

183. López P, Gutiérrez С, Suárez A. IL-10 and TNFalpha genotypes in SLE. // J Biomed Biotechnol. -2010.2010:838390.

184. Lotrich F. Inflammatory cytokines, growth factors, and depression. // Curr Pharm Des. -2012. -N. 6. -P. *.

185. Louis E, Franchimont D, Pirón A et al. Tumour necrosis factor (TNF) gene polymorphism influences TNF-alpha production in lipopolysaccharide (LPS)-stimulated whole blood cell culture in healthy humans.// Clin Exp Immunol. - 1998. - Vol. 113. - p. 401-6.

186. Lucotte G, Bathelier C, Mercier G. TNF-alpha polymorphisms in multiple sclerosis: no association with -238 and -308 promoter alleles, but the microsatellite allele al 1 is associated with the disease in French patients. // Mult Scler. -2000. -V6. -p78-80.

187. Luzina IG, Lockatell V, Lavania S, Pickering EM, et all. Natural

production and functional effects of alternatively spliced

interleukin-4 protein in asthma.// Cytokine. -2012,-V58. -Nl. -

207

p:20-26.

188. Luzina IG, Lockatell V, Todd NW, Highsmith K, et all. Alternatively spliced variants of interleukin-4 promote inflammation differentially. // J Leukoc Biol. -2011. -V89. -N5. -p 763-770

189. Madiai F, Hackshaw K.V, Chiu I.M. Characterization of the entire transcription unit of the mouse fibroblast growth factor 1 (FGF-1) gene. Tissue-specific expression of the FGF-l.A mRNA // J Biol Chem. -1999. -V. 274. -P. 11937-44.

190. Masutani K, Miyake K, Nakashima H., Hirano T, Kubo M. Impact of interferon-gamma and interleukin-4 gene polymorphisms on development and progression of IgA nephropathy in Japanese patients // Am J Kidney Dis. -2003. -V. 41.-P. 371-9.

191. Mauduit C, Hamamah S, Benahmed M. Stem cell factor/c-kit system in spermatogenesis. // Hum. Reprod. Update. 1999. -Vol.5, №5. -P.535-545.

192. Maurer M, Kruse N, Giess R, Toyka KV, Rieckmann P. Genetic variation at position -1082 of the IL10 promotor and the outcome of multiple sclerosis. // J Neuroimmunol. -2000. -V104. -Nl. -p:98-100.

193. Maury CP, Liljestrom M, Laiho K, et all. Tumor necrosis factor alpha, its soluble receptor I, and -308 gene promoter polymorphism in patients with rheumatoid arthritis with or without amyloidosis: implications for the pathogenesis of nephropathy and anemia of chronic disease in reactive amyloidosis.// Arthritis Rheum. - 2003. - Vol. 48. - p. 3068-

3076.

194. Maxwell JR, Potter C, Hyrich KL, et al. Association of the tumour necrosis factor-308 variant with differential response to anti-TNF agents in the treatment of rheumatoid arthritis.// Hum Mol Genet. - 2008. - Vol. 17. - p. 3532-8.

195. McCurdy D. K., Zaldivar F., Sandborg C., Imfeld K., and Berman M. Interleukin-4 (IL-4) and IL-4 antagonist, IL-4d2, expression in synovial fluid from patients with juvenile rheumatoid arthritis (JRA). Arthritis Rheum. 41, SI00. 98.

196. Meazza R., Verdiani S., Biassoni R., Coppolecchia M., Gaggero A. Identification of a novel interleukin-15 (IL-15) transcript isoform generated by alternative splicing in human small cell lung cancer cell lines // Oncogene. -1996. -V. 12. -P. 2187-92.

197. Messer G., Spengler U., Jung M.C., Honold G., Blomer K. Polymorphic structure of the tumor necrosis factor (TNF) locus: an Ncol polymorphism in the first intron of the human TNF-beta gene correlates with a variant amino acid in position 26 and a reduced level of TNF-beta production // J Exp Med. -1991. -V. 173. -P. 209-19.

198. Metcalf D, Moore MAS (1971) Haemopoietic Cell,North-Holland Publ. Co., Amsterdam.

199. Metcalf D. The Unsolved enigmas of leukemia inhibitory factor.//Stem cells-2003.-V.21. P.5-14.

200. Miceli-Richard C, Comets E, Verstuyft C, Tamouza R, Loiseau P, Ravaud P, Kupper H, Becquemont L, Charron D, Mariette X. A single tumour necrosis factor haplotype influences the

response to adalimumab in rheumatoid arthritis.// Ann Rheum Dis. - 2008. - Vol. 67(4). - p. 478-484.

