Адгезия клеток родококков к жидким углеводородам и их производным тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.02.03, кандидат биологических наук Рубцова, Екатерина Владиславовна

• Рубцова, Екатерина Владиславовна
• кандидат биологических наук
• 2011

Оглавление диссертации кандидат биологических наук Рубцова, Екатерина Владиславовна

Введение 4 ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

Глава 1. Биологические особенности актинобактерий рода 10 Ююйососст

1.1. Экологическая характеристика родококков

1.2. Пути ассимиляции углеводородных субстратов

Глава 2. Адгезивная активность микроорганизмов 22 в отношении жидких гидрофобных соединений

2.1. Физико-химические свойства углеводородов и масел

2.2. Адгезия как механизм адаптации микроорганизмов к условиям внешней среды; термодинамические аспекты и механизмы процесса адгезии

2.3. Использование адгезивных свойств микроорганизмов 42 в биотехнологии

2.4. Адсорбционная иммобилизация клеток микроорганизмов

2.5. Состояние проблемы адгезии актинобактерий рода 53 Яко^сосст к жидким гидрофобным соединениям

ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ

Глава 3. Материалы и методы исследования г*

3.1. Рабочая коллекция, условия культивирования родококков

3.2. Тп5-мутагенез клеток родококков

3.3. Определение адгезивной активности исследуемых культур 64 в отношении жидких углеводородов и их производных

3.4. Определение степени гидрофобности клеток родококков

3.5. Определение общего липида в клетках родококков

3.6. Оценка углеводородокисляющей активности родококков

3.7. Определение термодинамических характеристик клеток 68 родококков на границе раздела фаз вода-воздух и вода-углеводород

3.8. Адсорбционная иммобилизация клеток микроорганизмов 69 в колонке, содержащей криогель на основе полиакриламида

3.9. Определение жизнеспособности и функциональной 71 активности иммобилизованных на гелевом носителе клеток

3.10. Статистическая обработка результатов исследования

Глава 4. Характеристика адгезивных свойств актинобактерий рода Rhodococcus

Глава 5. Термодинамические свойства клеток родококков 114 при взаимодействии с жидкими углеводородами

Глава 6. Адсорбционная иммобилизация клеток родококков 121 на полиакриламидном геле

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Адгезия клеток родококков к жидким углеводородам и их производным»

Актуальность проблемы. Бактериальная адгезия является начальным этапом процесса ассимиляции и биотрансформации органических субстратов. Повышенный интерес исследователей к процессам адгезии бактериальных клеток к углеводородным соединениям и их производным обусловлен возрастающим загрязнением окружающей среды гидрофобными ксенобиотиками (Johnsen et al., 2005; Liu et al., 2009). Гетерофазные микробиологические процессы находят всё более широкое применение в биотехнологиях получения красителей и ароматизаторов на основе углеводородного сырья (Morrish et al., 2008; Garikipati et al., 2009), биотрансформации сложных органических соединений (Leon et al., 1998; Janikowski et al., 2002), а также в биотехнологиях очистки загрязненных углеводородами и маслами сточных вод (Quijano et al., 2009). Необходимо отметить, что если особенности адгезии микроорганизмов к твердым поверхностям и формирования биопленок в настоящее время интенсивно изучаются (Романова и др., 2006; Николаев, Плакунов, 2007; Speranza et al., 2004; Tsuneda et al., 2004; Bayoudh et al., 2006), то сведения об адгезивной активности бактериальных клеток в отношении жидких гидрофобных соединений немногочисленны и касаются, в основном, представителей грамотрицательных бактерий родов Pseudomonas и Acinetobacter (Rosenberg, 2006; Zoueki et al., 2010). Бактериальная адгезия к жидким углеводородам отдельными авторами (Busscher, van der Mei, 2006; Munoz et al., 2007) рассматривается как механизм образования биопленок в водно-углеводородных средах, которые применяются в гетерофазных биореакторах. Аналогичные механизмы реализуются при бактериальной колонизации различных твердых поверхностей (трубопроводного и емкостного нефтяного оборудования, медицинского инструментария), покрытых жидкими гидрофобными пленками (Lejeune, 2003; Brakstad, Bonaunet, 2006).

Актинобактерии рода Ююс1ососси8 — сравнительно новый объект промышленного использования, характеризующийся наличием полифункциональных оксигеназных ферментных комплексов и способностью к окислительной трансформации широкого спектра природных и антропогенных углеводородов. Адгезивные свойства родококков обусловливают эффективность процесса усвоения углеводородных субстратов и обеспечивают конкурентное преимущество данных микроорганизмов в биотопах районов нефтяных загрязнений и нефтепромыслов (Ившина, 1997; ^Ъу1е et а1., 1999). Реализация биотехнологического потенциала родококков предусматривает всестороннее изучение механизмов их адгезии к. гидрофобным соединениям, а также физико-химических и биологических факторов, регулирующих данный процесс. В лаборатории алканотрофных микроорганизмов Института экологии и генетики микроорганизмов УрО РАН в течение ряда лет изучаются закономерности адгезии клеток родококков к твердым носителям (Криворучко, 2008; КпуошсЫсо а1., 2006, 2009), тогда как подобные исследования в отношении гидрофобных жидкостей ранее не проводились.

Цель, настоящей работы - исследование особенностей и механизмов адгезивной активности актинобактерий рода Ккойососст в отношении жидких углеводородных соединений и их производных.

Основные задачи исследования:

1. Исследовать адгезивные свойства родококков разных видов в отношении жидких углеводородов и их производных.

2. Определить термодинамические характеристики процесса адгезии клеток родококков к жидким углеводородам.

3. Изучить влияние условий культивирования родококков на, их адгезивную активность.

4. Исследовать процесс адсорбционной иммобилизации клеток родококков в гидрофобизованном гелевом носителе.

Научная новизна. Установлено, что актинобактерии рода Rhodococcus обладают высокой адгезивной активностью в отношении жидких углеводородов и их производных. Выявлена прямая зависимость показателя клеточной адгезии от длины углеродной цепи и степени гидрофобности н-алканов в, ряду Сю—>Ci6- Показано, что адгезивные свойства родококков зависят от их штаммовой специфичности, экологической приуроченности и условий культивирования. Обосновано, что родококки, изолированные из нефтезагрязненных экосистем, характеризуются повышенной адгезивной активностью по сравнению с таковыми, изолированными из незагрязненных природных биотопов. Впервые выявлена достоверная корреляция1 между степенью адгезии клеток родококков к жидким углеводородным субстратам и показателями клеточного роста. С использованием метода высокоточной межфазной тензиометрии исследована термодинамика адгезионного процесса и экспериментально подтвержден сорбционный механизм формирования биопленки R. ruber в водно-углеводородной системе.

Теоретическое и практическое значение работы. Полученные данные расширяют представление о процессе адгезии микроорганизмов к жидким гидрофобным субстратам как ключевом этапе ассимиляции углеводородных соединений и механизме адаптации к существованию в углеводородсодержащих биотопах. В результате проведенных исследований отобраны штаммы родококков с высокой (84-98%) степенью адгезивной активности в отношении алифатических и ароматических углеводородов, технических углеводородных смесей, пищевых и косметических масел. Выявленные закономерности изменения термодинамических параметров адгезионного процесса клеток родококков на границе раздела фаз углеводород-вода могут быть использованы, при регуляции роста бактериальных биопленок в жидких гетерофазных системах. Разработан метод селективного выделения родококков из смешанных микробных популяций на колонке с гидрофобизованным полиакриламидным криогелем (криоПААГ). Определены оптимальные условия адсорбционной иммобилизации родококков, обеспечивающие повышенную жизнеспособность, каталитическую активность и функциональную стабильность закрепленных в криоПААГ клеток. Полученные данные и отобранные штаммы с высокой адгезивной активностью могут быть использованы при разработке иммобилизованных биокатализаторов процессов направленной трансформации углеводородных соединений и биоочистки нефтезагрязненных сточных вод.

Основные положения, выносимые на защиту

1. Актинобактерии рода КНо(1ососст обладают высокой адгезивной активностью в отношении жидких (алифатических, ароматических) углеводородов и их производных (технических углеводородных смесей, пищевых и косметических масел).

2. Адгезивные характеристики родококков определяются степенью гидрофобности клеточной стенки и зависят от штаммовой специфичности, экологической приуроченности и условий культивирования.

3. Клетки родококков, адсорбируясь на межфазной поверхности углеводород-вода, проявляют выраженные поверхностно-активные свойства. При насыщении клетками- межфазного сорбционного слоя наблюдается качественное изменение термодинамических параметров системы, что свидетельствует о начале процесса пленкообразования.

4. Использование в качестве носителя гидрофобизованного криоПААГ обеспечивает возможность селективного выделения родококков из смешанных микробных популяций.

Апробация работы и публикации. Основные положения диссертационной работы доложены и обсуждены на Региональной научной конференции студентов, аспирантов и молодых ученых «Фундаментальные и прикладные исследования в биологии и экологии», Пермь, 2007; VI и VII Международной конференции «Современное состояние и перспективы развития микробиологии и биотехнологии», Минск, 2008, 2010; III Международной конференции «Микробное разнообразие: состояние, стратегия сохранения, биотехнологический потенциал», Пермь-Н. Новгород-Пермь, 2008; 14th International Biodeterioration and Biodégradation Symposium, Мессина, Италия, 2008; II Всероссийском с международным участием конгрессе студентов и аспирантов-биологов «Симбиоз Россия 2009», Пермь, 2009; Всероссийской научной конференции с международным участием «Физиология и генетика микроорганизмов в природных и экспериментальных системах», Москва, 2009; 14th European Congress on Biotechnology, Барселона, Испания, 2009; 24th Conférence of the European Colloid and Interface Society, Прага, Чехия, 2010.

По теме диссертации опубликовано 14 печатных работ, из них 2 статьи в научных журналах, рекомендованных ВАК Минобрнауки РФ.

Объем и структура работы. Работа изложена на 188 страницах машинописного текста, содержит 14 таблиц и 36 рисунков. Диссертация состоит из введения, обзора литературы, описания материалов и методов исследования, трех глав собственных исследований, заключения, выводов, списка цитируемой литературы, включающего 387 наименований, в том числе 57 на русском и 330 на английском языках.

Заключение диссертации по теме «Микробиология», Рубцова, Екатерина Владиславовна

ВЫВОДЫ

1. Установлено, что актинобактерии рода Rhodococcus проявляют выраженную (>60%) адгезивную активность в отношении жидких углеводородов и их производных. Наиболее высокие (93-98%) показатели адгезии выявлены у представителей R. opacus и R. ruber в отношении н-алканов.

2. Показано, что адгезивные свойства родококков зависят от физико-химических свойств гидрофобного субстрата, а также состава питательной среды, условий культивирования и экологической приуроченности штаммов. Родококки, изолированные из нефтезагрязненных экосистем, характеризуются повышенной адгезивной активностью по сравнению с таковыми из незагрязненных биотопов.

3. Выявлена положительная корреляция (R=0,87; Р=0,0049) между показателями клеточного роста и степенью адгезии родококков к жидким углеводородам. Обнаруженная зависимость подтверждается с использованием полученного Тп5-мутантного клона R. ruber с гидрофильной клеточной стенкой, дефицитного по адгезии к н-гексадекану и не способного к росту в присутствии н-гексадекана.

4. Определены термодинамические параметры (свободная энергия, работа адгезии, полная межфазная энергия) адгезионного процесса на границе раздела фаз я-гексадекан-вода, свидетельствующие о начале формирования биопленки при достижении пороговой концентрации клеток родококков в межфазном слое.

5. Разработан метод селективной адсорбции клеток родококков в гидрофобизованном криоПААГ, обеспечивающий выделение (свыше 70%) представителей R. ruber из смешанных бактериальных популяций. Иммобилизованные клетки родококков характеризуются высокими (93-95%) показателями жизнеспособности и функциональной стабильности в течение шести месяцев хранения.

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

Работа представляет собой комплексное исследование адгезивных свойств коллекционных штаммов родокококков в отношении жидких углеводородов и их производных. В результате проведенных экспериментов установлено, что актинобактерии рода Rhodococcus обладают высокой (>60%) адгезивной активностью в отношении жидких гидрофобных соединений. Наибольшие показатели адгезии зарегистрированы в отношении представителей R. ruber и R. opacus.

