Адаптивные свойства уропатогенных Escherichia coli тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.02.03, кандидат наук Аль Баяти Басим Мохаммад Ибрахим

• Аль Баяти Басим Мохаммад Ибрахим
• кандидат наук
• 2017

Оглавление диссертации кандидат наук Аль Баяти Басим Мохаммад Ибрахим

СОДЕРЖАНИЕ

ВВЕДЕНИЕ

1 ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Факторы вирулентности уропатогенных бактерий

1.2. Механизмы устойчивости возбудителей инфекций мочевыводящих путей к антимикробным препаратам

1.3. Роль микробных биопленок в развитии инфекций мочевыводящих путей

1.4. Клинические проявления инфекций мочевыводящих путей

2 ОБЪЕКТ, МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

2.1. Экспериментальные модели

2.2. Методы микробиологических и молекулярно -генетических исследований

2.3. Методы статистической обработки экспериментальных данных

3 ХАРАКТЕРИСТИКА УСЛОВНО-ПАТОГЕННЫХ БАКТЕРИЙ, ВЫДЕЛЕННЫХ ОТ БОЛЬНЫХ С ПРИЗНАКАМИ ИНФЕКЦИЙ МОЧЕВЫВОДЯЩИХ ПУТЕЙ

3.1. Видовой состав микроорганизмов, выделяемых при инфекциях мочевыводящих путей

3.2. Характеристика спектра чувствительности уропатогенных бактерий к антимикробным препаратам

3.3. Определение наличия БЛРС фенотипическим методом и выбор препаратов

4 ОПРЕДЕЛЕНИЕ НАЛИЧИЯ ДЕТЕРМИНАНТ ВИРУЛЕНТНОСТИ У КЛИНИЧЕСКИХ ШТАММОВ E. COLI

4.1. Выявление генов устойчивости к антибиотикам

4.2. Определение гена fimH

5 ВЛИЯНИЕ НАЛИЧИЯ ГЕНА FIMH НА АДГЕЗИВНЫЕ СВОЙСТВА И ПЛЕНКООБРАЗУЮЩУЮ СПОСОБНОСТЬ КЛИНИЧЕСКИХ ШТАММОВ E. COLI

5.1. Изучение адгезивной активности штаммов E. coli, отличающихся по наличию гена fimH

5.2. Динамика формирования микробных биопленок эталонным и клиническими штаммами E. coli

5.3. Исследования морфологических особенностей модели микробной биопленки E. coli на поверхности изделий медицинского назначения

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

ВЫВОДЫ

СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННОМ ЛИТЕРАТУРЫ

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Адаптивные свойства уропатогенных Escherichia coli»

ВВЕДЕНИЕ

Актуальность исследования. Инфекции мочевыводящих путей (ИМП) занимают второе место по распространенности среди заболеваний мочевыделительной системы человека (Takhar, Moran, 2014). Данные заболевания диагностируются у людей обоих полов разного возраста, хотя чаще встречаются у женщин (Manning et al., 2010). Ежегодно более 7 млн. человек обращаются к специалистам с подозрениями на инфекции мочевыводящих путей, более миллиона из них госпитализируют, а затраты на их лечение составляют примерно 3 млрд. долларов (Naber et al., 2009). К факторам риска, способствующим развитию инфекций мочевыводящих путей, относятся половая активность, период менопаузы, беременность, медицинские осложнения и наличие бактериальных инфекций (Hertting, 2011).

Инфекции мочевыводящих путей чаще всего имеют бактериальную этиологию (Al-Badr et al., 2013). Несмотря на то, что в организме человека имеется множество механизмов защиты от инфекций мочевыводящих путей, включая регулярные полные опорожнения мочевого пузыря, некоторое количество остаточной мочи, задерживающейся в мочевом пузыре, является благоприятной средой для размножения обитающих там бактерий, которые и могут стать причиной развития инфекционного процесса (Brooks et al., 2010).

Ведущую роль в развитии инфекций мочевыводящих путей играют представители семейства Enterobacteriaceae, а на долю Escherichia coli приходится почти 90% всех диагностированных случаев (Reza et al., 2011). Бактерии E. coli, поражающие мочевыделительную систему, получили название уропатогенных E. coli (UPEC). В процессе эволюции эти бактерии приобрели целый ряд факторов, включая адгезины, токсины, сидерофоры и полисахаридные структуры клеточной стенки, которые обеспечивают их адаптацию к существованию в данном биотопе, а именно поддерживают и усиливают прикрепление к клеткам уроэпителия, повышая их устойчивость к действию лекарственных препаратов, иммунологических защитных механизмов (Гриценко и др., 1998; Yamamoto et al.,

2007; Farshad et al., 2010; Sokurenko et al., 2004; Thoureen et al., 2015). Использование молекулярно-генетических методов, в частности полимеразной цепной реакции, позволяет эффективно определять факторы вирулентности штаммов UPEC (Flores-Mireles et al., 2015).

Важным параметром, описывающим активность бактерий - возбудителей инфекций мочевыводящих путей, является резистентность к антимикробным препаратам (Erb et al., 2007). Выработка патогенными бактериями, обитающими в мочевыводящей системе, резистентности к антимикробным препаратам, что, в свою очередь, осложняет лечение инфекций мочевыводящих путей - это проблема, с которой в последнее время все чаще сталкиваются во многих странах (CDER, 2015). Частично данное явление обусловлено обширным, чрезмерным, нецелевым или неправильным использованием антибиотиков (Johnson et al., 2006). Согласно исследованиям европейских ученых, количество зафиксированных случаев резистентности к антибиотикам возрастает от года к году, при этом в последнее время появились сведения о существенном увеличении числа патогенных бактериях, устойчивых к действию нескольких наиболее распространенных антибиотиков, использующихся для лечения ИМП (Barber et al., 2013).

Еще одной стратегией бактерий, позволяющей им выживать в условиях макроорганизма, является их способность к формированию микробных биопленок, что и играет ключевую роль в патогенезе инфекций мочевыводящих путей (Jabalameli et al., 2012). Биопленочные формы бактерий характеризуются сниженной метаболической активностью и повышенной устойчивостью к действию антимикробных препаратов. Микробные биопленки могут формироваться как на поверхности клеток макроорганизма, так и на изделиях медицинского назначения, обуславливая, тем самым, длительную персистенцию возбудителя и развитие катетер-ассоциированных инфекций (Wilson et al., 2011; Peter et al., 2012).

Степень разработанности проблемы. Ведущая роль в развитии инфекций мочевыводящих путей принадлежит условно-патогенным бактериям семейства Enterobacteriaceae (Gradwohl et al., 2011; Mazzulli, 2012; Vasudevan, 2014; Edmonton, 2015; NICE, 2015).

В работах (Mladin et al., 2009; Ramirez, Tolmasky, 2010; Tada et al., 2013; Saad et al., 2015; Praharaj et al., 2016) приведены данные о наличии в геноме условно-патогенных бактерий генов, кодирующих устойчивость к антимикробным препаратам.

Значение факторов адгезии грамотрицательных бактерий для реализации начальных этапов взаимодействия с макроорганизмом, обеспечивающих развитие инфекционного процесса, представлено в работах (Далин, Фиш, 1985; Маянский, 2006; Mladin et al., 2009; Oliveira et al., 2011; Tarchouna et al., 2013; Abass et al., 2014; Hojati et al., 2015).

В работах (Schroll et al., 2007; Wilson et al., 2011; Jabalameli et al., 2012; Peter et al., 2012; Scott et al., 2015) обоснована важная роль микробных биопленок в развитии инфекционных заболеваний, связанных с оказанием медицинской помощи при использовании изделий медицинского назначения.

Цель исследования - изучить адаптивные свойства уропатогенных Escherichia coli, выделенных от пациентов Багдадского учебного госпиталя.

Задачи исследования.

1. Изучить видовой состав возбудителей, выделенных от больных с признаками ИМП, определить преобладающие виды и провести анализ частоты встречаемости возбудителей заболеваний в зависимости от пола и возраста пациентов.

2. Определить спектр чувствительности клинических штаммов E. coli к антимикробным препаратам и наличие у них бета-лактамаз расширенного спектра (БЛРС) фенотипическим методом.

3. Выявить корреляцию установленной фенотипическими методами устойчивости к бета-лактамным и аминоглизидным антибиотикам уропатогенных E. coli с наличием генетических детерминант: плазмидных генов ctx-m и aac(3)-II.

4. Изучить влияние наличия гена fimH на адгезивные свойства и пленкообразующую способность клинических штаммов E. coli.

5. Исследовать структурные особенности моделей микробных биопленок E. coli, сформированных на поверхности изделий медицинского назначения в условиях in vitro, штаммами, отличающимися по наличию гена fimH.

Научная новизна. Впервые показано, что наличие гена fimH обеспечивает более эффективный процесс формирования микробных биопленок клиническими штаммами E. coli в условиях in vitro на инертных поверхностях лунок иммунологического планшета и фрагментах полиуретанового уретрального катетера.

Установлено, что продукция бета-лактамаз расширенного спектра уропатогенными штаммами E. coli, выделенными от пациентов с признаками ИМП Багдадского учебного госпиталя, связана с наличием плазмидного гена ctx-m, что и обусловливает их полирезистентность к бета-лактамным антибиотикам.

Выявлено, что сочетанная устойчивость клинических штаммов E. coli к аминогликозидам II и III поколения связана с наличием плазмидного гена aac(3)-II, кодирующего фермент ацетилтрансферазу, субстратом для которого являются тобрамицин и гентамицин.

Теоретическая и практическая значимость работы. Обобщены и систематизированы данные о биологических особенностях уропатогенных E. coli - возбудителях ИМП бактериальной этиологии, механизмах их устойчивости к антимикробным препаратам, роли микробных биопленок в развитии ИМП.

Полученные результаты являются основанием для выбора наиболее эффективных антибиотиков при лечении ИМП, вызванных полирезистентными штаммами уропатогенных E. coli, продуцирующих бета-лактамазы расширенного спектра и ацетилтрансферазу.

Полученные данные о повышенной способности уропатогенных E. coli, имеющих плазмидный ген fimH, к формированию биопленок на изделиях медицинского назначения, являются основанием для разработки и проведения

мероприятий по предотвращению катетер-ассоциированных инфекций при оказании высокотехнологичной медицинской помощи.

Методология диссертационного исследования. Диссертационная работа носит экспериментальный характер. Выбор методов настоящей работы соответствовал поставленным целям и задачам. Предметом исследования стало изучение микробного пейзажа возбудителей ИМП, определение спектра их чувствительности к антимикробным препаратам и факторов вирулентности, а также исследование адгезивных свойства и пленкообразующей способности клинических штаммов.

При проведении исследования и изложении материала автором были применены такие общенаучные методы, как анализ литературных данных и обобщение, эмпирические методы исследования (измерение, эксперимент, метод сравнения, оценка и описание). Применение указанных методов и детальный статистический анализ полученных значений позволил обеспечить объективность и достоверность результатов и выводов.

Внедрение в практику. Материалы диссертации используются в учебном процессе кафедры микробиологии, биотехнологии и химии ФГБОУ ВО «Саратовский государственный аграрный университет имени Н. И. Вавилова», кафедры микробиологии и физиологии растений ФГБОУ ВО «Саратовский национальный исследовательский государственный университет имени Н. Г. Чернышевского».

Основные положения, выносимые на защиту.

1. Клинические штаммы уропатогенных E. coli, выделенные от пациентов с признаками ИМП, находящихся на амбулаторном лечении в Багдадском учебном госпитале, характеризуются множественной лекарственной устойчивостью к антимикробным препаратам, применяемым для этиотропной терапии.

2. Устойчивость клинических штаммов уропатогенных E. coli к бета-лактамным и аминогликозидным антибиотикам связана с наличием у них гена ctx-

m, кодирующего бета-лактамазы расширенного спектра, и гена aac(3)-II, кодирующего фермент ацетилтрансферазу.

3. Активное формирование микробных биопленок на поверхности изделий медицинского назначения клиническими штаммами уропатогенных E. coli связано с их высокой адгезивной способностью, обусловленной наличием гена fimH.

Степень достоверности и апробация работы. Высокая степень достоверности результатов проведенных исследований подтверждается использованием как общепринятых, так и современных микробиологических и генетических методов исследований и статистической обработки информации. Исследования проведены с использованием аттестованных методик и поверенного оборудования.

Результаты диссертационного исследования представлены на следующих научных конференциях: II Международная научно-практическая конференция «Основные проблемы естественных и математических наук» (Волгоград, 2015 г.), VII Международная научная конференция молодых ученых «Представляем научные достижения миру. Естественные науки» (Саратов, 2016 г.), VIII Региональная научная конференция «Исследования молодых ученых в биологии и экологии» (Саратов, 2016 г.), Международная научно-практическая конференция «Материалы и методы инновационных исследований и разработок» (Пенза, 2016 г.), Всероссийская научно-практическая конференция по медицинской микробиологии и клинической микологии «ХК Кашкинские чтения» (Санкт-Петербург, 2016).

Структура и объем диссертации. Диссертация состоит из введения, обзора литературы, описания объектов, материалов и методов, трех глав экспериментальных исследований, заключения и выводов, а также списка использованной литературы, который включает 350 источников, в том числе 337 иностранных авторов.

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Факторы вирулентности уропатогенных бактерий

Мочевые пути являются одним из наиболее частых мест попадания бактерий - возбудителей инфекций в организм человека, а ИМП являются наиболее распространенными инфекциями бактериальной этиологии (Southwick, 2007). Острые или неосложненные ИМП обычно вызваны одним видом бактерии -патогена, в то время как осложненные ИМП вызваны несколькими микроорганизмами (NKUDIC, 2011). В случае ИМП было показано, что грамотрицательные бактерии в целом, и энтеробактерии в частности, чаще всего встречаются в посевах мочи (частота их встречаемости составляет 55-86%), в то время как грамположительные кокки встречаются значительно реже (Loeb et al., 2009). Поскольку наиболее распространенным возбудителем ИМП является E. coli, механизм развития инфекции будет рассмотрен на примере этих бактерий (Sanchez et al., 2012).

Самым распространенным внекишечным эшерихиозом является пиогенное поражение мочевыделительной системы.

Уропатогенные бактерии E. coli присутствуют в микрофлоре кишечника, а патогенные штаммы могут заражать мочевые пути путем экспрессии особых факторов вирулентности (включая адгезины, токсины, сидерофоры и полисахаридные оболочки), которые способствуют их прикреплению к мембранам клеток с последующей колонизацией мочевых путей (Southwick, 2007).

Уропатогенность E. coli связана со способностью микроорганизмов к закреплению на эпителии мочевыводящих путей. Это явление связано с поливалентностью адгезивного процесса. Гены, ответственные за синтез адгезинов, находятся в участках бактериальной хромомомы, называемых островами патогенности. Синтез других факторов вирулентности, в том числе

цитотоксинов, сидерофоров, также связан с этими генами (Далин, Фиш, 1985; Southwick, 2007).

Адгезины подразделяют на фимбриальные и афимбриальные в зависимости от того, является ли адгезин частью жесткой фимбрии или пили. Фимбрии и пили представляют собой поверхностные гликопротеины, которые выступают в качестве лигандов для рецепторов клеток уроэпителия. Наиболее распространенными являются пили типов I, P и S (Маянский, 2006).