201. Mironov AA, Fickett JW, Gelfand MS. Frequent alternative splicing of human genes. // Genome Res. -1999. -V9. -N12. -p:1288-1293.

202. Mitchell S.A., Grove J., Spurkland A., Boberg K.M., Fleming K.A. Association of the tumour necrosis factor alpha -308 but not the interleukin 10 -627 promoter polymorphism with genetic susceptibility to primary sclerosing cholangitis // Gut. -2001. -V. 49. -P. 288-94. Notes: CORPORATE NAME: European Study Group of Primary Sclerosing Cholangitis.

203. Miyazawa K., Williams D. A., Gotoh A., Nishimaki J., Et all. Membrane-bound Steel factor induces more persistent tyrosine kinase activation and longer life span of c-kit gene-encoded protein than its soluble form. // Blood. - 1995. - Vol. 85(3). -P.641-649

204. Modrek B, Resch A, Grasso C, Lee C. Genome-wide detection of alternative splicing in expressed sequences of human genes. // Nucleic Acids Res. -2001. -V29. -N13. -p:2850-2859.

205. Mosley B., De Imus C., Friend D., Boiani N., Thoma B. Dual oncostatin M (OSM) receptors. Cloning and characterization of an alternative signaling subunit conferring OSM-specific receptor activation // J Biol Chem. -1996. -V. 271. -P. 32635-43.

206. Munoz-Sanjuan I., Smallwood P.M., Nathans J. Isoform diversity

among fibroblast growth factor homologous factors is generated

by alternative promoter usage and differential splicing // J Biol

210

Chem. -2000. -V. 275. -P. 2589-97.

207. Muzio M., Polentarutti N., Sironi M., Poli G., De Gioia L. Cloning and characterization of a new isoform of the interleukin 1 receptor antagonist // J Exp Med. -1995. -V. 182. -P. 623-8.

208. Nadal-Ginard B., Smith C.W., Patton J.G., Breitbart R.E. Alternative splicing is an efficient mechanism for the generation of protein diversity: contractile protein genes as a model system // Adv Enzyme Regul. -1991. -V. 31. -P. 261 -86.

209. Nagaraj SH, Gasser RB, Ranganathan S. A hitchhiker's guide to expressed sequence tag (EST) analysis. // Brief Bioinform. -2007.-V8-Nl.-p. 6-21.

210. Nagata S., Tsuchiya M., Asano S., Yamamoto O., Hirata Y. The chromosomal gene structure and two mRNAs for human granulocyte colony-stimulating factor // EMBO J. -1986. -V. 5. -P. 575-81.

211. Nakamura Y, Koyama K, Matsushima M. VNTR sequences as transcriptional, translational, or functional regulators. // J Hum Genet. -1998. -V43. -N3 -p: 149-52

212. Nandurkar H.H., Robb L., Nicholl J.K., Hilton D.J., Sutherland G.R., Begley C.G. The gene for the human interleukin-11 receptor alpha chain locus is highly homologous to the murine gene and contains alternatively spliced first exons // Int J Biochem Cell Biol. -1997. -V. 29. -P. 753-66.

213. Nembaware V, Lupindo B, Schouest K, Spillane C, Scheffler K, Seoighe C. Genome-wide survey of allele-specific splicing in humans. // BMC Genomics. -2008. -V9. -p:265.

214. Neuman MG, Nanau RM. Single-nucleotide polymorphisms in inflammatory bowel disease. // Transl Res. -2012. -V.160. -P.45-64.

215. Nishimura H, Yajima T, Naiki Y, Tsunobuchi H, Umemura M. Differential roles of interleukin 15 mRNA isoforms generated by alternative splicing in immune responses in vivo // J Exp Med. -2000. -V. 191. -P. 157-70.

216. Oh J.W, Revel M, Chebath J. A soluble interleukin 6 receptor isolated from conditioned medium of human breast cancer cells is encoded by a differentially spliced mRNA // Cytokine. -1996. -V. 8. -P. 401-9.

217. Onu A, Pohl T, Krause H, Bulfone-Paus S. Regulation of IL-15 secretion via the leader peptide of two IL-15 isoforms // J Immunol. -1997. -V. 158. -P. 255-62.