Нами показано, что наиболее эффективными субстратами для адгезии клеток родококков являются н-алканы (64-84% прикрепленных клеток), моторное (79%) и минеральное (78%) масла, керосин (71%) и ксилол нефтяной (74%). Выявлена прямая зависимость показателя клеточной адгезии от длины углеродной цепи и степени гидрофобности н-алканов в ряду С1 q—>С[б- Экспериментально подтверждено, что адгезивные свойства родококков зависят от источника углеродного питания, солености, кислотности и температуры среды культивирования, а также от физико-химических свойств гидрофобного соединения, соотношения гидрофобной/водной фаз, продолжительности контакта между ними и температуры окружающей среды. Показано, что культивирование родококков при 28°G в нейтральной или слабощелочной богатой питательной среде или минеральной среде1 с добавлением н-гексадекана способствует наибольшей адгезивной активности клеток. По нашим данным, максимальные показатели адгезии наблюдаются при соотношении гидрофобной/водной фаз 1:2,5.

Экспериментально обосновано, что адгезия является необходимым этапом в ассимиляции гидрофобных соединений и может рассматриваться как адаптивный механизм к условиям существования в углеводородсодержащих биотопах. Нами установлена достоверная корреляция (R=0,87, р=0,0049) между показателями клеточного роста родококков в присутствии гидрофобных соединений и адгезивной активностью в отношении данных соединений. Кроме того, показано, что для штаммов, обладающих высокой (> 70%) адгезивной активностью, степень потребления углеводородов составляет в среднем 44%. В то время как для штаммов с более низкими (< 70%) показателями адгезии в отношении исследуемых углеводородов, данный показатель не превышал 22%. Установлено также, что для штаммов родококков, выделенных из нефтезагрязненных биотопов, характерна высокая (82,46%) адгезивная активность, при этом степень потребления углеводородов данными культурами составляет 47,16%. В то время как для родококков, выделенных из незагрязненных проб, аналогичные показатели составили 75,16 и 34,65%, соответственно.

В результате исследования процесса накопления биомассы клетками родококков в присутствии различных н-алканов выявлена четкая зависимость (R=0,87, р=0,0049) показателя, клеточного роста от степени адгезии родококков к алкановому субстрату. Полученные результаты свидетельствуют о том, что интенсивность роста данных бактерий в присутствии исследуемых углеводородов- обусловлена эффективностью процесса их адгезии к этим гидрофобным соединениям. Следует отметить, что мутантный клон R. ruber ИЭГМ 231', полученный путем транспозонного мутагенеза, дефицитный по адгезивной активности, не способен к росту на н-гексадекане. При этом количество суммарных клеточных липидов данного клона составляет 5,4 ± 0,76 % от сухого веса клеток, что в 2 раза меньше по сравнению с таковым родительского штамма.

Исследование термодинамических параметров процесса адгезии клеток родококков на разделе фаз углеводрод-вода с использованием автоматического тензиометра показало четкую зависимость их межфазной (R=-0,9872, р=0,0002) и поверхностной (R=-0,9700, /7=0,00001) активности от используемой клеточной концентрации. Расчет термодинамических параметров адгезионного процесса, в частности свободной энергии и работы адгезии, показал, что при достижении пороговой концентрации бактериальных клеток происходит образование межклеточных контактов и инициация формирования бактериальной биопленки. Полученные данные могут быть использованы для регуляции роста бактериальных биопленок в жидких гетерофазных системах.

На основании данных по адгезии родококков к жидким углеводородам показана возможность их иммобилизации и концентрирования в колонке с гелевым носителем на основе криоПААГ. Установлено, что гидрофобизация носителя путем ввода остатков н-додекана в структуру гидрофильного криогеля способствует увеличению адсорбционной емкости криоПААГ на 40-50%. Подобраны оптимальные условия сорбционной иммобилизации клеток родококков на гелевом носителе. Выявлена высокая функциональная стабильность закрепленных в гидрофобизованном криоПААГ клеток R. ruber. Показано, что дыхательная активность иммобилизованных родококков превосходит таковую свободных клеток на 15-17%. Показана возможность длительного (0,5 года) хранения иммобилизованных родококков без потери их жизнеспособности.

В результате проведенных исследований разработан метод селективного выделения и концентрирования актинобактерий рода Rhodococcus из смешанных бактериальных популяций с использованием гидрофобизованной криоПААГ-колонки: Полученные данные могут быть использованы при разработке биокатализатора на основе иммобилизованных клеток родококков для направленной трансформации углеводородных соединений и биоочистки нефтезагрязненных вод.

145

Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Рубцова, Екатерина Владиславовна, 2011 год

1. Абрамзон A.A., Зайченко Л.П., Файнгольд С.И. Поверхностно-активные вещества. Синтез, анализ, свойства, применение: учеб. пособие для вузов / Под. ред. A.A. Абрамзона. Л.: Химия, 1988. — 200 с.

2. Березин И.В. Иммобилизованные ферменты / И.В. Березин, Н.Л. Клячко, A.B. Левашов и др. // Биотехнология: учеб. пособие для вузов. 7 изд. -М.: Высш. шк., 1987. 159 с.

3. Биосинтез биологически активных веществ иммобилизованными клетками микроорганизмов / Н.С. Егоров, Н.С. Ландау, Е.А. Борман и др. // Прикл биохимия и микробиология. 1984. -Т. 20, №5 — С. 579-592.

4. Биотрансформация ß-ситостерола и сложных эфиров ß-ситостерола актинобактериями рода Rhodococcus / И.Б. Ившина, В.В. Гришко, Е.М. Ноговицина и др. // Прикл биохимия и микробиология. 2005. — Т. 41, №6.-С. 626-633.

5. Бирюков В.В., Барбот B.C. Основные направления разработки аппаратуры для биосинтеза микробных метаболитов иммобилизованными клетками аэробных микроорганизмов: сб. науч. трудов «Иммобилизованные клетки в биотехнологии». — Пущино, 1987.-С. 72-86.

6. Влияние солености среды на деструкцию нефтяных масел нокардиоподобными бактериями / И.С. Звягинцева, М.Н. Поглазов, М.Т. Готоева и др. // Микробиология. 2001. - Т. 70, № 6. - С. 657666.

7. Влияние состава клеточных липидов на формирование неспецифической антибиотикорезистентности алканотрофных родококков / М.С. Куюкина, И.Б. Ившина, М.И. Рычкова и др. // Микробиология. 2000. - Т. 69, № 1. - С. 62-69.

8. Гвоздяк П.И. Иммобилизованные микроорганизмы в очистке сточных вод от ксенобиотиков: сб. науч. трудов «Иммобилизованные клетки в биотехнологии». — Пущино, 1987. — С. 57-61.

9. Дерягин Б.В., Кротова H.A., Смилга В.П. Адгезия твердых тел. — М.: Наука, 1973.-278 с.

10. Жубанова A.A. Шигаева М.Х. Иммобилизованные клетки микроорганизмов // Биотехнология. Теория и практика. — 1997. — № 2. — С. 35-38.

11. Звягинцев, Д.Г. Почва и микроорганизмы. — М.: Изд-во МГУ, 1987. — 256 с.

12. Зимон, А. Д. Коллоидная химия: учеб. для вузов. 4-е изд., испр. и доп. - М.: АГАР, 2003. - 318 с.

13. Ившина И.Б. Бактерии рода Rhodococcus (иммунодиагностика, детекция, биоразнообразие) : дис. . д-ра биол. наук : 03.00.07 : защищена 23.12.1997 : утв. 06.03.1998 / Ившина Ирина Борисовна. — Пермь, 1997.- 197 с

14. Ившина И.Б., Пшеничнов P.A., Оборин A.A. Пропанокисляющие родококки. Свердловск.: УНЦ АН СССР, 1987. - 125 с.

15. Илялетдинов А.Н. , Алиева P.M. Микробиологическая очистка промышленных сточных вод иммобилизованными клетками микроорганизмов-деструкторов: сб. науч. трудов «Иммобилизованные клетки в биотехнологии». — Пущино, 1987. С. 62-71.

16. Иммобилизация клеток Е. coli в макропористые криогели на основе полиакриламида / К.А. Луста, Н.Г. Старостина, Н.Б. Горкина и др. // Прикл биохимия и микробиология. 1988. - Т. 24, №4. - С. 504-513.

17. Иммобилизация уксуснокислых бактерий на углеродных волокнах и использование их для трансформации тиодигликоля / Н.Г. Медведева, Ю.А. Гриднева, A.A. Лысенко и др. // Биотехнология. -2001.-№ 5.-С. 51-57.

18. Иммобилизованные клетки микроорганизмов / А.П. Синицын, Е.И. Райнина, В.И. Лозинский и др.. -М.: Изд-во МГУ, 1994. 288 с.

19. Использование иммобилизованных клеток микроорганизмов для получения этанола: Сб. науч. трудов «Иммобилизованные клетки в биотехнологии» / А.П. Синицын, Е.И. Райнина, Г.П. Бачурина и др.. -Пущино, 1987. С. 87-95.

20. Каталог штаммов региональной профилированной коллекции алканотрофных микроорганизмов / под ред. И.Б. Ившиной. -М.: Наука, 1994.- 163 с.

21. Квасников Е.И. Клюшникова Т.М. Микроорганизмы деструкторы нефти в водных бассейнах. - Киев.: Наукова думка, 1981. - 132 с.

22. Кейтс М. Техника липидологии. Выделение, анализ и идентификация липидов. -М.: Мир, 1975. 324 с.

23. Коронелли Т.В. Поступление углеводородов в клетки микроорганизмов // Успехи микробиологии. 1980. - № 15. - С. 99-111.

24. Коронелли Т.В. Принципы и методы интенсификации биологического разрушения углеводородов в окружающей среде (обзор) // Прикл биохимия и микробиология. 1996. - Т. 32, № 6. - С. 579-585.

25. Костерин A.B., Софинская O.A. Эффект влажности и верхнего техногенно незагрязненного слоя почвы в биодеградации тридекана // Вестник СамГУ — Естественнонаучная серия. Второй спец. вып. 2004. -С. 158- 175.

26. Кощеенко К.А., Суходольская Г.В. Иммобилизация клеток микроорганизмов: Сб. науч. трудов «Иммобилизованные клетки в биотехнологии». — Пущино, 1987. С. 4-13.

27. Криворучко A.B. Адсорбционная иммобилизация клеток алканотрофных родококков : дис. . к-та биол. наук : 03.00.07 : защищена 06.11.2008 : утв 16.01.2009 Текст./ Криворучко Анастасия Владимировна. — Пермь, 2008. — 174 с.

28. Лозинский, В.И. Новое семейство макропористых и сверхмакропористых материалов биотехнологического назначения — полимерные криогели // Известия РАН, Сер. хим. 2008. - № 5. — С.996-1013.

29. Лосиков Б.В. Нефтепродукты. Свойства, качество, применение: справочник. — М.: Химия, 1966. 776 с.

30. Методы общей бактериологии. Том 3 / пер. с англ. / под ред. Ф. Герхардта и др. М.: Мир, 1984. - 264 с.

31. Молекулярная генетика: учеб.-метод. пособие / под. ред. С.В. Боронниковой; Перм. ун-т. Пермь, 2007. Никитина О.А. - 150 с.

32. Нестеренко О.А., Квасников Е.И., Ногина Т.М. Нокардиоподобные и коринеподобные бактерии . Киев: Наукова думка, 1985. - 336 с.

33. Николаев Ю.А., Плакунов В.К. Биопленка — «город микробов» или аналог многоклеточного организма? // Микробиология. 2007. - Т.76, №2.-С. 149-163.

34. Оборин А.А., Стадник Е.В. Нефтегазопоисковая геомикробиология. — Екатеринбург: УрО РАН, 1996. 406 с.

35. Образование водорода термофильными анаэробными бактериями Clostridium thermosaccharolyticum, иммобилизованными в криогель поливинилового спирта / О.А. Никитина, С.С. Зацепин, С.В. Калюжный и др. // Микробиология. 1993. -Т. 62, № 3. - С. 477-489.