Р-фимбрии являются основной разновидностью пилей, которые специфичны для уропатогенных эшерихий. Название Р-фимбрии связано с тем, что чаще всего бактерии, имеющие эти пили, ассоциированны с пиелонефритом. Р-фимбрии не обнаружены у патогенных диареегенных и комменсальных штаммов эшарихий. Р-фимбрии образуют многочисленные антигенные варианты, которые образуют связь с гликосфинголипидным рецептором. Химическая специфичность рецептора определяется глобобиозой, а адгезия на клеточной мембране - церамидом (Theodoras, 2011).

Пили I типа (чувствительные к маннозе) встречаются практически у всех штаммов E. coli и представляют собой спиралевидные трубки с повторяющимися сегментами fimA, которые связаны с дистальным кончиком, содержащим адгезин FimH. Между адгезином FimH и уроплакинами (белками-рецепторами, расположенными на мембранах клеток уроэпителия, покрывающих поверхность полости мочевого пузыря) во время колонизации происходит процесс специфического связывания, который считается первым этапом последующей колонизации и заражения (рис. 1.1.1) (Davis, Flood, 2011). Установлено, что фимбрии I типа при взаимодействии с маннозными радикалами уроплакинов провоцируют инвазию бактерий внутрь эпителия. Это приводит к персистенции уропатогенных E. coli и предопределяет развитие рецидивов (Далин, Фиш, 1985, Oliveira et al., 2011).

Рисунок 1.1.1 - Связывание адгезина FimH с уроплакинами (Davis, Flood, 2011). FimH Adhesin-адгезин FimH; Uroplakins-уроплакины; Umbrella cell-эпителиальная клетка;

Urothelial cell-клетка уротелия

После связывания активированные адгезины FimH перемещаются к более глубоко лежащим слоям уроэпителия, и как только патоген попадает внутрь клеток, начинается инвазивный процесс (рис. 1.1.2) (Hernandez, 2013).

Рисунок 1.1.2 - Прикрепление уропатогенов к поверхности эпителия. A. Уропатоген входит в цитозоль. B. Быстрое внутриклеточное размножение бактерий в течение первых 24 ч. C.

Скорость размножения уменьшается, образуется защитная матрица биопленки. D. Кластеризованные уропатогены становятся подвижными и отделяются от биопленки для дальнейшего распространения. Подписи к рисунку: Umbrella cell - эпителиальная клетка;

Urothelial cell - клетка уротелия; Uropathogen - уропатоген; Intracellular proliferation -внутриклеточное размножение; Biofilm formation - образование биопленки; Dispersion of filamentous uropathogens - распространение нитчатых уропатогенных бактерий

В отличие от Р-фимбрий, которые являются обязательным, фимбрии I типа чаще обнаруживаются у штаммов, ассоциированных с циститом. Вероятно, разные адгезины определяют адгезию бактерий в различных отделах мочевыделительного тракта (Hernandez, 2013).

В адгезии уропатогенных Е. coli могут участвовать и другие адгезины. Например, существует корреляция между патогенностью эшерихий и F1^ фимбриями, которые связываются с глоботриазилцерамидом и галактозилцерамидом, обнаруженными в эпителиальных клетках почек, мочевого пузыря и мочеточников (Маянский, 2006).

Dr-адгезин является одним из факторов восходящей колонизации мочевыделительной системы. Рецепторы к Dr-адгезину находятся в различных тканях, например, в паренхиме почек (Sanchez et al., 2012).

Повреждение эпителия связано с пиогенностью уропатогенных эшерихий, т.е. со способностью инициировать и поддерживать нейтрофилзависимое воспаление. Факторы пиогенности точно не известны. Взаимодействие уропатогенных эшерихий с эпителиоцитами обуславливает быструю продукцию последними нейтрофильных хемокинов (ИЛ-8 и других) (Davis, Flood, 2011).

Таким образом, пиогенное поражение мочевыделительной системы можно описать следующим образом. В результате адгезии уропатогенных штаммов эшерихий происходит активация клеток уротелия и секреция провоспалительных цитокинов. Хемокины (ИЛ-8 и другие) служат стимулом для трансэндотелиальной мобилизации нейтрофилов. Последние преодолевают эпителиальный барьер, выходят в ткани и на мукозальную поверхность. При этом они способствуют стерилизации уретрального тракта в результате уничтожения бактерий, сами же становятся источником медиаторов, поддерживающих развитие воспалительного процесса в форме хронической или рецидивирующей болезни (Маянский, 2006).

1.2. Механизмы устойчивости возбудителей инфекций мочевыводящих путей

к антимикробным препаратам

Инфекционные заболевания мочевыводящих путей являются одной из наиболее распространенных причиной заболеваемости и смертности среди людей (Salvatore, Resman-Targoff, 2015). Чаще всего инфицированию подвергаются уретра и мочевой пузырь (Al-Badr, Al-Shaikh, 2013; Doi et al., 2013). Представители семейства Enterobacteriaceae в целом, и E. coli в частности, являются наиболее частыми бактериальными агентами в патогенезе ИМП, они являются возбудителями в 65-75% неосложненных и осложненных случаев ИМП (Gupta, Hooton, 2011). Штаммы E. coli, поражающие мочеполовую систему человека (UPEC) обладают особыми факторами вирулентности, которые играют важную роль в патогенезе (Carattoli, 2009). Перенос детерминант антибиотикорезистентности к другим штаммам E. coli и другим родам бактерий, а также синтез ферментов, разрушающих антимикробные препараты, являются наиболее важными факторами вирулентности, проявляемыми штаммами UPEC (Mladin et al., 2009; Tsai et al., 2009).

Инфекции мочевых путей лечат антибактериальными терапевтическими препаратами (Bush, 2010). Антибиотики, такие как аминогликозиды, цефалоспорины, карбапенемы или фторхинолоны существенно сокращают период лечения и восстановления (ECDC, 2014). Устойчивость многих бактериальных уропатогенов к широкому спектру антибиотиков, активно используемых при лечении ИМП, является крайне актуальной проблемой в последние годы. Наиболее явной причиной данного явления является увеличение использования антибиотиков в медицине (Sidjabat, Paterson, 2015).

aac(3)-II ген устойчивости к аминогликозидам

Аминогликозиды являются группой традиционных антибактериальных терапевтических агентов широкого спектра действия (Yang, 2010). Они действуют путем ингибирования синтеза белка в бактериальной клетке, и показывают зависимую от концентрации бактерицидную активность в отношении

большинства грамотрицательных аэробных и факультативн-анаэробных бактерий (Bothe, 2012). Гентамицин, амикацин, тобрамицин являются наиболее часто используемыми аминогликозидами в клинической практике (Schlecht, Bruno, 2015). Устойчивость к гентамицину и другим аминогликозидам обусловлена либо хромосомными мутациями, либо приобретением бактериями генов устойчивости, переносимых на мобильных генетических элементах (плазмиды, интегроны и транспозоны) (Moulds, Jeyasingham, 2010). Кроме того, было выявлено, что синтез аминогликозидмодифицирующих ферментов является наиболее часто встречающимся плазмидным механизмом возникновения

антибиотикорезистентности (Tada et al., 2013). Эти ферменты включают аминогликозидацетил-трансферазы AAC, аминогликозидфосфорил-трансферазы APT и аминогликозиднуклеотидил-трансферазы ANT, которые выполняют роль кофакторов при модификации лекарственных препаратов в бактериальной клетке. В результате модифицированные аминогликозиды плохо связываются с рибосомами, что позволяет бактериям выживать в присутствии антибиотиков (Saad et al., 2015). AAC(3)-трансферазы относятся к N-ацетилтрансферазам, которые представлены девятью подклассами (I-IX), отличающимися друг от друга изоферментами и сайтами связывания с субстратом (Emanuele et al., 2009). Гены, кодирующие синтез AAC(3)-ферментов, являются преобладающими факторами, определяющими устойчивость к аминогликозидам в различных популяциях E. coli (включая UPEC) (Ramirez, Tolmasky, 2010). Показано, что эти гены имеют по меньшей мере пять аллелей от aac(3)-IIa до aac(3)-IIe (Ho et al., 2010).

В связи с вышеизложенным, идентификация генов устойчивости к антибиотикам группы аминогликозидов имеет крайне важное значение как непосредственно для лечения инфекций мочевыделительной системы, так и для создания генетической базы данных факторов патогенности (Erb et al., 2007).

Бета-лактамазы расширенного спектра действия

Бета-лактамазы расширенного спектра действия относятся к ферментам, которые кодируются плазмидными или хромосомными генами (мутации в генах tem и shv) и могут разрушать бета-лактамные молекулы антибиотиков Rahn, 2008; Grabe et al., 2012. Бета-лактамазы расширенного спектра действия представляет собой один из основных механизмов формирования устойчивости к бета-лактамным антибиотикам у грамотрицательных патогенов (наиболее часто у E. coli и Klebsiella spp.) Этот механизм возникает в результате широкого использования антибиотиков (Jain, Mondal, 2008). Существует много типов бета-лактамаз, которые различаются по своей способности к дезактивации определенного бета-лактама, по их уязвимости к действию ингибиторов бета-лактамаз и физическим характеристикам (молекулярная масса и изоэлектрическая точка) (Bush, 2010; Beytur et al., 2015). Они накапливаются в периплазматическом пространстве и атакуют бета-лактамные препараты, прежде чем они взаимодействуют со своими клеточными мишенями (Sharma et al., 2012). Показано, что БЛРС подразделяются на четыре основные группы: A, B, C, и D. Наиболее распространенными типами БЛРС являются TEM, SHV, CTX-M, AmpC и OXA-БЛРС (Yazdi et al., 2012; Kaye, Pogue, 2015).

CTX-M ферменты являются представителями класса A, кодируются плазмидными генами blactx-m и обнаруживаются, главным образом, в бактериях E. coli. Они не ассоциированы с TEM - или SHV-БЛРС и впервые были изолированы в Германии, Аргентине и Франции в 1989 году (Canton et al., 2008). В последние годы наблюдается распространение CTX-M ферментов во всем мире и в различных географических районах, в том числе в США, Африке, Европе и Азии. Эти ферменты обладают более высокой активностью в отношении цефотаксима по сравнению с другими цефалоспоринами (цефтазидим, цефтриаксон), с чем связано их название (CTX-M-БЛРС) (Canton et al., 2008; Doi et al., 2013; Tansarli et al., 2014; Sidjabat, Paterson, 2015). В исследованиях последних лет было показано, что в Европе ген ctx-m у бактерий UPEC стал преобладающим по сравнению с tem- и shv. Количество инфекций

мочевыводящих путей, вызванных UPEC, имеющими эти ферменты, значительно увеличилось во всех возрастных группах обоих полов за последние десять лет (Yumuk et al., 2008; Garrec et al., 2011; ECDC, 2014).

Поскольку гены, опосредующие другие механизмы антибиотикорезистентности, часто располагаются на той же плазмиде, штаммы, имеющие БЛРС, обычно показывают множественную лекарственную устойчивость к широкому спектру антимикробных агентов (Bradford, 2001). Этот вопрос представляет собой глобальную проблему во всем мире. Распространение БЛРС-продуцирующих бактерий ведет к повышению затрат на здравоохранение, неэффективности лечения, высокой продолжительности болезней, а также увеличению показателя смертности (Qi et al., 2010; Beytur et al., 2015).

Таким образом, фенотипическая и генотипическая индикация ctx-m ферментов имеет большое значение для лечения бактериальных инфекций, изучения различных вопросов эпидемиологии и рациональной антибактериальной терапии (Garrec et al., 2011).

Институт клинических и лабораторных стандартов (ИКЛС) и Национальный комитет по клиническим лабораторным стандартам (НККЛС) разработали стандартные методы скрининга бактерий E. coli и Klebsiella spp. на наличие БЛРС (Aziz et al., 2015). Методы основаны на определении минимальной ингибирующей концентрации (МИК) выбранных антимикробных препаратов либо методом разведения в бульоне, либо методом установления зоны подавления роста микроорганизма с помощью диско-диффузионного теста. Методика проведения и интерпретации результатов скрининговых и подтверждающих тестов хорошо известна. При использовании более чем одного антибиотика чувствительность скрининга увеличивается (CLSI, 2005). Фенотипически тест на подтверждение заключается в проверке наличия ингибирующего действия клавулановой кислоты на цефтазидим, цефотаксим и/или цефтриаксон. Процедура включает использование дисков, содержащих 10 мкг вышеуказанных антибиотиков с добавлением или без добавления 1 мкг клавулановой кислоты. Увеличение > 5 мм в диаметре зон ингибирования вокруг антибиотических

дисков с наличием клавулановой кислоты считается положительным результатом (CLSI, 2005). К сожалению, этот метод определения БЛРС не позволяет обнаружить все типы лактамаз (Al-Mayahi, Al-Mohana, 2014; Kaye, Pogue, 2015).

Выявить наличие БЛРС-продуцирующих грамотрицательных уропатогенов (в том числе E. coli) можно с использованием генотипических методов. Процедура включает использование полимеразной цепной реакции (ПЦР) со специфическими праймерами для выявления точного присутствия каждого типа гена (Nasehi et al., 2010).

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Аль Баяти Басим Мохаммад Ибрахим, 2017 год

СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННОЙ ЛИТЕРАТУРЫ

1. Афиногенова, А.Г. Микробные биопленки ран: состояние вопроса / А.Г. Афиногенова, Е.Н. Даровская // Травматология и ортопедия России. - 2011. -№ 3 (61). - С. 119-125.

2. Брилис, В.И. Методика изучения адгезивного процесса микроорганизмов / В.И. Брилис, Т.А. Брилене, Х.П. Ленцнер [и др.] // Лабораторное дело. - 1986. - № 4. - С. 210-212.

3. Гизатулина, С.С. Способ оценки состояния микрофлоры кишечника человека по количеству адгезивно-активных колоний и типу адгезинов / С.С. Гизатулина, М.О. Биргер, Л.И. Кулинич // Микробиология. - 1991. -№ 4. - С. 21 -23.

4. Гриценко, В.А. Механизмы уропатогенности бактерий / В.А. Гриценко, Д.Г. Дерябин, Ю.А. Брудастов, О.В. Бухарин // Микробиология. - 1998. - №6. - С. 93-98.

5. Далин, М.В. Адгезины микроорганизмов / М.В. Далин, Н.Г. Фиш // Итоги науки и техники ВИНИТИ. Сер. Микробиология. - 1985. - Т. 16. -106 с.

6. Лагун, Л.В. Бета-лактамазы расширенного спектра и их значение в формировании устойчивости возбудителей инфекций мочевыводящих путей к антибактериальным препаратам / Л.В. Лагун // Проблемы здоровья и экологии. -2012. - № 3 (33). - С. 82-88.

7. Маянский, А.Н. Патогенетическая микробиология: руководство / А.Н. Маянский. - Н. Нижний Новгород: Издательство НижГМА. - 2006. - С. 520.

8. Методические рекомендации МУК 4.2.1890-04 «Определение чувствительности микроорганизмов к антибактериальным препаратам» // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. - 2004. - Т. 6, № 4. -С. 306-359.

9. Решедько, Г.К. Значение ферментативной модификации аминогликозидов в развитии резистентности у бактерий / Г.К. Решедько //

Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. - 1999. - Т. 1, № 1. -С. 40-50.

10. Сидоренко, С.В. Механизмы резистентности микроорганизмов / В кн.: Практическое руководство по антиинфекционной химиотерапии / под ред. Л.С. Страчунского, Ю.Б. Белоусова, С.Н. Козлова. - 2002. НИИАХ СГМА. - С. 31-48.

11. Тец, В.В. Микроорганизмы и антибиотики. Инфекции кожи, мягких тканей, костей и суставов / В.В. Тец. - СПб.: КЛЕ-Т. - 2006. - 128 с.