218. Oppenheim J.J, Feldmann M. Cytokine Reference. Academic Press, 2001. T. l.-P. 3-47.

219. Padyukov L, Lampa J, Heimbiirger M, Ernestam Set all. Genetic markers for the efficacy of tumour necrosis factor blocking therapy in rheumatoid arthritis.// Ann Rheum Dis. - 2003. - Vol. 62. - p. 526-529

220. Pastinen T, Ge B, Hudson T.J. Influence of human genome polymorphism on gene expression. // Human Molecular Genetics. - 2006. - Vol. 15 (Spec N 1). - R9-16.

221. Pavy S, Toonen EJ, Miceli-Richard C, Barrera P, van Riel PL, Criswell LA, Mariette X, Coenen MJ. Tumour necrosis factor a -308G—>A polymorphism is not associated with response to

TNFa blockers in Caucasian patients with rheumatoid arthritis: systematic review and meta-analysis.// Ann Rheum Dis. - 2010. -Vol. 69.-p. 1022-1028.

222. Perkins H.D, van Leeuwen B.H, Hardy C.M, Kerr P.J. The complete cDNA sequences of IL-2, IL-4, IL-6 AND IL-10 from the European rabbit (Oryctolagus cuniculus) // Cytokine. -2000. -V. 12. -P. 555-65.

223. Pociot F, M0lvig J, Wogensen L, Worsaae H, Nerup J. A TaqI polymorphism in the human interleukin-1 beta (IL-1 beta) gene correlates with IL-1 beta secretion in vitro. // Eur J Clin Invest. -1992. -V22. -N6. -p:396-402.

224. Pooja S, Chaudhary P, Nayak LV, Rajender S, Saini KS, et all. Polymorphic variations in IL-ip, IL-6 and IL-10 genes, their circulating serum levels and breast cancer risk in Indian women. // Cytokine. -2012, -V.17. -P*.

225. Prajapati R, Plant D, Barton A. Genetic and genomic predictors of anti-TNF response. Pharmacogenomics. -2011. -V12 -Nil -P:1571-1585.

226. Prasad P, Kumar A, Gupta R, Juyal RC, Thelma BK. Caucasian and Asian specific rheumatoid arthritis risk loci reveal limited replication and apparent allelic heterogeneity in north Indians. PLoS One. 2012;7(2):e31584.

227. Pravica V, Perrey C, Stevens A, Lee JH, Hutchinson IV. A single nucleotide polymorphism in the first intron of the human IFN-gamma gene: absolute correlation with a polymorphic CA microsatellite marker of high IFN-gamma production. Hum

Immunol. 2000 Sep;61(9):863-6.

213

228. Prinz M., Hanisch U.K., Kettenmann H., Kirchhoff F. Alternative splicing of mouse IL-15 is due to the use of an internal splice site in exon 5 // Brain Res Mol Brain Res. -1998. -V. 63. -P. 155-62.

229. Ptitsyn L.R., Smirnov S.V., Al'tman I.B., Samsonova N.N., Khodiakova A.V., Vasilenko R.N. [Production of recombinant hIL-4delta2-a native isoform of human interleukin-4 in Escherichia coli cells] // Bioorg Khim. -1999. -V. 25. -P. 623-9.

230. Puck J.M., Pepper A.E., Henthorn P.S., Candotti F., Isakov J. Mutation analysis of IL2RG in human X-linked severe combined immunodeficiency//Blood. -1997. -V. 89. -P. 1968-77.

231. Qidwai T., Khan F.Tumour Necrosis Factor Gene Polymorphism and Disease Prevalence Scandinavian.// Journal of Immunology. - Scandinavian Journal of Immunology. - 2011. - Vol. 74. - p. 522-547.

232. Rathjen P.D., Toth S., Willis A., Heath J.K., Smith A.G. Differentiation inhibiting activity is produced in matrix-associated and diffusible forms that are generated by alternate promoter usage // Cell. -1990. -V. 62. -P. 1105-14.

233. Robinson J., Sieff C., Delia D., Edwards P.A., Greaves M. Expression of cell-surface HLA-DR, HLA-ABC and glycophorin during erythroid differentiation // Nature. -1981. -V. 289. -P. 6871.