36. Осипов А.И. Пономарева Л.В., Иванова Т.А. Диологическая очистка нефтезагрязненных почв // Доклады РАСХН. 1998. - № 6. - С. 20-22.

37. Оценка гидрофобных свойств бактериальных клеток по адсорбции на поверхности капель хлороформа / Е.В. Серебрякова, И.В. Дармов, Н.П. Медведев и др. // Микробиология. 2002. - Т. 71, № 2. - С. 237-239.

38. Петров А.А. Химия алканов. М.: Наука, 1974. - 243 с.

39. Пиковский Ю.И. Трансформация техногенных потоков нефти в почвенных экосистемах. М.: Наука, 1988. — 254 с.

40. Поверхностные явления в масляных фракциях / И.В. Ионова,

41. B.П. Барабанов, Д.Н. Колушев и др. // Структура и динамика молекулярных систем. 2003. - Т. 10, ч. 3. - С. 121-123.

42. Позмогова И.Н. Возможные пути окисления жидких н-алканов микроорганизмами // Успехи микробиологии. — 1968. № 5. - С. 62-89.

43. Полярные липиды углеводородокисляющих бактерий / Т.В. Коронелли,

44. C.Г. Юферова, В.В. Ильинский и др. // Микробиология. 1993. -Т.62., № 2. С. 231-237.

45. Разработка феноменологической модели кинетики бактериальной адсорбции на низкоэнергетических поверхностях / В.В. Федорович, C.B. Калюжный, П. ван дер Мирен и др. // Вестн Моек ун-та. Сер. 2. Химия. 2002. - Т. 43, № 6. - С. 417-419.

46. Рачинский В.В., Давидова Е.Г., Лопатышкина А.И. Локализация окисления н-парафинов дрожжами // ДАН СССР. — 1971. Т. 200," № 2. - С. 457-460.

47. Ребиндер П.А. Поверхностные явления в дисперсных системах: Коллоидная химия. — М.: Наука, 1978. 368 с.

48. Сидоренко C.B. Инфекционный процесс как "диалог""между хозяином и паразитом // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия.-2001.-Т. 3, № 4. С. 301-315.

49. Скрябин Г.К., Головлева Л.А. Использование микроорганизмов в органическом синтезе. М.: Наука, 1976. — 336 с.

50. Современная микробиология. Прокариоты. В 2-х тт / под ред. Й. Ленгелера, Г. Древса, Г. Шлегеля. М.: Мир, 2005. - Т.2 - 496 с.

51. Сорбция микроорганизмов крупнопористыми агарозными криогелями, содержащими привитые алифатические цепи различной длины / В.Г. Евтюгин, А.Б.Маргулис, Л.Г. Дамшкалн и др. // Микробиология. — 2009. Т. 78, № 5. - С. 667-673.

52. Образование биопленок пример социального поведения бактерий / Ю.М. Романова, Т.А. Смирнова, A.JI. Андреев, Т.С. Ильина, Л.В. Диденко, A.JI. Гинцбург // Микробиология. - 2006. - Т. 75, № 4. -С. 556-661.

53. Тютюнников Б.Н. Химия жиров. М.: Пищевая промышленность, 1974.-446 с.

54. Фенотипическая характеристика родококков из различных экосистем / И.Б. Ившина, М.В. Бердичевская, Л.В. Зверева и др. // Микробиология. 1995. - Т. 64, № 4. -С. 507-513.

55. Физико-химические основы иммобилизации клеток методом сорбции (обзор) / Е.И. Козляк, М.М. Якимов, И.Б. Уткин и др. // Прикл биохимия и микробиология. 1991. - Т. 27, № 6. - С. 788-803.

56. Фролов Ю.Г. Курс коллоидной химии. Поверхностные явления и дисперсные системы: учебник для вузов. — 2-е изд., перераб. и доп. — М.: Химия, 1988.-464 с.

57. Шеховцова Н.В., Звягинцев Д.Г., Паников Н.С. Кинетика, роста Arthrobacter globiformis и Pseudomonas fluorescens на средах со стекловолокном // Микробиология. — 1992. -Т. 61, № 6. — С. 995— 1004.

58. A comparison of five methods for assaying bacterial hydrophobicity / J.K. Dillon, J.A. Fuerst, A.C. Hayward et al. // J. Microbiol. Methods. -1986. V. 6, N. l.-P. 13-19.

59. A comparison' of thermodynamic approaches to predict the adhesion of dairy microorganisms to solid substrata / M.N. Bellon-Fontaine, N. Mozes, H.C.Van der Mei et al. II Cell Biophys. -1990. V. 17, N. 1. - P. 93-106.

60. A comparison of various methods to predict bacterial predilection for organic solvents used as reaction media / T. Hamada, Y. Sameshima, K. Honda et al. II J. Biosci. Bioeng. 2008. - V. 106, N. 4. - P. 357-362.

61. A GAC biofilm reactor for the continuous degradation of 4—chlorophenol: treatment efficiency and microbial analysis / M.F. Carvalho, I. Vasconcelos, A.T. Bull et al. // Appl. Microbiol. Biotechnol. 2001. - V. 57, N. 3. -P. 419-426.

62. A new test based on 'salting out' to measure relative surface hydrophobicity of bacterial cells / M. Lindahl, A. Faris, T. Wadstrom et a\. II Biochim. Biophys. Acta. 1981. -V. 677, N. 3-4. - P. 471^176.

63. A novel transformation of polychlorinated biphenyls by Rhodococcus sp. strain RHA1 / M. Seto, K. Kimbara, M. Shimura et al.- II Appl. Environ. Microbiol. 1995. -V. 61, N. 9. 3353-3358.

64. A rewiew: The genus Rhodococcus / K.S. Bell, J.C. Philp, D.W.J. Aw et al. II J. Appl. Microbiol. 1998. - V. 85, N. 2. - P. 195-210.

65. Abbasnezhad H., Gray M.R., Foght J.M. Two different mechanisms for adhesion of Gram-negative bacterium, Pseudomonas fluorescens LP6a, to an oil-water interface // Colloids Surf. B Biointerfaces. 2008. - V. 62, N l.-P. 36-41.

66. Abu-Lail N.I., Camesano T.A. Role of ionic strength on the relationship of biopolymer conformation, DLVO contributions, and steric interactions to bioadhesion of Pseudomonas putida KT2442 // Biomacromolecules. — 2003. V.4, N 4. P. 1000-1012.

67. Acetylene degradation by new isolates of aerobic bacteria and comparison of acetylene hydratase enzymes / B.M. Rosner, F.A. Rainey, R.M. Kroppenstedt et al. II FEMS Microbiol. Letters. 1997. - V. 148, N. 2: -P. 175-180.

68. Adamson A.W., Gast A.P. Physical chemistry of surfaces. 6th ed. — John Wiley & Sons.- 1997. - 804 p.

69. Adaptation of Rhodococcus erythropolis DCL14 to growth on n—alkanes, alcohols and terpenes / C.C.R. de Carvalho, B. Parreno-Marchante, G. Neumann et al. II Appl. Microbiol. Biotechnol. 2005b. - V. 67, N. 3. -P. 383-388.

70. Adhesion and aggregation ability of probiotic strain Lactobacillus acidophilus M92 / B. Kos, J. Suskovic, S.Vukovic et al. // J. Appl. Micorbiol. 2003. - V. 94, N. 6. - P. 981-987.

71. Adhesion of Acinetobacter venetianus to diesel fuel droplets studied with in situ electrochemical and molecular probes / F. Baldi, N. Ivosevic, A. Minacci et al. II Appl. Environ. Microbiol. 1999. - V. 65, N. 5. -P. 2041-2048.

72. Adhesion of single bacterial cells in the micronewton range / P.H. Tsang, G. Li,. Y.V. Brun et al. Il Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2006. - V. 103. -P. 5764—5768.

73. Adhesion to cellulose of the Gram-positive bacterium Ruminococcus albus involves type IV pili / H. Rakotoarivonina, G. Jubelin, M. Hebraud et al. Il Microbiology. -2002. V. 148.-P. 1871-1880.

74. Adhesion, autoaggregation and hydrophobicity of 13 strains of Bifidobacterium longum / B. Del Re, B. Sgorbati, M. Miglioli et al. Il Lett. Appl. Microbiol. 2000. - V. 31, N. 6. - P. 438-442.

75. Affinity fractionation of lymphocytes using a monolithic cryogel / A. Kumar, F.M. Plieva, I.Yu et al. II J Immunol Methods. 2003. -V. 283, N 1-2.-P. 185-194.

76. Alkanotrophic Rhodococcus ruber as a biosurfactant producer / J.C. Philp, M.S. Kuyukina, I.B. Ivshina et al. II Appl. Microbiol. Biotechnol. 2002. -V. 59, N. 2-3 .-P. 318-324.

77. Alvarez H.M. Relationship between b-oxidation pathway and the hydrocarbon-degrading profile in the Actinomycetes bacteria // Int. Biodeterior. Biodegrad. 2003. - V.52, N 1. - P. 35-42.

78. An alkane-responsive expression system for the production of fine chemicals / S. Panke, A. Meyer, C.M. Huber et al. // Appl. Environ. Microbiol. 1999. - V. 65, N. 6. - P. 2324-2332.

79. An oil-degrading bacterium: Rhodococcus erythropolis strain 3C-9 and its biosurfactants / F. Peng, Z. Liu, L. Wang et al. II J. Appl. Microbiol. -2007.-V. 102, N. 6.-P. 1603-1611.

80. Aqueous solubility molecular size relationships: a mechanistic case study using Cio - to Ci9-alkanes / J. Tools, J. van Dijk, E.J.M. Vebruggen et al. II J. Phys. Chem. A. - 2002. V. 106, N. 11. - P. 2760-2765.

81. Arai K., Kusu F., Takamura K. Electrochemical behavior of drugs at oihwater interfaces, in: A.G. Volkov, D.W. Deamer (Eds.), Liquid-Liquid Interfaces. Theory and Methods // CRC Press, Boca Raton, 1996. -375p.

82. Ascön-Cabrera M.A., Ascön-Reyes D.B., Lebeault J.-M. Degradation activity of adhered and suspended Pseudomonas cells cultured on 2,4,6— trichlorophenol, measured by indirect conductimetry // J. Appl. Microbiol. -1995. V. 79. N. 6. - P. 617-624.

83. Ashraf W., Mihdir A., Murrell J.C. Bacterial oxidation of propane // FEMS Microbiol. Lett. 1994. - V. 122, N. 1-2. - P. 1-6.

84. Aspray T.J., Carvalho D.J.C., Philp J.C. Application of soil slurry respirometry to optimise and subsequently monitor ex situ bioremediation of hydrocarbon—contaminated soils // Int. Biodeterior. Biodegrad. — 2007. — V. 60, N. 4.-P. 279-284.

85. Atkinson B., Fowler H.W. The significance of microbial film in fermenters // Adv. Biochem. Eng. 1974. - V. 3. - P. 221-227.

86. Augmentation of selfpurification capacity of sewer pipe by immobilizing microbes on the pipe surface / I.W. Marjaka, K. Miyanaga, K. Hori et al. Il Biochem. Eng. J. 2003. - V. 15, N. 1. - P. 69-75.

87. Autoaggregation and adhesion ability in a Bifidobacterium suis strain / B. Del Re, A. Busetto, G. Vignola et al. II Lett. Appl. Microbiol. 1998. -V. 27, N. 5.-P. 307-310.

88. Bacterial adherence to hydrocarbons and to surfaces in the oral cavity / M. Rosenberg, E. Rosenberg, H. Judes et al. // FEMS Microbiol. Lett. -1983.-Vol. 20, N. l.-P. 1-5.

89. Bacterial adhesion: a physicochemical approach / M.C.M. van Loosdrecht, J. Lyklema, W. Norde et al. Il Microb. Ecol. 1989. - V. 17, N. 1. - P. 1-15.

90. Bacterial PCB degradation / A.W. Boyle, C.J. Silvin, J.P. Hassett et al. Il Biodégradation. 1992. - V. 3, N. 2-3. - P. 285-298.