12. Эйдельштейн, М.В. Б-лактамазы аэробных грамотрицательных бактерий: характеристика, основные принципы классификации, современные методы выявления и типирования / М.В. Эйдельштейн // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. - 2001. - Т. 3, № 3. - С. 223-242.

13. Эйдельштейн, М.В. Выявление бета-лактамаз расширенного спектра у грамотрицательных бактерий с помощью фенотипических методов. Пособие для врачей / М.В. Эйдельштейн // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. - 2001. - T. 3, № 3. - С. 183-189.

14. Abalaka, M. PCR the advent, usefulness and efficiency in recombinant DNA technology / M. Abalaka, I.I. Henry // Journal of Biological Sciences and Bioconservation. - 2011. - Vol. 3. - P. 16-25.

15. Abass, S.K. Isolation of multi antibiotics resistance Escherichia coli from UTI and the detection of papC and fimH virulence genes by PCR technique / S.K. Abass, M.R. Ali, S.H. Authman // Diyala Journal for Pure Sciences. - 2014. - Vol. 10, № 1. - P. 112-127.

16. Abdul-Wahid, A.A. Dissemination of aminoglycosides resistance in Pseudomonas aeruginosa isolates in Al-Nasseryia hospitals / A.A. Abdul-Wahid // Kufa Journal for Nursing Sciences. - 2015. - Vol. 5, № 1. - P. 1-11.

17. Abed, Z.A. Genotypic study of two virulence factors fimH and kpsMTII in UPEC isolated from children with UTIs / Z.A. Abed, K.A. Habib, Z.N. Abbas // Baghdad Science Journal. - 2014. - Vol. 11, № 4. - P.1-6.

18. Abujnah, A.A. MDR and ESBLs genes among Escherichia coli from patients with UTIs in Northwestern Libya / A.A. Abujnah, A. Zorgani, M.A. Sabri, H.

El-Mohammady, R.A. Khalek // Libyan Journal of Medicine. - 2015, - Vol. 10, Issue 26412. - P. 1-7.

19. Agarwal, J. Pathogenomics of UPEC / J. Agarwal, S. Srivastava, M. Singh // Indian Journal of Medical Microbiology. - 2012. - Vol. 30, № 2. - P. 141-149.

20. Agbagwa, O.E. The prevalence of UTI pathogens in urine specimen obtained from a hospital in Rivers State Nigeria / O.E. Agbagwa, J.U. Ifeanacho Emeka // Journal of Microbiology Research. - 2015. - Vol. 5, № 5. - P. 143-148.

21. Ahmed, I. The erratic antibiotic susceptibility patterns of bacterial pathogens causing UTIs / I. Ahmed, M. Sajed, A. Sultan, I. Murtaza, S. Yousaf // Experimental and Clinical Sciences International Online Journal for Advances in Science. - 2015. - Vol. 14. - P. 916-925.

22. Aiyegoro, O.A. Incidence of UTI among children and adolescents in lle-lfe, Nigeria / O.A. Aiyegoro, O.O. Igbinosa, I.N. Ogunmwonyi, E.E. Odjadjare // African Journal of Microbiology Reserch. - 2007. Vol. 1, № 2. - P. 013-019.

23. Al-Alak, S.K.A. Molecular study of adherence factors in UPEC related to fluoroquinolones resistance / S.K.A. Al-Alak, S.H. Authman // M.Sc. Thesis. College of Science, Al-Mustansiriyah University, Baghdad, Iraq. - 2012. - P. 1-128.

24. Al-Badr, A. Recurrent UTIs management in women: A review / A. Al-Badr, G. Al-Shaikh // Sultan Qaboos University Medical Journal. - 2013. - Vol. 13, Issue 3. - P. 359-367.

25. Abalaka, M. PCR the advent, usefulness and efficiency in recombinant DNA technology / M. Abalaka, I.I. Henry // Journal of Biological Sciences and Bioconservation. - 2011. - Vol. 3. - P. 16-25.

26. Alcántar-Curiel, M.D. Risk factors for ESBLs-producing Escherichia coli UTIs in a tertiary hospital / M.D. Alcántar-Curiel, C.M. Alpuche-Aranda, H.J. Varona-Bobadilla, C. Gayosso-Vázquez, M.D. Jarillo-Quijada // Salud Pública de México. -2015. - Vol. 57. - P. 412-418.

27. Alemu, A. Bacterial profile and drug susceptibility pattern of UTI in pregnant women at University of Gondar Teaching Hospital, Northwest Ethiopia / A.

Alemu, F. Moges, Y. Shiferaw, K. Tafess, A. Kassu // BioMed Central Research Notes. - 2012. - Vol. 5. - P. 197.

28. Al-Mayahi, F.S.A. Incidence of ESBLs-producing Escherichia coli in patients with UTI / F.S.A. Al-Mayahi, A.M. Al-Mohana // Journal of Al-Qadisiyah for Pure Science. - 2014. - Vol. 19, № 2. - P. 1-55.

29. Al-Run, I.I. Community-acquired UTI causing microorganisms among paraplegic patients in Gaza strip / I.I. Al-Run // M.Sc. Study. College of Education, Islamic University, Gaza, Palestine. - 2008. - P. 1-136.

30. Alsohaili, S.A. Bacterial pathogens in UTI and antibiotic resistance pattern in Zaraqa, Jordan / S.A. Alsohaili, M.H. Alharahsheh, M.A. Almshagbeh, R.A. Alkhawaldeh, W.M. Alkhawaldeh // European Scientific Journal. -2015. -Vol. 11, № 12. - P. 171-177.

31. American College of Obstetricians and Gynecologists (ACOG). Committee Opinion № 494: Sulfonamides, nitrofurantoin, and risk of birth defects // American Journal of Obstetrics and Gynecology. - 2011. - Vol. 117, № 6. - P. 1484-1485.

32. Anatomy Dictionary. Human Body anatomy // Anatomy Dictionary. -2014. Available online from www.aokainc .com/urinary- systems.

33. Anderson, G.G. Intracellular bacterial communities (IBCs) of UPEC in urinary tract pathogenesis / G.G. Anderson, K.W. Dodson, T.M. Hooton, S.J. Hultgren // Trends in Microbiology. -2004. - Vol. 12. - P. 424-430.

34. Anderson, G.G. Polysaccharide capsule and sialic acid-mediated regulation promotes biofilm-like IBCs during cystitis / G.G. Anderson, C.C. Goller, S. Justice // Infection and Immunology. - 2010. - Vol. 78. - P. 963-975.

35. Andrade Melo, R.D.C. Presence of fimH, mrkD, and irp2 virulence genes in KPC-2-producing Klebsiella pneumoniae isolates in Recife-PE, Brazil / R.D.C. Andrade Melo, E.M. Rodrigues de Barros, N.G. Loureiro, H.R. Lacerda de Melo, M.A. Vieira Maciel // Current Microbiology. - 2014. - Vol. 69, № 3. - P. 1-8.

36. Arisoy, M. Detection of virulence factors of Escherichia coli from children by multiplex PCR / M. Arisoy, D. Ayasev, M. Ekim // International Journal of Clinical Practice. - 2006. - Vol. 60. - P. 170-173.

37. Aziz, S.Z. Identification of ESBL ctx-m-15 genes from isolates of UTI / S.Z. Aziz, S.J. Abbas, S.A. Addoos // Al-Kufa Journal of Biology. - 2015. - Vol. 7, № 1.

- P. 1-16.

38. Azra, S.H. Resistance patterns of urinary isolates in a tertiary Indian hospital / S.H. Azra, D. Nair, J. Kaur, G. Baweja, M. Deb // Journal of Ayub Medical College Abottabad, Pakistan. - 2007. - Vol. 19. - P. 39-41.

39. Bahalo, S. Detection of some virulence factors of Escherichia coli isolated from UTI isolated of children in Shahrekord Iran by multiplex PCR / S. Bahalo, E. Tajbakhsh, S. Tajbakhsh, M. Momeni, F. Tajbakhsh // Middle East Journal of Scientific Research. - 2013. - Vol. 14, № 1. - P. 29-32.

40. Barber, A.E. UTIs: Current and emerging management strategies / A.E. Barber, J.P. Norton, A.M. Spivak, M.A. Mulvey // Clinical Infectious Diseases. - 2013.

- Vol. 57. - P. 719-724.

41. Baskin, L.S. UTI/Pyelonephritis / L.S. Baskin, H. Copp, M. DiSandro, A. Arnhym, A. Champeau // UCSF Medical Center, Pediatric Urology, San Francisco, CA, USA. - 2013. - P.1-3. Available online from http://www.urology.ucsf.edu

42. Battikhi, M.N. Correlation of UTI pathogens, antibiogram and age group in pregnant women / M.N. Battikhi, Q.G. Battikhi // Journal of Microbiology and Experimentation. - 2015. - Vol. 2, Issue 4. - P. 1-6.

43. Beytur, A. Oral amoxicillin-clavulanic acid treatment in UTIs caused by ESBL-producing organisms / A. Beytur, Y. Yakupogullari, F. Oguz, B. Otlu, H. Kaysadu // Jundishapur Journal of Microbiology. - 2015. - Vol. 8, № 1. - P. 1-5.

44. Biscola, F.T. Determination of adhesin gene sequences in, and biofilm formation by, O157 and non-O157 shiga toxin-producing Escherichia coli strains isolated from different Sources / F.T. Biscola, C.M. Abe, B.E. Guth // Applied Environmental Microbiology. - 2011. - Vol. 77, № 7. - P. 2201-2208.

45. Blango, M.G. Persistence of UPEC in the face of multiple antibiotics / M.G. Blango, M.A. Mulvey // Antimicrobial Agents and Chemotherapy. - 2010. - Vol. 54. - P. 1855-1863.

46. Boothe, D.M. Aminoglycosides: Antibacterial agents / D.M. Boothe // Merck Manuals: The Merck Veterinary Manual. New Jersey, USA. - 2012. - P. 1-19. Available online from http://www.merckvetmanual.com/mvm/pharmacology/antibacterial agents/aminoglycos ides.html

47. Boyko, E.J. Risk of UTI and ASB among diabetic and nondiabetic postmenopausal women / E.J. Boyko, S.D. Fihn, D. Scholes, L. Abraham, B. Monsey // American Journal of Epidemiology. - 2005. - Vol. 161. - P. 557-564.

48. Brachman, P.S. Bacterial infections of humans: Epidemiology and control / P.S. Brachman, E. Abrutyn // 4th edition. Springer Science+Business Media, USA. -2009. - P. 543-576.

49. Bradford, P.A. ESBLs in the 21st century: Characterization, epidemiology, and detection of this important resistance threat / P.A. Bradford // Clinical Microbiology Reviews. - 2001. - Vol. 14, № 4. - P. 933-951.

50. Brien, K.O. The prevalence of UTI in children under five years old presenting with an acute illness in UK general practice / K.O. Brien // Ph.D. Study. Cardiff University, Wales, UK. - 2013. - P. 1-316.

51. Briongos-Figuero, L.S. Epidemiology, risk factors, and comorbidity for UTIs caused by ESBL producing Enterobacteria / L.S. Briongos-Figuero, T. Gómez-Traveso, P. Bachiller-Luque, M.D-G. González, A. Gómez-Nieto // International Journal of Clinical Practice. - 2012. - Vol. 66, № 9. - P. 891-896.

52. British Infection Association (BIA). Diagnosis of UTI: Quick reference guide for primary care // Royal College of General Practitioners (RCGP), UK. - 2014. -P. 1-8. Available online from https://www.gov.uk/government/uploads/system/uploads/attachment data/file/323398/ UTI guidelines with RCGP logo.pdf

53. Brooks, G.F. Jawetz, Melnick and Adelberg's Medical Microbiology. Section III: Bacteriology / G.F. Brooks, K.C. Carroll, J.S. Butel, S.A. Morse, T.A. Mietzner // 25th international edition. McGraw-Hill Lange Medical Book, USA. - 2010, - P. 145-370.

54. Bunyan, I.A. Investigation of fimH adhesin among Enterobacter spp. isolates and their role in biofilm formation / I.A. Bunyan, M.S. Abdul-Razzaq, H.O. Al-Dahmoshi, N.S. Kadhim // International Journal of Pharmaceutical Invention. - 2013. -Vol. 3, Issue 1. - P. 1-18.

55. Burd, E. A critical appraisal of the role of the clinical microbiology laboratory in the diagnosis of UTIs / E. Burd, K.S. Kehl // Journal of Clinical Microbiology. - 2011. - Vol. 49, Suppl. 9. - P. S34-S38.

56. Burton, D.C. Trends in CAUTIs in adult intensive care units-United States, 1990-2007 / D.C. Burton, J.R. Edwards, A. Srinivasan // Infection Control and Hospital Epidemiology. - 2011. - Vol. 32, № 8. - P. 748-756.

57. Bush, K. Functional classification scheme for beta-lactamases and its correlation with molecular structure / K. Bush, G. Jacoby, A. Medeiros // Antimicrobial Agents and Chemotherapy. - 1995. - № 39. - P. 1211-1233.

58. Bush, K. New beta-lactamases in gram-negative bacteria: Diversity and impact on the selection of antimicrobial therapy / K. Bush // Clinical Infectious Diseases. - 2001. Vol. 32, № 7. - P. 1085-1089.

59. Bush, K. ESBLs in North America, 1987-2006 / K. Bush // Clinical Microbiology and Infection. - 2008. - Vol. 14, Suppl 1. - P. 134-143.

60. Bush, K. The coming age antibiotic discovery and therapuaticalue / K. Bush // Annals of the New York Academy of Sciences. - 2010. - Vol. 1212. - P. 1-4.

61. Butler, C.C. Containing antibiotic resistance: Decreased antibiotic-resistant coliform UTIs with reduction in antibiotic prescribing by general practices / C.C. Butler, F. Dunstan, M. Heginbothom // British Journal of General Practice. - 2007. - Vol. 57. -P. 785-792.

62. Caljouw, M.A.A. Predictive factors of UTIs among the oldest old in the general population: A population-based prospective follow-up study / M.A.A. Caljouw, W.P.J. Elzen, H.J.M. Cools, J. Gussekloo // BMC Medicine. - 2011. - Vol. 9, № 57. - P. 1-8.

63. Canton, R. Prevalence and spread of ESBL-producing Enterobacteriaceae in Europe / R. Canton, A. Novais, A. Valverde, E. Machado, L. Peixe // Clinical Microbiology and Infection. - 2008. - Vol. 14, Suppl. 1. - P. 144-153.

64. Carattoli, A. Resistance plasmid families in Enterobacteriaceae / A. Carattoli // Antimicrobial Agents and Chemotherapy. - 2009. - Vol. 53, № 6. - P. 22272238.

65. Center for Drug Evaluation and Research (CDER). Complicated UTIs: Developing drugs for treatment - Guide for industry // U.S. Department of Health and Human Services, Food and Drug Administration, USA. - 2015. - P. 1-17.

66. Chakupurakal, R. Urinary tract pathogens and resistance pattern / R. Chakupurakal, M. Ahmed, D.N. Sobithadevi, S. Chinnappan, T. Reynolds // Journal of Clinical Pathology. - 2010. - Vol. 63, № 7. - P. 652-654.

67. Chamberlain, N.R. Medical microbiology: The big picture. Section 10: Genitourinary tract, Chapter 34: Infections of the urethra, bladder, kidney, and prostate / N.R. Chamberlain // McGraw Hill Company, USA. - 2009. - P. 341-346.