234. Rodríguez-Carreón AA, Zúñiga J, Hernández-Pacheco G,

Rodríguez-Pérez JM, et all. Tumor necrosis factor-alpha -308

promoter polymorphism contributes independently to HLA

alleles in the severity of rheumatoid arthritis in Mexicans.//

214

Journal of Autoimmunity. - 2005. - Vol. 24(1). - p. 63-68.

235. Romano M., Marcucci R., Baralle F.E. Splicing of constitutive upstream introns is essential for the recognition of intra-exonic suboptimal splice sites in the thrombopoietin gene // Nucleic Acids Res. -2001. -V. 29. -P. 886-94.

236. Rosenwasser L.J. Promoter polymorphism in the candidate genes, IL-4, IL-9, TGF-betal, for atopy and asthma // Int Arch Allergy Immunol. -1999. -V. 118. -P. 268-70.

237. Rosenwasser L.J., Borish L. Genetics of atopy and asthma: the rationale behind promoter-based candidate gene studies (IL-4 and IL-10) // Am J Respir Crit Care Med. -1997. -V. 156. -P. S152-5.

238. Saha A, Dhir A, Ranjan A, Gupta V, Bairwa N, Bamezai R. Functional IFNG polymorphism in intron 1 in association with an increased risk to promote sporadic breast cancer.// Immunogenetics. -2005. -V57. -N3-4. -p 165-171.

239. Sakkas L.I., Tourtellotte C., Berney S., Myers A.R., Platsoucas C.D. Increased levels of alternatively spliced interleukin 4 (IL-4delta2) transcripts in peripheral blood mononuclear cells from patients with systemic sclerosis // Clin Diagn Lab Immunol. -1999. -V. 6.-P. 660-4.

240. Sayani F., Montero-Julian F.A., Ranchin V., Prevost J.M., Flavetta S. Identification of the soluble granulocyte-macrophage colony stimulating factor receptor protein in vivo // Blood. -2000. -V. 95. -P. 461-9.

241.

Schiff MH. Role of interleukin 1 and interleukin 1 receptor

antagonist in the mediation of rheumatoid arthritis. // Ann Rheum Dis. -2000. -V59 Suppl l:il03-108.

242. Schotte H, Schlüter B, Drynda S, Willeke P, et all. Interleukin 10 promoter microsatellite polymorphisms are associated with response to long term treatment with etanercept in patients with rheumatoid arthritis. // Ann Rheum Dis. -2005. -V64(4)-p:575-581.

243. Seah G.T., Gao P.S., Hopkin J.M., Rook G.A. Interleukin-4 and its alternatively spliced variant (IL-4delta2) in patients with atopic asthma // Am J Respir Crit Care Med. -2001. -V. 164. -P. 1016-8.

244. Seah G.T., Rook G.A. High levels of mRNA encoding IL-4 in unstimulated peripheral blood mononuclear cells from tuberculosis patients revealed by quantitative nested reverse transcriptase-polymerase chain reaction; correlations with serum IgE levels // Scand J Infect Dis. -2001. -V. 33. -P. 106-9.

245. Seah G.T., Scott G.M., Rook G.A. Type 2 cytokine gene activation and its relationship to extent of disease in patients with tuberculosis // J Infect Dis. -2000. -V. 181. -P. 385-9.

246. Seitz C., Muller P., Krieg R.C., Mannel D.N., Hehlgans T. A novel p75TNF receptor isoform mediating NFkappa B activation // J Biol Chem. -2001. -V. 276. -P. 19390-5.

247. Sennikov S.V., Krysov S.V., Injelevskaya T.V., Silkov A.N., Grishina L.V., Kozlov V.A. Quantitative analysis of human immunoregulatory cytokines by electrochemi luminescence method // J Immunol Methods. -2003. -V. 275. -P. 81-8.

248. Sette C, Dolci S, Geremia R, Rossi P. The role of stem cell factor and of alternative c-kit gene products in the establishment, maintenance and function of germ cells. Int J Dev Biol. 2000;44(6):599-608.

249. Settmacher U, Volk HD, von Baehr R, Wolff H, Jahn S.In vitro stimulation of human fetal lymphocytes by mitogens and interleukins.//Immunol Lett. 1993 Feb;35(2): 147-52.

250. Shi Y.F., Hill M., Novak A., Chen Z.Q., Wang R.X. Human hematopoietic cell express two forms of the cytokine receptor common gamma-chain (gamma c) // Cell Res. -1997. -V. 7. -P. 195-205.