91. Balebona M.C., Morinigo M.A., Borrego J.J. Hydrophobicity and adhesion to fish cells and mucus of Vibrio strains isolated from infected fish // Int. Microbiol. 2001. - V. 4, N. 1. - P. 21-26.

92. Banat I.M., Makkar R.S., Cameotra S.S. Potential commercial applications of microbial surfactants // Appl. Microbiol.Biotechnol. 2000. - V. 53, N. 5. - P. 495-508.

93. Banerjee S., Yalkowsky S.H., Valvani S.C. Water solubility and octanol/water partition coefficients of organics: limitations of the solubility-partition coefficient correlation // Environ. Sci.Technol. 1980. — V. 14, N. 10.-P. 1227-1229.

94. Barton A.J., Sagers R.D., Pitt W.G. Bacterial adhesion to orthopedic implant polymers //J. Biomed. Mater. Res. 1996. -V. 30, N. 3. - P. 403-410.

95. Bassel J.B., Mortimer R.K. Identification of mutations preventing ft-hexadecane uptake among 26 «-alkane non-utilizing mutants of Yarrowia (Saccharomycopsis) lipolytica II Curr. Genet. — 1985. V. 9, N. 7. — P. 579586.

96. Behki R.M., Topp E.E., Blackwell B.A. Ring hydroxylation of N-methylcarbamate insecticides by Rhodococcus TE1 // J Agrie and Food Chem. 1994.-V. 42, N. 6.-P. 1375-1378.

97. Bicca F.C., Fleck L.C., Ayub M.A.Z. Production of biosurfactant by hydrocarbon degrading Rhodococcus ruber and Rhodococcus erythropolis II Rev Microbiol. 1999. - V. 30, N. 3. - P. 231-236.

98. Bioconversions of aliphatic compounds by Pseudomonas oleovorans in multiphase bioreactors background and economic potential / B. Witholt, M.J. Desmet, J. Kingma et al. II Trends Biotechnol. - 1990. - V. 8, N. 2. -P. 46-52.

99. Biosurfactant production by Rhodococcus erythropolis grown on glycerol as sole carbon source / E.M.P. Ciapina, W.C. Meló, A.L.M.M. Santa et al. // Appl. Biochem. Biotechnol. 2006. - V. 131, N. 1-3. - P. 880-886.

100. Biosynthesis of fatty acids and triacylglyverols by 2,6,10,14-tetramethyl pentadecane-grown cells of Nocardia globerula 432 / H.M. Alvarez, M.F. Souto et al. II FEMS Microbiol. Lett. 2001. - V.200. - P. 195-200.

101. Biotransformation in double-phase systems: physiological responses of Pseudomonas putida DOT—TIE to a double phase made of aliphatic alcohols and biosynthesis of substituted catechols / A. Rojas, E. Duque,

102. A. Schmid et al. Il Appl Environ Microbiol. 2004. - V. 70, N. 6. -P. 3637-3643.

103. Bos R., van der Mei H.C., Busscher H.J. Physico-chemistry of initial microbial adhesive interactions its mechanisms and methods for study // FEMS Microbiol. Rev. - 1999. - V. 23, N. 2. - P. 179-230.

104. Bouchez M., Blanchet D., Vandecasteele J.P. Substrate availability in phenanthrene biodégradation: transfer mechanism and influence on metabolism // Appl. Microbiol. Biotechnol. 1995. - V. 43, N. 5. -P. 952-960.

105. Bouwer E.J., Zehnder A.J. Bioremediation of organic compounds-putting microbial-metabolism to work //Trends Biotechnology. 1993. — V. 11, N. 8.-P. 360-367.

106. Bowen W.R., Lovitt R.W., Wright C.J. Atomic force microscopy study of the adhesion of Saccharomyces cerevisiae // J Colloid Interface Sci. — 2001.-V. 237, N. l.-P. 54-61.

107. Brinton C.C. The structure, function, synthesis and genetic control of bacterial pili and a molecular model for DNA and RNA transport in gram negative bacteria / Trans N Y Acad Sci. 1965. - V. 27, N. 8. - P. 10031054.

108. Broadway N.M., Dickinson F.M., Ratledge C. The enzymology of dicarboxylic acid formation by Corynebacterium sp. strain 7E1C grown on rc-alkanes // J. Gen. Microbiol. 1993. - V. 139. - P. 1337-1344.

109. Brushan B. Adhesion and stiction: Mechanisms, measurement techniques, and methods for reduction // J Vac Sci Technol B. 2003. - V. 21. N. 6. -P. 2262-2296.

110. Bunt C.R., Jones D.S., Tucker I.G. The effects of pH, ionic strength and polyvalent ions on the cell surface hydrophobicity of Escherichia coli evaluated by the BATH and HIC methods // Int. J. Pharm. 1995. - V. 113, N. 2.-P. 257-261.

111. Busscher H.J., Retief D.H., Arends J. Relationship between surface-free energies of dental resins and bond strengths to etched enamel // Dent. Materials. 1987. - V. 3, N. 2. - P. 60-63.

112. Camesano T.A., Unice K.M., Logan B.E. Modeling dynamic blocking of colloids in porous media using intracolumn deposition patterns and breakthrough curves // Colloids Surf. A. 1999. - V. 160, N. 3. - P. 291307.

113. Carbon source-induced modifications in the mycolic acid content and cell wall permeability of Rhodococcus erythropolis El /1. Sokolovska, R. Rosenberg, C. Riez et al. II Appl. Environ. Microbiol. 2003. - V. 69. -P. 7019-7027.

114. Cassidy M.B., Lee H., Trevors J.T. Environmental applications of immobilized microbial cells: a review // J. Ind. Microbiol. Biotechnol. -1996. -V. 16, N. 2. P. 79-101.

115. Castellani A., Chalmers A.J. Manual of tropical medicine, 3rd ed. // Williams, Wood and Co., New York. 1919. -1040 p.

116. Cell hydrophobicity as a criterion of selection of bacterial producers of biosurfactants / N.N. Volchenko, S.G. Karasev, D.V. Nimchenko et al. II Microbiology. 2007. - V. 76, N. 1. - P. 112-114.

117. Cell surface hydrophobicity and mycolic acid composition of Rhodococcus strains isolated from active sludge foam / H.M. Stratton. P.R. Brooks,

118. P.C. Griffiths et al. II J. Indust. Microbiol. Biotechnol. 2001. - V. 28, N. 5.-P. 264-267.

119. Cell surface hydrophobicity and slime production of Staphylococcus epidermidis Brazilian Isolates / N. Krepsky, R.B.R. Ferreira, A.P.F. Nunes et al. // Current Microbiol. 2003. - V. 46, N. 4 - P. 280-286.

120. Cell-surface hydrophobicity and scum formation of Rhodococcus rhodochrous strains with different colonial morphologies / M. Sunair, N. Iwabuchi, Y. Yoshizawa et al. II J. Appl. Microbiol. -1997. V. 82, N. 2.-P. 204-210.

121. Cell-surface hydrophobicity of adherent oral bacteria / E. Weis, M. Rosenberg, H. Judes et al. II Curr. Microbiol. 1982. - V. 7, N. 2. P. 125-128.

122. Chang W.-N., Liu C.-W., Liu H.-S. Hydrophobic cell surface and bioflocculation behavior of Rhodococcus erythropolis II Process Biochem. — 2009. V. 44, N. 9. - P. 955-962.

123. Chang Y.I., Su C.Y. Flocculation behavior of Sphingobium chlorophenolicum in degrading pentachlorophenol at different life stages // Biotechnol. Bioeng. 2003. - V. 82, N. 7. - P. 843-850.

124. Changes in molecular species composition of nocardomycolic acids in Nocardia rubra by the growth temperature / I. Tomiyasu, S. Toriyama, I. Yano et al. II Chem. Phys. Lipids. 1981. - V. 28, N. 1. - P. 41-45.

125. Characklis W.G. Attached microbial growths. I. Attachment and growth // Water Res. 1973. - V. 7. - P. 1113-1127.

126. Characterization of microemulsions in a hydrocarbon fermentation by electron microscopy / A. Einsele, H. Schneider, A. Fiechter et al. II Technology. 1975. - V.53. - P. 241-243.

127. Characterization of multiple-substrate utilization by anthracenedegrading Mycobacterium frederiksbergense LB501T / L.Y. Wick, N. Pasche, S.M.A

128. Bemasconi et al. Il Appl. Environ. Microbiol. 2003a. - V. 69, N. 10. -P. 6133-6142.

129. Christova N., Tuleva B., Nikolova-Damyanova B. Enhanced hydrocarbon biodégradation by a newly isolated Bacillus subtilis strain // Z Naturforsch C. 2004. - V. 59, N. 3-4. - P. 205-208.

130. Chromatography of microbial cells using continuous supermacroporous affinity and ion-exchange columns / P. Arvidsson, F.M. Plieva, I.N. Savina et al. II J. Chromatogr. A. 2002. - V.977. - P. 27-38.

131. Chrzanowski L., Kaczorek E., Olszanowski A. Relation between Candida maltosa Hydrophobicity and Hydrocarbon Biodégradation // World J. Microbiol. Biotechnol. -2005. V. 21, N. 6-7. -P.1273-1277.

132. Comparison of contact angles and adhesion to hexadecane of urogenital, dairy, and poultry lactobacilli: effect of serial culture passages / G. Reid, P.L. Cuperus, A.W. Bruce et al. // Appl. Environ. Microbiol. 1992. -V. 58, N. 5.-P. 1549-1553.

133. Comparison of oil composition changes due to biodégradation and physical weathering in different oils / Z. Wang, M. Fingas, S. Blenkinsopp et al. Il J. Chromatogr. A. 1998. - V. 809, N. 1-2. - P. 89-107.

134. Continuous bioconversion of «-octane to octanoic acid by recombinant Escherichia coli (alk+) growing in a two—liquid-phase chemostat / E. Weenink, T. Vos, H. Preusting et al. Il Biotechnol.Bioeng. 1992. -V. 41, N. 2.-P. 263-272.

135. Cooksey K.E., Wigglesworth-Cooksey B. Adhesion of bacteria and diatoms to surfaces in the sea: a review // Aquat. Microb. Ecol. — 1995. — V. 9, N. 9. P. 87-96.

136. Daly J.G., Stevenson R.M.W. Hydrophobic and haemagglutinating properties of Renibacterium salmoninarum II J. Gen. Microbiol. — 1987. — V. 133.-P. 3575-3580.

137. Dankert J., Hogt A.H., Feijen J. Biomedical polymers: bacterial adhesion, colonization, and infection // CRC Crit. Rev. Biocompat. 1986. - V. 2. -P. 219-301.

138. Daugulis A.J. Partitioning bioreactors // Curr. Opin. Biotechnol. 1997. -V. 8, N. 2.-P. 169-174.

139. Daugulis A.J., Boudreau N.G. Removal and destruction of high concentrations of gaseous toluene in a two-phase partitioning bioreactor by Alcaligenes xylosoxidans II Biotechnol. Lett. 2003. — V. 25, N. 17. — P.1421-1424.

140. Davey M.E., O'Toole G.A. Microbial Biofilms: From Ecology to Molecular Genetics // Microbiol. Mol. Biol. Rev 2000. - V. 64, N. 4. - P. 847-867.

141. Degradation of isooctane by Mycobacterium austroafricanum IFP 2173: growth and catabolic pathway / F. Solano-Serena, R. Marchai, S. Heiss et al. // J. Appl. Microbiol. 2004. - V. 97, N. 3. - P. 1-11.

142. Degradation of phenol by Rhodococcus erythropolis UPV-1 immobilized on Biolite® in packed-bed reactor / M.B. Prieto, A. Hidalgo, J.L. Serra et al.} I I J. Biotechnol. 2002. -V. 97, N. 1. - P. 1-11.

143. Déziel E., Comeau Y., Villemur R. Two-liquid-phase bioreactors for enhanced degradation of hydrophobic/toxic compounds // Biodegradation. 1999. - V. 10, N. 3. - P. 219-233.