68. Chang, U-I. A comparison of the clinical characteristics of elderly and non-elderly women with community onset, non-obstructive acute pyelonephritis / U-I. Chang, H.W. Kim, Y-S. Noh, S-H. Wie // The Korean Journal of Internal Medicine. -2015. - Vol. 30. - P. 372-383.

69. Chenoweth, C.E. UTIs / C.E. Chenoweth, S. Saint // Infectious Disease Clinics of North America. - 2011. - Vol. 25, № 1. - P. 103-115.

70. Chenoweth, C.E. Preventing CAUTIs in the intensive care unit / C.E. Chenoweth, S. Saint // Critical Care Clinics. - 2013. - Vol. 29, № 1. - P. 19-32.

71. Chenoweth, C.E. Diagnosis, management, and prevention of CAUTIs / C.E. Chenoweth, C.V. Gould, S. Saint // Infectious Disease Clinics of North America. -2014. - Vol. 28, № 1. - P. 105-119.

72. Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI). Performance standards for antimicrobial susceptibility testing // CLSI. 950 West valley road, Suite 2500, Wayne, PA 19087, USA. - 2005. - Supplement M100-S15. Available online from www.clsi.org

73. Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI). Performance standards for antimicrobial susceptibility testing // CLSI. 950 West valley road, Suite 2500, Wayne, PA 19087, USA. - 2008. 18th informational supplement. - M100-S18. Available online from http : //www .clsi.org

74. Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI). Urinalysis; Approved guideline // CLSI. 950 West valley road, Suite 2500, Wayne, PA 19087, USA. - 2009. -Vol. 29, № 4. (3rd edition, GP16-A3.) - P. 1-41. Available online from http://www.clsi.org

75. CLSI (Clinical and Laboratory Standards Institute). Performance standards for antimicrobial susceptibility testing // CLSI, 950 West valley road, Suite 2500, Wayne, PA 19087, USA. - 2012a. - 18th informational supplement. - M100-S18 U. Available online from www.clsi.org

76. Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI). Performance standards for antimicrobial susceptibility testing // CLSI, 950 West valley road, Suite 2500, Wayne, PA 19087, USA. - 2012b. 22nd informational supplements update. - M100-S22 U. Available online from www.clsi.org

77. Coelho, R. Renal and perinephric abscesses: Analysis of 65 cases / R. Coelho, E.D. Schneider-Montero, J.L. Mesquita // World Journal of Surgery. - 2007. -Vol. 31. - P. 431-436.

78. Colgan, R. Diagnosis and treatment of acute pyelonephritis / R. Colgan // American Academy of Family Physicians. - 2011. - Vol. 84. - P. 519-526.

79. Conway, P.H. Recurrent UTI in children, risk factor and association with prophylactic antimicrobials / P.H. Conway, A. Canaan, T. Zaoutis, B.V. Henry, JAMA. - 2007. - Vol. 298, № 2. - P. 179-86.

80. Cornforth, T. Treatment and prevention of UTIs: What you need to know about UTI treatments and prevention / Cornforth T // 2014. Available online from http://womenshealth.about.com/cs/bladderhealth/a/UTI 2.htm

81. Cosgrove, S.E. Antibiotic guidelines 2015-2016: Treatment recommendations for adults inpatients. Section 6.17: UTI / S.E. Cosgrove, E. Avdic, K.

Dzintars, J. Smith // The Johns Hopkins Hospital: Antimicrobial Stewardship Program. -2015. - P. 110-114. Available online from http://www.insidehopkinsmedicine.org/amp

82. Coyne, K.S. The prevalence of LUTS in the USA, UK, and Sweden: Results from the epidemiology of LUTS study / K.S. Coyne, C.C. Sexton, C.L. Thompson // British Journal of Urology International. - 2009. - Vol. 104. - P. 352-360.

83. Craig, J. Antibiotic prophylaxis and recurrent UTI in children / J. Craig, J. Simpson, G. Williams // The New England Journal of Medicine. - 2009. - Vol. 361. - P. 1748-1759.

84. Crider, K.S. Antibacterial medication use during pregnancy and risk of birth defects / K.S. Crider, M.A. Cleves, J. Reefhuis // Archives of Pediatrics and Adolescent Medicine Journal. - 2009. - Vol. 163, № 11. - P. 978-985.

85. Croxen, M.A. Molecular mechanisms of Escherichia coli pathogenicity / M.A. Croxen, B.B. Finlay // Nature Reviews Microbiology. - 2010. - Vol. 8, № 1. - P. 26-38.

86. Dakhl, Z.F. Dissemination of aminoglycosides resistance in Pseudomonas aeruginosa isolates in Al-Diwaniya hospitals, Iraq / Z.F. Dakhl, S.K. Alwan // International J. of Advanced Research. - 2015. - Vol. 3, Issue 11. - P. 376-384.

87. Darouiche, R.O. Device-associated infections: A macroproblem that starts with microadherence / R.O. Darouiche // Clinical Infectious Diseases. - 2001. - Vol. 33, № 9. - P. 1567-1572.

88. Danson, S. Guidelines for the diagnosis and management of recurrent UTI in women / S. Dason, J.T. Dason, A. Kapoor // Canadian Urological Association. -2011. - Vol. 5, № 5. - P. 316-322.

89. Davis, N.F. The pathogenesis of UTIs: Clinical management of complicated UTI / N.F. Davis, H.D. Flood // Dr. Ahmad Nikibakhsh (Ed.). - 2011. - P. 1-21. Available online from http://www.intechopen.com/books/clinical-management-of-complicated-urinary-tractinfection/the-pathogenesis-of-urinary-tract-infections

90. Dayan, N. UTIs caused by community-acquired ESBL-producing and nonproducing bacteria: A comparative study / N. Dayan, H. Dabbah, I. Weissman, I. Aga, L. Even // Journal of Pediatrics. - 2013. - Vol. 163. - P. 1417-21.

91. Degnan, L.A. ESBL bacteria from urine isolates in children / L.A. Degnan, A.M. Milstone, M. Diener-West // The Journal of Pediatric Pharmacology and Therapeutics. - 2015. - Vol. 20, № 5. - P. 373-377.

92. Dielubanza, E.J. UTIs in women / E.J. Dielubanza, A.J. Schaeffer // Medical Clinics of North America. - 2011. - Vol. 95, № 1. - P. 27-41.

93. Dielubanza, E.J. Targeted antimicrobial prophylaxis using rectal swab cultures in men in association with reduced incidence of postoperative infectious complications and cost care / E.J. Dielubanza, K.T. Aisha, R. Teresa, S. Zembower // The journal of Urology. - 2011. - Vol. 187. - P. 1275-1279.

94. Dobrindt, U. Targeting virulence traits: Potential strategies to combat extraintestinal pathogenic Escherichia coli infections / U. Dobrindt, J. Hacker // Current Opinion in Microbiology. - 2008. - Vol. 11, № 5. - P. 409-413.

95. Dohmae, S. Bacillus cereus nosocomial infection from reused towels in Japan / S. Dohmae, T. Okubo, W. Higuchi, T. Takano, H. Isobe // Journal of Hospital Infection. - 2008. - Vol. 69, № 4. - P. 361-367.

96. Doi, Y. Community-associated ESBL-producing Escherichia coli infection in the United States / Y. Doi, Y.S. Park, J.I. Rivera, J.M. Adams-Haduch, A. Hingwe // Clinical Infectious Diseases. - 2013. - Vol. 56. - P. 641-648.

97. Donlan, R.M. Biofilms: Survival mechanisms of clinically relevant microorganisms / R.M. Donlan, J.W. Costerton // Clinical Microbiology Reviews. -2002. - Vol. 15, № 2. - P. 167-193.

98. Drekonja, D.M. UTIs / D.M. Drekonja, J.R. Johnson // Primary Care. -2008. - Vol. 35. - P. 345-367.

99. Dwyer, B.E. Single nucleotide polypmorphisms of FimH associated with adherence and biofilm formation by serovars of Salmonella enterica / B.E. Dwyer, K.L. Newton, D. Kisiela, E.V. Sokurenko, S. Clegg // Microbiology. - 2011. - Vol. 157. - P. 3162-3171.

100. Edmonton, A.B. Diagnosis and management of UTI in long term care facilities: Clinical practice guideline / A.B. Edmonton // Toward Optimized Practice

(TOP) Working Group. - 2015. - P. 1-22. Available online from http://www.topalbertadoctors. org

101. El-Garbulli, F.R. Emergence of ctx-m gene among ESBL positive Escherichia coli isolates from UTI outpatients at Benghazi, Libya / F.R. El-Garbulli, M.M. Buzayan, N. Mathlouthi // The 2nd Symposium on Theories and Applications of Basic and Biosciences. - 2015. - P. 27-35.

102. Ellis, D. Risk fectors for hospital-acquired antimicrobial-resistant infection caused by Acinetobacter baumannii / D. Ellis, B. Cohen, J. Liu, E. Larson // Antimicrobial Resistance and Infection Control. - 2015. - Vol. 4, № 40. - P. 1-5.

103. Emanuele, D-M. Do we still need the aminoglycosides / D-M. Emanuele,

G. Alexandras, U. Riccardo, E.F. Matthew // International Journal of Antimicrobial Agents. - 2009. - Vol. 33, № 3. - P. 201-205.

104. Emody, L. Virulence factors of UPEC / L. Emody, M. Kerenyi, G. Nagy // International J. of Antimicrobial Agents. - 2003. - Vol. 22, Suppl 2. - P. 29-33.

105. Epp, A. Recurrent UTI. SOGC Clinical Practice Guideline / A. Epp, S.K. Saskatoon, A. Larochelle, Q.C. St. Lambert // Society of Obstetricians and Gynaecologist of Canada. - 2010. - № 250. - P. 1082-1090.

106. Erb, A. Prevalence of antibiotic resistance in Escherichia coli: Overview of geographical, temporal, and methodological variations / A. Erb, T. Sturmer, R. Marre,

H. Brenner // European Journal of Clinical Microbiology and Infectious Diseases. -2007. - Vol. 26. Issue 2. - P. 83-90.

107. Eriksson, I. UTI: A serious health problem in old women / I. Eriksson // Medical Dissertation. Department of Community Medicine and Rehabilitation, Geriatric Medicine, Umea University, Umea, Sweden. - 2011. - P. 1-80.

108. European Center for Disease Prevention and Control (ECDC). Antimicrobial resistance surveillance in Europe: 2013. Stockholm, Sweden. 2014. Available online from http://ecdc.europa.eu/en/publications/Publications/antimicrobial-resistancesurveillance-europe-2013 .pdf

109. Eshetie, S. MDR and carbapenemase producing Enterobacteriaceae among patients with UTI at referral Hospital, Northwest Ethiopia / S. Eshetie, C. Unakal, A.

Gelaw, B. Ayelign, M. Endris // Antimicrobial Resistance and Infection Control. - 2015.

- Vol. 4, No. 12. - P. 1-8.

110. Eto, D.S. Integrin-mediated host cell invasion by type 1-piliated UPEC / D.S. Eto, T.A. Jones, J.L. Sundsbak, M.A. Mulvey // PLOS Pathogens. - 2007. - Vol. 3.

- P. e100.

111. Fagan, M. Antibiotic resistance patterns of bacteria causing UTIs in the elderly living in nursing homes versus the elderly living at home: An observational study / M. Fagan, M. Lindb^k, N. Grude, H. Reiso, M. Romoren // BMC Geriatrics. -2015. - Vol. 15, № 98. - P. 1-7.

112. Fan, N.C. Rise of community-onset UTI caused by ESBL-producing Escherichia coli in children / N.C. Fan, H.H. Chen, C.L. Chen, L.S. Ou // Journal of Microbiology, Immunology, and Infection. - 2014. - Vol. 47. - P. 399-405.

113. Farhan, M.B. Detection fimH and papG genes of Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae isolated from gallstone, urine stone, and gastrointestinal canal by PCR / M.B. Farhan, A.S. Hussain, A.M. Ali // Al-Anbar University Journal for Pure Sciences. - 2012. - Vol. 6, № 3. - P. 1-8.

114. Farshad, S. Association of virulent genes Hly, Sfa, Cnf-1, and Pap with antibiotic sensitivity in Escherichia coli strains isolated from children with CAUTI / S. Farshad, F. Emamghoraishi, A. Japoni // Iranian Red Crescent Medical Journal. - 2010.

- Vol. 12, № 1. - P. 33-37.

115. Farshad, S. Microbial susceptibility, virulence factors, and plasmid profiles of UPEC strains isolated from children in Jahrom, Iran / S. Farshad, R. Ranjbar, A. Japoni, M. Hosseini, M. Anvarinejad // Achieves of Iranian Medicine Journal. - 2012. -Vol. 15, № 5. - P. 312-316.

116. Fattahi, S. Relationship of biofilm formation and different virulence genes in UPEC isolates from Northwest Iran / S. Fattahi, H.S. Kafil, M.R. Nahai, M. Asgharzadeh // GMS Hygiene and Infection Control. - 2015. - Vol. 10. - P. 1-7.

117. Finch, R.G. Coagulase-negative staphylococci, in: Principles and practice in clinical bacteriology / R.G. Finch, S.H. Gillespie, P.M. Hawkey // 2nd edition. John Wiley and Sons, UK. - 2006. - P. 99-111.

118. Flores-Mireles, A.L. UTIs: Epidemiology, mechanisms of infection, and treatment options / A.L. Flores-Mireles, J.N. Walker, M. Caparon, S.J. Hultgren // Nature Reviews Microbiology. - 2015. - Vol. 13. - P. 269-284.

119. Garofalo, C.K. Escherichia coli from urine of female patients with UTIs is competent for IBC formation / C.K. Garofalo, T.M. Hooton, S.M. Martin, W.E. Stamm, J.J. Palermo // Infection and Immunity. - 2007. - Vol. 75. - P. 52-60.

120. Garrec, H. Comparison of nine phenotypic methods for detection of ESBL production by Enterobacteriaceae / H. Garrec, L. Drieux-Rouzet, J-L. Golmard, V. Jarlier, J. Robert // Journal of Clinical Microbiology. - 2011. - Vol. 49, № 3. - P. 10481057.

121. Ghanesherbaf, F. Related factors with permanent scar in children with UTIs / F. Ghanesherbaf, A. Kharazme, R. Gharaeigomei // Journal of North Khorasan University of Medical Sciences. - 2011. - Vol. 3. - P. 57-67.

122. Giedraitiene, A. Antibiotic resistance mechanisms of clinically important bacteria / A. Giedraitiene, A. Vitkauskiene, R. Naginiene, A. Pavilonis // Medical Journal of Australia. - 2011. - Vol. 47, № 3. - P. 137-146.

123. Gillespie, S.H. Principles and Practice of Clinical Bacteriology / S.H. Gillespie, P.M. Hawkey // 2nd edition. John Wiley and Sons, Ltd. - 2006. - P. 1-427.

124. Gonfalves, A. Iberian Lynx (Lynx pardinus) from the captive breeding program as reservoir of antimicrobial resistant Enterococci and Escherichia coli isolates / A. Gonfalves, G. Igrejas, H. Radhouani, T. Santos, R. Monteiro // JIOMICS. - 2013. -Vol. 3, Issue 2. - P. 138-144.

125. Gorter, K. Risk of recurrent acute lower UTIs and prescription patterns of antibiotics with/without diabetes in primary care / K. Gorter, E. Hak, P.A. Zuithoff // Family Practice. - 2010. - Vol. 27. - P. 379-385.

126. Grabe, M. Guidelines on the management of urinary and male genital tract infections / M. Grabe, M.C. Bishop, T.E. Bjerklund-Johansen, H. Botto, M. Qek // European Association of Urology. - 2008. - P. 1-116.