251. Singh G, Cooper TA. Minigene reporter for identification and analysis of cis elements and trans factors affecting pre-mRNA splicing. // Biotechniques. -2006. -V41. -N2. -p 177-181.

252. Skrabanek L, Campagne F. Tissuelnfo: high-throughput identification of tissue expression profiles and specificity. // Nucleic Acids Res. -2001 -V29. -N21 -El02-2.

253. Smith AJ, Humphries SE. Cytokine and cytokine receptor gene polymorphisms and their functionality. // Cytokine Growth Factor Rev. -2009. -V20. -Nl. -p:43-59.

254. Smith C.W., Valcarcel J. Alternative pre-mRNA splicing: the logic of combinatorial control // Trends Biochem Sci. -2000. -V. 25.-P. 381-8.

255. Smith KC, Bateman AC, Fussell HM, Howell WM. Cytokine gene polymorphisms and breast cancer susceptibility and prognosis. // Eur J Immunogenet. -2004. -V31. -N4. -p:167-173.

256. Soga Y, Nishimura F, Ohyama H, Maeda H, Takashiba S, Murayama Y. Tumor necrosis factor-alpha gene (TNF-a) -1031/ -863, -857 single-nucleotide polymorphisms (SNPs) are associated with severe adult periodontitis in Japanese.// J Clin Periodontol. -2003. - Vol. 30. - p. 524-531.

257. Sorg R.V, Enczmann J, Sorg U.R, Schneider E.M, Wernet P. Identification of an alternatively spliced transcript of human interleukin-4 lacking the sequence encoded by exon 2 // Exp Hematol.-1993. -V. 21.-P. 560-3.

258. Sotgiu S, Pugliatti M, Serra C, Rosati G, et all. Tumor necrosis factor 2 allele does not contribute to increased tumor necrosis factor-alpha production in Sardinian multiple sclerosis. // Ann Neurol. -1999. -V46, -N5. -p:799-800.

259. Stadler ZK, Vijai J, Thorn P, Kirchhoff T, Hansen NA, Kauff ND, Robson M, Offit K. Genome-wide association studies of cancer predisposition. // Hematol Oncol Clin North Am. -2010. -V 24. -N5. -P:973-996.

260. Straubinger A.F, Viveiros M.M., Straubinger R.K. Identification of two transcripts of canine, feline, and porcine interleukin-1 alpha // Gene. -1999. -V. 236. -P. 273-80.

261. Suda T, Murray R, Guidos C, Zlotnik A. Growth-promoting activity of IL-1 alpha, IL-6, and tumor necrosis factor-alpha in combination with IL-2, IL-4, or IL-7 on murine thymocytes. Differential effects on CD4/CD8 subsets and on CD3+/CD3-double-negative thymocytes.// J Immunol. 1990 Apr 15;144(8):3039-45.

Suda T, Okada S, Suda J, Miura Y. , Ito M. A stimulatory

218

effect of recombinant murine interleukin-7 (IL-7) on B-cell colony formation and an inhibitory effect of IL-1 alpha // Blood. -1989. -V. 74.-P. 1936-41.

263. Suzu S, Hatake K, Ota J, Mishima Y, Yamada M. Identification of alternatively spliced transcripts encoding murine macrophage colony-stimulating factor // Biochem Biophys Res Commun. -1998. -V. 245. -P. 120-6.

264. Takabayashi A, Ihara K, Sasaki Y, Kusuhara K, Nishima S, Hara T. Novel polymorphism in the 5'-untranslated region of the interleukin-4 gene // J Hum Genet. -1999. -V. 44. -P. 352-3.

265. Tarkowski E, Liljeroth A.M., Nilsson A, Ricksten A, Davidsson P. TNF gene polymorphism and its relation to intracerebral production of TNFalpha and TNFbeta in AD // Neurology. -2000. -V. 54. -P. 2077-81.

266. Tavernier J, Tuypens T, Plaetinck G, Verhee A, Fiers W, Devos R. Molecular basis of the membrane-anchored and two soluble isoforms of the human interleukin 5 receptor alpha subunit // Proc Natl Acad Sci USA. -1992. -V. 89. -P. 7041-5.

267. Terme M, Ullrich E, Aymeric L, Meinhardt Cancer-induced immunosuppression: IL-18-elicited immunoablative NK cells.// Cancer Res. -2012 -V72(l 1) -p:2757-67.