144. Dickinson E., Euston S.R., Woskett C.M. Competitive adsorption of food macromolecules and surfactants at the oil-water interface // Prog. Colloid Polym. Sei. 1990. - V. 82. - P. 65-75.

145. Digital image analysis of growth and starvation response of a surface colonizing Acientobacter sp / G.A. James, D.R. Korber, D.E. Caldwell et al. II J. Bacteriol. 1995. - V.177, N. 4. - P. 907-915.

146. Diversity of bacterial strains degrading hexadecane in relation to the mode of substrate uptake / M. Bouchez-Naïtali, H. Rakatozafy, R. Marchai et al. // J. Appl Microbiol. 1999. - V. 86, N. 3. - P. 421-428.

147. Doyle R.J. Contribution of hydrophobic effect to microbial infection // Microbes Infect. 2000. - V. 2, N. 4. - P. 391-400.

148. Duff S.J.B., Murray W.D. Oxidation of benzyl alcohol by cells of Pichia pastoris and by alchogol-oxidase in aqueous and nonaqueous reaction media //Biotechnol. Bioeng.- 1989.-V. 34, N. 2.-P. 153-159.

149. Edwards J.G. The biochemistry of cell adhesion // Prog. Surf. Sci. 1983. -V. 13, N. 2.-P. 125-196.

150. Effect of cell appendages on the adhesion property of a highly adhesive bacterium, Acinetobacter sp. Toi 5 / S. Ishii, H Unno, S. Miyata et al. Il Biosci. Biotechnol. Biochem. 2006. - V. 70, N. 11. - P. 2635-2640.

151. Effect of culture conditions on growth and adhesion of Bacillus licheniformis / T.A. Rodionova, N.V. Shekhovtsova, N.S. Panikov et al. Il Microbiology. -2003. -V. 72, N. 4. P. 466^71.

152. Effect of dispersing oil phase on the biodegradability of a solid alkane dissolved in non-biodegradable oil / K. Hori, Y. Matsuzaki, Y. Tanji et <z/.'//Appl. Microbiol. Biotechnol. 2002. - V. 59, N. 4-5. - P. 574-579.

153. Effect of spreading pressure on surface free energy determinations by means of contact angle measurements / H.J. Busscher, A.W.J, van Pelt, H.P. de Jong et al. II Colloids Surf B Biointerfaces. 1983. - V. 95, N. 1. -P. 23-27.

154. Effects of Culture Conditions on the Mycolic Acid Composition of Isolates of Rhodococcus spp. from Activated Sludge Foams / H.M. Stratton, P.R. Brooks, E.L. Carr // System. Appl. Microbiol. 2003. - V. 26, N. 2. -P. 165-171

155. Efroymson R.A., Alexander M. Biodégradation by an Arthrobacter species of hydrocarbons partitioned into an organic solvent // Appl. Environ. Microbiol. 1991. -V. 57, N. 5. - P. 1441-1447.

156. Efroymson R.A., Alexander M. Reduced mineralization of low concentrations of phenanthrene because of sequestering in nonaqueous-phase liquids // Environ. Sci. Technol. 1995. - V. 29, N. 2. - P. 515-521.

157. Electrophoretic mobility and hydrophobicity as measure to predict the initial steps of bacterial adhesion / M.C.M. van Loosdrecht, J. Lyklema, W. Norde et al. H Appl Environ Microbiol. 19876. - V. 53, N. 8. - P. 1898-1901

158. Emulsification of crude oil by an alkane-oxidizing Rhodococcus species isolated from seawater / H. Bredholt, K. Josefsen, A. Vatland et al. II Can. J. Microbiol. 1998. - V. 44, N. 4. - P. 330-340.

159. Enhanced biodégradation of diesel oil by a newly identified Rhodococcus baikonurensis EN3 in the presence of mycolic acid / M. Lee, M.K. Kim, I. Singleton et al. II J. Appl. Microbiol. 2006. - V. 100, N. 2. - P. 325333.

160. Enhanced biodégradation of phenanthrene in a biphasic culture system / A. Kôhler, M. Schuuttoff, D. Bryniok et al. Il Biodégradation. 1994. -V. 5, N. 2.-P. 93-103.

161. Enhanced bioproduction of carvone in a two-liquid-phase partitioning bioreactor with a highly hydrophobic biocatalyst / J.L.E. Morrish, E.T. Brennan, H.C. Dry et al. Il Biotechnol. Bioeng. 2008. - V. 101, N. 4.-P. 768-775.

162. Erickson L.E., Nakahara T. Growth in cultures with two liquid phases: hydrocarbon uptake and transport // Process Biochem. 1975. - V. 10. -P. 9-13.

163. Evidence for interfacial uptake in hexadecane degradation by Rhodococcus equi: the importance of cell flocculation / M. Bouchez—Naïtali, D. Blanchet, V.Bardin et al. II Microbiology. 2001. - V. 147, N. - P. 2537-2543.

164. Experimental study of oil-water interface layers dilatation rheological properties / Z. Hong, Z. Feng, T. Ji'an et al. II Chin. Sei. Bullet. 2002. -V. 47, N. 24. - P. 2056-2059.

165. Faris A., Wadstrom T., Freer J.H. Hydrophobic adsorptive and hemagglutinating properties of Escherichia coli possessing colonization factor antigens (CFA/I or CFA/II), type 1 pili, or other pili // Curr. Microbiol. 1981.-V. 5, N. 5. - P. 67-72.

166. Fattom A., Shilo M. Hydrophobicity as an adhesion mechanism of benthic cyanobacteria // Appl.Environ. Microbiol. 1984. - V.47, N. 1. - P. 135143.

167. Feldner J., Bredt W., Kahane I. Influence of cell shape and surface charge on attachment of Mycoplasma pneumoniae to glass surfaces // J. Bacteriol. — 1983.-V. 153, N. l.-P. 1-5.

168. Fernandes P.J., Cabral J.M.S., Pinheiro H.M. Bioconversion of a hydrocortisone derivative in organic-aqueous two-liquid phase system // Enzime Microb. Technol. 1995. -V. 17, N. 2. - P. 163-167.

169. Fernandes P.J., Powell J.A., Archer A.C. Construction of Rhodococcus random mutagenesis libraries using Tn5 transposition complexes // Microbiology. 2001. -V. 147. - P. 2529-2536.

170. Finnerty W.R. The biology and genetics of the genus Rhodococcus II Annual Rev.Microbiol. 1992. -V. 46. - P. 193-218.

171. Fletcher M. Effects of electrolytes on attachment of aquatic bacteria to solid surfaces // Estuaries Coasts. 1988. - V. 11, N. 4. - P. 226-230.

172. Fletcher M., Lessmann J.M., Loeb G.I. Bacterial surface adhesives and biofilm matrix polymers of marine and freshwater bacteria // Biofouling. -1991. -V. 4, N. l.-P. 129-140.

173. Fletcher M., Loeb L.I. Influence of substratum characteristics on the attachment of a marine pseudomonas to solid surface // Appl. Environ. Microbiol. 1979. -V. 37, N. 1. 67-72.

174. Formation of intracytoplasmic lipid inclusions by Rhodococcus opacus strain PD630 / H.M. Alvarez, F. Mayer, D. Fabritius et al. II Arch. Microbiol. 1996. - V. 165, N 6. - P. 377-386.

175. Gardin H., Pauss A. K-carrageenan/gelatin gel beads for the co-immobilization of aerobic and anaerobic microbial communities degrading 2,4,6-trichlorophenol under air-limited conditions // Appl. Microbiol. Biotechnol. -2001. V. 56. - P. 517-524.

176. Garikipati S.V.B.J., Mclver A.M., Peeples T.L. Whole-cell biocatalysis for 1-naphthol production in liquid-liquid biphasic systems // Appl. Environ. Microbiol. 2009. - V. 75, N. 20. - P. 6545-6552.

177. Gasoline and diesel oil biodegradation / R. Marchal, S. Penet, F: Solano-Serena et al. // Oil Gas Sci. Technol. -2003. V. 58, N. 4. - P. 441-448.

178. Geesey G.G. Bacterial behaviour at surfaces // Cur Opin In Microbiol. -2001.-V. 4, N. 3.-P. 296-300.

179. Gerson D.E., Scheer D. Cell surface energy, contact angles, and phase partition // Biochim. biophys. Acta. 1980. - V. 602, N. 3. - P. 269-280.

180. Gilan (Orr) I Hadar Y., Sivan A. Colonization, biofilm formation and biodegradation of polyethylene by a strain of Rhodococcus ruber II Appl. Microbiol. Biotechnol. 2004. - V. 65, N. 1. - P. 97-104.

181. Gill C.O., Ratledge C. Toxicity of «-alkanes, «-alkenes, «-alkanols and n-alkilbromiges towards yeasts // J. Gen. Microbiol. — 1972. — V.72, N. -P. 165-172.

182. Girardeau J., Bertin Y. Pilins of fimbrial adhesins of different member species of Enterobacteriaceae are structurally similar to the C-terminal half ofadhesin proteins//FEBS Lett.-1995.-V. 357, N. l.-P. 103-108.

183. Goodfellow M. Genus Rhodococcus II In S.T. Williams, M. E. Sharpe, J.G. Holt. Bergey's manual of systematic bacteriology, vol. 4. Williams & Wilkins, Baltimore, MD. 1989. - P. 2362-2371.

184. Grimberg S.J., Stringfellow W.T., Aitken M.D. Quantifying the biodégradation of phenanthrene by Pseudomonas stützen PI6 in the presence of a nonionic surfactant // Appl. Environ. Microbiol. 1996. — V. 62, N. 7.-P. 2387-2392.

185. Gross M.J., Logan B.E. Influence of different chemical treatments on transport of Alcaligenes paradoxus in porous media // Appl. Environ. Microbiol. 1995. -V. 61, N. 5. - P. 1750-1756.

186. Guenter T., Dornberger U., Fritsche W. Effects of ryegrass on biodégradation of hydrocarbons in soil // Chemosphere. 1996. - V. 33, N.2.-P. 203-215.

187. Gutierrez J.R., Erickson L.E. Hydrocarbon uptake in hydrocarbon fermentations // Biotechnol. Bioeng. 1977. - V. 19, N. 9. - P. 1331-1349.

188. Hailas L.E., Vestal J.R. The growth of Mycobacterium convolutum on solid «-allcane substrates: effect on cellular lipid composition // Can. J. Microbiol. 1978.-V. 24, N. 10.-P. 1197-1203.

189. Handley P.S. Structure, composition and function of surface structures on oral bacteria // Biofouling. 1990. - V. 2. - P. 239-264.

190. Handley P.S., Carter P.L., Fielding J. Streptococcus salivarius strains carry either fibrils or fimbriae on the cell surface // J. Bacteriol. 1984. - V. 157, N. l.-P. 64-72.

191. Harrop A.J. Production of naphthalene-cis-glycol by Pseudomonas putida in the presence of organic solvents / A.J.Harrop, J.M.Woodley, M.D. Lilly // Enzyme Microb. Technol. 1992. - V. 14, N. 9. - P. 725-730.

192. Hart D.J., Vreeland R.H. Changes in the hydrophobic-hydrophilic cell surface character of Halomonas elongata in response to NaCl // J. Bacteriol. 1988.-V. 170, N. l.-P. 132-135.

193. Hermansson M. The DLVO theory in microbial adhesion // Colloids Surf. B. 1999. - V. 14, N. 1-4. - P. 105-119.

194. High throughput processing of particulate-containing samples using supermacroporous elastic monoliths in microtiter (multiwell) plate format / I.Yu. Galaev, M.B. Dainiak, F.M. Plieva et al. // J. Chromatogr. A. 2005. -V. 1065, N. 2.-P. 169-175.

195. Hori K., Matsumoto S. Bacterial adhesion: From mechanism to control // Biochem. Eng. J. 2010. - V. 48, N. 3. - P. 424^134.

196. Hug H., Blanch H.W., Fiechter A. The functional role of lipids in hydrocarbon assimilation // Biotechnol. Bioeng. 1974. - V. 16, N. 7. -P. 965-985.

197. Hydrophobic and electrostatic characterization of surface structures of bacteria and its relationship to adhesion to an air-water interface / M. Hermansson, S. Kjelleberg, T.K. Korhonen et al. // Arch. Microbiol. -1982.-V. 131, N. 4.-P. 308-312.