127. Grabe, M., Bjerklund-Johansen T.E., Botto H. European association of urology (EAU) Guidelines on Urological Infections / M. Grabe, T.E. Bjerklund-Johansen, H. Botto // European Association of Urology. - 2010. - P. 224-241.

128. Grabe, M. Guidelines on urological infections / M. Grabe, T.E. Bjerklund-Johansen, H.B. Botto, M. Wullt, K.G. Qek // European Association of Urology. - 2013. -P. 1-106. Available online from https://uroweb.org/wp-content/uploads/18 Urological-infections LR.pdf

129. Grabe, M. Guidelines on urological infections / M. Grabe, R. Bartoletti, T.E. Bjerklund Johansen, T. Cai, M. Qek // European Association of Urology. - 2015. -P. 1-86. Available online from http://uroweb.org/wp-content/uploads/19-Urological-infections_LR2 .pdf

130. Gradwohl, S.E. UTI: Guidelines for clinical care ambulatory / S.E. Gradwohl, C.M. Bettcher, C.E. Chenoweth, R.V. Harrison, L. Zoschnick // Quality Management Program, University of Michigan. Michigan, USA. - 2011. - P. 1-9.

131. Gray, B.M. Streptococcal infections. Chapter 35: Bacterial infections of humans: Epidemiology and control / B.M. Gray, D.L. Stevens // 4th edition. Springer Science+Business, USA. - 2009. - P. 743-782.

132. Greene, S.E. Human urine decreases function and expression of type 1 pili in UPEC / S.E. Greene, M.E. Hibbing, J. Janetka, S.L. Chen, S.J. Hultgren // American Society for Microbiology. - 2015. - Vol. 6, Issue 4. - P. 1-9.

133. Guidelines and Protocols Advisory Committee (GPAC). Macroscopic and microscopic urinalysis and the investigation of UTI // British Columbia Medical Association, Canada. - 2009. Available online from www.BCGuidelines.ca

134. Guo, A. FimH alleles direct preferential binding of Salmonella to distinct mammalian cells or to avian cells / A. Guo, S. Cao, L. Tu, P. Chen, C. Zhang // Microbiology. - 2009. - Vol. 155. - P. 1623-1633.

135. Gupta, K. International clinical practice guidelines for the treatment of acute uncomplicated cystitis and pyelonephritis in women: A 2010 update by the IDS of America and the European SMIDs / K. Gupta, T.M. Hooton, K.G. Naber // Clinical Infectious Diseases. - 2011. - Vol. 52, № 5. - P. e103-e120.

136. Hamed, S.M. Aminoglycoside resistance patterns of certain gram negative uropathogens recovered from hospitalized Egyptian patients / S.M. Hamed, K.M. Aboshanab, F. Walid, W.F. Elkhatib // British Microbiology Research Journal. - 2013. -Vol. 3, № 4. - P. 678-691.

137. Hamdan, H.Z. Epidemiology of UTIs and antibiotics sensitivity among pregnant women at Khartoum north hospital / H.Z. Hamdan, A.H. Ziad, S.K. Ali // Annals of Clinical Microbiology and Antimicrobials. - 2011. - Vol. 10. - P. 2.

138. Han, S.B. Aminoglycoside therapy for childhood UTI due to ESBL-producing Escherichia coli or Klebsiella pneumoniae / S.B. Han, S.C. Lee, S.Y. Lee, D.C. Jeong, // BMC Infectious Diseases. - 2015. - Vol. 15, № 414. - P. 1-8.

139. Hancock, V. Biofilm formation by asymptomatic and virulent UTIs Escherichia coli strains / V. Hancock, L. Ferrieres, P. Klemm // FEMS Microbiology Letters. - 2007. - Vol. 267. - P. 30-37.

140. Hancock, V. Functional genomics of probiotic Escherichia coli Nissle 1917, 83972, and UPEC strain CFT073: Comparison of transcriptomes, growth and biofilm formation / V. Hancock, R.M. Vejborg, P. Klemm // Molecular Genetics and Genomics. - 2010. - Vol. 284. - P. 437-454.

141. Harmsen, M. Parents' awareness of and knowledge about young children's UTIs / M. Harmsen, M. Wensing, J. Wouden, R. Grol // Patient Education and Counseling. - 2007. - Vol. 66. - P. 250-255.

142. Hashemiparast, M-S. Effective factors in UTI prevention among children: Application of health belief model / M-S. Hashemiparast, D. Shojaeizadeh, K. Aezam, A. Tol // Open Journal of Preventive Medicine. - 2015. - Vol. 5. - P. 72-77.

143. Health Protection Agency (HPA). Investigation of urine // UK Standards for Microbiology Investigations. - 2012. - B 41, Issue 7.1. - P.1-41. Available online from http://www.hpa.org.uk/SMI/pdf

144. Hernandez, J.G. Mechanisms of microbial-host interaction during ASB / J.G. Hernandez // Doctoral Dissertation. Faculty of Medicine, Lund University, Lund, Sweden. - 2013. - P. 1-101.

145. Hertting, O. UTI: Pathogenesis and complications / O. Hertting // Department of Microbiology, Tumor and Cell Biology, Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden. - 2011. - P. 1-57.

146. Hickling, D.R. Anatomy and physiology of the urinary tract: Relation to host defense and microbial infection / D.R. Hickling, T-T. Sun, X-R. Wu // Microbiology Spectrum. - 2015. - Vol. 3, № 4. - P. 1-29.

147. High, K.P. Clinical practice guideline for the evaluation of fever and infection in older adult residents of long-term care facilities: 2008 Update by the Infectious Diseases Society of America / K.P. High, S.F. Bradley, S. Gravenstein // Clinical Infectious Diseases. - 2009. - Vol. 48, № 2. - P. 149-171.

148. Hilt, E.E. Urine is not sterile: Use of enhanced urine culture techniques to detect resident bacterial flora in the adult female bladder / E.E. Hilt, K. McKinley, M.M. Pearce // Journal of Clinical Microbiology. - 2014. - Vol. 52. - P. 871-876.

149. Hisano, M. Diabetes mellitus as a risk factor for resistant strains on female patients with recurrent UTI: A study of 493 patients / M. Hisano, H. Bruschini, A.C. Nicodemo, M. Lucon, C.M. Gomes // European Urology Supplements. - 2014. - Vol. 13. - P. e453.

150. Ho, P.L. Genetic identity of aminoglycoside resistance genes in Escherichia coli isolates from human and animal sources / P.L. Ho, R.C. Wong, S.W. Lo, K.H. Chow // Journal of Medical Microbiology. - 2010. - Vol. 59. - P. 702-707.

151. Ho, P-L. Prevalence of aminoglycoside modifying enzyme and 16S rRNA methylase genes among aminoglycoside-resistant Escherichia coli isolates / P-L. Ho, L-M. Leung, K-H. Chow, E.L. Lai, W-U. Lo // Journal of Microbiology, Immunology, and Infection. - 2016. - Vol. 49. - P. 123-126.

152. Hojati, Z. Detection of fimH gene in UPEC strains isolated from patients with UTI / Z. Hojati, B. Zamanzad, M. Hashemzadeh, R. Molaie, A. Gholipour // Jundishapur Journal of Microbiology. - 2015. - Vol. 8, № 2. - P. 1-4.

153. Hooton, T.M. Clinical practice. Uncomplicated UTI / T.M. Hooton // The New England Journal of Medicine. - 2012. - Vol. 366, № 11. - P. 1028-1037.

154. Hooton, T.M. Voided MSU culture and acute cystitis in premenopausal women / T.M. Hooton, P.L. Roberts, M.E. Cox, A.E. Stapleton // New England Journal of Medicine. - 2013. - Vol. 369. - P. 1883-1891.

155. Horsley, H. Enterococcus faecalis subverts and invades the host urothelium in patients with chronic UTI / H. Horsley, J. Malone-Lee, D. Holland // PLOS One. -2013. - Vol. 8. - P. e83637.

156. Hotchandani, R. UTIs in women / R. Hotchandani, K.K. Aggarwal // Indian Journal of Clinical Practice. - 2012. - Vol. 23, № 4. - P.187-192.

157. Hu, X. A high throughput multiplex PCR assay for simultaneous detection of seven aminoglycoside-resistance genes in Enterobacteriaceae / X. Hu, B. Xu, Y. Yang, D. Liu, M. Yang // BMC Microbiology. - 2013. - Vol. 13, Issue 58. - P. 1-9.

158. Jabalameli, F. Evaluation of biofilm production and characterization of genes encoding type III secretion system among Pseudomonas aeruginosa isolated from burn patients / F. Jabalameli, A. Mirsalehian, B. Khoramian, M. Aligholi, S.S. Khoramrooz // Burns. - 2012. - Vol. 38, № 8. - P. 1192-1197.

159. Jackson C. Practical Manual of Physical Medicine and Rehabilitation / C. Jackson // 2nd edition. Elsevier Mosby. Philadelphia, USA. 2006.

160. Jafari, M. The first report of cmy, aac(6')-Ib, and 16S rRNA methylase genes among Pseudomonas aeruginosa isolates from Iran / M. Jafari, F. Fallah, R.S. Borhan, M. Navidinia, A.I. Karimi // Archives of Pediatric Infectious Diseases. - 2013. -Vol. 1, № 3. - P. 109-112.

161. Jain, A. tem and shv genes in ESBLs producing Klebsiella species and their antimicrobial resistance pattern / A. Jain, R. Mondal // Indian Journal of Medical Research. - 2008. - Vol. 128, No. 6. - P. 759-764.

162. Jenkins, C. Salmonella spp. in: Principles and practice in clinical bacteriology / C. Jenkins, S.H. Gillespie, P.M. Hawkey // 2nd edition. John Wiley and Sons Ltd, UK. - 2006. - P. 367- 376.

163. Jeong, J.Y. Detection of qnr in clinical isolates of Escherichia coli from Korea / J.Y. Jeong, H.J. Yoon, E.S. Kim, Y. Lee, S.H. Choi // Antimicrobial Agents and Chemotherapy. - 2005. - Vol. 49, № 6. - P. 2522-2524.

164. John, U. UTIs in children after renal transplantation / U. John, M.J. Kemper // Pediatric Nephrology. - 2009. - Vol. 24. - P. 1129-1136.

165. Johnson, J.R. Antimicrobial urinary catheters to prevent CAUTI in hospitalized patients / J.R. Johnson, M.A. Kuskowski, T.J. Wilt // Annals of Internal Medicine. - 2006. - Vol. 144. - P. 116-126.

166. Justice, S.S. Differentiation and developmental pathways of UPEC in urinary tract pathogenesis / S.S. Justice, C. Hung, J.A. Theriot, D.A. Fletcher, G.G. Anderson // Proceedings of the National Academy of Sciences. - 2004. - Vol. 101, № 5. - P. 1333-1338.

167. Juthani-Mehta, M. Clinical features to identify UTI in nursing home residents: A cohort study / M. Juthani-Mehta, V. Quagliarello, E. Perrelli // Journal of the American Geriatrics Society. - 2009. - Vol. 57, № 6. - P. 963-970.

168. Kaczmarek, A. Prevalence of genes encoding virulence factors among Escherichia coli with K1 antigen and non-K1 Escherichia coli strains / A. Kaczmarek, A. Budzynska, E. Gospodarek // Journal of Medical Microbiology. - 2012. - Vol. 61, № 10. - P. 1360-1365.

169. Kafil, H.S. Assessment of biofilm formation by Enterococci isolates from UTIs with different virulence profiles / H.S. Kafil, A.M. Mobarez // Journal of King Saud University-Science. - 2015. - Vol. 27, Issue 4. - P. 312-317.

170. Kani, S.S. Impact of a multidimensional infection control approach on CAUTI rates in an adult intensive care unit in Lebanon: INICC findings / S.S. Kani, N. Zahreddine, V.D. Rosenthal, L. Alamuddin, Z. Kanafani // International Journal of Infectious Diseases. - 2013. - Vol. 17, № 9. - P. e686-e690.

171. Kareem, I.J. Antibiotic susceptibilities of gram negative aerobic bacteria isolated from UTIs in community / I.J. Kareem, I.Y. Rasheed // Iraqi Journal of Medical Sciences. - 2011. - Vol. 9, № 4. - P. 295-300.

172. Kashef, N. Antimicrobial susceptibility patterns of community-acquired uropathogens in Tehran, Iran / N. Kashef, G.E. Djavid, S. Shahbazi // The Journal of Infection in Developing Countries. - 2010. - Vol. 4, № 4. - P. 202-206.

173. Kassakian, S.Z. Changing epidemiology of infections due to ESBL-producing bacteria / S.Z. Kassakian, L.A. Mermel // Antimicrobial Resistance and Infection Control. - 2014. - Vol. 3. - P. 9.

174. Kato, K. Seasonal trend and clinical presentation of Bacillus cereus bloodstream infection: Association with summer and indwelling catheter / K. Kato, Y. Matsumura, M. Yamamoto, M. Nagao // European Journal of Clinical Microbiology and Infectious Diseases. - 2014. - Vol. 33, № 8. - P. 1371-1379.

175. Katsarolis, I. Acute uncomplicated cystitis: From surveillance data to a rationale for empirical treatment / I. Katsarolis, G. Poulakou, S. Athanasia // International Journal of Antimicrobial Agents. - 2010. - Vol. 35, № 1. - P. 62-67.

176. Katz, A.R. Sexually transmitted disease (STD) update: A review of the CDC 2010 STD treatment guidelines and epidemiologic trends of common STDs in Hawaii / A.R. Katz, M.V. Lee, G.M. Wasserman // Hawaii Journal of Medicine and Public Health. - 2012. - Vol. 71, № 3. - P. 68-73.

177. Kau, A.L. Interaction of UPEC with host uroepithelium / A.L. Kau, D.A. Hunstad, S.J. Hultgren // Current Opinion in Microbiology. - 2005. - Vol. 8, № 1. - P. 54-59.

178. Kaye, K.S. Infections caused by resistant gram negative bacteria: Epidemiology and management / K.S. Kaye, J.M. Pogue // Journal of Human Pharmacology and Drug Therapy. - 2015. - Vol. 35, Issue 10. - P. 949-962.

179. Kayser, F.H. Medical microbiology. Part II: Bacteriology / F.H. Kayser, K.A. Bienz, J. Eckert, R.M. Zinkernagel // 10th edition. Georg Thieme Verlag, Germany. - 2005. - P. 229-345.

180. Kelley, S.P. Urinary ATP and visualization of intracellular bacteria: A superior diagnostic marker for recurrent UTI in renal transplant recipients / S.P. Kelley, H.R. Courtneidge, R.E. Birch // Springerplus. - 2014. - Vol. 3. - P. 200.

181. Khawcharoenporn, T. UTIs due to MDR Enterobacteriaceae: Prevalence and risk factors in a Chicago emergency department / T. Khawcharoenporn, S. Vasoo, K. Singh // Emergency Medicine International. - 2013. - P. 7.

182. Kim, H-K. The recent review of the genitourinary syndrome of menopause / H-K. Kim, S-Y. Kang, Y-J. Chung, J-H. Kim, M-R. Kim // Journal of Menopausal Medicine. - 2015. - Vol. 21. - P. 65-71.

183. King, C. Risk Factors for healthcare-associated UTI and their application in surveillance using hospital administrative data: A systematic review / C. King, L. Garcia Alvarez, A. Holmes, L. Moore, T. Galletly // Journal of Hospital Infection. - 2012. -Vol. 82. - P. 219-226.