268. Terry CF, Loukaci V, Green FR. Cooperative influence of genetic polymorphisms on interleukin 6 transcriptional regulation. // J Biol Chem. -2000. -V275. -N24. -p: 18138-44.

269. Thesleff I, Wang X.P, Suomalainen M. // C.R.Biol. 2007. V. 330. № 6-7. P. 561-564.

270. Tischer E., Mitchell R., Hartman T., Silva M., Gospodarowicz D. The human gene for vascular endothelial growth factor. Multiple protein forms are encoded through alternative exon splicing // J Biol Chem. -1991. -V. 266. -P. 11947-54.

271. Toksoz D., Zsebo K.M., Smith K.A., Hu S. , Brankow D. Support of human hematopoiesis in long-term bone marrow cultures by murine stromal cells selectively expressing the membrane-bound and secreted forms of the human homolog of the steel gene product, stem cell factor // Proc Natl Acad Sci U S

A. -1992. -V. 89. -P. 7350-4.

272. Tountas NA, Casini-Raggi V, Yang H, et all. Functional and ethnic association of allele 2 of the interleukin-1 receptor antagonist gene in ulcerative colitis. // Gastroenterology. -1999. -VI17. -N4. -p:806-813.

273. Tsytsikov V.N., Yurovsky V.V., Atamas S.P., Alms W.J., White

B. Identification and characterization of two alternative splice variants of human interleukin-2 // J Biol Chem. -1996. -V. 271. -P. 23055-60.

274. Turner DM, Williams DM, Sankaran D, Lazarus M, et all. An investigation of polymorphism in the interleukin-10 gene promoter. // Eur J Immunogenet. -1997. -V24 -pi-8

275. Udalova IA, Nedospasov SA, Webb GC, Chaplin DD, Turetskaya RL. Highly informative typing of the human TNF locus using six adjacent polymorphic markers. // Genomics. -1993.-V16.-Nl.-p 180-186.

276. Uglialoro AM, Turbay D, Pesavento PA, Delgado JC, et all.

Identification of three new single nucleotide polymorphisms in

220

the human tumor necrosis factor-alpha gene promoter. // Tissue Antigens. -1998. -V52. -N4. -p:359-367.

277. Van der Linden MW, Huizinga TW, Stoeken DJ, Sturk A, Westendorp RG. Determination of tumour necrosis factor-alpha and interleukin-10 production in a whole blood stimulation system: assessment of laboratory error and individual variation.// J Immunol Methods. - 1998. - Vol. 218. -p. 63-71.

278. van der Pouw Kraan TC, van Veen A, Boeije LC, van Tuyl SA, et all. An IL-13 promoter polymorphism associated with increased risk of allergic asthma. // Genes Immun. -1999. -Vl(l). -p:61-65.

279. Van Heel DA, Udalova IA, De Silva AP, McGovern DPet all. Inflammatory bowel disease is associated with a TNF polymorphism that affects an interaction between the OCT1 and NF(-kappa)B transcription factors.// Hum Mol Genet. - 2002. -Vol. 11.-p. 1281-1289.

280. Vikram NK, Bhatt SP, Bhushan B, Luthra K, et all. Associations of -308G/A polymorphism of tumor necrosis factor (TNP)-a gene and serum TNF-a levels with measures of obesity, intraabdominal and subcutaneous abdominal fat, subclinical inflammation and insulin resistance in Asian Indians in north India. // Dis Markers. -2011. -V31. -N1 ,-p:39-46.

281. Voulgaropoulou F., Myers R.L., Chiu I.M. Alternative splicing of fibroblast growth factor 1 (FGF-1) transcripts: a cellular dilemma in determining exon selection and exclusion // DNA Cell Biol. -1994. -V. 13. -P. 1001-9.

Voyle R.B., Rathjen P.D. Regulated expression of alternate

221

transcripts from the mouse oncostatin M gene: implications for interleukin-6 family cytokines // Cytokine. -2000. -V. 12. -P. 134-41.

283. Waldron-Lynch F, Adams C, Amos C, et all. Tumour necrosis factor 5' promoter single nucleotide polymorphisms influence susceptibility to rheumatoid arthritis (RA) in immunogenetically defined multiplex RA families. // Genes Immun. - 2001. - Vol. 2(2).-p. 82-7.