198. Hydrophobicity development, alkane oxidation, and crude-oil emulsification in a Rhodococcus species / H. Bredholt, P. Bruheim, M. Potocky et al. II Can. J. Microbiol. 2002. - V. 48, N. 4. - P. 295-304.

199. Hydrophobicity of bacteria Zymomonas mobilis under varied environmental conditions / P. Zikmanis, L. Shakirova, L. Auzina et al. II Process Biochem. 2007. - V. 42, N. 4. - P. 745-750.

200. Hydrophobised sawdust as a carrier for immobilisation of the hydrocarbon-oxidising bacterium Rhodococcus ruber / E.A. Podorozhko, V.l. Lozinsky, I.B. Ivshina et al. II Biores. Technol. 2008. - V. 99, N. 6. - P. 20012008.

201. Identification and application of plasmids suitable for transfer of foreign DNA to members of the genus Gordonia / M. Arenskötter, D.Baumeister, R. ICalscheuer et al. II Appl. Environ.Microbiol.- 2003. V.69, N 8. -P. 4971-4974.

202. Identification and environmental detection of Rhodococcus species by 16S rDNA-targeted PCR / K.S. Bell, M.S. Kuyukina, S. Heidbrink et al. II J. Appl. Microbiol. -1999. Y. 87, N. 4. - P. 472-480.

203. Immobilization of hydrocarbon-oxidizing bacteria in poly(vinyl alchohol) cryogels hydrophobized using a biosurfactant / M.S. Kuyukina, I.B. Ivshina, A.Yu. Gavrin et al. II J. Microbiol. Methods. 2006. - V. 65, N. 3. - P. 596-603.

204. Influence of biosurfactants produced by Candida antartica on surface properties of microorganism and biodégradation of n-alkanes / Z. Hua, J. Chen, S. Lun et al. II Water Res. 2003. - V. 37, N. 17. - P. 4143-4150.

205. Influence of electrical properties on the evaluation of the surface hydrophobicity of Bacillus subtilis / F. Ahimou, M. Paquot, P. Jacques et al. II J. Microbiol. Methods. 2001. - V.45. N 2. - P. 119-126.

206. Influence of the growth substrate on ester-linked phospho- and' glycolipid fatty acids of Mycobacterium sp. LB501T /L.Y. Wick, O. Pelz, S.M. Bernasconi et al. II Environ. Microbiol. 20036. - V. 5, N. 8. - P. 672680.

207. Influence of Tween 80 on the mycolic acids composition of three cutaneous Corynebacteria / J. Chevalier, M—T. Pommier, A. Cremieux et al. II J. Gen. Microbiol. 1988. - V. 134. - P. 2457-2461.

208. Integrated isolation of antibody fragments from microbial cell culture fluids using supermacroporous cryogels / M.B. Dainiak, A. Kumar, F.M. Plieva et al. II J. Chromatogr. A. 2004. - V. 1045, N. 1-2. - P. 93-98.

209. Interfacial tension measurements in an oil/water/bacteria system by laserlight scattering / E. Kowalewski, J.A. Stensen, E.Gilje et al. // SCA 2004-10.-2004.-P. 1-13.

210. Ioneda T., De Almeida T.E. Time course dependent changes in contents and physical properties of glycolipid species in Rhodococcus rhodochrous // Chem. Phys. Lipids. 1991. - V. 59, N. 3.-P. 225-231.

211. Isken S., de Bont J.A.M. Bacteria tolerant to organic solvents // Extremophiles. 1998. - V. 2, N. 3. - P. 229-238.

212. Jenkinson H.F. Big events in a small world: the changing face of oral microbiology // J. Dent. Res. 2002. - V. 81, N. 2. - P. 84-88.

213. Jimenez I., Bartha R. Solvent-augmented mineralization of pyrene by a Mycobacterium sp // Appl. Environ. Microbiol. — 1996. V. 62, N. 7. -P. 2311-2316.

214. Jones G.W., Isaacson R.E. Proteinaceous bacterial adhesins and their receptors // Crit Rev Microbiol. 1984. - V. 10, N. 3. - P. 229-260.

215. Jonsson P., Wadstrom T. High surface hydrophobicity of Staphylococcus aureus as revealed by hydrophobic interaction chromatography // Curr. Microbiol. 1983. - V. 8, N. 6. - P. 347-353.

216. Katsikogianni M., Missirlis Y.F. Concise review of mechanisms of bacterial adhesion to biomaterials and of techniques used in estimating bacteria-material interactions // Eur. Cell Mater. 2004. - V. 8. - P. 37-57.

217. Kelkar D.S., Kumar A.R., Zinjarde S.S. Hydrocarbon emulsiflcation and enhanced crude oil degradation by lauroyl glucose ester // Bioresource Technol. -2007. V. 98, N. 7.-P. 1505-1508.

218. Kim I.S., Foght J.M., Gray M.R. Selective transport and accumulation of alkanes by Rhodococcus erythropolis S+14He // Biotechnol. Bioeng. -2002. V. 80, N. 6. - P. 650-659.

219. Knox T., Clefee K.R. Synthesis of long-chain esters in a loop reactor system using a fungal cell bound enzyme // Process Biochem. 1984. — V. 19. P. - 188-192.

220. Komarov E.V., Ganin P.G. Zeta-potential of n-alkane emulsion droplets and its role in substrate transport into yeast cells // Appl. Biochem. Microbiol. V. 2004. - V. 40, N. 3. - P. 272-279.

221. Koronelli T.V. Principles and methods for raising the efficiency of biological degradation of hydrocarbons in the environment: review // Appl. Biochem. Microbiol. 1996. - V. 32, N. 6. - P. 519-525.

222. Lalande M., Rene F., Tissier J. Fouling and its control in heat exchangers in the dairy industry // Biofouling. 1989. - V. 1, N. 3. - P. 233-250.

223. Lang S., Philp J. Surface-active lipids in rhodococci // Anton van Leeuwen. 1998.-V. 74, N. 1-3.-P. 59-70.

224. Lappin-Scott H.M., Costerton J.W. Bacterial biofims and surface fouling // Biofouling. 1989. - V. 1, N. 4. - P. 323-342.

225. Lejeune P. Contamination of abiotic surfaces: what a colonizing bacterium sees and how to blur it // Trends Microbiol. 2003. - V. 11, N. 4. - P. 179184.

226. Li Q., Logan B.E. Enhancing bacterial transport for bioaugmentation of aquifers using low ionic strength solutions and surfactants // Water Res. -1999.-Y. 33, N. 4.-P. 1090-1100.

227. Linker—based bio—compatible microemulsions / E. Acosta, T. Nguyen, A. Witthayapanyanon et al.~\ II Environ. Sci. Technol. — 2005. V. 39, N 5. -P. 1275-1282.

228. Liu C.W., Chang W.N., Liu H.S. Bioremediation of n—alkanes and the formation of biofloccules by Rhodococcus erythropolis NTU—1 under various saline conditions and sea water // Biochem. Eng. J. 2009. — V. 45, N. l.-P. 69-75.

229. Ludwig B., Akundi A., Kendall K. A. long-chain secondary alcohol dehydrogenase from Rhodococcus erythropolis ATCC 4277 // Appl. Environ. Microbiol 1995. -V. 61, N. 10. - P. 3729-3733.

230. Macdonald J.A., Rittmann B.E. Performance standards for in situ bioremediation // Environ. Sci. Technol. -1993. V. 27, N. 10. - P. 19741979.

231. Mackay D., Puig H., McCarty L.S. An equation describing the time course and variability in uptake and toxicity of narcotic chemicals to fish // Environ. Toxicol. Chem. 1992. - V 11, N. 7. - P. 941-951.

232. Mackay D., Shiu W.Y., Ma K.C. Illustrated Handbook of physical-chemical properties and environmental fate for organic chemicals, Vol. Ill, Volatile organic chemicals // Chelsea: Lewis publishers Inc., 1993- 916p.

233. MacLeod C.T., Daugulis A J. Biodégradation of polycyclic aromatic hydrocarbons in a two-phase partitioning bioreactor in the presence of a bioavailable solvent // Appl. Microbiol. Biot. 2003. - V. 62, N. 2-3. P. 291-296.

234. Mahanty B., Pakshirajan K., Dasu V.V. A two liquid phase partitioning bioreactor system for the biodégradation of pyrene: Comparative evaluation and cost-benefit analysis // J. Chem. Tech. Biotechnol. — 2010. V. 85, N. 3.-P. 349-355.

235. Malik A., Kakii K. Novel coaggregating microbial consortium: testing strength for field applications // Biores. Technol. 2008. - V. 99, N. 11. -P. 4627-4634.

236. Malinowski J.J. Two-phase partitioning bioreactors in fermentation technology//Biotechnol. Adv. 2001. -V. 19, N. 7. - P. 525-538.

237. Mallee F.M., Blanch H.W. Mechanistic model for microbial growth on hydrocarbons // Biotechnol. Bioeng. 1977. - V. 19. - P. 1793-1816.

238. Malmqvist T. Bacterial hydrophobicity measured as partition of palmitic acid between the two immiscible phases of cell surface and buffer // Acta Path Microbial Scand (sect B). 1983.-V. 91, N. 12.-P. 69-73.

239. Mangan M.W., Meijer W.G. Random insertion mutagenesis of Rhodococcus equi using transposomes // FEMS Microbiol. Letters. 2001. - V. 205, N. 2. -P. 243-246.

240. Marshall K.C. Microbial adhesion in biotechnological processes // Curr. Opin. Biotechnol. 1994. - V.5, N. 3. - P. 296-301.

241. Marshall K.C., Stout R., Mitchell R. Mechanism of the initiai events in the sorption of marine bacteria to surfaces // J. Gen. Microbiol. 1971a. -V. 68. V. P. 337-348.

242. Marshall K.C., Stout R., Mitchell R. Selective sorption of bacteria from sea water//Can. J. Microbiol. 19716. - V. 17.-P. 1413-1416.

243. McEldowney S., Fletcher M. Effect of growth conditions and surface characteristics of aquatic bacteria on their attachment to solid surfaces // J. Gen. Microbiol. 1986. -V. 132. - P. 513-523.

244. McLee A.G., Davies S.L. Linear growth of a Torulopsis sp. on «-alkanes // Can. J. Microbiol. 1972. -V. 18, N. 3. - P. 315-319.

245. Measurement of the surface—free energy of bacterial cell surfaces and itsirelevance for adhesion / H.J. Busscher, A.H. Weerkamp, H.L. van der Mei, \et al. // J. Appl. Environ. Microbiol. 1984. - V. 48, N. 5. - P. 980-983.

246. Mechanical properties of hexadecane-water interfaces with adsorbed hydrophobic bacteria / Z. Kang, A. Yeung, J.M. Foght et al. // Colloid Surf. B: Biointerfaces. 2008. - V. 62, N. 2. - P. 273-279.

247. Medrzycka K.B. The effect of particle concentration on the zeta potential in extremely dilute solutions // Colloid Polym. Sci. 1991. - V. 269, N. 1. -P. 85-90.

248. Meinders J.M., Van der Mei H.C., Busscher H.J. Deposition efficiency and reversibility of bacterial adhesion under flow conditions // J. Colloid. Interface Sci. 1995. -V. 176, N. 2. - P. 329-341.

249. Microbial assimilation of hydrocarbons. I. The fine structure of a hydrocarbon oxidizing Acinetobacter sp / R.S. Kennedy, W.R. Finnerty, K. Sudarsanan et al. II Arch. Microbiol. 1975. - V. 102, N. 2. - P. 7583.

250. Microbial degradation kinetics of solid alkane dissolved in nondegradable oil phase / D.H. Choi, K. Hori, Y. Tanji et al. II Biochem. Eng J. 1999. -V. 3, N. 1. - P. 71-78.

251. Microbial growth on hydrocarbons- some experimental results / S.K. Velankar, S.M. Barnett, C.W. Houston et al. Il Biotechnol. Bioeng. -1975.-V. 17, N. 2.-P. 241-251.