184. Kisiela, D.I. Inhibition and reversal of microbial attachment by an antibody with parasteric activity against the FimH adhesin of UPEC / D.I. Kisiela, H. Avagyan, D. Friend, A. Jalan // PLOS Pathogens. - 2015. - Vol. 11, № 5. - P. 1-22.

185. Knothe, H. Transferable resistance to cefotaxime, cefoxitin, cefamandole and cefuroxime in clinical isolates of Klebsiella pneumoniae and Serratia marcescens / H. Knothe, P. Shash, V. Kremery, M. Antal, S. Mitsuhashi // Infection. - 1983. - Vol. 11. - P. 315-317.

186. Kodner, C.M. Recurrent UTIs in women: Diagnosis and management / C.M. Kodner, E.K. Gupton // American Family Physician. - 2010. - Vol. 82, № 6. - P. 638-643.

187. Kolawole, A.S. Prevalence of UTIs among patients attending Dalhatu Araf specialist hospital, Lafia, Nasarawa State, Nigeria / A.S. Kolawole, O.M. Kolawole, Y.T. Kandaki-Olukemi, S.K. Babatunde // International Journal of Medicine and Medical Sciences. - 2009. - Vol 1, № 5. - P. 163-167.

188. Krause, K. UTIs in the elderly: Symptomatology and prevention / K. Krause, M. Mowassee, C. Auerhahn // The American Journal of Nurse Practitioners. -2008. - Vol. 12. - P. 57-63.

189. Kresken, M. Occurrence of MDR to oral antibiotics among Escherichia coli urine isolates from outpatient departments in Germany: ESBLs and the role of fosfomycin / M. Kresken, I. Pfeifer, D. Hafner, R. Wresch, B. Körber-Irrgang // International Journal of Antimicrobial Agents. - 2014. - Vol. 44. - P. 295-300.

190. Krzemien, G. Urinary Levels of Interleukin-6 and Interleukin-8 in Children with UTIs to Age two / G. Krzemien, M. Roszkowska-Blaim, I. Kostro, A. Szmigielska, M. Karpinska // Medical Science Monitor. - 2004. - Vol. 10, № 11. - P. CR593-597.

191. Kucheria, R. UTIs: New insights into a common problem / R. Kucheria, P. Dasgupta, S.H. Sacks, M.S. Khan, N.S. Sheerin // Postgraduate Medical Journal. - 2005. - Vol. 81. - P. 83-86.

192. Lahiri, A. Engagement of TLR signaling as adjuvant: Towards smarter vaccine and beyond / A. Lahiri, P. Das, D. Chakravortty // Vaccine. - 2008. - Vol. 26, № 52. - P. 6777-6783.

193. Lau, A.Y. A comparative study on bacterial cultures of urine samples obtained by clean-void technique versus urethral catheterization / A.Y. Lau, S.N. Wong, K.T. Yip, K.W. Fong, S.P. Li // Acta Paediatrica. - 2007. - Vol. 96, № 3. - P. 432-436.

194. Lautenbach, E. Bacterial infections of humans: Epidemiology and control; Healthcare-acquired bacterial infections / E. Lautenbach, P.S. Brachman, E. Abrutyn, A.S. Evans// 4th edition. Springer Science+Business Media: New York, USA. - 2009. -P. 553,563.

195. Leboffe, M.J. A photographic atlas for the microbiology laboratory. Chapter 13: Bacterial pathogens / M.J. Leboffe, B.E. Pierce // 3rd edition. Morton Publishing Company, USA. - 2005. - P. 129-158.

196. Lee, M-T. Comparative effectiveness of different oral antibiotics regimens for treatment of UTI in outpatients: An analysis of national representative claims database / M-T. Lee, S-H. Lee, S-S. Chang, S-H Lee, M. Lee // Medicine. - 2014. - Vol. 93, № 28. - P. 1-10.

197. Lee, M.J. Why is ASB overtreated: A tertiary care institutional survey of resident physicians / M.J. Lee, M. Kim, N-H. Kim, C-J Kim // BMC Infectious Diseases. - 2015. - Vol. 15, № 289. - P. 1-7.

198. Leyla, G. Virulence properties of Escherichia coli isolated from clinical bovine mastitis / G. Leyla, G. Kadri // Turkish Journal of Veterinary and Animal Sciences. - 2007. - Vol. 31, № 5. - P. 361-365.

199. Lipsy, S. Clinical practice guidelines: Prevention and control of CAUTI / S. Lipsy, P. Ceo, K. Green, J. Harris, L.C. Maw // The Society of Urologic Nurses and Associates (SUNA). New Jersey, USA. - 2010. - P. 1-17.

200. Little, P. Dipsticks and diagnostic algorithms in UTI: Development and validation randomised trial, economic analysis, observational cohort and qualitative study / P. Little, S. Turner, K. Rumsby, G. Warner, M. Moore // Health Technology Assessment. - 2009. - Vol. 13, № 19. - P. 1-96.

201. Litwin, M.S. Urologic diseases in America project: Analytical methods and principal findings / M.S. Litwin, C.S. Saigal, E.M. Yano, C. Avila, S.A. Geschwind // The Journal of Urology. - 2005. - Vol. 173, № 3. - P. 933-937.

202. Loeb, M. Evidence-based infectious diseases. Chapter 9: UTIs / M. Loeb, F. Smaill, M. Smieja, T. Feketa // 2nd edition. BMJ Books. Wiley-Blackwell Publishing Ltd., UK. - 2009. - P. 115-135.

203. Logan, N.A. Principles and practice in clinical bacteriology: Bacillus spp. and related genera / N.A. Logan, M. Rodríguez-Díaz, S.H. Gillespie, P.M. Hawkey // 2nd edition. John Wiley and Sons Ltd., UK. - 2006. - P. 139-158.

204. Lorenzo-Gómez, M.F. Evaluation of a therapeutic vaccine for the prevention of recurrent UTIs versus prophylactic treatment with antibiotics / M.F. Lorenzo-Gómez, B. Padilla-Fernández, F.J. García-Criado, J.A. Mirón-Canelo, A. Gil-Vicente // International Urogynecology Journal. - 2013. - Vol. 24. - P. 127-134.

205. Magill, S.S. Prevalence of healthcare-associated infections in acute care hospitals in Jacksonville, Florida / S.S. Magill, W. Hellinger, J. Cohen, R. Kay // Infection Control and Hospital Epidemiology. - 2012. - Vol. 33, № 3. - P. 283-291.

206. Mahmood, M.A. Prevalence and antimicrobial susceptibility of pathogens in UTIs / M.A. Mahmood // Journal of Al-Nahrain University. - 2011. - Vol. 14, № 4. -P. 146-152.

207. Mallard, K. Development of real-time PCR for the differential detection and quantification of Ureaplasma urealyticum and U. parvum / K. Mallard, K. Schopfer, T. Bodmer // J. Microbiological Methods. - 2005. - Vol. 60. - P. 13-19.

208. Manning, S.D. Escherichia coli infections: Deadly diseases and epidemics. Chapter 7: Diagnosis and treatment / S.D. Manning, H. Babcock, D.L. Heymann // 2nd edition. Chelsea House Publishers, New York, USA. - 2010. - P. 72-84.

209. Mazzulli, T. Diagnosis and management of simple and complicated UTIs / T. Mazzulli // The Canadian J. of Urology. - 2012. - Vol. 19, Suppl. 1. - P. 42-48.

210. McPherson, R.A. Henry's Clinical Diagnosis and Management by Laboratory Methods : Basic examination of the urine / R.A. McPherson, M.R. Pincus, J. Ben-Ezra // 22nd edition. Elsevier Saunders. USA. - 2011. - P. 445-479.

211. Melican, K. UPEC P and type-1 fimbriae act in synergy in a living host to facilitate renal colonization leading to nephron obstruction / K. Melican, R.M. Sandoval, A. Kader, L. Josefsson, G.A. Tanner // PLOS Pathogens. - 2011. - Vol. 7, № 2. - P. e1001298.

212. Miller, C.L. Improving compliance with clinical practice guidelines to reduce UTI in long term care / C.L. Miller // Doctor of Nursing Practice Program Projects. College of Nursing and Health Student Publications, Wright State University. Wright, Ohio, USA. - 2015. - P. 1-84. Available online from http://corescholar.libraries.wright.edu/nursing dnp/13

213. Mladin, C. Genetic analysis of virulence and pathogenicity features of UPEC isolated from patients with neurogenic bladder / C. Mladin, C.R. Usein, M. Chifiriuc, A. Palade, C.L. Slavu // Romanian Biotechnological Letters. - 2009. - Vol. 14, № 6. - P. 4906-4911.

214. Moulds, R. Gentamicin: A great way to start / R. Moulds, M.S. Jeyasingham // Australian Prescriber. - 2010. - Vol. 33, № 5. - P. 134-135.

215. Moyo, S.J. Bacterial isolates and drug susceptibility patterns of UTI among pregnant women at Muhimbili national hospital in Tanzania / S.J. Moyo, S. Aboud, M. Kasubi, S.Y. Maselle // Tanzania Journal of Health Research. - 2010. - Vol. 12, № 4. -P. 236-240.

216. Muller, L.M. Increased risk of common infections in patients with Type 1 and Type 2 Diabetes mellitus / L.M. Muller, K.J. Gorter, E. Hak, W.L. Goudzwaard, F.C. Schellevis // Clinical Infectious Diseases. - 2005. - Vol. 41, № 3. - P. 281-288.

217. Muvunyi, C.M. Decreased susceptibility to commonly used antimicrobial agents in bacterial pathogens isolated from UTIs in Rwanda: Need for new antimicrobial guidelines / C.M. Muvunyi, F. Masaisa, C. Bayingana, L. Mutesa // American J. Tropical Medicine and Hygiene. - 2011. - Vol. 84, № 6. - P. 923-928.

218. Naber, K.G. Immunoactive prophylaxis of recurrent UTIs: A meta-analysis / K.G. Naber, Y.H. Cho, T. Matsumoto, A.J. Schaeffer // International Journal of Antimicrobial Agents. - 2009. - Vol. 33, № 2. - P. 111-119.

219. Naish, W. UTI: Diagnosis and management for nurses / W. Naish, M. Hallam // Nursing Standard. - 2007. - Vol. 21. - P. 50-57.

220. Nanakali, Z.G. Antibiotic resistance study and detection of virulence gene among UPEC / Z.G. Nanakali, Z.F. Ahmad // Kirkuk University Journal of Scientific Studies. - 2015. - Vol. 10, № 3. - P. 205-229.

221. Nasehi, L. CTX-M, TEM, and SHV Beta-lactamases in clinical isolates of Klebsiella pneumoniae isolated from Tehran, Iran / L. Nasehi, F. Shahcheraghi, V.S. Nikbin, S. Nematzadeh // Iranian Journal of Basic Medical Sciences. - 2010. - Vol. 13, № 3. - P. 111-118.

222. National Committee for Clinical Laboratory Standard (NCCLS). Performance standards for antimicrobial susceptibility testing // NCCLS, 950 West valley road, Suite 2500, Wayne, PA 19087, USA. - 2000. - Supplement M100-S10. Available online from www.clsi.org

223. National Committee for Clinical Laboratory Standards (NCCLS). Performance standards for antimicrobial susceptibility testing // NCCLS, 950 West valley road, Suite 2500, Wayne, PA 19087, USA. - 2001. - International Supplement, 11th edition. Available online from www.clsi.org

224. National Kidney and Urologic Diseases Information Clearinghouse (NKUDIC). UTIs in adults // The National Institute of Diabetes and Digestive and Kidney Diseases. National Institute of Health. MD, USA. - 2011. - P.1-12. Available online from http://www.urologic.niddk.nih.gov

225. Naves, P. Correlation between virulence factors and in vitro biofilm formation by Escherichia coli strains / P. Naves, G. del Prado, L. Huelves, M. Gracia, V. Ruiz // Microbial Pathogenesis. - 2008. - Vol. 45, № 2. - P. 86-91.

226. National Institute for health and Clinical Excellence (NICE). UTI in Children: Diagnosis, treatment and long-term management // NICE, Manchester, UK. -2007. - Clinical guideline № 54. - P. 1-36. Available online from: http://guidance.nice.org.uk/CG054

227. National Institute for Health and Care Excellence (NICE). Infection prevention and control of healthcare-associated infections in primary and community care // NICE, Manchester, UK. - 2012. - Clinical guideline № 139. - P. 1-47. Available online from http://guidance.nice.org.uk/cg139

228. National Institute for health and Clinical Excellence (NICE). UTIs in adults // NICE, Manchester, UK. - 2015. - Quality standard № 90. - P. 1-36. Available online from http://guidance.nice.org.uk/qs90

229. Ndegwa, D.W. Aminoglycoside modifying enzymes detected in strains of Escherichia, Klebsiella, Pseudomonas, and Acinetobacter implicated in invasive infections in Nairobi, Kenya / D.W. Ndegwa, N.L. Budambula, S. Kariuki, G. Revathi, J.N. Kiiru // Centre for Microbiology Research, Kenya Medical Research Institute, Nairobi, Kenya. - 2008. - P. 109-119. Available online from http: //j ournal s.jkuat.ac .ke/index .php/j scp/article/download/685/631

230. Neal, D.E. Complicated UTIs / D.E. Neal // Urologic Clinics of North America. - 2008. - Vol. 35, № 1. - P. 13-22.

231. Nicolle, L.E. Uncomplicated UTI in adults including uncomplicated pyelonephritis / L.E. Nicolle // Urologic Clinics of North America. - 2008. - Vol. 35. -P. 1-12.

232. Nicolle, L.E. Urinary catheter-associated infections / L.E. Nicolle // Infectious Diseases Clinics of North America. - 2012. - Vol. 26, № 1. - P. 13-27.

233. Nor, N.S. Bacterial pathogens and antibiotic resistance patterns in children with UTI in a Malaysian tertiary hospital / N.S. Nor, N.A. Abu, M.A. Rashid, F.M. Fadzli, M.I. Selamat // Medical J. Malaysia. - 2015. - Vol. 70, № 3. - P. 153-157.

234. Norinder, B.S. Do Escherichia coli strains causing acute cystitis have a distinct virulence repertoire / B.S. Norinder, B. Koves, M. Yadav, A. Brauner, C. Svanborg // Microbial Pathogenesis. - 2012. - Vol. 52. - P. 10-16.

235. Nowell, L. Prevalence of renal anomalies after UTIs in hospitalized infants less than 2 months of age / L. Nowell, C. Moran, P.B. Smith, P. Seed, B.D. Alexander // Journal of Perinatology. - 2010. - Vol. 30. - P. 281-285.

236. Nozarian, Z. Microbial etiology and antimicrobial susceptibility of Bactria implicated in UTI in Tehran, Iran / Z. Nozarian, A. Abdollahi // Iranian Journal of Pathology. - 2015. - Vol. 10, № 1. - P. 54-60.

237. Okonko, I.O. Antibiotics sensitivity and resistance patterns of uropathogens to nitrofurantoin and nalidixic acid in pregnant women with UTIs in Ibadan, Nigeria / I.O. Okonko, O.B. Donbraye-Emmanuel, L.A. Ijandipe, A.A. Ogun // Middle-East Journal of Scientific Research. - 2009. - Vol. 4, № 2. - P. 105-109.

238. Oliveira, F.A. Virulence characteristics and antimicrobial susceptibility of UPEC strains / F.A. Oliveira, K.S. Paludo, L.N. Arend, S.M. Farah, F.O. Pedrosa // Genetic and Molecular Research. - 2011. - Vol. 10, № 4. - P. 4114-4125.