284. Walter M.R., Cook W.J., Zhao B.G., Cameron R.P. Jr, Ealick S.E. Crystal structure of recombinant human interleukin-4 // J Biol Chem. -1992. -V. 267. -P. 20371-6.

285. Wang GS, Cooper TA. Splicing in disease: disruption of the splicing code and the decoding machinery. // Nat Rev Genet. -2007.-V8.-N10-p 749-761.

286. Wang YC, Sung WW, Wu TC, Wang L, et all. Interleukin-10 haplotype may predict survival and relapse in resected non-small cell lung cancer. // PLoS One. -2012. -V7. -N7. e39525.

287. Watkins R.H., D'Angio C.T., Ryan R.M., Patel A., Maniscalco W.M. Differential expression of VEGF mRNA splice variants in newborn and adult hyperoxic lung injury // Am J Physiol. -1999. -V. 276. -P. L858-67.

288. Weissbach L., Tran K., Colquhoun S.A., Champliaud M.F., Towle C.A. Detection of an interleukin-1 intracellular receptor antagonist mRNA variant // Biochem Biophys Res Commun. -1998. -V. 244.-P. 91-5.

289. Welker P., Schadendorf D., Artuc M., Grabbe J., Henz B.M.

Expression of SCF splice variants in human melanocytes and melanoma cell lines: potential prognostic implications // Br J Cancer. -2000. -V. 82. -P. 1453-8.

290. Westendorp RG, Langermans JA, Huizinga TW et al. Genetic influence on cytokine production and fatal meningococcal disease.// Lancet. - 1997. - Vol. 349. - p. 170-173.

291. Xu X., Liao J., Creek K.E., Pirisi L. Human keratinocytes and tumor-derived cell lines express alternatively spliced forms of transforming growth factor-alpha mRNA, encoding precursors lacking carboxyl-terminal valine residues // Oncogene. -1999. -V. 18.-P. 5554-62.

292. Yashin AI, Wu D, Arbeev KG, Ukraintseva SV. Polygenic effects of common single-nucleotide polymorphisms on life span: when association meets causality. // Rejuvenation Res. -2012 -VI5 -N4 -P.381-394.

293. Yatsenko O.P., Filipenko M.L., Khrapov E.A., Voronina E.N., Kozlov V.A., Sennikov S.V. Alternative splicing of mRNA of mouse interleukin-4 and interleukin-6 // Cytokine. -2004. -V. 28. -P. 190-6.

294. Yatsenko O.P., Filipenko M.L., Voronina E.N., Khrapov E.A., Sennikov S.V., Kozlov V.A. Alternative splicing of murine interleukin-4 mRNA // Bull Exp Biol Med. -2004. -V. 137. -P. 179-81.

295. Zav'yalov V.P., Denesyuk A.I., White B., Yurovsky V.V., Atamas S.P., Korpela T. Molecular model of an alternative splice variant of human IL-4, IL-4 delta 2, a naturally occurring

inhibitor of IL-4-stimulated T cell proliferation // Immunol Lett. -

223

1997. -V. 58. -P. 149-52.

297.

■t

298.

299.

300.

Zheng G, Rao Q, Wu K, He Z, Geng Y. Membrane-bound macrophage colony-stimulating factor and its receptor play adhesion molecule-like roles in leukemic cells // Leuk Res. -2000. -V.24.-P. 375-83.

Ziegler S.F, Davis T, Schneringer J.A, Franklin T.L, Tough T.W. Alternative forms of the human G-CSF receptor function in growth signal transduction // New Biol. -1991. -V. 3. -P. 1242-8.

Collins F.S. Implications of the Human Genome Project for medical science / F.S. Collins, V.A. McKusick // JAMA.-2001.-Vol. 285,-№ 5.-P. 540-544.

D'Andrea A, Ma X, Aste-Amezaga M, Paganin C, Trinchieri G. Stimulatory and inhibitory effects of interleukin (IL)-4 and IL-13 on the production of cytokines by human peripheral blood mononuclear cells: priming for IL-12 and tumor necrosis factor alpha production // J Exp Med. -1995. -V. 181. -P. 537-46.

Waldvogel A.S, Lepage M.F, Zakher A, Reichel M.P, Eicher R, Heussler V.T. Expression of interleukin 4, interleukin 4 splice variants and interferon gamma mRNA in calves experimentally infected with Fasciola hepatica // Vet Immunol Immunopathol. -2004. -V. 97.-P. 53-63.