252. Monolayer adsorption of a "bald" Mutant of the highly adhesive and hydrophobic bacterium Acinetobacter sp. strain Toi 5 to a hydrocarbon surface / K. Hori, H. Watanabe, S. Ishii et al. II Appl. Environ. Microbiol.2008. — V. 74, N. 8.-P. 2511-2517.

253. Morgan P., Watkinson R.J. Biodégradation of components of petroleum // Biochemistry of microbial degradation. Kluwer Academic Publishers, Dordrecht, The Netherlands. 1994. - P. 1-31.

254. Mudd S., Mudd E.B.H. The penetration of bacteria through capillary IV. A kinetic mechanism in interfaces // J. Exp. Med. — 1924. V40, N. 5. -P. 633-645.

255. Muñoz R., Guieysse B., Mattiasson B. Phenanthrene biodégradation by an algal—bacterial consortium in two—phase partitioning bioreactors // Appl. Microbiol. Biot. 2003. V. - 61, N. 3. - p. 261-267.

256. Murray W.D., Duff S.J.B. Bio-oxidation of aliphatic and aromatic high molecular weight alcohols by Pichia pastoris II Appl. Microbiol. Biotchnol.- 1990. V. 33, N. 2. - P. 202-305.

257. Mycolic acids: structure, biosynthesis and physiological functions / C.E. Barry, R.E. Lee, K. Mdluli et al. II Prog. Lipid Res. 1998. - V. 37, N. 2-3.-P. 143-179.

258. Nakahara T., Erickson L.E., Gutierrez J.R. Characteristics of hydrocarbon uptake in cultures with two liquid phases // Biotechnol. Bioeng. 1977. — V. 19, N. l.-P. 9-25.

259. Nielsen D.R., Daugulis A.J., Mclellan P.J. Transient performance of a two-phase partitioning bioscrubber treating a benzene-contaminated gas stream II Environ. Sci. Technol. 2005. - V. 39, N. 22. - P. 8871-977.

260. Nikolova P., Ward O.P. Whole cell biocatalysis in nonconventional media // J. Ind. Microbiol. 1993. - V. 12, N. 2. - P. 76-86.

261. Norde W., Lyklema J. Protein adsorption and bacterial adhesion to solid surfaces: a colloid—chemical approach // Colloids Surf. 1989. - V. 38, N. l.-P. 1-13.

262. Notermans S.J., Dormans J. A. M. A., Mead G.C. Contribution of surface attachment to the establishment of micro-organisms in food processing plants: a review // Biofouling. 1991. - V. 5, N. 1. - P. 21-36.

263. Nutritional requirements of a biosurfactant producing strain Rhodococcus sp. 51T7 / M J. Espuny, S. Egido, I. Rodôn et al. II Biotechnol. Lett. — 1996. V. 18, N. 5. - P. 521-526.

264. Olofsson A.C., Zita A., Hermansson M. Floe stability and adhesion of green-fluorescent-protein-marked bacteria to floes in activated sludge // Microbiol.-1998.-V. 144.-P. 519-528.

265. Partially oxidized polycyclic aromatic hydrocarbons show an increased bioavailability and biodegradability / R. Meulenberga, H.M. Rijnaartsa, H.J. Doddemaa et al. II FEMS Microbiol. Lett. 1997. - V. 152, N. 1. -P. 45-49.

266. Pearce W.A., Buchanan T.M. Structure and cell membrane-binding properties of bacterial fimbriae // In E. H. Beachey (ed.). Bacterial adherence.Chapman and Hall, London. 1980. - P. 291-344.

267. Phanikumar M.S., Hyndman D.W. Interactions between sorption and biodégradation: exploring bioavailability and pulsed nutrient injection efficiency // Water Res. 2003. - V. 39, N. 5. - P. 1-13.

268. Phenol and «-alkanes (C12 and Ciô) utilization: influence on yeast cell surface hydrophobicity / L. Chrzanowski, K. Bielicka-Daszkiewicz, M. Owsianiak et al. II World Journal of Microbiology and Biotechnology. 2008. - V. 24, N. 9. - P. 1943-1949.

269. Physiological adaptations involved in alkane assimilation at a low temperature by Rhodococcus sp. strain Q15 / L.G. Whyte, S.J. Slagman,

270. F. Pietrantonio et al. II Appl. Environ. Microbiol. 1999. - V. 65, N. 7. -P. 2961-2968.

271. Pilotscale production of (S)-styrene oxide from styrene by recombinant Escherichia coli synthesizing styrene monooxygenase / S. Panke, M. Held, M.G. Wubbolts et al. II Biotechnol. Bioeng. 2002. - V. 80, N. 1. - P. 3341.

272. Polymeric cryogels as promising materials of biotechnological interest / V.l. Lozinsky, I.Yu. Galaev, F.M. Plieva et al. II Trends Biotechnol. -2003. — V. 21, N. 10.-P. 445-451.

273. Population heterogeneity affects transport of bacteria through sand columns at low flow rates / S.F. Simoni, H. Harms, T.N.P. Bosma et al. II Environ. Sei. Technol.- 1998.-V. 32, N. 14.-P. 2100-2105.

274. Pratt-Terpstra I.H., Weerkamp A.H., Busscher H.J. Microbial factors in a thermodynamic approach of oral streptococcal adhesion to solid substrata // J. Colloid. Interface Sei. 1989. - V. 129, N. 2. - P. 568-574.

275. Prediction of the adaptability of Pseudomonas putida DOT—TIE to a second phase of a solvent for economically sound two—phase biotransformations /

276. G.Neumann, N. Kabelitz, A. Zehnsdorf et al. II Appl. Environ. Microbiol. — 2005. — V. 71, N. 11. P. 6606-6612.

277. Pringle J.H., Fletcher M. Influence of substratum wettability on attachment of freshwater bacteria to solid surfaces // Appl. Environ. Microbiol. 1987. -V. 45, N. 3. — P. 811-817.

278. Prokop A., Erikson L.E. Growth models of cultures with two liquid phases. VII. Substrate dissolved in dispersed phase; effect of dispersed phase volume and temperature // Biotechnol. Bioeng. 1972. - V. 14, N. 4. -P. 571-586.

279. Quirynen M., Bollen C.M. The influence of surface roughness and surface-free energy on supra- and subgingival plaque formation in man. A review of the literature // J. Clin. Periodontol. 1995. - V. 22, N. 1. - P. 1-14.

280. Rapid degradation of the triazinone herbicide metamitron by a Rhodococcus sp. isolated from treated soil / N.R. Parekh, A. Walker, S.J. Roberts et al. II J. Appl. Bacteriol. 1994. - V. 77, N. 5. - P. 467-475.

281. Recovery oí Rhodococcus biosurfactants using methyl-tertiary butyl ether extraction / M.S. Kuyukina, I.B. Ivshina, J.C. Philp et al. II J. Microbiol. Methods. 2001. - V. 46, N. 2. - P. 149-156.

282. Relations between macroscopic and microscopic adhesion of Streptococcus mitis strains to surfaces / V. Vadillo-Rodriguez, H.J. Busscher, W. Norde et al. II Microbiology. 2004. — V. 150.-P. 1015-1022.

283. Relationships between colony morphotypes and oil tolerance in Rhodococcus rhodochrous / N. Iwabuchi, M. Sunairi, H. Anzai et al. II Appl. Environ. Microbiol. 2000. - V. 66, N. 11. - P. 5073-5077.

284. Relationships between Octanol-Water Partition Coefficients and Aqueous Solubility / M.M. Miller, S.P. Wasik, G.-L. Huang et al. II Environ. Sei. Technol. 1985. - V. 19, N. 6. - P. 522-529.

285. Responses of Mycobacterium sp. LB501T to the low bioavailability of solid anthracene / L.Y. Wick, A. Ruiz de Munain, D. Springael et al. // Appl. Microbiol. Biotechnol. 20026. - V.58, N. 3. - P. 378-385.

286. Reversibility and mechanism of bacterial adhesion / H.H.M. Rijnaarts, W. Norde, E.J. Bouwer et al. II Coll. Surfaces B. 1995. - V. 4, N. 1. -P. 191-197.

287. Reversibility of adhesion of oral streptococci to solids / H.J. Busscher, M.H.M.J.C. Uyen, A.H. Weerkamp et al. IIFEMS Microbiol. Lett. 1986. - V. 35, N 2-3. - P. 303-306.

288. Rivera J.L., McCabe C., Cummings P.T. Molecular simulations of liquidliquid interfacial properties: water—«-alkane and water-methanol-rc-alkane systems // Phys. Rev. E. 2003. - V. 67, N. 1. - P. 11603/1-11603-10.

289. Role of nonadsorbing polymers in bacterial aggregation / K.J. Eboigbodin, J.R.A. Newton, A.F. Routh et al. I I Langmuir. 2005. - V. 21, N. 26. -P. 12315-12319.

290. Role of pili in adherence of Pseudomonas aeruginosa to mammalian buccal epithelial cells / D.E. Woods, D.C. Straus, W.G. Johanson et al. II Infect. Immun. — 1980. — V. 29, N. 3.-P. 1146-1151.

291. Role of thin fimbriae in adherence and growth of Acinetobacter calcoaceticus RAG—1 on hexadecane / M. Rosenberg, E.A. Bayer, L. Delarea et al. II Appl. Environ. Microbiol. 1982. - V. 44, N. 4. -P. 929-937.

292. Rosenberg E. Hydrocarbon-Oxidizing Bacteria // Prokaryotes. 2006a. — Parti.-P. 564-577.

293. Rosenberg M. Bacterial adherence to hydrocarbons: a useful technique for studying cell surface hydrophobicity // FEMS Microbiol. Lett. 1984. — V. 22, N. 3.-P. 289-295.

294. Rosenberg M. Basic and applied aspects of microbial adhesion at the hydrocarbon : water interface // Crit. Rev. Microbiol. 1991. - V. 18, N. 2.-P. 159-173.

295. Rosenberg M. Microbial adhesion to hydrocarbons: twenty-five years of doing MATH // FEMS Microbiol. Lett. 20066. - V. 262, N. 2. -P. 129-34.

296. Rosenberg M., Gutnick D., Rosenberg E. Adherence of bacteria to hydrocarbons: a simple method for measuring cell—surface hydrophobicity // FEMS Microbiol. Lett. 1980. - V. 9, N. 1. - P. 29-33.

297. Rosenberg M., Kjelleberg S. Hydrophobic interactions: role in microbial adhesion (review) // Adv. Microb. Ecol. 1986. - V. 9. - P. 353-393.

298. Rosenberg M., Rosenberg E. Role of adherence in growth of Acinetobacter calcoaceticus RAG-1 on hexadecane // J. Bacteriol. 1981. - V. 148, N. l.-P. 51-57.

299. Rouxhet P.G., Mozes N. Physical chemistry of the interaction between attached microorganisms and their support // Water Sci. Technol. 1990. -V. 22.-P. 1-16.

300. Rutter P.R., Vincent P.B. The adhesion of microorganisms to surfaces: physico-chemical' aspects // In Microbial Adhesion to Surfaces. RCW Berkeley, RM Lynch, JMellin, PR Rutter, and B Vincent (eds.). Chichester: E. HorwoodLtd, 1980. P. 79-93.

301. Salter G.J., Kell D.B. Solvent selection for whole cell biotransformations in organic media // Crit. Rev. Biotechnol. 1995. - V. 15, N. 2. - P. 139177.

302. Schwartz R.D., McCoy C.J. Epoxidation of 1,7-octadiene by Pseudomonas oleovorans: fermentation in the presence of cyclohexane // Appl. Environ. Microbiol. 1977. -V. 34, N. 1. - P. 47-49.

303. Scott C.C., Finnerty W.R. A comparative analysis of the ultrastructure of hydrocarbon oxidizing micro-organisms // J. Gen. Microbiol. 1976. -V. 94.-P. 342-350.

304. Shabtai Y., Fleminger G. Adsorption of Rhodococcus Strain GIN-1 (NCIMB 40340) on Titanium Dioxide and Coal Fly Ash Particle // Appl. Environ. Microbiol. 1994. - V. 60, N. 9. - P. 3079-3088.