239. Oliveira, da Silva J. Successful treatment of lower UTIs with oral fosfomycin: A report of three cases / J. Oliveira, da Silva, M.C. Zorat Yu, A. Doi, M.R. Elmor de Araujo, P.A. Mathiasi Neto // Revista da Sociedade Brasileira de Medicina Tropical. - 2015. - Vol. 48, № 3. - P. 358-360.

240. OM, F.R. A Review on UTI in pregnancy / F.R. OM, T. Balasubramanian, M. Shejina, M.M. Mohthash // International Journal of Pharma Research and Review. -2015. - Vol. 4, № 2. - P. 26-33.

241. Oshodi, A.J. Bacterial uropathogen among benign prostatic hyperplasia patients at a Tertiary hospital in Nigeria / A.J. Oshodi, C. Nwabuisi, A.A. Popoola, L.D. Edungbola, O.O. Agbede // Open Journal of Medical Microbiology. - 2015. - Vol. 5. - P. 22-27. Available online from http://dx.doi.org/10.4236/ojmm.2015.51004

242. Pallett, A. Complicated UTIs: Practical solutions for the treatment of MR gram-negative bacteria / A. Pallett, H. Kieran // Journal of Antimicrobial Chemotherapy. - 2010. - Vol. 65, Suppl. 3. - P. 25-33.

243. Parsons, C.L. The role of the urinary epithelium in the pathogenesis of interstitial cystitis/prostatitis/urethritis / C.L. Parsons // Urology. - 2007. - Vol. 69. - P. 9-16.

244. Partridge, S.R. Analysis of antibiotic resistance regions in gram negative bacteria: Review article / S.R. Partridge // FEMS Microbiology Reviews. - 2011. - Vol. 35. - P. 820-855.

245. Paschke, A.A. Previous antimicrobial exposure is associated with drug-resistant UTIs in Children / A.A. Paschke, T. Zaoutis, P. Conway // Pediatrics. - 2010. -Vol. 125. - P. 664-672.

246. Peter, T. Update on biofilm infections in the urinary tract / T. Peter, B. Koves, K. Nagy, S.J. Hultgren, W. Mendling // World Journal of Urology. - 2012. - Vol. 30. - P. 51-57.

247. Piccoli, G.B. The clinical and imaging presentation of acute "noncomplicated" pyelonephritis, A new profile for an ancient disease / G.B. Piccoli, V. Consiglio, M.C. Deagostini, M. Serra, M. Biolcati // BMC Nephrology. - 2011. - Vol. 12, № 68. P. 1-10.

248. Poulou, A. Modified CLSI ESBL confirmatory test for phenotypic detection of ESBLs among Enterobacteriaceae producing various P-lactamases / A. Poulou, E. Grivakou, G. Vrioni, V. Koumaki, T. Pittaras // Journal of Clinical Microbiology. - 2014. - Vol. 52, № 5. - P. 1483-1489.

249. Praharaj, A.K. Phenotypic detection and molecular characterization of beta lactamase genes among Citrobacter species in a tertiary care hospital / A.K. Praharaj, A. Khajuria, M. Kumar, N. Grover // Avicenna Journal of Medicine. - 2016. - Vol. 6, Issue 1. - P. 17-27.

250. Prakasam, A.K. A cross sectional study on distribution of UTI and their antibiotic utilization pattern in Kerala / A.K. Prakasam, K.G. Kumar, M. Vijayan // International Journal of Pharm Tech Research. - 2012. - Vol. 4, № 3. - P. 1309-1316.

251. Pratt, R.J. Epic 2: National evidenced-based guidelines for preventing healthcare-associated infections in NHS hospitals in England / R.J. Pratt, C.M. Pellowe,

L.A. Wilson, H.P. Loveday, P.J. Harper // Journal of Hospital Infection. - 2007. - Vol. 65, Suppl. 1. - P. S1-S64.

252. Qi, C. Changing prevalence of Escherichia coli with CTX-M-type ESBLs in outpatient urinary Escherichia coli between 2003 and 2008 / C. Qi, V. Pilla, J.H. Yu, K. Reed // Diagnostic Microbiology and Infectious Disease. - 2010. - Vol. 67, № 1. - P. 87-91.

253. Queenan, A.M. Effects of inoculum and beta lactamase activity in AmpC-and ESBL-producing Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae clinical isolates tested by using NCCLS ESBL methodology / A.M. Queenan, B. Foleno, C. Gownley // Journal of Clinical Microbiology. - 2004. - Vol. 42, № 1. - P. 269-275.

254. Rahdar, M. Detection of PAP, SFA, AFA, FOC, and FimH adhesin-encoding operons in UPEC isolates collected from patients with UTI / M. Rahdar, A. Rashki, H.R. Miri, M.R. Ghalehnoo // Jundishapur Journal of Microbiology. - 2015. -Vol. 8, № 8. - P. 1-6.

255. Rahman, H. Molecular prevalence and antibiotics resistance pattern of class A bla CTX-M-1 and bla TEM-1 beta lactamases in UPEC isolates from Pakistan / H. Rahman, M. Naeem, I. Khan, J. Khan, M. Haroon // Turkish Journal of Medical Sciences. - 2016. - Vol. 46. - P. 1-6.

256. Rahn, D. UTIs: Contemporary management / D. Rahn // Urologic Nursing. - 2008. - Vol. 28, № 5. - P. 333-341.

257. Rajesh, K.R. Prevalence of antimicrobial resistance in uropathogens and determining empirical therapy for UTIs / K.R. Rajesh, S. Mathavi, R.I. Priyadarsni // International Journal of Basic Medical Sciences. - 2010. - Vol. 1, Issue 5. - P. 260-263.

258. Ramirez, M.S. Aminoglycoside modifying enzymes / M.S. Ramirez, M.E. Tolmasky // Drug Resistance Updates. - 2010. - Vol. 13, № 6. - P. 151-171.

259. Rashid, M. Antimicrobial-resistant and ESBL-producing Escherichia coli in different ecological niches in Bangladesh / M. Rashid, M.M. Rakib, B. Hasan // Infection Ecology and Epidemiology. - 2015. - Vol. 5, № 26712. - P. 1-7.

260. Raval, R. Clino-pathological features of UTI in Rural India / R. Raval, R.J. Verma, H. Kareliya // Advances in Infectious Diseases. - 2015. - Vol. 5. - P. 132-139.

261. Raz, R. UTI in postmenopausal women / R. Raz // Korean Journal of Urology. - 2011. - Vol. 52. - P. 801-808.

262. Reddy, U.D. Complicated UTIs: Highlights on diagnosis and minimally invasive treatment / U.D. Reddy, A. Chetwood, A.M. Saafan // European Medical Journal of Urology. - 2015. - P. 57-61.

263. Reisner, A. Type 1 fimbriae contribute to CAUTIs caused by Escherichia coli / A. Reisner, M. Maierl, M. Jörger, R. Krause, D. Berger // Journal of Bacteriology. - 2014. - Vol. 196, № 5. - P. 931-939.

264. Reza, G. Phylogenetic background and virulence genes of Escherichia coli isolates from coli septicemic and healthy broiler chickens in Iran / G. Reza, S. Masoud, S. Mahmood, O. Mahla // Tropical Animal Health and Production. -2011. - Vol. 43. - P. 153-157.

265. Ribeiro, T.M. Genotypic characterization of virulence factors in Escherichia coli strain Q2 w23sa2ws from patients with cystitis / T.M. Ribeiro, T. Yano, L.D. Silva // Revista do Instituto de Medicina Tropical de Säo Paulo. - 2008. -Vol. 50, № 5. - P. 255-260.

266. Robino, L. Detection of IBCs in a child with Escherichia coli recurrent UTIs / L. Robino, P. Scavone, L. Araujo // Pathogens and Disease. - 2013. - Vol. 68. -P. 78-81.

267. Robino, L. Intracellular bacteria in the pathogenesis of Escherichia coli UTI in children / L. Robino, P. Scavone, L. Araujo // Clinical Infectious Diseases. -2014. - Vol. 59. - P. e158-e164.

268. Rodgers, M. Diagnostic tests and algorithms used in the investigation of haematuria: Systematic reviews and economic evaluation / M. Rodgers, J. Nixon, S. Hempel, T. Aho, J. Kelly // Health Technology Assessment. - 2006. - Vol. 10, № 18. -P. iii-ix.

269. Rodrigues e Barros, I.C. Microorganisms prevalent in UTIs and antimicrobial sensitivity profile: Analysis of patients attended at the military police hospital of the State of Goias, Brazil, in the period from 1998 to 2008 / I.C. Rodrigues e

Barros, A.U. Ribeiro, A.C. Vieira da Costa, D.C. Nunes, K.S. Neres // International Journal of Health Sciences. - 2011. - Vol. 29, № 4. - P. 243-247.

270. Rosen, D.A. Utilization of an IBC pathway in Klebsiella pneumoniae UTI and the effects of FimK on type 1 pilus expression / D.A. Rosen, J.S. Pinkner, J.M. Jones, J.N. Walker, S. Clegg // Infection and Immunity. - 2008a. - Vol. 76. - P. 33373345.

271. Rosen, D.A. Molecular variations in Klebsiella pneumoniae and Escherichia coli FimH affect function and pathogenesis in the urinary tract / D.A. Rosen, J.S. Pinkner, J.N. Walker, J.S. Elam, J.M. Jones // Infection and Immunity. -2008b. - Vol. 76, № 7. - P. 3346-3356.

272. Rosen, J.M. Mechanisms of pain from UTI / J.M. Rosen, D.J. Klumpp // International Journal of Urology. - 2014. - Vol. 21, Suppl. 1. - P. 26-32.

273. Ruppe, E. CTX-M ß-Lactamases in Escherichia coli from community-acquired UTIs, Cambodia / E. Ruppe, S. Hem, S. Lath, V. Gautier, F. Ariey // Emerging Infectious Diseases Journal. - 2009. - Vol. 15, № 5. - P. 741-748.

274. Ryan, K.J. Sherris medical microbiology: An introduction to infectious diseases. Chapter 21: Enterobacteriaceae and Chapter 66: UTI / K.J. Ryan, C.G. Ray // 4th edition. McGraw Hill, USA. - 2004. - P. 349, 867.

275. Saad, K.A. Detection of ctx-m and aac(3)-II antibiotic resistance genes in Escherichia coli isolated from leukemic children with UTI / K.A. Saad, I.M. Juma, K.A. Jassim // M.Sc. thesis. College of Health and Medical Technology, Middle Technical University, Baghdad, Iraq. - 2015. - P. 1-96.

276. Saha, S. Antimicrobial resistance in uropathogen isolates from patients with UTIs / S. Saha, S. Rahman, N. Hassan, S.L. Sarkar, K. Islam // Biomedical Research and Therapy. - 2015. - Vol. 2, № 5. - P. 263-269.

277. Salvatore, D.J. Treatment options for UTIs caused by ESBL-producing Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae / D.J. Salvatore, B.H. Resman-Targoff // Journal of Academic Hospital Medicine. - 2015. - Vol. 7, Issue 1. - P. 1-4.

278. Samson, G. Neurogenic bladder in spinal cord injury / G. Samson, D.D. Cardenas // Physical Medicine and Rehabilitation Clinics of North America. - 2007. -Vol. 18, № 2. - P. 255-274.

279. Sanchez, G. In vitro antimicrobial resistance of urinary Escherichia coli isolates among U.S outpatients from 2000 to 2010 / G. Sanchez, R. Master, J. Karlowsky // Antimicrobial Agents and Chemotherapy. - 2012. - Vol. 56, № 4. - P. 2181-2183.

280. Sanches, I. Urinary tuberculosis: Serious complications may occur when diagnosis is delayed / I. Sanches, C. Pinto, M. Sousa, A. Caravalno, R. Raquel Duarte // Acta Médica Portuguesa. - 2015. - Vol. 28. - P. 382-385.

281. Schaeffer, A.J. UTIs in adults / A.J. Schaeffer, B. Foxman, E. Tracy // Journal of the National Kidney and Urological Diseases information clearing house NXIH publication. - 2007. Available online from https://www.niddk.nih.gov/health-information/health-topics/urologic-disease/urinary-tract-infections-in-adults/Pages/facts. aspx

282. Schlager, T.A. Absence of bacterial reservoirs in the bladder epithelium of patients with chronic bacteriuria due to neurogenic bladder / T.A. Schlager, J.O. Hendley, C.A. Peters // Journal of Urology. - 2009. - Vol. 182, Suppl. 4. - P. 1714-1719.

283. Schlecht, H.P. Merck Manual: Aminoglycosides / H.P. Schlecht, C. Bruno // - 2015. - Professional version. Available online from http://www.merckmanuals.com/Professional/Infectious-Diseases/Bacteria-and-Antibacterial-Drugs

284. Schmiemann, G. The diagnosis of UTI: A systematic review / G. Schmiemann, E. Kniehl, K. Gebhardt // Deutsches Arzteblatt International. - 2010. -Vol. 107, № 21. - P. 361-367.

285. Schroll, C. Role of type 1 and type 3 fimbriae in Klebsiella pneumoniae biofilm formation / C. Schroll, K.B. Barken, K.A. Krogfelt, C. Struve // BMC Microbiology. - 2010. - Vol. 10. - P. 179.

286. Schwan, W.R. Regulation of genes in UPEC / W.R. Schwan // World Journal of Clinical Infectious Diseases. - 2011. - Vol. 1. - P. 17-25.

287. Schwartz, D.J. Positively selected FimH residues enhance virulence during UTI by altering FimH conformation / D.J. Schwartz, V. Kalasa, J.S. Pinknera, S.L. Chenb, C.N. Spauldinga // Proceedings of the National Academy of Sciences of the USA (PNAS). - 2013. - Vol. 110, № 39. - P. 15530-15537.

288. Scott, V.C. Intracellular bacterial communities: A potential etiology for chronic lower urinary tract symptoms / V.C. Scott, D.A. Haake, B.M. Churchill, S.S. Justice, J-H. Kim // Urology. - 2015. - Vol. 86, № 3. - P. 425-431.

289. Scottish Intercollegiate Guidelines Network (SIGN). Management of suspected bacterial UTI in adults: A national clinical guideline // 2006. Available online from http: //www.si gn. ac .uk/guidelines/fulltext/8 8/index.html

290. Scottish Intercollegiate Guidelines Network (SIGN). Management of suspected bacterial UTI in adults: A national clinical guideline // 2012. - № 88. - P. 140. Available online from http: //www .sign.ac.uk

291. Sedighi, I. Dissemination of ESBLs and quinolone resistance genes among clinical isolates of UPEC in children / I. Sedighi, M.R. Arabestani, A. Rahimbakhsh, Z. Karimitabar, M.Y. Alikhani // Jundishapur Journal of Microbiology. - 2015. - Vol. 8, № 7. - P. 1-6.

292. Selvakumar, B.N. Prevalence and antibacterial resistance of ESBLs among pregnant women with UTI / B.N. Selvakumar, R. Jasmine // International Journal of Pharmaceutical Sciences and Research. - 2011. - Vol. 2, № 11. - P. 2846-2848.

293. Shaaban, M.T. Susceptibility of bacteria infecting urinary tract to some antibiotics and essential oils / M.T. Shaaban, H.A. Ghozlan, M.M. El Maghraby // Journal of Applied Pharmaceutical Science. - 2012. - Vol. 02, № 04. - P. 90-98.

294. Shah, D.A. Antibiotic resistance pattern of Pseudomonas aeruginosa isolated from urine samples of UTIs patients in Karachi, Pakistan / D.A. Shah, S. Wasim, F.E. Abdullah // Pakistan Journal of Medical Sciences. - 2015. - Vol. 31, № 2. -P. 341-345.

295. Shah, L.J. UTI: Bacteriological profile and its antibiotic susceptibility in western India / L.J. Shah, G.M. Vaghela, H. Mahida // National Journal of Medical Research. - 2015. - Vol. 5, Issue 1. - P. 71-74.

296. Shakil, S. Aminoglycoside versus bacteria-A description of the action, resistance mechanism, and nosocomial battleground / S. Shakil, R. Khan, R. Zarrilli, K. Khan // Journal of Biomedical Science. - 2008. - Vol. 15. - P. 5-14.

297. Sharifi, Y. Prevalence of ctx-m genes in bacterial strain isolated from patients hospitalized in ICUs in the city of Qom, Iran / Y. Sharifi, A. Morovvati, A. Abedzadeh, A. Javadi // Journal of Medical Bacteriology. - 2015. - Vol. 4, № 3, 4. - P. 45-54.

298. Sharma, A. ESBL-A continuous diagnosis challenge to clinical microbiology laboratories / A. Sharma, M.R. Prakash, M. Veena, R.E. Singh, K.N. Basavaraj // International Journal of Applied Biology and Pharmaceutical Technology. -2012. - Vol. 3, Issue 2. - P. 9-15.

299. Shindel, A.W. Urologic aspects of HIV infection / A.W. Shindel, A. Akhavan, I.D. Sharlip // Medical Clinics of North America. - 2011. - Vol. 95, № 1. - P. 129-151.

300. Shulman, S.T. Theodor Escherich: The first pediatric infectious diseases physician / S.T. Shulman, H.C. Friedmann // Clinical Infectious Diseases. - 2007. - Vol. 45, № 8. - P. 1025-1029.

301. Sidjabat, H.E. MDR Escherichia coli in Asia: Epidemiology and Management / H.E. Sidjabat, D.L. Paterson // Expert Review of Anti-Infective Therapy. - 2015. - Vol. 13, Issue 5. - P. 575-591.

302. Simon, H. UTI / H. Simon, D. Zieve // University of Maryland Medical Center. - 2012. Available online from http://umm.edu/health/medical/reports/articles/urinary-tract-infection#ixzz3oaFq0532

303. Singh, R.E. ESBL production: Resistance pattern in Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae: A study by DDST method / R.E. Singh, M. Veena, K.G. Raghukumar, G. Vishwanath, P.N. Sridhar Rao // International Journal of Applied Biology and Pharmaceutical Technology. - 2011. - Vol. 2, Issue 4. - P. 415-422.

304. Sivatbasan, N. Microscopy, culture, and sensitive management of uncomplicated UTIs in adults in the primary care setting / N. Sivatbasan, K. Rakowski // Saudi Medical Journal. - 2011. - Vol. 32, № 6. - P. 559-562.

305. Slavchev, G. Virulence of UPEC / G. Slavchev, E. Pisareva, N. Markova // Journal of Culture Collections. - 2009. - Vol. 6. - P. 3-9.

306. Sokurenko, E.V. Selection footprint in the FimH adhesin shows pathoadaptive niche differentiation in Escherichia coli / E. V. Sokurenko, M. Feldgarden,

E. Trintchina, S. J. Weissman, S. Avagyan, S. Chattopadhyay, J. R. Johnson, D. E. Dykhuizen // Molecular Biology and Evolution. - 2004. - Vol. 21. - P. 1373-1383.

307. Sorlozano, A. Evolution of the resistance to antibiotics of bacteria involved in UTIs: A 7-year surveillance study / A. Sorlozano, A. Jimenez-Pacheco, C.J. de Dios Luna, A. Sampedro // American Journal of Infection Control. - 2014. - Vol. 42. - P. 1033-1038.

308. Soto, S.M. Biofilm formation in UPEC strains: Relationship with prostatitis, urovirulence factors and antimicrobial resistance / S.M. Soto, A. Smithson, J.A. Martinez, J.P. Horcajada, J. Mensa // Journal of Urology. - 2007. - Vol. 177, № 1. -P. 365-368.

309. Southwick, F. Infectious diseases: A clinical short course. Chapter 9: Genitourinary tract infections and sexually transmitted diseases / F. Southwick // 2nd edition. McGraw-Hill companies, Inc., Medical Publishing Division, USA. - 2007. - P. 231-255.

310. Stahlhut, S.G. Population variability of the FimH type 1 fimbrial adhesin in Klebsiella pneumoniae / S.G. Stahlhut, S. Chattopadhyay, C. Struve, S.J. Weissman, P. Aprikian // Journal of Bacteriology. - 2009. - Vol. 191, № 6. - P. 1941-1950.

311. Stapleton, A.E. UTI pathogenesis: Host factors / A.E. Stapleton // Infectious Diseases Clinics of North America. - 2014. - Vol. 28, № 1. - P. 149-159.

312. Strazdins, V. Recurrent UTI in adults in Latvia: 2014 Observational study / V. Strazdins, H. Cernevskis // Journal of Nephrology and Therapeutics. - 2015. - Vol. 5, Issue 4. - P. 1-3.

313. Tada, T. Novel 6'-N-aminoglycoside acetyltransferases aac(6)-Iaj from a clinical isolate of Pseudomonas aeruginosa / T. Tada, T. Miyoshi-Akiyama, K.

Shimada, M. Shimojima, T. Kirikae // Antimicrobial Agents and Chemotherapy. - 2013. - Vol. 57. - P. 96-100.

314. Tajbakhsh, E. Isolation and molecular detection of gram negative Bacteria causing UTI in patients referred to Shahrekord hospitals, Iran / E. Tajbakhsh, S. Tajbakhsh, F. Khamesipour / Iran Red Crescent Med Journal. - 2015. - Vol. 17, № 5. -P. 1-8.

315. Takhar, S.S. Diagnosis and management of UTI in the emergency department and outpatient settings / S.S. Takhar, G.J. Moran // Infectious Diseases Clinics of North America. - 2014. - Vol. 28, № 1. - P. 33-48.

316. Taneja, N. UTI in a Tertiary, Care centre from North India / N. Taneja, S.S. Chatterjee, M. Singh, S. Singh, M. Sharma // Indian Journal of Medical Research. -2010. - Vol. 131. - P. 101-105.

317. Tang, Y-W. Advanced techniques in diagnostic microbiology. Chapter 5: Phenotypic testing of bacterial antimicrobial susceptibility / Y-W. Tang, C.W. Stratton, C. Qi, X. Zheng // Springer Science+Business Media LLC, USA. - 2006, - P. 63-83.

318. Tansarli, G.S. Proportion of ESBL-producing isolates among Enterobacteriaceae in Africa: Evaluation of the evidence-systematic review / G.S. Tansarli, P. Poulikakos, A. Kapaskelis, M.E. Falagas // Journal of Antimicrobial Chemotherapy. - 2014. - Vol. 69. - P. 1177-1184.

319. Tarchouna, M. Distribution of uropathogenic virulence genes in Escherichia coli isolated from patients with UTI / M. Tarchouna, A. Ferjani, W. Ben-Selma, J. Boukadida // International Journal of Infectious Diseases. - 2013. - Vol. 17, № 6. - P. e450-e453.

320. Taxier, R. UTI Pathway / R. Taxier, E. Austin, D. Caglar, C. Crowell, S. Fenstermacher // Seattle children's hospital. Seattle, USA. - 2015. - P. 1-43. Available online from: http://www.seattlechildrens.org/pdf/UTI-pathway.pdf

321. Tchesnokova, V. Type-1 fimbrial adhesin FimH elicits an immune response that enhances cell adhesion of Escherichia coli / V. Tchesnokova, P. Aprikian, D. Kisiela, S. Gowey, N. Korotkova // Infection and Immunity. - 2011. - Vol. 79, No. 10. -P. 3895-3904.

322. Thaden, J.T. Increasing incidence of ESBL producing Escherichia coli in community hospitals throughout the Southeastern U.S / J.T. Thaden, V.G. Fowler, D.J. Sexton, D.J. Anderson // Infection Control and Hospital Epidemiology. - 2015. - Vol. 00, № 0. - P. 1-6.

323. Theodoros, K. Urinary tract immunology: Clinical management of complicated UTI / K. Theodoros // Dr. Ahmad Nikibakhsh (Ed.), - 2011. Available online from: http://www.intechopen.com/books/clinical-management-of-complicated-urinary-tract-infection/urinary-tractimmunology

324. Thomas, L. Treatment of fungal UTI / L. Thomas, C.R. Tracy // Urologic Clinics of North America. - 2015. - Vol. 42, Issue 4. - P. 473-483.

325. Thoureen, T. UTI / T. Thoureen, S. Scott, J. Best, F. Lo Vecchio // AHC Media. Georgia, USA. - 2015. Available online from http://www.ahcmedia.com/articles/135127-urinary-tract-infection

326. Thumbikat, P. Bacteria-induced uroplakin signaling mediates bladder response to infection / P. Thumbikat, R.E. Berry, G. Zhou, B.K. Billips, R.E. Yaggie // PLOS Pathogens. - 2009. - Vol. 5. - P. e1000415.

327. Touaibia, M. Glycodendrimers as anti-adhesion drugs against type 1 fimbriated Escherichia coli uropathogenic infections / M. Touaibia, R. Roy // Mini Reviews in Medicinal Chemistry. - 2007. - Vol. 7, № 12. - P. 1270-1283.

328. Tsai, K.W. Difference in the regulation of IL-8 expression induced by UPEC between two kinds of urinary tract epithelial cells / K.W. Tsai, H.T. Lai, T.C. Tsai, Y.C. Wu, Y.T. Yang // Journal of Biomedical Sciences. - 2009. - Vol. 16, № 91. -P. 1-14.

329. Ugbogu, O. Asymptomatic bacteriuria among pregnant women in Aba / O. Ugbogu, R. Ogbonnaya, O. Nworie // Nigeria Journal of Microbiology. - 2010. - Vol. 24. - P. 2024-2027.

330. Upadhyay, S. Genetic environment of plasmid mediated CTX-M-15 ESBLs from clinical and food borne bacteria in North-Eastern India / S. Upadhyay, A. Hussain, S. Mishra, A. Maurya, A. Bhattacharjee // PLOS ONE. - 2015. - P. 1-11.

331. Vakulenko, S.B. Versatility of aminoglycosides and prospects for their future / S.B. Vakulenko, S. Mobashery // Clinical Microbiology Reviews. - 2003. - Vol. 16, № 3. - P. 430-450.

332. Vandepitte, J. Basic laboratory procedures in clinical bacteriology. Part 1: Bacteriological investigations: Urine / J. Vandepitte, J. Verhaegen, K. Engbaek, P. Rohner, P. Piot // 2nd edition. WHO, Geneva, Switzerland. - 2003. - P. 30-36.

333. Vasudevan, R. UTI: An overview of the infection and the associated risk factors / R. Vasudevan // Journal of Microbiology and Experimentation. - 2014. - Vol. 1, № 2.- P. 1-15.

334. Vincent, M. Helicase-dependent isothermal DNA amplification / M. Vincent, Y. Xu, H. Kong // EMBO Reports. - 2004. - Vol. 5, № 8. - P. 795-800.

335. Waheed, L.A. A colour atlas of medical bacteriology / L.A. Waheed, A.S. David, I.I. Abdullah, M.A. Abass, Z.I. Jassim // Department of teaching laboratories and central public health laboratory. Ministry of Health. Baghdad, Iraq. - 2008. - Vol. 35. -P. 43-55.

336. Watterworth, L., Topp E., Schraft H. Multiplex PCR-DNA probe assay for the detection of pathogenic Escherichia coli / L. Watterworth, E. Topp, H. Schraft // Journal of Microbiological Methods. - 2005. - Vol. 60, № 1. - P. 93-105.

337. Wang, C.H. Cranberry-containing products for prevention of UTIs in susceptible populations: A systematic review and meta-analysis of randomized controlled trials / C.H. Wang, C.C. Fang, N.C. Chen, S.S. Liu, P.H. Yu // Archives of Internal Medicine. - 2012. - Vol. 172, № 13. - P. 988-996.

338. Wagenlehner, F.M. Diagnosis and management for urosepsis / F.M. Wagenlehner, C. Lichtenstern, C. Rolfes // International Journal of Urology. - 2013. -Vol. 20. - P. 963-970.

339. Wenz, J.R. Escherichia coli isolates serotypes, genotypes, and virulence genes and clinical coliform mastitis severity / J.R. Wenz, G.M. Barrington, F.B. Garry, R.P. Ellis, R.J. Magnuson // Journal of Dairy Sciences. - 2006. - Vol. 89. - P. 34083412.

340. Wilson, B.A. Bacterial pathogenesis: A molecular approach. Chapter 11: Bacterial strategies for evading or surviving host defence systems / B.A. Wilson, A.A. Salyers, D.D. Whitt, M.E. Winkler // 3rd edition. American Society for Microbiology, Washington DC, USA. - 2011. - P. 193-224.

341. Wolfe, A.J. Evidence of uncultivated bacteria in the adult female bladder / A.J. Wolfe, E. Toh, N. Shibata // Journal of Clinical Microbiology. - 2012. - Vol. 50. -P. 1376-1383.

342. World Health Organization (WHO). WHO's first global report on antibiotic resistance reveals serious, worldwide threat to public health // WHO. - 2014. Available online from http: //www.who. int/en

343. Wright, K.J. Development of IBCs of UPEC depends on type 1 pili / K.J. Wright, P.C. Seed, S.J. Hultgren // Cellular Microbiology. - 2007. - Vol. 9. - P. 22302241.

344. Yamamoto, S. Molecular epidemiology of UPEC / S. Yamamoto // Journal of Infection and Chemotherapy. - 2007. - Vol. 13. - P. 68-73.

345. Yang, L.Y. Development of aminoglycoside antibiotics effective against resistant bacterial strains / L.Y. Yang // Current Topics in Medicinal Chemistry. - 2010.

- Vol. 10, № 18. - P. 1898-1826.

346. Yazdi, M. Genotypic versus Phenotypic methods to detect ESBLs in UPEC / M. Yazdi, A. Nazemi, M. Mirinargasi, M. Jafarpour // Annals of Biological Research.

- 2012. - Vol. 3, № 5. - P. 2454-2458.

347. Yumuk, Z. Turkey: A further country concerned by community-acquired Escherichia coli clone O25-ST131 producing CTX-M-15 / Z. Yumuk, G. Afacan, M.H. Nicolas-Chanoine, A. Sotto, J.P. Lavigne // Journal of Antimicrobial Chemotherapy. -2008. - Vol. 62, № 2. - P. 284-288.

348. Yun, K.W. Molecular typing of UPEC isolated from Korean children with UTI / K.W. Yun, D.S. Kim, W. Kim, I.S. Lim // Korean Journal of Pediatrics. - 2015. -Vol. 58, № 1. - P. 20-27.

349. Zalamanovici, T.A. Antimicrobial agents for treating uncomplicated UTI in women / T.A. Zalamanovici, H. Green, M. Paul, J. Yaphe, L. Leibovici // Cochrane

Database Systematic Review. - 2010. - Vol. 10. Available online from https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20927755

350. Zdziarski, J. Molecular basis of commensalism in the urinary tract: Low virulence or virulence attenuation / J. Zdziarski, C. Svanborg, B. Wullt, J. Hacker, U. Dobrindt // Infection and Immunity. - 2008. - Vol. 76, № 2. - P. 695-703.