305. Sharma S.L., Pant A. Biodégradation and conversion of alkanes and crude oil by a marine Rhodococcus sp // Biodégradation. 2000. - V. 11, N. 5. — P. 289-294.

306. Shin M., Nguyen T., Ramsay J. Evaluation of support materials for the surface immobilization and decolorization of amaranth by Trametes versicilor II Appl. Microbiol. Biotechnol. 2002. - V. 60, N. 1-2. -P. 218223.

307. Short Protocols in Molecular Biology / edited by Frederick M. Ausubel et al., 3rd edition John Wiley & Sons. 1995. - p 900.

308. Shreve G.S., Inguva S., Gunnam S. Rhamnolipid biosurfactant enhancement of hexadecane biodégradation by Pseudomonas aeruginosa II Mol. Mar. Biol. Biotechnol. 1995. - V. 4, N. 4. - P. 331-337.

309. Sikkema J., de Bont J.A.M., Poolman B. Interactions of cyclic hydrocarbons with biological membranes // J. Biol. Chem. 1994. - V. 269, N. 11. -P, 8022-8028.

310. Sikkema J., de Bont J.A.M., Poolman B. Mechanisms of membrane toxicity of hydrocarbons // Microbiol. Rev. 1995. - V. 59, N. 2. - P. 201-222.V

311. Solvent partitioning and whole-cell sitosterol bioconversion activity in aqueous-organic two-phase systems / A.Cruz, P. Fernandes, J.M.S. Cabrai et al. // Enzyme Microb. Technol. 2004. - V. 34, N. 3-4. -P.342-353.

312. Solvent-tolerant bacteria for biotransformations in two-phase fermentation systems / H.J. Heipieper, G. Neumann, S. Cornelissen et al. II Appl. Microbiol. Biotechnol. 2007. - V. 74, N. 5. - P. 961-973.

313. Sorongon M.L., Bloodgood R.A., Burchard R.P. Hydrophobicity, Adhesion, and Surface-Exposed Proteins of Gliding Bacteria // Appl. Environ. Microbiol. 1991. - V. 57, N. 11. - P. 3193-3199.

314. Stabilization of oil—water emulsions by hydrophobic bacteria / L.S. Dorobantu, A.K.C. Yeung, J.M. Foght et al. // Appl. Environ. Microbiol. 2004. - V. 70, N. 10. - P. 6333-6336.

315. Stackebrandt E., Rainey F.A., Ward-Rainey N.L. Proposal for a new hierarchic classification system, Actinobacteria classis nov // Int. J. Syst. Bacteriol. 1997. - V. 47, N. 2. - P. 479-491.

316. Steininger C., Allerberger F., Gnaiger E.Clinical significance of inhibition kinetics for Streptococcus pyogenes in response to penicillin // J. Antimicrob. Chemother. 2002. - V. 50, N. 4. - P. 517-523.

317. Stelmack P.L., Gray M.R., Pickard M.A. Bacterial adhesion to soil contaminants in the presence of surfactants // Appl. Environ. Microbiol. — 1999.-V. 65,N. l.-P 163-168.

318. Stenström T.A. Bacterial hydrophobicity, an overall parameter for the measurement of adhesion potential to soil particles // Appl. Environ. Microbiol.-1989.-V. 55,N. l.-P. 142-147.

319. Stratton H.M., Seviour R.J., Soddell J.A. Effect of culture conditions on cell surface hydrophobicity of nocardioforms // Actinomycetes. — 1993. —V. 4, N. 2. P. 40^46.

320. Strevett K.A., Chen G. Microbial surface thermodynamics and applications // Res. Microbiol. 2003. - V. 154, N. 5. - P. 329-335.

321. Structural analysis of a biofilm which enhances carbon steel corrosion in nutritionally poor aquatic environments / Y. Tanji, Y. Morono, A. Soejima et al. II J. Biosci. Bioeng. 1999. - V. 88, N. 5. - P. 551-556.

322. Study of cryostructurization of polymer systems: VII Structure formation under freezing of poly(vinyl alcohol) aqueous solutions / V.l. Lozinsky, L.V. Domotenko, E.S. Vainerman et al. II Colloid Polymer Sei. 1986. -V. 264, N. l.-P. 19-24.

323. Surface free energies of oral streptococci and their adhesion to solids / H.M. Uyen, H.J. Busscher, A.H. Weerkamp et al. II FEMS Microbiol. Lett. -1985. V. 30, N. 1-2. - P. 103-106.

324. Surface properties of bifidobacterial strains of human origin / P.F. Perez, Y. Minnaard, E.A. Disalvo et al. II Appl. Environ. Microbiol. 1998. -V. 64, N. l.-P. 21-26.

325. Surface properties of lactobacilli isolated from the small intestine of pigs / T. Wadstrom, K. Andersson, M. Sydow et al. II J. Appl. Microbiol. 1987. -V. 62, N. 6.-P. 513-520.

326. Surface thermodynamics of bacterial adhesion / D.R. Absolom, F.V. Lamberty, Z. Policova et al. I I Appl. Environ. Microbiol. 1983. V.46, N l.-P. 90-97.

327. Sutcliffe I.C. Cell envelope composition and organisation in the genus Rhodococcus II Anton, van Leeuwen. 1998. - V. 74, N. 1-3. - P. 49-58.

328. Suzuki T., Yamaguchi T., Ishida M. Immobilization of Prototheca zopfii in calcium-alginate beads for the degradation of hydrocarbons // Process Biochem. 1998. -V. 33, N. 5. - P. 541-546:

329. The hydrophobicity of bacteria—an important factor in their initial adhesion at the air-water interface / B. Dahlback, M. Hermansson, S. Kjelleberg \et al. // Arch. Microbiol. 1981. - V. 128, N. 3. - P. 267-270.

330. The possible involvement of cell surface and outer membrane proteins of Acinetobacter sp. A3 in crude oil degradation / K. Hanson, G. Vikram,

331. C. Kale let al. // FEMS Microbiol. Lett. 1994. - V. 122, N. 3. - P. 275280.

332. The potential of polymeric cryogels in bioseparation / V.I. Lozinsky, F.M. Plieva, I.Yu. Galaev let al. II Bioseparation. 2002. - V. 10, N. 4-5. -P. 163-188.

333. The role of bacterial cell wall hydrophobicity in adhesion / M.C.M. van Loosdrecht, J. Lyklema, W. Norde let al. II Appl. Environ. Microbiol. — 1987a.-V. 53, N. 8.-P. 1893-1897.

334. The transient phase between growth and nongrowth of heterotrophic bacteria, with emphasis on the marine environment / S. Kjelleberg, M. Hermansson, P. Marden // Annu. Rev. Microbiol. 1987. - V. 41. -P. 25-49.

335. Thornley M.J., Thorne K.J.I., Glauert A.M. Detachment and chemical characterization of the regularly arranged subunits from the surface of an Acinetobacter 11 J. Bacteriol. 1974. - V. 118, N. 2. - P. 654-662.

336. Tomiyasu I. Mycolic acid composition and thermallyadaptive changes in Nocardia asteroids II J. Bacteriol. 1982. - V. 151. - P. 828-837.

337. Two morphological types of cell appendages on a stronlgy adhesive bacterium Acinetobacter sp. strain Tol 5 / S. Ishii, J. Koki, H. Unno let al. II Appl. Environ. Microbiol. 2004. - V. 70, N. 8. - P. 5026-5029.

338. Use of a two-phase partitioning bioreactor for degrading polycyclic aromatic hydrocarbons by a Sphingomonas sp / T.B. Janikowski,

339. D. Velicogna, M. Punt let al. II Appl. Microbiol. Biotechnol. 2002. -V. 59, N. 2-3.-P. 368-376.

340. Verbruggen E.M.J., Hermens J.L.M., Tools J. Physicochemical properties of higher nonaromatic hydrocarbons: a literature study // J. Phys. Chem. Ref. Data-2000.-V. 29.-P. 1435-1445.

341. Vrionis H.A., Kropinski M., Daugulis A.J. A Enhancement of a two—phase partitioning bioreactor system by modification of the microbial catalyst: demonstration of concept // Biotechnol. Bioeng. — 2002. — V. 79, N. 6. — P. 587-594.

342. Walker J.D., Colwell R.R. Microbial petroleum degradation: use of mixed hydrocarbon substrates II Appl. Microbiol. 1974. - V. 27, N. 6. - P. 10531060.

343. Walker S.L., Hill J.E., Redman J-.A. Influence of growth phase on adhesion kinetics of Escherichia coli D21g // Appl. Environ. Microbiol. — 2005. -V. 71, N. 6.-P. 3093-3099.

344. Warhust A.M., Fewson C.A. Biotransformation catalyzed by the genus Rhodococcus II Cr. Rev. Biotechnol. 1994. - V. 14, N. 1. - P. 29-73.

345. Watkinson R., Morgan P. Physiology of aliphatic hydrocarbondegrading microorganisms // Biodegradation. 1990. - V. 1, N. 2-3. - P. 79-92.

346. Weiss L., Harlos J.P. Short-term interactions between cell surfaces // Progress Surface Sei. -1972. V. 1. - P. 355-405.

347. Whole-cell biocatalysis in organic media / R. León, P. Fernandes, H.M. Pinheiro et al. H Enzyme Microb. Technol. 1998. - V. 23, N. 7-8. -P. 483-500.

348. Wick L.Y., Wattiau P., Harms H. Influence of the growth substrate on the mycolic acid profiles of mycobacteria // Environ. Microbiol. 2002a. -V. 4, N. 10.-P. 612-616.

349. Woods N.R., Murrell J.C. Epoxidation of gaseous alkenes by a Rhodococcus sp // Biotechnology. Lett. 1990. - V. 12, N. 6. - P. 409-414.

350. Wrenn B.A., Venosa A.D Selective enumeration of aromatic and aliphatic hydrocarbon-degrading bacteria by a most-probable number procedure // Can. J. Microbiol. 1996. - V. 42, N. 3. - P. 252-258.

351. Wubbolts M.G., Favre-Bulle O., Witholt B. Biosynthesis of synthons . in two—liquid-phase media // Biotechnol. Bioeng. — 1996. V. 52, N. 2.1. P. 301-308.

352. Yagafarova G.G., Skvortsova I.N. A new oil-oxidizing strain of Rhodococcus erythropolis II Appl. Biochem. Microbiol. 1996. — V. 32, N. 2. - P. 207- 209.

353. Yaskovich G.A. The role of cell surface hydrophobicity in adsorption immobilization of bacterial strains // Appl. Biochem. Microbiol. — 1998. -V. 34, N. 4.-P. 373-376.

354. Yeom S.H., Daugulis A.J. Benzene biodégradation in a,two-phase partition bioreactor by Alcaligenes xylosoxîdans Y234 I I Process Biochem. — 2001. — V. 36.-P. 765-772.

355. Yeom S.H., Louie J., Daugilis A.J. The use of partitioning bioreactors for the treatment of high-concentration benzene solutions // Can. J. Chem. Eng. 2001. - V. 79, N. 5. - P. 785-790.

356. Zhang Y., Miller RlM. Effect of a Pseudomonas rhamnolipid biosurfactant on cell hydrophobicity and biodégradation, of octadecane // Appl. Environ. Microbiol. 1994. -V. 60, N. 6. - P. 2101-2106.

357. Zinjarde S.S., Pant A. Emulsifier from a tropical marine yeast, Yarrowia lipolytica NCIM 3589 II J. Basic Microbiol: 2002. - V. 42, N. 1. - P. 6773.

358. Zita A., Hermansson M. Effects of bacterial cell surface structures and hydrophobicity on attachment to activated sludge floes // Appl. Environ. Microbiol. 1997. - V. 63, N. 3. - P. 1168-1170.

359. Zita A., Hermansson M. Effects of ionic strength on bacterial adhesion and stability of floes in a wastewater activated sludge system // Appl. Environ. Microbiol. 1994. - V. 60. N. 9. - P. 3041-3048.

360. Zoueki C.W., Tufenkji N., Ghoshal S. A modified microbial adhesion to hydrocarbons assay to account for the presence of hydrocarbon droplets // J. Colloid Interface Sci. 2010. - V. 344, V. 2. - P. 492-496.